Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES	254															ENSGT00940000156794	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000157947
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	120				ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000158245	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000157947	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000166711	ENSGT00520000055647.b	ENSGT00940000160462	ENSGT00940000158710	ENSGT00390000010440	ENSGT00940000177451	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000168316	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00390000010440	ENSGT00940000177451	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000168316	ENSGT00940000164795	ENSGT00390000010463.b	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00990000205468	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00390000010463.b	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00990000205468	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00390000010463.b	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000169841	ENSGT00990000205468	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398.i.a	ENSGT01090000260005.a.b.b
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	51	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398.i.a	ENSGT01090000260005.a.b.b
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	105	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	849					dmxl2 (ENSSPAG00000008964) #11	gldn (ENSSPAG00000008919) #12	cyp19a1a (ENSSPAG00000008892) #13	tnfaip8l3 (ENSSPAG00000008878) #14	scg3 (ENSSPAG00000008854) #15	lysmd2 (ENSSPAG00000008840) #16	tmod2 (ENSSPAG00000008794) #17	leo1 (ENSSPAG00000008739) #18	mapk6 (ENSSPAG00000008669) #19	USP50 (ENSSPAG00000008639) #20	USP8 (ENSSPAG00000008544) #21	hdc (ENSSPAG00000008510) #22	slc27a2a (ENSSPAG00000008401) #23
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	88	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23
Orange clownfish	MODERN SPECIES		BTBD1 (ENSAPEG00000024697)	RAMAC (ENSAPEG00000024710)	homer2 (ENSAPEG00000024715)	WHAMM (ENSAPEG00000024724)	FSD2 (ENSAPEG00000024731)	ENSAPEG00000024734	pde8a (ENSAPEG00000024753)	gatm (ENSAPEG00000024762)	ENSAPEG00000024763 ##23	gatm (ENSAPEG00000024765)	ENSAPEG00000024767 ##23	leo1 (ENSAPEG00000024770) #18	mapk6 (ENSAPEG00000024774) #19	USP50 (ENSAPEG00000024776) #20	USP8 (ENSAPEG00000024777) #21	hdc (ENSAPEG00000024785) #22	slc27a2a (ENSAPEG00000024790) #23	ENSAPEG00000024794	tmod2 (ENSAPEG00000024798) #17	lysmd2 (ENSAPEG00000024802) #16	scg3 (ENSAPEG00000024804) #15	tnfaip8l3 (ENSAPEG00000024806) #14	cyp19a1a (ENSAPEG00000024822) #13	gldn (ENSAPEG00000024829) #12	dmxl2 (ENSAPEG00000024830) #11	sema6dl (ENSAPEG00000024831)	ENSAPEG00000024832	slc24a5 (ENSAPEG00000024833)	myef2 (ENSAPEG00000024834)	CTXN2 (ENSAPEG00000024835)	SLC12A1 (ENSAPEG00000024836)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1658								tnfaip8l3 (ENSAOCG00000010960) #14	scg3 (ENSAOCG00000010977) #15	lysmd2 (ENSAOCG00000010986) #16	tmod2 (ENSAOCG00000011016) #17	leo1 (ENSAOCG00000011059) #18	mapk6 (ENSAOCG00000011125) #19	USP50 (ENSAOCG00000011162) #20	USP8 (ENSAOCG00000011268) #21	hdc (ENSAOCG00000011328) #22	slc27a2a (ENSAOCG00000011372) #23	ENSAOCG00000011392
Spiny chromis	MODERN SPECIES	15	pdzk1 (ENSAPOG00000005635)	GPR89B (ENSAPOG00000005612)	zgc:113337 (ENSAPOG00000005542)	ENSAPOG00000005500	ENSAPOG00000005476	CFAP91 (ENSAPOG00000005434)	nr1i2 (ENSAPOG00000005425)	gsk3ba (ENSAPOG00000005406)	GPR156 (ENSAPOG00000005361)	LRRC58 (ENSAPOG00000005325)	fstl1b (ENSAPOG00000005305)	ENSAPOG00000005255	gja8a (ENSAPOG00000005225)	USP50 (ENSAPOG00000005219) #20	USP8 (ENSAPOG00000005184) #21	hdc (ENSAPOG00000005147) #22	slc27a2a (ENSAPOG00000005081) #23	ENSAPOG00000005065	gatm (ENSAPOG00000005045)	pde8a (ENSAPOG00000004983)	ENSAPOG00000004907	FSD2 (ENSAPOG00000004867)	WHAMM (ENSAPOG00000004852)	HOMER2 (ENSAPOG00000004827)	RAMAC (ENSAPOG00000004796)	BTBD1 (ENSAPOG00000004778)	TM6SF1 (ENSAPOG00000004747)	ENSAPOG00000004712	ap1s2 (ENSAPOG00000000114)	PHKA2 (ENSAPOG00000004565)	ppef1 (ENSAPOG00000004359)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Midas cichlid	DUPLICATION
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Midas cichlid	MODERN SPECIES	149												mapk6 (ENSACIG00000003997) #19	USP50 (ENSACIG00000004035) #20	USP8 (ENSACIG00000004085) #21	hdc (ENSACIG00000004200) #22	hdc (ENSACIG00000004236) #22	slc27a2a (ENSACIG00000004265) #23	ENSACIG00000004289 ##23	gatm (ENSACIG00000004325)	pde8a (ENSACIG00000004340)	FSD2 (ENSACIG00000004423)	WHAMM (ENSACIG00000004489)	homer2 (ENSACIG00000004517)	ENSACIG00000004536	BTBD1 (ENSACIG00000004540)	TM6SF1 (ENSACIG00000004562)	ENSACIG00000004601	ap1s2 (ENSACIG00000004677)	PHKA2 (ENSACIG00000004689)	ppef1 (ENSACIG00000004747)	ENSACIG00000004788
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b.v #23	ENSGT00940000164068.a.b.b.u #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	924					dmxl2 (ENSHBUG00000009859) #11	gldn (ENSHBUG00000009686) #12	cyp19a1a (ENSHBUG00000009666) #13	tnfaip8l3 (ENSHBUG00000009641) #14	scg3 (ENSHBUG00000009628) #15	lysmd2 (ENSHBUG00000009617) #16	tmod2 (ENSHBUG00000009604) #17	leo1 (ENSHBUG00000009559) #18	mapk6 (ENSHBUG00000009545) #19	ENSHBUG00000009538 #20	USP8 (ENSHBUG00000009524) #21	hdc (ENSHBUG00000009464) #22	slc27a2a (ENSHBUG00000009422) #23	slc27a2a (ENSHBUG00000009398) #23
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000164068.a.b.b.v #23	ENSGT00940000164068.a.b.b.u #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a
P. nyererei	MODERN SPECIES	479	myef2 (ENSPNYG00000010879)	slc24a5 (ENSPNYG00000010946)	ENSPNYG00000010969	sema6dl (ENSPNYG00000010980)	dmxl2 (ENSPNYG00000011039) #11	gldn (ENSPNYG00000011228) #12	cyp19a1a (ENSPNYG00000011284) #13	tnfaip8l3 (ENSPNYG00000011309) #14	scg3 (ENSPNYG00000011317) #15	lysmd2 (ENSPNYG00000011344) #16	tmod2 (ENSPNYG00000011358) #17	leo1 (ENSPNYG00000011401) #18	mapk6 (ENSPNYG00000011430) #19	USP50 (ENSPNYG00000011444) #20	USP8 (ENSPNYG00000011489) #21	hdc (ENSPNYG00000011557) #22	ENSPNYG00000011707
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b.v #23	ENSGT00940000164068.a.b.b.u #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Eastern happy	MODERN SPECIES		myef2 (ENSACLG00000017421)	slc24a5 (ENSACLG00000017757)	ENSACLG00000017790	sema6dl (ENSACLG00000017894)	dmxl2 (ENSACLG00000018247) #11	gldn (ENSACLG00000018741) #12	cyp19a1a (ENSACLG00000018805) #13	tnfaip8l3 (ENSACLG00000018837) #14	scg3 (ENSACLG00000018841) #15	lysmd2 (ENSACLG00000018861) #16	tmod2 (ENSACLG00000018873) #17	leo1 (ENSACLG00000018946) #18	mapk6 (ENSACLG00000018989) #19	ENSACLG00000018995 #20	USP8 (ENSACLG00000019006) #21	hdc (ENSACLG00000019048) #22	slc27a2a (ENSACLG00000019098) #23	slc27a2a (ENSACLG00000019112) #23	ENSACLG00000019129 ##23	gatm (ENSACLG00000019193)	pde8a (ENSACLG00000019234)	ENSACLG00000019348	FSD2 (ENSACLG00000019390)	WHAMM (ENSACLG00000019425)	homer2 (ENSACLG00000019478)	ENSACLG00000019516	BTBD1 (ENSACLG00000019537)	TM6SF1 (ENSACLG00000019609)	ZRSR2 (ENSACLG00000019635)	ap1s2 (ENSACLG00000019778)	PHKA2 (ENSACLG00000019794)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1091	SLC12A1 (ENSMZEG00005007840)	dut (ENSMZEG00005007493)	FBN1 (ENSMZEG00005007376)	dmxl2 (ENSMZEG00005007258) #11	gldn (ENSMZEG00005007223) #12	cyp19a1a (ENSMZEG00005007207) #13	tnfaip8l3 (ENSMZEG00005007197) #14	scg3 (ENSMZEG00005007186) #15	lysmd2 (ENSMZEG00005007166) #16	tmod2 (ENSMZEG00005007119) #17	leo1 (ENSMZEG00005007090) #18	ENSMZEG00005007074	mapk6 (ENSMZEG00005007063) #19	USP50 (ENSMZEG00005007047) #20	USP8 (ENSMZEG00005006937) #21	hdc (ENSMZEG00005006893) #22	slc27a2a (ENSMZEG00005006850) #23	ENSMZEG00005006825	slc27a2a (ENSMZEG00005006791) #23	ENSMZEG00005006764 ##23	gatm (ENSMZEG00005006734)	pde8a (ENSMZEG00005006720)	ENSMZEG00005006674	FSD2 (ENSMZEG00005006662)	WHAMM (ENSMZEG00005006649)	homer2 (ENSMZEG00005006626)	RAMAC (ENSMZEG00005006611)	BTBD1 (ENSMZEG00005006580)	TM6SF1 (ENSMZEG00005006541)	ZRSR2 (ENSMZEG00005006531)	ap1s2 (ENSMZEG00005006513)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	320	myef2 (ENSNBRG00000023602)	slc24a5 (ENSNBRG00000023639)	ENSNBRG00000023648	sema6dl (ENSNBRG00000023681)	dmxl2 (ENSNBRG00000023751) #11	gldn (ENSNBRG00000023805) #12	cyp19a1a (ENSNBRG00000023814) #13	tnfaip8l3 (ENSNBRG00000023823) #14	scg3 (ENSNBRG00000023830) #15	lysmd2 (ENSNBRG00000023840) #16	tmod2 (ENSNBRG00000023847) #17	leo1 (ENSNBRG00000023860) #18	mapk6 (ENSNBRG00000023878) #19	USP50 (ENSNBRG00000023890) #20	USP8 (ENSNBRG00000023918) #21	hdc (ENSNBRG00000023952) #22	slc27a2a (ENSNBRG00000023957) #23
Nile tilapia	MODERN SPECIES		ENSONIG00000030175	slc24a5 (ENSONIG00000037887)	ENSONIG00000032500	sema6dl (ENSONIG00000033002)	dmxl2 (ENSONIG00000000145) #11	gldn (ENSONIG00000000153) #12	cyp19a1a (ENSONIG00000000155) #13	tnfaip8l3 (ENSONIG00000041467) #14	scg3 (ENSONIG00000000167) #15	lysmd2 (ENSONIG00000000172) #16	tmod2 (ENSONIG00000000174) #17	leo1 (ENSONIG00000000176) #18	mapk6 (ENSONIG00000000180) #19	ENSONIG00000000183 #20	USP8 (ENSONIG00000000185) #21	hdc (ENSONIG00000000190) #22	slc27a2a (ENSONIG00000030469) #23	slc27a2a (ENSONIG00000034343) #23	slc27a2a (ENSONIG00000015562) #23	ENSONIG00000036671	ENSONIG00000000192 ##23	gatm (ENSONIG00000000198)	pde8a (ENSONIG00000000200)	ENSONIG00000000206	ENSONIG00000038956	WHAMM (ENSONIG00000000209)	homer2 (ENSONIG00000000214)	RAMAC (ENSONIG00000041300)	BTBD1 (ENSONIG00000000221)	TM6SF1 (ENSONIG00000000225)	ZRSR2 (ENSONIG00000000228)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	48													ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441.l #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1616	ENSNFUG00015012019	FBN1 (ENSNFUG00015012042)	DUT (ENSNFUG00015012340)	SLC12A1 (ENSNFUG00015012441)	CTXN2 (ENSNFUG00015014721)	myef2 (ENSNFUG00015014748)	slc24a5 (ENSNFUG00015014791)	RNF128 (ENSNFUG00015014983)	SEMA6DL (ENSNFUG00015015127)	ENSNFUG00015016858	dmxl2 (ENSNFUG00015017061) #11	ENSNFUG00015021737	MAPK6 (ENSNFUG00015021741) #19	USP50 (ENSNFUG00015021748) #20	USP8 (ENSNFUG00015021753) #21	hdc (ENSNFUG00015021763) #22	slc27a2a (ENSNFUG00015021794) #23	ENSNFUG00015021824 ##23	gatm (ENSNFUG00015021982)	PDE8A (ENSNFUG00015022081)	ENSNFUG00015023174	ENSNFUG00015023176	Nfu_g_1_003224 (ENSNFUG00015023178)	ENSNFUG00015023181	WHAMM (ENSNFUG00015023184)	HOMER2 (ENSNFUG00015023189)	RAMAC (ENSNFUG00015023200)	BTBD1 (ENSNFUG00015023206)	TM6SF1 (ENSNFUG00015023230)	ENSNFUG00015023245	AP1S2 (ENSNFUG00015023257)
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	775													mapk6 (ENSKMAG00000015751) #19	ENSKMAG00000015714 #20	USP8 (ENSKMAG00000015687) #21	hdc (ENSKMAG00000015592) #22	ENSKMAG00000015559
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a.f #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a.f #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	77				ENSGT00390000000096.b.a.f #11	ENSGT00940000158020.d.e #12	ENSGT00940000158020.d.f #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Sailfin molly	MODERN SPECIES	487													mapk6 (ENSPLAG00000019155) #19	USP50 (ENSPLAG00000019177) #20	USP8 (ENSPLAG00000019236) #21	hdc (ENSPLAG00000019292) #22	slc27a2a (ENSPLAG00000019388) #23	ENSPLAG00000019398 ##23	gatm (ENSPLAG00000019428)	pde8a (ENSPLAG00000019501)	ENSPLAG00000019561	FSD2 (ENSPLAG00000019746)	WHAMM (ENSPLAG00000019767)	HOMER2 (ENSPLAG00000019823)	RAMAC (ENSPLAG00000019830)	BTBD1 (ENSPLAG00000019856)	TM6SF1 (ENSPLAG00000019860)	ZRSR2 (ENSPLAG00000019869)	ap1s2 (ENSPLAG00000000641)	PHKA2 (ENSPLAG00000019960)	ppef1 (ENSPLAG00000020021)
Amazon molly	MODERN SPECIES	363		dmxl2 (ENSPFOG00000017973) #11	gldn (ENSPFOG00000024041) #12	ENSPFOG00000022115 #11	gldn (ENSPFOG00000017909) #12	cyp19a1a (ENSPFOG00000017864) #13	tnfaip8l3 (ENSPFOG00000020850) #14	tnfaip8l3 (ENSPFOG00000020849) #14	scg3 (ENSPFOG00000017829) #15	lysmd2 (ENSPFOG00000017823) #16	tmod2 (ENSPFOG00000017790) #17	leo1 (ENSPFOG00000017762) #18	mapk6 (ENSPFOG00000017732) #19	ENSPFOG00000024374 #20	USP8 (ENSPFOG00000017705) #21	hdc (ENSPFOG00000017675) #22	slc27a2a (ENSPFOG00000017641) #23	ENSPFOG00000017620 ##23	gatm (ENSPFOG00000017592)	pde8a (ENSPFOG00000017477)	ENSPFOG00000017459	FSD2 (ENSPFOG00000017446)	WHAMM (ENSPFOG00000017430)	homer2 (ENSPFOG00000017423)	HOMER2 (ENSPFOG00000017369)	RAMAC (ENSPFOG00000017361)	BTBD1 (ENSPFOG00000017331)	TM6SF1 (ENSPFOG00000017318)	ZRSR2 (ENSPFOG00000017288)	ap1s2 (ENSPFOG00000017274)	PHKA2 (ENSPFOG00000017142)
Guppy	MODERN SPECIES	455	myef2 (ENSPREG00000010801)	slc24a5 (ENSPREG00000011000)	ENSPREG00000011029	sema6dl (ENSPREG00000011050)	dmxl2 (ENSPREG00000011194) #11	gldn (ENSPREG00000011547) #12	cyp19a1a (ENSPREG00000012213) #13	tnfaip8l3 (ENSPREG00000018651) #14	scg3 (ENSPREG00000018659) #15	lysmd2 (ENSPREG00000018677) #16	tmod2 (ENSPREG00000018693) #17	leo1 (ENSPREG00000018743) #18	mapk6 (ENSPREG00000018774) #19	USP50 (ENSPREG00000018791) #20	USP8 (ENSPREG00000018813) #21	hdc (ENSPREG00000018872) #22	slc27a2a (ENSPREG00000018896) #23	ENSPREG00000018911	ENSPREG00000018922 ##23	gatm (ENSPREG00000018938)	pde8a (ENSPREG00000018974)	FSD2 (ENSPREG00000019086)	WHAMM (ENSPREG00000019100)	HOMER2 (ENSPREG00000019120)	ENSPREG00000019136	BTBD1 (ENSPREG00000019151)	TM6SF1 (ENSPREG00000019184)	ZRSR2 (ENSPREG00000019201)	ap1s2 (ENSPREG00000019224)	PHKA2 (ENSPREG00000019259)	ppef1 (ENSPREG00000019419)
Platyfish	MODERN SPECIES	18	myef2 (ENSXMAG00000016686)	slc24a5 (ENSXMAG00000016727)	ENSXMAG00000020048	sema6dl (ENSXMAG00000002234)	dmxl2 (ENSXMAG00000002209) #11	gldn (ENSXMAG00000002203) #12	cyp19a1a (ENSXMAG00000002192) #13	tnfaip8l3 (ENSXMAG00000002189) #14	scg3 (ENSXMAG00000002179) #15	lysmd2 (ENSXMAG00000027022) #16	tmod2 (ENSXMAG00000002168) #17	leo1 (ENSXMAG00000002158) #18	mapk6 (ENSXMAG00000002154) #19	USP50 (ENSXMAG00000002152) #20	USP8 (ENSXMAG00000002148) #21	hdc (ENSXMAG00000024575) #22	slc27a2a (ENSXMAG00000002117) #23	ENSXMAG00000002111 ##23	gatm (ENSXMAG00000002105)	pde8a (ENSXMAG00000002082)	ENSXMAG00000022313	ENSXMAG00000029722	FSD2 (ENSXMAG00000002076)	WHAMM (ENSXMAG00000002066)	HOMER2 (ENSXMAG00000002059)	RAMAC (ENSXMAG00000015208)	BTBD1 (ENSXMAG00000015211)	TM6SF1 (ENSXMAG00000015231)	ZRSR2 (ENSXMAG00000015258)	ap1s2 (ENSXMAG00000015858)	PHKA2 (ENSXMAG00000002032)
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Mummichog	MODERN SPECIES	421					dmxl2 (ENSFHEG00000008267) #11	gldn (ENSFHEG00000008159) #12	cyp19a1a (ENSFHEG00000008132) #13	tnfaip8l3 (ENSFHEG00000008048) #14	scg3 (ENSFHEG00000008043) #15	lysmd2 (ENSFHEG00000008031) #16	tmod2 (ENSFHEG00000008019) #17	leo1 (ENSFHEG00000007981) #18	mapk6 (ENSFHEG00000007971) #19	USP50 (ENSFHEG00000007950) #20	USP8 (ENSFHEG00000007910) #21	hdc (ENSFHEG00000007888) #22	slc27a2a (ENSFHEG00000007856) #23	ENSFHEG00000007841 ##23	gatm (ENSFHEG00000007791)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	234	slc24a5 (ENSCVAG00000010829)	ENSCVAG00000010837	sema6dl (ENSCVAG00000011031)	ENSCVAG00000011053	dmxl2 (ENSCVAG00000011203) #11	gldn (ENSCVAG00000011216) #12	cyp19a1a (ENSCVAG00000011244) #13	tnfaip8l3 (ENSCVAG00000011253) #14	scg3 (ENSCVAG00000011399) #15	lysmd2 (ENSCVAG00000011412) #16	tmod2 (ENSCVAG00000011453) #17	leo1 (ENSCVAG00000011488) #18	mapk6 (ENSCVAG00000011499) #19	USP50 (ENSCVAG00000011525) #20	USP8 (ENSCVAG00000011538) #21	hdc (ENSCVAG00000011565) #22	slc27a2a (ENSCVAG00000011574) #23	ENSCVAG00000011603 ##23	gatm (ENSCVAG00000011627)	pde8a (ENSCVAG00000011637)	ENSCVAG00000011650	FSD2 (ENSCVAG00000011667)	WHAMM (ENSCVAG00000011675)	HOMER2 (ENSCVAG00000011709)	RAMAC (ENSCVAG00000011717)	BTBD1 (ENSCVAG00000011742)	paqr5a (ENSCVAG00000011779)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Indian medaka	MODERN SPECIES	26	myef2 (ENSOMEG00000010072)	slc24a5 (ENSOMEG00000010143)	ENSOMEG00000010170	sema6dl (ENSOMEG00000000246)	dmxl2 (ENSOMEG00000000249) #11	gldn (ENSOMEG00000010517) #12	cyp19a1a (ENSOMEG00000010567) #13	tnfaip8l3 (ENSOMEG00000010579) #14	scg3 (ENSOMEG00000010616) #15	lysmd2 (ENSOMEG00000010630) #16	tmod2 (ENSOMEG00000010680) #17	leo1 (ENSOMEG00000010732) #18	mapk6 (ENSOMEG00000010774) #19	USP50 (ENSOMEG00000010801) #20	USP8 (ENSOMEG00000010929) #21	hdc (ENSOMEG00000011031) #22	slc27a2a (ENSOMEG00000011076) #23	ENSOMEG00000011120 ##23	gatm (ENSOMEG00000011167)	pde8a (ENSOMEG00000011337)	ENSOMEG00000000695	FSD2 (ENSOMEG00000011485)	WHAMM (ENSOMEG00000011562)	HOMER2 (ENSOMEG00000011626)	RAMAC (ENSOMEG00000011658)	BTBD1 (ENSOMEG00000011710)	TM6SF1 (ENSOMEG00000011787)	ZRSR2 (ENSOMEG00000011857)	ap1s2 (ENSOMEG00000011899)	PHKA2 (ENSOMEG00000012081)	ENSOMEG00000012119
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	17	FBN1 (ENSOJAG00000020999)	dut (ENSOJAG00000021291)	SLC12A1 (ENSOJAG00000021409)	myef2 (ENSOJAG00000022384)	slc24a5 (ENSOJAG00000000119)	sema6dl (ENSOJAG00000000388)	gldn (ENSOJAG00000000624) #12	tnfaip8l3 (ENSOJAG00000000632) #14	scg3 (ENSOJAG00000000637) #15	lysmd2 (ENSOJAG00000000648) #16	leo1 (ENSOJAG00000000660) #18	tmod2 (ENSOJAG00000000678) #17	mapk6 (ENSOJAG00000000712) #19	USP50 (ENSOJAG00000000736) #20	USP8 (ENSOJAG00000000766) #21	hdc (ENSOJAG00000000791) #22	slc27a2a (ENSOJAG00000000805) #23	ENSOJAG00000000811	ENSOJAG00000000814 ##23	gatm (ENSOJAG00000000821)	pde8a (ENSOJAG00000001062)	ENSOJAG00000001570	ENSOJAG00000001600	WHAMM (ENSOJAG00000001609)	HOMER2 (ENSOJAG00000001631)	ENSOJAG00000001683	BTBD1 (ENSOJAG00000001731)	TM6SF1 (ENSOJAG00000001807)	ENSOJAG00000001816	ENSOJAG00000001827	ap1s2 (ENSOJAG00000001842)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	17	ENSORLG00000002764	sema6dl (ENSORLG00000002823)	dmxl2 (ENSORLG00000002886) #11	ENSORLG00000025494	gldn (ENSORLG00000002908) #12	cyp19a1a (ENSORLG00000002949) #13	tnfaip8l3 (ENSORLG00000027022) #14	scg3 (ENSORLG00000002989) #15	lysmd2 (ENSORLG00000026773) #16	ENSORLG00000029392	tmod2 (ENSORLG00000003045) #17	leo1 (ENSORLG00000003064) #18	mapk6 (ENSORLG00000003082) #19	ENSORLG00000003094 #20	USP8 (ENSORLG00000003140) #21	hdc (ENSORLG00000003155) #22	slc27a2a (ENSORLG00000003164) #23	ENSORLG00000003218 ##23	gatm (ENSORLG00000003253)	pde8a (ENSORLG00000003332)	ENSORLG00000003341	FSD2 (ENSORLG00000003348)	WHAMM (ENSORLG00000003364)	homer2 (ENSORLG00000003402)	ENSORLG00000003414	BTBD1 (ENSORLG00000003434)	TM6SF1 (ENSORLG00000003460)	ZRSR2 (ENSORLG00000003476)	ap1s2 (ENSORLG00000024796)	PHKA2 (ENSORLG00000003555)	ppef1 (ENSORLG00000003571)
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Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000166817	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	17	cdkl5 (ENSMAMG00000010484)	ENSMAMG00000010639	ppef1 (ENSMAMG00000010651)	PHKA2 (ENSMAMG00000010670)	ENSMAMG00000010759	ENSMAMG00000010779	TM6SF1 (ENSMAMG00000010807)	BTBD1 (ENSMAMG00000010819)	RAMAC (ENSMAMG00000010845)	homer2 (ENSMAMG00000010853)	WHAMM (ENSMAMG00000010873)	FSD2 (ENSMAMG00000010882)	ENSMAMG00000010931	pde8a (ENSMAMG00000010958)	gatm (ENSMAMG00000010991)	ENSMAMG00000011023 #22	ENSMAMG00000011048 #23	ENSMAMG00000011066 ##23	ENSMAMG00000011073 #21	ENSMAMG00000011122 #20	mapk6 (ENSMAMG00000011149) #19	leo1 (ENSMAMG00000011168) #18	tmod2 (ENSMAMG00000011188) #17	lysmd2 (ENSMAMG00000011220) #16	scg3 (ENSMAMG00000011230) #15	tnfaip8l3 (ENSMAMG00000025301) #14	cyp19a1a (ENSMAMG00000011245) #13	gldn (ENSMAMG00000011254) #12	dmxl2 (ENSMAMG00000011273) #11	ENSMAMG00000011368	sema6dl (ENSMAMG00000011398)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	14					dmxl2 (ENSBSLG00000004472) #11	gldn (ENSBSLG00000004340) #12	cyp19a1a (ENSBSLG00000004284) #13	tnfaip8l3 (ENSBSLG00000004280) #14	scg3 (ENSBSLG00000004273) #15	lysmd2 (ENSBSLG00000004267) #16	tmod2 (ENSBSLG00000004212) #17	leo1 (ENSBSLG00000004159) #18	mapk6 (ENSBSLG00000004144) #19	USP50 (ENSBSLG00000004132) #20	USP8 (ENSBSLG00000003855) #21	hdc (ENSBSLG00000003221) #22	slc27a2a (ENSBSLG00000003205) #23	ENSBSLG00000003193 ##23	gatm (ENSBSLG00000003189)	pde8a (ENSBSLG00000002693)	ENSBSLG00000002349	ENSBSLG00000002313	WHAMM (ENSBSLG00000002284)	homer2 (ENSBSLG00000002210)	RAMAC (ENSBSLG00000001912)	BTBD1 (ENSBSLG00000001833)	TM6SF1 (ENSBSLG00000001823)	ZRSR2 (ENSBSLG00000001814)	ap1s2 (ENSBSLG00000001793)	ENSBSLG00000001788	PHKA2 (ENSBSLG00000001403)
