Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 316 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT00940000154181 ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000160140.a.b ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00940000172596 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000157106 ENSGT01090000260040.b.a.b ENSGT00390000003465.a ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00940000156357 ENSGT00940000159405 ENSGT00950000182995.e.b Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000160140.a.b ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918 ENSGT00940000154697.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00940000156357 ENSGT00940000159405 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162274 ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.b ENSGT00940000169819 ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00940000156357 ENSGT00940000159405 Amniota ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01100000264651 ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000167005 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A 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ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Tarsier MODERN SPECIES 3146 OSR2 (ENSTSYG00000013426) #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.q.b ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000012916.h ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 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ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000164643 ENSGT00390000010391.w.b ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 Marmoset MODERN SPECIES 7 MTDH (ENSCJAG00000005059) ENSCJAG00000082247 ENSCJAG00000069717 MATN2 (ENSCJAG00000015501) ENSCJAG00000015549 ERICH5 (ENSCJAG00000015555) RIDA (ENSCJAG00000015560) POP1 (ENSCJAG00000015567) NIPAL2 (ENSCJAG00000040562) KCNS2 (ENSCJAG00000045971) STK3 (ENSCJAG00000015597) OSR2 (ENSCJAG00000015627) #22 VPS13B (ENSCJAG00000015651) ENSCJAG00000076638 RGS22 (ENSCJAG00000015721) FBXO43 (ENSCJAG00000015760) ENSCJAG00000080456 SPAG1 (ENSCJAG00000015770) ENSCJAG00000066551 RNF19A (ENSCJAG00000015794) ENSCJAG00000079952 ENSCJAG00000067452 ANKRD46 (ENSCJAG00000015816) SNX31 (ENSCJAG00000015820) PABPC1 (ENSCJAG00000015833) ENSCJAG00000085316 YWHAZ (ENSCJAG00000015844) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 120 ENSGT00940000153446.a.a.q.a.a.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000164643 ENSGT00390000010391.w.b ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 214 ENSSBOG00000032260 MATN2 (ENSSBOG00000002029) RPL30 (ENSSBOG00000031109) ERICH5 (ENSSBOG00000029799) ENSSBOG00000022742 POP1 (ENSSBOG00000020830) NIPAL2 (ENSSBOG00000026543) KCNS2 (ENSSBOG00000018618) STK3 (ENSSBOG00000027109) OSR2 (ENSSBOG00000035052) #22 VPS13B (ENSSBOG00000027822) ENSSBOG00000024423 ENSSBOG00000022499 RGS22 (ENSSBOG00000023420) FBXO43 (ENSSBOG00000027482) ENSSBOG00000022710 ENSSBOG00000029490 SPAG1 (ENSSBOG00000029976) 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ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.q.b ENSGT00390000015318.c ENSGT01030000234916 ENSGT00550000074784.a.b ENSGT00940000158008 ENSGT00910000147071 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000163468 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00390000010391.w.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00940000153773.a.b.a.a.a ENSGT01090000260040.a.a.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.q.b ENSGT00390000015318.c ENSGT01030000234916 ENSGT00550000074784.a.b ENSGT00940000158008 ENSGT00910000147071 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00390000010783 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ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00390000010391.w.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00390000003465.b.b.o.a ENSGT00440000033468.c.b Gorilla MODERN SPECIES 21 MTDH (ENSGGOG00000000539) ENSGGOG00000000543 ENSGGOG00000036904 ENSGGOG00000013111 MATN2 (ENSGGOG00000015748) ENSGGOG00000037587 RPL30 (ENSGGOG00000005502) ERICH5 (ENSGGOG00000001184) RIDA (ENSGGOG00000001185) POP1 (ENSGGOG00000003176) NIPAL2 (ENSGGOG00000002387) ENSGGOG00000028028 KCNS2 (ENSGGOG00000002797) STK3 (ENSGGOG00000034989) ENSGGOG00000025398 ENSGGOG00000006716 #22 ENSGGOG00000039991 VPS13B (ENSGGOG00000034850) COX6C (ENSGGOG00000013771) RGS22 (ENSGGOG00000039315) FBXO43 (ENSGGOG00000000296) POLR2K (ENSGGOG00000024539) SPAG1 (ENSGGOG00000010949) RNF19A (ENSGGOG00000026234) ANKRD46 (ENSGGOG00000012039) SNX31 (ENSGGOG00000023807) PABPC1 (ENSGGOG00000006785) ENSGGOG00000022133 ZNF706 (ENSGGOG00000043557) ENSGGOG00000025511 GRHL2 (ENSGGOG00000004401) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.q.b ENSGT00940000158008 ENSGT00910000147071 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000166912 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000163468 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00390000010391.w.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00390000003465.b.b.o.a ENSGT00440000033468.c.b ENSGT01090000260040.a.a.b Pan ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.q.b ENSGT00390000015318.c ENSGT00940000158008 ENSGT00910000147071 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000166912 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000163468 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00390000003465.b.b.o.a ENSGT00440000033468.c.b ENSGT00940000155788 ENSGT00390000002944.f Chimpanzee MODERN SPECIES 21 TSPYL5 (ENSPTRG00000020445) MTDH (ENSPTRG00000020447) LAPTM4B (ENSPTRG00000020448) ENSPTRG00000046478 MATN2 (ENSPTRG00000020451) ENSPTRG00000044251 RPL30 (ENSPTRG00000020454) ERICH5 (ENSPTRG00000020456) RIDA (ENSPTRG00000020457) POP1 (ENSPTRG00000020458) NIPAL2 (ENSPTRG00000045973) ENSPTRG00000044772 KCNS2 (ENSPTRG00000039728) STK3 (ENSPTRG00000020462) ENSPTRG00000046155 OSR2 (ENSPTRG00000020463) #22 VPS13B (ENSPTRG00000020464) ENSPTRG00000044726 COX6C (ENSPTRG00000020467) RGS22 (ENSPTRG00000020468) 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ENSPPAG00000027115 ENSPPAG00000003654 GRHL2 (ENSPPAG00000042743) Human MODERN SPECIES 20 MTERF3 (ENSG00000156469) PTDSS1 (ENSG00000156471) SDC2 (ENSG00000169439) CPQ (ENSG00000104324) TSPYL5 (ENSG00000180543) MTDH (ENSG00000147649) LAPTM4B (ENSG00000104341) MATN2 (ENSG00000132561) RPL30 (ENSG00000156482) ERICH5 (ENSG00000177459) RIDA (ENSG00000132541) POP1 (ENSG00000104356) NIPAL2 (ENSG00000104361) STK3 (ENSG00000104375) KCNS2 (ENSG00000156486) OSR2 (ENSG00000164920) #22 VPS13B (ENSG00000132549) COX6C (ENSG00000164919) RGS22 (ENSG00000132554) FBXO43 (ENSG00000156509) POLR2K (ENSG00000147669) SPAG1 (ENSG00000104450) RNF19A (ENSG00000034677) ANKRD46 (ENSG00000186106) SNX31 (ENSG00000174226) PABPC1 (ENSG00000070756) YWHAZ (ENSG00000164924) ZNF706 (ENSG00000120963) GRHL2 (ENSG00000083307) NCALD (ENSG00000104490) RRM2B (ENSG00000048392) Orangutan MODERN SPECIES 21 SDC2 (ENSPPYG00000032941) CPQ (ENSPPYG00000018768) TSPYL5 (ENSPPYG00000018769) MTDH (ENSPPYG00000018770) ENSPPYG00000018771 ENSPPYG00000038790 ENSPPYG00000018772 MATN2 (ENSPPYG00000018773) RPL30 (ENSPPYG00000018774) ERICH5 (ENSPPYG00000018775) RIDA (ENSPPYG00000018776) POP1 (ENSPPYG00000018777) NIPAL2 (ENSPPYG00000018778) KCNS2 (ENSPPYG00000018779) STK3 (ENSPPYG00000018780) ENSPPYG00000018781 #22 VPS13B (ENSPPYG00000018782) COX6C (ENSPPYG00000030699) RGS22 (ENSPPYG00000018784) FBXO43 (ENSPPYG00000018785) POLR2K (ENSPPYG00000018786) SPAG1 (ENSPPYG00000018787) RNF19A (ENSPPYG00000039695) ANKRD46 (ENSPPYG00000018788) SNX31 (ENSPPYG00000018789) PABPC1 (ENSPPYG00000018790) YWHAZ (ENSPPYG00000018791) ENSPPYG00000018792 ENSPPYG00000035143 ENSPPYG00000033958 GRHL2 (ENSPPYG00000018794) Gibbon MODERN SPECIES 6 RAB2A (ENSNLEG00000036148) CHD7 (ENSNLEG00000002027) ENSNLEG00000033557 ENSNLEG00000035467 ENSNLEG00000033932 ENSNLEG00000002143 CLVS1 (ENSNLEG00000002146) ASPH (ENSNLEG00000002208) ERICH5 (ENSNLEG00000002460) RIDA (ENSNLEG00000027254) POP1 (ENSNLEG00000002541) NIPAL2 (ENSNLEG00000002626) ENSNLEG00000030963 STK3 (ENSNLEG00000002668) ENSNLEG00000027654 ENSNLEG00000002725 #22 ENSNLEG00000002742 ENSNLEG00000029708 COX6C (ENSNLEG00000002864) RGS22 (ENSNLEG00000002877) FBXO43 (ENSNLEG00000002980) ENSNLEG00000002993 SPAG1 (ENSNLEG00000002998) ENSNLEG00000030526 RNF19A (ENSNLEG00000003030) ENSNLEG00000029724 ANKRD46 (ENSNLEG00000028498) SNX31 (ENSNLEG00000003099) ENSNLEG00000003142 YWHAZ (ENSNLEG00000030006) ZNF706 (ENSNLEG00000003260) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.q.b ENSGT00550000074784.a.b ENSGT00940000158008 ENSGT00910000147071 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792.q ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000163468 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00440000033468.c.b ENSGT00940000155788 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.q.b ENSGT00390000004027 ENSGT00550000074828.a.g.a.g.a ENSGT00550000074784.a.b ENSGT00940000158008 ENSGT00910000147071 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00960000187108 ENSGT00420000029792.q.e ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000163468 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b.u ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00440000033468.c.b ENSGT00390000002944.f ENSGT00940000155788 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 32 ENSRBIG00000042178 KCNS2 (ENSRBIG00000021207) STK3 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Crab-eating macaque MODERN SPECIES 18 ENSMFAG00000058643 MTDH (ENSMFAG00000039516) LAPTM4B (ENSMFAG00000042049) ENSMFAG00000064852 ENSMFAG00000031152 MATN2 (ENSMFAG00000042275) ENSMFAG00000047873 RPL30 (ENSMFAG00000031945) ERICH5 (ENSMFAG00000002519) ENSMFAG00000028633 POP1 (ENSMFAG00000000347) NIPAL2 (ENSMFAG00000027246) KCNS2 (ENSMFAG00000030529) STK3 (ENSMFAG00000000855) ENSMFAG00000041731 OSR2 (ENSMFAG00000030128) #22 ENSMFAG00000048508 VPS13B (ENSMFAG00000034665) COX6C (ENSMFAG00000050069) ENSMFAG00000000071 RGS22 (ENSMFAG00000000941) POLR2K (ENSMFAG00000053611) SPAG1 (ENSMFAG00000027456) RNF19A (ENSMFAG00000044073) ENSMFAG00000063483 ANKRD46 (ENSMFAG00000043665) SNX31 (ENSMFAG00000042840) PABPC1 (ENSMFAG00000044845) ENSMFAG00000001740 ENSMFAG00000060175 ENSMFAG00000058793 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.q.a.a ENSGT01030000234916 ENSGT00940000158008 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(ENSMLEG00000031470) ENSMLEG00000022228 LAPTM4B (ENSMLEG00000037249) MATN2 (ENSMLEG00000020381) ENSMLEG00000042330 RPL30 (ENSMLEG00000036764) ERICH5 (ENSMLEG00000041974) ENSMLEG00000000048 POP1 (ENSMLEG00000034986) NIPAL2 (ENSMLEG00000018604) ENSMLEG00000032863 KCNS2 (ENSMLEG00000008880) STK3 (ENSMLEG00000028343) ENSMLEG00000038589 OSR2 (ENSMLEG00000034070) #22 ENSMLEG00000033951 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Bushbaby MODERN SPECIES 119 PTDSS1 (ENSOGAG00000004305) ENSOGAG00000034918 SDC2 (ENSOGAG00000014867) ENSOGAG00000027986 CPQ (ENSOGAG00000014871) TSPYL5 (ENSOGAG00000025044) MTDH (ENSOGAG00000002065) ENSOGAG00000000512 MATN2 (ENSOGAG00000000513) ERICH5 (ENSOGAG00000001464) ENSOGAG00000001465 POP1 (ENSOGAG00000001466) NIPAL2 (ENSOGAG00000024518) KCNS2 (ENSOGAG00000029674) STK3 (ENSOGAG00000016347) OSR2 (ENSOGAG00000007928) #22 ENSOGAG00000034274 VPS13B (ENSOGAG00000007929) RGS22 (ENSOGAG00000008411) FBXO43 (ENSOGAG00000008418) ENSOGAG00000008422 ENSOGAG00000008426 RNF19A (ENSOGAG00000007137) ANKRD46 (ENSOGAG00000012234) SNX31 (ENSOGAG00000012237) PABPC1 (ENSOGAG00000007921) ENSOGAG00000033497 ENSOGAG00000027151 ENSOGAG00000032973 GRHL2 (ENSOGAG00000004751) NCALD (ENSOGAG00000034513) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00730000111146.p ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Mouse lemur MODERN SPECIES 31 CPQ (ENSMICG00000047973) ENSMICG00000033375 ENSMICG00000010589 LAPTM4B (ENSMICG00000038044) ENSMICG00000044005 MATN2 (ENSMICG00000006923) RPL30 (ENSMICG00000004620) ENSMICG00000036228 ERICH5 (ENSMICG00000043438) ENSMICG00000046083 POP1 (ENSMICG00000004361) ENSMICG00000038757 NIPAL2 (ENSMICG00000004367) KCNS2 (ENSMICG00000047216) STK3 (ENSMICG00000004379) OSR2 (ENSMICG00000004390) #22 VPS13B (ENSMICG00000004392) ENSMICG00000004456 RGS22 (ENSMICG00000038466) FBXO43 (ENSMICG00000041879) POLR2K (ENSMICG00000044624) SPAG1 (ENSMICG00000007495) RNF19A (ENSMICG00000034867) ANKRD46 (ENSMICG00000038072) SNX31 (ENSMICG00000010234) PABPC1 (ENSMICG00000009121) ENSMICG00000034946 ENSMICG00000045227 ENSMICG00000034184 GRHL2 (ENSMICG00000014771) NCALD (ENSMICG00000045417) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00730000111146.p ENSGT00960000187108 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00940000169819 ENSGT00940000153773.a.b.