Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000157397 ENSGT01030000234532.A.b ENSGT00940000158347.z ENSGT00940000159303 ENSGT00390000000096.b.a #11 ENSGT00940000158020.d #12 ENSGT00840000129915.b #13 ENSGT00390000003488.a.a #14 ENSGT00390000005488 #15 ENSGT00940000160054 #16 ENSGT00940000158280 #17 ENSGT00550000074952 #18 ENSGT00940000154351 #19 ENSGT00940000160441 #20 ENSGT00940000157542 #21 ENSGT00940000157938 #22 ENSGT00940000164068.a.b.b #23 ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23 ENSGT00390000011613 ENSGT00940000156422 ENSGT00510000047412.b ENSGT00940000158441 ENSGT00510000046704.b.b ENSGT00940000157324 ENSGT00390000011190 ENSGT00940000156756 ENSGT00390000012913.b ENSGT00950000183152.A Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157397 ENSGT01030000234532.A.b ENSGT00940000158347.z ENSGT00940000159303 ENSGT00390000000096.b.a #11 ENSGT00940000158020.d #12 ENSGT00840000129915.b #13 ENSGT00390000003488.a.a #14 ENSGT00390000005488 #15 ENSGT00940000160054 #16 ENSGT00940000158280 #17 ENSGT00550000074952 #18 ENSGT00940000154351 #19 ENSGT00940000160441 #20 ENSGT00940000157542 #21 ENSGT00940000157938 #22 ENSGT00940000164068.a.b.b #23 ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23 ENSGT00390000011613 ENSGT00940000156422 ENSGT00510000047412.b ENSGT00940000158441 ENSGT00510000046704.b.b ENSGT00940000157324 ENSGT00390000011190 ENSGT00940000156756 ENSGT00390000012913.b ENSGT00950000183152.A ENSGT00970000193372.a.a.tc.a ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000165409.f Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157397 ENSGT01030000234532.A.b ENSGT00940000158347.z ENSGT00940000159303 ENSGT00390000000096.b.a #11 ENSGT00940000158020.d #12 ENSGT00840000129915.b #13 ENSGT00390000003488.a.a #14 ENSGT00390000005488 #15 ENSGT00940000160054 #16 ENSGT00940000158280 #17 ENSGT00550000074952 #18 ENSGT00940000154351 #19 ENSGT00940000160441 #20 ENSGT00940000157542 #21 ENSGT00940000157938 #22 ENSGT00940000164068.a.b.b #23 ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23 ENSGT00390000011613 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ENSGT00970000193372.a.a.tc.a ENSGT00950000183118.A.c.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157397 ENSGT01030000234532.A.b ENSGT00940000158347.z ENSGT00940000159303 ENSGT00390000000096.b.a #11 ENSGT00940000158020.d #12 ENSGT00840000129915.b #13 ENSGT00390000003488.a.a #14 ENSGT00390000005488 #15 ENSGT00940000160054 #16 ENSGT00940000158280 #17 ENSGT00550000074952 #18 ENSGT00940000154351 #19 ENSGT00940000160441 #20 ENSGT00940000157542 #21 ENSGT00940000157938 #22 ENSGT00940000164068.a.b.b #23 ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23 ENSGT00390000011613 ENSGT00940000156422 ENSGT00510000047412.b ENSGT00940000158441 ENSGT00510000046704.b.b ENSGT00940000157324 ENSGT00390000011190 ENSGT00940000156756 ENSGT00390000012913.b ENSGT01000000220501 ENSGT00950000183152.A ENSGT00970000193372.a.a.tc.a ENSGT00950000183118.A.c.a Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157397 ENSGT01030000234532.A.b ENSGT00940000158347.z ENSGT00940000159303 ENSGT00390000000096.b.a #11 ENSGT00940000158020.d #12 