Clupeocephala	DUPLICATION
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	513													ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00390000015701 #26
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	308	ENSGT00940000160599	ENSGT00940000156028.t	ENSGT00390000007237.s	ENSGT00940000163093.a.a	ENSGT00940000161428	ENSGT00940000160457.a	ENSGT00940000168097	ENSGT00940000167612.a	ENSGT01030000234640.b	ENSGT00950000183048.b.a.c	ENSGT00950000183023.A.h #12	ENSGT00990000204702 #17	ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00390000015701 #26
Otophysi	DUPLICATION
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000156028.t	ENSGT00390000007237.s	ENSGT00940000161428	ENSGT00940000160457.a	ENSGT00940000168097	ENSGT01030000234640.b	ENSGT00950000183048.b.a.c	ENSGT00950000183023.A.h #12	ENSGT00950000183023.B.m.a #13	ENSGT00950000183023.B.m.b #16	ENSGT00990000204702 #17	ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a.b #21	ENSGT00950000182944.A.a.a #25	ENSGT00390000015701 #26	ENSGT00940000155677.b #28	ENSGT00940000159782.b #29	ENSGT00390000015655.a.m.b #30	ENSGT00940000156648.f #31	ENSGT00940000156536.e.a.j #32	ENSGT00390000009497.a #33	ENSGT00940000155350.h #34	ENSGT00940000156251.b #35	ENSGT00390000006320 #36	ENSGT00390000007918 #37	ENSGT00970000193642	ENSGT00940000159682	ENSGT00940000163088.b	ENSGT00940000168885.c
Cyprinoidei	DUPLICATION
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000156028.t	ENSGT00390000007237.s	ENSGT00940000163093.a.a.a.a	ENSGT00940000163093.a.a.a.b.a	ENSGT00940000163093.a.a.a.b.b	ENSGT00940000161428	ENSGT00940000160457.a	ENSGT00510000046499.y	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.b #11	ENSGT00950000183023.B.m.b #16	ENSGT00990000204702 #17	ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a.b #21	ENSGT00950000182944.A.a.a.a #25	ENSGT00950000182944.A.a.a.b #24	ENSGT00390000015701 #26	ENSGT00940000155677.b #28	ENSGT00940000159782.b #29	ENSGT00390000015655.a.m.b #30	ENSGT00940000156648.f #31	ENSGT00940000156536.e.a.j #32	ENSGT00390000009497.a #33	ENSGT00940000155350.h #34	ENSGT00940000156251.b #35	ENSGT00390000006320 #36	ENSGT00390000007918 #37	ENSGT00390000018651.a	ENSGT00940000156466	ENSGT00990000204705
Zebrafish	DUPLICATION
Zebrafish	MODERN SPECIES	13	or62b1 (ENSDARG00000092577) #7	or62b4 (ENSDARG00000105729) #8	or62b3 (ENSDARG00000095417) #9	or62b5 (ENSDARG00000105706) #10	or62a1 (ENSDARG00000094714) #11	or62a3 (ENSDARG00000093856) #12	or61a1 (ENSDARG00000092558) #13	or61c2 (ENSDARG00000092707) #14	or61c1 (ENSDARG00000094326) #15	ENSDARG00000096264 #16	defbl1 (ENSDARG00000075161) #17	pold3 (ENSDARG00000076169) #18	chrdl2 (ENSDARG00000078916) #19	ENSDARG00000089578 #20	neu3.1 (ENSDARG00000096382) #21	neu3.2 (ENSDARG00000010047) #22	neu3.3 (ENSDARG00000058327) #23	neu3.4 (ENSDARG00000096381) #24	neu3.5 (ENSDARG00000096368) #25	wdr73 (ENSDARG00000023152) #26	defbl2 (ENSDARG00000096380) #27	gria4b (ENSDARG00000059368) #28	elmod1 (ENSDARG00000062056) #29	slc35f2 (ENSDARG00000069745) #30	CUL5 (ENSDARG00000004260) #31	CAPN5 (ENSDARG00000069748) #32	ompb (ENSDARG00000032380) #33	MYO7A (ENSDARG00000044632) #34	ENSDARG00000079293 #35	nadk2 (ENSDARG00000007181) #36	skp2 (ENSDARG00000004937) #37
Zebrafish	MODERN SPECIES	13	or62b5 (ENSDARG00000105706) #10	or62a1 (ENSDARG00000094714) #11	or62a3 (ENSDARG00000093856) #12	or61a1 (ENSDARG00000092558) #13	or61c2 (ENSDARG00000092707) #14	or61c1 (ENSDARG00000094326) #15	ENSDARG00000096264 #16	defbl1 (ENSDARG00000075161) #17	pold3 (ENSDARG00000076169) #18	chrdl2 (ENSDARG00000078916) #19	ENSDARG00000089578 #20	neu3.1 (ENSDARG00000096382) #21	neu3.2 (ENSDARG00000010047) #22	neu3.3 (ENSDARG00000058327) #23	neu3.4 (ENSDARG00000096381) #24	neu3.5 (ENSDARG00000096368) #25	wdr73 (ENSDARG00000023152) #26	defbl2 (ENSDARG00000096380) #27	gria4b (ENSDARG00000059368) #28	elmod1 (ENSDARG00000062056) #29	slc35f2 (ENSDARG00000069745) #30	CUL5 (ENSDARG00000004260) #31	CAPN5 (ENSDARG00000069748) #32	ompb (ENSDARG00000032380) #33	MYO7A (ENSDARG00000044632) #34	ENSDARG00000079293 #35	nadk2 (ENSDARG00000007181) #36	skp2 (ENSDARG00000004937) #37	ENSDARG00000093126	lmbrd2b (ENSDARG00000017312)	capslb (ENSDARG00000003414)
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	144	ENSGT00390000007237.s.a	ENSGT00940000163093.a.a.a.a	ENSGT00940000163093.a.a.a.b.a	ENSGT00940000163093.a.a.a.b.b	ENSGT00940000161428.e	ENSGT00940000160457.a.b	ENSGT00950000183048.b.a.d.i	ENSGT00950000183023.A.h.c.a.a ##16	ENSGT00950000183023.A.h.c.b.a.a.a #8	ENSGT00950000183023.A.h.c.b.b #9	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.b #12	ENSGT00950000183023.B.m.b.b #16	ENSGT00990000204702.b #17	ENSGT00940000163239.e #18	ENSGT00940000166571.a #19	ENSGT00950000182944.A.a.a.a.a.a #25	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.d #24
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	89	ENSGT00940000163093.a.a.a.b.a	ENSGT00940000163093.a.a.a.b.b	ENSGT00940000161428.e	ENSGT00940000160457.a.b	ENSGT00950000183048.b.a.d.i	ENSGT00950000183023.A.h.c.a.a ##16	ENSGT00950000183023.A.h.c.b.a.a.a #8	ENSGT00950000183023.A.h.c.b.a.b #10	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.b #12	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.b.a.a.a.b #11	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.b.b #11	ENSGT00950000183023.B.m.b.b #16	ENSGT00990000204702.b #17	ENSGT00940000163239.e #18	ENSGT00940000166571.a #19	ENSGT00950000182944.A.a.a.a.a.a #25	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.d #24	ENSGT00950000182944.A.a.a.a.b #25	ENSGT00390000015701.g #26	ENSGT00940000155677.b.l #28	ENSGT00940000159782.b.j #29	ENSGT00390000015655.a.m.b.f #30	ENSGT00940000156648.f.a #31	ENSGT00940000156536.e.a.j.b #32	ENSGT00390000009497.a.e #33	ENSGT00940000155350.h.f #34	ENSGT00940000156251.b #35	ENSGT00390000006320.t #36	ENSGT00390000007918.b #37	ENSGT00390000018651.a.g	ENSGT00990000204705.a
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	2002												defbl1 (ENSSGRG00000019000) #17	pold3 (ENSSGRG00000019002) #18	chrdl2 (ENSSGRG00000019008) #19	ENSSGRG00000019009 #20	NEU3 (ENSSGRG00000019012) #25
Common carp reference	MODERN SPECIES	38	ENSCCRG00000008906	ENSCCRG00000080655	ENSCCRG00000065299	or62b4 (ENSCCRG00000055223) #8	or62b5 (ENSCCRG00000080334) #10	or62a3 (ENSCCRG00000060080) #12	or62a1 (ENSCCRG00000011710) #11	or62a1 (ENSCCRG00000024126) #11	or62a1 (ENSCCRG00000028160) #11	ENSCCRG00000024121 #16	defbl1 (ENSCCRG00000031763) #17	defbl1 (ENSCCRG00000016744) #17	pold3 (ENSCCRG00000041029) #18	ENSCCRG00000067418	chrdl2 (ENSCCRG00000076415) #19	ENSCCRG00000003660 #25	neu3.4 (ENSCCRG00000067519) #24	ENSCCRG00000080549 #25	wdr73 (ENSCCRG00000003680) #26	gria4b (ENSCCRG00000067130) #28	elmod1 (ENSCCRG00000023504) #29	slc35f2 (ENSCCRG00000007018) #30	ENSCCRG00000046721 #31	CAPN5 (ENSCCRG00000017389) #32	MYO7A (ENSCCRG00000050029) #34	GDPD4 (ENSCCRG00000050622) #35	nadk2 (ENSCCRG00000011371) #36	skp2 (ENSCCRG00000069379) #37	lmbrd2b (ENSCCRG00000050645)	il7r (ENSCCRG00000063390)	myo5b (ENSCCRG00000050749)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	207	ENSGT01080000257533.a	ENSGT00610000087474.c	ENSGT00940000166868.a.a	ENSGT00940000164695.b.b	ENSGT00940000160599.q	ENSGT00940000156028.t.b	ENSGT00390000007237.s.b	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.a.a #12	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.a.b #12	ENSGT00950000183023.B.m.b.a #16	ENSGT00990000204702.a #17	ENSGT00940000163239.f #18	ENSGT00940000166571.b #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a.b.a #21	ENSGT00950000182944.A.a.a.a.a.b #25	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.c.b #24	ENSGT00390000015701.h #26	ENSGT00650000094922.p #27	ENSGT00940000155677.b.k #28	ENSGT00940000159782.b.i #29	ENSGT00390000015655.a.m.b.e #30	ENSGT00940000156648.f.b #31	ENSGT00940000156536.e.a.j.a #32	ENSGT00390000009497.a.f #33	ENSGT00940000155350.h.e #34	ENSGT00390000006320.s #36	ENSGT00390000007918.a #37	ENSGT00390000018651.a.h	ENSGT00940000156466.eb	ENSGT00990000204705.b
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Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	1892															ENSGT00950000182944.A.a.b.b #21	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.c.a #24
Goldfish	MODERN SPECIES	40	ENSCARG00000037363 #8	ENSCARG00000037383 #8	or62b3 (ENSCARG00000037401) #9	or62a1 (ENSCARG00000037435) #11	or62a1 (ENSCARG00000037468) #11	or62a1 (ENSCARG00000037484) #11	or62a1 (ENSCARG00000037505) #11	or62a1 (ENSCARG00000037515) #11	ENSCARG00000037556 #16	ENSCARG00000037594 #16	defbl1 (ENSCARG00000037610) #17	pold3 (ENSCARG00000037652) #18	chrdl2 (ENSCARG00000037905) #19	ENSCARG00000037976 #20	neu3.1 (ENSCARG00000038003) #21	NEU3 (ENSCARG00000038008) #24	NEU3 (ENSCARG00000038028) #25	NEU3 (ENSCARG00000038041) #24	wdr73 (ENSCARG00000038059) #26	gria4b (ENSCARG00000038091) #28	elmod1 (ENSCARG00000038454) #29	slc35f2 (ENSCARG00000038502) #30	CUL5 (ENSCARG00000038536) #31	CAPN5 (ENSCARG00000024584) #32	ompb (ENSCARG00000025699) #33	MYO7A (ENSCARG00000025821) #34	ENSCARG00000029274 #35	nadk2 (ENSCARG00000029310) #36	skp2 (ENSCARG00000029482) #37	lmbrd2b (ENSCARG00000029545)	il7r (ENSCARG00000029729)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.c.a #24
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	4373																ENSSGRG00000001961 #24
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	207	ENSGT00610000087474.c	ENSGT00940000166868.a.a	ENSGT00940000164695.b.b	ENSGT00940000160599.q	ENSGT00940000156028.t.b	ENSGT00390000007237.s.b	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.a.a #12	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.a.b #12	ENSGT00950000183023.B.m.b.a #16	ENSGT00990000204702.a #17	ENSGT00940000163239.f #18	ENSGT00940000166571.b #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a.b.a #21	ENSGT00950000182944.A.a.a.a.a.b #25	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.c.b #24	ENSGT00390000015701.h #26	ENSGT00650000094922.p #27	ENSGT00940000155677.b.k #28	ENSGT00940000159782.b.i #29	ENSGT00390000015655.a.m.b.e #30	ENSGT00940000156648.f.b #31	ENSGT00940000156536.e.a.j.a #32	ENSGT00390000009497.a.f #33	ENSGT00940000155350.h.e #34	ENSGT00390000006320.s #36	ENSGT00390000007918.a #37	ENSGT00390000018651.a.h	ENSGT00940000156466.eb	ENSGT00990000204705.b	ENSGT00940000155402.a.b.e.a
Goldfish	MODERN SPECIES	40	or62b3 (ENSCARG00000037401) #9	or62a1 (ENSCARG00000037435) #11	or62a1 (ENSCARG00000037468) #11	or62a1 (ENSCARG00000037484) #11	or62a1 (ENSCARG00000037505) #11	or62a1 (ENSCARG00000037515) #11	ENSCARG00000037556 #16	ENSCARG00000037594 #16	defbl1 (ENSCARG00000037610) #17	pold3 (ENSCARG00000037652) #18	chrdl2 (ENSCARG00000037905) #19	ENSCARG00000037976 #20	neu3.1 (ENSCARG00000038003) #21	NEU3 (ENSCARG00000038008) #24	NEU3 (ENSCARG00000038028) #25	NEU3 (ENSCARG00000038041) #24	wdr73 (ENSCARG00000038059) #26	gria4b (ENSCARG00000038091) #28	elmod1 (ENSCARG00000038454) #29	slc35f2 (ENSCARG00000038502) #30	CUL5 (ENSCARG00000038536) #31	CAPN5 (ENSCARG00000024584) #32	ompb (ENSCARG00000025699) #33	MYO7A (ENSCARG00000025821) #34	ENSCARG00000029274 #35	nadk2 (ENSCARG00000029310) #36	skp2 (ENSCARG00000029482) #37	lmbrd2b (ENSCARG00000029545)	il7r (ENSCARG00000029729)	myo5b (ENSCARG00000029808)	cfap53 (ENSCARG00000032666)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00390000007237.s.b	ENSGT00940000163093.a.a.b	ENSGT00940000161428.f	ENSGT00940000160457.a.a	ENSGT00940000168097	ENSGT00950000183048.b.a.d.j	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.a.a #12	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.a.b #12	ENSGT00950000183023.B.m.b.a #16	ENSGT00990000204702.a #17	ENSGT00940000163239.f #18	ENSGT00940000166571.b #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a.b.a #21	ENSGT00950000182944.A.a.a.a.a.b #25	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.c.b #24	ENSGT00390000015701.h #26	ENSGT00650000094922.p #27	ENSGT00940000155677.b.k #28	ENSGT00940000159782.b.i #29	ENSGT00390000015655.a.m.b.e #30	ENSGT00940000156648.f.b #31	ENSGT00940000156536.e.a.j.a #32	ENSGT00390000009497.a.f #33	ENSGT00940000155350.h.e #34	ENSGT00390000006320.s #36	ENSGT00390000007918.a #37	ENSGT00390000018651.a.h	ENSGT00940000156466.eb	ENSGT00990000204705.b	ENSGT00940000155402.a.b.e.a
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	343												or62a2 (ENSSGRG00000044819) ##16	pold3 (ENSSGRG00000044820) #18	chrdl2 (ENSSGRG00000044822) #19	NEU3 (ENSSGRG00000044824) #25	ENSSGRG00000044825 #24	wdr73 (ENSSGRG00000044827) #26	defbl2 (ENSSGRG00000044829) #27	gria4b (ENSSGRG00000044952) #28	elmod1 (ENSSGRG00000048337) #29	slc35f2 (ENSSGRG00000048338) #30	CUL5 (ENSSGRG00000048342) #31	CAPN5 (ENSSGRG00000048363) #32	ompb (ENSSGRG00000048373) #33	MYO7A (ENSSGRG00000048382) #34	nadk2 (ENSSGRG00000048405) #36	skp2 (ENSSGRG00000048412) #37	lmbrd2b (ENSSGRG00000048422)	capslb (ENSSGRG00000048599)	il7r (ENSSGRG00000048600)	myo5b (ENSSGRG00000048632)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	144	ENSGT00940000163093.a.a.a.a	ENSGT00940000163093.a.a.a.b.a	ENSGT00940000163093.a.a.a.b.b	ENSGT00940000161428.e	ENSGT00940000160457.a.b	ENSGT00950000183048.b.a.d.i	ENSGT00950000183023.A.h.c.a.a ##16	ENSGT00950000183023.A.h.c.b.a.a.a #8	ENSGT00950000183023.A.h.c.b.b #9	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.b #12	ENSGT00950000183023.B.m.b.b #16	ENSGT00990000204702.b #17	ENSGT00940000163239.e #18	ENSGT00940000166571.a #19	ENSGT00950000182944.A.a.a.a.a.a #25	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.d #24
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	89	ENSGT00940000163093.a.a.a.b.b	ENSGT00940000161428.e	ENSGT00940000160457.a.b	ENSGT00950000183048.b.a.d.i	ENSGT00950000183023.A.h.c.a.a ##16	ENSGT00950000183023.A.h.c.b.a.a.a #8	ENSGT00950000183023.A.h.c.b.a.b #10	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.b #12	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.b.a.a.a.b #11	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.b.b #11	ENSGT00950000183023.B.m.b.b #16	ENSGT00990000204702.b #17	ENSGT00940000163239.e #18	ENSGT00940000166571.a #19	ENSGT00950000182944.A.a.a.a.a.a #25	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.d #24	ENSGT00950000182944.A.a.a.a.b #25	ENSGT00390000015701.g #26	ENSGT00940000155677.b.l #28	ENSGT00940000159782.b.j #29	ENSGT00390000015655.a.m.b.f #30	ENSGT00940000156648.f.a #31	ENSGT00940000156536.e.a.j.b #32	ENSGT00390000009497.a.e #33	ENSGT00940000155350.h.f #34	ENSGT00940000156251.b #35	ENSGT00390000006320.t #36	ENSGT00390000007918.b #37	ENSGT00390000018651.a.g	ENSGT00990000204705.a	ENSGT00940000155402.a.b.e.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	38	ENSCCRG00000080655	ENSCCRG00000065299	or62b4 (ENSCCRG00000055223) #8	or62b5 (ENSCCRG00000080334) #10	or62a3 (ENSCCRG00000060080) #12	or62a1 (ENSCCRG00000011710) #11	or62a1 (ENSCCRG00000024126) #11	or62a1 (ENSCCRG00000028160) #11	ENSCCRG00000024121 #16	defbl1 (ENSCCRG00000031763) #17	defbl1 (ENSCCRG00000016744) #17	pold3 (ENSCCRG00000041029) #18	ENSCCRG00000067418	chrdl2 (ENSCCRG00000076415) #19	ENSCCRG00000003660 #25	neu3.4 (ENSCCRG00000067519) #24	ENSCCRG00000080549 #25	wdr73 (ENSCCRG00000003680) #26	gria4b (ENSCCRG00000067130) #28	elmod1 (ENSCCRG00000023504) #29	slc35f2 (ENSCCRG00000007018) #30	ENSCCRG00000046721 #31	CAPN5 (ENSCCRG00000017389) #32	MYO7A (ENSCCRG00000050029) #34	GDPD4 (ENSCCRG00000050622) #35	nadk2 (ENSCCRG00000011371) #36	skp2 (ENSCCRG00000069379) #37	lmbrd2b (ENSCCRG00000050645)	il7r (ENSCCRG00000063390)	myo5b (ENSCCRG00000050749)	ENSCCRG00000070030
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00510000046499	ENSGT01100000263522.B.b.l	ENSGT00940000167612.b	ENSGT00950000183048.b.b.c	ENSGT00950000183023.A.g.b ##16	ENSGT01030000234640.b	ENSGT00950000183048.b.a.c	ENSGT00950000183023.A.h #12	ENSGT00950000183023.B.m.a #13	ENSGT00950000183023.B.m.b #16	ENSGT00990000204702 #17	ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a.b #21	ENSGT00950000182944.A.a.a #25	ENSGT00390000015701 #26	ENSGT00940000155677.b #28	ENSGT00940000159782.b #29	ENSGT00390000015655.a.m.b #30	ENSGT00940000156536.e.a.j #32	ENSGT00940000155350.h #34	ENSGT00940000156251.b #35	ENSGT00390000006320 #36	ENSGT00390000007918 #37	ENSGT00390000018651.a	ENSGT00990000204705	ENSGT00940000155402.a.b	ENSGT00970000193642	ENSGT00940000159682	ENSGT01100000263551.b.b.a.e.a
