Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B #22 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 1074 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 902 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00940000161971 ENSGT00960000186993 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000154276 ENSGT01020000230359.E ENSGT00940000153709.B ENSGT01090000260005.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01040000240451.a.b.a ENSGT00940000159587 ENSGT00390000016293 ENSGT00940000161297 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000158200 ENSGT00940000165418 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00960000186993 ENSGT00940000161971 ENSGT00960000187237 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00950000185411 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000154276 ENSGT01020000230359.E ENSGT00940000153709.B ENSGT01090000260005.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01040000240451.a.b.a ENSGT00940000159587 ENSGT00390000016293 Amniota ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00960000187237 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 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ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409 ENSGT00940000163376 Kangaroo rat MODERN SPECIES 361 Atg101 (ENSDORG00000000193) #13 Nr4a1 (ENSDORG00000000196) #14 Tamalin (ENSDORG00000000198) #15 Acvr1b (ENSDORG00000023410) #16 Acvrl1 (ENSDORG00000016137) #17 Ankrd33 (ENSDORG00000015050) #18 Fignl2 (ENSDORG00000029523) Scn8a (ENSDORG00000016310) #19 Slc4a8 (ENSDORG00000011277) #20 Galnt6 (ENSDORG00000015297) #21 Cela1 (ENSDORG00000010121) #22 ENSDORG00000025542 #23 Smagp (ENSDORG00000027416) #24 Dazap2 (ENSDORG00000028740) #25 ENSDORG00000014216 #26 Tfcp2 (ENSDORG00000014214) #27 Csrnp2 (ENSDORG00000026384) #28 Letmd1 (ENSDORG00000010376) #29 Slc11a2 (ENSDORG00000008507) #30 Higd1c (ENSDORG00000015929) #31 ENSDORG00000026920 Tmprss12 (ENSDORG00000004652) Atf1 (ENSDORG00000007920) Dip2b (ENSDORG00000007913) Larp4 (ENSDORG00000004013) ENSDORG00000028650 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154026.b.b.h.j.b #9 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 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Ankrd33 (ENSJJAG00000018769) #18 Fignl2 (ENSJJAG00000024263) Scn8a (ENSJJAG00000018047) #19 Slc4a8 (ENSJJAG00000016335) #20 Galnt6 (ENSJJAG00000017457) #21 Cela1 (ENSJJAG00000000473) #22 ENSJJAG00000021830 ENSJJAG00000021573 #24 Dazap2 (ENSJJAG00000019705) #25 ENSJJAG00000012793 #26 Tfcp2 (ENSJJAG00000019094) #27 Csrnp2 (ENSJJAG00000017839) #28 Letmd1 (ENSJJAG00000022897) #29 Slc11a2 (ENSJJAG00000024107) #30 Dip2b (ENSJJAG00000010269) ENSJJAG00000014649 ENSJJAG00000001889 Lima1 (ENSJJAG00000012969) Cers5 (ENSJJAG00000023418) Gpd1 (ENSJJAG00000021922) Smarcd1 (ENSJJAG00000015550) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000154026.b.b.h.j.b #9 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00950000184761 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 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#20 Galnt6 (MGP_CAROLIEiJ_G0020299) #21 Cela1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020298) #22 Bin2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020297) #23 Smagp (MGP_CAROLIEiJ_G0020296) #24 Dazap2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020295) #25 Pou6f1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020294) #26 Tfcp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020293) #27 Csrnp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020292) #28 Letmd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020291) #29 MGP_CAROLIEiJ_G0020290 Slc11a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020289) #30 MGP_CAROLIEiJ_G0020288 MGP_CAROLIEiJ_G0020287 MGP_CAROLIEiJ_G0020286 MGP_CAROLIEiJ_G0020285 MGP_CAROLIEiJ_G0020284 Atf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020283) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154026.b.b.h.j.b #9 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00950000184761 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00860000136312 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786.q.b ENSGT00940000154786.q.a ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b Mouse MODERN SPECIES 6 Krt87 (ENSMUSG00000047641) #9 Krt7 (ENSMUSG00000023039) #10 Krt80 (ENSMUSG00000037185) #11 Smim41 (ENSMUSG00000075408) #12 Atg101 (ENSMUSG00000037204) #13 Nr4a1 (ENSMUSG00000023034) #14 Tamalin (ENSMUSG00000000531) #15 Acvr1b (ENSMUSG00000000532) #16 Acvrl1 (ENSMUSG00000000530) #17 Ankrd33 (ENSMUSG00000047034) #18 Fignl2 (ENSMUSG00000095440) Tmdd1 (ENSMUSG00000113558) Scn8a (ENSMUSG00000023033) #19 Slc4a8 (ENSMUSG00000023032) #20 Galnt6 (ENSMUSG00000037280) #21 Cela1 (ENSMUSG00000023031) #22 Bin2 (ENSMUSG00000098112) #23 Smagp (ENSMUSG00000053559) #24 Dazap2 (ENSMUSG00000000346) #25 Pou6f1 (ENSMUSG00000009739) #26 Tfcp2 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ENSGT00940000154786.r ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409.o ENSGT00940000163376 Steppe mouse MODERN SPECIES 200 Ankrd33 (ENSMSIG00000021619) #18 ENSMSIG00000021610 Tmdd1 (ENSMSIG00000021604) Scn8a (ENSMSIG00000021532) #19 Slc4a8 (ENSMSIG00000021453) #20 Galnt6 (ENSMSIG00000021390) #21 Cela1 (ENSMSIG00000021359) #22 Bin2 (ENSMSIG00000021261) #23 ENSMSIG00000021218 #24 ENSMSIG00000021203 #25 Pou6f1 (ENSMSIG00000021185) #26 Tfcp2 (ENSMSIG00000021105) #27 Csrnp2 (ENSMSIG00000021085) #28 Letmd1 (ENSMSIG00000021017) #29 ENSMSIG00000021004 Slc11a2 (ENSMSIG00000020938) #30 ENSMSIG00000020934 spretus MODERN SPECIES 6 MGP_SPRETEiJ_G0021206 #9 Krt88 (MGP_SPRETEiJ_G0021205) #8 MGP_SPRETEiJ_G0021204 #9 Krt7 (MGP_SPRETEiJ_G0021203) #10 Krt80 (MGP_SPRETEiJ_G0021202) #11 Atg101 (MGP_SPRETEiJ_G0021201) #13 Nr4a1 (MGP_SPRETEiJ_G0021200) #14 Tamalin (MGP_SPRETEiJ_G0021199) #15 Acvr1b (MGP_SPRETEiJ_G0021198) #16 Acvrl1 (MGP_SPRETEiJ_G0021197) #17 Ankrd33 (MGP_SPRETEiJ_G0021196) #18 Fignl2 (MGP_SPRETEiJ_G0021195) Scn8a (MGP_SPRETEiJ_G0021194) #19 Slc4a8 (MGP_SPRETEiJ_G0021193) #20 Galnt6 (MGP_SPRETEiJ_G0021192) #21 Cela1 (MGP_SPRETEiJ_G0021191) #22 Bin2 (MGP_SPRETEiJ_G0021190) #23 Smagp (MGP_SPRETEiJ_G0021189) #24 Dazap2 (MGP_SPRETEiJ_G0021188) #25 Pou6f1 (MGP_SPRETEiJ_G0021187) #26 Tfcp2 (MGP_SPRETEiJ_G0021186) #27 Csrnp2 (MGP_SPRETEiJ_G0021185) #28 Letmd1 (MGP_SPRETEiJ_G0021184) #29 MGP_SPRETEiJ_G0021183 Slc11a2 (MGP_SPRETEiJ_G0021182) #30 MGP_SPRETEiJ_G0021181 MGP_SPRETEiJ_G0021180 Tmprss12 (MGP_SPRETEiJ_G0021179) Atf1 (MGP_SPRETEiJ_G0021178) Dip2b (MGP_SPRETEiJ_G0021177) MGP_SPRETEiJ_G0021176 Shrew mouse MODERN SPECIES 8 MGP_PahariEiJ_G0020314 #9 Krt81 (MGP_PahariEiJ_G0020313) #9 Krt88 (MGP_PahariEiJ_G0020312) #8 Krt7 (MGP_PahariEiJ_G0020311) #10 Krt80 (MGP_PahariEiJ_G0020310) #11 Atg101 (MGP_PahariEiJ_G0020309) #13 Nr4a1 (MGP_PahariEiJ_G0020308) #14 Tamalin (MGP_PahariEiJ_G0020307) #15 Acvr1b (MGP_PahariEiJ_G0020306) #16 Acvrl1 (MGP_PahariEiJ_G0020305) #17 Ankrd33 (MGP_PahariEiJ_G0020304) #18 Fignl2 (MGP_PahariEiJ_G0020303) Scn8a (MGP_PahariEiJ_G0020302) #19 Slc4a8 (MGP_PahariEiJ_G0020301) #20 Galnt6 (MGP_PahariEiJ_G0020300) #21 Cela1 (MGP_PahariEiJ_G0020299) #22 Bin2 (MGP_PahariEiJ_G0020298) #23 Smagp (MGP_PahariEiJ_G0020297) #24 Dazap2 (MGP_PahariEiJ_G0020296) #25 Pou6f1 (MGP_PahariEiJ_G0020295) #26 Tfcp2 (MGP_PahariEiJ_G0020294) #27 Csrnp2 (MGP_PahariEiJ_G0020293) #28 Letmd1 (MGP_PahariEiJ_G0020292) #29 Slc11a2 (MGP_PahariEiJ_G0020291) #30 MGP_PahariEiJ_G0020290 MGP_PahariEiJ_G0020289 MGP_PahariEiJ_G0020288 Tmprss12 (MGP_PahariEiJ_G0020287) Atf1 (MGP_PahariEiJ_G0020286) Dip2b (MGP_PahariEiJ_G0020285) Larp4 (MGP_PahariEiJ_G0020284) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00940000154026.b.b.g.b ##9 ENSGT00940000154026.b.b.h #9 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 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ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409 ENSGT00940000163376 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154026.b.b.h.b #9 ENSGT00940000154026.b.b.h.a.a.b #9 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 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ENSMICG00000043558 TMPRSS12 (ENSMICG00000014455) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154026.b.b.h.b #9 ENSGT00940000154026.b.b.h.a.a.b #9 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00390000003023 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409 ENSGT00990000203730 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1512 SCN8A (ENSPSMG00000007228) #19 SLC4A8 (ENSPSMG00000007136) #20 GALNT6 (ENSPSMG00000007061) #21 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Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00950000184761 ENSGT00390000003023 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00910000148932 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409 ENSGT00940000163376 Tarsier MODERN SPECIES 4209 CELA1 (ENSTSYG00000033635) #22 BIN2 (ENSTSYG00000004218) #23 SMAGP (ENSTSYG00000005521) #24 DAZAP2 (ENSTSYG00000005505) #25 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161279 #11 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ENSGT00940000153147.m.a.b.i.a ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a.e.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685.o.b #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT01080000258859 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409.c Vervet Monkey MODERN SPECIES 2 KRT81 (ENSCSAG00000005782) ENSCSAG00000005795 KRT7 (ENSCSAG00000005799) #10 ENSCSAG00000005803 KRT80 (ENSCSAG00000005813) #11 ATG101 (ENSCSAG00000005819) #13 NR4A1 (ENSCSAG00000005822) #14 TAMALIN (ENSCSAG00000005826) #15 ACVR1B (ENSCSAG00000005829) #16 ACVRL1 (ENSCSAG00000005832) #17 ANKRD33 (ENSCSAG00000005834) #18 SCN8A (ENSCSAG00000005859) #19 SLC4A8 (ENSCSAG00000005876) #20 ENSCSAG00000019255 GALNT6 (ENSCSAG00000005887) #21 CELA1 (ENSCSAG00000005892) #22 ENSCSAG00000005895 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ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT01080000258859 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409.c Macaca ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00910000147057 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00390000003023 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00910000148932 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a.e.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685.o.b #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409.c ENSGT00990000203730 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 526 KRT7 (ENSMNEG00000034954) #10 KRT80 (ENSMNEG00000032449) #11 ATG101 (ENSMNEG00000038302) #13 NR4A1 (ENSMNEG00000030022) #14 TAMALIN (ENSMNEG00000032518) #15 ACVR1B (ENSMNEG00000041904) #16 ACVRL1 (ENSMNEG00000038433) #17 ANKRD33 (ENSMNEG00000038182) #18 FIGNL2 (ENSMNEG00000010990) TMDD1 (ENSMNEG00000041611) SCN8A (ENSMNEG00000022599) #19 ENSMNEG00000039618 ENSMNEG00000024790 SLC4A8 (ENSMNEG00000029087) #20 GALNT6 (ENSMNEG00000036728) #21 CELA1 (ENSMNEG00000043609) #22 BIN2 (ENSMNEG00000038041) #23 DAZAP2 (ENSMNEG00000034058) #25 SMAGP (ENSMNEG00000028629) #24 POU6F1 (ENSMNEG00000029805) #26 TFCP2 (ENSMNEG00000011740) #27 CSRNP2 (ENSMNEG00000028791) #28 LETMD1 (ENSMNEG00000030951) #29 SLC11A2 (ENSMNEG00000037707) #30 HIGD1C (ENSMNEG00000013167) #31 METTL7A (ENSMNEG00000005792) TMPRSS12 (ENSMNEG00000031814) ATF1 (ENSMNEG00000043185) DIP2B (ENSMNEG00000044361) LARP4 (ENSMNEG00000034602) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161838.j.a.a 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snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2207 KRT81 (ENSRBIG00000029205) ENSRBIG00000025431 KRT7 (ENSRBIG00000043757) #10 KRT80 (ENSRBIG00000030932) #11 ATG101 (ENSRBIG00000028557) #13 NR4A1 (ENSRBIG00000036422) #14 TAMALIN (ENSRBIG00000010764) #15 ACVR1B (ENSRBIG00000037087) #16 ENSRBIG00000036170 ACVRL1 (ENSRBIG00000028774) #17 ANKRD33 (ENSRBIG00000030526) #18 FIGNL2 (ENSRBIG00000006929) SCN8A (ENSRBIG00000039953) #19 SLC4A8 (ENSRBIG00000006317) #20 GALNT6 (ENSRBIG00000041590) #21 CELA1 (ENSRBIG00000003848) #22 BIN2 (ENSRBIG00000035511) #23 DAZAP2 (ENSRBIG00000044166) #25 SMAGP (ENSRBIG00000029217) #24 POU6F1 (ENSRBIG00000017513) #26 TFCP2 (ENSRBIG00000043884) #27 CSRNP2 (ENSRBIG00000044429) #28 LETMD1 (ENSRBIG00000034947) #29 SLC11A2 (ENSRBIG00000037590) #30 HIGD1C (ENSRBIG00000043800) #31 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1766 ENSRROG00000031600 KRT7 (ENSRROG00000040456) #10 KRT80 (ENSRROG00000041866) #11 ATG101 (ENSRROG00000033976) #13 NR4A1 (ENSRROG00000028655) #14 TAMALIN 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ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786.e ENSGT00940000161878 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154026.b.b.h #9 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00960000186993 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629.f #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330.l #30 ENSGT00940000154786.f.a.b ENSGT00940000155330.m.b #30 ENSGT00940000154786.f.a.a ENSGT00940000155330.m.a #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786.e ENSGT00940000161878 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154026.b.b.g.a.f ##9 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00960000186993 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629.f #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330.l #30 ENSGT00940000155330.m.b #30 ENSGT00940000154786.f.a.a ENSGT00940000155330.m.a #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786.e ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 Goat MODERN SPECIES 24 ENSCHIG00000023520 #8 ENSCHIG00000023937 ##9 ENSCHIG00000021968 ##9 KRT7 (ENSCHIG00000020612) #10 KRT80 (ENSCHIG00000015503) #11 ATG101 (ENSCHIG00000017209) #13 NR4A1 (ENSCHIG00000009664) #14 TAMALIN (ENSCHIG00000025555) #15 ACVR1B (ENSCHIG00000018417) #16 ACVRL1 (ENSCHIG00000027035) #17 ENSCHIG00000016439 #18 SCN8A (ENSCHIG00000009567) #19 ENSCHIG00000017126 SLC4A8 (ENSCHIG00000013042) #20 GALNT6 (ENSCHIG00000017266) #21 CELA1 (ENSCHIG00000011067) #22 ENSCHIG00000002918 #23 SMAGP (ENSCHIG00000025991) #24 DAZAP2 (ENSCHIG00000025258) #25 ENSCHIG00000008588 #26 ENSCHIG00000026367 #26 TFCP2 (ENSCHIG00000022175) #27 CSRNP2 (ENSCHIG00000017177) #28 LETMD1 (ENSCHIG00000008272) #29 ENSCHIG00000026028 #30 ENSCHIG00000023871 #30 ENSCHIG00000018958 ENSCHIG00000012991 #30 HIGD1C (ENSCHIG00000026601) #31 ENSCHIG00000021113 TMPRSS12 (ENSCHIG00000023016) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 ENSOARG00020014353 ##9 KRT7 (ENSOARG00020014582) #10 KRT80 (ENSOARG00020014652) #11 SMIM41 (ENSOARG00020014750) #12 ATG101 (ENSOARG00020014768) #13 NR4A1 (ENSOARG00020014807) #14 TAMALIN (ENSOARG00020014917) #15 ACVR1B (ENSOARG00020015084) #16 ACVRL1 (ENSOARG00020015554) #17 ENSOARG00020015723 #18 FIGNL2 (ENSOARG00020015786) SCN8A (ENSOARG00020015921) #19 ENSOARG00020018366 SLC4A8 (ENSOARG00020018389) #20 GALNT6 (ENSOARG00020018817) #21 CELA1 (ENSOARG00020018910) #22 BIN2 (ENSOARG00020019023) #23 DAZAP2 (ENSOARG00020019274) #25 SMAGP (ENSOARG00020019563) #24 POU6F1 (ENSOARG00020019639) #26 TFCP2 (ENSOARG00020019795) #27 CSRNP2 (ENSOARG00020020021) #28 LETMD1 (ENSOARG00020020065) #29 ENSOARG00020020191 #30 ENSOARG00020020745 ENSOARG00020020771 #30 HIGD1C (ENSOARG00020020906) #31 ENSOARG00020020942 TMPRSS12 (ENSOARG00020020971) ATF1 (ENSOARG00020021026) DIP2B (ENSOARG00020021074) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154026.b.b.g.a.f ##9 ENSGT00940000154026.b.b.h #9 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629.f #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330.l.b.a #30 ENSGT00940000154786.f.a.b ENSGT00940000155330.m.b #30 ENSGT00940000154786.f.a.a ENSGT00940000155330.m.a #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786.e ENSGT00390000017639.c Bos ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154026.b.b.g.a.f ##9 ENSGT00940000154026.b.b.h #9 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629.f #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330.l.b.a #30 ENSGT00940000154786.f.a.b ENSGT00940000155330.m.b #30 ENSGT00940000154786.f.a.a ENSGT00940000155330.m.a #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786.e ENSGT00390000017639.c Bos_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154026.b.b.h #9 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000009755 #12 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT01100000263481.n.a.b.a.a.a.b.b.a.b.a.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629.f #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330.l.a #30 ENSGT00940000154786.f.a.b ENSGT00940000155330.m.b #30 ENSGT00940000154786.f.a.a ENSGT00940000155330.m.a #30 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ENSGT00940000161971 ENSGT00960000186993 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629.f #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786.e ENSGT00940000168617 ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409 Donkey MODERN SPECIES 14 ENSEASG00005028172 #9 KRT7 (ENSEASG00005008820) #10 ENSEASG00005008814 KRT80 (ENSEASG00005024921) #11 SMIM41 (ENSEASG00005008797) #12 ATG101 (ENSEASG00005036805) #13 NR4A1 (ENSEASG00005008782) #14 TAMALIN (ENSEASG00005008779) #15 ACVR1B (ENSEASG00005008768) #16 ACVRL1 (ENSEASG00005008753) #17 ENSEASG00005038500 #18 ENSEASG00005036724 SCN8A (ENSEASG00005008696) #19 SLC4A8 (ENSEASG00005006225) #20 GALNT6 (ENSEASG00005006013) #21 CELA1 (ENSEASG00005006009) #22 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#25 POU6F1 (ENSECAG00000024200) #26 TFCP2 (ENSECAG00000020650) #27 CSRNP2 (ENSECAG00000020403) #28 LETMD1 (ENSECAG00000014209) #29 SLC11A2 (ENSECAG00000020056) #30 HIGD1C (ENSECAG00000013371) #31 ENSECAG00000027812 TMPRSS12 (ENSECAG00000009548) METTL7A (ENSECAG00000020202) ENSECAG00000048892 ATF1 (ENSECAG00000016445) DIP2B (ENSECAG00000017791) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 177 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 Hedgehog MODERN SPECIES 7506 GALNT6 (ENSEEUG00000008691) #21 ENSEEUG00000008674 #22 BIN2 (ENSEEUG00000008622) #23 ENSEEUG00000008595 DAZAP2 (ENSEEUG00000008563) #25 Common shrew DUPLICATION Common shrew MODERN SPECIES 6948 ENSSARG00000009886 #22 Common shrew MODERN SPECIES 2810 ENSSARG00000010916 #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000164369 ENSGT00940000154026.b.b #9 ENSGT00940000163840 #8 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409 ENSGT00940000163376 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000164369 ENSGT00940000154026.b.b #9 ENSGT00940000163840 #8 ENSGT00940000161303 #10 ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00390000016511 #13 ENSGT00950000183038.a.b.a #14 ENSGT00530000063734.b #15 ENSGT00940000157032 #16 ENSGT00940000161446 #17 ENSGT00500000044852.b #18 ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263 #19 ENSGT00940000157422 #20 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#28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409 ENSGT00940000163376 Hyrax MODERN SPECIES 6215 ENSPCAG00000012652 #20 GALNT6 (ENSPCAG00000012566) #21 CELA1 (ENSPCAG00000012513) #22 BIN2 (ENSPCAG00000012402) #23 SMAGP (ENSPCAG00000012320) #24 DAZAP2 (ENSPCAG00000012282) #25 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 170 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000161878 ENSGT00940000158200 ENSGT00950000182997.a.b.b.b ENSGT00940000154409 ENSGT00940000163376 Armadillo MODERN SPECIES 1062 SLC4A8 (ENSDNOG00000016961) #20 GALNT6 (ENSDNOG00000031434) #21 CELA1 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ENSGT00390000017840 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155862.a.b.a.b.a ENSGT00940000162738.j.b.a ENSGT00940000162738.j.b.b.b ENSGT00940000162738.j.b.b.a.b ENSGT00940000162738.j.b.b.a.a ENSGT00940000162738.i ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00940000153993.B ENSGT01050000244890.a.b.b ENSGT00940000160612.d ENSGT00940000161557.b ENSGT00940000161557.a.b ENSGT00960000187237 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00950000185372 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT01040000240451.a.b.a ENSGT00940000159587 ENSGT00390000016293 ENSGT00940000161297 ENSGT00390000017840 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000009597 ENSGT00940000162738.j.b.a ENSGT00940000162738.j.b.b.b ENSGT00940000162738.j.b.b.a.b ENSGT00940000162738.j.b.b.a.a 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(ENSACAG00000037920) AVIL (ENSACAG00000012787) TSFM (ENSACAG00000013044) tuatara MODERN SPECIES 1722 ENSSPUG00000007740 ENSSPUG00000007610 ENSSPUG00000007573 ENSSPUG00000007553 ENSSPUG00000007529 KRT80 (ENSSPUG00000007486) #11 BCDIN3D (ENSSPUG00000007468) FAIM2 (ENSSPUG00000007377) AQP2 (ENSSPUG00000007363) AQP5 (ENSSPUG00000007350) ENSSPUG00000007291 ENSSPUG00000007273 SLC4A8 (ENSSPUG00000006895) #20 GALNT6 (ENSSPUG00000006755) #21 CELA1 (ENSSPUG00000006736) #22 BIN2 (ENSSPUG00000006703) #23 ENSSPUG00000006678 DAZAP2 (ENSSPUG00000006650) #25 ENSSPUG00000006643 POU6F1 (ENSSPUG00000006629) #26 TFCP2 (ENSSPUG00000006579) #27 CSRNP2 (ENSSPUG00000006567) #28 LETMD1 (ENSSPUG00000006556) #29 SLC11A2 (ENSSPUG00000006538) #30 HIGD1C (ENSSPUG00000006517) #31 CTDSP2 (ENSSPUG00000006499) AVIL (ENSSPUG00000006451) TSFM (ENSSPUG00000006435) EEF1AKMT3 (ENSSPUG00000006426) METTL1 (ENSSPUG00000006381) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000161853 ENSGT00940000155862.a.b.b ENSGT00960000188776 ENSGT00940000155862.a.b.a.b.b ENSGT00940000155862.a.b.a.b.a ENSGT00940000162738.j.b.a ENSGT00940000162738.i ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00940000153993.B ENSGT01050000244890.a.b.b ENSGT00940000160612.d ENSGT00940000161557.b ENSGT00960000187237 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00950000185372 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00940000162804 #31 ENSGT01040000240451.a.b.a ENSGT00940000159587 ENSGT00390000016293 ENSGT00940000161297 ENSGT00390000017840 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000162738.j.a.b ENSGT00940000155862.a.b.b ENSGT00960000188776 ENSGT00940000155862.a.b.a.b.b ENSGT00940000155862.a.b.a.b.a ENSGT00940000162738.j.b.a ENSGT00940000162738.i ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00940000153993.B ENSGT01050000244890.a.b.b ENSGT00940000160612.d ENSGT00940000161557.b ENSGT00960000187237 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00950000185372 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT01040000240451.a.b.a ENSGT00390000016293 ENSGT00940000161297 ENSGT00390000017840 ENSGT00950000182905.a.a.b ENSGT00940000158208 Aves ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000155862.a.b.b ENSGT00940000155862.a.b.a.b.b.a ENSGT00960000188776 ENSGT00940000155862.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000155862.a.b.a.b.a ENSGT00940000162738.j.b.a ENSGT00940000162738.i ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00940000153993.B ENSGT01050000244890.a.b.b ENSGT00940000160612.d ENSGT00940000161557.b ENSGT00960000187237 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00950000185372 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT01040000240451.a.b.a ENSGT00390000016293 ENSGT00940000161297 ENSGT00390000017840 ENSGT00950000182905.a.a.b ENSGT00940000154770 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000155862.a.b.b ENSGT00940000155862.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000155862.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000155862.a.b.a.b.a ENSGT00940000162738.j.b.a ENSGT00940000155862.a.a.a.a.a ENSGT00940000162738.i ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00940000153993.B ENSGT01050000244890.a.b.b ENSGT00940000160612.d ENSGT00940000161557.b ENSGT00960000187237 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00390000000685 #25 ENSGT00950000185372 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00950000183167.a.b.b.b #29 ENSGT00940000155330 #30 ENSGT00390000016293 ENSGT00940000161297 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ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000155862.a.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000155862.a.b.b ENSGT00940000155862.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000155862.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000155862.a.a.a.a.b.b.b.b ENSGT00940000155862.a.a.a.a.a ENSGT00940000162738.i ENSGT00940000161279 #11 ENSGT00940000153993.B ENSGT01050000244890.a.b.b ENSGT00940000160612.d ENSGT00940000161557.b ENSGT00960000187237 ENSGT00940000157422 #20 ENSGT00940000160845 #21 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a #22 ENSGT00950000182882.A.a #23 ENSGT00390000010077 #24 ENSGT00940000160106 #26 ENSGT00940000157629 #27 ENSGT00950000183072.b.a #28 ENSGT00550000075017 ENSGT00390000003427 ENSGT00940000159439 ENSGT01030000234815 Zebra finch DUPLICATION Zebra finch DUPLICATION Zebra finch MODERN SPECIES 22 ENSTGUG00000027201 ENSTGUG00000019319 ENSTGUG00000003913 ENSTGUG00000025188 ENSTGUG00000004022 ENSTGUG00000024866 KRT80 (ENSTGUG00000025828) #11 BCDIN3D (ENSTGUG00000020510) FAIM2 (ENSTGUG00000027219) AQP2 (ENSTGUG00000022423) AQP5 (ENSTGUG00000022648) 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DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153393.B ENSGT00940000155615.i.a ENSGT00940000154583.e.a ENSGT00390000013951 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00730000111323 ENSGT01050000244824.F ENSGT00950000182846.a.a.b.a ENSGT00940000161090.B.c.b.b.a ENSGT00940000153993.B ENSGT01090000260194 ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000159891 ENSGT00390000015021 ENSGT00940000161232 ENSGT00940000160712 ENSGT00940000155331.B ENSGT00390000016619.b ENSGT00940000155224.c.a ENSGT00940000154360.A.a ENSGT00390000010265 ENSGT00940000159006.c.a ENSGT00940000154129.gd ENSGT00990000209831 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00730000111323 ENSGT01050000244824.F ENSGT00940000164287 ENSGT00940000168313 ENSGT00950000182846.a.a.b.a.c ENSGT00950000182846.a.a.b.a.d ENSGT00940000161090.B.c.b.b.a 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Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT01080000257445 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT01090000260174 ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 ENSGT00950000183131.a.f Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 48 ENSHCOG00000019174 CELA1 (ENSHCOG00000019200) #22 ENSHCOG00000019212 #22 ENSHCOG00000019232 rdh5 (ENSHCOG00000019277) bloc1s1 (ENSHCOG00000019301) itcha (ENSHCOG00000019377) pxmp4 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ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 ENSGT00950000183131.a.f Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT01080000257445 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 ENSGT00950000183131.a.f Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT01080000257445 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a.g.b ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 ENSGT00950000183131.a.f Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 640 ENSHBUG00000003566 manbal (ENSHBUG00000003540) SRC (ENSHBUG00000003523) APCDD1L (ENSHBUG00000003483) vapb (ENSHBUG00000003466) ENSHBUG00000003453 rab22a (ENSHBUG00000003434) ENSHBUG00000003424 BCDIN3D (ENSHBUG00000003414) cers5 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ENSGT00950000183131.a.f Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT01080000257445 ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a.g.b ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00390000010923 ENSGT00940000160402 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 ENSGT00950000183131.a.f Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 1108 ENSMZEG00005003991 manbal (ENSMZEG00005004018) SRC (ENSMZEG00005004034) APCDD1L (ENSMZEG00005004075) vapb (ENSMZEG00005004084) ENSMZEG00005004112 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ENSORLG00000022198 ENSORLG00000028532 ENSORLG00000007183 ENSORLG00000023973 ENSORLG00000007238 nudt3b (ENSORLG00000025270) rps10 (ENSORLG00000007257) pacsin1b (ENSORLG00000007282) SPDEF (ENSORLG00000029267) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT01080000257445 ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.t.a #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.t.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT01060000248530.C.d.x.b ENSGT00940000163895 ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT01080000257445 ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.t.a #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT01060000248530.C.d.x.b ENSGT00940000163895 ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 11 SRC (ENSKMAG00000014774) APCDD1L (ENSKMAG00000014756) ENSKMAG00000014747 vapb (ENSKMAG00000014728) rab22a (ENSKMAG00000014705) ENSKMAG00000014667 BCDIN3D (ENSKMAG00000014656) COX14 (ENSKMAG00000014652) ENSKMAG00000014641 cers5 (ENSKMAG00000014613) gpd1b (ENSKMAG00000014583) smarcd1 (ENSKMAG00000014527) ENSKMAG00000014476 ENSKMAG00000014435 #22 ENSKMAG00000014411 #22 CELA1 (ENSKMAG00000014398) #22 gls2b (ENSKMAG00000014362) bloc1s1 (ENSKMAG00000014318) itcha (ENSKMAG00000014234) pxmp4 (ENSKMAG00000014204) tgm5l (ENSKMAG00000014174) eya2 (ENSKMAG00000014120) GCNT7 (ENSKMAG00000014094) rtf2 (ENSKMAG00000014071) tfap2c (ENSKMAG00000014011) ENSKMAG00000013976 CDH22 (ENSKMAG00000013931) ZNFX1 (ENSKMAG00000013898) tbc1d20 (ENSKMAG00000013864) rbck1 (ENSKMAG00000013826) NECAB3 (ENSKMAG00000013778) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1619 SRC (ENSNFUG00015015352) BX323459.1 (ENSNFUG00015015029) VAPB (ENSNFUG00015014990) RAB22A (ENSNFUG00015014978) ENSNFUG00015013788 BCDIN3D (ENSNFUG00015013721) COX14 (ENSNFUG00015013719) cers5 (ENSNFUG00015013638) gpd1b (ENSNFUG00015013578) ENSNFUG00015013569 SMARCD1 (ENSNFUG00015011883) ENSNFUG00015011752 ENSNFUG00015011154 ENSNFUG00015011053 ENSNFUG00015011034 #22 CELA1 (ENSNFUG00015011022) #22 gls2b (ENSNFUG00015010000) rdh5 (ENSNFUG00015009940) BLOC1S1 (ENSNFUG00015009921) ITCH (ENSNFUG00015005831) pxmp4 (ENSNFUG00015005510) tgm5l (ENSNFUG00015005493) eya2 (ENSNFUG00015005070) ENSNFUG00015004996 ENSNFUG00015004990 GCNT7 (ENSNFUG00015004943) RTFDC1 (ENSNFUG00015004915) tfap2c (ENSNFUG00015004896) ENSNFUG00015004888 CABZ01034923.1 (ENSNFUG00015004738) ZNFX1 (ENSNFUG00015023246) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161337.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000161337.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000161337.a.a.b.a.a.b.i ENSGT00940000161337.a.a.b.a.a.b.j ENSGT00940000161337.a.a.a.a ENSGT00940000161337.a.a.a.b ENSGT00940000160096 ENSGT00940000154984.B ENSGT00940000165514 ENSGT00940000160129 ENSGT00720000109813 ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000153393.B ENSGT00950000182846.a.a.b.a.a.e ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.t.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 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Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1539 ENSCVAG00000017709 #22 CELA1 (ENSCVAG00000017716) #22 gls2b (ENSCVAG00000017770) rdh5 (ENSCVAG00000017796) bloc1s1 (ENSCVAG00000017816) itcha (ENSCVAG00000017836) pxmp4 (ENSCVAG00000017857) tgm5l (ENSCVAG00000018042) eya2 (ENSCVAG00000018151) Mummichog DUPLICATION Mummichog MODERN SPECIES 345 ENSFHEG00000016192 cand2 (ENSFHEG00000016177) sec13 (ENSFHEG00000016019) ENSFHEG00000015987 dnase1l4.2 (ENSFHEG00000015902) ENSFHEG00000015888 #22 CELA1 (ENSFHEG00000015859) #22 gls2b (ENSFHEG00000015848) rdh5 (ENSFHEG00000015812) bloc1s1 (ENSFHEG00000015756) itcha (ENSFHEG00000015750) pxmp4 (ENSFHEG00000015705) tgm5l (ENSFHEG00000015688) eya2 (ENSFHEG00000015629) rtf2 (ENSFHEG00000015617) GCNT7 (ENSFHEG00000015580) tfap2c (ENSFHEG00000015575) bves (ENSFHEG00000015556) Mummichog MODERN SPECIES 194 ENSFHEG00000015435 #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b 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ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT01060000248530.C.d ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT01090000260174 ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT01060000248530.C.d ENSGT00940000163895 ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182905.b ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT01090000260174 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 ENSGT00950000183131.a.f Lumpfish MODERN SPECIES 20 cyp24a1 (ENSCLMG00005016705) ENSCLMG00005016704 manbal (ENSCLMG00005016703) SRC (ENSCLMG00005016702) APCDD1L (ENSCLMG00005016701) vapb (ENSCLMG00005016698) rab22a (ENSCLMG00005016697) ENSCLMG00005014150 BCDIN3D (ENSCLMG00005014139) ENSCLMG00005014138 cers5 (ENSCLMG00005014137) gpd1b (ENSCLMG00005014129) smarcd1 (ENSCLMG00005012219) ENSCLMG00005012204 CELA1 (ENSCLMG00005012203) #22 ENSCLMG00005012166 #22 gls2b (ENSCLMG00005009007) rdh5 (ENSCLMG00005008974) bloc1s1 (ENSCLMG00005008973) itcha (ENSCLMG00005001098) pxmp4 (ENSCLMG00005001050) tgm5l (ENSCLMG00005001046) eya2 (ENSCLMG00005001015) GCNT7 (ENSCLMG00005001014) rtf2 (ENSCLMG00005001013) tfap2c (ENSCLMG00005001012) CDH22 (ENSCLMG00005001010) ZNFX1 (ENSCLMG00005000864) tbc1d20 (ENSCLMG00005000854) rbck1 (ENSCLMG00005000804) ENSCLMG00005000802 Stickleback MODERN SPECIES 17 ENSGACG00000005505 ENSGACG00000005510 cyp24a1 (ENSGACG00000005512) manbal (ENSGACG00000005545) SRC (ENSGACG00000005548) APCDD1L (ENSGACG00000005560) vapb (ENSGACG00000005571) rab22a (ENSGACG00000005608) ENSGACG00000005643 BCDIN3D (ENSGACG00000005676) cers5 (ENSGACG00000005678) gpd1b (ENSGACG00000005724) smarcd1 (ENSGACG00000005758) ASIC1 (ENSGACG00000005765) ENSGACG00000005769 #22 ENSGACG00000005785 #22 gls2b (ENSGACG00000005817) rdh5 (ENSGACG00000005847) bloc1s1 (ENSGACG00000005870) itcha (ENSGACG00000005875) pxmp4 (ENSGACG00000005891) tgm5l (ENSGACG00000005904) eya2 (ENSGACG00000005912) rtf2 (ENSGACG00000005926) GCNT7 (ENSGACG00000005941) tfap2c (ENSGACG00000005944) CDH22 (ENSGACG00000005966) ZNFX1 (ENSGACG00000006038) tbc1d20 (ENSGACG00000006050) rbck1 (ENSGACG00000006056) NECAB3 (ENSGACG00000006069) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182905.b ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT01060000248530.C.d ENSGT00940000163895 ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a Pike perch MODERN SPECIES 17 cyp24a1 (ENSSLUG00000012382) ENSSLUG00000012354 manbal (ENSSLUG00000012345) SRC (ENSSLUG00000010249) APCDD1L (ENSSLUG00000010165) vapb (ENSSLUG00000010157) rab22a (ENSSLUG00000010128) ENSSLUG00000007746 BCDIN3D (ENSSLUG00000007596) COX14 (ENSSLUG00000007594) cers5 (ENSSLUG00000007586) gpd1b (ENSSLUG00000007575) smarcd1 (ENSSLUG00000007148) ENSSLUG00000006835 ENSSLUG00000006809 #22 CELA1 (ENSSLUG00000006800) #22 gls2b (ENSSLUG00000004580) rdh5 (ENSSLUG00000004206) rdh5 (ENSSLUG00000004157) bloc1s1 (ENSSLUG00000004132) itcha (ENSSLUG00000001012) pxmp4 (ENSSLUG00000000717) tgm5l (ENSSLUG00000000711) eya2 (ENSSLUG00000000699) ENSSLUG00000000690 GCNT7 (ENSSLUG00000000686) rtf2 (ENSSLUG00000000679) tfap2c (ENSSLUG00000000674) CDH22 (ENSSLUG00000000666) ZNFX1 (ENSSLUG00000000580) tbc1d20 (ENSSLUG00000000553) Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 cyp24a1 (ENSCGOG00000023265) ENSCGOG00000023258 manbal (ENSCGOG00000023255) SRC (ENSCGOG00000022172) APCDD1L (ENSCGOG00000022116) vapb (ENSCGOG00000022113) rab22a (ENSCGOG00000022109) ENSCGOG00000021817 BCDIN3D (ENSCGOG00000021815) ENSCGOG00000021814 cers5 (ENSCGOG00000021810) gpd1b (ENSCGOG00000021790) smarcd1 (ENSCGOG00000021430) ENSCGOG00000021385 ENSCGOG00000021382 #22 CELA1 (ENSCGOG00000021310) #22 gls2b (ENSCGOG00000020781) rdh5 (ENSCGOG00000020700) bloc1s1 (ENSCGOG00000020690) itcha (ENSCGOG00000018197) pxmp4 (ENSCGOG00000018129) tgm5l (ENSCGOG00000018128) eya2 (ENSCGOG00000018103) GCNT7 (ENSCGOG00000018098) rtf2 (ENSCGOG00000018096) tfap2c (ENSCGOG00000018093) ENSCGOG00000018091 CDH22 (ENSCGOG00000017329) ZNFX1 (ENSCGOG00000017228) tbc1d20 (ENSCGOG00000017221) rbck1 (ENSCGOG00000017217) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT01080000257445 ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT01090000260174 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 ENSGT00950000183131.a.f Gilthead seabream MODERN SPECIES 20 ENSSAUG00010000659 cyp24a1 (ENSSAUG00010000663) ENSSAUG00010000675 manbal (ENSSAUG00010000679) SRC (ENSSAUG00010000750) APCDD1L (ENSSAUG00010003650) vapb (ENSSAUG00010003652) rab22a (ENSSAUG00010003658) ENSSAUG00010003683 BCDIN3D (ENSSAUG00010003729) COX14 (ENSSAUG00010003732) cers5 (ENSSAUG00010003739) gpd1b (ENSSAUG00010003752) smarcd1 (ENSSAUG00010003785) ENSSAUG00010005674 cela1.3 (ENSSAUG00010005768) #22 gls2b (ENSSAUG00010005816) rdh5 (ENSSAUG00010008774) bloc1s1 (ENSSAUG00010008776) itcha (ENSSAUG00010008871) pxmp4 (ENSSAUG00010017128) tgm5l (ENSSAUG00010017129) eya2 (ENSSAUG00010017131) rtf2 (ENSSAUG00010017138) GCNT7 (ENSSAUG00010017140) tfap2c (ENSSAUG00010017146) ENSSAUG00010017156 ENSSAUG00010017160 CDH22 (ENSSAUG00010017167) ZNFX1 (ENSSAUG00010017184) tbc1d20 (ENSSAUG00010017190) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 Large yellow croaker MODERN SPECIES 478 cyp24a1 (ENSLCRG00005002173) ENSLCRG00005023759 manbal (ENSLCRG00005023753) SRC (ENSLCRG00005023516) APCDD1L (ENSLCRG00005023411) vapb 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ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 18 ENSATEG00000025085 ENSATEG00000025084 ENSATEG00000025083 APCDD1L (ENSATEG00000026034) ENSATEG00000025081 vapb (ENSATEG00000028403) rab22a (ENSATEG00000025926) ENSATEG00000025078 ENSATEG00000025441 ENSATEG00000025076 ENSATEG00000025075 gpd1b 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ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.q.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.q.a #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT01030000234588.a.a.b ENSGT00940000156777.c ENSGT00940000156637.b ENSGT00940000158040.d ENSGT00940000157586.e ENSGT00940000166065.a ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a ENSGT00940000160123.e.b.a.b ENSGT00940000160123.e.b.b ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918 ENSGT00950000182973.a.c.a.c Indian medaka MODERN SPECIES 8 cyp24a1 (ENSOMEG00000013649) ENSOMEG00000013609 manbal (ENSOMEG00000013578) SRC (ENSOMEG00000013533) APCDD1L (ENSOMEG00000013483) vapb (ENSOMEG00000013470) ENSOMEG00000000903 rab22a (ENSOMEG00000013425) ENSOMEG00000013394 BCDIN3D (ENSOMEG00000013355) COX14 (ENSOMEG00000013342) cers5 (ENSOMEG00000013324) gpd1b (ENSOMEG00000013286) smarcd1 (ENSOMEG00000013234) ENSOMEG00000013169 CELA1 (ENSOMEG00000013115) #22 ENSOMEG00000013096 #22 ENSOMEG00000013070 #22 tnni1b (ENSOMEG00000013028) csrp1b (ENSOMEG00000013015) NAV1 (ENSOMEG00000012980) mybphb (ENSOMEG00000012906) SYT2 (ENSOMEG00000012840) ENSOMEG00000012734 ENSOMEG00000012697 ENSOMEG00000012547 ENSOMEG00000012442 GRM4 (ENSOMEG00000012281) nudt3b (ENSOMEG00000012248) rps10 (ENSOMEG00000012208) pacsin1b (ENSOMEG00000012156) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182932.C.a ENSGT00950000182905.b ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.q.