Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000017606.a.b ENSGT00990000204633 ENSGT00940000164352.b ENSGT00510000047678.a.a.a ENSGT00510000047678.a.b ENSGT00940000165237.b.a ENSGT00940000160452 ENSGT00940000159176 ENSGT00940000161924 ENSGT00940000153514.a.a ENSGT00390000014852.b ENSGT00840000129970 ENSGT00940000157625.a.a ENSGT00940000157690 ENSGT00940000156201.a.b ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.a #23 ENSGT00390000001390.a.b #24 ENSGT00940000158476.b #25 ENSGT00940000160081.c.b #26 ENSGT00940000158541 ENSGT00940000159355 ENSGT00390000013973.B.g.b ENSGT00940000165054.D ENSGT00390000000463.b ENSGT00940000170309 ENSGT00940000157338.b ENSGT00390000006544 ENSGT00940000156104.A ENSGT01050000244961.a.a.b ENSGT00840000130004 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000006348 ENSGT00390000017606.a.b ENSGT00990000204633 ENSGT00940000164352.b ENSGT00510000047678.a.a.a ENSGT00940000165237.b.a ENSGT00940000160452 ENSGT00940000159176 ENSGT00940000161924 ENSGT00940000153514.a.a ENSGT00840000129970 ENSGT01030000235046.b ENSGT00940000157625.a.a ENSGT00940000157690 ENSGT00940000156201.a.b ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.a #23 ENSGT00390000001390.a.b #24 ENSGT00940000158476.b #25 ENSGT00940000160081.c.b #26 ENSGT00940000158541 ENSGT00940000159355 ENSGT00390000013973.B.g.b ENSGT00940000159761 ENSGT00980000202148 ENSGT00940000165054.D ENSGT00390000000463.b ENSGT00940000170309 ENSGT00940000157338.b ENSGT00390000006544 ENSGT00940000165440 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000163861.a ENSGT00390000015826 ENSGT01050000244893.c.b.b.b ENSGT00390000007786.a.b ENSGT00940000160720.b.b ENSGT00510000047678.a.a.a ENSGT00940000165237.b.a ENSGT00940000160452.b ENSGT00940000159176 ENSGT00940000153514.a.a ENSGT00840000129970 ENSGT01030000235046.b ENSGT00940000157625.a.a ENSGT00940000157690 ENSGT00940000156201.a.b ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.a.c #23 ENSGT00390000001390.a.b #24 ENSGT00940000158476.b #25 ENSGT00940000160081.c.b #26 ENSGT00940000158541 ENSGT00940000159355 ENSGT00390000013973.B.g.b ENSGT00940000165054.D ENSGT00390000000463.b ENSGT00940000170309 ENSGT00940000157338.b ENSGT00390000006544 ENSGT00940000156104.A ENSGT01050000244961.a.a.b ENSGT00940000155825.s.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000047678.a.a.a.f ENSGT00940000165237.b.a ENSGT00940000160452.b ENSGT00940000159176 ENSGT00940000153514.a.a ENSGT00390000014852.b.d ENSGT00840000129970 ENSGT00940000157625.a.a.d ENSGT01030000235046.b ENSGT00940000157625.a.a.c.b ENSGT00940000157690.c.a ENSGT00940000156201.a.b.h ENSGT00940000157625.a.a.c.a ENSGT00940000157690.c.b ENSGT00940000156201.a.b.g.a ENSGT00940000159304.p #22 ENSGT00940000165638.a.a.c #23 ENSGT00390000001390.a.b.b ##24 ENSGT00940000158476.b #25 ENSGT00940000160081.c.b #26 ENSGT00940000158541.e.a ENSGT00940000159355.cb.b ENSGT00390000013973.B.g.b.z.a.a ENSGT00940000165054.D ENSGT00390000000463.b.f ENSGT00940000170309 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#22 ENSGT00940000165638.a.a.c #23 ENSGT00390000001390.a.b.b.b ##24 ENSGT00940000158476.b.h #25 ENSGT00940000160081.c.b.e #26 ENSGT00940000158541.e.a ENSGT00940000159355.bb ENSGT00940000159355.cb.a.b ENSGT00390000013973.B.g.b.y ENSGT00940000159355.cb.a.a ENSGT00390000013973.B.g.b.z.a.a.b ENSGT00940000165054.D.g ENSGT00390000000463.b.f.a ENSGT00940000157338.b.h ENSGT00390000006544 ENSGT00940000156104.A.e.