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Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000169841	ENSGT00990000205468	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398.i.a	ENSGT01090000260005.a.b.b
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	51	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398.i.a	ENSGT01090000260005.a.b.b
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	105	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
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Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	849					dmxl2 (ENSSPAG00000008964) #11	gldn (ENSSPAG00000008919) #12	cyp19a1a (ENSSPAG00000008892) #13	tnfaip8l3 (ENSSPAG00000008878) #14	scg3 (ENSSPAG00000008854) #15	lysmd2 (ENSSPAG00000008840) #16	tmod2 (ENSSPAG00000008794) #17	leo1 (ENSSPAG00000008739) #18	mapk6 (ENSSPAG00000008669) #19	USP50 (ENSSPAG00000008639) #20	USP8 (ENSSPAG00000008544) #21	hdc (ENSSPAG00000008510) #22	slc27a2a (ENSSPAG00000008401) #23
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	88	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23
Orange clownfish	MODERN SPECIES		BTBD1 (ENSAPEG00000024697)	RAMAC (ENSAPEG00000024710)	homer2 (ENSAPEG00000024715)	WHAMM (ENSAPEG00000024724)	FSD2 (ENSAPEG00000024731)	ENSAPEG00000024734	pde8a (ENSAPEG00000024753)	gatm (ENSAPEG00000024762)	ENSAPEG00000024763 ##23	gatm (ENSAPEG00000024765)	ENSAPEG00000024767 ##23	leo1 (ENSAPEG00000024770) #18	mapk6 (ENSAPEG00000024774) #19	USP50 (ENSAPEG00000024776) #20	USP8 (ENSAPEG00000024777) #21	hdc (ENSAPEG00000024785) #22	slc27a2a (ENSAPEG00000024790) #23	ENSAPEG00000024794	tmod2 (ENSAPEG00000024798) #17	lysmd2 (ENSAPEG00000024802) #16	scg3 (ENSAPEG00000024804) #15	tnfaip8l3 (ENSAPEG00000024806) #14	cyp19a1a (ENSAPEG00000024822) #13	gldn (ENSAPEG00000024829) #12	dmxl2 (ENSAPEG00000024830) #11	sema6dl (ENSAPEG00000024831)	ENSAPEG00000024832	slc24a5 (ENSAPEG00000024833)	myef2 (ENSAPEG00000024834)	CTXN2 (ENSAPEG00000024835)	SLC12A1 (ENSAPEG00000024836)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1658								tnfaip8l3 (ENSAOCG00000010960) #14	scg3 (ENSAOCG00000010977) #15	lysmd2 (ENSAOCG00000010986) #16	tmod2 (ENSAOCG00000011016) #17	leo1 (ENSAOCG00000011059) #18	mapk6 (ENSAOCG00000011125) #19	USP50 (ENSAOCG00000011162) #20	USP8 (ENSAOCG00000011268) #21	hdc (ENSAOCG00000011328) #22	slc27a2a (ENSAOCG00000011372) #23	ENSAOCG00000011392
Spiny chromis	MODERN SPECIES	15	pdzk1 (ENSAPOG00000005635)	GPR89B (ENSAPOG00000005612)	zgc:113337 (ENSAPOG00000005542)	ENSAPOG00000005500	ENSAPOG00000005476	CFAP91 (ENSAPOG00000005434)	nr1i2 (ENSAPOG00000005425)	gsk3ba (ENSAPOG00000005406)	GPR156 (ENSAPOG00000005361)	LRRC58 (ENSAPOG00000005325)	fstl1b (ENSAPOG00000005305)	ENSAPOG00000005255	gja8a (ENSAPOG00000005225)	USP50 (ENSAPOG00000005219) #20	USP8 (ENSAPOG00000005184) #21	hdc (ENSAPOG00000005147) #22	slc27a2a (ENSAPOG00000005081) #23	ENSAPOG00000005065	gatm (ENSAPOG00000005045)	pde8a (ENSAPOG00000004983)	ENSAPOG00000004907	FSD2 (ENSAPOG00000004867)	WHAMM (ENSAPOG00000004852)	HOMER2 (ENSAPOG00000004827)	RAMAC (ENSAPOG00000004796)	BTBD1 (ENSAPOG00000004778)	TM6SF1 (ENSAPOG00000004747)	ENSAPOG00000004712	ap1s2 (ENSAPOG00000000114)	PHKA2 (ENSAPOG00000004565)	ppef1 (ENSAPOG00000004359)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Midas cichlid	DUPLICATION
Midas cichlid	MODERN SPECIES	149													mapk6 (ENSACIG00000003997) #19	USP50 (ENSACIG00000004035) #20	USP8 (ENSACIG00000004085) #21	hdc (ENSACIG00000004200) #22	hdc (ENSACIG00000004236) #22	slc27a2a (ENSACIG00000004265) #23	ENSACIG00000004289 ##23	gatm (ENSACIG00000004325)	pde8a (ENSACIG00000004340)	FSD2 (ENSACIG00000004423)	WHAMM (ENSACIG00000004489)	homer2 (ENSACIG00000004517)	ENSACIG00000004536	BTBD1 (ENSACIG00000004540)	TM6SF1 (ENSACIG00000004562)	ENSACIG00000004601	ap1s2 (ENSACIG00000004677)	PHKA2 (ENSACIG00000004689)	ppef1 (ENSACIG00000004747)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	149												mapk6 (ENSACIG00000003997) #19	USP50 (ENSACIG00000004035) #20	USP8 (ENSACIG00000004085) #21	hdc (ENSACIG00000004200) #22	hdc (ENSACIG00000004236) #22	slc27a2a (ENSACIG00000004265) #23	ENSACIG00000004289 ##23	gatm (ENSACIG00000004325)	pde8a (ENSACIG00000004340)	FSD2 (ENSACIG00000004423)	WHAMM (ENSACIG00000004489)	homer2 (ENSACIG00000004517)	ENSACIG00000004536	BTBD1 (ENSACIG00000004540)	TM6SF1 (ENSACIG00000004562)	ENSACIG00000004601	ap1s2 (ENSACIG00000004677)	PHKA2 (ENSACIG00000004689)	ppef1 (ENSACIG00000004747)	ENSACIG00000004788
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b.v #23	ENSGT00940000164068.a.b.b.u #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	924					dmxl2 (ENSHBUG00000009859) #11	gldn (ENSHBUG00000009686) #12	cyp19a1a (ENSHBUG00000009666) #13	tnfaip8l3 (ENSHBUG00000009641) #14	scg3 (ENSHBUG00000009628) #15	lysmd2 (ENSHBUG00000009617) #16	tmod2 (ENSHBUG00000009604) #17	leo1 (ENSHBUG00000009559) #18	mapk6 (ENSHBUG00000009545) #19	ENSHBUG00000009538 #20	USP8 (ENSHBUG00000009524) #21	hdc (ENSHBUG00000009464) #22	slc27a2a (ENSHBUG00000009422) #23	slc27a2a (ENSHBUG00000009398) #23
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000164068.a.b.b.v #23	ENSGT00940000164068.a.b.b.u #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a
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Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b.v #23	ENSGT00940000164068.a.b.b.u #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Eastern happy	MODERN SPECIES		myef2 (ENSACLG00000017421)	slc24a5 (ENSACLG00000017757)	ENSACLG00000017790	sema6dl (ENSACLG00000017894)	dmxl2 (ENSACLG00000018247) #11	gldn (ENSACLG00000018741) #12	cyp19a1a (ENSACLG00000018805) #13	tnfaip8l3 (ENSACLG00000018837) #14	scg3 (ENSACLG00000018841) #15	lysmd2 (ENSACLG00000018861) #16	tmod2 (ENSACLG00000018873) #17	leo1 (ENSACLG00000018946) #18	mapk6 (ENSACLG00000018989) #19	ENSACLG00000018995 #20	USP8 (ENSACLG00000019006) #21	hdc (ENSACLG00000019048) #22	slc27a2a (ENSACLG00000019098) #23	slc27a2a (ENSACLG00000019112) #23	ENSACLG00000019129 ##23	gatm (ENSACLG00000019193)	pde8a (ENSACLG00000019234)	ENSACLG00000019348	FSD2 (ENSACLG00000019390)	WHAMM (ENSACLG00000019425)	homer2 (ENSACLG00000019478)	ENSACLG00000019516	BTBD1 (ENSACLG00000019537)	TM6SF1 (ENSACLG00000019609)	ZRSR2 (ENSACLG00000019635)	ap1s2 (ENSACLG00000019778)	PHKA2 (ENSACLG00000019794)
