Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00940000158049 ENSGT01020000230412.A.c.a ENSGT00940000163383 ENSGT00940000156235 ENSGT00390000012207 ENSGT00940000153601.a.a ENSGT00940000160918 ENSGT00940000159729 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 ENSGT00940000164784 ENSGT00390000007746 #20 ENSGT00390000014148 #21 ENSGT00940000160010 #22 ENSGT00390000004458 #23 ENSGT00940000156231 #24 ENSGT00940000153181 #25 ENSGT00940000159200 ENSGT00940000153246.b ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294 ENSGT00530000064194 ENSGT00940000170611 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 ENSGT00940000159976 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000158049 ENSGT01020000230412.A.c.a ENSGT00940000163383 ENSGT00940000156235 ENSGT00390000012207 ENSGT00940000153601.a.a ENSGT00940000160918 ENSGT00940000159729 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 ENSGT00940000164784 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ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 ENSGT00390000016800 ENSGT00530000064123 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000178229 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183161.a.b ENSGT00940000158049 ENSGT01020000230412.A.c.a ENSGT00940000156235 ENSGT00390000012207 ENSGT00940000153601.a.a ENSGT00940000160918 ENSGT00940000159729 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 ENSGT00940000161613 #19 ENSGT00390000007746 #20 ENSGT00390000014148 #21 ENSGT00940000160010 #22 ENSGT00390000004458 #23 ENSGT00940000156231 #24 ENSGT00940000153181.z #25 ENSGT00950000182858.A.b.b ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 ENSGT00390000016800 ENSGT00530000064123 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000178229 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 156 MED27 (ENSUPAG00010011579) NTNG2 (ENSUPAG00010011504) SETX (ENSUPAG00010011465) TTF1 (ENSUPAG00010011449) CFAP77 (ENSUPAG00010011437) BARHL1 (ENSUPAG00010011426) DDX31 (ENSUPAG00010011408) ENSUPAG00010011403 AK8 (ENSUPAG00010011364) #19 SPACA9 (ENSUPAG00010011343) #20 TSC1 (ENSUPAG00010011312) #21 GFI1B (ENSUPAG00010011298) #22 GTF3C5 (ENSUPAG00010011268) #23 CEL (ENSUPAG00010011253) #24 RALGDS (ENSUPAG00010009287) #25 GBGT1 (ENSUPAG00010009274) ENSUPAG00010009264 SURF6 (ENSUPAG00010009255) MED22 (ENSUPAG00010009242) ENSUPAG00010009198 SURF1 (ENSUPAG00010009179) ENSUPAG00010009151 SURF4 (ENSUPAG00010009141) STKLD1 (ENSUPAG00010009115) REXO4 (ENSUPAG00010008958) ADAMTS13 (ENSUPAG00010008908) ENSUPAG00010008892 Squirrel MODERN SPECIES 87 PRRC2B (ENSSTOG00000024364) POMT1 (ENSSTOG00000004011) UCK1 (ENSSTOG00000004058) RAPGEF1 (ENSSTOG00000002466) MED27 (ENSSTOG00000008925) NTNG2 (ENSSTOG00000010575) SETX (ENSSTOG00000021600) TTF1 (ENSSTOG00000007957) CFAP77 (ENSSTOG00000007973) BARHL1 (ENSSTOG00000024230) DDX31 (ENSSTOG00000007985) ENSSTOG00000004976 AK8 (ENSSTOG00000003440) #19 SPACA9 (ENSSTOG00000019976) #20 TSC1 (ENSSTOG00000003477) #21 GFI1B (ENSSTOG00000022285) #22 GTF3C5 (ENSSTOG00000023452) #23 CEL (ENSSTOG00000025882) #24 RALGDS (ENSSTOG00000010884) #25 GBGT1 (ENSSTOG00000033831) Alpin marmot MODERN SPECIES 47 PRRC2B (ENSMMMG00000011717) POMT1 (ENSMMMG00000011692) UCK1 (ENSMMMG00000011656) RAPGEF1 (ENSMMMG00000011529) MED27 (ENSMMMG00000011517) NTNG2 (ENSMMMG00000011377) SETX (ENSMMMG00000011147) TTF1 (ENSMMMG00000011133) CFAP77 (ENSMMMG00000011095) BARHL1 (ENSMMMG00000011083) ENSMMMG00000011072 GTF3C4 (ENSMMMG00000011057) AK8 (ENSMMMG00000011029) #19 SPACA9 (ENSMMMG00000011006) #20 TSC1 (ENSMMMG00000010855) #21 GFI1B (ENSMMMG00000010832) #22 GTF3C5 (ENSMMMG00000010805) #23 CEL (ENSMMMG00000010784) #24 RALGDS (ENSMMMG00000010748) #25 GBGT1 (ENSMMMG00000010723) ENSMMMG00000010709 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 6 UCK1 (ENSSVLG00005016660) PRRT1B (ENSSVLG00005016788) RAPGEF1 (ENSSVLG00005016872) MED27 (ENSSVLG00005017453) ENSSVLG00005017582 NTNG2 (ENSSVLG00005017637) SETX (ENSSVLG00005017731) ENSSVLG00005017981 CFAP77 (ENSSVLG00005018111) BARHL1 (ENSSVLG00005018193) DDX31 (ENSSVLG00005018236) GTF3C4 (ENSSVLG00005018400) AK8 (ENSSVLG00005018451) #19 SPACA9 (ENSSVLG00005018579) #20 TSC1 (ENSSVLG00005018656) #21 GFI1B (ENSSVLG00005018870) #22 GTF3C5 (ENSSVLG00005019188) #23 CEL (ENSSVLG00005019483) #24 RALGDS (ENSSVLG00005019860) #25 GBGT1 (ENSSVLG00005020564) ENSSVLG00005020620 ENSSVLG00005020674 ENSSVLG00005020798 ENSSVLG00005021039 ENSSVLG00005021321 ENSSVLG00005021381 ENSSVLG00005021439 PIERCE1 (ENSSVLG00005021480) PPP1R26 (ENSSVLG00005021536) ENSSVLG00005021574 FCN1 (ENSSVLG00005021662) Tree shrew MODERN SPECIES 4794 ENSTBEG00000013636 DDX31 (ENSTBEG00000013672) GTF3C4 (ENSTBEG00000013851) AK8 (ENSTBEG00000013947) #19 ENSTBEG00000014127 SPACA9 (ENSTBEG00000014137) #20 TSC1 (ENSTBEG00000014176) #21 GFI1B (ENSTBEG00000014459) #22 GTF3C5 (ENSTBEG00000014529) #23 ENSTBEG00000014624 CEL (ENSTBEG00000014670) #24 Primates ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01020000230412.A.c.a ENSGT00940000163383 ENSGT00940000156235 ENSGT00910000147033 ENSGT00390000012207 ENSGT00940000153601.a.a ENSGT00940000160918 ENSGT00940000159729 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 ENSGT00940000161613 #19 ENSGT00390000007746 #20 ENSGT00390000014148 #21 ENSGT00940000160010 #22 ENSGT00390000004458 #23 ENSGT00940000156231 #24 ENSGT00940000153181.z #25 ENSGT00950000182858.A.b.b ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a.c.b ENSGT00940000155193.a.a.f ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 ENSGT00390000016800 ENSGT00530000064123 ENSGT00390000018038 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01020000230412.A.c.a ENSGT00940000163383 ENSGT00940000156235 ENSGT00910000147033 ENSGT00390000012207 ENSGT00940000153601.a.a ENSGT00940000160918 ENSGT00940000159729 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 ENSGT00940000161613 #19 ENSGT00390000007746 #20 ENSGT00390000014148 #21 ENSGT00940000160010 #22 