Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154654	ENSGT00390000014243 #7	ENSGT00940000156012 #8	ENSGT01030000234558.C #9	ENSGT00390000014781 #10	ENSGT00390000014594 #11	ENSGT00940000159391 #12	ENSGT00940000154149.b.a #13	ENSGT00940000154499 #14	ENSGT00530000063646.a #15	ENSGT00390000001254 #16	ENSGT00940000155635 #17	ENSGT00940000154614 #18	ENSGT00530000063751.a #20	ENSGT00730000111014 #21	ENSGT00390000012568 #22	ENSGT00940000156236 #23	ENSGT00390000010743.a #24	ENSGT01030000234606.b #25	ENSGT00940000156560 #27	ENSGT00730000111187.b #28	ENSGT00940000156874 #29	ENSGT00940000157082 #30	ENSGT00940000154790.a.a.b #31	ENSGT00940000155656 #32	ENSGT00940000157391 #33	ENSGT00390000012703.a #34	ENSGT01030000234625.B.c #35	ENSGT00390000018676 #37	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374
Equus	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000154654	ENSGT00390000014243 #7	ENSGT00940000156012 #8	ENSGT01030000234558.C #9	ENSGT00390000014781 #10	ENSGT00390000014594 #11	ENSGT00940000159391 #12	ENSGT00940000154149.b.a #13	ENSGT00940000154499 #14	ENSGT00530000063646.a #15	ENSGT00390000001254 #16	ENSGT00940000155635 #17	ENSGT00940000154614 #18	ENSGT00530000063751.a.h #20	ENSGT00730000111014 #21	ENSGT00390000012568 #22	ENSGT00940000156236 #23	ENSGT00390000010743.a #24	ENSGT01030000234606.b #25	ENSGT00940000156560 #27	ENSGT00730000111187.b #28	ENSGT00940000156874 #29	ENSGT00940000157082 #30	ENSGT00940000154790.a.a.b #31	ENSGT00940000155656 #32	ENSGT00940000157391 #33	ENSGT00390000012703.a #34	ENSGT01030000234625.B.c #35	ENSGT00950000183198.c.b.a.u.a #36	ENSGT00390000018676 #37	ENSGT00720000108846.a
Donkey	MODERN SPECIES	17	APOBEC4 (ENSEASG00005006513) #7	RGL1 (ENSEASG00005006506) #8	COLGALT2 (ENSEASG00005006501) #9	TSEN15 (ENSEASG00005030439) #10	ENSEASG00005006469 #11	EDEM3 (ENSEASG00005005781) #12	NIBAN1 (ENSEASG00005005707) #13	RNF2 (ENSEASG00005005698) #14	TRMT1L (ENSEASG00005005551) #15	SWT1 (ENSEASG00005005530) #16	IVNS1ABP (ENSEASG00005005527) #17	HMCN1 (ENSEASG00005027535) #18	ENSEASG00005024699 #19	ENSEASG00005005489 #20	TPR (ENSEASG00005005475) #21	ODR4 (ENSEASG00005005469) #22	PDC (ENSEASG00005005464) #23	PTGS2 (ENSEASG00005005459) #24	ENSEASG00005003470 #25	ENSEASG00005003268 #26	ENSEASG00005003260 #27	CENPF (ENSEASG00005003253) #28	PTPN14 (ENSEASG00005003087) #29	SMYD2 (ENSEASG00005002894) #30	PROX1 (ENSEASG00005030708) #31	RPS6KC1 (ENSEASG00005002866) #32	ANGEL2 (ENSEASG00005002856) #33	VASH2 (ENSEASG00005002846) #34	FLVCR1 (ENSEASG00005002836) #35	ENSEASG00005002833 #36	SPATA45 (ENSEASG00005024302) #37
Horse	MODERN SPECIES	26	COLGALT2 (ENSECAG00000017358) #9	TSEN15 (ENSECAG00000003249) #10	C5H1orf21 (ENSECAG00000018288)	ENSECAG00000053872	ENSECAG00000053638	EDEM3 (ENSECAG00000018383) #12	NIBAN1 (ENSECAG00000007385) #13	RNF2 (ENSECAG00000014782) #14	TRMT1L (ENSECAG00000020999) #15	SWT1 (ENSECAG00000012085) #16	IVNS1ABP (ENSECAG00000018870) #17	HMCN1 (ENSECAG00000007173) #18	ENSECAG00000044821 ##20	ENSECAG00000020648 #20	TPR (ENSECAG00000020724) #21	ODR4 (ENSECAG00000008289) #22	PDC (ENSECAG00000015729) #23	PTGS2 (ENSECAG00000017181) #24	PLA2G4A (ENSECAG00000024810) #25	ENSECAG00000031761	KCNK2 (ENSECAG00000023472) #27	CENPF (ENSECAG00000024127) #28	PTPN14 (ENSECAG00000007687) #29	SMYD2 (ENSECAG00000022049) #30	PROX1 (ENSECAG00000019220) #31	RPS6KC1 (ENSECAG00000021706) #32	VASH2 (ENSECAG00000015846) #34	ANGEL2 (ENSECAG00000010723) #33	FLVCR1 (ENSECAG00000017787) #35	ENSECAG00000033183 #36	SPATA45 (ENSECAG00000038528) #37
