Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	167									ENSGT00740000116794 #18	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00860000134673	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT01000000215701	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000154902	ENSGT00510000047676
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	296							ENSGT00940000156883 #15	ENSGT00510000047589 #16	ENSGT00940000155710.a #17	ENSGT00740000116794 #18	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00860000134673	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT01030000235294	ENSGT01050000244965.a.b	ENSGT00390000004582 #28	ENSGT00660000095541.a.a #27	ENSGT00390000013968 #26	ENSGT00940000166409	ENSGT00950000183148.b.b	ENSGT00390000018613.a	ENSGT01100000263540.A.a	ENSGT00940000160793	ENSGT00940000158550
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	313							ENSGT00940000156883 #15	ENSGT00510000047589 #16	ENSGT00940000155710.a #17	ENSGT00740000116794 #18	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00860000134673	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00390000004582 #28	ENSGT00660000095541.a.a #27	ENSGT00390000013968 #26
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162535	ENSGT00390000004632	ENSGT00940000154704.d.b #7	ENSGT00940000165723.b #8	ENSGT00940000156675.c #9	ENSGT00940000155309.o #10	ENSGT00940000154445.a #14	ENSGT00940000156883 #15	ENSGT00510000047589 #16	ENSGT00940000155710.a #17	ENSGT00740000116794 #18	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00860000134673	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00390000013968 #26	ENSGT00660000095541.a.a #27	ENSGT00390000004582 #28	ENSGT00940000160366	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b	ENSGT00940000168728	ENSGT00940000164834.a	ENSGT01030000234613.b.a.b.h #30	ENSGT01030000234613.b.a.b.g #31	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a #32	ENSGT00390000016478.c.b #33	ENSGT00940000154862.x.b #34
Channel catfish	MODERN SPECIES	22	PRKG1 (ENSIPUG00000000923) #7	dkk1a (ENSIPUG00000001048) #8	pcdh15a (ENSIPUG00000001088) #9	ENSIPUG00000002311 #10	ckba (ENSIPUG00000002321) #11	ENSIPUG00000002368 #12	ENSIPUG00000002379 #13	Cisd1 (ENSIPUG00000002387) #14	DHX57 (ENSIPUG00000002412) #15	galm (ENSIPUG00000002550) #16	atl2 (ENSIPUG00000002603) #17	ENSIPUG00000002624 #18	HELLS (ENSIPUG00000002634) #19	ENSIPUG00000002680 #20	ENSIPUG00000002709 #21	H2afy2 (ENSIPUG00000002757) #22	gbf1 (ENSIPUG00000002803) #23	pitx3 (ENSIPUG00000002981) #24	PNLIPRP2 (ENSIPUG00000002993) #25	gins1 (ENSIPUG00000003089) #26	ninl (ENSIPUG00000003152) #27	AIFM2 (ENSIPUG00000003201) #28	ENSIPUG00000003245 #29	ENSIPUG00000003257 #30	exoc3l4 (ENSIPUG00000003285) #31	ENSIPUG00000003305 #32	eif5 (ENSIPUG00000003331) #33	mark3 (ENSIPUG00000003398) #34	ckba (ENSIPUG00000003503) #35	trmt61a (ENSIPUG00000003613) #36	bag5 (ENSIPUG00000003641) #37
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000162535	ENSGT00390000004632	ENSGT00940000154704.d.b #7	ENSGT00940000165723.b #8	ENSGT00940000156675.c #9	ENSGT00940000155309.o #10	ENSGT00940000154445.a #14	ENSGT00940000156883 #15	ENSGT00510000047589 #16	ENSGT00940000155710.a #17	ENSGT00740000116794 #18	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00860000134673	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00390000013968 #26	ENSGT00660000095541.a.a #27	ENSGT00390000004582 #28	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b	ENSGT00940000168728	ENSGT00940000164834.a	ENSGT01030000234613.b.a.b.h #30	ENSGT01030000234613.b.a.b.g #31	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a #32	ENSGT00390000016478.c.b #33	ENSGT00940000154862.x.b #34	ENSGT00950000182772.A.a.b.`b.a #35
Electric eel	MODERN SPECIES	1	HPSE2 (ENSEEEG00000003368)	hps1 (ENSEEEG00000003372)	st3gal7 (ENSEEEG00000003373)	morn4 (ENSEEEG00000003374)	nkx1.2la (ENSEEEG00000003375)	prkg1a (ENSEEEG00000003379) #7	dkk1a (ENSEEEG00000003389) #8	pcdh15a (ENSEEEG00000003396) #9	ENSEEEG00000003400 #10	cisd1 (ENSEEEG00000003401) #14	DHX57 (ENSEEEG00000003403) #15	galm (ENSEEEG00000003433) #16	atl2 (ENSEEEG00000003481) #17	hells (ENSEEEG00000004554) #19	ENSEEEG00000004611 #21	macroh2a2 (ENSEEEG00000004618) #22	ENSEEEG00000004622	pitx3 (ENSEEEG00000004623) #24	PNLIPRP2 (ENSEEEG00000004628) #25	gins1 (ENSEEEG00000004750) #26	ninl (ENSEEEG00000004759) #27	AIFM2 (ENSEEEG00000004763) #28	ENSEEEG00000004768	ENSEEEG00000004773	ENSEEEG00000004775 #32	EIF5 (ENSEEEG00000004780) #33	mark3a (ENSEEEG00000004785) #34	ckba (ENSEEEG00000004850) #35	ENSEEEG00000004949	trmt61a (ENSEEEG00000004950) #36	bag5 (ENSEEEG00000004951) #37
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162535	ENSGT00390000004632	ENSGT00940000154704.d.b #7	ENSGT00940000165723.b #8	ENSGT00940000156675.c #9	ENSGT00940000155309.o #10	ENSGT00940000154445.a #14	ENSGT00940000156883 #15	ENSGT00510000047589 #16	ENSGT00940000155710.a #17	ENSGT00740000116794 #18	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00860000134673	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00390000013968 #26	ENSGT00660000095541.a.a #27	ENSGT00390000004582 #28	ENSGT00940000160366	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b	ENSGT00940000156837	ENSGT00940000164834.a	ENSGT01030000234613.b.a.b.h #30	ENSGT01030000234613.b.a.b.g #31	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a #32	ENSGT00390000016478.c.b #33	ENSGT00940000154862.x.b #34
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	10	ENSPNAG00000030093	morn4 (ENSPNAG00000030091)	nkx1.2la (ENSPNAG00000030090)	prkg1a (ENSPNAG00000030089) #7	dkk1a (ENSPNAG00000030084) #8	pcdh15a (ENSPNAG00000030069) #9	ENSPNAG00000030016 #10	cisd1 (ENSPNAG00000030012) #14	DHX57 (ENSPNAG00000030009) #15	galm (ENSPNAG00000030001) #16	atl2 (ENSPNAG00000029989) #17	ENSPNAG00000029973 #18	hells (ENSPNAG00000029968) #19	ENSPNAG00000006895 #20	ENSPNAG00000029953 #21	macroh2a2 (ENSPNAG00000029946) #22	GBF1 (ENSPNAG00000029938) #23	pitx3 (ENSPNAG00000029928) #24	PNLIPRP2 (ENSPNAG00000029920) #25	gins1 (ENSPNAG00000029876) #26	ninl (ENSPNAG00000029902) #27	AIFM2 (ENSPNAG00000029863) #28	ENSPNAG00000029857	ENSPNAG00000004680	ENSPNAG00000029833	ENSPNAG00000029830	ENSPNAG00000029823	ENSPNAG00000029810 #30	ENSPNAG00000029805 #30	exoc3l4 (ENSPNAG00000004678) #31	ENSPNAG00000029768 #32
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	17	dkk1a (ENSAMXG00000036955) #8	pcdh15a (ENSAMXG00000002174) #9	ENSAMXG00000043287	ENSAMXG00000037132	ENSAMXG00000035834	ENSAMXG00000002153 #10	cisd1 (ENSAMXG00000029084) #14	DHX57 (ENSAMXG00000002141) #15	galm (ENSAMXG00000002135) #16	atl2 (ENSAMXG00000002117) #17	ENSAMXG00000002107 #18	hells (ENSAMXG00000002088) #19	ENSAMXG00000042009	ENSAMXG00000040001 #20	ENSAMXG00000002073 #21	macroh2a2 (ENSAMXG00000002015) #22	GBF1 (ENSAMXG00000002009) #23	pitx3 (ENSAMXG00000029072) #24	PNLIPRP2 (ENSAMXG00000002005) #25	gins1 (ENSAMXG00000041281) #26	ninl (ENSAMXG00000001987) #27	AIFM2 (ENSAMXG00000001966) #28	ENSAMXG00000034311	ENSAMXG00000029877	ENSAMXG00000035908	ENSAMXG00000038628	ENSAMXG00000033759	exoc3l4 (ENSAMXG00000001925) #31	ENSAMXG00000001905 #32	EIF5 (ENSAMXG00000001895) #33	mark3a (ENSAMXG00000001870) #34
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000167263	ENSGT00940000158638	ENSGT00940000154141.B	ENSGT00940000165391	ENSGT00940000164285.a.f	ENSGT00940000154711.a.a	ENSGT00940000155930.g.a	ENSGT00940000156883 #15	ENSGT00510000047589 #16	ENSGT00940000155710.a #17	ENSGT00740000116794 #18	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00390000013968.c #26	ENSGT00660000095541.a.a #27	ENSGT00390000004582 #28	ENSGT00940000160366	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b	ENSGT00940000164834.a	ENSGT01030000234613.b.a.b.h #30	ENSGT01030000234613.b.a.b.g #31	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a #32	ENSGT00390000016478.c.b #33	ENSGT00940000154862.x.b #34	ENSGT00950000182772.A.a.b.`b.a #35	ENSGT01030000234848
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	87	ENSGT00730000110943.B.c.b	ENSGT00950000182980.a.b.b.b.gc.b	ENSGT00940000158638.l	ENSGT00940000154141.B.eb	ENSGT00940000165391.b	ENSGT00940000164285.a.f.a	ENSGT00940000154711.a.a.d	ENSGT00940000155930.g.a.b	ENSGT00940000156883.h #15	ENSGT00510000047589 #16	ENSGT00940000155710.a.l #17	ENSGT00740000116794 #18	ENSGT00740000115593.a #19	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000154865.kc.b	ENSGT00940000158120.g #22	ENSGT00940000156925.v.a #23	ENSGT00940000154518.b.j #24	ENSGT00390000013968.c #26	ENSGT00660000095541.a.a.i #27	ENSGT00390000004582.e #28	ENSGT00940000160366.i	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b	ENSGT00940000164834.a	ENSGT01030000234613.b.a.b.g.b #31	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a.a #32	ENSGT00390000016478.c.b #33	ENSGT00940000154862.x.b.l #34	ENSGT01100000266056	ENSGT00950000182772.A.a.b.`b.a.n #35	ENSGT00940000154239.a.e.b #36