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b Coquerels sifaka MODERN SPECIES 288 MTERF3 (ENSPCOG00000024551) PTDSS1 (ENSPCOG00000012653) SDC2 (ENSPCOG00000025635) CPQ (ENSPCOG00000013230) MTDH (ENSPCOG00000014642) LAPTM4B (ENSPCOG00000024247) MATN2 (ENSPCOG00000028802) RPL30 (ENSPCOG00000016608) ENSPCOG00000022716 ENSPCOG00000013438 ENSPCOG00000014936 POP1 (ENSPCOG00000019420) NIPAL2 (ENSPCOG00000015818) KCNS2 (ENSPCOG00000003471) STK3 (ENSPCOG00000021841) OSR2 (ENSPCOG00000026580) #22 VPS13B (ENSPCOG00000027260) COX6C (ENSPCOG00000028763) RGS22 (ENSPCOG00000018902) FBXO43 (ENSPCOG00000022956) ENSPCOG00000019331 SPAG1 (ENSPCOG00000021388) RNF19A (ENSPCOG00000003000) ENSPCOG00000028413 SNX31 (ENSPCOG00000017253) PABPC1 (ENSPCOG00000020234) YWHAZ (ENSPCOG00000027987) ZNF706 (ENSPCOG00000028713) ENSPCOG00000028386 GRHL2 (ENSPCOG00000003815) NCALD (ENSPCOG00000002430) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 13 MTDH (ENSPSMG00000011621) LAPTM4B (ENSPSMG00000011676) MATN2 (ENSPSMG00000011943) ENSPSMG00000012033 ENSPSMG00000012039 ENSPSMG00000012047 RIDA (ENSPSMG00000012066) POP1 (ENSPSMG00000012091) NIPAL2 (ENSPSMG00000012103) KCNS2 (ENSPSMG00000012114) STK3 (ENSPSMG00000012165) OSR2 (ENSPSMG00000012178) #22 VPS13B (ENSPSMG00000012326) ENSPSMG00000012355 RGS22 (ENSPSMG00000012424) FBXO43 (ENSPSMG00000012438) POLR2K (ENSPSMG00000012451) SPAG1 (ENSPSMG00000012471) RNF19A (ENSPSMG00000012490) ANKRD46 (ENSPSMG00000012518) SNX31 (ENSPSMG00000012537) PABPC1 (ENSPSMG00000012609) ENSPSMG00000012736 ENSPSMG00000012795 ENSPSMG00000012798 ENSPSMG00000012800 GRHL2 (ENSPSMG00000012819) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT00900000143156.a ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00940000153773.a.b.a.b Tree shrew MODERN SPECIES 1450 OSR2 (ENSTBEG00000001576) #22 VPS13B (ENSTBEG00000002114) ENSTBEG00000005064 ENSTBEG00000005095 Glires ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT00900000143156.a ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00940000153773.a.b.a.b Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a.d ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.s.a ENSGT00390000012138.a.b.s.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Rabbit MODERN SPECIES 14 ENSOCUG00000002662 CPQ (ENSOCUG00000014385) TSPYL5 (ENSOCUG00000009903) ENSOCUG00000031706 MTDH (ENSOCUG00000011400) LAPTM4B (ENSOCUG00000013689) MATN2 (ENSOCUG00000017377) RPL30 (ENSOCUG00000017386) ENSOCUG00000017391 ENSOCUG00000035058 POP1 (ENSOCUG00000017400) ENSOCUG00000017407 KCNS2 (ENSOCUG00000004540) STK3 (ENSOCUG00000004545) ENSOCUG00000011503 OSR2 (ENSOCUG00000022383) #22 VPS13B (ENSOCUG00000008725) ENSOCUG00000039216 RGS22 (ENSOCUG00000031074) FBXO43 (ENSOCUG00000008776) ENSOCUG00000029376 SPAG1 (ENSOCUG00000001879) RNF19A (ENSOCUG00000001892) ANKRD46 (ENSOCUG00000009778) SNX31 (ENSOCUG00000009781) ENSOCUG00000004354 YWHAZ (ENSOCUG00000000734) ZNF706 (ENSOCUG00000008661) GRHL2 (ENSOCUG00000004750) NCALD (ENSOCUG00000009431) RRM2B (ENSOCUG00000008545) Pika MODERN SPECIES 8865 OSR2 (ENSOPRG00000005325) #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT00900000143156.a ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00940000153773.a.b.a.b Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT00900000143156.a ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00940000153773.a.b.a.b Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.s.a.b ENSGT00390000012138.a.a.j.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT00900000143156.a ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00940000153773.a.b.a.b Eurasian red squirrel MODERN SPECIES TSPYL5 (ENSSVLG00005002014) ENSSVLG00005002034 ENSSVLG00005002083 ENSSVLG00005002092 LAPTM4B (ENSSVLG00005002108) MATN2 (ENSSVLG00005002132) ENSSVLG00005002166 ENSSVLG00005002192 ENSSVLG00005002202 ERICH5 (ENSSVLG00005002215) ENSSVLG00005002234 POP1 (ENSSVLG00005002246) NIPAL2 (ENSSVLG00005002294) KCNS2 (ENSSVLG00005002345) STK3 (ENSSVLG00005002365) OSR2 (ENSSVLG00005002406) #22 VPS13B (ENSSVLG00005002505) ENSSVLG00005002791 ENSSVLG00005002798 ENSSVLG00005002811 ENSSVLG00005002823 ENSSVLG00005002835 RGS22 (ENSSVLG00005002884) FBXO43 (ENSSVLG00005003116) ENSSVLG00005003136 ENSSVLG00005003160 ENSSVLG00005003189 RNF19A (ENSSVLG00005003226) ENSSVLG00005003243 SNX31 (ENSSVLG00005003271) PABPC1 (ENSSVLG00005003305) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.a.j.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT00900000143156.a ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00940000153773.a.b.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b Alpin marmot MODERN SPECIES 18 MTDH (ENSMMMG00000015702) ENSMMMG00000015749 LAPTM4B (ENSMMMG00000015757) MATN2 (ENSMMMG00000015779) ENSMMMG00000015872 RIDA (ENSMMMG00000015899) POP1 (ENSMMMG00000015905) NIPAL2 (ENSMMMG00000015942) KCNS2 (ENSMMMG00000015951) STK3 (ENSMMMG00000015954) OSR2 (ENSMMMG00000015987) #22 VPS13B (ENSMMMG00000016018) COX6C (ENSMMMG00000016076) RGS22 (ENSMMMG00000016089) FBXO43 (ENSMMMG00000016105) ENSMMMG00000016111 ENSMMMG00000016116 ENSMMMG00000016121 RNF19A (ENSMMMG00000016129) ANKRD46 (ENSMMMG00000016148) SNX31 (ENSMMMG00000016151) PABPC1 (ENSMMMG00000016183) ENSMMMG00000016188 GRHL2 (ENSMMMG00000016231) NCALD (ENSMMMG00000016254) RRM2B (ENSMMMG00000016263) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.a.j.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 1 MTERF3 (ENSUPAG00010013471) PTDSS1 (ENSUPAG00010013461) SDC2 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(ENSSTOG00000011455) NIPAL2 (ENSSTOG00000000646) KCNS2 (ENSSTOG00000024646) STK3 (ENSSTOG00000000651) ENSSTOG00000029048 OSR2 (ENSSTOG00000021263) #22 ENSSTOG00000027003 VPS13B (ENSSTOG00000015651) COX6C (ENSSTOG00000015672) RGS22 (ENSSTOG00000015674) FBXO43 (ENSSTOG00000027663) POLR2K (ENSSTOG00000006123) SPAG1 (ENSSTOG00000006135) RNF19A (ENSSTOG00000006177) ENSSTOG00000024280 SNX31 (ENSSTOG00000016392) PABPC1 (ENSSTOG00000016395) ENSSTOG00000034817 ENSSTOG00000023864 ZNF706 (ENSSTOG00000022580) ENSSTOG00000031885 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094.hb ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT01100000263484.B.b.b ENSGT00390000007776 ENSGT00390000011748 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 13 ENSHGLG00000021132 ENSHGLG00000050956 ENSHGLG00000008700 ENSHGLG00000041488 MATN2 (ENSHGLG00000010275) ENSHGLG00000010022 ENSHGLG00000033730 RPL30 (ENSHGLG00000034047) ERICH5 (ENSHGLG00000005192) HRSP12 (ENSHGLG00000035354) POP1 (ENSHGLG00000006029) ENSHGLG00000047572 NIPAL2 (ENSHGLG00000040382) KCNS2 (ENSHGLG00000039128) STK3 (ENSHGLG00000008473) OSR2 (ENSHGLG00000011216) #22 VPS13B (ENSHGLG00000012549) COX6C (ENSHGLG00000017404) RGS22 (ENSHGLG00000018462) ENSHGLG00000018671 FBXO43 (ENSHGLG00000017578) ENSHGLG00000004285 SPAG1 (ENSHGLG00000004354) RNF19A (ENSHGLG00000004447) ENSHGLG00000004487 ANKRD46 (ENSHGLG00000004526) SNX31 (ENSHGLG00000005963) PABPC1 (ENSHGLG00000007713) ENSHGLG00000009040 ENSHGLG00000033770 ENSHGLG00000047813 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094.hb ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT01100000263484.B.b.b ENSGT00390000007776 ENSGT00390000011748 Guinea pig MODERN SPECIES GDF6 (ENSCPOG00000010549) UQCRB (ENSCPOG00000037355) MTERF3 (ENSCPOG00000003487) PTDSS1 (ENSCPOG00000003491) SDC2 (ENSCPOG00000036427) CPQ (ENSCPOG00000007260) MTDH (ENSCPOG00000037219) LAPTM4B (ENSCPOG00000020368) MATN2 (ENSCPOG00000003062) RPL30 (ENSCPOG00000030315) RIDA (ENSCPOG00000036991) POP1 (ENSCPOG00000002901) NIPAL2 (ENSCPOG00000032021) KCNS2 (ENSCPOG00000026156) STK3 (ENSCPOG00000010689) OSR2 (ENSCPOG00000020572) #22 ENSCPOG00000019380 VPS13B (ENSCPOG00000014447) COX6C (ENSCPOG00000014456) RGS22 (ENSCPOG00000002153) FBXO43 (ENSCPOG00000002160) POLR2K (ENSCPOG00000036717) SPAG1 (ENSCPOG00000002162) RNF19A (ENSCPOG00000007313) ANKRD46 (ENSCPOG00000032374) SNX31 (ENSCPOG00000012914) PABPC1 (ENSCPOG00000012917) YWHAZ (ENSCPOG00000040522) ZNF706 (ENSCPOG00000037379) TRHR (ENSCPOG00000011339) NUDCD1 (ENSCPOG00000036228) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094.hb ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT01100000263484.B.b.b ENSGT00390000007776 ENSGT00390000011748 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 124 PTDSS1 (ENSCLAG00000005033) SDC2 (ENSCLAG00000006071) CPQ (ENSCLAG00000007372) TSPYL5 (ENSCLAG00000007761) ENSCLAG00000007799 MTDH (ENSCLAG00000007884) LAPTM4B (ENSCLAG00000005642) MATN2 (ENSCLAG00000005911) RPL30 (ENSCLAG00000006288) ERICH5 (ENSCLAG00000006781) RIDA (ENSCLAG00000006938) POP1 (ENSCLAG00000007208) NIPAL2 (ENSCLAG00000008008) KCNS2 (ENSCLAG00000018060) STK3 (ENSCLAG00000012018) OSR2 (ENSCLAG00000012733) #22 VPS13B (ENSCLAG00000004590) COX6C (ENSCLAG00000004170) RGS22 (ENSCLAG00000004565) FBXO43 (ENSCLAG00000007471) POLR2K (ENSCLAG00000010033) SPAG1 (ENSCLAG00000013379) RNF19A (ENSCLAG00000015646) ENSCLAG00000017008 SNX31 (ENSCLAG00000011888) PABPC1 (ENSCLAG00000009676) YWHAZ (ENSCLAG00000004303) ENSCLAG00000005116 ZNF706 (ENSCLAG00000005214) TRHR (ENSCLAG00000005381) NUDCD1 (ENSCLAG00000005542) Degu MODERN SPECIES 159 ENSODEG00000018842 ENSODEG00000018863 MTDH (ENSODEG00000003805) LAPTM4B (ENSODEG00000003827) MATN2 (ENSODEG00000003867) ENSODEG00000003943 RIDA (ENSODEG00000003956) POP1 (ENSODEG00000003984) NIPAL2 (ENSODEG00000004019) KCNS2 (ENSODEG00000004047) STK3 (ENSODEG00000004108) OSR2 (ENSODEG00000004176) #22 ENSODEG00000004192 ENSODEG00000004228 ENSODEG00000004243 RGS22 (ENSODEG00000004270) ENSODEG00000004346 ENSODEG00000004358 SPAG1 (ENSODEG00000004385) ENSODEG00000019080 ENSODEG00000003147 SNX31 (ENSODEG00000003171) ENSODEG00000003229 YWHAZ (ENSODEG00000003295) ENSODEG00000003308 ENSODEG00000003317 ENSODEG00000003325 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT00900000143156.a ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 