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 25 cacng4b (ENSSSAG00000115662) ENSSSAG00000102109 ENSSSAG00000111918 ENSSSAG00000042205 ENSSSAG00000042185 ENSSSAG00000042152 ENSSSAG00000042140 ENSSSAG00000041939 fahd1 (ENSSSAG00000105643) narfl (ENSSSAG00000064948) ENSSSAG00000041810 e4f1 (ENSSSAG00000101972) ENSSSAG00000041785 slc5a11 (ENSSSAG00000008560) ENSSSAG00000009022 AQP8 (ENSSSAG00000038092) #22 aqp8 (ENSSSAG00000037417) #23 ENSSSAG00000088176 ##24 CBX8 (ENSSSAG00000010070) #25 cbx4 (ENSSSAG00000111048) #26 tbc1d16 (ENSSSAG00000000640) ENSSSAG00000114795 ENSSSAG00000040524 ENSSSAG00000040242 ENSSSAG00000005230 tex2 (ENSSSAG00000077472) axin2 (ENSSSAG00000093630) cep112 (ENSSSAG00000114158) ENSSSAG00000042687 CYTH3 (ENSSSAG00000100528) ENSSSAG00000042941 River trout MODERN SPECIES aimp2 (ENSSTUG00000005148) cacng4b (ENSSTUG00000005141) CACNG1 (ENSSTUG00000005133) PITPNC1 (ENSSTUG00000005077) MSRB1 (ENSSTUG00000005012) ENSSTUG00000004998 ENSSTUG00000004989 fahd1 (ENSSTUG00000004985) hagh (ENSSTUG00000004757) narfl (ENSSTUG00000004589) zgc:113333 (ENSSTUG00000004548) e4f1 (ENSSTUG00000004520) GRID2IP (ENSSTUG00000004355) slc5a11 (ENSSTUG00000004304) ENSSTUG00000003375 aqp8a.1 (ENSSTUG00000003304) #22 aqp8b (ENSSTUG00000003248) #23 ENSSTUG00000003232 cbx8a (ENSSTUG00000003209) #25 cbx4 (ENSSTUG00000003171) #26 tbc1d16 (ENSSTUG00000003042) GAA (ENSSTUG00000002971) GAA (ENSSTUG00000002946) ENSSTUG00000002911 ENSSTUG00000002873 ENSSTUG00000002848 ENSSTUG00000002839 ENSSTUG00000002161 tex2 (ENSSTUG00000002001) axin2 (ENSSTUG00000001975) ENSSTUG00000001921 Salmo ANCESTRAL SPECIES 214 ENSGT00940000156201.a.b.g.b ENSGT00940000159304.p.b #22 ENSGT00390000001390.a.b.b.a ##24 ENSGT00940000158476.b.g #25 ENSGT00940000160081.c.b.f #26 ENSGT00940000158541.e.b ENSGT00940000159355.cb.b ENSGT00390000013973.B.g.b.z.a.a.a ENSGT00940000165054.D.h ENSGT00940000159761 ENSGT00390000000463.b.f.b ENSGT00940000157338.b.g ENSGT00940000166387 River trout MODERN SPECIES 25 cacng4b (ENSSTUG00000037057) CACNG1 (ENSSTUG00000037041) PITPNC1 (ENSSTUG00000037033) MSRB1 (ENSSTUG00000037021) ENSSTUG00000037008 ENSSTUG00000037000 fahd1 (ENSSTUG00000036993) hagh (ENSSTUG00000036875) narfl (ENSSTUG00000036753) zgc:113333 (ENSSTUG00000036734) e4f1 (ENSSTUG00000036730) ENSSTUG00000036720 GRID2IP (ENSSTUG00000044232) slc5a11 (ENSSTUG00000044187) ENSSTUG00000044136 aqp8a.1 (ENSSTUG00000044121) #22 aqp8b (ENSSTUG00000044117) #23 ENSSTUG00000044102 #24 cbx8a (ENSSTUG00000044090) #25 cbx4 (ENSSTUG00000044086) #26 tbc1d16 (ENSSTUG00000044052) GAA (ENSSTUG00000043789) ENSSTUG00000043774 ENSSTUG00000043100 tex2 (ENSSTUG00000042832) ENSSTUG00000042813 axin2 (ENSSTUG00000042652) cep112 (ENSSTUG00000042265) ENSSTUG00000042243 ENSSTUG00000042225 ENSSTUG00000042184 Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 ENSSSAG00000091044 cacng4b (ENSSSAG00000099527) ENSSSAG00000105911 ENSSSAG00000000688 ENSSSAG00000110219 ENSSSAG00000083198 ENSSSAG00000091210 fahd1 (ENSSSAG00000114353) ENSSSAG00000001779 narfl (ENSSSAG00000041839) ENSSSAG00000000724 e4f1 (ENSSSAG00000000733) ENSSSAG00000082800 slc5a11 (ENSSSAG00000041703) ENSSSAG00000038601 AQP8 (ENSSSAG00000110207) #22 aqp8b (ENSSSAG00000046069) #23 ENSSSAG00000091609 ##24 cbx8a (ENSSSAG00000114988) #25 cbx4 (ENSSSAG00000041681) #26 tbc1d16 (ENSSSAG00000040590) ENSSSAG00000000467 ENSSSAG00000005181 ENSSSAG00000010255 tex2 (ENSSSAG00000084431) axin2 (ENSSSAG00000000697) ENSSSAG00000102375 ENSSSAG00000042675 ENSSSAG00000055737 ENSSSAG00000042275 CYTH3 (ENSSSAG00000082306) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 199 ENSGT00940000157690.c.a.b 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ENSOMYG00000075898 slc5a11 (ENSOMYG00000059069) ENSOMYG00000054973 AQP8 (ENSOMYG00000018729) #22 aqp8b (ENSOMYG00000018645) #23 ENSOMYG00000018554 ##24 cbx8a (ENSOMYG00000018438) #25 cbx4 (ENSOMYG00000018524) #26 tbc1d16 (ENSOMYG00000060882) ENSOMYG00000013473 ENSOMYG00000050298 ENSOMYG00000068406 ENSOMYG00000015969 ENSOMYG00000014306 tex2 (ENSOMYG00000012939) axin2 (ENSOMYG00000018349) ENSOMYG00000057167 cep112 (ENSOMYG00000051132) ENSOMYG00000018263 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 118 ENSGT00390000015826 ENSGT01050000244893.c.b.b.b ENSGT00390000007786.a.b.e ENSGT00940000160720.b.b.e.a ENSGT00510000047678.a.a.a.f ENSGT00940000165237.b.a ENSGT00940000160452.b ENSGT00940000159176 ENSGT00940000153514.a.a.m ENSGT00390000014852.b.c ENSGT00390000014852.b.d ENSGT00840000129970 ENSGT00940000157625.a.a.d ENSGT00940000157690.c.b ENSGT00940000156201.a.b.g.a.b ENSGT00940000159304.p #22 ENSGT00940000165638.a.a.c #23 ENSGT00390000001390.a.b.b.b ##24 ENSGT00940000158476.b #25 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ENSOKIG00005044115 ENSOKIG00005044104 ENSOKIG00005043872 ENSOKIG00005043816 tex2 (ENSOKIG00005043309) axin2 (ENSOKIG00005043263) ENSOKIG00005043238 cep112 (ENSOKIG00005042901) Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 712 ENSGT00930000150969.B.e ENSGT00940000160577.b ENSGT00920000149163.j ENSGT00940000157625.a.b.e ENSGT00940000156201.a.a.f ENSGT00940000156372.t ENSGT00940000159304.o.a ##22 ENSGT00940000159304.o.b ##22 ENSGT00940000165638.a.a.d ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.b ENSGT01000000215398.a ENSGT00940000157809.j.a.e.b.l Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00390000009492.f ENSGT00500000044930.e.a.d ENSGT00940000158812.j.a.p ENSGT00940000164352.a.g ENSGT00940000165237.b.b.d ENSGT00390000001723 ENSGT00940000160619.l.a.b ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B.f ENSGT00940000160577.a ENSGT00920000149163.i ENSGT00940000157625.a.b.f ENSGT00940000156201.a.a.e ENSGT00940000156372.s ENSGT00940000165638.b.a.a ##23 ENSGT00940000159304.o.a ##22 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MRTFB (ENSOMYG00000034323) ercc4 (ENSOMYG00000034286) cpped1 (ENSOMYG00000034264) shisa9a (ENSOMYG00000034255) ENSOMYG00000052785 SNX29 (ENSOMYG00000034067) ENSOMYG00000034028 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00500000044930.e.a.c ENSGT00940000158812.j.a.o ENSGT01000000221588 ENSGT00940000164352.a.h ENSGT00940000159689 ENSGT00510000047678.a.a.b ENSGT00940000165237.b.b.c ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B.f ENSGT00940000160577.a ENSGT00920000149163.i ENSGT00940000157625.a.b.f ENSGT00940000156201.a.a.e ENSGT00940000156372.s ENSGT00940000165638.b.a.a ##23 ENSGT00940000159304.o.b ##22 ENSGT00940000165638.a.a.d ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b.k ENSGT01000000215398.b ENSGT00940000154590.e ENSGT00940000156278.r.b ENSGT00940000164514.a.c.a ENSGT00390000008825.a.c.a.a ENSGT00940000163474 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b.e ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873.d ENSGT00940000163663.B.b.c.b ENSGT00940000163663.B.b.d ENSGT00730000110975.b Coho salmon MODERN SPECIES 17 tom1l2 (ENSOKIG00005009452) atpaf2 (ENSOKIG00005009428) GID4 (ENSOKIG00005009416) noxo1b (ENSOKIG00005009408) ENSOKIG00005009400 neurl2 (ENSOKIG00005009384) msrb1b (ENSOKIG00005009373) ENSOKIG00005009367 mlst8 (ENSOKIG00005009347) bricd5 (ENSOKIG00005009331) pgp (ENSOKIG00005009320) zdhhc4 (ENSOKIG00005009292) grid2ipb (ENSOKIG00005009163) arhgap17a (ENSOKIG00005008532) lcmt1 (ENSOKIG00005008250) aqp8a.1 (ENSOKIG00005008217) ##22 ENSOKIG00005008203 ##23 ENSOKIG00005008182 ENSOKIG00005008166 ENSOKIG00005008152 hbae4 (ENSOKIG00005008121) ENSOKIG00005007524 foxj1b (ENSOKIG00005007486) UBALD1 (ENSOKIG00005007477) ENSOKIG00005007466 MRTFB (ENSOKIG00005007433) ercc4 (ENSOKIG00005007341) shisa9a (ENSOKIG00005007313) SNX29 (ENSOKIG00005007189) ENSOKIG00005007143 ENSOKIG00005007134 Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 10 baiap2l1b (ENSELUG00000006865) bri3 (ENSELUG00000006813) TECPR1 (ENSELUG00000000216) lmtk2 (ENSELUG00000006709) pvalb1 (ENSELUG00000006688) pvalb8 (ENSELUG00000006669) aimp2 (ENSELUG00000006646) cacng4b (ENSELUG00000006621) hagh (ENSELUG00000006601) fahd1 (ENSELUG00000006568) narfl (ENSELUG00000006548) e4f1 (ENSELUG00000000207) GRID2IP (ENSELUG00000006388) slc5a11 (ENSELUG00000006253) arhgap17b (ENSELUG00000006184) AQP8 (ENSELUG00000006113) #22 aqp8b (ENSELUG00000006091) #23 cbx8a (ENSELUG00000006062) #25 cbx4 (ENSELUG00000006022) #26 tbc1d16 (ENSELUG00000006001) GAA (ENSELUG00000005981) ENSELUG00000005957 tex2 (ENSELUG00000005900) ENSELUG00000030546 axin2 (ENSELUG00000005769) cep112 (ENSELUG00000005729) ENSELUG00000001391 CACNG5 (ENSELUG00000005574) ENSELUG00000030021 ENSELUG00000005558 RAC1 (ENSELUG00000018657) Northern pike MODERN SPECIES 4 atpaf2 (ENSELUG00000001192) GID4 (ENSELUG00000018541) noxo1b (ENSELUG00000018551) RNF151 (ENSELUG00000018574) ENSELUG00000018620 neurl2 (ENSELUG00000018631) msrb1b (ENSELUG00000018663) ENSELUG00000018675 MEIOB (ENSELUG00000018701) mlst8 (ENSELUG00000000801) bricd5 (ENSELUG00000025950) pgp (ENSELUG00000018770) zdhhc4 (ENSELUG00000018782) grid2ipb (ENSELUG00000018823) arhgap17a (ENSELUG00000018904) aqp8a.1 (ENSELUG00000018983) #22 hbae4 (ENSELUG00000019002) ENSELUG00000019035 foxj1b (ENSELUG00000019053) UBALD1 (ENSELUG00000032018) ENSELUG00000019069 MRTFB (ENSELUG00000019087) ercc4 (ENSELUG00000019115) cpped1 (ENSELUG00000019151) shisa9a (ENSELUG00000019170) SNX29 (ENSELUG00000019189) ENSELUG00000000819 ENSELUG00000019208 rsl1d1 (ENSELUG00000019243) ENSELUG00000019258 ENSELUG00000019267 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00500000044930.e.a ENSGT00940000158812.j.a ENSGT00940000164352.a ENSGT00940000159689 ENSGT00510000047678.a.a.b ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT01030000235046.a ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000154590 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000008825.a ENSGT01100000263632.b ENSGT00940000178019 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00940000173220 ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000164324 ENSGT00730000110975 Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 11 tbl3 (ENSGMOG00000011562) ENSGMOG00000032136 ENSGMOG00000011543 NDUFB10 (ENSGMOG00000011538) ENSGMOG00000011527 ENSGMOG00000025555 ENSGMOG00000011462 MSRB1 (ENSGMOG00000024174) ENSGMOG00000030577 fahd1 (ENSGMOG00000020263) hagh (ENSGMOG00000011437) narfl (ENSGMOG00000011424) e4f1 (ENSGMOG00000011409) slc5a11 (ENSGMOG00000011347) arhgap17b (ENSGMOG00000011331) AQP8 (ENSGMOG00000032268) #22 ENSGMOG00000023990 #24 cbx8a (ENSGMOG00000027284) #25 cbx4 (ENSGMOG00000031904) #26 tbc1d16 (ENSGMOG00000011285) ENSGMOG00000011262 ENSGMOG00000011232 tex2 (ENSGMOG00000011198) axin2 (ENSGMOG00000031244) cep112 (ENSGMOG00000011134) ENSGMOG00000026255 CACNG5 (ENSGMOG00000035294) CYTH3 (ENSGMOG00000008919) ENSGMOG00000030185 rac1b (ENSGMOG00000028922) stk19 (ENSGMOG00000008901) Cod MODERN SPECIES 9 atpaf2 (ENSGMOG00000005553) GID4 (ENSGMOG00000005534) noxo1b (ENSGMOG00000032993) ENSGMOG00000023717 ENSGMOG00000033069 msrb1b (ENSGMOG00000032780) ENSGMOG00000027199 ENSGMOG00000005404 mlst8 (ENSGMOG00000005385) bricd5 (ENSGMOG00000029047) pgp (ENSGMOG00000024072) zdhhc4 (ENSGMOG00000005351) grid2ipb (ENSGMOG00000005318) arhgap17a (ENSGMOG00000035125) lcmt1 (ENSGMOG00000001230) aqp8a.1 (ENSGMOG00000001220) #22 