Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B #22 Vertebrata DUPLICATION Vertebrata DUPLICATION Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 176 ENSGT00890000139436.B ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000164174 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000167703 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000166634 ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b 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ENSGT00390000015216 ENSGT00940000157480 ENSGT00950000183004.a.b.a.a Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 5877 ENSTSYG00000013307 #20 CAV2 (ENSTSYG00000008002) #21 CAV1 (ENSTSYG00000033105) #22 MET (ENSTSYG00000000920) #23 Tarsier MODERN SPECIES 3782 ENSTSYG00000029354 ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00400000023684 ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.a.e.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000164704 ENSGT01020000230614 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000157480 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00400000023684 ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.a.e.b.n.a ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000164704 ENSGT01020000230614 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00400000023684 ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 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ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212.`b ENSGT00940000164704 ENSGT01020000230614 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00400000023684 ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.a.e.b.n.a ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212.`b ENSGT00940000164704 ENSGT01020000230614 ENSGT01010000223358 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 Macaca ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000013961.b.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.a.e.b.n.a ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212.`b ENSGT00940000164704 ENSGT01020000230614 ENSGT01010000223358 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 95 FOXP2 (ENSMNEG00000034461) MDFIC (ENSMNEG00000045431) TFEC (ENSMNEG00000000097) ENSMNEG00000021473 ENSMNEG00000038687 TES (ENSMNEG00000039367) CAV2 (ENSMNEG00000042279) #21 CAV1 (ENSMNEG00000044995) #22 MET (ENSMNEG00000038573) #23 CAPZA2 (ENSMNEG00000044342) ENSMNEG00000042576 ST7 (ENSMNEG00000043047) WNT2 (ENSMNEG00000035850) ASZ1 (ENSMNEG00000042319) CFTR (ENSMNEG00000042569) CTTNBP2 (ENSMNEG00000039935) ENSMNEG00000036764 ANKRD7 (ENSMNEG00000029642) ENSMNEG00000007384 ENSMNEG00000038870 KCND2 (ENSMNEG00000001242) TSPAN12 (ENSMNEG00000034729) ING3 (ENSMNEG00000038183) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156246 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.a.e.b.n.a ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212.`b ENSGT00940000164704 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000157480 ENSGT00950000183004.a.b.a.a Rhesus MODERN SPECIES 13 ZNF277 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ENSMFAG00000065499 ENSMFAG00000057626 FOXP2 (ENSMFAG00000000636) MDFIC (ENSMFAG00000050895) TFEC (ENSMFAG00000035684) TES (ENSMFAG00000005909) ENSMFAG00000064881 CAV2 (ENSMFAG00000048330) #21 CAV1 (ENSMFAG00000046330) #22 MET (ENSMFAG00000028602) #23 CAPZA2 (ENSMFAG00000041237) ST7 (ENSMFAG00000008568) WNT2 (ENSMFAG00000044147) ASZ1 (ENSMFAG00000033937) CFTR (ENSMFAG00000000170) ENSMFAG00000053020 CTTNBP2 (ENSMFAG00000039255) ENSMFAG00000056701 LSM8 (ENSMFAG00000047892) ANKRD7 (ENSMFAG00000039109) KCND2 (ENSMFAG00000046158) TSPAN12 (ENSMFAG00000002377) ING3 (ENSMFAG00000044425) CPED1 (ENSMFAG00000031588) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154720.b.pb ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00400000023684 ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.a.e.b.n.a ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212.`b ENSGT00940000164704 ENSGT01020000230614 ENSGT01010000223358 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 Olive baboon MODERN SPECIES 14 DOCK4 (ENSPANG00000023666) ZNF277 (ENSPANG00000012693) IFRD1 (ENSPANG00000021877) LSMEM1 (ENSPANG00000032836) ENSPANG00000049042 TMEM168 (ENSPANG00000025365) BMT2 (ENSPANG00000022368) GPR85 (ENSPANG00000038655) SMIM30 (ENSPANG00000031865) PPP1R3A (ENSPANG00000017583) FOXP2 (ENSPANG00000024715) MDFIC (ENSPANG00000015175) TFEC (ENSPANG00000022367) TES (ENSPANG00000008934) CAV2 (ENSPANG00000045499) #21 CAV1 (ENSPANG00000015174) #22 MET (ENSPANG00000024383) #23 CAPZA2 (ENSPANG00000024714) ST7 (ENSPANG00000020407) WNT2 (ENSPANG00000048086) ASZ1 (ENSPANG00000016260) CFTR (ENSPANG00000015987) CTTNBP2 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MODERN SPECIES 13 LRRN3 (ENSCSAG00000019130) DOCK4 (ENSCSAG00000011152) ZNF277 (ENSCSAG00000011126) IFRD1 (ENSCSAG00000011121) ENSCSAG00000011114 TMEM168 (ENSCSAG00000011110) BMT2 (ENSCSAG00000011101) GPR85 (ENSCSAG00000019131) SMIM30 (ENSCSAG00000011096) PPP1R3A (ENSCSAG00000011088) FOXP2 (ENSCSAG00000011057) MDFIC (ENSCSAG00000010952) TFEC (ENSCSAG00000010942) TES (ENSCSAG00000010935) CAV2 (ENSCSAG00000010925) #21 CAV1 (ENSCSAG00000010920) #22 MET (ENSCSAG00000010912) #23 CAPZA2 (ENSCSAG00000010902) ST7 (ENSCSAG00000010897) ENSCSAG00000010890 WNT2 (ENSCSAG00000010887) ASZ1 (ENSCSAG00000010871) ENSCSAG00000010820 CTTNBP2 (ENSCSAG00000010811) ENSCSAG00000010802 ANKRD7 (ENSCSAG00000010796) KCND2 (ENSCSAG00000010780) TSPAN12 (ENSCSAG00000010773) ING3 (ENSCSAG00000010764) CPED1 (ENSCSAG00000010728) WNT16 (ENSCSAG00000010637) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 328 ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 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ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000161777.b ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000157480 ENSGT00950000183004.a.b.a.a Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 581 ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.a.e.b Sloth MODERN SPECIES 709 CAV1 (ENSCHOG00000006336) #22 Armadillo MODERN SPECIES 580 FAM78B (ENSDNOG00000015274) PPP1R3A (ENSDNOG00000043246) ENSDNOG00000035670 ENSDNOG00000044410 ENSDNOG00000016038 MDFIC (ENSDNOG00000046332) ENSDNOG00000033166 TFEC (ENSDNOG00000045240) TES (ENSDNOG00000040287) CAV1 (ENSDNOG00000041953) #22 MET (ENSDNOG00000039331) #23 ENSDNOG00000005771 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000160513 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.a.e.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000161777.b ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000157480 ENSGT00950000183004.a.b.a.a Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000160513 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.a.e.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a 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ENSLAFG00000032200 ENSLAFG00000005279 WNT16 (ENSLAFG00000010025) Hyrax MODERN SPECIES 652 CAV2 (ENSPCAG00000006589) #21 CAV1 (ENSPCAG00000006603) #22 Tenrec MODERN SPECIES 907 CAV2 (ENSETEG00000011934) #21 CAV1 (ENSETEG00000011937) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160513 ENSGT00940000164174 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.a.e.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000161777.a ENSGT00940000153661.b ENSGT00940000161777.b ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00510000047764 ENSGT00940000156619 ENSGT00390000015216 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160513 ENSGT00940000164174 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.a.e.b ENSGT00390000000873.a.b.c ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000153661.b.f ENSGT00940000161777.a.i.a ENSGT00940000153661.b.e.b ENSGT00940000161777.b Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156246 ENSGT00940000160513 ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000010292 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.b.a #22 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ENSGT00390000013249 ENSGT00940000159477 ENSGT00940000163382.a Common wall lizard MODERN SPECIES 1 ENSPMRG00000013235 ENSPMRG00000013233 DOCK4 (ENSPMRG00000011255) ZNF277 (ENSPMRG00000010889) IFRD1 (ENSPMRG00000010887) LSMEM1 (ENSPMRG00000010881) TMEM168 (ENSPMRG00000010878) BMT2 (ENSPMRG00000010873) GPR85 (ENSPMRG00000010870) PPP1R3A (ENSPMRG00000010867) FOXP2 (ENSPMRG00000010845) MDFIC (ENSPMRG00000010831) TFEC (ENSPMRG00000010811) TES (ENSPMRG00000010792) CAV2 (ENSPMRG00000010787) #21 CAV1 (ENSPMRG00000010783) #22 MET (ENSPMRG00000010518) #23 CAPZA2 (ENSPMRG00000010465) ST7 (ENSPMRG00000010415) ASZ1 (ENSPMRG00000010379) CFTR (ENSPMRG00000010360) CTTNBP2 (ENSPMRG00000010336) ENSPMRG00000010327 ENSPMRG00000010321 ENSPMRG00000010282 KCND2 (ENSPMRG00000010278) ENSPMRG00000010273 TSPAN12 (ENSPMRG00000010270) ING3 (ENSPMRG00000010234) CPED1 (ENSPMRG00000010212) WNT16 (ENSPMRG00000010203) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 15 ZNF277 (ENSSMRG00000012714) IFRD1 (ENSSMRG00000012713) 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painted turtle MODERN SPECIES 7 TMEM200C (ENSCPBG00000006823) EPB41L3 (ENSCPBG00000006846) ZBTB14 (ENSCPBG00000006929) AKAIN1 (ENSCPBG00000006937) DLGAP1 (ENSCPBG00000006952) TGIF1 (ENSCPBG00000006961) ENSCPBG00000006966 ENSCPBG00000006970 MYOM1 (ENSCPBG00000007000) PPP1R3A (ENSCPBG00000007087) FOXP2 (ENSCPBG00000007098) MDFIC (ENSCPBG00000007111) TFEC (ENSCPBG00000007125) TES (ENSCPBG00000007139) CAV2 (ENSCPBG00000007156) #21 CAV1 (ENSCPBG00000007159) #22 MET (ENSCPBG00000007168) #23 CAPZA2 (ENSCPBG00000007179) ST7 (ENSCPBG00000007194) WNT2 (ENSCPBG00000007227) ASZ1 (ENSCPBG00000007263) CFTR (ENSCPBG00000007379) ENSCPBG00000008123 ENSCPBG00000008135 LSM8 (ENSCPBG00000008154) ENSCPBG00000008183 ENSCPBG00000008248 ENSCPBG00000008257 KCND2 (ENSCPBG00000008266) ENSCPBG00000008270 TSPAN12 (ENSCPBG00000008296) Three-toed box turtle MODERN SPECIES 28 ENSTMTG00000019088 DOCK4 (ENSTMTG00000009569) ZNF277 (ENSTMTG00000008775) IFRD1 (ENSTMTG00000008751) LSMEM1 (ENSTMTG00000008738) TMEM168 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(ENSTGUG00000005050) ENSTGUG00000024421 WNT2 (ENSTGUG00000005016) ASZ1 (ENSTGUG00000004962) CFTR (ENSTGUG00000004828) CTTNBP2 (ENSTGUG00000004732) LSM8 (ENSTGUG00000028972) ENSTGUG00000019694 KCND2 (ENSTGUG00000004691) TSPAN12 (ENSTGUG00000004668) ING3 (ENSTGUG00000004655) CPED1 (ENSTGUG00000004646) WNT16 (ENSTGUG00000025350) Common canary MODERN SPECIES 6 CPM (ENSSCAG00000009225) MDM2 (ENSSCAG00000009237) SLC35E3 (ENSSCAG00000009248) NUP107 (ENSSCAG00000009262) RAP1B (ENSSCAG00000009270) TMEM168 (ENSSCAG00000009271) BMT2 (ENSSCAG00000009277) GPR85 (ENSSCAG00000009290) PPP1R3A (ENSSCAG00000009300) ENSSCAG00000009306 FOXP2 (ENSSCAG00000009355) MDFIC (ENSSCAG00000009429) TFEC (ENSSCAG00000009440) TES (ENSSCAG00000009450) CAV2 (ENSSCAG00000009464) #21 CAV1 (ENSSCAG00000009469) #22 MET (ENSSCAG00000009475) #23 CAPZA2 (ENSSCAG00000009492) ST7 (ENSSCAG00000009507) WNT2 (ENSSCAG00000009523) ENSSCAG00000009534 CFTR (ENSSCAG00000009670) CTTNBP2 (ENSSCAG00000010165) LSM8 (ENSSCAG00000000112) 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MODERN SPECIES 222 LSMEM1 (ENSSCUG00000004400) TMEM168 (ENSSCUG00000004395) BMT2 (ENSSCUG00000004394) GPR85 (ENSSCUG00000004392) SMIM30 (ENSSCUG00000004391) PPP1R3A (ENSSCUG00000004388) ENSSCUG00000004387 ENSSCUG00000004386 FOXP2 (ENSSCUG00000004384) ENSSCUG00000004383 MDFIC (ENSSCUG00000004382) TFEC (ENSSCUG00000004379) TES (ENSSCUG00000004376) ENSSCUG00000004375 CAV2 (ENSSCUG00000004372) #21 CAV1 (ENSSCUG00000004371) #22 MET (ENSSCUG00000004369) #23 CAPZA2 (ENSSCUG00000004368) ST7 (ENSSCUG00000004335) WNT2 (ENSSCUG00000004314) ASZ1 (ENSSCUG00000004312) ENSSCUG00000004311 CFTR (ENSSCUG00000004308) CTTNBP2 (ENSSCUG00000004304) LSM8 (ENSSCUG00000004301) ENSSCUG00000004296 Anura ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT01020000230359.B ENSGT00940000155659 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000167703 ENSGT00390000013347.a ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010382 ENSGT00890000139436.B ENSGT01040000241896 ENSGT00940000157682.B ENSGT00940000155480 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000155993 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(ENSCMIG00000010998) CADPS2 (ENSCMIG00000011225) fezf1 (ENSCMIG00000011752) Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 843 ENSGT00950000183006.A.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 Elephant shark MODERN SPECIES 1500 tmcc1b (ENSCMIG00000000535) PLXND1 (ENSCMIG00000000415) ENSCMIG00000000328 rho (ENSCMIG00000000254) IFT122 (ENSCMIG00000000237) ENSCMIG00000000225 ENSCMIG00000020095 ENSCMIG00000020094 CCDC174 (ENSCMIG00000020093) cand2 (ENSCMIG00000020092) sec13 (ENSCMIG00000020091) GRIP2 (ENSCMIG00000020090) ENSCMIG00000020089 ENSCMIG00000020088 cav4a (ENSCMIG00000020087) ##22 cav3 (ENSCMIG00000020086) ##22 oxtr (ENSCMIG00000020085) ENSCMIG00000020084 tusc2a (ENSCMIG00000020083) rassf1 (ENSCMIG00000020082) zmynd10 (ENSCMIG00000020081) sema3h (ENSCMIG00000020080) ENSCMIG00000020079 APEH (ENSCMIG00000020078) BSN (ENSCMIG00000020077) borcs6 (ENSCMIG00000020076) ENSCMIG00000020075 ENSCMIG00000020074 ENSCMIG00000020073 RBSN (ENSCMIG00000020072) mrps25 (ENSCMIG00000020071) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 580 ENSGT00950000183006.A.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000009678 ENSGT01050000244882.b.c.a ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873 ENSGT00950000183006.A.a.b ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000155616 ENSGT01010000222866 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000153973 ENSGT00940000175089 ENSGT00530000063687.b.a ENSGT00390000001016.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00960000189798 Coelacanth MODERN SPECIES 240 ENSLACG00000007350 TMEM179 (ENSLACG00000008733) KIF26A (ENSLACG00000015005) ARL8B (ENSLACG00000016025) EDEM1 (ENSLACG00000016116) GRM7 (ENSLACG00000017483) ENSLACG00000018123 LMCD1 (ENSLACG00000018161) SSUH2 (ENSLACG00000018294) ENSLACG00000018315 CAV3 (ENSLACG00000018353) ##22 OXTR (ENSLACG00000018362) RAD18 (ENSLACG00000018437) SRGAP3 (ENSLACG00000018512) THUMPD3 (ENSLACG00000018604) vhl (ENSLACG00000018618) ENSLACG00000018645 ENSLACG00000018685 exoc3l1 (ENSLACG00000018701) MATCAP1 (ENSLACG00000018735) ENSLACG00000018753 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873 ENSGT00950000183006.A.a.b ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00390000014874 ENSGT00530000063687.a ENSGT00390000001016.