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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158442 #7	ENSGT00390000003964.b #8	ENSGT00940000163024 #9	ENSGT00940000156477 #10	ENSGT00940000154468 #11	ENSGT01010000222542 #12	ENSGT00390000005315 #13	ENSGT00940000155740 #14	ENSGT00940000160611 #16	ENSGT00940000162210 #15	ENSGT00940000161566 #17	ENSGT00940000160586 #18	ENSGT00530000063113.B #19	ENSGT00940000166164	ENSGT00940000161056 #21	ENSGT00940000160455 #22	ENSGT00400000024545 #23	ENSGT00390000018118 #24	ENSGT00940000160254 #25	ENSGT00390000015972 #26	ENSGT01100000263751	ENSGT00940000158315 #27	ENSGT00390000001159 #28	ENSGT00940000159233 #29	ENSGT00390000018330 #30	ENSGT00940000160950 #31	ENSGT00390000013764 #32	ENSGT00940000156358 #33	ENSGT00940000156917 #34	ENSGT00730000111114 #35	ENSGT00530000063829.C #36
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000158442 #7	ENSGT00390000003964.b #8	ENSGT00940000163024 #9	ENSGT00940000156477 #10	ENSGT00940000154468 #11	ENSGT01010000222542 #12	ENSGT00390000005315 #13	ENSGT00940000155740 #14	ENSGT00940000160611 #16	ENSGT00940000162210 #15	ENSGT00940000161566 #17	ENSGT00940000160586 #18	ENSGT00530000063113.B #19	ENSGT00940000166164	ENSGT00940000161056 #21	ENSGT00940000160455 #22	ENSGT00400000024545 #23	ENSGT00390000018118 #24	ENSGT00940000160254 #25	ENSGT00390000015972 #26	ENSGT01100000263751	ENSGT00940000158315 #27	ENSGT00390000001159 #28	ENSGT00940000159233 #29	ENSGT00390000018330 #30	ENSGT00940000160950 #31	ENSGT00390000013764 #32	ENSGT00940000156358 #33	ENSGT00940000156917 #34	ENSGT00730000111114 #35	ENSGT00530000063829.C #36
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	24	EPB41L1 (ENSUPAG00010003586) #7	CNBD2 (ENSUPAG00010003714) #8	SCAND1 (ENSUPAG00010003746) #9	PHF20 (ENSUPAG00010003757) #10	RBM39 (ENSUPAG00010003791) #11	ENSUPAG00010003857 #12	ENSUPAG00010003860 #13	NFS1 (ENSUPAG00010003874) #14	CPNE1 (ENSUPAG00010003896) #15	RBM12 (ENSUPAG00010003967) #16	SPAG4 (ENSUPAG00010004003) #17	ENSUPAG00010004028 #18	ERGIC3 (ENSUPAG00010004159) #19	ENSUPAG00010004187 #20	ENSUPAG00010004196 #21	GDF5 (ENSUPAG00010004214) #22	ENSUPAG00010004220 #23	UQCC1 (ENSUPAG00010004223) #24	FAM83C (ENSUPAG00010004293) #25	ENSUPAG00010004311 #26	MMP24 (ENSUPAG00010004328) #27	PROCR (ENSUPAG00010004359) #28	EDEM2 (ENSUPAG00010004372) #29	TRPC4AP (ENSUPAG00010004385) #30	MYH7B (ENSUPAG00010004442) #31	GSS (ENSUPAG00010004505) #32	ACSS2 (ENSUPAG00010004531) #33	GGT7 (ENSUPAG00010004573) #34	NCOA6 (ENSUPAG00010004584) #35	TP53INP2 (ENSUPAG00010004603) #36	PIGU (ENSUPAG00010004614) #37
