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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000006890	ENSGT00940000157377 #7	ENSGT00550000075078 #8	ENSGT00940000160415 #9	ENSGT00390000005900 #10	ENSGT00950000182881.a.a.b #11	ENSGT00950000182910.b #12	ENSGT01050000244905.B #13	ENSGT01080000257420.C.b.b.a.a #14	ENSGT01080000257420.C.b.b.a.b.b #15	ENSGT00390000016401 #17	ENSGT00390000014272 #18	ENSGT00940000156363 #19	ENSGT00940000154971 #20	ENSGT00510000049735 #21	ENSGT00940000158799 #22	ENSGT00940000153173.b.b #23	ENSGT00940000154994.b #24	ENSGT00940000157202 #25	ENSGT00940000157943.b #26	ENSGT00940000155338 #27	ENSGT00510000048410 #28	ENSGT00390000007911 #29	ENSGT00940000154881 #30	ENSGT00940000159275 #31	ENSGT00940000154664 #32	ENSGT00390000012959.a #33	ENSGT00940000156331 #34	ENSGT00940000153814.b #35	ENSGT00940000156395 #36	ENSGT00940000162183 #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000006890	ENSGT00940000157377 #7	ENSGT00550000075078 #8	ENSGT00940000160415 #9	ENSGT00390000005900 #10	ENSGT00950000182881.a.a.b #11	ENSGT00950000182910.b #12	ENSGT01050000244905.B #13	ENSGT01080000257420.C.b.b.a.a #14	ENSGT01080000257420.C.b.b.a.b.b #15	ENSGT00390000016401 #17	ENSGT00390000014272 #18	ENSGT00940000156363 #19	ENSGT00940000154971 #20	ENSGT00510000049735 #21	ENSGT00940000158799 #22	ENSGT00940000153173.b.b #23	ENSGT00940000154994.b #24	ENSGT00940000157202 #25	ENSGT00940000157943.b.i #26	ENSGT00940000155338 #27	ENSGT00510000048410 #28	ENSGT00390000007911 #29	ENSGT00940000154881 #30	ENSGT00940000159275 #31	ENSGT00940000154664 #32	ENSGT00390000012959.a #33	ENSGT00940000156331 #34	ENSGT00940000153814.b #35	ENSGT00940000156395 #36	ENSGT00940000162183 #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	46	MLX (ENSUPAG00010009827) #7	COASY (ENSUPAG00010009813) #8	HSD17B1 (ENSUPAG00010009808) #9	NAGLU (ENSUPAG00010009802) #10	ATP6V0A1 (ENSUPAG00010009720) #11	CAVIN1 (ENSUPAG00010009709) #12	STAT3 (ENSUPAG00010009648) #13	STAT5A (ENSUPAG00010009605) #14	ENSUPAG00010009596 #15	ENSUPAG00010009583 #16	GHDC (ENSUPAG00010009572) #17	HCRT (ENSUPAG00010009569) #18	KCNH4 (ENSUPAG00010009543) #19	RAB5C (ENSUPAG00010009535) #20	HSPB9 (ENSUPAG00010009527) #21	KAT2A (ENSUPAG00010009504) #22	DHX58 (ENSUPAG00010009486) #23	C17orf113 (ENSUPAG00010009476) #24	ZNF385C (ENSUPAG00010009440) #25	NKIRAS2 (ENSUPAG00010009426) #26	DNAJC7 (ENSUPAG00010009401) #27	CNP (ENSUPAG00010009395) #28	ODAD4 (ENSUPAG00010009389) #29	ACLY (ENSUPAG00010009305) #30	KLHL11 (ENSUPAG00010009300) #31	KLHL10 (ENSUPAG00010009288) #32	NT5C3B (ENSUPAG00010009269) #33	FKBP10 (ENSUPAG00010009227) #34	P3H4 (ENSUPAG00010009210) #35	JUP (ENSUPAG00010009167) #36	HAP1 (ENSUPAG00010009150) #37