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ENSGT00940000157938 #22 ENSGT00940000164068.a.b.b #23 ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23 ENSGT00390000011613 ENSGT00940000156422 ENSGT00510000047412.b ENSGT00940000158441 ENSGT00510000046704.b.b ENSGT00940000157324 ENSGT00390000011190 ENSGT00940000156756 ENSGT00390000012913.b ENSGT00950000183152.A ENSGT00970000193372.a.a.tc.a ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000159830 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 849 dmxl2 (ENSSPAG00000008964) #11 gldn (ENSSPAG00000008919) #12 cyp19a1a (ENSSPAG00000008892) #13 tnfaip8l3 (ENSSPAG00000008878) #14 scg3 (ENSSPAG00000008854) #15 lysmd2 (ENSSPAG00000008840) #16 tmod2 (ENSSPAG00000008794) #17 leo1 (ENSSPAG00000008739) #18 mapk6 (ENSSPAG00000008669) #19 USP50 (ENSSPAG00000008639) #20 USP8 (ENSSPAG00000008544) #21 hdc (ENSSPAG00000008510) #22 slc27a2a (ENSSPAG00000008401) #23 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000157397 ENSGT01030000234532.A.b ENSGT00940000158347.z ENSGT00940000159303 ENSGT00390000000096.b.a #11 ENSGT00940000158020.d #12 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ENSGT00940000157938 #22 ENSGT00940000164068.a.b.b #23 Orange clownfish MODERN SPECIES BTBD1 (ENSAPEG00000024697) RAMAC (ENSAPEG00000024710) homer2 (ENSAPEG00000024715) WHAMM (ENSAPEG00000024724) FSD2 (ENSAPEG00000024731) ENSAPEG00000024734 pde8a (ENSAPEG00000024753) gatm (ENSAPEG00000024762) ENSAPEG00000024763 ##23 gatm (ENSAPEG00000024765) ENSAPEG00000024767 ##23 leo1 (ENSAPEG00000024770) #18 mapk6 (ENSAPEG00000024774) #19 USP50 (ENSAPEG00000024776) #20 USP8 (ENSAPEG00000024777) #21 hdc (ENSAPEG00000024785) #22 slc27a2a (ENSAPEG00000024790) #23 ENSAPEG00000024794 tmod2 (ENSAPEG00000024798) #17 lysmd2 (ENSAPEG00000024802) #16 scg3 (ENSAPEG00000024804) #15 tnfaip8l3 (ENSAPEG00000024806) #14 cyp19a1a (ENSAPEG00000024822) #13 gldn (ENSAPEG00000024829) #12 dmxl2 (ENSAPEG00000024830) #11 sema6dl (ENSAPEG00000024831) ENSAPEG00000024832 slc24a5 (ENSAPEG00000024833) myef2 (ENSAPEG00000024834) CTXN2 (ENSAPEG00000024835) SLC12A1 (ENSAPEG00000024836) Clown anemonefish MODERN SPECIES 1658 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ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23 ENSGT00390000011613 ENSGT00940000156422 ENSGT00510000047412.b ENSGT00940000158441 ENSGT00510000046704.b.b ENSGT00940000157324 ENSGT00390000011190 ENSGT00940000156756 ENSGT00390000012913.b ENSGT00940000166817 ENSGT01000000220501 ENSGT00950000183152.A ENSGT00970000193372.a.a.tc.a Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157397 ENSGT01030000234532.A.b ENSGT00940000158347.z ENSGT00940000159303 ENSGT00390000000096.b.a #11 ENSGT00940000158020.d #12 ENSGT00840000129915.b #13 ENSGT00390000003488.a.a #14 ENSGT00390000005488 #15 ENSGT00940000160054 #16 ENSGT00940000158280 #17 ENSGT00550000074952 #18 ENSGT00940000154351 #19 ENSGT00940000160441 #20 ENSGT00940000157542 #21 ENSGT00940000157938 #22 ENSGT00940000164068.a.b.b #23 ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23 ENSGT00390000011613 ENSGT00940000156422 ENSGT00510000047412.b ENSGT00940000158441 ENSGT00510000046704.b.b ENSGT00940000157324 ENSGT00390000011190 ENSGT00940000156756 