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Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
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Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000163467.a.a.b.f.a.b.b	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b.a	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000163467.a.a.b.f.a.b.b	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Sailfin molly	MODERN SPECIES	634											tor1 (ENSPLAG00000014637) #17	tor1 (ENSPLAG00000014655) #18	nsa2 (ENSPLAG00000014684) #19	gfm2 (ENSPLAG00000014750) #20	hexb (ENSPLAG00000014763) #21	ENC1 (ENSPLAG00000014764) #22	ENSPLAG00000014772 #23	ARHGEF28 (ENSPLAG00000014795) #24
Amazon molly	MODERN SPECIES	280	ENSPFOG00000022341	ttll11 (ENSPFOG00000014960)	dab2ipb (ENSPFOG00000014953)	dipk1b (ENSPFOG00000014908)	mrps2 (ENSPFOG00000014903)	ENSPFOG00000014898	olfm1a (ENSPFOG00000014850)	COL5A1 (ENSPFOG00000012917)	FNBP1 (ENSPFOG00000012695)	agpat2 (ENSPFOG00000012638)	egfl7 (ENSPFOG00000012611)	tor1 (ENSPFOG00000012543) #17	nsa2 (ENSPFOG00000012512) #19	gfm2 (ENSPFOG00000012381) #20	hexb (ENSPFOG00000012191) #21	ENC1 (ENSPFOG00000012176) #22	ARHGEF28 (ENSPFOG00000012124) #24	ankra2 (ENSPFOG00000012023)	foxd1 (ENSPFOG00000011960)	btf3 (ENSPFOG00000011979)	TMEM174 (ENSPFOG00000011952)	fcho2 (ENSPFOG00000011692)	TNPO1 (ENSPFOG00000011447)	mob1bb (ENSPFOG00000011395)	dck (ENSPFOG00000011348)	ENSPFOG00000010945	NPFFR2 (ENSPFOG00000010931)	ENSPFOG00000010927	ENSPFOG00000010851	fbp1b (ENSPFOG00000010778)	gas1b (ENSPFOG00000020253)
Guppy	MODERN SPECIES	442	ENSPREG00000021648	ttll11 (ENSPREG00000021639)	dab2ipb (ENSPREG00000021572)	mrps2 (ENSPREG00000021519)	ENSPREG00000021513	olfm1a (ENSPREG00000021493)	COL5A1 (ENSPREG00000021379)	FNBP1 (ENSPREG00000021213)	agpat2 (ENSPREG00000021142)	egfl7 (ENSPREG00000021100)	tor1 (ENSPREG00000021086) #17	tor1 (ENSPREG00000021079) #18	nsa2 (ENSPREG00000021068) #19	gfm2 (ENSPREG00000021026) #20	hexb (ENSPREG00000020991) #21	ENC1 (ENSPREG00000020971) #22	ENSPREG00000020933 #24	ENSPREG00000020919 #24	ankra2 (ENSPREG00000020906)	btf3 (ENSPREG00000020894)	foxd1 (ENSPREG00000020886)	TMEM174 (ENSPREG00000020871)	fcho2 (ENSPREG00000020776)	TNPO1 (ENSPREG00000020705)	mob1bb (ENSPREG00000020689)	dck (ENSPREG00000020678)	SLC4A4 (ENSPREG00000020602)	NPFFR2 (ENSPREG00000020572)	ENSPREG00000020568	ENSPREG00000020562	ENSPREG00000020548
Platyfish	MODERN SPECIES	22	mrps2 (ENSXMAG00000018132)	ENSXMAG00000018131	ENSXMAG00000026107	olfm1a (ENSXMAG00000022464)	COL5A1 (ENSXMAG00000017898)	ENSXMAG00000027308	ENSXMAG00000023352	FNBP1 (ENSXMAG00000017879)	agpat2 (ENSXMAG00000021933)	egfl7 (ENSXMAG00000005711)	tor1 (ENSXMAG00000028893) #17	tor1 (ENSXMAG00000023565) #18	nsa2 (ENSXMAG00000000762) #19	gfm2 (ENSXMAG00000000772) #20	hexb (ENSXMAG00000000795) #21	ENC1 (ENSXMAG00000023069) #22	ARHGEF28 (ENSXMAG00000014765) #24	ankra2 (ENSXMAG00000009076)	btf3 (ENSXMAG00000009089)	foxd1 (ENSXMAG00000009102)	TMEM174 (ENSXMAG00000024151)	fcho2 (ENSXMAG00000005481)	TNPO1 (ENSXMAG00000005440)	mob1bb (ENSXMAG00000005427)	dck (ENSXMAG00000005412)	SLC4A4 (ENSXMAG00000005345)	NPFFR2 (ENSXMAG00000026051)	ENSXMAG00000025366	ENSXMAG00000005324	fbp1b (ENSXMAG00000005310)	gas1b (ENSXMAG00000020027)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154427.A.d	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Mummichog	MODERN SPECIES	306									agpat2 (ENSFHEG00000006472)	egfl7 (ENSFHEG00000006462)	tor1 (ENSFHEG00000006311) #17	tor1 (ENSFHEG00000006282) #17	nsa2 (ENSFHEG00000000905) #19	gfm2 (ENSFHEG00000006210) #20	hexb (ENSFHEG00000006138) #21	ENC1 (ENSFHEG00000006127) #22	ARHGEF28 (ENSFHEG00000006108) #24	ankra2 (ENSFHEG00000006063)	btf3 (ENSFHEG00000006034)	foxd1 (ENSFHEG00000006027)	TMEM174 (ENSFHEG00000006015)	fcho2 (ENSFHEG00000005994)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1110									FNBP1 (ENSCVAG00000009768)	agpat2 (ENSCVAG00000009789)	egfl7 (ENSCVAG00000009969)	tor1 (ENSCVAG00000009976) #17	gfm2 (ENSCVAG00000010057) #20	nsa2 (ENSCVAG00000010074) #19	hexb (ENSCVAG00000010091) #21	ENC1 (ENSCVAG00000010099) #22
