Mammalia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161044 ENSGT00940000161927 ENSGT00940000154371.b ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT01000000220768 Theria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Guinea pig MODERN SPECIES 2 ENSCPOG00000037055 C1orf68 (ENSCPOG00000035893) ENSCPOG00000033053 ENSCPOG00000030235 ENSCPOG00000037041 ENSCPOG00000030043 ENSCPOG00000030563 ENSCPOG00000033173 ENSCPOG00000032596 ENSCPOG00000035955 ENSCPOG00000030264 ENSCPOG00000040656 ENSCPOG00000032513 ENSCPOG00000039783 ENSCPOG00000034456 ENSCPOG00000027424 #22 ENSCPOG00000021328 S100A11 (ENSCPOG00000009745) ENSCPOG00000033136 THEM4 (ENSCPOG00000000143) THEM5 (ENSCPOG00000001050) C2CD4D (ENSCPOG00000031360) RORC (ENSCPOG00000023600) LINGO4 (ENSCPOG00000003563) TDRKH (ENSCPOG00000003556) OAZ3 (ENSCPOG00000003550) MRPL9 (ENSCPOG00000021168) CELF3 (ENSCPOG00000003539) SNX27 (ENSCPOG00000007869) TUFT1 (ENSCPOG00000007866) CGN (ENSCPOG00000023121) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.d #22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.d #22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.d #22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 771 Ccnj (ENSNGAG00000023593) Zfp518a (ENSNGAG00000012849) Blnk (ENSNGAG00000017997) Dntt (ENSNGAG00000012677) Opalin (ENSNGAG00000018775) Tll2 (ENSNGAG00000018339) Tm9sf3 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ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Prairie vole MODERN SPECIES 48 ENSMOCG00000000250 #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES Cc2d2b (ENSPEMG00000020898) Ccnj (ENSPEMG00000030735) Zfp518a (ENSPEMG00000019344) Blnk (ENSPEMG00000019675) Dntt (ENSPEMG00000019606) Opalin (ENSPEMG00000031402) Tll2 (ENSPEMG00000018066) Tm9sf3 (ENSPEMG00000019600) Pik3ap1 (ENSPEMG00000019544) ENSPEMG00000005693 Lcor (ENSPEMG00000018115) Slit1 (ENSPEMG00000002625) Arhgap19 (ENSPEMG00000014758) ENSPEMG00000009720 Rrp12 (ENSPEMG00000008437) Pgam1 (ENSPEMG00000012759) #22 Exosc1 (ENSPEMG00000010710) Zdhhc16 (ENSPEMG00000007675) Mms19 (ENSPEMG00000013174) Ubtd1 (ENSPEMG00000024360) Ankrd2 (ENSPEMG00000013562) Hoga1 (ENSPEMG00000014860) Morn4 (ENSPEMG00000027726) Pi4k2a (ENSPEMG00000016260) Avpi1 (ENSPEMG00000011234) Marveld1 (ENSPEMG00000000505) Zfyve27 (ENSPEMG00000000658) Sfrp5 (ENSPEMG00000018114) Golga7b (ENSPEMG00000019018) Crtac1 (ENSPEMG00000018527) R3hcc1l (ENSPEMG00000009290) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Sperm whale MODERN SPECIES 12 COX15 (ENSPCTG00005015651) ENTPD7 (ENSPCTG00005015609) SLC25A28 (ENSPCTG00005015533) ENSPCTG00005015512 NKX2-3 (ENSPCTG00005015458) GOT1 (ENSPCTG00005015383) CNNM1 (ENSPCTG00005015224) HPSE2 (ENSPCTG00005014453) ENSPCTG00005014329 R3HCC1L (ENSPCTG00005014293) SFRP5 (ENSPCTG00005014239) ZFYVE27 (ENSPCTG00005013655) MARVELD1 (ENSPCTG00005013584) AVPI1 (ENSPCTG00005013541) PI4K2A (ENSPCTG00005013487) ENSPCTG00005013431 #22 PGAM1 (ENSPCTG00005013367) ##22 EXOSC1 (ENSPCTG00005013217) ZDHHC16 (ENSPCTG00005012891) MMS19 (ENSPCTG00005012756) RRP12 (ENSPCTG00005011281) FRAT2 (ENSPCTG00005011203) FRAT1 (ENSPCTG00005011174) ARHGAP19 (ENSPCTG00005011029) LCOR (ENSPCTG00005010896) PIK3AP1 (ENSPCTG00005022480) TM9SF3 (ENSPCTG00005022471) TLL2 (ENSPCTG00005022462) OPALIN (ENSPCTG00005022448) DNTT (ENSPCTG00005022440) BLNK (ENSPCTG00005022431) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 7 ZNF518A (ENSRFEG00010014399) BLNK (ENSRFEG00010014241) DNTT (ENSRFEG00010013880) OPALIN (ENSRFEG00010013702) TLL2 (ENSRFEG00010013346) TM9SF3 (ENSRFEG00010013289) PIK3AP1 (ENSRFEG00010013202) ENSRFEG00010013148 ENSRFEG00010013097 LCOR (ENSRFEG00010013002) SLIT1 (ENSRFEG00010012897) FRAT1 (ENSRFEG00010012872) ARHGAP19 (ENSRFEG00010012522) FRAT2 (ENSRFEG00010012480) RRP12 (ENSRFEG00010012357) ENSRFEG00010012320 #22 EXOSC1 (ENSRFEG00010012162) ZDHHC16 (ENSRFEG00010011834) MMS19 (ENSRFEG00010011787) UBTD1 (ENSRFEG00010011733) ANKRD2 (ENSRFEG00010011484) HOGA1 (ENSRFEG00010011363) MORN4 (ENSRFEG00010011280) PI4K2A (ENSRFEG00010011240) AVPI1 (ENSRFEG00010011224) MARVELD1 (ENSRFEG00010011202) ZFYVE27 (ENSRFEG00010010662) SFRP5 (ENSRFEG00010010565) GOLGA7B (ENSRFEG00010010476) ENSRFEG00010010438 CRTAC1 (ENSRFEG00010010283) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.d #22 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Suina ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 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ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 14 DNTT (ENSOARG00020023188) ENSOARG00020023269 OPALIN (ENSOARG00020013479) TLL2 (ENSOARG00020014105) TM9SF3 (ENSOARG00020014308) PIK3AP1 (ENSOARG00020014374) ENSOARG00020014565 ENSOARG00020014604 LCOR (ENSOARG00020014633) SLIT1 (ENSOARG00020014873) ENSOARG00020015779 ARHGAP19 (ENSOARG00020015846) FRAT1 (ENSOARG00020016442) FRAT2 (ENSOARG00020016463) RRP12 (ENSOARG00020016512) PGAM1 (ENSOARG00020017087) ##22 EXOSC1 (ENSOARG00020017150) ZDHHC16 (ENSOARG00020017365) MMS19 (ENSOARG00020017722) UBTD1 (ENSOARG00020018950) ANKRD2 (ENSOARG00020018993) HOGA1 (ENSOARG00020019351) MORN4 (ENSOARG00020019435) PI4K2A (ENSOARG00020019502) AVPI1 (ENSOARG00020019577) 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ENSGT00940000157611 ENSGT00440000033805.h.a ENSGT00390000017130 ENSGT00940000156165 ENSGT00950000183029.A.n.a ENSGT01100000263481.n.a.a.a.b.b.b.a.a.a.b.a.a.b ENSGT01050000244942.b.a.a ENSGT00940000154609 ENSGT00940000155221.l ENSGT00960000191550 ENSGT00940000157708 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000158164 ENSGT00390000001325 ENSGT00390000005323 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 27 PIP5K1B (ENSBIXG00005002661) FXN (ENSBIXG00005016495) TJP2 (ENSBIXG00005016444) ENTREP1 (ENSBIXG00005015945) APBA1 (ENSBIXG00005000159) PTAR1 (ENSBIXG00005015792) CFAP95 (ENSBIXG00005015744) MAMDC2 (ENSBIXG00005015686) ENSBIXG00005015663 ENSBIXG00005015611 ENSBIXG00005002258 ENSBIXG00005015415 KLF9 (ENSBIXG00005015399) TRPM3 (ENSBIXG00005015290) CEMIP2 (ENSBIXG00005002091) ENSBIXG00005014723 ##22 ENSBIXG00005014713 ABHD17B (ENSBIXG00005014706) ENSBIXG00005014654 GDA (ENSBIXG00005014619) ENSBIXG00005014554 ZFAND5 (ENSBIXG00005014532) ENSBIXG00005014461 ENSBIXG00005014453 ENSBIXG00005001926 TMC1 (ENSBIXG00005005407) ALDH1A1 (ENSBIXG00005001914) ENSBIXG00005014241 ENSBIXG00005014214 RORB (ENSBIXG00005006505) ENSBIXG00005014163 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.c.a ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 26 TMEM252 (ENSBGRG00000002724) PIP5K1B (ENSBGRG00000002519) ENSBGRG00000002457 TJP2 (ENSBGRG00000001216) ENTREP1 (ENSBGRG00000000954) APBA1 (ENSBGRG00000000786) PTAR1 (ENSBGRG00000000713) CFAP95 (ENSBGRG00000000656) MAMDC2 (ENSBGRG00000000561) ENSBGRG00000000527 ENSBGRG00000000522 ENSBGRG00000000389 KLF9 (ENSBGRG00000000307) ENSBGRG00000024088 TRPM3 (ENSBGRG00000023218) ENSBGRG00000023134 ##22 CEMIP2 (ENSBGRG00000022945) ABHD17B (ENSBGRG00000022905) C9orf85 (ENSBGRG00000022827) ENSBGRG00000022780 GDA (ENSBGRG00000022461) ENSBGRG00000022438 ENSBGRG00000022416 ZFAND5 (ENSBGRG00000022368) ENSBGRG00000022352 TMC1 (ENSBGRG00000022319) ENSBGRG00000022195 ENSBGRG00000022028 ENSBGRG00000021968 ENSBGRG00000021937 RORB (ENSBGRG00000021739) Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.c.b ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.c.b ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 11 ENSBGRG00000008249 ENSBGRG00000008056 ENSBGRG00000007929 ENSBGRG00000007873 CAB39 (ENSBGRG00000007648) ITM2C (ENSBGRG00000007373) SPATA3 (ENSBGRG00000023080) C2orf72 (ENSBGRG00000023040) HTR2B (ENSBGRG00000022997) PSMD1 (ENSBGRG00000022636) ARMC9 (ENSBGRG00000021327) B3GNT7 (ENSBGRG00000021246) ENSBGRG00000021053 NMUR1 (ENSBGRG00000021016) PTMA (ENSBGRG00000020966) ENSBGRG00000020936 ##22 PDE6D (ENSBGRG00000020792) NPPC (ENSBGRG00000020756) COPS7B (ENSBGRG00000020160) DIS3L2 (ENSBGRG00000019933) ENSBGRG00000019258 ENSBGRG00000018978 ENSBGRG00000018889 ENSBGRG00000018743 ECEL1 (ENSBGRG00000018392) PRSS56 (ENSBGRG00000018237) CHRND (ENSBGRG00000018073) CHRNG (ENSBGRG00000017953) ENSBGRG00000017390 ENSBGRG00000017352 PHC2 (ENSBGRG00000017122) Bos ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00950000183198.c.a.a.a.a.d ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.d ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00950000183198.c.a.a.a.a.d ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.d ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Cow MODERN SPECIES 18 DNTT (ENSBTAG00000020427) OPALIN (ENSBTAG00000011740) TLL2 (ENSBTAG00000011743) TM9SF3 (ENSBTAG00000016298) PIK3AP1 (ENSBTAG00000019872) ENSBTAG00000055267 LCOR (ENSBTAG00000046239) SLIT1 (ENSBTAG00000043991) ENSBTAG00000050121 ARHGAP19 (ENSBTAG00000040427) ENSBTAG00000050994 FRAT1 (ENSBTAG00000007956) FRAT2 (ENSBTAG00000046701) RRP12 (ENSBTAG00000002191) ENSBTAG00000050033 PGAM1 (ENSBTAG00000012697) ##22 EXOSC1 (ENSBTAG00000012699) ZDHHC16 (ENSBTAG00000012702) MMS19 (ENSBTAG00000012704) UBTD1 (ENSBTAG00000012719) ANKRD2 (ENSBTAG00000012720) HOGA1 (ENSBTAG00000012721) MORN4 (ENSBTAG00000011137) PI4K2A (ENSBTAG00000002010) AVPI1 (ENSBTAG00000023947) MARVELD1 (ENSBTAG00000013478) ZFYVE27 (ENSBTAG00000018564) SFRP5 (ENSBTAG00000018566) GOLGA7B (ENSBTAG00000008100) CRTAC1 (ENSBTAG00000008102) R3HCC1L (ENSBTAG00000021856) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 18 TLL2 (ENSBIXG00005002281) TM9SF3 (ENSBIXG00005028883) PIK3AP1 (ENSBIXG00005005043) ENSBIXG00005005048 ENSBIXG00005002223 ENSBIXG00005028924 LCOR (ENSBIXG00005028951) ENSBIXG00005028964 SLIT1 (ENSBIXG00005001987) ENSBIXG00005029073 ARHGAP19 (ENSBIXG00005029131) FRAT1 (ENSBIXG00005005196) FRAT2 (ENSBIXG00005029158) ENSBIXG00005005204 RRP12 (ENSBIXG00005005234) PGAM1 (ENSBIXG00005001611) ##22 EXOSC1 (ENSBIXG00005005275) ZDHHC16 (ENSBIXG00005009297) MMS19 (ENSBIXG00005009397) ANKRD2 (ENSBIXG00005009522) HOGA1 (ENSBIXG00005009628) MORN4 (ENSBIXG00005000550) AVPI1 (ENSBIXG00005009706) PI4K2A (ENSBIXG00005006986) SFRP5 (ENSBIXG00005009770) ZFYVE27 (ENSBIXG00005000645) CRTAC1 (ENSBIXG00005010075) ENSBIXG00005010106 R3HCC1L (ENSBIXG00005010153) LOXL4 (ENSBIXG00005010186) PYROXD2 (ENSBIXG00005010212) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.d ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Domestic yak MODERN SPECIES 17 CCNJ (ENSBGRG00000025803) ZNF518A (ENSBGRG00000025820) BLNK (ENSBGRG00000025843) DNTT (ENSBGRG00000025937) OPALIN (ENSBGRG00000025982) TLL2 (ENSBGRG00000026019) TM9SF3 (ENSBGRG00000026055) PIK3AP1 (ENSBGRG00000026070) LCOR (ENSBGRG00000026094) ENSBGRG00000026107 SLIT1 (ENSBGRG00000026122) ARHGAP19 (ENSBGRG00000026190) FRAT1 (ENSBGRG00000015960) FRAT2 (ENSBGRG00000015978) RRP12 (ENSBGRG00000016021) PGAM1 (ENSBGRG00000016427) ##22 EXOSC1 (ENSBGRG00000016530) ZDHHC16 (ENSBGRG00000016715) MMS19 (ENSBGRG00000017310) UBTD1 (ENSBGRG00000017993) ANKRD2 (ENSBGRG00000018070) HOGA1 (ENSBGRG00000018609) C10orf62 (ENSBGRG00000018744) MORN4 (ENSBGRG00000018805) PI4K2A (ENSBGRG00000018890) AVPI1 (ENSBGRG00000018935) MARVELD1 (ENSBGRG00000018953) ZFYVE27 (ENSBGRG00000019044) SFRP5 (ENSBGRG00000019974) GOLGA7B (ENSBGRG00000020042) CRTAC1 (ENSBGRG00000020315) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Equus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156981 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ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Microbat MODERN SPECIES 1003 ENSMLUG00000006617 ENSMLUG00000014058 BLNK (ENSMLUG00000004792) ENSMLUG00000028644 ENSMLUG00000025630 DNTT (ENSMLUG00000009288) OPALIN (ENSMLUG00000009306) TLL2 (ENSMLUG00000009321) TM9SF3 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ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 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ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Polar bear MODERN SPECIES 92 TCTN3 (ENSUMAG00000021345) ENTPD1 (ENSUMAG00000021352) CC2D2B (ENSUMAG00000021359) CCNJ (ENSUMAG00000021372) ENSUMAG00000021388 DNTT (ENSUMAG00000021390) OPALIN (ENSUMAG00000021392) TLL2 (ENSUMAG00000021398) TM9SF3 (ENSUMAG00000021413) PIK3AP1 (ENSUMAG00000021435) ENSUMAG00000021531 LCOR (ENSUMAG00000021534) SLIT1 (ENSUMAG00000021542) ARHGAP19 (ENSUMAG00000021549) RRP12 (ENSUMAG00000021621) PGAM1 (ENSUMAG00000022000) ##22 EXOSC1 (ENSUMAG00000022002) ZDHHC16 (ENSUMAG00000022010) MMS19 (ENSUMAG00000022094) UBTD1 (ENSUMAG00000022418) ANKRD2 (ENSUMAG00000022422) HOGA1 (ENSUMAG00000022428) C10orf62 (ENSUMAG00000022429) MORN4 (ENSUMAG00000022435) PI4K2A (ENSUMAG00000022461) AVPI1 (ENSUMAG00000022522) ZFYVE27 (ENSUMAG00000022526) GOLGA7B (ENSUMAG00000022532) CRTAC1 (ENSUMAG00000022534) R3HCC1L (ENSUMAG00000022536) LOXL4 (ENSUMAG00000022540) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT01100000263542.C 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ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Red fox MODERN SPECIES CC2D2B (ENSVVUG00000022896) CCNJ (ENSVVUG00000022906) ZNF518A (ENSVVUG00000022923) BLNK (ENSVVUG00000022925) DNTT (ENSVVUG00000022935) OPALIN (ENSVVUG00000022943) TLL2 (ENSVVUG00000022956) TM9SF3 (ENSVVUG00000022966) PIK3AP1 (ENSVVUG00000022997) LCOR (ENSVVUG00000023048) ENSVVUG00000023056 ENSVVUG00000023060 SLIT1 (ENSVVUG00000023084) ARHGAP19 (ENSVVUG00000023153) RRP12 (ENSVVUG00000023168) PGAM1 (ENSVVUG00000023188) ##22 EXOSC1 (ENSVVUG00000023192) ZDHHC16 (ENSVVUG00000023199) MMS19 (ENSVVUG00000023217) UBTD1 (ENSVVUG00000023233) ANKRD2 (ENSVVUG00000023235) HOGA1 (ENSVVUG00000023238) C10orf62 (ENSVVUG00000023240) MORN4 (ENSVVUG00000023247) PI4K2A (ENSVVUG00000023252) AVPI1 (ENSVVUG00000023255) MARVELD1 (ENSVVUG00000023256) ZFYVE27 (ENSVVUG00000023261) SFRP5 (ENSVVUG00000023267) CRTAC1 (ENSVVUG00000023277) R3HCC1L (ENSVVUG00000023317) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 20 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ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b lion MODERN SPECIES 11 ZNF518A (ENSPLOG00000010829) BLNK (ENSPLOG00000010748) DNTT (ENSPLOG00000010620) OPALIN (ENSPLOG00000010434) TLL2 (ENSPLOG00000010054) TM9SF3 (ENSPLOG00000009950) PIK3AP1 (ENSPLOG00000009896) ENSPLOG00000009855 ENSPLOG00000009829 LCOR (ENSPLOG00000009797) SLIT1 (ENSPLOG00000009381) ARHGAP19 (ENSPLOG00000009135) FRAT1 (ENSPLOG00000009063) FRAT2 (ENSPLOG00000009047) RRP12 (ENSPLOG00000008947) PGAM1 (ENSPLOG00000008827) ##22 EXOSC1 (ENSPLOG00000008570) ZDHHC16 (ENSPLOG00000008436) MMS19 (ENSPLOG00000008337) UBTD1 (ENSPLOG00000008292) ANKRD2 (ENSPLOG00000008119) HOGA1 (ENSPLOG00000008038) MORN4 (ENSPLOG00000007986) PI4K2A (ENSPLOG00000007948) AVPI1 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SPECIES 136 TCTN3 (ENSPTIG00000022055) ENTPD1 (ENSPTIG00000004212) CC2D2B (ENSPTIG00000007848) CCNJ (ENSPTIG00000011284) ZNF518A (ENSPTIG00000002660) BLNK (ENSPTIG00000012472) DNTT (ENSPTIG00000017792) OPALIN (ENSPTIG00000021294) TLL2 (ENSPTIG00000006648) TM9SF3 (ENSPTIG00000008859) PIK3AP1 (ENSPTIG00000010276) LCOR (ENSPTIG00000011664) SLIT1 (ENSPTIG00000013365) ARHGAP19 (ENSPTIG00000020172) RRP12 (ENSPTIG00000004428) PGAM1 (ENSPTIG00000016815) ##22 EXOSC1 (ENSPTIG00000017701) ZDHHC16 (ENSPTIG00000019919) MMS19 (ENSPTIG00000021793) UBTD1 (ENSPTIG00000012419) ANKRD2 (ENSPTIG00000012729) HOGA1 (ENSPTIG00000014480) C10orf62 (ENSPTIG00000015070) MORN4 (ENSPTIG00000015742) PI4K2A (ENSPTIG00000016813) AVPI1 (ENSPTIG00000017197) ZFYVE27 (ENSPTIG00000018038) GOLGA7B (ENSPTIG00000020956) CRTAC1 (ENSPTIG00000021313) ENSPTIG00000005720 LOXL4 (ENSPTIG00000006871) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 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ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Bushbaby MODERN SPECIES 299 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sifaka MODERN SPECIES 592 ENTPD1 (ENSPCOG00000024914) ENSPCOG00000000546 ENSPCOG00000028681 ENSPCOG00000022671 CCNJ (ENSPCOG00000020585) BLNK (ENSPCOG00000024376) DNTT (ENSPCOG00000027142) OPALIN (ENSPCOG00000003690) TLL2 (ENSPCOG00000025513) TM9SF3 (ENSPCOG00000018190) PIK3AP1 (ENSPCOG00000016804) LCOR (ENSPCOG00000017788) SLIT1 (ENSPCOG00000028603) ARHGAP19 (ENSPCOG00000015366) RRP12 (ENSPCOG00000014009) PGAM1 (ENSPCOG00000016118) ##22 EXOSC1 (ENSPCOG00000027539) ZDHHC16 (ENSPCOG00000027800) MMS19 (ENSPCOG00000013373) UBTD1 (ENSPCOG00000020849) ANKRD2 (ENSPCOG00000022155) C10orf62 (ENSPCOG00000003877) HOGA1 (ENSPCOG00000026545) MORN4 (ENSPCOG00000015266) PI4K2A (ENSPCOG00000014965) AVPI1 (ENSPCOG00000021859) ZFYVE27 (ENSPCOG00000027569) SFRP5 (ENSPCOG00000020059) GOLGA7B (ENSPCOG00000014287) CRTAC1 (ENSPCOG00000002194) Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 771 VMA21 (ENSPSMG00000013387) GPR50 (ENSPSMG00000013398) ENSPSMG00000013407 ##22 ENSPSMG00000013417 CD99L2 (ENSPSMG00000013439) MTMR1 (ENSPSMG00000013485) MTM1 (ENSPSMG00000013504) MAMLD1 (ENSPSMG00000013530) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 968 DNTT (ENSPSMG00000007016) OPALIN (ENSPSMG00000007053) TLL2 (ENSPSMG00000007085) TM9SF3 (ENSPSMG00000007155) PIK3AP1 (ENSPSMG00000007273) ENSPSMG00000007301 ENSPSMG00000007305 LCOR (ENSPSMG00000007345) SLIT1 (ENSPSMG00000007534) ARHGAP19 (ENSPSMG00000007657) FRAT1 (ENSPSMG00000007672) RRP12 (ENSPSMG00000007959) PGAM1 (ENSPSMG00000008048) ##22 EXOSC1 (ENSPSMG00000008122) ZDHHC16 (ENSPSMG00000008385) MMS19 (ENSPSMG00000008890) UBTD1 (ENSPSMG00000008967) ANKRD2 (ENSPSMG00000008988) HOGA1 (ENSPSMG00000009007) MORN4 (ENSPSMG00000009044) PI4K2A (ENSPSMG00000009062) AVPI1 (ENSPSMG00000009076) MARVELD1 (ENSPSMG00000009082) ZFYVE27 (ENSPSMG00000009295) SFRP5 (ENSPSMG00000009435) GOLGA7B (ENSPSMG00000009462) CRTAC1 (ENSPSMG00000009508) R3HCC1L (ENSPSMG00000009613) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 542 DNAJC27 (ENSCATG00000029231) ENSCATG00000028816 ADCY3 (ENSCATG00000006719) CENPO (ENSCATG00000035791) PTRHD1 (ENSCATG00000033690) NCOA1 (ENSCATG00000035964) ITSN2 (ENSCATG00000017804) PFN4 (ENSCATG00000032266) TP53I3 (ENSCATG00000040448) SF3B6 (ENSCATG00000030936) FKBP1B (ENSCATG00000016638) WDCP (ENSCATG00000030463) MFSD2B (ENSCATG00000040488) UBXN2A (ENSCATG00000007176) ATAD2B (ENSCATG00000035587) ENSCATG00000036009 ##22 KLHL29 (ENSCATG00000037112) TDRD15 (ENSCATG00000014633) APOB (ENSCATG00000025709) LDAH (ENSCATG00000025214) GDF7 (ENSCATG00000015865) HS1BP3 (ENSCATG00000038867) ENSCATG00000037321 RHOB (ENSCATG00000021066) PUM2 (ENSCATG00000043826) ENSCATG00000041330 SDC1 (ENSCATG00000044796) LAPTM4A (ENSCATG00000036860) MATN3 (ENSCATG00000038685) WDR35 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SPECIES 46 ENSGT00940000157133 ENSGT00940000156549.a.a ENSGT00390000016702 ENSGT00500000044959 ENSGT00950000183021.b ENSGT00940000155936.b ENSGT00530000064185.b ENSGT00530000064185.a ENSGT00390000017067 ENSGT00940000161217 ENSGT00390000005908 ENSGT00940000153311.a.b.b ENSGT00390000001660 ENSGT00390000005318.b.b.a ENSGT00520000055567.a.b ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a ##22 ENSGT00550000074694.b ENSGT00940000158824 ENSGT00590000083139 ENSGT00390000009688 ENSGT00940000160140.b ENSGT00390000013092 ENSGT00900000143745 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000157575 ENSGT00940000161171 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000157581 ENSGT00940000155745 ENSGT00390000011905.n.a ENSGT00940000158993 Capuchin MODERN SPECIES 1 ADCY3 (ENSCCAG00000021802) CENPO (ENSCCAG00000026815) PTRHD1 (ENSCCAG00000033856) NCOA1 (ENSCCAG00000023754) ITSN2 (ENSCCAG00000006141) FAM228A (ENSCCAG00000029149) FAM228B (ENSCCAG00000033095) PFN4 (ENSCCAG00000028499) TP53I3 (ENSCCAG00000032310) SF3B6 (ENSCCAG00000036653) 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##22 ATAD2B (ENSSBOG00000032583) KLHL29 (ENSSBOG00000021000) APOB (ENSSBOG00000008834) LDAH (ENSSBOG00000031409) GDF7 (ENSSBOG00000022327) HS1BP3 (ENSSBOG00000023433) ENSSBOG00000032320 RHOB (ENSSBOG00000013056) PUM2 (ENSSBOG00000022007) ENSSBOG00000029288 LAPTM4A (ENSSBOG00000031549) MATN3 (ENSSBOG00000027840) WDR35 (ENSSBOG00000030509) TTC32 (ENSSBOG00000024543) OSR1 (ENSSBOG00000023175) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 222 ENSCCAG00000016654 ANAPC1 (ENSCCAG00000024583) MERTK (ENSCCAG00000026739) TMEM87B (ENSCCAG00000031687) FBLN7 (ENSCCAG00000031423) ENSCCAG00000019771 ENSCCAG00000019984 ENSCCAG00000037584 TTL (ENSCCAG00000029632) POLR1B (ENSCCAG00000035252) CHCHD5 (ENSCCAG00000032057) SLC20A1 (ENSCCAG00000030266) CKAP2L 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(ENSNLEG00000014236) AVPI1 (ENSNLEG00000014255) ZFYVE27 (ENSNLEG00000014267) SFRP5 (ENSNLEG00000014325) GOLGA7B (ENSNLEG00000014326) ENSNLEG00000035121 CRTAC1 (ENSNLEG00000014328) R3HCC1L (ENSNLEG00000014364) LOXL4 (ENSNLEG00000014379) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493.a ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00910000147157 Orangutan MODERN SPECIES 1 CC2D2B (ENSPPYG00000002514) CCNJ 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ENSGGOG00000003388 SLC25A3 (ENSGGOG00000015886) IKBIP (ENSGGOG00000008397) APAF1 (ENSGGOG00000008401) ANKS1B (ENSGGOG00000008413) Gorilla MODERN SPECIES 1 ENSGGOG00000007015 CCNJ (ENSGGOG00000006034) ZNF518A (ENSGGOG00000017106) BLNK (ENSGGOG00000001032) DNTT (ENSGGOG00000001035) OPALIN (ENSGGOG00000000901) TLL2 (ENSGGOG00000015595) TM9SF3 (ENSGGOG00000015606) PIK3AP1 (ENSGGOG00000015613) ENSGGOG00000026025 LCOR (ENSGGOG00000005550) SLIT1 (ENSGGOG00000005553) ARHGAP19 (ENSGGOG00000006319) FRAT1 (ENSGGOG00000036954) RRP12 (ENSGGOG00000014850) PGAM1 (ENSGGOG00000028602) ##22 EXOSC1 (ENSGGOG00000003099) ENSGGOG00000003105 ENSGGOG00000026594 MMS19 (ENSGGOG00000003110) UBTD1 (ENSGGOG00000015224) ANKRD2 (ENSGGOG00000015227) PI4K2A (ENSGGOG00000015247) MORN4 (ENSGGOG00000015242) AVPI1 (ENSGGOG00000015256) MARVELD1 (ENSGGOG00000027335) ZFYVE27 (ENSGGOG00000024663) SFRP5 (ENSGGOG00000012574) GOLGA7B (ENSGGOG00000016005) CRTAC1 (ENSGGOG00000016011) ENSGGOG00000041605 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493.a ENSGT00390000008787.b ENSGT00550000076264 ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00910000147157 Human MODERN SPECIES 1 CC2D2B (ENSG00000188649) CCNJ (ENSG00000107443) ZNF518A (ENSG00000177853) BLNK (ENSG00000095585) DNTT (ENSG00000107447) OPALIN (ENSG00000197430) TLL2 (ENSG00000095587) TM9SF3 (ENSG00000077147) PIK3AP1 (ENSG00000155629) LCOR (ENSG00000196233) SLIT1 (ENSG00000187122) ARHGAP19 (ENSG00000213390) FRAT1 (ENSG00000165879) FRAT2 (ENSG00000181274) RRP12 (ENSG00000052749) PGAM1 (ENSG00000171314) ##22 EXOSC1 (ENSG00000171311) ZDHHC16 (ENSG00000171307) MMS19 (ENSG00000155229) UBTD1 (ENSG00000165886) ANKRD2 (ENSG00000165887) HOGA1 (ENSG00000241935) ENSG00000249967 C10orf62 (ENSG00000203942) MORN4 (ENSG00000171160) PI4K2A (ENSG00000155252) AVPI1 (ENSG00000119986) MARVELD1 (ENSG00000155254) ZFYVE27 (ENSG00000155256) SFRP5 (ENSG00000120057) GOLGA7B (ENSG00000155265) Pan ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493.b.a ENSGT00390000008787.b ENSGT00550000076264 ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000010434.b ENSGT00730000111173 ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00910000147157 ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee MODERN SPECIES 19 ADGRB3 (ENSPTRG00000018325) LMBRD1 (ENSPTRG00000018326) ENSPTRG00000044889 COL19A1 (ENSPTRG00000018327) COL9A1 (ENSPTRG00000018329) FAM135A (ENSPTRG00000018330) SDHAF4 (ENSPTRG00000018331) ENSPTRG00000050587 SMAP1 (ENSPTRG00000018333) B3GAT2 (ENSPTRG00000018334) ENSPTRG00000039066 OGFRL1 (ENSPTRG00000018335) RIMS1 (ENSPTRG00000051415) ENSPTRG00000046439 KCNQ5 (ENSPTRG00000018339) ENSPTRG00000048515 ##22 ENSPTRG00000018341 KHDC1L (ENSPTRG00000052071) ENSPTRG00000051619 ENSPTRG00000049430 DPPA5 (ENSPTRG00000029547) KHDC3L (ENSPTRG00000029546) OOEP (ENSPTRG00000029545) DDX43 (ENSPTRG00000018344) CGAS (ENSPTRG00000018345) MTO1 (ENSPTRG00000048593) EEF1A1 (ENSPTRG00000018347) SLC17A5 (ENSPTRG00000018348) CD109 (ENSPTRG00000018349) ENSPTRG00000052684 COL12A1 (ENSPTRG00000018351) Chimpanzee MODERN SPECIES 3 ENSPTRG00000047060 PLXNC1 (ENSPTRG00000005301) CEP83 (ENSPTRG00000005302) ENSPTRG00000049511 TMCC3 (ENSPTRG00000005304) NDUFA12 (ENSPTRG00000005306) NR2C1 (ENSPTRG00000005307) FGD6 (ENSPTRG00000005309) ENSPTRG00000043616 VEZT (ENSPTRG00000005312) ENSPTRG00000045308 ENSPTRG00000044514 METAP2 (ENSPTRG00000005313) USP44 (ENSPTRG00000005314) NTN4 (ENSPTRG00000005315) ENSPTRG00000049896 ##22 SNRPF (ENSPTRG00000005317) CCDC38 (ENSPTRG00000005318) AMDHD1 (ENSPTRG00000005319) HAL (ENSPTRG00000005320) LTA4H (ENSPTRG00000005321) ELK3 (ENSPTRG00000005322) CDK17 (ENSPTRG00000005323) ENSPTRG00000046831 CFAP54 (ENSPTRG00000005326) NEDD1 (ENSPTRG00000005329) ENSPTRG00000039568 TMPO (ENSPTRG00000005331) SLC25A3 (ENSPTRG00000005333) ENSPTRG00000005334 APAF1 (ENSPTRG00000005335) Chimpanzee MODERN SPECIES 1 CCNJ (ENSPTRG00000002790) ZNF518A (ENSPTRG00000043182) BLNK (ENSPTRG00000002792) DNTT (ENSPTRG00000002793) OPALIN (ENSPTRG00000022887) TLL2 (ENSPTRG00000002795) TM9SF3 (ENSPTRG00000002797) PIK3AP1 (ENSPTRG00000002798) LCOR (ENSPTRG00000002801) ENSPTRG00000052704 SLIT1 (ENSPTRG00000033956) ARHGAP19 (ENSPTRG00000047078) FRAT1 (ENSPTRG00000051237) FRAT2 (ENSPTRG00000002805) RRP12 (ENSPTRG00000002806) PGAM1 (ENSPTRG00000002807) ##22 EXOSC1 (ENSPTRG00000002808) ZDHHC16 (ENSPTRG00000002809) MMS19 (ENSPTRG00000002810) UBTD1 (ENSPTRG00000002811) ANKRD2 (ENSPTRG00000002812) PI4K2A (ENSPTRG00000002815) MORN4 (ENSPTRG00000045678) AVPI1 (ENSPTRG00000002816) MARVELD1 (ENSPTRG00000051550) ZFYVE27 (ENSPTRG00000002818) SFRP5 (ENSPTRG00000045244) GOLGA7B (ENSPTRG00000045507) CRTAC1 (ENSPTRG00000002821) ENSPTRG00000042728 R3HCC1L (ENSPTRG00000002822) Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 19 ADGRB3 (ENSPPAG00000037212) LMBRD1 (ENSPPAG00000032391) ENSPPAG00000028836 COL19A1 (ENSPPAG00000040447) COL9A1 (ENSPPAG00000036128) FAM135A (ENSPPAG00000034229) SDHAF4 (ENSPPAG00000032082) ENSPPAG00000032234 SMAP1 (ENSPPAG00000036070) ENSPPAG00000032375 ENSPPAG00000041570 OGFRL1 (ENSPPAG00000043342) RIMS1 (ENSPPAG00000040646) ENSPPAG00000034250 KCNQ5 (ENSPPAG00000040956) ENSPPAG00000038149 ##22 ENSPPAG00000041906 KHDC1L (ENSPPAG00000025424) ENSPPAG00000043529 ENSPPAG00000039320 DPPA5 (ENSPPAG00000035257) KHDC3L (ENSPPAG00000043830) OOEP (ENSPPAG00000037341) DDX43 (ENSPPAG00000034199) CGAS (ENSPPAG00000028648) MTO1 (ENSPPAG00000028710) EEF1A1 (ENSPPAG00000038736) SLC17A5 (ENSPPAG00000026527) CD109 (ENSPPAG00000029267) ENSPPAG00000043602 COL12A1 (ENSPPAG00000044050) Bonobo MODERN SPECIES 1 TCTN3 (ENSPPAG00000043730) ENTPD1 (ENSPPAG00000033911) ENSPPAG00000038503 CCNJ (ENSPPAG00000039585) BLNK (ENSPPAG00000040349) DNTT (ENSPPAG00000040802) ENSPPAG00000041321 TLL2 (ENSPPAG00000040475) TM9SF3 (ENSPPAG00000042084) PIK3AP1 (ENSPPAG00000042299) ENSPPAG00000001131 LCOR (ENSPPAG00000024948) SLIT1 (ENSPPAG00000023312) ARHGAP19 (ENSPPAG00000027208) RRP12 (ENSPPAG00000043885) PGAM1 (ENSPPAG00000028548) ##22 EXOSC1 (ENSPPAG00000039842) ZDHHC16 (ENSPPAG00000030292) MMS19 (ENSPPAG00000044031) UBTD1 (ENSPPAG00000041666) ANKRD2 (ENSPPAG00000034743) ENSPPAG00000025810 ENSPPAG00000030161 AVPI1 (ENSPPAG00000033222) ZFYVE27 (ENSPPAG00000029291) SFRP5 (ENSPPAG00000031585) GOLGA7B (ENSPPAG00000040315) CRTAC1 (ENSPPAG00000042754) ENSPPAG00000031192 R3HCC1L (ENSPPAG00000039950) LOXL4 (ENSPPAG00000030338) Bonobo MODERN SPECIES 18 ENSPPAG00000030177 ADAMTS12 (ENSPPAG00000037028) RXFP3 (ENSPPAG00000012921) SLC45A2 (ENSPPAG00000006580) AMACR (ENSPPAG00000043217) RAI14 (ENSPPAG00000039153) ENSPPAG00000033122 RAD1 (ENSPPAG00000028406) BRIX1 (ENSPPAG00000038183) DNAJC21 (ENSPPAG00000042627) AGXT2 (ENSPPAG00000035314) PRLR (ENSPPAG00000043899) ENSPPAG00000037233 IL7R (ENSPPAG00000039723) CAPSL (ENSPPAG00000019420) ENSPPAG00000004829 ##22 ENSPPAG00000040298 ENSPPAG00000039004 ENSPPAG00000031288 LMBRD2 (ENSPPAG00000029193) SKP2 (ENSPPAG00000026467) ENSPPAG00000036531 RANBP3L (ENSPPAG00000031849) SLC1A3 (ENSPPAG00000032856) NIPBL (ENSPPAG00000038200) ENSPPAG00000039740 ENSPPAG00000032480 CPLANE1 (ENSPPAG00000036782) NUP155 (ENSPPAG00000043867) ENSPPAG00000000687 ENSPPAG00000030132 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154368.l ENSGT00940000156675 ENSGT00390000017639 ENSGT00940000155309.f ENSGT00940000154445.e.a ENSGT00940000155109.