Climbing perch	MODERN SPECIES	16	myef2 (ENSATEG00000017892)	slc24a5 (ENSATEG00000017821)	ENSATEG00000017812	sema6dl (ENSATEG00000017659)	dmxl2 (ENSATEG00000017438) #11	gldn (ENSATEG00000017422) #12	cyp19a1a (ENSATEG00000017392) #13	tnfaip8l3 (ENSATEG00000017365) #14	scg3 (ENSATEG00000017352) #15	lysmd2 (ENSATEG00000017347) #16	tmod2 (ENSATEG00000017316) #17	ENSATEG00000017300	mapk6 (ENSATEG00000017234) #19	USP50 (ENSATEG00000017201) #20	ENSATEG00000017188 #21	hdc (ENSATEG00000017150) #22	slc27a2a (ENSATEG00000017134) #23	ENSATEG00000017088 ##23	gatm (ENSATEG00000017058)	pde8a (ENSATEG00000016933)	ENSATEG00000025699	ENSATEG00000016862	WHAMM (ENSATEG00000016846)	homer2 (ENSATEG00000016830)	RAMAC (ENSATEG00000016819)	BTBD1 (ENSATEG00000016780)	TM6SF1 (ENSATEG00000016763)	ENSATEG00000025875	ENSATEG00000016735	ENSATEG00000016521	ENSATEG00000016469
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Turbot	MODERN SPECIES	17	myef2 (ENSSMAG00000021279)	slc24a5 (ENSSMAG00000021278)	ENSSMAG00000021277	sema6dl (ENSSMAG00000021276)	dmxl2 (ENSSMAG00000021275) #11	gldn (ENSSMAG00000021274) #12	cyp19a1a (ENSSMAG00000014538) #13	tnfaip8l3 (ENSSMAG00000036688) #14	scg3 (ENSSMAG00000014287) #15	lysmd2 (ENSSMAG00000014268) #16	tmod2 (ENSSMAG00000014241) #17	leo1 (ENSSMAG00000014228) #18	mapk6 (ENSSMAG00000014205) #19	ENSSMAG00000014197 #20	ENSSMAG00000014186 #21	hdc (ENSSMAG00000014150) #22	slc27a2a (ENSSMAG00000014132) #23	ENSSMAG00000014127 ##23	gatm (ENSSMAG00000014093)	pde8a (ENSSMAG00000014068)	ENSSMAG00000013994	FSD2 (ENSSMAG00000013983)	WHAMM (ENSSMAG00000013975)	homer2 (ENSSMAG00000013939)	ENSSMAG00000013934	BTBD1 (ENSSMAG00000013911)	TM6SF1 (ENSSMAG00000013892)	ENSSMAG00000013874	ENSSMAG00000025910	ENSSMAG00000013858	PHKA2 (ENSSMAG00000013655)
Tongue sole	MODERN SPECIES	15	ENSCSEG00000012628	slc39a1 (ENSCSEG00000012617)	tmem208 (ENSCSEG00000012613)	SMAD6 (ENSCSEG00000012602)	SMAD3 (ENSCSEG00000012585)	map2k5 (ENSCSEG00000012573)	ccnd1 (ENSCSEG00000012564)	vstm2b (ENSCSEG00000012557)	scg3 (ENSCSEG00000012546) #15	lysmd2 (ENSCSEG00000012539) #16	tmod2 (ENSCSEG00000012523) #17	leo1 (ENSCSEG00000012502) #18	mapk6 (ENSCSEG00000012488) #19	ENSCSEG00000012481 #20	USP8 (ENSCSEG00000012449) #21	hdc (ENSCSEG00000010006) #22	slc27a2a (ENSCSEG00000009981) #23	gatm (ENSCSEG00000009953)	pde8a (ENSCSEG00000009892)	ENSCSEG00000009860	FSD2 (ENSCSEG00000009849)	homer2 (ENSCSEG00000009815)	RAMAC (ENSCSEG00000009800)	ENSCSEG00000009786	BTBD1 (ENSCSEG00000009763)	TM6SF1 (ENSCSEG00000009726)	ZRSR2 (ENSCSEG00000009682)	ap1s2 (ENSCSEG00000009663)	PHKA2 (ENSCSEG00000009624)	ppef1 (ENSCSEG00000009602)	ENSCSEG00000009585
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT01000000220501	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	30					ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000157369.b
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2798					dmxl2 (ENSSLDG00000011135) #11	gldn (ENSSLDG00000011076) #12	cyp19a1a (ENSSLDG00000011037) #13	tnfaip8l3 (ENSSLDG00000011020) #14	scg3 (ENSSLDG00000010953) #15	lysmd2 (ENSSLDG00000010930) #16	tmod2 (ENSSLDG00000010883) #17	leo1 (ENSSLDG00000010803) #18	mapk6 (ENSSLDG00000010745) #19	USP50 (ENSSLDG00000010708) #20	USP8 (ENSSLDG00000010574) #21	hdc (ENSSLDG00000010482) #22	slc27a2a (ENSSLDG00000010432) #23	ENSSLDG00000010403 ##23	gatm (ENSSLDG00000010359)	pde8a (ENSSLDG00000010194)	ENSSLDG00000010060	FSD2 (ENSSLDG00000010016)	WHAMM (ENSSLDG00000009986)	homer2 (ENSSLDG00000009970)	HOMER2 (ENSSLDG00000009944)	RAMAC (ENSSLDG00000009924)	BTBD1 (ENSSLDG00000009893)	ap1s2 (ENSSLDG00000009877)	ENSSLDG00000009759	TM6SF1 (ENSSLDG00000009722)	crybgx (ENSSLDG00000009695)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	3					dmxl2 (ENSSDUG00000003667) #11	gldn (ENSSDUG00000003629) #12	cyp19a1a (ENSSDUG00000003606) #13	tnfaip8l3 (ENSSDUG00000003597) #14	scg3 (ENSSDUG00000003574) #15	lysmd2 (ENSSDUG00000003541) #16	tmod2 (ENSSDUG00000003503) #17	leo1 (ENSSDUG00000003483) #18	mapk6 (ENSSDUG00000003444) #19	USP50 (ENSSDUG00000003425) #20	USP8 (ENSSDUG00000003393) #21	hdc (ENSSDUG00000003241) #22	slc27a2a (ENSSDUG00000003195) #23	ENSSDUG00000003186 ##23	gatm (ENSSDUG00000003160)	pde8a (ENSSDUG00000003079)	ENSSDUG00000003044	FSD2 (ENSSDUG00000002921)	WHAMM (ENSSDUG00000002890)	homer2 (ENSSDUG00000002857)	RAMAC (ENSSDUG00000002843)	BTBD1 (ENSSDUG00000002814)	ap1s2 (ENSSDUG00000002801)	ZRSR2 (ENSSDUG00000002784)	TM6SF1 (ENSSDUG00000002771)	crybgx (ENSSDUG00000002750)	lctla (ENSSDUG00000002714)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	96	CTXN2 (ENSLCAG00010004347)	myef2 (ENSLCAG00010004354)	slc24a5 (ENSLCAG00010004373)	ENSLCAG00010004382	sema6dl (ENSLCAG00010004441)	dmxl2 (ENSLCAG00010004591) #11	cyp19a1a (ENSLCAG00010004693) #13	tnfaip8l3 (ENSLCAG00010004733) #14	scg3 (ENSLCAG00010004735) #15	lysmd2 (ENSLCAG00010004741) #16	tmod2 (ENSLCAG00010004750) #17	leo1 (ENSLCAG00010004765) #18	mapk6 (ENSLCAG00010004774) #19	USP50 (ENSLCAG00010004782) #20	USP8 (ENSLCAG00010004793) #21	hdc (ENSLCAG00010004811) #22	slc27a2a (ENSLCAG00010004818) #23	ENSLCAG00010004829 ##23	gatm (ENSLCAG00010004861)	pde8a (ENSLCAG00010004887)	ENSLCAG00010004942	ENSLCAG00010004951	WHAMM (ENSLCAG00010004960)	HOMER2 (ENSLCAG00010004968)	RAMAC (ENSLCAG00010004975)	BTBD1 (ENSLCAG00010004976)	TM6SF1 (ENSLCAG00010004986)	ENSLCAG00010004989	ENSLCAG00010004992	ap1s2 (ENSLCAG00010005007)	PHKA2 (ENSLCAG00010005084)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000154829.j	ENSGT01100000263512.b.b.a.i	ENSGT00940000159726	ENSGT00390000016316	ENSGT00940000158077	ENSGT00950000182963.b.a.d	ENSGT00940000159407.q	ENSGT00940000157355.c	ENSGT00940000166846	ENSGT00940000159830	ENSGT00940000154664.h.n.c.r	ENSGT00940000154664.h.n.c.q	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a
Tetraodon	MODERN SPECIES	20	myef2 (ENSTNIG00000009526)	slc24a5 (ENSTNIG00000009525)	ENSTNIG00000009524	sema6dl (ENSTNIG00000009523)	dmxl2 (ENSTNIG00000009522) #11	gldn (ENSTNIG00000009521) #12	cyp19a1a (ENSTNIG00000009520) #13	tnfaip8l3 (ENSTNIG00000009519) #14	scg3 (ENSTNIG00000009518) #15	lysmd2 (ENSTNIG00000009517) #16	tmod2 (ENSTNIG00000009516) #17	leo1 (ENSTNIG00000009515) #18	mapk6 (ENSTNIG00000009514) #19	USP50 (ENSTNIG00000009513) #20	USP8 (ENSTNIG00000009512) #21	hdc (ENSTNIG00000009511) #22	slc27a2a (ENSTNIG00000009510) #23	ENSTNIG00000009509	ENSTNIG00000009508	GRPR (ENSTNIG00000009507)	vegfd (ENSTNIG00000001247)	ENSTNIG00000009506	ace2 (ENSTNIG00000009505)	NHS (ENSTNIG00000009504)	ENSTNIG00000009503	ENSTNIG00000001566	cdkl5 (ENSTNIG00000009502)	ENSTNIG00000009501	ppef1 (ENSTNIG00000009500)	KLHL10 (ENSTNIG00000009499)	KLHL10 (ENSTNIG00000009498)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000165409.f
Pike perch	MODERN SPECIES	20	myef2 (ENSSLUG00000025326)	slc24a5 (ENSSLUG00000025332)	ENSSLUG00000025336	sema6dl (ENSSLUG00000025355)	dmxl2 (ENSSLUG00000025439) #11	gldn (ENSSLUG00000025470) #12	cyp19a1a (ENSSLUG00000025475) #13	tnfaip8l3 (ENSSLUG00000025477) #14	scg3 (ENSSLUG00000025480) #15	lysmd2 (ENSSLUG00000025484) #16	tmod2 (ENSSLUG00000025503) #17	leo1 (ENSSLUG00000025525) #18	mapk6 (ENSSLUG00000025532) #19	USP50 (ENSSLUG00000025537) #20	USP8 (ENSSLUG00000025547) #21	hdc (ENSSLUG00000000317) #22	slc27a2a (ENSSLUG00000000428) #23	ENSSLUG00000000582 ##23	gatm (ENSSLUG00000000714)	pde8a (ENSSLUG00000000765)	ENSSLUG00000000874	FSD2 (ENSSLUG00000000881)	ENSSLUG00000000886	HOMER2 (ENSSLUG00000000893)	RAMAC (ENSSLUG00000000901)	BTBD1 (ENSSLUG00000000906)	TM6SF1 (ENSSLUG00000000918)	ZRSR2 (ENSSLUG00000000930)	ap1s2 (ENSSLUG00000000935)	PHKA2 (ENSSLUG00000000992)	ppef1 (ENSSLUG00000001148)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	17	myef2 (ENSCGOG00000014246)	slc24a5 (ENSCGOG00000014290)	ENSCGOG00000014294	sema6dl (ENSCGOG00000014318)	dmxl2 (ENSCGOG00000016075) #11	gldn (ENSCGOG00000017158) #12	cyp19a1a (ENSCGOG00000017219) #13	tnfaip8l3 (ENSCGOG00000019666) #14	scg3 (ENSCGOG00000019667) #15	lysmd2 (ENSCGOG00000019669) #16	tmod2 (ENSCGOG00000019676) #17	leo1 (ENSCGOG00000020013) #18	mapk6 (ENSCGOG00000020022) #19	USP50 (ENSCGOG00000020044) #20	USP8 (ENSCGOG00000020077) #21	hdc (ENSCGOG00000020688) #22	ENSCGOG00000020725	ENSCGOG00000020737 ##23	gatm (ENSCGOG00000020970)	pde8a (ENSCGOG00000020973)	ENSCGOG00000021126	ENSCGOG00000021127	WHAMM (ENSCGOG00000021130)	homer2 (ENSCGOG00000021139)	HOMER2 (ENSCGOG00000021158)	RAMAC (ENSCGOG00000021165)	BTBD1 (ENSCGOG00000021167)	TM6SF1 (ENSCGOG00000021170)	ENSCGOG00000021171	ap1s2 (ENSCGOG00000021174)	PHKA2 (ENSCGOG00000021261)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	13								ENSGT00390000012054.b.c	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a	ENSGT00940000159830
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Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a.j	ENSGT00940000165409.f
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b	ENSGT00940000158347.z	ENSGT00940000159303	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020.d #12	ENSGT00840000129915.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00950000183152.A	ENSGT00970000193372.a.a.tc.a	ENSGT00950000183118.A.c.a.j	ENSGT00940000165409.f
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Large yellow croaker	MODERN SPECIES	480	myef2 (ENSLCRG00005021141)	slc24a5 (ENSLCRG00005021139)	ENSLCRG00005021137	sema6dl (ENSLCRG00005021111)	dmxl2 (ENSLCRG00005016306) #11	gldn (ENSLCRG00005016234) #12	cyp19a1a (ENSLCRG00005016193) #13	tnfaip8l3 (ENSLCRG00005016189) #14	scg3 (ENSLCRG00005016183) #15	lysmd2 (ENSLCRG00005016182) #16	tmod2 (ENSLCRG00005016155) #17	leo1 (ENSLCRG00005016152) #18	mapk6 (ENSLCRG00005016151) #19	USP50 (ENSLCRG00005016147) #20	USP8 (ENSLCRG00005016140) #21	hdc (ENSLCRG00005016067) #22	slc27a2a (ENSLCRG00005015804) #23	ENSLCRG00005015596 ##23	gatm (ENSLCRG00005015578)	pde8a (ENSLCRG00005014288)	ENSLCRG00005014270	FSD2 (ENSLCRG00005014263)	WHAMM (ENSLCRG00005014261)	homer2 (ENSLCRG00005014259)	ENSLCRG00005014258	BTBD1 (ENSLCRG00005013954)	TM6SF1 (ENSLCRG00005013951)	ZRSR2 (ENSLCRG00005013949)	ap1s2 (ENSLCRG00005013948)	ENSLCRG00005013947	PHKA2 (ENSLCRG00005013589)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	18	myef2 (ENSSAUG00010022203)	slc24a5 (ENSSAUG00010022209)	ENSSAUG00010022214	sema6dl (ENSSAUG00010022220)	dmxl2 (ENSSAUG00010022332) #11	gldn (ENSSAUG00010022349) #12	cyp19a1a (ENSSAUG00010022362) #13	tnfaip8l3 (ENSSAUG00010022651) #14	scg3 (ENSSAUG00010022653) #15	lysmd2 (ENSSAUG00010022656) #16	tmod2 (ENSSAUG00010022659) #17	leo1 (ENSSAUG00010022669) #18	mapk6 (ENSSAUG00010022674) #19	ENSSAUG00010022675 #20	USP8 (ENSSAUG00010022679) #21	hdc (ENSSAUG00010022696) #22	slc27a2a (ENSSAUG00010022708) #23	ENSSAUG00010022874 ##23	gatm (ENSSAUG00010022921)	ENSSAUG00010022922	ENSSAUG00010022923	ENSSAUG00010022931	ENSSAUG00010022934	fam219b (ENSSAUG00010022936)	COX5a2 (ENSSAUG00010022937)	SNAP25 (ENSSAUG00010022941)	LRRC28 (ENSSAUG00010022944)	igf1rb (ENSSAUG00010022954)	ap3s2 (ENSSAUG00010023180)	ANPEP (ENSSAUG00010023189)	ANPEP (ENSSAUG00010023403)
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	107												leo1 (ENSLBEG00000023895) #18	mapk6 (ENSLBEG00000023939) #19	USP50 (ENSLBEG00000023975) #20	USP8 (ENSLBEG00000024024) #21	hdc (ENSLBEG00000024097) #22	slc27a2a (ENSLBEG00000024149) #23	ENSLBEG00000024176 ##23	gatm (ENSLBEG00000024205)	pde8a (ENSLBEG00000024275)	ENSLBEG00000024341	FSD2 (ENSLBEG00000024404)	WHAMM (ENSLBEG00000024435)	homer2 (ENSLBEG00000024491)	ENSLBEG00000024550	BTBD1 (ENSLBEG00000024568)	TM6SF1 (ENSLBEG00000024596)	ENSLBEG00000024627	ap1s2 (ENSLBEG00000024656)	PHKA2 (ENSLBEG00000024738)	ppef1 (ENSLBEG00000024940)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	348	myef2 (ENSHCOG00000001652)	slc24a5 (ENSHCOG00000001643)	ENSHCOG00000001637	sema6dl (ENSHCOG00000001615)	dmxl2 (ENSHCOG00000001569) #11	gldn (ENSHCOG00000001538) #12	cyp19a1a (ENSHCOG00000001526) #13	tnfaip8l3 (ENSHCOG00000001518) #14	scg3 (ENSHCOG00000001502) #15	lysmd2 (ENSHCOG00000001488) #16	tmod2 (ENSHCOG00000001479) #17	leo1 (ENSHCOG00000001464) #18	mapk6 (ENSHCOG00000001456) #19	USP50 (ENSHCOG00000001443) #20	USP8 (ENSHCOG00000001428) #21	hdc (ENSHCOG00000021012) #22	slc27a2a (ENSHCOG00000020884) #23	ENSHCOG00000020878 ##23	gatm (ENSHCOG00000020850)	pde8a (ENSHCOG00000020827)	ENSHCOG00000020785	FSD2 (ENSHCOG00000020768)	WHAMM (ENSHCOG00000020763)	HOMER2 (ENSHCOG00000020729)	ENSHCOG00000020696	RAMAC (ENSHCOG00000000556)	BTBD1 (ENSHCOG00000020685)	TM6SF1 (ENSHCOG00000020669)	ZRSR2 (ENSHCOG00000020661)	ap1s2 (ENSHCOG00000020643)	PHKA2 (ENSHCOG00000020629)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	17	ALX4 (ENSMMDG00005023319)	ext2 (ENSMMDG00005023325)	DAGLA (ENSMMDG00005000118)	polr2l (ENSMMDG00005000150)	CPSF7 (ENSMMDG00005000159)	sdhaf2 (ENSMMDG00005000174)	syt7b (ENSMMDG00005000192)	saa (ENSMMDG00005000208)	saa (ENSMMDG00005000214)	saa (ENSMMDG00005000222)	tmod2 (ENSMMDG00005000252) #17	leo1 (ENSMMDG00005000296) #18	mapk6 (ENSMMDG00005000307) #19	USP50 (ENSMMDG00005000320) #20	USP8 (ENSMMDG00005000391) #21	hdc (ENSMMDG00005000553) #22	slc27a2a (ENSMMDG00005002197) #23	ENSMMDG00005002492 ##23	gatm (ENSMMDG00005002819)	pde8a (ENSMMDG00005002907)	ENSMMDG00005004292	FSD2 (ENSMMDG00005004308)	WHAMM (ENSMMDG00005004322)	homer2 (ENSMMDG00005004343)	RAMAC (ENSMMDG00005004357)	BTBD1 (ENSMMDG00005004374)	TM6SF1 (ENSMMDG00005004488)	ZRSR2 (ENSMMDG00005004508)	ap1s2 (ENSMMDG00005004533)	ENSMMDG00005004596	ppef1 (ENSMMDG00005004614)
Cod	MODERN SPECIES	5	ENSGMOG00000030531	ENSGMOG00000023894	ENSGMOG00000026442	ENSGMOG00000012961	ENSGMOG00000012968	tssc4 (ENSGMOG00000029139)	ENSGMOG00000005940	ENSGMOG00000036015	ENSGMOG00000024372	cd81a (ENSGMOG00000004521)	kcnc1a (ENSGMOG00000031054)	tph1b (ENSGMOG00000000022)	ENSGMOG00000000019	ENSGMOG00000016010 #21	ENSGMOG00000031103	hdc (ENSGMOG00000016050) #22	ENSGMOG00000016102 #23	ENSGMOG00000016076 #23	ENSGMOG00000008131 ##23	ENSGMOG00000008134	ENSGMOG00000008135	ENSGMOG00000036681	ENSGMOG00000008141	ENSGMOG00000024769	ENSGMOG00000034158	ENSGMOG00000027767	ENSGMOG00000030829	ENSGMOG00000033889	ENSGMOG00000035164	cyp1a (ENSGMOG00000000318)	ENSGMOG00000029214
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	101	ENSGT00940000164990.d	ENSGT00940000154996.a.b.b	ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.b	ENSGT00390000006347.a	ENSGT00940000160333	ENSGT00390000017790	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000163723.A.e	ENSGT00940000163723.A.f.b	ENSGT01050000244900.a.a.b.eb	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00390000005764	ENSGT00530000063106.B	ENSGT00940000155333.A.a
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000164990.d	ENSGT00940000154996.a.b.b	ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.b	ENSGT00390000006347.a	ENSGT00940000160333	ENSGT00390000017790	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000163723.A.e	ENSGT00940000163723.A.f.b	ENSGT01050000244900.a.a.b.eb.h	ENSGT00940000158280.l #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422.j	ENSGT00940000156422.i	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00390000005764	ENSGT00530000063106.B
Huchen	MODERN SPECIES	3364										USP50 (ENSHHUG00000023655) #20	USP8 (ENSHHUG00000023668) #21	ENSHHUG00000023679	ENSHHUG00000023685	ENSHHUG00000023701	ENSHHUG00000023705	hdc (ENSHHUG00000023709) #22	ENSHHUG00000023718 #23
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	85	ENSGT00390000006347.a.g.b	ENSGT00390000006347.a.g.a	ENSGT00940000160333	ENSGT00390000017790	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000163723.A.e	ENSGT00940000163723.A.f.b	ENSGT01050000244900.a.a.b.eb.h	ENSGT00940000158280.l #17	ENSGT01050000244900.a.a.b.eb.g.a	ENSGT00940000158280.k #17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422.j	ENSGT00940000156422.i	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b.a	ENSGT00940000157324.l	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00390000005764	ENSGT00530000063106.B	ENSGT00940000155333.A.a.i.a
Oncorhynchus	DUPLICATION
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157938.i #22
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157938.i #22
Coho salmon	MODERN SPECIES	1491										ENSOKIG00005028905 #19	USP50 (ENSOKIG00005028926) #20	ENSOKIG00005029020 #21	ENSOKIG00005024520	ENSOKIG00005024526	ENSOKIG00005024528	ENSOKIG00005024541 #22
Chinook salmon	MODERN SPECIES	1488														ENSOTSG00005031325	ENSOTSG00005031326	ENSOTSG00005031327 #22
Oncorhynchus	DUPLICATION
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	465																ENSGT00940000157938.j.a #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23
Rainbow trout	MODERN SPECIES	27	ENSOMYG00000048968	ENSOMYG00000004278	ENSOMYG00000004018	ENSOMYG00000077260	ENSOMYG00000004192	ENSOMYG00000003351	ENSOMYG00000003441	ENSOMYG00000053221	ENSOMYG00000004444	ENSOMYG00000073125 #17	ENSOMYG00000024703 #18	ENSOMYG00000004588 #19	USP50 (ENSOMYG00000004613) #20	ENSOMYG00000054987 #21	ENSOMYG00000036605	hdc (ENSOMYG00000048576) #22	slc27a2a (ENSOMYG00000035881) #23	ENSOMYG00000073495 ##23	gatm (ENSOMYG00000058991)	ENSOMYG00000060984	pde8a (ENSOMYG00000074691)	ENSOMYG00000076233	ENSOMYG00000058176	ENSOMYG00000064324	ENSOMYG00000077619	ENSOMYG00000058373	FSD2 (ENSOMYG00000048469)	WHAMM (ENSOMYG00000057419)	homer2 (ENSOMYG00000063764)	ENSOMYG00000050671	crybgx (ENSOMYG00000048390)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	639																ENSGT00940000157938.j.a #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23
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Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	106		ENSGT00390000006347.a.g.a	ENSGT00940000160333	ENSGT00390000017790	ENSGT01080000257714.b	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000163723.A.e	ENSGT00940000163723.A.f.b	ENSGT01050000244900.a.a.b.eb.h	ENSGT00940000158280.l #17	ENSGT00550000074952.k #18	ENSGT00940000154351 #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000163460.a.a.c.a.b	ENSGT00940000157938.j.b #22	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422.i	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b.b	ENSGT00940000157324.l	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00390000005764	ENSGT00530000063106.B	ENSGT01030000234532.B.e.b.e	ENSGT00530000062962.b.a.e	ENSGT00940000155744.t.a	ENSGT00940000156926.d
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Salmo	ANCESTRAL SPECIES	188												ENSGT00940000154351.yb #19	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542.e.b #21	ENSGT00940000163460.a.a.c.a.b	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b.o #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a.e ##23	ENSGT00390000011613.t	ENSGT00390000011613.s	ENSGT00940000156422.j	ENSGT00510000047412.b.f	ENSGT00940000158441.f	ENSGT00510000046704.b.b.a.d	ENSGT00940000157324.l	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000165890.a
River trout	DUPLICATION
River trout	MODERN SPECIES	21	lingo1b (ENSSTUG00000011940)	cpt1aa (ENSSTUG00000011258)	cars1 (ENSSTUG00000009452)	slc22a18 (ENSSTUG00000009401)	pex16 (ENSSTUG00000009372)	arfgap2 (ENSSTUG00000009272)	ENSSTUG00000009257	ENSSTUG00000009241	ENSSTUG00000009226	ENSSTUG00000009200	tmod2 (ENSSTUG00000009120) #17	mapk6 (ENSSTUG00000009095) #19	USP50 (ENSSTUG00000009048) #20	USP8 (ENSSTUG00000009019) #21	ENSSTUG00000009007	hdc (ENSSTUG00000008064) #22	slc27a2a (ENSSTUG00000007988) #23	ENSSTUG00000007666 ##23	gatm (ENSSTUG00000007634)	ENSSTUG00000007632	pde8a (ENSSTUG00000006015)	ENSSTUG00000005958	FSD2 (ENSSTUG00000005940)	WHAMM (ENSSTUG00000005932)	HOMER2 (ENSSTUG00000005871)	ENSSTUG00000005865	crybgx (ENSSTUG00000005860)	lctla (ENSSTUG00000005848)	tipin (ENSSTUG00000005839)	dis3l (ENSSTUG00000005812)	ENSSTUG00000005780
