Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 606 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00940000154404.a ENSGT00390000017491 ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00530000064489 ENSGT01060000250538 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000186338 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b #22 Euteleostomi DUPLICATION Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156433.B ENSGT01030000235062 ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00940000154404.a ENSGT00390000017491 ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00530000064489 ENSGT01060000250538 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a ENSGT00950000182959.a.b.b.b ##22 ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a ENSGT00390000009310 ENSGT00940000170563 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT01030000235062 ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491 ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT01030000235062 ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491 ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000164122 ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b ENSGT00940000160123 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000156870 Amniota ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT01030000235062 ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491 ENSGT00940000175801 ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b ENSGT00940000160123 ENSGT00940000159916 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT01030000235062 ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491 ENSGT00940000175801 ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b ENSGT00940000160123 ENSGT00940000159916 Theria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000175801 ENSGT00390000017491.s.a ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000161479 ENSGT00940000163242 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT01050000245084 ENSGT00940000154133.A Eutheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162876 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000175801 ENSGT00390000017491.s.a ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000161479 ENSGT00940000163242 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00940000164956 ENSGT01050000245084 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162876 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000175801 ENSGT00390000017491.s.a ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT01030000235549 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000161479 ENSGT00940000164064 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.l ENSGT01030000235549 ENSGT00940000153201.j.k.a.b ENSGT00940000153201.j.k.a.a.b ENSGT00940000161479 ENSGT00940000164064 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e 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(ENSOPRG00000002390) #22 SERGEF (ENSOPRG00000002434) TPH1 (ENSOPRG00000002467) SAAL1 (ENSOPRG00000002493) ENSOPRG00000002525 ENSOPRG00000002539 ENSOPRG00000002549 Rabbit MODERN SPECIES 466 SOX6 (ENSOCUG00000012557) C11orf58 (ENSOCUG00000036088) PLEKHA7 (ENSOCUG00000017373) RPS13 (ENSOCUG00000005536) PIK3C2A (ENSOCUG00000005541) NUCB2 (ENSOCUG00000005131) ENSOCUG00000029474 ENSOCUG00000014161 ENSOCUG00000039600 USH1C (ENSOCUG00000002028) OTOG (ENSOCUG00000006205) MYOD1 (ENSOCUG00000021405) #22 KCNC1 (ENSOCUG00000025304) #23 SERGEF (ENSOCUG00000002409) SAAL1 (ENSOCUG00000002418) ENSOCUG00000002424 SAA4 (ENSOCUG00000024412) ENSOCUG00000017620 ENSOCUG00000021891 HPS5 (ENSOCUG00000017624) ENSOCUG00000017633 ENSOCUG00000015939 LDHC (ENSOCUG00000027929) TSG101 (ENSOCUG00000013940) UEVLD (ENSOCUG00000013952) MISFA (ENSOCUG00000038035) SPTY2D1 (ENSOCUG00000025674) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B 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(ENSSVLG00005004914) ENSSVLG00005004896 ENSSVLG00005004866 ENSSVLG00005004846 HPS5 (ENSSVLG00005004813) GTF2H1 (ENSSVLG00005016086) ENSSVLG00005015754 LDHC (ENSSVLG00005015342) TSG101 (ENSSVLG00005015216) UEVLD (ENSSVLG00005015052) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00390000004737.a ENSGT00390000004737.b.a.p ENSGT00940000155818 ENSGT00940000170775 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.l.e ENSGT00940000161479 ENSGT00940000153903.a.a Kangaroo rat MODERN 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#23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00390000004737.a ENSGT00390000004737.b.a.p ENSGT00940000155818 ENSGT00940000170775 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.l.e ENSGT00940000161479 ENSGT00940000153903.a.a Muroidea ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00940000170775 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.l.e ENSGT00940000161479 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00970000193605 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00550000075124 ENSGT00940000159109 ENSGT00390000004010.a.a 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ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b ENSGT00390000004737.a Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00550000075124 ENSGT00940000159109 ENSGT00390000004010.a.a ENSGT00950000182935.A ENSGT00940000154315.a ENSGT00950000182696.B.b ENSGT00940000153116.A ENSGT00940000157145 ENSGT00390000000089 ENSGT00940000163348.e.c ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b ENSGT00390000004737.a Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 97 4931406B18Rik (ENSMOCG00000013427) Iglon5 (ENSMOCG00000014619) Vsig10l (ENSMOCG00000017203) Etfb (ENSMOCG00000021177) Cldnd2 (ENSMOCG00000022596) Nkg7 (ENSMOCG00000007727) Lim2 (ENSMOCG00000013148) Gm38999 (ENSMOCG00000011273) Siglecg (ENSMOCG00000008279) Siglecf (ENSMOCG00000016848) ENSMOCG00000003394 ENSMOCG00000001795 ENSMOCG00000006148 ENSMOCG00000014546 ENSMOCG00000016813 ENSMOCG00000021232 #22 Luzp2 (ENSMOCG00000008924) Siglech (ENSMOCG00000000862) Tubgcp5 (ENSMOCG00000013811) Prairie vole MODERN SPECIES 97 Kcnj11 (ENSMOCG00000007862) Abcc8 (ENSMOCG00000013816) Ush1c (ENSMOCG00000015362) Otog (ENSMOCG00000020280) ENSMOCG00000002983 #22 Kcnc1 (ENSMOCG00000020898) #23 Tph1 (ENSMOCG00000022944) Saal1 (ENSMOCG00000019240) ENSMOCG00000012708 Saa3 (ENSMOCG00000022825) Saa4 (ENSMOCG00000003806) ENSMOCG00000021805 ENSMOCG00000012779 Abcc6 (ENSMOCG00000016244) ENSMOCG00000010788 Emp3 (ENSMOCG00000006718) Tmem143 (ENSMOCG00000012780) Syngr4 (ENSMOCG00000020597) Kdelr1 (ENSMOCG00000000652) Grin2d (ENSMOCG00000019653) Northern American deer mouse MODERN SPECIES Syngr4 (ENSPEMG00000011020) Tmem143 (ENSPEMG00000015974) Emp3 (ENSPEMG00000027338) ENSPEMG00000014876 ENSPEMG00000024292 ENSPEMG00000030125 ENSPEMG00000031055 ENSPEMG00000031392 Abcc6 (ENSPEMG00000016077) Nomo1 (ENSPEMG00000016802) ENSPEMG00000028367 Kcnj11 (ENSPEMG00000006566) Abcc8 (ENSPEMG00000003061) Ush1c (ENSPEMG00000016758) Otog (ENSPEMG00000011623) Myod1 (ENSPEMG00000017570) #22 Kcnc1 (ENSPEMG00000014098) #23 Sergef (ENSPEMG00000008220) Tph1 (ENSPEMG00000011560) Saal1 (ENSPEMG00000003170) ENSPEMG00000026619 ENSPEMG00000019341 ENSPEMG00000028115 ENSPEMG00000012474 Svip (ENSPEMG00000017315) Gas2 (ENSPEMG00000006543) Fancf (ENSPEMG00000026089) Slc17a6 (ENSPEMG00000012568) Ano5 (ENSPEMG00000011022) Nell1 (ENSPEMG00000009575) Slc6a5 (ENSPEMG00000020942) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00550000075124 ENSGT00940000159109 ENSGT00390000004010.a.a ENSGT00950000182935.A ENSGT00940000154315.a ENSGT00950000182696.B.b ENSGT00940000153116.A ENSGT00940000157145 ENSGT00390000000089 ENSGT00940000163348.e.c ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 271 Grwd1 (ENSCGRG00001010417) Grin2d (ENSCGRG00001004821) ENSCGRG00001020346 Syngr4 (ENSCGRG00001019310) ENSCGRG00001016333 Tmem143 (ENSCGRG00001004118) Emp3 (ENSCGRG00001019827) ENSCGRG00001015977 Abcc6 (ENSCGRG00001019363) Nomo1 (ENSCGRG00001022926) ENSCGRG00001007718 Kcnj11 (ENSCGRG00001016383) Abcc8 (ENSCGRG00001019046) Ush1c (ENSCGRG00001019889) Otog (ENSCGRG00001017020) Myod1 (ENSCGRG00001012742) #22 Kcnc1 (ENSCGRG00001000468) #23 ENSCGRG00001023881 Tph1 (ENSCGRG00001020143) ENSCGRG00001013232 Saa3 (ENSCGRG00001011262) Golden Hamster MODERN SPECIES 792 Kcnj14 (ENSMAUG00000013149) Grwd1 (ENSMAUG00000008728) Grin2d (ENSMAUG00000015271) Kdelr1 (ENSMAUG00000017897) Syngr4 (ENSMAUG00000019444) Tmem143 (ENSMAUG00000021611) Emp3 (ENSMAUG00000011967) ENSMAUG00000017711 ENSMAUG00000019813 Abcc6 (ENSMAUG00000011133) Nomo1 (ENSMAUG00000014334) Kcnj11 (ENSMAUG00000006751) Abcc8 (ENSMAUG00000007029) Ush1c (ENSMAUG00000000973) ENSMAUG00000018031 Myod1 (ENSMAUG00000013881) #22 Kcnc1 (ENSMAUG00000020682) #23 Sergef (ENSMAUG00000010081) Tph1 (ENSMAUG00000002337) Saal1 (ENSMAUG00000003480) Saa3 (ENSMAUG00000001692) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00550000075124 ENSGT00940000159109 ENSGT00390000004010.a.a ENSGT00950000182935.A ENSGT00940000154315.a ENSGT00950000182696.B.b ENSGT00940000153116.A ENSGT00940000157145 ENSGT00390000000089 ENSGT00940000163348.e.c ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.l.e ENSGT00940000161479 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00970000193605 ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160074 ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00550000075124 ENSGT00940000159109 ENSGT00390000004010.a.a ENSGT00950000182935.A ENSGT00940000154315.a ENSGT00950000182696.B.b ENSGT00940000153116.A ENSGT00940000157145 ENSGT00390000000089 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b ENSGT00390000004737.b.a.p ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.l.e ENSGT00940000161479 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00970000193605 ENSGT00940000154133.A Mus_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160074 ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00550000075124 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Nomo1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029755) Kcnj11 (MGP_CAROLIEiJ_G0029756) Abcc8 (MGP_CAROLIEiJ_G0029757) Ush1c (MGP_CAROLIEiJ_G0029758) Otog (MGP_CAROLIEiJ_G0029759) Myod1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029760) #22 Kcnc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029761) #23 Sergef (MGP_CAROLIEiJ_G0029762) Tph1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029763) Saal1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029764) Saa3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029765) Saa4 (MGP_CAROLIEiJ_G0029766) MGP_CAROLIEiJ_G0029767 MGP_CAROLIEiJ_G0029768 Hps5 (MGP_CAROLIEiJ_G0029769) Gtf2h1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029770) Ldha (MGP_CAROLIEiJ_G0029771) MGP_CAROLIEiJ_G0029772 Tsg101 (MGP_CAROLIEiJ_G0029773) Uevld (MGP_CAROLIEiJ_G0029774) MGP_CAROLIEiJ_G0029775 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00550000075124 ENSGT00940000159109 ENSGT00390000004010.a.a ENSGT00950000182935.A ENSGT00940000154315.a ENSGT00950000182696.B.b ENSGT00950000183364 ENSGT00940000153116.A ENSGT00940000157145 ENSGT00390000000089 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 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ENSGT00940000153903.a.b.b Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159336 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b.d ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT01030000235549 ENSGT00940000153201.j.k.a.b ENSGT00940000161479 ENSGT00940000164064 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159336 