Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 265 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023 ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000162477 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000165711 ENSGT00940000161275 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023 ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000176900 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00940000160174 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000159413 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00940000167949 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 ENSGT00390000004172 ENSGT01090000260082.d.b ENSGT00940000160610 ENSGT00940000167198 ENSGT00940000156034.a Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00940000160174 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156509 ENSGT00940000159413 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00940000167949 ENSGT00950000182941.a.a.a ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000155086.A Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00940000165353 ENSGT00390000018318 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00940000160174 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000159413 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183163.a.b ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00390000018318 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00940000160174 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000156274 ENSGT01080000257573 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000159413 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000166976 ENSGT00940000155086.B Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 634 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00950000182985.b.a #22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 995 ENSGT00940000155726.qb ENSGT00940000156274.p ENSGT00940000156248.e.b.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00950000182985.b.a #22 Huchen MODERN SPECIES 8295 ppp1r14c (ENSHHUG00000005699) #22 Huchen MODERN SPECIES 12589 ppp1r14c (ENSHHUG00000016785) ##22 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT01070000253766.C.o.a.g.a ENSGT00940000159157 ENSGT00940000171557 ENSGT00390000018318 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00940000160174.e ENSGT00940000155712 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155726.pb ENSGT00940000156799 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156248.f ENSGT01080000257573.b.b ENSGT00940000156248.e.b.a ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00950000182985.b.a.g #22 ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165.j ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000171406 ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000166083.e.b ENSGT00390000016516 ENSGT00940000158032 ENSGT00390000002693 ENSGT00490000043329.a.b.g.b.n ENSGT00940000153739.a.b.s.h ENSGT00940000156975 ENSGT00530000063834.e.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000014037.c.g ENSGT01070000253766.C.o.a.g.a ENSGT00940000159157 ENSGT00390000018318 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00940000160174.e ENSGT00940000155712 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155726.pb ENSGT00940000156799 ENSGT00650000094590 ENSGT00940000156248.f ENSGT01080000257573.b.b ENSGT00940000156248.e.b.a ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00950000182985.b.a.g #22 ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165.j ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000171406 ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000166083.e.b ENSGT00390000016516 ENSGT00940000158032 ENSGT00390000002693 ENSGT00940000153739.a.b.s.h ENSGT00940000156975 ENSGT00530000063834.e.b ENSGT01030000234626.A.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 25 pinx1 (ENSSSAG00000083381) tdh (ENSSSAG00000120478) XKR6 (ENSSSAG00000048936) ENSSSAG00000046040 sh3bgrl2 (ENSSSAG00000111685) rps12 (ENSSSAG00000052194) eya4 (ENSSSAG00000052176) tcf21 (ENSSSAG00000053635) tbpl1 (ENSSSAG00000053615) ENSSSAG00000093466 SGK1 (ENSSSAG00000102243) aldh8a1 (ENSSSAG00000002134) ENSSSAG00000053648 myb (ENSSSAG00000053590) mtfr2 (ENSSSAG00000053623) ENSSSAG00000115865 #22 DDX1 (ENSSSAG00000101660) ENSSSAG00000093246 nbas (ENSSSAG00000100596) ENSSSAG00000058661 ENSSSAG00000049424 lratd1 (ENSSSAG00000116758) sec63 (ENSSSAG00000106527) ENSSSAG00000002210 ENSSSAG00000093825 ENSSSAG00000002244 ENSSSAG00000109824 ENSSSAG00000099516 ENSSSAG00000113910 ENSSSAG00000097224 ENSSSAG00000054138 River trout MODERN SPECIES ENSSTUG00000001623 ENSSTUG00000001615 sox7 (ENSSTUG00000001611) pinx1 (ENSSTUG00000001608) tdh (ENSSTUG00000001594) xkr6b (ENSSTUG00000001583) sh3bgrl2 (ENSSTUG00000001573) rps12 (ENSSTUG00000001562) eya4 (ENSSTUG00000001100) tcf21 (ENSSTUG00000001059) tbpl1 (ENSSTUG00000001048) aldh8a1 (ENSSTUG00000001029) ENSSTUG00000001015 ENSSTUG00000001004 mtfr2 (ENSSTUG00000000980) ppp1r14c (ENSSTUG00000000971) #22 lratd1 (ENSSTUG00000000963) ENSSTUG00000000958 sec63 (ENSSTUG00000000871) iyd (ENSSTUG00000000807) ENSSTUG00000000796 ENSSTUG00000000661 runx2b (ENSSTUG00000000618) ost4 (ENSSTUG00000000615) agbl5 (ENSSTUG00000000601) tmem214 (ENSSTUG00000000572) KIF3C (ENSSTUG00000000496) rab10 (ENSSTUG00000000486) GAREM2 (ENSSTUG00000000473) hadhb (ENSSTUG00000000072) tfap2d (ENSSTUG00000000070) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.a.g #22 Coho salmon MODERN SPECIES 13 ENSOKIG00005043191 ENSOKIG00005043172 ENSOKIG00005043161 ENSOKIG00005043148 ENSOKIG00005043131 ENSOKIG00005043110 slc2a12 (ENSOKIG00005043047) ENSOKIG00005043035 aldh8a1 (ENSOKIG00005043002) ENSOKIG00005042854 ENSOKIG00005042833 ENSOKIG00005042813 ENSOKIG00005042792 mtfr2 (ENSOKIG00005042772) ENSOKIG00005042756 ENSOKIG00005042743 #22 xkr6b (ENSOKIG00005042709) tdh (ENSOKIG00005042692) pinx1 (ENSOKIG00005042639) sox7 (ENSOKIG00005042632) ENSOKIG00005042523 FNDC4 (ENSOKIG00005042506) ENSOKIG00005042491 ENSOKIG00005042477 znf513a (ENSOKIG00005042468) ENSOKIG00005042462 snx17 (ENSOKIG00005041951) atraid (ENSOKIG00005041910) eif2b4 (ENSOKIG00005041038) ENSOKIG00005040994 nme6 (ENSOKIG00005040986) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00390000004923.B.a ENSGT00940000154242.a.d ENSGT00940000161092.d ENSGT00390000014037.c.h ENSGT00940000157818 ENSGT01070000253766.C.o.a.g.b ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000159097 ENSGT00560000077266.a ENSGT00940000160174.f ENSGT00940000155726.qb ENSGT00940000156274.p ENSGT00940000156248.e.b.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00950000182985.b.a.h #22 ENSGT00940000161165.i ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000166083.e.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00940000155566.w ENSGT00950000183117.b ENSGT00490000043329.a.b.g.b.m ENSGT00940000155459.x.a ENSGT00940000153739.a.b.s.g Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00390000004923.B.a ENSGT00940000175432 ENSGT00940000161092.d ENSGT00390000014037.c.h ENSGT00940000157818 ENSGT01070000253766.C.o.a.g.b ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000159097 ENSGT00560000077266.a ENSGT00940000160174.f ENSGT00940000155726.qb ENSGT00940000156274.p ENSGT00940000156248.e.b.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00950000182985.b.a.h #22 ENSGT00940000161165.i ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000166083.e.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00940000155566.w ENSGT00950000183117.b ENSGT00390000016516.f.a ENSGT00490000043329.a.b.g.b.m ENSGT00940000155459.x.a ENSGT00940000153739.a.b.s.g ENSGT00940000156975.n.b ENSGT00950000182848.d.f Rainbow trout MODERN SPECIES 29 ENSOMYG00000053991 KIF3C (ENSOMYG00000025146) ENSOMYG00000063999 ENSOMYG00000060536 DNMT3A (ENSOMYG00000008370) ENSOMYG00000067532 ENSOMYG00000063049 ENSOMYG00000055202 ENSOMYG00000008519 ENSOMYG00000008565 ENSOMYG00000062251 ENSOMYG00000070205 ENSOMYG00000001421 ENSOMYG00000054045 ENSOMYG00000019693 ENSOMYG00000060391 #22 ENSOMYG00000068643 ENSOMYG00000077823 ENSOMYG00000064844 ENSOMYG00000027370 ENSOMYG00000016143 ENSOMYG00000063433 ENSOMYG00000071634 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00940000165540.d ENSGT00390000004923.B.a ENSGT00940000175432 ENSGT00940000161092.d ENSGT00390000014037.c.h ENSGT00940000157818 ENSGT01070000253766.C.o.a.g.b ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000159097 ENSGT00560000077266.a ENSGT00940000160174.f ENSGT00940000156274.p ENSGT00940000156248.e.b.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00950000182985.b.a.h #22 ENSGT00940000161165.i ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000166083.e.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00940000155566.w ENSGT00950000183117.b ENSGT00390000016516.e ENSGT00490000043329.a.b.g.b.m Coho salmon MODERN SPECIES 3 sox7 (ENSOKIG00005008971) tdh (ENSOKIG00005008939) mtmr9 (ENSOKIG00005008912) ccm2 (ENSOKIG00005008509) fam167ab (ENSOKIG00005008442) ENSOKIG00005008429 zgc:153284 (ENSOKIG00005008413) rps12 (ENSOKIG00005008392) ENSOKIG00005008385 tcf21 (ENSOKIG00005008375) hbs1l (ENSOKIG00005008024) ENSOKIG00005007893 armc1l (ENSOKIG00005007864) ENSOKIG00005007821 ENSOKIG00005007810 PPP1R14C (ENSOKIG00005007794) #22 ENSOKIG00005007781 lratd1 (ENSOKIG00005007751) ENSOKIG00005007745 runx2b (ENSOKIG00005007701) ENSOKIG00005007679 PHIP (ENSOKIG00005006050) tbx18 (ENSOKIG00005005781) selenoi (ENSOKIG00005005717) ost4 (ENSOKIG00005005701) MAPRE3 (ENSOKIG00005005678) KIF3C (ENSOKIG00005005638) rab10 (ENSOKIG00005005622) tfap2d (ENSOKIG00005005616) ENSOKIG00005005605 Chinook salmon MODERN SPECIES 913 ppp1r14c (ENSOTSG00005038822) #22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000004923.B.a ENSGT00940000154242.a.d ENSGT00940000161092.d ENSGT00390000014037.c.h ENSGT00940000157818 ENSGT01070000253766.C.o.a.g.b ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000159097 ENSGT00560000077266.a ENSGT00940000171557 ENSGT00940000160174.f ENSGT00940000156274.p ENSGT00940000156248.e.b.b ENSGT00940000164948 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00950000182985.b.a.h #22 ENSGT00940000161165.i ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000166083.e.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00940000155566.w ENSGT00950000183117.b ENSGT00490000043329.a.b.g.b.m ENSGT00940000155459.x.a ENSGT00940000153739.a.b.s.g Atlantic salmon MODERN SPECIES 6 ENSSSAG00000118670 ENSSSAG00000087736 XKR6 (ENSSSAG00000053569) ENSSSAG00000048104 ENSSSAG00000094955 ENSSSAG00000084478 SH3L3 (ENSSSAG00000048914) rps12 (ENSSSAG00000100974) tcf21 (ENSSSAG00000096772) SGK1 (ENSSSAG00000058955) ENSSSAG00000089812 HBS1L (ENSSSAG00000065234) MYB (ENSSSAG00000065168) armc1l (ENSSSAG00000100347) ENSSSAG00000110032 ENSSSAG00000085875 #22 ENSSSAG00000111755 ENSSSAG00000048091 ENSSSAG00000002148 ENSSSAG00000111511 ENSSSAG00000117369 hmgn3 (ENSSSAG00000099936) ENSSSAG00000097093 ENSSSAG00000097427 ENSSSAG00000054711 tbx18 (ENSSSAG00000107202) selenoi (ENSSSAG00000059365) ENSSSAG00000081879 ENSSSAG00000112119 KIF3C (ENSSSAG00000120471) ENSSSAG00000122164 Northern pike MODERN SPECIES 17 sh3bgrl2 (ENSELUG00000005914) ENSELUG00000031944 rps12 (ENSELUG00000005935) eya4 (ENSELUG00000006225) tcf21 (ENSELUG00000006291) tbpl1 (ENSELUG00000006318) slc2a12 (ENSELUG00000006333) SGK1 (ENSELUG00000000202) ENSELUG00000030676 aldh8a1 (ENSELUG00000006417) hbs1l (ENSELUG00000006444) myb (ENSELUG00000006491) mtfr2 (ENSELUG00000006523) armc1l (ENSELUG00000006566) ENSELUG00000006639 ppp1r14c (ENSELUG00000030754) #22 DDX1 (ENSELUG00000006743) nbas (ENSELUG00000007088) ENSELUG00000033088 lratd1 (ENSELUG00000025774) sec63 (ENSELUG00000007214) iyd (ENSELUG00000007281) itsn2a (ENSELUG00000007309) ENSELUG00000007344 ENSELUG00000007505 runx2b (ENSELUG00000007656) ENSELUG00000025146 clic5b (ENSELUG00000007750) enpp5 (ENSELUG00000007776) ENSELUG00000033400 PHIP (ENSELUG00000007846) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000165654 ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00940000157463.b ENSGT01010000229923 ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a #22 Cod MODERN SPECIES 13 esrrgb (ENSGMOG00000024251) si:ch73-21k16.4 (ENSGMOG00000033019) ENSGMOG00000001619 ENSGMOG00000001645 ENSGMOG00000012764 ENSGMOG00000026317 ENSGMOG00000018430 ENSGMOG00000018442 ENSGMOG00000011300 nbas (ENSGMOG00000011251) ENSGMOG00000019937 ENSGMOG00000026853 ENSGMOG00000035117 sec63 (ENSGMOG00000001044) ENSGMOG00000001040 ENSGMOG00000001031 #22 ENSGMOG00000024559 ENSGMOG00000029351 ENSGMOG00000030197 ENSGMOG00000024697 vrtn (ENSGMOG00000030935) syndig1l (ENSGMOG00000022880) dll4 (ENSGMOG00000006005) chac1 (ENSGMOG00000006018) ino80 (ENSGMOG00000006031) vps18 (ENSGMOG00000006080) rhov (ENSGMOG00000025331) pigh (ENSGMOG00000006099) ENSGMOG00000006111 wdr21 (ENSGMOG00000006130) dpf3 (ENSGMOG00000006148) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT01010000229923 ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT01080000257573 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000163299.B.b.b.g.a Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 16 DDX1 (ENSMMDG00005008779) nbas (ENSMMDG00005007487) lratd1 (ENSMMDG00005007437) MTLN (ENSMMDG00005007435) ENSMMDG00005007434 ENSMMDG00005007432 sec63 (ENSMMDG00005007427) iyd (ENSMMDG00005007418) ppp1r14c (ENSMMDG00005007415) #22 ENSMMDG00005007408 armc1l (ENSMMDG00005007406) mtfr2 (ENSMMDG00005007404) PDE7B (ENSMMDG00005006790) myb (ENSMMDG00005006547) hbs1l (ENSMMDG00005006508) aldh8a1 (ENSMMDG00005006495) SGK1 (ENSMMDG00005006445) slc2a12 (ENSMMDG00005006427) tbpl1 (ENSMMDG00005006420) tcf21 (ENSMMDG00005006416) eya4 (ENSMMDG00005006387) rps12 (ENSMMDG00005006376) ENSMMDG00005006360 sh3bgrl2 (ENSMMDG00005006358) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT01010000229923 ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT01080000257573 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 465 kidins220b (ENSHCOG00000000223) ENSHCOG00000000229 ENSHCOG00000007192 cpsf3 (ENSHCOG00000007251) ADAM17 (ENSHCOG00000007264) taf1b (ENSHCOG00000000234) klf11a (ENSHCOG00000000673) RRM2 (ENSHCOG00000000242) ENSHCOG00000007346 ENSHCOG00000007365 ENSHCOG00000007373 ubr7 (ENSHCOG00000007377) ASB2 (ENSHCOG00000007421) sec63 (ENSHCOG00000007466) iyd (ENSHCOG00000007479) ppp1r14c (ENSHCOG00000007490) #22 ENSHCOG00000007512 armc1l (ENSHCOG00000007533) mtfr2 (ENSHCOG00000007539) PDE7B (ENSHCOG00000007553) myb (ENSHCOG00000007560) hbs1l (ENSHCOG00000007581) aldh8a1 (ENSHCOG00000007598) SGK1 (ENSHCOG00000007633) CNIH3 (ENSHCOG00000007653) ENSHCOG00000007667 ptchd4 (ENSHCOG00000007675) opn5 (ENSHCOG00000007694) cd2ap (ENSHCOG00000007770) tnfrsf21 (ENSHCOG00000007783) ENSHCOG00000007789 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT01010000229923 ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT01080000257573 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00970000193390.c.a.a.b ENSGT01030000234583.a.a.c.