River trout	MODERN SPECIES	145												mapk6 (ENSSTUG00000024747) #19	USP50 (ENSSTUG00000024724) #20	ENSSTUG00000024710	ENSSTUG00000024600 #21	hdc (ENSSTUG00000023126) #22	slc27a2a (ENSSTUG00000022965) #23	gatm (ENSSTUG00000022939)	ENSSTUG00000022932	pde8a (ENSSTUG00000022848)	ENSSTUG00000022829	FSD2 (ENSSTUG00000022799)	ENSSTUG00000022791	WHAMM (ENSSTUG00000022766)	HOMER2 (ENSSTUG00000022734)	RAMAC (ENSSTUG00000022713)	gatm (ENSSTUG00000022702)
Atlantic salmon	DUPLICATION
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	2	ENSSSAG00000070128	ENSSSAG00000044071	s22ai (ENSSSAG00000039227)	ENSSSAG00000009752	ENSSSAG00000098004	ENSSSAG00000108375	ENSSSAG00000089459	ENSSSAG00000118428	ENSSSAG00000088019 #17	leo1 (ENSSSAG00000110496) #18	mapk6 (ENSSSAG00000086103) #19	USP50 (ENSSSAG00000108441) #20	ENSSSAG00000010195 #21	ENSSSAG00000009637	ENSSSAG00000093071	hdc (ENSSSAG00000098647) #22	slc27a2a (ENSSSAG00000012340) #23	ENSSSAG00000108011 ##23	gatm (ENSSSAG00000069650)	pde8a (ENSSSAG00000097988)	ENSSSAG00000009779	FSD2 (ENSSSAG00000073255)	ENSSSAG00000092676	ENSSSAG00000121906	HOMER2 (ENSSSAG00000103439)	crybgx (ENSSSAG00000008876)	ENSSSAG00000008839	tipin (ENSSSAG00000082602)	ENSSSAG00000103573	RAB11A (ENSSSAG00000099276)	DENND4A (ENSSSAG00000100635)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	18	ENSSSAG00000062476	ENSSSAG00000065651	ENSSSAG00000009760	ENSSSAG00000105914	ENSSSAG00000086985	ENSSSAG00000076581	ENSSSAG00000005625	ENSSSAG00000055518	tmod2 (ENSSSAG00000060985) #17	ENSSSAG00000116709 #18	ENSSSAG00000055469 #19	USP50 (ENSSSAG00000110764) #20	ENSSSAG00000121071 #21	ENSSSAG00000111698	ENSSSAG00000091356	hdc (ENSSSAG00000042330) #22	slc27a2a (ENSSSAG00000122085) #23	s27a2 (ENSSSAG00000115180) ##23	gatm (ENSSSAG00000055493)	pde8a (ENSSSAG00000094947)	ENSSSAG00000073264	ENSSSAG00000095380	WHAMM (ENSSSAG00000110696)	homer2 (ENSSSAG00000098183)	RAMAC (ENSSSAG00000069672)	crybgx (ENSSSAG00000069661)	lctla (ENSSSAG00000043842)	tipin (ENSSSAG00000043439)	dis3l (ENSSSAG00000121052)	ENSSSAG00000092940	RAB11A (ENSSSAG00000062971)
Northern pike	MODERN SPECIES	1	lingo1b (ENSELUG00000020454)	cpt1aa (ENSELUG00000020423)	cars1 (ENSELUG00000020347)	slc22a18 (ENSELUG00000020269)	pex16 (ENSELUG00000020226)	arfgap2 (ENSELUG00000020186)	ENSELUG00000020152	ENSELUG00000020067	ENSELUG00000032105	ppfia1 (ENSELUG00000020126)	tmod2 (ENSELUG00000020038) #17	leo1 (ENSELUG00000019983) #18	mapk6 (ENSELUG00000019924) #19	USP50 (ENSELUG00000019889) #20	USP8 (ENSELUG00000019872) #21	hdc (ENSELUG00000019843) #22	slc27a2a (ENSELUG00000019801) #23	gatm (ENSELUG00000001472)	pde8a (ENSELUG00000019742)	ENSELUG00000019621	ENSELUG00000019658	WHAMM (ENSELUG00000019600)	ENSELUG00000019542	homer2 (ENSELUG00000019561)	crybgx (ENSELUG00000019531)	lctla (ENSELUG00000019497)	tipin (ENSELUG00000019453)	dis3l (ENSELUG00000019420)	ENSELUG00000019353	RAB11B (ENSELUG00000019240)	dennd4a (ENSELUG00000000821)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000167699
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000156756.g	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT01060000248998	ENSGT01030000235336
Atlantic herring	MODERN SPECIES	22	dmxl2 (ENSCHAG00000027257) #11	sema6dl (ENSCHAG00000027149)	slc24a5 (ENSCHAG00000027112)	myef2 (ENSCHAG00000027099)	CTXN2 (ENSCHAG00000027094)	SLC12A1 (ENSCHAG00000026896)	dut (ENSCHAG00000026861)	FBN1 (ENSCHAG00000026378)	SHC4 (ENSCHAG00000026318)	SECISBP2L (ENSCHAG00000026315)	fgf7 (ENSCHAG00000026314)	trpm7 (ENSCHAG00000025138)	USP50 (ENSCHAG00000024971) #20	USP8 (ENSCHAG00000024764) #21	gabpb1 (ENSCHAG00000024666)	hdc (ENSCHAG00000024348) #22	slc27a2a (ENSCHAG00000024270) #23	ENSCHAG00000024250 #23	ENSCHAG00000023685 ##23	gatm (ENSCHAG00000023628)	pde8a (ENSCHAG00000022667)	ENSCHAG00000022594	FSD2 (ENSCHAG00000022583)	WHAMM (ENSCHAG00000022574)	HOMER2 (ENSCHAG00000022545)	RAMAC (ENSCHAG00000022537)	BTBD1 (ENSCHAG00000022510)	TM6SF1 (ENSCHAG00000022465)	HDGFL3 (ENSCHAG00000022405)	BNC1 (ENSCHAG00000022380)	dnaja2a (ENSCHAG00000022281)
Denticle herring	MODERN SPECIES	7	ENSDCDG00000034746	SECISBP2L (ENSDCDG00000034733)	fgf7 (ENSDCDG00000034727)	dtwd1 (ENSDCDG00000034723)	ENSDCDG00000034696	spata5l1 (ENSDCDG00000034686)	zgc:153317 (ENSDCDG00000034684)	slc30a4 (ENSDCDG00000034681)	bloc1s6 (ENSDCDG00000034679)	mibp2 (ENSDCDG00000034675)	ENSDCDG00000034671	SPPL2A (ENSDCDG00000034664)	trpm7 (ENSDCDG00000032159)	USP8 (ENSDCDG00000031420) #21	gabpb1 (ENSDCDG00000031385)	hdc (ENSDCDG00000030901) #22	slc27a2a (ENSDCDG00000030799) #23	ENSDCDG00000030474 #23	ENSDCDG00000029976 #23	ENSDCDG00000029816 ##23	gatm (ENSDCDG00000029807)	pde8a (ENSDCDG00000029146)	ENSDCDG00000029124	FSD2 (ENSDCDG00000029121)	WHAMM (ENSDCDG00000029117)	HOMER2 (ENSDCDG00000029113)	RAMAC (ENSDCDG00000029111)	nap1l4b (ENSDCDG00000029103)	cars1 (ENSDCDG00000028076)	SBF2 (ENSDCDG00000022757)	adma (ENSDCDG00000022641)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	76	ENSGT00390000018390	ENSGT00950000183158.D.b.f.qb	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000157947.a.b	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	143	ENSGT00950000183158.D.b.f.qb	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000158245.dc	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000157947.a.b	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	431	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277.g	ENSGT00940000153766.B.k.b	ENSGT00390000009277.h	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842.sc	ENSGT00940000159842.rc.a	ENSGT00940000158245.dc	ENSGT00940000157722.h	ENSGT00940000157091.l	ENSGT00940000157091.k	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000157947.a.b	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324.d.b	ENSGT00940000153942.b.l
Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	37	BNC1 (ENSCARG00000020536)	ENSCARG00000020526	ENSCARG00000020494	ENSCARG00000020483	mibp2 (ENSCARG00000020468)	ENSCARG00000020463	zgc:153317 (ENSCARG00000020447)	spata5l1 (ENSCARG00000020437)	ENSCARG00000018850	fgf7 (ENSCARG00000018796)	SECISBP2L (ENSCARG00000018785)	bloc1s6 (ENSCARG00000018764)	ENSCARG00000018743	ENSCARG00000018674	ENSCARG00000057191	hdc (ENSCARG00000057074) #22	zgc:158482 (ENSCARG00000057022)	gatm (ENSCARG00000056905)	pde8a (ENSCARG00000056736)	ENSCARG00000056674
Goldfish	MODERN SPECIES	9	ripor1 (ENSCARG00000026226)	ENSCARG00000026387	pard6a (ENSCARG00000026658)	ranbp10 (ENSCARG00000026694)	tsnaxip1 (ENSCARG00000027094)	nutf2 (ENSCARG00000027109)	edc4 (ENSCARG00000027166)	NRN1L (ENSCARG00000028199)	pskh1 (ENSCARG00000028209)	fan1 (ENSCARG00000028223)	mbtps1 (ENSCARG00000028403)	SLC38A8 (ENSCARG00000030978)	necab2 (ENSCARG00000031006)	trpm7 (ENSCARG00000002058)	USP8 (ENSCARG00000002303) #21	hdc (ENSCARG00000002388) #22	zgc:158482 (ENSCARG00000002690)	gatm (ENSCARG00000002711)	ENSCARG00000002730	ENSCARG00000002733	ENSCARG00000002734	snrpa (ENSCARG00000002745)	zgc:153119 (ENSCARG00000002762)	itpkcb (ENSCARG00000002768)	ryr1b (ENSCARG00000003067)	rasgrp4 (ENSCARG00000006386)	HNRNPUL1 (ENSCARG00000006475)	opa3 (ENSCARG00000006723)	ppp1r13l (ENSCARG00000006738)	TMEM91 (ENSCARG00000006747)	exosc5 (ENSCARG00000006758)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	325	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000158030	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000159843.e	ENSGT00940000153766.B.k.b	ENSGT00390000009277.h	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842.rc.a	ENSGT00940000158245.dc	ENSGT00940000157722.h	ENSGT00940000157091.l	ENSGT00940000157091.k	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000157947.a.b	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324.d.b	ENSGT00940000153942.b.l	ENSGT00390000005844.a.a.fd.a
Golden-line barbel	DUPLICATION
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1395												trpm7 (ENSSGRG00000028244)	USP8 (ENSSGRG00000028568) #21	gabpb1 (ENSSGRG00000028570)	hdc (ENSSGRG00000028573) #22	hdc (ENSSGRG00000028574) #22	zgc:158482 (ENSSGRG00000028578)	gatm (ENSSGRG00000028615)	pde8a (ENSSGRG00000028617)	ENSSGRG00000028703	homer2 (ENSSGRG00000028704)	ENSSGRG00000028726
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1395													trpm7 (ENSSGRG00000028244)	USP8 (ENSSGRG00000028568) #21	gabpb1 (ENSSGRG00000028570)	hdc (ENSSGRG00000028573) #22	hdc (ENSSGRG00000028574) #22	zgc:158482 (ENSSGRG00000028578)	gatm (ENSSGRG00000028615)	pde8a (ENSSGRG00000028617)	ENSSGRG00000028703	homer2 (ENSSGRG00000028704)	ENSSGRG00000028726
Common carp reference	MODERN SPECIES	9	slc24a5 (ENSCCRG00000008959)	myef2 (ENSCCRG00000061413)	CTXN2 (ENSCCRG00000067222)	FBN1 (ENSCCRG00000046007)	SLC12A1 (ENSCCRG00000072933)	ENSCCRG00000050773	fgf7 (ENSCCRG00000078422)	dtwd1 (ENSCCRG00000017138)	ENSCCRG00000065096	ENSCCRG00000078143	ENSCCRG00000064509	zgc:153317 (ENSCCRG00000038113)	ENSCCRG00000015148	ENSCCRG00000043353	USP8 (ENSCCRG00000074705) #21	hdc (ENSCCRG00000049366) #22	zgc:158482 (ENSCCRG00000031854)	pde8a (ENSCCRG00000069907)	ENSCCRG00000079133	WHAMM (ENSCCRG00000070235)	ENSCCRG00000066171	HDGFL3 (ENSCCRG00000048987)	ENSCCRG00000052235
Zebrafish	MODERN SPECIES	9	ENSDARG00000100044	nedd4a (ENSDARG00000099843)	sdr42e1 (ENSDARG00000098838)	wtip (ENSDARG00000103607)	gpib (ENSDARG00000103826)	ENSDARG00000102796	GARRE1 (ENSDARG00000105288)	ss18l2 (ENSDARG00000101085)	lsm14ab (ENSDARG00000100553)	ENSDARG00000092774	tm2d3 (ENSDARG00000076618)	larp6a (ENSDARG00000005355)	trpm7 (ENSDARG00000036232)	USP8 (ENSDARG00000063719) #21	gabpb1 (ENSDARG00000023659)	hdc (ENSDARG00000075454) #22	slc27a2a (ENSDARG00000036237) #23	zgc:158482 (ENSDARG00000067520)	gatm (ENSDARG00000036239)	pde8a (ENSDARG00000087941)	ENSDARG00000103011	homer2 (ENSDARG00000059349)
Characiphysae	DUPLICATION
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	125	ENSGT00390000018390	ENSGT00950000183158.D.b.f.qb	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938.s #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000157947.a.b	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	128	ENSGT00390000018390	ENSGT00950000183158.D.b.f.qb	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938.s #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000157947.a.b	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	159	ENSGT00390000018390	ENSGT00950000183158.D.b.f.qb	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938.s #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	1847																hdc (ENSPNAG00000012345) #22	slc27a2a (ENSPNAG00000012245) #23
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	614	dtwd1 (ENSAMXG00000036176)	ENSAMXG00000037222	ENSAMXG00000043363	spata5l1 (ENSAMXG00000031455)	zgc:153317 (ENSAMXG00000042391)	slc30a4 (ENSAMXG00000043270)	bloc1s6 (ENSAMXG00000029463)	mibp2 (ENSAMXG00000040660)	ENSAMXG00000035375	SPPL2A (ENSAMXG00000011067)	ENSAMXG00000033315	trpm7 (ENSAMXG00000040086)	ENSAMXG00000038145	USP8 (ENSAMXG00000041256) #21	gabpb1 (ENSAMXG00000039169)	hdc (ENSAMXG00000041840) #22	slc27a2a (ENSAMXG00000033051) #23	pde8a (ENSAMXG00000041948)	gatm (ENSAMXG00000008299)	zgc:158482 (ENSAMXG00000031817)	ENSAMXG00000041106 #23	ENSAMXG00000001167	FSD2 (ENSAMXG00000043145)	ENSAMXG00000034573	homer2 (ENSAMXG00000029601)	ENSAMXG00000040601
Electric eel	MODERN SPECIES	431	FBN1 (ENSEEEG00000023165)	ENSEEEG00000023151	fgf7 (ENSEEEG00000023150)	dtwd1 (ENSEEEG00000023149)	ENSEEEG00000023037	spata5l1 (ENSEEEG00000023028)	ENSEEEG00000023027	slc30a4 (ENSEEEG00000023026)	bloc1s6 (ENSEEEG00000023021)	mibp2 (ENSEEEG00000023020)	ENSEEEG00000023019	SPPL2A (ENSEEEG00000023018)	trpm7 (ENSEEEG00000022730)	USP8 (ENSEEEG00000022668) #21	gabpb1 (ENSEEEG00000022667)	hdc (ENSEEEG00000022665) #22	slc27a2a (ENSEEEG00000022656) #23	ENSEEEG00000022654 #23
Channel catfish	MODERN SPECIES	23	leo1 (ENSIPUG00000018066) #18	dmxl2 (ENSIPUG00000017769) #11	gldn (ENSIPUG00000017758) #12	cyp19a1a (ENSIPUG00000017676) #13	ENSIPUG00000017656	ENSIPUG00000017632	ENSIPUG00000017615	ENSIPUG00000017604	ENSIPUG00000017575	mibp2 (ENSIPUG00000017560)	cdc42se2 (ENSIPUG00000017541)	sppl2a (ENSIPUG00000017501)	trpm7 (ENSIPUG00000017419)	USP8 (ENSIPUG00000017369) #21	gabpb1 (ENSIPUG00000017273)	hdc (ENSIPUG00000017191) #22	SLC27A2 (ENSIPUG00000017159) #23	ENSIPUG00000017141 #23	ENSIPUG00000017134	pde8a (ENSIPUG00000017054)	ENSIPUG00000017011	fsd2 (ENSIPUG00000017001)	ENSIPUG00000016990	homer2 (ENSIPUG00000016976)	ENSIPUG00000016949	tm6sf1 (ENSIPUG00000016918)	HDGFL3 (ENSIPUG00000016897)	BNC1 (ENSIPUG00000016867)	ENSIPUG00000016852	ENSIPUG00000016841	ENSIPUG00000016833
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157938.t #22
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157938.t #22
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157938.t #22
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	1126													trpm7 (ENSPNAG00000025651)	USP8 (ENSPNAG00000006058) #21	gabpb1 (ENSPNAG00000005201)	ENSPNAG00000025820 #22
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	13					ENSGT00940000159843.a	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101.a	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545.b	ENSGT00940000159842.wc	ENSGT00940000157091.i	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875.a	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000164068.a.b.b #23	ENSGT00940000164068.a.b.a.a.a ##23	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422.a	ENSGT00510000047412.b	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324.a	ENSGT00390000010463.b	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00390000005844.a.a.d.a	ENSGT00940000157398.i.a	ENSGT01090000260005.a.b.b	ENSGT00940000159206.b	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143.bb.b
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Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00390000012420	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
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Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101.w	ENSGT00940000160101.x	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00910000146654	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00390000012420	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952
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Laterata	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00910000146654	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
Common wall lizard	MODERN SPECIES	5	DTWD1 (ENSPMRG00000016336)	ENSPMRG00000016338	ENSPMRG00000016350	ENSPMRG00000016356	SPATA5L1 (ENSPMRG00000016369)	ENSPMRG00000016374	SLC30A4 (ENSPMRG00000016379)	BLOC1S6 (ENSPMRG00000016383)	SQOR (ENSPMRG00000016388)	ENSPMRG00000016394	SPPL2A (ENSPMRG00000016403)	TRPM7 (ENSPMRG00000016586)	USP50 (ENSPMRG00000017719) #20	USP8 (ENSPMRG00000017790) #21	GABPB1 (ENSPMRG00000017997)	HDC (ENSPMRG00000018009) #22	SLC27A2 (ENSPMRG00000018083)	GATM (ENSPMRG00000018090)	PDE8A (ENSPMRG00000018103)	ENSPMRG00000018111	FSD2 (ENSPMRG00000018115)	WHAMM (ENSPMRG00000018125)	ENSPMRG00000018135	BTBD1 (ENSPMRG00000018147)	ENSPMRG00000018155	ENSPMRG00000018159	TM6SF1 (ENSPMRG00000018163)	HDGFL3 (ENSPMRG00000018170)	BNC1 (ENSPMRG00000018178)	SH3GL3 (ENSPMRG00000018185)	ENSPMRG00000018196
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	46	GALK2 (ENSSMRG00000022357)	FGF7 (ENSSMRG00000022359)	DTWD1 (ENSSMRG00000022361)	ENSSMRG00000022362	SPATA5L1 (ENSSMRG00000022363)	SLC30A4 (ENSSMRG00000022365)	BLOC1S6 (ENSSMRG00000022367)	SQOR (ENSSMRG00000022368)	ENSSMRG00000022369	SPPL2A (ENSSMRG00000022370)	TRPM7 (ENSSMRG00000022371)	USP50 (ENSSMRG00000022372) #20	USP8 (ENSSMRG00000022373) #21	ENSSMRG00000022374	GABPB1 (ENSSMRG00000022375)	HDC (ENSSMRG00000022376) #22	SLC27A2 (ENSSMRG00000022377)	GATM (ENSSMRG00000022378)	PDE8A (ENSSMRG00000022379)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000159842.ac.a	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613.a.a	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324.s	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b.a	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143.e
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000159842.ac.a	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613.a.a	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324.s	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000168079	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b.a	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952
Blue-lipped sea krait	DUPLICATION
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	533															KCNJ2 (ENSLLTG00000010455)	ENSLLTG00000009767 #22	SLC27A2 (ENSLLTG00000009739)	GATM (ENSLLTG00000009724)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	1139												TRPM7 (ENSLLTG00000006513)	USP50 (ENSLLTG00000006482) #20	USP8 (ENSLLTG00000012625) #21	GABPB1 (ENSLLTG00000012607)	ENSLLTG00000012597 #22
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000159842.ac.a	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613.a.a	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324.s	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b.a	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143.e
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	88	ENSNSUG00000019472	ENSNSUG00000019471	ENSNSUG00000019469	C15orf48 (ENSNSUG00000019467)	SLC30A4 (ENSNSUG00000019449)	BLOC1S6 (ENSNSUG00000019448)	ENSNSUG00000019447	SQOR (ENSNSUG00000019446)	ENSNSUG00000019445	ENSNSUG00000019444	SPPL2A (ENSNSUG00000019443)	TRPM7 (ENSNSUG00000019442)	USP50 (ENSNSUG00000019441) #20	USP8 (ENSNSUG00000019440) #21	GABPB1 (ENSNSUG00000019439)	HDC (ENSNSUG00000019438) #22	SLC27A2 (ENSNSUG00000019437)	ENSNSUG00000019436	ENSNSUG00000019435	ENSNSUG00000019434	ENSNSUG00000019433	ENSNSUG00000019432	HOMER2 (ENSNSUG00000019431)	ENSNSUG00000019430	ENSNSUG00000019429	BTBD1 (ENSNSUG00000019428)	TM6SF1 (ENSNSUG00000019427)	HDGFL3 (ENSNSUG00000019426)	BNC1 (ENSNSUG00000019425)	SH3GL3 (ENSNSUG00000019424)	ENSNSUG00000019423
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	44	FGF7 (ENSPTXG00000008382)	DTWD1 (ENSPTXG00000008381)	ENSPTXG00000008379	SPATA5L1 (ENSPTXG00000008376)	C15orf48 (ENSPTXG00000005750)	SLC30A4 (ENSPTXG00000005749)	BLOC1S6 (ENSPTXG00000005748)	SQOR (ENSPTXG00000005747)	ENSPTXG00000005746	ENSPTXG00000005745	SPPL2A (ENSPTXG00000005744)	TRPM7 (ENSPTXG00000005743)	USP50 (ENSPTXG00000005742) #20	USP8 (ENSPTXG00000005741) #21	GABPB1 (ENSPTXG00000005739)	HDC (ENSPTXG00000005707) #22	SLC27A2 (ENSPTXG00000005706)	GATM (ENSPTXG00000005705)	ENSPTXG00000005704	ENSPTXG00000005699	ENSPTXG00000005697	WHAMM (ENSPTXG00000005696)	HOMER2 (ENSPTXG00000005695)	ENSPTXG00000005693	ENSPTXG00000005692	BTBD1 (ENSPTXG00000005690)	ENSPTXG00000005689	ENSPTXG00000005687	HDGFL3 (ENSPTXG00000005686)	BNC1 (ENSPTXG00000005667)	SH3GL3 (ENSPTXG00000005660)
Indian cobra	MODERN SPECIES	14	FGF7 (ENSNNAG00000019070)	DTWD1 (ENSNNAG00000019075)	ENSNNAG00000019103	SPATA5L1 (ENSNNAG00000019114)	C15orf48 (ENSNNAG00000019116)	SLC30A4 (ENSNNAG00000019118)	BLOC1S6 (ENSNNAG00000019120)	SQOR (ENSNNAG00000019122)	ENSNNAG00000019125	ENSNNAG00000019126	ENSNNAG00000019128	TRPM7 (ENSNNAG00000019137)	USP50 (ENSNNAG00000019144) #20	USP8 (ENSNNAG00000019145) #21	GABPB1 (ENSNNAG00000019146)	HDC (ENSNNAG00000019147) #22	SLC27A2 (ENSNNAG00000003825)	ENSNNAG00000003902	PDE8A (ENSNNAG00000003934)	FSD2 (ENSNNAG00000003958)	WHAMM (ENSNNAG00000004004)	HOMER2 (ENSNNAG00000004093)	ENSNNAG00000004126	ENSNNAG00000004139	BTBD1 (ENSNNAG00000004162)	TM6SF1 (ENSNNAG00000004210)	HDGFL3 (ENSNNAG00000004248)	BNC1 (ENSNNAG00000004277)	SH3GL3 (ENSNNAG00000004309)	ENSNNAG00000004376	ADAMTSL3 (ENSNNAG00000004464)
