Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000159850 ENSGT00940000166139 ENSGT00940000164634 ENSGT01100000266768 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b ENSGT00940000170114 ENSGT00950000183010.a.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000160973 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000159850 ENSGT00940000166139 ENSGT00940000164634 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b ENSGT00940000170114 ENSGT00950000183010.a.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 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ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 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Zbtb7c (ENSDORG00000002188) Smad2 (ENSDORG00000013015) Skor2 (ENSDORG00000012420) ENSDORG00000027748 Hdhd2 (ENSDORG00000012417) Katnal2 (ENSDORG00000005500) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 ENSGT00940000158788 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 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ATP5F1A (ENSSVLG00005016277) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT01030000236530 ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846.z Alpin marmot MODERN SPECIES 10 SMAD4 (ENSMMMG00000005628) ELAC1 (ENSMMMG00000005660) ME2 (ENSMMMG00000005680) MRO (ENSMMMG00000005705) MAPK4 (ENSMMMG00000005718) SKA1 (ENSMMMG00000005747) CXXC1 (ENSMMMG00000005766) MBD1 (ENSMMMG00000005802) CFAP53 (ENSMMMG00000005890) 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ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 126 ME2 (ENSUPAG00010015322) MRO (ENSUPAG00010015355) ENSUPAG00010015363 MAPK4 (ENSUPAG00010015372) SKA1 (ENSUPAG00010015379) CXXC1 (ENSUPAG00010015403) MBD1 (ENSUPAG00010015449) CFAP53 (ENSUPAG00010015532) MYO5B (ENSUPAG00010015539) ACAA2 (ENSUPAG00010015705) LIPG (ENSUPAG00010015731) ENSUPAG00010015756 C18orf32 (ENSUPAG00010015774) DYM (ENSUPAG00010015792) ENSUPAG00010015826 SMAD7 (ENSUPAG00010015842) #22 CTIF (ENSUPAG00010015848) #23 ZBTB7C (ENSUPAG00010015885) SMAD2 (ENSUPAG00010015902) Squirrel MODERN SPECIES 97 SMAD4 (ENSSTOG00000028580) ELAC1 (ENSSTOG00000010591) ME2 (ENSSTOG00000027218) MRO (ENSSTOG00000009940) MAPK4 (ENSSTOG00000022822) SKA1 (ENSSTOG00000003367) CXXC1 (ENSSTOG00000029092) MBD1 (ENSSTOG00000007780) CFAP53 (ENSSTOG00000007769) MYO5B (ENSSTOG00000019663) ACAA2 (ENSSTOG00000020792) LIPG (ENSSTOG00000016012) ENSSTOG00000005193 C18orf32 (ENSSTOG00000024071) DYM (ENSSTOG00000021838) SMAD7 (ENSSTOG00000020985) #22 CTIF (ENSSTOG00000001967) #23 ZBTB7C (ENSSTOG00000011681) ENSSTOG00000030530 SMAD2 (ENSSTOG00000003788) Primates ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741.s ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 ENSGT00940000158788 Bushbaby MODERN SPECIES 127 MEX3C (ENSOGAG00000030858) SMAD4 (ENSOGAG00000012081) ELAC1 (ENSOGAG00000012076) ME2 (ENSOGAG00000010482) MRO (ENSOGAG00000016668) MAPK4 (ENSOGAG00000016663) SKA1 (ENSOGAG00000016657) CXXC1 (ENSOGAG00000033715) MBD1 (ENSOGAG00000003784) ENSOGAG00000003781 MYO5B (ENSOGAG00000016529) ACAA2 (ENSOGAG00000016527) LIPG (ENSOGAG00000016524) ENSOGAG00000029213 DYM (ENSOGAG00000013935) SMAD7 (ENSOGAG00000013932) #22 CTIF (ENSOGAG00000013927) #23 ZBTB7C (ENSOGAG00000000444) SMAD2 (ENSOGAG00000000443) SKOR2 (ENSOGAG00000032696) IER3IP1 (ENSOGAG00000016626) HDHD2 (ENSOGAG00000016619) KATNAL2 (ENSOGAG00000016612) PIAS2 (ENSOGAG00000012636) ST8SIA5 (ENSOGAG00000012633) LOXHD1 (ENSOGAG00000012621) RNF165 (ENSOGAG00000025147) C18orf25 (ENSOGAG00000005093) HAUS1 (ENSOGAG00000005096) ENSOGAG00000026684 PSTPIP2 (ENSOGAG00000007141) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654.e ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741.s ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 ENSGT00940000158788 Mouse lemur MODERN SPECIES 10 ELAC1 (ENSMICG00000017524) ENSMICG00000017523 ENSMICG00000045071 MRO (ENSMICG00000008008) MAPK4 (ENSMICG00000015044) SKA1 (ENSMICG00000006429) CXXC1 (ENSMICG00000006424) MBD1 (ENSMICG00000006414) CFAP53 (ENSMICG00000006410) MYO5B (ENSMICG00000005287) ACAA2 (ENSMICG00000005278) LIPG (ENSMICG00000017104) ENSMICG00000017102 C18orf32 (ENSMICG00000042525) DYM (ENSMICG00000017535) SMAD7 (ENSMICG00000034183) #22 CTIF (ENSMICG00000010167) #23 ZBTB7C (ENSMICG00000038331) SMAD2 (ENSMICG00000007882) SKOR2 (ENSMICG00000031129) IER3IP1 (ENSMICG00000043887) HDHD2 (ENSMICG00000042121) KATNAL2 (ENSMICG00000007857) PIAS2 (ENSMICG00000013229) ST8SIA5 (ENSMICG00000013224) ENSMICG00000017500 LOXHD1 (ENSMICG00000001316) RNF165 (ENSMICG00000011741) C18orf25 (ENSMICG00000004834) HAUS1 (ENSMICG00000017501) ENSMICG00000028901 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654.e ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741.s ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 ENSGT00940000158788 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 262 ACAA2 (ENSPCOG00000021233) LIPG (ENSPCOG00000017489) ENSPCOG00000024759 C18orf32 (ENSPCOG00000028796) DYM (ENSPCOG00000010198) SMAD7 (ENSPCOG00000003237) #22 CTIF (ENSPCOG00000013391) #23 ZBTB7C (ENSPCOG00000019918) SMAD2 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(ENSPSMG00000018239) PIAS2 (ENSPSMG00000018197) ST8SIA5 (ENSPSMG00000018127) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Tarsier MODERN SPECIES 2494 ENSTSYG00000035286 #22 CTIF (ENSTSYG00000030461) #23 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 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ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167.g ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846.i Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b.o ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D.k ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT01100000265012 ENSGT00910000147179 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a 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ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167.g Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 155 ELAC1 (ENSMNEG00000034310) ME2 (ENSMNEG00000034912) MRO (ENSMNEG00000033026) ENSMNEG00000000269 MAPK4 (ENSMNEG00000038618) SKA1 (ENSMNEG00000029687) CXXC1 (ENSMNEG00000028715) MBD1 (ENSMNEG00000038822) CFAP53 (ENSMNEG00000015915) MYO5B (ENSMNEG00000033529) ACAA2 (ENSMNEG00000037789) LIPG (ENSMNEG00000043610) ENSMNEG00000035945 C18orf32 (ENSMNEG00000037414) DYM (ENSMNEG00000030545) SMAD7 (ENSMNEG00000039694) #22 CTIF (ENSMNEG00000039395) #23 ENSMNEG00000045230 ENSMNEG00000034460 ZBTB7C (ENSMNEG00000031886) SMAD2 (ENSMNEG00000037330) ENSMNEG00000038031 IER3IP1 (ENSMNEG00000030543) ENSMNEG00000038574 KATNAL2 (ENSMNEG00000029817) ENSMNEG00000040070 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 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(ENSPANG00000011894) MAPK4 (ENSPANG00000009483) SKA1 (ENSPANG00000030336) CXXC1 (ENSPANG00000009435) MBD1 (ENSPANG00000010867) MYO5B (ENSPANG00000022089) ACAA2 (ENSPANG00000002878) LIPG (ENSPANG00000024235) ENSPANG00000031295 C18orf32 (ENSPANG00000040941) ENSPANG00000037588 ENSPANG00000046129 SMAD7 (ENSPANG00000025519) #22 CTIF (ENSPANG00000017087) #23 ZBTB7C (ENSPANG00000016942) SMAD2 (ENSPANG00000025520) SKOR2 (ENSPANG00000017535) IER3IP1 (ENSPANG00000041314) HDHD2 (ENSPANG00000010312) ELOA2 (ENSPANG00000049945) KATNAL2 (ENSPANG00000017088) PIAS2 (ENSPANG00000016213) ST8SIA5 (ENSPANG00000024947) LOXHD1 (ENSPANG00000025288) RNF165 (ENSPANG00000025287) C18orf25 (ENSPANG00000006488) HAUS1 (ENSPANG00000029808) ATP5F1A (ENSPANG00000007341) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00950000183134.c.b.o ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.b.b.a.b ENSGT01020000230346.E.s.b.b ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT01100000264016 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.b.t.a ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167.g Drill MODERN SPECIES 1607 ME2 (ENSMLEG00000041492) MRO (ENSMLEG00000038700) MAPK4 (ENSMLEG00000031017) ENSMLEG00000039079 ENSMLEG00000026616 SKA1 (ENSMLEG00000030498) CXXC1 (ENSMLEG00000032181) MBD1 (ENSMLEG00000043121) CFAP53 (ENSMLEG00000010151) MYO5B (ENSMLEG00000030497) ACAA2 (ENSMLEG00000035935) LIPG (ENSMLEG00000028146) RPL17 (ENSMLEG00000041470) C18orf32 (ENSMLEG00000042407) DYM (ENSMLEG00000036447) ENSMLEG00000038861 #22 CTIF (ENSMLEG00000041132) #23 ENSMLEG00000037738 ENSMLEG00000038973 ZBTB7C (ENSMLEG00000034896) SMAD2 (ENSMLEG00000037596) ENSMLEG00000040989 Sooty mangabey MODERN SPECIES 190 MAPK4 (ENSCATG00000016401) ENSCATG00000017689 ENSCATG00000033940 SKA1 (ENSCATG00000039979) CXXC1 (ENSCATG00000035708) MBD1 (ENSCATG00000029959) CFAP53 (ENSCATG00000026928) MYO5B (ENSCATG00000038137) ACAA2 (ENSCATG00000031450) LIPG (ENSCATG00000033603) ENSCATG00000043658 ENSCATG00000037257 ENSCATG00000018328 DYM (ENSCATG00000031272) ENSCATG00000037245 SMAD7 (ENSCATG00000037681) #22 CTIF (ENSCATG00000038134) #23 ENSCATG00000045052 ENSCATG00000005038 ZBTB7C (ENSCATG00000044413) SMAD2 (ENSCATG00000003842) SKOR2 (ENSCATG00000035815) IER3IP1 (ENSCATG00000035811) HDHD2 (ENSCATG00000035277) KATNAL2 (ENSCATG00000037094) ELOA2 (ENSCATG00000032113) PIAS2 (ENSCATG00000034031) ST8SIA5 (ENSCATG00000030338) LOXHD1 (ENSCATG00000036618) RNF165 (ENSCATG00000037696) C18orf25 (ENSCATG00000039068) Vervet Monkey MODERN SPECIES 9 ELAC1 (ENSCSAG00000018090) ME2 (ENSCSAG00000018086) MRO (ENSCSAG00000018082) MAPK4 (ENSCSAG00000018078) ENSCSAG00000018568 SKA1 (ENSCSAG00000018076) CXXC1 (ENSCSAG00000018072) MBD1 (ENSCSAG00000018070) CFAP53 (ENSCSAG00000018065) MYO5B (ENSCSAG00000018060) ACAA2 (ENSCSAG00000018054) LIPG (ENSCSAG00000018043) C18orf32 (ENSCSAG00000018029) DYM (ENSCSAG00000018028) ENSCSAG00000018569 SMAD7 (ENSCSAG00000018024) #22 CTIF (ENSCSAG00000018021) #23 ZBTB7C (ENSCSAG00000018018) SMAD2 (ENSCSAG00000018016) SKOR2 (ENSCSAG00000018012) IER3IP1 (ENSCSAG00000018009) HDHD2 (ENSCSAG00000018007) KATNAL2 (ENSCSAG00000018001) ELOA2 (ENSCSAG00000018570) PIAS2 (ENSCSAG00000017995) ST8SIA5 (ENSCSAG00000017993) LOXHD1 (ENSCSAG00000017984) RNF165 (ENSCSAG00000017974) C18orf25 (ENSCSAG00000017972) HAUS1 (ENSCSAG00000017970) ATP5F1A (ENSCSAG00000017968) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 805 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00950000185441 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 869 ENSRROG00000043502 #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2308 SMAD7 (ENSRBIG00000037910) #22 CTIF (ENSRBIG00000043937) #23 ENSRBIG00000044548 ENSRBIG00000024942 ENSRBIG00000035449 ZBTB7C (ENSRBIG00000028717) ZP4 (ENSRBIG00000042352) RYR2 (ENSRBIG00000027513) MTR (ENSRBIG00000034565) ACTN2 (ENSRBIG00000038349) ENSRBIG00000043115 HEATR1 (ENSRBIG00000039995) LGALS8 (ENSRBIG00000041075) EDARADD (ENSRBIG00000039820) ENSRBIG00000026836 ERO1B (ENSRBIG00000043925) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654.c ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b 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Carnivora ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT01030000240358 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Felidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 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(ENSAMEG00000023574) HDHD2 (ENSAMEG00000012799) KATNAL2 (ENSAMEG00000012794) PIAS2 (ENSAMEG00000012748) LOXHD1 (ENSAMEG00000012676) RNF165 (ENSAMEG00000012667) C18orf25 (ENSAMEG00000012662) ENSAMEG00000025621 HAUS1 (ENSAMEG00000012644) ATP5F1A (ENSAMEG00000012614) PSTPIP2 (ENSAMEG00000012579) Ursus ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.d ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846.bb.b ENSGT00940000158788 ENSGT00390000007354 Polar bear MODERN SPECIES 96 MEX3C (ENSUMAG00000003137) SMAD4 (ENSUMAG00000003120) ELAC1 (ENSUMAG00000003132) ME2 (ENSUMAG00000003096) MRO (ENSUMAG00000003055) MAPK4 (ENSUMAG00000003042) SKA1 (ENSUMAG00000003034) CXXC1 (ENSUMAG00000003014) MBD1 (ENSUMAG00000002947) MYO5B (ENSUMAG00000002812) ACAA2 (ENSUMAG00000002792) LIPG (ENSUMAG00000002779) ENSUMAG00000002766 C18orf32 (ENSUMAG00000002755) DYM (ENSUMAG00000002750) ENSUMAG00000002746 #22 CTIF (ENSUMAG00000002735) #23 ZBTB7C (ENSUMAG00000002721) SMAD2 (ENSUMAG00000002720) IER3IP1 (ENSUMAG00000002717) HDHD2 (ENSUMAG00000002716) KATNAL2 (ENSUMAG00000002674) PIAS2 (ENSUMAG00000002661) ST8SIA5 (ENSUMAG00000002618) LOXHD1 (ENSUMAG00000002413) RNF165 (ENSUMAG00000002386) C18orf25 (ENSUMAG00000002382) HAUS1 (ENSUMAG00000002378) ATP5F1A (ENSUMAG00000002375) PSTPIP2 (ENSUMAG00000002367) EPG5 (ENSUMAG00000002362) American black bear MODERN SPECIES 3715 SMAD7 (ENSUAMG00000021020) #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 24 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ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT01030000240358 ENSGT00390000006029 Donkey MODERN SPECIES 27 MEX3C (ENSEASG00005032865) SMAD4 (ENSEASG00005003805) ELAC1 (ENSEASG00005003810) ME2 (ENSEASG00005003813) MRO (ENSEASG00005003818) MAPK4 (ENSEASG00005003821) SKA1 (ENSEASG00005033486) CXXC1 (ENSEASG00005003826) ENSEASG00005003857 MYO5B (ENSEASG00005004025) ACAA2 (ENSEASG00005005395) LIPG (ENSEASG00005005399) ENSEASG00005025626 ENSEASG00005031152 DYM (ENSEASG00005015845) SMAD7 (ENSEASG00005016092) #22 CTIF (ENSEASG00005016094) #23 ZBTB7C (ENSEASG00005016097) SMAD2 (ENSEASG00005016099) SKOR2 (ENSEASG00005016101) IER3IP1 (ENSEASG00005037358) HDHD2 (ENSEASG00005016104) 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#23 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 10 MEX3C (ENSRFEG00010016751) SMAD4 (ENSRFEG00010016623) ELAC1 (ENSRFEG00010016582) ME2 (ENSRFEG00010016375) MRO (ENSRFEG00010016266) MAPK4 (ENSRFEG00010016193) SKA1 (ENSRFEG00010015982) CXXC1 (ENSRFEG00010015320) MBD1 (ENSRFEG00010015077) CFAP53 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(ENSSSCG00000004499) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D 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Pecora ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Yarkand deer MODERN SPECIES 19 MEX3C (ENSCHYG00000025999) SMAD4 (ENSCHYG00000026027) ELAC1 (ENSCHYG00000026085) ME2 (ENSCHYG00000026116) MRO (ENSCHYG00000026169) MAPK4 (ENSCHYG00000026191) SKA1 (ENSCHYG00000026215) CXXC1 (ENSCHYG00000026245) ENSCHYG00000026350 MYO5B (ENSCHYG00000026574) ACAA2 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ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642.b ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b.m ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846.ab.a Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 15 MEX3C (ENSOARG00020016147) SMAD4 (ENSOARG00020016034) ELAC1 (ENSOARG00020015975) ME2 (ENSOARG00020015563) MRO (ENSOARG00020015446) MAPK4 (ENSOARG00020015369) SKA1 (ENSOARG00020015277) ENSOARG00020013652 MYO5B (ENSOARG00020012171) ACAA2 (ENSOARG00020011796) LIPG (ENSOARG00020011622) RPL17 (ENSOARG00020011339) C18orf32 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ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846.ab ENSGT00940000158788 Wild yak MODERN SPECIES 21 MYO5B (ENSBMUG00000013378) ACAA2 (ENSBMUG00000013306) LIPG (ENSBMUG00000013263) DYM (ENSBMUG00000013185) SMAD7 (ENSBMUG00000013143) #22 CTIF (ENSBMUG00000013125) #23 ENSBMUG00000013104 Domestic yak MODERN SPECIES 13 SMAD4 (ENSBGRG00000024537) ELAC1 (ENSBGRG00000024517) ME2 (ENSBGRG00000024333) MRO (ENSBGRG00000024247) MAPK4 (ENSBGRG00000024208) SKA1 (ENSBGRG00000024086) CXXC1 (ENSBGRG00000023942) MBD1 (ENSBGRG00000023527) ENSBGRG00000023396 ENSBGRG00000023371 ACAA2 (ENSBGRG00000023212) LIPG (ENSBGRG00000023098) ENSBGRG00000022965 ENSBGRG00000022927 DYM (ENSBGRG00000022704) SMAD7 (ENSBGRG00000022643) #22 ENSBGRG00000022591 CTIF (ENSBGRG00000022473) #23 ZBTB7C (ENSBGRG00000022372) SMAD2 (ENSBGRG00000022238) 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LOXHD1 (ENSMMSG00000007604) RNF165 (ENSMMSG00000011227) C18orf25 (ENSMMSG00000011290) HAUS1 (ENSMMSG00000011347) ATP5F1A (ENSMMSG00000011430) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01000000220806 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 Blue whale MODERN SPECIES 5 ELAC1 (ENSBMSG00010009858) ME2 (ENSBMSG00010009846) MRO (ENSBMSG00010009824) ENSBMSG00010009805 ENSBMSG00010009796 SKA1 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ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01000000220806 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 Dolphin MODERN SPECIES 380 SMAD7 (ENSTTRG00000004362) #22 CTIF (ENSTTRG00000004347) #23 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654.i ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741.k ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01000000220806 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Vaquita MODERN SPECIES 5 ELAC1 (ENSPSNG00000008066) ME2 (ENSPSNG00000008129) MRO (ENSPSNG00000008257) ENSPSNG00000008320 SKA1 (ENSPSNG00000008361) CXXC1 (ENSPSNG00000008435) MBD1 (ENSPSNG00000008606) CFAP53 (ENSPSNG00000008868) MYO5B (ENSPSNG00000008965) ENSPSNG00000009066 ACAA2 (ENSPSNG00000009112) LIPG (ENSPSNG00000009216) ENSPSNG00000009327 ENSPSNG00000009445 DYM (ENSPSNG00000009515) ENSPSNG00000009632 #22 ENSPSNG00000009707 CTIF (ENSPSNG00000009732) #23 ZBTB7C (ENSPSNG00000009825) SMAD2 (ENSPSNG00000009901) SKOR2 (ENSPSNG00000010229) IER3IP1 (ENSPSNG00000010315) HDHD2 (ENSPSNG00000010382) KATNAL2 (ENSPSNG00000010440) ENSPSNG00000010683 PIAS2 (ENSPSNG00000010743) ST8SIA5 (ENSPSNG00000010902) LOXHD1 (ENSPSNG00000011419) RNF165 (ENSPSNG00000013772) C18orf25 (ENSPSNG00000013977) HAUS1 (ENSPSNG00000014089) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654.j ENSGT00990000210587 ENSGT00390000011654.i ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000169764 ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00390000018741.k ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00390000008808.k.a.a ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01000000220806 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 Beluga whale MODERN SPECIES 25 ME2 (ENSDLEG00000004409) MRO (ENSDLEG00000004425) MAPK4 (ENSDLEG00000004428) ENSDLEG00000004434 ENSDLEG00000004437 CXXC1 (ENSDLEG00000004445) MBD1 (ENSDLEG00000004462) CFAP53 (ENSDLEG00000004488) MYO5B (ENSDLEG00000004517) ACAA2 (ENSDLEG00000004552) ENSDLEG00000004561 LIPG (ENSDLEG00000004571) ENSDLEG00000004581 CUNH18orf32 (ENSDLEG00000004598) DYM (ENSDLEG00000004613) SMAD7 (ENSDLEG00000004642) #22 ENSDLEG00000004646 CTIF (ENSDLEG00000004651) #23 ZBTB7C (ENSDLEG00000006486) SMAD2 (ENSDLEG00000006490) Narwhal MODERN SPECIES 295 ENSMMNG00015000436 MEX3C (ENSMMNG00015000471) SMAD4 (ENSMMNG00015000527) ELAC1 (ENSMMNG00015000560) ME2 (ENSMMNG00015000602) MRO (ENSMMNG00015000680) ENSMMNG00015000706 ENSMMNG00015000736 ACAA2 (ENSMMNG00015000776) ENSMMNG00015000802 LIPG (ENSMMNG00015000826) ENSMMNG00015000862 ENSMMNG00015000947 DYM (ENSMMNG00015001014) ENSMMNG00015001110 SMAD7 (ENSMMNG00015001136) #22 ENSMMNG00015001156 CTIF (ENSMMNG00015001193) #23 ZBTB7C (ENSMMNG00015001274) SMAD2 (ENSMMNG00015001331) SKOR2 (ENSMMNG00015001428) ENSMMNG00015001451 HDHD2 (ENSMMNG00015001468) KATNAL2 (ENSMMNG00015001513) ENSMMNG00015001565 PIAS2 (ENSMMNG00015001607) ST8SIA5 (ENSMMNG00015001685) LOXHD1 (ENSMMNG00015002006) RNF165 (ENSMMNG00015002686) C18orf25 (ENSMMNG00015002704) HAUS1 (ENSMMNG00015002726) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1147 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 Armadillo MODERN SPECIES 2302 KDELR3 (ENSDNOG00000023846) KCNJ4 (ENSDNOG00000010402) CSNK1E (ENSDNOG00000035425) TMEM184B (ENSDNOG00000045612) PLA2G6 (ENSDNOG00000024817) BAIAP2L2 (ENSDNOG00000024549) ENSDNOG00000049001 PICK1 (ENSDNOG00000044540) SOX10 (ENSDNOG00000044459) POLR2F (ENSDNOG00000005884) C22orf23 (ENSDNOG00000042358) MICALL1 (ENSDNOG00000008467) EIF3L (ENSDNOG00000047382) ENSDNOG00000034176 ENSDNOG00000015624 SMAD7 (ENSDNOG00000047206) #22 CTIF (ENSDNOG00000037310) #23 ZBTB7C (ENSDNOG00000045505) ENSDNOG00000037675 ENSDNOG00000045395 SMAD2 (ENSDNOG00000009315) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Tenrec MODERN SPECIES 513 SMAD7 (ENSETEG00000001041) #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00390000011654 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Hyrax MODERN SPECIES 11338 SMAD7 (ENSPCAG00000015115) #22 Elephant MODERN SPECIES 375 ELAC1 (ENSLAFG00000001538) ME2 (ENSLAFG00000001536) MRO (ENSLAFG00000013029) MAPK4 (ENSLAFG00000013022) ENSLAFG00000026060 SKA1 (ENSLAFG00000005238) CXXC1 (ENSLAFG00000030706) MBD1 (ENSLAFG00000031328) ENSLAFG00000015611 MYO5B (ENSLAFG00000015591) ACAA2 (ENSLAFG00000022796) LIPG (ENSLAFG00000003595) RPL17 (ENSLAFG00000005569) C18orf32 (ENSLAFG00000021351) DYM (ENSLAFG00000017747) SMAD7 (ENSLAFG00000008013) #22 CTIF (ENSLAFG00000016335) #23 ZBTB7C (ENSLAFG00000003436) SMAD2 (ENSLAFG00000000143) SKOR2 (ENSLAFG00000020778) HDHD2 (ENSLAFG00000004419) KATNAL2 (ENSLAFG00000004417) PIAS2 (ENSLAFG00000018135) ST8SIA5 (ENSLAFG00000010716) LOXHD1 (ENSLAFG00000008500) ENSLAFG00000030824 ENSLAFG00000008497 C18orf25 (ENSLAFG00000013703) ENSLAFG00000010897 ENSLAFG00000031983 