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b.d ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.k.a.b ENSGT00940000161479 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT01100000263734 ENSGT00940000154133.A Coquerels sifaka MODERN SPECIES 591 CYP2R1 (ENSPCOG00000017738) ENSPCOG00000014163 CALCB (ENSPCOG00000025246) INSC (ENSPCOG00000024807) SOX6 (ENSPCOG00000008289) C11orf58 (ENSPCOG00000012109) ENSPCOG00000016080 PLEKHA7 (ENSPCOG00000020850) ENSPCOG00000024432 PIK3C2A (ENSPCOG00000009463) ENSPCOG00000015410 KCNJ11 (ENSPCOG00000009073) ABCC8 (ENSPCOG00000018480) USH1C (ENSPCOG00000024567) OTOG (ENSPCOG00000023596) MYOD1 (ENSPCOG00000028149) #22 KCNC1 (ENSPCOG00000028118) #23 SERGEF (ENSPCOG00000015228) TPH1 (ENSPCOG00000022787) SAAL1 (ENSPCOG00000013362) ENSPCOG00000023938 ENSPCOG00000008984 SAA4 (ENSPCOG00000014650) HPS5 (ENSPCOG00000018482) GTF2H1 (ENSPCOG00000016794) ENSPCOG00000025606 ENSPCOG00000022047 TSG101 (ENSPCOG00000022058) UEVLD (ENSPCOG00000016777) ENSPCOG00000015051 SPTY2D1 (ENSPCOG00000020606) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 708 CALCB (ENSPSMG00000008444) INSC (ENSPSMG00000008493) SOX6 (ENSPSMG00000008573) ENSPSMG00000008607 PLEKHA7 (ENSPSMG00000008661) ENSPSMG00000008669 PIK3C2A (ENSPSMG00000008738) NUCB2 (ENSPSMG00000008836) KCNJ11 (ENSPSMG00000008899) ABCC8 (ENSPSMG00000009601) USH1C (ENSPSMG00000010622) OTOG (ENSPSMG00000010669) MYOD1 (ENSPSMG00000010680) #22 KCNC1 (ENSPSMG00000010686) #23 SERGEF (ENSPSMG00000010715) TPH1 (ENSPSMG00000010741) SAAL1 (ENSPSMG00000010764) ENSPSMG00000010777 Mouse lemur MODERN SPECIES 27 CYP2R1 (ENSMICG00000031499) CALCA (ENSMICG00000036545) CALCB (ENSMICG00000044384) INSC 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ENSOGAG00000032142 KCNJ11 (ENSOGAG00000029803) ABCC8 (ENSOGAG00000006103) USH1C (ENSOGAG00000006113) OTOG (ENSOGAG00000033908) MYOD1 (ENSOGAG00000029784) #22 KCNC1 (ENSOGAG00000011185) #23 SERGEF (ENSOGAG00000011195) TPH1 (ENSOGAG00000011200) SAAL1 (ENSOGAG00000011202) ENSOGAG00000029424 ENSOGAG00000027885 ENSOGAG00000011206 HPS5 (ENSOGAG00000011208) GTF2H1 (ENSOGAG00000000710) LDHC (ENSOGAG00000003725) LDHAL6A (ENSOGAG00000009261) TSG101 (ENSOGAG00000009264) ENSOGAG00000009268 SPTY2D1 (ENSOGAG00000031814) TMEM86A (ENSOGAG00000004415) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158305 ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.s.a ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b.d ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.b ENSGT00940000161479 ENSGT00940000164064 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT01100000263734 ENSGT01050000245084 Tarsier MODERN SPECIES 859 MYOD1 (ENSTSYG00000014042) #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00940000153272.a.b.o.b.a ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.s.a.a ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b.d ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.b ENSGT00940000161479 ENSGT00940000164064 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT01100000263734 ENSGT00940000154133.A Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687.v ENSGT00940000153272.a.b.o.b.a ENSGT00390000000687.u ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00440000038603.n ENSGT00390000017491.s.a.a.e ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00940000155622.g ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b.d ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.a.f.a ENSGT00940000161479 ENSGT00940000164064 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000154770.q.b ENSGT00940000153903.a.b.b Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162876 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687.v 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SAA2-SAA4 (ENSG00000255071) SAA2 (ENSG00000134339) SAA1 (ENSG00000173432) HPS5 (ENSG00000110756) GTF2H1 (ENSG00000110768) LDHA (ENSG00000134333) LDHC (ENSG00000166796) LDHAL6A (ENSG00000166800) Gorilla MODERN SPECIES 2 CALCA (ENSGGOG00000014148) CALCB (ENSGGOG00000000799) INSC (ENSGGOG00000002992) SOX6 (ENSGGOG00000010884) ENSGGOG00000022363 PLEKHA7 (ENSGGOG00000006435) RPS13 (ENSGGOG00000007450) PIK3C2A (ENSGGOG00000011040) NUCB2 (ENSGGOG00000005914) NCR3LG1 (ENSGGOG00000022788) KCNJ11 (ENSGGOG00000003700) ABCC8 (ENSGGOG00000015972) ENSGGOG00000039510 USH1C (ENSGGOG00000016001) OTOG (ENSGGOG00000016024) MYOD1 (ENSGGOG00000008222) #22 KCNC1 (ENSGGOG00000015717) #23 SERGEF (ENSGGOG00000000685) TPH1 (ENSGGOG00000009041) MRGPRX4 (ENSGGOG00000016538) ENSGGOG00000039414 ENSGGOG00000025669 SAA4 (ENSGGOG00000003359) SAA2 (ENSGGOG00000010301) ENSGGOG00000010297 ENSGGOG00000006531 HPS5 (ENSGGOG00000010309) GTF2H1 (ENSGGOG00000008405) LDHA (ENSGGOG00000010350) LDHC (ENSGGOG00000015884) LDHAL6A (ENSGGOG00000039584) Orangutan MODERN SPECIES 2 ENSPPYG00000041260 CALCA (ENSPPYG00000025911) CALCB (ENSPPYG00000003461) INSC (ENSPPYG00000003460) SOX6 (ENSPPYG00000003459) C11H11orf58 (ENSPPYG00000003458) PLEKHA7 (ENSPPYG00000003457) ENSPPYG00000036022 PIK3C2A (ENSPPYG00000003455) NUCB2 (ENSPPYG00000003454) NCR3LG1 (ENSPPYG00000003453) KCNJ11 (ENSPPYG00000003452) ABCC8 (ENSPPYG00000004122) USH1C (ENSPPYG00000003451) OTOG (ENSPPYG00000003450) MYOD1 (ENSPPYG00000003449) #22 KCNC1 (ENSPPYG00000003448) #23 SERGEF (ENSPPYG00000003446) TPH1 (ENSPPYG00000003445) SAAL1 (ENSPPYG00000039447) MRGPRX3 (ENSPPYG00000038501) ENSPPYG00000003442 MRGPRX4 (ENSPPYG00000039348) SAA4 (ENSPPYG00000031722) SAA2 (ENSPPYG00000003440) ENSPPYG00000036972 HPS5 (ENSPPYG00000003439) GTF2H1 (ENSPPYG00000003438) LDHA (ENSPPYG00000003437) LDHC (ENSPPYG00000003436) LDHAL6A (ENSPPYG00000003435) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00940000153272.a.b.o.b.a ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.s.a.a.a ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT01030000234639.A.b.a.b.a.b.b.j.a.a.b ENSGT01030000234639.A.b.a.b.a.b.b.j.a.b ENSGT00940000155622.f ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b.d ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066.c ENSGT00940000153201.j.k.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000161479 ENSGT00940000164064 ENSGT00940000153903.a.a Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 465 ENSGT00390000001927.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT01030000234639.A.b.a.b.a.b.b.j.a.a.b Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 54 NUCB2 (ENSRBIG00000026384) KCNJ11 (ENSRBIG00000017895) ABCC8 (ENSRBIG00000028087) USH1C (ENSRBIG00000032711) OTOG (ENSRBIG00000038420) MYOD1 (ENSRBIG00000031582) #22 KCNC1 (ENSRBIG00000023874) #23 SERGEF (ENSRBIG00000030422) TPH1 (ENSRBIG00000008098) SAAL1 (ENSRBIG00000031243) ENSRBIG00000041399 MRGPRX3 (ENSRBIG00000044341) SAA4 (ENSRBIG00000043432) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1485 NUCB2 (ENSRROG00000041737) KCNJ11 (ENSRROG00000027035) ABCC8 (ENSRROG00000038913) USH1C (ENSRROG00000043583) OTOG (ENSRROG00000031218) MYOD1 (ENSRROG00000038327) #22 KCNC1 (ENSRROG00000025905) #23 SERGEF (ENSRROG00000044406) TPH1 (ENSRROG00000040674) SAAL1 (ENSRROG00000035972) ENSRROG00000042459 MRGPRX3 (ENSRROG00000022175) ENSRROG00000030356 SAA4 (ENSRROG00000041678) ENSRROG00000032522 HPS5 (ENSRROG00000045543) GTF2H1 (ENSRROG00000044245) ENSRROG00000034244 LDHC (ENSRROG00000025865) ENSRROG00000029002 LDHAL6A (ENSRROG00000041316) Cercopithecinae 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ENSGT00940000164064 ENSGT00940000153903.a.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 131 CALCA (ENSMNEG00000041856) CALCB (ENSMNEG00000033056) INSC (ENSMNEG00000041648) SOX6 (ENSMNEG00000015482) ENSMNEG00000020819 C11orf58 (ENSMNEG00000039475) PLEKHA7 (ENSMNEG00000042391) ENSMNEG00000043614 PIK3C2A (ENSMNEG00000031943) NUCB2 (ENSMNEG00000036376) NCR3LG1 (ENSMNEG00000000053) KCNJ11 (ENSMNEG00000023626) ABCC8 (ENSMNEG00000018051) USH1C (ENSMNEG00000012077) OTOG (ENSMNEG00000040832) MYOD1 (ENSMNEG00000044032) #22 KCNC1 (ENSMNEG00000029034) #23 SERGEF (ENSMNEG00000043939) TPH1 (ENSMNEG00000028667) SAAL1 (ENSMNEG00000021954) ENSMNEG00000035570 SAA4 (ENSMNEG00000043404) SAA2 (ENSMNEG00000041389) HPS5 (ENSMNEG00000030883) ENSMNEG00000042089 GTF2H1 (ENSMNEG00000036878) ENSMNEG00000042413 LDHC (ENSMNEG00000033782) ENSMNEG00000024949 LDHAL6A (ENSMNEG00000041126) TSG101 (ENSMNEG00000041853) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00940000153272.a.b.o.b.a 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ENSGT00390000007101.d.b Sperm whale MODERN SPECIES 7 INSC (ENSPCTG00005013109) SOX6 (ENSPCTG00005013480) C16H11orf58 (ENSPCTG00005013885) ENSPCTG00005013965 PLEKHA7 (ENSPCTG00005014003) RPS13 (ENSPCTG00005014477) ENSPCTG00005014567 PIK3C2A (ENSPCTG00005014624) ENSPCTG00005015020 NUCB2 (ENSPCTG00005004244) ENSPCTG00005004506 KCNJ11 (ENSPCTG00005004532) ABCC8 (ENSPCTG00005004712) USH1C (ENSPCTG00005006223) OTOG (ENSPCTG00005006334) MYOD1 (ENSPCTG00005006484) #22 KCNC1 (ENSPCTG00005006503) #23 SERGEF (ENSPCTG00005006546) TPH1 (ENSPCTG00005006667) SAAL1 (ENSPCTG00005006752) ENSPCTG00005006800 ENSPCTG00005006824 ENSPCTG00005006852 HPS5 (ENSPCTG00005006903) GTF2H1 (ENSPCTG00005007039) ENSPCTG00005007257 LDHA (ENSPCTG00005007271) LDHC (ENSPCTG00005007321) ENSPCTG00005007383 TSG101 (ENSPCTG00005007406) UEVLD (ENSPCTG00005007495) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000167952 ENSGT00940000167380 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t.u.r ENSGT00940000157813 ENSGT00940000157251.hb ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.a ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.u ENSGT00940000161479 ENSGT00940000153903.a.a.m.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT01050000245084 ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b Dolphin MODERN SPECIES 230 MYOD1 (ENSTTRG00000013869) #22 KCNC1 (ENSTTRG00000013876) #23 SERGEF (ENSTTRG00000013883) TPH1 (ENSTTRG00000013891) SAAL1 (ENSTTRG00000013896) ENSTTRG00000013900 ENSTTRG00000013902 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000167952 ENSGT00940000167380 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t.u.r ENSGT00940000157813 ENSGT00940000157251.hb ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.a ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.u ENSGT00940000161479 ENSGT00940000153903.a.a.m.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00390000012981.rb.a.a ENSGT01050000245084 ENSGT00940000154133.A Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000167380 ENSGT00390000001511 ENSGT00390000018086.y.b.b ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t.u.r ENSGT00940000157813 ENSGT00940000157251.hb ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.a ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.u ENSGT00940000161479 ENSGT00940000153903.a.a.m.