Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158937	ENSGT00390000003303	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.b	ENSGT00940000156147	ENSGT00390000014113	ENSGT00940000155613	ENSGT00440000038430	ENSGT00940000156613	ENSGT00940000156816	ENSGT00940000155937	ENSGT00390000004917	ENSGT00390000002211	ENSGT00940000157960	ENSGT01020000230346.C #20	ENSGT00390000005524 #21	ENSGT00950000182980.a.a #22	ENSGT00940000158474	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00390000002237	ENSGT00950000183136.a.a	ENSGT00940000154785.A.ub	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000008198	ENSGT00390000009196	ENSGT00940000158774	ENSGT00710000106769	ENSGT00390000001830.i.a	ENSGT00390000005052	ENSGT00910000144260	ENSGT01030000234532.A.a.b	ENSGT00940000158622
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158937	ENSGT00390000003303	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.b	ENSGT00940000156147	ENSGT00390000014113	ENSGT00940000155613	ENSGT00440000038430	ENSGT00940000156613	ENSGT00940000156816	ENSGT00940000155937	ENSGT00390000004917	ENSGT00390000002211	ENSGT00940000157960	ENSGT01020000230346.C #20	ENSGT00390000005524 #21	ENSGT00950000182980.a.a #22	ENSGT00940000158474	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00390000002237	ENSGT00950000183136.a.a	ENSGT00940000154785.A.ub	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000008198	ENSGT00390000009196	ENSGT00940000158774	ENSGT00710000106769	ENSGT00390000001830.i.a	ENSGT00390000005052	ENSGT00910000144260	ENSGT01030000234532.A.a.b	ENSGT00940000158622
Megabat	MODERN SPECIES	7112														PSMC1 (ENSPVAG00000010020) #20	NRDE2 (ENSPVAG00000010023) #21	CALM1 (ENSPVAG00000010028) #22
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000158937	ENSGT00390000003303	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.b	ENSGT00940000156147	ENSGT00390000014113	ENSGT00940000155613	ENSGT00440000038430	ENSGT00940000156613	ENSGT00940000156816	ENSGT00940000155937	ENSGT00390000004917	ENSGT00390000002211	ENSGT00940000157960	ENSGT01020000230346.C #20	ENSGT00390000005524 #21	ENSGT00950000182980.a.a #22	ENSGT00940000158474	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00390000002237	ENSGT00950000183136.a.a	ENSGT00940000154785.A.ub	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000008198	ENSGT00390000009196	ENSGT00940000158774	ENSGT00710000106769	ENSGT00390000001830.i.a	ENSGT00390000005052	ENSGT00910000144260	ENSGT01030000234532.A.a.b	ENSGT00940000158622
Greater horseshoe bat	DUPLICATION
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	24	GALC (ENSRFEG00010011294)	GPR65 (ENSRFEG00010011274)	ENSRFEG00010011219	KCNK10 (ENSRFEG00010011135)	ENSRFEG00010011077	SPATA7 (ENSRFEG00010010944)	PTPN21 (ENSRFEG00010010878)	ZC3H14 (ENSRFEG00010010356)	EML5 (ENSRFEG00010010199)	TTC8 (ENSRFEG00010009898)	FOXN3 (ENSRFEG00010009812)	EFCAB11 (ENSRFEG00010009733)	TDP1 (ENSRFEG00010009605)	ENSRFEG00010009545 #20	NRDE2 (ENSRFEG00010009498) #21	ENSRFEG00010009378 #22	TTC7B (ENSRFEG00010009283)	ENSRFEG00010009197	RPS6KA5 (ENSRFEG00010009141)	DGLUCY (ENSRFEG00010008974)	GPR68 (ENSRFEG00010008925)	CCDC88C (ENSRFEG00010008851)	PPP4R3A (ENSRFEG00010008400)	CATSPERB (ENSRFEG00010008158)	TC2N (ENSRFEG00010008069)	FBLN5 (ENSRFEG00010007980)	TRIP11 (ENSRFEG00010007740)	ATXN3 (ENSRFEG00010007362)	ENSRFEG00010007278	CPSF2 (ENSRFEG00010007223)	ENSRFEG00010007181
