Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	307												ENSGT00950000182888.a.a.a #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890 #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT00390000009329	ENSGT00940000155897	ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000017462	ENSGT00940000158865
Euteleosteomorpha	DUPLICATION
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	152	ENSGT00390000009329	ENSGT00390000000529	ENSGT00940000159607	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00390000014118	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000163467.a.a.b.f.a.b.b	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b.a	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000163467.a.a.b.f.a.b.b	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Sailfin molly	MODERN SPECIES	634											tor1 (ENSPLAG00000014637) #17	tor1 (ENSPLAG00000014655) #18	nsa2 (ENSPLAG00000014684) #19	gfm2 (ENSPLAG00000014750) #20	hexb (ENSPLAG00000014763) #21	ENC1 (ENSPLAG00000014764) #22	ENSPLAG00000014772 #23	ARHGEF28 (ENSPLAG00000014795) #24
Amazon molly	MODERN SPECIES	280	ENSPFOG00000022341	ttll11 (ENSPFOG00000014960)	dab2ipb (ENSPFOG00000014953)	dipk1b (ENSPFOG00000014908)	mrps2 (ENSPFOG00000014903)	ENSPFOG00000014898	olfm1a (ENSPFOG00000014850)	COL5A1 (ENSPFOG00000012917)	FNBP1 (ENSPFOG00000012695)	agpat2 (ENSPFOG00000012638)	egfl7 (ENSPFOG00000012611)	tor1 (ENSPFOG00000012543) #17	nsa2 (ENSPFOG00000012512) #19	gfm2 (ENSPFOG00000012381) #20	hexb (ENSPFOG00000012191) #21	ENC1 (ENSPFOG00000012176) #22	ARHGEF28 (ENSPFOG00000012124) #24	ankra2 (ENSPFOG00000012023)	foxd1 (ENSPFOG00000011960)	btf3 (ENSPFOG00000011979)	TMEM174 (ENSPFOG00000011952)	fcho2 (ENSPFOG00000011692)	TNPO1 (ENSPFOG00000011447)	mob1bb (ENSPFOG00000011395)	dck (ENSPFOG00000011348)	ENSPFOG00000010945	NPFFR2 (ENSPFOG00000010931)	ENSPFOG00000010927	ENSPFOG00000010851	fbp1b (ENSPFOG00000010778)	gas1b (ENSPFOG00000020253)
Guppy	MODERN SPECIES	442	ENSPREG00000021648	ttll11 (ENSPREG00000021639)	dab2ipb (ENSPREG00000021572)	mrps2 (ENSPREG00000021519)	ENSPREG00000021513	olfm1a (ENSPREG00000021493)	COL5A1 (ENSPREG00000021379)	FNBP1 (ENSPREG00000021213)	agpat2 (ENSPREG00000021142)	egfl7 (ENSPREG00000021100)	tor1 (ENSPREG00000021086) #17	tor1 (ENSPREG00000021079) #18	nsa2 (ENSPREG00000021068) #19	gfm2 (ENSPREG00000021026) #20	hexb (ENSPREG00000020991) #21	ENC1 (ENSPREG00000020971) #22	ENSPREG00000020933 #24	ENSPREG00000020919 #24	ankra2 (ENSPREG00000020906)	btf3 (ENSPREG00000020894)	foxd1 (ENSPREG00000020886)	TMEM174 (ENSPREG00000020871)	fcho2 (ENSPREG00000020776)	TNPO1 (ENSPREG00000020705)	mob1bb (ENSPREG00000020689)	dck (ENSPREG00000020678)	SLC4A4 (ENSPREG00000020602)	NPFFR2 (ENSPREG00000020572)	ENSPREG00000020568	ENSPREG00000020562	ENSPREG00000020548
Platyfish	MODERN SPECIES	22	mrps2 (ENSXMAG00000018132)	ENSXMAG00000018131	ENSXMAG00000026107	olfm1a (ENSXMAG00000022464)	COL5A1 (ENSXMAG00000017898)	ENSXMAG00000027308	ENSXMAG00000023352	FNBP1 (ENSXMAG00000017879)	agpat2 (ENSXMAG00000021933)	egfl7 (ENSXMAG00000005711)	tor1 (ENSXMAG00000028893) #17	tor1 (ENSXMAG00000023565) #18	nsa2 (ENSXMAG00000000762) #19	gfm2 (ENSXMAG00000000772) #20	hexb (ENSXMAG00000000795) #21	ENC1 (ENSXMAG00000023069) #22	ARHGEF28 (ENSXMAG00000014765) #24	ankra2 (ENSXMAG00000009076)	btf3 (ENSXMAG00000009089)	foxd1 (ENSXMAG00000009102)	TMEM174 (ENSXMAG00000024151)	fcho2 (ENSXMAG00000005481)	TNPO1 (ENSXMAG00000005440)	mob1bb (ENSXMAG00000005427)	dck (ENSXMAG00000005412)	SLC4A4 (ENSXMAG00000005345)	NPFFR2 (ENSXMAG00000026051)	ENSXMAG00000025366	ENSXMAG00000005324	fbp1b (ENSXMAG00000005310)	gas1b (ENSXMAG00000020027)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154427.A.d	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Mummichog	MODERN SPECIES	306									agpat2 (ENSFHEG00000006472)	egfl7 (ENSFHEG00000006462)	tor1 (ENSFHEG00000006311) #17	tor1 (ENSFHEG00000006282) #17	nsa2 (ENSFHEG00000000905) #19	gfm2 (ENSFHEG00000006210) #20	hexb (ENSFHEG00000006138) #21	ENC1 (ENSFHEG00000006127) #22	ARHGEF28 (ENSFHEG00000006108) #24	ankra2 (ENSFHEG00000006063)	btf3 (ENSFHEG00000006034)	foxd1 (ENSFHEG00000006027)	TMEM174 (ENSFHEG00000006015)	fcho2 (ENSFHEG00000005994)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1110									FNBP1 (ENSCVAG00000009768)	agpat2 (ENSCVAG00000009789)	egfl7 (ENSCVAG00000009969)	tor1 (ENSCVAG00000009976) #17	gfm2 (ENSCVAG00000010057) #20	nsa2 (ENSCVAG00000010074) #19	hexb (ENSCVAG00000010091) #21	ENC1 (ENSCVAG00000010099) #22
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156.p	ENSGT00940000157156.o	ENSGT00940000153288.a.b.b.a	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1611	ENSNFUG00015008765	plac8.1 (ENSNFUG00015008759)	cops4 (ENSNFUG00015008730)	LIN54 (ENSNFUG00015008673)	SEC31A (ENSNFUG00015008627)	TMEM150C (ENSNFUG00015008611)	ENOPH1 (ENSNFUG00015008609)	hnrnpd (ENSNFUG00015008606)	ENSNFUG00015008598	ENSNFUG00015008593	mat2al (ENSNFUG00015008587)	ENSNFUG00015008584	ZSWIM6 (ENSNFUG00015008475)	CABZ01117349.1 (ENSNFUG00015008278)	PITPNM2 (ENSNFUG00015008110)	ENC1 (ENSNFUG00015008026) #22	ARHGEF28 (ENSNFUG00015007985) #24	FAM73B (ENSNFUG00015007961)	ST6GALNAC4 (ENSNFUG00015007952)	ST6GALNAC6 (ENSNFUG00015007948)	spout1 (ENSNFUG00015007895)	CCBL1 (ENSNFUG00015007724)	SURF6 (ENSNFUG00015007712)	surf1 (ENSNFUG00015007701)	RPL7A (ENSNFUG00015007670)	USP20 (ENSNFUG00015006390)	ptges (ENSNFUG00015006244)	GARNL3 (ENSNFUG00015005423)	ENSNFUG00015005249	CACFD1 (ENSNFUG00015005239)	ptcd2 (ENSNFUG00015005220)
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	150	dab2ipb (ENSKMAG00000012390)	ttll11 (ENSKMAG00000012516)	dipk1b (ENSKMAG00000012539)	mrps2 (ENSKMAG00000012557)	ENSKMAG00000012579	olfm1a (ENSKMAG00000012620)	ENSKMAG00000012663	ENSKMAG00000012699	FNBP1 (ENSKMAG00000012784)	agpat2 (ENSKMAG00000013050)	egfl7 (ENSKMAG00000013148)	tor1 (ENSKMAG00000013227) #17	nsa2 (ENSKMAG00000013244) #19	gfm2 (ENSKMAG00000013277) #20	hexb (ENSKMAG00000013345) #21	ENC1 (ENSKMAG00000013378) #22
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e.l #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156.m	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e.l.a.b #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.e.l.a.a #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156.m	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	3	zgc:63972 (ENSOJAG00000010443)	dab2ipb (ENSOJAG00000010728)	ttll11 (ENSOJAG00000012352)	dipk1b (ENSOJAG00000012407)	mrps2 (ENSOJAG00000012422)	ENSOJAG00000012439	olfm1a (ENSOJAG00000012455)	COL5A1 (ENSOJAG00000012526)	FNBP1 (ENSOJAG00000012626)	agpat2 (ENSOJAG00000012718)	egfl7 (ENSOJAG00000012729)	tor1 (ENSOJAG00000012750) #17	tor1 (ENSOJAG00000012776) #17	nsa2 (ENSOJAG00000012785) #19	ENSOJAG00000012801 #20	ENC1 (ENSOJAG00000012890) #22	ARHGEF28 (ENSOJAG00000012916) #24	ankra2 (ENSOJAG00000013011)	btf3 (ENSOJAG00000013079)	foxd1 (ENSOJAG00000013148)	TMEM174 (ENSOJAG00000013157)	fcho2 (ENSOJAG00000013199)	TNPO1 (ENSOJAG00000013577)	mob1bb (ENSOJAG00000014572)	dck (ENSOJAG00000014618)	SLC4A4 (ENSOJAG00000014859)	NPFFR2 (ENSOJAG00000017219)	ENSOJAG00000017235	ENSOJAG00000017260	fbp1b (ENSOJAG00000017269)	gas1b (ENSOJAG00000017286)
Indian medaka	MODERN SPECIES	30	ENSOMEG00000013226	olfm1a (ENSOMEG00000013275)	ENSOMEG00000013314	ENSOMEG00000013349	FNBP1 (ENSOMEG00000013391)	agpat2 (ENSOMEG00000013414)	egfl7 (ENSOMEG00000013528)	tor1 (ENSOMEG00000000734) #17	tor1 (ENSOMEG00000013592) #17	tor1 (ENSOMEG00000000697) #17	tor1 (ENSOMEG00000013630) #17	tor1 (ENSOMEG00000013661) #17	nsa2 (ENSOMEG00000013689) #19	gfm2 (ENSOMEG00000013774) #20	hexb (ENSOMEG00000013880) #21	ENC1 (ENSOMEG00000013923) #22	ARHGEF28 (ENSOMEG00000014109) #24	ankra2 (ENSOMEG00000014199)	foxd1 (ENSOMEG00000014209)	btf3 (ENSOMEG00000014241)	TMEM174 (ENSOMEG00000014273)	fcho2 (ENSOMEG00000014430)	TNPO1 (ENSOMEG00000014567)	mob1bb (ENSOMEG00000014587)	dck (ENSOMEG00000014621)	SLC4A4 (ENSOMEG00000014851)	NPFFR2 (ENSOMEG00000014930)	ENSOMEG00000014942	ENSOMEG00000014975	fbp1b (ENSOMEG00000015002)	gas1b (ENSOMEG00000015018)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e.l #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156.m	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777
Chinese medaka	MODERN SPECIES	753					ttll11 (ENSOSIG00000004764)	dipk1b (ENSOSIG00000004768)	mrps2 (ENSOSIG00000004776)	ENSOSIG00000004779	olfm1a (ENSOSIG00000004784)	ENSOSIG00000004789	FNBP1 (ENSOSIG00000004837)	agpat2 (ENSOSIG00000006447)	egfl7 (ENSOSIG00000006448)	tor1 (ENSOSIG00000006455) #17	nsa2 (ENSOSIG00000006456) #19	ENC1 (ENSOSIG00000006461) #22	ankra2 (ENSOSIG00000006464)	btf3 (ENSOSIG00000006465)	foxd1 (ENSOSIG00000006466)	TMEM174 (ENSOSIG00000006467)	fcho2 (ENSOSIG00000006476)	TNPO1 (ENSOSIG00000007249)	mob1ba (ENSOSIG00000008338)	ENSOSIG00000008374	ENSOSIG00000016533	fbp1b (ENSOSIG00000016535)	gas1b (ENSOSIG00000016536)	c9 (ENSOSIG00000016538)	dab2 (ENSOSIG00000016543)	zgc:162472 (ENSOSIG00000016546)	RTKN (ENSOSIG00000016555)
