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Glires	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153352.B	ENSGT00400000024767	ENSGT00940000155809	ENSGT00940000155257	ENSGT00940000157716	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.a #10	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.b #11	ENSGT00530000063534.b #13	ENSGT01050000244827.D.b.b #14	ENSGT00940000162030 #15	ENSGT00940000155351 #16	ENSGT00530000064714 #17	ENSGT00390000018550 #18	ENSGT00940000161242 #19	ENSGT00940000156184 #20	ENSGT00390000000909 #22	ENSGT00940000157732 #24	ENSGT00940000156696.B #25	ENSGT01030000234610.b.a.b.b #26	ENSGT01030000234610.b.a.b.a #27	ENSGT01030000234610.b.a.a #28	ENSGT00390000012228 #29	ENSGT00390000015489 #30	ENSGT00940000153342.a #31	ENSGT00940000158034 #32	ENSGT00940000154418.a.a #33	ENSGT00940000162369	ENSGT00940000159034 #35	ENSGT00390000001742.a #36	ENSGT00390000015849 #37	ENSGT00940000155588.b
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159529	ENSGT00940000153352.B	ENSGT00940000155809	ENSGT00940000155257	ENSGT00940000157716	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.a #10	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.b #11	ENSGT00530000063534.b #13	ENSGT01050000244827.D.b.b #14	ENSGT00940000162030 #15	ENSGT00940000155351 #16	ENSGT00530000064714 #17	ENSGT00390000018550 #18	ENSGT00940000161242 #19	ENSGT00940000156184 #20	ENSGT00390000000909 #22	ENSGT00940000157732 #24	ENSGT00940000156696.B #25	ENSGT01030000234610.b.a.b.b #26	ENSGT01030000234610.b.a.b.a #27	ENSGT01030000234610.b.a.a #28	ENSGT00390000012228 #29	ENSGT00390000015489 #30	ENSGT00940000153342.a #31	ENSGT00940000158034 #32	ENSGT00940000154418.a.a #33	ENSGT00940000163289.b #34	ENSGT00940000159034 #35	ENSGT00390000001742.a #36	ENSGT00390000015849 #37	ENSGT00940000155588.b
Rabbit	MODERN SPECIES	9	ENSOCUG00000039094 #7	ENSOCUG00000037965 #8	ENSOCUG00000016851 #9	SORCS1 (ENSOCUG00000000972) #10	SORCS3 (ENSOCUG00000013880) #11	ENSOCUG00000031917 #12	CFAP58 (ENSOCUG00000008719) #13	ITPRIP (ENSOCUG00000008713) #14	GSTO2 (ENSOCUG00000008708) #15	GSTO1 (ENSOCUG00000008702) #16	CFAP43 (ENSOCUG00000008688) #17	SFR1 (ENSOCUG00000012794) #18	COL17A1 (ENSOCUG00000003049) #19	SLK (ENSOCUG00000003035) #20	ENSOCUG00000038741 #21	STN1 (ENSOCUG00000003028) #22	ENSOCUG00000037086 #23	SH3PXD2A (ENSOCUG00000013769) #24	NEURL1 (ENSOCUG00000013760) #25	CALHM3 (ENSOCUG00000025668) #26	CALHM1 (ENSOCUG00000027986) #27	CALHM2 (ENSOCUG00000006336) #28	PDCD11 (ENSOCUG00000006312) #29	ENSOCUG00000033131 #30	TAF5 (ENSOCUG00000006303) #31	PCGF6 (ENSOCUG00000012441) #32	INA (ENSOCUG00000004969) #33	ENSOCUG00000009107 #34	CNNM2 (ENSOCUG00000009098) #35	AS3MT (ENSOCUG00000000626) #36	ENSOCUG00000037788 #37
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Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000153352.B	ENSGT00400000024767	ENSGT00940000155809	ENSGT00940000155257	ENSGT00940000157716	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.a #10	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.b #11	ENSGT00530000063534.b #13	ENSGT01050000244827.D.b.b #14	ENSGT00940000162030 #15	ENSGT00940000155351 #16	ENSGT00530000064714 #17	ENSGT00390000018550 #18	ENSGT00940000161242 #19	ENSGT00940000156184 #20	ENSGT00390000000909 #22	ENSGT00940000157732 #24	ENSGT00940000156696.B #25	ENSGT01030000234610.b.a.b.b #26	ENSGT01030000234610.b.a.b.a #27	ENSGT01030000234610.b.a.a #28	ENSGT00390000012228 #29	ENSGT00390000015489 #30	ENSGT00940000153342.a #31	ENSGT00940000158034 #32	ENSGT00940000154418.a.a #33	ENSGT00940000162369	ENSGT00940000159034 #35	ENSGT00390000001742.a #36	ENSGT00390000015849 #37	ENSGT00940000155588.b