Lizard	MODERN SPECIES	1347									ENSACAG00000003722	ENSACAG00000003777	SPPL2A (ENSACAG00000003785)	TRPM7 (ENSACAG00000003845)	USP50 (ENSACAG00000003981) #20	USP8 (ENSACAG00000003991) #21	GABPB1 (ENSACAG00000004186)	HDC (ENSACAG00000004258) #22
tuatara	MODERN SPECIES	126	FGF7 (ENSSPUG00000011440)	DTWD1 (ENSSPUG00000011432)	ENSSPUG00000011407	ENSSPUG00000011395	ATP8B4 (ENSSPUG00000011354)	C15orf48 (ENSSPUG00000011293)	SLC30A4 (ENSSPUG00000011286)	BLOC1S6 (ENSSPUG00000011274)	SQOR (ENSSPUG00000011244)	ENSSPUG00000011228	SPPL2A (ENSSPUG00000011146)	TRPM7 (ENSSPUG00000010871)	USP50 (ENSSPUG00000010816) #20	USP8 (ENSSPUG00000010804) #21	GABPB1 (ENSSPUG00000010792)	HDC (ENSSPUG00000010770) #22	SLC27A2 (ENSSPUG00000010748)	GATM (ENSSPUG00000010726)	ENSSPUG00000010709	ENSSPUG00000010702	ENSSPUG00000010693	ENSSPUG00000010686	ENSSPUG00000010676	ENSSPUG00000010665	FSD2 (ENSSPUG00000010593)	WHAMM (ENSSPUG00000010552)	ENSSPUG00000010544	HOMER2 (ENSSPUG00000010512)	ENSSPUG00000010499	C15orf40 (ENSSPUG00000010493)	BTBD1 (ENSSPUG00000010473)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00910000146654	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00390000012420	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00990000205468	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00910000146654	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
Aves	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00990000205468	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00910000146654	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	47												ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00390000011613.c	ENSGT00390000011613.d	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
Duck	MODERN SPECIES	2	ENSAPLG00000020089	ENSAPLG00000005706	ALPK3 (ENSAPLG00000028618)	ENSAPLG00000005884	ENSAPLG00000006184	ENSAPLG00000025363	ENSAPLG00000026725	ENSAPLG00000024532	ENSAPLG00000000602	ENSAPLG00000002065	OR11L1 (ENSAPLG00000002086)	SPPL2A (ENSAPLG00000014658)	TRPM7 (ENSAPLG00000015254)	USP8 (ENSAPLG00000001449) #21	GABPB1 (ENSAPLG00000002560)	HDC (ENSAPLG00000002933) #22	GATM (ENSAPLG00000003331)	PDE8A (ENSAPLG00000003946)	FSD2 (ENSAPLG00000004759)	WHAMM (ENSAPLG00000004963)	HOMER2 (ENSAPLG00000005079)	ENSAPLG00000021975	ENSAPLG00000027363	BTBD1 (ENSAPLG00000005398)	TM6SF1 (ENSAPLG00000005660)	HDGFL3 (ENSAPLG00000005715)	BNC1 (ENSAPLG00000005793)	SH3GL3 (ENSAPLG00000005948)	ENSAPLG00000006348	ADAMTSL3 (ENSAPLG00000011192)	SAXO2 (ENSAPLG00000011186)
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	54										ENSABRG00000003311	ENSABRG00000003294	SPPL2A (ENSABRG00000003190)	TRPM7 (ENSABRG00000003140)	USP8 (ENSABRG00000003086) #21	GABPB1 (ENSABRG00000003054)	HDC (ENSABRG00000001689) #22	ENSABRG00000001566	ENSABRG00000001528	PDE8A (ENSABRG00000001371)	FSD2 (ENSABRG00000001284)	WHAMM (ENSABRG00000001247)	HOMER2 (ENSABRG00000001179)	ENSABRG00000001161	ENSABRG00000001141	BTBD1 (ENSABRG00000001098)	TM6SF1 (ENSABRG00000001021)	HDGFL3 (ENSABRG00000000979)	BNC1 (ENSABRG00000000876)	SH3GL3 (ENSABRG00000000806)	ENSABRG00000000673	ADAMTSL3 (ENSABRG00000000633)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d
Japanese quail	MODERN SPECIES	1	COPS2 (ENSCJPG00005020044)	GALK2 (ENSCJPG00005020066)	FGF7 (ENSCJPG00005020071)	DTWD1 (ENSCJPG00005020072)	SPATA5L1 (ENSCJPG00005020074)	C15orf48 (ENSCJPG00005020076)	SLC30A4 (ENSCJPG00005020078)	BLOC1S6 (ENSCJPG00005020079)	SQOR (ENSCJPG00005020080)	ENSCJPG00005020089	ENSCJPG00005020090	SPPL2A (ENSCJPG00005020091)	TRPM7 (ENSCJPG00005020093)	USP8 (ENSCJPG00005020198) #21	GABPB1 (ENSCJPG00005020200)	HDC (ENSCJPG00005020202) #22	GATM (ENSCJPG00005020207)	PDE8A (ENSCJPG00005020208)	FSD2 (ENSCJPG00005020212)	WHAMM (ENSCJPG00005020213)	HOMER2 (ENSCJPG00005020214)	ENSCJPG00005020219	ENSCJPG00005020220	BTBD1 (ENSCJPG00005020221)	TM6SF1 (ENSCJPG00005020222)	HDGFL3 (ENSCJPG00005020224)	BNC1 (ENSCJPG00005020227)	SH3GL3 (ENSCJPG00005020230)	ENSCJPG00005020233	ADAMTSL3 (ENSCJPG00005020237)	SAXO2 (ENSCJPG00005020255)
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d
Turkey	MODERN SPECIES	3	SECISBP2L (ENSMGAG00000007165)	COPS2 (ENSMGAG00000007200)	GALK2 (ENSMGAG00000007213)	FGF7 (ENSMGAG00000007239)	DTWD1 (ENSMGAG00000007251)	C15orf48 (ENSMGAG00000007267)	SLC30A4 (ENSMGAG00000007274)	BLOC1S6 (ENSMGAG00000007293)	SQOR (ENSMGAG00000007296)	ENSMGAG00000007552	ENSMGAG00000007325	SPPL2A (ENSMGAG00000007335)	TRPM7 (ENSMGAG00000007383)	USP8 (ENSMGAG00000007448) #21	GABPB1 (ENSMGAG00000007495)	HDC (ENSMGAG00000007531) #22	ENSMGAG00000007592	FSD2 (ENSMGAG00000007666)	HOMER2 (ENSMGAG00000007704)	ENSMGAG00000016131	BTBD1 (ENSMGAG00000007743)	TM6SF1 (ENSMGAG00000007791)	HDGFL3 (ENSMGAG00000007835)	BNC1 (ENSMGAG00000007844)	SH3GL3 (ENSMGAG00000007852)	ENSMGAG00000007894	ENSMGAG00000020239	ENSMGAG00000007972	SAXO2 (ENSMGAG00000007982)	ENSMGAG00000022452	EFL1 (ENSMGAG00000007991)
Chicken	MODERN SPECIES	1	GALK2 (ENSGALG00010016069)	FGF7 (ENSGALG00010016094)	FAM227B (ENSGALG00010016101)	DTWD1 (ENSGALG00010016113)	SPATA5L1 (ENSGALG00010016122)	C10H15ORF48 (ENSGALG00010016930)	SLC30A4 (ENSGALG00010016931)	SQRDL (ENSGALG00010016962)	BLOC1S6 (ENSGALG00010017070)	ITGB1BP3 (ENSGALG00010017109)	ENSGALG00010017135	SPPL2A (ENSGALG00010017221)	TRPM7 (ENSGALG00010017300)	USP8 (ENSGALG00010017377) #21	GABPB1 (ENSGALG00010017451)	HDC (ENSGALG00010017510) #22	GATM (ENSGALG00010017604)	PDE8A (ENSGALG00010020912)	FSD2 (ENSGALG00010017656)	WHAMM (ENSGALG00010017658)	HOMER2 (ENSGALG00010016591)	FAM103A1 (ENSGALG00010016607)	ENSGALG00010016620	BTBD1 (ENSGALG00010016643)	TM6SF1 (ENSGALG00010016664)	HDGFL3 (ENSGALG00010016746)	ENSGALG00010016765	BNC1 (ENSGALG00010016769)	SH3GL3 (ENSGALG00010016810)	ADAMTSL3 (ENSGALG00010016874)	ENSGALG00010016888
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
Golden eagle	MODERN SPECIES	21	GALK2 (ENSACCG00020011191)	FGF7 (ENSACCG00020011206)	DTWD1 (ENSACCG00020011221)	SPATA5L1 (ENSACCG00020011230)	C15orf48 (ENSACCG00020011244)	SLC30A4 (ENSACCG00020011263)	BLOC1S6 (ENSACCG00020011273)	SQOR (ENSACCG00020011285)	ENSACCG00020011306	ENSACCG00020011322	SPPL2A (ENSACCG00020011358)	TRPM7 (ENSACCG00020011402)	USP50 (ENSACCG00020011427) #20	USP8 (ENSACCG00020011473) #21	GABPB1 (ENSACCG00020011533)	HDC (ENSACCG00020011559) #22	SLC27A2 (ENSACCG00020011594)	GATM (ENSACCG00020011727)	PDE8A (ENSACCG00020011791)	FSD2 (ENSACCG00020011900)	WHAMM (ENSACCG00020011947)	HOMER2 (ENSACCG00020011969)	ENSACCG00020012036	BTBD1 (ENSACCG00020012130)	TM6SF1 (ENSACCG00020012235)	HDGFL3 (ENSACCG00020012292)	BNC1 (ENSACCG00020012355)	SH3GL3 (ENSACCG00020012411)	ENSACCG00020012454	ADAMTSL3 (ENSACCG00020012570)	SAXO2 (ENSACCG00020012741)
Kakapo	MODERN SPECIES	1	SECISBP2L (ENSSHBG00005020305)	COPS2 (ENSSHBG00005020299)	GALK2 (ENSSHBG00005020296)	FGF7 (ENSSHBG00005020294)	DTWD1 (ENSSHBG00005020290)	SPATA5L1 (ENSSHBG00005020287)	C15orf48 (ENSSHBG00005020286)	SLC30A4 (ENSSHBG00005020283)	BLOC1S6 (ENSSHBG00005020282)	SQOR (ENSSHBG00005020281)	NMRK2 (ENSSHBG00005020278)	SPPL2A (ENSSHBG00005020276)	TRPM7 (ENSSHBG00005016879)	USP8 (ENSSHBG00005016425) #21	GABPB1 (ENSSHBG00005016414)	HDC (ENSSHBG00005016403) #22	SLC27A2 (ENSSHBG00005016387)	GATM (ENSSHBG00005016379)	ENSSHBG00005016362	ENSSHBG00005016358	FSD2 (ENSSHBG00005016341)	WHAMM (ENSSHBG00005016334)	HOMER2 (ENSSHBG00005016330)	ENSSHBG00005016325	ENSSHBG00005016318	BTBD1 (ENSSHBG00005016313)	TM6SF1 (ENSSHBG00005016309)	HDGFL3 (ENSSHBG00005016303)	BNC1 (ENSSHBG00005016268)	SH3GL3 (ENSSHBG00005016254)	ENSSHBG00005016250
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d
Medium ground finch	MODERN SPECIES	16	GALK2 (ENSGFOG00000002092)	FGF7 (ENSGFOG00000002066)	DTWD1 (ENSGFOG00000002054)	SPATA5L1 (ENSGFOG00000002043)	ENSGFOG00000002035	SLC30A4 (ENSGFOG00000002020)	BLOC1S6 (ENSGFOG00000002011)	SQOR (ENSGFOG00000002001)	ENSGFOG00000001995	ENSGFOG00000001989	SPPL2A (ENSGFOG00000001961)	TRPM7 (ENSGFOG00000001913)	USP50 (ENSGFOG00000001892) #20	USP8 (ENSGFOG00000001867) #21	GABPB1 (ENSGFOG00000001861)	HDC (ENSGFOG00000001849) #22	GATM (ENSGFOG00000001842)	PDE8A (ENSGFOG00000001830)	FSD2 (ENSGFOG00000001811)	WHAMM (ENSGFOG00000001797)	HOMER2 (ENSGFOG00000001781)	ENSGFOG00000001775	ENSGFOG00000001764	BTBD1 (ENSGFOG00000001720)	TM6SF1 (ENSGFOG00000001702)	HDGFL3 (ENSGFOG00000001696)	BNC1 (ENSGFOG00000001682)	SH3GL3 (ENSGFOG00000001675)	ENSGFOG00000001643	ADAMTSL3 (ENSGFOG00000001615)	SAXO2 (ENSGFOG00000001605)
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d
Zebra finch	MODERN SPECIES	1	GALK2 (ENSTGUG00000007298)	FGF7 (ENSTGUG00000027805)	DTWD1 (ENSTGUG00000007331)	SPATA5L1 (ENSTGUG00000007340)	ENSTGUG00000022847	SLC30A4 (ENSTGUG00000007351)	BLOC1S6 (ENSTGUG00000007369)	SQOR (ENSTGUG00000007375)	ENSTGUG00000007396	ENSTGUG00000025054	SPPL2A (ENSTGUG00000007425)	TRPM7 (ENSTGUG00000007440)	USP8 (ENSTGUG00000007507) #21	USP50 (ENSTGUG00000007496) #20	GABPB1 (ENSTGUG00000026845)	HDC (ENSTGUG00000007569) #22	GATM (ENSTGUG00000007597)	PDE8A (ENSTGUG00000007621)	FSD2 (ENSTGUG00000007666)	WHAMM (ENSTGUG00000007672)	HOMER2 (ENSTGUG00000007682)	ENSTGUG00000028282	ENSTGUG00000007701	BTBD1 (ENSTGUG00000007705)	TM6SF1 (ENSTGUG00000007727)	HDGFL3 (ENSTGUG00000007749)	BNC1 (ENSTGUG00000007753)	SH3GL3 (ENSTGUG00000007759)	ENSTGUG00000007777	ADAMTSL3 (ENSTGUG00000007800)	SAXO2 (ENSTGUG00000007844)
Common canary	MODERN SPECIES	12	GALK2 (ENSSCAG00000005191)	FGF7 (ENSSCAG00000005194)	DTWD1 (ENSSCAG00000005200)	SPATA5L1 (ENSSCAG00000005208)	C15orf48 (ENSSCAG00000005211)	SLC30A4 (ENSSCAG00000005215)	BLOC1S6 (ENSSCAG00000005220)	SQOR (ENSSCAG00000005222)	ENSSCAG00000005225	ENSSCAG00000005229	SPPL2A (ENSSCAG00000005244)	TRPM7 (ENSSCAG00000005261)	USP8 (ENSSCAG00000005275) #21	USP50 (ENSSCAG00000005283) #20	GABPB1 (ENSSCAG00000005288)	HDC (ENSSCAG00000005290) #22	GATM (ENSSCAG00000005298)	PDE8A (ENSSCAG00000005304)	FSD2 (ENSSCAG00000005320)	WHAMM (ENSSCAG00000005332)	HOMER2 (ENSSCAG00000005338)	ENSSCAG00000005341	ENSSCAG00000005344	BTBD1 (ENSSCAG00000005352)	TM6SF1 (ENSSCAG00000005360)	HDGFL3 (ENSSCAG00000005367)	BNC1 (ENSSCAG00000005374)	SH3GL3 (ENSSCAG00000005388)	ENSSCAG00000005399	ADAMTSL3 (ENSSCAG00000005422)	SAXO2 (ENSSCAG00000005481)
Flycatcher	MODERN SPECIES	1	FGF7 (ENSFALG00000026559)	DTWD1 (ENSFALG00000025090)	ENSFALG00000027735	SPATA5L1 (ENSFALG00000011487)	C15orf48 (ENSFALG00000011485)	SLC30A4 (ENSFALG00000011480)	BLOC1S6 (ENSFALG00000026626)	SQOR (ENSFALG00000027391)	ENSFALG00000028981	ENSFALG00000027060	SPPL2A (ENSFALG00000011434)	TRPM7 (ENSFALG00000011416)	USP50 (ENSFALG00000026025) #20	USP8 (ENSFALG00000011392) #21	GABPB1 (ENSFALG00000011370)	HDC (ENSFALG00000011339) #22	ENSFALG00000011319	ENSFALG00000011280	FSD2 (ENSFALG00000022881)	WHAMM (ENSFALG00000011224)	HOMER2 (ENSFALG00000011215)	ENSFALG00000011211	BTBD1 (ENSFALG00000025818)	TM6SF1 (ENSFALG00000011182)	HDGFL3 (ENSFALG00000011161)	BNC1 (ENSFALG00000011147)	SH3GL3 (ENSFALG00000011132)	ENSFALG00000011122	ADAMTSL3 (ENSFALG00000011113)	SAXO2 (ENSFALG00000027196)	EFL1 (ENSFALG00000011103)
Great tit	MODERN SPECIES	1	COPS2 (ENSPMJG00000019183)	GALK2 (ENSPMJG00000019184)	FGF7 (ENSPMJG00000019185)	DTWD1 (ENSPMJG00000019187)	SPATA5L1 (ENSPMJG00000019190)	ENSPMJG00000019191	SLC30A4 (ENSPMJG00000019193)	BLOC1S6 (ENSPMJG00000019194)	SQOR (ENSPMJG00000019195)	ENSPMJG00000019196	SPPL2A (ENSPMJG00000019197)	TRPM7 (ENSPMJG00000019198)	USP50 (ENSPMJG00000019199) #20	USP8 (ENSPMJG00000000051) #21	GABPB1 (ENSPMJG00000000237)	HDC (ENSPMJG00000000248) #22	GATM (ENSPMJG00000000282)	PDE8A (ENSPMJG00000000298)	FSD2 (ENSPMJG00000000348)	WHAMM (ENSPMJG00000000360)	HOMER2 (ENSPMJG00000000385)	ENSPMJG00000000408	ENSPMJG00000000420	BTBD1 (ENSPMJG00000000426)	TM6SF1 (ENSPMJG00000000441)	HDGFL3 (ENSPMJG00000000466)	BNC1 (ENSPMJG00000000487)	SH3GL3 (ENSPMJG00000000514)	ENSPMJG00000000530	ADAMTSL3 (ENSPMJG00000000577)	SAXO2 (ENSPMJG00000000642)
African ostrich	MODERN SPECIES	834	FGF7 (ENSSCUG00000014270)	ENSSCUG00000014267	DTWD1 (ENSSCUG00000014264)	SPATA5L1 (ENSSCUG00000014260)	SLC30A4 (ENSSCUG00000014256)	BLOC1S6 (ENSSCUG00000014252)	SQOR (ENSSCUG00000014248)	ENSSCUG00000014242	ENSSCUG00000014239	SPPL2A (ENSSCUG00000014216)	TRPM7 (ENSSCUG00000014197)	USP50 (ENSSCUG00000014190) #20	USP8 (ENSSCUG00000014181) #21	ENSSCUG00000014179	GABPB1 (ENSSCUG00000014173)	HDC (ENSSCUG00000014170) #22	SLC27A2 (ENSSCUG00000014162)	GATM (ENSSCUG00000014155)	PDE8A (ENSSCUG00000014146)	FSD2 (ENSSCUG00000014139)	WHAMM (ENSSCUG00000014136)	HOMER2 (ENSSCUG00000014134)	ENSSCUG00000014131	ENSSCUG00000014129	BTBD1 (ENSSCUG00000014127)	TM6SF1 (ENSSCUG00000014122)	HDGFL3 (ENSSCUG00000014117)	BNC1 (ENSSCUG00000014110)	SH3GL3 (ENSSCUG00000014101)	ENSSCUG00000014090	ADAMTSL3 (ENSSCUG00000014073)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	31	FGF7 (ENSCPRG00005014649)	DTWD1 (ENSCPRG00005014654)	ENSCPRG00005014657	ATP8B4 (ENSCPRG00005014680)	SPATA5L1 (ENSCPRG00005014904)	C15orf48 (ENSCPRG00005014908)	SLC30A4 (ENSCPRG00005014914)	BLOC1S6 (ENSCPRG00005014919)	SQOR (ENSCPRG00005014924)	ENSCPRG00005014929	SPPL2A (ENSCPRG00005014945)	TRPM7 (ENSCPRG00005015267)	USP50 (ENSCPRG00005016060) #20	USP8 (ENSCPRG00005016079) #21	GABPB1 (ENSCPRG00005016149)	HDC (ENSCPRG00005016158) #22	SLC27A2 (ENSCPRG00005016163)	GATM (ENSCPRG00005016170)	PDE8A (ENSCPRG00005016191)	FSD2 (ENSCPRG00005016209)	WHAMM (ENSCPRG00005016212)	HOMER2 (ENSCPRG00005016216)	ENSCPRG00005016223	BTBD1 (ENSCPRG00005016227)	TM6SF1 (ENSCPRG00005016236)	HDGFL3 (ENSCPRG00005016242)	BNC1 (ENSCPRG00005016251)	SH3GL3 (ENSCPRG00005016257)	ENSCPRG00005016266	ADAMTSL3 (ENSCPRG00005016284)	SAXO2 (ENSCPRG00005016298)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000172921	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00390000012420	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
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Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	1533				ENSCABG00000016022	ENSCABG00000016025	SPATA5L1 (ENSCABG00000016039)	SLC30A4 (ENSCABG00000016143)	BLOC1S6 (ENSCABG00000016144)	SQOR (ENSCABG00000016145)	ENSCABG00000016147	SPPL2A (ENSCABG00000016151)	TRPM7 (ENSCABG00000016163)	USP50 (ENSCABG00000017195) #20	USP8 (ENSCABG00000017201) #21	GABPB1 (ENSCABG00000017268)	HDC (ENSCABG00000017269) #22	SLC27A2 (ENSCABG00000017271)	GATM (ENSCABG00000017272)	ENSCABG00000017276	ENSCABG00000017280	FSD2 (ENSCABG00000017286)	WHAMM (ENSCABG00000017287)	HOMER2 (ENSCABG00000017291)	ENSCABG00000017292	C15orf40 (ENSCABG00000017293)	BTBD1 (ENSCABG00000017296)	TM6SF1 (ENSCABG00000017387)	HDGFL3 (ENSCABG00000017390)	BNC1 (ENSCABG00000017396)	ENSCABG00000017405	SH3GL3 (ENSCABG00000017406)
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Chinese turtle	MODERN SPECIES	2248												ENSPSIG00000017896	USP50 (ENSPSIG00000018029) #20	ENSPSIG00000018031	GABPB1 (ENSPSIG00000018045)	HDC (ENSPSIG00000018114) #22	SLC27A2 (ENSPSIG00000005751)	GATM (ENSPSIG00000006047)	PDE8A (ENSPSIG00000006401)	FSD2 (ENSPSIG00000006685)	WHAMM (ENSPSIG00000006692)	HOMER2 (ENSPSIG00000006694)	ENSPSIG00000006833	ENSPSIG00000006838	BTBD1 (ENSPSIG00000006934)	TM6SF1 (ENSPSIG00000007151)	HDGFL3 (ENSPSIG00000007220)	BNC1 (ENSPSIG00000007268)	SH3GL3 (ENSPSIG00000007506)	ENSPSIG00000007569	ADAMTSL3 (ENSPSIG00000007706)
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	45						ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00390000012420	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d
Theria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00940000175727	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00940000175727	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
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Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
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Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.B	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.B	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.B	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.B	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091.g	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.B	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Polar bear	MODERN SPECIES	282	LEO1 (ENSUMAG00000019156) #18	TMOD3 (ENSUMAG00000019150) #17	TMOD2 (ENSUMAG00000019149)	LYSMD2 (ENSUMAG00000019144) #16	SCG3 (ENSUMAG00000019142) #15	DMXL2 (ENSUMAG00000017518) #11	GLDN (ENSUMAG00000017168) #12	CYP19A1 (ENSUMAG00000017122) #13	TNFAIP8L3 (ENSUMAG00000017115) #14	AP4E1 (ENSUMAG00000017041)	SPPL2A (ENSUMAG00000016817)	TRPM7 (ENSUMAG00000015380)	USP50 (ENSUMAG00000015191) #20	USP8 (ENSUMAG00000014849) #21	GABPB1 (ENSUMAG00000014794)	HDC (ENSUMAG00000014790) #22	SLC27A2 (ENSUMAG00000014731)	ATP8B4 (ENSUMAG00000014687)	DTWD1 (ENSUMAG00000014673)	FGF7 (ENSUMAG00000014669)	FAM227B (ENSUMAG00000014646)	GALK2 (ENSUMAG00000014626)	COPS2 (ENSUMAG00000014609)	SECISBP2L (ENSUMAG00000014412)	ENSUMAG00000014363	SHC4 (ENSUMAG00000014355)	CEP152 (ENSUMAG00000014338)	FBN1 (ENSUMAG00000010969)	DUT (ENSUMAG00000010375)	SLC12A1 (ENSUMAG00000010193)	CTXN2 (ENSUMAG00000010165)
American black bear	MODERN SPECIES	1285												ENSUAMG00000024060	USP50 (ENSUAMG00000024350) #20	USP8 (ENSUAMG00000024352) #21	GABPB1 (ENSUAMG00000024353)	HDC (ENSUAMG00000024354) #22	SLC27A2 (ENSUAMG00000024355)
Giant Panda	MODERN SPECIES	15	MAPK6 (ENSAMEG00000007132) #19	LEO1 (ENSAMEG00000007095) #18	TMOD3 (ENSAMEG00000030744) #17	LYSMD2 (ENSAMEG00000009315) #16	SCG3 (ENSAMEG00000009266) #15	DMXL2 (ENSAMEG00000009193) #11	GLDN (ENSAMEG00000026754) #12	CYP19A1 (ENSAMEG00000009155) #13	TNFAIP8L3 (ENSAMEG00000019034) #14	AP4E1 (ENSAMEG00000009126)	SPPL2A (ENSAMEG00000009085)	TRPM7 (ENSAMEG00000009020)	USP50 (ENSAMEG00000009011) #20	USP8 (ENSAMEG00000008969) #21	GABPB1 (ENSAMEG00000008928)	HDC (ENSAMEG00000008883) #22	SLC27A2 (ENSAMEG00000008843)	ATP8B4 (ENSAMEG00000016003)	DTWD1 (ENSAMEG00000001411)	FAM227B (ENSAMEG00000001419)	FGF7 (ENSAMEG00000001428)	GALK2 (ENSAMEG00000001434)	COPS2 (ENSAMEG00000001465)	SECISBP2L (ENSAMEG00000001504)	SHC4 (ENSAMEG00000001535)	ENSAMEG00000019278	CEP152 (ENSAMEG00000001549)	FBN1 (ENSAMEG00000001577)	DUT (ENSAMEG00000001873)	SLC12A1 (ENSAMEG00000001894)	CTXN2 (ENSAMEG00000019296)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.B	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
American mink	MODERN SPECIES	171						GLDN (ENSNVIG00000020916) #12	CYP19A1 (ENSNVIG00000020889) #13	TNFAIP8L3 (ENSNVIG00000020876) #14	AP4E1 (ENSNVIG00000020828)	SPPL2A (ENSNVIG00000020800)	TRPM7 (ENSNVIG00000020690)	USP50 (ENSNVIG00000020666) #20	USP8 (ENSNVIG00000020628) #21	ENSNVIG00000020625	GABPB1 (ENSNVIG00000020562)	HDC (ENSNVIG00000020520) #22	SLC27A2 (ENSNVIG00000020478)	ATP8B4 (ENSNVIG00000020414)	DTWD1 (ENSNVIG00000020399)	FGF7 (ENSNVIG00000020380)	FAM227B (ENSNVIG00000020305)	GALK2 (ENSNVIG00000020240)	COPS2 (ENSNVIG00000020203)	SECISBP2L (ENSNVIG00000020142)	ENSNVIG00000020123	SHC4 (ENSNVIG00000020076)	CEP152 (ENSNVIG00000019841)	FBN1 (ENSNVIG00000019713)	DUT (ENSNVIG00000019693)	SLC12A1 (ENSNVIG00000019453)	CTXN2 (ENSNVIG00000019426)
Ferret	MODERN SPECIES	210	ENSMPUG00000007660 #18	TMOD3 (ENSMPUG00000007668) #17	TMOD2 (ENSMPUG00000007783)	LYSMD2 (ENSMPUG00000007790) #16	SCG3 (ENSMPUG00000007793) #15	DMXL2 (ENSMPUG00000007804) #11	GLDN (ENSMPUG00000007823) #12	CYP19A1 (ENSMPUG00000007830) #13	TNFAIP8L3 (ENSMPUG00000018890) #14	SPPL2A (ENSMPUG00000007838)	AP4E1 (ENSMPUG00000007850)	TRPM7 (ENSMPUG00000007861)	USP50 (ENSMPUG00000007878) #20	USP8 (ENSMPUG00000007890) #21	GABPB1 (ENSMPUG00000007902)	HDC (ENSMPUG00000007907) #22	SLC27A2 (ENSMPUG00000007916)	ATP8B4 (ENSMPUG00000007926)	DTWD1 (ENSMPUG00000007939)	ENSMPUG00000007943
