Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Amniota DUPLICATION Amniota ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00940000154126.h ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000168298 ENSGT00940000158105 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00740000117098 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000168298 Theria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00740000117098 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000168298 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00940000155329 #15 ENSGT00940000162839 #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00740000117098 ENSGT00940000155038 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00740000117098 ENSGT00940000155038 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000162839.a.l ##16 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000168298 Primates ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154677.h #23 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154677.h #23 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000011576.a #37 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154677.h #23 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000011576.a #37 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.p ##20 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154677.h #23 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000011576.a #37 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.p ##20 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154677.h #23 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000011576.a #37 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00620000089275 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00940000163894 #17 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.p ##20 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154677.h #23 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000011576.a #37 Drill MODERN SPECIES 1546 APELA (ENSMLEG00000010629) #14 ENSMLEG00000005471 #15 TRIM75 (ENSMLEG00000027498) #16 ENSMLEG00000044005 #17 TMEM192 (ENSMLEG00000041694) #18 KLHL2 (ENSMLEG00000001226) #19 GK3 (ENSMLEG00000031590) #20 MSMO1 (ENSMLEG00000038216) #21 CPE (ENSMLEG00000030269) #22 ENSMLEG00000032503 #23 ENSMLEG00000035584 #24 TLL1 (ENSMLEG00000032845) #25 SPOCK3 (ENSMLEG00000036560) #26 ANXA10 (ENSMLEG00000041410) #27 DDX60 (ENSMLEG00000030919) #28 DDX60L (ENSMLEG00000027365) #29 PALLD (ENSMLEG00000037012) #30 CBR4 (ENSMLEG00000029195) #31 SH3RF1 (ENSMLEG00000039808) #32 NEK1 (ENSMLEG00000039697) #33 CLCN3 (ENSMLEG00000037522) #34 HPF1 (ENSMLEG00000023008) #35 ENSMLEG00000034030 #36 MFAP3L (ENSMLEG00000041779) #37 Sooty mangabey MODERN SPECIES 272 NPY5R (ENSCATG00000022555) TKTL2 (ENSCATG00000022800) TMA16 (ENSCATG00000010392) MARCHF1 (ENSCATG00000033869) SMIM31 (ENSCATG00000013550) APELA (ENSCATG00000037336) #14 ENSCATG00000036915 ENSCATG00000035799 #15 TRIM75 (ENSCATG00000021106) #16 ENSCATG00000035632 #17 TMEM192 (ENSCATG00000031779) #18 ENSCATG00000040073 ##20 KLHL2 (ENSCATG00000042711) #19 MSMO1 (ENSCATG00000029596) #21 ENSCATG00000040801 CPE (ENSCATG00000034797) #22 ENSCATG00000038353 #24 TLL1 (ENSCATG00000045361) #25 SPOCK3 (ENSCATG00000045135) #26 ANXA10 (ENSCATG00000041057) #27 DDX60 (ENSCATG00000038859) #28 DDX60L (ENSCATG00000044236) #29 PALLD (ENSCATG00000034876) #30 ENSCATG00000038325 CBR4 (ENSCATG00000044537) #31 SH3RF1 (ENSCATG00000044552) #32 NEK1 (ENSCATG00000041685) #33 CLCN3 (ENSCATG00000035110) #34 HPF1 (ENSCATG00000040382) #35 ENSCATG00000029833 #36 MFAP3L (ENSCATG00000017844) #37 Olive baboon MODERN SPECIES 13 TMA16 (ENSPANG00000018456) MARCHF1 (ENSPANG00000010028) ENSPANG00000037313 SMIM31 (ENSPANG00000029574) APELA (ENSPANG00000034001) #14 ENSPANG00000040369 ##15 ENSPANG00000014469 #15 ENSPANG00000036093 #17 ENSPANG00000038075 ENSPANG00000046375 TMEM192 (ENSPANG00000015573) #18 GK3 (ENSPANG00000049013) #20 KLHL2 (ENSPANG00000007135) #19 MSMO1 (ENSPANG00000044750) #21 ENSPANG00000025445 CPE (ENSPANG00000008752) #22 ENSPANG00000044888 #24 TLL1 (ENSPANG00000019718) #25 ENSPANG00000050156 SPOCK3 (ENSPANG00000006370) #26 ANXA10 (ENSPANG00000009896) #27 ENSPANG00000019535 #28 DDX60L (ENSPANG00000017684) #29 PALLD (ENSPANG00000018592) #30 CBR4 (ENSPANG00000017537) #31 SH3RF1 (ENSPANG00000006245) #32 NEK1 (ENSPANG00000018130) #33 CLCN3 (ENSPANG00000011413) #34 HPF1 (ENSPANG00000006046) #35 ENSPANG00000007780 #36 MFAP3L (ENSPANG00000008031) #37 Macaca ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.p ##20 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT01100000263493.a.a.a.b.b.b.b.a.b.b.a.b.b.a ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000011576.a #37 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 15 MARCHF1 (ENSMFAG00000045943) ENSMFAG00000059015 ENSMFAG00000056114 ENSMFAG00000065779 SMIM31 (ENSMFAG00000031722) APELA (ENSMFAG00000031660) #14 TRIM61 (ENSMFAG00000026475) #15 ENSMFAG00000056784 ##15 TRIM75 (ENSMFAG00000030081) #16 TMEM192 (ENSMFAG00000039396) #18 ENSMFAG00000064449 ENSMFAG00000061493 KLHL2 (ENSMFAG00000041292) #19 GK3 (ENSMFAG00000052925) #20 MSMO1 (ENSMFAG00000045090) #21 CPE (ENSMFAG00000037970) #22 ENSMFAG00000057954 #24 ENSMFAG00000052178 TLL1 (ENSMFAG00000001125) #25 ENSMFAG00000050486 SPOCK3 (ENSMFAG00000039387) #26 ENSMFAG00000055789 ENSMFAG00000055266 ANXA10 (ENSMFAG00000002951) #27 DDX60 (ENSMFAG00000016136) #28 DDX60L (ENSMFAG00000045327) #29 PALLD (ENSMFAG00000001632) #30 CBR4 (ENSMFAG00000002570) #31 SH3RF1 (ENSMFAG00000026776) #32 NEK1 (ENSMFAG00000043975) #33 CLCN3 (ENSMFAG00000039959) #34 Rhesus MODERN SPECIES 15 NPY5R (ENSMMUG00000020242) TKTL2 (ENSMMUG00000003388) TMA16 (ENSMMUG00000004482) MARCHF1 (ENSMMUG00000041688) ENSMMUG00000062029 SMIM31 (ENSMMUG00000059520) APELA (ENSMMUG00000064230) #14 ENSMMUG00000062956 ##15 ENSMMUG00000012508 #15 TRIM60 (ENSMMUG00000000102) ##15 TRIM75 (ENSMMUG00000050635) #16 TMEM192 (ENSMMUG00000021912) #18 KLHL2 (ENSMMUG00000017342) #19 GK3 (ENSMMUG00000017343) #20 MSMO1 (ENSMMUG00000056040) #21 CPE (ENSMMUG00000023400) #22 ENSMMUG00000054824 TLL1 (ENSMMUG00000015799) #25 SPOCK3 (ENSMMUG00000006851) #26 ANXA10 (ENSMMUG00000001879) #27 DDX60 (ENSMMUG00000001880) #28 DDX60L (ENSMMUG00000003634) #29 PALLD (ENSMMUG00000007365) #30 CBR4 (ENSMMUG00000015921) #31 SH3RF1 (ENSMMUG00000012701) #32 ENSMMUG00000050412 NEK1 (ENSMMUG00000012244) #33 CLCN3 (ENSMMUG00000010228) #34 HPF1 (ENSMMUG00000010232) #35 MFAP3L (ENSMMUG00000040113) #37 AADAT (ENSMMUG00000019473) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 375 SMIM31 (ENSMNEG00000028811) APELA (ENSMNEG00000033023) #14 ENSMNEG00000032263 #15 ENSMNEG00000045039 ENSMNEG00000034528 #15 TRIM75 (ENSMNEG00000014648) #16 TMEM192 (ENSMNEG00000038903) #18 ENSMNEG00000042068 ##20 KLHL2 (ENSMNEG00000032807) #19 MSMO1 (ENSMNEG00000009247) #21 CPE (ENSMNEG00000042411) #22 ENSMNEG00000005430 #24 TLL1 (ENSMNEG00000029076) #25 SPOCK3 (ENSMNEG00000030644) #26 ANXA10 (ENSMNEG00000009695) #27 DDX60 (ENSMNEG00000030573) #28 DDX60L (ENSMNEG00000029554) #29 PALLD (ENSMNEG00000042389) #30 CBR4 (ENSMNEG00000045378) #31 SH3RF1 (ENSMNEG00000039365) #32 NEK1 (ENSMNEG00000042336) #33 CLCN3 (ENSMNEG00000028245) #34 HPF1 (ENSMNEG00000029561) #35 ENSMNEG00000034235 #36 MFAP3L (ENSMNEG00000038878) #37 AADAT (ENSMNEG00000014362) Vervet Monkey MODERN SPECIES 26 FSTL5 (ENSCSAG00000003200) NAF1 (ENSCSAG00000003199) NPY1R (ENSCSAG00000003197) NPY5R (ENSCSAG00000003195) TMA16 (ENSCSAG00000003193) MARCHF1 (ENSCSAG00000003192) SMIM31 (ENSCSAG00000003186) ENSCSAG00000003182 ENSCSAG00000000105 ENSCSAG00000000103 #15 TRIM60 (ENSCSAG00000000101) ##15 TMEM192 (ENSCSAG00000003180) #18 KLHL2 (ENSCSAG00000003177) #19 GK3 (ENSCSAG00000000100) #20 MSMO1 (ENSCSAG00000003174) #21 CPE (ENSCSAG00000003171) #22 TLL1 (ENSCSAG00000003170) #25 SPOCK3 (ENSCSAG00000003165) #26 ENSCSAG00000003162 ANXA10 (ENSCSAG00000003159) #27 DDX60 (ENSCSAG00000003155) #28 DDX60L (ENSCSAG00000003149) #29 PALLD (ENSCSAG00000003143) #30 CBR4 (ENSCSAG00000003127) #31 SH3RF1 (ENSCSAG00000003124) #32 NEK1 (ENSCSAG00000003121) #33 CLCN3 (ENSCSAG00000003116) #34 HPF1 (ENSCSAG00000003113) #35 MFAP3L (ENSCSAG00000003111) #37 AADAT (ENSCSAG00000003109) ENSCSAG00000000098 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 287 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00910000148912 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00620000089275 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1170 SMIM31 (ENSRROG00000042199) APELA (ENSRROG00000028795) #14 ENSRROG00000036449 #15 ENSRROG00000045692 TRIM75 (ENSRROG00000038459) #16 TMEM192 (ENSRROG00000025812) #18 ENSRROG00000009326 KLHL2 (ENSRROG00000031904) #19 MSMO1 (ENSRROG00000042423) #21 ENSRROG00000028538 CPE (ENSRROG00000044324) #22 ENSRROG00000033368 #24 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2254 ENSRBIG00000004342 KLHL2 (ENSRBIG00000038533) #19 MSMO1 (ENSRBIG00000039648) #21 CPE (ENSRBIG00000032074) #22 ENSRBIG00000042572 #23 ENSRBIG00000039572 ENSRBIG00000011855 #24 TLL1 (ENSRBIG00000032934) #25 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01090000260040.b.b.b.b.a.a.a.b ENSGT00950000182907.a.b.b.b.tb ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154677.h #23 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000010063.o.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01090000260040.b.b.b.b.a.a.a.b ENSGT00950000182907.a.b.b.b.tb ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154677.h #23 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000010063.o.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01090000260040.b.b.b.b.a.a.a.b ENSGT00950000182907.a.b.b.b.tb.a ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b.a #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154677.h #23 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876.o.a #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000010063.o.b Gorilla MODERN SPECIES 17 NAF1 (ENSGGOG00000000894) NPY1R (ENSGGOG00000004467) NPY5R (ENSGGOG00000004465) TKTL2 (ENSGGOG00000011873) TMA16 (ENSGGOG00000025324) MARCHF1 (ENSGGOG00000012475) ENSGGOG00000026017 SMIM31 (ENSGGOG00000039468) APELA (ENSGGOG00000036686) #14 ENSGGOG00000042661 #15 TRIM60 (ENSGGOG00000009550) ##15 TRIM75 (ENSGGOG00000004692) #16 KLHL2 (ENSGGOG00000001786) #19 GK3 (ENSGGOG00000036122) #20 MSMO1 (ENSGGOG00000015730) #21 CPE (ENSGGOG00000026366) #22 ENSGGOG00000042709 #23 ENSGGOG00000023838 #24 TLL1 (ENSGGOG00000000148) #25 SPOCK3 (ENSGGOG00000036722) #26 ANXA10 (ENSGGOG00000007800) #27 DDX60 (ENSGGOG00000012801) #28 DDX60L (ENSGGOG00000014778) #29 PALLD (ENSGGOG00000009674) #30 CBR4 (ENSGGOG00000024424) #31 SH3RF1 (ENSGGOG00000000154) #32 NEK1 (ENSGGOG00000008001) #33 CLCN3 (ENSGGOG00000014250) #34 HPF1 (ENSGGOG00000003090) #35 ENSGGOG00000024271 #36 ENSGGOG00000026687 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01090000260040.b.b.b.b.a.a.a.b ENSGT00950000182907.a.b.b.b.tb.a ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b.a #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154677.h #23 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876.o.a #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000010063.o.b Pan ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01090000260040.b.b.b.b.a.a.a.b ENSGT00950000182907.a.b.b.b.tb.a ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183347 #14 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b.a #20 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154677.h #23 ENSGT00390000004860.ab #24 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876.o.a #35 ENSGT00940000154256.l.a #36 ENSGT00390000010063.o.b Bonobo MODERN SPECIES 17 NPY1R (ENSPPAG00000044130) TKTL2 (ENSPPAG00000024062) TMA16 (ENSPPAG00000000177) MARCHF1 (ENSPPAG00000044145) ENSPPAG00000044141 ENSPPAG00000028110 SMIM31 (ENSPPAG00000028428) APELA (ENSPPAG00000040006) #14 ENSPPAG00000026877 #15 TRIM60 (ENSPPAG00000009774) ##15 TRIM75 (ENSPPAG00000000495) #16 TMEM192 (ENSPPAG00000030031) #18 ENSPPAG00000020375 #19 GK3 (ENSPPAG00000038634) #20 MSMO1 (ENSPPAG00000037413) #21 CPE (ENSPPAG00000030038) #22 ENSPPAG00000005749 ENSPPAG00000038330 #23 ENSPPAG00000032897 #24 TLL1 (ENSPPAG00000038906) #25 SPOCK3 (ENSPPAG00000032890) #26 ANXA10 (ENSPPAG00000031022) #27 ENSPPAG00000040254 #28 DDX60L (ENSPPAG00000014553) #29 ENSPPAG00000042740 #30 ENSPPAG00000027926 CBR4 (ENSPPAG00000037448) #31 SH3RF1 (ENSPPAG00000034156) #32 NEK1 (ENSPPAG00000018386) #33 CLCN3 (ENSPPAG00000042101) #34 HPF1 (ENSPPAG00000000046) #35 Chimpanzee MODERN SPECIES 17 NPY1R (ENSPTRG00000016561) NPY5R (ENSPTRG00000016562) TKTL2 (ENSPTRG00000016563) TMA16 (ENSPTRG00000023618) MARCHF1 (ENSPTRG00000016564) ENSPTRG00000044373 ENSPTRG00000047384 SMIM31 (ENSPTRG00000046070) APELA (ENSPTRG00000044082) #14 TRIM60 (ENSPTRG00000016568) ##15 TRIM75 (ENSPTRG00000044938) #16 TMEM192 (ENSPTRG00000047471) #18 KLHL2 (ENSPTRG00000016572) #19 GK3 (ENSPTRG00000042842) #20 MSMO1 (ENSPTRG00000016574) #21 CPE (ENSPTRG00000016575) #22 ENSPTRG00000048332 #23 ENSPTRG00000044749 #24 TLL1 (ENSPTRG00000016577) #25 SPOCK3 (ENSPTRG00000016579) #26 ANXA10 (ENSPTRG00000016580) #27 DDX60 (ENSPTRG00000016581) #28 DDX60L (ENSPTRG00000016582) #29 PALLD (ENSPTRG00000016583) #30 ENSPTRG00000046885 CBR4 (ENSPTRG00000016585) #31 SH3RF1 (ENSPTRG00000016587) #32 NEK1 (ENSPTRG00000016588) #33 CLCN3 (ENSPTRG00000016589) #34 HPF1 (ENSPTRG00000016590) #35 ENSPTRG00000051762 #36 Human MODERN SPECIES 16 NAF1 (ENSG00000145414) NPY1R (ENSG00000164128) NPY5R (ENSG00000164129) TKTL2 (ENSG00000151005) TMA16 (ENSG00000198498) MARCHF1 (ENSG00000145416) SMIM31 (ENSG00000248771) APELA (ENSG00000248329) #14 TRIM61 (ENSG00000183439) #15 TRIM60 (ENSG00000176979) ##15 TRIM75 (ENSG00000250374) #16 TMEM192 (ENSG00000170088) #18 KLHL2 (ENSG00000109466) #19 GK3 (ENSG00000229894) #20 MSMO1 (ENSG00000052802) #21 CPE (ENSG00000109472) #22 TLL1 (ENSG00000038295) #25 SPOCK3 (ENSG00000196104) #26 ANXA10 (ENSG00000109511) #27 DDX60 (ENSG00000137628) #28 DDX60L (ENSG00000181381) #29 PALLD (ENSG00000129116) #30 CBR4 (ENSG00000145439) #31 SH3RF1 (ENSG00000154447) #32 NEK1 (ENSG00000137601) #33 CLCN3 (ENSG00000109572) #34 HPF1 (ENSG00000056050) #35 MFAP3L (ENSG00000198948) #37 AADAT (ENSG00000109576) GALNTL6 (ENSG00000174473) GALNT7 (ENSG00000109586) Orangutan MODERN SPECIES 17 NAF1 (ENSPPYG00000041011) NPY1R (ENSPPYG00000015164) NPY5R (ENSPPYG00000015165) TKTL2 (ENSPPYG00000015166) TMA16 (ENSPPYG00000038978) MARCHF1 (ENSPPYG00000015168) SMIM31 (ENSPPYG00000036900) ENSPPYG00000032638 TRIM61 (ENSPPYG00000036212) #15 TRIM60 (ENSPPYG00000015172) ##15 TRIM75 (ENSPPYG00000015174) #16 TMEM192 (ENSPPYG00000032838) #18 KLHL2 (ENSPPYG00000015176) #19 GK3 (ENSPPYG00000038697) #20 MSMO1 (ENSPPYG00000015178) #21 CPE (ENSPPYG00000015179) #22 ENSPPYG00000032018 #24 TLL1 (ENSPPYG00000015181) #25 SPOCK3 (ENSPPYG00000015182) #26 ANXA10 (ENSPPYG00000015183) #27 DDX60 (ENSPPYG00000015184) #28 DDX60L (ENSPPYG00000015185) #29 PALLD (ENSPPYG00000015186) #30 CBR4 (ENSPPYG00000015188) #31 SH3RF1 (ENSPPYG00000015189) #32 NEK1 (ENSPPYG00000015190) #33 CLCN3 (ENSPPYG00000015192) #34 HPF1 (ENSPPYG00000015193) #35 MFAP3L (ENSPPYG00000015194) #37 AADAT (ENSPPYG00000015196) ENSPPYG00000015200 Gibbon MODERN SPECIES 22 MARCHF1 (ENSNLEG00000006467) ENSNLEG00000028234 ENSNLEG00000018928 SMIM31 (ENSNLEG00000036078) ENSNLEG00000006472 ENSNLEG00000033723 ENSNLEG00000006473 #15 ENSNLEG00000018929 ENSNLEG00000035696 TRIM75 (ENSNLEG00000018930) #16 TMEM192 (ENSNLEG00000006475) #18 KLHL2 (ENSNLEG00000006478) #19 ENSNLEG00000033748 ##20 MSMO1 (ENSNLEG00000032156) #21 ENSNLEG00000031432 CPE (ENSNLEG00000006506) #22 ENSNLEG00000034714 #23 ENSNLEG00000028854 #24 TLL1 (ENSNLEG00000006519) #25 SPOCK3 (ENSNLEG00000006528) #26 ANXA10 (ENSNLEG00000006535) #27 DDX60 (ENSNLEG00000006542) #28 DDX60L (ENSNLEG00000006565) #29 PALLD (ENSNLEG00000006567) #30 CBR4 (ENSNLEG00000029627) #31 SH3RF1 (ENSNLEG00000006600) #32 NEK1 (ENSNLEG00000006608) #33 CLCN3 (ENSNLEG00000006634) #34 HPF1 (ENSNLEG00000006641) #35 ENSNLEG00000035908 #36 ENSNLEG00000029490 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672.v.a ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00940000154911.x.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154949.b.t ENSGT00940000155436.o.b ENSGT01050000244808.A.b.a.a.a.a.o.a.b ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672.v.a ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00940000154911.x.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154949.b.t ENSGT00940000155436.o.b ENSGT01050000244808.A.b.a.a.a.a.o.a.b ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672.v.a.a ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00940000154911.x.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434.g #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000154949.b.t ENSGT00940000155436.o.b ENSGT01050000244808.A.b.a.a.a.a.o.a.b ENSGT00940000157225 #25 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 247 ENSSBOG00000028140 #18 KLHL2 (ENSSBOG00000034285) #19 MSMO1 (ENSSBOG00000033313) #21 CPE (ENSSBOG00000027387) #22 ENSSBOG00000008970 ENSSBOG00000022652 ENSSBOG00000024411 TLL1 (ENSSBOG00000014320) #25 ENSSBOG00000001568 Capuchin MODERN SPECIES 40 C4orf45 (ENSCCAG00000026409) RAPGEF2 (ENSCCAG00000030508) FSTL5 (ENSCCAG00000028472) ENSCCAG00000029238 ENSCCAG00000017321 NAF1 (ENSCCAG00000030023) NPY1R (ENSCCAG00000026126) NPY5R (ENSCCAG00000019833) TMA16 (ENSCCAG00000035169) MARCHF1 (ENSCCAG00000022757) ENSCCAG00000018984 ENSCCAG00000024802 TMEM192 (ENSCCAG00000026074) #18 ENSCCAG00000025570 #19 MSMO1 (ENSCCAG00000035852) #21 CPE (ENSCCAG00000037998) #22 ENSCCAG00000018649 ENSCCAG00000023563 ENSCCAG00000007647 ENSCCAG00000033757 TLL1 (ENSCCAG00000030699) #25 Marmoset MODERN SPECIES 15 ENSCJAG00000075344 ENSCJAG00000082984 SMIM31 (ENSCJAG00000043535) ENSCJAG00000012493 APELA (ENSCJAG00000069932) #14 ENSCJAG00000079596 ENSCJAG00000085934 ENSCJAG00000061286 ##16 ENSCJAG00000068598 ##15 TRIM61 (ENSCJAG00000064577) #15 ENSCJAG00000077024 ENSCJAG00000076362 TMEM192 (ENSCJAG00000009198) #18 KLHL2 (ENSCJAG00000009218) #19 MSMO1 (ENSCJAG00000009301) #21 CPE (ENSCJAG00000009311) #22 ENSCJAG00000080666 TLL1 (ENSCJAG00000009353) #25 ENSCJAG00000087018 ENSCJAG00000082998 ENSCJAG00000085666 ENSCJAG00000075932 SPOCK3 (ENSCJAG00000004671) #26 ANXA10 (ENSCJAG00000004702) #27 DDX60 (ENSCJAG00000004726) #28 DDX60L (ENSCJAG00000046221) #29 PALLD (ENSCJAG00000004780) #30 CBR4 (ENSCJAG00000086762) #31 ENSCJAG00000060059 SH3RF1 (ENSCJAG00000004855) #32 ENSCJAG00000077338 Mas night monkey MODERN SPECIES 780 TMEM192 (ENSANAG00000035418) #18 ENSANAG00000022273 #19 MSMO1 (ENSANAG00000025546) #21 ENSANAG00000021346 ##23 CPE (ENSANAG00000020326) #22 ENSANAG00000022318 ENSANAG00000025470 ENSANAG00000025901 TLL1 (ENSANAG00000019560) #25 Tarsier MODERN SPECIES 4423 TMEM192 (ENSTSYG00000025666) #18 KLHL2 (ENSTSYG00000009268) #19 MSMO1 (ENSTSYG00000035751) #21 CPE (ENSTSYG00000009705) #22 ENSTSYG00000034714 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749.l #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749.l #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Mouse lemur MODERN SPECIES 5 ENSMICG00000042810 DCTD (ENSMICG00000006929) TRIM60 (ENSMICG00000033211) ##15 TMEM192 (ENSMICG00000001365) #18 KLHL2 (ENSMICG00000000794) #19 MSMO1 (ENSMICG00000033307) #21 CPE (ENSMICG00000046699) #22 TLL1 (ENSMICG00000007263) #25 SPOCK3 (ENSMICG00000009138) #26 ANXA10 (ENSMICG00000013528) #27 DDX60 (ENSMICG00000013542) #28 ENSMICG00000028842 ENSMICG00000036078 #30 CBR4 (ENSMICG00000034212) #31 SH3RF1 (ENSMICG00000017298) #32 ENSMICG00000033035 NEK1 (ENSMICG00000017300) #33 CLCN3 (ENSMICG00000017306) #34 HPF1 (ENSMICG00000017309) #35 MFAP3L (ENSMICG00000017310) #37 ENSMICG00000008046 ENSMICG00000043865 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 360 CPE (ENSPSMG00000015665) #22 TLL1 (ENSPSMG00000015755) #25 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 689 ENSPCOG00000020042 KLHL2 (ENSPCOG00000017119) #19 CPE (ENSPCOG00000026341) #22 TLL1 (ENSPCOG00000025854) #25 SPOCK3 (ENSPCOG00000025291) #26 ANXA10 (ENSPCOG00000007620) #27 DDX60 (ENSPCOG00000008412) #28 PALLD (ENSPCOG00000017752) #30 CBR4 (ENSPCOG00000023811) #31 SH3RF1 (ENSPCOG00000028382) #32 NEK1 (ENSPCOG00000014720) #33 CLCN3 (ENSPCOG00000027365) #34 HPF1 (ENSPCOG00000001107) #35 MFAP3L (ENSPCOG00000003060) #37 AADAT (ENSPCOG00000027071) ZNF790 (ENSPCOG00000022212) ZFP30 (ENSPCOG00000000277) ZNF573 (ENSPCOG00000020957) Bushbaby MODERN SPECIES 292 TRIM75 (ENSOGAG00000013813) #16 TMEM192 (ENSOGAG00000013815) #18 KLHL2 (ENSOGAG00000009276) #19 ENSOGAG00000009281 #21 CPE (ENSOGAG00000008219) #22 ENSOGAG00000024583 TLL1 (ENSOGAG00000011582) #25 SPOCK3 (ENSOGAG00000002571) #26 ANXA10 (ENSOGAG00000007053) #27 ENSOGAG00000034614 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000168298 ENSGT00940000158105 Tree shrew MODERN SPECIES 296 KLHL2 (ENSTBEG00000005297) #19 ENSTBEG00000006704 #22 Glires ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000168298 ENSGT00940000158105 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000264116 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.a.l ##16 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 830 ENSOCUG00000029735 #22 Rabbit MODERN SPECIES 75 ENSOCUG00000031636 #22 Rabbit MODERN SPECIES 730 ENSOCUG00000017803 #22 SAPCD2 (ENSOCUG00000010287) ENSOCUG00000023126 Rabbit MODERN SPECIES 434 TKTL2 (ENSOCUG00000021786) TMA16 (ENSOCUG00000011276) MARCHF1 (ENSOCUG00000011279) ENSOCUG00000023551 ENSOCUG00000038988 ENSOCUG00000030219 ENSOCUG00000033354 ENSOCUG00000001363 #15 ENSOCUG00000029446 ##15 TRIM60 (ENSOCUG00000032619) ##15 ENSOCUG00000029651 ##16 ENSOCUG00000021069 #16 TMEM192 (ENSOCUG00000016357) #18 KLHL2 (ENSOCUG00000003760) #19 MSMO1 (ENSOCUG00000003769) #21 ENSOCUG00000008181 #22 ENSOCUG00000021688 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000168298 ENSGT00940000158105 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000012054.