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.q.a #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT01030000234588.a.a.b ENSGT00940000156777.c ENSGT01010000223242 ENSGT00940000156637.b ENSGT00940000158040.d ENSGT00940000157586.e ENSGT00940000166065.a ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a ENSGT00940000160123.e.b.a.b ENSGT00940000160123.e.b.b ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b ENSGT00940000157882 ENSGT00440000034918 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 19 ENSORLG00000023353 manbal (ENSORLG00000023854) SRC (ENSORLG00000006714) APCDD1L (ENSORLG00000006724) vapb (ENSORLG00000006745) ENSORLG00000025533 ENSORLG00000023158 rab22a (ENSORLG00000026049) ENSORLG00000006805 BCDIN3D (ENSORLG00000022941) cers5 (ENSORLG00000006833) COX14 (ENSORLG00000022328) gpd1b (ENSORLG00000006847) smarcd1 (ENSORLG00000006870) ENSORLG00000006894 ENSORLG00000025997 #22 ENSORLG00000006922 #22 CELA1 (ENSORLG00000006967) #22 tnni1b (ENSORLG00000006990) csrp1b (ENSORLG00000007008) ENSORLG00000026873 NAV1 (ENSORLG00000007109) mybphb (ENSORLG00000007135) ENSORLG00000007159 ENSORLG00000022198 ENSORLG00000028532 ENSORLG00000007183 ENSORLG00000023973 ENSORLG00000007238 nudt3b (ENSORLG00000025270) rps10 (ENSORLG00000007257) Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.r #22 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.r #22 Chinese medaka MODERN SPECIES 3281 ENSOSIG00000001913 #22 Cyprinodontiformes DUPLICATION Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.s #22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.s #22 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 11 manbal (ENSKMAG00000014809) SRC (ENSKMAG00000014774) APCDD1L (ENSKMAG00000014756) ENSKMAG00000014747 vapb (ENSKMAG00000014728) rab22a (ENSKMAG00000014705) ENSKMAG00000014667 BCDIN3D (ENSKMAG00000014656) COX14 (ENSKMAG00000014652) ENSKMAG00000014641 cers5 (ENSKMAG00000014613) gpd1b (ENSKMAG00000014583) smarcd1 (ENSKMAG00000014527) ENSKMAG00000014476 ENSKMAG00000014435 #22 ENSKMAG00000014411 #22 CELA1 (ENSKMAG00000014398) #22 gls2b (ENSKMAG00000014362) bloc1s1 (ENSKMAG00000014318) itcha (ENSKMAG00000014234) pxmp4 (ENSKMAG00000014204) tgm5l (ENSKMAG00000014174) eya2 (ENSKMAG00000014120) GCNT7 (ENSKMAG00000014094) rtf2 (ENSKMAG00000014071) tfap2c (ENSKMAG00000014011) ENSKMAG00000013976 CDH22 (ENSKMAG00000013931) ZNFX1 (ENSKMAG00000013898) tbc1d20 (ENSKMAG00000013864) rbck1 (ENSKMAG00000013826) Cyprinodontiformes DUPLICATION Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182905.b ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT01080000257445 ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.t.a #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.t.b #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT01060000248530.C.d.x.b ENSGT00940000163895 ENSGT00940000159376 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000182905.b ENSGT00940000156230.o ENSGT00390000003422 ENSGT00940000158250.d.a ENSGT00640000091492.b ENSGT01080000257445 ENSGT00940000155769.`b.b ENSGT00940000157009 ENSGT00950000183066.a.b.a.b ENSGT00940000153993.B ENSGT00390000002190 ENSGT01030000234515.a.a.a.k ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.b.t.a #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00940000157014.f ENSGT00390000001562 ENSGT01050000244866.D.b.a ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000160402 ENSGT00390000010923 ENSGT00950000182848.c.b.a.b ENSGT01060000248530.C.d.x.b ENSGT00940000163895 ENSGT00940000159376 ENSGT00940000155154.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 11 ENSKMAG00000014825 manbal (ENSKMAG00000014809) SRC (ENSKMAG00000014774) APCDD1L (ENSKMAG00000014756) ENSKMAG00000014747 vapb (ENSKMAG00000014728) rab22a (ENSKMAG00000014705) ENSKMAG00000014667 BCDIN3D (ENSKMAG00000014656) COX14 (ENSKMAG00000014652) ENSKMAG00000014641 cers5 (ENSKMAG00000014613) gpd1b (ENSKMAG00000014583) smarcd1 (ENSKMAG00000014527) ENSKMAG00000014476 ENSKMAG00000014435 #22 ENSKMAG00000014411 #22 CELA1 (ENSKMAG00000014398) #22 gls2b (ENSKMAG00000014362) bloc1s1 (ENSKMAG00000014318) itcha (ENSKMAG00000014234) pxmp4 (ENSKMAG00000014204) tgm5l (ENSKMAG00000014174) eya2 (ENSKMAG00000014120) GCNT7 (ENSKMAG00000014094) rtf2 (ENSKMAG00000014071) tfap2c (ENSKMAG00000014011) ENSKMAG00000013976 CDH22 (ENSKMAG00000013931) ZNFX1 (ENSKMAG00000013898) tbc1d20 (ENSKMAG00000013864) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1619 manbal (ENSNFUG00015018938) SRC (ENSNFUG00015015352) BX323459.1 (ENSNFUG00015015029) VAPB (ENSNFUG00015014990) RAB22A (ENSNFUG00015014978) ENSNFUG00015013788 BCDIN3D (ENSNFUG00015013721) COX14 (ENSNFUG00015013719) cers5 (ENSNFUG00015013638) gpd1b (ENSNFUG00015013578) ENSNFUG00015013569 SMARCD1 (ENSNFUG00015011883) ENSNFUG00015011752 ENSNFUG00015011154 ENSNFUG00015011053 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NTRK3 (ENSELUG00000016689) ENSELUG00000016769 Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 59 ENSELUG00000030930 ENSELUG00000012098 #22 Northern pike MODERN SPECIES 82 ENSELUG00000001283 #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 3 zgc:171566 (ENSSSAG00000042676) ENSSSAG00000042697 MCM2 (ENSSSAG00000042717) ENSSSAG00000108862 ccdc51 (ENSSSAG00000082299) dnase1l4.2 (ENSSSAG00000042975) ENSSSAG00000108536 CL062 (ENSSSAG00000043016) cers5 (ENSSSAG00000067468) gpd1b (ENSSSAG00000043162) smarcd1 (ENSSSAG00000043397) asic1b (ENSSSAG00000047167) ENSSSAG00000087361 ENSSSAG00000120768 #22 ENSSSAG00000055016 #22 ENSSSAG00000055002 #22 ENSSSAG00000087837 gls2b (ENSSSAG00000055116) RDH5 (ENSSSAG00000058768) bloc1s1 (ENSSSAG00000058802) ITGA7 (ENSSSAG00000058863) npff (ENSSSAG00000059544) ENSSSAG00000059561 ENSSSAG00000089742 ENSSSAG00000063960 ENSSSAG00000064261 ENSSSAG00000110532 ENSSSAG00000004165 MAP3K12 (ENSSSAG00000004308) PCBP2 (ENSSSAG00000005732) ENSSSAG00000086826 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 Zig-zag eel MODERN SPECIES 19 ENSMAMG00000008450 ENSMAMG00000008435 ENSMAMG00000008423 ENSMAMG00000008384 tfap2c 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##22 ENSSDUG00000007026 #22 FAM13A (ENSSDUG00000007740) herc3 (ENSSDUG00000007794) ppm1kb (ENSSDUG00000007874) abcg2d (ENSSDUG00000007902) pkd2 (ENSSDUG00000007941) g3bp2a (ENSSDUG00000008013) uso1 (ENSSDUG00000008097) coro2aa (ENSSDUG00000008243) anp32b (ENSSDUG00000008282) trmo (ENSSDUG00000008290) ENSSDUG00000008304 sh3gl2a (ENSSDUG00000008361) ENSSDUG00000008392 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000013951 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00730000111323 ENSGT01050000244824.F ENSGT00940000164287 ENSGT00940000168313 ENSGT00950000182846.a.a.b.a.c ENSGT00950000182846.a.a.b.a.d ENSGT00940000161090.B.c.b.b.a ENSGT00940000153993.B ENSGT01090000260194 ENSGT01030000234515.a.a.a ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154583.e.a ENSGT00390000013951 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00730000111323 ENSGT01050000244824.F ENSGT00940000164287 ENSGT00940000166028 ENSGT00950000182846.a.a.b.a.d ENSGT00940000161090.B.c.b.b.a ENSGT00940000153993.B ENSGT01090000260194 ENSGT01030000234515.a.a.a ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 ENSGT00510000048121 ENSGT00530000065109 ENSGT00390000017669 ENSGT00940000155146 ENSGT00940000157869.e.b ENSGT00940000155306.a ENSGT00940000157928 ENSGT00940000156494 ENSGT00620000089227 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154583.e.a ENSGT00390000013951 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00730000111323 ENSGT01050000244824.F ENSGT00940000164287 ENSGT00940000168313 ENSGT00950000182846.a.a.b.a.c ENSGT00950000182846.a.a.b.a.d ENSGT00940000161090.B.c.b.b.a ENSGT00940000153993.B ENSGT01090000260194 ENSGT01030000234515.a.a.a ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 ENSGT00510000048121 ENSGT00530000065109 ENSGT00390000017669 ENSGT00940000155146 ENSGT00940000157869.e.b ENSGT00940000155306.a ENSGT00940000157928 ENSGT00940000156494 ENSGT00620000089227 Characiphysae_b DUPLICATION Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000013951 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00730000111323 ENSGT01050000244824.F ENSGT00940000164287 ENSGT00940000168313 ENSGT00950000182846.a.a.b.a.c ENSGT00950000182846.a.a.b.a.d ENSGT00940000161090.B.c.b.b.a ENSGT00940000153993.B ENSGT01090000260194 ENSGT01030000234515.a.a.a ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.a #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 ENSGT00510000048121 ENSGT00530000065109 ENSGT00390000017669 ENSGT00940000155146 ENSGT00940000157869.e.b ENSGT00940000155306.a ENSGT00940000157928 ENSGT00940000156494 ENSGT00620000089227 Characoidei DUPLICATION Characoidei ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.a.a #22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.a.b #22 ENSGT00390000010463.a.a.a.a ENSGT00940000161168 ENSGT00390000002689 ENSGT00390000014944.a ENSGT00940000166000 ENSGT00510000048121 ENSGT00530000065109 ENSGT00390000017669 ENSGT00940000155146 ENSGT00940000157869.e.b ENSGT00940000155306.a ENSGT00940000157928 ENSGT00940000156494 ENSGT00620000089227 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1212 CELA1 (ENSAMXG00000014110) #22 ENSAMXG00000035756 ENSAMXG00000040394 #22 gls2b (ENSAMXG00000004802) rdh5 (ENSAMXG00000038946) bloc1s1 (ENSAMXG00000039913) tbc1d20 (ENSAMXG00000041540) rbck1 (ENSAMXG00000004941) ENSAMXG00000037599 rpp14 (ENSAMXG00000042078) HTD2 (ENSAMXG00000025978) pxk (ENSAMXG00000004944) pdhb 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Red-bellied piranha MODERN SPECIES 103 CELA1 (ENSPNAG00000029808) #22 ENSPNAG00000029818 #22 gls2b (ENSPNAG00000029837) rdh5 (ENSPNAG00000029847) bloc1s1 (ENSPNAG00000029856) tbc1d20 (ENSPNAG00000029862) rbck1 (ENSPNAG00000029872) rpp14 (ENSPNAG00000029880) HTD2 (ENSPNAG00000029891) pxk (ENSPNAG00000029914) pdhb (ENSPNAG00000029924) kctd6a (ENSPNAG00000029932) ccdc71 (ENSPNAG00000029934) stab1 (ENSPNAG00000005656) NISCH (ENSPNAG00000029982) ENSPNAG00000004690 nol8 (ENSPNAG00000029992) Electric eel MODERN SPECIES 237 cers5 (ENSEEEG00000007622) gpd1b (ENSEEEG00000007630) smarcd1 (ENSEEEG00000007720) ENSEEEG00000007728 asic1b (ENSEEEG00000007733) CELA1 (ENSEEEG00000007734) #22 gls2b (ENSEEEG00000007742) rdh5 (ENSEEEG00000007744) bloc1s1 (ENSEEEG00000007803) tbc1d20 (ENSEEEG00000007805) rbck1 (ENSEEEG00000007806) rpp14 (ENSEEEG00000007807) HTD2 (ENSEEEG00000007808) pxk (ENSEEEG00000007812) pdhb (ENSEEEG00000007841) kctd6a (ENSEEEG00000007848) ccdc71 (ENSEEEG00000007849) stab1 (ENSEEEG00000007865) NISCH (ENSEEEG00000008053) ENSEEEG00000008064 ENSEEEG00000008068 Characiphysae_b DUPLICATION Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00390000017193 ENSGT00940000169304 ENSGT00390000014634 ENSGT00530000062932 ENSGT00940000155214.k.a ENSGT00440000039084.a.b ENSGT00390000001761 ENSGT00940000165981 ENSGT00530000064123.g ENSGT00390000004524 ENSGT00940000156744.p ENSGT00390000004511.c.a.d ENSGT00940000155826 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00950000183005.a.b ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.b.a #22 ENSGT00940000158867 ENSGT00940000160259.f ENSGT00940000165000 ENSGT00940000161645.a ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000165922 ENSGT00940000159383 ENSGT00940000158840 ENSGT00390000007109 ENSGT00940000172372 ENSGT00940000157979 ENSGT00390000014471 ENSGT00940000153212.bb.b.b ENSGT00940000153212.bb.b.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 284 ENSGT00390000004511.c.a.d ENSGT00940000155826 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00950000183005.a.b ENSGT00940000163149.b.c.a.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.b.a #22 ENSGT00940000158867 ENSGT00940000165000 ENSGT00940000161645.a ENSGT00940000158075 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000165922 ENSGT00940000159383 ENSGT00940000158840 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 280 CMKLR1 (ENSPNAG00000001271) ENSPNAG00000008970 ENSPNAG00000008983 ENSPNAG00000008995 CMKLR1 (ENSPNAG00000009016) ENSPNAG00000009023 ENSPNAG00000009032 cmklr1 (ENSPNAG00000009040) CMKLR1 (ENSPNAG00000009048) wscd2 (ENSPNAG00000005405) carnmt1 (ENSPNAG00000009100) trpm6 (ENSPNAG00000009126) rorb (ENSPNAG00000009139) MFSD3 (ENSPNAG00000009159) anxa1a (ENSPNAG00000009223) ENSPNAG00000009869 #22 ENSPNAG00000009898 mbd2 (ENSPNAG00000009910) rnf185 (ENSPNAG00000009937) YTHDC2 (ENSPNAG00000010128) ENSPNAG00000010167 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2547 ENSPNAG00000013879 #22 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2261 ENSPNAG00000003113 #22 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 296 ENSPNAG00000002399 ENSPNAG00000012832 #22 ENSPNAG00000002498 #22 ENSPNAG00000013019 #22 dcc (ENSPNAG00000013078) trabd2a (ENSPNAG00000013117) ENSPNAG00000013128 HOOK3 (ENSPNAG00000013166) rnf170 (ENSPNAG00000002602) june (ENSPNAG00000013186) ENSPNAG00000013188 Mexicana tetra MODERN SPECIES 153 surf4 (ENSAMXG00000008115) surf2 (ENSAMXG00000008087) bbln (ENSAMXG00000033178) ENSAMXG00000008021 dnm1a (ENSAMXG00000007980) golga2 (ENSAMXG00000007941) haus4 (ENSAMXG00000007907) ddrgk1 (ENSAMXG00000007876) LZTS3 (ENSAMXG00000041913) FASTKD5 (ENSAMXG00000025880) ENSAMXG00000041481 rnf185 (ENSAMXG00000007798) mbd2 (ENSAMXG00000042143) ENSAMXG00000036262 ENSAMXG00000030416 CELA1 (ENSAMXG00000014225) #22 dcc (ENSAMXG00000014271) trabd2a (ENSAMXG00000041427) HOOK3 (ENSAMXG00000014373) rnf170 (ENSAMXG00000036159) june (ENSAMXG00000025986) THAP1 (ENSAMXG00000029741) ENSAMXG00000035930 tek (ENSAMXG00000007111) Electric eel MODERN SPECIES 853 rnf185 (ENSEEEG00000004491) mbd2 (ENSEEEG00000004488) ENSEEEG00000004245 ENSEEEG00000004211 #22 dcc (ENSEEEG00000004208) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.b.b #22 Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.b.b #22 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 296 ENSPNAG00000002399 ENSPNAG00000012832 #22 ENSPNAG00000002498 #22 ENSPNAG00000013019 #22 dcc (ENSPNAG00000013078) trabd2a (ENSPNAG00000013117) ENSPNAG00000013128 HOOK3 (ENSPNAG00000013166) rnf170 (ENSPNAG00000002602) june (ENSPNAG00000013186) ENSPNAG00000013188 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 296 ENSPNAG00000002399 ENSPNAG00000012832 #22 ENSPNAG00000002498 #22 ENSPNAG00000013019 #22 dcc (ENSPNAG00000013078) trabd2a (ENSPNAG00000013117) ENSPNAG00000013128 HOOK3 (ENSPNAG00000013166) rnf170 (ENSPNAG00000002602) june (ENSPNAG00000013186) ENSPNAG00000013188 Channel catfish MODERN SPECIES 13 podxl2 (ENSIPUG00000009274) mcm2 (ENSIPUG00000009302) ccdc51 (ENSIPUG00000009350) ENSIPUG00000009357 ENSIPUG00000009381 dnase1l4.2 (ENSIPUG00000009506) ENSIPUG00000009514 bcdin3d (ENSIPUG00000009539) ENSIPUG00000009553 CERS5 (ENSIPUG00000009566) gpd1 (ENSIPUG00000009634) smarcd1 (ENSIPUG00000009660) asic1 (ENSIPUG00000009680) ENSIPUG00000009724 ENSIPUG00000009731 tmprss12 (ENSIPUG00000009741) #22 gls2b (ENSIPUG00000009764) ENSIPUG00000009923 rdh5 (ENSIPUG00000009950) bloc1s1 (ENSIPUG00000009969) tbc1d20 (ENSIPUG00000010009) rbck1 (ENSIPUG00000010047) rpp14 (ENSIPUG00000010066) HTD2 (ENSIPUG00000010099) PXK (ENSIPUG00000010143) pdhb (ENSIPUG00000010279) KCTD6 (ENSIPUG00000010343) ccdc71 (ENSIPUG00000010381) stab1 (ENSIPUG00000010453) nisch (ENSIPUG00000010896) ENSIPUG00000010913 Cyprinoidei DUPLICATION Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00730000111323 ENSGT01050000244824.F ENSGT00940000164287 ENSGT00940000166028 ENSGT00950000182846.a.a.b.b ENSGT00950000182846.a.a.b.a.d ENSGT00940000163467.a.b.b.b.a.a ENSGT00940000161090.B.c.b.b.a ENSGT00940000153993.B ENSGT01090000260194 ENSGT01030000234515.a.a.a ENSGT00390000003114.e.a.b ENSGT00940000156629 ENSGT00940000168601 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.c #22 ENSGT01050000244806.b.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a.b.b.a.b.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 815 ENSGT00390000003114.e.a.b.c ENSGT00940000156629.c.b ENSGT00940000168601.b ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.c.a #22 ENSGT01050000244806.b.a.b.c.a.a.b.a ENSGT01050000244806.b.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b.a ENSGT01050000244806.b.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a.b.b.a.b.b.b.b.b.b.a.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01100000263547.a.b.b.a.a.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 760 cela1.6 (ENSCARG00000036326) #22 ENSCARG00000036322 ENSCARG00000036308 ENSCARG00000036305 ENSCARG00000036293 ENSCARG00000036287 ENSCARG00000036282 ENSCARG00000036277 ENSCARG00000036268 ENSCARG00000036251 ENSCARG00000036218 ENSCARG00000036202 CACNA2D2 (ENSCARG00000034649) ENSCARG00000034280 ENSCARG00000034268 ENSCARG00000034259 Goldfish MODERN SPECIES 395 ENSCARG00000023472 ENSCARG00000023477 gpd1b (ENSCARG00000023485) smarcd1 (ENSCARG00000023720) ENSCARG00000026365 cela1.6 (ENSCARG00000027655) #22 ENSCARG00000027677 ENSCARG00000027687 ENSCARG00000027699 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 584 ENSGT00390000003114.e.a.b.c ENSGT00940000156629.c.b ENSGT00940000168601.b ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.c.a #22 ENSGT01050000244806.b.a.b.c.a.a.b.a ENSGT01050000244806.b.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b.a ENSGT01050000244806.b.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a.b.b.a.b.b.b.b.b.b.a.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01100000263547.a.b.b.a.a.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000156238.a.b ENSGT00400000022095.b.b Common carp reference MODERN SPECIES 43 ENSCCRG00000012696 ENSCCRG00000017129 ENSCCRG00000059791 ENSCCRG00000074651 ENSCCRG00000077803 ENSCCRG00000070237 ENSCCRG00000055490 ENSCCRG00000030410 ENSCCRG00000031004 ENSCCRG00000028117 ENSCCRG00000059720 ENSCCRG00000077366 gpd1b (ENSCCRG00000068821) smarcd1 (ENSCCRG00000008523) ENSCCRG00000020257 cela1.6 (ENSCCRG00000024881) #22 ENSCCRG00000045905 ENSCCRG00000071327 ENSCCRG00000066234 ENSCCRG00000029590 ENSCCRG00000029580 ENSCCRG00000029571 ENSCCRG00000062441 ENSCCRG00000017148 ENSCCRG00000067439 ENSCCRG00000017186 ENSCCRG00000017313 ENSCCRG00000012263 ENSCCRG00000058822 ENSCCRG00000058109 ENSCCRG00000037049 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1072 ENSSGRG00000022684 ENSSGRG00000022682 ENSSGRG00000022681 ENSSGRG00000022680 gpd1b (ENSSGRG00000022158) smarcd1 (ENSSGRG00000022106) ENSSGRG00000021651 cela1.6 (ENSSGRG00000021639) #22 ENSSGRG00000021636 ENSSGRG00000021635 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 891 ENSGT00950000183052.b.c.a.a.b.b.a.a.a ENSGT00950000182858.A.b.b.g.b.t.b.b ENSGT00390000003114.e.a.b.d ENSGT00940000156629.d ENSGT00940000168601.a ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.c.b #22 ENSGT01050000244806.b.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a.b.b.a.b.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 805 ENSGT00940000156629.c.a ENSGT00940000168601.a ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.c.b #22 ENSGT01050000244806.b.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a.b.b.a.b.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a Common carp reference MODERN SPECIES 5 ENSCCRG00000027446 ENSCCRG00000034701 ENSCCRG00000070051 ENSCCRG00000063921 ENSCCRG00000017173 ENSCCRG00000043660 ENSCCRG00000073018 ENSCCRG00000066508 ENSCCRG00000009993 ENSCCRG00000078880 ENSCCRG00000057545 ENSCCRG00000066245 gpd1b (ENSCCRG00000020211) ENSCCRG00000020235 ENSCCRG00000008534 cela1.6 (ENSCCRG00000065573) #22 ENSCCRG00000024871 ENSCCRG00000073495 ENSCCRG00000034238 ENSCCRG00000065268 ENSCCRG00000074512 ENSCCRG00000081735 ENSCCRG00000066178 ENSCCRG00000057208 ENSCCRG00000036851 ENSCCRG00000076879 ENSCCRG00000057123 ENSCCRG00000061722 ENSCCRG00000072807 ENSCCRG00000059158 ENSCCRG00000054800 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1416 cela1.6 (ENSSGRG00000019668) #22 ENSSGRG00000019664 ENSSGRG00000019663 ENSSGRG00000019662 ENSSGRG00000019661 Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 1322 cela1.6 (ENSCARG00000036963) #22 ENSCARG00000036953 ENSCARG00000036882 Goldfish MODERN SPECIES 14 slx9 (ENSCARG00000030582) ENSCARG00000030708 cnot9 (ENSCARG00000034144) ftcd (ENSCARG00000034487) mstna (ENSCARG00000035931) stat1a (ENSCARG00000035963) glsa (ENSCARG00000036617) nab1a (ENSCARG00000040133) mfsd6a (ENSCARG00000040144) ENSCARG00000040156 ahr1b (ENSCARG00000040185) ENSCARG00000040267 ahr2 (ENSCARG00000040299) ENSCARG00000040642 ENSCARG00000040720 cela1.6 (ENSCARG00000042709) #22 ENSCARG00000042744 ENSCARG00000042799 ENSCARG00000042821 ENSCARG00000042828 ENSCARG00000042842 ENSCARG00000042855 ENSCARG00000042865 ENSCARG00000042875 rbck1 (ENSCARG00000042920) tbc1d20 (ENSCARG00000043050) bloc1s1 (ENSCARG00000043091) rdh5 (ENSCARG00000043145) rdh5 (ENSCARG00000043185) gls2b (ENSCARG00000043284) ENSCARG00000043384 Zebrafish MODERN SPECIES 14 ENSDARG00000090612 ENSDARG00000090601 ENSDARG00000090869 ENSDARG00000092230 ENSDARG00000100301 ENSDARG00000090310 zgc:171500 (ENSDARG00000071553) ENSDARG00000058753 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bonytongue MODERN SPECIES 14 gpd1b (ENSSFOG00015006749) smarcd1 (ENSSFOG00015006704) ENSSFOG00015006648 ENSSFOG00015028401 #22 ENSSFOG00015027284 #22 ENSSFOG00015025933 #22 ENSSFOG00015032804 #22 ENSSFOG00015031401 #22 ENSSFOG00015025491 #22 ENSSFOG00015027355 #22 ENSSFOG00015030354 #22 ENSSFOG00015026296 #22 ENSSFOG00015029562 #22 ENSSFOG00015027307 #22 ENSSFOG00015025574 #22 ENSSFOG00015032238 #22 ENSSFOG00015030118 #22 ENSSFOG00015028781 #22 gls2b (ENSSFOG00015013928) rdh5 (ENSSFOG00015013894) bloc1s1 (ENSSFOG00015026403) ITGA7 (ENSSFOG00015013843) npffl (ENSSFOG00015033293) PPP1R1A (ENSSFOG00015029572) PDE1B (ENSSFOG00015013758) nckap1l (ENSSFOG00015026764) col2a1b (ENSSFOG00015013432) ENSSFOG00015013386 myg1 (ENSSFOG00015013355) MAP3K12 (ENSSFOG00015013294) PCBP2 (ENSSFOG00015013231) Asian bonytongue MODERN SPECIES 44 ENSSFOG00015033193 #22 ENSSFOG00015026581 #22 ENSSFOG00015029315 #22 ENSSFOG00015025193 #22 ENSSFOG00015006624 #22 ENSSFOG00015029411 #22 ENSSFOG00015025964 #22 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Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000155281 ENSGT00940000158227 ENSGT00950000183019.f.a ENSGT00940000165403 ENSGT00940000159301 ENSGT00940000161049 ENSGT00390000010557 ENSGT00940000174963 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.b ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a ##28 ENSGT00530000063779.B.a ENSGT00940000158377.b ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000154621.a.b ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT01040000240451.a.b.b.a.a ENSGT01040000240451.a.b.b.b Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 214 ENSGT00990000204628 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000158548 ENSGT00940000173926 ENSGT00940000180074 ENSGT00940000160089 ENSGT00940000156360.c ENSGT00970000197767 ENSGT00940000160253 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00390000006098 ENSGT00390000008686.c.d ENSGT00390000005979.a ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00940000165167 ENSGT00940000154621.a.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 151 ENSGT00940000158227 ENSGT00950000183019.f.a.c.a ENSGT00940000177454 ENSGT00940000155020.u.a.b ENSGT00940000165403 ENSGT00940000159301.c.a ENSGT00390000010557 ENSGT00940000174963 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210.d ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.a.b ENSGT00920000149157.d ENSGT00390000008686.c.d ENSGT00390000005979.a ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a ENSGT00530000063629.b.c Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.h ENSGT00530000063629.b.c Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT01040000240451.a.b.b.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT01040000240451.a.b.b.b Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 12 trpc1 (ENSMMDG00005014745) CHST2 (ENSMMDG00005014757) SLC9A9 (ENSMMDG00005014761) dipk2ab (ENSMMDG00005014766) plod2 (ENSMMDG00005014786) ENSMMDG00005014813 zic4 (ENSMMDG00005014816) zic1 (ENSMMDG00005014818) AGTR1 (ENSMMDG00005014819) cpb1 (ENSMMDG00005014820) gyg1b (ENSMMDG00005014823) bdh1 (ENSMMDG00005014824) NCK1 (ENSMMDG00005014828) slc35g2b (ENSMMDG00005014833) ENSMMDG00005014836 ENSMMDG00005014839 ##22 csrnp1b (ENSMMDG00005014841) ##28 ENSMMDG00005014842 slc22a13b (ENSMMDG00005014845) slc22a13b (ENSMMDG00005014855) slc22a13b (ENSMMDG00005014860) slc22a13b (ENSMMDG00005014867) slc22a13b (ENSMMDG00005014874) slc22a13b (ENSMMDG00005014877) slc22a13b (ENSMMDG00005014881) slc22a13b (ENSMMDG00005014892) oxsr1b (ENSMMDG00005014929) myd88 (ENSMMDG00005017199) cry-dash (ENSMMDG00005017204) map3k22 (ENSMMDG00005017227) acaa1 (ENSMMDG00005017256) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00940000153759.a.a.h ENSGT00530000063629.b.c Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 250 dipk2ab (ENSHCOG00000011938) plod2 (ENSHCOG00000011922) ENSHCOG00000011873 zic4 (ENSHCOG00000011816) zic1 (ENSHCOG00000011805) AGTR1 (ENSHCOG00000000344) cpb1 (ENSHCOG00000011742) gyg1b (ENSHCOG00000011712) cluap1 (ENSHCOG00000011685) bdh1 (ENSHCOG00000011587) NCK1 (ENSHCOG00000011576) ENSHCOG00000011571 slc35g2b (ENSHCOG00000011559) slc35g2b (ENSHCOG00000011544) ENSHCOG00000011507 ENSHCOG00000011452 ##22 ENSHCOG00000011432 ENSHCOG00000011401 csrnp1b (ENSHCOG00000011387) ##28 LIMD2 (ENSHCOG00000011373) map3k22 (ENSHCOG00000011362) ENSHCOG00000011327 ENSHCOG00000011249 ENSHCOG00000011241 trdmt1 (ENSHCOG00000011232) RSU1 (ENSHCOG00000011204) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00940000153759.a.a.h ENSGT00530000063629.b.c Tetraodontidae DUPLICATION Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b.d ##22 ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b.c ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x.g.a ENSGT00940000154607.b.a.x.g.b ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a.g ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00900000141099.u ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g Tetraodon DUPLICATION 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ENSGT00530000063629.b.c Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00530000063629.b.c ENSGT00940000156360.c Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00530000063629.b.c ENSGT00940000156360.c Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES 494 trpc1 (ENSLCRG00005012627) CHST2 (ENSLCRG00005012693) SLC9A9 (ENSLCRG00005012694) dipk2ab (ENSLCRG00005012698) plod2 (ENSLCRG00005012767) ENSLCRG00005018782 zic4 (ENSLCRG00005018783) zic1 (ENSLCRG00005018785) AGTR1 (ENSLCRG00005018786) cpb1 (ENSLCRG00005018788) gyg1b (ENSLCRG00005018805) bdh1 (ENSLCRG00005018813) NCK1 (ENSLCRG00005018814) 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ENSDLAG00005008693 ##22 csrnp1b (ENSDLAG00005008686) ##28 ENSDLAG00005028245 slc22a13b (ENSDLAG00005008613) slc22a13b (ENSDLAG00005008547) oxsr1b (ENSDLAG00005007101) CRY-DASH (ENSDLAG00005006961) map3k22 (ENSDLAG00005006903) ENSDLAG00005006829 plcd1a (ENSDLAG00005004449) VILL (ENSDLAG00005014862) CTDSL (ENSDLAG00005031689) gars1 (ENSDLAG00005012902) gars1 (ENSDLAG00005017209) hhatlb (ENSDLAG00005012810) klhl40b (ENSDLAG00005012799) Gilthead seabream MODERN SPECIES 10 pcolce2b (ENSSAUG00010015811) trpc1 (ENSSAUG00010016036) CHST2 (ENSSAUG00010016134) SLC9A9 (ENSSAUG00010016137) dipk2ab (ENSSAUG00010016141) plod2 (ENSSAUG00010016232) ENSSAUG00010021788 zic4 (ENSSAUG00010021791) zic1 (ENSSAUG00010021798) cpb1 (ENSSAUG00010021806) gyg1b (ENSSAUG00010021832) bdh1 (ENSSAUG00010021834) NCK1 (ENSSAUG00010021837) slc35g2b (ENSSAUG00010021838) ENSSAUG00010021839 ENSSAUG00010021841 ##22 csrnp1b (ENSSAUG00010021842) ##28 LIMD2 (ENSSAUG00010021845) slc22a13b (ENSSAUG00010021846) slc22a13b (ENSSAUG00010021849) slc22a13b (ENSSAUG00010021864) slc22a13b (ENSSAUG00010021875) oxsr1b (ENSSAUG00010021895) myd88 (ENSSAUG00010022345) cry-dash (ENSSAUG00010022353) ENSSAUG00010022369 prpf4bb (ENSSAUG00010022377) PXDC1 (ENSSAUG00010022569) TMX3 (ENSSAUG00010022579) DSEL (ENSSAUG00010022808) ENSSAUG00010022809 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00940000153759.a.a.h Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00940000153759.a.a.h Pike perch MODERN SPECIES 417 bdh1 (ENSSLUG00000004936) NCK1 (ENSSLUG00000004947) slc35g2b (ENSSLUG00000004951) gorasp1b (ENSSLUG00000004952) ENSSLUG00000017006 ##22 csrnp1b (ENSSLUG00000017015) ##28 LIMD2 (ENSSLUG00000017027) slc22a13b (ENSSLUG00000017039) ENSSLUG00000017053 ENSSLUG00000017059 Channel bull blenny MODERN SPECIES 12 trpc1 (ENSCGOG00000022576) CHST2 (ENSCGOG00000022571) SLC9A9 (ENSCGOG00000022565) dipk2ab (ENSCGOG00000022562) plod2 (ENSCGOG00000020724) ENSCGOG00000020605 zic4 (ENSCGOG00000020604) zic1 (ENSCGOG00000020600) AGTR1 (ENSCGOG00000020598) cpb1 (ENSCGOG00000020513) gyg1b (ENSCGOG00000020497) bdh1 (ENSCGOG00000020495) NCK1 (ENSCGOG00000020490) slc35g2b (ENSCGOG00000020489) ENSCGOG00000020486 ENSCGOG00000020108 ##22 csrnp1b (ENSCGOG00000020095) ##28 ENSCGOG00000020093 slc22a13b (ENSCGOG00000020087) slc22a13b (ENSCGOG00000020082) oxsr1b (ENSCGOG00000019330) myd88 (ENSCGOG00000019275) cry-dash (ENSCGOG00000019209) map3k22 (ENSCGOG00000019186) ENSCGOG00000019180 plcd1a (ENSCGOG00000017960) VILL (ENSCGOG00000017429) ctdspla (ENSCGOG00000017347) gars1 (ENSCGOG00000016987) gars1 (ENSCGOG00000016768) hhatlb (ENSCGOG00000016762) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT00940000182355 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00940000153759.a.a.h Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00530000063629.b.c ENSGT00940000156360.c Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 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##28 ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154607.b.a.x.p ENSGT00940000154607.b.a.x.o ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g Poecilia ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154607.b.a.x.p ENSGT00940000154607.b.a.x.o ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 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ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x.i ENSGT00940000154607.b.a.x.j ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000181016 ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x.i.b ENSGT00940000154607.b.a.x.j ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 790 GORASP1 (ENSAOCG00000020500) ENSAOCG00000020564 ##22 csrnp1b (ENSAOCG00000020582) ##28 ENSAOCG00000020610 slc22a13b (ENSAOCG00000020677) slc22a13b (ENSAOCG00000002232) ENSAOCG00000020845 ARVCF (ENSAOCG00000020856) BMP10 (ENSAOCG00000020890) smad4a (ENSAOCG00000020944) rfx3 (ENSAOCG00000021007) glis3 (ENSAOCG00000021022) UNC5C (ENSAOCG00000021129) Orange clownfish MODERN SPECIES 14 CHST2 (ENSAPEG00000016815) SLC9A9 (ENSAPEG00000016845) dipk2ab (ENSAPEG00000016993) plod2 (ENSAPEG00000017014) ENSAPEG00000017115 ENSAPEG00000017122 zic4 (ENSAPEG00000017132) zic1 (ENSAPEG00000017143) AGTR1 (ENSAPEG00000017182) cpb1 (ENSAPEG00000017190) gyg1b (ENSAPEG00000017210) bdh1 (ENSAPEG00000017234) NCK1 (ENSAPEG00000017248) slc35g2b (ENSAPEG00000017261) ENSAPEG00000017267 ENSAPEG00000017285 ##22 csrnp1b (ENSAPEG00000017300) ##28 ENSAPEG00000017326 slc22a13b (ENSAPEG00000017348) LIMD2 (ENSAPEG00000017411) slc22a13b (ENSAPEG00000017432) slc22a13b (ENSAPEG00000017544) slc22a13b (ENSAPEG00000017576) oxsr1b (ENSAPEG00000017631) myd88 (ENSAPEG00000017990) cry-dash (ENSAPEG00000017999) map3k22 (ENSAPEG00000018071) ENSAPEG00000018173 plcd1a (ENSAPEG00000018217) VILL (ENSAPEG00000018324) ctdspla (ENSAPEG00000018781) Spiny chromis MODERN SPECIES 1113 AGTR1 (ENSAPOG00000014635) cpb1 (ENSAPOG00000014766) gyg1b (ENSAPOG00000014777) bdh1 (ENSAPOG00000014787) NCK1 (ENSAPOG00000000410) slc35g2b (ENSAPOG00000014805) ENSAPOG00000014814 ENSAPOG00000014831 ##22 csrnp1b (ENSAPOG00000014839) ##28 LIMD2 (ENSAPOG00000014848) ENSAPOG00000014869 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.x ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00940000153759.a.a.h Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01060000248594.f ENSGT00940000161292 ENSGT00940000160094 ENSGT00520000055625.b ENSGT01030000234558.A.a.b ENSGT00940000165699.B ENSGT00940000154200.B ENSGT00940000160269 ENSGT01050000244888.b.a.c.b ENSGT00940000157819 ENSGT00940000154674.q.b ENSGT00940000156929 ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d.b ENSGT00390000008686.c.d ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a.a.a ##28 ENSGT00530000063779.B.b ENSGT00940000158377.b.i.a ENSGT00940000154607.b.a.w ENSGT00940000154621.a.b.b.a ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT00940000165361 ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392.e.b ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.a.b ENSGT00940000153759.a.a.g ENSGT00940000153759.a.a.h Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 270 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ENSGT00950000183019.f.a ENSGT00940000159945 ENSGT00940000159301 ENSGT00940000161049 ENSGT00390000010557 ENSGT00390000005322 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a ##28 ENSGT00530000063779.B ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000154621.a.b ENSGT00510000048324 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.d ENSGT00940000153759.a.a ENSGT00940000156795 ENSGT00940000159600 Sauria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159945 ENSGT00940000159301 ENSGT00940000161049 ENSGT00390000010557 ENSGT00390000005322 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.b.a.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000154992.b.a.a.a ENSGT00940000154992.b.a.a.b ENSGT00920000149157 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ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.d ENSGT00940000153759.a.a Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159945 ENSGT00940000159301 ENSGT00940000161049 ENSGT00390000010557 ENSGT00390000005322 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.b.a.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000154992.b.a.a.a ENSGT00940000154992.b.a.a.b ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a ##28 ENSGT00530000063779.B ENSGT00950000183580 ENSGT00940000154607.b.a.a ENSGT00940000162134 ENSGT00940000154621.a.b ENSGT00510000048324 ENSGT01070000253936 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.d Aves ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159945 ENSGT00940000159301 ENSGT00940000161049 ENSGT00390000010557 ENSGT00390000005322 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.b.a.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000154992.b.a.a.a ENSGT00940000154992.b.a.a.b ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a ##28 ENSGT00530000063779.B ENSGT00950000183580 ENSGT00940000154607.b.a.a.c ENSGT00940000162134 ENSGT00940000154621.a.b ENSGT00510000048324 ENSGT01070000253936 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.d African ostrich MODERN SPECIES 193 PRKAG2 (ENSSCUG00000001393) RHEB (ENSSCUG00000001388) CRYGN (ENSSCUG00000001383) NUB1 (ENSSCUG00000001380) C9orf152 (ENSSCUG00000001379) XYLB (ENSSCUG00000001372) ACVR2B (ENSSCUG00000001362) EXOG (ENSSCUG00000001359) ENSSCUG00000001338 ENSSCUG00000001322 ENSSCUG00000001315 ENSSCUG00000001308 WDR48 (ENSSCUG00000001301) GORASP1 (ENSSCUG00000001294) TTC21A (ENSSCUG00000001291) ENSSCUG00000001287 ##22 CSRNP1 (ENSSCUG00000001282) ##28 XIRP1 (ENSSCUG00000001273) SLC22A13 (ENSSCUG00000001271) ENSSCUG00000001264 MYD88 (ENSSCUG00000001261) Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183019.f.a ENSGT00940000159945 ENSGT00940000159301 ENSGT00940000161049 ENSGT00390000010557 ENSGT00390000005322 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.b.a.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000154992.b.a.a.a ENSGT00940000154992.b.a.a.b ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a ##28 ENSGT00530000063779.B ENSGT00950000183580 ENSGT00940000154607.b.a.a.d ENSGT00940000154607.b.a.a.c ENSGT00940000162134 ENSGT00940000154621.a.b ENSGT00510000048324 ENSGT01070000253936 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183019.f.a ENSGT00940000159945 ENSGT00940000159301 ENSGT00940000161049 ENSGT00390000010557 ENSGT00390000005322 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.b.a.b ENSGT00940000154992.b.a.a.a ENSGT01030000235508 ENSGT00940000154992.b.a.a.b ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a ##28 ENSGT00530000063779.B ENSGT00940000154607.b.a.a.d ENSGT00940000154607.b.a.a.c ENSGT00940000162134 ENSGT00940000154621.a.b ENSGT00510000048324 ENSGT01070000253936 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.d Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159945 ENSGT00940000159301 ENSGT00940000161049 ENSGT00390000010557 ENSGT00390000005322 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.b.a.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000154992.b.a.a.a ENSGT01100000266186 ENSGT00940000154992.b.a.a.b ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a ##28 ENSGT00530000063779.B ENSGT00940000154607.b.a.a.c ENSGT00940000162134 ENSGT00940000154621.a.b ENSGT00510000048324 ENSGT01070000253936 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.d ENSGT00940000153759.a.a ENSGT01100000263521.a.a.a.a Golden eagle MODERN SPECIES 19 RHEB (ENSACCG00020003157) CRYGN (ENSACCG00020003178) WDR86 (ENSACCG00020003190) NUB1 (ENSACCG00020003205) C9orf152 (ENSACCG00020003218) XYLB (ENSACCG00020003246) ACVR2B (ENSACCG00020003300) EXOG (ENSACCG00020003324) ENSACCG00020003340 ENSACCG00020003381 ENSACCG00020003412 ENSACCG00020003428 WDR48 (ENSACCG00020003453) GORASP1 (ENSACCG00020003474) ENSACCG00020003485 ENSACCG00020003508 ##22 CSRNP1 (ENSACCG00020003528) ##28 XIRP1 (ENSACCG00020003537) SLC22A13 (ENSACCG00020003547) OXSR1 (ENSACCG00020003561) MYD88 (ENSACCG00020003581) ENSACCG00020003602 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ENSCPRG00005003126 ENSCPRG00005003125 ENSCPRG00005003076 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159945 ENSGT00940000159301 ENSGT00940000161049 ENSGT00390000010557 ENSGT00390000005322 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.b.a.b ENSGT00940000154992.b.a.a.a.b ENSGT00940000154992.b.a.a.a.a ENSGT00940000154992.b.a.a.b ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT01030000234528.B.