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156.p	ENSGT00940000157156.o	ENSGT00940000153288.a.b.b.a	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1611	ENSNFUG00015008765	plac8.1 (ENSNFUG00015008759)	cops4 (ENSNFUG00015008730)	LIN54 (ENSNFUG00015008673)	SEC31A (ENSNFUG00015008627)	TMEM150C (ENSNFUG00015008611)	ENOPH1 (ENSNFUG00015008609)	hnrnpd (ENSNFUG00015008606)	ENSNFUG00015008598	ENSNFUG00015008593	mat2al (ENSNFUG00015008587)	ENSNFUG00015008584	ZSWIM6 (ENSNFUG00015008475)	CABZ01117349.1 (ENSNFUG00015008278)	PITPNM2 (ENSNFUG00015008110)	ENC1 (ENSNFUG00015008026) #22	ARHGEF28 (ENSNFUG00015007985) #24	FAM73B (ENSNFUG00015007961)	ST6GALNAC4 (ENSNFUG00015007952)	ST6GALNAC6 (ENSNFUG00015007948)	spout1 (ENSNFUG00015007895)	CCBL1 (ENSNFUG00015007724)	SURF6 (ENSNFUG00015007712)	surf1 (ENSNFUG00015007701)	RPL7A (ENSNFUG00015007670)	USP20 (ENSNFUG00015006390)	ptges (ENSNFUG00015006244)	GARNL3 (ENSNFUG00015005423)	ENSNFUG00015005249	CACFD1 (ENSNFUG00015005239)	ptcd2 (ENSNFUG00015005220)
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	150	dab2ipb (ENSKMAG00000012390)	ttll11 (ENSKMAG00000012516)	dipk1b (ENSKMAG00000012539)	mrps2 (ENSKMAG00000012557)	ENSKMAG00000012579	olfm1a (ENSKMAG00000012620)	ENSKMAG00000012663	ENSKMAG00000012699	FNBP1 (ENSKMAG00000012784)	agpat2 (ENSKMAG00000013050)	egfl7 (ENSKMAG00000013148)	tor1 (ENSKMAG00000013227) #17	nsa2 (ENSKMAG00000013244) #19	gfm2 (ENSKMAG00000013277) #20	hexb (ENSKMAG00000013345) #21	ENC1 (ENSKMAG00000013378) #22
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e.l #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156.m	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e.l.a.b #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.e.l.a.a #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156.m	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	3	zgc:63972 (ENSOJAG00000010443)	dab2ipb (ENSOJAG00000010728)	ttll11 (ENSOJAG00000012352)	dipk1b (ENSOJAG00000012407)	mrps2 (ENSOJAG00000012422)	ENSOJAG00000012439	olfm1a (ENSOJAG00000012455)	COL5A1 (ENSOJAG00000012526)	FNBP1 (ENSOJAG00000012626)	agpat2 (ENSOJAG00000012718)	egfl7 (ENSOJAG00000012729)	tor1 (ENSOJAG00000012750) #17	tor1 (ENSOJAG00000012776) #17	nsa2 (ENSOJAG00000012785) #19	ENSOJAG00000012801 #20	ENC1 (ENSOJAG00000012890) #22	ARHGEF28 (ENSOJAG00000012916) #24	ankra2 (ENSOJAG00000013011)	btf3 (ENSOJAG00000013079)	foxd1 (ENSOJAG00000013148)	TMEM174 (ENSOJAG00000013157)	fcho2 (ENSOJAG00000013199)	TNPO1 (ENSOJAG00000013577)	mob1bb (ENSOJAG00000014572)	dck (ENSOJAG00000014618)	SLC4A4 (ENSOJAG00000014859)	NPFFR2 (ENSOJAG00000017219)	ENSOJAG00000017235	ENSOJAG00000017260	fbp1b (ENSOJAG00000017269)	gas1b (ENSOJAG00000017286)
Indian medaka	MODERN SPECIES	30	ENSOMEG00000013226	olfm1a (ENSOMEG00000013275)	ENSOMEG00000013314	ENSOMEG00000013349	FNBP1 (ENSOMEG00000013391)	agpat2 (ENSOMEG00000013414)	egfl7 (ENSOMEG00000013528)	tor1 (ENSOMEG00000000734) #17	tor1 (ENSOMEG00000013592) #17	tor1 (ENSOMEG00000000697) #17	tor1 (ENSOMEG00000013630) #17	tor1 (ENSOMEG00000013661) #17	nsa2 (ENSOMEG00000013689) #19	gfm2 (ENSOMEG00000013774) #20	hexb (ENSOMEG00000013880) #21	ENC1 (ENSOMEG00000013923) #22	ARHGEF28 (ENSOMEG00000014109) #24	ankra2 (ENSOMEG00000014199)	foxd1 (ENSOMEG00000014209)	btf3 (ENSOMEG00000014241)	TMEM174 (ENSOMEG00000014273)	fcho2 (ENSOMEG00000014430)	TNPO1 (ENSOMEG00000014567)	mob1bb (ENSOMEG00000014587)	dck (ENSOMEG00000014621)	SLC4A4 (ENSOMEG00000014851)	NPFFR2 (ENSOMEG00000014930)	ENSOMEG00000014942	ENSOMEG00000014975	fbp1b (ENSOMEG00000015002)	gas1b (ENSOMEG00000015018)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e.l #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156.m	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777
Chinese medaka	MODERN SPECIES	753					ttll11 (ENSOSIG00000004764)	dipk1b (ENSOSIG00000004768)	mrps2 (ENSOSIG00000004776)	ENSOSIG00000004779	olfm1a (ENSOSIG00000004784)	ENSOSIG00000004789	FNBP1 (ENSOSIG00000004837)	agpat2 (ENSOSIG00000006447)	egfl7 (ENSOSIG00000006448)	tor1 (ENSOSIG00000006455) #17	nsa2 (ENSOSIG00000006456) #19	ENC1 (ENSOSIG00000006461) #22	ankra2 (ENSOSIG00000006464)	btf3 (ENSOSIG00000006465)	foxd1 (ENSOSIG00000006466)	TMEM174 (ENSOSIG00000006467)	fcho2 (ENSOSIG00000006476)	TNPO1 (ENSOSIG00000007249)	mob1ba (ENSOSIG00000008338)	ENSOSIG00000008374	ENSOSIG00000016533	fbp1b (ENSOSIG00000016535)	gas1b (ENSOSIG00000016536)	c9 (ENSOSIG00000016538)	dab2 (ENSOSIG00000016543)	zgc:162472 (ENSOSIG00000016546)	RTKN (ENSOSIG00000016555)