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460.v #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000012054.b.kb ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b.b ##15 ENSGT00940000162839.b.a #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460.v #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000156591 ENSGT00390000012054.b.jb ENSGT00390000012054.b.kb ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 Squirrel MODERN SPECIES 155 PSD3 (ENSSTOG00000000985) ENSSTOG00000031895 ENSSTOG00000033053 NAF1 (ENSSTOG00000023858) NPY1R (ENSSTOG00000007201) NPY5R (ENSSTOG00000021377) TKTL2 (ENSSTOG00000005500) TMA16 (ENSSTOG00000024763) MARCHF1 (ENSSTOG00000005521) SMIM31 (ENSSTOG00000030605) ENSSTOG00000031174 ENSSTOG00000022355 #15 TMEM192 (ENSSTOG00000000402) #18 KLHL2 (ENSSTOG00000012255) #19 MSMO1 (ENSSTOG00000012269) #21 CPE (ENSSTOG00000012273) #22 TLL1 (ENSSTOG00000009333) #25 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 160 ENSUPAG00010014762 ENSUPAG00010014754 NAF1 (ENSUPAG00010014749) NPY1R (ENSUPAG00010014707) NPY5R (ENSUPAG00010014700) TKTL2 (ENSUPAG00010014692) TMA16 (ENSUPAG00010014673) MARCHF1 (ENSUPAG00010014549) SMIM31 (ENSUPAG00010014544) ENSUPAG00010014536 ENSUPAG00010014526 #15 ENSUPAG00010014518 ##15 ENSUPAG00010014515 #16 KLHL2 (ENSUPAG00010014482) #19 MSMO1 (ENSUPAG00010014459) #21 CPE (ENSUPAG00010014448) #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 17 ENSMMMG00000015467 PCDH17 (ENSMMMG00000015460) NPY1R (ENSMMMG00000015418) NPY5R (ENSMMMG00000015413) TKTL2 (ENSMMMG00000015408) MARCHF1 (ENSMMMG00000015318) ENSMMMG00000015311 SMIM31 (ENSMMMG00000015309) ENSMMMG00000015301 ENSMMMG00000015295 #15 ENSMMMG00000015289 ##15 ENSMMMG00000015277 #16 TMEM192 (ENSMMMG00000015247) #18 KLHL2 (ENSMMMG00000015232) #19 ENSMMMG00000015220 #21 CPE (ENSMMMG00000015202) #22 TLL1 (ENSMMMG00000015190) #25 SPOCK3 (ENSMMMG00000015114) #26 ANXA10 (ENSMMMG00000015085) #27 DDX60 (ENSMMMG00000015007) #28 PALLD (ENSMMMG00000014986) #30 CBR4 (ENSMMMG00000014978) #31 SH3RF1 (ENSMMMG00000014962) #32 NEK1 (ENSMMMG00000014666) #33 CLCN3 (ENSMMMG00000014320) #34 HPF1 (ENSMMMG00000014313) #35 MFAP3L (ENSMMMG00000014303) #37 AADAT (ENSMMMG00000014288) ENSMMMG00000014269 GALNTL6 (ENSMMMG00000014240) GALNT7 (ENSMMMG00000014182) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 ENSSVLG00005000429 MARCHF1 (ENSSVLG00005000488) ENSSVLG00005000541 ENSSVLG00005000557 SMIM31 (ENSSVLG00005000575) ENSSVLG00005000594 ENSSVLG00005000615 #15 ENSSVLG00005000633 ENSSVLG00005000652 ##15 ENSSVLG00005000666 ENSSVLG00005000680 ##16 TRIM75 (ENSSVLG00005000696) #16 ENSSVLG00005000719 #18 KLHL2 (ENSSVLG00005000822) #19 MSMO1 (ENSSVLG00005000949) #21 CPE (ENSSVLG00005000975) #22 ENSSVLG00005000996 TLL1 (ENSSVLG00005001039) #25 ENSSVLG00005001107 SPOCK3 (ENSSVLG00005001298) #26 ANXA10 (ENSSVLG00005001520) #27 ENSSVLG00005001553 #28 PALLD (ENSSVLG00005001640) #30 ENSSVLG00005001751 ENSSVLG00005001764 #31 SH3RF1 (ENSSVLG00005001800) #32 NEK1 (ENSSVLG00005001904) #33 CLCN3 (ENSSVLG00005002005) #34 HPF1 (ENSSVLG00005002099) #35 MFAP3L (ENSSVLG00005002117) #37 AADAT (ENSSVLG00005002134) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263802 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 25 NPY1R (ENSHGLG00000039833) NPY5R (ENSHGLG00000017420) TMA16 (ENSHGLG00000014898) MARCHF1 (ENSHGLG00000008819) ENSHGLG00000040885 ENSHGLG00000041181 ENSHGLG00000049940 SMIM31 (ENSHGLG00000004408) ENSHGLG00000010125 ENSHGLG00000020521 #15 TRIM60 (ENSHGLG00000044107) ##15 ENSHGLG00000042682 #16 TMEM192 (ENSHGLG00000042804) #18 KLHL2 (ENSHGLG00000006484) #19 ENSHGLG00000005109 #21 CPE (ENSHGLG00000044272) #22 ENSHGLG00000050964 ENSHGLG00000038708 ENSHGLG00000041799 ENSHGLG00000043287 ENSHGLG00000006655 #25 ENSHGLG00000049226 ENSHGLG00000034446 #26 ENSHGLG00000047271 ENSHGLG00000039306 ENSHGLG00000035113 #26 ANXA10 (ENSHGLG00000001262) #27 ENSHGLG00000050525 #28 ENSHGLG00000013790 #28 ENSHGLG00000034493 PALLD (ENSHGLG00000015506) #30 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156591 ENSGT00390000012054.b.hb.b ENSGT00390000012054.b.hb.a ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000263802 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Guinea pig MODERN SPECIES 1 PSD3 (ENSCPOG00000002659) ENSCPOG00000019452 ENSCPOG00000035688 ENSCPOG00000009771 NAF1 (ENSCPOG00000010331) NPY1R (ENSCPOG00000031707) Npy5r (ENSCPOG00000011688) TKTL2 (ENSCPOG00000019878) TMA16 (ENSCPOG00000038434) MARCHF1 (ENSCPOG00000001120) ENSCPOG00000035796 TRIM61 (ENSCPOG00000023119) #15 TMEM192 (ENSCPOG00000038235) #18 KLHL2 (ENSCPOG00000005820) #19 MSMO1 (ENSCPOG00000005831) #21 CPE (ENSCPOG00000015469) #22 TLL1 (ENSCPOG00000007003) #25 SPOCK3 (ENSCPOG00000011838) #26 GFRA1 (ENSCPOG00000014933) CCDC172 (ENSCPOG00000014936) PNLIP (ENSCPOG00000013420) PNLIPRP2 (ENSCPOG00000003077) C10orf82 (ENSCPOG00000003084) HSPA12A (ENSCPOG00000003085) ENO4 (ENSCPOG00000010978) SHTN1 (ENSCPOG00000010984) VAX1 (ENSCPOG00000000542) KCNK18 (ENSCPOG00000003594) SLC18A2 (ENSCPOG00000003595) PDZD8 (ENSCPOG00000029989) EMX2 (ENSCPOG00000003299) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000157357 ENSGT00940000156591 ENSGT00390000012054.b.hb.b ENSGT00390000012054.b.hb.a ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 110 ENSCLAG00000013815 ENSCLAG00000015279 ENSCLAG00000017207 NAF1 (ENSCLAG00000017209) NPY1R (ENSCLAG00000015952) NPY5R (ENSCLAG00000015988) TKTL2 (ENSCLAG00000017876) TMA16 (ENSCLAG00000016351) MARCHF1 (ENSCLAG00000014711) ENSCLAG00000013724 ENSCLAG00000014568 TRIM61 (ENSCLAG00000018051) #15 TMEM192 (ENSCLAG00000014967) #18 KLHL2 (ENSCLAG00000012624) #19 MSMO1 (ENSCLAG00000012431) #21 CPE (ENSCLAG00000012208) #22 TLL1 (ENSCLAG00000011556) #25 SPOCK3 (ENSCLAG00000015922) #26 ANXA10 (ENSCLAG00000013504) #27 DDX60 (ENSCLAG00000015332) #28 PALLD (ENSCLAG00000014162) #30 CBR4 (ENSCLAG00000013243) #31 SH3RF1 (ENSCLAG00000012679) #32 NEK1 (ENSCLAG00000013999) #33 CLCN3 (ENSCLAG00000013493) #34 HPF1 (ENSCLAG00000012272) #35 MFAP3L (ENSCLAG00000011811) #37 ENSCLAG00000012782 ENSCLAG00000011469 GALNTL6 (ENSCLAG00000014070) GALNT7 (ENSCLAG00000012394) Degu MODERN SPECIES 77 ENSODEG00000019368 ENSODEG00000006419 NAF1 (ENSODEG00000006528) NPY1R (ENSODEG00000006377) NPY5R (ENSODEG00000005343) ENSODEG00000007708 TKTL2 (ENSODEG00000019464) ENSODEG00000007438 MARCHF1 (ENSODEG00000007243) ENSODEG00000019414 ENSODEG00000006154 TRIM61 (ENSODEG00000005706) #15 TMEM192 (ENSODEG00000005566) #18 ENSODEG00000005284 #19 MSMO1 (ENSODEG00000006599) #21 CPE (ENSODEG00000005488) #22 TLL1 (ENSODEG00000005997) #25 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000012054.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000168298 ENSGT00940000158105 Kangaroo rat MODERN SPECIES 323 Csgalnact1 (ENSDORG00000009698) Sh2d4a (ENSDORG00000009696) ENSDORG00000025696 ENSDORG00000028028 ENSDORG00000011496 Naf1 (ENSDORG00000011327) Npy1r (ENSDORG00000023613) Npy5r (ENSDORG00000011329) Tma16 (ENSDORG00000011359) ENSDORG00000008534 Smim31 (ENSDORG00000027013) ENSDORG00000028293 Tmem192 (ENSDORG00000013638) #18 Klhl2 (ENSDORG00000016605) #19 Msmo1 (ENSDORG00000006807) #21 Cpe (ENSDORG00000008289) #22 Tll1 (ENSDORG00000007473) #25 Spock3 (ENSDORG00000005181) #26 Anxa10 (ENSDORG00000016695) #27 Ddx60 (ENSDORG00000007349) #28 Palld (ENSDORG00000004430) #30 Cbr4 (ENSDORG00000004432) #31 Sh3rf1 (ENSDORG00000004433) #32 ENSDORG00000024191 ENSDORG00000025576 #33 Clcn3 (ENSDORG00000010932) #34 ENSDORG00000029352 #35 Mfap3l (ENSDORG00000024753) #37 Aadat (ENSDORG00000005370) Galntl6 (ENSDORG00000011826) ENSDORG00000026508 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000012054.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000012054.b.nb ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000012054.b.nb.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00860000135825 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000012054.b.nb.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00860000135825 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00390000012054.b.nb.a ENSGT00390000012054.b.nb.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00860000135825 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 184 Nat2 (ENSCGRG00001001166) Nat1 (ENSCGRG00001019576) Naf1 (ENSCGRG00001018484) Npy1r (ENSCGRG00001017400) Npy5r (ENSCGRG00001001699) Tktl2 (ENSCGRG00001003220) Tma16 (ENSCGRG00001017111) Marchf1 (ENSCGRG00001015013) Smim31 (ENSCGRG00001010073) Apela (ENSCGRG00001009208) Trim61 (ENSCGRG00001008597) #15 ENSCGRG00001002342 #16 Tmem192 (ENSCGRG00001004418) #18 Klhl2 (ENSCGRG00001024220) #19 Msmo1 (ENSCGRG00001022848) #21 Cpe (ENSCGRG00001021360) #22 ENSCGRG00001014910 Tll1 (ENSCGRG00001012198) #25 Spock3 (ENSCGRG00001002033) #26 Anxa10 (ENSCGRG00001020615) #27 Ddx60 (ENSCGRG00001018201) #28 Palld (ENSCGRG00001009316) #30 Cbr4 (ENSCGRG00001008452) #31 Sh3rf1 (ENSCGRG00001006240) #32 Nek1 (ENSCGRG00001014900) #33 Clcn3 (ENSCGRG00001022469) #34 Hpf1 (ENSCGRG00001019103) #35 Mfap3l (ENSCGRG00001017293) #37 Aadat (ENSCGRG00001015537) ENSCGRG00001018787 Galntl6 (ENSCGRG00001016834) Golden Hamster MODERN SPECIES 669 ENSMAUG00000017158 ENSMAUG00000018244 Nat2 (ENSMAUG00000013927) Nat1 (ENSMAUG00000013734) Naf1 (ENSMAUG00000013072) Npy5r (ENSMAUG00000015685) Tma16 (ENSMAUG00000013621) Marchf1 (ENSMAUG00000012137) Smim31 (ENSMAUG00000011274) Apela (ENSMAUG00000010344) Trim61 (ENSMAUG00000009549) #15 Tmem192 (ENSMAUG00000010370) #18 Klhl2 (ENSMAUG00000004976) #19 Msmo1 (ENSMAUG00000012095) #21 ENSMAUG00000011720 Cpe (ENSMAUG00000010887) #22 Tll1 (ENSMAUG00000008471) #25 Spock3 (ENSMAUG00000003473) #26 Anxa10 (ENSMAUG00000001421) #27 Ddx60 (ENSMAUG00000016664) #28 ENSMAUG00000018482 #30 Cbr4 (ENSMAUG00000017962) #31 Sh3rf1 (ENSMAUG00000000082) #32 ENSMAUG00000018140 #33 Clcn3 (ENSMAUG00000015301) #34 Hpf1 (ENSMAUG00000014126) #35 Mfap3l (ENSMAUG00000014241) #37 Aadat (ENSMAUG00000015707) ENSMAUG00000013989 BC030500 (ENSMAUG00000013365) ENSMAUG00000012405 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000012054.b.nb.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 8 Nat2 (ENSPEMG00000029233) Nat1 (ENSPEMG00000031250) Naf1 (ENSPEMG00000014321) Npy1r (ENSPEMG00000026944) Npy5r (ENSPEMG00000021268) Tktl2 (ENSPEMG00000014862) Tma16 (ENSPEMG00000016198) Marchf1 (ENSPEMG00000010003) Smim31 (ENSPEMG00000000281) Apela (ENSPEMG00000028986) ENSPEMG00000025788 #15 ENSPEMG00000025503 ##15 Tmem192 (ENSPEMG00000011743) #18 Klhl2 (ENSPEMG00000009201) #19 Msmo1 (ENSPEMG00000016575) #21 Cpe (ENSPEMG00000013904) #22 ENSPEMG00000025201 Tll1 (ENSPEMG00000012383) #25 ENSPEMG00000024368 ENSPEMG00000031225 Spock3 (ENSPEMG00000014397) #26 ENSPEMG00000030382 Anxa10 (ENSPEMG00000020433) #27 Ddx60 (ENSPEMG00000023735) #28 Palld (ENSPEMG00000023321) #30 Cbr4 (ENSPEMG00000022822) #31 Sh3rf1 (ENSPEMG00000015623) #32 Nek1 (ENSPEMG00000012961) #33 Clcn3 (ENSPEMG00000008384) #34 Hpf1 (ENSPEMG00000016055) #35 Mfap3l (ENSPEMG00000025834) #37 Prairie vole MODERN SPECIES 106 ENSMOCG00000018119 Nat2 (ENSMOCG00000014233) Nat1 (ENSMOCG00000020091) Naf1 (ENSMOCG00000010360) Npy1r (ENSMOCG00000001075) Tktl2 (ENSMOCG00000022658) Tma16 (ENSMOCG00000016803) Marchf1 (ENSMOCG00000001423) Smim31 (ENSMOCG00000000768) Apela (ENSMOCG00000006416) Trim61 (ENSMOCG00000003717) #15 ENSMOCG00000000340 #16 Tmem192 (ENSMOCG00000001291) #18 Klhl2 (ENSMOCG00000014266) #19 Msmo1 (ENSMOCG00000012604) #21 Cpe (ENSMOCG00000004657) #22 Tll1 (ENSMOCG00000005773) #25 Spock3 (ENSMOCG00000016081) #26 Murinae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000012054.b.nb.a ENSGT00390000012054.b.nb.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00860000135825 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Mus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000012054.b.nb.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000163787 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000154107.b.m.b ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00860000135825 ENSGT00940000155038 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000012054.b.nb.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000163787 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000154107.b.m.b ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00860000135634 ENSGT00860000135825 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000012054.b.nb.b ENSGT00390000004697.g ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000163787 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000154107.b.m.b ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00860000135634 ENSGT00860000135825 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000012054.b.nb.b ENSGT00390000004697.g ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00950000183499 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000163787 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000154107.b.m.b ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00860000135634 ENSGT00860000135825 spretus MODERN SPECIES 17 Nat2 (MGP_SPRETEiJ_G0032215) Nat1 (MGP_SPRETEiJ_G0032214) MGP_SPRETEiJ_G0032213 Npy1r (MGP_SPRETEiJ_G0032212) Npy5r (MGP_SPRETEiJ_G0032211) Tktl2 (MGP_SPRETEiJ_G0032210) Tma16 (MGP_SPRETEiJ_G0032209) Marchf1 (MGP_SPRETEiJ_G0032208) MGP_SPRETEiJ_G0032207 Trim61 (MGP_SPRETEiJ_G0032206) #15 Trim60 (MGP_SPRETEiJ_G0032205) ##15 Trim75 (MGP_SPRETEiJ_G0032204) Tmem192 (MGP_SPRETEiJ_G0032203) #18 Klhl2 (MGP_SPRETEiJ_G0032202) #19 Msmo1 (MGP_SPRETEiJ_G0032201) #21 Cpe (MGP_SPRETEiJ_G0032200) #22 Tll1 (MGP_SPRETEiJ_G0032199) #25 MGP_SPRETEiJ_G0032198 Spock3 (MGP_SPRETEiJ_G0032197) #26 Anxa10 (MGP_SPRETEiJ_G0032196) #27 Palld (MGP_SPRETEiJ_G0032194) #30 Cbr4 (MGP_SPRETEiJ_G0032193) #31 Sh3rf1 (MGP_SPRETEiJ_G0032192) #32 Nek1 (MGP_SPRETEiJ_G0032191) #33 Clcn3 (MGP_SPRETEiJ_G0032190) #34 Hpf1 (MGP_SPRETEiJ_G0032189) #35 Mfap3l (MGP_SPRETEiJ_G0032188) #37 Aadat (MGP_SPRETEiJ_G0032187) Gm10283 (MGP_SPRETEiJ_G0032186) BC030500 (MGP_SPRETEiJ_G0032185) Galntl6 (MGP_SPRETEiJ_G0032184) Steppe mouse MODERN SPECIES 2767 Smim31 (ENSMSIG00000016375) ENSMSIG00000016364 Apela (ENSMSIG00000016356) Trim61 (ENSMSIG00000016348) #15 Trim60 (ENSMSIG00000016338) ##15 Trim75 (ENSMSIG00000016333) Tmem192 (ENSMSIG00000016216) #18 ENSMSIG00000016191 Klhl2 (ENSMSIG00000016169) #19 Msmo1 (ENSMSIG00000016154) #21 Cpe (ENSMSIG00000016122) #22 Mouse MODERN SPECIES 17 Nat1 (ENSMUSG00000025588) Naf1 (ENSMUSG00000014907) Npy1r (ENSMUSG00000036437) Npy5r (ENSMUSG00000044014) Tktl2 (ENSMUSG00000025519) Tma16 (ENSMUSG00000025591) Marchf1 (ENSMUSG00000036469) Smim31 (ENSMUSG00000074300) Apela (ENSMUSG00000079042) Trim61 (ENSMUSG00000109718) #15 Trim60 (ENSMUSG00000053490) ##15 Trim75 (ENSMUSG00000071089) Tmem192 (ENSMUSG00000025521) #18 Klhl2 (ENSMUSG00000031605) #19 Msmo1 (ENSMUSG00000031604) #21 Cpe (ENSMUSG00000037852) #22 Tll1 (ENSMUSG00000053626) #25 Sgo2b (ENSMUSG00000094443) Spock3 (ENSMUSG00000054162) #26 Anxa10 (ENSMUSG00000031635) #27 Ddx60 (ENSMUSG00000037921) #28 Palld (ENSMUSG00000058056) #30 Cbr4 (ENSMUSG00000031641) #31 Sh3rf1 (ENSMUSG00000031642) #32 Nek1 (ENSMUSG00000031644) #33 Clcn3 (ENSMUSG00000004319) #34 Hpf1 (ENSMUSG00000038005) #35 Mfap3l (ENSMUSG00000031647) #37 Aadat (ENSMUSG00000057228) Gm10283 (ENSMUSG00000070023) BC030500 (ENSMUSG00000049946) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 17 Nat2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031099) Nat1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031098) Naf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031097) Npy1r (MGP_CAROLIEiJ_G0031096) Npy5r (MGP_CAROLIEiJ_G0031095) Tktl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031094) Tma16 (MGP_CAROLIEiJ_G0031093) Marchf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031092) MGP_CAROLIEiJ_G0031091 Trim61 (MGP_CAROLIEiJ_G0031090) #15 Trim60 (MGP_CAROLIEiJ_G0031089) ##15 Trim75 (MGP_CAROLIEiJ_G0031088) Tmem192 (MGP_CAROLIEiJ_G0031087) #18 Klhl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031086) #19 Msmo1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031085) #21 Cpe (MGP_CAROLIEiJ_G0031084) #22 Tll1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031083) #25 Spock3 (MGP_CAROLIEiJ_G0031082) #26 Anxa10 (MGP_CAROLIEiJ_G0031081) #27 Ddx60 (MGP_CAROLIEiJ_G0031080) #28 Palld (MGP_CAROLIEiJ_G0031079) #30 Cbr4 (MGP_CAROLIEiJ_G0031078) #31 Sh3rf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031077) #32 Nek1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031076) #33 Clcn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0031075) #34 Hpf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031074) #35 Mfap3l (MGP_CAROLIEiJ_G0031073) #37 Aadat (MGP_CAROLIEiJ_G0031072) MGP_CAROLIEiJ_G0031071 MGP_CAROLIEiJ_G0031070 Galntl6 (MGP_CAROLIEiJ_G0031069) Shrew mouse MODERN SPECIES 10 Nat2 (MGP_PahariEiJ_G0021565) Nat1 (MGP_PahariEiJ_G0021564) MGP_PahariEiJ_G0021563 Npy1r (MGP_PahariEiJ_G0021562) Npy5r (MGP_PahariEiJ_G0021561) Tktl2 (MGP_PahariEiJ_G0021560) Tma16 (MGP_PahariEiJ_G0021559) Marchf1 (MGP_PahariEiJ_G0021558) MGP_PahariEiJ_G0021557 Trim61 (MGP_PahariEiJ_G0021556) #15 Trim60 (MGP_PahariEiJ_G0021555) ##15 Trim75 (MGP_PahariEiJ_G0021554) Tmem192 (MGP_PahariEiJ_G0021553) #18 Klhl2 (MGP_PahariEiJ_G0021552) #19 Msmo1 (MGP_PahariEiJ_G0021551) #21 Cpe (MGP_PahariEiJ_G0021550) #22 Tll1 (MGP_PahariEiJ_G0021549) #25 Sgo2b (MGP_PahariEiJ_G0021548) Spock3 (MGP_PahariEiJ_G0021547) #26 Anxa10 (MGP_PahariEiJ_G0021546) #27 MGP_PahariEiJ_G0021545 Palld (MGP_PahariEiJ_G0021544) #30 Cbr4 (MGP_PahariEiJ_G0021543) #31 Sh3rf1 (MGP_PahariEiJ_G0021542) #32 Nek1 (MGP_PahariEiJ_G0021541) #33 Clcn3 (MGP_PahariEiJ_G0021540) #34 Hpf1 (MGP_PahariEiJ_G0021539) #35 Mfap3l (MGP_PahariEiJ_G0021538) #37 Aadat (MGP_PahariEiJ_G0021537) MGP_PahariEiJ_G0021536 Galntl6 (MGP_PahariEiJ_G0021535) Rat MODERN SPECIES 7 Nat1 (ENSRNOG00000049498) ENSRNOG00000063117 Naf1 (ENSRNOG00000026403) Npy1r (ENSRNOG00000014149) Npy5r (ENSRNOG00000014172) Tktl2 (ENSRNOG00000014185) Tma16 (ENSRNOG00000014188) Marchf1 (ENSRNOG00000026310) Smim31 (ENSRNOG00000057966) ENSRNOG00000069283 Apela (ENSRNOG00000067022) AABR07025051.3 (ENSRNOG00000054322) Tmem192 (ENSRNOG00000030199) #18 Klhl2 (ENSRNOG00000029441) #19 Msmo1 (ENSRNOG00000032297) #21 Cpe (ENSRNOG00000043387) #22 Tll1 (ENSRNOG00000033528) #25 AABR07025074.1 (ENSRNOG00000032550) AABR07025089.1 (ENSRNOG00000032995) Spock3 (ENSRNOG00000029903) #26 Anxa10 (ENSRNOG00000014339) #27 LOC120097562 (ENSRNOG00000056947) #28 Palldl1 (ENSRNOG00000010107) #30 Ddx60 (ENSRNOG00000059097) #28 Cbr4 (ENSRNOG00000024411) #31 Sh3rf1 (ENSRNOG00000010358) #32 Nek1 (ENSRNOG00000010418) #33 Clcn3 (ENSRNOG00000010682) #34 Hpf1 (ENSRNOG00000011293) #35 LOC100360260 (ENSRNOG00000060395) Ppia-ps13 (ENSRNOG00000062799) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1876 Cpe (ENSNGAG00000016354) #22 ENSNGAG00000001360 Tll1 (ENSNGAG00000016771) #25 Spock3 (ENSNGAG00000007048) #26 ENSNGAG00000017956 Anxa10 (ENSNGAG00000020093) #27 ENSNGAG00000017960 #28 ENSNGAG00000017404 #30 Cbr4 (ENSNGAG00000014720) #31 Sh3rf1 (ENSNGAG00000018102) #32 Nek1 (ENSNGAG00000013907) #33 Clcn3 (ENSNGAG00000015859) #34 Hpf1 (ENSNGAG00000012861) #35 Mfap3l (ENSNGAG00000002714) #37 Aadat (ENSNGAG00000014609) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 62 Cd82 (ENSJJAG00000010666) Alx4 (ENSJJAG00000014358) Ext2 (ENSJJAG00000003668) Pelp1 (ENSJJAG00000013033) ENSJJAG00000008060 Alox12 (ENSJJAG00000000399) Rnasek (ENSJJAG00000018322) 