ENSGT00390000004458 #23 ENSGT00940000156231 #24 ENSGT00940000153181.z #25 ENSGT00950000182858.A.b.b ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a.c.b ENSGT00940000155193.a.a.f ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 ENSGT00390000016800 ENSGT00530000064123 ENSGT00390000018038 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01020000230412.A.c.a ENSGT00940000163383 ENSGT00940000156235 ENSGT00910000147033 ENSGT00390000012207 ENSGT00940000153601.a.a ENSGT00940000160918 ENSGT00940000159729 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 ENSGT00940000161613 #19 ENSGT00390000007746 #20 ENSGT00390000014148 #21 ENSGT00940000160010 #22 ENSGT00390000004458 #23 ENSGT00940000156231 #24 ENSGT00940000153181.z #25 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Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156235 ENSGT00390000012207.j ENSGT00910000147295 ENSGT00910000147033 ENSGT00390000012207.i.b ENSGT00940000153601.a.a ENSGT00940000160918 ENSGT00940000159729 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 ENSGT00940000161613 #19 ENSGT00390000007746 #20 ENSGT00390000014148 #21 ENSGT00940000160010 #22 ENSGT00390000004458 #23 ENSGT00940000156231 #24 ENSGT00940000153181.z #25 ENSGT00950000182858.A.b.b ENSGT00950000182858.A.a.a ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.b.s ENSGT00390000014818.j ENSGT00940000153294.m.b.r.a ENSGT00530000064194 ENSGT00390000016800 ENSGT00530000064123 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156235 ENSGT00390000012207.j ENSGT00910000147295 ENSGT00910000147033 ENSGT00390000012207.i.b ENSGT00940000153601.a.a ENSGT00940000160918 ENSGT00940000159729 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 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ENSGT00940000178229 Megabat MODERN SPECIES 353 TTF1 (ENSPVAG00000002038) CFAP77 (ENSPVAG00000002042) BARHL1 (ENSPVAG00000002046) DDX31 (ENSPVAG00000002050) GTF3C4 (ENSPVAG00000002052) AK8 (ENSPVAG00000002053) #19 SPACA9 (ENSPVAG00000002055) #20 TSC1 (ENSPVAG00000002056) #21 ENSPVAG00000002058 #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158049 ENSGT01020000230412.A.c.a ENSGT00940000163383 ENSGT00940000156235 ENSGT00390000012207 ENSGT00940000153601.a.a ENSGT00940000160918 ENSGT00940000159729 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 ENSGT00940000161613 #19 ENSGT00390000007746 #20 ENSGT00390000014148 #21 ENSGT00940000160010 #22 ENSGT00390000004458 #23 ENSGT00940000156231 #24 ENSGT00940000153181.z.b #25 ENSGT00950000182858.A.b.b ENSGT00950000182858.A.a.a.m ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 ENSGT00390000016800 ENSGT00530000064123 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000178229 Microbat MODERN SPECIES 1498 SETX (ENSMLUG00000004836) ENSMLUG00000004861 DDX31 (ENSMLUG00000011507) GTF3C4 (ENSMLUG00000011547) TSC1 (ENSMLUG00000006647) #21 GFI1B (ENSMLUG00000006673) #22 GTF3C5 (ENSMLUG00000006684) #23 ENSMLUG00000026415 #24 ENSMLUG00000027198 #24 ENSMLUG00000006710 #24 ENSMLUG00000029545 #24 RALGDS (ENSMLUG00000017466) #25 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 3 POMT1 (ENSRFEG00010011466) UCK1 (ENSRFEG00010011586) PRRT1B (ENSRFEG00010011742) RAPGEF1 (ENSRFEG00010011862) MED27 (ENSRFEG00010012877) NTNG2 (ENSRFEG00010013000) SETX (ENSRFEG00010013062) TTF1 (ENSRFEG00010013126) CFAP77 (ENSRFEG00010013175) BARHL1 (ENSRFEG00010013240) DDX31 (ENSRFEG00010013285) GTF3C4 (ENSRFEG00010013327) AK8 (ENSRFEG00010013382) #19 SPACA9 (ENSRFEG00010013459) #20 TSC1 (ENSRFEG00010013563) #21 GFI1B (ENSRFEG00010013771) #22 GTF3C5 (ENSRFEG00010013965) #23 CEL (ENSRFEG00010014276) #24 RALGDS (ENSRFEG00010014681) #25 GBGT1 (ENSRFEG00010014887) ABO (ENSRFEG00010014997) 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Suina ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000158049 ENSGT01020000230412.A.c.a ENSGT00940000163383 ENSGT00940000156235 ENSGT00390000012207 ENSGT00940000153601.a.a ENSGT00940000160918 ENSGT00940000159729 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 ENSGT00940000161613 #19 ENSGT00390000007746 #20 ENSGT00390000014148 #21 ENSGT00940000160010 #22 ENSGT00390000004458 #23 ENSGT00940000156231 #24 ENSGT00940000153181.z #25 ENSGT00950000182858.A.b.b ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b ENSGT00950000182858.A.a.a ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00940000153294.m.a ENSGT00390000014818 ENSGT00530000064194 ENSGT00390000016800 ENSGT00530000064123 Pig MODERN SPECIES POMT1 (ENSSSCG00000005716) UCK1 (ENSSSCG00000005717) PRRT1B (ENSSSCG00000031465) RAPGEF1 (ENSSSCG00000005719) MED27 (ENSSSCG00000005720) NTNG2 (ENSSSCG00000005723) SETX (ENSSSCG00000005724) TTF1 (ENSSSCG00000005725) CFAP77 (ENSSSCG00000005727) BARHL1 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ENSGT00940000156880 ENSGT00950000182975.a.a.b ENSGT00390000014658 ENSGT00940000159244 ENSGT00560000078707 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 2 UCK1 (ENSBIXG00005012183) PRRT1B (ENSBIXG00005012138) RAPGEF1 (ENSBIXG00005012047) MED27 (ENSBIXG00005011937) NTNG2 (ENSBIXG00005011889) SETX (ENSBIXG00005011828) TTF1 (ENSBIXG00005011724) ENSBIXG00005011692 CFAP77 (ENSBIXG00005011671) BARHL1 (ENSBIXG00005011650) DDX31 (ENSBIXG00005011618) GTF3C4 (ENSBIXG00005011513) AK8 (ENSBIXG00005001111) #19 SPACA9 (ENSBIXG00005011449) #20 TSC1 (ENSBIXG00005011396) #21 GFI1B (ENSBIXG00005011310) #22 GTF3C5 (ENSBIXG00005011251) #23 CEL (ENSBIXG00005011145) #24 RALGDS (ENSBIXG00005011070) #25 GBGT1 (ENSBIXG00005010899) ENSBIXG00005010804 ENSBIXG00005010799 ENSBIXG00005010741 ENSBIXG00005010722 GLT6D1 (ENSBIXG00005010707) ENSBIXG00005000638 ENSBIXG00005010677 KCNT1 (ENSBIXG00005010453) CAMSAP1 (ENSBIXG00005008646) UBAC1 (ENSBIXG00005008614) NACC2 (ENSBIXG00005008585) Cow MODERN SPECIES 2 PRRT1B 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ENSCHYG00000025640 ENSCHYG00000025684 ENSCHYG00000025740 GLT6D1 (ENSCHYG00000025780) ENSCHYG00000025799 SOHLH1 (ENSCHYG00000025814) KCNT1 (ENSCHYG00000025895) CAMSAP1 (ENSCHYG00000026516) UBAC1 (ENSCHYG00000026555) NACC2 (ENSCHYG00000026588) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183161.a.b ENSGT00940000158049 ENSGT01020000230412.A.c.a ENSGT00940000156235 ENSGT00390000012207 ENSGT00940000153601.a.a ENSGT00940000160918 ENSGT00940000159729 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 ENSGT00940000161613 #19 ENSGT00390000007746 #20 ENSGT00390000014148 #21 ENSGT00940000160010 #22 ENSGT00390000004458 #23 ENSGT00940000156231 #24 ENSGT00940000153181.z #25 ENSGT00950000182858.A.b.b Arabian camel MODERN SPECIES 30 POMT1 (ENSCDRG00005006084) UCK1 (ENSCDRG00005006047) RAPGEF1 (ENSCDRG00005004831) MED27 (ENSCDRG00005004656) NTNG2 (ENSCDRG00005004638) SETX (ENSCDRG00005004571) TTF1 (ENSCDRG00005004487) ENSCDRG00005004468 CFAP77 (ENSCDRG00005004446) BARHL1 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Golden eagle MODERN SPECIES 16 POMT1 (ENSACCG00020013833) UCK1 (ENSACCG00020013870) PRRT1B (ENSACCG00020013892) RAPGEF1 (ENSACCG00020013990) MED27 (ENSACCG00020014108) NTNG2 (ENSACCG00020014123) SETX (ENSACCG00020014176) TTF1 (ENSACCG00020014241) CFAP77 (ENSACCG00020014262) BARHL1 (ENSACCG00020014275) DDX31 (ENSACCG00020014292) GTF3C4 (ENSACCG00020014316) ENSACCG00020014358 SPACA9 (ENSACCG00020014400) #20 TSC1 (ENSACCG00020014425) #21 GFI1B (ENSACCG00020014453) #22 CEL (ENSACCG00020014463) #24 GTF3C5 (ENSACCG00020014480) #23 RALGDS (ENSACCG00020014509) #25 GBGT1 (ENSACCG00020014545) ENSACCG00020014574 SURF6 (ENSACCG00020014640) MED22 (ENSACCG00020014651) RPL7A (ENSACCG00020014662) SURF1 (ENSACCG00020014703) SURF2 (ENSACCG00020014719) SURF4 (ENSACCG00020014728) ENSACCG00020014739 REXO4 (ENSACCG00020014754) ADAMTS13 (ENSACCG00020014817) ENSACCG00020014783 Kakapo MODERN SPECIES 9 POMT1 (ENSSHBG00005017043) UCK1 (ENSSHBG00005017024) PRRT1B (ENSSHBG00005017020) RAPGEF1 (ENSSHBG00005014669) 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toad MODERN SPECIES 12 ENSLLEG00000026821 RAPGEF1 (ENSLLEG00000026921) ENSLLEG00000028225 MED27 (ENSLLEG00000028273) NTNG2 (ENSLLEG00000028376) SETX (ENSLLEG00000028475) ENSLLEG00000028595 ENSLLEG00000028788 ENSLLEG00000028891 BARHL1 (ENSLLEG00000028903) DDX31 (ENSLLEG00000028957) GTF3C4 (ENSLLEG00000029087) ENSLLEG00000029120 SPACA9 (ENSLLEG00000029193) #20 TSC1 (ENSLLEG00000029219) #21 GFI1B (ENSLLEG00000029316) #22 GTF3C5 (ENSLLEG00000029343) #23 CEL (ENSLLEG00000029379) #24 ENSLLEG00000029433 #25 ENSLLEG00000029554 ENSLLEG00000029558 ENSLLEG00000029569 ENSLLEG00000029579 ENSLLEG00000029589 ENSLLEG00000029600 ENSLLEG00000029609 ENSLLEG00000029736 ENSLLEG00000029811 ENSLLEG00000029904 ENSLLEG00000029916 ENSLLEG00000029931 Frog MODERN SPECIES 8 pomt1 (ENSXETG00000001481) hsp90ab1 (ENSXETG00000001482) prrt1b (ENSXETG00000047973) rapgef1 (ENSXETG00000001485) med27 (ENSXETG00000001486) ntng2 (ENSXETG00000037767) setx (ENSXETG00000006254) ttf1 (ENSXETG00000040672) cfap77 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