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000165654 ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT01080000257573 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT01030000234583.a.a.c.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000017627.a.a.a ENSGT00940000165654 ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 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ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s ENSGT00940000166622 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156549.a.b ENSGT00940000153634.b.b ENSGT00390000017627.a.a.a ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00950000182941.a.a.a.a.c ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000176295 ENSGT00940000166622 Chinese medaka MODERN SPECIES 796 naga (ENSOSIG00000015738) ENSOSIG00000015744 wdr26b (ENSOSIG00000015800) fez2b 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ENSGT00940000160174 ENSGT01030000234583.a.a.c.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000153634.b.b ENSGT00390000017627.a.a.a ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 Mummichog MODERN SPECIES 2255 fez2b (ENSFHEG00000008834) esrrgb (ENSFHEG00000008797) si:ch73-21k16.4 (ENSFHEG00000008699) LPIN1 (ENSFHEG00000008634) ENSFHEG00000008571 ENSFHEG00000008549 ENSFHEG00000008545 ENSFHEG00000008502 DDX1 (ENSFHEG00000008444) nbas 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ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT01030000234583.a.a.c.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000166622.m.b Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000017627.a.a.a ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l.g ENSGT00940000171406 ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT01030000234583.a.a.c.b.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000166622.m.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000017627.a.a.a 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SPECIES 14 ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000171406 ENSGT00530000064185 ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT01010000229923 ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00940000163520.A.a.a.a.a.a.a.g.a.b.b ENSGT00970000193390.c.a.a.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000153634.b.b ENSGT00390000017627.a.a.a ENSGT00940000165654 ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000164632.b.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00970000193390.c.a.a.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s Lumpfish MODERN SPECIES 16 ENSCLMG00005012107 wdr26b (ENSCLMG00005012234) fez2b (ENSCLMG00005012791) esrrgb (ENSCLMG00005012792) si:ch73-21k16.4 (ENSCLMG00005012793) LPIN1 (ENSCLMG00005012806) ENSCLMG00005012886 ENSCLMG00005012890 DDX1 (ENSCLMG00005012911) nbas (ENSCLMG00005013273) lratd1 (ENSCLMG00005015535) MTLN (ENSCLMG00005015536) ENSCLMG00005015537 sec63 (ENSCLMG00005015538) iyd (ENSCLMG00005015549) ppp1r14c (ENSCLMG00005015550) #22 ENSCLMG00005015551 armc1l (ENSCLMG00005015552) mtfr2 (ENSCLMG00005015553) PDE7B (ENSCLMG00005015554) myb 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ENSGT00940000156549.a.b ENSGT00390000017627.a.a.a ENSGT00940000153433.B.a.a ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000157219.e ENSGT00520000055570.B.l ENSGT00940000155936.a.b ENSGT00940000155678 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000007551 ENSGT00940000157463.b ENSGT00390000001965 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00950000182941.a.a.a.a ENSGT00940000164948 ENSGT00950000183215.c.a.a ENSGT00940000159413 ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712.l ENSGT00940000155712.k ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s Tetraodon MODERN SPECIES 5 rsph9 (ENSTNIG00000000503) mrps18a (ENSTNIG00000016302) ENSTNIG00000016303 si:ch73-21k16.4 (ENSTNIG00000016304) LPIN1 (ENSTNIG00000016305) GNPAT (ENSTNIG00000016306) ENSTNIG00000000786 ENSTNIG00000016307 itsn2a (ENSTNIG00000016308) DDX1 (ENSTNIG00000016309) nbas (ENSTNIG00000016310) lratd1 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ENSGT00940000156248 ENSGT00940000156274 ENSGT00940000156799 ENSGT00940000155726 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00970000193390.c.a.a.b ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000157260.s Siamese fighting fish MODERN SPECIES 13 ENSBSLG00000025435 ENSBSLG00000025027 rps12 (ENSBSLG00000025024) eya4 (ENSBSLG00000024236) tcf21 (ENSBSLG00000024175) tbpl1 (ENSBSLG00000024172) slc2a12 (ENSBSLG00000024164) DDX1 (ENSBSLG00000024072) nbas (ENSBSLG00000023241) lratd1 (ENSBSLG00000023173) MTLN (ENSBSLG00000023168) ENSBSLG00000023162 ENSBSLG00000023158 sec63 (ENSBSLG00000023059) iyd (ENSBSLG00000022978) ppp1r14c (ENSBSLG00000022965) #22 ENSBSLG00000022954 armc1l (ENSBSLG00000022951) mtfr2 (ENSBSLG00000022941) PDE7B (ENSBSLG00000022578) myb (ENSBSLG00000022543) hbs1l (ENSBSLG00000022394) aldh8a1 (ENSBSLG00000022325) SGK1 (ENSBSLG00000021304) itsn2a (ENSBSLG00000018378) ENSBSLG00000018217 ENSBSLG00000018176 LPIN1 (ENSBSLG00000017617) si:ch73-21k16.4 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MODERN SPECIES 134 ENSPNAG00000022806 XCR1 (ENSPNAG00000022758) ENSPNAG00000022732 ppp1r14c (ENSPNAG00000022649) #22 iyd (ENSPNAG00000022631) selenoi (ENSPNAG00000022609) DNAJC16 (ENSPNAG00000022574) agmat (ENSPNAG00000022490) pink1 (ENSPNAG00000022461) cdaa (ENSPNAG00000022445) cdaa (ENSPNAG00000022416) ENSPNAG00000022405 ENSPNAG00000022398 fam43b (ENSPNAG00000022389) mul1b (ENSPNAG00000022374) CAMK2N1 (ENSPNAG00000022326) VWA5B1 (ENSPNAG00000022312) ddx19a (ENSPNAG00000022254) ENSPNAG00000022242 Mexicana tetra MODERN SPECIES 6 ACAP3 (ENSAMXG00000004927) ENSAMXG00000041584 ints11 (ENSAMXG00000038758) cptp (ENSAMXG00000004933) ENSAMXG00000043047 ENSAMXG00000004935 FHIP1A (ENSAMXG00000004939) ENSAMXG00000036777 DCLK2 (ENSAMXG00000040052) ENSAMXG00000034155 egr4 (ENSAMXG00000030340) cyp17a2 (ENSAMXG00000043927) ENSAMXG00000038595 ENSAMXG00000025984 ENSAMXG00000041374 ppp1r14c (ENSAMXG00000037953) #22 selenoi (ENSAMXG00000042381) iyd (ENSAMXG00000030031) DNAJC16 (ENSAMXG00000018083) agmat 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ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023 ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000176900 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000162477 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023 ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000158236 Anura ANCESTRAL SPECIES 583 ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b ENSGT00950000182985.b.a #22 Frog MODERN SPECIES 5 esr1 (ENSXETG00000012364) stxbp5 (ENSXETG00000029924) ccdc170 (ENSXETG00000014590) zbtb2 (ENSXETG00000012362) adgb (ENSXETG00000047736) rab32 (ENSXETG00000007893) grm1 (ENSXETG00000007892) ENSXETG00000045386 shprh (ENSXETG00000025060) sult6b1.5 (ENSXETG00000030952) tbc1d32 (ENSXETG00000007886) sult6b1.2 (ENSXETG00000025065) ENSXETG00000007884 ENSXETG00000041580 strn (ENSXETG00000039028) ppp1r14c (ENSXETG00000022545) #22 ENSXETG00000038328 trim67 (ENSXETG00000022539) c1orf131 (ENSXETG00000025071) gnpat (ENSXETG00000022535) dll1 (ENSXETG00000022525) fam120b (ENSXETG00000022524) ENSXETG00000035559 psmb1 (ENSXETG00000008557) tbp (ENSXETG00000008556) pdcd2 (ENSXETG00000008555) ermard (ENSXETG00000045843) phf10 (ENSXETG00000008552) c6orf120 (ENSXETG00000025079) wdr27 (ENSXETG00000036962) ENSXETG00000041880 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 7 CCDC170 (ENSLLEG00000025215) ENSLLEG00000025397 ZBTB2 (ENSLLEG00000025418) STXBP5 (ENSLLEG00000025451) ADGB (ENSLLEG00000025721) RAB32 (ENSLLEG00000026313) GRM1 (ENSLLEG00000026342) ENSLLEG00000026410 ENSLLEG00000026498 ENSLLEG00000026758 ENSLLEG00000026807 ENSLLEG00000026991 ENSLLEG00000027089 ENSLLEG00000027112 STRN (ENSLLEG00000027232) PPP1R14C (ENSLLEG00000027623) #22 FAXC (ENSLLEG00000027665) FBXL4 (ENSLLEG00000027710) POU3F2 (ENSLLEG00000027756) ENSLLEG00000027771 ENSLLEG00000027794 ENSLLEG00000027804 ENSLLEG00000027822 MMS22L (ENSLLEG00000027848) KLHL32 (ENSLLEG00000027990) ENSLLEG00000028102 GPR63 (ENSLLEG00000028126) FHL5 (ENSLLEG00000028132) UFL1 (ENSLLEG00000028160) ENSLLEG00000004989 FUT9 (ENSLLEG00000005028) Amniota ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162477 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023 ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Mammalia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162477 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023 ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Platypus MODERN SPECIES 11 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ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Opossum MODERN SPECIES 1 ENSMODG00000044259 STXBP5 (ENSMODG00000016862) SAMD5 (ENSMODG00000045013) ENSMODG00000016847 UST (ENSMODG00000016836) TAB2 (ENSMODG00000016831) ENSMODG00000016829 PPIL4 (ENSMODG00000016825) GINM1 (ENSMODG00000016822) KATNA1 (ENSMODG00000016819) LATS1 (ENSMODG00000016812) ENSMODG00000048057 ENSMODG00000016808 PCMT1 (ENSMODG00000016804) LRP11 (ENSMODG00000016792) ENSMODG00000016787 #22 IYD (ENSMODG00000016781) ENSMODG00000041763 ENSMODG00000016771 MTHFD1L (ENSMODG00000016765) ENSMODG00000046586 ZBTB2 (ENSMODG00000040530) RMND1 (ENSMODG00000016750) ARMT1 (ENSMODG00000028240) CCDC170 (ENSMODG00000016728) ESR1 (ENSMODG00000016719) SYNE1 (ENSMODG00000016253) MYCT1 (ENSMODG00000008518) VIP (ENSMODG00000008511) FBXO5 (ENSMODG00000008501) MTRF1L (ENSMODG00000008487) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162477 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(ENSPCIG00000025569) NUP43 (ENSPCIG00000025570) PCMT1 (ENSPCIG00000025571) LRP11 (ENSPCIG00000025572) PPP1R14C (ENSPCIG00000025574) #22 IYD (ENSPCIG00000000102) ENSPCIG00000036024 MTHFD1L (ENSPCIG00000000340) ENSPCIG00000000275 ZBTB2 (ENSPCIG00000000317) RMND1 (ENSPCIG00000015430) ARMT1 (ENSPCIG00000015424) CCDC170 (ENSPCIG00000015420) ENSPCIG00000015401 ENSPCIG00000026913 ENSPCIG00000035321 ENSPCIG00000037024 ENSPCIG00000026821 MYCT1 (ENSPCIG00000026720) ENSPCIG00000026717 Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 ADGB (ENSSHAG00000027661) STXBP5 (ENSSHAG00000000934) SAMD5 (ENSSHAG00000028775) SASH1 (ENSSHAG00000013003) UST (ENSSHAG00000032035) TAB2 (ENSSHAG00000016804) ENSSHAG00000026461 ENSSHAG00000017000 PPIL4 (ENSSHAG00000017140) GINM1 (ENSSHAG00000020912) KATNA1 (ENSSHAG00000017296) LATS1 (ENSSHAG00000017388) NUP43 (ENSSHAG00000022940) PCMT1 (ENSSHAG00000023309) LRP11 (ENSSHAG00000027360) PPP1R14C (ENSSHAG00000017832) #22 IYD (ENSSHAG00000005031) PLEKHG1 (ENSSHAG00000009584) MTHFD1L 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(ENSPCTG00005005536) Blue whale MODERN SPECIES 3 UST (ENSBMSG00010010316) ENSBMSG00010010306 TAB2 (ENSBMSG00010010292) ZC3H12D (ENSBMSG00010010274) PPIL4 (ENSBMSG00010010254) GINM1 (ENSBMSG00010010234) KATNA1 (ENSBMSG00010010214) LATS1 (ENSBMSG00010010190) ENSBMSG00010010172 NUP43 (ENSBMSG00010010153) PCMT1 (ENSBMSG00010010090) LRP11 (ENSBMSG00010010034) ENSBMSG00010010009 ENSBMSG00010009982 ENSBMSG00010009953 ENSBMSG00010009935 #22 IYD (ENSBMSG00010009876) PLEKHG1 (ENSBMSG00010009838) MTHFD1L (ENSBMSG00010009772) AKAP12 (ENSBMSG00010009739) ZBTB2 (ENSBMSG00010009731) RMND1 (ENSBMSG00010009721) ARMT1 (ENSBMSG00010009705) CCDC170 (ENSBMSG00010009670) ESR1 (ENSBMSG00010009630) ENSBMSG00010009590 ENSBMSG00010009558 ENSBMSG00010009535 ENSBMSG00010009099 MYCT1 (ENSBMSG00010008945) VIP (ENSBMSG00010008935) Pecora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 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ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 