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00960000189798 ENSGT00930000152979 Anura DUPLICATION Anura ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00940000161454.i.a.b ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00940000163873 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.a ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 11 ENSLLEG00000029830 TRNT1 (ENSLLEG00000029877) CRBN (ENSLLEG00000030072) LRRN1 (ENSLLEG00000030088) ENSLLEG00000030102 SUMF1 (ENSLLEG00000014064) ITPR1 (ENSLLEG00000014236) ENSLLEG00000017319 BHLHE40 (ENSLLEG00000017398) ARL8B (ENSLLEG00000017797) EDEM1 (ENSLLEG00000017941) GRM7 (ENSLLEG00000018177) LMCD1 (ENSLLEG00000018847) ENSLLEG00000019021 ENSLLEG00000019153 ENSLLEG00000019332 ##22 OXTR (ENSLLEG00000019366) RAD18 (ENSLLEG00000019425) ENSLLEG00000019942 SRGAP3 (ENSLLEG00000019969) TPR (ENSLLEG00000020224) ODR4 (ENSLLEG00000021599) PDC (ENSLLEG00000021813) ENSLLEG00000021850 PTGS2 (ENSLLEG00000021891) PLA2G4A (ENSLLEG00000022334) ENSLLEG00000023172 PLPP6 (ENSLLEG00000023248) FAM78B (ENSLLEG00000023271) UCK2 (ENSLLEG00000023321) TMCO1 (ENSLLEG00000023474) Frog MODERN SPECIES 4 setmar (ENSXETG00000032592) ENSXETG00000039434 sumf1 (ENSXETG00000005149) itpr1 (ENSXETG00000005153) bhlhe40 (ENSXETG00000035212) arl8b (ENSXETG00000034571) edem1 (ENSXETG00000005217) ENSXETG00000043187 grm7 (ENSXETG00000015711) ENSXETG00000045616 lmcd1 (ENSXETG00000015748) ENSXETG00000035465 XB5956430 [provisional:ssuh2] (ENSXETG00000015781) ENSXETG00000046985 oxtr (ENSXETG00000001441) cav3.1 (ENSXETG00000046990) ##22 rad18 (ENSXETG00000033878) ENSXETG00000049418 srgap3 (ENSXETG00000001445) rpl32 (ENSXETG00000001461) thumpd3 (ENSXETG00000001447) vhl (ENSXETG00000001448) irak2 (ENSXETG00000001449) tatdn2 (ENSXETG00000034509) ENSXETG00000034417 sec13 (ENSXETG00000001453) cand2 (ENSXETG00000001455) ENSXETG00000038317 mbd4 (ENSXETG00000026622) ENSXETG00000047236 ift122 (ENSXETG00000001463) Anura ANCESTRAL SPECIES 228 ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000183006.A.a.b ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.b ##22 ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00390000016224 ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000164911 ENSGT00940000154471.a.a Leishan spiny toad MODERN SPECIES 12 ST6GALNAC4 (ENSLLEG00000028566) ENSLLEG00000028550 PHF8 (ENSLLEG00000028501) ENSLLEG00000028484 FAM120C (ENSLLEG00000028450) WNK3 (ENSLLEG00000028345) TSR2 (ENSLLEG00000028315) SRPK3 (ENSLLEG00000028215) IDH3G (ENSLLEG00000027844) SSR4 (ENSLLEG00000027741) PDZD4 (ENSLLEG00000027705) ENSLLEG00000027672 L1CAM (ENSLLEG00000026877) AVPR2 (ENSLLEG00000026789) ENSLLEG00000026754 ##22 CAV3 (ENSLLEG00000026712) ##22 ARHGAP4 (ENSLLEG00000026304) RPL35 (ENSLLEG00000026232) ENSLLEG00000026207 ENSLLEG00000026185 ENSLLEG00000026171 ENSLLEG00000026111 ENSLLEG00000025593 SCAI (ENSLLEG00000025446) RABEPK (ENSLLEG00000025333) HSPA5 (ENSLLEG00000024531) ENSLLEG00000024453 GAPVD1 (ENSLLEG00000023990) ENSLLEG00000023896 MVB12B (ENSLLEG00000023667) ENSLLEG00000023628 Frog MODERN SPECIES 8 ENSXETG00000044975 XB5817984 [provisional:opn1sw] (ENSXETG00000025579) opn1lw (ENSXETG00000014236) avpr2 (ENSXETG00000014233) ENSXETG00000044634 ENSXETG00000037697 ENSXETG00000045839 ENSXETG00000044239 ENSXETG00000044106 ENSXETG00000044823 brinp1 (ENSXETG00000036540) ENSXETG00000040192 astn2 (ENSXETG00000021737) trim32 (ENSXETG00000021730) XB5932841 [provisional:cav2] (ENSXETG00000032332) ##22 cav3.2 (ENSXETG00000021728) ##22 arhgap4 (ENSXETG00000021725) naa10 (ENSXETG00000044663) nudt16 (ENSXETG00000021723) renbp (ENSXETG00000021721) nt5dc2 (ENSXETG00000023942) bicd2l (ENSXETG00000023941) ENSXETG00000039774 myh8 (ENSXETG00000042899) ENSXETG00000044214 ENSXETG00000041980 tktl2 (ENSXETG00000026656) tnc (ENSXETG00000023938) ENSXETG00000043270 ENSXETG00000038323 tnfsf15 (ENSXETG00000042774) Amniota ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873 ENSGT00950000183006.A.a.b ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a 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ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.u.a ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.u.a ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 Goat MODERN SPECIES 14 TRNT1 (ENSCHIG00000007030) CRBN (ENSCHIG00000022897) ENSCHIG00000017211 LRRN1 (ENSCHIG00000009563) ENSCHIG00000019739 SUMF1 (ENSCHIG00000026539) ITPR1 (ENSCHIG00000018318) BHLHE40 (ENSCHIG00000014557) ARL8B (ENSCHIG00000011960) EDEM1 (ENSCHIG00000011192) ENSCHIG00000008494 ENSCHIG00000021691 GRM7 (ENSCHIG00000000474) LMCD1 (ENSCHIG00000012706) SSUH2 (ENSCHIG00000021708) CAV3 (ENSCHIG00000010009) ##22 OXTR (ENSCHIG00000007774) RAD18 (ENSCHIG00000007965) ENSCHIG00000016941 SRGAP3 (ENSCHIG00000019201) THUMPD3 (ENSCHIG00000024037) ENSCHIG00000010782 SETD5 (ENSCHIG00000025966) LHFPL4 (ENSCHIG00000018946) MTMR14 (ENSCHIG00000016043) CPNE9 (ENSCHIG00000023346) BRPF1 (ENSCHIG00000013470) OGG1 (ENSCHIG00000022673) CAMK1 (ENSCHIG00000018171) TADA3 (ENSCHIG00000012388) ARPC4 (ENSCHIG00000015714) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 10 CNTN4 (ENSOARG00020015064) TRNT1 (ENSOARG00020014826) CRBN (ENSOARG00020014355) ENSOARG00020014311 LRRN1 (ENSOARG00020014291) ENSOARG00020014205 SUMF1 (ENSOARG00020014038) ITPR1 (ENSOARG00020012519) BHLHE40 (ENSOARG00020012417) ARL8B (ENSOARG00020012288) EDEM1 (ENSOARG00020012137) ENSOARG00020012075 GRM7 (ENSOARG00020011716) LMCD1 (ENSOARG00020011551) SSUH2 (ENSOARG00020011381) CAV3 (ENSOARG00020011348) ##22 OXTR (ENSOARG00020011329) RAD18 (ENSOARG00020011184) SRGAP3 (ENSOARG00020010228) THUMPD3 (ENSOARG00020025485) SETD5 (ENSOARG00020025409) LHFPL4 (ENSOARG00020025385) MTMR14 (ENSOARG00020025368) CPNE9 (ENSOARG00020025304) BRPF1 (ENSOARG00020025261) OGG1 (ENSOARG00020025235) CAMK1 (ENSOARG00020025222) TADA3 (ENSOARG00020025208) ARPC4 (ENSOARG00020025183) ENSOARG00020025165 ENSOARG00020025145 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00960000191185 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.u.a ENSGT00940000154857 Bos ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00940000162732 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.b ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00960000191185 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.u.a ENSGT00940000154857 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00940000162732 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.b ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.u.a ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 Wild yak MODERN SPECIES 2029 CAV3 (ENSBMUG00000012109) ##22 OXTR (ENSBMUG00000012104) RAD18 (ENSBMUG00000012051) SRGAP3 (ENSBMUG00000011948) THUMPD3 (ENSBMUG00000011874) SETD5 (ENSBMUG00000011841) LHFPL4 (ENSBMUG00000011769) MTMR14 (ENSBMUG00000011737) CPNE9 (ENSBMUG00000011671) BRPF1 (ENSBMUG00000011619) OGG1 (ENSBMUG00000011527) CAMK1 (ENSBMUG00000011473) TADA3 (ENSBMUG00000011450) ENSBMUG00000011400 ENSBMUG00000011377 ENSBMUG00000011363 Domestic yak MODERN SPECIES 14 LRRN1 (ENSBGRG00000023800) ENSBGRG00000023820 ENSBGRG00000023834 ENSBGRG00000023871 ENSBGRG00000023884 SUMF1 (ENSBGRG00000023916) ITPR1 (ENSBGRG00000024500) BHLHE40 (ENSBGRG00000026121) ARL8B (ENSBGRG00000026129) EDEM1 (ENSBGRG00000026138) GRM7 (ENSBGRG00000026154) ENSBGRG00000026180 ENSBGRG00000026184 LMCD1 (ENSBGRG00000006947) SSUH2 (ENSBGRG00000007163) CAV3 (ENSBGRG00000007247) ##22 OXTR (ENSBGRG00000007298) RAD18 (ENSBGRG00000007350) SRGAP3 (ENSBGRG00000007703) ENSBGRG00000008258 THUMPD3 (ENSBGRG00000008275) SETD5 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(ENSNVIG00000015215) BRPF1 (ENSNVIG00000015086) CAMK1 (ENSNVIG00000015040) OGG1 (ENSNVIG00000014967) TADA3 (ENSNVIG00000014954) ARPC4 (ENSNVIG00000014919) ENSNVIG00000014897 ENSNVIG00000014845 Ferret MODERN SPECIES 163 ENSMPUG00000017019 ENSMPUG00000017021 SUMF1 (ENSMPUG00000017022) ENSMPUG00000017028 ITPR1 (ENSMPUG00000017024) BHLHE40 (ENSMPUG00000017029) ENSMPUG00000017030 ARL8B (ENSMPUG00000017035) EDEM1 (ENSMPUG00000017042) ENSMPUG00000017055 ENSMPUG00000020112 GRM7 (ENSMPUG00000017057) ENSMPUG00000020113 LMCD1 (ENSMPUG00000017058) SSUH2 (ENSMPUG00000017059) CAV3 (ENSMPUG00000017061) ##22 OXTR (ENSMPUG00000017062) RAD18 (ENSMPUG00000017063) SRGAP3 (ENSMPUG00000017064) ENSMPUG00000017065 ENSMPUG00000017066 SETD5 (ENSMPUG00000017067) LHFPL4 (ENSMPUG00000017068) ENSMPUG00000017069 MTMR14 (ENSMPUG00000017070) CPNE9 (ENSMPUG00000017072) BRPF1 (ENSMPUG00000017121) OGG1 (ENSMPUG00000017122) CAMK1 (ENSMPUG00000017123) TADA3 (ENSMPUG00000017125) ARPC4 (ENSMPUG00000017127) Canidae ANCESTRAL 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ARPC4 (ENSPLOG00000004614) TTLL3 (ENSPLOG00000004638) RPUSD3 (ENSPLOG00000004650) CIDEC (ENSPLOG00000004663) leopard MODERN SPECIES 114 GRM7 (ENSPPRG00000001163) LMCD1 (ENSPPRG00000002208) SSUH2 (ENSPPRG00000002754) CAV3 (ENSPPRG00000002936) ##22 OXTR (ENSPPRG00000002982) RAD18 (ENSPPRG00000004021) SRGAP3 (ENSPPRG00000007280) THUMPD3 (ENSPPRG00000008071) SETD5 (ENSPPRG00000008405) LHFPL4 (ENSPPRG00000008567) ENSPPRG00000009278 MTMR14 (ENSPPRG00000010211) CPNE9 (ENSPPRG00000013002) BRPF1 (ENSPPRG00000013919) OGG1 (ENSPPRG00000015892) CAMK1 (ENSPPRG00000018158) TADA3 (ENSPPRG00000019348) ARPC4 (ENSPPRG00000022008) ENSPPRG00000024720 Cat MODERN SPECIES 1 CNTN4 (ENSFCAG00000000649) IL5RA (ENSFCAG00000000652) TRNT1 (ENSFCAG00000026805) CRBN (ENSFCAG00000026512) LRRN1 (ENSFCAG00000029530) ENSFCAG00000037787 SUMF1 (ENSFCAG00000011512) ITPR1 (ENSFCAG00000002477) BHLHE40 (ENSFCAG00000034238) ARL8B (ENSFCAG00000000736) EDEM1 (ENSFCAG00000000737) ENSFCAG00000029757 GRM7 (ENSFCAG00000029003) LMCD1 (ENSFCAG00000014723) SSUH2 (ENSFCAG00000014724) CAV3 (ENSFCAG00000035688) ##22 OXTR (ENSFCAG00000014726) RAD18 (ENSFCAG00000025747) SRGAP3 (ENSFCAG00000008390) THUMPD3 (ENSFCAG00000006171) SETD5 (ENSFCAG00000005610) LHFPL4 (ENSFCAG00000029519) MTMR14 (ENSFCAG00000014190) CPNE9 (ENSFCAG00000018421) BRPF1 (ENSFCAG00000014191) OGG1 (ENSFCAG00000014192) CAMK1 (ENSFCAG00000014193) TADA3 (ENSFCAG00000014195) ARPC4 (ENSFCAG00000025643) ENSFCAG00000018210 RPUSD3 (ENSFCAG00000014199) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00390000018599 Equus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT01090000263390 ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 Donkey MODERN SPECIES 13 IL5RA (ENSEASG00005003564) TRNT1 (ENSEASG00005003577) CRBN (ENSEASG00005003584) LRRN1 (ENSEASG00005003592) ENSEASG00005032131 SUMF1 (ENSEASG00005003601) ITPR1 (ENSEASG00005004852) BHLHE40 (ENSEASG00005034761) ARL8B (ENSEASG00005023967) EDEM1 (ENSEASG00005013107) ENSEASG00005031999 GRM7 (ENSEASG00005013291) ENSEASG00005013295 LMCD1 (ENSEASG00005013302) SSUH2 (ENSEASG00005013304) CAV3 (ENSEASG00005033820) ##22 OXTR (ENSEASG00005013312) RAD18 (ENSEASG00005013316) SRGAP3 (ENSEASG00005013321) THUMPD3 (ENSEASG00005013327) ENSEASG00005027715 SETD5 (ENSEASG00005013335) LHFPL4 (ENSEASG00005013343) MTMR14 (ENSEASG00005013346) CPNE9 (ENSEASG00005013424) BRPF1 (ENSEASG00005014142) OGG1 (ENSEASG00005014145) CAMK1 (ENSEASG00005014147) TADA3 (ENSEASG00005014149) ARPC4 (ENSEASG00005030254) TTLL3 (ENSEASG00005014156) Horse MODERN SPECIES 7 IL5RA (ENSECAG00000022503) TRNT1 (ENSECAG00000014420) CRBN (ENSECAG00000015422) LRRN1 (ENSECAG00000002874) ENSECAG00000011514 SUMF1 (ENSECAG00000020242) ITPR1 (ENSECAG00000020933) BHLHE40 (ENSECAG00000015069) ARL8B (ENSECAG00000013084) EDEM1 (ENSECAG00000023369) ENSECAG00000056332 ENSECAG00000048581 GRM7 (ENSECAG00000016171) LMCD1 (ENSECAG00000010791) SSUH2 (ENSECAG00000039589) CAV3 (ENSECAG00000020701) ##22 OXTR (ENSECAG00000017844) ENSECAG00000056983 RAD18 (ENSECAG00000010746) SRGAP3 (ENSECAG00000010118) THUMPD3 (ENSECAG00000002016) ENSECAG00000057920 SETD5 (ENSECAG00000016843) LHFPL4 (ENSECAG00000038489) MTMR14 (ENSECAG00000020625) CPNE9 (ENSECAG00000007471) BRPF1 (ENSECAG00000021020) OGG1 (ENSECAG00000010671) CAMK1 (ENSECAG00000023628) TADA3 (ENSECAG00000018186) TTLL3 (ENSECAG00000003474) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00390000018599 Megabat MODERN SPECIES 2658 CAV3 (ENSPVAG00000012217) ##22 OXTR (ENSPVAG00000012219) RAD18 (ENSPVAG00000012220) SRGAP3 (ENSPVAG00000012222) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 8 NT5DC2 (ENSRFEG00010020356) STAB1 (ENSRFEG00010018575) NISCH (ENSRFEG00010018464) TNNC1 (ENSRFEG00010018419) SEMA3G (ENSRFEG00010018373) PHF7 (ENSRFEG00010018334) BAP1 (ENSRFEG00010017990) DNAH1 (ENSRFEG00010017179) GLYCTK (ENSRFEG00010017030) ENSRFEG00010017009 WDR82 (ENSRFEG00010016964) PPM1M (ENSRFEG00010016849) GRM7 (ENSRFEG00010016395) LMCD1 (ENSRFEG00010016208) SSUH2 (ENSRFEG00010016053) CAV3 (ENSRFEG00010016003) ##22 OXTR (ENSRFEG00010015954) RAD18 (ENSRFEG00010015794) SRGAP3 (ENSRFEG00010015658) ENSRFEG00010015601 THUMPD3 (ENSRFEG00010015565) ENSRFEG00010015554 SETD5 (ENSRFEG00010015275) LHFPL4 (ENSRFEG00010015205) ENSRFEG00010015187 MTMR14 (ENSRFEG00010014861) CPNE9 (ENSRFEG00010014762) BRPF1 (ENSRFEG00010014594) OGG1 (ENSRFEG00010014259) CAMK1 (ENSRFEG00010014169) TADA3 (ENSRFEG00010014087) Microbat MODERN SPECIES 945 ENSMLUG00000022634 ENSMLUG00000030387 ENSMLUG00000017429 LMCD1 (ENSMLUG00000016476) SSUH2 (ENSMLUG00000016480) CAV3 (ENSMLUG00000024508) ##22 OXTR (ENSMLUG00000016492) RAD18 (ENSMLUG00000016494) SRGAP3 (ENSMLUG00000010338) THUMPD3 (ENSMLUG00000008538) SETD5 (ENSMLUG00000008573) LHFPL4 (ENSMLUG00000023073) ENSMLUG00000012935 CPNE9 (ENSMLUG00000012948) BRPF1 (ENSMLUG00000012954) OGG1 (ENSMLUG00000012962) CAMK1 (ENSMLUG00000012973) TADA3 (ENSMLUG00000012978) ARPC4 (ENSMLUG00000025088) TTLL3 (ENSMLUG00000003727) RPUSD3 (ENSMLUG00000006135) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00390000018599 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00390000018599 Tree shrew MODERN SPECIES 1093 ENSTBEG00000012502 CAV3 (ENSTBEG00000012712) ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00390000018599 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b Rabbit MODERN SPECIES 436 CRBN (ENSOCUG00000025795) LRRN1 (ENSOCUG00000023697) ENSOCUG00000036915 ENSOCUG00000036153 ENSOCUG00000026652 SUMF1 (ENSOCUG00000012348) ITPR1 (ENSOCUG00000012148) ENSOCUG00000015177 ENSOCUG00000014090 EDEM1 (ENSOCUG00000014098) ENSOCUG00000039475 GRM7 (ENSOCUG00000017426) ENSOCUG00000024911 LMCD1 (ENSOCUG00000010136) SSUH2 (ENSOCUG00000014613) CAV3 (ENSOCUG00000005950) ##22 RAD18 (ENSOCUG00000000013) Pika MODERN SPECIES 2978 LMCD1 (ENSOPRG00000003445) SSUH2 (ENSOPRG00000003461) CAV3 (ENSOPRG00000003492) ##22 OXTR (ENSOPRG00000003503) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 Kangaroo rat MODERN SPECIES 331 Cntn6 (ENSDORG00000005702) Cntn4 (ENSDORG00000014028) Il5ra (ENSDORG00000014033) Trnt1 (ENSDORG00000014035) Crbn (ENSDORG00000014038) Lrrn1 (ENSDORG00000023814) Setmar (ENSDORG00000026212) Sumf1 (ENSDORG00000006695) Itpr1 (ENSDORG00000005966) Bhlhe40 (ENSDORG00000028127) Arl8b (ENSDORG00000023904) Edem1 (ENSDORG00000002004) Grm7 (ENSDORG00000007450) Lmcd1 (ENSDORG00000003932) Ssu2 (ENSDORG00000009888) Cav3 (ENSDORG00000023359) ##22 Oxtr (ENSDORG00000007711) ENSDORG00000029722 Rad18 (ENSDORG00000001099) ENSDORG00000001101 Thumpd3 (ENSDORG00000003257) Setd5 (ENSDORG00000003260) Lhfpl4 (ENSDORG00000009115) Mtmr14 (ENSDORG00000011006) Cpne9 (ENSDORG00000011008) Brpf1 (ENSDORG00000011011) Ogg1 (ENSDORG00000011013) Camk1 (ENSDORG00000011016) ENSDORG00000024872 ENSDORG00000011019 Arpc4 (ENSDORG00000030103) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 45 ENSJJAG00000004639 Lrrn1 (ENSJJAG00000021670) Setmar (ENSJJAG00000024359) Sumf1 (ENSJJAG00000014950) Itpr1 (ENSJJAG00000021325) ENSJJAG00000015303 ENSJJAG00000022672 Arl8b (ENSJJAG00000017608) Edem1 (ENSJJAG00000007371) ENSJJAG00000015222 ENSJJAG00000017538 Grm7 (ENSJJAG00000023200) ENSJJAG00000016367 Lmcd1 (ENSJJAG00000016825) Ssu2 (ENSJJAG00000023516) Cav3 (ENSJJAG00000024313) ##22 Oxtr (ENSJJAG00000016459) ENSJJAG00000021410 Rad18 (ENSJJAG00000001484) ENSJJAG00000000240 Srgap3 (ENSJJAG00000011741) ENSJJAG00000022541 ENSJJAG00000014704 Thumpd3 (ENSJJAG00000017751) Setd5 (ENSJJAG00000014155) Lhfpl4 (ENSJJAG00000020034) Mtmr14 (ENSJJAG00000014129) Cpne9 (ENSJJAG00000021054) Brpf1 (ENSJJAG00000022779) Ogg1 (ENSJJAG00000002128) Camk1 (ENSJJAG00000024094) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00960000189964 ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00960000189964 ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 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Camk1 (ENSMOCG00000013180) ENSMOCG00000017039 ENSMOCG00000021227 Arpc4 (ENSMOCG00000020537) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 16 Cntn4 (ENSPEMG00000020085) Il5ra (ENSPEMG00000000193) Trnt1 (ENSPEMG00000019845) Crbn (ENSPEMG00000020177) Lrrn1 (ENSPEMG00000019903) Setmar (ENSPEMG00000023423) Sumf1 (ENSPEMG00000012549) Itpr1 (ENSPEMG00000018533) ENSPEMG00000025770 Bhlhe40 (ENSPEMG00000028508) Arl8b (ENSPEMG00000029131) Edem1 (ENSPEMG00000005304) Grm7 (ENSPEMG00000029693) Lmcd1 (ENSPEMG00000013048) Ssu2 (ENSPEMG00000022560) Cav3 (ENSPEMG00000029098) ##22 Oxtr (ENSPEMG00000027376) Rad18 (ENSPEMG00000022129) Srgap3 (ENSPEMG00000022268) Thumpd3 (ENSPEMG00000022411) Setd5 (ENSPEMG00000022422) Lhfpl4 (ENSPEMG00000009516) Mtmr14 (ENSPEMG00000007108) Cpne9 (ENSPEMG00000000816) Brpf1 (ENSPEMG00000015200) Ogg1 (ENSPEMG00000017476) Camk1 (ENSPEMG00000009642) Tada3 (ENSPEMG00000009947) Arpc4 (ENSPEMG00000000402) Ttll3 (ENSPEMG00000010000) Rpusd3 (ENSPEMG00000017245) Murinae ANCESTRAL 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ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 15 Cntn6 (MGP_CAROLIEiJ_G0028695) Cntn4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028696) Il5ra (MGP_CAROLIEiJ_G0028697) Trnt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028698) Crbn (MGP_CAROLIEiJ_G0028699) Lrrn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028700) Setmar (MGP_CAROLIEiJ_G0028701) Sumf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028702) Itpr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028703) Bhlhe40 (MGP_CAROLIEiJ_G0028704) Arl8b (MGP_CAROLIEiJ_G0028705) Edem1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028706) Grm7 (MGP_CAROLIEiJ_G0028707) Lmcd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028708) Ssu2 (MGP_CAROLIEiJ_G0028709) Cav3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028710) ##22 Oxtr (MGP_CAROLIEiJ_G0028711) Rad18 (MGP_CAROLIEiJ_G0028712) Srgap3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028713) MGP_CAROLIEiJ_G0028714 Setd5 (MGP_CAROLIEiJ_G0028715) Lhfpl4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028716) Mtmr14 (MGP_CAROLIEiJ_G0028717) Cpne9 (MGP_CAROLIEiJ_G0028718) Brpf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028719) Ogg1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028720) Camk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028721) Tada3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028722) Arpc4 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(ENSSVLG00005025604) ##22 OXTR (ENSSVLG00005025596) RAD18 (ENSSVLG00005025578) SRGAP3 (ENSSVLG00005025521) THUMPD3 (ENSSVLG00005025481) SETD5 (ENSSVLG00005025433) LHFPL4 (ENSSVLG00005025392) MTMR14 (ENSSVLG00005025326) CPNE9 (ENSSVLG00005025235) BRPF1 (ENSSVLG00005025105) OGG1 (ENSSVLG00005025032) CAMK1 (ENSSVLG00005024976) TADA3 (ENSSVLG00005024948) ENSSVLG00005024910 ENSSVLG00005024852 RPUSD3 (ENSSVLG00005024754) Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 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ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059.c Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233.o ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059.c Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 62 ENSSBOG00000025385 CNTN4 (ENSSBOG00000025686) IL5RA (ENSSBOG00000020431) TRNT1 (ENSSBOG00000021208) CRBN (ENSSBOG00000024658) LRRN1 (ENSSBOG00000018919) SETMAR (ENSSBOG00000023556) SUMF1 (ENSSBOG00000031100) 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ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00910000148533 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 546 IL5RA (ENSMNEG00000043242) TRNT1 (ENSMNEG00000037805) CRBN (ENSMNEG00000044270) LRRN1 (ENSMNEG00000021728) ENSMNEG00000013018 SETMAR (ENSMNEG00000045183) SUMF1 (ENSMNEG00000003566) ITPR1 (ENSMNEG00000034253) BHLHE40 (ENSMNEG00000038264) ARL8B (ENSMNEG00000029717) EDEM1 (ENSMNEG00000034041) ENSMNEG00000021998 GRM7 (ENSMNEG00000031784) LMCD1 (ENSMNEG00000039664) SSUH2 (ENSMNEG00000032764) CAV3 (ENSMNEG00000045110) ##22 OXTR (ENSMNEG00000037475) ENSMNEG00000027815 RAD18 (ENSMNEG00000013464) SRGAP3 (ENSMNEG00000028942) ENSMNEG00000032308 THUMPD3 (ENSMNEG00000030529) SETD5 (ENSMNEG00000045236) ENSMNEG00000026054 LHFPL4 (ENSMNEG00000032394) MTMR14 (ENSMNEG00000036145) CPNE9 (ENSMNEG00000032338) BRPF1 (ENSMNEG00000028158) OGG1 (ENSMNEG00000037925) CAMK1 (ENSMNEG00000036021) TADA3 (ENSMNEG00000034551) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00440000033232.c.f ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861.c ENSGT00940000157717 ENSGT01100000263493.a.a.a.b.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT01030000236289.b ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00910000148533 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 Rhesus MODERN SPECIES 11 CRBN (ENSMMUG00000017986) LRRN1 (ENSMMUG00000049373) SETMAR 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ENSMFAG00000063438 ENSMFAG00000047622 ENSMFAG00000029998 GRM7 (ENSMFAG00000027785) LMCD1 (ENSMFAG00000033976) SSUH2 (ENSMFAG00000035455) CAV3 (ENSMFAG00000037376) ##22 OXTR (ENSMFAG00000037530) ENSMFAG00000030087 RAD18 (ENSMFAG00000028864) ENSMFAG00000033455 THUMPD3 (ENSMFAG00000044884) LHFPL4 (ENSMFAG00000033316) MTMR14 (ENSMFAG00000038577) CPNE9 (ENSMFAG00000035676) BRPF1 (ENSMFAG00000045669) OGG1 (ENSMFAG00000041077) CAMK1 (ENSMFAG00000040953) TADA3 (ENSMFAG00000044750) ARPC4 (ENSMFAG00000038887) TTLL3 (ENSMFAG00000033928) RPUSD3 (ENSMFAG00000032407) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 439 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1474 GRM7 (ENSRROG00000033250) ENSRROG00000028079 LMCD1 (ENSRROG00000020720) SSUH2 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ENSGT00940000161059 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00940000161059 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 78 LMCD1 (ENSPCOG00000024274) SSUH2 (ENSPCOG00000027173) CAV3 (ENSPCOG00000012825) ##22 OXTR (ENSPCOG00000028395) ENSPCOG00000015559 ENSPCOG00000028101 SRGAP3 (ENSPCOG00000015774) ENSPCOG00000018095 ENSPCOG00000018666 SETD5 (ENSPCOG00000026651) LHFPL4 (ENSPCOG00000009071) ENSPCOG00000020447 MTMR14 (ENSPCOG00000024971) CPNE9 (ENSPCOG00000027624) BRPF1 (ENSPCOG00000014975) OGG1 (ENSPCOG00000026933) CAMK1 (ENSPCOG00000007081) TADA3 (ENSPCOG00000008818) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 470 ENSPSMG00000000321 LMCD1 (ENSPSMG00000000365) SSUH2 (ENSPSMG00000000378) CAV3 (ENSPSMG00000000392) ##22 OXTR (ENSPSMG00000000411) RAD18 (ENSPSMG00000000455) SRGAP3 (ENSPSMG00000000659) ENSPSMG00000000979 Mouse lemur MODERN SPECIES 18 ENSMICG00000028441 SIMC1 (ENSMICG00000015305) ENSMICG00000036088 KIAA1191 (ENSMICG00000037293) ENSMICG00000004020 ENSMICG00000046823 CLTB (ENSMICG00000004024) FAF2 (ENSMICG00000009955) RNF44 (ENSMICG00000009971) CDHR2 (ENSMICG00000027886) SNCB (ENSMICG00000013390) EIF4E1B (ENSMICG00000047427) TSPAN17 (ENSMICG00000026948) GC (ENSMICG00000041732) LMCD1 (ENSMICG00000000396) CAV3 (ENSMICG00000035303) ##22 OXTR (ENSMICG00000038137) RAD18 (ENSMICG00000013536) SRGAP3 (ENSMICG00000013547) THUMPD3 (ENSMICG00000010095) SETD5 (ENSMICG00000010105) LHFPL4 (ENSMICG00000046941) MTMR14 (ENSMICG00000015187) CPNE9 (ENSMICG00000015210) BRPF1 (ENSMICG00000015227) OGG1 (ENSMICG00000015259) CAMK1 (ENSMICG00000044800) TADA3 (ENSMICG00000012205) ARPC4 (ENSMICG00000046050) TTLL3 (ENSMICG00000035256) RPUSD3 (ENSMICG00000002315) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00390000018599 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00390000018599 Tenrec MODERN SPECIES 7315 CAV3 (ENSETEG00000000511) ##22 OXTR (ENSETEG00000000514) Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 ENSGT00640000091554 ENSGT00940000156378.b ENSGT00390000008947 ENSGT00390000016233 ENSGT00940000154857 ENSGT00390000018599 Elephant MODERN SPECIES 49 CNTN6 (ENSLAFG00000008927) CNTN4 (ENSLAFG00000011631) IL5RA (ENSLAFG00000011644) TRNT1 (ENSLAFG00000023191) CRBN (ENSLAFG00000017627) LRRN1 (ENSLAFG00000010287) ENSLAFG00000026765 SUMF1 (ENSLAFG00000010276) ITPR1 (ENSLAFG00000002957) BHLHE40 (ENSLAFG00000004896) ARL8B (ENSLAFG00000007764) EDEM1 (ENSLAFG00000007772) GRM7 (ENSLAFG00000002333) LMCD1 (ENSLAFG00000015653) SSUH2 (ENSLAFG00000010680) CAV3 (ENSLAFG00000030253) ##22 OXTR (ENSLAFG00000005307) RAD18 (ENSLAFG00000004667) SRGAP3 (ENSLAFG00000005453) THUMPD3 (ENSLAFG00000005103) SETD5 (ENSLAFG00000008849) LHFPL4 (ENSLAFG00000008855) MTMR14 (ENSLAFG00000010144) ENSLAFG00000029305 BRPF1 (ENSLAFG00000016431) OGG1 (ENSLAFG00000016438) CAMK1 (ENSLAFG00000016446) TADA3 (ENSLAFG00000017494) ARPC4 (ENSLAFG00000025912) TTLL3 (ENSLAFG00000020693) RPUSD3 (ENSLAFG00000017501) Hyrax MODERN SPECIES 6155 CAV3 (ENSPCAG00000010618) ##22 OXTR (ENSPCAG00000010647) Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1139 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b Armadillo MODERN SPECIES 1373 ENSDNOG00000045152 GRM7 (ENSDNOG00000015428) ENSDNOG00000046600 LMCD1 (ENSDNOG00000000622) SSUH2 (ENSDNOG00000000625) CAV3 (ENSDNOG00000031489) ##22 OXTR (ENSDNOG00000033285) Sloth MODERN SPECIES 6581 CAV3 (ENSCHOG00000003842) ##22 OXTR (ENSCHOG00000003846) Platypus MODERN SPECIES 84 TRNT1 (ENSOANG00000007514) CRBN (ENSOANG00000007513) LRRN1 (ENSOANG00000010239) ENSOANG00000003769 SUMF1 (ENSOANG00000019838) ITPR1 (ENSOANG00000003765) BHLHE40 (ENSOANG00000038785) ARL8B (ENSOANG00000051209) EDEM1 (ENSOANG00000003763) ENSOANG00000012380 ENSOANG00000002636 ENSOANG00000013668 ENSOANG00000041232 LMCD1 (ENSOANG00000041669) SSUH2 (ENSOANG00000011551) CAV3 (ENSOANG00000044650) ##22 OXTR (ENSOANG00000007720) ENSOANG00000046474 SRGAP3 (ENSOANG00000014483) THUMPD3 (ENSOANG00000014481) SETD5 (ENSOANG00000015208) LHFPL4 (ENSOANG00000036882) MTMR14 (ENSOANG00000015207) CPNE9 (ENSOANG00000041727) BRPF1 (ENSOANG00000012087) OGG1 (ENSOANG00000045738) CAMK1 (ENSOANG00000012085) TADA3 (ENSOANG00000012084) ARPC4 (ENSOANG00000012083) ENSOANG00000012082 ENSOANG00000012081 Sauria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445 ENSGT00940000161880 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000183006.A.a.b ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 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ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000003964.b ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 ENSGT00530000063687.a ENSGT00390000001016.b Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT01030000238841 ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 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ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 ENSGT00530000063687.a ENSGT00390000001016.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000160900 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874 ENSGT00530000063687.a ENSGT00390000001016.b 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ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 ENSGT00390000014874.d ENSGT00530000063687.a ENSGT00390000001016.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000160900 ENSGT01020000230394.e.b.a Golden eagle MODERN SPECIES 12 ENSACCG00020009645 IL5RA (ENSACCG00020009685) TRNT1 (ENSACCG00020009728) CRBN (ENSACCG00020009742) ENSACCG00020009755 LRRN1 (ENSACCG00020009768) ENSACCG00020009779 SUMF1 (ENSACCG00020009793) ITPR1 (ENSACCG00020009868) BHLHE40 (ENSACCG00020009955) ARL8B (ENSACCG00020009966) EDEM1 (ENSACCG00020009983) GRM7 (ENSACCG00020010003) LMCD1 (ENSACCG00020010014) SSUH2 (ENSACCG00020010024) CAV3 (ENSACCG00020010035) ##22 OXTR (ENSACCG00020010045) RAD18 (ENSACCG00020010080) SRGAP3 (ENSACCG00020010374) THUMPD3 (ENSACCG00020010551) ENSACCG00020010562 IRAK2 (ENSACCG00020010579) SEC13 (ENSACCG00020010591) CAND2 (ENSACCG00020010611) ENSACCG00020010634 ENSACCG00020010648 MBD4 (ENSACCG00020010658) IFT122 (ENSACCG00020010690) RHO (ENSACCG00020010735) ENSACCG00020010746 PLXND1 (ENSACCG00020010906) Kakapo MODERN SPECIES 3 CNTN6 (ENSSHBG00005021239) CNTN4 (ENSSHBG00005021238) IL5RA (ENSSHBG00005021237) TRNT1 (ENSSHBG00005021236) CRBN (ENSSHBG00005021235) LRRN1 (ENSSHBG00005021234) ENSSHBG00005021232 SUMF1 (ENSSHBG00005021231) ITPR1 (ENSSHBG00005021182) BHLHE40 (ENSSHBG00005021165) ARL8B (ENSSHBG00005021164) EDEM1 (ENSSHBG00005021161) GRM7 (ENSSHBG00005021159) LMCD1 (ENSSHBG00005021158) SSUH2 (ENSSHBG00005021156) CAV3 (ENSSHBG00005021155) ##22 OXTR (ENSSHBG00005021154) RAD18 (ENSSHBG00005021151) SRGAP3 (ENSSHBG00005021150) THUMPD3 (ENSSHBG00005021147) ENSSHBG00005021145 IRAK2 (ENSSHBG00005021143) ENSSHBG00005021139 ABHD6 (ENSSHBG00005021137) DNASE1L3 (ENSSHBG00005021136) FLNB (ENSSHBG00005021128) SLMAP (ENSSHBG00005021121) DENND6A (ENSSHBG00005021116) ARF4 (ENSSHBG00005021114) PDE12 (ENSSHBG00005021113) DNAH12 (ENSSHBG00005021015) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a ENSGT00390000001016.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000160900 ENSGT01020000230394.e.b.a ENSGT00940000155189 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a ENSGT00390000001016.