Squirrel	MODERN SPECIES	161	EPB41L1 (ENSSTOG00000011029) #7	ENSSTOG00000031834	CNBD2 (ENSSTOG00000015345) #8	PHF20 (ENSSTOG00000024453) #10	SCAND1 (ENSSTOG00000025008) #9	RBM39 (ENSSTOG00000030698) #11	ROMO1 (ENSSTOG00000015322) #13	ENSSTOG00000015317 #14	RBM12 (ENSSTOG00000019739) #16	CPNE1 (ENSSTOG00000033147) #15	SPAG4 (ENSSTOG00000015312) #17	ENSSTOG00000015308 #18	ERGIC3 (ENSSTOG00000020256) #19	ENSSTOG00000013172	CEP250 (ENSSTOG00000013121) #21	GDF5 (ENSSTOG00000026204) #22	ENSSTOG00000001690 #23	UQCC1 (ENSSTOG00000013116) #24	FAM83C (ENSSTOG00000019705) #25	EIF6 (ENSSTOG00000013111) #26	MMP24 (ENSSTOG00000013103) #27	ENSSTOG00000032051	PROCR (ENSSTOG00000011916) #28	EDEM2 (ENSSTOG00000011911) #29	TRPC4AP (ENSSTOG00000011689) #30	MYH7B (ENSSTOG00000011646) #31	GSS (ENSSTOG00000011637) #32	ACSS2 (ENSSTOG00000011617) #33	GGT7 (ENSSTOG00000011584) #34	NCOA6 (ENSSTOG00000025050) #35	TP53INP2 (ENSSTOG00000014835) #36
Alpin marmot	MODERN SPECIES		MYL9 (ENSMMMG00000022784)	DLGAP4 (ENSMMMG00000022789)	AAR2 (ENSMMMG00000022945)	EPB41L1 (ENSMMMG00000022952) #7	CNBD2 (ENSMMMG00000023129) #8	SCAND1 (ENSMMMG00000023133) #9	PHF20 (ENSMMMG00000023134) #10	ENSMMMG00000023151 #11	ENSMMMG00000023176	ROMO1 (ENSMMMG00000023178) #13	NFS1 (ENSMMMG00000023185) #14	CPNE1 (ENSMMMG00000023191) #15	SPAG4 (ENSMMMG00000023202) #17	ERGIC3 (ENSMMMG00000023223) #19	ENSMMMG00000023239 #21	GDF5 (ENSMMMG00000023244) #22	ENSMMMG00000023247 #23	UQCC1 (ENSMMMG00000023253) #24	FAM83C (ENSMMMG00000023285) #25	EIF6 (ENSMMMG00000023286) #26	ENSMMMG00000023291	MMP24 (ENSMMMG00000023292) #27	PROCR (ENSMMMG00000023300) #28	EDEM2 (ENSMMMG00000023305) #29	TRPC4AP (ENSMMMG00000023318) #30	MYH7B (ENSMMMG00000023328) #31	GSS (ENSMMMG00000023346) #32	ACSS2 (ENSMMMG00000023354) #33	GGT7 (ENSMMMG00000023368) #34	NCOA6 (ENSMMMG00000023374) #35	PIGU (ENSMMMG00000023384) #37
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Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158442 #7	ENSGT00390000003964.b #8	ENSGT00940000163024 #9	ENSGT00940000156477 #10	ENSGT00940000154468 #11	ENSGT00390000005315 #13	ENSGT00940000155740 #14	ENSGT00940000160611 #16	ENSGT00940000162210 #15	ENSGT00940000161566 #17	ENSGT00940000160586 #18	ENSGT00530000063113.B #19	ENSGT00940000161056.k #21	ENSGT00400000024545 #23	ENSGT00940000161056.l #21	ENSGT00940000160455 #22	ENSGT00390000018118 #24	ENSGT00940000160254 #25	ENSGT00390000015972 #26	ENSGT01100000263751	ENSGT00940000158315 #27	ENSGT00390000001159 #28	ENSGT00940000159233 #29	ENSGT00390000018330 #30	ENSGT00940000160950 #31	ENSGT00390000013764 #32	ENSGT00940000156358 #33	ENSGT00940000156917 #34	ENSGT00730000111114 #35	ENSGT00530000063829.C #36	ENSGT00390000014941 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	129	AAR2 (ENSCLAG00000017214)	EPB41L1 (ENSCLAG00000017026) #7	CNBD2 (ENSCLAG00000016955) #8	SCAND1 (ENSCLAG00000016943) #9	PHF20 (ENSCLAG00000016211) #10	RBM39 (ENSCLAG00000016940) #11	ROMO1 (ENSCLAG00000016857) #13	NFS1 (ENSCLAG00000017111) #14	CPNE1 (ENSCLAG00000017220) #15	RBM12 (ENSCLAG00000017230) #16	SPAG4 (ENSCLAG00000016833) #17	ENSCLAG00000017131 #18	ERGIC3 (ENSCLAG00000017257) #19	ENSCLAG00000017231	ENSCLAG00000017110 #21	GDF5 (ENSCLAG00000017037) #22	UQCC1 (ENSCLAG00000016937) #24	FAM83C (ENSCLAG00000016840) #25	MMP24 (ENSCLAG00000017243) #27	ENSCLAG00000015911	PROCR (ENSCLAG00000016150) #28	EDEM2 (ENSCLAG00000016226) #29	TRPC4AP (ENSCLAG00000017276) #30	MYH7B (ENSCLAG00000017117) #31	GSS (ENSCLAG00000017163) #32	ACSS2 (ENSCLAG00000016248) #33	GGT7 (ENSCLAG00000017317) #34	NCOA6 (ENSCLAG00000017340) #35	TP53INP2 (ENSCLAG00000016875) #36	PIGU (ENSCLAG00000016489) #37	MAP1LC3A (ENSCLAG00000016760)
