Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	91	ENSGT00940000154030.a.b	ENSGT00940000161652 #7	ENSGT00940000162396 #8	ENSGT00390000001793 #9	ENSGT00940000159468 #10	ENSGT00390000014122.i.b.a.b #11	ENSGT00390000003466 #12	ENSGT00390000008195 #13	ENSGT00390000002448 #14	ENSGT00730000111137 #15	ENSGT00940000155671 #17	ENSGT00940000157666 #18	ENSGT00940000155623 #19	ENSGT00390000003990 #20	ENSGT00940000155699 #21	ENSGT00390000008069 #22	ENSGT00940000155443 #23	ENSGT01090000260040.b.b.b.b.a.a ##24	ENSGT01090000260040.b.b.b.b.b #24	ENSGT00440000033827 #25	ENSGT00940000157612 #26	ENSGT00940000155982 #27	ENSGT00390000013305.a.a.v #28	ENSGT00390000013305.a.a.u.a ##28	ENSGT00940000154645.A #30	ENSGT00950000182995.e.a.a.a #31	ENSGT00390000007900 #32	ENSGT00390000004263.b #33	ENSGT00940000155646 #34	ENSGT00940000160213 #35	ENSGT00940000170593 #36
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	194	SOX11 (ENSCLAG00000002180) #7	DCDC2C (ENSCLAG00000002204) #8	ALLC (ENSCLAG00000002247) #9	COLEC11 (ENSCLAG00000002289) #10	RPS7 (ENSCLAG00000002424) #11	RNASEH1 (ENSCLAG00000002440) #12	ADI1 (ENSCLAG00000002464) #13	TRAPPC12 (ENSCLAG00000002486) #14	EIPR1 (ENSCLAG00000002535) #15	ENSCLAG00000001592 #16	MYT1L (ENSCLAG00000001644) #17	PXDN (ENSCLAG00000001727) #18	ASAP2 (ENSCLAG00000001989) #19	ITGB1BP1 (ENSCLAG00000002388) #20	CPSF3 (ENSCLAG00000002727) #21	IAH1 (ENSCLAG00000002879) #22	ADAM17 (ENSCLAG00000003055) #23	YWHAQ (ENSCLAG00000003576) #24	TAF1B (ENSCLAG00000003776) #25	GRHL1 (ENSCLAG00000004000) #26	ENSCLAG00000004146 #27	RRM2 (ENSCLAG00000001926) #28	ENSCLAG00000002025 #29	HPCAL1 (ENSCLAG00000002037) #30	ODC1 (ENSCLAG00000002140) #31	NOL10 (ENSCLAG00000002234) #32	ATP6V1C2 (ENSCLAG00000006612) #33	PDIA6 (ENSCLAG00000006956) #34	KCNF1 (ENSCLAG00000017968) #35	ENSCLAG00000007661 #36	SLC66A3 (ENSCLAG00000008584) #37
Degu	MODERN SPECIES	192									MYT1L (ENSODEG00000001544) #17	ENSODEG00000018668	PXDN (ENSODEG00000001228) #18	ASAP2 (ENSODEG00000001497) #19	ENSODEG00000018909	ENSODEG00000003101 #20	CPSF3 (ENSODEG00000003129) #21	IAH1 (ENSODEG00000003362) #22	ADAM17 (ENSODEG00000003472) #23	YWHAQ (ENSODEG00000001504) ##24	ENSODEG00000001535	TAF1B (ENSODEG00000002052) #25	GRHL1 (ENSODEG00000002151) #26	ENSODEG00000002288 #27	RRM2 (ENSODEG00000002317) ##28	ENSODEG00000002415 #30	ODC1 (ENSODEG00000000437) #31	NOL10 (ENSODEG00000000508) #32	ATP6V1C2 (ENSODEG00000000754) #33	ENSODEG00000000842 #34	ENSODEG00000000975 #36	ENSODEG00000000987 #37	ENSODEG00000001162