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183072.a ##28 ENSGT00530000063779.B ENSGT00950000183580 ENSGT00940000154607.b.a.a ENSGT00940000162134 ENSGT00510000048324 ENSGT01070000253936 ENSGT00940000165167 ENSGT00940000164858 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.d ENSGT00940000153759.a.a Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159301 ENSGT00940000161049 ENSGT00390000010557 ENSGT00390000005322 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.b.a.b.e 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toad DUPLICATION Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad MODERN SPECIES 2 SLC2A1 (ENSLLEG00000012925) ENSLLEG00000012834 ENSLLEG00000012756 ENSLLEG00000012722 LACTBL1 (ENSLLEG00000012669) ENSLLEG00000012643 ENSLLEG00000012597 EPHB2 (ENSLLEG00000011745) C1QB (ENSLLEG00000011599) ENSLLEG00000011590 C1QC (ENSLLEG00000011553) C1QA (ENSLLEG00000011526) EPHA8 (ENSLLEG00000011398) LRRC4B (ENSLLEG00000011376) ENSLLEG00000011272 ENSLLEG00000011201 ##22 ENSLLEG00000011172 ##22 ENSLLEG00000011014 ##22 ENSLLEG00000010942 ##22 ENSLLEG00000010916 ENSLLEG00000010900 CA11 (ENSLLEG00000010804) ENSLLEG00000010781 ENSLLEG00000010760 ENSLLEG00000010655 ENSLLEG00000010542 ENSLLEG00000010464 ENSLLEG00000010428 ENSLLEG00000010401 ENSLLEG00000010305 ENSLLEG00000010285 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 409 ENSLLEG00000012677 ENSLLEG00000012623 ##22 ENSLLEG00000012502 ##22 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 409 ENSLLEG00000012677 ENSLLEG00000012623 ##22 ENSLLEG00000012502 ##22 Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad MODERN SPECIES 195 ENSLLEG00000020062 ##22 ENSLLEG00000019989 ##22 ENSLLEG00000019964 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 2 ENSLLEG00000012834 ENSLLEG00000012756 ENSLLEG00000012722 LACTBL1 (ENSLLEG00000012669) ENSLLEG00000012643 ENSLLEG00000012597 EPHB2 (ENSLLEG00000011745) C1QB (ENSLLEG00000011599) ENSLLEG00000011590 C1QC (ENSLLEG00000011553) C1QA (ENSLLEG00000011526) EPHA8 (ENSLLEG00000011398) LRRC4B (ENSLLEG00000011376) ENSLLEG00000011272 ENSLLEG00000011201 ##22 ENSLLEG00000011172 ##22 ENSLLEG00000011014 ##22 ENSLLEG00000010942 ##22 ENSLLEG00000010916 ENSLLEG00000010900 CA11 (ENSLLEG00000010804) ENSLLEG00000010781 ENSLLEG00000010760 ENSLLEG00000010655 ENSLLEG00000010542 ENSLLEG00000010464 ENSLLEG00000010428 ENSLLEG00000010401 ENSLLEG00000010305 ENSLLEG00000010285 SHISA7 (ENSLLEG00000010231) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 2 ENSLLEG00000012756 ENSLLEG00000012722 LACTBL1 (ENSLLEG00000012669) ENSLLEG00000012643 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(ENSLLEG00000022859) ENSLLEG00000023402 PLEKHM2 (ENSLLEG00000023602) SLC25A34 (ENSLLEG00000023886) TMEM82 (ENSLLEG00000024031) FBLIM1 (ENSLLEG00000024117) ENSLLEG00000024197 ZBTB17 (ENSLLEG00000024289) Frog MODERN SPECIES 7 ece1 (ENSXETG00000044790) fbxo42 (ENSXETG00000023248) ENSXETG00000043133 ENSXETG00000044123 ENSXETG00000044293 ENSXETG00000047079 ENSXETG00000048722 ENSXETG00000046160 cplane2 (ENSXETG00000044434) hspg2 (ENSXETG00000017911) ldlrad2 (ENSXETG00000044324) usp48 (ENSXETG00000017918) ENSXETG00000046903 ENSXETG00000044759 ENSXETG00000045472 cela3a (ENSXETG00000039928) ##22 ddi2 (ENSXETG00000013448) padi2 (ENSXETG00000013441) sdhb (ENSXETG00000013435) atp13a2 (ENSXETG00000048227) mfap2 (ENSXETG00000042694) crocc (ENSXETG00000013421) szrd1 (ENSXETG00000046445) necap2 (ENSXETG00000047811) ENSXETG00000047152 plekhm2 (ENSXETG00000013400) fblim1 (ENSXETG00000031940) spen (ENSXETG00000043324) zbtb17 (ENSXETG00000042595) hspb7 (ENSXETG00000043909) ENSXETG00000048885 Amniota 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ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000163614 ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Tasmanian devil MODERN SPECIES 2 VWA5B1 (ENSSHAG00000010861) MUL1 (ENSSHAG00000028356) ENSSHAG00000021409 FAM43B (ENSSHAG00000025670) PINK1 (ENSSHAG00000020723) DDOST (ENSSHAG00000008129) KIF17 (ENSSHAG00000007422) SH2D5 (ENSSHAG00000030485) HP1BP3 (ENSSHAG00000006618) EIF4G3 (ENSSHAG00000003774) ECE1 (ENSSHAG00000024468) ALPL (ENSSHAG00000017506) RAP1GAP (ENSSHAG00000017419) USP48 (ENSSHAG00000017182) ENSSHAG00000017116 ENSSHAG00000016664 ##22 ENSSHAG00000030694 CDC42 (ENSSHAG00000016413) WNT4 (ENSSHAG00000022072) ENSSHAG00000031737 ENSSHAG00000027198 ZBTB40 (ENSSHAG00000014880) EPHA8 (ENSSHAG00000014595) ENSSHAG00000024110 C1QC (ENSSHAG00000021711) C1QB (ENSSHAG00000028244) EPHB2 (ENSSHAG00000012536) LACTBL1 (ENSSHAG00000030447) ENSSHAG00000012269 KDM1A (ENSSHAG00000011939) LUZP1 (ENSSHAG00000025254) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00970000193558 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 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ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000163614 ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Common wonbat MODERN SPECIES 1084 ENSVURG00010023785 FAM43B (ENSVURG00010023783) ENSVURG00010023781 PINK1 (ENSVURG00010023778) DDOST (ENSVURG00010023777) ENSVURG00010023776 SH2D5 (ENSVURG00010023773) HP1BP3 (ENSVURG00010023769) EIF4G3 (ENSVURG00010023743) ECE1 (ENSVURG00010023732) ALPL (ENSVURG00010023731) RAP1GAP (ENSVURG00010023720) USP48 (ENSVURG00010023712) ENSVURG00010023710 HSPG2 (ENSVURG00010023610) ENSVURG00010023584 ##22 CDC42 (ENSVURG00010023579) WNT4 (ENSVURG00010023575) ENSVURG00010023574 ZBTB40 (ENSVURG00010023571) EPHA8 (ENSVURG00010023568) C1QA (ENSVURG00010023565) C1QC (ENSVURG00010023564) C1QB (ENSVURG00010023562) EPHB2 (ENSVURG00010023557) LACTBL1 (ENSVURG00010023556) KDM1A (ENSVURG00010023356) LUZP1 (ENSVURG00010023311) ENSVURG00010023309 HNRNPR (ENSVURG00010023303) TCEA3 (ENSVURG00010023300) koala MODERN SPECIES 14 ENSPCIG00000035467 ENSPCIG00000026441 ##22 ENSPCIG00000026439 ENSPCIG00000035891 CDC42 (ENSPCIG00000026436) ENSPCIG00000026434 WNT4 (ENSPCIG00000032945) ZBTB40 (ENSPCIG00000026425) EPHA8 (ENSPCIG00000026424) ENSPCIG00000026421 C1QB (ENSPCIG00000026420) EPHB2 (ENSPCIG00000026177) LACTBL1 (ENSPCIG00000026176) ENSPCIG00000034946 ENSPCIG00000026175 KDM1A (ENSPCIG00000026174) LUZP1 (ENSPCIG00000026173) Wallaby MODERN SPECIES 14784 ENSMEUG00000010244 ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT01090000263332 ENSGT00950000183063.d ENSGT00990000211281 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT01090000263332 ENSGT00950000183063.d ENSGT00990000211281 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 3962 ENSEEUG00000006906 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT01090000263332 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ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Suina ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00990000211281 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Pig MODERN SPECIES 14 CDA (ENSSSCG00000021259) PINK1 (ENSSSCG00000003506) ENSSSCG00000047631 DDOST (ENSSSCG00000003505) KIF17 (ENSSSCG00000003508) SH2D5 (ENSSSCG00000003509) HP1BP3 (ENSSSCG00000003511) EIF4G3 (ENSSSCG00000003512) ECE1 (ENSSSCG00000003513) ALPL (ENSSSCG00000032607) RAP1GAP (ENSSSCG00000022029) USP48 (ENSSSCG00000024197) LDLRAD2 (ENSSSCG00000050518) HSPG2 (ENSSSCG00000003514) ENSSSCG00000059680 ENSSSCG00000037400 ##22 ENSSSCG00000030015 CDC42 (ENSSSCG00000003520) ENSSSCG00000003521 ZBTB40 (ENSSSCG00000026276) EPHA8 (ENSSSCG00000003523) C1QA (ENSSSCG00000003524) C1QC (ENSSSCG00000038706) C1QB (ENSSSCG00000033512) EPHB2 (ENSSSCG00000003527) LACTBL1 (ENSSSCG00000003529) TEX46 (ENSSSCG00000003530) KDM1A (ENSSSCG00000003531) LUZP1 (ENSSSCG00000003532) ENSSSCG00000025500 HNRNPR (ENSSSCG00000023761) Chacoan peccary MODERN SPECIES 808 CDA (ENSCWAG00000007665) PINK1 (ENSCWAG00000007688) DDOST (ENSCWAG00000007742) KIF17 (ENSCWAG00000007840) SH2D5 (ENSCWAG00000008300) HP1BP3 (ENSCWAG00000008445) EIF4G3 (ENSCWAG00000008633) ECE1 (ENSCWAG00000010623) ALPL (ENSCWAG00000011532) ENSCWAG00000011768 RAP1GAP (ENSCWAG00000011845) USP48 (ENSCWAG00000012611) LDLRAD2 (ENSCWAG00000012945) HSPG2 (ENSCWAG00000013049) ENSCWAG00000013839 ENSCWAG00000013850 ##22 ENSCWAG00000013923 CDC42 (ENSCWAG00000013943) WNT4 (ENSCWAG00000014008) ZBTB40 (ENSCWAG00000014072) EPHA8 (ENSCWAG00000014139) C1QA (ENSCWAG00000014258) C1QC (ENSCWAG00000014280) C1QB (ENSCWAG00000014330) EPHB2 (ENSCWAG00000014368) LACTBL1 (ENSCWAG00000014714) TEX46 (ENSCWAG00000014803) KDM1A (ENSCWAG00000014847) LUZP1 (ENSCWAG00000014958) HTR1D (ENSCWAG00000014997) HNRNPR (ENSCWAG00000015020) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00970000193558 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Camelidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a Arabian camel MODERN SPECIES 4 FAM43B (ENSCDRG00005008700) CDA (ENSCDRG00005008712) PINK1 (ENSCDRG00005008763) DDOST (ENSCDRG00005008944) KIF17 (ENSCDRG00005009097) SH2D5 (ENSCDRG00005009446) HP1BP3 (ENSCDRG00005009568) EIF4G3 (ENSCDRG00005009852) ECE1 (ENSCDRG00005011473) ALPL (ENSCDRG00005011675) RAP1GAP (ENSCDRG00005012075) USP48 (ENSCDRG00005012725) LDLRAD2 (ENSCDRG00005013118) HSPG2 (ENSCDRG00005013192) ENSCDRG00005013988 ENSCDRG00005014010 ##22 ENSCDRG00005014098 CDC42 (ENSCDRG00005014119) WNT4 (ENSCDRG00005014185) ZBTB40 (ENSCDRG00005014228) EPHA8 (ENSCDRG00005014357) C1QA (ENSCDRG00005014427) C1QC (ENSCDRG00005014455) C1QB (ENSCDRG00005014476) EPHB2 (ENSCDRG00005014531) LACTBL1 (ENSCDRG00005014651) TEX46 (ENSCDRG00005014727) KDM1A (ENSCDRG00005014888) LUZP1 (ENSCDRG00005017675) ENSCDRG00005017708 HTR1D (ENSCDRG00005017723) Alpaca MODERN SPECIES 2914 ENSVPAG00000006918 ##22 CDC42 (ENSVPAG00000006919) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00970000193558 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a Pecora ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT01010000229896 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a Yarkand deer MODERN SPECIES 31 PINK1 (ENSCHYG00000004517) DDOST (ENSCHYG00000004536) KIF17 (ENSCHYG00000004555) SH2D5 (ENSCHYG00000004604) HP1BP3 (ENSCHYG00000004626) EIF4G3 (ENSCHYG00000004685) ENSCHYG00000004882 ECE1 (ENSCHYG00000004904) ALPL (ENSCHYG00000005079) ENSCHYG00000005193 RAP1GAP (ENSCHYG00000005242) USP48 (ENSCHYG00000005594) ENSCHYG00000005895 HSPG2 (ENSCHYG00000005998) ENSCHYG00000006438 ENSCHYG00000006459 ##22 ENSCHYG00000006531 CDC42 (ENSCHYG00000006559) WNT4 (ENSCHYG00000006643) ZBTB40 (ENSCHYG00000006725) EPHA8 (ENSCHYG00000007086) C1QA (ENSCHYG00000007174) C1QC (ENSCHYG00000007194) ENSCHYG00000007207 C1QB (ENSCHYG00000007220) EPHB2 (ENSCHYG00000007261) LACTBL1 (ENSCHYG00000007423) TEX46 (ENSCHYG00000007471) KDM1A (ENSCHYG00000007485) LUZP1 (ENSCHYG00000007580) ENSCHYG00000007625 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT01010000229896 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT01010000229896 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888.a ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b Bovinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000169203 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT01010000229896 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888.a ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a Bos ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01100000263481.n.b.a.b.b.b ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000169203 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT01010000229896 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888.a ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503.j ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a Bos_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000000911 ENSGT01100000263481.n.b.a.b.b.b ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT01010000229896 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888.a ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503.j ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 11 ENSBIXG00005027984 PINK1 (ENSBIXG00005028009) DDOST (ENSBIXG00005028060) KIF17 (ENSBIXG00005004827) SH2D5 (ENSBIXG00005004839) HP1BP3 (ENSBIXG00005028160) ENSBIXG00005004846 EIF4G3 (ENSBIXG00005004936) ECE1 (ENSBIXG00005005026) ALPL (ENSBIXG00005028957) ENSBIXG00005002114 RAP1GAP (ENSBIXG00005002007) USP48 (ENSBIXG00005001908) HSPG2 (ENSBIXG00005005253) ENSBIXG00005005267 ENSBIXG00005029233 ##22 ENSBIXG00005001567 CDC42 (ENSBIXG00005001558) WNT4 (ENSBIXG00005030836) EPHA8 (ENSBIXG00005030812) ZBTB40 (ENSBIXG00005030774) C1QC (ENSBIXG00005030754) ENSBIXG00005030749 C1QB (ENSBIXG00005030741) EPHB2 (ENSBIXG00005030712) LACTBL1 (ENSBIXG00005030699) TEX46 (ENSBIXG00005030685) KDM1A (ENSBIXG00005030666) LUZP1 (ENSBIXG00005030651) ENSBIXG00005030641 HNRNPR (ENSBIXG00005030608) Cow MODERN SPECIES 11 FAM43B (ENSBTAG00000046988) CDA (ENSBTAG00000052516) PINK1 (ENSBTAG00000006084) DDOST (ENSBTAG00000006085) KIF17 (ENSBTAG00000017644) ENSBTAG00000050449 SH2D5 (ENSBTAG00000001082) HP1BP3 (ENSBTAG00000018656) EIF4G3 (ENSBTAG00000040215) ECE1 (ENSBTAG00000002977) ALPL (ENSBTAG00000008951) RAP1GAP (ENSBTAG00000008952) USP48 (ENSBTAG00000006940) HSPG2 (ENSBTAG00000017122) ENSBTAG00000030269 CELA3B (ENSBTAG00000013085) ##22 ENSBTAG00000040602 CDC42 (ENSBTAG00000001700) WNT4 (ENSBTAG00000051083) ZBTB40 (ENSBTAG00000016448) EPHA8 (ENSBTAG00000020102) C1QA (ENSBTAG00000007153) C1QC (ENSBTAG00000011193) ENSBTAG00000011195 C1QB (ENSBTAG00000011196) EPHB2 (ENSBTAG00000045902) LACTBL1 (ENSBTAG00000030413) TEX46 (ENSBTAG00000053631) KDM1A (ENSBTAG00000009500) LUZP1 (ENSBTAG00000009502) HTR1D (ENSBTAG00000040329) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000000911 ENSGT01100000263481.n.b.a.b.b.b ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000169203 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888.a ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503.j ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a Wild yak MODERN SPECIES 1753 ENSBMUG00000015287 ENSBMUG00000015270 ##22 ENSBMUG00000015259 CDC42 (ENSBMUG00000015235) WNT4 (ENSBMUG00000015211) ZBTB40 (ENSBMUG00000015163) EPHA8 (ENSBMUG00000015108) C1QA (ENSBMUG00000015089) C1QC (ENSBMUG00000015067) ENSBMUG00000015061 C1QB (ENSBMUG00000015055) EPHB2 (ENSBMUG00000014918) LACTBL1 (ENSBMUG00000014535) TEX46 (ENSBMUG00000014525) KDM1A (ENSBMUG00000014489) LUZP1 (ENSBMUG00000014443) HTR1D (ENSBMUG00000014427) Domestic yak MODERN SPECIES 11 FAM43B (ENSBGRG00000005498) ENSBGRG00000000172 ENSBGRG00000000179 PINK1 (ENSBGRG00000000185) DDOST (ENSBGRG00000000203) KIF17 (ENSBGRG00000000228) SH2D5 (ENSBGRG00000000243) HP1BP3 (ENSBGRG00000000283) EIF4G3 (ENSBGRG00000000420) ENSBGRG00000000750 ECE1 (ENSBGRG00000000770) ALPL (ENSBGRG00000000875) RAP1GAP (ENSBGRG00000000964) USP48 (ENSBGRG00000001116) ENSBGRG00000003230 ENSBGRG00000003236 ##22 ENSBGRG00000003260 ENSBGRG00000003268 CDC42 (ENSBGRG00000003276) WNT4 (ENSBGRG00000003297) ZBTB40 (ENSBGRG00000003315) EPHA8 (ENSBGRG00000003384) C1QA (ENSBGRG00000003422) C1QC (ENSBGRG00000003430) ENSBGRG00000003435 C1QB (ENSBGRG00000003451) EPHB2 (ENSBGRG00000003473) ENSBGRG00000003557 LACTBL1 (ENSBGRG00000003569) TEX46 (ENSBGRG00000003590) KDM1A (ENSBGRG00000003651) American bison MODERN SPECIES 3363 CAMK2N1 (ENSBBBG00000002572) MUL1 (ENSBBBG00000016013) CDA (ENSBBBG00000015999) PINK1 (ENSBBBG00000015990) DDOST (ENSBBBG00000015981) KIF17 (ENSBBBG00000003976) SH2D5 (ENSBBBG00000015920) HP1BP3 (ENSBBBG00000015901) EIF4G3 (ENSBBBG00000015829) ENSBBBG00000015606 ECE1 (ENSBBBG00000003884) ALPL (ENSBBBG00000015415) RAP1GAP (ENSBBBG00000015375) USP48 (ENSBBBG00000001369) ENSBBBG00000003520 ENSBBBG00000002779 ##22 ENSBBBG00000015152 CDC42 (ENSBBBG00000015145) WNT4 (ENSBBBG00000015113) ZBTB40 (ENSBBBG00000015088) EPHA8 (ENSBBBG00000003724) C1QA (ENSBBBG00000000807) C1QC (ENSBBBG00000003708) C1QB (ENSBBBG00000000810) EPHB2 (ENSBBBG00000007412) LACTBL1 (ENSBBBG00000014948) TEX46 (ENSBBBG00000003601) KDM1A (ENSBBBG00000003619) LUZP1 (ENSBBBG00000000837) HTR1D (ENSBBBG00000000846) HNRNPR (ENSBBBG00000000856) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888.a ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000163614.g.a Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 FAM43B (ENSOARG00020023661) CDA (ENSOARG00020023645) 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ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888.c ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000153314.a.a ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888.c ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a Dog MODERN SPECIES 11 CDA (ENSCAFG00845002612) PINK1 (ENSCAFG00845002503) DDOST (ENSCAFG00845002430) KIF17 (ENSCAFG00845002359) SH2D5 (ENSCAFG00845002312) HP1BP3 (ENSCAFG00845002257) ENSCAFG00845002211 EIF4G3 (ENSCAFG00845002097) ECE1 (ENSCAFG00845001686) ALPL (ENSCAFG00845001491) RAP1GAP (ENSCAFG00845001318) USP48 (ENSCAFG00845001096) LDLRAD2 (ENSCAFG00845001010) HSPG2 (ENSCAFG00845000888) ENSCAFG00845000853 ENSCAFG00845000837 ##22 ENSCAFG00845000823 ENSCAFG00845000796 WNT4 (ENSCAFG00845000755) ZBTB40 (ENSCAFG00845000670) EPHA8 (ENSCAFG00845000509) C1QA (ENSCAFG00845000400) C1QC (ENSCAFG00845000378) C1QB (ENSCAFG00845000358) EPHB2 (ENSCAFG00845000323) LACTBL1 (ENSCAFG00845000283) TEX46 (ENSCAFG00845000271) KDM1A (ENSCAFG00845000177) LUZP1 (ENSCAFG00845015540) HTR1D (ENSCAFG00845015510) HNRNPR (ENSCAFG00845015456) Dingo MODERN SPECIES 41 CDA (ENSCAFG00020008511) PINK1 (ENSCAFG00020008517) DDOST (ENSCAFG00020008554) KIF17 (ENSCAFG00020009198) SH2D5 (ENSCAFG00020009298) HP1BP3 (ENSCAFG00020009309) EIF4G3 (ENSCAFG00020009953) ENSCAFG00020016479 ECE1 (ENSCAFG00020016482) ALPL (ENSCAFG00020016498) RAP1GAP (ENSCAFG00020016548) ENSCAFG00020018814 ENSCAFG00020019060 HSPG2 (ENSCAFG00020019108) ENSCAFG00020019543 ENSCAFG00020019545 ##22 ENSCAFG00020019557 ENSCAFG00020019559 WNT4 (ENSCAFG00020019560) ZBTB40 (ENSCAFG00020019562) EPHA8 (ENSCAFG00020019592) C1QA (ENSCAFG00020019600) C1QC (ENSCAFG00020019601) C1QB (ENSCAFG00020019603) EPHB2 (ENSCAFG00020019605) LACTBL1 (ENSCAFG00020019607) TEX46 (ENSCAFG00020019612) KDM1A (ENSCAFG00020019613) LUZP1 (ENSCAFG00020019616) HTR1D (ENSCAFG00020019625) ENSCAFG00020019630 Red fox MODERN SPECIES 88 CDA (ENSVVUG00000029487) PINK1 (ENSVVUG00000029488) DDOST (ENSVVUG00000029501) KIF17 (ENSVVUG00000029523) SH2D5 (ENSVVUG00000029534) HP1BP3 (ENSVVUG00000029543) EIF4G3 (ENSVVUG00000029639) ECE1 (ENSVVUG00000030005) ALPL (ENSVVUG00000030054) RAP1GAP (ENSVVUG00000030064) USP48 (ENSVVUG00000030068) ENSVVUG00000030074 ENSVVUG00000030077 HSPG2 (ENSVVUG00000030123) ENSVVUG00000030296 ENSVVUG00000030301 ##22 ENSVVUG00000030306 CDC42 (ENSVVUG00000030308) WNT4 (ENSVVUG00000030311) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888.f ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888.f ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a Ferret MODERN SPECIES 167 ENSMPUG00000016109 MUL1 (ENSMPUG00000016108) CDA (ENSMPUG00000016106) PINK1 (ENSMPUG00000016102) DDOST (ENSMPUG00000016099) KIF17 (ENSMPUG00000016094) SH2D5 (ENSMPUG00000016093) HP1BP3 (ENSMPUG00000016092) EIF4G3 (ENSMPUG00000016068) ECE1 (ENSMPUG00000016062) ALPL (ENSMPUG00000016060) RAP1GAP 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(ENSAMEG00000002847) ECE1 (ENSAMEG00000014139) ALPL (ENSAMEG00000014237) RAP1GAP (ENSAMEG00000014275) USP48 (ENSAMEG00000014344) ENSAMEG00000028115 HSPG2 (ENSAMEG00000014404) ENSAMEG00000020216 ENSAMEG00000014546 ##22 ENSAMEG00000028767 CDC42 (ENSAMEG00000014602) ENSAMEG00000014620 ZBTB40 (ENSAMEG00000014635) EPHA8 (ENSAMEG00000014652) C1QA (ENSAMEG00000014779) C1QC (ENSAMEG00000014787) C1QB (ENSAMEG00000014789) EPHB2 (ENSAMEG00000014794) LACTBL1 (ENSAMEG00000014880) TEX46 (ENSAMEG00000029370) KDM1A (ENSAMEG00000014887) LUZP1 (ENSAMEG00000014945) HTR1D (ENSAMEG00000020218) HNRNPR (ENSAMEG00000009537) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT01090000263332 ENSGT00950000183063.d ENSGT00990000211281 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 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ENSGT00940000153587.b Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00990000211281 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00730000113107 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f.t ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 27 CDA (ENSRFEG00010018627) PINK1 (ENSRFEG00010018673) DDOST (ENSRFEG00010018709) KIF17 (ENSRFEG00010018752) SH2D5 (ENSRFEG00010018825) HP1BP3 (ENSRFEG00010018876) EIF4G3 (ENSRFEG00010019016) ECE1 (ENSRFEG00010019581) ALPL (ENSRFEG00010019947) 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ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a Donkey MODERN SPECIES 25 CDA (ENSEASG00005026862) PINK1 (ENSEASG00005014843) DDOST (ENSEASG00005014397) KIF17 (ENSEASG00005014345) SH2D5 (ENSEASG00005014338) HP1BP3 (ENSEASG00005014325) EIF4G3 (ENSEASG00005011857) ECE1 (ENSEASG00005009111) ENSEASG00005033575 ALPL (ENSEASG00005007810) RAP1GAP (ENSEASG00005007728) USP48 (ENSEASG00005007584) ENSEASG00005035450 HSPG2 (ENSEASG00005007410) ENSEASG00005007291 ENSEASG00005007285 ##22 ENSEASG00005007280 CDC42 (ENSEASG00005007276) ENSEASG00005028240 ZBTB40 (ENSEASG00005007270) EPHA8 (ENSEASG00005007259) ENSEASG00005007252 C1QC (ENSEASG00005023595) C1QB (ENSEASG00005007247) EPHB2 (ENSEASG00005007064) LACTBL1 (ENSEASG00005007026) TEX46 (ENSEASG00005033543) KDM1A (ENSEASG00005005392) LUZP1 (ENSEASG00005005238) HTR1D (ENSEASG00005038482) HNRNPR (ENSEASG00005005231) Horse MODERN SPECIES 11 FAM43B (ENSECAG00000056817) CDA (ENSECAG00000013981) PINK1 (ENSECAG00000009170) DDOST (ENSECAG00000019546) KIF17 (ENSECAG00000015396) SH2D5 (ENSECAG00000013721) HP1BP3 (ENSECAG00000007787) EIF4G3 (ENSECAG00000011147) ECE1 (ENSECAG00000015812) ALPL (ENSECAG00000011467) RAP1GAP (ENSECAG00000022900) USP48 (ENSECAG00000012657) LDLRAD2 (ENSECAG00000034255) HSPG2 (ENSECAG00000012961) ENSECAG00000000938 ENSECAG00000022425 ##22 ENSECAG00000034700 CDC42 (ENSECAG00000019180) WNT4 (ENSECAG00000018933) ZBTB40 (ENSECAG00000016319) EPHA8 (ENSECAG00000022132) C1QA (ENSECAG00000048305) C1QC (ENSECAG00000020325) C1QB (ENSECAG00000019868) EPHB2 (ENSECAG00000011631) LACTBL1 (ENSECAG00000026933) TEX46 (ENSECAG00000027858) KDM1A (ENSECAG00000019669) LUZP1 (ENSECAG00000000901) HTR1D (ENSECAG00000005697) HNRNPR (ENSECAG00000013733) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 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ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Lagomorpha DUPLICATION Lagomorpha DUPLICATION Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b.h ##22 ENSGT01030000234528.B.b.b.g.a ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000157034 Rabbit MODERN SPECIES 4 USP48 (ENSOCUG00000007800) LDLRAD2 (ENSOCUG00000010951) HSPG2 (ENSOCUG00000010955) ENSOCUG00000021421 ENSOCUG00000025350 ##22 ENSOCUG00000027546 ##22 ENSOCUG00000024267 ##22 ENSOCUG00000027583 ##22 ENSOCUG00000037269 ENSOCUG00000025318 ##22 ENSOCUG00000025145 ##22 ENSOCUG00000015194 ##22 ENSOCUG00000034005 ##22 ENSOCUG00000029720 ##22 ENSOCUG00000011199 ENSOCUG00000027531 ##22 ENSOCUG00000009986 ENSOCUG00000022473 ZBTB40 (ENSOCUG00000005075) EPHA8 (ENSOCUG00000015119) C1QA (ENSOCUG00000029367) C1QC (ENSOCUG00000015138) C1QB (ENSOCUG00000015143) EPHB2 (ENSOCUG00000013540) LACTBL1 (ENSOCUG00000022450) ENSOCUG00000031115 KDM1A (ENSOCUG00000001164) LUZP1 (ENSOCUG00000001168) ENSOCUG00000011102 HNRNPR (ENSOCUG00000006686) ENSOCUG00000010670 Pika MODERN SPECIES 7034 ENSOPRG00000015280 ##22 Lagomorpha DUPLICATION Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.g.b.a ##22 Pika DUPLICATION Pika MODERN SPECIES 6172 ENSOPRG00000008267 ##22 Pika MODERN SPECIES 9126 ENSOPRG00000006737 ##22 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 4 DDOST (ENSOCUG00000021391) KIF17 (ENSOCUG00000001822) SH2D5 (ENSOCUG00000022310) HP1BP3 (ENSOCUG00000002445) EIF4G3 (ENSOCUG00000002451) ECE1 (ENSOCUG00000011960) ALPL (ENSOCUG00000004447) RAP1GAP (ENSOCUG00000024485) USP48 (ENSOCUG00000007800) LDLRAD2 (ENSOCUG00000010951) HSPG2 (ENSOCUG00000010955) ENSOCUG00000021421 ENSOCUG00000025350 ##22 ENSOCUG00000027546 ##22 ENSOCUG00000024267 ##22 ENSOCUG00000027583 ##22 ENSOCUG00000037269 ENSOCUG00000025318 ##22 ENSOCUG00000025145 ##22 ENSOCUG00000015194 ##22 ENSOCUG00000034005 ##22 ENSOCUG00000029720 ##22 ENSOCUG00000011199 ENSOCUG00000027531 ##22 ENSOCUG00000009986 ENSOCUG00000022473 ZBTB40 (ENSOCUG00000005075) EPHA8 (ENSOCUG00000015119) C1QA (ENSOCUG00000029367) C1QC (ENSOCUG00000015138) C1QB (ENSOCUG00000015143) Rabbit MODERN SPECIES 4 HP1BP3 (ENSOCUG00000002445) EIF4G3 (ENSOCUG00000002451) ECE1 (ENSOCUG00000011960) ALPL (ENSOCUG00000004447) RAP1GAP (ENSOCUG00000024485) USP48 (ENSOCUG00000007800) LDLRAD2 (ENSOCUG00000010951) HSPG2 (ENSOCUG00000010955) ENSOCUG00000021421 ENSOCUG00000025350 ##22 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ENSOCUG00000027546 ##22 ENSOCUG00000025350 ##22 ENSOCUG00000021421 HSPG2 (ENSOCUG00000010955) LDLRAD2 (ENSOCUG00000010951) USP48 (ENSOCUG00000007800) RAP1GAP (ENSOCUG00000024485) ALPL (ENSOCUG00000004447) ECE1 (ENSOCUG00000011960) EIF4G3 (ENSOCUG00000002451) HP1BP3 (ENSOCUG00000002445) SH2D5 (ENSOCUG00000022310) Rabbit MODERN SPECIES 4 C1QC (ENSOCUG00000015138) C1QA (ENSOCUG00000029367) EPHA8 (ENSOCUG00000015119) ZBTB40 (ENSOCUG00000005075) ENSOCUG00000022473 ENSOCUG00000009986 ENSOCUG00000027531 ##22 ENSOCUG00000011199 ENSOCUG00000029720 ##22 ENSOCUG00000034005 ##22 ENSOCUG00000015194 ##22 ENSOCUG00000025145 ##22 ENSOCUG00000025318 ##22 ENSOCUG00000037269 ENSOCUG00000027583 ##22 ENSOCUG00000024267 ##22 ENSOCUG00000027546 ##22 ENSOCUG00000025350 ##22 ENSOCUG00000021421 HSPG2 (ENSOCUG00000010955) LDLRAD2 (ENSOCUG00000010951) USP48 (ENSOCUG00000007800) RAP1GAP (ENSOCUG00000024485) ALPL (ENSOCUG00000004447) ECE1 (ENSOCUG00000011960) EIF4G3 (ENSOCUG00000002451) HP1BP3 (ENSOCUG00000002445) SH2D5 (ENSOCUG00000022310) KIF17 (ENSOCUG00000001822) DDOST (ENSOCUG00000021391) PINK1 (ENSOCUG00000006306) Lagomorpha DUPLICATION Lagomorpha DUPLICATION Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.g.b.b.a.a ##22 Rabbit MODERN SPECIES 4 CDA (ENSOCUG00000016246) PINK1 (ENSOCUG00000006306) DDOST (ENSOCUG00000021391) KIF17 (ENSOCUG00000001822) SH2D5 (ENSOCUG00000022310) HP1BP3 (ENSOCUG00000002445) EIF4G3 (ENSOCUG00000002451) ECE1 (ENSOCUG00000011960) ALPL (ENSOCUG00000004447) RAP1GAP (ENSOCUG00000024485) USP48 (ENSOCUG00000007800) LDLRAD2 (ENSOCUG00000010951) HSPG2 (ENSOCUG00000010955) ENSOCUG00000021421 ENSOCUG00000025350 ##22 ENSOCUG00000027546 ##22 ENSOCUG00000024267 ##22 ENSOCUG00000027583 ##22 ENSOCUG00000037269 ENSOCUG00000025318 ##22 ENSOCUG00000025145 ##22 ENSOCUG00000015194 ##22 ENSOCUG00000034005 ##22 ENSOCUG00000029720 ##22 ENSOCUG00000011199 ENSOCUG00000027531 ##22 ENSOCUG00000009986 ENSOCUG00000022473 ZBTB40 (ENSOCUG00000005075) EPHA8 (ENSOCUG00000015119) C1QA (ENSOCUG00000029367) Pika MODERN SPECIES 5019 ENSOPRG00000001979 ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.g.b.b.a.b ##22 Pika DUPLICATION Pika DUPLICATION Pika MODERN SPECIES 9215 ENSOPRG00000015970 ##22 ENSOPRG00000015944 ##22 Pika MODERN SPECIES 8323 ENSOPRG00000009541 ##22 Pika MODERN SPECIES 9215 ENSOPRG00000015970 ##22 ENSOPRG00000015944 ##22 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 4 ECE1 (ENSOCUG00000011960) ALPL (ENSOCUG00000004447) RAP1GAP (ENSOCUG00000024485) USP48 (ENSOCUG00000007800) LDLRAD2 (ENSOCUG00000010951) HSPG2 (ENSOCUG00000010955) ENSOCUG00000021421 ENSOCUG00000025350 ##22 ENSOCUG00000027546 ##22 ENSOCUG00000024267 ##22 ENSOCUG00000027583 ##22 ENSOCUG00000037269 ENSOCUG00000025318 ##22 ENSOCUG00000025145 ##22 ENSOCUG00000015194 ##22 ENSOCUG00000034005 ##22 ENSOCUG00000029720 ##22 ENSOCUG00000011199 ENSOCUG00000027531 ##22 ENSOCUG00000009986 ENSOCUG00000022473 ZBTB40 (ENSOCUG00000005075) EPHA8 (ENSOCUG00000015119) C1QA (ENSOCUG00000029367) C1QC (ENSOCUG00000015138) C1QB (ENSOCUG00000015143) EPHB2 (ENSOCUG00000013540) LACTBL1 (ENSOCUG00000022450) ENSOCUG00000031115 KDM1A (ENSOCUG00000001164) LUZP1 (ENSOCUG00000001168) Rabbit MODERN SPECIES 4 ALPL (ENSOCUG00000004447) RAP1GAP (ENSOCUG00000024485) USP48 (ENSOCUG00000007800) LDLRAD2 (ENSOCUG00000010951) HSPG2 (ENSOCUG00000010955) ENSOCUG00000021421 ENSOCUG00000025350 ##22 ENSOCUG00000027546 ##22 ENSOCUG00000024267 ##22 ENSOCUG00000027583 ##22 ENSOCUG00000037269 ENSOCUG00000025318 ##22 ENSOCUG00000025145 ##22 ENSOCUG00000015194 ##22 ENSOCUG00000034005 ##22 ENSOCUG00000029720 ##22 ENSOCUG00000011199 ENSOCUG00000027531 ##22 ENSOCUG00000009986 ENSOCUG00000022473 ZBTB40 (ENSOCUG00000005075) EPHA8 (ENSOCUG00000015119) C1QA (ENSOCUG00000029367) C1QC (ENSOCUG00000015138) C1QB (ENSOCUG00000015143) EPHB2 (ENSOCUG00000013540) LACTBL1 (ENSOCUG00000022450) ENSOCUG00000031115 KDM1A (ENSOCUG00000001164) LUZP1 (ENSOCUG00000001168) ENSOCUG00000011102 Rabbit MODERN SPECIES 4 EIF4G3 (ENSOCUG00000002451) ECE1 (ENSOCUG00000011960) ALPL (ENSOCUG00000004447) RAP1GAP (ENSOCUG00000024485) USP48 (ENSOCUG00000007800) LDLRAD2 (ENSOCUG00000010951) HSPG2 (ENSOCUG00000010955) ENSOCUG00000021421 ENSOCUG00000025350 ##22 ENSOCUG00000027546 ##22 ENSOCUG00000024267 ##22 ENSOCUG00000027583 ##22 ENSOCUG00000037269 ENSOCUG00000025318 ##22 ENSOCUG00000025145 ##22 ENSOCUG00000015194 ##22 ENSOCUG00000034005 ##22 ENSOCUG00000029720 ##22 ENSOCUG00000011199 ENSOCUG00000027531 ##22 ENSOCUG00000009986 ENSOCUG00000022473 ZBTB40 (ENSOCUG00000005075) EPHA8 (ENSOCUG00000015119) C1QA (ENSOCUG00000029367) C1QC (ENSOCUG00000015138) C1QB (ENSOCUG00000015143) EPHB2 (ENSOCUG00000013540) LACTBL1 (ENSOCUG00000022450) ENSOCUG00000031115 KDM1A (ENSOCUG00000001164) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.g.b.b.b ##22 Pika MODERN SPECIES 6994 ENSOPRG00000006013 ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000012141.b ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b.h ##22 ENSGT01030000234528.B.b.b.g.a ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Rabbit MODERN SPECIES 4 MUL1 (ENSOCUG00000000628) CDA (ENSOCUG00000016246) PINK1 (ENSOCUG00000006306) DDOST (ENSOCUG00000021391) KIF17 (ENSOCUG00000001822) SH2D5 (ENSOCUG00000022310) HP1BP3 (ENSOCUG00000002445) EIF4G3 (ENSOCUG00000002451) ECE1 (ENSOCUG00000011960) ALPL (ENSOCUG00000004447) RAP1GAP (ENSOCUG00000024485) USP48 (ENSOCUG00000007800) LDLRAD2 (ENSOCUG00000010951) HSPG2 (ENSOCUG00000010955) ENSOCUG00000021421 ENSOCUG00000025350 ##22 ENSOCUG00000027546 ##22 ENSOCUG00000024267 ##22 ENSOCUG00000027583 ##22 ENSOCUG00000037269 ENSOCUG00000025318 ##22 ENSOCUG00000025145 ##22 ENSOCUG00000015194 ##22 ENSOCUG00000034005 ##22 ENSOCUG00000029720 ##22 ENSOCUG00000011199 ENSOCUG00000027531 ##22 ENSOCUG00000009986 ENSOCUG00000022473 ZBTB40 (ENSOCUG00000005075) EPHA8 (ENSOCUG00000015119) Pika MODERN SPECIES 4208 LDLRAD2 (ENSOPRG00000002761) HSPG2 (ENSOPRG00000002779) ENSOPRG00000002981 ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT01090000263332 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00970000193558 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00730000113107 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00730000113107 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 ENSHGLG00000046822 CDA (ENSHGLG00000016526) PINK1 (ENSHGLG00000019022) KIF17 (ENSHGLG00000012003) SH2D5 (ENSHGLG00000037356) HP1BP3 (ENSHGLG00000018291) ENSHGLG00000012742 EIF4G3 (ENSHGLG00000015724) ECE1 (ENSHGLG00000014531) ENSHGLG00000032019 ALPL (ENSHGLG00000010100) RAP1GAP (ENSHGLG00000018695) ENSHGLG00000015049 HSPG2 (ENSHGLG00000010568) ENSHGLG00000019661 ENSHGLG00000014591 ##22 ENSHGLG00000033342 ##22 ENSHGLG00000011337 ENSHGLG00000044378 ENSHGLG00000013331 ZBTB40 (ENSHGLG00000016950) EPHA8 (ENSHGLG00000009876) C1QA (ENSHGLG00000011009) C1QC (ENSHGLG00000013065) C1QB (ENSHGLG00000016977) EPHB2 (ENSHGLG00000018029) LACTBL1 (ENSHGLG00000018161) TEX46 (ENSHGLG00000047177) KDM1A (ENSHGLG00000014570) ENSHGLG00000032038 LUZP1 (ENSHGLG00000009891) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 ENSHGLG00000049799 LUZP1 (ENSHGLG00000009891) ENSHGLG00000032038 KDM1A (ENSHGLG00000014570) TEX46 (ENSHGLG00000047177) LACTBL1 (ENSHGLG00000018161) EPHB2 (ENSHGLG00000018029) C1QB (ENSHGLG00000016977) C1QC (ENSHGLG00000013065) C1QA (ENSHGLG00000011009) EPHA8 (ENSHGLG00000009876) ZBTB40 (ENSHGLG00000016950) ENSHGLG00000013331 ENSHGLG00000044378 ENSHGLG00000011337 ENSHGLG00000033342 ##22 ENSHGLG00000014591 ##22 ENSHGLG00000019661 HSPG2 (ENSHGLG00000010568) ENSHGLG00000015049 RAP1GAP (ENSHGLG00000018695) ALPL (ENSHGLG00000010100) ENSHGLG00000032019 ECE1 (ENSHGLG00000014531) EIF4G3 (ENSHGLG00000015724) ENSHGLG00000012742 HP1BP3 (ENSHGLG00000018291) SH2D5 (ENSHGLG00000037356) KIF17 (ENSHGLG00000012003) PINK1 (ENSHGLG00000019022) CDA (ENSHGLG00000016526) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00730000113107 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00950000182890.B.b.j Guinea pig DUPLICATION Guinea pig MODERN SPECIES 25 ENSCPOG00000000504 ENSCPOG00000030412 HNRNPR (ENSCPOG00000040556) ENSCPOG00000032945 LUZP1 (ENSCPOG00000010753) KDM1A (ENSCPOG00000010744) LACTBL1 (ENSCPOG00000022624) EPHB2 (ENSCPOG00000010844) C1QB (ENSCPOG00000008124) C1QC (ENSCPOG00000031590) C1QA (ENSCPOG00000030985) EPHA8 (ENSCPOG00000021134) ZBTB40 (ENSCPOG00000012844) WNT4 (ENSCPOG00000040292) CDC42 (ENSCPOG00000006543) ENSCPOG00000030052 ##22 ENSCPOG00000032739 ENSCPOG00000038881 ##22 HSPG2 (ENSCPOG00000026832) ENSCPOG00000034722 USP48 (ENSCPOG00000008464) RAP1GAP (ENSCPOG00000024422) ALPL (ENSCPOG00000007028) ECE1 (ENSCPOG00000011666) EIF4G3 (ENSCPOG00000013487) ENSCPOG00000013485 SH2D5 (ENSCPOG00000002788) KIF17 (ENSCPOG00000025758) DDOST (ENSCPOG00000002786) PINK1 (ENSCPOG00000024597) CDA (ENSCPOG00000036030) Guinea pig MODERN SPECIES 25 CAMK2N1 (ENSCPOG00000031753) MUL1 (ENSCPOG00000034079) CDA (ENSCPOG00000036030) PINK1 (ENSCPOG00000024597) DDOST (ENSCPOG00000002786) KIF17 (ENSCPOG00000025758) SH2D5 (ENSCPOG00000002788) ENSCPOG00000013485 EIF4G3 (ENSCPOG00000013487) ECE1 (ENSCPOG00000011666) ALPL (ENSCPOG00000007028) RAP1GAP (ENSCPOG00000024422) USP48 (ENSCPOG00000008464) ENSCPOG00000034722 HSPG2 (ENSCPOG00000026832) ENSCPOG00000038881 ##22 ENSCPOG00000032739 ENSCPOG00000030052 ##22 CDC42 (ENSCPOG00000006543) WNT4 (ENSCPOG00000040292) ZBTB40 (ENSCPOG00000012844) EPHA8 (ENSCPOG00000021134) C1QA (ENSCPOG00000030985) C1QC (ENSCPOG00000031590) C1QB (ENSCPOG00000008124) EPHB2 (ENSCPOG00000010844) LACTBL1 (ENSCPOG00000022624) KDM1A (ENSCPOG00000010744) LUZP1 (ENSCPOG00000010753) ENSCPOG00000032945 HNRNPR (ENSCPOG00000040556) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00730000113107 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00950000182890.B.b.j Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 159 MUL1 (ENSCLAG00000007620) FAM43B (ENSCLAG00000009147) CDA (ENSCLAG00000009273) PINK1 (ENSCLAG00000008925) DDOST (ENSCLAG00000012871) SH2D5 (ENSCLAG00000013408) HP1BP3 (ENSCLAG00000016763) EIF4G3 (ENSCLAG00000016985) ECE1 (ENSCLAG00000012254) ALPL (ENSCLAG00000007567) RAP1GAP (ENSCLAG00000011156) USP48 (ENSCLAG00000007619) ENSCLAG00000008631 HSPG2 (ENSCLAG00000009491) ENSCLAG00000008501 ENSCLAG00000009037 ##22 ENSCLAG00000009263 CDC42 (ENSCLAG00000011266) WNT4 (ENSCLAG00000010626) ZBTB40 (ENSCLAG00000015032) ENSCLAG00000011831 EPHA8 (ENSCLAG00000014518) C1QA (ENSCLAG00000009255) C1QC (ENSCLAG00000009600) C1QB (ENSCLAG00000011016) EPHB2 (ENSCLAG00000011252) LACTBL1 (ENSCLAG00000009588) TEX46 (ENSCLAG00000014987) KDM1A (ENSCLAG00000007181) LUZP1 (ENSCLAG00000008774) ENSCLAG00000012687 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 133 ENSODEG00000014173 LACTBL1 (ENSODEG00000014475) EPHB2 (ENSODEG00000015223) ENSODEG00000020286 C1QB (ENSODEG00000015143) C1QC (ENSODEG00000015249) C1QA (ENSODEG00000016110) EPHA8 (ENSODEG00000014623) ZBTB40 (ENSODEG00000015208) ENSODEG00000016237 ENSODEG00000020316 ENSODEG00000014387 WNT4 (ENSODEG00000014777) CDC42 (ENSODEG00000015760) ENSODEG00000014833 ENSODEG00000014468 ##22 ENSODEG00000014629 ##22 HSPG2 (ENSODEG00000015394) ENSODEG00000014605 USP48 (ENSODEG00000015315) RAP1GAP (ENSODEG00000015689) ALPL (ENSODEG00000014674) ECE1 (ENSODEG00000016105) ENSODEG00000015534 ENSODEG00000014814 ENSODEG00000016820 ENSODEG00000015879 ENSODEG00000014931 ENSODEG00000015109 SH2D5 (ENSODEG00000015096) KIF17 (ENSODEG00000015337) Degu MODERN SPECIES 133 ENSODEG00000020313 KIF17 (ENSODEG00000015337) SH2D5 (ENSODEG00000015096) ENSODEG00000015109 ENSODEG00000014931 ENSODEG00000015879 ENSODEG00000016820 ENSODEG00000014814 ENSODEG00000015534 ECE1 (ENSODEG00000016105) ALPL (ENSODEG00000014674) RAP1GAP (ENSODEG00000015689) USP48 (ENSODEG00000015315) ENSODEG00000014605 HSPG2 (ENSODEG00000015394) ENSODEG00000014629 ##22 ENSODEG00000014468 ##22 ENSODEG00000014833 CDC42 (ENSODEG00000015760) WNT4 (ENSODEG00000014777) ENSODEG00000014387 ENSODEG00000020316 ENSODEG00000016237 ZBTB40 (ENSODEG00000015208) EPHA8 (ENSODEG00000014623) C1QA (ENSODEG00000016110) C1QC (ENSODEG00000015249) C1QB (ENSODEG00000015143) ENSODEG00000020286 EPHB2 (ENSODEG00000015223) LACTBL1 (ENSODEG00000014475) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00730000113107 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(ENSMMMG00000018891) TCEA3 (ENSMMMG00000018885) ASAP3 (ENSMMMG00000018861) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES PINK1 (ENSSVLG00005002792) DDOST (ENSSVLG00005002822) KIF17 (ENSSVLG00005002882) SH2D5 (ENSSVLG00005003006) ENSSVLG00005003055 EIF4G3 (ENSSVLG00005003256) ENSSVLG00005003637 ECE1 (ENSSVLG00005003708) ALPL (ENSSVLG00005003857) RAP1GAP (ENSSVLG00005003927) ENSSVLG00005004003 ENSSVLG00005004044 ENSSVLG00005004059 LDLRAD2 (ENSSVLG00005004069) ENSSVLG00005005552 ENSSVLG00005005566 ##22 ENSSVLG00005005628 WNT4 (ENSSVLG00005005714) ZBTB40 (ENSSVLG00005005776) EPHA8 (ENSSVLG00005005942) C1QA (ENSSVLG00005006048) C1QC (ENSSVLG00005006074) C1QB (ENSSVLG00005006095) EPHB2 (ENSSVLG00005006141) LACTBL1 (ENSSVLG00005006410) TEX46 (ENSSVLG00005006473) KDM1A (ENSSVLG00005006528) LUZP1 (ENSSVLG00005006625) HTR1D (ENSSVLG00005006648) HNRNPR (ENSSVLG00005006684) ZNF436 (ENSSVLG00005006783) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT01090000263332 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT01090000263332 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b 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(ENSMAUG00000009674) ENSMAUG00000010141 ENSMAUG00000017425 ENSMAUG00000008583 Hspg2 (ENSMAUG00000009979) ENSMAUG00000007289 ##22 Cdc42 (ENSMAUG00000004523) Wnt4 (ENSMAUG00000011257) Zbtb40 (ENSMAUG00000010466) Epha8 (ENSMAUG00000021011) C1qa (ENSMAUG00000012996) C1qc (ENSMAUG00000010986) C1qb (ENSMAUG00000016429) Ephb2 (ENSMAUG00000010555) Lactbl1 (ENSMAUG00000013696) Tex46 (ENSMAUG00000013680) Kdm1a (ENSMAUG00000018795) Luzp1 (ENSMAUG00000011708) ENSMAUG00000003424 Htr1d (ENSMAUG00000015812) Hnrnpr (ENSMAUG00000013503) Murinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT01090000263332 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 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Luzp1 (ENSMUSG00000001089) Htr1d (ENSMUSG00000070687) Hnrnpr (ENSMUSG00000066037) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00730000113107 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b.o ##22 ENSGT01030000234528.B.b.b.p ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00860000135869 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a spretus MODERN SPECIES 13 Fam43b (MGP_SPRETEiJ_G0027671) Cda (MGP_SPRETEiJ_G0027670) Pink1 (MGP_SPRETEiJ_G0027669) Ddost (MGP_SPRETEiJ_G0027668) Kif17 (MGP_SPRETEiJ_G0027667) Sh2d5 (MGP_SPRETEiJ_G0027666) Hp1bp3 (MGP_SPRETEiJ_G0027665) Eif4g3 (MGP_SPRETEiJ_G0027664) Ece1 (MGP_SPRETEiJ_G0027663) Alpl (MGP_SPRETEiJ_G0027662) Rap1gap (MGP_SPRETEiJ_G0027661) Usp48 (MGP_SPRETEiJ_G0027660) MGP_SPRETEiJ_G0027659 Hspg2 (MGP_SPRETEiJ_G0027658) 1700013G24Rik (MGP_SPRETEiJ_G0027657) Cela3b (MGP_SPRETEiJ_G0027656) ##22 Cela3a (MGP_SPRETEiJ_G0027655) ##22 Cdc42 (MGP_SPRETEiJ_G0027654) Wnt4 (MGP_SPRETEiJ_G0027653) Zbtb40 (MGP_SPRETEiJ_G0027652) Epha8 (MGP_SPRETEiJ_G0027651) C1qa (MGP_SPRETEiJ_G0027650) C1qc (MGP_SPRETEiJ_G0027649) C1qb (MGP_SPRETEiJ_G0027648) Ephb2 (MGP_SPRETEiJ_G0027647) Lactbl1 (MGP_SPRETEiJ_G0027646) Tex46 (MGP_SPRETEiJ_G0027645) Kdm1a (MGP_SPRETEiJ_G0027644) Luzp1 (MGP_SPRETEiJ_G0027643) MGP_SPRETEiJ_G0027642 Htr1d (MGP_SPRETEiJ_G0027641) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT01090000263332 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b.o ##22 ENSGT01030000234528.B.b.b.p ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00860000135869 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a Mouse MODERN SPECIES 13 Pink1 (ENSMUSG00000028756) Ddost (ENSMUSG00000028757) Kif17 (ENSMUSG00000028758) Sh2d5 (ENSMUSG00000045349) Hp1bp3 (ENSMUSG00000028759) Eif4g3 (ENSMUSG00000028760) Ece1 (ENSMUSG00000057530) ENSMUSG00000121582 Alpl (ENSMUSG00000028766) Rap1gap (ENSMUSG00000041351) Usp48 (ENSMUSG00000043411) Ldlrad2 (ENSMUSG00000094035) Hspg2 (ENSMUSG00000028763) 1700013G24Rik (ENSMUSG00000041399) Cela3b (ENSMUSG00000023433) ##22 Cela3a (ENSMUSG00000078520) ##22 Cdc42 (ENSMUSG00000006699) Wnt4 (ENSMUSG00000036856) Zbtb40 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ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Steppe mouse MODERN SPECIES 1483 Cela3a (ENSMSIG00000020243) ##22 spretus MODERN SPECIES 13 Cda (MGP_SPRETEiJ_G0027670) Pink1 (MGP_SPRETEiJ_G0027669) Ddost (MGP_SPRETEiJ_G0027668) Kif17 (MGP_SPRETEiJ_G0027667) Sh2d5 (MGP_SPRETEiJ_G0027666) Hp1bp3 (MGP_SPRETEiJ_G0027665) Eif4g3 (MGP_SPRETEiJ_G0027664) Ece1 (MGP_SPRETEiJ_G0027663) Alpl (MGP_SPRETEiJ_G0027662) Rap1gap (MGP_SPRETEiJ_G0027661) Usp48 (MGP_SPRETEiJ_G0027660) MGP_SPRETEiJ_G0027659 Hspg2 (MGP_SPRETEiJ_G0027658) 1700013G24Rik (MGP_SPRETEiJ_G0027657) Cela3b (MGP_SPRETEiJ_G0027656) ##22 Cela3a (MGP_SPRETEiJ_G0027655) ##22 Cdc42 (MGP_SPRETEiJ_G0027654) Wnt4 (MGP_SPRETEiJ_G0027653) Zbtb40 (MGP_SPRETEiJ_G0027652) Epha8 (MGP_SPRETEiJ_G0027651) C1qa (MGP_SPRETEiJ_G0027650) C1qc (MGP_SPRETEiJ_G0027649) C1qb (MGP_SPRETEiJ_G0027648) Ephb2 (MGP_SPRETEiJ_G0027647) Lactbl1 (MGP_SPRETEiJ_G0027646) Tex46 (MGP_SPRETEiJ_G0027645) Kdm1a (MGP_SPRETEiJ_G0027644) Luzp1 (MGP_SPRETEiJ_G0027643) MGP_SPRETEiJ_G0027642 Htr1d (MGP_SPRETEiJ_G0027641) Zfp46 (MGP_SPRETEiJ_G0027639) Ryukyu mouse DUPLICATION Ryukyu mouse MODERN SPECIES 13 Fam43b (MGP_CAROLIEiJ_G0026691) Cda (MGP_CAROLIEiJ_G0026690) Pink1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026689) Ddost (MGP_CAROLIEiJ_G0026688) Kif17 (MGP_CAROLIEiJ_G0026687) Sh2d5 (MGP_CAROLIEiJ_G0026686) Hp1bp3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026685) Eif4g3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026684) Ece1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026683) MGP_CAROLIEiJ_G0026682 Rap1gap (MGP_CAROLIEiJ_G0026681) Usp48 (MGP_CAROLIEiJ_G0026680) MGP_CAROLIEiJ_G0026679 Hspg2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026678) 1700013G24Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0026677) MGP_CAROLIEiJ_G0026676 ##22 MGP_CAROLIEiJ_G0026675 ##22 Cdc42 (MGP_CAROLIEiJ_G0026674) Wnt4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026673) Zbtb40 (MGP_CAROLIEiJ_G0026672) Epha8 (MGP_CAROLIEiJ_G0026671) C1qa (MGP_CAROLIEiJ_G0026670) C1qc (MGP_CAROLIEiJ_G0026669) C1qb (MGP_CAROLIEiJ_G0026668) Ephb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026667) Lactbl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026666) Tex46 (MGP_CAROLIEiJ_G0026665) Kdm1a (MGP_CAROLIEiJ_G0026664) Luzp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026663) MGP_CAROLIEiJ_G0026662 Htr1d (MGP_CAROLIEiJ_G0026661) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 13 Cda (MGP_CAROLIEiJ_G0026690) Pink1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026689) Ddost (MGP_CAROLIEiJ_G0026688) Kif17 (MGP_CAROLIEiJ_G0026687) Sh2d5 (MGP_CAROLIEiJ_G0026686) Hp1bp3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026685) Eif4g3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026684) Ece1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026683) MGP_CAROLIEiJ_G0026682 Rap1gap (MGP_CAROLIEiJ_G0026681) Usp48 (MGP_CAROLIEiJ_G0026680) MGP_CAROLIEiJ_G0026679 Hspg2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026678) 1700013G24Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0026677) MGP_CAROLIEiJ_G0026676 ##22 MGP_CAROLIEiJ_G0026675 ##22 Cdc42 (MGP_CAROLIEiJ_G0026674) Wnt4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026673) Zbtb40 (MGP_CAROLIEiJ_G0026672) Epha8 (MGP_CAROLIEiJ_G0026671) C1qa (MGP_CAROLIEiJ_G0026670) C1qc (MGP_CAROLIEiJ_G0026669) C1qb (MGP_CAROLIEiJ_G0026668) Ephb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026667) Lactbl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026666) Tex46 (MGP_CAROLIEiJ_G0026665) Kdm1a (MGP_CAROLIEiJ_G0026664) Luzp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026663) MGP_CAROLIEiJ_G0026662 Htr1d (MGP_CAROLIEiJ_G0026661) Hnrnpr (MGP_CAROLIEiJ_G0026660) Primates ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000001206 ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00990000211281 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00990000211281 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00990000211281 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 11 ENSMICG00000031953 KDM1A (ENSMICG00000013347) TEX46 (ENSMICG00000037936) LACTBL1 (ENSMICG00000037177) EPHB2 (ENSMICG00000005069) ENSMICG00000008763 EIF4G3 (ENSMICG00000008548) ECE1 (ENSMICG00000005478) ALPL (ENSMICG00000013905) RAP1GAP (ENSMICG00000013741) USP48 (ENSMICG00000013764) LDLRAD2 (ENSMICG00000013789) HSPG2 (ENSMICG00000013802) ENSMICG00000028255 ENSMICG00000013902 ##22 ENSMICG00000015627 ##22 ENSMICG00000037468 CDC42 (ENSMICG00000000389) WNT4 (ENSMICG00000000391) ZBTB40 (ENSMICG00000007464) EPHA8 (ENSMICG00000005047) C1QA (ENSMICG00000033787) C1QC (ENSMICG00000046982) C1QB (ENSMICG00000047215) ENSMICG00000032553 ENSMICG00000032748 ENSMICG00000047565 EMC1 (ENSMICG00000004009) ENSMICG00000004019 AKR7L (ENSMICG00000004025) SLC66A1 (ENSMICG00000010512) Mouse lemur MODERN SPECIES 11 LUZP1 (ENSMICG00000034030) ENSMICG00000031953 KDM1A (ENSMICG00000013347) TEX46 (ENSMICG00000037936) LACTBL1 (ENSMICG00000037177) EPHB2 (ENSMICG00000005069) ENSMICG00000008763 EIF4G3 (ENSMICG00000008548) ECE1 (ENSMICG00000005478) ALPL (ENSMICG00000013905) RAP1GAP (ENSMICG00000013741) USP48 (ENSMICG00000013764) LDLRAD2 (ENSMICG00000013789) HSPG2 (ENSMICG00000013802) ENSMICG00000028255 ENSMICG00000013902 ##22 ENSMICG00000015627 ##22 ENSMICG00000037468 CDC42 (ENSMICG00000000389) WNT4 (ENSMICG00000000391) ZBTB40 (ENSMICG00000007464) EPHA8 (ENSMICG00000005047) C1QA (ENSMICG00000033787) C1QC (ENSMICG00000046982) C1QB (ENSMICG00000047215) ENSMICG00000032553 ENSMICG00000032748 ENSMICG00000047565 EMC1 (ENSMICG00000004009) ENSMICG00000004019 AKR7L (ENSMICG00000004025) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00990000211281 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Coquerels sifaka MODERN SPECIES 481 ALPL (ENSPCOG00000017888) RAP1GAP (ENSPCOG00000014202) USP48 (ENSPCOG00000018309) LDLRAD2 (ENSPCOG00000013173) HSPG2 (ENSPCOG00000014813) ENSPCOG00000023883 ##22 ENSPCOG00000020873 CDC42 (ENSPCOG00000023240) WNT4 (ENSPCOG00000022822) ENSPCOG00000012183 ZBTB40 (ENSPCOG00000006905) EPHA8 (ENSPCOG00000020705) C1QA (ENSPCOG00000024922) C1QC (ENSPCOG00000018070) C1QB (ENSPCOG00000028706) EPHB2 (ENSPCOG00000001598) LACTBL1 (ENSPCOG00000024643) TEX46 (ENSPCOG00000021993) KDM1A (ENSPCOG00000022311) LUZP1 (ENSPCOG00000020802) HTR1D (ENSPCOG00000010862) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 2701 ENSPSMG00000006819 ENSPSMG00000006799 ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 124 CDA (ENSOGAG00000013122) PINK1 (ENSOGAG00000013125) DDOST (ENSOGAG00000013135) KIF17 (ENSOGAG00000013138) SH2D5 (ENSOGAG00000016056) HP1BP3 (ENSOGAG00000013143) EIF4G3 (ENSOGAG00000013147) ECE1 (ENSOGAG00000014067) ALPL (ENSOGAG00000011253) ENSOGAG00000033588 RAP1GAP (ENSOGAG00000011255) USP48 (ENSOGAG00000011259) LDLRAD2 (ENSOGAG00000027369) HSPG2 (ENSOGAG00000010117) ENSOGAG00000031962 ENSOGAG00000010140 ##22 ENSOGAG00000014261 WNT4 (ENSOGAG00000010203) ZBTB40 (ENSOGAG00000004797) EPHA8 (ENSOGAG00000004798) C1QA (ENSOGAG00000027446) C1QC (ENSOGAG00000011962) C1QB (ENSOGAG00000011960) EPHB2 (ENSOGAG00000014678) ENSOGAG00000027585 TEX46 (ENSOGAG00000025352) KDM1A (ENSOGAG00000002158) LUZP1 (ENSOGAG00000002161) ENSOGAG00000031738 ENSOGAG00000033955 HNRNPR (ENSOGAG00000009179) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Tarsier MODERN SPECIES 5217 ALPL (ENSTSYG00000037143) RAP1GAP (ENSTSYG00000031324) USP48 (ENSTSYG00000001515) LDLRAD2 (ENSTSYG00000035408) HSPG2 (ENSTSYG00000027474) CELA3B (ENSTSYG00000008065) ##22 CDC42 (ENSTSYG00000032218) WNT4 (ENSTSYG00000025455) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012141.b ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227.c ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Cebidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000012141.b ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227.c ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012141.b ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227.c ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b Capuchin MODERN SPECIES 15 PINK1 (ENSCCAG00000029573) DDOST (ENSCCAG00000034304) KIF17 (ENSCCAG00000035604) SH2D5 (ENSCCAG00000020945) HP1BP3 (ENSCCAG00000021628) EIF4G3 (ENSCCAG00000033501) ENSCCAG00000020191 ECE1 (ENSCCAG00000020532) ENSCCAG00000005707 ALPL (ENSCCAG00000020559) RAP1GAP (ENSCCAG00000020781) USP48 (ENSCCAG00000018086) ENSCCAG00000003627 LDLRAD2 (ENSCCAG00000037241) HSPG2 (ENSCCAG00000033733) ENSCCAG00000037299 ##22 ENSCCAG00000026436 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 110 MUL1 (ENSSBOG00000027279) FAM43B (ENSSBOG00000030752) CDA (ENSSBOG00000027557) PINK1 (ENSSBOG00000028477) DDOST (ENSSBOG00000026043) KIF17 (ENSSBOG00000020316) SH2D5 (ENSSBOG00000019858) ENSSBOG00000003429 ENSSBOG00000030146 EIF4G3 (ENSSBOG00000026901) ECE1 (ENSSBOG00000031052) ALPL (ENSSBOG00000027104) RAP1GAP (ENSSBOG00000031430) USP48 (ENSSBOG00000010871) HSPG2 (ENSSBOG00000029263) ENSSBOG00000025165 ##22 CDC42 (ENSSBOG00000025711) WNT4 (ENSSBOG00000026862) ZBTB40 (ENSSBOG00000027235) EPHA8 (ENSSBOG00000022604) C1QA (ENSSBOG00000021423) C1QC (ENSSBOG00000012337) C1QB (ENSSBOG00000021816) EPHB2 (ENSSBOG00000021226) ENSSBOG00000025425 TEX46 (ENSSBOG00000003491) KDM1A (ENSSBOG00000025105) LUZP1 (ENSSBOG00000015465) HTR1D (ENSSBOG00000009946) HNRNPR (ENSSBOG00000026580) ZNF436 (ENSSBOG00000036244) Marmoset MODERN SPECIES 19 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(ENSANAG00000028669) EIF4G3 (ENSANAG00000037410) ENSANAG00000013798 ENSANAG00000022170 ALPL (ENSANAG00000032445) RAP1GAP (ENSANAG00000022516) USP48 (ENSANAG00000025699) LDLRAD2 (ENSANAG00000023686) HSPG2 (ENSANAG00000029487) ENSANAG00000030810 ##22 ENSANAG00000035200 WNT4 (ENSANAG00000033305) ZBTB40 (ENSANAG00000010550) ENSANAG00000004229 C1QA (ENSANAG00000028574) C1QC (ENSANAG00000028417) C1QB (ENSANAG00000032021) EPHB2 (ENSANAG00000027036) LACTBL1 (ENSANAG00000027538) TEX46 (ENSANAG00000009283) KDM1A (ENSANAG00000026300) LUZP1 (ENSANAG00000036938) HTR1D (ENSANAG00000016499) HNRNPR (ENSANAG00000036315) ZNF436 (ENSANAG00000035299) Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.u ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.u ##22 ENSGT01030000234528.B.b.b.v ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00910000147595 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a.h ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.u ##22 ENSGT01030000234528.B.b.b.v ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000001206 ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00390000001153.`b ENSGT00420000029746.e.a.b.b.a ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.u ##22 ENSGT01030000234528.B.b.b.v ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a.h ENSGT00910000147595 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000001206 ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 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ENSGT00910000147595 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee MODERN SPECIES DDOST (ENSPTRG00000033766) KIF17 (ENSPTRG00000000294) SH2D5 (ENSPTRG00000000295) HP1BP3 (ENSPTRG00000000296) EIF4G3 (ENSPTRG00000000297) ECE1 (ENSPTRG00000000298) ENSPTRG00000051989 ENSPTRG00000052609 FAM231D (ENSPTRG00000030418) NBPF3 (ENSPTRG00000000300) ALPL (ENSPTRG00000000302) RAP1GAP (ENSPTRG00000000303) USP48 (ENSPTRG00000000304) LDLRAD2 (ENSPTRG00000000306) HSPG2 (ENSPTRG00000000307) ENSPTRG00000042992 ##22 CELA3A (ENSPTRG00000046509) ##22 CDC42 (ENSPTRG00000051031) WNT4 (ENSPTRG00000052708) ZBTB40 (ENSPTRG00000000315) EPHA8 (ENSPTRG00000000316) C1QA (ENSPTRG00000000318) C1QC (ENSPTRG00000000319) C1QB (ENSPTRG00000043586) EPHB2 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Gorilla MODERN SPECIES ENSGGOG00000025478 DDOST (ENSGGOG00000014576) KIF17 (ENSGGOG00000014589) SH2D5 (ENSGGOG00000014606) HP1BP3 (ENSGGOG00000038037) EIF4G3 (ENSGGOG00000005832) ECE1 (ENSGGOG00000012085) ENSGGOG00000005438 ENSGGOG00000039091 ENSGGOG00000028490 ALPL (ENSGGOG00000010700) ENSGGOG00000010722 USP48 (ENSGGOG00000004749) LDLRAD2 (ENSGGOG00000013206) HSPG2 (ENSGGOG00000013212) CELA3B (ENSGGOG00000043912) ##22 CELA3A (ENSGGOG00000008807) ##22 ENSGGOG00000038269 ENSGGOG00000043752 WNT4 (ENSGGOG00000022618) ZBTB40 (ENSGGOG00000010010) EPHA8 (ENSGGOG00000010020) C1QA (ENSGGOG00000010034) C1QC (ENSGGOG00000010043) C1QB (ENSGGOG00000041359) EPHB2 (ENSGGOG00000008345) LACTBL1 (ENSGGOG00000014102) ENSGGOG00000043959 KDM1A (ENSGGOG00000003664) LUZP1 (ENSGGOG00000012024) HTR1D (ENSGGOG00000002214) Orangutan MODERN SPECIES CDA (ENSPPYG00000001771) ENSPPYG00000000601 ENSPPYG00000001770 PINK1 (ENSPPYG00000001769) DDOST (ENSPPYG00000001768) KIF17 (ENSPPYG00000001767) SH2D5 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(ENSNLEG00000008052) USP48 (ENSNLEG00000008071) LDLRAD2 (ENSNLEG00000033558) HSPG2 (ENSNLEG00000008145) ENSNLEG00000029811 ##22 ENSNLEG00000008196 CDC42 (ENSNLEG00000033395) ENSNLEG00000008238 ENSNLEG00000008244 ZBTB40 (ENSNLEG00000008268) EPHA8 (ENSNLEG00000008246) C1QA (ENSNLEG00000008315) C1QC (ENSNLEG00000008324) C1QB (ENSNLEG00000008329) EPHB2 (ENSNLEG00000008335) LACTBL1 (ENSNLEG00000008360) KDM1A (ENSNLEG00000008363) LUZP1 (ENSNLEG00000008408) HNRNPR (ENSNLEG00000008411) ZNF436 (ENSNLEG00000008477) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.v ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00910000147595 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a.h ENSGT00940000164888 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ENSGT01030000234528.B.b.b.v ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00910000147595 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a.h ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00390000000696.`b ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155865.a.b ENSGT00950000185365 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.v ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00390000000696.`b ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 217 ENSMNEG00000031567 LDLRAD2 (ENSMNEG00000041514) HSPG2 (ENSMNEG00000043761) CELA3A (ENSMNEG00000041598) ##22 ENSMNEG00000034339 WNT4 (ENSMNEG00000029287) ENSMNEG00000033901 ZBTB40 (ENSMNEG00000032628) EPHA8 (ENSMNEG00000016192) ENSMNEG00000033771 C1QC (ENSMNEG00000015156) C1QB (ENSMNEG00000038237) EPHB2 (ENSMNEG00000041730) LACTBL1 (ENSMNEG00000039133) TEX46 (ENSMNEG00000042138) KDM1A (ENSMNEG00000036380) LUZP1 (ENSMNEG00000040324) HTR1D (ENSMNEG00000016027) HNRNPR (ENSMNEG00000035841) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164709.a.b.b.a.a.b.a.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT01100000263539.b.b.b.a.b.a.b ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.v ##22 ENSGT00940000166898.a.a.b.b.a.a.b.a.b.a.a.a ENSGT00940000164888 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00390000000696.`b ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b Crab-eating macaque MODERN SPECIES CDA (ENSMFAG00000000090) PINK1 (ENSMFAG00000025542) DDOST (ENSMFAG00000046185) KIF17 (ENSMFAG00000043993) SH2D5 (ENSMFAG00000051643) HP1BP3 (ENSMFAG00000039770) EIF4G3 (ENSMFAG00000033446) ECE1 (ENSMFAG00000043294) ENSMFAG00000049325 ALPL (ENSMFAG00000039118) RAP1GAP (ENSMFAG00000001962) ENSMFAG00000059901 USP48 (ENSMFAG00000039193) LDLRAD2 (ENSMFAG00000043285) HSPG2 (ENSMFAG00000030725) CELA3A (ENSMFAG00000008347) ##22 ENSMFAG00000047960 ENSMFAG00000064051 ENSMFAG00000032516 WNT4 (ENSMFAG00000045973) BCCIP (ENSMFAG00000036436) ZBTB40 (ENSMFAG00000043032) EPHA8 (ENSMFAG00000037600) C1QA (ENSMFAG00000037955) C1QC (ENSMFAG00000038771) EPHB2 (ENSMFAG00000003479) LACTBL1 (ENSMFAG00000032421) TEX46 (ENSMFAG00000041849) KDM1A (ENSMFAG00000037505) LUZP1 (ENSMFAG00000038318) HTR1D (ENSMFAG00000029390) Rhesus MODERN SPECIES ENSMMUG00000060391 CDA (ENSMMUG00000056564) PINK1 (ENSMMUG00000008835) DDOST (ENSMMUG00000008836) SH2D5 (ENSMMUG00000008847) ENSMMUG00000049307 HP1BP3 (ENSMMUG00000008852) EIF4G3 (ENSMMUG00000004149) ECE1 (ENSMMUG00000010942) ENSMMUG00000058996 ALPL (ENSMMUG00000002217) RAP1GAP (ENSMMUG00000002218) USP48 (ENSMMUG00000017344) LDLRAD2 (ENSMMUG00000014826) HSPG2 (ENSMMUG00000014828) CELA3B (ENSMMUG00000003887) ##22 ENSMMUG00000054334 ENSMMUG00000051883 CDC42 (ENSMMUG00000022009) WNT4 (ENSMMUG00000061414) ENSMMUG00000046184 ZBTB40 (ENSMMUG00000018618) EPHA8 (ENSMMUG00000020754) ENSMMUG00000058256 ENSMMUG00000063725 C1QC (ENSMMUG00000020756) C1QB (ENSMMUG00000058486) EPHB2 (ENSMMUG00000023382) LACTBL1 (ENSMMUG00000041482) TEX46 (ENSMMUG00000058332) KDM1A (ENSMMUG00000009773) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000001206 ENSGT00550000076460 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00390000018086.o.a.b ENSGT00940000156050 ENSGT00390000001153.`b ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.v ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00910000147595 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a.h ENSGT00940000159654 ENSGT00390000000696.`b ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00390000018086.o.a.b ENSGT00940000156050 ENSGT00390000001153.`b ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.v ##22 ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00910000147595 ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a.h ENSGT00940000159654 ENSGT00390000000696.`b ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b Drill MODERN SPECIES 1031 ENSMLEG00000038625 KIF17 (ENSMLEG00000016629) SH2D5 (ENSMLEG00000039602) HP1BP3 (ENSMLEG00000030450) ENSMLEG00000011069 EIF4G3 (ENSMLEG00000042409) ECE1 (ENSMLEG00000043943) ENSMLEG00000040825 ALPL (ENSMLEG00000029011) RAP1GAP (ENSMLEG00000032467) USP48 (ENSMLEG00000035443) LDLRAD2 (ENSMLEG00000009278) ENSMLEG00000040821 HSPG2 (ENSMLEG00000033827) CELA3A (ENSMLEG00000041742) ##22 ENSMLEG00000036909 ENSMLEG00000041955 WNT4 (ENSMLEG00000029567) ENSMLEG00000036482 Sooty mangabey MODERN SPECIES 227 CDA (ENSCATG00000033984) PINK1 (ENSCATG00000029338) DDOST (ENSCATG00000035128) KIF17 (ENSCATG00000031554) SH2D5 (ENSCATG00000026848) HP1BP3 (ENSCATG00000030045) ENSCATG00000006272 EIF4G3 (ENSCATG00000034614) ECE1 (ENSCATG00000032439) ENSCATG00000033977 ALPL (ENSCATG00000035161) RAP1GAP (ENSCATG00000032723) USP48 (ENSCATG00000032848) LDLRAD2 (ENSCATG00000026463) HSPG2 (ENSCATG00000035754) CELA3A (ENSCATG00000025823) ##22 ENSCATG00000034536 WNT4 (ENSCATG00000028581) ENSCATG00000028522 ZBTB40 (ENSCATG00000031739) EPHA8 (ENSCATG00000032359) C1QA (ENSCATG00000031472) C1QC (ENSCATG00000033253) C1QB (ENSCATG00000032963) EPHB2 (ENSCATG00000036561) LACTBL1 (ENSCATG00000035607) TEX46 (ENSCATG00000029908) KDM1A (ENSCATG00000035213) LUZP1 (ENSCATG00000033769) HTR1D (ENSCATG00000006900) HNRNPR (ENSCATG00000035305) Olive baboon MODERN SPECIES FAM43B (ENSPANG00000006289) ENSPANG00000012765 PINK1 (ENSPANG00000015168) ENSPANG00000041446 DDOST (ENSPANG00000023662) KIF17 (ENSPANG00000025491) SH2D5 (ENSPANG00000020849) HP1BP3 (ENSPANG00000009567) EIF4G3 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HSPG2 (ENSCSAG00000000907) CELA3A (ENSCSAG00000000908) ##22 CDC42 (ENSCSAG00000000909) WNT4 (ENSCSAG00000000910) ZBTB40 (ENSCSAG00000000911) EPHA8 (ENSCSAG00000000912) ENSCSAG00000000913 C1QC (ENSCSAG00000000914) C1QB (ENSCSAG00000000915) EPHB2 (ENSCSAG00000000916) LACTBL1 (ENSCSAG00000000917) TEX46 (ENSCSAG00000000918) KDM1A (ENSCSAG00000000919) LUZP1 (ENSCSAG00000000920) HTR1D (ENSCSAG00000000642) HNRNPR (ENSCSAG00000000922) ZNF436 (ENSCSAG00000000923) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000155865.a.b ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00390000001153.`b ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.v ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00390000000696.`b ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 820 ENSRBIG00000011639 ECE1 (ENSRBIG00000042375) ENSRBIG00000040628 ALPL (ENSRBIG00000034890) RAP1GAP (ENSRBIG00000026760) USP48 (ENSRBIG00000034751) LDLRAD2 (ENSRBIG00000038368) ENSRBIG00000029775 HSPG2 (ENSRBIG00000028096) CELA3A (ENSRBIG00000032732) ##22 ENSRBIG00000042316 WNT4 (ENSRBIG00000004240) ENSRBIG00000037287 ZBTB40 (ENSRBIG00000034608) ENSRBIG00000029605 EPHA8 (ENSRBIG00000042028) C1QA (ENSRBIG00000036287) C1QC (ENSRBIG00000020363) C1QB (ENSRBIG00000020453) EPHB2 (ENSRBIG00000044791) LACTBL1 (ENSRBIG00000033393) TEX46 (ENSRBIG00000039313) KDM1A (ENSRBIG00000039880) LUZP1 (ENSRBIG00000034178) HTR1D (ENSRBIG00000017300) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1147 ENSRROG00000037656 CDA (ENSRROG00000029546) PINK1 (ENSRROG00000039420) DDOST (ENSRROG00000034929) KIF17 (ENSRROG00000042276) 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ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a Bonobo MODERN SPECIES PINK1 (ENSPPAG00000030106) ENSPPAG00000003937 DDOST (ENSPPAG00000038676) KIF17 (ENSPPAG00000021626) SH2D5 (ENSPPAG00000022445) HP1BP3 (ENSPPAG00000040189) EIF4G3 (ENSPPAG00000038299) ECE1 (ENSPPAG00000028307) ENSPPAG00000028007 NBPF3 (ENSPPAG00000028135) ALPL (ENSPPAG00000030488) RAP1GAP (ENSPPAG00000037273) USP48 (ENSPPAG00000028188) LDLRAD2 (ENSPPAG00000044115) HSPG2 (ENSPPAG00000041282) CELA3A (ENSPPAG00000035035) ##22 ENSPPAG00000043001 ENSPPAG00000031108 WNT4 (ENSPPAG00000009237) ZBTB40 (ENSPPAG00000034112) EPHA8 (ENSPPAG00000040764) C1QC (ENSPPAG00000027943) C1QB (ENSPPAG00000039218) EPHB2 (ENSPPAG00000032919) LACTBL1 (ENSPPAG00000039301) TEX46 (ENSPPAG00000036417) KDM1A (ENSPPAG00000042062) LUZP1 (ENSPPAG00000041932) HTR1D (ENSPPAG00000015499) HNRNPR (ENSPPAG00000040797) ZNF436 (ENSPPAG00000037405) Chimpanzee MODERN SPECIES 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(ENSPPYG00000039063) ##22 CELA3A (ENSPPYG00000037851) ##22 CDC42 (ENSPPYG00000001755) WNT4 (ENSPPYG00000001754) ZBTB40 (ENSPPYG00000001752) EPHA8 (ENSPPYG00000001751) C1QA (ENSPPYG00000001750) C1QC (ENSPPYG00000001749) C1QB (ENSPPYG00000001748) EPHB2 (ENSPPYG00000029431) LACTBL1 (ENSPPYG00000034082) TEX46 (ENSPPYG00000035212) KDM1A (ENSPPYG00000001747) LUZP1 (ENSPPYG00000001746) HTR1D (ENSPPYG00000001745) HNRNPR (ENSPPYG00000001744) ZNF436 (ENSPPYG00000001743) Gibbon MODERN SPECIES 331 CELA3A (ENSNLEG00000015865) ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000155503 ENSGT00450000040404.a ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000163614 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162826 ENSGT00390000000911 ENSGT00390000001206 ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 Elephant MODERN SPECIES 270 FAM43B (ENSLAFG00000005812) CDA (ENSLAFG00000013577) PINK1 (ENSLAFG00000013575) DDOST (ENSLAFG00000013567) KIF17 (ENSLAFG00000000646) SH2D5 (ENSLAFG00000000650) HP1BP3 (ENSLAFG00000012525) EIF4G3 (ENSLAFG00000012534) ECE1 (ENSLAFG00000005583) ALPL (ENSLAFG00000029718) RAP1GAP (ENSLAFG00000007354) USP48 (ENSLAFG00000007361) LDLRAD2 (ENSLAFG00000002049) HSPG2 (ENSLAFG00000002050) ENSLAFG00000028109 ENSLAFG00000003598 ##22 Hyrax MODERN SPECIES 3163 ENSPCAG00000014608 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 3842 ENSETEG00000008190 ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 914 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT00390000004327 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000153675.a.a.b.f ENSGT00940000159654 Sloth MODERN SPECIES 11137 ENSCHOG00000007622 ##22 ENSCHOG00000007616 Armadillo MODERN SPECIES 1848 ENSDNOG00000018710 GAS2L1 (ENSDNOG00000035253) RASL10A (ENSDNOG00000036166) AP1B1 (ENSDNOG00000018712) ENSDNOG00000047265 THOC5 (ENSDNOG00000016572) NIPSNAP1 (ENSDNOG00000043433) NF2 (ENSDNOG00000041723) CABP7 (ENSDNOG00000000895) ZMAT5 (ENSDNOG00000000899) UQCR10 (ENSDNOG00000034990) ASCC2 (ENSDNOG00000000902) LDLRAD2 (ENSDNOG00000040878) HSPG2 (ENSDNOG00000002131) ENSDNOG00000045113 ENSDNOG00000024327 ##22 CDC42 (ENSDNOG00000031296) WNT4 (ENSDNOG00000047719) Platypus DUPLICATION Platypus MODERN SPECIES 16 MUL1 (ENSOANG00000046135) ENSOANG00000044151 FAM43B (ENSOANG00000000596) CDA (ENSOANG00000037717) PINK1 (ENSOANG00000010400) DDOST (ENSOANG00000041094) KIF17 (ENSOANG00000004731) SH2D5 (ENSOANG00000038889) HP1BP3 (ENSOANG00000004341) EIF4G3 (ENSOANG00000012444) ECE1 (ENSOANG00000014757) ALPL (ENSOANG00000043949) RAP1GAP (ENSOANG00000005926) USP48 (ENSOANG00000005928) ENSOANG00000042496 ENSOANG00000043977 ##22 ENSOANG00000012297 ##22 CDC42 (ENSOANG00000046752) WNT4 (ENSOANG00000036915) ENSOANG00000039887 ENSOANG00000039402 ENSOANG00000036326 ENSOANG00000007847 ENSOANG00000036277 ENSOANG00000011720 ENSOANG00000037060 ENSOANG00000039247 ENSOANG00000038813 SVBP (ENSOANG00000042819) ENSOANG00000000323 C1orf50 (ENSOANG00000007982) Platypus MODERN SPECIES 16 ENSOANG00000044151 FAM43B (ENSOANG00000000596) CDA (ENSOANG00000037717) PINK1 (ENSOANG00000010400) DDOST (ENSOANG00000041094) KIF17 (ENSOANG00000004731) SH2D5 (ENSOANG00000038889) HP1BP3 (ENSOANG00000004341) EIF4G3 (ENSOANG00000012444) ECE1 (ENSOANG00000014757) ALPL (ENSOANG00000043949) RAP1GAP (ENSOANG00000005926) USP48 (ENSOANG00000005928) ENSOANG00000042496 ENSOANG00000043977 ##22 ENSOANG00000012297 ##22 CDC42 (ENSOANG00000046752) WNT4 (ENSOANG00000036915) ENSOANG00000039887 ENSOANG00000039402 ENSOANG00000036326 ENSOANG00000007847 ENSOANG00000036277 ENSOANG00000011720 ENSOANG00000037060 ENSOANG00000039247 ENSOANG00000038813 SVBP (ENSOANG00000042819) ENSOANG00000000323 C1orf50 (ENSOANG00000007982) P3H1 (ENSOANG00000009375) Sauria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160016 ENSGT00390000015175 ENSGT00390000005744 ENSGT00950000182999.a ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454.n ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433 ENSGT00940000156275 ENSGT00950000182858.C ENSGT00940000160840 ENSGT00940000156792 ENSGT00390000004248 ENSGT00940000169116 ENSGT00950000182834.C ENSGT00940000165031 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341.b ENSGT00940000165186.A ENSGT00940000165186.C Lepidosauria DUPLICATION Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000160016 ENSGT00390000015175 ENSGT00950000182999.a ENSGT00390000017294 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454.n ENSGT00940000156687.g.e ENSGT00950000186294 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT01030000234528.B.b.b.z ##22 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.y ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159003 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000160016 ENSGT00390000015175 ENSGT00990000213461 ENSGT00950000182999.a ENSGT00390000017294 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454.n ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.y ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433 ENSGT00940000153217.d ENSGT00940000153217.c.b.b.a ENSGT00940000153217.c.b.b.b ENSGT00940000156151 ENSGT00940000153798.A.b ENSGT00390000002421 ENSGT00940000162724 ENSGT00940000156759 ENSGT00940000156136 ENSGT00560000077335 ENSGT00510000046803.a ENSGT00600000084471 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159003 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000160016 ENSGT00390000015175 ENSGT00990000213461 ENSGT00950000182999.a ENSGT00390000017294 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454.n ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000168148 ENSGT01030000234528.B.b.b.y ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433 ENSGT00940000153217.d ENSGT00940000153217.c.b.b.a ENSGT00940000153217.c.b.b.b ENSGT00940000156151 ENSGT00940000153798.A.b ENSGT00940000156759 ENSGT00560000077335 ENSGT00510000046803.a ENSGT00600000084471.z ENSGT00390000002461 ENSGT00390000006238 ENSGT00940000158496 Elapidae DUPLICATION Elapidae DUPLICATION Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.y.a.a ##22 Elapidae_a DUPLICATION Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.y.a.a.a ##22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.y.a.a.a ##22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 2876 ENSNSUG00000000415 ##22 Eastern brown snake MODERN SPECIES 1619 ENSPTXG00000013614 ##22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 7484 ENSLLTG00000007038 ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.y.a.a.b ##22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 7483 ENSLLTG00000007026 ##22 Elapidae DUPLICATION Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.y.a.b.a ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.y.a.b.a ##22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.y.a.b.a ##22 Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake MODERN SPECIES 2698 ENSNSUG00000003960 ##22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 2738 ENSNSUG00000004092 ##22 Eastern brown snake MODERN SPECIES 1426 ENSPTXG00000017291 ##22 Indian cobra MODERN SPECIES 9 ENSNNAG00000018399 HSPB7 (ENSNNAG00000018391) ZBTB17 (ENSNNAG00000018379) SPEN (ENSNNAG00000018364) TMEM82 (ENSNNAG00000018345) SLC25A34 (ENSNNAG00000018330) ENSNNAG00000018319 ENSNNAG00000018313 DDOST (ENSNNAG00000018280) SH2D5 (ENSNNAG00000018265) HP1BP3 (ENSNNAG00000018258) ENSNNAG00000017125 ECE1 (ENSNNAG00000016216) ALPL (ENSNNAG00000016112) RAP1GAP (ENSNNAG00000016087) ENSNNAG00000015991 ##22 ENSNNAG00000015948 SVBP (ENSNNAG00000015933) TRIM62 (ENSNNAG00000015919) PADI2 (ENSNNAG00000015905) ENSNNAG00000015625 ENSNNAG00000015588 RCC2 (ENSNNAG00000015565) KLHDC7A (ENSNNAG00000015552) ARHGEF10L (ENSNNAG00000014690) ALDH4A1 (ENSNNAG00000014252) IFFO2 (ENSNNAG00000014163) EMC1 (ENSNNAG00000012313) MRTO4 (ENSNNAG00000012214) AKR7L (ENSNNAG00000012186) ENSNNAG00000012161 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.y.a.b.b ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.y.a.b.b ##22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.y.a.b.b ##22 Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake MODERN SPECIES 2683 ENSNSUG00000003905 ##22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 2190 ENSNSUG00000002280 ##22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 5857 ENSLLTG00000009066 ##22 ENSLLTG00000009047 ##22 ENSLLTG00000009022 SVBP (ENSLLTG00000008994) TRIM62 (ENSLLTG00000008977) PADI2 (ENSLLTG00000008946) ENSLLTG00000008911 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT01030000234528.B.b.b.y.b ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433 ENSGT00940000153217.d ENSGT00940000153217.c.b.b.a ENSGT00940000153217.c.b.b.b ENSGT00940000156151 ENSGT00940000153798.A.b ENSGT00940000156759 ENSGT00560000077335 ENSGT00510000046803.a ENSGT00600000084471.z ENSGT00390000002461 ENSGT00390000006238 ENSGT00940000158496 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 156 ENSGT01030000234528.B.b.b.y.b ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433 ENSGT00940000153217.d ENSGT00940000153217.c.b.b.a ENSGT00940000153217.c.b.b.b.a ENSGT00940000153217.c.b.b.b.b ENSGT00940000156151 ENSGT00940000153798.A.b Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 5857 ENSLLTG00000009066 ##22 ENSLLTG00000009047 ##22 ENSLLTG00000009022 SVBP (ENSLLTG00000008994) TRIM62 (ENSLLTG00000008977) PADI2 (ENSLLTG00000008946) ENSLLTG00000008911 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 161 ENSGT01030000234528.B.b.b.y.b ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433 ENSGT00940000153217.d ENSGT00940000153217.c.b.b.a ENSGT00940000153217.c.b.b.b.b ENSGT00940000156151 ENSGT00940000153798.A.b Eastern brown snake MODERN SPECIES 238 ENSPTXG00000018774 ##22 ENSPTXG00000018778 SVBP (ENSPTXG00000018781) TRIM62 (ENSPTXG00000018782) PADI2 (ENSPTXG00000018784) ENSPTXG00000018788 ENSPTXG00000018790 RCC2 (ENSPTXG00000018791) ARHGEF10L (ENSPTXG00000018792) Lizard MODERN SPECIES 1562 ENSACAG00000012636 ##22 ENSACAG00000012599 ENSACAG00000012592 ENSACAG00000012575 Laterata ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000159003 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000160016 ENSGT00390000015175 ENSGT00990000213461 ENSGT00950000182999.a ENSGT00390000017294 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454.n ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.y ##22 ENSGT01030000234528.B.b.b.z ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433 ENSGT00940000153217.d ENSGT00940000153217.c.b.b.a ENSGT00940000153217.c.b.b.b ENSGT00940000156151 ENSGT00940000153798.A.b ENSGT00390000002421 ENSGT00940000162724 ENSGT00940000156759 ENSGT00940000156136 ENSGT00560000077335 ENSGT00510000046803.a Common wall lizard MODERN SPECIES 16 ANK1 (ENSPMRG00000020098) NKX6-3 (ENSPMRG00000019967) GPAT4 (ENSPMRG00000019960) ENSPMRG00000019954 GINS4 (ENSPMRG00000019943) GOLGA7 (ENSPMRG00000019937) ENSPMRG00000019931 SFRP1 (ENSPMRG00000019923) ENSPMRG00000019920 ZMAT4 (ENSPMRG00000019911) ENSPMRG00000019906 TCIM (ENSPMRG00000019902) ENSPMRG00000019895 ENSPMRG00000019879 HSPG2 (ENSPMRG00000017360) ENSPMRG00000016838 ##22 ENSPMRG00000016757 ##22 SVBP (ENSPMRG00000016715) TRIM62 (ENSPMRG00000016708) PADI2 (ENSPMRG00000016274) ENSPMRG00000016125 ENSPMRG00000016114 ENSPMRG00000016109 MAD2L2 (ENSPMRG00000016100) ENSPMRG00000016092 AGTRAP (ENSPMRG00000016088) ENSPMRG00000016082 ENSPMRG00000016074 ENSPMRG00000016062 CLCN6 (ENSPMRG00000015723) ENSPMRG00000015665 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 125 HP1BP3 (ENSSMRG00000011733) EIF4G3 (ENSSMRG00000011757) ECE1 (ENSSMRG00000018160) ALPL (ENSSMRG00000018162) RAP1GAP (ENSSMRG00000018163) USP48 (ENSSMRG00000018165) MRPL20 (ENSSMRG00000018188) HSPG2 (ENSSMRG00000018199) ENSSMRG00000018641 ##22 ENSSMRG00000018674 ##22 ENSSMRG00000018683 SVBP (ENSSMRG00000018684) TRIM62 (ENSSMRG00000018688) PADI2 (ENSSMRG00000018690) ENSSMRG00000018693 ENSSMRG00000018758 RCC2 (ENSSMRG00000018759) ARHGEF10L (ENSSMRG00000018762) IGSF21 (ENSSMRG00000018770) KLHDC7A (ENSSMRG00000018771) PAX7 (ENSSMRG00000018775) TAS1R2 (ENSSMRG00000018777) ALDH4A1 (ENSSMRG00000018792) IFFO2 (ENSSMRG00000018816) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000159003 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000160016 ENSGT00390000015175 ENSGT00950000182999.a ENSGT00390000017294 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454.n ENSGT00940000156687.g.e ENSGT00950000186294 ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT01030000234528.B.b.b.z ##22 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.y ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.z ##22 Laterata ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000160016 ENSGT00390000015175 ENSGT00990000213461 ENSGT00950000182999.a ENSGT00390000017294 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454.n ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b.y ##22 ENSGT01030000234528.B.b.b.z ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433 ENSGT00940000153217.d ENSGT00940000153217.c.b.b.a ENSGT00940000153217.c.b.b.b ENSGT00940000156151 ENSGT00940000153798.A.b ENSGT00390000002421 ENSGT00940000162724 ENSGT00940000156759 ENSGT00940000156136 ENSGT00560000077335 ENSGT00510000046803.a ENSGT00600000084471 Common wall lizard MODERN SPECIES 16 NKX6-3 (ENSPMRG00000019967) GPAT4 (ENSPMRG00000019960) ENSPMRG00000019954 GINS4 (ENSPMRG00000019943) GOLGA7 (ENSPMRG00000019937) ENSPMRG00000019931 SFRP1 (ENSPMRG00000019923) ENSPMRG00000019920 ZMAT4 (ENSPMRG00000019911) ENSPMRG00000019906 TCIM (ENSPMRG00000019902) ENSPMRG00000019895 ENSPMRG00000019879 HSPG2 (ENSPMRG00000017360) ENSPMRG00000016838 ##22 ENSPMRG00000016757 ##22 SVBP (ENSPMRG00000016715) TRIM62 (ENSPMRG00000016708) PADI2 (ENSPMRG00000016274) ENSPMRG00000016125 ENSPMRG00000016114 ENSPMRG00000016109 MAD2L2 (ENSPMRG00000016100) ENSPMRG00000016092 AGTRAP (ENSPMRG00000016088) ENSPMRG00000016082 ENSPMRG00000016074 ENSPMRG00000016062 CLCN6 (ENSPMRG00000015723) ENSPMRG00000015665 ENSPMRG00000015659 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 125 HP1BP3 (ENSSMRG00000011733) EIF4G3 (ENSSMRG00000011757) ECE1 (ENSSMRG00000018160) ALPL (ENSSMRG00000018162) RAP1GAP (ENSSMRG00000018163) USP48 (ENSSMRG00000018165) MRPL20 (ENSSMRG00000018188) HSPG2 (ENSSMRG00000018199) ENSSMRG00000018641 ##22 ENSSMRG00000018674 ##22 ENSSMRG00000018683 SVBP (ENSSMRG00000018684) TRIM62 (ENSSMRG00000018688) PADI2 (ENSSMRG00000018690) ENSSMRG00000018693 ENSSMRG00000018758 RCC2 (ENSSMRG00000018759) ARHGEF10L (ENSSMRG00000018762) IGSF21 (ENSSMRG00000018770) KLHDC7A (ENSSMRG00000018771) PAX7 (ENSSMRG00000018775) TAS1R2 (ENSSMRG00000018777) ALDH4A1 (ENSSMRG00000018792) IFFO2 (ENSSMRG00000018816) UBR4 (ENSSMRG00000018817) tuatara MODERN SPECIES 1818 ECE1 (ENSSPUG00000004687) ALPL (ENSSPUG00000004755) RAP1GAP (ENSSPUG00000004796) USP48 (ENSSPUG00000004893) ENSSPUG00000005129 ##22 ENSSPUG00000005157 SVBP (ENSSPUG00000005169) TRIM62 (ENSSPUG00000005187) ZNF362 (ENSSPUG00000005255) PHC2 (ENSSPUG00000005287) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160016 ENSGT00390000015175 ENSGT00390000005744 ENSGT00950000182999.a ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454.n ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00390000004581 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433 ENSGT00940000156275 ENSGT00950000182858.C 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ENSGT00940000156275 ENSGT00940000160840 ENSGT00940000156792 ENSGT00390000004248 ENSGT00940000169116 ENSGT00950000182834.C ENSGT00940000165031 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341.b ENSGT00940000165186.C ENSGT00940000158624 ENSGT00940000158725 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000160016 ENSGT00390000015175 ENSGT00390000005744 ENSGT00950000182999.a ENSGT00390000017294 ENSGT00940000158776 ENSGT00510000048936 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454.n ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156138 ENSGT00940000156015 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433.k ENSGT00940000156275 ENSGT00940000160840 ENSGT00940000156792 ENSGT00390000004248 ENSGT00940000169116 ENSGT00950000182834.C ENSGT00940000165031.c ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341.b ENSGT00940000165186.C ENSGT00940000158624 ENSGT00940000158725 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157087.a.b 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ENSCPBG00000009819 PPCS (ENSCPBG00000009814) ZMYND12 (ENSCPBG00000009809) SLC2A1 (ENSCPBG00000009801) HP1BP3 (ENSCPBG00000009787) EIF4G3 (ENSCPBG00000008943) ECE1 (ENSCPBG00000008882) ALPL (ENSCPBG00000008863) ENSCPBG00000008851 RAP1GAP (ENSCPBG00000008822) USP48 (ENSCPBG00000008781) ENSCPBG00000008769 ENSCPBG00000008760 HSPG2 (ENSCPBG00000008105) ENSCPBG00000007636 ##22 ENSCPBG00000007610 SVBP (ENSCPBG00000007600) TRIM62 (ENSCPBG00000007592) ZNF362 (ENSCPBG00000007576) PHC2 (ENSCPBG00000007518) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155314 ENSGT00940000156454.n ENSGT00940000156050 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156015 ENSGT00940000156670 ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433 ENSGT00940000156275 ENSGT00940000160840 ENSGT00940000156792 ENSGT00390000004248 ENSGT00940000169116 ENSGT00950000182834.C ENSGT00940000165031 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341.b ENSGT00940000165186.C ENSGT00940000158624 ENSGT00940000158725 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 9 HP1BP3 (ENSGEVG00005013872) EIF4G3 (ENSGEVG00005013995) ECE1 (ENSGEVG00005014699) ALPL (ENSGEVG00005016638) RAP1GAP (ENSGEVG00005016765) ENSGEVG00005017064 USP48 (ENSGEVG00005017093) HSPG2 (ENSGEVG00005017226) ENSGEVG00005017581 ENSGEVG00005017592 ##22 ENSGEVG00005017631 SVBP (ENSGEVG00005017651) TRIM62 (ENSGEVG00005017666) ZNF362 (ENSGEVG00005017700) PHC2 (ENSGEVG00005017723) ENSGEVG00005017744 SLC2A1 (ENSGEVG00005017755) ZMYND12 (ENSGEVG00005017810) PPCS (ENSGEVG00005017979) PPIH (ENSGEVG00005017999) ENSGEVG00005018031 ENSGEVG00005018059 CLDN19 (ENSGEVG00005018105) P3H1 (ENSGEVG00005018304) C1orf50 (ENSGEVG00005018825) Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2223 ENSCABG00000008968 TPRA1 (ENSCABG00000008970) MCM2 (ENSCABG00000008975) PODXL2 (ENSCABG00000008978) ABTB1 (ENSCABG00000008980) MGLL (ENSCABG00000008982) KBTBD12 (ENSCABG00000008985) SEC61A1 (ENSCABG00000008986) RUVBL1 (ENSCABG00000008989) EEFSEC (ENSCABG00000008991) ENSCABG00000008995 ##22 ENSCABG00000009033 SVBP (ENSCABG00000009037) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b ##22 Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.bb ##22 Euteleosteomorpha DUPLICATION Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000163886.A ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00940000161304.a.a ENSGT00940000156073.c.b ENSGT00940000160740 ENSGT00940000154327.b.f ENSGT01060000248556.B ENSGT00390000003156.b ENSGT00390000000288 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000163886.A ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000163886.A ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000180612 ENSGT00940000159127 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000163886.A ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000180612 ENSGT00940000159127 ENSGT00730000114327 