Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155877 #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155877 #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 830 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00940000155877 #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 211 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182989.D.a.a ENSGT00940000157877.b ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00390000003348 ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00940000164454 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00390000003348 ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182835.c.c 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#24 ENSNNAG00000018596 ENSNNAG00000018634 FAM3A (ENSNNAG00000018651) SLC10A3 (ENSNNAG00000018658) UBL4A (ENSNNAG00000018662) ENSNNAG00000018664 ENSNNAG00000018666 ENSNNAG00000018668 ENSNNAG00000018671 GDI1 (ENSNNAG00000018677) ATP6AP1 (ENSNNAG00000018685) TAFAZZIN (ENSNNAG00000018691) DNASE1L1 (ENSNNAG00000018696) ENSNNAG00000018704 Lizard MODERN SPECIES LTV1 (ENSACAG00000007964) ENSACAG00000010973 ENSACAG00000011003 PLP2 (ENSACAG00000029625) ENSACAG00000011090 PRICKLE3 (ENSACAG00000011010) PFKFB1 (ENSACAG00000011246) ENSACAG00000011664 ENSACAG00000041739 ENSACAG00000011814 PHF8 (ENSACAG00000011904) FAM120C (ENSACAG00000012139) WNK3 (ENSACAG00000012261) TSR2 (ENSACAG00000012270) FGD1 (ENSACAG00000012290) GNL3L (ENSACAG00000012525) #22 ENSACAG00000042765 ENSACAG00000036892 ENSACAG00000004234 #24 ENSACAG00000023284 ENSACAG00000004622 ENSACAG00000004854 FAM3A (ENSACAG00000004999) SLC10A3 (ENSACAG00000005038) UBL4A (ENSACAG00000043371) ENSACAG00000034714 PLXNA3 (ENSACAG00000005063) 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ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00940000161807 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000159855 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00390000012929 ENSGT00940000153231.A ENSGT00390000006665.b ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000160145.b ENSGT00940000157847 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000164454 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00940000155170 ENSGT00550000074803 ENSGT00390000016224.j.a ENSGT00940000162821 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000159855 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000160145.b ENSGT00940000157847 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000163627 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00940000155170 ENSGT00550000074803 ENSGT00390000016224.j.a ENSGT00940000162821 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000159855 ENSGT00940000164196.e ENSGT00940000159667 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000160145.b ENSGT00940000157847 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000164454 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00940000155170 ENSGT00550000074803 ENSGT00390000016224.j.a ENSGT00940000162821 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000159855 Kakapo MODERN SPECIES 75 DPF2 (ENSSHBG00005019320) ENSSHBG00005019314 ENSSHBG00005019310 ENSSHBG00005019307 DRAP1 (ENSSHBG00005019305) RELA (ENSSHBG00005019302) ENSSHBG00005019297 ENSSHBG00005019295 CDK16 (ENSSHBG00005019294) ENSSHBG00005019291 ENSSHBG00005019289 ENSSHBG00005019288 RBM10 (ENSSHBG00005019052) NDUFB11 (ENSSHBG00005019046) HUWE1 (ENSSHBG00005009089) #24 GNL3L (ENSSHBG00005008311) #22 ENSSHBG00005008296 PFKFB1 (ENSSHBG00005008286) HSD17B10 (ENSSHBG00005008270) NAA10 (ENSSHBG00005008241) ENSSHBG00005008222 CCDC22 (ENSSHBG00005008204) SMC1A (ENSSHBG00005008142) Golden eagle MODERN SPECIES 56 ENSACCG00020016331 TSR2 (ENSACCG00020010392) ENSACCG00020010405 ENSACCG00020010414 PHF8 (ENSACCG00020010436) ENSACCG00020010459 #24 HUWE1 (ENSACCG00020015067) #24 GNL3L (ENSACCG00020016701) #22 ENSACCG00020016704 PFKFB1 (ENSACCG00020016708) HSD17B10 (ENSACCG00020016714) NAA10 (ENSACCG00020016717) ENSACCG00020016722 ENSACCG00020016723 CCDC22 (ENSACCG00020016726) CACNA1F (ENSACCG00020016732) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000164454 ENSGT00950000182835.c.c.b ENSGT00940000155170 ENSGT00550000074803 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000164454 ENSGT00950000182835.c.c.b ENSGT00940000155170 ENSGT00550000074803 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000164454 ENSGT00950000182835.c.c.b ENSGT00940000155170 ENSGT00550000074803 Chicken MODERN SPECIES 77 ENSGALG00010000432 #24 GNL3L (ENSGALG00010000428) #22 ITIH6 (ENSGALG00010000422) NSMCE3 (ENSGALG00010000406) PFKFB1 (ENSGALG00010000402) HSD17B10 (ENSGALG00010000367) NAA10 (ENSGALG00010000340) Mammalia ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000013859 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162821 ENSGT00940000164196 ENSGT00940000159667 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000164454 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000164248 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445 ENSGT00940000161880 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c Platypus MODERN SPECIES 17 ENSOANG00000013585 GPR173 (ENSOANG00000038762) ENSOANG00000038317 ENSOANG00000013587 IQSEC2 (ENSOANG00000005666) SMC1A (ENSOANG00000009211) ENSOANG00000041612 HSD17B10 (ENSOANG00000009214) ENSOANG00000031628 HUWE1 (ENSOANG00000000714) #24 PHF8 (ENSOANG00000000712) FAM120C (ENSOANG00000000710) WNK3 (ENSOANG00000000708) TSR2 (ENSOANG00000000707) FGD1 (ENSOANG00000000703) GNL3L (ENSOANG00000000700) #22 ENSOANG00000000695 ENSOANG00000020339 PFKFB1 (ENSOANG00000000691) APEX2 (ENSOANG00000040218) ALAS2 (ENSOANG00000000687) TREX2 (ENSOANG00000000686) ENSOANG00000029619 BGN (ENSOANG00000000684) ATP2B3 (ENSOANG00000000679) CCNQ (ENSOANG00000000678) DUSP9 (ENSOANG00000005316) PNCK (ENSOANG00000036709) ENSOANG00000010213 BCAP31 (ENSOANG00000010212) ABCD1 (ENSOANG00000041560) Theria ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000164196 ENSGT00940000159667 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000164196 ENSGT00940000159667 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00840000130063 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 123 ENSGT00940000162070 ENSGT00940000162389 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 165 ENSGT00940000163245 ENSGT00940000162070 ENSGT00940000162389 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00940000163245 ENSGT00940000162070 ENSGT00940000162389 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 Elephant MODERN SPECIES 584 ENSLAFG00000028389 ENSLAFG00000008306 ENSLAFG00000032108 GPR173 (ENSLAFG00000018731) TSPYL2 (ENSLAFG00000018730) KDM5C (ENSLAFG00000000303) IQSEC2 (ENSLAFG00000006181) SMC1A (ENSLAFG00000002363) RIBC1 (ENSLAFG00000030955) HSD17B10 (ENSLAFG00000002368) HUWE1 (ENSLAFG00000014785) #24 PHF8 (ENSLAFG00000016189) WNK3 (ENSLAFG00000018354) TSR2 (ENSLAFG00000018093) FGD1 (ENSLAFG00000018095) GNL3L (ENSLAFG00000016701) #22 MAGED2 (ENSLAFG00000021533) ENSLAFG00000021415 PFKFB1 (ENSLAFG00000018310) APEX2 (ENSLAFG00000018312) ALAS2 (ENSLAFG00000028949) MAGEH1 (ENSLAFG00000028261) FOXR2 (ENSLAFG00000028716) RRAGB (ENSLAFG00000016144) UBQLN2 (ENSLAFG00000030258) ENSLAFG00000009657 SPIN3 (ENSLAFG00000028333) ENSLAFG00000026755 ENSLAFG00000025577 ENSLAFG00000027414 ENSLAFG00000017963 Hyrax MODERN SPECIES 2137 GNL3L (ENSPCAG00000005304) #22 Tenrec MODERN SPECIES 2619 GNL3L (ENSETEG00000019317) #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155877 #22 Armadillo MODERN SPECIES 1871 PHF8 (ENSDNOG00000001516) FAM120C (ENSDNOG00000001910) WNK3 (ENSDNOG00000012207) ENSDNOG00000048891 FGD1 (ENSDNOG00000016487) GNL3L (ENSDNOG00000048230) #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155877 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 2735 ENSEEUG00000010951 #22 Common shrew MODERN SPECIES 2028 GNL3L (ENSSARG00000005360) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.b.b Suina ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00510000049526 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a Pig MODERN SPECIES 300 GPR173 (ENSSSCG00000024958) TSPYL2 (ENSSSCG00000012323) KANTR (ENSSSCG00000060489) KDM5C (ENSSSCG00000012322) IQSEC2 (ENSSSCG00000012324) SMC1A (ENSSSCG00000012325) RIBC1 (ENSSSCG00000012326) HSD17B10 (ENSSSCG00000012327) HUWE1 (ENSSSCG00000012328) #24 ENSSSCG00000047701 PHF8 (ENSSSCG00000012329) FAM120C (ENSSSCG00000035822) WNK3 (ENSSSCG00000012332) TSR2 (ENSSSCG00000012334) FGD1 (ENSSSCG00000012335) GNL3L (ENSSSCG00000012336) #22 ENSSSCG00000038019 TRO (ENSSSCG00000039027) PFKFB1 (ENSSSCG00000024814) ENSSSCG00000041777 APEX2 (ENSSSCG00000012348) ALAS2 (ENSSSCG00000012347) PAGE2B (ENSSSCG00000012346) USP51 (ENSSSCG00000012349) MAGEH1 (ENSSSCG00000012350) FOXR2 (ENSSSCG00000020805) ENSSSCG00000059274 RRAGB (ENSSSCG00000037228) KLF8 (ENSSSCG00000012352) UBQLN2 (ENSSSCG00000035264) ENSSSCG00000041254 Chacoan peccary MODERN SPECIES 796 PHF8 (ENSCWAG00000004040) FAM120C (ENSCWAG00000003876) WNK3 (ENSCWAG00000003738) TSR2 (ENSCWAG00000018566) FGD1 (ENSCWAG00000018471) ENSCWAG00000018460 GNL3L (ENSCWAG00000018441) #22 ENSCWAG00000018418 MAGED2 (ENSCWAG00000018357) ENSCWAG00000018133 PFKFB1 (ENSCWAG00000017886) APEX2 (ENSCWAG00000017787) ALAS2 (ENSCWAG00000017659) USP51 (ENSCWAG00000017642) MAGEH1 (ENSCWAG00000017629) FOXR2 (ENSCWAG00000017607) RRAGB (ENSCWAG00000017548) KLF8 (ENSCWAG00000017467) UBQLN2 (ENSCWAG00000017442) NBDY (ENSCWAG00000017431) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.b.b Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000162389 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a Cetacea ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000162389 