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	3	dab2ipb (ENSORLG00000003707)	ttll11 (ENSORLG00000003660)	dipk1b (ENSORLG00000003651)	mrps2 (ENSORLG00000003640)	ENSORLG00000030208	olfm1a (ENSORLG00000025343)	COL5A1 (ENSORLG00000003591)	ENSORLG00000025318	FNBP1 (ENSORLG00000003554)	agpat2 (ENSORLG00000003435)	egfl7 (ENSORLG00000003417)	tor1 (ENSORLG00000003403) #17	nsa2 (ENSORLG00000003379) #19	gfm2 (ENSORLG00000003360) #20	hexb (ENSORLG00000003323) #21	ENC1 (ENSORLG00000003288) #22	ARHGEF28 (ENSORLG00000028035) #24	ankra2 (ENSORLG00000003277)	ENSORLG00000022026	btf3 (ENSORLG00000003257)	TMEM174 (ENSORLG00000003242)	fcho2 (ENSORLG00000003234)	TNPO1 (ENSORLG00000003182)	mob1bb (ENSORLG00000003125)	dck (ENSORLG00000003108)	SLC4A4 (ENSORLG00000003072)	NPFFR2 (ENSORLG00000003050)	ENSORLG00000003038	ENSORLG00000003024	fbp1b (ENSORLG00000002997)	gas1b (ENSORLG00000002967)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000181622	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000181622	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000181622	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1330												tor1 (ENSAOCG00000014393) #17	nsa2 (ENSAOCG00000014373) #19	gfm2 (ENSAOCG00000014342) #20	hexb (ENSAOCG00000014256) #21	ENC1 (ENSAOCG00000014173) #22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	7	ENSAPEG00000023140	dab2ipb (ENSAPEG00000023179)	ttll11 (ENSAPEG00000023272)	dipk1b (ENSAPEG00000023298)	mrps2 (ENSAPEG00000023312)	olfm1a (ENSAPEG00000023333)	COL5A1 (ENSAPEG00000023373)	ENSAPEG00000023518	FNBP1 (ENSAPEG00000023547)	agpat2 (ENSAPEG00000023715)	egfl7 (ENSAPEG00000023724)	tor1 (ENSAPEG00000000332) #17	nsa2 (ENSAPEG00000000376) #19	gfm2 (ENSAPEG00000000424) #20	hexb (ENSAPEG00000000545) #21	ENC1 (ENSAPEG00000000639) #22	ARHGEF28 (ENSAPEG00000000716) #24	ankra2 (ENSAPEG00000000895)	btf3 (ENSAPEG00000000915)	foxd1 (ENSAPEG00000000936)	ENSAPEG00000000952	TMEM174 (ENSAPEG00000000954)	fcho2 (ENSAPEG00000000982)	TNPO1 (ENSAPEG00000001112)	mob1bb (ENSAPEG00000001183)	dck (ENSAPEG00000001210)	SLC4A4 (ENSAPEG00000001234)	NPFFR2 (ENSAPEG00000001373)	ENSAPEG00000001459	ENSAPEG00000001466	fbp1b (ENSAPEG00000001478)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	150						ENSAPOG00000005203	COL5A1 (ENSAPOG00000005584)	ENSAPOG00000005629	FNBP1 (ENSAPOG00000000139)	agpat2 (ENSAPOG00000000141)	egfl7 (ENSAPOG00000005827)	tor1 (ENSAPOG00000005853) #17	nsa2 (ENSAPOG00000005882) #19	gfm2 (ENSAPOG00000005965) #20	hexb (ENSAPOG00000006044) #21	ENC1 (ENSAPOG00000001131) #22	ARHGEF28 (ENSAPOG00000006195) #24	ankra2 (ENSAPOG00000006251)	btf3 (ENSAPOG00000006276)	foxd1 (ENSAPOG00000006297)	TMEM174 (ENSAPOG00000006338)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1280												tor1 (ENSSPAG00000014091) #17	nsa2 (ENSSPAG00000014137) #19	gfm2 (ENSSPAG00000014163) #20	hexb (ENSSPAG00000014244) #21	ENC1 (ENSSPAG00000014329) #22	ARHGEF28 (ENSSPAG00000014338) #24
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.a.b	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.a.b	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.a.b	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	287	ttll11 (ENSHBUG00000010134)	ENSHBUG00000010142	dipk1b (ENSHBUG00000010155)	mrps2 (ENSHBUG00000010171)	olfm1a (ENSHBUG00000010226)	ENSHBUG00000010242	COL5A1 (ENSHBUG00000010535)	ENSHBUG00000010575	FNBP1 (ENSHBUG00000010835)	agpat2 (ENSHBUG00000010863)	egfl7 (ENSHBUG00000010873)	tor1 (ENSHBUG00000010924) #17	nsa2 (ENSHBUG00000010944) #19	gfm2 (ENSHBUG00000011021) #20	hexb (ENSHBUG00000011110) #21	ENC1 (ENSHBUG00000011125) #22
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777