Kangaroo rat MODERN SPECIES 336 Ptdss1 (ENSDORG00000010478) Sdc2 (ENSDORG00000023682) ENSDORG00000024009 Cpq (ENSDORG00000015406) Tspyl5 (ENSDORG00000015407) Mtdh (ENSDORG00000004411) Laptm4b (ENSDORG00000026371) Matn2 (ENSDORG00000001226) ENSDORG00000026515 ENSDORG00000012384 Rida (ENSDORG00000015382) Pop1 (ENSDORG00000015384) Nipal2 (ENSDORG00000013257) Kcns2 (ENSDORG00000007088) Stk3 (ENSDORG00000007089) Osr2 (ENSDORG00000011823) #22 Vps13b (ENSDORG00000012357) Cox6c (ENSDORG00000000009) Fbxo43 (ENSDORG00000000697) Polr2k (ENSDORG00000028386) Spag1 (ENSDORG00000000699) Rnf19a (ENSDORG00000000701) Ankrd46 (ENSDORG00000012247) Snx31 (ENSDORG00000014406) Pabpc1 (ENSDORG00000013935) Ywhaz (ENSDORG00000011156) Zfp706 (ENSDORG00000015819) Grhl2 (ENSDORG00000007051) Ncald (ENSDORG00000025691) Rrm2b (ENSDORG00000007056) Ubr5 (ENSDORG00000007058) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00950000182878.b.b.o ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT00900000143156.a ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 96 Mtdh (ENSJJAG00000017818) ENSJJAG00000014247 ENSJJAG00000012241 Matn2 (ENSJJAG00000022386) ENSJJAG00000021232 ENSJJAG00000020177 Pop1 (ENSJJAG00000013325) ENSJJAG00000010693 Nipal2 (ENSJJAG00000000450) Kcns2 (ENSJJAG00000021215) Stk3 (ENSJJAG00000019016) ENSJJAG00000012640 Osr2 (ENSJJAG00000012336) #22 Vps13b (ENSJJAG00000017780) ENSJJAG00000019740 Rgs22 (ENSJJAG00000011143) Fbxo43 (ENSJJAG00000007559) ENSJJAG00000000271 Spag1 (ENSJJAG00000014363) Rnf19a (ENSJJAG00000012255) Ankrd46 (ENSJJAG00000001029) Snx31 (ENSJJAG00000018446) ENSJJAG00000015918 ENSJJAG00000010886 ENSJJAG00000002258 Zfp706 (ENSJJAG00000000146) Grhl2 (ENSJJAG00000021484) Ncald (ENSJJAG00000017643) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00950000182878.b.b.o ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT00900000143156.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 760 Cpq (ENSNGAG00000021825) Tspyl5 (ENSNGAG00000013439) ENSNGAG00000020936 Mtdh (ENSNGAG00000011464) Laptm4b (ENSNGAG00000004954) Matn2 (ENSNGAG00000013927) ENSNGAG00000015276 Erich5 (ENSNGAG00000013838) Rida (ENSNGAG00000024030) Pop1 (ENSNGAG00000001582) Nipal2 (ENSNGAG00000021423) Kcns2 (ENSNGAG00000004621) ENSNGAG00000021406 Osr2 (ENSNGAG00000022766) #22 Vps13b (ENSNGAG00000013908) Cox6c (ENSNGAG00000020308) Rgs22 (ENSNGAG00000022745) Fbxo43 (ENSNGAG00000015827) Polr2k (ENSNGAG00000020950) Spag1 (ENSNGAG00000023969) Rnf19a (ENSNGAG00000006667) Ankrd46 (ENSNGAG00000018485) Snx31 (ENSNGAG00000021124) ENSNGAG00000000996 ENSNGAG00000006289 ENSNGAG00000010111 Zfp706 (ENSNGAG00000012379) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00950000182878.b.b.o ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT00900000143156.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT00900000143156.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Northern American deer mouse MODERN SPECIES 12 ENSPEMG00000029126 Sdc2 (ENSPEMG00000001814) Cpq (ENSPEMG00000007404) Tspyl5 (ENSPEMG00000005131) Mtdh (ENSPEMG00000021866) Laptm4b (ENSPEMG00000021641) ENSPEMG00000031351 Matn2 (ENSPEMG00000022322) ENSPEMG00000022132 Erich5 (ENSPEMG00000021961) Rida (ENSPEMG00000021792) Pop1 (ENSPEMG00000023633) Nipal2 (ENSPEMG00000022571) Kcns2 (ENSPEMG00000030882) ENSPEMG00000022099 Osr2 (ENSPEMG00000023942) #22 ENSPEMG00000022768 Vps13b (ENSPEMG00000021894) ENSPEMG00000023434 Rgs22 (ENSPEMG00000001987) Fbxo43 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(ENSMAUG00000001085) Laptm4b (ENSMAUG00000014122) Matn2 (ENSMAUG00000000454) Rpl30 (ENSMAUG00000006886) Rida (ENSMAUG00000000274) Pop1 (ENSMAUG00000017537) ENSMAUG00000016175 Nipal2 (ENSMAUG00000012882) Kcns2 (ENSMAUG00000016680) Stk3 (ENSMAUG00000016665) Osr2 (ENSMAUG00000010756) #22 Vps13b (ENSMAUG00000013877) Rgs22 (ENSMAUG00000005717) Fbxo43 (ENSMAUG00000011238) Polr2k (ENSMAUG00000010288) Spag1 (ENSMAUG00000003740) Rnf19a (ENSMAUG00000010432) Ankrd46 (ENSMAUG00000012258) Snx31 (ENSMAUG00000014120) ENSMAUG00000003523 ENSMAUG00000008936 Ywhaz (ENSMAUG00000001602) Zfp706 (ENSMAUG00000000628) ENSMAUG00000000279 ENSMAUG00000005244 Ncald (ENSMAUG00000000793) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 207 ENSCGRG00001022919 Mterf3 (ENSCGRG00001020186) PTDSS1 (ENSCGRG00001017439) Sdc2 (ENSCGRG00001015958) ENSCGRG00001013803 Tspyl5 (ENSCGRG00001012646) Mtdh (ENSCGRG00001010894) Laptm4b (ENSCGRG00001006505) Matn2 (ENSCGRG00001022796) Rpl30 (ENSCGRG00001020021) Rida (ENSCGRG00001019905) Pop1 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ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.b ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Rat MODERN SPECIES 17 Sdc2 (ENSRNOG00000004936) Cpq (ENSRNOG00000005931) Tspyl5 (ENSRNOG00000006278) RGD1562404 (ENSRNOG00000014169) ENSRNOG00000066306 Mtdh (ENSRNOG00000006870) ENSRNOG00000068626 Laptm4b (ENSRNOG00000006766) Matn2 (ENSRNOG00000006060) Erich5 (ENSRNOG00000005956) Rida (ENSRNOG00000005437) Pop1 (ENSRNOG00000005243) Nipal2 (ENSRNOG00000005190) Kcns2 (ENSRNOG00000066111) Stk3 (ENSRNOG00000011278) Osr2 (ENSRNOG00000011136) #22 Vps13b (ENSRNOG00000066252) Cox6c (ENSRNOG00000010807) RGD1565056 (ENSRNOG00000026873) Rgs22 (ENSRNOG00000025551) ENSRNOG00000063604 Fbxo43 (ENSRNOG00000010459) Polr2k (ENSRNOG00000010408) Spag1 (ENSRNOG00000010078) ENSRNOG00000064780 Rnf19a (ENSRNOG00000009658) Ankrd46 (ENSRNOG00000025504) Snx31 (ENSRNOG00000025501) Pabpc1 (ENSRNOG00000008639) LOC362901 (ENSRNOG00000031383) Ywhaz (ENSRNOG00000008195) Mus ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182878.b.b.o ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.a.j.b ENSGT00700000106136 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.b ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00860000135649 ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 Shrew mouse MODERN SPECIES 8 MGP_PahariEiJ_G0019724 Sdc2 (MGP_PahariEiJ_G0019725) Cpq (MGP_PahariEiJ_G0019726) Tspyl5 (MGP_PahariEiJ_G0019727) Mtdh (MGP_PahariEiJ_G0019728) Laptm4b (MGP_PahariEiJ_G0019729) Matn2 (MGP_PahariEiJ_G0019730) MGP_PahariEiJ_G0019731 Rpl30 (MGP_PahariEiJ_G0019732) Erich5 (MGP_PahariEiJ_G0019733) Rida (MGP_PahariEiJ_G0019734) Pop1 (MGP_PahariEiJ_G0019735) Nipal2 (MGP_PahariEiJ_G0019736) Kcns2 (MGP_PahariEiJ_G0019737) Stk3 (MGP_PahariEiJ_G0019738) Osr2 (MGP_PahariEiJ_G0019739) #22 Vps13b (MGP_PahariEiJ_G0019740) Cox6c (MGP_PahariEiJ_G0019741) Rgs22 (MGP_PahariEiJ_G0019742) Fbxo43 (MGP_PahariEiJ_G0019743) MGP_PahariEiJ_G0019744 Spag1 (MGP_PahariEiJ_G0019745) Rnf19a (MGP_PahariEiJ_G0019746) Ankrd46 (MGP_PahariEiJ_G0019747) Snx31 (MGP_PahariEiJ_G0019748) Pabpc1 (MGP_PahariEiJ_G0019749) MGP_PahariEiJ_G0019750 MGP_PahariEiJ_G0019751 Zfp706 (MGP_PahariEiJ_G0019752) Grhl2 (MGP_PahariEiJ_G0019753) Ncald (MGP_PahariEiJ_G0019754) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182878.b.b.o ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.k ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.a.j.b ENSGT00700000106136 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b.o.a.a ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.b ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00860000135649 ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 6 Sema5a (MGP_CAROLIEiJ_G0019715) Sdc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019716) Cpq (MGP_CAROLIEiJ_G0019717) Tspyl5 (MGP_CAROLIEiJ_G0019718) Mtdh (MGP_CAROLIEiJ_G0019719) Laptm4b (MGP_CAROLIEiJ_G0019720) Matn2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019721) MGP_CAROLIEiJ_G0019722 Rpl30 (MGP_CAROLIEiJ_G0019723) Erich5 (MGP_CAROLIEiJ_G0019724) Rida (MGP_CAROLIEiJ_G0019725) Pop1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019726) Nipal2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019727) Kcns2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019728) Stk3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019729) Osr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019730) #22 Vps13b (MGP_CAROLIEiJ_G0019731) Cox6c (MGP_CAROLIEiJ_G0019732) Rgs22 (MGP_CAROLIEiJ_G0019733) Fbxo43 (MGP_CAROLIEiJ_G0019734) Polr2k (MGP_CAROLIEiJ_G0019735) Spag1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019736) Rnf19a (MGP_CAROLIEiJ_G0019737) Ankrd46 (MGP_CAROLIEiJ_G0019738) Snx31 (MGP_CAROLIEiJ_G0019739) Pabpc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019740) Ywhaz (MGP_CAROLIEiJ_G0019741) MGP_CAROLIEiJ_G0019742 Zfp706 (MGP_CAROLIEiJ_G0019743) Grhl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019744) Ncald (MGP_CAROLIEiJ_G0019745) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000182878.b.b.o ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.k ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.a.j.b ENSGT00700000106136 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b.o.a.a ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.b ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00860000135649 ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 Mouse MODERN SPECIES 6 Sema5a (ENSMUSG00000022231) Sdc2 (ENSMUSG00000022261) Cpq (ENSMUSG00000039007) Tspyl5 (ENSMUSG00000038984) Mtdh (ENSMUSG00000022255) Laptm4b (ENSMUSG00000022257) Matn2 (ENSMUSG00000022324) 9430069I07Rik (ENSMUSG00000094447) Rpl30 (ENSMUSG00000058600) Erich5 (ENSMUSG00000044726) Rida (ENSMUSG00000022323) Pop1 (ENSMUSG00000022325) Nipal2 (ENSMUSG00000038879) Kcns2 (ENSMUSG00000050963) Stk3 (ENSMUSG00000022329) Osr2 (ENSMUSG00000022330) #22 Vps13b (ENSMUSG00000037646) Cox6c (ENSMUSG00000014313) Rgs22 (ENSMUSG00000037627) Fbxo43 (ENSMUSG00000048230) Polr2k (ENSMUSG00000045996) Spag1 (ENSMUSG00000037617) Rnf19a (ENSMUSG00000022280) Ankrd46 (ENSMUSG00000048307) Snx31 (ENSMUSG00000013611) Pabpc1 (ENSMUSG00000022283) Ywhaz (ENSMUSG00000022285) Zfp706 (ENSMUSG00000062397) Grhl2 (ENSMUSG00000022286) Ncald (ENSMUSG00000051359) Rrm2b (ENSMUSG00000022292) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000158036 ENSGT00940000157222 ENSGT00950000182878.b.b.o ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.k ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.ab ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b.o.a.a ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.b ENSGT00510000046985.i.b.a ENSGT01090000260040.a.a.a.r ENSGT00860000135649 ENSGT00390000003465.b.b spretus MODERN SPECIES 6 Tas2r119 (MGP_SPRETEiJ_G0020610) Sema5a (MGP_SPRETEiJ_G0020611) Cpq (MGP_SPRETEiJ_G0020613) Tspyl5 (MGP_SPRETEiJ_G0020614) Mtdh (MGP_SPRETEiJ_G0020615) Laptm4b (MGP_SPRETEiJ_G0020616) Matn2 (MGP_SPRETEiJ_G0020617) MGP_SPRETEiJ_G0020618 Rpl30 (MGP_SPRETEiJ_G0020619) Erich5 (MGP_SPRETEiJ_G0020620) Rida (MGP_SPRETEiJ_G0020621) Pop1 (MGP_SPRETEiJ_G0020622) Nipal2 (MGP_SPRETEiJ_G0020623) Kcns2 (MGP_SPRETEiJ_G0020624) Stk3 (MGP_SPRETEiJ_G0020625) Osr2 (MGP_SPRETEiJ_G0020626) #22 Vps13b (MGP_SPRETEiJ_G0020627) Cox6c (MGP_SPRETEiJ_G0020628) Rgs22 (MGP_SPRETEiJ_G0020629) Fbxo43 (MGP_SPRETEiJ_G0020630) Polr2k (MGP_SPRETEiJ_G0020631) Spag1 (MGP_SPRETEiJ_G0020632) Rnf19a (MGP_SPRETEiJ_G0020633) Ankrd46 (MGP_SPRETEiJ_G0020634) Snx31 (MGP_SPRETEiJ_G0020635) Pabpc1 (MGP_SPRETEiJ_G0020636) MGP_SPRETEiJ_G0020637 Ywhaz (MGP_SPRETEiJ_G0020638) MGP_SPRETEiJ_G0020639 Zfp706 (MGP_SPRETEiJ_G0020640) Grhl2 (MGP_SPRETEiJ_G0020641) Steppe mouse MODERN SPECIES 3308 Cpq (ENSMSIG00000016806) Tspyl5 (ENSMSIG00000016794) ENSMSIG00000016786 Mtdh (ENSMSIG00000016720) ENSMSIG00000016703 Laptm4b (ENSMSIG00000016687) 9430069I07Rik (ENSMSIG00000016655) Matn2 (ENSMSIG00000016562) ENSMSIG00000016533 Erich5 (ENSMSIG00000016520) Rida (ENSMSIG00000016480) Pop1 (ENSMSIG00000016402) Nipal2 (ENSMSIG00000016374) Kcns2 (ENSMSIG00000016369) Stk3 (ENSMSIG00000016310) Osr2 (ENSMSIG00000016289) #22 Vps13b (ENSMSIG00000016021) Cox6c (ENSMSIG00000015963) ENSMSIG00000015927 Rgs22 (ENSMSIG00000015850) Fbxo43 (ENSMSIG00000015840) ENSMSIG00000015808 Spag1 (ENSMSIG00000015763) Rnf19a (ENSMSIG00000015703) ENSMSIG00000015663 Snx31 (ENSMSIG00000015612) Pabpc1 (ENSMSIG00000015570) ENSMSIG00000015548 ENSMSIG00000015546 Ywhaz (ENSMSIG00000015504) ENSMSIG00000015497 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t ENSGT00960000187108 ENSGT00390000012138.a.a.j ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00900000143156 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160530 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 10213 OSR2 (ENSEEUG00000008304) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182878.b.b.k.b ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00960000187108 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00900000143156 ENSGT01090000260040.a.a.b Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00950000186060 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.a.a ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00950000186060 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Equus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.a.a ENSGT00500000044936 ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00940000156357 Horse MODERN SPECIES 30 MTERF3 (ENSECAG00000012943) PTDSS1 (ENSECAG00000016050) SDC2 (ENSECAG00000008484) CPQ (ENSECAG00000008913) TSPYL5 (ENSECAG00000009322) MTDH (ENSECAG00000010986) LAPTM4B (ENSECAG00000020137) MATN2 (ENSECAG00000002579) RPL30 (ENSECAG00000021705) ERICH5 (ENSECAG00000041388) RIDA (ENSECAG00000035364) POP1 (ENSECAG00000024236) NIPAL2 (ENSECAG00000010269) KCNS2 (ENSECAG00000048755) STK3 (ENSECAG00000010526) OSR2 (ENSECAG00000017784) #22 VPS13B (ENSECAG00000019852) ENSECAG00000047767 ENSECAG00000058264 ENSECAG00000058443 ENSECAG00000048128 ENSECAG00000045630 RGS22 (ENSECAG00000010182) SPAG1 (ENSECAG00000022600) RNF19A (ENSECAG00000007894) ANKRD46 (ENSECAG00000013340) SNX31 (ENSECAG00000013989) PABPC1 (ENSECAG00000020699) YWHAZ (ENSECAG00000021882) ENSECAG00000057513 GRHL2 (ENSECAG00000013681) Donkey MODERN SPECIES 3 MTERF3 (ENSEASG00005003303) PTDSS1 (ENSEASG00005003297) SDC2 (ENSEASG00005025355) CPQ (ENSEASG00005003289) TSPYL5 (ENSEASG00005038289) MTDH (ENSEASG00005003279) LAPTM4B (ENSEASG00005003271) MATN2 (ENSEASG00005003231) ENSEASG00005034460 ENSEASG00005036010 RIDA (ENSEASG00005023762) POP1 (ENSEASG00005003189) NIPAL2 (ENSEASG00005003183) KCNS2 (ENSEASG00005037262) STK3 (ENSEASG00005003082) OSR2 (ENSEASG00005003076) #22 ENSEASG00005025677 VPS13B (ENSEASG00005002951) ENSEASG00005002888 RGS22 (ENSEASG00005002871) ENSEASG00005035318 SPAG1 (ENSEASG00005002835) RNF19A (ENSEASG00005002831) ANKRD46 (ENSEASG00005002824) SNX31 (ENSEASG00005002815) PABPC1 (ENSEASG00005002810) ENSEASG00005002806 ENSEASG00005002802 GRHL2 (ENSEASG00005002798) NCALD (ENSEASG00005002796) RRM2B (ENSEASG00005002789) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00950000186060 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Megabat MODERN SPECIES 3410 OSR2 (ENSPVAG00000004363) #22 VPS13B (ENSPVAG00000004364) ENSPVAG00000004366 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00950000186060 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.a ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 5 ENSRFEG00010015382 CPQ (ENSRFEG00010015436) TSPYL5 (ENSRFEG00010015512) ENSRFEG00010015533 MTDH (ENSRFEG00010015577) LAPTM4B (ENSRFEG00010015916) MATN2 (ENSRFEG00010016062) ENSRFEG00010016135 RPL30 (ENSRFEG00010016148) ERICH5 (ENSRFEG00010016246) ENSRFEG00010016340 POP1 (ENSRFEG00010016389) NIPAL2 (ENSRFEG00010016437) KCNS2 (ENSRFEG00010016528) STK3 (ENSRFEG00010016550) OSR2 (ENSRFEG00010016629) #22 VPS13B (ENSRFEG00010016767) ENSRFEG00010017088 RGS22 (ENSRFEG00010017161) FBXO43 (ENSRFEG00010018248) ENSRFEG00010018329 SPAG1 (ENSRFEG00010018396) RNF19A (ENSRFEG00010018669) ANKRD46 (ENSRFEG00010018712) SNX31 (ENSRFEG00010018757) PABPC1 (ENSRFEG00010018981) YWHAZ (ENSRFEG00010019368) ZNF706 (ENSRFEG00010019443) ENSRFEG00010019469 ENSRFEG00010019510 ENSRFEG00010019533 Microbat MODERN SPECIES 1231 NIPAL2 (ENSMLUG00000023973) KCNS2 (ENSMLUG00000002923) STK3 (ENSMLUG00000002928) OSR2 (ENSMLUG00000013412) #22 ENSMLUG00000028149 VPS13B (ENSMLUG00000001663) COX6C (ENSMLUG00000014896) RGS22 (ENSMLUG00000005800) FBXO43 (ENSMLUG00000008544) SPAG1 (ENSMLUG00000008559) RNF19A (ENSMLUG00000008606) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00950000186060 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 Felidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00950000186060 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 Panthera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00950000186060 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00950000186060 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00960000187108 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b leopard MODERN SPECIES 52 MTERF3 (ENSPPRG00000022053) PTDSS1 (ENSPPRG00000024013) SDC2 (ENSPPRG00000023701) CPQ (ENSPPRG00000023489) TSPYL5 (ENSPPRG00000022349) MTDH (ENSPPRG00000023252) LAPTM4B (ENSPPRG00000000122) MATN2 (ENSPPRG00000002691) ENSPPRG00000003481 ENSPPRG00000003614 RIDA (ENSPPRG00000004025) POP1 (ENSPPRG00000005002) NIPAL2 (ENSPPRG00000005743) KCNS2 (ENSPPRG00000014270) STK3 (ENSPPRG00000007099) OSR2 (ENSPPRG00000007822) #22 VPS13B (ENSPPRG00000009033) ENSPPRG00000009927 RGS22 (ENSPPRG00000018641) FBXO43 (ENSPPRG00000020083) ENSPPRG00000024679 SPAG1 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(ENSPLOG00000010390) NCALD (ENSPLOG00000010356) Tiger MODERN SPECIES 17 ENSPTIG00000013060 MTERF3 (ENSPTIG00000013347) PTDSS1 (ENSPTIG00000013972) SDC2 (ENSPTIG00000014010) CPQ (ENSPTIG00000014176) MTDH (ENSPTIG00000014696) LAPTM4B (ENSPTIG00000015012) MATN2 (ENSPTIG00000015210) RPL30 (ENSPTIG00000016098) ERICH5 (ENSPTIG00000016261) RIDA (ENSPTIG00000016283) POP1 (ENSPTIG00000016527) NIPAL2 (ENSPTIG00000016793) KCNS2 (ENSPTIG00000009540) STK3 (ENSPTIG00000017116) OSR2 (ENSPTIG00000017237) #22 VPS13B (ENSPTIG00000017938) ENSPTIG00000018907 RGS22 (ENSPTIG00000019122) FBXO43 (ENSPTIG00000020120) ENSPTIG00000020210 ENSPTIG00000020272 RNF19A (ENSPTIG00000020344) ANKRD46 (ENSPTIG00000020561) SNX31 (ENSPTIG00000020831) PABPC1 (ENSPTIG00000021083) ENSPTIG00000021410 ZNF706 (ENSPTIG00000021515) GRHL2 (ENSPTIG00000021606) NCALD (ENSPTIG00000001883) Cat MODERN SPECIES 249 MTERF3 (ENSFCAG00000028511) PTDSS1 (ENSFCAG00000004399) SDC2 (ENSFCAG00000031304) CPQ (ENSFCAG00000028975) TSPYL5 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ENSGT00390000003465.b.b Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000000970.a.b.b ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b.l.a.a ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.a.d ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788.f Dingo MODERN SPECIES 88 ENSCAFG00020026743 LAPTM4B (ENSCAFG00020026749) MATN2 (ENSCAFG00020026751) ENSCAFG00020026754 ERICH5 (ENSCAFG00020026757) RIDA (ENSCAFG00020026760) POP1 (ENSCAFG00020026765) NIPAL2 (ENSCAFG00020026774) KCNS2 (ENSCAFG00020026776) STK3 (ENSCAFG00020026777) OSR2 (ENSCAFG00020026780) #22 VPS13B (ENSCAFG00020026800) ENSCAFG00020026813 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Ursus ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222.d ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.b ENSGT00940000158008.l ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792.l ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00950000186261 ENSGT00940000154612.m.b.c ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00390000015797.c.b ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.a American black bear MODERN SPECIES 2591 ENSUAMG00000020837 OSR2 (ENSUAMG00000020839) #22 Polar bear MODERN SPECIES 157 MTERF3 (ENSUMAG00000016674) PTDSS1 (ENSUMAG00000016680) SDC2 (ENSUMAG00000016692) CPQ (ENSUMAG00000016716) TSPYL5 (ENSUMAG00000016736) MTDH (ENSUMAG00000016763) 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American mink DUPLICATION American mink MODERN SPECIES 10 PTDSS1 (ENSNVIG00000024295) SDC2 (ENSNVIG00000024300) CPQ (ENSNVIG00000024303) TSPYL5 (ENSNVIG00000024306) MTDH (ENSNVIG00000024307) LAPTM4B (ENSNVIG00000024315) MATN2 (ENSNVIG00000024321) ENSNVIG00000024337 ENSNVIG00000024341 RIDA (ENSNVIG00000024343) POP1 (ENSNVIG00000024345) NIPAL2 (ENSNVIG00000024352) KCNS2 (ENSNVIG00000024354) STK3 (ENSNVIG00000024356) ENSNVIG00000024359 #22 OSR2 (ENSNVIG00000000004) #22 VPS13B (ENSNVIG00000000017) ENSNVIG00000000364 ENSNVIG00000000371 RGS22 (ENSNVIG00000000412) FBXO43 (ENSNVIG00000000429) ENSNVIG00000000441 POLR2K (ENSNVIG00000000467) SPAG1 (ENSNVIG00000000482) RN19A (ENSNVIG00000000513) ANR46 (ENSNVIG00000000557) SNX31 (ENSNVIG00000000636) PABPC1 (ENSNVIG00000000651) ENSNVIG00000000688 ZNF706 (ENSNVIG00000000720) ENSNVIG00000000737 American mink MODERN SPECIES 10 MTER1 (ENSNVIG00000024293) PTDSS1 (ENSNVIG00000024295) SDC2 (ENSNVIG00000024300) CPQ (ENSNVIG00000024303) TSPYL5 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ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 Pig MODERN SPECIES 12 SDC2 (ENSSSCG00000006088) CPQ (ENSSSCG00000006087) TSPYL5 (ENSSSCG00000033112) MTDH (ENSSSCG00000006084) LAPTM4B (ENSSSCG00000006083) MATN2 (ENSSSCG00000006082) ENSSSCG00000045692 ENSSSCG00000006081 ENSSSCG00000050707 RIDA (ENSSSCG00000006079) POP1 (ENSSSCG00000006078) NIPAL2 (ENSSSCG00000031267) KCNS2 (ENSSSCG00000031917) ENSSSCG00000041004 STK3 (ENSSSCG00000006074) OSR2 (ENSSSCG00000006073) #22 ENSSSCG00000042557 VPS13B (ENSSSCG00000006071) COX6C (ENSSSCG00000060790) ENSSSCG00000031418 RGS22 (ENSSSCG00000006069) FBXO43 (ENSSSCG00000053859) POLR2K (ENSSSCG00000021180) SPAG1 (ENSSSCG00000027587) RNF19A (ENSSSCG00000006066) ANKRD46 (ENSSSCG00000006065) SNX31 (ENSSSCG00000006064) PABPC1 (ENSSSCG00000006063) ENSSSCG00000060547 ENSSSCG00000006062 ZNF706 (ENSSSCG00000056174) Chacoan peccary MODERN SPECIES 113 MTERF3 (ENSCWAG00000012957) PTDSS1 (ENSCWAG00000013029) SDC2 (ENSCWAG00000013078) CPQ (ENSCWAG00000013136) TSPYL5 (ENSCWAG00000013175) MTDH (ENSCWAG00000013207) LAPTM4B (ENSCWAG00000013348) MATN2 (ENSCWAG00000013418) RPL30 (ENSCWAG00000013516) ENSCWAG00000013630 RIDA (ENSCWAG00000013669) POP1 (ENSCWAG00000013710) NIPAL2 (ENSCWAG00000013768) KCNS2 (ENSCWAG00000014022) STK3 (ENSCWAG00000014054) OSR2 (ENSCWAG00000014166) #22 ENSCWAG00000014212 ENSCWAG00000014309 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182878.b.b.k.b ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00960000187108 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00900000143156 ENSGT01090000260040.a.a.b Camelidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00390000010783 ENSGT00960000187108 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b.sb ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Arabian camel MODERN SPECIES 17 MTERF3 (ENSCDRG00005021236) PTDSS1 (ENSCDRG00005021243) SDC2 (ENSCDRG00005021247) 