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000160900 ENSGT01020000230394.e.b.a ENSGT00940000155189 Flycatcher MODERN SPECIES 3 IL5RA (ENSFALG00000013534) TRNT1 (ENSFALG00000013539) CRBN (ENSFALG00000013540) LRRN1 (ENSFALG00000014525) ENSFALG00000023036 SUMF1 (ENSFALG00000013555) ITPR1 (ENSFALG00000013566) ENSFALG00000023539 ENSFALG00000027473 ARL8B (ENSFALG00000013578) EDEM1 (ENSFALG00000013588) ENSFALG00000024020 GRM7 (ENSFALG00000013602) ENSFALG00000025075 LMCD1 (ENSFALG00000013612) CAV3 (ENSFALG00000024966) ##22 OXTR (ENSFALG00000013622) RAD18 (ENSFALG00000013625) SRGAP3 (ENSFALG00000013628) ENSFALG00000023660 ENSFALG00000026425 THUMPD3 (ENSFALG00000013631) ENSFALG00000013639 ENSFALG00000013647 ENSFALG00000013653 ENSFALG00000013662 MBD4 (ENSFALG00000013663) IFT122 (ENSFALG00000013670) RHO (ENSFALG00000013673) ENSFALG00000013675 PLXND1 (ENSFALG00000013678) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C.l ENSGT00940000155198.C.k ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b 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##22 OXTR (ENSSCAG00000015355) RAD18 (ENSSCAG00000015359) SRGAP3 (ENSSCAG00000015492) THUMPD3 (ENSSCAG00000015878) ENSSCAG00000015885 IRAK2 (ENSSCAG00000015888) SEC13 (ENSSCAG00000015892) CAND2 (ENSSCAG00000015898) ENSSCAG00000015908 MBD4 (ENSSCAG00000015913) IFT122 (ENSSCAG00000016026) RHO (ENSSCAG00000016206) ENSSCAG00000016208 PLXND1 (ENSSCAG00000016217) TMCC1 (ENSSCAG00000016238) Zebra finch MODERN SPECIES 3 CHL1 (ENSTGUG00000009997) CNTN6 (ENSTGUG00000010053) CNTN4 (ENSTGUG00000010102) IL5RA (ENSTGUG00000010171) TRNT1 (ENSTGUG00000010192) CRBN (ENSTGUG00000010200) LRRN1 (ENSTGUG00000010215) ENSTGUG00000019447 SUMF1 (ENSTGUG00000010221) ITPR1 (ENSTGUG00000010241) BHLHE40 (ENSTGUG00000010301) ARL8B (ENSTGUG00000022959) EDEM1 (ENSTGUG00000010316) GRM7 (ENSTGUG00000010358) LMCD1 (ENSTGUG00000010388) CAV3 (ENSTGUG00000010401) ##22 OXTR (ENSTGUG00000020441) RAD18 (ENSTGUG00000010405) SRGAP3 (ENSTGUG00000010415) THUMPD3 (ENSTGUG00000010440) ENSTGUG00000024732 IRAK2 (ENSTGUG00000010449) 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##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a ENSGT00390000001016.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000160900 ENSGT01020000230394.e.b.a Pink-footed goose MODERN SPECIES 49 CNTN6 (ENSABRG00000015653) CNTN4 (ENSABRG00000014569) IL5RA (ENSABRG00000014471) TRNT1 (ENSABRG00000014416) CRBN (ENSABRG00000014371) LRRN1 (ENSABRG00000014369) ENSABRG00000014367 SUMF1 (ENSABRG00000014365) ITPR1 (ENSABRG00000010195) BHLHE40 (ENSABRG00000009713) ARL8B (ENSABRG00000009711) EDEM1 (ENSABRG00000009573) GRM7 (ENSABRG00000009502) LMCD1 (ENSABRG00000009469) SSUH2 (ENSABRG00000009453) CAV3 (ENSABRG00000009447) ##22 OXTR (ENSABRG00000009437) RAD18 (ENSABRG00000009421) SRGAP3 (ENSABRG00000009392) THUMPD3 (ENSABRG00000009373) ENSABRG00000009365 IRAK2 (ENSABRG00000009344) GHRL (ENSABRG00000009307) SEC13 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(ENSAPLG00000005859) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C ENSGT00940000160890 ENSGT00390000009678 ENSGT00390000016404 ENSGT00940000157154.d ENSGT00940000162663 ENSGT00390000008983.a ENSGT00940000155071.E ENSGT00940000158384 ENSGT00940000154861 ENSGT00940000157717 ENSGT01030000234648.a.a.d ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.e ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 ENSGT00530000063687.a ENSGT00390000001016.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000160900 ENSGT01020000230394.e.b.a Japanese quail MODERN SPECIES 3 CNTN4 (ENSCJPG00005018679) IL5RA (ENSCJPG00005018680) TRNT1 (ENSCJPG00005018681) CRBN (ENSCJPG00005018682) LRRN1 (ENSCJPG00005018683) ENSCJPG00005018684 SUMF1 (ENSCJPG00005018685) ITPR1 (ENSCJPG00005018726) 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ENSGT00940000158489.a.b ENSGT00940000154857.yb.b ENSGT00940000158931 ENSGT01000000215056 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p Otophysi ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158931 ENSGT01000000215056 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.b.f ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00390000014125 ENSGT00940000157392.o.a ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00530000063965.w ENSGT00390000010674.a ENSGT00390000006521 ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158931 ENSGT01000000215056 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.b.f ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00390000014125 ENSGT00940000157392.o.a ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00530000063965.w ENSGT00390000010674.a ENSGT00390000006521 ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158931 ENSGT01000000215056 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.b.f ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00390000014125 ENSGT00940000157392.o.a ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00530000063965.w ENSGT00390000010674.a ENSGT00390000006521 ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158931 ENSGT01000000215056 ENSGT00390000018596.A.a.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.b.f ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00390000014125 ENSGT00940000157392.o.a ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00530000063965.w ENSGT00390000010674.a ENSGT00390000006521 ENSGT00590000083094.a.a.c.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d ENSGT00940000166826 ENSGT00940000163827.a.b ENSGT00940000158726 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 204 uqcrc1 (ENSPNAG00000015283) ENSPNAG00000015296 cidec (ENSPNAG00000015305) ENSPNAG00000004908 ip6k2a (ENSPNAG00000015370) SEC61A1 (ENSPNAG00000015442) emc3 (ENSPNAG00000015485) ENSPNAG00000015584 gpx1b (ENSPNAG00000015648) fancd2 (ENSPNAG00000015905) tex264a (ENSPNAG00000015924) GRM2 (ENSPNAG00000015964) parp3 (ENSPNAG00000015983) ENSPNAG00000015991 ENSPNAG00000016030 ##22 cav3 (ENSPNAG00000016047) ##22 oxtra (ENSPNAG00000016063) rad18 (ENSPNAG00000016082) SRGAP3 (ENSPNAG00000016170) hemk1 (ENSPNAG00000016216) cish (ENSPNAG00000016230) twf2a (ENSPNAG00000016250) wdr82 (ENSPNAG00000016298) ENSPNAG00000016327 cplane2 (ENSPNAG00000016332) ENSPNAG00000003421 synprb (ENSPNAG00000016547) ENSPNAG00000016591 slc6a22.2 (ENSPNAG00000016597) Mexicana tetra MODERN SPECIES 4 ENSAMXG00000015577 uqcrc1 (ENSAMXG00000015553) ENSAMXG00000033066 cidec (ENSAMXG00000033496) ENSAMXG00000043680 ip6k2a (ENSAMXG00000038271) SEC61A1 (ENSAMXG00000015471) emc3 (ENSAMXG00000030172) ENSAMXG00000015361 gpx1b (ENSAMXG00000032878) fancd2 (ENSAMXG00000015244) tex264a (ENSAMXG00000015230) GRM2 (ENSAMXG00000015216) parp3 (ENSAMXG00000015192) ENSAMXG00000035563 ##22 cav3 (ENSAMXG00000015170) ##22 oxtra (ENSAMXG00000030671) rad18 (ENSAMXG00000002534) SRGAP3 (ENSAMXG00000002500) hemk1 (ENSAMXG00000002479) cish (ENSAMXG00000039928) twf2a (ENSAMXG00000039033) wdr82 (ENSAMXG00000002459) ENSAMXG00000034577 cplane2 (ENSAMXG00000029647) ENSAMXG00000002420 synprb (ENSAMXG00000034853) slc6a22.2 (ENSAMXG00000002364) ENSAMXG00000040849 slc6a22.1 (ENSAMXG00000002330) fkbp5 (ENSAMXG00000032850) Electric eel MODERN SPECIES 24 uqcrc1 (ENSEEEG00000024345) ENSEEEG00000024406 cidec (ENSEEEG00000024407) ENSEEEG00000024408 ip6k2a (ENSEEEG00000024410) SEC61A1 (ENSEEEG00000024411) emc3 (ENSEEEG00000024412) ENSEEEG00000024426 gpx1b (ENSEEEG00000024445) fancd2 (ENSEEEG00000024447) tex264a (ENSEEEG00000024449) GRM2 (ENSEEEG00000024450) parp3 (ENSEEEG00000024451) ENSEEEG00000024453 ENSEEEG00000024455 ##22 cav3 (ENSEEEG00000024456) ##22 oxtra (ENSEEEG00000024457) rad18 (ENSEEEG00000024458) SRGAP3 (ENSEEEG00000024459) ENSEEEG00000024461 lin7a (ENSEEEG00000024462) ACSS3 (ENSEEEG00000024463) ppfia2 (ENSEEEG00000024464) llph (ENSEEEG00000024465) hcls1 (ENSEEEG00000024466) ENSEEEG00000024467 guca1a (ENSEEEG00000024468) orc5 (ENSEEEG00000024470) lhfpl3 (ENSEEEG00000024474) ENSEEEG00000024476 ndufb2 (ENSEEEG00000024480) Channel catfish MODERN SPECIES 2 Uqcrc1 (ENSIPUG00000019292) ENSIPUG00000019267 Cidec (ENSIPUG00000019254) ENSIPUG00000019245 ENSIPUG00000019236 ip6k2a (ENSIPUG00000019219) SEC61A1 (ENSIPUG00000019165) emc3 (ENSIPUG00000019110) usp4 (ENSIPUG00000019043) gpx1b (ENSIPUG00000019026) fancd2 (ENSIPUG00000018838) TEX264 (ENSIPUG00000018818) grm2 (ENSIPUG00000018803) parp3 (ENSIPUG00000018781) ENSIPUG00000018775 cav3 (ENSIPUG00000018767) ##22 oxtr (ENSIPUG00000018759) rad18 (ENSIPUG00000018681) srgap3 (ENSIPUG00000018609) HEMK1 (ENSIPUG00000018583) cish (ENSIPUG00000018578) twf2 (ENSIPUG00000018553) wdr82 (ENSIPUG00000018524) ENSIPUG00000018522 rsg1 (ENSIPUG00000018519) ENSIPUG00000018033 synprb (ENSIPUG00000017989) slc6a22.2 (ENSIPUG00000017959) slc6a22.1 (ENSIPUG00000017897) slc6a22.1 (ENSIPUG00000017859) fkbp5 (ENSIPUG00000017816) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01080000257376.a.b.b.h.i.a.a ENSGT00940000166798 ENSGT00940000156468.e ENSGT00940000157842.a ENSGT00940000156310.p ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c 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ENSGT00940000166826.u ENSGT00940000163827.a.b.f ENSGT00940000158726.m ENSGT00910000144115.a.hc.a.a Goldfish MODERN SPECIES 46 gnat1 (ENSCARG00000030118) sema3fa (ENSCARG00000029420) ENSCARG00000029342 CAMKV (ENSCARG00000029318) ENSCARG00000029277 ip6k2a (ENSCARG00000029268) sec61a1l (ENSCARG00000029021) emc3 (ENSCARG00000028979) ENSCARG00000021323 gpx1b (ENSCARG00000021187) gpx1b (ENSCARG00000021179) fancd2 (ENSCARG00000021069) GRM2 (ENSCARG00000021020) parp3 (ENSCARG00000021008) ENSCARG00000021005 cav3 (ENSCARG00000020991) ##22 oxtra (ENSCARG00000020971) rad18 (ENSCARG00000020948) SRGAP3 (ENSCARG00000020449) hemk1 (ENSCARG00000020408) cish (ENSCARG00000020401) wdr82 (ENSCARG00000020355) cplane2 (ENSCARG00000020291) ENSCARG00000009710 synprb (ENSCARG00000009353) opn1mw4 (ENSCARG00000009348) slc6a22.2 (ENSCARG00000009332) slc6a22.1 (ENSCARG00000009300) fkbp5 (ENSCARG00000009260) SRSF3 (ENSCARG00000009242) ENSCARG00000009227 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 273 ENSGT01030000234595.B.c.a.c.b ENSGT00940000158855.a ENSGT00950000182998.C.b.a.b ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.k ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000011230.j ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.c ENSGT00390000014125.a ENSGT00940000157392.o.a.b ENSGT00530000063965.w.a ENSGT01060000253611 ENSGT00390000006521.g ENSGT00590000083094.a.a.c.b.a ENSGT01030000234637.b.d.a.b.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.b ENSGT00940000166826.u ENSGT00940000163827.a.b.f ENSGT00940000158726.m Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 59 gnat1 (ENSSGRG00000037816) sema3fa (ENSSGRG00000037815) ENSSGRG00000037813 CAMKV (ENSSGRG00000037719) ENSSGRG00000037714 ip6k2a (ENSSGRG00000037712) sec61a1l (ENSSGRG00000037259) emc3 (ENSSGRG00000037199) ENSSGRG00000036720 fancd2 (ENSSGRG00000036487) tex264a (ENSSGRG00000036486) GRM2 (ENSSGRG00000036485) parp3 (ENSSGRG00000036459) ENSSGRG00000036457 ENSSGRG00000036454 ##22 cav3 (ENSSGRG00000036452) ##22 oxtra (ENSSGRG00000036447) rad18 (ENSSGRG00000036442) SRGAP3 (ENSSGRG00000033898) hemk1 (ENSSGRG00000033847) cish (ENSSGRG00000033845) wdr82 (ENSSGRG00000033627) ENSSGRG00000033625 cplane2 (ENSSGRG00000033624) ENSSGRG00000030770 synprb (ENSSGRG00000030685) opn1mw4 (ENSSGRG00000030682) opn1mw3 (ENSSGRG00000030661) slc6a22.2 (ENSSGRG00000030660) slc6a22.1 (ENSSGRG00000030658) slc6a22.1 (ENSSGRG00000030657) Golden-line barbel MODERN SPECIES 2968 cav3 (ENSSGRG00000010646) ##22 ENSSGRG00000010645 Common carp reference MODERN SPECIES 10 arl8ba (ENSCCRG00000076186) edem1 (ENSCCRG00000052393) gnat1 (ENSCCRG00000055580) sema3fa (ENSCCRG00000052418) ENSCCRG00000052472 ENSCCRG00000022670 ENSCCRG00000042692 ip6k2a (ENSCCRG00000064127) sec61a1l (ENSCCRG00000067404) ENSCCRG00000006982 ENSCCRG00000022775 fancd2 (ENSCCRG00000016553) ENSCCRG00000023457 parp3 (ENSCCRG00000031993) ENSCCRG00000069999 cav3 (ENSCCRG00000049151) ##22 oxtra (ENSCCRG00000036316) rad18 (ENSCCRG00000040556) SRGAP3 (ENSCCRG00000021972) hemk1 (ENSCCRG00000036259) twf2a (ENSCCRG00000080820) wdr82 (ENSCCRG00000064412) ENSCCRG00000074941 ENSCCRG00000076732 synprb (ENSCCRG00000009142) opn1mw4 (ENSCCRG00000073092) slc6a22.2 (ENSCCRG00000018439) slc6a22.1 (ENSCCRG00000067329) fkbp5 (ENSCCRG00000072230) ENSCCRG00000061375 ENSCCRG00000014458 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000156703.e.b.f ENSGT00940000166798.b ENSGT00940000156468.e.e ENSGT00940000157842.a.d ENSGT00940000156310.p.e ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e.b.b ENSGT00390000005780.b.a ENSGT00940000154932.B.c ENSGT00940000165239.b.b ENSGT00390000016970.k ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c.a ENSGT00940000158855.b ENSGT00950000182998.C.b.a.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.l ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000011230.i ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.d ENSGT00390000014125.b ENSGT00940000157392.o.a.a ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00530000063965.w.b ENSGT00390000010674.a ENSGT00390000006521.h ENSGT00590000083094.a.a.c.