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000167711.a.a.b	ENSGT00730000110943.B.c.b	ENSGT00950000182980.a.b.b.b.gc.b	ENSGT00940000158638.l	ENSGT00940000154141.B.eb	ENSGT00940000165391.b	ENSGT00940000164285.a.f.a	ENSGT00940000154711.a.a.d	ENSGT00940000155930.g.a.b	ENSGT00940000156883.h #15	ENSGT00510000047589 #16	ENSGT00940000155710.a.l #17	ENSGT00740000115593.a #19	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000154865.kc.b	ENSGT00940000158120.g #22	ENSGT00940000156925.v.a #23	ENSGT00940000154518.b.j #24	ENSGT00390000013968.c #26	ENSGT00660000095541.a.a.i #27	ENSGT00390000004582.e #28	ENSGT00940000160366.i	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b	ENSGT00940000164834.a	ENSGT01030000234613.b.a.b.h #30	ENSGT01030000234613.b.a.b.g.a #31	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a.b #32	ENSGT00390000016478.c.a.b ##33	ENSGT00940000154862.x.b.k #34	ENSGT00950000182772.A.a.b.`b.a.m #35	ENSGT00940000154239.a.f #36
Common carp reference	MODERN SPECIES	48	ENSCCRG00000001182	ENSCCRG00000001175	calm2a (ENSCCRG00000080623)	TTC7A (ENSCCRG00000021494)	mcfd2 (ENSCCRG00000025548)	ENSCCRG00000079722	socs5b (ENSCCRG00000055545)	ENSCCRG00000067455	epas1b (ENSCCRG00000027310)	atl2 (ENSCCRG00000029458) #17	galm (ENSCCRG00000058321) #16	hells (ENSCCRG00000029434) #19	ENSCCRG00000052977 #20	ENSCCRG00000025131 #21	ENSCCRG00000072851	macroh2a2 (ENSCCRG00000027439) #22	ENSCCRG00000027640 #23	pitx3 (ENSCCRG00000047836) #24	ENSCCRG00000031584	gins1 (ENSCCRG00000018976) #26	ninl (ENSCCRG00000018970) #27	ENSCCRG00000018965 #28	ENSCCRG00000055451	ENSCCRG00000018951	ENSCCRG00000018947 #30	exoc3l4 (ENSCCRG00000075093) #31	ENSCCRG00000018917 #32	ENSCCRG00000067235 ##33	MARK3 (ENSCCRG00000018569) #34	bag5 (ENSCCRG00000020801) #37	ENSCCRG00000018566
Goldfish	MODERN SPECIES	31	PLEKHH2 (ENSCARG00000058871)	epcam (ENSCARG00000058790)	calm2a (ENSCARG00000058664)	TTC7A (ENSCARG00000058641)	mcfd2 (ENSCARG00000058626)	ENSCARG00000058618	socs5b (ENSCARG00000058600)	ENSCARG00000058592	PRKCE (ENSCARG00000058387)	epas1b (ENSCARG00000056927)	galm (ENSCARG00000056791) #16	atl2 (ENSCARG00000052292) #17	ENSCARG00000052052 #18	hells (ENSCARG00000051495) #19	ENSCARG00000051148 #21	macroh2a2 (ENSCARG00000051088) #22	GBF1 (ENSCARG00000050901) #23	pitx3 (ENSCARG00000050860) #24	gins1 (ENSCARG00000050815) #26	ninl (ENSCARG00000050765) #27	AIFM2 (ENSCARG00000050745) #28	ENSCARG00000050720	ENSCARG00000050710	ENSCARG00000050690 #30	exoc3l4 (ENSCARG00000050658) #31	ENSCARG00000050635 #32	ENSCARG00000050625	EIF5 (ENSCARG00000050598) #33	mark3a (ENSCARG00000046908) #34	ENSCARG00000046809	ckba (ENSCARG00000046562) #35
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	802										ENSGT00940000155930.g.a.a	ENSGT00940000156883.g #15	ENSGT00940000155710.a.k #17	ENSGT00740000115593.b #19	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865.kc.a	ENSGT00940000158120.h #22	ENSGT00940000156925.v.b #23	ENSGT00940000154518.b.i #24
Goldfish	MODERN SPECIES	4	tial1 (ENSCARG00000063712)	ENSCARG00000063696	ENSCARG00000063676	rgs17 (ENSCARG00000063664)	ENSCARG00000063550	il22ra2 (ENSCARG00000063530)	rab1ab (ENSCARG00000063350)	tbp (ENSCARG00000063161)	rhoua (ENSCARG00000063145)	rab4a (ENSCARG00000063134)	epas1b (ENSCARG00000062718)	DHX57 (ENSCARG00000062466) #15	atl2 (ENSCARG00000056846) #17	hells (ENSCARG00000056179) #19	ENSCARG00000055916	macroh2a2 (ENSCARG00000055870) #22	GBF1 (ENSCARG00000055550) #23	pitx3 (ENSCARG00000055479) #24	ENSCARG00000055448	ENSCARG00000055436	exoc3l4 (ENSCARG00000055416) #31	ENSCARG00000055390 #32	EIF5 (ENSCARG00000055286) #33	mark3a (ENSCARG00000054962) #34	ENSCARG00000054937	ckba (ENSCARG00000054814) #35	trmt61a (ENSCARG00000054803) #36	bag5 (ENSCARG00000054747) #37	coa8 (ENSCARG00000054688)	klc1a (ENSCARG00000054267)	ttl (ENSCARG00000054215)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	216	ENSGT00940000157675.b	ENSGT00940000164251.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.b.gc.a	ENSGT00940000167263	ENSGT00940000158638.k	ENSGT00940000154141.B.db	ENSGT00940000165391.a	ENSGT00940000164285.a.f.b	ENSGT00940000154711.a.a.c	ENSGT00940000155930.g.a.a	ENSGT00940000156883.g #15	ENSGT00940000155710.a.k #17	ENSGT00740000115593.b #19	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865.kc.a	ENSGT00940000158120.h #22	ENSGT00940000156925.v.b #23	ENSGT00940000154518.b.i #24	ENSGT01030000234613.b.a.b.g.b #31	ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a.a #32	ENSGT00390000016478.c.b #33	ENSGT00940000154862.x.b.l #34
Common carp reference	MODERN SPECIES	18	ENSCCRG00000081416	ENSCCRG00000061863	calm2a (ENSCCRG00000077289)	si:ch211-93n23.7 (ENSCCRG00000027992)	TTC7A (ENSCCRG00000027985)	mcfd2 (ENSCCRG00000063255)	ENSCCRG00000082634	socs5b (ENSCCRG00000067878)	ENSCCRG00000075770	epas1b (ENSCCRG00000024181)	ENSCCRG00000024186 #15	atl2 (ENSCCRG00000060545) #17	hells (ENSCCRG00000027223) #19	ENSCCRG00000056281 #21	ENSCCRG00000073729	macroh2a2 (ENSCCRG00000018156) #22	ENSCCRG00000038554 #23	pitx3 (ENSCCRG00000038544) #24	ENSCCRG00000078542	ENSCCRG00000041921	ENSCCRG00000018934 #31	ENSCCRG00000018498 #32	EIF5 (ENSCCRG00000018349) #33	mark3a (ENSCCRG00000074047) #34	ckba (ENSCCRG00000018553) #35	trmt61a (ENSCCRG00000055745) #36	bag5 (ENSCCRG00000031680) #37	coa8 (ENSCCRG00000020794)	klc1a (ENSCCRG00000061513)	ttl (ENSCCRG00000023529)	fignl1 (ENSCCRG00000063996)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	116									ENSSGRG00000024169	epas1b (ENSSGRG00000023515)	galm (ENSSGRG00000023513) #16	DHX57 (ENSSGRG00000023512) #15	atl2 (ENSSGRG00000023176) #17	hells (ENSSGRG00000022846) #19	ENSSGRG00000022842 #21	macroh2a2 (ENSSGRG00000022749) #22	GBF1 (ENSSGRG00000022584) #23	pitx3 (ENSSGRG00000022571) #24	gins1 (ENSSGRG00000022567) #26	ninl (ENSSGRG00000022553) #27	ENSSGRG00000022547 #28	ENSSGRG00000022546	ENSSGRG00000022544	ENSSGRG00000022543	ENSSGRG00000022540	ENSSGRG00000022536 #32	ENSSGRG00000022422 #33	mark3a (ENSSGRG00000020219) #34	ENSSGRG00000020175	ckba (ENSSGRG00000020174) #35	trmt61a (ENSSGRG00000020170) #36
Zebrafish	MODERN SPECIES	4	ENSDARG00000087190	calm2a (ENSDARG00000031427)	si:ch211-93n23.7 (ENSDARG00000089552)	TTC7A (ENSDARG00000074760)	mcfd2 (ENSDARG00000039757)	prop1 (ENSDARG00000039756)	socs5b (ENSDARG00000062745)	PRKCE (ENSDARG00000069928)	epas1b (ENSDARG00000057671)	DHX57 (ENSDARG00000057660) #15	galm (ENSDARG00000057630) #16	atl2 (ENSDARG00000057719) #17	ENSDARG00000075943 #18	hells (ENSDARG00000057738) #19	ENSDARG00000092199 #20	macroh2a2 (ENSDARG00000087897) #22	GBF1 (ENSDARG00000027016) #23	pitx3 (ENSDARG00000070069) #24	ENSDARG00000093267	ENSDARG00000102319	ENSDARG00000058160 #32	exoc3l4 (ENSDARG00000058180) #31	ENSDARG00000061714 #30	ENSDARG00000108535	AIFM2 (ENSDARG00000077549) #28	ninl (ENSDARG00000098414) #27	gins1 (ENSDARG00000007624) #26	RPS6KA2 (ENSDARG00000028469)	rnaset2 (ENSDARG00000036282)	ENSDARG00000110698	csmd1a (ENSDARG00000044414)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	344										ENSGT00940000156883 #15	ENSGT00510000047589 #16	ENSGT00940000155710.a #17	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152
Denticle herring	MODERN SPECIES	18	ENSDCDG00000030196	ENSDCDG00000030097	papss2a (ENSDCDG00000029691)	minpp1a (ENSDCDG00000029678)	sgms1a (ENSDCDG00000029675)	CHST15 (ENSDCDG00000029674)	GPR26 (ENSDCDG00000029673)	ENSDCDG00000029671	DAGLB (ENSDCDG00000029649)	SPAG9 (ENSDCDG00000029319)	DHX57 (ENSDCDG00000029279) #15	galm (ENSDCDG00000029275) #16	atl2 (ENSDCDG00000029106) #17	ENSDCDG00000028917 #21	ENSDCDG00000028900	macroh2a2 (ENSDCDG00000028894) #22	GBF1 (ENSDCDG00000025174) #23	pitx3 (ENSDCDG00000025042) #24	PNLIPRP2 (ENSDCDG00000024970) #25	hspa12a (ENSDCDG00000024026)	eno4 (ENSDCDG00000024011)	shtn1 (ENSDCDG00000024009)	atp6v1ba (ENSDCDG00000021445)	vax1 (ENSDCDG00000021379)	hells (ENSDCDG00000020562) #19	ENSDCDG00000020528	itgb3b (ENSDCDG00000016909)	mettl9 (ENSDCDG00000016807)	ENSDCDG00000016803	fam135a (ENSDCDG00000016781)	ENSDCDG00000016765
