Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159329 #22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159329 #22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	986															ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	258														ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113 #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000164164	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000161826.B	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823
Theria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00940000164879	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Glires	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	580	ABHD16B (ENSUPAG00010003740) #7	ZBTB46 (ENSUPAG00010003742) #8	SLC2A4RG (ENSUPAG00010003756) #9	ZGPAT (ENSUPAG00010003773) #10	ENSUPAG00010003811 #11	RTEL1 (ENSUPAG00010003834) #12	STMN3 (ENSUPAG00010004560) #13	GMEB2 (ENSUPAG00010004569) #14	HELZ2 (ENSUPAG00010004576) #15	FNDC11 (ENSUPAG00010004587) #16	SRMS (ENSUPAG00010004602) #17	PTK6 (ENSUPAG00010004618) #18	PPDPF (ENSUPAG00010004632) #19	EEF1A2 (ENSUPAG00010004639) #20	KCNQ2 (ENSUPAG00010004658) #21	CHRNA4 (ENSUPAG00010004850) #22	COL20A1 (ENSUPAG00010004864) #23	ARFGAP1 (ENSUPAG00010005043) #24	BIRC7 (ENSUPAG00010005297) #25
Squirrel	MODERN SPECIES	114	ZBTB46 (ENSSTOG00000012003) #8	SLC2A4RG (ENSSTOG00000024188) #9	ENSSTOG00000023660	ZGPAT (ENSSTOG00000011986) #10	ARFRP1 (ENSSTOG00000011978) #11	RTEL1 (ENSSTOG00000011948) #12	STMN3 (ENSSTOG00000006830) #13	GMEB2 (ENSSTOG00000023031) #14	HELZ2 (ENSSTOG00000023572) #15	FNDC11 (ENSSTOG00000007853) #16	SRMS (ENSSTOG00000007835) #17	PTK6 (ENSSTOG00000007821) #18	PPDPF (ENSSTOG00000007808) #19	EEF1A2 (ENSSTOG00000028862) #20	KCNQ2 (ENSSTOG00000020023) #21	CHRNA4 (ENSSTOG00000028017) #22	COL20A1 (ENSSTOG00000014595) #23	ARFGAP1 (ENSSTOG00000022151) #24	BIRC7 (ENSSTOG00000034074) #25	YTHDF1 (ENSSTOG00000023001)	ENSSTOG00000030778	SLC17A9 (ENSSTOG00000008798)	GID8 (ENSSTOG00000025077)	DIDO1 (ENSSTOG00000012318)	TCFL5 (ENSSTOG00000026350)	ENSSTOG00000021578	ENSSTOG00000020474	MRGBP (ENSSTOG00000012953)	NTSR1 (ENSSTOG00000026120)	SLCO4A1 (ENSSTOG00000019826)	GATA5 (ENSSTOG00000010454)
Alpin marmot	MODERN SPECIES		ENSMMMG00000001114	ZGPAT (ENSMMMG00000001152) #10	ENSMMMG00000001208	ARFRP1 (ENSMMMG00000001220) #11	RTEL1 (ENSMMMG00000001278) #12	STMN3 (ENSMMMG00000001758) #13	GMEB2 (ENSMMMG00000001787) #14	ENSMMMG00000001804	HELZ2 (ENSMMMG00000001816) #15	FNDC11 (ENSMMMG00000001907) #16	SRMS (ENSMMMG00000001913) #17	PTK6 (ENSMMMG00000001940) #18	PPDPF (ENSMMMG00000001957) #19	EEF1A2 (ENSMMMG00000001969) #20	KCNQ2 (ENSMMMG00000002019) #21	CHRNA4 (ENSMMMG00000002798) #22	COL20A1 (ENSMMMG00000002849) #23	ARFGAP1 (ENSMMMG00000003181) #24	BIRC7 (ENSMMMG00000003407) #25	YTHDF1 (ENSMMMG00000003425)	SLC17A9 (ENSMMMG00000003461)	GID8 (ENSMMMG00000003488)	DIDO1 (ENSMMMG00000003510)	TCFL5 (ENSMMMG00000003663)	ENSMMMG00000003673	OGFR (ENSMMMG00000003753)	MRGBP (ENSMMMG00000003862)	NTSR1 (ENSMMMG00000003907)	SLCO4A1 (ENSMMMG00000003911)	GATA5 (ENSMMMG00000003966)	RBBP8NL (ENSMMMG00000004035)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	ENSSVLG00005011709	ZGPAT (ENSSVLG00005011600) #10	ARFRP1 (ENSSVLG00005011495) #11	RTEL1 (ENSSVLG00005011431) #12	STMN3 (ENSSVLG00005011307) #13	GMEB2 (ENSSVLG00005011239) #14	ENSSVLG00005011188	HELZ2 (ENSSVLG00005011029) #15	FNDC11 (ENSSVLG00005010998) #16	SRMS (ENSSVLG00005010852) #17	PTK6 (ENSSVLG00005010733) #18	PPDPF (ENSSVLG00005010700) #19	EEF1A2 (ENSSVLG00005004916) #20	KCNQ2 (ENSSVLG00005004604) #21	ENSSVLG00005004478	CHRNA4 (ENSSVLG00005004453) #22	ENSSVLG00005004184	ARFGAP1 (ENSSVLG00005003989) #24	BIRC7 (ENSSVLG00005003913) #25	YTHDF1 (ENSSVLG00005003892)	BHLHE23 (ENSSVLG00005003872)	SLC17A9 (ENSSVLG00005003839)	GID8 (ENSSVLG00005003819)	ENSSVLG00005003753	TCFL5 (ENSSVLG00005003713)	COL9A3 (ENSSVLG00005003650)	ENSSVLG00005003605	MRGBP (ENSSVLG00005003577)	NTSR1 (ENSSVLG00005003558)	SLCO4A1 (ENSSVLG00005003525)	GATA5 (ENSSVLG00005003441)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	83	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	235	ZBTB46 (ENSCLAG00000009288) #8	SLC2A4RG (ENSCLAG00000009004) #9	LIME1 (ENSCLAG00000003864)	ZGPAT (ENSCLAG00000004087) #10	ARFRP1 (ENSCLAG00000004200) #11	RTEL1 (ENSCLAG00000005519) #12	STMN3 (ENSCLAG00000004737) #13	GMEB2 (ENSCLAG00000005998) #14	HELZ2 (ENSCLAG00000006292) #15	FNDC11 (ENSCLAG00000005206) #16	SRMS (ENSCLAG00000005546) #17	PTK6 (ENSCLAG00000005884) #18	PPDPF (ENSCLAG00000005999) #19	EEF1A2 (ENSCLAG00000006710) #20	KCNQ2 (ENSCLAG00000004205) #21	CHRNA4 (ENSCLAG00000002115) #22	ENSCLAG00000002569	ARFGAP1 (ENSCLAG00000003171) #24	NKAIN4 (ENSCLAG00000003530)	BIRC7 (ENSCLAG00000003588) #25	YTHDF1 (ENSCLAG00000005989)	SLC17A9 (ENSCLAG00000006378)	GID8 (ENSCLAG00000006562)	DIDO1 (ENSCLAG00000006615)	ENSCLAG00000007594	ENSCLAG00000007710	OGFR (ENSCLAG00000008130)	ENSCLAG00000002627	NTSR1 (ENSCLAG00000002645)	SLCO4A1 (ENSCLAG00000007190)	CABLES2 (ENSCLAG00000007291)
Degu	MODERN SPECIES	235	SLC2A4RG (ENSODEG00000006508) #9	LIME1 (ENSODEG00000006535)	ZGPAT (ENSODEG00000006562) #10	ENSODEG00000006608	ARFRP1 (ENSODEG00000006629) #11	RTEL1 (ENSODEG00000006769) #12	STMN3 (ENSODEG00000007140) #13	ENSODEG00000007154 #14	HELZ2 (ENSODEG00000007200) #15	ENSODEG00000007298 #16	SRMS (ENSODEG00000007310) #17	PTK6 (ENSODEG00000007334) #18	PPDPF (ENSODEG00000003923) #19	EEF1A2 (ENSODEG00000003948) #20	KCNQ2 (ENSODEG00000004014) #21	CHRNA4 (ENSODEG00000004088) #22	ENSODEG00000004143	ARFGAP1 (ENSODEG00000004250) #24	NKAIN4 (ENSODEG00000004313)	BIRC7 (ENSODEG00000004350) #25	ENSODEG00000004380	SLC17A9 (ENSODEG00000004413)	ENSODEG00000004429	DIDO1 (ENSODEG00000004463)	TCFL5 (ENSODEG00000004537)	ENSODEG00000004560	ENSODEG00000004588	OGFR (ENSODEG00000004656)	MRGBP (ENSODEG00000004674)	NTSR1 (ENSODEG00000004689)	SLCO4A1 (ENSODEG00000004720)
Guinea pig	MODERN SPECIES	119	ABHD16B (ENSCPOG00000014395) #7	ZBTB46 (ENSCPOG00000002803) #8	SLC2A4RG (ENSCPOG00000035815) #9	ENSCPOG00000019294	ZGPAT (ENSCPOG00000014427) #10	ARFRP1 (ENSCPOG00000038193) #11	RTEL1 (ENSCPOG00000014414) #12	STMN3 (ENSCPOG00000023626) #13	GMEB2 (ENSCPOG00000025567) #14	HELZ2 (ENSCPOG00000006905) #15	FNDC11 (ENSCPOG00000010652) #16	SRMS (ENSCPOG00000006895) #17	PTK6 (ENSCPOG00000006885) #18	EEF1A2 (ENSCPOG00000022072) #20	KCNQ2 (ENSCPOG00000006949) #21	CHRNA4 (ENSCPOG00000010559) #22	ENSCPOG00000021624	ARFGAP1 (ENSCPOG00000025055) #24	NKAIN4 (ENSCPOG00000005586)	BIRC7 (ENSCPOG00000020366) #25	YTHDF1 (ENSCPOG00000010202)	SLC17A9 (ENSCPOG00000001082)	GID8 (ENSCPOG00000007888)	DIDO1 (ENSCPOG00000004884)	TCFL5 (ENSCPOG00000020307)	ENSCPOG00000002720	OGFR (ENSCPOG00000003143)	MRGBP (ENSCPOG00000020272)	NTSR1 (ENSCPOG00000033878)	SLCO4A1 (ENSCPOG00000015749)	GATA5 (ENSCPOG00000030979)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407.n #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	363	ENSCGRG00001023546	Zbtb46 (ENSCGRG00001023433) #8	Lime1 (ENSCGRG00001016932)	Zgpat (ENSCGRG00001011442) #10	ENSCGRG00001001706 #11	Rtel1 (ENSCGRG00001015046) #12	Stmn3 (ENSCGRG00001003004) #13	Gmeb2 (ENSCGRG00001018755) #14	Helz2 (ENSCGRG00001016744) #15	Fndc11 (ENSCGRG00001014780) #16	Srms (ENSCGRG00001017493) #17	Ptk6 (ENSCGRG00001016711) #18	Ppdpf (ENSCGRG00001014557) #19	Eef1a2 (ENSCGRG00001013389) #20	Kcnq2 (ENSCGRG00001001207) #21	Chrna4 (ENSCGRG00001016463) #22	ENSCGRG00001008086	Arfgap1 (ENSCGRG00001000341) #24	Nkain4 (ENSCGRG00001017529)	Birc7 (ENSCGRG00001017256) #25	Ythdf1 (ENSCGRG00001016568)	Bhlhe23 (ENSCGRG00001006715)	Slc17a9 (ENSCGRG00001016886)	Gid8 (ENSCGRG00001015095)	Dido1 (ENSCGRG00001011636)	Tcfl5 (ENSCGRG00001005121)	Col9a3 (ENSCGRG00001019417)	Ogfr (ENSCGRG00001018620)	Mrgbp (ENSCGRG00001017599)	Ntsr1 (ENSCGRG00001017131)	Slco4a1 (ENSCGRG00001013645)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	664	Abhd16b (ENSMAUG00000009336) #7	Zbtb46 (ENSMAUG00000003658) #8	Lime1 (ENSMAUG00000018778)	Zgpat (ENSMAUG00000017248) #10	ENSMAUG00000006741 #11	Rtel1 (ENSMAUG00000021859) #12	Stmn3 (ENSMAUG00000021053) #13	Gmeb2 (ENSMAUG00000001339) #14	Helz2 (ENSMAUG00000000857) #15	Fndc11 (ENSMAUG00000005228) #16	Srms (ENSMAUG00000017526) #17	Ptk6 (ENSMAUG00000021245) #18	Ppdpf (ENSMAUG00000018881) #19	Eef1a2 (ENSMAUG00000007024) #20	Kcnq2 (ENSMAUG00000016622) #21	Chrna4 (ENSMAUG00000001465) #22	ENSMAUG00000021616	Arfgap1 (ENSMAUG00000015799) #24	Nkain4 (ENSMAUG00000011539)	Birc7 (ENSMAUG00000019324) #25	Ythdf1 (ENSMAUG00000017660)	Bhlhe23 (ENSMAUG00000009252)	Slc17a9 (ENSMAUG00000019462)	Dido1 (ENSMAUG00000016487)	Tcfl5 (ENSMAUG00000015318)	Col9a3 (ENSMAUG00000012721)	Ogfr (ENSMAUG00000018534)	Mrgbp (ENSMAUG00000017237)	Ntsr1 (ENSMAUG00000017871)	Slco4a1 (ENSMAUG00000009594)	Gata5 (ENSMAUG00000004902)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Prairie vole	DUPLICATION
Prairie vole	MODERN SPECIES	357	Zbtb46 (ENSMOCG00000019212) #8	Lime1 (ENSMOCG00000020930)	Zgpat (ENSMOCG00000001324) #10	ENSMOCG00000003005 #11	Rtel1 (ENSMOCG00000006621) #12	Stmn3 (ENSMOCG00000002791) #13	Gmeb2 (ENSMOCG00000020432) #14	Helz2 (ENSMOCG00000016283) #15	Fndc11 (ENSMOCG00000019957) #16	Srms (ENSMOCG00000005339) #17	Ptk6 (ENSMOCG00000017863) #18	Ppdpf (ENSMOCG00000012754) #19	Eef1a2 (ENSMOCG00000015062) #20	Kcnq2 (ENSMOCG00000011486) #21	ENSMOCG00000019495 #22	ENSMOCG00000004769 #22	ENSMOCG00000022336	Arfgap1 (ENSMOCG00000000921) #24	Nkain4 (ENSMOCG00000021378)	Birc7 (ENSMOCG00000007072) #25	Ythdf1 (ENSMOCG00000013573)	Bhlhe23 (ENSMOCG00000010535)	Slc17a9 (ENSMOCG00000021060)	Gid8 (ENSMOCG00000022789)	Dido1 (ENSMOCG00000016348)	Tcfl5 (ENSMOCG00000013113)	Col9a3 (ENSMOCG00000008409)	Ogfr (ENSMOCG00000014592)	Mrgbp (ENSMOCG00000000356)	Ntsr1 (ENSMOCG00000006208)	Slco4a1 (ENSMOCG00000018880)
Prairie vole	MODERN SPECIES	357	Abhd16b (ENSMOCG00000009364) #7	Zbtb46 (ENSMOCG00000019212) #8	Lime1 (ENSMOCG00000020930)	Zgpat (ENSMOCG00000001324) #10	ENSMOCG00000003005 #11	Rtel1 (ENSMOCG00000006621) #12	Stmn3 (ENSMOCG00000002791) #13	Gmeb2 (ENSMOCG00000020432) #14	Helz2 (ENSMOCG00000016283) #15	Fndc11 (ENSMOCG00000019957) #16	Srms (ENSMOCG00000005339) #17	Ptk6 (ENSMOCG00000017863) #18	Ppdpf (ENSMOCG00000012754) #19	Eef1a2 (ENSMOCG00000015062) #20	Kcnq2 (ENSMOCG00000011486) #21	ENSMOCG00000019495 #22	ENSMOCG00000004769 #22	ENSMOCG00000022336	Arfgap1 (ENSMOCG00000000921) #24	Nkain4 (ENSMOCG00000021378)	Birc7 (ENSMOCG00000007072) #25	Ythdf1 (ENSMOCG00000013573)	Bhlhe23 (ENSMOCG00000010535)	Slc17a9 (ENSMOCG00000021060)	Gid8 (ENSMOCG00000022789)	Dido1 (ENSMOCG00000016348)	Tcfl5 (ENSMOCG00000013113)	Col9a3 (ENSMOCG00000008409)	Ogfr (ENSMOCG00000014592)	Mrgbp (ENSMOCG00000000356)	Ntsr1 (ENSMOCG00000006208)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	17	Abhd16b (ENSPEMG00000016010) #7	Zbtb46 (ENSPEMG00000015286) #8	Lime1 (ENSPEMG00000013925)	Zgpat (ENSPEMG00000015676) #10	Arfrp1 (ENSPEMG00000027815) #11	Rtel1 (ENSPEMG00000011774) #12	Stmn3 (ENSPEMG00000009067) #13	Gmeb2 (ENSPEMG00000029904) #14	Helz2 (ENSPEMG00000016538) #15	Fndc11 (ENSPEMG00000019134) #16	Srms (ENSPEMG00000011231) #17	Ptk6 (ENSPEMG00000013137) #18	Ppdpf (ENSPEMG00000030332) #19	Eef1a2 (ENSPEMG00000007292) #20	Kcnq2 (ENSPEMG00000000964) #21	Chrna4 (ENSPEMG00000003527) #22	ENSPEMG00000003874	Arfgap1 (ENSPEMG00000020266) #24	Nkain4 (ENSPEMG00000020232)	Birc7 (ENSPEMG00000020215) #25	Ythdf1 (ENSPEMG00000020199)	Bhlhe23 (ENSPEMG00000013766)	Slc17a9 (ENSPEMG00000020148)	Gid8 (ENSPEMG00000020136)	Dido1 (ENSPEMG00000020026)	Tcfl5 (ENSPEMG00000019973)	Col9a3 (ENSPEMG00000019951)	Ogfr (ENSPEMG00000019927)	Mrgbp (ENSPEMG00000030337)	Ntsr1 (ENSPEMG00000019912)	ENSPEMG00000031188
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Mus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2762	Abhd16b (ENSMSIG00000012732) #7	Zbtb46 (ENSMSIG00000012738) #8	Lime1 (ENSMSIG00000012757)	Zgpat (ENSMSIG00000012783) #10	Arfrp1 (ENSMSIG00000012801) #11	Rtel1 (ENSMSIG00000012832) #12	Stmn3 (ENSMSIG00000013246) #13	Gmeb2 (ENSMSIG00000013265) #14	Helz2 (ENSMSIG00000013287) #15	Fndc11 (ENSMSIG00000013398) #16	Srms (ENSMSIG00000013408) #17	Ptk6 (ENSMSIG00000013435) #18	Ppdpf (ENSMSIG00000013448) #19	Eef1a2 (ENSMSIG00000013475) #20	Kcnq2 (ENSMSIG00000013491) #21	Chrna4 (ENSMSIG00000014109) #22	Col20a1 (ENSMSIG00000014136) #23	Arfgap1 (ENSMSIG00000014444) #24	Nkain4 (ENSMSIG00000014670)	Birc7 (ENSMSIG00000014718) #25	Ythdf1 (ENSMSIG00000014745)	ENSMSIG00000014799	Bhlhe23 (ENSMSIG00000014821)
spretus	MODERN SPECIES	11	Abhd16b (MGP_SPRETEiJ_G0025736) #7	Zbtb46 (MGP_SPRETEiJ_G0025735) #8	Lime1 (MGP_SPRETEiJ_G0025733)	Zgpat (MGP_SPRETEiJ_G0025732) #10	Arfrp1 (MGP_SPRETEiJ_G0025731) #11	Rtel1 (MGP_SPRETEiJ_G0025730) #12	Stmn3 (MGP_SPRETEiJ_G0025729) #13	Gmeb2 (MGP_SPRETEiJ_G0025728) #14	Helz2 (MGP_SPRETEiJ_G0025727) #15	Fndc11 (MGP_SPRETEiJ_G0025726) #16	Srms (MGP_SPRETEiJ_G0025725) #17	Ptk6 (MGP_SPRETEiJ_G0025724) #18	Ppdpf (MGP_SPRETEiJ_G0025723) #19	Eef1a2 (MGP_SPRETEiJ_G0025722) #20	Kcnq2 (MGP_SPRETEiJ_G0025721) #21	Chrna4 (MGP_SPRETEiJ_G0025720) #22	Col20a1 (MGP_SPRETEiJ_G0025719) #23	Arfgap1 (MGP_SPRETEiJ_G0025718) #24	Nkain4 (MGP_SPRETEiJ_G0025717)	Birc7 (MGP_SPRETEiJ_G0025716) #25	Ythdf1 (MGP_SPRETEiJ_G0025715)	Bhlhe23 (MGP_SPRETEiJ_G0025714)	Slc17a9 (MGP_SPRETEiJ_G0025713)	Gid8 (MGP_SPRETEiJ_G0025712)	Dido1 (MGP_SPRETEiJ_G0025711)	Tcfl5 (MGP_SPRETEiJ_G0025710)	Col9a3 (MGP_SPRETEiJ_G0025709)	Ogfr (MGP_SPRETEiJ_G0025708)	Mrgbp (MGP_SPRETEiJ_G0025707)	Ntsr1 (MGP_SPRETEiJ_G0025706)	Slco4a1 (MGP_SPRETEiJ_G0025705)
Mouse	MODERN SPECIES	11	Abhd16b (ENSMUSG00000055882) #7	Zbtb46 (ENSMUSG00000027583) #8	Lime1 (ENSMUSG00000090077)	Zgpat (ENSMUSG00000027582) #10	Arfrp1 (ENSMUSG00000038671) #11	Rtel1 (ENSMUSG00000038685) #12	Stmn3 (ENSMUSG00000027581) #13	Gmeb2 (ENSMUSG00000038705) #14	Helz2 (ENSMUSG00000027580) #15	Fndc11 (ENSMUSG00000047841) #16	Srms (ENSMUSG00000027579) #17	Ptk6 (ENSMUSG00000038751) #18	Ppdpf (ENSMUSG00000016344) #19	Eef1a2 (ENSMUSG00000016349) #20	Kcnq2 (ENSMUSG00000016346) #21	Chrna4 (ENSMUSG00000027577) #22	Col20a1 (ENSMUSG00000016356) #23	Arfgap1 (ENSMUSG00000027575) #24	Nkain4 (ENSMUSG00000027574)	Birc7 (ENSMUSG00000038840) #25	Ythdf1 (ENSMUSG00000038848)	Bhlhe23 (ENSMUSG00000045493)	Slc17a9 (ENSMUSG00000023393)	Gid8 (ENSMUSG00000027573)	Dido1 (ENSMUSG00000038914)	Tcfl5 (ENSMUSG00000038932)	Col9a3 (ENSMUSG00000027570)	Ogfr (ENSMUSG00000049401)	Mrgbp (ENSMUSG00000027569)	Ntsr1 (ENSMUSG00000027568)	Slco4a1 (ENSMUSG00000038963)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	16	Abhd16b (MGP_PahariEiJ_G0026257) #7	Zbtb46 (MGP_PahariEiJ_G0026256) #8	Lime1 (MGP_PahariEiJ_G0026255)	Zgpat (MGP_PahariEiJ_G0026254) #10	Arfrp1 (MGP_PahariEiJ_G0026253) #11	Rtel1 (MGP_PahariEiJ_G0026252) #12	Stmn3 (MGP_PahariEiJ_G0026251) #13	Gmeb2 (MGP_PahariEiJ_G0026250) #14	Helz2 (MGP_PahariEiJ_G0026249) #15	Fndc11 (MGP_PahariEiJ_G0026248) #16	Srms (MGP_PahariEiJ_G0026247) #17	Ptk6 (MGP_PahariEiJ_G0026246) #18	Ppdpf (MGP_PahariEiJ_G0026245) #19	Eef1a2 (MGP_PahariEiJ_G0026244) #20	Kcnq2 (MGP_PahariEiJ_G0026243) #21	Chrna4 (MGP_PahariEiJ_G0026242) #22	Col20a1 (MGP_PahariEiJ_G0026241) #23	Arfgap1 (MGP_PahariEiJ_G0026240) #24	Nkain4 (MGP_PahariEiJ_G0026239)	Birc7 (MGP_PahariEiJ_G0026238) #25	Ythdf1 (MGP_PahariEiJ_G0026237)	Bhlhe23 (MGP_PahariEiJ_G0026236)	Slc17a9 (MGP_PahariEiJ_G0026235)	Gid8 (MGP_PahariEiJ_G0026234)	Dido1 (MGP_PahariEiJ_G0026233)	Tcfl5 (MGP_PahariEiJ_G0026232)	Col9a3 (MGP_PahariEiJ_G0026231)	Ogfr (MGP_PahariEiJ_G0026230)	Mrgbp (MGP_PahariEiJ_G0026229)	Ntsr1 (MGP_PahariEiJ_G0026228)	Slco4a1 (MGP_PahariEiJ_G0026227)
Rat	MODERN SPECIES	13	Dnajc5 (ENSRNOG00000015202)	Tpd52l2 (ENSRNOG00000015067) #7	Zbtb46 (ENSRNOG00000014592) #8	Lime1 (ENSRNOG00000049336)	Zgpat (ENSRNOG00000014235) #10	Arfrp1 (ENSRNOG00000013992) #11	Rtel1 (ENSRNOG00000027513) #12	Stmn3 (ENSRNOG00000013657) #13	Gmeb2 (ENSRNOG00000013339) #14	Helz2 (ENSRNOG00000013267) #15	Fndc11 (ENSRNOG00000013243) #16	Srms (ENSRNOG00000013003) #17	Ptk6 (ENSRNOG00000012987) #18	Ppdpf (ENSRNOG00000012722) #19	Eef1a2 (ENSRNOG00000011624) #21	Chrna4 (ENSRNOG00000011202) #22	Arfgap1 (ENSRNOG00000043150) #24	Col20a1 (ENSRNOG00000010326)	Nkain4 (ENSRNOG00000031834)	Birc7 (ENSRNOG00000043311) #25	Ythdf1 (ENSRNOG00000027015)	Bhlhe23 (ENSRNOG00000010312)	Slc17a9 (ENSRNOG00000010275)	Gid8 (ENSRNOG00000065606)	Dido1 (ENSRNOG00000009936)	Tcfl5 (ENSRNOG00000061199)	Col9a3 (ENSRNOG00000009531)	Ogfr (ENSRNOG00000009355)	Mrgbp (ENSRNOG00000059891)	Ntsr1 (ENSRNOG00000028708)	ENSRNOG00000064180
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1229	Zbtb46 (ENSNGAG00000015931) #8	Lime1 (ENSNGAG00000015127)	ENSNGAG00000014626 #10	Arfrp1 (ENSNGAG00000014373) #11	ENSNGAG00000014149	Rtel1 (ENSNGAG00000003665) #12	Stmn3 (ENSNGAG00000015941) #13	Gmeb2 (ENSNGAG00000015465) #14	Helz2 (ENSNGAG00000013840) #15	Fndc11 (ENSNGAG00000012749) #16	Srms (ENSNGAG00000012152) #17	Ptk6 (ENSNGAG00000010563) #18	Ppdpf (ENSNGAG00000009696) #19	Eef1a2 (ENSNGAG00000009003) #20	Kcnq2 (ENSNGAG00000020074) #21	Chrna4 (ENSNGAG00000016193) #22	Col20a1 (ENSNGAG00000011814) #23	Arfgap1 (ENSNGAG00000005117) #24	Nkain4 (ENSNGAG00000002013)	Birc7 (ENSNGAG00000000904) #25	Ythdf1 (ENSNGAG00000000334)	Bhlhe23 (ENSNGAG00000000159)	Slc17a9 (ENSNGAG00000020412)	Gid8 (ENSNGAG00000020229)	Dido1 (ENSNGAG00000018812)	Tcfl5 (ENSNGAG00000006700)	Col9a3 (ENSNGAG00000001500)	Ogfr (ENSNGAG00000000640)	Mrgbp (ENSNGAG00000021492)	Ntsr1 (ENSNGAG00000021420)	Slco4a1 (ENSNGAG00000021326)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	171	Lime1 (ENSJJAG00000018995)	ENSJJAG00000018714 #10	Arfrp1 (ENSJJAG00000013827) #11	Rtel1 (ENSJJAG00000005487) #12	ENSJJAG00000023281	Stmn3 (ENSJJAG00000023139) #13	ENSJJAG00000013900	Gmeb2 (ENSJJAG00000022801) #14	Helz2 (ENSJJAG00000021775) #15	Fndc11 (ENSJJAG00000021148) #16	Srms (ENSJJAG00000020649) #17	Ptk6 (ENSJJAG00000020457) #18	Ppdpf (ENSJJAG00000020293) #19	Eef1a2 (ENSJJAG00000020185) #20	Kcnq2 (ENSJJAG00000019808) #21	Chrna4 (ENSJJAG00000018512) #22	ENSJJAG00000016700	Arfgap1 (ENSJJAG00000015383) #24	Nkain4 (ENSJJAG00000014525)	Birc7 (ENSJJAG00000014210) #25	Ythdf1 (ENSJJAG00000013589)	Bhlhe23 (ENSJJAG00000013438)	ENSJJAG00000001169	Slc17a9 (ENSJJAG00000000563)	Gid8 (ENSJJAG00000000120)	Dido1 (ENSJJAG00000022740)	ENSJJAG00000022001	Col9a3 (ENSJJAG00000020792)	Ogfr (ENSJJAG00000020054)	Mrgbp (ENSJJAG00000019784)	Ntsr1 (ENSJJAG00000019264)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	448	Dnajc5 (ENSDORG00000026811)	Tpd52l2 (ENSDORG00000003704)	Abhd16b (ENSDORG00000026158) #7	Zbtb46 (ENSDORG00000001367) #8	Lime1 (ENSDORG00000001366)	Zgpat (ENSDORG00000001360) #10	Arfrp1 (ENSDORG00000013488) #11	Rtel1 (ENSDORG00000013483) #12	Stmn3 (ENSDORG00000006916) #13	Gmeb2 (ENSDORG00000005599) #14	Helz2 (ENSDORG00000005596) #15	Fndc11 (ENSDORG00000005594) #16	Ptk6 (ENSDORG00000004529) #18	Eef1a2 (ENSDORG00000004854) #20	Kcnq2 (ENSDORG00000011128) #21	Chrna4 (ENSDORG00000023973) #22	ENSDORG00000015431	Arfgap1 (ENSDORG00000010660) #24	Nkain4 (ENSDORG00000001799)	Birc7 (ENSDORG00000025467) #25	Ythdf1 (ENSDORG00000002879)	Gid8 (ENSDORG00000003411)	ENSDORG00000011113	Tcfl5 (ENSDORG00000004511)	Col9a3 (ENSDORG00000004509)	ENSDORG00000030204	ENSDORG00000027453	Ntsr1 (ENSDORG00000025445)	Slco4a1 (ENSDORG00000001161)	ENSDORG00000026178	Rbbp8nl (ENSDORG00000007635)
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	473														ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000165345	ENSGT00940000159329 #22
Rabbit	MODERN SPECIES	1318																CHRNA4 (ENSOCUG00000002185) #22
Pika	MODERN SPECIES	4073														ENSOPRG00000005964 #20	ENSOPRG00000005943	CHRNA4 (ENSOPRG00000005933) #22
Primates	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247
Gorilla	MODERN SPECIES	11	ENSGGOG00000004804	ZGPAT (ENSGGOG00000004801) #10	ARFRP1 (ENSGGOG00000004799) #11	TNFRSF6B (ENSGGOG00000037565)	RTEL1 (ENSGGOG00000004784) #12	STMN3 (ENSGGOG00000004779) #13	GMEB2 (ENSGGOG00000008653) #14	HELZ2 (ENSGGOG00000008640) #15	FNDC11 (ENSGGOG00000008639) #16	SRMS (ENSGGOG00000011330) #17	PTK6 (ENSGGOG00000011325) #18	ENSGGOG00000036746 #19	EEF1A2 (ENSGGOG00000011319) #20	ENSGGOG00000037300	KCNQ2 (ENSGGOG00000008388) #21	CHRNA4 (ENSGGOG00000008378) #22	COL20A1 (ENSGGOG00000008361) #23	ARFGAP1 (ENSGGOG00000008353) #24	ENSGGOG00000008346	BIRC7 (ENSGGOG00000008343) #25	YTHDF1 (ENSGGOG00000008340)	BHLHE23 (ENSGGOG00000040834)	SLC17A9 (ENSGGOG00000001599)	GID8 (ENSGGOG00000036471)	DIDO1 (ENSGGOG00000001594)	ENSGGOG00000027339	TCFL5 (ENSGGOG00000017041)	COL9A3 (ENSGGOG00000017028)	OGFR (ENSGGOG00000017022)	MRGBP (ENSGGOG00000017018)	ENSGGOG00000042663
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247
Human	MODERN SPECIES	12	LIME1 (ENSG00000203896)	ENSG00000273154	ZGPAT (ENSG00000197114) #10	ARFRP1 (ENSG00000101246) #11	TNFRSF6B (ENSG00000243509)	RTEL1 (ENSG00000258366) #12	STMN3 (ENSG00000197457) #13	GMEB2 (ENSG00000101216) #14	HELZ2 (ENSG00000130589) #15	FNDC11 (ENSG00000125531) #16	SRMS (ENSG00000125508) #17	PTK6 (ENSG00000101213) #18	PPDPF (ENSG00000125534) #19	EEF1A2 (ENSG00000101210) #20	KCNQ2 (ENSG00000075043) #21	CHRNA4 (ENSG00000101204) #22	COL20A1 (ENSG00000101203) #23	ARFGAP1 (ENSG00000101199) #24	NKAIN4 (ENSG00000101198)	BIRC7 (ENSG00000101197) #25	YTHDF1 (ENSG00000149658)	BHLHE23 (ENSG00000125533)	SLC17A9 (ENSG00000101194)	GID8 (ENSG00000101193)	DIDO1 (ENSG00000101191)	TCFL5 (ENSG00000101190)	COL9A3 (ENSG00000092758)	OGFR (ENSG00000060491)	MRGBP (ENSG00000101189)	NTSR1 (ENSG00000101188)	SLCO4A1 (ENSG00000101187)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247.a
Bonobo	MODERN SPECIES	11	ENSPPAG00000038340 #9	LIME1 (ENSPPAG00000037722)	ZGPAT (ENSPPAG00000027831) #10	ARFRP1 (ENSPPAG00000023993) #11	TNFRSF6B (ENSPPAG00000039916)	RTEL1 (ENSPPAG00000037897) #12	ENSPPAG00000036639 #13	GMEB2 (ENSPPAG00000024286) #14	HELZ2 (ENSPPAG00000037593) #15	FNDC11 (ENSPPAG00000005287) #16	SRMS (ENSPPAG00000032626) #17	PTK6 (ENSPPAG00000028129) #18	PPDPF (ENSPPAG00000038524) #19	EEF1A2 (ENSPPAG00000027504) #20	KCNQ2 (ENSPPAG00000033331) #21	CHRNA4 (ENSPPAG00000037528) #22	COL20A1 (ENSPPAG00000024254) #23	ARFGAP1 (ENSPPAG00000032118) #24	NKAIN4 (ENSPPAG00000029205)	BIRC7 (ENSPPAG00000027746) #25	YTHDF1 (ENSPPAG00000023277)	SLC17A9 (ENSPPAG00000015837)	GID8 (ENSPPAG00000041274)	DIDO1 (ENSPPAG00000035601)	ENSPPAG00000034363	ENSPPAG00000033377	COL9A3 (ENSPPAG00000031491)	OGFR (ENSPPAG00000026028)	ENSPPAG00000011919	ENSPPAG00000039273	ENSPPAG00000041361
Chimpanzee	MODERN SPECIES	11	SLC2A4RG (ENSPTRG00000013751) #9	LIME1 (ENSPTRG00000039458)	ZGPAT (ENSPTRG00000013750) #10	ARFRP1 (ENSPTRG00000013747) #11	ENSPTRG00000050999	RTEL1 (ENSPTRG00000013746) #12	STMN3 (ENSPTRG00000030476) #13	GMEB2 (ENSPTRG00000013744) #14	FNDC11 (ENSPTRG00000013742) #16	HELZ2 (ENSPTRG00000013743) #15	SRMS (ENSPTRG00000013741) #17	PTK6 (ENSPTRG00000048800) #18	PPDPF (ENSPTRG00000013739) #19	EEF1A2 (ENSPTRG00000013737) #20	KCNQ2 (ENSPTRG00000013736) #21	CHRNA4 (ENSPTRG00000013735) #22	COL20A1 (ENSPTRG00000013734) #23	ARFGAP1 (ENSPTRG00000013733) #24	NKAIN4 (ENSPTRG00000013732)	BIRC7 (ENSPTRG00000013731) #25	YTHDF1 (ENSPTRG00000013730)	BHLHE23 (ENSPTRG00000013728)	SLC17A9 (ENSPTRG00000013727)	GID8 (ENSPTRG00000013726)	DIDO1 (ENSPTRG00000013725)	ENSPTRG00000049832	TCFL5 (ENSPTRG00000023366)	COL9A3 (ENSPTRG00000013721)	OGFR (ENSPTRG00000013720)	MRGBP (ENSPTRG00000013719)	NTSR1 (ENSPTRG00000013718)