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b.c ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.a.a ENSGT00940000166826.v ENSGT00940000163827.a.b.e ENSGT00940000158726.n Goldfish MODERN SPECIES 24 gnat1 (ENSCARG00000011343) sema3fa (ENSCARG00000010812) ENSCARG00000010769 CAMKV (ENSCARG00000010685) ENSCARG00000010633 ip6k2a (ENSCARG00000010621) sec61a1l (ENSCARG00000010442) emc3 (ENSCARG00000010347) ENSCARG00000007595 gpx1b (ENSCARG00000007472) tex264a (ENSCARG00000007453) GRM2 (ENSCARG00000007443) parp3 (ENSCARG00000007415) ENSCARG00000007410 ENSCARG00000007404 ##22 cav3 (ENSCARG00000007392) ##22 oxtra (ENSCARG00000007370) rad18 (ENSCARG00000007356) SRGAP3 (ENSCARG00000006137) hemk1 (ENSCARG00000006015) cish (ENSCARG00000006005) wdr82 (ENSCARG00000005881) ENSCARG00000005836 cplane2 (ENSCARG00000005804) ENSCARG00000058115 synprb (ENSCARG00000057667) opn1mw4 (ENSCARG00000057618) slc6a22.2 (ENSCARG00000057539) slc6a22.1 (ENSCARG00000057516) fkbp5 (ENSCARG00000057465) SRSF3 (ENSCARG00000057422) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160395.b ENSGT00940000156703.e.b.f ENSGT00940000166798.b ENSGT00940000156468.e.e ENSGT00940000157842.a.d ENSGT00940000156310.p.e ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e.b.b ENSGT00390000005780.b.a ENSGT00940000154932.B.c ENSGT00940000156150.w ENSGT00390000016970.k ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c.a ENSGT00940000158855.b ENSGT00950000182998.C.b.a.a ENSGT00950000183006.B.f.b.b.l ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000011230.i ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.d ENSGT00390000014125.b ENSGT00940000157392.o.a.a ENSGT00530000063868.a.a ENSGT00530000063965.w.b ENSGT00390000010674.a ENSGT00390000006521.h ENSGT00590000083094.a.a.c.b.b ENSGT01030000234637.b.d.a.b.c ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.d.a.a.a ENSGT00940000166826.v ENSGT00940000163827.a.b.e ENSGT00940000158726.n Common carp reference MODERN SPECIES 16 gnat1 (ENSCCRG00000052368) sema3fa (ENSCCRG00000052379) ENSCCRG00000022644 ENSCCRG00000033964 ENSCCRG00000006833 ip6k2a (ENSCCRG00000076362) sec61a1l (ENSCCRG00000074427) emc3 (ENSCCRG00000006860) ENSCCRG00000012166 ENSCCRG00000059337 tex264a (ENSCCRG00000078280) ENSCCRG00000064341 parp3 (ENSCCRG00000063799) ENSCCRG00000031986 ENSCCRG00000031983 ##22 cav3 (ENSCCRG00000036312) ##22 oxtra (ENSCCRG00000023334) rad18 (ENSCCRG00000079191) SRGAP3 (ENSCCRG00000036971) hemk1 (ENSCCRG00000036863) cish (ENSCCRG00000062818) twf2a (ENSCCRG00000036755) wdr82 (ENSCCRG00000057982) ENSCCRG00000063069 cplane2 (ENSCCRG00000036727) ENSCCRG00000018667 opn1mw4 (ENSCCRG00000018441) synprb (ENSCCRG00000018463) opn1mw3 (ENSCCRG00000078209) slc6a22.2 (ENSCCRG00000017119) slc6a22.1 (ENSCCRG00000014353) Golden-line barbel MODERN SPECIES 3373 cav3 (ENSSGRG00000002932) ##22 Zebrafish MODERN SPECIES 21 sema3fa (ENSDARG00000011163) ENSDARG00000097941 ENSDARG00000077060 CAMKV (ENSDARG00000027963) ENSDARG00000060235 ip6k2a (ENSDARG00000008310) sec61a1l (ENSDARG00000005675) emc3 (ENSDARG00000020607) ENSDARG00000014770 gpx1b (ENSDARG00000006207) fancd2 (ENSDARG00000053574) tex264a (ENSDARG00000092154) GRM2 (ENSDARG00000004150) parp3 (ENSDARG00000003961) ENSDARG00000003900 cav3 (ENSDARG00000024141) ##22 oxtra (ENSDARG00000033956) rad18 (ENSDARG00000027938) SRGAP3 (ENSDARG00000060309) hemk1 (ENSDARG00000078894) cish (ENSDARG00000060316) twf2a (ENSDARG00000094792) wdr82 (ENSDARG00000014083) cplane2 (ENSDARG00000028442) ENSDARG00000070567 synprb (ENSDARG00000044278) opn1mw4 (ENSDARG00000000638) opn1mw3 (ENSDARG00000044279) opn1mw2 (ENSDARG00000044280) opn1mw1 (ENSDARG00000097008) slc6a22.2 (ENSDARG00000001354) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 242 ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 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(ENSCHAG00000001899) Atlantic herring MODERN SPECIES 21 KCNQ2 (ENSCHAG00000024632) CHRNA4 (ENSCHAG00000024836) arfrp1 (ENSCHAG00000024895) STMN3 (ENSCHAG00000024912) HELZ2 (ENSCHAG00000024918) ENSCHAG00000024931 ENSCHAG00000024935 stk35l (ENSCHAG00000024947) bin2b (ENSCHAG00000024959) ENSCHAG00000025002 TEX264 (ENSCHAG00000025008) grm2b (ENSCHAG00000025014) rrp9 (ENSCHAG00000025036) ENSCHAG00000025136 cav4a (ENSCHAG00000025137) ##22 cav3 (ENSCHAG00000025139) ##22 oxtrb (ENSCHAG00000025141) ptgis (ENSCHAG00000025145) KCNB1 (ENSCHAG00000025157) ENSCHAG00000025160 ENSCHAG00000025165 stau1 (ENSCHAG00000025191) cyc1 (ENSCHAG00000025227) raly (ENSCHAG00000025255) eif2s2 (ENSCHAG00000025262) asip1 (ENSCHAG00000025275) COQ10A (ENSCHAG00000025283) ANKRD52 (ENSCHAG00000025372) snrpc (ENSCHAG00000026173) SPDEF (ENSCHAG00000026175) ENSCHAG00000026178 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000011082 ENSGT00940000165239.a ENSGT00390000016901.a ENSGT01030000234595.B.c.a.d 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(ENSGMOG00000007988) ENSGMOG00000007993 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b 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ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Tongue sole MODERN SPECIES 2 SLC6A17 (ENSCSEG00000002297) RBM15 (ENSCSEG00000002314) AMIGO1 (ENSCSEG00000002315) GPR61 (ENSCSEG00000002319) AMPD2 (ENSCSEG00000002328) ENSCSEG00000002397 irf6 (ENSCSEG00000002406) guca1e (ENSCSEG00000002411) ENSCSEG00000002440 PBRM1 (ENSCSEG00000002456) cse1l (ENSCSEG00000002471) ENSCSEG00000002502 ENSCSEG00000002505 ENSCSEG00000002507 ENSCSEG00000002511 cav3 (ENSCSEG00000002512) ##22 oxtra (ENSCSEG00000002513) rad18 (ENSCSEG00000002516) SRGAP3 (ENSCSEG00000002531) thumpd3 (ENSCSEG00000002546) PTGIS (ENSCSEG00000002550) GRM2 (ENSCSEG00000002556) parp3 (ENSCSEG00000002582) ENSCSEG00000002621 ENSCSEG00000002623 ENSCSEG00000002625 ENSCSEG00000002633 ENSCSEG00000002638 ENSCSEG00000002641 inka1a (ENSCSEG00000002646) gnai2a (ENSCSEG00000002650) Turbot DUPLICATION Turbot MODERN SPECIES 18 uroc1 (ENSSMAG00000001228) sec61a1 (ENSSMAG00000001194) ip6k2b (ENSSMAG00000001168) ENSSMAG00000028353 inka1a (ENSSMAG00000034411) ENSSMAG00000000848 slc38a3a (ENSSMAG00000000768) emc3 (ENSSMAG00000000752) ENSSMAG00000000738 ENSSMAG00000000726 fancd2 (ENSSMAG00000000703) tex264a (ENSSMAG00000000697) ENSSMAG00000000693 parp3 (ENSSMAG00000000680) ENSSMAG00000000679 CAV3 (ENSSMAG00000000677) ##22 rad18 (ENSSMAG00000000650) SRGAP3 (ENSSMAG00000000633) THUMPD3 (ENSSMAG00000000609) ENSSMAG00000000604 ENSSMAG00000000598 ENSSMAG00000032707 ENSSMAG00000000580 ENSSMAG00000000559 ENSSMAG00000000546 guca1e (ENSSMAG00000000515) irf6 (ENSSMAG00000000507) ENSSMAG00000000500 ENSSMAG00000027810 ENSSMAG00000000446 ENSSMAG00000000436 Turbot MODERN SPECIES 18 ENSSMAG00000016859 ENSSMAG00000016893 ENSSMAG00000016930 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ENSGT00950000183146.a.b.a Siamese fighting fish MODERN SPECIES 16 inka1a (ENSBSLG00000010584) ENSBSLG00000010649 slc38a3a (ENSBSLG00000010942) RBM5 (ENSBSLG00000012897) emc3 (ENSBSLG00000012932) ENSBSLG00000013450 ENSBSLG00000015064 fancd2 (ENSBSLG00000015076) tex264a (ENSBSLG00000015812) GRM2 (ENSBSLG00000016594) ENSBSLG00000016638 ENSBSLG00000016651 parp3 (ENSBSLG00000016681) ENSBSLG00000016714 ENSBSLG00000016741 ##22 cav3 (ENSBSLG00000016767) ##22 oxtra (ENSBSLG00000016860) rad18 (ENSBSLG00000016932) SRGAP3 (ENSBSLG00000017176) ENSBSLG00000019661 thumpd3 (ENSBSLG00000019667) ENSBSLG00000019695 KCNB1 (ENSBSLG00000019777) cse1l (ENSBSLG00000020274) PBRM1 (ENSBSLG00000019852) ENSBSLG00000020323 irf6 (ENSBSLG00000020337) ENSBSLG00000020344 AMPD2 (ENSBSLG00000021293) GPR61 (ENSBSLG00000022153) AMIGO1 (ENSBSLG00000022154) Climbing perch MODERN SPECIES 18 ENSATEG00000027130 ENSATEG00000003327 ENSATEG00000003705 inka1a (ENSATEG00000003711) ENSATEG00000003726 slc38a3a (ENSATEG00000003770) 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ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000177126 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Lumpfish MODERN SPECIES 20 sec61a1 (ENSCLMG00005000137) ip6k2b (ENSCLMG00005000221) ENSCLMG00005000227 inka1a (ENSCLMG00005000273) gnai2a (ENSCLMG00005000280) slc38a3a (ENSCLMG00005000287) RBM5 (ENSCLMG00005000296) emc3 (ENSCLMG00005000311) ENSCLMG00005000316 gpx1a (ENSCLMG00005000320) tex264a (ENSCLMG00005000324) GRM2 (ENSCLMG00005000326) parp3 (ENSCLMG00005000328) ENSCLMG00005000342 ENSCLMG00005000343 ##22 cav3 (ENSCLMG00005000345) ##22 oxtra (ENSCLMG00005000347) rad18 (ENSCLMG00005000350) SRGAP3 (ENSCLMG00005000395) thumpd3 (ENSCLMG00005001103) PTGIS (ENSCLMG00005001112) ENSCLMG00005001113 ENSCLMG00005001115 cse1l (ENSCLMG00005001134) PBRM1 (ENSCLMG00005003177) WDR77 (ENSCLMG00005008650) guca1e (ENSCLMG00005008653) irf6 (ENSCLMG00005008656) ENSCLMG00005008659 AMPD2 (ENSCLMG00005008666) GPR61 (ENSCLMG00005008774) Stickleback MODERN SPECIES 281 ENSGACG00000000832 ENSGACG00000000833 inka1a (ENSGACG00000000836) ENSGACG00000000837 gnai2a (ENSGACG00000000839) slc38a3a (ENSGACG00000000845) RBM5 (ENSGACG00000000858) emc3 (ENSGACG00000000868) ENSGACG00000000872 ENSGACG00000000882 fancd2 (ENSGACG00000000884) tex264a (ENSGACG00000000897) GRM2 (ENSGACG00000000898) parp3 (ENSGACG00000000906) ENSGACG00000000911 cav3 (ENSGACG00000000913) ##22 oxtra (ENSGACG00000000914) rad18 (ENSGACG00000000920) SRGAP3 (ENSGACG00000000924) ENSGACG00000000928 thumpd3 (ENSGACG00000000930) PTGIS (ENSGACG00000000936) ENSGACG00000000945 cse1l (ENSGACG00000000963) PBRM1 (ENSGACG00000000980) WDR77 (ENSGACG00000000986) ENSGACG00000000989 irf6 (ENSGACG00000000990) ENSGACG00000001004 AMPD2 (ENSGACG00000001008) GPR61 (ENSGACG00000001011) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000177126 ENSGT00940000153769.E ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 ENSCGOG00000020480 inka1a (ENSCGOG00000020476) gnai2a (ENSCGOG00000019536) slc38a3a (ENSCGOG00000018788) RBM5 (ENSCGOG00000018528) emc3 (ENSCGOG00000018423) ENSCGOG00000016898 ENSCGOG00000016830 fancd2 (ENSCGOG00000015808) tex264a (ENSCGOG00000015766) GRM2 (ENSCGOG00000015754) ENSCGOG00000015752 parp3 (ENSCGOG00000015732) ENSCGOG00000015728 ENSCGOG00000015726 ##22 cav3 (ENSCGOG00000015724) ##22 oxtra (ENSCGOG00000015718) rad18 (ENSCGOG00000015704) SRGAP3 (ENSCGOG00000013106) thumpd3 (ENSCGOG00000013020) PTGIS (ENSCGOG00000012968) KCNB1 (ENSCGOG00000012932) ENSCGOG00000012878 cse1l (ENSCGOG00000011881) PBRM1 (ENSCGOG00000010700) ENSCGOG00000010666 guca1e (ENSCGOG00000010622) irf6 (ENSCGOG00000010614) ENSCGOG00000010612 ENSCGOG00000010610 AMPD2 (ENSCGOG00000008169) Pike perch MODERN SPECIES 73 ENSSLUG00000012723 ENSSLUG00000012679 inka1a 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ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 20 ENSSAUG00010013352 ENSSAUG00010013342 inka1a (ENSSAUG00010013338) gnai2a (ENSSAUG00010013336) slc38a3a (ENSSAUG00010013198) RBM5 (ENSSAUG00010012073) emc3 (ENSSAUG00010012059) ENSSAUG00010007887 GPX1 (ENSSAUG00010007839) fancd2 (ENSSAUG00010005914) tex264a (ENSSAUG00010005879) GRM2 (ENSSAUG00010005874) parp3 (ENSSAUG00010005832) ENSSAUG00010005823 ENSSAUG00010005821 ##22 CAV3 (ENSSAUG00010005819) ##22 oxtra (ENSSAUG00010005815) rad18 (ENSSAUG00010005811) SRGAP3 (ENSSAUG00010003884) thumpd3 (ENSSAUG00010003779) PTGIS (ENSSAUG00010003767) KCNB1 (ENSSAUG00010003764) ENSSAUG00010003637 cse1l (ENSSAUG00010003553) PBRM1 (ENSSAUG00010002595) ENSSAUG00010002560 guca1e (ENSSAUG00010002558) irf6 (ENSSAUG00010002557) ENSSAUG00010002555 AMPD2 (ENSSAUG00010002521) GPR61 (ENSSAUG00010002501) Gilthead seabream MODERN SPECIES 20 ENSSAUG00010020649 CAMKV (ENSSAUG00010020655) ENSSAUG00010020659 ENSSAUG00010020707 inka1b (ENSSAUG00010021439) gnai2b (ENSSAUG00010021442) SLC38A3 (ENSSAUG00010021448) rbm5 (ENSSAUG00010021679) BRK1 (ENSSAUG00010021738) ENSSAUG00010021739 TEX264 (ENSSAUG00010021740) ENSSAUG00010000299 grm2b (ENSSAUG00010000316) rrp9 (ENSSAUG00010000336) cav4a (ENSSAUG00010000351) ##22 cav3 (ENSSAUG00010000355) ##22 OXTR (ENSSAUG00010000360) SRGAP3 (ENSSAUG00010000587) ptgis (ENSSAUG00010003471) KCNB1 (ENSSAUG00010003485) ENSSAUG00010003487 ENSSAUG00010003491 stau1 (ENSSAUG00010003501) pbrm1l (ENSSAUG00010003714) CAMK1 (ENSSAUG00010012768) FAM107A (ENSSAUG00010014408) ENSSAUG00010014409 cfap20dc (ENSSAUG00010014413) PTPRG (ENSSAUG00010014428) ENSSAUG00010014963 synprb (ENSSAUG00010020127) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b ENSGT00940000153769.E ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l European seabass MODERN SPECIES 10 ENSDLAG00005031909 ENSDLAG00005033274 inka1a (ENSDLAG00005013873) ENSDLAG00005013878 ENSDLAG00005013891 slc38a3a (ENSDLAG00005013911) ENSDLAG00005014608 emc3 (ENSDLAG00005014979) ENSDLAG00005015138 ENSDLAG00005030942 fancd2 (ENSDLAG00005019300) tex264a (ENSDLAG00005019698) ENSDLAG00005019701 parp3 (ENSDLAG00005019741) ENSDLAG00005019799 ##22 cav3 (ENSDLAG00005031137) ##22 oxtra (ENSDLAG00005031803) rad18 (ENSDLAG00005019823) SRGAP3 (ENSDLAG00005019890) THUMPD3 (ENSDLAG00005021141) ENSDLAG00005021352 ENSDLAG00005029163 ENSDLAG00005021459 ENSDLAG00005021486 ENSDLAG00005021556 ENSDLAG00005021660 ENSDLAG00005021713 ENSDLAG00005021677 irf6 (ENSDLAG00005021682) ENSDLAG00005021690 ENSDLAG00005031019 Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES 478 ENSLCRG00005013517 ENSLCRG00005013550 inka1a (ENSLCRG00005013560) gnai2a (ENSLCRG00005013564) slc38a3a (ENSLCRG00005013735) RBM5 (ENSLCRG00005015976) emc3 (ENSLCRG00005016054) 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ENSLCRG00005017757 cav4a (ENSLCRG00005017756) ##22 cav3 (ENSLCRG00005017754) ##22 OXTR (ENSLCRG00005017752) SRGAP3 (ENSLCRG00005012334) ptgis (ENSLCRG00005012296) KCNB1 (ENSLCRG00005012288) ENSLCRG00005012285 ENSLCRG00005012267 stau1 (ENSLCRG00005012188) pbrm1l (ENSLCRG00005006349) CAMK1 (ENSLCRG00005005644) FAM107A (ENSLCRG00005005631) ENSLCRG00005005628 cfap20dc (ENSLCRG00005005625) PTPRG (ENSLCRG00005000378) ENSLCRG00005023840 synprb (ENSLCRG00005023839) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000173262 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000173262 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000173262 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l ENSGT00950000183146.a.b.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000173262 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b.a ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l ENSGT00950000183146.a.b.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000173262 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b.a ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l ENSGT00950000183146.a.b.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000173262 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b.a ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l ENSGT00950000183146.a.b.