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000167612.b	ENSGT00950000183048.b.b.c	ENSGT01030000234640.a.a.e	ENSGT00950000183023.A.g.b ##16	ENSGT01030000234640.b	ENSGT00950000183048.b.a.c	ENSGT00950000183023.A.h.a.b #12	ENSGT00950000183023.B.m.a #13	ENSGT00950000183023.A.h.a.a #12	ENSGT00950000183023.B.m.b #16	ENSGT00990000204702 #17	ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00940000178035	ENSGT00950000182944.A.a.b #21	ENSGT00950000182944.A.a.a #25	ENSGT00390000015701 #26	ENSGT00940000155677.b #28	ENSGT00940000159782.b #29	ENSGT00390000015655.a.m.b #30	ENSGT00940000156536.e.a.j #32	ENSGT00940000155350.h #34	ENSGT00940000156251.b #35	ENSGT00390000006320 #36	ENSGT00390000007918 #37	ENSGT00390000018651.a	ENSGT00990000204705	ENSGT00940000155402.a.b	ENSGT00970000193642	ENSGT00940000159682	ENSGT00940000163088.b
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	128	ENSGT00950000183048.b.b.c	ENSGT01030000234640.a.a.e	ENSGT00950000183023.A.g.b ##16	ENSGT00950000183023.A.g.a.b ##16	ENSGT01030000234640.b	ENSGT00950000183048.b.a.c	ENSGT00950000183023.A.h.a.b #12	ENSGT00950000183023.B.m.a #13	ENSGT00950000183023.A.h.a.a #12	ENSGT00950000183023.B.m.b #16	ENSGT00990000204702 #17	ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00940000178035	ENSGT00950000182944.A.a.b #21	ENSGT00950000182944.A.a.a #25	ENSGT00390000015701 #26	ENSGT00940000155677.b #28	ENSGT00940000159782.b #29	ENSGT00390000015655.a.m.b #30	ENSGT00940000156536.e.a.j #32	ENSGT00940000155350.h #34	ENSGT00940000156251.b #35	ENSGT00390000006320 #36	ENSGT00390000007918 #37	ENSGT00390000018651.a	ENSGT00990000204705	ENSGT00940000155402.a.b	ENSGT00970000193642	ENSGT00940000159682	ENSGT00940000163088.b
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	343				ENSPNAG00000017396	ENSPNAG00000017385	ENSPNAG00000017373 #12	ENSPNAG00000017343 #12	or61a1 (ENSPNAG00000017297) #13	or61c1 (ENSPNAG00000017281) #16	defbl1 (ENSPNAG00000017275) #17	chrdl2 (ENSPNAG00000017261) #19	ENSPNAG00000017212	ENSPNAG00000017139	neu3.1 (ENSPNAG00000017133) #21	ENSPNAG00000017118	neu3.5 (ENSPNAG00000017066) #25	wdr73 (ENSPNAG00000017053) #26	defbl2 (ENSPNAG00000017019) #27	ENSPNAG00000017011	gria4b (ENSPNAG00000003456) #28	elmod1 (ENSPNAG00000016782) #29	CAPN5 (ENSPNAG00000016661) #32	slc35f2 (ENSPNAG00000016587) #30	ENSPNAG00000016576	MYO7A (ENSPNAG00000016536) #34	ENSPNAG00000016308 #35	capslb (ENSPNAG00000016284)	il7r (ENSPNAG00000016278)	myo5b (ENSPNAG00000016264)	cfap53 (ENSPNAG00000016196)	chek1 (ENSPNAG00000016155)
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Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000160599	ENSGT00940000156028.t	ENSGT00390000007237.s	ENSGT00940000161428	ENSGT00940000160457.a	ENSGT00940000168097	ENSGT01030000234640.b	ENSGT00950000183048.b.a.c	ENSGT00950000183023.A.h #12	ENSGT00950000183023.B.m.a #13	ENSGT00950000183023.B.m.b #16	ENSGT00990000204702 #17	ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a.b #21	ENSGT00950000182944.A.a.a #25	ENSGT00390000015701 #26	ENSGT00940000155677.b #28	ENSGT00940000159782.b #29	ENSGT00390000015655.a.m.b #30	ENSGT00940000156648.f #31	ENSGT00940000156536.e.a.j #32	ENSGT00390000009497.a #33	ENSGT00940000155350.h #34	ENSGT00940000156251.b #35	ENSGT00390000006320 #36	ENSGT00390000007918 #37	ENSGT00970000193642	ENSGT00940000159682	ENSGT00940000163088.b
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Channel catfish	MODERN SPECIES	9	ARSB (ENSIPUG00000002667)	kif20a (ENSIPUG00000002633)	cdc23 (ENSIPUG00000002615)	CAMLG (ENSIPUG00000002605)	ddx46 (ENSIPUG00000002564)	ENSIPUG00000002537	b9d2 (ENSIPUG00000002529)	tgfb1 (ENSIPUG00000002511)	ENSIPUG00000002481	cbr1l (ENSIPUG00000002463)	defbl1 (ENSIPUG00000002456) #17	ENSIPUG00000002438	pold3 (ENSIPUG00000002408) #18	chrdl2 (ENSIPUG00000002365) #19	xrra1 (ENSIPUG00000002351) #20	neu3 (ENSIPUG00000002341) #21	wdr73 (ENSIPUG00000002280) #26	ENSIPUG00000002182	ENSIPUG00000002158	defbl2 (ENSIPUG00000002102) #27	ENSIPUG00000002077	gria4b (ENSIPUG00000002027) #28	elmod1 (ENSIPUG00000001979) #29	slc35f2 (ENSIPUG00000001958) #30	CAPN5 (ENSIPUG00000001939) #32	MYO7A (ENSIPUG00000001886) #34	nadk2 (ENSIPUG00000001868) #36	skp2 (ENSIPUG00000001858) #37	lmbrd2b (ENSIPUG00000001814)	capslb (ENSIPUG00000001802)	il7r (ENSIPUG00000001777)
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Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	128	ENSGT00940000167612.b	ENSGT00950000183048.b.b.c	ENSGT01030000234640.a.a.e	ENSGT00950000183023.A.g.b ##16	ENSGT00950000183023.A.g.a.b ##16	ENSGT01030000234640.b	ENSGT00950000183048.b.a.c	ENSGT00950000183023.A.h.a.b #12	ENSGT00950000183023.B.m.a #13	ENSGT00950000183023.A.h.a.a #12	ENSGT00950000183023.B.m.b #16	ENSGT00990000204702 #17	ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00940000178035	ENSGT00950000182944.A.a.b #21	ENSGT00950000182944.A.a.a #25	ENSGT00390000015701 #26	ENSGT00940000155677.b #28	ENSGT00940000159782.b #29	ENSGT00390000015655.a.m.b #30	ENSGT00940000156536.e.a.j #32	ENSGT00940000155350.h #34	ENSGT00940000156251.b #35	ENSGT00390000006320 #36	ENSGT00390000007918 #37	ENSGT00390000018651.a	ENSGT00990000204705	ENSGT00940000155402.a.b	ENSGT00970000193642	ENSGT00940000159682
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	343						ENSPNAG00000017396	ENSPNAG00000017385	ENSPNAG00000017373 #12	ENSPNAG00000017343 #12	or61a1 (ENSPNAG00000017297) #13	or61c1 (ENSPNAG00000017281) #16	defbl1 (ENSPNAG00000017275) #17	chrdl2 (ENSPNAG00000017261) #19	ENSPNAG00000017212	ENSPNAG00000017139	neu3.1 (ENSPNAG00000017133) #21	ENSPNAG00000017118	neu3.5 (ENSPNAG00000017066) #25	wdr73 (ENSPNAG00000017053) #26	defbl2 (ENSPNAG00000017019) #27	ENSPNAG00000017011	gria4b (ENSPNAG00000003456) #28	elmod1 (ENSPNAG00000016782) #29	CAPN5 (ENSPNAG00000016661) #32	slc35f2 (ENSPNAG00000016587) #30	ENSPNAG00000016576	MYO7A (ENSPNAG00000016536) #34	ENSPNAG00000016308 #35	capslb (ENSPNAG00000016284)	il7r (ENSPNAG00000016278)	myo5b (ENSPNAG00000016264)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	5	nectin3b (ENSAMXG00000002520)	diablob (ENSAMXG00000041613)	b9d2 (ENSAMXG00000038790)	ENSAMXG00000002558	ENSAMXG00000002607	cbr1l (ENSAMXG00000033906)	ENSAMXG00000033580	ENSAMXG00000002637	ENSAMXG00000041922 #12	ENSAMXG00000041289 #12	or61c1 (ENSAMXG00000032768) #16	defbl1 (ENSAMXG00000002657) #17	pold3 (ENSAMXG00000002663) #18	chrdl2 (ENSAMXG00000002716) #19	ENSAMXG00000030537	neu3.1 (ENSAMXG00000030778) #21	wdr73 (ENSAMXG00000041077) #26	defbl2 (ENSAMXG00000002849) #27	gria4b (ENSAMXG00000002917) #28	elmod1 (ENSAMXG00000037229) #29	slc35f2 (ENSAMXG00000030030) #30	CAPN5 (ENSAMXG00000003190) #32	MYO7A (ENSAMXG00000003253) #34	nadk2 (ENSAMXG00000003366) #36	skp2 (ENSAMXG00000003385) #37	lmbrd2b (ENSAMXG00000032666)	capslb (ENSAMXG00000003433)	il7r (ENSAMXG00000038525)	ENSAMXG00000040957	ENSAMXG00000039113	cfap53 (ENSAMXG00000003914)
Electric eel	MODERN SPECIES	6	ENSEEEG00000003049	ppm1nb (ENSEEEG00000003052)	rtn2b (ENSEEEG00000003053)	nectin3b (ENSEEEG00000003054)	diablob (ENSEEEG00000003056)	b9d2 (ENSEEEG00000003058)	ENSEEEG00000003059	ENSEEEG00000003060	ENSEEEG00000003062	ENSEEEG00000003064 #12	ENSEEEG00000003067 #12	ENSEEEG00000003069 #12	defbl1 (ENSEEEG00000003074) #17	pold3 (ENSEEEG00000003079) #18	chrdl2 (ENSEEEG00000003081) #19	neu3.1 (ENSEEEG00000003083) #21	wdr73 (ENSEEEG00000003084) #26	gria4b (ENSEEEG00000003092) #28	elmod1 (ENSEEEG00000003127) #29	slc35f2 (ENSEEEG00000003134) #30	ENSEEEG00000003137	ENSEEEG00000003138 #30	CAPN5 (ENSEEEG00000003139) #32	MYO7A (ENSEEEG00000003150) #34	nadk2 (ENSEEEG00000003171) #36	skp2 (ENSEEEG00000003175) #37	lmbrd2b (ENSEEEG00000003181)	capslb (ENSEEEG00000003186)	il7r (ENSEEEG00000003189)	myo5b (ENSEEEG00000003234)	cfap53 (ENSEEEG00000004124)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000160599	ENSGT00940000156028.t	ENSGT00390000007237.s	ENSGT00940000163093.a.a.a.a	ENSGT00940000163093.a.a.a.b.a	ENSGT00940000163093.a.a.a.b.b	ENSGT00940000161428	ENSGT00940000160457.a	ENSGT00510000046499.y	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.b #11	ENSGT00950000183023.B.m.b #16	ENSGT00990000204702 #17	ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a.b #21	ENSGT00950000182944.A.a.a.a #25	ENSGT00950000182944.A.a.a.b #24	ENSGT00390000015701 #26	ENSGT00940000155677.b #28	ENSGT00940000159782.b #29	ENSGT00390000015655.a.m.b #30	ENSGT00940000156648.f #31	ENSGT00940000156536.e.a.j #32	ENSGT00390000009497.a #33	ENSGT00940000155350.h #34	ENSGT00940000156251.b #35	ENSGT00390000006320 #36	ENSGT00390000007918 #37	ENSGT00390000018651.a	ENSGT00940000156466
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	207	ENSGT00390000003107.b.i.c	ENSGT01080000257533.a	ENSGT00610000087474.c	ENSGT00940000166868.a.a	ENSGT00940000164695.b.b	ENSGT00940000160599.q	ENSGT00940000156028.t.b	ENSGT00390000007237.s.b	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.a.a #12	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.a.b #12	ENSGT00950000183023.B.m.b.a #16	ENSGT00990000204702.a #17	ENSGT00940000163239.f #18	ENSGT00940000166571.b #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a.b.a #21	ENSGT00950000182944.A.a.a.a.a.b #25	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.c.b #24	ENSGT00390000015701.h #26	ENSGT00650000094922.p #27	ENSGT00940000155677.b.k #28	ENSGT00940000159782.b.i #29	ENSGT00390000015655.a.m.b.e #30	ENSGT00940000156648.f.b #31	ENSGT00940000156536.e.a.j.a #32	ENSGT00390000009497.a.f #33	ENSGT00940000155350.h.e #34	ENSGT00390000006320.s #36	ENSGT00390000007918.a #37	ENSGT00390000018651.a.h	ENSGT00940000156466.eb
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000160599.q	ENSGT00940000156028.t.b	ENSGT00390000007237.s.b	ENSGT00940000163093.a.a.b	ENSGT00940000161428.f	ENSGT00940000160457.a.a	ENSGT00940000168097	ENSGT00950000183048.b.a.d.j	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.a.a #12	ENSGT00950000183023.A.h.d.b.a.a.b #12	ENSGT00950000183023.B.m.b.a #16	ENSGT00990000204702.a #17	ENSGT00940000163239.f #18	ENSGT00940000166571.b #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a.b.a #21	ENSGT00950000182944.A.a.a.a.a.b #25	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.c.b #24	ENSGT00390000015701.h #26	ENSGT00650000094922.p #27	ENSGT00940000155677.b.k #28	ENSGT00940000159782.b.i #29	ENSGT00390000015655.a.m.b.e #30	ENSGT00940000156648.f.b #31	ENSGT00940000156536.e.a.j.a #32	ENSGT00390000009497.a.f #33	ENSGT00940000155350.h.e #34	ENSGT00390000006320.s #36	ENSGT00390000007918.a #37	ENSGT00390000018651.a.h	ENSGT00940000156466.eb
Common carp reference	MODERN SPECIES	45	ENSCCRG00000056766	b9d2 (ENSCCRG00000063478)	ENSCCRG00000008975	cbr1l (ENSCCRG00000056610)	ENSCCRG00000034010	or62a3 (ENSCCRG00000053349) #12	or62a3 (ENSCCRG00000009341) #12	or62a3 (ENSCCRG00000063021) #12	ENSCCRG00000062614	or62a3 (ENSCCRG00000069479) #12	ENSCCRG00000037328 #16	defbl1 (ENSCCRG00000037329) #17	pold3 (ENSCCRG00000037335) #18	chrdl2 (ENSCCRG00000063343) #19	ENSCCRG00000037448 #20	neu3.1 (ENSCCRG00000054230) #21	ENSCCRG00000037233 #25	defbl2 (ENSCCRG00000062722) #27	gria4b (ENSCCRG00000064152) #28	elmod1 (ENSCCRG00000060203) #29	slc35f2 (ENSCCRG00000025636) #30	ENSCCRG00000071860 #31	ENSCCRG00000049995 #32	ompb (ENSCCRG00000077840) #33	ENSCCRG00000017754 #34	nadk2 (ENSCCRG00000050625) #36	skp2 (ENSCCRG00000059949) #37	lmbrd2b (ENSCCRG00000011451)	capslb (ENSCCRG00000061757)	il7r (ENSCCRG00000056341)	ENSCCRG00000055703
Goldfish	MODERN SPECIES	13	C6 (ENSCARG00000004176)	rnf180b (ENSCARG00000004098)	b9d2 (ENSCARG00000004078)	ENSCARG00000004050	cbr1l (ENSCARG00000004022)	ENSCARG00000004010	ENSCARG00000004001	ENSCARG00000003996	or62a2 (ENSCARG00000003975) ##16	or62a2 (ENSCARG00000003968) ##16	or62a3 (ENSCARG00000003948) #12	or62a3 (ENSCARG00000003931) #12	defbl1 (ENSCARG00000003914) #17	pold3 (ENSCARG00000003881) #18	chrdl2 (ENSCARG00000003838) #19	neu3.1 (ENSCARG00000003806) #21	NEU3 (ENSCARG00000070462) #25	defbl2 (ENSCARG00000070461) #27	gria4b (ENSCARG00000070450) #28	elmod1 (ENSCARG00000070445) #29	slc35f2 (ENSCARG00000070444) #30	CUL5 (ENSCARG00000070443) #31	ompb (ENSCARG00000070442) #33	CAPN5 (ENSCARG00000070441) #32	MYO7A (ENSCARG00000070438) #34	nadk2 (ENSCARG00000070436) #36	skp2 (ENSCARG00000070435) #37	lmbrd2b (ENSCARG00000070420)	capslb (ENSCARG00000070418)	il7r (ENSCARG00000070416)	myo5b (ENSCARG00000070339)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	1892																ENSGT00950000182944.A.a.b.b #21	ENSGT00950000182944.A.a.a.b.c.a #24
Goldfish	MODERN SPECIES	40	ENSCARG00000037351 ##16	ENSCARG00000037363 #8	ENSCARG00000037383 #8	or62b3 (ENSCARG00000037401) #9	or62a1 (ENSCARG00000037435) #11	or62a1 (ENSCARG00000037468) #11	or62a1 (ENSCARG00000037484) #11	or62a1 (ENSCARG00000037505) #11	or62a1 (ENSCARG00000037515) #11	ENSCARG00000037556 #16	ENSCARG00000037594 #16	defbl1 (ENSCARG00000037610) #17	pold3 (ENSCARG00000037652) #18	chrdl2 (ENSCARG00000037905) #19	ENSCARG00000037976 #20	neu3.1 (ENSCARG00000038003) #21	NEU3 (ENSCARG00000038008) #24	NEU3 (ENSCARG00000038028) #25	NEU3 (ENSCARG00000038041) #24	wdr73 (ENSCARG00000038059) #26	gria4b (ENSCARG00000038091) #28	elmod1 (ENSCARG00000038454) #29	slc35f2 (ENSCARG00000038502) #30	CUL5 (ENSCARG00000038536) #31	CAPN5 (ENSCARG00000024584) #32	ompb (ENSCARG00000025699) #33	MYO7A (ENSCARG00000025821) #34	ENSCARG00000029274 #35	nadk2 (ENSCARG00000029310) #36	skp2 (ENSCARG00000029482) #37	lmbrd2b (ENSCARG00000029545)
Zebrafish	MODERN SPECIES	13	or62b2 (ENSDARG00000093183) ##16	or62b1 (ENSDARG00000092577) #7	or62b4 (ENSDARG00000105729) #8	or62b3 (ENSDARG00000095417) #9	or62b5 (ENSDARG00000105706) #10	or62a1 (ENSDARG00000094714) #11	or62a3 (ENSDARG00000093856) #12	or61a1 (ENSDARG00000092558) #13	or61c2 (ENSDARG00000092707) #14	or61c1 (ENSDARG00000094326) #15	ENSDARG00000096264 #16	defbl1 (ENSDARG00000075161) #17	pold3 (ENSDARG00000076169) #18	chrdl2 (ENSDARG00000078916) #19	ENSDARG00000089578 #20	neu3.1 (ENSDARG00000096382) #21	neu3.2 (ENSDARG00000010047) #22	neu3.3 (ENSDARG00000058327) #23	neu3.4 (ENSDARG00000096381) #24	neu3.5 (ENSDARG00000096368) #25	wdr73 (ENSDARG00000023152) #26	defbl2 (ENSDARG00000096380) #27	gria4b (ENSDARG00000059368) #28	elmod1 (ENSDARG00000062056) #29	slc35f2 (ENSDARG00000069745) #30	CUL5 (ENSDARG00000004260) #31	CAPN5 (ENSDARG00000069748) #32	ompb (ENSDARG00000032380) #33	MYO7A (ENSDARG00000044632) #34	ENSDARG00000079293 #35	nadk2 (ENSDARG00000007181) #36
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	644													ENSGT00990000204702 #17	ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00950000182944.A.a #25
Atlantic herring	MODERN SPECIES	24	fabp6 (ENSCHAG00000012886)	slc23a1 (ENSCHAG00000012939)	pfdn1 (ENSCHAG00000015113)	ENSCHAG00000015132	hnrnph1l (ENSCHAG00000015173)	slc9a6b (ENSCHAG00000015324)	fhl1b (ENSCHAG00000016125)	ENSCHAG00000016137	ENSCHAG00000016221	htatsf1 (ENSCHAG00000016240)	ENSCHAG00000016271	tmtops3b (ENSCHAG00000016296)	fgf13b (ENSCHAG00000016452)	f9b (ENSCHAG00000016496)	MCF2 (ENSCHAG00000016562)	neu3.1 (ENSCHAG00000016580) #25	rbm41 (ENSCHAG00000016591)	trim47 (ENSCHAG00000016599)	trim3b (ENSCHAG00000016622)	ENSCHAG00000016851	ENSCHAG00000016860	cfap298 (ENSCHAG00000016864)	synj1 (ENSCHAG00000016950)	SLC46A3 (ENSCHAG00000017815)	ENSCHAG00000017829	sod1 (ENSCHAG00000017872)	TIAM1 (ENSCHAG00000018070)	GRIK1 (ENSCHAG00000018442)	bach1b (ENSCHAG00000020662)	ENSCHAG00000020667	cct8 (ENSCHAG00000020688)
Denticle herring	MODERN SPECIES	16	rb1 (ENSDCDG00000013751)	ccdc61 (ENSDCDG00000013740)	ENSDCDG00000013736	si:ch211-191j22.3 (ENSDCDG00000013734)	ENSDCDG00000013718	ppm1nb (ENSDCDG00000013717)	rtn2b (ENSDCDG00000013715)	nectin3b (ENSDCDG00000013713)	ENSDCDG00000013712	b9d2 (ENSDCDG00000013709)	cbr1l (ENSDCDG00000013706)	defbl1 (ENSDCDG00000013700) #17	ENSDCDG00000013698	pold3 (ENSDCDG00000013696) #18	chrdl2 (ENSDCDG00000013690) #19	neu3.5 (ENSDCDG00000013686) #25	pals1b (ENSDCDG00000013681)	ENSDCDG00000013671	pals1b (ENSDCDG00000012372)	atp6v1d (ENSDCDG00000012010)	rbm25b (ENSDCDG00000011916)	hsp90ab1 (ENSDCDG00000008304)	elp3 (ENSDCDG00000007728)	ENSDCDG00000007706	gphnb (ENSDCDG00000005811)	msi2a (ENSDCDG00000005614)	ENSDCDG00000005607	ENSDCDG00000005600	dlat (ENSDCDG00000005590)	chek1 (ENSDCDG00000005581)	ENSDCDG00000005578
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	113				ENSGT00940000165793	ENSGT00940000175321	ENSGT00940000153936.b	ENSGT00950000182887.C.a.b	ENSGT01100000263522.B.a	ENSGT01100000263522.B.b	ENSGT00940000158353	ENSGT00390000006450	ENSGT00960000187097	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00440000038181	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00390000015701 #26	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00940000160131	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000158551	ENSGT00940000153680.a	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT01060000248592.C	ENSGT01060000248589.A	ENSGT01060000248589.B	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00940000162644	ENSGT00390000003912	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000161729.n