Orangutan	MODERN SPECIES	11	ABHD16B (ENSPPYG00000011250) #7	ZBTB46 (ENSPPYG00000011247) #8	SLC2A4RG (ENSPPYG00000036922) #9	LIME1 (ENSPPYG00000038431)	ZGPAT (ENSPPYG00000011246) #10	ARFRP1 (ENSPPYG00000011245) #11	TNFRSF6B (ENSPPYG00000030992)	STMN3 (ENSPPYG00000011243) #13	GMEB2 (ENSPPYG00000011242) #14	ENSPPYG00000011240 #16	SRMS (ENSPPYG00000011239) #17	PTK6 (ENSPPYG00000011238) #18	ENSPPYG00000011237 #19	EEF1A2 (ENSPPYG00000011236) #20	KCNQ2 (ENSPPYG00000011234) #21	CHRNA4 (ENSPPYG00000011231) #22	COL20A1 (ENSPPYG00000011230) #23	ARFGAP1 (ENSPPYG00000011229) #24	NKAIN4 (ENSPPYG00000011228)	BIRC7 (ENSPPYG00000011227) #25	YTHDF1 (ENSPPYG00000011226)	BHLHE23 (ENSPPYG00000033782)	SLC17A9 (ENSPPYG00000011222)	GID8 (ENSPPYG00000011221)	DIDO1 (ENSPPYG00000011220)	TCFL5 (ENSPPYG00000011219)	COL9A3 (ENSPPYG00000037415)	ENSPPYG00000011218	ENSPPYG00000011217	NTSR1 (ENSPPYG00000011216)	SLCO4A1 (ENSPPYG00000011213)
Gibbon	MODERN SPECIES	3	ENSNLEG00000010171 #8	SLC2A4RG (ENSNLEG00000010167) #9	ENSNLEG00000010165	ZGPAT (ENSNLEG00000010146) #10	ARFRP1 (ENSNLEG00000010131) #11	TNFRSF6B (ENSNLEG00000030355)	RTEL1 (ENSNLEG00000010105) #12	STMN3 (ENSNLEG00000010103) #13	GMEB2 (ENSNLEG00000010094) #14	ENSNLEG00000010083 #15	SRMS (ENSNLEG00000010077) #17	PTK6 (ENSNLEG00000034758) #18	PPDPF (ENSNLEG00000010068) #19	EEF1A2 (ENSNLEG00000010060) #20	ENSNLEG00000010053	CHRNA4 (ENSNLEG00000026877) #22	COL20A1 (ENSNLEG00000010011) #23	ARFGAP1 (ENSNLEG00000009990) #24	ENSNLEG00000009987	BIRC7 (ENSNLEG00000009978) #25	ENSNLEG00000028421	ENSNLEG00000031234	ENSNLEG00000009969	GID8 (ENSNLEG00000009967)	DIDO1 (ENSNLEG00000009953)	ENSNLEG00000032503	ENSNLEG00000009920	ENSNLEG00000009914	ENSNLEG00000009904	ENSNLEG00000032112	NTSR1 (ENSNLEG00000009910)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00910000147201	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00910000147201	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Rhesus	DUPLICATION
Rhesus	MODERN SPECIES	35																ENSMMUG00000064465 #22	ENSMMUG00000055017
Rhesus	MODERN SPECIES	1	LIME1 (ENSMMUG00000050212)	ZGPAT (ENSMMUG00000000171) #10	ARFRP1 (ENSMMUG00000000169) #11	TNFRSF6B (ENSMMUG00000045470)	ENSMMUG00000050030	RTEL1 (ENSMMUG00000000167) #12	STMN3 (ENSMMUG00000058868) #13	GMEB2 (ENSMMUG00000039256) #14	HELZ2 (ENSMMUG00000006070) #15	FNDC11 (ENSMMUG00000006069) #16	SRMS (ENSMMUG00000050161) #17	PTK6 (ENSMMUG00000006065) #18	PPDPF (ENSMMUG00000048418) #19	EEF1A2 (ENSMMUG00000022526) #20	KCNQ2 (ENSMMUG00000015918)	ENSMMUG00000015916 #22	COL20A1 (ENSMMUG00000015912) #23	ARFGAP1 (ENSMMUG00000015911) #24	NKAIN4 (ENSMMUG00000009231)	BIRC7 (ENSMMUG00000009229) #25	YTHDF1 (ENSMMUG00000009227)	BHLHE23 (ENSMMUG00000037896)	SLC17A9 (ENSMMUG00000005713)	GID8 (ENSMMUG00000050053)	DIDO1 (ENSMMUG00000019310)	TCFL5 (ENSMMUG00000008229)	ENSMMUG00000016859	OGFR (ENSMMUG00000016856)	MRGBP (ENSMMUG00000046848)	NTSR1 (ENSMMUG00000016854)	ENSMMUG00000016851
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	1	ENSMFAG00000039964 #9	ZGPAT (ENSMFAG00000001467) #10	LIME1 (ENSMFAG00000038089)	ARFRP1 (ENSMFAG00000001321) #11	TNFRSF6B (ENSMFAG00000034289)	ENSMFAG00000063698	RTEL1 (ENSMFAG00000043680) #12	STMN3 (ENSMFAG00000044092) #13	GMEB2 (ENSMFAG00000053299) #14	ENSMFAG00000060663	SRMS (ENSMFAG00000039048) #17	PTK6 (ENSMFAG00000042934) #18	ENSMFAG00000039551 #19	EEF1A2 (ENSMFAG00000041810) #20	KCNQ2 (ENSMFAG00000042590) #21	CHRNA4 (ENSMFAG00000000312) #22	COL20A1 (ENSMFAG00000001425) #23	ARFGAP1 (ENSMFAG00000045918) #24	NKAIN4 (ENSMFAG00000003175)	ENSMFAG00000045233 #25	ENSMFAG00000050102	YTHDF1 (ENSMFAG00000042868)	ENSMFAG00000060017	SLC17A9 (ENSMFAG00000044450)	GID8 (ENSMFAG00000064422)	DIDO1 (ENSMFAG00000000130)	ENSMFAG00000002692	ENSMFAG00000002720	OGFR (ENSMFAG00000037888)	MRGBP (ENSMFAG00000058768)	ENSMFAG00000030438
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	462	SLC2A4RG (ENSMNEG00000037179) #9	LIME1 (ENSMNEG00000029323)	ZGPAT (ENSMNEG00000019568) #10	ARFRP1 (ENSMNEG00000036325) #11	TNFRSF6B (ENSMNEG00000030049)	RTEL1 (ENSMNEG00000038842) #12	STMN3 (ENSMNEG00000036685) #13	GMEB2 (ENSMNEG00000045521) #14	HELZ2 (ENSMNEG00000044829) #15	FNDC11 (ENSMNEG00000008593) #16	SRMS (ENSMNEG00000022895) #17	PTK6 (ENSMNEG00000028388) #18	PPDPF (ENSMNEG00000032310) #19	EEF1A2 (ENSMNEG00000044939) #20	KCNQ2 (ENSMNEG00000033017) #21	CHRNA4 (ENSMNEG00000002400) #22	ENSMNEG00000039409	ARFGAP1 (ENSMNEG00000014434) #24	NKAIN4 (ENSMNEG00000000351)	BIRC7 (ENSMNEG00000040250) #25	YTHDF1 (ENSMNEG00000030851)	ENSMNEG00000025670	BHLHE23 (ENSMNEG00000001627)	SLC17A9 (ENSMNEG00000028689)	GID8 (ENSMNEG00000037263)	DIDO1 (ENSMNEG00000035888)	TCFL5 (ENSMNEG00000041869)	ENSMNEG00000037036	OGFR (ENSMNEG00000014861)	MRGBP (ENSMNEG00000038652)	NTSR1 (ENSMNEG00000030073)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00910000147201	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247
Olive baboon	MODERN SPECIES	7	UCKL1 (ENSPANG00000011184)	ZNF512B (ENSPANG00000020637)	SAMD10 (ENSPANG00000005907)	PRPF6 (ENSPANG00000024135)	C20orf204 (ENSPANG00000032029)	SOX18 (ENSPANG00000024134)	TCEA2 (ENSPANG00000024133)	ENSPANG00000024132	ENSPANG00000020638	OPRL1 (ENSPANG00000048514)	NPBWR2 (ENSPANG00000046186)	MYT1 (ENSPANG00000005908)	PCMTD2 (ENSPANG00000020639)	EEF1A2 (ENSPANG00000026187) #20	KCNQ2 (ENSPANG00000024128) #21	CHRNA4 (ENSPANG00000011181) #22	COL20A1 (ENSPANG00000001217) #23	ARFGAP1 (ENSPANG00000033349) #24	NKAIN4 (ENSPANG00000011180)	BIRC7 (ENSPANG00000021470) #25	YTHDF1 (ENSPANG00000021472)	BHLHE23 (ENSPANG00000042385)	SLC17A9 (ENSPANG00000011749)	GID8 (ENSPANG00000011748)	DIDO1 (ENSPANG00000026186)	TCFL5 (ENSPANG00000021056)	ENSPANG00000024126	OGFR (ENSPANG00000048448)	MRGBP (ENSPANG00000043588)	NTSR1 (ENSPANG00000014255)	ENSPANG00000030177
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00910000147201	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247
Drill	MODERN SPECIES	1087	SLC2A4RG (ENSMLEG00000036498) #9	LIME1 (ENSMLEG00000038721)	ZGPAT (ENSMLEG00000035416) #10	ARFRP1 (ENSMLEG00000034228) #11	TNFRSF6B (ENSMLEG00000038268)	RTEL1 (ENSMLEG00000036100) #12	STMN3 (ENSMLEG00000036350) #13	GMEB2 (ENSMLEG00000039586) #14	HELZ2 (ENSMLEG00000034372) #15	FNDC11 (ENSMLEG00000027553) #16	SRMS (ENSMLEG00000042766) #17	PTK6 (ENSMLEG00000029204) #18	PPDPF (ENSMLEG00000015350) #19	EEF1A2 (ENSMLEG00000021843) #20	KCNQ2 (ENSMLEG00000038645) #21	CHRNA4 (ENSMLEG00000035637) #22	COL20A1 (ENSMLEG00000028700) #23	ARFGAP1 (ENSMLEG00000044087) #24	NKAIN4 (ENSMLEG00000029404)	BIRC7 (ENSMLEG00000008457) #25	YTHDF1 (ENSMLEG00000009252)	ENSMLEG00000004545	SLC17A9 (ENSMLEG00000036356)	GID8 (ENSMLEG00000042442)	DIDO1 (ENSMLEG00000034306)	ENSMLEG00000007821	COL9A3 (ENSMLEG00000041767)	OGFR (ENSMLEG00000040857)	ENSMLEG00000040901	ENSMLEG00000041581	ENSMLEG00000006099
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	187	SLC2A4RG (ENSCATG00000033165) #9	LIME1 (ENSCATG00000027340)	ZGPAT (ENSCATG00000034076) #10	ARFRP1 (ENSCATG00000039104) #11	TNFRSF6B (ENSCATG00000012537)	RTEL1 (ENSCATG00000013982) #12	STMN3 (ENSCATG00000036117) #13	GMEB2 (ENSCATG00000021997) #14	HELZ2 (ENSCATG00000014259) #15	FNDC11 (ENSCATG00000019090) #16	SRMS (ENSCATG00000037362) #17	PTK6 (ENSCATG00000039122) #18	ENSCATG00000035784 #19	EEF1A2 (ENSCATG00000036349) #20	KCNQ2 (ENSCATG00000018473) #21	CHRNA4 (ENSCATG00000044554) #22	COL20A1 (ENSCATG00000034558) #23	ARFGAP1 (ENSCATG00000035183) #24	NKAIN4 (ENSCATG00000020669)	BIRC7 (ENSCATG00000015429) #25	YTHDF1 (ENSCATG00000033272)	ENSCATG00000021474	BHLHE23 (ENSCATG00000022765)	SLC17A9 (ENSCATG00000040220)	GID8 (ENSCATG00000038096)	DIDO1 (ENSCATG00000032733)	TCFL5 (ENSCATG00000016160)	COL9A3 (ENSCATG00000030703)	OGFR (ENSCATG00000034931)	MRGBP (ENSCATG00000036826)	NTSR1 (ENSCATG00000043092)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b.d.a #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00910000147247	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	671	SLC2A4RG (ENSRBIG00000033868) #9	LIME1 (ENSRBIG00000034401)	ZGPAT (ENSRBIG00000034134) #10	ARFRP1 (ENSRBIG00000044065) #11	TNFRSF6B (ENSRBIG00000040501)	RTEL1 (ENSRBIG00000038522) #12	STMN3 (ENSRBIG00000044464) #13	GMEB2 (ENSRBIG00000034424) #14	HELZ2 (ENSRBIG00000044653) #15	FNDC11 (ENSRBIG00000019675) #16	SRMS (ENSRBIG00000036167) #17	PTK6 (ENSRBIG00000030008) #18	PPDPF (ENSRBIG00000030806) #19	EEF1A2 (ENSRBIG00000011386) #20	KCNQ2 (ENSRBIG00000033123) #21	CHRNA4 (ENSRBIG00000040880) #22	COL20A1 (ENSRBIG00000035309) #23	ARFGAP1 (ENSRBIG00000019841) #24	NKAIN4 (ENSRBIG00000044975)	BIRC7 (ENSRBIG00000044970) #25	YTHDF1 (ENSRBIG00000044959)	BHLHE23 (ENSRBIG00000026436)	SLC17A9 (ENSRBIG00000044949)	GID8 (ENSRBIG00000044944)	DIDO1 (ENSRBIG00000028408)	TCFL5 (ENSRBIG00000033479)	ENSRBIG00000034671	OGFR (ENSRBIG00000030910)	MRGBP (ENSRBIG00000035316)	ENSRBIG00000030344	NTSR1 (ENSRBIG00000034200)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1209	SLC2A4RG (ENSRROG00000028292) #9	LIME1 (ENSRROG00000015370)	ZGPAT (ENSRROG00000039084) #10	ARFRP1 (ENSRROG00000010121) #11	TNFRSF6B (ENSRROG00000009615)	RTEL1 (ENSRROG00000038795) #12	STMN3 (ENSRROG00000031460) #13	GMEB2 (ENSRROG00000031210) #14	HELZ2 (ENSRROG00000009088) #15	FNDC11 (ENSRROG00000013293) #16	SRMS (ENSRROG00000019037) #17	PTK6 (ENSRROG00000005676) #18	PPDPF (ENSRROG00000029100) #19	EEF1A2 (ENSRROG00000012377) #20	KCNQ2 (ENSRROG00000030287) #21	CHRNA4 (ENSRROG00000026578) #22	COL20A1 (ENSRROG00000037231) #23	ARFGAP1 (ENSRROG00000029373) #24	NKAIN4 (ENSRROG00000035031)	BIRC7 (ENSRROG00000039594) #25	YTHDF1 (ENSRROG00000033014)	BHLHE23 (ENSRROG00000038786)	SLC17A9 (ENSRROG00000041713)	GID8 (ENSRROG00000037608)	DIDO1 (ENSRROG00000044763)	ENSRROG00000004971	ENSRROG00000042285	ENSRROG00000029777	OGFR (ENSRROG00000012775)	ENSRROG00000034485	ENSRROG00000013236
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00940000178207	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515.e #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00940000178207	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515.e #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515.e #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Capuchin	MODERN SPECIES	553	ENSCCAG00000022832	ZBTB46 (ENSCCAG00000022107) #8	SLC2A4RG (ENSCCAG00000032965) #9	LIME1 (ENSCCAG00000029228)	ZGPAT (ENSCCAG00000035441) #10	ARFRP1 (ENSCCAG00000022484) #11	TNFRSF6B (ENSCCAG00000023856)	RTEL1 (ENSCCAG00000028154) #12	STMN3 (ENSCCAG00000014315) #13	GMEB2 (ENSCCAG00000034831) #14	HELZ2 (ENSCCAG00000027744) #15	SRMS (ENSCCAG00000038086) #17	PTK6 (ENSCCAG00000035452) #18	EEF1A2 (ENSCCAG00000023615) #20	KCNQ2 (ENSCCAG00000027787) #21	CHRNA4 (ENSCCAG00000026573) #22	COL20A1 (ENSCCAG00000012160) #23	ARFGAP1 (ENSCCAG00000027205) #24	NKAIN4 (ENSCCAG00000029526)	BIRC7 (ENSCCAG00000037815) #25	YTHDF1 (ENSCCAG00000024650)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	93	ABHD16B (ENSSBOG00000033830) #7	ZBTB46 (ENSSBOG00000019387) #8	SLC2A4RG (ENSSBOG00000027522) #9	LIME1 (ENSSBOG00000028724)	ZGPAT (ENSSBOG00000028752) #10	ARFRP1 (ENSSBOG00000021962) #11	RTEL1 (ENSSBOG00000016779) #12	TNFRSF6B (ENSSBOG00000035198)	STMN3 (ENSSBOG00000036133) #13	GMEB2 (ENSSBOG00000024225) #14	HELZ2 (ENSSBOG00000033345) #15	SRMS (ENSSBOG00000030339) #17	PTK6 (ENSSBOG00000025332) #18	EEF1A2 (ENSSBOG00000021512) #20	KCNQ2 (ENSSBOG00000019522) #21	CHRNA4 (ENSSBOG00000029663) #22	COL20A1 (ENSSBOG00000028118) #23	ARFGAP1 (ENSSBOG00000030523) #24	NKAIN4 (ENSSBOG00000022021)	BIRC7 (ENSSBOG00000030127) #25	YTHDF1 (ENSSBOG00000027278)	SLC17A9 (ENSSBOG00000029063)	GID8 (ENSSBOG00000020603)	DIDO1 (ENSSBOG00000028181)	ENSSBOG00000026416	ENSSBOG00000032867	OGFR (ENSSBOG00000027155)	ENSSBOG00000023786	NTSR1 (ENSSBOG00000001221)	SLCO4A1 (ENSSBOG00000030164)	GATA5 (ENSSBOG00000034203)
Marmoset	MODERN SPECIES	17	ZBTB46 (ENSCJAG00000010439) #8	SLC2A4RG (ENSCJAG00000036855) #9	LIME1 (ENSCJAG00000038018)	ZGPAT (ENSCJAG00000010398) #10	ARFRP1 (ENSCJAG00000010382) #11	RTEL1 (ENSCJAG00000010336) #12	STMN3 (ENSCJAG00000010324) #13	GMEB2 (ENSCJAG00000075313) #14	ENSCJAG00000081424	FNDC11 (ENSCJAG00000010272) #16	SRMS (ENSCJAG00000010253) #17	PTK6 (ENSCJAG00000010243) #18	ENSCJAG00000076938 #19	EEF1A2 (ENSCJAG00000010227) #20	KCNQ2 (ENSCJAG00000010184) #21	CHRNA4 (ENSCJAG00000010168) #22	COL20A1 (ENSCJAG00000010103) #23	ARFGAP1 (ENSCJAG00000010078) #24	ENSCJAG00000009955 #25	YTHDF1 (ENSCJAG00000010056)	SLC17A9 (ENSCJAG00000082534)	GID8 (ENSCJAG00000010007)	DIDO1 (ENSCJAG00000003827)	TCFL5 (ENSCJAG00000009980)	COL9A3 (ENSCJAG00000009909)	OGFR (ENSCJAG00000043786)	MRGBP (ENSCJAG00000041703)	NTSR1 (ENSCJAG00000041245)	SLCO4A1 (ENSCJAG00000009785)	RBBP8NL (ENSCJAG00000014173)	CABLES2 (ENSCJAG00000014189)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	628	ZBTB46 (ENSANAG00000028560) #8	SLC2A4RG (ENSANAG00000037537) #9	LIME1 (ENSANAG00000027128)	ZGPAT (ENSANAG00000035708) #10	ARFRP1 (ENSANAG00000036343) #11	TNFRSF6B (ENSANAG00000026265)	RTEL1 (ENSANAG00000019600) #12	STMN3 (ENSANAG00000033038) #13	GMEB2 (ENSANAG00000024904) #14	HELZ2 (ENSANAG00000019546) #15	SRMS (ENSANAG00000026924) #17	PTK6 (ENSANAG00000024550) #18	PPDPF (ENSANAG00000035520) #19	EEF1A2 (ENSANAG00000035272) #20	KCNQ2 (ENSANAG00000036022) #21	CHRNA4 (ENSANAG00000009699) #22	COL20A1 (ENSANAG00000023543) #23	ENSANAG00000036435 #24	ENSANAG00000033769	BIRC7 (ENSANAG00000036822) #25	ENSANAG00000034786	SLC17A9 (ENSANAG00000037919)	GID8 (ENSANAG00000038136)	DIDO1 (ENSANAG00000036369)	ENSANAG00000033851	COL9A3 (ENSANAG00000029986)	OGFR (ENSANAG00000023834)	ENSANAG00000020630	NTSR1 (ENSANAG00000028125)	SLCO4A1 (ENSANAG00000025751)	GATA5 (ENSANAG00000032190)
Tarsier	MODERN SPECIES	1615			ZGPAT (ENSTSYG00000000795) #10	ARFRP1 (ENSTSYG00000033120) #11	TNFRSF6B (ENSTSYG00000034993)	RTEL1 (ENSTSYG00000036434) #12	STMN3 (ENSTSYG00000036799) #13	GMEB2 (ENSTSYG00000031015) #14	HELZ2 (ENSTSYG00000027453) #15	FNDC11 (ENSTSYG00000000635) #16	SRMS (ENSTSYG00000030556) #17	PTK6 (ENSTSYG00000031564) #18	PPDPF (ENSTSYG00000033172) #19	EEF1A2 (ENSTSYG00000029463) #20	KCNQ2 (ENSTSYG00000028027) #21	CHRNA4 (ENSTSYG00000037562) #22	COL20A1 (ENSTSYG00000029460) #23	ARFGAP1 (ENSTSYG00000005848) #24	NKAIN4 (ENSTSYG00000030936)	BIRC7 (ENSTSYG00000012709) #25	YTHDF1 (ENSTSYG00000033436)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	12											ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Bushbaby	MODERN SPECIES	138	ABHD16B (ENSOGAG00000030985) #7	ZBTB46 (ENSOGAG00000000852) #8	SLC2A4RG (ENSOGAG00000029486) #9	LIME1 (ENSOGAG00000028914)	ZGPAT (ENSOGAG00000034509) #10	ARFRP1 (ENSOGAG00000026673) #11	RTEL1 (ENSOGAG00000028487) #12	STMN3 (ENSOGAG00000034051) #13	GMEB2 (ENSOGAG00000008826) #14	HELZ2 (ENSOGAG00000031068) #15	FNDC11 (ENSOGAG00000027142) #16	SRMS (ENSOGAG00000008816) #17	PPDPF (ENSOGAG00000008810) #19	EEF1A2 (ENSOGAG00000004630) #20	KCNQ2 (ENSOGAG00000009901) #21	CHRNA4 (ENSOGAG00000003054) #22	ARFGAP1 (ENSOGAG00000031121) #24	BIRC7 (ENSOGAG00000027612) #25	YTHDF1 (ENSOGAG00000000480)	ENSOGAG00000031010	SLC17A9 (ENSOGAG00000013837)	GID8 (ENSOGAG00000013834)	DIDO1 (ENSOGAG00000013822)	TCFL5 (ENSOGAG00000013819)	ENSOGAG00000011190	OGFR (ENSOGAG00000011186)	MRGBP (ENSOGAG00000011183)	NTSR1 (ENSOGAG00000027155)	SLCO4A1 (ENSOGAG00000005124)	GATA5 (ENSOGAG00000025085)	RBBP8NL (ENSOGAG00000000946)
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	10											ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Mouse lemur	MODERN SPECIES	9	ZBTB46 (ENSMICG00000012871) #8	SLC2A4RG (ENSMICG00000027188) #9	LIME1 (ENSMICG00000008850)	ZGPAT (ENSMICG00000033269) #10	ARFRP1 (ENSMICG00000008840) #11	TNFRSF6B (ENSMICG00000031323)	RTEL1 (ENSMICG00000008812) #12	STMN3 (ENSMICG00000029780) #13	GMEB2 (ENSMICG00000043724) #14	HELZ2 (ENSMICG00000027046) #15	FNDC11 (ENSMICG00000002023) #16	SRMS (ENSMICG00000044206) #17	PPDPF (ENSMICG00000005959) #19	EEF1A2 (ENSMICG00000015319) #20	KCNQ2 (ENSMICG00000031055) #21	CHRNA4 (ENSMICG00000035086) #22	ARFGAP1 (ENSMICG00000013625) #24	BIRC7 (ENSMICG00000008469) #25	YTHDF1 (ENSMICG00000032266)	SLC17A9 (ENSMICG00000045180)	GID8 (ENSMICG00000046912)	DIDO1 (ENSMICG00000006217)	TCFL5 (ENSMICG00000030702)	ENSMICG00000043180	OGFR (ENSMICG00000045669)	MRGBP (ENSMICG00000048156)	NTSR1 (ENSMICG00000026504)	SLCO4A1 (ENSMICG00000001139)	GATA5 (ENSMICG00000037048)	RBBP8NL (ENSMICG00000031675)	ENSMICG00000006412
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	139											ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	2507																ENSPSMG00000002819 #22
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	594	ZBTB46 (ENSPCOG00000016933) #8	SLC2A4RG (ENSPCOG00000020613) #9	LIME1 (ENSPCOG00000022044)	ZGPAT (ENSPCOG00000012369) #10	ARFRP1 (ENSPCOG00000024163) #11	TNFRSF6B (ENSPCOG00000022312)	RTEL1 (ENSPCOG00000013374) #12	STMN3 (ENSPCOG00000023075) #13	GMEB2 (ENSPCOG00000007006) #14	HELZ2 (ENSPCOG00000017149) #15	FNDC11 (ENSPCOG00000017414) #16	SRMS (ENSPCOG00000024367) #17	PPDPF (ENSPCOG00000019647) #19	EEF1A2 (ENSPCOG00000018056) #20	KCNQ2 (ENSPCOG00000013133) #21	CHRNA4 (ENSPCOG00000017991) #22	ARFGAP1 (ENSPCOG00000027176) #24	BIRC7 (ENSPCOG00000015457) #25	YTHDF1 (ENSPCOG00000025969)	SLC17A9 (ENSPCOG00000014828)	GID8 (ENSPCOG00000019546)	DIDO1 (ENSPCOG00000023499)	TCFL5 (ENSPCOG00000017126)	ENSPCOG00000024112	OGFR (ENSPCOG00000020031)	MRGBP (ENSPCOG00000023597)	NTSR1 (ENSPCOG00000015702)	SLCO4A1 (ENSPCOG00000021209)	GATA5 (ENSPCOG00000007837)	RBBP8NL (ENSPCOG00000028470)	CABLES2 (ENSPCOG00000025315)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000178207	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000028339	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000028339	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Suina	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.a.a.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Pig	MODERN SPECIES	8	ABHD16B (ENSSSCG00000035915) #7	ZBTB46 (ENSSSCG00000040388) #8	SLC2A4RG (ENSSSCG00000037562) #9	LIME1 (ENSSSCG00000061743)	ARFRP1 (ENSSSCG00000035304) #11	ZGPAT (ENSSSCG00000036595) #10	RTEL1 (ENSSSCG00000039160) #12	STMN3 (ENSSSCG00000038405) #13	GMEB2 (ENSSSCG00000040107) #14	FNDC11 (ENSSSCG00000038651) #16	SRMS (ENSSSCG00000036706) #17	PTK6 (ENSSSCG00000031474) #18	ENSSSCG00000040118 #19	EEF1A2 (ENSSSCG00000040401) #20	KCNQ2 (ENSSSCG00000031746) #21	CHRNA4 (ENSSSCG00000039677) #22	ENSSSCG00000037260	ARFGAP1 (ENSSSCG00000032235) #24	NKAIN4 (ENSSSCG00000036544)	ENSSSCG00000036109 #25	YTHDF1 (ENSSSCG00000040086)	BHLHE23 (ENSSSCG00000054477)	SLC17A9 (ENSSSCG00000040931)	GID8 (ENSSSCG00000034173)	ENSSSCG00000033946	TCFL5 (ENSSSCG00000038631)	COL9A3 (ENSSSCG00000040554)	ENSSSCG00000056699	MRGBP (ENSSSCG00000053677)	NTSR1 (ENSSSCG00000038278)	ENSSSCG00000040565
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	803																CHRNA4 (ENSCWAG00000018036) #22	ENSCWAG00000016924	ARFGAP1 (ENSCWAG00000016739) #24	ENSCWAG00000016673	BIRC7 (ENSCWAG00000016545) #25	YTHDF1 (ENSCWAG00000016494)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000028339	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000028339	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000028339	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000028339	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407.j #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000028339	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407.j #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407.j #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000178207	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Narwhal	MODERN SPECIES	299	TPD52L2 (ENSMMNG00015000666)	ZBTB46 (ENSMMNG00015000842) #8	SLC2A4RG (ENSMMNG00015000872) #9	ENSMMNG00015000902	ZGPAT (ENSMMNG00015000934) #10	ENSMMNG00015001006 #11	TNFRSF6B (ENSMMNG00015001055)	RTEL1 (ENSMMNG00015001129) #12	STMN3 (ENSMMNG00015001283) #13	GMEB2 (ENSMMNG00015001319) #14	ENSMMNG00015001359	FNDC11 (ENSMMNG00015001382) #16	ENSMMNG00015001417 #19	EEF1A2 (ENSMMNG00015001463) #20	KCNQ2 (ENSMMNG00015001643) #21	CHRNA4 (ENSMMNG00015001872) #22	ENSMMNG00015002114	ARFGAP1 (ENSMMNG00015002472) #24	NKAIN4 (ENSMMNG00015002566)	BIRC7 (ENSMMNG00015002630) #25	YTHDF1 (ENSMMNG00015002665)	BHLHE23 (ENSMMNG00015002701)	SLC17A9 (ENSMMNG00015002717)	GID8 (ENSMMNG00015002735)	DIDO1 (ENSMMNG00015002766)	TCFL5 (ENSMMNG00015002807)	ENSMMNG00015002855	OGFR (ENSMMNG00015002906)	MRGBP (ENSMMNG00015002936)	NTSR1 (ENSMMNG00015002962)	SLCO4A1 (ENSMMNG00015002992)
Beluga whale	MODERN SPECIES	36	TPD52L2 (ENSDLEG00000006229)	ABHD16B (ENSDLEG00000006240) #7	ZBTB46 (ENSDLEG00000006243) #8	SLC2A4RG (ENSDLEG00000006246) #9	ZGPAT (ENSDLEG00000006248) #10	ARFRP1 (ENSDLEG00000006274) #11	TNFRSF6B (ENSDLEG00000006327)	RTEL1 (ENSDLEG00000006299) #12	STMN3 (ENSDLEG00000006329) #13	GMEB2 (ENSDLEG00000006334) #14	ENSDLEG00000006341	FNDC11 (ENSDLEG00000006348) #16	PPDPF (ENSDLEG00000006352) #19	EEF1A2 (ENSDLEG00000006359) #20	KCNQ2 (ENSDLEG00000006373) #21	CHRNA4 (ENSDLEG00000006419) #22	ARFGAP1 (ENSDLEG00000006487) #24	ENSDLEG00000006501	NKAIN4 (ENSDLEG00000006505)	BIRC7 (ENSDLEG00000006511) #25	YTHDF1 (ENSDLEG00000006539)	BHLHE23 (ENSDLEG00000006552)	SLC17A9 (ENSDLEG00000006561)	GID8 (ENSDLEG00000006569)	DIDO1 (ENSDLEG00000006572)	TCFL5 (ENSDLEG00000006581)	ENSDLEG00000006589	OGFR (ENSDLEG00000006610)	MRGBP (ENSDLEG00000006615)	NTSR1 (ENSDLEG00000006619)	SLCO4A1 (ENSDLEG00000006657)
Vaquita	MODERN SPECIES	6	DNAJC5 (ENSPSNG00000018545)	TPD52L2 (ENSPSNG00000018664)	ZBTB46 (ENSPSNG00000018908) #8	SLC2A4RG (ENSPSNG00000018950) #9	ZGPAT (ENSPSNG00000019030) #10	ARFRP1 (ENSPSNG00000019111) #11	TNFRSF6B (ENSPSNG00000019151)	RTEL1 (ENSPSNG00000019209) #12	STMN3 (ENSPSNG00000019332) #13	GMEB2 (ENSPSNG00000019400) #14	ENSPSNG00000019447 #15	FNDC11 (ENSPSNG00000019486) #16	ENSPSNG00000019504 #19	EEF1A2 (ENSPSNG00000019559) #20	KCNQ2 (ENSPSNG00000019705) #21	CHRNA4 (ENSPSNG00000020351) #22	ENSPSNG00000020436	ARFGAP1 (ENSPSNG00000020779) #24	NKAIN4 (ENSPSNG00000020851)	BIRC7 (ENSPSNG00000020957) #25	YTHDF1 (ENSPSNG00000021004)	BHLHE23 (ENSPSNG00000021049)	SLC17A9 (ENSPSNG00000021073)	GID8 (ENSPSNG00000021145)	DIDO1 (ENSPSNG00000021175)	TCFL5 (ENSPSNG00000021221)	COL9A3 (ENSPSNG00000021251)	OGFR (ENSPSNG00000021362)	MRGBP (ENSPSNG00000021374)	NTSR1 (ENSPSNG00000021395)	SLCO4A1 (ENSPSNG00000021425)
Dolphin	MODERN SPECIES	3121													EEF1A2 (ENSTTRG00000001835) #20	KCNQ2 (ENSTTRG00000001831) #21	ENSTTRG00000001828	CHRNA4 (ENSTTRG00000001827) #22	COL20A1 (ENSTTRG00000001818) #23	ARFGAP1 (ENSTTRG00000001815) #24	NKAIN4 (ENSTTRG00000001813)	BIRC7 (ENSTTRG00000001809) #25	YTHDF1 (ENSTTRG00000001804)	SLC17A9 (ENSTTRG00000001799)	GID8 (ENSTTRG00000001797)	DIDO1 (ENSTTRG00000001786)	TCFL5 (ENSTTRG00000001783)	ENSTTRG00000001775	OGFR (ENSTTRG00000001768)	MRGBP (ENSTTRG00000001765)	NTSR1 (ENSTTRG00000001763)	ENSTTRG00000001754
Sperm whale	MODERN SPECIES	5	UCKL1 (ENSPCTG00005017107)	DNAJC5 (ENSPCTG00005017353)	TPD52L2 (ENSPCTG00005017466)	ABHD16B (ENSPCTG00005018143) #7	ZBTB46 (ENSPCTG00005018166) #8	SLC2A4RG (ENSPCTG00005007152) #9	ZGPAT (ENSPCTG00005007242) #10	ARFRP1 (ENSPCTG00005007278) #11	TNFRSF6B (ENSPCTG00005007324)	RTEL1 (ENSPCTG00005007361) #12	STMN3 (ENSPCTG00005007434) #13	GMEB2 (ENSPCTG00005007480) #14	FNDC11 (ENSPCTG00005007541) #16	ENSPCTG00005007565 #17	KCNQ2 (ENSPCTG00005007656) #21	CHRNA4 (ENSPCTG00005008656) #22	ENSPCTG00005008740	ARFGAP1 (ENSPCTG00005008975) #24	NKAIN4 (ENSPCTG00005009376)	BIRC7 (ENSPCTG00005009624) #25	YTHDF1 (ENSPCTG00005009694)	ENSPCTG00005009752	ENSPCTG00005009792	SLC17A9 (ENSPCTG00005009878)	GID8 (ENSPCTG00005010283)	ENSPCTG00005010335	ENSPCTG00005010449	COL9A3 (ENSPCTG00005010512)	OGFR (ENSPCTG00005010786)	MRGBP (ENSPCTG00005010826)	NTSR1 (ENSPCTG00005010880)