P. nyererei	MODERN SPECIES	297	ENSPNYG00000002651	dipk1b (ENSPNYG00000002632)	mrps2 (ENSPNYG00000002624)	ENSPNYG00000002612	olfm1a (ENSPNYG00000002567)	COL5A1 (ENSPNYG00000002267)	ENSPNYG00000002231	ENSPNYG00000002214	FNBP1 (ENSPNYG00000002152)	agpat2 (ENSPNYG00000002138)	egfl7 (ENSPNYG00000002069)	tor1 (ENSPNYG00000002052) #17	nsa2 (ENSPNYG00000002028) #19	gfm2 (ENSPNYG00000001950) #20	hexb (ENSPNYG00000001935) #21	ENC1 (ENSPNYG00000001928) #22	ENSPNYG00000001882 #24	ankra2 (ENSPNYG00000001843)	btf3 (ENSPNYG00000001828)	foxd1 (ENSPNYG00000001818)	fcho2 (ENSPNYG00000001628)	TNPO1 (ENSPNYG00000001522)	mob1bb (ENSPNYG00000001509)	dck (ENSPNYG00000001253)	SLC4A4 (ENSPNYG00000001164)	NPFFR2 (ENSPNYG00000001069)	ENSPNYG00000000984	ENSPNYG00000000952	fbp1b (ENSPNYG00000000923)	gas1b (ENSPNYG00000000902)	c9 (ENSPNYG00000000896)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	dab2ipb (ENSMZEG00005003883)	ttll11 (ENSMZEG00005003989)	ENSMZEG00005004032	dipk1b (ENSMZEG00005004041)	mrps2 (ENSMZEG00005004066)	olfm1a (ENSMZEG00005004110)	COL5A1 (ENSMZEG00005004152)	ENSMZEG00005004297	FNBP1 (ENSMZEG00005004314)	agpat2 (ENSMZEG00005004407)	egfl7 (ENSMZEG00005004420)	tor1 (ENSMZEG00005004445) #17	nsa2 (ENSMZEG00005004450) #19	gfm2 (ENSMZEG00005004469) #20	hexb (ENSMZEG00005004537) #21	ENC1 (ENSMZEG00005004589) #22	ENSMZEG00005004598 #24	ankra2 (ENSMZEG00005004645)	btf3 (ENSMZEG00005004698)	foxd1 (ENSMZEG00005004712)	fcho2 (ENSMZEG00005004754)	TNPO1 (ENSMZEG00005004913)	mob1bb (ENSMZEG00005004954)	dck (ENSMZEG00005004974)	SLC4A4 (ENSMZEG00005005012)	NPFFR2 (ENSMZEG00005005088)	ENSMZEG00005005173	ENSMZEG00005005187	fbp1b (ENSMZEG00005005220)	gas1b (ENSMZEG00005005253)	c9 (ENSMZEG00005005264)
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	ENSACLG00000027616	dipk1b (ENSACLG00000027613)	mrps2 (ENSACLG00000027610)	ENSACLG00000027608	ENSACLG00000027602	olfm1a (ENSACLG00000027600)	COL5A1 (ENSACLG00000027546)	ENSACLG00000027526	FNBP1 (ENSACLG00000027481)	agpat2 (ENSACLG00000027477)	egfl7 (ENSACLG00000027456)	tor1 (ENSACLG00000027453) #17	nsa2 (ENSACLG00000027450) #19	gfm2 (ENSACLG00000027430) #20	hexb (ENSACLG00000027420) #21	ENC1 (ENSACLG00000027402) #22	ARHGEF28 (ENSACLG00000027367) #24	ankra2 (ENSACLG00000027357)	btf3 (ENSACLG00000027347)	foxd1 (ENSACLG00000027344)	ENSACLG00000027336	fcho2 (ENSACLG00000027259)	TNPO1 (ENSACLG00000027223)	mob1bb (ENSACLG00000027216)	dck (ENSACLG00000027209)	SLC4A4 (ENSACLG00000027117)	NPFFR2 (ENSACLG00000027070)	ENSACLG00000027054	ENSACLG00000027025	fbp1b (ENSACLG00000027007)	gas1b (ENSACLG00000026998)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	336	dab2ipb (ENSNBRG00000008531)	ENSNBRG00000008604	ENSNBRG00000008612	dipk1b (ENSNBRG00000008628)	mrps2 (ENSNBRG00000008658)	olfm1a (ENSNBRG00000008693)	COL5A1 (ENSNBRG00000008750)	ENSNBRG00000009001	FNBP1 (ENSNBRG00000009051)	agpat2 (ENSNBRG00000009109)	egfl7 (ENSNBRG00000009119)	tor1 (ENSNBRG00000009136) #17	nsa2 (ENSNBRG00000009155) #19	gfm2 (ENSNBRG00000009181) #20	hexb (ENSNBRG00000009225) #21	ENC1 (ENSNBRG00000009321) #22	ARHGEF28 (ENSNBRG00000009368) #24	ankra2 (ENSNBRG00000009594)	btf3 (ENSNBRG00000009623)	foxd1 (ENSNBRG00000009642)	fcho2 (ENSNBRG00000009710)	TNPO1 (ENSNBRG00000009998)	mob1bb (ENSNBRG00000010053)	dck (ENSNBRG00000010072)	SLC4A4 (ENSNBRG00000010089)	NPFFR2 (ENSNBRG00000010141)	ENSNBRG00000010162	ENSNBRG00000010215	fbp1b (ENSNBRG00000010231)	gas1b (ENSNBRG00000010256)	c9 (ENSNBRG00000010281)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	dab2ipb (ENSONIG00000011245)	ttll11 (ENSONIG00000011243)	dipk1b (ENSONIG00000011241)	mrps2 (ENSONIG00000011240)	ENSONIG00000023677	olfm1a (ENSONIG00000011237)	ENSONIG00000011209	FNBP1 (ENSONIG00000011203)	agpat2 (ENSONIG00000011201)	ENSONIG00000035802	egfl7 (ENSONIG00000011197)	tor1 (ENSONIG00000011193) #17	nsa2 (ENSONIG00000011188) #19	gfm2 (ENSONIG00000011183) #20	hexb (ENSONIG00000011177) #21	ENC1 (ENSONIG00000020511) #22	ARHGEF28 (ENSONIG00000011175) #24	ankra2 (ENSONIG00000037402)	btf3 (ENSONIG00000011166)	foxd1 (ENSONIG00000020510)	ENSONIG00000040457	fcho2 (ENSONIG00000011160)	TNPO1 (ENSONIG00000011151)	mob1bb (ENSONIG00000011150)	dck (ENSONIG00000011146)	SLC4A4 (ENSONIG00000011138)	NPFFR2 (ENSONIG00000011136)	ENSONIG00000011135	ENSONIG00000011130	fbp1b (ENSONIG00000011126)	GAS1 (ENSONIG00000020508)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159777	ENSGT00940000155567	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000013846.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462