ATP5F1A (ENSLAFG00000014779) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160973 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00940000166139 ENSGT00940000164634 ENSGT01070000254624 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846.e ENSGT00940000158788 Opossum MODERN SPECIES 2 ENSMODG00000037484 ENSMODG00000003833 MAPK4 (ENSMODG00000003819) ENSMODG00000003805 ENSMODG00000003795 ENSMODG00000003773 ENSMODG00000043831 MYO5B (ENSMODG00000003753) ACAA2 (ENSMODG00000003595) ENSMODG00000039010 LIPG (ENSMODG00000003564) ENSMODG00000003534 C18orf32 (ENSMODG00000003518) ENSMODG00000050373 DYM (ENSMODG00000003506) SMAD7 (ENSMODG00000039523) #22 CTIF (ENSMODG00000003464) #23 ENSMODG00000046916 ZBTB7C (ENSMODG00000003412) ENSMODG00000042470 SMAD2 (ENSMODG00000003393) SKOR2 (ENSMODG00000003381) IER3IP1 (ENSMODG00000037588) HDHD2 (ENSMODG00000044379) KATNAL2 (ENSMODG00000003358) ENSMODG00000003324 ENSMODG00000048012 ST8SIA5 (ENSMODG00000003305) LOXHD1 (ENSMODG00000003285) RNF165 (ENSMODG00000003260) ENSMODG00000043074 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160973 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00940000166139 ENSGT00940000164634 ENSGT01070000254624 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846.e ENSGT00940000158788 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000161642 ENSGT00940000159850 ENSGT00940000166139 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SPECIES 1 ENSGT00940000158867 ENSGT00940000160973.h ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000159850 ENSGT00940000166139 ENSGT00940000164634 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158867 ENSGT00940000160973.h ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000159850 ENSGT00940000166139 ENSGT00940000164634 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b 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ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b Mainland tiger snake MODERN SPECIES 15 MEX3C (ENSNSUG00000013103) SMAD4 (ENSNSUG00000013101) ELAC1 (ENSNSUG00000013099) ME2 (ENSNSUG00000013096) MAPK4 (ENSNSUG00000013095) ENSNSUG00000013094 ENSNSUG00000013093 ENSNSUG00000013092 ENSNSUG00000013091 ENSNSUG00000013090 ACAA2 (ENSNSUG00000013087) LIPG (ENSNSUG00000012949) ENSNSUG00000012945 C18orf32 (ENSNSUG00000012944) DYM (ENSNSUG00000012943) SMAD7 (ENSNSUG00000012942) #22 CTIF (ENSNSUG00000012893) #23 ENSNSUG00000012891 Eastern brown snake MODERN SPECIES 2 DCC (ENSPTXG00000017825) MEX3C (ENSPTXG00000017824) SMAD4 (ENSPTXG00000017823) ELAC1 (ENSPTXG00000017822) ME2 (ENSPTXG00000017821) MAPK4 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tuatara MODERN SPECIES 631 SMAD7 (ENSSPUG00000015295) #22 CTIF (ENSSPUG00000014734) #23 ENSSPUG00000014650 ZBTB7C (ENSSPUG00000014644) ENSSPUG00000014624 HDHD2 (ENSSPUG00000014604) KATNAL2 (ENSSPUG00000014578) PIAS2 (ENSSPUG00000014552) ENSSPUG00000014537 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158867 ENSGT00940000160973 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000159850 ENSGT00940000166139 ENSGT00940000164634 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 ENSGT00940000158788 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 9 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(ENSACCG00020016656) ACAA2 (ENSACCG00020016573) LIPG (ENSACCG00020016557) RPL17 (ENSACCG00020016537) C18orf32 (ENSACCG00020016535) DYM (ENSACCG00020016531) SMAD7 (ENSACCG00020016530) #22 CTIF (ENSACCG00020016528) #23 ZBTB7C (ENSACCG00020016526) SMAD2 (ENSACCG00020016518) SKOR2 (ENSACCG00020016513) IER3IP1 (ENSACCG00020016510) HDHD2 (ENSACCG00020016506) KATNAL2 (ENSACCG00020016503) PIAS2 (ENSACCG00020016500) ENSACCG00020016495 ST8SIA5 (ENSACCG00020016492) LOXHD1 (ENSACCG00020016482) RNF165 (ENSACCG00020016454) ENSACCG00020016448 C18orf25 (ENSACCG00020016442) HAUS1 (ENSACCG00020016407) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158867 ENSGT00940000160973 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000159850 ENSGT00940000166139 ENSGT00940000164634 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a.d ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846.eb.b ENSGT00940000158788 Phasianidae DUPLICATION Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156170.b ENSGT00940000156873.f ENSGT00940000160524 ENSGT00390000018044.b.a ENSGT00940000154437.ad.b ENSGT00390000015600.c.b ENSGT00940000154470.a ENSGT00940000162144 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000159146 ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872.k #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a.d.a.b ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167.a ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846.eb.b ENSGT00940000158788 Japanese quail MODERN SPECIES 699 TXNL1 (ENSCJPG00005004863) NEDD4L (ENSCJPG00005004869) ALPK2 (ENSCJPG00005004887) MALT1 (ENSCJPG00005004888) ZNF532 (ENSCJPG00005004899) SEC11C (ENSCJPG00005004904) GRP (ENSCJPG00005004907) RAX (ENSCJPG00005004909) CPLX4 (ENSCJPG00005004910) LMAN1 (ENSCJPG00005004911) ACAA2 (ENSCJPG00005004912) LIPG (ENSCJPG00005004913) ENSCJPG00005004917 C18orf32 (ENSCJPG00005004922) DYM (ENSCJPG00005004924) SMAD7 (ENSCJPG00005004928) #22 CTIF (ENSCJPG00005004929) #23 ZBTB7C (ENSCJPG00005004933) SMAD2 (ENSCJPG00005004935) SKOR2 (ENSCJPG00005004937) IER3IP1 (ENSCJPG00005004943) HDHD2 (ENSCJPG00005004947) KATNAL2 (ENSCJPG00005004948) PIAS2 (ENSCJPG00005004954) ST8SIA5 (ENSCJPG00005005152) LOXHD1 (ENSCJPG00005005160) RNF165 (ENSCJPG00005005197) C18orf25 (ENSCJPG00005005205) HAUS1 (ENSCJPG00005005206) ATP5F1A (ENSCJPG00005005208) PSTPIP2 (ENSCJPG00005005209) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 5 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ENSGALG00010012316 SMAD7B (ENSGALG00010012323) #22 ENSGALG00010012332 ENSGALG00010012336 ENSGALG00010012342 ENSGALG00010012348 ENSGALG00010012357 ENSGALG00010012370 ENSGALG00010012380 ENSGALG00010012393 ENSGALG00010012437 ENSGALG00010012459 ENSGALG00010012463 ENSGALG00010012464 ENSGALG00010012467 ENSGALG00010012519 ENSGALG00010012547 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000160973 ENSGT00940000157435 ENSGT00730000111224 ENSGT00950000183134.c.b ENSGT00940000159850 ENSGT01030000234969 ENSGT00940000166139 ENSGT00940000164634 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a.c ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846.eb.b ENSGT00940000158788 Pink-footed goose MODERN SPECIES 457 SMAD7 (ENSABRG00000001503) #22 CTIF (ENSABRG00000001480) #23 Duck MODERN SPECIES 4281 MEX3C (ENSAPLG00000003916) SMAD4 (ENSAPLG00000003924) ELAC1 (ENSAPLG00000007218) ME2 (ENSAPLG00000004164) MAPK4 (ENSAPLG00000004651) ENSAPLG00000004736 ENSAPLG00000004971 ENSAPLG00000005297 MYO5B (ENSAPLG00000005427) ACAA2 (ENSAPLG00000006058) LIPG (ENSAPLG00000008809) ENSAPLG00000008451 C18orf32 (ENSAPLG00000017090) DYM (ENSAPLG00000007759) ENSAPLG00000022343 SMAD7 (ENSAPLG00000001268) #22 CTIF (ENSAPLG00000014486) #23 ZBTB7C (ENSAPLG00000016660) SMAD2 (ENSAPLG00000004964) SKOR2 (ENSAPLG00000022487) IER3IP1 (ENSAPLG00000018295) HDHD2 (ENSAPLG00000004974) KATNAL2 (ENSAPLG00000005005) PIAS2 (ENSAPLG00000005190) ENSAPLG00000022068 ST8SIA5 (ENSAPLG00000011069) LOXHD1 (ENSAPLG00000010718) ENSAPLG00000018736 RNF165 (ENSAPLG00000006619) C18orf25 (ENSAPLG00000017723) HAUS1 (ENSAPLG00000011232) Anura ANCESTRAL SPECIES 158 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ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc ENSGT00950000183161.a.b Greater amberjack MODERN SPECIES 140 cplx4a (ENSSDUG00000016619) rx3 (ENSSDUG00000016611) ENSSDUG00000016602 ZNF532 (ENSSDUG00000016581) ENSSDUG00000016553 ENSSDUG00000016544 NEDD4L (ENSSDUG00000016405) prlra (ENSSDUG00000016376) agxt2 (ENSSDUG00000016303) agxt2 (ENSSDUG00000016272) dnajc21 (ENSSDUG00000016254) bxdc2 (ENSSDUG00000016234) rad1 (ENSSDUG00000016212) C18orf32 (ENSSDUG00000016201) DYM (ENSSDUG00000016160) smad7 (ENSSDUG00000016143) #22 CTIF (ENSSDUG00000016033) #23 ZBTB7C (ENSSDUG00000015994) S1PR3 (ENSSDUG00000015985) SHC3 (ENSSDUG00000015933) SEMA4D (ENSSDUG00000015908) add1 (ENSSDUG00000015861) nop14 (ENSSDUG00000015804) SNCA (ENSSDUG00000015777) klf4 (ENSSDUG00000015764) RAD23B (ENSSDUG00000015720) ZNF462 (ENSSDUG00000015700) TMEM38B (ENSSDUG00000015691) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2993 lman1 (ENSSLDG00000006402) cplx4a (ENSSLDG00000006459) rx3 (ENSSLDG00000006470) ENSSLDG00000006484 ZNF532 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ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000159594 ENSGT00940000158581 ENSGT00390000017459 ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000156229 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc ENSGT00950000183161.a.b Tongue sole MODERN SPECIES 5 lman1 (ENSCSEG00000019669) cplx4a (ENSCSEG00000019682) rx3 (ENSCSEG00000019689) ENSCSEG00000019692 ZNF532 (ENSCSEG00000019696) ENSCSEG00000019710 ENSCSEG00000019715 NEDD4L (ENSCSEG00000019723) prlra (ENSCSEG00000019808) agxt2 (ENSCSEG00000019812) dnajc21 (ENSCSEG00000019817) bxdc2 (ENSCSEG00000019821) rad1 (ENSCSEG00000019829) C18orf32 (ENSCSEG00000019834) DYM (ENSCSEG00000019838) smad7 (ENSCSEG00000019851) #22 CTIF (ENSCSEG00000019857) #23 ZBTB7C (ENSCSEG00000019864) S1PR3 (ENSCSEG00000019866) SHC3 (ENSCSEG00000019867) SEMA4D (ENSCSEG00000019873) add1 (ENSCSEG00000019880) nop14 (ENSCSEG00000019893) ENSCSEG00000019908 klf4 (ENSCSEG00000019913) ENSCSEG00000019917 dusp4 (ENSCSEG00000019921) ENSCSEG00000019922 ENSCSEG00000019929 slc26a1 (ENSCSEG00000019933) paqr3b (ENSCSEG00000019938) Turbot MODERN SPECIES 7 lman1 (ENSSMAG00000006326) cplx4a (ENSSMAG00000006319) rx3 (ENSSMAG00000006310) ENSSMAG00000006298 ENSSMAG00000006266 ENSSMAG00000006255 ENSSMAG00000006244 ENSSMAG00000006019 prlra (ENSSMAG00000005991) agxt2 (ENSSMAG00000005959) dnajc21 (ENSSMAG00000005935) ENSSMAG00000005909 ENSSMAG00000005887 C18orf32 (ENSSMAG00000005879) DYM (ENSSMAG00000005831) smad7 (ENSSMAG00000005816) #22 CTIF (ENSSMAG00000005707) #23 ZBTB7C (ENSSMAG00000005692) S1PR3 (ENSSMAG00000005684) ENSSMAG00000005630 SEMA4D (ENSSMAG00000005595) ENSSMAG00000005455 ENSSMAG00000005394 ENSSMAG00000005378 klf4 (ENSSMAG00000005364) RAD23B (ENSSMAG00000005335) ZNF462 (ENSSMAG00000024653) TMEM38B (ENSSMAG00000005314) ENSSMAG00000022201 ENSSMAG00000005273 PRRC2B (ENSSMAG00000005244) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000166467 ENSGT00650000094838 ENSGT00940000154437 ENSGT00530000063340 ENSGT00940000160524 ENSGT00940000156873 ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156125.h.b ENSGT00940000156125.h.a ENSGT00510000047097 ENSGT00390000014467 ENSGT00500000044913 ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000159594 ENSGT00940000158581 ENSGT00390000017459 ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000156229 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00560000078707 ENSGT00940000159244.b ENSGT00390000018059.a ENSGT00940000157147.c.b ENSGT00950000183161.a.b ENSGT00390000008519.lc ENSGT00940000157066.p ENSGT00940000156026.e.d ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000156411 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156229 ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00390000017459 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000159594 ENSGT00940000158581 ENSGT00390000018741 ENSGT00500000044913 ENSGT00390000014467 ENSGT00510000047097 ENSGT00940000156125.g ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156873 ENSGT00940000160524 ENSGT00530000063340 Fugu MODERN SPECIES 18 PRRC2B (ENSTRUG00000007589) fam78ab (ENSTRUG00000032625) PLPP7 (ENSTRUG00000008404) ENSTRUG00000027641 edf1 (ENSTRUG00000008728) PRAG1 (ENSTRUG00000022632) ENSTRUG00000008858 TMEM38B (ENSTRUG00000008873) ENSTRUG00000026785 ZNF462 (ENSTRUG00000009094) RAD23B (ENSTRUG00000009265) klf4 (ENSTRUG00000009613) SNCA (ENSTRUG00000009668) nop14 (ENSTRUG00000009735) DYM (ENSTRUG00000009986) smad7 (ENSTRUG00000010212) #22 CTIF (ENSTRUG00000029992) #23 ENSTRUG00000024280 ZBTB7C (ENSTRUG00000024387) S1PR3 (ENSTRUG00000010370) SHC3 (ENSTRUG00000010389) SEMA4D (ENSTRUG00000010805) add1 (ENSTRUG00000011011) ENSTRUG00000011332 rad1 (ENSTRUG00000027142) bxdc2 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Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000166467 ENSGT00650000094838 ENSGT00940000154437 ENSGT00530000063340 ENSGT00940000160524 ENSGT00940000156873 ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156125.h.b ENSGT00940000156125.h.a ENSGT00510000047097 ENSGT00390000014467 ENSGT00500000044913 ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000159594 ENSGT00940000158581 ENSGT00390000017459 ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000156229 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc Ballan wrasse MODERN SPECIES 189 cplx4a (ENSLBEG00000017489) rx3 (ENSLBEG00000017507) ENSLBEG00000017519 ZNF532 (ENSLBEG00000017544) ENSLBEG00000017601 ENSLBEG00000017633 NEDD4L (ENSLBEG00000017685) prlra (ENSLBEG00000017756) agxt2 (ENSLBEG00000017854) agxt2 (ENSLBEG00000017922) 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ENSGT00940000156229 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000166467 ENSGT00650000094838 ENSGT00940000154437 ENSGT00530000063340 ENSGT00940000160524 ENSGT00940000156873 ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156125.h.b ENSGT00940000156125.h.a ENSGT00510000047097 ENSGT00390000014467 ENSGT00500000044913 ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000159594 ENSGT00940000158581 ENSGT00390000017459 ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000156229 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc ENSGT00950000183161.a.b Gilthead seabream MODERN SPECIES 3 surf1 (ENSSAUG00010014005) ENSSAUG00010014001 RPL7A (ENSSAUG00010013978) usp20 (ENSSAUG00010013702) ptges 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ENSGT00510000047097 ENSGT00390000014467 ENSGT00500000044913 ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000159594 ENSGT00940000158581 ENSGT00390000017459 ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000156229 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc ENSGT00950000183161.a.b Large yellow croaker MODERN SPECIES 4 cplx4a (ENSLCRG00005004891) rx3 (ENSLCRG00005004890) ENSLCRG00005004889 ZNF532 (ENSLCRG00005004887) ENSLCRG00005004885 ENSLCRG00005004883 NEDD4L (ENSLCRG00005004014) prlra (ENSLCRG00005004001) agxt2 (ENSLCRG00005003916) dnajc21 (ENSLCRG00005003906) bxdc2 (ENSLCRG00005003889) rad1 (ENSLCRG00005003878) ENSLCRG00005003876 C18orf32 (ENSLCRG00005003873) DYM (ENSLCRG00005003847) smad7 (ENSLCRG00005003846) #22 CTIF (ENSLCRG00005003841) #23 ZBTB7C (ENSLCRG00005003837) S1PR3 (ENSLCRG00005003832) SHC3 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TMEM38B (ENSDLAG00005000487) ENSDLAG00005000498 ENSDLAG00005000511 ENSDLAG00005000552 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159146 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000166467 ENSGT00650000094838 ENSGT00940000154437 ENSGT00530000063340 ENSGT00940000160524 ENSGT00940000156873 ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156125.h.a ENSGT00510000047097 ENSGT00390000014467 ENSGT00500000044913 ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000159594 ENSGT00940000158581 ENSGT00390000017459 ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000156229 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000014907.B ENSGT00940000159146 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000166467 ENSGT00650000094838 ENSGT00530000063340 ENSGT00940000160524 ENSGT00940000156873 ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156125.h.a ENSGT00510000047097 ENSGT00390000014467 ENSGT00500000044913 ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000159594 ENSGT00940000158581 ENSGT00390000017459 ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000156229 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc ENSGT00950000183161.a.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 3 sppl3 (ENSCGOG00000017874) nt5c2l1 (ENSCGOG00000017969) KCNN2 (ENSCGOG00000018849) drg1 (ENSCGOG00000018857) STARD7 (ENSCGOG00000019010) slc20a1b (ENSCGOG00000019114) pcyox1 (ENSCGOG00000019176) fam136a (ENSCGOG00000019179) gmcl1 (ENSCGOG00000019183) agxt2 (ENSCGOG00000019407) dnajc21 (ENSCGOG00000019541) bxdc2 (ENSCGOG00000019568) rad1 (ENSCGOG00000019547) C18orf32 (ENSCGOG00000019714) DYM (ENSCGOG00000019724) smad7 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ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000156229 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc Oryzias ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159146 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000166467 ENSGT00650000094838 ENSGT00940000154437 ENSGT00530000063340 ENSGT00940000160524 ENSGT00940000156873 ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156125.h.a ENSGT00510000047097 ENSGT00500000044913 ENSGT00390000014467 ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000159594 ENSGT00940000158581 ENSGT00390000017459 ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000156229 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc ENSGT00950000183161.a.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000166467 ENSGT00650000094838 ENSGT00940000154437 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(ENSOJAG00000003881) smad7 (ENSOJAG00000004050) #22 CTIF (ENSOJAG00000004106) #23 ZBTB7C (ENSOJAG00000004145) S1PR3 (ENSOJAG00000004178) SHC3 (ENSOJAG00000004194) SEMA4D (ENSOJAG00000004445) add1 (ENSOJAG00000005293) ENSOJAG00000006660 klf4 (ENSOJAG00000006684) RAD23B (ENSOJAG00000006710) ZNF462 (ENSOJAG00000006735) ENSOJAG00000006755 TMEM38B (ENSOJAG00000006775) PRAG1 (ENSOJAG00000006780) edf1 (ENSOJAG00000006789) PRRC2B (ENSOJAG00000006817) Indian medaka MODERN SPECIES 30 ccbe1 (ENSOMEG00000007041) lman1 (ENSOMEG00000007069) cplx4a (ENSOMEG00000007085) rx3 (ENSOMEG00000007096) ZNF532 (ENSOMEG00000007130) ENSOMEG00000007194 NEDD4L (ENSOMEG00000007465) ENSOMEG00000007554 prlra (ENSOMEG00000007593) agxt2 (ENSOMEG00000000886) dnajc21 (ENSOMEG00000007657) bxdc2 (ENSOMEG00000007680) rad1 (ENSOMEG00000007713) C18orf32 (ENSOMEG00000007723) DYM (ENSOMEG00000007811) smad7 (ENSOMEG00000007852) #22 CTIF (ENSOMEG00000007917) #23 ZBTB7C (ENSOMEG00000007949) S1PR3 (ENSOMEG00000007980) SHC3 (ENSOMEG00000008022) SEMA4D (ENSOMEG00000008158) add1 (ENSOMEG00000008294) nop14 (ENSOMEG00000008357) ENSOMEG00000008371 klf4 (ENSOMEG00000008393) RAD23B (ENSOMEG00000008426) ZNF462 (ENSOMEG00000008459) TMEM38B (ENSOMEG00000008481) PRAG1 (ENSOMEG00000008501) edf1 (ENSOMEG00000008537) PRRC2B (ENSOMEG00000008601) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159146 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000166467 ENSGT00650000094838 ENSGT00940000154437 ENSGT00530000063340 ENSGT00940000160524 ENSGT00940000156873 ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156125.h.a ENSGT00510000047097 ENSGT00500000044913 ENSGT00390000014467 ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000159594 ENSGT00940000158581 ENSGT00390000017459 ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000156229 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000008519.lc ENSGT00950000183161.a.b Chinese medaka MODERN SPECIES 57 cplx4a (ENSOSIG00000015814) lman1 (ENSOSIG00000015818) rx3 (ENSOSIG00000015822) ENSOSIG00000015825 ZNF532 (ENSOSIG00000015829) ENSOSIG00000015935 ENSOSIG00000015937 NEDD4L (ENSOSIG00000015970) prlra (ENSOSIG00000016260) agxt2 (ENSOSIG00000016278) dnajc21 (ENSOSIG00000016281) bxdc2 (ENSOSIG00000016285) rad1 (ENSOSIG00000016287) ENSOSIG00000016290 DYM (ENSOSIG00000016294) smad7 (ENSOSIG00000016305) #22 CTIF (ENSOSIG00000016315) #23 ZBTB7C (ENSOSIG00000016319) S1PR3 (ENSOSIG00000016322) SHC3 (ENSOSIG00000016324) SEMA4D (ENSOSIG00000016337) add1 (ENSOSIG00000016517) nop14 (ENSOSIG00000016626) ENSOSIG00000016799 klf4 (ENSOSIG00000016803) ZNF462 (ENSOSIG00000016809) TMEM38B (ENSOSIG00000016812) PRAG1 (ENSOSIG00000016817) edf1 (ENSOSIG00000003392) PRRC2B (ENSOSIG00000003446) nxnl2 (ENSOSIG00000003466) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 3 cplx4a (ENSORLG00000021868) rx3 (ENSORLG00000027320) ENSORLG00000026115 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ENSSSAG00000090421 ENSSSAG00000112522 ENSSSAG00000109564 ENSSSAG00000081791 ENSSSAG00000113915 ENSSSAG00000097665 ENSSSAG00000112033 ENSSSAG00000101896 ENSSSAG00000100777 ENSSSAG00000000236 ENSSSAG00000089972 lman1 (ENSSSAG00000107155) cplx4a (ENSSSAG00000107056) River trout MODERN SPECIES 15 ERMP1 (ENSSTUG00000004580) KIAA2026 (ENSSTUG00000004550) ENSSTUG00000004222 oaz1b (ENSSTUG00000004143) PRAG1 (ENSSTUG00000004115) TMEM38B (ENSSTUG00000004089) ZNF462 (ENSSTUG00000004041) rad23b (ENSSTUG00000004025) klf4 (ENSSTUG00000004009) SNCA (ENSSTUG00000003984) ENSSTUG00000003971 nop14 (ENSSTUG00000003568) add1 (ENSSTUG00000003278) C18orf32 (ENSSTUG00000003240) DYM (ENSSTUG00000003126) smad7 (ENSSTUG00000003077) #22 CTIF (ENSSTUG00000003028) #23 ENSSTUG00000003021 ZBTB7C (ENSSTUG00000003002) ENSSTUG00000003000 