Blue whale	MODERN SPECIES	6	ZBTB46 (ENSBMSG00010010124) #8	SLC2A4RG (ENSBMSG00010010132) #9	LIME1 (ENSBMSG00010010146)	ZGPAT (ENSBMSG00010010160) #10	ENSBMSG00010010180 #11	TNFRSF6B (ENSBMSG00010010199)	RTEL1 (ENSBMSG00010010226) #12	STMN3 (ENSBMSG00010010250) #13	GMEB2 (ENSBMSG00010010265) #14	ENSBMSG00010010275	FNDC11 (ENSBMSG00010010281) #16	PTK6 (ENSBMSG00010010315) #18	PPDPF (ENSBMSG00010010333) #19	EEF1A2 (ENSBMSG00010010345) #20	KCNQ2 (ENSBMSG00010010397) #21	CHRNA4 (ENSBMSG00010010697) #22	ENSBMSG00010010754	ARFGAP1 (ENSBMSG00010010909) #24	NKAIN4 (ENSBMSG00010011008)	BIRC7 (ENSBMSG00010011034) #25	YTHDF1 (ENSBMSG00010011055)	BHLHE23 (ENSBMSG00010011080)	SLC17A9 (ENSBMSG00010011094)	GID8 (ENSBMSG00010011118)	ENSBMSG00010011147	ENSBMSG00010011180	TCFL5 (ENSBMSG00010011196)	ENSBMSG00010011229	OGFR (ENSBMSG00010011267)	MRGBP (ENSBMSG00010011280)	NTSR1 (ENSBMSG00010011293)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718
Yarkand deer	MODERN SPECIES	15	ABHD16B (ENSCHYG00000021761) #7	ZBTB46 (ENSCHYG00000021787) #8	SLC2A4RG (ENSCHYG00000021881) #9	ZGPAT (ENSCHYG00000021994) #10	ARFRP1 (ENSCHYG00000022042) #11	TNFRSF6B (ENSCHYG00000022144)	RTEL1 (ENSCHYG00000022197) #12	STMN3 (ENSCHYG00000022430) #13	GMEB2 (ENSCHYG00000022512) #14	FNDC11 (ENSCHYG00000022671) #16	SRMS (ENSCHYG00000022689) #17	PTK6 (ENSCHYG00000022722) #18	PPDPF (ENSCHYG00000022802) #19	EEF1A2 (ENSCHYG00000022823) #20	KCNQ2 (ENSCHYG00000022884) #21	CHRNA4 (ENSCHYG00000023185) #22	COL20A1 (ENSCHYG00000023249) #23	ARFGAP1 (ENSCHYG00000023418) #24	BIRC7 (ENSCHYG00000024242) #25	YTHDF1 (ENSCHYG00000024279)	BHLHE23 (ENSCHYG00000024339)	SLC17A9 (ENSCHYG00000024379)	GID8 (ENSCHYG00000024609)	DIDO1 (ENSCHYG00000024645)	TCFL5 (ENSCHYG00000024725)	ENSCHYG00000024763	OGFR (ENSCHYG00000024794)	MRGBP (ENSCHYG00000024816)	NTSR1 (ENSCHYG00000024836)	SLCO4A1 (ENSCHYG00000024856)	ENSCHYG00000024915
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635.nb	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635.nb	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635.nb	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b.d #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718
Bos	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635.nb	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b.d #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635.nb	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b.d #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00390000004044.kb	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00970000197151	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Cow	MODERN SPECIES	4	SLC2A4RG (ENSBTAG00000016664) #9	LIME1 (ENSBTAG00000007501)	ZGPAT (ENSBTAG00000007498) #10	ARFRP1 (ENSBTAG00000007497) #11	TNFRSF6B (ENSBTAG00000027407)	RTEL1 (ENSBTAG00000021096) #12	STMN3 (ENSBTAG00000038974) #13	GMEB2 (ENSBTAG00000014769) #14	FNDC11 (ENSBTAG00000027405) #16	SRMS (ENSBTAG00000001985) #17	PTK6 (ENSBTAG00000044091) #18	PPDPF (ENSBTAG00000031800) #19	EEF1A2 (ENSBTAG00000021685) #20	KCNQ2 (ENSBTAG00000003030) #21	ENSBTAG00000031764	CHRNA4 (ENSBTAG00000017198) #22	COL20A1 (ENSBTAG00000004582)	ARFGAP1 (ENSBTAG00000004916) #24	ENSBTAG00000051598	BIRC7 (ENSBTAG00000004911) #25	YTHDF1 (ENSBTAG00000010383)	BHLHE23 (ENSBTAG00000010873)	SLC17A9 (ENSBTAG00000001829)	GID8 (ENSBTAG00000001827)	DIDO1 (ENSBTAG00000006002)	TCFL5 (ENSBTAG00000046520)	COL9A3 (ENSBTAG00000015581)	OGFR (ENSBTAG00000031718)	MRGBP (ENSBTAG00000031716)	NTSR1 (ENSBTAG00000021727)	SLCO4A1 (ENSBTAG00000016388)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	4	ZBTB46 (ENSBIXG00005003020) #8	SLC2A4RG (ENSBIXG00005018672) #9	ZGPAT (ENSBIXG00005018723) #10	ARFRP1 (ENSBIXG00005018785) #11	ENSBIXG00005018798	RTEL1 (ENSBIXG00005018917) #12	STMN3 (ENSBIXG00005007568) #13	GMEB2 (ENSBIXG00005018966) #14	FNDC11 (ENSBIXG00005018984) #16	SRMS (ENSBIXG00005019096) #17	PTK6 (ENSBIXG00005003117) #18	ENSBIXG00005003125 #19	EEF1A2 (ENSBIXG00005019170) #20	KCNQ2 (ENSBIXG00005019244) #21	ENSBIXG00005003134	CHRNA4 (ENSBIXG00005019296) #22	ENSBIXG00005005672	ARFGAP1 (ENSBIXG00005020213) #24	ENSBIXG00005006458	BIRC7 (ENSBIXG00005003370) #25	YTHDF1 (ENSBIXG00005003409)	BHLHE23 (ENSBIXG00005020315)	SLC17A9 (ENSBIXG00005005595)	GID8 (ENSBIXG00005003440)	DIDO1 (ENSBIXG00005020462)	TCFL5 (ENSBIXG00005003466)	COL9A3 (ENSBIXG00005020674)	OGFR (ENSBIXG00005006823)	MRGBP (ENSBIXG00005006040)	NTSR1 (ENSBIXG00005020774)	ENSBIXG00005020790
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635.nb	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b.d #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT00960000188905	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Domestic yak	MODERN SPECIES	3	SLC2A4RG (ENSBGRG00000015318) #9	ENSBGRG00000015342	ZGPAT (ENSBGRG00000015402) #10	ARFRP1 (ENSBGRG00000015487) #11	ENSBGRG00000015689	RTEL1 (ENSBGRG00000015752) #12	ENSBGRG00000016032 #13	GMEB2 (ENSBGRG00000016222) #14	FNDC11 (ENSBGRG00000016384) #16	SRMS (ENSBGRG00000016410) #17	PTK6 (ENSBGRG00000016608) #18	ENSBGRG00000016703 #19	EEF1A2 (ENSBGRG00000016759) #20	KCNQ2 (ENSBGRG00000016904) #21	ENSBGRG00000018038	CHRNA4 (ENSBGRG00000018085) #22	ARFGAP1 (ENSBGRG00000018203) #24	ENSBGRG00000018634	BIRC7 (ENSBGRG00000019380) #25	ENSBGRG00000019416	BHLHE23 (ENSBGRG00000019503)	SLC17A9 (ENSBGRG00000019565)	GID8 (ENSBGRG00000020140)	DIDO1 (ENSBGRG00000020262)	TCFL5 (ENSBGRG00000020529)	COL9A3 (ENSBGRG00000020604)	OGFR (ENSBGRG00000020644)	MRGBP (ENSBGRG00000020678)	ENSBGRG00000020718	NTSR1 (ENSBGRG00000020731)	SLCO4A1 (ENSBGRG00000020768)
Wild yak	MODERN SPECIES	2902																CHRNA4 (ENSBMUG00000005972) #22	ENSBMUG00000005999	ARFGAP1 (ENSBMUG00000006116) #24	BIRC7 (ENSBMUG00000006255) #25
American bison	MODERN SPECIES	2997	ZBTB46 (ENSBBBG00000018391) #8	ENSBBBG00000018362	ZGPAT (ENSBBBG00000018356) #10	ARFRP1 (ENSBBBG00000018329) #11	TNFRSF6B (ENSBBBG00000018268)	RTEL1 (ENSBBBG00000018256) #12	STMN3 (ENSBBBG00000018165) #13	GMEB2 (ENSBBBG00000018153) #14	FNDC11 (ENSBBBG00000018128) #16	SRMS (ENSBBBG00000018118) #17	ENSBBBG00000018103 #18	ENSBBBG00000004448 #19	EEF1A2 (ENSBBBG00000018089) #20	KCNQ2 (ENSBBBG00000018060) #21	ENSBBBG00000017850	CHRNA4 (ENSBBBG00000017847) #22	ENSBBBG00000017808	ARFGAP1 (ENSBBBG00000017718) #24	BIRC7 (ENSBBBG00000017559) #25	YTHDF1 (ENSBBBG00000017540)	SLC17A9 (ENSBBBG00000017525)	GID8 (ENSBBBG00000004333)	ENSBBBG00000017486	ENSBBBG00000008003	COL9A3 (ENSBBBG00000017417)	OGFR (ENSBBBG00000017322)	ENSBBBG00000017309	NTSR1 (ENSBBBG00000017290)	SLCO4A1 (ENSBBBG00000017273)	ENSBBBG00000007619
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635.nb	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Goat	MODERN SPECIES	4	ABHD16B (ENSCHIG00000002136) #7	ZBTB46 (ENSCHIG00000027256) #8	SLC2A4RG (ENSCHIG00000013029) #9	ZGPAT (ENSCHIG00000026209) #10	ARFRP1 (ENSCHIG00000010007) #11	TNFRSF6B (ENSCHIG00000023828)	RTEL1 (ENSCHIG00000014098) #12	STMN3 (ENSCHIG00000025919) #13	GMEB2 (ENSCHIG00000010276) #14	FNDC11 (ENSCHIG00000010688) #16	SRMS (ENSCHIG00000014015) #17	PTK6 (ENSCHIG00000025310) #18	ENSCHIG00000016840 #19	EEF1A2 (ENSCHIG00000016589) #20	KCNQ2 (ENSCHIG00000011199) #21	CHRNA4 (ENSCHIG00000023125) #22	ENSCHIG00000013050	ARFGAP1 (ENSCHIG00000027204) #24	BIRC7 (ENSCHIG00000021634) #25	YTHDF1 (ENSCHIG00000026494)	BHLHE23 (ENSCHIG00000012514)	SLC17A9 (ENSCHIG00000021766)	GID8 (ENSCHIG00000023483)	DIDO1 (ENSCHIG00000010423)	TCFL5 (ENSCHIG00000019060)	ENSCHIG00000022644	OGFR (ENSCHIG00000020689)	ENSCHIG00000014569	NTSR1 (ENSCHIG00000026075)	SLCO4A1 (ENSCHIG00000020363)	GATA5 (ENSCHIG00000014469)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	4	ABHD16B (ENSOARG00020011710) #7	ZBTB46 (ENSOARG00020011728) #8	LIME1 (ENSOARG00020011907)	ZGPAT (ENSOARG00020012012) #10	ARFRP1 (ENSOARG00020012087) #11	TNFRSF6B (ENSOARG00020003178)	RTEL1 (ENSOARG00020003210) #12	STMN3 (ENSOARG00020003323) #13	GMEB2 (ENSOARG00020003375) #14	FNDC11 (ENSOARG00020003472) #16	SRMS (ENSOARG00020003498) #17	PTK6 (ENSOARG00020003662) #18	ENSOARG00020003728 #19	EEF1A2 (ENSOARG00020003758) #20	KCNQ2 (ENSOARG00020003802) #21	CHRNA4 (ENSOARG00020004285) #22	ARFGAP1 (ENSOARG00020004787) #24	BIRC7 (ENSOARG00020005025) #25	YTHDF1 (ENSOARG00020005076)	BHLHE23 (ENSOARG00020005128)	SLC17A9 (ENSOARG00020005151)	GID8 (ENSOARG00020005239)	TCFL5 (ENSOARG00020005326)	COL9A3 (ENSOARG00020005388)	OGFR (ENSOARG00020005520)	MRGBP (ENSOARG00020005556)	NTSR1 (ENSOARG00020005581)	GATA5 (ENSOARG00020005701)	RBBP8NL (ENSOARG00020005734)	CABLES2 (ENSOARG00020005784)	RPS21 (ENSOARG00020005843)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1193	ZBTB46 (ENSMMSG00000022854) #8	SLC2A4RG (ENSMMSG00000022847) #9	LIME1 (ENSMMSG00000022834)	ZGPAT (ENSMMSG00000022821) #10	ENSMMSG00000022813 #11	TNFRSF6B (ENSMMSG00000022803)	RTEL1 (ENSMMSG00000022788) #12	STMN3 (ENSMMSG00000022766) #13	GMEB2 (ENSMMSG00000022745) #14	FNDC11 (ENSMMSG00000022733) #16	SRMS (ENSMMSG00000022723) #17	PTK6 (ENSMMSG00000022709) #18	PPDPF (ENSMMSG00000022705) #19	EEF1A2 (ENSMMSG00000022690) #20	KCNQ2 (ENSMMSG00000022085) #21	CHRNA4 (ENSMMSG00000021992) #22	ENSMMSG00000021796	ARFGAP1 (ENSMMSG00000021515) #24	BIRC7 (ENSMMSG00000021444) #25	YTHDF1 (ENSMMSG00000021404)	BHLHE23 (ENSMMSG00000021377)	SLC17A9 (ENSMMSG00000021281)	GID8 (ENSMMSG00000021243)	DIDO1 (ENSMMSG00000021079)	ENSMMSG00000021045	TCFL5 (ENSMMSG00000021020)	ENSMMSG00000020900	OGFR (ENSMMSG00000020874)	MRGBP (ENSMMSG00000020847)	NTSR1 (ENSMMSG00000020812)	ENSMMSG00000020792
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000155572	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.k.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C
Arabian camel	MODERN SPECIES	10	TPD52L2 (ENSCDRG00005010759)	ZBTB46 (ENSCDRG00005010623) #8	ENSCDRG00005010553 #9	LIME1 (ENSCDRG00005010477)	ZGPAT (ENSCDRG00005010433) #10	ARFRP1 (ENSCDRG00005010277) #11	RTEL1 (ENSCDRG00005010018) #12	STMN3 (ENSCDRG00005009921) #13	GMEB2 (ENSCDRG00005009783) #14	FNDC11 (ENSCDRG00005009753) #16	SRMS (ENSCDRG00005009590) #17	ENSCDRG00005009530 #18	ENSCDRG00005009451 #19	EEF1A2 (ENSCDRG00005009396) #20	KCNQ2 (ENSCDRG00005009242) #21	CHRNA4 (ENSCDRG00005009073) #22	COL20A1 (ENSCDRG00005007791) #23	ARFGAP1 (ENSCDRG00005007544) #24	ENSCDRG00005007451	YTHDF1 (ENSCDRG00005007257)	BHLHE23 (ENSCDRG00005007231)	SLC17A9 (ENSCDRG00005007165)	GID8 (ENSCDRG00005007119)	ENSCDRG00005007053	TCFL5 (ENSCDRG00005006962)	ENSCDRG00005006839	OGFR (ENSCDRG00005006813)	MRGBP (ENSCDRG00005006775)	NTSR1 (ENSCDRG00005006734)	ENSCDRG00005006702	SLCO4A1 (ENSCDRG00005006674)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000028339	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.q.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.q.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.q.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694.e #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.q.b.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00960000192285
Giant Panda	MODERN SPECIES	4	ZBTB46 (ENSAMEG00000001783) #8	SLC2A4RG (ENSAMEG00000001776) #9	ENSAMEG00000001764	ZGPAT (ENSAMEG00000024713) #10	ARFRP1 (ENSAMEG00000001741) #11	TNFRSF6B (ENSAMEG00000031252)	RTEL1 (ENSAMEG00000001689) #12	STMN3 (ENSAMEG00000001672) #13	GMEB2 (ENSAMEG00000001647) #14	HELZ2 (ENSAMEG00000001622) #15	FNDC11 (ENSAMEG00000026205) #16	SRMS (ENSAMEG00000001582) #17	ENSAMEG00000024443 #19	EEF1A2 (ENSAMEG00000026845) #20	KCNQ2 (ENSAMEG00000001530) #21	CHRNA4 (ENSAMEG00000001515) #22	ENSAMEG00000017307 #24	ENSAMEG00000026916 #24	NKAIN4 (ENSAMEG00000017310)	BIRC7 (ENSAMEG00000017319) #25	YTHDF1 (ENSAMEG00000017323)	SLC17A9 (ENSAMEG00000017329)	GID8 (ENSAMEG00000017333)	DIDO1 (ENSAMEG00000017335)	ENSAMEG00000017341	COL9A3 (ENSAMEG00000017342)	ENSAMEG00000029718	ENSAMEG00000025015	SLCO4A1 (ENSAMEG00000023949)	ENSAMEG00000025108	GATA5 (ENSAMEG00000028627)
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	106	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694.f #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.q.b.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00400000022086.b.b
American black bear	MODERN SPECIES	959								ENSUAMG00000025224 #15	ENSUAMG00000025222 #15	FNDC11 (ENSUAMG00000025220) #16	SRMS (ENSUAMG00000025219) #17	PTK6 (ENSUAMG00000025217) #18	ENSUAMG00000025214 #19	EEF1A2 (ENSUAMG00000025211) #20	KCNQ2 (ENSUAMG00000024996) #21	CHRNA4 (ENSUAMG00000024994) #22	ENSUAMG00000024993	COL20A1 (ENSUAMG00000024976) #23	ARFGAP1 (ENSUAMG00000024971) #24
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.q.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00390000014718	ENSGT00940000160139
Ferret	MODERN SPECIES	236	SLC2A4RG (ENSMPUG00000008537) #9	LIME1 (ENSMPUG00000008523)	ARFRP1 (ENSMPUG00000008452) #11	ENSMPUG00000020178	RTEL1 (ENSMPUG00000008435) #12	STMN3 (ENSMPUG00000008430) #13	ENSMPUG00000008389	GMEB2 (ENSMPUG00000008374) #14	HELZ2 (ENSMPUG00000008361) #15	FNDC11 (ENSMPUG00000020177) #16	SRMS (ENSMPUG00000008349) #17	PTK6 (ENSMPUG00000008313) #18	PPDPF (ENSMPUG00000008301) #19	EEF1A2 (ENSMPUG00000008289) #20	KCNQ2 (ENSMPUG00000008202) #21	CHRNA4 (ENSMPUG00000008195) #22	ENSMPUG00000008149	ARFGAP1 (ENSMPUG00000008138) #24	BIRC7 (ENSMPUG00000008120) #25	YTHDF1 (ENSMPUG00000008111)	ENSMPUG00000008107	SLC17A9 (ENSMPUG00000008097)	GID8 (ENSMPUG00000008060)	DIDO1 (ENSMPUG00000008006)	ENSMPUG00000008000	COL9A3 (ENSMPUG00000007936)	ENSMPUG00000007934	MRGBP (ENSMPUG00000007912)	ENSMPUG00000007908	ENSMPUG00000007904	NTSR1 (ENSMPUG00000007899)
American mink	MODERN SPECIES	82	ZBTB46 (ENSNVIG00000019084) #8	SLC2A4RG (ENSNVIG00000019104) #9	ENSNVIG00000019119	ZGPAT (ENSNVIG00000019139) #10	ARFRP1 (ENSNVIG00000019161) #11	ENSNVIG00000019199	RTEL1 (ENSNVIG00000019209) #12	STMN3 (ENSNVIG00000019308) #13	GMEB2 (ENSNVIG00000019333) #14	HELZ2 (ENSNVIG00000019384) #15	FNDC11 (ENSNVIG00000019458) #16	SRMS (ENSNVIG00000019464) #17	PPDPF (ENSNVIG00000019474) #19	EEF1A2 (ENSNVIG00000019476) #20	KCNQ2 (ENSNVIG00000019509) #21	CHRNA4 (ENSNVIG00000019659) #22	ARFGAP1 (ENSNVIG00000019685) #24	BIRC7 (ENSNVIG00000019781) #25	YTHDF1 (ENSNVIG00000019799)	SLC17A9 (ENSNVIG00000019834)	GID8 (ENSNVIG00000019869)	ENSNVIG00000019894	ENSNVIG00000019943	COL9A3 (ENSNVIG00000019962)	MRGBP (ENSNVIG00000020047)	NTSR1 (ENSNVIG00000020055)	SLCO4A1 (ENSNVIG00000020066)	ENSNVIG00000020092	GATA5 (ENSNVIG00000020102)	RBBP8NL (ENSNVIG00000020118)	CABLES2 (ENSNVIG00000020141)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.a.a.q.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406.c #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f.c #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.a.a.q.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406.c #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Dingo	MODERN SPECIES	343	TPD52L2 (ENSCAFG00020001989)	ABHD16B (ENSCAFG00020001985) #7	ZBTB46 (ENSCAFG00020001979) #8	ENSCAFG00020001968 #9	ENSCAFG00020001962	ZGPAT (ENSCAFG00020001956) #10	ARFRP1 (ENSCAFG00020001953) #11	TNFRSF6B (ENSCAFG00020001946)	RTEL1 (ENSCAFG00020001919) #12	STMN3 (ENSCAFG00020001907) #13	GMEB2 (ENSCAFG00020001902) #14	FNDC11 (ENSCAFG00020001885) #16	SRMS (ENSCAFG00020001858) #17	EEF1A2 (ENSCAFG00020001844) #20	KCNQ2 (ENSCAFG00020001486) #21	CHRNA4 (ENSCAFG00020001385) #22	ENSCAFG00020001328	ARFGAP1 (ENSCAFG00020001313) #24	ENSCAFG00020001259	BIRC7 (ENSCAFG00020001235) #25	ENSCAFG00020001219	YTHDF1 (ENSCAFG00020001214)	BHLHE23 (ENSCAFG00020001194)	SLC17A9 (ENSCAFG00020001162)	GID8 (ENSCAFG00020001150)	ENSCAFG00020001136	ENSCAFG00020001124	TCFL5 (ENSCAFG00020001087)	ENSCAFG00020001056	ENSCAFG00020001048	MRGBP (ENSCAFG00020001037)
Dog	MODERN SPECIES	16	ZGPAT (ENSCAFG00845018472) #10	ARFRP1 (ENSCAFG00845018384) #11	TNFRSF6B (ENSCAFG00845018187)	ENSCAFG00845017564 #12	ENSCAFG00845017453 #13	ENSCAFG00845017271 #16	ENSCAFG00845017209 #17	ENSCAFG00845022791 #13	GMEB2 (ENSCAFG00845022265) #14	ENSCAFG00845022080 #15	FNDC11 (ENSCAFG00845022015) #16	ENSCAFG00845021922 #17	ENSCAFG00845021666 #19	EEF1A2 (ENSCAFG00845021542) #20	KCNQ2 (ENSCAFG00845021011) #21	CHRNA4 (ENSCAFG00845020832) #22	ENSCAFG00845020115	ARFGAP1 (ENSCAFG00845019425) #24	NKAIN4 (ENSCAFG00845019207)	ENSCAFG00845019116 #25	ENSCAFG00845018982	YTHDF1 (ENSCAFG00845018849)	BHLHE23 (ENSCAFG00845018744)	SLC17A9 (ENSCAFG00845018620)	GID8 (ENSCAFG00845018539)	DIDO1 (ENSCAFG00845018415)	TCFL5 (ENSCAFG00845018226)	COL9A3 (ENSCAFG00845018010)	ENSCAFG00845017856	MRGBP (ENSCAFG00845017766)	NTSR1 (ENSCAFG00845017702)
Red fox	MODERN SPECIES	108	TPD52L2 (ENSVVUG00000014997)	ZBTB46 (ENSVVUG00000015002) #8	SLC2A4RG (ENSVVUG00000015007) #9	ENSVVUG00000015009	ZGPAT (ENSVVUG00000015014) #10	ARFRP1 (ENSVVUG00000015040) #11	RTEL1 (ENSVVUG00000015049) #12	TNFRSF6B (ENSVVUG00000015153)	ENSVVUG00000015155 ##13	GMEB2 (ENSVVUG00000015156) #14	HELZ2 (ENSVVUG00000015158) #15	ENSVVUG00000015166 #17	FNDC11 (ENSVVUG00000015177) #16	EEF1A2 (ENSVVUG00000015184) #20	KCNQ2 (ENSVVUG00000015194) #21	CHRNA4 (ENSVVUG00000015205) #22	ENSVVUG00000015209	ARFGAP1 (ENSVVUG00000015255) #24	NKAIN4 (ENSVVUG00000015272)	ENSVVUG00000015273 #25	YTHDF1 (ENSVVUG00000015275)	ENSVVUG00000015283	SLC17A9 (ENSVVUG00000015289)	GID8 (ENSVVUG00000015314)	DIDO1 (ENSVVUG00000015321)	TCFL5 (ENSVVUG00000015386)	ENSVVUG00000015387	ENSVVUG00000015395	MRGBP (ENSVVUG00000015402)	NTSR1 (ENSVVUG00000015408)	SLCO4A1 (ENSVVUG00000015410)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	3									ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.q.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	2									ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.q.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	1									ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a.q.b #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
lion	MODERN SPECIES	3	SLC2A4RG (ENSPLOG00000020109) #9	LIME1 (ENSPLOG00000020054)	ZGPAT (ENSPLOG00000020018) #10	ARFRP1 (ENSPLOG00000019876) #11	TNFRSF6B (ENSPLOG00000019829)	RTEL1 (ENSPLOG00000018546) #12	STMN3 (ENSPLOG00000018304) #13	GMEB2 (ENSPLOG00000018224) #14	HELZ2 (ENSPLOG00000018197) #15	FNDC11 (ENSPLOG00000018176) #16	SRMS (ENSPLOG00000018151) #17	PTK6 (ENSPLOG00000018089) #18	ENSPLOG00000018035 #19	EEF1A2 (ENSPLOG00000017979) #20	KCNQ2 (ENSPLOG00000017884) #21	CHRNA4 (ENSPLOG00000017836) #22	ENSPLOG00000017179	ARFGAP1 (ENSPLOG00000016829) #24	BIRC7 (ENSPLOG00000016713) #25	YTHDF1 (ENSPLOG00000016671)	BHLHE23 (ENSPLOG00000016645)	SLC17A9 (ENSPLOG00000016527)	GID8 (ENSPLOG00000016492)	DIDO1 (ENSPLOG00000016452)	TCFL5 (ENSPLOG00000016420)	COL9A3 (ENSPLOG00000016182)	OGFR (ENSPLOG00000016077)	MRGBP (ENSPLOG00000016026)	NTSR1 (ENSPLOG00000015983)	SLCO4A1 (ENSPLOG00000015950)	GATA5 (ENSPLOG00000015886)
leopard	MODERN SPECIES	105	ENSPPRG00000023425 #7	ZBTB46 (ENSPPRG00000023561) #8	SLC2A4RG (ENSPPRG00000023998) #9	ZGPAT (ENSPPRG00000024151) #10	ARFRP1 (ENSPPRG00000024309) #11	TNFRSF6B (ENSPPRG00000024773)	STMN3 (ENSPPRG00000014885) #13	GMEB2 (ENSPPRG00000014369) #14	ENSPPRG00000012697	HELZ2 (ENSPPRG00000012585) #15	SRMS (ENSPPRG00000009301) #17	PTK6 (ENSPPRG00000009136) #18	ENSPPRG00000008829 #19	EEF1A2 (ENSPPRG00000008644) #20	KCNQ2 (ENSPPRG00000007632) #21	CHRNA4 (ENSPPRG00000004145) #22	ENSPPRG00000003520	ARFGAP1 (ENSPPRG00000022748) #24	ENSPPRG00000023805	BIRC7 (ENSPPRG00000024060) #25	YTHDF1 (ENSPPRG00000020805)	SLC17A9 (ENSPPRG00000019375)	GID8 (ENSPPRG00000015995)	ENSPPRG00000015125	ENSPPRG00000010546	COL9A3 (ENSPPRG00000010419)	ENSPPRG00000009399	MRGBP (ENSPPRG00000008348)	NTSR1 (ENSPPRG00000007852)	SLCO4A1 (ENSPPRG00000007640)	GATA5 (ENSPPRG00000006784)
Tiger	MODERN SPECIES	253	C20orf204 (ENSPTIG00000010349)	PRPF6 (ENSPTIG00000011184)	SAMD10 (ENSPTIG00000013488)	ZNF512B (ENSPTIG00000014076)	DNAJC5 (ENSPTIG00000017196)	TPD52L2 (ENSPTIG00000017852)	ZBTB46 (ENSPTIG00000018929) #8	ZGPAT (ENSPTIG00000020325) #10	ARFRP1 (ENSPTIG00000021097) #11	STMN3 (ENSPTIG00000015482) #13	GMEB2 (ENSPTIG00000016000) #14	ENSPTIG00000018372 #15	PTK6 (ENSPTIG00000018694) #18	ENSPTIG00000019343 #19	EEF1A2 (ENSPTIG00000019573) #20	CHRNA4 (ENSPTIG00000006707) #22	ARFGAP1 (ENSPTIG00000015171) #24	ENSPTIG00000015596	BIRC7 (ENSPTIG00000016083) #25	YTHDF1 (ENSPTIG00000017355)	SLC17A9 (ENSPTIG00000018794)	GID8 (ENSPTIG00000019701)	ENSPTIG00000020540	ENSPTIG00000006278	NTSR1 (ENSPTIG00000009080)	ENSPTIG00000009938	CABLES2 (ENSPTIG00000011195)	ENSPTIG00000012625	ADRM1 (ENSPTIG00000012974)	OSBPL2 (ENSPTIG00000015979)	MTG2 (ENSPTIG00000018100)
Cat	MODERN SPECIES	2	ZBTB46 (ENSFCAG00000001175) #8	SLC2A4RG (ENSFCAG00000027250) #9	ENSFCAG00000044471	ENSFCAG00000001173 #10	ARFRP1 (ENSFCAG00000044777) #11	TNFRSF6B (ENSFCAG00000022732)	STMN3 (ENSFCAG00000031508) #13	GMEB2 (ENSFCAG00000031273) #14	HELZ2 (ENSFCAG00000008926) #15	FNDC11 (ENSFCAG00000006167) #16	SRMS (ENSFCAG00000008678) #17	PTK6 (ENSFCAG00000033150) #18	ENSFCAG00000024386 #19	EEF1A2 (ENSFCAG00000028726) #20	KCNQ2 (ENSFCAG00000008923) #21	CHRNA4 (ENSFCAG00000030656) #22	COL20A1 (ENSFCAG00000008920)	ARFGAP1 (ENSFCAG00000008919) #24	BIRC7 (ENSFCAG00000008918) #25	YTHDF1 (ENSFCAG00000008917)	BHLHE23 (ENSFCAG00000048281)	SLC17A9 (ENSFCAG00000025163)	GID8 (ENSFCAG00000045255)	DIDO1 (ENSFCAG00000015588)	TCFL5 (ENSFCAG00000024469)	COL9A3 (ENSFCAG00000001332)	ENSFCAG00000043168	MRGBP (ENSFCAG00000028818)	NTSR1 (ENSFCAG00000000383)	SLCO4A1 (ENSFCAG00000000381)	GATA5 (ENSFCAG00000001058)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000028339	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Equus	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Horse	MODERN SPECIES	14	SLC2A4RG (ENSECAG00000020369) #9	LIME1 (ENSECAG00000019698)	ZGPAT (ENSECAG00000019674) #10	ARFRP1 (ENSECAG00000019636) #11	TNFRSF6B (ENSECAG00000032390)	RTEL1 (ENSECAG00000021707) #12	STMN3 (ENSECAG00000021320) #13	GMEB2 (ENSECAG00000019377) #14	HELZ2 (ENSECAG00000013636) #15	FNDC11 (ENSECAG00000004861) #16	SRMS (ENSECAG00000053306) #17	PTK6 (ENSECAG00000009935) #18	ENSECAG00000009413 #19	EEF1A2 (ENSECAG00000025109) #20	KCNQ2 (ENSECAG00000020526) #21	CHRNA4 (ENSECAG00000016151) #22	COL20A1 (ENSECAG00000033282) #23	ARFGAP1 (ENSECAG00000038435) #24	NKAIN4 (ENSECAG00000039065)	BIRC7 (ENSECAG00000020286) #25	YTHDF1 (ENSECAG00000019475)	BHLHE23 (ENSECAG00000031478)	SLC17A9 (ENSECAG00000012252)	GID8 (ENSECAG00000011992)	DIDO1 (ENSECAG00000007150)	ENSECAG00000004464	ENSECAG00000056017	COL9A3 (ENSECAG00000023357)	OGFR (ENSECAG00000021836)	MRGBP (ENSECAG00000021079)	NTSR1 (ENSECAG00000019337)
Donkey	MODERN SPECIES	6	ZBTB46 (ENSEASG00005023155) #8	SLC2A4RG (ENSEASG00005023157) #9	LIME1 (ENSEASG00005023158)	ENSEASG00005030827 #10	ARFRP1 (ENSEASG00005023160) #11	TNFRSF6B (ENSEASG00005029941)	RTEL1 (ENSEASG00005023163) #12	STMN3 (ENSEASG00005023166) #13	GMEB2 (ENSEASG00005023167) #14	FNDC11 (ENSEASG00005028136) #16	SRMS (ENSEASG00005023170) #17	PTK6 (ENSEASG00005023171) #18	ENSEASG00005023172 #19	EEF1A2 (ENSEASG00005037380) #20	KCNQ2 (ENSEASG00005023175) #21	CHRNA4 (ENSEASG00005023176) #22	ENSEASG00005023177	ARFGAP1 (ENSEASG00005023181) #24	NKAIN4 (ENSEASG00005023184)	BIRC7 (ENSEASG00005023185) #25	YTHDF1 (ENSEASG00005023186)	SLC17A9 (ENSEASG00005023189)	GID8 (ENSEASG00005023190)	ENSEASG00005023191	ENSEASG00005023192	ENSEASG00005036171	ENSEASG00005034582	OGFR (ENSEASG00005023195)	MRGBP (ENSEASG00005026220)	NTSR1 (ENSEASG00005023199)	SLCO4A1 (ENSEASG00005023200)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000028339	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Megabat	MODERN SPECIES	3682															ENSPVAG00000014114	CHRNA4 (ENSPVAG00000014109) #22	COL20A1 (ENSPVAG00000014108) #23	ARFGAP1 (ENSPVAG00000014107) #24