Atlantic herring	MODERN SPECIES	4	ENSCHAG00000009536	ENSCHAG00000009520	mlh1 (ENSCHAG00000009405)	lrrfip2 (ENSCHAG00000008980)	ATE1 (ENSCHAG00000008664)	fgfr2 (ENSCHAG00000001587)	ENSCHAG00000024901	ENSCHAG00000024894	ENSCHAG00000024889	NEU3 (ENSCHAG00000024887)	DHX57 (ENSCHAG00000024807) #15	galm (ENSCHAG00000024799) #16	atl2 (ENSCHAG00000024497) #17	hells (ENSCHAG00000024099) #19	ENSCHAG00000024065 #21	macroh2a2 (ENSCHAG00000024058) #22	ENSCHAG00000024052	GBF1 (ENSCHAG00000023858) #23	pitx3 (ENSCHAG00000023844) #24	PNLIPRP2 (ENSCHAG00000023673) #25	hspa12a (ENSCHAG00000023660)	ENSCHAG00000023653	eno4 (ENSCHAG00000023646)	shtn1 (ENSCHAG00000023623)	atp6v1ba (ENSCHAG00000023063)	vax1 (ENSCHAG00000023047)	ENSCHAG00000023031	ENSCHAG00000023025	ENSCHAG00000023008	kmo (ENSCHAG00000022962)	opn3 (ENSCHAG00000022951)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	89	ENSGT00940000159518.a	ENSGT00390000005029	ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a	ENSGT00940000155588.b	ENSGT00390000015849	ENSGT00940000163289.b.a.b	ENSGT00940000154418.a.a.a	ENSGT00940000158034	ENSGT00940000166025.b	ENSGT01030000234610.b.a.a	ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT01000000215701	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	88	ENSGT00940000159518.a	ENSGT00390000005029	ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a	ENSGT00940000155588.b	ENSGT00390000015849	ENSGT00940000163289.b.a.b	ENSGT00940000154418.a.a.a	ENSGT00940000158034	ENSGT00940000166025.b	ENSGT01030000234610.b.a.a	ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT01000000215701	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00950000183054.b.d.i	ENSGT00940000155078.a.b.a.b.g.b	ENSGT00810000125473.A.d	ENSGT00390000009155.c	ENSGT00940000158698.b.b	ENSGT00940000164611.a.b.b	ENSGT00940000159518.a.c	ENSGT00390000005029.h	ENSGT00940000158034.r	ENSGT00940000166025.b.a	ENSGT00740000115593.d #19	ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT00940000167270.e #21	ENSGT00940000154865	ENSGT01000000215701	ENSGT00940000158120.i #22	ENSGT00940000156925.v.k.a #23	ENSGT00940000156925.v.l #23	ENSGT00940000154518.b.d #24	ENSGT00940000154551.b.l.a	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00940000155068.a.b.d	ENSGT00940000161152.d	ENSGT01030000234606.a.a.a.b.j	ENSGT00700000104522.d	ENSGT00940000157593.s	ENSGT00390000017746.l	ENSGT00940000165200.f	ENSGT00940000154902.tb.a.b	ENSGT00940000153168.B.a	ENSGT00940000156126.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000183027.a.b.c.a.a	ENSGT00950000183054.b.d.i	ENSGT00940000155078.a.b.a.b.g.b	ENSGT00810000125473.A.d	ENSGT00390000009155.c	ENSGT00940000158698.b.b	ENSGT00940000164611.a.b.b	ENSGT00940000159518.a.c	ENSGT00390000005029.h	ENSGT00940000158034.r	ENSGT00940000166025.b.a	ENSGT00740000115593.d #19	ENSGT01030000234610.b.a.b.b.c	ENSGT00940000167270.e #21	ENSGT00940000154865.vb.a	ENSGT00940000158120.i #22	ENSGT00940000156925.v.k.a #23	ENSGT00940000154518.b.d #24	ENSGT00940000154551.b.l.a	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00940000155068.a.b.d	ENSGT00940000161152.d	ENSGT01030000234606.a.a.a.b.j	ENSGT00700000104522.d	ENSGT00940000157593.s	ENSGT00390000017746.l	ENSGT00940000165200.f	ENSGT00940000153168.B.a	ENSGT00940000156126.a	ENSGT00500000044929.c.b	ENSGT00940000155823.B.e
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00950000183027.a.b.c.a.a	ENSGT00950000183054.b.d.i	ENSGT00940000155078.a.b.a.b.g.b	ENSGT00810000125473.A.d	ENSGT00390000009155.c	ENSGT00940000158698.b.b	ENSGT00940000164611.a.b.b	ENSGT00940000159518.a.c	ENSGT00390000005029.h	ENSGT00940000158034.r	ENSGT00940000166025.b.a	ENSGT00740000115593.d #19	ENSGT01030000234610.b.a.b.b.c	ENSGT00940000167270.e #21	ENSGT00940000154865.vb.a	ENSGT00940000158120.i #22	ENSGT00940000156925.v.k.a #23	ENSGT00940000154518.b.d #24	ENSGT00940000154551.b.l.a	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00940000155068.a.b.d	ENSGT00940000161152.d	ENSGT00700000104522.d	ENSGT00940000157593.s	ENSGT00390000017746.l	ENSGT00940000165200.f	ENSGT00940000153168.B.a	ENSGT00940000156126.a	ENSGT00500000044929.c.b	ENSGT00940000155823.B.e	ENSGT00940000158843.h
Atlantic salmon	MODERN SPECIES		ENSSSAG00000112156	ENSSSAG00000068314	RAB1A (ENSSSAG00000090451)	ENSSSAG00000068334	ENSSSAG00000109421	tlx1 (ENSSSAG00000068344)	ENSSSAG00000094428	fgf8a (ENSSSAG00000068350)	fbxw4 (ENSSSAG00000068356)	ENSSSAG00000108556	ENSSSAG00000068371	ENSSSAG00000068387 #19	ENSSSAG00000069017 #21	ENSSSAG00000069079	ENSSSAG00000000766 #23	macroh2a2 (ENSSSAG00000069088) #22	ENSSSAG00000001804 #24	hspa12a (ENSSSAG00000075965)	eno4 (ENSSSAG00000001960)	ENSSSAG00000001970	VATB2 (ENSSSAG00000001987)	vax1 (ENSSSAG00000082494)	kcnk18 (ENSSSAG00000002025)	slc18a2 (ENSSSAG00000002046)	PDZD8 (ENSSSAG00000002120)	ENSSSAG00000099419	yipf4 (ENSSSAG00000084783)	ttc27 (ENSSSAG00000101525)	LTBP1 (ENSSSAG00000003342)	rasgrp3 (ENSSSAG00000004411)	ENSSSAG00000005447
River trout	MODERN SPECIES	9	myoz1a (ENSSTUG00000031839)	SYNPO2L (ENSSTUG00000031861)	zgc:153169 (ENSSTUG00000031867)	ENSSTUG00000031891	cep68 (ENSSTUG00000032111)	ENSSTUG00000032122	tlx1 (ENSSTUG00000032131)	ENSSTUG00000032153	fgf8a (ENSSTUG00000032164)	fbxw4 (ENSSTUG00000032200)	pcgf6 (ENSSTUG00000032319)	ENSSTUG00000032338	hells (ENSSTUG00000032377) #19	CALHM3 (ENSSTUG00000033080)	ENSSTUG00000033111 #21	macroh2a2 (ENSSTUG00000033196) #22	GBF1 (ENSSTUG00000033240) #23	pitx3 (ENSSTUG00000033791) #24	hspa12a (ENSSTUG00000033806)	eno4 (ENSSTUG00000034029)	ENSSTUG00000034039	atp6v1ba (ENSSTUG00000034054)	vax1 (ENSSTUG00000034155)	kcnk18 (ENSSTUG00000034165)	slc18a2 (ENSSTUG00000034186)	PDZD8 (ENSSTUG00000034458)	ENSSTUG00000034471	yipf4 (ENSSTUG00000034479)	BIRC6 (ENSSTUG00000034521)	ENSSTUG00000035136	LTBP1 (ENSSTUG00000035188)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000183054.b.d.i	ENSGT00950000183045.C.mb.b	ENSGT00940000155078.a.b.a.b.g.b	ENSGT00810000125473.A.d	ENSGT00390000009155.c	ENSGT00940000158698.b.b	ENSGT00940000164611.a.b.b	ENSGT00940000159518.a.c	ENSGT00390000005029.h	ENSGT00940000158034.r	ENSGT00940000166025.b.a	ENSGT00740000115593.d #19	ENSGT01030000234610.b.a.b.b.c	ENSGT00940000167270.e #21	ENSGT00940000154865.vb.a	ENSGT00940000158120.i #22	ENSGT00940000156925.v.k.a #23	ENSGT00940000154518.b.d #24	ENSGT00940000154551.b.l.a	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00940000155068.a.b.d	ENSGT00940000161152.d	ENSGT01030000234606.a.a.a.b.j	ENSGT00700000104522.d	ENSGT00940000157593.s	ENSGT00390000017746.l	ENSGT00940000165200.f	ENSGT00940000153168.B.a	ENSGT00940000156126.a	ENSGT00940000155823.B.e	ENSGT00940000158843.h
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000183027.a.b.c.a.a	ENSGT00950000183054.b.d.i	ENSGT00950000183045.C.mb.b	ENSGT00940000155078.a.b.a.b.g.b	ENSGT00810000125473.A.d	ENSGT00390000009155.c	ENSGT00940000158698.b.b	ENSGT00940000164611.a.b.b	ENSGT00940000159518.a.c	ENSGT00390000005029.h	ENSGT00940000158034.r	ENSGT00940000166025.b.a	ENSGT00740000115593.d #19	ENSGT01030000234610.b.a.b.b.c	ENSGT00940000167270.e #21	ENSGT00940000158120.i #22	ENSGT00940000156925.v.k.a #23	ENSGT00940000154518.b.d #24	ENSGT00940000154551.b.l.a	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00940000155068.a.b.d	ENSGT00940000161152.d	ENSGT01030000234606.a.a.a.b.j	ENSGT00700000104522.d	ENSGT00940000157593.s	ENSGT00390000017746.l	ENSGT00940000165200.f	ENSGT00940000153168.B.a	ENSGT00940000156126.a	ENSGT00940000155823.B.e	ENSGT00940000158843.h
Chinook salmon	MODERN SPECIES		usp54a (ENSOTSG00005008635)	myoz1a (ENSOTSG00005008636)	SYNPO2L (ENSOTSG00005008637)	zgc:153169 (ENSOTSG00005008639)	ENSOTSG00005008641	cep68 (ENSOTSG00005008645)	ENSOTSG00005008646	tlx1 (ENSOTSG00005008647)	ENSOTSG00005008648	fgf8a (ENSOTSG00005008649)	fbxw4 (ENSOTSG00005008650)	pcgf6 (ENSOTSG00005008656)	ENSOTSG00005008658	hells (ENSOTSG00005008668) #19	ENSOTSG00005009960 #21	macroh2a2 (ENSOTSG00005010028) #22	GBF1 (ENSOTSG00005010041) #23	pitx3 (ENSOTSG00005010053) #24	hspa12a (ENSOTSG00005010059)	eno4 (ENSOTSG00005010082)	atp6v1ba (ENSOTSG00005010104)	vax1 (ENSOTSG00005013057)	ENSOTSG00005013059	kcnk18 (ENSOTSG00005013061)	slc18a2 (ENSOTSG00005013064)	PDZD8 (ENSOTSG00005013117)	ENSOTSG00005013118	yipf4 (ENSOTSG00005013119)	BIRC6 (ENSOTSG00005013120)	LTBP1 (ENSOTSG00005013163)	rasgrp3 (ENSOTSG00005013432)
Coho salmon	MODERN SPECIES	2	zgc:153169 (ENSOKIG00005048056)	ENSOKIG00005048047	ENSOKIG00005048043	tlx1 (ENSOKIG00005048040)	ENSOKIG00005048037	ENSOKIG00005048035	fgf8a (ENSOKIG00005048027)	fbxw4 (ENSOKIG00005047999)	ENSOKIG00005047981	ENSOKIG00005047965	hells (ENSOKIG00005047721) #19	CALHM3 (ENSOKIG00005047689)	ENSOKIG00005047665 #21	ENSOKIG00005047628	ENSOKIG00005047612	macroh2a2 (ENSOKIG00005047591) #22	GBF1 (ENSOKIG00005047404) #23	pitx3 (ENSOKIG00005047372) #24	hspa12a (ENSOKIG00005047314)	eno4 (ENSOKIG00005047294)	atp6v1ba (ENSOKIG00005047038)	vax1 (ENSOKIG00005046994)	ENSOKIG00005046965	kcnk18 (ENSOKIG00005046949)	SLC18A2 (ENSOKIG00005046818)	PDZD8 (ENSOKIG00005046777)	ENSOKIG00005046768	yipf4 (ENSOKIG00005046762)	BIRC6 (ENSOKIG00005046163)	LTBP1 (ENSOKIG00005045568)	ENSOKIG00005045536
Rainbow trout	MODERN SPECIES	15	ENSOMYG00000042176	ENSOMYG00000042180	ENSOMYG00000042216	ENSOMYG00000042335	ENSOMYG00000042337	tlx1 (ENSOMYG00000042338)	ENSOMYG00000042342	fgf8a (ENSOMYG00000042351)	fbxw4 (ENSOMYG00000042367)	ENSOMYG00000042394	ENSOMYG00000042401	ENSOMYG00000042443 #19	ENSOMYG00000042758	ENSOMYG00000042781 #21	ENSOMYG00000077179	macroh2a2 (ENSOMYG00000042807) #22	ENSOMYG00000042851 #23	ENSOMYG00000059612	pitx3 (ENSOMYG00000042905) #24	hspa12a (ENSOMYG00000026525)	eno4 (ENSOMYG00000026607)	ENSOMYG00000077730	atp6v1ba (ENSOMYG00000027282)	vax1 (ENSOMYG00000029820)	ENSOMYG00000029834	kcnk18 (ENSOMYG00000076015)	SLC18A2 (ENSOMYG00000030075)	PDZD8 (ENSOMYG00000030310)	ENSOMYG00000030317	yipf4 (ENSOMYG00000073100)	BIRC6 (ENSOMYG00000030671)
Huchen	MODERN SPECIES	122	ENSHHUG00000033859	cep68 (ENSHHUG00000033851)	ENSHHUG00000033850	tlx1 (ENSHHUG00000033847)	ENSHHUG00000033846	fgf8a (ENSHHUG00000033818)	ENSHHUG00000033805	ENSHHUG00000033802	pcgf6 (ENSHHUG00000033799)	ENSHHUG00000033727	hells (ENSHHUG00000033611) #19	CALHM3 (ENSHHUG00000033600)	ENSHHUG00000033576 #21	ENSHHUG00000033542	ENSHHUG00000033537	macroh2a2 (ENSHHUG00000033523) #22	ENSHHUG00000033244 #23