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000154268.e.a.hb.a	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000154268.e.a.hb.a	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Dingo	MODERN SPECIES	205	TMOD2 (ENSCAFG00020019033)	ENSCAFG00020019036 #16	ENSCAFG00020019039 #16	SCG3 (ENSCAFG00020019040) #15	DMXL2 (ENSCAFG00020019070) #11	GLDN (ENSCAFG00020019134) #12	CYP19A1 (ENSCAFG00020019162) #13	TNFAIP8L3 (ENSCAFG00020019185) #14	AP4E1 (ENSCAFG00020019190)	ENSCAFG00020019217	SPPL2A (ENSCAFG00020019219)	TRPM7 (ENSCAFG00020019231)	USP50 (ENSCAFG00020019320) #20	USP8 (ENSCAFG00020019330) #21	GABPB1 (ENSCAFG00020019337)	HDC (ENSCAFG00020019342) #22	SLC27A2 (ENSCAFG00020019360)	ATP8B4 (ENSCAFG00020019375)	DTWD1 (ENSCAFG00020019410)	FAM227B (ENSCAFG00020019412)	FGF7 (ENSCAFG00020019413)	GALK2 (ENSCAFG00020019416)	COPS2 (ENSCAFG00020019420)	ENSCAFG00020019424	ENSCAFG00020019427	SHC4 (ENSCAFG00020019437)	ENSCAFG00020019445	CEP152 (ENSCAFG00020019447)	ENSCAFG00020019456	FBN1 (ENSCAFG00020019590)	DUT (ENSCAFG00020021937)
Dog	MODERN SPECIES	23	LEO1 (ENSCAFG00845026719) #18	TMOD2 (ENSCAFG00845026270) #17	ENSCAFG00845026097 #16	SCG3 (ENSCAFG00845025888) #15	DMXL2 (ENSCAFG00845025245) #11	GLDN (ENSCAFG00845025056) #12	CYP19A1 (ENSCAFG00845024965) #13	TNFAIP8L3 (ENSCAFG00845024928) #14	AP4E1 (ENSCAFG00845024763)	ENSCAFG00845024711	SPPL2A (ENSCAFG00845024415)	TRPM7 (ENSCAFG00845024080)	USP50 (ENSCAFG00845023997) #20	USP8 (ENSCAFG00845023888) #21	GABPB1 (ENSCAFG00845023655)	HDC (ENSCAFG00845023453) #22	SLC27A2 (ENSCAFG00845023230)	ATP8B4 (ENSCAFG00845022807)	DTWD1 (ENSCAFG00845022680)	FAM227B (ENSCAFG00845022301)	FGF7 (ENSCAFG00845022021)	COPS2 (ENSCAFG00845021829)	SECISBP2L (ENSCAFG00845021603)	ENSCAFG00845021520	SHC4 (ENSCAFG00845021323)	CEP152 (ENSCAFG00845020950)	ENSCAFG00845020766	FBN1 (ENSCAFG00845020514)	ENSCAFG00845020266	SLC12A1 (ENSCAFG00845019364)	CTXN2 (ENSCAFG00845019232)
Red fox	MODERN SPECIES	28	ENSVVUG00000018776	WFDC8 (ENSVVUG00000018753)	ENSVVUG00000018747	ENSVVUG00000018744	ENSVVUG00000018741	CYP19A1 (ENSVVUG00000018740) #13	TNFAIP8L3 (ENSVVUG00000018736) #14	AP4E1 (ENSVVUG00000018715)	ENSVVUG00000018709	SPPL2A (ENSVVUG00000018696)	ENSVVUG00000018693	TRPM7 (ENSVVUG00000016973)	USP50 (ENSVVUG00000016749) #20	USP8 (ENSVVUG00000016731) #21	GABPB1 (ENSVVUG00000016725)	HDC (ENSVVUG00000016631) #22	SLC27A2 (ENSVVUG00000016617)	ATP8B4 (ENSVVUG00000016597)	DTWD1 (ENSVVUG00000016581)	FGF7 (ENSVVUG00000016575)	FAM227B (ENSVVUG00000016558)	GALK2 (ENSVVUG00000016538)	COPS2 (ENSVVUG00000016395)	SECISBP2L (ENSVVUG00000016354)	EID1 (ENSVVUG00000016342)	SHC4 (ENSVVUG00000016338)	CEP152 (ENSVVUG00000016313)	FBN1 (ENSVVUG00000014737)	DUT (ENSVVUG00000014696)	SLC12A1 (ENSVVUG00000014691)	CTXN2 (ENSVVUG00000014689)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.B.a	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183178.a.q.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.lb	ENSGT00940000158030
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Cat	MODERN SPECIES	237	TMOD3 (ENSFCAG00000012569) #17	LYSMD2 (ENSFCAG00000028252) #16	SCG3 (ENSFCAG00000012567) #15	DMXL2 (ENSFCAG00000028210) #11	GLDN (ENSFCAG00000010317) #12	CYP19A1 (ENSFCAG00000023859) #13	TNFAIP8L3 (ENSFCAG00000032180) #14	AP4E1 (ENSFCAG00000010314)	SPPL2A (ENSFCAG00000023141)	TRPM7 (ENSFCAG00000024588)	USP50 (ENSFCAG00000008601) #20	ENSFCAG00000047005	USP8 (ENSFCAG00000025193) #21	ENSFCAG00000052365	GABPB1 (ENSFCAG00000025484)	HDC (ENSFCAG00000004538) #22	SLC27A2 (ENSFCAG00000011025)	ATP8B4 (ENSFCAG00000029598)	DTWD1 (ENSFCAG00000027604)	FAM227B (ENSFCAG00000025633)	FGF7 (ENSFCAG00000031568)	GALK2 (ENSFCAG00000006030)	COPS2 (ENSFCAG00000023002)	SECISBP2L (ENSFCAG00000022355)	SHC4 (ENSFCAG00000035557)	ENSFCAG00000029320	CEP152 (ENSFCAG00000009080)	ENSFCAG00000035975	FBN1 (ENSFCAG00000015352)	ENSFCAG00000015350	SLC12A1 (ENSFCAG00000015347)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
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Donkey	MODERN SPECIES	11	TMOD3 (ENSEASG00005010006) #17	TMOD2 (ENSEASG00005010009)	ENSEASG00005010012 #16	SCG3 (ENSEASG00005010013) #15	DMXL2 (ENSEASG00005010302) #11	GLDN (ENSEASG00005014538) #12	CYP19A1 (ENSEASG00005014547) #13	TNFAIP8L3 (ENSEASG00005033995) #14	AP4E1 (ENSEASG00005014560)	ENSEASG00005014582	SPPL2A (ENSEASG00005014584)	TRPM7 (ENSEASG00005014713)	USP50 (ENSEASG00005016618) #20	USP8 (ENSEASG00005016621) #21	GABPB1 (ENSEASG00005016630)	HDC (ENSEASG00005016633) #22	SLC27A2 (ENSEASG00005016639)	ATP8B4 (ENSEASG00005016649)	DTWD1 (ENSEASG00005028815)	FAM227B (ENSEASG00005037184)	FGF7 (ENSEASG00005016667)	GALK2 (ENSEASG00005016671)	COPS2 (ENSEASG00005016680)	SECISBP2L (ENSEASG00005016797)	SHC4 (ENSEASG00005016804)	ENSEASG00005016810	CEP152 (ENSEASG00005016832)	FBN1 (ENSEASG00005017178)	DUT (ENSEASG00005017779)	SLC12A1 (ENSEASG00005017794)	CTXN2 (ENSEASG00005023826)
Horse	MODERN SPECIES		TMOD3 (ENSECAG00000021291) #17	TMOD2 (ENSECAG00000013328)	LYSMD2 (ENSECAG00000016259) #16	SCG3 (ENSECAG00000016522) #15	DMXL2 (ENSECAG00000000381) #11	GLDN (ENSECAG00000019919) #12	CYP19A1 (ENSECAG00000020474) #13	TNFAIP8L3 (ENSECAG00000004768) #14	AP4E1 (ENSECAG00000022163)	ENSECAG00000031753	SPPL2A (ENSECAG00000008167)	TRPM7 (ENSECAG00000017780)	USP8 (ENSECAG00000006611) #21	ENSECAG00000039469	GABPB1 (ENSECAG00000016926)	HDC (ENSECAG00000019282) #22	SLC27A2 (ENSECAG00000024288)	ATP8B4 (ENSECAG00000019617)	DTWD1 (ENSECAG00000012316)	FAM227B (ENSECAG00000013743)	FGF7 (ENSECAG00000015510)	GALK2 (ENSECAG00000017631)	COPS2 (ENSECAG00000024709)	SECISBP2L (ENSECAG00000011253)	SHC4 (ENSECAG00000015163)	ENSECAG00000017875	CEP152 (ENSECAG00000026853)	FBN1 (ENSECAG00000018455)	ENSECAG00000032606	ENSECAG00000040429	ENSECAG00000047262
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	24	LEO1 (ENSRFEG00010000806) #18	TMOD3 (ENSRFEG00010000877) #17	TMOD2 (ENSRFEG00010000911)	LYSMD2 (ENSRFEG00010000952) #16	SCG3 (ENSRFEG00010000990) #15	DMXL2 (ENSRFEG00010001047) #11	GLDN (ENSRFEG00010001263) #12	CYP19A1 (ENSRFEG00010001310) #13	TNFAIP8L3 (ENSRFEG00010001350) #14	AP4E1 (ENSRFEG00010001391)	SPPL2A (ENSRFEG00010001466)	TRPM7 (ENSRFEG00010001550)	USP50 (ENSRFEG00010001620) #20	USP8 (ENSRFEG00010001670) #21	GABPB1 (ENSRFEG00010001734)	HDC (ENSRFEG00010001803) #22	SLC27A2 (ENSRFEG00010001849)	ATP8B4 (ENSRFEG00010001887)	ENSRFEG00010001939	ENSRFEG00010001948	DTWD1 (ENSRFEG00010001966)	FAM227B (ENSRFEG00010002010)	FGF7 (ENSRFEG00010002069)	GALK2 (ENSRFEG00010002101)	COPS2 (ENSRFEG00010002164)	SECISBP2L (ENSRFEG00010002393)	SHC4 (ENSRFEG00010002689)	ENSRFEG00010002721	CEP152 (ENSRFEG00010002757)	FBN1 (ENSRFEG00010002836)	ENSRFEG00010002932
Microbat	MODERN SPECIES	960	TMOD3 (ENSMLUG00000003974) #17	ENSMLUG00000003967	ENSMLUG00000003963 #16	SCG3 (ENSMLUG00000003959) #15	DMXL2 (ENSMLUG00000005617) #11	GLDN (ENSMLUG00000009874) #12	CYP19A1 (ENSMLUG00000009854) #13	TNFAIP8L3 (ENSMLUG00000009833) #14	AP4E1 (ENSMLUG00000009792)	SPPL2A (ENSMLUG00000016737)	TRPM7 (ENSMLUG00000000187)	ENSMLUG00000024658	USP50 (ENSMLUG00000006756) #20	USP8 (ENSMLUG00000000389) #21	GABPB1 (ENSMLUG00000005780)	HDC (ENSMLUG00000005768) #22	SLC27A2 (ENSMLUG00000005760)	ATP8B4 (ENSMLUG00000008270)	DTWD1 (ENSMLUG00000001784)	FGF7 (ENSMLUG00000010428)	GALK2 (ENSMLUG00000013767)	ENSMLUG00000025580	COPS2 (ENSMLUG00000013760)	SECISBP2L (ENSMLUG00000012918)	ENSMLUG00000028542	SHC4 (ENSMLUG00000012913)	EID1 (ENSMLUG00000027610)	CEP152 (ENSMLUG00000012896)	FBN1 (ENSMLUG00000006857)	ENSMLUG00000026203	DUT (ENSMLUG00000006842)
Megabat	MODERN SPECIES	2012															GABPB1 (ENSPVAG00000014016)	HDC (ENSPVAG00000014015) #22	SLC27A2 (ENSPVAG00000014014)	ATP8B4 (ENSPVAG00000014012)	DTWD1 (ENSPVAG00000014010)	FGF7 (ENSPVAG00000014008)	FAM227B (ENSPVAG00000014006)	GALK2 (ENSPVAG00000014005)	COPS2 (ENSPVAG00000014002)
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Suina	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.e #13	ENSGT00840000129915.f.a #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	162	TMOD2 (ENSCWAG00000017285)	LYSMD2 (ENSCWAG00000017224) #16	SCG3 (ENSCWAG00000017178) #15	DMXL2 (ENSCWAG00000016348) #11	GLDN (ENSCWAG00000016239) #12	ENSCWAG00000016194 #13	ENSCWAG00000016133 #13	TNFAIP8L3 (ENSCWAG00000016092) #14	AP4E1 (ENSCWAG00000015944)	SPPL2A (ENSCWAG00000015851)	TRPM7 (ENSCWAG00000015732)	USP50 (ENSCWAG00000015632) #20	ENSCWAG00000015578	USP8 (ENSCWAG00000015418) #21	GABPB1 (ENSCWAG00000015126)	HDC (ENSCWAG00000014906) #22	SLC27A2 (ENSCWAG00000014655)	ENSCWAG00000014590	ENSCWAG00000014561	ATP8B4 (ENSCWAG00000014354)	DTWD1 (ENSCWAG00000014288)	FGF7 (ENSCWAG00000014249)	FAM227B (ENSCWAG00000014030)	GALK2 (ENSCWAG00000013932)	COPS2 (ENSCWAG00000013767)	SECISBP2L (ENSCWAG00000013654)	ENSCWAG00000013614	SHC4 (ENSCWAG00000013443)	CEP152 (ENSCWAG00000013079)	FBN1 (ENSCWAG00000012108)	DUT (ENSCWAG00000011642)
Pig	MODERN SPECIES		SCG3 (ENSSSCG00000004630) #15	DMXL2 (ENSSSCG00000032517) #11	ENSSSCG00000039810	GLDN (ENSSSCG00000004632) #12	ENSSSCG00000030168 #13	CYP19A1 (ENSSSCG00000053670) #13	ENSSSCG00000054479 #13	TNFAIP8L3 (ENSSSCG00000031794) #14	AP4E1 (ENSSSCG00000004634)	SPPL2A (ENSSSCG00000004635)	TRPM7 (ENSSSCG00000004636)	ENSSSCG00000034352	USP50 (ENSSSCG00000004638) #20	USP8 (ENSSSCG00000004639) #21	GABPB1 (ENSSSCG00000004645)	HDC (ENSSSCG00000004644) #22	SLC27A2 (ENSSSCG00000004643)	ATP8B4 (ENSSSCG00000004646)	DTWD1 (ENSSSCG00000004647)	FAM227B (ENSSSCG00000004648)	FGF7 (ENSSSCG00000056997)	GALK2 (ENSSSCG00000004651)	COPS2 (ENSSSCG00000004652)	SECISBP2L (ENSSSCG00000004653)	SHC4 (ENSSSCG00000056133)	ENSSSCG00000004656	CEP152 (ENSSSCG00000004657)	FBN1 (ENSSSCG00000004658)	DUT (ENSSSCG00000032141)	SLC12A1 (ENSSSCG00000004659)	CTXN2 (ENSSSCG00000040204)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.fb	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.g #13	ENSGT00840000129915.h.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.fb.a.a	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.g #13	ENSGT00840000129915.h.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157455.d	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.fb.a.a	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.g #13	ENSGT00840000129915.h.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157455.d	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.fb.a.a	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.g #13	ENSGT00840000129915.h.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157455.d	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.fb.b	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	15					ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.g #13	ENSGT00840000129915.h.b #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157455.d	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.fb.b	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Narwhal	MODERN SPECIES	308	ADAMTS7 (ENSMMNG00015011528)	OTUD7A (ENSMMNG00015011573)	ENSMMNG00015011603	CHRNA7 (ENSMMNG00015011644)	GLDN (ENSMMNG00015011725) #12	ENSMMNG00015011743 #13	ENSMMNG00015011765 #13	TNFAIP8L3 (ENSMMNG00015011780) #14	AP4E1 (ENSMMNG00015011800)	SPPL2A (ENSMMNG00015011842)	TRPM7 (ENSMMNG00015011878)	USP50 (ENSMMNG00015011969) #20	USP8 (ENSMMNG00015012008) #21	ENSMMNG00015012050	GABPB1 (ENSMMNG00015012066)	HDC (ENSMMNG00015012111) #22	SLC27A2 (ENSMMNG00015012162)	ATP8B4 (ENSMMNG00015012192)	DTWD1 (ENSMMNG00015012231)	FAM227B (ENSMMNG00015012255)	FGF7 (ENSMMNG00015012274)	GALK2 (ENSMMNG00015012300)	COPS2 (ENSMMNG00015012398)	ENSMMNG00015012444	SECISBP2L (ENSMMNG00015012466)	SHC4 (ENSMMNG00015012494)	ENSMMNG00015009285	CEP152 (ENSMMNG00015009292)	FBN1 (ENSMMNG00015009350)	ENSMMNG00015009615	SLC12A1 (ENSMMNG00015009684)
Beluga whale	MODERN SPECIES	6					GLDN (ENSDLEG00000000055) #12	ENSDLEG00000000096 #13	ENSDLEG00000000169 #13	TNFAIP8L3 (ENSDLEG00000000192) #14	AP4E1 (ENSDLEG00000000211)	SPPL2A (ENSDLEG00000000286)	TRPM7 (ENSDLEG00000000688)	USP50 (ENSDLEG00000001975) #20	USP8 (ENSDLEG00000002010) #21	ENSDLEG00000002028	GABPB1 (ENSDLEG00000002033)	HDC (ENSDLEG00000002055) #22	SLC27A2 (ENSDLEG00000002116)	ENSDLEG00000002132	ATP8B4 (ENSDLEG00000002139)	DTWD1 (ENSDLEG00000002176)	ENSDLEG00000002194	FGF7 (ENSDLEG00000002210)	GALK2 (ENSDLEG00000002218)	COPS2 (ENSDLEG00000002228)	ENSDLEG00000002252	SECISBP2L (ENSDLEG00000002258)	SHC4 (ENSDLEG00000002283)	EID1 (ENSDLEG00000002309)	CEP152 (ENSDLEG00000002321)	FBN1 (ENSDLEG00000002928)	DUT (ENSDLEG00000006173)
Vaquita	MODERN SPECIES	11	SCG3 (ENSPSNG00000003829) #15	DMXL2 (ENSPSNG00000003848) #11	GLDN (ENSPSNG00000003891) #12	ENSPSNG00000003906	ENSPSNG00000003922 #13	ENSPSNG00000003950 #13	TNFAIP8L3 (ENSPSNG00000000040) #14	AP4E1 (ENSPSNG00000000121)	SPPL2A (ENSPSNG00000000157)	TRPM7 (ENSPSNG00000000210)	USP50 (ENSPSNG00000000254) #20	USP8 (ENSPSNG00000000360) #21	ENSPSNG00000000424	ENSPSNG00000000442	GABPB1 (ENSPSNG00000000475)	HDC (ENSPSNG00000000543) #22	SLC27A2 (ENSPSNG00000000629)	ATP8B4 (ENSPSNG00000000704)	DTWD1 (ENSPSNG00000000835)	FAM227B (ENSPSNG00000000877)	FGF7 (ENSPSNG00000000924)	GALK2 (ENSPSNG00000000985)	COPS2 (ENSPSNG00000001079)	ENSPSNG00000001137	SECISBP2L (ENSPSNG00000001195)	SHC4 (ENSPSNG00000001282)	ENSPSNG00000001325	CEP152 (ENSPSNG00000001370)	FBN1 (ENSPSNG00000001444)	ENSPSNG00000001566	SLC12A1 (ENSPSNG00000001705)
Dolphin	MODERN SPECIES	661									TNFAIP8L3 (ENSTTRG00000016814) #14	AP4E1 (ENSTTRG00000016813)	SPPL2A (ENSTTRG00000016810)	TRPM7 (ENSTTRG00000016807)	USP50 (ENSTTRG00000016806) #20	USP8 (ENSTTRG00000016799) #21	GABPB1 (ENSTTRG00000016796)	HDC (ENSTTRG00000016795) #22	SLC27A2 (ENSTTRG00000016794)
Sperm whale	MODERN SPECIES	2	AEN (ENSPCTG00005010135)	ISG20 (ENSPCTG00005010179)	ENSPCTG00005010210	GLDN (ENSPCTG00005010257) #12	ENSPCTG00005010408 #13	ENSPCTG00005010575 #13	ENSPCTG00005010682	TNFAIP8L3 (ENSPCTG00005010714) #14	AP4E1 (ENSPCTG00005010739)	SPPL2A (ENSPCTG00005010807)	TRPM7 (ENSPCTG00005010932)	USP50 (ENSPCTG00005011145) #20	USP8 (ENSPCTG00005011258) #21	ENSPCTG00005011605	GABPB1 (ENSPCTG00005011636)	HDC (ENSPCTG00005012031) #22	SLC27A2 (ENSPCTG00005012273)	ATP8B4 (ENSPCTG00005012571)	DTWD1 (ENSPCTG00005012831)	FAM227B (ENSPCTG00005012868)	FGF7 (ENSPCTG00005013150)	GALK2 (ENSPCTG00005013239)	COPS2 (ENSPCTG00005013416)	SECISBP2L (ENSPCTG00005013698)	SHC4 (ENSPCTG00005013829)	EID1 (ENSPCTG00005014143)	CEP152 (ENSPCTG00005014169)	FBN1 (ENSPCTG00005014246)	ENSPCTG00005015021	SLC12A1 (ENSPCTG00005015544)	CTXN2 (ENSPCTG00005016323)
Blue whale	MODERN SPECIES	11	ENSBMSG00010004570 #13	ENSBMSG00010004614 #13	ENSBMSG00010004634 #13	ENSBMSG00010004647	ENSBMSG00010004669	TNFAIP8L3 (ENSBMSG00010004677) #14	AP4E1 (ENSBMSG00010004683)	SPPL2A (ENSBMSG00010004699)	TRPM7 (ENSBMSG00010004784)	USP50 (ENSBMSG00010004807) #20	ENSBMSG00010004816	USP8 (ENSBMSG00010004840) #21	ENSBMSG00010004870	ENSBMSG00010000006	GABPB1 (ENSBMSG00010000014)	HDC (ENSBMSG00010000060) #22	SLC27A2 (ENSBMSG00010000133)	ATP8B4 (ENSBMSG00010000210)	DTWD1 (ENSBMSG00010000263)	FAM227B (ENSBMSG00010000310)	FGF7 (ENSBMSG00010000387)	GALK2 (ENSBMSG00010000446)	COPS2 (ENSBMSG00010000546)	ENSBMSG00010000637	SECISBP2L (ENSBMSG00010000662)	SHC4 (ENSBMSG00010000726)	ENSBMSG00010000767	CEP152 (ENSBMSG00010000790)	FBN1 (ENSBMSG00010000886)	ENSBMSG00010000939	SLC12A1 (ENSBMSG00010001064)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.C.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.eb.a	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.j #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.C.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.eb.a	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.j #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C.b	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.eb.a	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.j #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.eb.a	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
Bos	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000378.d.b.gb.c.a	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.j #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000154796.C.b.a	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.eb.a	ENSGT00940000158030
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000378.d.b.gb.c.a	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.j #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000154796.C.b.a	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.eb.a	ENSGT00940000158030
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	1	LYSMD2 (ENSBIXG00005016362) #16	SCG3 (ENSBIXG00005016339) #15	DMXL2 (ENSBIXG00005016290) #11	GLDN (ENSBIXG00005002586) #12	CYP19A1 (ENSBIXG00005002570) #13	TNFAIP8L3 (ENSBIXG00005007460) #14	AP4E1 (ENSBIXG00005016092)	ENSBIXG00005002557	SPPL2A (ENSBIXG00005002553)	TRPM7 (ENSBIXG00005000101)	ENSBIXG00005015898	USP50 (ENSBIXG00005002497) #20	USP8 (ENSBIXG00005015842) #21	GABPB1 (ENSBIXG00005015740)	ENSBIXG00005015549	HDC (ENSBIXG00005015532) #22	SLC27A2 (ENSBIXG00005015472)	ATP8B4 (ENSBIXG00005015376)	DTWD1 (ENSBIXG00005015228)	FAM227B (ENSBIXG00005015185)	FGF7 (ENSBIXG00005007016)	ENSBIXG00005015037	GALK2 (ENSBIXG00005015016)	COPS2 (ENSBIXG00005014970)	SECISBP2L (ENSBIXG00005014835)	ENSBIXG00005014780	SHC4 (ENSBIXG00005014771)	ENSBIXG00005014751	ENSBIXG00005014729	CEP152 (ENSBIXG00005002058)	FBN1 (ENSBIXG00005014593)
Cow	MODERN SPECIES	1	LYSMD2 (ENSBTAG00000017683) #16	SCG3 (ENSBTAG00000017677) #15	ENSBTAG00000050593	DMXL2 (ENSBTAG00000000737) #11	GLDN (ENSBTAG00000002576) #12	CYP19A1 (ENSBTAG00000014890) #13	TNFAIP8L3 (ENSBTAG00000010472) #14	AP4E1 (ENSBTAG00000013616)	SPPL2A (ENSBTAG00000011831)	TRPM7 (ENSBTAG00000031165)	USP8 (ENSBTAG00000011916) #21	ENSBTAG00000052971	USP50 (ENSBTAG00000011929) #20	GABPB1 (ENSBTAG00000022801)	ENSBTAG00000054826	HDC (ENSBTAG00000009911) #22	SLC27A2 (ENSBTAG00000004303)	ATP8B4 (ENSBTAG00000011936)	DTWD1 (ENSBTAG00000006201)	FAM227B (ENSBTAG00000053150)	FGF7 (ENSBTAG00000051898)	GALK2 (ENSBTAG00000004011)	COPS2 (ENSBTAG00000013425)	SECISBP2L (ENSBTAG00000046553)	SHC4 (ENSBTAG00000022583)	ENSBTAG00000005217	EID1 (ENSBTAG00000027764)	CEP152 (ENSBTAG00000011661)	FBN1 (ENSBTAG00000002278)	DUT (ENSBTAG00000011998)	SLC12A1 (ENSBTAG00000010145)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000378.d.b.gb.c.a	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.j #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000154796.C.b.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.eb.a	ENSGT00940000158030
Wild yak	MODERN SPECIES	467														USP8 (ENSBMUG00000022875) #21	GABPB1 (ENSBMUG00000022829)	HDC (ENSBMUG00000022811) #22
Domestic yak	MODERN SPECIES	2	LYSMD2 (ENSBGRG00000008885) #16	ENSBGRG00000008931	SCG3 (ENSBGRG00000008958) #15	DMXL2 (ENSBGRG00000009228) #11	GLDN (ENSBGRG00000009477) #12	ENSBGRG00000009541 #13	TNFAIP8L3 (ENSBGRG00000009620) #14	AP4E1 (ENSBGRG00000009637)	SPPL2A (ENSBGRG00000009830)	TRPM7 (ENSBGRG00000010039)	ENSBGRG00000010845	USP50 (ENSBGRG00000010940) #20	USP8 (ENSBGRG00000011116) #21	ENSBGRG00000011710	GABPB1 (ENSBGRG00000011755)	HDC (ENSBGRG00000011998) #22	SLC27A2 (ENSBGRG00000012326)	ATP8B4 (ENSBGRG00000012550)	DTWD1 (ENSBGRG00000012645)	FAM227B (ENSBGRG00000012687)	FGF7 (ENSBGRG00000013093)	GALK2 (ENSBGRG00000013156)	ENSBGRG00000013382	COPS2 (ENSBGRG00000013413)	SECISBP2L (ENSBGRG00000014018)	SHC4 (ENSBGRG00000014591)	ENSBGRG00000014971	ENSBGRG00000014994	CEP152 (ENSBGRG00000015031)	FBN1 (ENSBGRG00000015364)	ENSBGRG00000016185
American bison	MODERN SPECIES	3046	TMOD3 (ENSBBBG00000010655) #17	TMOD2 (ENSBBBG00000010651)	LYSMD2 (ENSBBBG00000006760) #16	SCG3 (ENSBBBG00000025459) #15	DMXL2 (ENSBBBG00000007858) #11	GLDN (ENSBBBG00000025074) #12	CYP19A1 (ENSBBBG00000025027) #13	TNFAIP8L3 (ENSBBBG00000006591) #14	AP4E1 (ENSBBBG00000024954)	SPPL2A (ENSBBBG00000008228)	TRPM7 (ENSBBBG00000006819)	ENSBBBG00000000206	USP50 (ENSBBBG00000000210) #20	USP8 (ENSBBBG00000006450) #21	GABPB1 (ENSBBBG00000024554)	HDC (ENSBBBG00000024497) #22	SLC27A2 (ENSBBBG00000008894)	ATP8B4 (ENSBBBG00000024325)	DTWD1 (ENSBBBG00000024231)	FAM227B (ENSBBBG00000024210)	FGF7 (ENSBBBG00000024162)	GALK2 (ENSBBBG00000006282)	COPS2 (ENSBBBG00000006261)	SECISBP2L (ENSBBBG00000024009)	SHC4 (ENSBBBG00000023940)	ENSBBBG00000008317	CEP152 (ENSBBBG00000007294)	FBN1 (ENSBBBG00000008419)	DUT (ENSBBBG00000023725)	SLC12A1 (ENSBBBG00000023647)	CTXN2 (ENSBBBG00000023315)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915.j #13	ENSGT00840000129915.i #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.C.b	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00990000208676	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.fb	ENSGT00940000158030