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ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00900000143156 Pecora ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00960000187108 ENSGT00390000012138.a.a.j ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b.x.b.a ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT00900000143156 ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT01010000222946 Yarkand deer MODERN SPECIES 13 ENSCHYG00000005986 CPQ (ENSCHYG00000005922) ENSCHYG00000005896 ENSCHYG00000005882 MTDH (ENSCHYG00000005467) ENSCHYG00000005355 MATN2 (ENSCHYG00000005216) RPL30 (ENSCHYG00000005137) ERICH5 (ENSCHYG00000005099) ENSCHYG00000005063 POP1 (ENSCHYG00000022354) NIPAL2 (ENSCHYG00000022205) KCNS2 (ENSCHYG00000022187) STK3 (ENSCHYG00000022075) ENSCHYG00000022054 OSR2 (ENSCHYG00000021949) #22 ENSCHYG00000021931 VPS13B (ENSCHYG00000021656) ENSCHYG00000021569 ENSCHYG00000021549 RGS22 (ENSCHYG00000020409) FBXO43 (ENSCHYG00000020294) POLR2K (ENSCHYG00000020234) SPAG1 (ENSCHYG00000020151) RNF19A (ENSCHYG00000020042) ANKRD46 (ENSCHYG00000019909) SNX31 (ENSCHYG00000019663) PABPC1 (ENSCHYG00000019189) ENSCHYG00000019129 ENSCHYG00000018994 ENSCHYG00000018871 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00960000187108 ENSGT00390000012138.a.a.j ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b.x.b.a.b ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT00900000143156 ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT01010000222946 Siberian musk deer MODERN SPECIES 174 PTDSS1 (ENSMMSG00000001590) SDC2 (ENSMMSG00000001606) CPQ (ENSMMSG00000001621) TSPYL5 (ENSMMSG00000001636) MTDH (ENSMMSG00000001656) LAPTM4B (ENSMMSG00000001732) MATN2 (ENSMMSG00000001772) ENSMMSG00000001801 ENSMMSG00000001823 ERICH5 (ENSMMSG00000001834) RIDA (ENSMMSG00000001842) POP1 (ENSMMSG00000001856) NIPAL2 (ENSMMSG00000001867) KCNS2 (ENSMMSG00000001883) STK3 (ENSMMSG00000001896) OSR2 (ENSMMSG00000001927) #22 VPS13B (ENSMMSG00000001947) ENSMMSG00000002027 ENSMMSG00000002049 RGS22 (ENSMMSG00000002098) FBXO43 (ENSMMSG00000002471) POLR2K (ENSMMSG00000002483) SPAG1 (ENSMMSG00000002500) ENSMMSG00000002542 ANKRD46 (ENSMMSG00000002557) SNX31 (ENSMMSG00000002585) PABPC1 (ENSMMSG00000002644) YWHAZ (ENSMMSG00000002669) ENSMMSG00000002702 ENSMMSG00000002708 GRHL2 (ENSMMSG00000002727) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.e.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b.x.b.a.b ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT00900000143156 ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT01010000222946.d.b Caprinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000153288.a.a.d.h.b ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.f ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792.f ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b.x.b.a.b.b ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT00900000143156 ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT01010000222946.d.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 25 MTERF3 (ENSOARG00020003585) PTDSS1 (ENSOARG00020003441) CPQ (ENSOARG00020003139) TSPYL5 (ENSOARG00020003073) ENSOARG00020003057 MTDH (ENSOARG00020024390) ENSOARG00020024346 MATN2 (ENSOARG00020024259) ENSOARG00020024228 ENSOARG00020024208 RIDA (ENSOARG00020024188) POP1 (ENSOARG00020024170) NIPAL2 (ENSOARG00020024078) KCNS2 (ENSOARG00020024063) STK3 (ENSOARG00020024012) OSR2 (ENSOARG00020023989) #22 VPS13B (ENSOARG00020023325) ENSOARG00020023270 RGS22 (ENSOARG00020022670) FBXO43 (ENSOARG00020022615) POLR2K (ENSOARG00020022599) SPAG1 (ENSOARG00020022463) RNF19A (ENSOARG00020022413) ANKRD46 (ENSOARG00020022374) SNX31 (ENSOARG00020022297) PABPC1 (ENSOARG00020022236) ENSOARG00020022202 YWHAZ (ENSOARG00020022136) ZNF706 (ENSOARG00020022100) GRHL2 (ENSOARG00020021997) NCALD (ENSOARG00020021967) Goat MODERN SPECIES 5 ENSCHIG00000008528 ENSCHIG00000019776 ENSCHIG00000019993 ENSCHIG00000012579 MTDH (ENSCHIG00000020299) ENSCHIG00000007841 MATN2 (ENSCHIG00000022338) RPL30 (ENSCHIG00000016945) ENSCHIG00000021324 RIDA (ENSCHIG00000012463) POP1 (ENSCHIG00000017066) NIPAL2 (ENSCHIG00000015486) ENSCHIG00000004977 KCNS2 (ENSCHIG00000004644) STK3 (ENSCHIG00000010771) OSR2 (ENSCHIG00000019458) #22 ENSCHIG00000006748 ENSCHIG00000022299 ENSCHIG00000016789 RGS22 (ENSCHIG00000013238) FBXO43 (ENSCHIG00000008303) ENSCHIG00000012813 SPAG1 (ENSCHIG00000018545) RNF19A (ENSCHIG00000014198) ANKRD46 (ENSCHIG00000020276) SNX31 (ENSCHIG00000014508) PABPC1 (ENSCHIG00000023714) ENSCHIG00000017005 ENSCHIG00000020223 ENSCHIG00000007167 GRHL2 (ENSCHIG00000017724) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862.c ENSGT00510000046986.x.a.c ENSGT00940000153288.a.a.d ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.e.a.b ENSGT00940000153446.a.a.e.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792.c.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b.x.b.a.b ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 American bison MODERN SPECIES 3348 CPQ (ENSBBBG00000012919) ENSBBBG00000012922 ENSBBBG00000001706 MTDH (ENSBBBG00000012966) ENSBBBG00000008284 MATN2 (ENSBBBG00000013106) RPL30 (ENSBBBG00000013116) ENSBBBG00000013121 ENSBBBG00000006940 POP1 (ENSBBBG00000002653) ENSBBBG00000013166 KCNS2 (ENSBBBG00000013171) STK3 (ENSBBBG00000008905) OSR2 (ENSBBBG00000013191) #22 ENSBBBG00000013208 ENSBBBG00000002668 COX6C (ENSBBBG00000013243) RGS22 (ENSBBBG00000001626) FBXO43 (ENSBBBG00000008147) POLR2K (ENSBBBG00000013298) ENSBBBG00000013304 ENSBBBG00000013317 RNF19A (ENSBBBG00000002715) ANKRD46 (ENSBBBG00000013348) SNX31 (ENSBBBG00000013373) ENSBBBG00000001561 YWHAZ (ENSBBBG00000013437) ZNF706 (ENSBBBG00000013456) GRHL2 (ENSBBBG00000013495) Bos ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862.c ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a.e.a.b ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792.c.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b.x.b.a.b ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000153446.a.a.e.a.a.b ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.cb ENSGT00960000187108 ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792.c.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000163089.b.x.b.a.b ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Domestic yak MODERN SPECIES 9 CPQ (ENSBGRG00000005518) TSPYL5 (ENSBGRG00000005504) ENSBGRG00000005453 MTDH (ENSBGRG00000005120) ENSBGRG00000005040 MATN2 (ENSBGRG00000004856) RPL30 (ENSBGRG00000004783) ERICH5 (ENSBGRG00000004723) ENSBGRG00000004680 POP1 (ENSBGRG00000004614) ENSBGRG00000004591 ENSBGRG00000004577 NIPAL2 (ENSBGRG00000004376) KCNS2 (ENSBGRG00000004341) STK3 (ENSBGRG00000004102) OSR2 (ENSBGRG00000004042) #22 ENSBGRG00000003904 ENSBGRG00000003863 ENSBGRG00000003826 ENSBGRG00000012009 RGS22 (ENSBGRG00000010982) FBXO43 (ENSBGRG00000010794) POLR2K (ENSBGRG00000010705) SPAG1 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ENSBIXG00005012042 SNX31 (ENSBIXG00005012055) PABPC1 (ENSBIXG00005005823) ENSBIXG00005001276 ENSBIXG00005012298 GRHL2 (ENSBIXG00005012342) Cow MODERN SPECIES 5 CPQ (ENSBTAG00000011908) ENSBTAG00000046135 TSPYL5 (ENSBTAG00000011572) ENSBTAG00000011290 ENSBTAG00000032432 MTDH (ENSBTAG00000003098) LAPTM4B (ENSBTAG00000016959) MATN2 (ENSBTAG00000017165) RPL30 (ENSBTAG00000016278) ERICH5 (ENSBTAG00000018493) RIDA (ENSBTAG00000012595) POP1 (ENSBTAG00000012596) NIPAL2 (ENSBTAG00000018206) KCNS2 (ENSBTAG00000007768) STK3 (ENSBTAG00000026234) OSR2 (ENSBTAG00000013213) #22 VPS13B (ENSBTAG00000012357) COX6C (ENSBTAG00000014130) RGS22 (ENSBTAG00000019793) FBXO43 (ENSBTAG00000019795) POLR2K (ENSBTAG00000022539) SPAG1 (ENSBTAG00000032544) ENSBTAG00000050156 RNF19A (ENSBTAG00000017833) ENSBTAG00000054554 ANKRD46 (ENSBTAG00000001254) SNX31 (ENSBTAG00000011271) PABPC1 (ENSBTAG00000046358) YWHAZ (ENSBTAG00000000236) ZNF706 (ENSBTAG00000008054) GRHL2 (ENSBTAG00000004518) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 17 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(ENSBMSG00010014151) KCNS2 (ENSBMSG00010014119) ENSBMSG00010014104 STK3 (ENSBMSG00010014023) OSR2 (ENSBMSG00010013955) #22 ENSBMSG00010019262 VPS13B (ENSBMSG00010018620) COX6C (ENSBMSG00010018531) RGS22 (ENSBMSG00010018309) FBXO43 (ENSBMSG00010018245) SPAG1 (ENSBMSG00010018129) RNF19A (ENSBMSG00010018105) ANKRD46 (ENSBMSG00010018073) ENSBMSG00010018067 SNX31 (ENSBMSG00010018001) PABPC1 (ENSBMSG00010017940) YWHAZ (ENSBMSG00010017904) ENSBMSG00010017889 ENSBMSG00010017870 GRHL2 (ENSBMSG00010017745) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000157222 ENSGT00950000182878.b.b.k.b ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000155144.j ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792.j ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00950000183123.g.b.b.g.a ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000155384.a.h ENSGT00940000157094 ENSGT01060000248806.b ENSGT00950000183212.A ENSGT00980000199387.d.b ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792.j.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00950000183123.g.b.b.g.a ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000155384.a.h ENSGT00940000157094 ENSGT01060000248806.b ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00390000003465.b.b Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792.j.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00950000183123.g.b.b.g.a ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000155384.a.h ENSGT00940000157094 ENSGT01060000248806.b ENSGT00950000183212.A ENSGT00980000199387.d.b ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000162862 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00390000010783 ENSGT00420000029792.j.