Fugu	MODERN SPECIES	18	c9 (ENSTRUG00000018574)	dab2 (ENSTRUG00000018569)	mrps2 (ENSTRUG00000018568)	ENSTRUG00000020074	olfm1a (ENSTRUG00000018565)	ENSTRUG00000021440	COL5A1 (ENSTRUG00000018538)	FNBP1 (ENSTRUG00000018533)	agpat2 (ENSTRUG00000018530)	egfl7 (ENSTRUG00000021363)	tor1 (ENSTRUG00000024655) #18	tor1 (ENSTRUG00000018521) #17	tor1 (ENSTRUG00000024523) #17	nsa2 (ENSTRUG00000025113) #19	hexb (ENSTRUG00000018510) #21	ENC1 (ENSTRUG00000018509) #22	ARHGEF28 (ENSTRUG00000018508) #24	ankra2 (ENSTRUG00000018506)	btf3 (ENSTRUG00000023038)	foxd1 (ENSTRUG00000018503)	fcho2 (ENSTRUG00000018494)	mob1bb (ENSTRUG00000018489)	dck (ENSTRUG00000031783)	SLC4A4 (ENSTRUG00000018460)	npffr-2 (ENSTRUG00000018455)	ENSTRUG00000028567	ENSTRUG00000032548	aif1l (ENSTRUG00000020405)	prkaa1 (ENSTRUG00000018441)	ttc33 (ENSTRUG00000018440)	ptger4b (ENSTRUG00000028946)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	377									ENSLBEG00000020159	agpat2 (ENSLBEG00000020181)	egfl7 (ENSLBEG00000020202)	tor1 (ENSLBEG00000020286) #17	nsa2 (ENSLBEG00000020299) #19	gfm2 (ENSLBEG00000020327) #20	hexb (ENSLBEG00000020421) #21	ENC1 (ENSLBEG00000020565) #22	ARHGEF28 (ENSLBEG00000020679) #24	ankra2 (ENSLBEG00000021076)	btf3 (ENSLBEG00000021101)	foxd1 (ENSLBEG00000021126)	fcho2 (ENSLBEG00000021231)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000177534	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000177534	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000177534	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
European seabass	MODERN SPECIES	9	ttll11 (ENSDLAG00005020892)	ENSDLAG00005020889	ENSDLAG00005020886	ENSDLAG00005026339	ENSDLAG00005026497	ENSDLAG00005020853	ENSDLAG00005020848	ENSDLAG00005019465	ENSDLAG00005032168	ENSDLAG00005028638 #18	ENSDLAG00005027893	ENSDLAG00005029718 #17	NSA2 (ENSDLAG00005019422) #19	gfm2 (ENSDLAG00005018401) #20	hexb (ENSDLAG00005017654) #21	ENC1 (ENSDLAG00005017634) #22	ARHGEF28 (ENSDLAG00005017354) #24	ankra2 (ENSDLAG00005017531)	btf3 (ENSDLAG00005006186)	foxd1 (ENSDLAG00005029808)	TMEM174 (ENSDLAG00005017336)	fcho2 (ENSDLAG00005016468)	TNPO1 (ENSDLAG00005015570)	mob1bb (ENSDLAG00005001255)	DCK (ENSDLAG00005015518)	SLC4A4 (ENSDLAG00005012024)	NPFFR2 (ENSDLAG00005011980)	ENSDLAG00005011969	ENSDLAG00005011901	gas1b (ENSDLAG00005011889)	ENSDLAG00005011878
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	4	dab2ipb (ENSLCRG00005004818)	ttll11 (ENSLCRG00005004985)	dipk1b (ENSLCRG00005004988)	mrps2 (ENSLCRG00005004990)	ENSLCRG00005004991	olfm1a (ENSLCRG00005004992)	COL5A1 (ENSLCRG00005004998)	ENSLCRG00005005002	FNBP1 (ENSLCRG00005005019)	agpat2 (ENSLCRG00005005782)	egfl7 (ENSLCRG00005005783)	tor1 (ENSLCRG00005005786) #17	nsa2 (ENSLCRG00005005788) #19	gfm2 (ENSLCRG00005005797) #20	hexb (ENSLCRG00005005847) #21	ENC1 (ENSLCRG00005006223) #22	ARHGEF28 (ENSLCRG00005006225) #24	ankra2 (ENSLCRG00005006233)	btf3 (ENSLCRG00005006241)	foxd1 (ENSLCRG00005006254)	TMEM174 (ENSLCRG00005006256)	ENSLCRG00005006257	fcho2 (ENSLCRG00005006297)	TNPO1 (ENSLCRG00005008667)	mob1bb (ENSLCRG00005008720)	dck (ENSLCRG00005008722)	SLC4A4 (ENSLCRG00005008735)	atp5fa1 (ENSLCRG00005010046)	hwa (ENSLCRG00005010221)	zgc:122979 (ENSLCRG00005010224)	ENSLCRG00005010226
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	3	COL5A1 (ENSSAUG00010019625)	ENSSAUG00010019621	FNBP1 (ENSSAUG00010015419)	agpat2 (ENSSAUG00010015362)	egfl7 (ENSSAUG00010015339)	ENSSAUG00010015309	ENSSAUG00010015298	tor1 (ENSSAUG00010015291) #18	tor1 (ENSSAUG00010015289) #18	tor1 (ENSSAUG00010015287) #18	tor1 (ENSSAUG00010015285) #18	tor1 (ENSSAUG00010015282) #17	nsa2 (ENSSAUG00010015274) #19	gfm2 (ENSSAUG00010013860) #20	hexb (ENSSAUG00010013757) #21	ENC1 (ENSSAUG00010013742) #22	ARHGEF28 (ENSSAUG00010013738) #24	ankra2 (ENSSAUG00010013735)	btf3 (ENSSAUG00010013734)	foxd1 (ENSSAUG00010013733)	TMEM174 (ENSSAUG00010013732)	fcho2 (ENSSAUG00010013016)	TNPO1 (ENSSAUG00010010779)	mob1bb (ENSSAUG00010010730)	dck (ENSSAUG00010010725)	SLC4A4 (ENSSAUG00010010148)	NPFFR2 (ENSSAUG00010010136)	ENSSAUG00010010132	ENSSAUG00010010129	fbp1b (ENSSAUG00010010126)	gas1b (ENSSAUG00010010125)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT01040000244713	