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Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	320	myef2 (ENSNBRG00000023602)	slc24a5 (ENSNBRG00000023639)	ENSNBRG00000023648	sema6dl (ENSNBRG00000023681)	dmxl2 (ENSNBRG00000023751) #11	gldn (ENSNBRG00000023805) #12	cyp19a1a (ENSNBRG00000023814) #13	tnfaip8l3 (ENSNBRG00000023823) #14	scg3 (ENSNBRG00000023830) #15	lysmd2 (ENSNBRG00000023840) #16	tmod2 (ENSNBRG00000023847) #17	leo1 (ENSNBRG00000023860) #18	mapk6 (ENSNBRG00000023878) #19	USP50 (ENSNBRG00000023890) #20	USP8 (ENSNBRG00000023918) #21	hdc (ENSNBRG00000023952) #22	slc27a2a (ENSNBRG00000023957) #23
Nile tilapia	MODERN SPECIES		ENSONIG00000030175	slc24a5 (ENSONIG00000037887)	ENSONIG00000032500	sema6dl (ENSONIG00000033002)	dmxl2 (ENSONIG00000000145) #11	gldn (ENSONIG00000000153) #12	cyp19a1a (ENSONIG00000000155) #13	tnfaip8l3 (ENSONIG00000041467) #14	scg3 (ENSONIG00000000167) #15	lysmd2 (ENSONIG00000000172) #16	tmod2 (ENSONIG00000000174) #17	leo1 (ENSONIG00000000176) #18	mapk6 (ENSONIG00000000180) #19	ENSONIG00000000183 #20	USP8 (ENSONIG00000000185) #21	hdc (ENSONIG00000000190) #22	slc27a2a (ENSONIG00000030469) #23	slc27a2a (ENSONIG00000034343) #23	slc27a2a (ENSONIG00000015562) #23	ENSONIG00000036671	ENSONIG00000000192 ##23	gatm (ENSONIG00000000198)	pde8a (ENSONIG00000000200)	ENSONIG00000000206	ENSONIG00000038956	WHAMM (ENSONIG00000000209)	homer2 (ENSONIG00000000214)	RAMAC (ENSONIG00000041300)	BTBD1 (ENSONIG00000000221)	TM6SF1 (ENSONIG00000000225)	ZRSR2 (ENSONIG00000000228)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	48													ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441.l #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1616	ENSNFUG00015012019	FBN1 (ENSNFUG00015012042)	DUT (ENSNFUG00015012340)	SLC12A1 (ENSNFUG00015012441)	CTXN2 (ENSNFUG00015014721)	myef2 (ENSNFUG00015014748)	slc24a5 (ENSNFUG00015014791)	RNF128 (ENSNFUG00015014983)	SEMA6DL (ENSNFUG00015015127)	ENSNFUG00015016858	dmxl2 (ENSNFUG00015017061) #11	ENSNFUG00015021737	MAPK6 (ENSNFUG00015021741) #19	USP50 (ENSNFUG00015021748) #20	USP8 (ENSNFUG00015021753) #21	hdc (ENSNFUG00015021763) #22	slc27a2a (ENSNFUG00015021794) #23	ENSNFUG00015021824 ##23	gatm (ENSNFUG00015021982)	PDE8A (ENSNFUG00015022081)	ENSNFUG00015023174	ENSNFUG00015023176	Nfu_g_1_003224 (ENSNFUG00015023178)	ENSNFUG00015023181	WHAMM (ENSNFUG00015023184)	HOMER2 (ENSNFUG00015023189)	RAMAC (ENSNFUG00015023200)	BTBD1 (ENSNFUG00015023206)	TM6SF1 (ENSNFUG00015023230)	ENSNFUG00015023245	AP1S2 (ENSNFUG00015023257)
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	775													mapk6 (ENSKMAG00000015751) #19	ENSKMAG00000015714 #20	USP8 (ENSKMAG00000015687) #21	hdc (ENSKMAG00000015592) #22	ENSKMAG00000015559
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a.f #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a.f #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
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Guppy	MODERN SPECIES	455	myef2 (ENSPREG00000010801)	slc24a5 (ENSPREG00000011000)	ENSPREG00000011029	sema6dl (ENSPREG00000011050)	dmxl2 (ENSPREG00000011194) #11	gldn (ENSPREG00000011547) #12	cyp19a1a (ENSPREG00000012213) #13	tnfaip8l3 (ENSPREG00000018651) #14	scg3 (ENSPREG00000018659) #15	lysmd2 (ENSPREG00000018677) #16	tmod2 (ENSPREG00000018693) #17	leo1 (ENSPREG00000018743) #18	mapk6 (ENSPREG00000018774) #19	USP50 (ENSPREG00000018791) #20	USP8 (ENSPREG00000018813) #21	hdc (ENSPREG00000018872) #22	slc27a2a (ENSPREG00000018896) #23	ENSPREG00000018911	ENSPREG00000018922 ##23	gatm (ENSPREG00000018938)	pde8a (ENSPREG00000018974)	FSD2 (ENSPREG00000019086)	WHAMM (ENSPREG00000019100)	HOMER2 (ENSPREG00000019120)	ENSPREG00000019136	BTBD1 (ENSPREG00000019151)	TM6SF1 (ENSPREG00000019184)	ZRSR2 (ENSPREG00000019201)	ap1s2 (ENSPREG00000019224)	PHKA2 (ENSPREG00000019259)	ppef1 (ENSPREG00000019419)
Platyfish	MODERN SPECIES	18	myef2 (ENSXMAG00000016686)	slc24a5 (ENSXMAG00000016727)	ENSXMAG00000020048	sema6dl (ENSXMAG00000002234)	dmxl2 (ENSXMAG00000002209) #11	gldn (ENSXMAG00000002203) #12	cyp19a1a (ENSXMAG00000002192) #13	tnfaip8l3 (ENSXMAG00000002189) #14	scg3 (ENSXMAG00000002179) #15	lysmd2 (ENSXMAG00000027022) #16	tmod2 (ENSXMAG00000002168) #17	leo1 (ENSXMAG00000002158) #18	mapk6 (ENSXMAG00000002154) #19	USP50 (ENSXMAG00000002152) #20	USP8 (ENSXMAG00000002148) #21	hdc (ENSXMAG00000024575) #22	slc27a2a (ENSXMAG00000002117) #23	ENSXMAG00000002111 ##23	gatm (ENSXMAG00000002105)	pde8a (ENSXMAG00000002082)	ENSXMAG00000022313	ENSXMAG00000029722	FSD2 (ENSXMAG00000002076)	WHAMM (ENSXMAG00000002066)	HOMER2 (ENSXMAG00000002059)	RAMAC (ENSXMAG00000015208)	BTBD1 (ENSXMAG00000015211)	TM6SF1 (ENSXMAG00000015231)	ZRSR2 (ENSXMAG00000015258)	ap1s2 (ENSXMAG00000015858)	PHKA2 (ENSXMAG00000002032)
