Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157970 #7	ENSGT00510000048978 #8	ENSGT00940000161366 #9	ENSGT00940000158669 #10	ENSGT00940000154450 #11	ENSGT00530000063881.a.b #12	ENSGT00990000204354 #13	ENSGT01060000248564.a.b #14	ENSGT00440000035378.c #15	ENSGT00940000158484 #16	ENSGT00940000158000 #17	ENSGT00940000156197 #18	ENSGT00490000043398 #19	ENSGT00390000002428.a.g.a #20	ENSGT00910000144211.n.a.fb #21	ENSGT00940000160504 #22	ENSGT00940000160992 #23	ENSGT00940000161085 #24	ENSGT00940000157034 #25	ENSGT00940000153587.b #26	ENSGT00940000153511.a #27	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a #28	ENSGT00950000182852.A.b #29	ENSGT00940000157193 #30	ENSGT00390000007769 #31	ENSGT00450000040404.a #32	ENSGT00940000155503 #33	ENSGT00940000161091 #34	ENSGT00940000161227 #35	ENSGT00940000162143 #36	ENSGT00940000160469 #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157970 #7	ENSGT00510000048978 #8	ENSGT00940000161366 #9	ENSGT00940000158669 #10	ENSGT00940000154450 #11	ENSGT00530000063881.a.b #12	ENSGT00990000204354 #13	ENSGT01060000248564.a.b #14	ENSGT00440000035378.c #15	ENSGT00940000158484 #16	ENSGT00940000158000 #17	ENSGT00940000156197 #18	ENSGT00490000043398 #19	ENSGT00390000002428.a.g.a #20	ENSGT00910000144211.n.a.fb #21	ENSGT00940000160504 #22	ENSGT00940000160992 #23	ENSGT00940000161085 #24	ENSGT00940000157034 #25	ENSGT00940000153587.b #26	ENSGT00940000153511.a #27	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a #28	ENSGT00950000182852.A.b #29	ENSGT00940000157193 #30	ENSGT00390000007769 #31	ENSGT00450000040404.a #32	ENSGT00940000155503 #33	ENSGT00940000161091 #34	ENSGT00940000161227 #35	ENSGT00940000162143 #36	ENSGT00940000160469 #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157970 #7	ENSGT00510000048978 #8	ENSGT00940000161366 #9	ENSGT00940000158669 #10	ENSGT00940000154450 #11	ENSGT00530000063881.a.b #12	ENSGT00990000204354 #13	ENSGT01060000248564.a.b #14	ENSGT00440000035378.c #15	ENSGT00940000158484 #16	ENSGT00940000158000 #17	ENSGT00940000156197 #18	ENSGT00490000043398 #19	ENSGT00390000002428.a.g.a #20	ENSGT00910000144211.n.a.fb #21	ENSGT00940000160504 #22	ENSGT00940000160992 #23	ENSGT00940000161085 #24	ENSGT00940000157034 #25	ENSGT00940000153587.b #26	ENSGT00940000153511.a #27	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a #28	ENSGT00950000182852.A.b #29	ENSGT00940000157193 #30	ENSGT00390000007769 #31	ENSGT00450000040404.a #32	ENSGT00940000155503 #33	ENSGT00940000161091 #34	ENSGT00940000161227 #35	ENSGT00940000162143 #36	ENSGT00940000160469 #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	294	GRHL3 (ENSUPAG00010021122) #7	IFNLR1 (ENSUPAG00010021115) #8	IL22RA1 (ENSUPAG00010021107) #9	MYOM3 (ENSUPAG00010021069) #10	SRSF10 (ENSUPAG00010021046) #11	PNRC2 (ENSUPAG00010021043) #12	ENSUPAG00010021041 #13	CNR2 (ENSUPAG00010021037) #14	FUCA1 (ENSUPAG00010021031) #15	HMGCL (ENSUPAG00010021020) #16	GALE (ENSUPAG00010021009) #17	LYPLA2 (ENSUPAG00010021003) #18	PITHD1 (ENSUPAG00010020991) #19	ELOA (ENSUPAG00010020981) #20	RPL11 (ENSUPAG00010020974) #21	ID3 (ENSUPAG00010020971) #22	E2F2 (ENSUPAG00010020963) #23	ASAP3 (ENSUPAG00010020955) #24	TCEA3 (ENSUPAG00010020944) #25	ZNF436 (ENSUPAG00010020939) #26	HNRNPR (ENSUPAG00010020927) #27	ENSUPAG00010020922 #28	LUZP1 (ENSUPAG00010020907) #29	KDM1A (ENSUPAG00010020880) #30	TEX46 (ENSUPAG00010020875) #31	LACTBL1 (ENSUPAG00010020863) #32	EPHB2 (ENSUPAG00010020830) #33	C1QB (ENSUPAG00010020826) #34	C1QC (ENSUPAG00010020824) #35	C1QA (ENSUPAG00010020820) #36	EPHA8 (ENSUPAG00010020808) #37