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	3	dab2ipb (ENSORLG00000003707)	ttll11 (ENSORLG00000003660)	dipk1b (ENSORLG00000003651)	mrps2 (ENSORLG00000003640)	ENSORLG00000030208	olfm1a (ENSORLG00000025343)	COL5A1 (ENSORLG00000003591)	ENSORLG00000025318	FNBP1 (ENSORLG00000003554)	agpat2 (ENSORLG00000003435)	egfl7 (ENSORLG00000003417)	tor1 (ENSORLG00000003403) #17	nsa2 (ENSORLG00000003379) #19	gfm2 (ENSORLG00000003360) #20	hexb (ENSORLG00000003323) #21	ENC1 (ENSORLG00000003288) #22	ARHGEF28 (ENSORLG00000028035) #24	ankra2 (ENSORLG00000003277)	ENSORLG00000022026	btf3 (ENSORLG00000003257)	TMEM174 (ENSORLG00000003242)	fcho2 (ENSORLG00000003234)	TNPO1 (ENSORLG00000003182)	mob1bb (ENSORLG00000003125)	dck (ENSORLG00000003108)	SLC4A4 (ENSORLG00000003072)	NPFFR2 (ENSORLG00000003050)	ENSORLG00000003038	ENSORLG00000003024	fbp1b (ENSORLG00000002997)	gas1b (ENSORLG00000002967)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000181622	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000181622	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000181622	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1330												tor1 (ENSAOCG00000014393) #17	nsa2 (ENSAOCG00000014373) #19	gfm2 (ENSAOCG00000014342) #20	hexb (ENSAOCG00000014256) #21	ENC1 (ENSAOCG00000014173) #22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	7	ENSAPEG00000023140	dab2ipb (ENSAPEG00000023179)	ttll11 (ENSAPEG00000023272)	dipk1b (ENSAPEG00000023298)	mrps2 (ENSAPEG00000023312)	olfm1a (ENSAPEG00000023333)	COL5A1 (ENSAPEG00000023373)	ENSAPEG00000023518	FNBP1 (ENSAPEG00000023547)	agpat2 (ENSAPEG00000023715)	egfl7 (ENSAPEG00000023724)	tor1 (ENSAPEG00000000332) #17	nsa2 (ENSAPEG00000000376) #19	gfm2 (ENSAPEG00000000424) #20	hexb (ENSAPEG00000000545) #21	ENC1 (ENSAPEG00000000639) #22	ARHGEF28 (ENSAPEG00000000716) #24	ankra2 (ENSAPEG00000000895)	btf3 (ENSAPEG00000000915)	foxd1 (ENSAPEG00000000936)	ENSAPEG00000000952	TMEM174 (ENSAPEG00000000954)	fcho2 (ENSAPEG00000000982)	TNPO1 (ENSAPEG00000001112)	mob1bb (ENSAPEG00000001183)	dck (ENSAPEG00000001210)	SLC4A4 (ENSAPEG00000001234)	NPFFR2 (ENSAPEG00000001373)	ENSAPEG00000001459	ENSAPEG00000001466	fbp1b (ENSAPEG00000001478)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	150						ENSAPOG00000005203	COL5A1 (ENSAPOG00000005584)	ENSAPOG00000005629	FNBP1 (ENSAPOG00000000139)	agpat2 (ENSAPOG00000000141)	egfl7 (ENSAPOG00000005827)	tor1 (ENSAPOG00000005853) #17	nsa2 (ENSAPOG00000005882) #19	gfm2 (ENSAPOG00000005965) #20	hexb (ENSAPOG00000006044) #21	ENC1 (ENSAPOG00000001131) #22	ARHGEF28 (ENSAPOG00000006195) #24	ankra2 (ENSAPOG00000006251)	btf3 (ENSAPOG00000006276)	foxd1 (ENSAPOG00000006297)	TMEM174 (ENSAPOG00000006338)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1280												tor1 (ENSSPAG00000014091) #17	nsa2 (ENSSPAG00000014137) #19	gfm2 (ENSSPAG00000014163) #20	hexb (ENSSPAG00000014244) #21	ENC1 (ENSSPAG00000014329) #22	ARHGEF28 (ENSSPAG00000014338) #24
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.a.b	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.a.b	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.a.b	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	287	ttll11 (ENSHBUG00000010134)	ENSHBUG00000010142	dipk1b (ENSHBUG00000010155)	mrps2 (ENSHBUG00000010171)	olfm1a (ENSHBUG00000010226)	ENSHBUG00000010242	COL5A1 (ENSHBUG00000010535)	ENSHBUG00000010575	FNBP1 (ENSHBUG00000010835)	agpat2 (ENSHBUG00000010863)	egfl7 (ENSHBUG00000010873)	tor1 (ENSHBUG00000010924) #17	nsa2 (ENSHBUG00000010944) #19	gfm2 (ENSHBUG00000011021) #20	hexb (ENSHBUG00000011110) #21	ENC1 (ENSHBUG00000011125) #22
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777
P. nyererei	MODERN SPECIES	297	ENSPNYG00000002651	dipk1b (ENSPNYG00000002632)	mrps2 (ENSPNYG00000002624)	ENSPNYG00000002612	olfm1a (ENSPNYG00000002567)	COL5A1 (ENSPNYG00000002267)	ENSPNYG00000002231	ENSPNYG00000002214	FNBP1 (ENSPNYG00000002152)	agpat2 (ENSPNYG00000002138)	egfl7 (ENSPNYG00000002069)	tor1 (ENSPNYG00000002052) #17	nsa2 (ENSPNYG00000002028) #19	gfm2 (ENSPNYG00000001950) #20	hexb (ENSPNYG00000001935) #21	ENC1 (ENSPNYG00000001928) #22	ENSPNYG00000001882 #24	ankra2 (ENSPNYG00000001843)	btf3 (ENSPNYG00000001828)	foxd1 (ENSPNYG00000001818)	fcho2 (ENSPNYG00000001628)	TNPO1 (ENSPNYG00000001522)	mob1bb (ENSPNYG00000001509)	dck (ENSPNYG00000001253)	SLC4A4 (ENSPNYG00000001164)	NPFFR2 (ENSPNYG00000001069)	ENSPNYG00000000984	ENSPNYG00000000952	fbp1b (ENSPNYG00000000923)	gas1b (ENSPNYG00000000902)	c9 (ENSPNYG00000000896)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	dab2ipb (ENSMZEG00005003883)	ttll11 (ENSMZEG00005003989)	ENSMZEG00005004032	dipk1b (ENSMZEG00005004041)	mrps2 (ENSMZEG00005004066)	olfm1a (ENSMZEG00005004110)	COL5A1 (ENSMZEG00005004152)	ENSMZEG00005004297	FNBP1 (ENSMZEG00005004314)	agpat2 (ENSMZEG00005004407)	egfl7 (ENSMZEG00005004420)	tor1 (ENSMZEG00005004445) #17	nsa2 (ENSMZEG00005004450) #19	gfm2 (ENSMZEG00005004469) #20	hexb (ENSMZEG00005004537) #21	ENC1 (ENSMZEG00005004589) #22	ENSMZEG00005004598 #24	ankra2 (ENSMZEG00005004645)	btf3 (ENSMZEG00005004698)	foxd1 (ENSMZEG00005004712)	fcho2 (ENSMZEG00005004754)	TNPO1 (ENSMZEG00005004913)	mob1bb (ENSMZEG00005004954)	dck (ENSMZEG00005004974)	SLC4A4 (ENSMZEG00005005012)	NPFFR2 (ENSMZEG00005005088)	ENSMZEG00005005173	ENSMZEG00005005187	fbp1b (ENSMZEG00005005220)	gas1b (ENSMZEG00005005253)	c9 (ENSMZEG00005005264)
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	ENSACLG00000027616	dipk1b (ENSACLG00000027613)	mrps2 (ENSACLG00000027610)	ENSACLG00000027608	ENSACLG00000027602	olfm1a (ENSACLG00000027600)	COL5A1 (ENSACLG00000027546)	ENSACLG00000027526	FNBP1 (ENSACLG00000027481)	agpat2 (ENSACLG00000027477)	egfl7 (ENSACLG00000027456)	tor1 (ENSACLG00000027453) #17	nsa2 (ENSACLG00000027450) #19	gfm2 (ENSACLG00000027430) #20	hexb (ENSACLG00000027420) #21	ENC1 (ENSACLG00000027402) #22	ARHGEF28 (ENSACLG00000027367) #24	ankra2 (ENSACLG00000027357)	btf3 (ENSACLG00000027347)	foxd1 (ENSACLG00000027344)	ENSACLG00000027336	fcho2 (ENSACLG00000027259)	TNPO1 (ENSACLG00000027223)	mob1bb (ENSACLG00000027216)	dck (ENSACLG00000027209)	SLC4A4 (ENSACLG00000027117)	NPFFR2 (ENSACLG00000027070)	ENSACLG00000027054	ENSACLG00000027025	fbp1b (ENSACLG00000027007)	gas1b (ENSACLG00000026998)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	336	dab2ipb (ENSNBRG00000008531)	ENSNBRG00000008604	ENSNBRG00000008612	dipk1b (ENSNBRG00000008628)	mrps2 (ENSNBRG00000008658)	olfm1a (ENSNBRG00000008693)	COL5A1 (ENSNBRG00000008750)	ENSNBRG00000009001	FNBP1 (ENSNBRG00000009051)	agpat2 (ENSNBRG00000009109)	egfl7 (ENSNBRG00000009119)	tor1 (ENSNBRG00000009136) #17	nsa2 (ENSNBRG00000009155) #19	gfm2 (ENSNBRG00000009181) #20	hexb (ENSNBRG00000009225) #21	ENC1 (ENSNBRG00000009321) #22	ARHGEF28 (ENSNBRG00000009368) #24	ankra2 (ENSNBRG00000009594)	btf3 (ENSNBRG00000009623)	foxd1 (ENSNBRG00000009642)	fcho2 (ENSNBRG00000009710)	TNPO1 (ENSNBRG00000009998)	mob1bb (ENSNBRG00000010053)	dck (ENSNBRG00000010072)	SLC4A4 (ENSNBRG00000010089)	NPFFR2 (ENSNBRG00000010141)	ENSNBRG00000010162	ENSNBRG00000010215	fbp1b (ENSNBRG00000010231)	gas1b (ENSNBRG00000010256)	c9 (ENSNBRG00000010281)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	dab2ipb (ENSONIG00000011245)	ttll11 (ENSONIG00000011243)	dipk1b (ENSONIG00000011241)	mrps2 (ENSONIG00000011240)	ENSONIG00000023677	olfm1a (ENSONIG00000011237)	ENSONIG00000011209	FNBP1 (ENSONIG00000011203)	agpat2 (ENSONIG00000011201)	ENSONIG00000035802	egfl7 (ENSONIG00000011197)	tor1 (ENSONIG00000011193) #17	nsa2 (ENSONIG00000011188) #19	gfm2 (ENSONIG00000011183) #20	hexb (ENSONIG00000011177) #21	ENC1 (ENSONIG00000020511) #22	ARHGEF28 (ENSONIG00000011175) #24	ankra2 (ENSONIG00000037402)	btf3 (ENSONIG00000011166)	foxd1 (ENSONIG00000020510)	ENSONIG00000040457	fcho2 (ENSONIG00000011160)	TNPO1 (ENSONIG00000011151)	mob1bb (ENSONIG00000011150)	dck (ENSONIG00000011146)	SLC4A4 (ENSONIG00000011138)	NPFFR2 (ENSONIG00000011136)	ENSONIG00000011135	ENSONIG00000011130	fbp1b (ENSONIG00000011126)	GAS1 (ENSONIG00000020508)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159777	ENSGT00940000155567	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000177534	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000013846.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462
Fugu	MODERN SPECIES	18	c9 (ENSTRUG00000018574)	dab2 (ENSTRUG00000018569)	mrps2 (ENSTRUG00000018568)	ENSTRUG00000020074	olfm1a (ENSTRUG00000018565)	ENSTRUG00000021440	COL5A1 (ENSTRUG00000018538)	FNBP1 (ENSTRUG00000018533)	agpat2 (ENSTRUG00000018530)	egfl7 (ENSTRUG00000021363)	tor1 (ENSTRUG00000024655) #18	tor1 (ENSTRUG00000018521) #17	tor1 (ENSTRUG00000024523) #17	nsa2 (ENSTRUG00000025113) #19	hexb (ENSTRUG00000018510) #21	ENC1 (ENSTRUG00000018509) #22	ARHGEF28 (ENSTRUG00000018508) #24	ankra2 (ENSTRUG00000018506)	btf3 (ENSTRUG00000023038)	foxd1 (ENSTRUG00000018503)	fcho2 (ENSTRUG00000018494)	mob1bb (ENSTRUG00000018489)	dck (ENSTRUG00000031783)	SLC4A4 (ENSTRUG00000018460)	npffr-2 (ENSTRUG00000018455)	ENSTRUG00000028567	ENSTRUG00000032548	aif1l (ENSTRUG00000020405)	prkaa1 (ENSTRUG00000018441)	ttc33 (ENSTRUG00000018440)	ptger4b (ENSTRUG00000028946)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	377									ENSLBEG00000020159	agpat2 (ENSLBEG00000020181)	egfl7 (ENSLBEG00000020202)	tor1 (ENSLBEG00000020286) #17	nsa2 (ENSLBEG00000020299) #19	gfm2 (ENSLBEG00000020327) #20	hexb (ENSLBEG00000020421) #21	ENC1 (ENSLBEG00000020565) #22	ARHGEF28 (ENSLBEG00000020679) #24	ankra2 (ENSLBEG00000021076)	btf3 (ENSLBEG00000021101)	foxd1 (ENSLBEG00000021126)	fcho2 (ENSLBEG00000021231)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000177534	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000177534	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156689	ENSGT01060000248756	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000177534	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