24 TAB2 (ENSOARG00020019595) ZC3H12D (ENSOARG00020019718) PPIL4 (ENSOARG00020019852) GINM1 (ENSOARG00020019919) KATNA1 (ENSOARG00020019961) LATS1 (ENSOARG00020020046) NUP43 (ENSOARG00020020162) PCMT1 (ENSOARG00020020247) LRP11 (ENSOARG00020020445) ENSOARG00020020509 ENSOARG00020020751 ENSOARG00020020776 ENSOARG00020020849 ENSOARG00020020885 ENSOARG00020020931 PPP1R14C (ENSOARG00020020977) #22 IYD (ENSOARG00020021015) PLEKHG1 (ENSOARG00020021072) MTHFD1L (ENSOARG00020021229) AKAP12 (ENSOARG00020021809) ZBTB2 (ENSOARG00020021872) RMND1 (ENSOARG00020021897) ARMT1 (ENSOARG00020021948) CCDC170 (ENSOARG00020021972) ESR1 (ENSOARG00020022045) SYNE1 (ENSOARG00020022335) MYCT1 (ENSOARG00020024842) VIP (ENSOARG00020024851) FBXO5 (ENSOARG00020024869) MTRF1L (ENSOARG00020024904) RGS17 (ENSOARG00020024922) Goat MODERN SPECIES 28 ENSCHIG00000004128 ENSCHIG00000023938 ENSCHIG00000012517 ENSCHIG00000006873 ENSCHIG00000018340 ENSCHIG00000014062 ENSCHIG00000001983 ENSCHIG00000006005 ENSCHIG00000018826 ENSCHIG00000009129 ENSCHIG00000008160 ENSCHIG00000019400 ENSCHIG00000009062 ENSCHIG00000025529 ENSCHIG00000023203 PPP1R14C (ENSCHIG00000026590) #22 IYD (ENSCHIG00000026899) PLEKHG1 (ENSCHIG00000011933) MTHFD1L (ENSCHIG00000026337) AKAP12 (ENSCHIG00000013493) ZBTB2 (ENSCHIG00000023404) RMND1 (ENSCHIG00000013571) ARMT1 (ENSCHIG00000024403) CCDC170 (ENSCHIG00000015746) ESR1 (ENSCHIG00000014058) ENSCHIG00000022719 ENSCHIG00000017428 SYNE1 (ENSCHIG00000016453) MYCT1 (ENSCHIG00000027092) VIP (ENSCHIG00000015334) ENSCHIG00000018470 Siberian musk deer MODERN SPECIES 60 TAB2 (ENSMMSG00000003518) ZC3H12D (ENSMMSG00000003543) PPIL4 (ENSMMSG00000003589) GINM1 (ENSMMSG00000003620) KATNA1 (ENSMMSG00000003646) LATS1 (ENSMMSG00000003677) NUP43 (ENSMMSG00000003704) PCMT1 (ENSMMSG00000003758) LRP11 (ENSMMSG00000003820) ENSMMSG00000003839 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6 ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b.bc ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Equus ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c.p.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b.bb.b 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ENSEASG00005027920 ENSEASG00005025382 ENSEASG00005033246 SEMA3E (ENSEASG00005003478) SEMA3A (ENSEASG00005003396) SEMA3D (ENSEASG00005002742) GRM3 (ENSEASG00005002690) ENSEASG00005002583 DMTF1 (ENSEASG00005002390) TMEM243 (ENSEASG00005002366) CROT (ENSEASG00005002345) Horse MODERN SPECIES 24 GINM1 (ENSECAG00000017120) KATNA1 (ENSECAG00000010086) LATS1 (ENSECAG00000000891) NUP43 (ENSECAG00000018413) ENSECAG00000054669 ENSECAG00000054538 PCMT1 (ENSECAG00000005292) LRP11 (ENSECAG00000026818) ENSECAG00000037075 ENSECAG00000033237 ENSECAG00000047371 ENSECAG00000036563 ENSECAG00000003090 ENSECAG00000059096 ENSECAG00000037408 ENSECAG00000034476 #22 IYD (ENSECAG00000018766) PLEKHG1 (ENSECAG00000007095) MTHFD1L (ENSECAG00000001166) AKAP12 (ENSECAG00000022166) ZBTB2 (ENSECAG00000021762) RMND1 (ENSECAG00000018207) ARMT1 (ENSECAG00000015349) CCDC170 (ENSECAG00000013130) ESR1 (ENSECAG00000022441) SYNE1 (ENSECAG00000017353) ENSECAG00000057509 MYCT1 (ENSECAG00000015960) ENSECAG00000059138 VIP (ENSECAG00000013586) FBXO5 (ENSECAG00000011630) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778.d ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b.bc ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778.d ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b.bc ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 21 ENSRFEG00010014494 ENSRFEG00010014513 PPIL4 (ENSRFEG00010014539) GINM1 (ENSRFEG00010014635) KATNA1 (ENSRFEG00010014679) LATS1 (ENSRFEG00010014763) ENSRFEG00010014829 NUP43 (ENSRFEG00010014897) PCMT1 (ENSRFEG00010015151) LRP11 (ENSRFEG00010015632) ENSRFEG00010015741 ENSRFEG00010015765 ENSRFEG00010015855 ENSRFEG00010015921 ENSRFEG00010016156 PPP1R14C (ENSRFEG00010016410) #22 IYD (ENSRFEG00010016480) ENSRFEG00010016530 ENSRFEG00010016588 PLEKHG1 (ENSRFEG00010016656) MTHFD1L (ENSRFEG00010016718) ENSRFEG00010017181 AKAP12 (ENSRFEG00010017239) ZBTB2 (ENSRFEG00010017257) RMND1 (ENSRFEG00010017312) ARMT1 (ENSRFEG00010017409) CCDC170 (ENSRFEG00010017486) ESR1 (ENSRFEG00010017671) SYNE1 (ENSRFEG00010017835) MYCT1 (ENSRFEG00010018323) VIP (ENSRFEG00010018363) Microbat MODERN SPECIES 1428 PPP1R14C (ENSMLUG00000023245) #22 IYD (ENSMLUG00000008377) PLEKHG1 (ENSMLUG00000016927) MTHFD1L (ENSMLUG00000005296) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Glires ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Rodentia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c 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ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Kangaroo rat MODERN SPECIES 417 Adgb (ENSDORG00000026056) Stxbp5 (ENSDORG00000004997) Sash1 (ENSDORG00000002479) Ust (ENSDORG00000015868) Tab2 (ENSDORG00000000707) ENSDORG00000027483 Ppil4 (ENSDORG00000007186) Ginm1 (ENSDORG00000007187) ENSDORG00000025692 ENSDORG00000029134 Lats1 (ENSDORG00000007190) ENSDORG00000002203 Pcmt1 (ENSDORG00000003137) Lrp11 (ENSDORG00000003139) ENSDORG00000023774 Ppp1r14c (ENSDORG00000029153) #22 Iyd (ENSDORG00000016201) ENSDORG00000029716 Mthfd1l (ENSDORG00000006234) Zbtb2 (ENSDORG00000013305) ENSDORG00000025869 ENSDORG00000000434 Ccdc170 (ENSDORG00000014673) Esr1 (ENSDORG00000010443) Syne1 (ENSDORG00000013226) Myct1 (ENSDORG00000027276) Vip (ENSDORG00000015940) Fbxo5 (ENSDORG00000000495) Mtrf1l (ENSDORG00000010997) Rgs17 (ENSDORG00000011002) Oprm1 (ENSDORG00000002315) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000162477 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a 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ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00900000143212 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00900000143212 ENSGT00940000156778 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Iyd (ENSCGRG00001022969) Plekhg1 (ENSCGRG00001023431) Mthfd1l (ENSCGRG00001022372) Akap12 (ENSCGRG00001022879) Zbtb2 (ENSCGRG00001023273) Rmnd1 (ENSCGRG00001018312) Armt1 (ENSCGRG00001019042) Ccdc170 (ENSCGRG00001019582) Esr1 (ENSCGRG00001024268) ENSCGRG00001024508 ENSCGRG00001016292 ENSCGRG00001017406 Myct1 (ENSCGRG00001007389) Vip (ENSCGRG00001023726) Fbxo5 (ENSCGRG00001024225) Golden Hamster MODERN SPECIES 621 Stxbp5 (ENSMAUG00000021149) Samd5 (ENSMAUG00000011794) ENSMAUG00000001554 ENSMAUG00000020795 ENSMAUG00000008799 Tab2 (ENSMAUG00000011287) Zc3h12d (ENSMAUG00000015783) Ppil4 (ENSMAUG00000015059) Ginm1 (ENSMAUG00000008067) ENSMAUG00000016471 ENSMAUG00000012301 Lats1 (ENSMAUG00000020092) Nup43 (ENSMAUG00000018659) Pcmt1 (ENSMAUG00000011320) Lrp11 (ENSMAUG00000014809) Ppp1r14c (ENSMAUG00000019718) #22 Iyd (ENSMAUG00000013810) ENSMAUG00000011570 Mthfd1l (ENSMAUG00000016191) ENSMAUG00000020409 Zbtb2 (ENSMAUG00000008627) Rmnd1 (ENSMAUG00000011585) Armt1 (ENSMAUG00000012945) Ccdc170 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Katna1 (ENSPEMG00000020852) Lats1 (ENSPEMG00000021147) Nup43 (ENSPEMG00000022692) Pcmt1 (ENSPEMG00000027593) Lrp11 (ENSPEMG00000000669) ENSPEMG00000026371 ENSPEMG00000026324 ENSPEMG00000027039 ENSPEMG00000025014 ENSPEMG00000028469 ENSPEMG00000029355 ENSPEMG00000031117 Ppp1r14c (ENSPEMG00000026419) #22 Iyd (ENSPEMG00000009998) Plekhg1 (ENSPEMG00000003381) Mthfd1l (ENSPEMG00000012428) ENSPEMG00000028722 Zbtb2 (ENSPEMG00000028248) Rmnd1 (ENSPEMG00000014544) Armt1 (ENSPEMG00000027664) Ccdc170 (ENSPEMG00000018858) ENSPEMG00000028412 Esr1 (ENSPEMG00000012747) ENSPEMG00000000704 ENSPEMG00000029017 ENSPEMG00000013933 ENSPEMG00000007014 Myct1 (ENSPEMG00000016041) Prairie vole MODERN SPECIES 358 ENSMOCG00000018965 Nt5dc1 (ENSMOCG00000011487) Tspyl4 (ENSMOCG00000006852) Tspyl1 (ENSMOCG00000007884) Dse (ENSMOCG00000021598) Calhm6 (ENSMOCG00000017769) Calhm5 (ENSMOCG00000011633) Trappc3l (ENSMOCG00000011302) Calhm4 (ENSMOCG00000004418) ENSMOCG00000002869 ENSMOCG00000021945 Grik2 (ENSMOCG00000022205) Ascc3 (ENSMOCG00000004549) Sim1 (ENSMOCG00000017754) ENSMOCG00000008070 Ppp1r14c (ENSMOCG00000002551) #22 Iyd (ENSMOCG00000012475) Plekhg1 (ENSMOCG00000006027) Mthfd1l (ENSMOCG00000011918) ENSMOCG00000019373 Zbtb2 (ENSMOCG00000018175) Rmnd1 (ENSMOCG00000012373) Armt1 (ENSMOCG00000008335) Ccdc170 (ENSMOCG00000015340) ENSMOCG00000008666 Esr1 (ENSMOCG00000004623) Syne1 (ENSMOCG00000003007) Myct1 (ENSMOCG00000003327) Vip (ENSMOCG00000000402) Fbxo5 (ENSMOCG00000016622) Mtrf1l (ENSMOCG00000016147) Murinae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Rat MODERN SPECIES Zfp748 (ENSRNOG00000069921) Spry3-ps1 (ENSRNOG00000064505) LOC102551340 (ENSRNOG00000047145) Zfp273l-ps1 (ENSRNOG00000046353) ENSRNOG00000068667 ENSRNOG00000066169 ENSRNOG00000067171 ENSRNOG00000070839 ENSRNOG00000068976 ENSRNOG00000063413 ENSRNOG00000067926 ENSRNOG00000069813 ENSRNOG00000067477 ENSRNOG00000070838 AABR07001348.1 (ENSRNOG00000023081) Ppp1r14c (ENSRNOG00000016368) #22 Iyd (ENSRNOG00000016286) Plekhg1 (ENSRNOG00000016011) Mthfd1l (ENSRNOG00000019582) Akap12 (ENSRNOG00000019549) Zbtb2 (ENSRNOG00000019544) Rmnd1 (ENSRNOG00000019501) Armt1 (ENSRNOG00000019489) Ccdc170 (ENSRNOG00000024280) Esr1 (ENSRNOG00000019358) Syne1 (ENSRNOG00000018960) Myct1 (ENSRNOG00000018858) Vip (ENSRNOG00000018808) Fbxo5 (ENSRNOG00000024077) Mtrf1l (ENSRNOG00000018773) Rgs17 (ENSRNOG00000018690) Mus ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Shrew mouse MODERN SPECIES 13 Tff1 (MGP_PahariEiJ_G0023681) Tmprss3 (MGP_PahariEiJ_G0023682) Ubash3a (MGP_PahariEiJ_G0023683) Rsph1 (MGP_PahariEiJ_G0023684) Slc37a1 (MGP_PahariEiJ_G0023685) Pde9a (MGP_PahariEiJ_G0023686) MGP_PahariEiJ_G0023687 Ndufv3 (MGP_PahariEiJ_G0023688) Pknox1 (MGP_PahariEiJ_G0023689) Cbs (MGP_PahariEiJ_G0023690) U2af1 (MGP_PahariEiJ_G0023691) Cryaa (MGP_PahariEiJ_G0023692) Sik1 (MGP_PahariEiJ_G0023693) MGP_PahariEiJ_G0023694 Rrp1b (MGP_PahariEiJ_G0023695) Ppp1r14c (MGP_PahariEiJ_G0023696) #22 Iyd (MGP_PahariEiJ_G0023697) Plekhg1 (MGP_PahariEiJ_G0023698) Mthfd1l (MGP_PahariEiJ_G0023699) Akap12 (MGP_PahariEiJ_G0023700) Zbtb2 (MGP_PahariEiJ_G0023701) MGP_PahariEiJ_G0023702 Armt1 (MGP_PahariEiJ_G0023703) MGP_PahariEiJ_G0023704 Esr1 (MGP_PahariEiJ_G0023705) MGP_PahariEiJ_G0023706 MGP_PahariEiJ_G0023707 Myct1 (MGP_PahariEiJ_G0023708) Vip (MGP_PahariEiJ_G0023709) Fbxo5 (MGP_PahariEiJ_G0023710) Mtrf1l (MGP_PahariEiJ_G0023711) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401.a ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Ryukyu mouse MODERN SPECIES 1 Ppp1r14c (MGP_CAROLIEiJ_G0015077) #22 Iyd (MGP_CAROLIEiJ_G0015078) Plekhg1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015079) Mthfd1l (MGP_CAROLIEiJ_G0015080) Akap12 (MGP_CAROLIEiJ_G0015081) Zbtb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015082) Rmnd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015083) Armt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015084) Ccdc170 (MGP_CAROLIEiJ_G0015085) Esr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015086) MGP_CAROLIEiJ_G0015087 MGP_CAROLIEiJ_G0015088 Myct1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015089) Vip (MGP_CAROLIEiJ_G0015090) Fbxo5 (MGP_CAROLIEiJ_G0015091) Mtrf1l (MGP_CAROLIEiJ_G0015092) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000169591.d ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c.x ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401.a ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Mouse MODERN SPECIES 1 H60c (ENSMUSG00000091618) Ppp1r14c (ENSMUSG00000040653) #22 Iyd (ENSMUSG00000019762) Plekhg1 (ENSMUSG00000040624) Mthfd1l (ENSMUSG00000040675) Akap12 (ENSMUSG00000038587) Zbtb2 (ENSMUSG00000075327) Rmnd1 (ENSMUSG00000019763) Armt1 (ENSMUSG00000061759) Ccdc170 (ENSMUSG00000019767) Esr1 (ENSMUSG00000019768) Syne1 (ENSMUSG00000096054) Myct1 (ENSMUSG00000046916) Vip (ENSMUSG00000019772) Fbxo5 (ENSMUSG00000019773) Mtrf1l (ENSMUSG00000019774) Rgs17 (ENSMUSG00000019775) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000169591.d ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c.x ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401.a ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d spretus MODERN SPECIES 1 MGP_SPRETEiJ_G0015877 MGP_SPRETEiJ_G0015878 MGP_SPRETEiJ_G0015880 MGP_SPRETEiJ_G0015881 Ppp1r14c (MGP_SPRETEiJ_G0015882) #22 Iyd (MGP_SPRETEiJ_G0015883) Plekhg1 (MGP_SPRETEiJ_G0015884) Mthfd1l (MGP_SPRETEiJ_G0015885) Akap12 (MGP_SPRETEiJ_G0015886) Zbtb2 (MGP_SPRETEiJ_G0015887) Rmnd1 (MGP_SPRETEiJ_G0015888) Armt1 (MGP_SPRETEiJ_G0015889) Ccdc170 (MGP_SPRETEiJ_G0015890) Esr1 (MGP_SPRETEiJ_G0015891) MGP_SPRETEiJ_G0015893 Myct1 (MGP_SPRETEiJ_G0015895) Vip (MGP_SPRETEiJ_G0015896) Fbxo5 (MGP_SPRETEiJ_G0015897) Mtrf1l (MGP_SPRETEiJ_G0015898) Rgs17 (MGP_SPRETEiJ_G0015899) Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 3100 Rnf24 (ENSMSIG00000014545) Pank2 (ENSMSIG00000014519) Mavs (ENSMSIG00000014493) Ap5s1 (ENSMSIG00000014451) Cdc25b (ENSMSIG00000014383) ENSMSIG00000014378 Spef1 (ENSMSIG00000014334) 1700037H04Rik (ENSMSIG00000014310) Hspa12b (ENSMSIG00000014280) Siglec1 (ENSMSIG00000014173) Adam33 (ENSMSIG00000014090) Gfra4 (ENSMSIG00000014050) Atrn (ENSMSIG00000014020) ENSMSIG00000014004 ENSMSIG00000013992 ENSMSIG00000013972 #22 Dnaaf9 (ENSMSIG00000013648) Slc4a11 (ENSMSIG00000013565) ENSMSIG00000013514 Ddrgk1 (ENSMSIG00000013480) Lzts3 (ENSMSIG00000013473) ENSMSIG00000013450 Ubox5 (ENSMSIG00000013436) Avp (ENSMSIG00000013423) Oxt (ENSMSIG00000013416) Mrps26 (ENSMSIG00000013383) ENSMSIG00000013369 Ptpra (ENSMSIG00000013175) Vps16 (ENSMSIG00000013066) Tmem239 (ENSMSIG00000013056) 1700020A23Rik (ENSMSIG00000013042) Steppe mouse MODERN SPECIES 3173 ENSMSIG00000028950 ENSMSIG00000028953 H60c (ENSMSIG00000028958) ENSMSIG00000028966 #22 ENSMSIG00000028971 Plekhg1 (ENSMSIG00000028989) Mthfd1l (ENSMSIG00000029009) ENSMSIG00000029049 Akap12 (ENSMSIG00000029068) ENSMSIG00000029085 Zbtb2 (ENSMSIG00000029096) Rmnd1 (ENSMSIG00000029100) Armt1 (ENSMSIG00000029112) Ccdc170 (ENSMSIG00000029125) Esr1 (ENSMSIG00000029132) Syne1 (ENSMSIG00000029148) Myct1 (ENSMSIG00000029269) Vip (ENSMSIG00000029272) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Marmotini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157838.c.c ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 219 ENSUPAG00010013564 #22 IYD (ENSUPAG00010013543) PLEKHG1 (ENSUPAG00010013492) MTHFD1L (ENSUPAG00010013390) AKAP12 (ENSUPAG00010013348) ZBTB2 (ENSUPAG00010013345) RMND1 (ENSUPAG00010013328) ARMT1 (ENSUPAG00010013297) CCDC170 (ENSUPAG00010013267) ESR1 (ENSUPAG00010013233) SYNE1 (ENSUPAG00010012988) MYCT1 (ENSUPAG00010012980) VIP (ENSUPAG00010012967) FBXO5 (ENSUPAG00010012958) MTRF1L (ENSUPAG00010012945) RGS17 (ENSUPAG00010012932) Squirrel MODERN SPECIES 89 SAMD5 (ENSSTOG00000034237) SASH1 (ENSSTOG00000002365) UST (ENSSTOG00000003436) TAB2 (ENSSTOG00000020798) ZC3H12D (ENSSTOG00000013975) PPIL4 (ENSSTOG00000013980) GINM1 (ENSSTOG00000013991) KATNA1 (ENSSTOG00000013998) ENSSTOG00000023820 LATS1 (ENSSTOG00000013443) NUP43 (ENSSTOG00000013449) PCMT1 (ENSSTOG00000024407) LRP11 (ENSSTOG00000000512) ENSSTOG00000001385 ENSSTOG00000029925 PPP1R14C (ENSSTOG00000002019) #22 IYD (ENSSTOG00000002022) PLEKHG1 (ENSSTOG00000010912) MTHFD1L (ENSSTOG00000010921) AKAP12 (ENSSTOG00000029201) ZBTB2 (ENSSTOG00000021611) RMND1 (ENSSTOG00000013141) ARMT1 (ENSSTOG00000013153) CCDC170 (ENSSTOG00000013161) ESR1 (ENSSTOG00000006748) ENSSTOG00000030302 ENSSTOG00000006796 ENSSTOG00000034176 MYCT1 (ENSSTOG00000010644) VIP (ENSSTOG00000007656) FBXO5 (ENSSTOG00000029069) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 ENSSVLG00005014219 TAB2 (ENSSVLG00005014149) ZC3H12D (ENSSVLG00005014060) PPIL4 (ENSSVLG00005013984) ENSSVLG00005013892 KATNA1 (ENSSVLG00005013780) LATS1 (ENSSVLG00005013545) NUP43 (ENSSVLG00005013493) PCMT1 (ENSSVLG00005013272) ENSSVLG00005013084 LRP11 (ENSSVLG00005012935) ENSSVLG00005012789 ENSSVLG00005012647 ENSSVLG00005012613 ENSSVLG00005012559 PPP1R14C (ENSSVLG00005012500) #22 IYD (ENSSVLG00005012284) PLEKHG1 (ENSSVLG00005012201) MTHFD1L (ENSSVLG00005012073) AKAP12 (ENSSVLG00005012004) ZBTB2 (ENSSVLG00005011964) RMND1 (ENSSVLG00005011890) ARMT1 (ENSSVLG00005011814) CCDC170 (ENSSVLG00005011680) ESR1 (ENSSVLG00005011518) ENSSVLG00005011101 ENSSVLG00005010970 ENSSVLG00005010938 ENSSVLG00005021418 MYCT1 (ENSSVLG00005021349) VIP (ENSSVLG00005021260) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473.b ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b.dc ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00440000039314.a.e.a.b Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473.b ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b.dc ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00440000039314.a.e.a.b Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000155237 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473.b ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b.dc ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00440000039314.a.e.a.b Degu MODERN SPECIES 287 PPP1R14C (ENSODEG00000001211) #22 IYD (ENSODEG00000001311) ENSODEG00000018708 PLEKHG1 (ENSODEG00000001446) MTHFD1L (ENSODEG00000001602) ENSODEG00000018687 ZBTB2 (ENSODEG00000001142) RMND1 (ENSODEG00000001174) ENSODEG00000001262 ENSODEG00000001273 ENSODEG00000001305 CCDC170 (ENSODEG00000000921) ENSODEG00000000997 ESR1 (ENSODEG00000001036) SYNE1 (ENSODEG00000001363) MYCT1 (ENSODEG00000001986) Naked mole-rat female MODERN SPECIES ENSHGLG00000046601 ENSHGLG00000010921 ENSHGLG00000012955 ENSHGLG00000009741 ZC3H12D (ENSHGLG00000008570) PPIL4 (ENSHGLG00000007609) GINM1 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(ENSOPRG00000010391) #22 IYD (ENSOPRG00000010409) Primates ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Mouse lemur MODERN SPECIES 28 ADGB (ENSMICG00000037898) STXBP5 (ENSMICG00000013483) SAMD5 (ENSMICG00000038329) SASH1 (ENSMICG00000014483) UST (ENSMICG00000014507) TAB2 (ENSMICG00000027001) ZC3H12D (ENSMICG00000044838) PPIL4 (ENSMICG00000006287) GINM1 (ENSMICG00000006295) KATNA1 (ENSMICG00000006299) LATS1 (ENSMICG00000006305) NUP43 (ENSMICG00000006312) PCMT1 (ENSMICG00000006318) LRP11 (ENSMICG00000006322) ENSMICG00000042667 PPP1R14C (ENSMICG00000038749) #22 ENSMICG00000045223 ENSMICG00000026491 IYD (ENSMICG00000004582) PLEKHG1 (ENSMICG00000004593) MTHFD1L (ENSMICG00000004610) AKAP12 (ENSMICG00000034625) ZBTB2 (ENSMICG00000027366) RMND1 (ENSMICG00000010583) ARMT1 (ENSMICG00000047928) CCDC170 (ENSMICG00000029885) ESR1 (ENSMICG00000007592) SYNE1 (ENSMICG00000007620) ENSMICG00000042037 MYCT1 (ENSMICG00000036362) VIP (ENSMICG00000035122) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 662 ADGB (ENSPSMG00000018921) STXBP5 (ENSPSMG00000019075) SAMD5 (ENSPSMG00000019299) SASH1 (ENSPSMG00000019391) UST (ENSPSMG00000019453) TAB2 (ENSPSMG00000019496) ZC3H12D (ENSPSMG00000019522) PPIL4 (ENSPSMG00000019538) GINM1 (ENSPSMG00000019547) KATNA1 (ENSPSMG00000019600) LATS1 (ENSPSMG00000019622) NUP43 (ENSPSMG00000019639) PCMT1 (ENSPSMG00000019845) LRP11 (ENSPSMG00000019915) ENSPSMG00000019973 PPP1R14C (ENSPSMG00000019988) #22 IYD (ENSPSMG00000020030) PLEKHG1 (ENSPSMG00000020047) MTHFD1L (ENSPSMG00000020197) AKAP12 (ENSPSMG00000020300) ZBTB2 (ENSPSMG00000020305) RMND1 (ENSPSMG00000020327) ARMT1 (ENSPSMG00000020363) CCDC170 (ENSPSMG00000020376) ENSPSMG00000020377 ESR1 (ENSPSMG00000020487) SYNE1 (ENSPSMG00000021005) MYCT1 (ENSPSMG00000021158) VIP (ENSPSMG00000021172) FBXO5 (ENSPSMG00000021196) MTRF1L (ENSPSMG00000021227) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 633 SASH1 (ENSPCOG00000023715) ENSPCOG00000001613 UST (ENSPCOG00000021446) TAB2 (ENSPCOG00000023142) ZC3H12D (ENSPCOG00000017645) PPIL4 (ENSPCOG00000016997) GINM1 (ENSPCOG00000005553) KATNA1 (ENSPCOG00000020880) ENSPCOG00000026729 LATS1 (ENSPCOG00000018478) NUP43 (ENSPCOG00000027486) PCMT1 (ENSPCOG00000019203) LRP11 (ENSPCOG00000017776) ENSPCOG00000027781 ENSPCOG00000026119 PPP1R14C (ENSPCOG00000015939) #22 IYD (ENSPCOG00000026393) PLEKHG1 (ENSPCOG00000020861) MTHFD1L (ENSPCOG00000001632) AKAP12 (ENSPCOG00000016860) ZBTB2 (ENSPCOG00000000698) RMND1 (ENSPCOG00000014323) ARMT1 (ENSPCOG00000022613) Bushbaby MODERN SPECIES 241 ENSOGAG00000025001 PPP1R14C (ENSOGAG00000009514) #22 IYD (ENSOGAG00000006759) PLEKHG1 (ENSOGAG00000033661) MTHFD1L (ENSOGAG00000011273) AKAP12 (ENSOGAG00000011277) ZBTB2 (ENSOGAG00000005262) RMND1 (ENSOGAG00000005263) ARMT1 (ENSOGAG00000010684) CCDC170 (ENSOGAG00000006312) ESR1 (ENSOGAG00000012580) SYNE1 (ENSOGAG00000012587) MYCT1 (ENSOGAG00000005357) VIP (ENSOGAG00000006513) FBXO5 (ENSOGAG00000006519) MTRF1L (ENSOGAG00000006521) RGS17 (ENSOGAG00000006526) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT00950000185143 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007046.b.a.a.x ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c.q.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 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ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c.q.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.g ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.h ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00900000143690 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c.q.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.g 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ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c.q.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.g ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.h.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.a.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.h.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000154295.y.b.f ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 Chimpanzee MODERN SPECIES 19 ZC3H12D (ENSPTRG00000050357) ENSPTRG00000048467 PPIL4 (ENSPTRG00000018692) GINM1 (ENSPTRG00000018693) KATNA1 (ENSPTRG00000018694) LATS1 (ENSPTRG00000018696) NUP43 (ENSPTRG00000018697) PCMT1 (ENSPTRG00000018699) LRP11 (ENSPTRG00000018700) RAET1E 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(ENSNLEG00000015443) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c.r ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b.f ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.f.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.a.c.b.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.f.a.a.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b.e ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00940000153336.e.a.a.a.b.b ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683.l.b Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c.q.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.f.a.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.b.f.a.a.a.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.a.c.b.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.a.a.c.b.b 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(ENSACCG00020005320) ESR1 (ENSACCG00020005342) SYNE1 (ENSACCG00020006416) MYCT1 (ENSACCG00020007328) VIP (ENSACCG00020007352) FBXO5 (ENSACCG00020007364) MTRF1L (ENSACCG00020007439) RGS17 (ENSACCG00020007480) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162477 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023 ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Anatidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162477 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023 ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Duck MODERN SPECIES 21 ENSAPLG00000028353 STXBP5 (ENSAPLG00000014903) SAMD5 (ENSAPLG00000016694) ENSAPLG00000022887 SASH1 (ENSAPLG00000007750) UST (ENSAPLG00000008044) TAB2 (ENSAPLG00000008173) ZC3H12D (ENSAPLG00000008379) PPIL4 (ENSAPLG00000008437) GINM1 (ENSAPLG00000008777) KATNA1 (ENSAPLG00000008891) LATS1 (ENSAPLG00000009385) NUP43 (ENSAPLG00000028569) PCMT1 (ENSAPLG00000009762) LRP11 (ENSAPLG00000009937) 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ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00940000155393.d Japanese quail MODERN SPECIES 21 ADGB (ENSCJPG00005005864) STXBP5 (ENSCJPG00005005911) SAMD5 (ENSCJPG00005005947) SASH1 (ENSCJPG00005005963) UST (ENSCJPG00005006187) TAB2 (ENSCJPG00005006196) ZC3H12D (ENSCJPG00005006197) PPIL4 (ENSCJPG00005006198) GINM1 (ENSCJPG00005006199) KATNA1 (ENSCJPG00005006212) LATS1 (ENSCJPG00005006283) ENSCJPG00005006284 NUP43 (ENSCJPG00005006287) PCMT1 (ENSCJPG00005006305) LRP11 (ENSCJPG00005006308) PPP1R14C (ENSCJPG00005006377) #22 IYD (ENSCJPG00005006409) PLEKHG1 (ENSCJPG00005006423) MTHFD1L (ENSCJPG00005006446) AKAP12 (ENSCJPG00005007509) ZBTB2 (ENSCJPG00005007510) RMND1 (ENSCJPG00005007512) CCDC170 (ENSCJPG00005007525) ESR1 (ENSCJPG00005007531) ENSCJPG00005007549 ENSCJPG00005007605 MYCT1 (ENSCJPG00005007730) VIP (ENSCJPG00005007731) FBXO5 (ENSCJPG00005007733) MTRF1L (ENSCJPG00005007734) RGS17 (ENSCJPG00005007740) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162477 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#22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00960000189587 ENSGT00530000064023 ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133 ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 Chinese turtle MODERN SPECIES 461 SAMD5 (ENSPSIG00000014876) SASH1 (ENSPSIG00000014898) UST (ENSPSIG00000015610) ENSPSIG00000015911 TAB2 (ENSPSIG00000016192) ZC3H12D (ENSPSIG00000016475) PPIL4 (ENSPSIG00000016651) GINM1 (ENSPSIG00000016675) KATNA1 (ENSPSIG00000017091) LATS1 (ENSPSIG00000017097) NUP43 (ENSPSIG00000017199) PCMT1 (ENSPSIG00000017327) ENSPSIG00000017362 PPP1R14C (ENSPSIG00000017492) #22 IYD (ENSPSIG00000017499) ENSPSIG00000017546 PLEKHG1 (ENSPSIG00000017610) MTHFD1L (ENSPSIG00000018016) AKAP12 (ENSPSIG00000018242) ZBTB2 (ENSPSIG00000018246) RMND1 (ENSPSIG00000018248) ARMT1 (ENSPSIG00000004092) CCDC170 (ENSPSIG00000004116) ESR1 (ENSPSIG00000004166) ENSPSIG00000004530 ENSPSIG00000004795 ENSPSIG00000004808 ENSPSIG00000004853 MYCT1 (ENSPSIG00000004949) Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162477 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388.b ENSGT00940000156283 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156638 ENSGT00940000157684 ENSGT00390000004803 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00940000161275 ENSGT00950000182985.b.a #22 ENSGT00390000004348 ENSGT00940000157723 ENSGT00940000157477 ENSGT00730000111244 ENSGT00940000158401 ENSGT00390000013337 ENSGT00960000189587 ENSGT00530000064023 ENSGT00390000012924.a ENSGT00940000158133.g ENSGT00940000154481.a.b ENSGT00390000011642 ENSGT00950000183154.a ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 Emydidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162477 ENSGT00390000014904 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00510000048701 