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	23	TMOD3 (ENSOARG00020025709) #17	TMOD2 (ENSOARG00020025714)	LYSMD2 (ENSOARG00020025732) #16	SCG3 (ENSOARG00020025738) #15	DMXL2 (ENSOARG00020025748) #11	GLDN (ENSOARG00020025773) #12	CYP19 (ENSOARG00020025784) #13	ENSOARG00020025789 #13	TNFAIP8L3 (ENSOARG00020025791) #14	AP4E1 (ENSOARG00020025796)	SPPL2A (ENSOARG00020003032)	TRPM7 (ENSOARG00020003229)	USP8 (ENSOARG00020004691) #21	USP50 (ENSOARG00020005040) #20	GABPB1 (ENSOARG00020005089)	HDC (ENSOARG00020005236) #22	SLC27A2 (ENSOARG00020005413)	ATP8B4 (ENSOARG00020005521)	DTWD1 (ENSOARG00020005620)	FAM227B (ENSOARG00020005651)	FGF7 (ENSOARG00020005708)	GALK2 (ENSOARG00020005733)	COPS2 (ENSOARG00020005884)	SECISBP2L (ENSOARG00020005980)	SHC4 (ENSOARG00020006073)	ENSOARG00020006136	CEP152 (ENSOARG00020006167)	ENSOARG00020006361	FBN1 (ENSOARG00020006413)	ENSOARG00020006888	SLC12A1 (ENSOARG00020007145)
Goat	MODERN SPECIES	1	TMOD3 (ENSCHIG00000021290) #17	TMOD2 (ENSCHIG00000023304)	LYSMD2 (ENSCHIG00000010565) #16	SCG3 (ENSCHIG00000025094) #15	DMXL2 (ENSCHIG00000012762) #11	GLDN (ENSCHIG00000025761) #12	CYP19A1 (ENSCHIG00000019108) #13	ENSCHIG00000019271 #13	TNFAIP8L3 (ENSCHIG00000022861) #14	AP4E1 (ENSCHIG00000013640)	SPPL2A (ENSCHIG00000020318)	TRPM7 (ENSCHIG00000012697)	USP50 (ENSCHIG00000010248) #20	USP8 (ENSCHIG00000013071) #21	GABPB1 (ENSCHIG00000010179)	HDC (ENSCHIG00000017262) #22	SLC27A2 (ENSCHIG00000016543)	ATP8B4 (ENSCHIG00000020664)	DTWD1 (ENSCHIG00000011812)	ENSCHIG00000020807	FGF7 (ENSCHIG00000015574)	GALK2 (ENSCHIG00000021093)	COPS2 (ENSCHIG00000021490)	SECISBP2L (ENSCHIG00000017527)	ENSCHIG00000007799	SHC4 (ENSCHIG00000013813)	CEP152 (ENSCHIG00000020655)	ENSCHIG00000008960	ENSCHIG00000016675	FBN1 (ENSCHIG00000021045)	ENSCHIG00000010553
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	257	TMOD3 (ENSMMSG00000007942) #17	ENSMMSG00000007986	LYSMD2 (ENSMMSG00000008168) #16	SCG3 (ENSMMSG00000008191) #15	DMXL2 (ENSMMSG00000008260) #11	ENSMMSG00000008364	GLDN (ENSMMSG00000008387) #12	CYP19A1 (ENSMMSG00000008477) #13	TNFAIP8L3 (ENSMMSG00000008559) #14	AP4E1 (ENSMMSG00000008584)	SPPL2A (ENSMMSG00000008629)	TRPM7 (ENSMMSG00000008711)	USP50 (ENSMMSG00000008838) #20	USP8 (ENSMMSG00000008930) #21	GABPB1 (ENSMMSG00000009079)	HDC (ENSMMSG00000009304) #22	SLC27A2 (ENSMMSG00000009495)	ATP8B4 (ENSMMSG00000009612)	DTWD1 (ENSMMSG00000009668)	FAM227B (ENSMMSG00000009713)	FGF7 (ENSMMSG00000009828)	GALK2 (ENSMMSG00000009852)	COPS2 (ENSMMSG00000009947)	SECISBP2L (ENSMMSG00000010062)	SHC4 (ENSMMSG00000010146)	ENSMMSG00000010244	CEP152 (ENSMMSG00000010287)	ENSMMSG00000010395	ENSMMSG00000010418	FBN1 (ENSMMSG00000010464)	ENSMMSG00000010905
Yarkand deer	MODERN SPECIES	3	ENSCHYG00000005653	TMOD2 (ENSCHYG00000005690)	LYSMD2 (ENSCHYG00000005755) #16	SCG3 (ENSCHYG00000005796) #15	ENSCHYG00000005885	DMXL2 (ENSCHYG00000005927) #11	GLDN (ENSCHYG00000006071) #12	TNFAIP8L3 (ENSCHYG00000006220) #14	AP4E1 (ENSCHYG00000006273)	ENSCHYG00000006470	TRPM7 (ENSCHYG00000006608)	USP50 (ENSCHYG00000006996) #20	USP8 (ENSCHYG00000007093) #21	ENSCHYG00000007280	GABPB1 (ENSCHYG00000007299)	HDC (ENSCHYG00000007411) #22	SLC27A2 (ENSCHYG00000007515)	ATP8B4 (ENSCHYG00000007591)	DTWD1 (ENSCHYG00000007636)	FAM227B (ENSCHYG00000007685)	FGF7 (ENSCHYG00000007894)	GALK2 (ENSCHYG00000007932)	COPS2 (ENSCHYG00000008031)	SECISBP2L (ENSCHYG00000008131)	SHC4 (ENSCHYG00000008290)	ENSCHYG00000008356	ENSCHYG00000008383	CEP152 (ENSCHYG00000008408)	FBN1 (ENSCHYG00000008666)	ENSCHYG00000009220	SLC12A1 (ENSCHYG00000009510)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.C	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000157397
Arabian camel	MODERN SPECIES	32	SCG3 (ENSCDRG00005017511) #15	DMXL2 (ENSCDRG00005017610) #11	GLDN (ENSCDRG00005018113) #12	ENSCDRG00005018180 #13	ENSCDRG00005018244 #13	ENSCDRG00005018295 #13	ENSCDRG00005018413 #13	TNFAIP8L3 (ENSCDRG00005018434) #14	ENSCDRG00005018450	AP4E1 (ENSCDRG00005018470)	SPPL2A (ENSCDRG00005018587)	TRPM7 (ENSCDRG00005018732)	USP50 (ENSCDRG00005018896) #20	USP8 (ENSCDRG00005018956) #21	GABPB1 (ENSCDRG00005019093)	HDC (ENSCDRG00005019210) #22	SLC27A2 (ENSCDRG00005019239)	ATP8B4 (ENSCDRG00005019304)	ENSCDRG00005019464	DTWD1 (ENSCDRG00005019472)	FAM227B (ENSCDRG00005019494)	FGF7 (ENSCDRG00005019583)	GALK2 (ENSCDRG00005019606)	COPS2 (ENSCDRG00005019662)	SECISBP2L (ENSCDRG00005019710)	SHC4 (ENSCDRG00005019741)	ENSCDRG00005019782	CEP152 (ENSCDRG00005019796)	FBN1 (ENSCDRG00005019854)	ENSCDRG00005020063	DUT (ENSCDRG00005006369)
Alpaca	MODERN SPECIES	3332																HDC (ENSVPAG00000001888) #22	SLC27A2 (ENSVPAG00000001887)	ATP8B4 (ENSVPAG00000001886)
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	1017																ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137
Hedgehog	MODERN SPECIES	3784																HDC (ENSEEUG00000013767) #22	SLC27A2 (ENSEEUG00000013714)
Common shrew	MODERN SPECIES	7038																HDC (ENSSARG00000006351) #22	ENSSARG00000006317
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00940000175727	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Primates	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00940000175727	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00940000175727	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00940000175727	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	281	LEO1 (ENSPSMG00000017949) #18	TMOD3 (ENSPSMG00000018010) #17	TMOD2 (ENSPSMG00000018041)	ENSPSMG00000018061 #16	SCG3 (ENSPSMG00000018102) #15	DMXL2 (ENSPSMG00000018217) #11	GLDN (ENSPSMG00000018240) #12	CYP19A1 (ENSPSMG00000018278) #13	TNFAIP8L3 (ENSPSMG00000018293) #14	AP4E1 (ENSPSMG00000018319)	SPPL2A (ENSPSMG00000018360)	TRPM7 (ENSPSMG00000018555)	USP50 (ENSPSMG00000018698) #20	USP8 (ENSPSMG00000018736) #21	GABPB1 (ENSPSMG00000018771)	HDC (ENSPSMG00000018805) #22	SLC27A2 (ENSPSMG00000018822)	ATP8B4 (ENSPSMG00000018886)	DTWD1 (ENSPSMG00000018903)	ENSPSMG00000018907	FGF7 (ENSPSMG00000018916)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	424										AP4E1 (ENSPCOG00000019301)	SPPL2A (ENSPCOG00000015701)	TRPM7 (ENSPCOG00000028104)	ENSPCOG00000020743	USP50 (ENSPCOG00000027706) #20	USP8 (ENSPCOG00000026775) #21	HDC (ENSPCOG00000013488) #22	SLC27A2 (ENSPCOG00000003546)	ATP8B4 (ENSPCOG00000025693)	ENSPCOG00000009623	ENSPCOG00000027901	DTWD1 (ENSPCOG00000000343)	FGF7 (ENSPCOG00000025535)	ENSPCOG00000027669	ENSPCOG00000027600	GALK2 (ENSPCOG00000016316)	COPS2 (ENSPCOG00000013132)	SECISBP2L (ENSPCOG00000014679)	SHC4 (ENSPCOG00000015169)	CEP152 (ENSPCOG00000027728)	FBN1 (ENSPCOG00000026107)	ENSPCOG00000018855
Mouse lemur	MODERN SPECIES	22	ENSMICG00000041955	TMOD3 (ENSMICG00000006216) #17	LYSMD2 (ENSMICG00000034220) #16	SCG3 (ENSMICG00000010286) #15	DMXL2 (ENSMICG00000010807) #11	GLDN (ENSMICG00000030199) #12	CYP19A1 (ENSMICG00000041874) #13	ENSMICG00000031384 #14	ENSMICG00000010752	ENSMICG00000047242	SPPL2A (ENSMICG00000010743)	TRPM7 (ENSMICG00000010294)	USP50 (ENSMICG00000001120) #20	USP8 (ENSMICG00000005859) #21	GABPB1 (ENSMICG00000027983)	HDC (ENSMICG00000003503) #22	SLC27A2 (ENSMICG00000003492)	ATP8B4 (ENSMICG00000003484)	DTWD1 (ENSMICG00000032408)	FAM227B (ENSMICG00000013037)	FGF7 (ENSMICG00000013048)	GALK2 (ENSMICG00000013027)	ENSMICG00000035032	SECISBP2L (ENSMICG00000013007)	SHC4 (ENSMICG00000035080)	EID1 (ENSMICG00000028947)	CEP152 (ENSMICG00000012585)	FBN1 (ENSMICG00000013056)	ENSMICG00000013050	SLC12A1 (ENSMICG00000013031)	MYEF2 (ENSMICG00000014513)
Bushbaby	MODERN SPECIES	126	LEO1 (ENSOGAG00000002254) #18	TMOD3 (ENSOGAG00000002253) #17	TMOD2 (ENSOGAG00000013745)	LYSMD2 (ENSOGAG00000013741) #16	SCG3 (ENSOGAG00000013737) #15	ENSOGAG00000034281	DMXL2 (ENSOGAG00000013716) #11	GLDN (ENSOGAG00000013711) #12	CYP19A1 (ENSOGAG00000001848) #13	TNFAIP8L3 (ENSOGAG00000024393) #14	AP4E1 (ENSOGAG00000027801)	SPPL2A (ENSOGAG00000012784)	TRPM7 (ENSOGAG00000012316)	USP50 (ENSOGAG00000012313) #20	USP8 (ENSOGAG00000012308) #21	HDC (ENSOGAG00000004638) #22	SLC27A2 (ENSOGAG00000004637)	ENSOGAG00000034285	GABPB1 (ENSOGAG00000004640)	ATP8B4 (ENSOGAG00000002188)	DTWD1 (ENSOGAG00000013291)	FGF7 (ENSOGAG00000013290)	GALK2 (ENSOGAG00000013286)	COPS2 (ENSOGAG00000013284)	SECISBP2L (ENSOGAG00000013280)	ENSOGAG00000031612	SHC4 (ENSOGAG00000013273)	CEP152 (ENSOGAG00000013259)	FBN1 (ENSOGAG00000009566)	DUT (ENSOGAG00000028847)	SLC12A1 (ENSOGAG00000010916)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00910000147635	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000155753.h	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000157722.d	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00910000147635	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542.o #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00910000147140.a	ENSGT00940000155753.h	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000157722.d	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000016493.b.a	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542.o #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000155753.h	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000157722.d	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc
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Pan	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000016493.b.a	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542.o #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000155753.h	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000157722.d	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc	ENSGT00940000158030
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Gorilla	MODERN SPECIES	6	ENSGGOG00000026003	TMOD3 (ENSGGOG00000036537) #17	TMOD2 (ENSGGOG00000015671)	ENSGGOG00000021952 #16	SCG3 (ENSGGOG00000002662) #15	DMXL2 (ENSGGOG00000014666) #11	GLDN (ENSGGOG00000003454) #12	CYP19A1 (ENSGGOG00000014029) #13	ENSGGOG00000022663 #14	AP4E1 (ENSGGOG00000011600)	SPPL2A (ENSGGOG00000013154)	TRPM7 (ENSGGOG00000027678)	USP50 (ENSGGOG00000016014) #20	USP8 (ENSGGOG00000024945) #21	GABPB1 (ENSGGOG00000007783)	HDC (ENSGGOG00000006092) #22	SLC27A2 (ENSGGOG00000006087)	ATP8B4 (ENSGGOG00000015212)	DTWD1 (ENSGGOG00000027921)	FGF7 (ENSGGOG00000005378)	ENSGGOG00000022889	FAM227B (ENSGGOG00000042553)	GALK2 (ENSGGOG00000002838)	COPS2 (ENSGGOG00000002827)	SECISBP2L (ENSGGOG00000007289)	SHC4 (ENSGGOG00000010408)	CEP152 (ENSGGOG00000000404)	ENSGGOG00000037122	FBN1 (ENSGGOG00000003292)	ENSGGOG00000005658	SLC12A1 (ENSGGOG00000000757)
Orangutan	MODERN SPECIES	6	LEO1 (ENSPPYG00000006481) #18	TMOD3 (ENSPPYG00000006480) #17	TMOD2 (ENSPPYG00000006479)	LYSMD2 (ENSPPYG00000006478) #16	SCG3 (ENSPPYG00000006477) #15	DMXL2 (ENSPPYG00000029802) #11	GLDN (ENSPPYG00000006476) #12	CYP19A1 (ENSPPYG00000006475) #13	ENSPPYG00000006474 #14	AP4E1 (ENSPPYG00000006473)	SPPL2A (ENSPPYG00000006472)	TRPM7 (ENSPPYG00000006471)	USP50 (ENSPPYG00000006470) #20	USP8 (ENSPPYG00000006469) #21	GABPB1 (ENSPPYG00000006468)	HDC (ENSPPYG00000006467) #22	SLC27A2 (ENSPPYG00000006466)	ENSPPYG00000034899	ATP8B4 (ENSPPYG00000006465)	DTWD1 (ENSPPYG00000006464)	FGF7 (ENSPPYG00000039648)	FAM227B (ENSPPYG00000006462)	GALK2 (ENSPPYG00000006463)	COPS2 (ENSPPYG00000006460)	SECISBP2L (ENSPPYG00000006459)	ENSPPYG00000032718	SHC4 (ENSPPYG00000006457)	CEP152 (ENSPPYG00000006456)	FBN1 (ENSPPYG00000006455)	ENSPPYG00000006454	SLC12A1 (ENSPPYG00000006453)
Gibbon	MODERN SPECIES	21	SCG3 (ENSNLEG00000006436) #15	DMXL2 (ENSNLEG00000006382) #11	GLDN (ENSNLEG00000006380) #12	CYP19A1 (ENSNLEG00000006364) #13	ENSNLEG00000027408	ENSNLEG00000006361 #14	AP4E1 (ENSNLEG00000006329)	ENSNLEG00000032043	SPPL2A (ENSNLEG00000006313)	TRPM7 (ENSNLEG00000006292)	ENSNLEG00000034559	ENSNLEG00000032168 #20	USP8 (ENSNLEG00000006246) #21	ENSNLEG00000031262	GABPB1 (ENSNLEG00000006227)	HDC (ENSNLEG00000006211) #22	SLC27A2 (ENSNLEG00000006196)	ATP8B4 (ENSNLEG00000006176)	ENSNLEG00000030237	ENSNLEG00000030399	DTWD1 (ENSNLEG00000034521)	FAM227B (ENSNLEG00000006158)	FGF7 (ENSNLEG00000006163)	GALK2 (ENSNLEG00000006148)	COPS2 (ENSNLEG00000006127)	SECISBP2L (ENSNLEG00000006102)	SHC4 (ENSNLEG00000006096)	CEP152 (ENSNLEG00000006071)	FBN1 (ENSNLEG00000006015)	DUT (ENSNLEG00000005996)	SLC12A1 (ENSNLEG00000005967)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00910000147635	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000155753.h	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000157722.d	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a.b #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00910000147635	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000155753.h	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000157722.d	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a.b #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00910000147635	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C.a.a	ENSGT00950000182838.C.b	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000155753.h	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843.g.b	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843.h	ENSGT00940000157722.d	ENSGT00940000159843.g.a	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a.b #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00910000147635	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C.a.a	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843.g.b	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843.h	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b.`b.a	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc.m.b	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	77	TMOD3 (ENSMNEG00000028320) #17	TMOD2 (ENSMNEG00000043126)	LYSMD2 (ENSMNEG00000042179) #16	SCG3 (ENSMNEG00000041747) #15	DMXL2 (ENSMNEG00000041811) #11	GLDN (ENSMNEG00000042338) #12	CYP19A1 (ENSMNEG00000037630) #13	ENSMNEG00000011449	TNFAIP8L3 (ENSMNEG00000005536) #14	AP4E1 (ENSMNEG00000034681)	SPPL2A (ENSMNEG00000032324)	TRPM7 (ENSMNEG00000034322)	USP50 (ENSMNEG00000033928) #20	USP8 (ENSMNEG00000023367) #21	GABPB1 (ENSMNEG00000031368)	HDC (ENSMNEG00000020730) #22	SLC27A2 (ENSMNEG00000034842)	ATP8B4 (ENSMNEG00000029784)	ENSMNEG00000005477	ENSMNEG00000042762	DTWD1 (ENSMNEG00000044996)	FAM227B (ENSMNEG00000037771)	FGF7 (ENSMNEG00000034668)	GALK2 (ENSMNEG00000039391)	COPS2 (ENSMNEG00000029711)	SECISBP2L (ENSMNEG00000032007)	SHC4 (ENSMNEG00000035410)	CEP152 (ENSMNEG00000033405)	FBN1 (ENSMNEG00000031686)	ENSMNEG00000041908	SLC12A1 (ENSMNEG00000025405)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a.b #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00910000147635	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C.a.a	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843.g.b	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843.g.a	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b.`b.a	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc.m.b	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Rhesus	MODERN SPECIES	17	LEO1 (ENSMMUG00000002346) #18	TMOD3 (ENSMMUG00000002345) #17	TMOD2 (ENSMMUG00000017432)	LYSMD2 (ENSMMUG00000017437) #16	SCG3 (ENSMMUG00000017435) #15	DMXL2 (ENSMMUG00000000754) #11	GLDN (ENSMMUG00000005976) #12	CYP19A1 (ENSMMUG00000002553) #13	TNFAIP8L3 (ENSMMUG00000001388) #14	AP4E1 (ENSMMUG00000015159)	ENSMMUG00000052556	TRPM7 (ENSMMUG00000008575)	USP50 (ENSMMUG00000008574) #20	USP8 (ENSMMUG00000014884) #21	GABPB1 (ENSMMUG00000002879)	HDC (ENSMMUG00000002877) #22	SLC27A2 (ENSMMUG00000002876)	ENSMMUG00000057283	ATP8B4 (ENSMMUG00000003684)	ENSMMUG00000050608	ENSMMUG00000056522	DTWD1 (ENSMMUG00000013496)	FGF7 (ENSMMUG00000009842)	FAM227B (ENSMMUG00000009840)	ENSMMUG00000049831	GALK2 (ENSMMUG00000009839)	COPS2 (ENSMMUG00000009838)	SECISBP2L (ENSMMUG00000009837)	SHC4 (ENSMMUG00000009833)	CEP152 (ENSMMUG00000009829)	FBN1 (ENSMMUG00000004239)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	17	TMOD3 (ENSMFAG00000045173) #17	LYSMD2 (ENSMFAG00000001285) #16	SCG3 (ENSMFAG00000031824) #15	DMXL2 (ENSMFAG00000035773) #11	GLDN (ENSMFAG00000041483) #12	ENSMFAG00000064052	CYP19A1 (ENSMFAG00000038412) #13	TNFAIP8L3 (ENSMFAG00000046411) #14	ENSMFAG00000053030	AP4E1 (ENSMFAG00000045764)	SPPL2A (ENSMFAG00000036983)	TRPM7 (ENSMFAG00000031753)	USP50 (ENSMFAG00000043824) #20	ENSMFAG00000033355 #21	GABPB1 (ENSMFAG00000004070)	HDC (ENSMFAG00000000845) #22	SLC27A2 (ENSMFAG00000038376)	ATP8B4 (ENSMFAG00000034721)	DTWD1 (ENSMFAG00000058237)	FGF7 (ENSMFAG00000064609)	FAM227B (ENSMFAG00000035254)	GALK2 (ENSMFAG00000000451)	ENSMFAG00000003309	ENSMFAG00000051616	SECISBP2L (ENSMFAG00000001802)	SHC4 (ENSMFAG00000038568)	CEP152 (ENSMFAG00000040377)	FBN1 (ENSMFAG00000041075)	DUT (ENSMFAG00000037325)	SLC12A1 (ENSMFAG00000031713)	CTXN2 (ENSMFAG00000065829)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	30					ENSGT00390000000096.b.a.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00910000147635	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C.b	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00910000147140	ENSGT00940000155753.h	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843.h	ENSGT00940000157722.d	ENSGT00940000159843.g.b	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b.k	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b.l
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	100					ENSGT00390000000096.b.a.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00910000147635	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C.b	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00910000147140	ENSGT00940000155753.h	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843.h	ENSGT00940000157722.d	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b.l	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	130					ENSCATG00000032447 #11	GLDN (ENSCATG00000029273) #12	ENSCATG00000000723	CYP19A1 (ENSCATG00000023085) #13	TNFAIP8L3 (ENSCATG00000043901) #14	AP4E1 (ENSCATG00000031112)	SPPL2A (ENSCATG00000034691)	TRPM7 (ENSCATG00000038396)	USP50 (ENSCATG00000011670) #20	USP8 (ENSCATG00000043193) #21	GABPB1 (ENSCATG00000015466)	HDC (ENSCATG00000042342) #22	SLC27A2 (ENSCATG00000037910)	ATP8B4 (ENSCATG00000013473)	ENSCATG00000033138	DTWD1 (ENSCATG00000032469)	FGF7 (ENSCATG00000043126)	ENSCATG00000039047	FAM227B (ENSCATG00000029979)	GALK2 (ENSCATG00000034152)	COPS2 (ENSCATG00000029862)	SECISBP2L (ENSCATG00000033967)	SHC4 (ENSCATG00000039953)	CEP152 (ENSCATG00000014580)	FBN1 (ENSCATG00000019781)	ENSCATG00000038736	SLC12A1 (ENSCATG00000041847)
Drill	MODERN SPECIES	1188					ENSMLEG00000025555 #11	GLDN (ENSMLEG00000034123) #12	CYP19A1 (ENSMLEG00000042379) #13	ENSMLEG00000024309	TNFAIP8L3 (ENSMLEG00000035175) #14	AP4E1 (ENSMLEG00000044424)	SPPL2A (ENSMLEG00000030844)	TRPM7 (ENSMLEG00000033742)	USP50 (ENSMLEG00000034934) #20	USP8 (ENSMLEG00000028256) #21	GABPB1 (ENSMLEG00000030632)	HDC (ENSMLEG00000029523) #22	SLC27A2 (ENSMLEG00000015925)	ATP8B4 (ENSMLEG00000040408)	ENSMLEG00000037613	ENSMLEG00000040924
Olive baboon	DUPLICATION
Olive baboon	MODERN SPECIES	17	ENSPANG00000041088	ENSPANG00000017748	ENSPANG00000017729	EID1 (ENSPANG00000011518)	ENSPANG00000017733	ENSPANG00000017735	COPS2 (ENSPANG00000017736)	GALK2 (ENSPANG00000017737)	ENSPANG00000017738	ENSPANG00000017726	ENSPANG00000017727	ENSPANG00000040207	ENSPANG00000043467	ENSPANG00000017728	GABPB1 (ENSPANG00000017688)	ENSPANG00000017687 #22	ENSPANG00000017686	ENSPANG00000046860	SPPL2A (ENSPANG00000017548)	ENSPANG00000017547	ENSPANG00000017449	ENSPANG00000033742	ENSPANG00000017454 #19	ENSPANG00000017453 #18	ENSPANG00000017481 #17	ENSPANG00000017484 #16	ENSPANG00000017483 #15	ENSPANG00000044179	ENSPANG00000045860	ENSPANG00000017451	ENSPANG00000017406