European seabass	MODERN SPECIES	9	ttll11 (ENSDLAG00005020892)	ENSDLAG00005020889	ENSDLAG00005020886	ENSDLAG00005026339	ENSDLAG00005026497	ENSDLAG00005020853	ENSDLAG00005020848	ENSDLAG00005019465	ENSDLAG00005032168	ENSDLAG00005028638 #18	ENSDLAG00005027893	ENSDLAG00005029718 #17	NSA2 (ENSDLAG00005019422) #19	gfm2 (ENSDLAG00005018401) #20	hexb (ENSDLAG00005017654) #21	ENC1 (ENSDLAG00005017634) #22	ARHGEF28 (ENSDLAG00005017354) #24	ankra2 (ENSDLAG00005017531)	btf3 (ENSDLAG00005006186)	foxd1 (ENSDLAG00005029808)	TMEM174 (ENSDLAG00005017336)	fcho2 (ENSDLAG00005016468)	TNPO1 (ENSDLAG00005015570)	mob1bb (ENSDLAG00005001255)	DCK (ENSDLAG00005015518)	SLC4A4 (ENSDLAG00005012024)	NPFFR2 (ENSDLAG00005011980)	ENSDLAG00005011969	ENSDLAG00005011901	gas1b (ENSDLAG00005011889)	ENSDLAG00005011878
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	4	dab2ipb (ENSLCRG00005004818)	ttll11 (ENSLCRG00005004985)	dipk1b (ENSLCRG00005004988)	mrps2 (ENSLCRG00005004990)	ENSLCRG00005004991	olfm1a (ENSLCRG00005004992)	COL5A1 (ENSLCRG00005004998)	ENSLCRG00005005002	FNBP1 (ENSLCRG00005005019)	agpat2 (ENSLCRG00005005782)	egfl7 (ENSLCRG00005005783)	tor1 (ENSLCRG00005005786) #17	nsa2 (ENSLCRG00005005788) #19	gfm2 (ENSLCRG00005005797) #20	hexb (ENSLCRG00005005847) #21	ENC1 (ENSLCRG00005006223) #22	ARHGEF28 (ENSLCRG00005006225) #24	ankra2 (ENSLCRG00005006233)	btf3 (ENSLCRG00005006241)	foxd1 (ENSLCRG00005006254)	TMEM174 (ENSLCRG00005006256)	ENSLCRG00005006257	fcho2 (ENSLCRG00005006297)	TNPO1 (ENSLCRG00005008667)	mob1bb (ENSLCRG00005008720)	dck (ENSLCRG00005008722)	SLC4A4 (ENSLCRG00005008735)	atp5fa1 (ENSLCRG00005010046)	hwa (ENSLCRG00005010221)	zgc:122979 (ENSLCRG00005010224)	ENSLCRG00005010226
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	3	COL5A1 (ENSSAUG00010019625)	ENSSAUG00010019621	FNBP1 (ENSSAUG00010015419)	agpat2 (ENSSAUG00010015362)	egfl7 (ENSSAUG00010015339)	ENSSAUG00010015309	ENSSAUG00010015298	tor1 (ENSSAUG00010015291) #18	tor1 (ENSSAUG00010015289) #18	tor1 (ENSSAUG00010015287) #18	tor1 (ENSSAUG00010015285) #18	tor1 (ENSSAUG00010015282) #17	nsa2 (ENSSAUG00010015274) #19	gfm2 (ENSSAUG00010013860) #20	hexb (ENSSAUG00010013757) #21	ENC1 (ENSSAUG00010013742) #22	ARHGEF28 (ENSSAUG00010013738) #24	ankra2 (ENSSAUG00010013735)	btf3 (ENSSAUG00010013734)	foxd1 (ENSSAUG00010013733)	TMEM174 (ENSSAUG00010013732)	fcho2 (ENSSAUG00010013016)	TNPO1 (ENSSAUG00010010779)	mob1bb (ENSSAUG00010010730)	dck (ENSSAUG00010010725)	SLC4A4 (ENSSAUG00010010148)	NPFFR2 (ENSSAUG00010010136)	ENSSAUG00010010132	ENSSAUG00010010129	fbp1b (ENSSAUG00010010126)	gas1b (ENSSAUG00010010125)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT01040000244713	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT01040000244713	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pike perch	MODERN SPECIES	33	ttll11 (ENSSLUG00000022799)	dipk1b (ENSSLUG00000022807)	mrps2 (ENSSLUG00000022813)	ENSSLUG00000022816	olfm1a (ENSSLUG00000022831)	COL5A1 (ENSSLUG00000022876)	ENSSLUG00000022886	FNBP1 (ENSSLUG00000022956)	agpat2 (ENSSLUG00000023560)	egfl7 (ENSSLUG00000023566)	tor1 (ENSSLUG00000023572) #18	tor1 (ENSSLUG00000023578) #17	nsa2 (ENSSLUG00000023585) #19	gfm2 (ENSSLUG00000023617) #20	hexb (ENSSLUG00000023865) #21	ENC1 (ENSSLUG00000024173) #22	ARHGEF28 (ENSSLUG00000024179) #24	ankra2 (ENSSLUG00000024202)	btf3 (ENSSLUG00000024208)	foxd1 (ENSSLUG00000024212)	fcho2 (ENSSLUG00000024230)	TNPO1 (ENSSLUG00000024422)	mob1bb (ENSSLUG00000024630)	dck (ENSSLUG00000024643)	SLC4A4 (ENSSLUG00000024801)	NPFFR2 (ENSSLUG00000025461)	ENSSLUG00000025464	ENSSLUG00000001570	fbp1b (ENSSLUG00000001585)	gas1b (ENSSLUG00000001595)	c9 (ENSSLUG00000001632)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	3	mrps2 (ENSCGOG00000008415)	ENSCGOG00000008410	olfm1a (ENSCGOG00000008397)	COL5A1 (ENSCGOG00000008390)	FNBP1 (ENSCGOG00000005602)	agpat2 (ENSCGOG00000005552)	egfl7 (ENSCGOG00000005539)	tor1 (ENSCGOG00000005524) #17	tor1 (ENSCGOG00000005486) #17	tor1 (ENSCGOG00000005484) #17	tor1 (ENSCGOG00000005480) #17	tor1 (ENSCGOG00000005447) #17	nsa2 (ENSCGOG00000005397) #19	gfm2 (ENSCGOG00000005289) #20	hexb (ENSCGOG00000004228) #21	ENC1 (ENSCGOG00000004176) #22	ARHGEF28 (ENSCGOG00000004149) #24	ankra2 (ENSCGOG00000004121)	btf3 (ENSCGOG00000004085)	foxd1 (ENSCGOG00000004064)	ENSCGOG00000024118	fcho2 (ENSCGOG00000024058)	TNPO1 (ENSCGOG00000023998)	mob1bb (ENSCGOG00000023990)	dck (ENSCGOG00000023978)	SLC4A4 (ENSCGOG00000022658)	NPFFR2 (ENSCGOG00000022515)	ENSCGOG00000022508	ENSCGOG00000022507	ENSCGOG00000022505	fbp1b (ENSCGOG00000022483)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000159526	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000158321	ENSGT00390000015280	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777	ENSGT00940000155567
Stickleback	MODERN SPECIES	13	zgc:63972 (ENSGACG00000015917)	dab2ipb (ENSGACG00000015916)	ttll11 (ENSGACG00000015915)	dipk1b (ENSGACG00000015914)	mrps2 (ENSGACG00000015913)	olfm1a (ENSGACG00000015907)	COL5A1 (ENSGACG00000015903)	FNBP1 (ENSGACG00000015902)	ENSGACG00000015900	agpat2 (ENSGACG00000015898)	egfl7 (ENSGACG00000015896)	tor1 (ENSGACG00000015894) #17	nsa2 (ENSGACG00000015892) #19	gfm2 (ENSGACG00000015889) #20	hexb (ENSGACG00000015887) #21	ENC1 (ENSGACG00000015886) #22	erbin (ENSGACG00000015884)	nln (ENSGACG00000015881)	sgtb (ENSGACG00000015874)	trappc13 (ENSGACG00000015870)	mob1bb (ENSGACG00000015867)	dck (ENSGACG00000015866)	SLC4A4 (ENSGACG00000015864)	NPFFR2 (ENSGACG00000015862)	ENSGACG00000015860	ENSGACG00000015859	fbp1b (ENSGACG00000015857)	c9 (ENSGACG00000015856)	dab2 (ENSGACG00000015854)	zgc:162472 (ENSGACG00000015852)	ENSGACG00000015851
Lumpfish	MODERN SPECIES	3	FNBP1 (ENSCLMG00005013853)	agpat2 (ENSCLMG00005013857)	egfl7 (ENSCLMG00005013888)	ENSCLMG00005013892	tor1 (ENSCLMG00005013893) #17	ENSCLMG00005013895	hexb (ENSCLMG00005013901) #21	ENSCLMG00005013928	ENSCLMG00005013929	ENSCLMG00005013931	ENSCLMG00005013933	ENSCLMG00005013934	ENSCLMG00005013935	ENSCLMG00005013936	ENSCLMG00005013937	ENC1 (ENSCLMG00005013939) #22	ARHGEF28 (ENSCLMG00005013941) #24	nln (ENSCLMG00005013946)	sgtb (ENSCLMG00005014432)	trappc13 (ENSCLMG00005014437)	mob1bb (ENSCLMG00005014457)	dck (ENSCLMG00005014459)	SLC4A4 (ENSCLMG00005014467)	NPFFR2 (ENSCLMG00005015541)	ENSCLMG00005015542	ENSCLMG00005015547	fbp1b (ENSCLMG00005015558)	gas1b (ENSCLMG00005015560)	ENSCLMG00005015561	dab2 (ENSCLMG00005015621)	ENSCLMG00005015622
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000155853.d.a.b	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000017026	ENSGT00940000159952.a.b	ENSGT00390000009710	ENSGT00940000157603	ENSGT00940000157310.g	ENSGT00990000203589.b.b	ENSGT00940000158270	ENSGT00940000158176	ENSGT00390000003122.a.a.a	ENSGT00510000046704.b.a.c	ENSGT00940000156354.p	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT01040000244713	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777
Tongue sole	MODERN SPECIES	5	AP3B1 (ENSCSEG00000013388)	scamp1 (ENSCSEG00000013358)	lhfpl2a (ENSCSEG00000013349)	ARSB (ENSCSEG00000013331)	ARSB (ENSCSEG00000013315)	ARSB (ENSCSEG00000013306)	ARSB (ENSCSEG00000013290)	DMGDH (ENSCSEG00000013250)	bhmt (ENSCSEG00000013233)	JMY (ENSCSEG00000013221)	HOMER1 (ENSCSEG00000013201)	tor1 (ENSCSEG00000013176) #17	nsa2 (ENSCSEG00000013161) #19	gfm2 (ENSCSEG00000013115) #20	hexb (ENSCSEG00000013085) #21	ENC1 (ENSCSEG00000013077) #22	ARHGEF28 (ENSCSEG00000013022) #24	ankra2 (ENSCSEG00000012998)	btf3 (ENSCSEG00000013006)	foxd1 (ENSCSEG00000012995)	fcho2 (ENSCSEG00000012754)	TNPO1 (ENSCSEG00000012674)	mob1bb (ENSCSEG00000012669)	dck (ENSCSEG00000012658)	SLC4A4 (ENSCSEG00000012599)	NPFFR2 (ENSCSEG00000012579)	ENSCSEG00000012575	ENSCSEG00000012569	fbp1b (ENSCSEG00000012550)	gas1b (ENSCSEG00000012543)	pi4kaa (ENSCSEG00000012459)
Turbot	MODERN SPECIES	16	otpa (ENSSMAG00000026303)	tbca (ENSSMAG00000010486)	AP3B1 (ENSSMAG00000010503)	SCAMP1 (ENSSMAG00000010527)	ENSSMAG00000026772	LHFPL2 (ENSSMAG00000010559)	ARSB (ENSSMAG00000010569)	DMGDH (ENSSMAG00000010584)	bhmt (ENSSMAG00000010622)	JMY (ENSSMAG00000010657)	HOMER1 (ENSSMAG00000010667)	ENSSMAG00000010704 #17	NSA2 (ENSSMAG00000010754) #19	gfm2 (ENSSMAG00000010773) #20	hexb (ENSSMAG00000010849) #21	ENC1 (ENSSMAG00000011072) #22	ENSSMAG00000034516	ARHGEF28 (ENSSMAG00000011073) #24	ankra2 (ENSSMAG00000011128)	btf3 (ENSSMAG00000011148)	foxd1 (ENSSMAG00000028504)	ENSSMAG00000032227	fcho2 (ENSSMAG00000011163)	TNPO1 (ENSSMAG00000011202)	ENSSMAG00000011258	ENSSMAG00000011280	ENSSMAG00000011390	nudcd3 (ENSSMAG00000011438)	mrps24 (ENSSMAG00000030328)	gnsb (ENSSMAG00000011471)	polm (ENSSMAG00000011509)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155853.d.a.b	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Barramundi perch	MODERN SPECIES		dab2ipb (ENSLCAG00010020210)	ttll11 (ENSLCAG00010020231)	ENSLCAG00010020235	dipk1b (ENSLCAG00010020238)	mrps2 (ENSLCAG00010020240)	ENSLCAG00010020242	olfm1a (ENSLCAG00010020247)	ENSLCAG00010020278	FNBP1 (ENSLCAG00010020448)	agpat2 (ENSLCAG00010020612)	egfl7 (ENSLCAG00010020616)	tor1 (ENSLCAG00010020635) #17	nsa2 (ENSLCAG00010020661) #19	gfm2 (ENSLCAG00010020737) #20	hexb (ENSLCAG00010020934) #21	ENC1 (ENSLCAG00010021005) #22	ARHGEF28 (ENSLCAG00010021010) #24	ankra2 (ENSLCAG00010021015)	btf3 (ENSLCAG00010021025)	foxd1 (ENSLCAG00010021037)	TMEM174 (ENSLCAG00010021040)	fcho2 (ENSLCAG00010021128)	TNPO1 (ENSLCAG00010021272)	mob1bb (ENSLCAG00010021563)	dck (ENSLCAG00010021576)	SLC4A4 (ENSLCAG00010021674)	NPFFR2 (ENSLCAG00010022165)	ENSLCAG00010022172	ENSLCAG00010022179	fbp1b (ENSLCAG00010022190)	gas1b (ENSLCAG00010022199)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	114	ENSGT00940000157321	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00390000017382	ENSGT00390000014118	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.f.b #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.f.a #18	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3042	SLC4A4 (ENSSLDG00000015570)	dck (ENSSLDG00000015520)	mob1bb (ENSSLDG00000015512)	mrps2 (ENSSLDG00000015489)	olfm1a (ENSSLDG00000015461)	COL5A1 (ENSSLDG00000015379)	FNBP1 (ENSSLDG00000015269)	agpat2 (ENSSLDG00000015225)	egfl7 (ENSSLDG00000015176)	tor1 (ENSSLDG00000015158) #17	tor1 (ENSSLDG00000015142) #18	tor1 (ENSSLDG00000015126) #18	nsa2 (ENSSLDG00000015100) #19	gfm2 (ENSSLDG00000014952) #20	hexb (ENSSLDG00000015025) #21	ENC1 (ENSSLDG00000014933) #22	ARHGEF28 (ENSSLDG00000014890) #24	ankra2 (ENSSLDG00000014857)	btf3 (ENSSLDG00000014843)	foxd1 (ENSSLDG00000014830)	TMEM174 (ENSSLDG00000014821)	fcho2 (ENSSLDG00000014677)	TNPO1 (ENSSLDG00000014578)	HOMER1 (ENSSLDG00000014538)	JMY (ENSSLDG00000014512)	bhmt (ENSSLDG00000014491)	DMGDH (ENSSLDG00000014440)	ARSB (ENSSLDG00000014410)	lhfpl2a (ENSSLDG00000014391)	scamp1 (ENSSLDG00000014368)	AP3B1 (ENSSLDG00000014297)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	286												tor1 (ENSSDUG00000021250) #18	nsa2 (ENSSDUG00000021266) #19	gfm2 (ENSSDUG00000021273) #20	hexb (ENSSDUG00000021322) #21	ENC1 (ENSSDUG00000021619) #22