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00950000183123.g.b.b.g.a ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000155384.a.h ENSGT00940000157094 ENSGT01060000248806.b ENSGT00950000183212.A ENSGT00980000199387.d.b ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.b Narwhal MODERN SPECIES 300 MTERF3 (ENSMMNG00015012737) PTDSS1 (ENSMMNG00015012705) SDC2 (ENSMMNG00015012686) CPQ (ENSMMNG00015012661) TSPYL5 (ENSMMNG00015012653) MTDH (ENSMMNG00015012582) LAPTM4B (ENSMMNG00015012560) MATN2 (ENSMMNG00015012438) ENSMMNG00015012331 ERICH5 (ENSMMNG00015012317) ENSMMNG00015012305 POP1 (ENSMMNG00015012259) NIPAL2 (ENSMMNG00015012229) KCNS2 (ENSMMNG00015012202) STK3 (ENSMMNG00015012175) OSR2 (ENSMMNG00015012148) #22 ENSMMNG00015012128 VPS13B (ENSMMNG00015012082) COX6C (ENSMMNG00015012045) RGS22 (ENSMMNG00015011847) FBXO43 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ENSDLEG00000002593 PABPC1 (ENSDLEG00000002559) ENSDLEG00000002547 Vaquita MODERN SPECIES 8 MTERF3 (ENSPSNG00000014276) PTDSS1 (ENSPSNG00000014356) SDC2 (ENSPSNG00000014445) CPQ (ENSPSNG00000014529) TSPYL5 (ENSPSNG00000014593) MTDH (ENSPSNG00000014659) ENSPSNG00000014848 MATN2 (ENSPSNG00000015000) ENSPSNG00000016013 ERICH5 (ENSPSNG00000016114) ENSPSNG00000016171 POP1 (ENSPSNG00000016227) NIPAL2 (ENSPSNG00000016364) KCNS2 (ENSPSNG00000016474) STK3 (ENSPSNG00000016511) OSR2 (ENSPSNG00000016679) #22 VPS13B (ENSPSNG00000016812) COX6C (ENSPSNG00000016995) RGS22 (ENSPSNG00000017084) FBXO43 (ENSPSNG00000018045) SPAG1 (ENSPSNG00000018122) RNF19A (ENSPSNG00000018200) ANKRD46 (ENSPSNG00000018238) SNX31 (ENSPSNG00000018275) ENSPSNG00000018412 ENSPSNG00000018450 PABPC1 (ENSPSNG00000018503) ENSPSNG00000018640 ENSPSNG00000018705 GRHL2 (ENSPSNG00000018751) NCALD (ENSPSNG00000018982) Dolphin MODERN SPECIES 1565 OSR2 (ENSTTRG00000007477) #22 VPS13B (ENSTTRG00000007479) ENSTTRG00000007485 RGS22 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ENSGT00390000012138.a.a ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000167005 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Kakapo MODERN SPECIES UQCRB (ENSSHBG00005002501) MTERF3 (ENSSHBG00005002485) PTDSS1 (ENSSHBG00005002473) SDC2 (ENSSHBG00005002460) CPQ (ENSSHBG00005002449) MTDH (ENSSHBG00005002419) LAPTM4B (ENSSHBG00005002393) MATN2 (ENSSHBG00005002362) ENSSHBG00005002337 RIDA (ENSSHBG00005002325) POP1 (ENSSHBG00005002300) ENSSHBG00005002282 ENSSHBG00005002272 KCNS2 (ENSSHBG00005002261) STK3 (ENSSHBG00005002130) OSR2 (ENSSHBG00005002071) #22 VPS13B (ENSSHBG00005002000) ENSSHBG00005001870 ENSSHBG00005001842 FBXO43 (ENSSHBG00005001820) ENSSHBG00005001799 ENSSHBG00005001773 RNF19A (ENSSHBG00005001737) ANKRD46 (ENSSHBG00005001715) SNX31 (ENSSHBG00005001685) ENSSHBG00005001643 YWHAZ (ENSSHBG00005001617) ZNF706 (ENSSHBG00005001607) GRHL2 (ENSSHBG00005001579) NCALD (ENSSHBG00005001526) RRM2B (ENSSHBG00005001510) Golden eagle MODERN SPECIES 20 GDF6 (ENSACCG00020002250) UQCRB (ENSACCG00020002239) MTERF3 (ENSACCG00020002223) PTDSS1 (ENSACCG00020002199) SDC2 (ENSACCG00020002180) CPQ (ENSACCG00020002156) MTDH (ENSACCG00020002122) LAPTM4B (ENSACCG00020002074) MATN2 (ENSACCG00020002048) RPL30 (ENSACCG00020002001) RIDA (ENSACCG00020001973) POP1 (ENSACCG00020001927) NIPAL2 (ENSACCG00020001866) KCNS2 (ENSACCG00020001844) STK3 (ENSACCG00020001831) OSR2 (ENSACCG00020001813) #22 VPS13B (ENSACCG00020001758) ENSACCG00020001615 ENSACCG00020001602 RGS22 (ENSACCG00020001537) FBXO43 (ENSACCG00020001480) POLR2K (ENSACCG00020001468) ENSACCG00020001446 ENSACCG00020001393 RNF19A (ENSACCG00020001363) ANKRD46 (ENSACCG00020001341) SNX31 (ENSACCG00020001323) ENSACCG00020001278 YWHAZ (ENSACCG00020001258) ZNF706 (ENSACCG00020001245) GRHL2 (ENSACCG00020001184) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162274 ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000167005 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000164643 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162274 ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000154181.a 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ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00940000153773.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00940000156357 Chicken MODERN SPECIES 11 GDF6 (ENSGALG00010011423) UQCRB (ENSGALG00010011428) MTERF3 (ENSGALG00010011445) PTDSS1 (ENSGALG00010011450) SDC2 (ENSGALG00010011477) CPQ (ENSGALG00010011497) MTDH (ENSGALG00010011531) LAPTM4B (ENSGALG00010011556) MATN2 (ENSGALG00010011628) RPL30 (ENSGALG00010011650) RIDA (ENSGALG00010011662) POP1 (ENSGALG00010011673) NIPAL2 (ENSGALG00010011683) KCNS2 (ENSGALG00010011874) STK3 (ENSGALG00010011982) OSR2 (ENSGALG00010011297) #22 VPS13B (ENSGALG00010011312) COX6C (ENSGALG00010011326) RGS22 (ENSGALG00010011347) FBXO43 (ENSGALG00010010872) ENSGALG00010010876 SPAG1 (ENSGALG00010010894) RNF19A (ENSGALG00010011359) ANKRD46 (ENSGALG00010011401) PABPC1 (ENSGALG00010011414) YWHAZ (ENSGALG00010011703) ZNF706 (ENSGALG00010011751) GRHL2 (ENSGALG00010011772) 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ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Common wall lizard MODERN SPECIES 15 MTERF3 (ENSPMRG00000021471) PTDSS1 (ENSPMRG00000021459) SDC2 (ENSPMRG00000021445) CPQ (ENSPMRG00000021436) MTDH (ENSPMRG00000021423) LAPTM4B (ENSPMRG00000021414) MATN2 (ENSPMRG00000021402) ENSPMRG00000021391 ENSPMRG00000021385 ENSPMRG00000021376 POP1 (ENSPMRG00000021364) NIPAL2 (ENSPMRG00000021352) KCNS2 (ENSPMRG00000021350) ENSPMRG00000021346 STK3 (ENSPMRG00000021340) OSR2 (ENSPMRG00000021333) #22 ENSPMRG00000021318 VPS13B (ENSPMRG00000021254) ENSPMRG00000021224 RGS22 (ENSPMRG00000021151) FBXO43 (ENSPMRG00000021113) POLR2K (ENSPMRG00000021106) SPAG1 (ENSPMRG00000021093) RNF19A (ENSPMRG00000021080) ENSPMRG00000021071 ENSPMRG00000021063 SNX31 (ENSPMRG00000021056) 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#22 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000167005 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000157094 ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.b ENSGT01090000260040.a.a.b ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b Lizard MODERN SPECIES 1007 OSR2 (ENSACAG00000016280) #22 VPS13B (ENSACAG00000016301) ENSACAG00000041646 RGS22 (ENSACAG00000016376) FBXO43 (ENSACAG00000016378) ENSACAG00000020961 ENSACAG00000044886 ENSACAG00000028868 RNF19A (ENSACAG00000016401) ANKRD46 (ENSACAG00000016427) SNX31 (ENSACAG00000016431) ENSACAG00000016470 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000162274 ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00530000063576.B ENSGT00940000157222 ENSGT00390000018110 ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b ENSGT00420000029792 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.C 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#22 VPS13B (ENSLOCG00000009760) RGS22 (ENSLOCG00000009743) FBXO43 (ENSLOCG00000009732) polr2k (ENSLOCG00000009730) spag1a (ENSLOCG00000009713) rnf19a (ENSLOCG00000009704) SNX31 (ENSLOCG00000009692) PABPC3 (ENSLOCG00000009681) ywhaz (ENSLOCG00000009671) znf706 (ENSLOCG00000009661) grhl2b (ENSLOCG00000009655) ncalda (ENSLOCG00000009644) id4 (ENSLOCG00000009639) cep76 (ENSLOCG00000009631) psmg2 (ENSLOCG00000009625) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000159405 ENSGT00940000154181.b ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b ENSGT00420000029792.qb.b ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.A ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00940000172596 ENSGT00530000063692.a ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A ENSGT00510000048187 ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00940000156554.a Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.a.g ENSGT00940000178526 ENSGT00390000004263.a.d.b ENSGT00950000182995.e.b.`b.a ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357.j ENSGT00940000154181.b ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.a.a ENSGT00420000029792.qb.b ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000154984.A ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00940000172596 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.a.a.a.b ENSGT00940000158703.l ENSGT01090000260040.b.b.a.b ENSGT00390000003465.b.b.a ENSGT00940000158703.k.b ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260040.b.b.a.a.b ENSGT00940000169819 ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862.e ENSGT00940000162435.a.b P. kingsleyae MODERN SPECIES 1 PRELID3A (ENSPKIG00000015520) spire1a (ENSPKIG00000015599) ATP6V1C1 (ENSPKIG00000015818) ENSPKIG00000015872 azin1b 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ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A ENSGT00510000048187 ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00940000156554.a ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000158819 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00990000204549 ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000153446.a.a.x ENSGT00940000158008 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260061.c.a.d ENSGT01090000260040.b.b.a.d ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000011759 ENSGT00940000158819 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ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a ENSGT01090000260040.b.b.a.d ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 7 oxr1b (ENSMMDG00005019992) sqlea (ENSMMDG00005019944) rnf144b (ENSMMDG00005019939) ENSMMDG00005019885 atp6v1c1a (ENSMMDG00005019843) azin1a (ENSMMDG00005019831) KLF10 (ENSMMDG00005019829) ubr5 (ENSMMDG00005019800) ENSMMDG00005019783 LAPTM4B (ENSMMDG00005019780) MATN2 (ENSMMDG00005019776) rida (ENSMMDG00005019771) POP1 (ENSMMDG00005019767) NIPAL2 (ENSMMDG00005019765) KCNS2 (ENSMMDG00005019762) osr2 (ENSMMDG00005019759) #22 VPS13B (ENSMMDG00005019751) ENSMMDG00005019744 FBXO43 (ENSMMDG00005019742) ENSMMDG00005019729 RNF19A 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ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 480 zfpm2a (ENSHCOG00000014205) ENSHCOG00000014186 oxr1b (ENSHCOG00000014145) sqlea (ENSHCOG00000014116) rnf144b (ENSHCOG00000014090) ENSHCOG00000014070 ENSHCOG00000014059 atp6v1c1a (ENSHCOG00000014045) azin1a (ENSHCOG00000014039) ubr5 (ENSHCOG00000014022) ENSHCOG00000013917 ENSHCOG00000013907 POP1 (ENSHCOG00000013888) NIPAL2 (ENSHCOG00000013854) KCNS2 (ENSHCOG00000013836) osr2 (ENSHCOG00000013823) #22 VPS13B (ENSHCOG00000013804) ENSHCOG00000013646 FBXO43 (ENSHCOG00000013550) ENSHCOG00000013540 rnf19a (ENSHCOG00000013534) pabpc1a (ENSHCOG00000013502) ENSHCOG00000013467 ncalda (ENSHCOG00000013434) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158819 ENSGT00940000171948 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00990000204549 ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00420000029792.qb.a 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ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158819 ENSGT00940000171948 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00390000003058.b.a.a.b ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A Oryzias ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000155187.B ENSGT00390000011759 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(ENSORLG00000002567) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00940000155187.B ENSGT00390000011759 ENSGT00940000158819 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357.u ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703.t ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781.a ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000158416.q.a Indian medaka MODERN SPECIES 5 ENSOMEG00000007685 ENSOMEG00000007679 ENSOMEG00000007672 ENSOMEG00000007650 zfpm2a (ENSOMEG00000007591) ENSOMEG00000007508 oxr1b (ENSOMEG00000007395) sqlea (ENSOMEG00000007200) rnf144b (ENSOMEG00000007140) ENSOMEG00000007105 ENSOMEG00000007004 rida (ENSOMEG00000006978) POP1 (ENSOMEG00000006915) NIPAL2 (ENSOMEG00000006875) KCNS2 (ENSOMEG00000006854) osr2 (ENSOMEG00000006838) #22 ENSOMEG00000006821 ENSOMEG00000000703 gprc6a (ENSOMEG00000006801) ptpn2a (ENSOMEG00000006761) ENSOMEG00000001023 preb (ENSOMEG00000006709) fam210ab (ENSOMEG00000006689) ldlrad4b (ENSOMEG00000006668) ENSOMEG00000006647 ENSOMEG00000006615 seh1l (ENSOMEG00000006526) dpys (ENSOMEG00000006455) DCSTAMP (ENSOMEG00000006421) RIMS2 (ENSOMEG00000006339) dcaf13 (ENSOMEG00000006040) Javanese ricefish MODERN SPECIES 7 rnf144b (ENSOJAG00000010170) ZNF622 (ENSOJAG00000010128) ENSOJAG00000010117 atp6v1c1a (ENSOJAG00000009889) azin1a (ENSOJAG00000009830) ENSOJAG00000009806 ENSOJAG00000005787 LAPTM4B (ENSOJAG00000005771) MATN2 (ENSOJAG00000005428) ENSOJAG00000005349 rida (ENSOJAG00000005336) NIPAL2 (ENSOJAG00000005316) ccng1 (ENSOJAG00000005297) KCNS2 (ENSOJAG00000005290) ENSOJAG00000005272 osr2 (ENSOJAG00000005242) #22 VPS13B (ENSOJAG00000005133) 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ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A Platyfish MODERN SPECIES 17 oxr1b (ENSXMAG00000003868) sqlea (ENSXMAG00000003411) rnf144b (ENSXMAG00000022380) ENSXMAG00000002369 atp6v1c1a (ENSXMAG00000002385) azin1a (ENSXMAG00000002403) ENSXMAG00000002425 ubr5 (ENSXMAG00000002429) ENSXMAG00000011490 LAPTM4B (ENSXMAG00000003242) MATN2 (ENSXMAG00000003255) rida (ENSXMAG00000028764) POP1 (ENSXMAG00000002472) NIPAL2 (ENSXMAG00000021565) KCNS2 (ENSXMAG00000020015) osr2 (ENSXMAG00000002498) #22 VPS13B (ENSXMAG00000002500) RGS22 (ENSXMAG00000002513) FBXO43 (ENSXMAG00000029248) ENSXMAG00000002533 rnf19a (ENSXMAG00000002545) pabpc1a (ENSXMAG00000002555) ywhabl (ENSXMAG00000002570) ZNF706 (ENSXMAG00000003736) ENSXMAG00000002574 ncalda (ENSXMAG00000024227) id4 (ENSXMAG00000027976) cep76 (ENSXMAG00000002590) ptpn2a (ENSXMAG00000002596) seh1l (ENSXMAG00000002610) CEP192 (ENSXMAG00000002611) Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158819 ENSGT00940000171948 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357.t ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008.f.b ENSGT00940000158008.f.a ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A Guppy MODERN SPECIES 446 ENSPREG00000020984 rida (ENSPREG00000020963) POP1 (ENSPREG00000020951) NIPAL2 (ENSPREG00000020935) KCNS2 (ENSPREG00000020923) osr2 (ENSPREG00000020911) #22 VPS13B (ENSPREG00000020825) ENSPREG00000020775 FBXO43 (ENSPREG00000020741) ENSPREG00000020712 ENSPREG00000020693 rnf19a (ENSPREG00000020677) pabpc1a (ENSPREG00000019595) ENSPREG00000019398 ENSPREG00000019387 grhl2a (ENSPREG00000019373) ncalda (ENSPREG00000019365) ENSPREG00000019345 ENSPREG00000019323 mrps35 (ENSPREG00000019306) ENSPREG00000019295 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00940000158819 ENSGT00940000171948 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357.t ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008.f.b ENSGT00940000158008.f.a ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 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ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781.c ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A Spiny chromis MODERN SPECIES 180 ENSAPOG00000007415 atp6v1c1a (ENSAPOG00000007513) azin1a (ENSAPOG00000007545) ENSAPOG00000007569 ubr5 (ENSAPOG00000007770) ENSAPOG00000007844 LAPTM4B (ENSAPOG00000007897) MATN2 (ENSAPOG00000008131) rida (ENSAPOG00000008174) POP1 (ENSAPOG00000008198) NIPAL2 (ENSAPOG00000008210) KCNS2 (ENSAPOG00000008220) osr2 (ENSAPOG00000008249) #22 VPS13B (ENSAPOG00000008624) ENSAPOG00000008686 FBXO43 (ENSAPOG00000000234) ENSAPOG00000008803 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00940000158819 ENSGT00940000171948 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab 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ENSONIG00000006871 ENSONIG00000006873 ZNF706 (ENSONIG00000035397) ENSONIG00000006874 ncalda (ENSONIG00000006880) id4 (ENSONIG00000006883) cep76 (ENSONIG00000006884) ptpn2a (ENSONIG00000006890) seh1l (ENSONIG00000006895) CEP192 (ENSONIG00000006896) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00990000203729 ENSGT01050000244883.A.a.a.b ENSGT00940000162287.A.j ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A ENSGT00510000048187 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 331 ENSNBRG00000001835 ENSNBRG00000001852 ENSNBRG00000001861 ENSNBRG00000001883 atp6v1c1a (ENSNBRG00000001891) AZIN1 (ENSNBRG00000001916) ENSNBRG00000001956 ubr5 (ENSNBRG00000001982) ENSNBRG00000002125 LAPTM4B (ENSNBRG00000002138) MATN2 (ENSNBRG00000002186) rida (ENSNBRG00000002321) POP1 (ENSNBRG00000002356) NIPAL2 (ENSNBRG00000002403) KCNS2 (ENSNBRG00000002432) osr2 (ENSNBRG00000002444) #22 VPS13B (ENSNBRG00000002486) RGS22 (ENSNBRG00000002706) ENSNBRG00000002829 ENSNBRG00000002935 rnf19a (ENSNBRG00000003021) ENSNBRG00000003068 ENSNBRG00000003138 ZNF706 (ENSNBRG00000003150) ENSNBRG00000003159 ncalda (ENSNBRG00000003212) id4 (ENSNBRG00000003231) cep76 (ENSNBRG00000003246) ptpn2a (ENSNBRG00000003283) ENSNBRG00000003290 ENSNBRG00000003304 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT01020000230438.A.e.a.m.b.b ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a 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pabpc1a (ENSHBUG00000020487) ENSHBUG00000020420 ZNF706 (ENSHBUG00000020382) GRHL2 (ENSHBUG00000020365) ncalda (ENSHBUG00000020311) id4 (ENSHBUG00000020288) cep76 (ENSHBUG00000020279) ptpn2a (ENSHBUG00000020237) seh1l (ENSHBUG00000020222) ENSHBUG00000019958 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT01020000230438.A.e.a.m.b.b ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008.g.a ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A ENSGT00510000048187 P. nyererei MODERN SPECIES 420 ENSPNYG00000003996 ENSPNYG00000004011 atp6v1c1a (ENSPNYG00000004031) azin1a (ENSPNYG00000004085) ENSPNYG00000004113 ubr5 (ENSPNYG00000004164) ENSPNYG00000004272 LAPTM4B (ENSPNYG00000004282) MATN2 (ENSPNYG00000004311) rida (ENSPNYG00000004442) POP1 (ENSPNYG00000004476) NIPAL2 (ENSPNYG00000004507) KCNS2 (ENSPNYG00000004524) osr2 (ENSPNYG00000004536) #22 VPS13B (ENSPNYG00000004591) RGS22 (ENSPNYG00000004942) FBXO43 (ENSPNYG00000005054) ENSPNYG00000005080 ENSPNYG00000005119 rnf19a (ENSPNYG00000005150) pabpc1a (ENSPNYG00000005192) ENSPNYG00000005256 ZNF706 (ENSPNYG00000005282) grhl2a (ENSPNYG00000005293) ncalda (ENSPNYG00000005340) id4 (ENSPNYG00000005362) cep76 (ENSPNYG00000005376) ptpn2a (ENSPNYG00000005413) seh1l (ENSPNYG00000005432) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT01070000253760.b.a.a.a.a.b.b.k.a.b.a.a.a.a.b.b.a.b.b.a.b.a ENSGT01060000248661.a.b.c.a ENSGT01020000230438.A.e.a.m.b.b ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00940000159405 ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a 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(ENSACLG00000009338) ENSACLG00000009243 cep76 (ENSACLG00000009210) ptpn2a (ENSACLG00000009154) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158819 ENSGT00940000171948 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00990000204549 ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158819 ENSGT00730000111263 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00990000204549 ENSGT00390000004263.a.d.a 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ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A Seriola ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158819 ENSGT00730000111263 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00990000204549 ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2975 azin1a (ENSSLDG00000013226) ENSSLDG00000013206 ubr5 (ENSSLDG00000013014) ENSSLDG00000012901 LAPTM4B (ENSSLDG00000012857) MATN2 (ENSSLDG00000012668) rida 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Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000155187.B ENSGT00390000011759 ENSGT00940000158819 ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000160311.a.a.d ENSGT01090000260061.c.a.d.b.a.a ENSGT00940000155788.k ENSGT00940000158862 ENSGT00940000162435 ENSGT00390000000781 ENSGT00940000154686.b ENSGT00940000153393.A ENSGT00510000048187 Turbot MODERN SPECIES ENSSMAG00000009783 ENSSMAG00000009858 sqlea (ENSSMAG00000009991) ENSSMAG00000010035 ENSSMAG00000010080 atp6v1c1a (ENSSMAG00000010166) ENSSMAG00000010181 ubr5 (ENSSMAG00000010194) ENSSMAG00000010329 LAPTM4B (ENSSMAG00000010374) MATN2 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perch MODERN SPECIES 40 oxr1b (ENSSLUG00000023661) sqlea (ENSSLUG00000023716) rnf144b (ENSSLUG00000023892) ENSSLUG00000006140 atp6v1c1a (ENSSLUG00000006176) AZIN1 (ENSSLUG00000006230) ENSSLUG00000006242 ubr5 (ENSSLUG00000006281) ENSSLUG00000006459 LAPTM4B (ENSSLUG00000006470) MATN2 (ENSSLUG00000006481) rida (ENSSLUG00000006497) POP1 (ENSSLUG00000006514) NIPAL2 (ENSSLUG00000006526) KCNS2 (ENSSLUG00000006535) osr2 (ENSSLUG00000006539) #22 VPS13B (ENSSLUG00000006563) ENSSLUG00000006632 FBXO43 (ENSSLUG00000006655) ENSSLUG00000006668 rnf19a (ENSSLUG00000006701) pabpc1a (ENSSLUG00000006845) ENSSLUG00000008033 ZNF706 (ENSSLUG00000008041) ENSSLUG00000008050 ncalda (ENSSLUG00000008098) Channel bull blenny MODERN SPECIES 7 rnf144b (ENSCGOG00000014880) ENSCGOG00000014881 ENSCGOG00000014883 ATP6V1C1 (ENSCGOG00000014890) azin1a (ENSCGOG00000015602) ENSCGOG00000015624 ENSCGOG00000016235 ENSCGOG00000016242 LAPTM4B (ENSCGOG00000016246) MATN2 (ENSCGOG00000016249) ENSCGOG00000016257 rida 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yellow croaker MODERN SPECIES 484 sqlea (ENSLCRG00005015687) rnf144b (ENSLCRG00005015719) ENSLCRG00005015735 ENSLCRG00005015746 atp6v1c1a (ENSLCRG00005015803) azin1a (ENSLCRG00005015829) ENSLCRG00005015850 ubr5 (ENSLCRG00005015962) ENSLCRG00005016293 LAPTM4B (ENSLCRG00005016308) MATN2 (ENSLCRG00005016318) rida (ENSLCRG00005016328) POP1 (ENSLCRG00005016340) NIPAL2 (ENSLCRG00005016376) KCNS2 (ENSLCRG00005000636) osr2 (ENSLCRG00005000644) #22 VPS13B (ENSLCRG00005000725) ENSLCRG00005000882 FBXO43 (ENSLCRG00005000896) ENSLCRG00005000903 rnf19a (ENSLCRG00005000929) pabpc1a (ENSLCRG00005001129) ENSLCRG00005001365 ZNF706 (ENSLCRG00005001367) grhl2a (ENSLCRG00005001373) ncalda (ENSLCRG00005001697) id4 (ENSLCRG00005001726) cep76 (ENSLCRG00005001780) ptpn2a (ENSLCRG00005002163) seh1l (ENSLCRG00005002172) CEP192 (ENSLCRG00005002740) European seabass MODERN SPECIES 6 ENSDLAG00005013501 sqlea (ENSDLAG00005013813) ENSDLAG00005030365 ENSDLAG00005014169 atp6v1c1a (ENSDLAG00005014247) AZIN1 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(ENSGMOG00000026792) ENSGMOG00000013417 ENSGMOG00000013437 ENSGMOG00000013448 ENSGMOG00000013462 ENSGMOG00000013469 ncalda (ENSGMOG00000027021) id4 (ENSGMOG00000022166) cep76 (ENSGMOG00000013513) ptpn2a (ENSGMOG00000013532) SEH1L (ENSGMOG00000013550) ENSGMOG00000032926 ENSGMOG00000034566 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000048187 ENSGT00940000153393.A ENSGT00940000154686.b ENSGT00390000000781 ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.k ENSGT01090000260040.b.b.a.d ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00880000138038 ENSGT00950000182982.A.a ENSGT00950000182982.C.c.a ENSGT01050000244838.D.a.a ENSGT00950000182810.A.a.b ENSGT00390000004915.a ENSGT00940000157647.d ENSGT00940000164859 ENSGT00390000011137 ENSGT00940000155321.d.a ENSGT00940000154655.a.i.a ENSGT00730000111042 Northern pike MODERN SPECIES 15 SEH1L (ENSELUG00000003728) ptpn2a (ENSELUG00000003708) cep76 (ENSELUG00000003693) id4 (ENSELUG00000032505) ncalda (ENSELUG00000003663) grhl2a (ENSELUG00000003646) ENSELUG00000003632 pabpc1a (ENSELUG00000003614) ENSELUG00000003588 ENSELUG00000003573 rida (ENSELUG00000003537) POP1 (ENSELUG00000003526) NIPAL2 (ENSELUG00000003504) KCNS2 (ENSELUG00000003500) ENSELUG00000033955 osr2 (ENSELUG00000003493) #22 ENSELUG00000027765 ENSELUG00000030603 VPS13B (ENSELUG00000003468) ENSELUG00000003417 fbxo43 (ENSELUG00000003389) ECHDC1 (ENSELUG00000003366) si:ch211-151o1.4 (ENSELUG00000001588) SOGA3 (ENSELUG00000003336) elovl4a (ENSELUG00000003322) PRELID3A (ENSELUG00000003312) fbxo32 (ENSELUG00000003297) KLHL38 (ENSELUG00000003275) LRATD2 (ENSELUG00000003267) nsmce2 (ENSELUG00000003259) washc5 (ENSELUG00000003237) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684.cb.a.a.a ENSGT00500000044936.c.a ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000012138.a.b.c.b ENSGT00880000138038 ENSGT00950000182982.A.a ENSGT00950000182982.C.c.a ENSGT01050000244838.D.a.a ENSGT00950000182810.A.a.b ENSGT00390000004915.a ENSGT00940000157647.d ENSGT00940000159198.g ENSGT00950000182986.a.b.b.l.a.b ENSGT00940000164859 ENSGT00390000011137 Huchen MODERN SPECIES 7052 osr2 (ENSHHUG00000011335) #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000154686.b.f ENSGT00390000000781 ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862.n ENSGT00940000155788.k.a ENSGT01090000260040.b.b.a.d ENSGT00940000160311.a.a.a.a ENSGT00940000160311.a.a.