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	15	ZBTB46 (ENSRFEG00010012264) #8	ENSRFEG00010012466	ENSRFEG00010012620 #10	ARFRP1 (ENSRFEG00010012720) #11	TNFRSF6B (ENSRFEG00010012819)	RTEL1 (ENSRFEG00010012863) #12	STMN3 (ENSRFEG00010012988) #13	GMEB2 (ENSRFEG00010013014) #14	HELZ2 (ENSRFEG00010013192) #15	FNDC11 (ENSRFEG00010013271) #16	SRMS (ENSRFEG00010013295) #17	PTK6 (ENSRFEG00010013418) #18	PPDPF (ENSRFEG00010013473) #19	EEF1A2 (ENSRFEG00010013568) #20	KCNQ2 (ENSRFEG00010013657) #21	CHRNA4 (ENSRFEG00010014002) #22	ENSRFEG00010014109	ARFGAP1 (ENSRFEG00010015968) #24	NKAIN4 (ENSRFEG00010016435)	BIRC7 (ENSRFEG00010016554) #25	YTHDF1 (ENSRFEG00010016741)	BHLHE23 (ENSRFEG00010016835)	SLC17A9 (ENSRFEG00010016863)	GID8 (ENSRFEG00010017068)	ENSRFEG00010017096	TCFL5 (ENSRFEG00010017418)	ENSRFEG00010017452	OGFR (ENSRFEG00010017492)	MRGBP (ENSRFEG00010017510)	NTSR1 (ENSRFEG00010017545)	SLCO4A1 (ENSRFEG00010017567)
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159329 #22
Common shrew	MODERN SPECIES	159																CHRNA4 (ENSSARG00000008070) #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	10405																CHRNA4 (ENSEEUG00000015849) #22
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	78	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	86	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	88	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00940000160139
Elephant	MODERN SPECIES	52	ABHD16B (ENSLAFG00000004457) #7	ZBTB46 (ENSLAFG00000012490) #8	SLC2A4RG (ENSLAFG00000012489) #9	ENSLAFG00000010687 #10	ARFRP1 (ENSLAFG00000010685) #11	TNFRSF6B (ENSLAFG00000032756)	RTEL1 (ENSLAFG00000021665) #12	STMN3 (ENSLAFG00000025727) #13	GMEB2 (ENSLAFG00000012335) #14	ENSLAFG00000006397 #15	FNDC11 (ENSLAFG00000006392) #16	PTK6 (ENSLAFG00000016890) #18	PPDPF (ENSLAFG00000026496) #19	EEF1A2 (ENSLAFG00000004005) #20	KCNQ2 (ENSLAFG00000027679) #21	CHRNA4 (ENSLAFG00000005402) #22	ENSLAFG00000027493	ARFGAP1 (ENSLAFG00000015786) #24	NKAIN4 (ENSLAFG00000013477)	BIRC7 (ENSLAFG00000031254) #25	YTHDF1 (ENSLAFG00000008884)	ENSLAFG00000002108	GID8 (ENSLAFG00000014167)	DIDO1 (ENSLAFG00000005671)	TCFL5 (ENSLAFG00000014903)	ENSLAFG00000010016	ENSLAFG00000022322	MRGBP (ENSLAFG00000018296)	NTSR1 (ENSLAFG00000008862)	SLCO4A1 (ENSLAFG00000007102)	GATA5 (ENSLAFG00000002741)
Hyrax	MODERN SPECIES	315																CHRNA4 (ENSPCAG00000015540) #22
Tenrec	MODERN SPECIES	16520																ENSETEG00000002989 #22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	215	ENSGT00940000155572	ENSGT00940000162803 #7	ENSGT00390000012450	ENSGT00940000158060 #8	ENSGT00940000162832 #9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00390000009113.a.a #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22
Armadillo	MODERN SPECIES	1537	ENSDNOG00000014930	ABHD16B (ENSDNOG00000041507) #7	ENSDNOG00000032707	ZBTB46 (ENSDNOG00000045164) #8	SLC2A4RG (ENSDNOG00000045627) #9	ENSDNOG00000036205	ZGPAT (ENSDNOG00000025874) #10	ENSDNOG00000001531 #11	RTEL1 (ENSDNOG00000046492) #12	STMN3 (ENSDNOG00000049349) #13	GMEB2 (ENSDNOG00000041843) #14	HELZ2 (ENSDNOG00000017809) #15	PPDPF (ENSDNOG00000048593) #19	EEF1A2 (ENSDNOG00000013873) #20	ENSDNOG00000047869 #21	CHRNA4 (ENSDNOG00000043797) #22
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00940000164879	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b.f ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00940000164879	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b.e.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00940000164879	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b.e.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00510000050080	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00940000164879	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b.e.b.b.a ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532.b	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT00390000014718
koala	MODERN SPECIES	11	ENSPCIG00000017921	ZGPAT (ENSPCIG00000017922) #10	ARFRP1 (ENSPCIG00000017923) #11	TNFRSF6B (ENSPCIG00000017924)	RTEL1 (ENSPCIG00000017939) #12	STMN3 (ENSPCIG00000017964) #13	GMEB2 (ENSPCIG00000017965) #14	HELZ2 (ENSPCIG00000017966) #15	ENSPCIG00000017969	FNDC11 (ENSPCIG00000017970) #16	SRMS (ENSPCIG00000017972) #17	PTK6 (ENSPCIG00000017976) #18	ENSPCIG00000032699 ##19	EEF1A2 (ENSPCIG00000017980) #20	KCNQ2 (ENSPCIG00000017983) #21	CHRNA4 (ENSPCIG00000017131) #22	ENSPCIG00000017140	ENSPCIG00000034787	ARFGAP1 (ENSPCIG00000017160) #24	ENSPCIG00000017165	ENSPCIG00000017168 #25	YTHDF1 (ENSPCIG00000017170)	BHLHE23 (ENSPCIG00000017180)	SLC17A9 (ENSPCIG00000017181)	GID8 (ENSPCIG00000017182)	ENSPCIG00000017185	ENSPCIG00000036461	ENSPCIG00000017186	ENSPCIG00000037454	ENSPCIG00000017187	ENSPCIG00000017189
Common wonbat	MODERN SPECIES	35	ENSVURG00010014025	ZGPAT (ENSVURG00010014029) #10	ARFRP1 (ENSVURG00010014035) #11	TNFRSF6B (ENSVURG00010014053)	RTEL1 (ENSVURG00010014066) #12	STMN3 (ENSVURG00010014123) #13	GMEB2 (ENSVURG00010014132) #14	HELZ2 (ENSVURG00010014199) #15	ENSVURG00010014893	FNDC11 (ENSVURG00010014907) #16	SRMS (ENSVURG00010014915) #17	PTK6 (ENSVURG00010014923) #18	ENSVURG00010014930 ##19	EEF1A2 (ENSVURG00010014938) #20	KCNQ2 (ENSVURG00010015014) #21	CHRNA4 (ENSVURG00010016329) #22	ENSVURG00010016978	ENSVURG00010017017 #24	ENSVURG00010017663	ENSVURG00010017671 #25	YTHDF1 (ENSVURG00010017681)	BHLHE23 (ENSVURG00010017694)	SLC17A9 (ENSVURG00010017698)	GID8 (ENSVURG00010017708)	ENSVURG00010017716	ENSVURG00010017730	ENSVURG00010017735	MRGBP (ENSVURG00010017741)	NTSR1 (ENSVURG00010017743)	SLCO4A1 (ENSVURG00010017751)	ENSVURG00010017753
Wallaby	MODERN SPECIES	1057																CHRNA4 (ENSMEUG00000006728) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	ZBTB46 (ENSSHAG00000017616) #8	SLC2A4RG (ENSSHAG00000022555) #9	ZGPAT (ENSSHAG00000017828) #10	TNFRSF6B (ENSSHAG00000031393)	ARFRP1 (ENSSHAG00000024589) #11	RTEL1 (ENSSHAG00000017874) #12	GMEB2 (ENSSHAG00000023960) #14	ENSSHAG00000018163 #15	ENSSHAG00000028470	FNDC11 (ENSSHAG00000018231) #16	SRMS (ENSSHAG00000018268) #17	PTK6 (ENSSHAG00000018321) #18	ENSSHAG00000018338 ##19	EEF1A2 (ENSSHAG00000018414) #20	KCNQ2 (ENSSHAG00000000392) #21	CHRNA4 (ENSSHAG00000005283) #22	ENSSHAG00000008158	ARFGAP1 (ENSSHAG00000008569) #24	NKAIN4 (ENSSHAG00000009407)	ENSSHAG00000010237 #25	YTHDF1 (ENSSHAG00000010430)	BHLHE23 (ENSSHAG00000008128)	SLC17A9 (ENSSHAG00000008884)	DIDO1 (ENSSHAG00000009621)	TCFL5 (ENSSHAG00000009928)	ENSSHAG00000025084	ENSSHAG00000010685	NTSR1 (ENSSHAG00000025949)	SLCO4A1 (ENSSHAG00000007017)	GATA5 (ENSSHAG00000012125)	ENSSHAG00000013047
Opossum	MODERN SPECIES		ENSMODG00000047016	ZGPAT (ENSMODG00000017016) #10	ARFRP1 (ENSMODG00000017011) #11	TNFRSF6B (ENSMODG00000051538)	RTEL1 (ENSMODG00000017003) #12	STMN3 (ENSMODG00000016978) #13	GMEB2 (ENSMODG00000016974) #14	ENSMODG00000016966 #15	ENSMODG00000016904	FNDC11 (ENSMODG00000036893) #16	SRMS (ENSMODG00000016887) #17	PTK6 (ENSMODG00000016881) #18	ENSMODG00000016871 ##19	EEF1A2 (ENSMODG00000016868) #20	KCNQ2 (ENSMODG00000016863) #21	CHRNA4 (ENSMODG00000016860) #22	ENSMODG00000016855	ENSMODG00000046551	ARFGAP1 (ENSMODG00000016848) #24	ENSMODG00000016845	ENSMODG00000016844 #25	YTHDF1 (ENSMODG00000016842)	BHLHE23 (ENSMODG00000023267)	SLC17A9 (ENSMODG00000016838)	GID8 (ENSMODG00000016835)	DIDO1 (ENSMODG00000016832)	TCFL5 (ENSMODG00000016827)	ENSMODG00000016823	ENSMODG00000043896	ENSMODG00000016803	NTSR1 (ENSMODG00000016798)
Platypus	MODERN SPECIES	19	ENSOANG00000042451	ENSOANG00000047371	ENSOANG00000004918	RGS19 (ENSOANG00000050487)	ENSOANG00000046150	OPRL1 (ENSOANG00000050101)	NPBWR2 (ENSOANG00000004915)	MYT1 (ENSOANG00000004914)	PCMTD2 (ENSOANG00000004913)	ENSOANG00000037370	SRMS (ENSOANG00000004911) #17	PTK6 (ENSOANG00000004910) #18	ENSOANG00000004909 ##19	EEF1A2 (ENSOANG00000038015) #20	KCNQ2 (ENSOANG00000003731) #21	CHRNA4 (ENSOANG00000003725) #22	ENSOANG00000003728	ENSOANG00000003727	ARFGAP1 (ENSOANG00000045856) #24	ENSOANG00000003724	ENSOANG00000031992 #25	YTHDF1 (ENSOANG00000003723)	SLC17A9 (ENSOANG00000004970)	GID8 (ENSOANG00000004972)	ENSOANG00000004973	TCFL5 (ENSOANG00000004974)	ENSOANG00000051322	ENSOANG00000004976	MRGBP (ENSOANG00000050356)	NTSR1 (ENSOANG00000004978)	SLCO4A1 (ENSOANG00000004979)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000164164	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Aves	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01020000230412.B.b.a	ENSGT00940000159165	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Golden eagle	MODERN SPECIES	19	PRPF6 (ENSACCG00020001251)	ENSACCG00020001276	ENSACCG00020001285	SOX18 (ENSACCG00020001300)	TCEA2 (ENSACCG00020001314)	RGS19 (ENSACCG00020001333)	OPRL1 (ENSACCG00020001346)	NPBWR2 (ENSACCG00020001357)	MYT1 (ENSACCG00020001386)	PCMTD2 (ENSACCG00020001449)	ENSACCG00020001479	SRMS (ENSACCG00020001497) #17	ENSACCG00020001516 ##19	EEF1A2 (ENSACCG00020001531) #20	KCNQ2 (ENSACCG00020001545) #21	CHRNA4 (ENSACCG00020001562) #22	COL20A1 (ENSACCG00020001583) #23	ENSACCG00020001634	ARFGAP1 (ENSACCG00020001667) #24	NKAIN4 (ENSACCG00020001746)	ENSACCG00020001773	YTHDF1 (ENSACCG00020001782)	BHLHE23 (ENSACCG00020001799)	SLC17A9 (ENSACCG00020001822)	GID8 (ENSACCG00020001847)	DIDO1 (ENSACCG00020001862)	TCFL5 (ENSACCG00020001900)	OGFR (ENSACCG00020001936)	MRGBP (ENSACCG00020001964)	NTSR1 (ENSACCG00020001989)	SLCO4A1 (ENSACCG00020002023)
Kakapo	MODERN SPECIES	5	SOX18 (ENSSHBG00005012412)	TCEA2 (ENSSHBG00005012396)	RGS19 (ENSSHBG00005012387)	OPRL1 (ENSSHBG00005012373)	NPBWR2 (ENSSHBG00005012364)	MYT1 (ENSSHBG00005012341)	ENSSHBG00005012318	PCMTD2 (ENSSHBG00005012304)	ENSSHBG00005012288	ENSSHBG00005012265	ENSSHBG00005012225	SRMS (ENSSHBG00005012187) #17	ENSSHBG00005012166 ##19	EEF1A2 (ENSSHBG00005012141) #20	KCNQ2 (ENSSHBG00005012054) #21	CHRNA4 (ENSSHBG00005012009) #22	ENSSHBG00005011166	ENSSHBG00005010860	ARFGAP1 (ENSSHBG00005010826) #24	ENSSHBG00005010765	BIRC7 (ENSSHBG00005010714) #25	YTHDF1 (ENSSHBG00005010688)	BHLHE23 (ENSSHBG00005010567)	SLC17A9 (ENSSHBG00005010502)	GID8 (ENSSHBG00005000701)	DIDO1 (ENSSHBG00005017886)	ENSSHBG00005017876	ENSSHBG00005017865	OGFR (ENSSHBG00005017855)	MRGBP (ENSSHBG00005017850)	NTSR1 (ENSSHBG00005017846)
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Great tit	MODERN SPECIES	12	ZNF512B (ENSPMJG00000007165)	SAMD10 (ENSPMJG00000007166)	PRPF6 (ENSPMJG00000007168)	ENSPMJG00000007169	SOX18 (ENSPMJG00000007194)	TCEA2 (ENSPMJG00000007198)	RGS19 (ENSPMJG00000007203)	OPRL1 (ENSPMJG00000007207)	NPBWR2 (ENSPMJG00000007212)	MYT1 (ENSPMJG00000007233)	ENSPMJG00000007240	SRMS (ENSPMJG00000007243) #17	ENSPMJG00000007245 ##19	EEF1A2 (ENSPMJG00000007257) #20	KCNQ2 (ENSPMJG00000007262) #21	CHRNA4 (ENSPMJG00000007280) #22	ENSPMJG00000007283	ENSPMJG00000007294	ARFGAP1 (ENSPMJG00000007302) #24	NKAIN4 (ENSPMJG00000007318)	BIRC7 (ENSPMJG00000007326) #25	YTHDF1 (ENSPMJG00000007329)	BHLHE23 (ENSPMJG00000007353)	SLC17A9 (ENSPMJG00000007357)	GID8 (ENSPMJG00000007358)	DIDO1 (ENSPMJG00000007359)	TCFL5 (ENSPMJG00000007361)	OGFR (ENSPMJG00000007365)	MRGBP (ENSPMJG00000007370)	NTSR1 (ENSPMJG00000007373)	SLCO4A1 (ENSPMJG00000007375)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Flycatcher	MODERN SPECIES	12	ENSFALG00000010326	ENSFALG00000027805	SOX18 (ENSFALG00000010339)	ENSFALG00000024638	TCEA2 (ENSFALG00000010343)	RGS19 (ENSFALG00000010348)	OPRL1 (ENSFALG00000010352)	NPBWR2 (ENSFALG00000014956)	MYT1 (ENSFALG00000010354)	ENSFALG00000010359	ENSFALG00000010362	SRMS (ENSFALG00000010370) #17	ENSFALG00000028509 ##19	EEF1A2 (ENSFALG00000010382) #20	KCNQ2 (ENSFALG00000010396) #21	CHRNA4 (ENSFALG00000010418) #22	ENSFALG00000010438	ENSFALG00000010451	ARFGAP1 (ENSFALG00000026353) #24	NKAIN4 (ENSFALG00000010455)	BIRC7 (ENSFALG00000010458) #25	YTHDF1 (ENSFALG00000010463)	BHLHE23 (ENSFALG00000010468)	SLC17A9 (ENSFALG00000010473)	GID8 (ENSFALG00000010483)	DIDO1 (ENSFALG00000010488)	TCFL5 (ENSFALG00000024225)	ENSFALG00000010500	OGFR (ENSFALG00000025576)	MRGBP (ENSFALG00000028338)	ENSFALG00000026281
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Zebra finch	MODERN SPECIES	13	PRPF6 (ENSTGUG00000007221)	ENSTGUG00000022947	SOX18 (ENSTGUG00000007265)	TCEA2 (ENSTGUG00000007270)	RGS19 (ENSTGUG00000027981)	OPRL1 (ENSTGUG00000026051)	NPBWR2 (ENSTGUG00000007312)	ENSTGUG00000023865	MYT1 (ENSTGUG00000007315)	ENSTGUG00000007380	SRMS (ENSTGUG00000007405) #17	ENSTGUG00000007418 ##19	EEF1A2 (ENSTGUG00000007419) #20	ENSTGUG00000021626	KCNQ2 (ENSTGUG00000007434) #21	CHRNA4 (ENSTGUG00000007453) #22	ENSTGUG00000007458	ENSTGUG00000007511	ARFGAP1 (ENSTGUG00000007518) #24	NKAIN4 (ENSTGUG00000007547)	BIRC7 (ENSTGUG00000007560) #25	YTHDF1 (ENSTGUG00000007565)	BHLHE23 (ENSTGUG00000007576)	SLC17A9 (ENSTGUG00000007577)	GID8 (ENSTGUG00000027933)	DIDO1 (ENSTGUG00000007595)	TCFL5 (ENSTGUG00000022221)	COL9A3 (ENSTGUG00000007624)	OGFR (ENSTGUG00000022732)	MRGBP (ENSTGUG00000007684)	NTSR1 (ENSTGUG00000029344)
Common canary	MODERN SPECIES	21	SAMD10 (ENSSCAG00000014512)	PRPF6 (ENSSCAG00000014517)	ENSSCAG00000014527	ENSSCAG00000014539	TCEA2 (ENSSCAG00000014543)	RGS19 (ENSSCAG00000014553)	OPRL1 (ENSSCAG00000014557)	NPBWR2 (ENSSCAG00000014560)	MYT1 (ENSSCAG00000014565)	PCMTD2 (ENSSCAG00000014584)	ENSSCAG00000014590	SRMS (ENSSCAG00000014600) #17	ENSSCAG00000014605 ##19	EEF1A2 (ENSSCAG00000014611) #20	KCNQ2 (ENSSCAG00000014634) #21	CHRNA4 (ENSSCAG00000014702) #22	ENSSCAG00000014712	ENSSCAG00000014739	ARFGAP1 (ENSSCAG00000014752) #24	NKAIN4 (ENSSCAG00000014769)	BIRC7 (ENSSCAG00000014776) #25	YTHDF1 (ENSSCAG00000014786)	BHLHE23 (ENSSCAG00000014796)	SLC17A9 (ENSSCAG00000014804)	GID8 (ENSSCAG00000014826)	DIDO1 (ENSSCAG00000014834)	TCFL5 (ENSSCAG00000014842)	OGFR (ENSSCAG00000014846)	MRGBP (ENSSCAG00000014854)	NTSR1 (ENSSCAG00000014863)	SLCO4A1 (ENSSCAG00000014874)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	40	SAMD10 (ENSGFOG00000000386)	PRPF6 (ENSGFOG00000000357)	ENSGFOG00000000341	SOX18 (ENSGFOG00000000332)	TCEA2 (ENSGFOG00000000324)	RGS19 (ENSGFOG00000011257)	OPRL1 (ENSGFOG00000011255)	NPBWR2 (ENSGFOG00000011252)	MYT1 (ENSGFOG00000011242)	PCMTD2 (ENSGFOG00000011236)	ENSGFOG00000011225	SRMS (ENSGFOG00000011218) #17	ENSGFOG00000011211 ##19	EEF1A2 (ENSGFOG00000011206) #20	KCNQ2 (ENSGFOG00000010012) #21	CHRNA4 (ENSGFOG00000009966) #22	ENSGFOG00000009897	ENSGFOG00000009879	ARFGAP1 (ENSGFOG00000009862) #24	NKAIN4 (ENSGFOG00000009843)	BIRC7 (ENSGFOG00000009835) #25	YTHDF1 (ENSGFOG00000009828)	SLC17A9 (ENSGFOG00000009808)	GID8 (ENSGFOG00000009803)	DIDO1 (ENSGFOG00000009796)	TCFL5 (ENSGFOG00000009771)	ENSGFOG00000009753	OGFR (ENSGFOG00000009747)	MRGBP (ENSGFOG00000009739)	NTSR1 (ENSGFOG00000009733)	ENSGFOG00000009731
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01020000230412.B.b.a	ENSGT00940000159165	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT01020000230412.B.b.a	ENSGT00940000159165	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Duck	MODERN SPECIES	12	NFATC2 (ENSAPLG00000007259)	ATP9A (ENSAPLG00000006598)	ENSAPLG00000028344	PRPF6 (ENSAPLG00000015219)	TCEA2 (ENSAPLG00000010208)	RGS19 (ENSAPLG00000006136)	OPRL1 (ENSAPLG00000026067)	NPBWR2 (ENSAPLG00000011667)	MYT1 (ENSAPLG00000007386)	PCMTD2 (ENSAPLG00000007753)	ENSAPLG00000007917	SRMS (ENSAPLG00000008178) #17	ENSAPLG00000020848	EEF1A2 (ENSAPLG00000008691) #20	KCNQ2 (ENSAPLG00000008262) #21	CHRNA4 (ENSAPLG00000007776) #22	BIRC7 (ENSAPLG00000006107) #25	ENSAPLG00000007141	ENSAPLG00000006994	ARFGAP1 (ENSAPLG00000006416) #24	NKAIN4 (ENSAPLG00000006143)	YTHDF1 (ENSAPLG00000005985)	SLC17A9 (ENSAPLG00000005312)	GID8 (ENSAPLG00000005405)	ENSAPLG00000028484	ENSAPLG00000003283	ENSAPLG00000016892	ENSAPLG00000003290	OGFR (ENSAPLG00000028652)	MRGBP (ENSAPLG00000029735)	SLCO4A1 (ENSAPLG00000003398)
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	10	SAMD10 (ENSABRG00000006601)	PRPF6 (ENSABRG00000006592)	ENSABRG00000006575	SOX18 (ENSABRG00000006568)	TCEA2 (ENSABRG00000006563)	RGS19 (ENSABRG00000006556)	OPRL1 (ENSABRG00000006548)	NPBWR2 (ENSABRG00000006540)	MYT1 (ENSABRG00000006421)	PCMTD2 (ENSABRG00000006404)	ENSABRG00000006385	SRMS (ENSABRG00000006372) #17	ENSABRG00000006359 ##19	EEF1A2 (ENSABRG00000006342) #20	KCNQ2 (ENSABRG00000006307) #21	CHRNA4 (ENSABRG00000006273) #22	COL20A1 (ENSABRG00000006131) #23	ENSABRG00000006106	ARFGAP1 (ENSABRG00000006095) #24	NKAIN4 (ENSABRG00000006089)	BIRC7 (ENSABRG00000006077) #25	YTHDF1 (ENSABRG00000006064)	ENSABRG00000006061	ENSABRG00000006034	BHLHE23 (ENSABRG00000006028)	SLC17A9 (ENSABRG00000005983)	GID8 (ENSABRG00000005950)	DIDO1 (ENSABRG00000005803)	TCFL5 (ENSABRG00000005756)	OGFR (ENSABRG00000005699)	MRGBP (ENSABRG00000005636)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823
Japanese quail	MODERN SPECIES	12	PRPF6 (ENSCJPG00005003735)	ENSCJPG00005003720	SOX18 (ENSCJPG00005003719)	TCEA2 (ENSCJPG00005003707)	RGS19 (ENSCJPG00005003701)	OPRL1 (ENSCJPG00005003692)	NPBWR2 (ENSCJPG00005003691)	MYT1 (ENSCJPG00005003679)	PCMTD2 (ENSCJPG00005003675)	ENSCJPG00005003227	SRMS (ENSCJPG00005003222) #17	ENSCJPG00005003220 ##19	EEF1A2 (ENSCJPG00005003152) #20	ENSCJPG00005003150	KCNQ2 (ENSCJPG00005003135) #21	CHRNA4 (ENSCJPG00005003134) #22	COL20A1 (ENSCJPG00005003131) #23	ENSCJPG00005003130	ARFGAP1 (ENSCJPG00005003128) #24	NKAIN4 (ENSCJPG00005003127)	BIRC7 (ENSCJPG00005003125) #25	YTHDF1 (ENSCJPG00005003123)	BHLHB4 (ENSCJPG00005003114)	SLC17A9 (ENSCJPG00005003112)	GID8 (ENSCJPG00005003111)	DIDO1 (ENSCJPG00005003105)	TCFL5 (ENSCJPG00005003103)	ENSCJPG00005003099	OGFR (ENSCJPG00005003095)	MRGBP (ENSCJPG00005003093)	NTSR1 (ENSCJPG00005003089)
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159165	ENSGT00390000008161.a.a	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000163687	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823
Chicken	MODERN SPECIES	12	SAMD10 (ENSGALG00010022560)	PRPF6 (ENSGALG00010022553)	ENSGALG00010024999	ENSGALG00010022527	SOX18 (ENSGALG00010022524)	TCEA2 (ENSGALG00010023328)	RGS19 (ENSGALG00010023287)	OPRL1 (ENSGALG00010023269)	NPBWR2 (ENSGALG00010023256)	MYT1 (ENSGALG00010023242)	ENSGALG00010023230	PTK6 (ENSGALG00010023198) #17	PPDPF (ENSGALG00010023193) ##19	EEF1A2 (ENSGALG00010023180) #20	KCNQ2 (ENSGALG00010023174) #21	CHRNA4 (ENSGALG00010023162) #22	COL20A1 (ENSGALG00010023125) #23	DEPTOR (ENSGALG00010023069)	ARFGAP1 (ENSGALG00010023048) #24	NKAIN4 (ENSGALG00010024194)	BIRC7 (ENSGALG00010024168) #25	YTHDF1 (ENSGALG00010024141)	BHLHE23 (ENSGALG00010024982)	SLC17A9 (ENSGALG00010021754)	GID8 (ENSGALG00010024129)	DIDO1 (ENSGALG00010024124)	TCFL5 (ENSGALG00010022356)	COL9A3 (ENSGALG00010022320)	OGFR (ENSGALG00010022308)	MRGBP (ENSGALG00010022299)	NTSR1 (ENSGALG00010021510)
Turkey	MODERN SPECIES	14	TCFL5 (ENSMGAG00000021882)	ENSMGAG00000005875	ENSMGAG00000005862	DIDO1 (ENSMGAG00000006090)	ENSMGAG00000006105	ENSMGAG00000006123	ENSMGAG00000018427	ENSMGAG00000006134	YTHDF1 (ENSMGAG00000006139)	ENSMGAG00000006181	ENSMGAG00000006164 #25	ARFGAP1 (ENSMGAG00000021728) #24	ENSMGAG00000006200 #24	ENSMGAG00000006260	ENSMGAG00000006241	ENSMGAG00000006295 #22	ENSMGAG00000006326 #21	ENSMGAG00000006400 #20	ENSMGAG00000006490	ENSMGAG00000006462 #17	ENSMGAG00000006439 ##19	PCMTD2 (ENSMGAG00000022774)	ENSMGAG00000017792	ENSMGAG00000006569	ENSMGAG00000017542	ENSMGAG00000015542	ENSMGAG00000006627	ENSMGAG00000006663	ENSMGAG00000019718	ENSMGAG00000015543	ENSMGAG00000006634
African ostrich	MODERN SPECIES	150		TPD52L2 (ENSSCUG00000002860)	UCKL1 (ENSSCUG00000002855)	ZNF512B (ENSSCUG00000002848)	PRPF6 (ENSSCUG00000002847)	ENSSCUG00000002845	SOX18 (ENSSCUG00000002844)	TCEA2 (ENSSCUG00000002842)	OPRL1 (ENSSCUG00000002839)	NPBWR2 (ENSSCUG00000002838)	MYT1 (ENSSCUG00000002835)	ENSSCUG00000002834	SRMS (ENSSCUG00000002831) #17	EEF1A2 (ENSSCUG00000002827) #20	KCNQ2 (ENSSCUG00000002825) #21	CHRNA4 (ENSSCUG00000002822) #22	ENSSCUG00000002818	ENSSCUG00000002816	ENSSCUG00000002814	ENSSCUG00000002812	BIRC7 (ENSSCUG00000002807) #25	YTHDF1 (ENSSCUG00000002804)	SLC17A9 (ENSSCUG00000002797)	GID8 (ENSSCUG00000002796)	ENSSCUG00000002794	ENSSCUG00000002793	TCFL5 (ENSSCUG00000002792)	OGFR (ENSSCUG00000002790)	ENSSCUG00000002789	NTSR1 (ENSSCUG00000002787)	SLCO4A1 (ENSSCUG00000002786)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	59	PRPF6 (ENSCPRG00005006052)	SOX18 (ENSCPRG00005006047)	TCEA2 (ENSCPRG00005006035)	RGS19 (ENSCPRG00005006030)	LKAAEAR1 (ENSCPRG00005006028)	OPRL1 (ENSCPRG00005006014)	NPBWR2 (ENSCPRG00005006011)	MYT1 (ENSCPRG00005005983)	PCMTD2 (ENSCPRG00005005973)	ENSCPRG00005005964	SRMS (ENSCPRG00005005952) #17	PTK6 (ENSCPRG00005005947) #18	ENSCPRG00005005916 ##19	EEF1A2 (ENSCPRG00005005907) #20	KCNQ2 (ENSCPRG00005005896) #21	CHRNA4 (ENSCPRG00005005873) #22	ENSCPRG00005005854	ENSCPRG00005005795	ENSCPRG00005005780	ENSCPRG00005005771	YTHDF1 (ENSCPRG00005005766)	SLC17A9 (ENSCPRG00005005743)	GID8 (ENSCPRG00005005740)	DIDO1 (ENSCPRG00005005723)	TCFL5 (ENSCPRG00005005722)	ENSCPRG00005005699	NTSR1 (ENSCPRG00005005694)	ENSCPRG00005005684	SLCO4A1 (ENSCPRG00005005674)	GATA5 (ENSCPRG00005005663)	RBBP8NL (ENSCPRG00005005655)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00550000075016	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000163709 #23	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00550000075016	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218.u #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00550000075016	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218.u #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000164405.f	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	60	PRPF6 (ENSTMTG00000001076)	SOX18 (ENSTMTG00000001101)	TCEA2 (ENSTMTG00000001108)	RGS19 (ENSTMTG00000001128)	LKAAEAR1 (ENSTMTG00000001139)	OPRL1 (ENSTMTG00000001150)	NPBWR2 (ENSTMTG00000001158)	MYT1 (ENSTMTG00000001169)	PCMTD2 (ENSTMTG00000001197)	ENSTMTG00000001234	SRMS (ENSTMTG00000001362) #17	PTK6 (ENSTMTG00000001373) #18	ENSTMTG00000001392 ##19	EEF1A2 (ENSTMTG00000001400) #20	KCNQ2 (ENSTMTG00000001413) #21	CHRNA4 (ENSTMTG00000001423) #22	ENSTMTG00000001442	ENSTMTG00000001502	ARFGAP1 (ENSTMTG00000001592) #24	ENSTMTG00000001608	BIRC7 (ENSTMTG00000001619) #25	YTHDF1 (ENSTMTG00000001634)	BHLHE23 (ENSTMTG00000001651)	ENSTMTG00000001654	SLC17A9 (ENSTMTG00000001662)	GID8 (ENSTMTG00000001679)	DIDO1 (ENSTMTG00000001693)	TCFL5 (ENSTMTG00000001714)	OGFR (ENSTMTG00000001726)	MRGBP (ENSTMTG00000001733)	NTSR1 (ENSTMTG00000001739)