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00390000014118	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	3	dab2ipb (ENSMAMG00000018682)	ttll11 (ENSMAMG00000018750)	ENSMAMG00000018780	ENSMAMG00000024326	ENSMAMG00000018821	ENSMAMG00000018845	ENSMAMG00000019021	ENSMAMG00000019202	ENSMAMG00000019221	mrps2 (ENSMAMG00000019225)	ENSMAMG00000019247 #18	ENSMAMG00000000375 #17	NSA2 (ENSMAMG00000025113) #19	gfm2 (ENSMAMG00000000452) #20	hexb (ENSMAMG00000000591) #21	ENC1 (ENSMAMG00000000656) #22	ARHGEF28 (ENSMAMG00000000680) #24	ankra2 (ENSMAMG00000000896)	btf3 (ENSMAMG00000028335)	foxd1 (ENSMAMG00000000953)	TMEM174 (ENSMAMG00000000976)	fcho2 (ENSMAMG00000001025)	TNPO1 (ENSMAMG00000001357)	mob1bb (ENSMAMG00000025274)	DCK (ENSMAMG00000001492)	SLC4A4 (ENSMAMG00000001527)	NPFFR2 (ENSMAMG00000001663)	ENSMAMG00000001936	ENSMAMG00000001960	ENSMAMG00000026424	gas1b (ENSMAMG00000002059)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000017382	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00390000014118	ENSGT00950000182888.a.a.a.f #18	ENSGT00950000182888.a.a.a.e #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.e #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b
Climbing perch	MODERN SPECIES	3	ENSATEG00000011669	mrps2 (ENSATEG00000029578)	ENSATEG00000011642	ENSATEG00000011634	ENSATEG00000011496	ENSATEG00000011084	ENSATEG00000011044	ENSATEG00000026414	ENSATEG00000011025 #18	ENSATEG00000010990 #18	ENSATEG00000028054 #17	ENSATEG00000010982 #17	NSA2 (ENSATEG00000010924) #19	gfm2 (ENSATEG00000010821) #20	hexb (ENSATEG00000010779) #21	ENC1 (ENSATEG00000010768) #22	ARHGEF28 (ENSATEG00000010673) #24	ankra2 (ENSATEG00000010640)	btf3 (ENSATEG00000010619)	foxd1 (ENSATEG00000010611)	fcho2 (ENSATEG00000010522)	TNPO1 (ENSATEG00000010408)	mob1bb (ENSATEG00000010361)	DCK (ENSATEG00000010355)	SLC4A4 (ENSATEG00000010257)	NPFFR2 (ENSATEG00000028711)	ENSATEG00000010200	ENSATEG00000010080	ENSATEG00000010039	gas1b (ENSATEG00000010026)	ENSATEG00000010002
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	3	egfl7 (ENSBSLG00000011602)	agpat2 (ENSBSLG00000011659)	FNBP1 (ENSBSLG00000011784)	COL5A1 (ENSBSLG00000013355)	olfm1a (ENSBSLG00000014064)	ENSBSLG00000014139	ENSBSLG00000014155	ENSBSLG00000014168 #18	tor1 (ENSBSLG00000014198) #18	ENSBSLG00000014342	ENSBSLG00000014350 #18	tor1 (ENSBSLG00000014441) #17	nsa2 (ENSBSLG00000014530) #19	gfm2 (ENSBSLG00000014536) #20	hexb (ENSBSLG00000014718) #21	ENC1 (ENSBSLG00000016048) #22	ARHGEF28 (ENSBSLG00000016710) #24	ankra2 (ENSBSLG00000017046)	btf3 (ENSBSLG00000017215)	foxd1 (ENSBSLG00000017286)	TMEM174 (ENSBSLG00000017293)	fcho2 (ENSBSLG00000017359)	TNPO1 (ENSBSLG00000017922)	mob1bb (ENSBSLG00000018553)	dck (ENSBSLG00000018568)	SLC4A4 (ENSBSLG00000018599)	NPFFR2 (ENSBSLG00000019417)	ENSBSLG00000019462	ENSBSLG00000019474	fbp1b (ENSBSLG00000019494)	gas1b (ENSBSLG00000019523)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	3	ENSMMDG00005016416	ENSMMDG00005016417	ENSMMDG00005016419	NPFFR2 (ENSMMDG00005016435)	SLC4A4 (ENSMMDG00005016559)	dck (ENSMMDG00005020811)	mob1bb (ENSMMDG00005020817)	TNPO1 (ENSMMDG00005020843)	fcho2 (ENSMMDG00005021184)	foxd1 (ENSMMDG00005021419)	btf3 (ENSMMDG00005021420)	ankra2 (ENSMMDG00005021427)	nsa2 (ENSMMDG00005021452) #19	gfm2 (ENSMMDG00005021459) #20	hexb (ENSMMDG00005021472) #21	ENC1 (ENSMMDG00005021728) #22	ENSMMDG00005021735	ENSMMDG00005021755 #24	tor1 (ENSMMDG00005021756) #17	egfl7 (ENSMMDG00005021759)	agpat2 (ENSMMDG00005021762)	FNBP1 (ENSMMDG00005021792)	ENSMMDG00005022348	ENSMMDG00005022351	ENSMMDG00005022352	mrps2 (ENSMMDG00005022354)	dipk1b (ENSMMDG00005022355)	ttll11 (ENSMMDG00005022356)	dab2ipb (ENSMMDG00005022383)	ENSMMDG00005023249	zgc:63972 (ENSMMDG00005023250)
Cod	MODERN SPECIES	17	ENSGMOG00000011051	ENSGMOG00000000129	ENSGMOG00000007069	ENSGMOG00000007062	ENSGMOG00000013389 #17	ENSGMOG00000030306 #17	ENSGMOG00000027691 #17	ENSGMOG00000003212 #19	ENSGMOG00000003221 #17	ENSGMOG00000036383	ENSGMOG00000007055 #17	ENSGMOG00000026460 #17	NSA2 (ENSGMOG00000027946) #19	gfm2 (ENSGMOG00000003177) #20	hexb (ENSGMOG00000003149) #21	ENC1 (ENSGMOG00000003140) #22	ARHGEF28 (ENSGMOG00000000254) #24	ankra2 (ENSGMOG00000000317)	btf3 (ENSGMOG00000000326)	foxd1 (ENSGMOG00000000330)	TMEM174 (ENSGMOG00000023180)	fcho2 (ENSGMOG00000000337)	TNPO1 (ENSGMOG00000000347)	mob1bb (ENSGMOG00000008133)	DCK (ENSGMOG00000008130)	SLC4A4 (ENSGMOG00000008121)	NPFFR2 (ENSGMOG00000008118)	ENSGMOG00000008117	ENSGMOG00000030708	ENSGMOG00000025772	ENSGMOG00000008106
Euteleosteomorpha	DUPLICATION
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	209											ENSGT00940000155305.b.a	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000162618	ENSGT00940000159721.g	ENSGT00510000048902.a.e	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.a ##22	ENSGT00390000012710.a.b	ENSGT00940000165661	ENSGT00390000012355.A.a.a.a	ENSGT00530000063681.b.a	ENSGT00940000166823	ENSGT00440000039046	ENSGT00390000015930	ENSGT00940000155771.d	ENSGT00730000110989.c.b	ENSGT00490000043395	ENSGT00940000159086	ENSGT01030000234598.b.b	ENSGT00940000159834	ENSGT00940000154929.C	ENSGT00940000165775.a
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	175	ENSGT00940000166823	ENSGT00440000039046	ENSGT00390000015930	ENSGT00940000155771.d	ENSGT00730000110989.c.b	ENSGT00490000043395	ENSGT00940000165661	ENSGT00390000012355.A.a.a.a	ENSGT00530000063681.b.a	ENSGT00390000012710.a.b	ENSGT00390000005811	ENSGT00940000155305.b.a	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000159721.g	ENSGT00510000048902.a.e	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.a ##22	ENSGT00940000158634.a.d	ENSGT00530000063335.B.a.b	ENSGT00940000156820.a.a.f	ENSGT00940000156117.e.a	ENSGT00390000017892
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	104						ENSGT00940000156117.e.a	ENSGT00390000017892	ENSGT00940000156820.a.a.f	ENSGT00530000063335.B.a.b	ENSGT00940000158634.a.d	ENSGT00390000005811	ENSGT00940000155305.b.a	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000159721.g	ENSGT00510000048902.a.e	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.a ##22	ENSGT00390000012710.a.b	ENSGT00530000063681.b.a	ENSGT00390000012355.A.a.a.a	ENSGT00940000165661	ENSGT00490000043395	ENSGT00730000110989.c.b	ENSGT00940000155771.d	ENSGT00940000160018	ENSGT00940000156516	ENSGT00740000116886	ENSGT00940000158884
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.a ##22
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	346	mzt2b (ENSHCOG00000012386)	ENSHCOG00000012379	ENSHCOG00000012348	SLC4A4 (ENSHCOG00000012083)	dck (ENSHCOG00000008518)	mob1bb (ENSHCOG00000008488)	fcho2 (ENSHCOG00000008467)	ENSHCOG00000008445	foxd1 (ENSHCOG00000008430)	btf3 (ENSHCOG00000008425)	ankra2 (ENSHCOG00000008411)	tor1 (ENSHCOG00000008396) #17	nsa2 (ENSHCOG00000008385) #19	gfm2 (ENSHCOG00000008208) #20	hexb (ENSHCOG00000008136) #21	ENC1 (ENSHCOG00000007859) ##22	egfl7 (ENSHCOG00000007849)	agpat2 (ENSHCOG00000007781)	FNBP1 (ENSHCOG00000007760)	ENSHCOG00000007683	COL5A1 (ENSHCOG00000007659)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	23	PPP6C (ENSMMDG00005009882)	ENSMMDG00005009884	ENSMMDG00005009886	sh3glb2a (ENSMMDG00005009900)	PIP5KL1 (ENSMMDG00005010059)	ptar1 (ENSMMDG00005010061)	APBA1 (ENSMMDG00005010064)	ENSMMDG00005010068	TJP2 (ENSMMDG00005010070)	ENSMMDG00005010074	fxn (ENSMMDG00005010078)	HMGCR (ENSMMDG00005010082)	ENSMMDG00005010085	GCNT4 (ENSMMDG00005010089)	fam169aa (ENSMMDG00005010092)	ENC1 (ENSMMDG00005010094) ##22	ENSMMDG00005010095	fam151b (ENSMMDG00005010097)	ankrd34bb (ENSMMDG00005010099)	dhfr (ENSMMDG00005010101)	gtf2h2 (ENSMMDG00005010102)	oclnb (ENSMMDG00005010114)	marveld2b (ENSMMDG00005010116)	sdf2l1 (ENSMMDG00005010117)	TOP3B (ENSMMDG00005010120)	ENSMMDG00005010126	ppm1f (ENSMMDG00005010128)	ENSMMDG00005010130	ENSMMDG00005010132	ENSMMDG00005010134	ENSMMDG00005010135
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00940000158634.a.c.a	ENSGT00530000063335.B.a.b	ENSGT00940000156820.a.a.e.a	ENSGT00390000017892	ENSGT00390000014593	ENSGT00940000156117.e.a	ENSGT00940000157986	ENSGT00390000018806	ENSGT00940000159671	ENSGT00940000165720	ENSGT00940000155305.b.a	ENSGT00940000154742.b.e	ENSGT00940000162618	ENSGT00940000159721.g	ENSGT00510000048902.a.e	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.a ##22	ENSGT00390000012710.b.b	ENSGT00390000012710.a.b	ENSGT00940000165661	ENSGT00390000012355.A.a.a.a	ENSGT00530000063681.b.a	ENSGT00940000166823	ENSGT00440000039046	ENSGT00390000015930	ENSGT00940000155771.d	ENSGT00730000110989.c.b	ENSGT00490000043395	ENSGT00940000159086	ENSGT01030000234598.b.b	ENSGT00940000159834	ENSGT00940000154929.C