ENSGMOG00000015825 ##23 ENSGMOG00000022654 ENSGMOG00000029846 HbB4 (ENSGMOG00000026357) hbae4 (ENSGMOG00000030505) HbB2 (ENSGMOG00000026934) ENSGMOG00000035245 ENSGMOG00000017919 foxj1b (ENSGMOG00000036970) ENSGMOG00000028050 ENSGMOG00000029237 MRTFB (ENSGMOG00000000632) ENSGMOG00000000626 ercc4 (ENSGMOG00000000603) cpped1 (ENSGMOG00000000584) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00500000044930.e.a ENSGT00940000158812.j.a ENSGT00940000164352.a 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ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000154590 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000008825.a ENSGT01100000263632.b ENSGT00940000178019 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00940000173220 ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00940000164324 ENSGT00730000110975 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00500000044930.e.a ENSGT00940000158812.j.a ENSGT00940000164352.a ENSGT00940000159689 ENSGT00510000047678.a.a.b ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT01030000235046.a ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000008825.a ENSGT01100000263632.b 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SNX29 (ENSAPEG00000003272) Spiny chromis MODERN SPECIES 1361 zdhhc4 (ENSAPOG00000010699) ENSAPOG00000010713 grid2ipb (ENSAPOG00000010795) arhgap17a (ENSAPOG00000010875) lcmt1 (ENSAPOG00000010934) aqp8a.1 (ENSAPOG00000010943) #22 ENSAPOG00000010989 ##23 hbae5 (ENSAPOG00000010950) ENSAPOG00000011017 hbbe3 (ENSAPOG00000011025) hbae4 (ENSAPOG00000011038) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2123 arhgap17a (ENSSPAG00000023105) lcmt1 (ENSSPAG00000023090) aqp8a.1 (ENSSPAG00000023085) #22 ENSSPAG00000023082 ##23 hbae5 (ENSSPAG00000023077) ENSSPAG00000023070 hbbe3 (ENSSPAG00000023068) hbae4 (ENSSPAG00000023067) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00500000044930.e.a ENSGT00940000158812.j.a ENSGT00940000164352.a ENSGT00940000159689 ENSGT00510000047678.a.a.b ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT01030000235046.a ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 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ENSGT00390000008825.a ENSGT01100000263632.b ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00730000110975 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00440000038603 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00500000044930.e.a ENSGT00940000158812.j.a ENSGT00940000164352.a ENSGT00940000159689 ENSGT00510000047678.a.a.b ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT01030000235046.a ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00730000110975 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00440000038603 ENSGT00940000155582.q.b Pike perch MODERN SPECIES 89 GID4 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ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00730000110975 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00940000177425 ENSGT00440000038603 ENSGT00940000155582.q.b Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000009492 ENSGT00500000044930.e.a ENSGT00940000158812.j.a ENSGT00940000164352.a ENSGT00940000159689 ENSGT00510000047678.a.a.b ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000154590 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00730000110975 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00940000177425 ENSGT00440000038603 ENSGT00940000155582.q.b European seabass MODERN SPECIES 11 ENSDLAG00005009626 foxl3 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arhgap17a (ENSSAUG00010011620) lcmt1 (ENSSAUG00010011445) aqp8a.1 (ENSSAUG00010011442) #22 