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 573 ENSHBUG00000011688 inka1a (ENSHBUG00000011707) gnai2a (ENSHBUG00000011738) slc38a3a (ENSHBUG00000011817) RBM5 (ENSHBUG00000011901) emc3 (ENSHBUG00000011947) ENSHBUG00000011959 gpx1a (ENSHBUG00000012040) fancd2 (ENSHBUG00000013047) tex264a (ENSHBUG00000013102) GRM2 (ENSHBUG00000000822) parp3 (ENSHBUG00000013149) ENSHBUG00000013164 ENSHBUG00000013208 ##22 cav3 (ENSHBUG00000013214) ##22 oxtra (ENSHBUG00000013219) rad18 (ENSHBUG00000013322) SRGAP3 (ENSHBUG00000013388) thumpd3 (ENSHBUG00000013405) PTGIS (ENSHBUG00000013417) KCNB1 (ENSHBUG00000013429) ENSHBUG00000013457 cse1l (ENSHBUG00000013599) PBRM1 (ENSHBUG00000013706) WDR77 (ENSHBUG00000013718) irf6 (ENSHBUG00000013746) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000173262 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b.a ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l ENSGT00950000183146.a.b.a P. nyererei MODERN SPECIES 405 ENSPNYG00000006226 inka1a (ENSPNYG00000006256) gnai2a (ENSPNYG00000006273) slc38a3a (ENSPNYG00000006318) RBM5 (ENSPNYG00000006361) ENSPNYG00000006387 emc3 (ENSPNYG00000006394) ENSPNYG00000006414 GPX1 (ENSPNYG00000006427) fancd2 (ENSPNYG00000006458) tex264a (ENSPNYG00000006538) GRM2 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ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451.o ENSGT00940000157451.p ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Zebra mbuna MODERN SPECIES 1108 ENSMZEG00005009616 ENSMZEG00005009670 inka1a (ENSMZEG00005009796) gnai2a (ENSMZEG00005009803) slc38a3a (ENSMZEG00005009874) RBM5 (ENSMZEG00005010035) emc3 (ENSMZEG00005010056) ENSMZEG00005010087 GPX1 (ENSMZEG00005010124) fancd2 (ENSMZEG00005010208) tex264a (ENSMZEG00005010513) GRM2 (ENSMZEG00005010522) parp3 (ENSMZEG00005010534) ENSMZEG00005010542 ENSMZEG00005010547 ##22 cav3 (ENSMZEG00005010569) ##22 oxtra (ENSMZEG00005010574) rad18 (ENSMZEG00005010577) SRGAP3 (ENSMZEG00005010590) thumpd3 (ENSMZEG00005010623) PTGIS (ENSMZEG00005010636) KCNB1 (ENSMZEG00005010648) ENSMZEG00005010656 cse1l (ENSMZEG00005010674) PBRM1 (ENSMZEG00005010710) WDR77 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458 ENSNBRG00000003650 ENSNBRG00000003688 inka1a (ENSNBRG00000003996) gnai2a (ENSNBRG00000004004) slc38a3a (ENSNBRG00000004092) RBM5 (ENSNBRG00000004400) emc3 (ENSNBRG00000004461) ENSNBRG00000004473 GPX1 (ENSNBRG00000004492) fancd2 (ENSNBRG00000004506) tex264a (ENSNBRG00000004635) GRM2 (ENSNBRG00000004642) parp3 (ENSNBRG00000004669) ENSNBRG00000004714 ENSNBRG00000004725 ##22 cav3 (ENSNBRG00000004767) ##22 oxtra (ENSNBRG00000004778) rad18 (ENSNBRG00000004794) SRGAP3 (ENSNBRG00000004829) thumpd3 (ENSNBRG00000004886) PTGIS (ENSNBRG00000004899) KCNB1 (ENSNBRG00000004973) ENSNBRG00000004996 ENSNBRG00000005013 cse1l (ENSNBRG00000005053) PBRM1 (ENSNBRG00000005145) WDR77 (ENSNBRG00000005219) irf6 (ENSNBRG00000005274) ENSNBRG00000005289 AMPD2 (ENSNBRG00000005371) GPR61 (ENSNBRG00000005437) Nile tilapia MODERN SPECIES 17 ip6k2b (ENSONIG00000019025) ENSONIG00000033315 inka1a (ENSONIG00000019016) gnai2a (ENSONIG00000019015) slc38a3a (ENSONIG00000019013) RBM5 (ENSONIG00000019007) emc3 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ENSACIG00000020755 ENSACIG00000020725 ##22 cav3 (ENSACIG00000020684) ##22 oxtra (ENSACIG00000020670) rad18 (ENSACIG00000020655) SRGAP3 (ENSACIG00000020195) thumpd3 (ENSACIG00000020096) ENSACIG00000020074 KCNB1 (ENSACIG00000020068) ENSACIG00000020041 cse1l (ENSACIG00000020004) PBRM1 (ENSACIG00000019953) WDR77 (ENSACIG00000019934) irf6 (ENSACIG00000019918) ENSACIG00000019879 AMPD2 (ENSACIG00000019844) GPR61 (ENSACIG00000019832) AMIGO1 (ENSACIG00000019820) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000173262 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000177126 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000160607 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l Clown anemonefish MODERN SPECIES 1490 GRM2 (ENSAOCG00000004621) ENSAOCG00000004606 parp3 (ENSAOCG00000004597) ENSAOCG00000004565 ENSAOCG00000004560 ##22 cav3 (ENSAOCG00000000166) ##22 oxtra (ENSAOCG00000004533) rad18 (ENSAOCG00000004507) SRGAP3 (ENSAOCG00000004461) thumpd3 (ENSAOCG00000004399) PTGIS (ENSAOCG00000004381) KCNB1 (ENSAOCG00000004373) ENSAOCG00000004372 ENSAOCG00000004367 cse1l (ENSAOCG00000004356) PBRM1 (ENSAOCG00000004301) WDR77 (ENSAOCG00000004257) guca1e (ENSAOCG00000004190) irf6 (ENSAOCG00000004183) ENSAOCG00000004170 AMPD2 (ENSAOCG00000004151) Orange clownfish MODERN SPECIES 24 thsd7aa (ENSAPEG00000017374) ENSAPEG00000017325 tmem106bb (ENSAPEG00000017293) arl4ab (ENSAPEG00000017251) chtopa (ENSAPEG00000017156) snapin (ENSAPEG00000017134) smad10a (ENSAPEG00000017121) pex11b (ENSAPEG00000017101) ilf2 (ENSAPEG00000017042) ENSAPEG00000017024 ENSAPEG00000017011 GRM2 (ENSAPEG00000016990) parp3 (ENSAPEG00000016950) ENSAPEG00000016937 ENSAPEG00000016902 ##22 cav3 (ENSAPEG00000016894) ##22 oxtra (ENSAPEG00000016873) rad18 (ENSAPEG00000016837) SRGAP3 (ENSAPEG00000016753) thumpd3 (ENSAPEG00000016740) PTGIS (ENSAPEG00000016727) KCNB1 (ENSAPEG00000016720) ENSAPEG00000016699 ENSAPEG00000016687 cse1l (ENSAPEG00000016588) PBRM1 (ENSAPEG00000016492) WDR77 (ENSAPEG00000016476) guca1e (ENSAPEG00000016465) irf6 (ENSAPEG00000016453) ENSAPEG00000016434 AMPD2 (ENSAPEG00000016356) Spiny chromis MODERN SPECIES 127 inka1a (ENSAPOG00000006121) gnai2a (ENSAPOG00000006101) slc38a3a (ENSAPOG00000006050) RBM5 (ENSAPOG00000006011) emc3 (ENSAPOG00000005897) ENSAPOG00000005852 GPX1 (ENSAPOG00000005747) fancd2 (ENSAPOG00000005606) tex264a (ENSAPOG00000005431) GRM2 (ENSAPOG00000005417) parp3 (ENSAPOG00000005374) ENSAPOG00000005307 ENSAPOG00000005299 ##22 cav3 (ENSAPOG00000005287) ##22 oxtra (ENSAPOG00000005271) rad18 (ENSAPOG00000005260) SRGAP3 (ENSAPOG00000005213) ENSAPOG00000005105 tmem120aa (ENSAPOG00000005013) styxl1 (ENSAPOG00000004976) ENSAPOG00000004951 ENSAPOG00000004924 hspb9l (ENSAPOG00000004910) fam53c (ENSAPOG00000004900) slbp2 (ENSAPOG00000004873) zmat2 (ENSAPOG00000004818) lcp2a (ENSAPOG00000004790) ENSAPOG00000004752 nhp2 (ENSAPOG00000004742) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1386 GRM2 (ENSSPAG00000007288) parp3 (ENSSPAG00000007267) ENSSPAG00000007259 ENSSPAG00000007248 ##22 cav3 (ENSSPAG00000007240) ##22 oxtr (ENSSPAG00000007184) rad18 (ENSSPAG00000007165) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b ENSGT00940000177126 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l ENSGT00950000183146.a.b.a Oryzias ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b ENSGT00940000177126 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l ENSGT00950000183146.a.b.a Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000003721.d.a.g.b.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b ENSGT00940000177126 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b 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(ENSORLG00000000530) irf6 (ENSORLG00000000511) ENSORLG00000000487 ENSORLG00000022382 ENSORLG00000000453 GPR61 (ENSORLG00000000438) Chinese medaka MODERN SPECIES 2341 cav3 (ENSOSIG00000004385) ##22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b ENSGT00940000177126 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451 ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l ENSGT00950000183146.a.b.a ENSGT00940000158161.e.a Indian medaka MODERN SPECIES 8 ENSOMEG00000010430 inka1a (ENSOMEG00000010447) gnai2a (ENSOMEG00000010483) slc38a3a (ENSOMEG00000010628) RBM5 (ENSOMEG00000010653) ENSOMEG00000010677 emc3 (ENSOMEG00000010762) ENSOMEG00000010935 gpx1a (ENSOMEG00000011003) fancd2 (ENSOMEG00000013047) tex264a (ENSOMEG00000013747) GRM2 (ENSOMEG00000013796) parp3 (ENSOMEG00000013854) ENSOMEG00000013874 ENSOMEG00000013898 ##22 cav3 (ENSOMEG00000013915) ##22 oxtra (ENSOMEG00000013924) rad18 (ENSOMEG00000014011) SRGAP3 (ENSOMEG00000014065) thumpd3 (ENSOMEG00000014115) PTGIS (ENSOMEG00000014168) ENSOMEG00000014181 ENSOMEG00000014261 cse1l (ENSOMEG00000014357) PBRM1 (ENSOMEG00000014423) ENSOMEG00000014455 WDR77 (ENSOMEG00000014503) irf6 (ENSOMEG00000014527) ENSOMEG00000014538 ENSOMEG00000014552 AMPD2 (ENSOMEG00000014615) Javanese ricefish MODERN SPECIES 19 ENSOJAG00000004939 ENSOJAG00000004955 inka1a (ENSOJAG00000005186) GNAI2 (ENSOJAG00000005215) slc38a3a (ENSOJAG00000005279) RBM5 (ENSOJAG00000005606) emc3 (ENSOJAG00000005715) ENSOJAG00000005768 gpx1a (ENSOJAG00000008261) tex264a (ENSOJAG00000008276) GRM2 (ENSOJAG00000008290) parp3 (ENSOJAG00000008368) ENSOJAG00000008436 ENSOJAG00000003784 ##22 ENSOJAG00000003812 cav3 (ENSOJAG00000003843) ##22 oxtra (ENSOJAG00000003873) rad18 (ENSOJAG00000003949) SRGAP3 (ENSOJAG00000004406) thumpd3 (ENSOJAG00000006420) PTGIS (ENSOJAG00000006960) KCNB1 (ENSOJAG00000007142) ENSOJAG00000007216 PBRM1 (ENSOJAG00000007474) ENSOJAG00000007958 irf6 (ENSOJAG00000007964) ENSOJAG00000011697 ENSOJAG00000011757 blcap (ENSOJAG00000011763) ENSOJAG00000011766 lmcd1 (ENSOJAG00000012611) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156310.o ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b ENSGT00940000177126 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l ENSGT00950000183146.a.b.a Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156310.o ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b ENSGT00940000177126 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451 ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l ENSGT00950000183146.a.b.a Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b ENSGT00940000177126 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00940000165342.b ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a ENSGT00390000010711 ENSGT00940000157451.n ENSGT00940000158169.a ENSGT00950000183011.d.d ENSGT00950000182998.C.a.l ENSGT00950000183146.a.b.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 23 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ENSMMDG00005013249 PTPRG (ENSMMDG00005013274) ENSMMDG00005013780 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154368.t ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000162824 ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b ENSGT01030000234595.B.c.a.c ENSGT00940000158855 ENSGT00950000182998.C.b.a ENSGT00950000183006.A.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e ENSGT00940000154899.fb.a ENSGT00550000074884 ENSGT00390000003017.c.a.k ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000155261.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000166625 ENSGT00940000154786.ab.a ENSGT00940000154786.ab.b Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063849.A.a.c ENSGT00940000162824 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ENSGT00940000165239.b.f ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b.d ENSGT01030000234595.B.c.a.c.f ENSGT00940000158855.d ENSGT00950000182998.C.b.a.e ENSGT00950000183006.A.a.a.a.b ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.bb.a ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.d ENSGT00390000011230.m ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.h ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e.d ENSGT00940000154899.fb.a.d ENSGT00550000074884.l.b ENSGT00390000003017.c.a.k.a ENSGT00940000154409.eb.b.m ENSGT00940000155261.a.b.d ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.g ENSGT00940000166625.a ENSGT00940000154786.ab.b.b ENSGT00940000156263.l.c ENSGT00940000161971.r Salmo ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063849.A.a.c ENSGT00940000162824 ENSGT00940000155125.a.b.c ENSGT00940000157127.b.h ENSGT00940000156617.e.b.g ENSGT00390000011082.pb.a ENSGT00390000005780.b.f ENSGT00940000154932.B.l ENSGT00940000165239.b.f ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b.d ENSGT01030000234595.B.c.a.c.f ENSGT00940000158855.d ENSGT00950000182998.C.b.a.e ENSGT00950000183006.A.a.a.a.b ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.bb.a ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.d ENSGT00390000011230.m ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.h ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e.d ENSGT00940000154899.fb.a.d ENSGT00550000074884.l.b ENSGT00390000003017.c.a.k.a ENSGT00940000154409.eb.b.m ENSGT00940000155261.a.b.d ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.g ENSGT00940000166625.a ENSGT00940000154786.ab.b.b ENSGT00940000156263.l.c ENSGT00940000161971.r River trout MODERN SPECIES 5 inka1a (ENSSTUG00000022898) ENSSTUG00000022905 gnai2a (ENSSTUG00000022943) slc38a3a (ENSSTUG00000023083) RBM5 (ENSSTUG00000026871) BRK1 (ENSSTUG00000027493) emc3 (ENSSTUG00000027507) ENSSTUG00000027605 gpx1b (ENSSTUG00000031566) fancd2 (ENSSTUG00000031710) tex264a (ENSSTUG00000033938) GRM2 (ENSSTUG00000033947) parp3 (ENSSTUG00000033963) ENSSTUG00000033983 ENSSTUG00000033991 ##22 CAV3 (ENSSTUG00000034000) ##22 oxtra (ENSSTUG00000034019) rad18 (ENSSTUG00000034070) SRGAP3 (ENSSTUG00000034144) thumpd3 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ENSSSAG00000077210 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063849.A.a.c ENSGT00940000162824 ENSGT00940000155125.a.b.c ENSGT00940000157127.b.h ENSGT00940000156617.e.b.g ENSGT00390000011082.pb.a ENSGT00390000005780.b.f ENSGT00940000154932.B.l ENSGT00940000165239.b.f ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b.d ENSGT01030000234595.B.c.a.c.f ENSGT00940000158855.d ENSGT00950000182998.C.b.a.e ENSGT00950000183006.A.a.a.a.b ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.bb.a ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.d ENSGT00390000011230.m ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.h ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e.d ENSGT00940000154899.fb.a.d ENSGT00550000074884.l.b ENSGT00390000003017.c.a.k.a ENSGT00940000154409.eb.b.m ENSGT00940000155261.a.b.d ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.g ENSGT00940000166625.a ENSGT00940000154786.ab.b.b ENSGT00940000156263.l.c ENSGT00940000154857.yb.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063849.A.a.c ENSGT00940000162824 ENSGT00940000155125.a.b.c ENSGT00940000157127.b.h ENSGT00940000156617.e.b.g ENSGT00390000011082.pb.a ENSGT00390000005780.b.f ENSGT00940000154932.B.l ENSGT00940000165239.b.f ENSGT00390000016970 ENSGT00390000016901.b.d ENSGT01030000234595.B.c.a.c.f ENSGT00940000158855.d ENSGT00950000182998.C.b.a.e ENSGT00950000183006.A.a.a.a.b ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.bb.a ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.d ENSGT00390000011230.m ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.h ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000153709.A.e.d ENSGT00940000154899.fb.a.d ENSGT00550000074884.l.b ENSGT00390000003017.c.a.k.a ENSGT00940000154409.eb.b.m ENSGT00940000155261.a.b.d ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.g ENSGT00940000166625.a ENSGT00940000154786.ab.b.b ENSGT00940000156263.l.c ENSGT00940000154857.yb.a Coho salmon MODERN SPECIES inka1a (ENSOKIG00005008511) ENSOKIG00005008520 gnai2a (ENSOKIG00005008537) slc38a3a (ENSOKIG00005008677) RBM5 (ENSOKIG00005010583) BRK1 (ENSOKIG00005011468) emc3 (ENSOKIG00005011488) ENSOKIG00005011840 gpx1b (ENSOKIG00005016080) fancd2 (ENSOKIG00005016162) 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atf7b (ENSOMYG00000047538) atf1 (ENSOMYG00000047379) ENSOMYG00000047373 ENSOMYG00000047319 ENSOMYG00000047221 Huchen MODERN SPECIES 397 ENSHHUG00000049631 ENSHHUG00000049619 inka1a (ENSHHUG00000049613) ENSHHUG00000049603 gnai2a (ENSHHUG00000049525) slc38a3a (ENSHHUG00000049520) RBM5 (ENSHHUG00000049495) BRK1 (ENSHHUG00000049486) emc3 (ENSHHUG00000049453) ENSHHUG00000049195 gpx1b (ENSHHUG00000049156) tex264a (ENSHHUG00000049141) GRM2 (ENSHHUG00000049118) ENSHHUG00000049111 ENSHHUG00000049099 ##22 CAV3 (ENSHHUG00000049096) ##22 oxtra (ENSHHUG00000049080) rad18 (ENSHHUG00000049044) SRGAP3 (ENSHHUG00000049037) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 544 ENSGT00940000153769.E.i.a ENSGT00530000063849.A.a.d ENSGT00940000155125.a.b.d ENSGT00940000157127.b.g ENSGT00940000156617.e.b.h ENSGT00390000011082.pb.b ENSGT00390000005780.b.e ENSGT00940000154932.B.k ENSGT00940000156150.w ENSGT00940000165239.b.e ENSGT00390000016901.b.c ENSGT01030000234595.B.c.a.c.e ENSGT00940000158855.c ENSGT00950000182998.C.b.a.f 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SPECIES 42 ENSGT00940000153769.E.i.a ENSGT00530000063849.A.a.d ENSGT00940000155125.a.b.d ENSGT00940000157127.b.g ENSGT00940000156617.e.b.h ENSGT00990000210367 ENSGT00390000011082.pb.b ENSGT00390000005780.b.e ENSGT00940000154932.B.k ENSGT00940000165239.b.e ENSGT00390000016901.b.c ENSGT01030000234595.B.c.a.c.e ENSGT00940000158855.c ENSGT00950000182998.C.b.a.f ENSGT00950000183006.A.a.