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	255	ENSGT00940000156317.w.b.f	ENSGT00390000005811.db	ENSGT00940000158634.a.c.b.b.a.a	ENSGT00530000063335.B.a.b.j	ENSGT00940000156820.a.a.e.b.b	ENSGT00390000017892.i	ENSGT00390000014593	ENSGT00940000156117.e.a	ENSGT00940000157986	ENSGT00940000165720.l	ENSGT00940000155305.b.a	ENSGT00940000154742.b.e	ENSGT00940000162618	ENSGT00940000159721.g	ENSGT00510000048902.a.e.d	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.a ##22	ENSGT00390000012710.a.b.b	ENSGT00940000165661	ENSGT00390000012355.A.a.a.a.b	ENSGT00530000063681.b.a	ENSGT00940000166823	ENSGT00440000039046	ENSGT00390000015930	ENSGT00940000155771.d	ENSGT00730000110989.c.b	ENSGT00490000043395	ENSGT00940000159086	ENSGT01030000234598.b.b	ENSGT00940000159834.p	ENSGT00940000159834.o.a	ENSGT00940000165775.a.u
Huchen	MODERN SPECIES	2179															fam169aa (ENSHHUG00000017794)	ENC1 (ENSHHUG00000017786) ##22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000154390.F	ENSGT00390000005811.db	ENSGT00940000158634.a.c.b.b.a.a	ENSGT00530000063335.B.a.b.j	ENSGT00940000156820.a.a.e.b.b	ENSGT00390000017892.i	ENSGT00390000014593	ENSGT00940000156117.e.a	ENSGT00940000157986	ENSGT00940000165720.l	ENSGT00940000155305.b.a	ENSGT00940000154742.b.e	ENSGT00940000162618	ENSGT00940000159721.g	ENSGT00510000048902.a.e.d	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.a ##22	ENSGT00390000012710.b.b.b.b.b.b	ENSGT00390000012710.a.b.b	ENSGT00940000165661	ENSGT00390000012355.A.a.a.a.b	ENSGT00530000063681.b.a	ENSGT00940000166823	ENSGT00440000039046	ENSGT00390000015930	ENSGT00940000155771.d	ENSGT00730000110989.c.b	ENSGT00490000043395	ENSGT00940000159086	ENSGT01030000234598.b.b	ENSGT00940000159834.o.a	ENSGT00940000154929.C
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154390.F	ENSGT00390000005811.db	ENSGT00940000158634.a.c.b.a	ENSGT00530000063335.B.a.b.j	ENSGT00940000156820.a.a.e.b.b	ENSGT00390000017892.i	ENSGT00390000014593	ENSGT00940000156117.e.a	ENSGT00940000157986	ENSGT00940000165720.l	ENSGT00940000155305.b.a	ENSGT00940000154742.b.e	ENSGT00940000162618	ENSGT00940000159721.g	ENSGT00510000048902.a.e.d	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.a ##22	ENSGT00390000012710.b.b.b.b.b.b.a	ENSGT00390000012710.b.b.b.b.a.a	ENSGT00390000012710.b.b.a.a	ENSGT00390000012710.a.b.a.b	ENSGT00940000159207.n	ENSGT00390000012710.a.b.b.c	ENSGT00940000165661	ENSGT00390000012355.A.a.a.a.b	ENSGT00530000063681.b.a	ENSGT00940000166823	ENSGT00440000039046	ENSGT00390000015930	ENSGT00940000155771.d	ENSGT00730000110989.c.b	ENSGT00490000043395
River trout	MODERN SPECIES	39	URGCP (ENSSTUG00000034191)	fxn (ENSSTUG00000034193)	TJP2 (ENSSTUG00000001226)	ENTREP1 (ENSSTUG00000003283)	APBA1 (ENSSTUG00000003305)	ptar1 (ENSSTUG00000003358)	CFAP95 (ENSSTUG00000003371)	mamdc2a (ENSSTUG00000003391)	slc39a14 (ENSSTUG00000003511)	ENSSTUG00000003536	ENSSTUG00000003549	HMGCR (ENSSTUG00000003622)	ENSSTUG00000003876	gcnt4a (ENSSTUG00000004011)	ENSSTUG00000004026	ENC1 (ENSSTUG00000004071) ##22	ENSSTUG00000004082	ENSSTUG00000004093	ENSSTUG00000004124	ENSSTUG00000004140	ENSSTUG00000004178	ENSSTUG00000004193	ENSSTUG00000004210	ENSSTUG00000004223	ENSSTUG00000004247	dhfr (ENSSTUG00000004291)	ankrd34bb (ENSSTUG00000004327)	fam151b (ENSSTUG00000004338)	ccdc125 (ENSSTUG00000004359)	rad17 (ENSSTUG00000004400)	zgc:86811 (ENSSTUG00000004500)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	6	TJP2 (ENSSSAG00000045631)	APBA1 (ENSSSAG00000099740)	PTAR1 (ENSSSAG00000048789)	ENSSSAG00000091755	CFAP95 (ENSSSAG00000105999)	mamdc2a (ENSSSAG00000048808)	ENSSSAG00000048862	ENSSSAG00000048881	HMGCR (ENSSSAG00000049070)	ENSSSAG00000097330	ENSSSAG00000094394	ENSSSAG00000112425	ENSSSAG00000053787	GCNT4 (ENSSSAG00000039354)	ENSSSAG00000121417	ENSSSAG00000039476 ##22	ENSSSAG00000111030	ENSSSAG00000039677	ENSSSAG00000039717	ENSSSAG00000114974	ENSSSAG00000112001	ENSSSAG00000039752	ENSSSAG00000090325	ENSSSAG00000039900	ENSSSAG00000090002	ENSSSAG00000110459	ENSSSAG00000086660	ENSSSAG00000090777	dhfr (ENSSSAG00000040064)	ankrd34bb (ENSSSAG00000091973)	fam151b (ENSSSAG00000040081)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000005811.db	ENSGT00940000158634.a.c.b.b.a.a	ENSGT00530000063335.B.a.b.j	ENSGT00940000156820.a.a.e.b.b	ENSGT01090000260373.c.a	ENSGT00390000017892.i	ENSGT00390000014593	ENSGT00940000156117.e.a	ENSGT00940000157986	ENSGT00940000165720.l	ENSGT00940000155305.b.a	ENSGT00940000154742.b.e	ENSGT00940000162618	ENSGT00940000159721.g	ENSGT00510000048902.a.e.d	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.a ##22	ENSGT00390000012710.a.b.b	ENSGT00940000165661	ENSGT00390000012355.A.a.a.a.b	ENSGT00530000063681.b.a	ENSGT00940000166823	ENSGT00440000039046	ENSGT00390000015930	ENSGT00940000155771.d.g	ENSGT00730000110989.c.b	ENSGT00490000043395	ENSGT00940000159086	ENSGT01030000234598.b.b	ENSGT00940000159834.p	ENSGT00900000141033.a.cb.a	ENSGT00730000112019.b
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00940000154390.F	ENSGT00390000005811.db	ENSGT00940000158634.a.c.b.b.a.a	ENSGT00530000063335.B.a.b.j	ENSGT00940000156820.a.a.e.b.b	ENSGT01090000260373.c.a	ENSGT00390000017892.i	ENSGT00940000156117.e.a	ENSGT00940000157986	ENSGT00940000165720.l	ENSGT00940000155305.b.a	ENSGT00940000154742.b.e	ENSGT00940000162618	ENSGT00940000159721.g	ENSGT00510000048902.a.e.d	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.a ##22	ENSGT00390000012710.a.b.b	ENSGT00940000165661	ENSGT00390000012355.A.a.a.a.b	ENSGT00530000063681.b.a	ENSGT00940000166823	ENSGT00440000039046	ENSGT00390000015930	ENSGT00940000155771.d.g	ENSGT00730000110989.c.b	ENSGT00490000043395	ENSGT00940000159086	ENSGT01030000234598.b.b	ENSGT00940000159834.p	ENSGT00900000141033.a.cb.a	ENSGT00730000112019.b
Chinook salmon	MODERN SPECIES	99															ENSOTSG00005037699	ENC1 (ENSOTSG00005037700) ##22	ENSOTSG00005037701	ENSOTSG00005037702	ENSOTSG00005037703	ENSOTSG00005037705	ENSOTSG00005037706	dhfr (ENSOTSG00005037708)	ankrd34bb (ENSOTSG00005037713)	fam151b (ENSOTSG00005037715)	ENSOTSG00005037765
Coho salmon	MODERN SPECIES	28	fxn (ENSOKIG00005002534)	TJP2 (ENSOKIG00005002402)	ENTREP1 (ENSOKIG00005002325)	ENSOKIG00005002315	ENSOKIG00005002306	ENSOKIG00005002292	ptar1 (ENSOKIG00005002281)	mamdc2a (ENSOKIG00005002217)	slc39a14 (ENSOKIG00005002151)	ENSOKIG00005002082	HMGCR (ENSOKIG00005001974)	ENSOKIG00005001889	gcnt4a (ENSOKIG00005001850)	ENSOKIG00005001833	ENSOKIG00005001817	ENC1 (ENSOKIG00005001804) ##22	ENSOKIG00005001799	ENSOKIG00005001797	ENSOKIG00005001789	ENSOKIG00005001784	ENSOKIG00005001771	ENSOKIG00005039626	ENSOKIG00005039556	ENSOKIG00005039528	ENSOKIG00005039517	ENSOKIG00005039503	ENSOKIG00005039484	ENSOKIG00005039473	ENSOKIG00005039449	ENSOKIG00005039428	dhfr (ENSOKIG00005039336)
Northern pike	MODERN SPECIES	12	APBA1 (ENSELUG00000006278)	ENSELUG00000025844	ENSELUG00000025517	ptar1 (ENSELUG00000006311)	CFAP95 (ENSELUG00000006330)	mamdc2a (ENSELUG00000006419)	slc39a14 (ENSELUG00000006511)	ascc2 (ENSELUG00000006562)	ENSELUG00000006599	sec14l8 (ENSELUG00000006620)	ENSELUG00000006638	HMGCR (ENSELUG00000006676)	ENSELUG00000006697	gcnt4a (ENSELUG00000006723)	ENSELUG00000006745	ENC1 (ENSELUG00000001406) ##22	ENSELUG00000001629	ENSELUG00000029733	ENSELUG00000006825	dhfr (ENSELUG00000006861)	ankrd34bb (ENSELUG00000006938)	fam151b (ENSELUG00000032047)	ccdc125 (ENSELUG00000000242)	rad17 (ENSELUG00000007100)	zgc:86811 (ENSELUG00000007114)	marveld2b (ENSELUG00000007149)	oclnb (ENSELUG00000007170)	gtf2h2 (ENSELUG00000007247)	erap1b (ENSELUG00000007307)	sncaip (ENSELUG00000007340)	SNX2 (ENSELUG00000007419)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b ##22
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000009329	ENSGT00390000000529.k	ENSGT00940000159607	ENSGT00950000183047.d.e	ENSGT00940000159211.C	ENSGT00940000156959.A	ENSGT00390000014118	ENSGT00390000017382.r	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00940000160015	ENSGT00950000182888.a.a.a #17	ENSGT00390000018706 #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b ##22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000018729.a.f	ENSGT00940000156090.b
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	1280														ENSGT00390000018706.b #19	ENSGT00390000008107.c.a.h #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b.a ##22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000009329.e	ENSGT00390000000529.k	ENSGT00940000159607.p	ENSGT01040000240782.a.a	ENSGT00950000183047.d.e.b	ENSGT00940000159211.C.nb.a.a	ENSGT00940000156959.A.k.b	ENSGT00390000014118.g	ENSGT00390000017382.r.a	ENSGT00390000006452.b.a.c	ENSGT00390000008726.h.a.e	ENSGT00940000160015.c	ENSGT00950000182888.a.a.a.d #17	ENSGT00390000018706.b #19	ENSGT00390000008107.c.a.h #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b.a ##22	ENSGT00940000155831.cb.d #24	ENSGT00940000157156.q	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b.d	ENSGT00390000004161.h	ENSGT00950000182929.B.a.b.b	ENSGT00940000157105.d.b	ENSGT00940000155389.w	ENSGT01050000244898.b.b.b	ENSGT00940000157321.e.a	ENSGT00940000156290.b.d	ENSGT01070000253744.b.b.f.b	ENSGT00940000154821.a.a.e.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000018729.a.f
Salmo	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000000529.k	ENSGT00940000159607.p	ENSGT01040000240782.a.a	ENSGT00950000183047.d.e.b	ENSGT00940000159211.C.nb.a.a	ENSGT00940000156959.A.k.b	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.a.a.d	ENSGT00390000014118.g	ENSGT00390000017382.r.a	ENSGT00390000006452.b.a.c	ENSGT00390000008726.h.a.e	ENSGT00940000160015.c	ENSGT00950000182888.a.a.a.d #17	ENSGT00390000018706.b #19	ENSGT00390000008107.c.a.h #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b.a ##22	ENSGT00940000155831.cb.d #24	ENSGT00940000157156.q	ENSGT00940000153288.b.h	ENSGT00940000157140.b.a.b.b.d	ENSGT00390000004161.h	ENSGT00950000182929.B.a.b.b	ENSGT00940000157105.d.b	ENSGT00940000155389.w	ENSGT01050000244898.b.b.b	ENSGT00940000157321.e.a	ENSGT00940000156290.b.d	ENSGT01070000253744.b.b.f.b	ENSGT00940000154821.a.a.e.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000018729.a.f