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684.cb.a.a.a ENSGT00500000044936.c.a ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000012138.a.b.c.b.a ENSGT00880000138038 ENSGT00950000182982.A.a ENSGT00950000182982.C.c.a.h ENSGT01050000244838.D.a.a ENSGT00950000182810.A.a.b ENSGT00390000004915.a ENSGT00940000157647.d ENSGT00940000164859 ENSGT00390000011137 ENSGT00940000155321.d.a ENSGT00940000154655.a.i.a Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160530 #22 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 536 ENSSSAG00000016182 #22 ENSSSAG00000089196 Atlantic salmon MODERN SPECIES 662 ENSSSAG00000084838 #22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 1019 ENSSSAG00000023202 #22 ENSSSAG00000070116 ENSSSAG00000100931 River trout MODERN SPECIES 41 osr2 (ENSSTUG00000035281) #22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00950000183199.b.n ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT00940000156554.a ENSGT00390000000724.c.b.c ENSGT00940000154686.b.e.a ENSGT00390000000781.g ENSGT00940000162435 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00420000029792.qb.a.e.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684.cb.a.a.a ENSGT00500000044936.c.a ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000012138.a.b.c.b.a ENSGT00880000138038 ENSGT00950000182982.A.a ENSGT00950000182982.C.c.a.g ENSGT00950000182982.C.c.a.h ENSGT01050000244838.D.a.a ENSGT00950000182810.A.a.b ENSGT00390000004915.a ENSGT00940000157647.d ENSGT00940000159198.g.l ENSGT00940000164859 ENSGT00390000011137 Rainbow trout MODERN SPECIES 11 trim71 (ENSOMYG00000077838) cnot10 (ENSOMYG00000073977) ENSOMYG00000058538 ENSOMYG00000072363 ENSOMYG00000049688 ENSOMYG00000054979 ENSOMYG00000066946 ENSOMYG00000068668 RIDA (ENSOMYG00000035169) POP1 (ENSOMYG00000069502) ENSOMYG00000059470 ENSOMYG00000049524 NIPAL2 (ENSOMYG00000069985) KCNS2 (ENSOMYG00000051289) ENSOMYG00000048893 OSR2 (ENSOMYG00000050135) #22 ENSOMYG00000024763 ENSOMYG00000073433 VPS13B (ENSOMYG00000064938) RGS22 (ENSOMYG00000067468) FBXO43 (ENSOMYG00000057769) RL30 (ENSOMYG00000025458) ENSOMYG00000030225 si:ch211-151o1.4 (ENSOMYG00000052485) ENSOMYG00000047968 elovl4a (ENSOMYG00000024737) ENSOMYG00000063820 ENSOMYG00000074461 ENSOMYG00000060832 ENSOMYG00000027996 ENSOMYG00000052788 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 142 ENSGT00940000154686.b.e.a ENSGT00390000000781.g ENSGT00940000162435 ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00420000029792.qb.a.e.a ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00500000044936.c.a ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000012138.a.b.c.b.a ENSGT00880000138038 ENSGT00950000182982.C.c.a.h ENSGT01050000244838.D.a.a ENSGT00950000182810.A.a.b ENSGT00390000004915.a ENSGT00940000157647.d ENSGT00940000159198.g.l ENSGT00940000164859 ENSGT00390000011137 ENSGT00940000155321.e.k ENSGT00940000154655.a.i.a ENSGT00730000111042 Chinook salmon MODERN SPECIES 115 osr2 (ENSOTSG00005024559) #22 ENSOTSG00005024557 ENSOTSG00005024556 ENSOTSG00005024554 si:dkey-87o1.2 (ENSOTSG00005024553) nbn (ENSOTSG00005024552) OSGIN2 (ENSOTSG00005024551) gtpbp10 (ENSOTSG00005024479) ENSOTSG00005024416 ENSOTSG00005024411 znf687a 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SPECIES 221 ENSOKIG00005025659 OSR2 (ENSOKIG00005025632) #22 osr2 (ENSOKIG00005025604) #22 Coho salmon MODERN SPECIES 221 ENSOKIG00005025659 OSR2 (ENSOKIG00005025632) #22 osr2 (ENSOKIG00005025604) #22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.c.b ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000153446.a.a.w.b ENSGT00390000012138.a.b.d ENSGT00420000029792.qb.a ENSGT00940000154984.A ENSGT00390000008918 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.a.a.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 285 ENSGT00940000158485 ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708.a ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00390000015035 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 182 ENSGT00940000158485 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00390000015035 ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000160219 ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000161506 ENSGT00940000154947.l ENSGT00940000154697.b ENSGT00530000063692.a Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 285 ENSGT00940000158485 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321.m.b ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530.e #22 ENSGT00940000160530.f #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000015035 ENSGT00510000047412.a.g ENSGT00940000160219.d ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000161506 ENSGT00940000160806 ENSGT00940000157062.e ENSGT00390000010652.A.a.b ENSGT00390000010652.A.a.a.t ENSGT00940000160472 Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 35 SLC39A1 (ENSCARG00000053878) CREB3L4 (ENSCARG00000053883) cyp11c1 (ENSCARG00000053897) pklr (ENSCARG00000054302) ENSCARG00000054845 zbtb7b (ENSCARG00000054928) khdc4 (ENSCARG00000054943) malsu1 (ENSCARG00000055039) spag1b (ENSCARG00000055088) ENSCARG00000055321 ENSCARG00000055331 fzd6 (ENSCARG00000055337) POP1 (ENSCARG00000055346) NIPAL2 (ENSCARG00000055439) KCNS2 (ENSCARG00000055524) osr2 (ENSCARG00000055536) #22 VPS13B (ENSCARG00000055631) ENSCARG00000057549 ENSCARG00000057556 ago1 (ENSCARG00000057687) dhdds (ENSCARG00000062456) ENSCARG00000062521 ENSCARG00000062587 ENSCARG00000062647 ENSCARG00000062661 ENSCARG00000062689 ENSCARG00000062746 C1orf232 (ENSCARG00000062754) fam110d (ENSCARG00000062759) SLC9A1 (ENSCARG00000062768) sybu (ENSCARG00000062935) Goldfish MODERN SPECIES 7 ENSCARG00000020503 ENSCARG00000001982 ENSCARG00000001990 ENSCARG00000002012 DENND4B (ENSCARG00000002069) ENSCARG00000002245 ENSCARG00000002258 clk2b (ENSCARG00000002335) ENSCARG00000002517 pklr (ENSCARG00000002571) ENSCARG00000002835 zbtb7b (ENSCARG00000002850) khdc4 (ENSCARG00000002856) fbxo43 (ENSCARG00000002861) ENSCARG00000002878 osr2 (ENSCARG00000002909) #22 ENSCARG00000002911 ENSCARG00000002915 ENSCARG00000002922 DCSTAMP (ENSCARG00000002928) RIMS2 (ENSCARG00000003057) ENSCARG00000004291 FAM83A (ENSCARG00000004312) ENSCARG00000004322 upk1a (ENSCARG00000004329) ENSCARG00000004347 ENSCARG00000004369 rbm42 (ENSCARG00000004435) cd22 (ENSCARG00000004451) ENSCARG00000004478 ENSCARG00000004491 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 343 ENSGT00940000159321.m.a ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530.e #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000015035 ENSGT00510000047412.a.g ENSGT00940000160219.d ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000161506 ENSGT00940000160806 ENSGT00940000157062.e ENSGT00390000010652.A.a.a.t ENSGT00940000160472 ENSGT01090000260029.a.b.b.b.a.a.b.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000164559.B.f Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 994 ENSSGRG00000032666 KCNS2 (ENSSGRG00000032668) osr2 (ENSSGRG00000032670) #22 ENSSGRG00000032676 fbxo43 (ENSSGRG00000032677) spag1b (ENSSGRG00000032678) khdc4 (ENSSGRG00000032685) zbtb7b (ENSSGRG00000032690) HDGFL3 (ENSSGRG00000032695) ENSSGRG00000032704 Golden-line barbel MODERN SPECIES 186 fzd6 (ENSSGRG00000026439) NIPAL2 (ENSSGRG00000026436) osr2 (ENSSGRG00000026434) #22 ENSSGRG00000026432 ENSSGRG00000026431 ADCYAP1R1 (ENSSGRG00000025992) POMGNT1 (ENSSGRG00000025866) TSPAN1 (ENSSGRG00000025862) pik3r3b (ENSSGRG00000025409) MAST2 (ENSSGRG00000024199) tmem69 (ENSSGRG00000024147) GPBP1L1 (ENSSGRG00000024112) nasp (ENSSGRG00000024108) akr1a1b (ENSSGRG00000023967) orc1 (ENSSGRG00000023671) mpl (ENSSGRG00000023664) tie1 (ENSSGRG00000023283) ENSSGRG00000023251 Common carp reference MODERN SPECIES 47 ENSCCRG00000025937 ENSCCRG00000004221 #22 ENSCCRG00000027566 ENSCCRG00000027575 ENSCCRG00000068847 ENSCCRG00000002397 ENSCCRG00000059795 ENSCCRG00000008901 ENSCCRG00000080775 ENSCCRG00000063406 ENSCCRG00000003135 ENSCCRG00000075267 ENSCCRG00000021417 ENSCCRG00000069116 ENSCCRG00000065514 ENSCCRG00000055145 ENSCCRG00000077715 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 285 ENSGT00940000158485 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321.m.b ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530.e #22 ENSGT00940000160530.f #22 ENSGT00940000154684 ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000015035 ENSGT00510000047412.a.g ENSGT00940000160219.d ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000161506 ENSGT00940000160806 ENSGT00940000157062.e ENSGT00390000010652.A.a.b ENSGT00390000010652.A.a.a.t ENSGT00940000160472 ENSGT01050000244841.A.a.a.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160530.f #22 Common carp reference MODERN SPECIES 2 ENSCCRG00000071989 NIPAL2 (ENSCCRG00000065433) KCNS2 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ENSIPUG00000018210 slc35b3 (ENSIPUG00000018188) eef1e1 (ENSIPUG00000018171) tmem14ca (ENSIPUG00000018106) mak (ENSIPUG00000018069) gcm2 (ENSIPUG00000018059) ENSIPUG00000018049 elovl2 (ENSIPUG00000018019) Gnal (ENSIPUG00000017980) mppe1 (ENSIPUG00000017960) VPS13B (ENSIPUG00000017891) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 249 ENSGT00940000158485 ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00940000154684 Electric eel MODERN SPECIES 114 fzd6 (ENSEEEG00000014970) LAPTM4B (ENSEEEG00000014968) MATN2 (ENSEEEG00000014936) POP1 (ENSEEEG00000014926) NIPAL2 (ENSEEEG00000014909) KCNS2 (ENSEEEG00000014908) osr2 (ENSEEEG00000014907) #22 ENSEEEG00000014901 ENC1 (ENSEEEG00000014893) ARHGEF28 (ENSEEEG00000014886) ankra2 (ENSEEEG00000014880) btf3 (ENSEEEG00000014862) foxd1 (ENSEEEG00000014859) TMEM174 (ENSEEEG00000014858) fcho2 (ENSEEEG00000014854) TNPO1 (ENSEEEG00000014224) ptcd2 (ENSEEEG00000014188) MAP1B 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ENSAMXG00000040972 serpinb1l3 (ENSAMXG00000041699) SERPINB8 (ENSAMXG00000043672) ENSAMXG00000029888 ENSAMXG00000043149 ENSAMXG00000015270 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 457 osr2 (ENSPNAG00000024124) #22 ENSPNAG00000024151 VPS13B (ENSPNAG00000024387) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063884.a ENSGT00390000003058.b.a.a.a.b ENSGT00390000013853.c ENSGT00390000004263.a.d.a ENSGT00950000182995.e.b.ab ENSGT00940000159405 ENSGT00940000156357 ENSGT00940000154181.b.a ENSGT00940000153446.a.a.w.a ENSGT00940000158008 ENSGT00390000012138.a.b.c.b ENSGT00420000029792.qb.a.m ENSGT00390000017478 ENSGT00940000159321 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000160530 #22 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00940000154697.b ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00940000158703.r ENSGT00940000160311.a.a ENSGT01100000263524.B.a.a.e ENSGT00510000046803.b.a.a ENSGT00940000159540.d ENSGT00940000161250 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000004322 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