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00390000012981.rb.a.a ENSGT01050000245084 ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b Beluga whale MODERN SPECIES 32 ENSDLEG00000005632 INSC (ENSDLEG00000005606) ENSDLEG00000005557 SOX6 (ENSDLEG00000005509) CUNH11orf58 (ENSDLEG00000005498) PLEKHA7 (ENSDLEG00000005386) RPS13 (ENSDLEG00000005358) ENSDLEG00000020962 PIK3C2A (ENSDLEG00000020912) NUCB2 (ENSDLEG00000020854) ENSDLEG00000020840 KCNJ11 (ENSDLEG00000020835) ABCC8 (ENSDLEG00000016659) USH1C (ENSDLEG00000016116) OTOG (ENSDLEG00000015797) MYOD1 (ENSDLEG00000015755) #22 KCNC1 (ENSDLEG00000015743) #23 SERGEF (ENSDLEG00000015727) TPH1 (ENSDLEG00000015701) SAAL1 (ENSDLEG00000015675) ENSDLEG00000015657 HPS5 (ENSDLEG00000015626) GTF2H1 (ENSDLEG00000015605) ENSDLEG00000015586 ENSDLEG00000015577 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SERGEF (ENSCDRG00005013823) TPH1 (ENSCDRG00005013726) SAAL1 (ENSCDRG00005013646) ENSCDRG00005013613 ENSCDRG00005013545 HPS5 (ENSCDRG00005013369) GTF2H1 (ENSCDRG00005013223) ENSCDRG00005013197 ENSCDRG00005013169 LDHC (ENSCDRG00005012071) TSG101 (ENSCDRG00005011857) UEVLD (ENSCDRG00005011579) ENSCDRG00005011524 SPTY2D1 (ENSCDRG00005011497) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000167380 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t.u ENSGT00940000175801 ENSGT00390000017491.s.b ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.a ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 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Panthera ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t.u.j.a ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684.g ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b.k ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.a.h ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.a.g ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b.l ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j.m.b ENSGT00940000161479 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT01100000263734 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000159336 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000162876 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t.u.j.a 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ENSECAG00000048632 ENSECAG00000036499 HPS5 (ENSECAG00000015720) GTF2H1 (ENSECAG00000019056) LDHA (ENSECAG00000020669) LDHC (ENSECAG00000022126) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00940000167380 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t.u ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.a ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000161479 ENSGT00940000164064 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000162876 ENSGT00940000156267 ENSGT00940000167380 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t.u ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.a ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000161479 ENSGT00940000163242.a ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 2 ENSRFEG00010021391 INSC (ENSRFEG00010021354) SOX6 (ENSRFEG00010021298) ENSRFEG00010021282 C11orf58 (ENSRFEG00010021253) PLEKHA7 (ENSRFEG00010021179) ENSRFEG00010021136 PIK3C2A (ENSRFEG00010021091) NUCB2 (ENSRFEG00010021004) ENSRFEG00010020981 KCNJ11 (ENSRFEG00010020978) ENSRFEG00010020967 ABCC8 (ENSRFEG00010020943) USH1C (ENSRFEG00010020886) OTOG (ENSRFEG00010020852) MYOD1 (ENSRFEG00010020830) #22 KCNC1 (ENSRFEG00010020809) #23 ENSRFEG00010020796 SERGEF (ENSRFEG00010020728) TPH1 (ENSRFEG00010020684) SAAL1 (ENSRFEG00010020641) ENSRFEG00010020599 ENSRFEG00010020584 ENSRFEG00010020556 ENSRFEG00010020515 HPS5 (ENSRFEG00010020475) GTF2H1 (ENSRFEG00010020416) ENSRFEG00010020271 LDHC (ENSRFEG00010020017) ENSRFEG00010019955 ENSRFEG00010019776 Microbat MODERN SPECIES 1061 ENSMLUG00000009029 SOX6 (ENSMLUG00000007911) C11orf58 (ENSMLUG00000001589) PLEKHA7 (ENSMLUG00000001591) ENSMLUG00000009751 PIK3C2A (ENSMLUG00000007089) ENSMLUG00000029239 ENSMLUG00000024625 KCNJ11 (ENSMLUG00000012273) NUCB2 (ENSMLUG00000004101) ABCC8 (ENSMLUG00000012276) USH1C (ENSMLUG00000002529) OTOG (ENSMLUG00000002545) ENSMLUG00000029772 MYOD1 (ENSMLUG00000007940) #22 KCNC1 (ENSMLUG00000007950) #23 ENSMLUG00000007974 TPH1 (ENSMLUG00000008011) SAAL1 (ENSMLUG00000008022) ENSMLUG00000028709 ENSMLUG00000016314 ENSMLUG00000008051 HPS5 (ENSMLUG00000016318) GTF2H1 (ENSMLUG00000016329) ENSMLUG00000016343 LDHC (ENSMLUG00000016348) TSG101 (ENSMLUG00000016353) UEVLD (ENSMLUG00000016358) ENSMLUG00000027941 TMEM86A (ENSMLUG00000016391) Megabat MODERN SPECIES 2033 PLEKHA7 (ENSPVAG00000012804) RPS13 (ENSPVAG00000012806) PIK3C2A (ENSPVAG00000012807) NUCB2 (ENSPVAG00000012810) ENSPVAG00000012812 ABCC8 (ENSPVAG00000012814) USH1C (ENSPVAG00000012818) OTOG (ENSPVAG00000012824) MYOD1 (ENSPVAG00000012829) #22 KCNC1 (ENSPVAG00000012831) #23 SERGEF (ENSPVAG00000012835) TPH1 (ENSPVAG00000012838) SAAL1 (ENSPVAG00000012842) ENSPVAG00000012844 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.b #22 Common shrew MODERN SPECIES 12629 MYOD1 (ENSSARG00000002401) #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000156267 ENSGT00940000162876 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000161479 ENSGT00940000163242 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000156267 ENSGT00940000162876 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000161479 ENSGT00940000163242 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b ENSGT00940000160123 ENSGT00940000159916 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000156267 ENSGT00940000162876 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000161479 ENSGT00940000163242 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b ENSGT00940000160123 ENSGT00940000159916 Elephant MODERN SPECIES 209 PDE3B (ENSLAFG00000008453) CYP2R1 (ENSLAFG00000005356) ENSLAFG00000003276 ENSLAFG00000015843 INSC (ENSLAFG00000005686) SOX6 (ENSLAFG00000002917) C11orf58 (ENSLAFG00000007606) PLEKHA7 (ENSLAFG00000007609) RPS13 (ENSLAFG00000026881) PIK3C2A (ENSLAFG00000003710) NUCB2 (ENSLAFG00000007349) KCNJ11 (ENSLAFG00000031878) ABCC8 (ENSLAFG00000007014) USH1C (ENSLAFG00000022470) OTOG (ENSLAFG00000004882) MYOD1 (ENSLAFG00000018353) #22 KCNC1 (ENSLAFG00000018355) #23 SERGEF (ENSLAFG00000018367) ENSLAFG00000007862 ENSLAFG00000027166 HPS5 (ENSLAFG00000011289) GTF2H1 (ENSLAFG00000011296) ENSLAFG00000011307 LDHAL6B (ENSLAFG00000003680) TSG101 (ENSLAFG00000003682) UEVLD (ENSLAFG00000020671) SPTY2D1 (ENSLAFG00000003686) TMEM86A (ENSLAFG00000002024) IGSF22 (ENSLAFG00000031965) PTPN5 (ENSLAFG00000013689) ENSLAFG00000032037 Hyrax MODERN SPECIES 2097 MYOD1 (ENSPCAG00000001317) #22 KCNC1 (ENSPCAG00000001336) #23 Tenrec MODERN SPECIES 12083 MYOD1 (ENSETEG00000003979) #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1009 ENSGT00940000156626.h ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 Armadillo MODERN SPECIES 788 ENSDNOG00000038648 ENSDNOG00000045802 ENSDNOG00000031477 NUP43 (ENSDNOG00000046324) LATS1 (ENSDNOG00000019236) ENSDNOG00000034858 USH1C (ENSDNOG00000031779) OTOG (ENSDNOG00000015439) MYOD1 (ENSDNOG00000017164) #22 KCNC1 (ENSDNOG00000048695) #23 ENSDNOG00000039972 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159336 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066.a ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000161479 ENSGT00940000163242 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT01050000245084 ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b ENSGT00940000160123 Opossum MODERN SPECIES 4 PDE3B (ENSMODG00000007280) CYP2R1 (ENSMODG00000007273) INSC (ENSMODG00000007236) ENSMODG00000024593 ENSMODG00000029280 SOX6 (ENSMODG00000007224) C11orf58 (ENSMODG00000043387) PLEKHA7 (ENSMODG00000007138) RPS13 (ENSMODG00000007078) ENSMODG00000007062 NUCB2 (ENSMODG00000007015) KCNJ11 (ENSMODG00000007004) ABCC8 (ENSMODG00000006995) USH1C (ENSMODG00000006841) OTOG (ENSMODG00000006791) MYOD1 (ENSMODG00000006749) #22 KCNC1 (ENSMODG00000006734) #23 ENSMODG00000006721 TPH1 (ENSMODG00000006704) SAAL1 (ENSMODG00000006679) ENSMODG00000024617 HPS5 (ENSMODG00000006574) ENSMODG00000006540 LDHA (ENSMODG00000006522) ENSMODG00000006509 ENSMODG00000040672 ENSMODG00000006410 ENSMODG00000006389 ENSMODG00000049605 ENSMODG00000037593 ENSMODG00000006373 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159336 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 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ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066.a ENSGT00940000153201.i.a ENSGT01030000235549 ENSGT00940000161479 ENSGT00940000163242 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT01050000245084 ENSGT00940000164956 ENSGT00940000154133.A Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687.b ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491.t.w ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e.e ENSGT00940000163348.e.f ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066.a ENSGT00940000153201.i.a.b ENSGT01030000235549.a.b ENSGT00940000161479 ENSGT01030000235549.a.a ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT01050000245084 ENSGT00940000164956 ENSGT00940000154133.A koala MODERN SPECIES 108 PSMA1 (ENSPCIG00000010513) PDE3B (ENSPCIG00000034172) CYP2R1 (ENSPCIG00000010518) ENSPCIG00000010519 INSC (ENSPCIG00000010520) SOX6 (ENSPCIG00000021385) C11orf58 (ENSPCIG00000021388) PLEKHA7 (ENSPCIG00000021403) ENSPCIG00000013612 PIK3C2A (ENSPCIG00000013619) NUCB2 (ENSPCIG00000013631) ENSPCIG00000035386 ENSPCIG00000013127 ABCC8 (ENSPCIG00000013643) USH1C (ENSPCIG00000013650) MYOD1 (ENSPCIG00000018402) #22 KCNC1 (ENSPCIG00000013732) #23 ENSPCIG00000013737 TPH1 (ENSPCIG00000013741) SAAL1 (ENSPCIG00000013745) ENSPCIG00000033997 HPS5 (ENSPCIG00000013753) GTF2H1 (ENSPCIG00000013760) ENSPCIG00000013770 LDHC (ENSPCIG00000013990) ENSPCIG00000013992 TSG101 (ENSPCIG00000013997) UEVLD (ENSPCIG00000014004) MISFA (ENSPCIG00000014006) ENSPCIG00000037419 SPTY2D1 (ENSPCIG00000014008) Common wonbat MODERN SPECIES 608 ENSVURG00010005754 ENSVURG00010005761 INSC (ENSVURG00010005781) SOX6 (ENSVURG00010005847) C11orf58 (ENSVURG00010005869) PLEKHA7 (ENSVURG00010005891) RPS13 (ENSVURG00010005940) PIK3C2A (ENSVURG00010005972) NUCB2 (ENSVURG00010006037) ENSVURG00010006183 ENSVURG00010006198 KCNJ11 (ENSVURG00010006207) ABCC8 (ENSVURG00010006223) USH1C (ENSVURG00010006258) OTOG (ENSVURG00010006327) MYOD1 (ENSVURG00010006453) #22 KCNC1 (ENSVURG00010006461) #23 SERGEF (ENSVURG00010006477) TPH1 (ENSVURG00010006498) SAAL1 (ENSVURG00010006512) Wallaby MODERN SPECIES 12482 MYOD1 (ENSMEUG00000014270) #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 5 PDE3B (ENSSHAG00000014935) CYP2R1 (ENSSHAG00000014886) ENSSHAG00000025195 INSC (ENSSHAG00000014350) ENSSHAG00000028264 SOX6 (ENSSHAG00000006502) ENSSHAG00000008106 PLEKHA7 (ENSSHAG00000007139) RPS13 (ENSSHAG00000004052) PIK3C2A (ENSSHAG00000001008) ENSSHAG00000028371 KCNJ11 (ENSSHAG00000022074) ABCC8 (ENSSHAG00000017597) USH1C (ENSSHAG00000017497) OTOG (ENSSHAG00000017355) MYOD1 (ENSSHAG00000017220) #22 KCNC1 (ENSSHAG00000022035) #23 ENSSHAG00000023659 TPH1 (ENSSHAG00000016519) SAAL1 (ENSSHAG00000030904) HPS5 (ENSSHAG00000016026) GTF2H1 (ENSSHAG00000015946) ENSSHAG00000025930 LDHC (ENSSHAG00000030723) ENSSHAG00000029476 TSG101 (ENSSHAG00000015267) ENSSHAG00000022059 ENSSHAG00000023698 SPTY2D1 (ENSSHAG00000015061) ENSSHAG00000024232 TMEM86A (ENSSHAG00000022231) Platypus MODERN SPECIES 14 CYP2R1 (ENSOANG00000006368) ENSOANG00000041034 INSC (ENSOANG00000030687) ENSOANG00000001353 ENSOANG00000022345 ENSOANG00000050997 C11orf58 (ENSOANG00000036260) PLEKHA7 (ENSOANG00000007688) RPS13 (ENSOANG00000007687) PIK3C2A (ENSOANG00000007685) NUCB2 (ENSOANG00000007683) ENSOANG00000045336 ABCC8 (ENSOANG00000007680) ENSOANG00000007679 OTOG (ENSOANG00000010676) ENSOANG00000047737 #22 KCNC1 (ENSOANG00000003052) #23 ENSOANG00000044323 TPH1 (ENSOANG00000050270) ENSOANG00000000811 SAAL1 (ENSOANG00000000809) ENSOANG00000000595 ENSOANG00000044149 HPS5 (ENSOANG00000044228) GTF2H1 (ENSOANG00000014982) LDHA (ENSOANG00000048733) ENSOANG00000008367 TSG101 (ENSOANG00000008368) UEVLD (ENSOANG00000050347) SPTY2D1 (ENSOANG00000051208) TMEM86A (ENSOANG00000049158) Sauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491 ENSGT00940000175801.b ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00980000200162 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.a.b ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00940000164122 ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b ENSGT00940000160123 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a 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ENSAPLG00000006128 CYB5R2 (ENSAPLG00000006316) PPFIBP2 (ENSAPLG00000006571) OLFML1 (ENSAPLG00000006707) SYT9 (ENSAPLG00000006733) SPON1 (ENSAPLG00000006849) C11orf91 (ENSAPLG00000017898) KIAA1549L (ENSAPLG00000008459) HIPK3 (ENSAPLG00000007742) CSTF3 (ENSAPLG00000007217) ENSAPLG00000017408 ENSAPLG00000026679 ENSAPLG00000006924 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159336 ENSGT00940000158305 ENSGT00940000156267 ENSGT00390000001511 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00390000017491 ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b.a ENSGT00390000004737.b.a.o.a.a.