Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00860000133854	ENSGT00940000158239.b #7	ENSGT00940000159606 #8	ENSGT00940000155861.C #9	ENSGT00940000156444 #11	ENSGT00390000005159 #12	ENSGT00390000018209	ENSGT00940000155390 #13	ENSGT00940000158202 #14	ENSGT00400000022323 #15	ENSGT00940000160319 #16	ENSGT00940000160994 #18	ENSGT00530000064199 #19	ENSGT00390000010316 #20	ENSGT00390000011295.a #21	ENSGT00390000015228 #22	ENSGT00390000003590 #23	ENSGT00940000153189.B #24	ENSGT00940000159722 #25	ENSGT00390000012561.b #26	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b #27	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ##27	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ##27	ENSGT00940000154107.b	ENSGT00530000064234	ENSGT00390000001138.b	ENSGT00390000004145	ENSGT00940000158493	ENSGT00390000005550	ENSGT00390000005581.b	ENSGT00390000008096.B
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158239.b #7	ENSGT00940000159606 #8	ENSGT00940000155861.C #9	ENSGT00390000000560.m.a.b #10	ENSGT00940000156444 #11	ENSGT00390000005159 #12	ENSGT00390000018209	ENSGT00940000155390 #13	ENSGT00940000158202 #14	ENSGT00400000022323 #15	ENSGT00940000160319 #16	ENSGT00940000160994 #18	ENSGT00530000064199 #19	ENSGT00390000010316 #20	ENSGT00390000011295.a #21	ENSGT00390000015228 #22	ENSGT00390000003590 #23	ENSGT00940000153189.B #24	ENSGT00940000159722 #25	ENSGT00390000012561.b.v ##26	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b #27	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ##27	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ##27	ENSGT00940000154107.b	ENSGT00530000064234	ENSGT00390000001138.b	ENSGT00390000004145	ENSGT00940000158493	ENSGT00390000005550	ENSGT00390000005581.b	ENSGT00390000012178.g.a.a
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	103	ENSGT00940000158239.b #7	ENSGT00940000159606 #8	ENSGT00940000155861.C #9	ENSGT00390000000560.m.a.b #10	ENSGT00940000156444 #11	ENSGT00390000005159 #12	ENSGT00390000018209	ENSGT00940000155390 #13	ENSGT00940000158202 #14	ENSGT00400000022323 #15	ENSGT00940000160319 #16	ENSGT00940000160994 #18	ENSGT00530000064199 #19	ENSGT00390000010316 #20	ENSGT00390000011295.a #21	ENSGT00390000015228 #22	ENSGT00390000003590 #23	ENSGT00940000153189.B #24	ENSGT00940000159722 #25	ENSGT00390000012561.b.v ##26	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b #27
Squirrel	MODERN SPECIES	326	FZD7 (ENSSTOG00000020705) #7	CDK15 (ENSSTOG00000016128) #8	ALS2 (ENSSTOG00000016119) #9	ENSSTOG00000029531 #10	MPP4 (ENSSTOG00000025322) #11	TMEM237 (ENSSTOG00000025175) #12	STRADB (ENSSTOG00000021132) #13	TRAK2 (ENSSTOG00000002930) #14	FLACC1 (ENSSTOG00000006296) #15	CASP8 (ENSSTOG00000011342) #16	ENSSTOG00000022094 #17	CASP10 (ENSSTOG00000002364) #18	CFLAR (ENSSTOG00000009642) #19	NDUFB3 (ENSSTOG00000009635) #20	HYCC2 (ENSSTOG00000023641) #21	ORC2 (ENSSTOG00000019442) #22	NIF3L1 (ENSSTOG00000030641) #23	PPIL3 (ENSSTOG00000028255) #24	CLK1 (ENSSTOG00000009578) #25	ENSSTOG00000030689 #26	ENSSTOG00000020989 #27
