Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00440000039564.b	ENSGT00940000153362.a.hb.b	ENSGT00390000002417	ENSGT00960000192410	ENSGT00940000156622	ENSGT00530000063074.b.b	ENSGT00940000154980	ENSGT00940000157713	ENSGT00940000158014	ENSGT00940000155394	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00940000160698	ENSGT00940000159215 #20	ENSGT00950000182959.a.b.b.a #21	ENSGT00950000182959.a.a #22	ENSGT00940000153222.a.a #23	ENSGT00940000157479 #24	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b #25	ENSGT00390000006546 #26	ENSGT00530000063745.b #27	ENSGT00940000156144 #28	ENSGT00940000157277 #30	ENSGT00940000163725 #31	ENSGT00940000162858	ENSGT00940000158251 #33	ENSGT00950000182839.A.c #34	ENSGT00640000091574 #35	ENSGT00940000155352 #36	ENSGT00920000149095.b	ENSGT00500000044938
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018775.ab	ENSGT00440000039564.b	ENSGT00940000153362.a.hb.b	ENSGT00390000002417	ENSGT00940000156622	ENSGT00530000063074.b.b	ENSGT00940000154980	ENSGT00940000157713	ENSGT00940000158014	ENSGT00940000155394	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00940000160698	ENSGT00940000159215 #20	ENSGT00950000182959.a.b.b.a #21	ENSGT00950000182959.a.a #22	ENSGT00940000153222.a.a #23	ENSGT00940000157479 #24	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b #25	ENSGT00390000006546 #26	ENSGT00530000063745.b #27	ENSGT00940000156144 #28	ENSGT00940000157277 #30	ENSGT00940000163725 #31	ENSGT00940000162858	ENSGT00940000158251 #33	ENSGT00950000182839.A.c #34	ENSGT00640000091574 #35	ENSGT00940000155352 #36	ENSGT00390000009130.a.a.b.h	ENSGT00920000149095.b
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000018775.ab	ENSGT00440000039564.b	ENSGT00940000153362.a.hb.b	ENSGT00390000002417	ENSGT00940000156622	ENSGT00530000063074.b.b	ENSGT00940000154980	ENSGT00940000157713	ENSGT00940000158014	ENSGT00940000155394	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00940000160698	ENSGT00940000159215 #20	ENSGT00950000182959.a.b.b.a #21	ENSGT00950000182959.a.a #22	ENSGT00940000153222.a.a #23	ENSGT00940000157479 #24	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b #25	ENSGT00390000006546 #26	ENSGT00530000063745.b #27	ENSGT00940000156144 #28	ENSGT00940000157277 #30	ENSGT00940000163725 #31	ENSGT00940000163898 #32	ENSGT00940000158251 #33	ENSGT00950000182839.A.c #34	ENSGT00640000091574 #35	ENSGT00940000155352 #36	ENSGT00390000009130.a.a.b.h	ENSGT00920000149095.b
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	89														PTPRQ (ENSUPAG00010013494) #20	MYF6 (ENSUPAG00010013483) #21	MYF5 (ENSUPAG00010013472) #22	LIN7A (ENSUPAG00010013458) #23	ACSS3 (ENSUPAG00010013440) #24	PPFIA2 (ENSUPAG00010013381) #25	CCDC59 (ENSUPAG00010013356) #26	METTL25 (ENSUPAG00010013340) #27	TMTC2 (ENSUPAG00010013331) #28	ENSUPAG00010013316 #29	SLC6A15 (ENSUPAG00010013281) #30	TSPAN19 (ENSUPAG00010013269) #31	ENSUPAG00010013204 #32	ALX1 (ENSUPAG00010013178) #33	RASSF9 (ENSUPAG00010013163) #34	NTS (ENSUPAG00010013159) #35	MGAT4C (ENSUPAG00010013143) #36
Squirrel	MODERN SPECIES	298										SYT1 (ENSSTOG00000022817)	PAWR (ENSSTOG00000015765)	PPP1R12A (ENSSTOG00000011329)	OTOGL (ENSSTOG00000019523)	PTPRQ (ENSSTOG00000024058) #20	MYF6 (ENSSTOG00000015808) #21	MYF5 (ENSSTOG00000015810) #22	LIN7A (ENSSTOG00000015812) #23	ACSS3 (ENSSTOG00000013956) #24	PPFIA2 (ENSSTOG00000013971) #25
Alpin marmot	MODERN SPECIES	11	GLIPR1 (ENSMMMG00000002546)	KRR1 (ENSMMMG00000002493)	PHLDA1 (ENSMMMG00000002474)	ENSMMMG00000002289	BBS10 (ENSMMMG00000002273)	OSBPL8 (ENSMMMG00000002240)	ZDHHC17 (ENSMMMG00000002185)	ENSMMMG00000002164	E2F7 (ENSMMMG00000002119)	NAV3 (ENSMMMG00000002035)	SYT1 (ENSMMMG00000001991)	PPP1R12A (ENSMMMG00000001751)	OTOGL (ENSMMMG00000001599)	PTPRQ (ENSMMMG00000001485) #20	MYF6 (ENSMMMG00000001463) #21	MYF5 (ENSMMMG00000001446) #22	LIN7A (ENSMMMG00000001429) #23	ACSS3 (ENSMMMG00000001391) #24	PPFIA2 (ENSMMMG00000001244) #25	CCDC59 (ENSMMMG00000001213) #26	METTL25 (ENSMMMG00000001158) #27	TMTC2 (ENSMMMG00000001120) #28	ENSMMMG00000001090	SLC6A15 (ENSMMMG00000001050) #30	TSPAN19 (ENSMMMG00000001031) #31	LRRIQ1 (ENSMMMG00000000979)	ALX1 (ENSMMMG00000000949) #33	NTS (ENSMMMG00000000924) #35	MGAT4C (ENSMMMG00000000872) #36	ENSMMMG00000000843	ENSMMMG00000000830
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	14	NAP1L1 (ENSSVLG00005023160)	BBS10 (ENSSVLG00005023257)	ENSSVLG00005023266	OSBPL8 (ENSSVLG00005023307)	ZDHHC17 (ENSSVLG00005023480)	ENSSVLG00005023521	E2F7 (ENSSVLG00005023615)	ENSSVLG00005023728	NAV3 (ENSSVLG00005023837)	SYT1 (ENSSVLG00005024299)	PAWR (ENSSVLG00005024360)	PPP1R12A (ENSSVLG00005024407)	OTOGL (ENSSVLG00005024601)	PTPRQ (ENSSVLG00005025041) #20	MYF6 (ENSSVLG00005025222) #21	MYF5 (ENSSVLG00005025239) #22	LIN7A (ENSSVLG00005025250) #23	BLVRB (ENSSVLG00005025266)	ACSS3 (ENSSVLG00005000239) #24	PPFIA2 (ENSSVLG00005001201) #25	CCDC59 (ENSSVLG00005002316) #26	METTL25 (ENSSVLG00005002343) #27	TMTC2 (ENSSVLG00005002395) #28	SLC6A15 (ENSSVLG00005002476) #30	TSPAN19 (ENSSVLG00005002560) #31	LRRIQ1 (ENSSVLG00005002609)	ALX1 (ENSSVLG00005002747) #33	RASSF9 (ENSSVLG00005002780) #34	NTS (ENSSVLG00005002800) #35	MGAT4C (ENSSVLG00005002827) #36	ENSSVLG00005002860