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00700000104815	ENSGT00730000111282.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00940000157956.p	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157536.a.b	ENSGT00940000159295	ENSGT00940000155114	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00940000163239 #18	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00390000015701 #26	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00940000164481.b.b	ENSGT00390000016213	ENSGT00940000157181	ENSGT01100000263497.D	ENSGT00390000014835	ENSGT00940000175063	ENSGT00940000159256.o
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	107						ENSGT00730000111282.b.c	ENSGT00940000153993.A.j.h	ENSGT00940000157956.o.b.e.a	ENSGT00940000166305.B.h	ENSGT00970000198205	ENSGT00940000155114.o.a	ENSGT00940000159306.b.a.d	ENSGT00390000001520.d	ENSGT00940000166571.d #19	ENSGT00940000163239.g #18	ENSGT00950000182944.A.a.c #25	ENSGT00390000015701.b #26	ENSGT00650000094922.c.a #27	ENSGT00390000016213.j	ENSGT00940000157181.c	ENSGT01100000263497.D.h	ENSGT00990000211386	ENSGT00940000160330	ENSGT00940000158431.a.a.a.a.b.a.c.b.a	ENSGT00390000005826.a.a.u.a	ENSGT00500000044869.a.b.m	ENSGT00940000155312.b.e	ENSGT00940000155288.b.pd.a.a	ENSGT00940000160232.k.a	ENSGT00940000161428.a	ENSGT00940000160457.a.d
Huchen	MODERN SPECIES	263			PAK3 (ENSHHUG00000047475)	her1 (ENSHHUG00000047498)	mepcea (ENSHHUG00000047501)	ENSHHUG00000047507	ENSHHUG00000047517	ENSHHUG00000047526	ephb4a (ENSHHUG00000047570)	ENSHHUG00000047681	PSMB6 (ENSHHUG00000047684)	KCNAB3 (ENSHHUG00000047692)	spag7 (ENSHHUG00000047837)	chrdl2 (ENSHHUG00000047853) #19	pold3 (ENSHHUG00000047869) #18	NEU3 (ENSHHUG00000047887) #25	wdr73 (ENSHHUG00000047891) #26	defbl2 (ENSHHUG00000047905) #27	nfrkb (ENSHHUG00000047910)	tmem45b (ENSHHUG00000047932)	gng8 (ENSHHUG00000047939)	ENSHHUG00000047943	ENSHHUG00000047947	ENSHHUG00000047949	napaa (ENSHHUG00000047952)	RSPH6A (ENSHHUG00000047974)	ENSHHUG00000047979	ENSHHUG00000048013	ENSHHUG00000048017	ENSHHUG00000048022	ENSHHUG00000048031
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00530000063484.b.a.g.b	ENSGT00940000154895.a.b.h	ENSGT00940000156128.b.i	ENSGT00950000182988.a.b.b.b.q.b	ENSGT00730000111282.b.c	ENSGT00940000153993.A.j.h	ENSGT00940000157956.o.b.e.a	ENSGT00940000166305.B.h	ENSGT00970000198205	ENSGT00940000155114.o.a	ENSGT00940000159306.b.a.c.b.a	ENSGT00940000159306.b.a.d	ENSGT00390000001520.d	ENSGT00940000166571.d #19	ENSGT00940000163239.g #18	ENSGT00950000182944.A.a.c #25	ENSGT00390000015701.b #26	ENSGT00650000094922.c.a #27	ENSGT00390000016213.j	ENSGT00940000157181.c	ENSGT01100000263497.D.h	ENSGT00990000211386	ENSGT00940000160330	ENSGT00940000158431.a.a.a.a.b.a.c.b.a	ENSGT00390000005826.a.a.u.a	ENSGT00500000044869.a.b.m	ENSGT00940000155312.b.e	ENSGT00940000155288.b.pd.a.a	ENSGT00940000160232.k.a	ENSGT00940000161428.a	ENSGT00940000160457.a.d
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000159971.k	ENSGT00530000063484.b.a.g.b	ENSGT00940000154895.a.b.h	ENSGT00940000156128.b.i	ENSGT00950000182988.a.b.b.b.q.b	ENSGT00730000111282.b.c	ENSGT00940000153993.A.j.h	ENSGT00940000157956.o.b.e.a	ENSGT00940000166305.B.h	ENSGT00970000198205	ENSGT00940000155114.o.a	ENSGT00940000159306.b.a.d	ENSGT00390000001520.d	ENSGT00940000166571.d #19	ENSGT00940000163239.g #18	ENSGT00950000182944.A.a.c #25	ENSGT00390000015701.b #26	ENSGT00650000094922.c.a #27	ENSGT00390000016213.j	ENSGT00940000157181.c	ENSGT01100000263497.D.h	ENSGT00990000211386	ENSGT00940000156646.c.e	ENSGT00940000160330	ENSGT00940000158431.a.a.a.a.b.a.c.b.a	ENSGT00390000005826.a.a.u.a	ENSGT00500000044869.a.b.m	ENSGT00940000155312.b.e	ENSGT00940000155288.b.pd.a.a	ENSGT00940000160232.k.a	ENSGT00940000161428.a
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	23	il13ra2 (ENSSSAG00000051928)	ENSSSAG00000051908	ENSSSAG00000051877	ENSSSAG00000051310	ENSSSAG00000068125	her1 (ENSSSAG00000045929)	mepcea (ENSSSAG00000045920)	ENSSSAG00000006558	ephb4a (ENSSSAG00000111074)	ENSSSAG00000083386	ENSSSAG00000103571	ENSSSAG00000119780	ENSSSAG00000088026	chrdl2 (ENSSSAG00000005351) #19	ENSSSAG00000005314 #18	ENSSSAG00000088831 #25	defbl2 (ENSSSAG00000087880) #27	ENSSSAG00000106743 #26	nfrkb (ENSSSAG00000005134)	ENSSSAG00000005260	gbg8 (ENSSSAG00000005246)	ENSSSAG00000005239	ENSSSAG00000117353	ENSSSAG00000005094	snaa (ENSSSAG00000005060)	ENSSSAG00000005042	ENSSSAG00000003910	ENSSSAG00000003824	ENSSSAG00000003110	ENSSSAG00000002603	ENSSSAG00000113183
River trout	MODERN SPECIES	10	ENSSTUG00000030922	ENSSTUG00000030941	ENSSTUG00000030954	PAK3 (ENSSTUG00000031007)	ENSSTUG00000031049	her1 (ENSSTUG00000031054)	mepcea (ENSSTUG00000031059)	DLG4 (ENSSTUG00000031075)	ephb4a (ENSSTUG00000031657)	ENSSTUG00000031681	PSMB6 (ENSSTUG00000031722)	KCNAB3 (ENSSTUG00000031742)	spag7 (ENSSTUG00000031758)	chrdl2 (ENSSTUG00000031772) #19	pold3 (ENSSTUG00000031790) #18	NEU3 (ENSSTUG00000031846) #25	wdr73 (ENSSTUG00000031854) #26	defbl2 (ENSSTUG00000031875) #27	nfrkb (ENSSTUG00000031893)	tmem45b (ENSSTUG00000032001)	gng8 (ENSSTUG00000032025)	ENSSTUG00000032031	ENSSTUG00000032050	ENSSTUG00000032163	napaa (ENSSTUG00000032173)	ENSSTUG00000032207	ENSSTUG00000032255	zgc:153345 (ENSSTUG00000033399)	RYR1 (ENSSTUG00000033866)	ENSSTUG00000002413	b9d2 (ENSSTUG00000003188)
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Coho salmon	MODERN SPECIES	21	PAK3 (ENSOKIG00005049992)	her7 (ENSOKIG00005049976)	her7 (ENSOKIG00005049971)	her7 (ENSOKIG00005049967)	her7 (ENSOKIG00005049964)	her1 (ENSOKIG00005049962)	mepcea (ENSOKIG00005049960)	DLG4 (ENSOKIG00005049897)	ephb4a (ENSOKIG00005049858)	tnfsf13 (ENSOKIG00005049851)	PSMB6 (ENSOKIG00005049848)	KCNAB3 (ENSOKIG00005049838)	spag7 (ENSOKIG00005049823)	chrdl2 (ENSOKIG00005049818) #19	ENSOKIG00005049811 #20	NEU3 (ENSOKIG00005049809) #25	defbl2 (ENSOKIG00005049807) #27	st14b (ENSOKIG00005049804)	nfrkb (ENSOKIG00005049797)	tmem45b (ENSOKIG00005049790)	gng8 (ENSOKIG00005049786)	sycn.2 (ENSOKIG00005049782)	ENSOKIG00005049780	ENSOKIG00005049772	ENSOKIG00005049767	napaa (ENSOKIG00005049734)	RSPH6A (ENSOKIG00005049717)	SYMPK (ENSOKIG00005049688)	ENSOKIG00005049610	im:7138535 (ENSOKIG00005049601)	ENSOKIG00005049597
Rainbow trout	MODERN SPECIES	364	her7 (ENSOMYG00000075219)	her1 (ENSOMYG00000036410)	mepcea (ENSOMYG00000036417)	ENSOMYG00000036450	ephb4a (ENSOMYG00000055315)	ENSOMYG00000074215	ENSOMYG00000055695	tnfsf13 (ENSOMYG00000036508)	ENSOMYG00000036493	ENSOMYG00000036765	ENSOMYG00000039211	ENSOMYG00000039221 #19	ENSOMYG00000058486	ENSOMYG00000062975 #18	ENSOMYG00000039235 #20	ENSOMYG00000039262 #25	ENSOMYG00000064410	st14b (ENSOMYG00000039274)	nfrkb (ENSOMYG00000039365)	tmem45b (ENSOMYG00000039451)	ENSOMYG00000052403	gng8 (ENSOMYG00000060005)	sycn.2 (ENSOMYG00000039942)	ENSOMYG00000065741	ENSOMYG00000073264	ENSOMYG00000039952	ENSOMYG00000039955	napaa (ENSOMYG00000039684)	ENSOMYG00000040039	ENSOMYG00000040287	ENSOMYG00000040902
Huchen	MODERN SPECIES	401							ENSHHUG00000003279	ENSHHUG00000003272	tnfsf13 (ENSHHUG00000003246)	PSMB6 (ENSHHUG00000003220)	KCNAB3 (ENSHHUG00000003168)	spag7 (ENSHHUG00000003139)	chrdl2 (ENSHHUG00000003096) #19	pold3 (ENSHHUG00000003082) #18	ENSHHUG00000003069	NEU3 (ENSHHUG00000003065) #25	wdr73 (ENSHHUG00000003058) #26	defbl2 (ENSHHUG00000003016) #27	st14b (ENSHHUG00000003010)	nfrkb (ENSHHUG00000003000)	tmem45b (ENSHHUG00000002985)	gng8 (ENSHHUG00000002971)	sycn.2 (ENSHHUG00000002961)	ENSHHUG00000002955	ENSHHUG00000002945	napaa (ENSHHUG00000002555)	ENSHHUG00000002465	SYMPK (ENSHHUG00000002239)	ENSHHUG00000002053	im:7138535 (ENSHHUG00000002029)	zgc:153345 (ENSHHUG00000002015)
Northern pike	MODERN SPECIES	6	PAK3 (ENSELUG00000001587)	her7 (ENSELUG00000025242)	her7 (ENSELUG00000018519)	her1 (ENSELUG00000033502)	mepcea (ENSELUG00000018561)	DLG4 (ENSELUG00000018741)	ephb4a (ENSELUG00000018814)	ENSELUG00000029460	tnfsf13 (ENSELUG00000018833)	psmb6 (ENSELUG00000018917)	KCNAB3 (ENSELUG00000018953)	spag7 (ENSELUG00000018959)	chrdl2 (ENSELUG00000019011) #19	pold3 (ENSELUG00000019068) #18	ENSELUG00000030086 #20	neu3.5 (ENSELUG00000031402) #25	wdr73 (ENSELUG00000019094) #26	defbl2 (ENSELUG00000019103) #27	st14b (ENSELUG00000000812)	nfrkb (ENSELUG00000019186)	tmem45b (ENSELUG00000019210)	gng8 (ENSELUG00000025754)	sycn.2 (ENSELUG00000019231)	ENSELUG00000019250	EHD2 (ENSELUG00000019299)	ENSELUG00000019352	ENSELUG00000019308	napaa (ENSELUG00000019393)	RSPH6A (ENSELUG00000019472)	SYMPK (ENSELUG00000000850)	HNRNPUL1 (ENSELUG00000019520)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	194	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000161570	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000161570	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000178850	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00950000182962.a.a.c	ENSGT00550000074787.d.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000178850	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	214	ENSHCOG00000001884	klhl13 (ENSHCOG00000001866)	WDR44 (ENSHCOG00000001853)	zgc:163098 (ENSHCOG00000001838)	ENSHCOG00000001828	ENSHCOG00000001819	il13ra2 (ENSHCOG00000001808)	ENSHCOG00000001782	ENSHCOG00000001775	CAPN6 (ENSHCOG00000001768)	PAK3 (ENSHCOG00000001751)	mepcea (ENSHCOG00000001737)	defbl2 (ENSHCOG00000001728) #27	spag7 (ENSHCOG00000001721)	chrdl2 (ENSHCOG00000001717) #19	neu3.1 (ENSHCOG00000001706) #25	KCNAB3 (ENSHCOG00000000057)	ephb4a (ENSHCOG00000001430)	DLG4 (ENSHCOG00000001414)	zbtb20 (ENSHCOG00000001402)	slc25a5 (ENSHCOG00000001394)	ENSHCOG00000001386	cdc23 (ENSHCOG00000001380)	zgc:175280 (ENSHCOG00000001352)	CASR (ENSHCOG00000001307)	CASR (ENSHCOG00000001304)	b4galt4 (ENSHCOG00000001297)	ENSHCOG00000001294	ENSHCOG00000021019	gsx1 (ENSHCOG00000021013)	ENSHCOG00000020973
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000170012.b	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b.j	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000162696.c.b	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b.j	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000178850	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	165	ENSKMAG00000009578	ENSKMAG00000009593	klhl13 (ENSKMAG00000009629)	WDR44 (ENSKMAG00000009668)	zgc:163098 (ENSKMAG00000009727)	LRCH2 (ENSKMAG00000009841)	il13ra2 (ENSKMAG00000009902)	ENSKMAG00000009921	ENSKMAG00000009938	ENSKMAG00000009963	ENSKMAG00000010018	mepcea (ENSKMAG00000010102)	ENSKMAG00000010125 #27	spag7 (ENSKMAG00000010156)	chrdl2 (ENSKMAG00000010174) #19	neu3.1 (ENSKMAG00000010198) #25	KCNAB3 (ENSKMAG00000010218)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1620	WDR44 (ENSNFUG00015006676)	zgc:163098 (ENSNFUG00015006653)	ENSNFUG00015006635	LRCH2 (ENSNFUG00015006622)	il13ra2 (ENSNFUG00015006619)	ENSNFUG00015006615	DCX (ENSNFUG00015006611)	CAPN6 (ENSNFUG00015006456)	PAK3 (ENSNFUG00015006197)	ENSNFUG00015006116	MEPCE (ENSNFUG00015006107)	ENSNFUG00015006100 #27	SPAG7 (ENSNFUG00015006089)	CHRDL2 (ENSNFUG00015006064) #19	ENSNFUG00015006047 #20	NEU3 (ENSNFUG00015006042) #25	KCNAB3 (ENSNFUG00015005992)	ephb4a (ENSNFUG00015005893)	DLG4 (ENSNFUG00015005156)	zbtb20 (ENSNFUG00015004957)	SLC25A6 (ENSNFUG00015004935)	GFRA3 (ENSNFUG00015004922)	KIF20A (ENSNFUG00015004800)	CASR (ENSNFUG00015004766)	ENSNFUG00015004755	B4GALT4 (ENSNFUG00015004747)	ENSNFUG00015004741	ENSNFUG00015004730	GSX1 (ENSNFUG00015023772)	ATP6V1A (ENSNFUG00015023769)	ZDHHC23A (ENSNFUG00015023765)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000170012.b	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b.j	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b.j	ENSGT00940000156128.b.e	ENSGT00940000156128.b.f	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b.j	ENSGT00940000156128.b.e	ENSGT00940000156128.b.f.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b.j	ENSGT00940000156128.b.e.b	ENSGT00940000156128.b.e.a	ENSGT00940000156128.b.f.b	ENSGT00940000156128.b.f.a	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349	ENSGT00950000182962.a.a.c
Amazon molly	MODERN SPECIES	255								ENSPFOG00000019448	ENSPFOG00000023813	PAK3 (ENSPFOG00000019435)	mepcea (ENSPFOG00000019428)	defbl2 (ENSPFOG00000019427) #27	spag7 (ENSPFOG00000019424)	chrdl2 (ENSPFOG00000019419) #19	ENSPFOG00000022329 #20	neu3.1 (ENSPFOG00000019416) #25	KCNAB3 (ENSPFOG00000019413)	ephb4a (ENSPFOG00000019399)	DLG4 (ENSPFOG00000019381)	zbtb20 (ENSPFOG00000019375)	slc25a5 (ENSPFOG00000019373)	ENSPFOG00000019369	cdc23 (ENSPFOG00000019353)	kif20a (ENSPFOG00000019347)	zgc:175280 (ENSPFOG00000019339)	CASR (ENSPFOG00000019334)	b4galt4 (ENSPFOG00000019331)	ENSPFOG00000019327	gsx1 (ENSPFOG00000019324)	ENSPFOG00000019323	ENSPFOG00000019318
Sailfin molly	MODERN SPECIES	1222											mepcea (ENSPLAG00000014396)	defbl2 (ENSPLAG00000014405) #27	spag7 (ENSPLAG00000014413)	chrdl2 (ENSPLAG00000014451) #19	ENSPLAG00000014464 #20	neu3.1 (ENSPLAG00000014471) #25	KCNAB3 (ENSPLAG00000014495)	ephb4a (ENSPLAG00000014544)
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Platyfish	MODERN SPECIES	2	ENSXMAG00000023119	klhl13 (ENSXMAG00000012602)	WDR44 (ENSXMAG00000012621)	zgc:163098 (ENSXMAG00000012662)	LRCH2 (ENSXMAG00000012688)	il13ra2 (ENSXMAG00000012711)	ENSXMAG00000027031	ENSXMAG00000012721	ENSXMAG00000012735	PAK3 (ENSXMAG00000012751)	mepcea (ENSXMAG00000027456)	defbl2 (ENSXMAG00000023191) #27	spag7 (ENSXMAG00000024624)	chrdl2 (ENSXMAG00000029664) #19	ENSXMAG00000021167 #20	neu3.1 (ENSXMAG00000012775) #25	KCNAB3 (ENSXMAG00000027861)	ephb4a (ENSXMAG00000012812)	DLG4 (ENSXMAG00000012882)	zbtb20 (ENSXMAG00000012908)	slc25a5 (ENSXMAG00000020938)	ENSXMAG00000012915	cdc23 (ENSXMAG00000028922)	kif20a (ENSXMAG00000012940)	zgc:175280 (ENSXMAG00000012958)	CASR (ENSXMAG00000012971)	b4galt4 (ENSXMAG00000012973)	ENSXMAG00000012978	ENSXMAG00000012980	ENSXMAG00000011611	ATP6V1A (ENSXMAG00000012982)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154359.o	ENSGT00940000154359.p	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b.j	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349	ENSGT00950000182962.a.a.c
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	540							sox9a (ENSCVAG00000023444)	ENSCVAG00000023445	ENSCVAG00000023446	ENSCVAG00000023447	PAK3 (ENSCVAG00000023448)	mepcea (ENSCVAG00000023449)	defbl2 (ENSCVAG00000023450) #27	spag7 (ENSCVAG00000023451)	chrdl2 (ENSCVAG00000023452) #19	neu3.1 (ENSCVAG00000023453) #25	KCNAB3 (ENSCVAG00000023454)	ephb4a (ENSCVAG00000023455)	DLG4 (ENSCVAG00000023456)
Mummichog	MODERN SPECIES	693		ENSFHEG00000014136	WDR44 (ENSFHEG00000014153)	zgc:163098 (ENSFHEG00000014263)	LRCH2 (ENSFHEG00000014312)	il13ra2 (ENSFHEG00000014321)	ENSFHEG00000014355	ENSFHEG00000014383	ENSFHEG00000014401	PAK3 (ENSFHEG00000014416)	mepcea (ENSFHEG00000014422)	defbl2 (ENSFHEG00000014431) #27	spag7 (ENSFHEG00000014441)	chrdl2 (ENSFHEG00000014449) #19	ENSFHEG00000014455 #20	neu3.1 (ENSFHEG00000014463) #25	KCNAB3 (ENSFHEG00000000705)	ephb4a (ENSFHEG00000014581)	DLG4 (ENSFHEG00000014627)	zbtb20 (ENSFHEG00000014650)	slc25a5 (ENSFHEG00000014680)	ENSFHEG00000014699	cdc23 (ENSFHEG00000014759)	kif20a (ENSFHEG00000014776)	zgc:175280 (ENSFHEG00000014818)	CASR (ENSFHEG00000015075)	ENSFHEG00000015094	ENSFHEG00000015102	gsx1 (ENSFHEG00000015114)	ENSFHEG00000015125	ENSFHEG00000015150
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Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	5	klhl13 (ENSORLG00000007208)	WDR44 (ENSORLG00000007184)	zgc:163098 (ENSORLG00000007141)	LRCH2 (ENSORLG00000007113)	il13ra2 (ENSORLG00000007069)	ENSORLG00000007061	ENSORLG00000028908	ENSORLG00000022730	ENSORLG00000007043	PAK3 (ENSORLG00000007006)	mepcea (ENSORLG00000027617)	defbl2 (ENSORLG00000029256) #27	spag7 (ENSORLG00000029507)	chrdl2 (ENSORLG00000006973) #19	ENSORLG00000006960 #20	neu3.1 (ENSORLG00000028485) #25	KCNAB3 (ENSORLG00000006941)	ENSORLG00000030463	ephb4a (ENSORLG00000006909)	DLG4 (ENSORLG00000006845)	zbtb20 (ENSORLG00000025378)	ENSORLG00000006789	ENSORLG00000006782	cdc23 (ENSORLG00000006778)	kif20a (ENSORLG00000006748)	zgc:175280 (ENSORLG00000006716)	CASR (ENSORLG00000006682)	b4galt4 (ENSORLG00000006677)	ENSORLG00000022920	ENSORLG00000006672	gsx1 (ENSORLG00000006664)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	717	zgc:163098 (ENSOSIG00000024015)	ENSOSIG00000024016	ENSOSIG00000024017	ENSOSIG00000024018	il13ra2 (ENSOSIG00000003790)	ENSOSIG00000003797	ENSOSIG00000003805	ENSOSIG00000003840	ENSOSIG00000003925	PAK3 (ENSOSIG00000003993)	mepcea (ENSOSIG00000006021)	ENSOSIG00000006022 #27	spag7 (ENSOSIG00000006024)	ENSOSIG00000006025 #19	ENSOSIG00000006029 #20	neu3.1 (ENSOSIG00000006030) #25	KCNAB3 (ENSOSIG00000006034)	ephb4a (ENSOSIG00000006070)	DLG4 (ENSOSIG00000006106)	zbtb20 (ENSOSIG00000010299)	slc25a5 (ENSOSIG00000010301)	ENSOSIG00000010304	cdc23 (ENSOSIG00000010313)	kif20a (ENSOSIG00000010768)	zgc:175280 (ENSOSIG00000010818)	CASR (ENSOSIG00000010849)	b4galt4 (ENSOSIG00000010850)	ENSOSIG00000010851	gsx1 (ENSOSIG00000010852)	ENSOSIG00000010853	ATP6V1A (ENSOSIG00000010886)