ENSGT00940000156778 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000158473 ENSGT00940000161388.b 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ENSGT00950000185472 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 301 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 Acanthophiinae DUPLICATION Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.a ##22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 1237 ENSNSUG00000011138 ##22 ENSNSUG00000011137 ##22 Eastern brown snake MODERN SPECIES 976 ENSPTXG00000015845 ##22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.b ##22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 1237 ENSNSUG00000011138 ##22 ENSNSUG00000011137 ##22 Eastern brown snake MODERN SPECIES 1501 ENSPTXG00000015456 ##22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 3682 PPP1R14B (ENSLLTG00000002384) ##22 FKBP2 (ENSLLTG00000002388) ENSLLTG00000006554 DNAJC4 (ENSLLTG00000006597) NUDT22 (ENSLLTG00000006623) TRPT1 (ENSLLTG00000006645) ENSLLTG00000006684 tuatara MODERN SPECIES 1118 ENSSPUG00000005431 PC (ENSSPUG00000005463) ENSSPUG00000005519 ENSSPUG00000005532 KCNK4 (ENSSPUG00000005547) GPR137 (ENSSPUG00000005567) ENSSPUG00000005575 ENSSPUG00000005590 ENSSPUG00000005596 PLCB3 (ENSSPUG00000005615) PPP1R14B (ENSSPUG00000005736) ##22 FKBP2 (ENSSPUG00000005764) DNAJC4 (ENSSPUG00000005787) NUDT22 (ENSSPUG00000005809) FERMT3 (ENSSPUG00000005869) STIP1 (ENSSPUG00000006129) MACROD1 (ENSSPUG00000006177) FLRT1 (ENSSPUG00000006188) HOXB3 (ENSSPUG00000006266) HOXB4 (ENSSPUG00000006280) HOXB6 (ENSSPUG00000006308) HOXB7 (ENSSPUG00000006323) HOXB8 (ENSSPUG00000006333) HOXB9 (ENSSPUG00000006346) TTLL6 (ENSSPUG00000006396) ENSSPUG00000006484 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000156646 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.b ENSGT00940000161083 ENSGT00940000155559.a.b ENSGT00390000018173 ENSGT00940000164608 ENSGT00940000153433.B.b ENSGT00940000160341 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00940000165892 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000164137 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00940000166053 ENSGT00950000185472 ENSGT00600000084617 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000164878 ENSGT00940000156646 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.b ENSGT00940000161083 ENSGT00940000155559.a.b ENSGT00390000018173 ENSGT00940000164608 ENSGT00940000153433.B.b ENSGT00940000160341 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00940000165892 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000164137 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00940000166053 ENSGT00950000185472 ENSGT00600000084617 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000164878 ENSGT00940000156646 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.b ENSGT00940000161083 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ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT01020000231208 ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00940000166053 ENSGT00950000185472 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 33 SLC3A2 (ENSTMTG00000000348) ENSTMTG00000000382 RPS6KA4 (ENSTMTG00000000708) ENSTMTG00000001778 ENSTMTG00000001784 PRDX5 (ENSTMTG00000001793) TRMT112 (ENSTMTG00000001799) ESRRA (ENSTMTG00000001807) KCNK4 (ENSTMTG00000001814) GPR137 (ENSTMTG00000001827) ENSTMTG00000001831 ENSTMTG00000001838 ENSTMTG00000001843 ENSTMTG00000001855 PLCB3 (ENSTMTG00000001890) PPP1R14B (ENSTMTG00000001916) ##22 FKBP2 (ENSTMTG00000001925) ENSTMTG00000001943 DNAJC4 (ENSTMTG00000001958) NUDT22 (ENSTMTG00000001965) TRPT1 (ENSTMTG00000001971) FERMT3 (ENSTMTG00000001979) STIP1 (ENSTMTG00000001988) MACROD1 (ENSTMTG00000002001) FLRT1 (ENSTMTG00000002016) OTUB1 (ENSTMTG00000002025) ENSTMTG00000002032 NAA40 (ENSTMTG00000002041) RCOR2 (ENSTMTG00000002058) MARK2 (ENSTMTG00000002082) ENSTMTG00000002131 painted turtle MODERN SPECIES 2386 SART1 (ENSCPBG00000023434) ENSCPBG00000023437 SLC3A2 (ENSCPBG00000023438) ENSCPBG00000023440 RPS6KA4 (ENSCPBG00000023443) ENSCPBG00000023455 PRDX5 (ENSCPBG00000023457) TRMT112 (ENSCPBG00000023458) ESRRA (ENSCPBG00000023459) KCNK4 (ENSCPBG00000023461) GPR137 (ENSCPBG00000023463) ENSCPBG00000023464 ENSCPBG00000023465 ENSCPBG00000023467 PLCB3 (ENSCPBG00000023470) PPP1R14B (ENSCPBG00000023479) ##22 FKBP2 (ENSCPBG00000023480) ENSCPBG00000023482 DNAJC4 (ENSCPBG00000023487) NUDT22 (ENSCPBG00000023489) FERMT3 (ENSCPBG00000023490) STIP1 (ENSCPBG00000023493) MACROD1 (ENSCPBG00000023496) FLRT1 (ENSCPBG00000023497) OTUB1 (ENSCPBG00000023500) ENSCPBG00000023503 NAA40 (ENSCPBG00000023507) RCOR2 (ENSCPBG00000023509) MARK2 (ENSCPBG00000023513) ENSCPBG00000023518 ENSCPBG00000023519 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156646 ENSGT00950000182980.a.b.a.b.b 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SPECIES 160 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 139 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT01000000215390 ENSGT00530000064165.a ENSGT00940000157679 ENSGT00940000154902 ENSGT00390000007552 ENSGT00390000008975 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000156457 ENSGT00390000011639 ENSGT01100000263497.B ENSGT00940000160376 ENSGT00390000012589 ENSGT00390000007539 ENSGT01000000214440.C Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT01000000215390 ENSGT00530000064165.a ENSGT00940000157679 ENSGT00940000154902 ENSGT00390000007552 ENSGT00390000008975 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000156457 ENSGT00390000011639 ENSGT01100000263497.B ENSGT00940000160376 ENSGT00390000012589 ENSGT00390000007539 ENSGT01000000214440.C Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT01000000215390 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ENSGT01000000214440.C Zebra finch DUPLICATION Zebra finch MODERN SPECIES 38 ENSTGUG00000019935 ENSTGUG00000019544 ENSTGUG00000024122 ENSTGUG00000021122 ENSTGUG00000028351 ##22 ENSTGUG00000021607 ENSTGUG00000026301 ENSTGUG00000024115 ZNHIT2 (ENSTGUG00000028129) ENSTGUG00000023246 ENSTGUG00000022783 ENSTGUG00000020399 ENSTGUG00000019002 ENSTGUG00000023172 ENSTGUG00000026847 ENSTGUG00000024903 ##22 ENSTGUG00000019532 ENSTGUG00000029303 ENSTGUG00000023972 ENSTGUG00000028725 ENSTGUG00000019257 ENSTGUG00000014456 ENSTGUG00000022510 ENSTGUG00000022895 ENSTGUG00000029251 ENSTGUG00000020446 ENSTGUG00000024709 ENSTGUG00000027721 ENSTGUG00000025536 ENSTGUG00000024672 ENSTGUG00000025402 Zebra finch MODERN SPECIES 38 ENSTGUG00000028725 ENSTGUG00000023972 ENSTGUG00000029303 ENSTGUG00000019532 ENSTGUG00000024903 ##22 ENSTGUG00000026847 ENSTGUG00000023172 ENSTGUG00000019002 ENSTGUG00000020399 ENSTGUG00000022783 ENSTGUG00000023246 ZNHIT2 (ENSTGUG00000028129) ENSTGUG00000024115 ENSTGUG00000026301 ENSTGUG00000021607 ENSTGUG00000028351 ##22 ENSTGUG00000021122 ENSTGUG00000024122 ENSTGUG00000019544 ENSTGUG00000019935 ENSTGUG00000024726 ENSTGUG00000026145 ENSTGUG00000022402 ENSTGUG00000025943 UBXN1 (ENSTGUG00000029060) ENSTGUG00000020286 ENSTGUG00000022941 ENSTGUG00000020163 ENSTGUG00000022623 ENSTGUG00000027990 STX5 (ENSTGUG00000021933) Mammalia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000164608 ENSGT00940000153433.B.b ENSGT00390000018173 ENSGT00940000160341 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00940000165892 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b ENSGT00940000156048.a.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Theria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155978.a.a ENSGT01090000260186 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 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ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 9 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ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Elephant MODERN SPECIES 532 NRXN2 (ENSLAFG00000002103) ENSLAFG00000029715 SLC22A12 (ENSLAFG00000004533) SLC22A11 (ENSLAFG00000028688) RPS6KA4 (ENSLAFG00000008921) CCDC88B (ENSLAFG00000030165) ENSLAFG00000032572 PRDX5 (ENSLAFG00000025661) TRMT112 (ENSLAFG00000029149) ESRRA (ENSLAFG00000026176) CATSPERZ (ENSLAFG00000023390) KCNK4 (ENSLAFG00000011590) GPR137 (ENSLAFG00000011589) BAD (ENSLAFG00000021738) PLCB3 (ENSLAFG00000009090) PPP1R14B (ENSLAFG00000021755) ##22 FKBP2 (ENSLAFG00000009087) VEGFB (ENSLAFG00000025678) DNAJC4 (ENSLAFG00000009083) NUDT22 (ENSLAFG00000009080) TRPT1 (ENSLAFG00000009075) FERMT3 (ENSLAFG00000009071) STIP1 (ENSLAFG00000014685) ENSLAFG00000014681 FLRT1 (ENSLAFG00000014677) OTUB1 (ENSLAFG00000021422) COX8A (ENSLAFG00000011304) NAA40 (ENSLAFG00000022166) RCOR2 (ENSLAFG00000006094) MARK2 (ENSLAFG00000006072) SPINDOC (ENSLAFG00000030919) Hyrax MODERN SPECIES 5197 PLCB3 (ENSPCAG00000000982) ENSPCAG00000000929 ##22 FKBP2 (ENSPCAG00000000900) VEGFB (ENSPCAG00000000875) DNAJC4 (ENSPCAG00000000835) NUDT22 (ENSPCAG00000000798) TRPT1 (ENSPCAG00000000762) FERMT3 (ENSPCAG00000000711) STIP1 (ENSPCAG00000000641) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.a.a ENSGT01090000260186 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160483 ENSGT01090000260186 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Bushbaby MODERN SPECIES 255 SF1 (ENSOGAG00000016196) PYGM (ENSOGAG00000008083) RASGRP2 (ENSOGAG00000016190) NRXN2 (ENSOGAG00000001359) ENSOGAG00000001354 SLC22A11 (ENSOGAG00000011026) RPS6KA4 (ENSOGAG00000007168) CCDC88B (ENSOGAG00000031887) PRDX5 (ENSOGAG00000025702) TRMT112 (ENSOGAG00000013535) ESRRA (ENSOGAG00000033092) KCNK4 (ENSOGAG00000007163) GPR137 (ENSOGAG00000007161) BAD (ENSOGAG00000007160) PLCB3 (ENSOGAG00000007150) PPP1R14B (ENSOGAG00000030926) ##22 FKBP2 (ENSOGAG00000028269) VEGFB (ENSOGAG00000007142) DNAJC4 (ENSOGAG00000007140) NUDT22 (ENSOGAG00000007136) TRPT1 (ENSOGAG00000007134) FERMT3 (ENSOGAG00000007125) STIP1 (ENSOGAG00000007117) FLRT1 (ENSOGAG00000007115) MACROD1 (ENSOGAG00000027152) OTUB1 (ENSOGAG00000007114) COX8A (ENSOGAG00000007112) NAA40 (ENSOGAG00000013369) RCOR2 (ENSOGAG00000007109) MARK2 (ENSOGAG00000007105) SPINDOC (ENSOGAG00000005020) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157258 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Mouse lemur MODERN SPECIES 27 SF1 (ENSMICG00000001202) PYGM (ENSMICG00000001197) RASGRP2 (ENSMICG00000034620) NRXN2 (ENSMICG00000001185) SLC22A12 (ENSMICG00000008804) RPS6KA4 (ENSMICG00000029334) CCDC88B (ENSMICG00000016989) PRDX5 (ENSMICG00000016988) ENSMICG00000016987 ESRRA (ENSMICG00000016983) CATSPERZ (ENSMICG00000042558) KCNK4 (ENSMICG00000016981) GPR137 (ENSMICG00000009219) BAD (ENSMICG00000028209) PLCB3 (ENSMICG00000016970) PPP1R14B (ENSMICG00000036134) ##22 FKBP2 (ENSMICG00000016960) VEGFB (ENSMICG00000016957) DNAJC4 (ENSMICG00000016955) NUDT22 (ENSMICG00000033716) FERMT3 (ENSMICG00000016943) TRPT1 (ENSMICG00000016950) ENSMICG00000016933 MACROD1 (ENSMICG00000048123) FLRT1 (ENSMICG00000047913) OTUB1 (ENSMICG00000016916) COX8A (ENSMICG00000044396) NAA40 (ENSMICG00000016908) RCOR2 (ENSMICG00000016903) MARK2 (ENSMICG00000016891) SPINDOC (ENSMICG00000016878) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157258 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 696 RPS6KA4 (ENSPSMG00000004037) CCDC88B (ENSPSMG00000003977) PRDX5 (ENSPSMG00000003936) ENSPSMG00000003927 TRMT112 (ENSPSMG00000003922) ESRRA (ENSPSMG00000003906) ENSPSMG00000003870 KCNK4 (ENSPSMG00000003846) GPR137 (ENSPSMG00000003816) BAD (ENSPSMG00000003764) PLCB3 (ENSPSMG00000003710) PPP1R14B (ENSPSMG00000003637) ##22 FKBP2 (ENSPSMG00000003619) VEGFB (ENSPSMG00000003600) DNAJC4 (ENSPSMG00000003581) NUDT22 (ENSPSMG00000003569) TRPT1 (ENSPSMG00000003527) FERMT3 (ENSPSMG00000003497) ENSPSMG00000003481 ENSPSMG00000003478 FLRT1 (ENSPSMG00000003476) MACROD1 (ENSPSMG00000003466) OTUB1 (ENSPSMG00000003353) COX8A (ENSPSMG00000003291) NAA40 (ENSPSMG00000003280) RCOR2 (ENSPSMG00000003230) MARK2 (ENSPSMG00000001867) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 59 GDPD1 (ENSPSMG00000013681) ENSPSMG00000013650 DHX40 (ENSPSMG00000013562) CLTC (ENSPSMG00000013323) PTRH2 (ENSPSMG00000013145) VMP1 (ENSPSMG00000013121) TUBD1 (ENSPSMG00000012993) RPS6KB1 (ENSPSMG00000012813) RNFT1 (ENSPSMG00000012709) MED13 (ENSPSMG00000012622) INTS2 (ENSPSMG00000012510) BRIP1 (ENSPSMG00000012482) TBX4 (ENSPSMG00000012454) TBX2 (ENSPSMG00000012434) ENSPSMG00000012423 ##22 BCAS3 (ENSPSMG00000012239) PPM1D (ENSPSMG00000011798) APPBP2 (ENSPSMG00000011771) CHCT1 (ENSPSMG00000011749) ENSPSMG00000011700 CA4 (ENSPSMG00000011627) ZNHIT3 (ENSPSMG00000011614) MYO19 (ENSPSMG00000011604) PIGW (ENSPSMG00000011565) GGNBP2 (ENSPSMG00000011529) DHRS11 (ENSPSMG00000011489) MRM1 (ENSPSMG00000011470) LHX1 (ENSPSMG00000011466) AATF (ENSPSMG00000011456) ACACA (ENSPSMG00000011387) Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 760 PIH1D2 (ENSPCOG00000024160) NKAPD1 (ENSPCOG00000003388) TIMM8B (ENSPCOG00000026969) SDHD (ENSPCOG00000019028) ENSPCOG00000024440 ENSPCOG00000028355 TEX12 (ENSPCOG00000023524) BCO2 (ENSPCOG00000020109) PTS (ENSPCOG00000024186) NCAM1 (ENSPCOG00000022925) TTC12 (ENSPCOG00000024368) DRD2 (ENSPCOG00000007514) TMPRSS5 (ENSPCOG00000006628) ZW10 (ENSPCOG00000020599) USP28 (ENSPCOG00000018279) ENSPCOG00000019270 ##22 HTR3B (ENSPCOG00000013139) HTR3A (ENSPCOG00000025438) ZBTB16 (ENSPCOG00000004404) NNMT (ENSPCOG00000027693) C11orf71 (ENSPCOG00000015231) ENSPCOG00000022719 REXO2 (ENSPCOG00000027639) NXPE1 (ENSPCOG00000016490) NXPE4 (ENSPCOG00000017129) CADM1 (ENSPCOG00000028587) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 124 SF1 (ENSPCOG00000027546) PYGM (ENSPCOG00000004127) RASGRP2 (ENSPCOG00000017062) NRXN2 (ENSPCOG00000006501) SLC22A12 (ENSPCOG00000018089) RPS6KA4 (ENSPCOG00000014786) CCDC88B (ENSPCOG00000016059) PRDX5 (ENSPCOG00000022463) TRMT112 (ENSPCOG00000027044) ESRRA (ENSPCOG00000014809) CATSPERZ (ENSPCOG00000028418) KCNK4 (ENSPCOG00000013602) GPR137 (ENSPCOG00000020356) BAD (ENSPCOG00000028095) PLCB3 (ENSPCOG00000027858) ENSPCOG00000028120 ##22 FKBP2 (ENSPCOG00000014307) VEGFB (ENSPCOG00000015577) DNAJC4 (ENSPCOG00000016505) NUDT22 (ENSPCOG00000022559) TRPT1 (ENSPCOG00000010370) FERMT3 (ENSPCOG00000000399) STIP1 (ENSPCOG00000014850) MACROD1 (ENSPCOG00000023544) FLRT1 (ENSPCOG00000013563) OTUB1 (ENSPCOG00000016768) COX8A (ENSPCOG00000025872) NAA40 (ENSPCOG00000020757) RCOR2 (ENSPCOG00000020568) MARK2 (ENSPCOG00000015081) SPINDOC (ENSPCOG00000028492) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Tarsier MODERN SPECIES 2127 ENSTSYG00000031490 ##22 FKBP2 (ENSTSYG00000027856) VEGFB (ENSTSYG00000035870) DNAJC4 (ENSTSYG00000032443) NUDT22 (ENSTSYG00000027995) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.a ##22 Chimpanzee MODERN SPECIES 5 MED6 (ENSPTRG00000006496) TTC9 (ENSPTRG00000039204) MAP3K9 (ENSPTRG00000006499) PCNX1 (ENSPTRG00000006500) ENSPTRG00000040068 SIPA1L1 (ENSPTRG00000023075) RGS6 (ENSPTRG00000006504) DPF3 (ENSPTRG00000030704) DCAF4 (ENSPTRG00000006507) ENSPTRG00000043558 ZFYVE1 (ENSPTRG00000006508) RBM25 (ENSPTRG00000006509) PSEN1 (ENSPTRG00000006510) PAPLN (ENSPTRG00000006512) NUMB (ENSPTRG00000006513) ENSPTRG00000051883 ##22 HEATR4 (ENSPTRG00000006515) ACOT2 (ENSPTRG00000006516) ACOT4 (ENSPTRG00000006518) ACOT6 (ENSPTRG00000030702) DNAL1 (ENSPTRG00000006520) PNMA1 (ENSPTRG00000006521) MIDEAS (ENSPTRG00000006523) PTGR2 (ENSPTRG00000006524) ZNF410 (ENSPTRG00000006525) FAM161B (ENSPTRG00000006526) COQ6 (ENSPTRG00000006527) ENTPD5 (ENSPTRG00000006528) ENSPTRG00000043054 BBOF1 (ENSPTRG00000006530) ALDH6A1 (ENSPTRG00000006531) Gibbon MODERN SPECIES 14 HIBCH (ENSNLEG00000006646) INPP1 (ENSNLEG00000006655) MFSD6 (ENSNLEG00000006661) ENSNLEG00000026634 NAB1 (ENSNLEG00000035600) ENSNLEG00000006675 STAT1 (ENSNLEG00000006694) ENSNLEG00000006724 STAT4 (ENSNLEG00000006726) MYO1B (ENSNLEG00000006735) NABP1 (ENSNLEG00000030065) CAVIN2 (ENSNLEG00000006776) ENSNLEG00000013541 TMEFF2 (ENSNLEG00000006778) ENSNLEG00000031318 ENSNLEG00000035441 ##22 ENSNLEG00000034807 ENSNLEG00000028697 SLC39A10 (ENSNLEG00000006791) DNAH7 (ENSNLEG00000006803) ENSNLEG00000033012 STK17B (ENSNLEG00000006813) HECW2 (ENSNLEG00000006821) ENSNLEG00000006833 GTF3C3 (ENSNLEG00000006837) C2orf66 (ENSNLEG00000006848) PGAP1 (ENSNLEG00000006849) ANKRD44 (ENSNLEG00000006855) SF3B1 (ENSNLEG00000006861) COQ10B (ENSNLEG00000006871) ENSNLEG00000029205 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 122 PYGM (ENSRBIG00000032806) RASGRP2 (ENSRBIG00000040699) NRXN2 (ENSRBIG00000044691) SLC22A12 (ENSRBIG00000039478) SLC22A11 (ENSRBIG00000028306) RPS6KA4 (ENSRBIG00000040205) CCDC88B (ENSRBIG00000041460) ENSRBIG00000028781 ENSRBIG00000042875 ESRRA (ENSRBIG00000034658) ENSRBIG00000041694 KCNK4 (ENSRBIG00000036849) GPR137 (ENSRBIG00000038631) BAD (ENSRBIG00000044217) PLCB3 (ENSRBIG00000035714) ENSRBIG00000022403 ##22 FKBP2 (ENSRBIG00000027285) VEGFB (ENSRBIG00000034954) DNAJC4 (ENSRBIG00000040426) NUDT22 (ENSRBIG00000034358) TRPT1 (ENSRBIG00000040432) FERMT3 (ENSRBIG00000030040) STIP1 (ENSRBIG00000016275) FLRT1 (ENSRBIG00000030335) MACROD1 (ENSRBIG00000041173) OTUB1 (ENSRBIG00000043461) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b ##22 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.a ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 518 PYGM (ENSCATG00000034886) RASGRP2 (ENSCATG00000042628) NRXN2 (ENSCATG00000038140) SLC22A12 (ENSCATG00000043695) SLC22A11 (ENSCATG00000033115) RPS6KA4 (ENSCATG00000032072) CCDC88B (ENSCATG00000030984) PRDX5 (ENSCATG00000036341) ENSCATG00000037611 ESRRA (ENSCATG00000027912) CATSPERZ (ENSCATG00000033568) KCNK4 (ENSCATG00000030913) GPR137 (ENSCATG00000033477) BAD (ENSCATG00000033143) PLCB3 (ENSCATG00000031941) ENSCATG00000038370 ##22 FKBP2 (ENSCATG00000039463) VEGFB (ENSCATG00000031275) DNAJC4 (ENSCATG00000031950) NUDT22 (ENSCATG00000033002) TRPT1 (ENSCATG00000031563) FERMT3 (ENSCATG00000036049) STIP1 (ENSCATG00000038593) MACROD1 (ENSCATG00000037653) ENSCATG00000033959 FLRT1 (ENSCATG00000003844) OTUB1 (ENSCATG00000036180) COX8A (ENSCATG00000033437) NAA40 (ENSCATG00000035111) RCOR2 (ENSCATG00000033413) MARK2 (ENSCATG00000030205) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.a ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 433 PYGM (ENSMNEG00000019869) RASGRP2 (ENSMNEG00000023432) NRXN2 (ENSMNEG00000043644) ENSMNEG00000036100 SLC22A11 (ENSMNEG00000029979) RPS6KA4 (ENSMNEG00000032025) CCDC88B (ENSMNEG00000033453) PRDX5 (ENSMNEG00000028092) TRMT112 (ENSMNEG00000013487) ESRRA (ENSMNEG00000027151) CATSPERZ (ENSMNEG00000039355) KCNK4 (ENSMNEG00000040947) GPR137 (ENSMNEG00000044491) BAD (ENSMNEG00000044675) PLCB3 (ENSMNEG00000028331) ENSMNEG00000045463 ##22 FKBP2 (ENSMNEG00000025167) VEGFB (ENSMNEG00000044681) DNAJC4 (ENSMNEG00000041418) NUDT22 (ENSMNEG00000035263) TRPT1 (ENSMNEG00000033348) FERMT3 (ENSMNEG00000034532) STIP1 (ENSMNEG00000041943) ENSMNEG00000020968 FLRT1 (ENSMNEG00000017975) MACROD1 (ENSMNEG00000034860) OTUB1 (ENSMNEG00000041958) COX8A (ENSMNEG00000041613) NAA40 (ENSMNEG00000032942) RCOR2 (ENSMNEG00000038097) MARK2 (ENSMNEG00000045327) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.b ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2924 ENSRBIG00000028104 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 341 REG1A (ENSMNEG00000045263) ENSMNEG00000041460 REG1B (ENSMNEG00000035935) REG3G (ENSMNEG00000043718) ENSMNEG00000031490 ENSMNEG00000044917 ENSMNEG00000031795 LRRTM4 (ENSMNEG00000039557) ENSMNEG00000026354 GCFC2 (ENSMNEG00000035165) MRPL19 (ENSMNEG00000039037) EVA1A (ENSMNEG00000009692) TACR1 (ENSMNEG00000015631) POLE4 (ENSMNEG00000014492) HK2 (ENSMNEG00000036197) ENSMNEG00000033745 ##22 SEMA4F (ENSMNEG00000042562) M1AP (ENSMNEG00000028589) DOK1 (ENSMNEG00000031847) LOXL3 (ENSMNEG00000030648) HTRA2 (ENSMNEG00000044494) AUP1 (ENSMNEG00000034556) DQX1 (ENSMNEG00000043354) TLX2 (ENSMNEG00000006060) PCGF1 (ENSMNEG00000042227) LBX2 (ENSMNEG00000037341) TTC31 (ENSMNEG00000000034) CCDC142 (ENSMNEG00000043743) MRPL53 (ENSMNEG00000040378) MOGS (ENSMNEG00000042799) WBP1 (ENSMNEG00000035068) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group DUPLICATION Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.c ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.c ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.c ##22 Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee MODERN SPECIES 972 XG (ENSPTRG00000023871) GYG2 (ENSPTRG00000021625) ARSD (ENSPTRG00000048052) ARSH (ENSPTRG00000021630) ARSF (ENSPTRG00000021631) ENSPTRG00000046538 PRKX (ENSPTRG00000022476) ENSPTRG00000047401 ENSPTRG00000051405 NLGN4X (ENSPTRG00000021635) ENSPTRG00000045716 PUDP (ENSPTRG00000050372) ENSPTRG00000043603 STS (ENSPTRG00000021640) PNPLA4 (ENSPTRG00000021641) ENSPTRG00000003827 ##22 ENSPTRG00000021637 ANOS1 (ENSPTRG00000021645) FAM9A (ENSPTRG00000021649) ENSPTRG00000044756 FAM9B (ENSPTRG00000045285) TBL1X (ENSPTRG00000044234) GPR143 (ENSPTRG00000051528) SHROOM2 (ENSPTRG00000045318) ENSPTRG00000046452 CLDN34 (ENSPTRG00000043310) WWC3 (ENSPTRG00000021653) ENSPTRG00000047344 CLCN4 (ENSPTRG00000021655) MID1 (ENSPTRG00000021656) HCCS (ENSPTRG00000021657) Chimpanzee MODERN SPECIES 2 SF1 (ENSPTRG00000003846) PYGM (ENSPTRG00000003845) RASGRP2 (ENSPTRG00000003844) NRXN2 (ENSPTRG00000003843) SLC22A12 (ENSPTRG00000003841) SLC22A11 (ENSPTRG00000023703) RPS6KA4 (ENSPTRG00000003839) CCDC88B (ENSPTRG00000003836) PRDX5 (ENSPTRG00000003835) TRMT112 (ENSPTRG00000003834) ESRRA (ENSPTRG00000003833) KCNK4 (ENSPTRG00000003832) GPR137 (ENSPTRG00000003831) BAD (ENSPTRG00000003830) PLCB3 (ENSPTRG00000003828) PPP1R14B (ENSPTRG00000041138) ##22 FKBP2 (ENSPTRG00000003826) VEGFB (ENSPTRG00000003825) DNAJC4 (ENSPTRG00000003824) NUDT22 (ENSPTRG00000003823) TRPT1 (ENSPTRG00000003822) FERMT3 (ENSPTRG00000024042) STIP1 (ENSPTRG00000003820) ENSPTRG00000043258 ENSPTRG00000052372 FLRT1 (ENSPTRG00000028604) MACROD1 (ENSPTRG00000003818) OTUB1 (ENSPTRG00000003817) COX8A (ENSPTRG00000003816) NAA40 (ENSPTRG00000003815) RCOR2 (ENSPTRG00000003814) Gorilla MODERN SPECIES 2 MAP4K2 (ENSGGOG00000002968) PYGM (ENSGGOG00000012733) RASGRP2 (ENSGGOG00000012695) NRXN2 (ENSGGOG00000003597) SLC22A12 (ENSGGOG00000003591) SLC22A11 (ENSGGOG00000011450) ENSGGOG00000004129 PRDX5 (ENSGGOG00000001337) TRMT112 (ENSGGOG00000001334) ESRRA (ENSGGOG00000001333) CATSPERZ (ENSGGOG00000001331) KCNK4 (ENSGGOG00000001329) ENSGGOG00000012259 BAD (ENSGGOG00000012256) PLCB3 (ENSGGOG00000012218) ENSGGOG00000012211 ##22 FKBP2 (ENSGGOG00000012201) ENSGGOG00000012193 DNAJC4 (ENSGGOG00000012182) NUDT22 (ENSGGOG00000012174) TRPT1 (ENSGGOG00000012163) FERMT3 (ENSGGOG00000012149) STIP1 (ENSGGOG00000012132) ENSGGOG00000040851 FLRT1 (ENSGGOG00000023646) MACROD1 (ENSGGOG00000012120) ENSGGOG00000012111 COX8A (ENSGGOG00000006870) NAA40 (ENSGGOG00000023645) RCOR2 (ENSGGOG00000016070) MARK2 (ENSGGOG00000017093) Homo/Pan/Gorilla group DUPLICATION Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157974 ENSGT00940000153514.b ENSGT00950000183014.f.a.g.b.a.b.a.a ENSGT00940000160642 ENSGT00390000015060.n ENSGT00440000037606.b ENSGT00940000158781 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000162403 ENSGT00530000063410.b ENSGT01030000234607.A.b ENSGT00940000161508 ENSGT00940000155235.g.b ENSGT00940000155408 ENSGT00940000157249 ENSGT00950000182985.b.b.i.b.d.a ##22 ENSGT00940000154453.b.a.b.a ENSGT00940000162639 ENSGT00910000147537 ENSGT00910000146869 ENSGT00940000159743 ENSGT00940000158720.c.b ENSGT00940000158720.c.a ENSGT00940000159232.h.b ENSGT00940000159232.h.a ENSGT00940000156190.h ENSGT00390000004840 ENSGT00390000012547.b.b.b ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000159094 ENSGT00940000156597.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157974 ENSGT00940000153514.b ENSGT00950000183014.f.a.g.b.a.b.a.a ENSGT00940000160642 ENSGT00390000015060.n ENSGT00440000037606.b ENSGT00940000158781 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000162403 ENSGT00530000063410.b ENSGT01030000234607.A.b ENSGT00940000161508 ENSGT00940000155235.g.b ENSGT00940000155408 ENSGT00940000157249 ENSGT00950000182985.b.b.i.b.d.a ##22 ENSGT00940000154453.b.a.b.a ENSGT00940000162639 ENSGT00910000147537 ENSGT00910000146869 ENSGT00940000159743 ENSGT00940000158720.c.b ENSGT00940000158720.c.a ENSGT00940000159232.h.b ENSGT00940000159232.h.a ENSGT00940000156190.h ENSGT00390000004840 ENSGT00390000012547.b.b.b ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000159094 ENSGT00940000156597.b Pan ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157974 ENSGT00940000153514.b ENSGT00950000183014.f.a.g.b.a.b.a.a ENSGT00940000160642 ENSGT00390000015060.n ENSGT00440000037606.b ENSGT00940000158781 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000162403 ENSGT00530000063410.b ENSGT01030000234607.A.b ENSGT00940000161508 ENSGT00940000155235.g.b ENSGT00940000155408 ENSGT00940000157249 ENSGT00950000182985.b.b.i.b.d.a ##22 ENSGT00940000154453.b.a.b.a ENSGT00940000162639 ENSGT00910000147537 ENSGT00910000146869 ENSGT00940000159743 ENSGT00940000158720.c.b ENSGT00940000158720.c.a ENSGT00940000159232.h.b ENSGT00940000159232.h.a ENSGT00940000156190.h ENSGT00390000004840 ENSGT00390000012547.b.b.b ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000159094 ENSGT00940000156597.b Bonobo MODERN SPECIES 15 INO80D (ENSPPAG00000017120) NDUFS1 (ENSPPAG00000032284) ENSPPAG00000033754 ENSPPAG00000031391 ZDBF2 (ENSPPAG00000038901) ADAM23 (ENSPPAG00000030147) FAM237A (ENSPPAG00000028915) DYTN (ENSPPAG00000008787) ENSPPAG00000031338 FASTKD2 (ENSPPAG00000021300) CPO (ENSPPAG00000033230) KLF7 (ENSPPAG00000035305) CREB1 (ENSPPAG00000042817) METTL21A (ENSPPAG00000041715) ENSPPAG00000010296 ENSPPAG00000029502 ##22 CCNYL1 (ENSPPAG00000034051) FZD5 (ENSPPAG00000000897) ENSPPAG00000004988 ENSPPAG00000034737 PLEKHM3 (ENSPPAG00000028938) ENSPPAG00000019104 CRYGD (ENSPPAG00000030489) CRYGC (ENSPPAG00000029445) CRYGB (ENSPPAG00000019473) CRYGA (ENSPPAG00000038408) C2orf80 (ENSPPAG00000035033) IDH1 (ENSPPAG00000039215) PIKFYVE (ENSPPAG00000038724) PTH2R (ENSPPAG00000000087) MAP2 (ENSPPAG00000042145) Chimpanzee MODERN SPECIES 15 INO80D (ENSPTRG00000012841) NDUFS1 (ENSPTRG00000012842) EEF1B2 (ENSPTRG00000049619) CMKLR2 (ENSPTRG00000012844) ENSPTRG00000052002 ZDBF2 (ENSPTRG00000029052) ADAM23 (ENSPTRG00000012846) FAM237A (ENSPTRG00000045763) DYTN (ENSPTRG00000042355) MDH1B (ENSPTRG00000012847) FASTKD2 (ENSPTRG00000012848) CPO (ENSPTRG00000012849) KLF7 (ENSPTRG00000012850) CREB1 (ENSPTRG00000043959) METTL21A (ENSPTRG00000012852) ENSPTRG00000045370 ##22 CCNYL1 (ENSPTRG00000012853) FZD5 (ENSPTRG00000012855) ENSPTRG00000049925 ENSPTRG00000043594 PLEKHM3 (ENSPTRG00000012857) ENSPTRG00000049376 CRYGD (ENSPTRG00000012858) CRYGC (ENSPTRG00000012859) CRYGB (ENSPTRG00000012861) CRYGA (ENSPTRG00000012862) C2orf80 (ENSPTRG00000012863) IDH1 (ENSPTRG00000012865) PIKFYVE (ENSPTRG00000012866) PTH2R (ENSPTRG00000012868) MAP2 (ENSPTRG00000012869) Gorilla MODERN SPECIES 15 INO80D (ENSGGOG00000015570) NDUFS1 (ENSGGOG00000001513) EEF1B2 (ENSGGOG00000007002) ENSGGOG00000042195 ZDBF2 (ENSGGOG00000023142) ENSGGOG00000024971 ADAM23 (ENSGGOG00000012509) FAM237A (ENSGGOG00000037017) DYTN (ENSGGOG00000027242) MDH1B (ENSGGOG00000002059) FASTKD2 (ENSGGOG00000002062) CPO (ENSGGOG00000016053) KLF7 (ENSGGOG00000009338) CREB1 (ENSGGOG00000024394) METTL21A (ENSGGOG00000015815) ENSGGOG00000022138 ##22 CCNYL1 (ENSGGOG00000039803) FZD5 (ENSGGOG00000042758) ENSGGOG00000043005 PLEKHM3 (ENSGGOG00000000998) ENSGGOG00000040001 CRYGD (ENSGGOG00000027001) CRYGC (ENSGGOG00000026944) CRYGB (ENSGGOG00000008895) CRYGA (ENSGGOG00000022179) C2orf80 (ENSGGOG00000004332) IDH1 (ENSGGOG00000012619) PIKFYVE (ENSGGOG00000012992) PTH2R (ENSGGOG00000016959) ENSGGOG00000028471 MAP2 (ENSGGOG00000027310) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.d.