Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00720000108792.A	ENSGT00940000161703 #7	ENSGT00940000157781 #8	ENSGT00390000014376 #9	ENSGT00940000161393 #10	ENSGT00390000000706 #11	ENSGT00940000162104 #12	ENSGT00940000156328.b #13	ENSGT00940000158092 #14	ENSGT00940000157394 #15	ENSGT00490000044045 #16	ENSGT00940000154872.C #17	ENSGT00940000161026 #19	ENSGT00730000111762	ENSGT01030000234607.A.a.b.a #21	ENSGT00940000161501 #22	ENSGT00390000016168.a #23	ENSGT00940000158053 #24	ENSGT00950000183162.a.b #25	ENSGT00900000140979.a.b.vb #26	ENSGT00950000183087.A.a.b.a #27	ENSGT01030000234539.b.b.a #28	ENSGT00950000183125.b.a.a #30	ENSGT00940000159012.s #31	ENSGT00550000074946 #32	ENSGT00940000159904 #33	ENSGT00860000135606	ENSGT00940000158444 #34	ENSGT00940000158973.b #35	ENSGT00390000015164 #36	ENSGT00950000182787.E.d.e.b #37
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	17	ABCA13 (ENSSVLG00005014005) #7	UPP1 (ENSSVLG00005013201) #8	C7orf57 (ENSSVLG00005012981) #9	SUN3 (ENSSVLG00005012831) #10	ENSSVLG00005012753 #11	PKD1L1 (ENSSVLG00005011632) #12	TNS3 (ENSSVLG00005011504) #13	IGFBP3 (ENSSVLG00005011249) #14	IGFBP1 (ENSSVLG00005011086) #15	CCDC201 (ENSSVLG00005011011) #16	ADCY1 (ENSSVLG00005010730) #17	ENSSVLG00005010661 #18	RAMP3 (ENSSVLG00005010625) #19	ENSSVLG00005010590 #20	TBRG4 (ENSSVLG00005010517) #21	NACAD (ENSSVLG00005010480) #22	CCM2 (ENSSVLG00005010354) #23	MYO1G (ENSSVLG00005010085) #24	PURB (ENSSVLG00005010055) #25	ENSSVLG00005009916 #26	ENSSVLG00005009853 #27	ZMIZ2 (ENSSVLG00005009754) #28	ENSSVLG00005009696 #29	OGDH (ENSSVLG00005009410) #30	ENSSVLG00005009279 #31	DDX56 (ENSSVLG00005009218) #32	NPC1L1 (ENSSVLG00005008888) #33	NUDCD3 (ENSSVLG00005008781) #34	CAMK2B (ENSSVLG00005007607) #35	ENSSVLG00005007143 #36	GCK (ENSSVLG00005006971) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00720000108792.A	ENSGT00940000161703 #7	ENSGT00940000154150.gd.b	ENSGT00940000157781 #8	ENSGT00390000014376 #9	ENSGT00940000161393 #10	ENSGT00390000000706 #11	ENSGT00940000162104 #12	ENSGT00940000156328.b #13	ENSGT00940000158092 #14	ENSGT00940000157394 #15	ENSGT00940000154872.C #17	ENSGT00940000161026 #19	ENSGT00730000111762	ENSGT01030000234607.A.a.b.a #21	ENSGT00940000161501 #22	ENSGT00390000016168.a #23	ENSGT00940000158053 #24	ENSGT00950000183162.a.b #25	ENSGT00900000140979.a.b.vb #26	ENSGT00950000183087.A.a.b.a #27	ENSGT00950000183087.B ##27	ENSGT01030000234539.b.b.a #28	ENSGT00950000183125.b.a.a #30	ENSGT00940000159012.s #31	ENSGT00550000074946 #32	ENSGT00940000159904 #33	ENSGT00860000135606	ENSGT00940000158444 #34	ENSGT00940000158973.b #35	ENSGT00390000015164 #36
