Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160150.b #7	ENSGT00940000153972.C #8	ENSGT00390000009067 #9	ENSGT00390000005508.a #10	ENSGT00940000157810 #11	ENSGT00940000160061 #12	ENSGT00940000156189 #13	ENSGT00940000160790 #14	ENSGT01020000230394.e.a.a.a #15	ENSGT00390000005529.b #16	ENSGT00390000009899.b #17	ENSGT00940000155263 #18	ENSGT00940000154380.a #19	ENSGT00390000016211 #20	ENSGT00530000063702.a #21	ENSGT00390000014443 #22	ENSGT00390000004323.a #23	ENSGT00390000009250 #24	ENSGT00940000161995 #25	ENSGT00940000163480	ENSGT00390000009978 #26	ENSGT01060000248595.b.a.a #27	ENSGT00950000182939.a.b.a #28	ENSGT00940000160461 #29	ENSGT00940000157610 #30	ENSGT00940000153561.b.b #31	ENSGT00940000162430 #32	ENSGT00940000156551 #33
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160150.b #7	ENSGT00940000153972.C #8	ENSGT00390000009067 #9	ENSGT00390000005508.a #10	ENSGT00940000157810 #11	ENSGT00940000160061 #12	ENSGT00940000156189 #13	ENSGT00940000160790 #14	ENSGT01020000230394.e.a.a.a #15	ENSGT00390000005529.b #16	ENSGT00390000009899.b #17	ENSGT00940000155263 #18	ENSGT00940000154380.a #19	ENSGT00390000016211 #20	ENSGT00530000063702.a #21	ENSGT00390000014443 #22	ENSGT00390000004323.a #23	ENSGT00390000009250 #24	ENSGT00940000161995 #25	ENSGT00940000163480	ENSGT00390000009978 #26	ENSGT01060000248595.b.a.a #27	ENSGT00950000182939.a.b.a #28	ENSGT00940000160461 #29	ENSGT00940000157610 #30	ENSGT00940000153561.b.b #31	ENSGT00940000162430 #32	ENSGT00940000156551 #33
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000160150.b #7	ENSGT00940000153972.C #8	ENSGT00390000009067 #9	ENSGT00390000005508.a #10	ENSGT00940000157810 #11	ENSGT00940000160061 #12	ENSGT00940000156189 #13	ENSGT00940000160790 #14	ENSGT01020000230394.e.a.a.a #15	ENSGT00390000005529.b #16	ENSGT00390000009899.b #17	ENSGT00940000155263 #18	ENSGT00940000154380.a #19	ENSGT00390000016211 #20	ENSGT00530000063702.a #21	ENSGT00390000014443 #22	ENSGT00390000004323.a #23	ENSGT00390000009250 #24	ENSGT00940000161995 #25	ENSGT00940000163480	ENSGT00390000009978 #26	ENSGT01060000248595.b.a.a #27	ENSGT00950000182939.a.b.a #28	ENSGT00940000160461 #29	ENSGT00940000157610 #30	ENSGT00940000153561.b.b #31	ENSGT00940000162430 #32	ENSGT00940000156551 #33
Squirrel	MODERN SPECIES	229	MOV10L1 (ENSSTOG00000003747) #7	PANX2 (ENSSTOG00000022957) #8	TRABD (ENSSTOG00000015169) #9	SELENOO (ENSSTOG00000021258) #10	TUBGCP6 (ENSSTOG00000025992) #11	HDAC10 (ENSSTOG00000015253) #12	MAPK12 (ENSSTOG00000015261) #13	MAPK11 (ENSSTOG00000015274) #14	PLXNB2 (ENSSTOG00000024431) #15	DENND6B (ENSSTOG00000015282) #16	PPP6R2 (ENSSTOG00000014815) #17	SBF1 (ENSSTOG00000014827) #18	ADM2 (ENSSTOG00000029571) #19	MIOX (ENSSTOG00000020836) #20	LMF2 (ENSSTOG00000028688) #21	NCAPH2 (ENSSTOG00000022417) #22	SCO2 (ENSSTOG00000026780) #23	TYMP (ENSSTOG00000000281) #24	ODF3B (ENSSTOG00000028471) #25	SYCE3 (ENSSTOG00000024024) #26	CPT1B (ENSSTOG00000014192) #27	CHKB (ENSSTOG00000028511) #28	MAPK8IP2 (ENSSTOG00000025549) #29	ARSA (ENSSTOG00000024727) #30	SHANK3 (ENSSTOG00000029090) #31	ENSSTOG00000022660 #32	ENSSTOG00000002723 #33