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT01040000244713	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pike perch	MODERN SPECIES	33	ttll11 (ENSSLUG00000022799)	dipk1b (ENSSLUG00000022807)	mrps2 (ENSSLUG00000022813)	ENSSLUG00000022816	olfm1a (ENSSLUG00000022831)	COL5A1 (ENSSLUG00000022876)	ENSSLUG00000022886	FNBP1 (ENSSLUG00000022956)	agpat2 (ENSSLUG00000023560)	egfl7 (ENSSLUG00000023566)	tor1 (ENSSLUG00000023572) #18	tor1 (ENSSLUG00000023578) #17	nsa2 (ENSSLUG00000023585) #19	gfm2 (ENSSLUG00000023617) #20	hexb (ENSSLUG00000023865) #21	ENC1 (ENSSLUG00000024173) #22	ARHGEF28 (ENSSLUG00000024179) #24	ankra2 (ENSSLUG00000024202)	btf3 (ENSSLUG00000024208)	foxd1 (ENSSLUG00000024212)	fcho2 (ENSSLUG00000024230)	TNPO1 (ENSSLUG00000024422)	mob1bb (ENSSLUG00000024630)	dck (ENSSLUG00000024643)	SLC4A4 (ENSSLUG00000024801)	NPFFR2 (ENSSLUG00000025461)	ENSSLUG00000025464	ENSSLUG00000001570	fbp1b (ENSSLUG00000001585)	gas1b (ENSSLUG00000001595)	c9 (ENSSLUG00000001632)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	3	mrps2 (ENSCGOG00000008415)	ENSCGOG00000008410	olfm1a (ENSCGOG00000008397)	COL5A1 (ENSCGOG00000008390)	FNBP1 (ENSCGOG00000005602)	agpat2 (ENSCGOG00000005552)	egfl7 (ENSCGOG00000005539)	tor1 (ENSCGOG00000005524) #17	tor1 (ENSCGOG00000005486) #17	tor1 (ENSCGOG00000005484) #17	tor1 (ENSCGOG00000005480) #17	tor1 (ENSCGOG00000005447) #17	nsa2 (ENSCGOG00000005397) #19	gfm2 (ENSCGOG00000005289) #20	hexb (ENSCGOG00000004228) #21	ENC1 (ENSCGOG00000004176) #22	ARHGEF28 (ENSCGOG00000004149) #24	ankra2 (ENSCGOG00000004121)	btf3 (ENSCGOG00000004085)	foxd1 (ENSCGOG00000004064)	ENSCGOG00000024118	fcho2 (ENSCGOG00000024058)	TNPO1 (ENSCGOG00000023998)	mob1bb (ENSCGOG00000023990)	dck (ENSCGOG00000023978)	SLC4A4 (ENSCGOG00000022658)	NPFFR2 (ENSCGOG00000022515)	ENSCGOG00000022508	ENSCGOG00000022507	ENSCGOG00000022505	fbp1b (ENSCGOG00000022483)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000159526	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000158321	ENSGT00390000015280	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777	ENSGT00940000155567
Stickleback	MODERN SPECIES	13	zgc:63972 (ENSGACG00000015917)	dab2ipb (ENSGACG00000015916)	ttll11 (ENSGACG00000015915)	dipk1b (ENSGACG00000015914)	mrps2 (ENSGACG00000015913)	olfm1a (ENSGACG00000015907)	COL5A1 (ENSGACG00000015903)	FNBP1 (ENSGACG00000015902)	ENSGACG00000015900	agpat2 (ENSGACG00000015898)	egfl7 (ENSGACG00000015896)	tor1 (ENSGACG00000015894) #17	nsa2 (ENSGACG00000015892) #19	gfm2 (ENSGACG00000015889) #20	hexb (ENSGACG00000015887) #21	ENC1 (ENSGACG00000015886) #22	erbin (ENSGACG00000015884)	nln (ENSGACG00000015881)	sgtb (ENSGACG00000015874)	trappc13 (ENSGACG00000015870)	mob1bb (ENSGACG00000015867)	dck (ENSGACG00000015866)	SLC4A4 (ENSGACG00000015864)	NPFFR2 (ENSGACG00000015862)	ENSGACG00000015860	ENSGACG00000015859	fbp1b (ENSGACG00000015857)	c9 (ENSGACG00000015856)	dab2 (ENSGACG00000015854)	zgc:162472 (ENSGACG00000015852)	ENSGACG00000015851
Lumpfish	MODERN SPECIES	3	FNBP1 (ENSCLMG00005013853)	agpat2 (ENSCLMG00005013857)	egfl7 (ENSCLMG00005013888)	ENSCLMG00005013892	tor1 (ENSCLMG00005013893) #17	ENSCLMG00005013895	hexb (ENSCLMG00005013901) #21	ENSCLMG00005013928	ENSCLMG00005013929	ENSCLMG00005013931	ENSCLMG00005013933	ENSCLMG00005013934	ENSCLMG00005013935	ENSCLMG00005013936	ENSCLMG00005013937	ENC1 (ENSCLMG00005013939) #22	ARHGEF28 (ENSCLMG00005013941) #24	nln (ENSCLMG00005013946)	sgtb (ENSCLMG00005014432)	trappc13 (ENSCLMG00005014437)	mob1bb (ENSCLMG00005014457)	dck (ENSCLMG00005014459)	SLC4A4 (ENSCLMG00005014467)	NPFFR2 (ENSCLMG00005015541)	ENSCLMG00005015542	ENSCLMG00005015547	fbp1b (ENSCLMG00005015558)	gas1b (ENSCLMG00005015560)	ENSCLMG00005015561	dab2 (ENSCLMG00005015621)	ENSCLMG00005015622
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000155853.d.a.b	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000017026	ENSGT00940000159952.a.b	ENSGT00390000009710	ENSGT00940000157603	ENSGT00940000157310.g	ENSGT00990000203589.b.b	ENSGT00940000158270	ENSGT00940000158176	ENSGT00390000003122.a.a.a	ENSGT00510000046704.b.a.c	ENSGT00940000156354.p	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT01040000244713	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777