Alpin marmot	MODERN SPECIES	26	C7orf57 (ENSMMMG00000015182) #9	SUN3 (ENSMMMG00000015174) #10	HUS1 (ENSMMMG00000015160) #11	PKD1L1 (ENSMMMG00000015029) #12	TNS3 (ENSMMMG00000014995) #13	ENSMMMG00000014987	ENSMMMG00000014980	ENSMMMG00000014975	IGFBP3 (ENSMMMG00000014868) #14	IGFBP1 (ENSMMMG00000014859) #15	ADCY1 (ENSMMMG00000014821) #17	RAMP3 (ENSMMMG00000014813) #19	ENSMMMG00000014809	ENSMMMG00000014801 #20	TBRG4 (ENSMMMG00000014785) #21	NACAD (ENSMMMG00000014752) #22	CCM2 (ENSMMMG00000014704) #23	MYO1G (ENSMMMG00000014692) #24	ENSMMMG00000014682	ENSMMMG00000014677	ENSMMMG00000014669 ##27	ZMIZ2 (ENSMMMG00000014533) #28	OGDH (ENSMMMG00000014266) #30	ENSMMMG00000014248 #31	DDX56 (ENSMMMG00000014226) #32	NPC1L1 (ENSMMMG00000014118) #33	NUDCD3 (ENSMMMG00000014107) #34	CAMK2B (ENSMMMG00000012507) #35	YKT6 (ENSMMMG00000012487) #36	GCK (ENSMMMG00000012459) #37	MYL7 (ENSMMMG00000012448)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	26		ENSGT00940000161703 #7	ENSGT00940000154150.gd.b	ENSGT00940000157781 #8	ENSGT00390000014376 #9	ENSGT00940000161393 #10	ENSGT00390000000706 #11	ENSGT00940000162104 #12	ENSGT00940000156328.b #13	ENSGT00940000158092 #14	ENSGT00940000157394 #15	ENSGT00940000154872.C #17	ENSGT00940000161026 #19	ENSGT00730000111762	ENSGT01030000234607.A.a.b.a #21	ENSGT00940000161501 #22	ENSGT00390000016168.a #23	ENSGT00940000158053 #24	ENSGT00950000183162.a.b #25	ENSGT00900000140979.a.b.vb #26	ENSGT00950000183087.A.a.b.a #27	ENSGT01030000234539.b.b.a #28	ENSGT00950000183125.b.a.a #30	ENSGT00940000159012.s #31	ENSGT00550000074946 #32	ENSGT00940000159904 #33	ENSGT00860000135606	ENSGT00940000158444 #34	ENSGT00940000158973.b #35	ENSGT00390000015164 #36	ENSGT00950000182787.E.d.e.b #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	214								ENSUPAG00010022138	TNS3 (ENSUPAG00010022127) #13	IGFBP3 (ENSUPAG00010022117) #14	IGFBP1 (ENSUPAG00010022114) #15	ADCY1 (ENSUPAG00010022109) #17	RAMP3 (ENSUPAG00010022107) #19	ENSUPAG00010022103 #20	TBRG4 (ENSUPAG00010022093) #21	NACAD (ENSUPAG00010022077) #22	CCM2 (ENSUPAG00010022066) #23	MYO1G (ENSUPAG00010022057) #24	PURB (ENSUPAG00010022054) #25	H2AZ2 (ENSUPAG00010022047) #26	ENSUPAG00010022046	ENSUPAG00010022045 #27	ZMIZ2 (ENSUPAG00010022033) #28	OGDH (ENSUPAG00010021984) #30	TMED4 (ENSUPAG00010021975) #31	DDX56 (ENSUPAG00010021974) #32	NPC1L1 (ENSUPAG00010021963) #33	NUDCD3 (ENSUPAG00010021958) #34	CAMK2B (ENSUPAG00010021102) #35	YKT6 (ENSUPAG00010021076) #36	GCK (ENSUPAG00010021047) #37
Squirrel	MODERN SPECIES	78	ENSSTOG00000032455 #7	ENSSTOG00000026135	UPP1 (ENSSTOG00000005502) #8	C7orf57 (ENSSTOG00000005482) #9	SUN3 (ENSSTOG00000005471) #10	HUS1 (ENSSTOG00000027204) #11	ENSSTOG00000005345 #12	TNS3 (ENSSTOG00000015793) #13	IGFBP3 (ENSSTOG00000008762) #14	IGFBP1 (ENSSTOG00000008746) #15	ADCY1 (ENSSTOG00000008713) #17	ENSSTOG00000015205	RAMP3 (ENSSTOG00000025331) #19	ENSSTOG00000020680	TBRG4 (ENSSTOG00000008370) #21	NACAD (ENSSTOG00000022804) #22	CCM2 (ENSSTOG00000026702) #23	MYO1G (ENSSTOG00000004101) #24	H2AZ2 (ENSSTOG00000011533) #26	ENSSTOG00000010215 #27	ZMIZ2 (ENSSTOG00000010197) #28	OGDH (ENSSTOG00000000469) #30	TMED4 (ENSSTOG00000014658) #31	DDX56 (ENSSTOG00000000464) #32	NPC1L1 (ENSSTOG00000020879) #33	ENSSTOG00000031145	NUDCD3 (ENSSTOG00000000456) #34	CAMK2B (ENSSTOG00000000450) #35	YKT6 (ENSSTOG00000000448) #36	GCK (ENSSTOG00000002740) #37	MYL7 (ENSSTOG00000002725)