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.bb.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.c ENSGT00390000011230.n ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.g ENSGT00940000153709.A.e.c ENSGT00940000154899.fb.a.c ENSGT00550000074884.l.a ENSGT00390000003017.c.a.l ENSGT00390000003017.c.a.k.b ENSGT00940000154409.eb.b.n ENSGT00940000155261.a.b.c ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.h ENSGT00940000166625.b ENSGT00940000154786.ab.a ENSGT01060000251739 ENSGT00940000156263.l.d River trout MODERN SPECIES 7 ENSSTUG00000023816 inka1a (ENSSTUG00000023810) gnai2a (ENSSTUG00000023795) slc38a3a (ENSSTUG00000021357) ENSSTUG00000021255 ENSSTUG00000021244 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(ENSSSAG00000089526) ##22 oxtra (ENSSSAG00000008503) rad18 (ENSSSAG00000008523) SRGAP3 (ENSSSAG00000008796) ENSSSAG00000106447 ENSSSAG00000042207 ENSSSAG00000042266 ENSSSAG00000044784 ENSSSAG00000044801 ENSSSAG00000044811 ENSSSAG00000044820 atf7b (ENSSSAG00000044840) ENSSSAG00000097027 atf1 (ENSSSAG00000048676) ENSSSAG00000085447 ENSSSAG00000048686 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158314.d.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b.b ENSGT00940000153769.E.i.a ENSGT00530000063849.A.a.d ENSGT00940000155125.a.b.d ENSGT00940000157127.b.g ENSGT00390000011082.pb.b ENSGT00390000005780.b.e ENSGT00940000154932.B.k ENSGT00940000165239.b.e ENSGT00390000016901.b.c ENSGT01030000234595.B.c.a.c.e ENSGT00940000158855.c ENSGT00950000182998.C.b.a.f ENSGT00950000183006.A.a.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.bb.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.c ENSGT00390000011230.n ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.g ENSGT00940000153709.A.e.c ENSGT00940000154899.fb.a.c ENSGT00550000074884.l.a ENSGT00390000003017.c.a.l ENSGT00390000003017.c.a.k.b ENSGT00940000154409.eb.b.n ENSGT00940000155261.a.b.c ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.h ENSGT00940000166625.b ENSGT00940000154786.ab.a ENSGT01060000253399 ENSGT00940000156263.l.d Rainbow trout MODERN SPECIES 28 ENSOMYG00000052391 inka1a (ENSOMYG00000032743) ENSOMYG00000060593 ENSOMYG00000032779 ENSOMYG00000059988 slc38a3a (ENSOMYG00000033093) ENSOMYG00000034332 pob (ENSOMYG00000034350) ENSOMYG00000034922 gpx1 (ENSOMYG00000039867) tex264a (ENSOMYG00000039876) ENSOMYG00000072279 ENSOMYG00000039888 parp3 (ENSOMYG00000039908) ENSOMYG00000039921 CAV3 (ENSOMYG00000047799) ##22 oxtra (ENSOMYG00000026475) rad18 (ENSOMYG00000026572) ENSOMYG00000077111 ENSOMYG00000068281 ENSOMYG00000058606 SRGAP3 (ENSOMYG00000026806) ENSOMYG00000027171 ENSOMYG00000027520 ENSOMYG00000062642 ENSOMYG00000027583 ENSOMYG00000027647 ENSOMYG00000064549 ENSOMYG00000027716 atf7b (ENSOMYG00000027943) ENSOMYG00000031353 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158314.d.a ENSGT01050000244841.A.b.b.b.b.b ENSGT00940000153769.E.i.a ENSGT00530000063849.A.a.d ENSGT00940000155125.a.b.d ENSGT00940000157127.b.g ENSGT00390000011082.pb.b ENSGT00390000005780.b.e ENSGT00940000154932.B.k ENSGT00940000165239.b.e ENSGT00390000016901.b.c ENSGT01030000234595.B.c.a.c.e ENSGT00940000158855.c ENSGT00950000182998.C.b.a.f ENSGT00950000183006.A.a.a.a.a ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.bb.b ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.b.c ENSGT00390000011230.n ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.g ENSGT00940000153709.A.e.c ENSGT00940000154899.fb.a.c ENSGT00550000074884.l.a ENSGT00390000003017.c.a.l ENSGT00390000003017.c.a.k.b ENSGT00940000154409.eb.b.n ENSGT00940000155261.a.b.c ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.h ENSGT00940000166625.b ENSGT00940000154786.ab.a ENSGT01060000253399 ENSGT00940000156263.l.d Coho salmon MODERN SPECIES 25 ip6k2b (ENSOKIG00005012265) TMCC2 (ENSOKIG00005012281) ENSOKIG00005012302 ENSOKIG00005012431 inka1a (ENSOKIG00005012454) GNAI2 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ENSOTSG00005019553 ENSOTSG00005019555 ##22 CAV3 (ENSOTSG00005019557) ##22 oxtra (ENSOTSG00005019560) rad18 (ENSOTSG00005019562) SRGAP3 (ENSOTSG00005019615) PTGIS (ENSOTSG00005022574) KCNB1 (ENSOTSG00005022791) cse1l (ENSOTSG00005022802) ENSOTSG00005022929 ENSOTSG00005022930 ENSOTSG00005022932 atf7b (ENSOTSG00005022933) DIP2B (ENSOTSG00005023002) atf1 (ENSOTSG00005033544) ENSOTSG00005033545 ENSOTSG00005033546 ENSOTSG00005033547 Huchen MODERN SPECIES 102 ENSHHUG00000013157 inka1a (ENSHHUG00000013151) gnai2a (ENSHHUG00000013109) slc38a3a (ENSHHUG00000012988) BRK1 (ENSHHUG00000012952) emc3 (ENSHHUG00000012913) ENSHHUG00000012636 gpx1b (ENSHHUG00000012613) ENSHHUG00000012611 ENSHHUG00000012608 tex264a (ENSHHUG00000012604) GRM2 (ENSHHUG00000012556) parp3 (ENSHHUG00000012497) ENSHHUG00000012490 ENSHHUG00000012485 ##22 CAV3 (ENSHHUG00000012482) ##22 oxtra (ENSHHUG00000012470) Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 779 ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ##22 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ENSGT00940000156378.a.b.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00990000211485.a.a ENSGT00940000155048.d.b.e ENSGT00590000083094.a.a.c.b.c.b ENSGT00950000182998.C.b.b.c ENSGT00940000158328.g ENSGT01030000234595.B.c.a.d.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000161061.b.q.b ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b ENSGT00940000166826 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.l ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.a.c.a.k.a.a.a ENSGT01030000234637.b.d.a.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b.f ##22 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.cb.a ##22 ENSGT01050000244882.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182824.a.b.a.j.b.b ENSGT00940000153709.A.f.e ENSGT00940000154899.fb.b.c ENSGT00390000008325.b.a.c ENSGT00940000157304.m ENSGT00390000003017.c.b.b.e ENSGT00940000156378.a.b.c.b ENSGT00990000212577 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trub2 (ENSSSAG00000054021) ENSSSAG00000104706 ENSSSAG00000085612 entpd8 (ENSSSAG00000054031) ENSSSAG00000105670 ENSSSAG00000054070 ENSSSAG00000122006 fkbp5 (ENSSSAG00000099623) slc6a22.1 (ENSSSAG00000104794) slc6a22.2 (ENSSSAG00000054751) ENSSSAG00000055587 ENSSSAG00000110368 ENSSSAG00000088508 ENSSSAG00000093435 synprb (ENSSSAG00000083113) CAV3 (ENSSSAG00000071903) ##22 ENSSSAG00000122213 SRGAP3 (ENSSSAG00000055833) ptgis (ENSSSAG00000064171) ENSSSAG00000064298 ENSSSAG00000064305 stau1 (ENSSSAG00000064428) pbrm1l (ENSSSAG00000065235) ENSSSAG00000073372 ENSSSAG00000112938 ENSSSAG00000075480 ENSSSAG00000075534 ENSSSAG00000098557 ENSSSAG00000076633 ENSSSAG00000079472 RRP9 (ENSSSAG00000079477) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161061.b.r.a.a ENSGT00940000160058.d ENSGT00390000015582 ENSGT00940000156773.h ENSGT01100000263542.B.a.w ENSGT00940000160379.e ENSGT00910000144115.a.hc.a.f.b.a ENSGT00910000144115.a.hc.a.e ENSGT00940000158726.o ENSGT00940000163827.a.b.i.b 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ENSECRG00000010140 ENSECRG00000010150 syn1 (ENSECRG00000010162) ENSECRG00000010182 araf (ENSECRG00000010197) imp4 (ENSECRG00000010219) ENSECRG00000010237 ENSECRG00000010305 l1cama (ENSECRG00000010406) AVPR2 (ENSECRG00000010459) cav4b (ENSECRG00000010466) ##22 ENSECRG00000010474 ##22 ARHGAP4 (ENSECRG00000010487) zgc:103759 (ENSECRG00000010513) zgc:103759 (ENSECRG00000010530) naa10 (ENSECRG00000010563) ENSECRG00000010589 G6PD (ENSECRG00000010607) ikbkg (ENSECRG00000010631) ssr4 (ENSECRG00000010653) sephs3 (ENSECRG00000010661) ENSECRG00000010673 wdr45 (ENSECRG00000010700) ENSECRG00000010731 ENSECRG00000010749 ENSECRG00000010753 ENSECRG00000010763 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.f.b.b ##22 Hagfish MODERN SPECIES 1257 ENSEBUG00000007588 ENSEBUG00000002443 ENSEBUG00000009553 ENSEBUG00000009673 ENSEBUG00000010997 ENSEBUG00000005847 ENSEBUG00000009760 ENSEBUG00000005104 tes (ENSEBUG00000002690) cav3 (ENSEBUG00000005767) ##22 ENSEBUG00000011657 ENSEBUG00000011333 ENSEBUG00000000734 ENSEBUG00000014331 ENSEBUG00000016003 ENSEBUG00000012587 POLR2B (ENSEBUG00000010593) ENSEBUG00000006034 ENSEBUG00000016511 ENSEBUG00000000816 ENSEBUG00000009039 ENSEBUG00000015570 ENSEBUG00000000743 crk (ENSEBUG00000016675) pptc7a (ENSEBUG00000004514) Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00730000111314 ENSGT01050000244850.B ENSGT00390000000903.a ENSGT00390000001439 ENSGT00940000157992 ENSGT00390000002915 ENSGT00940000153769.E ENSGT00940000160568 ENSGT00390000016313.a.a ENSGT00510000047602 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b ENSGT00940000158082.a.a ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000163982 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160243 ENSGT00940000165748 ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00730000111314 ENSGT01050000244850.B ENSGT00390000000903.a ENSGT00390000001439 ENSGT00940000157992 ENSGT00390000002915 ENSGT00940000153769.E ENSGT00940000160568 ENSGT00390000016313.a.a ENSGT00510000047602 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b ENSGT00940000158082.a.a ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000163982 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000003224.B ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000160243 ENSGT00940000165748 ENSGT00940000159926 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00950000182839.A.c ENSGT00640000091574 ENSGT00940000155352 ENSGT00500000044938 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zgc:103499 (ENSSFOG00015014041) cep290 (ENSSFOG00015013723) ENSSFOG00015013644 ENSSFOG00015013590 dusp6 (ENSSFOG00015031634) POC1B (ENSSFOG00015013560) TES (ENSSFOG00015013536) ENSSFOG00015013521 cav1 (ENSSFOG00015030307) ##22 met (ENSSFOG00015013423) #23 ENSSFOG00015013339 ST7 (ENSSFOG00015013213) asz1 (ENSSFOG00015013181) cftr (ENSSFOG00015013079) TIMP3 (ENSSFOG00015013032) ENSSFOG00015013014 FLNC (ENSSFOG00015012863) LTA4H (ENSSFOG00015012722) ENSSFOG00015012650 lamb4 (ENSSFOG00015012356) ENSSFOG00015012218 PTPRZ1 (ENSSFOG00015012128) aass (ENSSFOG00015012006) fezf1 (ENSSFOG00015011943) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 205 ENSGT00950000182839.A.c ENSGT00640000091574 ENSGT00940000155352 ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000157538.f ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000160413 ENSGT00940000167617 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.b.b.b ENSGT00390000000972 ENSGT00940000157033.h ENSGT00940000156088.c.b ENSGT00390000001116 ENSGT00940000177974 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00940000155352 ENSGT00940000154675.w.b ENSGT00530000063822.a.b.a ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000157538.f ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000160413 ENSGT00940000167617 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.b.b.b ENSGT00390000000972 ENSGT00940000157033.h ENSGT00940000156088.c.b ENSGT00940000168658 ENSGT00390000011055 ENSGT00940000158153.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000155352.gb.a.a ENSGT00940000154675.w.b ENSGT00530000063822.a.b.a ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000157538.f ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000160413 ENSGT00940000167617 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a ENSGT00390000000972 ENSGT00940000157033.h ENSGT00940000156088.c.b ENSGT00940000154910.b.a ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000155960.a ENSGT00940000157402 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000155352.gb.b ENSGT00940000154675.w.b ENSGT00530000063822.a.b.a ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C 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Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155352.gb.b ENSGT00940000154675.w.b ENSGT00530000063822.a.b.a ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000157538.f ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000167617 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b.m.a ENSGT00940000158082.b.m.b ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.b ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00390000010968.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160974.b.c ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160208 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155352.gb.b ENSGT00940000154675.w.b ENSGT00530000063822.a.b.a ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000157538.f ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b 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ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567.i ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00390000010968.a Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT00940000155352.gb.b ENSGT00940000180028 ENSGT00940000154675.w.b ENSGT00530000063822.a.b.a ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000157538.f ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000167617 ENSGT00940000158082.b.m.a ENSGT00940000158082.b.m.b ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567.i ENSGT00940000158293 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 137 ENSGT00940000155352.gb.b ENSGT00940000180028 ENSGT00940000154675.w.b ENSGT00530000063822.a.b.a ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000157538.f ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000167617 ENSGT00940000158082.b.m.a ENSGT00940000158082.b.m.b.d ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567.i ENSGT00940000158293 ENSGT00940000153377.B ENSGT00940000164138 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1322 kitlga (ENSAOCG00000017230) ENSAOCG00000017248 dusp6 (ENSAOCG00000017253) poc1b (ENSAOCG00000017276) CPA1 (ENSAOCG00000017308) ENSAOCG00000017326 CPA1 (ENSAOCG00000017374) CPA1 (ENSAOCG00000017430) tes (ENSAOCG00000017493) cav2 (ENSAOCG00000017513) #21 cav1 (ENSAOCG00000017536) ##22 met (ENSAOCG00000017600) #23 ENSAOCG00000017618 st7 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damselfish MODERN SPECIES 348 tes (ENSSPAG00000008727) cav2 (ENSSPAG00000008756) #21 cav1 (ENSSPAG00000008767) ##22 met (ENSSPAG00000008782) #23 ENSSPAG00000008838 st7 (ENSSPAG00000008861) wnt2 (ENSSPAG00000008915) asz1 (ENSSPAG00000008937) cftr (ENSSPAG00000008983) CTTNBP2 (ENSSPAG00000009045) ENSSPAG00000009111 ENSSPAG00000009130 BET1L (ENSSPAG00000009163) deaf1 (ENSSPAG00000009175) drd4a (ENSSPAG00000009200) ENSSPAG00000009216 GRAMD4 (ENSSPAG00000009245) ENSSPAG00000009319 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155352.gb.b ENSGT00940000154675.w.b ENSGT00530000063822.a.b.a ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000157538.f ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000160413 ENSGT00940000167617 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b.n ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c ENSGT00390000017767.a.