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Mummichog	MODERN SPECIES	421					dmxl2 (ENSFHEG00000008267) #11	gldn (ENSFHEG00000008159) #12	cyp19a1a (ENSFHEG00000008132) #13	tnfaip8l3 (ENSFHEG00000008048) #14	scg3 (ENSFHEG00000008043) #15	lysmd2 (ENSFHEG00000008031) #16	tmod2 (ENSFHEG00000008019) #17	leo1 (ENSFHEG00000007981) #18	mapk6 (ENSFHEG00000007971) #19	USP50 (ENSFHEG00000007950) #20	USP8 (ENSFHEG00000007910) #21	hdc (ENSFHEG00000007888) #22	slc27a2a (ENSFHEG00000007856) #23	ENSFHEG00000007841 ##23	gatm (ENSFHEG00000007791)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	234	slc24a5 (ENSCVAG00000010829)	ENSCVAG00000010837	sema6dl (ENSCVAG00000011031)	ENSCVAG00000011053	dmxl2 (ENSCVAG00000011203) #11	gldn (ENSCVAG00000011216) #12	cyp19a1a (ENSCVAG00000011244) #13	tnfaip8l3 (ENSCVAG00000011253) #14	scg3 (ENSCVAG00000011399) #15	lysmd2 (ENSCVAG00000011412) #16	tmod2 (ENSCVAG00000011453) #17	leo1 (ENSCVAG00000011488) #18	mapk6 (ENSCVAG00000011499) #19	USP50 (ENSCVAG00000011525) #20	USP8 (ENSCVAG00000011538) #21	hdc (ENSCVAG00000011565) #22	slc27a2a (ENSCVAG00000011574) #23	ENSCVAG00000011603 ##23	gatm (ENSCVAG00000011627)	pde8a (ENSCVAG00000011637)	ENSCVAG00000011650	FSD2 (ENSCVAG00000011667)	WHAMM (ENSCVAG00000011675)	HOMER2 (ENSCVAG00000011709)	RAMAC (ENSCVAG00000011717)	BTBD1 (ENSCVAG00000011742)	paqr5a (ENSCVAG00000011779)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Indian medaka	MODERN SPECIES	26	myef2 (ENSOMEG00000010072)	slc24a5 (ENSOMEG00000010143)	ENSOMEG00000010170	sema6dl (ENSOMEG00000000246)	dmxl2 (ENSOMEG00000000249) #11	gldn (ENSOMEG00000010517) #12	cyp19a1a (ENSOMEG00000010567) #13	tnfaip8l3 (ENSOMEG00000010579) #14	scg3 (ENSOMEG00000010616) #15	lysmd2 (ENSOMEG00000010630) #16	tmod2 (ENSOMEG00000010680) #17	leo1 (ENSOMEG00000010732) #18	mapk6 (ENSOMEG00000010774) #19	USP50 (ENSOMEG00000010801) #20	USP8 (ENSOMEG00000010929) #21	hdc (ENSOMEG00000011031) #22	slc27a2a (ENSOMEG00000011076) #23	ENSOMEG00000011120 ##23	gatm (ENSOMEG00000011167)	pde8a (ENSOMEG00000011337)	ENSOMEG00000000695	FSD2 (ENSOMEG00000011485)	WHAMM (ENSOMEG00000011562)	HOMER2 (ENSOMEG00000011626)	RAMAC (ENSOMEG00000011658)	BTBD1 (ENSOMEG00000011710)	TM6SF1 (ENSOMEG00000011787)	ZRSR2 (ENSOMEG00000011857)	ap1s2 (ENSOMEG00000011899)	PHKA2 (ENSOMEG00000012081)	ENSOMEG00000012119
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	17	FBN1 (ENSOJAG00000020999)	dut (ENSOJAG00000021291)	SLC12A1 (ENSOJAG00000021409)	myef2 (ENSOJAG00000022384)	slc24a5 (ENSOJAG00000000119)	sema6dl (ENSOJAG00000000388)	gldn (ENSOJAG00000000624) #12	tnfaip8l3 (ENSOJAG00000000632) #14	scg3 (ENSOJAG00000000637) #15	lysmd2 (ENSOJAG00000000648) #16	leo1 (ENSOJAG00000000660) #18	tmod2 (ENSOJAG00000000678) #17	mapk6 (ENSOJAG00000000712) #19	USP50 (ENSOJAG00000000736) #20	USP8 (ENSOJAG00000000766) #21	hdc (ENSOJAG00000000791) #22	slc27a2a (ENSOJAG00000000805) #23	ENSOJAG00000000811	ENSOJAG00000000814 ##23	gatm (ENSOJAG00000000821)	pde8a (ENSOJAG00000001062)	ENSOJAG00000001570	ENSOJAG00000001600	WHAMM (ENSOJAG00000001609)	HOMER2 (ENSOJAG00000001631)	ENSOJAG00000001683	BTBD1 (ENSOJAG00000001731)	TM6SF1 (ENSOJAG00000001807)	ENSOJAG00000001816	ENSOJAG00000001827	ap1s2 (ENSOJAG00000001842)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	17	ENSORLG00000002764	sema6dl (ENSORLG00000002823)	dmxl2 (ENSORLG00000002886) #11	ENSORLG00000025494	gldn (ENSORLG00000002908) #12	cyp19a1a (ENSORLG00000002949) #13	tnfaip8l3 (ENSORLG00000027022) #14	scg3 (ENSORLG00000002989) #15	lysmd2 (ENSORLG00000026773) #16	ENSORLG00000029392	tmod2 (ENSORLG00000003045) #17	leo1 (ENSORLG00000003064) #18	mapk6 (ENSORLG00000003082) #19	ENSORLG00000003094 #20	USP8 (ENSORLG00000003140) #21	hdc (ENSORLG00000003155) #22	slc27a2a (ENSORLG00000003164) #23	ENSORLG00000003218 ##23	gatm (ENSORLG00000003253)	pde8a (ENSORLG00000003332)	ENSORLG00000003341	FSD2 (ENSORLG00000003348)	WHAMM (ENSORLG00000003364)	homer2 (ENSORLG00000003402)	ENSORLG00000003414	BTBD1 (ENSORLG00000003434)	TM6SF1 (ENSORLG00000003460)	ZRSR2 (ENSORLG00000003476)	ap1s2 (ENSORLG00000024796)	PHKA2 (ENSORLG00000003555)	ppef1 (ENSORLG00000003571)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000166817	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	17	cdkl5 (ENSMAMG00000010484)	ENSMAMG00000010639	ppef1 (ENSMAMG00000010651)	PHKA2 (ENSMAMG00000010670)	ENSMAMG00000010759	ENSMAMG00000010779	TM6SF1 (ENSMAMG00000010807)	BTBD1 (ENSMAMG00000010819)	RAMAC (ENSMAMG00000010845)	homer2 (ENSMAMG00000010853)	WHAMM (ENSMAMG00000010873)	FSD2 (ENSMAMG00000010882)	ENSMAMG00000010931	pde8a (ENSMAMG00000010958)	gatm (ENSMAMG00000010991)	ENSMAMG00000011023 #22	ENSMAMG00000011048 #23	ENSMAMG00000011066 ##23	ENSMAMG00000011073 #21	ENSMAMG00000011122 #20	mapk6 (ENSMAMG00000011149) #19	leo1 (ENSMAMG00000011168) #18	tmod2 (ENSMAMG00000011188) #17	lysmd2 (ENSMAMG00000011220) #16	scg3 (ENSMAMG00000011230) #15	tnfaip8l3 (ENSMAMG00000025301) #14	cyp19a1a (ENSMAMG00000011245) #13	gldn (ENSMAMG00000011254) #12	dmxl2 (ENSMAMG00000011273) #11	ENSMAMG00000011368	sema6dl (ENSMAMG00000011398)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	14					dmxl2 (ENSBSLG00000004472) #11	gldn (ENSBSLG00000004340) #12	cyp19a1a (ENSBSLG00000004284) #13	tnfaip8l3 (ENSBSLG00000004280) #14	scg3 (ENSBSLG00000004273) #15	lysmd2 (ENSBSLG00000004267) #16	tmod2 (ENSBSLG00000004212) #17	leo1 (ENSBSLG00000004159) #18	mapk6 (ENSBSLG00000004144) #19	USP50 (ENSBSLG00000004132) #20	USP8 (ENSBSLG00000003855) #21	hdc (ENSBSLG00000003221) #22	slc27a2a (ENSBSLG00000003205) #23	ENSBSLG00000003193 ##23	gatm (ENSBSLG00000003189)	pde8a (ENSBSLG00000002693)	ENSBSLG00000002349	ENSBSLG00000002313	WHAMM (ENSBSLG00000002284)	homer2 (ENSBSLG00000002210)	RAMAC (ENSBSLG00000001912)	BTBD1 (ENSBSLG00000001833)	TM6SF1 (ENSBSLG00000001823)	ZRSR2 (ENSBSLG00000001814)	ap1s2 (ENSBSLG00000001793)	ENSBSLG00000001788	PHKA2 (ENSBSLG00000001403)
Climbing perch	MODERN SPECIES	16	myef2 (ENSATEG00000017892)	slc24a5 (ENSATEG00000017821)	ENSATEG00000017812	sema6dl (ENSATEG00000017659)	dmxl2 (ENSATEG00000017438) #11	gldn (ENSATEG00000017422) #12	cyp19a1a (ENSATEG00000017392) #13	tnfaip8l3 (ENSATEG00000017365) #14	scg3 (ENSATEG00000017352) #15	lysmd2 (ENSATEG00000017347) #16	tmod2 (ENSATEG00000017316) #17	ENSATEG00000017300	mapk6 (ENSATEG00000017234) #19	USP50 (ENSATEG00000017201) #20	ENSATEG00000017188 #21	hdc (ENSATEG00000017150) #22	slc27a2a (ENSATEG00000017134) #23	ENSATEG00000017088 ##23	gatm (ENSATEG00000017058)	pde8a (ENSATEG00000016933)	ENSATEG00000025699	ENSATEG00000016862	WHAMM (ENSATEG00000016846)	homer2 (ENSATEG00000016830)	RAMAC (ENSATEG00000016819)	BTBD1 (ENSATEG00000016780)	TM6SF1 (ENSATEG00000016763)	ENSATEG00000025875	ENSATEG00000016735	ENSATEG00000016521	ENSATEG00000016469