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	243	ENSGT00940000164611.a.b.a	ENSGT00940000164095.a	ENSGT00940000159518.a.d	ENSGT00390000005029.g	ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a	ENSGT00940000155588.b	ENSGT00390000015849	ENSGT00940000163289.b.a.b	ENSGT00940000154418.a.a.a	ENSGT00940000158034.q	ENSGT00940000166025.b.b	ENSGT01030000234610.b.a.a	ENSGT00740000115593.c #19	ENSGT00940000167270.f #21	ENSGT00940000158302.d.a.j.b	ENSGT00940000158120.j #22	ENSGT00940000156925.v.k.b #23	ENSGT00940000154518.b.c #24	ENSGT00940000154551.b.l.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b.c	ENSGT00940000161152.c	ENSGT01030000234606.a.a.a.b.i	ENSGT00700000104522.c	ENSGT00940000157593.t	ENSGT00390000017746.k	ENSGT00940000165200.e	ENSGT00940000154902.tb.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B.b	ENSGT00940000156126.b
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000164611.a.b.a	ENSGT00940000164095.a	ENSGT00940000159518.a.d	ENSGT00390000005029.g	ENSGT00940000155588.b	ENSGT00390000015849	ENSGT00940000163289.b.a.b	ENSGT00940000154418.a.a.a	ENSGT00940000158034.q	ENSGT00940000166025.b.b	ENSGT01030000234610.b.a.a	ENSGT01030000234610.b.a.b.b.d	ENSGT00740000115593.c #19	ENSGT00940000167270.f #21	ENSGT00940000154865.vb.b	ENSGT00940000158120.j #22	ENSGT00940000156925.v.k.b #23	ENSGT00940000154518.b.c #24	ENSGT00940000154551.b.l.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b.c	ENSGT00940000161152.c	ENSGT01030000234606.a.a.a.b.i	ENSGT00700000104522.c	ENSGT00940000157593.t	ENSGT00390000017746.k	ENSGT00940000165200.e	ENSGT00940000154902.tb.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B.b	ENSGT00940000156126.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000164611.a.b.a	ENSGT00940000164095.a	ENSGT00940000159518.a.d	ENSGT00390000005029.g	ENSGT00940000155588.b	ENSGT00390000015849	ENSGT00940000163289.b.a.b	ENSGT00940000154418.a.a.a	ENSGT00940000158034.q	ENSGT00940000166025.b.b	ENSGT01030000234610.b.a.a	ENSGT01030000234610.b.a.b.b.d	ENSGT00740000115593.c #19	ENSGT00940000167270.f #21	ENSGT00940000154865.vb.b	ENSGT00940000158120.j #22	ENSGT00940000156925.v.k.b #23	ENSGT00940000154518.b.c #24	ENSGT00940000154551.b.l.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b.c	ENSGT00940000161152.c	ENSGT01030000234606.a.a.a.b.i	ENSGT00700000104522.c	ENSGT00940000157593.t	ENSGT00390000017746.k	ENSGT00940000165200.e	ENSGT00940000154902.tb.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B.b	ENSGT00500000044929.c.a
River trout	MODERN SPECIES	35	ENSSTUG00000007746	slc2a15a (ENSSTUG00000007570)	fgf8a (ENSSTUG00000007553)	fbxw4 (ENSSTUG00000007530)	cyp17a1 (ENSSTUG00000007509)	borcs7 (ENSSTUG00000007494)	nt5c2a (ENSSTUG00000006989)	inaa (ENSSTUG00000006947)	pcgf6 (ENSSTUG00000006916)	ENSSTUG00000006905	calhm2.1 (ENSSTUG00000006901)	CALHM3 (ENSSTUG00000006872)	hells (ENSSTUG00000005197) #19	ENSSTUG00000005002 #21	ENSSTUG00000004984	macroh2a2 (ENSSTUG00000004938) #22	GBF1 (ENSSTUG00000004539) #23	pitx3 (ENSSTUG00000004502) #24	hspa12a (ENSSTUG00000004185)	shtn1 (ENSSTUG00000004139)	atp6v1ba (ENSSTUG00000003351)	vax1 (ENSSTUG00000003279)	ENSSTUG00000003218	ENSSTUG00000003210	slc18a2 (ENSSTUG00000002972)	PDZD8 (ENSSTUG00000002940)	ENSSTUG00000002918	exo1 (ENSSTUG00000002874)	yipf4 (ENSSTUG00000002782)	ttc27 (ENSSTUG00000000711)	LTBP1 (ENSSTUG00000000479)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	9	slc2a15a (ENSSSAG00000069641)	fgf8a (ENSSSAG00000098674)	fbxw4 (ENSSSAG00000069868)	cyp17a1 (ENSSSAG00000069890)	borcs7 (ENSSSAG00000119087)	nt5c2a (ENSSSAG00000069977)	inaa (ENSSSAG00000072742)	pcgf6 (ENSSSAG00000072746)	ENSSSAG00000101552	ENSSSAG00000072757	ENSSSAG00000072792 #19	ENSSSAG00000085939	ENSSSAG00000074124 #21	ENSSSAG00000074170	ENSSSAG00000074264 #23	H2AW (ENSSSAG00000074192) #22	ENSSSAG00000075958 #24	hspa12a (ENSSSAG00000001820)	shtn1 (ENSSSAG00000076009)	atp6v1ba (ENSSSAG00000076022)	vax1 (ENSSSAG00000101324)	pla2g4f (ENSSSAG00000076076)	kcnk18 (ENSSSAG00000093804)	SLC18A2 (ENSSSAG00000076093)	PDZD8 (ENSSSAG00000076238)	ENSSSAG00000100205	exo1 (ENSSSAG00000103371)	yipf4 (ENSSSAG00000039940)	ttc27 (ENSSSAG00000042355)	LTBP1 (ENSSSAG00000044896)	rasgrp3 (ENSSSAG00000054335)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000164611.a.b.a	ENSGT00940000164095.a	ENSGT00940000159518.a.d	ENSGT00390000005029.g	ENSGT00940000155588.b	ENSGT00390000015849	ENSGT00940000163289.b.a.b	ENSGT00940000154418.a.a.a	ENSGT00940000158034.q	ENSGT00940000166025.b.b	ENSGT01030000234610.b.a.a	ENSGT01030000234610.b.a.b.b.d	ENSGT00740000115593.c #19	ENSGT00940000167270.f #21	ENSGT00940000158302.d.a.j.b	ENSGT00940000158120.j #22	ENSGT00940000156925.v.k.b #23	ENSGT00940000154518.b.c #24	ENSGT00940000154551.b.l.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b.c	ENSGT00940000161152.c	ENSGT01030000234606.a.a.a.b.i	ENSGT00940000165789	ENSGT00700000104522.c	ENSGT00940000157593.t	ENSGT00390000017746.k	ENSGT00940000165200.e	ENSGT00940000154902.tb.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B.b
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158698.b.a	ENSGT00940000164611.a.b.a	ENSGT00940000164095.a	ENSGT00940000159518.a.d	ENSGT00390000005029.g	ENSGT00940000155588.b	ENSGT00390000015849	ENSGT00940000163289.b.a.b	ENSGT00940000154418.a.a.a	ENSGT00940000158034.q	ENSGT00940000166025.b.b	ENSGT01030000234610.b.a.a	ENSGT01030000234610.b.a.b.b.d	ENSGT00740000115593.c #19	ENSGT00940000167270.f #21	ENSGT00940000158120.j #22	ENSGT00940000156925.v.k.b #23	ENSGT00940000154518.b.c #24	ENSGT00940000154551.b.l.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b.c	ENSGT00940000161152.c	ENSGT01030000234606.a.a.a.b.i	ENSGT00700000104522.c	ENSGT00940000157593.t	ENSGT00390000017746.k	ENSGT00940000165200.e	ENSGT00940000154902.tb.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B.b	ENSGT00940000156126.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	24	slc2a15a (ENSOKIG00005007891)	fgf8a (ENSOKIG00005008657)	fbxw4 (ENSOKIG00005008688)	cyp17a1 (ENSOKIG00005008708)	borcs7 (ENSOKIG00005008726)	nt5c2a (ENSOKIG00005008775)	inaa (ENSOKIG00005009179)	pcgf6 (ENSOKIG00005009188)	ENSOKIG00005009221	calhm2.1 (ENSOKIG00005009238)	ENSOKIG00005009251	hells (ENSOKIG00005009326) #19	ENSOKIG00005009572 #21	ENSOKIG00005009632	ENSOKIG00005009641	macroh2a2 (ENSOKIG00005009648) #22	GBF1 (ENSOKIG00005009693) #23	pitx3 (ENSOKIG00005009765) #24	hspa12a (ENSOKIG00005009791)	shtn1 (ENSOKIG00005009885)	atp6v1ba (ENSOKIG00005010025)	vax1 (ENSOKIG00005011277)	ENSOKIG00005011296	ENSOKIG00005011313	slc18a2 (ENSOKIG00005011345)	PDZD8 (ENSOKIG00005011782)	ENSOKIG00005011792	exo1 (ENSOKIG00005011806)	yipf4 (ENSOKIG00005011823)	BIRC6 (ENSOKIG00005012005)	ttc27 (ENSOKIG00005013611)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	30	tlx1 (ENSOTSG00005035580)	ENSOTSG00005035582	slc2a15a (ENSOTSG00005035584)	fgf8a (ENSOTSG00005035753)	fbxw4 (ENSOTSG00005035754)	cyp17a1 (ENSOTSG00005035756)	borcs7 (ENSOTSG00005035757)	nt5c2a (ENSOTSG00005035759)	inaa (ENSOTSG00005036210)	pcgf6 (ENSOTSG00005036212)	ENSOTSG00005036213	ENSOTSG00005036214	calhm2.1 (ENSOTSG00005036217)	hells (ENSOTSG00005036242) #19	ENSOTSG00005036262 #21	macroh2a2 (ENSOTSG00005036265) #22	GBF1 (ENSOTSG00005036267) #23	pitx3 (ENSOTSG00005036400) #24	hspa12a (ENSOTSG00005036401)	shtn1 (ENSOTSG00005036449)	atp6v1ba (ENSOTSG00005036450)	vax1 (ENSOTSG00005000729)	ENSOTSG00005001025	kcnk18 (ENSOTSG00005001027)	slc18a2 (ENSOTSG00005001033)	PDZD8 (ENSOTSG00005001087)	ENSOTSG00005001092	ENSOTSG00005001104	exo1 (ENSOTSG00005001128)	yipf4 (ENSOTSG00005001383)	BIRC6 (ENSOTSG00005001432)
Rainbow trout	MODERN SPECIES		ENSOMYG00000003660	slc2a15a (ENSOMYG00000003788)	fgf8a (ENSOMYG00000060026)	fbxw4 (ENSOMYG00000003974)	cyp17a1 (ENSOMYG00000004006)	borcs7 (ENSOMYG00000004037)	nt5c2a (ENSOMYG00000004691)	inaa (ENSOMYG00000005199)	pcgf6 (ENSOMYG00000005228)	ENSOMYG00000005272	ENSOMYG00000005291	ENSOMYG00000005308	hells (ENSOMYG00000005852) #19	ENSOMYG00000006563 #21	ENSOMYG00000073245	macroh2a2 (ENSOMYG00000006631) #22	ENSOMYG00000007886 #23	pitx3 (ENSOMYG00000009122) #24	hspa12a (ENSOMYG00000009142)	shtn1 (ENSOMYG00000009169)	atp6v1ba (ENSOMYG00000009477)	vax1 (ENSOMYG00000065891)	ENSOMYG00000010089	ENSOMYG00000010100	SLC18A2 (ENSOMYG00000010158)	ENSOMYG00000010196	ENSOMYG00000056164	ENSOMYG00000010215	exo1 (ENSOMYG00000010296)	yipf4 (ENSOMYG00000030331)	BIRC6 (ENSOMYG00000010511)
Huchen	MODERN SPECIES	245	ENSHHUG00000048893	slc2a15a (ENSHHUG00000048880)	fgf8a (ENSHHUG00000048858)	fbxw4 (ENSHHUG00000048838)	ENSHHUG00000048835	cyp17a1 (ENSHHUG00000048782)	borcs7 (ENSHHUG00000048776)	nt5c2a (ENSHHUG00000048746)	inaa (ENSHHUG00000048740)	pcgf6 (ENSHHUG00000048735)	ENSHHUG00000048723	calhm2.1 (ENSHHUG00000048720)	hells (ENSHHUG00000048559) #19	ENSHHUG00000048503 #21	ENSHHUG00000048493	macroh2a2 (ENSHHUG00000048480) #22	ENSHHUG00000048452 #23	pitx3 (ENSHHUG00000048444) #24	hspa12a (ENSHHUG00000048417)	shtn1 (ENSHHUG00000048402)	atp6v1ba (ENSHHUG00000048354)	vax1 (ENSHHUG00000048353)	ENSHHUG00000048341	kcnk18 (ENSHHUG00000048340)	slc18a2 (ENSHHUG00000048330)	PDZD8 (ENSHHUG00000048326)	ENSHHUG00000048325	ENSHHUG00000048323	exo1 (ENSHHUG00000048317)	yipf4 (ENSHHUG00000048315)	ttc27 (ENSHHUG00000048146)
