Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000161056 #7	ENSGT00510000049503	ENSGT00530000063113.B #9	ENSGT00940000160586 #10	ENSGT00940000161566 #11	ENSGT00940000162210 #12	ENSGT00940000160611 #13	ENSGT00940000155740 #14	ENSGT00390000005315 #15	ENSGT01010000222542	ENSGT00940000154468 #16	ENSGT00940000156477 #18	ENSGT00940000163024 #17	ENSGT00390000003964.b #19	ENSGT00940000158442 #21	ENSGT00390000007796 #22	ENSGT00940000155308 #23	ENSGT00940000155458 #24	ENSGT00940000159849 #25	ENSGT00390000004786 #26	ENSGT00940000160331 #27	ENSGT00950000182872.f.a.a.b #28	ENSGT00390000011347 #29	ENSGT00950000182982.B #30	ENSGT00940000161648 #31	ENSGT00390000013867 #32	ENSGT00950000183202.a.a #33	ENSGT00940000160596 #34	ENSGT00390000002635 #35	ENSGT00950000183154.b.b #36	ENSGT00390000003422 #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161056 #7	ENSGT00940000166164 #8	ENSGT00530000063113.B #9	ENSGT00940000160586 #10	ENSGT00940000161566 #11	ENSGT00940000162210 #12	ENSGT00940000160611 #13	ENSGT00940000155740 #14	ENSGT00390000005315 #15	ENSGT01010000222542	ENSGT00940000154468 #16	ENSGT00940000156477 #18	ENSGT00940000163024 #17	ENSGT00390000003964.b #19	ENSGT00940000158442 #21	ENSGT00390000007796 #22	ENSGT00940000155308 #23	ENSGT00940000155458 #24	ENSGT00940000159849 #25	ENSGT00390000004786 #26	ENSGT00940000160331 #27	ENSGT00950000182872.f.a.a.b #28	ENSGT00390000011347 #29	ENSGT00950000182982.B #30	ENSGT00940000161648 #31	ENSGT00390000013867 #32	ENSGT00950000183202.a.a #33	ENSGT00940000160596 #34	ENSGT00390000002635 #35	ENSGT00950000183154.b.b #36	ENSGT00390000003422 #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000161056 #7	ENSGT00940000166164 #8	ENSGT00530000063113.B #9	ENSGT00940000160586 #10	ENSGT00940000161566 #11	ENSGT00940000162210 #12	ENSGT00940000160611 #13	ENSGT00940000155740 #14	ENSGT00390000005315 #15	ENSGT01010000222542	ENSGT00940000154468 #16	ENSGT00940000156477 #18	ENSGT00940000163024 #17	ENSGT00390000003964.b #19	ENSGT00940000158442 #21	ENSGT00390000007796 #22	ENSGT00940000155308 #23	ENSGT00940000155458 #24	ENSGT00940000159849 #25	ENSGT00390000004786 #26	ENSGT00940000160331 #27	ENSGT00950000182872.f.a.a.b #28	ENSGT00390000011347 #29	ENSGT00950000182982.B #30	ENSGT00940000161648 #31	ENSGT00390000013867 #32	ENSGT00950000183202.a.a #33	ENSGT00940000160596 #34	ENSGT00390000002635 #35	ENSGT00950000183154.b.b #36	ENSGT00390000003422 #37
Squirrel	MODERN SPECIES	161	CEP250 (ENSSTOG00000013121) #7	ENSSTOG00000013172 #8	ERGIC3 (ENSSTOG00000020256) #9	ENSSTOG00000015308 #10	SPAG4 (ENSSTOG00000015312) #11	CPNE1 (ENSSTOG00000033147) #12	RBM12 (ENSSTOG00000019739) #13	ENSSTOG00000015317 #14	ROMO1 (ENSSTOG00000015322) #15	RBM39 (ENSSTOG00000030698) #16	SCAND1 (ENSSTOG00000025008) #17	PHF20 (ENSSTOG00000024453) #18	CNBD2 (ENSSTOG00000015345) #19	ENSSTOG00000031834 #20	EPB41L1 (ENSSTOG00000011029) #21	AAR2 (ENSSTOG00000011040) #22	DLGAP4 (ENSSTOG00000019844) #23	MYL9 (ENSSTOG00000001722) #24	TGIF2 (ENSSTOG00000001729) #25	RAB5IF (ENSSTOG00000022280) #26	SLA2 (ENSSTOG00000013924) #27	NDRG3 (ENSSTOG00000022531) #28	DSN1 (ENSSTOG00000012462) #29	