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	22	PCDH9 (ENSRFEG00010001289)	ENSRFEG00010001244	PCDH20 (ENSRFEG00010001210)	TDRD3 (ENSRFEG00010001175)	DIAPH3 (ENSRFEG00010000605)	ENSRFEG00010000334	PCDH17 (ENSRFEG00010000323)	ENSRFEG00010000303	OLFM4 (ENSRFEG00010000281)	PCDH8 (ENSRFEG00010000264)	CNMD (ENSRFEG00010000232)	SUGT1 (ENSRFEG00010000205)	ELF1 (ENSRFEG00010000181)	WBP4 (ENSRFEG00010018932)	KBTBD6 (ENSRFEG00010018916)	ENSRFEG00010018883 #22	KBTBD7 (ENSRFEG00010018870)	MTRF1 (ENSRFEG00010018838)	NAA16 (ENSRFEG00010018490)	RGCC (ENSRFEG00010018401)	VWA8 (ENSRFEG00010017755)	DGKH (ENSRFEG00010016960)	AKAP11 (ENSRFEG00010016903)	TNFSF11 (ENSRFEG00010016778)	FAM216B (ENSRFEG00010016757)	EPSTI1 (ENSRFEG00010016685)	DNAJC15 (ENSRFEG00010016645)	ENOX1 (ENSRFEG00010016570)	CCDC122 (ENSRFEG00010016478)	LACC1 (ENSRFEG00010016430)	SMIM2 (ENSRFEG00010016302)
Microbat	MODERN SPECIES	1314										FOXN3 (ENSMLUG00000008780)	EFCAB11 (ENSMLUG00000017591)	ENSMLUG00000017592	KCNK13 (ENSMLUG00000017594)	PSMC1 (ENSMLUG00000007471) #20	NRDE2 (ENSMLUG00000007484) #21	CALM1 (ENSMLUG00000007519) #22
Equus	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158937	ENSGT00390000003303	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.b	ENSGT00940000156147	ENSGT00390000014113	ENSGT00940000155613	ENSGT00440000038430	ENSGT00940000156613	ENSGT00940000156816	ENSGT00940000155937	ENSGT00390000004917	ENSGT00390000002211	ENSGT00940000157960	ENSGT01020000230346.C #20	ENSGT00390000005524 #21	ENSGT00950000182980.a.a #22	ENSGT00940000158474	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00950000183136.a.a	ENSGT00940000154785.A.ub	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000008198	ENSGT01090000263388	ENSGT00390000009196	ENSGT00940000158774	ENSGT00710000106769.l	ENSGT00390000001830.i.a	ENSGT00390000005052	ENSGT00910000144260	ENSGT01030000234532.A.a.b	ENSGT00940000158622
Horse	MODERN SPECIES	16	GPR65 (ENSECAG00000023251)	KCNK10 (ENSECAG00000023360)	SPATA7 (ENSECAG00000010675)	PTPN21 (ENSECAG00000017641)	ZC3H14 (ENSECAG00000013214)	EML5 (ENSECAG00000012293)	TTC8 (ENSECAG00000022892)	FOXN3 (ENSECAG00000026917)	ENSECAG00000056887	EFCAB11 (ENSECAG00000018727)	TDP1 (ENSECAG00000018893)	ENSECAG00000059281	KCNK13 (ENSECAG00000001079)	PSMC1 (ENSECAG00000003601) #20	NRDE2 (ENSECAG00000003862) #21	CALM1 (ENSECAG00000009162) #22	TTC7B (ENSECAG00000012842)	RPS6KA5 (ENSECAG00000023892)	GPR68 (ENSECAG00000004969)	CCDC88C (ENSECAG00000019716)	ENSECAG00000045022	PPP4R3A (ENSECAG00000011172)	CATSPERB (ENSECAG00000006002)	ENSECAG00000055815	TC2N (ENSECAG00000007305)	FBLN5 (ENSECAG00000012066)	TRIP11 (ENSECAG00000007621)	ATXN3 (ENSECAG00000015533)	CPSF2 (ENSECAG00000023935)	SLC24A4 (ENSECAG00000013708)	RIN3 (ENSECAG00000009714)
Donkey	MODERN SPECIES	27	GALC (ENSEASG00005020327)	GPR65 (ENSEASG00005029517)	KCNK10 (ENSEASG00005020345)	SPATA7 (ENSEASG00005020353)	PTPN21 (ENSEASG00005020362)	ENSEASG00005034500	ZC3H14 (ENSEASG00005020371)	EML5 (ENSEASG00005020427)	TTC8 (ENSEASG00005020527)	FOXN3 (ENSEASG00005020541)	EFCAB11 (ENSEASG00005020550)	TDP1 (ENSEASG00005020608)	KCNK13 (ENSEASG00005030412)	PSMC1 (ENSEASG00005020668) #20	NRDE2 (ENSEASG00005020675) #21	CALM1 (ENSEASG00005020680) #22	TTC7B (ENSEASG00005020685)	RPS6KA5 (ENSEASG00005020699)	GPR68 (ENSEASG00005030111)	CCDC88C (ENSEASG00005020710)	PPP4R3A (ENSEASG00005020716)	CATSPERB (ENSEASG00005020720)	ENSEASG00005027113	TC2N (ENSEASG00005020730)	FBLN5 (ENSEASG00005020741)	TRIP11 (ENSEASG00005020749)	ATXN3 (ENSEASG00005020880)	NDUFB1 (ENSEASG00005021175)	CPSF2 (ENSEASG00005021193)	SLC24A4 (ENSEASG00005021233)	RIN3 (ENSEASG00005021264)