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000156276 ENSGT00940000155426.t ENSGT00390000014563.a.b ENSGT00950000183033.a.a.d ENSGT00940000154185.l.a.b ENSGT00940000156416 ENSGT01030000235256 ENSGT00390000013594 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.a ##22 ENSGT00940000154939 ENSGT00940000153335.a.b.y.a ENSGT00940000159995 ENSGT00390000014794.b ENSGT00390000004181 ENSGT00940000161078 ENSGT00940000157470 ENSGT00530000063713.a ENSGT00510000055172 ENSGT00390000014082.b ENSGT00940000158394 ENSGT00390000000984.t.a ENSGT00940000158210 ENSGT00950000182810.B.a.x.b.b ENSGT00940000158794 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00910000147615 ENSGT00940000154368.l ENSGT00940000156675 ENSGT00390000017639 ENSGT00940000155309.f ENSGT00940000154445.e.a ENSGT00940000155109.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000156276 ENSGT00390000014563.a.b ENSGT00950000183033.a.a.d ENSGT00940000154185.l.a.b ENSGT00940000156416 ENSGT01030000235256 ENSGT00390000013594 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.a ##22 ENSGT00940000154939 ENSGT00940000153335.a.b.y.a ENSGT00940000159995 ENSGT00390000014794.b ENSGT00390000004181 ENSGT00940000161078 ENSGT00940000157470 ENSGT00530000063713.a ENSGT00510000055172 ENSGT00390000014082.b ENSGT00940000158394 ENSGT00390000000984.t.a ENSGT00940000165721 ENSGT00940000158210 ENSGT00950000182810.B.a.x.b.b Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT00940000156675 ENSGT00390000017639 ENSGT01100000263525.b.b.a.d ENSGT00940000155309.f ENSGT00940000154445.e.a ENSGT00940000155109.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000156276 ENSGT00950000183079.B.c ENSGT00390000014563.a.b ENSGT00950000183033.a.a.d ENSGT00940000154185.l.a.b ENSGT00940000156416 ENSGT01030000235256 ENSGT00390000013594 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.a ##22 ENSGT00940000154939 ENSGT00940000153335.a.b.y.a ENSGT00940000159995 ENSGT00390000014794.b ENSGT00390000004181 ENSGT00940000161078 ENSGT00940000157470 ENSGT00530000063713.a ENSGT00510000055172 ENSGT00390000014082.b ENSGT00940000158394 ENSGT00390000000984.t.b ENSGT00940000165721 ENSGT00940000158210 ENSGT00950000182810.B.a.x.b.b Sooty mangabey MODERN SPECIES 595 PCDH15 (ENSCATG00000044325) ZWINT (ENSCATG00000044437) ENSCATG00000022893 IPMK (ENSCATG00000026842) CISD1 (ENSCATG00000030948) UBE2D1 (ENSCATG00000006141) TFAM (ENSCATG00000027920) BICC1 (ENSCATG00000016603) ENSCATG00000030400 PHYHIPL (ENSCATG00000037368) FAM13C (ENSCATG00000032373) ENSCATG00000034993 SLC16A9 (ENSCATG00000013976) CCDC6 (ENSCATG00000033448) ENSCATG00000045201 ##22 ANK3 (ENSCATG00000039015) ENSCATG00000038329 RHOBTB1 (ENSCATG00000042026) TMEM26 (ENSCATG00000043914) CABCOCO1 (ENSCATG00000014612) ARID5B (ENSCATG00000035614) RTKN2 (ENSCATG00000043432) ZNF365 (ENSCATG00000030610) ENSCATG00000036398 ADO (ENSCATG00000016498) EGR2 (ENSCATG00000036150) ENSCATG00000033855 ENSCATG00000030709 ENSCATG00000033326 JMJD1C (ENSCATG00000040124) Macaca ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154368.l ENSGT00940000156675 ENSGT00390000017639 ENSGT00940000155309.f ENSGT00940000154445.e.a ENSGT00940000155109.b ENSGT00440000039001 ENSGT00940000156276 ENSGT00940000155426.t ENSGT00390000014563.a.b ENSGT00950000183033.a.a.d ENSGT00940000154185.l.a.b ENSGT00940000156416 ENSGT01030000235256 ENSGT00390000013594 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.a ##22 ENSGT00940000154939 ENSGT00940000153335.a.b.y.a ENSGT00940000159995 ENSGT00390000014794.b ENSGT00390000004181 ENSGT00940000161078 ENSGT00940000157470 ENSGT00530000063713.a ENSGT00510000055172 ENSGT00390000014082.b ENSGT00940000158394 ENSGT00390000000984.t.a ENSGT00940000158210 ENSGT00950000182810.B.a.x.b.b ENSGT00940000158794 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 353 IPMK (ENSMNEG00000033112) CISD1 (ENSMNEG00000039390) UBE2D1 (ENSMNEG00000040023) TFAM (ENSMNEG00000030206) BICC1 (ENSMNEG00000009601) ENSMNEG00000030319 PHYHIPL (ENSMNEG00000035222) FAM13C (ENSMNEG00000044679) ENSMNEG00000031580 SLC16A9 (ENSMNEG00000029664) MRLN (ENSMNEG00000014934) CCDC6 (ENSMNEG00000030697) ENSMNEG00000029490 ##22 ENSMNEG00000044750 ANK3 (ENSMNEG00000034594) CDK1 (ENSMNEG00000043947) RHOBTB1 (ENSMNEG00000042613) TMEM26 (ENSMNEG00000038130) CABCOCO1 (ENSMNEG00000031430) ARID5B (ENSMNEG00000041462) RTKN2 (ENSMNEG00000044923) ZNF365 (ENSMNEG00000030489) ENSMNEG00000033048 ADO (ENSMNEG00000028166) EGR2 (ENSMNEG00000042085) NRBF2 (ENSMNEG00000025366) ENSMNEG00000043648 ENSMNEG00000029188 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.l.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 406 PLXNC1 (ENSCATG00000044596) CEP83 (ENSCATG00000042979) ENSCATG00000021201 ENSCATG00000034695 TMCC3 (ENSCATG00000025807) ENSCATG00000041283 NDUFA12 (ENSCATG00000002834) NR2C1 (ENSCATG00000030438) ENSCATG00000037021 FGD6 (ENSCATG00000008001) ENSCATG00000041076 ENSCATG00000041454 VEZT (ENSCATG00000043374) METAP2 (ENSCATG00000043908) USP44 (ENSCATG00000035851) ENSCATG00000044202 ##22 NTN4 (ENSCATG00000006259) ENSCATG00000003132 CCDC38 (ENSCATG00000041407) AMDHD1 (ENSCATG00000043814) HAL (ENSCATG00000016653) LTA4H (ENSCATG00000043659) ELK3 (ENSCATG00000035761) CDK17 (ENSCATG00000008799) CFAP54 (ENSCATG00000040097) NEDD1 (ENSCATG00000040561) ENSCATG00000035402 ENSCATG00000037155 SLC25A3 (ENSCATG00000042696) IKBIP (ENSCATG00000039722) APAF1 (ENSCATG00000042930) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h.m ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00910000147157 ENSGT00390000013726 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b 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ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00910000147157 ENSGT00390000013726 Vervet Monkey DUPLICATION Vervet Monkey MODERN SPECIES 17 CFH (ENSCSAG00000013551) CFHR4 (ENSCSAG00000013559) CFHR2 (ENSCSAG00000013569) CFHR5 (ENSCSAG00000013575) F13B (ENSCSAG00000013580) ASPM (ENSCSAG00000013591) ZBTB41 (ENSCSAG00000013610) CRB1 (ENSCSAG00000013619) DENND1B (ENSCSAG00000013627) C1orf53 (ENSCSAG00000013637) LHX9 (ENSCSAG00000013642) NEK7 (ENSCSAG00000013647) ATP6V1G3 (ENSCSAG00000013651) ENSCSAG00000013661 PTPRC (ENSCSAG00000013674) ENSCSAG00000000249 ##22 NR5A2 (ENSCSAG00000013702) ZNF281 (ENSCSAG00000000250) KIF14 (ENSCSAG00000013776) DDX59 (ENSCSAG00000013799) CAMSAP2 (ENSCSAG00000013807) GPR25 (ENSCSAG00000000251) INAVA (ENSCSAG00000013813) KIF21B (ENSCSAG00000013828) CACNA1S (ENSCSAG00000013846) ASCL5 (ENSCSAG00000000252) TMEM9 (ENSCSAG00000013860) PKP1 (ENSCSAG00000013888) TNNT2 (ENSCSAG00000013948) LAD1 (ENSCSAG00000013986) TNNI1 (ENSCSAG00000013998) Vervet Monkey MODERN SPECIES 24 PHKB (ENSCSAG00000005516) ITFG1 (ENSCSAG00000005522) NETO2 (ENSCSAG00000005537) ENSCSAG00000005547 GPT2 (ENSCSAG00000005551) C16orf87 (ENSCSAG00000005553) MYLK3 (ENSCSAG00000005556) ORC6 (ENSCSAG00000005565) VPS35 (ENSCSAG00000005571) SHCBP1 (ENSCSAG00000005573) ENSCSAG00000005578 ENSCSAG00000005589 ENSCSAG00000005598 ZNF267 (ENSCSAG00000005600) KRBOX5 (ENSCSAG00000005603) ENSCSAG00000018861 ##22 AHSP (ENSCSAG00000005606) RUSF1 (ENSCSAG00000005610) SLC5A2 (ENSCSAG00000005614) ARMC5 (ENSCSAG00000005617) COX6A2 (ENSCSAG00000005620) ENSCSAG00000005623 ITGAX (ENSCSAG00000005672) ITGAM (ENSCSAG00000005696) TRIM72 (ENSCSAG00000005704) PYCARD (ENSCSAG00000005708) FUS (ENSCSAG00000005711) PRSS36 (ENSCSAG00000005720) PRSS8 (ENSCSAG00000005726) KAT8 (ENSCSAG00000005731) BCKDK (ENSCSAG00000005732) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 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##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Olive baboon MODERN SPECIES 2 CCNJ (ENSPANG00000021449) ENSPANG00000043364 ZNF518A (ENSPANG00000021450) BLNK (ENSPANG00000021417) DNTT (ENSPANG00000021421) OPALIN (ENSPANG00000041066) TLL2 (ENSPANG00000021427) TM9SF3 (ENSPANG00000021412) PIK3AP1 (ENSPANG00000021373) LCOR (ENSPANG00000021376) SLIT1 (ENSPANG00000021383) ARHGAP19 (ENSPANG00000021365) FRAT1 (ENSPANG00000021367) FRAT2 (ENSPANG00000021368) RRP12 (ENSPANG00000021360) PGAM1 (ENSPANG00000021321) ##22 EXOSC1 (ENSPANG00000021324) ZDHHC16 (ENSPANG00000021326) MMS19 (ENSPANG00000021328) UBTD1 (ENSPANG00000021352) ANKRD2 (ENSPANG00000021351) HOGA1 (ENSPANG00000040105) MORN4 (ENSPANG00000021290) PI4K2A (ENSPANG00000021292) 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ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.h ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000010434.b ENSGT00730000111173 ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b ENSGT00940000157042 Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 90 BICDL1 (ENSSBOG00000020926) CIT (ENSSBOG00000033965) ENSSBOG00000024739 PRKAB1 (ENSSBOG00000030942) TMEM233 (ENSSBOG00000023158) CCDC60 (ENSSBOG00000027014) HSPB8 (ENSSBOG00000022568) SRRM4 (ENSSBOG00000035310) ENSSBOG00000036079 SUDS3 (ENSSBOG00000034907) TAOK3 (ENSSBOG00000032744) PEBP1 (ENSSBOG00000025736) VSIG10 (ENSSBOG00000036249) WSB2 (ENSSBOG00000025618) RFC5 (ENSSBOG00000030812) ENSSBOG00000026256 ##22 KSR2 (ENSSBOG00000033625) NOS1 (ENSSBOG00000009305) FBXO21 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ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049709 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Rodentia ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Rodentia_A DUPLICATION Rodentia_A DUPLICATION Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.a ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 30 ENSHGLG00000000234 ENSHGLG00000043321 ENSHGLG00000015276 HMGXB4 (ENSHGLG00000037083) TOM1 (ENSHGLG00000015296) HMOX1 (ENSHGLG00000008950) MCM5 (ENSHGLG00000008256) RASD2 (ENSHGLG00000007940) ENSHGLG00000007308 ENSHGLG00000006549 ENSHGLG00000036993 ARHGAP19 (ENSHGLG00000043596) ENSHGLG00000039731 FRAT2 (ENSHGLG00000021387) RRP12 (ENSHGLG00000016772) PGAM1 (ENSHGLG00000016865) ##22 EXOSC1 (ENSHGLG00000016927) ZDHHC16 (ENSHGLG00000017705) MMS19 (ENSHGLG00000019329) UBTD1 (ENSHGLG00000006858) ANKRD2 (ENSHGLG00000008161) ENSHGLG00000033035 HOGA1 (ENSHGLG00000038633) MORN4 (ENSHGLG00000018443) PI4K2A (ENSHGLG00000013652) AVPI1 (ENSHGLG00000010646) MARVELD1 (ENSHGLG00000034069) SFRP5 (ENSHGLG00000010192) ZFYVE27 (ENSHGLG00000013301) ENSHGLG00000038015 ENSHGLG00000011698 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.a ##22 Guinea pig MODERN SPECIES 1 ENTPD1 (ENSCPOG00000003603) CCNJ (ENSCPOG00000001476) ZNF518A (ENSCPOG00000006322) BLNK (ENSCPOG00000012667) DNTT (ENSCPOG00000002370) ENSCPOG00000034213 TLL2 (ENSCPOG00000000539) TM9SF3 (ENSCPOG00000002320) PIK3AP1 (ENSCPOG00000012888) ENSCPOG00000005739 LCOR (ENSCPOG00000035033) SLIT1 (ENSCPOG00000005743) ARHGAP19 (ENSCPOG00000021474) FRAT2 (ENSCPOG00000000139) RRP12 (ENSCPOG00000004215) PGAM1 (ENSCPOG00000034665) ##22 EXOSC1 (ENSCPOG00000001173) ZDHHC16 (ENSCPOG00000006710) MMS19 (ENSCPOG00000006715) UBTD1 (ENSCPOG00000033582) ANKRD2 (ENSCPOG00000035324) HOGA1 (ENSCPOG00000004555) C10orf62 (ENSCPOG00000033899) MORN4 (ENSCPOG00000031641) PI4K2A (ENSCPOG00000004558) AVPI1 (ENSCPOG00000024508) MARVELD1 (ENSCPOG00000024434) ENSCPOG00000013283 SFRP5 (ENSCPOG00000021880) GOLGA7B (ENSCPOG00000031966) CRTAC1 (ENSCPOG00000007832) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.a ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.a ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.a ##22 Squirrel MODERN SPECIES 236 CC2D2B (ENSSTOG00000005628) CCNJ (ENSSTOG00000005634) ZNF518A (ENSSTOG00000021018) BLNK (ENSSTOG00000012711) DNTT (ENSSTOG00000012729) OPALIN (ENSSTOG00000012748) TLL2 (ENSSTOG00000002746) TM9SF3 (ENSSTOG00000002762) PIK3AP1 (ENSSTOG00000002786) LCOR (ENSSTOG00000010811) SLIT1 (ENSSTOG00000010816) ARHGAP19 (ENSSTOG00000019537) FRAT1 (ENSSTOG00000009543) FRAT2 (ENSSTOG00000023988) RRP12 (ENSSTOG00000006515) PGAM1 (ENSSTOG00000025955) ##22 EXOSC1 (ENSSTOG00000006615) ZDHHC16 (ENSSTOG00000006627) MMS19 (ENSSTOG00000006641) UBTD1 (ENSSTOG00000006700) ANKRD2 (ENSSTOG00000006701) ENSSTOG00000020441 HOGA1 (ENSSTOG00000011929) MORN4 (ENSSTOG00000026926) PI4K2A (ENSSTOG00000006737) AVPI1 (ENSSTOG00000029293) MARVELD1 (ENSSTOG00000006756) ZFYVE27 (ENSSTOG00000012103) SFRP5 (ENSSTOG00000012113) GOLGA7B (ENSSTOG00000012116) CRTAC1 (ENSSTOG00000012122) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.b ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 39 ENSMMMG00000021357 ZNF518A (ENSMMMG00000021365) BLNK (ENSMMMG00000021371) DNTT (ENSMMMG00000021389) OPALIN (ENSMMMG00000021401) TLL2 (ENSMMMG00000021409) ENSMMMG00000021418 PIK3AP1 (ENSMMMG00000021426) ENSMMMG00000021445 ENSMMMG00000021452 LCOR (ENSMMMG00000021462) SLIT1 (ENSMMMG00000021470) ARHGAP19 (ENSMMMG00000021533) FRAT2 (ENSMMMG00000021560) RRP12 (ENSMMMG00000021563) PGAM1 (ENSMMMG00000021588) ##22 EXOSC1 (ENSMMMG00000021593) ZDHHC16 (ENSMMMG00000021606) MMS19 (ENSMMMG00000021617) UBTD1 (ENSMMMG00000021672) ANKRD2 (ENSMMMG00000021677) HOGA1 (ENSMMMG00000021688) C10orf62 (ENSMMMG00000021691) ENSMMMG00000021693 PI4K2A (ENSMMMG00000021697) AVPI1 (ENSMMMG00000021725) ZFYVE27 (ENSMMMG00000021729) SFRP5 (ENSMMMG00000021743) GOLGA7B (ENSMMMG00000021751) CRTAC1 (ENSMMMG00000021757) R3HCC1L (ENSMMMG00000021780) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.i.