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153352.B	ENSGT00400000024767	ENSGT00940000155809	ENSGT00940000155257	ENSGT00940000157716	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.a #10	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.b #11	ENSGT00530000063534.b #13	ENSGT01050000244827.D.b.b #14	ENSGT00940000162030 #15	ENSGT00940000155351 #16	ENSGT00530000064714 #17	ENSGT00390000018550 #18	ENSGT00940000161242 #19	ENSGT00940000156184 #20	ENSGT00390000000909 #22	ENSGT00940000157732 #24	ENSGT00940000156696.B #25	ENSGT01030000234610.b.a.b.b #26	ENSGT01030000234610.b.a.b.a #27	ENSGT01030000234610.b.a.a #28	ENSGT00390000012228 #29	ENSGT00390000015489 #30	ENSGT00940000153342.a #31	ENSGT00940000158034 #32	ENSGT00940000154418.a.a #33	ENSGT00940000162369	ENSGT00940000159034 #35	ENSGT00390000001742.a #36	ENSGT00390000015849 #37	ENSGT00940000155588.b
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Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153352.B	ENSGT00400000024767	ENSGT00940000155809	ENSGT00940000155257	ENSGT00940000157716	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.a #10	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.b #11	ENSGT00530000063534.b #13	ENSGT01050000244827.D.b.b #14	ENSGT00940000162030 #15	ENSGT00940000155351 #16	ENSGT00530000064714 #17	ENSGT00390000018550 #18	ENSGT00940000161242 #19	ENSGT00940000156184 #20	ENSGT00390000000909 #22	ENSGT00940000157732 #24	ENSGT00940000156696.B #25	ENSGT01030000234610.b.a.b.b #26	ENSGT01030000234610.b.a.b.a #27	ENSGT01030000234610.b.a.a #28	ENSGT00390000012228 #29	ENSGT00390000015489 #30	ENSGT00940000153342.a #31	ENSGT00940000158034 #32	ENSGT00940000154418.a.a #33	ENSGT00940000162369	ENSGT00940000159034 #35	ENSGT00390000001742.a #36	ENSGT00390000015849 #37	ENSGT00940000155588.b
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Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159529	ENSGT00940000153352.B.e	ENSGT00940000155809	ENSGT00940000155257.e	ENSGT00940000157716	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.a #10	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.b #11	ENSGT00530000063534.b #13	ENSGT01050000244827.D.b.b #14	ENSGT00940000162030 #15	ENSGT00940000155351 #16	ENSGT00530000064714 #17	ENSGT00390000018550 #18	ENSGT00940000161242 #19	ENSGT00940000156184 #20	ENSGT00390000000909 #22	ENSGT00940000157732 #24	ENSGT00940000156696.B #25	ENSGT01030000234610.b.a.b.b #26	ENSGT01030000234610.b.a.b.a #27	ENSGT01030000234610.b.a.a #28	ENSGT00390000012228 #29	ENSGT00390000015489 #30	ENSGT00940000153342.a #31	ENSGT00940000158034 #32	ENSGT00940000154418.a.a #33	ENSGT00940000162369	ENSGT00940000159034 #35	ENSGT00390000001742.a #36	ENSGT00390000015849 #37	ENSGT00940000155588.b
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Mus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155809	ENSGT00400000024767	ENSGT00940000155257	ENSGT00940000157716	ENSGT00390000015440.a	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.a #10	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.b #11	ENSGT00530000063534.b #13	ENSGT01050000244827.D.b.b #14	ENSGT00940000162030 #15	ENSGT00940000155351 #16	ENSGT00530000064714 #17	ENSGT00390000018550 #18	ENSGT00940000161242 #19	ENSGT00940000156184 #20	ENSGT00390000000909 #22	ENSGT00940000157732 #24	ENSGT00940000156696.B #25	ENSGT00940000162950.c	ENSGT01030000234610.b.a.b.b #26	ENSGT01030000234610.b.a.b.a #27	ENSGT01030000234610.b.a.a #28	ENSGT00390000012228 #29	ENSGT00390000015489 #30	ENSGT00940000153342.a #31	ENSGT00940000158034 #32	ENSGT00940000154418.a.a #33	ENSGT00940000162369	ENSGT00940000159034 #35	ENSGT00390000001742.a #36	ENSGT00390000015849 #37
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