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201.j ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000164122 ENSGT00940000154133.A ENSGT00390000007101.d.b 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(ENSGFOG00000014191) OTOG (ENSGFOG00000014193) MYOD1 (ENSGFOG00000014197) #22 KCNC1 (ENSGFOG00000014198) #23 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 64 CYP2R1 (ENSCPRG00005001210) ENSCPRG00005001195 INSC (ENSCPRG00005001166) SOX6 (ENSCPRG00005001080) C11orf58 (ENSCPRG00005001016) PLEKHA7 (ENSCPRG00005000979) RPS13 (ENSCPRG00005000894) PIK3C2A (ENSCPRG00005000874) NUCB2 (ENSCPRG00005000844) ENSCPRG00005000808 KCNJ11 (ENSCPRG00005000802) ABCC8 (ENSCPRG00005000714) USH1C (ENSCPRG00005000582) OTOG (ENSCPRG00005000529) ENSCPRG00005000446 MYOD1 (ENSCPRG00005000428) #22 KCNC1 (ENSCPRG00005000411) #23 SERGEF (ENSCPRG00005000274) TPH1 (ENSCPRG00005000260) SAAL1 (ENSCPRG00005000231) ENSCPRG00005000214 ENSCPRG00005017256 HPS5 (ENSCPRG00005017251) GTF2H1 (ENSCPRG00005017249) LDHA (ENSCPRG00005017245) ENSCPRG00005017243 TSG101 (ENSCPRG00005017234) SPTY2D1 (ENSCPRG00005017230) TMEM86A (ENSCPRG00005017229) IGSF22 (ENSCPRG00005017227) PTPN5 (ENSCPRG00005017224) Anura ANCESTRAL SPECIES 163 ENSGT00940000163348.e ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000156912 #23 ENSGT00940000160684 ENSGT00950000182885.A.a ENSGT00390000004737.b.b ENSGT00940000155818 ENSGT00390000015066 ENSGT00940000153201 ENSGT00940000153903.a.a ENSGT00940000154133.A ENSGT00940000153903.a.b.b ENSGT00940000164956 ENSGT00390000007101.d.b ENSGT00940000159916 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000153362.b Frog MODERN SPECIES 4 ENSXETG00000040706 PTPN5 (ENSXETG00000042778) ENSXETG00000041841 ENSXETG00000047729 ENSXETG00000044019 ENSXETG00000047278 spty2d1 (ENSXETG00000043007) uevld (ENSXETG00000008509) ldha (ENSXETG00000041431) tsg101 (ENSXETG00000046442) ush1c (ENSXETG00000043793) ENSXETG00000048951 ENSXETG00000044994 ENSXETG00000049215 OTOG (ENSXETG00000048795) MYOD1 (ENSXETG00000046866) #22 kcnc1 (ENSXETG00000014391) #23 sergef (ENSXETG00000014410) ENSXETG00000042377 ENSXETG00000048806 saal1 (ENSXETG00000018990) gtf2h1 (ENSXETG00000018992) abcc8 (ENSXETG00000046120) ENSXETG00000046872 ENSXETG00000045579 XB995201 [provisional] (ENSXETG00000022477) ENSXETG00000041634 ENSXETG00000037097 ENSXETG00000047592 ENSXETG00000042912 XB5846708 [provisional] (ENSXETG00000035870) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000156433.B ENSGT01030000235062 ENSGT00390000000687 ENSGT00940000155817.a.a ENSGT00940000154404.a ENSGT00390000017491 ENSGT00940000157813 ENSGT00390000001927.a ENSGT00530000064489 ENSGT01060000250538 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a ENSGT00950000182959.a.b.b.b ##22 ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a ENSGT00390000009310 ENSGT00940000166133 ENSGT00390000003368 ENSGT00970000193609 ENSGT00940000165906 ENSGT00940000158152 ENSGT00940000164224 ENSGT00940000157504 ENSGT00390000007725.A.b ENSGT00940000160210 ENSGT00940000158688 ENSGT00940000159534 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000158175 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a ENSGT00950000182959.a.b.b.b ##22 ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a ENSGT00390000009310 ENSGT00940000166133 ENSGT00390000003368 ENSGT00970000193609 ENSGT00940000165906 ENSGT00940000158152 ENSGT00940000164224 ENSGT00940000157504 ENSGT00390000007725.A.b ENSGT00940000160210 ENSGT00940000158688 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.b ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000153362.b ENSGT00940000160333 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000159535 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000160004 ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000155733.a.a Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000164715 ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000153362.b ENSGT00440000039564.a.b.a ENSGT00940000159535 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159916.d ENSGT00940000160004 ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000167812.a ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000164955.a ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.b ENSGT00940000159701 ENSGT00390000014700.b.a.a.c ENSGT00940000159464 Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 2 BRSK2 (ENSSFOG00015011235) ABTB2 (ENSSFOG00015011282) B4GALNT4 (ENSSFOG00015011329) ENSSFOG00015011350 igf2b (ENSSFOG00015029596) NAP1L4 (ENSSFOG00015011392) phlda2 (ENSSFOG00015011437) slc22a18 (ENSSFOG00015011420) OSBPL5 (ENSSFOG00015011457) ENSSFOG00015011522 PTPN5 (ENSSFOG00015011591) DUSP8 (ENSSFOG00015027508) MOB2 (ENSSFOG00015011693) ENSSFOG00015011743 ENSSFOG00015011750 myod1 (ENSSFOG00015029499) #22 tnnt3a (ENSSFOG00015011790) ENSSFOG00015011834 ENSSFOG00015011872 CTSD (ENSSFOG00015011884) DRD4 (ENSSFOG00015011928) BET1L (ENSSFOG00015024284) ric8a (ENSSFOG00015028913) ENSSFOG00015011996 lrp5 (ENSSFOG00015012061) KMT5B (ENSSFOG00015012132) TP53I11 (ENSSFOG00015032032) CD82 (ENSSFOG00015012215) tspan18b (ENSSFOG00015012258) ext2 (ENSSFOG00015012303) ALX4 (ENSSFOG00015027263) Asian bonytongue MODERN SPECIES 20 ENSSFOG00015031340 ENSSFOG00015002434 CPT1A (ENSSFOG00015002348) cars1 (ENSSFOG00015002202) nap1l4b (ENSSFOG00015002142) phlda2 (ENSSFOG00015002113) OSBPL5 (ENSSFOG00015002010) PTPN5 (ENSSFOG00015001826) dusp8a (ENSSFOG00015025183) MOB2 (ENSSFOG00015001705) kcnj11 (ENSSFOG00015025143) abcc8 (ENSSFOG00015001504) ush1c (ENSSFOG00015001489) OTOG (ENSSFOG00015025460) zgc:172145 (ENSSFOG00015001401) myod1 (ENSSFOG00015001375) #22 TNNT3 (ENSSFOG00015001321) ENSSFOG00015001312 ENSSFOG00015001301 tnni2a.4 (ENSSFOG00015001189) tnni2a.2 (ENSSFOG00015001029) ENSSFOG00015000969 SYT8 (ENSSFOG00015000963) ENSSFOG00015000957 ctsd (ENSSFOG00015000892) ENSSFOG00015000887 antkmt (ENSSFOG00015026035) IFT140 (ENSSFOG00015000759) cstpp1 (ENSSFOG00015000701) fibinb (ENSSFOG00015000695) bbox1 (ENSSFOG00015000689) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 564 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000160745.d ENSGT00390000007739 ENSGT00940000164715.b ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000169159 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000159535 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000160004.f ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ENSGT00940000177178 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000160745.d ENSGT00390000007739 ENSGT00940000164715.b ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000169159 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000159535 ENSGT00940000156870 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MODERN SPECIES 16 ENSCSEG00000002352 CA12 (ENSCSEG00000002347) MAN2C1 (ENSCSEG00000002320) bmt2 (ENSCSEG00000002312) TMEM168 (ENSCSEG00000002308) ptdss2 (ENSCSEG00000002299) ENSCSEG00000002298 ENSCSEG00000002294 ifitm5 (ENSCSEG00000002289) cat (ENSCSEG00000002281) syt12 (ENSCSEG00000002273) PEAK1 (ENSCSEG00000002269) LRTM2 (ENSCSEG00000002266) CACNA2D4 (ENSCSEG00000002252) zgc:172145 (ENSCSEG00000002238) myod1 (ENSCSEG00000002233) #22 tnnt3a (ENSCSEG00000002198) ENSCSEG00000002191 ENSCSEG00000002189 ENSCSEG00000002176 ENSCSEG00000002173 TNNI2 (ENSCSEG00000002169) TNNI2 (ENSCSEG00000002164) TNNI2 (ENSCSEG00000002145) tnni2a.2 (ENSCSEG00000002138) tnni2a.1 (ENSCSEG00000002133) ENSCSEG00000002121 septin15 (ENSCSEG00000002096) ENSCSEG00000002089 smpd3 (ENSCSEG00000002076) ENSCSEG00000002072 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000009456 ENSGT00420000029847 ENSGT00940000157021 ENSGT00940000156519.p ENSGT00390000010961.d ENSGT00390000010961.c ENSGT00390000016453 ENSGT00390000008931 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Cod MODERN SPECIES 22 ENSGMOG00000009524 ENSGMOG00000028403 ENSGMOG00000009519 ENSGMOG00000009508 ENSGMOG00000035361 ENSGMOG00000031788 ENSGMOG00000034008 ENSGMOG00000031025 actr6 (ENSGMOG00000003691) ENSGMOG00000027867 si:ch211-59o9.10 (ENSGMOG00000037257) ENSGMOG00000003566 ENSGMOG00000003907 ENSGMOG00000024112 ENSGMOG00000003800 ENSGMOG00000030879 #22 tnnt3a (ENSGMOG00000016942) ENSGMOG00000027097 ENSGMOG00000034763 ENSGMOG00000036471 tnni2a.1 (ENSGMOG00000026765) ENSGMOG00000031300 SYT8 (ENSGMOG00000016874) ENSGMOG00000016861 PTPRZ1 (ENSGMOG00000010806) ENSGMOG00000036942 aass (ENSGMOG00000010875) fezf1 (ENSGMOG00000023584) CADPS2 (ENSGMOG00000035623) slc13a1 (ENSGMOG00000009178) IQUB (ENSGMOG00000019307) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 303 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000011262.e.b Euacanthomorphacea 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SPECIES 136 ndufs3 (ENSHCOG00000007117) slc22a18 (ENSHCOG00000007148) HACD3 (ENSHCOG00000000227) SLC24A1 (ENSHCOG00000007190) ENSHCOG00000007227 socs4 (ENSHCOG00000007249) wdhd1 (ENSHCOG00000007286) ENSHCOG00000007299 gch1 (ENSHCOG00000007311) SAMD4A (ENSHCOG00000007338) pacsin3 (ENSHCOG00000007361) GLG1 (ENSHCOG00000007399) tnni2b.1 (ENSHCOG00000007414) aph1b (ENSHCOG00000007434) OTOG (ENSHCOG00000007493) myod1 (ENSHCOG00000007505) #22 TNNT3 (ENSHCOG00000007514) ENSHCOG00000007520 foxr1 (ENSHCOG00000007530) atp6v0d1 (ENSHCOG00000000254) ENSHCOG00000007547 ENSHCOG00000000257 ENSHCOG00000007798 ENSHCOG00000007856 ENSHCOG00000007893 c1qtnf4 (ENSHCOG00000007905) ENSHCOG00000007911 ist1 (ENSHCOG00000007934) mphosph10 (ENSHCOG00000007964) mcee (ENSHCOG00000007970) FTH1 (ENSHCOG00000007973) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 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ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a Indian medaka MODERN SPECIES 418 SAMD4A (ENSOMEG00000019399) ero1a (ENSOMEG00000019468) pacsin3 (ENSOMEG00000019556) GLG1 (ENSOMEG00000000522) aph1b (ENSOMEG00000019680) OTOG (ENSOMEG00000019766) myod1 (ENSOMEG00000019794) #22 TNNT3 (ENSOMEG00000019818) ENSOMEG00000019829 ENSOMEG00000019845 atp6v0d1 (ENSOMEG00000019877) ENSOMEG00000019889 ENSOMEG00000019915 ENSOMEG00000019927 ENSOMEG00000019935 ENSOMEG00000019949 ENSOMEG00000019961 ENSOMEG00000019965 ENSOMEG00000019974 Javanese ricefish MODERN SPECIES 17 tipin (ENSOJAG00000005185) lctla (ENSOJAG00000005207) ENSOJAG00000005332 crybgx (ENSOJAG00000005363) cars1 (ENSOJAG00000005475) pex16 (ENSOJAG00000007521) arfgap2 (ENSOJAG00000007620) ENSOJAG00000007826 ENSOJAG00000000082 ENSOJAG00000000092 aph1b (ENSOJAG00000000118) GLG1 (ENSOJAG00000000386) pacsin3 (ENSOJAG00000000649) ero1a (ENSOJAG00000000675) SAMD4A (ENSOJAG00000000786) myod1 (ENSOJAG00000000842) #22 TNNT3 (ENSOJAG00000000845) ENSOJAG00000000851 ENSOJAG00000000853 ENSOJAG00000000856 atp6v0d1 (ENSOJAG00000000868) ENSOJAG00000001288 ENSOJAG00000001291 large2 (ENSOJAG00000001373) ENSOJAG00000001687 ENSOJAG00000001702 ENSOJAG00000001711 ENSOJAG00000001732 ENSOJAG00000001763 drd4b (ENSOJAG00000001779) ENSOJAG00000001790 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 148 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 17 ENSORLG00000026066 ENSORLG00000018346 ENSORLG00000023805 ENSORLG00000027380 ENSORLG00000026415 dis3l (ENSORLG00000018364) tipin (ENSORLG00000018370) lctla (ENSORLG00000030071) crybgx (ENSORLG00000030061) cars1 (ENSORLG00000022551) pex16 (ENSORLG00000019603) arfgap2 (ENSORLG00000019613) ENSORLG00000019631 ENSORLG00000029986 ENSORLG00000000017 ENSORLG00000022079 #22 ENSORLG00000023713 ENSORLG00000019668 ENSORLG00000029446 foxr1 (ENSORLG00000019674) atp6v0d1 (ENSORLG00000026745) ENSORLG00000019694 ENSORLG00000028201 ENSORLG00000024705 ENSORLG00000025073 ENSORLG00000022342 aph1b (ENSORLG00000018404) ENSORLG00000023229 ENSORLG00000029833 pacsin3 (ENSORLG00000019702) ero1a (ENSORLG00000023932) Chinese medaka MODERN SPECIES 4043 myod1 (ENSOSIG00000014093) #22 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.f.a ENSGT00940000163716.c.b.d.b.a ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b.d.b.