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Turbot	MODERN SPECIES	17	myef2 (ENSSMAG00000021279)	slc24a5 (ENSSMAG00000021278)	ENSSMAG00000021277	sema6dl (ENSSMAG00000021276)	dmxl2 (ENSSMAG00000021275) #11	gldn (ENSSMAG00000021274) #12	cyp19a1a (ENSSMAG00000014538) #13	tnfaip8l3 (ENSSMAG00000036688) #14	scg3 (ENSSMAG00000014287) #15	lysmd2 (ENSSMAG00000014268) #16	tmod2 (ENSSMAG00000014241) #17	leo1 (ENSSMAG00000014228) #18	mapk6 (ENSSMAG00000014205) #19	ENSSMAG00000014197 #20	ENSSMAG00000014186 #21	hdc (ENSSMAG00000014150) #22	slc27a2a (ENSSMAG00000014132) #23	ENSSMAG00000014127 ##23	gatm (ENSSMAG00000014093)	pde8a (ENSSMAG00000014068)	ENSSMAG00000013994	FSD2 (ENSSMAG00000013983)	WHAMM (ENSSMAG00000013975)	homer2 (ENSSMAG00000013939)	ENSSMAG00000013934	BTBD1 (ENSSMAG00000013911)	TM6SF1 (ENSSMAG00000013892)	ENSSMAG00000013874	ENSSMAG00000025910	ENSSMAG00000013858	PHKA2 (ENSSMAG00000013655)
Tongue sole	MODERN SPECIES	15	ENSCSEG00000012628	slc39a1 (ENSCSEG00000012617)	tmem208 (ENSCSEG00000012613)	SMAD6 (ENSCSEG00000012602)	SMAD3 (ENSCSEG00000012585)	map2k5 (ENSCSEG00000012573)	ccnd1 (ENSCSEG00000012564)	vstm2b (ENSCSEG00000012557)	scg3 (ENSCSEG00000012546) #15	lysmd2 (ENSCSEG00000012539) #16	tmod2 (ENSCSEG00000012523) #17	leo1 (ENSCSEG00000012502) #18	mapk6 (ENSCSEG00000012488) #19	ENSCSEG00000012481 #20	USP8 (ENSCSEG00000012449) #21	hdc (ENSCSEG00000010006) #22	slc27a2a (ENSCSEG00000009981) #23	gatm (ENSCSEG00000009953)	pde8a (ENSCSEG00000009892)	ENSCSEG00000009860	FSD2 (ENSCSEG00000009849)	homer2 (ENSCSEG00000009815)	RAMAC (ENSCSEG00000009800)	ENSCSEG00000009786	BTBD1 (ENSCSEG00000009763)	TM6SF1 (ENSCSEG00000009726)	ZRSR2 (ENSCSEG00000009682)	ap1s2 (ENSCSEG00000009663)	PHKA2 (ENSCSEG00000009624)	ppef1 (ENSCSEG00000009602)	ENSCSEG00000009585
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	30					ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000157369.b
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2798					dmxl2 (ENSSLDG00000011135) #11	gldn (ENSSLDG00000011076) #12	cyp19a1a (ENSSLDG00000011037) #13	tnfaip8l3 (ENSSLDG00000011020) #14	scg3 (ENSSLDG00000010953) #15	lysmd2 (ENSSLDG00000010930) #16	tmod2 (ENSSLDG00000010883) #17	leo1 (ENSSLDG00000010803) #18	mapk6 (ENSSLDG00000010745) #19	USP50 (ENSSLDG00000010708) #20	USP8 (ENSSLDG00000010574) #21	hdc (ENSSLDG00000010482) #22	slc27a2a (ENSSLDG00000010432) #23	ENSSLDG00000010403 ##23	gatm (ENSSLDG00000010359)	pde8a (ENSSLDG00000010194)	ENSSLDG00000010060	FSD2 (ENSSLDG00000010016)	WHAMM (ENSSLDG00000009986)	homer2 (ENSSLDG00000009970)	HOMER2 (ENSSLDG00000009944)	RAMAC (ENSSLDG00000009924)	BTBD1 (ENSSLDG00000009893)	ap1s2 (ENSSLDG00000009877)	ENSSLDG00000009759	TM6SF1 (ENSSLDG00000009722)	crybgx (ENSSLDG00000009695)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	3					dmxl2 (ENSSDUG00000003667) #11	gldn (ENSSDUG00000003629) #12	cyp19a1a (ENSSDUG00000003606) #13	tnfaip8l3 (ENSSDUG00000003597) #14	scg3 (ENSSDUG00000003574) #15	lysmd2 (ENSSDUG00000003541) #16	tmod2 (ENSSDUG00000003503) #17	leo1 (ENSSDUG00000003483) #18	mapk6 (ENSSDUG00000003444) #19	USP50 (ENSSDUG00000003425) #20	USP8 (ENSSDUG00000003393) #21	hdc (ENSSDUG00000003241) #22	slc27a2a (ENSSDUG00000003195) #23	ENSSDUG00000003186 ##23	gatm (ENSSDUG00000003160)	pde8a (ENSSDUG00000003079)	ENSSDUG00000003044	FSD2 (ENSSDUG00000002921)	WHAMM (ENSSDUG00000002890)	homer2 (ENSSDUG00000002857)	RAMAC (ENSSDUG00000002843)	BTBD1 (ENSSDUG00000002814)	ap1s2 (ENSSDUG00000002801)	ZRSR2 (ENSSDUG00000002784)	TM6SF1 (ENSSDUG00000002771)	crybgx (ENSSDUG00000002750)	lctla (ENSSDUG00000002714)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	96	CTXN2 (ENSLCAG00010004347)	myef2 (ENSLCAG00010004354)	slc24a5 (ENSLCAG00010004373)	ENSLCAG00010004382	sema6dl (ENSLCAG00010004441)	dmxl2 (ENSLCAG00010004591) #11	cyp19a1a (ENSLCAG00010004693) #13	tnfaip8l3 (ENSLCAG00010004733) #14	scg3 (ENSLCAG00010004735) #15	lysmd2 (ENSLCAG00010004741) #16	tmod2 (ENSLCAG00010004750) #17	leo1 (ENSLCAG00010004765) #18	mapk6 (ENSLCAG00010004774) #19	USP50 (ENSLCAG00010004782) #20	USP8 (ENSLCAG00010004793) #21	hdc (ENSLCAG00010004811) #22	slc27a2a (ENSLCAG00010004818) #23	ENSLCAG00010004829 ##23	gatm (ENSLCAG00010004861)	pde8a (ENSLCAG00010004887)	ENSLCAG00010004942	ENSLCAG00010004951	WHAMM (ENSLCAG00010004960)	HOMER2 (ENSLCAG00010004968)	RAMAC (ENSLCAG00010004975)	BTBD1 (ENSLCAG00010004976)	TM6SF1 (ENSLCAG00010004986)	ENSLCAG00010004989	ENSLCAG00010004992	ap1s2 (ENSLCAG00010005007)	PHKA2 (ENSLCAG00010005084)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000154829.j	ENSGT01100000263512.b.b.a.i	ENSGT00940000159726	ENSGT00390000016316	ENSGT00940000158077	ENSGT00950000182963.b.a.d	ENSGT00940000159407.q	ENSGT00940000157355.c	ENSGT00940000166846	ENSGT00940000159830	ENSGT00940000154664.h.n.c.r	ENSGT00940000154664.h.n.c.q	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a