Tongue sole	MODERN SPECIES	5	AP3B1 (ENSCSEG00000013388)	scamp1 (ENSCSEG00000013358)	lhfpl2a (ENSCSEG00000013349)	ARSB (ENSCSEG00000013331)	ARSB (ENSCSEG00000013315)	ARSB (ENSCSEG00000013306)	ARSB (ENSCSEG00000013290)	DMGDH (ENSCSEG00000013250)	bhmt (ENSCSEG00000013233)	JMY (ENSCSEG00000013221)	HOMER1 (ENSCSEG00000013201)	tor1 (ENSCSEG00000013176) #17	nsa2 (ENSCSEG00000013161) #19	gfm2 (ENSCSEG00000013115) #20	hexb (ENSCSEG00000013085) #21	ENC1 (ENSCSEG00000013077) #22	ARHGEF28 (ENSCSEG00000013022) #24	ankra2 (ENSCSEG00000012998)	btf3 (ENSCSEG00000013006)	foxd1 (ENSCSEG00000012995)	fcho2 (ENSCSEG00000012754)	TNPO1 (ENSCSEG00000012674)	mob1bb (ENSCSEG00000012669)	dck (ENSCSEG00000012658)	SLC4A4 (ENSCSEG00000012599)	NPFFR2 (ENSCSEG00000012579)	ENSCSEG00000012575	ENSCSEG00000012569	fbp1b (ENSCSEG00000012550)	gas1b (ENSCSEG00000012543)	pi4kaa (ENSCSEG00000012459)
Turbot	MODERN SPECIES	16	otpa (ENSSMAG00000026303)	tbca (ENSSMAG00000010486)	AP3B1 (ENSSMAG00000010503)	SCAMP1 (ENSSMAG00000010527)	ENSSMAG00000026772	LHFPL2 (ENSSMAG00000010559)	ARSB (ENSSMAG00000010569)	DMGDH (ENSSMAG00000010584)	bhmt (ENSSMAG00000010622)	JMY (ENSSMAG00000010657)	HOMER1 (ENSSMAG00000010667)	ENSSMAG00000010704 #17	NSA2 (ENSSMAG00000010754) #19	gfm2 (ENSSMAG00000010773) #20	hexb (ENSSMAG00000010849) #21	ENC1 (ENSSMAG00000011072) #22	ENSSMAG00000034516	ARHGEF28 (ENSSMAG00000011073) #24	ankra2 (ENSSMAG00000011128)	btf3 (ENSSMAG00000011148)	foxd1 (ENSSMAG00000028504)	ENSSMAG00000032227	fcho2 (ENSSMAG00000011163)	TNPO1 (ENSSMAG00000011202)	ENSSMAG00000011258	ENSSMAG00000011280	ENSSMAG00000011390	nudcd3 (ENSSMAG00000011438)	mrps24 (ENSSMAG00000030328)	gnsb (ENSSMAG00000011471)	polm (ENSSMAG00000011509)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155853.d.a.b	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Barramundi perch	MODERN SPECIES		dab2ipb (ENSLCAG00010020210)	ttll11 (ENSLCAG00010020231)	ENSLCAG00010020235	dipk1b (ENSLCAG00010020238)	mrps2 (ENSLCAG00010020240)	ENSLCAG00010020242	olfm1a (ENSLCAG00010020247)	ENSLCAG00010020278	FNBP1 (ENSLCAG00010020448)	agpat2 (ENSLCAG00010020612)	egfl7 (ENSLCAG00010020616)	tor1 (ENSLCAG00010020635) #17	nsa2 (ENSLCAG00010020661) #19	gfm2 (ENSLCAG00010020737) #20	hexb (ENSLCAG00010020934) #21	ENC1 (ENSLCAG00010021005) #22	ARHGEF28 (ENSLCAG00010021010) #24	ankra2 (ENSLCAG00010021015)	btf3 (ENSLCAG00010021025)	foxd1 (ENSLCAG00010021037)	TMEM174 (ENSLCAG00010021040)	fcho2 (ENSLCAG00010021128)	TNPO1 (ENSLCAG00010021272)	mob1bb (ENSLCAG00010021563)	dck (ENSLCAG00010021576)	SLC4A4 (ENSLCAG00010021674)	NPFFR2 (ENSLCAG00010022165)	ENSLCAG00010022172	ENSLCAG00010022179	fbp1b (ENSLCAG00010022190)	gas1b (ENSLCAG00010022199)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	114	ENSGT00940000157321	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f.b #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.f.a #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3042	SLC4A4 (ENSSLDG00000015570)	dck (ENSSLDG00000015520)	mob1bb (ENSSLDG00000015512)	mrps2 (ENSSLDG00000015489)	olfm1a (ENSSLDG00000015461)	COL5A1 (ENSSLDG00000015379)	FNBP1 (ENSSLDG00000015269)	agpat2 (ENSSLDG00000015225)	egfl7 (ENSSLDG00000015176)	tor1 (ENSSLDG00000015158) #17	tor1 (ENSSLDG00000015142) #18	tor1 (ENSSLDG00000015126) #18	nsa2 (ENSSLDG00000015100) #19	gfm2 (ENSSLDG00000014952) #20	hexb (ENSSLDG00000015025) #21	ENC1 (ENSSLDG00000014933) #22	ARHGEF28 (ENSSLDG00000014890) #24	ankra2 (ENSSLDG00000014857)	btf3 (ENSSLDG00000014843)	foxd1 (ENSSLDG00000014830)	TMEM174 (ENSSLDG00000014821)	fcho2 (ENSSLDG00000014677)	TNPO1 (ENSSLDG00000014578)	HOMER1 (ENSSLDG00000014538)	JMY (ENSSLDG00000014512)	bhmt (ENSSLDG00000014491)	DMGDH (ENSSLDG00000014440)	ARSB (ENSSLDG00000014410)	lhfpl2a (ENSSLDG00000014391)	scamp1 (ENSSLDG00000014368)	AP3B1 (ENSSLDG00000014297)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	286												tor1 (ENSSDUG00000021250) #18	nsa2 (ENSSDUG00000021266) #19	gfm2 (ENSSDUG00000021273) #20	hexb (ENSSDUG00000021322) #21	ENC1 (ENSSDUG00000021619) #22