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.f.a ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00390000011262.e.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000007753.b ENSGT00940000157933 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00390000002030.l ENSGT00940000166202 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pacsin3 (ENSCVAG00000006247) glg1b (ENSCVAG00000006375) tnni2b.1 (ENSCVAG00000006390) aph1b (ENSCVAG00000006407) OTOG (ENSCVAG00000000628) myod1 (ENSCVAG00000006504) #22 TNNT3 (ENSCVAG00000006519) ENSCVAG00000006531 ENSCVAG00000006553 ENSCVAG00000006565 ENSCVAG00000006585 foxr1 (ENSCVAG00000006599) atp6v0d1 (ENSCVAG00000006618) ENSCVAG00000006642 ENSCVAG00000006645 ENSCVAG00000006653 ENSCVAG00000006659 ENSCVAG00000006667 ENSCVAG00000006673 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 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ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a 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ENSGT00390000014065 ENSGT00390000017480 ENSGT00940000161832.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00980000199380.a.b ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000007753.b ENSGT00940000157933 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00390000002030 ENSGT00940000166202 ENSGT00940000155836.B ENSGT01030000234532.B.e.b.e Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 2000 ENSAOCG00000016088 ENSAOCG00000016140 tnni2b.1 (ENSAOCG00000016168) aph1b (ENSAOCG00000016196) OTOG (ENSAOCG00000016353) myod1 (ENSAOCG00000016381) #22 TNNT3 (ENSAOCG00000016439) ENSAOCG00000001128 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2013 myod1 (ENSAOCG00000011653) #22 MYO9B (ENSAOCG00000011575) Orange clownfish MODERN SPECIES ENSAPEG00000000186 SERINC4 (ENSAPEG00000000185) hypk (ENSAPEG00000000184) mfap1 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(ENSAPOG00000009100) ENSAPOG00000009120 ENSAPOG00000009168 tnni2b.1 (ENSAPOG00000009198) aph1b (ENSAPOG00000009227) OTOG (ENSAPOG00000009407) myod1 (ENSAPOG00000000266) #22 TNNT3 (ENSAPOG00000009460) ENSAPOG00000009481 ENSAPOG00000009501 ENSAPOG00000009515 ENSAPOG00000009535 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 78 ENSSPAG00000017872 myod1 (ENSSPAG00000017839) #22 TNNT3 (ENSSPAG00000017227) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 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ENSGT00940000177294 ENSGT00490000044642.a.a.a.a.a.b.a.a.b.h Zebra mbuna MODERN SPECIES 1091 atp6v0d1 (ENSMZEG00005015650) foxr1 (ENSMZEG00005015635) HACD3 (ENSMZEG00005015600) SLC24A1 (ENSMZEG00005015586) dennd4a (ENSMZEG00005015311) socs4 (ENSMZEG00005015254) wdhd1 (ENSMZEG00005015228) gch1 (ENSMZEG00005015209) SAMD4A (ENSMZEG00005015188) ero1a (ENSMZEG00005015175) pacsin3 (ENSMZEG00005015162) glg1b (ENSMZEG00005015115) TNNI2 (ENSMZEG00005015093) aph1b (ENSMZEG00005015081) OTOG (ENSMZEG00005015041) myod1 (ENSMZEG00005015006) #22 TNNT3 (ENSMZEG00005014820) ENSMZEG00005014810 ENSMZEG00005014803 ENSMZEG00005014794 ENSMZEG00005014786 ENSMZEG00005014779 ENSMZEG00005014767 slc22a18 (ENSMZEG00005014753) NR2E3 (ENSMZEG00005014737) ENSMZEG00005014718 ENSMZEG00005014709 mpped2a (ENSMZEG00005014683) zdhhc13 (ENSMZEG00005014665) csrp3 (ENSMZEG00005014652) e2f8 (ENSMZEG00005014622) Eastern happy MODERN SPECIES ENSACLG00000008777 HACD3 (ENSACLG00000008783) SLC24A1 (ENSACLG00000008823) 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Tetraodon MODERN SPECIES 20 ENSTNIG00000005151 NR2E3 (ENSTNIG00000005150) HACD3 (ENSTNIG00000001644) SLC24A1 (ENSTNIG00000018806) dennd4a (ENSTNIG00000018805) socs4 (ENSTNIG00000002432) wdhd1 (ENSTNIG00000018803) gch1 (ENSTNIG00000018802) SAMD4A (ENSTNIG00000018801) ero1a (ENSTNIG00000018800) pacsin3 (ENSTNIG00000018799) glg1b (ENSTNIG00000018797) tnni2b.1 (ENSTNIG00000018796) aph1b (ENSTNIG00000018795) OTOG (ENSTNIG00000018794) myod1 (ENSTNIG00000018793) #22 TNNT3 (ENSTNIG00000018792) ENSTNIG00000018791 foxr1 (ENSTNIG00000018790) atp6v0d1 (ENSTNIG00000018789) ENSTNIG00000018788 ENSTNIG00000018787 ENSTNIG00000018786 c1qtnf4 (ENSTNIG00000018785) ndufs3 (ENSTNIG00000018784) prc1b (ENSTNIG00000018783) ENSTNIG00000018782 hddc3 (ENSTNIG00000018781) mfap1 (ENSTNIG00000018780) hypk (ENSTNIG00000018779) SERINC4 (ENSTNIG00000018778) Fugu MODERN SPECIES 4 ENSTRUG00000015637 NR2E3 (ENSTRUG00000015582) slc22a18 (ENSTRUG00000015561) HACD3 (ENSTRUG00000015510) SLC24A1 (ENSTRUG00000015482) dennd4a 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ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 Ballan wrasse MODERN SPECIES 142 HACD3 (ENSLBEG00000024570) SLC24A1 (ENSLBEG00000024638) dennd4a (ENSLBEG00000024700) socs4 (ENSLBEG00000024771) wdhd1 (ENSLBEG00000024847) gch1 (ENSLBEG00000024950) SAMD4A (ENSLBEG00000025062) ero1a (ENSLBEG00000025153) pacsin3 (ENSLBEG00000025230) glg1b (ENSLBEG00000025302) tnni2b.1 (ENSLBEG00000025369) aph1b (ENSLBEG00000025401) ENSLBEG00000025428 ENSLBEG00000025444 ENSLBEG00000025461 myod1 (ENSLBEG00000025479) #22 TNNT3 (ENSLBEG00000025517) ENSLBEG00000025581 ENSLBEG00000025615 foxr1 (ENSLBEG00000025631) atp6v0d1 (ENSLBEG00000025653) ENSLBEG00000025684 ENSLBEG00000025703 ENSLBEG00000025718 c1qtnf4 (ENSLBEG00000025735) ndufs3 (ENSLBEG00000025754) ptpmt1 (ENSLBEG00000025784) prc1b (ENSLBEG00000025812) vps33b (ENSLBEG00000025870) hddc3 (ENSLBEG00000025928) hypk (ENSLBEG00000025967) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 ENSGT00690000102225 Channel bull blenny MODERN SPECIES 17 NR2E3 (ENSCGOG00000001111) slc22a18 (ENSCGOG00000001108) HACD3 (ENSCGOG00000001094) SLC24A1 (ENSCGOG00000001085) dennd4a (ENSCGOG00000000880) socs4 (ENSCGOG00000000851) wdhd1 (ENSCGOG00000000697) gch1 (ENSCGOG00000000646) SAMD4A (ENSCGOG00000000470) ero1a (ENSCGOG00000000411) pacsin3 (ENSCGOG00000000368) glg1b (ENSCGOG00000000287) tnni2b.1 (ENSCGOG00000000244) aph1b (ENSCGOG00000000232) OTOG (ENSCGOG00000000174) myod1 (ENSCGOG00000000126) #22 TNNT3 (ENSCGOG00000000102) ENSCGOG00000000089 ENSCGOG00000000084 ENSCGOG00000000074 ENSCGOG00000019539 foxr1 (ENSCGOG00000019537) atp6v0d1 (ENSCGOG00000019523) ENSCGOG00000019501 c1qtnf4 (ENSCGOG00000019498) ndufs3 (ENSCGOG00000019478) ptpmt1 (ENSCGOG00000019475) prc1b (ENSCGOG00000019399) vps33b (ENSCGOG00000018984) hddc3 (ENSCGOG00000018977) mfap1 (ENSCGOG00000018963) Pike perch MODERN SPECIES 42 NR2E3 (ENSSLUG00000014245) slc22a18 (ENSSLUG00000014266) HACD3 (ENSSLUG00000014295) SLC24A1 (ENSSLUG00000014312) dennd4a (ENSSLUG00000014340) socs4 (ENSSLUG00000014357) wdhd1 (ENSSLUG00000014371) gch1 (ENSSLUG00000014411) SAMD4A (ENSSLUG00000014423) ero1a (ENSSLUG00000014452) pacsin3 (ENSSLUG00000014868) glg1b (ENSSLUG00000014927) tnni2b.1 (ENSSLUG00000015288) aph1b (ENSSLUG00000015292) OTOG (ENSSLUG00000015304) myod1 (ENSSLUG00000015360) #22 TNNT3 (ENSSLUG00000015377) ENSSLUG00000015385 foxr1 (ENSSLUG00000015392) atp6v0d1 (ENSSLUG00000015419) ENSSLUG00000015470 ENSSLUG00000015477 ENSSLUG00000015482 c1qtnf4 (ENSSLUG00000015485) ndufs3 (ENSSLUG00000015488) ptpmt1 (ENSSLUG00000015495) prc1b (ENSSLUG00000015534) vps33b (ENSSLUG00000015798) hddc3 (ENSSLUG00000015881) mfap1 (ENSSLUG00000015886) hypk (ENSSLUG00000015896) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 ENSGT00690000102225 ENSGT00390000008502 ENSGT01030000234623.a.b.b Lumpfish MODERN SPECIES 18 ENSCLMG00005003411 ENSCLMG00005003410 ENSCLMG00005003408 ENSCLMG00005003406 ENSCLMG00005003404 socs4 (ENSCLMG00005003403) wdhd1 (ENSCLMG00005003392) gch1 (ENSCLMG00005003387) SAMD4A (ENSCLMG00005003385) ero1a (ENSCLMG00005003328) pacsin3 (ENSCLMG00005003323) glg1b (ENSCLMG00005003173) tnni2b.1 (ENSCLMG00005003095) aph1b (ENSCLMG00005003089) OTOG (ENSCLMG00005003067) MYOD1 (ENSCLMG00005003056) #22 TNNT3 (ENSCLMG00005003049) ENSCLMG00005003043 ENSCLMG00005003037 ENSCLMG00005003032 foxr1 (ENSCLMG00005003021) atp6v0d1 (ENSCLMG00005002959) ENSCLMG00005002921 ENSCLMG00005002881 c1qtnf4 (ENSCLMG00005002868) ENSCLMG00005002846 ENSCLMG00005002820 ENSCLMG00005012057 ENSCLMG00005012056 ENSCLMG00005012055 ENSCLMG00005012052 Stickleback MODERN SPECIES 1 ENSGACG00000017297 ENSGACG00000017302 dapk2a (ENSGACG00000017307) ENSGACG00000017310 ENSGACG00000017313 dis3l (ENSGACG00000017315) socs4 (ENSGACG00000017319) wdhd1 (ENSGACG00000017321) gch1 (ENSGACG00000017325) ENSGACG00000017331 pacsin3 (ENSGACG00000017333) GLG1 (ENSGACG00000017337) tnni2b.1 (ENSGACG00000017338) aph1b (ENSGACG00000017339) OTOG (ENSGACG00000017343) myod1 (ENSGACG00000017350) #22 TNNT3 (ENSGACG00000017352) ENSGACG00000017354 foxr1 (ENSGACG00000017356) atp6v0d1 (ENSGACG00000017358) ENSGACG00000017378 c1qtnf4 (ENSGACG00000017381) ndufs3 (ENSGACG00000017384) ptpmt1 (ENSGACG00000017391) prc1b (ENSGACG00000017394) vps33b (ENSGACG00000017403) hddc3 (ENSGACG00000017413) mfap1 (ENSGACG00000017419) hypk (ENSGACG00000017423) SERINC4 (ENSGACG00000017426) ENSGACG00000017432 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a 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HACD3 (ENSSAUG00010011805) SLC24A1 (ENSSAUG00010011812) dennd4a (ENSSAUG00010011836) GFUS (ENSSAUG00010012034) socs4 (ENSSAUG00010012526) wdhd1 (ENSSAUG00010012535) gch1 (ENSSAUG00010012542) SAMD4A (ENSSAUG00010012545) ero1a (ENSSAUG00010012573) pacsin3 (ENSSAUG00010012825) glg1b (ENSSAUG00010012845) TNNI2 (ENSSAUG00010012899) aph1b (ENSSAUG00010012901) myod1 (ENSSAUG00010012905) #22 TNNT3 (ENSSAUG00010012907) ENSSAUG00010012908 ENSSAUG00010012909 ENSSAUG00010012913 ENSSAUG00010012915 ppef1 (ENSSAUG00010012918) ENSSAUG00010012923 ENSSAUG00010012925 cdkl5 (ENSSAUG00010012926) SCML2 (ENSSAUG00010012942) NHS (ENSSAUG00010012957) ace2 (ENSSAUG00010013032) ENSSAUG00010017573 zgc:113276 (ENSSAUG00010017574) pir (ENSSAUG00010017576) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a.c ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 8 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ENSATEG00000016528 ENSATEG00000026393 ENSATEG00000016694 ENSATEG00000016726 ENSATEG00000016866 #22 ENSATEG00000016880 ENSATEG00000016938 ENSATEG00000016974 ENSATEG00000017030 ENSATEG00000017062 ENSATEG00000017251 ENSATEG00000017101 ENSATEG00000017115 ENSATEG00000017151 ENSATEG00000017171 ENSATEG00000017190 c1qtnf4 (ENSATEG00000017205) ENSATEG00000017226 ptpmt1 (ENSATEG00000017238) vps33b (ENSATEG00000017282) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 14 gpn1 (ENSBSLG00000003856) BRSK2 (ENSBSLG00000004153) ABTB2 (ENSBSLG00000004282) ENSBSLG00000004346 ENSBSLG00000004356 large2 (ENSBSLG00000004866) ENSBSLG00000005590 ENSBSLG00000005808 ENSBSLG00000005820 ENSBSLG00000005891 SHANK2 (ENSBSLG00000006606) CTTN (ENSBSLG00000007102) ppfia1 (ENSBSLG00000008183) ENSBSLG00000014549 aph1b (ENSBSLG00000014773) myod1 (ENSBSLG00000014781) #22 TNNT3 (ENSBSLG00000014791) ENSBSLG00000014864 ENSBSLG00000014877 ENSBSLG00000014883 ENSBSLG00000014886 foxr1 (ENSBSLG00000014895) atp6v0d1 (ENSBSLG00000014931) ENSBSLG00000015001 ENSBSLG00000015182 c1qtnf4 (ENSBSLG00000015265) ndufs3 (ENSBSLG00000015288) ptpmt1 (ENSBSLG00000015450) prc1b (ENSBSLG00000015476) vps33b (ENSBSLG00000015623) hddc3 (ENSBSLG00000015688) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 ENSGT00690000102225 Seriola ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 ENSGT00690000102225 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2714 myef2 (ENSSLDG00000021862) ENSSLDG00000021852 CTXN2 (ENSSLDG00000021847) SLC12A1 (ENSSLDG00000021800) dennd4a (ENSSLDG00000021745) socs4 (ENSSLDG00000021736) wdhd1 (ENSSLDG00000021689) gch1 (ENSSLDG00000021679) SAMD4A (ENSSLDG00000021630) ero1a (ENSSLDG00000021600) pacsin3 (ENSSLDG00000021581) glg1b (ENSSLDG00000021532) TNNI2 (ENSSLDG00000021512) aph1b (ENSSLDG00000021492) OTOG (ENSSLDG00000021395) myod1 (ENSSLDG00000021376) #22 TNNT3 (ENSSLDG00000021245) Greater amberjack MODERN SPECIES 3 slc22a18 (ENSSDUG00000016604) HACD3 (ENSSDUG00000016623) SLC24A1 (ENSSDUG00000016668) dennd4a (ENSSDUG00000016708) socs4 (ENSSDUG00000016907) wdhd1 (ENSSDUG00000016996) gch1 (ENSSDUG00000017494) SAMD4A (ENSSDUG00000017510) ENSSDUG00000017549 ero1a (ENSSDUG00000017566) pacsin3 (ENSSDUG00000017630) glg1b (ENSSDUG00000017681) ENSSDUG00000017775 aph1b (ENSSDUG00000017793) OTOG (ENSSDUG00000017868) myod1 (ENSSDUG00000018276) #22 TNNT3 (ENSSDUG00000018283) ENSSDUG00000018305 ENSSDUG00000018321 ENSSDUG00000018331 foxr1 (ENSSDUG00000018344) atp6v0d1 (ENSSDUG00000018360) ENSSDUG00000018375 ENSSDUG00000018386 ENSSDUG00000018406 ENSSDUG00000018427 ENSSDUG00000018441 c1qtnf4 (ENSSDUG00000018457) ndufs3 (ENSSDUG00000018492) ptpmt1 (ENSSDUG00000018606) prc1b (ENSSDUG00000018615) Barramundi perch MODERN SPECIES 96 NR2E3 (ENSLCAG00010017688) slc22a18 (ENSLCAG00010017678) HACD3 (ENSLCAG00010017676) SLC24A1 (ENSLCAG00010017673) dennd4a (ENSLCAG00010017670) socs4 (ENSLCAG00010017668) wdhd1 (ENSLCAG00010017654) gch1 (ENSLCAG00010017650) SAMD4A (ENSLCAG00010017642) ero1a (ENSLCAG00010017638) pacsin3 (ENSLCAG00010017636) glg1b (ENSLCAG00010017596) tnni2b.1 (ENSLCAG00010017526) aph1b (ENSLCAG00010017523) OTOG (ENSLCAG00010017486) myod1 (ENSLCAG00010017465) #22 TNNT3 (ENSLCAG00010017455) ENSLCAG00010017452 ENSLCAG00010017447 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 ENSGT00690000102225 ENSGT00390000008502 ENSGT01030000234623.a.b.b Turbot MODERN SPECIES 17 ENSSMAG00000007972 ENSSMAG00000007954 ENSSMAG00000007929 HACD3 (ENSSMAG00000007882) SLC24A1 (ENSSMAG00000007857) DENND4A (ENSSMAG00000007433) wdhd1 (ENSSMAG00000007346) ENSSMAG00000034634 SAMD4A (ENSSMAG00000007254) ero1a (ENSSMAG00000007207) ENSSMAG00000007168 ENSSMAG00000006788 ENSSMAG00000006609 ENSSMAG00000006568 ENSSMAG00000027873 ENSSMAG00000006529 #22 ENSSMAG00000006392 ENSSMAG00000006376 ENSSMAG00000006344 ENSSMAG00000006320 ENSSMAG00000027949 ENSSMAG00000006274 ENSSMAG00000006222 c1qtnf4 (ENSSMAG00000030864) ENSSMAG00000006194 ptpmt1 (ENSSMAG00000006187) prc1b (ENSSMAG00000006152) vps33b (ENSSMAG00000006116) hddc3 (ENSSMAG00000006096) mfap1 (ENSSMAG00000006029) hypk (ENSSMAG00000006081) Tongue sole MODERN SPECIES 25 ENSCSEG00000011338 ENSCSEG00000011313 ENSCSEG00000011305 BRSK2 (ENSCSEG00000011247) ENSCSEG00000011220 CORO2B (ENSCSEG00000011186) anp32a (ENSCSEG00000011176) glceb (ENSCSEG00000011164) paqr5a (ENSCSEG00000011095) ero1a (ENSCSEG00000011060) pacsin3 (ENSCSEG00000011036) glg1b (ENSCSEG00000010964) tnni2b.1 (ENSCSEG00000010949) aph1b (ENSCSEG00000010946) OTOG (ENSCSEG00000010918) myod1 (ENSCSEG00000010907) #22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.b.f #22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.b.f #22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.b.f #22 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 496 ENSHCOG00000009000 ENSHCOG00000009005 ENSHCOG00000009038 znf277 (ENSHCOG00000009285) immp2l (ENSHCOG00000009329) ENSHCOG00000009337 ENSHCOG00000009421 DUS2 (ENSHCOG00000009462) SLC7A10 (ENSHCOG00000009496) urahb (ENSHCOG00000009505) ENSHCOG00000009602 ENSHCOG00000009616 LRTM2 (ENSHCOG00000009629) CACNA2D4 (ENSHCOG00000009660) ENSHCOG00000009665 MYOD1 (ENSHCOG00000009682) #22 ENSHCOG00000009758 ENSHCOG00000009794 dldh (ENSHCOG00000009848) ENSHCOG00000009869 tnni2a.1 (ENSHCOG00000009875) tnni2a.2 (ENSHCOG00000009882) ENSHCOG00000009905 Euteleostomi DUPLICATION Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 542 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 ENSGT00940000158477.a.b.b ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 Channel catfish MODERN SPECIES 5 mrpl23 (ENSIPUG00000005383) ENSIPUG00000005353 ENSIPUG00000005334 cpt1a (ENSIPUG00000005228) nap1l4a (ENSIPUG00000005201) phlda2 (ENSIPUG00000005186) OSBPL5 (ENSIPUG00000005152) ENSIPUG00000005122 ENSIPUG00000005070 dusp8a (ENSIPUG00000005041) mob2a (ENSIPUG00000005022) kcnj11 (ENSIPUG00000005009) abcc8 (ENSIPUG00000004801) ush1c (ENSIPUG00000004724) zgc:172145 (ENSIPUG00000004699) myod1 (ENSIPUG00000004693) ##22 tnnt3a (ENSIPUG00000004658) ENSIPUG00000004650 ENSIPUG00000004645 ENSIPUG00000004583 tnni2 (ENSIPUG00000004539) tnni2a.3 (ENSIPUG00000004514) TNNI2 (ENSIPUG00000004491) tnni2a.2 (ENSIPUG00000004477) TNNI2 (ENSIPUG00000004462) ENSIPUG00000004455 SYT8 (ENSIPUG00000004448) PDCD2L (ENSIPUG00000004421) banp (ENSIPUG00000004342) ENSIPUG00000004314 znf469 (ENSIPUG00000004306) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 Electric eel MODERN SPECIES 236 ENSEEEG00000007618 nap1l4a (ENSEEEG00000007616) phlda2 (ENSEEEG00000007614) OSBPL5 (ENSEEEG00000007471) ENSEEEG00000007463 dusp8a (ENSEEEG00000007456) mob2a (ENSEEEG00000007448) kcnj11 (ENSEEEG00000007443) abcc8 (ENSEEEG00000007434) ush1c (ENSEEEG00000007432) myod1 (ENSEEEG00000007431) ##22 tnnt3a (ENSEEEG00000007429) ENSEEEG00000007427 tnni2a.4 (ENSEEEG00000007412) tnni2a.3 (ENSEEEG00000007394) tnni2a.2 (ENSEEEG00000007393) tnni2a.1 (ENSEEEG00000007391) ENSEEEG00000007390 SYT8 (ENSEEEG00000007387) pdcd2l (ENSEEEG00000007386) banp (ENSEEEG00000007385) ENSEEEG00000007384 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000161238.k ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000160745.d ENSGT00390000007739 ENSGT00940000164715.b ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000169159 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000159535 ENSGT00940000160004.f ENSGT01050000244956.a.a.n ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116.i ENSGT00940000158339 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 296 ENSGT00940000161238.k.b ENSGT00950000182885.C.a.a ENSGT00940000160745.d.b ENSGT00390000007739.a.b ENSGT00940000164715.b.a ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a.b ENSGT00940000169159.b ENSGT00940000159535.g ENSGT00940000156870.cb ENSGT00940000160004.f.b ENSGT01050000244956.a.a.n.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b.e ENSGT00940000156626.w.a ENSGT00950000183002.A.d ENSGT00920000149457.b ENSGT00950000182959.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00940000167812.c ENSGT00940000153901.a.b.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT00950000182839.B.a.a.l.b ENSGT00940000155871.k.a ENSGT00940000155871.l ENSGT00530000065415.a ENSGT00390000011116.i.b ENSGT00940000158339.b ENSGT00940000155200.ec.b ENSGT00390000001368.o Goldfish MODERN SPECIES 17 ENSCARG00000013197 mrpl23 (ENSCARG00000013181) ENSCARG00000013069 nap1l4a (ENSCARG00000013043) phlda2 (ENSCARG00000013035) OSBPL5 (ENSCARG00000012856) ENSCARG00000012825 ENSCARG00000012810 ENSCARG00000012795 dusp8a (ENSCARG00000012784) mob2a (ENSCARG00000012767) kcnj11 (ENSCARG00000012748) abcc8 (ENSCARG00000011954) ush1c (ENSCARG00000011715) zgc:172145 (ENSCARG00000011680) myod1 (ENSCARG00000011672) ##22 tnnt3a (ENSCARG00000011669) ENSCARG00000011667 ENSCARG00000011653 tnni2a.1 (ENSCARG00000011629) SYT8 (ENSCARG00000011614) RASSF8 (ENSCARG00000011612) kras (ENSCARG00000011599) ENSCARG00000011595 banp (ENSCARG00000011549) pdcd2l (ENSCARG00000011542) ENSCARG00000011509 FBXO31 (ENSCARG00000011416) ENSCARG00000011380 ENSCARG00000011358 pkp3a (ENSCARG00000011246) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161238.k.b ENSGT00950000182885.C.a.a ENSGT00940000160745.d.b ENSGT00390000007739.b ENSGT00940000164715.b.a ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a.b ENSGT00940000169159.b ENSGT00940000159535.g ENSGT00940000156870.cb ENSGT00940000160004.f.b ENSGT01050000244956.a.a.n.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b.e ENSGT00940000156626.w.a ENSGT00950000183002.A.d ENSGT00920000149457.b ENSGT00950000182959.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00940000167812.c ENSGT00940000153901.a.b.b.a ENSGT00940000153901.a.b.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT00950000182839.B.a.a.l.b ENSGT00940000155871.l ENSGT00530000065415.a ENSGT00390000011116.i.b ENSGT00940000158339.b ENSGT00940000155200.ec.b.a ENSGT00390000001368.o Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 366 nap1l4a (ENSSGRG00000041037) phlda2 (ENSSGRG00000041036) OSBPL5 (ENSSGRG00000039818) ENSSGRG00000039787 dusp8a (ENSSGRG00000039777) mob2a (ENSSGRG00000039776) kcnj11 (ENSSGRG00000039775) abcc8 (ENSSGRG00000039570) ush1c (ENSSGRG00000039517) zgc:172145 (ENSSGRG00000039515) myod1 (ENSSGRG00000039484) ##22 tnnt3a (ENSSGRG00000039479) ENSSGRG00000039475 ENSSGRG00000039467 tnni2a.4 (ENSSGRG00000039431) ENSSGRG00000039428 ENSSGRG00000039427 ENSSGRG00000039426 RASSF8 (ENSSGRG00000039425) kras (ENSSGRG00000039378) itpkcb (ENSSGRG00000039365) zgc:153119 (ENSSGRG00000039362) snrpa (ENSSGRG00000039361) tbrg1 (ENSSGRG00000039290) cfap45 (ENSSGRG00000039288) Golden-line barbel MODERN SPECIES 198 ush1c (ENSSGRG00000038778) zgc:172145 (ENSSGRG00000038989) myod1 (ENSSGRG00000038991) ##22 ENSSGRG00000038998 ENSSGRG00000039000 ENSSGRG00000039001 ENSSGRG00000039005 tnni2a.3 (ENSSGRG00000039007) tnni2a.2 (ENSSGRG00000039009) tnni2a.1 (ENSSGRG00000039014) ENSSGRG00000039020 ENSSGRG00000039021 RASSF8 (ENSSGRG00000039023) kras (ENSSGRG00000039029) ENSSGRG00000039099 ENSSGRG00000039100 pdcd2l (ENSSGRG00000039101) ENSSGRG00000039102 Common carp reference MODERN SPECIES 37 ENSCCRG00000031922 ENSCCRG00000031052 nap1l4a (ENSCCRG00000031099) phlda2 (ENSCCRG00000059697) ENSCCRG00000031128 ENSCCRG00000068830 ENSCCRG00000066001 ENSCCRG00000070357 dusp8a 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ENSGT00950000182959.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000158477.b ENSGT00940000167812.d ENSGT00940000153901.a.b.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.b ENSGT01030000234858 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l.a ENSGT00940000155871.k.b ENSGT00530000065415.b ENSGT00390000011116.i.a ENSGT00940000158339.a ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00390000001368.p ENSGT00390000011067.B Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00950000182885.C.a.b ENSGT00940000160745.d.a ENSGT00390000007739.a.a ENSGT00940000164715.b.b ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a.a ENSGT00940000169159.a ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000159535.h ENSGT00940000156870.bb.b.a ENSGT00940000160004.f.a ENSGT01050000244956.a.a.n.b ENSGT00990000203615.a.a.a.b.f ENSGT00940000156626.w.b ENSGT00950000183002.A.c ENSGT00920000149457.a ENSGT00950000182959.