Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158360 ENSGT00940000155427 ENSGT00940000156923 ENSGT00940000154268.f ENSGT00950000182883.a.b.a #10 ENSGT00390000005530.a.b #11 ENSGT00950000183046.b #12 ENSGT00390000003051 #13 ENSGT00390000008029 #14 ENSGT00390000015038 #15 ENSGT00940000161647 #16 ENSGT00940000155000 #17 ENSGT00390000001994 #18 ENSGT00390000002457 #19 ENSGT00390000010029 #20 ENSGT00940000159188 #22 ENSGT00940000157683 #23 ENSGT00940000162732 #24 ENSGT00940000159344 #25 ENSGT00940000156032 #26 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.b #27 ENSGT00940000158874 #28 ENSGT00390000008932.c.a.a #29 ENSGT00390000008932.c.b #30 ENSGT00390000008932.c.a.b #31 ENSGT00940000155538 #33 ENSGT00950000183173.P #35 ENSGT00390000005672.a.b #36 ENSGT00390000004037 #37 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000162637 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000158360 ENSGT00940000155427 ENSGT00940000156923 ENSGT00940000154268.f ENSGT00950000182883.a.b.a #10 ENSGT00390000005530.a.b #11 ENSGT00950000183046.b #12 ENSGT00390000003051 #13 ENSGT00390000008029 #14 ENSGT00390000015038 #15 ENSGT00940000161647 #16 ENSGT00940000155000 #17 ENSGT00390000001994 #18 ENSGT00390000002457 #19 ENSGT00390000010029 #20 ENSGT00940000159188 #22 ENSGT00940000157683 #23 ENSGT00940000162732 #24 ENSGT00940000159344 #25 ENSGT00940000156032 #26 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.b #27 ENSGT00940000158874 #28 ENSGT00390000008932.c.a.a #29 ENSGT00390000008932.c.b #30 ENSGT00390000008932.c.a.b #31 ENSGT00940000155538 #33 ENSGT00950000183173.P #35 ENSGT00390000005672.a.b #36 ENSGT00390000004037 #37 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000162637 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000155427 ENSGT00940000156923 ENSGT00940000154268.f ENSGT00950000182883.a.b.a #10 ENSGT00390000005530.a.b #11 ENSGT00950000183046.b #12 ENSGT00390000003051 #13 ENSGT00390000008029 #14 ENSGT00390000015038 #15 ENSGT00940000161647 #16 ENSGT00940000155000 #17 ENSGT00390000001994 #18 ENSGT00390000002457 #19 ENSGT00390000010029 #20 ENSGT00390000009212.i.a.a #21 ENSGT00940000159188 #22 ENSGT00940000157683 #23 ENSGT00940000162732 #24 ENSGT00940000159344 #25 ENSGT00940000156032 #26 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.b #27 ENSGT00940000158874 #28 ENSGT00390000008932.c.a.a #29 ENSGT00390000008932.c.b #30 ENSGT00390000008932.c.a.b #31 ENSGT00940000155538 #33 ENSGT00950000183173.P #35 ENSGT00390000005672.a.b #36 ENSGT00390000004037 #37 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000162637 Squirrel MODERN SPECIES 185 NXPH1 (ENSSTOG00000024868) #10 ICA1 (ENSSTOG00000004278) #11 GLCCI1 (ENSSTOG00000021063) #12 UMAD1 (ENSSTOG00000034216) #13 RPA3 (ENSSTOG00000031875) #14 MIOS (ENSSTOG00000014620) #15 COL28A1 (ENSSTOG00000023884) #16 C1GALT1 (ENSSTOG00000028307) #17 ASNS (ENSSTOG00000005421) #18 TAC1 (ENSSTOG00000005410) #19 ENSSTOG00000034550 #20 ENSSTOG00000034315 #21 DLX5 (ENSSTOG00000005162) #22 DLX6 (ENSSTOG00000020785) #23 SEM1 (ENSSTOG00000011501) #24 SLC25A13 (ENSSTOG00000008106) #25 