Squirrel	MODERN SPECIES	90	RETREG3 (ENSSTOG00000003702)	PSMC3IP (ENSSTOG00000003682)	MLX (ENSSTOG00000003660) #7	COASY (ENSSTOG00000003638) #8	HSD17B1 (ENSSTOG00000003627) #9	NAGLU (ENSSTOG00000003602) #10	ATP6V0A1 (ENSSTOG00000003569) #11	STAT3 (ENSSTOG00000006741) #13	STAT5A (ENSSTOG00000006713) #14	STAT5B (ENSSTOG00000006691) #15	GHDC (ENSSTOG00000022647) #17	HCRT (ENSSTOG00000006669) #18	KCNH4 (ENSSTOG00000006633) #19	HSPB9 (ENSSTOG00000006602) #21	RAB5C (ENSSTOG00000006620) #20	KAT2A (ENSSTOG00000006556) #22	DHX58 (ENSSTOG00000006524) #23	ZNF385C (ENSSTOG00000020287) #25	ENSSTOG00000006159 #26	DNAJC7 (ENSSTOG00000006122) #27	CNP (ENSSTOG00000006116) #28	ODAD4 (ENSSTOG00000006075) #29	ACLY (ENSSTOG00000006029) #30	KLHL11 (ENSSTOG00000026300) #31	KLHL10 (ENSSTOG00000005983) #32	NT5C3B (ENSSTOG00000005969) #33	FKBP10 (ENSSTOG00000005956) #34	P3H4 (ENSSTOG00000028974) #35	JUP (ENSSTOG00000005910) #36	HAP1 (ENSSTOG00000020475) #37	GAST (ENSSTOG00000005906)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	42	RETREG3 (ENSMMMG00000005418)	PSMC3IP (ENSMMMG00000005444)	MLX (ENSMMMG00000005464) #7	COASY (ENSMMMG00000005496) #8	HSD17B1 (ENSMMMG00000005512) #9	NAGLU (ENSMMMG00000005528) #10	ATP6V0A1 (ENSMMMG00000005552) #11	CAVIN1 (ENSMMMG00000005775) #12	STAT3 (ENSMMMG00000005779) #13	STAT5A (ENSMMMG00000005892) #14	STAT5B (ENSMMMG00000005973) #15	GHDC (ENSMMMG00000006013) #17	HCRT (ENSMMMG00000006029) #18	KCNH4 (ENSMMMG00000006041) #19	RAB5C (ENSMMMG00000006088) #20	KAT2A (ENSMMMG00000006120) #22	DHX58 (ENSMMMG00000006156) #23	ZNF385C (ENSMMMG00000006176) #25	ENSMMMG00000006193 #26	DNAJC7 (ENSMMMG00000006215) #27	CNP (ENSMMMG00000006240) #28	ENSMMMG00000006244 #29	ENSMMMG00000006252 #29	ACLY (ENSMMMG00000006262) #30	KLHL11 (ENSMMMG00000006432) #31	KLHL10 (ENSMMMG00000006440) #32	NT5C3B (ENSMMMG00000006451) #33	FKBP10 (ENSMMMG00000006462) #34	JUP (ENSMMMG00000006521) #36	HAP1 (ENSMMMG00000006582) #37	GAST (ENSMMMG00000006600)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	12	PSMC3IP (ENSSVLG00005004134)	MLX (ENSSVLG00005004171) #7	COASY (ENSSVLG00005004216) #8	HSD17B1 (ENSSVLG00005004237) #9	ENSSVLG00005004269 #10	ATP6V0A1 (ENSSVLG00005004340) #11	CAVIN1 (ENSSVLG00005004409) #12	STAT3 (ENSSVLG00005004451) #13	STAT5A (ENSSVLG00005004549) #14	STAT5B (ENSSVLG00005004598) #15	GHDC (ENSSVLG00005000199) #17	HCRT (ENSSVLG00005000222) #18	KCNH4 (ENSSVLG00005000254) #19	ENSSVLG00005000284 #20	HSPB9 (ENSSVLG00005000293) #21	KAT2A (ENSSVLG00005000319) #22	DHX58 (ENSSVLG00005000354) #23	ZNF385C (ENSSVLG00005000419) #25	C17orf113 (ENSSVLG00005000459) #24	ENSSVLG00005000476 #26	ENSSVLG00005000498 #27	CNP (ENSSVLG00005000524) #28	ODAD4 (ENSSVLG00005000556) #29	ACLY (ENSSVLG00005000630) #30	KLHL11 (ENSSVLG00005000699) #31	KLHL10 (ENSSVLG00005000723) #32	NT5C3B (ENSSVLG00005000754) #33	FKBP10 (ENSSVLG00005000785) #34	P3H4 (ENSSVLG00005000841) #35	JUP (ENSSVLG00005000914) #36	ENSSVLG00005001006 #35