0610010K14Rik (ENSJJAG00000018786) Bcl6b (ENSJJAG00000023524) Slc16a13 (ENSJJAG00000020350) Slc16a11 (ENSJJAG00000016016) ENSJJAG00000009111 Asgr2 (ENSJJAG00000023464) Klhl2 (ENSJJAG00000008522) #19 Msmo1 (ENSJJAG00000021536) #21 Cpe (ENSJJAG00000009087) #22 Tll1 (ENSJJAG00000012213) #25 ENSJJAG00000023954 ENSJJAG00000008746 Spock3 (ENSJJAG00000012852) #26 Anxa10 (ENSJJAG00000023763) #27 ENSJJAG00000000315 #28 Palld (ENSJJAG00000000347) #30 Cbr4 (ENSJJAG00000015283) #31 ENSJJAG00000006073 Sh3rf1 (ENSJJAG00000021488) #32 ENSJJAG00000021393 Nek1 (ENSJJAG00000020556) #33 Clcn3 (ENSJJAG00000000856) #34 Hpf1 (ENSJJAG00000011349) #35 Mfap3l (ENSJJAG00000021487) #37 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00740000117098 ENSGT00940000155038 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.d #22 Hedgehog MODERN SPECIES 1213 ENSEEUG00000012890 #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00740000117098 ENSGT00940000155038 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000153064.b.d.g.b.b.b ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000263802 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00490000043413 Suina ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000158241 ENSGT00390000012574 ENSGT00420000029769.b ENSGT00940000156950 ENSGT00940000156344 ENSGT00940000158645 ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT00940000160549 ENSGT00940000157483 ENSGT00940000158285 ENSGT00940000162839.a.a ##16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 Chacoan peccary MODERN SPECIES 959 TMEM144 (ENSCWAG00000018284) GASK1B (ENSCWAG00000018359) GRIA2 (ENSCWAG00000018394) GLRB (ENSCWAG00000018857) PDGFC (ENSCWAG00000018879) CTSO (ENSCWAG00000018905) TDO2 (ENSCWAG00000018921) ASIC5 (ENSCWAG00000019007) GUCY1B1 (ENSCWAG00000019062) GUCY1A1 (ENSCWAG00000019182) ENSCWAG00000019268 ##16 ENSCWAG00000019285 #18 ENSCWAG00000019301 ##16 KLHL2 (ENSCWAG00000019332) #19 MSMO1 (ENSCWAG00000019568) #21 CPE (ENSCWAG00000019596) #22 TLL1 (ENSCWAG00000019620) #25 ENSCWAG00000019734 Pig MODERN SPECIES 16 GUCY1B1 (ENSSSCG00000008870) GUCY1A1 (ENSSSCG00000008866) ENSSSCG00000048616 ##15 ENSSSCG00000047847 ##15 ENSSSCG00000050154 ##15 ENSSSCG00000051162 ##16 ENSSSCG00000062623 ##16 ENSSSCG00000045736 ##16 ENSSSCG00000044849 ##15 ENSSSCG00000008860 ENSSSCG00000046428 ##16 TMEM192 (ENSSSCG00000020868) #18 KLHL2 (ENSSSCG00000008858) #19 MSMO1 (ENSSSCG00000008857) #21 ENSSSCG00000008855 CPE (ENSSSCG00000008854) #22 ENSSSCG00000046178 TLL1 (ENSSSCG00000008853) #25 MAP9 (ENSSSCG00000008852) ENSSSCG00000043541 ENSSSCG00000042370 ENSSSCG00000036417 ENSSSCG00000061357 ENSSSCG00000057119 ENSSSCG00000008892 ENSSSCG00000008850 ENSSSCG00000053955 ENSSSCG00000034355 ENSSSCG00000008845 KDR (ENSSSCG00000008844) KIT (ENSSSCG00000008842) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00490000043413 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00490000043413 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183015.D ENSGT00940000153692.A ENSGT00940000155133.b ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b ENSGT00390000015549 ENSGT00950000182974.a.b ENSGT00940000157583 ENSGT00940000161743 ENSGT00990000211293 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00670000098059.k.b ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00390000009194.b ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000153464.B.j ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153692.A ENSGT00940000155133.b ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b ENSGT00390000015549 ENSGT00950000182974.a.b ENSGT00940000157583 ENSGT00940000161743 ENSGT00940000157376.ub ENSGT00990000211293.a ENSGT00940000155329.a.m ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00670000098059.k.b ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00390000009194.b ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000153464.B.j ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000157376.ub ENSGT00990000211293.a ENSGT00940000155329.a.m ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012.b #21 ENSGT00670000098059.k.b ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00390000009194.b ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184.a ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000153464.B.j ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183015.D ENSGT00940000153692.A ENSGT00940000155133.b ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b.g ENSGT00390000015549 ENSGT00950000182974.a.b ENSGT00940000157583 ENSGT00940000161743 ENSGT00990000211293.a ENSGT00940000155329.a.m ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012.b #21 ENSGT00670000098059.k.b ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00390000009194.b ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184.a ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000153464.B.j ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183015.D ENSGT00940000153692.A ENSGT00940000155133.b ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b.g ENSGT00390000015549 ENSGT00950000182974.a.b ENSGT00940000157583 ENSGT00940000161743 ENSGT00990000211293.a ENSGT00940000155329.a.m ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012.b #21 ENSGT00670000098059.k.b ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00390000009194.b ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000153464.B.j ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00490000043413 Beluga whale MODERN SPECIES 82 WDFY3 (ENSDLEG00000013480) ENSDLEG00000014603 ARHGAP24 (ENSDLEG00000014621) MAPK10 (ENSDLEG00000014759) PTPN13 (ENSDLEG00000016284) ENSDLEG00000016931 SLC10A6 (ENSDLEG00000016941) C4orf36 (ENSDLEG00000016944) AFF1 (ENSDLEG00000016951) HSD17B13 (ENSDLEG00000017020) ENSDLEG00000017033 TMEM192 (ENSDLEG00000017043) #18 ENSDLEG00000017050 KLHL2 (ENSDLEG00000017065) #19 MSMO1 (ENSDLEG00000017106) #21 CPE (ENSDLEG00000017126) #22 ENSDLEG00000017146 ENSDLEG00000017161 TLL1 (ENSDLEG00000017176) #25 Narwhal MODERN SPECIES 307 PTPN13 (ENSMMNG00015020602) ENSMMNG00015020444 C4orf36 (ENSMMNG00015020430) AFF1 (ENSMMNG00015020355) ENSMMNG00015020309 HSD17B13 (ENSMMNG00015020266) ENSMMNG00015020247 ENSMMNG00015020235 ENSMMNG00015020225 ##15 ENSMMNG00015020208 ##16 ENSMMNG00015020185 TMEM192 (ENSMMNG00015020171) #18 KLHL2 (ENSMMNG00015020081) #19 MSMO1 (ENSMMNG00015020022) #21 ENSMMNG00015019999 CPE (ENSMMNG00015019964) #22 ENSMMNG00015019945 TLL1 (ENSMMNG00015019817) #25 RBM46 (ENSMMNG00015019749) LRAT (ENSMMNG00015019719) FGG (ENSMMNG00015019685) ENSMMNG00015019607 FGB (ENSMMNG00015019560) PLRG1 (ENSMMNG00015019530) DCHS2 (ENSMMNG00015019454) ENSMMNG00015019414 SFRP2 (ENSMMNG00015019388) RNF175 (ENSMMNG00015019342) TLR2 (ENSMMNG00015019314) TMEM131L (ENSMMNG00015019219) MND1 (ENSMMNG00015019145) Vaquita MODERN SPECIES 16 ARHGAP24 (ENSPSNG00000003397) MAPK10 (ENSPSNG00000003815) PTPN13 (ENSPSNG00000004803) SLC10A6 (ENSPSNG00000005183) C4orf36 (ENSPSNG00000005211) AFF1 (ENSPSNG00000005255) ENSPSNG00000005321 HSD17B13 (ENSPSNG00000005413) ENSPSNG00000005468 ENSPSNG00000005484 ##15 ENSPSNG00000005502 ##16 TMEM192 (ENSPSNG00000005518) #18 ENSPSNG00000005531 KLHL2 (ENSPSNG00000005586) #19 MSMO1 (ENSPSNG00000005743) #21 CPE (ENSPSNG00000005768) #22 ENSPSNG00000005833 TLL1 (ENSPSNG00000005952) #25 ENSPSNG00000006136 NPY2R (ENSPSNG00000006159) RBM46 (ENSPSNG00000006190) LRAT (ENSPSNG00000006257) FGG (ENSPSNG00000006301) ENSPSNG00000006395 FGB (ENSPSNG00000006555) PLRG1 (ENSPSNG00000006643) DCHS2 (ENSPSNG00000006710) SFRP2 (ENSPSNG00000006907) RNF175 (ENSPSNG00000006939) TLR2 (ENSPSNG00000006991) TMEM131L (ENSPSNG00000009760) Dolphin MODERN SPECIES 1807 TMEM192 (ENSTTRG00000012873) #18 KLHL2 (ENSTTRG00000012885) #19 MSMO1 (ENSTTRG00000012897) #21 CPE (ENSTTRG00000012901) #22 Sperm whale MODERN SPECIES 18 ENSPCTG00005001903 ENSPCTG00005001889 ARHGAP24 (ENSPCTG00005001841) MAPK10 (ENSPCTG00005001640) ENSPCTG00005001550 PTPN13 (ENSPCTG00005001290) SLC10A6 (ENSPCTG00005001180) C7H4orf36 (ENSPCTG00005001168) AFF1 (ENSPCTG00005001103) KLHL8 (ENSPCTG00005001049) HSD17B13 (ENSPCTG00005001010) ENSPCTG00005000991 ##15 TMEM192 (ENSPCTG00005000934) #18 KLHL2 (ENSPCTG00005000844) #19 MSMO1 (ENSPCTG00005000817) #21 CPE (ENSPCTG00005000793) #22 TLL1 (ENSPCTG00005000720) #25 ENSPCTG00005000696 GUF1 (ENSPCTG00005000657) GNPDA2 (ENSPCTG00005000612) GABRG1 (ENSPCTG00005000574) GABRA2 (ENSPCTG00005000542) COX7B2 (ENSPCTG00005000515) ENSPCTG00005000506 GABRA4 (ENSPCTG00005000486) GABRB1 (ENSPCTG00005000470) COMMD8 (ENSPCTG00005000436) ATP10D (ENSPCTG00005000367) ENSPCTG00005000323 CORIN (ENSPCTG00005008164) NFXL1 (ENSPCTG00005008066) Blue whale MODERN SPECIES 16 MAPK10 (ENSBMSG00010002157) PTPN13 (ENSBMSG00010001970) SLC10A6 (ENSBMSG00010001920) C4orf36 (ENSBMSG00010001908) AFF1 (ENSBMSG00010001892) KLHL8 (ENSBMSG00010001848) HSD17B13 (ENSBMSG00010001808) ENSBMSG00010001790 ENSBMSG00010001779 ##15 ENSBMSG00010001734 ##16 ENSBMSG00010001708 TMEM192 (ENSBMSG00010001694) #18 KLHL2 (ENSBMSG00010001582) #19 MSMO1 (ENSBMSG00010001541) #21 ENSBMSG00010001535 CPE (ENSBMSG00010001524) #22 ENSBMSG00010001516 TLL1 (ENSBMSG00010001481) #25 ENSBMSG00010001435 ENSBMSG00010001409 FGG (ENSBMSG00010001380) ENSBMSG00010001358 FGB (ENSBMSG00010001327) PLRG1 (ENSBMSG00010001300) DCHS2 (ENSBMSG00010001251) ENSBMSG00010001222 SFRP2 (ENSBMSG00010001204) TLR2 (ENSBMSG00010001186) TMEM131L (ENSBMSG00010001155) MND1 (ENSBMSG00010001093) TRIM2 (ENSBMSG00010001046) Pecora ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b.g ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00490000043413 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b.g ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00490000043413 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b.g ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00490000043413 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b.g ENSGT00510000047351.b.h.b ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000164895 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b Goat MODERN SPECIES 8 PLRG1 (ENSCHIG00000014074) FGB (ENSCHIG00000014958) ENSCHIG00000006146 ENSCHIG00000018253 FGG (ENSCHIG00000014747) ENSCHIG00000025097 LRAT (ENSCHIG00000017020) RBM46 (ENSCHIG00000000502) ENSCHIG00000010226 ENSCHIG00000019259 TMEM192 (ENSCHIG00000025377) #18 ENSCHIG00000021159 ENSCHIG00000021994 KLHL2 (ENSCHIG00000009018) #19 MSMO1 (ENSCHIG00000012999) #21 CPE (ENSCHIG00000025090) #22 TLL1 (ENSCHIG00000024381) #25 MAP9 (ENSCHIG00000010944) NPY2R (ENSCHIG00000010029) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 8 TMEM192 (ENSOARG00020014920) #18 ENSOARG00020014949 KLHL2 (ENSOARG00020014991) #19 MSMO1 (ENSOARG00020015391) #21 CPE (ENSOARG00020015433) #22 ENSOARG00020015506 TLL1 (ENSOARG00020015593) #25 NPY2R (ENSOARG00020016352) RBM46 (ENSOARG00020016391) ENSOARG00020016630 FGG (ENSOARG00020016663) FGB (ENSOARG00020016912) PLRG1 (ENSOARG00020017161) ENSOARG00020017458 SFRP2 (ENSOARG00020017587) RNF175 (ENSOARG00020017703) TMEM131L (ENSOARG00020017957) MND1 (ENSOARG00020019027) TRIM2 (ENSOARG00020019393) ENSOARG00020019717 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT01030000235093 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b.g ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b Bos ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT01030000235093 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b.g ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b Bos_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b.g ENSGT00940000158467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00490000043413 ENSGT00940000155905.a Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 8 TMEM192 (ENSBIXG00005027077) #18 KLHL2 (ENSBIXG00005004669) #19 MSMO1 (ENSBIXG00005027233) #21 CPE (ENSBIXG00005027266) #22 TLL1 (ENSBIXG00005004712) #25 ENSBIXG00005027393 NPY2R (ENSBIXG00005027404) RBM46 (ENSBIXG00005004730) LRAT (ENSBIXG00005027426) FGG (ENSBIXG00005027566) ENSBIXG00005027629 FGB (ENSBIXG00005027692) ENSBIXG00005027706 PLRG1 (ENSBIXG00005027740) DCHS2 (ENSBIXG00005027853) SFRP2 (ENSBIXG00005004796) RNF175 (ENSBIXG00005027933) TLR2 (ENSBIXG00005027951) TMEM131L (ENSBIXG00005028029) Cow MODERN SPECIES 8 TMEM192 (ENSBTAG00000035265) #18 KLHL2 (ENSBTAG00000005263) #19 MSMO1 (ENSBTAG00000003068) #21 CPE (ENSBTAG00000016514) #22 TLL1 (ENSBTAG00000005968) #25 MAP9 (ENSBTAG00000019053) NPY2R (ENSBTAG00000016633) RBM46 (ENSBTAG00000001696) LRAT (ENSBTAG00000017167) FGG (ENSBTAG00000006745) FGA (ENSBTAG00000001638) FGB (ENSBTAG00000022120) PLRG1 (ENSBTAG00000007234) DCHS2 (ENSBTAG00000024545) SFRP2 (ENSBTAG00000018563) RNF175 (ENSBTAG00000019426) TLR2 (ENSBTAG00000008008) TMEM131L (ENSBTAG00000016625) MND1 (ENSBTAG00000000281) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00730000111184 ENSGT01030000235093 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b.g ENSGT00510000047351.b.h.a ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000162999 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 Domestic yak MODERN SPECIES 7 ENSBGRG00000021644 ENSBGRG00000021593 ENSBGRG00000021569 IL15 (ENSBGRG00000021437) ENSBGRG00000021418 INPP4B (ENSBGRG00000020985) USP38 (ENSBGRG00000020903) ENSBGRG00000020881 GAB1 (ENSBGRG00000020583) SMARCA5 (ENSBGRG00000020282) ENSBGRG00000020247 ENSBGRG00000020228 TMEM192 (ENSBGRG00000020095) #18 KLHL2 (ENSBGRG00000019657) #19 MSMO1 (ENSBGRG00000019539) #21 CPE (ENSBGRG00000019419) #22 ENSBGRG00000019274 TLL1 (ENSBGRG00000019182) #25 ENSBGRG00000019119 NPY2R (ENSBGRG00000019075) RBM46 (ENSBGRG00000018958) ENSBGRG00000018917 ENSBGRG00000018894 ENSBGRG00000018841 FGG (ENSBGRG00000018677) ENSBGRG00000018573 FGB (ENSBGRG00000018357) PLRG1 (ENSBGRG00000018001) DCHS2 (ENSBGRG00000017841) SFRP2 (ENSBGRG00000017757) RNF175 (ENSBGRG00000017628) Wild yak MODERN SPECIES 991 TMEM192 (ENSBMUG00000016154) #18 KLHL2 (ENSBMUG00000016122) #19 MSMO1 (ENSBMUG00000016087) #21 CPE (ENSBMUG00000016022) #22 American bison MODERN SPECIES 3031 ENSBBBG00000000176 TMEM192 (ENSBBBG00000024688) #18 KLHL2 (ENSBBBG00000024680) #19 MSMO1 (ENSBBBG00000024613) #21 CPE (ENSBBBG00000009027) #22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1212 CPE (ENSMMSG00000024156) #22 TLL1 (ENSMMSG00000024165) #25 MAP9 (ENSMMSG00000024180) NPY2R (ENSMMSG00000024188) Yarkand deer MODERN SPECIES 28 KIF2B (ENSCHYG00000011589) ENSCHYG00000011579 ENSCHYG00000011571 ENSCHYG00000011534 ENSCHYG00000011516 ENSCHYG00000011509 CA10 (ENSCHYG00000011443) ENSCHYG00000011414 ENSCHYG00000011372 ENSCHYG00000011175 ENSCHYG00000011145 ENSCHYG00000011103 TMEM192 (ENSCHYG00000011026) #18 KLHL2 (ENSCHYG00000010387) #19 MSMO1 (ENSCHYG00000010302) #21 CPE (ENSCHYG00000010237) #22 TLL1 (ENSCHYG00000009383) #25 MAP9 (ENSCHYG00000009139) NPY2R (ENSCHYG00000009114) ENSCHYG00000009097 RBM46 (ENSCHYG00000008968) LRAT (ENSCHYG00000008924) ENSCHYG00000008882 FGG (ENSCHYG00000004044) FGB (ENSCHYG00000004003) PLRG1 (ENSCHYG00000003975) DCHS2 (ENSCHYG00000003909) ENSCHYG00000003890 SFRP2 (ENSCHYG00000003882) RNF175 (ENSCHYG00000003842) TLR2 (ENSCHYG00000003827) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000155973.b ENSGT00940000155927 ENSGT00510000047351.b ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000164636 ENSGT00940000156432.a ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156323 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00490000043413 ENSGT00940000155905.a Arabian camel MODERN SPECIES 11 NPY1R (ENSCDRG00005010732) NPY5R (ENSCDRG00005010760) TKTL2 (ENSCDRG00005010777) TMA16 (ENSCDRG00005010797) MARCHF1 (ENSCDRG00005011016) ENSCDRG00005011156 ENSCDRG00005011198 #15 ENSCDRG00005011248 ##16 ENSCDRG00005011275 ##15 TRIM60 (ENSCDRG00005011312) ##15 ENSCDRG00005011326 ##15 ENSCDRG00005011368 ##15 TMEM192 (ENSCDRG00005011396) #18 KLHL2 (ENSCDRG00005011503) #19 MSMO1 (ENSCDRG00005011836) #21 CPE (ENSCDRG00005011907) #22 TLL1 (ENSCDRG00005012137) #25 NPY2R (ENSCDRG00005015866) RBM46 (ENSCDRG00005015891) LRAT (ENSCDRG00005015964) FGG (ENSCDRG00005015999) ENSCDRG00005016051 FGB (ENSCDRG00005016102) PLRG1 (ENSCDRG00005016205) DCHS2 (ENSCDRG00005016276) ENSCDRG00005016436 SFRP2 (ENSCDRG00005016484) RNF175 (ENSCDRG00005016510) TMEM131L (ENSCDRG00005016677) MND1 (ENSCDRG00005018329) TRIM2 (ENSCDRG00005018429) Alpaca MODERN SPECIES 1892 TMEM192 (ENSVPAG00000006050) #18 KLHL2 (ENSVPAG00000006051) #19 MSMO1 (ENSVPAG00000006052) #21 ENSVPAG00000006053 #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 9 DOK2 (ENSRFEG00010013330) GFRA2 (ENSRFEG00010013383) LZTS1 (ENSRFEG00010013630) ATP6V1B2 (ENSRFEG00010013734) ENSRFEG00010014532 SLC18A1 (ENSRFEG00010014560) SMIM31 (ENSRFEG00010014668) ENSRFEG00010014714 ENSRFEG00010014772 #15 ENSRFEG00010014823 ##15 ENSRFEG00010014876 TRIM75 (ENSRFEG00010014895) #16 ENSRFEG00010014913 #18 KLHL2 (ENSRFEG00010014970) #19 MSMO1 (ENSRFEG00010015756) #21 CPE (ENSRFEG00010015819) #22 ENSRFEG00010015880 ENSRFEG00010015901 ENSRFEG00010007174 ENSRFEG00010007195 TLL1 (ENSRFEG00010007269) #25 ENSRFEG00010007312 ENSRFEG00010007357 ENSRFEG00010007884 ENSRFEG00010008341 ENSRFEG00010008480 ADGRE3 (ENSRFEG00010008585) CLEC17A (ENSRFEG00010009003) NDUFB7 (ENSRFEG00010009032) TECR (ENSRFEG00010009075) DNAJB1 (ENSRFEG00010009149) Microbat MODERN SPECIES 938 ENSMLUG00000028077 NAF1 (ENSMLUG00000004627) NPY1R (ENSMLUG00000003432) NPY5R (ENSMLUG00000012044) TKTL2 (ENSMLUG00000017315) TMA16 (ENSMLUG00000009697) ENSMLUG00000009712 ENSMLUG00000029949 ##16 ENSMLUG00000028427 ##16 ENSMLUG00000002174 ##16 ENSMLUG00000024057 ENSMLUG00000027802 TMEM192 (ENSMLUG00000014023) #18 KLHL2 (ENSMLUG00000014026) #19 MSMO1 (ENSMLUG00000014033) #21 CPE (ENSMLUG00000014038) #22 TLL1 (ENSMLUG00000011094) #25 ENSMLUG00000012832 NPY2R (ENSMLUG00000010894) ENSMLUG00000022847 RBM46 (ENSMLUG00000003221) LRAT (ENSMLUG00000027595) ENSMLUG00000024636 FGG (ENSMLUG00000005542) ENSMLUG00000005537 FGB (ENSMLUG00000007690) ENSMLUG00000008318 ENSMLUG00000024184 DCHS2 (ENSMLUG00000008273) SFRP2 (ENSMLUG00000012827) ENSMLUG00000030163 Megabat MODERN SPECIES 3052 TMEM192 (ENSPVAG00000013703) #18 KLHL2 (ENSPVAG00000013705) #19 MSMO1 (ENSPVAG00000013707) #21 CPE (ENSPVAG00000013709) #22 Equus ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179.g ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.a.f ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.a.e ##15 ENSGT00940000160288.c ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000166009 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 Donkey MODERN SPECIES 22 NPY5R (ENSEASG00005022193) TKTL2 (ENSEASG00005022190) ENSEASG00005032091 MARCHF1 (ENSEASG00005022175) ENSEASG00005035279 ENSEASG00005022170 ENSEASG00005024405 #15 ENSEASG00005022150 ##15 ENSEASG00005022165 ##16 ENSEASG00005029182 ##15 ENSEASG00005022156 ENSEASG00005022153 ##16 ENSEASG00005022147 #18 KLHL2 (ENSEASG00005022140) #19 MSMO1 (ENSEASG00005022137) #21 CPE (ENSEASG00005022134) #22 TLL1 (ENSEASG00005021920) #25 SPOCK3 (ENSEASG00005021900) #26 ANXA10 (ENSEASG00005021891) #27 ENSEASG00005021885 #28 DDX60 (ENSEASG00005021849) #28 DDX60L (ENSEASG00005021597) #29 ENSEASG00005021516 PALLD (ENSEASG00005021504) #30 CBR4 (ENSEASG00005036781) #31 ENSEASG00005038062 SH3RF1 (ENSEASG00005021491) #32 NEK1 (ENSEASG00005021225) #33 CLCN3 (ENSEASG00005021120) #34 HPF1 (ENSEASG00005021112) #35 MFAP3L (ENSEASG00005036117) #37 Horse MODERN SPECIES 11 TMA16 (ENSECAG00000015062) MARCHF1 (ENSECAG00000015012) SMIM31 (ENSECAG00000040839) ENSECAG00000014997 ENSECAG00000030364 TRIM61 (ENSECAG00000014985) #15 ENSECAG00000038371 ##15 ENSECAG00000042205 ##16 ENSECAG00000034596 ##15 ENSECAG00000014971 ENSECAG00000042254 ##16 TRIM75 (ENSECAG00000036019) #16 TMEM192 (ENSECAG00000014003) #18 KLHL2 (ENSECAG00000010727) #19 MSMO1 (ENSECAG00000010554) #21 CPE (ENSECAG00000009256) #22 TLL1 (ENSECAG00000002251) #25 SPOCK3 (ENSECAG00000024906) #26 ENSECAG00000032479 ANXA10 (ENSECAG00000024897) #27 ENSECAG00000048862 ENSECAG00000032492 #28 DDX60 (ENSECAG00000053648) #28 DDX60L (ENSECAG00000024062) #29 ENSECAG00000036595 PALLD (ENSECAG00000023122) #30 CBR4 (ENSECAG00000022089) #31 ENSECAG00000034250 SH3RF1 (ENSECAG00000021240) #32 NEK1 (ENSECAG00000017058) #33 CLCN3 (ENSECAG00000014556) #34 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Felidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.a.h ##15 ENSGT00940000155329.a.g ##15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466.y Panthera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.a.h ##15 ENSGT00940000155329.a.g ##15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466.y Tiger MODERN SPECIES 197 FSTL5 (ENSPTIG00000012695) NAF1 (ENSPTIG00000017246) NPY1R (ENSPTIG00000018154) NPY5R (ENSPTIG00000006906) TKTL2 (ENSPTIG00000006932) TMA16 (ENSPTIG00000019805) MARCHF1 (ENSPTIG00000000356) SMIM31 (ENSPTIG00000007551) ENSPTIG00000008117 ENSPTIG00000008842 #15 ENSPTIG00000007024 ##15 TRIM75 (ENSPTIG00000007068) #16 TMEM192 (ENSPTIG00000010598) #18 KLHL2 (ENSPTIG00000012142) #19 MSMO1 (ENSPTIG00000016830) #21 CPE (ENSPTIG00000017187) #22 TLL1 (ENSPTIG00000018056) #25 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00980000198737 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000155329.a.g ##15 ENSGT00940000155329.a.h ##15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000161896.a.b ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466.y lion MODERN SPECIES 4 TMA16 (ENSPLOG00000002926) MARCHF1 (ENSPLOG00000002796) SMIM31 (ENSPLOG00000002763) ENSPLOG00000002751 ENSPLOG00000002742 #15 ENSPLOG00000002734 ##16 ENSPLOG00000002721 ##15 ENSPLOG00000002645 ##15 ENSPLOG00000002631 ##15 ENSPLOG00000002618 ##16 TRIM75 (ENSPLOG00000002609) #16 TMEM192 (ENSPLOG00000002592) #18 ENSPLOG00000002581 KLHL2 (ENSPLOG00000002511) #19 MSMO1 (ENSPLOG00000002397) #21 CPE (ENSPLOG00000002372) #22 TLL1 (ENSPLOG00000002308) #25 SPOCK3 (ENSPLOG00000002005) #26 ANXA10 (ENSPLOG00000001849) #27 DDX60 (ENSPLOG00000001802) #28 PALLD (ENSPLOG00000001684) #30 CBR4 (ENSPLOG00000001598) #31 SH3RF1 (ENSPLOG00000001582) #32 NEK1 (ENSPLOG00000001370) #33 CLCN3 (ENSPLOG00000001246) #34 HPF1 (ENSPLOG00000001222) #35 MFAP3L (ENSPLOG00000001200) #37 AADAT (ENSPLOG00000001178) GALNTL6 (ENSPLOG00000001123) GALNT7 (ENSPLOG00000001095) ENSPLOG00000001073 leopard MODERN SPECIES 6 NPY1R (ENSPPRG00000004916) NPY5R (ENSPPRG00000019628) TKTL2 (ENSPPRG00000019644) TMA16 (ENSPPRG00000005729) MARCHF1 (ENSPPRG00000007272) SMIM31 (ENSPPRG00000007471) ENSPPRG00000007697 ENSPPRG00000008123 #15 ENSPPRG00000008790 TRIM75 (ENSPPRG00000019812) #16 TMEM192 (ENSPPRG00000010312) #18 ENSPPRG00000009513 ENSPPRG00000019945 KLHL2 (ENSPPRG00000013074) #19 MSMO1 (ENSPPRG00000013994) #21 CPE (ENSPPRG00000014615) #22 TLL1 (ENSPPRG00000020476) #25 SPOCK3 (ENSPPRG00000002753) #26 ENSPPRG00000003228 ENSPPRG00000003940 ENSPPRG00000005082 ANXA10 (ENSPPRG00000006171) #27 DDX60 (ENSPPRG00000009286) #28 PALLD (ENSPPRG00000013273) #30 CBR4 (ENSPPRG00000013827) #31 SH3RF1 (ENSPPRG00000014500) #32 ENSPPRG00000015165 NEK1 (ENSPPRG00000004431) #33 CLCN3 (ENSPPRG00000007291) #34 HPF1 (ENSPPRG00000008880) #35 MFAP3L (ENSPPRG00000009549) #37 Cat MODERN SPECIES 235 TMA16 (ENSFCAG00000025387) MARCHF1 (ENSFCAG00000036975) ENSFCAG00000047364 ENSFCAG00000039066 ENSFCAG00000027968 #15 ENSFCAG00000049195 ##16 ENSFCAG00000052166 ##15 ENSFCAG00000044409 ##15 TRIM60 (ENSFCAG00000030798) ##15 TRIM75 (ENSFCAG00000041452) #16 TMEM192 (ENSFCAG00000038577) #18 ENSFCAG00000027336 ENSFCAG00000030760 KLHL2 (ENSFCAG00000008566) #19 MSMO1 (ENSFCAG00000032708) #21 CPE (ENSFCAG00000012182) #22 ENSFCAG00000053542 TLL1 (ENSFCAG00000013188) #25 SPOCK3 (ENSFCAG00000031122) #26 ENSFCAG00000035033 ANXA10 (ENSFCAG00000005123) #27 DDX60 (ENSFCAG00000010766) #28 PALLD (ENSFCAG00000027262) #30 CBR4 (ENSFCAG00000030280) #31 SH3RF1 (ENSFCAG00000005799) #32 ENSFCAG00000026999 NEK1 (ENSFCAG00000007579) #33 CLCN3 (ENSFCAG00000000778) #34 HPF1 (ENSFCAG00000023188) #35 MFAP3L (ENSFCAG00000012588) #37 AADAT (ENSFCAG00000012591) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000264116 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012.c #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828.u.b #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Canidae ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012.c.a.a.b.b #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828.u.b #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00970000194818 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012.c.a.a.b.b.a #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828.u.b #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT01030000235199 ENSGT00940000160508 Dingo MODERN SPECIES 277 PPID (ENSCAFG00020002844) FNIP2 (ENSCAFG00020002855) C4orf45 (ENSCAFG00020002887) RAPGEF2 (ENSCAFG00020002959) FSTL5 (ENSCAFG00020005256) NAF1 (ENSCAFG00020005334) NPY1R (ENSCAFG00020005356) NPY5R (ENSCAFG00020005363) TMA16 (ENSCAFG00020005368) MARCHF1 (ENSCAFG00020005387) SMIM31 (ENSCAFG00020005400) ENSCAFG00020005410 TMEM192 (ENSCAFG00020005427) #18 KLHL2 (ENSCAFG00020005436) #19 ENSCAFG00020005440 #21 CPE (ENSCAFG00020005449) #22 TLL1 (ENSCAFG00020005500) #25 SPOCK3 (ENSCAFG00020005682) #26 Dog MODERN SPECIES 6 FNIP2 (ENSCAFG00845011970) C4orf45 (ENSCAFG00845012183) RAPGEF2 (ENSCAFG00845005844) ENSCAFG00845006088 FSTL5 (ENSCAFG00845006204) NAF1 (ENSCAFG00845006391) NPY1R (ENSCAFG00845006432) NPY5R (ENSCAFG00845006457) TMA16 (ENSCAFG00845006502) MARCHF1 (ENSCAFG00845006581) SMIM31 (ENSCAFG00845006636) ENSCAFG00845006682 TMEM192 (ENSCAFG00845006828) #18 KLHL2 (ENSCAFG00845006973) #19 MSMO1 (ENSCAFG00845007120) #21 CPE (ENSCAFG00845007191) #22 TLL1 (ENSCAFG00845007341) #25 SPOCK3 (ENSCAFG00845007714) #26 ANXA10 (ENSCAFG00845008084) #27 ENSCAFG00845008534 #28 ENSCAFG00845009409 BTC (ENSCAFG00845009447) ENSCAFG00845009525 Red fox MODERN SPECIES 69 FNIP2 (ENSVVUG00000021066) C4orf45 (ENSVVUG00000021076) RAPGEF2 (ENSVVUG00000021085) FSTL5 (ENSVVUG00000021188) NAF1 (ENSVVUG00000022303) NPY1R (ENSVVUG00000022316) NPY5R (ENSVVUG00000022317) TMA16 (ENSVVUG00000022320) MARCHF1 (ENSVVUG00000022324) APELA (ENSVVUG00000022338) ENSVVUG00000022341 #15 ENSVVUG00000022349 TMEM192 (ENSVVUG00000022358) #18 KLHL2 (ENSVVUG00000022372) #19 MSMO1 (ENSVVUG00000022387) #21 CPE (ENSVVUG00000022392) #22 ENSVVUG00000022421 TLL1 (ENSVVUG00000022513) #25 SPOCK3 (ENSVVUG00000023913) #26 ANXA10 (ENSVVUG00000023918) #27 DDX60 (ENSVVUG00000023953) #28 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000264116 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012.c #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828.u.b #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 165 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012.c #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828.u.b #26 American mink MODERN SPECIES 302 SMIM31 (ENSNVIG00000022894) ENSNVIG00000022896 ENSNVIG00000022900 ENSNVIG00000022901 #15 ENSNVIG00000022904 ##16 ENSNVIG00000022908 TRIM60 (ENSNVIG00000022910) ##15 ENSNVIG00000022911 ##15 TRIM75 (ENSNVIG00000022919) #16 ENSNVIG00000022921 KLHL2 (ENSNVIG00000022925) #19 MSMO1 (ENSNVIG00000022952) #21 ENSNVIG00000022957 CPE (ENSNVIG00000022960) #22 TLL1 (ENSNVIG00000022963) #25 SPOCK3 (ENSNVIG00000022984) #26 Ferret MODERN SPECIES 469 KLHL2 (ENSMPUG00000014246) #19 CPE (ENSMPUG00000014238) #22 ENSMPUG00000020071 TLL1 (ENSMPUG00000014233) #25 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000264116 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012.c #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828.u.b #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Giant Panda MODERN SPECIES 15 NPY5R (ENSAMEG00000027931) TKTL2 (ENSAMEG00000020105) TMA16 (ENSAMEG00000001147) MARCHF1 (ENSAMEG00000001142) SMIM31 (ENSAMEG00000031344) ENSAMEG00000030591 ENSAMEG00000025226 #15 ENSAMEG00000027946 ##16 ENSAMEG00000031128 ##15 ENSAMEG00000025716 ##15 TRIM60 (ENSAMEG00000005532) ##15 TRIM75 (ENSAMEG00000019737) #16 TMEM192 (ENSAMEG00000005536) #18 KLHL2 (ENSAMEG00000005550) #19 MSMO1 (ENSAMEG00000005596) #21 CPE (ENSAMEG00000005123) #22 TLL1 (ENSAMEG00000005039) #25 ENSAMEG00000005035 SPOCK3 (ENSAMEG00000005030) #26 ENSAMEG00000026069 ANXA10 (ENSAMEG00000013452) #27 DDX60 (ENSAMEG00000013429) #28 PALLD (ENSAMEG00000013412) #30 CBR4 (ENSAMEG00000013400) #31 SH3RF1 (ENSAMEG00000013355) #32 ENSAMEG00000013347 NEK1 (ENSAMEG00000013287) #33 CLCN3 (ENSAMEG00000013246) #34 HPF1 (ENSAMEG00000013232) #35 MFAP3L (ENSAMEG00000000904) #37 AADAT (ENSAMEG00000000909) Ursus ANCESTRAL SPECIES 206 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000161969 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00950000186078 ENSGT01100000264116 ENSGT00940000155329.b.a.a #15 ENSGT00940000162839.a ##16 ENSGT00940000155329.a.i.a ##15 ENSGT00940000155329.b.a.b ##15 ENSGT00940000155329.a.i.b ##15 ENSGT00940000162839.b #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012.c #21 ENSGT00940000157158.d #22 Polar bear MODERN SPECIES 123 NPY5R (ENSUMAG00000019761) TKTL2 (ENSUMAG00000019765) TMA16 (ENSUMAG00000019768) ENSUMAG00000019774 ENSUMAG00000019782 ENSUMAG00000019784 ENSUMAG00000019792 #15 ENSUMAG00000019797 ##16 ENSUMAG00000019801 ##15 ENSUMAG00000019804 ##15 ENSUMAG00000019810 ##15 ENSUMAG00000019813 #16 TMEM192 (ENSUMAG00000019818) #18 KLHL2 (ENSUMAG00000019823) #19 MSMO1 (ENSUMAG00000019828) #21 CPE (ENSUMAG00000019832) #22 American black bear MODERN SPECIES 6323 CPE (ENSUAMG00000013064) #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00940000155329 #15 ENSGT00940000162839 #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188.d #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000155329 #15 ENSGT00940000162839 #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188.d #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Tenrec MODERN SPECIES 1178 CPE (ENSETEG00000011201) #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000155329 #15 ENSGT00940000162839 #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188.d #28 ENSGT00940000164328 #29 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Elephant MODERN SPECIES 355 ENSLAFG00000032521 #16 ENSLAFG00000028009 #16 ENSLAFG00000030115 #16 ENSLAFG00000031814 #16 ENSLAFG00000029136 #16 TMEM192 (ENSLAFG00000018152) #18 KLHL2 (ENSLAFG00000004204) #19 ENSLAFG00000031808 #21 ENSLAFG00000007061 #21 CPE (ENSLAFG00000005287) #22 TLL1 (ENSLAFG00000002137) #25 SPOCK3 (ENSLAFG00000001654) #26 ANXA10 (ENSLAFG00000003884) #27 ENSLAFG00000032464 #28 ENSLAFG00000030244 #28 ENSLAFG00000014392 #28 ENSLAFG00000003113 #28 ENSLAFG00000026072 #29 ENSLAFG00000031839 #30 ENSLAFG00000016121 #30 CBR4 (ENSLAFG00000016271) #31 SH3RF1 (ENSLAFG00000015901) #32 ENSLAFG00000013526 #33 ENSLAFG00000032725 #33 CLCN3 (ENSLAFG00000001385) #34 Hyrax MODERN SPECIES 882 ENSPCAG00000015475 #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 570 ENSGT00940000155329 #15 ENSGT00940000162839 #16 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 Sloth MODERN SPECIES 961 CPE (ENSCHOG00000010826) #22 Armadillo MODERN SPECIES 4401 ENSDNOG00000034842 #16 ENSDNOG00000045638 #15 ENSDNOG00000034498 #16 ENSDNOG00000036548 #15 ENSDNOG00000035577 #15 ENSDNOG00000032335 #15 ENSDNOG00000042283 #15 ENSDNOG00000045737 #15 ENSDNOG00000033261 #16 ENSDNOG00000046782 ENSDNOG00000032640 TMEM192 (ENSDNOG00000038375) #18 KLHL2 (ENSDNOG00000009598) #19 MSMO1 (ENSDNOG00000009622) #21 CPE (ENSDNOG00000009634) #22 ENSDNOG00000048025 TLL1 (ENSDNOG00000040283) #25 SPOCK3 (ENSDNOG00000002623) #26 ENSDNOG00000043866 ENSDNOG00000039505 ENSDNOG00000044221 #26 ENSDNOG00000044485 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003125 ENSGT00390000010773 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828.l #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000168298.a ENSGT00940000158105 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003125 ENSGT00390000010773 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000160098 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828.l #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT01020000234456 ENSGT00940000155038 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00390000003125 ENSGT00390000010773 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000265874 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000160098 ENSGT00940000157225 #25 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000003125 ENSGT00390000010773 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000265874 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000160098 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000160623 #27 koala MODERN SPECIES 288 ENSPCIG00000025904 ENSPCIG00000035462 ENSPCIG00000037143 ENSPCIG00000033572 TMEM192 (ENSPCIG00000019396) #18 KLHL2 (ENSPCIG00000015750) #19 MSMO1 (ENSPCIG00000015761) #21 CPE (ENSPCIG00000015770) #22 SLC25A27 (ENSPCIG00000024333) TLL1 (ENSPCIG00000024320) #25 ANXA10 (ENSPCIG00000024265) #27 Common wonbat MODERN SPECIES 1022 ENSVURG00010012892 ENSVURG00010012894 ENSVURG00010012899 FSTL5 (ENSVURG00010012909) ENSVURG00010012922 NPY1R (ENSVURG00010012939) NPY5R (ENSVURG00010012943) TMA16 (ENSVURG00010012954) MARCHF1 (ENSVURG00010012963) ENSVURG00010012979 ENSVURG00010012992 TMEM192 (ENSVURG00010013001) #18 ENSVURG00010013007 KLHL2 (ENSVURG00010013019) #19 MSMO1 (ENSVURG00010013031) #21 CPE (ENSVURG00010013048) #22 SLC25A27 (ENSVURG00010013068) TLL1 (ENSVURG00010013083) #25 ANXA10 (ENSVURG00010013106) #27 ENSVURG00010013227 ENSVURG00010013232 ENSVURG00010013237 #26 ENSVURG00010013252 #26 Wallaby MODERN SPECIES 1847 CPE (ENSMEUG00000006426) #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 5 FNIP2 (ENSSHAG00000012348) ENSSHAG00000011457 RAPGEF2 (ENSSHAG00000008902) ENSSHAG00000007253 FSTL5 (ENSSHAG00000022840) ENSSHAG00000022911 ENSSHAG00000027182 NPY1R (ENSSHAG00000005266) TMA16 (ENSSHAG00000015979) ENSSHAG00000028424 ENSSHAG00000020741 ENSSHAG00000026698 TMEM192 (ENSSHAG00000004682) #18 KLHL2 (ENSSHAG00000021791) #19 MSMO1 (ENSSHAG00000024239) #21 CPE (ENSSHAG00000020757) #22 ENSSHAG00000011364 ENSSHAG00000029092 TLL1 (ENSSHAG00000008850) #25 SPOCK3 (ENSSHAG00000026209) #26 ANXA10 (ENSSHAG00000016767) #27 ENSSHAG00000025468 #28 DDX60 (ENSSHAG00000016219) #28 PALLD (ENSSHAG00000015991) #30 CBR4 (ENSSHAG00000030245) #31 SH3RF1 (ENSSHAG00000013252) #32 NEK1 (ENSSHAG00000012339) #33 CLCN3 (ENSSHAG00000011599) #34 HPF1 (ENSSHAG00000011452) #35 MFAP3L (ENSSHAG00000026889) #37 ENSSHAG00000008847 Opossum MODERN SPECIES 4 FNIP2 (ENSMODG00000002053) ENSMODG00000028470 RAPGEF2 (ENSMODG00000002092) FSTL5 (ENSMODG00000002119) ENSMODG00000028980 NPY1R (ENSMODG00000002155) ENSMODG00000002165 TMA16 (ENSMODG00000002170) ENSMODG00000037408 ENSMODG00000038475 ENSMODG00000002245 TMEM192 (ENSMODG00000002258) #18 ENSMODG00000037105 KLHL2 (ENSMODG00000002334) #19 MSMO1 (ENSMODG00000002349) #21 CPE (ENSMODG00000002373) #22 TLL1 (ENSMODG00000002435) #25 ENSMODG00000038806 SPOCK3 (ENSMODG00000002474) #26 ANXA10 (ENSMODG00000002499) #27 ENSMODG00000027995 #28 ENSMODG00000036807 #28 ENSMODG00000002645 #28 PALLD (ENSMODG00000002837) #30 CBR4 (ENSMODG00000040132) #31 SH3RF1 (ENSMODG00000002876) #32 NEK1 (ENSMODG00000002981) #33 CLCN3 (ENSMODG00000003024) #34 HPF1 (ENSMODG00000003037) #35 MFAP3L (ENSMODG00000003046) #37 ENSMODG00000045663 Platypus MODERN SPECIES 3 FNIP2 (ENSOANG00000014975) ENSOANG00000042674 ENSOANG00000021204 RAPGEF2 (ENSOANG00000014970) FSTL5 (ENSOANG00000009694) ENSOANG00000014157 NPY1R (ENSOANG00000015958) NPY5R (ENSOANG00000008226) TMA16 (ENSOANG00000008227) ENSOANG00000008229 ENSOANG00000045739 TRIM39 (ENSOANG00000007812) TMEM192 (ENSOANG00000007811) #18 KLHL2 (ENSOANG00000014478) #19 MSMO1 (ENSOANG00000014479) #21 CPE (ENSOANG00000014480) #22 TLL1 (ENSOANG00000014482) #25 SPOCK3 (ENSOANG00000014484) #26 ENSOANG00000039215 ENSOANG00000028702 #28 DDX60 (ENSOANG00000007454) #28 PALLD (ENSOANG00000007453) #30 ENSOANG00000007445 #31 SH3RF1 (ENSOANG00000007444) #32 NEK1 (ENSOANG00000007443) #33 CLCN3 (ENSOANG00000007442) #34 HPF1 (ENSOANG00000007441) #35 MFAP3L (ENSOANG00000007440) #37 AADAT (ENSOANG00000007439) ENSOANG00000029673 ENSOANG00000012484 Sauria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000159795.b ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.b ENSGT00390000004594.a Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000159795.b ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.b ENSGT00390000004594.a Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000159795.b ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.b ENSGT00390000004594.a Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000159795.b ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.b ENSGT00390000004594.a Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a.bb #30 ENSGT00940000153441.a.a.cb #30 ENSGT01000000217744 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.b ENSGT00390000004594.a Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 19 C4orf45 (ENSGEVG00005007840) RAPGEF2 (ENSGEVG00005007446) FSTL5 (ENSGEVG00005007330) NAF1 (ENSGEVG00005007277) ENSGEVG00005007260 ENSGEVG00005007249 NPY5R (ENSGEVG00005007231) TMA16 (ENSGEVG00005007189) MARCHF1 (ENSGEVG00005007144) ENSGEVG00005007116 ENSGEVG00005007094 ENSGEVG00005007075 TMEM192 (ENSGEVG00005007052) #18 KLHL2 (ENSGEVG00005007016) #19 MSMO1 (ENSGEVG00005006998) #21 CPE (ENSGEVG00005006900) #22 TLL1 (ENSGEVG00005006646) #25 ENSGEVG00005006562 #26 ENSGEVG00005006528 #26 ANXA10 (ENSGEVG00005006474) #27 ENSGEVG00005006422 #28 ENSGEVG00005004639 ENSGEVG00005004581 #30 ENSGEVG00005004489 #30 ENSGEVG00005004456 SH3RF1 (ENSGEVG00005004432) #32 NEK1 (ENSGEVG00005004393) #33 CLCN3 (ENSGEVG00005004287) #34 HPF1 (ENSGEVG00005004257) #35 MFAP3L (ENSGEVG00005004240) #37 ENSGEVG00005004201 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 1090 ITPK1 (ENSCABG00000017032) LYSET (ENSCABG00000017127) ENSCABG00000017129 UBR7 (ENSCABG00000017130) BTBD7 (ENSCABG00000017132) ENSCABG00000017133 KLHL2 (ENSCABG00000017141) #19 MSMO1 (ENSCABG00000017309) #21 CPE (ENSCABG00000017314) #22 TLL1 (ENSCABG00000017411) #25 ENSCABG00000017417 SMARCD2 (ENSCABG00000017418) PSMC5 (ENSCABG00000017419) FTSJ3 (ENSCABG00000017421) Emydidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000159795.b ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.b ENSGT00390000004594.a Three-toed box turtle MODERN SPECIES 26 PPID (ENSTMTG00000000312) FNIP2 (ENSTMTG00000000456) C4orf45 (ENSTMTG00000000520) RAPGEF2 (ENSTMTG00000000558) FSTL5 (ENSTMTG00000000627) NAF1 (ENSTMTG00000000655) NPY1R (ENSTMTG00000000675) NPY5R (ENSTMTG00000000688) TMA16 (ENSTMTG00000000696) MARCHF1 (ENSTMTG00000000719) ENSTMTG00000000730 ENSTMTG00000000735 TMEM192 (ENSTMTG00000000743) #18 KLHL2 (ENSTMTG00000000756) #19 MSMO1 (ENSTMTG00000000770) #21 CPE (ENSTMTG00000000780) #22 TLL1 (ENSTMTG00000000801) #25 ENSTMTG00000000817 #26 ENSTMTG00000000841 #26 ANXA10 (ENSTMTG00000000863) #27 ENSTMTG00000000898 ENSTMTG00000001398 #28 DDX60 (ENSTMTG00000003118) #28 ENSTMTG00000003575 PALLD (ENSTMTG00000003582) #30 CBR4 (ENSTMTG00000003604) #31 SH3RF1 (ENSTMTG00000003623) #32 NEK1 (ENSTMTG00000003707) #33 CLCN3 (ENSTMTG00000004179) #34 HPF1 (ENSTMTG00000004238) #35 MFAP3L (ENSTMTG00000004256) #37 painted turtle MODERN SPECIES 839 ENSCPBG00000018632 TMEM192 (ENSCPBG00000018639) #18 ENSCPBG00000018652 KLHL2 (ENSCPBG00000018659) #19 MSMO1 (ENSCPBG00000018666) #21 CPE (ENSCPBG00000018671) #22 TLL1 (ENSCPBG00000018681) #25 SPOCK3 (ENSCPBG00000018702) #26 Chinese turtle MODERN SPECIES 166 ENSPSIG00000005473 TMA16 (ENSPSIG00000005469) MARCHF1 (ENSPSIG00000005453) ENSPSIG00000000494 ENSPSIG00000000489 TMEM192 (ENSPSIG00000005332) #18 KLHL2 (ENSPSIG00000005124) #19 MSMO1 (ENSPSIG00000005113) #21 CPE (ENSPSIG00000005030) #22 TLL1 (ENSPSIG00000004710) #25 SPOCK3 (ENSPSIG00000004633) #26 ANXA10 (ENSPSIG00000004447) #27 ENSPSIG00000004424 DDX60 (ENSPSIG00000004307) #28 PALLD (ENSPSIG00000017707) #30 CBR4 (ENSPSIG00000017496) #31 SH3RF1 (ENSPSIG00000017101) #32 NEK1 (ENSPSIG00000014156) #33 CLCN3 (ENSPSIG00000012094) #34 HPF1 (ENSPSIG00000011612) #35 MFAP3L (ENSPSIG00000011328) #37 AADAT (ENSPSIG00000009122) ENSPSIG00000009023 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.b ENSGT00390000004594.a ENSGT00940000155038 Aves ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.a ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000154136.k.b.b.a ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.a ENSGT00940000155038 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000167073 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.a ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495.a ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000166775 ENSGT00960000190177 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.a ENSGT00940000155038 Pink-footed goose MODERN SPECIES 114 ENSABRG00000016442 NAF1 (ENSABRG00000016457) NPY1R (ENSABRG00000016462) NPY5R (ENSABRG00000016465) TMA16 (ENSABRG00000016469) MARCHF1 (ENSABRG00000016476) SMIM31 (ENSABRG00000016489) ENSABRG00000016493 TMEM192 (ENSABRG00000016499) #18 KLHL2 (ENSABRG00000016504) #19 MSMO1 (ENSABRG00000016509) #21 CPE (ENSABRG00000016514) #22 TLL1 (ENSABRG00000016533) #25 ENSABRG00000016576 SPOCK3 (ENSABRG00000016578) #26 ENSABRG00000016589 ANXA10 (ENSABRG00000016590) #27 ENSABRG00000016598 DDX60 (ENSABRG00000016611) #28 PALLD (ENSABRG00000016648) #30 CBR4 (ENSABRG00000016965) #31 SH3RF1 (ENSABRG00000017004) #32 NEK1 (ENSABRG00000017138) #33 CLCN3 (ENSABRG00000018429) #34 HPF1 (ENSABRG00000019454) #35 