Northern pike	MODERN SPECIES	5	fgf8a (ENSELUG00000015308)	fbxw4 (ENSELUG00000015291)	cyp17a1 (ENSELUG00000014836)	ENSELUG00000015261	ENSELUG00000001250	borcs7 (ENSELUG00000015228)	nt5c2a (ENSELUG00000015147)	inaa (ENSELUG00000015029)	pcgf6 (ENSELUG00000015010)	ENSELUG00000014991	calhm2.1 (ENSELUG00000014966)	CALHM3 (ENSELUG00000014947)	hells (ENSELUG00000014909) #19	ENSELUG00000014562 #21	ENSELUG00000025259	macroh2a2 (ENSELUG00000014527) #22	GBF1 (ENSELUG00000014474) #23	pitx3 (ENSELUG00000014303) #24	PNLIPRP2 (ENSELUG00000014287) #25	hspa12a (ENSELUG00000014254)	eno4 (ENSELUG00000014183)	shtn1 (ENSELUG00000001085)	atp6v1ba (ENSELUG00000014059)	vax1 (ENSELUG00000014001)	ENSELUG00000013969	slc18a2 (ENSELUG00000013933)	PDZD8 (ENSELUG00000013841)	ENSELUG00000013835	exo1 (ENSELUG00000013778)	yipf4 (ENSELUG00000025107)	BIRC6 (ENSELUG00000013694)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	96	ENSGT00390000005029	ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a	ENSGT00940000155588.b	ENSGT00390000015849	ENSGT00940000163289.b.a.b	ENSGT00940000154418.a.a.a	ENSGT00940000158034	ENSGT00940000166025.b	ENSGT01030000234610.b.a.a	ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00860000134673	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676
Cod	MODERN SPECIES	6	ENSGMOG00000016289	sfr1 (ENSGMOG00000016280)	ENSGMOG00000016222	ENSGMOG00000016203	ENSGMOG00000016016	ENSGMOG00000012677	ENSGMOG00000012670	ENSGMOG00000026927	ENSGMOG00000036392	ENSGMOG00000017930	ENSGMOG00000017916	hells (ENSGMOG00000017884) #19	ENSGMOG00000031326 #21	ENSGMOG00000033488	ENSGMOG00000025595	macroh2a2 (ENSGMOG00000007928) #22	ENSGMOG00000007931 #23	pitx3 (ENSGMOG00000037230) #24	PNLIPRP2 (ENSGMOG00000007955) #25	hspa12a (ENSGMOG00000005300)	eno4 (ENSGMOG00000015450)	shtn1 (ENSGMOG00000024092)	atp6v1ba (ENSGMOG00000000178)	vax1 (ENSGMOG00000033199)	kcnk18 (ENSGMOG00000029708)	SLC18A2 (ENSGMOG00000000199)	PDZD8 (ENSGMOG00000000209)	ENSGMOG00000000216	exo1 (ENSGMOG00000000235)	yipf4 (ENSGMOG00000000242)	BIRC6 (ENSGMOG00000000246)
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	51	ENSGT00390000005029	ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a	ENSGT00940000155588.b	ENSGT00390000015849	ENSGT00940000163289.b.a.b	ENSGT00940000154418.a.a.a	ENSGT00940000158034	ENSGT00940000166025.b	ENSGT01030000234610.b.a.a	ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT00860000134673	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	6	cep68 (ENSMMDG00005024573)	pcgf5a (ENSMMDG00005024571)	ENSMMDG00005024569	ENSMMDG00005024566	ENSMMDG00005024565	inaa (ENSMMDG00005024563)	pcgf6 (ENSMMDG00005024561)	ENSMMDG00005024559	calhm2.1 (ENSMMDG00005024558)	CALHM3 (ENSMMDG00005024557)	hells (ENSMMDG00005024554) #19	ENSMMDG00005024553	ENSMMDG00005024552	ENSMMDG00005024551 #21	ENSMMDG00005024550	macroh2a2 (ENSMMDG00005024548) #22	GBF1 (ENSMMDG00005024541) #23	pitx3 (ENSMMDG00005024535) #24	PNLIPRP2 (ENSMMDG00005024531) #25	hspa12a (ENSMMDG00005024516)	eno4 (ENSMMDG00005024508)	shtn1 (ENSMMDG00005024504)	atp6v1ba (ENSMMDG00005024487)	vax1 (ENSMMDG00005024482)	ENSMMDG00005024481	ENSMMDG00005024480	ENSMMDG00005024479	ENSMMDG00005024476	slc18a2 (ENSMMDG00005024475)	PDZD8 (ENSMMDG00005024474)	ENSMMDG00005024472
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	57									ENSGT00860000134673	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT01030000234610.b.a.a	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	51																macroh2a2 (ENSHCOG00000015984) #22	pcca (ENSHCOG00000016098)	chchd1 (ENSHCOG00000016120)	ddx51 (ENSHCOG00000016131)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000013448.a.a	ENSGT00570000079239	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000158005	ENSGT00390000017259	ENSGT00390000012337	ENSGT00940000157348	ENSGT00940000157563	ENSGT00940000156083	ENSGT00940000154200.A.b	ENSGT00940000164286.j.b.b	ENSGT00390000010672	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000183100.B	ENSGT00390000002970	ENSGT00390000013448.a.a	ENSGT00570000079239	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000158005	ENSGT00390000017259	ENSGT00390000012337	ENSGT00940000157348	ENSGT00940000157563	ENSGT00940000156083	ENSGT00940000154200.A.b	ENSGT00940000164286.j.b.b	ENSGT00390000010672	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	36														ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	34														ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	18	vsx1 (ENSLBEG00000028279)	ENSLBEG00000028271	acss1 (ENSLBEG00000028252)	ENSLBEG00000028243	apmap (ENSLBEG00000028238)	CST7 (ENSLBEG00000028232)	ENSLBEG00000028229	SYNDIG1 (ENSLBEG00000028204)	CUL7 (ENSLBEG00000028182)	ENSLBEG00000028162	ENSLBEG00000028150	ppp2r5d (ENSLBEG00000028133)	mea1 (ENSLBEG00000028116)	ENSLBEG00000028111 #20	ENSLBEG00000028084 #21	macroh2a2 (ENSLBEG00000028058) #22	GBF1 (ENSLBEG00000028029) #23	pitx3 (ENSLBEG00000028018) #24	PNLIPRP2 (ENSLBEG00000028003) #25	hspa12a (ENSLBEG00000027962)	shtn1 (ENSLBEG00000027938)	atp6v1ba (ENSLBEG00000027920)	vax1 (ENSLBEG00000027910)	ENSLBEG00000027906	ENSLBEG00000027902	slc18a2 (ENSLBEG00000027865)	PDZD8 (ENSLBEG00000027834)	hells (ENSLBEG00000027807) #19	rab1ab (ENSLBEG00000027781)	cep68 (ENSLBEG00000027768)	ENSLBEG00000027757
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	33															ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	55															ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	6												ENSSAUG00010005730	ENSSAUG00010005732	ENSSAUG00010005752 #21	ENSSAUG00010006169	macroh2a2 (ENSSAUG00010006235) #22	GBF1 (ENSSAUG00010006241) #23	pitx3 (ENSSAUG00010006247) #24	PNLIPRP2 (ENSSAUG00010006256) #25	ENSSAUG00010006495	hspa12a (ENSSAUG00010006500)	eno4 (ENSSAUG00010007495)	ENSSAUG00010007501	ENSSAUG00010007503	ENSSAUG00010007514	ENSSAUG00010007976	vax1 (ENSSAUG00010007979)	ENSSAUG00010007980	ENSSAUG00010007982	kcnk18 (ENSSAUG00010007983)	slc18a2 (ENSSAUG00010007986)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	70															ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126
European seabass	MODERN SPECIES	1	tlx1 (ENSDLAG00005030787)	ENSDLAG00005026816	slc2a15a (ENSDLAG00005005837)	fgf8a (ENSDLAG00005005948)	fbxw4 (ENSDLAG00005034129)	nt5c2a (ENSDLAG00005006205)	ENSDLAG00005007486	cyp17a1 (ENSDLAG00005007508)	ENSDLAG00005007814	ENSDLAG00005034886	ENSDLAG00005034809	ENSDLAG00005026678	ENSDLAG00005007835 #21	ENSDLAG00005028275	ENSDLAG00005031885	macroh2a2 (ENSDLAG00005007863) #22	ENSDLAG00005007951 #23	pitx3 (ENSDLAG00005031960) #24	PNLIPRP2 (ENSDLAG00005010610) #25	hspa12a (ENSDLAG00005010828)	eno4 (ENSDLAG00005029158)	shtn1 (ENSDLAG00005028218)	atp6v1ba (ENSDLAG00005011103)	vax1 (ENSDLAG00005026925)	ENSDLAG00005034934	ENSDLAG00005011244	kcnk18 (ENSDLAG00005011279)	ENSDLAG00005029778	slc18a2 (ENSDLAG00005011313)	PDZD8 (ENSDLAG00005034084)	exo1 (ENSDLAG00005011654)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	47														ENSLCRG00005016946	ENSLCRG00005016947	macroh2a2 (ENSLCRG00005016948) #22	GBF1 (ENSLCRG00005016963) #23	pitx3 (ENSLCRG00005017015) #24	ENSLCRG00005017020 #25
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	48															ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000154511.a	ENSGT00950000182909.b.b.b	ENSGT00390000008797	ENSGT00940000153335.a.b	ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.e	ENSGT00510000047589 #16	ENSGT00390000014293.b	ENSGT00390000007683	ENSGT00940000164412.a.a.a	ENSGT00940000156999	ENSGT00940000156237	ENSGT00570000079168.b.b.a	ENSGT00950000183100.B	ENSGT00390000002970	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126	ENSGT00500000044929.d
Pike perch	MODERN SPECIES	159				ENSSLUG00000019015	NDST2 (ENSSLUG00000019055)	ENSSLUG00000020227	polr1c (ENSSLUG00000020236)	fbxo28 (ENSSLUG00000020256)	ENSSLUG00000020257	ENSSLUG00000020260 #21	ENSSLUG00000020271	ENSSLUG00000020273	ENSSLUG00000020277	ENSSLUG00000020285	ENSSLUG00000020287	macroh2a2 (ENSSLUG00000020292) #22	GBF1 (ENSSLUG00000020311) #23	pitx3 (ENSSLUG00000020345) #24	PNLIPRP2 (ENSSLUG00000020360) #25	hspa12a (ENSSLUG00000020454)	eno4 (ENSSLUG00000020473)	shtn1 (ENSSLUG00000020484)	atp6v1ba (ENSSLUG00000020585)	vax1 (ENSSLUG00000020864)	kcnk18 (ENSSLUG00000020871)	ENSSLUG00000020875	slc18a2 (ENSSLUG00000020881)	zgc:113176 (ENSSLUG00000020909)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	6	ENSCGOG00000012706	ctu2 (ENSCGOG00000012712)	ENSCGOG00000012952	cyp17a1 (ENSCGOG00000013001)	borcs7 (ENSCGOG00000013875)	nt5c2a (ENSCGOG00000013879)	cdk1 (ENSCGOG00000014119)	ENSCGOG00000014412	chchd1 (ENSCGOG00000014426)	ENSCGOG00000014432	ENSCGOG00000014448	polr1c (ENSCGOG00000014458)	fbxo28 (ENSCGOG00000014578)	ENSCGOG00000014588 #21	ENSCGOG00000014709	macroh2a2 (ENSCGOG00000014711) #22	GBF1 (ENSCGOG00000014760) #23	pitx3 (ENSCGOG00000016802) #24	ENSCGOG00000016806	PNLIPRP2 (ENSCGOG00000016809) #25	hspa12a (ENSCGOG00000016831)	eno4 (ENSCGOG00000017132)	shtn1 (ENSCGOG00000017143)	atp6v1ba (ENSCGOG00000017175)	vax1 (ENSCGOG00000017564)	ENSCGOG00000017568	exo1 (ENSCGOG00000017571)	yipf4 (ENSCGOG00000017597)	BIRC6 (ENSCGOG00000004095)	ttc27 (ENSCGOG00000004589)	ENSCGOG00000005307