ENSSAUG00010011438 ##23 hbbe3 (ENSSAUG00010011429) hbae5 (ENSSAUG00010011425) hbae4 (ENSSAUG00010011422) ENSSAUG00010009359 foxj1b (ENSSAUG00010009334) ubald1b (ENSSAUG00010009333) MRTFB (ENSSAUG00010009332) ercc4 (ENSSAUG00010009250) cpped1 (ENSSAUG00010009242) shisa9a (ENSSAUG00010009241) SNX29 (ENSSAUG00010009236) ENSSAUG00010009230 rsl1d1 (ENSSAUG00010009225) gspt1 (ENSSAUG00010007954) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000009492 ENSGT00500000044930.e.a ENSGT00940000158812.j.a ENSGT00940000164352.a ENSGT00940000159689 ENSGT00510000047678.a.a.b ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000008825.a ENSGT01100000263632.b ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00730000110975 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00940000177425 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000009492 ENSGT00500000044930.e.a ENSGT00940000158812.j.a ENSGT00940000164352.a ENSGT00940000159689 ENSGT00510000047678.a.a.b ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000008825.a ENSGT01100000263632.b ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00730000110975 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00940000177425 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009492 ENSGT00500000044930.e.a ENSGT00940000158812.j.a ENSGT00940000164352.a ENSGT00940000159689 ENSGT00510000047678.a.a.b ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000154590 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00730000110975 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00440000038603 ENSGT00940000155582.q.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159664 ENSGT01090000260051.b.a.b ENSGT00940000157017.a.b.a ENSGT00390000005895 ENSGT00390000014852.a ENSGT00390000004691 ENSGT00940000153514.a.b ENSGT00390000013574 ENSGT00900000141125 ENSGT00940000162951 ENSGT00530000063718.a.a ENSGT00940000158558.b ENSGT00390000007041 ENSGT00940000165566.a ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000154590 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00730000110975 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00440000038603 ENSGT00940000155582.q.b ENSGT00760000119398 Greater amberjack MODERN SPECIES 27 ENSSDUG00000009366 ENSSDUG00000009354 UTS2R (ENSSDUG00000009351) ogfod3 (ENSSDUG00000009338) hexdc (ENSSDUG00000009317) cybc1 (ENSSDUG00000009309) narf (ENSSDUG00000009290) FDXR (ENSSDUG00000009034) mrpl38 (ENSSDUG00000008991) ENSSDUG00000008951 wbp2 (ENSSDUG00000008902) RAB26 (ENSSDUG00000008859) PEMT (ENSSDUG00000008850) rasd1 (ENSSDUG00000008835) lcmt1 (ENSSDUG00000008795) aqp8a.1 (ENSSDUG00000008771) #22 ENSSDUG00000008751 ##23 hbae5 (ENSSDUG00000008737) hbbe3 (ENSSDUG00000008731) hbae4 (ENSSDUG00000008727) ENSSDUG00000008653 foxj1b (ENSSDUG00000008637) ubald1b (ENSSDUG00000008629) MRTFB (ENSSDUG00000008600) ercc4 (ENSSDUG00000008568) cpped1 (ENSSDUG00000008545) shisa9a (ENSSDUG00000008529) ENSSDUG00000008526 SNX29 (ENSSDUG00000008483) ENSSDUG00000008467 rsl1d1 (ENSSDUG00000008447) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2780 ENSSLDG00000019123 ENSSLDG00000019129 ogfod3 (ENSSLDG00000019136) hexdc (ENSSLDG00000019153) cybc1 (ENSSLDG00000019176) narf (ENSSLDG00000019246) FDXR (ENSSLDG00000019288) mrpl38 (ENSSLDG00000019306) ENSSLDG00000019319 wbp2 (ENSSLDG00000019336) RAB26 (ENSSLDG00000019351) PEMT (ENSSLDG00000019376) rasd1 (ENSSLDG00000019388) lcmt1 (ENSSLDG00000019394) aqp8a.1 (ENSSLDG00000019450) #22 ENSSLDG00000019496 ##23 hbae5 (ENSSLDG00000019509) hbbe3 (ENSSLDG00000019517) hbae4 (ENSSLDG00000019533) ENSSLDG00000019574 foxj1b (ENSSLDG00000019635) ubald1b (ENSSLDG00000019645) Barramundi perch MODERN SPECIES 