ENSGT00390000012913.b 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ENSGT01030000234532.A.b ENSGT00940000158347.z ENSGT00940000159303 ENSGT00390000000096.b.a #11 ENSGT00940000158020.d #12 ENSGT00840000129915.b #13 ENSGT00390000003488.a.a #14 ENSGT00390000005488 #15 ENSGT00940000160054 #16 ENSGT00940000158280 #17 ENSGT00550000074952 #18 ENSGT00940000154351 #19 ENSGT00940000160441 #20 ENSGT00940000157542 #21 ENSGT00940000157938 #22 ENSGT00940000164068.a.b.b #23 ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23 ENSGT00390000011613 ENSGT00940000156422 ENSGT00510000047412.b ENSGT00940000158441 ENSGT00510000046704.b.b ENSGT00940000157324 ENSGT00390000011190 ENSGT00940000156756 ENSGT00390000012913.b ENSGT00950000183152.A ENSGT00970000193372.a.a.tc.a ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000159830 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 14 dmxl2 (ENSBSLG00000004472) #11 gldn (ENSBSLG00000004340) #12 cyp19a1a (ENSBSLG00000004284) #13 tnfaip8l3 (ENSBSLG00000004280) #14 scg3 (ENSBSLG00000004273) #15 lysmd2 (ENSBSLG00000004267) #16 tmod2 (ENSBSLG00000004212) #17 leo1 (ENSBSLG00000004159) #18 mapk6 (ENSBSLG00000004144) #19 USP50 (ENSBSLG00000004132) #20 USP8 (ENSBSLG00000003855) #21 hdc (ENSBSLG00000003221) #22 slc27a2a (ENSBSLG00000003205) #23 ENSBSLG00000003193 ##23 gatm (ENSBSLG00000003189) pde8a (ENSBSLG00000002693) ENSBSLG00000002349 ENSBSLG00000002313 WHAMM (ENSBSLG00000002284) homer2 (ENSBSLG00000002210) RAMAC (ENSBSLG00000001912) BTBD1 (ENSBSLG00000001833) TM6SF1 (ENSBSLG00000001823) ZRSR2 (ENSBSLG00000001814) ap1s2 (ENSBSLG00000001793) ENSBSLG00000001788 PHKA2 (ENSBSLG00000001403) Climbing perch MODERN SPECIES 16 myef2 (ENSATEG00000017892) slc24a5 (ENSATEG00000017821) ENSATEG00000017812 sema6dl (ENSATEG00000017659) dmxl2 (ENSATEG00000017438) #11 gldn (ENSATEG00000017422) #12 cyp19a1a (ENSATEG00000017392) #13 tnfaip8l3 (ENSATEG00000017365) #14 scg3 (ENSATEG00000017352) #15 lysmd2 (ENSATEG00000017347) #16 tmod2 (ENSATEG00000017316) #17 ENSATEG00000017300 mapk6 (ENSATEG00000017234) #19 USP50 (ENSATEG00000017201) #20 ENSATEG00000017188 #21 hdc (ENSATEG00000017150) #22 slc27a2a (ENSATEG00000017134) #23 ENSATEG00000017088 ##23 gatm (ENSATEG00000017058) pde8a (ENSATEG00000016933) ENSATEG00000025699 ENSATEG00000016862 WHAMM (ENSATEG00000016846) homer2 (ENSATEG00000016830) RAMAC (ENSATEG00000016819) BTBD1 (ENSATEG00000016780) TM6SF1 (ENSATEG00000016763) ENSATEG00000025875 ENSATEG00000016735 ENSATEG00000016521 ENSATEG00000016469 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157397 ENSGT01030000234532.A.b ENSGT00940000158347.z ENSGT00940000159303 ENSGT00390000000096.b.a #11 ENSGT00940000158020.d #12 ENSGT00840000129915.b #13 ENSGT00390000003488.a.a #14 ENSGT00390000005488 #15 ENSGT00940000160054 #16 ENSGT00940000158280 #17 ENSGT00550000074952 #18 ENSGT00940000154351 #19 ENSGT00940000160441 #20 ENSGT00940000157542 #21 ENSGT00940000157938 #22 ENSGT00940000164068.a.b.b #23 ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23 ENSGT00390000011613 ENSGT00940000156422 ENSGT00510000047412.b ENSGT00940000158441 ENSGT00510000046704.b.b ENSGT00940000157324 ENSGT00390000011190 ENSGT00940000156756 