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000159912 ENSGT00530000063540.a ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00940000162763 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ENSGT00940000154172.ab.a.b.b ENSGT00940000158517 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000003082 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000159912 ENSGT00530000063540.a ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00940000162763 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ENSGT00940000154172.ab.a.b.b Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000162070 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00390000001055.e ENSGT00940000159912 ENSGT00530000063540.a ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00940000162763 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00840000130063 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ENSGT00940000158517 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00390000001055.e ENSGT00940000159912 ENSGT00530000063540.a ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00940000162763 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00840000130063 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ENSGT00940000158517 ENSGT01100000263504.a.b.b.a.b Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000162389 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b 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FGD1 (ENSBMSG00010018441) GNL3L (ENSBMSG00010018498) #22 MAGED2 (ENSBMSG00010018562) ENSBMSG00010018665 ALAS2 (ENSBMSG00010018686) APEX2 (ENSBMSG00010018751) PFKFB1 (ENSBMSG00010018787) ENSBMSG00010018946 MAGEH1 (ENSBMSG00010019102) FOXR2 (ENSBMSG00010019118) RRAGB (ENSBMSG00010019141) KLF8 (ENSBMSG00010019225) UBQLN2 (ENSBMSG00010019310) NBDY (ENSBMSG00010019319) ENSBMSG00010019331 SPIN3 (ENSBMSG00010019338) ENSBMSG00010019353 Pecora ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000153299.c.b.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.i ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a 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ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00940000167970.a.b Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 23 ESR2 (ENSOARG00020014342) SYNE2 (ENSOARG00020013014) ENSOARG00020012856 SGPP1 (ENSOARG00020012809) WDR89 (ENSOARG00020012765) ENSOARG00020012701 PPP2R5E (ENSOARG00020012571) ENSOARG00020012477 GPHB5 (ENSOARG00020012444) RHOJ (ENSOARG00020012405) ENSOARG00020012354 KCNH5 (ENSOARG00020011903) ENSOARG00020011846 ENSOARG00020011822 SYT16 (ENSOARG00020011691) ENSOARG00020011650 #22 SNAPC1 (ENSOARG00020011607) HIF1A (ENSOARG00020011056) PRKCH (ENSOARG00020010910) TMEM30B (ENSOARG00020010869) SLC38A6 (ENSOARG00020010682) TRMT5 (ENSOARG00020010606) ENSOARG00020010525 MNAT1 (ENSOARG00020010470) SIX4 (ENSOARG00020010405) SIX1 (ENSOARG00020010359) SIX6 (ENSOARG00020010325) C14orf39 (ENSOARG00020009961) ENSOARG00020009798 ENSOARG00020009767 DHRS7 (ENSOARG00020009716) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 205 SMC1A (ENSOARG00020009423) RIBC1 (ENSOARG00020009197) HSD17B10 (ENSOARG00020009062) ENSOARG00020009018 HUWE1 (ENSOARG00020006767) #24 ENSOARG00020006494 ENSOARG00020006481 ENSOARG00020006463 ENSOARG00020006441 PHF8 (ENSOARG00020024344) ENSOARG00020024314 WNK3 (ENSOARG00020024240) WNK3 (ENSOARG00020024139) TSR2 (ENSOARG00020024077) FGD1 (ENSOARG00020024044) ENSOARG00020024031 #22 MAGED2 (ENSOARG00020023984) PFKFB1 (ENSOARG00020023816) APEX2 (ENSOARG00020023778) ALAS2 (ENSOARG00020023746) MAGEH1 (ENSOARG00020023703) FOXR2 (ENSOARG00020023670) RRAGB (ENSOARG00020023609) KLF8 (ENSOARG00020023543) UBQLN2 (ENSOARG00020023528) ENSOARG00020023517 NBDY (ENSOARG00020023507) ENSOARG00020023498 ENSOARG00020023480 ENSOARG00020023465 ENSOARG00020023450 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 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ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000153299.c.b.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.i ENSGT00940000159438 ENSGT00940000156786.l ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a.e ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a.f Cow MODERN SPECIES 177 TSPYL2 (ENSBTAG00000017783) ENSBTAG00000007493 KDM5C (ENSBTAG00000014943) IQSEC2 (ENSBTAG00000014945) SMC1A (ENSBTAG00000017761) RIBC1 (ENSBTAG00000017769) HSD17B10 (ENSBTAG00000017779) HUWE1 (ENSBTAG00000006122) #24 ENSBTAG00000005098 PHF8 (ENSBTAG00000013289) FAM120C (ENSBTAG00000003855) WNK3 (ENSBTAG00000023182) TSR2 (ENSBTAG00000015858) FGD1 (ENSBTAG00000015860) RAB21 (ENSBTAG00000019370) GNL3L (ENSBTAG00000031564) #22 ENSBTAG00000049441 MAGED2 (ENSBTAG00000039888) TRO (ENSBTAG00000051604) PFKFB1 (ENSBTAG00000000172) APEX2 (ENSBTAG00000013177) ALAS2 (ENSBTAG00000013178) MAGEH1 (ENSBTAG00000039090) FOXR2 (ENSBTAG00000046659) RRAGB (ENSBTAG00000012980) KLF8 (ENSBTAG00000005852) UBQLN2 (ENSBTAG00000021843) NBDY (ENSBTAG00000054746) ENSBTAG00000049019 ENSBTAG00000053877 SPIN2 (ENSBTAG00000013260) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 315 ENSBIXG00005012165 KDM5C (ENSBIXG00005012243) IQSEC2 (ENSBIXG00005012330) SMC1A (ENSBIXG00005012407) RIBC1 (ENSBIXG00005012480) HSD17B10 (ENSBIXG00005001371) HUWE1 (ENSBIXG00005013164) #24 ENSBIXG00005013304 PHF8 (ENSBIXG00005013537) FAM120C (ENSBIXG00005013694) ENSBIXG00005013719 WNK3 (ENSBIXG00005013750) ENSBIXG00005001713 FGD1 (ENSBIXG00005013811) ENSBIXG00005013829 GNL3L (ENSBIXG00005001728) #22 ENSBIXG00005007315 MAGED2 (ENSBIXG00005014025) ENSBIXG00005014063 ENSBIXG00005001826 ENSBIXG00005014077 PFKFB1 (ENSBIXG00005014145) APEX2 (ENSBIXG00005014199) ALAS2 (ENSBIXG00005014264) MAGEH1 (ENSBIXG00005001884) FOXR2 (ENSBIXG00005014322) RRAGB (ENSBIXG00005014371) KLF8 (ENSBIXG00005014469) UBQLN2 (ENSBIXG00005014517) NBDY (ENSBIXG00005014528) ENSBIXG00005014533 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000153299.c.b.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.i ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT01090000260200 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a.e Domestic yak MODERN SPECIES 69 TSPYL2 (ENSBGRG00000025740) ENSBGRG00000025757 KDM5C (ENSBGRG00000025771) IQSEC2 (ENSBGRG00000025892) RIBC1 (ENSBGRG00000025975) HSD17B10 (ENSBGRG00000025993) HUWE1 (ENSBGRG00000026013) #24 ENSBGRG00000026042 PHF8 (ENSBGRG00000026049) ENSBGRG00000026075 ENSBGRG00000026084 WNK3 (ENSBGRG00000026090) ENSBGRG00000026097 FGD1 (ENSBGRG00000026106) ENSBGRG00000026149 GNL3L (ENSBGRG00000026157) #22 ENSBGRG00000026166 MAGED2 (ENSBGRG00000026168) ENSBGRG00000026172 PFKFB1 (ENSBGRG00000007193) ENSBGRG00000007503 APEX2 (ENSBGRG00000007525) ALAS2 (ENSBGRG00000007653) ENSBGRG00000007858 ENSBGRG00000007909 MAGEH1 (ENSBGRG00000007940) FOXR2 (ENSBGRG00000007965) RRAGB (ENSBGRG00000008042) ENSBGRG00000008268 KLF8 (ENSBGRG00000008297) UBQLN2 (ENSBGRG00000008416) Wild yak MODERN SPECIES 921 ENSBMUG00000012905 FGD1 (ENSBMUG00000012883) GNL3L (ENSBMUG00000012851) #22 ENSBMUG00000012795 MAGED2 (ENSBMUG00000012762) American bison MODERN SPECIES 2686 GNL3L (ENSBBBG00000006771) #22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 90 GPR173 (ENSMMSG00000004982) TSPYL2 (ENSMMSG00000004991) ENSMMSG00000005022 KDM5C (ENSMMSG00000005040) IQSEC2 (ENSMMSG00000005270) SMC1A (ENSMMSG00000005622) RIBC1 (ENSMMSG00000005693) HSD17B10 (ENSMMSG00000005843) HUWE1 (ENSMMSG00000005955) #24 ENSMMSG00000006513 PHF8 (ENSMMSG00000006574) ENSMMSG00000006866 ENSMMSG00000006940 ENSMMSG00000007398 FGD1 (ENSMMSG00000007433) GNL3L (ENSMMSG00000007509) #22 MAGED2 (ENSMMSG00000007590) ENSMMSG00000007676 PFKFB1 (ENSMMSG00000007731) APEX2 (ENSMMSG00000007815) ALAS2 (ENSMMSG00000007838) ENSMMSG00000007905 MAGEH1 (ENSMMSG00000007925) FOXR2 (ENSMMSG00000007940) RRAGB (ENSMMSG00000007959) KLF8 (ENSMMSG00000008026) UBQLN2 (ENSMMSG00000008075) NBDY (ENSMMSG00000008086) SPIN3 (ENSMMSG00000008104) ENSMMSG00000008143 ENSMMSG00000008156 Yarkand deer MODERN SPECIES 1323 IQSEC2 (ENSCHYG00000017227) SMC1A (ENSCHYG00000016933) RIBC1 (ENSCHYG00000016704) HSD17B10 (ENSCHYG00000016557) ENSCHYG00000016502 HUWE1 (ENSCHYG00000016142) #24 ENSCHYG00000016027 ENSCHYG00000015970 PHF8 (ENSCHYG00000015566) ENSCHYG00000015498 ENSCHYG00000015432 FAM120C (ENSCHYG00000015064) WNK3 (ENSCHYG00000014818) ENSCHYG00000014706 FGD1 (ENSCHYG00000014503) GNL3L (ENSCHYG00000014302) #22 MAGED2 (ENSCHYG00000014061) ENSCHYG00000014013 PFKFB1 (ENSCHYG00000013428) APEX2 (ENSCHYG00000013314) ALAS2 (ENSCHYG00000013150) ENSCHYG00000013116 ZNF81 (ENSCHYG00000013067) ZNF182 (ENSCHYG00000013010) ENSCHYG00000012978 ENSCHYG00000012946 SLC38A5 (ENSCHYG00000012767) ENSCHYG00000012549 PORCN (ENSCHYG00000012176) EBP (ENSCHYG00000012133) TBC1D25 (ENSCHYG00000012073) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a Alpaca MODERN SPECIES 318 GNL3L (ENSVPAG00000002757) #22 Arabian camel MODERN SPECIES 204 TSPYL2 (ENSCDRG00005020210) KANTR (ENSCDRG00005020229) KDM5C (ENSCDRG00005020258) IQSEC2 (ENSCDRG00005020361) ENSCDRG00005020393 SMC1A (ENSCDRG00005020402) RIBC1 (ENSCDRG00005020442) HSD17B10 (ENSCDRG00005020487) HUWE1 (ENSCDRG00005020527) #24 ENSCDRG00005020654 PHF8 (ENSCDRG00005020670) FAM120C (ENSCDRG00005008991) WNK3 (ENSCDRG00005009083) TSR2 (ENSCDRG00005009269) FGD1 (ENSCDRG00005009349) GNL3L (ENSCDRG00005009469) #22 ENSCDRG00005009639 ENSCDRG00005009671 MAGED2 (ENSCDRG00005009732) ENSCDRG00005010042 PFKFB1 (ENSCDRG00005010443) APEX2 (ENSCDRG00005010743) ALAS2 (ENSCDRG00005010822) FAM104B (ENSCDRG00005011003) ENSCDRG00005011062 USP51 (ENSCDRG00005011079) MAGEH1 (ENSCDRG00005011093) FOXR2 (ENSCDRG00005011115) RRAGB (ENSCDRG00005011140) KLF8 (ENSCDRG00005011290) UBQLN2 (ENSCDRG00005011422) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b 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ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 Ursus ANCESTRAL SPECIES 289 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 Polar bear MODERN SPECIES 436 PHF8 (ENSUMAG00000019347) FAM120C (ENSUMAG00000019275) WNK3 (ENSUMAG00000019207) TSR2 (ENSUMAG00000019189) FGD1 (ENSUMAG00000019104) GNL3L (ENSUMAG00000019089) #22 American black bear MODERN SPECIES 2976 TSR2 (ENSUAMG00000009605) FGD1 (ENSUAMG00000009553) GNL3L (ENSUAMG00000009526) #22 Giant Panda MODERN SPECIES 2288 ENSAMEG00000002792 ENSAMEG00000005200 ENSAMEG00000005189 KDM5C (ENSAMEG00000005133) IQSEC2 (ENSAMEG00000005107) SMC1A (ENSAMEG00000005053) RIBC1 (ENSAMEG00000005048) HSD17B10 (ENSAMEG00000005036) ENSAMEG00000028133 HUWE1 (ENSAMEG00000004896) #24 PHF8 (ENSAMEG00000006185) FAM120C (ENSAMEG00000006166) WNK3 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ENSCAFG00845024775 ENSCAFG00845024814 Red fox MODERN SPECIES 299 ENSVVUG00000002384 ENSVVUG00000002378 WNK3 (ENSVVUG00000002310) TSR2 (ENSVVUG00000002247) FGD1 (ENSVVUG00000002221) GNL3L (ENSVVUG00000002172) #22 MAGED2 (ENSVVUG00000002095) Felidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000153095.g.b.b ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912.a ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a.q.a ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b Panthera ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912.a ENSGT00840000130063 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a.q.a ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ENSGT00940000154103.b Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162741.j ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912.a ENSGT00840000130063 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a.q.a ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b lion MODERN SPECIES 88 NEXMIF (ENSPLOG00000015399) ABCB7 (ENSPLOG00000015472) UPRT (ENSPLOG00000015614) ZDHHC15 (ENSPLOG00000015678) MAGEE2 (ENSPLOG00000015837) ATP7A (ENSPLOG00000015884) COX7B (ENSPLOG00000015994) MAGT1 (ENSPLOG00000016070) ATRX (ENSPLOG00000016232) FGF16 (ENSPLOG00000016349) PHF8 (ENSPLOG00000016412) FAM120C (ENSPLOG00000016518) WNK3 (ENSPLOG00000016605) TSR2 (ENSPLOG00000017069) FGD1 (ENSPLOG00000017101) GNL3L (ENSPLOG00000017251) #22 MAGED2 (ENSPLOG00000017329) ENSPLOG00000017426 ENSPLOG00000017485 PFKFB1 (ENSPLOG00000017772) APEX2 (ENSPLOG00000017994) ALAS2 (ENSPLOG00000018064) ENSPLOG00000018115 RRAGB (ENSPLOG00000018142) KLF8 (ENSPLOG00000018302) UBQLN2 (ENSPLOG00000018514) NBDY (ENSPLOG00000018530) ENSPLOG00000018542 ENSPLOG00000018573 ENSPLOG00000018608 ENSPLOG00000018644 leopard MODERN SPECIES 197 ENSPPRG00000001169 FAM120C (ENSPPRG00000001218) WNK3 (ENSPPRG00000001312) TSR2 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ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000164196 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000161795 ENSGT01090000260962 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000162389 ENSGT00940000162070 ENSGT00940000163245 ENSGT00390000008621.i ENSGT00940000160559 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.d ENSGT00940000160940 ENSGT00940000159479 ENSGT00940000162262 ENSGT00940000160459 Donkey MODERN SPECIES 36 ENSEASG00005034980 ENSEASG00005014871 ENSEASG00005029096 ENSEASG00005037688 ENSEASG00005017946 ENSEASG00005014453 RIBC1 (ENSEASG00005015483) HSD17B10 (ENSEASG00005015494) HUWE1 (ENSEASG00005015775) #24 ENSEASG00005010838 FAM120C (ENSEASG00005027127) ENSEASG00005013854 ENSEASG00005013849 TSR2 (ENSEASG00005034316) FGD1 (ENSEASG00005013013) GNL3L (ENSEASG00005006957) #22 MAGED2 (ENSEASG00005018726) ENSEASG00005034501 PFKFB1 (ENSEASG00005022726) APEX2 (ENSEASG00005011694) ENSEASG00005011666 ENSEASG00005027347 ENSEASG00005018677 ENSEASG00005018541 ENSEASG00005037403 ENSEASG00005030435 ENSEASG00005027341 ENSEASG00005003940 ENSEASG00005026757 ENSEASG00005037978 ENSEASG00005033094 Horse MODERN SPECIES 480 ENSECAG00000048152 FTH1 (ENSECAG00000003925) ENSECAG00000055553 GPR173 (ENSECAG00000011110) TSPYL2 (ENSECAG00000005556) KDM5C (ENSECAG00000024956) IQSEC2 (ENSECAG00000021698) RIBC1 (ENSECAG00000018431) SMC1A (ENSECAG00000019776) HUWE1 (ENSECAG00000021385) #24 PHF8 (ENSECAG00000026860) WNK3 (ENSECAG00000026821) WNK3 (ENSECAG00000050691) TSR2 (ENSECAG00000029844) FGD1 (ENSECAG00000000025) GNL3L (ENSECAG00000000035) #22 ENSECAG00000059470 MAGED2 (ENSECAG00000000036) ENSECAG00000057341 ENSECAG00000052462 PFKFB1 (ENSECAG00000000039) APEX2 (ENSECAG00000026921) ALAS2 (ENSECAG00000000068) MAGED1 (ENSECAG00000040088) GSPT2 (ENSECAG00000043139) ENSECAG00000034424 ENSECAG00000029663 ENSECAG00000037493 NUDT11 (ENSECAG00000032305) ENSECAG00000023638 BMP15 (ENSECAG00000023233) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603.d ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b Megabat MODERN SPECIES 467 GNL3L (ENSPVAG00000008758) #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603.d ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b Microbat MODERN SPECIES 1106 ENSMLUG00000009557 ENSMLUG00000025331 GPR173 (ENSMLUG00000026646) TSPYL2 (ENSMLUG00000013088) KDM5C (ENSMLUG00000004986) IQSEC2 (ENSMLUG00000005010) SMC1A (ENSMLUG00000000158) RIBC1 (ENSMLUG00000000174) ENSMLUG00000000175 HUWE1 (ENSMLUG00000000179) #24 PHF8 (ENSMLUG00000000508) FAM120C (ENSMLUG00000005433) WNK3 (ENSMLUG00000008181) TSR2 (ENSMLUG00000010613) FGD1 (ENSMLUG00000010619) GNL3L (ENSMLUG00000008331) #22 ITIH6 (ENSMLUG00000013415) MAGED2 (ENSMLUG00000012630) TRO (ENSMLUG00000016279) PFKFB1 (ENSMLUG00000016291) ENSMLUG00000016298 ALAS2 (ENSMLUG00000016305) ENSMLUG00000006806 USP51 (ENSMLUG00000015717) RRAGB (ENSMLUG00000015720) KLF8 (ENSMLUG00000016695) UBQLN2 (ENSMLUG00000007552) ENSMLUG00000004357 SPIN3 (ENSMLUG00000015431) ENSMLUG00000006656 ENSMLUG00000002732 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES ENSRFEG00010002507 IQSEC2 (ENSRFEG00010002435) SMC1A (ENSRFEG00010002323) RIBC1 (ENSRFEG00010002277) HSD17B10 (ENSRFEG00010002239) HUWE1 (ENSRFEG00010002183) #24 PHF8 (ENSRFEG00010001984) ENSRFEG00010001924 FAM120C (ENSRFEG00010001877) ENSRFEG00010001859 ENSRFEG00010001852 WNK3 (ENSRFEG00010001743) ENSRFEG00010001718 TSR2 (ENSRFEG00010001704) FGD1 (ENSRFEG00010001665) GNL3L (ENSRFEG00010001603) #22 ENSRFEG00010001587 ITIH6 (ENSRFEG00010001541) MAGED2 (ENSRFEG00010001490) PFKFB1 (ENSRFEG00010001373) APEX2 (ENSRFEG00010001302) ALAS2 (ENSRFEG00010001268) USP51 (ENSRFEG00010001250) MAGEH1 (ENSRFEG00010001238) ENSRFEG00010001225 RRAGB (ENSRFEG00010001176) KLF8 (ENSRFEG00010001110) UBQLN2 (ENSRFEG00010001060) ENSRFEG00010001051 NBDY (ENSRFEG00010001038) ENSRFEG00010001022 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 Primates ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000001055 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000001055 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b Mouse lemur MODERN SPECIES 169 IQSEC2 (ENSMICG00000007877) SMC1A (ENSMICG00000014444) RIBC1 (ENSMICG00000014493) HSD17B10 (ENSMICG00000014508) HUWE1 (ENSMICG00000010879) #24 PHF8 (ENSMICG00000011779) FAM120C (ENSMICG00000011820) ENSMICG00000042068 ENSMICG00000047587 ENSMICG00000028874 WNK3 (ENSMICG00000011844) ENSMICG00000033159 ENSMICG00000027258 TSR2 (ENSMICG00000010116) FGD1 (ENSMICG00000010121) GNL3L (ENSMICG00000010144) #22 ENSMICG00000042417 ENSMICG00000033971 ENSMICG00000030111 ENSMICG00000035154 ENSMICG00000044749 ENSMICG00000042881 MAGED2 (ENSMICG00000035446) ENSMICG00000032024 PFKFB1 (ENSMICG00000003427) APEX2 (ENSMICG00000043181) ALAS2 (ENSMICG00000003435) FAM104B (ENSMICG00000043344) ENSMICG00000043531 MAGEH1 (ENSMICG00000017394) RRAGB (ENSMICG00000035059) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 213 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000001055 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 868 ENSPCOG00000024532 TSR2 (ENSPCOG00000002354) FGD1 (ENSPCOG00000017816) GNL3L (ENSPCOG00000016430) #22 ENSPCOG00000019698 ITIH6 (ENSPCOG00000021013) MAGED2 (ENSPCOG00000012185) TRO (ENSPCOG00000022855) PFKFB1 (ENSPCOG00000019906) APEX2 (ENSPCOG00000016083) ALAS2 (ENSPCOG00000003133) FAM104B (ENSPCOG00000013525) Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 475 CNTN5 (ENSPSMG00000010213) ENSPSMG00000010065 ARHGAP42 (ENSPSMG00000010056) PGR (ENSPSMG00000010007) ENSPSMG00000009993 #22 TRPC6 (ENSPSMG00000009925) ANGPTL5 (ENSPSMG00000009823) CEP126 (ENSPSMG00000009809) CFAP300 (ENSPSMG00000009802) YAP1 (ENSPSMG00000009653) BIRC3 (ENSPSMG00000009531) BIRC2 (ENSPSMG00000009475) ENSPSMG00000009400 MMP7 (ENSPSMG00000009394) MMP20 (ENSPSMG00000009381) MMP27 (ENSPSMG00000009374) MMP8 (ENSPSMG00000009363) ENSPSMG00000009358 MMP10 (ENSPSMG00000009342) MMP1 (ENSPSMG00000009331) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1200 ENSPSMG00000017995 #22 ENSPSMG00000018004 Bushbaby MODERN SPECIES 371 PHF8 (ENSOGAG00000002148) FAM120C (ENSOGAG00000002150) WNK3 (ENSOGAG00000002959) TSR2 (ENSOGAG00000003468) FGD1 (ENSOGAG00000032407) ENSOGAG00000031954 GNL3L (ENSOGAG00000016754) #22 ENSOGAG00000027617 ENSOGAG00000026370 ENSOGAG00000028553 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b Tarsier MODERN SPECIES 7030 TSR2 (ENSTSYG00000005670) FGD1 (ENSTSYG00000005676) GNL3L (ENSTSYG00000004110) #22 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 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SPECIES 203 ENSCSAG00000012657 XAGE2 (ENSCSAG00000012647) GPR173 (ENSCSAG00000000125) TSPYL2 (ENSCSAG00000012621) KDM5C (ENSCSAG00000012588) IQSEC2 (ENSCSAG00000012572) SMC1A (ENSCSAG00000012563) RIBC1 (ENSCSAG00000012553) HSD17B10 (ENSCSAG00000012546) HUWE1 (ENSCSAG00000012534) #24 PHF8 (ENSCSAG00000012488) FAM120C (ENSCSAG00000012447) WNK3 (ENSCSAG00000012379) ENSCSAG00000012366 FGD1 (ENSCSAG00000012335) GNL3L (ENSCSAG00000012324) #22 ENSCSAG00000000124 ITIH6 (ENSCSAG00000012306) MAGED2 (ENSCSAG00000012266) TRO (ENSCSAG00000012194) PFKFB1 (ENSCSAG00000012140) APEX2 (ENSCSAG00000012124) ALAS2 (ENSCSAG00000012117) FAM104B (ENSCSAG00000012104) PAGE3 (ENSCSAG00000012096) ENSCSAG00000012094 MAGEH1 (ENSCSAG00000000123) USP51 (ENSCSAG00000000122) ENSCSAG00000000121 FOXR2 (ENSCSAG00000000120) RRAGB (ENSCSAG00000012089) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a 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ENSGT00940000163664 ENSGT00940000162993 Rhesus MODERN SPECIES 327 FAM156A (ENSMMUG00000053322) GPR173 (ENSMMUG00000052416) TSPYL2 (ENSMMUG00000002593) KDM5C (ENSMMUG00000020553) IQSEC2 (ENSMMUG00000020555) ENSMMUG00000050146 SMC1A (ENSMMUG00000009293) RIBC1 (ENSMMUG00000009295) HSD17B10 (ENSMMUG00000009296) HUWE1 (ENSMMUG00000006362) #24 PHF8 (ENSMMUG00000008751) FAM120C (ENSMMUG00000008760) WNK3 (ENSMMUG00000005433) TSR2 (ENSMMUG00000012612) FGD1 (ENSMMUG00000012613) GNL3L (ENSMMUG00000008231) #22 ITIH6 (ENSMMUG00000007339) MAGED2 (ENSMMUG00000007345) ALAS2 (ENSMMUG00000008429) TRO (ENSMMUG00000008422) PFKFB1 (ENSMMUG00000008425) APEX2 (ENSMMUG00000008428) ENSMMUG00000045847 ENSMMUG00000053924 FAM104B (ENSMMUG00000059922) PAGE3 (ENSMMUG00000010324) ENSMMUG00000060530 MAGEH1 (ENSMMUG00000046259) USP51 (ENSMMUG00000052760) ENSMMUG00000042926 FOXR2 (ENSMMUG00000061763) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 205 GPR173 (ENSMNEG00000009350) TSPYL2 (ENSMNEG00000035444) KDM5C (ENSMNEG00000038248) IQSEC2 (ENSMNEG00000043840) SMC1A (ENSMNEG00000029158) RIBC1 (ENSMNEG00000000866) HSD17B10 (ENSMNEG00000033240) ENSMNEG00000030731 HUWE1 (ENSMNEG00000028305) #24 ENSMNEG00000043124 PHF8 (ENSMNEG00000031521) FAM120C (ENSMNEG00000043194) WNK3 (ENSMNEG00000000787) TSR2 (ENSMNEG00000041996) FGD1 (ENSMNEG00000044881) GNL3L (ENSMNEG00000034813) #22 ITIH6 (ENSMNEG00000042036) MAGED2 (ENSMNEG00000044797) TRO (ENSMNEG00000037926) PFKFB1 (ENSMNEG00000039571) APEX2 (ENSMNEG00000036783) ALAS2 (ENSMNEG00000035005) ENSMNEG00000029837 FAM104B (ENSMNEG00000039753) PAGE3 (ENSMNEG00000036137) ENSMNEG00000045510 MAGEH1 (ENSMNEG00000016687) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00390000014996.z ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.f ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153097.B.a.b.f.a.a ENSGT00390000001055 ENSGT00940000153097.B.a.b.e ENSGT00940000153097.B.a.a ENSGT00940000153097.B.a.b.f.a.b ENSGT00940000153097.B.a.b.f.b ENSGT00840000130063 Olive baboon MODERN SPECIES 792 HUWE1 (ENSPANG00000011865) #24 ENSPANG00000047548 PHF8 (ENSPANG00000003596) ENSPANG00000046836 ENSPANG00000038127 PAGE3 (ENSPANG00000007124) FAM104B (ENSPANG00000010719) ENSPANG00000039566 ENSPANG00000042061 ENSPANG00000037421 ALAS2 (ENSPANG00000003145) APEX2 (ENSPANG00000003595) PFKFB1 (ENSPANG00000007945) TRO (ENSPANG00000014010) ITIH6 (ENSPANG00000009040) GNL3L (ENSPANG00000012588) #22 FGD1 (ENSPANG00000010099) ENSPANG00000008042 ENSPANG00000047101 ENSPANG00000044207 WNK3 (ENSPANG00000006679) FAM120C (ENSPANG00000010270) FOXR2 (ENSPANG00000039946) RRAGB (ENSPANG00000003594) ENSPANG00000042225 ENSPANG00000042132 KLF8 (ENSPANG00000011601) ENSPANG00000041589 ENSPANG00000039865 ENSPANG00000051403 UBQLN2 (ENSPANG00000003144) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 175 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00390000014996.z ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.f ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153097.B.a.b.f.a.a ENSGT00390000001055 ENSGT00940000153097.B.a.b.e ENSGT00940000153097.B.a.a ENSGT00940000153097.B.a.b.f.a.b ENSGT00940000153097.B.a.b.f.b ENSGT00840000130063 Drill MODERN SPECIES 1073 HUWE1 (ENSMLEG00000040083) #24 ENSMLEG00000034750 PHF8 (ENSMLEG00000039406) FAM120C (ENSMLEG00000032896) WNK3 (ENSMLEG00000029595) TSR2 (ENSMLEG00000032632) FGD1 (ENSMLEG00000030030) GNL3L (ENSMLEG00000029679) #22 ITIH6 (ENSMLEG00000028158) MAGED2 (ENSMLEG00000002525) TRO (ENSMLEG00000032029) PFKFB1 (ENSMLEG00000040347) APEX2 (ENSMLEG00000028208) ALAS2 (ENSMLEG00000034163) ENSMLEG00000032157 ENSMLEG00000027409 Sooty mangabey MODERN SPECIES 284 HUWE1 (ENSCATG00000033964) #24 ENSCATG00000036636 PHF8 (ENSCATG00000040353) FAM120C (ENSCATG00000044222) WNK3 (ENSCATG00000034697) ENSCATG00000036868 FGD1 (ENSCATG00000036367) GNL3L (ENSCATG00000031729) #22 ITIH6 (ENSCATG00000044595) MAGED2 (ENSCATG00000036626) TRO (ENSCATG00000039483) PFKFB1 (ENSCATG00000027526) APEX2 (ENSCATG00000044854) ALAS2 (ENSCATG00000006585) ENSCATG00000043958 FAM104B (ENSCATG00000029688) PAGE5 (ENSCATG00000030330) PAGE3 (ENSCATG00000030931) ENSCATG00000038059 ENSCATG00000038893 MAGEH1 (ENSCATG00000016838) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 826 ENSGT00390000012692.f ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2026 GNL3L (ENSRBIG00000041351) #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 784 ENSRROG00000029439 FGD1 (ENSRROG00000036167) GNL3L (ENSRROG00000036933) #22 Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000155373.f ENSGT00390000011365.b.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a.a #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153097.B.a.b.d ENSGT00390000001055 ENSGT00940000153097.B.a.b.c ENSGT00940000153097.B.a.a ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000155373.f ENSGT00390000011365.b.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a.a #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153097.B.a.b.d ENSGT00390000001055 ENSGT00940000153097.B.a.b.c.b ENSGT00940000153097.B.a.a ENSGT00940000153097.B.a.b.c.a ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 118 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000155373.f ENSGT00390000011365.b.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a.a #22 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162980 Capuchin MODERN SPECIES 755 PHF8 (ENSCCAG00000020967) FAM120C (ENSCCAG00000027648) WNK3 (ENSCCAG00000021463) ENSCCAG00000024746 ENSCCAG00000030724 ENSCCAG00000025263 TSR2 (ENSCCAG00000025421) FGD1 (ENSCCAG00000031347) GNL3L (ENSCCAG00000023052) #22 MAGED2 (ENSCCAG00000034934) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 230 TSPYL2 (ENSSBOG00000026060) KDM5C (ENSSBOG00000035565) IQSEC2 (ENSSBOG00000035604) SMC1A (ENSSBOG00000033095) RIBC1 (ENSSBOG00000027804) HSD17B10 (ENSSBOG00000027007) HUWE1 (ENSSBOG00000018862) #24 PHF8 (ENSSBOG00000033359) FAM120C (ENSSBOG00000035457) ENSSBOG00000029988 ENSSBOG00000027791 WNK3 (ENSSBOG00000020896) TSR2 (ENSSBOG00000019737) FGD1 (ENSSBOG00000030775) ENSSBOG00000029805 ENSSBOG00000007626 #22 ITIH6 (ENSSBOG00000026864) ENSSBOG00000025146 ENSSBOG00000026032 ENSSBOG00000026792 TRO (ENSSBOG00000022559) PFKFB1 (ENSSBOG00000026646) APEX2 (ENSSBOG00000030500) ALAS2 (ENSSBOG00000030120) ENSSBOG00000033527 ENSSBOG00000022981 ENSSBOG00000031935 PAGE3 (ENSSBOG00000027971) ENSSBOG00000025228 ENSSBOG00000024305 MAGEH1 (ENSSBOG00000016153) Marmoset MODERN SPECIES 78 TSPYL2 (ENSCJAG00000005850) KDM5C (ENSCJAG00000084781) IQSEC2 (ENSCJAG00000005948) SMC1A (ENSCJAG00000005985) RIBC1 (ENSCJAG00000006044) HSD17B10 (ENSCJAG00000041248) HUWE1 (ENSCJAG00000006076) #24 ENSCJAG00000086851 PHF8 (ENSCJAG00000006260) ENSCJAG00000073277 FAM120C (ENSCJAG00000006315) WNK3 (ENSCJAG00000000221) TSR2 (ENSCJAG00000079432) FGD1 (ENSCJAG00000000230) ENSCJAG00000044040 GNL3L (ENSCJAG00000000252) #22 ITIH6 (ENSCJAG00000031505) TRO (ENSCJAG00000007581) ALAS2 (ENSCJAG00000016542) PFKFB1 (ENSCJAG00000016601) APEX2 (ENSCJAG00000016584) FAM104B (ENSCJAG00000047719) ENSCJAG00000016507 PAGE3 (ENSCJAG00000016523) MAGEH1 (ENSCJAG00000045988) USP51 (ENSCJAG00000023436) FOXR2 (ENSCJAG00000048454) RRAGB (ENSCJAG00000007317) ENSCJAG00000032076 KLF8 (ENSCJAG00000007304) UBQLN2 (ENSCJAG00000007299) Mas night monkey MODERN SPECIES 547 HUWE1 (ENSANAG00000029359) #24 PHF8 (ENSANAG00000021151) FAM120C (ENSANAG00000020909) ENSANAG00000030716 ENSANAG00000010465 WNK3 (ENSANAG00000023178) TSR2 (ENSANAG00000000062) FGD1 (ENSANAG00000023583) ENSANAG00000015501 ENSANAG00000023117 #22 ITIH6 (ENSANAG00000034254) MAGED2 (ENSANAG00000030510) TRO (ENSANAG00000031246) PFKFB1 (ENSANAG00000024490) ENSANAG00000021907 ALAS2 (ENSANAG00000022690) ENSANAG00000036702 FAM104B (ENSANAG00000026192) ENSANAG00000022117 PAGE3 (ENSANAG00000027674) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B.k.a ENSGT00940000160465 ENSGT00940000161729 ENSGT00730000111053.j ENSGT00390000011725.d ENSGT00940000153655.A.b ENSGT00940000159812 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00940000155877.i.a.b #22 ENSGT00440000037505.a ENSGT01060000248589.B ENSGT01060000248592.C ENSGT01060000248592.D ENSGT01060000248592.B ENSGT01060000248592.E ENSGT00940000158290 ENSGT00940000163586 ENSGT00940000161405 ENSGT00940000155975 ENSGT01030000234621.A ENSGT00950000182897.B.a.a ENSGT00900000143541 ENSGT01030000234621.B ENSGT00940000160283 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01030000234590.A.b.a.b.a ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B.k.b ENSGT00940000160465 ENSGT00940000161729 ENSGT00730000111053.j ENSGT00390000011725.d ENSGT00940000153655.A.b ENSGT00940000159812 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00940000155877.i.a.b #22 ENSGT00440000037505.a ENSGT01060000248589.B ENSGT01060000248592.C ENSGT01060000248592.D ENSGT01060000248592.B ENSGT01060000248592.E ENSGT00940000158290 ENSGT00940000163586 ENSGT00940000161405 ENSGT00940000155975 ENSGT01030000234621.A ENSGT00950000182897.B.a.a ENSGT01030000234621.B