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00640000091574 ENSGT00940000155352.gb.b ENSGT00940000154675.w.b ENSGT00530000063822.a.b.a ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000157538.f ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000167617 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b.n ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c ENSGT00390000017767.a.b Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160199 ENSGT00940000153438.a.s ENSGT00390000009140 ENSGT00950000183113.b.a ENSGT00940000157431.c.a ENSGT00390000016435.g.a ENSGT00940000156052.k.b ENSGT00390000001424.wb.a ENSGT00390000002564.b.d ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000167617 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b.m.a ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000159701 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 Fugu MODERN SPECIES 21 tspan18b (ENSTRUG00000021855) alx4b (ENSTRUG00000017056) lmo2 (ENSTRUG00000020798) ENSTRUG00000017064 csk (ENSTRUG00000017074) edc3 (ENSTRUG00000017078) cpa1 (ENSTRUG00000024152) arid3b (ENSTRUG00000017079) cox5aa (ENSTRUG00000017081) RPP25 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ENSGT00940000160974.b.c ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00390000010968.a Stickleback MODERN SPECIES 14 NTS (ENSGACG00000009549) MGAT4C (ENSGACG00000009544) eif4g2b (ENSGACG00000009454) ENSGACG00000009450 zgc:103499 (ENSGACG00000009418) cep290 (ENSGACG00000009388) TMTC3 (ENSGACG00000009378) kitlga (ENSGACG00000009373) ENSGACG00000009345 dusp6 (ENSGACG00000009342) POC1B (ENSGACG00000009335) cep41 (ENSGACG00000009309) cpa1 (ENSGACG00000009214) tes (ENSGACG00000009210) cav2 (ENSGACG00000009202) #21 cav1 (ENSGACG00000009201) ##22 met (ENSGACG00000009190) #23 ENSGACG00000009107 st7 (ENSGACG00000009091) wnt2 (ENSGACG00000009061) asz1 (ENSGACG00000009054) cftr (ENSGACG00000009039) CTTNBP2 (ENSGACG00000009015) ENSGACG00000009014 ENSGACG00000008997 ENSGACG00000008981 ENSGACG00000008957 BET1L (ENSGACG00000008949) deaf1 (ENSGACG00000008942) drd4a (ENSGACG00000008935) ENSGACG00000008928 Lumpfish MODERN SPECIES 21 ENSCLMG00005012441 eif4g2b (ENSCLMG00005011254) ENSCLMG00005011240 zgc:103499 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ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022 #23 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.b ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000160208 Pike perch MODERN SPECIES 51 eif4g2b (ENSSLUG00000018294) ENSSLUG00000018251 ENSSLUG00000018246 zgc:103499 (ENSSLUG00000018243) cep290 (ENSSLUG00000017639) TMTC3 (ENSSLUG00000017550) kitlga (ENSSLUG00000017537) ENSSLUG00000017480 dusp6 (ENSSLUG00000017467) poc1b (ENSSLUG00000016865) cep41 (ENSSLUG00000016828) cpa1 (ENSSLUG00000016768) tes (ENSSLUG00000016752) cav2 (ENSSLUG00000016749) #21 cav1 (ENSSLUG00000016735) ##22 met (ENSSLUG00000016694) #23 ENSSLUG00000016639 st7 (ENSSLUG00000013546) ENSSLUG00000013476 ENSSLUG00000013474 asz1 (ENSSLUG00000013461) cftr (ENSSLUG00000008780) ENSSLUG00000008636 ENSSLUG00000008594 ENSSLUG00000008584 ENSSLUG00000008579 ENSSLUG00000024614 ENSSLUG00000024610 ENSSLUG00000024607 ENSSLUG00000024605 Channel bull blenny MODERN SPECIES 20 ENSCGOG00000010341 MGAT4C (ENSCGOG00000010345) eif4g2b (ENSCGOG00000010359) ENSCGOG00000010997 zgc:103499 (ENSCGOG00000011002) cep290 (ENSCGOG00000011023) TMTC3 (ENSCGOG00000011107) kitlga (ENSCGOG00000011439) ENSCGOG00000011442 dusp6 (ENSCGOG00000011447) poc1b (ENSCGOG00000011452) cep41 (ENSCGOG00000011654) cpa1 (ENSCGOG00000011673) tes (ENSCGOG00000011867) cav2 (ENSCGOG00000011869) #21 cav1 (ENSCGOG00000011870) ##22 met (ENSCGOG00000011876) #23 ENSCGOG00000011915 ST7 (ENSCGOG00000012578) wnt2 (ENSCGOG00000012579) asz1 (ENSCGOG00000012583) cftr (ENSCGOG00000012633) ENSCGOG00000015576 ENSCGOG00000015580 ENSCGOG00000015611 ENSCGOG00000015736 gtse1 (ENSCGOG00000015945) atp2b1b (ENSCGOG00000015957) BET1L (ENSCGOG00000015967) deaf1 (ENSCGOG00000015969) GRAMD4 (ENSCGOG00000015982) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00640000091574 ENSGT00940000155352.gb.b 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ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000160413 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b.r.a.b ENSGT00940000158082.b.r.b ENSGT00940000158082.b.r.a.a ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022.l.a #23 ENSGT00390000016680 ENSGT00940000165477 ENSGT00390000016897.d ENSGT01100000263502.A.b.b.e ENSGT00940000158637 ENSGT00390000007685 ENSGT00390000000987.n ENSGT00390000000987.m ENSGT00940000155662.e.b ENSGT00940000180066 ENSGT00940000176351 ENSGT00390000011355.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b Channel catfish MODERN SPECIES 27 borcs5 (ENSIPUG00000013168) c8h12orf29 (ENSIPUG00000013206) ENSIPUG00000013245 ENSIPUG00000013281 TMTC3 (ENSIPUG00000013316) KITLG (ENSIPUG00000013385) ENSIPUG00000013475 ENSIPUG00000013500 dusp6 (ENSIPUG00000013507) POC1B (ENSIPUG00000013524) cep41 (ENSIPUG00000013607) CPA1 (ENSIPUG00000013685) cbpa1 (ENSIPUG00000013706) tes (ENSIPUG00000013766) cav2 (ENSIPUG00000013796) #21 cav1 (ENSIPUG00000013804) ##22 met (ENSIPUG00000013833) #23 ENSIPUG00000013918 ENSIPUG00000013941 ENSIPUG00000013928 ENSIPUG00000013949 ENSIPUG00000013959 SMPD3 (ENSIPUG00000013967) ENSIPUG00000013990 ENSIPUG00000014005 ENSIPUG00000014016 ENSIPUG00000014026 ENSIPUG00000014033 ENSIPUG00000014043 septin15 (ENSIPUG00000014056) ENSIPUG00000014084 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000157523.g.b ENSGT00390000015016 ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000157538.f ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000160413 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b.q ENSGT00940000158082.b.r.b ENSGT00940000158082.b.r.a.a ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 Electric eel MODERN SPECIES 414 ccnd2a (ENSEEEG00000007568) tigara (ENSEEEG00000007571) fgf6a (ENSEEEG00000007580) zgc:77158 (ENSEEEG00000007585) zgc:154077 (ENSEEEG00000007586) DYRK4 (ENSEEEG00000007588) ndufa9a (ENSEEEG00000007590) GALNT8 (ENSEEEG00000007598) dusp6 (ENSEEEG00000007660) ENSEEEG00000007664 cep41 (ENSEEEG00000007676) ENSEEEG00000007678 cpa1 (ENSEEEG00000007704) tes (ENSEEEG00000007809) cav2 (ENSEEEG00000007810) #21 cav1 (ENSEEEG00000007811) ##22 ENSEEEG00000007814 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 191 ENSGT00940000157523.g.b ENSGT00390000015016 ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000166588 ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000160413 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b.r.a.b ENSGT00940000158082.b.r.b ENSGT00940000158082.b.r.a.a ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 305 zgc:103499 (ENSPNAG00000006372) cep290 (ENSPNAG00000027091) ENSPNAG00000004087 kitlga (ENSPNAG00000026606) ENSPNAG00000026589 dusp6 (ENSPNAG00000026583) POC1B (ENSPNAG00000026557) cep41 (ENSPNAG00000026546) CPA1 (ENSPNAG00000006008) CPA1 (ENSPNAG00000026515) CPA1 (ENSPNAG00000026452) CPA1 (ENSPNAG00000026424) CPA1 (ENSPNAG00000026413) tes (ENSPNAG00000026400) cav2 (ENSPNAG00000004040) #21 cav1 (ENSPNAG00000026365) ##22 ENSPNAG00000026347 ENSPNAG00000026322 ENSPNAG00000004035 ENSPNAG00000026238 ENSPNAG00000026217 ENSPNAG00000026025 Mexicana tetra MODERN SPECIES 16 ENSAMXG00000043481 ENSAMXG00000029344 ENSAMXG00000044053 PCDH11Y (ENSAMXG00000011146) ENSAMXG00000041593 ENSAMXG00000011667 dusp6 (ENSAMXG00000043968) POC1B (ENSAMXG00000011656) ENSAMXG00000034962 cep41 (ENSAMXG00000037744) CPA1 (ENSAMXG00000034684) CPA1 (ENSAMXG00000011639) CPA1 (ENSAMXG00000011629) tes (ENSAMXG00000011622) cav2 (ENSAMXG00000036358) #21 cav1 (ENSAMXG00000030802) ##22 mxd3 (ENSAMXG00000039618) rnf103 (ENSAMXG00000036300) immt (ENSAMXG00000011592) ENSAMXG00000040680 ptcd3 (ENSAMXG00000011570) ENSAMXG00000011559 ENSAMXG00000011553 prpf19 (ENSAMXG00000011547) tcirg1b (ENSAMXG00000011532) mrnip (ENSAMXG00000035662) sqstm1 (ENSAMXG00000011526) mgat4b (ENSAMXG00000031451) ENSAMXG00000042248 ENSAMXG00000030588 canx (ENSAMXG00000015162) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT01100000264346 ENSGT00390000007975.a.b.b ENSGT00940000157523.g.b ENSGT00390000015016 ENSGT00500000044938 ENSGT00730000111039.C ENSGT00940000157538.f ENSGT00390000018272.i ENSGT00950000182953.B.b ENSGT00940000158342.b ENSGT00940000167617 ENSGT00390000002222 ENSGT00940000158082.b.o.b ENSGT00940000155993 ENSGT00950000183006.A.b #21 ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 ENSGT00940000158022.l.a #23 ENSGT00390000016680 ENSGT00940000160224 ENSGT00940000165477 ENSGT00390000016897.d ENSGT01100000263502.A.b.b ENSGT00940000158637 ENSGT00390000007685 ENSGT00390000000987.n ENSGT00390000000987.m ENSGT00940000155662.e.b ENSGT00940000180066 ENSGT00940000176351 ENSGT00390000011355.a Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 974 ENSGT00940000158082.b.o.b ENSGT00940000155993.e ENSGT00950000183006.A.b.j #21 ENSGT00950000183006.B.f.a.i ##22 ENSGT00940000158022.l.a.b #23 Goldfish MODERN SPECIES 45 galnt18a (ENSCARG00000069901) zgc:162634 (ENSCARG00000069907) btbd10a (ENSCARG00000069909) bmal1a (ENSCARG00000069955) borcs5 (ENSCARG00000070027) zgc:103499 (ENSCARG00000070035) cep290 (ENSCARG00000070057) TMTC3 (ENSCARG00000070095) ENSCARG00000070111 dusp6 (ENSCARG00000070124) poc1b (ENSCARG00000070125) cep41 (ENSCARG00000070126) CPA1 (ENSCARG00000070128) tes (ENSCARG00000070134) cav2 (ENSCARG00000070136) #21 cav1 (ENSCARG00000070137) ##22 met (ENSCARG00000070150) #23 ENSCARG00000070179 ENSCARG00000070180 ENSCARG00000070181 ENSCARG00000070182 ENSCARG00000070185 parietopsin (ENSCARG00000070187) ENSCARG00000070189 ENSCARG00000070201 tdg.1 (ENSCARG00000070207) samm50 (ENSCARG00000070212) CACNA2D4 (ENSCARG00000070254) LRTM2 (ENSCARG00000070299) ENSCARG00000070301 rlbp1b (ENSCARG00000070304) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 664 ENSGT00940000167617.b ENSGT00390000002222.r ENSGT00940000158082.b.o.b ENSGT00940000155993.e ENSGT00950000183006.A.b.j #21 ENSGT00950000183006.B.f.a.i ##22 ENSGT00940000158022.l.a.b #23 Golden-line barbel MODERN SPECIES 2036 cav2 (ENSSGRG00000008274) #21 cav1 (ENSSGRG00000008277) ##22 ENSSGRG00000008280 Common carp reference MODERN SPECIES 37 galnt18a (ENSCCRG00000018850) ENSCCRG00000053903 pth1a (ENSCCRG00000070549) btbd10a (ENSCCRG00000074745) bmal1a (ENSCCRG00000036467) borcs5 (ENSCCRG00000038864) zgc:103499 (ENSCCRG00000076025) TMTC3 (ENSCCRG00000032596) kitlga (ENSCCRG00000036401) dusp6 (ENSCCRG00000061132) poc1b (ENSCCRG00000072391) cep41 (ENSCCRG00000056040) cpa1 (ENSCCRG00000046612) tes (ENSCCRG00000046585) cav2 (ENSCCRG00000051030) #21 cav1 (ENSCCRG00000074353) ##22 met (ENSCCRG00000050913) #23 ENSCCRG00000059438 ENSCCRG00000050818 ENSCCRG00000050810 parietopsin (ENSCCRG00000050805) NT5DC3 (ENSCCRG00000050803) uqcc6 (ENSCCRG00000050802) TDG (ENSCCRG00000050800) tdg.1 (ENSCCRG00000050797) ENSCCRG00000050795 ENSCCRG00000050792 samm50 (ENSCCRG00000008590) ENSCCRG00000030965 ENSCCRG00000011805 ENSCCRG00000030963 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000157523.g.b.e.a 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NT5DC3 (ENSCARG00000011785) ENSCARG00000011752 tdg.1 (ENSCARG00000011739) ENSCARG00000011732 cav1 (ENSCARG00000011698) ##22 met (ENSCARG00000010298) #23 ENSCARG00000010189 ENSCARG00000010162 ENSCARG00000010150 ENSCARG00000010127 samm50 (ENSCARG00000010088) LRTM2 (ENSCARG00000010075) ENSCARG00000010062 ENSCARG00000010053 cav1 (ENSCARG00000010039) ##22 cav2 (ENSCARG00000010029) #21 tes (ENSCARG00000010012) cpa1 (ENSCARG00000009717) cep41 (ENSCARG00000009673) poc1b (ENSCARG00000009095) Goldfish MODERN SPECIES 17 MMP15 (ENSCARG00000004169) ENSCARG00000004300 ENSCARG00000005327 ELMO3 (ENSCARG00000005496) e2f4 (ENSCARG00000008555) e2f4 (ENSCARG00000008569) ENSCARG00000008609 setd6 (ENSCARG00000008807) cnot1 (ENSCARG00000008876) kdm7ab (ENSCARG00000009026) poc1b (ENSCARG00000009095) cep41 (ENSCARG00000009673) cpa1 (ENSCARG00000009717) tes (ENSCARG00000010012) cav2 (ENSCARG00000010029) #21 cav1 (ENSCARG00000010039) ##22 ENSCARG00000010053 ENSCARG00000010062 LRTM2 (ENSCARG00000010075) samm50 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btbd10a (ENSSGRG00000050851) BMAL1 (ENSSGRG00000050810) zgc:103499 (ENSSGRG00000050801) ENSSGRG00000050797 ENSSGRG00000050710 kitlga (ENSSGRG00000050708) ENSSGRG00000050707 dusp6 (ENSSGRG00000050706) poc1b (ENSSGRG00000050705) cep41 (ENSSGRG00000050704) ENSSGRG00000050703 cav2 (ENSSGRG00000050702) #21 cav1 (ENSSGRG00000050701) ##22 met (ENSSGRG00000050236) #23 ENSSGRG00000050227 ENSSGRG00000050226 ENSSGRG00000050224 ENSSGRG00000050222 ENSSGRG00000050220 ENSSGRG00000050219 tdg.1 (ENSSGRG00000050218) ENSSGRG00000050217 ENSSGRG00000050216 ENSSGRG00000050213 ENSSGRG00000050212 rlbp1b (ENSSGRG00000050207) mfge8b (ENSSGRG00000050185) hapln3 (ENSSGRG00000050183) Zebrafish MODERN SPECIES 17 btbd10a (ENSDARG00000062674) bmal1a (ENSDARG00000006791) borcs5 (ENSDARG00000077830) C25H12orf29 (ENSDARG00000045785) cep290 (ENSDARG00000062727) TMTC3 (ENSDARG00000062846) kitlga (ENSDARG00000070917) ENSDARG00000045792 dusp6 (ENSDARG00000070914) poc1b (ENSDARG00000021110) cep41 (ENSDARG00000038500) cpa1 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Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.f.a ##22 Hagfish MODERN SPECIES 47 ENSEBUG00000013433 cav1 (ENSEBUG00000003330) ##22 txnrd3 (ENSEBUG00000005809) ENSEBUG00000007184 ENSEBUG00000007454 psmd6 (ENSEBUG00000004609) EPYC (ENSEBUG00000007673) ENSEBUG00000004275 prkcda (ENSEBUG00000013178) ENSEBUG00000012155 nrf1 (ENSEBUG00000004634) ENSEBUG00000012945 idh3g (ENSEBUG00000012086) ENSEBUG00000006452 ENSEBUG00000007603 ENSEBUG00000013531 ENSEBUG00000008457 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.g ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.g ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.g ##22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.g ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183006.B.g ##22 Anura ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00530000063868.a ENSGT00530000063965 ENSGT00390000014365 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00940000155631 ENSGT00940000161296 ENSGT00940000159388 ENSGT00940000158855 ENSGT00940000158328 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