ENSGT00390000012913.b ENSGT01000000220501 ENSGT00950000183152.A ENSGT00970000193372.a.a.tc.a ENSGT00950000183118.A.c.a Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157397 ENSGT01030000234532.A.b ENSGT00940000158347.z ENSGT00940000159303 ENSGT00390000000096.b.a #11 ENSGT00940000158020.d #12 ENSGT00840000129915.b #13 ENSGT00390000003488.a.a #14 ENSGT00390000005488 #15 ENSGT00940000160054 #16 ENSGT00940000158280 #17 ENSGT00550000074952 #18 ENSGT00940000154351 #19 ENSGT00940000160441 #20 ENSGT00940000157542 #21 ENSGT00940000157938 #22 ENSGT00940000164068.a.b.b #23 ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23 ENSGT00390000011613 ENSGT00940000156422 ENSGT00510000047412.b ENSGT00940000158441 ENSGT00510000046704.b.b ENSGT00940000157324 ENSGT00390000011190 ENSGT00940000156756 ENSGT00390000012913.b ENSGT01000000220501 ENSGT00950000183152.A ENSGT00970000193372.a.a.tc.a ENSGT00950000183118.A.c.a Turbot MODERN SPECIES 17 myef2 (ENSSMAG00000021279) slc24a5 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ENSGT00510000046704.b.b ENSGT00940000157324 ENSGT00390000011190 ENSGT00940000156756 ENSGT00390000012913.b ENSGT00950000183152.A ENSGT00970000193372.a.a.tc.a ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000165409.f Pike perch MODERN SPECIES 20 myef2 (ENSSLUG00000025326) slc24a5 (ENSSLUG00000025332) ENSSLUG00000025336 sema6dl (ENSSLUG00000025355) dmxl2 (ENSSLUG00000025439) #11 gldn (ENSSLUG00000025470) #12 cyp19a1a (ENSSLUG00000025475) #13 tnfaip8l3 (ENSSLUG00000025477) #14 scg3 (ENSSLUG00000025480) #15 lysmd2 (ENSSLUG00000025484) #16 tmod2 (ENSSLUG00000025503) #17 leo1 (ENSSLUG00000025525) #18 mapk6 (ENSSLUG00000025532) #19 USP50 (ENSSLUG00000025537) #20 USP8 (ENSSLUG00000025547) #21 hdc (ENSSLUG00000000317) #22 slc27a2a (ENSSLUG00000000428) #23 ENSSLUG00000000582 ##23 gatm (ENSSLUG00000000714) pde8a (ENSSLUG00000000765) ENSSLUG00000000874 FSD2 (ENSSLUG00000000881) ENSSLUG00000000886 HOMER2 (ENSSLUG00000000893) RAMAC (ENSSLUG00000000901) BTBD1 (ENSSLUG00000000906) TM6SF1 (ENSSLUG00000000918) 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Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000012054.b.c ENSGT00390000005488 #15 ENSGT00940000160054 #16 ENSGT00940000158280 #17 ENSGT00550000074952 #18 ENSGT00940000154351 #19 ENSGT00940000160441 #20 ENSGT00940000157542 #21 ENSGT00940000157938 #22 ENSGT00940000164068.a.b.b #23 ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23 ENSGT00390000011613 ENSGT00940000156422 ENSGT00510000047412.b ENSGT00940000158441 ENSGT00510000046704.b.b ENSGT00940000157324 ENSGT00390000011190 ENSGT00940000156756 ENSGT00390000012913.b ENSGT00950000183152.A ENSGT00970000193372.a.a.tc.a ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000159830 Stickleback MODERN SPECIES 1 gpib (ENSGACG00000014922) wtip (ENSGACG00000014970) sdr42e1 (ENSGACG00000014971) zgc:101040 (ENSGACG00000014973) ENSGACG00000014976 ENSGACG00000014977 ENSGACG00000014978 ENSGACG00000014980 scg3 (ENSGACG00000014981) #15 lysmd2 (ENSGACG00000014985) #16 tmod2 (ENSGACG00000014989) #17 leo1 (ENSGACG00000014999) #18 mapk6 (ENSGACG00000015004) #19 USP50 (ENSGACG00000015008) #20 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