ENSGT00940000160283 ENSGT01030000234571.a.a Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000234590.A.b.b ENSGT00510000046760.b ENSGT00390000008489 ENSGT00390000007965 ENSGT00940000154942.h ENSGT00940000153664.B.k.b ENSGT00390000018400.bb.a.b.a ENSGT00940000160465 ENSGT00940000161729 ENSGT00730000111053.j ENSGT00390000011725.d ENSGT00940000153655.A.b ENSGT00940000159812 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00940000155877.i.a.b #22 ENSGT00440000037505.a ENSGT01060000248589.B ENSGT01060000248592.D ENSGT01060000248592.B ENSGT01060000248592.E ENSGT00940000158290 ENSGT00940000161405 ENSGT00940000155975 ENSGT01030000234621.A ENSGT00390000013091.q.a ENSGT00950000182897.B.a.a ENSGT01030000234621.B ENSGT00940000160283 ENSGT01030000234571.a.a ENSGT00940000156903 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 54 TM4SF4 (ENSSBOG00000023962) WWTR1 (ENSSBOG00000022386) ENSSBOG00000021576 ANKUB1 (ENSSBOG00000019018) RNF13 (ENSSBOG00000023866) PFN2 (ENSSBOG00000035879) ENSSBOG00000032137 TSC22D2 (ENSSBOG00000025217) SERP1 (ENSSBOG00000035923) EIF2A (ENSSBOG00000022479) SELENOT (ENSSBOG00000028418) ERICH6 (ENSSBOG00000033438) SIAH2 (ENSSBOG00000025717) MINDY4B (ENSSBOG00000021253) CLRN1 (ENSSBOG00000029016) ENSSBOG00000035099 #22 GPR171 (ENSSBOG00000009570) GPR87 (ENSSBOG00000025278) P2RY13 (ENSSBOG00000026950) P2RY12 (ENSSBOG00000008981) MED12L (ENSSBOG00000034783) IGSF10 (ENSSBOG00000022507) ENSSBOG00000024512 AADACL2 (ENSSBOG00000029261) AADAC (ENSSBOG00000018433) SUCNR1 (ENSSBOG00000035745) ENSSBOG00000036049 MBNL1 (ENSSBOG00000020980) P2RY1 (ENSSBOG00000017142) RAP2B (ENSSBOG00000010993) ARHGEF26 (ENSSBOG00000019075) Mas night monkey MODERN SPECIES 401 TM4SF4 (ENSANAG00000038134) WWTR1 (ENSANAG00000029620) COMMD2 (ENSANAG00000023648) ANKUB1 (ENSANAG00000037045) RNF13 (ENSANAG00000032141) PFN2 (ENSANAG00000035572) TSC22D2 (ENSANAG00000033309) ENSANAG00000030670 EIF2A (ENSANAG00000038084) SELENOT (ENSANAG00000024261) ENSANAG00000020869 ERICH6 (ENSANAG00000021605) SIAH2 (ENSANAG00000016748) MINDY4B (ENSANAG00000038244) CLRN1 (ENSANAG00000036741) ENSANAG00000022057 #22 ENSANAG00000031186 GPR171 (ENSANAG00000017383) GPR87 (ENSANAG00000019565) P2RY13 (ENSANAG00000038036) P2RY12 (ENSANAG00000018631) MED12L (ENSANAG00000029382) IGSF10 (ENSANAG00000030658) AADACL2 (ENSANAG00000027707) AADAC (ENSANAG00000036921) SUCNR1 (ENSANAG00000037486) ENSANAG00000036831 ENSANAG00000015250 MBNL1 (ENSANAG00000028111) ENSANAG00000001399 P2RY1 (ENSANAG00000010368) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155877.i.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155877.i.b #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01100000263493.a.b.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000161622 ENSGT00940000153725.b ENSGT00950000182909.a ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000155570 ENSGT00940000155496.b ENSGT00390000017606.a.a.i.b.a.a.f.a ENSGT00910000145427 ENSGT00390000008903 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000009065 ENSGT00940000155877.i.b #22 ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00950000182976.b.b ENSGT00940000155674 ENSGT00940000157368 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000162627 ENSGT00420000029753.a ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000001437 ENSGT00940000159154 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000155000.v ENSGT00940000159608 ENSGT00940000155603.A.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01100000263493.a.b.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000161622 ENSGT00940000153725.b ENSGT00950000182909.a ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000155570 ENSGT00940000155496.b ENSGT00390000017606.a.a.i.b.a.a.f.a ENSGT00910000145427 ENSGT00390000008903 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000009065 ENSGT00940000155877.i.b #22 ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00950000182976.b.b ENSGT00940000155674 ENSGT00940000157368 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000162627 ENSGT00420000029753.a ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000001437 ENSGT00940000159154 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000155000.v ENSGT00940000159608 ENSGT00940000155603.A.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00510000047710 ENSGT00940000161622 ENSGT00940000153725.b ENSGT00950000182909.a ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000155570 ENSGT00940000155496.b ENSGT00390000017606.a.a.i.b.a.a.f.a ENSGT00910000145427 ENSGT00390000008903 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000009065 ENSGT00940000155877.i.b #22 ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00950000182976.b.b ENSGT00910000147652 ENSGT00940000155674 ENSGT00940000157368 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000162627 ENSGT00420000029753.a ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000001437 ENSGT00940000159154 ENSGT00520000060104 ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.b ENSGT00950000182908.A Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00510000047710 ENSGT00940000161622 ENSGT00940000153725.b ENSGT00950000182909.a ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000155570 ENSGT00940000155496.b ENSGT00390000017606.a.a.i.b.a.a.f.a ENSGT00910000145427 ENSGT00390000008903 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000009065 ENSGT00940000155877.i.b #22 ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00950000182976.b.b ENSGT00910000147652 ENSGT00940000155674 ENSGT00940000157368 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000162627 ENSGT00420000029753.a ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000001437 ENSGT00940000159154 ENSGT00520000060104 ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.b ENSGT00950000182908.A Pan ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00510000047710 ENSGT00940000161622 ENSGT00940000153725.b ENSGT00950000182909.a ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000155570 ENSGT00940000155496.b ENSGT00390000017606.a.a.i.b.a.a.f.a ENSGT00910000145427 ENSGT00390000008903 ENSGT00390000002743.g ENSGT00390000009065 ENSGT00940000155877.i.b #22 ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00950000182976.b.b ENSGT00910000147652 ENSGT00940000155674 ENSGT00940000157368 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000162627 ENSGT00420000029753.a ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000001437 ENSGT00940000159154 ENSGT00520000060104 ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.b ENSGT00950000182908.A Chimpanzee MODERN SPECIES 18 ADAMTS6 (ENSPTRG00000016927) CWC27 (ENSPTRG00000016925) SREK1IP1 (ENSPTRG00000016924) SHISAL2B (ENSPTRG00000016923) RGS7BP (ENSPTRG00000016921) RNF180 (ENSPTRG00000016919) HTR1A (ENSPTRG00000016918) IPO11 (ENSPTRG00000016915) LRRC70 (ENSPTRG00000040740) DIMT1 (ENSPTRG00000016914) KIF2A (ENSPTRG00000016913) ZSWIM6 (ENSPTRG00000016910) SMIM15 (ENSPTRG00000016908) ENSPTRG00000048427 ERCC8 (ENSPTRG00000016905) ENSPTRG00000021940 #22 ELOVL7 (ENSPTRG00000016903) DEPDC1B (ENSPTRG00000016902) PDE4D (ENSPTRG00000016900) ENSPTRG00000051791 RAB3C (ENSPTRG00000016898) GAPT (ENSPTRG00000028710) PLK2 (ENSPTRG00000016896) GPBP1 (ENSPTRG00000016894) MIER3 (ENSPTRG00000016893) SETD9 (ENSPTRG00000016892) MAP3K1 (ENSPTRG00000016891) ENSPTRG00000039819 ENSPTRG00000047789 ANKRD55 (ENSPTRG00000016888) ENSPTRG00000018925 Bonobo MODERN SPECIES 18 SHISAL2B (ENSPPAG00000040146) RGS7BP (ENSPPAG00000020192) RNF180 (ENSPPAG00000030487) HTR1A (ENSPPAG00000022738) IPO11 (ENSPPAG00000042249) ENSPPAG00000006742 DIMT1 (ENSPPAG00000034312) KIF2A (ENSPPAG00000034153) ZSWIM6 (ENSPPAG00000042428) ENSPPAG00000029204 ENSPPAG00000036991 SMIM15 (ENSPPAG00000025331) ENSPPAG00000044035 ENSPPAG00000037061 ERCC8 (ENSPPAG00000029388) ENSPPAG00000040301 #22 ELOVL7 (ENSPPAG00000042760) DEPDC1B (ENSPPAG00000035889) ENSPPAG00000040693 PDE4D (ENSPPAG00000041704) ENSPPAG00000042968 RAB3C (ENSPPAG00000003265) GAPT (ENSPPAG00000025071) PLK2 (ENSPPAG00000040133) ACTBL2 (ENSPPAG00000013938) GPBP1 (ENSPPAG00000027686) MIER3 (ENSPPAG00000043927) SETD9 (ENSPPAG00000022367) MAP3K1 (ENSPPAG00000036823) ANKRD55 (ENSPPAG00000043099) ENSPPAG00000030322 Orangutan MODERN SPECIES 18 ENSPPYG00000032959 ENSPPYG00000040427 SHISAL2B (ENSPPYG00000040410) RGS7BP (ENSPPYG00000015502) RNF180 (ENSPPYG00000015501) HTR1A (ENSPPYG00000015500) ENSPPYG00000030937 ENSPPYG00000035503 IPO11 (ENSPPYG00000015498) DIMT1 (ENSPPYG00000015497) KIF2A (ENSPPYG00000015496) ENSPPYG00000036952 ZSWIM6 (ENSPPYG00000025925) SMIM15 (ENSPPYG00000015492) NDUFAF2 (ENSPPYG00000015491) ENSPPYG00000041513 #22 ERCC8 (ENSPPYG00000015490) ELOVL7 (ENSPPYG00000015489) DEPDC1B (ENSPPYG00000015488) PDE4D (ENSPPYG00000015486) RAB3C (ENSPPYG00000015485) GAPT (ENSPPYG00000015484) PLK2 (ENSPPYG00000015483) ACTBL2 (ENSPPYG00000015482) GPBP1 (ENSPPYG00000015481) MIER3 (ENSPPYG00000015480) SETD9 (ENSPPYG00000015479) MAP3K1 (ENSPPYG00000015478) ANKRD55 (ENSPPYG00000015476) IL6ST (ENSPPYG00000015475) IL31RA (ENSPPYG00000015473) Gibbon MODERN SPECIES 8 SREK1IP1 (ENSNLEG00000029872) SHISAL2B (ENSNLEG00000035740) RGS7BP (ENSNLEG00000003240) RNF180 (ENSNLEG00000003235) HTR1A (ENSNLEG00000018215) ENSNLEG00000027208 ENSNLEG00000031456 ENSNLEG00000027868 IPO11 (ENSNLEG00000003072) DIMT1 (ENSNLEG00000002996) KIF2A (ENSNLEG00000002865) ENSNLEG00000002851 ENSNLEG00000029273 ENSNLEG00000002834 NDUFAF2 (ENSNLEG00000002819) ENSNLEG00000031593 #22 ERCC8 (ENSNLEG00000002757) ELOVL7 (ENSNLEG00000031923) DEPDC1B (ENSNLEG00000002677) ENSNLEG00000030635 ENSNLEG00000034735 PDE4D (ENSNLEG00000002595) RAB3C (ENSNLEG00000002575) PLK2 (ENSNLEG00000002471) ACTBL2 (ENSNLEG00000018212) ENSNLEG00000032427 GPBP1 (ENSNLEG00000002381) MIER3 (ENSNLEG00000002269) SETD9 (ENSNLEG00000002266) MAP3K1 (ENSNLEG00000002250) ENSNLEG00000028269 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00510000047710 ENSGT01100000263493.a.b.