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 20 NECTIN4 (ENSHGLG00000010781) ARHGAP30 (ENSHGLG00000006495) USF1 (ENSHGLG00000012402) TSTD1 (ENSHGLG00000035841) ENSHGLG00000038623 ENSHGLG00000015520 ENSHGLG00000048048 ENSHGLG00000049342 CD244 (ENSHGLG00000016536) ENSHGLG00000046741 CD48 (ENSHGLG00000016645) SLAMF1 (ENSHGLG00000013870) ENSHGLG00000036722 CD84 (ENSHGLG00000018167) ENSHGLG00000040731 ENSHGLG00000044874 ##22 VANGL2 (ENSHGLG00000015020) NHLH1 (ENSHGLG00000020397) NCSTN (ENSHGLG00000007191) COPA (ENSHGLG00000011307) PEX19 (ENSHGLG00000006365) DCAF8 (ENSHGLG00000009593) PEA15 (ENSHGLG00000049375) CASQ1 (ENSHGLG00000036911) ATP1A4 (ENSHGLG00000018340) ATP1A2 (ENSHGLG00000015210) IGSF8 (ENSHGLG00000017599) KCNJ9 (ENSHGLG00000015357) KCNJ10 (ENSHGLG00000035959) PIGM (ENSHGLG00000020908) SLAMF9 (ENSHGLG00000014754) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 ENSGT00390000015287.h.g.a ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 ENSGT00390000015287.h.g.a ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 145 ZNF518A (ENSUPAG00010013976) BLNK (ENSUPAG00010013982) DNTT (ENSUPAG00010014016) OPALIN (ENSUPAG00010014040) TLL2 (ENSUPAG00010014051) TM9SF3 (ENSUPAG00010014080) PIK3AP1 (ENSUPAG00010014107) HNRNPA1L2 (ENSUPAG00010014177) ENSUPAG00010014178 LCOR (ENSUPAG00010014187) SLIT1 (ENSUPAG00010014205) ARHGAP19 (ENSUPAG00010014329) FRAT1 (ENSUPAG00010014412) FRAT2 (ENSUPAG00010014413) RRP12 (ENSUPAG00010014418) PGAM1 (ENSUPAG00010014455) ##22 ENSUPAG00010014471 ZDHHC16 (ENSUPAG00010014509) MMS19 (ENSUPAG00010014546) UBTD1 (ENSUPAG00010014630) ANKRD2 (ENSUPAG00010014650) HOGA1 (ENSUPAG00010014672) ENSUPAG00010014696 MORN4 (ENSUPAG00010014704) PI4K2A (ENSUPAG00010014721) AVPI1 (ENSUPAG00010014745) MARVELD1 (ENSUPAG00010014753) ZFYVE27 (ENSUPAG00010014758) SFRP5 (ENSUPAG00010014793) GOLGA7B (ENSUPAG00010014804) CRTAC1 (ENSUPAG00010014843) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 13 BLNK (ENSSVLG00005021548) DNTT (ENSSVLG00005021305) OPALIN (ENSSVLG00005021033) TLL2 (ENSSVLG00005020186) TM9SF3 (ENSSVLG00005019967) PIK3AP1 (ENSSVLG00005019678) ENSSVLG00005019543 ENSSVLG00005019472 LCOR (ENSSVLG00005019384) SLIT1 (ENSSVLG00005018555) ENSSVLG00005018513 ARHGAP19 (ENSSVLG00005018106) FRAT1 (ENSSVLG00005018038) ENSSVLG00005018017 RRP12 (ENSSVLG00005017893) PGAM1 (ENSSVLG00005017816) ##22 EXOSC1 (ENSSVLG00005017650) ZDHHC16 (ENSSVLG00005017379) MMS19 (ENSSVLG00005017214) ANKRD2 (ENSSVLG00005016694) C10orf62 (ENSSVLG00005016610) HOGA1 (ENSSVLG00005016513) MORN4 (ENSSVLG00005016417) PI4K2A (ENSSVLG00005016376) AVPI1 (ENSSVLG00005016336) MARVELD1 (ENSSVLG00005016317) ZFYVE27 (ENSSVLG00005015995) SFRP5 (ENSSVLG00005015909) GOLGA7B (ENSSVLG00005015799) CRTAC1 (ENSSVLG00005015382) R3HCC1L (ENSSVLG00005015247) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 ABCC9 (ENSSVLG00005022831) CMAS (ENSSVLG00005010853) ENSSVLG00005010892 ST8SIA1 (ENSSVLG00005010944) C2CD5 (ENSSVLG00005011062) ETNK1 (ENSSVLG00005011233) ENSSVLG00005011366 SOX5 (ENSSVLG00005011483) BCAT1 (ENSSVLG00005012012) ENSSVLG00005012187 DNAI7 (ENSSVLG00005012568) ETFRF1 (ENSSVLG00005013055) KRAS (ENSSVLG00005013177) LMNTD1 (ENSSVLG00005013266) RASSF8 (ENSSVLG00005013368) ENSSVLG00005013521 ##22 BHLHE41 (ENSSVLG00005013568) SSPN (ENSSVLG00005013638) ITPR2 (ENSSVLG00005014004) INTS13 (ENSSVLG00005014650) FGFR1OP2 (ENSSVLG00005014699) ENSSVLG00005014788 TM7SF3 (ENSSVLG00005014809) MED21 (ENSSVLG00005014838) STK38L (ENSSVLG00005014875) BMAL2 (ENSSVLG00005015014) SMCO2 (ENSSVLG00005015897) ENSSVLG00005016025 ENSSVLG00005016042 PPFIBP1 (ENSSVLG00005016094) REP15 (ENSSVLG00005016211) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 18 LRRC74A (ENSHGLG00000013955) ANGEL1 (ENSHGLG00000019080) VASH1 (ENSHGLG00000014181) ENSHGLG00000009813 ESRRB (ENSHGLG00000007373) GPATCH2L (ENSHGLG00000011249) IFT43 (ENSHGLG00000006159) TGFB3 (ENSHGLG00000041469) ENSHGLG00000009260 ERG28 (ENSHGLG00000035965) FLVCR2 (ENSHGLG00000012149) BATF (ENSHGLG00000009995) ENSHGLG00000032847 ENSHGLG00000034007 JDP2 (ENSHGLG00000046590) ENSHGLG00000012043 ##22 Fos (ENSHGLG00000009642) TMED10 (ENSHGLG00000009862) ENSHGLG00000011281 ZC2HC1C (ENSHGLG00000012165) ENSHGLG00000014222 ENSHGLG00000040406 MLH3 (ENSHGLG00000015005) EIF2B2 (ENSHGLG00000016520) ENSHGLG00000050804 ENSHGLG00000018678 ENSHGLG00000013243 RPS6KL1 (ENSHGLG00000013483) DLST (ENSHGLG00000009814) PROX2 (ENSHGLG00000011710) ENSHGLG00000046547 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.j ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Long-tailed chinchilla DUPLICATION Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 214 ENTPD1 (ENSCLAG00000002693) CC2D2B (ENSCLAG00000002936) CCNJ (ENSCLAG00000003191) ENSCLAG00000004870 ZNF518A (ENSCLAG00000017653) BLNK (ENSCLAG00000005498) DNTT (ENSCLAG00000006186) OPALIN (ENSCLAG00000006654) TLL2 (ENSCLAG00000007122) TM9SF3 (ENSCLAG00000002078) PIK3AP1 (ENSCLAG00000002443) LCOR (ENSCLAG00000008402) SLIT1 (ENSCLAG00000009153) ARHGAP19 (ENSCLAG00000002574) RRP12 (ENSCLAG00000003753) ENSCLAG00000002369 ##22 EXOSC1 (ENSCLAG00000002463) ZDHHC16 (ENSCLAG00000002570) MMS19 (ENSCLAG00000002928) UBTD1 (ENSCLAG00000002195) ANKRD2 (ENSCLAG00000002245) HOGA1 (ENSCLAG00000002513) MORN4 (ENSCLAG00000001852) PI4K2A (ENSCLAG00000001867) AVPI1 (ENSCLAG00000001993) MARVELD1 (ENSCLAG00000002008) ZFYVE27 (ENSCLAG00000002084) SFRP5 (ENSCLAG00000002118) GOLGA7B (ENSCLAG00000002560) CRTAC1 (ENSCLAG00000002601) R3HCC1L (ENSCLAG00000002695) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 169 NME7 (ENSCLAG00000007842) ATP1B1 (ENSCLAG00000009477) DPT (ENSCLAG00000005439) ENSCLAG00000005901 TBX19 (ENSCLAG00000006520) SFT2D2 (ENSCLAG00000007183) ENSCLAG00000004496 GPR161 (ENSCLAG00000005310) DCAF6 (ENSCLAG00000005742) ENSCLAG00000004770 ADCY10 (ENSCLAG00000005189) RCSD1 (ENSCLAG00000004726) CREG1 (ENSCLAG00000005740) CD247 (ENSCLAG00000005425) POU2F1 (ENSCLAG00000005927) ENSCLAG00000005067 ##22 STYXL2 (ENSCLAG00000006188) ENSCLAG00000017324 MAEL (ENSCLAG00000006862) ILDR2 (ENSCLAG00000008045) ENSCLAG00000008737 TADA1 (ENSCLAG00000009819) POGK (ENSCLAG00000004943) ENSCLAG00000008264 FAM78B (ENSCLAG00000009778) UCK2 (ENSCLAG00000010692) ENSCLAG00000004400 TMCO1 (ENSCLAG00000004923) ENSCLAG00000006096 MGST3 (ENSCLAG00000007690) LRRC52 (ENSCLAG00000006632) Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 296 ENSODEG00000000552 ENSODEG00000000567 ENSODEG00000000580 ENSODEG00000000592 ENSODEG00000018618 ENSODEG00000000602 ##22 ENSODEG00000018667 ENSODEG00000001156 ENSODEG00000018765 ENSODEG00000001186 ENSODEG00000001196 ENSODEG00000001234 ENSODEG00000001248 ENSODEG00000001317 ENSODEG00000018656 ENSODEG00000001352 ENSODEG00000018550 Degu MODERN SPECIES 261 ENSODEG00000014860 ENSODEG00000019926 ARL5B (ENSODEG00000013924) NSUN6 (ENSODEG00000010093) ENSODEG00000011487 ##22 CACNB2 (ENSODEG00000009971) SLC39A12 (ENSODEG00000010075) MRC1 (ENSODEG00000010406) TMEM236 (ENSODEG00000013808) ENSODEG00000010216 HACD1 (ENSODEG00000012161) ST8SIA6 (ENSODEG00000010495) ENSODEG00000011037 ENSODEG00000009896 ENSODEG00000009660 CUBN (ENSODEG00000010405) RSU1 (ENSODEG00000009946) C1QL3 (ENSODEG00000010477) PTER (ENSODEG00000010317) ENSODEG00000010031 Degu MODERN SPECIES 157 ENSODEG00000007553 ENSODEG00000006646 ENSODEG00000007386 ENSODEG00000008496 ENSODEG00000007187 CFAP126 (ENSODEG00000006839) SDHC (ENSODEG00000008215) MPZ (ENSODEG00000008395) PCP4L1 (ENSODEG00000008404) NR1I3 (ENSODEG00000008562) TOMM40L (ENSODEG00000006761) APOA2 (ENSODEG00000007021) FCER1G (ENSODEG00000007489) NDUFS2 (ENSODEG00000007813) ADAMTS4 (ENSODEG00000011124) ENSODEG00000008124 ##22 B4GALT3 (ENSODEG00000008462) PPOX (ENSODEG00000007017) USP21 (ENSODEG00000010632) UFC1 (ENSODEG00000008078) DEDD (ENSODEG00000008446) NIT1 (ENSODEG00000008755) PFDN2 (ENSODEG00000007888) ENSODEG00000007376 KLHDC9 (ENSODEG00000008140) NECTIN4 (ENSODEG00000009227) ENSODEG00000012487 ENSODEG00000012848 TSTD1 (ENSODEG00000010923) ENSODEG00000008881 F11R (ENSODEG00000007564) Degu MODERN SPECIES 51 DNAH5 (ENSODEG00000015643) ENSODEG00000015511 CEP55 (ENSODEG00000015163) FFAR4 (ENSODEG00000016129) RBP4 (ENSODEG00000015640) PDE6C (ENSODEG00000015159) FRA10AC1 (ENSODEG00000016002) ENSODEG00000014890 LGI1 (ENSODEG00000015911) ENSODEG00000015909 SLC35G1 (ENSODEG00000016132) ENSODEG00000015694 ##22 PLCE1 (ENSODEG00000016086) NOC3L (ENSODEG00000015822) ENSODEG00000015684 ENSODEG00000015179 HELLS (ENSODEG00000015916) CYP2C18 (ENSODEG00000015439) ENSODEG00000020373 ENSODEG00000015492 ENSODEG00000015808 ENSODEG00000015364 SORBS1 (ENSODEG00000015885) ENSODEG00000015731 ALDH18A1 (ENSODEG00000015796) TCTN3 (ENSODEG00000015591) ENTPD1 (ENSODEG00000017035) Degu MODERN SPECIES 356 SLC6A9 (ENSODEG00000001483) CCDC24 (ENSODEG00000001255) B4GALT2 (ENSODEG00000002805) ATP6V0B (ENSODEG00000002795) DPH2 (ENSODEG00000002604) IPO13 (ENSODEG00000002581) ARTN (ENSODEG00000002533) ST3GAL3 (ENSODEG00000002472) ENSODEG00000002231 ##22 KDM4A (ENSODEG00000002177) PTPRF (ENSODEG00000003593) HYI (ENSODEG00000003277) SZT2 (ENSODEG00000002541) MED8 (ENSODEG00000002395) ELOVL1 (ENSODEG00000002280) CDC20 (ENSODEG00000002247) MPL (ENSODEG00000002358) TIE1 (ENSODEG00000002098) C1orf210 (ENSODEG00000002000) TMEM125 (ENSODEG00000018817) CFAP57 (ENSODEG00000001921) EBNA1BP2 (ENSODEG00000001868) ENSODEG00000018750 ENSODEG00000001842 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 355 Cc2d2b (ENSDORG00000028246) Ccnj (ENSDORG00000008265) Zfp518a (ENSDORG00000025759) Blnk (ENSDORG00000008045) Dntt (ENSDORG00000008047) Opalin (ENSDORG00000008050) Tll2 (ENSDORG00000008052) Tm9sf3 (ENSDORG00000008053) Pik3ap1 (ENSDORG00000003681) ENSDORG00000029222 ENSDORG00000026699 Slit1 (ENSDORG00000015380) Arhgap19 (ENSDORG00000012582) ENSDORG00000030156 Rrp12 (ENSDORG00000009199) Pgam1 (ENSDORG00000027733) ##22 Exosc1 (ENSDORG00000016528) Zdhhc16 (ENSDORG00000016530) Mms19 (ENSDORG00000016531) Ubtd1 (ENSDORG00000029750) Ankrd2 (ENSDORG00000016536) Hoga1 (ENSDORG00000016537) Morn4 (ENSDORG00000016540) Pi4k2a (ENSDORG00000002269) Avpi1 (ENSDORG00000028399) Marveld1 (ENSDORG00000002279) Zfyve27 (ENSDORG00000008178) Sfrp5 (ENSDORG00000008180) Golga7b (ENSDORG00000015475) Crtac1 (ENSDORG00000015477) ENSDORG00000024055 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.k ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.k ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 82 Lmntd1 (ENSMOCG00000008486) Kras (ENSMOCG00000011313) Etfrf1 (ENSMOCG00000000926) Casc1 (ENSMOCG00000010336) Irag2 (ENSMOCG00000001897) Bcat1 (ENSMOCG00000018342) Sox5 (ENSMOCG00000003982) Etnk1 (ENSMOCG00000015568) C2cd5 (ENSMOCG00000005597) St8sia1 (ENSMOCG00000020160) Sult6b2 (ENSMOCG00000001915) Cmas (ENSMOCG00000021041) Abcc9 (ENSMOCG00000018016) Kcnj8 (ENSMOCG00000000081) Ldhb (ENSMOCG00000001380) ENSMOCG00000016666 ##22 Gys2 (ENSMOCG00000000198) Spx (ENSMOCG00000006172) Golt1b (ENSMOCG00000019088) Recql (ENSMOCG00000007093) Pyroxd1 (ENSMOCG00000002670) Iapp (ENSMOCG00000012346) ENSMOCG00000020797 ENSMOCG00000012882 ENSMOCG00000015685 ENSMOCG00000003164 Slco1b2 (ENSMOCG00000009708) Slco1c1 (ENSMOCG00000014209) Pde3a (ENSMOCG00000005904) ENSMOCG00000007837 Aebp2 (ENSMOCG00000005729) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.k ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.l ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.l ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 12 Abce1 (ENSMOCG00000013213) Otud4 (ENSMOCG00000012639) Smad1 (ENSMOCG00000002828) Mmaa (ENSMOCG00000000542) 1700011L22Rik (ENSMOCG00000010556) Zfp827 (ENSMOCG00000020399) ENSMOCG00000002657 Lsm6 (ENSMOCG00000020049) Slc10a7 (ENSMOCG00000007838) ENSMOCG00000017327 Pou4f2 (ENSMOCG00000014811) Ttc29 (ENSMOCG00000010925) ENSMOCG00000018841 ENSMOCG00000010337 Ednra (ENSMOCG00000017745) ENSMOCG00000016788 ##22 Rasd2 (ENSMOCG00000014090) Hmox1 (ENSMOCG00000005130) Tom1 (ENSMOCG00000010687) Hmgxb4 (ENSMOCG00000005178) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.a.l ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 634 Srfbp1 (ENSMAUG00000009431) Lox (ENSMAUG00000008060) 1700034E13Rik (ENSMAUG00000007545) Gykl1 (ENSMAUG00000005428) ENSMAUG00000004463 Snx2 (ENSMAUG00000018379) Dpep3 (ENSMAUG00000017410) ENSMAUG00000017250 Snx24 (ENSMAUG00000017166) Ppic (ENSMAUG00000016808) Prdm6 (ENSMAUG00000016287) Cep120 (ENSMAUG00000016424) Csnk1g3 (ENSMAUG00000015117) Zfp608 (ENSMAUG00000014536) ENSMAUG00000013888 ENSMAUG00000014738 ##22 Gramd3 (ENSMAUG00000012430) Aldh7a1 (ENSMAUG00000001614) Phax (ENSMAUG00000014638) Tex43 (ENSMAUG00000013359) Lmnb1 (ENSMAUG00000010471) Marchf3 (ENSMAUG00000012056) C330018D20Rik (ENSMAUG00000011803) Megf10 (ENSMAUG00000004517) Prrc1 (ENSMAUG00000011136) Ctxn3 (ENSMAUG00000010112) Ccdc192 (ENSMAUG00000011938) Slc12a2 (ENSMAUG00000009760) Fbn2 (ENSMAUG00000009747) Slc27a6 (ENSMAUG00000019470) Isoc1 (ENSMAUG00000017533) Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 64 Ccar1 (ENSJJAG00000024055) Tet1 (ENSJJAG00000023109) Slc25a16 (ENSJJAG00000019315) Dna2 (ENSJJAG00000021501) ENSJJAG00000022466 ENSJJAG00000022736 ENSJJAG00000018983 Atoh7 (ENSJJAG00000014782) Mypn (ENSJJAG00000007229) Herc4 (ENSJJAG00000016624) Sirt1 (ENSJJAG00000021678) ENSJJAG00000011610 Lrrtm3 (ENSJJAG00000017094) Ctnna3 (ENSJJAG00000018409) Reep3 (ENSJJAG00000017116) ENSJJAG00000004728 ##22 Jmjd1c (ENSJJAG00000023295) Nrbf2 (ENSJJAG00000000936) ENSJJAG00000021676 Zfp365 (ENSJJAG00000019674) Rtkn2 (ENSJJAG00000019121) Arid5b (ENSJJAG00000001974) Cabcoco1 (ENSJJAG00000023473) Tmem26 (ENSJJAG00000010064) ENSJJAG00000018107 ENSJJAG00000018248 ENSJJAG00000015480 ENSJJAG00000017885 ENSJJAG00000016045 Ccdc6 (ENSJJAG00000000385) Slc16a9 (ENSJJAG00000014368) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 179 Aldh18a1 (ENSJJAG00000015332) Tctn3 (ENSJJAG00000014982) Entpd1 (ENSJJAG00000014493) Cc2d2b (ENSJJAG00000009099) ENSJJAG00000022402 Blnk (ENSJJAG00000017943) Dntt (ENSJJAG00000022684) Tll2 (ENSJJAG00000007261) Tm9sf3 (ENSJJAG00000000058) Pik3ap1 (ENSJJAG00000012258) ENSJJAG00000010901 ENSJJAG00000006963 Slit1 (ENSJJAG00000021868) Arhgap19 (ENSJJAG00000012736) Rrp12 (ENSJJAG00000000110) ENSJJAG00000015130 ##22 Exosc1 (ENSJJAG00000013311) Zdhhc16 (ENSJJAG00000011384) Mms19 (ENSJJAG00000016216) Ubtd1 (ENSJJAG00000013950) Ankrd2 (ENSJJAG00000013600) Hoga1 (ENSJJAG00000013267) Morn4 (ENSJJAG00000013030) Pi4k2a (ENSJJAG00000021991) Avpi1 (ENSJJAG00000021703) Marveld1 (ENSJJAG00000012601) Zfyve27 (ENSJJAG00000005638) Sfrp5 (ENSJJAG00000022836) Golga7b (ENSJJAG00000021511) Crtac1 (ENSJJAG00000020645) ENSJJAG00000020251 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000165139.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.a ##22 ENSGT00390000015287.h ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049709 ENSGT00390000013298 Rabbit MODERN SPECIES 9 SORBS1 (ENSOCUG00000013647) ALDH18A1 (ENSOCUG00000005956) TCTN3 (ENSOCUG00000005964) ENSOCUG00000024251 ENTPD1 (ENSOCUG00000012677) CC2D2B (ENSOCUG00000011118) CCNJ (ENSOCUG00000011114) ZNF518A (ENSOCUG00000015638) BLNK (ENSOCUG00000002864) DNTT (ENSOCUG00000002871) OPALIN (ENSOCUG00000002880) TLL2 (ENSOCUG00000002883) LCOR (ENSOCUG00000029435) SLIT1 (ENSOCUG00000003676) ARHGAP19 (ENSOCUG00000021497) ENSOCUG00000005679 ##22 FRAT1 (ENSOCUG00000005650) RRP12 (ENSOCUG00000005662) ENSOCUG00000011898 ZDHHC16 (ENSOCUG00000000595) MMS19 (ENSOCUG00000007776) UBTD1 (ENSOCUG00000007789) ANKRD2 (ENSOCUG00000007793) HOGA1 (ENSOCUG00000007799) MORN4 (ENSOCUG00000007810) PI4K2A (ENSOCUG00000007814) AVPI1 (ENSOCUG00000007821) MARVELD1 (ENSOCUG00000025329) ZFYVE27 (ENSOCUG00000001352) SFRP5 (ENSOCUG00000021137) GOLGA7B (ENSOCUG00000017860) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Degu MODERN SPECIES 66 UBE2E3 (ENSODEG00000012934) ITGA4 (ENSODEG00000011915) ENSODEG00000012379 CERKL (ENSODEG00000012012) NEUROD1 (ENSODEG00000019934) ITPRID2 (ENSODEG00000011169) PPP1R1C (ENSODEG00000012042) PDE1A (ENSODEG00000011693) DNAJC10 (ENSODEG00000011257) FRZB (ENSODEG00000011697) NCKAP1 (ENSODEG00000012291) DUSP19 (ENSODEG00000012741) ENSODEG00000011202 ENSODEG00000011356 ENSODEG00000010656 ##22 ZNF804A (ENSODEG00000011236) FSIP2 (ENSODEG00000011670) ENSODEG00000011277 ZC3H15 (ENSODEG00000010533) ITGAV (ENSODEG00000013327) ENSODEG00000019974 FAM171B (ENSODEG00000011840) ZSWIM2 (ENSODEG00000010673) CALCRL (ENSODEG00000014219) GULP1 (ENSODEG00000010757) COL3A1 (ENSODEG00000010707) COL5A2 (ENSODEG00000010110) ENSODEG00000019830 ENSODEG00000009648 ENSODEG00000019783 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 86 Lrrn4 (ENSMOCG00000011080) Crls1 (ENSMOCG00000006111) Mcm8 (ENSMOCG00000015893) Trmt6 (ENSMOCG00000022320) Chgb (ENSMOCG00000001424) Shld1 (ENSMOCG00000005816) Gpcpd1 (ENSMOCG00000013354) Prokr2 (ENSMOCG00000012413) Cds2 (ENSMOCG00000015701) Pcna (ENSMOCG00000019613) Tmem230 (ENSMOCG00000019540) Slc23a2 (ENSMOCG00000021732) Rassf2 (ENSMOCG00000000426) Prnd (ENSMOCG00000022573) Prnp (ENSMOCG00000003173) ENSMOCG00000021022 ##22 Adra1d (ENSMOCG00000006284) Smox (ENSMOCG00000011648) Rnf24 (ENSMOCG00000008073) Pank2 (ENSMOCG00000015823) Mavs (ENSMOCG00000022480) Ap5s1 (ENSMOCG00000007406) Cdc25b (ENSMOCG00000000383) Cenpb (ENSMOCG00000006748) Spef1 (ENSMOCG00000016870) 1700037H04Rik (ENSMOCG00000002686) Hspa12b (ENSMOCG00000020638) Siglec1 (ENSMOCG00000013504) Adam33 (ENSMOCG00000022885) Gfra4 (ENSMOCG00000020802) Atrn (ENSMOCG00000000501) Prairie vole MODERN SPECIES 80 ENSMOCG00000001406 Gpr52 (ENSMOCG00000007360) Rabgap1l (ENSMOCG00000007533) ENSMOCG00000009195 Rc3h1 (ENSMOCG00000016587) ENSMOCG00000014126 Serpinc1 (ENSMOCG00000019599) Zbtb37 (ENSMOCG00000005828) Dars2 (ENSMOCG00000020112) Cenpl (ENSMOCG00000015725) ENSMOCG00000005640 Ankrd45 (ENSMOCG00000021366) ENSMOCG00000011324 Tnfsf4 (ENSMOCG00000016434) Tnfsf18 (ENSMOCG00000021434) ENSMOCG00000022063 ##22 Fasl (ENSMOCG00000002112) Suco (ENSMOCG00000005241) 4930558K02Rik (ENSMOCG00000000623) Pigc (ENSMOCG00000003546) Dnm3 (ENSMOCG00000020210) ENSMOCG00000008821 ENSMOCG00000008075 Mettl13 (ENSMOCG00000011261) Vamp4 (ENSMOCG00000015230) Myoc (ENSMOCG00000011618) Myocos (ENSMOCG00000013431) ENSMOCG00000021278 ENSMOCG00000012732 ENSMOCG00000013255 Fmo4 (ENSMOCG00000018998) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Marmoset MODERN SPECIES 21 PLEKHG6 (ENSCJAG00000000666) CD9 (ENSCJAG00000000659) VWF (ENSCJAG00000000613) ANO2 (ENSCJAG00000000606) NTF3 (ENSCJAG00000000605) KCNA5 (ENSCJAG00000068399) KCNA1 (ENSCJAG00000068371) KCNA6 (ENSCJAG00000061475) ENSCJAG00000075610 ENSCJAG00000001647 ENSCJAG00000001628 FGF6 (ENSCJAG00000001613) FGF23 (ENSCJAG00000069632) TIGAR (ENSCJAG00000040111) CCND2 (ENSCJAG00000001593) ENSCJAG00000001586 ##22 ENSCJAG00000021822 PARP11 (ENSCJAG00000001570) ENSCJAG00000082222 CRACR2A (ENSCJAG00000018917) ENSCJAG00000063173 PRMT8 (ENSCJAG00000018891) ENSCJAG00000018882 TEAD4 (ENSCJAG00000018796) ENSCJAG00000085073 FOXM1 (ENSCJAG00000018781) RHNO1 (ENSCJAG00000018790) TEX52 (ENSCJAG00000018779) NRIP2 (ENSCJAG00000083523) ITFG2 (ENSCJAG00000018765) FKBP4 (ENSCJAG00000018746) Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 1050 VIPR2 (ENSANAG00000024103) DYNC2I1 (ENSANAG00000030447) ESYT2 (ENSANAG00000019778) NCAPG2 (ENSANAG00000029627) ENSANAG00000026104 ENSANAG00000026862 ENSANAG00000029187 UBE3C (ENSANAG00000030081) MNX1 (ENSANAG00000031648) ENSANAG00000020425 ENSANAG00000021639 LMBR1 (ENSANAG00000026160) ENSANAG00000025885 ##22 RNF32 (ENSANAG00000035219) ENSANAG00000030048 RBM33 (ENSANAG00000032494) ENSANAG00000024223 EN2 (ENSANAG00000034609) INSIG1 (ENSANAG00000026708) HTR5A (ENSANAG00000027051) PAXIP1 (ENSANAG00000030136) DPP6 (ENSANAG00000023529) Mas night monkey MODERN SPECIES 349 PEX16 (ENSANAG00000024741) LARGE2 (ENSANAG00000024552) PHF21A (ENSANAG00000033662) ENSANAG00000034457 CREB3L1 (ENSANAG00000023783) DGKZ (ENSANAG00000023123) ENSANAG00000030861 CHRM4 (ENSANAG00000007361) AMBRA1 (ENSANAG00000037577) HARBI1 (ENSANAG00000038532) ATG13 (ENSANAG00000036615) ARHGAP1 (ENSANAG00000038289) ZNF408 (ENSANAG00000036294) F2 (ENSANAG00000036904) CKAP5 (ENSANAG00000031236) ENSANAG00000038320 ##22 LRP4 (ENSANAG00000038492) CSTPP1 (ENSANAG00000037882) ENSANAG00000026796 ARFGAP2 (ENSANAG00000031850) PACSIN3 (ENSANAG00000030038) DDB2 (ENSANAG00000036510) ACP2 (ENSANAG00000032696) NR1H3 (ENSANAG00000037990) MADD (ENSANAG00000024603) MYBPC3 (ENSANAG00000023289) SPI1 (ENSANAG00000029485) SLC39A13 (ENSANAG00000027448) ENSANAG00000037076 RAPSN (ENSANAG00000022248) CELF1 (ENSANAG00000031770) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00910000147469 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00910000147469 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 ENSGT00940000161421 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00910000148533 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 Macaca ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c.f ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00910000148533 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 546 SETMAR (ENSMNEG00000045183) SUMF1 (ENSMNEG00000003566) ITPR1 (ENSMNEG00000034253) BHLHE40 (ENSMNEG00000038264) ARL8B (ENSMNEG00000029717) EDEM1 (ENSMNEG00000034041) ENSMNEG00000021998 GRM7 (ENSMNEG00000031784) LMCD1 (ENSMNEG00000039664) SSUH2 (ENSMNEG00000032764) CAV3 (ENSMNEG00000045110) OXTR (ENSMNEG00000037475) ENSMNEG00000027815 RAD18 (ENSMNEG00000013464) SRGAP3 (ENSMNEG00000028942) ENSMNEG00000032308 ##22 THUMPD3 (ENSMNEG00000030529) SETD5 (ENSMNEG00000045236) ENSMNEG00000026054 LHFPL4 (ENSMNEG00000032394) MTMR14 (ENSMNEG00000036145) CPNE9 (ENSMNEG00000032338) BRPF1 (ENSMNEG00000028158) OGG1 (ENSMNEG00000037925) CAMK1 (ENSMNEG00000036021) TADA3 (ENSMNEG00000034551) ENSMNEG00000045138 TTLL3 (ENSMNEG00000041644) RPUSD3 (ENSMNEG00000040308) CIDEC (ENSMNEG00000033573) JAGN1 (ENSMNEG00000030195) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00910000147469 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT00390000005596 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156905 ENSGT00950000182899.B.a ENSGT00940000154927 ENSGT00530000063627.a ENSGT00940000157453 ENSGT00390000001394 ENSGT00940000154652.f ENSGT01030000234579.B.b ENSGT00940000159927 ENSGT00940000160889 ENSGT00940000161271 ENSGT00960000190786 ENSGT00390000016480 ENSGT00940000157953 ENSGT01000000214655 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ##22 ENSGT00950000182950.B ENSGT00390000017146.b.e ENSGT00730000111351 Bonobo MODERN SPECIES 4 CUL4A (ENSPPAG00000034185) LAMP1 (ENSPPAG00000034963) ENSPPAG00000037417 ADPRHL1 (ENSPPAG00000003407) DCUN1D2 (ENSPPAG00000031617) TMCO3 (ENSPPAG00000035939) TFDP1 (ENSPPAG00000031115) ATP4B (ENSPPAG00000010621) GRK1 (ENSPPAG00000011431) ENSPPAG00000012872 GAS6 (ENSPPAG00000030726) ENSPPAG00000032641 C13orf46 (ENSPPAG00000031241) RASA3 (ENSPPAG00000032851) CFAP97D2 (ENSPPAG00000025104) ENSPPAG00000027566 ##22 CDC16 (ENSPPAG00000029807) UPF3A (ENSPPAG00000042267) CHAMP1 (ENSPPAG00000012131) Chimpanzee MODERN SPECIES 4 PCID2 (ENSPTRG00000006053) CUL4A (ENSPTRG00000006054) LAMP1 (ENSPTRG00000006055) GRTP1 (ENSPTRG00000006056) ADPRHL1 (ENSPTRG00000045938) DCUN1D2 (ENSPTRG00000006059) TMCO3 (ENSPTRG00000006060) TFDP1 (ENSPTRG00000048704) ATP4B (ENSPTRG00000006063) GRK1 (ENSPTRG00000006064) TMEM255B (ENSPTRG00000045155) ENSPTRG00000043183 C13H13orf46 (ENSPTRG00000047848) RASA3 (ENSPTRG00000006069) CFAP97D2 (ENSPTRG00000050483) ENSPTRG00000045939 ##22 CDC16 (ENSPTRG00000006072) UPF3A (ENSPTRG00000006073) CHAMP1 (ENSPTRG00000052016) Gibbon MODERN SPECIES 13 ITPR1 (ENSNLEG00000003382) ENSNLEG00000003704 ARL8B (ENSNLEG00000034641) EDEM1 (ENSNLEG00000003738) ENSNLEG00000036159 ENSNLEG00000032377 ENSNLEG00000003761 ENSNLEG00000034183 LMCD1 (ENSNLEG00000003766) SSUH2 (ENSNLEG00000003778) CAV3 (ENSNLEG00000003781) OXTR (ENSNLEG00000029699) ENSNLEG00000029940 RAD18 (ENSNLEG00000003789) SRGAP3 (ENSNLEG00000003842) ENSNLEG00000018950 ##22 THUMPD3 (ENSNLEG00000003863) SETD5 (ENSNLEG00000003896) LHFPL4 (ENSNLEG00000029860) ENSNLEG00000035746 MTMR14 (ENSNLEG00000003963) CPNE9 (ENSNLEG00000004055) BRPF1 (ENSNLEG00000004094) ENSNLEG00000004149 ENSNLEG00000035161 TADA3 (ENSNLEG00000004174) ARPC4 (ENSNLEG00000004196) ENSNLEG00000026984 RPUSD3 (ENSNLEG00000004214) CIDEC (ENSNLEG00000004221) JAGN1 (ENSNLEG00000004230) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161027 ENSGT00940000153370.a.a ENSGT00390000013169 ENSGT00940000160285 ENSGT00930000151054 ENSGT00410000028887 ENSGT00940000165817 ENSGT00530000063721.B ENSGT00940000161002 ENSGT00940000162651 ENSGT00940000155070.k.b ENSGT00940000161776 ENSGT00390000016784 ENSGT00940000162438 ENSGT00940000159147 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000154524.a ENSGT00940000154276.hb.a.f ENSGT00940000157743 ENSGT00390000017253 ENSGT00390000007479.y.a.n.a ENSGT00390000017147 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000001738 ENSGT00530000064783 ENSGT00390000009753 ENSGT00390000010028 ENSGT01030000234598.b.b ENSGT00940000160988 ENSGT00940000160125 ENSGT00940000157941 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161992 ENSGT00940000161027 ENSGT00940000153370.a.a ENSGT00390000013169 ENSGT00940000160285 ENSGT00930000151054 ENSGT00410000028887 ENSGT00530000063721.B ENSGT00940000161002 ENSGT00940000162651 ENSGT00940000155070.k.b ENSGT00940000161776 ENSGT00390000016784 ENSGT00940000162438 ENSGT00940000159147 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000154524.a ENSGT00940000154276.hb.a.f ENSGT00940000157743 ENSGT00390000017253 ENSGT00390000007479.y.a.n.a ENSGT00390000017147 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000001738 ENSGT00530000064783 ENSGT00390000009753 ENSGT00390000010028 ENSGT01030000234598.b.b ENSGT00940000160988 ENSGT00940000160125 ENSGT00940000157941 Pan ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161992 ENSGT00940000161027 ENSGT00940000153370.a.a ENSGT00390000013169 ENSGT00940000160285 ENSGT00930000151054 ENSGT00410000028887 ENSGT00530000063721.B.i ENSGT00940000161002 ENSGT00940000162651 ENSGT00940000155070.k.b