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT01030000235286	ENSGT00940000156128.b.g	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349	ENSGT00950000182962.a.a.c
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	5	klhl13 (ENSOJAG00000007961)	WDR44 (ENSOJAG00000008216)	LRCH2 (ENSOJAG00000009038)	il13ra2 (ENSOJAG00000009055)	ENSOJAG00000009074	ENSOJAG00000009094	ENSOJAG00000009126	ENSOJAG00000009214	ENSOJAG00000009280	PAK3 (ENSOJAG00000009632)	mepcea (ENSOJAG00000010230)	ENSOJAG00000010239 #27	spag7 (ENSOJAG00000010259)	chrdl2 (ENSOJAG00000010282) #19	ENSOJAG00000010292 #20	neu3.1 (ENSOJAG00000010304) #25	KCNAB3 (ENSOJAG00000010444)	ephb4a (ENSOJAG00000011767)	DLG4 (ENSOJAG00000012147)	zbtb20 (ENSOJAG00000014619)	slc25a5 (ENSOJAG00000014638)	ENSOJAG00000014688	cdc23 (ENSOJAG00000014709)	kif20a (ENSOJAG00000014973)	zgc:175280 (ENSOJAG00000015419)	CASR (ENSOJAG00000015518)	b4galt4 (ENSOJAG00000015548)	ENSOJAG00000015560	gsx1 (ENSOJAG00000015778)	ENSOJAG00000015794	ENSOJAG00000015829
Indian medaka	MODERN SPECIES	4	ENSOMEG00000002113	ENSOMEG00000002106	ENSOMEG00000002099	ENSOMEG00000002096	ENSOMEG00000000890	ENSOMEG00000002090	ENSOMEG00000000647	ENSOMEG00000002083	CAPN6 (ENSOMEG00000002072)	PAK3 (ENSOMEG00000000022)	mepcea (ENSOMEG00000002027)	ENSOMEG00000002020 #27	spag7 (ENSOMEG00000002015)	chrdl2 (ENSOMEG00000002002) #19	ENSOMEG00000001984 #20	neu3.1 (ENSOMEG00000001975) #25	KCNAB3 (ENSOMEG00000001963)	ephb4a (ENSOMEG00000001930)	DLG4 (ENSOMEG00000001894)	zbtb20 (ENSOMEG00000022583)	slc25a5 (ENSOMEG00000022568)	ENSOMEG00000022535	ENSOMEG00000022513	cdc23 (ENSOMEG00000022499)	kif20a (ENSOMEG00000022448)	zgc:175280 (ENSOMEG00000000588)	CASR (ENSOMEG00000022274)	b4galt4 (ENSOMEG00000022251)	ENSOMEG00000022228	ENSOMEG00000022186	gsx1 (ENSOMEG00000022169)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349	ENSGT00950000182962.a.a.c
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00940000178035	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349	ENSGT00950000182962.a.a.c
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000170012.b	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00940000178035	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349	ENSGT00950000182962.a.a.c
Orange clownfish	MODERN SPECIES	6	klhl13 (ENSAPEG00000001532)	WDR44 (ENSAPEG00000001435)	zgc:163098 (ENSAPEG00000001348)	LRCH2 (ENSAPEG00000001259)	il13ra2 (ENSAPEG00000001250)	ENSAPEG00000001230	ENSAPEG00000001202	ENSAPEG00000001181	CAPN6 (ENSAPEG00000001173)	PAK3 (ENSAPEG00000001106)	mepcea (ENSAPEG00000001077)	defbl2 (ENSAPEG00000001050) #27	spag7 (ENSAPEG00000001023)	chrdl2 (ENSAPEG00000000959) #19	ENSAPEG00000000948	neu3.1 (ENSAPEG00000000939) #25	KCNAB3 (ENSAPEG00000000865)	ephb4a (ENSAPEG00000000843)	ENSAPEG00000000823	DLG4 (ENSAPEG00000000772)	zbtb20 (ENSAPEG00000000755)	slc25a5 (ENSAPEG00000000725)	ENSAPEG00000000633	cdc23 (ENSAPEG00000000605)	kif20a (ENSAPEG00000000528)	zgc:175280 (ENSAPEG00000000390)	CASR (ENSAPEG00000000343)	b4galt4 (ENSAPEG00000000316)	ENSAPEG00000024542	ENSAPEG00000024539	gsx1 (ENSAPEG00000024536)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	3194														chrdl2 (ENSAOCG00000023759) #19	ENSAOCG00000001736	neu3.1 (ENSAOCG00000023732) #25	KCNAB3 (ENSAOCG00000023721)	ephb4a (ENSAOCG00000023692)	DLG4 (ENSAOCG00000001698)	zbtb20 (ENSAOCG00000001687)	slc25a5 (ENSAOCG00000023538)	ENSAOCG00000023517	cdc23 (ENSAOCG00000023487)	kif20a (ENSAOCG00000023445)	zgc:175280 (ENSAOCG00000023389)	CASR (ENSAOCG00000002065)	b4galt4 (ENSAOCG00000023124)	ENSAOCG00000023116	gsx1 (ENSAOCG00000023111)	ENSAOCG00000023098	ENSAOCG00000023080
Spiny chromis	MODERN SPECIES	87								klhl4 (ENSAPOG00000005078)	ENSAPOG00000005148	ENSAPOG00000005192	mepcea (ENSAPOG00000005209)	defbl2 (ENSAPOG00000005234) #27	spag7 (ENSAPOG00000005268)	chrdl2 (ENSAPOG00000005282) #19	ENSAPOG00000005302	neu3.1 (ENSAPOG00000005320) #25	KCNAB3 (ENSAPOG00000005907)	ephb4a (ENSAPOG00000006005)	DLG4 (ENSAPOG00000006156)	zbtb20 (ENSAPOG00000006197)	slc25a5 (ENSAPOG00000006216)	ENSAPOG00000006231	cdc23 (ENSAPOG00000006290)	kif20a (ENSAPOG00000006379)	zgc:175280 (ENSAPOG00000006459)	CASR (ENSAPOG00000006738)	b4galt4 (ENSAPOG00000006778)	ENSAPOG00000006796	ARHGAP31 (ENSAPOG00000006810)	gsx1 (ENSAPOG00000006823)	ENSAPOG00000006857
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	303	ENSSPAG00000000827	klhl13 (ENSSPAG00000000834)	WDR44 (ENSSPAG00000000856)	zgc:163098 (ENSSPAG00000000916)	LRCH2 (ENSSPAG00000000932)	il13ra2 (ENSSPAG00000001044)	ENSSPAG00000001052	ENSSPAG00000001066	CAPN6 (ENSSPAG00000001103)	PAK3 (ENSSPAG00000001121)	mepcea (ENSSPAG00000001215)	defbl2 (ENSSPAG00000001220) #27	spag7 (ENSSPAG00000001236)	chrdl2 (ENSSPAG00000001249) #19	ENSSPAG00000001279 #20	neu3.1 (ENSSPAG00000001287) #25	KCNAB3 (ENSSPAG00000001367)	ephb4a (ENSSPAG00000002280)	DLG4 (ENSSPAG00000002389)	zbtb20 (ENSSPAG00000002466)	slc25a5 (ENSSPAG00000002476)	ENSSPAG00000002519	cdc23 (ENSSPAG00000002552)	kif20a (ENSSPAG00000002610)	zgc:175280 (ENSSPAG00000002654)	CASR (ENSSPAG00000002702)	b4galt4 (ENSSPAG00000002731)	ENSSPAG00000002737	gsx1 (ENSSPAG00000002754)	ENSSPAG00000002775	ATP6V1A (ENSSPAG00000002871)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000170012.b	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00940000167349
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	316	ENSHBUG00000022865	klhl13 (ENSHBUG00000022852)	WDR44 (ENSHBUG00000022792)	zgc:163098 (ENSHBUG00000022716)	LRCH2 (ENSHBUG00000022582)	il13ra2 (ENSHBUG00000022573)	ENSHBUG00000022549	ENSHBUG00000022513	ENSHBUG00000022468	PAK3 (ENSHBUG00000022441)	mepcea (ENSHBUG00000022377)	ENSHBUG00000022371 #27	spag7 (ENSHBUG00000022355)	chrdl2 (ENSHBUG00000022343) #19	ENSHBUG00000022335 #20	neu3.1 (ENSHBUG00000022320) #25	KCNAB3 (ENSHBUG00000022306)	ephb4a (ENSHBUG00000022249)	DLG4 (ENSHBUG00000021892)	zbtb20 (ENSHBUG00000021810)	slc25a5 (ENSHBUG00000021794)	ENSHBUG00000021756	cdc23 (ENSHBUG00000021740)	kif20a (ENSHBUG00000021672)	zgc:175280 (ENSHBUG00000021656)	CASR (ENSHBUG00000021647)	b4galt4 (ENSHBUG00000021627)	ENSHBUG00000021621	ENSHBUG00000021606	gsx1 (ENSHBUG00000021594)	ENSHBUG00000021585
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000170012.b	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000176877.a.a.b	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000170012.b	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000176877.a.a.b	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1092	ENSMZEG00005016764	ENSMZEG00005016767	klhl13 (ENSMZEG00005016775)	WDR44 (ENSMZEG00005016787)	zgc:163098 (ENSMZEG00005016805)	LRCH2 (ENSMZEG00005016833)	il13ra2 (ENSMZEG00005016847)	ENSMZEG00005016855	ENSMZEG00005016861	ENSMZEG00005016867	PAK3 (ENSMZEG00005016881)	mepcea (ENSMZEG00005016927)	defbl2 (ENSMZEG00005016935) #27	spag7 (ENSMZEG00005016948)	chrdl2 (ENSMZEG00005016967) #19	neu3.1 (ENSMZEG00005016972) #25	KCNAB3 (ENSMZEG00005016976)	ephb4a (ENSMZEG00005017020)	DLG4 (ENSMZEG00005017060)	zbtb20 (ENSMZEG00005017078)	slc25a5 (ENSMZEG00005017085)	ENSMZEG00005017094	cdc23 (ENSMZEG00005017099)	kif20a (ENSMZEG00005017113)	zgc:175280 (ENSMZEG00005017124)	CASR (ENSMZEG00005017168)	b4galt4 (ENSMZEG00005018344)	ENSMZEG00005018346	gsx1 (ENSMZEG00005018350)	ENSMZEG00005018353	ATP6V1A (ENSMZEG00005018360)
Eastern happy	MODERN SPECIES	1	ENSACLG00000016521	klhl13 (ENSACLG00000016535)	WDR44 (ENSACLG00000016595)	zgc:163098 (ENSACLG00000016647)	LRCH2 (ENSACLG00000016781)	il13ra2 (ENSACLG00000016811)	ENSACLG00000016835	ENSACLG00000016853	ENSACLG00000016898	PAK3 (ENSACLG00000016946)	mepcea (ENSACLG00000017089)	ENSACLG00000017111 #27	spag7 (ENSACLG00000017150)	chrdl2 (ENSACLG00000017255) #19	ENSACLG00000017285 #20	neu3.1 (ENSACLG00000017325) #25	KCNAB3 (ENSACLG00000017346)	ephb4a (ENSACLG00000017429)	DLG4 (ENSACLG00000017536)	zbtb20 (ENSACLG00000017873)	slc25a5 (ENSACLG00000017899)	ENSACLG00000017944	cdc23 (ENSACLG00000017972)	kif20a (ENSACLG00000018065)	ENSACLG00000018119	zgc:175280 (ENSACLG00000018154)	CASR (ENSACLG00000018246)	b4galt4 (ENSACLG00000018259)	ENSACLG00000018269	ENSACLG00000018286	gsx1 (ENSACLG00000018323)
P. nyererei	MODERN SPECIES	359	ENSPNYG00000016644	ENSPNYG00000016626	klhl13 (ENSPNYG00000016602)	WDR44 (ENSPNYG00000016554)	zgc:163098 (ENSPNYG00000016481)	LRCH2 (ENSPNYG00000016401)	il13ra2 (ENSPNYG00000016382)	ENSPNYG00000016317	ENSPNYG00000016293	ENSPNYG00000016119	PAK3 (ENSPNYG00000015725)	mepcea (ENSPNYG00000015597)	defbl2 (ENSPNYG00000015587) #27	spag7 (ENSPNYG00000015519)	chrdl2 (ENSPNYG00000015500) #19	neu3.1 (ENSPNYG00000015488) #25	KCNAB3 (ENSPNYG00000015455)	ephb4a (ENSPNYG00000015420)	DLG4 (ENSPNYG00000015386)	zbtb20 (ENSPNYG00000015366)	slc25a5 (ENSPNYG00000015346)	ENSPNYG00000015313	cdc23 (ENSPNYG00000015257)	kif20a (ENSPNYG00000015214)	ENSPNYG00000015194	zgc:175280 (ENSPNYG00000015150)	CASR (ENSPNYG00000014966)	b4galt4 (ENSPNYG00000014923)	ENSPNYG00000014906	ENSPNYG00000014892	gsx1 (ENSPNYG00000014873)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	378	ENSNBRG00000021161	klhl13 (ENSNBRG00000021173)	WDR44 (ENSNBRG00000021189)	zgc:163098 (ENSNBRG00000021199)	LRCH2 (ENSNBRG00000021243)	ENSNBRG00000021271	il13ra2 (ENSNBRG00000021286)	ENSNBRG00000021302	ENSNBRG00000021317	CAPN6 (ENSNBRG00000021345)	PAK3 (ENSNBRG00000021502)	mepcea (ENSNBRG00000021532)	defbl2 (ENSNBRG00000021537) #27	spag7 (ENSNBRG00000021547)	chrdl2 (ENSNBRG00000021556) #19	neu3.1 (ENSNBRG00000021580) #25	KCNAB3 (ENSNBRG00000021597)	ephb4a (ENSNBRG00000021627)	DLG4 (ENSNBRG00000021684)	zbtb20 (ENSNBRG00000021723)	slc25a5 (ENSNBRG00000021746)	ENSNBRG00000021796	cdc23 (ENSNBRG00000021843)	kif20a (ENSNBRG00000021876)	zgc:175280 (ENSNBRG00000021916)	ENSNBRG00000021971	CASR (ENSNBRG00000022021)	b4galt4 (ENSNBRG00000022133)	ENSNBRG00000022141	ENSNBRG00000022153	gsx1 (ENSNBRG00000022162)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	1	ENSONIG00000039571	ENSONIG00000005278	klhl13 (ENSONIG00000005275)	WDR44 (ENSONIG00000005269)	zgc:163098 (ENSONIG00000005263)	LRCH2 (ENSONIG00000005258)	il13ra2 (ENSONIG00000005254)	ENSONIG00000033591	DCX (ENSONIG00000027531)	ENSONIG00000005243	PAK3 (ENSONIG00000005232)	mepcea (ENSONIG00000033327)	ENSONIG00000023994 #27	spag7 (ENSONIG00000005227)	chrdl2 (ENSONIG00000005224) #19	neu3a (ENSONIG00000005223) #25	KCNAB3 (ENSONIG00000005215)	ephb4a (ENSONIG00000005204)	DLG4 (ENSONIG00000005194)	zbtb20 (ENSONIG00000005193)	slc25a5 (ENSONIG00000002822)	ENSONIG00000005188	cdc23 (ENSONIG00000005184)	ENSONIG00000037585	kif20a (ENSONIG00000005177)	zgc:175280 (ENSONIG00000005172)	CASR (ENSONIG00000005168)	b4galt4 (ENSONIG00000005167)	ENSONIG00000005164	gsx1 (ENSONIG00000005163)	ENSONIG00000005160
Midas cichlid	MODERN SPECIES	888													defbl2 (ENSACIG00000000700) #27	spag7 (ENSACIG00000000715)	chrdl2 (ENSACIG00000000746) #19	neu3.1 (ENSACIG00000000776) #25	KCNAB3 (ENSACIG00000000796)	ephb4a (ENSACIG00000000842)	DLG4 (ENSACIG00000000887)	ENSACIG00000000936	zbtb20 (ENSACIG00000000946)	slc25a5 (ENSACIG00000000952)	ENSACIG00000000971	cdc23 (ENSACIG00000000994)	kif20a (ENSACIG00000001045)	zgc:175280 (ENSACIG00000001095)	CASR (ENSACIG00000001191)	b4galt4 (ENSACIG00000001214)	ENSACIG00000001232	gsx1 (ENSACIG00000001245)	ENSACIG00000001273
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000179312	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000161570	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154622.a.b.m	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00950000182962.a.a.c	ENSGT00550000074787.d.a.b	ENSGT00940000156558.a.b
Fugu	MODERN SPECIES	6	ENSTRUG00000024988	ENSTRUG00000020929	klhl13 (ENSTRUG00000016735)	WDR44 (ENSTRUG00000016743)	LRCH2 (ENSTRUG00000016753)	ENSTRUG00000016772	ENSTRUG00000031958	DCX (ENSTRUG00000016775)	ENSTRUG00000016780	PAK3 (ENSTRUG00000016790)	mepcea (ENSTRUG00000023614)	ENSTRUG00000022488 #27	spag7 (ENSTRUG00000016806)	chrdl2 (ENSTRUG00000016808) #19	ENSTRUG00000027911 #20	neu3.1 (ENSTRUG00000022280) #25	KCNAB3 (ENSTRUG00000016817)	ephb4a (ENSTRUG00000016825)	DLG4 (ENSTRUG00000016826)	zbtb20 (ENSTRUG00000016839)	ants6 (ENSTRUG00000016841)	ENSTRUG00000016846	cdc23 (ENSTRUG00000016848)	kif20a (ENSTRUG00000016852)	zgc:175280 (ENSTRUG00000016862)	CASR (ENSTRUG00000016870)	b4galt4 (ENSTRUG00000016879)	ENSTRUG00000032078	ENSTRUG00000016892	ENSTRUG00000016893	ATP6V1A (ENSTRUG00000016898)
Tetraodon	MODERN SPECIES	22	dpf2 (ENSTNIG00000010057)	SPTBN2 (ENSTNIG00000010056)	LTBP3 (ENSTNIG00000010055)	ENSTNIG00000010054	klhl13 (ENSTNIG00000010053)	WDR44 (ENSTNIG00000010052)	LRCH2 (ENSTNIG00000010051)	il13ra2 (ENSTNIG00000001799)	ENSTNIG00000010050	DCX (ENSTNIG00000010049)	ENSTNIG00000010048	PAK3 (ENSTNIG00000010047)	mepcea (ENSTNIG00000010046)	spag7 (ENSTNIG00000010045)	chrdl2 (ENSTNIG00000010044) #19	neu3.1 (ENSTNIG00000010043) #25	KCNAB3 (ENSTNIG00000010042)	ENSTNIG00000010041	ephb4a (ENSTNIG00000010040)	DLG4 (ENSTNIG00000010039)	zbtb20 (ENSTNIG00000010038)	ENSTNIG00000010037	ENSTNIG00000010036	cdc23 (ENSTNIG00000010035)	kif20a (ENSTNIG00000010034)	zgc:175280 (ENSTNIG00000010033)	CASR (ENSTNIG00000010032)	b4galt4 (ENSTNIG00000010031)	ENSTNIG00000010030	ENSTNIG00000010029	ENSTNIG00000000759
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	56	rps14 (ENSLBEG00000002421)	WDR44 (ENSLBEG00000002455)	zgc:163098 (ENSLBEG00000002498)	LRCH2 (ENSLBEG00000002683)	il13ra2 (ENSLBEG00000002719)	ENSLBEG00000002745	ENSLBEG00000002765	ENSLBEG00000002796	ENSLBEG00000002820	PAK3 (ENSLBEG00000002856)	mepcea (ENSLBEG00000002932)	defbl2 (ENSLBEG00000002947) #27	spag7 (ENSLBEG00000002961)	chrdl2 (ENSLBEG00000002978) #19	ENSLBEG00000002995 #20	neu3.1 (ENSLBEG00000003026) #25	KCNAB3 (ENSLBEG00000003037)	ephb4a (ENSLBEG00000003073)	DLG4 (ENSLBEG00000003177)	zbtb20 (ENSLBEG00000003299)	slc25a5 (ENSLBEG00000003333)	ENSLBEG00000003363	cdc23 (ENSLBEG00000003397)	kif20a (ENSLBEG00000003479)	zgc:175280 (ENSLBEG00000003521)	CASR (ENSLBEG00000003570)	b4galt4 (ENSLBEG00000003593)	ENSLBEG00000003615	gsx1 (ENSLBEG00000003628)	ENSLBEG00000003642	ATP6V1A (ENSLBEG00000003686)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00950000182962.a.a.c	ENSGT00550000074787.d.a.b
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00950000182962.a.a.c	ENSGT00550000074787.d.a.b	ENSGT00940000156558.a.b	ENSGT01050000244868.c.b
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	4	ENSSAUG00010025595	klhl13 (ENSSAUG00010025596)	WDR44 (ENSSAUG00010025602)	zgc:163098 (ENSSAUG00010025815)	LRCH2 (ENSSAUG00010025830)	il13ra2 (ENSSAUG00010025832)	ENSSAUG00010025833	ENSSAUG00010025834	CAPN6 (ENSSAUG00010025836)	PAK3 (ENSSAUG00010025886)	mepcea (ENSSAUG00010026538)	defbl2 (ENSSAUG00010026539) #27	spag7 (ENSSAUG00010026541)	chrdl2 (ENSSAUG00010026542) #19	ENSSAUG00010026544 #20	neu3.1 (ENSSAUG00010026547) #25	KCNAB3 (ENSSAUG00010026552)	ephb4a (ENSSAUG00010026574)	DLG4 (ENSSAUG00010026607)	zbtb20 (ENSSAUG00010026646)	SLC25A5 (ENSSAUG00010026647)	ENSSAUG00010026649	cdc23 (ENSSAUG00010026651)	kif20a (ENSSAUG00010001529)	zgc:175280 (ENSSAUG00010001799)	CASR (ENSSAUG00010001814)	b4galt4 (ENSSAUG00010001823)	ENSSAUG00010001831	ENSSAUG00010001837	ENSSAUG00010001841	ATP6V1A (ENSSAUG00010001843)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00950000182962.a.a.c	ENSGT00550000074787.d.a.b	ENSGT00940000156558.a.b	ENSGT01050000244868.c.b
European seabass	MODERN SPECIES	4	ENSDLAG00005001102	klhl13 (ENSDLAG00005001115)	ENSDLAG00005001188	zgc:163098 (ENSDLAG00005001664)	ENSDLAG00005028992	ENSDLAG00005001750	il13ra2 (ENSDLAG00005001759)	ENSDLAG00005031440	ENSDLAG00005001774	ENSDLAG00005001788	ENSDLAG00005001894	ENSDLAG00005001988	ENSDLAG00005001996 #27	ENSDLAG00005029222 #19	ENSDLAG00005002022 #20	ENSDLAG00005035044 #25	ENSDLAG00005002038	ENSDLAG00005002221	ENSDLAG00005003615	ENSDLAG00005004710	ENSDLAG00005004684	ENSDLAG00005004720	ENSDLAG00005004746	KIF20A (ENSDLAG00005004911)	zgc:175280 (ENSDLAG00005004934)	ENSDLAG00005005018	b4galt4 (ENSDLAG00005005129)	ENSDLAG00005005146	ENSDLAG00005005170	ENSDLAG00005005190	ENSDLAG00005005203