painted turtle	MODERN SPECIES	2365								MYT1 (ENSCPBG00000027220)	PCMTD2 (ENSCPBG00000027219)	ENSCPBG00000027217	SRMS (ENSCPBG00000027211) #17	PTK6 (ENSCPBG00000027206) #18	ENSCPBG00000027204 ##19	EEF1A2 (ENSCPBG00000027203) #20	KCNQ2 (ENSCPBG00000027200) #21	CHRNA4 (ENSCPBG00000027193) #22	ENSCPBG00000027192	ENSCPBG00000027191	ARFGAP1 (ENSCPBG00000027189) #24	ENSCPBG00000027188	BIRC7 (ENSCPBG00000027185) #25	YTHDF1 (ENSCPBG00000027183)	BHLHE23 (ENSCPBG00000027173)	ENSCPBG00000027172	SLC17A9 (ENSCPBG00000027170)	GID8 (ENSCPBG00000027168)	DIDO1 (ENSCPBG00000027166)	TCFL5 (ENSCPBG00000027164)	ENSCPBG00000027162	OGFR (ENSCPBG00000027160)	MRGBP (ENSCPBG00000027159)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00550000075016	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218.u #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2561	PRPF6 (ENSCABG00000000848)	SOX18 (ENSCABG00000000851)	TCEA2 (ENSCABG00000000852)	RGS19 (ENSCABG00000000856)	LKAAEAR1 (ENSCABG00000000858)	OPRL1 (ENSCABG00000000859)	NPBWR2 (ENSCABG00000000861)	MYT1 (ENSCABG00000000863)	PCMTD2 (ENSCABG00000000883)	ENSCABG00000000885	SRMS (ENSCABG00000000899) #17	PTK6 (ENSCABG00000000966) #18	ENSCABG00000000978 ##19	EEF1A2 (ENSCABG00000000982) #20	KCNQ2 (ENSCABG00000000995) #21	CHRNA4 (ENSCABG00000001062) #22	COL20A1 (ENSCABG00000001068) #23	ENSCABG00000001081	ARFGAP1 (ENSCABG00000001178) #24	ENSCABG00000001183	ENSCABG00000001187	YTHDF1 (ENSCABG00000001188)	BHLHE23 (ENSCABG00000001192)	SLC17A9 (ENSCABG00000001196)	GID8 (ENSCABG00000001197)	DIDO1 (ENSCABG00000001201)	TCFL5 (ENSCABG00000001205)
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	5	SOX18 (ENSGEVG00005005139)	TCEA2 (ENSGEVG00005005154)	RGS19 (ENSGEVG00005005183)	LKAAEAR1 (ENSGEVG00005005201)	OPRL1 (ENSGEVG00005005218)	NPBWR2 (ENSGEVG00005005239)	MYT1 (ENSGEVG00005005285)	PCMTD2 (ENSGEVG00005005405)	ENSGEVG00005005458	SRMS (ENSGEVG00005005595) #17	ENSGEVG00005005620 #18	ENSGEVG00005005649 #18	ENSGEVG00005005682 ##19	EEF1A2 (ENSGEVG00005005714) #20	KCNQ2 (ENSGEVG00005005845) #21	CHRNA4 (ENSGEVG00005006100) #22	ENSGEVG00005006138	ENSGEVG00005006261	ARFGAP1 (ENSGEVG00005006291) #24	ENSGEVG00005006342	BIRC7 (ENSGEVG00005006406) #25	YTHDF1 (ENSGEVG00005006447)	BHLHE23 (ENSGEVG00005006472)	SLC17A9 (ENSGEVG00005006485)	GID8 (ENSGEVG00005006543)	DIDO1 (ENSGEVG00005006576)	TCFL5 (ENSGEVG00005006612)	OGFR (ENSGEVG00005006667)	MRGBP (ENSGEVG00005006691)	NTSR1 (ENSGEVG00005006730)	SLCO4A1 (ENSGEVG00005006781)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1798	TCEA2 (ENSPSIG00000009776)	RGS19 (ENSPSIG00000010046)	LKAAEAR1 (ENSPSIG00000010229)	OPRL1 (ENSPSIG00000010249)	ENSPSIG00000000774	NPBWR2 (ENSPSIG00000000787)	MYT1 (ENSPSIG00000010265)	PCMTD2 (ENSPSIG00000010774)	ENSPSIG00000010957	ENSPSIG00000011000	SRMS (ENSPSIG00000011019) #17	PTK6 (ENSPSIG00000011122) #18	ENSPSIG00000011465 ##19	EEF1A2 (ENSPSIG00000011654) #20	KCNQ2 (ENSPSIG00000011876) #21	CHRNA4 (ENSPSIG00000012045) #22	ENSPSIG00000012392	ENSPSIG00000012399 #23	ENSPSIG00000012497	ENSPSIG00000012555	ARFGAP1 (ENSPSIG00000012829) #24	NKAIN4 (ENSPSIG00000012841)	BIRC7 (ENSPSIG00000012902) #25
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000180601	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974.k	ENSGT00940000159974.l	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Indian cobra	MODERN SPECIES	2	ENSNNAG00000002529	ENSNNAG00000002537	ENSNNAG00000002547	OPRL1 (ENSNNAG00000002555)	ENSNNAG00000002565	MYT1 (ENSNNAG00000002575)	PCMTD2 (ENSNNAG00000002597)	ENSNNAG00000002642	ENSNNAG00000002899	ENSNNAG00000002923	SRMS (ENSNNAG00000002930) #17	PTK6 (ENSNNAG00000002945) #18	ENSNNAG00000002955 ##19	EEF1A2 (ENSNNAG00000002963) #20	KCNQ2 (ENSNNAG00000002988) #21	CHRNA4 (ENSNNAG00000003075) #22	ENSNNAG00000003092	ENSNNAG00000003135	ARFGAP1 (ENSNNAG00000003264) #24	BIRC7 (ENSNNAG00000003288) #25	YTHDF1 (ENSNNAG00000003299)	BHLHE23 (ENSNNAG00000003313)	SLC17A9 (ENSNNAG00000000826)	GID8 (ENSNNAG00000000846)	DIDO1 (ENSNNAG00000000882)	TCFL5 (ENSNNAG00000000936)	OGFR (ENSNNAG00000000952)	NTSR1 (ENSNNAG00000000967)	SLCO4A1 (ENSNNAG00000000979)	ENSNNAG00000001003	ENSNNAG00000001023
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974.k	ENSGT00940000159974.l	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974.k	ENSGT00940000159974.l	ENSGT00940000160391	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	194																CHRNA4 (ENSNSUG00000006459) #22	ENSNSUG00000006460	ENSNSUG00000006461	ARFGAP1 (ENSNSUG00000006462) #24	NKAIN4 (ENSNSUG00000006463)	BIRC7 (ENSNSUG00000006464) #25	YTHDF1 (ENSNSUG00000006465)	BHLHE23 (ENSNSUG00000006467)	SLC17A9 (ENSNSUG00000006468)	GID8 (ENSNSUG00000006469)	DIDO1 (ENSNSUG00000006470)	TCFL5 (ENSNSUG00000006479)	ENSNSUG00000006480	ENSNSUG00000006481
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	8	ENSPTXG00000013140	RGS19 (ENSPTXG00000013142)	OPRL1 (ENSPTXG00000013144)	ENSPTXG00000013153	NPBWR2 (ENSPTXG00000013154)	ENSPTXG00000013155	MYT1 (ENSPTXG00000013156)	PCMTD2 (ENSPTXG00000013158)	ENSPTXG00000013163	SRMS (ENSPTXG00000013172) #17	PTK6 (ENSPTXG00000013175) #18	ENSPTXG00000013180 ##19	EEF1A2 (ENSPTXG00000013181) #20	KCNQ2 (ENSPTXG00000013185) #21	ENSPTXG00000013188	CHRNA4 (ENSPTXG00000013189) #22	ENSPTXG00000013190	ENSPTXG00000013191	ARFGAP1 (ENSPTXG00000013192) #24	ENSPTXG00000013193	BIRC7 (ENSPTXG00000013194) #25	YTHDF1 (ENSPTXG00000013195)	BHLHE23 (ENSPTXG00000013197)	SLC17A9 (ENSPTXG00000013198)	GID8 (ENSPTXG00000013206)	DIDO1 (ENSPTXG00000013207)	TCFL5 (ENSPTXG00000013209)	OGFR (ENSPTXG00000013210)	MRGBP (ENSPTXG00000013211)	NTSR1 (ENSPTXG00000013212)	SLCO4A1 (ENSPTXG00000013213)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	4707																CHRNA4 (ENSLLTG00000015908) #22
Lizard	MODERN SPECIES	3	RGS19 (ENSACAG00000006332)	ENSACAG00000040691	OPRL1 (ENSACAG00000043781)	NPBWR2 (ENSACAG00000006302)	ENSACAG00000043016	MYT1 (ENSACAG00000006249)	PCMTD2 (ENSACAG00000035696)	ENSACAG00000006172	SRMS (ENSACAG00000024839) #17	PTK6 (ENSACAG00000006031) #18	ENSACAG00000006027 ##19	EEF1A2 (ENSACAG00000006007) #20	ENSACAG00000035831	KCNQ2 (ENSACAG00000005872) #21	ENSACAG00000038200	CHRNA4 (ENSACAG00000005817) #22	ENSACAG00000005710	ENSACAG00000005686	ARFGAP1 (ENSACAG00000042571) #24	ENSACAG00000040279	NKAIN4 (ENSACAG00000026860)	BIRC7 (ENSACAG00000043634) #25	YTHDF1 (ENSACAG00000005560)	ENSACAG00000044252	ENSACAG00000042736	SLC17A9 (ENSACAG00000005516)	GID8 (ENSACAG00000005506)	DIDO1 (ENSACAG00000005462)	TCFL5 (ENSACAG00000005435)	ENSACAG00000005213	OGFR (ENSACAG00000005168)
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000166123	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113.b ##19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406 #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Common wall lizard	MODERN SPECIES	14	ENSPMRG00000004257	ENSPMRG00000004254	TCEA2 (ENSPMRG00000004237)	RGS19 (ENSPMRG00000004212)	ENSPMRG00000004201	OPRL1 (ENSPMRG00000004194)	NPBWR2 (ENSPMRG00000004187)	MYT1 (ENSPMRG00000004106)	PCMTD2 (ENSPMRG00000004087)	ENSPMRG00000004043	SRMS (ENSPMRG00000004031) #17	PTK6 (ENSPMRG00000004016) #18	ENSPMRG00000004009 ##19	EEF1A2 (ENSPMRG00000003996) #20	KCNQ2 (ENSPMRG00000003976) #21	CHRNA4 (ENSPMRG00000003969) #22	ENSPMRG00000003893	ENSPMRG00000003882	ARFGAP1 (ENSPMRG00000003874) #24	ENSPMRG00000003868	BIRC7 (ENSPMRG00000003861) #25	YTHDF1 (ENSPMRG00000003853)	ENSPMRG00000003847	ENSPMRG00000004755	BHLHE23 (ENSPMRG00000004753)	SLC17A9 (ENSPMRG00000004747)	GID8 (ENSPMRG00000004738)	DIDO1 (ENSPMRG00000004709)	TCFL5 (ENSPMRG00000004692)	ENSPMRG00000004660	OGFR (ENSPMRG00000004647)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	49								MYT1 (ENSSMRG00000013968)	PCMTD2 (ENSSMRG00000013967)	ENSSMRG00000013965	SRMS (ENSSMRG00000013964) #17	PTK6 (ENSSMRG00000013958) #18	ENSSMRG00000013957 ##19	EEF1A2 (ENSSMRG00000013956) #20	KCNQ2 (ENSSMRG00000012710) #21	CHRNA4 (ENSSMRG00000012709) #22	ENSSMRG00000012696	ENSSMRG00000012695	ENSSMRG00000012694	NKAIN4 (ENSSMRG00000012686)	BIRC7 (ENSSMRG00000012684) #25	YTHDF1 (ENSSMRG00000012683)	BHLHE23 (ENSSMRG00000012675)	ENSSMRG00000012673	SLC17A9 (ENSSMRG00000012672)	GID8 (ENSSMRG00000012671)	DIDO1 (ENSSMRG00000012669)	ENSSMRG00000012668	ENSSMRG00000012667	ENSSMRG00000012665	OGFR (ENSSMRG00000012661)
tuatara	MODERN SPECIES	805						OPRL1 (ENSSPUG00000000599)	NPBWR2 (ENSSPUG00000000644)	MYT1 (ENSSPUG00000000654)	PCMTD2 (ENSSPUG00000000681)	ENSSPUG00000000708	SRMS (ENSSPUG00000000737) #17	PTK6 (ENSSPUG00000000750) #18	ENSSPUG00000000776 ##19	EEF1A2 (ENSSPUG00000000783) #20	KCNQ2 (ENSSPUG00000000830) #21	CHRNA4 (ENSSPUG00000000850) #22	EFL1 (ENSSPUG00000000941)	SAXO2 (ENSSPUG00000000969)	ADAMTSL3 (ENSSPUG00000001001)	ENSSPUG00000001056	SH3GL3 (ENSSPUG00000001116)	BNC1 (ENSSPUG00000001128)	HDGFL3 (ENSSPUG00000001149)	ENSSPUG00000001162	TM6SF1 (ENSSPUG00000001175)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00550000075016	ENSGT00950000182844.a.a	ENSGT00940000162709	ENSGT00940000159974	ENSGT00940000160391	ENSGT00390000009883	ENSGT00940000160661	ENSGT00940000163127	ENSGT00940000156364	ENSGT00950000183032.A.b.b.b	ENSGT00940000161518 #17	ENSGT00940000161218 #18	ENSGT00390000009113 #19	ENSGT00950000183029.C #20	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000153769.G	ENSGT00940000164411	ENSGT00890000139515 #24	ENSGT00940000157989.a.b	ENSGT00940000160406.a #25	ENSGT00940000156911	ENSGT00940000162992	ENSGT00940000158186	ENSGT00390000015162	ENSGT00940000155532	ENSGT00390000002821	ENSGT00940000161930	ENSGT00390000018730.A	ENSGT00390000007823	ENSGT01100000263518.A.a.a.a
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	3	PMEPA1 (ENSLLEG00000025512)	ENSLLEG00000025385	KCNB1 (ENSLLEG00000025214)	ENSLLEG00000025166	ENSLLEG00000025148	PTGIS (ENSLLEG00000025064)	ENSLLEG00000025043	PTK6 (ENSLLEG00000024912) #18	ENSLLEG00000024845 #19	KCNQ2 (ENSLLEG00000023563) #21	ENSLLEG00000023497	ENSLLEG00000023480	ENSLLEG00000023464	ENSLLEG00000023447	ENSLLEG00000023407	CHRNA4 (ENSLLEG00000022052) #22	ENSLLEG00000021584	ENSLLEG00000021370	ARFGAP1 (ENSLLEG00000015838) #24	ENSLLEG00000015479	ENSLLEG00000015318 #25	ENSLLEG00000015287	ENSLLEG00000015099	ENSLLEG00000015068	ENSLLEG00000015048	YTHDF1 (ENSLLEG00000014959)	ENSLLEG00000014866	ENSLLEG00000014827	BHLHE23 (ENSLLEG00000014808)	ENSLLEG00000014768	ENSLLEG00000014685
Frog	MODERN SPECIES	1	ENSXETG00000047434	ENSXETG00000031730	ENSXETG00000032059	pcmtd2 (ENSXETG00000048911)	ENSXETG00000033189	ENSXETG00000037128	ENSXETG00000039818 #17	ENSXETG00000044110	ENSXETG00000046154	ptk6 (ENSXETG00000031017) #18	ppdpf (ENSXETG00000041601) #19	ENSXETG00000041568	eef1a2 (ENSXETG00000019567) #20	kcnq2 (ENSXETG00000032009) #21	ENSXETG00000049296	chrna4 (ENSXETG00000044956) #22	ENSXETG00000043980	deptorl (ENSXETG00000042520)	arfgap1 (ENSXETG00000047116) #24	nkain4 (ENSXETG00000044261)	birc7 (ENSXETG00000013316) #25	ythdf1 (ENSXETG00000027086)	BHLHE23 (ENSXETG00000048927)	slc17a9 (ENSXETG00000041666)	gid8 (ENSXETG00000043089)	umad1 (ENSXETG00000006106)	ENSXETG00000043119	tcfl5 (ENSXETG00000034754)	col9a3 (ENSXETG00000045554)	ENSXETG00000048261	ENSXETG00000038083
Coelacanth	MODERN SPECIES	388													ppdpfb (ENSLACG00000002835) #19	EEF1A2 (ENSLACG00000004296) #20	KCNQ2 (ENSLACG00000005644) #21	CHRNA4 (ENSLACG00000010383) #22	ENSLACG00000011040	ENSLACG00000012267	ARFGAP1 (ENSLACG00000012603) #24	NKAIN4 (ENSLACG00000013142)	ENSLACG00000013969	YTHDF1 (ENSLACG00000014195)	BHLHE23 (ENSLACG00000016169)	SLC17A9 (ENSLACG00000016533)	GID8 (ENSLACG00000016647)	DIDO1 (ENSLACG00000016718)	TCFL5 (ENSLACG00000016963)	COL9A3 (ENSLACG00000017042)	ENSLACG00000017289
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	62					ENSGT00940000159472	ENSGT00390000001562	ENSGT00390000000546	ENSGT00950000183131.a	ENSGT00950000183176.a	ENSGT00950000182863.A.a.b	ENSGT00940000155581.A	ENSGT00940000158764	ENSGT00700000104550.a.j	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694 #15	ENSGT00950000183149.B	ENSGT00940000158197	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000155094	ENSGT00940000160207	ENSGT00950000183113.a.b	ENSGT00390000002707	ENSGT01030000234623.a.a.a.a.a
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000159381	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.a	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000001562	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014	ENSGT00950000183131.a	ENSGT00950000183176.a	ENSGT00950000182863.A.a.b	ENSGT00940000155581.A	ENSGT00940000158764	ENSGT00700000104550.a.j	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093 #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694.g #15	ENSGT00940000160694.h #15	ENSGT00950000183149.B	ENSGT00940000158197	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000155094.a	ENSGT00940000155094.b	ENSGT00940000160207	ENSGT00950000183113.a.b
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	67	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.a	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000001562	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014	ENSGT00950000183131.a.f	ENSGT00950000183176.a	ENSGT00950000182863.A.a.b	ENSGT00940000158764	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000155167.a	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00940000160694.g.a #15	ENSGT00940000163473.j	ENSGT00530000063106.A	ENSGT00940000160694.h #15	ENSGT00950000183149.B	ENSGT00940000158197	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000155094.a	ENSGT00940000160207.a
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	58											ENSGT00940000165541.d	ENSGT00940000158764.f	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000155167.a	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f.g #13	ENSGT00950000183149.B.a	ENSGT00940000158197	ENSGT00940000155094.b	ENSGT00940000160207.b	ENSGT00950000183113.a.b	ENSGT00390000002707	ENSGT00940000155407	ENSGT00940000157965.d	ENSGT00940000161086	ENSGT00530000063693.b
Asian bonytongue	DUPLICATION
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	10	mat2ab (ENSSFOG00015027261)	si:ch211-283h6.4 (ENSSFOG00015001551)	usp39 (ENSSFOG00015001542)	ENSSFOG00015032713	ENSSFOG00015001529	ebf2 (ENSSFOG00015001451)	zgc:162200 (ENSSFOG00015001424)	nt5dc2 (ENSSFOG00015001364)	ENSSFOG00015001344	tbc1d25 (ENSSFOG00015028889)	ENSSFOG00015001226	tox2 (ENSSFOG00015001168)	ENSSFOG00015001026	PREX1 (ENSSFOG00015000864)	kcnq2a (ENSSFOG00015028801) #21	CHRNA4 (ENSSFOG00015000746) #22	zgpat (ENSSFOG00015000739) #10	ENSSFOG00015000734	rtel1 (ENSSFOG00015000577) #12	STMN3 (ENSSFOG00015000551) #13	pdyn (ENSSFOG00015031763)	stk35 (ENSSFOG00015026476)	ENSSFOG00015000467	ccn5 (ENSSFOG00015000413)	ada (ENSSFOG00015000358)	ENSSFOG00015000334	ttpal (ENSSFOG00015000316)	hnf4a (ENSSFOG00015000282)	R3HDML (ENSSFOG00015000276)	fitm2 (ENSSFOG00015000270)	GDAP1L1 (ENSSFOG00015000236)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	14	ENSSFOG00015032394	ENSSFOG00015019751	ENSSFOG00015019791	tgm2b (ENSSFOG00015019841)	rprd1b (ENSSFOG00015019874)	VSTM2L (ENSSFOG00015019919)	tgm5l (ENSSFOG00015019930)	ITCH (ENSSFOG00015019968)	ENSSFOG00015025239	ENSSFOG00015031799	cbfa2t2 (ENSSFOG00015020083)	SNTA1 (ENSSFOG00015020141)	tox2 (ENSSFOG00015020204)	RALGAPB (ENSSFOG00015020305)	KCNQ2 (ENSSFOG00015020469) #21	CHRNA4 (ENSSFOG00015020486) #22	arfrp1 (ENSSFOG00015020500) #11	STMN3 (ENSSFOG00015020531) #13	GMEB2 (ENSSFOG00015020551) #14	HELZ2 (ENSSFOG00015020580) #15	ENSSFOG00015020597	ENSSFOG00015020601	ENSSFOG00015020619	HESX1 (ENSSFOG00015020712)	il17rd (ENSSFOG00015020761)	arhgef3 (ENSSFOG00015032625)	TASOR (ENSSFOG00015020843)	CCDC66 (ENSSFOG00015020887)	IP6K1 (ENSSFOG00015020899)	gmppb (ENSSFOG00015020926)	lmcd1 (ENSSFOG00015026071)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	3	xpc (ENSPKIG00000013720)	si:dkey-72l14.3 (ENSPKIG00000013498)	borcs6 (ENSPKIG00000013322)	sema3h (ENSPKIG00000013268)	rhoab (ENSPKIG00000013242)	ENSPKIG00000013207	CISH (ENSPKIG00000013193)	WDR82 (ENSPKIG00000013151)	glyctk (ENSPKIG00000013132)	tcta (ENSPKIG00000013116)	ENSPKIG00000013077	tox2 (ENSPKIG00000013053)	ENSPKIG00000012739	PREX1 (ENSPKIG00000012475)	kcnq2a (ENSPKIG00000012195) #21	CHRNA4 (ENSPKIG00000012089) #22	zgpat (ENSPKIG00000012056) #10	TNFRSF6B (ENSPKIG00000012032)	rtel1 (ENSPKIG00000011779) #12	STMN3 (ENSPKIG00000011705) #13	pdyn (ENSPKIG00000011685)	stk35 (ENSPKIG00000011662)	ENSPKIG00000011647	ccn5 (ENSPKIG00000011628)	ada (ENSPKIG00000011595)	pkig (ENSPKIG00000011567)	ttpal (ENSPKIG00000011537)	hnf4a (ENSPKIG00000011493)	R3HDML (ENSPKIG00000011447)	fitm2 (ENSPKIG00000011423)	GDAP1L1 (ENSPKIG00000011388)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	346													ENSGT01000000215962	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000155167.a	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00950000183149.B	ENSGT00940000158197.d	ENSGT00390000000020.a	ENSGT00940000163908
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	92	ENSGT00940000167828	ENSGT00940000154570.a.b	ENSGT00390000009278.b	ENSGT00940000153216.a.b	ENSGT01030000234528.B.a.a.a	ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a	ENSGT00940000154171.A	ENSGT00390000012058.c.b	ENSGT00950000182931.A.a.b	ENSGT01030000234578.B.b.a	ENSGT00950000183117.a.b.a	ENSGT00940000153544.a.i.b	ENSGT00390000006349	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000155167.a	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00950000183149.B	ENSGT00940000158197.d	ENSGT00390000000020.a	ENSGT00940000163908	ENSGT01000000215408	ENSGT00940000153185.a.a.b	ENSGT00940000163310.l	ENSGT00940000154967.a.a.a	ENSGT00950000182835.d.a.k.b	ENSGT00940000155308.c	ENSGT00940000165533.d
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000153593.h.a.b	ENSGT00940000158081.o.a	ENSGT01030000235156	ENSGT00940000157166.c	ENSGT00940000157564	ENSGT00940000158665.d	ENSGT00550000074800.a.b	ENSGT00390000008086.b	ENSGT00940000154587.a.a	ENSGT01050000244898.a.a.b	ENSGT01050000244838.H.d.d	ENSGT00940000154290.a.f	ENSGT00940000166653	ENSGT00940000154296.a	ENSGT01030000234559.a.b	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT00940000155463	ENSGT00940000154748.C	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a	ENSGT00940000161181.d	ENSGT00940000157355.d	ENSGT00940000159407.r	ENSGT00940000154164.d	ENSGT00940000155246	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000160776	ENSGT00940000156314.b	ENSGT00940000159590
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159994	ENSGT00510000053055	ENSGT00940000158081.o.a	ENSGT01030000235156	ENSGT00940000157166.c	ENSGT00940000157564	ENSGT00940000158665.d	ENSGT00550000074800.a.b	ENSGT00390000008086.b	ENSGT00940000154587.a.a	ENSGT01050000244898.a.a.b	ENSGT01050000244838.H.d.d	ENSGT00940000154290.a.f	ENSGT00940000154296.a	ENSGT01030000234559.a.b	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT00940000155463	ENSGT00940000154748.C	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00940000155246	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000160776	ENSGT00940000156314.b	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000164531	ENSGT00940000155557.jc.b	ENSGT00530000063498.A	ENSGT00940000156395.e	ENSGT00940000162183
Channel catfish	MODERN SPECIES	1	Homer3 (ENSIPUG00000013573)	ENSIPUG00000013542	mast3 (ENSIPUG00000013441)	ABCB11 (ENSIPUG00000013273)	rsph3 (ENSIPUG00000013238)	DHRS9 (ENSIPUG00000013202)	atp5b (ENSIPUG00000013169)	TMEM275 (ENSIPUG00000013154)	mknk1 (ENSIPUG00000013117)	mob3c (ENSIPUG00000013102)	elovl1b (ENSIPUG00000013050)	ENSIPUG00000013032	ENSIPUG00000013004	btf3l4 (ENSIPUG00000012937)	ptgfr (ENSIPUG00000012920)	chrna4b (ENSIPUG00000012912) #22	zgpat (ENSIPUG00000012890) #10	rtel1 (ENSIPUG00000012793) #12	ENSIPUG00000012780	ENSIPUG00000012753	txlng (ENSIPUG00000012738)	rbbp7 (ENSIPUG00000012670)	ZRSR2 (ENSIPUG00000012642)	AP1S2 (ENSIPUG00000012616)	krt94 (ENSIPUG00000012605)	krt98 (ENSIPUG00000012588)	krt15 (ENSIPUG00000012578)	krt99 (ENSIPUG00000012554)	ENSIPUG00000012522	ENSIPUG00000012460	jupa (ENSIPUG00000012370)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000159994	ENSGT00510000053055	ENSGT00940000158081.o.a	ENSGT01030000235156	ENSGT00940000157166.c	ENSGT00940000157564	ENSGT00940000158665.d	ENSGT00550000074800.a.b	ENSGT00390000008086.b	ENSGT00940000154587.a.a	ENSGT01050000244898.a.a.b	ENSGT01050000244838.H.d.d	ENSGT00940000154290.a.f	ENSGT00940000154296.a	ENSGT01030000234559.a.b	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT00940000155463	ENSGT00940000154748.C	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00940000155246	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000160776	ENSGT00940000156314.b	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000164531	ENSGT00940000154902.nb.b	ENSGT00940000155557.jc.b	ENSGT00530000063498.A	ENSGT00940000156395.e
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159994	ENSGT00510000053055	ENSGT00940000158081.o.a	ENSGT01030000235156	ENSGT00940000157166.c	ENSGT00940000157564	ENSGT00940000158665.d	ENSGT00550000074800.a.b	ENSGT00390000008086.b	ENSGT00940000154587.a.a	ENSGT01050000244898.a.a.b	ENSGT01050000244838.H.d.d	ENSGT00940000154290.a.f	ENSGT00940000154296.a	ENSGT01030000234559.a.b	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT00940000155463	ENSGT00940000154748.C	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a	ENSGT00940000161181.d	ENSGT00940000155246	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000160776	ENSGT00940000156314.b	ENSGT00940000159590	ENSGT00940000164531	ENSGT00940000154902.nb.b	ENSGT00940000155557.jc.b
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	279	ENSPNAG00000002617	ENSPNAG00000013185	homer3b (ENSPNAG00000013178)	ENSPNAG00000006948	MAST3 (ENSPNAG00000013145)	ABCB11 (ENSPNAG00000002545)	ENSPNAG00000002506	atp5f1b (ENSPNAG00000002497)	TMEM275 (ENSPNAG00000012972)	mknk1 (ENSPNAG00000012955)	mob3c (ENSPNAG00000002465)	elovl1b (ENSPNAG00000012919)	ENSPNAG00000002436	btf3l4 (ENSPNAG00000012839)	ptgfr (ENSPNAG00000012814)	chrna4b (ENSPNAG00000012801) #22	zgpat (ENSPNAG00000012769) #10	rtel1 (ENSPNAG00000012695) #12	txlng (ENSPNAG00000002236)	rbb4l (ENSPNAG00000012314)	ZRSR2 (ENSPNAG00000012282)	ap1s2 (ENSPNAG00000012260)	npepps (ENSPNAG00000012234)	mrpl45 (ENSPNAG00000012194)	ENSPNAG00000002143	socs7 (ENSPNAG00000002131)	sp2 (ENSPNAG00000002098)	ENSPNAG00000012071	ENSPNAG00000012011	ENSPNAG00000011994	cdc6 (ENSPNAG00000002042)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	20	arrdc2 (ENSAMXG00000018766)	ENSAMXG00000029224	homer3b (ENSAMXG00000040188)	ENSAMXG00000036056	MAST3 (ENSAMXG00000018741)	ABCB11 (ENSAMXG00000018718)	ENSAMXG00000037091	atp5f1b (ENSAMXG00000018700)	TMEM275 (ENSAMXG00000038233)	mknk1 (ENSAMXG00000018676)	mob3c (ENSAMXG00000042044)	elovl1b (ENSAMXG00000035083)	ENSAMXG00000018633	btf3l4 (ENSAMXG00000029439)	ptgfr (ENSAMXG00000018613)	chrna4b (ENSAMXG00000018597) #22	zgpat (ENSAMXG00000018583) #10	rtel1 (ENSAMXG00000018571) #12	txlng (ENSAMXG00000018555)	rbb4l (ENSAMXG00000018532)	ZRSR2 (ENSAMXG00000018502)	ap1s2 (ENSAMXG00000031582)	npepps (ENSAMXG00000018441)	mrpl45 (ENSAMXG00000018409)	ENSAMXG00000040159	socs7 (ENSAMXG00000018378)	sp2 (ENSAMXG00000041753)	ENSAMXG00000018370	ENSAMXG00000039084	WIPF2 (ENSAMXG00000018361)	cdc6 (ENSAMXG00000018360)
Electric eel	MODERN SPECIES	103	ENSEEEG00000005817	si:ch211-1a19.2 (ENSEEEG00000005816)	arrdc2 (ENSEEEG00000005735)	homer3b (ENSEEEG00000005730)	MAST3 (ENSEEEG00000005697)	ABCB11 (ENSEEEG00000005621)	DHRS9 (ENSEEEG00000005616)	atp5f1b (ENSEEEG00000005607)	ENSEEEG00000005605	mknk1 (ENSEEEG00000004776)	mob3c (ENSEEEG00000004729)	elovl1b (ENSEEEG00000004727)	ENSEEEG00000004726	btf3l4 (ENSEEEG00000004723)	ptgfr (ENSEEEG00000004721)	chrna4b (ENSEEEG00000004662) #22	zgpat (ENSEEEG00000004658) #10	rtel1 (ENSEEEG00000004656) #12	txlng (ENSEEEG00000004535)	rbb4l (ENSEEEG00000004485)	ZRSR2 (ENSEEEG00000004483)	ap1s2 (ENSEEEG00000004443)	npepps (ENSEEEG00000003661)	ENSEEEG00000003641	ENSEEEG00000003640	ENSEEEG00000003639	rnf13 (ENSEEEG00000003638)	pfn2b (ENSEEEG00000003637)	dynlt2b (ENSEEEG00000003636)	ENSEEEG00000003635	ENSEEEG00000003632