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	76															ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT01030000234606.a.a.a.b	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Stickleback	MODERN SPECIES	537												ENSGACG00000014588	ENSGACG00000014589	ENSGACG00000014593	ENSGACG00000014594	macroh2a2 (ENSGACG00000014597) #22	GBF1 (ENSGACG00000014607) #23	pitx3 (ENSGACG00000014620) #24	hspa12a (ENSGACG00000014625)	eno4 (ENSGACG00000014633)	atp6v1ba (ENSGACG00000014640)	vax1 (ENSGACG00000014648)	kcnk18 (ENSGACG00000014652)
Lumpfish	MODERN SPECIES	6	galm (ENSCLMG00005015913) #16	ENSCLMG00005015912	ENSCLMG00005015911	ENSCLMG00005015910	ENSCLMG00005015909	ENSCLMG00005015908	chchd1 (ENSCLMG00005015907)	ENSCLMG00005015906	zswim8 (ENSCLMG00005007548)	NDST2 (ENSCLMG00005005506)	ENSCLMG00005005496	polr1c (ENSCLMG00005005493)	fbxo28 (ENSCLMG00005005490)	ENSCLMG00005005489	ENSCLMG00005005488 #21	macroh2a2 (ENSCLMG00005005469) #22	GBF1 (ENSCLMG00005005452) #23	pitx3 (ENSCLMG00005005448) #24	PNLIPRP2 (ENSCLMG00005005300) #25	hspa12a (ENSCLMG00005004843)	ENSCLMG00005004837	eno4 (ENSCLMG00005004833)	shtn1 (ENSCLMG00005004825)	atp6v1ba (ENSCLMG00005004516)	vax1 (ENSCLMG00005004434)	ENSCLMG00005004371	ENSCLMG00005021382	ENSCLMG00005021381	kcnk18 (ENSCLMG00005021380)	slc18a2 (ENSCLMG00005021379)	PDZD8 (ENSCLMG00005021378)
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	290															ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	stx3a (ENSTNIG00000004243)	pknox1.1 (ENSTNIG00000004244)	ENSTNIG00000004245	ENSTNIG00000001053	wdr4 (ENSTNIG00000004246)	noto (ENSTNIG00000004247)	ENSTNIG00000001239	ACSF2 (ENSTNIG00000004254)	bdnf (ENSTNIG00000004258)	lin7c (ENSTNIG00000004259)	FTH1 (ENSTNIG00000004260)	mcee (ENSTNIG00000000800)	ENSTNIG00000004261	ENSTNIG00000004262	ist1 (ENSTNIG00000004263)	macroh2a2 (ENSTNIG00000004264) #22	GBF1 (ENSTNIG00000004265) #23	ENSTNIG00000004266	ENSTNIG00000004267	asb16 (ENSTNIG00000004268)	tmub2 (ENSTNIG00000004269)	ENSTNIG00000004270	ubtf (ENSTNIG00000004271)	ENSTNIG00000004272	slc4a1a (ENSTNIG00000004222)	selenow2b (ENSTNIG00000004274)	ENSTNIG00000004275	dnaaf1 (ENSTNIG00000004277)	nav3 (ENSTNIG00000004292)	ENSTNIG00000004304	gcsha (ENSTNIG00000004305)
Fugu	DUPLICATION
Fugu	MODERN SPECIES	71									ENSTRUG00000030390	ENSTRUG00000027803	ENSTRUG00000031042 #21	ENSTRUG00000032386	ENSTRUG00000030941	ENSTRUG00000027987 #21	ENSTRUG00000027174	macroh2a2 (ENSTRUG00000032820) #22	ENSTRUG00000029697	ENSTRUG00000027200	ENSTRUG00000031991	ENSTRUG00000031763	ENSTRUG00000028054	ENSTRUG00000028302	ENSTRUG00000031454	ENSTRUG00000028247	ENSTRUG00000028703	ENSTRUG00000026177 #23	ENSTRUG00000028178	ENSTRUG00000028262 #23	macroh2a2 (ENSTRUG00000031200) #22	ENSTRUG00000032589	ENSTRUG00000031898
Fugu	MODERN SPECIES	71	ENSTRUG00000031773	NDST2 (ENSTRUG00000017908)	ENSTRUG00000020969	ENSTRUG00000026545	vax1 (ENSTRUG00000026904)	atp6v1ba (ENSTRUG00000031006)	ENSTRUG00000024671 #25	ENSTRUG00000031629	hspa12a (ENSTRUG00000032899)	ENSTRUG00000027534	ENSTRUG00000027519	ENSTRUG00000026931	ENSTRUG00000030910	ENSTRUG00000031898	ENSTRUG00000032589	macroh2a2 (ENSTRUG00000031200) #22	ENSTRUG00000028262 #23	ENSTRUG00000028178	ENSTRUG00000026177 #23	ENSTRUG00000028703	ENSTRUG00000028247	ENSTRUG00000031454	ENSTRUG00000028302	ENSTRUG00000028054	ENSTRUG00000031763	ENSTRUG00000031991	ENSTRUG00000027200	ENSTRUG00000029697	macroh2a2 (ENSTRUG00000032820) #22	ENSTRUG00000027174	ENSTRUG00000027987 #21
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000002970	ENSGT00390000013448.a.a	ENSGT00570000079239	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000158005	ENSGT00390000017259	ENSGT00390000012337	ENSGT00940000157348	ENSGT00940000157563	ENSGT00940000156083	ENSGT00940000154200.A.b	ENSGT00940000164286.j.b.b	ENSGT00390000010672	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	17															ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	17																ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126
Climbing perch	MODERN SPECIES	6			ENSATEG00000003618	aprt (ENSATEG00000003661)	ENSATEG00000003686	PIEZO1 (ENSATEG00000003732)	ENSATEG00000003926	ENSATEG00000003996	ENSATEG00000026832	ENSATEG00000028298	ENSATEG00000004080	ENSATEG00000004229	ENSATEG00000004256	ENSATEG00000004273	ENSATEG00000004364	macroh2a2 (ENSATEG00000004389) #22	ENSATEG00000004428 #23	pitx3 (ENSATEG00000004628) #24	PNLIPRP2 (ENSATEG00000004645) #25	hspa12a (ENSATEG00000004846)	eno4 (ENSATEG00000004931)	shtn1 (ENSATEG00000005018)	atp6v1ba (ENSATEG00000005059)	vax1 (ENSATEG00000005127)	kcnk18 (ENSATEG00000027518)	SLC18A2 (ENSATEG00000005173)	PDZD8 (ENSATEG00000027211)	ENSATEG00000005264	exo1 (ENSATEG00000005276)	yipf4 (ENSATEG00000005311)	BIRC6 (ENSATEG00000005336)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	6	ENSBSLG00000012611	ENSBSLG00000012601	vps8 (ENSBSLG00000012110)	ENSBSLG00000012078	ENSBSLG00000011720	ENSBSLG00000010760	ENSBSLG00000024464	ttc27 (ENSBSLG00000024294)	yipf4 (ENSBSLG00000024277)	exo1 (ENSBSLG00000024250)	ENSBSLG00000024245	ENSBSLG00000024243	ENSBSLG00000024241	ENSBSLG00000024235	ENSBSLG00000024151	macroh2a2 (ENSBSLG00000024140) #22	ENSBSLG00000024134	GBF1 (ENSBSLG00000023945) #23	pitx3 (ENSBSLG00000023836) #24	ENSBSLG00000023769	hspa12a (ENSBSLG00000023629)	ENSBSLG00000023604	ENSBSLG00000023517	ENSBSLG00000023487	ENSBSLG00000023452	vax1 (ENSBSLG00000023400)	NDST2 (ENSBSLG00000023311)	zswim8 (ENSBSLG00000021426)	chchd1 (ENSBSLG00000020206)	ENSBSLG00000020204	ENSBSLG00000020188
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	6	nvl (ENSMAMG00000008767)	ENSMAMG00000008758	fbxo28 (ENSMAMG00000024850)	ENSMAMG00000008700	ENSMAMG00000008673	ENSMAMG00000008615	zswim8 (ENSMAMG00000008438)	ENSMAMG00000008421	chchd1 (ENSMAMG00000008418)	ENSMAMG00000024883	ENSMAMG00000024731	ENSMAMG00000024620 #16	ENSMAMG00000008320	ENSMAMG00000008296	ENSMAMG00000008227 #21	macroh2a2 (ENSMAMG00000026624) #22	ENSMAMG00000008002 #23	pitx3 (ENSMAMG00000007953) #24	PNLIPRP2 (ENSMAMG00000007932) #25	hspa12a (ENSMAMG00000007877)	eno4 (ENSMAMG00000007845)	shtn1 (ENSMAMG00000007810)	atp6v1ba (ENSMAMG00000007769)	vax1 (ENSMAMG00000007747)	ENSMAMG00000007714	ENSMAMG00000024700	ENSMAMG00000007655	ENSMAMG00000007547	yipf4 (ENSMAMG00000026886)	BIRC6 (ENSMAMG00000007373)	ttc27 (ENSMAMG00000007326)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00390000013448.a.a	ENSGT00570000079239	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000158005	ENSGT00390000017259	ENSGT00390000012337	ENSGT00940000157348	ENSGT00940000157563	ENSGT00940000156083	ENSGT00940000154200.A.b	ENSGT00940000164286.j.b.b	ENSGT00390000010672	ENSGT00940000170402	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000154418.a.a.a	ENSGT00530000063867.b	ENSGT00940000157081	ENSGT00940000155884.a.c	ENSGT00940000159583	ENSGT00390000018730.B	ENSGT00950000183045.A.a.a	ENSGT00940000155134.y	ENSGT00940000156983.a.b	ENSGT00910000147025	ENSGT00390000005537	ENSGT00940000158042	ENSGT00940000157361.b	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126
Tongue sole	MODERN SPECIES	3	chchd1 (ENSCSEG00000001654)	HNRNPLL (ENSCSEG00000001646)	TNFAIP3 (ENSCSEG00000001638)	perp (ENSCSEG00000001633)	tspan14 (ENSCSEG00000001627)	ENSCSEG00000001621	ldb3a (ENSCSEG00000001614)	bmpr1aa (ENSCSEG00000001608)	rps27a (ENSCSEG00000001603)	ENSCSEG00000001598	rtn4a (ENSCSEG00000001594)	lhb (ENSCSEG00000001582)	ENSCSEG00000001580	ENSCSEG00000001568	ENSCSEG00000001495	macroh2a2 (ENSCSEG00000001483) #22	ENSCSEG00000001453 #24	GBF1 (ENSCSEG00000001430) #23	CCDC88A (ENSCSEG00000001262)	ugp2b (ENSCSEG00000001237)	MDH1 (ENSCSEG00000001022)	WDPCP (ENSCSEG00000001003)	otx1 (ENSCSEG00000000992)	EHBP1 (ENSCSEG00000000951)	GTPBP2 (ENSCSEG00000000936)	polh (ENSCSEG00000000930)	ENSCSEG00000000924	comtd1 (ENSCSEG00000000915)	vdac2 (ENSCSEG00000000908)	ENSCSEG00000000901	pcgf6 (ENSCSEG00000000895)