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	493	SPTBN2 (ENSLCRG00005013723)	LRCH2 (ENSLCRG00005013718)	ENSLCRG00005013717	ENSLCRG00005013715	ENSLCRG00005013714	ENSLCRG00005013706	ENSLCRG00005013705	ENSLCRG00005013703	CAPN6 (ENSLCRG00005013681)	PAK3 (ENSLCRG00005013626)	mepcea (ENSLCRG00005013612)	defbl2 (ENSLCRG00005013610) #27	spag7 (ENSLCRG00005013605)	chrdl2 (ENSLCRG00005013603) #19	ENSLCRG00005013602 #20	neu3.1 (ENSLCRG00005013601) #25	KCNAB3 (ENSLCRG00005013534)	ephb4a (ENSLCRG00005013471)	ENSLCRG00005013461	DLG4 (ENSLCRG00005007873)	zbtb20 (ENSLCRG00005007820)	slc25a5 (ENSLCRG00005007719)	ENSLCRG00005007716	cdc23 (ENSLCRG00005007446)	kif20a (ENSLCRG00005007414)	zgc:175280 (ENSLCRG00005007409)	CASR (ENSLCRG00005007402)	b4galt4 (ENSLCRG00005007397)	ENSLCRG00005007389	ENSLCRG00005007385	prdx4 (ENSLCRG00005007311)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00950000182962.a.a.c	ENSGT00550000074787.d.a.b
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00950000182962.a.a.c	ENSGT00550000074787.d.a.b
Pike perch	MODERN SPECIES	37	klhl13 (ENSSLUG00000017118)	WDR44 (ENSSLUG00000017175)	zgc:163098 (ENSSLUG00000017713)	LRCH2 (ENSSLUG00000017720)	il13ra2 (ENSSLUG00000017730)	ENSSLUG00000017733	ENSSLUG00000017735	CAPN6 (ENSSLUG00000017746)	ENSSLUG00000017760	PAK3 (ENSSLUG00000017797)	mepcea (ENSSLUG00000018178)	defbl2 (ENSSLUG00000018186) #27	spag7 (ENSSLUG00000018196)	chrdl2 (ENSSLUG00000018204) #19	ENSSLUG00000018214 #20	neu3.1 (ENSSLUG00000018222) #25	KCNAB3 (ENSSLUG00000018267)	ephb4a (ENSSLUG00000019372)	DLG4 (ENSSLUG00000019553)	zbtb20 (ENSSLUG00000022441)	slc25a5 (ENSSLUG00000022443)	ENSSLUG00000022451	cdc23 (ENSSLUG00000022463)	kif20a (ENSSLUG00000022502)	zgc:175280 (ENSSLUG00000022542)	CASR (ENSSLUG00000022588)	b4galt4 (ENSSLUG00000022606)	ENSSLUG00000022613	ENSSLUG00000022622	ENSSLUG00000022628	ATP6V1A (ENSSLUG00000022635)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	5	ENSCGOG00000020298	ENSCGOG00000020300	klhl13 (ENSCGOG00000020313)	WDR44 (ENSCGOG00000020380)	zgc:163098 (ENSCGOG00000020627)	LRCH2 (ENSCGOG00000020662)	il13ra2 (ENSCGOG00000020670)	ENSCGOG00000020672	ENSCGOG00000020674	CAPN6 (ENSCGOG00000020693)	PAK3 (ENSCGOG00000021210)	mepcea (ENSCGOG00000022358)	defbl2 (ENSCGOG00000022360) #27	spag7 (ENSCGOG00000022363)	chrdl2 (ENSCGOG00000022365) #19	neu3.1 (ENSCGOG00000022370) #25	KCNAB3 (ENSCGOG00000022404)	ephb4a (ENSCGOG00000022924)	DLG4 (ENSCGOG00000023411)	zbtb20 (ENSCGOG00000023770)	slc25a6 (ENSCGOG00000023776)	ENSCGOG00000023810	cdc23 (ENSCGOG00000023850)	kif20a (ENSCGOG00000023879)	zgc:175280 (ENSCGOG00000023892)	CASR (ENSCGOG00000023900)	b4galt4 (ENSCGOG00000023906)	ENSCGOG00000023908	ENSCGOG00000023909	ENSCGOG00000023910	ENSCGOG00000001603
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT01040000240539.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154622.a.b.m	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00950000182962.a.a.c	ENSGT00550000074787.d.a.b	ENSGT00940000156558.a.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	5	ENSCLMG00005012294	klhl13 (ENSCLMG00005012299)	WDR44 (ENSCLMG00005012565)	zgc:163098 (ENSCLMG00005013287)	ENSCLMG00005013288	ENSCLMG00005013290	il13ra2 (ENSCLMG00005013291)	ENSCLMG00005013292	ENSCLMG00005013293	CAPN6 (ENSCLMG00005013295)	PAK3 (ENSCLMG00005013311)	mepcea (ENSCLMG00005013448)	defbl2 (ENSCLMG00005013450) #27	spag7 (ENSCLMG00005013454)	chrdl2 (ENSCLMG00005013457) #19	neu3.1 (ENSCLMG00005013459) #25	KCNAB3 (ENSCLMG00005013462)	ephb4a (ENSCLMG00005013552)	DLG4 (ENSCLMG00005014402)	zbtb20 (ENSCLMG00005014405)	slc25a6 (ENSCLMG00005014408)	ENSCLMG00005014411	ENSCLMG00005014414	cdc23 (ENSCLMG00005014416)	kif20a (ENSCLMG00005014562)	zgc:175280 (ENSCLMG00005014696)	CASR (ENSCLMG00005014698)	b4galt4 (ENSCLMG00005014701)	ENSCLMG00005014702	ENSCLMG00005014705	ENSCLMG00005014707
Stickleback	MODERN SPECIES	7	ENSGACG00000020712	klhl13 (ENSGACG00000020711)	WDR44 (ENSGACG00000020710)	zgc:163098 (ENSGACG00000020709)	LRCH2 (ENSGACG00000020708)	il13ra2 (ENSGACG00000020707)	ENSGACG00000020706	ENSGACG00000020705	ENSGACG00000020704	PAK3 (ENSGACG00000020703)	ENSGACG00000020702	mepcea (ENSGACG00000020701)	defbl2 (ENSGACG00000020700) #27	spag7 (ENSGACG00000020699)	chrdl2 (ENSGACG00000020698) #19	neu3.1 (ENSGACG00000020697) #25	KCNAB3 (ENSGACG00000020696)	ephb4a (ENSGACG00000020695)	DLG4 (ENSGACG00000020694)	zbtb20 (ENSGACG00000020693)	ENSGACG00000020692	ENSGACG00000020691	cdc23 (ENSGACG00000020690)	kif20a (ENSGACG00000020689)	zgc:175280 (ENSGACG00000020688)	CASR (ENSGACG00000020687)	b4galt4 (ENSGACG00000020686)	ENSGACG00000020685	ENSGACG00000020684	ENSGACG00000020683	ATP6V1A (ENSGACG00000020682)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154622.a.b.m	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00940000178035	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154622.a.b.m	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c	ENSGT00550000074787.d.a.b
Greater amberjack	MODERN SPECIES	139	ENSSDUG00000010067	klhl13 (ENSSDUG00000010032)	WDR44 (ENSSDUG00000009993)	zgc:163098 (ENSSDUG00000009881)	LRCH2 (ENSSDUG00000009829)	il13ra2 (ENSSDUG00000009799)	ENSSDUG00000009783	ENSSDUG00000009748	CAPN6 (ENSSDUG00000009382)	PAK3 (ENSSDUG00000008331)	mepcea (ENSSDUG00000008253)	defbl2 (ENSSDUG00000008238) #27	spag7 (ENSSDUG00000008225)	chrdl2 (ENSSDUG00000008183) #19	ENSSDUG00000008172	neu3.1 (ENSSDUG00000008169) #25	KCNAB3 (ENSSDUG00000007354)	ephb4a (ENSSDUG00000007249)	DLG4 (ENSSDUG00000007205)	zbtb20 (ENSSDUG00000007188)	ENSSDUG00000007174	ENSSDUG00000007156	cdc23 (ENSSDUG00000007107)	kif20a (ENSSDUG00000007080)	zgc:175280 (ENSSDUG00000007014)	CASR (ENSSDUG00000006989)	b4galt4 (ENSSDUG00000006975)	ENSSDUG00000006959	ENSSDUG00000006944	ENSSDUG00000006920	ATP6V1A (ENSSDUG00000006881)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3035	ENSSLDG00000020530	klhl13 (ENSSLDG00000020504)	WDR44 (ENSSLDG00000020444)	zgc:163098 (ENSSLDG00000020364)	LRCH2 (ENSSLDG00000020331)	il13ra2 (ENSSLDG00000020312)	ENSSLDG00000020293	ENSSLDG00000020280	CAPN6 (ENSSLDG00000020262)	PAK3 (ENSSLDG00000020143)	mepcea (ENSSLDG00000020120)	defbl2 (ENSSLDG00000020114) #27	spag7 (ENSSLDG00000020103)	chrdl2 (ENSSLDG00000020064) #19	ENSSLDG00000020051	neu3.1 (ENSSLDG00000020043) #25	KCNAB3 (ENSSLDG00000020006)	ephb4a (ENSSLDG00000019946)	DLG4 (ENSSLDG00000019840)	zbtb20 (ENSSLDG00000019822)	ENSSLDG00000019804	ENSSLDG00000019788	cdc23 (ENSSLDG00000019752)	kif20a (ENSSLDG00000019720)	zgc:175280 (ENSSLDG00000019714)	CASR (ENSSLDG00000019692)	b4galt4 (ENSSLDG00000019681)	ENSSLDG00000019672	gsx1 (ENSSLDG00000019661)	ENSSLDG00000019626	ATP6V1A (ENSSLDG00000019592)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	94	ENSLCAG00010005694	klhl13 (ENSLCAG00010005705)	WDR44 (ENSLCAG00010005762)	zgc:163098 (ENSLCAG00010006045)	LRCH2 (ENSLCAG00010006112)	il13ra2 (ENSLCAG00010006126)	ENSLCAG00010006130	ENSLCAG00010006136	CAPN6 (ENSLCAG00010006146)	PAK3 (ENSLCAG00010006195)	mepcea (ENSLCAG00010006223)	defbl2 (ENSLCAG00010006231) #27	spag7 (ENSLCAG00010006239)	chrdl2 (ENSLCAG00010006252) #19	ENSLCAG00010006262 #20	ENSLCAG00010006274 #25	KCNAB3 (ENSLCAG00010006338)	ephb4a (ENSLCAG00010006501)	DLG4 (ENSLCAG00010006576)	zbtb20 (ENSLCAG00010006640)	ENSLCAG00010006647	ENSLCAG00010006663	cdc23 (ENSLCAG00010006697)	kif20a (ENSLCAG00010006765)	zgc:175280 (ENSLCAG00010006873)	CASR (ENSLCAG00010007265)	b4galt4 (ENSLCAG00010007287)	ENSLCAG00010007289	ENSLCAG00010007293	gsx1 (ENSLCAG00010007297)	ENSLCAG00010007307
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c
Turbot	MODERN SPECIES	16	klhl13 (ENSSMAG00000013595)	ENSSMAG00000013573	zgc:163098 (ENSSMAG00000013442)	ENSSMAG00000013376	il13ra2 (ENSSMAG00000013307)	ENSSMAG00000023137	ENSSMAG00000013241	ENSSMAG00000013231	ENSSMAG00000013188	ENSSMAG00000013182	ENSSMAG00000023875 #27	ENSSMAG00000013168	ENSSMAG00000013155 #19	ENSSMAG00000013136 #20	ENSSMAG00000013080	ENSSMAG00000013071 #25	ENSSMAG00000013005	ENSSMAG00000012907	ENSSMAG00000012883	ENSSMAG00000012861	ENSSMAG00000012828	ENSSMAG00000012742	KIF20A (ENSSMAG00000012711)	zgc:175280 (ENSSMAG00000012677)	ENSSMAG00000012665	b4galt4 (ENSSMAG00000012659)	ENSSMAG00000012641	ENSSMAG00000012630	ENSSMAG00000012555	ENSSMAG00000012526	ENSSMAG00000012496
Tongue sole	MODERN SPECIES	10	ENSCSEG00000020107	KLHL9 (ENSCSEG00000020109)	WDR44 (ENSCSEG00000020110)	zgc:163098 (ENSCSEG00000020119)	LRCH2 (ENSCSEG00000020135)	il13ra2 (ENSCSEG00000020143)	ENSCSEG00000020159	ENSCSEG00000020162	ENSCSEG00000020168	ENSCSEG00000020171	PAK3 (ENSCSEG00000020210)	mepcea (ENSCSEG00000020220)	ENSCSEG00000020221 #27	spag7 (ENSCSEG00000020223)	chrdl2 (ENSCSEG00000020231) #19	neu3.1 (ENSCSEG00000020236) #25	ENSCSEG00000020240	KCNAB3 (ENSCSEG00000020245)	ephb4a (ENSCSEG00000020306)	DLG4 (ENSCSEG00000020314)	zbtb20 (ENSCSEG00000020320)	slc25a5 (ENSCSEG00000020323)	ENSCSEG00000020329	cdc23 (ENSCSEG00000020338)	kif20a (ENSCSEG00000020345)	zgc:175280 (ENSCSEG00000020365)	CASR (ENSCSEG00000020372)	b4galt4 (ENSCSEG00000020375)	ENSCSEG00000020377	ENSCSEG00000020379	gsx1 (ENSCSEG00000020381)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	5	ENSMAMG00000016936	klhl13 (ENSMAMG00000016944)	ENSMAMG00000024463	ENSMAMG00000016965	zgc:163098 (ENSMAMG00000016977)	ENSMAMG00000017030	il13ra2 (ENSMAMG00000017034)	ENSMAMG00000027396	ENSMAMG00000017075	ENSMAMG00000017101	ENSMAMG00000017123	ENSMAMG00000017139	ENSMAMG00000017157 #27	ENSMAMG00000017173	ENSMAMG00000017181 #19	ENSMAMG00000017200 #25	ENSMAMG00000017208	ENSMAMG00000017219	ENSMAMG00000017275	ENSMAMG00000017438	ENSMAMG00000017456	ENSMAMG00000017476	ENSMAMG00000026984	ENSMAMG00000017506	KIF20A (ENSMAMG00000017548)	zgc:175280 (ENSMAMG00000017561)	ENSMAMG00000017580	b4galt4 (ENSMAMG00000017595)	ENSMAMG00000026946	ENSMAMG00000017611	ENSMAMG00000017618
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000170012	ENSGT00940000154359	ENSGT00940000157557	ENSGT00390000010687.a.b	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000159971	ENSGT00530000063484.b.a	ENSGT00940000154895.a.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000153993.A.j	ENSGT00650000094922 #27	ENSGT00390000001520	ENSGT00940000166571 #19	ENSGT00390000016048 #20	ENSGT00950000182944.A.a #25	ENSGT00940000159306.b.a	ENSGT00940000166305.B	ENSGT00940000157956.o.b	ENSGT00940000158617	ENSGT00940000154400	ENSGT00940000165282.b	ENSGT00950000182950.A	ENSGT00940000156931	ENSGT00940000164978.b.d	ENSGT00940000157596	ENSGT00940000158378	ENSGT00940000159458.e.b	ENSGT00940000159458.e.a	ENSGT00940000154361.A	ENSGT00950000182962.a.a.c
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Atlantic herring	DUPLICATION
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Atlantic herring	DUPLICATION
Atlantic herring	DUPLICATION
Atlantic herring	DUPLICATION
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Atlantic herring	MODERN SPECIES	4	DLK2 (ENSCHAG00000008913)	dnph1 (ENSCHAG00000009007)	mea1 (ENSCHAG00000009013)	ppp2r5d (ENSCHAG00000009027)	ENSCHAG00000009156	PPP2R5D (ENSCHAG00000009221)	ENSCHAG00000009343	CUL7 (ENSCHAG00000009408)	SYNDIG1 (ENSCHAG00000011053)	ENSCHAG00000011088	apmap (ENSCHAG00000011098)	ENSCHAG00000011129	TMEM26 (ENSCHAG00000011144)	ENSCHAG00000011149	ENSCHAG00000011222	NEU3 (ENSCHAG00000011227) ##25	ENSCHAG00000011234	ENSCHAG00000011264	ENSCHAG00000011300	ENSCHAG00000011317	ENSCHAG00000011338	ENSCHAG00000011356	ENSCHAG00000011366	ide (ENSCHAG00000011376)	marchf5 (ENSCHAG00000011612)	cpeb3 (ENSCHAG00000011779)	ENSCHAG00000011703	BTAF1 (ENSCHAG00000011990)	BTAF1 (ENSCHAG00000016105)	CCNJ (ENSCHAG00000016690)	ENSCHAG00000016699
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b ##25
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b ##25
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b ##25
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b ##25
Percomorphaceae_B	DUPLICATION
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c ##25
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c ##25
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c ##25
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.c ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	2727																NEU3 (ENSLBEG00000011833) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000011852) ##25	ENSLBEG00000011868
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	287									NFIX (ENSLBEG00000021105)	rnf11a (ENSLBEG00000021032)	HMOX1 (ENSLBEG00000021015)	ENSLBEG00000020993	ENSLBEG00000020977	NEU3 (ENSLBEG00000020961) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020949) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020937) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020919) ##25	ENSLBEG00000020905	ENSLBEG00000020889	fdx2 (ENSLBEG00000020878)	s1pr5b (ENSLBEG00000020859)	keap1b (ENSLBEG00000020837)	ENSLBEG00000020827	CDKN2D (ENSLBEG00000020818)	ap1m2 (ENSLBEG00000020783)	ENSLBEG00000020752	SMARCA4 (ENSLBEG00000020655)	atg4da (ENSLBEG00000020609)	MAST1 (ENSLBEG00000020537)	rnaseh2a (ENSLBEG00000020494)	ENSLBEG00000020466
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	2727															NEU3 (ENSLBEG00000011833) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000011852) ##25	ENSLBEG00000011868
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	287								NFIX (ENSLBEG00000021105)	rnf11a (ENSLBEG00000021032)	HMOX1 (ENSLBEG00000021015)	ENSLBEG00000020993	ENSLBEG00000020977	NEU3 (ENSLBEG00000020961) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020949) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020937) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020919) ##25	ENSLBEG00000020905	ENSLBEG00000020889	fdx2 (ENSLBEG00000020878)	s1pr5b (ENSLBEG00000020859)	keap1b (ENSLBEG00000020837)	ENSLBEG00000020827	CDKN2D (ENSLBEG00000020818)	ap1m2 (ENSLBEG00000020783)	ENSLBEG00000020752	SMARCA4 (ENSLBEG00000020655)	atg4da (ENSLBEG00000020609)	MAST1 (ENSLBEG00000020537)	rnaseh2a (ENSLBEG00000020494)	ENSLBEG00000020466	ENSLBEG00000020228
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	287											NFIX (ENSLBEG00000021105)	rnf11a (ENSLBEG00000021032)	HMOX1 (ENSLBEG00000021015)	ENSLBEG00000020993	ENSLBEG00000020977	NEU3 (ENSLBEG00000020961) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020949) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020937) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020919) ##25	ENSLBEG00000020905	ENSLBEG00000020889	fdx2 (ENSLBEG00000020878)	s1pr5b (ENSLBEG00000020859)	keap1b (ENSLBEG00000020837)	ENSLBEG00000020827	CDKN2D (ENSLBEG00000020818)	ap1m2 (ENSLBEG00000020783)	ENSLBEG00000020752	SMARCA4 (ENSLBEG00000020655)	atg4da (ENSLBEG00000020609)	MAST1 (ENSLBEG00000020537)
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	287										NFIX (ENSLBEG00000021105)	rnf11a (ENSLBEG00000021032)	HMOX1 (ENSLBEG00000021015)	ENSLBEG00000020993	ENSLBEG00000020977	NEU3 (ENSLBEG00000020961) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020949) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020937) ##25	NEU3 (ENSLBEG00000020919) ##25	ENSLBEG00000020905	ENSLBEG00000020889	fdx2 (ENSLBEG00000020878)	s1pr5b (ENSLBEG00000020859)	keap1b (ENSLBEG00000020837)	ENSLBEG00000020827	CDKN2D (ENSLBEG00000020818)	ap1m2 (ENSLBEG00000020783)	ENSLBEG00000020752	SMARCA4 (ENSLBEG00000020655)	atg4da (ENSLBEG00000020609)	MAST1 (ENSLBEG00000020537)	rnaseh2a (ENSLBEG00000020494)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.c ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.c ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000166223.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.c ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Channel bull blenny	MODERN SPECIES		ENSCGOG00000021740	ENSCGOG00000021738	ENSCGOG00000021737	ENSCGOG00000021735	elof1 (ENSCGOG00000021727)	pld6 (ENSCGOG00000021726)	ENSCGOG00000021724	tspan34 (ENSCGOG00000021722)	dand5 (ENSCGOG00000021720)	NFIX (ENSCGOG00000021693)	rnf11a (ENSCGOG00000021688)	HMOX1 (ENSCGOG00000021690)	ENSCGOG00000021685	ENSCGOG00000021681	ENSCGOG00000021679	NEU3 (ENSCGOG00000021678) ##25	ENSCGOG00000021677	ENSCGOG00000021676	fdx2 (ENSCGOG00000021674)	s1pr5b (ENSCGOG00000021673)	keap1b (ENSCGOG00000021671)	ENSCGOG00000021669	CDKN2D (ENSCGOG00000021666)	ap1m2 (ENSCGOG00000021610)	ENSCGOG00000021526	SMARCA4 (ENSCGOG00000020723)	atg4da (ENSCGOG00000020669)	MAST1 (ENSCGOG00000020651)	rnaseh2a (ENSCGOG00000020614)	SOX10 (ENSCGOG00000020612)	ENSCGOG00000020610
Pike perch	MODERN SPECIES	69	ENSSLUG00000024805	ENSSLUG00000024802	ENSSLUG00000024800	ENSSLUG00000024798	PLPPR2 (ENSSLUG00000024794)	elof1 (ENSSLUG00000024791)	pld6 (ENSSLUG00000024790)	RAB3D (ENSSLUG00000024787)	tspan34 (ENSSLUG00000024786)	dand5 (ENSSLUG00000024784)	NFIX (ENSSLUG00000024749)	rnf11a (ENSSLUG00000024737)	HMOX1 (ENSSLUG00000024735)	ENSSLUG00000024733	ENSSLUG00000024731	NEU3 (ENSSLUG00000024708) ##25	ENSSLUG00000024698	ENSSLUG00000024697	fdx2 (ENSSLUG00000024696)	s1pr5b (ENSSLUG00000024694)	keap1b (ENSSLUG00000024692)	ENSSLUG00000024687	CDKN2D (ENSSLUG00000024686)	ap1m2 (ENSSLUG00000024580)	ENSSLUG00000023970	SMARCA4 (ENSSLUG00000016006)	atg4da (ENSSLUG00000015299)	MAST1 (ENSSLUG00000015278)	ENSSLUG00000015266	rnaseh2a (ENSSLUG00000015229)	SOX10 (ENSSLUG00000015215)