River trout	MODERN SPECIES	15	CACFD1 (ENSSTUG00000049750)	ENSSTUG00000049754	ENSSTUG00000035403	ENSSTUG00000035409	FNBP1 (ENSSTUG00000035432)	COL5A1 (ENSSTUG00000035555)	ENSSTUG00000035601	ppp1r26 (ENSSTUG00000035633)	mrps2 (ENSSTUG00000035638)	dipk1b (ENSSTUG00000035651)	agpat2 (ENSSTUG00000035662)	egfl7 (ENSSTUG00000035670)	tor1 (ENSSTUG00000035735) #17	nsa2 (ENSSTUG00000035751) #19	hexb (ENSSTUG00000035782) #21	ENC1 (ENSSTUG00000035953) ##22	ARHGEF28 (ENSSTUG00000035967) #24	ankra2 (ENSSTUG00000036021)	btf3 (ENSSTUG00000036025)	foxd1 (ENSSTUG00000036032)	TMEM174 (ENSSTUG00000036035)	apoa4a (ENSSTUG00000036042)	fcho2 (ENSSTUG00000036056)	TNPO1 (ENSSTUG00000036279)	MOB1B (ENSSTUG00000036525)	dck (ENSSTUG00000036589)	SLC4A4 (ENSSTUG00000036695)	NPFFR2 (ENSSTUG00000039090)	ENSSTUG00000039096	ENSSTUG00000039110	ENSSTUG00000039134
Atlantic salmon	MODERN SPECIES		ENSSSAG00000078562	ptcd2 (ENSSSAG00000084732)	ENSSSAG00000078573	ENSSSAG00000078575	ENSSSAG00000078637	COL5A1 (ENSSSAG00000079384)	ENSSSAG00000079410	ENSSSAG00000079417	ppp1r26 (ENSSSAG00000079421)	mrps2 (ENSSSAG00000079426)	dipk1b (ENSSSAG00000079431)	ENSSSAG00000109208	tinp1 (ENSSSAG00000111807) #19	ENSSSAG00000079447 #17	hexb (ENSSSAG00000000265) #21	ENC1 (ENSSSAG00000079458) ##22	ARHGEF28 (ENSSSAG00000000544) #24	ENSSSAG00000100616	ENSSSAG00000084001	ENSSSAG00000084502	ankra2 (ENSSSAG00000000631)	ENSSSAG00000000689	foxd1 (ENSSSAG00000099692)	TMEM174 (ENSSSAG00000000709)	ENSSSAG00000102395	fcho2 (ENSSSAG00000092276)	TNPO1 (ENSSSAG00000001451)	mol1a (ENSSSAG00000001698)	DCK (ENSSSAG00000001721)	SLC4A4 (ENSSSAG00000001818)	ENSSSAG00000002614
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000155897.qb.a	ENSGT00390000009329.e	ENSGT00390000000529.k	ENSGT00940000159607.p	ENSGT01040000240782.a.a	ENSGT00950000183047.d.e.b	ENSGT00940000159211.C.nb.a.a	ENSGT00940000156959.A.k.b	ENSGT00940000181901	ENSGT00390000017382.r.a	ENSGT00390000006452.b.a.c	ENSGT00390000008726.h.a.e	ENSGT00940000160015.c	ENSGT00390000018706.b #19	ENSGT00390000008107.c.a.h #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b.a ##22	ENSGT00940000155831.cb.d #24	ENSGT00940000157156.q	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b.d	ENSGT00390000004161.h	ENSGT00950000182929.B.a.b.b	ENSGT00940000157105.d.b	ENSGT00940000155389.w	ENSGT01050000244898.b.b.b	ENSGT00940000157321.e.a	ENSGT00940000156290.b.d	ENSGT01070000253744.b.b.f.b	ENSGT00940000154821.a.a.e.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000018729.a.f
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000009329.e	ENSGT00390000000529.k	ENSGT00940000159607.p	ENSGT01040000240782.a.a	ENSGT00950000183047.d.e.b	ENSGT00940000159211.C.nb.a.a	ENSGT00940000156959.A.k.b	ENSGT01090000260029.a.a.a.a.a.a.b.b.a.a.d.c	ENSGT00390000014118.g	ENSGT00390000017382.r.a	ENSGT00390000006452.b.a.c	ENSGT00390000008726.h.a.e	ENSGT00940000160015.c	ENSGT00390000018706.b #19	ENSGT00390000008107.c.a.h #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b.a ##22	ENSGT00940000155831.cb.d #24	ENSGT00940000157156.q	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b.d	ENSGT00390000004161.h	ENSGT00950000182929.B.a.b.b	ENSGT00940000157105.d.b	ENSGT00940000155389.w	ENSGT01050000244898.b.b.b	ENSGT00940000157321.e.a	ENSGT00940000156290.b.d	ENSGT01070000253744.b.b.f.b	ENSGT00940000154821.a.a.e.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000018729.a.f
Coho salmon	MODERN SPECIES	15	ENSOKIG00005028838	ENSOKIG00005028856	FNBP1 (ENSOKIG00005028971)	ENSOKIG00005030948	ENSOKIG00005030972	ENSOKIG00005031025	ENSOKIG00005031070	ppp1r26 (ENSOKIG00005031085)	mrps2 (ENSOKIG00005031112)	dipk1b (ENSOKIG00005031127)	agpat2 (ENSOKIG00005031147)	egfl7 (ENSOKIG00005031159)	NSA2 (ENSOKIG00005031206) #19	ENSOKIG00005031219	hexb (ENSOKIG00005031280) #21	ENC1 (ENSOKIG00005032125) ##22	ankra2 (ENSOKIG00005032143)	ENSOKIG00005032187	foxd1 (ENSOKIG00005032220)	TMEM174 (ENSOKIG00005032225)	apoa4a (ENSOKIG00005032239)	fcho2 (ENSOKIG00005032346)	TNPO1 (ENSOKIG00005034029)	MOB1B (ENSOKIG00005034307)	dck (ENSOKIG00005034369)	SLC4A4 (ENSOKIG00005034421)	NPFFR2 (ENSOKIG00005034757)	ENSOKIG00005034769	ENSOKIG00005034791	ENSOKIG00005034808	ENSOKIG00005034840
Chinook salmon	MODERN SPECIES	12	CACFD1 (ENSOTSG00005040704)	ENSOTSG00005040703	ENSOTSG00005040699	FNBP1 (ENSOTSG00005040294)	ENSOTSG00005040289	ENSOTSG00005040288	ENSOTSG00005040286	ENSOTSG00005040285	ppp1r26 (ENSOTSG00005040283)	mrps2 (ENSOTSG00005040282)	dipk1b (ENSOTSG00005040280)	agpat2 (ENSOTSG00005040279)	egfl7 (ENSOTSG00005040276)	nsa2 (ENSOTSG00005040274) #19	hexb (ENSOTSG00005040192) #21	ENC1 (ENSOTSG00005040189) ##22	ENSOTSG00005040188	cckbra (ENSOTSG00005040166)	NALF1 (ENSOTSG00005040165)	lig4 (ENSOTSG00005040164)	irs2a (ENSOTSG00005040162)	rab20 (ENSOTSG00005040160)	CARS2 (ENSOTSG00005037450)	ankrd10a (ENSOTSG00005037430)	plekha3 (ENSOTSG00005037426)	znf385b (ENSOTSG00005037424)	ENSOTSG00005037421	neurod1 (ENSOTSG00005037420)	ppp1r1c (ENSOTSG00005037418)	dusp19b (ENSOTSG00005037417)	nckap1 (ENSOTSG00005037021)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	26	ENSOMYG00000048192	ENSOMYG00000057889	ENSOMYG00000041265	ENSOMYG00000000577	ENSOMYG00000060251	ENSOMYG00000000570	mrps2 (ENSOMYG00000000562)	ENSOMYG00000064084	dipk1b (ENSOMYG00000000548)	ENSOMYG00000065439	agpat2 (ENSOMYG00000041245)	egfl7 (ENSOMYG00000000507)	ENSOMYG00000071090	NSA2 (ENSOMYG00000056747) #19	hexb (ENSOMYG00000000436) #21	ENC1 (ENSOMYG00000000268) ##22	ENSOMYG00000059901	ARHGEF28 (ENSOMYG00000000251) #24	ankra2 (ENSOMYG00000000227)	ENSOMYG00000000217	foxd1 (ENSOMYG00000000189)	ENSOMYG00000059087	ENSOMYG00000000149	fcho2 (ENSOMYG00000000122)	ENSOMYG00000041233	MOB1B (ENSOMYG00000041162)	ENSOMYG00000070118	DCK (ENSOMYG00000041148)	SLC4A4 (ENSOMYG00000040169)	NPFFR2 (ENSOMYG00000039927)	ENSOMYG00000053809
Huchen	MODERN SPECIES	3345														nsa2 (ENSHHUG00000020234) #19	hexb (ENSHHUG00000020282) #21	ENC1 (ENSHHUG00000020337) ##22
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	118	ENSGT00940000159607.o	ENSGT00950000183047.d.e.a	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000159211.C.nb.a.b	ENSGT00940000156959.A.k.a	ENSGT00390000014118.h	ENSGT00390000017382.r.b	ENSGT00390000006452.b.a.d	ENSGT00390000008726.h.a.f	ENSGT00940000160015.d	ENSGT00950000182888.a.a.a.c.a.a #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.c.a.b #17	ENSGT00390000018706.a #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a.g #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b.b ##22	ENSGT00940000155831.cb.c #24	ENSGT00940000157156.r	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b.c	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105.d.a	ENSGT00940000155389.x	ENSGT01050000244898.b.b.a	ENSGT00940000157321.e.b	ENSGT00940000156290.b.c	ENSGT01070000253744.b.b.f.a	ENSGT00940000154821.a.a.e.b	ENSGT00940000156090.b.d	ENSGT00550000074846.lb	ENSGT00390000016167.i
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	80	ENSGT00390000009329.f	ENSGT00390000000529.l	ENSGT00940000159607.o	ENSGT00950000183047.d.e.a	ENSGT00940000159211.C.nb.a.b	ENSGT00940000156959.A.k.a	ENSGT00390000014118.h	ENSGT00390000017382.r.b	ENSGT00390000006452.b.a.d	ENSGT00390000008726.h.a.f	ENSGT00940000160015.d	ENSGT00950000182888.a.a.a.c.a.b.b.a #17	ENSGT00390000018706.a #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a.g #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b.b ##22	ENSGT00940000155831.cb.c #24	ENSGT00940000157156.r	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b.c	ENSGT00390000004161.g	ENSGT00940000157105.d.a	ENSGT00940000155389.x	ENSGT01050000244898.b.b.a	ENSGT00940000157321.e.b	ENSGT00940000156290.b.c	ENSGT01070000253744.b.b.f.a	ENSGT00940000154821.a.a.e.b	ENSGT00940000156090.b.d	ENSGT01000000214630.a	ENSGT00900000141071.b.d.a
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000000529.l	ENSGT00940000159607.o	ENSGT00950000183047.d.e.a	ENSGT00940000159211.C.nb.a.b	ENSGT00940000156959.A.k.a	ENSGT00390000014118.h	ENSGT00390000017382.r.b	ENSGT00390000006452.b.a.d	ENSGT00390000008726.h.a.f	ENSGT00940000160015.d	ENSGT00950000182888.a.a.a.c.a.b.b.a #17	ENSGT00950000182888.a.a.a.c.a.a #17	ENSGT00390000018706.a #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a.g #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b.b ##22	ENSGT00940000155831.cb.c #24	ENSGT00940000157156.r	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b.c	ENSGT00390000004161.g	ENSGT00940000157105.d.a	ENSGT00940000155389.x	ENSGT01050000244898.b.b.a	ENSGT00940000157321.e.b	ENSGT00940000156290.b.c	ENSGT01070000253744.b.b.f.a	ENSGT00940000154821.a.a.e.b	ENSGT00940000156090.b.d	ENSGT01000000214630.a	ENSGT00900000141071.b.d.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00390000009329.f	ENSGT00390000000529.l	ENSGT00940000159607.o	ENSGT00950000183047.d.e.a	ENSGT00940000159211.C.nb.a.b	ENSGT00940000156959.A.k.a	ENSGT00390000014118.h	ENSGT00390000017382.r.b	ENSGT00390000006452.b.a.d	ENSGT00390000008726.h.a.f	ENSGT00940000160015.d	ENSGT00950000182888.a.a.a.c.a.b.b.a #17	ENSGT00390000018706.a #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a.g #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b.b ##22	ENSGT00940000155831.cb.c #24	ENSGT00940000157156.r	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b.c	ENSGT00390000004161.g	ENSGT00940000157105.d.a	ENSGT00940000155389.x	ENSGT01050000244898.b.b.a	ENSGT00940000157321.e.b	ENSGT00940000156290.b.c	ENSGT01070000253744.b.b.f.a	ENSGT00940000154821.a.a.e.b	ENSGT00940000156090.b.d	ENSGT01000000214630.a	ENSGT00900000141071.b.d.a