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000163886.A ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00730000114327 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00730000114327 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b Ballan wrasse MODERN SPECIES 13 SLC22A23 (ENSLBEG00000024883) DSP (ENSLBEG00000025091) tbc1d7 (ENSLBEG00000025427) PHACTR1 (ENSLBEG00000025468) sirt5 (ENSLBEG00000025501) adcy1a (ENSLBEG00000025537) igfbp1a (ENSLBEG00000025619) igfbp3 (ENSLBEG00000025636) TNS3 (ENSLBEG00000025682) ENSLBEG00000025765 si:ch211-191a24.4 (ENSLBEG00000025783) si:ch1073-287p18.1 (ENSLBEG00000025791) naprt (ENSLBEG00000025810) ENSLBEG00000025872 ENSLBEG00000025955 ENSLBEG00000025980 ##22 ENSLBEG00000026051 arpc5b (ENSLBEG00000026190) PLA2G4A (ENSLBEG00000026233) ptgs2b (ENSLBEG00000026283) pdcb (ENSLBEG00000026303) tprb (ENSLBEG00000026334) ENSLBEG00000026392 ENSLBEG00000026450 rfx2 (ENSLBEG00000026595) acsbg2 (ENSLBEG00000026691) mllt1b (ENSLBEG00000026732) myo1f (ENSLBEG00000026776) adamts10 (ENSLBEG00000026815) zap70 (ENSLBEG00000026844) mob3a (ENSLBEG00000026856) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00730000114327 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157354.i ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183190.a.a.a.b Lumpfish MODERN SPECIES 19 DSP (ENSCLMG00005018027) tbc1d7 (ENSCLMG00005018070) ENSCLMG00005018071 sirt5 (ENSCLMG00005018073) adcy1a (ENSCLMG00005018074) ENSCLMG00005018076 igfbp1a (ENSCLMG00005018077) igfbp3 (ENSCLMG00005018078) ENSCLMG00005018079 ENSCLMG00005018088 si:ch211-191a24.4 (ENSCLMG00005018119) C8orf82 (ENSCLMG00005018120) naprt (ENSCLMG00005018123) ENSCLMG00005018141 ENSCLMG00005018724 ENSCLMG00005018733 ##22 ADCYAP1R1 (ENSCLMG00005002939) ENSCLMG00005003738 ENSCLMG00005003741 ZC3H3 (ENSCLMG00005003764) mafaa (ENSCLMG00005003765) atpaf1 (ENSCLMG00005003766) RHPN1 (ENSCLMG00005003769) TUT4 (ENSCLMG00005003783) gpx7 (ENSCLMG00005005048) ENSCLMG00005005049 pomgnt1 (ENSCLMG00005005057) TSPAN1 (ENSCLMG00005005093) PIK3R3 (ENSCLMG00005005105) ENSCLMG00005006028 MAST2 (ENSCLMG00005006053) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 18 DSP (ENSCGOG00000006277) tbc1d7 (ENSCGOG00000006253) PHACTR1 (ENSCGOG00000006215) sirt5 (ENSCGOG00000006155) adcy1a (ENSCGOG00000006036) igfbp1a (ENSCGOG00000006030) igfbp3 (ENSCGOG00000006029) ENSCGOG00000006026 ENSCGOG00000005626 si:ch211-191a24.4 (ENSCGOG00000005621) C8orf82 (ENSCGOG00000005620) naprt (ENSCGOG00000005481) ENSCGOG00000002922 ENSCGOG00000002745 ENSCGOG00000002605 ENSCGOG00000002352 ##22 ADCYAP1R1 (ENSCGOG00000001833) ENSCGOG00000001772 ENSCGOG00000001755 ENSCGOG00000001749 ZC3H3 (ENSCGOG00000001742) mafaa (ENSCGOG00000001737) atpaf1 (ENSCGOG00000001729) RHPN1 (ENSCGOG00000001518) TUT4 (ENSCGOG00000001260) gpx7 (ENSCGOG00000001250) ENSCGOG00000001245 TSPAN1 (ENSCGOG00000001243) pomgnt1 (ENSCGOG00000001217) ENSCGOG00000001155 MAST2 (ENSCGOG00000000759) Pike perch MODERN SPECIES 59 DSP (ENSSLUG00000009955) tbc1d7 (ENSSLUG00000009934) PHACTR1 (ENSSLUG00000009924) sirt5 (ENSSLUG00000009911) adcy1a (ENSSLUG00000009905) igfbp1a (ENSSLUG00000009898) igfbp3 (ENSSLUG00000009894) ENSSLUG00000009891 ENSSLUG00000009367 si:ch211-191a24.4 (ENSSLUG00000009339) C8orf82 (ENSSLUG00000009335) naprt (ENSSLUG00000008976) ENSSLUG00000007697 ENSSLUG00000007603 ENSSLUG00000007579 ENSSLUG00000007573 ##22 ADCYAP1R1 (ENSSLUG00000007373) ENSSLUG00000007338 ENSSLUG00000007305 ZC3H3 (ENSSLUG00000007296) mafaa (ENSSLUG00000007292) atpaf1 (ENSSLUG00000007279) RHPN1 (ENSSLUG00000007209) TUT4 (ENSSLUG00000006967) gpx7 (ENSSLUG00000006908) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00730000114327 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b Gilthead seabream MODERN SPECIES 2 ENSSAUG00010013153 tbc1d7 (ENSSAUG00010013932) PHACTR1 (ENSSAUG00010013943) ENSSAUG00010013953 sirt5 (ENSSAUG00010013959) adcy1a (ENSSAUG00010014004) igfbp1a (ENSSAUG00010014351) igfbp3 (ENSSAUG00010014354) ENSSAUG00010014357 TNS3 (ENSSAUG00010014361) ENSSAUG00010014383 si:ch211-191a24.4 (ENSSAUG00010014938) C8orf82 (ENSSAUG00010014940) naprt (ENSSAUG00010014942) ENSSAUG00010015000 ENSSAUG00010016581 ##22 ADCYAP1R1 (ENSSAUG00010016654) ENSSAUG00010020328 ENSSAUG00010020332 ZC3H3 (ENSSAUG00010020333) mafaa (ENSSAUG00010007885) atpaf1 (ENSSAUG00010007888) ENSSAUG00010007889 ENSSAUG00010007890 RHPN1 (ENSSAUG00010007894) ENSSAUG00010007905 ENSSAUG00010007907 ENSSAUG00010007912 LONP1 (ENSSAUG00010007927) LRRC24 (ENSSAUG00010008319) ENSSAUG00010008323 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00730000114327 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b European seabass MODERN SPECIES 17 ENSDLAG00005014814 ENSDLAG00005027314 ENSDLAG00005014725 sirt5 (ENSDLAG00005014707) adcy1a (ENSDLAG00005014071) igfbp1a (ENSDLAG00005014009) igfbp3 (ENSDLAG00005027811) TNS3 (ENSDLAG00005013907) ENSDLAG00005013750 si:ch211-191a24.4 (ENSDLAG00005033040) ENSDLAG00005013574 ENSDLAG00005010794 ENSDLAG00005010698 ENSDLAG00005010653 ENSDLAG00005027136 ENSDLAG00005031656 ##22 ENSDLAG00005010453 ENSDLAG00005034029 ENSDLAG00005010349 ZC3H3 (ENSDLAG00005010316) mafaa (ENSDLAG00005030978) ENSDLAG00005010285 RHPN1 (ENSDLAG00005010260) ENSDLAG00005010201 ENSDLAG00005010194 ENSDLAG00005031434 ENSDLAG00005010180 pomgnt1 (ENSDLAG00005010107) TSPAN1 (ENSDLAG00005010091) PIK3R3 (ENSDLAG00005009702) MAST2 (ENSDLAG00005007444) Large yellow croaker MODERN SPECIES 489 foxq1b (ENSLCRG00005011207) ENSLCRG00005011210 foxc1b (ENSLCRG00005011211) gmds (ENSLCRG00005011216) MYLK4 (ENSLCRG00005011276) ENSLCRG00005011279 bmb (ENSLCRG00005011333) pycr3 (ENSLCRG00005011338) ENSLCRG00005011342 ENSLCRG00005011349 ENSLCRG00005011465 ENSLCRG00005011469 ENSLCRG00005011471 NOS1AP (ENSLCRG00005011474) ENSLCRG00005011479 ENSLCRG00005011481 ##22 ADCYAP1R1 (ENSLCRG00005011512) ENSLCRG00005015010 ENSLCRG00005015011 ZC3H3 (ENSLCRG00005000788) mafaa (ENSLCRG00005000798) atpaf1 (ENSLCRG00005000801) RHPN1 (ENSLCRG00005000827) TUT4 (ENSLCRG00005000937) gpx7 (ENSLCRG00005002246) ENSLCRG00005002274 ENSLCRG00005002315 ENSLCRG00005002312 PRRC2C (ENSLCRG00005002318) myoc (ENSLCRG00005002326) rangrf (ENSLCRG00005002331) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000180612 ENSGT00940000159127 ENSGT00730000114327 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a Carangaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 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ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260029.a.a.b.a.b ENSGT00950000183014.f.b.b.a.a ENSGT00950000183044.a.b ENSGT00740000115898 ENSGT00390000004681.a.a ENSGT00940000154573 ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ENSGT01100000263594.b ENSGT00940000159466 ENSGT00390000014886 ENSGT00390000008371.a ENSGT00390000003574.a ENSGT00940000154149.b.a.g.b ENSGT00530000063646.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000153456.a ENSGT00390000011521 ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00940000158137.c.b Greater amberjack MODERN SPECIES 73 GFUS (ENSSDUG00000021654) GFUS (ENSSDUG00000021667) SERPINB1 (ENSSDUG00000021682) ENSSDUG00000021696 ENSSDUG00000021705 ENSSDUG00000021712 ENSSDUG00000021725 ENSSDUG00000021730 prrx1b (ENSSDUG00000021734) gorab (ENSSDUG00000021741) ntmt2 (ENSSDUG00000021747) kifap3a (ENSSDUG00000021766) niban1a (ENSSDUG00000021794) TRMT1L (ENSSDUG00000021807) ENSSDUG00000021831 ENSSDUG00000021837 ##22 ADCYAP1R1 (ENSSDUG00000021845) ENSSDUG00000021851 ENSSDUG00000021862 ZC3H3 (ENSSDUG00000021871) mafaa (ENSSDUG00000021887) atpaf1 (ENSSDUG00000021892) RHPN1 (ENSSDUG00000021905) TUT4 (ENSSDUG00000021923) ENSSDUG00000021936 ENSSDUG00000021945 gpx7 (ENSSDUG00000021949) ENSSDUG00000021954 ENSSDUG00000021971 naprt (ENSSDUG00000022027) C8orf82 (ENSSDUG00000000071) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3176 ENSSLDG00000017392 pycr3 (ENSSLDG00000017378) bmb (ENSSLDG00000017363) SERPINB1 (ENSSLDG00000017322) GFUS (ENSSLDG00000016998) SERPINB1 (ENSSLDG00000016912) ENSSLDG00000016881 ENSSLDG00000016872 prrx1b (ENSSLDG00000016851) gorab (ENSSLDG00000016829) ntmt2 (ENSSLDG00000016809) kifap3a (ENSSLDG00000016743) niban1a (ENSSLDG00000016719) TRMT1L (ENSSLDG00000016579) ENSSLDG00000016388 ENSSLDG00000016313 ##22 ENSSLDG00000016289 ADCYAP1R1 (ENSSLDG00000016253) ENSSLDG00000016216 ENSSLDG00000016189 ZC3H3 (ENSSLDG00000016166) mafaa (ENSSLDG00000016154) atpaf1 (ENSSLDG00000016141) RHPN1 (ENSSLDG00000016111) TUT4 (ENSSLDG00000016071) gpx7 (ENSSLDG00000016054) ENSSLDG00000016038 ENSSLDG00000015993 naprt (ENSSLDG00000015903) C8orf82 (ENSSLDG00000015856) si:ch211-191a24.4 (ENSSLDG00000015849) Barramundi perch MODERN SPECIES 118 SLC22A23 (ENSLCAG00010022003) ENSLCAG00010021993 tbc1d7 (ENSLCAG00010021990) PHACTR1 (ENSLCAG00010021985) sirt5 (ENSLCAG00010021977) adcy1a (ENSLCAG00010021961) igfbp1a (ENSLCAG00010021944) igfbp3 (ENSLCAG00010021938) TNS3 (ENSLCAG00010021933) ENSLCAG00010021870 si:ch211-191a24.4 (ENSLCAG00010021848) C8orf82 (ENSLCAG00010021844) naprt (ENSLCAG00010021814) ENSLCAG00010021749 ENSLCAG00010021746 ENSLCAG00010021740 ##22 ADCYAP1R1 (ENSLCAG00010021708) ENSLCAG00010021688 ENSLCAG00010021683 ENSLCAG00010021670 mafaa (ENSLCAG00010021667) atpaf1 (ENSLCAG00010021665) ENSLCAG00010021662 ENSLCAG00010021660 ENSLCAG00010021658 NOS1AP (ENSLCAG00010021656) ENSLCAG00010021654 ENSLCAG00010021651 rgs4 (ENSLCAG00010021649) rgs5a (ENSLCAG00010021645) rgs16 (ENSLCAG00010021642) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00730000114327 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b Zig-zag eel MODERN SPECIES 18 ENSMAMG00000014057 ENSMAMG00000028147 sirt5 (ENSMAMG00000014096) adcy1a (ENSMAMG00000014223) igfbp1a (ENSMAMG00000014282) igfbp3 (ENSMAMG00000014314) TNS3 (ENSMAMG00000014334) ENSMAMG00000014357 ENSMAMG00000024348 si:ch211-191a24.4 (ENSMAMG00000014382) ENSMAMG00000014388 ENSMAMG00000014400 ENSMAMG00000014434 ENSMAMG00000014576 ENSMAMG00000014625 ENSMAMG00000014655 ##22 ENSMAMG00000014684 ENSMAMG00000014718 ENSMAMG00000014735 ZC3H3 (ENSMAMG00000014787) mafaa (ENSMAMG00000014803) ENSMAMG00000014818 RHPN1 (ENSMAMG00000014859) ENSMAMG00000014890 ENSMAMG00000014948 ENSMAMG00000015400 ENSMAMG00000014977 pomgnt1 (ENSMAMG00000014990) TSPAN1 (ENSMAMG00000015037) PIK3R3 (ENSMAMG00000015060) MAST2 (ENSMAMG00000015099) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 ENSGT00730000114327 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b Climbing perch MODERN SPECIES 17 ENSATEG00000002115 ENSATEG00000025672 sirt5 (ENSATEG00000002168) adcy1a (ENSATEG00000002179) igfbp1a (ENSATEG00000002248) igfbp3 (ENSATEG00000002286) TNS3 (ENSATEG00000002291) ENSATEG00000002401 si:ch211-191a24.4 (ENSATEG00000002409) ENSATEG00000002442 ENSATEG00000002466 ENSATEG00000002589 ENSATEG00000002700 ENSATEG00000002933 ENSATEG00000003215 ENSATEG00000003453 ##22 ENSATEG00000003478 ENSATEG00000003542 ENSATEG00000003655 ZC3H3 (ENSATEG00000003718) mafaa (ENSATEG00000028752) ENSATEG00000003758 RHPN1 (ENSATEG00000003810) ENSATEG00000003823 ENSATEG00000003849 ENSATEG00000028259 ENSATEG00000003890 ENSATEG00000030160 ENSATEG00000003903 POMGNT1 (ENSATEG00000003917) ENSATEG00000004022 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s.f ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000163886.A ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000180612 ENSGT00940000159127 ENSGT00950000182946.lb.b.h ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154843.F.c.b ENSGT00390000009122 ENSGT00940000155842.s.f ENSGT00940000156080.l ENSGT00940000154872.B ENSGT00940000157394.a ENSGT00940000158092.o ENSGT00940000156328.a.b.a ENSGT00940000158137.c.b ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00390000011521 ENSGT00940000153456.a ENSGT00940000164676 ENSGT00940000155265.b.b.a ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 204 ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 220 ENSGT00940000155265.b.b.b ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 268 ENSGT00940000155265.b.b.b.c ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a ##22 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00390000012765 ENSGT00940000153837.a.a ENSGT00940000156988 ENSGT00940000159127 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2005 ENSAOCG00000014779 ENSAOCG00000014793 ##22 ADCYAP1R1 (ENSAOCG00000014830) ENSAOCG00000014865 Orange clownfish MODERN SPECIES 11 EPS15L1 (ENSAPEG00000020895) rad23ab (ENSAPEG00000020817) ENSAPEG00000020775 ARHGAP39 (ENSAPEG00000020738) ENSAPEG00000020715 rad54l (ENSAPEG00000020658) ENSAPEG00000020646 st3gal3a (ENSAPEG00000020625) ENSAPEG00000020595 PTBP1 (ENSAPEG00000020568) stil (ENSAPEG00000020340) serpinc1 (ENSAPEG00000020299) zbtb37 (ENSAPEG00000020270) ENSAPEG00000020257 ENSAPEG00000020206 ENSAPEG00000020185 ##22 ADCYAP1R1 (ENSAPEG00000020153) ENSAPEG00000020091 ENSAPEG00000020061 ZC3H3 (ENSAPEG00000020037) mafaa (ENSAPEG00000020025) atpaf1 (ENSAPEG00000020007) RHPN1 (ENSAPEG00000019929) TUT4 (ENSAPEG00000019857) gpx7 (ENSAPEG00000019831) cdc14ab (ENSAPEG00000019790) vcam1b (ENSAPEG00000019674) slc30a7 (ENSAPEG00000019606) dph5 (ENSAPEG00000019561) s1pr1 (ENSAPEG00000019550) ENSAPEG00000019454 Spiny chromis MODERN SPECIES 2402 ENSAPOG00000004432 ##22 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 18 ENSMMDG00005014313 tbc1d7 (ENSMMDG00005014308) PHACTR1 (ENSMMDG00005014293) sirt5 (ENSMMDG00005014270) adcy1a (ENSMMDG00005014255) igfbp1a (ENSMMDG00005014247) igfbp3 (ENSMMDG00005014244) ENSMMDG00005014239 ENSMMDG00005013983 si:ch211-191a24.4 (ENSMMDG00005013972) C8orf82 (ENSMMDG00005013971) naprt (ENSMMDG00005013881) ENSMMDG00005013864 ENSMMDG00005013861 ENSMMDG00005013809 ENSMMDG00005013655 ##22 ADCYAP1R1 (ENSMMDG00005013643) ENSMMDG00005013639 ENSMMDG00005013618 ZC3H3 (ENSMMDG00005013615) mafaa (ENSMMDG00005013612) RHPN1 (ENSMMDG00005013600) TUT4 (ENSMMDG00005012661) gpx7 (ENSMMDG00005012629) SHISAL2A (ENSMMDG00005012627) slc1a7b (ENSMMDG00005012623) PODN (ENSMMDG00005012621) scp2b (ENSMMDG00005012617) cpt2 (ENSMMDG00005012616) magoh (ENSMMDG00005012613) aatf (ENSMMDG00005012612) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT01030000235262 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000177597 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000182909.b.a.a.cb ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT01030000235262 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000182909.b.a.a.cb ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 River trout MODERN SPECIES 24 mapre2 (ENSSTUG00000050454) dtna (ENSSTUG00000050468) KLHL14 (ENSSTUG00000050593) ENSSTUG00000050597 CACNA1E (ENSSTUG00000050622) RNF11 (ENSSTUG00000050754) ENSSTUG00000003683 ENSSTUG00000003810 ZNF830 (ENSSTUG00000004130) ENSSTUG00000004133 ENSSTUG00000004601 ENSSTUG00000016551 prkacbb (ENSSTUG00000016567) exosc4 (ENSSTUG00000016838) ENSSTUG00000016850 ENSSTUG00000016859 ##22 MYLK4 (ENSSTUG00000016881) foxc1a (ENSSTUG00000016949) foxf2a (ENSSTUG00000016957) foxq1a (ENSSTUG00000016965) irf4a (ENSSTUG00000016969) dusp22b (ENSSTUG00000016989) ripk1l (ENSSTUG00000016994) ENSSTUG00000017009 ENSSTUG00000017065 PHLPP1 (ENSSTUG00000017079) PHACTR1 (ENSSTUG00000017217) ENSSTUG00000017340 adcy1b (ENSSTUG00000017396) IGFBP1 (ENSSTUG00000017860) IGFBP3 (ENSSTUG00000017865) Northern pike MODERN SPECIES 2 KLHL14 (ENSELUG00000021436) CACNA1E (ENSELUG00000021389) RNF11 (ENSELUG00000021315) rpe65a (ENSELUG00000021297) ENSELUG00000021268 ENSELUG00000021264 ZNF830 (ENSELUG00000021238) EFCAB14 (ENSELUG00000021219) ADGRL2 (ENSELUG00000021154) prkacbb (ENSELUG00000021034) exosc4 (ENSELUG00000026718) GPAA1 (ENSELUG00000020988) ENSELUG00000020957 ENSELUG00000020949 DHX30 (ENSELUG00000020943) ENSELUG00000020854 ##22 wrnip1 (ENSELUG00000019799) MYLK4 (ENSELUG00000019766) ENSELUG00000029551 foxc1a (ENSELUG00000019719) ENSELUG00000027282 foxf2a (ENSELUG00000019684) irf4a (ENSELUG00000019609) dusp22b (ENSELUG00000019302) ripk1l (ENSELUG00000019275) ENSELUG00000019236 MEP1B (ENSELUG00000019128) PHLPP1 (ENSELUG00000019046) SIRT5 (ENSELUG00000018832) adcy1b (ENSELUG00000018779) IGFBP3 (ENSELUG00000018696) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000156959.C ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 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ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b ENSGT00940000158092.p Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b ENSGT00940000158092.p Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B.b ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B.b ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B.b ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Orange clownfish MODERN SPECIES 1 RNF11 (ENSAPEG00000003552) rpe65a (ENSAPEG00000003563) SRSF11 (ENSAPEG00000003619) ENSAPEG00000003685 ZNF830 (ENSAPEG00000003742) EFCAB14 (ENSAPEG00000003750) ENSAPEG00000003778 ENSAPEG00000003797 ENSAPEG00000003886 ENSAPEG00000003931 exosc4 (ENSAPEG00000003972) GPAA1 (ENSAPEG00000003987) ENSAPEG00000004049 ENSAPEG00000004129 DHX30 (ENSAPEG00000004418) ENSAPEG00000004490 ##22 wrnip1 (ENSAPEG00000004508) MYLK4 (ENSAPEG00000004541) foxc1a (ENSAPEG00000004547) foxf2a (ENSAPEG00000004573) foxq1a (ENSAPEG00000004602) irf4a (ENSAPEG00000004617) dusp22b (ENSAPEG00000004637) ripk1l (ENSAPEG00000004703) opn7a (ENSAPEG00000004717) MEP1B (ENSAPEG00000004783) PHLPP1 (ENSAPEG00000004948) PHACTR1 (ENSAPEG00000005017) ENSAPEG00000005077 SIRT5 (ENSAPEG00000005104) adcy1b (ENSAPEG00000005123) Clown anemonefish MODERN SPECIES 873 GPAA1 (ENSAOCG00000017429) ENSAOCG00000017464 ENSAOCG00000017764 DHX30 (ENSAOCG00000017807) ENSAOCG00000017831 ##22 wrnip1 (ENSAOCG00000002711) MYLK4 (ENSAOCG00000017879) foxc1a (ENSAOCG00000017895) foxf2a (ENSAOCG00000017906) foxq1a (ENSAOCG00000017918) irf4a (ENSAOCG00000001260) dusp22b (ENSAOCG00000017936) ripk1l (ENSAOCG00000001266) opn7a (ENSAOCG00000018016) MEP1B (ENSAOCG00000018043) PHLPP1 (ENSAOCG00000018132) ENSAOCG00000018170 ENSAOCG00000018185 ENSAOCG00000018189 SIRT5 (ENSAOCG00000018198) Spiny chromis MODERN SPECIES 754 ENSAPOG00000023352 ENSAPOG00000023624 DHX30 (ENSAPOG00000023675) ENSAPOG00000023758 ##22 wrnip1 (ENSAPOG00000023777) MYLK4 (ENSAPOG00000023822) foxc1a (ENSAPOG00000023831) foxq1a (ENSAPOG00000023836) foxf2a (ENSAPOG00000023862) irf4a (ENSAPOG00000023876) dusp22b (ENSAPOG00000023887) ripk1l (ENSAPOG00000023904) opn7a (ENSAPOG00000023973) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2112 ENSSPAG00000021807 ENSSPAG00000021887 DHX30 (ENSSPAG00000022184) ENSSPAG00000022241 ##22 wrnip1 (ENSSPAG00000022544) MYLK4 (ENSSPAG00000022551) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b Midas cichlid MODERN SPECIES 641 CACNA1E (ENSACIG00000018187) ENSACIG00000018156 rpe65a (ENSACIG00000018112) SRSF11 (ENSACIG00000018075) ENSACIG00000018034 ZNF830 (ENSACIG00000018018) ENSACIG00000018004 ENSACIG00000017990 ENSACIG00000017949 ENSACIG00000017932 exosc4 (ENSACIG00000017924) GPAA1 (ENSACIG00000017906) ENSACIG00000017879 ENSACIG00000017622 DHX30 (ENSACIG00000017560) ENSACIG00000017548 ##22 wrnip1 (ENSACIG00000017529) MYLK4 (ENSACIG00000017494) foxc1a (ENSACIG00000017489) foxf2a (ENSACIG00000017477) foxq1a (ENSACIG00000017470) irf4a (ENSACIG00000017452) dusp22b (ENSACIG00000017434) ripk1l (ENSACIG00000017396) opn7a (ENSACIG00000017356) MEP1B (ENSACIG00000017305) PHLPP1 (ENSACIG00000017274) PHACTR1 (ENSACIG00000017248) SIRT5 (ENSACIG00000017231) adcy1b (ENSACIG00000017194) igfbp1b (ENSACIG00000017060) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000177054 ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000177054 ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000177054 ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b ENSGT00940000158092.p Mangrove rivulus MODERN SPECIES 65 ENSKMAG00000015391 exosc4 (ENSKMAG00000015373) GPAA1 (ENSKMAG00000015311) ENSKMAG00000015204 ENSKMAG00000015154 DHX30 (ENSKMAG00000015124) ENSKMAG00000015102 ##22 wrnip1 (ENSKMAG00000015081) MYLK4 (ENSKMAG00000015056) foxc1a (ENSKMAG00000015040) foxf2a (ENSKMAG00000015033) foxq1a (ENSKMAG00000015026) irf4a (ENSKMAG00000015009) ripk1l (ENSKMAG00000014984) opn7a (ENSKMAG00000014956) MEP1B (ENSKMAG00000014925) PHLPP1 (ENSKMAG00000014856) ENSKMAG00000014817 PHACTR1 (ENSKMAG00000014734) SIRT5 (ENSKMAG00000014681) adcy1b (ENSKMAG00000014589) IGFBP1 (ENSKMAG00000014503) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1618 KLHL14 (ENSNFUG00015017040) CACNA1E (ENSNFUG00015017202) Nfu_g_1_020184 (ENSNFUG00015021750) rpe65a (ENSNFUG00015021762) SRSF11 (ENSNFUG00015021894) ANKRD13C (ENSNFUG00015021904) ZNF830 (ENSNFUG00015021922) ENSNFUG00015021924 LPHN2 (ENSNFUG00015021990) ENSNFUG00015022643 PRKACB (ENSNFUG00015022666) EXOSC4 (ENSNFUG00015022960) GPAA1 (ENSNFUG00015022968) ENSNFUG00015022990 DHX30 (ENSNFUG00015022995) ENSNFUG00015023009 ##22 wrnip1 (ENSNFUG00015023017) MYLK4 (ENSNFUG00015023030) ENSNFUG00015023052 FOXC1A (ENSNFUG00015023055) FOXF2A (ENSNFUG00015023057) foxq1a (ENSNFUG00015023060) irf4a (ENSNFUG00015023063) ENSNFUG00015023065 ENSNFUG00015023066 ripk1l (ENSNFUG00015023069) opn7a (ENSNFUG00015023088) MEP1B (ENSNFUG00015023097) PHLPP1 (ENSNFUG00015023102) PHACTR1 (ENSNFUG00015023123) ENSNFUG00015023158 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000156959.C ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000156959.C ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b Sheepshead minnow MODERN SPECIES 389 ENSCVAG00000007027 ENSCVAG00000007013 rpe65a (ENSCVAG00000007003) SRSF11 (ENSCVAG00000006934) ENSCVAG00000006886 ZNF830 (ENSCVAG00000006839) ENSCVAG00000006826 ENSCVAG00000006819 ENSCVAG00000006799 prkacbb (ENSCVAG00000006652) exosc4 (ENSCVAG00000006625) GPAA1 (ENSCVAG00000006616) ENSCVAG00000006586 ENSCVAG00000006572 DHX30 (ENSCVAG00000006410) ENSCVAG00000006369 ##22 wrnip1 (ENSCVAG00000006352) MYLK4 (ENSCVAG00000006345) foxc1a (ENSCVAG00000006311) foxq1a (ENSCVAG00000006300) irf4a (ENSCVAG00000006290) dusp22b (ENSCVAG00000006271) ripk1l (ENSCVAG00000006262) opn7a (ENSCVAG00000006245) Mummichog MODERN SPECIES 314 CACNA1E (ENSFHEG00000013252) ENSFHEG00000013281 rpe65a (ENSFHEG00000013334) SRSF11 (ENSFHEG00000013348) ENSFHEG00000013408 ZNF830 (ENSFHEG00000013414) ENSFHEG00000013420 ENSFHEG00000013434 ENSFHEG00000013500 prkacbb (ENSFHEG00000013527) exosc4 (ENSFHEG00000013533) GPAA1 (ENSFHEG00000013557) ENSFHEG00000013564 ENSFHEG00000014144 DHX30 (ENSFHEG00000014172) ENSFHEG00000014638 ##22 wrnip1 (ENSFHEG00000014687) MYLK4 (ENSFHEG00000014710) foxc1a (ENSFHEG00000014725) foxf2a (ENSFHEG00000014729) foxq1a (ENSFHEG00000014747) irf4a (ENSFHEG00000014786) dusp22b (ENSFHEG00000014798) ripk1l (ENSFHEG00000014819) opn7a (ENSFHEG00000014883) ENSFHEG00000014906 MEP1B (ENSFHEG00000015055) PHLPP1 (ENSFHEG00000015164) ENSFHEG00000015196 ENSFHEG00000015206 SIRT5 (ENSFHEG00000015217) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b Platyfish MODERN SPECIES 20 CACNA1E (ENSXMAG00000019132) RNF11 (ENSXMAG00000029976) rpe65a (ENSXMAG00000019141) SRSF11 (ENSXMAG00000019180) ENSXMAG00000019195 ZNF830 (ENSXMAG00000020352) ENSXMAG00000028770 ENSXMAG00000025254 ENSXMAG00000019206 prkacbb (ENSXMAG00000016258) exosc4 (ENSXMAG00000016287) GPAA1 (ENSXMAG00000024682) ENSXMAG00000022076 ENSXMAG00000016315 DHX30 (ENSXMAG00000016336) ENSXMAG00000016359 ##22 wrnip1 (ENSXMAG00000016362) MYLK4 (ENSXMAG00000016372) foxc1a (ENSXMAG00000024377) foxf2a (ENSXMAG00000017028) foxq1a (ENSXMAG00000021726) irf4a (ENSXMAG00000017015) dusp22b (ENSXMAG00000023204) ripk1l (ENSXMAG00000016997) opn7a (ENSXMAG00000016993) MEP1B (ENSXMAG00000016976) PHLPP1 (ENSXMAG00000016960) PHACTR1 (ENSXMAG00000016948) SIRT5 (ENSXMAG00000016935) adcy1b (ENSXMAG00000016898) igfbp1b (ENSXMAG00000016888) Poecilia ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000177054 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b Guppy MODERN SPECIES 447 rpe65a (ENSPREG00000008958) RNF11 (ENSPREG00000009001) RPE65 (ENSPREG00000009027) SRSF11 (ENSPREG00000009065) ENSPREG00000009091 ZNF830 (ENSPREG00000009117) ENSPREG00000009122 ENSPREG00000009210 ENSPREG00000009620 prkacbb (ENSPREG00000009625) exosc4 (ENSPREG00000009632) GPAA1 (ENSPREG00000009648) ENSPREG00000009702 ENSPREG00000009730 DHX30 (ENSPREG00000010021) ENSPREG00000010050 ##22 wrnip1 (ENSPREG00000010059) ENSPREG00000010073 foxc1a (ENSPREG00000010086) foxf2a (ENSPREG00000010093) foxq1a (ENSPREG00000010102) irf4a (ENSPREG00000010114) acss2l (ENSPREG00000010140) ndufv2 (ENSPREG00000010179) ENSPREG00000010202 twsg1a (ENSPREG00000010229) ralbp1 (ENSPREG00000010252) RAB31 (ENSPREG00000010269) vapal (ENSPREG00000010275) ENSPREG00000010283 APCDD1 (ENSPREG00000010291) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000153897.a ENSGT00940000166855 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A ENSGT00940000157394.b Fugu MODERN SPECIES 14 dtna (ENSTRUG00000007855) ENSTRUG00000023325 KLHL14 (ENSTRUG00000008361) CACNA1E (ENSTRUG00000008613) RNF11 (ENSTRUG00000023432) rpe65a (ENSTRUG00000009002) ENSTRUG00000009572 ENSTRUG00000022117 ENSTRUG00000009316 ENSTRUG00000009997 ENSTRUG00000010596 exosc4 (ENSTRUG00000025054) GPAA1 (ENSTRUG00000010940) ENSTRUG00000011046 ENSTRUG00000031365 ENSTRUG00000019992 ##22 wrnip1 (ENSTRUG00000011447) MYLK4 (ENSTRUG00000011481) foxc1a (ENSTRUG00000020037) foxf2a (ENSTRUG00000011537) foxq1a (ENSTRUG00000019504) irf4a (ENSTRUG00000021189) dusp22b (ENSTRUG00000024159) ripk1l (ENSTRUG00000011793) opn7a (ENSTRUG00000011946) MEP1B (ENSTRUG00000011996) PHLPP1 (ENSTRUG00000012154) ENSTRUG00000024462 PHACTR1 (ENSTRUG00000012375) SIRT5 (ENSTRUG00000012455) adcy1b (ENSTRUG00000012530) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Ballan wrasse MODERN SPECIES 4 nr4a1 (ENSLBEG00000016018) #14 tamalin (ENSLBEG00000016065) #15 dgkaa (ENSLBEG00000016113) rnf41 (ENSLBEG00000016172) ankrd52a (ENSLBEG00000016223) COQ10A (ENSLBEG00000016301) cs (ENSLBEG00000016331) ENSLBEG00000016374 racgap1 (ENSLBEG00000016422) ENSLBEG00000016489 bin2a (ENSLBEG00000016519) #23 GPAA1 (ENSLBEG00000016565) ENSLBEG00000016624 ENSLBEG00000016663 DHX30 (ENSLBEG00000016705) ENSLBEG00000016759 ##22 wrnip1 (ENSLBEG00000016807) MYLK4 (ENSLBEG00000016865) foxc1a (ENSLBEG00000016914) foxf2a (ENSLBEG00000016938) foxq1a (ENSLBEG00000016957) irf4a (ENSLBEG00000016976) dusp22b (ENSLBEG00000016986) ripk1l (ENSLBEG00000017019) opn7a (ENSLBEG00000017091) MEP1B (ENSLBEG00000017151) PHLPP1 (ENSLBEG00000017227) PHACTR1 (ENSLBEG00000017318) ENSLBEG00000017362 ENSLBEG00000017385 ENSLBEG00000017407 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A European seabass MODERN SPECIES KLHL14 (ENSDLAG00005025780) ENSDLAG00005025342 ENSDLAG00005025296 ENSDLAG00005025293 ENSDLAG00005025283 ENSDLAG00005027212 ENSDLAG00005030209 ENSDLAG00005025271 ENSDLAG00005022421 ENSDLAG00005022155 EXOSC4 (ENSDLAG00005022136) ENSDLAG00005022092 ENSDLAG00005022085 ENSDLAG00005022055 ENSDLAG00005022026 ENSDLAG00005022020 ##22 wrnip1 (ENSDLAG00005034913) MYLK4 (ENSDLAG00005022001) foxc1a (ENSDLAG00005021999) foxf2a (ENSDLAG00005021995) foxq1a (ENSDLAG00005021992) irf4a (ENSDLAG00005021983) dusp22b (ENSDLAG00005021976) ripk1l (ENSDLAG00005021971) ENSDLAG00005021964 ENSDLAG00005021947 ENSDLAG00005021592 ENSDLAG00005021571 ENSDLAG00005021514 ENSDLAG00005021506 ADCY1 (ENSDLAG00005021214) Large yellow croaker MODERN SPECIES 1 CACNA1E (ENSLCRG00005000586) RNF11 (ENSLCRG00005003646) rpe65a (ENSLCRG00005003653) SRSF11 (ENSLCRG00005003711) ENSLCRG00005003723 ZNF830 (ENSLCRG00005003911) EFCAB14 (ENSLCRG00005003913) ENSLCRG00005004003 ENSLCRG00005014852 ENSLCRG00005014860 exosc4 (ENSLCRG00005015936) GPAA1 (ENSLCRG00005015938) ENSLCRG00005015939 ENSLCRG00005015943 DHX30 (ENSLCRG00005015964) ENSLCRG00005015965 ##22 wrnip1 (ENSLCRG00005015966) MYLK4 (ENSLCRG00005015968) foxc1a (ENSLCRG00005015969) foxf2a (ENSLCRG00005015970) foxq1a (ENSLCRG00005015972) irf4a (ENSLCRG00005015973) dusp22b (ENSLCRG00005015974) ripk1l (ENSLCRG00005015975) opn7a (ENSLCRG00005015977) MEP1B (ENSLCRG00005015978) PHLPP1 (ENSLCRG00005015982) PHACTR1 (ENSLCRG00005016360) ENSLCRG00005016401 SIRT5 (ENSLCRG00005016402) adcy1b (ENSLCRG00005016410) Gilthead seabream MODERN SPECIES 13 KLHL14 (ENSSAUG00010007453) CACNA1E (ENSSAUG00010007497) RNF11 (ENSSAUG00010012109) rpe65a (ENSSAUG00010012127) SRSF11 (ENSSAUG00010012277) ENSSAUG00010012280 ZNF830 (ENSSAUG00010012313) EFCAB14 (ENSSAUG00010012315) ENSSAUG00010012472 ENSSAUG00010022390 exosc4 (ENSSAUG00010022985) GPAA1 (ENSSAUG00010022987) ENSSAUG00010023003 ENSSAUG00010023017 DHX30 (ENSSAUG00010023334) ENSSAUG00010023342 ##22 wrnip1 (ENSSAUG00010023344) MYLK4 (ENSSAUG00010023347) foxc1a (ENSSAUG00010023353) foxf2a (ENSSAUG00010023354) foxq1a (ENSSAUG00010023355) irf4a (ENSSAUG00010023357) dusp22b (ENSSAUG00010023358) ripk1l (ENSSAUG00010023359) opn7a (ENSSAUG00010023361) MEP1B (ENSSAUG00010023365) PHLPP1 (ENSSAUG00010023394) ENSSAUG00010023396 ENSSAUG00010023408 ENSSAUG00010023409 SIRT5 (ENSSAUG00010023410) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00950000182933.C.i ENSGT00950000182966.C.b.a ENSGT00390000000337 ENSGT00390000006103 ENSGT00940000158452 ENSGT01050000244890.a.a.b ENSGT00940000166346 ENSGT00940000177382 ENSGT01010000229112 ENSGT01030000234599.a.b.d.b.a.a ENSGT01030000234599.a.b.d.a.b.b ENSGT01060000249354 ENSGT00940000156907.p.b.b.a.b ENSGT00940000159218.a Stickleback MODERN SPECIES 2 KLHL14 (ENSGACG00000017904) CACNA1E (ENSGACG00000017893) RNF11 (ENSGACG00000017888) rpe65a (ENSGACG00000017857) ENSGACG00000017855 ENSGACG00000017854 ZNF830 (ENSGACG00000017853) EFCAB14 (ENSGACG00000017852) ENSGACG00000017847 prkacbb (ENSGACG00000017842) exosc4 (ENSGACG00000017838) GPAA1 (ENSGACG00000017835) ENSGACG00000017834 ENSGACG00000017831 DHX30 (ENSGACG00000017828) ENSGACG00000017827 ##22 wrnip1 (ENSGACG00000017821) MYADM (ENSGACG00000017818) ENSGACG00000017816 ENSGACG00000017812 sdr39u1 (ENSGACG00000017811) ENSGACG00000017799 parp2 (ENSGACG00000017794) zgc:66427 (ENSGACG00000017792) ENSGACG00000017787 ENSGACG00000017784 ENSGACG00000017781 apol1 (ENSGACG00000017779) ENSGACG00000017778 ENSGACG00000017777 hnrnpc (ENSGACG00000017772) Lumpfish MODERN SPECIES 8 CACNA1E (ENSCLMG00005022738) RNF11 (ENSCLMG00005022737) rpe65a (ENSCLMG00005022736) ENSCLMG00005022734 ENSCLMG00005022713 ZNF830 (ENSCLMG00005022710) EFCAB14 (ENSCLMG00005022709) ENSCLMG00005022708 ENSCLMG00005022703 ENSCLMG00005022532 exosc4 (ENSCLMG00005022527) GPAA1 (ENSCLMG00005022526) ENSCLMG00005022525 ENSCLMG00005022524 DHX30 (ENSCLMG00005022523) ENSCLMG00005022498 ##22 wrnip1 (ENSCLMG00005022495) BEST4 (ENSCLMG00005022494) MYADM (ENSCLMG00005022493) ltb4r2b (ENSCLMG00005022492) sdr39u1 (ENSCLMG00005022491) ENSCLMG00005022488 parp2 (ENSCLMG00005022472) ENSCLMG00005022469 ENSCLMG00005022468 zgc:66427 (ENSCLMG00005022467) ENSCLMG00005022466 ENSCLMG00005022464 ENSCLMG00005022463 stard3nl (ENSCLMG00005022461) ENSCLMG00005022459 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Channel bull blenny MODERN SPECIES 8 CACNA1E (ENSCGOG00000008658) RNF11 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ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Carangaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000177054 ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 69 CACNA1E (ENSLCAG00010006026) RNF11 (ENSLCAG00010008706) rpe65a (ENSLCAG00010008728) SRSF11 (ENSLCAG00010008776) ENSLCAG00010008791 ZNF830 (ENSLCAG00010008839) ENSLCAG00010008843 ENSLCAG00010008911 ENSLCAG00010009124 exosc4 (ENSLCAG00010009355) GPAA1 (ENSLCAG00010009363) ENSLCAG00010009378 ENSLCAG00010009383 DHX30 (ENSLCAG00010009394) ENSLCAG00010009406 ##22 ENSLCAG00010009408 ##22 wrnip1 (ENSLCAG00010009449) MYLK4 (ENSLCAG00010009598) foxc1a (ENSLCAG00010009603) foxf2a (ENSLCAG00010009606) foxq1a (ENSLCAG00010009610) irf4a (ENSLCAG00010009618) dusp22b (ENSLCAG00010009634) ripk1l (ENSLCAG00010009640) opn7a (ENSLCAG00010009644) MEP1B (ENSLCAG00010009658) PHLPP1 (ENSLCAG00010009705) PHACTR1 (ENSLCAG00010009788) ENSLCAG00010009797 ENSLCAG00010009802 adcy1b (ENSLCAG00010009831) Barramundi perch MODERN SPECIES 69 KLHL14 (ENSLCAG00010005557) CACNA1E (ENSLCAG00010006026) RNF11 (ENSLCAG00010008706) rpe65a (ENSLCAG00010008728) SRSF11 (ENSLCAG00010008776) ENSLCAG00010008791 ZNF830 (ENSLCAG00010008839) ENSLCAG00010008843 ENSLCAG00010008911 ENSLCAG00010009124 exosc4 (ENSLCAG00010009355) GPAA1 (ENSLCAG00010009363) ENSLCAG00010009378 ENSLCAG00010009383 DHX30 (ENSLCAG00010009394) ENSLCAG00010009406 ##22 ENSLCAG00010009408 ##22 wrnip1 (ENSLCAG00010009449) MYLK4 (ENSLCAG00010009598) foxc1a (ENSLCAG00010009603) foxf2a (ENSLCAG00010009606) foxq1a (ENSLCAG00010009610) irf4a (ENSLCAG00010009618) dusp22b (ENSLCAG00010009634) ripk1l (ENSLCAG00010009640) opn7a (ENSLCAG00010009644) MEP1B (ENSLCAG00010009658) PHLPP1 (ENSLCAG00010009705) PHACTR1 (ENSLCAG00010009788) ENSLCAG00010009797 ENSLCAG00010009802 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 ENSGT00940000157153.w ENSGT00940000159347 ENSGT01100000263524.B.b.b ENSGT00950000183111.b.a.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00940000155842.t ENSGT01100000263533.b.a.a.b ENSGT00940000156080.k ENSGT00940000154872.A Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2928 ENSSLDG00000007973 exosc4 (ENSSLDG00000008003) GPAA1 (ENSSLDG00000008023) ENSSLDG00000008096 DHX30 (ENSSLDG00000008176) ENSSLDG00000008284 ##22 wrnip1 (ENSSLDG00000008321) MYLK4 (ENSSLDG00000008332) Greater amberjack MODERN SPECIES 99 KLHL14 (ENSSDUG00000018412) CACNA1E (ENSSDUG00000018484) RNF11 (ENSSDUG00000018698) rpe65a (ENSSDUG00000018708) ENSSDUG00000018738 ENSSDUG00000018770 ENSSDUG00000018838 ZNF830 (ENSSDUG00000018857) ADGRL2 (ENSSDUG00000018871) ENSSDUG00000018921 exosc4 (ENSSDUG00000018966) GPAA1 (ENSSDUG00000018978) ENSSDUG00000019039 ENSSDUG00000019068 DHX30 (ENSSDUG00000019188) ENSSDUG00000019289 ##22 wrnip1 (ENSSDUG00000019990) MYLK4 (ENSSDUG00000020006) foxc1a (ENSSDUG00000020024) foxf2a (ENSSDUG00000020028) foxq1a (ENSSDUG00000020033) irf4a (ENSSDUG00000020038) dusp22b (ENSSDUG00000020054) ripk1l (ENSSDUG00000020067) opn7a (ENSSDUG00000020100) MEP1B (ENSSDUG00000020161) PHLPP1 (ENSSDUG00000020186) PHACTR1 (ENSSDUG00000020251) ENSSDUG00000020274 SIRT5 (ENSSDUG00000020289) adcy1b (ENSSDUG00000020308) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 Tongue sole MODERN SPECIES 12 ENSCSEG00000009110 oxsr1a (ENSCSEG00000009121) plcd1b (ENSCSEG00000009190) ctdsplb (ENSCSEG00000009394) hhatla (ENSCSEG00000009423) klhl40a (ENSCSEG00000009445) ENSCSEG00000009460 ENSCSEG00000009479 ENSCSEG00000009480 eif2b5 (ENSCSEG00000009494) casq1a (ENSCSEG00000009578) ENSCSEG00000009607 ENSCSEG00000009626 DHX30 (ENSCSEG00000009744) wrnip1 (ENSCSEG00000009773) ENSCSEG00000009757 ##22 MYLK4 (ENSCSEG00000009791) foxc1a (ENSCSEG00000009864) foxf2a (ENSCSEG00000009870) foxq1a (ENSCSEG00000009875) irf4a (ENSCSEG00000009886) dusp22b (ENSCSEG00000009896) ripk1l (ENSCSEG00000009905) opn7a (ENSCSEG00000009941) MEP1B (ENSCSEG00000009958) PHLPP1 (ENSCSEG00000010072) ENSCSEG00000010090 PHACTR1 (ENSCSEG00000010111) SIRT5 (ENSCSEG00000010122) adcy1b (ENSCSEG00000010136) IGFBP1 (ENSCSEG00000010195) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000177054 ENSGT00940000156348.B ENSGT00940000168875 ENSGT00940000153348.B ENSGT00390000013685 ENSGT00940000164582.b ENSGT00940000155265.b.a ENSGT00940000158279 ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.b ##22 ENSGT00390000008538 ENSGT00940000156211.a.b ENSGT00940000162303.a.b ENSGT00940000163866.a.a ENSGT00940000162937.a.b ENSGT00940000159059 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ENSATEG00000029818 ENSATEG00000007488 ENSATEG00000007534 ENSATEG00000007553 ENSATEG00000007595 ENSATEG00000007581 ENSATEG00000030121 ENSATEG00000007607 ENSATEG00000007721 EXOSC4 (ENSATEG00000007766) ENSATEG00000007796 ENSATEG00000007832 ENSATEG00000007947 ENSATEG00000008254 ENSATEG00000008280 ##22 wrnip1 (ENSATEG00000008306) MYLK4 (ENSATEG00000008322) foxc1a (ENSATEG00000008335) foxf2a (ENSATEG00000008353) foxq1a (ENSATEG00000008360) irf4a (ENSATEG00000008375) dusp22b (ENSATEG00000008418) ripk1l (ENSATEG00000008438) ENSATEG00000008461 ENSATEG00000008553 ENSATEG00000008694 ENSATEG00000008715 ENSATEG00000008773 adcy1b (ENSATEG00000008822) igfbp1b (ENSATEG00000008951) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 8 CACNA1E (ENSBSLG00000017267) RNF11 (ENSBSLG00000015989) rpe65a (ENSBSLG00000015961) ENSBSLG00000015945 ENSBSLG00000015890 ZNF830 (ENSBSLG00000015885) ENSBSLG00000015881 ENSBSLG00000015874 ENSBSLG00000008271 ENSBSLG00000007180 exosc4 (ENSBSLG00000007147) GPAA1 (ENSBSLG00000007113) 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ENSGMOG00000025773 ENSGMOG00000023123 ENSGMOG00000033774 amotl2b (ENSGMOG00000009481) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000165797 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000163807 ENSGT00940000172200 ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00390000005717.t ENSGT00940000164897.a.a ENSGT00410000025556.a.b Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 222 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000165797 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00940000173933 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000163807 ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 275 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT01100000263547.a.b.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000153467.a.a ENSGT00390000010101 ENSGT00950000183204.b.b.a ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.q ENSGT00940000157064.a.b.a ENSGT00390000004674.j ENSGT00390000004674.i.b ENSGT00940000157607 ENSGT00550000075121 ENSGT01050000244939.a.a.b.a.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00390000006172 ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.b.e.a ENSGT00940000166038 ENSGT00940000154667.b.a ENSGT00940000159858 ENSGT00940000154044.a.a.q.a ENSGT01090000260052.a.b.j.c ENSGT00940000155482 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ENSGT00940000155482 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000165797 ENSGT00940000158077.r ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00940000173933 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000163807 ENSGT00940000154164.d.h ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d Atlantic herring MODERN SPECIES 1 fbn2b (ENSCHAG00000016353) CTXN1 (ENSCHAG00000019520) timm44 (ENSCHAG00000020190) hnrnpm (ENSCHAG00000019546) ENSCHAG00000020582 marchf2 (ENSCHAG00000020646) ENSCHAG00000020666 ENSCHAG00000020682 zgc:194221 (ENSCHAG00000020720) C1QTNF7 (ENSCHAG00000020734) CC2D2A (ENSCHAG00000020750) fbxl5 (ENSCHAG00000021161) CPEB2 (ENSCHAG00000021191) ndnf (ENSCHAG00000021283) prdm5 (ENSCHAG00000021298) CELA3A (ENSCHAG00000021369) ##22 slc34a2b (ENSCHAG00000021385) ENSCHAG00000021903 psmb11b (ENSCHAG00000021913) ENSCHAG00000021946 ENSCHAG00000021973 mdp1 (ENSCHAG00000021989) ACE2 (ENSCHAG00000022039) ENSCHAG00000023519 cltrn (ENSCHAG00000023525) ENSCHAG00000023535 NHS (ENSCHAG00000023553) zgc:113423 (ENSCHAG00000023600) RAI2 (ENSCHAG00000023611) ENSCHAG00000023612 CDKL5 (ENSCHAG00000023634) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000165797 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00940000173933 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00390000005717.t ENSGT00940000164897.a.