ENSGT00940000161776 ENSGT00390000016784 ENSGT00940000162438 ENSGT00940000159147 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000154524.a ENSGT00940000154276.hb.a.f ENSGT00940000157743 ENSGT00390000017253 ENSGT00390000007479.y.a.n.a ENSGT00390000017147 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000001738 ENSGT00530000064783 ENSGT00390000009753 ENSGT00390000010028 ENSGT01030000234598.b.b ENSGT00940000160988 ENSGT00940000160125 ENSGT00940000157941 Chimpanzee MODERN SPECIES 2 KCNK7 (ENSPTRG00000003885) EHBP1L1 (ENSPTRG00000003883) FAM89B (ENSPTRG00000003882) ZNRD2 (ENSPTRG00000003881) LTBP3 (ENSPTRG00000003880) SCYL1 (ENSPTRG00000003879) ENSPTRG00000049826 ENSPTRG00000044235 SLC25A45 (ENSPTRG00000003874) TIGD3 (ENSPTRG00000003873) DPF2 (ENSPTRG00000003872) CDC42EP2 (ENSPTRG00000051376) POLA2 (ENSPTRG00000003870) ENSPTRG00000052347 CAPN1 (ENSPTRG00000003869) ENSPTRG00000044015 ##22 SPDYC (ENSPTRG00000028537) ENSPTRG00000048485 SYVN1 (ENSPTRG00000003868) MRPL49 (ENSPTRG00000003867) FAU (ENSPTRG00000003866) ZNHIT2 (ENSPTRG00000003865) TM7SF2 (ENSPTRG00000003864) VPS51 (ENSPTRG00000003863) TMEM262 (ENSPTRG00000050805) ZFPL1 (ENSPTRG00000003861) CDCA5 (ENSPTRG00000003860) NAALADL1 (ENSPTRG00000003859) SAC3D1 (ENSPTRG00000003858) SNX15 (ENSPTRG00000003857) ARL2 (ENSPTRG00000034478) Bonobo MODERN SPECIES 2 KCNK7 (ENSPPAG00000040175) EHBP1L1 (ENSPPAG00000022447) ENSPPAG00000023660 ZNRD2 (ENSPPAG00000035017) LTBP3 (ENSPPAG00000036458) SCYL1 (ENSPPAG00000029818) ENSPPAG00000022234 ENSPPAG00000036161 SLC25A45 (ENSPPAG00000035170) TIGD3 (ENSPPAG00000001675) DPF2 (ENSPPAG00000043218) CDC42EP2 (ENSPPAG00000017994) POLA2 (ENSPPAG00000038067) ENSPPAG00000030242 CAPN1 (ENSPPAG00000027661) ENSPPAG00000036656 ##22 SPDYC (ENSPPAG00000039970) ENSPPAG00000025565 SYVN1 (ENSPPAG00000024469) MRPL49 (ENSPPAG00000037118) FAU (ENSPPAG00000040318) ZNHIT2 (ENSPPAG00000024364) TM7SF2 (ENSPPAG00000030405) VPS51 (ENSPPAG00000026847) TMEM262 (ENSPPAG00000041718) ZFPL1 (ENSPPAG00000019581) CDCA5 (ENSPPAG00000027263) NAALADL1 (ENSPPAG00000043800) ENSPPAG00000041034 SNX15 (ENSPPAG00000036705) ARL2 (ENSPPAG00000041696) Gorilla MODERN SPECIES 2 KCNK7 (ENSGGOG00000011766) EHBP1L1 (ENSGGOG00000011754) FAM89B (ENSGGOG00000011751) ZNRD2 (ENSGGOG00000011746) LTBP3 (ENSGGOG00000000714) SCYL1 (ENSGGOG00000000712) ENSGGOG00000025059 FRMD8 (ENSGGOG00000014773) SLC25A45 (ENSGGOG00000014767) TIGD3 (ENSGGOG00000014762) DPF2 (ENSGGOG00000026412) CDC42EP2 (ENSGGOG00000038944) POLA2 (ENSGGOG00000003056) ENSGGOG00000007767 CAPN1 (ENSGGOG00000007754) ENSGGOG00000022894 ##22 SPDYC (ENSGGOG00000004263) ENSGGOG00000024036 SYVN1 (ENSGGOG00000002718) MRPL49 (ENSGGOG00000024514) FAU (ENSGGOG00000002714) ZNHIT2 (ENSGGOG00000002712) TM7SF2 (ENSGGOG00000002708) VPS51 (ENSGGOG00000002704) TMEM262 (ENSGGOG00000041966) ZFPL1 (ENSGGOG00000002697) CDCA5 (ENSGGOG00000026067) NAALADL1 (ENSGGOG00000002695) SAC3D1 (ENSGGOG00000024890) SNX15 (ENSGGOG00000010421) ARL2 (ENSGGOG00000005254) Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154245.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154713.B ENSGT00390000018121 ENSGT00940000156728 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000160857 ENSGT00940000155951.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000012305.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b.a ##22 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00530000063690.a.b.a.b.c ENSGT00510000048509 ENSGT00940000156935 ENSGT00390000014817 ENSGT00390000008110 ENSGT00390000013532 ENSGT00940000153284.b ENSGT00870000136875 ENSGT00940000158643 ENSGT00390000011192 ENSGT01080000257472 ENSGT00940000158757 ENSGT00940000154326.a.a.h.a.a ENSGT00390000003601.b Mas night monkey MODERN SPECIES 469 GABRB1 (ENSANAG00000026324) ENSANAG00000025231 COMMD8 (ENSANAG00000019583) ATP10D (ENSANAG00000026040) ENSANAG00000020160 CORIN (ENSANAG00000024072) NFXL1 (ENSANAG00000021407) CNGA1 (ENSANAG00000026609) NIPAL1 (ENSANAG00000022393) TXK (ENSANAG00000031213) TEC (ENSANAG00000035862) SLAIN2 (ENSANAG00000020742) SLC10A4 (ENSANAG00000029030) ZAR1 (ENSANAG00000035179) FRYL (ENSANAG00000030260) ENSANAG00000027091 ##22 OCIAD1 (ENSANAG00000037176) OCIAD2 (ENSANAG00000033240) CWH43 (ENSANAG00000036936) DCUN1D4 (ENSANAG00000006089) LRRC66 (ENSANAG00000027871) SGCB (ENSANAG00000037522) SPATA18 (ENSANAG00000024358) USP46 (ENSANAG00000037399) RASL11B (ENSANAG00000030414) ENSANAG00000036362 ENSANAG00000027223 SCFD2 (ENSANAG00000037492) ENSANAG00000032461 LNX1 (ENSANAG00000028251) ENSANAG00000037095 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154245.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154713.B ENSGT00390000018121 ENSGT00940000156728 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000160857 ENSGT00940000155951.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000012305.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b.a ##22 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00530000063690.a.b.a.b.c ENSGT00510000048509 ENSGT00940000156935 ENSGT00390000014817 ENSGT00390000008110 ENSGT00390000013532 ENSGT00940000153284.b ENSGT00870000136875 ENSGT00940000158643 ENSGT00390000011192 ENSGT01080000257472 ENSGT00940000158757 ENSGT00940000154326.a.a.h.a.a ENSGT00390000003601.b Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000159024 ENSGT00940000154245.B ENSGT00900000143503 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000156728 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000160857 ENSGT00940000155951.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000012305.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b.a ##22 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00530000063690.a.b.a.b.c ENSGT00510000048509 ENSGT00940000156935 ENSGT00390000014817 ENSGT00390000008110 ENSGT00390000013532 ENSGT00940000153284.b.g ENSGT00940000158643 ENSGT00390000011192 ENSGT01080000257472 ENSGT00940000158757 ENSGT00940000154326.a.a.h.a.a ENSGT00390000003601.b ENSGT00940000156043 Capuchin MODERN SPECIES 124 GABRB1 (ENSCCAG00000031056) ENSCCAG00000021015 COMMD8 (ENSCCAG00000037718) ATP10D (ENSCCAG00000032623) CORIN (ENSCCAG00000036055) NFXL1 (ENSCCAG00000035844) CNGA1 (ENSCCAG00000027342) NIPAL1 (ENSCCAG00000032859) TXK (ENSCCAG00000017733) TEC (ENSCCAG00000034761) ENSCCAG00000021799 SLAIN2 (ENSCCAG00000008869) SLC10A4 (ENSCCAG00000037459) ENSCCAG00000034311 FRYL (ENSCCAG00000034554) ENSCCAG00000037817 ##22 OCIAD1 (ENSCCAG00000025450) OCIAD2 (ENSCCAG00000031065) CWH43 (ENSCCAG00000020925) DCUN1D4 (ENSCCAG00000016912) LRRC66 (ENSCCAG00000037453) SGCB (ENSCCAG00000012614) SPATA18 (ENSCCAG00000020113) ENSCCAG00000030356 ENSCCAG00000032234 RASL11B (ENSCCAG00000037560) ENSCCAG00000031404 ENSCCAG00000030526 ENSCCAG00000023197 SCFD2 (ENSCCAG00000031373) FIP1L1 (ENSCCAG00000021687) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 896 BRWD3 (ENSANAG00000008738) ENSANAG00000026677 ENSANAG00000020981 TBX22 (ENSANAG00000021162) ENSANAG00000029835 ITM2A (ENSANAG00000036156) GPR174 (ENSANAG00000019966) P2RY10 (ENSANAG00000020031) LPAR4 (ENSANAG00000020241) ENSANAG00000035162 ENSANAG00000024359 ENSANAG00000033757 TAF9B (ENSANAG00000036258) PGK1 (ENSANAG00000024705) ATP7A (ENSANAG00000023455) ENSANAG00000022195 ##22 COX7B (ENSANAG00000022390) MAGT1 (ENSANAG00000030919) ATRX (ENSANAG00000032142) ENSANAG00000027335 FGF16 (ENSANAG00000037272) MAGEE1 (ENSANAG00000037886) PBDC1 (ENSANAG00000018001) ZDHHC15 (ENSANAG00000023886) UPRT (ENSANAG00000030692) ABCB7 (ENSANAG00000031764) NEXMIF (ENSANAG00000024438) RLIM (ENSANAG00000021696) SLC16A2 (ENSANAG00000031908) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 88 ENSJJAG00000014774 Lrrc2 (ENSJJAG00000012595) ENSJJAG00000023493 Als2cl (ENSJJAG00000017612) Prss46 (ENSJJAG00000021613) Prss45 (ENSJJAG00000019524) ENSJJAG00000014988 ENSJJAG00000012384 Myl3 (ENSJJAG00000021882) Pth1r (ENSJJAG00000020640) Ccdc12 (ENSJJAG00000014918) Nbeal2 (ENSJJAG00000018112) Nradd (ENSJJAG00000008456) ENSJJAG00000000233 Setd2 (ENSJJAG00000022758) ENSJJAG00000014043 ##22 Kif9 (ENSJJAG00000004798) Klhl18 (ENSJJAG00000022221) Ngp (ENSJJAG00000019896) Ptpn23 (ENSJJAG00000023111) ENSJJAG00000012176 ENSJJAG00000011308 ENSJJAG00000018014 Cspg5 (ENSJJAG00000011976) ENSJJAG00000022882 ENSJJAG00000009892 ENSJJAG00000023311 ENSJJAG00000010648 ENSJJAG00000013858 Cdc25a (ENSJJAG00000005624) Camp (ENSJJAG00000020763) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 293 TRMT10C (ENSUPAG00010020476) ENSUPAG00010020479 ZBTB11 (ENSUPAG00010020492) RPL24 (ENSUPAG00010020498) CEP97 (ENSUPAG00010020505) NXPE3 (ENSUPAG00010020518) NFKBIZ (ENSUPAG00010020526) ENSUPAG00010020562 ##22 ZPLD1 (ENSUPAG00010020567) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 23 FNDC9 (ENSHGLG00000035156) CYFIP2 (ENSHGLG00000013823) ITK (ENSHGLG00000018493) GARIN3 (ENSHGLG00000016204) ENSHGLG00000021195 ENSHGLG00000014147 ENSHGLG00000046979 ENSHGLG00000017927 ENSHGLG00000042356 ENSHGLG00000041626 SGCD (ENSHGLG00000014518) ENSHGLG00000043124 MRPL22 (ENSHGLG00000018496) GEMIN5 (ENSHGLG00000013629) CNOT8 (ENSHGLG00000039848) ENSHGLG00000044881 ##22 ENSHGLG00000047467 ENSHGLG00000050510 LARP1 (ENSHGLG00000006267) HAND1 (ENSHGLG00000008657) SAP30L (ENSHGLG00000040967) GALNT10 (ENSHGLG00000011151) MFAP3 (ENSHGLG00000012228) FAM114A2 (ENSHGLG00000005817) GRIA1 (ENSHGLG00000008564) ENSHGLG00000049292 ENSHGLG00000040393 NMUR2 (ENSHGLG00000016664) ENSHGLG00000046430 GLRA1 (ENSHGLG00000016730) G3BP1 (ENSHGLG00000014921) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.a ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.a ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 617 Cc2d2b (ENSMAUG00000020785) Ccnj (ENSMAUG00000021828) Zfp518a (ENSMAUG00000021731) Blnk (ENSMAUG00000021912) Dntt (ENSMAUG00000020553) Opalin (ENSMAUG00000019374) Tll2 (ENSMAUG00000003237) Tm9sf3 (ENSMAUG00000020867) Pik3ap1 (ENSMAUG00000021883) ENSMAUG00000021613 Lcor (ENSMAUG00000019331) Slit1 (ENSMAUG00000002133) Arhgap19 (ENSMAUG00000020627) ENSMAUG00000018859 Rrp12 (ENSMAUG00000020743) ENSMAUG00000021727 ##22 ENSMAUG00000020462 Zdhhc16 (ENSMAUG00000020857) Mms19 (ENSMAUG00000021095) Ubtd1 (ENSMAUG00000019537) Ankrd2 (ENSMAUG00000018303) 4933411K16Rik (ENSMAUG00000017996) Hoga1 (ENSMAUG00000021216) Morn4 (ENSMAUG00000019301) Pi4k2a (ENSMAUG00000018850) Avpi1 (ENSMAUG00000020844) Marveld1 (ENSMAUG00000020397) Zfyve27 (ENSMAUG00000020339) Sfrp5 (ENSMAUG00000019322) Golga7b (ENSMAUG00000019120) Crtac1 (ENSMAUG00000019399) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 16 Zfp518a (ENSMOCG00000007078) Blnk (ENSMOCG00000015343) Dntt (ENSMOCG00000018899) Opalin (ENSMOCG00000009465) Tll2 (ENSMOCG00000014816) Tm9sf3 (ENSMOCG00000017499) Pik3ap1 (ENSMOCG00000019863) ENSMOCG00000016297 Lcor (ENSMOCG00000022456) Slit1 (ENSMOCG00000010266) Arhgap19 (ENSMOCG00000011553) ENSMOCG00000021597 ENSMOCG00000001977 Frat2 (ENSMOCG00000001178) Rrp12 (ENSMOCG00000006753) ENSMOCG00000003968 ##22 ENSMOCG00000006004 Zdhhc16 (ENSMOCG00000010918) ENSMOCG00000015241 Ubtd1 (ENSMOCG00000004869) Ankrd2 (ENSMOCG00000005548) Hoga1 (ENSMOCG00000008769) Morn4 (ENSMOCG00000011013) Pi4k2a (ENSMOCG00000012623) Avpi1 (ENSMOCG00000012593) Marveld1 (ENSMOCG00000013119) Zfyve27 (ENSMOCG00000014672) Sfrp5 (ENSMOCG00000017190) Golga7b (ENSMOCG00000018394) Crtac1 (ENSMOCG00000021947) ENSMOCG00000019358 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.b ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 730 Myo1f (ENSMAUG00000002414) Adamts10 (ENSMAUG00000012826) Actl9 (ENSMAUG00000004280) ENSMAUG00000017033 ENSMAUG00000012218 ENSMAUG00000017172 Pot1b (ENSMAUG00000020767) Adgre4 (ENSMAUG00000008688) ENSMAUG00000007845 Adgre1 (ENSMAUG00000000651) Vav1 (ENSMAUG00000021145) Trip10 (ENSMAUG00000005828) ENSMAUG00000020000 C3 (ENSMAUG00000013599) Tnfsf14 (ENSMAUG00000020967) ENSMAUG00000015229 ##22 Cd70 (ENSMAUG00000019101) ENSMAUG00000021205 Tubb4a (ENSMAUG00000017901) Dennd1c (ENSMAUG00000006409) Crb3 (ENSMAUG00000019988) ENSMAUG00000000871 Slc25a41 (ENSMAUG00000014724) Khsrp (ENSMAUG00000018966) Gm17949 (ENSMAUG00000018260) ENSMAUG00000015346 Pspn (ENSMAUG00000019121) Alkbh7 (ENSMAUG00000000800) Clpp (ENSMAUG00000021469) Acer1 (ENSMAUG00000012781) Mllt1 (ENSMAUG00000011374) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 81 ENSJJAG00000013742 ENSJJAG00000007203 Ephb6 (ENSJJAG00000015598) Trpv6 (ENSJJAG00000010273) Trpv5 (ENSJJAG00000020226) Tas2r144 (ENSJJAG00000017432) ENSJJAG00000012066 Tmem139 (ENSJJAG00000014062) Casp2 (ENSJJAG00000008256) Zyx (ENSJJAG00000016066) Epha1 (ENSJJAG00000021813) ENSJJAG00000010770 Tcaf1 (ENSJJAG00000020805) Or6b1 (ENSJJAG00000016325) Nobox (ENSJJAG00000017542) ENSJJAG00000002419 ##22 ENSJJAG00000005242 ENSJJAG00000024312 ENSJJAG00000003559 Ezh2 (ENSJJAG00000014722) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 743 PRRG3 (ENSPCOG00000023165) VMA21 (ENSPCOG00000028336) GPR50 (ENSPCOG00000027251) ENSPCOG00000014562 ##22 ENSPCOG00000023929 CD99L2 (ENSPCOG00000015996) MTMR1 (ENSPCOG00000019778) MTM1 (ENSPCOG00000017319) MAMLD1 (ENSPCOG00000019557) ENSPCOG00000025016 TMEM185A (ENSPCOG00000020150) ENSPCOG00000017118 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b ##22 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a ##22 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Drill MODERN SPECIES 226 ENTPD1 (ENSMLEG00000032678) ENSMLEG00000031797 CC2D2B (ENSMLEG00000041340) CCNJ (ENSMLEG00000021833) ZNF518A (ENSMLEG00000020642) BLNK (ENSMLEG00000037312) DNTT (ENSMLEG00000041343) OPALIN (ENSMLEG00000028586) TLL2 (ENSMLEG00000042598) TM9SF3 (ENSMLEG00000032756) PIK3AP1 (ENSMLEG00000036975) LCOR (ENSMLEG00000017762) SLIT1 (ENSMLEG00000039609) ARHGAP19 (ENSMLEG00000037965) RRP12 (ENSMLEG00000041317) ENSMLEG00000040909 ##22 EXOSC1 (ENSMLEG00000027643) ZDHHC16 (ENSMLEG00000044387) MMS19 (ENSMLEG00000043890) UBTD1 (ENSMLEG00000039442) ANKRD2 (ENSMLEG00000032656) PI4K2A (ENSMLEG00000032830) MORN4 (ENSMLEG00000031488) AVPI1 (ENSMLEG00000031158) ZFYVE27 (ENSMLEG00000032971) GOLGA7B (ENSMLEG00000025571) CRTAC1 (ENSMLEG00000018903) R3HCC1L (ENSMLEG00000044088) LOXL4 (ENSMLEG00000039866) PYROXD2 (ENSMLEG00000027593) HPS1 (ENSMLEG00000035442) Olive baboon MODERN SPECIES 7 MAFB (ENSPANG00000016615) TOP1 (ENSPANG00000025552) PLCG1 (ENSPANG00000023857) ZHX3 (ENSPANG00000023855) LPIN3 (ENSPANG00000010914) EMILIN3 (ENSPANG00000020628) CHD6 (ENSPANG00000025554) ENSPANG00000037008 PTPRT (ENSPANG00000010915) ENSPANG00000041815 SRSF6 (ENSPANG00000035224) L3MBTL1 (ENSPANG00000026135) SGK2 (ENSPANG00000003908) IFT52 (ENSPANG00000021782) MYBL2 (ENSPANG00000023992) ENSPANG00000010304 ##22 TOX2 (ENSPANG00000023990) JPH2 (ENSPANG00000023989) OSER1 (ENSPANG00000022564) GDAP1L1 (ENSPANG00000022715) FITM2 (ENSPANG00000022713) R3HDML (ENSPANG00000030933) HNF4A (ENSPANG00000026281) TTPAL (ENSPANG00000026279) SERINC3 (ENSPANG00000024778) PKIG (ENSPANG00000022565) ADA (ENSPANG00000023202) CCN5 (ENSPANG00000021786) KCNK15 (ENSPANG00000024499) RIMS4 (ENSPANG00000000384) YWHAB (ENSPANG00000004093) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158773 ENSGT00940000160583 ENSGT00910000146870 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT01020000230401.b.a.m.a ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00910000146810 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00940000157160.e ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00940000163116 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00390000010652.C Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 175 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 192 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00910000147385 ENSGT00910000146870 ENSGT00940000156205 ENSGT00910000148191 ENSGT00940000157771 ENSGT01020000230401.b.a.m.a ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00390000011698.c.a.c.a.i ENSGT00940000160523 ENSGT00910000146810 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00950000182891.a.a.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000156291 ENSGT00860000135750 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00940000163116 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00390000010652.C Sooty mangabey MODERN SPECIES 215 LYSMD4 (ENSCATG00000045215) ENSCATG00000041680 MEF2A (ENSCATG00000013642) ENSCATG00000022742 LRRC28 (ENSCATG00000040008) ENSCATG00000013868 TTC23 (ENSCATG00000030495) SYNM (ENSCATG00000025065) PGPEP1L (ENSCATG00000028080) IGF1R (ENSCATG00000027553) ENSCATG00000036401 ENSCATG00000037029 ARRDC4 (ENSCATG00000042268) ENSCATG00000039546 ENSCATG00000030455 ENSCATG00000038786 ##22 NR2F2 (ENSCATG00000031188) ENSCATG00000018962 MCTP2 (ENSCATG00000040946) ENSCATG00000044758 RGMA (ENSCATG00000031113) CHD2 (ENSCATG00000031069) FAM174B (ENSCATG00000037463) ST8SIA2 (ENSCATG00000035756) ENSCATG00000037617 SLCO3A1 (ENSCATG00000037751) SV2B (ENSCATG00000040402) Drill MODERN SPECIES 1648 ENSMLEG00000022570 ENSMLEG00000026190 MEF2A (ENSMLEG00000040969) ENSMLEG00000043137 LRRC28 (ENSMLEG00000028357) ENSMLEG00000029728 TTC23 (ENSMLEG00000042651) SYNM (ENSMLEG00000027302) PGPEP1L (ENSMLEG00000039938) IGF1R (ENSMLEG00000036236) ENSMLEG00000043699 ENSMLEG00000018383 ARRDC4 (ENSMLEG00000026370) ENSMLEG00000033372 ENSMLEG00000037058 ENSMLEG00000027490 ##22 NR2F2 (ENSMLEG00000039345) ENSMLEG00000022024 MCTP2 (ENSMLEG00000035947) ENSMLEG00000040680 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 557 ENSMNEG00000036969 ENSMNEG00000031350 LYSMD4 (ENSMNEG00000040707) ENSMNEG00000031780 MEF2A (ENSMNEG00000030025) ENSMNEG00000019113 ENSMNEG00000032848 LRRC28 (ENSMNEG00000037760) TTC23 (ENSMNEG00000029743) SYNM (ENSMNEG00000033330) PGPEP1L (ENSMNEG00000021363) IGF1R (ENSMNEG00000038485) ENSMNEG00000022749 ARRDC4 (ENSMNEG00000038340) ENSMNEG00000037257 ENSMNEG00000040826 ##22 NR2F2 (ENSMNEG00000035712) ENSMNEG00000043107 MCTP2 (ENSMNEG00000035810) ENSMNEG00000031378 RGMA (ENSMNEG00000034257) CHD2 (ENSMNEG00000036875) ENSMNEG00000037638 FAM174B (ENSMNEG00000045033) ENSMNEG00000039640 ST8SIA2 (ENSMNEG00000035925) SLCO3A1 (ENSMNEG00000034162) SV2B (ENSMNEG00000040435) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 1039 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A.j Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00940000158773 ENSGT00940000160583 ENSGT00910000146870 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00910000146810 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00940000161069.f ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00940000157160.e ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156813 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00940000158773 ENSGT00940000160583 ENSGT00910000146870 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00390000010718 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156813 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000162149 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000158773 ENSGT00910000147385 ENSGT00940000160583 ENSGT00910000146870 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00390000010718 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156813 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000162149 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00940000158773 ENSGT00910000147385 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00390000010718 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156813 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000162149 Pan ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00940000158773 ENSGT00910000147385 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000170417 ENSGT00940000157771 ENSGT00530000063847.a ENSGT00940000159268 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000156682 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000160523 ENSGT00390000010718 ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ##22 ENSGT00940000157540.A ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000155888 ENSGT00940000157160.e ENSGT00730000111392 ENSGT00910000147013 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT00940000156813 ENSGT00390000009453 Chimpanzee MODERN SPECIES 6 CERS3 (ENSPTRG00000007502) ADAMTS17 (ENSPTRG00000007500) ENSPTRG00000047954 LYSMD4 (ENSPTRG00000007497) MEF2A (ENSPTRG00000007496) ENSPTRG00000046616 LRRC28 (ENSPTRG00000007495) TTC23 (ENSPTRG00000007494) SYNM (ENSPTRG00000007493) ENSPTRG00000007492 IGF1R (ENSPTRG00000007489) FAM169B (ENSPTRG00000042426) ARRDC4 (ENSPTRG00000007487) SPATA8 (ENSPTRG00000007486) ENSPTRG00000045669 ENSPTRG00000044433 ##22 NR2F2 (ENSPTRG00000044693) ENSPTRG00000052493 ENSPTRG00000043984 MCTP2 (ENSPTRG00000007482) RGMA (ENSPTRG00000007480) CHD2 (ENSPTRG00000007478) ENSPTRG00000044489 ENSPTRG00000042874 FAM174B (ENSPTRG00000007475) ENSPTRG00000047348 ST8SIA2 (ENSPTRG00000049717) ENSPTRG00000052368 SLCO3A1 (ENSPTRG00000007471) SV2B (ENSPTRG00000007469) VPS33B (ENSPTRG00000007468) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 321 GRM7 (ENSANAG00000036825) LMCD1 (ENSANAG00000034565) SSUH2 (ENSANAG00000038074) ENSANAG00000025958 CAV3 (ENSANAG00000027621) OXTR (ENSANAG00000031655) RAD18 (ENSANAG00000033360) ENSANAG00000037778 SRGAP3 (ENSANAG00000034431) ENSANAG00000024293 ##22 THUMPD3 (ENSANAG00000002365) SETD5 (ENSANAG00000005767) LHFPL4 (ENSANAG00000032953) MTMR14 (ENSANAG00000033686) CPNE9 (ENSANAG00000034969) BRPF1 (ENSANAG00000019372) OGG1 (ENSANAG00000037964) CAMK1 (ENSANAG00000027843) TADA3 (ENSANAG00000031129) ENSANAG00000037313 TTLL3 (ENSANAG00000025962) ENSANAG00000029371 ENSANAG00000030547 ENSANAG00000031570 SLC6A1 (ENSANAG00000028300) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 219 ATP6V1FNB (ENSCCAG00000033294) ENSCCAG00000034897 FLNC (ENSCCAG00000022550) CCDC136 (ENSCCAG00000034758) OPN1SW (ENSCCAG00000037669) CALU (ENSCCAG00000037513) FAM71F1 (ENSCCAG00000032023) FAM71F2 (ENSCCAG00000028902) IMPDH (ENSCCAG00000020872) PRRT4 (ENSCCAG00000024784) RBM28 (ENSCCAG00000035105) ENSCCAG00000022053 LEP (ENSCCAG00000032161) ENSCCAG00000025380 LRRC4 (ENSCCAG00000002650) ENSCCAG00000014968 ##22 SND1 (ENSCCAG00000036847) PAX4 (ENSCCAG00000005730) FSCN3 (ENSCCAG00000026519) ENSCCAG00000027943 GCC1 (ENSCCAG00000022144) ZNF800 (ENSCCAG00000021078) GRM8 (ENSCCAG00000020804) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 243 ENSGT00550000074994.p ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 181 ENSGT00550000074994.p ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 190 ENSMNEG00000042479 ENSMNEG00000042773 VWC2 (ENSMNEG00000035702) ZPBP (ENSMNEG00000008202) SPATA48 (ENSMNEG00000040240) IKZF1 (ENSMNEG00000033465) ENSMNEG00000028866 DDC (ENSMNEG00000000178) GRB10 (ENSMNEG00000039855) ENSMNEG00000042806 COBL (ENSMNEG00000044240) ENSMNEG00000013900 ENSMNEG00000042241 ENSMNEG00000037561 ENSMNEG00000019174 ENSMNEG00000034131 ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 250 ENSGT00550000074994.p ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 354 ENSGT00550000074994.p ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Drill MODERN SPECIES 1237 ENSMLEG00000040898 ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 133 SUN3 (ENSCATG00000036420) C7orf57 (ENSCATG00000028895) UPP1 (ENSCATG00000040025) ABCA13 (ENSCATG00000034377) CDC14C (ENSCATG00000032252) ENSCATG00000044759 VWC2 (ENSCATG00000009270) ZPBP (ENSCATG00000036172) SPATA48 (ENSCATG00000036782) IKZF1 (ENSCATG00000041205) DDC (ENSCATG00000013954) GRB10 (ENSCATG00000026832) COBL (ENSCATG00000031936) ENSCATG00000031533 ENSCATG00000035640 ENSCATG00000033364 ##22 VSTM2A (ENSCATG00000018326) ENSCATG00000017520 SEC61G (ENSCATG00000036780) ENSCATG00000029935 EGFR (ENSCATG00000039642) LANCL2 (ENSCATG00000038535) VOPP1 (ENSCATG00000014863) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.b ##22 Orangutan MODERN SPECIES 2 KCNK7 (ENSPPYG00000003059) EHBP1L1 (ENSPPYG00000003060) FAM89B (ENSPPYG00000003061) ZNRD2 (ENSPPYG00000003062) LTBP3 (ENSPPYG00000003063) SCYL1 (ENSPPYG00000003064) ENSPPYG00000030176 ENSPPYG00000003066 FRMD8 (ENSPPYG00000031154) SLC25A45 (ENSPPYG00000003067) TIGD3 (ENSPPYG00000003068) DPF2 (ENSPPYG00000003069) CDC42EP2 (ENSPPYG00000032097) POLA2 (ENSPPYG00000003071) CAPN1 (ENSPPYG00000003073) ENSPPYG00000041044 ##22 SPDYC (ENSPPYG00000003074) ENSPPYG00000032178 SYVN1 (ENSPPYG00000003075) MRPL49 (ENSPPYG00000037407) FAU (ENSPPYG00000038797) ZNHIT2 (ENSPPYG00000003078) TM7SF2 (ENSPPYG00000003079) VPS51 (ENSPPYG00000003080) TMEM262 (ENSPPYG00000040202) ZFPL1 (ENSPPYG00000003082) ENSPPYG00000003083 NAALADL1 (ENSPPYG00000003084) SAC3D1 (ENSPPYG00000003085) ENSPPYG00000003086 ARL2 (ENSPPYG00000038004) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Marmoset MODERN SPECIES 3 ENSCJAG00000041013 ##22 POLR3K (ENSCJAG00000011568) SNRNP25 (ENSCJAG00000080317) MPG (ENSCJAG00000011582) NPRL3 (ENSCJAG00000011598) HBZ (ENSCJAG00000043819) HBM (ENSCJAG00000011639) ENSCJAG00000011647 HBQ1 (ENSCJAG00000011671) LUC7L (ENSCJAG00000011674) FAM234A (ENSCJAG00000037284) RGS11 (ENSCJAG00000011745) ARHGDIG (ENSCJAG00000061079) AXIN1 (ENSCJAG00000011809) MRPL28 (ENSCJAG00000083388) PGAP6 (ENSCJAG00000011857) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Capuchin MODERN SPECIES 58 C11orf94 (ENSCCAG00000021208) PEX16 (ENSCCAG00000030937) LARGE2 (ENSCCAG00000022292) PHF21A (ENSCCAG00000031643) ENSCCAG00000032167 CREB3L1 (ENSCCAG00000036096) DGKZ (ENSCCAG00000027153) ENSCCAG00000030225 CHRM4 (ENSCCAG00000016622) AMBRA1 (ENSCCAG00000036631) HARBI1 (ENSCCAG00000033538) ATG13 (ENSCCAG00000033415) ARHGAP1 (ENSCCAG00000005865) ZNF408 (ENSCCAG00000029472) F2 (ENSCCAG00000028699) PGAM4 (ENSCCAG00000037081) ##22 CKAP5 (ENSCCAG00000029859) ENSCCAG00000033202 LRP4 (ENSCCAG00000034888) C11orf49 (ENSCCAG00000028967) ENSCCAG00000036464 PACSIN3 (ENSCCAG00000031265) DDB2 (ENSCCAG00000031012) ACP2 (ENSCCAG00000022333) NR1H3 (ENSCCAG00000024854) MADD (ENSCCAG00000036617) MYBPC3 (ENSCCAG00000036859) SPI1 (ENSCCAG00000022473) SLC39A13 (ENSCCAG00000034535) PSMC3 (ENSCCAG00000025080) RAPSN (ENSCCAG00000022014) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 42 FREY1 (ENSSBOG00000032977) PEX16 (ENSSBOG00000001635) LARGE2 (ENSSBOG00000024444) PHF21A (ENSSBOG00000026213) CREB3L1 (ENSSBOG00000026826) DGKZ (ENSSBOG00000028666) ENSSBOG00000025813 CHRM4 (ENSSBOG00000015294) AMBRA1 (ENSSBOG00000021917) HARBI1 (ENSSBOG00000025915) ATG13 (ENSSBOG00000009657) ARHGAP1 (ENSSBOG00000032970) ZNF408 (ENSSBOG00000033023) F2 (ENSSBOG00000020779) CKAP5 (ENSSBOG00000031735) ENSSBOG00000028063 ##22 ENSSBOG00000032726 LRP4 (ENSSBOG00000032261) CSTPP1 (ENSSBOG00000033686) ENSSBOG00000031368 PACSIN3 (ENSSBOG00000033696) DDB2 (ENSSBOG00000030867) ACP2 (ENSSBOG00000033600) NR1H3 (ENSSBOG00000027982) MADD (ENSSBOG00000021915) MYBPC3 (ENSSBOG00000030340) SPI1 (ENSSBOG00000022091) SLC39A13 (ENSSBOG00000010603) ENSSBOG00000006227 RAPSN (ENSSBOG00000022262) CELF1 (ENSSBOG00000021912) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 984 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 ENSGT00940000154939 