ENSSTUG00000002993 ENSSTUG00000002736 ENSSTUG00000045614 ENSSTUG00000044785 ENSSTUG00000044738 rpl28 (ENSSTUG00000044729) pdcl (ENSSTUG00000044722) ENSSTUG00000044710 pdxp (ENSSTUG00000044695) SETD9 (ENSSTUG00000044678) mier3a (ENSSTUG00000044614) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000009531.f ENSGT00390000011483.a ENSGT00390000008296.b.b.a ENSGT00940000166601.g ENSGT00940000157066.p.c ENSGT00390000018845.e.g ENSGT00940000156411.od.a.a ENSGT00390000012078.b.jb ENSGT00940000156229.cb ENSGT00950000183175.B.b.g ENSGT00940000166449.m.a ENSGT00390000017459 ENSGT00940000158581.i ENSGT00390000018741.b ENSGT00390000008772.k ENSGT00940000159872.a #22 ENSGT00940000153432.A.b.a #23 ENSGT00940000159814.j ENSGT00940000153692.A.a.a ENSGT00940000157583.k ENSGT00940000153372.A.e.a.b.b.b ENSGT00940000157870.a.a ENSGT00390000013620 ENSGT00950000182974.a.b.g ENSGT00940000159324 ENSGT00390000011509 ENSGT00390000008732.b.a.b ENSGT00940000159569 ENSGT00940000162045.n ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.l Rainbow trout MODERN SPECIES 26 ENSOMYG00000054303 ENSOMYG00000054684 TMEM38B (ENSOMYG00000036537) ENSOMYG00000036548 ENSOMYG00000036558 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#23 ENSGT00940000159814.j ENSGT00940000153692.A.a.a ENSGT00940000157583.k ENSGT00940000153372.A.e.a.b.b.b ENSGT00940000157870.a.a ENSGT00390000013620 ENSGT00950000182974.a.b.g Chinook salmon MODERN SPECIES 12 ERMP1 (ENSOTSG00005022706) ENSOTSG00005022760 ENSOTSG00005022762 oaz1b (ENSOTSG00005022877) PRAG1 (ENSOTSG00005022878) TMEM38B (ENSOTSG00005022880) ZNF462 (ENSOTSG00005022883) rad23b (ENSOTSG00005022884) klf4 (ENSOTSG00005022892) ENSOTSG00005034666 ENSOTSG00005034667 nop14 (ENSOTSG00005034672) add1 (ENSOTSG00005034797) ENSOTSG00005034946 DYM (ENSOTSG00005034949) smad7 (ENSOTSG00005035057) #22 CTIF (ENSOTSG00005035061) #23 ZBTB7C (ENSOTSG00005035064) ENSOTSG00005035069 mapk10 (ENSOTSG00005035107) klhl8 (ENSOTSG00005037690) ENSOTSG00005037819 NUP54 (ENSOTSG00005037824) PPEF2 (ENSOTSG00005037834) ENSOTSG00005038094 BCL7A (ENSOTSG00005038095) ENSOTSG00005038096 denr (ENSOTSG00005038097) ENSOTSG00005038174 ENSOTSG00005038177 denr (ENSOTSG00005038179) Coho salmon MODERN SPECIES 15 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ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156873 ENSGT00940000160524 ENSGT00530000063340 Salmo ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063839.s.b ENSGT00990000210603 ENSGT00390000011483.b ENSGT00390000008296.b.b.b ENSGT00940000166601.h ENSGT00940000157066.p.d ENSGT00390000018845.e.h ENSGT00940000156411.od.a.b ENSGT00390000012078.b.kb ENSGT00940000156229.db ENSGT00950000183175.B.b.h ENSGT00940000166449.m.b ENSGT00940000158581.j ENSGT00390000018741.a ENSGT00390000008772.l ENSGT00940000159872.b #22 ENSGT00940000153432.A.b.b #23 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814.i ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00950000182971.C ENSGT00940000159594 ENSGT00500000044913 ENSGT00390000014467 ENSGT00510000047097 ENSGT00940000156125 ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156873 ENSGT00940000160524 ENSGT00530000063340 Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000118206 KIAA2026 (ENSSSAG00000047252) ENSSSAG00000047303 ENSSSAG00000091091 ENSSSAG00000049723 TMEM38B (ENSSSAG00000049754) ENSSSAG00000049762 RAD23B (ENSSSAG00000049773) ENSSSAG00000110029 ENSSSAG00000049798 ENSSSAG00000120282 ENSSSAG00000049859 C18orf32 (ENSSSAG00000050260) ENSSSAG00000107067 DYM (ENSSSAG00000050382) smad7 (ENSSSAG00000105197) #22 CTIF (ENSSSAG00000117482) #23 ENSSSAG00000053523 ZBTB7C (ENSSSAG00000082268) S1PR3 (ENSSSAG00000053529) ENSSSAG00000053535 zgc:86839 (ENSSSAG00000053543) sema4d (ENSSSAG00000053620) ENSSSAG00000058105 bxdc2 (ENSSSAG00000058119) dnajc21 (ENSSSAG00000058125) AGT2 (ENSSSAG00000058142) prlra (ENSSSAG00000058216) ENSSSAG00000058291 ENSSSAG00000117230 ENSSSAG00000059288 River trout MODERN SPECIES 6 ERMP1 (ENSSTUG00000012221) ENSSTUG00000013634 KIAA2026 (ENSSTUG00000013642) ENSSTUG00000013672 oaz1b (ENSSTUG00000013875) ENSSTUG00000013890 TMEM38B (ENSSTUG00000013897) ZNF462 (ENSSTUG00000013918) rad23b (ENSSTUG00000013936) klf4 (ENSSTUG00000013959) SNCA (ENSSTUG00000013980) ENSSTUG00000013996 add1 (ENSSTUG00000014013) C18orf32 (ENSSTUG00000014279) DYM 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ENSGT00940000159594 ENSGT00500000044913 ENSGT00390000014467 ENSGT00510000047097 ENSGT00940000156125 ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156873 ENSGT00940000160524 ENSGT00530000063340 ENSGT00940000154437 Rainbow trout MODERN SPECIES 3 ENSOMYG00000017092 ENSOMYG00000070406 TMEM38B (ENSOMYG00000017086) ENSOMYG00000017077 RAD23B (ENSOMYG00000017033) ENSOMYG00000017011 ENSOMYG00000073808 ENSOMYG00000036610 ENSOMYG00000064321 ENSOMYG00000074901 ENSOMYG00000076685 ENSOMYG00000016976 ENSOMYG00000016918 C18orf32 (ENSOMYG00000016898) DYM (ENSOMYG00000016841) smad7 (ENSOMYG00000016806) #22 CTIF (ENSOMYG00000076853) #23 ENSOMYG00000064644 ZBTB7C (ENSOMYG00000016792) S1PR3 (ENSOMYG00000016786) ENSOMYG00000016576 zgc:86839 (ENSOMYG00000016552) ENSOMYG00000016484 BRIX1 (ENSOMYG00000016416) dnajc21 (ENSOMYG00000016393) agxt2 (ENSOMYG00000016365) prlra (ENSOMYG00000016339) ENSOMYG00000015962 ENSOMYG00000015920 ENSOMYG00000015908 ENSOMYG00000015862 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 48 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C18orf32 (ENSELUG00000008514) DYM (ENSELUG00000008586) smad7 (ENSELUG00000033786) #22 CTIF (ENSELUG00000008733) #23 ZBTB7C (ENSELUG00000008773) S1PR3 (ENSELUG00000008782) SHC3 (ENSELUG00000008829) zgc:86839 (ENSELUG00000008853) SEMA4D (ENSELUG00000008951) rad1 (ENSELUG00000009026) bxdc2 (ENSELUG00000009050) ENSELUG00000026643 dnajc21 (ENSELUG00000009111) ENSELUG00000009214 ENSELUG00000009121 agxt2 (ENSELUG00000009295) prlra (ENSELUG00000009331) NEDD4L (ENSELUG00000009580) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000009531 ENSGT00390000011483 ENSGT00390000008296.b.b ENSGT00940000166601 ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000156411 ENSGT00390000012078.b ENSGT00940000156229 ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000166449 ENSGT00390000017459 ENSGT00940000158581 ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00950000182971.C.pc.b ENSGT00950000182971.C.pc.a ENSGT00940000159594 ENSGT00500000044913 ENSGT00510000047097 ENSGT00940000156125 ENSGT00940000154851.B.b ENSGT00940000156873 ENSGT00940000160524 ENSGT00530000063340 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 217 ENSGT00940000158002 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00950000182971.C.pc.b ENSGT00950000182971.C.pc.a ENSGT00940000159594 ENSGT00950000182940.b.b.f ENSGT00940000155123.b.b ENSGT00940000155305.b.b ENSGT00940000161373 ENSGT00940000158581 ENSGT00940000155301.a ENSGT01030000234535.E.d Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00940000156340.a.d ENSGT00940000158002 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000158176 