Tetraodon	MODERN SPECIES	20	myef2 (ENSTNIG00000009526)	slc24a5 (ENSTNIG00000009525)	ENSTNIG00000009524	sema6dl (ENSTNIG00000009523)	dmxl2 (ENSTNIG00000009522) #11	gldn (ENSTNIG00000009521) #12	cyp19a1a (ENSTNIG00000009520) #13	tnfaip8l3 (ENSTNIG00000009519) #14	scg3 (ENSTNIG00000009518) #15	lysmd2 (ENSTNIG00000009517) #16	tmod2 (ENSTNIG00000009516) #17	leo1 (ENSTNIG00000009515) #18	mapk6 (ENSTNIG00000009514) #19	USP50 (ENSTNIG00000009513) #20	USP8 (ENSTNIG00000009512) #21	hdc (ENSTNIG00000009511) #22	slc27a2a (ENSTNIG00000009510) #23	ENSTNIG00000009509	ENSTNIG00000009508	GRPR (ENSTNIG00000009507)	vegfd (ENSTNIG00000001247)	ENSTNIG00000009506	ace2 (ENSTNIG00000009505)	NHS (ENSTNIG00000009504)	ENSTNIG00000009503	ENSTNIG00000001566	cdkl5 (ENSTNIG00000009502)	ENSTNIG00000009501	ppef1 (ENSTNIG00000009500)	KLHL10 (ENSTNIG00000009499)	KLHL10 (ENSTNIG00000009498)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Pike perch	MODERN SPECIES	20	myef2 (ENSSLUG00000025326)	slc24a5 (ENSSLUG00000025332)	ENSSLUG00000025336	sema6dl (ENSSLUG00000025355)	dmxl2 (ENSSLUG00000025439) #11	gldn (ENSSLUG00000025470) #12	cyp19a1a (ENSSLUG00000025475) #13	tnfaip8l3 (ENSSLUG00000025477) #14	scg3 (ENSSLUG00000025480) #15	lysmd2 (ENSSLUG00000025484) #16	tmod2 (ENSSLUG00000025503) #17	leo1 (ENSSLUG00000025525) #18	mapk6 (ENSSLUG00000025532) #19	USP50 (ENSSLUG00000025537) #20	USP8 (ENSSLUG00000025547) #21	hdc (ENSSLUG00000000317) #22	slc27a2a (ENSSLUG00000000428) #23	ENSSLUG00000000582 ##23	gatm (ENSSLUG00000000714)	pde8a (ENSSLUG00000000765)	ENSSLUG00000000874	FSD2 (ENSSLUG00000000881)	ENSSLUG00000000886	HOMER2 (ENSSLUG00000000893)	RAMAC (ENSSLUG00000000901)	BTBD1 (ENSSLUG00000000906)	TM6SF1 (ENSSLUG00000000918)	ZRSR2 (ENSSLUG00000000930)	ap1s2 (ENSSLUG00000000935)	PHKA2 (ENSSLUG00000000992)	ppef1 (ENSSLUG00000001148)
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Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	13								ENSGT00390000012054.b.c	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
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Lumpfish	MODERN SPECIES	18	ENSCLMG00005002957	ZNF507 (ENSCLMG00005002971)	DPY19L3 (ENSCLMG00005002985)	ENSCLMG00005003005	ENSCLMG00005003040	dhcr7 (ENSCLMG00005003186)	MMP15 (ENSCLMG00005003189)	zgc:101040 (ENSCLMG00005003191)	scg3 (ENSCLMG00005003194) #15	lysmd2 (ENSCLMG00005003274) #16	tmod2 (ENSCLMG00005003275) #17	leo1 (ENSCLMG00005003282) #18	mapk6 (ENSCLMG00005003286) #19	USP50 (ENSCLMG00005003291) #20	USP8 (ENSCLMG00005003315) #21	hdc (ENSCLMG00005003335) #22	slc27a2a (ENSCLMG00005005836) #23	ENSCLMG00005005839 ##23	gatm (ENSCLMG00005006018)	pde8a (ENSCLMG00005006030)	ENSCLMG00005007419	FSD2 (ENSCLMG00005007422)	WHAMM (ENSCLMG00005007423)	HOMER2 (ENSCLMG00005007425)	RAMAC (ENSCLMG00005007426)	BTBD1 (ENSCLMG00005007427)	sdr42e1 (ENSCLMG00005007438)	wtip (ENSCLMG00005007439)	gpib (ENSCLMG00005007445)	GARRE1 (ENSCLMG00005007632)	ss18l2 (ENSCLMG00005007635)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a.j	ENSGT00940000165409.f
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a.j	ENSGT00940000165409.f
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Large yellow croaker	MODERN SPECIES	480	myef2 (ENSLCRG00005021141)	slc24a5 (ENSLCRG00005021139)	ENSLCRG00005021137	sema6dl (ENSLCRG00005021111)	dmxl2 (ENSLCRG00005016306) #11	gldn (ENSLCRG00005016234) #12	cyp19a1a (ENSLCRG00005016193) #13	tnfaip8l3 (ENSLCRG00005016189) #14	scg3 (ENSLCRG00005016183) #15	lysmd2 (ENSLCRG00005016182) #16	tmod2 (ENSLCRG00005016155) #17	leo1 (ENSLCRG00005016152) #18	mapk6 (ENSLCRG00005016151) #19	USP50 (ENSLCRG00005016147) #20	USP8 (ENSLCRG00005016140) #21	hdc (ENSLCRG00005016067) #22	slc27a2a (ENSLCRG00005015804) #23	ENSLCRG00005015596 ##23	gatm (ENSLCRG00005015578)	pde8a (ENSLCRG00005014288)	ENSLCRG00005014270	FSD2 (ENSLCRG00005014263)	WHAMM (ENSLCRG00005014261)	homer2 (ENSLCRG00005014259)	ENSLCRG00005014258	BTBD1 (ENSLCRG00005013954)	TM6SF1 (ENSLCRG00005013951)	ZRSR2 (ENSLCRG00005013949)	ap1s2 (ENSLCRG00005013948)	ENSLCRG00005013947	PHKA2 (ENSLCRG00005013589)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	18	myef2 (ENSSAUG00010022203)	slc24a5 (ENSSAUG00010022209)	ENSSAUG00010022214	sema6dl (ENSSAUG00010022220)	dmxl2 (ENSSAUG00010022332) #11	gldn (ENSSAUG00010022349) #12	cyp19a1a (ENSSAUG00010022362) #13	tnfaip8l3 (ENSSAUG00010022651) #14	scg3 (ENSSAUG00010022653) #15	lysmd2 (ENSSAUG00010022656) #16	tmod2 (ENSSAUG00010022659) #17	leo1 (ENSSAUG00010022669) #18	mapk6 (ENSSAUG00010022674) #19	ENSSAUG00010022675 #20	USP8 (ENSSAUG00010022679) #21	hdc (ENSSAUG00010022696) #22	slc27a2a (ENSSAUG00010022708) #23	ENSSAUG00010022874 ##23	gatm (ENSSAUG00010022921)	ENSSAUG00010022922	ENSSAUG00010022923	ENSSAUG00010022931	ENSSAUG00010022934	fam219b (ENSSAUG00010022936)	COX5a2 (ENSSAUG00010022937)	SNAP25 (ENSSAUG00010022941)	LRRC28 (ENSSAUG00010022944)	igf1rb (ENSSAUG00010022954)	ap3s2 (ENSSAUG00010023180)	ANPEP (ENSSAUG00010023189)	ANPEP (ENSSAUG00010023403)
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	107												leo1 (ENSLBEG00000023895) #18	mapk6 (ENSLBEG00000023939) #19	USP50 (ENSLBEG00000023975) #20	USP8 (ENSLBEG00000024024) #21	hdc (ENSLBEG00000024097) #22	slc27a2a (ENSLBEG00000024149) #23	ENSLBEG00000024176 ##23	gatm (ENSLBEG00000024205)	pde8a (ENSLBEG00000024275)	ENSLBEG00000024341	FSD2 (ENSLBEG00000024404)	WHAMM (ENSLBEG00000024435)	homer2 (ENSLBEG00000024491)	ENSLBEG00000024550	BTBD1 (ENSLBEG00000024568)	TM6SF1 (ENSLBEG00000024596)	ENSLBEG00000024627	ap1s2 (ENSLBEG00000024656)	PHKA2 (ENSLBEG00000024738)	ppef1 (ENSLBEG00000024940)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	348	myef2 (ENSHCOG00000001652)	slc24a5 (ENSHCOG00000001643)	ENSHCOG00000001637	sema6dl (ENSHCOG00000001615)	dmxl2 (ENSHCOG00000001569) #11	gldn (ENSHCOG00000001538) #12	cyp19a1a (ENSHCOG00000001526) #13	tnfaip8l3 (ENSHCOG00000001518) #14	scg3 (ENSHCOG00000001502) #15	lysmd2 (ENSHCOG00000001488) #16	tmod2 (ENSHCOG00000001479) #17	leo1 (ENSHCOG00000001464) #18	mapk6 (ENSHCOG00000001456) #19	USP50 (ENSHCOG00000001443) #20	USP8 (ENSHCOG00000001428) #21	hdc (ENSHCOG00000021012) #22	slc27a2a (ENSHCOG00000020884) #23	ENSHCOG00000020878 ##23	gatm (ENSHCOG00000020850)	pde8a (ENSHCOG00000020827)	ENSHCOG00000020785	FSD2 (ENSHCOG00000020768)	WHAMM (ENSHCOG00000020763)	HOMER2 (ENSHCOG00000020729)	ENSHCOG00000020696	RAMAC (ENSHCOG00000000556)	BTBD1 (ENSHCOG00000020685)	TM6SF1 (ENSHCOG00000020669)	ZRSR2 (ENSHCOG00000020661)	ap1s2 (ENSHCOG00000020643)	PHKA2 (ENSHCOG00000020629)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	17	ALX4 (ENSMMDG00005023319)	ext2 (ENSMMDG00005023325)	DAGLA (ENSMMDG00005000118)	polr2l (ENSMMDG00005000150)	CPSF7 (ENSMMDG00005000159)	sdhaf2 (ENSMMDG00005000174)	syt7b (ENSMMDG00005000192)	saa (ENSMMDG00005000208)	saa (ENSMMDG00005000214)	saa (ENSMMDG00005000222)	tmod2 (ENSMMDG00005000252) #17	leo1 (ENSMMDG00005000296) #18	mapk6 (ENSMMDG00005000307) #19	USP50 (ENSMMDG00005000320) #20	USP8 (ENSMMDG00005000391) #21	hdc (ENSMMDG00005000553) #22	slc27a2a (ENSMMDG00005002197) #23	ENSMMDG00005002492 ##23	gatm (ENSMMDG00005002819)	pde8a (ENSMMDG00005002907)	ENSMMDG00005004292	FSD2 (ENSMMDG00005004308)	WHAMM (ENSMMDG00005004322)	homer2 (ENSMMDG00005004343)	RAMAC (ENSMMDG00005004357)	BTBD1 (ENSMMDG00005004374)	TM6SF1 (ENSMMDG00005004488)	ZRSR2 (ENSMMDG00005004508)	ap1s2 (ENSMMDG00005004533)	ENSMMDG00005004596	ppef1 (ENSMMDG00005004614)
Cod	MODERN SPECIES	5	ENSGMOG00000030531	ENSGMOG00000023894	ENSGMOG00000026442	ENSGMOG00000012961	ENSGMOG00000012968	tssc4 (ENSGMOG00000029139)	ENSGMOG00000005940	ENSGMOG00000036015	ENSGMOG00000024372	cd81a (ENSGMOG00000004521)	kcnc1a (ENSGMOG00000031054)	tph1b (ENSGMOG00000000022)	ENSGMOG00000000019	ENSGMOG00000016010 #21	ENSGMOG00000031103	hdc (ENSGMOG00000016050) #22	ENSGMOG00000016102 #23	ENSGMOG00000016076 #23	ENSGMOG00000008131 ##23	ENSGMOG00000008134	ENSGMOG00000008135	ENSGMOG00000036681	ENSGMOG00000008141	ENSGMOG00000024769	ENSGMOG00000034158	ENSGMOG00000027767	ENSGMOG00000030829	ENSGMOG00000033889	ENSGMOG00000035164	cyp1a (ENSGMOG00000000318)	ENSGMOG00000029214
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	101	ENSGT00940000164990.d	ENSGT00940000154996.a.b.b	ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.b	ENSGT00390000006347.a	ENSGT00940000160333	ENSGT00390000017790	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000163723.A.e	ENSGT00940000163723.A.f.b	ENSGT01050000244900.a.a.b.eb	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00390000005764	ENSGT00530000063106.B	ENSGT00940000155333.A.a
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000164990.d	ENSGT00940000154996.a.b.b	ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.b	ENSGT00390000006347.a	ENSGT00940000160333	ENSGT00390000017790	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000163723.A.e	ENSGT00940000163723.A.f.b	ENSGT01050000244900.a.a.b.eb.h	ENSGT00940000158280.l #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422.j	ENSGT00940000156422.i	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00390000005764	ENSGT00530000063106.B
Huchen	MODERN SPECIES	3364										USP50 (ENSHHUG00000023655) #20	USP8 (ENSHHUG00000023668) #21	ENSHHUG00000023679	ENSHHUG00000023685	ENSHHUG00000023701	ENSHHUG00000023705	hdc (ENSHHUG00000023709) #22	ENSHHUG00000023718 #23
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	85	ENSGT00390000006347.a.g.b	ENSGT00390000006347.a.g.a	ENSGT00940000160333	ENSGT00390000017790	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000163723.A.e	ENSGT00940000163723.A.f.b	ENSGT01050000244900.a.a.b.eb.h	ENSGT00940000158280.l #17	ENSGT01050000244900.a.a.b.eb.g.a	ENSGT00940000158280.k #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422.j	ENSGT00940000156422.i	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b.a	ENSGT00940000157324.l	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00390000005764	ENSGT00530000063106.B	ENSGT00940000155333.A.a.i.a
Oncorhynchus	DUPLICATION
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157938.i #22
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157938.i #22
Coho salmon	MODERN SPECIES	1491										ENSOKIG00005028905 #19	USP50 (ENSOKIG00005028926) #20	ENSOKIG00005029020 #21	ENSOKIG00005024520	ENSOKIG00005024526	ENSOKIG00005024528	ENSOKIG00005024541 #22
Chinook salmon	MODERN SPECIES	1488														ENSOTSG00005031325	ENSOTSG00005031326	ENSOTSG00005031327 #22
Oncorhynchus	DUPLICATION
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	465																ENSGT00940000157938.j.a #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23
Rainbow trout	MODERN SPECIES	27	ENSOMYG00000048968	ENSOMYG00000004278	ENSOMYG00000004018	ENSOMYG00000077260	ENSOMYG00000004192	ENSOMYG00000003351	ENSOMYG00000003441	ENSOMYG00000053221	ENSOMYG00000004444	ENSOMYG00000073125 #17	ENSOMYG00000024703 #18	ENSOMYG00000004588 #19	USP50 (ENSOMYG00000004613) #20	ENSOMYG00000054987 #21	ENSOMYG00000036605	hdc (ENSOMYG00000048576) #22	slc27a2a (ENSOMYG00000035881) #23	ENSOMYG00000073495 ##23	gatm (ENSOMYG00000058991)	ENSOMYG00000060984	pde8a (ENSOMYG00000074691)	ENSOMYG00000076233	ENSOMYG00000058176	ENSOMYG00000064324	ENSOMYG00000077619	ENSOMYG00000058373	FSD2 (ENSOMYG00000048469)	WHAMM (ENSOMYG00000057419)	homer2 (ENSOMYG00000063764)	ENSOMYG00000050671	crybgx (ENSOMYG00000048390)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	639																ENSGT00940000157938.j.a #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23
Coho salmon	MODERN SPECIES	1453																hdc (ENSOKIG00005032872) #22	slc27a2a (ENSOKIG00005033441) #23	ENSOKIG00005034091 ##23	gatm (ENSOKIG00005034244)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.b	ENSGT00390000006347.a.g.b	ENSGT00940000160333	ENSGT00390000017790	ENSGT01080000257714.b	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000163723.A.e	ENSGT00940000163723.A.f.b	ENSGT01050000244900.a.a.b.eb.h	ENSGT00940000158280.l #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000163460.a.a.c.a.b	ENSGT00940000157938.j.b #22	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422.i	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b.a	ENSGT00940000157324.l	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00390000005764	ENSGT00530000063106.B	ENSGT00940000155333.A.a.i.a	ENSGT00940000154914.vb	ENSGT00940000155836.B.j	ENSGT01030000234532.B.e.b.e