SOGA1 (ENSSTOG00000023271) #30	TLDC2 (ENSSTOG00000000597) #31	SAMHD1 (ENSSTOG00000002833) #32	RBL1 (ENSSTOG00000021696) #33	MROH8 (ENSSTOG00000016155) #34	RPN2 (ENSSTOG00000011742) #35	GHRH (ENSSTOG00000001984) #36	MANBAL (ENSSTOG00000011770) #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	24	ENSUPAG00010004196 #7	ENSUPAG00010004187 #7	ERGIC3 (ENSUPAG00010004159) #9	ENSUPAG00010004028 #10	SPAG4 (ENSUPAG00010004003) #11	RBM12 (ENSUPAG00010003967) #13	CPNE1 (ENSUPAG00010003896) #12	NFS1 (ENSUPAG00010003874) #14	ENSUPAG00010003860 #15	ENSUPAG00010003857	RBM39 (ENSUPAG00010003791) #16	PHF20 (ENSUPAG00010003757) #18	SCAND1 (ENSUPAG00010003746) #17	CNBD2 (ENSUPAG00010003714) #19	EPB41L1 (ENSUPAG00010003586) #21	AAR2 (ENSUPAG00010003575) #22	DLGAP4 (ENSUPAG00010003309) #23	ENSUPAG00010003297 #24	TGIF2 (ENSUPAG00010003288) #25	RAB5IF (ENSUPAG00010003277) #26	SLA2 (ENSUPAG00010003263) #27	NDRG3 (ENSUPAG00010003233) #28	DSN1 (ENSUPAG00010003205) #29	SOGA1 (ENSUPAG00010003186) #30	TLDC2 (ENSUPAG00010003169) #31	SAMHD1 (ENSUPAG00010003146) #32	RBL1 (ENSUPAG00010003087) #33	MROH8 (ENSUPAG00010003057) #34	RPN2 (ENSUPAG00010002985) #35	GHRH (ENSUPAG00010002968) #36	ENSUPAG00010002954
Alpin marmot	MODERN SPECIES		UQCC1 (ENSMMMG00000023253)	ENSMMMG00000023247	GDF5 (ENSMMMG00000023244)	ENSMMMG00000023239 #7	ERGIC3 (ENSMMMG00000023223) #9	SPAG4 (ENSMMMG00000023202) #11	CPNE1 (ENSMMMG00000023191) #12	NFS1 (ENSMMMG00000023185) #14	ROMO1 (ENSMMMG00000023178) #15	ENSMMMG00000023176	ENSMMMG00000023151 #16	PHF20 (ENSMMMG00000023134) #18	SCAND1 (ENSMMMG00000023133) #17	CNBD2 (ENSMMMG00000023129) #19	EPB41L1 (ENSMMMG00000022952) #21	AAR2 (ENSMMMG00000022945) #22	DLGAP4 (ENSMMMG00000022789) #23	MYL9 (ENSMMMG00000022784) #24	TGIF2 (ENSMMMG00000022781) #25	RAB5IF (ENSMMMG00000022774) #26	SLA2 (ENSMMMG00000022773) #27	NDRG3 (ENSMMMG00000022756) #28	DSN1 (ENSMMMG00000022749) #29	SOGA1 (ENSMMMG00000022731) #30	TLDC2 (ENSMMMG00000022730) #31	SAMHD1 (ENSMMMG00000015933) #32	RBL1 (ENSMMMG00000015873) #33	MROH8 (ENSMMMG00000015842) #34	RPN2 (ENSMMMG00000015754) #35	GHRH (ENSMMMG00000015728) #36	MANBAL (ENSMMMG00000015723) #37
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	CEP250 (ENSSVLG00005012988) #7	C20orf173 (ENSSVLG00005013087)	ERGIC3 (ENSSVLG00005013274) #9	ENSSVLG00005013579 #10	SPAG4 (ENSSVLG00005013790) #11	CPNE1 (ENSSVLG00005013955) #12	NFS1 (ENSSVLG00005014414) #14	ROMO1 (ENSSVLG00005014584) #15	ENSSVLG00005014624	ENSSVLG00005014687 #16	PHF20 (ENSSVLG00005015235) #18	SCAND1 (ENSSVLG00005015414) #17	CNBD2 (ENSSVLG00005015451) #19	ENSSVLG00005015760	EPB41L1 (ENSSVLG00005015914) #21	AAR2 (ENSSVLG00005016272) #22	DLGAP4 (ENSSVLG00005016321) #23	MYL9 (ENSSVLG00005016643) #24	ENSSVLG00005016679 #25	RAB5IF (ENSSVLG00005016720) #26	SLA2 (ENSSVLG00005016772) #27	NDRG3 (ENSSVLG00005016927) #28	DSN1 (ENSSVLG00005017205) #29	SOGA1 (ENSSVLG00005017574) #30	TLDC2 (ENSSVLG00005017632) #31	ENSSVLG00005017718	SAMHD1 (ENSSVLG00005017826) #32	RBL1 (ENSSVLG00005018528) #33	MROH8 (ENSSVLG00005018930) #34	RPN2 (ENSSVLG00005019182) #35	GHRH (ENSSVLG00005019269) #36