431 atpaf2 (ENSLCAG00010028088) GID4 (ENSLCAG00010028089) noxo1b (ENSLCAG00010028090) ENSLCAG00010028091 neurl2 (ENSLCAG00010028092) msrb1b (ENSLCAG00010028093) ENSLCAG00010028094 MEIOB (ENSLCAG00010028095) mlst8 (ENSLCAG00010028096) bricd5 (ENSLCAG00010028097) pgp (ENSLCAG00010028098) zdhhc4 (ENSLCAG00010028099) grid2ipb (ENSLCAG00010028100) arhgap17a (ENSLCAG00010028101) lcmt1 (ENSLCAG00010028102) aqp8a.1 (ENSLCAG00010028103) #22 ENSLCAG00010028104 ##23 hbae5 (ENSLCAG00010028105) ENSLCAG00010028106 hbbe3 (ENSLCAG00010028107) hbae4 (ENSLCAG00010028108) ENSLCAG00010028115 foxj1b (ENSLCAG00010028118) ubald1b (ENSLCAG00010028119) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000009492 ENSGT00500000044930.e.a ENSGT00940000158812.j.a ENSGT00940000164352.a ENSGT00940000159689 ENSGT00510000047678.a.a.b ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000178476 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000008825.a ENSGT01100000263632.b ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00730000110975 ENSGT00940000162720.a.b.a Tongue sole MODERN SPECIES 18 noxo1b (ENSCSEG00000000896) GID4 (ENSCSEG00000000898) atpaf2 (ENSCSEG00000000905) ENSCSEG00000000911 foxl3 (ENSCSEG00000000919) ENSCSEG00000000921 MEIOB (ENSCSEG00000000926) mlst8 (ENSCSEG00000000934) bricd5 (ENSCSEG00000000940) pgp (ENSCSEG00000000945) zdhhc4 (ENSCSEG00000000947) grid2ipb (ENSCSEG00000000952) ENSCSEG00000000964 ENSCSEG00000000976 lcmt1 (ENSCSEG00000000983) aqp8a.1 (ENSCSEG00000000989) #22 ENSCSEG00000000995 hbae5 (ENSCSEG00000001002) ENSCSEG00000001010 HBE1 (ENSCSEG00000001017) ENSCSEG00000001190 ENSCSEG00000001193 hbae4 (ENSCSEG00000001195) DAGLB (ENSCSEG00000001216) SPAG9 (ENSCSEG00000001227) noc3l (ENSCSEG00000001257) ENSCSEG00000001265 ch25h (ENSCSEG00000001266) acta2 (ENSCSEG00000001272) GRID1 (ENSCSEG00000001285) ENSCSEG00000001297 Turbot MODERN SPECIES 9 GID4 (ENSSMAG00000009052) noxo1b (ENSSMAG00000009040) ENSSMAG00000009015 neurl2 (ENSSMAG00000008992) msrb1b (ENSSMAG00000008970) ENSSMAG00000008954 ENSSMAG00000008821 mlst8 (ENSSMAG00000008770) bricd5 (ENSSMAG00000008752) pgp (ENSSMAG00000008748) zdhhc4 (ENSSMAG00000008696) ENSSMAG00000008695 grid2ipb (ENSSMAG00000008656) arhgap17a (ENSSMAG00000008554) lcmt1 (ENSSMAG00000008498) aqp8a.1 (ENSSMAG00000008477) #22 ENSSMAG00000008469 ##23 ENSSMAG00000008459 hbae4 (ENSSMAG00000021725) hbae5 (ENSSMAG00000008444) ENSSMAG00000008257 foxj1b (ENSSMAG00000008197) ENSSMAG00000023967 ENSSMAG00000008161 MRTFB (ENSSMAG00000008135) ercc4 (ENSSMAG00000008092) ENSSMAG00000022831 cpped1 (ENSSMAG00000008063) shisa9a (ENSSMAG00000008053) SNX29 (ENSSMAG00000007999) ENSSMAG00000007986 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 18 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(ENSMAMG00000005970) ENSMAMG00000024761 grid2ipb (ENSMAMG00000005902) arhgap17a (ENSMAMG00000005495) lcmt1 (ENSMAMG00000026824) aqp8a.1 (ENSMAMG00000005456) #22 ENSMAMG00000004830 ##23 hbae5 (ENSMAMG00000004812) hbbe3 (ENSMAMG00000004796) hbae4 (ENSMAMG00000004789) ENSMAMG00000004697 foxj1b (ENSMAMG00000025608) ENSMAMG00000004669 ENSMAMG00000004664 MRTFB (ENSMAMG00000004563) ercc4 (ENSMAMG00000004523) cpped1 (ENSMAMG00000004494) shisa9a (ENSMAMG00000004471) SNX29 (ENSMAMG00000004442) ENSMAMG00000004410 ENSMAMG00000004424 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156940.b ENSGT00390000009492 ENSGT00500000044930.e.a ENSGT00940000158812.j.a ENSGT00940000164352.a ENSGT00940000159689 ENSGT00940000165237.b.b ENSGT00390000001723 ENSGT00390000014795 ENSGT00930000150969.B ENSGT00940000160577 ENSGT00920000149163 ENSGT00940000157625.a.b ENSGT00940000156201.a.a ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000176976 ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT00940000154590 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000163474 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b ENSGT00730000110975 ENSGT00940000162720.a.b.a ENSGT00940000177425 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 9 ENSBSLG00000023346 foxl3 (ENSBSLG00000023526) tom1l2 (ENSBSLG00000023533) atpaf2 (ENSBSLG00000023576) GID4 (ENSBSLG00000023586) noxo1b (ENSBSLG00000023596) ENSBSLG00000023607 ENSBSLG00000023656 ENSBSLG00000023660 mlst8 (ENSBSLG00000023673) bricd5 (ENSBSLG00000023689) pgp (ENSBSLG00000023691) zdhhc4 (ENSBSLG00000023694) arhgap17a (ENSBSLG00000015375) lcmt1 (ENSBSLG00000016200) aqp8a.1 (ENSBSLG00000016222) #22 ENSBSLG00000016227 ##23 hbae5 (ENSBSLG00000016230) ENSBSLG00000016238 hbbe3 (ENSBSLG00000016244) hbae4 (ENSBSLG00000016248) ENSBSLG00000016795 foxj1b (ENSBSLG00000017710) ubald1b (ENSBSLG00000017716) ENSBSLG00000017727 ENSBSLG00000017751 ercc4 (ENSBSLG00000017768) cpped1 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#22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b ENSGT01000000215398 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000154590 ENSGT00940000156278 ENSGT00940000164514.a ENSGT00390000009925.a.k.b ENSGT00390000008825.a.b ENSGT00940000163474 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000165873 ENSGT00940000163663.B.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000017606.a.b ENSGT00990000204633 ENSGT00940000164352.b.s ENSGT00510000047678.b ENSGT00940000165237.b.a ENSGT00940000160452 ENSGT00940000159176 ENSGT00940000161924 ENSGT00940000153514.a.a ENSGT00390000014852.b ENSGT00840000129970 ENSGT01030000235046 ENSGT00940000157625.a.a ENSGT00940000157690 ENSGT00940000156201.a.b ENSGT00940000159304 #22 ENSGT00940000165638.a.b ##23 ENSGT00940000165638.a.a #23 ENSGT00390000001390.a.b #24 ENSGT00940000158476.b #25 ENSGT00940000160081.c.b #26 ENSGT00940000158541 ENSGT00940000159355 ENSGT00390000013973.B.g.b ENSGT00940000165054.D 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ENSCARG00000016800 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00950000182951.A.a.a.c.a.a.e ENSGT00940000162800.c ENSGT00940000156940.b.d ENSGT00390000009492.c ENSGT00940000158812.j.a.f ENSGT00940000164352.a.c ENSGT00940000159689.d ENSGT00510000047678.a.a.b.c ENSGT00390000001723.g ENSGT00390000014795.h ENSGT00940000160577.e ENSGT00920000149163.f ENSGT00940000157625.a.b.b ENSGT00940000156201.a.a.b ENSGT00940000156372.o ENSGT00940000159304.f #22 ENSGT00940000163288.a.b.b.b.a.b.a ENSGT00940000157809.j.a.e.b.a.a.b ENSGT00940000157809.j.a.e.b.b.a.b ENSGT00940000154590.c ENSGT00940000156278.pe.b ENSGT00940000164514.a.e ENSGT00390000009925.a.k.b.a ENSGT00390000008825.a.b.d ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b.i.b.a ENSGT00390000004394.j ENSGT00940000165873.a.a ENSGT00940000163663.B.b.f ENSGT00730000110975.i ENSGT00940000175733.c ENSGT01030000236780.a Common carp reference MODERN SPECIES 44 tom1l2 (ENSCCRG00000074603) atpaf2 (ENSCCRG00000012945) noxo1b (ENSCCRG00000045535) ENSCCRG00000073528 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arhgap17a (ENSEEEG00000009151) lcmt1 (ENSEEEG00000009258) aqp8a.1 (ENSEEEG00000009264) #22 aqp8a.2 (ENSEEEG00000009497) ##23 ENSEEEG00000009534 hbbe2 (ENSEEEG00000010084) hbae4 (ENSEEEG00000010086) ENSEEEG00000010162 foxj1b (ENSEEEG00000010164) mgrn1a (ENSEEEG00000010165) UBALD1 (ENSEEEG00000010191) MRTFB (ENSEEEG00000010192) ercc4 (ENSEEEG00000010194) cpped1 (ENSEEEG00000010195) shisa9a (ENSEEEG00000010196) SNX29 (ENSEEEG00000010199) ENSEEEG00000010251 ENSEEEG00000010252