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000158477.b ENSGT00940000167812.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.b ENSGT01030000234858 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l.a ENSGT00940000155871.k.b ENSGT00530000065415.b ENSGT00390000011116.i.a ENSGT00390000011116.j ENSGT00940000158339.a ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00390000001368.p ENSGT00390000011067.B Common carp reference MODERN SPECIES 33 ENSCCRG00000076888 nap1l4a (ENSCCRG00000053707) phlda2 (ENSCCRG00000031114) ENSCCRG00000050262 ENSCCRG00000006126 ENSCCRG00000070395 ENSCCRG00000075142 ENSCCRG00000022539 dusp8a (ENSCCRG00000056844) mob2a (ENSCCRG00000008336) kcnj11 (ENSCCRG00000075210) abcc8 (ENSCCRG00000004760) ush1c (ENSCCRG00000014177) ENSCCRG00000081027 zgc:172145 (ENSCCRG00000074849) myod1 (ENSCCRG00000078915) ##22 TNNT3 (ENSCCRG00000056652) ENSCCRG00000059451 ENSCCRG00000049337 tnni2a.3 (ENSCCRG00000067810) tnni2a.2 (ENSCCRG00000007838) SYT8 (ENSCCRG00000007820) ENSCCRG00000049349 ENSCCRG00000024104 kras (ENSCCRG00000049418) ENSCCRG00000062479 banp (ENSCCRG00000029986) ENSCCRG00000068910 pdcd2l (ENSCCRG00000043265) ENSCCRG00000015852 ENSCCRG00000043287 Goldfish MODERN SPECIES 45 th (ENSCARG00000050601) igf2b (ENSCARG00000050562) mrpl23 (ENSCARG00000050540) ENSCARG00000050525 ENSCARG00000049918 nap1l4a (ENSCARG00000049783) phlda2 (ENSCARG00000049767) OSBPL5 (ENSCARG00000048773) ENSCARG00000048706 dusp8a (ENSCARG00000048679) mob2a (ENSCARG00000048612) kcnj11 (ENSCARG00000048580) abcc8 (ENSCARG00000047502) ush1c (ENSCARG00000047304) zgc:172145 (ENSCARG00000047288) myod1 (ENSCARG00000047275) ##22 ENSCARG00000047262 tnni2a.3 (ENSCARG00000047250) ENSCARG00000047242 tnni2a.2 (ENSCARG00000047218) tnni2a.1 (ENSCARG00000047183) ENSCARG00000047172 RASSF8 (ENSCARG00000047148) kras (ENSCARG00000047124) ENSCARG00000047116 ENSCARG00000047113 banp (ENSCARG00000047101) pdcd2l (ENSCARG00000070326) ENSCARG00000070322 FBXO31 (ENSCARG00000070320) dynlrb2 (ENSCARG00000070319) Zebrafish MODERN SPECIES 17 slc27a2b (ENSDARG00000100731) ENSDARG00000079374 ENSDARG00000062632 DUOXA2 (ENSDARG00000078962) ENSDARG00000063314 eif3ja 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(ENSDCDG00000026959) SHF (ENSDCDG00000026956) ENSDCDG00000026953 ENSDCDG00000026948 ube2q1 (ENSDCDG00000026915) CHRNB4 (ENSDCDG00000026897) CHRNA3 (ENSDCDG00000026890) ENSDCDG00000026881 ENSDCDG00000026877 chrna5 (ENSDCDG00000026872) ENSDCDG00000026869 ABCC8 (ENSDCDG00000026610) OTOG (ENSDCDG00000026583) myod1 (ENSDCDG00000026580) ##22 tnnt3b (ENSDCDG00000026571) ENSDCDG00000026556 ENSDCDG00000026554 ENSDCDG00000026552 tnni2b.1 (ENSDCDG00000026551) tnni2b.2 (ENSDCDG00000026548) galns (ENSDCDG00000026497) trappc2l (ENSDCDG00000026484) PABPN1L (ENSDCDG00000026482) CBFA2T3 (ENSDCDG00000026480) ACSF3 (ENSDCDG00000026303) pacsin3 (ENSDCDG00000026254) FADD (ENSDCDG00000026252) ano1a (ENSDCDG00000022511) zgc:153993 (ENSDCDG00000022398) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 261 ENSGT00940000165890 ENSGT00940000157369.b ENSGT00390000005764 ENSGT00530000063106.B ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155836.B ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00530000062962.b.a.e 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ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000165890 ENSGT00940000157369.b ENSGT00390000005764 ENSGT00530000063106.B ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00940000154914.vb ENSGT00940000155836.B.j ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000160967.f ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01000000216979 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c ENSGT00940000160892.f ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000159464 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000165890 ENSGT00940000157369.b ENSGT00390000005764 ENSGT00530000063106.B ENSGT00940000155333.A.a.i.a ENSGT00940000154914.vb ENSGT00940000155836.B.j ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000160967.f ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ENSGT00940000159464 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b ENSGT00390000004417.b ENSGT01010000223078 ENSGT00940000155024.a.b.c.b.a.b ENSGT00940000164815.b ENSGT00940000158999.l Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 280 ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01000000216979 Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 18 tipin (ENSOMYG00000050576) dis3l (ENSOMYG00000048031) ENSOMYG00000021812 ENSOMYG00000074521 RAB11A (ENSOMYG00000026657) DENND4A (ENSOMYG00000065265) SLC24A1 (ENSOMYG00000004910) HACD3 (ENSOMYG00000040606) ENSOMYG00000074482 ENSOMYG00000054709 ENSOMYG00000062139 ENSOMYG00000061598 ENSOMYG00000076821 ENSOMYG00000040832 ENSOMYG00000052295 myod (ENSOMYG00000061213) ##22 ENSOMYG00000014317 ENSOMYG00000051029 ENSOMYG00000060665 ENSOMYG00000029106 ENSOMYG00000067636 ENSOMYG00000070828 ENSOMYG00000029425 ENSOMYG00000058923 ENSOMYG00000057894 ENSOMYG00000077868 ENSOMYG00000054869 ENSOMYG00000062350 ENSOMYG00000059180 ENSOMYG00000065256 ENSOMYG00000064251 Rainbow trout MODERN SPECIES 27 tipin (ENSOMYG00000074288) dis3l (ENSOMYG00000052777) ENSOMYG00000062709 RAB11A (ENSOMYG00000049890) DENND4A (ENSOMYG00000076284) SLC24A1 (ENSOMYG00000004858) HACD3 (ENSOMYG00000059785) ENSOMYG00000023825 ENSOMYG00000004974 ENSOMYG00000050119 ENSOMYG00000005006 ENSOMYG00000005082 ENSOMYG00000060149 ENSOMYG00000063706 ENSOMYG00000069614 myod1 (ENSOMYG00000029242) ##22 TNNT3 (ENSOMYG00000049303) ENSOMYG00000055514 ENSOMYG00000029082 ENSOMYG00000057374 ENSOMYG00000029399 ENSOMYG00000030016 ENSOMYG00000030025 ENSOMYG00000029435 CTSD (ENSOMYG00000029741) ENSOMYG00000050352 ENSOMYG00000072011 ENSOMYG00000030266 ENSOMYG00000030436 ENSOMYG00000062215 ENSOMYG00000077711 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 299 ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01000000216979 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b Chinook salmon MODERN SPECIES 770 myod1 (ENSOTSG00005017359) ##22 TNNT3 (ENSOTSG00005017364) Coho salmon DUPLICATION Coho salmon MODERN SPECIES 311 ENSOKIG00005032064 MYOD1 (ENSOKIG00005032085) ##22 TNNT3 (ENSOKIG00005032107) Coho salmon MODERN SPECIES 32 dis3l (ENSOKIG00005040437) rab11a (ENSOKIG00005041589) ENSOKIG00005041640 ENSOKIG00005041656 DENND4A (ENSOKIG00005041726) ENSOKIG00005042607 SLC24A1 (ENSOKIG00005042621) HACD3 (ENSOKIG00005042645) arih1l (ENSOKIG00005042766) NR2E3 (ENSOKIG00005043003) ENSOKIG00005017602 ENSOKIG00005017668 aph1b 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ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ENSGT00940000163911.b.c.a.b ENSGT00940000162463.a ENSGT00940000160974.b.d.j River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 21 ENSSTUG00000005865 crybgx (ENSSTUG00000005860) lctla (ENSSTUG00000005848) tipin (ENSSTUG00000005839) dis3l (ENSSTUG00000005812) ENSSTUG00000005780 rab11a (ENSSTUG00000005754) dennd4a (ENSSTUG00000004971) SLC24A1 (ENSSTUG00000004931) HACD3 (ENSSTUG00000004705) ARIH1 (ENSSTUG00000004569) NR2E3 (ENSSTUG00000004529) ENSSTUG00000004489 ENSSTUG00000004484 aph1b (ENSSTUG00000004478) myod1 (ENSSTUG00000004466) ##22 TNNT3 (ENSSTUG00000004390) ENSSTUG00000004371 ENSSTUG00000004360 tnni2b.1 (ENSSTUG00000004312) TNNI2 (ENSSTUG00000004289) ENSSTUG00000004274 ENSSTUG00000004269 ctsd (ENSSTUG00000003756) ENSSTUG00000003710 drd4b (ENSSTUG00000003691) ENSSTUG00000035126 sirt3 (ENSSTUG00000035121) psmd13 (ENSSTUG00000035024) ENSSTUG00000035009 SLC7A5 (ENSSTUG00000034374) River trout MODERN SPECIES 3 ENSSTUG00000007012 ppfia1 (ENSSTUG00000004645) tmod2 (ENSSTUG00000004523) leo1 (ENSSTUG00000004341) ENSSTUG00000004325 rab11a (ENSSTUG00000004309) dennd4a (ENSSTUG00000002300) SLC24A1 (ENSSTUG00000002229) HACD3 (ENSSTUG00000002183) arih1l (ENSSTUG00000002114) NR2E3 (ENSSTUG00000002100) ENSSTUG00000002080 ENSSTUG00000002075 aph1b (ENSSTUG00000002066) OTOG (ENSSTUG00000001950) myod1 (ENSSTUG00000001933) ##22 ENSSTUG00000001917 ENSSTUG00000001903 tnni2b.1 (ENSSTUG00000001896) TNNI2 (ENSSTUG00000001889) ENSSTUG00000001875 ENSSTUG00000001870 ENSSTUG00000001858 ctsd (ENSSTUG00000001706) ENSSTUG00000001686 ENSSTUG00000001681 drd4b (ENSSTUG00000001673) sirt3 (ENSSTUG00000001668) psmd13 (ENSSTUG00000001588) ENSSTUG00000001580 SLC7A5 (ENSSTUG00000001349) Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 ENSSSAG00000008839 tipin (ENSSSAG00000082602) ENSSSAG00000103573 RAB11A (ENSSSAG00000099276) DENND4A (ENSSSAG00000100635) SLC24A1 (ENSSSAG00000009849) HACD3 (ENSSSAG00000009594) ENSSSAG00000099816 ENSSSAG00000072984 ENSSSAG00000101082 ENSSSAG00000094543 ENSSSAG00000104282 ENSSSAG00000113698 ENSSSAG00000096205 TNNT3 (ENSSSAG00000010002) myod1 (ENSSSAG00000040107) ##22 ENSSSAG00000084840 ENSSSAG00000108614 TNNI2 (ENSSSAG00000009799) tnni2b.2 (ENSSSAG00000115361) ENSSSAG00000102508 ENSSSAG00000096849 ENSSSAG00000111535 ENSSSAG00000120009 ENSSSAG00000114143 ENSSSAG00000110591 ENSSSAG00000013813 ENSSSAG00000095829 ENSSSAG00000040098 CTSD (ENSSSAG00000010227) ENSSSAG00000010218 Atlantic salmon MODERN SPECIES 18 lctla (ENSSSAG00000043842) tipin (ENSSSAG00000043439) dis3l (ENSSSAG00000121052) ENSSSAG00000092940 RAB11A (ENSSSAG00000062971) DENND4A (ENSSSAG00000082487) SLC24A1 (ENSSSAG00000010183) HACD3 (ENSSSAG00000095799) ENSSSAG00000095519 ENSSSAG00000009961 ENSSSAG00000009811 ENSSSAG00000119131 ENSSSAG00000010246 ENSSSAG00000104869 ENSSSAG00000056579 ENSSSAG00000010004 ##22 TNNT3 (ENSSSAG00000009998) ENSSSAG00000108582 ENSSSAG00000103815 ENSSSAG00000095150 TNNI2 (ENSSSAG00000084513) TNNI2 (ENSSSAG00000010176) tnni2b.2 (ENSSSAG00000010154) ENSSSAG00000101599 ENSSSAG00000009981 ENSSSAG00000027269 ENSSSAG00000102956 ENSSSAG00000094753 ENSSSAG00000058230 ENSSSAG00000105548 ENSSSAG00000105539 Huchen MODERN SPECIES 6393 myod1 (ENSHHUG00000024826) ##22 TNNT3 (ENSHHUG00000024664) Northern pike MODERN SPECIES 1 crybgx (ENSELUG00000019531) lctla (ENSELUG00000019497) tipin (ENSELUG00000019453) dis3l (ENSELUG00000019420) ENSELUG00000019353 RAB11B (ENSELUG00000019240) dennd4a (ENSELUG00000000821) SLC24A1 (ENSELUG00000019158) HACD3 (ENSELUG00000019142) arih1l (ENSELUG00000019125) NR2E3 (ENSELUG00000019079) ENSELUG00000019041 ENSELUG00000018968 aph1b (ENSELUG00000018962) OTOG (ENSELUG00000018933) MYOD1 (ENSELUG00000018844) ##22 TNNT3 (ENSELUG00000018827) ENSELUG00000026443 ENSELUG00000018803 ENSELUG00000018743 tnni2b.1 (ENSELUG00000018719) ENSELUG00000028322 ENSELUG00000028980 ENSELUG00000033770 ENSELUG00000027344 ENSELUG00000028989 ctsd (ENSELUG00000018601) ENSELUG00000018575 drd4b (ENSELUG00000018550) sirt3 (ENSELUG00000018526) psmd13 (ENSELUG00000018515) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 Cod MODERN SPECIES 5 ENSGMOG00000012317 immp1l (ENSGMOG00000012313) ELP4 (ENSGMOG00000012307) pax6b (ENSGMOG00000012304) wt1b (ENSGMOG00000012296) eif3m (ENSGMOG00000012291) prrg4 (ENSGMOG00000012288) QSER1 (ENSGMOG00000024870) cstf3 (ENSGMOG00000012275) hipk3b (ENSGMOG00000012267) ENSGMOG00000012262 spon1a (ENSGMOG00000013410) ENSGMOG00000013397 ENSGMOG00000011343 ENSGMOG00000011350 ENSGMOG00000035611 ##22 TNNT3 (ENSGMOG00000011393) ENSGMOG00000028561 tnni2b.1 (ENSGMOG00000018981) ENSGMOG00000018961 ENSGMOG00000018911 ENSGMOG00000006402 ENSGMOG00000025002 ENSGMOG00000006378 ENSGMOG00000025333 ENSGMOG00000006346 ENSGMOG00000006331 ENSGMOG00000003209 ENSGMOG00000003176 ENSGMOG00000003144 ENSGMOG00000002967 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 ENSGT00940000158477 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT01030000234990 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 ENSGT00390000017767.