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154654	ENSGT00390000014243 #7	ENSGT00940000156012 #8	ENSGT01030000234558.C #9	ENSGT00390000014781 #10	ENSGT00390000014594 #11	ENSGT00940000159391 #12	ENSGT00940000154149.b.a #13	ENSGT00940000154499 #14	ENSGT00530000063646.a #15	ENSGT00390000001254 #16	ENSGT00940000155635 #17	ENSGT00940000154614 #18	ENSGT00530000063751.a #20	ENSGT00730000111014 #21	ENSGT00390000012568 #22	ENSGT00940000156236 #23	ENSGT00390000010743.a #24	ENSGT01030000234606.b #25	ENSGT00940000156560 #27	ENSGT00730000111187.b #28	ENSGT00940000156874 #29	ENSGT00940000157082 #30	ENSGT00940000154790.a.a.b #31	ENSGT00940000155656 #32	ENSGT00940000157391 #33	ENSGT00390000012703.a #34	ENSGT01030000234625.B.c #35	ENSGT00390000018676 #37	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154654	ENSGT00390000014243 #7	ENSGT00940000156012 #8	ENSGT01030000234558.C #9	ENSGT00390000014781 #10	ENSGT00390000014594 #11	ENSGT00940000159391 #12	ENSGT00940000154149.b.a #13	ENSGT00940000154499 #14	ENSGT00530000063646.a #15	ENSGT00390000001254 #16	ENSGT00940000155635 #17	ENSGT00940000154614 #18	ENSGT00530000063751.a #20	ENSGT00730000111014 #21	ENSGT00390000012568 #22	ENSGT00940000156236 #23	ENSGT00390000010743.a #24	ENSGT01030000234606.b #25	ENSGT00940000156560 #27	ENSGT00730000111187.b #28	ENSGT00940000156874 #29	ENSGT00940000157082 #30	ENSGT00940000154790.a.a.b #31	ENSGT00940000155656 #32	ENSGT00940000157391 #33	ENSGT00390000012703.a #34	ENSGT01030000234625.B.c #35	ENSGT00390000018676 #37	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	14	ARPC5 (ENSRFEG00010021430)	RGL1 (ENSRFEG00010021462) #8	APOBEC4 (ENSRFEG00010021521) #7	COLGALT2 (ENSRFEG00010021532) #9	ENSRFEG00010010725 #10	C1orf21 (ENSRFEG00010011116) #11	EDEM3 (ENSRFEG00010011160) #12	NIBAN1 (ENSRFEG00010011245) #13	RNF2 (ENSRFEG00010011316) #14	TRMT1L (ENSRFEG00010011478) #15	SWT1 (ENSRFEG00010011617) #16	IVNS1ABP (ENSRFEG00010011670) #17	HMCN1 (ENSRFEG00010011748) #18	PRG4 (ENSRFEG00010011855) #20	TPR (ENSRFEG00010011972) #21	ODR4 (ENSRFEG00010012882) #22	PDC (ENSRFEG00010013111) #23	PTGS2 (ENSRFEG00010013243) #24	PLA2G4A (ENSRFEG00010013298) #25	KCNK2 (ENSRFEG00010013369) #27	CENPF (ENSRFEG00010013471) #28	PTPN14 (ENSRFEG00010013663) #29	SMYD2 (ENSRFEG00010013761) #30	PROX1 (ENSRFEG00010013970) #31	RPS6KC1 (ENSRFEG00010014099) #32	ANGEL2 (ENSRFEG00010014572) #33	VASH2 (ENSRFEG00010014636) #34	FLVCR1 (ENSRFEG00010015101) #35	SPATA45 (ENSRFEG00010015162) #37	TATDN3 (ENSRFEG00010015243)	ENSRFEG00010015432
Microbat	MODERN SPECIES	1002	ARPC5 (ENSMLUG00000002452)	APOBEC4 (ENSMLUG00000002458) #7	RGL1 (ENSMLUG00000005558) #8	ENSMLUG00000005568 #9	TSEN15 (ENSMLUG00000005573) #10	C1orf21 (ENSMLUG00000013690) #11	EDEM3 (ENSMLUG00000013699) #12	NIBAN1 (ENSMLUG00000009348) #13	RNF2 (ENSMLUG00000001129) #14	TRMT1L (ENSMLUG00000001136) #15	SWT1 (ENSMLUG00000001142) #16	IVNS1ABP (ENSMLUG00000014652) #17	HMCN1 (ENSMLUG00000016911) #18	ENSMLUG00000016901 #20	TPR (ENSMLUG00000016913) #21	ODR4 (ENSMLUG00000013135) #22	PDC (ENSMLUG00000013147) #23	PTGS2 (ENSMLUG00000008204) #24	PLA2G4A (ENSMLUG00000007650) #25	KCNK2 (ENSMLUG00000007701) #27	CENPF (ENSMLUG00000017038) #28	PTPN14 (ENSMLUG00000017033) #29	SMYD2 (ENSMLUG00000017025) #30	PROX1 (ENSMLUG00000006993) #31	RPS6KC1 (ENSMLUG00000002406) #32	ANGEL2 (ENSMLUG00000002393) #33	ENSMLUG00000002386 #34	FLVCR1 (ENSMLUG00000009724) #35	SPATA45 (ENSMLUG00000009716) #37	TATDN3 (ENSMLUG00000009692)	NSL1 (ENSMLUG00000009680)
Megabat	MODERN SPECIES	103														PRG4 (ENSPVAG00000005206) #20	TPR (ENSPVAG00000005208) #21	ODR4 (ENSPVAG00000005209) #22	PDC (ENSPVAG00000005210) #23