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000165797 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000165797 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a 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ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000174825 ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 1050 ENSAOCG00000022821 ENSAOCG00000022807 ##22 slc34a2b (ENSAOCG00000002109) ENSAOCG00000022749 psmb11b (ENSAOCG00000022715) CDH24 (ENSAOCG00000022705) cltrn (ENSAOCG00000022679) ENSAOCG00000022662 NHS (ENSAOCG00000022649) Orange clownfish MODERN SPECIES 11 ENSAPEG00000015838 zar1 (ENSAPEG00000015876) SLC10A4 (ENSAPEG00000015883) slain2 (ENSAPEG00000015904) anapc4 (ENSAPEG00000015942) PALLD (ENSAPEG00000016082) cbr4 (ENSAPEG00000016348) sh3rf1 (ENSAPEG00000016378) ENSAPEG00000016430 fbxl5 (ENSAPEG00000016481) CC2D2A (ENSAPEG00000016528) C1QTNF7 (ENSAPEG00000016743) CPEB2 (ENSAPEG00000016778) ndnf (ENSAPEG00000016834) prdm5 (ENSAPEG00000016846) ENSAPEG00000016896 ##22 slc34a2b (ENSAPEG00000016919) ENSAPEG00000016936 ENSAPEG00000016965 psmb11b (ENSAPEG00000017005) CDH24 (ENSAPEG00000017020) cltrn (ENSAPEG00000017037) ENSAPEG00000017060 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ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00940000160136.o.c.b.a ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b ENSGT00390000005717.t Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00940000160136.o.c.b.a ENSGT00390000006172 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ENSHBUG00000007130 ENSHBUG00000007138 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00940000160136.o.c.b.a ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b ENSGT00390000005717.t Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000158460 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Lyretail cichlid MODERN SPECIES 307 fryl (ENSNBRG00000004127) zar1 (ENSNBRG00000004254) SLC10A4 (ENSNBRG00000004325) slain2 (ENSNBRG00000004362) anapc4 (ENSNBRG00000004410) PALLD (ENSNBRG00000004482) cbr4 (ENSNBRG00000004516) sh3rf1 (ENSNBRG00000004551) ENSNBRG00000004599 fbxl5 (ENSNBRG00000004641) CC2D2A (ENSNBRG00000004707) C1QTNF7 (ENSNBRG00000004916) CPEB2 (ENSNBRG00000004949) ndnf (ENSNBRG00000004962) prdm5 (ENSNBRG00000004976) CELA3A (ENSNBRG00000005033) ##22 ENSNBRG00000005058 psmb11b (ENSNBRG00000005191) CDH24 (ENSNBRG00000005345) cltrn (ENSNBRG00000005573) ENSNBRG00000005583 NHS (ENSNBRG00000005609) RAI2 (ENSNBRG00000005712) SCML2 (ENSNBRG00000005723) CDKL5 (ENSNBRG00000005789) RS1 (ENSNBRG00000005841) ENSNBRG00000005854 syap1 (ENSNBRG00000005875) ENSNBRG00000005901 ENSNBRG00000005921 cldn33b (ENSNBRG00000005926) Nile tilapia MODERN SPECIES 14 fryl (ENSONIG00000003053) zar1 (ENSONIG00000003067) SLC10A4 (ENSONIG00000003068) slain2 (ENSONIG00000028891) anapc4 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ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00940000160136.o ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00990000204155 ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00940000173933.a ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00990000207634 ENSGT00400000024256 ENSGT00940000165071 ENSGT00940000160006 ENSGT00530000064649 ENSGT00940000159889.b.a ENSGT00940000160836.d.a.bb ENSGT00940000160836.d.a.cb ENSGT00940000160836.d.b.a.a ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 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ENSMAMG00000013409 ##22 ENSMAMG00000013376 ENSMAMG00000013326 ENSMAMG00000027441 ENSMAMG00000013145 cltrn (ENSMAMG00000013129) ENSMAMG00000013117 ENSMAMG00000013087 ENSMAMG00000013081 SCML2 (ENSMAMG00000013069) ENSMAMG00000013040 RS1 (ENSMAMG00000013031) ENSMAMG00000013016 ENSMAMG00000013001 SHROOM2 (ENSMAMG00000012981) ENSMAMG00000012977 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b ENSGT00390000005717.t Climbing perch MODERN SPECIES 17 zar1 (ENSATEG00000014450) SLC10A4 (ENSATEG00000014429) slain2 (ENSATEG00000014363) anapc4 (ENSATEG00000014342) PALLD (ENSATEG00000014297) cbr4 (ENSATEG00000014282) SH3RF1 (ENSATEG00000014208) NEK1 (ENSATEG00000014184) FBXL5 (ENSATEG00000014125) CC2D2A (ENSATEG00000013985) ENSATEG00000013967 C1QTNF7 (ENSATEG00000013953) CPEB2 (ENSATEG00000013906) ndnf (ENSATEG00000013882) prdm5 (ENSATEG00000013829) ENSATEG00000013807 ##22 ENSATEG00000013783 ENSATEG00000013717 ENSATEG00000013703 ENSATEG00000013580 cltrn (ENSATEG00000028011) ENSATEG00000013528 ENSATEG00000013510 ENSATEG00000013495 SCML2 (ENSATEG00000013420) ENSATEG00000013341 RS1 (ENSATEG00000013324) ENSATEG00000013292 ENSATEG00000013274 SHROOM2 (ENSATEG00000013251) ENSATEG00000013245 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 15 fryl (ENSBSLG00000002973) zar1 (ENSBSLG00000003261) SLC10A4 (ENSBSLG00000003264) slain2 (ENSBSLG00000003290) anapc4 (ENSBSLG00000003280) PALLD (ENSBSLG00000003301) cbr4 (ENSBSLG00000003321) sh3rf1 (ENSBSLG00000003324) NEK1 (ENSBSLG00000003333) fbxl5 (ENSBSLG00000003348) CC2D2A (ENSBSLG00000003358) CPEB2 (ENSBSLG00000003372) ENSBSLG00000003386 ndnf (ENSBSLG00000003389) prdm5 (ENSBSLG00000003396) ENSBSLG00000003400 ##22 slc34a2b (ENSBSLG00000003407) ENSBSLG00000003416 psmb11b (ENSBSLG00000003419) ENSBSLG00000003421 cltrn (ENSBSLG00000003423) ENSBSLG00000003424 ENSBSLG00000003427 ENSBSLG00000003428 NHS (ENSBSLG00000003430) RAI2 (ENSBSLG00000003432) SCML2 (ENSBSLG00000003433) CDKL5 (ENSBSLG00000003434) RS1 (ENSBSLG00000003435) ENSBSLG00000003436 syap1 (ENSBSLG00000003437) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00940000160136.o ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b ENSGT00390000005717.t Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00940000160136.o ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482.h ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b ENSGT00390000005717.t Tetraodon MODERN SPECIES fryl (ENSTNIG00000017666) zar1 (ENSTNIG00000017667) SLC10A4 (ENSTNIG00000017668) slain2 (ENSTNIG00000017669) anapc4 (ENSTNIG00000017670) PALLD (ENSTNIG00000017671) cbr4 (ENSTNIG00000017672) sh3rf1 (ENSTNIG00000017673) NEK1 (ENSTNIG00000017674) fbxl5 (ENSTNIG00000017675) CC2D2A (ENSTNIG00000017676) C1QTNF7 (ENSTNIG00000017677) CPEB2 (ENSTNIG00000017678) ndnf (ENSTNIG00000005902) prdm5 (ENSTNIG00000005901) CELA3B (ENSTNIG00000014238) ##22 slc34a2b (ENSTNIG00000006996) psmb11b (ENSTNIG00000006995) CDH24 (ENSTNIG00000006994) cltrn (ENSTNIG00000006993) ENSTNIG00000005471 NHS (ENSTNIG00000006370) RAI2 (ENSTNIG00000001537) SCML2 (ENSTNIG00000006371) CDKL5 (ENSTNIG00000006372) RS1 (ENSTNIG00000006373) AP1S2 (ENSTNIG00000006374) ENSTNIG00000006375 ENSTNIG00000006376 ENSTNIG00000001718 cldn33b (ENSTNIG00000006377) Fugu MODERN SPECIES 12 ociad2 (ENSTRUG00000022946) fryl (ENSTRUG00000024952) zar1 (ENSTRUG00000020011) SLC10A4 (ENSTRUG00000014657) anapc4 (ENSTRUG00000014626) PALLD (ENSTRUG00000014392) cbr4 (ENSTRUG00000014365) sh3rf1 (ENSTRUG00000014310) NEK1 (ENSTRUG00000014162) ENSTRUG00000031868 fbxl5 (ENSTRUG00000014096) C1QTNF7 (ENSTRUG00000014007) CPEB2 (ENSTRUG00000022887) ndnf (ENSTRUG00000013940) prdm5 (ENSTRUG00000013850) ENSTRUG00000013725 ##22 slc34a2b (ENSTRUG00000013587) psmb11b (ENSTRUG00000013369) ENSTRUG00000013437 CDH24 (ENSTRUG00000013111) cltrn (ENSTRUG00000013073) ENSTRUG00000012882 NHS (ENSTRUG00000012853) RAI2 (ENSTRUG00000012845) ENSTRUG00000012660 CDKL5 (ENSTRUG00000012621) ENSTRUG00000022550 AP1S2 (ENSTRUG00000012509) syap1 (ENSTRUG00000012401) SHROOM2 (ENSTRUG00000012349) ENSTRUG00000012341 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b ENSGT00390000005717.t Ballan wrasse MODERN SPECIES 2 ENSLBEG00000021692 SLC10A4 (ENSLBEG00000021739) slain2 (ENSLBEG00000021848) anapc4 (ENSLBEG00000021911) PALLD (ENSLBEG00000022060) cbr4 (ENSLBEG00000022202) sh3rf1 (ENSLBEG00000022238) ENSLBEG00000022327 fbxl5 (ENSLBEG00000022374) CC2D2A (ENSLBEG00000022479) C1QTNF7 (ENSLBEG00000022658) CPEB2 (ENSLBEG00000022680) ndnf (ENSLBEG00000022713) prdm5 (ENSLBEG00000022736) ENSLBEG00000022797 ENSLBEG00000022951 ##22 slc34a2b (ENSLBEG00000022993) ENSLBEG00000023037 psmb11b (ENSLBEG00000023068) ENSLBEG00000023089 cltrn (ENSLBEG00000023134) ENSLBEG00000023230 NHS (ENSLBEG00000023274) RAI2 (ENSLBEG00000023298) SCML2 (ENSLBEG00000023322) CDKL5 (ENSLBEG00000023396) RS1 (ENSLBEG00000023512) ENSLBEG00000023544 syap1 (ENSLBEG00000023588) SHROOM2 (ENSLBEG00000023649) ENSLBEG00000023698 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b ENSGT00390000005717.t Perciformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b ENSGT00390000005717.t ENSGT00940000164897.a.a Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b 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CPEB2 (ENSSLUG00000025072) ndnf (ENSSLUG00000025090) prdm5 (ENSSLUG00000025092) ENSSLUG00000025096 ##22 slc34a2b (ENSSLUG00000025097) psmb11b (ENSSLUG00000025101) ENSSLUG00000025112 cltrn (ENSSLUG00000025117) ENSSLUG00000025120 NHS (ENSSLUG00000025123) RAI2 (ENSSLUG00000025126) SCML2 (ENSSLUG00000025129) CDKL5 (ENSSLUG00000025137) RS1 (ENSSLUG00000025152) ENSSLUG00000025154 syap1 (ENSSLUG00000025158) ENSSLUG00000025160 ENSSLUG00000025162 cldn33b (ENSSLUG00000025163) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 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(ENSSAUG00010015160) ENSSAUG00010015149 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00390000004612 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000157620 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000158460 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00390000007586.a.b ENSGT00940000158340 ENSGT01030000234528.B.b.b.cb ##22 ENSGT00950000183177.a.b.a ENSGT00940000167983 ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000159567.a.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158080 ENSGT00950000182963.b.a.c ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000159407.r ENSGT00940000157355.d ENSGT00940000161181.d ENSGT00970000193372.a.a.tc.b ENSGT00390000007662.d.a ENSGT00940000155212.ab.b ENSGT00390000005717.t European seabass MODERN SPECIES 17 fryl (ENSDLAG00005015397) SLC10A4 (ENSDLAG00005007479) slain2 (ENSDLAG00005027601) anapc4 (ENSDLAG00005007507) PALLD (ENSDLAG00005007614) cbr4 (ENSDLAG00005008237) SH3RF1 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ENSHCOG00000012437 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 18 fryl (ENSMMDG00005000565) zar1 (ENSMMDG00005008904) SLC10A4 (ENSMMDG00005008905) slain2 (ENSMMDG00005008913) anapc4 (ENSMMDG00005008935) PALLD (ENSMMDG00005009027) cbr4 (ENSMMDG00005009093) sh3rf1 (ENSMMDG00005009097) ENSMMDG00005009099 fbxl5 (ENSMMDG00005009104) CC2D2A (ENSMMDG00005009121) C1QTNF7 (ENSMMDG00005009143) CPEB2 (ENSMMDG00005009150) ndnf (ENSMMDG00005009257) prdm5 (ENSMMDG00005009261) ENSMMDG00005009266 ##22 slc34a2b (ENSMMDG00005009296) ENSMMDG00005009302 psmb11b (ENSMMDG00005009310) CDH24 (ENSMMDG00005009445) mdp1 (ENSMMDG00005009448) cltrn (ENSMMDG00005009449) ENSMMDG00005009451 NHS (ENSMMDG00005009452) RAI2 (ENSMMDG00005009456) ENSMMDG00005009460 CDKL5 (ENSMMDG00005009464) ENSMMDG00005009468 AP1S2 (ENSMMDG00005009480) syap1 (ENSMMDG00005009498) ENSMMDG00005009499 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b 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(ENSELUG00000005198) zar1 (ENSELUG00000005238) SLC10A4 (ENSELUG00000005255) anapc4 (ENSELUG00000005347) PALLD (ENSELUG00000005476) cbr4 (ENSELUG00000005521) sh3rf1 (ENSELUG00000005555) NEK1 (ENSELUG00000005595) fbxl5 (ENSELUG00000005622) CC2D2A (ENSELUG00000000172) C1QTNF7 (ENSELUG00000005765) CPEB2 (ENSELUG00000005824) ndnf (ENSELUG00000005857) ENSELUG00000029930 prdm5 (ENSELUG00000005894) ENSELUG00000005923 ##22 slc34a2b (ENSELUG00000005959) ENSELUG00000005999 psmb11b (ENSELUG00000006016) psmb5 (ENSELUG00000006034) ENSELUG00000006102 mdp1 (ENSELUG00000006118) cltrn (ENSELUG00000006140) ENSELUG00000006167 dhcr24 (ENSELUG00000006209) ENSELUG00000025021 ENSELUG00000006273 bloc1s2 (ENSELUG00000006326) PLPP3 (ENSELUG00000006387) PRKAA2 (ENSELUG00000006423) dab1a (ENSELUG00000006600) Reedfish MODERN SPECIES 14 ENSECRG00000001209 BPHL (ENSECRG00000001177) ENSECRG00000001147 ripk1l (ENSECRG00000001089) dusp22b (ENSECRG00000001028) irf4a (ENSECRG00000000981) exoc2 (ENSECRG00000000920) ENSECRG00000000804 foxq1a (ENSECRG00000003809) ENSECRG00000003807 foxc1a (ENSECRG00000003801) gmds (ENSECRG00000003792) MYLK4 (ENSECRG00000003781) wrnip1 (ENSECRG00000003772) serpinb1 (ENSECRG00000003764) ENSECRG00000003755 ##22 amph (ENSECRG00000003738) ##23 vps41 (ENSECRG00000003103) ENSECRG00000002974 ENSECRG00000002960 ENSECRG00000002949 ralab (ENSECRG00000002936) ENSECRG00000002922 mplkip (ENSECRG00000002911) sugct (ENSECRG00000002898) inhbab (ENSECRG00000002889) ENSECRG00000002880 gli3 (ENSECRG00000002867) ENSECRG00000002857 adcy1b (ENSECRG00000002837) igfbp1a (ENSECRG00000002826) Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 498 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 444 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000153675.a.a.b ENSGT00740000117154 ENSGT00940000156275 ENSGT00950000182858.C ENSGT00940000165031 ENSGT00950000182696.B.b ENSGT00940000164021.A ENSGT00500000044947 ENSGT00950000182834.C ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000160362 ENSGT00940000159410 ENSGT00390000002770 ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00390000009368 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000153341 Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602 ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000153341 ENSGT00940000172767 ENSGT00940000154721 ENSGT00390000009368 ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000154171.A ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00390000009278.a ENSGT00940000154570.a.a ENSGT00940000159410 ENSGT00940000160362 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182834.C ENSGT00500000044947 ENSGT00940000164021.A ENSGT00950000182696.B.b.a ENSGT00940000165031.a ENSGT00950000182858.C Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 393 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00410000025596.a.a ENSGT00950000182970.A.b ENSGT00940000155167.a ENSGT00390000000732 ENSGT00940000159329 ENSGT00940000160093.b ENSGT00940000159925 ENSGT00390000006349 ENSGT00940000153544.a.i.b ENSGT00950000183117.a.b.a ENSGT01030000234578.B.b.a ENSGT00950000182931.A.a.b ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000154171.A ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT00940000153216.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000160362 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00940000154955.b ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000156024.i.a ENSGT00940000159166 ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00940000158400 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00390000006665.b.g ENSGT00940000160431 ENSGT00390000016889 ENSGT00940000157076.j.c ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000165619.b ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000158400 ENSGT00940000164736 ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000154171.A ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT00940000153216.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00940000154570.a.a ENSGT00940000159410 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ENSGT00940000163309.i ENSGT00390000012166.j.c ENSGT00940000165447.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 538 ENSSGRG00000026732 ENSSGRG00000026733 CEP104 (ENSSGRG00000026735) ENSSGRG00000026736 b3gnt7l (ENSSGRG00000026737) ENSSGRG00000026738 dffb (ENSSGRG00000026739) ENSSGRG00000026740 ENSSGRG00000026742 ENSSGRG00000026746 ENSSGRG00000026748 ENSSGRG00000026751 ENSSGRG00000026752 fhad1 (ENSSGRG00000026753) ela2 (ENSSGRG00000026754) ##22 ela2l (ENSSGRG00000026771) ##22 itpr3 (ENSSGRG00000026838) Common carp reference MODERN SPECIES 23 ENSCCRG00000066418 ENSCCRG00000016305 zgc:153759 (ENSCCRG00000013364) ENSCCRG00000076037 ENSCCRG00000066084 ENSCCRG00000004391 ENSCCRG00000040612 lrrc47 (ENSCCRG00000055501) ENSCCRG00000017274 si:ch211-147a11.3 (ENSCCRG00000038413) dffb (ENSCCRG00000071149) NPHP4 (ENSCCRG00000078735) AJAP1 (ENSCCRG00000002467) ENSCCRG00000054101 ela2 (ENSCCRG00000057313) ##22 ela2l (ENSCCRG00000073943) ##22 alas2 (ENSCCRG00000057252) itpr3 (ENSCCRG00000081887) 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Goldfish MODERN SPECIES 1111 ENSCARG00000059456 ENSCARG00000059469 ENSCARG00000059487 ela2l (ENSCARG00000059510) ##22 alas2 (ENSCARG00000059592) itpr3 (ENSCARG00000059689) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00950000183126.a.p.a.a.c.b.b.a ENSGT00950000183126.a.p.a.a.d.a.b ENSGT00950000183126.a.p.a.b.c ENSGT00940000153395.b.q.a.b.a ENSGT01030000235198.a ENSGT00530000063489.b.c ENSGT00390000013405.h ENSGT00940000165603.e ENSGT00390000016496.e ENSGT00390000016496.f ENSGT00390000014490.n ENSGT00510000048827.r.a ENSGT00510000048586.b ENSGT00390000014794.a ENSGT00950000183462 ENSGT01030000234528.B.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000159912.o ENSGT00940000157078.e ENSGT01100000263518.B.b.a.a.e ENSGT00940000165925.d.b ENSGT00940000155224.c.b.d ENSGT00390000010463.a.a.a.b.c ENSGT00940000159780.d ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f.e ENSGT01060000248556.B.h ENSGT00390000003156.b.k.b ENSGT01020000230412.A.c.b.c.a.h ENSGT00390000002659.c ENSGT00940000163309.j ENSGT00390000012166.i ENSGT00390000012166.j.d Common carp reference MODERN SPECIES 17 ENSCCRG00000054500 ENSCCRG00000017282 mad2l2 (ENSCCRG00000017280) lrrc47 (ENSCCRG00000017277) ENSCCRG00000068492 b3gnt7l (ENSCCRG00000017263) si:ch211-147a11.3 (ENSCCRG00000071747) ENSCCRG00000062728 ENSCCRG00000060850 ENSCCRG00000055673 ENSCCRG00000074229 ENSCCRG00000004279 ENSCCRG00000078314 ENSCCRG00000010509 fhad1 (ENSCCRG00000031431) ela2l (ENSCCRG00000031426) ##22 alas2 (ENSCCRG00000062931) itpr3 (ENSCCRG00000031308) ENSCCRG00000067373 cry3a (ENSCCRG00000031205) col2a1a (ENSCCRG00000076714) spryd4 (ENSCCRG00000058497) porcn (ENSCCRG00000010908) ENSCCRG00000004977 uck2a (ENSCCRG00000005099) tmco1 (ENSCCRG00000075574) ALDH9A1 (ENSCCRG00000057246) ENSCCRG00000068633 ENSCCRG00000069643 haus5 (ENSCCRG00000062060) fzr1a (ENSCCRG00000010959) Golden-line barbel MODERN SPECIES 15 ENSSGRG00000027570 ENSSGRG00000027568 ENSSGRG00000027567 ENSSGRG00000027566 ENSSGRG00000027565 mad2l2 (ENSSGRG00000027553) lrrc47 (ENSSGRG00000027548) b3gnt7l 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ENSAPOG00000016891 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 294 ENSSPAG00000012277 ela2 (ENSSPAG00000012234) ##22 ela2 (ENSSPAG00000012217) ##22 ela2l (ENSSPAG00000012201) ##22 ENSSPAG00000011364 ##22 tmem51a (ENSSPAG00000011254) kazna (ENSSPAG00000011203) ENSSPAG00000011185 ENSSPAG00000011170 foxj3 (ENSSPAG00000011143) rimkla (ENSSPAG00000011123) ENSSPAG00000011100 emp3b (ENSSPAG00000011086) ENSSPAG00000010786 znf362b (ENSSPAG00000010708) ENSSPAG00000010669 ENSSPAG00000010650 alas2 (ENSSPAG00000010615) ENSSPAG00000010521 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00980000199193 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000012265 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00980000199193 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000012265 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000160408 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136.o ENSGT00940000156136.p ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00940000164692 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00940000153216.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764.h Tetraodon MODERN SPECIES 24 espn (ENSTNIG00000011987) HES2 (ENSTNIG00000011986) HES2 (ENSTNIG00000011985) acot7 (ENSTNIG00000011984) GPR153 (ENSTNIG00000011983) ENSTNIG00000011982 ENSTNIG00000011981 rer1 (ENSTNIG00000011980) ENSTNIG00000011979 rer1 (ENSTNIG00000001745) tp73 (ENSTNIG00000011978) wrap73 (ENSTNIG00000011977) TPRG1L (ENSTNIG00000011976) ENSTNIG00000011975 ela2 (ENSTNIG00000011974) ##22 ela2l (ENSTNIG00000011973) ##22 ENSTNIG00000011972 ##22 prkar2aa (ENSTNIG00000011971) kazna (ENSTNIG00000011970) ENSTNIG00000018676 ENSTNIG00000007159 rimkla (ENSTNIG00000007158) emp3b (ENSTNIG00000007157) znf362b (ENSTNIG00000019373) ENSTNIG00000005680 alas2 (ENSTNIG00000005681) ENSTNIG00000004424 SLC7A5 (ENSTNIG00000005682) TOX2 (ENSTNIG00000005683) PIGT (ENSTNIG00000006540) phactr3a (ENSTNIG00000006539) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00980000199193 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000012265 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A Ballan wrasse MODERN SPECIES 249 acot7 (ENSLBEG00000019162) GPR153 (ENSLBEG00000019195) her3 (ENSLBEG00000019224) ENSLBEG00000019250 ENSLBEG00000019418 ENSLBEG00000019684 rer1 (ENSLBEG00000019828) tp73 (ENSLBEG00000019867) wrap73 (ENSLBEG00000019932) TPRG1L (ENSLBEG00000020010) ENSLBEG00000020046 ENSLBEG00000020072 ela2 (ENSLBEG00000020141) ##22 ela2l (ENSLBEG00000020185) ##22 ENSLBEG00000020225 ##22 ENSLBEG00000020416 kazna (ENSLBEG00000020477) ENSLBEG00000020578 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000160408 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000012265 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160408 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000012265 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764.h Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160408 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000012265 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000156275.e 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Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136.s.b ENSGT00940000156136.t ENSGT00940000156136.s.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00980000199193 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b 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croaker MODERN SPECIES 487 ENSLCRG00005019225 ENSLCRG00005019221 ENSLCRG00005019147 ENSLCRG00005019139 ENSLCRG00005019125 ENSLCRG00005019118 ENSLCRG00005019108 rer1 (ENSLCRG00005019104) tp73 (ENSLCRG00005018899) wrap73 (ENSLCRG00005018883) TPRG1L (ENSLCRG00005018880) ENSLCRG00005018879 ENSLCRG00005018877 ENSLCRG00005018843 ela2 (ENSLCRG00005018840) ##22 ela2l (ENSLCRG00005018839) ##22 ENSLCRG00005018838 ##22 tmem51a (ENSLCRG00005018837) kazna (ENSLCRG00005018834) ENSLCRG00005018831 foxj3 (ENSLCRG00005018826) rimkla (ENSLCRG00005018822) zmynd12 (ENSLCRG00005018821) emp3b (ENSLCRG00005018818) ENSLCRG00005018807 znf362b (ENSLCRG00005018799) ENSLCRG00005018796 ENSLCRG00005018793 alas2 (ENSLCRG00005018731) NECAB3 (ENSLCRG00005018729) SLC7A5 (ENSLCRG00005018726) Gilthead seabream MODERN SPECIES 21 ENSSAUG00010000635 ENSSAUG00010000624 ENSSAUG00010000596 ENSSAUG00010000478 ENSSAUG00010000461 ENSSAUG00010000397 rer1 (ENSSAUG00010020028) tp73 (ENSSAUG00010020000) wrap73 (ENSSAUG00010019979) 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ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000160408 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b.p ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A Seriola ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136.i.b ENSGT00940000156136.i.a ENSGT00940000156136.j ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b.p ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A Greater amberjack MODERN SPECIES 23 HES2 (ENSSDUG00000001146) acot7 (ENSSDUG00000001166) GPR153 (ENSSDUG00000001188) her3 (ENSSDUG00000001207) ENSSDUG00000001220 ENSSDUG00000001339 ENSSDUG00000001501 rer1 (ENSSDUG00000001522) tp73 (ENSSDUG00000001543) wrap73 (ENSSDUG00000001574) TPRG1L (ENSSDUG00000001732) ENSSDUG00000001762 ENSSDUG00000001811 ENSSDUG00000001855 ela2 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(ENSSLDG00000024960) zmynd12 (ENSSLDG00000024967) emp3b (ENSSLDG00000024973) ENSSLDG00000024993 znf362b (ENSSLDG00000025057) ENSSLDG00000025067 ENSSLDG00000025074 alas2 (ENSSLDG00000025084) ENSSLDG00000025100 SLC7A5 (ENSSLDG00000025117) Barramundi perch MODERN SPECIES 128 HES2 (ENSLCAG00010027536) acot7 (ENSLCAG00010027535) GPR153 (ENSLCAG00010027533) ENSLCAG00010027532 ENSLCAG00010027526 ENSLCAG00010027519 ENSLCAG00010027516 ENSLCAG00010027510 rer1 (ENSLCAG00010027508) tp73 (ENSLCAG00010027505) wrap73 (ENSLCAG00010027496) TPRG1L (ENSLCAG00010027493) ENSLCAG00010027488 ENSLCAG00010027482 ela2 (ENSLCAG00010027478) ##22 ela2l (ENSLCAG00010027476) ##22 ENSLCAG00010027473 kazna (ENSLCAG00010027471) ENSLCAG00010027469 ENSLCAG00010027467 ENSLCAG00010027464 rimkla (ENSLCAG00010027463) zmynd12 (ENSLCAG00010027462) emp3b (ENSLCAG00010027459) znf362b (ENSLCAG00010027453) ENSLCAG00010027451 ENSLCAG00010027449 alas2 (ENSLCAG00010027445) ENSLCAG00010027440 SLC7A5 (ENSLCAG00010027434) TOX2 (ENSLCAG00010027431) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153341 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000160408 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00940000164692 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a.f ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764.h Turbot MODERN SPECIES 2 ENSSMAG00000026044 ENSSMAG00000029110 HES2 (ENSSMAG00000011300) acot7 (ENSSMAG00000025657) GPR153 (ENSSMAG00000011229) her3 (ENSSMAG00000027712) ENSSMAG00000011198 ENSSMAG00000015831 ENSSMAG00000015832 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ENSCSEG00000005190 foxj3 (ENSCSEG00000005183) rimkla (ENSCSEG00000005179) emp3b (ENSCSEG00000005176) ENSCSEG00000005166 znf362b (ENSCSEG00000005161) ENSCSEG00000005150 alas2 (ENSCSEG00000005141) ENSCSEG00000005104 SLC7A5 (ENSCSEG00000005095) RNF223 (ENSCSEG00000005091) ptpn11b (ENSCSEG00000005082) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000160408 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764.h Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000160408 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000156136.c ENSGT00940000156136.d ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764.h Siamese fighting fish MODERN SPECIES 18 ybx1 (ENSBSLG00000003114) arhgef16 (ENSBSLG00000003080) espn (ENSBSLG00000003075) HES2 (ENSBSLG00000003074) HES2 (ENSBSLG00000003073) acot7 (ENSBSLG00000003069) 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ENSOMYG00000042867 ENSOMYG00000042877 ENSOMYG00000042882 ENSOMYG00000042904 ENSOMYG00000001488 dennd2da (ENSOMYG00000001623) ENSOMYG00000001646 ENSOMYG00000052672 ENSOMYG00000001702 EFHD2 (ENSOMYG00000001724) ENSOMYG00000001769 kazna (ENSOMYG00000002342) ENSOMYG00000002256 ##22 ENSOMYG00000067863 TMEM51 (ENSOMYG00000002301) ENSOMYG00000073172 rimkla (ENSOMYG00000002398) ENSOMYG00000002419 ENSOMYG00000002451 ENSOMYG00000066392 ENSOMYG00000002536 ENSOMYG00000002592 ENSOMYG00000002613 ENSOMYG00000002762 ENSOMYG00000002854 ENSOMYG00000002927 ENSOMYG00000002999 ENSOMYG00000003031 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000234597.a.b.b.f.j ENSGT00410000025596.a.a.d ENSGT00950000183149.B ENSGT00940000158197.d.a ENSGT00390000000020.a.z ENSGT00390000007975.b.b ENSGT00940000153544.a.i.b.c ENSGT00950000183117.a.b.a.e ENSGT01030000234578.B.b.a ENSGT00950000182931.A.a.b.c ENSGT00940000159081.t ENSGT00390000017353.m ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000154171.A ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT00390000009278.b.c ENSGT00940000154570.a.b.e ENSGT00390000014577.b.e ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b.h ENSGT00940000165031.b.g ENSGT00940000156275.e.c ENSGT00940000159540.c.d ENSGT00940000159912.k ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A.c ENSGT00970000193390.c.a.b.b.a.a ENSGT00940000158764.h.c ENSGT00940000165527.d.a.a Coho salmon MODERN SPECIES 8 GMEB2 (ENSOKIG00005023304) pdyn (ENSOKIG00005023315) stk35 (ENSOKIG00005023326) MTCH1 (ENSOKIG00005023341) ENSOKIG00005023384 stk38a (ENSOKIG00005023719) CEPT1 (ENSOKIG00005023804) ENSOKIG00005024519 dennd2da (ENSOKIG00005024542) ENSOKIG00005024572 ENSOKIG00005024589 efhd2 (ENSOKIG00005024592) ENSOKIG00005024603 fhad1 (ENSOKIG00005024611) ela2 (ENSOKIG00005024651) ##22 ela2l (ENSOKIG00005024711) ##22 kazna (ENSOKIG00005024752) rimkla (ENSOKIG00005024785) zmynd12 (ENSOKIG00005024803) emp3b (ENSOKIG00005024824) ENSOKIG00005024859 ENSOKIG00005024846 znf362b 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Salmo ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01030000234597.a.b.b.f.j.a ENSGT00410000025596.a.a.d ENSGT00950000183149.B ENSGT00940000158197.d.a ENSGT00390000000020.a.z ENSGT00390000007975.b.b ENSGT00940000153544.a.i.b.c ENSGT00950000183117.a.b.a.e ENSGT01030000234578.B.b.a ENSGT00950000182931.A.a.b.c ENSGT00940000159081.t ENSGT00390000017353.m ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000154171.A ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT00940000153216.a.b ENSGT00390000009278.b.c ENSGT00940000154570.a.b.e ENSGT00390000014577.b.e ENSGT00390000004248.c ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e.c ENSGT00940000159540.c.d ENSGT00390000003047.h ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A.c ENSGT00970000193390.c.a.b.b.a.a ENSGT00940000158764.h.c River trout MODERN SPECIES 20 STMN3 (ENSSTUG00000039057) GMEB2 (ENSSTUG00000039040) pdyn (ENSSTUG00000039029) stk35 (ENSSTUG00000039026) MTCH1 (ENSSTUG00000038996) ENSSTUG00000038994 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ENSELUG00000000288 alas2 (ENSELUG00000008070) ENSELUG00000025031 ENSELUG00000033680 SLC7A5 (ENSELUG00000008219) TOX2 (ENSELUG00000008264) wfdc2 (ENSELUG00000008317) PIGT (ENSELUG00000008351) Northern pike MODERN SPECIES 5 RPS6KA2 (ENSELUG00000019202) rnaset2 (ENSELUG00000019269) MYOM2 (ENSELUG00000019380) CSMD1 (ENSELUG00000019489) mcph1 (ENSELUG00000019645) angpt2a (ENSELUG00000019551) agpat5 (ENSELUG00000019699) tmem14a (ENSELUG00000019713) sult6b1 (ENSELUG00000019731) gsta3 (ENSELUG00000034680) CILK1 (ENSELUG00000019783) fbxo9 (ENSELUG00000019800) elovl5 (ENSELUG00000019836) gclc (ENSELUG00000019935) klhl31 (ENSELUG00000019960) ela2l (ENSELUG00000026958) ##22 ENSELUG00000019999 lrrc1 (ENSELUG00000020095) ENSELUG00000020119 FAM83B (ENSELUG00000020142) hcrtr2 (ENSELUG00000020170) ENSELUG00000020182 hmgcll1 (ENSELUG00000020228) bmp5 (ENSELUG00000020247) COL21A1 (ENSELUG00000020303) ENSELUG00000020422 DST (ENSELUG00000020586) ENSELUG00000028331 ENSELUG00000031724 ENSELUG00000020757 bag2 (ENSELUG00000031955) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137.z ENSGT00730000111482.b ENSGT00390000017213.B.a ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.e ENSGT00940000160408.h ENSGT01030000234571.a.b.e ENSGT00940000153341.l.b ENSGT00940000154721 ENSGT00390000012058.c.b.d ENSGT00940000154171.A ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.a.g ENSGT00940000159410 ENSGT00940000160362.j ENSGT00390000014577.b.a ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.a ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00940000166932.b ENSGT00390000003047 ENSGT00940000157799 ENSGT00940000165161 ENSGT00950000182914.a.a.b Asian bonytongue MODERN SPECIES 11 wrap73 (ENSSFOG00015010615) tp73 (ENSSFOG00015010669) ENSSFOG00015027502 rer1 (ENSSFOG00015010714) GPR153 (ENSSFOG00015010738) acot7 (ENSSFOG00015010765) HES2 (ENSSFOG00015010823) 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Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT00940000158764.h ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159540.c ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00390000011228.b.a.f ENSGT00390000013740 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 89 ENSGT00940000155581.A.c ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00940000159540.c.d ENSGT00940000156275.e.c ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b.e ENSGT00940000154570.a.b.e ENSGT00390000009278.b.c ENSGT00940000153216.a.b ENSGT00940000154570.a.b.f ENSGT00390000009278.b.d ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00390000017353.m ENSGT00940000159081.t ENSGT00950000182931.A.a.b.c ENSGT01030000234578.B.b.a ENSGT00950000183117.a.b.a.e ENSGT00940000153544.a.i.b.c ENSGT00390000007975.b.b ENSGT00390000000020.a.z ENSGT00940000158197.d.a ENSGT00950000183149.B ENSGT00410000025596.a.a.d ENSGT01030000234597.a.b.b.f.j ENSGT00950000182970.A.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158764.h.c ENSGT00970000193390.c.a.b.b.a.a ENSGT00940000155581.A.c ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00940000159540.c.d ENSGT00940000156275.e.c ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b.e ENSGT00940000154570.a.b.e ENSGT00390000009278.b.c ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00390000017353.m ENSGT00940000159081.t ENSGT00950000182931.A.a.b.c ENSGT01030000234578.B.b.a ENSGT00950000183117.a.b.a.e ENSGT00940000153544.a.i.b.c ENSGT00390000007975.b.b ENSGT00390000000020.a.z ENSGT00940000158197.d.a ENSGT00950000183149.B ENSGT00410000025596.a.a.d ENSGT01030000234597.a.b.b.f.j ENSGT00950000182970.A.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00970000193390.c.a.b.b.a.a ENSGT00940000155581.A.c ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047.h ENSGT00940000159540.c.d ENSGT00940000156275.e.c ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248.c ENSGT00390000014577.b.e ENSGT00940000154570.a.b.e ENSGT00390000009278.b.c ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00390000017353.m ENSGT00940000159081.t ENSGT00950000182931.A.a.b.c ENSGT01030000234578.B.b.a ENSGT00950000183117.a.b.a.e ENSGT00940000153544.a.i.b.c ENSGT00390000007975.b.b ENSGT00390000000020.a.z ENSGT00940000158197.d.a ENSGT00950000183149.B ENSGT00410000025596.a.a.d ENSGT01030000234597.a.b.b.f.j.a ENSGT00950000182970.A.b River trout MODERN SPECIES 20 TOX2 (ENSSTUG00000037724) ENSSTUG00000037749 SLC7A5 (ENSSTUG00000037761) ENSSTUG00000037789 alas2 (ENSSTUG00000037820) ENSSTUG00000038093 ENSSTUG00000038110 znf362b (ENSSTUG00000038119) ENSSTUG00000038159 emp3b (ENSSTUG00000038193) zmynd12 (ENSSTUG00000038211) rimkla (ENSSTUG00000038240) kazna (ENSSTUG00000038263) TMEM51 (ENSSTUG00000038317) ela2l (ENSSTUG00000038328) ##22 ela2 (ENSSTUG00000038342) ##22 ENSSTUG00000038364 efhd2 (ENSSTUG00000038400) ENSSTUG00000038411 igf3 (ENSSTUG00000038424) dennd2da (ENSSTUG00000038445) ENSSTUG00000038694 CEPT1 (ENSSTUG00000038721) stk38a (ENSSTUG00000038957) ENSSTUG00000038994 MTCH1 (ENSSTUG00000038996) stk35 (ENSSTUG00000039026) pdyn (ENSSTUG00000039029) GMEB2 (ENSSTUG00000039040) STMN3 (ENSSTUG00000039057) rtel1 (ENSSTUG00000039079) Atlantic salmon MODERN SPECIES 6 ENSSSAG00000068569 ENSSSAG00000068565 ENSSSAG00000068518 ENSSSAG00000068500 ENSSSAG00000068428 ENSSSAG00000095424 ENSSSAG00000068419 ENSSSAG00000068378 emp3 (ENSSSAG00000068369) zmynd12 (ENSSSAG00000068358) rimkla (ENSSSAG00000103644) kazna (ENSSSAG00000068338) ENSSSAG00000094335 ENSSSAG00000068316 ela2l (ENSSSAG00000068301) ##22 ENSSSAG00000068294 ##22 ENSSSAG00000099979 efhd2 (ENSSSAG00000068283) ENSSSAG00000068278 dennd2d (ENSSSAG00000068256) ENSSSAG00000068248 cept1 (ENSSSAG00000068187) ENSSSAG00000089405 ENSSSAG00000068161 ENSSSAG00000095969 ENSSSAG00000068148 stk35 (ENSSSAG00000100649) pdyn (ENSSSAG00000068141) gmeb2 (ENSSSAG00000068128) ENSSSAG00000068122 rtel1 (ENSSSAG00000068081) Huchen MODERN SPECIES 17 mthfr (ENSHHUG00000003738) ENSHHUG00000003894 HCK (ENSHHUG00000003899) ENSHHUG00000004438 gata5 (ENSHHUG00000004445) ENSHHUG00000004465 alas2 (ENSHHUG00000004484) znf362b (ENSHHUG00000004672) ENSHHUG00000004688 emp3b (ENSHHUG00000004703) zmynd12 (ENSHHUG00000004716) rimkla (ENSHHUG00000004724) kazna (ENSHHUG00000004731) TMEM51 (ENSHHUG00000004747) ela2l (ENSHHUG00000004752) ##22 ela2 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ENSGT00940000165031.b.g ENSGT00940000165031.b.h ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b.e ENSGT00940000154570.a.b.e ENSGT00390000009278.b.c ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00390000017353.m ENSGT00940000159081.t ENSGT00950000182931.A.a.b.c ENSGT01030000234578.B.b.a ENSGT00950000183117.a.b.a.e ENSGT00940000153544.a.i.b.c ENSGT00390000007975.b.b ENSGT00390000000020.a.z ENSGT00940000158197.d.a ENSGT00950000183149.B ENSGT00410000025596.a.a.d ENSGT01030000234597.a.b.b.f.j ENSGT00950000182970.A.