Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000006218 ENSGT00940000160574 ENSGT00440000034605.f.a #7 ENSGT00390000016768 #9 ENSGT00940000154234.a #10 ENSGT00940000155379 #11 ENSGT00530000063822.a.a #12 ENSGT00940000156046 #13 ENSGT00390000001680 #14 ENSGT00940000159310 #15 ENSGT00940000160980 #16 ENSGT00390000018100 #17 ENSGT00940000157661 #19 ENSGT00390000009140 #20 ENSGT00940000153438.a #21 ENSGT00940000160199 #22 ENSGT00940000153571.b #23 ENSGT00390000016309 #24 ENSGT00390000002169 #25 ENSGT00530000063472.b.b.a.b #26 ENSGT00940000155960.b #27 ENSGT00390000006758.b #29 ENSGT00940000157402 #30 ENSGT00950000182976.a.b #31 ENSGT00440000037417.A #32 ENSGT00940000158268.a #33 ENSGT00940000164881 ENSGT00390000013482 #34 ENSGT00390000004456 #35 ENSGT00940000156734 #36 ENSGT00730000111983 #37 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 2 ENSSVLG00005019782 #7 ENSSVLG00005019851 #8 FJX1 (ENSSVLG00005019889) #9 PAMR1 (ENSSVLG00005019988) #10 SLC1A2 (ENSSVLG00005020571) #11 CD44 (ENSSVLG00005021288) #12 PDHX (ENSSVLG00005021554) #13 APIP (ENSSVLG00005021719) #14 ENSSVLG00005021768 #15 ELF5 (ENSSVLG00005021853) #16 CAT (ENSSVLG00005022137) #17 ENSSVLG00005022214 #18 ABTB2 (ENSSVLG00005004819) #19 NAT10 (ENSSVLG00005004900) #20 CAPRIN1 (ENSSVLG00005004951) #21 LMO2 (ENSSVLG00005005066) #22 FBXO3 (ENSSVLG00005005111) #23 ENSSVLG00005005193 #24 C11orf91 (ENSSVLG00005005211) #25 KIAA1549L (ENSSVLG00005005254) #26 HIPK3 (ENSSVLG00005005422) #27 ENSSVLG00005005475 #28 CSTF3 (ENSSVLG00005005518) #29 TCP11L1 (ENSSVLG00005005675) #30 DEPDC7 (ENSSVLG00005005722) #31 QSER1 (ENSSVLG00005005823) #32 PRRG4 (ENSSVLG00005005895) #33 CCDC73 (ENSSVLG00005005944) #34 EIF3M (ENSSVLG00005006089) #35 WT1 (ENSSVLG00005006232) #36 ENSSVLG00005006549 #37 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00530000063981.b ENSGT00390000006218 ENSGT00940000160574 ENSGT00440000034605.f.a #7 ENSGT00940000154234.a #10 ENSGT00940000155379 #11 ENSGT00530000063822.a.a #12 ENSGT00940000156046 #13 ENSGT00390000001680 #14 ENSGT00940000159310 #15 ENSGT00940000160980 #16 ENSGT00390000018100 #17 ENSGT00940000157661 #19 ENSGT00390000009140.g #20 ENSGT00940000153438.a #21 ENSGT00940000160199 #22 ENSGT00940000153571.b #23 ENSGT00390000016309 #24 ENSGT00390000002169 #25 ENSGT00530000063472.b.b.a.b #26 ENSGT00940000155960.b #27 ENSGT00390000006758.b #29 ENSGT00940000157402 #30 ENSGT00950000182976.a.b #31 ENSGT00440000037417.A #32 ENSGT00940000158268.a #33 ENSGT00940000164881 ENSGT00390000013482 #34 ENSGT00390000004456 #35 ENSGT00940000156734 #36 ENSGT00730000111983 #37 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00530000063981.b ENSGT00390000006218 ENSGT00940000160574 ENSGT00440000034605.f.a #7 ENSGT00940000154234.a #10 ENSGT00940000155379 #11 ENSGT00530000063822.a.a #12 ENSGT00940000156046 #13 ENSGT00390000001680 #14 ENSGT00940000159310 #15 ENSGT00940000160980 #16 ENSGT00390000018100 #17 ENSGT00940000157661 #19 ENSGT00390000009140.g #20 ENSGT00940000153438.a #21 ENSGT00940000160199 #22 ENSGT00940000153571.b #23 ENSGT00390000016309 #24 ENSGT00390000002169 #25 ENSGT00530000063472.b.b.a.b #26 ENSGT00940000155960.b #27 ENSGT00390000006758.b #29 ENSGT00940000157402 #30 ENSGT00950000182976.a.b #31 ENSGT00440000037417.A #32 ENSGT00940000158268.a #33 ENSGT00940000164881 ENSGT00390000013482 #34 ENSGT00390000004456 #35 ENSGT00940000156734 #36 ENSGT00730000111983 #37 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 10 PRR5L (ENSUPAG00010001016) COMMD9 (ENSUPAG00010001008) LDLRAD3 (ENSUPAG00010000987) ENSUPAG00010000969 ##7 PAMR1 (ENSUPAG00010000955) #10 SLC1A2 (ENSUPAG00010000901) #11 CD44 (ENSUPAG00010000106) #12 PDHX (ENSUPAG00010000084) #13 APIP (ENSUPAG00010000057) #14 EHF (ENSUPAG00010019516) #15 ELF5 (ENSUPAG00010019491) #16 CAT (ENSUPAG00010019472) #17 ABTB2 (ENSUPAG00010019465) #19 NAT10 (ENSUPAG00010019438) #20 CAPRIN1 (ENSUPAG00010019403) #21 LMO2 (ENSUPAG00010019388) #22 FBXO3 (ENSUPAG00010019358) #23 ENSUPAG00010019350 #24 C11orf91 (ENSUPAG00010019347) #25 KIAA1549L (ENSUPAG00010019291) #26 HIPK3 (ENSUPAG00010019217) #27 CSTF3 (ENSUPAG00010019186) #29 DEPDC7 (ENSUPAG00010019164) #31 QSER1 (ENSUPAG00010019111) #32 PRRG4 (ENSUPAG00010019105) #33 ENSUPAG00010019098 CCDC73 (ENSUPAG00010019088) #34 EIF3M (ENSUPAG00010019056) #35 WT1 (ENSUPAG00010018940) #36 ENSUPAG00010018932 #37 RCN1 (ENSUPAG00010018924) Squirrel MODERN SPECIES 133 PRR5L (ENSSTOG00000022180) COMMD9 (ENSSTOG00000007267) LDLRAD3 (ENSSTOG00000007228) TRIM44 (ENSSTOG00000023760) #7 PAMR1 (ENSSTOG00000000826) #10 SLC1A2 (ENSSTOG00000000822) #11 ENSSTOG00000000813 #12 PDHX (ENSSTOG00000004403) #13 APIP (ENSSTOG00000004390) #14 ENSSTOG00000008622 #15 ELF5 (ENSSTOG00000008610) #16 CAT (ENSSTOG00000008595) #17 ABTB2 (ENSSTOG00000001839) #19 ENSSTOG00000001817 #20 CAPRIN1 (ENSSTOG00000006945) #21 LMO2 (ENSSTOG00000024319) #22 FBXO3 (ENSSTOG00000016405) #23 ENSSTOG00000011395 #24 C11orf91 (ENSSTOG00000026942) #25 KIAA1549L (ENSSTOG00000011381) #26 HIPK3 (ENSSTOG00000009714) #27 CSTF3 (ENSSTOG00000013306) #29 TCP11L1 (ENSSTOG00000013296) #30 DEPDC7 (ENSSTOG00000013289) #31 QSER1 (ENSSTOG00000027161) #32 PRRG4 (ENSSTOG00000002830) #33 ENSSTOG00000024817 #34 EIF3M (ENSSTOG00000010502) #35 WT1 (ENSSTOG00000023716) #36 ENSSTOG00000034266 #37 ENSSTOG00000008930 Alpin marmot MODERN SPECIES 3 PRR5L (ENSMMMG00000011238) COMMD9 (ENSMMMG00000011235) LDLRAD3 (ENSMMMG00000011216) TRIM44 (ENSMMMG00000011195) #7 PAMR1 (ENSMMMG00000011162) #10 SLC1A2 (ENSMMMG00000011014) #11 CD44 (ENSMMMG00000010323) #12 PDHX (ENSMMMG00000010279) #13 APIP (ENSMMMG00000010262) #14 EHF (ENSMMMG00000010179) #15 ELF5 (ENSMMMG00000010124) #16 CAT (ENSMMMG00000010087) #17 ABTB2 (ENSMMMG00000010060) #19 NAT10 (ENSMMMG00000009992) #20 CAPRIN1 (ENSMMMG00000008164) #21 LMO2 (ENSMMMG00000008095) #22 FBXO3 (ENSMMMG00000008035) #23 ENSMMMG00000008026 #24 C11orf91 (ENSMMMG00000008017) #25 KIAA1549L (ENSMMMG00000007942) #26 HIPK3 (ENSMMMG00000007810) #27 ENSMMMG00000007795 CSTF3 (ENSMMMG00000007765) #29 TCP11L1 (ENSMMMG00000007740) #30 QSER1 (ENSMMMG00000007677) #32 PRRG4 (ENSMMMG00000007662) #33 ENSMMMG00000007642 CCDC73 (ENSMMMG00000007616) #34 EIF3M (ENSMMMG00000007588) #35 WT1 (ENSMMMG00000007507) #36 ENSMMMG00000007498 #37