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Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000176171	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552 #7	ENSGT00530000063873.A #10	ENSGT00530000063873.B #12	ENSGT00390000000801 #13	ENSGT00960000187394	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #14	ENSGT00940000155270 #15	ENSGT00940000157974 #16	ENSGT00940000153514.b #17	ENSGT00950000183014.f.a #18	ENSGT00940000160642 #19	ENSGT00440000037606.b #21	ENSGT00940000158781 #22	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000162403	ENSGT00530000063410.b	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00940000161508	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000159743	ENSGT00940000159232	ENSGT00940000156190	ENSGT00390000004840	ENSGT00960000187202
Theria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000176171	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552 #7	ENSGT00530000063873.A #10	ENSGT00530000063873.B #12	ENSGT00390000000801 #13	ENSGT00960000187394	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #14	ENSGT00940000155270 #15	ENSGT00940000157974 #16	ENSGT00940000153514.b #17	ENSGT00950000183014.f.a #18	ENSGT00940000160642 #19	ENSGT00440000037606.b #21	ENSGT00940000158781 #22	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000162403	ENSGT00530000063410.b	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00940000161508	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000159743	ENSGT00940000163272	ENSGT00940000158720	ENSGT00940000159232	ENSGT00940000156190
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000176171	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552 #7	ENSGT00530000063873.A #10	ENSGT00530000063873.B #12	ENSGT00390000000801 #13	ENSGT00960000187394	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #14	ENSGT00940000155270 #15	ENSGT00940000157974 #16	ENSGT00940000153514.b #17	ENSGT00950000183014.f.a.h ##18	ENSGT00940000160642 #19	ENSGT00440000037606.b #21	ENSGT00940000158781 #22	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000162403	ENSGT00530000063410.b	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00940000161508	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000159743	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000163272	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000159232.h.b
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000176171	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552 #7	ENSGT00530000063873.A #10	ENSGT00530000063873.B #12	ENSGT00390000000801 #13	ENSGT00960000187394	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #14	ENSGT00940000155270 #15	ENSGT00940000157974 #16	ENSGT00940000153514.b #17	ENSGT00950000183014.f.a.h ##18	ENSGT00940000160642 #19	ENSGT00440000037606.b #21	ENSGT00940000158781 #22	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000162403	ENSGT00530000063410.b	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00940000161508	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000159743	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000159232.h.b
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155041	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552 #7	ENSGT00530000063873.A #10	ENSGT01090000260046	ENSGT00530000063873.B #12	ENSGT00390000000801 #13	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #14	ENSGT00940000155270 #15	ENSGT00940000157974 #16	ENSGT00940000153514.b #17	ENSGT00950000183014.f.a.h ##18	ENSGT00940000160642 #19	ENSGT00440000037606.b #21	ENSGT00940000158781 #22	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000162403	ENSGT00530000063410.b	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00940000161508	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000159743	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000159232.h.a
Primates	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000013916	ENSGT00940000155041	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552 #7	ENSGT00530000063873.A #10	ENSGT00530000063873.B #12	ENSGT00390000000801 #13	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #14	ENSGT00940000155270 #15	ENSGT00940000157974 #16	ENSGT00940000153514.b #17	ENSGT00950000183014.f.a.h ##18	ENSGT00940000160642 #19	ENSGT00440000037606.b #21	ENSGT00940000158781 #22	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000162403	ENSGT00530000063410.b	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00940000161508	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000159743	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000159232.h.a
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000013916	ENSGT00940000155041	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552 #7	ENSGT00530000063873.A #10	ENSGT00530000063873.B #12	ENSGT00390000000801 #13	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #14	ENSGT00940000155270 #15	ENSGT00940000157974 #16	ENSGT00940000153514.b #17	ENSGT00950000183014.f.a.g.a #18	ENSGT00940000160642 #19	ENSGT00440000037606.b #21	ENSGT00940000158781 #22	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000162403	ENSGT00530000063410.b	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00940000161508	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000159743	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000159232.h.a
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000013916	ENSGT00940000155041	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552 #7	ENSGT00530000063873.A #10	ENSGT00530000063873.B #12	ENSGT00390000000801 #13	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #14	ENSGT00940000155270 #15	ENSGT00940000157974 #16	ENSGT00940000153514.b #17	ENSGT00950000183014.f.a.g.a #18	ENSGT00940000160642 #19	ENSGT00440000037606.b #21	ENSGT00940000158781 #22	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000162403	ENSGT00530000063410.b	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00940000161508	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000162639	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000159743	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000158720.c.a
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552 #7	ENSGT00530000063873.A #10	ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a #11	ENSGT00530000063873.B #12	ENSGT00390000000801 #13	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #14	ENSGT00940000155270 #15	ENSGT00910000148124	ENSGT00940000157974 #16	ENSGT00940000153514.b #17	ENSGT00950000183014.f.a.g.a #18	ENSGT00940000160642 #19	ENSGT00390000015060.n #20	ENSGT00440000037606.b #21	ENSGT00940000158781 #22	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000162403	ENSGT00530000063410.b	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00940000161508	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000162639	ENSGT00910000146869	ENSGT00910000147537	ENSGT00940000159743	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000158720.c.a
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552 #7	ENSGT00530000063873.A #10	ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a #11	ENSGT00530000063873.B #12	ENSGT00390000000801 #13	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #14	ENSGT00940000155270 #15	ENSGT00910000148124	ENSGT00940000157974 #16	ENSGT00940000153514.b #17	ENSGT00950000183014.f.a.g.a.a #18	ENSGT00940000160642 #19	ENSGT00390000015060.n #20	ENSGT00440000037606.b #21	ENSGT00940000158781 #22	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000162403	ENSGT00530000063410.b	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00940000161508	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000162639	ENSGT00910000147537	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000159743	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000158720.c.a
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552 #7	ENSGT00530000063873.A #10	ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a #11	ENSGT00530000063873.B #12	ENSGT00390000000801 #13	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #14	ENSGT00940000155270 #15	ENSGT00940000157974 #16	ENSGT00940000153514.b #17	ENSGT00950000183014.f.a.g.a.a #18	ENSGT00940000160642 #19	ENSGT00390000015060.n #20	ENSGT00440000037606.b #21	ENSGT00940000158781 #22	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000162403	ENSGT00530000063410.b.c	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00940000161508	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000162639	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000159743	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000159232.h.b
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2758	RAPH1 (ENSRROG00000010278) #7	ENSRROG00000006311 #8	ENSRROG00000034411 #9	CD28 (ENSRROG00000043826) #10	ENSRROG00000034095 #11	CTLA4 (ENSRROG00000028565) #12	ICOS (ENSRROG00000038288) #13	PARD3B (ENSRROG00000013717) #14	NRP2 (ENSRROG00000040911) #15	INO80D (ENSRROG00000003571) #16	NDUFS1 (ENSRROG00000033953) #17	ENSRROG00000041925 #18	CMKLR2 (ENSRROG00000015659) #19	ENSRROG00000038360 #20	ZDBF2 (ENSRROG00000032109) #21	ADAM23 (ENSRROG00000036437) #22