Chinook salmon	MODERN SPECIES	26	CACFD1 (ENSOTSG00005021971)	REXO4 (ENSOTSG00005021972)	FNBP1 (ENSOTSG00005021974)	COL5A1 (ENSOTSG00005024614)	ENSOTSG00005024626	ppp1r26 (ENSOTSG00005024627)	mrps2 (ENSOTSG00005024628)	dipk1b (ENSOTSG00005024632)	agpat2 (ENSOTSG00005024635)	egfl7 (ENSOTSG00005024636)	tor1 (ENSOTSG00005024638) #17	tor1 (ENSOTSG00005024640) #17	nsa2 (ENSOTSG00005024642) #19	gfm2 (ENSOTSG00005024651) #20	hexb (ENSOTSG00005024669) #21	ENC1 (ENSOTSG00005024682) ##22	ankra2 (ENSOTSG00005024685)	btf3 (ENSOTSG00005024692)	foxd1 (ENSOTSG00005024694)	TMEM174 (ENSOTSG00005024696)	fcho2 (ENSOTSG00005024700)	TNPO1 (ENSOTSG00005027517)	MOB1B (ENSOTSG00005028267)	dck (ENSOTSG00005028395)	SLC4A4 (ENSOTSG00005028448)	NPFFR2 (ENSOTSG00005039750)	ENSOTSG00005039766	zgc:122979 (ENSOTSG00005039767)	hwa (ENSOTSG00005039768)	vcp (ENSOTSG00005039772)	zgc:77838 (ENSOTSG00005039830)
Coho salmon	MODERN SPECIES	21	CACFD1 (ENSOKIG00005048688)	REXO4 (ENSOKIG00005048696)	FNBP1 (ENSOKIG00005048725)	ENSOKIG00005048841	ENSOKIG00005048951	ENSOKIG00005048963	ppp1r26 (ENSOKIG00005048967)	mrps2 (ENSOKIG00005048968)	dipk1b (ENSOKIG00005048977)	agpat2 (ENSOKIG00005048980)	egfl7 (ENSOKIG00005048982)	tor1 (ENSOKIG00005038359) #17	nsa2 (ENSOKIG00005038405) #19	gfm2 (ENSOKIG00005038482) #20	hexb (ENSOKIG00005038659) #21	ENC1 (ENSOKIG00005038892) ##22	ARHGEF28 (ENSOKIG00005038932) #24	ankra2 (ENSOKIG00005039104)	btf3 (ENSOKIG00005039137)	foxd1 (ENSOKIG00005039179)	TMEM174 (ENSOKIG00005039194)	fcho2 (ENSOKIG00005039380)	TNPO1 (ENSOKIG00005040886)	MOB1B (ENSOKIG00005041667)	SLC4A4 (ENSOKIG00005042034)	NPFFR2 (ENSOKIG00005045515)	ENSOKIG00005045517	ENSOKIG00005045527	ENSOKIG00005045531	VCP (ENSOKIG00005045627)	zgc:77838 (ENSOKIG00005046395)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	364	ENSOMYG00000041279	ENSOMYG00000041271	ENSOMYG00000041268	ENSOMYG00000050453	ENSOMYG00000000586	ENSOMYG00000041262	mrps2 (ENSOMYG00000041260)	dipk1b (ENSOMYG00000041249)	agpat2 (ENSOMYG00000000532)	egfl7 (ENSOMYG00000060932)	ENSOMYG00000059822	ENSOMYG00000041224 #17	NSA2 (ENSOMYG00000041220) #19	gfm2 (ENSOMYG00000038309) #20	hexb (ENSOMYG00000037737) #21	ENC1 (ENSOMYG00000037623) ##22	ARHGEF28 (ENSOMYG00000037598) #24	ankra2 (ENSOMYG00000037576)	Btf3-1 (ENSOMYG00000037569)	foxd1 (ENSOMYG00000037563)	TMEM174 (ENSOMYG00000037558)	ENSOMYG00000036506	FCHO2 (ENSOMYG00000069297)	TNPO1 (ENSOMYG00000035081)	MOB1B (ENSOMYG00000034906)	DCK (ENSOMYG00000034882)	SLC4A4 (ENSOMYG00000034651)	NPFFR2 (ENSOMYG00000034453)	ENSOMYG00000034446	ENSOMYG00000034435	ENSOMYG00000034424
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000000529.l	ENSGT00940000159607.o	ENSGT00950000183047.d.e.a	ENSGT00940000154535.D.wb	ENSGT00940000159211.C.nb.a.b	ENSGT00940000156959.A.k.a	ENSGT00390000014118.h	ENSGT00390000017382.r.b	ENSGT00390000006452.b.a.d	ENSGT00390000008726.h.a.f	ENSGT00940000160015.d	ENSGT00950000182888.a.a.a.c.a.b.b.a #17	ENSGT00390000018706.a #19	ENSGT00550000074890.f #20	ENSGT00390000008107.c.a.g #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.f.b.b ##22	ENSGT00940000155831.cb.c #24	ENSGT00940000157156.r	ENSGT00940000153288.b.g	ENSGT00940000157140.b.a.b.b.c	ENSGT00390000004161.g	ENSGT00940000157105.d.a	ENSGT00940000155389.x	ENSGT01050000244898.b.b.a	ENSGT00940000157321.e.b	ENSGT00940000156290.b.c	ENSGT01070000253744.b.b.f.a	ENSGT00940000154821.a.a.e.b	ENSGT00940000156090.b.d	ENSGT01000000214630.a	ENSGT00900000141071.b.d.a
River trout	MODERN SPECIES	3	MAP1B (ENSSTUG00000021748)	ptcd2 (ENSSTUG00000021696)	ENSSTUG00000021676	REXO4 (ENSSTUG00000021646)	FNBP1 (ENSSTUG00000021425)	ENSSTUG00000021061	ENSSTUG00000021009	ppp1r26 (ENSSTUG00000020988)	dipk1b (ENSSTUG00000020945)	agpat2 (ENSSTUG00000020935)	egfl7 (ENSSTUG00000020894)	tor1 (ENSSTUG00000020809) #17	nsa2 (ENSSTUG00000020756) #19	gfm2 (ENSSTUG00000020572) #20	hexb (ENSSTUG00000020445) #21	ENC1 (ENSSTUG00000020413) ##22	ARHGEF28 (ENSSTUG00000020358) #24	ankra2 (ENSSTUG00000020344)	btf3 (ENSSTUG00000020316)	foxd1 (ENSSTUG00000020310)	TMEM174 (ENSSTUG00000020301)	fcho2 (ENSSTUG00000019513)	TNPO1 (ENSSTUG00000019248)	MOB1B (ENSSTUG00000019143)	dck (ENSSTUG00000019125)	ENSSTUG00000019120	SLC4A4 (ENSSTUG00000016091)	NPFFR2 (ENSSTUG00000015842)	zgc:122979 (ENSSTUG00000015838)	ENSSTUG00000015826	hwa (ENSSTUG00000015819)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	2	ENSSSAG00000111910	COL5A1 (ENSSSAG00000069796)	ENSSSAG00000069788	ppp1r26 (ENSSSAG00000069785)	mrps2 (ENSSSAG00000069784)	fa69b (ENSSSAG00000069777)	agpat2 (ENSSSAG00000118986)	egfl7 (ENSSSAG00000083641)	ENSSSAG00000069765 #17	ENSSSAG00000120318 #17	ENSSSAG00000086552 #17	ENSSSAG00000119406 #17	nsa2 (ENSSSAG00000069748) #19	gfm2 (ENSSSAG00000069717) #20	hexb (ENSSSAG00000069551) #21	ENC1 (ENSSSAG00000069539) ##22	ENSSSAG00000100343	ARHGEF28 (ENSSSAG00000069533) #24	ankra2 (ENSSSAG00000088737)	ENSSSAG00000069505	foxd1 (ENSSSAG00000102047)	TMEM174 (ENSSSAG00000069497)	fcho2 (ENSSSAG00000000898)	TNPO1 (ENSSSAG00000068062)	MOB1B (ENSSSAG00000100755)	DCK (ENSSSAG00000068041)	SLC4A4 (ENSSSAG00000067184)	NPFFR2 (ENSSSAG00000034609)	ENSSSAG00000067132	ENSSSAG00000067134	ENSSSAG00000104832
Huchen	MODERN SPECIES	16					ENSHHUG00000043473	ppp1r26 (ENSHHUG00000043476)	mrps2 (ENSHHUG00000043489)	dipk1b (ENSHHUG00000000009)	agpat2 (ENSHHUG00000000052)	egfl7 (ENSHHUG00000000060)	tor1 (ENSHHUG00000000078) #17	tor1 (ENSHHUG00000000116) #17	nsa2 (ENSHHUG00000000140) #19	gfm2 (ENSHHUG00000000422) #20	hexb (ENSHHUG00000000465) #21	ENC1 (ENSHHUG00000000825) ##22	ENSHHUG00000000830 #24	ENSHHUG00000000864 #24	ENSHHUG00000000869	ENSHHUG00000000879	ENSHHUG00000000891 #24	ankra2 (ENSHHUG00000000897)	ENSHHUG00000000918	foxd1 (ENSHHUG00000000981)	fcho2 (ENSHHUG00000001010)	TNPO1 (ENSHHUG00000001188)	MOB1B (ENSHHUG00000001436)	dck (ENSHHUG00000001529)	SLC4A4 (ENSHHUG00000001565)	NPFFR2 (ENSHHUG00000002860)	ENSHHUG00000002866
Northern pike	MODERN SPECIES	13	CACFD1 (ENSELUG00000003557)	ENSELUG00000003539	FNBP1 (ENSELUG00000003481)	COL5A1 (ENSELUG00000003331)	ENSELUG00000003285	ENSELUG00000003257	ppp1r26 (ENSELUG00000003244)	mrps2 (ENSELUG00000003223)	dipk1b (ENSELUG00000003199)	agpat2 (ENSELUG00000003185)	egfl7 (ENSELUG00000003173)	tor1 (ENSELUG00000003156) #17	nsa2 (ENSELUG00000003102) #19	gfm2 (ENSELUG00000003075) #20	hexb (ENSELUG00000003037) #21	ENC1 (ENSELUG00000003012) ##22	ARHGEF28 (ENSELUG00000002989) #24	ankra2 (ENSELUG00000002891)	foxd1 (ENSELUG00000002873)	btf3 (ENSELUG00000002875)	TMEM174 (ENSELUG00000002868)	fcho2 (ENSELUG00000000085)	TNPO1 (ENSELUG00000002821)	mob1ba (ENSELUG00000002806)	dck (ENSELUG00000002787)	SLC4A4 (ENSELUG00000002753)	NPFFR2 (ENSELUG00000002622)	ENSELUG00000000069	ENSELUG00000002592	ENSELUG00000002574	zgc:122979 (ENSELUG00000002557)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	226	ENSGT00940000153294	ENSGT00390000004339	ENSGT00390000009787	ENSGT00940000158829	ENSGT00390000011980.b.b	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000164999	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155976.b.a.b	ENSGT00940000166104	ENSGT00390000013846.a.a	ENSGT00550000074890 #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT00390000009329	ENSGT00940000155897	ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000017462
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000153294	ENSGT00390000004339	ENSGT00390000009787	ENSGT00940000158829	ENSGT00390000011980.b.b	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000164999	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155976.b.a.b	ENSGT00940000166104	ENSGT00390000013846.a.a	ENSGT00550000074890 #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT00390000009329	ENSGT00940000155897	ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000017462
Denticle herring	MODERN SPECIES	13	RPL7A (ENSDCDG00000023776)	zgc:103692 (ENSDCDG00000023789)	usp20 (ENSDCDG00000023804)	ptges (ENSDCDG00000023895)	garnl3 (ENSDCDG00000023947)	ENSDCDG00000025702	ttll11 (ENSDCDG00000025705)	dab2ipb (ENSDCDG00000025793)	zgc:63972 (ENSDCDG00000027594)	fibcd1b (ENSDCDG00000027599)	ENSDCDG00000027613	ENSDCDG00000027627	aif1l (ENSDCDG00000027629)	gfm2 (ENSDCDG00000027646) #20	hexb (ENSDCDG00000027690) #21	ENC1 (ENSDCDG00000027922) #22	ARHGEF28 (ENSDCDG00000027930) #24	ankra2 (ENSDCDG00000027948)	btf3 (ENSDCDG00000027954)	foxd1 (ENSDCDG00000027955)	TMEM174 (ENSDCDG00000027957)	fcho2 (ENSDCDG00000027988)	TNPO1 (ENSDCDG00000028773)	ptcd2 (ENSDCDG00000029276)	MAP1B (ENSDCDG00000029278)	ENSDCDG00000029284	ptger4b (ENSDCDG00000029286)	ttc33 (ENSDCDG00000029288)	DUSP26 (ENSDCDG00000029292)	ppiab (ENSDCDG00000029295)	ZMIZ2 (ENSDCDG00000029347)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	3	ASTN2 (ENSCHAG00000005594)	ENSCHAG00000006139	ENSCHAG00000006165	trim32 (ENSCHAG00000006233)	pappaa (ENSCHAG00000006243)	znf618 (ENSCHAG00000006313)	rgs3a (ENSCHAG00000006335)	ENSCHAG00000006417	rabepk (ENSCHAG00000006430)	hspa5 (ENSCHAG00000006471)	HSPA5 (ENSCHAG00000006720)	golga2 (ENSCHAG00000006912)	dnm1a (ENSCHAG00000007239)	ENSCHAG00000008202	bbln (ENSCHAG00000008217)	ENC1 (ENSCHAG00000008231) #22	ENSCHAG00000008245 #24	ankra2 (ENSCHAG00000008294)	btf3 (ENSCHAG00000008388)	foxd1 (ENSCHAG00000008410)	TMEM174 (ENSCHAG00000008427)	fcho2 (ENSCHAG00000008505)	TNPO1 (ENSCHAG00000010519)	ptcd2 (ENSCHAG00000010756)	MAP1B (ENSCHAG00000010761)	ptger4b (ENSCHAG00000010791)	ttc33 (ENSCHAG00000010798)	ENSCHAG00000010820	ZMIZ2 (ENSCHAG00000010847)	ENSCHAG00000011022	ENSCHAG00000011037