Olive baboon	MODERN SPECIES	42															ENSPANG00000036915	ENSPANG00000038704 #22	ENSPANG00000039154	ENSPANG00000048177
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	18	LEO1 (ENSCSAG00000011342) #18	TMOD3 (ENSCSAG00000011333) #17	TMOD2 (ENSCSAG00000011323)	LYSMD2 (ENSCSAG00000011314) #16	SCG3 (ENSCSAG00000011309) #15	DMXL2 (ENSCSAG00000011292) #11	GLDN (ENSCSAG00000011271) #12	CYP19A1 (ENSCSAG00000011238) #13	TNFAIP8L3 (ENSCSAG00000011156) #14	AP4E1 (ENSCSAG00000011146)	SPPL2A (ENSCSAG00000011133)	TRPM7 (ENSCSAG00000011086)	USP50 (ENSCSAG00000010971) #20	USP8 (ENSCSAG00000010966) #21	GABPB1 (ENSCSAG00000010961)	HDC (ENSCSAG00000010931) #22	SLC27A2 (ENSCSAG00000010869)	ATP8B4 (ENSCSAG00000010829)	DTWD1 (ENSCSAG00000010703)	FAM227B (ENSCSAG00000010690)	FGF7 (ENSCSAG00000010662)	GALK2 (ENSCSAG00000010657)	COPS2 (ENSCSAG00000010648)	SECISBP2L (ENSCSAG00000010632)	ENSCSAG00000010619	SHC4 (ENSCSAG00000010594)	EID1 (ENSCSAG00000019745)	CEP152 (ENSCSAG00000010548)	FBN1 (ENSCSAG00000010524)	DUT (ENSCSAG00000010486)	SLC12A1 (ENSCSAG00000010449)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	103	ENSGT00390000016493.b.a	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722.c	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000155753.h	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00390000001627.f.a.a.a	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc	ENSGT00940000165725
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1270						ENSRBIG00000039837 #11	GLDN (ENSRBIG00000031288) #12	CYP19A1 (ENSRBIG00000044028) #13	TNFAIP8L3 (ENSRBIG00000041296) #14	AP4E1 (ENSRBIG00000043072)	SPPL2A (ENSRBIG00000043618)	TRPM7 (ENSRBIG00000035887)	USP50 (ENSRBIG00000034159) #20	USP8 (ENSRBIG00000039162) #21	GABPB1 (ENSRBIG00000035389)	HDC (ENSRBIG00000030245) #22	SLC27A2 (ENSRBIG00000033922)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	3108						GLDN (ENSRROG00000044325) #12	CYP19A1 (ENSRROG00000027796) #13	TNFAIP8L3 (ENSRROG00000041522) #14	AP4E1 (ENSRROG00000040786)	ENSRROG00000032221	SPPL2A (ENSRROG00000040385)	TRPM7 (ENSRROG00000032172)	USP50 (ENSRROG00000034198) #20	USP8 (ENSRROG00000032034) #21	GABPB1 (ENSRROG00000018680)	HDC (ENSRROG00000031354) #22	SLC27A2 (ENSRROG00000043255)	ATP8B4 (ENSRROG00000041373)	ENSRROG00000045562	DTWD1 (ENSRROG00000003611)	FAM227B (ENSRROG00000010536)	FGF7 (ENSRROG00000032138)	ENSRROG00000035058	ENSRROG00000009461	COPS2 (ENSRROG00000041296)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc.q.b	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc.r	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.jc.r	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
Capuchin	MODERN SPECIES	9	MSC (ENSCCAG00000035736)	EYA1 (ENSCCAG00000030553)	XKR9 (ENSCCAG00000037032)	LACTB2 (ENSCCAG00000002927)	TRAM1 (ENSCCAG00000019006)	ENSCCAG00000034778	NCOA2 (ENSCCAG00000010036)	ENSCCAG00000026839	PRDM14 (ENSCCAG00000026032)	SLCO5A1 (ENSCCAG00000038101)	SULF1 (ENSCCAG00000025158)	C8orf34 (ENSCCAG00000037308)	PREX2 (ENSCCAG00000026088)	CPA6 (ENSCCAG00000024560)	GABPB1 (ENSCCAG00000020344)	HDC (ENSCCAG00000029275) #22	SLC27A2 (ENSCCAG00000026466)	ATP8B4 (ENSCCAG00000020420)	DTWD1 (ENSCCAG00000034288)	FAM227B (ENSCCAG00000030829)	FGF7 (ENSCCAG00000037731)	GALK2 (ENSCCAG00000009470)	COPS2 (ENSCCAG00000034198)	SECISBP2L (ENSCCAG00000030509)	SHC4 (ENSCCAG00000027114)	CEP152 (ENSCCAG00000035508)	ENSCCAG00000000946	FBN1 (ENSCCAG00000025962)	DUT (ENSCCAG00000028726)	SLC12A1 (ENSCCAG00000028938)	CTXN2 (ENSCCAG00000020504)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	73	EML1 (ENSSBOG00000024688)	ENSSBOG00000028054	TMOD2 (ENSSBOG00000026067)	LYSMD2 (ENSSBOG00000022696) #16	SCG3 (ENSSBOG00000028483) #15	DMXL2 (ENSSBOG00000021879) #11	GLDN (ENSSBOG00000026665) #12	CYP19A1 (ENSSBOG00000032300) #13	TNFAIP8L3 (ENSSBOG00000035937) #14	AP4E1 (ENSSBOG00000035637)	SPPL2A (ENSSBOG00000034961)	TRPM7 (ENSSBOG00000030864)	USP50 (ENSSBOG00000023047) #20	USP8 (ENSSBOG00000028249) #21	GABPB1 (ENSSBOG00000023162)	HDC (ENSSBOG00000029959) #22	SLC27A2 (ENSSBOG00000018319)	ENSSBOG00000033334	ATP8B4 (ENSSBOG00000034767)	ENSSBOG00000020229	DTWD1 (ENSSBOG00000009376)	FAM227B (ENSSBOG00000021531)	FGF7 (ENSSBOG00000029304)	GALK2 (ENSSBOG00000025258)	COPS2 (ENSSBOG00000024019)	SECISBP2L (ENSSBOG00000024354)	SHC4 (ENSSBOG00000011457)	ENSSBOG00000011389	ENSSBOG00000036086	CEP152 (ENSSBOG00000031306)	FBN1 (ENSSBOG00000024272)
Marmoset	MODERN SPECIES	1	ENSCJAG00000083944	TMOD3 (ENSCJAG00000048246) #17	LYSMD2 (ENSCJAG00000059165) #16	SCG3 (ENSCJAG00000001016) #15	DMXL2 (ENSCJAG00000001038) #11	ENSCJAG00000078614	GLDN (ENSCJAG00000001160) #12	CYP19A1 (ENSCJAG00000001188) #13	ENSCJAG00000073380	TNFAIP8L3 (ENSCJAG00000065209) #14	AP4E1 (ENSCJAG00000001217)	SPPL2A (ENSCJAG00000001267)	TRPM7 (ENSCJAG00000001322)	USP8 (ENSCJAG00000001378) #21	GABPB1 (ENSCJAG00000001449)	HDC (ENSCJAG00000001489) #22	SLC27A2 (ENSCJAG00000001504)	ATP8B4 (ENSCJAG00000001516)	DTWD1 (ENSCJAG00000001548)	FGF7 (ENSCJAG00000083241)	FAM227B (ENSCJAG00000001562)	GALK2 (ENSCJAG00000001580)	COPS2 (ENSCJAG00000001585)	SECISBP2L (ENSCJAG00000001637)	SHC4 (ENSCJAG00000001673)	CEP152 (ENSCJAG00000001706)	FBN1 (ENSCJAG00000001735)	DUT (ENSCJAG00000001813)	SLC12A1 (ENSCJAG00000001821)	CTXN2 (ENSCJAG00000040189)	MYEF2 (ENSCJAG00000001875)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	664	LYSMD2 (ENSANAG00000032260) #16	SCG3 (ENSANAG00000038079) #15	DMXL2 (ENSANAG00000038122) #11	GLDN (ENSANAG00000036122) #12	CYP19A1 (ENSANAG00000022843) #13	TNFAIP8L3 (ENSANAG00000032545) #14	AP4E1 (ENSANAG00000033916)	SPPL2A (ENSANAG00000020492)	TRPM7 (ENSANAG00000035495)	ENSANAG00000006598	USP8 (ENSANAG00000037924) #21	ENSANAG00000001540	ENSANAG00000006271	ENSANAG00000022805	GABPB1 (ENSANAG00000025207)	HDC (ENSANAG00000023809) #22	SLC27A2 (ENSANAG00000038506)	ENSANAG00000020984	ATP8B4 (ENSANAG00000029755)	DTWD1 (ENSANAG00000037736)	ENSANAG00000037534	FGF7 (ENSANAG00000035772)	FAM227B (ENSANAG00000033925)	GALK2 (ENSANAG00000034466)	COPS2 (ENSANAG00000033255)	SECISBP2L (ENSANAG00000027892)	EID1 (ENSANAG00000022853)	ENSANAG00000029738	SHC4 (ENSANAG00000038494)	CEP152 (ENSANAG00000027445)	FBN1 (ENSANAG00000004803)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Tree shrew	MODERN SPECIES	1957													ENSTBEG00000008343 #20	USP8 (ENSTBEG00000006988) #21	GABPB1 (ENSTBEG00000006382)	HDC (ENSTBEG00000005890) #22	SLC27A2 (ENSTBEG00000004758)
Glires	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Rabbit	MODERN SPECIES	8	LYSMD2 (ENSOCUG00000025598) #16	SCG3 (ENSOCUG00000025494) #15	DMXL2 (ENSOCUG00000005948) #11	GLDN (ENSOCUG00000006860) #12	CYP19A1 (ENSOCUG00000012303) #13	TNFAIP8L3 (ENSOCUG00000012295) #14	AP4E1 (ENSOCUG00000007193)	ENSOCUG00000039657	SPPL2A (ENSOCUG00000003710)	ENSOCUG00000036412	ENSOCUG00000033599	TRPM7 (ENSOCUG00000003125)	USP50 (ENSOCUG00000003117) #20	USP8 (ENSOCUG00000003686) #21	GABPB1 (ENSOCUG00000016849)	HDC (ENSOCUG00000016840) #22	SLC27A2 (ENSOCUG00000016831)	ATP8B4 (ENSOCUG00000008075)	ENSOCUG00000030060	ENSOCUG00000038570	ENSOCUG00000032086	DTWD1 (ENSOCUG00000016783)	FAM227B (ENSOCUG00000029524)	FGF7 (ENSOCUG00000006713)	GALK2 (ENSOCUG00000006461)	ENSOCUG00000036138	COPS2 (ENSOCUG00000006455)	SECISBP2L (ENSOCUG00000006443)	SHC4 (ENSOCUG00000006438)	EID1 (ENSOCUG00000025492)	CEP152 (ENSOCUG00000006424)
Pika	MODERN SPECIES	1665															ENSOPRG00000004895	HDC (ENSOPRG00000004870) #22	ENSOPRG00000004844
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00910000144338	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00910000144338	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00910000144338	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	116	TMOD3 (ENSCLAG00000009824) #17	TMOD2 (ENSCLAG00000011977)	ENSCLAG00000006958 #16	SCG3 (ENSCLAG00000007223) #15	DMXL2 (ENSCLAG00000009860) #11	GLDN (ENSCLAG00000009280) #12	CYP19A1 (ENSCLAG00000012685) #13	TNFAIP8L3 (ENSCLAG00000012480) #14	ENSCLAG00000012342	SPPL2A (ENSCLAG00000012765)	TRPM7 (ENSCLAG00000011050)	USP50 (ENSCLAG00000015654) #20	USP8 (ENSCLAG00000007502) #21	ENSCLAG00000007383	GABPB1 (ENSCLAG00000008550)	HDC (ENSCLAG00000011960) #22	SLC27A2 (ENSCLAG00000013393)	ATP8B4 (ENSCLAG00000011982)	DTWD1 (ENSCLAG00000014226)	FAM227B (ENSCLAG00000008942)	FGF7 (ENSCLAG00000008404)	GALK2 (ENSCLAG00000012869)	COPS2 (ENSCLAG00000013374)	SECISBP2L (ENSCLAG00000017094)	SHC4 (ENSCLAG00000014691)	EID1 (ENSCLAG00000008705)	CEP152 (ENSCLAG00000012592)	FBN1 (ENSCLAG00000014723)	DUT (ENSCLAG00000011626)	SLC12A1 (ENSCLAG00000008362)	CTXN2 (ENSCLAG00000011672)
Degu	MODERN SPECIES	146	TMOD2 (ENSODEG00000008645)	LYSMD2 (ENSODEG00000007006) #16	SCG3 (ENSODEG00000008588) #15	DMXL2 (ENSODEG00000007956) #11	ENSODEG00000019746	GLDN (ENSODEG00000010063) #12	CYP19A1 (ENSODEG00000007934) #13	TNFAIP8L3 (ENSODEG00000006955) #14	ENSODEG00000007172	SPPL2A (ENSODEG00000007784)	TRPM7 (ENSODEG00000008007)	USP50 (ENSODEG00000008119) #20	USP8 (ENSODEG00000007032) #21	ENSODEG00000008671	GABPB1 (ENSODEG00000007002)	HDC (ENSODEG00000007105) #22	SLC27A2 (ENSODEG00000007224)	ATP8B4 (ENSODEG00000010058)	DTWD1 (ENSODEG00000008473)	FGF7 (ENSODEG00000007753)	GALK2 (ENSODEG00000007459)	ENSODEG00000007686	SECISBP2L (ENSODEG00000007846)	ENSODEG00000007930	ENSODEG00000007307	CEP152 (ENSODEG00000008644)	FBN1 (ENSODEG00000007689)	ENSODEG00000008550	SLC12A1 (ENSODEG00000009402)	MYEF2 (ENSODEG00000007463)	SLC24A5 (ENSODEG00000010497)
Guinea pig	MODERN SPECIES	23	LEO1 (ENSCPOG00000009671) #18	TMOD3 (ENSCPOG00000002828) #17	TMOD2 (ENSCPOG00000012601)	LYSMD2 (ENSCPOG00000032986) #16	SCG3 (ENSCPOG00000014093) #15	DMXL2 (ENSCPOG00000009533) #11	GLDN (ENSCPOG00000034580) #12	CYP19A1 (ENSCPOG00000013810) #13	TNFAIP8L3 (ENSCPOG00000038999) #14	AP4E1 (ENSCPOG00000006153)	SPPL2A (ENSCPOG00000014127)	TRPM7 (ENSCPOG00000005405)	USP50 (ENSCPOG00000005401) #20	USP8 (ENSCPOG00000002205) #21	GABPB1 (ENSCPOG00000007407)	HDC (ENSCPOG00000027120) #22	SLC27A2 (ENSCPOG00000007399)	ATP8B4 (ENSCPOG00000015735)	DTWD1 (ENSCPOG00000003461)	FGF7 (ENSCPOG00000035241)	GALK2 (ENSCPOG00000003453)	COPS2 (ENSCPOG00000003447)	SECISBP2L (ENSCPOG00000003442)	EID1 (ENSCPOG00000031608)	ENSCPOG00000006525	CEP152 (ENSCPOG00000006518)	FBN1 (ENSCPOG00000004298)	DUT (ENSCPOG00000024107)	SLC12A1 (ENSCPOG00000005122)	CTXN2 (ENSCPOG00000031158)	MYEF2 (ENSCPOG00000010584)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	11	ENSHGLG00000039905	DNAAF4 (ENSHGLG00000015787)	PYGO1 (ENSHGLG00000034526)	PRTG (ENSHGLG00000009677)	NEDD4 (ENSHGLG00000013198)	ENSHGLG00000009904	ENSHGLG00000039885 #13	TNFAIP8L3 (ENSHGLG00000010967) #14	ENSHGLG00000012462	SPPL2A (ENSHGLG00000037024)	TRPM7 (ENSHGLG00000013915)	USP50 (ENSHGLG00000043391) #20	USP8 (ENSHGLG00000012639) #21	ENSHGLG00000014701	GABPB1 (ENSHGLG00000014271)	HDC (ENSHGLG00000010588) #22	SLC27A2 (ENSHGLG00000011641)	ATP8B4 (ENSHGLG00000012603)	DTWD1 (ENSHGLG00000048935)	ENSHGLG00000033635	FGF7 (ENSHGLG00000014214)	ENSHGLG00000016057	ENSHGLG00000009595	ENSHGLG00000010779	ENSHGLG00000018453	SHC4 (ENSHGLG00000011448)	EID1 (ENSHGLG00000046420)	CEP152 (ENSHGLG00000011145)	FBN1 (ENSHGLG00000010864)	ENSHGLG00000037945	DUT (ENSHGLG00000011864)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.xb.b	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	4	TMOD3 (ENSUPAG00010007589) #17	TMOD2 (ENSUPAG00010007615)	LYSMD2 (ENSUPAG00010007635) #16	SCG3 (ENSUPAG00010007640) #15	DMXL2 (ENSUPAG00010007657) #11	GLDN (ENSUPAG00010007827) #12	CYP19A1 (ENSUPAG00010007854) #13	ENSUPAG00010007875	TNFAIP8L3 (ENSUPAG00010007881) #14	AP4E1 (ENSUPAG00010007897)	SPPL2A (ENSUPAG00010008000)	TRPM7 (ENSUPAG00010008060)	USP50 (ENSUPAG00010008191) #20	USP8 (ENSUPAG00010008213) #21	GABPB1 (ENSUPAG00010008257)	HDC (ENSUPAG00010008336) #22	SLC27A2 (ENSUPAG00010008351)	ATP8B4 (ENSUPAG00010008357)	DTWD1 (ENSUPAG00010008408)	FAM227B (ENSUPAG00010008415)	FGF7 (ENSUPAG00010008449)	GALK2 (ENSUPAG00010008458)	COPS2 (ENSUPAG00010008477)	SECISBP2L (ENSUPAG00010008546)	SHC4 (ENSUPAG00010008562)	EID1 (ENSUPAG00010008597)	CEP152 (ENSUPAG00010008621)	FBN1 (ENSUPAG00010008765)	ENSUPAG00010008861	SLC12A1 (ENSUPAG00010008880)	CTXN2 (ENSUPAG00010009280)
Squirrel	MODERN SPECIES	71	ENSSTOG00000032278	LEO1 (ENSSTOG00000020671) #18	TMOD3 (ENSSTOG00000000249) #17	LYSMD2 (ENSSTOG00000015371) #16	SCG3 (ENSSTOG00000015355) #15	DMXL2 (ENSSTOG00000029061) #11	GLDN (ENSSTOG00000007455) #12	CYP19A1 (ENSSTOG00000006011) #13	TNFAIP8L3 (ENSSTOG00000005995) #14	AP4E1 (ENSSTOG00000005959)	SPPL2A (ENSSTOG00000005136)	TRPM7 (ENSSTOG00000000280)	USP50 (ENSSTOG00000000278) #20	USP8 (ENSSTOG00000005924) #21	GABPB1 (ENSSTOG00000016137)	HDC (ENSSTOG00000002266) #22	SLC27A2 (ENSSTOG00000021884)	ATP8B4 (ENSSTOG00000002248)	DTWD1 (ENSSTOG00000005426)	ENSSTOG00000029469	FGF7 (ENSSTOG00000027670)	GALK2 (ENSSTOG00000005373)	COPS2 (ENSSTOG00000005348)	SECISBP2L (ENSSTOG00000005317)	EID1 (ENSSTOG00000024210)	SHC4 (ENSSTOG00000003069)	CEP152 (ENSSTOG00000003043)	FBN1 (ENSSTOG00000007824)	ENSSTOG00000007811	SLC12A1 (ENSSTOG00000007768)	CTXN2 (ENSSTOG00000023277)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	7	TMOD3 (ENSMMMG00000015831) #17	TMOD2 (ENSMMMG00000015849)	ENSMMMG00000015923 #16	SCG3 (ENSMMMG00000015926) #15	DMXL2 (ENSMMMG00000015955) #11	GLDN (ENSMMMG00000016090) #12	CYP19A1 (ENSMMMG00000016103) #13	TNFAIP8L3 (ENSMMMG00000016114) #14	ENSMMMG00000016118	AP4E1 (ENSMMMG00000016124)	SPPL2A (ENSMMMG00000016150)	TRPM7 (ENSMMMG00000016191)	USP50 (ENSMMMG00000016253) #20	USP8 (ENSMMMG00000016260) #21	GABPB1 (ENSMMMG00000016321)	HDC (ENSMMMG00000016371) #22	SLC27A2 (ENSMMMG00000016383)	ATP8B4 (ENSMMMG00000016394)	DTWD1 (ENSMMMG00000016435)	FAM227B (ENSMMMG00000016448)	FGF7 (ENSMMMG00000016487)	GALK2 (ENSMMMG00000016493)	COPS2 (ENSMMMG00000016496)	SECISBP2L (ENSMMMG00000016511)	SHC4 (ENSMMMG00000016518)	EID1 (ENSMMMG00000016532)	ENSMMMG00000016537	FBN1 (ENSMMMG00000016560)	ENSMMMG00000016659	SLC12A1 (ENSMMMG00000016667)	CTXN2 (ENSMMMG00000016815)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	SCG3 (ENSSVLG00005003951) #15	ENSSVLG00005003911	DMXL2 (ENSSVLG00005003682) #11	ENSSVLG00005003544	GLDN (ENSSVLG00005003519) #12	CYP19A1 (ENSSVLG00005003478) #13	ENSSVLG00005003463	ENSSVLG00005003451	TNFAIP8L3 (ENSSVLG00005003434) #14	AP4E1 (ENSSVLG00005003370)	SPPL2A (ENSSVLG00005003313)	TRPM7 (ENSSVLG00005003021)	USP50 (ENSSVLG00005002911) #20	USP8 (ENSSVLG00005002839) #21	GABPB1 (ENSSVLG00005002736)	HDC (ENSSVLG00005002669) #22	SLC27A2 (ENSSVLG00005002589)	ATP8B4 (ENSSVLG00005002514)	DTWD1 (ENSSVLG00005002492)	FGF7 (ENSSVLG00005002472)	GALK2 (ENSSVLG00005002344)	ENSSVLG00005002244	SECISBP2L (ENSSVLG00005002173)	ENSSVLG00005002146	SHC4 (ENSSVLG00005002098)	CEP152 (ENSSVLG00005001882)	ENSSVLG00005001795	ENSSVLG00005001781	FBN1 (ENSSVLG00005001645)	ENSSVLG00005001592	ENSSVLG00005001505
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	33										ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	2									ENSGT00390000011072	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154856.A.a	ENSGT00940000161605	ENSGT00940000157856	ENSGT00390000005154	ENSGT00940000158670	ENSGT00940000154966	ENSGT01050000244827.D.b.a	ENSGT00390000004149	ENSGT00390000011072	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154856.A.a	ENSGT00940000161605	ENSGT00940000157856	ENSGT00390000005154	ENSGT00940000158670	ENSGT00940000154966	ENSGT01050000244827.D.b.a	ENSGT00390000004149	ENSGT00390000011072	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154856.A.a	ENSGT00940000161605	ENSGT00940000157856	ENSGT00390000005154	ENSGT00940000158670	ENSGT00940000154966	ENSGT01050000244827.D.b.a	ENSGT00390000004149	ENSGT00390000011072	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	188	Stard7 (ENSCGRG00001019429)	Tmem127 (ENSCGRG00001013245)	CIAO1 (ENSCGRG00001016622)	Snrnp200 (ENSCGRG00001022610)	ENSCGRG00001014240	Ncaph (ENSCGRG00001018072)	Blvra (ENSCGRG00001002848)	Ap4e1 (ENSCGRG00001023130)	ENSCGRG00001021438	Sppl2a (ENSCGRG00001004702)	Trpm7 (ENSCGRG00001022305)	ENSCGRG00001020900	Usp50 (ENSCGRG00001024172) #20	Usp8 (ENSCGRG00001023611) #21	Gabpb1 (ENSCGRG00001022883)	Hdc (ENSCGRG00001023140) #22	Slc27a2 (ENSCGRG00001021565)	Atp8b4 (ENSCGRG00001023798)	Dtwd1 (ENSCGRG00001011621)	Fgf7 (ENSCGRG00001021672)	ENSCGRG00001022441	Galk2 (ENSCGRG00001023593)	Cops2 (ENSCGRG00001014155)	Secisbp2l (ENSCGRG00001018900)	Shc4 (ENSCGRG00001000927)	Eid1 (ENSCGRG00001010267)	Cep152 (ENSCGRG00001000747)	Fbn1 (ENSCGRG00001019162)	ENSCGRG00001010033	Slc12a1 (ENSCGRG00001018507)	Ctxn2 (ENSCGRG00001010557)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	631	Astl (ENSMAUG00000010799)	Dusp2 (ENSMAUG00000005547)	Stard7 (ENSMAUG00000021334)	Tmem127 (ENSMAUG00000000907)	Ciao1 (ENSMAUG00000021994)	Snrnp200 (ENSMAUG00000011825)	Itpripl1 (ENSMAUG00000021535)	ENSMAUG00000021041	Blvra (ENSMAUG00000007089)	ENSMAUG00000020694	Sppl2a (ENSMAUG00000017369)	Trpm7 (ENSMAUG00000019210)	Usp50 (ENSMAUG00000019613) #20	Usp8 (ENSMAUG00000019997) #21	Gabpb1 (ENSMAUG00000015629)	Hdc (ENSMAUG00000015890) #22	Slc27a2 (ENSMAUG00000016759)	Atp8b4 (ENSMAUG00000016813)	ENSMAUG00000016470	Dtwd1 (ENSMAUG00000012537)	Fgf7 (ENSMAUG00000013683)	Galk2 (ENSMAUG00000005751)	Cops2 (ENSMAUG00000021767)	Secisbp2l (ENSMAUG00000012011)	ENSMAUG00000010454	Eid1 (ENSMAUG00000009902)	ENSMAUG00000021022	Cep152 (ENSMAUG00000013711)	Fbn1 (ENSMAUG00000019785)	Dut (ENSMAUG00000000956)	Slc12a1 (ENSMAUG00000004531)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154856.A.a	ENSGT00940000161605	ENSGT00940000157856	ENSGT00390000005154	ENSGT00940000158670	ENSGT00940000154966	ENSGT01050000244827.D.b.a	ENSGT00390000004149	ENSGT00390000011072	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Prairie vole	MODERN SPECIES	81	Astl (ENSMOCG00000012397)	Dusp2 (ENSMOCG00000016146)	Stard7 (ENSMOCG00000012311)	Tmem127 (ENSMOCG00000000251)	Ciao1 (ENSMOCG00000009518)	Snrnp200 (ENSMOCG00000011814)	Itpripl1 (ENSMOCG00000009786)	Ncaph (ENSMOCG00000002025)	Blvra (ENSMOCG00000012856)	ENSMOCG00000019484	Sppl2a (ENSMOCG00000003985)	Trpm7 (ENSMOCG00000012810)	Usp50 (ENSMOCG00000012932) #20	Usp8 (ENSMOCG00000011555) #21	Gabpb1 (ENSMOCG00000006290)	Hdc (ENSMOCG00000000576) #22	Slc27a2 (ENSMOCG00000015520)	Atp8b4 (ENSMOCG00000016392)	Dtwd1 (ENSMOCG00000013946)	Fgf7 (ENSMOCG00000006067)	Fam227b (ENSMOCG00000002372)	Galk2 (ENSMOCG00000022778)	Cops2 (ENSMOCG00000009875)	Secisbp2l (ENSMOCG00000014560)	Eid1 (ENSMOCG00000003456)	Shc4 (ENSMOCG00000020474)	Cep152 (ENSMOCG00000016204)	Fbn1 (ENSMOCG00000016631)	Dut (ENSMOCG00000009765)	Slc12a1 (ENSMOCG00000017261)	Ctxn2 (ENSMOCG00000020162)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	17	Dusp2 (ENSPEMG00000026801)	Stard7 (ENSPEMG00000028648)	Tmem127 (ENSPEMG00000025168)	Ciao1 (ENSPEMG00000015800)	ENSPEMG00000020700	Ncaph (ENSPEMG00000020773)	Blvra (ENSPEMG00000009849)	Ap4e1 (ENSPEMG00000021276)	Sppl2a (ENSPEMG00000022191)	ENSPEMG00000026620	ENSPEMG00000030019	Trpm7 (ENSPEMG00000013989)	Usp50 (ENSPEMG00000020756) #20	Usp8 (ENSPEMG00000023169) #21	Gabpb1 (ENSPEMG00000020310)	Hdc (ENSPEMG00000002047) #22	Slc27a2 (ENSPEMG00000021667)	Atp8b4 (ENSPEMG00000020855)	Dtwd1 (ENSPEMG00000024581)	Fgf7 (ENSPEMG00000029951)	Fam227b (ENSPEMG00000028378)	Galk2 (ENSPEMG00000006831)	Cops2 (ENSPEMG00000016940)	Secisbp2l (ENSPEMG00000010577)	Eid1 (ENSPEMG00000030985)	Shc4 (ENSPEMG00000006904)	Cep152 (ENSPEMG00000005457)	ENSPEMG00000029696	Dut (ENSPEMG00000030951)	Slc12a1 (ENSPEMG00000008530)	Ctxn2 (ENSPEMG00000000448)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154856.A.a	ENSGT00940000161605	ENSGT00940000157856	ENSGT00390000005154	ENSGT00940000158670	ENSGT00940000154966	ENSGT01050000244827.D.b.a	ENSGT00390000004149	ENSGT00390000011072	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b
