Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000165326 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000155393.d ENSGT00940000157669 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00950000183053.A ENSGT00940000157218.C ENSGT01030000234623.a.a.b ENSGT01030000235111 ENSGT00940000155104 ENSGT00510000047363 ENSGT00940000155058 ENSGT00940000159949 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000155677.b ENSGT00440000039469 ENSGT00390000004663 ENSGT00940000157765 ENSGT00940000155627 ENSGT00940000158563 ENSGT00940000159782 ENSGT00940000158415 ENSGT00390000015655.a ENSGT00940000159933 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000165326 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000155393.d ENSGT00940000157669 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 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TCEA3 (ENSMMSG00000008750) ZNF436 (ENSMMSG00000008791) HNRNPR (ENSMMSG00000008829) ENSMMSG00000008999 ENSMMSG00000009011 ENSMMSG00000009047 TEX46 (ENSMMSG00000009098) LACTBL1 (ENSMMSG00000009130) EPHB2 (ENSMMSG00000009204) C1QB (ENSMMSG00000009419) C1QC (ENSMMSG00000009457) C1QA (ENSMMSG00000009478) EPHA8 (ENSMMSG00000009498) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157970 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000161366 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000154450 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000165247 ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00440000035378.c ENSGT00940000158484 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000156197.d ENSGT00490000043398 ENSGT00390000002428.a.g.a ENSGT00910000144211.n.a ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000153587.b ENSGT00940000153511.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000157193 ENSGT00390000007769 ENSGT00450000040404.a ENSGT00940000155503 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161227 ENSGT00940000162143 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000157970 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000161366 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000154450 ENSGT00940000165247 ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00440000035378.c ENSGT00940000158484 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000156197.d ENSGT00490000043398.v ENSGT00390000002428.a.g.a ENSGT00910000144211.n.a ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000153587.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000163614.g.a ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000157193 ENSGT00390000007769 ENSGT00450000040404.a ENSGT00940000155503 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161227 ENSGT00940000162143 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 GRHL3 (ENSOARG00020011379) IFNLR1 (ENSOARG00020011823) IL22RA1 (ENSOARG00020012141) MYOM3 (ENSOARG00020012256) SRSF10 (ENSOARG00020012698) ENSOARG00020012860 ENSOARG00020012913 CNR2 (ENSOARG00020012960) FUCA1 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ENSGT00390000002428.a.g.a ENSGT00910000144211.n.a ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000153587.b ENSGT00940000153511.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000157193 ENSGT00390000007769 ENSGT00450000040404.a ENSGT00940000155503.j ENSGT00940000161091 ENSGT00940000154431.e.a.a.b.a.d ENSGT00940000161227 ENSGT00940000162143 Cow MODERN SPECIES 11 STPG1 (ENSBTAG00000010278) GRHL3 (ENSBTAG00000019791) IFNLR1 (ENSBTAG00000001101) IL22RA1 (ENSBTAG00000001100) MYOM3 (ENSBTAG00000014885) SRSF10 (ENSBTAG00000008072) PNRC2 (ENSBTAG00000030435) CNR2 (ENSBTAG00000019371) FUCA1 (ENSBTAG00000030434) HMGCL (ENSBTAG00000021832) GALE (ENSBTAG00000005002) LYPLA2 (ENSBTAG00000011625) PITHD1 (ENSBTAG00000021620) ELOA (ENSBTAG00000026585) RPL11 (ENSBTAG00000020905) ID3 (ENSBTAG00000030425) #22 E2F2 (ENSBTAG00000014400) ASAP3 (ENSBTAG00000012263) TCEA3 (ENSBTAG00000038865) ZNF436 (ENSBTAG00000002594) HNRNPR 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ENSBGRG00000004874 PITHD1 (ENSBGRG00000004830) ELOA (ENSBGRG00000004602) ID3 (ENSBGRG00000004562) #22 E2F2 (ENSBGRG00000004509) ASAP3 (ENSBGRG00000004358) TCEA3 (ENSBGRG00000004156) ZNF436 (ENSBGRG00000004113) HNRNPR (ENSBGRG00000003976) ENSBGRG00000003957 LUZP1 (ENSBGRG00000003910) KDM1A (ENSBGRG00000003651) TEX46 (ENSBGRG00000003590) LACTBL1 (ENSBGRG00000003569) ENSBGRG00000003557 EPHB2 (ENSBGRG00000003473) C1QB (ENSBGRG00000003451) ENSBGRG00000003435 C1QC (ENSBGRG00000003430) Wild yak MODERN SPECIES 1753 FUCA1 (ENSBMUG00000013863) HMGCL (ENSBMUG00000013890) GALE (ENSBMUG00000013927) ENSBMUG00000013978 PITHD1 (ENSBMUG00000014027) ELOA (ENSBMUG00000014096) ID3 (ENSBMUG00000014128) #22 E2F2 (ENSBMUG00000014201) ASAP3 (ENSBMUG00000014291) TCEA3 (ENSBMUG00000014332) ZNF436 (ENSBMUG00000014346) HNRNPR (ENSBMUG00000014402) HTR1D (ENSBMUG00000014427) LUZP1 (ENSBMUG00000014443) KDM1A (ENSBMUG00000014489) TEX46 (ENSBMUG00000014525) LACTBL1 (ENSBMUG00000014535) EPHB2 (ENSBMUG00000014918) C1QB (ENSBMUG00000015055) ENSBMUG00000015061 C1QC (ENSBMUG00000015067) C1QA (ENSBMUG00000015089) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157970 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000161366 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000154450 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00440000035378.c ENSGT00940000158484 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000156197 ENSGT00490000043398 ENSGT00390000002428.a.g.a ENSGT00910000144211.n.a ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000153587.b ENSGT00940000153511.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000157193 ENSGT00390000007769 ENSGT00450000040404.a ENSGT00940000155503 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000160469 Primates ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157970 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000161366 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000154450 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT01100000263986 ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00440000035378.c ENSGT00940000158484 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000156197 ENSGT00490000043398 ENSGT00390000002428.a.g.a ENSGT00910000144211.n.a ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000153587.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000157193 ENSGT00390000007769 ENSGT00450000040404.a ENSGT00940000155503 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000160469 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000157970 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000161366 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000154450 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00440000035378.c ENSGT00940000158484 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000156197 ENSGT00490000043398 ENSGT00390000002428.a.g.a ENSGT00910000144211.n.a ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000153587.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000154484.B.a.b 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ENSGT00940000156213 ENSGT00940000158264.b ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00960000189438 ENSGT00940000155019.a.a ENSGT00940000156139.ab ENSGT00940000162094 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT01100000263839 ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000161879 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000161215.hc.b ENSGT00940000163282.j ENSGT00940000163923.e ENSGT00940000163923.f ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00940000158264.b ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00960000189438 ENSGT00940000155019.a.a ENSGT00940000156139.ab ENSGT00940000162094 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT01100000263839 ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000161215.hc.b ENSGT00940000163282.j ENSGT00940000163923.e ENSGT00940000163923.f ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 ENSGT00950000182962.b.a Aves ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00940000158264.b ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00960000189438 ENSGT00940000155019.a.a ENSGT00940000156139.ab ENSGT00940000162094 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT01100000263839 ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163923.e ENSGT00940000163923.f ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 ENSGT00950000182962.b.a 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ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT01100000263839 ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163923.e ENSGT00940000163923.f ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 ENSGT00950000182962.b.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00530000063929.a.b Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000156598.l ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163923.e ENSGT00940000163923.f ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 ENSGT00950000182962.b.a ENSGT00960000189365 ENSGT00940000159398 Japanese quail MODERN SPECIES 15 SYF2 (ENSCJPG00005016303) RSRP1 (ENSCJPG00005016302) TMEM50A (ENSCJPG00005016301) ENSCJPG00005016300 MACO1 (ENSCJPG00005016299) LDLRAP1 (ENSCJPG00005016298) MAN1C1 (ENSCJPG00005016273) ENSCJPG00005016272 MTFR1L (ENSCJPG00005016271) ENSCJPG00005016270 TAF12 (ENSCJPG00005016269) ENSCJPG00005016267 GMEB1 (ENSCJPG00005016263) YTHDF2 (ENSCJPG00005016262) ENSCJPG00005016261 ID3 (ENSCJPG00005016260) #22 E2F2 (ENSCJPG00005016258) ASAP3 (ENSCJPG00005016116) TCEA3 (ENSCJPG00005016106) OPRD1 (ENSCJPG00005016105) RCC1 (ENSCJPG00005016103) PHACTR4 (ENSCJPG00005016101) SESN2 (ENSCJPG00005016100) FAM76A (ENSCJPG00005016099) ENSCJPG00005016045 ENSCJPG00005016044 FGR (ENSCJPG00005016042) AHDC1 (ENSCJPG00005016038) WASF2 (ENSCJPG00005016036) ENSCJPG00005016033 ENSCJPG00005016032 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 23 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139 GPATCH3 (ENSGFOG00000006273) NUDC (ENSGFOG00000006257) KDF1 (ENSGFOG00000006243) TENT5B (ENSGFOG00000006235) SLC9A1 (ENSGFOG00000006232) WDTC1 (ENSGFOG00000006223) TMEM222 (ENSGFOG00000006214) CD164L2 (ENSGFOG00000006209) WASF2 (ENSGFOG00000006201) FGR (ENSGFOG00000006174) ENSGFOG00000006139 FAM76A (ENSGFOG00000006127) SESN2 (ENSGFOG00000006120) PHACTR4 (ENSGFOG00000006113) RCC1 (ENSGFOG00000006100) ID3 (ENSGFOG00000006093) #22 E2F2 (ENSGFOG00000006080) ENSGFOG00000006066 TCEA3 (ENSGFOG00000006059) OPRD1 (ENSGFOG00000006052) Flycatcher MODERN SPECIES 15 ID3 (ENSFALG00000010806) #22 E2F2 (ENSFALG00000010803) ASAP3 (ENSFALG00000010769) TCEA3 (ENSFALG00000010750) RCC1 (ENSFALG00000010730) PHACTR4 (ENSFALG00000010715) SESN2 (ENSFALG00000010708) ENSFALG00000002817 FGR (ENSFALG00000002793) WASF2 (ENSFALG00000000708) GPR3 (ENSFALG00000000702) CD164L2 (ENSFALG00000023339) SYTL1 (ENSFALG00000000694) WDTC1 (ENSFALG00000000691) ENSFALG00000023022 SLC9A1 (ENSFALG00000000683) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159638 ENSGT00940000157151 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00940000158264.b ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000155019.a.a ENSGT00940000156139.ab ENSGT00940000162094 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034.v ENSGT00940000157669 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163923.e ENSGT00940000163923.f ENSGT00940000155462 ENSGT00940000164855 ENSGT00940000156226 ENSGT00530000063320.B ENSGT00940000157966 Golden eagle MODERN SPECIES 7 ENSACCG00020009169 ENSACCG00020009155 SRSF4 (ENSACCG00020009138) ENSACCG00020009092 TMEM200B (ENSACCG00020009062) EPB41 (ENSACCG00020009007) ENSACCG00020008918 TRNAU1AP (ENSACCG00020008893) RAB42 (ENSACCG00020010898) ENSACCG00020010889 