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	100	ENSGT00940000153294	ENSGT00390000004339	ENSGT00390000009787	ENSGT00940000158829	ENSGT00390000011980.b.b	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000164999	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155976.b.a.b	ENSGT00940000166104	ENSGT00390000013846.a.a	ENSGT00550000074890 #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT00390000009329	ENSGT00940000155897	ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000017462	ENSGT00390000015513.a.b.b
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00950000183135.A.a	ENSGT00390000017523	ENSGT01030000234555.a.a.a.c.a	ENSGT00940000153592.B.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000164999	ENSGT00940000159362	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155976.b.a.b	ENSGT00940000166104	ENSGT00390000013846.a.a	ENSGT00550000074890 #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT00390000009329	ENSGT00940000155897	ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000017462	ENSGT00390000015513.a.b.b
Channel catfish	MODERN SPECIES	20	ttll11 (ENSIPUG00000024127)	ENSIPUG00000024128	garnl3 (ENSIPUG00000024135)	zgc:63972 (ENSIPUG00000024144)	ENSIPUG00000024145	fibcd1b (ENSIPUG00000024146)	LAMC3 (ENSIPUG00000024147)	aif1l (ENSIPUG00000024152)	gfm2 (ENSIPUG00000024153) #20	hexb (ENSIPUG00000024169) #21	ENSIPUG00000005629	ENSIPUG00000005649	ENSIPUG00000005658	ENSIPUG00000005666	ENSIPUG00000005678	Enc1 (ENSIPUG00000005692) #22	ENSIPUG00000005712	ENSIPUG00000005715	arhgef28 (ENSIPUG00000005745) #24	ankra2 (ENSIPUG00000005849)	Btf3 (ENSIPUG00000005877)	foxd1 (ENSIPUG00000005902)	fcho2 (ENSIPUG00000005934)	ptcd2 (ENSIPUG00000006080)	ttc33 (ENSIPUG00000006092)	mvb12b (ENSIPUG00000006115)	mapkap1 (ENSIPUG00000006194)	ENSIPUG00000006268	c28h9orf172 (ENSIPUG00000006304)	ENSIPUG00000006314	mcc (ENSIPUG00000006341)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00940000153491.b.b.a	ENSGT00950000183135.A.a	ENSGT00390000017523	ENSGT01030000234555.a.a.a.c.a	ENSGT00940000153592.B.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000164999	ENSGT00940000159362	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155976.b.a.b	ENSGT00940000166104	ENSGT00390000013846.a.a	ENSGT00550000074890 #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT00390000009329	ENSGT00940000155897	ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000017462	ENSGT00390000015513.a.b.b
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00950000183135.A.a	ENSGT00390000017523	ENSGT01030000234555.a.a.a.c.a	ENSGT00940000153592.B.a	ENSGT00940000155853.d.a	ENSGT00940000156689	ENSGT00940000164999	ENSGT00940000159362	ENSGT00390000017030.b.a	ENSGT00940000155976.b.a.b	ENSGT00880000138014.a	ENSGT00940000166104	ENSGT00390000013846.a.a	ENSGT00550000074890 #20	ENSGT00390000008107.c.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT00390000009329	ENSGT00940000155897	ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000017462	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00940000155946.c.b	ENSGT00940000154079.b.b	ENSGT00940000160616
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	2	zswim7 (ENSPNAG00000017450)	adora2b (ENSPNAG00000017460)	SPECC1 (ENSPNAG00000017516)	dab2ipb (ENSPNAG00000007041)	ttll11 (ENSPNAG00000017759)	ENSPNAG00000017780	garnl3 (ENSPNAG00000018040)	zgc:63972 (ENSPNAG00000018062)	ENSPNAG00000018074	fibcd1b (ENSPNAG00000018104)	si:ch211-122f10.4 (ENSPNAG00000018259)	ENSPNAG00000018368	aif1l (ENSPNAG00000018392)	gfm2 (ENSPNAG00000018467) #20	hexb (ENSPNAG00000018571) #21	ENC1 (ENSPNAG00000018598) #22	ENSPNAG00000018943	ENSPNAG00000021129	ENSPNAG00000021200	ARHGEF28 (ENSPNAG00000021256) #24	ENSPNAG00000021279	ENSPNAG00000021287	ankra2 (ENSPNAG00000021321)	btf3 (ENSPNAG00000006350)	foxd1 (ENSPNAG00000021362)	TMEM174 (ENSPNAG00000006042)	fcho2 (ENSPNAG00000021417)	TNPO1 (ENSPNAG00000021484)	ptcd2 (ENSPNAG00000021490)	MAP1B (ENSPNAG00000021500)	ptger4b (ENSPNAG00000021508)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	137	ENSAMXG00000042581	ENSAMXG00000030544	ENSAMXG00000035005	ENSAMXG00000008513	garnl3 (ENSAMXG00000008524)	ENSAMXG00000035505	zgc:63972 (ENSAMXG00000035088)	fibcd1b (ENSAMXG00000008551)	ENSAMXG00000037479	ENSAMXG00000038426	si:ch211-122f10.4 (ENSAMXG00000010010)	ENSAMXG00000009995	aif1l (ENSAMXG00000036936)	gfm2 (ENSAMXG00000009979) #20	hexb (ENSAMXG00000036341) #21	ENC1 (ENSAMXG00000009945) #22	ENSAMXG00000033617	ARHGEF28 (ENSAMXG00000009924) #24	ENSAMXG00000009913	ankra2 (ENSAMXG00000009909)	btf3 (ENSAMXG00000043535)	foxd1 (ENSAMXG00000025555)	TMEM174 (ENSAMXG00000042241)	fcho2 (ENSAMXG00000009862)	TNPO1 (ENSAMXG00000009842)	ptcd2 (ENSAMXG00000029404)	MAP1B (ENSAMXG00000030234)	ENSAMXG00000030056	dnaja3b (ENSAMXG00000037061)	ptger4b (ENSAMXG00000008187)	fbp1b (ENSAMXG00000008165)
Electric eel	MODERN SPECIES	114								fzd6 (ENSEEEG00000014970)	LAPTM4B (ENSEEEG00000014968)	MATN2 (ENSEEEG00000014936)	POP1 (ENSEEEG00000014926)	NIPAL2 (ENSEEEG00000014909)	KCNS2 (ENSEEEG00000014908)	osr2 (ENSEEEG00000014907)	ENSEEEG00000014901	ENC1 (ENSEEEG00000014893) #22	ARHGEF28 (ENSEEEG00000014886) #24	ankra2 (ENSEEEG00000014880)	btf3 (ENSEEEG00000014862)	foxd1 (ENSEEEG00000014859)	TMEM174 (ENSEEEG00000014858)	fcho2 (ENSEEEG00000014854)	TNPO1 (ENSEEEG00000014224)	ptcd2 (ENSEEEG00000014188)	MAP1B (ENSEEEG00000014186)	ptger4b (ENSEEEG00000014183)	ttc33 (ENSEEEG00000014182)	fbp1b (ENSEEEG00000014122)	si:dkey-26g8.5 (ENSEEEG00000013915)	ENSEEEG00000013508	ENSEEEG00000013483
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Cyprininae	DUPLICATION
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Goldfish	MODERN SPECIES	44	usp20 (ENSCARG00000000727)	ptges (ENSCARG00000000808)	garnl3 (ENSCARG00000000939)	ENSCARG00000001266	ENSCARG00000001269	ENSCARG00000001272	ttll11 (ENSCARG00000001281)	ENSCARG00000001291	dab2ipb (ENSCARG00000001453)	ENSCARG00000002358	fibcd1b (ENSCARG00000002373)	ENSCARG00000002393	aif1l (ENSCARG00000002402)	gfm2 (ENSCARG00000002432) #20	hexb (ENSCARG00000002521) #21	ENC1 (ENSCARG00000002975) #22	ENSCARG00000002979	ankra2 (ENSCARG00000003016)	BTF3 (ENSCARG00000003078)	foxd1 (ENSCARG00000003086)	TMEM174 (ENSCARG00000003088)	fcho2 (ENSCARG00000003236)	TNPO1 (ENSCARG00000004811)	ptcd2 (ENSCARG00000004842)	MAP1B (ENSCARG00000004853)	ptger4b (ENSCARG00000004862)	ttc33 (ENSCARG00000004866)	fbp1b (ENSCARG00000004876)	ERLIN2 (ENSCARG00000004939)	ENSCARG00000005466	AR (ENSCARG00000005493)
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Common carp reference	MODERN SPECIES	7	ENSCCRG00000067960	ENSCCRG00000075382	ENSCCRG00000060506	ENSCCRG00000045281	ENSCCRG00000072677	ttll11 (ENSCCRG00000013355)	dab2ipb (ENSCCRG00000011032)	zgc:63972 (ENSCCRG00000026216)	ENSCCRG00000080312	ENSCCRG00000059273	fibcd1b (ENSCCRG00000082193)	ENSCCRG00000056523	ENSCCRG00000039917	gfm2 (ENSCCRG00000057540) #20	hexb (ENSCCRG00000040887) #21	ENC1 (ENSCCRG00000059718) #22	ARHGEF28 (ENSCCRG00000058433) #24	ankra2 (ENSCCRG00000006412)	foxd1 (ENSCCRG00000074201)	BTF3 (ENSCCRG00000061157)	fcho2 (ENSCCRG00000024864)	TNPO1 (ENSCCRG00000078324)	ptcd2 (ENSCCRG00000005456)	ENSCCRG00000057650	ptger4b (ENSCCRG00000072272)	fbp1b (ENSCCRG00000068753)	ttc33 (ENSCCRG00000059841)	ENSCCRG00000012073	ENSCCRG00000013293	EDA2R (ENSCCRG00000065168)	AR (ENSCCRG00000013298)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1508												ENSSGRG00000019117	aif1l (ENSSGRG00000019114)	gfm2 (ENSSGRG00000019111) #20	hexb (ENSSGRG00000018191) #21	ENC1 (ENSSGRG00000018165) #22
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000164999.g	ENSGT00940000156689.d	ENSGT00940000155853.d.a.f	ENSGT00940000158715.f	ENSGT00390000017030.b.a.h	ENSGT00940000155976.b.a.b.a	ENSGT00940000166104.`b	ENSGT00390000013846.a.a.a	ENSGT00550000074890.c #20	ENSGT00390000008107.c.a.a.a #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.g #22	ENSGT00940000166104.ab	ENSGT00390000013846.a.a.b.a.a	ENSGT00550000074890.d #20	ENSGT00390000008107.c.a.b #21	ENSGT00950000182983.B.a.b.h #22	ENSGT00940000155831.cb #24	ENSGT00940000157156.t	ENSGT00940000153288.a.b.a.b	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b.a	ENSGT00390000004161.e	ENSGT00940000157105.a.b	ENSGT00940000155389.u	ENSGT00390000009329.c	ENSGT00940000155897.ob	ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000017462.c.b	ENSGT00390000015513.a.b.b.c	ENSGT00390000014666.a.b	ENSGT00940000167361.b
Goldfish	DUPLICATION
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Goldfish	MODERN SPECIES	23	GTF2A2 (ENSCARG00000007148)	foxb1b (ENSCARG00000007164)	ENSCARG00000007167	anxa2b (ENSCARG00000007178)	rorab (ENSCARG00000007313)	tln2a (ENSCARG00000009522)	tpma (ENSCARG00000013993)	ENSCARG00000014195	isl2b (ENSCARG00000014202)	pstpip1b (ENSCARG00000014206)	ENSCARG00000014217	ENSCARG00000014232	aif1l (ENSCARG00000014358)	gfm2 (ENSCARG00000014394) #20	hexb (ENSCARG00000014602) #21	ENC1 (ENSCARG00000015330) #22	ARHGEF28 (ENSCARG00000015340) #24	ankra2 (ENSCARG00000015382)	btf3 (ENSCARG00000015419)	foxd1 (ENSCARG00000015431)	TMEM174 (ENSCARG00000015432)	fcho2 (ENSCARG00000015503)	TNPO1 (ENSCARG00000018581)	ptcd2 (ENSCARG00000018767)	MAP1B (ENSCARG00000018778)	ptger4b (ENSCARG00000018787)	ttc33 (ENSCARG00000018793)	fbp1b (ENSCARG00000018806)	ERLIN2 (ENSCARG00000018836)	ENSCARG00000019074	EDA2R (ENSCARG00000019080)
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