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 6 ARHGEF7 (ENSPANG00000019938) ANKRD10 (ENSPANG00000035969) ING1 (ENSPANG00000015880) CARS2 (ENSPANG00000017574) NAXD (ENSPANG00000000957) RAB20 (ENSPANG00000044058) COL4A2 (ENSPANG00000012522) COL4A1 (ENSPANG00000004421) IRS2 (ENSPANG00000029692) MYO16 (ENSPANG00000012679) ENSPANG00000019731 LIG4 (ENSPANG00000007562) ENSPANG00000045788 ENSPANG00000046676 NALF1 (ENSPANG00000009295) ENSPANG00000011850 ##22 ENSPANG00000044135 ENSPANG00000050745 ENSPANG00000037981 ARGLU1 (ENSPANG00000049597) EFNB2 (ENSPANG00000004281) ENSPANG00000007600 ENSPANG00000048625 ENSPANG00000041499 ENSPANG00000042101 ENSPANG00000046932 ENSPANG00000038142 SLC10A2 (ENSPANG00000049257) METTL21EP (ENSPANG00000008110) ENSPANG00000007563 POGLUT2 (ENSPANG00000018248) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Drill MODERN SPECIES 1591 ENSMLEG00000015628 ##22 ARGLU1 (ENSMLEG00000005466) EFNB2 (ENSMLEG00000036784) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 1 PLCG1 (ENSMFAG00000000283) ZHX3 (ENSMFAG00000038640) ENSMFAG00000047948 LPIN3 (ENSMFAG00000038975) EMILIN3 (ENSMFAG00000045816) CHD6 (ENSMFAG00000032830) PTPRT (ENSMFAG00000002480) ENSMFAG00000030794 ENSMFAG00000032571 SRSF6 (ENSMFAG00000036925) L3MBTL1 (ENSMFAG00000032249) SGK2 (ENSMFAG00000032486) IFT52 (ENSMFAG00000044608) MYBL2 (ENSMFAG00000032458) ENSMFAG00000062509 ENSMFAG00000026943 ##22 TOX2 (ENSMFAG00000036799) JPH2 (ENSMFAG00000002372) OSER1 (ENSMFAG00000000578) GDAP1L1 (ENSMFAG00000031122) ENSMFAG00000057869 FITM2 (ENSMFAG00000044491) R3HDML (ENSMFAG00000038530) HNF4A (ENSMFAG00000035660) ENSMFAG00000053985 TTPAL (ENSMFAG00000036596) SERINC3 (ENSMFAG00000045198) PKIG (ENSMFAG00000003009) ENSMFAG00000042071 CCN5 (ENSMFAG00000036685) RIMS4 (ENSMFAG00000052597) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 550 CC2D2B (ENSMNEG00000042350) CCNJ (ENSMNEG00000034961) ZNF518A (ENSMNEG00000028261) BLNK (ENSMNEG00000031238) DNTT (ENSMNEG00000043593) OPALIN (ENSMNEG00000036553) TLL2 (ENSMNEG00000000061) TM9SF3 (ENSMNEG00000040908) PIK3AP1 (ENSMNEG00000033410) LCOR (ENSMNEG00000030522) SLIT1 (ENSMNEG00000030571) ARHGAP19 (ENSMNEG00000042296) FRAT1 (ENSMNEG00000029910) FRAT2 (ENSMNEG00000006562) RRP12 (ENSMNEG00000036759) ENSMNEG00000028115 ##22 EXOSC1 (ENSMNEG00000029816) ZDHHC16 (ENSMNEG00000027994) MMS19 (ENSMNEG00000044701) UBTD1 (ENSMNEG00000039022) ANKRD2 (ENSMNEG00000039814) MORN4 (ENSMNEG00000035432) PI4K2A (ENSMNEG00000020019) AVPI1 (ENSMNEG00000032294) MARVELD1 (ENSMNEG00000009162) ZFYVE27 (ENSMNEG00000039230) SFRP5 (ENSMNEG00000043178) GOLGA7B (ENSMNEG00000033947) ENSMNEG00000001433 CRTAC1 (ENSMNEG00000035544) R3HCC1L (ENSMNEG00000037890) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.d ##22 Human MODERN SPECIES 1827 RPS6KA6 (ENSG00000072133) CYLC1 (ENSG00000183035) POU3F4 (ENSG00000196767) SH3BGRL (ENSG00000131171) HMGN5 (ENSG00000198157) BRWD3 (ENSG00000165288) TENT5D (ENSG00000174016) TBX22 (ENSG00000122145) ITM2A (ENSG00000078596) GPR174 (ENSG00000147138) P2RY10 (ENSG00000078589) LPAR4 (ENSG00000147145) RTL3 (ENSG00000179300) CYSLTR1 (ENSG00000173198) TAF9B (ENSG00000187325) PGAM4 (ENSG00000226784) ##22 PGK1 (ENSG00000102144) ATP7A (ENSG00000165240) COX7B (ENSG00000131174) MAGT1 (ENSG00000102158) ATRX (ENSG00000085224) FGF16 (ENSG00000196468) MAGEE1 (ENSG00000198934) PBDC1 (ENSG00000102390) MAGEE2 (ENSG00000186675) ZDHHC15 (ENSG00000102383) UPRT (ENSG00000094841) ABCB7 (ENSG00000131269) NEXMIF (ENSG00000050030) RLIM (ENSG00000131263) SLC16A2 (ENSG00000147100) Gorilla MODERN SPECIES 22 ENSGGOG00000039378 ZBTB5 (ENSGGOG00000043647) GRHPR (ENSGGOG00000003710) ZCCHC7 (ENSGGOG00000034973) PAX5 (ENSGGOG00000003633) MELK (ENSGGOG00000014746) RNF38 (ENSGGOG00000016336) GNE (ENSGGOG00000013160) CLTA (ENSGGOG00000013155) CCIN (ENSGGOG00000027920) GLIPR2 (ENSGGOG00000003324) RECK (ENSGGOG00000003313) ENSGGOG00000024545 ENSGGOG00000024475 ENSGGOG00000024643 ENSGGOG00000024966 ##22 SPAAR (ENSGGOG00000039944) HRCT1 (ENSGGOG00000036981) ENSGGOG00000043128 OR13J1 (ENSGGOG00000028587) ENSGGOG00000007705 FAM221B (ENSGGOG00000011270) HINT2 (ENSGGOG00000011265) SPAG8 (ENSGGOG00000011256) NPR2 (ENSGGOG00000011241) RGP1 (ENSGGOG00000007370) MSMP (ENSGGOG00000007374) GBA2 (ENSGGOG00000007356) CREB3 (ENSGGOG00000007353) ENSGGOG00000007440 CD72 (ENSGGOG00000017153) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 955 CCNJ (ENSCWAG00000017468) BLNK (ENSCWAG00000016542) DNTT (ENSCWAG00000016338) OPALIN (ENSCWAG00000015720) TLL2 (ENSCWAG00000015533) TM9SF3 (ENSCWAG00000015473) PIK3AP1 (ENSCWAG00000015321) ENSCWAG00000015271 LCOR (ENSCWAG00000015211) SLIT1 (ENSCWAG00000014663) ARHGAP19 (ENSCWAG00000014322) FRAT1 (ENSCWAG00000014264) FRAT2 (ENSCWAG00000014245) RRP12 (ENSCWAG00000014123) ENSCWAG00000014086 PGAM4 (ENSCWAG00000014065) ##22 EXOSC1 (ENSCWAG00000013946) ENSCWAG00000013760 MMS19 (ENSCWAG00000013469) UBTD1 (ENSCWAG00000013405) ANKRD2 (ENSCWAG00000013015) HOGA1 (ENSCWAG00000012895) MORN4 (ENSCWAG00000012823) PI4K2A (ENSCWAG00000012772) AVPI1 (ENSCWAG00000012736) MARVELD1 (ENSCWAG00000012717) ZFYVE27 (ENSCWAG00000012082) SFRP5 (ENSCWAG00000011979) GOLGA7B (ENSCWAG00000011885) CRTAC1 (ENSCWAG00000020281) R3HCC1L (ENSCWAG00000020239) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01100000263542.C ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.b ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00390000015820 ENSGT00530000063604.A ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Arabian camel MODERN SPECIES 2 ENSCDRG00005010552 CCNJ (ENSCDRG00005010456) ZNF518A (ENSCDRG00005010426) BLNK (ENSCDRG00005010120) DNTT (ENSCDRG00005009911) OPALIN (ENSCDRG00005009332) TLL2 (ENSCDRG00005009257) TM9SF3 (ENSCDRG00005008940) PIK3AP1 (ENSCDRG00005008820) ENSCDRG00005008738 LCOR (ENSCDRG00005008609) SLIT1 (ENSCDRG00005008525) ARHGAP19 (ENSCDRG00005008432) FRAT1 (ENSCDRG00005008405) RRP12 (ENSCDRG00005008039) PGAM4 (ENSCDRG00005007987) ##22 EXOSC1 (ENSCDRG00005007159) ZDHHC16 (ENSCDRG00005006637) MMS19 (ENSCDRG00005006081) UBTD1 (ENSCDRG00005006007) ANKRD2 (ENSCDRG00005005898) C10orf62 (ENSCDRG00005005880) HOGA1 (ENSCDRG00005005801) MORN4 (ENSCDRG00005005757) PI4K2A (ENSCDRG00005005722) AVPI1 (ENSCDRG00005005710) MARVELD1 (ENSCDRG00005005688) ZFYVE27 (ENSCDRG00005005050) SFRP5 (ENSCDRG00005004990) GOLGA7B (ENSCDRG00005004929) CRTAC1 (ENSCDRG00005004684) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Cow MODERN SPECIES 27 TMEM252 (ENSBTAG00000011874) PIP5K1B (ENSBTAG00000009917) FXN (ENSBTAG00000001306) TJP2 (ENSBTAG00000011770) ENTREP1 (ENSBTAG00000011173) APBA1 (ENSBTAG00000008877) PTAR1 (ENSBTAG00000005826) CFAP95 (ENSBTAG00000033396) MAMDC2 (ENSBTAG00000017369) SMC5 (ENSBTAG00000018437) ENSBTAG00000052999 KLF9 (ENSBTAG00000016229) TRPM3 (ENSBTAG00000007778) TRPM3 (ENSBTAG00000050253) CEMIP2 (ENSBTAG00000005090) ENSBTAG00000054590 ##22 ABHD17B (ENSBTAG00000006816) C8H9orf85 (ENSBTAG00000006831) GDA (ENSBTAG00000011545) ZFAND5 (ENSBTAG00000009417) ENSBTAG00000054894 TMC1 (ENSBTAG00000018778) ENSBTAG00000052698 ALDH1A1 (ENSBTAG00000008103) ANXA1 (ENSBTAG00000015978) ENSBTAG00000053207 RORB (ENSBTAG00000021699) TRPM6 (ENSBTAG00000033076) ENSBTAG00000051504 C8H9orf40 (ENSBTAG00000013231) CARNMT1 (ENSBTAG00000008204) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 4 ENSOARG00020025351 ENSOARG00020025359 SNRPB2 (ENSOARG00020025367) OTOR (ENSOARG00020025370) NANP (ENSOARG00020025376) ENSOARG00020003187 ENSOARG00020003227 ENSOARG00020003271 FBH1 (ENSOARG00020003456) ENSOARG00020003590 IL2RA (ENSOARG00020003621) RBM17 (ENSOARG00020003664) PFKFB3 (ENSOARG00020003727) PRKCQ (ENSOARG00020003986) SFMBT2 (ENSOARG00020004270) ENSOARG00020004315 ##22 ITIH5 (ENSOARG00020004363) ENSOARG00020004546 ITIH2 (ENSOARG00020004566) KIN (ENSOARG00020004659) ATP5F1C (ENSOARG00020004769) TAF3 (ENSOARG00020004833) GATA3 (ENSOARG00020004895) CELF2 (ENSOARG00020005064) USP6NL (ENSOARG00020005525) ECHDC3 (ENSOARG00020005746) ENSOARG00020005780 UPF2 (ENSOARG00020005801) DHTKD1 (ENSOARG00020005895) SEC61A2 (ENSOARG00020006097) NUDT5 (ENSOARG00020007141) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 13 JAM3 (ENSOARG00020009874) IGSF9B (ENSOARG00020010264) SPATA19 (ENSOARG00020010923) OPCML (ENSOARG00020011005) ENSOARG00020011324 ENSOARG00020011407 TMEM45B (ENSOARG00020011458) NFRKB (ENSOARG00020011602) PRDM10 (ENSOARG00020011870) APLP2 (ENSOARG00020012094) ENSOARG00020012954 ST14 (ENSOARG00020013007) ZBTB44 (ENSOARG00020013898) ADAMTS15 (ENSOARG00020014165) SNX19 (ENSOARG00020014289) ENSOARG00020014561 ##22 MS4A8 (ENSOARG00020014608) ENSOARG00020014643 MS4A15 (ENSOARG00020014705) CCDC86 (ENSOARG00020015152) PTGDR2 (ENSOARG00020015206) PRPF19 (ENSOARG00020015225) TMEM109 (ENSOARG00020015313) TMEM132A (ENSOARG00020015357) SLC15A3 (ENSOARG00020015451) ENSOARG00020015709 VPS37C (ENSOARG00020015860) ENSOARG00020015937 ENSOARG00020016043 ENSOARG00020016221 ENSOARG00020016320 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Blue whale MODERN SPECIES 7 CCNJ (ENSBMSG00010017383) ZNF518A (ENSBMSG00010017358) BLNK (ENSBMSG00010016850) DNTT (ENSBMSG00010016661) OPALIN (ENSBMSG00010016051) TLL2 (ENSBMSG00010015946) TM9SF3 (ENSBMSG00010015811) PIK3AP1 (ENSBMSG00010015684) ENSBMSG00010015636 LCOR (ENSBMSG00010015588) SLIT1 (ENSBMSG00010015125) ARHGAP19 (ENSBMSG00010014875) FRAT1 (ENSBMSG00010014808) FRAT2 (ENSBMSG00010014789) RRP12 (ENSBMSG00010014708) PGAM4 (ENSBMSG00010014630) ##22 EXOSC1 (ENSBMSG00010014544) ZDHHC16 (ENSBMSG00010014246) MMS19 (ENSBMSG00010014036) UBTD1 (ENSBMSG00010021584) ANKRD2 (ENSBMSG00010021528) HOGA1 (ENSBMSG00010021510) ENSBMSG00010021499 PI4K2A (ENSBMSG00010021477) AVPI1 (ENSBMSG00010021470) MARVELD1 (ENSBMSG00010021463) SFRP5 (ENSBMSG00010021454) ENSBMSG00010021433 ZFYVE27 (ENSBMSG00010021315) CRTAC1 (ENSBMSG00010021195) R3HCC1L (ENSBMSG00010021112) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES 1034 ENSPCTG00005015606 ##22 Sperm whale MODERN SPECIES SERPINI2 (ENSPCTG00005000778) PDCD10 (ENSPCTG00005000801) SERPINI1 (ENSPCTG00005000818) GOLIM4 (ENSPCTG00005000852) ENSPCTG00005000924 MECOM (ENSPCTG00005000999) ACTRT3 (ENSPCTG00005001252) MYNN (ENSPCTG00005001270) LRRC34 (ENSPCTG00005001296) LRRIQ4 (ENSPCTG00005001334) LRRC31 (ENSPCTG00005001353) SAMD7 (ENSPCTG00005001374) SEC62 (ENSPCTG00005001393) GPR160 (ENSPCTG00005001412) PHC3 (ENSPCTG00005001443) ENSPCTG00005001517 ##22 PRKCI (ENSPCTG00005001542) SKIL (ENSPCTG00005001599) CLDN11 (ENSPCTG00005001618) SLC7A14 (ENSPCTG00005001634) ENSPCTG00005001650 RPL22L1 (ENSPCTG00005001662) EIF5A2 (ENSPCTG00005001682) SLC2A2 (ENSPCTG00005001701) TNIK (ENSPCTG00005001786) PLD1 (ENSPCTG00005001936) TMEM212 (ENSPCTG00005002038) FNDC3B (ENSPCTG00005002082) GHSR (ENSPCTG00005002161) TNFSF10 (ENSPCTG00005002181) NCEH1 (ENSPCTG00005002205) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000164312 ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01100000263542.C ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081.a ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d.c.b ##22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 ENSGT00530000063711.b Elephant MODERN SPECIES 3 CC2D2B (ENSLAFG00000008968) CCNJ (ENSLAFG00000008972) BLNK (ENSLAFG00000003491) DNTT (ENSLAFG00000003492) OPALIN (ENSLAFG00000003493) TLL2 (ENSLAFG00000008166) TM9SF3 (ENSLAFG00000016524) PIK3AP1 (ENSLAFG00000011699) ENSLAFG00000014271 LCOR (ENSLAFG00000014729) SLIT1 (ENSLAFG00000014273) ARHGAP19 (ENSLAFG00000020968) ENSLAFG00000010024 ENSLAFG00000015960 RRP12 (ENSLAFG00000015965) PGAM4 (ENSLAFG00000015979) ##22 EXOSC1 (ENSLAFG00000015983) ZDHHC16 (ENSLAFG00000015990) MMS19 (ENSLAFG00000009246) UBTD1 (ENSLAFG00000010656) ANKRD2 (ENSLAFG00000010658) HOGA1 (ENSLAFG00000010660) MORN4 (ENSLAFG00000022767) PI4K2A (ENSLAFG00000010665) AVPI1 (ENSLAFG00000022434) ZFYVE27 (ENSLAFG00000013655) SFRP5 (ENSLAFG00000013658) GOLGA7B (ENSLAFG00000003367) CRTAC1 (ENSLAFG00000003369) R3HCC1L (ENSLAFG00000001419) LOXL4 (ENSLAFG00000001421) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 ENSGT00390000000134.a ENSGT00390000013726 Opossum MODERN SPECIES CC2D2B (ENSMODG00000004884) CCNJ (ENSMODG00000004869) ZNF518A (ENSMODG00000004851) BLNK (ENSMODG00000004839) DNTT (ENSMODG00000004658) ENSMODG00000025726 TLL2 (ENSMODG00000004648) TM9SF3 (ENSMODG00000004627) ENSMODG00000004606 PIK3AP1 (ENSMODG00000004594) LCOR (ENSMODG00000024950) SLIT1 (ENSMODG00000004492) ARHGAP19 (ENSMODG00000004364) ENSMODG00000039402 RRP12 (ENSMODG00000004315) ENSMODG00000004242 #22 EXOSC1 (ENSMODG00000004213) ZDHHC16 (ENSMODG00000004177) MMS19 (ENSMODG00000004099) ANKRD2 (ENSMODG00000003989) ENSMODG00000003970 HOGA1 (ENSMODG00000003963) MORN4 (ENSMODG00000003942) PI4K2A (ENSMODG00000003931) ENSMODG00000003917 MARVELD1 (ENSMODG00000003911) ZFYVE27 (ENSMODG00000003907) SFRP5 (ENSMODG00000003859) GOLGA7B (ENSMODG00000028192) CRTAC1 (ENSMODG00000003807) ENSMODG00000050795 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156590.b ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155493 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000162611.a ENSGT00940000154965.A ENSGT00940000157322.a ENSGT00940000157331 ENSGT00390000007081 ENSGT00390000013106 ENSGT00950000182926.b.d #22 ENSGT00390000015287 ENSGT00940000155032 ENSGT00390000015583 ENSGT00940000158630 ENSGT00940000153956.b ENSGT00530000063604.A ENSGT00390000015820 ENSGT00730000111173 ENSGT00390000010434.b ENSGT00510000049872 ENSGT00510000049375 ENSGT00390000013298 ENSGT00940000160608 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