TAF12 (ENSACCG00020010879) ENSACCG00020010861 GMEB1 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ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00940000158264.b ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833.f ENSGT00940000155019.a.a ENSGT00940000156139.ab ENSGT01010000229478 ENSGT00940000162094 ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT01100000263839 ENSGT00940000156761.e ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000161879 ENSGT00940000160992.a ENSGT00940000160992.b ENSGT00940000161085 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582.a ENSGT00390000003312 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163923.e ENSGT00940000163923.f ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 Eastern brown snake MODERN SPECIES 19 MATN1 (ENSPTXG00000009959) PTPRU (ENSPTXG00000009987) MECR (ENSPTXG00000016666) SRSF4 (ENSPTXG00000016672) ENSPTXG00000016678 TMEM200B (ENSPTXG00000016686) EPB41 (ENSPTXG00000005359) TRNAU1AP (ENSPTXG00000005360) 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SPECIES 2 ENSXETG00000042165 ENSXETG00000048943 FOXO6 (ENSXETG00000012944) scmh1 (ENSXETG00000012966) ctps1 (ENSXETG00000012949) rcc1 (ENSXETG00000012969) oprd1 (ENSXETG00000033842) tcea3 (ENSXETG00000012975) ENSXETG00000020617 taf12 (ENSXETG00000020616) rab39a (ENSXETG00000020622) gmeb1 (ENSXETG00000020625) ythdf2 (ENSXETG00000020636) gngt2.1 (ENSXETG00000030624) msra.2 (ENSXETG00000020629) id3 (ENSXETG00000020653) #22 sesn2 (ENSXETG00000020644) fgr (ENSXETG00000020659) ahdc1 (ENSXETG00000018716) wasf2 (ENSXETG00000003647) wdtc1 (ENSXETG00000020662) tmem222 (ENSXETG00000020673) sytl1 (ENSXETG00000020676) slc9a1 (ENSXETG00000020678) tent5b (ENSXETG00000020683) ENSXETG00000036010 kdf1 (ENSXETG00000020684) nudc (ENSXETG00000020686) gpatch3 (ENSXETG00000020692) pigv (ENSXETG00000020693) ENSXETG00000044298 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 5 TMEM200B (ENSLLEG00000003289) EPB41 (ENSLLEG00000003123) ENSLLEG00000003087 ENSLLEG00000003077 ENSLLEG00000003059 MED18 (ENSLLEG00000003040) 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(ENSLACG00000008759) asap3 (ENSLACG00000007662) TCEA3 (ENSLACG00000006976) OPRD1 (ENSLACG00000003077) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000010799 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00940000157330 ENSGT00940000165937 ENSGT00940000163885 ENSGT00530000063353.a.a ENSGT01100000263839 ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000155115.a.b ENSGT00940000165326 ENSGT00940000157034 ENSGT00940000155393.d ENSGT00940000157669 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00950000183053.A ENSGT00940000157218.C ENSGT01030000234623.a.a.b ENSGT01030000235111 ENSGT00940000155104 ENSGT00510000047363 ENSGT00940000155058 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000010799 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ENSGT00940000157330 ENSGT00940000165937 ENSGT00940000163885 ENSGT00530000063353.a.a ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000155115.a.b ENSGT00940000165326 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000159314 ENSGT00940000159599 ENSGT00940000166510 ENSGT00940000157970 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00940000165828 ENSGT00940000164359.a ENSGT00390000017195 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000164539 ENSGT00980000200482 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00940000153511.a ENSGT00390000012569.a ENSGT00940000154947.k ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e ENSGT00940000154716.gc.b ENSGT00950000183094.a.n ENSGT00390000018360.