Mus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154856.A.a	ENSGT00940000161605	ENSGT00940000157856	ENSGT00390000005154	ENSGT00940000158670	ENSGT00940000154966	ENSGT01050000244827.D.b.a	ENSGT00390000004149	ENSGT00390000011072	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00990000206984	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154856.A.a	ENSGT00940000161605	ENSGT00940000157856	ENSGT00390000005154	ENSGT00940000158670	ENSGT00940000154966	ENSGT01050000244827.D.b.a	ENSGT00390000004149	ENSGT00390000011072	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00990000206984	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154856.A.a	ENSGT00940000161605	ENSGT00940000157856	ENSGT00390000005154	ENSGT00940000158670	ENSGT00940000154966	ENSGT01050000244827.D.b.a	ENSGT00390000004149	ENSGT00390000011072	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00990000206984	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030
Mouse	MODERN SPECIES	11	Dusp2 (ENSMUSG00000027368)	Stard7 (ENSMUSG00000027367)	Tmem127 (ENSMUSG00000034850)	Ciao1 (ENSMUSG00000003662)	Snrnp200 (ENSMUSG00000003660)	1810024B03Rik (ENSMUSG00000044145)	Itpripl1 (ENSMUSG00000074825)	Ncaph (ENSMUSG00000034906)	Blvra (ENSMUSG00000001999)	Ap4e1 (ENSMUSG00000001998)	Sppl2a (ENSMUSG00000027366)	Trpm7 (ENSMUSG00000027365)	Usp50 (ENSMUSG00000027364) #20	Usp8 (ENSMUSG00000027363) #21	Gabpb1 (ENSMUSG00000027361)	Hdc (ENSMUSG00000027360) #22	Slc27a2 (ENSMUSG00000027359)	Atp8b4 (ENSMUSG00000060131)	Dtwd1 (ENSMUSG00000023330)	Fgf7 (ENSMUSG00000027208)	Fam227b (ENSMUSG00000027209)	Galk2 (ENSMUSG00000027207)	Cops2 (ENSMUSG00000027206)	Secisbp2l (ENSMUSG00000035093)	Eid1 (ENSMUSG00000091337)	Shc4 (ENSMUSG00000035109)	Cep152 (ENSMUSG00000068394)	Fbn1 (ENSMUSG00000027204)	Dut (ENSMUSG00000027203)	Slc12a1 (ENSMUSG00000027202)	Ctxn2 (ENSMUSG00000074872)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154856.A.a	ENSGT00940000161605	ENSGT00940000157856	ENSGT00390000005154	ENSGT00940000158670	ENSGT00940000154966	ENSGT01050000244827.D.b.a	ENSGT00390000004149	ENSGT00390000011072	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00940000154796.A	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00990000206984	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3248	ENSMSIG00000019346	Stard7 (ENSMSIG00000019361)	Tmem127 (ENSMSIG00000019390)	Ciao1 (ENSMSIG00000019407)	Snrnp200 (ENSMSIG00000019504)	ENSMSIG00000019614	1810024B03Rik (ENSMSIG00000019616)	Ncaph (ENSMSIG00000019647)	Blvra (ENSMSIG00000019697)	Ap4e1 (ENSMSIG00000019734)	Sppl2a (ENSMSIG00000019798)	Trpm7 (ENSMSIG00000019840)	Usp50 (ENSMSIG00000020056) #20	Usp8 (ENSMSIG00000020086) #21	ENSMSIG00000020139	Hdc (ENSMSIG00000020168) #22	Slc27a2 (ENSMSIG00000020212)	Atp8b4 (ENSMSIG00000020283)
spretus	MODERN SPECIES	11	Dusp2 (MGP_SPRETEiJ_G0025174)	Stard7 (MGP_SPRETEiJ_G0025173)	Tmem127 (MGP_SPRETEiJ_G0025172)	Ciao1 (MGP_SPRETEiJ_G0025171)	Snrnp200 (MGP_SPRETEiJ_G0025170)	1810024B03Rik (MGP_SPRETEiJ_G0025169)	Itpripl1 (MGP_SPRETEiJ_G0025168)	Ncaph (MGP_SPRETEiJ_G0025167)	Blvra (MGP_SPRETEiJ_G0025166)	Ap4e1 (MGP_SPRETEiJ_G0025165)	Sppl2a (MGP_SPRETEiJ_G0025164)	Trpm7 (MGP_SPRETEiJ_G0025163)	Usp50 (MGP_SPRETEiJ_G0025162) #20	Usp8 (MGP_SPRETEiJ_G0025161) #21	Gabpb1 (MGP_SPRETEiJ_G0025160)	Hdc (MGP_SPRETEiJ_G0025159) #22	Slc27a2 (MGP_SPRETEiJ_G0025158)	Atp8b4 (MGP_SPRETEiJ_G0025157)	Dtwd1 (MGP_SPRETEiJ_G0025156)	Fgf7 (MGP_SPRETEiJ_G0025155)	Fam227b (MGP_SPRETEiJ_G0025154)	Galk2 (MGP_SPRETEiJ_G0025153)	Cops2 (MGP_SPRETEiJ_G0025152)	Secisbp2l (MGP_SPRETEiJ_G0025151)	Eid1 (MGP_SPRETEiJ_G0025150)	Shc4 (MGP_SPRETEiJ_G0025149)	Cep152 (MGP_SPRETEiJ_G0025148)	MGP_SPRETEiJ_G0025147	Fbn1 (MGP_SPRETEiJ_G0025146)	Dut (MGP_SPRETEiJ_G0025145)	Slc12a1 (MGP_SPRETEiJ_G0025144)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	11	Dusp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024254)	Stard7 (MGP_CAROLIEiJ_G0024253)	Tmem127 (MGP_CAROLIEiJ_G0024252)	Ciao1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024251)	Snrnp200 (MGP_CAROLIEiJ_G0024250)	MGP_CAROLIEiJ_G0024249	Itpripl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024248)	Ncaph (MGP_CAROLIEiJ_G0024247)	Blvra (MGP_CAROLIEiJ_G0024246)	Ap4e1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024245)	Sppl2a (MGP_CAROLIEiJ_G0024244)	Trpm7 (MGP_CAROLIEiJ_G0024243)	Usp50 (MGP_CAROLIEiJ_G0024242) #20	Usp8 (MGP_CAROLIEiJ_G0024241) #21	Gabpb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024240)	Hdc (MGP_CAROLIEiJ_G0024239) #22	Slc27a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024238)	Atp8b4 (MGP_CAROLIEiJ_G0024237)	Dtwd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024236)	Fgf7 (MGP_CAROLIEiJ_G0024235)	Fam227b (MGP_CAROLIEiJ_G0024234)	Galk2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024233)	Cops2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024232)	Secisbp2l (MGP_CAROLIEiJ_G0024231)	Eid1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024230)	Shc4 (MGP_CAROLIEiJ_G0024229)	Cep152 (MGP_CAROLIEiJ_G0024228)	MGP_CAROLIEiJ_G0024227	Fbn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024226)	Dut (MGP_CAROLIEiJ_G0024225)	Slc12a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024224)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	16	Astl (MGP_PahariEiJ_G0025700)	Dusp2 (MGP_PahariEiJ_G0025699)	MGP_PahariEiJ_G0025698	MGP_PahariEiJ_G0025697	Ciao1 (MGP_PahariEiJ_G0025696)	Snrnp200 (MGP_PahariEiJ_G0025695)	Itpripl1 (MGP_PahariEiJ_G0025694)	Ncaph (MGP_PahariEiJ_G0025693)	Blvra (MGP_PahariEiJ_G0025692)	Ap4e1 (MGP_PahariEiJ_G0025691)	MGP_PahariEiJ_G0025690	Trpm7 (MGP_PahariEiJ_G0025689)	Usp50 (MGP_PahariEiJ_G0025688) #20	Usp8 (MGP_PahariEiJ_G0025687) #21	Gabpb1 (MGP_PahariEiJ_G0025686)	Hdc (MGP_PahariEiJ_G0025685) #22	Slc27a2 (MGP_PahariEiJ_G0025684)	MGP_PahariEiJ_G0025683	Dtwd1 (MGP_PahariEiJ_G0025682)	Fgf7 (MGP_PahariEiJ_G0025681)	Fam227b (MGP_PahariEiJ_G0025680)	Galk2 (MGP_PahariEiJ_G0025679)	Cops2 (MGP_PahariEiJ_G0025678)	Secisbp2l (MGP_PahariEiJ_G0025677)	Eid1 (MGP_PahariEiJ_G0025676)	Shc4 (MGP_PahariEiJ_G0025675)	Cep152 (MGP_PahariEiJ_G0025674)	MGP_PahariEiJ_G0025673	Fbn1 (MGP_PahariEiJ_G0025672)	Dut (MGP_PahariEiJ_G0025671)	Slc12a1 (MGP_PahariEiJ_G0025670)
Rat	MODERN SPECIES	13	Dusp2 (ENSRNOG00000013862)	Stard7 (ENSRNOG00000013479)	Tmem127 (ENSRNOG00000071101)	Ciao1 (ENSRNOG00000012638)	Snrnp200 (ENSRNOG00000012157)	Itpripl1 (ENSRNOG00000012151)	Ncaph (ENSRNOG00000012051)	Blvra (ENSRNOG00000011778)	Ap4e1 (ENSRNOG00000022938)	Sppl2a (ENSRNOG00000011652)	ENSRNOG00000033429	Trpm7 (ENSRNOG00000057806)	Usp50 (ENSRNOG00000011401) #20	Usp8 (ENSRNOG00000010729) #21	Gabpb1 (ENSRNOG00000010659)	Hdc (ENSRNOG00000010262) #22	Slc27a2 (ENSRNOG00000010128)	Atp8b4 (ENSRNOG00000031598)	Dtwd1 (ENSRNOG00000009593)	Fgf7 (ENSRNOG00000009425)	Fam227b (ENSRNOG00000037124)	Galk2 (ENSRNOG00000009289)	Cops2 (ENSRNOG00000008744)	Secisbp2l (ENSRNOG00000008629)	Eid1 (ENSRNOG00000008452)	Shc4 (ENSRNOG00000037134)	LOC120101650 (ENSRNOG00000031585)	Cep152 (ENSRNOG00000065817)	Fbn1 (ENSRNOG00000007302)	Dut (ENSRNOG00000007221)	Rpl32-ps1 (ENSRNOG00000032605)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	767		Tgfbi (ENSNGAG00000008714)	Smad5 (ENSNGAG00000022513)	Smim32 (ENSNGAG00000008630)	Trpc7 (ENSNGAG00000015892)	Spock1 (ENSNGAG00000022891)	Klhl3 (ENSNGAG00000021508)	Hnrnpa0 (ENSNGAG00000008883)	Blvra (ENSNGAG00000014028)	ENSNGAG00000022314	Sppl2a (ENSNGAG00000000975)	ENSNGAG00000020663	Trpm7 (ENSNGAG00000004836)	Usp8 (ENSNGAG00000010641) #21	Gabpb1 (ENSNGAG00000017899)	Hdc (ENSNGAG00000011189) #22	Slc27a2 (ENSNGAG00000023178)	Atp8b4 (ENSNGAG00000020421)	Dtwd1 (ENSNGAG00000019003)	Fgf7 (ENSNGAG00000017817)	Galk2 (ENSNGAG00000019161)	Cops2 (ENSNGAG00000009536)	Secisbp2l (ENSNGAG00000019213)	Eid1 (ENSNGAG00000010287)	Shc4 (ENSNGAG00000002909)	ENSNGAG00000001542	Fbn1 (ENSNGAG00000005361)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	176	Aven (ENSJJAG00000009970)	Ryr3 (ENSJJAG00000015590)	ENSJJAG00000015560	Tmco5b (ENSJJAG00000011082)	Fmn1 (ENSJJAG00000012269)	Grem1 (ENSJJAG00000013743)	Scg5 (ENSJJAG00000013555)	ENSJJAG00000014367	ENSJJAG00000020341	Sppl2a (ENSJJAG00000020554)	Trpm7 (ENSJJAG00000022636)	Usp50 (ENSJJAG00000009672) #20	Usp8 (ENSJJAG00000013596) #21	ENSJJAG00000017463	ENSJJAG00000017952	Hdc (ENSJJAG00000021664) #22	Slc27a2 (ENSJJAG00000012884)	ENSJJAG00000014259	Atp8b4 (ENSJJAG00000017268)	ENSJJAG00000013820	ENSJJAG00000020065	Dtwd1 (ENSJJAG00000007677)	ENSJJAG00000018025	ENSJJAG00000018894	Fgf7 (ENSJJAG00000010425)	Galk2 (ENSJJAG00000010967)	ENSJJAG00000011328	ENSJJAG00000011858	ENSJJAG00000012276	Cops2 (ENSJJAG00000012737)	Secisbp2l (ENSJJAG00000014644)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	330	Mapk6 (ENSDORG00000012645) #19	Leo1 (ENSDORG00000006827) #18	Tmod3 (ENSDORG00000014961) #17	Tmod2 (ENSDORG00000015900)	Scg3 (ENSDORG00000015478) #15	Dmxl2 (ENSDORG00000002341) #11	Gldn (ENSDORG00000006427) #12	Cyp19a1 (ENSDORG00000009484) #13	Tnfaip8l3 (ENSDORG00000029156) #14	ENSDORG00000010151	Sppl2a (ENSDORG00000008946)	Trpm7 (ENSDORG00000000789)	Usp50 (ENSDORG00000028003) #20	Usp8 (ENSDORG00000005653) #21	Gabpb1 (ENSDORG00000016453)	Hdc (ENSDORG00000016452) #22	Slc27a2 (ENSDORG00000016451)	Atp8b4 (ENSDORG00000016492)	Dtwd1 (ENSDORG00000011657)	Fgf7 (ENSDORG00000026408)	Galk2 (ENSDORG00000011650)	Cops2 (ENSDORG00000006941)	Secisbp2l (ENSDORG00000008662)	ENSDORG00000030215	ENSDORG00000010573	ENSDORG00000010570	Fbn1 (ENSDORG00000010561)	ENSDORG00000010560	Slc12a1 (ENSDORG00000010558)	ENSDORG00000015835	Slc24a5 (ENSDORG00000015834)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	101															ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	102															ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397	ENSGT01030000234532.A.b
Elephant	MODERN SPECIES	568															GABPB1 (ENSLAFG00000001929)	HDC (ENSLAFG00000010591) #22	SLC27A2 (ENSLAFG00000004735)	ENSLAFG00000031858	ENSLAFG00000027588	ENSLAFG00000007204	DTWD1 (ENSLAFG00000001810)	FGF7 (ENSLAFG00000009981)	GALK2 (ENSLAFG00000016919)	COPS2 (ENSLAFG00000022204)	SECISBP2L (ENSLAFG00000006484)	SHC4 (ENSLAFG00000008736)	CEP152 (ENSLAFG00000014279)	FBN1 (ENSLAFG00000000416)	DUT (ENSLAFG00000004976)	SLC12A1 (ENSLAFG00000012999)	CTXN2 (ENSLAFG00000029871)
Hyrax	MODERN SPECIES	2986																HDC (ENSPCAG00000014277) #22	SLC27A2 (ENSPCAG00000014184)
Tenrec	MODERN SPECIES	3649																HDC (ENSETEG00000017149) #22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	514									ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137
Sloth	MODERN SPECIES	3352																HDC (ENSCHOG00000012924) #22	SLC27A2 (ENSCHOG00000012911)
Armadillo	MODERN SPECIES	2833	ENSDNOG00000033753	RAB11FIP2 (ENSDNOG00000045786)	EMX2 (ENSDNOG00000047293)	PDZD8 (ENSDNOG00000043818)	SLC18A2 (ENSDNOG00000041849)	KCNK18 (ENSDNOG00000005657)	ENSDNOG00000039315	ENSDNOG00000041228 #14	AP4E1 (ENSDNOG00000004807)	SPPL2A (ENSDNOG00000006171)	TRPM7 (ENSDNOG00000012390)	USP8 (ENSDNOG00000019714) #21	GABPB1 (ENSDNOG00000044925)	ENSDNOG00000030818	ENSDNOG00000046053	HDC (ENSDNOG00000033558) #22	ENSDNOG00000018159
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000162699	ENSGT00940000159843	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00550000074952 #18	ENSGT00940000158280 #17	ENSGT00940000160631	ENSGT00940000160054 #16	ENSGT00390000005488 #15	ENSGT00390000000096.b.a #11	ENSGT00940000158020 #12	ENSGT00840000129915 #13	ENSGT00390000003488.a.a #14	ENSGT00950000182838.C	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091	ENSGT00940000160441 #20	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00940000159843	ENSGT00940000162699	ENSGT00950000183187.A	ENSGT00530000063301.a.b	ENSGT00490000043356.a	ENSGT00950000182870.a.b	ENSGT00950000182870.b	ENSGT00950000183158.D.b.f	ENSGT00390000018390.bb.a	ENSGT00940000158030	ENSGT00940000154412.B.b	ENSGT00940000157397
Common wonbat	DUPLICATION
Common wonbat	MODERN SPECIES	573																ENSVURG00010015892 #22
Common wonbat	MODERN SPECIES	1076	MAPK6 (ENSVURG00010004850) #19	LEO1 (ENSVURG00010004832) #18	TMOD3 (ENSVURG00010004794) #17	LYSMD2 (ENSVURG00010004752) #16	SCG3 (ENSVURG00010004741) #15	DMXL2 (ENSVURG00010004688) #11	CYP19A1 (ENSVURG00010004661) #13	TNFAIP8L3 (ENSVURG00010004650) #14	AP4E1 (ENSVURG00010004641)	SPPL2A (ENSVURG00010004585)	TRPM7 (ENSVURG00010004494)	USP50 (ENSVURG00010004429) #20	USP8 (ENSVURG00010004408) #21	ENSVURG00010004405	GABPB1 (ENSVURG00010004393)	ENSVURG00010004345 #22	SLC27A2 (ENSVURG00010004309)	ATP8B4 (ENSVURG00010004258)	DTWD1 (ENSVURG00010004239)	ENSVURG00010004224	FGF7 (ENSVURG00010004216)	GALK2 (ENSVURG00010004198)	COPS2 (ENSVURG00010004145)	SECISBP2L (ENSVURG00010004119)	ENSVURG00010004102
koala	MODERN SPECIES		LEO1 (ENSPCIG00000005153) #18	TMOD3 (ENSPCIG00000005166) #17	TMOD2 (ENSPCIG00000005194)	LYSMD2 (ENSPCIG00000005203) #16	SCG3 (ENSPCIG00000005212) #15	DMXL2 (ENSPCIG00000005228) #11	GLDN (ENSPCIG00000005270) #12	CYP19A1 (ENSPCIG00000005286) #13	TNFAIP8L3 (ENSPCIG00000005300) #14	AP4E1 (ENSPCIG00000017889)	SPPL2A (ENSPCIG00000025801)	TRPM7 (ENSPCIG00000025799)	USP50 (ENSPCIG00000025798) #20	USP8 (ENSPCIG00000025795) #21	GABPB1 (ENSPCIG00000025794)	HDC (ENSPCIG00000003694) #22	SLC27A2 (ENSPCIG00000003697)	ATP8B4 (ENSPCIG00000018026)	DTWD1 (ENSPCIG00000004173)	ENSPCIG00000018040	FGF7 (ENSPCIG00000018042)	ENSPCIG00000018038	GALK2 (ENSPCIG00000018043)	COPS2 (ENSPCIG00000018046)	SECISBP2L (ENSPCIG00000018047)	SHC4 (ENSPCIG00000018049)	CEP152 (ENSPCIG00000018054)	FBN1 (ENSPCIG00000022869)	ENSPCIG00000022883	SLC12A1 (ENSPCIG00000022889)	CTXN2 (ENSPCIG00000022900)
Wallaby	MODERN SPECIES	4768																HDC (ENSMEUG00000002760) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	MAPK6 (ENSSHAG00000017091) #19	LEO1 (ENSSHAG00000016879) #18	TMOD3 (ENSSHAG00000016742) #17	LYSMD2 (ENSSHAG00000016545) #16	SCG3 (ENSSHAG00000026438) #15	DMXL2 (ENSSHAG00000015967) #11	GLDN (ENSSHAG00000015668) #12	CYP19A1 (ENSSHAG00000015151) #13	TNFAIP8L3 (ENSSHAG00000022065) #14	AP4E1 (ENSSHAG00000014210)	SPPL2A (ENSSHAG00000013412)	TRPM7 (ENSSHAG00000012617)	USP50 (ENSSHAG00000012441) #20	USP8 (ENSSHAG00000012085) #21	GABPB1 (ENSSHAG00000031701)	HDC (ENSSHAG00000011147) #22	SLC27A2 (ENSSHAG00000010789)	ATP8B4 (ENSSHAG00000007396)	DTWD1 (ENSSHAG00000004048)	ENSSHAG00000001548	FGF7 (ENSSHAG00000027949)	GALK2 (ENSSHAG00000016566)	COPS2 (ENSSHAG00000027188)	SECISBP2L (ENSSHAG00000026437)	SHC4 (ENSSHAG00000015404)	CEP152 (ENSSHAG00000015100)	FBN1 (ENSSHAG00000013755)	DUT (ENSSHAG00000013061)	SLC12A1 (ENSSHAG00000012219)	CTXN2 (ENSSHAG00000025735)	MYEF2 (ENSSHAG00000011695)
Opossum	MODERN SPECIES		ENSMODG00000001962 #19	LEO1 (ENSMODG00000001979) #18	TMOD2 (ENSMODG00000040618)	LYSMD2 (ENSMODG00000002007) #16	SCG3 (ENSMODG00000002026) #15	DMXL2 (ENSMODG00000002058) #11	GLDN (ENSMODG00000002073) #12	CYP19A1 (ENSMODG00000002101) #13	TNFAIP8L3 (ENSMODG00000002109) #14	AP4E1 (ENSMODG00000002130)	SPPL2A (ENSMODG00000002148)	TRPM7 (ENSMODG00000002196)	USP50 (ENSMODG00000002207) #20	USP8 (ENSMODG00000002220) #21	GABPB1 (ENSMODG00000002253)	HDC (ENSMODG00000002284) #22	SLC27A2 (ENSMODG00000002320)	ENSMODG00000041220	ENSMODG00000038961	ATP8B4 (ENSMODG00000002365)	DTWD1 (ENSMODG00000002394)	FGF7 (ENSMODG00000046995)	ENSMODG00000002386	ENSMODG00000037020	GALK2 (ENSMODG00000002423)	ENSMODG00000002466	SECISBP2L (ENSMODG00000002516)	SHC4 (ENSMODG00000002552)	CEP152 (ENSMODG00000002582)	ENSMODG00000043195	FBN1 (ENSMODG00000002675)
Platypus	MODERN SPECIES	16	AGBL1 (ENSOANG00000009682)	KLHL25 (ENSOANG00000009685)	ZFAND6 (ENSOANG00000002944)	ENSOANG00000047570	BCL2A1 (ENSOANG00000013017)	MTHFS (ENSOANG00000009193)	ENSOANG00000045582	SLC30A4 (ENSOANG00000006336)	BLOC1S6 (ENSOANG00000042638)	SQOR (ENSOANG00000015184)	SPPL2A (ENSOANG00000008684)	TRPM7 (ENSOANG00000006883)	USP50 (ENSOANG00000006882) #20	USP8 (ENSOANG00000006879) #21	GABPB1 (ENSOANG00000006878)	HDC (ENSOANG00000038775) #22	SLC27A2 (ENSOANG00000006875)	ENSOANG00000006872	ENSOANG00000044704	PDE8A (ENSOANG00000049727)	FSD2 (ENSOANG00000004282)	WHAMM (ENSOANG00000046757)	HOMER2 (ENSOANG00000050248)	ENSOANG00000004275	ENSOANG00000004274	BTBD1 (ENSOANG00000013090)	TM6SF1 (ENSOANG00000020097)	ENSOANG00000004080	BNC1 (ENSOANG00000048584)	SH3GL3 (ENSOANG00000004069)	MINAR1 (ENSOANG00000010787)
Anura	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162699	ENSGT00940000153766.B	ENSGT00390000004624.a.b	ENSGT00940000160101	ENSGT00940000160700	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000159842	ENSGT00940000158245	ENSGT00940000157722	ENSGT00940000157091.a	ENSGT00940000157091.b	ENSGT00940000157542 #21	ENSGT00940000157875	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000161137	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000156422	ENSGT00940000158441	ENSGT00510000046704.b.b	ENSGT00940000157324	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000164795	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000164952	ENSGT00940000158143
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	6	SPATA5L1 (ENSLLEG00000006518)	SLC30A4 (ENSLLEG00000006585)	BLOC1S6 (ENSLLEG00000006722)	SQOR (ENSLLEG00000006754)	ENSLLEG00000006841	ENSLLEG00000006966	ENSLLEG00000006994	SPPL2A (ENSLLEG00000007069)	ENSLLEG00000007316	ENSLLEG00000007438	ENSLLEG00000008295	ENSLLEG00000009019	USP8 (ENSLLEG00000009062) #21	ENSLLEG00000009344	GABPB1 (ENSLLEG00000009418)	HDC (ENSLLEG00000010063) #22	ENSLLEG00000010342	ENSLLEG00000010491	ENSLLEG00000010987	GATM (ENSLLEG00000011091)	PDE8A (ENSLLEG00000011255)	ENSLLEG00000011795	ENSLLEG00000011814	ENSLLEG00000011870	ENSLLEG00000011910	WHAMM (ENSLLEG00000011929)	HOMER2 (ENSLLEG00000012024)	ENSLLEG00000012178	ENSLLEG00000012232	TM6SF1 (ENSLLEG00000012320)	HDGFL3 (ENSLLEG00000012483)
Frog	MODERN SPECIES	3	ENSXETG00000008788	atp8b4 (ENSXETG00000008789)	spata5l1 (ENSXETG00000038441)	slc30a4 (ENSXETG00000022040)	bloc1s6 (ENSXETG00000022045)	sqor (ENSXETG00000022046)	nmrk2 (ENSXETG00000022049)	ENSXETG00000034852	cdc42se2 (ENSXETG00000022051)	sppl2a (ENSXETG00000022052)	trpm7 (ENSXETG00000022057)	ENSXETG00000047653	XB5892783 [provisional:trpm7] (ENSXETG00000035125)	usp8 (ENSXETG00000016117) #21	gabpb1 (ENSXETG00000016116)	hdc (ENSXETG00000019831) #22	slc27a2 (ENSXETG00000016111)	gatm (ENSXETG00000016109)	pde8a (ENSXETG00000016104)	fsd2 (ENSXETG00000016103)	whamm (ENSXETG00000016099)	homer2 (ENSXETG00000016094)	tm6sf1 (ENSXETG00000025132)	c15orf40 (ENSXETG00000006028)	btbd1 (ENSXETG00000016087)	hdgfl3 (ENSXETG00000016086)	bnc1 (ENSXETG00000016084)	sh3gl3 (ENSXETG00000007747)	lmnb3 (ENSXETG00000015792)	adamtsl3 (ENSXETG00000006128)	ENSXETG00000043109
Coelacanth	MODERN SPECIES	269											TRPM7 (ENSLACG00000018358)	ENSLACG00000022650	USP50 (ENSLACG00000022208) #20	USP8 (ENSLACG00000018295) #21	GABPB1 (ENSLACG00000018253)	HDC (ENSLACG00000018205) #22	SLC27A2 (ENSLACG00000018170)	ENSLACG00000018162	GATM (ENSLACG00000018140)	PDE8A (ENSLACG00000018003)	FSD2 (ENSLACG00000017964)	WHAMM (ENSLACG00000017931)	HOMER2 (ENSLACG00000017843)	ENSLACG00000017822	ENSLACG00000017810	zgc:193812 (ENSLACG00000017770)	ENSLACG00000017654	TM6SF1 (ENSLACG00000017623)	HDGFL3 (ENSLACG00000017575)	BNC1 (ENSLACG00000017528)	SH3GL3 (ENSLACG00000017223)
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES	285															ENSGT00940000156794	ENSGT00940000157938 #22	ENSGT00940000157947
Lamprey	DUPLICATION
Lamprey	DUPLICATION
Lamprey	MODERN SPECIES	3337																hdc (ENSPMAG00000006051) #22
Lamprey	MODERN SPECIES	357													smg5 (ENSPMAG00000000410)	kif23 (ENSPMAG00000000386)	gabpb2b (ENSPMAG00000000377)	hdc (ENSPMAG00000000376) #22
Lamprey	DUPLICATION
Lamprey	MODERN SPECIES	2515																hdc (ENSPMAG00000005698) #22	ENSPMAG00000005686
Lamprey	MODERN SPECIES	3047																HDC (ENSPMAG00000004784) #22