Rainbow trout	MODERN SPECIES	18	ENSOMYG00000048357	ENSOMYG00000051037	ENSOMYG00000030514	galr1b (ENSOMYG00000068843)	ENSOMYG00000034905	ENSOMYG00000077523	ENSOMYG00000068387	ENSOMYG00000072026	atp6v0d1 (ENSOMYG00000062310)	hsd11b2 (ENSOMYG00000035088)	ENSOMYG00000004677 #19	USP50 (ENSOMYG00000004722) #20	ENSOMYG00000051725 #21	ENSOMYG00000076732	ENSOMYG00000065259	hdc (ENSOMYG00000055036) #22	slc27a2a (ENSOMYG00000030348) #23	ENSOMYG00000060174 ##23	gatm (ENSOMYG00000040856)	pde8a (ENSOMYG00000058534)	ENSOMYG00000053548	ENSOMYG00000075465	ENSOMYG00000049883	FSD2 (ENSOMYG00000050212)	WHAMM (ENSOMYG00000067414)	homer2 (ENSOMYG00000000066)	ENSOMYG00000053924	crybgx (ENSOMYG00000049421)	lctla (ENSOMYG00000004788)	tipin (ENSOMYG00000050576)	dis3l (ENSOMYG00000048031)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	106		ENSGT00390000006347.a.g.a	ENSGT00940000160333	ENSGT00390000017790	ENSGT01080000257714.b	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000163723.A.e	ENSGT00940000163723.A.f.b	ENSGT01050000244900.a.a.b.eb.h	ENSGT00940000158280.l #17	ENSGT00550000074952.k #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000163460.a.a.c.a.b	ENSGT00940000157938.j.b #22	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422.i	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b.b	ENSGT00940000157324.l	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00390000005764	ENSGT00530000063106.B	ENSGT01030000234532.B.e.b.e	ENSGT00530000062962.b.a.e	ENSGT00940000155744.t.a	ENSGT00940000156926.d
Coho salmon	MODERN SPECIES	32	cars1 (ENSOKIG00005034427)	ENSOKIG00005036102	PEX16 (ENSOKIG00005036181)	ENSOKIG00005036243	arfgap2 (ENSOKIG00005036260)	ENSOKIG00005036401	ENSOKIG00005036436	ENSOKIG00005036557	ENSOKIG00005037624 #17	LEO1 (ENSOKIG00005037738) #18	mapk6 (ENSOKIG00005037802) #19	USP50 (ENSOKIG00005037824) #20	ENSOKIG00005037888 #21	ENSOKIG00005037954	ENSOKIG00005037965	hdc (ENSOKIG00005038039) #22	ENSOKIG00005039108 ##23	gatm (ENSOKIG00005039835)	pde8a (ENSOKIG00005039876)	ENSOKIG00005040000	ENSOKIG00005040012	FSD2 (ENSOKIG00005040033)	WHAMM (ENSOKIG00005040049)	HOMER2 (ENSOKIG00005040071)	ENSOKIG00005040199	crybgx (ENSOKIG00005040244)	lctla (ENSOKIG00005040258)	ENSOKIG00005040323	dis3l (ENSOKIG00005040437)	rab11a (ENSOKIG00005041589)	ENSOKIG00005041640
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	188												ENSGT00940000154351.yb #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542.e.b #21	ENSGT00940000163460.a.a.c.a.b	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b.o #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a.e ##23	ENSGT00390000011613.t	ENSGT00390000011613.s	ENSGT00940000156422.j	ENSGT00510000047412.b.f	ENSGT00940000158441.f	ENSGT00510000046704.b.b.a.d	ENSGT00940000157324.l	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000165890.a
River trout	DUPLICATION
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River trout	MODERN SPECIES	145												mapk6 (ENSSTUG00000024747) #19	USP50 (ENSSTUG00000024724) #20	ENSSTUG00000024710	ENSSTUG00000024600 #21	hdc (ENSSTUG00000023126) #22	slc27a2a (ENSSTUG00000022965) #23	gatm (ENSSTUG00000022939)	ENSSTUG00000022932	pde8a (ENSSTUG00000022848)	ENSSTUG00000022829	FSD2 (ENSSTUG00000022799)	ENSSTUG00000022791	WHAMM (ENSSTUG00000022766)	HOMER2 (ENSSTUG00000022734)	RAMAC (ENSSTUG00000022713)	gatm (ENSSTUG00000022702)
Atlantic salmon	DUPLICATION
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Atlantic salmon	MODERN SPECIES	18	ENSSSAG00000062476	ENSSSAG00000065651	ENSSSAG00000009760	ENSSSAG00000105914	ENSSSAG00000086985	ENSSSAG00000076581	ENSSSAG00000005625	ENSSSAG00000055518	tmod2 (ENSSSAG00000060985) #17	ENSSSAG00000116709 #18	ENSSSAG00000055469 #19	USP50 (ENSSSAG00000110764) #20	ENSSSAG00000121071 #21	ENSSSAG00000111698	ENSSSAG00000091356	hdc (ENSSSAG00000042330) #22	slc27a2a (ENSSSAG00000122085) #23	s27a2 (ENSSSAG00000115180) ##23	gatm (ENSSSAG00000055493)	pde8a (ENSSSAG00000094947)	ENSSSAG00000073264	ENSSSAG00000095380	WHAMM (ENSSSAG00000110696)	homer2 (ENSSSAG00000098183)	RAMAC (ENSSSAG00000069672)	crybgx (ENSSSAG00000069661)	lctla (ENSSSAG00000043842)	tipin (ENSSSAG00000043439)	dis3l (ENSSSAG00000121052)	ENSSSAG00000092940	RAB11A (ENSSSAG00000062971)
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Goldfish	DUPLICATION
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Golden-line barbel	DUPLICATION
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Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1395													trpm7 (ENSSGRG00000028244)	USP8 (ENSSGRG00000028568) #21	gabpb1 (ENSSGRG00000028570)	hdc (ENSSGRG00000028573) #22	hdc (ENSSGRG00000028574) #22	zgc:158482 (ENSSGRG00000028578)	gatm (ENSSGRG00000028615)	pde8a (ENSSGRG00000028617)	ENSSGRG00000028703	homer2 (ENSSGRG00000028704)	ENSSGRG00000028726
Common carp reference	MODERN SPECIES	9	slc24a5 (ENSCCRG00000008959)	myef2 (ENSCCRG00000061413)	CTXN2 (ENSCCRG00000067222)	FBN1 (ENSCCRG00000046007)	SLC12A1 (ENSCCRG00000072933)	ENSCCRG00000050773	fgf7 (ENSCCRG00000078422)	dtwd1 (ENSCCRG00000017138)	ENSCCRG00000065096	ENSCCRG00000078143	ENSCCRG00000064509	zgc:153317 (ENSCCRG00000038113)	ENSCCRG00000015148	ENSCCRG00000043353	USP8 (ENSCCRG00000074705) #21	hdc (ENSCCRG00000049366) #22	zgc:158482 (ENSCCRG00000031854)	pde8a (ENSCCRG00000069907)	ENSCCRG00000079133	WHAMM (ENSCCRG00000070235)	ENSCCRG00000066171	HDGFL3 (ENSCCRG00000048987)	ENSCCRG00000052235
Zebrafish	MODERN SPECIES	9	ENSDARG00000100044	nedd4a (ENSDARG00000099843)	sdr42e1 (ENSDARG00000098838)	wtip (ENSDARG00000103607)	gpib (ENSDARG00000103826)	ENSDARG00000102796	GARRE1 (ENSDARG00000105288)	ss18l2 (ENSDARG00000101085)	lsm14ab (ENSDARG00000100553)	ENSDARG00000092774	tm2d3 (ENSDARG00000076618)	larp6a (ENSDARG00000005355)	trpm7 (ENSDARG00000036232)	USP8 (ENSDARG00000063719) #21	gabpb1 (ENSDARG00000023659)	hdc (ENSDARG00000075454) #22	slc27a2a (ENSDARG00000036237) #23	zgc:158482 (ENSDARG00000067520)	gatm (ENSDARG00000036239)	pde8a (ENSDARG00000087941)	ENSDARG00000103011	homer2 (ENSDARG00000059349)