Eupecaria_C	DUPLICATION
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.c ##25
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.c ##25
Large yellow croaker	DUPLICATION
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	481	ENSLCRG00005002391	elof1 (ENSLCRG00005002398)	ENSLCRG00005002427	ENSLCRG00005002433	ENSLCRG00005002436	tspan34 (ENSLCRG00005002441)	dand5 (ENSLCRG00005002448)	NFIX (ENSLCRG00005002487)	rnf11a (ENSLCRG00005002528)	HMOX1 (ENSLCRG00005002532)	ENSLCRG00005002538	ENSLCRG00005002542	ENSLCRG00005002548	NEU3 (ENSLCRG00005002553) ##25	ENSLCRG00005002559 ##25	NEU3 (ENSLCRG00005002612) ##25	ENSLCRG00005002614	ENSLCRG00005002617	fdx2 (ENSLCRG00005002620)	s1pr5b (ENSLCRG00005002624)	keap1 (ENSLCRG00005002628)	ENSLCRG00005002636	CDKN2D (ENSLCRG00005002639)	ap1m2 (ENSLCRG00005002656)	ENSLCRG00005002982	SMARCA4 (ENSLCRG00005007894)	atg4da (ENSLCRG00005008780)	MAST1 (ENSLCRG00005008792)	rnaseh2a (ENSLCRG00005009186)	SOX10 (ENSLCRG00005009213)	KCNJ4 (ENSLCRG00005009214)
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European seabass	MODERN SPECIES	13	kcnv2b (ENSDLAG00005010981)	atp5meb (ENSDLAG00005030491)	ENSDLAG00005010968	ENSDLAG00005010869	tnksb (ENSDLAG00005009305)	ENSDLAG00005009263	ENSDLAG00005033234	ENSDLAG00005031209	ENSDLAG00005021307	ENSDLAG00005004913	ENSDLAG00005002465	ENSDLAG00005020194	ENSDLAG00005011240	ENSDLAG00005012613	ENSDLAG00005006453	ENSDLAG00005026736 ##25	ENSDLAG00005034226	ENSDLAG00005031726	ENSDLAG00005026786	ENSDLAG00005031494	ENSDLAG00005030020	ENSDLAG00005015725	ENSDLAG00005031691	ENSDLAG00005035060	ENSDLAG00005031343	ENSDLAG00005031016	ALKBH2 (ENSDLAG00005030401)	UNG (ENSDLAG00005033372)	USP30 (ENSDLAG00005033342)	SVOP (ENSDLAG00005034860)	DAO (ENSDLAG00005034828)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.c.d ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.a	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.c.d ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
European seabass	MODERN SPECIES	20	ENSDLAG00005035100	ENSDLAG00005034675	ENSDLAG00005007949	ENSDLAG00005007954	ENSDLAG00005033110	ENSDLAG00005029455	ENSDLAG00005007991	ENSDLAG00005008025	ENSDLAG00005021936	ENSDLAG00005008056	ENSDLAG00005030170	ENSDLAG00005008075	ENSDLAG00005031386	ENSDLAG00005008204	ENSDLAG00005032780	ENSDLAG00005008225 ##25	ENSDLAG00005008231 ##25	ENSDLAG00005008241	ENSDLAG00005029476	s1pr5b (ENSDLAG00005035010)	keap1b (ENSDLAG00005008271)	ENSDLAG00005008311	ap1m2 (ENSDLAG00005008335)	ENSDLAG00005008870	ENSDLAG00005009156	ENSDLAG00005009447	ENSDLAG00005009485	ENSDLAG00005010262	ENSDLAG00005010273	ENSDLAG00005010276	ENSDLAG00005010277
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	481	ENSLCRG00005016988	ENSLCRG00005002380	ENSLCRG00005002391	elof1 (ENSLCRG00005002398)	ENSLCRG00005002427	ENSLCRG00005002433	ENSLCRG00005002436	tspan34 (ENSLCRG00005002441)	dand5 (ENSLCRG00005002448)	NFIX (ENSLCRG00005002487)	rnf11a (ENSLCRG00005002528)	HMOX1 (ENSLCRG00005002532)	ENSLCRG00005002538	ENSLCRG00005002542	ENSLCRG00005002548	NEU3 (ENSLCRG00005002553) ##25	ENSLCRG00005002559 ##25	NEU3 (ENSLCRG00005002612) ##25	ENSLCRG00005002614	ENSLCRG00005002617	fdx2 (ENSLCRG00005002620)	s1pr5b (ENSLCRG00005002624)	keap1 (ENSLCRG00005002628)	ENSLCRG00005002636	CDKN2D (ENSLCRG00005002639)	ap1m2 (ENSLCRG00005002656)	ENSLCRG00005002982	SMARCA4 (ENSLCRG00005007894)	atg4da (ENSLCRG00005008780)	MAST1 (ENSLCRG00005008792)	rnaseh2a (ENSLCRG00005009186)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES		ENSSAUG00010003888	ENSSAUG00010003885	ENSSAUG00010003882	palm3 (ENSSAUG00010003874)	ENSSAUG00010003869	elof1 (ENSSAUG00010003841)	pld6 (ENSSAUG00010003834)	ENSSAUG00010003832	tspan34 (ENSSAUG00010003831)	dand5 (ENSSAUG00010003827)	NFIX (ENSSAUG00010003122)	rnf11a (ENSSAUG00010003075)	HMOX1 (ENSSAUG00010003067)	ENSSAUG00010003063	ENSSAUG00010003057	NEU3 (ENSSAUG00010003053) ##25	ENSSAUG00010003043	fdx2 (ENSSAUG00010003033)	s1pr5b (ENSSAUG00010003030)	keap1b (ENSSAUG00010003018)	ENSSAUG00010003007	CDKN2D (ENSSAUG00010002999)	ap1m2 (ENSSAUG00010025874)	ENSSAUG00010025464	SMARCA4 (ENSSAUG00010025426)	atg4da (ENSSAUG00010025418)	MAST1 (ENSSAUG00010025373)	rnaseh2a (ENSSAUG00010025366)	SOX10 (ENSSAUG00010025364)	KCNJ4 (ENSSAUG00010025363)	ENSSAUG00010025362
Ovalentaria	DUPLICATION
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00940000165717	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000180156	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00940000180245	ENSGT00940000165322	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT01030000235069	ENSGT00550000074856.c.a
Atherinomorphae	DUPLICATION
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00940000165717	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00940000180245	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT01030000235069	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00950000182869.e.b.g.b	ENSGT00950000182888.b
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00940000165717	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00950000182869.e.b.g.b	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00500000044909	ENSGT00950000183174.A
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00940000165717	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00940000165894.a	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT01030000235069	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00950000182869.e.b.g.a.g	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00500000044909
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00940000165894.a	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.d ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.c.a ##25	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00950000182869.e.b.g.a.g	ENSGT00950000182888.b
NAME_6	DUPLICATION
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	108	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00940000165894.a	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a.a ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a.b ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.d ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.c.a ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.b ##25	ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.n.a.a.b	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00730000110989.c.a
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Guppy	MODERN SPECIES	442	ddx56 (ENSPREG00000015142)	DUSP26 (ENSPREG00000015207)	ppiaa (ENSPREG00000015219)	ZMIZ2 (ENSPREG00000015239)	ENSPREG00000015269	OGDH (ENSPREG00000015295)	CAMK2B (ENSPREG00000015332)	nudcd3 (ENSPREG00000015381)	mrps24 (ENSPREG00000015401)	gnsb (ENSPREG00000015426)	polm (ENSPREG00000015468)	ved (ENSPREG00000015482)	PURB (ENSPREG00000015491)	ENSPREG00000015501	ENSPREG00000015517	NEU3 (ENSPREG00000015543) ##25	CNNM4 (ENSPREG00000015553)	ENSPREG00000015579	ENSPREG00000015611	UBE2L5 (ENSPREG00000015634)	ckmt2a (ENSPREG00000015649)	RASGRF2 (ENSPREG00000015734)	ENSPREG00000015971 ##25	ENSPREG00000016017 ##25	ENSPREG00000016047 ##25	SLC25A1 (ENSPREG00000016126)	pi4kaa (ENSPREG00000016173)	MARVELD2 (ENSPREG00000016287)	oclna (ENSPREG00000016314)	ENSPREG00000016333	ENSPREG00000016338
Platyfish	MODERN SPECIES	22	aebp1a (ENSXMAG00000018732)	ddx56 (ENSXMAG00000018749)	DUSP26 (ENSXMAG00000018766)	ENSXMAG00000018774	ENSXMAG00000018813	ENSXMAG00000018821	CAMK2B (ENSXMAG00000025444)	nudcd3 (ENSXMAG00000018966)	mrps24 (ENSXMAG00000018973)	gnsb (ENSXMAG00000018977)	polm (ENSXMAG00000001138)	ved (ENSXMAG00000001165)	PURB (ENSXMAG00000020285)	ENSXMAG00000001168	ENSXMAG00000001176	NEU3 (ENSXMAG00000001188) ##25	CNNM4 (ENSXMAG00000001195)	ENSXMAG00000001208	ENSXMAG00000021071	UBE2L5 (ENSXMAG00000001950)	ckmt2a (ENSXMAG00000001254)	RASGRF2 (ENSXMAG00000001285)	ENSXMAG00000026627 ##25	ENSXMAG00000029262 ##25	ENSXMAG00000022816 ##25	ENSXMAG00000023874 ##25	ENSXMAG00000021503	NEU3 (ENSXMAG00000024524) ##25	SLC25A1 (ENSXMAG00000004598)	ENSXMAG00000028527	pi4kaa (ENSXMAG00000004531)
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Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	951								ENSCVAG00000004648	mrps24 (ENSCVAG00000004623)	gnsb (ENSCVAG00000004612)	ENSCVAG00000004593	ved (ENSCVAG00000004583)	PURB (ENSCVAG00000004571)	ENSCVAG00000004566	ENSCVAG00000004554	NEU3 (ENSCVAG00000004528) ##25	CNNM4 (ENSCVAG00000004523)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00940000165717	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	171	ddx56 (ENSKMAG00000016611)	DUSP26 (ENSKMAG00000016585)	ppiab (ENSKMAG00000016574)	ZMIZ2 (ENSKMAG00000016518)	ENSKMAG00000016483	OGDH (ENSKMAG00000016415)	CAMK2B (ENSKMAG00000016336)	nudcd3 (ENSKMAG00000016295)	mrps24 (ENSKMAG00000016276)	gnsb (ENSKMAG00000016225)	polm (ENSKMAG00000016194)	ved (ENSKMAG00000016182)	PURB (ENSKMAG00000016170)	ENSKMAG00000016156	ENSKMAG00000016143	NEU3 (ENSKMAG00000016130) ##25	CNNM4 (ENSKMAG00000016094)	ENSKMAG00000016058	ENSKMAG00000016036	ENSKMAG00000016019	ckmt2a (ENSKMAG00000015989)	RASGRF2 (ENSKMAG00000015947)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000155411.d	ENSGT00940000157492.a	ENSGT00940000157995	ENSGT00940000159267	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00940000180245	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT01030000235069	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00950000182869.e.b.g.b	ENSGT00950000182888.b
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155411.d	ENSGT00940000157492.a	ENSGT00940000157995	ENSGT00940000159267	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00940000180245	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT01030000235069	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00950000182869.e.b.g.b	ENSGT00950000182888.b
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	3	ENSORLG00000001039	ENSORLG00000025995	cetn3 (ENSORLG00000001027)	HAPLN1 (ENSORLG00000001020)	ENSORLG00000000992	ENSORLG00000000979	ENSORLG00000000900	nudcd3 (ENSORLG00000000883)	mrps24 (ENSORLG00000000867)	gnsb (ENSORLG00000000857)	polm (ENSORLG00000000840)	ved (ENSORLG00000023823)	PURB (ENSORLG00000000837)	ENSORLG00000024863	CNNM3 (ENSORLG00000000826)	neu3b (ENSORLG00000000809) ##25	ENSORLG00000000803	ENSORLG00000000795	ENSORLG00000000778	UBE2L5 (ENSORLG00000000771)	ENSORLG00000026985	ckmt2a (ENSORLG00000000769)	ENSORLG00000000753	ENSORLG00000000675	oclna (ENSORLG00000000668)	ENSORLG00000000652	ENSORLG00000023950	ENSORLG00000025597	ENSORLG00000027140	SLC25A1 (ENSORLG00000000564)	ENSORLG00000000548
Chinese medaka	MODERN SPECIES	1218								cetn3 (ENSOSIG00000016178)	HAPLN1 (ENSOSIG00000016179)	ENSOSIG00000016181	CAMK2B (ENSOSIG00000016468)	nudcd3 (ENSOSIG00000022147)	mrps24 (ENSOSIG00000022149)	ENSOSIG00000022151	CNNM3 (ENSOSIG00000022152)	NEU3 (ENSOSIG00000022153) ##25	ENSOSIG00000022155	tor4aa (ENSOSIG00000022157)	ENSOSIG00000022160	SLC25A1 (ENSOSIG00000022165)	MARVELD2 (ENSOSIG00000022193)	ANKRD34B (ENSOSIG00000022197)	RASGRF2 (ENSOSIG00000022236)	ckmt2a (ENSOSIG00000022294)	UBE2L5 (ENSOSIG00000022304)
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155411.d	ENSGT00940000157492.a	ENSGT00940000157995	ENSGT00940000159267	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00940000180245	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT01030000235069	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00950000182869.e.b.g.b	ENSGT00950000182888.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	30	ENSOMEG00000022855	ENSOMEG00000022880	cetn3 (ENSOMEG00000022901)	HAPLN1 (ENSOMEG00000022929)	ENSOMEG00000022943	OGDH (ENSOMEG00000022964)	CAMK2B (ENSOMEG00000022992)	nudcd3 (ENSOMEG00000023012)	mrps24 (ENSOMEG00000023018)	gnsb (ENSOMEG00000023040)	polm (ENSOMEG00000000622)	ved (ENSOMEG00000023061)	PURB (ENSOMEG00000023076)	ENSOMEG00000023083	CNNM3 (ENSOMEG00000023101)	ENSOMEG00000023108 ##25	CNNM4 (ENSOMEG00000023126)	ENSOMEG00000023165	ENSOMEG00000023202	UBE2L5 (ENSOMEG00000023226)	ENSOMEG00000023229	ckmt2a (ENSOMEG00000023240)	RASGRF2 (ENSOMEG00000023256)	ENSOMEG00000000814	oclna (ENSOMEG00000023280)	MARVELD2 (ENSOMEG00000000815)	ENSOMEG00000023307	ENSOMEG00000023313	ENSOMEG00000023317	SLC25A1 (ENSOMEG00000023335)	VDAC3 (ENSOMEG00000023354)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	3	ENSOJAG00000015538	ENSOJAG00000015981	ENSOJAG00000016196	mef2ca (ENSOJAG00000016218)	cetn3 (ENSOJAG00000016238)	HAPLN1 (ENSOJAG00000016279)	CAMK2B (ENSOJAG00000016481)	nudcd3 (ENSOJAG00000018366)	mrps24 (ENSOJAG00000018463)	gnsb (ENSOJAG00000018474)	polm (ENSOJAG00000018627)	ved (ENSOJAG00000018684)	PURB (ENSOJAG00000018690)	ENSOJAG00000018697	ENSOJAG00000001664	NEU3 (ENSOJAG00000001701) ##25	CNNM4 (ENSOJAG00000001764)	ENSOJAG00000001854	UBE2L5 (ENSOJAG00000002232)	ckmt2a (ENSOJAG00000002248)	RASGRF2 (ENSOJAG00000002297)	ENSOJAG00000002439	ENSOJAG00000002450	ENSOJAG00000002454	oclna (ENSOJAG00000002475)	ENSOJAG00000002491	MARVELD2 (ENSOJAG00000002502)	SLC25A1 (ENSOJAG00000003504)	zgc:56235 (ENSOJAG00000003581)	tor4aa (ENSOJAG00000004020)	brap (ENSOJAG00000004054)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.b ##25
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.b ##25
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.b ##25
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.b ##25
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.b ##25
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	108	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a.a ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a.b ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.d ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.c.a ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.b ##25	ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.n.a.a.b	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00950000182869.e.b.g.a.g	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00500000044909	ENSGT00950000183174.A	ENSGT00940000155101.e	ENSGT00580000081898.b	ENSGT00940000165179.a	ENSGT00940000157468.b.f	ENSGT00940000153876.B
Amazon molly	DUPLICATION
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Amazon molly	MODERN SPECIES	686														RASGRF2 (ENSPFOG00000024630)	ENSPFOG00000007196 ##25	NEU3 (ENSPFOG00000007202) ##25	ENSPFOG00000007218	SLC25A1 (ENSPFOG00000007275)	pi4kaa (ENSPFOG00000007319)	MARVELD2 (ENSPFOG00000024364)	oclna (ENSPFOG00000008118)	ENSPFOG00000008246	ENSPFOG00000008256	tor4aa (ENSPFOG00000008373)	NAA25 (ENSPFOG00000008401)	pitpnb (ENSPFOG00000008804)	ENSPFOG00000008906	ENSPFOG00000024572	pla2g3 (ENSPFOG00000009301)	ENSPFOG00000009351	ptpn11a (ENSPFOG00000009691)
Sailfin molly	DUPLICATION
Sailfin molly	MODERN SPECIES	241														ENSPLAG00000021644 ##25	NEU3 (ENSPLAG00000021637) ##25	NEU3 (ENSPLAG00000021631) ##25	NEU3 (ENSPLAG00000021617) ##25	ENSPLAG00000021603	SLC25A1 (ENSPLAG00000021594)	pi4kaa (ENSPLAG00000021572)	MARVELD2 (ENSPLAG00000021488)	oclna (ENSPLAG00000021455)	ENSPLAG00000021443	ENSPLAG00000021433	tor4aa (ENSPLAG00000021408)	brap (ENSPLAG00000021393)	NAA25 (ENSPLAG00000021358)	pitpnb (ENSPLAG00000021281)	ENSPLAG00000021251	pla2g3 (ENSPLAG00000021236)	ENSPLAG00000021204
Sailfin molly	MODERN SPECIES	241													ENSPLAG00000021644 ##25	NEU3 (ENSPLAG00000021637) ##25	NEU3 (ENSPLAG00000021631) ##25	NEU3 (ENSPLAG00000021617) ##25	ENSPLAG00000021603	SLC25A1 (ENSPLAG00000021594)	pi4kaa (ENSPLAG00000021572)	MARVELD2 (ENSPLAG00000021488)	oclna (ENSPLAG00000021455)	ENSPLAG00000021443	ENSPLAG00000021433	tor4aa (ENSPLAG00000021408)	brap (ENSPLAG00000021393)	NAA25 (ENSPLAG00000021358)	pitpnb (ENSPLAG00000021281)	ENSPLAG00000021251	pla2g3 (ENSPLAG00000021236)	ENSPLAG00000021204	ptpn11a (ENSPLAG00000021184)
Platyfish	MODERN SPECIES	22	PURB (ENSXMAG00000020285)	ENSXMAG00000001168	ENSXMAG00000001176	NEU3 (ENSXMAG00000001188) ##25	CNNM4 (ENSXMAG00000001195)	ENSXMAG00000001208	ENSXMAG00000021071	UBE2L5 (ENSXMAG00000001950)	ckmt2a (ENSXMAG00000001254)	RASGRF2 (ENSXMAG00000001285)	ENSXMAG00000026627 ##25	ENSXMAG00000029262 ##25	ENSXMAG00000022816 ##25	ENSXMAG00000023874 ##25	ENSXMAG00000021503	NEU3 (ENSXMAG00000024524) ##25	SLC25A1 (ENSXMAG00000004598)	ENSXMAG00000028527	pi4kaa (ENSXMAG00000004531)	MARVELD2 (ENSXMAG00000004516)	oclna (ENSXMAG00000004510)	ANKRD34B (ENSXMAG00000019595)	VDAC3 (ENSXMAG00000004494)	tor4aa (ENSXMAG00000004491)	brap (ENSXMAG00000005915)	NAA25 (ENSXMAG00000005930)	pitpnb (ENSXMAG00000030067)	ENSXMAG00000004477	pla2g3 (ENSXMAG00000004476)	ENSXMAG00000029628	ENSXMAG00000025197