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	317	KIAA2012 (ENSUPAG00010014115)	FZD7 (ENSUPAG00010014150) #7	CDK15 (ENSUPAG00010014153) #8	ALS2 (ENSUPAG00010014184) #9	MPP4 (ENSUPAG00010014266) #11	TMEM237 (ENSUPAG00010014479) #12	ENSUPAG00010014524	STRADB (ENSUPAG00010014591) #13	TRAK2 (ENSUPAG00010014606) #14	FLACC1 (ENSUPAG00010014658) #15	CASP8 (ENSUPAG00010014705) #16	CASP10 (ENSUPAG00010014765) #18	CFLAR (ENSUPAG00010014940) #19	NDUFB3 (ENSUPAG00010014966) #20	HYCC2 (ENSUPAG00010014985) #21	ORC2 (ENSUPAG00010015014) #22	NIF3L1 (ENSUPAG00010015151) #23	PPIL3 (ENSUPAG00010015181) #24	CLK1 (ENSUPAG00010015196) #25	ENSUPAG00010015320 ##26	ENSUPAG00010015353 #27
Alpin marmot	MODERN SPECIES	8	KIAA2012 (ENSMMMG00000012837)	CDK15 (ENSMMMG00000012752) #8	ALS2 (ENSMMMG00000012683) #9	ENSMMMG00000012669 #10	MPP4 (ENSMMMG00000012482) #11	TMEM237 (ENSMMMG00000012468) #12	ENSMMMG00000012437	STRADB (ENSMMMG00000012410) #13	TRAK2 (ENSMMMG00000012358) #14	FLACC1 (ENSMMMG00000012333) #15	CASP8 (ENSMMMG00000012315) #16	CASP10 (ENSMMMG00000012307) #18	CFLAR (ENSMMMG00000012269) #19	ENSMMMG00000012253 #20	HYCC2 (ENSMMMG00000012182) #21	ORC2 (ENSMMMG00000012136) #22	NIF3L1 (ENSMMMG00000012077) #23	PPIL3 (ENSMMMG00000012069) #24	CLK1 (ENSMMMG00000012051) #25	ENSMMMG00000012026 ##26	ENSMMMG00000011976 #27	ENSMMMG00000011959	ENSMMMG00000011912 ##27	AOX1 (ENSMMMG00000011886) ##27	ENSMMMG00000011877	KCTD18 (ENSMMMG00000011839)	SPATS2L (ENSMMMG00000011689)	MAIP1 (ENSMMMG00000011679)	TYW5 (ENSMMMG00000011668)	C2orf69 (ENSMMMG00000011660)	FTCDNL1 (ENSMMMG00000011655)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	12	TMEM237 (ENSSVLG00005004927) #12	ENSSVLG00005004791	STRADB (ENSSVLG00005004739) #13	ENSSVLG00005004684 #14	FLACC1 (ENSSVLG00005004644) #15	ENSSVLG00005004626	CASP8 (ENSSVLG00005004545) #16	ENSSVLG00005004469	ENSSVLG00005004452	CASP10 (ENSSVLG00005004333) #18	ENSSVLG00005004275	CFLAR (ENSSVLG00005004210) #19	NDUFB3 (ENSSVLG00005004178) #20	HYCC2 (ENSSVLG00005004160) #21	ENSSVLG00005004143	ORC2 (ENSSVLG00005004127) #22	ENSSVLG00005004114	NIF3L1 (ENSSVLG00005004091) #23	PPIL3 (ENSSVLG00005004070) #24	CLK1 (ENSSVLG00005004020) #25	BZW1 (ENSSVLG00005003945) #26	ENSSVLG00005003845 #27	ENSSVLG00005003767 ##27	AOX1 (ENSSVLG00005003683) ##27	SGO2 (ENSSVLG00005003633)	ENSSVLG00005003604	SPATS2L (ENSSVLG00005003512)	MAIP1 (ENSSVLG00005003433)	TYW5 (ENSSVLG00005003405)	C2orf69 (ENSSVLG00005003387)	FTCDNL1 (ENSSVLG00005003343)