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	68	ENSGT00940000158081.o.a.e	ENSGT01030000235156	ENSGT00940000157166.c	ENSGT00940000157564	ENSGT00550000074800.a.b	ENSGT00390000008086.b	ENSGT00940000154587.a.a	ENSGT01050000244898.a.a.b	ENSGT01050000244838.H.d.d	ENSGT00940000154290.a.f	ENSGT00940000166653	ENSGT00940000154296.a	ENSGT01030000234559.a.b	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000160093.a #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000167693	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT00940000155463	ENSGT00940000154748.C	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a	ENSGT00940000161181.d	ENSGT00940000157355.d	ENSGT00940000159407.r	ENSGT00940000154164.d	ENSGT00940000155258.h.a	ENSGT00940000155258.h.b	ENSGT00940000155246	ENSGT00390000012679
Zebrafish	DUPLICATION
Zebrafish	MODERN SPECIES	21	eya2 (ENSDARG00000018984)	rtf2 (ENSDARG00000040607)	GCNT7 (ENSDARG00000040608)	tfap2c (ENSDARG00000040606)	CDH22 (ENSDARG00000098824)	ZNFX1 (ENSDARG00000100280)	ddx27 (ENSDARG00000091831)	snrpb (ENSDARG00000011125)	itcha (ENSDARG00000074903)	NECAB3 (ENSDARG00000074794)	cbfa2t2 (ENSDARG00000074337)	SNTA1 (ENSDARG00000098420)	tox2 (ENSDARG00000100055)	RALGAPB (ENSDARG00000088899)	KCNQ2 (ENSDARG00000091130) #21	ENSDARG00000087071 #22	arfrp1 (ENSDARG00000057857) #11	STMN3 (ENSDARG00000038465) #13	ENSDARG00000016527 #15	sp7 (ENSDARG00000019516)	igsf8 (ENSDARG00000038467)	soat2 (ENSDARG00000059824)	ENSDARG00000059818	dctn2 (ENSDARG00000031388)	ENSDARG00000086980	ddit3 (ENSDARG00000059836)	mars1 (ENSDARG00000034396)	ENSDARG00000013390	shmt2 (ENSDARG00000104414)	ENSDARG00000087907	fam210b (ENSDARG00000052638)
Zebrafish	MODERN SPECIES	2	si:ch211-1a19.2 (ENSDARG00000076148)	arrdc2 (ENSDARG00000020761)	ENSDARG00000070073	homer3b (ENSDARG00000010789)	ENSDARG00000102434	ENSDARG00000086505	ABCB11 (ENSDARG00000070078)	atp5f1b (ENSDARG00000070083)	TMEM275 (ENSDARG00000105475)	mknk1 (ENSDARG00000018411)	mob3c (ENSDARG00000043705)	elovl1b (ENSDARG00000103735)	ENSDARG00000100764	ptgfr (ENSDARG00000074016)	btf3l4 (ENSDARG00000089681)	chrna4b (ENSDARG00000070724) #22	ENSDARG00000058416	zgpat (ENSDARG00000027403) #10	rtel1 (ENSDARG00000035074) #12	txlng (ENSDARG00000001969)	rbb4l (ENSDARG00000015208)	ZRSR2 (ENSDARG00000058448)	ap1s2 (ENSDARG00000058504)	ENSDARG00000088658	ENSDARG00000077475	ENSDARG00000113225	ENSDARG00000110231	ENSDARG00000115184	ENSDARG00000100754	ENSDARG00000116389	ENSDARG00000113079
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	1169														ENSGT00700000104550.a.j.b.e.b	ENSGT00940000160093.a.d #21	ENSGT00940000159329.i #22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	810														ENSGT00700000104550.a.j.b.e.b	ENSGT00940000160093.a.d #21	ENSGT00940000159329.i #22	ENSGT00940000156407.g #11
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	631														ENSSGRG00000012524	KCNQ2 (ENSSGRG00000012523) #21	ENSSGRG00000012518 #22	arfrp1 (ENSSGRG00000012315) #11	ENSSGRG00000012312 #15	ENSSGRG00000012310 #15	igsf8 (ENSSGRG00000012309)	ENSSGRG00000012308	ENSSGRG00000012222	dctn2 (ENSSGRG00000011098)	ENSSGRG00000011069	mars1 (ENSSGRG00000010865)	ARHGAP9 (ENSSGRG00000010853)	ENSSGRG00000010849	gli1 (ENSSGRG00000010847)	INHBC (ENSSGRG00000010845)	R3HDM2 (ENSSGRG00000010841)	shmt2 (ENSSGRG00000010836)
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	365	ENSGT00510000053055.a.a	ENSGT00940000158081.o.a.e.a.a.a	ENSGT01030000235156.a	ENSGT00940000157166.c.a	ENSGT00940000157564.i	ENSGT00550000074800.a.b.a	ENSGT00940000154587.a.a.e	ENSGT01050000244898.a.a.b.d	ENSGT01050000244838.H.d.d.b	ENSGT00390000008086.b	ENSGT00940000154587.a.a.f	ENSGT01050000244898.a.a.b.c	ENSGT01050000244838.H.d.d.a	ENSGT00940000154290.a.f	ENSGT00940000154296.a.a	ENSGT00940000159329.j.a #22	ENSGT00950000182970.A.b.i #12	ENSGT00940000166653	ENSGT00940000154296.a.b	ENSGT01030000234559.a.b	ENSGT00940000159329.j.b #22	ENSGT00940000167693	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00950000182970.A.b.j #12	ENSGT00940000155463.rc	ENSGT00940000154748.C.d	ENSGT00950000183152.A.c
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	85	ENSGT00510000053055.a.a	ENSGT00940000158081.o.a.e.a.a.a	ENSGT01030000235156.a	ENSGT00940000157166.c.a	ENSGT00940000157564.i	ENSGT00550000074800.a.b.a	ENSGT00940000154587.a.a.e	ENSGT01050000244898.a.a.b.d	ENSGT01050000244838.H.d.d.b	ENSGT00390000008086.b	ENSGT00940000154587.a.a.f	ENSGT01050000244898.a.a.b.c	ENSGT01050000244838.H.d.d.a	ENSGT00940000154290.a.f	ENSGT00940000154296.a.a	ENSGT00940000159329.j.a #22	ENSGT00940000166653	ENSGT00940000154296.a.b	ENSGT01030000234559.a.b	ENSGT00940000159329.j.b #22	ENSGT00940000167693	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00950000182970.A.b.j #12	ENSGT00940000155463.rc	ENSGT00940000154748.C.d	ENSGT00950000183152.A.c	ENSGT00940000166148.a	ENSGT00390000010652.D.a.a.d	ENSGT00940000159238.i	ENSGT00730000111231.k	ENSGT00610000086173.m
Common carp reference	MODERN SPECIES	13	wdr18 (ENSCCRG00000047605)	ENSCCRG00000062821	si:ch211-1a19.2 (ENSCCRG00000060243)	arrdc2 (ENSCCRG00000000256)	ENSCCRG00000077699	homer3b (ENSCCRG00000067228)	ENSCCRG00000044667	ENSCCRG00000069007	ENSCCRG00000075911	atp5f1b (ENSCCRG00000005211)	mknk1 (ENSCCRG00000002399)	mob3c (ENSCCRG00000072112)	elovl1b (ENSCCRG00000007221)	ENSCCRG00000007238	btf3l4 (ENSCCRG00000075040)	chrna4b (ENSCCRG00000007242) #22	rtel1 (ENSCCRG00000046189) #12	txlng (ENSCCRG00000011826)	rbb4l (ENSCCRG00000008449)	ENSCCRG00000008450	krt95 (ENSCCRG00000042483)	ENSCCRG00000060042	npepps (ENSCCRG00000080227)	mrpl45 (ENSCCRG00000073264)	ENSCCRG00000040476	socs7 (ENSCCRG00000040454)	sp2 (ENSCCRG00000007618)	ENSCCRG00000074632	cdc6 (ENSCCRG00000028069)	jupa (ENSCCRG00000014259)	ENSCCRG00000015139
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	802													elovl1b (ENSSGRG00000033610)	btf3l4 (ENSSGRG00000033602)	ptgfr (ENSSGRG00000033600)	chrna4b (ENSSGRG00000033599) #22	zgpat (ENSSGRG00000033588) #10	rtel1 (ENSSGRG00000033584) #12	txlng (ENSSGRG00000033583)	rbb4l (ENSSGRG00000033440)	ENSSGRG00000033435	ap1s2 (ENSSGRG00000033418)	krt95 (ENSSGRG00000033414)	krt95 (ENSSGRG00000033413)	ENSSGRG00000033412	npepps (ENSSGRG00000032235)	mrpl45 (ENSSGRG00000032224)	ENSSGRG00000032222	socs7 (ENSSGRG00000032220)	sp2 (ENSSGRG00000032219)	ENSSGRG00000032170
Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	3076												elovl1b (ENSCARG00000046252)	ENSCARG00000046238	btf3l4 (ENSCARG00000046177)	ENSCARG00000046162	chrna4b (ENSCARG00000046138) #22	rtel1 (ENSCARG00000044735) #12
Goldfish	MODERN SPECIES	2	PCDH20 (ENSCARG00000065581)	ENSCARG00000065576	krt15 (ENSCARG00000065561)	krt99 (ENSCARG00000065550)	ENSCARG00000065540	col9a1a (ENSCARG00000065526)	ptp4a1 (ENSCARG00000065496)	ENSCARG00000065477	lgsn (ENSCARG00000065458)	myom2a (ENSCARG00000061599)	ENSCARG00000060680	ENSCARG00000060602	elovl1b (ENSCARG00000060567)	ENSCARG00000060539	btf3l4 (ENSCARG00000060465)	chrna4b (ENSCARG00000060435) #22	rtel1 (ENSCARG00000060277) #12	txlng (ENSCARG00000060203)	rbb4l (ENSCARG00000058911)	ap1s2 (ENSCARG00000058855)	krt95 (ENSCARG00000058842)	ENSCARG00000058574	npepps (ENSCARG00000058207)	mrpl45 (ENSCARG00000058131)	ENSCARG00000058109	socs7 (ENSCARG00000058035)	sp2 (ENSCARG00000057980)	ENSCARG00000057953	cdc6 (ENSCARG00000057821)	jupa (ENSCARG00000057723)	comp (ENSCARG00000057168)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	365	ENSGT00550000074800.a.b.a	ENSGT00940000154587.a.a.e	ENSGT01050000244898.a.a.b.d	ENSGT01050000244838.H.d.d.b	ENSGT00390000008086.b	ENSGT00940000154587.a.a.f	ENSGT01050000244898.a.a.b.c	ENSGT01050000244838.H.d.d.a	ENSGT00940000154290.a.f	ENSGT00940000154296.a.a	ENSGT00940000159329.j.a #22	ENSGT00950000182970.A.b.i #12	ENSGT00940000166653	ENSGT00940000154296.a.b	ENSGT01030000234559.a.b	ENSGT00940000159329.j.b #22	ENSGT00940000167693	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00950000182970.A.b.j #12	ENSGT00940000155463.rc	ENSGT00940000154748.C.d	ENSGT00950000183152.A.c
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	85	ENSGT00940000157564.i	ENSGT00550000074800.a.b.a	ENSGT00940000154587.a.a.e	ENSGT01050000244898.a.a.b.d	ENSGT01050000244838.H.d.d.b	ENSGT00390000008086.b	ENSGT00940000154587.a.a.f	ENSGT01050000244898.a.a.b.c	ENSGT01050000244838.H.d.d.a	ENSGT00940000154290.a.f	ENSGT00940000154296.a.a	ENSGT00940000159329.j.a #22	ENSGT00940000166653	ENSGT00940000154296.a.b	ENSGT01030000234559.a.b	ENSGT00940000159329.j.b #22	ENSGT00940000167693	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00950000182970.A.b.j #12	ENSGT00940000155463.rc	ENSGT00940000154748.C.d	ENSGT00950000183152.A.c	ENSGT00940000166148.a	ENSGT00390000010652.D.a.a.d	ENSGT00940000159238.i	ENSGT00730000111231.k	ENSGT00610000086173.m	ENSGT00940000158959.b.a.b	ENSGT00940000164492.a.b.g	ENSGT00940000177302	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.b.a.c
Common carp reference	MODERN SPECIES	42	sid1 (ENSCCRG00000075340)	si:ch211-1a19.2 (ENSCCRG00000066064)	arrdc2 (ENSCCRG00000028505)	homer3b (ENSCCRG00000022298)	ENSCCRG00000022347	ENSCCRG00000074846	ENSCCRG00000005243	ENSCCRG00000072880	atp5f1b (ENSCCRG00000082208)	mknk1 (ENSCCRG00000073622)	elovl1b (ENSCCRG00000059168)	ENSCCRG00000059966	ENSCCRG00000065646	btf3l4 (ENSCCRG00000007229)	ptgfr (ENSCCRG00000016580)	chrna4b (ENSCCRG00000016577) #22	ENSCCRG00000076925	zgpat (ENSCCRG00000016573) #10	rtel1 (ENSCCRG00000016545) #12	txlng (ENSCCRG00000016532)	rbb4l (ENSCCRG00000015329)	ENSCCRG00000069751	ap1s2 (ENSCCRG00000055786)	ENSCCRG00000075032	comp (ENSCCRG00000067024)	ENSCCRG00000015210	klhl26 (ENSCCRG00000042316)	ddx49 (ENSCCRG00000074092)	lsm4 (ENSCCRG00000061369)	rab3ab (ENSCCRG00000044748)	ENSCCRG00000004563
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	334	ENSSGRG00000042946	homer3b (ENSSGRG00000042944)	ENSSGRG00000042943	MAST3 (ENSSGRG00000042891)	ABCB11 (ENSSGRG00000036244)	atp5f1b (ENSSGRG00000036035)	ENSSGRG00000036027	ENSSGRG00000036026	mknk1 (ENSSGRG00000035832)	mob3c (ENSSGRG00000035828)	elovl1b (ENSSGRG00000035802)	ENSSGRG00000035800	ENSSGRG00000035799	ENSSGRG00000035798	btf3l4 (ENSSGRG00000035766)	chrna4b (ENSSGRG00000035764) #22	rtel1 (ENSSGRG00000035204) #12	txlng (ENSSGRG00000035191)	rbb4l (ENSSGRG00000035045)	ENSSGRG00000035042	ap1s2 (ENSSGRG00000035035)
Goldfish	MODERN SPECIES	29	ipo9 (ENSCARG00000009059)	shisa4 (ENSCARG00000009025)	LMOD1 (ENSCARG00000009015)	timm17a (ENSCARG00000008998)	sulf2a (ENSCARG00000008362)	arpc4l (ENSCARG00000008278)	tada3l (ENSCARG00000008264)	rab7a (ENSCARG00000008208)	slc25a26 (ENSCARG00000008169)	LRIG1 (ENSCARG00000007107)	kbtbd8 (ENSCARG00000007045)	suclg2 (ENSCARG00000006982)	elovl1b (ENSCARG00000006968)	btf3l4 (ENSCARG00000006913)	ptgfr (ENSCARG00000006897)	chrna4b (ENSCARG00000006885) #22	ENSCARG00000006864	zgpat (ENSCARG00000006852) #10	txlng (ENSCARG00000006819)	rbb4l (ENSCARG00000006691)	ZRSR2 (ENSCARG00000006659)	ap1s2 (ENSCARG00000006644)	ENSCARG00000006614	ENSCARG00000006514	klhl26 (ENSCARG00000006442)	ddx49 (ENSCARG00000006404)	lsm4 (ENSCARG00000006330)	rab3ab (ENSCARG00000006269)	ENSCARG00000006254	gadd45ba (ENSCARG00000006194)	larp6b (ENSCARG00000006181)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	349						ENSGT00950000183188.A.a.b	ENSGT00940000159912	ENSGT00940000155581.A	ENSGT00950000182931.A.a.b	ENSGT01030000234578.B.b.a	ENSGT00950000183117.a.b.a	ENSGT00940000153544.a.i.b	ENSGT00390000006349	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000156407 #11	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00940000160694.g.a #15	ENSGT00940000160694.h #15
Atlantic herring	DUPLICATION
Atlantic herring	MODERN SPECIES	21	CHCHD6 (ENSCHAG00000021993)	ENSCHAG00000022005	DLGAP4 (ENSCHAG00000022019)	quo (ENSCHAG00000022027)	ENSCHAG00000022089	VSTM2L (ENSCHAG00000022093)	tgm5l (ENSCHAG00000022099)	pxmp4 (ENSCHAG00000022119)	itcha (ENSCHAG00000022207)	NECAB3 (ENSCHAG00000024178)	cbfa2t2 (ENSCHAG00000024199)	SNTA1 (ENSCHAG00000024405)	tox2 (ENSCHAG00000024410)	RALGAPB (ENSCHAG00000024451)	KCNQ2 (ENSCHAG00000024632) #21	CHRNA4 (ENSCHAG00000024836) #22	arfrp1 (ENSCHAG00000024895) #11	STMN3 (ENSCHAG00000024912) #13	HELZ2 (ENSCHAG00000024918) #15	ENSCHAG00000024931 #15	ENSCHAG00000024935	stk35l (ENSCHAG00000024947)	bin2b (ENSCHAG00000024959)	ENSCHAG00000025002	TEX264 (ENSCHAG00000025008)	grm2b (ENSCHAG00000025014)	rrp9 (ENSCHAG00000025036)	ENSCHAG00000025136	cav4a (ENSCHAG00000025137)	cav3 (ENSCHAG00000025139)	oxtrb (ENSCHAG00000025141)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	20	jph2 (ENSCHAG00000008724)	ENSCHAG00000008685	pmelb (ENSCHAG00000008614)	alas2 (ENSCHAG00000008589)	SLC7A5 (ENSCHAG00000008567)	ENSCHAG00000008559	ENSCHAG00000008544	ENSCHAG00000008537	dennd2da (ENSCHAG00000008468)	DRAM2 (ENSCHAG00000008444)	ENSCHAG00000008343	stk38a (ENSCHAG00000008299)	ENSCHAG00000008286	PREX1 (ENSCHAG00000006889)	kcnq2a (ENSCHAG00000001903) #21	chrna4b (ENSCHAG00000001170) #22	ren (ENSCHAG00000000872)	csf1b (ENSCHAG00000000834)	ENSCHAG00000025454	neu4 (ENSCHAG00000025432)	rbm39b (ENSCHAG00000025381)	rh50 (ENSCHAG00000025269)	ENSCHAG00000025049	eif2d (ENSCHAG00000024355)	mapkapk2b (ENSCHAG00000023946)	FMOD (ENSCHAG00000023913)	or90j1 (ENSCHAG00000023907)	ENSCHAG00000023898	ENSCHAG00000023888	itga5 (ENSCHAG00000023337)	ptges3b (ENSCHAG00000023309)
Denticle herring	DUPLICATION
Denticle herring	MODERN SPECIES	3	ENSDCDG00000035462	DLGAP4 (ENSDCDG00000035463)	quo (ENSDCDG00000035467)	tgm2b (ENSDCDG00000035483)	ENSDCDG00000035511	tgm5l (ENSDCDG00000015020)	pxmp4 (ENSDCDG00000015025)	itcha (ENSDCDG00000015061)	NECAB3 (ENSDCDG00000015678)	cbfa2t2 (ENSDCDG00000015692)	SNTA1 (ENSDCDG00000016443)	tlr22 (ENSDCDG00000016451)	tox2 (ENSDCDG00000016457)	RALGAPB (ENSDCDG00000016481)	KCNQ2 (ENSDCDG00000016550) #21	ENSDCDG00000016691 #22	arfrp1 (ENSDCDG00000016693) #11	STMN3 (ENSDCDG00000016696) #13	HELZ2 (ENSDCDG00000016701) #15	ENSDCDG00000016704 #15	csrp1b (ENSDCDG00000016707)	tnni1b (ENSDCDG00000016712)	ENSDCDG00000016714	ENSDCDG00000016717	ENSDCDG00000016719	tead3b (ENSDCDG00000016722)	ENSDCDG00000016750	ENSDCDG00000016757	ENSDCDG00000016758	ENSDCDG00000016760	rplp2 (ENSDCDG00000016763)
Denticle herring	DUPLICATION
Denticle herring	MODERN SPECIES	299													ENSDCDG00000016666	PFKFB2 (ENSDCDG00000016715)	GFUS (ENSDCDG00000022009)	chrna4b (ENSDCDG00000022388) #22	atp6ap1b (ENSDCDG00000022599)	GDI1 (ENSDCDG00000022604)	ITIH6 (ENSDCDG00000022708)	pfkfb1 (ENSDCDG00000022822)	ccn5 (ENSDCDG00000029077)	rrp12 (ENSDCDG00000029095)	ubtd1a (ENSDCDG00000029259)	zdhhc16a (ENSDCDG00000029262)	mettl18 (ENSDCDG00000029307)	pgam1a (ENSDCDG00000029309)	marveld1 (ENSDCDG00000029311)
Denticle herring	MODERN SPECIES	1	ENSDCDG00000027803	ENSDCDG00000027785	rimkla (ENSDCDG00000027778)	slc16a1b (ENSDCDG00000027771)	TAFA3 (ENSDCDG00000027763)	rhocb (ENSDCDG00000027759)	mov10b.1 (ENSDCDG00000027664)	wnt2bb (ENSDCDG00000027631)	capza1b (ENSDCDG00000027075)	cttnbp2nlb (ENSDCDG00000027049)	ENSDCDG00000027046	kcnd3 (ENSDCDG00000027039)	ENSDCDG00000027034	pfkfb2a (ENSDCDG00000026508)	GFUS (ENSDCDG00000024118)	chrna4b (ENSDCDG00000023975) #22	atp6ap1b (ENSDCDG00000023963)	GDI1 (ENSDCDG00000023631)	ITIH6 (ENSDCDG00000023158)	pfkfb1 (ENSDCDG00000022375)	ccn5 (ENSDCDG00000022338)	zgc:136971 (ENSDCDG00000022335)	ENSDCDG00000022321	tbc1d25 (ENSDCDG00000022318)	ENSDCDG00000022316	ENSDCDG00000022314	ada (ENSDCDG00000022311)	zgc:136971 (ENSDCDG00000022306)	pkig (ENSDCDG00000022297)	ttpal (ENSDCDG00000022287)	hnf4a (ENSDCDG00000022170)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	313													ENSGT01000000215962	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000155167.a	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00950000183149.B
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	104				ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000159898	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155380	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155380	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155380.rd.a	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b
Fugu	MODERN SPECIES	15	agrn (ENSTRUG00000006249)	ptpn11b (ENSTRUG00000006764)	RNF223 (ENSTRUG00000020331)	DENND2C (ENSTRUG00000007448)	ampd1 (ENSTRUG00000007552)	ENSTRUG00000031631	csde1 (ENSTRUG00000007996)	sike1 (ENSTRUG00000030693)	ENSTRUG00000008412	HTR6 (ENSTRUG00000008418)	TMCO4 (ENSTRUG00000008582)	vwa1 (ENSTRUG00000008802)	RALGAPB (ENSTRUG00000008862)	PREX1 (ENSTRUG00000009041)	kcnq2a (ENSTRUG00000009776) #21	chrna4b (ENSTRUG00000010213) #22	zgpat (ENSTRUG00000010488) #10	TTI1 (ENSTRUG00000010598)	VSTM2L (ENSTRUG00000010761)	ctnnbl1 (ENSTRUG00000010777)	ENSTRUG00000011017	E2F1 (ENSTRUG00000021626)	znf341 (ENSTRUG00000011385)	itchb (ENSTRUG00000011522)	ENSTRUG00000011677	VDR (ENSTRUG00000011907)	HDAC7 (ENSTRUG00000012347)	twist3 (ENSTRUG00000012607)	ENSTRUG00000026456	ENSTRUG00000012616	chchd6a (ENSTRUG00000012780)
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	agrn (ENSTNIG00000010884)	ptpn11b (ENSTNIG00000010883)	ENSTNIG00000010882	DENND2C (ENSTNIG00000010881)	ampd1 (ENSTNIG00000010880)	ENSTNIG00000010879	csde1 (ENSTNIG00000010878)	SIKE1 (ENSTNIG00000010877)	ENSTNIG00000010876	ENSTNIG00000010875	TMCO4 (ENSTNIG00000010874)	vwa1 (ENSTNIG00000010873)	RALGAPB (ENSTNIG00000010872)	PREX1 (ENSTNIG00000010871)	kcnq2a (ENSTNIG00000010870) #21	chrna4b (ENSTNIG00000004166) #22	zgpat (ENSTNIG00000004165) #10	TTI1 (ENSTNIG00000004164)	VSTM2L (ENSTNIG00000004163)	ctnnbl1 (ENSTNIG00000004162)	ENSTNIG00000005049	E2F1 (ENSTNIG00000005050)	znf341 (ENSTNIG00000005051)	itchb (ENSTNIG00000005052)	VDR (ENSTNIG00000005559)	HDAC7 (ENSTNIG00000005200)	twist3 (ENSTNIG00000000441)	ENSTNIG00000000714	casq1b (ENSTNIG00000007414)	PEA15 (ENSTNIG00000007415)	mrpl48 (ENSTNIG00000007416)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	83	agrn (ENSLBEG00000014305)	ptpn11b (ENSLBEG00000014479)	RNF223 (ENSLBEG00000014526)	DENND2C (ENSLBEG00000014549)	ampd1 (ENSLBEG00000014590)	ENSLBEG00000014652	csde1 (ENSLBEG00000014770)	SIKE1 (ENSLBEG00000014938)	ENSLBEG00000014975	HTR6 (ENSLBEG00000015013)	TMCO4 (ENSLBEG00000015047)	vwa1 (ENSLBEG00000015080)	RALGAPB (ENSLBEG00000015168)	PREX1 (ENSLBEG00000015502)	kcnq2a (ENSLBEG00000015962) #21	chrna4b (ENSLBEG00000016241) #22	zgpat (ENSLBEG00000016259) #10	TTI1 (ENSLBEG00000016289)	ENSLBEG00000016377	ctnnbl1 (ENSLBEG00000016474)	ENSLBEG00000016593	ENSLBEG00000016633	znf341 (ENSLBEG00000016666)	itchb (ENSLBEG00000016736)	ENSLBEG00000016863	VDR (ENSLBEG00000016950)	HDAC7 (ENSLBEG00000017042)	twist3 (ENSLBEG00000017118)	ENSLBEG00000017128	ENSLBEG00000017152
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
European seabass	MODERN SPECIES	14	ENSDLAG00005019363	ENSDLAG00005022089	ENSDLAG00005034563	DENND2C (ENSDLAG00005032504)	ENSDLAG00005022825	ENSDLAG00005023188	CSDE1 (ENSDLAG00005023227)	ENSDLAG00005031029	ENSDLAG00005023929	ENSDLAG00005033304	ENSDLAG00005023937	vwa1 (ENSDLAG00005023969)	ENSDLAG00005024005	ENSDLAG00005024474	ENSDLAG00005024925 #21	ENSDLAG00005025168 #22	ENSDLAG00005025206 #10	TTI1 (ENSDLAG00005025217)	ENSDLAG00005028354	CTNNBL1 (ENSDLAG00005025251)	ENSDLAG00005001254	ENSDLAG00005032604	znf341 (ENSDLAG00005001348)	itchb (ENSDLAG00005001657)	ENSDLAG00005006159	ENSDLAG00005006796	ENSDLAG00005007001	ENSDLAG00005026429	ENSDLAG00005007137	chchd6a (ENSDLAG00005007148)	ENSDLAG00005007242
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	487	agrn (ENSLCRG00005007112)	ENSLCRG00005010078	RNF223 (ENSLCRG00005011444)	DENND2C (ENSLCRG00005011454)	ampd1 (ENSLCRG00005011483)	ENSLCRG00005012205	csde1 (ENSLCRG00005012246)	SIKE1 (ENSLCRG00005014547)	ENSLCRG00005014549	HTR6 (ENSLCRG00005014550)	TMCO4 (ENSLCRG00005014551)	vwa1 (ENSLCRG00005014560)	RALGAPB (ENSLCRG00005014563)	PREX1 (ENSLCRG00005014739)	kcnq2a (ENSLCRG00005014845) #21	chrna4b (ENSLCRG00005015422) #22	zgpat (ENSLCRG00005015426) #10	TTI1 (ENSLCRG00005015427)	ENSLCRG00005015429	ctnnbl1 (ENSLCRG00005015445)	ENSLCRG00005016090	E2F1 (ENSLCRG00005016091)	znf341 (ENSLCRG00005016093)	itchb (ENSLCRG00005016126)	ENSLCRG00005019946	VDR (ENSLCRG00005019954)	HDAC7 (ENSLCRG00005019957)	twist3 (ENSLCRG00005019962)	ENSLCRG00005019963	chchd6a (ENSLCRG00005019964)	PLXNA1 (ENSLCRG00005020020)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	21	agrn (ENSSAUG00010018051)	ptpn11b (ENSSAUG00010021325)	RNF223 (ENSSAUG00010022415)	DENND2C (ENSSAUG00010022420)	ampd1 (ENSSAUG00010022440)	ENSSAUG00010023348	csde1 (ENSSAUG00010023384)	SIKE1 (ENSSAUG00010023472)	ENSSAUG00010023475	HTR6 (ENSSAUG00010023478)	TMCO4 (ENSSAUG00010023479)	vwa1 (ENSSAUG00010023514)	RALGAPB (ENSSAUG00010023528)	PREX1 (ENSSAUG00010023706)	kcnq2a (ENSSAUG00010024701) #21	chrna4b (ENSSAUG00010025269) #22	zgpat (ENSSAUG00010025272) #10	TTI1 (ENSSAUG00010025275)	ENSSAUG00010025279	ctnnbl1 (ENSSAUG00010025290)	ENSSAUG00010025604	E2F1 (ENSSAUG00010025606)	znf341 (ENSSAUG00010025608)	itchb (ENSSAUG00010025663)	ENSSAUG00010026789	VDR (ENSSAUG00010000414)	HDAC7 (ENSSAUG00010000473)	twist3 (ENSSAUG00010000502)	ENSSAUG00010000504	chchd6a (ENSSAUG00010000508)	PLXNA1 (ENSSAUG00010000626)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00520000055634.b.a	ENSGT01100000263518.A.a.a.a	ENSGT01080000257410.C	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT00940000154484.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	22	NTSR1 (ENSCLMG00005016570)	SLCO4A1 (ENSCLMG00005016572)	ENSCLMG00005016593	DENND2C (ENSCLMG00005016597)	ampd1 (ENSCLMG00005016601)	ENSCLMG00005016694	csde1 (ENSCLMG00005016725)	SIKE1 (ENSCLMG00005019234)	ENSCLMG00005019235	ENSCLMG00005019236	TMCO4 (ENSCLMG00005019251)	vwa1 (ENSCLMG00005019255)	RALGAPB (ENSCLMG00005019257)	PREX1 (ENSCLMG00005019263)	kcnq2a (ENSCLMG00005019317) #21	chrna4b (ENSCLMG00005019326) #22	zgpat (ENSCLMG00005019354) #10	TTI1 (ENSCLMG00005019357)	VSTM2L (ENSCLMG00005019366)	ctnnbl1 (ENSCLMG00005019378)	ENSCLMG00005020183	ENSCLMG00005020188	znf341 (ENSCLMG00005020191)	itchb (ENSCLMG00005020232)	KLHL10 (ENSCLMG00005021415)	ENSCLMG00005021416	VDR (ENSCLMG00005021420)	HDAC7 (ENSCLMG00005021433)	ENSCLMG00005000067	ENSCLMG00005000091	ENSCLMG00005000106
Stickleback	MODERN SPECIES	11	SNPH (ENSGACG00000004424)	NTSR1 (ENSGACG00000004431)	SLCO4A1 (ENSGACG00000004451)	DENND2C (ENSGACG00000004454)	ampd1 (ENSGACG00000004467)	ENSGACG00000004542	csde1 (ENSGACG00000004544)	SIKE1 (ENSGACG00000004553)	ENSGACG00000004575	ENSGACG00000004580	ENSGACG00000004585	vwa1 (ENSGACG00000004594)	RALGAPB (ENSGACG00000004605)	PREX1 (ENSGACG00000004620)	kcnq2a (ENSGACG00000004646) #21	chrna4b (ENSGACG00000004655) #22	zgpat (ENSGACG00000004662) #10	TTI1 (ENSGACG00000004667)	VSTM2L (ENSGACG00000004677)	ctnnbl1 (ENSGACG00000004681)	ENSGACG00000004708	ENSGACG00000004709	E2F1 (ENSGACG00000004732)	znf341 (ENSGACG00000004734)	itchb (ENSGACG00000004740)	ENSGACG00000004753	VDR (ENSGACG00000004763)	twist3 (ENSGACG00000004773)	ENSGACG00000004776	ENSGACG00000004778	PLXNA1 (ENSGACG00000004780)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	21	agrn (ENSCGOG00000014988)	ptpn11b (ENSCGOG00000016909)	RNF223 (ENSCGOG00000017557)	DENND2C (ENSCGOG00000017560)	ampd1 (ENSCGOG00000017617)	ENSCGOG00000018979	csde1 (ENSCGOG00000019005)	SIKE1 (ENSCGOG00000020182)	ENSCGOG00000020185	HTR6 (ENSCGOG00000020186)	TMCO4 (ENSCGOG00000020191)	vwa1 (ENSCGOG00000020237)	RALGAPB (ENSCGOG00000020326)	PREX1 (ENSCGOG00000021398)	kcnq2a (ENSCGOG00000022335) #21	chrna4b (ENSCGOG00000022504) #22	zgpat (ENSCGOG00000022585) #10	TTI1 (ENSCGOG00000022586)	ENSCGOG00000022588	ctnnbl1 (ENSCGOG00000022594)	ENSCGOG00000022713	ENSCGOG00000022714	znf341 (ENSCGOG00000022717)	ENSCGOG00000022732	itchb (ENSCGOG00000022775)	ENSCGOG00000023470	ENSCGOG00000023512	VDR (ENSCGOG00000023518)	HDAC7 (ENSCGOG00000023547)	twist3 (ENSCGOG00000003858)	ENSCGOG00000003866