ENSABRG00000019461 MFAP3L (ENSABRG00000019467) #37 Duck MODERN SPECIES 22 ETFDH (ENSAPLG00000014311) PPID (ENSAPLG00000014725) FNIP2 (ENSAPLG00000015049) C4orf45 (ENSAPLG00000015551) RAPGEF2 (ENSAPLG00000000967) FSTL5 (ENSAPLG00000002939) NAF1 (ENSAPLG00000003210) NPY1R (ENSAPLG00000003293) NPY5R (ENSAPLG00000000608) MARCHF1 (ENSAPLG00000003514) TMA16 (ENSAPLG00000003349) ENSAPLG00000023085 TMEM192 (ENSAPLG00000003617) #18 KLHL2 (ENSAPLG00000003706) #19 MSMO1 (ENSAPLG00000004461) #21 CPE (ENSAPLG00000004644) #22 TLL1 (ENSAPLG00000013257) #25 SPOCK3 (ENSAPLG00000013179) #26 ANXA10 (ENSAPLG00000007293) #27 ENSAPLG00000007278 DDX60 (ENSAPLG00000007120) #28 PALLD (ENSAPLG00000006750) #30 CBR4 (ENSAPLG00000006660) #31 SH3RF1 (ENSAPLG00000006243) #32 NEK1 (ENSAPLG00000005269) #33 CLCN3 (ENSAPLG00000004867) #34 MFAP3L (ENSAPLG00000004242) #37 AADAT (ENSAPLG00000003855) GALNTL6 (ENSAPLG00000003678) HMGB2 (ENSAPLG00000003284) GALNT7 (ENSAPLG00000003409) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000167073 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00390000004594.a ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000158277 ENSGT01030000234904 Japanese quail MODERN SPECIES 22 PPID (ENSCJPG00005000618) FNIP2 (ENSCJPG00005000625) C4orf45 (ENSCJPG00005000640) RAPGEF2 (ENSCJPG00005000649) FSTL5 (ENSCJPG00005000678) NAF1 (ENSCJPG00005000691) NPY1R (ENSCJPG00005000695) NPY5R (ENSCJPG00005000703) TMA16 (ENSCJPG00005000705) MARCHF1 (ENSCJPG00005000708) SMIM31 (ENSCJPG00005000712) ENSCJPG00005000714 TMEM192 (ENSCJPG00005000715) #18 KLHL2 (ENSCJPG00005000718) #19 MSMO1 (ENSCJPG00005000721) #21 CPE (ENSCJPG00005000725) #22 TLL1 (ENSCJPG00005000730) #25 SPOCK3 (ENSCJPG00005000751) #26 ENSCJPG00005000756 ANXA10 (ENSCJPG00005000758) #27 ENSCJPG00005000761 DDX60 (ENSCJPG00005000762) #28 PALLD (ENSCJPG00005000764) #30 AADAT (ENSCJPG00005000766) MFAP3L (ENSCJPG00005000768) #37 HPF1 (ENSCJPG00005000770) #35 CLCN3 (ENSCJPG00005000773) #34 NEK1 (ENSCJPG00005000788) #33 SH3RF1 (ENSCJPG00005000830) #32 CBR4 (ENSCJPG00005000833) #31 PCDH10 (ENSCJPG00005000865) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000167073 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00390000004594.a ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000158277 ENSGT01030000234904 Chicken MODERN SPECIES 33 ETFDH (ENSGALG00010008764) PPID (ENSGALG00010008825) FNIP2 (ENSGALG00010008931) C4orf45 (ENSGALG00010008947) RAPGEF2 (ENSGALG00010009026) FSTL5 (ENSGALG00010007901) NAF1 (ENSGALG00010007906) NPY1R (ENSGALG00010007918) NPY5R (ENSGALG00010007932) TMA16 (ENSGALG00010007955) MARCH1 (ENSGALG00010007980) APELA (ENSGALG00010007985) TMEM192 (ENSGALG00010007997) #18 KLHL2 (ENSGALG00010007872) #19 MSMO1 (ENSGALG00010007877) #21 CPE (ENSGALG00010007882) #22 ENSGALG00010009067 TLL1 (ENSGALG00010009080) #25 SPOCK3 (ENSGALG00010008036) #26 ENSGALG00010008040 ANXA10 (ENSGALG00010008049) #27 ENSGALG00010008059 DDX60 (ENSGALG00010008064) #28 PALLD (ENSGALG00010008296) #30 AADAT (ENSGALG00010008325) MFAP3L (ENSGALG00010008344) #37 HPF1 (ENSGALG00010008358) #35 CLCN3 (ENSGALG00010008372) #34 NEK1 (ENSGALG00010008412) #33 SH3RF1 (ENSGALG00010008431) #32 CBR4 (ENSGALG00010008007) #31 Turkey MODERN SPECIES 24 C4orf46 (ENSMGAG00000021923) ETFDH (ENSMGAG00000001893) FNIP2 (ENSMGAG00000001946) ENSMGAG00000022421 RAPGEF2 (ENSMGAG00000001999) FSTL5 (ENSMGAG00000002115) NAF1 (ENSMGAG00000002133) NPY1R (ENSMGAG00000002141) NPY5R (ENSMGAG00000017038) MARCHF1 (ENSMGAG00000002154) TMA16 (ENSMGAG00000002147) ENSMGAG00000017587 TMEM192 (ENSMGAG00000002167) #18 KLHL2 (ENSMGAG00000002182) #19 MSMO1 (ENSMGAG00000002208) #21 CPE (ENSMGAG00000002224) #22 TLL1 (ENSMGAG00000002241) #25 SPOCK3 (ENSMGAG00000002370) #26 ANXA10 (ENSMGAG00000017273) #27 ENSMGAG00000017870 DDX60 (ENSMGAG00000002432) #28 ENSMGAG00000017559 PALLD (ENSMGAG00000002454) #30 AADAT (ENSMGAG00000002461) MFAP3L (ENSMGAG00000002495) #37 HPF1 (ENSMGAG00000002498) #35 CLCN3 (ENSMGAG00000002509) #34 NEK1 (ENSMGAG00000017234) #33 SH3RF1 (ENSMGAG00000002651) #32 CBR4 (ENSMGAG00000002684) #31 ENSMGAG00000018383 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.a ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003125 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.a ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 Kakapo MODERN SPECIES 24 RXFP1 (ENSSHBG00005009370) C4orf46 (ENSSHBG00005009357) ETFDH (ENSSHBG00005009343) PPID (ENSSHBG00005009324) FNIP2 (ENSSHBG00005009301) RAPGEF2 (ENSSHBG00005009227) FSTL5 (ENSSHBG00005009162) NAF1 (ENSSHBG00005009128) NPY1R (ENSSHBG00005009066) NPY5R (ENSSHBG00005009056) TMA16 (ENSSHBG00005009052) MARCHF1 (ENSSHBG00005009039) TMEM192 (ENSSHBG00005009011) #18 KLHL2 (ENSSHBG00005008996) #19 MSMO1 (ENSSHBG00005008984) #21 CPE (ENSSHBG00005008973) #22 TLL1 (ENSSHBG00005008959) #25 SPOCK3 (ENSSHBG00005008946) #26 ANXA10 (ENSSHBG00005008926) #27 ENSSHBG00005008911 ENSSHBG00005008898 #28 PALLD (ENSSHBG00005005690) #30 CBR4 (ENSSHBG00005005334) #31 SH3RF1 (ENSSHBG00005005314) #32 NEK1 (ENSSHBG00005005255) #33 CLCN3 (ENSSHBG00005005187) #34 HPF1 (ENSSHBG00005000510) #35 MFAP3L (ENSSHBG00005000503) #37 AADAT (ENSSHBG00005013662) GALNTL6 (ENSSHBG00005013651) ENSSHBG00005013638 Golden eagle MODERN SPECIES RXFP1 (ENSACCG00020002703) ETFDH (ENSACCG00020002553) PPID (ENSACCG00020002526) FNIP2 (ENSACCG00020002487) RAPGEF2 (ENSACCG00020002363) FSTL5 (ENSACCG00020002304) NAF1 (ENSACCG00020002271) NPY1R (ENSACCG00020002251) NPY5R (ENSACCG00020002241) TMA16 (ENSACCG00020002217) MARCHF1 (ENSACCG00020002193) ENSACCG00020002173 TMEM192 (ENSACCG00020002161) #18 KLHL2 (ENSACCG00020002135) #19 MSMO1 (ENSACCG00020002096) #21 CPE (ENSACCG00020002082) #22 TLL1 (ENSACCG00020001700) #25 SPOCK3 (ENSACCG00020001409) #26 ANXA10 (ENSACCG00020001373) #27 ENSACCG00020001352 DDX60 (ENSACCG00020001079) #28 PALLD (ENSACCG00020000620) #30 CBR4 (ENSACCG00020000523) #31 SH3RF1 (ENSACCG00020000503) #32 NEK1 (ENSACCG00020000402) #33 CLCN3 (ENSACCG00020000290) #34 HPF1 (ENSACCG00020000284) #35 MFAP3L (ENSACCG00020000283) #37 AADAT (ENSACCG00020000281) GALNTL6 (ENSACCG00020010971) GALNT7 (ENSACCG00020010938) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000166775 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.a ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Great tit MODERN SPECIES 23 RXFP1 (ENSPMJG00000010854) ETFDH (ENSPMJG00000010862) PPID (ENSPMJG00000010863) FNIP2 (ENSPMJG00000010868) RAPGEF2 (ENSPMJG00000010922) FSTL5 (ENSPMJG00000010952) ENSPMJG00000010977 NPY1R (ENSPMJG00000010978) NPY5R (ENSPMJG00000010979) TMA16 (ENSPMJG00000010980) MARCHF1 (ENSPMJG00000010989) ENSPMJG00000011019 TMEM192 (ENSPMJG00000011020) #18 KLHL2 (ENSPMJG00000011021) #19 MSMO1 (ENSPMJG00000000074) #21 CPE (ENSPMJG00000000100) #22 TLL1 (ENSPMJG00000000139) #25 SPOCK3 (ENSPMJG00000000315) #26 ANXA10 (ENSPMJG00000000377) #27 ENSPMJG00000000767 PALLD (ENSPMJG00000000929) #30 CBR4 (ENSPMJG00000000979) #31 SH3RF1 (ENSPMJG00000000989) #32 NEK1 (ENSPMJG00000001000) #33 CLCN3 (ENSPMJG00000001231) #34 HPF1 (ENSPMJG00000001262) #35 ENSPMJG00000001293 MFAP3L (ENSPMJG00000001336) #37 AADAT (ENSPMJG00000001338) GALNTL6 (ENSPMJG00000001432) GALNT7 (ENSPMJG00000001488) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000166775 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.a ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Flycatcher MODERN SPECIES 22 ETFDH (ENSFALG00000003046) PPID (ENSFALG00000027186) FNIP2 (ENSFALG00000003021) RAPGEF2 (ENSFALG00000003011) FSTL5 (ENSFALG00000028177) ENSFALG00000003590 NPY1R (ENSFALG00000011120) NPY5R (ENSFALG00000011129) TMA16 (ENSFALG00000011142) MARCHF1 (ENSFALG00000023262) SMIM31 (ENSFALG00000028194) ENSFALG00000011178 TMEM192 (ENSFALG00000011185) #18 KLHL2 (ENSFALG00000011199) #19 MSMO1 (ENSFALG00000011210) #21 CPE (ENSFALG00000011233) #22 TLL1 (ENSFALG00000011281) #25 SPOCK3 (ENSFALG00000011321) #26 ANXA10 (ENSFALG00000011340) #27 PALLD (ENSFALG00000025066) #30 CBR4 (ENSFALG00000025399) #31 SH3RF1 (ENSFALG00000011380) #32 NEK1 (ENSFALG00000011390) #33 CLCN3 (ENSFALG00000011405) #34 HPF1 (ENSFALG00000011413) #35 MFAP3L (ENSFALG00000026913) #37 AADAT (ENSFALG00000011425) GALNTL6 (ENSFALG00000011441) ENSFALG00000011458 HMGB2 (ENSFALG00000011474) SAP30 (ENSFALG00000011481) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000166775 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.a ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000166775 ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.a ENSGT00940000155038 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Zebra finch MODERN SPECIES 25 C4orf46 (ENSTGUG00000019648) ETFDH (ENSTGUG00000005625) PPID (ENSTGUG00000005656) FNIP2 (ENSTGUG00000005685) RAPGEF2 (ENSTGUG00000005715) FSTL5 (ENSTGUG00000005764) NAF1 (ENSTGUG00000005798) NPY1R (ENSTGUG00000005806) NPY5R (ENSTGUG00000018793) TMA16 (ENSTGUG00000019356) MARCHF1 (ENSTGUG00000028514) ENSTGUG00000027290 TMEM192 (ENSTGUG00000005843) #18 KLHL2 (ENSTGUG00000005854) #19 MSMO1 (ENSTGUG00000005930) #21 CPE (ENSTGUG00000005938) #22 TLL1 (ENSTGUG00000005951) #25 SPOCK3 (ENSTGUG00000006005) #26 ANXA10 (ENSTGUG00000006030) #27 ENSTGUG00000027586 PALLD (ENSTGUG00000006061) #30 CBR4 (ENSTGUG00000025799) #31 SH3RF1 (ENSTGUG00000006100) #32 NEK1 (ENSTGUG00000006124) #33 CLCN3 (ENSTGUG00000006161) #34 HPF1 (ENSTGUG00000006209) #35 MFAP3L (ENSTGUG00000027066) #37 AADAT (ENSTGUG00000006219) GALNTL6 (ENSTGUG00000006232) GALNT7 (ENSTGUG00000006243) HMGB2 (ENSTGUG00000006267) Common canary MODERN SPECIES 2 C4orf46 (ENSSCAG00000010719) ETFDH (ENSSCAG00000010712) PPID (ENSSCAG00000010690) FNIP2 (ENSSCAG00000010676) RAPGEF2 (ENSSCAG00000010629) FSTL5 (ENSSCAG00000010580) NPY1R (ENSSCAG00000010564) NPY5R (ENSSCAG00000010561) TMA16 (ENSSCAG00000010556) MARCHF1 (ENSSCAG00000010549) SMIM31 (ENSSCAG00000010543) ENSSCAG00000010538 TMEM192 (ENSSCAG00000010536) #18 KLHL2 (ENSSCAG00000010531) #19 MSMO1 (ENSSCAG00000010529) #21 CPE (ENSSCAG00000010526) #22 TLL1 (ENSSCAG00000010520) #25 ENSSCAG00000010513 SPOCK3 (ENSSCAG00000010508) #26 ANXA10 (ENSSCAG00000010482) #27 PALLD (ENSSCAG00000010362) #30 CBR4 (ENSSCAG00000010314) #31 SH3RF1 (ENSSCAG00000010309) #32 NEK1 (ENSSCAG00000010284) #33 CLCN3 (ENSSCAG00000010271) #34 HPF1 (ENSSCAG00000010268) #35 MFAP3L (ENSSCAG00000010267) #37 AADAT (ENSSCAG00000010261) GALNTL6 (ENSSCAG00000010253) GALNT7 (ENSSCAG00000010245) HMGB2 (ENSSCAG00000010243) Medium ground finch MODERN SPECIES ENSGFOG00000001792 ENSGFOG00000001785 ETFDH (ENSGFOG00000001777) PPID (ENSGFOG00000001770) FNIP2 (ENSGFOG00000001467) RAPGEF2 (ENSGFOG00000001344) FSTL5 (ENSGFOG00000001319) NAF1 (ENSGFOG00000001309) NPY1R (ENSGFOG00000001302) NPY5R (ENSGFOG00000001299) TMA16 (ENSGFOG00000001292) MARCHF1 (ENSGFOG00000001285) TMEM192 (ENSGFOG00000001258) #18 KLHL2 (ENSGFOG00000001230) #19 MSMO1 (ENSGFOG00000001221) #21 CPE (ENSGFOG00000001212) #22 TLL1 (ENSGFOG00000001197) #25 SPOCK3 (ENSGFOG00000001186) #26 ANXA10 (ENSGFOG00000001171) #27 PALLD (ENSGFOG00000000415) #30 CBR4 (ENSGFOG00000000307) #31 SH3RF1 (ENSGFOG00000000301) #32 NEK1 (ENSGFOG00000000236) #33 CLCN3 (ENSGFOG00000000217) #34 HPF1 (ENSGFOG00000000212) #35 MFAP3L (ENSGFOG00000000209) #37 AADAT (ENSGFOG00000000202) GALNTL6 (ENSGFOG00000000182) GALNT7 (ENSGFOG00000000167) HMGB2 (ENSGFOG00000000158) SAP30 (ENSGFOG00000000154) African ostrich MODERN SPECIES 692 GASK1B (ENSSCUG00000013471) TMEM144 (ENSSCUG00000013475) RXFP1 (ENSSCUG00000013481) PPID (ENSSCUG00000013494) FNIP2 (ENSSCUG00000013506) RAPGEF2 (ENSSCUG00000013516) FSTL5 (ENSSCUG00000013533) NPY1R (ENSSCUG00000013539) NPY5R (ENSSCUG00000013542) TMA16 (ENSSCUG00000013543) MARCHF1 (ENSSCUG00000013546) SMIM31 (ENSSCUG00000013548) TMEM192 (ENSSCUG00000013551) #18 KLHL2 (ENSSCUG00000013554) #19 MSMO1 (ENSSCUG00000013562) #21 CPE (ENSSCUG00000013565) #22 TLL1 (ENSSCUG00000013569) #25 SPOCK3 (ENSSCUG00000013577) #26 ANXA10 (ENSSCUG00000013580) #27 DDX60 (ENSSCUG00000013584) #28 PALLD (ENSSCUG00000013612) #30 CBR4 (ENSSCUG00000013631) #31 ACTR3 (ENSSCUG00000013633) DPP10 (ENSSCUG00000013651) ENSSCUG00000013697 DDX18 (ENSSCUG00000013699) CCDC93 (ENSSCUG00000013701) INSIG2 (ENSSCUG00000013704) ENSSCUG00000013707 STEAP3 (ENSSCUG00000013709) C2orf76 (ENSSCUG00000013710) Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 33 PPID (ENSCPRG00005010369) FNIP2 (ENSCPRG00005010374) RAPGEF2 (ENSCPRG00005010412) FSTL5 (ENSCPRG00005010471) ENSCPRG00005010506 NAF1 (ENSCPRG00005010525) NPY1R (ENSCPRG00005010527) NPY5R (ENSCPRG00005010528) TMA16 (ENSCPRG00005010535) MARCHF1 (ENSCPRG00005010538) ENSCPRG00005010545 TMEM192 (ENSCPRG00005010548) #18 ENSCPRG00005010551 KLHL2 (ENSCPRG00005010559) #19 MSMO1 (ENSCPRG00005010564) #21 CPE (ENSCPRG00005010566) #22 TLL1 (ENSCPRG00005010590) #25 SPOCK3 (ENSCPRG00005010612) #26 DDX60 (ENSCPRG00005010657) #28 ANXA10 (ENSCPRG00005010935) #27 PALLD (ENSCPRG00005010949) #30 CBR4 (ENSCPRG00005011084) #31 SH3RF1 (ENSCPRG00005011088) #32 NEK1 (ENSCPRG00005011096) #33 CLCN3 (ENSCPRG00005011159) #34 HPF1 (ENSCPRG00005011172) #35 MFAP3L (ENSCPRG00005011182) #37 ENSCPRG00005011190 ENSCPRG00005011248 ENSCPRG00005011261 ENSCPRG00005011271 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000159795.b ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.b ENSGT00390000004594.a tuatara MODERN SPECIES 1647 FSTL5 (ENSSPUG00000004244) NAF1 (ENSSPUG00000004087) ENSSPUG00000004043 NPY1R (ENSSPUG00000004037) NPY5R (ENSSPUG00000004021) TMA16 (ENSSPUG00000003993) MARCHF1 (ENSSPUG00000003972) SMIM31 (ENSSPUG00000003958) ENSSPUG00000003947 TMEM192 (ENSSPUG00000003804) #18 KLHL2 (ENSSPUG00000003662) #19 MSMO1 (ENSSPUG00000003480) #21 CPE (ENSSPUG00000003426) #22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000159795.b ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.b ENSGT00390000004594.a Laterata ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157225.t #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000165556 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000159795.b ENSGT00940000153441.a.a #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594.b ENSGT00390000004594.a Common wall lizard MODERN SPECIES 17 FSTL5 (ENSPMRG00000012036) NAF1 (ENSPMRG00000012020) ENSPMRG00000012017 NPY1R (ENSPMRG00000012014) NPY5R (ENSPMRG00000012013) TMA16 (ENSPMRG00000012006) MARCHF1 (ENSPMRG00000011999) SMIM31 (ENSPMRG00000011993) ENSPMRG00000011989 ENSPMRG00000011986 TMEM192 (ENSPMRG00000011983) #18 KLHL2 (ENSPMRG00000011971) #19 ENSPMRG00000011966 ENSPMRG00000011963 #21 ENSPMRG00000011950 #21 CPE (ENSPMRG00000011944) #22 ENSPMRG00000011937 TLL1 (ENSPMRG00000011903) #25 ENSPMRG00000011897 SPOCK3 (ENSPMRG00000011877) #26 ENSPMRG00000011871 ANXA10 (ENSPMRG00000011860) #27 DDX60 (ENSPMRG00000010909) #28 ENSPMRG00000010679 PALLD (ENSPMRG00000010672) #30 CBR4 (ENSPMRG00000010655) #31 ENSPMRG00000010649 SH3RF1 (ENSPMRG00000010636) #32 NEK1 (ENSPMRG00000010552) #33 CLCN3 (ENSPMRG00000010515) #34 HPF1 (ENSPMRG00000010507) #35 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 26 RXFP1 (ENSSMRG00000001788) ETFDH (ENSSMRG00000002265) PPID (ENSSMRG00000002268) FNIP2 (ENSSMRG00000002272) RAPGEF2 (ENSSMRG00000002322) FSTL5 (ENSSMRG00000002512) NAF1 (ENSSMRG00000002532) NPY1R (ENSSMRG00000002571) NPY5R (ENSSMRG00000002582) TMA16 (ENSSMRG00000002584) MARCHF1 (ENSSMRG00000002599) ENSSMRG00000002634 TMEM192 (ENSSMRG00000002641) #18 KLHL2 (ENSSMRG00000002645) #19 MSMO1 (ENSSMRG00000002657) #21 CPE (ENSSMRG00000002666) #22 ENSSMRG00000002782 #25 SPOCK3 (ENSSMRG00000002829) #26 ANXA10 (ENSSMRG00000002887) #27 ENSSMRG00000002908 ENSSMRG00000002951 #28 ENSSMRG00000002979 #28 PALLD (ENSSMRG00000004456) #30 CBR4 (ENSSMRG00000004473) #31 SH3RF1 (ENSSMRG00000004477) #32 NEK1 (ENSSMRG00000004496) #33 CLCN3 (ENSSMRG00000009307) #34 HPF1 (ENSSMRG00000009308) #35 MFAP3L (ENSSMRG00000009309) #37 ENSSMRG00000009310 ENSSMRG00000009328 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158241 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157158.c.a ##22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000175718.a Lizard MODERN SPECIES 931 ENSACAG00000000684 #18 KLHL2 (ENSACAG00000000301) #19 MSMO1 (ENSACAG00000000271) #21 CPE (ENSACAG00000000260) #22 ENSACAG00000043912 TLL1 (ENSACAG00000000252) #25 ENSACAG00000010751 ENSACAG00000035013 SPOCK3 (ENSACAG00000016126) #26 Amniota DUPLICATION Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158.d #22 ENSGT00940000157158.c.a ##22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000175718.a Elapidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000012574 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012.t #21 ENSGT00940000157158.c.a ##22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000175718.a ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000157168 ENSGT00940000160665 ENSGT00940000170545 ENSGT00950000183061.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160373 ENSGT00440000033329.a.a.b ENSGT00390000010172 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000012574 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434.m #19 ENSGT00940000158012.t #21 ENSGT00940000157158.c.a ##22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000175718.a ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000157168 ENSGT00940000160665 ENSGT00940000170545 ENSGT00950000183061.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160373 ENSGT00440000033329.a.a.b ENSGT00390000010172 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000012574 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434.m #19 ENSGT00940000158012.t #21 ENSGT00940000157158.c.a ##22 ENSGT00390000015823.g.b ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000175718.a ENSGT00940000158467 ENSGT00940000157467 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000155316 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000157168 ENSGT00940000160665 ENSGT00940000170545 ENSGT00950000183061.