Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000003466 ENSGT00390000014122.i.b.a.b #7 ENSGT00940000159468 #8 ENSGT00390000001793 #9 ENSGT00940000162396 #10 ENSGT00940000161652 #12 ENSGT00940000154030.a.b #13 ENSGT00390000013670 #14 ENSGT00940000157701 #15 ENSGT00940000156464 #16 ENSGT00940000156714 #17 ENSGT01030000234564.a.a.a.a.b #18 ENSGT00940000155623 #19 ENSGT00390000003990 #20 ENSGT00940000155699 #21 ENSGT00390000008069 #22 ENSGT00940000155443 #23 ENSGT01090000260040.b.b.b.b.a.a #24 ENSGT00440000033827 #25 ENSGT00940000157612 #26 ENSGT00940000155982 #27 ENSGT00390000016845 #28 ENSGT00390000013305.a.a.v #29 ENSGT00940000154645.A #30 ENSGT00950000182995.e.a.a.a #31 ENSGT00390000007900 #32 ENSGT00390000004263.b #33 ENSGT00940000155646 #34 ENSGT00940000160213 #35 ENSGT00940000154459.B #36 ENSGT00940000153916.B #37 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003466 ENSGT00390000014122.i.b.a.b #7 ENSGT00940000159468 #8 ENSGT00390000001793 #9 ENSGT00940000162396 #10 ENSGT00940000161652 #12 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(ENSSTOG00000015273) ENY2 (ENSSTOG00000027768) NUDCD1 (ENSSTOG00000015266) TRHR (ENSSTOG00000015264) TMEM74 (ENSSTOG00000001096) EMC2 (ENSSTOG00000007594) EIF3E (ENSSTOG00000008976) RSPO2 (ENSSTOG00000021427) ANGPT1 (ENSSTOG00000008023) ABRA (ENSSTOG00000011664) OXR1 (ENSSTOG00000005468) ZFPM2 (ENSSTOG00000020729) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000008069.l ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000008069.l ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES SOX11 (ENSUPAG00010012315) #12 CMPK2 (ENSUPAG00010012310) #13 RSAD2 (ENSUPAG00010012305) #14 RNF144A (ENSUPAG00010012263) #15 ID2 (ENSUPAG00010012253) #16 KIDINS220 (ENSUPAG00010012028) #17 MBOAT2 (ENSUPAG00010011957) #18 ASAP2 (ENSUPAG00010011650) #19 ITGB1BP1 (ENSUPAG00010011629) #20 CPSF3 (ENSUPAG00010011610) #21 ENSUPAG00010011577 ##22 ADAM17 (ENSUPAG00010011539) #23 YWHAQ (ENSUPAG00010011534) ##24 TAF1B (ENSUPAG00010011508) #25 GRHL1 (ENSUPAG00010011483) #26 KLF11 (ENSUPAG00010011457) #27 CYS1 (ENSUPAG00010011444) #28 HPCAL1 (ENSUPAG00010011428) #30 ODC1 (ENSUPAG00010011416) #31 NOL10 (ENSUPAG00010011386) #32 ATP6V1C2 (ENSUPAG00010011265) #33 PDIA6 (ENSUPAG00010011237) #34 KCNF1 (ENSUPAG00010011227) #35 C2orf50 (ENSUPAG00010011218) #36 SLC66A3 (ENSUPAG00010011204) #37 ROCK2 (ENSUPAG00010011170) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 5 RNASEH1 (ENSSVLG00005021750) ENSSVLG00005021713 ##7 COLEC11 (ENSSVLG00005021395) #8 ALLC (ENSSVLG00005021266) #9 DCDC2C (ENSSVLG00005021143) #10 SOX11 (ENSSVLG00005021089) #12 CMPK2 (ENSSVLG00005020981) #13 RSAD2 (ENSSVLG00005020911) #14 RNF144A (ENSSVLG00005020868) #15 ID2 (ENSSVLG00005020830) #16 KIDINS220 (ENSSVLG00005020790) #17 MBOAT2 (ENSSVLG00005020748) #18 ASAP2 (ENSSVLG00005020310) #19 ITGB1BP1 (ENSSVLG00005020179) #20 CPSF3 (ENSSVLG00005020098) #21 IAH1 (ENSSVLG00005019997) #22 ADAM17 (ENSSVLG00005019936) #23 YWHAQ (ENSSVLG00005019899) #24 ENSSVLG00005019881 ENSSVLG00005019695 #25 ENSSVLG00005019438 #26 KLF11 (ENSSVLG00005019337) #27 CYS1 (ENSSVLG00005019295) #28 ENSSVLG00005019233 ##29 HPCAL1 (ENSSVLG00005019176) #30 ENSSVLG00005019056 #31 NOL10 (ENSSVLG00005018977) #32 ENSSVLG00005018931 ATP6V1C2 (ENSSVLG00005018543) #33 PDIA6 (ENSSVLG00005018305) #34 KCNF1 (ENSSVLG00005018274) #35 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000155623 #19 ENSGT00390000003990 #20 ENSGT00940000155699 #21 ENSGT00390000008069 #22 ENSGT00940000155443 #23 ENSGT01090000260040.b.b.b.b.a.a #24 ENSGT01090000260040.b.b.b.b.b ##24 ENSGT00440000033827 #25 ENSGT00940000157612 #26 ENSGT00940000155982 #27 ENSGT00390000013305.a.a.u.a ##29 ENSGT00390000016845 #28 ENSGT00390000013305.a.a.v #29 ENSGT00940000154645.A #30 ENSGT00950000182995.e.a.a.a #31 ENSGT00390000007900 #32 ENSGT00390000004263.b #33 ENSGT00940000155646 #34 ENSGT00940000160213 #35 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00940000154030.a.b #13 ENSGT00940000161652 #12 ENSGT00940000162396 #10 ENSGT00390000001793 #9 ENSGT00940000159468 #8 ENSGT00390000014122.i.b.a.b #7 ENSGT00390000003466 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