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158764.h.c ENSGT00970000193390.c.a.b.b.a.a ENSGT00940000155581.A.c ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912.k ENSGT00940000159540.c.d ENSGT00940000156275.e.c ENSGT00940000165031.b.g ENSGT00940000165031.b.h ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b.e ENSGT00940000154570.a.b.e ENSGT00390000009278.b.c ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00390000017353.m ENSGT00940000159081.t ENSGT00950000182931.A.a.b.c ENSGT01030000234578.B.b.a ENSGT00950000183117.a.b.a.e ENSGT00940000153544.a.i.b.c ENSGT00390000007975.b.b ENSGT00390000000020.a.z ENSGT00940000158197.d.a ENSGT00950000183149.B ENSGT00410000025596.a.a.d ENSGT01030000234597.a.b.b.f.j ENSGT00950000182970.A.b Chinook salmon MODERN SPECIES 7 ENSOTSG00005045318 TOX2 (ENSOTSG00005045316) ENSOTSG00005045315 SLC7A5 (ENSOTSG00005045108) ENSOTSG00005045099 alas2 (ENSOTSG00005045044) ENSOTSG00005045043 znf362b (ENSOTSG00005045042) ENSOTSG00005045041 emp3b (ENSOTSG00005045040) zmynd12 (ENSOTSG00005045039) rimkla (ENSOTSG00005045038) kazna (ENSOTSG00005045037) TMEM51 (ENSOTSG00005045036) ela2l (ENSOTSG00005045035) ##22 ela2 (ENSOTSG00005045034) ##22 fhad1 (ENSOTSG00005045032) efhd2 (ENSOTSG00005045030) ENSOTSG00005045029 ENSOTSG00005045027 dennd2da 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(ENSOKIG00005023315) GMEB2 (ENSOKIG00005023304) STMN3 (ENSOKIG00005023286) Northern pike MODERN SPECIES 11 wfdc2 (ENSELUG00000008317) TOX2 (ENSELUG00000008264) SLC7A5 (ENSELUG00000008219) ENSELUG00000033680 ENSELUG00000025031 alas2 (ENSELUG00000008070) ENSELUG00000000288 ENSELUG00000007910 znf362b (ENSELUG00000007874) ENSELUG00000007785 emp3b (ENSELUG00000007649) zmynd12 (ENSELUG00000007626) rimkla (ENSELUG00000007594) tmem51a (ENSELUG00000007576) ela2l (ENSELUG00000007559) ##22 ela2 (ENSELUG00000007524) ##22 ENSELUG00000007487 efhd2 (ENSELUG00000007433) ENSELUG00000007412 renbp (ENSELUG00000007400) ENSELUG00000007380 ENSELUG00000007370 phc2a (ENSELUG00000007357) slc2a1a (ENSELUG00000007325) trappc6b (ENSELUG00000007286) tpx2 (ENSELUG00000007269) ENSELUG00000000260 ENSELUG00000007165 asxl1 (ENSELUG00000007145) pcmtd2a (ENSELUG00000007072) MYT1 (ENSELUG00000007011) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159540.c 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ENSGT00940000161602 ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000153341 ENSGT00940000171598 ENSGT00940000154721 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 21 ENSMMDG00005005637 alas2 (ENSMMDG00005005641) ENSMMDG00005005649 znf362b (ENSMMDG00005005657) ENSMMDG00005005695 emp3b (ENSMMDG00005005698) zmynd12 (ENSMMDG00005005702) rimkla (ENSMMDG00005005704) ENSMMDG00005005705 ENSMMDG00005005709 kazna (ENSMMDG00005005739) ENSMMDG00005005743 tmem51a (ENSMMDG00005005746) ENSMMDG00005005800 ##22 ela2l (ENSMMDG00005006129) ##22 ela2 (ENSMMDG00005006139) ##22 ENSMMDG00005006851 ebp (ENSMMDG00005007053) ENSMMDG00005007058 apobec2b (ENSMMDG00005007061) ENSMMDG00005007064 ENSMMDG00005007069 mybpha (ENSMMDG00005007074) NAV1 (ENSMMDG00005007086) csrp1a (ENSMMDG00005007267) phlda3 (ENSMMDG00005007268) ENSMMDG00005007270 tnnt2a (ENSMMDG00005007275) PKP1 (ENSMMDG00005007364) TEAD3 (ENSMMDG00005007365) ENSMMDG00005000152 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 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ENSGT00940000178879 ENSGT00520000055570.B.l.h ENSGT00940000156136.a.a ENSGT00940000156136.b ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158764.h ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159540.c ENSGT00940000156275.e ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000164692 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a.b ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a.a ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136.a.b ENSGT00940000178879 ENSGT00520000055570.B.l.h ENSGT00940000156136.a.a ENSGT00940000156136.b ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 738 kazna (ENSHBUG00000023422) tmem51a (ENSHBUG00000023455) ela2l (ENSHBUG00000023500) ##22 ela2 (ENSHBUG00000023554) ##22 ENSHBUG00000023694 cbln10 (ENSHBUG00000023767) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158764.h ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159540.c ENSGT00940000156275.e ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000164692 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a.b ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a.a ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136.a.b ENSGT00520000055570.B.l.h ENSGT00940000178879 ENSGT00940000156136.a.a ENSGT00940000156136.b ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 P. nyererei MODERN SPECIES 344 TOX2 (ENSPNYG00000008546) SLC7A5 (ENSPNYG00000008569) 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ENSMZEG00005020311 TPRG1L (ENSMZEG00005020315) wrap73 (ENSMZEG00005020320) tp73 (ENSMZEG00005020334) rer1 (ENSMZEG00005020344) ENSMZEG00005020350 ENSMZEG00005020360 ENSMZEG00005020374 ENSMZEG00005020380 ENSMZEG00005020388 her3 (ENSMZEG00005020391) GPR153 (ENSMZEG00005020394) acot7 (ENSMZEG00005020398) Eastern happy MODERN SPECIES 12 TOX2 (ENSACLG00000024329) SLC7A5 (ENSACLG00000024324) ENSACLG00000024315 alas2 (ENSACLG00000023987) ENSACLG00000023978 ENSACLG00000023962 znf362b (ENSACLG00000023936) emp3b (ENSACLG00000023917) zmynd12 (ENSACLG00000023882) rimkla (ENSACLG00000023857) foxj3 (ENSACLG00000023827) ENSACLG00000023820 kazna (ENSACLG00000023740) tmem51a (ENSACLG00000023721) ela2l (ENSACLG00000023708) ##22 ela2 (ENSACLG00000023668) ##22 ENSACLG00000023520 cbln10 (ENSACLG00000023459) cbln10 (ENSACLG00000023403) TPRG1L (ENSACLG00000023385) wrap73 (ENSACLG00000023339) tp73 (ENSACLG00000023276) rer1 (ENSACLG00000023248) ENSACLG00000023218 ENSACLG00000023216 ENSACLG00000023209 ENSACLG00000023173 ENSACLG00000023049 ENSACLG00000023037 her3 (ENSACLG00000023028) GPR153 (ENSACLG00000023007) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 298 ENSNBRG00000004751 ENSNBRG00000004717 ENSNBRG00000004663 alas2 (ENSNBRG00000004620) ENSNBRG00000004559 znf362b (ENSNBRG00000004525) emp3b (ENSNBRG00000004474) zmynd12 (ENSNBRG00000004407) rimkla (ENSNBRG00000004379) ENSNBRG00000004328 ENSNBRG00000004319 kazna (ENSNBRG00000004301) ENSNBRG00000004290 tmem51a (ENSNBRG00000004281) ela2l (ENSNBRG00000004255) ##22 ela2 (ENSNBRG00000004233) ##22 ENSNBRG00000004183 cbln10 (ENSNBRG00000004172) ENSNBRG00000004152 TPRG1L (ENSNBRG00000004134) wrap73 (ENSNBRG00000003928) tp73 (ENSNBRG00000003678) rer1 (ENSNBRG00000003625) ENSNBRG00000003591 ENSNBRG00000003553 ENSNBRG00000003518 her3 (ENSNBRG00000003506) GPR153 (ENSNBRG00000003473) acot7 (ENSNBRG00000003425) HES2 (ENSNBRG00000003399) HES2 (ENSNBRG00000003376) Nile tilapia MODERN SPECIES 12 TOX2 (ENSONIG00000002202) SLC7A5 (ENSONIG00000002196) ENSONIG00000002191 alas2 (ENSONIG00000002184) ENSONIG00000002182 znf362b (ENSONIG00000002181) emp3b (ENSONIG00000002180) zmynd12 (ENSONIG00000002171) rimkla (ENSONIG00000002168) foxj3 (ENSONIG00000002167) ENSONIG00000002165 kazna (ENSONIG00000002160) ENSONIG00000032143 tmem51a (ENSONIG00000002156) ela2l (ENSONIG00000002140) ##22 ela2 (ENSONIG00000002124) ##22 ENSONIG00000027503 ENSONIG00000038130 ENSONIG00000035163 ENSONIG00000002121 ENSONIG00000036294 ENSONIG00000036727 TPRG1L (ENSONIG00000002116) ENSONIG00000028661 wrap73 (ENSONIG00000002110) tp73 (ENSONIG00000002106) rer1 (ENSONIG00000002100) ENSONIG00000029123 ENSONIG00000039488 ENSONIG00000002097 ENSONIG00000034410 Midas cichlid MODERN SPECIES 1346 ENSACIG00000021511 ENSACIG00000021524 ENSACIG00000021574 alas2 (ENSACIG00000021722) ENSACIG00000021741 znf362b (ENSACIG00000021780) emp3b (ENSACIG00000021797) zmynd12 (ENSACIG00000021841) rimkla (ENSACIG00000021880) foxj3 (ENSACIG00000021892) ENSACIG00000021922 kazna (ENSACIG00000021965) ENSACIG00000021973 tmem51a (ENSACIG00000021983) ela2l (ENSACIG00000021998) ##22 ela2 (ENSACIG00000022004) ##22 ENSACIG00000022014 cbln10 (ENSACIG00000022035) cbln10 (ENSACIG00000022052) TPRG1L (ENSACIG00000022067) wrap73 (ENSACIG00000022083) tp73 (ENSACIG00000022099) rer1 (ENSACIG00000022115) ENSACIG00000022132 ENSACIG00000022174 ENSACIG00000022184 ENSACIG00000022205 GPR153 (ENSACIG00000022239) acot7 (ENSACIG00000022245) HES2 (ENSACIG00000022261) HES2 (ENSACIG00000022267) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159540.c ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00390000012265 ENSGT00940000164692 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00980000199193 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000160408 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159540.c ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00390000012265 ENSGT00940000164692 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00980000199193 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000160408 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000164692 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136.p ENSGT00940000156136.o ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000153341 Fugu MODERN SPECIES 15 ENSTRUG00000013848 SLC7A5 (ENSTRUG00000026576) ENSTRUG00000013995 alas2 (ENSTRUG00000004798) ENSTRUG00000014254 znf362 (ENSTRUG00000014263) ENSTRUG00000022648 emp3b (ENSTRUG00000014337) rimkla (ENSTRUG00000014374) foxj3 (ENSTRUG00000014404) ENSTRUG00000020970 ENSTRUG00000023355 kazna (ENSTRUG00000014464) tmem51a (ENSTRUG00000020611) CTRC (ENSTRUG00000014497) ela2 (ENSTRUG00000014615) ##22 ENSTRUG00000014772 TPRG1L (ENSTRUG00000014863) wrap73 (ENSTRUG00000014886) tp73 (ENSTRUG00000014931) rer1 (ENSTRUG00000015012) tas1r1 (ENSTRUG00000015043) tas1r2b (ENSTRUG00000026470) her3 (ENSTRUG00000032181) GPR153 (ENSTRUG00000015145) acot7 (ENSTRUG00000015170) HES2 (ENSTRUG00000021965) HES2 (ENSTRUG00000015206) espn (ENSTRUG00000015217) arhgef16 (ENSTRUG00000015273) ybx1 (ENSTRUG00000024170) Tetraodon MODERN SPECIES 24 PIGT (ENSTNIG00000006540) TOX2 (ENSTNIG00000005683) SLC7A5 (ENSTNIG00000005682) ENSTNIG00000004424 alas2 (ENSTNIG00000005681) ENSTNIG00000005680 znf362b (ENSTNIG00000019373) emp3b (ENSTNIG00000007157) rimkla (ENSTNIG00000007158) ENSTNIG00000007159 ENSTNIG00000018676 kazna (ENSTNIG00000011970) prkar2aa (ENSTNIG00000011971) ENSTNIG00000011972 ##22 ela2l (ENSTNIG00000011973) ##22 ela2 (ENSTNIG00000011974) ##22 ENSTNIG00000011975 TPRG1L (ENSTNIG00000011976) wrap73 (ENSTNIG00000011977) tp73 (ENSTNIG00000011978) rer1 (ENSTNIG00000001745) ENSTNIG00000011979 rer1 (ENSTNIG00000011980) ENSTNIG00000011981 ENSTNIG00000011982 GPR153 (ENSTNIG00000011983) acot7 (ENSTNIG00000011984) HES2 (ENSTNIG00000011985) HES2 (ENSTNIG00000011986) espn (ENSTNIG00000011987) arhgef16 (ENSTNIG00000011988) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159540.c ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00390000012265 ENSGT00940000164692 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00980000199193 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000160408 Ballan wrasse MODERN SPECIES 249 ENSLBEG00000020578 kazna (ENSLBEG00000020477) ENSLBEG00000020416 ENSLBEG00000020225 ##22 ela2l (ENSLBEG00000020185) ##22 ela2 (ENSLBEG00000020141) ##22 ENSLBEG00000020072 ENSLBEG00000020046 TPRG1L (ENSLBEG00000020010) wrap73 (ENSLBEG00000019932) tp73 (ENSLBEG00000019867) rer1 (ENSLBEG00000019828) ENSLBEG00000019684 ENSLBEG00000019418 ENSLBEG00000019250 her3 (ENSLBEG00000019224) GPR153 (ENSLBEG00000019195) acot7 (ENSLBEG00000019162) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159540.c ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00390000012265 ENSGT00940000164692 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000153341 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00390000012265 ENSGT00940000164692 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158764.h ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000156275.e ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00390000012265 ENSGT00940000164692 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b Lumpfish MODERN SPECIES 22 NECAB3 (ENSCLMG00005006208) alas2 (ENSCLMG00005006200) 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(ENSBSLG00000003069) HES2 (ENSBSLG00000003073) HES2 (ENSBSLG00000003074) espn (ENSBSLG00000003075) arhgef16 (ENSBSLG00000003080) ybx1 (ENSBSLG00000003114) ppih (ENSBSLG00000003127) Zig-zag eel MODERN SPECIES 21 ENSMAMG00000018915 ENSMAMG00000018906 ENSMAMG00000018898 ENSMAMG00000018877 ENSMAMG00000018867 znf362b (ENSMAMG00000018846) ENSMAMG00000018795 ENSMAMG00000018774 ENSMAMG00000018742 rimkla (ENSMAMG00000025507) ENSMAMG00000018723 ENSMAMG00000024819 KAZN (ENSMAMG00000018678) ENSMAMG00000028046 ENSMAMG00000018661 ##22 ENSMAMG00000018643 ##22 ENSMAMG00000018596 TPRG1L (ENSMAMG00000025568) wrap73 (ENSMAMG00000018546) tp73 (ENSMAMG00000018524) ENSMAMG00000026476 rer1 (ENSMAMG00000018498) ENSMAMG00000018440 ENSMAMG00000018423 her3 (ENSMAMG00000018402) GPR153 (ENSMAMG00000018386) acot7 (ENSMAMG00000018320) HES2 (ENSMAMG00000025495) HES2 (ENSMAMG00000018357) ENSMAMG00000018288 arhgef16 (ENSMAMG00000018280) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159540.c ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000164692 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000153341 Pleuronectoidei DUPLICATION Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a.e ##22 Tongue sole MODERN SPECIES 1 RNF223 (ENSCSEG00000005091) SLC7A5 (ENSCSEG00000005095) ENSCSEG00000005104 alas2 (ENSCSEG00000005141) ENSCSEG00000005150 znf362b (ENSCSEG00000005161) ENSCSEG00000005166 emp3b (ENSCSEG00000005176) rimkla (ENSCSEG00000005179) foxj3 (ENSCSEG00000005183) ENSCSEG00000005190 kazna (ENSCSEG00000005197) tmem51a (ENSCSEG00000005221) ENSCSEG00000005224 ##22 ela2l (ENSCSEG00000005227) ##22 ela2 (ENSCSEG00000005237) ##22 ela2 (ENSCSEG00000005244) ##22 ENSCSEG00000005250 TPRG1L (ENSCSEG00000005267) tardbpa (ENSCSEG00000005274) CASZ1 (ENSCSEG00000005290) PEX14 (ENSCSEG00000005329) dffa (ENSCSEG00000005333) ENSCSEG00000005335 sst7 (ENSCSEG00000005343) srm (ENSCSEG00000005340) exosc10 (ENSCSEG00000005346) ENSCSEG00000005355 ENSCSEG00000005372 ENSCSEG00000005419 ENSCSEG00000005429 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155581.A ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a.f ##22 ENSGT00940000164692 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000153341 ENSGT00940000154721 Tongue sole MODERN SPECIES 1 SLC7A5 (ENSCSEG00000005095) ENSCSEG00000005104 alas2 (ENSCSEG00000005141) ENSCSEG00000005150 znf362b (ENSCSEG00000005161) ENSCSEG00000005166 emp3b (ENSCSEG00000005176) rimkla (ENSCSEG00000005179) foxj3 (ENSCSEG00000005183) ENSCSEG00000005190 kazna (ENSCSEG00000005197) tmem51a (ENSCSEG00000005221) ENSCSEG00000005224 ##22 ela2l (ENSCSEG00000005227) ##22 ela2 (ENSCSEG00000005237) ##22 ela2 (ENSCSEG00000005244) ##22 ENSCSEG00000005250 TPRG1L (ENSCSEG00000005267) tardbpa (ENSCSEG00000005274) CASZ1 (ENSCSEG00000005290) PEX14 (ENSCSEG00000005329) dffa (ENSCSEG00000005333) ENSCSEG00000005335 sst7 (ENSCSEG00000005343) srm (ENSCSEG00000005340) exosc10 (ENSCSEG00000005346) ENSCSEG00000005355 ENSCSEG00000005372 ENSCSEG00000005419 ENSCSEG00000005429 edn3b (ENSCSEG00000005453) Turbot MODERN SPECIES 2 ENSSMAG00000016580 ENSSMAG00000016573 ENSSMAG00000016554 ENSSMAG00000016509 ENSSMAG00000016491 ENSSMAG00000016415 ENSSMAG00000016317 ENSSMAG00000016295 ENSSMAG00000016282 rimkla (ENSSMAG00000016247) ENSSMAG00000016215 ENSSMAG00000016211 kazna (ENSSMAG00000016181) ENSSMAG00000025431 ENSSMAG00000016156 ##22 ENSSMAG00000016093 ##22 ENSSMAG00000015988 TPRG1L (ENSSMAG00000015960) wrap73 (ENSSMAG00000015916) tp73 (ENSSMAG00000015862) rer1 (ENSSMAG00000034473) ENSSMAG00000015832 ENSSMAG00000015831 ENSSMAG00000011198 her3 (ENSSMAG00000027712) GPR153 (ENSSMAG00000011229) acot7 (ENSSMAG00000025657) HES2 (ENSSMAG00000011300) ENSSMAG00000029110 ENSSMAG00000026044 arhgef16 (ENSSMAG00000011332) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159540.c ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b.p ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000164692 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00510000047137 ENSGT00940000156136 ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000153341 Barramundi perch MODERN SPECIES 128 SLC7A5 (ENSLCAG00010027434) ENSLCAG00010027440 alas2 (ENSLCAG00010027445) ENSLCAG00010027449 ENSLCAG00010027451 znf362b (ENSLCAG00010027453) emp3b (ENSLCAG00010027459) zmynd12 (ENSLCAG00010027462) rimkla (ENSLCAG00010027463) ENSLCAG00010027464 ENSLCAG00010027467 ENSLCAG00010027469 kazna (ENSLCAG00010027471) ENSLCAG00010027473 ela2l (ENSLCAG00010027476) ##22 ela2 (ENSLCAG00010027478) ##22 ENSLCAG00010027482 ENSLCAG00010027488 TPRG1L (ENSLCAG00010027493) wrap73 (ENSLCAG00010027496) tp73 (ENSLCAG00010027505) rer1 (ENSLCAG00010027508) ENSLCAG00010027510 ENSLCAG00010027516 ENSLCAG00010027519 ENSLCAG00010027526 ENSLCAG00010027532 GPR153 (ENSLCAG00010027533) acot7 (ENSLCAG00010027535) HES2 (ENSLCAG00010027536) HES2 (ENSLCAG00010027537) Seriola ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000159912 ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159540.c ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000165031.b ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00390000004248 ENSGT00390000014577.b ENSGT00940000165157 ENSGT00940000167828 ENSGT00940000154570.a.b.p ENSGT00390000009278.b ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000164692 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00390000003623 ENSGT00950000183153.c.b.a.b 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(ENSSDUG00000001136) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3155 ENSSLDG00000025100 alas2 (ENSSLDG00000025084) ENSSLDG00000025074 ENSSLDG00000025067 znf362b (ENSSLDG00000025057) ENSSLDG00000024993 emp3b (ENSSLDG00000024973) zmynd12 (ENSSLDG00000024967) rimkla (ENSSLDG00000024960) foxj3 (ENSSLDG00000024952) ENSSLDG00000024947 kazna (ENSSLDG00000024930) ENSSLDG00000024926 ENSSLDG00000024909 ##22 ela2l (ENSSLDG00000024900) ##22 ela2 (ENSSLDG00000024896) ##22 ENSSLDG00000024888 cbln10 (ENSSLDG00000024879) TPRG1L (ENSSLDG00000024871) wrap73 (ENSSLDG00000024857) tp73 (ENSSLDG00000024845) rer1 (ENSSLDG00000024832) ENSSLDG00000024824 ENSSLDG00000024815 ENSSLDG00000024806 her3 (ENSSLDG00000024803) GPR153 (ENSSLDG00000024798) acot7 (ENSSLDG00000024792) HES2 (ENSSLDG00000024785) HES2 (ENSSLDG00000024779) espn (ENSSLDG00000024741) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000159166 ENSGT00940000156024.i.a 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Common carp reference MODERN SPECIES 23 ENSCCRG00000010929 zgc:112962 (ENSCCRG00000010927) ALDH9A1 (ENSCCRG00000068152) tmco1 (ENSCCRG00000010916) uck2a (ENSCCRG00000060367) magoh (ENSCCRG00000010912) cpt2 (ENSCCRG00000010911) porcn (ENSCCRG00000072407) ENSCCRG00000010900 col2a1a (ENSCCRG00000058874) cry3a (ENSCCRG00000055194) ENSCCRG00000055400 itpr3 (ENSCCRG00000081887) alas2 (ENSCCRG00000057252) ela2l (ENSCCRG00000073943) ##22 ela2 (ENSCCRG00000057313) ##22 ENSCCRG00000054101 AJAP1 (ENSCCRG00000002467) NPHP4 (ENSCCRG00000078735) dffb (ENSCCRG00000071149) si:ch211-147a11.3 (ENSCCRG00000038413) ENSCCRG00000017274 lrrc47 (ENSCCRG00000055501) ENSCCRG00000040612 ENSCCRG00000004391 ENSCCRG00000066084 ENSCCRG00000076037 zgc:153759 (ENSCCRG00000013364) ENSCCRG00000016305 ENSCCRG00000066418 ENSCCRG00000048925 Goldfish MODERN SPECIES 48 ENSCARG00000038423 ALDH9A1 (ENSCARG00000036567) uck2a (ENSCARG00000036479) magoh (ENSCARG00000036439) cpt2 (ENSCARG00000036425) porcn (ENSCARG00000036395) 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RNF223 (ENSCSEG00000005091) ptpn11b (ENSCSEG00000005082) agrn (ENSCSEG00000005060) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00980000199193 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000012265 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764.h Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00980000199193 ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000012265 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764.h Ballan wrasse MODERN SPECIES 249 acot7 (ENSLBEG00000019162) GPR153 (ENSLBEG00000019195) her3 (ENSLBEG00000019224) ENSLBEG00000019250 ENSLBEG00000019418 ENSLBEG00000019684 rer1 (ENSLBEG00000019828) tp73 (ENSLBEG00000019867) wrap73 (ENSLBEG00000019932) TPRG1L (ENSLBEG00000020010) ENSLBEG00000020046 ENSLBEG00000020072 ela2 (ENSLBEG00000020141) ##22 ela2l (ENSLBEG00000020185) ##22 ENSLBEG00000020225 ##22 ENSLBEG00000020416 kazna (ENSLBEG00000020477) ENSLBEG00000020578 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160408 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000012265 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00940000159540.c ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764.h Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000012265 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764.h ENSGT00940000165527 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000160408 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00940000164692 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000165031.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764.h ENSGT00940000165527 Pike perch MODERN SPECIES 7 acot7 (ENSSLUG00000009512) ENSSLUG00000009533 GPR153 (ENSSLUG00000009537) ENSSLUG00000009544 ENSSLUG00000009643 ENSSLUG00000009828 ENSSLUG00000009923 ENSSLUG00000009983 rer1 (ENSSLUG00000010208) tp73 (ENSSLUG00000010210) wrap73 (ENSSLUG00000010215) TPRG1L (ENSSLUG00000010228) ENSSLUG00000010241 ela2 (ENSSLUG00000010276) ##22 ela2l (ENSSLUG00000010285) ##22 ENSSLUG00000010296 ##22 ENSSLUG00000010300 kazna (ENSSLUG00000010305) ENSSLUG00000010340 ENSSLUG00000010345 ENSSLUG00000010348 ENSSLUG00000010350 rimkla (ENSSLUG00000010354) zmynd12 (ENSSLUG00000010359) emp3b (ENSSLUG00000010361) ENSSLUG00000010364 znf362b (ENSSLUG00000010372) ENSSLUG00000010382 alas2 (ENSSLUG00000010390) NECAB3 (ENSSLUG00000010440) SLC7A5 (ENSSLUG00000010481) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161602.i ENSGT00940000161602.j ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.m.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000012265 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.a ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000009278.b ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000167828 ENSGT00940000165157 ENSGT00390000014577.b ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00940000156275.e ENSGT00390000003047 ENSGT00940000159912 ENSGT00950000183131.a.e ENSGT00940000155581.A ENSGT00940000158764.h ENSGT00940000165527 ENSGT00390000018558 Lumpfish MODERN SPECIES 22 acot7 (ENSCLMG00005003327) GPR153 (ENSCLMG00005003330) her3 (ENSCLMG00005003332) ENSCLMG00005003337 ENSCLMG00005003511 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(ENSLACG00000015738) ENSLACG00000015265 ENSLACG00000014695 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00390000001206 ENSGT00390000000911 ENSGT01050000244971.B ENSGT00940000162826 ENSGT00390000012141.b ENSGT00390000004940.a.b ENSGT00940000158938 ENSGT01080000257981 ENSGT00970000193437 ENSGT00940000154417 ENSGT00390000012939 ENSGT00940000155096 Anura ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00390000000911 ENSGT01050000244971.B ENSGT00940000162826 ENSGT00390000012141.b ENSGT00390000004940.a.b ENSGT00940000158938 ENSGT00940000154417 ENSGT00390000012939 ENSGT00940000155096 ENSGT00940000161504 ENSGT00390000016392 ENSGT00960000190452 Frog DUPLICATION Frog MODERN SPECIES 7 pla2g2d (ENSXETG00000048297) ubxn10 (ENSXETG00000044185) otud3 (ENSXETG00000049262) ENSXETG00000040911 ddx19b (ENSXETG00000028097) vwa5b1 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VWA5B1 (ENSNNAG00000013951) CAMK2N1 (ENSNNAG00000013932) PLA2G2F (ENSNNAG00000013916) PLA2G2A (ENSNNAG00000013873) Laterata ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000158724 ENSGT00940000164442.A.g.b ENSGT00940000164442.A.g.a ENSGT00940000163565.c.a ENSGT00940000164442.C ENSGT00940000163565.d ENSGT00940000164442.A.h ENSGT00390000014553 ENSGT00940000162571 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00390000001206 ENSGT00390000000911 ENSGT01050000244971.B ENSGT01030000234960.b ENSGT00940000162826 ENSGT00390000012939 ENSGT01060000248958 ENSGT00940000154417 ENSGT00940000158938 ENSGT00390000004940.a.b ENSGT00390000012141.b Argentine black and white tegu DUPLICATION Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 60 ENSSMRG00000008832 LACTBL1 (ENSSMRG00000008823) EPHB2 (ENSSMRG00000008819) C1QB (ENSSMRG00000008818) C1QC 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ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748 ENSGT00950000183106.b Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157630 ENSGT00940000162160 ENSGT00390000014553 ENSGT01030000234531.A.b.b.b.e.b ENSGT01030000234531.A.b.b.b.f ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00390000002770 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748 ENSGT00950000183106.b Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000158724 ENSGT00940000157630 ENSGT00940000162160 ENSGT00390000014553 ENSGT01030000234531.A.b.b.b.f.b.b ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 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MODERN SPECIES 726 Pramel12 (ENSMAUG00000013165) Pramel1 (ENSMAUG00000017344) Lrrc38 (ENSMAUG00000019684) Pdpn (ENSMAUG00000013176) Prdm2 (ENSMAUG00000017021) ENSMAUG00000009108 ENSMAUG00000010094 Tmem51 (ENSMAUG00000007940) Fhad1 (ENSMAUG00000001064) Efhd2 (ENSMAUG00000001147) ENSMAUG00000007283 Cela2a (ENSMAUG00000010885) ##22 Casp9 (ENSMAUG00000014326) Dnajc16 (ENSMAUG00000021653) Agmat (ENSMAUG00000022247) ENSMAUG00000020325 Plekhm2 (ENSMAUG00000010838) Slc25a34 (ENSMAUG00000020022) Tmem82 (ENSMAUG00000007567) Fblim1 (ENSMAUG00000018139) Spen (ENSMAUG00000008318) Zbtb17 (ENSMAUG00000001376) Hspb7 (ENSMAUG00000010732) Clcnkb (ENSMAUG00000000874) Clcnka (ENSMAUG00000017605) Fam131c (ENSMAUG00000021505) Epha2 (ENSMAUG00000009598) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234531.A.b.b.b.e.a.a.a.b.b ENSGT01030000234531.A.b.b.b.e.a.b.b ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A 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ENSPPYG00000030098 LRRC38 (ENSPPYG00000010676) ENSPPYG00000001857 ENSPPYG00000001856 PRDM2 (ENSPPYG00000001855) KAZN (ENSPPYG00000001854) ENSPPYG00000001850 FHAD1 (ENSPPYG00000001848) EFHD2 (ENSPPYG00000036146) CTRC (ENSPPYG00000001846) CELA2A (ENSPPYG00000034416) ##22 ENSPPYG00000010674 ##22 CELA2B (ENSPPYG00000001845) ##22 CASP9 (ENSPPYG00000001844) DNAJC16 (ENSPPYG00000001843) AGMAT (ENSPPYG00000001842) DDI2 (ENSPPYG00000001841) RSC1A1 (ENSPPYG00000031265) PLEKHM2 (ENSPPYG00000001840) SLC25A34 (ENSPPYG00000037176) TMEM82 (ENSPPYG00000001838) FBLIM1 (ENSPPYG00000001837) ENSPPYG00000041104 SPEN (ENSPPYG00000001834) ZBTB17 (ENSPPYG00000001833) SRARP (ENSPPYG00000001832) Orangutan MODERN SPECIES ENSPPYG00000030931 ENSPPYG00000031128 ENSPPYG00000001860 ENSPPYG00000035652 ENSPPYG00000030098 LRRC38 (ENSPPYG00000010676) ENSPPYG00000001857 ENSPPYG00000001856 PRDM2 (ENSPPYG00000001855) KAZN (ENSPPYG00000001854) ENSPPYG00000001850 FHAD1 (ENSPPYG00000001848) EFHD2 (ENSPPYG00000036146) CTRC 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ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.e.c ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009776.j.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b.d ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.b ##22 ENSGT00940000153216.a.b.c ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.c ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.qb ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748.a Vervet Monkey MODERN SPECIES 182 ENSCSAG00000018325 ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.e.c ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009776.j.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b.d ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.b ##22 ENSGT00940000153216.a.b.c ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.c ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.qb ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748.a Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.c ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 489 ENSPANG00000037278 ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.e.c ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009776.j.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b.d ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.b ##22 ENSGT00940000153216.a.b.c ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.c ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.qb ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748.b ENSGT00950000183106.b Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.e.c ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.a ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00910000148116 ENSGT01100000263493.a.b.b.a.a.a.a.a.b ENSGT01100000263493.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00940000164709.a.b.b.a.b.b.a.a.b.a.a.b.a ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b.c ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.c ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.qb ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748.a ENSGT00940000158748.b Crab-eating macaque MODERN SPECIES 44 ENSMFAG00000048500 ENSMFAG00000064807 ENSMFAG00000058263 CTRC (ENSMFAG00000054269) ENSMFAG00000014066 ##22 ENSMFAG00000043143 ##22 Rhesus DUPLICATION Rhesus MODERN SPECIES ENSMMUG00000054892 ENSMMUG00000058407 LRRC38 (ENSMMUG00000053824) PDPN (ENSMMUG00000000145) PRDM2 (ENSMMUG00000017040) ENSMMUG00000050642 ENSMMUG00000059275 ENSMMUG00000059157 KAZN (ENSMMUG00000023070) TMEM51 (ENSMMUG00000006164) FHAD1 (ENSMMUG00000003987) ENSMMUG00000053235 EFHD2 (ENSMMUG00000050246) ENSMMUG00000058742 ENSMMUG00000060541 ENSMMUG00000053550 ##22 ENSMMUG00000064552 ##22 CELA2B (ENSMMUG00000031821) ##22 CASP9 (ENSMMUG00000018163) DNAJC16 (ENSMMUG00000032244) AGMAT (ENSMMUG00000002802) RSC1A1 (ENSMMUG00000019912) PLEKHM2 (ENSMMUG00000016281) SLC25A34 (ENSMMUG00000060152) ENSMMUG00000055524 TMEM82 (ENSMMUG00000045777) FBLIM1 (ENSMMUG00000032243) SPEN (ENSMMUG00000008026) ZBTB17 (ENSMMUG00000008031) SRARP (ENSMMUG00000001911) HSPB7 (ENSMMUG00000001910) Rhesus MODERN SPECIES ENSMMUG00000058407 LRRC38 (ENSMMUG00000053824) PDPN (ENSMMUG00000000145) PRDM2 (ENSMMUG00000017040) ENSMMUG00000050642 ENSMMUG00000059275 ENSMMUG00000059157 KAZN (ENSMMUG00000023070) TMEM51 (ENSMMUG00000006164) FHAD1 (ENSMMUG00000003987) ENSMMUG00000053235 EFHD2 (ENSMMUG00000050246) ENSMMUG00000058742 ENSMMUG00000060541 ENSMMUG00000053550 ##22 ENSMMUG00000064552 ##22 CELA2B (ENSMMUG00000031821) ##22 CASP9 (ENSMMUG00000018163) DNAJC16 (ENSMMUG00000032244) AGMAT (ENSMMUG00000002802) RSC1A1 (ENSMMUG00000019912) PLEKHM2 (ENSMMUG00000016281) SLC25A34 (ENSMMUG00000060152) ENSMMUG00000055524 TMEM82 (ENSMMUG00000045777) FBLIM1 (ENSMMUG00000032243) SPEN (ENSMMUG00000008026) ZBTB17 (ENSMMUG00000008031) SRARP (ENSMMUG00000001911) HSPB7 (ENSMMUG00000001910) CLCNKB (ENSMMUG00000018235) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 663 ENSGT00390000009776.j.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.c ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1481 ENSRROG00000032598 TMEM51 (ENSRROG00000036091) FHAD1 (ENSRROG00000006955) EFHD2 (ENSRROG00000000643) CTRC (ENSRROG00000029528) ENSRROG00000033848 ##22 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.a.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.a.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.a.a ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 207 ENSCATG00000031710 ENSCATG00000037206 ENSCATG00000038414 ENSCATG00000034140 PRAMEF20 (ENSCATG00000022537) LRRC38 (ENSCATG00000035670) PDPN (ENSCATG00000039975) PRDM2 (ENSCATG00000029261) KAZN (ENSCATG00000039305) TMEM51 (ENSCATG00000032156) FHAD1 (ENSCATG00000034677) EFHD2 (ENSCATG00000010218) ENSCATG00000031108 ENSCATG00000032298 ENSCATG00000034453 ##22 ENSCATG00000028825 ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.a.a ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2375 ENSRROG00000029217 ##22 CELA2B (ENSRROG00000029503) ##22 CASP9 (ENSRROG00000041647) DNAJC16 (ENSRROG00000021561) AGMAT (ENSRROG00000032926) RSC1A1 (ENSRROG00000042834) PLEKHM2 (ENSRROG00000040448) SLC25A34 (ENSRROG00000029182) TMEM82 (ENSRROG00000030864) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.a.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 552 ENSCATG00000030064 ##22 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 128 ENSGT00940000153216.a.b.c ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.e.d ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.b ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b.d ENSGT00940000153216.a.b.c ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.a ##22 Drill MODERN SPECIES 1510 KAZN (ENSMLEG00000023176) TMEM51 (ENSMLEG00000036022) FHAD1 (ENSMLEG00000039315) EFHD2 (ENSMLEG00000000134) ENSMLEG00000032088 ENSMLEG00000033462 CELA2A (ENSMLEG00000036762) ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 207 ENSCATG00000030660 ENSCATG00000031710 ENSCATG00000037206 ENSCATG00000038414 ENSCATG00000034140 PRAMEF20 (ENSCATG00000022537) LRRC38 (ENSCATG00000035670) PDPN (ENSCATG00000039975) PRDM2 (ENSCATG00000029261) KAZN (ENSCATG00000039305) TMEM51 (ENSCATG00000032156) FHAD1 (ENSCATG00000034677) EFHD2 (ENSCATG00000010218) ENSCATG00000031108 ENSCATG00000032298 ENSCATG00000034453 ##22 ENSCATG00000028825 ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.a ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.a ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 44 ENSMFAG00000048500 ENSMFAG00000064807 ENSMFAG00000058263 CTRC (ENSMFAG00000054269) ENSMFAG00000014066 ##22 ENSMFAG00000043143 ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 508 ENSMNEG00000029126 ENSMNEG00000030236 ENSMNEG00000033443 ENSMNEG00000041850 PRAMEF20 (ENSMNEG00000043597) LRRC38 (ENSMNEG00000043446) PDPN (ENSMNEG00000043777) PRDM2 (ENSMNEG00000039705) KAZN (ENSMNEG00000038651) ENSMNEG00000027989 TMEM51 (ENSMNEG00000030790) FHAD1 (ENSMNEG00000045473) EFHD2 (ENSMNEG00000029503) CTRC (ENSMNEG00000029283) ENSMNEG00000033814 ##22 ENSMNEG00000034527 ##22 CELA2B (ENSMNEG00000035015) ##22 CASP9 (ENSMNEG00000032453) DNAJC16 (ENSMNEG00000015068) AGMAT (ENSMNEG00000038882) RSC1A1 (ENSMNEG00000027911) PLEKHM2 (ENSMNEG00000027232) SLC25A34 (ENSMNEG00000029592) TMEM82 (ENSMNEG00000044140) FBLIM1 (ENSMNEG00000041350) SPEN (ENSMNEG00000042402) ZBTB17 (ENSMNEG00000037648) SRARP (ENSMNEG00000041116) HSPB7 (ENSMNEG00000030966) CLCNKB (ENSMNEG00000030409) FAM131C (ENSMNEG00000037181) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.b.b.c ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.b.b.d ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.e.c ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009776.j.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b.d ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.b ##22 ENSGT00940000153216.a.b.c ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.c ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.qb ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.b.b.c ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.b.b.d ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.e.c ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009776.j.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b.d ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.b ##22 ENSGT00940000153216.a.b.c ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.c ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.qb ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.b.b.c ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.b.b.d ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.e.c ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009776.j.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b.d ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.b ##22 ENSGT00940000153216.a.b.c ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.c ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.qb ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 508 ENSMNEG00000039998 ENSMNEG00000029126 ENSMNEG00000030236 ENSMNEG00000033443 ENSMNEG00000041850 PRAMEF20 (ENSMNEG00000043597) LRRC38 (ENSMNEG00000043446) PDPN (ENSMNEG00000043777) PRDM2 (ENSMNEG00000039705) KAZN (ENSMNEG00000038651) ENSMNEG00000027989 TMEM51 (ENSMNEG00000030790) FHAD1 (ENSMNEG00000045473) EFHD2 (ENSMNEG00000029503) CTRC (ENSMNEG00000029283) ENSMNEG00000033814 ##22 ENSMNEG00000034527 ##22 CELA2B (ENSMNEG00000035015) ##22 CASP9 (ENSMNEG00000032453) DNAJC16 (ENSMNEG00000015068) AGMAT (ENSMNEG00000038882) RSC1A1 (ENSMNEG00000027911) PLEKHM2 (ENSMNEG00000027232) SLC25A34 (ENSMNEG00000029592) TMEM82 (ENSMNEG00000044140) FBLIM1 (ENSMNEG00000041350) SPEN (ENSMNEG00000042402) ZBTB17 (ENSMNEG00000037648) SRARP (ENSMNEG00000041116) HSPB7 (ENSMNEG00000030966) CLCNKB (ENSMNEG00000030409) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.b ##22 Rhesus MODERN SPECIES 246 ENSMMUG00000051177 ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 554 ENSCATG00000002331 ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 213 ENSGT01030000234528.B.a.a.pb.d.b.b ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.qb ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748.a ENSGT00950000183106.b.d Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2676 CELA2A (ENSRBIG00000028562) ##22 CELA2B (ENSRBIG00000032017) ##22 CASP9 (ENSRBIG00000030398) DNAJC16 (ENSRBIG00000044102) AGMAT (ENSRBIG00000029662) RSC1A1 (ENSRBIG00000031118) PLEKHM2 (ENSRBIG00000039082) SLC25A34 (ENSRBIG00000042919) TMEM82 (ENSRBIG00000041799) FBLIM1 (ENSRBIG00000036960) SPEN (ENSRBIG00000039654) ENSRBIG00000041098 ZBTB17 (ENSRBIG00000031303) SRARP (ENSRBIG00000031032) HSPB7 (ENSRBIG00000030637) CLCNKA (ENSRBIG00000032787) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.e ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00950000183107.a.b.a.tb.a ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 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##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003.f ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748.a ENSGT00940000158748.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.e.b.b ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.a.b ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.b.b.b ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00950000183107.a.b.a.tb.a ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a.pb ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.qb ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003.f 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ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00950000183107.a.b.a.tb.a ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00390000009710.p.a ENSGT00940000154570.b ENSGT00940000167437.a ENSGT00390000009776.j.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a.pb ##22 ENSGT01030000234528.B.a.a.qb ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003.f ENSGT00940000159003.e.a ENSGT00390000003860.h.a.a.d ENSGT00390000013067.a.a ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.b.b.b ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00950000183107.a.b.a.tb.a ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00390000009710.p.a ENSGT00940000154570.b ENSGT00940000167437.a ENSGT00390000009776.j.b ENSGT00390000009278 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ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.f.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.b.b.e.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.a.f ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b.d ENSGT01030000234528.B.a.a.qb ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748.a ENSGT00940000158748.b Olive baboon MODERN SPECIES AADACL4 (ENSPANG00000009070) AADACL3 (ENSPANG00000000763) CFAP107 (ENSPANG00000013325) ENSPANG00000032026 ENSPANG00000019717 ENSPANG00000008813 ENSPANG00000013765 LRRC38 (ENSPANG00000050121) PDPN (ENSPANG00000009068) PRDM2 (ENSPANG00000007508) KAZN (ENSPANG00000005382) ENSPANG00000040374 ENSPANG00000045260 ENSPANG00000019569 EFHD2 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ENSGT00940000158748.a ENSGT00950000183106.b.d ENSGT00940000158748.b Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2375 ENSRROG00000029217 ##22 CELA2B (ENSRROG00000029503) ##22 CASP9 (ENSRROG00000041647) DNAJC16 (ENSRROG00000021561) AGMAT (ENSRROG00000032926) RSC1A1 (ENSRROG00000042834) PLEKHM2 (ENSRROG00000040448) SLC25A34 (ENSRROG00000029182) TMEM82 (ENSRROG00000030864) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2676 CELA2A (ENSRBIG00000028562) ##22 CELA2B (ENSRBIG00000032017) ##22 CASP9 (ENSRBIG00000030398) DNAJC16 (ENSRBIG00000044102) AGMAT (ENSRBIG00000029662) RSC1A1 (ENSRBIG00000031118) PLEKHM2 (ENSRBIG00000039082) SLC25A34 (ENSRBIG00000042919) TMEM82 (ENSRBIG00000041799) FBLIM1 (ENSRBIG00000036960) SPEN (ENSRBIG00000039654) ENSRBIG00000041098 ZBTB17 (ENSRBIG00000031303) SRARP (ENSRBIG00000031032) HSPB7 (ENSRBIG00000030637) CLCNKA (ENSRBIG00000032787) ENSRBIG00000037053 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158724 ENSGT00940000157630 ENSGT00940000162160 ENSGT00390000014553 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ENSANAG00000018563 SRARP (ENSANAG00000030546) HSPB7 (ENSANAG00000020521) ENSANAG00000023434 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157630 ENSGT00940000162160 ENSGT00390000014553 ENSGT01030000234531.A.b.b.b ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00910000148116 ENSGT00390000002770 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748 ENSGT00950000183106.b Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 2250 ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000159698 Common shrew DUPLICATION Common shrew MODERN SPECIES 4216 ENSSARG00000012596 ##22 ENSSARG00000012599 ##22 CASP9 (ENSSARG00000012611) Common shrew MODERN SPECIES 4216 ENSSARG00000012596 ##22 ENSSARG00000012599 ##22 CASP9 (ENSSARG00000012611) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157630 ENSGT00940000162160 ENSGT00390000014553 ENSGT01030000234531.A.b.b.b ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00910000148116 ENSGT00390000002770 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748 ENSGT00950000183106.b Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157630 ENSGT00940000162160 ENSGT00390000014553 ENSGT01030000234531.A.b.b.b ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00910000148116 ENSGT00390000002770 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748 ENSGT00950000183106.b Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1745 ENSAMEG00000026366 ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000049215 ENSGT00940000161800 ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000158724 ENSGT00940000162160 ENSGT00390000014553 ENSGT01030000234531.A.b.b.b ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b.l ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748 ENSGT00950000183106.b Equus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183083.b.j ENSGT01040000241632 ENSGT00940000158724 ENSGT00940000162160 ENSGT00390000014553 ENSGT01030000234531.A.b.b.b ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00390000002770 ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b.k ENSGT00940000157087.a.b.l ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748 ENSGT00950000183106.b Horse MODERN SPECIES 11 TNFRSF8 (ENSECAG00000014108) TNFRSF1B (ENSECAG00000012481) VPS13D (ENSECAG00000016150) ENSECAG00000045103 DHRS3 (ENSECAG00000013582) AADACL3 (ENSECAG00000013280) CFAP107 (ENSECAG00000033407) ENSECAG00000010285 LRRC38 (ENSECAG00000010195) ENSECAG00000032595 ENSECAG00000050440 PRDM2 (ENSECAG00000008911) KAZN (ENSECAG00000006829) FHAD1 (ENSECAG00000025126) CTRC (ENSECAG00000025069) ENSECAG00000020902 ##22 CASP9 (ENSECAG00000017291) DNAJC16 (ENSECAG00000010422) AGMAT (ENSECAG00000008308) ENSECAG00000041115 PLEKHM2 (ENSECAG00000014652) SLC25A34 (ENSECAG00000013382) TMEM82 (ENSECAG00000013016) FBLIM1 (ENSECAG00000011874) ENSECAG00000050306 SPEN (ENSECAG00000008833) ZBTB17 (ENSECAG00000024826) SRARP (ENSECAG00000024814) ENSECAG00000023589 FAM131C (ENSECAG00000023469) EPHA2 (ENSECAG00000007650) Donkey MODERN SPECIES 25 AADACL3 (ENSEASG00005027488) ENSEASG00005008351 CFAP107 (ENSEASG00005016042) ENSEASG00005015988 ENSEASG00005015978 ENSEASG00005015975 ENSEASG00005028661 PRDM2 (ENSEASG00005015970) ENSEASG00005027620 ENSEASG00005037107 ENSEASG00005032223 TMEM51 (ENSEASG00005015962) FHAD1 (ENSEASG00005015958) EFHD2 (ENSEASG00005015953) CTRC (ENSEASG00005015948) ENSEASG00005015940 ##22 CASP9 (ENSEASG00005015937) DNAJC16 (ENSEASG00005015931) AGMAT (ENSEASG00005015929) ENSEASG00005015927 PLEKHM2 (ENSEASG00005015922) SLC25A34 (ENSEASG00005031113) TMEM82 (ENSEASG00005015917) FBLIM1 (ENSEASG00005015915) ENSEASG00005028986 ENSEASG00005032545 ENSEASG00005015911 ZBTB17 (ENSEASG00005015905) SRARP (ENSEASG00005015903) HSPB7 (ENSEASG00005028862) ENSEASG00005015892 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000049215 ENSGT00940000161800 ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000158724 ENSGT00940000162160 ENSGT00390000014553 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ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b.l ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748 ENSGT00950000183106.b Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 27 VPS13D (ENSRFEG00010008330) DHRS3 (ENSRFEG00010008475) ENSRFEG00010008557 ENSRFEG00010008603 ENSRFEG00010008691 ENSRFEG00010008754 ENSRFEG00010008828 LRRC38 (ENSRFEG00010008885) PDPN (ENSRFEG00010008924) PRDM2 (ENSRFEG00010009040) KAZN (ENSRFEG00010009239) TMEM51 (ENSRFEG00010009731) FHAD1 (ENSRFEG00010009808) EFHD2 (ENSRFEG00010010221) CTRC (ENSRFEG00010010289) ENSRFEG00010010440 ##22 CASP9 (ENSRFEG00010010566) DNAJC16 (ENSRFEG00010010616) AGMAT (ENSRFEG00010010690) ENSRFEG00010010770 PLEKHM2 (ENSRFEG00010010902) SLC25A34 (ENSRFEG00010011058) TMEM82 (ENSRFEG00010011094) FBLIM1 (ENSRFEG00010011168) SPEN (ENSRFEG00010011277) ZBTB17 (ENSRFEG00010011332) ENSRFEG00010011449 HSPB7 (ENSRFEG00010011506) ENSRFEG00010011668 FAM131C (ENSRFEG00010012642) EPHA2 (ENSRFEG00010012706) Microbat MODERN SPECIES 1534 CTRC (ENSMLUG00000009673) ENSMLUG00000029907 ##22 CASP9 (ENSMLUG00000009690) DNAJC16 (ENSMLUG00000009703) AGMAT (ENSMLUG00000009755) DDI2 (ENSMLUG00000030669) RSC1A1 (ENSMLUG00000000499) PLEKHM2 (ENSMLUG00000000500) SLC25A34 (ENSMLUG00000028747) TMEM82 (ENSMLUG00000028439) FBLIM1 (ENSMLUG00000010113) SPEN (ENSMLUG00000010144) ZBTB17 (ENSMLUG00000025202) ENSMLUG00000010219 HSPB7 (ENSMLUG00000010227) ENSMLUG00000008328 FAM131C (ENSMLUG00000009116) Megabat MODERN SPECIES 1018 ENSPVAG00000005074 ##22 CASP9 (ENSPVAG00000005080) DNAJC16 (ENSPVAG00000005081) AGMAT (ENSPVAG00000005083) DDI2 (ENSPVAG00000005084) RSC1A1 (ENSPVAG00000005085) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162160 ENSGT00390000014553 ENSGT01030000234531.A.b.b.b.i.a.b ENSGT01030000234531.A.b.b.b.i.a.a.a.b ENSGT01030000234531.A.b.b.b.i.a.a.b ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 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ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000000265 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000158748 ENSGT00950000183106.b Pig MODERN SPECIES 14 ENSSSCG00000063473 ENSSSCG00000059389 ENSSSCG00000040680 ENSSSCG00000037632 LRRC38 (ENSSSCG00000003449) ENSSSCG00000003448 PDPN (ENSSSCG00000003451) PRDM2 (ENSSSCG00000020710) ENSSSCG00000054874 ENSSSCG00000043303 KAZN (ENSSSCG00000037676) TMEM51 (ENSSSCG00000021026) FHAD1 (ENSSSCG00000003455) EFHD2 (ENSSSCG00000003458) CTRC (ENSSSCG00000054068) CELA2A (ENSSSCG00000003459) ##22 CASP9 (ENSSSCG00000003460) DNAJC16 (ENSSSCG00000003464) AGMAT (ENSSSCG00000003463) RSC1A1 (ENSSSCG00000003461) PLEKHM2 (ENSSSCG00000003468) SLC25A34 (ENSSSCG00000032950) TMEM82 (ENSSSCG00000003466) FBLIM1 (ENSSSCG00000003465) ZBTB17 (ENSSSCG00000026103) ENSSSCG00000059667 SRARP 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(ENSCHIG00000013701) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000234531.A.b.b.b.i.a.a.b.a.a.a.b.b ENSGT01030000234531.A.b.b.b.i.