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160373 ENSGT00440000033329.a.a.b Eastern brown snake MODERN SPECIES 12 TMEM144 (ENSPTXG00000005127) ETFDH (ENSPTXG00000005126) PPID (ENSPTXG00000005124) FNIP2 (ENSPTXG00000004689) RAPGEF2 (ENSPTXG00000000862) FSTL5 (ENSPTXG00000000789) NAF1 (ENSPTXG00000000786) NPY1R (ENSPTXG00000000784) TMA16 (ENSPTXG00000000781) MARCHF1 (ENSPTXG00000000778) SMIM31 (ENSPTXG00000000774) ENSPTXG00000000772 TMEM192 (ENSPTXG00000000769) #18 KLHL2 (ENSPTXG00000000187) #19 ENSPTXG00000000086 #21 CPE (ENSPTXG00000006331) ##22 ENSPTXG00000006329 TLL1 (ENSPTXG00000006313) #25 SPOCK3 (ENSPTXG00000006307) #26 ENSPTXG00000006305 FGG (ENSPTXG00000006302) ENSPTXG00000006300 FGB (ENSPTXG00000006297) PLRG1 (ENSPTXG00000006295) TLR2 (ENSPTXG00000006291) NDST4 (ENSPTXG00000006287) NDST3 (ENSPTXG00000006283) ENSPTXG00000006280 DLC1 (ENSPTXG00000006279) TRMT9B (ENSPTXG00000006278) ENSPTXG00000006277 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 9154 CPE (ENSLLTG00000011220) ##22 Indian cobra MODERN SPECIES 3 FBXL5 (ENSNNAG00000003139) WDR1 (ENSNNAG00000003110) SLC2A9 (ENSNNAG00000003087) OTOP1 (ENSNNAG00000018961) TMEM128 (ENSNNAG00000018959) GABRA2 (ENSNNAG00000018958) GABRA4 (ENSNNAG00000018954) ENSNNAG00000018952 ENSNNAG00000018947 LRAT (ENSNNAG00000018943) RBM46 (ENSNNAG00000018940) ENSNNAG00000018937 GUCY1A1 (ENSNNAG00000018932) GUCY1B1 (ENSNNAG00000018930) ASIC5 (ENSNNAG00000018929) CPE (ENSNNAG00000018926) ##22 TLL1 (ENSNNAG00000018921) #25 SPOCK3 (ENSNNAG00000018917) #26 FGG (ENSNNAG00000018914) ENSNNAG00000018910 FGB (ENSNNAG00000018900) PLRG1 (ENSNNAG00000018893) SFRP2 (ENSNNAG00000018889) TLR2 (ENSNNAG00000018887) NDST4 (ENSNNAG00000018883) ENSNNAG00000018880 NDST3 (ENSNNAG00000018877) DLC1 (ENSNNAG00000018863) TRMT9B (ENSNNAG00000018855) LONRF1 (ENSNNAG00000018846) ENSNNAG00000018845 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.a ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 931 ENSAMEG00000023849 ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157158.c.b ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 610 ENSAMEG00000029385 ##22 Anura ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT01100000263683 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000157188 #28 ENSGT00940000153441.a.a.b #30 ENSGT00940000157620 #31 ENSGT00940000155875 #32 ENSGT00940000158460 #33 ENSGT00940000153763.b #34 ENSGT00390000014876 #35 ENSGT00390000011576.a #37 ENSGT00390000004594 ENSGT00940000155038.b ENSGT00940000158105 ENSGT00940000154466 Leishan spiny toad MODERN SPECIES NPY1R (ENSLLEG00000003397) ENSLLEG00000003405 NPY5R (ENSLLEG00000003414) ENSLLEG00000003419 TMA16 (ENSLLEG00000003427) ENSLLEG00000003446 MARCHF1 (ENSLLEG00000003464) ENSLLEG00000003495 SMIM31 (ENSLLEG00000003501) ENSLLEG00000003512 TMEM192 (ENSLLEG00000003536) #18 ENSLLEG00000003564 ENSLLEG00000003570 KLHL2 (ENSLLEG00000008201) #19 MSMO1 (ENSLLEG00000008470) #21 CPE (ENSLLEG00000008567) #22 ENSLLEG00000008649 TLL1 (ENSLLEG00000008715) #25 SPOCK3 (ENSLLEG00000009222) #26 ENSLLEG00000009390 ENSLLEG00000009419 ENSLLEG00000009452 ENSLLEG00000009686 #27 ENSLLEG00000009909 #28 ENSLLEG00000010145 ENSLLEG00000010168 #30 ENSLLEG00000010194 ENSLLEG00000010212 #30 CBR4 (ENSLLEG00000010324) #31 SH3RF1 (ENSLLEG00000010395) #32 NEK1 (ENSLLEG00000010676) #33 Frog MODERN SPECIES ENSXETG00000042565 ENSXETG00000048863 ENSXETG00000048552 fstl5 (ENSXETG00000012007) ENSXETG00000049134 naf1 (ENSXETG00000035148) npy1r (ENSXETG00000004903) npy5r (ENSXETG00000004893) tma16 (ENSXETG00000004891) marchf1 (ENSXETG00000017063) SMIM31 (ENSXETG00000037312) apela (ENSXETG00000036618) tmem192 (ENSXETG00000017061) #18 klhl2 (ENSXETG00000034185) #19 msmo1 (ENSXETG00000000914) #21 cops6 (ENSXETG00000017037) #22 tll1 (ENSXETG00000017032) #25 spock3 (ENSXETG00000030204) #26 ENSXETG00000044473 anxa10 (ENSXETG00000032881) #27 ENSXETG00000045095 ENSXETG00000030600 ddx60 (ENSXETG00000043648) #28 ENSXETG00000043858 palld (ENSXETG00000033874) #30 cbr4 (ENSXETG00000004944) #31 sh3rf1 (ENSXETG00000004943) #32 nek1 (ENSXETG00000023155) #33 clcn3 (ENSXETG00000023146) #34 hpf1 (ENSXETG00000023144) #37 aadat (ENSXETG00000023143) Coelacanth MODERN SPECIES 373 CPE (ENSLACG00000003707) #22 TLL1 (ENSLACG00000009824) #25 SPOCK3 (ENSLACG00000014005) #26 ENSLACG00000016134 ANXA10 (ENSLACG00000017285) #27 DDX60 (ENSLACG00000017399) #28 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00770000121728 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 ENSGT00950000182924.A.b.a.b ENSGT00950000183054.a.a.a ENSGT00950000183027.b ENSGT00940000156337 ENSGT00990000210463 ENSGT00940000155475.h ENSGT00940000153395.a ENSGT00940000159954 Reedfish MODERN SPECIES 15 galt (ENSECRG00000007892) ENSECRG00000007879 cntfr (ENSECRG00000007868) IL11RA (ENSECRG00000007857) tmem267 (ENSECRG00000007850) rai14 (ENSECRG00000007831) NPY5R (ENSECRG00000007816) tma16 (ENSECRG00000007806) ENSECRG00000007781 MARCHF1 (ENSECRG00000007762) SMIM31 (ENSECRG00000007749) ENSECRG00000007739 tmem192 (ENSECRG00000007733) #18 KLHL2 (ENSECRG00000007705) #19 msmo1 (ENSECRG00000007681) #21 cpe (ENSECRG00000007638) #22 tll1 (ENSECRG00000007443) #25 spock3 (ENSECRG00000007391) #26 ENSECRG00000007377 #27 ANXA10 (ENSECRG00000007368) #27 ugt8 (ENSECRG00000007352) ENSECRG00000007345 NDST4 (ENSECRG00000007335) PRSS12 (ENSECRG00000007300) mettl14 (ENSECRG00000007257) sec24d (ENSECRG00000007231) ENSECRG00000007141 CLDN23 (ENSECRG00000007115) ENSECRG00000007110 PRAG1 (ENSECRG00000007098) mboat4 (ENSECRG00000007091) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158241 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000160623 #27 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000162414 ENSGT00940000154965.B ENSGT00390000001577 ENSGT00530000063669.a ENSGT00390000013015 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000170113 ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156495 ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000162414 ENSGT00940000154965.B ENSGT00390000001577 ENSGT00530000063669.a ENSGT00390000013015 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 145 ENSGT00940000181428 ENSGT00390000010773 ENSGT00940000154672 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000156418.e ENSGT00940000156495.p ENSGT00390000004697 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000162414.a ENSGT00940000154965.B ENSGT00390000001577 ENSGT00530000063669.a ENSGT00390000013015 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b P. kingsleyae MODERN SPECIES 6 etfdh (ENSPKIG00000018789) ppid (ENSPKIG00000018848) fnip2 (ENSPKIG00000018925) RAPGEF2 (ENSPKIG00000019232) fstl5 (ENSPKIG00000019640) NAF1 (ENSPKIG00000019687) npy1r (ENSPKIG00000019716) NPY5R (ENSPKIG00000019730) tma16 (ENSPKIG00000019747) MARCHF1 (ENSPKIG00000019778) ENSPKIG00000019806 ENSPKIG00000019815 tmem192 (ENSPKIG00000019831) #18 KLHL2 (ENSPKIG00000019885) #19 msmo1 (ENSPKIG00000019967) #21 cpe (ENSPKIG00000020014) #22 tll1 (ENSPKIG00000020645) #25 spock3 (ENSPKIG00000021579) #26 ugt8 (ENSPKIG00000021657) NDST4 (ENSPKIG00000021707) PRSS12 (ENSPKIG00000021778) mettl14 (ENSPKIG00000021821) slit2 (ENSPKIG00000021961) ENSPKIG00000022216 ENSPKIG00000022230 ENSPKIG00000022243 ENSPKIG00000022260 ncapg (ENSPKIG00000022276) fam184b (ENSPKIG00000022319) ENSPKIG00000022358 med28 (ENSPKIG00000022383) Asian bonytongue MODERN SPECIES 7 etfdh (ENSSFOG00015014755) ppid (ENSSFOG00015014728) RAPGEF2 (ENSSFOG00015014330) fstl5 (ENSSFOG00015014229) ENSSFOG00015014271 NAF1 (ENSSFOG00015014207) npy1r (ENSSFOG00015014195) NPY5R (ENSSFOG00015014190) tma16 (ENSSFOG00015014181) MARCHF1 (ENSSFOG00015025804) ENSSFOG00015014163 ENSSFOG00015014154 tmem192 (ENSSFOG00015014136) #18 KLHL2 (ENSSFOG00015014079) #19 msmo1 (ENSSFOG00015014052) #21 cpe (ENSSFOG00015014025) #22 tll1 (ENSSFOG00015013977) #25 spock3 (ENSSFOG00015013915) #26 ugt8 (ENSSFOG00015013892) NDST4 (ENSSFOG00015013821) PRSS12 (ENSSFOG00015013772) mettl14 (ENSSFOG00015013743) slit2 (ENSSFOG00015013660) ENSSFOG00015030965 ncapg (ENSSFOG00015013585) ENSSFOG00015013567 ENSSFOG00015025280 med28 (ENSSFOG00015013534) lap3 (ENSSFOG00015013505) qdprb.4 (ENSSFOG00015013456) LDB2 (ENSSFOG00015028235) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 353 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 409 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT01040000240855 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 363 ENSGT00940000160268 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT01040000240855 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 Atlantic herring MODERN SPECIES 14 ENSCHAG00000020227 stra6l (ENSCHAG00000020233) tdrd7a (ENSCHAG00000020267) TMOD1 (ENSCHAG00000020458) cplx2l (ENSCHAG00000020472) ENSCHAG00000020500 ENSCHAG00000020565 npy1r (ENSCHAG00000022354) tmem192 (ENSCHAG00000022362) #18 ENSCHAG00000022373 ENSCHAG00000022386 ENSCHAG00000022393 tma16 (ENSCHAG00000022400) KLHL2 (ENSCHAG00000022411) #19 msmo1 (ENSCHAG00000022621) #21 cpe (ENSCHAG00000022631) #22 tll1 (ENSCHAG00000022770) #25 spock3 (ENSCHAG00000025314) #26 ugt8 (ENSCHAG00000025323) NDST4 (ENSCHAG00000025335) ENSCHAG00000025371 TYRP1 (ENSCHAG00000025380) ENSCHAG00000025402 ENSCHAG00000025406 ENSCHAG00000025408 ENSCHAG00000025415 ENSCHAG00000025419 TCIRG1 (ENSCHAG00000025428) kdm2aa (ENSCHAG00000025485) pold4 (ENSCHAG00000025962) SSRP1 (ENSCHAG00000025965) Denticle herring MODERN SPECIES 14 ENSDCDG00000015030 stra6l (ENSDCDG00000015036) ENSDCDG00000015040 frem3 (ENSDCDG00000015053) hhip (ENSDCDG00000015168) ENSDCDG00000015416 ENSDCDG00000015650 npy1r (ENSDCDG00000020318) tmem192 (ENSDCDG00000020342) #18 apela (ENSDCDG00000020345) ENSDCDG00000020347 ENSDCDG00000020348 tma16 (ENSDCDG00000020350) KLHL2 (ENSDCDG00000020354) #19 msmo1 (ENSDCDG00000020357) #21 cpe (ENSDCDG00000020360) #22 tll1 (ENSDCDG00000020595) #25 SIRT5 (ENSDCDG00000021918) adcy1b (ENSDCDG00000021929) igfbp1b (ENSDCDG00000021949) IGFBP3 (ENSDCDG00000022153) TNS3 (ENSDCDG00000022743) DSP (ENSDCDG00000024080) slc22a23 (ENSDCDG00000026183) tubb2 (ENSDCDG00000026185) ssx2ipa (ENSDCDG00000026191) ENSDCDG00000026202 ENSDCDG00000026214 ENSDCDG00000026215 RNF11 (ENSDCDG00000026217) aurkb (ENSDCDG00000026218) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 242 ENSGT00940000162193 ENSGT00550000074857 ENSGT00940000153612.A ENSGT00530000063425.a.a.a.b ENSGT00390000018004 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT01040000240855 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000004179 ENSGT00390000006192 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 ENSGT00940000157352.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.b ENSGT00940000158826 ENSGT00940000165381 ENSGT00940000160246.d ENSGT00390000009391.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 163 ENSGT00940000162193 ENSGT00550000074857 ENSGT00940000153612.A ENSGT00530000063425.a.a.a.b ENSGT00390000018004 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT01040000240855 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000004179 ENSGT00390000006192 ENSGT00940000160268 ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 ENSGT00940000157352.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.b ENSGT00940000158826 ENSGT00940000165381 ENSGT00940000160246.d ENSGT00390000009391.a Channel catfish MODERN SPECIES 21 exoc1l (ENSIPUG00000003212) smc2 (ENSIPUG00000003173) ecpas (ENSIPUG00000003055) fbxo10 (ENSIPUG00000003036) polr1e (ENSIPUG00000003019) tmem192 (ENSIPUG00000002986) #18 apela (ENSIPUG00000002977) ENSIPUG00000002970 march1 (ENSIPUG00000002942) tma16 (ENSIPUG00000002917) med28 (ENSIPUG00000002898) npy1r (ENSIPUG00000002891) ENSIPUG00000002776 klhl2 (ENSIPUG00000002741) #19 msmo1 (ENSIPUG00000002734) #21 cpe (ENSIPUG00000002712) #22 tll1 (ENSIPUG00000002661) #25 spock3 (ENSIPUG00000002644) #26 UGT8 (ENSIPUG00000002626) NDST4 (ENSIPUG00000002589) prss12 (ENSIPUG00000002571) mettl14 (ENSIPUG00000002539) ZBTB5 (ENSIPUG00000002531) grhprb (ENSIPUG00000002516) UBA6 (ENSIPUG00000002471) APBB2 (ENSIPUG00000002447) ENSIPUG00000002428 ENSIPUG00000002410 ENSIPUG00000002397 fnip2 (ENSIPUG00000002304) ENSIPUG00000002284 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 188 ENSGT00390000006192 ENSGT00940000160268 ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 ENSGT00940000157352.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.b ENSGT00940000158826 ENSGT00940000165381 ENSGT00940000160246.d ENSGT00390000009391.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 233 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000006192 ENSGT00940000160268 ENSGT00390000012736 ENSGT00940000156418 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 ENSGT00940000158826.f ENSGT00940000165381 ENSGT00940000160246.d ENSGT00390000009391.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 298 tma16 (ENSPNAG00000001948) ENSPNAG00000011838 ENSPNAG00000011843 ENSPNAG00000011864 med28 (ENSPNAG00000001982) npy1r (ENSPNAG00000011882) ENSPNAG00000012004 KLHL2 (ENSPNAG00000002084) #19 msmo1 (ENSPNAG00000012092) #21 cpe (ENSPNAG00000012125) #22 tll1 (ENSPNAG00000012237) #25 spock3 (ENSPNAG00000012257) #26 ugt8 (ENSPNAG00000002181) NDST4 (ENSPNAG00000012335) Mexicana tetra MODERN SPECIES 13 ENSAMXG00000042006 ENSAMXG00000033612 ENSAMXG00000043812 tmem144a (ENSAMXG00000029249) gria2a (ENSAMXG00000015643) glrba (ENSAMXG00000032264) WDR19 (ENSAMXG00000042547) ncapd3 (ENSAMXG00000034800) primpol (ENSAMXG00000035771) ENSAMXG00000041797 ENSAMXG00000044002 ENSAMXG00000034701 ENSAMXG00000036858 KLHL2 (ENSAMXG00000037606) #19 msmo1 (ENSAMXG00000040310) #21 cpe (ENSAMXG00000033974) #22 tll1 (ENSAMXG00000039193) #25 spock3 (ENSAMXG00000000354) #26 ugt8 (ENSAMXG00000039733) ENSAMXG00000040656 ENSAMXG00000043675 ENSAMXG00000029228 NDST4 (ENSAMXG00000037801) PRSS12 (ENSAMXG00000029742) mettl14 (ENSAMXG00000039626) ENSAMXG00000034141 lad1 (ENSAMXG00000000233) ENSAMXG00000038878 ENSAMXG00000032330 ENSAMXG00000037149 ENSAMXG00000029932 Electric eel MODERN SPECIES 949 ENSEEEG00000008263 KLHL2 (ENSEEEG00000008269) #19 msmo1 (ENSEEEG00000008279) #21 cpe (ENSEEEG00000008281) #22 tll1 (ENSEEEG00000008285) #25 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00390000006192 ENSGT00940000160268 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225.a #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 ENSGT00940000157352.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.b ENSGT00940000158826 ENSGT00940000165381 ENSGT00940000160246.d ENSGT00390000009391.a ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01040000240855 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000167725.a ENSGT00390000003901 ENSGT00940000153566.b.b ENSGT00940000153566.b.a ENSGT00590000083165 ENSGT00940000156344.a.a ENSGT00940000156950.b.b ENSGT00940000156344.a.b ENSGT00940000156950.b.a ENSGT00390000012574.k ENSGT00390000006192.dc.a ENSGT00940000160268.f ENSGT00940000156418.x.a ENSGT00940000156434.c #19 ENSGT00940000158012.z #21 ENSGT00940000157158.e #22 ENSGT00940000157225.a.a #25 ENSGT00940000157828.w #26 ENSGT00940000156545.a ENSGT00940000157168.j ENSGT00940000158131.g ENSGT00550000075003.b ENSGT00940000157352.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.b.a ENSGT00940000158826.h ENSGT00940000165381.b ENSGT00940000160246.d.b ENSGT00390000009391.a.f ENSGT00390000004179.a ENSGT00940000159346.b ENSGT01040000240855.a.a Goldfish MODERN SPECIES 18 ENSCARG00000048343 melk (ENSCARG00000047337) pax5 (ENSCARG00000047130) zcchc7 (ENSCARG00000047117) ENSCARG00000047090 primpol (ENSCARG00000047051) ncapd3 (ENSCARG00000045173) glrba (ENSCARG00000044990) gria2a (ENSCARG00000044924) gria2a (ENSCARG00000044890) med28 (ENSCARG00000044879) npy1r (ENSCARG00000044871) ENSCARG00000043546 KLHL2 (ENSCARG00000042330) #19 msmo1 (ENSCARG00000042278) #21 cpe (ENSCARG00000042003) #22 tll1 (ENSCARG00000031774) #25 spock3 (ENSCARG00000031535) #26 ugt8 (ENSCARG00000031524) ENSCARG00000031516 NDST4 (ENSCARG00000031511) ENSCARG00000031445 mettl14 (ENSCARG00000031330) ENSCARG00000031312 ENSCARG00000030232 UBA6 (ENSCARG00000030036) grhprb (ENSCARG00000029491) ZBTB5 (ENSCARG00000029460) fnip2 (ENSCARG00000029006) tma16 (ENSCARG00000028943) ENSCARG00000028914 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00950000183041.B.j ENSGT00940000167725.b.a ENSGT00940000167725.a.e ENSGT00390000003901 ENSGT00940000153566.b.b ENSGT00940000153566.b.a ENSGT00590000083165 ENSGT00940000156344.a.b ENSGT00940000156950.b.a ENSGT00390000012574.k.b ENSGT00390000006192.dc.a ENSGT00940000160268.f ENSGT00940000156418.x.a ENSGT00940000156434.c #19 ENSGT00940000158012.z #21 ENSGT00940000157158.e #22 ENSGT00940000157225.a.a #25 ENSGT00940000157828.w #26 ENSGT00940000156545.a ENSGT00940000157168.j ENSGT00940000158131.g ENSGT00550000075003.b ENSGT00940000157352.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.b.a ENSGT00940000158826.h ENSGT00940000165381.b ENSGT00940000160246.d.b ENSGT00390000009391.a.f ENSGT00390000004179.a ENSGT00940000159346.b ENSGT01040000240855.a.a Common carp reference MODERN SPECIES 27 melk (ENSCCRG00000013347) pax5 (ENSCCRG00000013356) zcchc7 (ENSCCRG00000013384) ENSCCRG00000062343 ENSCCRG00000029421 primpol (ENSCCRG00000029416) ncapd3 (ENSCCRG00000024703) glrba (ENSCCRG00000080907) gria2a (ENSCCRG00000022287) tmem144a (ENSCCRG00000068594) med28 (ENSCCRG00000019706) npy1r (ENSCCRG00000019698) ENSCCRG00000009109 KLHL2 (ENSCCRG00000066175) #19 msmo1 (ENSCCRG00000026080) #21 cpe (ENSCCRG00000053277) #22 tll1 (ENSCCRG00000026462) #25 ENSCCRG00000070713 ENSCCRG00000022430 ENSCCRG00000074573 mettl14 (ENSCCRG00000005110) ENSCCRG00000015325 ENSCCRG00000081712 ENSCCRG00000053703 grhprb (ENSCCRG00000082325) ENSCCRG00000015175 fnip2 (ENSCCRG00000057646) tma16 (ENSCCRG00000078941) ENSCCRG00000035749 apela (ENSCCRG00000065720) tmem192 (ENSCCRG00000035750) #18 Golden-line barbel MODERN SPECIES 345 ENSSGRG00000020023 melk (ENSSGRG00000019749) pax5 (ENSSGRG00000019741) ENSSGRG00000019740 ENSSGRG00000019738 ENSSGRG00000019735 ncapd3 (ENSSGRG00000019478) ENSSGRG00000019461 glrba (ENSSGRG00000019271) gria2a (ENSSGRG00000015301) tmem144a (ENSSGRG00000015270) med28 (ENSSGRG00000015268) npy1r (ENSSGRG00000015264) ENSSGRG00000014383 msmo1 (ENSSGRG00000014374) #21 cpe (ENSSGRG00000014063) #22 ENSSGRG00000014057 #25 tll1 (ENSSGRG00000010781) #25 spock3 (ENSSGRG00000010717) #26 ugt8 (ENSSGRG00000010714) ENSSGRG00000009980 ENSSGRG00000000630 pih1d1 (ENSSGRG00000000449) ENSSGRG00000000446 tnnt1 (ENSSGRG00000000380) syt5a (ENSSGRG00000000272) fthl27 (ENSSGRG00000000189) ENSSGRG00000000145 ENSSGRG00000000123 kcnc3a (ENSSGRG00000053229) zgc:193811 (ENSSGRG00000053228) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 559 ENSGT00390000006192.dc.b ENSGT00940000160268.e ENSGT00940000156418.x.b ENSGT00940000156434.d #19 ENSGT00940000158012.y #21 ENSGT00940000157158.f #22 ENSGT00940000157225.a.b #25 ENSGT00940000157828.x #26 ENSGT00940000156545.b ENSGT00940000157168.i ENSGT00940000158131.h ENSGT00550000075003.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.b.b ENSGT00940000158826.g ENSGT00940000165381.a ENSGT00940000160246.d.a ENSGT00390000009391.a.e ENSGT00390000004179.b ENSGT00940000159346.a Goldfish MODERN SPECIES pax5 (ENSCARG00000019732) melk (ENSCARG00000019608) ENSCARG00000019557 kdm4c (ENSCARG00000019361) ENSCARG00000019179 chrna6 (ENSCARG00000019118) ENSCARG00000019086 uchl1 (ENSCARG00000019059) rbm47 (ENSCARG00000019027) lap3 (ENSCARG00000018666) clockb (ENSCARG00000017756) kitb (ENSCARG00000017200) ENSCARG00000016842 KLHL2 (ENSCARG00000016312) #19 msmo1 (ENSCARG00000016294) #21 cpe (ENSCARG00000016250) #22 tll1 (ENSCARG00000010130) #25 spock3 (ENSCARG00000009941) #26 ugt8 (ENSCARG00000009933) NDST4 (ENSCARG00000009922) ENSCARG00000009918 ENSCARG00000009914 ENSCARG00000009910 mettl14 (ENSCARG00000009904) ENSCARG00000009772 UBA6 (ENSCARG00000008177) grhprb (ENSCARG00000007449) ZBTB5 (ENSCARG00000007405) fnip2 (ENSCARG00000007276) ENSCARG00000007256 apela (ENSCARG00000007248) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 228 ENSGT00940000156344.a.a ENSGT00940000156950.b.b ENSGT00390000012574.k.a ENSGT00390000006192.cc ENSGT00940000160268.e ENSGT00940000156418.x.b ENSGT00940000156434.d #19 ENSGT00940000158012.y #21 ENSGT00940000157158.f #22 ENSGT00940000157225.a.b #25 ENSGT00940000157828.x #26 ENSGT00940000156545.b ENSGT00940000157168.i ENSGT00940000158131.h ENSGT00550000075003.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.b.b ENSGT00940000158826.g ENSGT00940000165381.a ENSGT00940000160246.d.a ENSGT00390000009391.a.e ENSGT00390000004179.b ENSGT00940000159346.a ENSGT01040000240855.a.b ENSGT00390000013749.a #18 Golden-line barbel MODERN SPECIES 142 ncapd3 (ENSSGRG00000052379) WDR19 (ENSSGRG00000052371) glrba (ENSSGRG00000052356) gria2a (ENSSGRG00000050826) tmem144a (ENSSGRG00000050757) ENSSGRG00000050756 npy1r (ENSSGRG00000050751) ENSSGRG00000050537 msmo1 (ENSSGRG00000050510) #21 cpe (ENSSGRG00000050483) #22 tll1 (ENSSGRG00000049076) #25 spock3 (ENSSGRG00000049036) #26 ugt8 (ENSSGRG00000049035) ENSSGRG00000048873 PRSS12 (ENSSGRG00000048868) mettl14 (ENSSGRG00000048867) mettl14 (ENSSGRG00000048866) ENSSGRG00000048753 UBA6 (ENSSGRG00000048710) ENSSGRG00000048708 grhprb (ENSSGRG00000048705) ZBTB5 (ENSSGRG00000048704) fnip2 (ENSSGRG00000048649) tma16 (ENSSGRG00000048640) ENSSGRG00000048638 Common carp reference MODERN SPECIES 22 melk (ENSCCRG00000070546) pax5 (ENSCCRG00000082823) ENSCCRG00000075970 ENSCCRG00000071504 ENSCCRG00000024692 ncapd3 (ENSCCRG00000024105) ENSCCRG00000024058 glrba (ENSCCRG00000024050) gria2a (ENSCCRG00000020037) tmem144a (ENSCCRG00000064637) med28 (ENSCCRG00000063275) npy1r (ENSCCRG00000082807) ENSCCRG00000040768 KLHL2 (ENSCCRG00000026066) #19 msmo1 (ENSCCRG00000061831) #21 cpe (ENSCCRG00000026118) #22 tll1 (ENSCCRG00000018355) #25 spock3 (ENSCCRG00000051714) #26 ugt8 (ENSCCRG00000050485) ENSCCRG00000073659 ENSCCRG00000058621 ENSCCRG00000015338 mettl14 (ENSCCRG00000015328) ENSCCRG00000015040 ENSCCRG00000009113 grhprb (ENSCCRG00000068184) ENSCCRG00000075470 fnip2 (ENSCCRG00000049977) tma16 (ENSCCRG00000028990) ENSCCRG00000060369 tmem192 (ENSCCRG00000029117) #18 Zebrafish MODERN SPECIES ENSDARG00000095593 zcchc7 (ENSDARG00000055443) ENSDARG00000055439 primpol (ENSDARG00000033273) ncapd3 (ENSDARG00000034773) WDR19 (ENSDARG00000037406) glrba (ENSDARG00000052782) gria2a (ENSDARG00000070173) tmem144a (ENSDARG00000037409) med28 (ENSDARG00000037410) npy1r (ENSDARG00000037411) ENSDARG00000061459 ENSDARG00000094202 KLHL2 (ENSDARG00000061786) #19 msmo1 (ENSDARG00000055876) #21 cpe (ENSDARG00000055874) #22 tll1 (ENSDARG00000037429) #25 spock3 (ENSDARG00000070266) #26 ENSDARG00000093816 ugt8 (ENSDARG00000037455) NDST4 (ENSDARG00000041776) PRSS12 (ENSDARG00000061830) mettl14 (ENSDARG00000070278) ENSDARG00000099995 UBA6 (ENSDARG00000080019) grhprb (ENSDARG00000019986) fnip2 (ENSDARG00000077648) tma16 (ENSDARG00000008068) ENSDARG00000037487 apela (ENSDARG00000094729) tmem192 (ENSDARG00000037484) #18 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 225 ENSGT00940000159346 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000159346 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT01060000249984 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01100000266717 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT01060000249984 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT01060000249984 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 518 ENSHCOG00000006356 tmem192 (ENSHCOG00000006369) #18 ENSHCOG00000006410 uchl1 (ENSHCOG00000006458) anxa5b (ENSHCOG00000006478) ENSHCOG00000006492 fgfbp2b (ENSHCOG00000006502) prom1b (ENSHCOG00000006543) ENSHCOG00000006561 tapt1b (ENSHCOG00000006584) clrn2 (ENSHCOG00000006597) lap3 (ENSHCOG00000006617) med28 (ENSHCOG00000006630) KLHL2 (ENSHCOG00000006655) #19 msmo1 (ENSHCOG00000006669) #21 cpe (ENSHCOG00000006691) #22 sfrp2 (ENSHCOG00000006708) ENSHCOG00000006716 ENSHCOG00000006735 ENSHCOG00000006748 fgg (ENSHCOG00000006860) lrata (ENSHCOG00000006886) ENSHCOG00000006896 NPY2R (ENSHCOG00000006933) pdlim3a (ENSHCOG00000006953) SORBS2 (ENSHCOG00000007030) ENSHCOG00000007054 cyp4v2a (ENSHCOG00000007076) mtnr1aa (ENSHCOG00000007083) fat1a (ENSHCOG00000000214) ENSHCOG00000007138 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT01060000249984 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00940000168756 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000165274.