Characiphysae	DUPLICATION
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	125	ENSGT00390000018390	ENSGT00950000183158.D.b.f.qb	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938.s #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000157947.a.b	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	128	ENSGT00390000018390	ENSGT00950000183158.D.b.f.qb	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938.s #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000157947.a.b	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	159	ENSGT00390000018390	ENSGT00950000183158.D.b.f.qb	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938.s #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	1847																hdc (ENSPNAG00000012345) #22	slc27a2a (ENSPNAG00000012245) #23
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	614	dtwd1 (ENSAMXG00000036176)	ENSAMXG00000037222	ENSAMXG00000043363	spata5l1 (ENSAMXG00000031455)	zgc:153317 (ENSAMXG00000042391)	slc30a4 (ENSAMXG00000043270)	bloc1s6 (ENSAMXG00000029463)	mibp2 (ENSAMXG00000040660)	ENSAMXG00000035375	SPPL2A (ENSAMXG00000011067)	ENSAMXG00000033315	trpm7 (ENSAMXG00000040086)	ENSAMXG00000038145	USP8 (ENSAMXG00000041256) #21	gabpb1 (ENSAMXG00000039169)	hdc (ENSAMXG00000041840) #22	slc27a2a (ENSAMXG00000033051) #23	pde8a (ENSAMXG00000041948)	gatm (ENSAMXG00000008299)	zgc:158482 (ENSAMXG00000031817)	ENSAMXG00000041106 #23	ENSAMXG00000001167	FSD2 (ENSAMXG00000043145)	ENSAMXG00000034573	homer2 (ENSAMXG00000029601)	ENSAMXG00000040601
Electric eel	MODERN SPECIES	431	FBN1 (ENSEEEG00000023165)	ENSEEEG00000023151	fgf7 (ENSEEEG00000023150)	dtwd1 (ENSEEEG00000023149)	ENSEEEG00000023037	spata5l1 (ENSEEEG00000023028)	ENSEEEG00000023027	slc30a4 (ENSEEEG00000023026)	bloc1s6 (ENSEEEG00000023021)	mibp2 (ENSEEEG00000023020)	ENSEEEG00000023019	SPPL2A (ENSEEEG00000023018)	trpm7 (ENSEEEG00000022730)	USP8 (ENSEEEG00000022668) #21	gabpb1 (ENSEEEG00000022667)	hdc (ENSEEEG00000022665) #22	slc27a2a (ENSEEEG00000022656) #23	ENSEEEG00000022654 #23
Channel catfish	MODERN SPECIES	23	leo1 (ENSIPUG00000018066) #18	dmxl2 (ENSIPUG00000017769) #11	gldn (ENSIPUG00000017758) #12	cyp19a1a (ENSIPUG00000017676) #13	ENSIPUG00000017656	ENSIPUG00000017632	ENSIPUG00000017615	ENSIPUG00000017604	ENSIPUG00000017575	mibp2 (ENSIPUG00000017560)	cdc42se2 (ENSIPUG00000017541)	sppl2a (ENSIPUG00000017501)	trpm7 (ENSIPUG00000017419)	USP8 (ENSIPUG00000017369) #21	gabpb1 (ENSIPUG00000017273)	hdc (ENSIPUG00000017191) #22	SLC27A2 (ENSIPUG00000017159) #23	ENSIPUG00000017141 #23	ENSIPUG00000017134	pde8a (ENSIPUG00000017054)	ENSIPUG00000017011	fsd2 (ENSIPUG00000017001)	ENSIPUG00000016990	homer2 (ENSIPUG00000016976)	ENSIPUG00000016949	tm6sf1 (ENSIPUG00000016918)	HDGFL3 (ENSIPUG00000016897)	BNC1 (ENSIPUG00000016867)	ENSIPUG00000016852	ENSIPUG00000016841	ENSIPUG00000016833
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157938.t #22
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157938.t #22
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157938.t #22
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	1126													trpm7 (ENSPNAG00000025651)	USP8 (ENSPNAG00000006058) #21	gabpb1 (ENSPNAG00000005201)	ENSPNAG00000025820 #22
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	13					ENSGT00940000159843.a	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101.a	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545.b	ENSGT00940000159842.wc	ENSGT00940000157091.i	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875.a	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422.a	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324.a	ENSGT00390000010463.b	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00390000005844.a.a.d.a	ENSGT00940000157398.i.a	ENSGT01090000260005.a.b.b	ENSGT00940000159206.b	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143.bb.b
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	2	SHC4 (ENSSFOG00015013320)	SECISBP2L (ENSSFOG00015013377)	cops2 (ENSSFOG00015013490)	FGF7 (ENSSFOG00015013548)	dtwd1 (ENSSFOG00015013665)	ENSSFOG00015013602	ATP8B4 (ENSSFOG00015013706)	spata5l1 (ENSSFOG00015013907)	ENSSFOG00015029255	slc30a4 (ENSSFOG00015013936)	NMRK2 (ENSSFOG00015013954)	ENSSFOG00015013971	trpm7 (ENSSFOG00015014022)	USP8 (ENSSFOG00015014211) #21	gabpb1 (ENSSFOG00015014308)	hdc (ENSSFOG00015014342) #22	slc27a2a (ENSSFOG00015014467) #23	SLC27A2 (ENSSFOG00015015329)	gatm (ENSSFOG00015015354)	pde8a (ENSSFOG00015015418)	ENSSFOG00015015618	WHAMM (ENSSFOG00015015669)	HOMER2 (ENSSFOG00015015742)	ENSSFOG00015027901	TM6SF1 (ENSSFOG00015015912)	BNC1 (ENSSFOG00015015932)	sh3gl3a (ENSSFOG00015015962)	gjd6 (ENSSFOG00015016045)	MARCHF3 (ENSSFOG00015016056)	lmnl3 (ENSSFOG00015016091)	ADAMTSL3 (ENSSFOG00015016182)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	14	SECISBP2L (ENSPKIG00000020244)	cops2 (ENSPKIG00000020180)	FGF7 (ENSPKIG00000020156)	dtwd1 (ENSPKIG00000020145)	ENSPKIG00000020109	ATP8B4 (ENSPKIG00000020020)	spata5l1 (ENSPKIG00000019971)	zgc:153317 (ENSPKIG00000019958)	slc30a4 (ENSPKIG00000019931)	NMRK2 (ENSPKIG00000019908)	ENSPKIG00000019883	trpm7 (ENSPKIG00000019818)	USP8 (ENSPKIG00000019742) #21	gabpb1 (ENSPKIG00000019705)	ENSPKIG00000019693	hdc (ENSPKIG00000019642) #22	ENSPKIG00000019612 #23	ENSPKIG00000019594 ##23	gatm (ENSPKIG00000019560)	pde8a (ENSPKIG00000019448)	ENSPKIG00000019387	WHAMM (ENSPKIG00000019349)	HOMER2 (ENSPKIG00000019278)	ENSPKIG00000019209	TM6SF1 (ENSPKIG00000019182)	BNC1 (ENSPKIG00000019153)	sh3gl3a (ENSPKIG00000019090)	gjd6 (ENSPKIG00000019048)	ENSPKIG00000018976	lmnl3 (ENSPKIG00000018883)	ENSPKIG00000018838