Pike perch	MODERN SPECIES	7	agrn (ENSSLUG00000025665)	ptpn11b (ENSSLUG00000025566)	RNF223 (ENSSLUG00000025560)	DENND2C (ENSSLUG00000025554)	ampd1 (ENSSLUG00000025520)	ENSSLUG00000025478	csde1 (ENSSLUG00000025415)	SIKE1 (ENSSLUG00000025370)	ENSSLUG00000025369	ENSSLUG00000025368	TMCO4 (ENSSLUG00000025352)	vwa1 (ENSSLUG00000025344)	RALGAPB (ENSSLUG00000025314)	PREX1 (ENSSLUG00000025148)	KCNQ2 (ENSSLUG00000025108) #21	chrna4b (ENSSLUG00000025095) #22	zgpat (ENSSLUG00000025089) #10	TTI1 (ENSSLUG00000025082)	ENSSLUG00000025081	ctnnbl1 (ENSSLUG00000025049)	ENSSLUG00000025033	E2F1 (ENSSLUG00000025028)	znf341 (ENSSLUG00000025014)	itchb (ENSSLUG00000023025)	ENSSLUG00000022720	VDR (ENSSLUG00000022658)	HDAC7 (ENSSLUG00000022517)	ENSSLUG00000022483	ENSSLUG00000022477	chchd6a (ENSSLUG00000022471)	PLXNA1 (ENSSLUG00000020983)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Turbot	MODERN SPECIES	2	ENSSMAG00000036720	ENSSMAG00000007504	ENSSMAG00000007493	ENSSMAG00000007477	atp13a2 (ENSSMAG00000007454)	szrd1 (ENSSMAG00000007430)	ENSSMAG00000007203	ENSSMAG00000007182	ENSSMAG00000033188	ENSSMAG00000007162	ENSSMAG00000007146	vwa1 (ENSSMAG00000007138)	ENSSMAG00000006970	ENSSMAG00000006763	ENSSMAG00000006690 #21	ENSSMAG00000006668 #22	ENSSMAG00000006646 #10	TTI1 (ENSSMAG00000006607)	ENSSMAG00000006588	CTNNBL1 (ENSSMAG00000006545)	ENSSMAG00000006502	ENSSMAG00000006487	znf341 (ENSSMAG00000006473)	itchb (ENSSMAG00000006375)	ENSSMAG00000006322	ENSSMAG00000006291	ENSSMAG00000006192	ENSSMAG00000027871	chchd6a (ENSSMAG00000006137)	ENSSMAG00000006041	ENSSMAG00000027996
Tongue sole	MODERN SPECIES	1	ENSCSEG00000002695	ERC2 (ENSCSEG00000002685)	wnt5a (ENSCSEG00000002679)	DENND2C (ENSCSEG00000002671)	ampd1 (ENSCSEG00000002666)	ENSCSEG00000002663	csde1 (ENSCSEG00000002620)	ENSCSEG00000002607	ENSCSEG00000002600	HTR6 (ENSCSEG00000002597)	TMCO4 (ENSCSEG00000002586)	vwa1 (ENSCSEG00000002431)	RALGAPB (ENSCSEG00000002363)	PREX1 (ENSCSEG00000002335)	kcnq2a (ENSCSEG00000002322) #21	chrna4b (ENSCSEG00000002311) #22	zgpat (ENSCSEG00000002301) #10	TTI1 (ENSCSEG00000002293)	ENSCSEG00000002288	ENSCSEG00000002282	ENSCSEG00000002275	sars1 (ENSCSEG00000002268)	zgc:77056 (ENSCSEG00000002264)	tmem106c (ENSCSEG00000002259)	ENSCSEG00000002248	krt18a.2 (ENSCSEG00000002243)	krt18a.1 (ENSCSEG00000002241)	krt8 (ENSCSEG00000002231)	B4GALT3 (ENSCSEG00000002223)	atp6ap1lb (ENSCSEG00000002217)	ENSCSEG00000002214
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	120				ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2740															kcnq2a (ENSSLDG00000019384) #21	chrna4b (ENSSLDG00000019411) #22	zgpat (ENSSLDG00000019446) #10	TTI1 (ENSSLDG00000019461)	ENSSLDG00000019483	ctnnbl1 (ENSSLDG00000019503)	ENSSLDG00000019550	E2F1 (ENSSLDG00000019631)	znf341 (ENSSLDG00000019660)	itchb (ENSSLDG00000019708)	ENSSLDG00000019783	VDR (ENSSLDG00000019807)	HDAC7 (ENSSLDG00000019841)	twist3 (ENSSLDG00000019889)	ENSSLDG00000019894	chchd6a (ENSSLDG00000019909)	PLXNA1 (ENSSLDG00000019941)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	96				DENND2C (ENSSDUG00000015661)	ampd1 (ENSSDUG00000015597)	ENSSDUG00000015578	csde1 (ENSSDUG00000015380)	SIKE1 (ENSSDUG00000015326)	ENSSDUG00000015298	HTR6 (ENSSDUG00000015285)	TMCO4 (ENSSDUG00000015259)	vwa1 (ENSSDUG00000015233)	RALGAPB (ENSSDUG00000015149)	PREX1 (ENSSDUG00000015028)	kcnq2a (ENSSDUG00000014794) #21	chrna4b (ENSSDUG00000014704) #22	zgpat (ENSSDUG00000014684) #10	TTI1 (ENSSDUG00000014660)	VSTM2L (ENSSDUG00000014651)	ctnnbl1 (ENSSDUG00000014630)	ENSSDUG00000014595	E2F1 (ENSSDUG00000014566)	znf341 (ENSSDUG00000014540)	itchb (ENSSDUG00000014398)	ENSSDUG00000014324	VDR (ENSSDUG00000014288)	HDAC7 (ENSSDUG00000014235)	twist3 (ENSSDUG00000014227)	ENSSDUG00000014220	ENSSDUG00000014214	chchd6a (ENSSDUG00000014204)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	62	ENSLCAG00010003921	RNF223 (ENSLCAG00010004007)	ENSLCAG00010004010	ENSLCAG00010004013	ampd1 (ENSLCAG00010004138)	ENSLCAG00010004648	csde1 (ENSLCAG00010004839)	SIKE1 (ENSLCAG00010005854)	ENSLCAG00010005858	HTR6 (ENSLCAG00010005863)	TMCO4 (ENSLCAG00010005868)	vwa1 (ENSLCAG00010005881)	RALGAPB (ENSLCAG00010005919)	PREX1 (ENSLCAG00010006060)	kcnq2a (ENSLCAG00010006318) #21	chrna4b (ENSLCAG00010006389) #22	zgpat (ENSLCAG00010006396) #10	ENSLCAG00010006401	TTI1 (ENSLCAG00010006406)	ENSLCAG00010006411	ctnnbl1 (ENSLCAG00010006430)	ENSLCAG00010006494	ENSLCAG00010006507	znf341 (ENSLCAG00010006512)	itchb (ENSLCAG00010006875)	ENSLCAG00010008065	VDR (ENSLCAG00010008096)	HDAC7 (ENSLCAG00010008134)	twist3 (ENSLCAG00010008159)	ENSLCAG00010008164	chchd6a (ENSLCAG00010008169)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT00940000164988	ENSGT00940000154484.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT01030000234583.a.b.b.f	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	21	ENSMAMG00000013283	ENSMAMG00000013236	ENSMAMG00000013221	DENND2C (ENSMAMG00000013134)	ENSMAMG00000008994	ENSMAMG00000028707	CSDE1 (ENSMAMG00000008821)	ENSMAMG00000008805	ENSMAMG00000026350	ENSMAMG00000008762	ENSMAMG00000008710	ENSMAMG00000008686	ENSMAMG00000008647	ENSMAMG00000008393	ENSMAMG00000008331 #21	ENSMAMG00000008298 #22	ENSMAMG00000008266 #10	TTI1 (ENSMAMG00000008219)	ENSMAMG00000008178	CTNNBL1 (ENSMAMG00000008115)	ENSMAMG00000008074	ENSMAMG00000008052	znf341 (ENSMAMG00000008000)	itchb (ENSMAMG00000007923)	ENSMAMG00000007892	ENSMAMG00000007869	ENSMAMG00000007788	ENSMAMG00000007779	ENSMAMG00000027581	chchd6a (ENSMAMG00000007740)	ENSMAMG00000007556
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT00940000154484.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT01030000234583.a.b.b.f	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	18	ENSBSLG00000013935	ptpn11b (ENSBSLG00000014153)	RNF223 (ENSBSLG00000014746)	DENND2C (ENSBSLG00000014757)	ampd1 (ENSBSLG00000014875)	ENSBSLG00000016455	csde1 (ENSBSLG00000016489)	SIKE1 (ENSBSLG00000019070)	ENSBSLG00000019084	ENSBSLG00000019100	TMCO4 (ENSBSLG00000019142)	vwa1 (ENSBSLG00000019304)	RALGAPB (ENSBSLG00000019309)	PREX1 (ENSBSLG00000019588)	kcnq2a (ENSBSLG00000020721) #21	chrna4b (ENSBSLG00000021098) #22	zgpat (ENSBSLG00000021208) #10	TTI1 (ENSBSLG00000021259)	ENSBSLG00000021278	ctnnbl1 (ENSBSLG00000021326)	E2F1 (ENSBSLG00000021619)	znf341 (ENSBSLG00000021630)	itchb (ENSBSLG00000021781)	ENSBSLG00000023524	plekhm2 (ENSBSLG00000023792)	ddost (ENSBSLG00000024220)	ZBTB17 (ENSBSLG00000024283)	hspb7 (ENSBSLG00000024284)	clcnk (ENSBSLG00000024288)	ENSBSLG00000024308	ENSBSLG00000024321
Climbing perch	MODERN SPECIES	20	ENSATEG00000004060	ENSATEG00000004040	DENND2C (ENSATEG00000004030)	ENSATEG00000003961	ENSATEG00000029204	CSDE1 (ENSATEG00000003864)	ENSATEG00000003841	ENSATEG00000003796	ENSATEG00000026807	ENSATEG00000003731	vwa1 (ENSATEG00000003719)	ENSATEG00000003680	ENSATEG00000003472	ENSATEG00000003394 #21	ENSATEG00000003383	ENSATEG00000003363 #22	ENSATEG00000003346 #10	TTI1 (ENSATEG00000003339)	ENSATEG00000027996	CTNNBL1 (ENSATEG00000003253)	ENSATEG00000003225	ENSATEG00000026074	znf341 (ENSATEG00000003196)	itchb (ENSATEG00000003069)	ENSATEG00000003051	ENSATEG00000003039	ENSATEG00000003014	ENSATEG00000002983	ENSATEG00000028964	chchd6a (ENSATEG00000002960)	ENSATEG00000002791
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00390000000020.a	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00390000007643	ENSGT01030000234558.A.a.a.b	ENSGT00390000003809	ENSGT00940000159173	ENSGT00390000003022	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT00390000017394
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00390000000020.a	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00390000007643	ENSGT01030000234558.A.a.a.b	ENSGT00390000003809	ENSGT00940000159173	ENSGT00390000003022	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT00390000017394
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1267								hist2h2l (ENSAOCG00000014189)	ENSAOCG00000014264	ENSAOCG00000014291	ENSAOCG00000014302	hspa8 (ENSAOCG00000014331)	bsx (ENSAOCG00000014346)	lim2.1 (ENSAOCG00000014364)	ntm (ENSAOCG00000014399)	chrna4b (ENSAOCG00000014427) #22	zgpat (ENSAOCG00000014437) #10	TTI1 (ENSAOCG00000014454)	ENSAOCG00000014467	ctnnbl1 (ENSAOCG00000014518)	ENSAOCG00000000956	znf341 (ENSAOCG00000000960)	MTCH1 (ENSAOCG00000000981)	phc2a (ENSAOCG00000014775)	ENSAOCG00000014791	si:dkeyp-104h9.5 (ENSAOCG00000014801)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	22	ptpn11b (ENSAPEG00000007668)	ENSAPEG00000007645	ptpn11b (ENSAPEG00000007583)	DENND2C (ENSAPEG00000007457)	ampd1 (ENSAPEG00000007395)	ENSAPEG00000007373	csde1 (ENSAPEG00000007194)	SIKE1 (ENSAPEG00000007134)	ENSAPEG00000007118	ENSAPEG00000007097	TMCO4 (ENSAPEG00000007080)	vwa1 (ENSAPEG00000007069)	RALGAPB (ENSAPEG00000006935)	PREX1 (ENSAPEG00000006771)	kcnq2a (ENSAPEG00000006700) #21	chrna4b (ENSAPEG00000006594) #22	zgpat (ENSAPEG00000006555) #10	TTI1 (ENSAPEG00000006505)	ENSAPEG00000006489	ctnnbl1 (ENSAPEG00000006430)	ENSAPEG00000006415	znf341 (ENSAPEG00000006358)	MTCH1 (ENSAPEG00000006331)	phc2a (ENSAPEG00000006309)	si:dkeyp-104h9.5 (ENSAPEG00000006293)	plod1a (ENSAPEG00000006235)	ccdc22 (ENSAPEG00000006218)	tbc1d25 (ENSAPEG00000006189)	ndufb11 (ENSAPEG00000006168)	rtel1 (ENSAPEG00000005998) #12	icmt (ENSAPEG00000005970)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1075														PREX1 (ENSAPOG00000001679)	kcnq2a (ENSAPOG00000001704) #21	chrna4b (ENSAPOG00000001720) #22	zgpat (ENSAPOG00000001732) #10	TTI1 (ENSAPOG00000001755)	VSTM2L (ENSAPOG00000001767)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	976				ampd1 (ENSSPAG00000000873)	ENSSPAG00000000845	csde1 (ENSSPAG00000000716)	SIKE1 (ENSSPAG00000000699)	ENSSPAG00000000682	HTR6 (ENSSPAG00000000660)	TMCO4 (ENSSPAG00000000559)	vwa1 (ENSSPAG00000000544)	RALGAPB (ENSSPAG00000000395)	ENSSPAG00000000379	PREX1 (ENSSPAG00000000242)	kcnq2a (ENSSPAG00000000195) #21	chrna4b (ENSSPAG00000022482) #22	zgpat (ENSSPAG00000022473) #10	TTI1 (ENSSPAG00000022442)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000158459	ENSGT00940000161187	ENSGT00390000012439	ENSGT00940000158097	ENSGT00940000160919	ENSGT00940000169158	ENSGT01030000234571.b.b.b.a.b	ENSGT00940000164482	ENSGT00390000015175	ENSGT00390000017294	ENSGT00940000159957	ENSGT00390000010674.b	ENSGT00940000164106
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000158459	ENSGT00940000161187	ENSGT00390000012439	ENSGT00940000158097	ENSGT00940000160919	ENSGT01030000234571.b.b.b.a.b	ENSGT00940000164482	ENSGT00390000015175	ENSGT00390000017294	ENSGT00940000159957	ENSGT00390000010674.b	ENSGT00940000164106	ENSGT00950000183106.b
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000178462	ENSGT00940000158459	ENSGT00940000161187	ENSGT00390000012439	ENSGT00940000158097	ENSGT00940000160919	ENSGT01030000234571.b.b.b.a.b	ENSGT00940000164482	ENSGT00390000015175	ENSGT00390000017294	ENSGT00940000159957	ENSGT00390000010674.b	ENSGT00940000164106
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000178462	ENSGT00940000158459	ENSGT00940000161187	ENSGT00390000012439	ENSGT00940000158097	ENSGT00940000160919	ENSGT01030000234571.b.b.b.a.b	ENSGT00940000164482	ENSGT00390000015175	ENSGT00390000017294	ENSGT00940000159957	ENSGT00390000010674.b	ENSGT00940000164106
P. nyererei	MODERN SPECIES	334	agrn (ENSPNYG00000014019)	ptpn11b (ENSPNYG00000013984)	RNF223 (ENSPNYG00000013966)	DENND2C (ENSPNYG00000013944)	ampd1 (ENSPNYG00000013894)	ENSPNYG00000013856	csde1 (ENSPNYG00000013745)	SIKE1 (ENSPNYG00000013674)	micos10 (ENSPNYG00000013653)	HTR6 (ENSPNYG00000013635)	TMCO4 (ENSPNYG00000013618)	vwa1 (ENSPNYG00000013596)	RALGAPB (ENSPNYG00000013512)	PREX1 (ENSPNYG00000013363)	kcnq2a (ENSPNYG00000013306) #21	chrna4b (ENSPNYG00000013286) #22	zgpat (ENSPNYG00000013216) #10	TTI1 (ENSPNYG00000013179)	ENSPNYG00000013154	ENSPNYG00000013136	MMP23B (ENSPNYG00000013104)	ubiad1 (ENSPNYG00000013083)	mib2 (ENSPNYG00000013047)	TTLL10 (ENSPNYG00000012912)	ARHGEF19 (ENSPNYG00000012863)	ENSPNYG00000012819	plekhm2 (ENSPNYG00000012736)	ddost (ENSPNYG00000012623)	ZBTB17 (ENSPNYG00000012572)	hspb7 (ENSPNYG00000012529)	clcnk (ENSPNYG00000012503)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000178462	ENSGT00940000158459	ENSGT00940000161187	ENSGT00390000012439	ENSGT00940000158097	ENSGT00940000160919	ENSGT01030000234571.b.b.b.a.b	ENSGT00940000164482	ENSGT00390000015175	ENSGT00390000017294	ENSGT00940000159957	ENSGT00390000010674.b	ENSGT00940000164106
Eastern happy	MODERN SPECIES	12	agrn (ENSACLG00000012612)	ptpn11b (ENSACLG00000013241)	RNF223 (ENSACLG00000013260)	DENND2C (ENSACLG00000013264)	ampd1 (ENSACLG00000013276)	ENSACLG00000013290	csde1 (ENSACLG00000013296)	SIKE1 (ENSACLG00000013315)	ENSACLG00000013318	HTR6 (ENSACLG00000013322)	TMCO4 (ENSACLG00000013327)	vwa1 (ENSACLG00000013358)	RALGAPB (ENSACLG00000013369)	PREX1 (ENSACLG00000013527)	kcnq2a (ENSACLG00000013614) #21	chrna4b (ENSACLG00000013765) #22	zgpat (ENSACLG00000013778) #10	TTI1 (ENSACLG00000013798)	ENSACLG00000013858	ENSACLG00000013935	twist3 (ENSACLG00000013952)	HDAC7 (ENSACLG00000013983)	VDR (ENSACLG00000014083)	ENSACLG00000014179	itchb (ENSACLG00000014241)	znf341 (ENSACLG00000014349)	E2F1 (ENSACLG00000014388)	ENSACLG00000014422	ctnnbl1 (ENSACLG00000014515)	ENSACLG00000014560	ENSACLG00000014582
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1103	bcas2 (ENSMZEG00005021757)	ptpn11b (ENSMZEG00005021748)	RNF223 (ENSMZEG00005021743)	ENSMZEG00005021735	ampd1 (ENSMZEG00005021714)	ENSMZEG00005021708	csde1 (ENSMZEG00005021675)	SIKE1 (ENSMZEG00005021665)	ENSMZEG00005021664	HTR6 (ENSMZEG00005021663)	TMCO4 (ENSMZEG00005021660)	vwa1 (ENSMZEG00005021656)	RALGAPB (ENSMZEG00005021651)	PREX1 (ENSMZEG00005021638)	kcnq2a (ENSMZEG00005021631) #21	chrna4b (ENSMZEG00005021625) #22	zgpat (ENSMZEG00005021620) #10	TTI1 (ENSMZEG00005021616)	ENSMZEG00005021611	cdk11b (ENSMZEG00005021598)	MMP23B (ENSMZEG00005021593)	ubiad1 (ENSMZEG00005021589)	mib2 (ENSMZEG00005021579)	ENSMZEG00005021564	ARHGEF19 (ENSMZEG00005021560)	ENSMZEG00005021550	plekhm2 (ENSMZEG00005021537)	ddost (ENSMZEG00005021534)	ZBTB17 (ENSMZEG00005021531)	hspb7 (ENSMZEG00005021524)	clcnk (ENSMZEG00005021519)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	1457																chrna4b (ENSHBUG00000010335) #22	zgpat (ENSHBUG00000010362) #10	TTI1 (ENSHBUG00000010383)	ENSHBUG00000001163
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	298	ptpn11b (ENSNBRG00000020391)	RNF223 (ENSNBRG00000020697)	ENSNBRG00000020707	ampd1 (ENSNBRG00000020746)	ENSNBRG00000020793	csde1 (ENSNBRG00000020808)	znhit1 (ENSNBRG00000020846)	SIKE1 (ENSNBRG00000020856)	ENSNBRG00000020862	HTR6 (ENSNBRG00000020872)	TMCO4 (ENSNBRG00000020883)	vwa1 (ENSNBRG00000020935)	RALGAPB (ENSNBRG00000020976)	PREX1 (ENSNBRG00000021211)	kcnq2a (ENSNBRG00000021311) #21	chrna4b (ENSNBRG00000021495) #22	zgpat (ENSNBRG00000021521) #10	TTI1 (ENSNBRG00000021577)	ENSNBRG00000021608	cdk11b (ENSNBRG00000021642)	MMP23B (ENSNBRG00000021726)	ubiad1 (ENSNBRG00000021744)	mib2 (ENSNBRG00000021760)	ARHGEF19 (ENSNBRG00000021825)	ENSNBRG00000021857	plekhm2 (ENSNBRG00000021891)	ddost (ENSNBRG00000021934)	ZBTB17 (ENSNBRG00000021960)	hspb7 (ENSNBRG00000021982)	clcnk (ENSNBRG00000022013)	fam131c (ENSNBRG00000022050)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	12	ptpn11b (ENSONIG00000009293)	RNF223 (ENSONIG00000009295)	ENSONIG00000034111	DENND2C (ENSONIG00000009297)	ampd1 (ENSONIG00000009299)	ENSONIG00000041385	csde1 (ENSONIG00000009309)	SIKE1 (ENSONIG00000009319)	ENSONIG00000035010	ENSONIG00000009321	TMCO4 (ENSONIG00000009323)	vwa1 (ENSONIG00000009327)	RALGAPB (ENSONIG00000009329)	PREX1 (ENSONIG00000009336)	kcnq2a (ENSONIG00000009352) #21	chrna4b (ENSONIG00000009364) #22	zgpat (ENSONIG00000009365) #10	ENSONIG00000035461	ENSONIG00000009367	ENSONIG00000034132	ENSONIG00000017911	las1l (ENSONIG00000031944)	cdk11b (ENSONIG00000006512)	MMP23B (ENSONIG00000006519)	ubiad1 (ENSONIG00000006522)	mib2 (ENSONIG00000006525)	TTLL10 (ENSONIG00000006528)	ENSONIG00000040541	ARHGEF19 (ENSONIG00000006529)	ENSONIG00000006530	plekhm2 (ENSONIG00000006540)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	869	ptpn11b (ENSACIG00000015071)	RNF223 (ENSACIG00000015101)	ENSACIG00000015103	ampd1 (ENSACIG00000015125)	ENSACIG00000015161	csde1 (ENSACIG00000015175)	ENSACIG00000015225	SIKE1 (ENSACIG00000015228)	ENSACIG00000015244	HTR6 (ENSACIG00000015275)	TMCO4 (ENSACIG00000015285)	vwa1 (ENSACIG00000015320)	RALGAPB (ENSACIG00000015365)	PREX1 (ENSACIG00000015727)	kcnq2a (ENSACIG00000015825) #21	chrna4b (ENSACIG00000015916) #22	zgpat (ENSACIG00000015939) #10	TTI1 (ENSACIG00000016000)	VSTM2L (ENSACIG00000016084)	ctnnbl1 (ENSACIG00000016096)	ENSACIG00000016134	E2F1 (ENSACIG00000016163)	znf341 (ENSACIG00000016180)	itchb (ENSACIG00000016245)	ENSACIG00000016493	VDR (ENSACIG00000016524)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	18	agrn (ENSKMAG00000005430)	ptpn11b (ENSKMAG00000005510)	RNF223 (ENSKMAG00000005538)	DENND2C (ENSKMAG00000005555)	ampd1 (ENSKMAG00000005597)	ENSKMAG00000005635	csde1 (ENSKMAG00000005685)	SIKE1 (ENSKMAG00000005832)	ENSKMAG00000005847	HTR6 (ENSKMAG00000005867)	TMCO4 (ENSKMAG00000005895)	vwa1 (ENSKMAG00000005979)	RALGAPB (ENSKMAG00000006031)	PREX1 (ENSKMAG00000006248)	kcnq2a (ENSKMAG00000006391) #21	chrna4b (ENSKMAG00000006487) #22	zgpat (ENSKMAG00000006523) #10	TTI1 (ENSKMAG00000006550)	ENSKMAG00000006606	ctnnbl1 (ENSKMAG00000006624)	E2F1 (ENSKMAG00000006661)	znf341 (ENSKMAG00000006686)	itchb (ENSKMAG00000006758)	ENSKMAG00000006867	VDR (ENSKMAG00000006886)	HDAC7 (ENSKMAG00000006932)	twist3 (ENSKMAG00000007022)	ENSKMAG00000007038	chchd6a (ENSKMAG00000007060)	PLXNA1 (ENSKMAG00000007119)	CHST13 (ENSKMAG00000007227)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1624	CHST13 (ENSNFUG00015024699)	PLXNA1 (ENSNFUG00015024533)	ENSNFUG00015024496	ENSNFUG00015024493	ENSNFUG00015024492	chchd6a (ENSNFUG00015024485)	ENSNFUG00015024480	twist3 (ENSNFUG00015024475)	HDAC7 (ENSNFUG00015024446)	VDR (ENSNFUG00015024414)	CABZ01088025.1 (ENSNFUG00015024400)	ITCH (ENSNFUG00015020682)	znf341 (ENSNFUG00015020454)	Nfu_g_1_001533 (ENSNFUG00015020448)	ENSNFUG00015020439	CHRNA4 (ENSNFUG00015020434) #22	ZGPAT (ENSNFUG00015020428) #10	ENSNFUG00015020425	TTI1 (ENSNFUG00015020398)	VSTM2L (ENSNFUG00015020389)	CTNNBL1 (ENSNFUG00015020058)	trim33 (ENSNFUG00015019481)	bcas2 (ENSNFUG00015019425)	OTUD3 (ENSNFUG00015019423)	TMEM240 (ENSNFUG00015019420)	SDHB (ENSNFUG00015019414)	ATP13A2 (ENSNFUG00015019337)	KDM5B (ENSNFUG00015016049)	ENSNFUG00015015829	KLHL12 (ENSNFUG00015015811)	ptpn1 (ENSNFUG00015015787)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000178711	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b
Mummichog	MODERN SPECIES	2191	ENSFHEG00000011052	RNF223 (ENSFHEG00000011048)	ENSFHEG00000000734	DENND2C (ENSFHEG00000011013)	ampd1 (ENSFHEG00000010948)	ENSFHEG00000010839	csde1 (ENSFHEG00000010799)	SIKE1 (ENSFHEG00000010567)	ENSFHEG00000010550	HTR6 (ENSFHEG00000010544)	TMCO4 (ENSFHEG00000010535)	vwa1 (ENSFHEG00000010523)	RALGAPB (ENSFHEG00000010507)	PREX1 (ENSFHEG00000010459)	kcnq2a (ENSFHEG00000010323) #21	chrna4b (ENSFHEG00000009994) #22	zgpat (ENSFHEG00000009966) #10	TTI1 (ENSFHEG00000009939)	ENSFHEG00000009923	ctnnbl1 (ENSFHEG00000009893)	ENSFHEG00000009841	ENSFHEG00000009829	E2F1 (ENSFHEG00000009783)	znf341 (ENSFHEG00000009763)	itchb (ENSFHEG00000009666)	ENSFHEG00000009618	VDR (ENSFHEG00000009605)	HDAC7 (ENSFHEG00000009554)	twist3 (ENSFHEG00000009517)	ENSFHEG00000009508	ENSFHEG00000009491
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	326		GRM8 (ENSCVAG00000006872)	ENSCVAG00000006883	ENSCVAG00000006893	gpr37b (ENSCVAG00000000677)	TMEM229A (ENSCVAG00000006914)	WASL (ENSCVAG00000007005)	LMOD2 (ENSCVAG00000007017)	asb15b (ENSCVAG00000007024)	kitlgb (ENSCVAG00000007029)	ENSCVAG00000007035	ENSCVAG00000007044	ints13 (ENSCVAG00000007126)	ANO6 (ENSCVAG00000007193)	ENSCVAG00000007224	chrna4b (ENSCVAG00000007248) #22	zgpat (ENSCVAG00000007255) #10	TTI1 (ENSCVAG00000007275)	VSTM2L (ENSCVAG00000007292)	ctnnbl1 (ENSCVAG00000007351)
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950.pb	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Poecilia	DUPLICATION
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	98	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950.pb	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329.o #22
Guppy	MODERN SPECIES	459	ENSPREG00000011437	DENND2C (ENSPREG00000011464)	ampd1 (ENSPREG00000011534)	ENSPREG00000011578	csde1 (ENSPREG00000011631)	SIKE1 (ENSPREG00000011886)	ENSPREG00000011895	HTR6 (ENSPREG00000011926)	ENSPREG00000011936	vwa1 (ENSPREG00000011949)	RALGAPB (ENSPREG00000012011)	ENSPREG00000012255	PREX1 (ENSPREG00000012299)	ENSPREG00000012441	kcnq2a (ENSPREG00000012457) #21	chrna4b (ENSPREG00000012536) #22	ENSPREG00000012563	prkar2aa (ENSPREG00000012594)	mgll (ENSPREG00000012613)	SLC26A6 (ENSPREG00000012628)	wdr6 (ENSPREG00000012649)	CELSR3 (ENSPREG00000012697)	dalrd3 (ENSPREG00000012917)	impdh2 (ENSPREG00000012972)	arih2 (ENSPREG00000013022)	xpc (ENSPREG00000013160)	si:dkey-72l14.3 (ENSPREG00000013225)	borcs6 (ENSPREG00000013240)	ENSPREG00000013252	sema3h (ENSPREG00000013271)	ENSPREG00000013347
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159329.o #22
Sailfin molly	MODERN SPECIES	2735															ENSPLAG00000012802	ENSPLAG00000012782 #22
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159329.p #22
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159329.p #22
Amazon molly	MODERN SPECIES	710																chrna4b (ENSPFOG00000010251) #22	ENSPFOG00000023781	zgpat (ENSPFOG00000010326) #10	TTI1 (ENSPFOG00000010333)	VSTM2L (ENSPFOG00000010476)	ctnnbl1 (ENSPFOG00000010501)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	3078																chrna4b (ENSPLAG00000005374) #22