Turbot	MODERN SPECIES	6	ENSSMAG00000015870	ENSSMAG00000025768	ENSSMAG00000015890	ENSSMAG00000030212	smap1 (ENSSMAG00000015928)	b3gat2 (ENSSMAG00000022064)	OGFRL1 (ENSSMAG00000015991)	asrgl1 (ENSSMAG00000016011)	RIMS1 (ENSSMAG00000016024)	ENSSMAG00000016172	ENSSMAG00000036317	FANCL (ENSSMAG00000016189)	ENSSMAG00000016222	CCDC85A (ENSSMAG00000031644)	ENSSMAG00000016337 #21	macroh2a2 (ENSSMAG00000016405) #22	ENSSMAG00000016437 #23	pitx3 (ENSSMAG00000016531) #24	PNLIPRP2 (ENSSMAG00000016552) #25	hspa12a (ENSSMAG00000016608)	eno4 (ENSSMAG00000016658)	shtn1 (ENSSMAG00000016666)	atp6v1ba (ENSSMAG00000016694)	vax1 (ENSSMAG00000027859)	kcnk18 (ENSSMAG00000036387)	SLC18A2 (ENSSMAG00000016741)	PDZD8 (ENSSMAG00000016796)	ENSSMAG00000016824	exo1 (ENSSMAG00000016851)	yipf4 (ENSSMAG00000016884)	ttc27 (ENSSMAG00000017147)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00570000079168.b.b.a	ENSGT00950000183100.B	ENSGT00390000002970	ENSGT00390000013448.a.a	ENSGT00570000079239	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000158005	ENSGT00390000017259	ENSGT00390000012337	ENSGT00940000157348	ENSGT00940000157563	ENSGT00940000156083	ENSGT00940000154200.A.b	ENSGT00390000010672	ENSGT00940000164286.j.b.b	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	122										ENSGT00940000157563	ENSGT00940000156083	ENSGT00940000154200.A.b	ENSGT00390000010672	ENSGT00940000164286.j.b.b	ENSGT00940000170402	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3195	ENSSLDG00000016280	ENSSLDG00000016310	ttyh3b (ENSSLDG00000016344)	ENSSLDG00000016376	ENSSLDG00000016429	mad1l1 (ENSSLDG00000016440)	ELFN1 (ENSSLDG00000016471)	ENSSLDG00000016483	tm9sf2 (ENSSLDG00000016503)	pcca (ENSSLDG00000016568)	ENSSLDG00000016657	vps8 (ENSSLDG00000016762)	ENSSLDG00000017298	ENSSLDG00000017314	ENSSLDG00000017333	macroh2a2 (ENSSLDG00000017346) #22	GBF1 (ENSSLDG00000017384) #23	pitx3 (ENSSLDG00000017463) #24	PNLIPRP2 (ENSSLDG00000017476) #25	hspa12a (ENSSLDG00000017504)	eno4 (ENSSLDG00000017570)	shtn1 (ENSSLDG00000017599)	atp6v1ba (ENSSLDG00000017647)	vax1 (ENSSLDG00000017988)	kcnk18 (ENSSLDG00000018002)	slc18a2 (ENSSLDG00000018015)	PDZD8 (ENSSLDG00000018047)	ENSSLDG00000018076	ENSSLDG00000018088	exo1 (ENSSLDG00000018097)	yipf4 (ENSSLDG00000018120)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	174								tm9sf2 (ENSSDUG00000021270)	pcca (ENSSDUG00000021326)	ENSSDUG00000021386	vps8 (ENSSDUG00000021424)	ENSSDUG00000021659	ENSSDUG00000021665	ENSSDUG00000021671	ENSSDUG00000021679	macroh2a2 (ENSSDUG00000021693) #22	GBF1 (ENSSDUG00000021709) #23	pitx3 (ENSSDUG00000021736) #24	PNLIPRP2 (ENSSDUG00000021751) #25	ENSSDUG00000021759	hspa12a (ENSSDUG00000021769)	ENSSDUG00000021791	ENSSDUG00000021800	eno4 (ENSSDUG00000021802)	shtn1 (ENSSDUG00000021818)	atp6v1ba (ENSSDUG00000021875)	vax1 (ENSSDUG00000021885)	kcnk18 (ENSSDUG00000021888)	slc18a2 (ENSSDUG00000021891)	PDZD8 (ENSSDUG00000021903)	ENSSDUG00000021914
Barramundi perch	MODERN SPECIES	561															zgc:175280 (ENSLCAG00010023098)	macroh2a2 (ENSLCAG00010023103) #22	GBF1 (ENSLCAG00010023120) #23	pitx3 (ENSLCAG00010023138) #24	ENSLCAG00010023142
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00570000079168.b.b.a	ENSGT00950000183100.B	ENSGT00390000002970	ENSGT00390000013448.a.a	ENSGT00570000079239	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000158005	ENSGT00390000017259	ENSGT00390000012337	ENSGT00940000157348	ENSGT00940000157563	ENSGT00940000156083	ENSGT00940000154200.A.b	ENSGT00940000164286.j.b.b	ENSGT00390000010672	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	67																ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	62																ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518.a	ENSGT00940000164095.a	ENSGT00940000164611.a.b	ENSGT00940000158698	ENSGT00390000009155	ENSGT00810000125473.A	ENSGT00940000155078.a.b.a.b	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT01030000234610.b.a.a	ENSGT00940000153566.b	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00940000170261	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	60	fgf8a (ENSKMAG00000017503)	slc2a15a (ENSKMAG00000017465)	ENSKMAG00000017448	tlx1 (ENSKMAG00000017438)	ENSKMAG00000017422	ENSKMAG00000017386	rab1ab (ENSKMAG00000017357)	hells (ENSKMAG00000017279) #19	CALHM3 (ENSKMAG00000017261)	calhm2.1 (ENSKMAG00000017248)	ncapd3 (ENSKMAG00000017218)	ENSKMAG00000017194	ENSKMAG00000017167 #20	ENSKMAG00000017115 #21	ENSKMAG00000016977	macroh2a2 (ENSKMAG00000016927) #22	GBF1 (ENSKMAG00000016781) #23	pitx3 (ENSKMAG00000016734) #24	PNLIPRP2 (ENSKMAG00000016665) #25	hspa12a (ENSKMAG00000016576)	eno4 (ENSKMAG00000016525)	shtn1 (ENSKMAG00000016499)	atp6v1ba (ENSKMAG00000016461)	vax1 (ENSKMAG00000016441)	ENSKMAG00000016428	slc18a2 (ENSKMAG00000016396)	PDZD8 (ENSKMAG00000016378)	ENSKMAG00000016367	ENSKMAG00000016333	ENSKMAG00000016298	ENSKMAG00000016270
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1612	CALHM3 (ENSNFUG00015001415)	HELLS (ENSNFUG00015001451) #19	rab1ab (ENSNFUG00015001545)	ENSNFUG00015001550	ENSNFUG00015001556	tlx1 (ENSNFUG00015001561)	ENSNFUG00015001570	slc2a15a (ENSNFUG00015001603)	FGF8A (ENSNFUG00015001647)	FBXW4 (ENSNFUG00015001665)	WBP1LA (ENSNFUG00015001688)	ENSNFUG00015001749	ENSNFUG00015001783 #21	ENSNFUG00015001809	ENSNFUG00015001812	macroh2a2 (ENSNFUG00015001818) #22	GBF1 (ENSNFUG00015001830) #23	pitx3 (ENSNFUG00015001868) #24	ENSNFUG00015001888	kcnk18 (ENSNFUG00015001909)	SLC18A2 (ENSNFUG00015001958)	PDZD8 (ENSNFUG00015002034)	ENSNFUG00015002040	EDARADD (ENSNFUG00015002047)	exo1 (ENSNFUG00015002054)	ENSNFUG00015002069	YIPF4 (ENSNFUG00015002074)	BIRC6 (ENSNFUG00015002101)	ttc27 (ENSNFUG00015002298)	LTBP1 (ENSNFUG00015002465)	ENSNFUG00015002479
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000183132.B	ENSGT00390000005029.k	ENSGT00940000159518.a	ENSGT00940000164095.a	ENSGT00940000158698	ENSGT00390000009155	ENSGT00810000125473.A	ENSGT00940000155078.a.b.a.b	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT00940000153566.b	ENSGT00940000153246.a.a.b.h	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT01070000253760.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00910000144296	ENSGT00940000167313	ENSGT00940000165928	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000162528	ENSGT00390000004153.d	ENSGT00950000182919.C
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	7														ENSGT00940000167270 #21	ENSGT01070000253760.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00910000144296	ENSGT00940000167313	ENSGT00940000165928	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000162528	ENSGT00390000004153.d	ENSGT00950000182919.C
Indian medaka	MODERN SPECIES	27	STK32C (ENSOMEG00000001824)	PWWP2B (ENSOMEG00000001817)	INPP5A (ENSOMEG00000001808)	nkx6.2 (ENSOMEG00000001792)	valopa (ENSOMEG00000001785)	ENSOMEG00000001777	ENSOMEG00000001767	ENSOMEG00000001759	ENSOMEG00000001748	ENSOMEG00000001733	vox (ENSOMEG00000001730)	ENSOMEG00000001729	dntt (ENSOMEG00000001723)	ENSOMEG00000001709 #21	ENSOMEG00000001703	macroh2a2 (ENSOMEG00000001698) #22	GBF1 (ENSOMEG00000001687) #23	GBF1 (ENSOMEG00000001669) #23	pitx3 (ENSOMEG00000001662) #24	hspa12a (ENSOMEG00000001644)	eno4 (ENSOMEG00000001627)	shtn1 (ENSOMEG00000001619)	atp6v1ba (ENSOMEG00000001604)	vax1 (ENSOMEG00000001595)	ciao2b (ENSOMEG00000001588)	ENSOMEG00000001578	ENSOMEG00000001574	ENSOMEG00000001567	ENSOMEG00000001557	ENSOMEG00000001550	ENSOMEG00000001546
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	6	ENSOJAG00000007852	ENSOJAG00000007883	rab1ab (ENSOJAG00000007982)	hells (ENSOJAG00000008349) #19	CALHM3 (ENSOJAG00000008718)	ncapd3 (ENSOJAG00000008815)	stra6l (ENSOJAG00000009728)	ENSOJAG00000009740	opn3 (ENSOJAG00000009755)	kmo (ENSOJAG00000009801)	ide (ENSOJAG00000009987)	ide (ENSOJAG00000011010)	ENSOJAG00000011972	ENSOJAG00000012035 #21	ENSOJAG00000012540	macroh2a2 (ENSOJAG00000012551) #22	GBF1 (ENSOJAG00000012579) #23	pitx3 (ENSOJAG00000012831) #24	hspa12a (ENSOJAG00000012888)	eno4 (ENSOJAG00000013401)	shtn1 (ENSOJAG00000013415)	atp6v1ba (ENSOJAG00000013525)	vax1 (ENSOJAG00000014413)	ciao2b (ENSOJAG00000014429)	ENSOJAG00000014435	ENSOJAG00000014457	ENSOJAG00000014469	ENSOJAG00000014479	ENSOJAG00000014485	ENSOJAG00000014501	ENSOJAG00000014554
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000183132.B	ENSGT00390000005029.k	ENSGT00940000159518.a	ENSGT00940000164095.a	ENSGT00940000158698	ENSGT00390000009155	ENSGT00810000125473.A	ENSGT00940000155078.a.b.a.b	ENSGT00740000115593 #19	ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT00940000153566.b	ENSGT00940000153246.a.a.b.h	ENSGT00530000068411 #20	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT01070000253760.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00390000017697.b	ENSGT00910000144296	ENSGT00940000165928	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000162528	ENSGT00390000004153.d	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000158988.a.b
Chinese medaka	MODERN SPECIES	2166																ENSOSIG00000002958 #22
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	6	fgf8a (ENSORLG00000024917)	slc2a15a (ENSORLG00000000924)	tlx1 (ENSORLG00000000935)	ENSORLG00000027360	ENSORLG00000024874	rab1ab (ENSORLG00000028104)	hells (ENSORLG00000000987) #19	CALHM3 (ENSORLG00000000995)	ncapd3 (ENSORLG00000001014)	ENSORLG00000025120	ENSORLG00000028371 #20	ENSORLG00000001051 #21	ENSORLG00000001066	ENSORLG00000027498	ENSORLG00000018201	macroh2a2 (ENSORLG00000001088) #22	GBF1 (ENSORLG00000001139) #23	pitx3 (ENSORLG00000027925) #24	hspa12a (ENSORLG00000001174)	eno4 (ENSORLG00000028334)	shtn1 (ENSORLG00000023645)	atp6v1ba (ENSORLG00000001220)	vax1 (ENSORLG00000027781)	ciao2b (ENSORLG00000026372)	ENSORLG00000022974	cdh5 (ENSORLG00000001288)	ENSORLG00000025505	tmem41ab (ENSORLG00000023287)	ENSORLG00000001303	mtx2 (ENSORLG00000001332)	ENSORLG00000001346