Squirrel	MODERN SPECIES	74	STPG1 (ENSSTOG00000020596)	GRHL3 (ENSSTOG00000023529) #7	IFNLR1 (ENSSTOG00000022523) #8	IL22RA1 (ENSSTOG00000001510) #9	MYOM3 (ENSSTOG00000000934) #10	SRSF10 (ENSSTOG00000000956) #11	PNRC2 (ENSSTOG00000000953) #12	CNR2 (ENSSTOG00000011946) #14	FUCA1 (ENSSTOG00000011938) #15	HMGCL (ENSSTOG00000011933) #16	GALE (ENSSTOG00000011927) #17	LYPLA2 (ENSSTOG00000011918) #18	PITHD1 (ENSSTOG00000028000) #19	ELOA (ENSSTOG00000023412) #20	ENSSTOG00000011904	ID3 (ENSSTOG00000009584) #22	E2F2 (ENSSTOG00000009576) #23	ASAP3 (ENSSTOG00000009547) #24	TCEA3 (ENSSTOG00000021068) #25	ZNF436 (ENSSTOG00000001212) #26	HNRNPR (ENSSTOG00000021981) #27	ENSSTOG00000006804 #28	LUZP1 (ENSSTOG00000022904) #29	KDM1A (ENSSTOG00000002451) #30	LACTBL1 (ENSSTOG00000023903) #32	EPHB2 (ENSSTOG00000015377) #33	C1QB (ENSSTOG00000023153) #34	C1QC (ENSSTOG00000030103) #35	C1QA (ENSSTOG00000034210) #36	EPHA8 (ENSSTOG00000008929) #37	ZBTB40 (ENSSTOG00000009598)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	15	GRHL3 (ENSMMMG00000018480) #7	IFNLR1 (ENSMMMG00000018513) #8	IL22RA1 (ENSMMMG00000018545) #9	MYOM3 (ENSMMMG00000018557) #10	SRSF10 (ENSMMMG00000018592) #11	PNRC2 (ENSMMMG00000018622) #12	ENSMMMG00000018624 #13	CNR2 (ENSMMMG00000018629) #14	FUCA1 (ENSMMMG00000018637) #15	HMGCL (ENSMMMG00000018659) #16	GALE (ENSMMMG00000018757) #17	LYPLA2 (ENSMMMG00000018761) #18	PITHD1 (ENSMMMG00000018765) #19	ELOA (ENSMMMG00000018774) #20	RPL11 (ENSMMMG00000018781) #21	ID3 (ENSMMMG00000018787) #22	E2F2 (ENSMMMG00000018795) #23	ASAP3 (ENSMMMG00000018861) #24	TCEA3 (ENSMMMG00000018885) #25	ZNF436 (ENSMMMG00000018891) #26	HNRNPR (ENSMMMG00000018898) #27	ENSMMMG00000018946 #28	LUZP1 (ENSMMMG00000018950) #29	KDM1A (ENSMMMG00000018957) #30	TEX46 (ENSMMMG00000018999) #31	EPHB2 (ENSMMMG00000019007) #33	C1QB (ENSMMMG00000019024) #34	C1QC (ENSMMMG00000019028) #35	C1QA (ENSMMMG00000019033) #36	ZBTB40 (ENSMMMG00000019071)	WNT4 (ENSMMMG00000019083)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES		IFNLR1 (ENSSVLG00005000894) #8	IL22RA1 (ENSSVLG00005000877) #9	MYOM3 (ENSSVLG00005000787) #10	ENSSVLG00005000730	SRSF10 (ENSSVLG00005000670) #11	PNRC2 (ENSSVLG00005000620) #12	ENSSVLG00005000604	CNR2 (ENSSVLG00005000589) #14	FUCA1 (ENSSVLG00005000561) #15	HMGCL (ENSSVLG00005000529) #16	GALE (ENSSVLG00005000509) #17	LYPLA2 (ENSSVLG00005000457) #18	PITHD1 (ENSSVLG00005000416) #19	ELOA (ENSSVLG00005000381) #20	RPL11 (ENSSVLG00005000344) #21	ID3 (ENSSVLG00005000320) #22	E2F2 (ENSSVLG00005000151) #23	ENSSVLG00005000104	ASAP3 (ENSSVLG00005006849) #24	TCEA3 (ENSSVLG00005006814) #25	ZNF436 (ENSSVLG00005006783) #26	HNRNPR (ENSSVLG00005006684) #27	HTR1D (ENSSVLG00005006648)	LUZP1 (ENSSVLG00005006625) #29	KDM1A (ENSSVLG00005006528) #30	TEX46 (ENSSVLG00005006473) #31	LACTBL1 (ENSSVLG00005006410) #32	EPHB2 (ENSSVLG00005006141) #33	C1QB (ENSSVLG00005006095) #34	C1QC (ENSSVLG00005006074) #35	C1QA (ENSSVLG00005006048) #36