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES ENSKMAG00000004884 ENSKMAG00000004898 tmem192 (ENSKMAG00000004911) #18 ENSKMAG00000004928 uchl1 (ENSKMAG00000004964) anxa5b (ENSKMAG00000005000) ENSKMAG00000005039 fgfbp2b (ENSKMAG00000005045) prom1b (ENSKMAG00000005076) tapt1b (ENSKMAG00000005225) clrn2 (ENSKMAG00000005277) lap3 (ENSKMAG00000005297) med28 (ENSKMAG00000005345) KLHL2 (ENSKMAG00000005376) #19 msmo1 (ENSKMAG00000005432) #21 cpe (ENSKMAG00000005476) #22 tll1 (ENSKMAG00000005528) #25 STOX2 (ENSKMAG00000005604) casp3a (ENSKMAG00000005649) osbp (ENSKMAG00000005675) pcm1 (ENSKMAG00000005715) asah1b (ENSKMAG00000005807) ENSKMAG00000005830 frg1 (ENSKMAG00000005841) fat1a (ENSKMAG00000005927) mtnr1aa (ENSKMAG00000006178) ENSKMAG00000006207 SORBS2 (ENSKMAG00000006336) pdlim3a (ENSKMAG00000006433) NPY2R (ENSKMAG00000006447) ENSKMAG00000006461 Turquoise killifish MODERN SPECIES 784 msmo1 (ENSNFUG00015013072) #21 cpe (ENSNFUG00015013079) #22 ENSNFUG00015013136 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a.f ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Poecilia ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a.f ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a.f ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Amazon molly MODERN SPECIES 284 ENSPFOG00000009574 tmem192 (ENSPFOG00000009568) #18 limch1a (ENSPFOG00000009374) uchl1 (ENSPFOG00000009277) anxa5b (ENSPFOG00000009133) ENSPFOG00000022319 ENSPFOG00000009116 fgfbp2b (ENSPFOG00000019884) prom1b (ENSPFOG00000008695) tapt1b (ENSPFOG00000008530) clrn2 (ENSPFOG00000008501) lap3 (ENSPFOG00000008375) med28 (ENSPFOG00000008370) KLHL2 (ENSPFOG00000008021) #19 msmo1 (ENSPFOG00000007964) #21 cpe (ENSPFOG00000007798) #22 tll1 (ENSPFOG00000007523) #25 STOX2 (ENSPFOG00000007478) casp3a (ENSPFOG00000007411) osbp (ENSPFOG00000007407) SART1 (ENSPFOG00000019883) pcm1 (ENSPFOG00000007075) asah1b (ENSPFOG00000006888) frg1 (ENSPFOG00000006721) fat1a (ENSPFOG00000006025) mtnr1aa (ENSPFOG00000023633) ENSPFOG00000021844 cyp4v2a (ENSPFOG00000005945) ENSPFOG00000005883 SORBS2 (ENSPFOG00000005667) pdlim3a (ENSPFOG00000005597) Sailfin molly MODERN SPECIES 1644 uchl1 (ENSPLAG00000007215) anxa5b (ENSPLAG00000007234) ENSPLAG00000007250 fgfbp2b (ENSPLAG00000007275) prom1b (ENSPLAG00000007609) tapt1b (ENSPLAG00000007629) clrn2 (ENSPLAG00000007643) lap3 (ENSPLAG00000007692) med28 (ENSPLAG00000007717) KLHL2 (ENSPLAG00000000164) #19 msmo1 (ENSPLAG00000007790) #21 cpe (ENSPLAG00000007825) #22 tll1 (ENSPLAG00000007869) #25 STOX2 (ENSPLAG00000007893) casp3a (ENSPLAG00000007909) Guppy MODERN SPECIES 439 tmem192 (ENSPREG00000000120) #18 limch1a (ENSPREG00000000119) uchl1 (ENSPREG00000000118) anxa5b (ENSPREG00000000117) ENSPREG00000000116 ENSPREG00000000115 ENSPREG00000000114 fgfbp2b (ENSPREG00000000113) prom1b (ENSPREG00000000112) tapt1b (ENSPREG00000000111) clrn2 (ENSPREG00000000110) lap3 (ENSPREG00000000109) med28 (ENSPREG00000000108) KLHL2 (ENSPREG00000000107) #19 msmo1 (ENSPREG00000000106) #21 cpe (ENSPREG00000000105) #22 tll1 (ENSPREG00000000104) #25 STOX2 (ENSPREG00000000103) casp3a (ENSPREG00000000102) osbp (ENSPREG00000000101) SART1 (ENSPREG00000000100) pcm1 (ENSPREG00000000099) asah1b (ENSPREG00000000098) frg1 (ENSPREG00000000097) fat1a (ENSPREG00000000096) mtnr1aa (ENSPREG00000000095) ENSPREG00000000094 ENSPREG00000000093 cyp4v2a (ENSPREG00000000092) ENSPREG00000000091 SORBS2 (ENSPREG00000000090) Platyfish MODERN SPECIES 19 ENSXMAG00000028953 ENSXMAG00000025494 tmem192 (ENSXMAG00000029736) #18 limch1a (ENSXMAG00000008036) uchl1 (ENSXMAG00000008035) anxa5b (ENSXMAG00000008002) ENSXMAG00000022552 ENSXMAG00000025458 prom1b (ENSXMAG00000007940) tapt1b (ENSXMAG00000007925) clrn2 (ENSXMAG00000020860) lap3 (ENSXMAG00000007910) med28 (ENSXMAG00000023776) KLHL2 (ENSXMAG00000007874) #19 msmo1 (ENSXMAG00000007869) #21 cpe (ENSXMAG00000007857) #22 tll1 (ENSXMAG00000007829) #25 STOX2 (ENSXMAG00000013946) casp3a (ENSXMAG00000013953) osbp (ENSXMAG00000007816) pcm1 (ENSXMAG00000007796) asah1b (ENSXMAG00000023084) frg1 (ENSXMAG00000007751) ENSXMAG00000024747 fat1a (ENSXMAG00000018793) mtnr1aa (ENSXMAG00000021449) cyp4v2a (ENSXMAG00000018848) ENSXMAG00000018871 SORBS2 (ENSXMAG00000018882) pdlim3a (ENSXMAG00000018913) NPY2R (ENSXMAG00000018941) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 Mummichog MODERN SPECIES 301 ENSFHEG00000009780 ENSFHEG00000009787 #18 ENSFHEG00000009805 uchl1 (ENSFHEG00000009823) anxa5b (ENSFHEG00000009904) ENSFHEG00000009918 ENSFHEG00000009935 fgfbp2b (ENSFHEG00000009948) prom1b (ENSFHEG00000009984) tapt1b (ENSFHEG00000009997) clrn2 (ENSFHEG00000010000) med28 (ENSFHEG00000010008) lap3 (ENSFHEG00000010050) KLHL2 (ENSFHEG00000010114) #19 msmo1 (ENSFHEG00000010123) #21 cpe (ENSFHEG00000010153) #22 tll1 (ENSFHEG00000010196) #25 STOX2 (ENSFHEG00000010231) casp3a (ENSFHEG00000010268) osbp (ENSFHEG00000010325) SART1 (ENSFHEG00000010334) pcm1 (ENSFHEG00000010512) asah1b (ENSFHEG00000010528) frg1 (ENSFHEG00000010540) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 408 limch1a (ENSCVAG00000009234) uchl1 (ENSCVAG00000009250) anxa5b (ENSCVAG00000009328) ENSCVAG00000000979 ENSCVAG00000009341 ENSCVAG00000000269 ENSCVAG00000009353 fgfbp2b (ENSCVAG00000009367) prom1b (ENSCVAG00000009464) tapt1b (ENSCVAG00000009494) clrn2 (ENSCVAG00000009500) lap3 (ENSCVAG00000009536) med28 (ENSCVAG00000009554) KLHL2 (ENSCVAG00000009584) #19 msmo1 (ENSCVAG00000009600) #21 cpe (ENSCVAG00000009637) #22 tll1 (ENSCVAG00000009728) #25 STOX2 (ENSCVAG00000009772) casp3a (ENSCVAG00000009785) osbp (ENSCVAG00000009794) SART1 (ENSCVAG00000009800) pcm1 (ENSCVAG00000009907) asah1b (ENSCVAG00000009950) frg1 (ENSCVAG00000009985) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Indian medaka MODERN SPECIES 35 tmem192 (ENSOMEG00000002958) #18 limch1a (ENSOMEG00000002927) uchl1 (ENSOMEG00000002850) anxa5b (ENSOMEG00000002839) ENSOMEG00000002831 abcg2d (ENSOMEG00000002823) pkd2 (ENSOMEG00000002803) fgfbp2b (ENSOMEG00000002783) prom1b (ENSOMEG00000002751) tapt1b (ENSOMEG00000002683) clrn2 (ENSOMEG00000002664) lap3 (ENSOMEG00000002652) med28 (ENSOMEG00000002641) KLHL2 (ENSOMEG00000000049) #19 msmo1 (ENSOMEG00000002617) #21 cpe (ENSOMEG00000002603) #22 tll1 (ENSOMEG00000002586) #25 STOX2 (ENSOMEG00000002551) casp3a (ENSOMEG00000002539) osbp (ENSOMEG00000002519) SART1 (ENSOMEG00000002508) ENSOMEG00000002506 ENSOMEG00000002491 asah1b (ENSOMEG00000002480) frg1 (ENSOMEG00000002468) fat1a (ENSOMEG00000002416) mtnr1aa (ENSOMEG00000002302) cyp4v2a (ENSOMEG00000002295) ENSOMEG00000002271 SORBS2 (ENSOMEG00000002245) pdlim3a (ENSOMEG00000000035) Javanese ricefish MODERN SPECIES ENSOJAG00000019534 tmem192 (ENSOJAG00000019520) #18 limch1a (ENSOJAG00000019447) uchl1 (ENSOJAG00000019360) anxa5b (ENSOJAG00000019100) ENSOJAG00000019069 ENSOJAG00000019054 fgfbp2b (ENSOJAG00000019011) prom1b (ENSOJAG00000018539) tapt1b (ENSOJAG00000018023) clrn2 (ENSOJAG00000017978) lap3 (ENSOJAG00000017676) med28 (ENSOJAG00000017634) KLHL2 (ENSOJAG00000017292) #19 msmo1 (ENSOJAG00000017202) #21 cpe (ENSOJAG00000017101) #22 tll1 (ENSOJAG00000012985) #25 STOX2 (ENSOJAG00000012577) casp3a (ENSOJAG00000012488) osbp (ENSOJAG00000012096) SART1 (ENSOJAG00000012070) pcm1 (ENSOJAG00000012043) asah1b (ENSOJAG00000011445) frg1 (ENSOJAG00000011389) fat1a (ENSOJAG00000010718) mtnr1aa (ENSOJAG00000010642) cyp4v2a (ENSOJAG00000010346) ENSOJAG00000009805 SORBS2 (ENSOJAG00000009723) pdlim3a (ENSOJAG00000009666) NPY2R (ENSOJAG00000009659) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00950000182996.b.b.c.b.h.a.e ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES ENSORLG00000023572 ENSORLG00000027261 ENSORLG00000030393 ENSORLG00000028432 ENSORLG00000024870 ENSORLG00000022954 ENSORLG00000007860 fgfbp2b (ENSORLG00000007870) prom1b (ENSORLG00000007886) tapt1b (ENSORLG00000007907) clrn2 (ENSORLG00000007911) lap3 (ENSORLG00000007934) med28 (ENSORLG00000007946) KLHL2 (ENSORLG00000007966) #19 msmo1 (ENSORLG00000007977) #21 cpe (ENSORLG00000007988) #22 tll1 (ENSORLG00000008008) #25 STOX2 (ENSORLG00000008020) casp3a (ENSORLG00000008049) osbp (ENSORLG00000008061) SART1 (ENSORLG00000028400) pcm1 (ENSORLG00000008079) asah1b (ENSORLG00000008089) frg1 (ENSORLG00000008106) ENSORLG00000025004 ENSORLG00000007851 ENSORLG00000029093 fat1a (ENSORLG00000008138) mtnr1aa (ENSORLG00000008141) cyp4v2a (ENSORLG00000008162) ENSORLG00000008184 Chinese medaka MODERN SPECIES 565 tmem192 (ENSOSIG00000023750) #18 ENSOSIG00000023752 ENSOSIG00000023753 uchl1 (ENSOSIG00000023756) anxa5b (ENSOSIG00000023766) ENSOSIG00000023772 ENSOSIG00000023773 fgfbp2b (ENSOSIG00000023774) prom1b (ENSOSIG00000023796) tapt1b (ENSOSIG00000023816) clrn2 (ENSOSIG00000023820) lap3 (ENSOSIG00000023824) med28 (ENSOSIG00000023826) KLHL2 (ENSOSIG00000023828) #19 msmo1 (ENSOSIG00000023830) #21 cpe (ENSOSIG00000003760) #22 tll1 (ENSOSIG00000004223) #25 STOX2 (ENSOSIG00000017522) casp3a (ENSOSIG00000017527) osbp (ENSOSIG00000017554) SART1 (ENSOSIG00000017594) pcm1 (ENSOSIG00000017614) asah1b (ENSOSIG00000017631) frg1 (ENSOSIG00000017918) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Nile tilapia MODERN SPECIES 18 ENSONIG00000039891 ENSONIG00000038675 tmem192 (ENSONIG00000039672) #18 limch1a (ENSONIG00000010070) uchl1 (ENSONIG00000033853) anxa10 (ENSONIG00000010080) ENSONIG00000038368 fgfbp2b (ENSONIG00000032020) prom1b (ENSONIG00000010087) tapt1b (ENSONIG00000010102) clrn2 (ENSONIG00000035045) lap3 (ENSONIG00000010107) med28 (ENSONIG00000041780) KLHL2 (ENSONIG00000010113) #19 msmo1 (ENSONIG00000010120) #21 cpe (ENSONIG00000010121) #22 tll1 (ENSONIG00000010127) #25 STOX2 (ENSONIG00000010140) casp3a (ENSONIG00000034753) osbp (ENSONIG00000010146) SART1 (ENSONIG00000021283) pcm1 (ENSONIG00000010148) asah1b (ENSONIG00000010157) frg1 (ENSONIG00000010162) STX12 (ENSONIG00000027156) fat1a (ENSONIG00000010165) mtnr1aa (ENSONIG00000010168) cyp4v2a (ENSONIG00000010170) ENSONIG00000010172 SORBS2 (ENSONIG00000033939) pdlim3 (ENSONIG00000010180) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00940000168756 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Zebra mbuna MODERN SPECIES 1109 ENSMZEG00005008367 ENSMZEG00005008355 ENSMZEG00005008341 tmem192 (ENSMZEG00005008328) #18 limch1a (ENSMZEG00005008279) uchl1 (ENSMZEG00005008246) anxa5b (ENSMZEG00005008212) ENSMZEG00005008196 prom1b (ENSMZEG00005008121) tapt1b (ENSMZEG00005008097) clrn2 (ENSMZEG00005008084) lap3 (ENSMZEG00005008066) med28 (ENSMZEG00005008056) KLHL2 (ENSMZEG00005008004) #19 msmo1 (ENSMZEG00005007983) #21 cpe (ENSMZEG00005007969) #22 tll1 (ENSMZEG00005007938) #25 STOX2 (ENSMZEG00005007911) casp3a (ENSMZEG00005007902) osbp (ENSMZEG00005007863) ENSMZEG00005007853 pcm1 (ENSMZEG00005007663) asah1b (ENSMZEG00005007597) ENSMZEG00005007584 frg1 (ENSMZEG00005007549) fat1a (ENSMZEG00005007352) mtnr1aa (ENSMZEG00005007308) cyp4v2a (ENSMZEG00005007276) ENSMZEG00005007264 SORBS2 (ENSMZEG00005007134) pdlim3a (ENSMZEG00005007088) Eastern happy MODERN SPECIES 18 ENSACLG00000026192 ENSACLG00000026199 ENSACLG00000026208 tmem192 (ENSACLG00000026216) #18 limch1a (ENSACLG00000026233) uchl1 (ENSACLG00000026376) anxa5b (ENSACLG00000026414) ENSACLG00000026451 prom1b (ENSACLG00000026470) tapt1b (ENSACLG00000026516) clrn2 (ENSACLG00000026523) lap3 (ENSACLG00000026528) med28 (ENSACLG00000026622) KLHL2 (ENSACLG00000026639) #19 msmo1 (ENSACLG00000026690) #21 cpe (ENSACLG00000026708) #22 tll1 (ENSACLG00000026748) #25 STOX2 (ENSACLG00000026829) casp3a (ENSACLG00000026855) osbp (ENSACLG00000026872) pcm1 (ENSACLG00000026935) asah1b (ENSACLG00000027041) frg1 (ENSACLG00000027065) fat1a (ENSACLG00000027090) mtnr1aa (ENSACLG00000027242) ENSACLG00000027244 ENSACLG00000027256 cyp4v2a (ENSACLG00000027261) ENSACLG00000027275 SORBS2 (ENSACLG00000027303) pdlim3a (ENSACLG00000027366) P. nyererei MODERN SPECIES 317 ENSPNYG00000014009 tmem192 (ENSPNYG00000014018) #18 ENSPNYG00000014042 limch1a (ENSPNYG00000014097) uchl1 (ENSPNYG00000014227) anxa5b (ENSPNYG00000014259) ENSPNYG00000014290 fgfbp2b (ENSPNYG00000014302) prom1b (ENSPNYG00000014332) tapt1b (ENSPNYG00000014371) clrn2 (ENSPNYG00000014396) lap3 (ENSPNYG00000014412) med28 (ENSPNYG00000014449) KLHL2 (ENSPNYG00000014480) #19 msmo1 (ENSPNYG00000014543) #21 cpe (ENSPNYG00000014567) #22 tll1 (ENSPNYG00000014590) #25 STOX2 (ENSPNYG00000014640) casp3a (ENSPNYG00000014661) osbp (ENSPNYG00000014702) SART1 (ENSPNYG00000014765) pcm1 (ENSPNYG00000014877) asah1b (ENSPNYG00000015179) frg1 (ENSPNYG00000015209) ENSPNYG00000015231 fat1a (ENSPNYG00000015276) mtnr1aa (ENSPNYG00000015382) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 478 ENSHBUG00000011856 ENSHBUG00000011828 ENSHBUG00000000327 tmem192 (ENSHBUG00000011815) #18 limch1a (ENSHBUG00000011789) uchl1 (ENSHBUG00000011728) anxa5b (ENSHBUG00000011686) ENSHBUG00000011644 prom1b (ENSHBUG00000011630) tapt1b (ENSHBUG00000001092) clrn2 (ENSHBUG00000011426) lap3 (ENSHBUG00000011413) med28 (ENSHBUG00000011367) KLHL2 (ENSHBUG00000011343) #19 msmo1 (ENSHBUG00000011271) #21 cpe (ENSHBUG00000011252) #22 tll1 (ENSHBUG00000011208) #25 STOX2 (ENSHBUG00000011117) casp3a (ENSHBUG00000011049) osbp (ENSHBUG00000011008) pcm1 (ENSHBUG00000010831) asah1b (ENSHBUG00000010739) frg1 (ENSHBUG00000010667) fat1a (ENSHBUG00000010584) mtnr1aa (ENSHBUG00000010485) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 332 FBXW7 (ENSNBRG00000005988) tma16 (ENSNBRG00000005999) ENSNBRG00000006033 ENSNBRG00000006056 tmem192 (ENSNBRG00000006066) #18 limch1a (ENSNBRG00000006080) uchl1 (ENSNBRG00000006104) anxa5b (ENSNBRG00000006129) ENSNBRG00000006169 prom1b (ENSNBRG00000006199) tapt1b (ENSNBRG00000006254) lap3 (ENSNBRG00000006335) med28 (ENSNBRG00000006394) KLHL2 (ENSNBRG00000006410) #19 msmo1 (ENSNBRG00000006453) #21 cpe (ENSNBRG00000006477) #22 tll1 (ENSNBRG00000006534) #25 STOX2 (ENSNBRG00000006613) casp3a (ENSNBRG00000006645) osbp (ENSNBRG00000006657) pcm1 (ENSNBRG00000006734) asah1b (ENSNBRG00000006774) frg1 (ENSNBRG00000006806) fat1a (ENSNBRG00000006827) mtnr1aa (ENSNBRG00000006898) cyp4v2a (ENSNBRG00000006904) ENSNBRG00000006937 SORBS2 (ENSNBRG00000006945) pdlim3a (ENSNBRG00000007015) NPY2R (ENSNBRG00000007033) ENSNBRG00000007046 Midas cichlid MODERN SPECIES 178 anxa5b (ENSACIG00000004756) ENSACIG00000004766 fgfbp2b (ENSACIG00000004776) prom1b (ENSACIG00000004782) tapt1b (ENSACIG00000005021) clrn2 (ENSACIG00000005053) lap3 (ENSACIG00000005066) med28 (ENSACIG00000005097) KLHL2 (ENSACIG00000005114) #19 msmo1 (ENSACIG00000005151) #21 cpe (ENSACIG00000005194) #22 tll1 (ENSACIG00000005219) #25 STOX2 (ENSACIG00000005301) casp3a (ENSACIG00000005319) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00940000168756 ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00940000168756 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b.c ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00940000168756 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b.c ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Orange clownfish MODERN SPECIES 17 ENSAPEG00000004117 ENSAPEG00000003999 ENSAPEG00000003786 ENSAPEG00000003765 ENSAPEG00000003660 ENSAPEG00000003498 ENSAPEG00000003412 ENSAPEG00000003322 ENSAPEG00000003300 ENSAPEG00000003281 ENSAPEG00000003232 lap3 (ENSAPEG00000003186) med28 (ENSAPEG00000003158) KLHL2 (ENSAPEG00000003104) #19 msmo1 (ENSAPEG00000003085) #21 cpe (ENSAPEG00000003027) #22 tll1 (ENSAPEG00000002950) #25 STOX2 (ENSAPEG00000002895) casp3a (ENSAPEG00000002852) osbp (ENSAPEG00000002726) sart1 (ENSAPEG00000002705) pcm1 (ENSAPEG00000002577) asah1b (ENSAPEG00000002506) frg1 (ENSAPEG00000002486) fat1a (ENSAPEG00000002402) mtnr1aa (ENSAPEG00000002388) H2BC13 (ENSAPEG00000002322) cyp4v2a (ENSAPEG00000002285) ENSAPEG00000002275 SORBS2 (ENSAPEG00000002202) pdlim3a (ENSAPEG00000002161) Clown anemonefish MODERN SPECIES 1904 cpe (ENSAOCG00000002901) #22 tll1 (ENSAOCG00000002887) #25 STOX2 (ENSAOCG00000000047) casp3a (ENSAOCG00000002879) osbp (ENSAOCG00000002875) sart1 (ENSAOCG00000002873) pcm1 (ENSAOCG00000002236) asah1b (ENSAOCG00000024267) frg1 (ENSAOCG00000024240) Spiny chromis MODERN SPECIES 1999 clrn2 (ENSAPOG00000014561) lap3 (ENSAPOG00000014638) med28 (ENSAPOG00000014666) KLHL2 (ENSAPOG00000014745) #19 msmo1 (ENSAPOG00000014767) #21 cpe (ENSAPOG00000014813) #22 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1084 ENSSPAG00000004847 ENSSPAG00000004842 ENSSPAG00000004820 #18 limch1a (ENSSPAG00000004655) uchl1 (ENSSPAG00000004629) anxa5b (ENSSPAG00000004592) ENSSPAG00000004581 fgfbp2b (ENSSPAG00000004574) prom1b (ENSSPAG00000004533) tapt1b (ENSSPAG00000004506) clrn2 (ENSSPAG00000004499) lap3 (ENSSPAG00000004459) med28 (ENSSPAG00000004444) KLHL2 (ENSSPAG00000004371) #19 msmo1 (ENSSPAG00000004349) #21 cpe (ENSSPAG00000004325) #22 tll1 (ENSSPAG00000004282) #25 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT01060000249984 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT01060000249984 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00940000168756 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00940000168756 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Siamese fighting fish MODERN SPECIES tma16 (ENSBSLG00000016753) ENSBSLG00000016695 ENSBSLG00000016617 tmem192 (ENSBSLG00000016583) #18 limch1a (ENSBSLG00000016334) anxa5b (ENSBSLG00000016091) ENSBSLG00000016073 fgfbp2b (ENSBSLG00000016071) prom1b (ENSBSLG00000015309) tapt1b (ENSBSLG00000014625) clrn2 (ENSBSLG00000014617) lap3 (ENSBSLG00000014556) med28 (ENSBSLG00000014542) KLHL2 (ENSBSLG00000014440) #19 msmo1 (ENSBSLG00000014426) #21 cpe (ENSBSLG00000014212) #22 tll1 (ENSBSLG00000009259) #25 STOX2 (ENSBSLG00000008701) casp3a (ENSBSLG00000008672) osbp (ENSBSLG00000008418) sart1 (ENSBSLG00000008388) pcm1 (ENSBSLG00000008147) asah1b (ENSBSLG00000007859) frg1 (ENSBSLG00000007607) fat1a (ENSBSLG00000007171) pou4f2 (ENSBSLG00000007128) ednraa (ENSBSLG00000007112) tmem184c (ENSBSLG00000006941) prmt9 (ENSBSLG00000006682) arhgap10 (ENSBSLG00000006233) nr3c2 (ENSBSLG00000006223) Climbing perch MODERN SPECIES ENSATEG00000011711 ENSATEG00000011702 tmem192 (ENSATEG00000011697) #18 ENSATEG00000011637 uchl1 (ENSATEG00000011596) anxa5b (ENSATEG00000011309) ENSATEG00000028462 fgfbp2b (ENSATEG00000011279) prom1b (ENSATEG00000011009) tapt1b (ENSATEG00000010981) CLRN2 (ENSATEG00000010965) ENSATEG00000010883 MED28 (ENSATEG00000010872) KLHL2 (ENSATEG00000010806) #19 msmo1 (ENSATEG00000010790) #21 cpe (ENSATEG00000010745) #22 tll1 (ENSATEG00000010655) #25 ENSATEG00000010636 ENSATEG00000010624 ENSATEG00000010615 ENSATEG00000010608 pcm1 (ENSATEG00000010492) asah1b (ENSATEG00000010450) frg1 (ENSATEG00000010414) ENSATEG00000029112 fat1a (ENSATEG00000010280) mtnr1aa (ENSATEG00000010218) cyp4v2a (ENSATEG00000010169) ENSATEG00000010153 ENSATEG00000010105 pdlim3a (ENSATEG00000010060) Zig-zag eel MODERN SPECIES ENSMAMG00000013124 ENSMAMG00000013106 tmem192 (ENSMAMG00000013082) #18 ENSMAMG00000013059 uchl1 (ENSMAMG00000013032) anxa5b (ENSMAMG00000012987) FGFBP1 (ENSMAMG00000027135) fgfbp2b (ENSMAMG00000027078) prom1b (ENSMAMG00000012934) tapt1b (ENSMAMG00000012923) CLRN2 (ENSMAMG00000012910) ENSMAMG00000012875 MED28 (ENSMAMG00000012833) KLHL2 (ENSMAMG00000012771) #19 msmo1 (ENSMAMG00000012760) #21 cpe (ENSMAMG00000012731) #22 tll1 (ENSMAMG00000012656) #25 ENSMAMG00000012578 ENSMAMG00000012601 ENSMAMG00000012567 ENSMAMG00000012504 ENSMAMG00000012486 pcm1 (ENSMAMG00000012436) asah1b (ENSMAMG00000012415) frg1 (ENSMAMG00000012406) fat1a (ENSMAMG00000012299) mtnr1aa (ENSMAMG00000009883) cyp4v2a (ENSMAMG00000009859) ENSMAMG00000009838 ENSMAMG00000009713 pdlim3a (ENSMAMG00000009673) Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT01060000249984 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159346 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 Turbot MODERN SPECIES 20 tma16 (ENSSMAG00000035445) ENSSMAG00000003502 ENSSMAG00000003487 ENSSMAG00000029681 tmem192 (ENSSMAG00000022705) #18 ENSSMAG00000003317 uchl1 (ENSSMAG00000003244) anxa5b (ENSSMAG00000003229) fgfbp2b (ENSSMAG00000003194) prom1b (ENSSMAG00000003051) tapt1b (ENSSMAG00000003023) ENSSMAG00000003014 ENSSMAG00000002985 KLHL2 (ENSSMAG00000002920) #19 MSMO1 (ENSSMAG00000002893) #21 cpe (ENSSMAG00000002871) #22 ENSSMAG00000002796 ENSSMAG00000034641 ENSSMAG00000029785 socs1b (ENSSMAG00000002682) ENSSMAG00000002664 prkcba (ENSSMAG00000002587) ENSSMAG00000014092 ENSSMAG00000028966 ENSSMAG00000002551 ENSSMAG00000002510 ENSSMAG00000030751 ENSSMAG00000002455 ENSSMAG00000002380 ENSSMAG00000026040 TLR2 (ENSSMAG00000002367) Tongue sole MODERN SPECIES 19 rps15a (ENSCSEG00000011624) ENSCSEG00000011634 xylt1 (ENSCSEG00000011638) hadh (ENSCSEG00000011658) cyp2u1 (ENSCSEG00000011794) mcrip2 (ENSCSEG00000011797) ENSCSEG00000011802 CREBBP (ENSCSEG00000011814) ADCY9 (ENSCSEG00000011858) SRL (ENSCSEG00000011866) TFAP4 (ENSCSEG00000011880) lap3 (ENSCSEG00000011887) med28 (ENSCSEG00000011893) KLHL2 (ENSCSEG00000011900) #19 msmo1 (ENSCSEG00000011912) #21 cpe (ENSCSEG00000011918) #22 gde1 (ENSCSEG00000011926) tmem186 (ENSCSEG00000011947) cxcl12b (ENSCSEG00000011953) xpnpep1 (ENSCSEG00000011960) ENSCSEG00000011989 add3a (ENSCSEG00000012009) mxi1 (ENSCSEG00000012044) dusp5 (ENSCSEG00000012054) smc3 (ENSCSEG00000012062) ENSCSEG00000012107 pdcd4b (ENSCSEG00000012126) bbip1 (ENSCSEG00000012152) shoc2 (ENSCSEG00000012163) adra2a (ENSCSEG00000012185) ENSCSEG00000012191 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT01060000249984 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 130 ENSLCAG00010018338 ENSLCAG00010018336 tmem192 (ENSLCAG00010018335) #18 limch1a (ENSLCAG00010018324) uchl1 (ENSLCAG00010018318) anxa5b (ENSLCAG00010018188) ENSLCAG00010018174 fgfbp2b (ENSLCAG00010018170) prom1b (ENSLCAG00010018151) tapt1b (ENSLCAG00010018143) clrn2 (ENSLCAG00010018138) lap3 (ENSLCAG00010018095) med28 (ENSLCAG00010018076) KLHL2 (ENSLCAG00010017950) #19 msmo1 (ENSLCAG00010017935) #21 cpe (ENSLCAG00010017933) #22 tll1 (ENSLCAG00010017777) #25 STOX2 (ENSLCAG00010017740) casp3a (ENSLCAG00010017729) osbp (ENSLCAG00010017717) SART1 (ENSLCAG00010017711) asah1b (ENSLCAG00010017689) frg1 (ENSLCAG00010017684) Barramundi perch MODERN SPECIES 1329 cpe (ENSLCAG00010027435) #22 Seriola ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT01060000249984 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 Greater amberjack MODERN SPECIES 13 ENSSDUG00000019709 ENSSDUG00000019704 tmem192 (ENSSDUG00000019698) #18 limch1a (ENSSDUG00000019636) uchl1 (ENSSDUG00000019591) anxa5b (ENSSDUG00000019555) ENSSDUG00000019537 fgfbp2b (ENSSDUG00000019530) prom1b (ENSSDUG00000019440) tapt1b (ENSSDUG00000019416) clrn2 (ENSSDUG00000019399) lap3 (ENSSDUG00000019362) med28 (ENSSDUG00000019345) KLHL2 (ENSSDUG00000019292) #19 msmo1 (ENSSDUG00000019270) #21 cpe (ENSSDUG00000019257) #22 tll1 (ENSSDUG00000019232) #25 STOX2 (ENSSDUG00000019182) casp3a (ENSSDUG00000019169) osbp (ENSSDUG00000019142) SART1 (ENSSDUG00000019131) pcm1 (ENSSDUG00000018960) asah1b (ENSSDUG00000018904) frg1 (ENSSDUG00000018886) fat1a (ENSSDUG00000018821) mtnr1aa (ENSSDUG00000018799) cyp4v2a (ENSSDUG00000018773) ENSSDUG00000018554 ENSSDUG00000018517 SORBS2 (ENSSDUG00000018399) pdlim3a (ENSSDUG00000018366) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2820 ENSSLDG00000005986 ENSSLDG00000005965 tmem192 (ENSSLDG00000005905) #18 limch1a (ENSSLDG00000005679) uchl1 (ENSSLDG00000005597) anxa5b (ENSSLDG00000005536) ENSSLDG00000005514 fgfbp2b (ENSSLDG00000005507) prom1b (ENSSLDG00000005362) tapt1b (ENSSLDG00000005311) clrn2 (ENSSLDG00000005303) lap3 (ENSSLDG00000005254) med28 (ENSSLDG00000005230) KLHL2 (ENSSLDG00000005192) #19 msmo1 (ENSSLDG00000005170) #21 cpe (ENSSLDG00000005126) #22 tll1 (ENSSLDG00000005070) #25 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Large yellow croaker MODERN SPECIES 481 ttc26 (ENSLCRG00005018878) ENSLCRG00005018872 SLC25A38 (ENSLCRG00005018870) ENSLCRG00005018868 ENSLCRG00005018867 ENSLCRG00005018865 ENSLCRG00005018864 ENSLCRG00005018863 ENSLCRG00005018862 ENSLCRG00005018860 ENSLCRG00005018858 ENSLCRG00005018674 med28 (ENSLCRG00005018669) KLHL2 (ENSLCRG00005018351) #19 msmo1 (ENSLCRG00005018343) #21 cpe (ENSLCRG00005018297) #22 tll1 (ENSLCRG00005018147) #25 STOX2 (ENSLCRG00005018142) casp3a (ENSLCRG00005018141) osbp (ENSLCRG00005018126) sart1 (ENSLCRG00005018125) pcm1 (ENSLCRG00005018124) asah1b (ENSLCRG00005017934) fat1a (ENSLCRG00005017762) mtnr1aa (ENSLCRG00005017735) cyp4v2a (ENSLCRG00005017729) tlr3 (ENSLCRG00005017721) SORBS2 (ENSLCRG00005017711) pdlim3a (ENSLCRG00005017703) NPY2R (ENSLCRG00005017700) ENSLCRG00005017699 European seabass MODERN SPECIES 20 ENSDLAG00005022223 ENSDLAG00005022228 ENSDLAG00005022233 ENSDLAG00005022244 uchl1 (ENSDLAG00005033732) anxa5b (ENSDLAG00005022304) ENSDLAG00005034875 fgfbp2b (ENSDLAG00005022547) prom1b (ENSDLAG00005022581) CLRN2 (ENSDLAG00005022960) TAPT1 (ENSDLAG00005022932) LAP3 (ENSDLAG00005022966) MED28 (ENSDLAG00005022993) KLHL2 (ENSDLAG00005023003) #19 msmo1 (ENSDLAG00005023171) #21 cpe (ENSDLAG00005033735) #22 tll1 (ENSDLAG00005023213) #25 ENSDLAG00005023517 ENSDLAG00005023521 ENSDLAG00005023547 ENSDLAG00005023685 pcm1 (ENSDLAG00005023691) asah1b (ENSDLAG00005023762) frg1 (ENSDLAG00005024168) ENSDLAG00005024178 fat1a (ENSDLAG00005024235) mtnr1aa (ENSDLAG00005024590) cyp4v2a (ENSDLAG00005024604) ENSDLAG00005024704 ENSDLAG00005024688 pdlim3a (ENSDLAG00005024741) Gilthead seabream MODERN SPECIES pdia2 (ENSSAUG00010020397) ENSSAUG00010020402 ENSSAUG00010020405 TLR2 (ENSSAUG00010020406) TMEM131L (ENSSAUG00010020407) mnd1 (ENSSAUG00010020408) trim2a (ENSSAUG00010020412) FHDC1 (ENSSAUG00010020672) arfip1 (ENSSAUG00010020674) FAM193A (ENSSAUG00010020692) ENSSAUG00010020728 sfrp2 (ENSSAUG00010020729) ENSSAUG00010020730 plrg1 (ENSSAUG00010020732) msmo1 (ENSSAUG00010020941) #21 cpe (ENSSAUG00010020944) #22 tll1 (ENSSAUG00010020995) #25 STOX2 (ENSSAUG00010024373) casp3a (ENSSAUG00010024374) osbp (ENSSAUG00010024375) sart1 (ENSSAUG00010024377) pcm1 (ENSSAUG00010024379) asah1b (ENSSAUG00010024421) frg1 (ENSSAUG00010024448) ENSSAUG00010024474 fat1a (ENSSAUG00010024502) mtnr1aa (ENSSAUG00010025513) cyp4v2a (ENSSAUG00010025520) ENSSAUG00010025539 SORBS2 (ENSSAUG00010025549) pdlim3a (ENSSAUG00010025558) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Channel bull blenny MODERN SPECIES ENSCGOG00000013682 ENSCGOG00000013685 tmem192 (ENSCGOG00000013686) #18 ENSCGOG00000013690 uchl1 (ENSCGOG00000013704) anxa5b (ENSCGOG00000013773) ENSCGOG00000015166 ENSCGOG00000015167 prom1b (ENSCGOG00000015176) tapt1b (ENSCGOG00000015406) clrn2 (ENSCGOG00000015735) lap3 (ENSCGOG00000015739) med28 (ENSCGOG00000015854) KLHL2 (ENSCGOG00000015878) #19 msmo1 (ENSCGOG00000016313) #21 cpe (ENSCGOG00000016322) #22 tll1 (ENSCGOG00000016391) #25 STOX2 (ENSCGOG00000016677) casp3a (ENSCGOG00000016678) osbp (ENSCGOG00000016693) SART1 (ENSCGOG00000016823) pcm1 (ENSCGOG00000016829) asah1b (ENSCGOG00000016936) frg1 (ENSCGOG00000017466) ENSCGOG00000017469 fat1a (ENSCGOG00000017507) mtnr1aa (ENSCGOG00000018850) cyp4v2a (ENSCGOG00000018854) ENSCGOG00000018894 SORBS2 (ENSCGOG00000018898) pdlim3a (ENSCGOG00000018918) Pike perch MODERN SPECIES 45 ENSSLUG00000013883 ENSSLUG00000013888 tmem192 (ENSSLUG00000013895) #18 limch1a (ENSSLUG00000013903) uchl1 (ENSSLUG00000013923) anxa5b (ENSSLUG00000013990) ENSSLUG00000015627 fgfbp2b (ENSSLUG00000015629) prom1b (ENSSLUG00000015699) tapt1b (ENSSLUG00000016488) clrn2 (ENSSLUG00000016535) lap3 (ENSSLUG00000016570) med28 (ENSSLUG00000001560) KLHL2 (ENSSLUG00000001785) #19 msmo1 (ENSSLUG00000002149) #21 cpe (ENSSLUG00000002168) #22 tll1 (ENSSLUG00000002292) #25 STOX2 (ENSSLUG00000003112) casp3a (ENSSLUG00000003135) osbp (ENSSLUG00000003307) SART1 (ENSSLUG00000004029) pcm1 (ENSSLUG00000004054) ENSSLUG00000004131 ENSSLUG00000004137 ENSSLUG00000004143 ENSSLUG00000004150 ENSSLUG00000004155 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Lumpfish MODERN SPECIES tmem192 (ENSCLMG00005011452) #18 ENSCLMG00005011453 ENSCLMG00005011454 ENSCLMG00005011455 uchl1 (ENSCLMG00005011456) anxa5b (ENSCLMG00005011471) ENSCLMG00005013243 fgfbp2b (ENSCLMG00005013245) prom1b (ENSCLMG00005013252) tapt1b (ENSCLMG00005013272) clrn2 (ENSCLMG00005014375) lap3 (ENSCLMG00005014377) med28 (ENSCLMG00005014390) KLHL2 (ENSCLMG00005014394) #19 msmo1 (ENSCLMG00005014439) #21 cpe (ENSCLMG00005014440) #22 tll1 (ENSCLMG00005014441) #25 STOX2 (ENSCLMG00005014446) casp3a (ENSCLMG00005014480) osbp (ENSCLMG00005014483) SART1 (ENSCLMG00005015392) pcm1 (ENSCLMG00005015394) asah1b (ENSCLMG00005015410) frg1 (ENSCLMG00005016552) fat1a (ENSCLMG00005016587) mtnr1aa (ENSCLMG00005018206) cyp4v2a (ENSCLMG00005018210) ENSCLMG00005018211 SORBS2 (ENSCLMG00005018217) pdlim3a (ENSCLMG00005018240) NPY2R (ENSCLMG00005018242) Stickleback MODERN SPECIES 4 dctpp1 (ENSGACG00000017141) ENSGACG00000017136 tma16 (ENSGACG00000017134) ENSGACG00000017133 tmem192 (ENSGACG00000017130) #18 ENSGACG00000017124 uchl1 (ENSGACG00000017099) anxa5b (ENSGACG00000017044) prom1b (ENSGACG00000017039) tapt1b (ENSGACG00000017035) clrn2 (ENSGACG00000017033) lap3 (ENSGACG00000016990) med28 (ENSGACG00000016989) KLHL2 (ENSGACG00000016987) #19 msmo1 (ENSGACG00000016984) #21 cpe (ENSGACG00000016968) #22 tll1 (ENSGACG00000016964) #25 STOX2 (ENSGACG00000016962) casp3a (ENSGACG00000016960) osbp (ENSGACG00000016955) SART1 (ENSGACG00000016951) pcm1 (ENSGACG00000016941) asah1b (ENSGACG00000016899) frg1 (ENSGACG00000016888) fat1a (ENSGACG00000016881) mtnr1aa (ENSGACG00000016880) ENSGACG00000016874 SORBS2 (ENSGACG00000016870) pdlim3a (ENSGACG00000016863) ENSGACG00000016861 fgg (ENSGACG00000016857) Ballan wrasse MODERN SPECIES 275 prom1b (ENSLBEG00000026918) tapt1b (ENSLBEG00000026978) clrn2 (ENSLBEG00000026998) lap3 (ENSLBEG00000027013) med28 (ENSLBEG00000027043) KLHL2 (ENSLBEG00000027054) #19 msmo1 (ENSLBEG00000000063) #21 cpe (ENSLBEG00000000071) #22 ENSLBEG00000000092 tll1 (ENSLBEG00000000111) #25 STOX2 (ENSLBEG00000000165) casp3a (ENSLBEG00000000219) osbp (ENSLBEG00000000949) pcm1 (ENSLBEG00000001227) asah1b (ENSLBEG00000001399) frg1 (ENSLBEG00000001466) ENSLBEG00000001548 ENSLBEG00000001573 ENSLBEG00000001611 mtnr1aa (ENSLBEG00000001653) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000156434 #19 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00520000055589.d.a.b ENSGT00940000153232.a.b.a ENSGT00940000156164.a ENSGT00390000007071 ENSGT00390000006641 ENSGT00530000063548.B ENSGT00390000004552 ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000156741 ENSGT00940000155973.b.d Tetraodon MODERN SPECIES 10 FBXW7 (ENSTNIG00000018665) obsl1a (ENSTNIG00000018664) tma16 (ENSTNIG00000018663) ENSTNIG00000018662 tmem192 (ENSTNIG00000018661) #18 limch1a (ENSTNIG00000018660) uchl1 (ENSTNIG00000004294) anxa5b (ENSTNIG00000004295) fgfbp2b (ENSTNIG00000004296) prom1b (ENSTNIG00000004297) tapt1b (ENSTNIG00000004298) lap3 (ENSTNIG00000004299) med28 (ENSTNIG00000004300) KLHL2 (ENSTNIG00000004301) #19 msmo1 (ENSTNIG00000004302) #21 cpe (ENSTNIG00000004303) #22 tll1 (ENSTNIG00000007135) #25 STOX2 (ENSTNIG00000007134) casp3a (ENSTNIG00000007133) osbp (ENSTNIG00000007132) pcm1 (ENSTNIG00000007130) asah1b (ENSTNIG00000007129) frg1 (ENSTNIG00000007128) ctnna2 (ENSTNIG00000007127) fat1a (ENSTNIG00000007126) mtnr1aa (ENSTNIG00000007125) cyp4v2a (ENSTNIG00000007124) ENSTNIG00000007123 SORBS2 (ENSTNIG00000007122) pdlim3a (ENSTNIG00000007121) NPY2R (ENSTNIG00000007120) Fugu MODERN SPECIES 8 ENSTRUG00000024940 ENSTRUG00000020278 tmem192 (ENSTRUG00000015356) #18 ENSTRUG00000015361 uchl1 (ENSTRUG00000020388) anxa5b (ENSTRUG00000015464) ENSTRUG00000015541 fgfbp2b (ENSTRUG00000015544) prom1b (ENSTRUG00000015548) tapt1b (ENSTRUG00000015598) clrn2 (ENSTRUG00000022979) lap3 (ENSTRUG00000015624) med28 (ENSTRUG00000020930) KLHL2 (ENSTRUG00000015659) #19 msmo1 (ENSTRUG00000015761) #21 cpe (ENSTRUG00000015779) #22 tll1 (ENSTRUG00000015820) #25 STOX2 (ENSTRUG00000015899) casp3a (ENSTRUG00000015915) osbp (ENSTRUG00000015950) SART1 (ENSTRUG00000025047) pcm1 (ENSTRUG00000015999) frg1 (ENSTRUG00000016208) ENSTRUG00000024959 fat1a (ENSTRUG00000002421) mtnr1aa (ENSTRUG00000004479) cyp4v2a (ENSTRUG00000004594) ENSTRUG00000005082 SORBS2 (ENSTRUG00000005445) pdlim3a (ENSTRUG00000005644) npy2r (ENSTRUG00000005990) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES ENSMMDG00005001910 zgc:136908 (ENSMMDG00005001837) ndufb7 (ENSMMDG00005001821) tecrb (ENSMMDG00005001726) dnajb1b (ENSMMDG00005001711) ENSMMDG00005001706 ENSMMDG00005001700 fgfbp2b (ENSMMDG00005001695) prom1b (ENSMMDG00005001687) tapt1b (ENSMMDG00005001629) clrn2 (ENSMMDG00005001602) lap3 (ENSMMDG00005000959) med28 (ENSMMDG00005000944) KLHL2 (ENSMMDG00005000938) #19 msmo1 (ENSMMDG00005000935) #21 cpe (ENSMMDG00005000931) #22 tll1 (ENSMMDG00005000915) #25 STOX2 (ENSMMDG00005000913) casp3a (ENSMMDG00005000912) ENSMMDG00005000911 osbp (ENSMMDG00005000884) sart1 (ENSMMDG00005000880) asah1b (ENSMMDG00005000748) frg1 (ENSMMDG00005000730) fat1a (ENSMMDG00005000446) mtnr1aa (ENSMMDG00005000387) cyp4v2a (ENSMMDG00005000382) ENSMMDG00005000376 SORBS2 (ENSMMDG00005000234) pdlim3a (ENSMMDG00005000158) NPY2R (ENSMMDG00005000149) Cod MODERN SPECIES 16 ENSGMOG00000029117 ENSGMOG00000025269 tmem192 (ENSGMOG00000001378) #18 ENSGMOG00000001316 uchl1 (ENSGMOG00000001303) anxa5b (ENSGMOG00000001284) ENSGMOG00000026273 fgfbp2b (ENSGMOG00000001254) prom1b (ENSGMOG00000001209) tapt1b (ENSGMOG00000001178) CLRN2 (ENSGMOG00000001162) LAP3 (ENSGMOG00000001127) MED28 (ENSGMOG00000001110) KLHL2 (ENSGMOG00000001085) #19 msmo1 (ENSGMOG00000001072) #21 cpe (ENSGMOG00000001055) #22 tll1 (ENSGMOG00000001034) #25 ENSGMOG00000032851 ENSGMOG00000001008 ENSGMOG00000000990 ENSGMOG00000000986 pcm1 (ENSGMOG00000000896) asah1b (ENSGMOG00000000876) frg1 (ENSGMOG00000000867) fat1a (ENSGMOG00000000811) mtnr1aa (ENSGMOG00000019779) cyp4v2a (ENSGMOG00000033054) ENSGMOG00000035330 ENSGMOG00000032323 pdlim3a (ENSGMOG00000000729) ENSGMOG00000000704 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT00390000004697 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306.fb ENSGT00940000155988.c ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000158012 #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 538 ENSGT00390000004697 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 #18 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306.fb.a ENSGT00940000155988.c.i ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000158012.`b.a #21 ENSGT00940000158012.ab #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 156 ENSGT00390000004697.e ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749.e.a #18 ENSGT00950000183159.a.v.a.a.a.b ENSGT00940000157306.fb.a ENSGT00940000155988.c.i ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT01080000257478.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000158012.ab #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828 #26 ENSGT00940000156545.c Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00390000002918.a.a ENSGT00390000004697.e ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749.e.a #18 ENSGT00950000183159.a.v.a.a.a.b.b ENSGT00940000157306.fb.a ENSGT00940000155988.c.i.a ENSGT00530000063586.b.c.a.f ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b.j ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000158012.`b.a.a #21 ENSGT00940000157158 #22 ENSGT00940000157225 #25 ENSGT00940000157828.z #26 ENSGT00940000156545.c ENSGT00940000157168 ENSGT00940000158131 ENSGT00550000075003.f ENSGT00940000156979 Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 51 NAF1 (ENSOMYG00000053470) tma16 (ENSOMYG00000075066) MARCHF1 (ENSOMYG00000068203) ENSOMYG00000025299 tmem192 (ENSOMYG00000065362) #18 ENSOMYG00000074300 uchl1 (ENSOMYG00000070862) anxa5b (ENSOMYG00000055809) ENSOMYG00000026481 prom1b (ENSOMYG00000054931) tapt1b (ENSOMYG00000061639) CLRN2 (ENSOMYG00000076028) ENSOMYG00000052818 MED28 (ENSOMYG00000048239) msmo1 (ENSOMYG00000071638) #21 cpe (ENSOMYG00000058254) #22 tll1 (ENSOMYG00000069817) #25 spock3 (ENSOMYG00000075207) #26 Rainbow trout MODERN SPECIES 51 ENSOMYG00000023756 tmem192 (ENSOMYG00000075172) #18 ENSOMYG00000054515 ENSOMYG00000068037 ENSOMYG00000049094 uchl1 (ENSOMYG00000072688) anxa5b (ENSOMYG00000039209) prom1b (ENSOMYG00000053172) ENSOMYG00000029488 tapt1b (ENSOMYG00000076859) CLRN2 (ENSOMYG00000048717) ENSOMYG00000055624 MED28 (ENSOMYG00000036280) msmo1 (ENSOMYG00000059786) #21 ENSOMYG00000062860 cpe (ENSOMYG00000066197) #22 ENSOMYG00000059383 tll1 (ENSOMYG00000076072) #25 ENSOMYG00000049847 spock3 (ENSOMYG00000050679) #26 ENSOMYG00000059247 ENSOMYG00000066210 ENSOMYG00000068313 ENSOMYG00000061242 ENSOMYG00000072749 ENSOMYG00000063381 ENSOMYG00000050690 ENSOMYG00000068820 ENSOMYG00000024857 ENSOMYG00000068577 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 329 ENSGT00850000132319.a.a.b.j ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000158012.`b.a.a #21 ENSGT00940000157158 #22 Coho salmon DUPLICATION Coho salmon MODERN SPECIES 37 clrn2 (ENSOKIG00005048978) ENSOKIG00005048976 ENSOKIG00005048972 ENSOKIG00005048911 MED28 (ENSOKIG00005048847) msmo1 (ENSOKIG00005048830) #21 CPE (ENSOKIG00005048816) #22 ENSOKIG00005048800 CD9 (ENSOKIG00005048774) ENSOKIG00005048764 CWF19L1 (ENSOKIG00005048748) dmtf1 (ENSOKIG00005048717) tmem243b (ENSOKIG00005048690) meig1 (ENSOKIG00005048677) dclre1c (ENSOKIG00005048602) hspa14 (ENSOKIG00005048580) ENSOKIG00005048571 SHANK3 (ENSOKIG00005048552) ano2b (ENSOKIG00005047394) ntf3 (ENSOKIG00005047218) TBC1D30 (ENSOKIG00005047209) gnsa (ENSOKIG00005046896) Coho salmon MODERN SPECIES 220 CLRN2 (ENSOKIG00005025586) lap3 (ENSOKIG00005025328) med28 (ENSOKIG00005025209) ENSOKIG00005025185 ENSOKIG00005025144 #21 cpe (ENSOKIG00005025017) #22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 287 ENSGT00390000010628.a ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00530000063255.B ENSGT00390000006192 ENSGT00940000158012.ab #21 ENSGT00940000157158 #22 River trout MODERN SPECIES 216 ENSSTUG00000035586 ENSSTUG00000036758 tapt1b (ENSSTUG00000036691) clrn2 (ENSSTUG00000036685) lap3 (ENSSTUG00000036671) med28 (ENSSTUG00000036659) msmo1 (ENSSTUG00000036640) #21 cpe (ENSSTUG00000036569) #22 ENSSTUG00000036559 Atlantic salmon MODERN SPECIES 473 ENSSSAG00000116349 CLRN2 (ENSSSAG00000091106) ENSSSAG00000117239 MED28 (ENSSSAG00000096077) ENSSSAG00000098783 #21 ENSSSAG00000110147 #22 Northern pike MODERN SPECIES 24 ENSELUG00000027158 ENSELUG00000006237 rbm47 (ENSELUG00000006148) mettl14 (ENSELUG00000030494) PRSS12 (ENSELUG00000006061) ENSELUG00000006040 ugt8 (ENSELUG00000006013) spock3 (ENSELUG00000006004) #26 ENSELUG00000001531 ENSELUG00000005976 ENSELUG00000005992 clrn2 (ENSELUG00000005969) lap3 (ENSELUG00000001147) med28 (ENSELUG00000005930) msmo1 (ENSELUG00000005920) #21 cpe (ENSELUG00000005902) #22 ENSELUG00000005835 ENSELUG00000005819 tll1 (ENSELUG00000005866) #25 qdpr (ENSELUG00000005795) tapt1b (ENSELUG00000005745) ENSELUG00000033295 ENSELUG00000030748 prom1b (ENSELUG00000031061) ENSELUG00000032164 fgfbp2b (ENSELUG00000000163) anxa5b (ENSELUG00000005687) uchl1 (ENSELUG00000005638) ENSELUG00000030518 ENSELUG00000005593 tmem192 (ENSELUG00000005559) #18 Spotted gar DUPLICATION Spotted gar MODERN SPECIES 670 rxfp1 (ENSLOCG00000008114) etfdh (ENSLOCG00000008102) ppid (ENSLOCG00000008085) fnip2 (ENSLOCG00000008049) C4orf45 (ENSLOCG00000008036) RAPGEF2 (ENSLOCG00000008011) fstl5 (ENSLOCG00000007998) NAF1 (ENSLOCG00000007989) npy1r (ENSLOCG00000007960) NPY5R (ENSLOCG00000018216) tma16 (ENSLOCG00000007945) MARCHF1 (ENSLOCG00000007938) tmem192 (ENSLOCG00000007925) #18 KLHL2 (ENSLOCG00000007894) #19 msmo1 (ENSLOCG00000007882) #21 cpe (ENSLOCG00000007871) #22 ENSLOCG00000018214 ENSLOCG00000007858 ENSLOCG00000007839 ENSLOCG00000018212 alas1 (ENSLOCG00000007826) arf3a (ENSLOCG00000007812) wnt10b (ENSLOCG00000007804) wnt1 (ENSLOCG00000007786) fkbp11 (ENSLOCG00000007767) ccdc65 (ENSLOCG00000007755) rps26 (ENSLOCG00000007743) ikzf4 (ENSLOCG00000007735) DNAJC22 (ENSLOCG00000007723) lmbr1l (ENSLOCG00000007708) dhh (ENSLOCG00000007693) Spotted gar MODERN SPECIES 671 setmar (ENSLOCG00000011063) lrrn1 (ENSLOCG00000018250) ENSLOCG00000011067 ENSLOCG00000011076 crbn (ENSLOCG00000011083) ENSLOCG00000011096 trnt1 (ENSLOCG00000011105) vhl (ENSLOCG00000011111) tatdn2 (ENSLOCG00000011120) ccdc174 (ENSLOCG00000011131) FGD5 (ENSLOCG00000011142) nr2c2 (ENSLOCG00000011160) mrps25 (ENSLOCG00000011170) RBSN (ENSLOCG00000011180) ENSLOCG00000011194 ENSLOCG00000011200 #22 ENSLOCG00000011216 TLL2 (ENSLOCG00000011225) tm9sf3 (ENSLOCG00000011244) ENSLOCG00000011257 dnajc12 (ENSLOCG00000011266) SIRT1 (ENSLOCG00000011271) cox5b2 (ENSLOCG00000011288) HERC4 (ENSLOCG00000011296) MYPN (ENSLOCG00000011326) ##30 atoh7 (ENSLOCG00000018251) PKD2L1 (ENSLOCG00000011334) ENSLOCG00000011349 ENSLOCG00000011359 ENSLOCG00000011362 GRK5 (ENSLOCG00000011376)