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000161622 ENSGT00940000153725.b ENSGT00950000182909.a ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000155570 ENSGT00940000155496.b ENSGT00910000145427 ENSGT00390000008903 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000009065 ENSGT00940000155877.i.b #22 ENSGT00940000154943.j ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00950000182976.b.b ENSGT00940000155674 ENSGT00910000147231 ENSGT00940000157368 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000162627 ENSGT00420000029753.a ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000001437 ENSGT00940000159154 ENSGT00520000060104 ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.b Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00510000047710 ENSGT01100000263493.a.b.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000161622 ENSGT00940000153725.b ENSGT00950000182909.a ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000155570 ENSGT00940000155496.b ENSGT00910000145427 ENSGT00390000008903 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000009065 ENSGT00940000155877.i.b #22 ENSGT00940000154943.j ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00950000182976.b.b ENSGT00940000155674 ENSGT00910000147231 ENSGT00940000157368 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000162627 ENSGT00420000029753.a ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000001437 ENSGT00940000159154 ENSGT00520000060104 ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.b Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00510000047710 ENSGT01100000263493.a.b.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000161622 ENSGT00940000153725.b ENSGT00950000182909.a ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000155570 ENSGT00940000155496.b ENSGT00910000145427 ENSGT00390000008903 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000009065 ENSGT00940000155877.i.b #22 ENSGT00940000154943.j ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00950000182976.b.b ENSGT00940000153877.g.b.a.a ENSGT00910000147409 ENSGT00940000155674 ENSGT00910000147231 ENSGT00940000157368 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000162627 ENSGT00420000029753.a ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000001437 ENSGT00940000159154 Macaca ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155967 ENSGT00510000047710 ENSGT01100000263493.a.b.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000161622 ENSGT00940000153725.b ENSGT00950000182909.a ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000155570 ENSGT00940000155496.b ENSGT00390000008903 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000009065 ENSGT00940000155877.i.b #22 ENSGT00940000154943.j ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00950000182976.b.b ENSGT00940000153877.g.b.a.a ENSGT00910000147409 ENSGT00940000155674 ENSGT00910000147231 ENSGT00940000157368 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000162627 ENSGT00420000029753.a ENSGT00940000155541.C.j ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000001437 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 283 CENPK (ENSMNEG00000045242) ADAMTS6 (ENSMNEG00000029474) CWC27 (ENSMNEG00000026520) SREK1IP1 (ENSMNEG00000040413) SHISAL2B (ENSMNEG00000037285) RGS7BP (ENSMNEG00000042653) RNF180 (ENSMNEG00000029156) HTR1A (ENSMNEG00000005737) ENSMNEG00000029563 IPO11 (ENSMNEG00000032061) DIMT1 (ENSMNEG00000013739) KIF2A (ENSMNEG00000030884) ZSWIM6 (ENSMNEG00000035020) SMIM15 (ENSMNEG00000006002) NDUFAF2 (ENSMNEG00000041130) ENSMNEG00000031230 #22 ERCC8 (ENSMNEG00000035298) ENSMNEG00000036221 ENSMNEG00000042345 ELOVL7 (ENSMNEG00000031532) DEPDC1B (ENSMNEG00000043156) ENSMNEG00000036410 ENSMNEG00000036559 PDE4D (ENSMNEG00000028858) ENSMNEG00000028014 RAB3C (ENSMNEG00000029967) PLK2 (ENSMNEG00000027569) ACTBL2 (ENSMNEG00000009130) ENSMNEG00000029800 GPBP1 (ENSMNEG00000013841) ENSMNEG00000020911 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00510000047710 ENSGT00940000161622 ENSGT00940000153725.b ENSGT00950000182909.a ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00910000147727 ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000155570 ENSGT00940000155496.b ENSGT00910000145427 ENSGT00390000008903 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000009065 ENSGT00940000155877.i.b #22 ENSGT00940000154943.j ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00950000182976.b.b ENSGT00940000153877.g.b.a.a ENSGT00910000147409 ENSGT00940000155674 ENSGT00940000157368 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000162627 ENSGT00420000029753.a ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000001437 ENSGT00940000159154 ENSGT00520000060104 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000155570 ENSGT00940000155496.b ENSGT00910000145427 ENSGT00390000008903 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000009065 ENSGT00940000155877.i.b #22 ENSGT00940000154943.j ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00950000182976.b.b ENSGT00940000153877.g.b.a.a ENSGT00910000147409 ENSGT00940000155674 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000162627 ENSGT00420000029753.a ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000001437 ENSGT00940000159154 ENSGT00520000060104 ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.b Drill MODERN SPECIES 1077 ENSMLEG00000029954 IPO11 (ENSMLEG00000014468) DIMT1 (ENSMLEG00000027706) KIF2A (ENSMLEG00000036610) ZSWIM6 (ENSMLEG00000039853) ENSMLEG00000037256 SMIM15 (ENSMLEG00000027450) ENSMLEG00000029892 NDUFAF2 (ENSMLEG00000040031) ENSMLEG00000039011 #22 ERCC8 (ENSMLEG00000032387) ENSMLEG00000040322 ENSMLEG00000021032 ELOVL7 (ENSMLEG00000035576) DEPDC1B (ENSMLEG00000043040) Sooty mangabey MODERN SPECIES 372 IPO11 (ENSCATG00000040159) ENSCATG00000034533 DIMT1 (ENSCATG00000020219) KIF2A (ENSCATG00000017426) ZSWIM6 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ELF1 (ENSCJAG00000017782) ENSCJAG00000017791 SLC25A15 (ENSCJAG00000069518) MRPS31 (ENSCJAG00000017805) FOXO1 (ENSCJAG00000068966) ENSCJAG00000084413 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00510000049526 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b Tree shrew MODERN SPECIES 1287 ENSTBEG00000000360 #22 Glires ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00510000049526 ENSGT00890000139436.A.b 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(ENSHGLG00000049275) ENSHGLG00000050802 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000162070 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049526 ENSGT00840000130063.e ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063.f ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162603 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 194 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 #24 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 ENSGT00940000162763 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 Squirrel MODERN SPECIES 351 GPR173 (ENSSTOG00000022218) TSPYL2 (ENSSTOG00000024396) KDM5C (ENSSTOG00000001217) IQSEC2 (ENSSTOG00000001231) SMC1A (ENSSTOG00000005481) RIBC1 (ENSSTOG00000005524) HSD17B10 (ENSSTOG00000005535) HUWE1 (ENSSTOG00000005546) #24 PHF8 (ENSSTOG00000000290) FAM120C 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(ENSMMMG00000012692) TSPYL2 (ENSMMMG00000012693) KANTR (ENSMMMG00000012705) KDM5C (ENSMMMG00000012711) IQSEC2 (ENSMMMG00000012831) SMC1A (ENSMMMG00000012856) RIBC1 (ENSMMMG00000012889) HSD17B10 (ENSMMMG00000012895) HUWE1 (ENSMMMG00000012907) #24 PHF8 (ENSMMMG00000013095) FAM120C (ENSMMMG00000013313) WNK3 (ENSMMMG00000013351) TSR2 (ENSMMMG00000013450) FGD1 (ENSMMMG00000013467) GNL3L (ENSMMMG00000013506) #22 ITIH6 (ENSMMMG00000013549) MAGED2 (ENSMMMG00000013585) ENSMMMG00000013632 PFKFB1 (ENSMMMG00000013675) APEX2 (ENSMMMG00000013719) ALAS2 (ENSMMMG00000013791) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 156 ENSSVLG00005015688 KANTR (ENSSVLG00005015675) KDM5C (ENSSVLG00005015304) IQSEC2 (ENSSVLG00005015113) ENSSVLG00005015050 SMC1A (ENSSVLG00005014765) RIBC1 (ENSSVLG00005014562) HSD17B10 (ENSSVLG00005014486) HUWE1 (ENSSVLG00005013657) #24 PHF8 (ENSSVLG00005013001) FAM120C (ENSSVLG00005012884) ENSSVLG00005012811 WNK3 (ENSSVLG00005012128) ENSSVLG00005012050 FGD1 (ENSSVLG00005011952) GNL3L (ENSSVLG00005011899) #22 ENSSVLG00005011877 ENSSVLG00005011838 ENSSVLG00005011811 ITIH6 (ENSSVLG00005011628) ENSSVLG00005011487 ENSSVLG00005011142 PFKFB1 (ENSSVLG00005010833) APEX2 (ENSSVLG00005010743) ALAS2 (ENSSVLG00005010575) ENSSVLG00005010526 ENSSVLG00005010499 ENSSVLG00005010473 ENSSVLG00005010447 ENSSVLG00005010343 ENSSVLG00005022919 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00390000004891 ENSGT00940000163673 ENSGT00940000162603 ENSGT00940000161062 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00940000162763 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 Rabbit MODERN SPECIES 1401 ENSOCUG00000005727 UBQLN2 (ENSOCUG00000025886) KLF8 (ENSOCUG00000005068) RRAGB (ENSOCUG00000008666) MAGEH1 (ENSOCUG00000011207) USP51 (ENSOCUG00000022810) ENSOCUG00000033823 ALAS2 (ENSOCUG00000013603) PFKFB1 (ENSOCUG00000001716) TRO (ENSOCUG00000001711) PHF8 (ENSOCUG00000002629) FAM120C (ENSOCUG00000011602) WNK3 (ENSOCUG00000011608) TSR2 (ENSOCUG00000027678) FGD1 (ENSOCUG00000000004) GNL3L (ENSOCUG00000007408) #22 ITIH6 (ENSOCUG00000004452) MAGED2 (ENSOCUG00000004456) HUWE1 (ENSOCUG00000007354) #24 ENSOCUG00000025084 