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01060000248589.D ENSGT00530000063353.a.a ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000155115.a.b ENSGT00940000165326 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000159314 ENSGT00940000159599 ENSGT00940000166510 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(ENSSTUG00000022672) dcdc2b (ENSSTUG00000022689) iqcc (ENSSTUG00000022723) ENSSTUG00000022739 soul3 (ENSSTUG00000022808) SLC25A29 (ENSSTUG00000022945) WARS1 (ENSSTUG00000022958) Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ATIF1 (ENSSSAG00000003198) rpl13a (ENSSSAG00000003176) ENSSSAG00000002882 ENSSSAG00000087348 ENSSSAG00000084934 ENSSSAG00000002472 ENSSSAG00000002405 pacrg (ENSSSAG00000002352) ENSSSAG00000084583 ctsl.1 (ENSSSAG00000002302) vgll2b (ENSSSAG00000002278) ENSSSAG00000103784 ythdf2 (ENSSSAG00000002258) ENSSSAG00000106971 ENSSSAG00000081915 id3 (ENSSSAG00000107585) #22 ENSSSAG00000104113 asap3 (ENSSSAG00000046943) ENSSSAG00000119200 ENSSSAG00000118915 rps6ka1 (ENSSSAG00000046073) cnksr1 (ENSSSAG00000045975) ENSSSAG00000045964 ENSSSAG00000045926 ENSSSAG00000093173 rcan3 (ENSSSAG00000045901) ENSSSAG00000112338 ENSSSAG00000107745 soul3 (ENSSSAG00000045871) ENSSSAG00000045794 SLC25A29 (ENSSSAG00000117536) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00950000183034.B.o ENSGT00390000002053.e 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ENSOMYG00000031341 id3 (ENSOMYG00000031328) #22 ENSOMYG00000031313 ENSOMYG00000075642 asap3 (ENSOMYG00000031084) ENSOMYG00000054061 rps6ka1 (ENSOMYG00000030536) cnksr1 (ENSOMYG00000030022) ENSOMYG00000030002 ENSOMYG00000059663 rcan3 (ENSOMYG00000029957) ENSOMYG00000029927 ENSOMYG00000050796 ENSOMYG00000029906 soul3 (ENSOMYG00000029896) ENSOMYG00000029807 ENSOMYG00000072899 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00950000183034.B.o ENSGT00390000002053.e ENSGT00940000165091.d.b ENSGT00390000010799.c ENSGT00940000153511.a.nb.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a.d ENSGT00940000157193.f ENSGT00950000182852.A.b.f ENSGT01060000248589.D.v ENSGT00940000157330.a ENSGT00940000165937.c.b ENSGT00940000163885.i ENSGT00530000063353.a.a.d ENSGT00940000156761.d ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504.g #22 ENSGT00940000155115.a.b.a ENSGT00940000165326.d ENSGT00390000017418.c ENSGT00940000159314.i ENSGT00940000159599.d ENSGT00940000166510 ENSGT00940000157970.k ENSGT00940000159501.d.b ENSGT00940000165828 ENSGT00990000210961 ENSGT00940000164539.k.b ENSGT00940000156480 ENSGT00940000157766.b.a.b Chinook salmon MODERN SPECIES 32 ENSOTSG00005022509 ENSOTSG00005022508 zmpste24 (ENSOTSG00005022505) atp5if1b (ENSOTSG00005022504) ENSOTSG00005022383 ENSOTSG00005022382 kdm1a (ENSOTSG00005022157) LUZP1 (ENSOTSG00005022156) PTAFR (ENSOTSG00005022155) pacrg (ENSOTSG00005022154) qkia (ENSOTSG00005022153) ctsl.1 (ENSOTSG00005022151) vgll2b (ENSOTSG00005022150) ythdf2 (ENSOTSG00005022149) ENSOTSG00005022146 id3 (ENSOTSG00005022145) #22 ENSOTSG00005022142 asap3 (ENSOTSG00005022140) ENSOTSG00005022139 ENSOTSG00005022138 rps6ka1 (ENSOTSG00005001549) cnksr1 (ENSOTSG00005001379) ENSOTSG00005001376 GRHL3 (ENSOTSG00005001333) rcan3 (ENSOTSG00005001014) tmem234 (ENSOTSG00005001010) ENSOTSG00005001006 soul3 (ENSOTSG00005000999) ENSOTSG00005000976 SLC25A29 (ENSOTSG00005000962) WDR25 (ENSOTSG00005000961) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165091.d.a ENSGT00390000010799.d ENSGT00940000153511.a.nb.a 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ENSSSAG00000000545 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000165091.d.a ENSGT00390000010799.d ENSGT00940000153511.a.nb.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a.c ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193.e ENSGT00950000182852.A.b.e ENSGT01060000248589.D.u.a ENSGT01060000248589.D.u.b ENSGT00940000157330.b ENSGT00940000165937.c.a ENSGT00940000178412.b ENSGT00940000163885.j ENSGT00530000063353.a.a.c ENSGT00940000156761.c ENSGT00940000160504.h #22 ENSGT00940000155115.a.b.b ENSGT00940000165326.c ENSGT00390000017418.d ENSGT00940000159314.j ENSGT00940000159599.c ENSGT00940000157970.l ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501.c ENSGT00940000159501.d.a ENSGT00970000198045 ENSGT00940000164359.a.c ENSGT00940000164539.k.a ENSGT00940000157766.b.a.a ENSGT00940000159694.a ENSGT00940000153724.B Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000165091.d.a ENSGT00390000010799.d ENSGT00940000153511.a.nb.