Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00390000011737	ENSGT00940000161898	ENSGT00940000159715	ENSGT00390000011048 #8	ENSGT01050000244891.C.c.b #9	ENSGT00530000063715.b #10	ENSGT00940000162731 #11	ENSGT00940000155814 #12	ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.a #13	ENSGT00940000158209 #14	ENSGT00390000004360.a.b.a.a.b #15	ENSGT00940000153676.b #17	ENSGT01100000263484.C.a #18	ENSGT00940000159319 #19	ENSGT01100000263536.B.c.a	ENSGT00940000158925 #22	ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a #23	ENSGT00950000183202.b #24	ENSGT00950000183115.b.a #26	ENSGT00390000012063 #27	ENSGT00390000003338 #28	ENSGT00390000010170.a.b #29	ENSGT01050000244937.a.a #30	ENSGT00390000011864 #31	ENSGT00940000159528 #32	ENSGT00940000160585 #33	ENSGT00710000106860	ENSGT00950000183097.a.a.b	ENSGT00940000159160	ENSGT00730000111163	ENSGT00940000161772
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	13	ENSSVLG00005002671 #7	SPRYD7 (ENSSVLG00005002639) #8	KPNA3 (ENSSVLG00005002614) #9	EBPL (ENSSVLG00005002591) #10	ARL11 (ENSSVLG00005002576) #11	RCBTB1 (ENSSVLG00005002559) #12	ENSSVLG00005002542 #13	SETDB2 (ENSSVLG00005002488) #14	CAB39L (ENSSVLG00005002440) #15	ENSSVLG00005002409 #16	CDADC1 (ENSSVLG00005002377) #17	MLNR (ENSSVLG00005002363) #18	ENSSVLG00005002325 #19	ENSSVLG00005002299 #20	ENSSVLG00005002284 #21	RCBTB2 (ENSSVLG00005002211) #22	LPAR6 (ENSSVLG00005002170) #23	RB1 (ENSSVLG00005002082) #24	ENSSVLG00005002047 #25	ITM2B (ENSSVLG00005002020) #26	MED4 (ENSSVLG00005001989) #27	ENSSVLG00005001974 #28	SUCLA2 (ENSSVLG00005001944) #29	ENSSVLG00005001859 #30	ENSSVLG00005001827 #31	LRCH1 (ENSSVLG00005001766) #32	RUBCNL (ENSSVLG00005001693) #33	ENSSVLG00005001657 #34	ENSSVLG00005001636 #35	ENSSVLG00005001618 #36	ENSSVLG00005001599 #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00390000011737	ENSGT00940000161898	ENSGT00940000159715	ENSGT00390000011048 #8	ENSGT01050000244891.C.c.b #9	ENSGT00530000063715.b #10	ENSGT00940000162731 #11	ENSGT00940000155814 #12	ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.a #13	ENSGT00940000158209 #14	ENSGT00390000004360.a.b.a.a.b #15	ENSGT00940000153676.b #17	ENSGT01100000263484.C.a #18	ENSGT00940000159319 #19	ENSGT01100000263536.B.c.a	ENSGT00940000158925 #22	ENSGT00950000183202.b #24	ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a #23	ENSGT00950000183115.b.a #26	ENSGT00390000012063 #27	ENSGT00390000003338 #28	ENSGT00390000010170.a.b #29	ENSGT01050000244937.a.a #30	ENSGT00390000011864 #31	ENSGT00940000159528 #32	ENSGT00940000160585 #33	ENSGT00710000106860	ENSGT00950000183097.a.a.b	ENSGT00940000159160	ENSGT00730000111163	ENSGT00940000161772