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.b ##25
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1893														oclna (ENSCVAG00000007578)	ENSCVAG00000000206	NEU3 (ENSCVAG00000007505) ##25	ENSCVAG00000007493
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.b ##25
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1611	NUDCD3 (ENSNFUG00015012047)	MRPS24 (ENSNFUG00015012040)	gnsb (ENSNFUG00015011217)	polm (ENSNFUG00015011030)	ved (ENSNFUG00015010913)	PURB (ENSNFUG00015010894)	ENSNFUG00015010889	ENSNFUG00015010886	CNNM4 (ENSNFUG00015010649)	ENSNFUG00015010493	ENSNFUG00015010366	ENSNFUG00015010340	UBE2L5 (ENSNFUG00015010265)	CKMT2 (ENSNFUG00015010050)	RASGRF2 (ENSNFUG00015008227)	ENSNFUG00015008116 ##25	ENSNFUG00015008111	oclna (ENSNFUG00015008106)	MARVELD2 (ENSNFUG00015008100)	aebp1a (ENSNFUG00015008027)	pnx (ENSNFUG00015008020)	ash2l (ENSNFUG00015007737)	grk5 (ENSNFUG00015007368)	ENSNFUG00015007331	SCARB1 (ENSNFUG00015007316)	ENSNFUG00015007303	ENSNFUG00015007297	tacr1b (ENSNFUG00015007292)	SLC4A5 (ENSNFUG00015004910)	SEZ6L (ENSNFUG00015004382)	ATP6V1B2 (ENSNFUG00015003929)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00940000165717	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000180156	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT01030000235069	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00950000182869.e.b.g.b	ENSGT00950000182888.b
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00550000074946	ENSGT00940000158107.a.a	ENSGT00940000165717	ENSGT01030000234539.b.b.a.i	ENSGT00390000003652.d	ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158973.a.b	ENSGT00940000158444	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000165439	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000167350	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000170783	ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT01030000235069	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00950000182869.e.b.g.b	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00500000044909
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1083	ddx56 (ENSACIG00000013747)	DUSP26 (ENSACIG00000013729)	ENSACIG00000013717	ENSACIG00000013674	ENSACIG00000013616	ENSACIG00000013573	CAMK2B (ENSACIG00000013545)	nudcd3 (ENSACIG00000013527)	mrps24 (ENSACIG00000013492)	gnsb (ENSACIG00000013336)	polm (ENSACIG00000013229)	ved (ENSACIG00000013202)	PURB (ENSACIG00000013197)	ENSACIG00000013181	ENSACIG00000013138	NEU3 (ENSACIG00000013098) ##25	CNNM4 (ENSACIG00000013069)
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES																ENSGT00940000161102	ENSGT00950000182944.A.b.c.e ##25	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT01030000235069	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00950000182869.e.b.g.b	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00500000044909
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	crata (ENSONIG00000011577)	crata (ENSONIG00000011580)	ENSONIG00000011584	tln1 (ENSONIG00000011589)	hmgcs1 (ENSONIG00000011599)	YTHDC2 (ENSONIG00000011601)	dcp2 (ENSONIG00000033239)	ENSONIG00000031888	psmb10 (ENSONIG00000011604)	ENSONIG00000011605	PURG (ENSONIG00000041233)	slc38a9 (ENSONIG00000011618)	nrg1 (ENSONIG00000011622)	il1b (ENSONIG00000011230)	ENSONIG00000011231	NEU3 (ENSONIG00000011232) ##25	CNNM4 (ENSONIG00000011234)	ENSONIG00000011236	ENSONIG00000011238	ENSONIG00000011239	ckmt2a (ENSONIG00000011242)	RASGRF2 (ENSONIG00000011247)	ANKRD34B (ENSONIG00000041287)	oclna (ENSONIG00000011260)	MARVELD2 (ENSONIG00000011263)	pi4kaa (ENSONIG00000011267)	SLC25A1 (ENSONIG00000011285)	ENSONIG00000031339	VDAC3 (ENSONIG00000031190)	tor4aa (ENSONIG00000011290)	brap (ENSONIG00000011292)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.f ##25
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.f ##25
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.f ##25
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.f ##25
Poeciliinae	DUPLICATION
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a ##25
Platyfish	DUPLICATION
Platyfish	DUPLICATION
Platyfish	MODERN SPECIES	22	pitpnb (ENSXMAG00000030067)	NAA25 (ENSXMAG00000005930)	brap (ENSXMAG00000005915)	tor4aa (ENSXMAG00000004491)	VDAC3 (ENSXMAG00000004494)	ANKRD34B (ENSXMAG00000019595)	oclna (ENSXMAG00000004510)	MARVELD2 (ENSXMAG00000004516)	pi4kaa (ENSXMAG00000004531)	ENSXMAG00000028527	SLC25A1 (ENSXMAG00000004598)	NEU3 (ENSXMAG00000024524) ##25	ENSXMAG00000021503	ENSXMAG00000023874 ##25	ENSXMAG00000022816 ##25	ENSXMAG00000029262 ##25	ENSXMAG00000026627 ##25	RASGRF2 (ENSXMAG00000001285)	ckmt2a (ENSXMAG00000001254)	UBE2L5 (ENSXMAG00000001950)	ENSXMAG00000021071	ENSXMAG00000001208	CNNM4 (ENSXMAG00000001195)	NEU3 (ENSXMAG00000001188) ##25	ENSXMAG00000001176	ENSXMAG00000001168	PURB (ENSXMAG00000020285)	ved (ENSXMAG00000001165)	polm (ENSXMAG00000001138)	gnsb (ENSXMAG00000018977)	mrps24 (ENSXMAG00000018973)
Platyfish	MODERN SPECIES	22	pla2g3 (ENSXMAG00000004476)	ENSXMAG00000004477	pitpnb (ENSXMAG00000030067)	NAA25 (ENSXMAG00000005930)	brap (ENSXMAG00000005915)	tor4aa (ENSXMAG00000004491)	VDAC3 (ENSXMAG00000004494)	ANKRD34B (ENSXMAG00000019595)	oclna (ENSXMAG00000004510)	MARVELD2 (ENSXMAG00000004516)	pi4kaa (ENSXMAG00000004531)	ENSXMAG00000028527	SLC25A1 (ENSXMAG00000004598)	NEU3 (ENSXMAG00000024524) ##25	ENSXMAG00000021503	ENSXMAG00000023874 ##25	ENSXMAG00000022816 ##25	ENSXMAG00000029262 ##25	ENSXMAG00000026627 ##25	RASGRF2 (ENSXMAG00000001285)	ckmt2a (ENSXMAG00000001254)	UBE2L5 (ENSXMAG00000001950)	ENSXMAG00000021071	ENSXMAG00000001208	CNNM4 (ENSXMAG00000001195)	NEU3 (ENSXMAG00000001188) ##25	ENSXMAG00000001176	ENSXMAG00000001168	PURB (ENSXMAG00000020285)	ved (ENSXMAG00000001165)	polm (ENSXMAG00000001138)
Platyfish	MODERN SPECIES	22	ENSXMAG00000004477	pitpnb (ENSXMAG00000030067)	NAA25 (ENSXMAG00000005930)	brap (ENSXMAG00000005915)	tor4aa (ENSXMAG00000004491)	VDAC3 (ENSXMAG00000004494)	ANKRD34B (ENSXMAG00000019595)	oclna (ENSXMAG00000004510)	MARVELD2 (ENSXMAG00000004516)	pi4kaa (ENSXMAG00000004531)	ENSXMAG00000028527	SLC25A1 (ENSXMAG00000004598)	NEU3 (ENSXMAG00000024524) ##25	ENSXMAG00000021503	ENSXMAG00000023874 ##25	ENSXMAG00000022816 ##25	ENSXMAG00000029262 ##25	ENSXMAG00000026627 ##25	RASGRF2 (ENSXMAG00000001285)	ckmt2a (ENSXMAG00000001254)	UBE2L5 (ENSXMAG00000001950)	ENSXMAG00000021071	ENSXMAG00000001208	CNNM4 (ENSXMAG00000001195)	NEU3 (ENSXMAG00000001188) ##25	ENSXMAG00000001176	ENSXMAG00000001168	PURB (ENSXMAG00000020285)	ved (ENSXMAG00000001165)	polm (ENSXMAG00000001138)	gnsb (ENSXMAG00000018977)
Poecilia	DUPLICATION
Poecilia	DUPLICATION
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155143	ENSGT00940000153876.B	ENSGT00940000157468.b.f	ENSGT00940000165179.a	ENSGT00580000081898.b	ENSGT00940000155101.e	ENSGT00950000183174.A	ENSGT00500000044909	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00950000182869.e.b.g.a.g	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.c.a ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.d ##25	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ##25	ENSGT00940000161102	ENSGT00940000170783	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000167350	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000165439	ENSGT00390000011179
Guppy	MODERN SPECIES	442	tmed2 (ENSPREG00000016617)	ptpn11a (ENSPREG00000016594)	ENSPREG00000016571	pla2g3 (ENSPREG00000016556)	ENSPREG00000016532	pitpnb (ENSPREG00000016510)	NAA25 (ENSPREG00000016454)	brap (ENSPREG00000016387)	tor4aa (ENSPREG00000016363)	ENSPREG00000016338	ENSPREG00000016333	oclna (ENSPREG00000016314)	MARVELD2 (ENSPREG00000016287)	pi4kaa (ENSPREG00000016173)	SLC25A1 (ENSPREG00000016126)	ENSPREG00000016047 ##25	ENSPREG00000016017 ##25	ENSPREG00000015971 ##25	RASGRF2 (ENSPREG00000015734)	ckmt2a (ENSPREG00000015649)	UBE2L5 (ENSPREG00000015634)	ENSPREG00000015611	ENSPREG00000015579	CNNM4 (ENSPREG00000015553)	NEU3 (ENSPREG00000015543) ##25	ENSPREG00000015517	ENSPREG00000015501	PURB (ENSPREG00000015491)	ved (ENSPREG00000015482)	polm (ENSPREG00000015468)	gnsb (ENSPREG00000015426)
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	108	ENSGT00940000157468.b.f	ENSGT00940000165179.a	ENSGT00580000081898.b	ENSGT00940000155101.e	ENSGT00950000183174.A	ENSGT00500000044909	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00950000182869.e.b.g.a.g	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.b.n.a.a.b	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.b ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.c.a ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.d ##25	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a.b ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a.a ##25	ENSGT00940000161102	ENSGT00940000170783	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000167350	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000165439
Sailfin molly	MODERN SPECIES	241	pla2g3 (ENSPLAG00000021236)	ENSPLAG00000021251	pitpnb (ENSPLAG00000021281)	NAA25 (ENSPLAG00000021358)	brap (ENSPLAG00000021393)	tor4aa (ENSPLAG00000021408)	ENSPLAG00000021433	ENSPLAG00000021443	oclna (ENSPLAG00000021455)	MARVELD2 (ENSPLAG00000021488)	pi4kaa (ENSPLAG00000021572)	SLC25A1 (ENSPLAG00000021594)	ENSPLAG00000021603	NEU3 (ENSPLAG00000021617) ##25	NEU3 (ENSPLAG00000021631) ##25	NEU3 (ENSPLAG00000021637) ##25	ENSPLAG00000021644 ##25
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.c.b ##25
Guppy	MODERN SPECIES	442	ENSPREG00000016571	pla2g3 (ENSPREG00000016556)	ENSPREG00000016532	pitpnb (ENSPREG00000016510)	NAA25 (ENSPREG00000016454)	brap (ENSPREG00000016387)	tor4aa (ENSPREG00000016363)	ENSPREG00000016338	ENSPREG00000016333	oclna (ENSPREG00000016314)	MARVELD2 (ENSPREG00000016287)	pi4kaa (ENSPREG00000016173)	SLC25A1 (ENSPREG00000016126)	ENSPREG00000016047 ##25	ENSPREG00000016017 ##25	ENSPREG00000015971 ##25	RASGRF2 (ENSPREG00000015734)	ckmt2a (ENSPREG00000015649)	UBE2L5 (ENSPREG00000015634)	ENSPREG00000015611	ENSPREG00000015579	CNNM4 (ENSPREG00000015553)	NEU3 (ENSPREG00000015543) ##25	ENSPREG00000015517	ENSPREG00000015501	PURB (ENSPREG00000015491)	ved (ENSPREG00000015482)	polm (ENSPREG00000015468)	gnsb (ENSPREG00000015426)	mrps24 (ENSPREG00000015401)	nudcd3 (ENSPREG00000015381)
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153876.B	ENSGT00940000157468.b.f	ENSGT00940000165179.a	ENSGT00580000081898.b	ENSGT00940000155101.e	ENSGT00950000183174.A	ENSGT00500000044909	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00950000182869.e.b.g.a.g	ENSGT00390000012355.A.a.a.b	ENSGT00730000110989.c.a	ENSGT00940000155771.c	ENSGT00550000074798.a.a	ENSGT00550000074856.c.a	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.c.a ##25	ENSGT00950000182944.A.b.c.f.a.d ##25	ENSGT00940000155679.d	ENSGT00950000182772.B.a.a.g	ENSGT00940000153654.ve.b	ENSGT00940000154290.b	ENSGT00940000167011	ENSGT00940000156317.w.a	ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ##25	ENSGT00940000161102	ENSGT00940000170783	ENSGT00950000183162.a.b.i.b	ENSGT00940000167350	ENSGT00940000158490	ENSGT00940000165439	ENSGT00390000011179	ENSGT00940000158444
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NAME_4	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.c.f ##25
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Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000166223.b.b.a.b.a	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
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Turquoise killifish	DUPLICATION
Turquoise killifish	DUPLICATION
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Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.d	ENSGT00940000181262	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
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Midas cichlid	DUPLICATION
Midas cichlid	DUPLICATION
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Midas cichlid	DUPLICATION
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Pseudocrenilabrinae	DUPLICATION
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Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.d.e ##25
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.d.e ##25
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.d.e ##25
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.b.a	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.e ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000177737	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.b	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c
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Eastern happy	MODERN SPECIES	18	ENSACLG00000007210	ENSACLG00000007213	ENSACLG00000007220	ENSACLG00000007225	PLPPR2 (ENSACLG00000007519)	elof1 (ENSACLG00000007539)	pld6 (ENSACLG00000007544)	RAB3D (ENSACLG00000007553)	tspan34 (ENSACLG00000007580)	dand5 (ENSACLG00000007596)	NFIX (ENSACLG00000007600)	rnf11a (ENSACLG00000007714)	HMOX1 (ENSACLG00000007729)	ENSACLG00000007737	ENSACLG00000007748	NEU3 (ENSACLG00000007753) ##25	NEU3 (ENSACLG00000007762) ##25	ENSACLG00000007765 ##25	ENSACLG00000007772	ENSACLG00000007782	fdx2 (ENSACLG00000007805)	s1pr5b (ENSACLG00000007818)	keap1b (ENSACLG00000007822)	ENSACLG00000007845	CDKN2D (ENSACLG00000007877)	ap1m2 (ENSACLG00000007855)	ENSACLG00000007886	ENSACLG00000007950	ENSACLG00000008000	SMARCA4 (ENSACLG00000008638)	atg4da (ENSACLG00000008714)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	18	ENSONIG00000021228	ENSONIG00000031268	ENSONIG00000032487	PLPPR2 (ENSONIG00000018084)	elof1 (ENSONIG00000028218)	pld6 (ENSONIG00000018083)	RAB3D (ENSONIG00000037772)	tspan34 (ENSONIG00000018079)	dand5 (ENSONIG00000018078)	NFIX (ENSONIG00000018077)	rnf11a (ENSONIG00000037073)	HMOX1 (ENSONIG00000018076)	ENSONIG00000018073	ENSONIG00000018071	ENSONIG00000028184	NEU3 (ENSONIG00000018069) ##25	neu3e (ENSONIG00000018070) ##25	ENSONIG00000018068	ENSONIG00000033442	fdx2 (ENSONIG00000018067)	s1pr5b (ENSONIG00000021227)	keap1b (ENSONIG00000018066)	ENSONIG00000018063	CDKN2D (ENSONIG00000032001)	ap1m2 (ENSONIG00000018060)	ENSONIG00000018056	SMARCA4 (ENSONIG00000018040)	atg4da (ENSONIG00000031738)	MAST1 (ENSONIG00000018034)	rnaseh2a (ENSONIG00000018033)	ENSONIG00000018032
Pseudocrenilabrinae	DUPLICATION
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.a	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.b	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
Nile tilapia	MODERN SPECIES	18	ENSONIG00000031268	ENSONIG00000032487	PLPPR2 (ENSONIG00000018084)	elof1 (ENSONIG00000028218)	pld6 (ENSONIG00000018083)	RAB3D (ENSONIG00000037772)	tspan34 (ENSONIG00000018079)	dand5 (ENSONIG00000018078)	NFIX (ENSONIG00000018077)	rnf11a (ENSONIG00000037073)	HMOX1 (ENSONIG00000018076)	ENSONIG00000018073	ENSONIG00000018071	ENSONIG00000028184	NEU3 (ENSONIG00000018069) ##25	neu3e (ENSONIG00000018070) ##25	ENSONIG00000018068	ENSONIG00000033442	fdx2 (ENSONIG00000018067)	s1pr5b (ENSONIG00000021227)	keap1b (ENSONIG00000018066)	ENSONIG00000018063	CDKN2D (ENSONIG00000032001)	ap1m2 (ENSONIG00000018060)	ENSONIG00000018056	SMARCA4 (ENSONIG00000018040)	atg4da (ENSONIG00000031738)	MAST1 (ENSONIG00000018034)	rnaseh2a (ENSONIG00000018033)	ENSONIG00000018032	KCNJ4 (ENSONIG00000018031)
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.a	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.b	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.a	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.a	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.b.a	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.e ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000177737	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.b	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768
Eastern happy	MODERN SPECIES	18	ENSACLG00000007220	ENSACLG00000007225	PLPPR2 (ENSACLG00000007519)	elof1 (ENSACLG00000007539)	pld6 (ENSACLG00000007544)	RAB3D (ENSACLG00000007553)	tspan34 (ENSACLG00000007580)	dand5 (ENSACLG00000007596)	NFIX (ENSACLG00000007600)	rnf11a (ENSACLG00000007714)	HMOX1 (ENSACLG00000007729)	ENSACLG00000007737	ENSACLG00000007748	NEU3 (ENSACLG00000007753) ##25	NEU3 (ENSACLG00000007762) ##25	ENSACLG00000007765 ##25	ENSACLG00000007772	ENSACLG00000007782	fdx2 (ENSACLG00000007805)	s1pr5b (ENSACLG00000007818)	keap1b (ENSACLG00000007822)	ENSACLG00000007845	CDKN2D (ENSACLG00000007877)	ap1m2 (ENSACLG00000007855)	ENSACLG00000007886	ENSACLG00000007950	ENSACLG00000008000	SMARCA4 (ENSACLG00000008638)	atg4da (ENSACLG00000008714)	MAST1 (ENSACLG00000009080)	ENSACLG00000009128