Degu	MODERN SPECIES	78	AAR2 (ENSODEG00000013083)	EPB41L1 (ENSODEG00000014523) #7	ENSODEG00000020355	CNBD2 (ENSODEG00000013416) #8	SCAND1 (ENSODEG00000013490) #9	PHF20 (ENSODEG00000013703) #10	RBM39 (ENSODEG00000013774) #11	ROMO1 (ENSODEG00000013417) #13	NFS1 (ENSODEG00000013068) #14	RBM12 (ENSODEG00000013870) #16	SPAG4 (ENSODEG00000013734) #17	ENSODEG00000013576 #18	ERGIC3 (ENSODEG00000015566) #19	CEP250 (ENSODEG00000013589) #21	ENSODEG00000014490 #23	GDF5 (ENSODEG00000013518) #22	ENSODEG00000020016	ENSODEG00000012880 #24	ENSODEG00000012965 #26	ENSODEG00000013668	MMP24 (ENSODEG00000013784) #27	PROCR (ENSODEG00000012672) #28	EDEM2 (ENSODEG00000013582) #29	ENSODEG00000020094	TRPC4AP (ENSODEG00000014176) #30	MYH7B (ENSODEG00000013313) #31	ENSODEG00000020172	ENSODEG00000013634	GSS (ENSODEG00000013028) #32	ENSODEG00000013536 #33	GGT7 (ENSODEG00000014267) #34
Guinea pig	MODERN SPECIES	45	EPB41L1 (ENSCPOG00000012245) #7	CNBD2 (ENSCPOG00000014556) #8	SCAND1 (ENSCPOG00000024930) #9	PHF20 (ENSCPOG00000002034) #10	ENSCPOG00000039333 #11	ROMO1 (ENSCPOG00000014622) #13	NFS1 (ENSCPOG00000014620) #14	RBM12 (ENSCPOG00000035170) #16	CPNE1 (ENSCPOG00000022553) #15	SPAG4 (ENSCPOG00000020244) #17	ENSCPOG00000039101 #18	ERGIC3 (ENSCPOG00000015692) #19	ENSCPOG00000040475	ENSCPOG00000033583 #21	ENSCPOG00000037705 #23	GDF5 (ENSCPOG00000002993) #22	UQCC1 (ENSCPOG00000002990) #24	FAM83C (ENSCPOG00000027379) #25	EIF6 (ENSCPOG00000013279) #26	MMP24 (ENSCPOG00000004050) #27	PROCR (ENSCPOG00000005271) #28	EDEM2 (ENSCPOG00000037179) #29	TRPC4AP (ENSCPOG00000003448) #30	MYH7B (ENSCPOG00000004208) #31	GSS (ENSCPOG00000004201) #32	ENSCPOG00000039987	ACSS2 (ENSCPOG00000004192) #33	GGT7 (ENSCPOG00000004187) #34	NCOA6 (ENSCPOG00000011318) #35	TP53INP2 (ENSCPOG00000030059) #36	MAP1LC3A (ENSCPOG00000030093)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	6	AAR2 (ENSHGLG00000040665)	ENSHGLG00000037775	SCAND1 (ENSHGLG00000032951) #9	PHF20 (ENSHGLG00000050363) #10	ENSHGLG00000017871 #11	ENSHGLG00000039326	ROMO1 (ENSHGLG00000036201) #13	NFS1 (ENSHGLG00000017280) #14	RBM12 (ENSHGLG00000013208) #16	CPNE1 (ENSHGLG00000013228) #15	SPAG4 (ENSHGLG00000017758) #17	ENSHGLG00000045390 #18	ENSHGLG00000005886 #19	ENSHGLG00000010420 #21	ENSHGLG00000039585 #21	GDF5 (ENSHGLG00000017753) #22	ENSHGLG00000021218 #23	UQCC1 (ENSHGLG00000017446) #24	FAM83C (ENSHGLG00000040004) #25	EIF6 (ENSHGLG00000010214) #26	MMP24 (ENSHGLG00000046205) #27	PROCR (ENSHGLG00000009583) #28	ENSHGLG00000036931	EDEM2 (ENSHGLG00000039402) #29	ENSHGLG00000011522	TRPC4AP (ENSHGLG00000015614) #30	GSS (ENSHGLG00000013619) #32	ENSHGLG00000049123	ACSS2 (ENSHGLG00000013444) #33	GGT7 (ENSHGLG00000007389) #34	ENSHGLG00000005296 #35