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160208 ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000159464 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 ENSGT00940000158477 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT01030000234990 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000178524 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160208 ENSGT00390000014700.b.a.a Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000160333 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000159535 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000160004 ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000157490 ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.b #22 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000164955.a ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 145 ENSGT00940000169159 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000159535 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000160004 ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000156626 ENSGT00950000183002.A ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000164955.a ENSGT00940000160974.b.d Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 542 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 ENSGT00940000158477.a.b.b ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 541 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.a.a ##22 ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 ENSGT00940000158477.a.b.b ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000021436 ENSCHAG00000021043 ENSCHAG00000020425 ENSCHAG00000020389 ENSCHAG00000020373 ENSCHAG00000020362 dusp8a (ENSCHAG00000020357) mob2a (ENSCHAG00000020294) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) abcc8 (ENSCHAG00000017040) ush1c (ENSCHAG00000016858) zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) MYOD1 (ENSCHAG00000016826) ##22 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) ENSCHAG00000016791 ENSCHAG00000016765 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) TNNI2 (ENSCHAG00000016508) TNNI2 (ENSCHAG00000016464) TNNI2 (ENSCHAG00000016374) TNNI2 (ENSCHAG00000016334) TNNI2 (ENSCHAG00000016279) TNNI2 (ENSCHAG00000016273) TNNI2 (ENSCHAG00000016209) TNNI2 (ENSCHAG00000016193) TNNI2 (ENSCHAG00000016160) tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) Atlantic herring MODERN SPECIES 22 MICAL2 (ENSCHAG00000017792) atpv0e2 (ENSCHAG00000017756) cars1 (ENSCHAG00000015312) nap1l4b (ENSCHAG00000015163) PHLDA2 (ENSCHAG00000015146) PHLDA2 (ENSCHAG00000015121) slc22a18 (ENSCHAG00000015000) OSBPL5 (ENSCHAG00000013553) ENSCHAG00000013402 PTPN5 (ENSCHAG00000013347) DUSP8 (ENSCHAG00000013334) mob2b (ENSCHAG00000013224) KCNJ11 (ENSCHAG00000013212) ABCC8 (ENSCHAG00000005413) OTOG (ENSCHAG00000004569) MYOD1 (ENSCHAG00000004523) ##22 tnnt3b (ENSCHAG00000004458) ENSCHAG00000004444 ENSCHAG00000004434 tnni2b.1 (ENSCHAG00000004290) ENSCHAG00000004279 ENSCHAG00000004256 ENSCHAG00000004224 ENSCHAG00000004218 DBNDD1 (ENSCHAG00000004207) ENSCHAG00000004200 ENSCHAG00000002366 def8 (ENSCHAG00000002070) ENSCHAG00000002030 mc1r (ENSCHAG00000002013) tcf25 (ENSCHAG00000001359) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000002524 ENSGT00950000183042.a.b.b ENSGT00950000186379 ENSGT00940000160180 ENSGT00940000154917 ENSGT00730000111305 ENSGT00940000163501 ENSGT00390000016453.m ENSGT00390000008931 ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b 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RFWD3 (ENSOKIG00005024030) GLG1 (ENSOKIG00005024239) ENSOKIG00005025795 ENSOKIG00005025848 CACNA2D4 (ENSOKIG00005026408) LRTM2 (ENSOKIG00005026822) ENSOKIG00005026827 zgc:172145 (ENSOKIG00005026835) MYOD1 (ENSOKIG00005026839) ##22 TNNT3 (ENSOKIG00005026856) ENSOKIG00005026885 ENSOKIG00005026905 TNNI2 (ENSOKIG00005026949) TNNI2 (ENSOKIG00005027031) tnni2a.2 (ENSOKIG00005027046) tnni2a.1 (ENSOKIG00005027100) SYT8 (ENSOKIG00005027132) ENSOKIG00005027164 drd4a (ENSOKIG00005027194) ENSOKIG00005027375 dldh (ENSOKIG00005027454) ENSOKIG00005028191 PTPRZ1 (ENSOKIG00005028335) ENSOKIG00005031137 Salmo ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000165017.a.e ENSGT01050000244882.a.a.a.a.a.d ENSGT01100000266261 ENSGT00390000003450.e ENSGT00940000164030.i.b ENSGT00390000001285.j.c ENSGT00940000154917.fb.a ENSGT00390000016453.n.a ENSGT00390000008931.g ENSGT00390000011262.e.a.b.b ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000160625.r.a.b ENSGT00940000155997.lb.b.u ENSGT00940000157572.a.b.c ENSGT00920000149457.c 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ptprz1 (ENSSSAG00000080236) Huchen MODERN SPECIES 544 RFWD3 (ENSHHUG00000050492) GLG1 (ENSHHUG00000050506) ENSHHUG00000050630 ENSHHUG00000050634 CACNA2D4 (ENSHHUG00000050645) LRTM2 (ENSHHUG00000050722) zgc:172145 (ENSHHUG00000000023) MYOD1 (ENSHHUG00000000050) ##22 tnnt3b (ENSHHUG00000000132) ENSHHUG00000000144 ENSHHUG00000000161 TNNI2 (ENSHHUG00000000165) TNNI2 (ENSHHUG00000000259) tnni2a.2 (ENSHHUG00000000268) tnni2a.2 (ENSHHUG00000000284) tnni2a.1 (ENSHHUG00000000288) ENSHHUG00000000310 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 489 ENSGT00940000164030.i.a ENSGT00390000001285.j.d ENSGT00390000002524 ENSGT00950000183042.a.b.b ENSGT00940000154917.fb.b ENSGT00730000111305 ENSGT00940000163501 ENSGT00390000016453.m ENSGT00390000008931.h ENSGT00390000011262.e.a.b.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p ENSGT00940000160625.r.a.a ENSGT00940000157572.a.b.d ENSGT00940000155997.lb.b.v ENSGT00920000149457.d ENSGT00950000182959.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000158477.a.b.d ENSGT00940000167812.f ENSGT00940000153901.a.b.b.c 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ENSSSAG00000092025 zgc:172145 (ENSSSAG00000055098) ENSSSAG00000007878 myod2 (ENSSSAG00000055102) ##22 TNNT3 (ENSSSAG00000055126) ENSSSAG00000100003 ENSSSAG00000055179 ENSSSAG00000055171 TNNI2 (ENSSSAG00000055203) ENSSSAG00000103611 tnni2a.1 (ENSSSAG00000055259) SYT8 (ENSSSAG00000119353) ENSSSAG00000055272 ENSSSAG00000055278 ENSSSAG00000122200 drd4a (ENSSSAG00000055298) deaf1 (ENSSSAG00000055310) ENSSSAG00000055330 ENSSSAG00000055331 River trout MODERN SPECIES 33 ENSSTUG00000012494 ENSSTUG00000012523 ENSSTUG00000012536 amn1 (ENSSTUG00000012549) etfbkmt (ENSSTUG00000012566) MLKL (ENSSTUG00000012572) RFWD3 (ENSSTUG00000012610) GLG1 (ENSSTUG00000012698) ENSSTUG00000013296 urahb (ENSSTUG00000013349) ENSSTUG00000013806 ENSSTUG00000015707 LRTM2 (ENSSTUG00000016977) ENSSTUG00000016981 zgc:172145 (ENSSTUG00000016985) MYOD1 (ENSSTUG00000016988) ##22 tnnt3b (ENSSTUG00000016997) ENSSTUG00000017023 ENSSTUG00000017036 tnni2a.2 (ENSSTUG00000017106) tnni2a.1 (ENSSTUG00000017118) SYT8 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ENSGT00940000160974.b.c.g.b ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160208 Rainbow trout MODERN SPECIES 22 ENSOMYG00000048775 amn1 (ENSOMYG00000045459) ENSOMYG00000055885 etfbkmt (ENSOMYG00000045453) MLKL (ENSOMYG00000045444) ENSOMYG00000045422 GLG1 (ENSOMYG00000045338) ENSOMYG00000073315 ENSOMYG00000069462 urahb (ENSOMYG00000045245) ENSOMYG00000044518 ENSOMYG00000054081 ENSOMYG00000044396 ENSOMYG00000064959 zgc:172145 (ENSOMYG00000068802) myod2 (ENSOMYG00000044372) ##22 TNNT3 (ENSOMYG00000044367) ENSOMYG00000044366 ENSOMYG00000054158 ENSOMYG00000051621 tnni2a.1 (ENSOMYG00000044342) SYT8 (ENSOMYG00000044334) ENSOMYG00000070342 ENSOMYG00000044289 ENSOMYG00000044274 drd4a (ENSOMYG00000044265) deaf1 (ENSOMYG00000044258) bet1l (ENSOMYG00000071324) ENSOMYG00000051072 ENSOMYG00000044242 ENSOMYG00000053913 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000164030.i.a ENSGT00390000001285.j.d ENSGT00390000002524 ENSGT00950000183042.a.b.b ENSGT00940000154917.fb.b ENSGT00730000111305 ENSGT00940000163501 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ENSGT00950000182959.b.a.b ##22 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000167812.b ENSGT00940000160974.b.a ENSGT00940000160208 ENSGT00390000014700.b.a.a.d ENSGT00390000009899.a.d.q ENSGT00940000156574.C.m ENSGT00940000156431.d ENSGT00390000017249.e ENSGT00940000158481.c ENSGT00940000157667.c ENSGT00940000156620 ENSGT00940000159662.a ENSGT00940000153438.a.u P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 12 ENSPKIG00000013662 BRSK2 (ENSPKIG00000013692) ABTB2 (ENSPKIG00000013765) B4GALNT4 (ENSPKIG00000013857) ENSPKIG00000013906 ENSPKIG00000013936 NAP1L4 (ENSPKIG00000013990) phlda2 (ENSPKIG00000014074) slc22a18 (ENSPKIG00000014108) OSBPL5 (ENSPKIG00000014169) ENSPKIG00000014210 ENSPKIG00000014235 PTPN5 (ENSPKIG00000014280) DUSP8 (ENSPKIG00000014327) MOB2 (ENSPKIG00000014366) MYOD1 (ENSPKIG00000014431) ##22 tnnt3a (ENSPKIG00000014475) ENSPKIG00000014525 ENSPKIG00000014539 ENSPKIG00000014558 ctsd (ENSPKIG00000014578) DRD4 (ENSPKIG00000014609) BET1L (ENSPKIG00000014630) ric8a (ENSPKIG00000014659) PPP6R3 (ENSPKIG00000014718) lrp5 (ENSPKIG00000014824) KMT5B (ENSPKIG00000014929) TP53I11 (ENSPKIG00000014988) cd82b (ENSPKIG00000015005) TSPAN18 (ENSPKIG00000015030) ext2 (ENSPKIG00000015088) P. kingsleyae MODERN SPECIES 38 ENSPKIG00000001158 CPT1A (ENSPKIG00000001242) cars1 (ENSPKIG00000001391) nap1l4b (ENSPKIG00000001515) phlda2 (ENSPKIG00000001555) OSBPL5 (ENSPKIG00000001623) ENSPKIG00000001750 PTPN5 (ENSPKIG00000001814) dusp8a (ENSPKIG00000001877) MOB2 (ENSPKIG00000001948) kcnj11 (ENSPKIG00000001997) abcc8 (ENSPKIG00000002041) ush1c (ENSPKIG00000002131) OTOG (ENSPKIG00000002227) zgc:172145 (ENSPKIG00000002339) MYOD1 (ENSPKIG00000002354) ##22 TNNT3 (ENSPKIG00000002402) ENSPKIG00000002481 ENSPKIG00000002526 ENSPKIG00000002535 TNNI2 (ENSPKIG00000002556) TNNI2 (ENSPKIG00000002585) tnni2a.2 (ENSPKIG00000002613) TNNI2 (ENSPKIG00000002626) SYT8 (ENSPKIG00000002642) ENSPKIG00000002661 ctsd (ENSPKIG00000002678) ENSPKIG00000002707 DRD4 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ENSLLEG00000030032 Elephant shark MODERN SPECIES 1493 ENSCMIG00000013246 ENSCMIG00000013240 ENSCMIG00000013224 ENSCMIG00000013206 ENSCMIG00000013201 ENSCMIG00000013198 ENSCMIG00000013195 ENSCMIG00000013191 ENSCMIG00000013179 kcnj11 (ENSCMIG00000013178) abcc8 (ENSCMIG00000012502) ENSCMIG00000012071 ush1c (ENSCMIG00000012065) OTOG (ENSCMIG00000012027) zgc:172145 (ENSCMIG00000012006) myod1 (ENSCMIG00000012005) #22 ctsd (ENSCMIG00000011996) ENSCMIG00000011990 ENSCMIG00000011984 ENSCMIG00000011979 ENSCMIG00000011975 ENSCMIG00000011961 ENSCMIG00000011952 tnnt3a (ENSCMIG00000011947) gatd1 (ENSCMIG00000011899) taldo1 (ENSCMIG00000011878) EPS8L2 (ENSCMIG00000011869) ENSCMIG00000011858 ENSCMIG00000011856 syt7b (ENSCMIG00000011838) DAGLA (ENSCMIG00000011824) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES 760 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b #22 Hagfish MODERN SPECIES 1080 ENSEBUG00000004974 ENSEBUG00000014754 spon1a (ENSEBUG00000007462) ENSEBUG00000010027 ENSEBUG00000005353 ENSEBUG00000013199 ENSEBUG00000000768 ENSEBUG00000016756 ndufs3 (ENSEBUG00000002805) ENSEBUG00000010585 ENSEBUG00000004846 ENSEBUG00000014462 ENSEBUG00000009390 ENSEBUG00000015193 ENSEBUG00000010939 ENSEBUG00000007373 #22 ENSEBUG00000005797 ENSEBUG00000009577 ENSEBUG00000013518 ENSEBUG00000008274 ENSEBUG00000001026 ENSEBUG00000012516 ENSEBUG00000010957 ENSEBUG00000013329 taf8 (ENSEBUG00000007222) ENSEBUG00000010730 ENSEBUG00000011613 #23