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.i.a.a.b.a.a.a.b.a ENSGT01030000234531.A.b.b.b.i.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234531.A.b.b.b.i.a.a.b.b ENSGT00940000162571 ENSGT00390000000013 ENSGT00940000159410 ENSGT00390000002770 ENSGT00940000154570.a.b ENSGT00940000154570.b ENSGT00390000009278 ENSGT00940000154171.A ENSGT00390000012058.c.b ENSGT00940000153216.a.b ENSGT01030000234528.B.a.a ##22 ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00950000182999.a.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00940000160830 ENSGT00390000010057 ENSGT00940000157635 ENSGT00390000003618 American bison DUPLICATION American bison MODERN SPECIES 3204 ENSBBBG00000003702 ENSBBBG00000003719 ENSBBBG00000015055 ENSBBBG00000015074 ENSBBBG00000015138 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KLHL17 (ENSBTAG00000013813) PERM1 (ENSBTAG00000014540) Cow MODERN SPECIES 7 ENSBTAG00000046630 ENSBTAG00000051014 ENSBTAG00000054147 ENSBTAG00000050422 ENSBTAG00000024791 LRRC38 (ENSBTAG00000017883) PDPN (ENSBTAG00000001788) PRDM2 (ENSBTAG00000020552) ENSBTAG00000050764 ENSBTAG00000054228 KAZN (ENSBTAG00000015606) TMEM51 (ENSBTAG00000005300) FHAD1 (ENSBTAG00000002408) EFHD2 (ENSBTAG00000009048) CTRC (ENSBTAG00000024497) ##22 CELA2A (ENSBTAG00000024496) ##22 CASP9 (ENSBTAG00000002472) DNAJC16 (ENSBTAG00000002476) AGMAT (ENSBTAG00000002478) ENSBTAG00000039662 PLEKHM2 (ENSBTAG00000018722) SLC25A34 (ENSBTAG00000018723) TMEM82 (ENSBTAG00000018724) FBLIM1 (ENSBTAG00000018725) SPEN (ENSBTAG00000018729) ZBTB17 (ENSBTAG00000018730) SAMD11 (ENSBTAG00000008739) NOC2L (ENSBTAG00000016528) KLHL17 (ENSBTAG00000013813) PERM1 (ENSBTAG00000014540) HES4 (ENSBTAG00000014705) Hybrid Bos Indicus DUPLICATION Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 7 ENSBIXG00005006987 ENSBIXG00005010103 ENSBIXG00005000864 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ENSGT00940000159698 ENSGT00940000155851 ENSGT00950000183195.a ENSGT00390000005744 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003.d ENSGT00940000154141.B.t.b ENSGT01100000263480.a.b.a.a.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00940000160830 ENSGT00390000010057 ENSGT00940000157635 Wild yak MODERN SPECIES 185 ENSBMUG00000025697 ENSBMUG00000025687 KAZN (ENSBMUG00000025682) TMEM51 (ENSBMUG00000025671) FHAD1 (ENSBMUG00000025658) EFHD2 (ENSBMUG00000025629) CTRC (ENSBMUG00000025619) ENSBMUG00000025605 ##22 CASP9 (ENSBMUG00000025595) DNAJC16 (ENSBMUG00000025587) AGMAT (ENSBMUG00000025575) ENSBMUG00000025563 PLEKHM2 (ENSBMUG00000025554) SLC25A34 (ENSBMUG00000025524) TMEM82 (ENSBMUG00000025518) FBLIM1 (ENSBMUG00000025515) SPEN (ENSBMUG00000025507) ZBTB17 (ENSBMUG00000025489) SAMD11 (ENSBMUG00000025476) NOC2L (ENSBMUG00000025453) KLHL17 (ENSBMUG00000025442) PLEKHN1 (ENSBMUG00000025439) ENSBMUG00000025435 Domestic yak MODERN SPECIES 5 ENSBGRG00000021466 ENSBGRG00000021449 ENSBGRG00000021430 ENSBGRG00000021379 ENSBGRG00000021323 ENSBGRG00000021291 LRRC38 (ENSBGRG00000021255) ENSBGRG00000021152 PRDM2 (ENSBGRG00000020945) ENSBGRG00000020912 KAZN (ENSBGRG00000020603) TMEM51 (ENSBGRG00000020549) FHAD1 (ENSBGRG00000020058) EFHD2 (ENSBGRG00000020005) CTRC (ENSBGRG00000019947) ENSBGRG00000019856 ##22 CASP9 (ENSBGRG00000019581) DNAJC16 (ENSBGRG00000019367) AGMAT (ENSBGRG00000019283) ENSBGRG00000019177 PLEKHM2 (ENSBGRG00000019013) SLC25A34 (ENSBGRG00000018908) TMEM82 (ENSBGRG00000018870) ENSBGRG00000018722 ENSBGRG00000018679 ENSBGRG00000018650 SPEN (ENSBGRG00000017603) ZBTB17 (ENSBGRG00000017262) SAMD11 (ENSBGRG00000017044) NOC2L (ENSBGRG00000016844) KLHL17 (ENSBGRG00000016634) Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 5 ENSCHYG00000025520 ENSCHYG00000025494 ENSCHYG00000025470 ENSCHYG00000025459 ENSCHYG00000025443 ENSCHYG00000025290 ENSCHYG00000025053 ENSCHYG00000024944 ENSCHYG00000024866 LRRC38 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ENSCMIG00000002383 ctdnep1a (ENSCMIG00000002397) ENSCMIG00000002409 ##22 ENSCMIG00000002423 FBXO2 (ENSCMIG00000002432) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 Coelacanth MODERN SPECIES 252 ENSLACG00000015265 rap1gapa (ENSLACG00000015738) alpl (ENSLACG00000017157) alpl (ENSLACG00000017187) ECE1 (ENSLACG00000017425) ENSLACG00000017443 EIF4G3 (ENSLACG00000017636) HP1BP3 (ENSLACG00000017868) SH2D5 (ENSLACG00000017939) KIF17 (ENSLACG00000017977) CLDN19 (ENSLACG00000018062) ENSLACG00000018111 YBX1 (ENSLACG00000018135) PPIH (ENSLACG00000018153) ENSLACG00000018183 ##22 ela3l (ENSLACG00000018193) ##22 ENSLACG00000018236 ##22 CASP9 (ENSLACG00000018259) DNAJC16 (ENSLACG00000018275) AGMAT (ENSLACG00000018305) CDA (ENSLACG00000022185) ENSLACG00000018329 ENSLACG00000018368 FAM43B (ENSLACG00000018434) MUL1 (ENSLACG00000018453) CAMK2N1 (ENSLACG00000018467) 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(ENSECRG00000011333) FOCAD (ENSECRG00000011383) ENSECRG00000011495 ENSECRG00000011506 H2AZ1 (ENSECRG00000011528) DDIT4L (ENSECRG00000011559) SLC39A8 (ENSECRG00000011574) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00940000154822.b ENSGT00900000141033.a ENSGT00940000161917 ENSGT00940000154929.A ENSGT00940000159834 ENSGT01030000234614.A ENSGT00910000144278 ENSGT01100000263557.A.b.a.b.b ENSGT00390000002865 ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 ENSGT00390000003050 ENSGT00940000160904 ENSGT00940000158864 ENSGT00390000016188 ENSGT00390000012082 ENSGT00940000157302 ENSGT00940000155805 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000160474 ENSGT00940000153499.a ENSGT00400000024390 ENSGT00390000002216 ENSGT00940000157438 ENSGT00390000015757 ENSGT00940000164013 Spotted gar MODERN SPECIES 658 ENSLOCG00000004288 OCLN (ENSLOCG00000004307) gtf2h2 (ENSLOCG00000004339) erap1b (ENSLOCG00000004362) naaladl1 (ENSLOCG00000004396) PIGO (ENSLOCG00000004414) stoml2 (ENSLOCG00000004431) ATOSB (ENSLOCG00000004450) UNC13B 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ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 ENSGT01100000263835 ENSGT00390000000860.b.a ENSGT00940000161008.e P. kingsleyae MODERN SPECIES 202 ANKRD34B (ENSPKIG00000014386) fam151b (ENSPKIG00000014403) ccdc125 (ENSPKIG00000014452) zgc:86811 (ENSPKIG00000014514) marveld2b (ENSPKIG00000014545) oclnb (ENSPKIG00000014568) gtf2h2 (ENSPKIG00000014619) naaladl1 (ENSPKIG00000014715) ENSPKIG00000014776 ENSPKIG00000014812 ENSPKIG00000014900 RUSC2 (ENSPKIG00000014978) ENSPKIG00000015023 ENSPKIG00000015060 PHF24 (ENSPKIG00000015104) ela3l (ENSPKIG00000015147) ##22 ENSPKIG00000015166 fam219ab (ENSPKIG00000015193) MYORG (ENSPKIG00000015235) CERT1 (ENSPKIG00000015282) POLK (ENSPKIG00000015422) ANKDD1B (ENSPKIG00000015545) Asian bonytongue MODERN SPECIES 8 zgc:86811 (ENSSFOG00015009920) marveld2b (ENSSFOG00015009959) oclnb (ENSSFOG00015009975) gtf2h2 (ENSSFOG00015010024) erap1b (ENSSFOG00015010153) naaladl1 (ENSSFOG00015010218) ENSSFOG00015031620 ENSSFOG00015010290 ENSSFOG00015010334 ENSSFOG00015010630 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(ENSELUG00000002217) ENSELUG00000029793 abhd17b (ENSELUG00000002227) zgc:101016 (ENSELUG00000024930) gda (ENSELUG00000002255) si:ch211-214j8.12 (ENSELUG00000002271) zfand5a (ENSELUG00000001198) TMC1 (ENSELUG00000002296) tmc2b (ENSELUG00000002307) ALDH1A1 (ENSELUG00000002323) anxa1a (ENSELUG00000002356) Northern pike MODERN SPECIES 16 rplp0 (ENSELUG00000023779) golga7 (ENSELUG00000023735) ENSELUG00000023650 loxl2a (ENSELUG00000023614) TACC1 (ENSELUG00000023543) plpp5 (ENSELUG00000023535) LETM2 (ENSELUG00000023516) ##29 ENSELUG00000023467 ENSELUG00000023429 hvcn1 (ENSELUG00000023400) crybb3 (ENSELUG00000023349) ENSELUG00000023319 ENSELUG00000023309 MSI1 (ENSELUG00000023280) TMEM233 (ENSELUG00000023245) ela3l (ENSELUG00000023230) ##22 dnai1.2 (ENSELUG00000023087) ENSELUG00000023052 fam219aa (ENSELUG00000030926) zgc:109965 (ENSELUG00000023031) rem1 (ENSELUG00000022935) ENSELUG00000022901 pnp4a (ENSELUG00000022846) sox12 (ENSELUG00000022839) trib3 (ENSELUG00000022831) maf1a 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ENSGT00940000158607 ENSGT00940000160930 ENSGT00940000165452.b ENSGT00940000157556.b ENSGT00390000005989.b.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000163496.b.a.c.a ENSGT00390000016407 ENSGT00940000158982 ENSGT00940000155411.c ENSGT00940000154880.g ENSGT00940000154880.h ENSGT00940000158711 ENSGT01040000240520 ENSGT00390000017819 ENSGT00940000158491.a ENSGT00940000153352.A ENSGT00940000166675 ENSGT00940000154078.a.b ENSGT00940000156168.A ENSGT00950000182913.A.a.a ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 ENSGT00940000176952 ENSGT00390000000860.b.a ENSGT00940000160905 ENSGT00940000157366 ENSGT00940000153636.b ENSGT00940000157611 ENSGT00440000033805 ENSGT00390000017130 ENSGT00610000087464 ENSGT01100000263540.B.d ENSGT00940000158607 ENSGT00940000165452.b ENSGT00940000157556.b ENSGT00390000005989.b.a ENSGT00940000164380.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 320 adgrv1 (ENSHBUG00000014231) lysmd3 (ENSHBUG00000014043) ENSHBUG00000014029 mblac2 (ENSHBUG00000014018) rtkna (ENSHBUG00000014009) smn1 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MODERN SPECIES 23 gig2p (ENSCGOG00000007512) SKIC3 (ENSCGOG00000006098) arsk (ENSCGOG00000005982) arrdc3a (ENSCGOG00000005931) ENSCGOG00000005929 ENSCGOG00000005925 lysmd3 (ENSCGOG00000005923) ENSCGOG00000005920 mblac2 (ENSCGOG00000005919) rtkna (ENSCGOG00000005737) smn1 (ENSCGOG00000005722) hspb11 (ENSCGOG00000005721) LZTS1 (ENSCGOG00000005712) ENSCGOG00000005704 bco2l (ENSCGOG00000005696) ela3l (ENSCGOG00000005678) ##22 ENSCGOG00000005674 fam219ab (ENSCGOG00000005654) klf9 (ENSCGOG00000005651) TRPM3 (ENSCGOG00000005145) cemip2 (ENSCGOG00000004855) abhd17b (ENSCGOG00000004819) zgc:101016 (ENSCGOG00000004816) gda (ENSCGOG00000004648) si:ch211-214j8.12 (ENSCGOG00000004645) entpd4 (ENSCGOG00000004248) slc25a37 (ENSCGOG00000004235) nkx3-1 (ENSCGOG00000004229) nkx2.7 (ENSCGOG00000004224) stc1 (ENSCGOG00000004216) ido1 (ENSCGOG00000004183) Pike perch MODERN SPECIES 2 adgra2 (ENSSLUG00000008497) pdlim2 (ENSSLUG00000009368) sorbs3 (ENSSLUG00000009372) SKIC3 (ENSSLUG00000009430) arrdc3a 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ENSGT00940000156168.A ENSGT00950000182913.A.a.a ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 ENSGT00940000176952 ENSGT00390000000860.b.a ENSGT00940000160905 ENSGT00940000157366 ENSGT00940000153636.b ENSGT00940000157611 ENSGT00440000033805 ENSGT00390000017130 ENSGT00610000087464 ENSGT01100000263540.B.d ENSGT00940000158607 ENSGT00940000160930 ENSGT00940000157556.b ENSGT00390000005989.b.a ENSGT00940000164380.a Carangaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000004985.a ENSGT00940000163496.b.a.c.b ENSGT00390000016407 ENSGT00940000158982 ENSGT00940000155411.c ENSGT00940000154880 ENSGT00940000158711 ENSGT01040000240520 ENSGT00390000017819 ENSGT00940000158491.a ENSGT00940000153352.A ENSGT00940000166675 ENSGT00940000154078.a.b ENSGT00940000156168.A ENSGT00950000182913.A.a.a ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 ENSGT00940000176952 ENSGT00390000000860.b.a ENSGT00940000160905 ENSGT00940000157366 ENSGT00940000153636.b ENSGT00940000157611 ENSGT00440000033805 ENSGT00390000017130 ENSGT00610000087464 ENSGT01100000263540.B.d ENSGT00940000158607 ENSGT00940000160930 ENSGT00940000157556.b ENSGT00390000005989.b.a ENSGT00940000164380.a Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000004985.a ENSGT00940000163496.b.a.c.b ENSGT00390000016407 ENSGT00940000158982 ENSGT00940000155411.c ENSGT00940000154880 ENSGT00940000158711 ENSGT01040000240520 ENSGT00390000017819 ENSGT00940000158491.a ENSGT00940000153352.A ENSGT00940000166675 ENSGT00940000154078.a.b ENSGT00940000156168.A ENSGT00950000182913.A.a.a ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 ENSGT00940000176952 ENSGT00390000000860.b.a ENSGT00940000160905 ENSGT00940000157366.n ENSGT00940000153636.b ENSGT00940000157611 ENSGT00440000033805 ENSGT00390000017130 ENSGT00610000087464 ENSGT01100000263540.B.d ENSGT00940000158607 ENSGT00940000160930 ENSGT00390000005989.b.a ENSGT00940000164380.a ENSGT00940000158918 Tongue sole DUPLICATION Tongue sole MODERN SPECIES 398 MCTP1 (ENSCSEG00000015560) zgc:194908 (ENSCSEG00000015552) SKIC3 (ENSCSEG00000015445) ENSCSEG00000015425 arrdc3a 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ENSGT00940000164380.a Barramundi perch MODERN SPECIES 95 gig2p (ENSLCAG00010027860) gig2p (ENSLCAG00010027858) SKIC3 (ENSLCAG00010027847) arsk (ENSLCAG00010027839) arrdc3a (ENSLCAG00010027838) adgrv1 (ENSLCAG00010027837) lysmd3 (ENSLCAG00010027835) ENSLCAG00010027834 mblac2 (ENSLCAG00010027831) rtkna (ENSLCAG00010027828) smn1 (ENSLCAG00010027827) hspb11 (ENSLCAG00010027826) LZTS1 (ENSLCAG00010027824) ENSLCAG00010027823 bco2l (ENSLCAG00010027822) ela3l (ENSLCAG00010027821) ##22 ENSLCAG00010027820 fam219ab (ENSLCAG00010027819) klf9 (ENSLCAG00010027817) TRPM3 (ENSLCAG00010027814) cemip2 (ENSLCAG00010027807) zgc:101016 (ENSLCAG00010027797) abhd17b (ENSLCAG00010027794) gda (ENSLCAG00010027792) si:ch211-214j8.12 (ENSLCAG00010027790) entpd4 (ENSLCAG00010027788) slc25a37 (ENSLCAG00010027785) nkx3-1 (ENSLCAG00010027784) stc1 (ENSLCAG00010027783) ido1 (ENSLCAG00010027782) RHOBTB2 (ENSLCAG00010027781) Seriola ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000004985.a ENSGT00940000163496.b.a.c.b 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ENSGT00940000158607 ENSGT00940000160930 ENSGT00940000157556.b ENSGT00390000005989.b.a ENSGT00940000164380.a Zig-zag eel MODERN SPECIES 23 SLF1 (ENSMAMG00000011335) MCTP1 (ENSMAMG00000011303) FAM81B (ENSMAMG00000011288) ENSMAMG00000011285 SKIC3 (ENSMAMG00000011266) arrdc3a (ENSMAMG00000011248) adgrv1 (ENSMAMG00000011138) ENSMAMG00000011099 ENSMAMG00000025077 mblac2 (ENSMAMG00000011089) rtkna (ENSMAMG00000011049) ENSMAMG00000011034 hspb11 (ENSMAMG00000026022) ENSMAMG00000010980 ENSMAMG00000027523 ela3l (ENSMAMG00000010642) ##22 ENSMAMG00000010638 bco2l (ENSMAMG00000010672) fam219ab (ENSMAMG00000010627) klf9 (ENSMAMG00000027923) TRPM3 (ENSMAMG00000010571) ENSMAMG00000025740 cemip2 (ENSMAMG00000010473) abhd17b (ENSMAMG00000028599) C9orf85 (ENSMAMG00000025643) gda (ENSMAMG00000010405) ENSMAMG00000010389 entpd4 (ENSMAMG00000010329) slc25a37 (ENSMAMG00000010310) nkx3-1 (ENSMAMG00000010300) ENSMAMG00000010284 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000004985.a ENSGT00940000163496.b.a.c.b ENSGT00390000016407 ENSGT00940000158982 ENSGT00940000155411.c ENSGT00940000154880 ENSGT00940000158711 ENSGT01040000240520 ENSGT00390000017819 ENSGT00940000158491.a ENSGT00940000153352.A ENSGT00940000166675 ENSGT00940000154078.a.b ENSGT00940000156168.A ENSGT00950000182913.A.a.a ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 ENSGT00940000176952 ENSGT00390000000860.b.a ENSGT00940000160905 ENSGT00940000157366 ENSGT00940000153636.b ENSGT00940000157611 ENSGT00440000033805 ENSGT00390000017130 ENSGT00610000087464 ENSGT01100000263540.B.d ENSGT00940000158607 ENSGT00940000165452.b ENSGT00390000005989.b.a ENSGT00940000164380.a ENSGT00940000158918 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 20 ENSBSLG00000014829 gig2p (ENSBSLG00000014809) SKIC3 (ENSBSLG00000014596) arsk (ENSBSLG00000014562) arrdc3a (ENSBSLG00000014525) lysmd3 (ENSBSLG00000013874) ENSBSLG00000013864 mblac2 (ENSBSLG00000013861) ENSBSLG00000013856 rtkna (ENSBSLG00000013783) smn1 (ENSBSLG00000013772) hspb11 (ENSBSLG00000013758) LZTS1 (ENSBSLG00000013736) 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sodierfish MODERN SPECIES 23 zgc:194908 (ENSMMDG00005011810) gig2p (ENSMMDG00005011809) SKIC3 (ENSMMDG00005011379) arsk (ENSMMDG00005011321) arrdc3a (ENSMMDG00005011314) adgrv1 (ENSMMDG00005011215) lysmd3 (ENSMMDG00005011176) ENSMMDG00005011174 mblac2 (ENSMMDG00005011172) rtkna (ENSMMDG00005011171) smn1 (ENSMMDG00005011169) hspb11 (ENSMMDG00005011166) LZTS1 (ENSMMDG00005011164) ENSMMDG00005011161 bco2l (ENSMMDG00005011143) ela3l (ENSMMDG00005011139) ##22 ENSMMDG00005011136 fam219ab (ENSMMDG00005011018) klf9 (ENSMMDG00005011015) TRPM3 (ENSMMDG00005011002) cemip2 (ENSMMDG00005006497) abhd17b (ENSMMDG00005006419) zgc:101016 (ENSMMDG00005006414) gda (ENSMMDG00005006361) si:ch211-214j8.12 (ENSMMDG00005006352) zfand5a (ENSMMDG00005006341) TMC1 (ENSMMDG00005006331) tmc2b (ENSMMDG00005006326) ALDH1A1 (ENSMMDG00005006321) cyp1d1 (ENSMMDG00005006317) ENSMMDG00005006313 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 NSG1 (ENSMMDG00005008331) aggf1 (ENSMMDG00005008332) ENSMMDG00005008338 loxl2a 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(ENSCHAG00000024023) fam151b (ENSCHAG00000024015) ankrd34bb (ENSCHAG00000024003) dhfr (ENSCHAG00000023995) dhfr (ENSCHAG00000023985) dhfr (ENSCHAG00000023983) ENSCHAG00000023982 si:ch211-214j8.12 (ENSCHAG00000023981) bco2l (ENSCHAG00000023828) ela3l (ENSCHAG00000023813) ##22 ENSCHAG00000023807 fam219ab (ENSCHAG00000023785) klf9 (ENSCHAG00000023779) TRPM3 (ENSCHAG00000023365) ENSCHAG00000023346 cemip2 (ENSCHAG00000022612) abhd17b (ENSCHAG00000022562) zgc:101016 (ENSCHAG00000022557) gda (ENSCHAG00000022270) zfand5a (ENSCHAG00000022244) TMC1 (ENSCHAG00000021935) tmc2b (ENSCHAG00000021594) ALDH1A1 (ENSCHAG00000018422) cyp1d1 (ENSCHAG00000018328) anxa1a (ENSCHAG00000018133) Atlantic herring MODERN SPECIES 3 PPP1CA (ENSCHAG00000012555) ENSCHAG00000012545 ENSCHAG00000012477 CUX2 (ENSCHAG00000012465) MTMR3 (ENSCHAG00000007923) CIT (ENSCHAG00000007548) RAB35 (ENSCHAG00000007521) rplp0 (ENSCHAG00000007441) ENSCHAG00000007340 CRYBB2 (ENSCHAG00000007319) crybb3 (ENSCHAG00000007098) ENSCHAG00000007087 ENSCHAG00000007078 MSI1 (ENSCHAG00000006959) ENSCHAG00000006947 ela3l (ENSCHAG00000005425) ##22 zgc:73226 (ENSCHAG00000005341) ENSCHAG00000003789 TRAF2 (ENSCHAG00000003456) RABL6 (ENSCHAG00000003414) AJM1 (ENSCHAG00000003401) MAPKAP1 (ENSCHAG00000003113) ENSCHAG00000002486 mvb12ba (ENSCHAG00000002360) lmx1ba (ENSCHAG00000027553) rapgef1b (ENSCHAG00000027537) uck1 (ENSCHAG00000027526) dnlz (ENSCHAG00000027525) lrrc8aa (ENSCHAG00000027524) phyhd1 (ENSCHAG00000027521) dolk (ENSCHAG00000027518) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00940000157027.n.a ENSGT01030000234598.b.b ENSGT00940000159086 ENSGT00490000043395 ENSGT00730000110989.c.b ENSGT00940000155771.d ENSGT00390000015930 ENSGT00440000039046 ENSGT00940000166823 ENSGT00530000063681.b.a ENSGT00390000012355.A.a.a.a ENSGT00940000165661 ENSGT00390000012710 ENSGT00610000087464 ENSGT00950000182913.A.a.a ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 ENSGT01100000263835 ENSGT00390000000860.b.a ENSGT00740000116816 ENSGT00940000160905 ENSGT00940000157366 ENSGT00940000153636.b ENSGT00940000157611 ENSGT00440000033805 ENSGT00390000017130 ENSGT00940000164966.b.b ENSGT01050000244942.b.a.a ENSGT01050000244942.b.a.b.e.a ENSGT00940000154609 ENSGT00950000183037.A.b ENSGT00940000167114 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00390000012733 ENSGT00940000157027.n.a ENSGT01030000234598.b.b ENSGT00940000159086 ENSGT00490000043395 ENSGT00730000110989.c.b ENSGT00940000155771.d ENSGT00390000015930 ENSGT00440000039046 ENSGT00940000166823 ENSGT00530000063681.b.a ENSGT00390000012355.A.a.a.a ENSGT00940000165661 ENSGT00610000087464 ENSGT00950000182913.A.a.a ENSGT01030000234528.B.a.b ##22 ENSGT01100000263835 ENSGT00390000000860.b.a ENSGT00740000116816 ENSGT00940000160905 ENSGT00940000157366 ENSGT00940000153636.b ENSGT00940000157611 ENSGT00440000033805 ENSGT00390000017130 ENSGT00940000164966.b.b.a ENSGT01050000244942.b.a.a ENSGT01050000244942.b.a.b.e.a ENSGT00950000183037.A.b ENSGT00940000167114 ENSGT00940000180176 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b.c.b ENSGT00390000012733.l ENSGT00940000157027.n.a.f ENSGT01030000234598.b.b.f ENSGT00940000159086.o.a ENSGT00490000043395.o ENSGT00730000110989.c.b.b ENSGT00940000155771.d.a ENSGT00390000015930.ib ENSGT00440000039046.d ENSGT00940000166823.b ENSGT00390000012355.A.a.a.a.d ENSGT00940000165661.f ENSGT00610000087464 ENSGT00950000182913.A.a.a ENSGT01030000234528.B.a.b.w ##22 ENSGT01100000263835.a ENSGT00390000000860.b.a.e ENSGT00940000160905.q.a ENSGT00940000157366.h ENSGT00940000153636.b.kb ENSGT00940000157611.c.a ENSGT00440000033805.mb ENSGT00390000017130.h ENSGT00940000164966.b.b.a.b ENSGT01050000244942.b.a.a.b ENSGT01050000244942.b.a.b.e.a ENSGT00950000183037.A.b ENSGT00940000167114 ENSGT00940000180176 ENSGT00940000155221.fb.i Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234578.A.b.a.a.b.c.b ENSGT00390000012733.l ENSGT00940000157027.n.a.f ENSGT01030000234598.b.b.f ENSGT00940000159086.o.a ENSGT00490000043395.o ENSGT00730000110989.c.b.b ENSGT00940000155771.d.a ENSGT00390000015930.ib ENSGT00440000039046.d ENSGT00940000166823.b ENSGT00390000012355.A.a.a.a.d ENSGT00940000165661.f ENSGT00610000087464 ENSGT00950000182913.A.a.a ENSGT01030000234528.B.a.b.w ##22 ENSGT01100000263835.a ENSGT00390000000860.b.a.e ENSGT00940000160905.q.a ENSGT00940000157366.h ENSGT00940000153636.b.kb ENSGT00940000157611.c.a ENSGT00440000033805.mb ENSGT00390000017130.h ENSGT00940000164966.b.b.a.b ENSGT01050000244942.b.a.a.b ENSGT01050000244942.b.a.b.e.a.a ENSGT00940000167114 ENSGT00940000180176 ENSGT00940000155221.fb.i ENSGT00940000154019.b.a Common carp reference MODERN SPECIES 7 ENSCCRG00000032468 rnf181 (ENSCCRG00000017981) tmem150aa (ENSCCRG00000055631) tango2 (ENSCCRG00000054245) arvcfb (ENSCCRG00000052725) erap1b (ENSCCRG00000056077) gtf2h2 (ENSCCRG00000002382) oclnb (ENSCCRG00000059341) marveld2b (ENSCCRG00000003357) zgc:86811 (ENSCCRG00000079444) rad17 (ENSCCRG00000062948) ccdc125 (ENSCCRG00000003513) ankrd34bb (ENSCCRG00000003521) ENSCCRG00000003532 ENSCCRG00000023448 ela3l (ENSCCRG00000063263) ##22 fam219ab (ENSCCRG00000062312) TRPM3 (ENSCCRG00000003758) cemip2 (ENSCCRG00000013344) zgc:101016 (ENSCCRG00000013472) gda (ENSCCRG00000013480) zfand5a (ENSCCRG00000061837) TMC1 (ENSCCRG00000013500) tmc2b (ENSCCRG00000013514) ENSCCRG00000077182 ENSCCRG00000082015 anxa1a (ENSCCRG00000062622) ENSCCRG00000078766 rorb (ENSCCRG00000018080) trpm6 (ENSCCRG00000018012) carnmt1 (ENSCCRG00000030327) Golden-line barbel MODERN SPECIES 194 tmem150aa (ENSSGRG00000014523) tango2 (ENSSGRG00000014526) arvcfb (ENSSGRG00000014530) erap1b (ENSSGRG00000014561) ENSSGRG00000014848 gtf2h2 (ENSSGRG00000014857) oclnb (ENSSGRG00000014955) marveld2b (ENSSGRG00000014956) zgc:86811 (ENSSGRG00000014958) rad17 (ENSSGRG00000014971) ccdc125 (ENSSGRG00000015545) fam151b (ENSSGRG00000015546) ankrd34bb (ENSSGRG00000015549) dhfr (ENSSGRG00000015550) bco2l (ENSSGRG00000015554) ela3l (ENSSGRG00000015856) ##22 ENSSGRG00000015857 fam219ab (ENSSGRG00000015858) klf9 (ENSSGRG00000015859) TRPM3 (ENSSGRG00000015860) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 764 ENSGT01030000234528.B.a.b.x ##22 ENSGT00390000000860.b.a.f ENSGT00940000160905.q.b ENSGT00940000157366.g ENSGT00940000153636.b.jb ENSGT00940000157611.c.b ENSGT00440000033805.nb ENSGT00390000017130.g ENSGT00940000164966.b.b.a.a ENSGT01050000244942.b.a.a.a Goldfish MODERN SPECIES 23 ENSCARG00000020303 cidec (ENSCARG00000020295) prkcaa (ENSCARG00000019188) cacng5a (ENSCARG00000019159) cacng1a (ENSCARG00000019151) psmd12 (ENSCARG00000018936) ENSCARG00000018901 ppp1r12c (ENSCARG00000018859) ENSCARG00000018830 rhebl1 (ENSCARG00000018812) MTMR14 (ENSCARG00000016335) LHFPL4 (ENSCARG00000016224) dhfr (ENSCARG00000016209) si:ch211-214j8.12 (ENSCARG00000016206) bco2l (ENSCARG00000016147) ela3l (ENSCARG00000016120) ##22 ENSCARG00000016109 fam219ab (ENSCARG00000016016) klf9 (ENSCARG00000016006) TRPM3 (ENSCARG00000015762) cemip2 (ENSCARG00000015640) abhd17b (ENSCARG00000015618) zgc:101016 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ela3l (ENSCCRG00000023442) ##22 fam219ab (ENSCCRG00000003548) klf9 (ENSCCRG00000055416) TRPM3 (ENSCCRG00000004341) cemip2 (ENSCCRG00000028507) ABHD17B (ENSCCRG00000068502) zgc:101016 (ENSCCRG00000079367) gda (ENSCCRG00000000579) zfand5a (ENSCCRG00000053528) TMC1 (ENSCCRG00000000525) tmc2b (ENSCCRG00000000246) cyp1d1 (ENSCCRG00000022624) anxa1a (ENSCCRG00000020932) rorb (ENSCCRG00000030350) trpm6 (ENSCCRG00000030341) carnmt1 (ENSCCRG00000018002) Golden-line barbel MODERN SPECIES 151 ENSSGRG00000045342 arvcfb (ENSSGRG00000045194) naaladl1 (ENSSGRG00000045178) erap1b (ENSSGRG00000044999) gtf2h2 (ENSSGRG00000044652) oclnb (ENSSGRG00000044644) marveld2b (ENSSGRG00000044642) zgc:86811 (ENSSGRG00000044636) rad17 (ENSSGRG00000044442) ccdc125 (ENSSGRG00000044439) ENSSGRG00000044438 ankrd34bb (ENSSGRG00000044437) dhfr (ENSSGRG00000044436) si:ch211-214j8.12 (ENSSGRG00000044434) bco2l (ENSSGRG00000044433) ela3l (ENSSGRG00000044423) ##22 fam219ab (ENSSGRG00000044400) klf9 (ENSSGRG00000044397) TRPM3 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ENSPMAG00000006169 #22 Lamprey MODERN SPECIES 199 ENSPMAG00000006282 ENSPMAG00000006277 lypla1 (ENSPMAG00000006253) ENSPMAG00000006242 KLHL38 (ENSPMAG00000006233) ENSPMAG00000006219 #22 ENSPMAG00000006215 #22 ENSPMAG00000006204 #22 ENSPMAG00000006201 #22 ENSPMAG00000006196 ENSPMAG00000006191 #22 ENSPMAG00000006187 #22 ENSPMAG00000006169 #22 Lamprey MODERN SPECIES 172 ENSPMAG00000001456 #22 ENSPMAG00000001448 ENSPMAG00000001438 ENSPMAG00000001435 Lamprey DUPLICATION Lamprey DUPLICATION Lamprey DUPLICATION Lamprey MODERN SPECIES 199 ENSPMAG00000006282 ENSPMAG00000006277 lypla1 (ENSPMAG00000006253) ENSPMAG00000006242 KLHL38 (ENSPMAG00000006233) ENSPMAG00000006219 #22 ENSPMAG00000006215 #22 ENSPMAG00000006204 #22 ENSPMAG00000006201 #22 ENSPMAG00000006196 ENSPMAG00000006191 #22 ENSPMAG00000006187 #22 ENSPMAG00000006169 #22 Lamprey MODERN SPECIES 199 ENSPMAG00000006282 ENSPMAG00000006277 lypla1 (ENSPMAG00000006253) ENSPMAG00000006242 KLHL38 (ENSPMAG00000006233) ENSPMAG00000006219 #22 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Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 Orange clownfish MODERN SPECIES 17 frem3 (ENSAPEG00000010978) ENSAPEG00000011084 smarca5 (ENSAPEG00000011117) USP38 (ENSAPEG00000011231) gab1 (ENSAPEG00000011280) 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ENSGT00390000013329 ENSGT00940000154355 ENSGT00940000161439 ENSGT00950000183110.b.a ENSGT00390000013841 ENSGT00940000161913 ENSGT00940000159946 ENSGT00940000158050.r ENSGT00390000009230 Guinea pig MODERN SPECIES 272 ENSCPOG00000038697 TPGS1 (ENSCPOG00000024989) CDC34 (ENSCPOG00000038311) HCN2 (ENSCPOG00000015216) BSG (ENSCPOG00000023530) POLRMT (ENSCPOG00000023061) FGF22 (ENSCPOG00000000150) RNF126 (ENSCPOG00000023655) FSTL3 (ENSCPOG00000007417) ENSCPOG00000034874 PTBP1 (ENSCPOG00000025512) PLPPR3 (ENSCPOG00000023211) ELANE (ENSCPOG00000026112) ##22 CFD (ENSCPOG00000006278) MED16 (ENSCPOG00000022405) R3HDM4 (ENSCPOG00000036185) ENSCPOG00000022990 ARID3A (ENSCPOG00000011820) WDR18 (ENSCPOG00000011827) GRIN3B (ENSCPOG00000011834) TMEM259 (ENSCPOG00000011843) CNN2 (ENSCPOG00000020121) ABCA7 (ENSCPOG00000010076) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182870.a.a.a.a ENSGT00940000160480 ENSGT00510000049549 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000160356 ENSGT00940000159142 ENSGT00940000156523.b ENSGT00390000008060 ENSGT00940000161721 ENSGT00940000157113 ENSGT00940000161332 ENSGT00940000160580 ENSGT00940000154739.B ENSGT01050000244924.a.a.b.e.b ENSGT00940000160280 ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 ENSGT00940000162255 ENSGT00390000003821 ENSGT00390000015467 ENSGT00940000160899 ENSGT00390000000289 ENSGT00940000161021 ENSGT00390000013329 ENSGT00940000154355 ENSGT00940000161439 ENSGT00950000183110.b.a ENSGT00390000013841 ENSGT00940000161913 ENSGT00940000159946 ENSGT00940000158050.r ENSGT00390000009230 Degu MODERN SPECIES 91 ODF3L2 (ENSODEG00000011368) ENSODEG00000011069 TPGS1 (ENSODEG00000011090) CDC34 (ENSODEG00000012979) HCN2 (ENSODEG00000011701) BSG (ENSODEG00000012207) FGF22 (ENSODEG00000011315) RNF126 (ENSODEG00000012651) FSTL3 (ENSODEG00000012224) PALM (ENSODEG00000014425) MISP (ENSODEG00000011604) ENSODEG00000013281 ENSODEG00000020059 PTBP1 (ENSODEG00000012267) PLPPR3 (ENSODEG00000012524) ELANE (ENSODEG00000011098) ##22 CFD (ENSODEG00000011238) MED16 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(ENSDORG00000002915) Sbno2 (ENSDORG00000002916) Stk11 (ENSDORG00000000433) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000160356 ENSGT00940000162161.A ENSGT00940000159142 ENSGT00940000156523.b ENSGT00390000008060 ENSGT00940000161721 ENSGT00940000157113 ENSGT00940000161332 ENSGT00940000162457 ENSGT00940000160580 ENSGT00940000154739.B ENSGT01050000244924.a.a.b ENSGT00940000160280 ENSGT01030000234551.k.d.a.c ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 ENSGT00940000162255 ENSGT00390000003821 ENSGT00940000180759 ENSGT00390000015467 ENSGT00940000157017.b ENSGT00940000160899 ENSGT00390000000289 ENSGT00940000161021 ENSGT00390000013329 ENSGT00940000154355 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ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 ENSGT00940000162255 ENSGT00390000003821 ENSGT00390000015467 ENSGT00940000157017.b ENSGT00940000160899 ENSGT00390000000289 ENSGT00940000161021 ENSGT00390000013329 ENSGT00940000154355 ENSGT00940000161439 ENSGT00950000183110.b.a ENSGT00390000013841 ENSGT00940000161913 ENSGT00940000159946 Primates ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000160356 ENSGT00940000162161.A ENSGT00940000159142 ENSGT00940000156523.b ENSGT00390000008060 ENSGT00940000161721 ENSGT00940000157113 ENSGT00940000161332 ENSGT00940000162457 ENSGT00940000160580 ENSGT00940000154739.B ENSGT01050000244924.a.a.b ENSGT00940000160280 ENSGT01030000234551.k.d.a.c ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 ENSGT00940000162255 ENSGT00390000003821 ENSGT00390000015467 ENSGT00940000157017.b ENSGT00940000160899 ENSGT00390000000289 ENSGT00940000161021 ENSGT00390000013329 ENSGT00940000154355 ENSGT00940000161439 ENSGT00950000183110.b.a ENSGT00390000013841 ENSGT00940000161913 ENSGT00940000159946 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000160356 ENSGT00940000162161.A ENSGT00940000159142 ENSGT00940000156523.b ENSGT00390000008060 ENSGT00940000161721 ENSGT00940000157113 ENSGT00940000161332 ENSGT00940000162457 ENSGT00940000160580 ENSGT00940000154739.B ENSGT01050000244924.a.a.b ENSGT00940000160280 ENSGT01030000234551.k.d.a.c ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 ENSGT00940000162255 ENSGT00390000003821 ENSGT00390000015467 ENSGT00940000157017.b ENSGT00940000160899 ENSGT00390000000289 ENSGT00940000161021 ENSGT00390000013329 ENSGT00940000154355 ENSGT00940000161439 ENSGT00950000183110.b.a ENSGT00390000013841 ENSGT00940000161913 ENSGT00940000159946 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000160356 ENSGT00940000162161.A ENSGT00940000159142 ENSGT00940000156523.b ENSGT00390000008060 ENSGT00940000161721 ENSGT00940000157113 ENSGT00940000161332 ENSGT00940000162457 ENSGT00940000160580 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GRIN3B (ENSNLEG00000001124) TMEM259 (ENSNLEG00000001014) ENSNLEG00000001161 ENSNLEG00000001165 ENSNLEG00000001199 POLR2E (ENSNLEG00000001207) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000160356 ENSGT00940000162161.A ENSGT00940000159142 ENSGT00940000156523.b ENSGT00390000008060 ENSGT00940000161721 ENSGT00940000157113 ENSGT00940000161332 ENSGT00940000162457 ENSGT00940000160580 ENSGT00940000154739.B ENSGT01050000244924.a.a.b ENSGT00940000160280 ENSGT01030000234551.k.d.a.c ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 ENSGT00940000162255 ENSGT00390000003821 ENSGT00390000015467 ENSGT00940000157017.b ENSGT00940000160899 ENSGT00390000000289 ENSGT00940000161021 ENSGT00390000013329 ENSGT00940000154355.f ENSGT00940000161439 ENSGT00950000183110.b.a ENSGT00390000013841 ENSGT00940000161913 ENSGT00940000159946 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000160356 ENSGT00940000162161.A ENSGT00940000159142 ENSGT00940000156523.b 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ENSGT00940000162255 ENSGT00390000003821 ENSGT00390000015467 ENSGT00940000157017.b ENSGT00940000160899 ENSGT00390000000289 ENSGT00940000161021 ENSGT00390000013329 ENSGT00940000154355.f ENSGT00940000161439 ENSGT00950000183110.b.a ENSGT00390000013841 ENSGT00940000161913 ENSGT00940000159946 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000160356 ENSGT00940000162161.A ENSGT00940000159142 ENSGT00940000156523.b ENSGT00390000008060 ENSGT00940000161721 ENSGT00940000157113 ENSGT00940000161332 ENSGT00940000162457 ENSGT00940000160580 ENSGT00940000154739.B ENSGT01050000244924.a.a.b ENSGT00940000160280 ENSGT01030000234551.k.d.a.c ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 ENSGT00940000162255 ENSGT00390000003821 ENSGT00390000015467 ENSGT00940000157017.b ENSGT00940000160899 ENSGT00390000000289 ENSGT00940000161021 ENSGT00390000013329 ENSGT00940000154355.f ENSGT00940000161439 ENSGT00950000183110.b.a ENSGT00390000013841 ENSGT00940000161913 ENSGT00940000159946 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000160356 ENSGT00940000162161.A ENSGT00940000159142 ENSGT00940000156523.b ENSGT00390000008060 ENSGT00940000161721 ENSGT00940000157113 ENSGT00940000161332 ENSGT00940000162457 ENSGT00940000160580 ENSGT00940000154739.B ENSGT01050000244924.a.a.b ENSGT00940000160280 ENSGT01030000234551.k.d.a.c ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 ENSGT00940000162255 ENSGT00390000003821 ENSGT00390000015467 ENSGT00940000157017.b ENSGT00940000160899 ENSGT00390000000289 ENSGT00940000161021 ENSGT00390000013329 ENSGT00940000154355.f ENSGT00940000161439 ENSGT00950000183110.b.a ENSGT00390000013841 ENSGT00940000161913 ENSGT00940000159946 Sooty mangabey MODERN SPECIES 177 TPGS1 (ENSCATG00000033484) CDC34 (ENSCATG00000032095) GZMM (ENSCATG00000045246) BSG (ENSCATG00000013588) HCN2 (ENSCATG00000042283) POLRMT (ENSCATG00000040393) FGF22 (ENSCATG00000041952) RNF126 (ENSCATG00000044481) PRSS57 (ENSCATG00000044736) FSTL3 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ENSGT00940000157113 ENSGT00940000161332 ENSGT00940000162457 ENSGT00940000160580 ENSGT00940000154739.B ENSGT01050000244924.a.a.b.v ENSGT00940000160280 ENSGT01030000234551.k.d.a.c ENSGT01030000234528.C.c.b ##22 ENSGT01030000234528.C.c.a ##22 ENSGT00940000162255 ENSGT00390000003821 ENSGT00390000015467 ENSGT00940000157017.b ENSGT00940000160899 ENSGT00390000000289 ENSGT00940000161021 ENSGT00390000013329 ENSGT00940000154355.f.o.b ENSGT00940000161439 ENSGT00950000183110.b.a ENSGT00390000013841 ENSGT00940000161913 ENSGT00940000159946 Marmoset MODERN SPECIES 14 TPGS1 (ENSCJAG00000012861) CDC34 (ENSCJAG00000012867) GZMM (ENSCJAG00000071081) BSG (ENSCJAG00000012880) HCN2 (ENSCJAG00000044532) POLRMT (ENSCJAG00000012913) FGF22 (ENSCJAG00000012945) RNF126 (ENSCJAG00000012960) FSTL3 (ENSCJAG00000077429) PRSS57 (ENSCJAG00000012976) PALM (ENSCJAG00000038253) MISP (ENSCJAG00000020198) ENSCJAG00000020162 PLPPR3 (ENSCJAG00000020154) ENSCJAG00000070145 PRTN3 (ENSCJAG00000045700) ##22 ELANE 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Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.d ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.d ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.d ##22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.d ##22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.d ##22 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.d ##22 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234528.C.d ##22 Climbing perch MODERN SPECIES hhip (ENSATEG00000012722) ENSATEG00000012793 ENSATEG00000012894 ENSATEG00000012992 ENSATEG00000013022 INPP4B (ENSATEG00000013142) ENSATEG00000013177 znf330 (ENSATEG00000013192) rnf150a (ENSATEG00000013265) ENSATEG00000013284 TBC1D9 (ENSATEG00000013303) ucp1 (ENSATEG00000013384) elmod2 (ENSATEG00000013413) ENSATEG00000026142 zgc:154142 (ENSATEG00000013459) ##22 ENSATEG00000013545 ##22 FAM13A (ENSATEG00000013904) herc3 (ENSATEG00000013999) ppm1kb (ENSATEG00000014062) abcg2d (ENSATEG00000014075) pkd2 (ENSATEG00000014100) 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