DYNC1I1 (ENSSTOG00000008078) #26 Pdk4 (ENSSTOG00000021060) #27 ASB4 (ENSSTOG00000026077) #28 PON2 (ENSSTOG00000011912) #29 PON3 (ENSSTOG00000025896) #30 PON1 (ENSSTOG00000011900) #31 ENSSTOG00000029077 #32 ENSSTOG00000030680 #33 ENSSTOG00000026064 #34 PEG10 (ENSSTOG00000022801) #35 SGCE (ENSSTOG00000001868) #36 CASD1 (ENSSTOG00000010829) #37 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 91 ICA1 (ENSUPAG00010018725) #11 GLCCI1 (ENSUPAG00010018705) #12 UMAD1 (ENSUPAG00010018691) #13 RPA3 (ENSUPAG00010018685) #14 MIOS (ENSUPAG00010018670) #15 ENSUPAG00010018666 COL28A1 (ENSUPAG00010018619) #16 C1GALT1 (ENSUPAG00010018594) #17 ASNS (ENSUPAG00010018582) #18 TAC1 (ENSUPAG00010018539) #19 SDHAF3 (ENSUPAG00010018532) #20 ENSUPAG00010018528 #21 DLX5 (ENSUPAG00010018520) #22 DLX6 (ENSUPAG00010018504) #23 SEM1 (ENSUPAG00010018488) #24 SLC25A13 (ENSUPAG00010018426) #25 DYNC1I1 (ENSUPAG00010018338) #26 PDK4 (ENSUPAG00010018316) #27 ASB4 (ENSUPAG00010018314) #28 PON2 (ENSUPAG00010018303) #29 PON3 (ENSUPAG00010018287) #30 PON1 (ENSUPAG00010018258) #31 PPP1R9A (ENSUPAG00010015293) #33 ENSUPAG00010015260 #35 SGCE (ENSUPAG00010014956) #36 CASD1 (ENSUPAG00010014912) #37 COL1A2 (ENSUPAG00010014832) BET1 (ENSUPAG00010014824) Alpin marmot MODERN SPECIES 22 PHF14 (ENSMMMG00000013854) NDUFA4 (ENSMMMG00000013836) NXPH1 (ENSMMMG00000013827) #10 ICA1 (ENSMMMG00000013715) #11 GLCCI1 (ENSMMMG00000013684) #12 UMAD1 (ENSMMMG00000013672) #13 RPA3 (ENSMMMG00000013664) #14 MIOS (ENSMMMG00000013649) #15 ENSMMMG00000013638 COL28A1 (ENSMMMG00000013600) #16 C1GALT1 (ENSMMMG00000013591) #17 ASNS (ENSMMMG00000013577) #18 TAC1 (ENSMMMG00000013539) #19 SDHAF3 (ENSMMMG00000013528) #20 ENSMMMG00000013521 ##21 DLX5 (ENSMMMG00000013512) #22 DLX6 (ENSMMMG00000013501) #23 ENSMMMG00000013494 SEM1 (ENSMMMG00000013480) #24 SLC25A13 (ENSMMMG00000013399) #25 DYNC1I1 (ENSMMMG00000013269) #26 PDK4 (ENSMMMG00000013241) #27 ASB4 (ENSMMMG00000013230) #28 BET1 (ENSMMMG00000013215) COL1A2 (ENSMMMG00000013132) CASD1 (ENSMMMG00000013107) #37 SGCE (ENSMMMG00000012980) #36 ENSMMMG00000012971 #35 PPP1R9A (ENSMMMG00000012538) #33 PON1 (ENSMMMG00000012515) #31 PON3 (ENSMMMG00000012511) #30 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 17 PHF14 (ENSSVLG00005004805) ENSSVLG00005004917 ENSSVLG00005004936 NXPH1 (ENSSVLG00005004963) #10 ICA1 (ENSSVLG00005005008) #11 GLCCI1 (ENSSVLG00005005120) #12 UMAD1 (ENSSVLG00005005159) #13 ENSSVLG00005005197 #14 MIOS (ENSSVLG00005005256) #15 COL28A1 (ENSSVLG00005005316) #16 ENSSVLG00005005474 #17 ASNS (ENSSVLG00005005522) #18 TAC1 (ENSSVLG00005005619) #19 ENSSVLG00005005692 SDHAF3 (ENSSVLG00005005726) #20 DLX5 (ENSSVLG00005005760) #22 DLX6 (ENSSVLG00005005785) #23 SEM1 (ENSSVLG00005005837) #24 SLC25A13 (ENSSVLG00005005915) #25 DYNC1I1 (ENSSVLG00005006176) #26 PDK4 (ENSSVLG00005006655) #27 ASB4 (ENSSVLG00005006747) #28 PON2 (ENSSVLG00005006826) #29 ENSSVLG00005006855 PON3 (ENSSVLG00005006880) #30 PON1 (ENSSVLG00005006959) #31 PPP1R9A (ENSSVLG00005007147) #33 ENSSVLG00005007478 ENSSVLG00005007534 PEG10 (ENSSVLG00005007575) #35 SGCE (ENSSVLG00005007757) #36