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Guinea pig	MODERN SPECIES	90	PDXK (ENSCPOG00000039719) #7	CSTB (ENSCPOG00000031855) #8	RRP1 (ENSCPOG00000038986) #9	AGPAT3 (ENSCPOG00000032718) #10	TRAPPC10 (ENSCPOG00000011117) #11	PWP2 (ENSCPOG00000023616) #12	GATD3 (ENSCPOG00000011419) #13	DNMT3L (ENSCPOG00000004070) #14	AIRE (ENSCPOG00000019868) #15	PFKL (ENSCPOG00000019438) #16	CFAP410 (ENSCPOG00000009611) #17	TRPM2 (ENSCPOG00000023512) #18	LRRC3 (ENSCPOG00000030436) #19	PCP4 (ENSCPOG00000039173) #20	DSCAM (ENSCPOG00000005367) #21	BACE2 (ENSCPOG00000007403) #22	ENSCPOG00000025373 #23	ENSCPOG00000013108 #24	ENSCPOG00000021489 #25	ENSCPOG00000007052 #26	RIPK4 (ENSCPOG00000022900) #27	PRDM15 (ENSCPOG00000023446) #28	C2CD2 (ENSCPOG00000002808) #29	ZBTB21 (ENSCPOG00000019792) #30	UMODL1 (ENSCPOG00000023566) #31	ABCG1 (ENSCPOG00000015194) #32	ENSCPOG00000006226 #33	TFF2 (ENSCPOG00000012065) #34	TMPRSS3 (ENSCPOG00000012057) #35	UBASH3A (ENSCPOG00000013429) #36	RSPH1 (ENSCPOG00000002266) #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000154826 #8	ENSGT00390000011821.b #9	ENSGT00950000182836.b.b.b.a #10	ENSGT00390000003873 #11	ENSGT00550000074981 #12	ENSGT00390000003706.a.a #13	ENSGT00940000161590	ENSGT00940000162228 #14	ENSGT00940000161104 #15	ENSGT00940000159292 #16	ENSGT00390000018807 #17	ENSGT00940000156404 #18	ENSGT00940000154360.A.b #19	ENSGT00530000064267 #20	ENSGT00940000154678.a.a #21	ENSGT00940000159548 #22	ENSGT00950000183004.a.b.a.b #24	ENSGT00940000155686.n.b #23	ENSGT00940000155207.a.b #26	ENSGT00940000159908 #27	ENSGT00940000157890 #28	ENSGT00530000063764.a #29	ENSGT00940000161028 #30	ENSGT00940000159975 #31	ENSGT00940000160131 #32	ENSGT00940000162416 #33	ENSGT00940000161334 #34	ENSGT00940000162623	ENSGT00940000158589 #35	ENSGT00940000160841 #36	ENSGT00940000157240 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	114	PDE9A (ENSCLAG00000005531)	SLC37A1 (ENSCLAG00000006046)	RSPH1 (ENSCLAG00000005001) #37	UBASH3A (ENSCLAG00000005633) #36	TMPRSS3 (ENSCLAG00000006858) #35	TFF2 (ENSCLAG00000014359) #34	TFF3 (ENSCLAG00000013670) #33	ABCG1 (ENSCLAG00000013116) #32	UMODL1 (ENSCLAG00000009892) #31	ZBTB21 (ENSCLAG00000006530) #30	C2CD2 (ENSCLAG00000007896) #29	PRDM15 (ENSCLAG00000005430) #28	RIPK4 (ENSCLAG00000007447) #27	PCP4 (ENSCLAG00000012532) #20	DSCAM (ENSCLAG00000016317) #21	BACE2 (ENSCLAG00000006208) #22	ENSCLAG00000006920 #23	FAM3B (ENSCLAG00000005832) #24	TMPRSS2 (ENSCLAG00000006480) #26	LRRC3 (ENSCLAG00000006488) #19	TRPM2 (ENSCLAG00000007001) #18	CFAP410 (ENSCLAG00000005977) #17	PFKL (ENSCLAG00000006907) #16	AIRE (ENSCLAG00000004699) #15	DNMT3L (ENSCLAG00000008128) #14	ICOSLG (ENSCLAG00000004572)	GATD3 (ENSCLAG00000006863) #13	PWP2 (ENSCLAG00000009503) #12	TRAPPC10 (ENSCLAG00000004935) #11	AGPAT3 (ENSCLAG00000005641) #10	RRP1 (ENSCLAG00000011639) #9
Degu	MODERN SPECIES	86	PTTG1IP (ENSODEG00000013537)	ENSODEG00000013838	ENSODEG00000014012	ENSODEG00000013439	TSPEAR (ENSODEG00000013818)	PDXK (ENSODEG00000013386) #7	AGPAT3 (ENSODEG00000012787) #10	ENSODEG00000013648 #11	PWP2 (ENSODEG00000013073) #12	ENSODEG00000013954 #13	PFKL (ENSODEG00000014418) #16	CFAP410 (ENSODEG00000012840) #17	TRPM2 (ENSODEG00000013043) #18	LRRC3 (ENSODEG00000020091) #19	DSCAM (ENSODEG00000012858) #21	BACE2 (ENSODEG00000013570) #22	ENSODEG00000014232 #24	ENSODEG00000013917 #23	TMPRSS2 (ENSODEG00000013358) #26	RIPK4 (ENSODEG00000013779) #27	PRDM15 (ENSODEG00000013112) #28	C2CD2 (ENSODEG00000014616) #29	ZBTB21 (ENSODEG00000014325) #30	UMODL1 (ENSODEG00000012627) #31	ABCG1 (ENSODEG00000012323) #32	TFF3 (ENSODEG00000013636) #33	TFF2 (ENSODEG00000012650) #34	ENSODEG00000014901	TMPRSS3 (ENSODEG00000013031) #35	UBASH3A (ENSODEG00000013424) #36	RSPH1 (ENSODEG00000012910) #37