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000002970	ENSGT00390000013448.a.a	ENSGT00570000079239	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000158005	ENSGT00390000017259	ENSGT00390000012337	ENSGT00940000157348	ENSGT00940000157563	ENSGT00940000156083	ENSGT00940000154200.A.b	ENSGT00390000010672	ENSGT00940000164286.j.b.b	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00390000002970	ENSGT00390000013448.a.a	ENSGT00570000079239	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000158005	ENSGT00390000017259	ENSGT00390000012337	ENSGT00940000157348	ENSGT00940000157563	ENSGT00940000156083	ENSGT00940000154200.A.b	ENSGT00940000164286.j.b.b	ENSGT00390000010672	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00390000002970	ENSGT00390000013448.a.a	ENSGT00570000079239	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000158005	ENSGT00390000017259	ENSGT00390000012337	ENSGT00940000157348	ENSGT00940000157563	ENSGT00940000156083	ENSGT00940000154200.A.b	ENSGT00940000164286.j.b.b	ENSGT00390000010672	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000154865	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00950000183100.B	ENSGT00390000002970	ENSGT00390000013448.a.a	ENSGT00570000079239	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000158005	ENSGT00390000017259	ENSGT00390000012337	ENSGT00940000157348	ENSGT00940000157563	ENSGT00940000156083	ENSGT00940000154200.A.b	ENSGT00390000010672	ENSGT00940000164286.j.b.b	ENSGT00940000167270 #21	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00940000175244	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	564											pcca (ENSAOCG00000005451)	ENSAOCG00000005427	vps8 (ENSAOCG00000005373)	ENSAOCG00000005160	ENSAOCG00000005132 #21	macroh2a2 (ENSAOCG00000005073) #22	GBF1 (ENSAOCG00000005026) #23	pitx3 (ENSAOCG00000004900) #24	PNLIPRP2 (ENSAOCG00000004838) #25	hspa12a (ENSAOCG00000004810)	eno4 (ENSAOCG00000004756)	shtn1 (ENSAOCG00000004712)	atp6v1ba (ENSAOCG00000004694)	vax1 (ENSAOCG00000004654)	ENSAOCG00000004643	slc18a2 (ENSAOCG00000004618)	PDZD8 (ENSAOCG00000004592)	ENSAOCG00000002094	ENSAOCG00000004551	exo1 (ENSAOCG00000004515)	yipf4 (ENSAOCG00000004491)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	12	nvl (ENSAPEG00000002541)	ENSAPEG00000002556	ENSAPEG00000002564	tk2 (ENSAPEG00000002582)	aprt (ENSAPEG00000002623)	CDT1 (ENSAPEG00000002650)	PIEZO1 (ENSAPEG00000002697)	tm9sf2 (ENSAPEG00000002870)	ENSAPEG00000002938	pcca (ENSAPEG00000002955)	ENSAPEG00000002973	vps8 (ENSAPEG00000003045)	ENSAPEG00000003091	ENSAPEG00000003109 #21	ENSAPEG00000003189	macroh2a2 (ENSAPEG00000003265) #22	GBF1 (ENSAPEG00000003341) #23	pitx3 (ENSAPEG00000003512) #24	PNLIPRP2 (ENSAPEG00000003532) #25	hspa12a (ENSAPEG00000003555)	eno4 (ENSAPEG00000003625)	shtn1 (ENSAPEG00000003722)	atp6v1ba (ENSAPEG00000003743)	vax1 (ENSAPEG00000003802)	ENSAPEG00000003834	slc18a2 (ENSAPEG00000003925)	PDZD8 (ENSAPEG00000003985)	ENSAPEG00000004026	ENSAPEG00000004041	exo1 (ENSAPEG00000004076)	yipf4 (ENSAPEG00000004236)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	189														ENSAPOG00000000786 #21	ENSAPOG00000022039	macroh2a2 (ENSAPOG00000022008) #22	GBF1 (ENSAPOG00000021947) #23	pitx3 (ENSAPOG00000021757) #24	PNLIPRP2 (ENSAPOG00000021732) #25	hspa12a (ENSAPOG00000021698)	eno4 (ENSAPOG00000000613)	shtn1 (ENSAPOG00000021597)	atp6v1ba (ENSAPOG00000021537)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	283																macroh2a2 (ENSSPAG00000015993) #22	GBF1 (ENSSPAG00000016028) #23	pitx3 (ENSSPAG00000016160) #24	PNLIPRP2 (ENSSPAG00000016183) #25	hspa12a (ENSSPAG00000016216)	eno4 (ENSSPAG00000016297)	shtn1 (ENSSPAG00000016326)	atp6v1ba (ENSSPAG00000016387)	vax1 (ENSSPAG00000016445)	ENSSPAG00000016464	slc18a2 (ENSSPAG00000016475)	PDZD8 (ENSSPAG00000016510)	ENSSPAG00000016518	ENSSPAG00000016529	exo1 (ENSSPAG00000016551)	yipf4 (ENSSPAG00000016664)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	13																ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000155139 #25	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1533																macroh2a2 (ENSACIG00000023708) #22
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	38																ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000153566.b	ENSGT00940000153335.a.b
Nile tilapia	MODERN SPECIES	4	ENSONIG00000018545	ENSONIG00000032996	ENSONIG00000037654	ENSONIG00000018544	ENSONIG00000036899	pitx3 (ENSONIG00000009139) #24	ENSONIG00000037889	ENSONIG00000038728	ttc27 (ENSONIG00000004659)	ENSONIG00000034519	ENSONIG00000035531	LTBP1 (ENSONIG00000011223)	ENSONIG00000032728	ENSONIG00000035814	ENSONIG00000033885	macroh2a2 (ENSONIG00000009134) #22	GBF1 (ENSONIG00000009136) #23	ENSONIG00000030396	zswim8 (ENSONIG00000007126)	ENSONIG00000036068	ENSONIG00000029462	rasgrp3 (ENSONIG00000004519)	ENSONIG00000004507	ENSONIG00000038064	elp6 (ENSONIG00000004504)	ENSONIG00000004493	ENSONIG00000039740	ENSONIG00000041912	ENSONIG00000014004	CALHM3 (ENSONIG00000037483)	ENSONIG00000009131
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	65															ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000153566.b	ENSGT00940000153335.a.b
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	76															ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00940000165200	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000153566.b	ENSGT00940000153335.a.b
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	1123																macroh2a2 (ENSHBUG00000008356) #22	GBF1 (ENSHBUG00000008426) #23	pitx3 (ENSHBUG00000008463) #24
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	8															ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000153566.b	ENSGT00940000153335.a.b	ENSGT00390000008797
P. nyererei	MODERN SPECIES	492																macroh2a2 (ENSPNYG00000004133) #22	ENSPNYG00000004112	GBF1 (ENSPNYG00000003951) #23	pitx3 (ENSPNYG00000003909) #24	hspa12a (ENSPNYG00000003856)	eno4 (ENSPNYG00000003792)	shtn1 (ENSPNYG00000003751)	atp6v1ba (ENSPNYG00000003696)	vax1 (ENSPNYG00000003674)	ENSPNYG00000003648	kcnk18 (ENSPNYG00000003604)	slc18a2 (ENSPNYG00000003555)	PDZD8 (ENSPNYG00000003509)	ENSPNYG00000003492	ENSPNYG00000003466	exo1 (ENSPNYG00000003414)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	5															ENSGT01030000234610.b.a.b.b	ENSGT00940000158120 #22	ENSGT00940000156925.v #23	ENSGT00940000154518.b #24	ENSGT00940000154551.b.i	ENSGT00950000182805.a.b	ENSGT00510000048167.a	ENSGT00940000155068.a.b	ENSGT00940000161152	ENSGT00700000104522	ENSGT00940000157593	ENSGT00390000017746	ENSGT00510000047676	ENSGT00940000153168.B	ENSGT01030000235521.b	ENSGT00940000153566.b	ENSGT00940000153335.a.b
Eastern happy	MODERN SPECIES	4	pcca (ENSACLG00000006725)	PIEZO1 (ENSACLG00000006682)	CDT1 (ENSACLG00000006664)	aprt (ENSACLG00000006659)	ENSACLG00000006658	tk2 (ENSACLG00000006650)	nvl (ENSACLG00000006630)	degs1 (ENSACLG00000006626)	fbxo28 (ENSACLG00000006612)	polr1c (ENSACLG00000006573)	ENSACLG00000006569	NDST2 (ENSACLG00000006524)	zswim8 (ENSACLG00000006424)	CALHM3 (ENSACLG00000006418)	ENSACLG00000006417	macroh2a2 (ENSACLG00000006212) #22	GBF1 (ENSACLG00000006017) #23	pitx3 (ENSACLG00000005981) #24	ENSACLG00000005964	hspa12a (ENSACLG00000005915)	eno4 (ENSACLG00000005900)	shtn1 (ENSACLG00000005896)	atp6v1ba (ENSACLG00000005481)	vax1 (ENSACLG00000005465)	kcnk18 (ENSACLG00000005460)	slc18a2 (ENSACLG00000005409)	PDZD8 (ENSACLG00000005404)	ENSACLG00000005072	ENSACLG00000005035	exo1 (ENSACLG00000005020)	yipf4 (ENSACLG00000005010)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1095	ENSMZEG00005004195	ENSMZEG00005004190	ENSMZEG00005004178	elovl6l (ENSMZEG00005004171)	ENSMZEG00005004164	abhd12 (ENSMZEG00005004140)	gins1 (ENSMZEG00005004114) #26	ninl (ENSMZEG00005004096) #27	AIFM2 (ENSMZEG00005004083) #28	entpd6 (ENSMZEG00005004067)	vsx1 (ENSMZEG00005004056)	ENSMZEG00005004047	acss1 (ENSMZEG00005004000)	CALHM3 (ENSMZEG00005003977)	ENSMZEG00005003921	macroh2a2 (ENSMZEG00005003876) #22	GBF1 (ENSMZEG00005003745) #23	pitx3 (ENSMZEG00005003703) #24	smim7 (ENSMZEG00005003690)	hspa12a (ENSMZEG00005003624)	ENSMZEG00005003505	ANKRD1 (ENSMZEG00005003491)	pcgf5a (ENSMZEG00005003485)	HECTD2 (ENSMZEG00005003436)	ppp1r3ca (ENSMZEG00005003419)	ENSMZEG00005003415	ENSMZEG00005003151	ENSMZEG00005003113	cyp26c1 (ENSMZEG00005003086)	ENSMZEG00005003040	ENSMZEG00005003025
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	468														CALHM3 (ENSNBRG00000018477)	ENSNBRG00000018492	macroh2a2 (ENSNBRG00000018499) #22	GBF1 (ENSNBRG00000018531) #23	pitx3 (ENSNBRG00000018586) #24	hspa12a (ENSNBRG00000018638)	eno4 (ENSNBRG00000018850)	shtn1 (ENSNBRG00000018884)	atp6v1ba (ENSNBRG00000018916)	vax1 (ENSNBRG00000018945)	slc18a2 (ENSNBRG00000018965)	PDZD8 (ENSNBRG00000018994)	ENSNBRG00000019022	ENSNBRG00000019028	exo1 (ENSNBRG00000019048)	yipf4 (ENSNBRG00000019091)	ncapd3 (ENSNBRG00000019145)	cdk1 (ENSNBRG00000019289)