HSD17B10 (ENSOCUG00000017937) ENSOCUG00000005034 IQSEC2 (ENSOCUG00000027852) KDM5C (ENSOCUG00000010139) KANTR (ENSOCUG00000037007) TSPYL2 (ENSOCUG00000027476) GPR173 (ENSOCUG00000006716) CLCN5 (ENSOCUG00000017336) USP27X (ENSOCUG00000000066) ENSOCUG00000037564 FOXP3 (ENSOCUG00000010135) Pika MODERN SPECIES 1020 ENSOPRG00000002722 #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156449 ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00930000150950.b ENSGT00390000013916 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000017619 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000156089 ENSGT00940000156552 ENSGT00530000063873.A ENSGT00530000063873.B ENSGT00390000000801 ENSGT00950000183214.a.b.a.b 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ENSGT00930000150950.b ENSGT00390000013916 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000017619 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000156089 ENSGT00940000156552 ENSGT00530000063873.A ENSGT00530000063873.B ENSGT00390000000801 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00940000155270.c ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157974 ENSGT00940000153514.b ENSGT00950000183014.f.a ENSGT00940000160642 ENSGT00440000037606.b ENSGT00940000158781 ENSGT00390000015769.B ENSGT00530000063410.b ENSGT01030000234607.A.b ENSGT00940000161508 ENSGT00940000155235 ENSGT00940000155408 ENSGT00940000157249 ENSGT00940000154453.b ENSGT00940000162639 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00930000150950.b ENSGT00390000013916 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000017619 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000156089 ENSGT00940000156552 ENSGT01030000234979.a ENSGT00530000063873.A ENSGT00530000063873.B ENSGT00390000000801 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00940000155270.c ENSGT00940000155877 #22 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ENSVURG00010004815 KLF7 (ENSVURG00010004801) CREB1 (ENSVURG00010004759) METTL21A (ENSVURG00010004735) ENSVURG00010004692 koala MODERN SPECIES 231 ICA1L (ENSPCIG00000008836) WDR12 (ENSPCIG00000008835) CARF (ENSPCIG00000008833) NBEAL1 (ENSPCIG00000022908) ENSPCIG00000022906 CYP20A1 (ENSPCIG00000022811) ABI2 (ENSPCIG00000015338) ENSPCIG00000015308 ENSPCIG00000015292 CD28 (ENSPCIG00000015286) CTLA4 (ENSPCIG00000015278) ENSPCIG00000015275 PARD3B (ENSPCIG00000006317) ENSPCIG00000006319 NRP2 (ENSPCIG00000006323) ENSPCIG00000006327 #22 INO80D (ENSPCIG00000006328) NDUFS1 (ENSPCIG00000009914) ENSPCIG00000009878 CMKLR2 (ENSPCIG00000015684) Wallaby MODERN SPECIES 12039 ENSMEUG00000001359 #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 2 ICA1L (ENSSHAG00000007656) WDR12 (ENSSHAG00000006960) CARF (ENSSHAG00000006210) NBEAL1 (ENSSHAG00000000284) ENSSHAG00000021267 CYP20A1 (ENSSHAG00000028734) ABI2 (ENSSHAG00000008450) ENSSHAG00000007679 CD28 (ENSSHAG00000028743) CTLA4 (ENSSHAG00000016177) ENSSHAG00000015832 ENSSHAG00000024535 PARD3B (ENSSHAG00000001616) ENSSHAG00000024159 ENSSHAG00000018322 ENSSHAG00000026001 #22 INO80D (ENSSHAG00000029318) NDUFS1 (ENSSHAG00000017865) EEF1B2 (ENSSHAG00000017853) CMKLR2 (ENSSHAG00000021936) ENSSHAG00000028209 ADAM23 (ENSSHAG00000017245) FAM237A (ENSSHAG00000017064) MDH1B (ENSSHAG00000016820) ENSSHAG00000016740 ENSSHAG00000022521 CPO (ENSSHAG00000026232) KLF7 (ENSSHAG00000015861) CREB1 (ENSSHAG00000013905) METTL21A (ENSSHAG00000013828) ENSSHAG00000013219 Anura ANCESTRAL SPECIES 226 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00390000003348 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000163627 ENSGT00940000164454 ENSGT00950000182835.c.c ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00390000012715 ENSGT00390000003937 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 12 ENSLLEG00000022536 ENSLLEG00000022552 ZMYM3 (ENSLLEG00000022609) NONO (ENSLLEG00000023526) ENSLLEG00000023617 ITGB1BP2 (ENSLLEG00000023671) 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ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 131 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00730000111044 ENSGT00940000155877 #22 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000161383 ENSGT00940000166196 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166313 ENSGT00940000159563 ENSGT00990000203541.b ENSGT00600000085663 ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 356 ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000164755.D.b ENSGT00390000015154 ENSGT00950000183102.C ENSGT00390000017780.e.ab ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000166169 ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.h ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b.d ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.c.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00510000048007 ENSGT00940000154343.fb ENSGT00510000047137.y ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482.a ENSGT00390000017213.B.b ENSGT00940000160408.g ENSGT01030000234571.a.b.f ENSGT00940000153341.l.a ENSGT00940000172767 ENSGT00390000009368 Asian bonytongue MODERN SPECIES 14 pqbp1 (ENSSFOG00015032016) TIMM17B (ENSSFOG00015028880) praf2 (ENSSFOG00015009826) ENSSFOG00015026127 sypb (ENSSFOG00015009670) plp2b (ENSSFOG00015024717) PRICKLE3 (ENSSFOG00015009613) gata1a (ENSSFOG00015009587) si:dkey-13a21.4 (ENSSFOG00015009566) HCFC1 (ENSSFOG00015009466) opn1sw2 (ENSSFOG00015009411) ENSSFOG00015009394 ENSSFOG00015032823 ENSSFOG00015008941 ENSSFOG00015008893 gnl3l (ENSSFOG00015008883) #22 tfe3b (ENSSFOG00015008689) ccdc120b (ENSSFOG00015008622) ENSSFOG00015008591 otud5b (ENSSFOG00015027588) cenps (ENSSFOG00015026443) tardbpb (ENSSFOG00015008512) RER1 (ENSSFOG00015008467) tas1r2.1 (ENSSFOG00015008301) ENSSFOG00015008268 GPR153 (ENSSFOG00015008256) espn (ENSSFOG00015008210) ARHGEF16 (ENSSFOG00015008185) ybx1 (ENSSFOG00015008173) ENSSFOG00015008150 taf10 (ENSSFOG00015008108) P. kingsleyae MODERN SPECIES 32 gpkow (ENSPKIG00000008382) pqbp1 (ENSPKIG00000008420) timm17b (ENSPKIG00000008438) praf2 (ENSPKIG00000008455) ENSPKIG00000008476 ENSPKIG00000008537 ENSPKIG00000008552 sypb (ENSPKIG00000008577) plp2b (ENSPKIG00000008615) PRICKLE3 (ENSPKIG00000008640) gata1a (ENSPKIG00000008667) si:dkey-13a21.4 (ENSPKIG00000008691) HCFC1 (ENSPKIG00000008723) opn1sw2 (ENSPKIG00000009651) opn1lw1 (ENSPKIG00000011983) gnl3l (ENSPKIG00000012014) #22 tfe3b (ENSPKIG00000012043) ccdc120b (ENSPKIG00000012066) otud5b (ENSPKIG00000012110) cenps (ENSPKIG00000012136) tardbpb (ENSPKIG00000012179) RER1 (ENSPKIG00000012231) tas1r2.1 (ENSPKIG00000012286) her3 (ENSPKIG00000012352) GPR153 (ENSPKIG00000012380) espn (ENSPKIG00000012406) ARHGEF16 (ENSPKIG00000012442) ybx1 (ENSPKIG00000012488) ENSPKIG00000012512 ENSPKIG00000012524 taf10 (ENSPKIG00000012550) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000167532 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00390000003348 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 257 ENSGT00980000199461 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000161531.b ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00530000063687.b.b.b.u ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b Denticle herring MODERN SPECIES 3 snai1a (ENSDCDG00000024020) ENSDCDG00000024019 ENSDCDG00000024016 top1a (ENSDCDG00000023981) ENSDCDG00000023946 fam83d (ENSDCDG00000023929) mafbb (ENSDCDG00000023928) ENSDCDG00000023924 adnpa (ENSDCDG00000023922) gata1a (ENSDCDG00000023920) si:dkey-13a21.4 (ENSDCDG00000023906) HCFC1 (ENSDCDG00000023838) MECP2 (ENSDCDG00000023819) opn1sw2 (ENSDCDG00000023817) opn1lw1 (ENSDCDG00000023816) gnl3l (ENSDCDG00000023810) #22 tfe3b (ENSDCDG00000023742) ITPR1 (ENSDCDG00000023173) pfkfb4b (ENSDCDG00000015652) ENSDCDG00000015409 uroc1 (ENSDCDG00000015360) arl8bb (ENSDCDG00000015351) ENSDCDG00000015348 SEMA3F (ENSDCDG00000021551) camkvb (ENSDCDG00000021439) ENSDCDG00000021427 mon1a (ENSDCDG00000021422) ENSDCDG00000021417 ENSDCDG00000021412 nelfcd (ENSDCDG00000021242) ctsz (ENSDCDG00000021228) Atlantic herring MODERN SPECIES 21 ndrg3a (ENSCHAG00000006188) ENSCHAG00000006168 trpc4apa (ENSCHAG00000003004) snai1a (ENSCHAG00000002866) ENSCHAG00000002843 ENSCHAG00000002600 ENSCHAG00000002536 MAFB (ENSCHAG00000002515) ENSCHAG00000002335 adnpa (ENSCHAG00000002315) gata1a (ENSCHAG00000002296) HCFC1 (ENSCHAG00000001262) mecp2 (ENSCHAG00000025011) ENSCHAG00000024994 ENSCHAG00000024977 gnl3l (ENSCHAG00000024890) #22 tfe3b (ENSCHAG00000024871) ENSCHAG00000024868 ENSCHAG00000024865 ENSCHAG00000024858 ENSCHAG00000024850 ENSCHAG00000024847 ENSCHAG00000024842 ENSCHAG00000024840 ENSCHAG00000024837 ENSCHAG00000024833 ENSCHAG00000024831 ENSCHAG00000024828 ENSCHAG00000024827 ENSCHAG00000024825 ENSCHAG00000024819 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 303 ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00390000006665.b.g ENSGT00940000155056.b ENSGT00940000163942.a ENSGT00940000158374.d ENSGT00940000166894 ENSGT00390000009278.a ENSGT00940000154570.a.a ENSGT00940000159410 ENSGT00940000165157 Channel catfish MODERN SPECIES 13 eif4g1a (ENSIPUG00000015470) opn1lw1 (ENSIPUG00000015456) gnl3l (ENSIPUG00000015441) #22 ENSIPUG00000015425 ccdc120b (ENSIPUG00000015381) BRPF3 (ENSIPUG00000015329) MON1B (ENSIPUG00000015318) cxxc1b (ENSIPUG00000015280) ENSIPUG00000015243 olfml3 (ENSIPUG00000015231) ENSIPUG00000015222 inavab (ENSIPUG00000015200) rabif (ENSIPUG00000015172) kdm5ba (ENSIPUG00000015005) Ipo9 (ENSIPUG00000014896) shisa4 (ENSIPUG00000014876) LMOD1 (ENSIPUG00000014866) timm17a (ENSIPUG00000014845) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a Electric eel MODERN SPECIES 17 etnk2 (ENSEEEG00000012697) sox13 (ENSEEEG00000012701) snrpe (ENSEEEG00000012703) yod1 (ENSEEEG00000012711) zgc:158258 (ENSEEEG00000012714) ENSEEEG00000012723 sh2d5 (ENSEEEG00000012730) hp1bp3 (ENSEEEG00000012732) ENSEEEG00000012734 ENSEEEG00000012736 ENSEEEG00000012739 pdrg1 (ENSEEEG00000012746) PPP1R3D (ENSEEEG00000012747) ENSEEEG00000012749 opn1lw1 (ENSEEEG00000012760) gnl3l (ENSEEEG00000012891) #22 tfe3b (ENSEEEG00000012904) cxxc1b (ENSEEEG00000012972) ccdc120b (ENSEEEG00000013153) ENSEEEG00000013154 EPB41L1 (ENSEEEG00000013208) KCND3 (ENSEEEG00000013250) INKA2 (ENSEEEG00000013252) ENSEEEG00000013253 rap1ab (ENSEEEG00000013259) PANK4 (ENSEEEG00000013280) draxina (ENSEEEG00000013282) agtrap (ENSEEEG00000013283) RNF207 (ENSEEEG00000013285) ENSEEEG00000013289 CHD5 (ENSEEEG00000013292) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 214 ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00390000006665.b.g ENSGT00940000155056.b ENSGT00940000163942.a ENSGT00940000158374.d Red-bellied piranha MODERN SPECIES 348 ENSPNAG00000009446 myg1 (ENSPNAG00000009469) ENSPNAG00000009483 top1a (ENSPNAG00000009507) ENSPNAG00000009533 fam83d (ENSPNAG00000009546) ENSPNAG00000009555 ENSPNAG00000009623 adnpa (ENSPNAG00000009630) gata1a (ENSPNAG00000009646) si:dkey-13a21.4 (ENSPNAG00000009664) HCFC1 (ENSPNAG00000009697) opn1sw2 (ENSPNAG00000009708) ENSPNAG00000009733 ENSPNAG00000009746 gnl3l (ENSPNAG00000005179) #22 tfe3b (ENSPNAG00000001347) cxxc1b (ENSPNAG00000006461) Mexicana tetra MODERN SPECIES 14 ephb2b (ENSAMXG00000006326) fam83d (ENSAMXG00000036827) adnpa (ENSAMXG00000006355) gata1a (ENSAMXG00000040272) si:dkey-13a21.4 (ENSAMXG00000032663) opn1sw2 (ENSAMXG00000037260) opn1lw1 (ENSAMXG00000006368) gnl3l (ENSAMXG00000006376) #22 tfe3b (ENSAMXG00000020781) cxxc1b (ENSAMXG00000006383) ccdc120b (ENSAMXG00000042805) grm6b (ENSAMXG00000006398) MON1B (ENSAMXG00000006415) BRPF3 (ENSAMXG00000041882) ENSAMXG00000031120 PLCH2 (ENSAMXG00000006425) ENSAMXG00000024789 LACTBL1 (ENSAMXG00000004600) ENSAMXG00000043590 ENSAMXG00000029622 smarcd1 (ENSAMXG00000004577) gpd1b (ENSAMXG00000029979) cers5 (ENSAMXG00000004553) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160318.c.a ENSGT00940000154681.b.d ENSGT00980000199461 ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000161531.b ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT01060000253577 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00730000111044 ENSGT00940000169444 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160318.c.a ENSGT00940000154681.b.d.f ENSGT00980000199461 ENSGT00390000018123.b.b ENSGT00940000155006.e.a.e ENSGT00950000182893.a.a.b.b.a ENSGT00940000158405.f ENSGT00940000161531.b.b ENSGT00940000164411.a ENSGT00530000063631.b.n.a.b 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ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00940000163250.B.b.a.a ENSGT00530000063548.A Orange clownfish MODERN SPECIES 20 arpc4 (ENSAPEG00000023544) pfkfb4a (ENSAPEG00000023519) MAPKAPK3 (ENSAPEG00000023504) top1a (ENSAPEG00000023452) ENSAPEG00000023431 fam83d (ENSAPEG00000023418) MAFB (ENSAPEG00000023407) ENSAPEG00000023397 adnpa (ENSAPEG00000023391) BCL2L1 (ENSAPEG00000023385) gata1a (ENSAPEG00000023372) si:dkey-13a21.4 (ENSAPEG00000023338) ENSAPEG00000023323 opn1sw2 (ENSAPEG00000023305) opn1lw1 (ENSAPEG00000023291) gnl3l (ENSAPEG00000023280) #22 tfe3b (ENSAPEG00000023266) cxxc1b (ENSAPEG00000023253) mbd1b (ENSAPEG00000023230) ccdc120b (ENSAPEG00000023200) SRPK3 (ENSAPEG00000023166) comtb (ENSAPEG00000023151) grm6b (ENSAPEG00000023124) traip (ENSAPEG00000023069) mon1a (ENSAPEG00000023054) ENSAPEG00000022994 camkvb (ENSAPEG00000022969) SEMA3F 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ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d Nile tilapia MODERN SPECIES 17 ENSONIG00000033933 ENSONIG00000035826 top1a (ENSONIG00000020303) ENSONIG00000035626 fam83d (ENSONIG00000020301) MAFB (ENSONIG00000020811) ENSONIG00000020300 ENSONIG00000028248 ENSONIG00000020298 gata1a (ENSONIG00000020297) si:dkey-13a21.4 (ENSONIG00000020296) hcfc1a (ENSONIG00000020295) opn1sw2 (ENSONIG00000020294) opn1sw2 (ENSONIG00000020293) opn1lw1 (ENSONIG00000020292) gnl3l (ENSONIG00000029260) #22 tfe3b (ENSONIG00000020291) cxxc1b (ENSONIG00000020290) ccdc120b (ENSONIG00000020288) SRPK3 (ENSONIG00000020287) comtb (ENSONIG00000020286) grm6b (ENSONIG00000020285) traip (ENSONIG00000020284) mon1a (ENSONIG00000020283) ENSONIG00000020282 camkvb (ENSONIG00000036268) SEMA3F (ENSONIG00000020280) ENSONIG00000028560 arl8bb (ENSONIG00000020279) NAAA (ENSONIG00000020278) bhlhe40 (ENSONIG00000020277) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b 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17 myh7ba (ENSACLG00000020780) snai1a (ENSACLG00000020860) ENSACLG00000020873 ENSACLG00000020905 top1a (ENSACLG00000020954) ENSACLG00000021023 fam83d (ENSACLG00000021027) ENSACLG00000021036 adnpa (ENSACLG00000021065) gata1a (ENSACLG00000021090) si:dkey-13a21.4 (ENSACLG00000021109) ENSACLG00000021128 opn1sw2 (ENSACLG00000021147) opn1sw2 (ENSACLG00000021193) opn1lw1 (ENSACLG00000021226) gnl3l (ENSACLG00000021244) #22 tfe3b (ENSACLG00000021271) cxxc1b (ENSACLG00000021315) mbd1b (ENSACLG00000021383) ENSACLG00000021406 ccdc120b (ENSACLG00000021415) SRPK3 (ENSACLG00000021452) comtb (ENSACLG00000021475) grm6b (ENSACLG00000021488) traip (ENSACLG00000021544) mon1a (ENSACLG00000021606) ENSACLG00000021639 camkvb (ENSACLG00000021669) ENSACLG00000021691 SEMA3F (ENSACLG00000021730) ENSACLG00000021860 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1108 ENSMZEG00005010045 ENSMZEG00005010062 top1a (ENSMZEG00005010072) ENSMZEG00005010126 fam83d (ENSMZEG00005010134) MAFB (ENSMZEG00005010140) ENSMZEG00005010154 adnpa 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(ENSSLUG00000007380) NAAA (ENSSLUG00000007391) bhlhe40 (ENSSLUG00000007397) Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 ENSCGOG00000002001 ENSCGOG00000001997 top1a (ENSCGOG00000001478) ENSCGOG00000001439 fam83d (ENSCGOG00000001435) ENSCGOG00000001432 MAFB (ENSCGOG00000001430) adnpa (ENSCGOG00000001427) BCL2L1 (ENSCGOG00000001425) gata1a (ENSCGOG00000001418) si:dkey-13a21.4 (ENSCGOG00000001417) hcfc1a (ENSCGOG00000001124) opn1sw2 (ENSCGOG00000001101) opn1sw2 (ENSCGOG00000001089) opn1lw1 (ENSCGOG00000001051) gnl3l (ENSCGOG00000001042) #22 tfe3b (ENSCGOG00000001023) cxxc1a (ENSCGOG00000000995) ENSCGOG00000000992 ENSCGOG00000000965 ccdc120b (ENSCGOG00000000963) SRPK3 (ENSCGOG00000000936) comtb (ENSCGOG00000000932) grm6b (ENSCGOG00000000769) traip (ENSCGOG00000000727) mon1a (ENSCGOG00000000725) ENSCGOG00000000720 camkvb (ENSCGOG00000000660) SEMA3F (ENSCGOG00000000535) arl8bb (ENSCGOG00000023683) NAAA (ENSCGOG00000023679) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A Stickleback MODERN SPECIES 17 trpc4apa (ENSGACG00000010137) snai1a (ENSGACG00000010147) ENSGACG00000010154 ENSGACG00000010157 ENSGACG00000010167 top1a (ENSGACG00000010175) fam83d (ENSGACG00000010183) MAFB (ENSGACG00000010185) ENSGACG00000010189 adnpa (ENSGACG00000010194) BCL2L1 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ENSCLMG00005012788 cxxc1b (ENSCLMG00005012498) ENSCLMG00005012492 ccdc120b (ENSCLMG00005012490) ENSCLMG00005012489 ENSCLMG00005012487 SRPK3 (ENSCLMG00005012486) comtb (ENSCLMG00005012436) grm6b (ENSCLMG00005012426) traip (ENSCLMG00005012422) mon1a (ENSCLMG00005012421) ENSCLMG00005012418 camkvb (ENSCLMG00005012417) SEMA3F (ENSCLMG00005012021) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d Gilthead seabream MODERN SPECIES 20 snai1a (ENSSAUG00010013621) ENSSAUG00010013623 ENSSAUG00010013624 top1a (ENSSAUG00010013632) ENSSAUG00010014343 fam83d (ENSSAUG00010014344) MAFB (ENSSAUG00010014345) ENSSAUG00010014348 BCL2L (ENSSAUG00010014353) gata1a (ENSSAUG00010014355) si:dkey-13a21.4 (ENSSAUG00010014358) hcfc1a (ENSSAUG00010014373) opn1sw2 (ENSSAUG00010014432) opn1sw2 (ENSSAUG00010014437) opn1lw1 (ENSSAUG00010014442) gnl3l (ENSSAUG00010014448) #22 tfe3b (ENSSAUG00010014478) cxxc1b (ENSSAUG00010014492) mbd1b (ENSSAUG00010014539) ccdc120b (ENSSAUG00010014546) SRPK3 (ENSSAUG00010014567) comtb (ENSSAUG00010017170) grm6b (ENSSAUG00010017188) traip (ENSSAUG00010017395) mon1a (ENSSAUG00010017406) ENSSAUG00010017412 camkvb (ENSSAUG00010017420) SEMA3F (ENSSAUG00010017498) arl8bb (ENSSAUG00010018930) ENSSAUG00010018932 bhlhe40 (ENSSAUG00010018934) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156917.b ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 #22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d Large yellow croaker MODERN SPECIES 478 ENSLCRG00005022347 ENSLCRG00005022348 top1a (ENSLCRG00005022352) ENSLCRG00005022423 fam83d (ENSLCRG00005022424) MAFB (ENSLCRG00005022425) 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ENSLCAG00010019393 adnpa (ENSLCAG00010019391) BCL2L1 (ENSLCAG00010019389) gata1a (ENSLCAG00010019384) si:dkey-13a21.4 (ENSLCAG00010019380) opn1sw2 (ENSLCAG00010019363) opn1sw2 (ENSLCAG00010019332) opn1sw2 (ENSLCAG00010019314) opn1lw1 (ENSLCAG00010019185) gnl3l (ENSLCAG00010019117) #22 tfe3b (ENSLCAG00010018845) cxxc1b (ENSLCAG00010018774) mbd1b (ENSLCAG00010018764) ccdc120b (ENSLCAG00010018757) SRPK3 (ENSLCAG00010018737) comtb (ENSLCAG00010018721) grm6b (ENSLCAG00010018700) traip (ENSLCAG00010018680) mon1a (ENSLCAG00010018669) ENSLCAG00010018663 camkvb (ENSLCAG00010018655) SEMA3F (ENSLCAG00010018634) arl8bb (ENSLCAG00010018615) NAAA (ENSLCAG00010018609) bhlhe40 (ENSLCAG00010018605) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 ENSMMDG00005007017 ENSMMDG00005007023 top1a (ENSMMDG00005007045) ZHX3 (ENSMMDG00005007888) fam83d (ENSMMDG00005007889) MAFB (ENSMMDG00005007892) ENSMMDG00005007895 adnpa (ENSMMDG00005007898) BCL2L1 (ENSMMDG00005007904) gata1a (ENSMMDG00005007905) si:dkey-13a21.4 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