ENSGT00390000003122.a.a.a ENSGT00510000046704.b.a.c ENSGT00940000156354.p ENSGT00950000182971.C.pc.a ENSGT00940000159594 ENSGT00950000182940.b.b.f ENSGT00940000155123.b.b ENSGT00940000155305.b.b ENSGT00940000161373 Channel catfish MODERN SPECIES 9 gfi1b (ENSIPUG00000012769) bcr (ENSIPUG00000012796) ENSIPUG00000012963 ube2g1b (ENSIPUG00000013199) arpc3 (ENSIPUG00000013231) gpn3 (ENSIPUG00000013244) vps29 (ENSIPUG00000013313) cel (ENSIPUG00000013351) zgc:92275 (ENSIPUG00000013424) grin1a (ENSIPUG00000013467) ENTPD2 (ENSIPUG00000013795) smarcb1 (ENSIPUG00000013824) mmp11 (ENSIPUG00000013850) atp8b1 (ENSIPUG00000013880) dym (ENSIPUG00000013952) smad7 (ENSIPUG00000014015) #22 CTIF (ENSIPUG00000014050) #23 Zbtb7c (ENSIPUG00000014134) S1PR3 (ENSIPUG00000014139) SHC3 (ENSIPUG00000014141) dmgdh (ENSIPUG00000014172) bhmt (ENSIPUG00000014231) jmy (ENSIPUG00000014252) homer1 (ENSIPUG00000014282) cks2 (ENSIPUG00000014370) sema4d (ENSIPUG00000014423) ENSIPUG00000014532 CERT1 (ENSIPUG00000014574) hmgcrb (ENSIPUG00000014685) ENSIPUG00000014745 ENSIPUG00000014765 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000156340.a.d ENSGT00940000158002 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000158176 ENSGT00390000003122.a.a.a ENSGT00510000046704.b.a.c ENSGT00940000156354.p ENSGT00950000182971.C.pc.a ENSGT00940000159594 ENSGT00950000182940.b.b.f ENSGT00940000155123.b.b ENSGT00940000155305.b.b ENSGT00940000161373 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 187 ENSGT00940000165298.a.a ENSGT00390000018018 ENSGT00950000183172.A ENSGT01050000245132 ENSGT00390000012669 ENSGT00390000004458 ENSGT00940000156231.o.a ENSGT00390000016856 ENSGT00940000158016.c.a.b ENSGT01100000263542.B.b.a.a ENSGT00440000038585.c ENSGT00940000156340.a.d ENSGT00940000158002 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b ENSGT00940000158176 ENSGT00390000003122.a.a.a ENSGT00510000046704.b.a.c ENSGT00940000156354.p ENSGT00950000182971.C.pc.a ENSGT00940000159594 ENSGT00950000182940.b.b.f ENSGT00940000155123.b.b ENSGT00940000155305.b.b Mexicana tetra MODERN SPECIES 5 klhl8 (ENSAMXG00000015545) ENSAMXG00000036712 ENSAMXG00000015641 gsdf (ENSAMXG00000039161) PPEF2 (ENSAMXG00000015666) NUP54 (ENSAMXG00000035922) bxdc2 (ENSAMXG00000043121) fech (ENSAMXG00000041094) ONECUT2 (ENSAMXG00000031267) st8sia3 (ENSAMXG00000015782) WDR7 (ENSAMXG00000015805) add1 (ENSAMXG00000015866) ENSAMXG00000015897 ATP8B1 (ENSAMXG00000015912) DYM (ENSAMXG00000035028) smad7 (ENSAMXG00000039935) #22 ENSAMXG00000040364 CTIF (ENSAMXG00000015964) #23 ZBTB7C (ENSAMXG00000015988) S1PR3 (ENSAMXG00000024840) SHC3 (ENSAMXG00000033684) DMGDH (ENSAMXG00000016019) bhmt (ENSAMXG00000016035) JMY (ENSAMXG00000016059) HOMER1 (ENSAMXG00000016078) zgc:86839 (ENSAMXG00000032988) SEMA4D (ENSAMXG00000030262) ENSAMXG00000016110 CERT1 (ENSAMXG00000016141) hmgcrb (ENSAMXG00000016175) smarcb1b (ENSAMXG00000038492) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 184 cel.1 (ENSPNAG00000006278) zgc:92275 (ENSPNAG00000028540) grin1a (ENSPNAG00000004430) ENTPD2 (ENSPNAG00000028812) smarcb1b (ENSPNAG00000028881) MMP11 (ENSPNAG00000028974) ATP8B1 (ENSPNAG00000006627) DYM (ENSPNAG00000029147) smad7 (ENSPNAG00000029164) #22 CTIF (ENSPNAG00000029174) #23 ZBTB7C (ENSPNAG00000029200) S1PR3 (ENSPNAG00000029205) ENSPNAG00000029225 ENSPNAG00000006941 ENSPNAG00000029278 Electric eel MODERN SPECIES 76 BCR (ENSEEEG00000003845) atp2a2b (ENSEEEG00000003792) ube2g1b (ENSEEEG00000003787) arpc3 (ENSEEEG00000003783) gpn3 (ENSEEEG00000003781) vps29 (ENSEEEG00000003777) GTF3C5 (ENSEEEG00000003758) cel.1 (ENSEEEG00000003754) zgc:92275 (ENSEEEG00000003752) grin1a (ENSEEEG00000003582) ENTPD2 (ENSEEEG00000003554) smarcb1b (ENSEEEG00000003506) MMP11 (ENSEEEG00000003499) ATP8B1 (ENSEEEG00000003495) DYM (ENSEEEG00000003488) smad7 (ENSEEEG00000003484) #22 CTIF (ENSEEEG00000003479) #23 ENSEEEG00000003477 ZBTB7C (ENSEEEG00000003475) S1PR3 (ENSEEEG00000003474) SHC3 (ENSEEEG00000003470) DMGDH (ENSEEEG00000003103) bhmt (ENSEEEG00000002951) JMY (ENSEEEG00000002927) HOMER1 (ENSEEEG00000002782) zgc:86839 (ENSEEEG00000002774) ENSEEEG00000002772 SEMA4D (ENSEEEG00000002770) ENSEEEG00000002699 CERT1 (ENSEEEG00000001976) hmgcrb (ENSEEEG00000001950) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00390000008220 ENSGT01020000230412.A.c.a ENSGT00940000156235.c.a ENSGT00940000153601.a.a.e.b.a ENSGT00940000160918 ENSGT00390000013112 ENSGT00390000008565.a ENSGT00940000157958 ENSGT00940000160114 ENSGT00390000016537 ENSGT00390000018706 ENSGT00950000182888.a.a.a.h ENSGT00940000157310 ENSGT00940000158002 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 #22 ENSGT00940000153432.A.b #23 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000154735.c ENSGT00940000154461.tc.b ENSGT01050000244887.A.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b.k ENSGT00950000182971.C.pc.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 221 ENSGT00390000016537.m ENSGT00390000018706.j ENSGT00950000182888.a.a.a.h.a.b.a ENSGT00940000157310.e ENSGT00940000158002.q ENSGT00390000008772.n ENSGT00940000159872.c #22 ENSGT00940000153432.A.b.f #23 ENSGT00940000159814.f ENSGT00940000154735.c.c ENSGT00940000154461.tc.b.b.b ENSGT00950000182870.a.a.a.b.k.a ENSGT00950000182971.C.pc.a ENSGT00940000159594.d ENSGT00950000182940.b.b.f.g ENSGT00940000155123.b.b.a ENSGT00940000155305.b.b.a ENSGT00940000161373.ab ENSGT01090000260030.a.b.a.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000155301.a.a.a ENSGT01030000234535.E.d.e.a ENSGT00950000183103.d.a.b.h Goldfish MODERN SPECIES 13 COL5A1 (ENSCARG00000041897) ENSCARG00000008533 miga2 (ENSCARG00000008549) ST6GALNAC6 (ENSCARG00000008562) spout1 (ENSCARG00000008610) nsa2 (ENSCARG00000008670) tor1 (ENSCARG00000008729) ENSCARG00000008763 ENSCARG00000008771 dolpp1 (ENSCARG00000008803) miga2 (ENSCARG00000008835) scamp1 (ENSCARG00000008856) ENSCARG00000008901 ENSCARG00000009069 DYM (ENSCARG00000009079) smad7 (ENSCARG00000009133) #22 CTIF (ENSCARG00000009140) #23 ENSCARG00000009145 hwa (ENSCARG00000009147) ENSCARG00000009156 st8sia5 (ENSCARG00000009177) LOXHD1 (ENSCARG00000009301) ENSCARG00000009785 ENSCARG00000009789 ENSCARG00000009793 ENSCARG00000009796 ENSCARG00000009798 RIC1 (ENSCARG00000009824) ENSCARG00000010531 ENSCARG00000010556 ENSCARG00000010572 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 240 ENSGT01020000230412.A.c.a.e ENSGT00940000156235.c.a.e ENSGT00940000153601.a.a.e.b.a.g ENSGT00940000160918.b ENSGT00390000013112.b ENSGT00390000008565.a.q ENSGT00940000157958.h ENSGT00940000160114.i ENSGT00390000016537.m ENSGT00390000018706.j ENSGT00950000182888.a.a.a.h.a.b.a ENSGT00950000182888.a.a.a.h.a.b.b.a ENSGT00940000157310.e ENSGT00940000158002.q ENSGT00390000008772.n ENSGT00940000159872.c #22 ENSGT00940000153432.A.b.f #23 ENSGT00940000159814.f ENSGT00940000154735.c.c ENSGT00940000154461.tc.b.b.b ENSGT01050000244887.A.b.b.d ENSGT00950000182870.a.a.a.b.k.a ENSGT00950000182971.C.pc.a ENSGT00940000159594.d ENSGT00950000182940.b.b.f.g 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