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00390000014118	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	3	dab2ipb (ENSMAMG00000018682)	ttll11 (ENSMAMG00000018750)	ENSMAMG00000018780	ENSMAMG00000024326	ENSMAMG00000018821	ENSMAMG00000018845	ENSMAMG00000019021	ENSMAMG00000019202	ENSMAMG00000019221	mrps2 (ENSMAMG00000019225)	ENSMAMG00000019247 #18	ENSMAMG00000000375 #17	NSA2 (ENSMAMG00000025113) #19	gfm2 (ENSMAMG00000000452) #20	hexb (ENSMAMG00000000591) #21	ENC1 (ENSMAMG00000000656) #22	ARHGEF28 (ENSMAMG00000000680) #24	ankra2 (ENSMAMG00000000896)	btf3 (ENSMAMG00000028335)	foxd1 (ENSMAMG00000000953)	TMEM174 (ENSMAMG00000000976)	fcho2 (ENSMAMG00000001025)	TNPO1 (ENSMAMG00000001357)	mob1bb (ENSMAMG00000025274)	DCK (ENSMAMG00000001492)	SLC4A4 (ENSMAMG00000001527)	NPFFR2 (ENSMAMG00000001663)	ENSMAMG00000001936	ENSMAMG00000001960	ENSMAMG00000026424	gas1b (ENSMAMG00000002059)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00390000014118	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Climbing perch	MODERN SPECIES	3	ENSATEG00000011669	mrps2 (ENSATEG00000029578)	ENSATEG00000011642	ENSATEG00000011634	ENSATEG00000011496	ENSATEG00000011084	ENSATEG00000011044	ENSATEG00000026414	ENSATEG00000011025 #18	ENSATEG00000010990 #18	ENSATEG00000028054 #17	ENSATEG00000010982 #17	NSA2 (ENSATEG00000010924) #19	gfm2 (ENSATEG00000010821) #20	hexb (ENSATEG00000010779) #21	ENC1 (ENSATEG00000010768) #22	ARHGEF28 (ENSATEG00000010673) #24	ankra2 (ENSATEG00000010640)	btf3 (ENSATEG00000010619)	foxd1 (ENSATEG00000010611)	fcho2 (ENSATEG00000010522)	TNPO1 (ENSATEG00000010408)	mob1bb (ENSATEG00000010361)	DCK (ENSATEG00000010355)	SLC4A4 (ENSATEG00000010257)	NPFFR2 (ENSATEG00000028711)	ENSATEG00000010200	ENSATEG00000010080	ENSATEG00000010039	gas1b (ENSATEG00000010026)	ENSATEG00000010002
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	3	egfl7 (ENSBSLG00000011602)	agpat2 (ENSBSLG00000011659)	FNBP1 (ENSBSLG00000011784)	COL5A1 (ENSBSLG00000013355)	olfm1a (ENSBSLG00000014064)	ENSBSLG00000014139	ENSBSLG00000014155	ENSBSLG00000014168 #18	tor1 (ENSBSLG00000014198) #18	ENSBSLG00000014342	ENSBSLG00000014350 #18	tor1 (ENSBSLG00000014441) #17	nsa2 (ENSBSLG00000014530) #19	gfm2 (ENSBSLG00000014536) #20	hexb (ENSBSLG00000014718) #21	ENC1 (ENSBSLG00000016048) #22	ARHGEF28 (ENSBSLG00000016710) #24	ankra2 (ENSBSLG00000017046)	btf3 (ENSBSLG00000017215)	foxd1 (ENSBSLG00000017286)	TMEM174 (ENSBSLG00000017293)	fcho2 (ENSBSLG00000017359)	TNPO1 (ENSBSLG00000017922)	mob1bb (ENSBSLG00000018553)	dck (ENSBSLG00000018568)	SLC4A4 (ENSBSLG00000018599)	NPFFR2 (ENSBSLG00000019417)	ENSBSLG00000019462	ENSBSLG00000019474	fbp1b (ENSBSLG00000019494)	gas1b (ENSBSLG00000019523)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	3	ENSMMDG00005016416	ENSMMDG00005016417	ENSMMDG00005016419	NPFFR2 (ENSMMDG00005016435)	SLC4A4 (ENSMMDG00005016559)	dck (ENSMMDG00005020811)	mob1bb (ENSMMDG00005020817)	TNPO1 (ENSMMDG00005020843)	fcho2 (ENSMMDG00005021184)	foxd1 (ENSMMDG00005021419)	btf3 (ENSMMDG00005021420)	ankra2 (ENSMMDG00005021427)	nsa2 (ENSMMDG00005021452) #19	gfm2 (ENSMMDG00005021459) #20	hexb (ENSMMDG00005021472) #21	ENC1 (ENSMMDG00005021728) #22	ENSMMDG00005021735	ENSMMDG00005021755 #24	tor1 (ENSMMDG00005021756) #17	egfl7 (ENSMMDG00005021759)	agpat2 (ENSMMDG00005021762)	FNBP1 (ENSMMDG00005021792)	ENSMMDG00005022348	ENSMMDG00005022351	ENSMMDG00005022352	mrps2 (ENSMMDG00005022354)	dipk1b (ENSMMDG00005022355)	ttll11 (ENSMMDG00005022356)	dab2ipb (ENSMMDG00005022383)	ENSMMDG00005023249	zgc:63972 (ENSMMDG00005023250)
Cod	MODERN SPECIES	17	ENSGMOG00000011051	ENSGMOG00000000129	ENSGMOG00000007069	ENSGMOG00000007062	ENSGMOG00000013389 #17	ENSGMOG00000030306 #17	ENSGMOG00000027691 #17	ENSGMOG00000003212 #19	ENSGMOG00000003221 #17	ENSGMOG00000036383	ENSGMOG00000007055 #17	ENSGMOG00000026460 #17	NSA2 (ENSGMOG00000027946) #19	gfm2 (ENSGMOG00000003177) #20	hexb (ENSGMOG00000003149) #21	ENC1 (ENSGMOG00000003140) #22	ARHGEF28 (ENSGMOG00000000254) #24	ankra2 (ENSGMOG00000000317)	btf3 (ENSGMOG00000000326)	foxd1 (ENSGMOG00000000330)	TMEM174 (ENSGMOG00000023180)	fcho2 (ENSGMOG00000000337)	TNPO1 (ENSGMOG00000000347)	mob1bb (ENSGMOG00000008133)	DCK (ENSGMOG00000008130)	SLC4A4 (ENSGMOG00000008121)	NPFFR2 (ENSGMOG00000008118)	ENSGMOG00000008117	ENSGMOG00000030708	ENSGMOG00000025772	ENSGMOG00000008106