Platyfish	MODERN SPECIES		ENSXMAG00000023604	ptpn11b (ENSXMAG00000012317)	RNF223 (ENSXMAG00000012315)	DENND2C (ENSXMAG00000026573)	ampd1 (ENSXMAG00000009029)	csde1 (ENSXMAG00000009080)	ENSXMAG00000009079	SIKE1 (ENSXMAG00000000910)	ENSXMAG00000021064	HTR6 (ENSXMAG00000006934)	TMCO4 (ENSXMAG00000006941)	vwa1 (ENSXMAG00000004822)	RALGAPB (ENSXMAG00000004783)	PREX1 (ENSXMAG00000028502)	kcnq2a (ENSXMAG00000001952) #21	chrna4b (ENSXMAG00000004772) #22	zgpat (ENSXMAG00000004759) #10	TTI1 (ENSXMAG00000004725)	VSTM2L (ENSXMAG00000004719)	ctnnbl1 (ENSXMAG00000004678)	ENSXMAG00000026194	E2F1 (ENSXMAG00000004669)	znf341 (ENSXMAG00000014133)	itchb (ENSXMAG00000004641)	ENSXMAG00000004623	VDR (ENSXMAG00000004608)	HDAC7 (ENSXMAG00000004559)	twist3 (ENSXMAG00000022265)	ENSXMAG00000004552	chchd6a (ENSXMAG00000028517)	PLXNA1 (ENSXMAG00000001369)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b.d	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345.d	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b.d	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345.d	ENSGT00940000164988	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	23	ENSOMEG00000015880	ENSOMEG00000015863	ampd1 (ENSOMEG00000015807)	ENSOMEG00000015735	ENSOMEG00000015717	ENSOMEG00000000993	csde1 (ENSOMEG00000015656)	SIKE1 (ENSOMEG00000015539)	ENSOMEG00000015509	ENSOMEG00000015489	TMCO4 (ENSOMEG00000015469)	vwa1 (ENSOMEG00000015422)	RALGAPB (ENSOMEG00000015358)	PREX1 (ENSOMEG00000015158)	kcnq2a (ENSOMEG00000014836) #21	chrna4b (ENSOMEG00000014686) #22	zgpat (ENSOMEG00000014655) #10	TTI1 (ENSOMEG00000014623)	ENSOMEG00000014584	ctnnbl1 (ENSOMEG00000014563)	ENSOMEG00000014470	znf341 (ENSOMEG00000014403)	E2F1 (ENSOMEG00000014342)	itchb (ENSOMEG00000014323)	ENSOMEG00000014287	VDR (ENSOMEG00000014238)	HDAC7 (ENSOMEG00000014188)	twist3 (ENSOMEG00000014023)	ENSOMEG00000013984	chchd6a (ENSOMEG00000013926)	PLXNA1 (ENSOMEG00000013858)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	21	ptpn11b (ENSOJAG00000009503)	ENSOJAG00000011432	ENSOJAG00000011453	DENND2C (ENSOJAG00000011464)	ampd1 (ENSOJAG00000011541)	ENSOJAG00000013497	csde1 (ENSOJAG00000013596)	SIKE1 (ENSOJAG00000015009)	ENSOJAG00000015019	ENSOJAG00000015026	TMCO4 (ENSOJAG00000015033)	vwa1 (ENSOJAG00000015048)	RALGAPB (ENSOJAG00000015070)	PREX1 (ENSOJAG00000015194)	kcnq2a (ENSOJAG00000015866) #21	chrna4b (ENSOJAG00000016034) #22	zgpat (ENSOJAG00000016037) #10	TTI1 (ENSOJAG00000016045)	ENSOJAG00000016053	ctnnbl1 (ENSOJAG00000016080)	ENSOJAG00000016730	ENSOJAG00000016806	E2F1 (ENSOJAG00000016833)	znf341 (ENSOJAG00000016846)	itchb (ENSOJAG00000016978)	ENSOJAG00000018566	VDR (ENSOJAG00000018775)	HDAC7 (ENSOJAG00000018904)	twist3 (ENSOJAG00000019336)	ENSOJAG00000019343	chchd6a (ENSOJAG00000019352)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b.d	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182839.B.a.b	ENSGT00390000016950	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00940000168345.d	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00390000009748	ENSGT00940000159381.c	ENSGT00390000006931	ENSGT01050000244866.D.b.b	ENSGT00940000159472	ENSGT00390000000546	ENSGT00940000157014.e	ENSGT00940000155473.c.a	ENSGT00940000159065.a	ENSGT00940000163428.a.a.b	ENSGT00940000167073	ENSGT00390000000903.b.b	ENSGT01050000244850.A.b.a.b	ENSGT00940000161154.b
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	21	DENND2C (ENSORLG00000000628)	ENSORLG00000022588	ampd1 (ENSORLG00000000655)	ENSORLG00000027709	csde1 (ENSORLG00000000707)	SIKE1 (ENSORLG00000000742)	ENSORLG00000024698	HTR6 (ENSORLG00000023384)	TMCO4 (ENSORLG00000000757)	vwa1 (ENSORLG00000000761)	RALGAPB (ENSORLG00000000780)	PREX1 (ENSORLG00000000806)	ENSORLG00000027858	kcnq2a (ENSORLG00000000854) #21	ENSORLG00000022428	chrna4b (ENSORLG00000000865) #22	zgpat (ENSORLG00000000880) #10	TTI1 (ENSORLG00000000898)	ENSORLG00000028351	ENSORLG00000023187	ctnnbl1 (ENSORLG00000000933)	ENSORLG00000021851	ENSORLG00000028875	ENSORLG00000028238	E2F1 (ENSORLG00000000945)	znf341 (ENSORLG00000000956)	itchb (ENSORLG00000001036)	ENSORLG00000001048	vdralpha (ENSORLG00000001063)	ENSORLG00000027783	ENSORLG00000001083
Chinese medaka	MODERN SPECIES	446	mtor (ENSOSIG00000010246)	agrn (ENSOSIG00000010284)	ENSOSIG00000012778	ENSOSIG00000012779	DENND2C (ENSOSIG00000012781)	ampd1 (ENSOSIG00000012814)	ENSOSIG00000013981	csde1 (ENSOSIG00000014072)	SIKE1 (ENSOSIG00000017583)	ENSOSIG00000017588	HTR6 (ENSOSIG00000017589)	vwa1 (ENSOSIG00000017609)	RALGAPB (ENSOSIG00000017630)	PREX1 (ENSOSIG00000017824)	kcnq2a (ENSOSIG00000018673) #21	chrna4b (ENSOSIG00000018753) #22	zgpat (ENSOSIG00000018821) #10	TTI1 (ENSOSIG00000018823)	ENSOSIG00000018825	ctnnbl1 (ENSOSIG00000018845)	E2F1 (ENSOSIG00000018922)	znf341 (ENSOSIG00000018929)	itchb (ENSOSIG00000018967)	ENSOSIG00000019201	VDR (ENSOSIG00000019223)	HDAC7 (ENSOSIG00000019236)	twist3 (ENSOSIG00000019239)	ENSOSIG00000019241	ENSOSIG00000019244	ENSOSIG00000019247	ENSOSIG00000019250
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	90	csde1 (ENSHCOG00000004158)	SIKE1 (ENSHCOG00000004187)	ENSHCOG00000004202	HTR6 (ENSHCOG00000004211)	TMCO4 (ENSHCOG00000004214)	vwa1 (ENSHCOG00000004227)	ENSHCOG00000004319	PREX1 (ENSHCOG00000004400)	kcnq2a (ENSHCOG00000004440) #21	ENSHCOG00000000840	SLCO4A1 (ENSHCOG00000004468)	gata5 (ENSHCOG00000004480)	ENSHCOG00000004491	HCK (ENSHCOG00000004526)	tm9sf4 (ENSHCOG00000004563)	chrna4b (ENSHCOG00000004588) #22	zgpat (ENSHCOG00000004674) #10	TTI1 (ENSHCOG00000004687)	VSTM2L (ENSHCOG00000004711)	ctnnbl1 (ENSHCOG00000004778)	ENSHCOG00000004837	ENSHCOG00000004848	znf341 (ENSHCOG00000004879)	itchb (ENSHCOG00000004956)	ENSHCOG00000004979	VDR (ENSHCOG00000005359)	HDAC7 (ENSHCOG00000005407)	twist3 (ENSHCOG00000005411)	ENSHCOG00000005424	chchd6a (ENSHCOG00000005427)	PLXNA1 (ENSHCOG00000005471)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	21	ptpn11b (ENSMMDG00005022326)	RNF223 (ENSMMDG00005022323)	ENSMMDG00005022321	DENND2C (ENSMMDG00005022313)	ampd1 (ENSMMDG00005021870)	ENSMMDG00005021853	csde1 (ENSMMDG00005018036)	SIKE1 (ENSMMDG00005017938)	ENSMMDG00005017936	ENSMMDG00005017934	TMCO4 (ENSMMDG00005017921)	vwa1 (ENSMMDG00005017916)	RALGAPB (ENSMMDG00005017888)	PREX1 (ENSMMDG00005012262)	kcnq2a (ENSMMDG00005012154) #21	chrna4b (ENSMMDG00005011861) #22	zgpat (ENSMMDG00005011854) #10	TTI1 (ENSMMDG00005011850)	ENSMMDG00005011847	ctnnbl1 (ENSMMDG00005010737)	ENSMMDG00005010700	E2F1 (ENSMMDG00005010698)	znf341 (ENSMMDG00005010682)	itchb (ENSMMDG00005007790)	ENSMMDG00005007751	VDR (ENSMMDG00005007734)	HDAC7 (ENSMMDG00005007685)	twist3 (ENSMMDG00005007678)	ENSMMDG00005007675	chchd6a (ENSMMDG00005007672)	PLXNA1 (ENSMMDG00005007654)
Cod	MODERN SPECIES		ENSGMOG00000027008	ENSGMOG00000025412	DENND2C (ENSGMOG00000012718)	ENSGMOG00000012722	ENSGMOG00000022869	CSDE1 (ENSGMOG00000012731)	ENSGMOG00000012741	ENSGMOG00000012747	ENSGMOG00000037186	ENSGMOG00000012759	vwa1 (ENSGMOG00000006448)	ENSGMOG00000006453	ENSGMOG00000006488	ENSGMOG00000034246	ENSGMOG00000006540 #21	ENSGMOG00000006567 #22	ENSGMOG00000028791 #10	TTI1 (ENSGMOG00000023842)	ENSGMOG00000030056	ENSGMOG00000031111	ENSGMOG00000025881	ENSGMOG00000020231	ENSGMOG00000032363	ENSGMOG00000032007	ENSGMOG00000031276	ENSGMOG00000029102	ENSGMOG00000031289	ENSGMOG00000033852	ENSGMOG00000028022	ENSGMOG00000026794	ENSGMOG00000037046
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	87	ENSGT00940000164692	ENSGT00390000013727.c	ENSGT01030000234558.A.a.a.b	ENSGT00940000155056.a	ENSGT00940000159584	ENSGT00940000160682.a	ENSGT00930000151037	ENSGT00940000157064.a.a	ENSGT00940000154757.xb.a.b	ENSGT00940000158337	ENSGT00940000153876.A	ENSGT00940000163259.b	ENSGT00700000104550.a.j.b	ENSGT00940000159925	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000155167.a	ENSGT00940000162635	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f.j #13	ENSGT00410000025596.a.a #14	ENSGT00950000183149.B	ENSGT00940000158197.d	ENSGT00390000000020.a	ENSGT00390000007975.b.b	ENSGT00940000153544.a.i.b	ENSGT00950000183117.a.b.a	ENSGT00950000182931.A.a.b	ENSGT00390000017353	ENSGT01030000234578.B.b.a
Northern pike	DUPLICATION
Northern pike	MODERN SPECIES	16	rtf2 (ENSELUG00000014386)	GCNT7 (ENSELUG00000014370)	ENSELUG00000014363	eya2 (ENSELUG00000014341)	ENSELUG00000014263	tgm5l (ENSELUG00000000519)	pxmp4 (ENSELUG00000001547)	itcha (ENSELUG00000014154)	NECAB3 (ENSELUG00000014035)	cbfa2t2 (ENSELUG00000013949)	SNTA1 (ENSELUG00000013871)	tox2 (ENSELUG00000013810)	ENSELUG00000028964	RALGAPB (ENSELUG00000013702)	KCNQ2 (ENSELUG00000013558) #21	CHRNA4 (ENSELUG00000013441) #22	ENSELUG00000013426	arfrp1 (ENSELUG00000013412) #11	ENSELUG00000031880	STMN3 (ENSELUG00000028288) #13	ENSELUG00000034691	HELZ2 (ENSELUG00000013322) #15	stk35l (ENSELUG00000013284)	FNDC11 (ENSELUG00000013250) #16	ENSELUG00000013234	ENSELUG00000013216	SERINC3 (ENSELUG00000013181)	tp53rk (ENSELUG00000013117)	slc2a10 (ENSELUG00000013105)	ENSELUG00000013079	tcf15 (ENSELUG00000013003)
Northern pike	MODERN SPECIES	11	ENSELUG00000005506	mfn2 (ENSELUG00000005449)	BRPF3 (ENSELUG00000005391)	MAPK13 (ENSELUG00000005103)	ENSELUG00000005040	ENSELUG00000005027	mtor (ENSELUG00000004972)	angptl7 (ENSELUG00000004817)	ENSELUG00000004804	agrn (ENSELUG00000004708)	ENSELUG00000004355	RNF223 (ENSELUG00000004313)	ENSELUG00000004270	PREX1 (ENSELUG00000004100)	kcnq2a (ENSELUG00000003819) #21	chrna4b (ENSELUG00000003742) #22	zgpat (ENSELUG00000003733) #10	ENSELUG00000003718	rtel1 (ENSELUG00000003671) #12	GMEB2 (ENSELUG00000003497) #14	pdyn (ENSELUG00000003484)	stk35 (ENSELUG00000003479)	MTCH1 (ENSELUG00000003458)	stk38a (ENSELUG00000003416)	CEPT1 (ENSELUG00000003384)	DRAM2 (ENSELUG00000000110)	dennd2da (ENSELUG00000003334)	ENSELUG00000003245	EPHB2 (ENSELUG00000003213)	LRRC38 (ENSELUG00000003189)	VPS13D (ENSELUG00000003164)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	818										ENSGT00940000158337.e	ENSGT00940000153876.A.e	ENSGT00940000163259.b.f	ENSGT00700000104550.a.j.b.c.a	ENSGT00940000159925.c	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00390000000732 #10	ENSGT00940000155167.a.b
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000001652.f.a	ENSGT00940000164692.e	ENSGT00390000013727.c	ENSGT01030000234558.A.a.a.b	ENSGT00940000155056.a	ENSGT00940000159584	ENSGT00940000160682.a.c	ENSGT00940000157064.a.a.d	ENSGT00930000151037	ENSGT00940000158337.e	ENSGT00940000153876.A.e	ENSGT00940000163259.b.f	ENSGT00700000104550.a.j.b.c.a	ENSGT00940000159925.c	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT01100000263529.a.a.a.a.b.c.b.g.b	ENSGT00940000156407.a #11	ENSGT00940000166655.i	ENSGT01030000234597.a.b.b.f.i.b #13	ENSGT00940000160694.g.a #15	ENSGT00940000158197.c.e	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000155094.a.c	ENSGT01030000234623.a.a.a.a.a.e	ENSGT00940000163348	ENSGT00390000012914.k.a	ENSGT00940000159430.d	ENSGT00390000004215.a.b.a.l	ENSGT00390000004215.a.b.a.k.b	ENSGT00940000161320.e.a.b
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000001652.f.a	ENSGT00940000164692.e	ENSGT00390000013727.c	ENSGT01030000234558.A.a.a.b	ENSGT00940000155056.a	ENSGT00940000159584	ENSGT00940000160682.a.c	ENSGT00940000157064.a.a.d	ENSGT00930000151037	ENSGT00940000158337.e	ENSGT00940000153876.A.e	ENSGT00940000163259.b.f	ENSGT00700000104550.a.j.b.c.a	ENSGT00940000159925.c	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT01100000263529.a.a.a.a.b.c.b.g.b	ENSGT00940000156407.a #11	ENSGT00940000166655.i	ENSGT01030000234597.a.b.b.f.i.b #13	ENSGT00940000160694.g.a #15	ENSGT00940000158197.c.e	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000155094.a.c	ENSGT01030000234623.a.a.a.a.a.e	ENSGT00940000163348	ENSGT00390000012914.k.a	ENSGT00940000159430.d	ENSGT00390000004215.a.b.a.l	ENSGT00940000161320.e.a.b	ENSGT00940000154491.d.b.b
Rainbow trout	DUPLICATION
Rainbow trout	MODERN SPECIES	28	rtf2 (ENSOMYG00000022594)	ENSOMYG00000069743	eya2 (ENSOMYG00000022568)	ENSOMYG00000029729	ENSOMYG00000022556	ENSOMYG00000022538	ENSOMYG00000060314	itcha (ENSOMYG00000015916)	ENSOMYG00000065591	NECAB3 (ENSOMYG00000015492)	cbfa2t2 (ENSOMYG00000015470)	SNTA1 (ENSOMYG00000015456)	tox2 (ENSOMYG00000015425)	ENSOMYG00000015288	ENSOMYG00000015095 #21	ENSOMYG00000014804 #22	ENSOMYG00000014736	ENSOMYG00000063827	arfrp1 (ENSOMYG00000014719) #11	ENSOMYG00000014651	ENSOMYG00000014634 #13	ENSOMYG00000014521 #15	ENSOMYG00000014500	ENSOMYG00000014493 #16	ENSOMYG00000067948	ENSOMYG00000014483	ENSOMYG00000056252	ENSOMYG00000014357	ENSOMYG00000050051	tp53rk (ENSOMYG00000014324)	ENSOMYG00000014313
Rainbow trout	MODERN SPECIES	30	plod1a (ENSOMYG00000025960)	ENSOMYG00000034768	ENSOMYG00000034792	ENSOMYG00000049935	ENSOMYG00000035019	ENSOMYG00000035189	ENSOMYG00000065651	ENSOMYG00000035846	ENSOMYG00000038351	ENSOMYG00000038575	ENSOMYG00000038583	ENSOMYG00000050181	ENSOMYG00000038748	ENSOMYG00000039953	ENSOMYG00000040706 #21	ENSOMYG00000042752 #22	TNFRSF6B (ENSOMYG00000042759)	RTEL1 (ENSOMYG00000042792) #12	STMN3 (ENSOMYG00000042847) #13	GMEB2 (ENSOMYG00000042853) #14	ENSOMYG00000042857	stk35 (ENSOMYG00000042860)	ENSOMYG00000060513	ENSOMYG00000042867	ENSOMYG00000042877	ENSOMYG00000042882	ENSOMYG00000042904	ENSOMYG00000001488	dennd2da (ENSOMYG00000001623)	ENSOMYG00000001646	ENSOMYG00000052672
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000001652.f.a	ENSGT00940000164692.e	ENSGT00390000013727.c	ENSGT01030000234558.A.a.a.b	ENSGT00940000155056.a	ENSGT00940000159584	ENSGT00940000160682.a.c	ENSGT00940000157064.a.a.d	ENSGT00930000151037	ENSGT00940000158337.e	ENSGT00940000153876.A.e	ENSGT00940000163259.b.f	ENSGT00700000104550.a.j.b.c.a	ENSGT00940000159925.c	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000155167.a.a	ENSGT00950000182970.A.b #12	ENSGT01030000234597.a.b.b.f.j #13	ENSGT00410000025596.a.a.d #14	ENSGT00950000183149.B	ENSGT00940000158197.d.a	ENSGT00390000000020.a.z	ENSGT00390000007975.b.b	ENSGT00940000153544.a.i.b.c	ENSGT00950000183117.a.b.a.e	ENSGT01030000234578.B.b.a	ENSGT00950000182931.A.a.b.c	ENSGT00940000159081.t	ENSGT00390000017353.m	ENSGT00390000012058.c.b
Coho salmon	DUPLICATION
Coho salmon	MODERN SPECIES	25	tfap2c (ENSOKIG00005047140)	GCNT7 (ENSOKIG00005047128)	rtf2 (ENSOKIG00005047123)	ENSOKIG00005047117	eya2 (ENSOKIG00005047080)	ENSOKIG00005047063	pxmp4 (ENSOKIG00005047049)	itcha (ENSOKIG00005045129)	ENSOKIG00005044979	cbfa2t2 (ENSOKIG00005044929)	ENSOKIG00005044917	ENSOKIG00005044883	tox2 (ENSOKIG00005044848)	RALGAPB (ENSOKIG00005044618)	KCNQ2 (ENSOKIG00005044400) #21	CHRNA4 (ENSOKIG00005044316) #22	ENSOKIG00005044303	arfrp1 (ENSOKIG00005044265) #11	ENSOKIG00005044181	STMN3 (ENSOKIG00005044143) #13	HELZ2 (ENSOKIG00005043991) #15	stk35l (ENSOKIG00005043963)	FNDC11 (ENSOKIG00005043948) #16	ENSOKIG00005043940	ENSOKIG00005043832	ENSOKIG00005043783	tp53rk (ENSOKIG00005043770)	ENSOKIG00005043528	TCF15 (ENSOKIG00005043490)	SCRT2 (ENSOKIG00005043482)	ENSOKIG00005043450
Coho salmon	MODERN SPECIES	8	TPRG1L (ENSOKIG00005020775)	ENSOKIG00005020854	mfn2 (ENSOKIG00005021705)	plod1a (ENSOKIG00005023099)	BRPF3 (ENSOKIG00005030204)	ENSOKIG00005030457	ENSOKIG00005030693	mtor (ENSOKIG00005030732)	angptl7 (ENSOKIG00005031143)	agrn (ENSOKIG00005031562)	ENSOKIG00005039623	RNF223 (ENSOKIG00005039970)	ENSOKIG00005040031	PREX1 (ENSOKIG00005040615)	kcnq2a (ENSOKIG00005022541) #21	chrna4b (ENSOKIG00005023088) #22	ENSOKIG00005023103	rtel1 (ENSOKIG00005023147) #12	STMN3 (ENSOKIG00005023286) #13	GMEB2 (ENSOKIG00005023304) #14	pdyn (ENSOKIG00005023315)	stk35 (ENSOKIG00005023326)	MTCH1 (ENSOKIG00005023341)	ENSOKIG00005023384	stk38a (ENSOKIG00005023719)	CEPT1 (ENSOKIG00005023804)	ENSOKIG00005024519	dennd2da (ENSOKIG00005024542)	ENSOKIG00005024572	ENSOKIG00005024589	efhd2 (ENSOKIG00005024592)
Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	MODERN SPECIES	31	ENSOTSG00005022796	eya2 (ENSOTSG00005022789)	ENSOTSG00005022787	pxmp4 (ENSOTSG00005022785)	itcha (ENSOTSG00005016301)	ENSOTSG00005016272	cbfa2t2 (ENSOTSG00005016129)	cbfa2t2 (ENSOTSG00005016127)	SNTA1 (ENSOTSG00005016124)	tox2 (ENSOTSG00005016122)	dap3 (ENSOTSG00005015992)	ENSOTSG00005015985	ENSOTSG00005015984	polr3c (ENSOTSG00005015982)	KCNQ2 (ENSOTSG00005015978) #21	CHRNA4 (ENSOTSG00005015974) #22	ENSOTSG00005015972	arfrp1 (ENSOTSG00005015970) #11	ENSOTSG00005015969	ENSOTSG00005015968	STMN3 (ENSOTSG00005015967) #13	HELZ2 (ENSOTSG00005015887) #15	stk35l (ENSOTSG00005015886)	FNDC11 (ENSOTSG00005015885) #16	ENSOTSG00005015884	SERINC3 (ENSOTSG00005015883)	ENSOTSG00005015881	tp53rk (ENSOTSG00005015877)	slc2a10 (ENSOTSG00005015874)	ENSOTSG00005015859	tcf15 (ENSOTSG00005015857)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	7	TPRG1L (ENSOTSG00005027996)	ENSOTSG00005028014	mfn2 (ENSOTSG00005028934)	plod1a (ENSOTSG00005029411)	BRPF3 (ENSOTSG00005042911)	ENSOTSG00005042912	ENSOTSG00005042918	mtor (ENSOTSG00005042924)	angptl7 (ENSOTSG00005042934)	agrn (ENSOTSG00005042937)	ENSOTSG00005044115	RNF223 (ENSOTSG00005044635)	ENSOTSG00005044641	PREX1 (ENSOTSG00005044675)	kcnq2a (ENSOTSG00005044725) #21	chrna4b (ENSOTSG00005044774) #22	ENSOTSG00005044777	rtel1 (ENSOTSG00005044781) #12	STMN3 (ENSOTSG00005044789) #13	GMEB2 (ENSOTSG00005044792) #14	pdyn (ENSOTSG00005044793)	stk35 (ENSOTSG00005044796)	MTCH1 (ENSOTSG00005044798)	ENSOTSG00005044828	STK38 (ENSOTSG00005044831)	CEPT1 (ENSOTSG00005044833)	ENSOTSG00005045022	dennd2da (ENSOTSG00005045025)	ENSOTSG00005045027	ENSOTSG00005045029	efhd2 (ENSOTSG00005045030)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000164692.e	ENSGT00390000013727.c	ENSGT01030000234558.A.a.a.b	ENSGT00940000155056.a	ENSGT00940000159584	ENSGT00940000160682.a.c	ENSGT00940000157064.a.a.d	ENSGT00930000151037	ENSGT00970000193381.a.a.c.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158337.e	ENSGT00940000153876.A.e	ENSGT00940000163259.b.f	ENSGT00700000104550.a.j.b.c.a	ENSGT00940000159925.c	ENSGT00940000160093.b #21	ENSGT00940000159329 #22	ENSGT00940000156407.a #11	ENSGT00940000166655.i	ENSGT01030000234597.a.b.b.f.i.b #13	ENSGT00940000160694.g.a #15	ENSGT00940000158197.c.e	ENSGT00390000006008 #16	ENSGT00940000155094.a.c	ENSGT01030000234623.a.a.a.a.a.e	ENSGT00940000162556.G.d.g.a.b.b.a	ENSGT00940000163348	ENSGT00390000012914.k.a	ENSGT00390000004215.a.b.a.k.b	ENSGT00940000161320.e.a.b	ENSGT00940000154491.d.b.b	ENSGT00740000115534.a.a.gb.b
River trout	DUPLICATION
River trout	MODERN SPECIES	7	ENSSTUG00000030299	tfap2c (ENSSTUG00000026157)	rtf2 (ENSSTUG00000026219)	GCNT7 (ENSSTUG00000026244)	eya2 (ENSSTUG00000026254)	RNF213 (ENSSTUG00000026277)	pxmp4 (ENSSTUG00000026318)	itcha (ENSSTUG00000026451)	NECAB3 (ENSSTUG00000030399)	cbfa2t2 (ENSSTUG00000030417)	SNTA1 (ENSSTUG00000030542)	tox2 (ENSSTUG00000030546)	ENSSTUG00000030589	RALGAPB (ENSSTUG00000030603)	KCNQ2 (ENSSTUG00000030932) #21	CHRNA4 (ENSSTUG00000031023) #22	ENSSTUG00000031046	arfrp1 (ENSSTUG00000031050) #11	ENSSTUG00000031061	STMN3 (ENSSTUG00000031072) #13	HELZ2 (ENSSTUG00000031078) #15	stk35l (ENSSTUG00000031221)	FNDC11 (ENSSTUG00000031239) #16	ENSSTUG00000031249	ENSSTUG00000031258	ENSSTUG00000031693	ENSSTUG00000031712	tp53rk (ENSSTUG00000031779)	ENSSTUG00000031789	tcf15 (ENSSTUG00000031957)	ENSSTUG00000031968
River trout	MODERN SPECIES	20	plod1a (ENSSTUG00000009059)	BRPF3 (ENSSTUG00000008700)	ENSSTUG00000008624	ENSSTUG00000008620	angptl7 (ENSSTUG00000008611)	mtor (ENSSTUG00000008045)	ENSSTUG00000008016	agrn (ENSSTUG00000006242)	ENSSTUG00000041620	ENSSTUG00000041552	RNF223 (ENSSTUG00000041542)	ENSSTUG00000040565	PREX1 (ENSSTUG00000039690)	kcnq2a (ENSSTUG00000039363) #21	ENSSTUG00000039356	chrna4b (ENSSTUG00000039342) #22	ENSSTUG00000039330	rtel1 (ENSSTUG00000039079) #12	STMN3 (ENSSTUG00000039057) #13	GMEB2 (ENSSTUG00000039040) #14	pdyn (ENSSTUG00000039029)	stk35 (ENSSTUG00000039026)	MTCH1 (ENSSTUG00000038996)	ENSSTUG00000038994	stk38a (ENSSTUG00000038957)	CEPT1 (ENSSTUG00000038721)	ENSSTUG00000038694	dennd2da (ENSSTUG00000038445)	igf3 (ENSSTUG00000038424)	ENSSTUG00000038411	efhd2 (ENSSTUG00000038400)
Atlantic salmon	DUPLICATION
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	14	tfap2c (ENSSSAG00000042513)	ENSSSAG00000042503	rtf2 (ENSSSAG00000042491)	eya2 (ENSSSAG00000041586)	ENSSSAG00000113884	ENSSSAG00000041408	ENSSSAG00000099299	itcha (ENSSSAG00000009092)	necab3 (ENSSSAG00000008672)	cbfa2t2 (ENSSSAG00000074944)	SNTA1 (ENSSSAG00000090448)	ENSSSAG00000120643	tox2 (ENSSSAG00000074925)	ENSSSAG00000074767	ENSSSAG00000073474 #21	ENSSSAG00000073387 #22	arfrp1 (ENSSSAG00000121578) #11	ENSSSAG00000073370	ENSSSAG00000073361 #13	ENSSSAG00000073332 #15	ENSSSAG00000088866	ENSSSAG00000073320 #16	p2ry1 (ENSSSAG00000073317)	ENSSSAG00000103666	ENSSSAG00000072682	ENSSSAG00000104432	ENSSSAG00000072672	tp53rk (ENSSSAG00000072668)	ENSSSAG00000072502	ENSSSAG00000072495	ENSSSAG00000072493
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	6	ENSSSAG00000009334	plod1a (ENSSSAG00000012359)	ENSSSAG00000046331	mapk13 (ENSSSAG00000046558)	ENSSSAG00000103364	ENSSSAG00000046715	ENSSSAG00000047251	ENSSSAG00000047263	ENSSSAG00000047358	ENSSSAG00000111976	ENSSSAG00000055221	ENSSSAG00000055414	ENSSSAG00000044871	ENSSSAG00000066450 #21	ENSSSAG00000095512	ENSSSAG00000068064 #22	rtel1 (ENSSSAG00000068081) #12	ENSSSAG00000068122 #13	gmeb2 (ENSSSAG00000068128) #14	pdyn (ENSSSAG00000068141)	stk35 (ENSSSAG00000100649)	ENSSSAG00000068148	ENSSSAG00000095969	ENSSSAG00000068161	ENSSSAG00000089405	cept1 (ENSSSAG00000068187)	ENSSSAG00000068248	dennd2d (ENSSSAG00000068256)	ENSSSAG00000068278	efhd2 (ENSSSAG00000068283)	ENSSSAG00000099979
Huchen	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	1228															ENSHHUG00000007341	CHRNA4 (ENSHHUG00000007521) #22	ENSHHUG00000007735	arfrp1 (ENSHHUG00000007750) #11	ENSHHUG00000007804	STMN3 (ENSHHUG00000007930) #13	HELZ2 (ENSHHUG00000007955) #15	stk35l (ENSHHUG00000008357)	FNDC11 (ENSHHUG00000008372) #16	ENSHHUG00000008378	ENSHHUG00000008383	ENSHHUG00000008772	tp53rk (ENSHHUG00000008785)	ENSHHUG00000008803	tcf15 (ENSHHUG00000009195)	ENSHHUG00000009206	ENSHHUG00000009216
Huchen	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	17																chrna4b (ENSHHUG00000005196) #22	ENSHHUG00000005193	TNFRSF6B (ENSHHUG00000005182)	ENSHHUG00000005147	ENSHHUG00000005143 #12	ENSHHUG00000005137 #12	STMN3 (ENSHHUG00000005110) #13	GMEB2 (ENSHHUG00000005099) #14	pdyn (ENSHHUG00000005090)	stk35 (ENSHHUG00000005074)	MTCH1 (ENSHHUG00000005067)	ENSHHUG00000005056	KCTD20 (ENSHHUG00000005050)	ENSHHUG00000005016	CEPT1 (ENSHHUG00000004930)	ENSHHUG00000004904
Huchen	MODERN SPECIES	505															PREX1 (ENSHHUG00000009602)	chrna4b (ENSHHUG00000010136) #22	zgpat (ENSHHUG00000010245) #10	ENSHHUG00000010257	GMEB2 (ENSHHUG00000010273) #14	stk35 (ENSHHUG00000010283)	ENSHHUG00000010286	stk38a (ENSHHUG00000010295)	CEPT1 (ENSHHUG00000010344)	dennd2da (ENSHHUG00000010550)	ENSHHUG00000010563	renbp (ENSHHUG00000010570)	efhd2 (ENSHHUG00000010581)
Spotted gar	MODERN SPECIES	656	myl9a (ENSLOCG00000001277)	LPIN3 (ENSLOCG00000001295)	mybl2b (ENSLOCG00000001337)	ENSLOCG00000001358	ift52 (ENSLOCG00000001372)	sgk2a (ENSLOCG00000001397)	L3MBTL1 (ENSLOCG00000001414)	ENSLOCG00000001442	EPB41L1 (ENSLOCG00000001454)	rpn2 (ENSLOCG00000001480)	ENSLOCG00000001496	CDK5RAP1 (ENSLOCG00000001505)	ENSLOCG00000001534	PREX1 (ENSLOCG00000001552)	kcnq2a (ENSLOCG00000001599) #21	chrna4b (ENSLOCG00000001635) #22	zgpat (ENSLOCG00000001659) #10	arfrp1 (ENSLOCG00000001677) #11	TNFRSF6B (ENSLOCG00000001688)	rtel1 (ENSLOCG00000001700) #12	STMN3 (ENSLOCG00000001717) #13	GMEB2 (ENSLOCG00000001741) #14	HELZ2 (ENSLOCG00000001770) #15	ccn5 (ENSLOCG00000001790)	ENSLOCG00000018356	FNDC11 (ENSLOCG00000001805) #16	stk35 (ENSLOCG00000001817)	pdyn (ENSLOCG00000001827)	ENSLOCG00000001839 #15	ada (ENSLOCG00000001870)	pkig (ENSLOCG00000001911)
Reedfish	MODERN SPECIES	1	tcf15 (ENSECRG00000007740)	itcha (ENSECRG00000007713)	VSTM2L (ENSECRG00000007701)	ctnnbl1 (ENSECRG00000007678)	cbfa2t2 (ENSECRG00000007661)	znf341 (ENSECRG00000007631)	pxmp4 (ENSECRG00000007618)	E2F1 (ENSECRG00000007605)	ENSECRG00000007598	SNTA1 (ENSECRG00000007587)	tox2 (ENSECRG00000007562)	TIMM10B (ENSECRG00000007555)	RALGAPB (ENSECRG00000007540)	PREX1 (ENSECRG00000007494)	kcnq2a (ENSECRG00000007454) #21	chrna4b (ENSECRG00000006928) #22	zgpat (ENSECRG00000006855) #10	arfrp1 (ENSECRG00000006843) #11	TNFRSF6B (ENSECRG00000006833)	dtx4a (ENSECRG00000006825)	ENSECRG00000006811	ENSECRG00000006800	ENSECRG00000006793	ENSECRG00000006783	ENSECRG00000006773	ENSECRG00000006766	ENSECRG00000006758	ENSECRG00000006749	ENSECRG00000006742	cldnd1b (ENSECRG00000006737)	ENSECRG00000006721
Elephant shark	MODERN SPECIES	2770																chrna4b (ENSCMIG00000004614) #22
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159329 #22
Hagfish	MODERN SPECIES	382	ENSEBUG00000004154	ENSEBUG00000008858	ENSEBUG00000001826	ENSEBUG00000002309	ptdss1a (ENSEBUG00000006615)	ENSEBUG00000016986	ENSEBUG00000005507	ENSEBUG00000000592	ENSEBUG00000001229	ENSEBUG00000002134	ENSEBUG00000004883	ENSEBUG00000012188	ENSEBUG00000012654	ENSEBUG00000013357	ENSEBUG00000012929	chrna4b (ENSEBUG00000014503) #22	ENSEBUG00000001022	ENSEBUG00000013760