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	110	ENSGT00390000011737	ENSGT00940000161898	ENSGT00940000159715	ENSGT00390000011048 #8	ENSGT01050000244891.C.c.b #9	ENSGT00530000063715.b #10	ENSGT00940000162731 #11	ENSGT00940000155814 #12	ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.a #13	ENSGT00940000158209 #14	ENSGT00390000004360.a.b.a.a.b #15	ENSGT00940000153676.b #17	ENSGT01100000263484.C.a #18	ENSGT00940000159319 #19	ENSGT01100000263536.B.c.a	ENSGT00940000158925 #22	ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a #23	ENSGT00950000183202.b #24	ENSGT00950000183115.b.a #26	ENSGT00390000012063 #27	ENSGT00390000003338 #28	ENSGT00390000010170.a.b #29	ENSGT01050000244937.a.a #30	ENSGT00390000011864 #31	ENSGT00940000159528 #32	ENSGT00940000160585 #33
Squirrel	MODERN SPECIES	165	RNASEH2B (ENSSTOG00000015126)	DLEU7 (ENSSTOG00000022745)	KCNRG (ENSSTOG00000001023)	TRIM13 (ENSSTOG00000024506)	SPRYD7 (ENSSTOG00000029895) #8	KPNA3 (ENSSTOG00000003006) #9	EBPL (ENSSTOG00000002999) #10	RCBTB1 (ENSSTOG00000028110) #12	PHF11 (ENSSTOG00000023483) #13	SETDB2 (ENSSTOG00000002985) #14	CAB39L (ENSSTOG00000002967) #15	ENSSTOG00000021927	CDADC1 (ENSSTOG00000011972) #17	MLNR (ENSSTOG00000011965) #18	FNDC3A (ENSSTOG00000011923) #19	RCBTB2 (ENSSTOG00000014863) #22	LPAR6 (ENSSTOG00000026961) #23	RB1 (ENSSTOG00000000927) #24	ITM2B (ENSSTOG00000007270) #26	MED4 (ENSSTOG00000001343) #27	NUDT15 (ENSSTOG00000001335) #28	SUCLA2 (ENSSTOG00000003010) #29	HTR2A (ENSSTOG00000002863) #30	ESD (ENSSTOG00000002854) #31	LRCH1 (ENSSTOG00000002840) #32
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	124	DLEU7 (ENSUPAG00010003981)	KCNRG (ENSUPAG00010004022)	TRIM13 (ENSUPAG00010004025)	SPRYD7 (ENSUPAG00010004032) #8	KPNA3 (ENSUPAG00010004046) #9	EBPL (ENSUPAG00010004067) #10	ARL11 (ENSUPAG00010004075) #11	RCBTB1 (ENSUPAG00010004083) #12	PHF11 (ENSUPAG00010004112) #13	SETDB2 (ENSUPAG00010004135) #14	CAB39L (ENSUPAG00010004156) #15	CDADC1 (ENSUPAG00010004175) #17	MLNR (ENSUPAG00010004242) #18	FNDC3A (ENSUPAG00010004258) #19	CYSLTR2 (ENSUPAG00010004301)	RCBTB2 (ENSUPAG00010004306) #22	RB1 (ENSUPAG00010004366) #24	LPAR6 (ENSUPAG00010004428) #23	ITM2B (ENSUPAG00010004431) #26	MED4 (ENSUPAG00010004439) #27	NUDT15 (ENSUPAG00010004450) #28	SUCLA2 (ENSUPAG00010004459) #29	HTR2A (ENSUPAG00010004485) #30	ESD (ENSUPAG00010004501) #31	LRCH1 (ENSUPAG00010004570) #32	ENSUPAG00010004625 #33
Alpin marmot	MODERN SPECIES	13	KCNRG (ENSMMMG00000023037)	TRIM13 (ENSMMMG00000023039)	SPRYD7 (ENSMMMG00000023040) #8	KPNA3 (ENSMMMG00000023052) #9	EBPL (ENSMMMG00000023057) #10	ARL11 (ENSMMMG00000023058) #11	RCBTB1 (ENSMMMG00000023061) #12	PHF11 (ENSMMMG00000023063) #13	SETDB2 (ENSMMMG00000023069) #14	ENSMMMG00000023071 #15	CDADC1 (ENSMMMG00000023083) #17	ENSMMMG00000023106	ENSMMMG00000023108	FNDC3A (ENSMMMG00000023109) #19	CYSLTR2 (ENSMMMG00000023126)	RCBTB2 (ENSMMMG00000023136) #22	RB1 (ENSMMMG00000023141) #24	LPAR6 (ENSMMMG00000023147) #23	ITM2B (ENSMMMG00000023154) #26	MED4 (ENSMMMG00000023156) #27	NUDT15 (ENSMMMG00000023158) #28	SUCLA2 (ENSMMMG00000023163) #29	HTR2A (ENSMMMG00000023175) #30	ESD (ENSMMMG00000023189) #31	LRCH1 (ENSMMMG00000023214) #32	RUBCNL (ENSMMMG00000023314) #33	LRRC63 (ENSMMMG00000023317)	LCP1 (ENSMMMG00000023327)	CPB2 (ENSMMMG00000023337)	ZC3H13 (ENSMMMG00000023343)	SIAH3 (ENSMMMG00000023403)