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1109	ENSMZEG00005023890	ENSMZEG00005023889	ENSMZEG00005023888	ENSMZEG00005023887	ENSMZEG00005023886	PLPPR2 (ENSMZEG00005023885)	elof1 (ENSMZEG00005023883)	pld6 (ENSMZEG00005023882)	RAB3D (ENSMZEG00005023881)	tspan34 (ENSMZEG00005023880)	dand5 (ENSMZEG00005023879)	NFIX (ENSMZEG00005023878)	ENSMZEG00005023877	NEU3 (ENSMZEG00005023876) ##25	NEU3 (ENSMZEG00005023875) ##25	ENSMZEG00005023874 ##25	ENSMZEG00005023873	ENSMZEG00005023872	fdx2 (ENSMZEG00005023871)	s1pr5b (ENSMZEG00005023870)	keap1b (ENSMZEG00005023869)	ENSMZEG00005023868	CDKN2D (ENSMZEG00005023867)	ap1m2 (ENSMZEG00005023866)	ENSMZEG00005023865	ENSMZEG00005023864	ENSMZEG00005023863	ENSMZEG00005023862	SMARCA4 (ENSMZEG00005023861)	atg4da (ENSMZEG00005023860)	ENSMZEG00005023859
P. nyererei	MODERN SPECIES	643															ENSPNYG00000024017	ENSPNYG00000024016 ##25	zglp1 (ENSPNYG00000024014)	fdx2 (ENSPNYG00000024013)	s1pr5b (ENSPNYG00000024012)	keap1b (ENSPNYG00000024008)	ENSPNYG00000024006	CDKN2D (ENSPNYG00000024004)	ap1m2 (ENSPNYG00000024003)	ENSPNYG00000024002	ENSPNYG00000024000	SMARCA4 (ENSPNYG00000023995)	atg4da (ENSPNYG00000023991)	MAST1 (ENSPNYG00000023989)	ENSPNYG00000023988	ENSPNYG00000023987	rnaseh2a (ENSPNYG00000023986)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	734																ENSHBUG00000007502 ##25	ENSHBUG00000007027	ENSHBUG00000007015	fdx2 (ENSHBUG00000007004)	s1pr5b (ENSHBUG00000006993)	keap1b (ENSHBUG00000006989)	ENSHBUG00000006982	CDKN2D (ENSHBUG00000006917)	ap1m2 (ENSHBUG00000006969)	ENSHBUG00000006790	ENSHBUG00000005484	ENSHBUG00000005468	SMARCA4 (ENSHBUG00000005447)	atg4da (ENSHBUG00000005336)	MAST1 (ENSHBUG00000005318)	ENSHBUG00000005303
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	301	ENSNBRG00000019558	ENSNBRG00000019549	ENSNBRG00000019539	ENSNBRG00000019525	ENSNBRG00000019508	elof1 (ENSNBRG00000019489)	pld6 (ENSNBRG00000019473)	RAB3D (ENSNBRG00000019454)	tspan34 (ENSNBRG00000019428)	dand5 (ENSNBRG00000019412)	NFIX (ENSNBRG00000019307)	rnf11a (ENSNBRG00000019250)	HMOX1 (ENSNBRG00000019244)	ENSNBRG00000019223	ENSNBRG00000019216	NEU3 (ENSNBRG00000019205) ##25	ENSNBRG00000019197	zglp1 (ENSNBRG00000019171)	fdx2 (ENSNBRG00000019149)	s1pr5b (ENSNBRG00000019138)	keap1b (ENSNBRG00000019129)	ENSNBRG00000019117	CDKN2D (ENSNBRG00000019096)	ap1m2 (ENSNBRG00000019060)	ENSNBRG00000018963	ENSNBRG00000018933	SMARCA4 (ENSNBRG00000018865)	atg4da (ENSNBRG00000018815)	MAST1 (ENSNBRG00000018757)	rnaseh2a (ENSNBRG00000018731)	ENSNBRG00000018705
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b ##25
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b ##25
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.a	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.a	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.a	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.b.a	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.e ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000177737	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.b	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j
Eastern happy	MODERN SPECIES	18	ENSACLG00000007213	ENSACLG00000007220	ENSACLG00000007225	PLPPR2 (ENSACLG00000007519)	elof1 (ENSACLG00000007539)	pld6 (ENSACLG00000007544)	RAB3D (ENSACLG00000007553)	tspan34 (ENSACLG00000007580)	dand5 (ENSACLG00000007596)	NFIX (ENSACLG00000007600)	rnf11a (ENSACLG00000007714)	HMOX1 (ENSACLG00000007729)	ENSACLG00000007737	ENSACLG00000007748	NEU3 (ENSACLG00000007753) ##25	NEU3 (ENSACLG00000007762) ##25	ENSACLG00000007765 ##25	ENSACLG00000007772	ENSACLG00000007782	fdx2 (ENSACLG00000007805)	s1pr5b (ENSACLG00000007818)	keap1b (ENSACLG00000007822)	ENSACLG00000007845	CDKN2D (ENSACLG00000007877)	ap1m2 (ENSACLG00000007855)	ENSACLG00000007886	ENSACLG00000007950	ENSACLG00000008000	SMARCA4 (ENSACLG00000008638)	atg4da (ENSACLG00000008714)	MAST1 (ENSACLG00000009080)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1109	rab11fip4b (ENSMZEG00005023892)	ENSMZEG00005023891	ENSMZEG00005023890	ENSMZEG00005023889	ENSMZEG00005023888	ENSMZEG00005023887	ENSMZEG00005023886	PLPPR2 (ENSMZEG00005023885)	elof1 (ENSMZEG00005023883)	pld6 (ENSMZEG00005023882)	RAB3D (ENSMZEG00005023881)	tspan34 (ENSMZEG00005023880)	dand5 (ENSMZEG00005023879)	NFIX (ENSMZEG00005023878)	ENSMZEG00005023877	NEU3 (ENSMZEG00005023876) ##25	NEU3 (ENSMZEG00005023875) ##25	ENSMZEG00005023874 ##25	ENSMZEG00005023873	ENSMZEG00005023872	fdx2 (ENSMZEG00005023871)	s1pr5b (ENSMZEG00005023870)	keap1b (ENSMZEG00005023869)	ENSMZEG00005023868	CDKN2D (ENSMZEG00005023867)	ap1m2 (ENSMZEG00005023866)	ENSMZEG00005023865	ENSMZEG00005023864	ENSMZEG00005023863	ENSMZEG00005023862	SMARCA4 (ENSMZEG00005023861)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000166223.b.b.a.a	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000181262	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000173081	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000181262	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.b.a	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000181262	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT01090000261423	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	2551											ENSAOCG00000017107	rnf11a (ENSAOCG00000001185)	HMOX1 (ENSAOCG00000017130)	ENSAOCG00000017146	ENSAOCG00000017161	NEU3 (ENSAOCG00000017168) ##25
Orange clownfish	MODERN SPECIES	17	ENSAPEG00000023513	ENSAPEG00000023510	ENSAPEG00000023499	PLPPR2 (ENSAPEG00000023488)	elof1 (ENSAPEG00000023438)	pld6 (ENSAPEG00000023430)	RAB3D (ENSAPEG00000023416)	tspan34 (ENSAPEG00000023403)	dand5 (ENSAPEG00000023394)	NFIX (ENSAPEG00000023351)	rnf11a (ENSAPEG00000023334)	HMOX1 (ENSAPEG00000023325)	ENSAPEG00000023313	ENSAPEG00000023300	ENSAPEG00000023267	NEU3 (ENSAPEG00000023257) ##25	ENSAPEG00000023251	ENSAPEG00000023241	fdx2 (ENSAPEG00000023232)	s1pr5b (ENSAPEG00000023229)	keap1b (ENSAPEG00000023223)	ENSAPEG00000023218	CDKN2D (ENSAPEG00000023215)	ap1m2 (ENSAPEG00000023204)	ENSAPEG00000023188	SMARCA4 (ENSAPEG00000023108)	atg4da (ENSAPEG00000023035)	ENSAPEG00000023018	MAST1 (ENSAPEG00000022973)	ENSAPEG00000022961	rnaseh2a (ENSAPEG00000022937)
Spiny chromis	DUPLICATION
Spiny chromis	MODERN SPECIES	3701																NEU3 (ENSAPOG00000021328) ##25
Spiny chromis	MODERN SPECIES	88									ENSAPOG00000005041	dand5 (ENSAPOG00000004996)	NFIX (ENSAPOG00000004937)	rnf11a (ENSAPOG00000004817)	HMOX1 (ENSAPOG00000004803)	ENSAPOG00000004786	ENSAPOG00000004766	ENSAPOG00000004745 ##25	ENSAPOG00000004728	zglp1 (ENSAPOG00000004713)	fdx2 (ENSAPOG00000004692)	s1pr5b (ENSAPOG00000004684)	keap1b (ENSAPOG00000004671)	ENSAPOG00000000116	CDKN2D (ENSAPOG00000004642)	ap1m2 (ENSAPOG00000004630)	ENSAPOG00000004583	SMARCA4 (ENSAPOG00000004542)	atg4da (ENSAPOG00000004393)	atg4da (ENSAPOG00000004347)	MAST1 (ENSAPOG00000004190)	rnaseh2a (ENSAPOG00000004101)	SOX10 (ENSAPOG00000004067)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	239	ENSSPAG00000012010	ENSSPAG00000012018	ENSSPAG00000012021	ENSSPAG00000012037	PLPPR2 (ENSSPAG00000012085)	elof1 (ENSSPAG00000012103)	pld6 (ENSSPAG00000012116)	ENSSPAG00000012133	tspan34 (ENSSPAG00000012150)	dand5 (ENSSPAG00000012165)	NFIX (ENSSPAG00000012179)	rnf11a (ENSSPAG00000012240)	HMOX1 (ENSSPAG00000012255)	ENSSPAG00000012292	ENSSPAG00000012330	NEU3 (ENSSPAG00000012338) ##25	ENSSPAG00000012346	ENSSPAG00000012355	ENSSPAG00000012365	zglp1 (ENSSPAG00000012373)	fdx2 (ENSSPAG00000012392)	s1pr5b (ENSSPAG00000012405)	keap1b (ENSSPAG00000012410)	ENSSPAG00000012424	CDKN2D (ENSSPAG00000012438)	ap1m2 (ENSSPAG00000012447)	ENSSPAG00000012489	SMARCA4 (ENSSPAG00000012533)	atg4da (ENSSPAG00000012672)	MAST1 (ENSSPAG00000012704)	ENSSPAG00000012759
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000178623	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000177737	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.c ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.c ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000166223.b.b.b	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.c.d ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.a	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.c.d ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
European seabass	MODERN SPECIES	20	ENSDLAG00005034675	ENSDLAG00005007949	ENSDLAG00005007954	ENSDLAG00005033110	ENSDLAG00005029455	ENSDLAG00005007991	ENSDLAG00005008025	ENSDLAG00005021936	ENSDLAG00005008056	ENSDLAG00005030170	ENSDLAG00005008075	ENSDLAG00005031386	ENSDLAG00005008204	ENSDLAG00005032780	ENSDLAG00005008225 ##25	ENSDLAG00005008231 ##25	ENSDLAG00005008241	ENSDLAG00005029476	s1pr5b (ENSDLAG00005035010)	keap1b (ENSDLAG00005008271)	ENSDLAG00005008311	ap1m2 (ENSDLAG00005008335)	ENSDLAG00005008870	ENSDLAG00005009156	ENSDLAG00005009447	ENSDLAG00005009485	ENSDLAG00005010262	ENSDLAG00005010273	ENSDLAG00005010276	ENSDLAG00005010277	ENSDLAG00005010287
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000178623	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.d	ENSGT00940000181262	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000177737	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000166223.b.b.b.a	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000166223.b.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b.f	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000166223.b.b.a.b.a	ENSGT00940000166223.b.b.b.a	ENSGT00940000166223.b.b.b.b	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b.f	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Seriola	DUPLICATION
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000178623	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d.j ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.i ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b.f	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT01030000234586.A.b.a
Greater amberjack	MODERN SPECIES	214	ENSSDUG00000000196	ENSSDUG00000000165	ENSSDUG00000023343	PLPPR2 (ENSSDUG00000023337)	elof1 (ENSSDUG00000023329)	pld6 (ENSSDUG00000023326)	RAB3D (ENSSDUG00000023322)	tspan34 (ENSSDUG00000023318)	dand5 (ENSSDUG00000023316)	NFIX (ENSSDUG00000023300)	rnf11a (ENSSDUG00000023294)	HMOX1 (ENSSDUG00000023292)	ENSSDUG00000023284	ENSSDUG00000023281	NEU3 (ENSSDUG00000023279) ##25	NEU3 (ENSSDUG00000023278) ##25	ENSSDUG00000023275	ENSSDUG00000023273	fdx2 (ENSSDUG00000023270)	s1pr5b (ENSSDUG00000023268)	keap1b (ENSSDUG00000023265)	ENSSDUG00000023263	CDKN2D (ENSSDUG00000023261)	ap1m2 (ENSSDUG00000023256)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2982										NFIX (ENSSLDG00000023509)	rnf11a (ENSSLDG00000023520)	HMOX1 (ENSSLDG00000023531)	ENSSLDG00000023542	ENSSLDG00000023552	NEU3 (ENSSLDG00000023560) ##25	NEU3 (ENSSLDG00000023565) ##25	ENSSLDG00000023572	ENSSLDG00000023581	fdx2 (ENSSLDG00000023600)	s1pr5b (ENSSLDG00000023617)	keap1b (ENSSLDG00000023620)	ENSSLDG00000023625	CDKN2D (ENSSLDG00000023627)	ap1m2 (ENSSLDG00000023631)	ENSSLDG00000023644	SMARCA4 (ENSSLDG00000023663)	atg4da (ENSSLDG00000023718)	MAST1 (ENSSLDG00000023742)	rnaseh2a (ENSSLDG00000023766)	SOX10 (ENSSLDG00000023781)	ENSSLDG00000023789
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000166223.b.b.b.b	ENSGT00390000009016	ENSGT00940000178623	ENSGT00940000173081	ENSGT00940000158145.a	ENSGT00390000000053.a	ENSGT00390000004368	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163721	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00950000182944.A.b.d.j ##25	ENSGT00950000182944.A.b.d.i ##25	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000161143	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000159543	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159801.B	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000156887.b.f	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000158046.a.b
Greater amberjack	MODERN SPECIES	214	ENSSDUG00000000216	ENSSDUG00000000196	ENSSDUG00000000165	ENSSDUG00000023343	PLPPR2 (ENSSDUG00000023337)	elof1 (ENSSDUG00000023329)	pld6 (ENSSDUG00000023326)	RAB3D (ENSSDUG00000023322)	tspan34 (ENSSDUG00000023318)	dand5 (ENSSDUG00000023316)	NFIX (ENSSDUG00000023300)	rnf11a (ENSSDUG00000023294)	HMOX1 (ENSSDUG00000023292)	ENSSDUG00000023284	ENSSDUG00000023281	NEU3 (ENSSDUG00000023279) ##25	NEU3 (ENSSDUG00000023278) ##25	ENSSDUG00000023275	ENSSDUG00000023273	fdx2 (ENSSDUG00000023270)	s1pr5b (ENSSDUG00000023268)	keap1b (ENSSDUG00000023265)	ENSSDUG00000023263	CDKN2D (ENSSDUG00000023261)	ap1m2 (ENSSDUG00000023256)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2982											NFIX (ENSSLDG00000023509)	rnf11a (ENSSLDG00000023520)	HMOX1 (ENSSLDG00000023531)	ENSSLDG00000023542	ENSSLDG00000023552	NEU3 (ENSSLDG00000023560) ##25	NEU3 (ENSSLDG00000023565) ##25	ENSSLDG00000023572	ENSSLDG00000023581	fdx2 (ENSSLDG00000023600)	s1pr5b (ENSSLDG00000023617)	keap1b (ENSSLDG00000023620)	ENSSLDG00000023625	CDKN2D (ENSSLDG00000023627)	ap1m2 (ENSSLDG00000023631)	ENSSLDG00000023644	SMARCA4 (ENSSLDG00000023663)	atg4da (ENSSLDG00000023718)	MAST1 (ENSSLDG00000023742)	rnaseh2a (ENSSLDG00000023766)	SOX10 (ENSSLDG00000023781)
Barramundi perch	DUPLICATION
Barramundi perch	DUPLICATION
Barramundi perch	DUPLICATION
Barramundi perch	DUPLICATION
Barramundi perch	DUPLICATION
Barramundi perch	MODERN SPECIES	113	ENSLCAG00010025188	ENSLCAG00010025191	PLPPR2 (ENSLCAG00010025196)	elof1 (ENSLCAG00010025204)	pld6 (ENSLCAG00010025218)	RAB3D (ENSLCAG00010025222)	tspan34 (ENSLCAG00010025227)	dand5 (ENSLCAG00010025230)	NFIX (ENSLCAG00010025252)	rnf11a (ENSLCAG00010025300)	HMOX1 (ENSLCAG00010025306)	ENSLCAG00010025315	ENSLCAG00010025320	ENSLCAG00010025324 ##25	ENSLCAG00010025325 ##25	ENSLCAG00010025327 ##25	ENSLCAG00010025331 ##25	ENSLCAG00010025333	ENSLCAG00010025336	ENSLCAG00010025338	fdx2 (ENSLCAG00010025344)	s1pr5b (ENSLCAG00010025347)	keap1b (ENSLCAG00010025348)	ENSLCAG00010025351	CDKN2D (ENSLCAG00010025359)	ap1m2 (ENSLCAG00010025411)	ENSLCAG00010025594	SMARCA4 (ENSLCAG00010025736)	atg4da (ENSLCAG00010025792)	MAST1 (ENSLCAG00010025816)	rnaseh2a (ENSLCAG00010025845)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	1158																ENSLCAG00010008874 ##25	ENSLCAG00010008880 ##25	ENSLCAG00010008886 ##25
Barramundi perch	MODERN SPECIES	113	ENSLCAG00010025183	ENSLCAG00010025186	ENSLCAG00010025188	ENSLCAG00010025191	PLPPR2 (ENSLCAG00010025196)	elof1 (ENSLCAG00010025204)	pld6 (ENSLCAG00010025218)	RAB3D (ENSLCAG00010025222)	tspan34 (ENSLCAG00010025227)	dand5 (ENSLCAG00010025230)	NFIX (ENSLCAG00010025252)	rnf11a (ENSLCAG00010025300)	HMOX1 (ENSLCAG00010025306)	ENSLCAG00010025315	ENSLCAG00010025320	ENSLCAG00010025324 ##25	ENSLCAG00010025325 ##25	ENSLCAG00010025327 ##25	ENSLCAG00010025331 ##25	ENSLCAG00010025333	ENSLCAG00010025336	ENSLCAG00010025338	fdx2 (ENSLCAG00010025344)	s1pr5b (ENSLCAG00010025347)	keap1b (ENSLCAG00010025348)	ENSLCAG00010025351	CDKN2D (ENSLCAG00010025359)	ap1m2 (ENSLCAG00010025411)	ENSLCAG00010025594	SMARCA4 (ENSLCAG00010025736)	atg4da (ENSLCAG00010025792)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	1663																ENSLCAG00010003453 ##25
Barramundi perch	DUPLICATION
Barramundi perch	DUPLICATION
Barramundi perch	MODERN SPECIES	113	ENSLCAG00010025191	PLPPR2 (ENSLCAG00010025196)	elof1 (ENSLCAG00010025204)	pld6 (ENSLCAG00010025218)	RAB3D (ENSLCAG00010025222)	tspan34 (ENSLCAG00010025227)	dand5 (ENSLCAG00010025230)	NFIX (ENSLCAG00010025252)	rnf11a (ENSLCAG00010025300)	HMOX1 (ENSLCAG00010025306)	ENSLCAG00010025315	ENSLCAG00010025320	ENSLCAG00010025324 ##25	ENSLCAG00010025325 ##25	ENSLCAG00010025327 ##25	ENSLCAG00010025331 ##25	ENSLCAG00010025333	ENSLCAG00010025336	ENSLCAG00010025338	fdx2 (ENSLCAG00010025344)	s1pr5b (ENSLCAG00010025347)	keap1b (ENSLCAG00010025348)	ENSLCAG00010025351	CDKN2D (ENSLCAG00010025359)	ap1m2 (ENSLCAG00010025411)	ENSLCAG00010025594	SMARCA4 (ENSLCAG00010025736)	atg4da (ENSLCAG00010025792)	MAST1 (ENSLCAG00010025816)	rnaseh2a (ENSLCAG00010025845)	SOX10 (ENSLCAG00010025851)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	1158															ENSLCAG00010008874 ##25	ENSLCAG00010008880 ##25	ENSLCAG00010008886 ##25
Barramundi perch	MODERN SPECIES	1158														ENSLCAG00010008874 ##25	ENSLCAG00010008880 ##25	ENSLCAG00010008886 ##25
Barramundi perch	MODERN SPECIES	113	ENSLCAG00010025186	ENSLCAG00010025188	ENSLCAG00010025191	PLPPR2 (ENSLCAG00010025196)	elof1 (ENSLCAG00010025204)	pld6 (ENSLCAG00010025218)	RAB3D (ENSLCAG00010025222)	tspan34 (ENSLCAG00010025227)	dand5 (ENSLCAG00010025230)	NFIX (ENSLCAG00010025252)	rnf11a (ENSLCAG00010025300)	HMOX1 (ENSLCAG00010025306)	ENSLCAG00010025315	ENSLCAG00010025320	ENSLCAG00010025324 ##25	ENSLCAG00010025325 ##25	ENSLCAG00010025327 ##25	ENSLCAG00010025331 ##25	ENSLCAG00010025333	ENSLCAG00010025336	ENSLCAG00010025338	fdx2 (ENSLCAG00010025344)	s1pr5b (ENSLCAG00010025347)	keap1b (ENSLCAG00010025348)	ENSLCAG00010025351	CDKN2D (ENSLCAG00010025359)	ap1m2 (ENSLCAG00010025411)	ENSLCAG00010025594	SMARCA4 (ENSLCAG00010025736)	atg4da (ENSLCAG00010025792)	MAST1 (ENSLCAG00010025816)