Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000013113 #7 ENSGT00390000000447 #8 ENSGT00730000111141 #9 ENSGT00390000000292.C #10 ENSGT00940000154065.b #11 ENSGT00940000155131 #12 ENSGT00940000160503 #13 ENSGT00940000158406 #14 ENSGT00940000158231 #15 ENSGT00510000049322 #16 ENSGT00940000162722 #17 ENSGT00940000161651 #18 ENSGT00390000016499 #19 ENSGT00390000000455.a #20 ENSGT00940000157964 #21 ENSGT00390000006278 #22 ENSGT00940000162103 #23 ENSGT00390000014210 #24 ENSGT00650000093475 #25 ENSGT00940000154267.B #26 ENSGT00940000161070 #27 ENSGT00530000063946.a #28 ENSGT00940000155551 #29 ENSGT00940000156294 #31 ENSGT00730000111463 #32 ENSGT00390000015202 #33 ENSGT00530000064274 #34 ENSGT00980000203465 ENSGT00940000162109.C ENSGT00730000111539 ENSGT00730000111511 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000013113 #7 ENSGT00390000000447 #8 ENSGT00730000111141 #9 ENSGT00390000000292.C #10 ENSGT00940000154065.b #11 ENSGT00940000155131 #12 ENSGT00940000160503 #13 ENSGT00940000158406 #14 ENSGT00940000158231 #15 ENSGT00510000049322 #16 ENSGT00940000162722 #17 ENSGT00940000161651 #18 ENSGT00390000016499 #19 ENSGT00390000000455.a #20 ENSGT00940000157964 #21 ENSGT00390000006278 #22 ENSGT00940000162103 #23 ENSGT00390000014210 #24 ENSGT00650000093475 #25 ENSGT00940000154267.B #26 ENSGT00940000161070 #27 ENSGT00530000063946.a #28 ENSGT00940000155551 #29 ENSGT00940000156294 #31 ENSGT00730000111463 #32 ENSGT00390000015202 #33 ENSGT00530000064274 #34 ENSGT00950000186330 ENSGT00730000111539 ENSGT00730000111511 ENSGT00860000134598 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000013113 #7 ENSGT00390000000447 #8 ENSGT00730000111141 #9 ENSGT00390000000292.C #10 ENSGT00940000154065.b #11 ENSGT00940000155131 #12 ENSGT00940000160503 #13 ENSGT00940000158406 #14 ENSGT00940000158231 #15 ENSGT00510000049322 #16 ENSGT00940000162722 #17 ENSGT00940000161651 #18 ENSGT00390000016499 #19 ENSGT00390000000455.a #20 ENSGT00940000157964 #21 ENSGT00390000006278 #22 ENSGT00940000162103 #23 ENSGT00390000014210 #24 ENSGT00650000093475 #25 ENSGT00940000154267.B #26 ENSGT00940000161070 #27 ENSGT00530000063946.a #28 ENSGT00940000155551 #29 ENSGT00940000156294 #31 ENSGT00730000111463 #32 ENSGT00390000015202 #33 ENSGT00530000064274 #34 ENSGT00950000186330 ENSGT00730000111539 ENSGT00730000111511 ENSGT00860000134598 Squirrel MODERN SPECIES 100 CRYZL1 (ENSSTOG00000008756) #7 DONSON (ENSSTOG00000008739) #8 SON (ENSSTOG00000020593) #9 GART (ENSSTOG00000008673) #10 DNAJC28 (ENSSTOG00000023797) #11 TMEM50B (ENSSTOG00000023740) #12 IFNGR2 (ENSSTOG00000000532) #13 IFNAR1 (ENSSTOG00000014989) #14 IL10RB (ENSSTOG00000001273) #15 IFNAR2 (ENSSTOG00000001265) #16 OLIG1 (ENSSTOG00000027713) #17 OLIG2 (ENSSTOG00000020899) #18 C21orf62 (ENSSTOG00000032411) #19 PAXBP1 (ENSSTOG00000014055) #20 SYNJ1 (ENSSTOG00000015806) #21 CFAP298 (ENSSTOG00000015799) #22 EVA1C (ENSSTOG00000026039) #23 URB1 (ENSSTOG00000004539) #24 ENSSTOG00000021442 #25 MIS18A (ENSSTOG00000004511) #26 HUNK (ENSSTOG00000024744) #27 SCAF4 (ENSSTOG00000004450) #28 SOD1 (ENSSTOG00000004434) #29 ENSSTOG00000030549 #30 TIAM1 (ENSSTOG00000005851) #31 KRTAP11-1 (ENSSTOG00000024635) #32 KRTAP7-1 (ENSSTOG00000021190) #33 KRTAP8-1 (ENSSTOG00000026383) #34 ENSSTOG00000034286 #35 ENSSTOG00000019958 #36 ENSSTOG00000031728 #37 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 121 ITSN1 (ENSUPAG00010002517) CRYZL1 (ENSUPAG00010002392) #7 DONSON (ENSUPAG00010002359) #8 SON (ENSUPAG00010002114) #9 GART (ENSUPAG00010002059) #10 DNAJC28 (ENSUPAG00010002056) #11 TMEM50B (ENSUPAG00010002016) #12 IFNGR2 (ENSUPAG00010002009) #13 IFNAR1 (ENSUPAG00010002002) #14 IL10RB (ENSUPAG00010001990) #15 IFNAR2 (ENSUPAG00010001980) #16 OLIG2 (ENSUPAG00010001977) #18 C21orf62 (ENSUPAG00010001971) #19 PAXBP1 (ENSUPAG00010001936) #20 SYNJ1 (ENSUPAG00010001714) #21 CFAP298 (ENSUPAG00010001693) #22 EVA1C (ENSUPAG00010001637) #23 URB1 (ENSUPAG00010001432) #24 MRAP (ENSUPAG00010001416) #25 MIS18A (ENSUPAG00010001398) #26 HUNK (ENSUPAG00010001365) #27 SCAF4 (ENSUPAG00010001272) #28 SOD1 (ENSUPAG00010001261) #29 TIAM1 (ENSUPAG00010001067) #31 KRTAP11-1 (ENSUPAG00010001054) #32 KRTAP7-1 (ENSUPAG00010001047) #33 KRTAP8-1 (ENSUPAG00010001044) #34 ENSUPAG00010001037 ENSUPAG00010001033 Alpin marmot MODERN SPECIES 4 CRYZL1 (ENSMMMG00000001338) #7 DONSON (ENSMMMG00000001308) #8 SON (ENSMMMG00000001137) #9 GART (ENSMMMG00000001006) #10 DNAJC28 (ENSMMMG00000000995) #11 TMEM50B (ENSMMMG00000000981) #12 IFNGR2 (ENSMMMG00000000863) #13 IFNAR1 (ENSMMMG00000000814) #14 ENSMMMG00000000809 IL10RB (ENSMMMG00000000798) #15 IFNAR2 (ENSMMMG00000000794) #16 OLIG2 (ENSMMMG00000000776) #18 C21orf62 (ENSMMMG00000000764) #19 PAXBP1 (ENSMMMG00000000713) #20 SYNJ1 (ENSMMMG00000000553) #21 CFAP298 (ENSMMMG00000000468) #22 ENSMMMG00000000442 EVA1C (ENSMMMG00000000337) #23 URB1 (ENSMMMG00000000218) #24 MRAP (ENSMMMG00000000197) #25 MIS18A (ENSMMMG00000000183) #26 HUNK (ENSMMMG00000000145) #27 SCAF4 (ENSMMMG00000000119) #28 SOD1 (ENSMMMG00000000101) #29 ENSMMMG00000018610 TIAM1 (ENSMMMG00000018539) #31 KRTAP11-1 (ENSMMMG00000018525) #32 KRTAP7-1 (ENSMMMG00000018520) #33 KRTAP8-1 (ENSMMMG00000018516) #34 ENSMMMG00000018510 ENSMMMG00000018449 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 1 ENSSVLG00005024353 #9 ENSSVLG00005024374 #10 DNAJC28 (ENSSVLG00005024390) #11 TMEM50B (ENSSVLG00005024403) #12 ENSSVLG00005024424 #13 ENSSVLG00005024436 IFNAR1 (ENSSVLG00005024454) #14 ENSSVLG00005024477 IL10RB (ENSSVLG00005024491) #15 ENSSVLG00005024535 #16 OLIG1 (ENSSVLG00005024562) #17 OLIG2 (ENSSVLG00005024572) #18 C21orf62 (ENSSVLG00005024581) #19 PAXBP1 (ENSSVLG00005024598) #20 SYNJ1 (ENSSVLG00005024795) #21 CFAP298 (ENSSVLG00005024931) #22 EVA1C (ENSSVLG00005008630) #23 URB1 (ENSSVLG00005008739) #24 ENSSVLG00005008770 ENSSVLG00005008802 #25 MIS18A (ENSSVLG00005008836) #26 ENSSVLG00005008885 #27 SCAF4 (ENSSVLG00005008966) #28 SOD1 (ENSSVLG00005009037) #29 TIAM1 (ENSSVLG00005009172) #31 KRTAP11-1 (ENSSVLG00005009539) #32 KRTAP7-1 (ENSSVLG00005009553) #33 KRTAP8-1 (ENSSVLG00005009568) #34 ENSSVLG00005009585 ENSSVLG00005009741 KRTAP19-5 (ENSSVLG00005009758)