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a.c ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193.e 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ENSGT00940000156103 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01060000248589.D ENSGT00940000157330 ENSGT00940000165937 ENSGT00940000163885 ENSGT00530000063353.a.a ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000155115.a.b ENSGT00940000165326 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000159314 ENSGT00940000159599 ENSGT00940000166510 ENSGT00940000157970 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00940000169877 ENSGT00940000165828 ENSGT00940000164359.a ENSGT00940000164539 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000157766.b.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 1 NEMF (ENSKMAG00000010412) MOK (ENSKMAG00000010372) WDR20 (ENSKMAG00000010348) ENSKMAG00000010322 DYNC1H1 (ENSKMAG00000010143) tmem30b (ENSKMAG00000010089) kdm1a (ENSKMAG00000010004) ENSKMAG00000009975 PTAFR (ENSKMAG00000009966) pacrg (ENSKMAG00000009956) qkia (ENSKMAG00000009926) ctsl.1 (ENSKMAG00000009899) ENSKMAG00000009870 ythdf2 (ENSKMAG00000009833) ENSKMAG00000009785 id3 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Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000017913.`b.b ENSGT00390000018395 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000163250.C ENSGT00940000162569.b.k.b ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b.h.b ENSGT00940000155885.a ENSGT00940000154630.a ENSGT00940000159004.a ENSGT00530000063615.a ENSGT00390000018319.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000160221.d ENSGT00950000182964.a.b.b.b ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000155115.a.b ENSGT00940000165326 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000159314 ENSGT00940000159599 ENSGT00940000166510 ENSGT00940000157970 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00940000165828 ENSGT00940000164359.a ENSGT00940000164539 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000153724.B Javanese ricefish MODERN SPECIES 14 ISYNA1 (ENSOJAG00000014717) tpgs1 (ENSOJAG00000014704) ENSOJAG00000014659 gna11b (ENSOJAG00000014571) ENSOJAG00000014558 PLPP2 (ENSOJAG00000022459) ENSOJAG00000022454 theg (ENSOJAG00000022451) shda (ENSOJAG00000022449) yju2 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ENSOMEG00000011231 ENSOMEG00000011211 asap3 (ENSOMEG00000011189) ENSOMEG00000011137 rps6ka1 (ENSOMEG00000011111) cnksr1 (ENSOMEG00000011044) ENSOMEG00000010950 ENSOMEG00000010942 nipal3 (ENSOMEG00000010908) rcan3 (ENSOMEG00000010885) si:dkey-221l4.10 (ENSOMEG00000010853) ENSOMEG00000000932 ENSOMEG00000010790 ENSOMEG00000010738 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000017913.`b.b ENSGT00390000018395 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000163250.C ENSGT00940000162569.b.k.b ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b.h.b ENSGT00940000155885.a ENSGT00940000155603.A.a.a.b ENSGT00940000159004.a ENSGT00530000063615.a ENSGT00390000018319.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000160221.d ENSGT00950000182964.a.b.b.b ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000155115.a.b ENSGT00940000165326 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000159314 ENSGT00940000159599 ENSGT00940000166510 ENSGT00940000157970 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00940000165828 ENSGT00940000164359.a ENSGT00940000164539 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000153724.B Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 14 pdcd10a (ENSORLG00000022553) ISYNA1 (ENSORLG00000014091) tpgs1 (ENSORLG00000014098) ENSORLG00000014104 gna11b (ENSORLG00000014137) ENSORLG00000014199 ENSORLG00000014235 ENSORLG00000025509 shda (ENSORLG00000014252) yju2 (ENSORLG00000014275) ENSORLG00000026133 ENSORLG00000028835 ENSORLG00000022536 ythdf2 (ENSORLG00000014323) ENSORLG00000030369 id3 (ENSORLG00000023230) #22 ENSORLG00000014356 asap3 (ENSORLG00000014389) ENSORLG00000014391 rps6ka1 (ENSORLG00000014406) cnksr1 (ENSORLG00000014435) ENSORLG00000014440 ENSORLG00000014445 nipal3 (ENSORLG00000014463) rcan3 (ENSORLG00000014477) si:dkey-221l4.10 (ENSORLG00000026978) dcdc2b (ENSORLG00000029049) tmem234 (ENSORLG00000029275) ENSORLG00000014503 soul3 (ENSORLG00000014505) SLC25A29 (ENSORLG00000025078) Chinese medaka MODERN SPECIES 21 ENSOSIG00000002627 tpgs1 (ENSOSIG00000002617) ENSOSIG00000002606 gna11b 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ENSGT00940000164539 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000007686.b.c.b ENSGT00940000156103 ENSGT01030000234906 ENSGT01020000230703 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01060000248589.D ENSGT00940000157330.i.b ENSGT00940000157330.i.a ENSGT00940000165937 ENSGT00940000163885 ENSGT00530000063353.a.a ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000155115.a.b ENSGT00940000165326 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000159314 ENSGT00940000159599 ENSGT00940000166510 ENSGT00940000157970 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00940000169877 ENSGT00940000165828 ENSGT00940000164359.a ENSGT00940000164539 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000157766.b.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159582 ENSGT00390000007686.b.c.b ENSGT01030000234906 ENSGT01020000230703 ENSGT00940000156103 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01060000248589.D ENSGT00940000157330.i.a ENSGT00940000165937 ENSGT00940000163885 ENSGT00530000063353.a.a ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 #22 ENSGT00940000155115.a.b ENSGT00940000165326 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000159314 ENSGT00940000159599 ENSGT00940000166510 ENSGT00940000157970 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00940000169877 ENSGT00940000165828 ENSGT00940000164359.a ENSGT00940000164539 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000157766.b.a Lumpfish MODERN SPECIES 14 WDR20 (ENSCLMG00005021244) ENSCLMG00005021242 ENSCLMG00005021241 DYNC1H1 (ENSCLMG00005021059) tmem30b (ENSCLMG00005021052) kdm1a (ENSCLMG00005021020) ENSCLMG00005021018 PTAFR (ENSCLMG00005021017) ENSCLMG00005021015 pacrg (ENSCLMG00005021000) qkia (ENSCLMG00005020998) ctsl.1 (ENSCLMG00005020997) vgll2b (ENSCLMG00005020995) ythdf2 (ENSCLMG00005020992) ENSCLMG00005020987 id3 (ENSCLMG00005020986) #22 ENSCLMG00005020985 asap3 (ENSCLMG00005020899) ENSCLMG00005020896 rps6ka1 (ENSCLMG00005017164) cnksr1 (ENSCLMG00005017085) ENSCLMG00005017082 GRHL3 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Zig-zag eel MODERN SPECIES 14 WDR20 (ENSMAMG00000006357) DYNC1H1 (ENSMAMG00000006389) ENSMAMG00000027489 tmem30b (ENSMAMG00000006532) kdm1a (ENSMAMG00000006551) ENSMAMG00000006646 ENSMAMG00000026499 ENSMAMG00000026159 ENSMAMG00000006694 ENSMAMG00000006702 ENSMAMG00000009491 ctsl.1 (ENSMAMG00000006723) vgll2b (ENSMAMG00000006758) ythdf2 (ENSMAMG00000006782) ENSMAMG00000006813 id3 (ENSMAMG00000006825) #22 ENSMAMG00000006836 asap3 (ENSMAMG00000006852) ENSMAMG00000006867 rps6ka1 (ENSMAMG00000006882) ENSMAMG00000009054 cnksr1 (ENSMAMG00000006948) ENSMAMG00000006969 ENSMAMG00000006976 nipal3 (ENSMAMG00000006984) rcan3 (ENSMAMG00000007010) ENSMAMG00000007028 ENSMAMG00000007037 ENSMAMG00000007087 ENSMAMG00000007105 SLC25A29 (ENSMAMG00000026464) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000018516 ENSGT00940000159582 ENSGT00390000007686.b.c.b ENSGT00940000156103 ENSGT01030000234906 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01060000248589.D ENSGT00940000157330 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