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	581	TTLL8 (ENSUPAG00010005382)	MLC1 (ENSUPAG00010005397)	MOV10L1 (ENSUPAG00010005423) #7	PANX2 (ENSUPAG00010005495) #8	TRABD (ENSUPAG00010005513) #9	SELENOO (ENSUPAG00010005528) #10	TUBGCP6 (ENSUPAG00010005693) #11	MAPK12 (ENSUPAG00010005892) #13	MAPK11 (ENSUPAG00010005908) #14	PLXNB2 (ENSUPAG00010005922) #15	DENND6B (ENSUPAG00010005962) #16	PPP6R2 (ENSUPAG00010006007) #17	ADM2 (ENSUPAG00010006199) #19	MIOX (ENSUPAG00010006204) #20	LMF2 (ENSUPAG00010006213) #21	NCAPH2 (ENSUPAG00010006221) #22	SCO2 (ENSUPAG00010006259) #23	TYMP (ENSUPAG00010006263) #24	ODF3B (ENSUPAG00010006319) #25	ENSUPAG00010006327	SYCE3 (ENSUPAG00010006330) #26	CPT1B (ENSUPAG00010006338) #27	CHKB (ENSUPAG00010006349) #28	MAPK8IP2 (ENSUPAG00010006363) #29
Alpin marmot	MODERN SPECIES	135	CRELD2 (ENSMMMG00000007552)	TTLL8 (ENSMMMG00000007470)	MLC1 (ENSMMMG00000007449)	MOV10L1 (ENSMMMG00000007395) #7	ENSMMMG00000007392 #8	TRABD (ENSMMMG00000007360) #9	SELENOO (ENSMMMG00000007224) #10	HDAC10 (ENSMMMG00000006995) #12	ENSMMMG00000006990 #13	ENSMMMG00000006982 #13	ENSMMMG00000006969 #14	PLXNB2 (ENSMMMG00000006871) #15	ENSMMMG00000006865 #16	PPP6R2 (ENSMMMG00000006816) #17	MIOX (ENSMMMG00000005543) #20	NCAPH2 (ENSMMMG00000005406) #22	TYMP (ENSMMMG00000005203) #24	ENSMMMG00000005199	SYCE3 (ENSMMMG00000005185) #26	CPT1B (ENSMMMG00000005156) #27	CHKB (ENSMMMG00000005141) #28	ENSMMMG00000005134 #29	ARSA (ENSMMMG00000005119) #30	ENSMMMG00000005099 ##31	ENSMMMG00000005087 #32	ENSMMMG00000005054 #33
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	14	PANX2 (ENSSVLG00005008282) #8	TRABD (ENSSVLG00005008334) #9	SELENOO (ENSSVLG00005008372) #10	TUBGCP6 (ENSSVLG00005008386) #11	HDAC10 (ENSSVLG00005008461) #12	MAPK12 (ENSSVLG00005009443) #13	MAPK11 (ENSSVLG00005009538) #14	ENSSVLG00005009917	ENSSVLG00005009955 #15	ENSSVLG00005010067 #16	ENSSVLG00005010106 #16	PPP6R2 (ENSSVLG00005010231) #17	ADM2 (ENSSVLG00005011019) #19	ENSSVLG00005011054	MIOX (ENSSVLG00005011076) #20	NCAPH2 (ENSSVLG00005011493) #22	SCO2 (ENSSVLG00005011562) #23	TYMP (ENSSVLG00005003437) #24	ODF3B (ENSSVLG00005003492) #25	SYCE3 (ENSSVLG00005003600) #26	CPT1B (ENSSVLG00005003625) #27	CHKB (ENSSVLG00005003656) #28	MAPK8IP2 (ENSSVLG00005003679) #29	ARSA (ENSSVLG00005003692) #30	ENSSVLG00005003705 #31	ENSSVLG00005003723 #31	ENSSVLG00005003731 #32	ENSSVLG00005003771 #33