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.d.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.i.b.d.b ##22 Bonobo MODERN SPECIES 17 MGAT4D (ENSPPAG00000036062) CLGN (ENSPPAG00000040396) ENSPPAG00000033463 ENSPPAG00000042997 MAML3 (ENSPPAG00000002376) MGST2 (ENSPPAG00000034504) ENSPPAG00000013101 ENSPPAG00000040472 SETD7 (ENSPPAG00000027000) RAB33B (ENSPPAG00000043376) ENSPPAG00000043084 ENSPPAG00000042826 NAA15 (ENSPPAG00000034447) ENSPPAG00000037033 MGARP (ENSPPAG00000040248) ENSPPAG00000037896 ##22 ELF2 (ENSPPAG00000016962) NOCT (ENSPPAG00000042856) ENSPPAG00000003317 ENSPPAG00000027209 SLC7A11 (ENSPPAG00000039405) PCDH18 (ENSPPAG00000003442) ENSPPAG00000032483 ENSPPAG00000036402 ENSPPAG00000042996 PABPC4L (ENSPPAG00000043745) PCDH10 (ENSPPAG00000035058) C4orf33 (ENSPPAG00000036110) SCLT1 (ENSPPAG00000039830) JADE1 (ENSPPAG00000027693) PGRMC2 (ENSPPAG00000042028) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00910000147058 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00910000147058 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Gibbon MODERN SPECIES 19 PYGM (ENSNLEG00000005206) RASGRP2 (ENSNLEG00000005105) NRXN2 (ENSNLEG00000005095) SLC22A12 (ENSNLEG00000005070) ENSNLEG00000005067 RPS6KA4 (ENSNLEG00000005042) ENSNLEG00000005014 ENSNLEG00000005003 TRMT112 (ENSNLEG00000028260) ESRRA (ENSNLEG00000004971) CATSPERZ (ENSNLEG00000004970) ENSNLEG00000004963 ENSNLEG00000004953 ENSNLEG00000028113 PLCB3 (ENSNLEG00000004895) PPP1R14B (ENSNLEG00000004890) ##22 FKBP2 (ENSNLEG00000004877) VEGFB (ENSNLEG00000004864) DNAJC4 (ENSNLEG00000004852) NUDT22 (ENSNLEG00000004838) ENSNLEG00000033525 ENSNLEG00000004819 STIP1 (ENSNLEG00000004777) ENSNLEG00000034495 ENSNLEG00000004776 OTUB1 (ENSNLEG00000004735) NAA40 (ENSNLEG00000029469) RCOR2 (ENSNLEG00000004721) MARK2 (ENSNLEG00000004656) ENSNLEG00000004652 ZFTA (ENSNLEG00000004648) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00910000147058 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 2 PYGM (ENSPPYG00000003099) RASGRP2 (ENSPPYG00000029839) NRXN2 (ENSPPYG00000003101) SLC22A12 (ENSPPYG00000003102) SLC22A11 (ENSPPYG00000003103) RPS6KA4 (ENSPPYG00000029624) CCDC88B (ENSPPYG00000003105) ENSPPYG00000003106 ENSPPYG00000025906 ESRRA (ENSPPYG00000003107) CATSPERZ (ENSPPYG00000036817) KCNK4 (ENSPPYG00000032735) ENSPPYG00000003109 BAD (ENSPPYG00000003110) PLCB3 (ENSPPYG00000003111) ENSPPYG00000035813 ##22 FKBP2 (ENSPPYG00000039319) VEGFB (ENSPPYG00000003113) DNAJC4 (ENSPPYG00000003114) ENSPPYG00000003115 TRPT1 (ENSPPYG00000003116) FERMT3 (ENSPPYG00000003117) STIP1 (ENSPPYG00000003118) ENSPPYG00000003119 ENSPPYG00000037537 FLRT1 (ENSPPYG00000003120) OTUB1 (ENSPPYG00000003121) COX8A (ENSPPYG00000003122) NAA40 (ENSPPYG00000003123) RCOR2 (ENSPPYG00000003124) MARK2 (ENSPPYG00000003125) Orangutan MODERN SPECIES 20 LAMB4 (ENSPPYG00000017908) LAMB1 (ENSPPYG00000017907) DLD (ENSPPYG00000017906) SLC26A3 (ENSPPYG00000017905) CBLL1 (ENSPPYG00000017904) SLC26A4 (ENSPPYG00000017903) BCAP29 (ENSPPYG00000032287) DUS4L (ENSPPYG00000017901) GPR22 (ENSPPYG00000017900) COG5 (ENSPPYG00000017899) HBP1 (ENSPPYG00000017898) PRKAR2B (ENSPPYG00000017897) PIK3CG (ENSPPYG00000017896) CCDC71L (ENSPPYG00000017895) NAMPT (ENSPPYG00000018270) ENSPPYG00000030217 ##22 ENSPPYG00000018285 ENSPPYG00000040630 SYPL1 (ENSPPYG00000041789) CDHR3 (ENSPPYG00000018293) ATXN7L1 (ENSPPYG00000018291) ENSPPYG00000017893 RINT1 (ENSPPYG00000017892) PUS7 (ENSPPYG00000017891) ENSPPYG00000040945 SRPK2 (ENSPPYG00000017889) KMT2E (ENSPPYG00000017888) LHFPL3 (ENSPPYG00000017887) ORC5 (ENSPPYG00000017886) RELN (ENSPPYG00000017885) SLC26A5 (ENSPPYG00000017884) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00910000147058 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00910000147058 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Human MODERN SPECIES 2 PYGM (ENSG00000068976) RASGRP2 (ENSG00000068831) NRXN2 (ENSG00000110076) SLC22A12 (ENSG00000197891) SLC22A11 (ENSG00000168065) RPS6KA4 (ENSG00000162302) CCDC88B (ENSG00000168071) PRDX5 (ENSG00000126432) TRMT112 (ENSG00000173113) ESRRA (ENSG00000173153) CATSPERZ (ENSG00000219435) KCNK4 (ENSG00000182450) GPR137 (ENSG00000173264) BAD (ENSG00000002330) PLCB3 (ENSG00000149782) PPP1R14B (ENSG00000173457) ##22 ENSG00000286264 FKBP2 (ENSG00000173486) VEGFB (ENSG00000173511) DNAJC4 (ENSG00000110011) NUDT22 (ENSG00000149761) TRPT1 (ENSG00000149743) FERMT3 (ENSG00000149781) STIP1 (ENSG00000168439) FLRT1 (ENSG00000126500) MACROD1 (ENSG00000133315) OTUB1 (ENSG00000167770) COX8A (ENSG00000176340) NAA40 (ENSG00000110583) RCOR2 (ENSG00000167771) MARK2 (ENSG00000072518) Pan ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 ENSGT00600000084617 Chimpanzee MODERN SPECIES 19 TMEM244 (ENSPTRG00000029415) ARHGAP18 (ENSPTRG00000018591) ENSPTRG00000040684 ENSPTRG00000044905 LAMA2 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ENSPPAG00000034060 ANOS1 (ENSPPAG00000037398) ENSPPAG00000038625 ENSPPAG00000012738 ENSPPAG00000040296 TBL1X (ENSPPAG00000040439) GPR143 (ENSPPAG00000040569) ENSPPAG00000043651 SHROOM2 (ENSPPAG00000041810) CLDN34 (ENSPPAG00000019292) WWC3 (ENSPPAG00000035084) ENSPPAG00000029035 CLCN4 (ENSPPAG00000004966) MID1 (ENSPPAG00000038224) HCCS (ENSPPAG00000040960) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00910000147058 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173.o ENSGT00390000009268.c ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 77 LAMA2 (ENSRBIG00000027581) ENSRBIG00000016254 ENSRBIG00000025462 ENSRBIG00000025755 PTPRK (ENSRBIG00000038839) THEMIS (ENSRBIG00000011336) C6orf58 (ENSRBIG00000032185) SOGA3 (ENSRBIG00000039790) KIAA0408 (ENSRBIG00000031115) ENSRBIG00000042119 ENSRBIG00000025986 ECHDC1 (ENSRBIG00000029743) RNF146 (ENSRBIG00000010428) RSPO3 (ENSRBIG00000038972) ENSRBIG00000032519 ENSRBIG00000034244 ##22 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 689 RASGRP2 (ENSRROG00000016261) NRXN2 (ENSRROG00000032200) SLC22A12 (ENSRROG00000029881) SLC22A11 (ENSRROG00000040186) RPS6KA4 (ENSRROG00000040388) CCDC88B (ENSRROG00000045197) ENSRROG00000021557 TRMT112 (ENSRROG00000044424) ESRRA (ENSRROG00000039613) CATSPERZ (ENSRROG00000028687) KCNK4 (ENSRROG00000029775) GPR137 (ENSRROG00000037712) BAD (ENSRROG00000034055) PLCB3 (ENSRROG00000033756) PPP1R14B (ENSRROG00000044431) ##22 FKBP2 (ENSRROG00000039908) VEGFB (ENSRROG00000000444) DNAJC4 (ENSRROG00000041457) NUDT22 (ENSRROG00000029876) TRPT1 (ENSRROG00000044905) FERMT3 (ENSRROG00000018258) STIP1 (ENSRROG00000031122) FLRT1 (ENSRROG00000021859) MACROD1 (ENSRROG00000045162) OTUB1 (ENSRROG00000041865) COX8A (ENSRROG00000035722) NAA40 (ENSRROG00000040534) RCOR2 (ENSRROG00000037726) MARK2 (ENSRROG00000030516) SPINDOC (ENSRROG00000013487) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 586 ENSRROG00000042963 ##22 TRMT11 (ENSRROG00000041258) HINT3 (ENSRROG00000028530) NCOA7 (ENSRROG00000033104) HEY2 (ENSRROG00000021457) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c.a.b ENSGT00940000160341.a ENSGT00390000009268.c.a.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Vervet Monkey MODERN SPECIES PYGM (ENSCSAG00000007250) RASGRP2 (ENSCSAG00000007242) NRXN2 (ENSCSAG00000007237) SLC22A12 (ENSCSAG00000007232) SLC22A11 (ENSCSAG00000007227) RPS6KA4 (ENSCSAG00000007216) CCDC88B (ENSCSAG00000007206) PRDX5 (ENSCSAG00000007195) ESRRA (ENSCSAG00000007192) ENSCSAG00000007187 CATSPERZ (ENSCSAG00000007181) KCNK4 (ENSCSAG00000007170) GPR137 (ENSCSAG00000007157) BAD (ENSCSAG00000007151) PLCB3 (ENSCSAG00000007117) PPP1R14B (ENSCSAG00000007003) ##22 FKBP2 (ENSCSAG00000007000) VEGFB (ENSCSAG00000006993) DNAJC4 (ENSCSAG00000006977) NUDT22 (ENSCSAG00000006966) FERMT3 (ENSCSAG00000006957) TRPT1 (ENSCSAG00000006952) STIP1 (ENSCSAG00000006931) MACROD1 (ENSCSAG00000006912) FLRT1 (ENSCSAG00000019174) OTUB1 (ENSCSAG00000006902) COX8A (ENSCSAG00000006887) NAA40 (ENSCSAG00000006886) RCOR2 (ENSCSAG00000006881) MARK2 (ENSCSAG00000006877) SPINDOC (ENSCSAG00000006870) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c.a.b ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00910000147058 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c.a.b ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00910000147058 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Cercopithecinae_d DUPLICATION Cercopithecinae_d DUPLICATION Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.j.g.a ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 251 ENSCATG00000019099 GCFC2 (ENSCATG00000044850) MRPL19 (ENSCATG00000031286) EVA1A (ENSCATG00000041521) TACR1 (ENSCATG00000035330) POLE4 (ENSCATG00000033537) HK2 (ENSCATG00000034110) ENSCATG00000040304 ##22 SEMA4F (ENSCATG00000040857) ENSCATG00000025408 M1AP (ENSCATG00000039619) DOK1 (ENSCATG00000013699) LOXL3 (ENSCATG00000001609) HTRA2 (ENSCATG00000037890) AUP1 (ENSCATG00000025926) DQX1 (ENSCATG00000037156) TLX2 (ENSCATG00000035266) PCGF1 (ENSCATG00000036071) LBX2 (ENSCATG00000033635) TTC31 (ENSCATG00000035568) CCDC142 (ENSCATG00000033704) MRPL53 (ENSCATG00000009492) MOGS (ENSCATG00000043762) Drill MODERN SPECIES 644 ENSMLEG00000027700 ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c.a.b ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j.g.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00910000147058 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Drill MODERN SPECIES 1111 PYGM (ENSMLEG00000033335) RASGRP2 (ENSMLEG00000042156) NRXN2 (ENSMLEG00000036031) SLC22A12 (ENSMLEG00000022071) SLC22A11 (ENSMLEG00000043533) RPS6KA4 (ENSMLEG00000030486) CCDC88B (ENSMLEG00000037123) PRDX5 (ENSMLEG00000036362) TRMT112 (ENSMLEG00000017888) ESRRA (ENSMLEG00000035857) CATSPERZ (ENSMLEG00000026650) KCNK4 (ENSMLEG00000026790) GPR137 (ENSMLEG00000028909) BAD (ENSMLEG00000015467) PLCB3 (ENSMLEG00000043541) ENSMLEG00000039492 ##22 FKBP2 (ENSMLEG00000040653) VEGFB (ENSMLEG00000039775) DNAJC4 (ENSMLEG00000009864) NUDT22 (ENSMLEG00000029253) TRPT1 (ENSMLEG00000031438) FERMT3 (ENSMLEG00000042680) STIP1 (ENSMLEG00000034810) ENSMLEG00000022551 FLRT1 (ENSMLEG00000027310) MACROD1 (ENSMLEG00000038936) OTUB1 (ENSMLEG00000039512) COX8A (ENSMLEG00000043306) NAA40 (ENSMLEG00000040713) RCOR2 (ENSMLEG00000041544) MARK2 (ENSMLEG00000042721) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.j ENSGT00940000157063 ENSGT00940000154977.l.a ENSGT00940000156908 ENSGT00940000154674.i.a.b ENSGT00390000011717 ENSGT00390000018710 ENSGT00950000183000.c.a.b.r.a ENSGT00390000000742 ENSGT00940000156130.b ENSGT00940000159124 ENSGT00940000158635 ENSGT00940000156473 ENSGT00910000144152.b.a.e ENSGT00940000158224 ENSGT00950000182985.b.b.j.h ##22 ENSGT00860000136016 ENSGT00940000159542 ENSGT00390000001846 ENSGT00530000064276 ENSGT00940000159419 ENSGT00390000004451 ENSGT01030000234597.a.b.b.e.a.a ENSGT00940000157068 ENSGT00940000155294 ENSGT00940000157988 ENSGT00940000155622.e.a.b ENSGT00940000156172.b ENSGT00390000002061 ENSGT00940000154530.s ENSGT00940000154530.r.b.a.b.b Drill DUPLICATION Drill MODERN SPECIES 839 C8orf89 (ENSMLEG00000042415) ENSMLEG00000030114 RDH10 (ENSMLEG00000043173) STAU2 (ENSMLEG00000044427) UBE2W (ENSMLEG00000038081) ELOC (ENSMLEG00000040786) TMEM70 (ENSMLEG00000034339) ENSMLEG00000033636 LY96 (ENSMLEG00000006247) JPH1 (ENSMLEG00000040097) GDAP1 (ENSMLEG00000032073) PI15 (ENSMLEG00000025565) CRISPLD1 (ENSMLEG00000000424) ENSMLEG00000021182 HNF4G (ENSMLEG00000022163) ENSMLEG00000044266 ##22 ENSMLEG00000005357 ZFHX4 (ENSMLEG00000038977) PEX2 (ENSMLEG00000009687) Drill MODERN SPECIES 553 ENSMLEG00000000050 CENPW (ENSMLEG00000033575) ENSMLEG00000033412 ##22 Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 397 JPH1 (ENSCATG00000043716) GDAP1 (ENSCATG00000022050) PI15 (ENSCATG00000040179) CRISPLD1 (ENSCATG00000037120) HNF4G (ENSCATG00000011177) ENSCATG00000033563 ##22 ENSCATG00000033397 ZFHX4 (ENSCATG00000033950) PEX2 (ENSCATG00000029304) PKIA (ENSCATG00000003870) ZC2HC1A (ENSCATG00000033780) IL7 (ENSCATG00000035484) STMN2 (ENSCATG00000028978) HEY1 (ENSCATG00000007863) TPD52 (ENSCATG00000042819) ENSCATG00000040451 ZBTB10 (ENSCATG00000041367) ENSCATG00000016166 ENSCATG00000022264 ZNF704 (ENSCATG00000033958) PAG1 (ENSCATG00000021872) Sooty mangabey MODERN SPECIES 312 ENSCATG00000000660 ##22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 3 SF1 (ENSPANG00000020754) PYGM (ENSPANG00000011408) RASGRP2 (ENSPANG00000010911) NRXN2 (ENSPANG00000004471) SLC22A12 (ENSPANG00000009833) SLC22A11 (ENSPANG00000017442) RPS6KA4 (ENSPANG00000003107) CCDC88B (ENSPANG00000016980) PRDX5 (ENSPANG00000033997) ENSPANG00000035234 ESRRA (ENSPANG00000024911) CATSPERZ (ENSPANG00000013727) KCNK4 (ENSPANG00000018628) GPR137 (ENSPANG00000016423) ENSPANG00000012183 ENSPANG00000012133 ##22 FKBP2 (ENSPANG00000031845) VEGFB (ENSPANG00000003693) DNAJC4 (ENSPANG00000017262) NUDT22 (ENSPANG00000015654) TRPT1 (ENSPANG00000011001) FERMT3 (ENSPANG00000011407) STIP1 (ENSPANG00000017079) FLRT1 (ENSPANG00000003558) MACROD1 (ENSPANG00000005925) OTUB1 (ENSPANG00000032360) COX8A (ENSPANG00000039572) NAA40 (ENSPANG00000002369) RCOR2 (ENSPANG00000007283) MARK2 (ENSPANG00000026211) SPINDOC (ENSPANG00000043963) Olive baboon MODERN SPECIES 18 KCNB2 (ENSPANG00000018223) TERF1 (ENSPANG00000025943) ENSPANG00000019416 ENSPANG00000046747 RDH10 (ENSPANG00000012143) STAU2 (ENSPANG00000021222) UBE2W (ENSPANG00000022869) ELOC (ENSPANG00000016947) TMEM70 (ENSPANG00000042898) LY96 (ENSPANG00000010318) JPH1 (ENSPANG00000013758) GDAP1 (ENSPANG00000014645) PI15 (ENSPANG00000001259) CRISPLD1 (ENSPANG00000023611) HNF4G (ENSPANG00000001380) ENSPANG00000017348 ##22 ZFHX4 (ENSPANG00000023610) PEX2 (ENSPANG00000013757) ENSPANG00000049899 ENSPANG00000038533 ENSPANG00000047952 PKIA (ENSPANG00000009671) ZC2HC1A (ENSPANG00000009231) IL7 (ENSPANG00000013756) ENSPANG00000044731 ENSPANG00000044985 STMN2 (ENSPANG00000011903) HEY1 (ENSPANG00000018687) MRPS28 (ENSPANG00000050269) TPD52 (ENSPANG00000025523) ENSPANG00000044957 Macaca ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c.a.b ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00940000161450 ENSGT00910000147058 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 342 TMEM244 (ENSMNEG00000035851) ARHGAP18 (ENSMNEG00000039897) LAMA2 (ENSMNEG00000032185) PTPRK (ENSMNEG00000041170) THEMIS (ENSMNEG00000024060) C6orf58 (ENSMNEG00000033146) SOGA3 (ENSMNEG00000031735) KIAA0408 (ENSMNEG00000028104) ENSMNEG00000041649 ENSMNEG00000037871 ECHDC1 (ENSMNEG00000028237) RNF146 (ENSMNEG00000031963) RSPO3 (ENSMNEG00000032801) ENSMNEG00000040460 CENPW (ENSMNEG00000031333) ENSMNEG00000030109 ##22 TRMT11 (ENSMNEG00000040840) HINT3 (ENSMNEG00000005610) ENSMNEG00000036487 NCOA7 (ENSMNEG00000044511) HEY2 (ENSMNEG00000037312) HDDC2 (ENSMNEG00000041109) TPD52L1 (ENSMNEG00000013701) RNF217 (ENSMNEG00000031095) ENSMNEG00000037147 NKAIN2 (ENSMNEG00000028319) TRDN (ENSMNEG00000035322) CLVS2 (ENSMNEG00000035011) SMPDL3A (ENSMNEG00000034155) FABP7 (ENSMNEG00000000102) PKIB (ENSMNEG00000041361) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.c.a.b ENSGT00940000160341.a ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.j ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.u ENSGT00940000161450 ENSGT00910000147058 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 Rhesus DUPLICATION Rhesus MODERN SPECIES 18 C8orf89 (ENSMMUG00000043699) RPL7 (ENSMMUG00000005141) RDH10 (ENSMMUG00000005143) ENSMMUG00000049695 STAU2 (ENSMMUG00000021588) UBE2W (ENSMMUG00000009755) ELOC (ENSMMUG00000005155) ENSMMUG00000041153 TMEM70 (ENSMMUG00000050147) LY96 (ENSMMUG00000003018) JPH1 (ENSMMUG00000050527) 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(ENSMFAG00000045746) MACROD1 (ENSMFAG00000000889) ENSMFAG00000058459 FLRT1 (ENSMFAG00000025476) OTUB1 (ENSMFAG00000033654) COX8A (ENSMFAG00000001343) NAA40 (ENSMFAG00000034118) RCOR2 (ENSMFAG00000039149) MARK2 (ENSMFAG00000032452) ENSMFAG00000063584 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 18 UBE2W (ENSMFAG00000000629) ENSMFAG00000063720 ELOC (ENSMFAG00000038428) ENSMFAG00000058731 ENSMFAG00000055320 TMEM70 (ENSMFAG00000062169) ENSMFAG00000060835 LY96 (ENSMFAG00000002255) ENSMFAG00000052449 JPH1 (ENSMFAG00000000513) GDAP1 (ENSMFAG00000052390) PI15 (ENSMFAG00000031904) CRISPLD1 (ENSMFAG00000003081) ENSMFAG00000023352 HNF4G (ENSMFAG00000033031) ENSMFAG00000039662 ##22 LGALS1 (ENSMFAG00000030003) ENSMFAG00000056990 ZFHX4 (ENSMFAG00000034757) ENSMFAG00000044463 PEX2 (ENSMFAG00000036908) ENSMFAG00000038579 ZC2HC1A (ENSMFAG00000044759) IL7 (ENSMFAG00000002965) ENSMFAG00000052358 ENSMFAG00000057693 ENSMFAG00000060626 STMN2 (ENSMFAG00000003646) HEY1 (ENSMFAG00000039491) MRPS28 (ENSMFAG00000057020) TPD52 (ENSMFAG00000031459) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483.a ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.f ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.x.a ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483.a ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.f ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911.x.a ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Marmoset MODERN SPECIES 2 CDC42BPG (ENSCJAG00000002669) NRXN2 (ENSCJAG00000002930) SLC22A12 (ENSCJAG00000002977) SLC22A11 (ENSCJAG00000070574) RPS6KA4 (ENSCJAG00000017957) CCDC88B (ENSCJAG00000017980) ENSCJAG00000086006 ENSCJAG00000018014 TRMT112 (ENSCJAG00000018026) ESRRA (ENSCJAG00000018030) CATSPERZ (ENSCJAG00000018046) KCNK4 (ENSCJAG00000018060) GPR137 (ENSCJAG00000018062) BAD (ENSCJAG00000018074) PLCB3 (ENSCJAG00000018081) PPP1R14B (ENSCJAG00000047020) ##22 FKBP2 (ENSCJAG00000038946) VEGFB (ENSCJAG00000018126) DNAJC4 (ENSCJAG00000018151) NUDT22 (ENSCJAG00000018163) TRPT1 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MODERN SPECIES 102 PYGM (ENSCCAG00000022826) ENSCCAG00000022664 NRXN2 (ENSCCAG00000025223) SLC22A12 (ENSCCAG00000021030) SLC22A11 (ENSCCAG00000019938) RPS6KA4 (ENSCCAG00000029039) CCDC88B (ENSCCAG00000020244) PRDX5 (ENSCCAG00000032386) ENSCCAG00000028185 ESRRA (ENSCCAG00000020410) CATSPERZ (ENSCCAG00000020720) KCNK4 (ENSCCAG00000020728) GPR137 (ENSCCAG00000021155) BAD (ENSCCAG00000010421) PLCB3 (ENSCCAG00000015511) PPP1R14B (ENSCCAG00000020283) ##22 FKBP2 (ENSCCAG00000032358) VEGFB (ENSCCAG00000020828) DNAJC4 (ENSCCAG00000020456) NUDT22 (ENSCCAG00000020502) OTOL1 (ENSCCAG00000024104) ENSCCAG00000028422 SPTSSB (ENSCCAG00000014270) NMD3 (ENSCCAG00000037460) PPM1L (ENSCCAG00000025291) OR2B3 (ENSCCAG00000035303) KPNA4 (ENSCCAG00000003106) SMC4 (ENSCCAG00000022762) ENSCCAG00000020211 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 136 ENSSBOG00000000540 NRXN2 (ENSSBOG00000025465) SLC22A12 (ENSSBOG00000023751) SLC22A11 (ENSSBOG00000016344) ENSSBOG00000028091 RPS6KA4 (ENSSBOG00000031882) CCDC88B 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night monkey MODERN SPECIES 660 PYGM (ENSANAG00000033338) RASGRP2 (ENSANAG00000026693) NRXN2 (ENSANAG00000028468) SLC22A12 (ENSANAG00000037377) SLC22A11 (ENSANAG00000022036) RPS6KA4 (ENSANAG00000038299) CCDC88B (ENSANAG00000029201) PRDX5 (ENSANAG00000027318) ENSANAG00000021626 ESRRA (ENSANAG00000033891) CATSPERZ (ENSANAG00000033403) KCNK4 (ENSANAG00000038205) GPR137 (ENSANAG00000033992) BAD (ENSANAG00000032197) PLCB3 (ENSANAG00000032258) ENSANAG00000026105 ##22 ENSANAG00000025147 VEGFB (ENSANAG00000024046) DNAJC4 (ENSANAG00000036443) NUDT22 (ENSANAG00000024100) TRPT1 (ENSANAG00000019580) FERMT3 (ENSANAG00000030526) ENSANAG00000032349 ENSANAG00000026818 FLRT1 (ENSANAG00000019976) MACROD1 (ENSANAG00000037887) OTUB1 (ENSANAG00000020656) COX8A (ENSANAG00000038341) NAA40 (ENSANAG00000032686) RCOR2 (ENSANAG00000020576) MARK2 (ENSANAG00000033532) Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 579 ENSANAG00000029153 ##22 ENSANAG00000023980 ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 579 ENSANAG00000029153 ##22 ENSANAG00000023980 ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 1029 ENSANAG00000024169 ##22 SLC11A2 (ENSANAG00000033449) HIGD1C (ENSANAG00000030406) ENSANAG00000023970 METTL7A (ENSANAG00000035861) TMPRSS12 (ENSANAG00000026837) ATF1 (ENSANAG00000033502) DIP2B (ENSANAG00000032064) LARP4 (ENSANAG00000029342) ENSANAG00000020925 ENSANAG00000036201 LIMA1 (ENSANAG00000034316) CERS5 (ENSANAG00000034838) GPD1 (ENSANAG00000024396) ENSANAG00000026495 ASIC1 (ENSANAG00000027378) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160483 ENSGT01090000260186 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b 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ENSGT00940000160483 ENSGT01090000260186 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160483 ENSGT01090000260186 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 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ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1053 Pygm (ENSNGAG00000014922) Rasgrp2 (ENSNGAG00000015520) Nrxn2 (ENSNGAG00000015111) Slc22a12 (ENSNGAG00000016504) ENSNGAG00000016821 Rps6ka4 (ENSNGAG00000017235) Ccdc88b (ENSNGAG00000019008) Prdx5 (ENSNGAG00000013612) Trmt112 (ENSNGAG00000019029) Esrra (ENSNGAG00000019617) Catsperz (ENSNGAG00000020348) Kcnk4 (ENSNGAG00000001056) Gpr137 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ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT01090000260186 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 19 Lgsn (ENSRNOG00000012205) Ptp4a1 (ENSRNOG00000011771) Phf3 (ENSRNOG00000011756) Spata31e1 (ENSRNOG00000026175) LOC689725 (ENSRNOG00000026195) Adgrb3 (ENSRNOG00000012045) Lmbrd1 (ENSRNOG00000012178) 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ENSGT00410000025985 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT01090000260186 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Ryukyu mouse DUPLICATION Ryukyu mouse MODERN SPECIES Lgsn (MGP_CAROLIEiJ_G0014008) MGP_CAROLIEiJ_G0014007 MGP_CAROLIEiJ_G0014006 Phf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0014005) Gm597 (MGP_CAROLIEiJ_G0014004) 4931408C20Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0014003) Adgrb3 (MGP_CAROLIEiJ_G0014002) Lmbrd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014001) Col19a1 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(ENSMUSG00000024970) Shrew mouse DUPLICATION Shrew mouse MODERN SPECIES 18 Lgsn (MGP_PahariEiJ_G0027257) MGP_PahariEiJ_G0027256 MGP_PahariEiJ_G0027255 MGP_PahariEiJ_G0027254 MGP_PahariEiJ_G0027253 Phf3 (MGP_PahariEiJ_G0027252) Adgrb3 (MGP_PahariEiJ_G0027251) Lmbrd1 (MGP_PahariEiJ_G0027250) Col19a1 (MGP_PahariEiJ_G0027249) Col9a1 (MGP_PahariEiJ_G0027248) Fam135a (MGP_PahariEiJ_G0027247) Sdhaf4 (MGP_PahariEiJ_G0027246) Smap1 (MGP_PahariEiJ_G0027245) B3gat2 (MGP_PahariEiJ_G0027244) MGP_PahariEiJ_G0027243 Ppp1r14bl (MGP_PahariEiJ_G0027242) ##22 MGP_PahariEiJ_G0027241 Kcnq5 (MGP_PahariEiJ_G0027240) Gsta3 (MGP_PahariEiJ_G0027239) Tmem14a (MGP_PahariEiJ_G0027238) Tram2 (MGP_PahariEiJ_G0027237) Efhc1 (MGP_PahariEiJ_G0027236) Paqr8 (MGP_PahariEiJ_G0027235) Mcm3 (MGP_PahariEiJ_G0027234) Il17f (MGP_PahariEiJ_G0027233) Il17a (MGP_PahariEiJ_G0027232) Pkhd1 (MGP_PahariEiJ_G0027231) Tfap2b (MGP_PahariEiJ_G0027230) Tfap2d (MGP_PahariEiJ_G0027229) Defb41 (MGP_PahariEiJ_G0027228) Defb18 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(MGP_PahariEiJ_G0014131) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160483 ENSGT01090000260186 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.k ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160483 ENSGT01090000260186 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268.k ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Northern American deer mouse MODERN SPECIES Rasgrp2 (ENSPEMG00000017801) Nrxn2 (ENSPEMG00000018477) ENSPEMG00000028736 Slc22a12 (ENSPEMG00000012720) ENSPEMG00000030122 Rps6ka4 (ENSPEMG00000014867) Ccdc88b (ENSPEMG00000003930) Prdx5 (ENSPEMG00000011606) Trmt112 (ENSPEMG00000014684) Esrra (ENSPEMG00000010701) Catsperz (ENSPEMG00000014337) Kcnk4 (ENSPEMG00000017633) Gpr137 (ENSPEMG00000016592) Bad (ENSPEMG00000015834) Plcb3 (ENSPEMG00000015923) Ppp1r14b (ENSPEMG00000015080) ##22 ENSPEMG00000018692 Vegfb (ENSPEMG00000012050) Dnajc4 (ENSPEMG00000018531) Nudt22 (ENSPEMG00000002624) Trpt1 (ENSPEMG00000013720) Fermt3 (ENSPEMG00000017447) ENSPEMG00000006132 ENSPEMG00000009317 Macrod1 (ENSPEMG00000014855) Flrt1 (ENSPEMG00000017136) Otub1 (ENSPEMG00000014074) Cox8a (ENSPEMG00000025233) Naa40 (ENSPEMG00000014476) Rcor2 (ENSPEMG00000018762) Mark2 (ENSPEMG00000004482) Prairie vole MODERN SPECIES 16 Sf1 (ENSMOCG00000022038) Pygm (ENSMOCG00000014745) Rasgrp2 (ENSMOCG00000003222) Nrxn2 (ENSMOCG00000002279) Slc22a12 (ENSMOCG00000018357) Rps6ka4 (ENSMOCG00000017820) Ccdc88b (ENSMOCG00000004168) ENSMOCG00000022652 ENSMOCG00000007447 Esrra (ENSMOCG00000017945) Catsperz (ENSMOCG00000013953) Kcnk4 (ENSMOCG00000020536) Gpr137 (ENSMOCG00000012626) Bad (ENSMOCG00000007074) Plcb3 (ENSMOCG00000003068) Ppp1r14b (ENSMOCG00000017324) ##22 ENSMOCG00000019729 Vegfb (ENSMOCG00000021740) Dnajc4 (ENSMOCG00000016715) Nudt22 (ENSMOCG00000018073) Trpt1 (ENSMOCG00000021342) Fermt3 (ENSMOCG00000006698) Stip1 (ENSMOCG00000013041) Macrod1 (ENSMOCG00000011709) Flrt1 (ENSMOCG00000013861) ENSMOCG00000001410 Cox8a (ENSMOCG00000002916) Naa40 (ENSMOCG00000014326) Rcor2 (ENSMOCG00000001766) Mark2 (ENSMOCG00000015697) Spindoc (ENSMOCG00000016927) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 401 Rasgrp2 (ENSCGRG00001014872) Nrxn2 (ENSCGRG00001023107) Slc22a12 (ENSCGRG00001024306) ENSCGRG00001003808 Rps6ka4 (ENSCGRG00001006171) Ccdc88b (ENSCGRG00001013694) Prdx5 (ENSCGRG00001021785) Trmt112 (ENSCGRG00001018319) Esrra (ENSCGRG00001022118) Catsperz (ENSCGRG00001023239) Kcnk4 (ENSCGRG00001022320) Gpr137 (ENSCGRG00001001170) ENSCGRG00001013654 Plcb3 (ENSCGRG00001015760) ENSCGRG00001017620 Ppp1r14b (ENSCGRG00001018612) ##22 Vegfb (ENSCGRG00001019009) Dnajc4 (ENSCGRG00001021692) Nudt22 (ENSCGRG00001001214) Trpt1 (ENSCGRG00001008474) Fermt3 (ENSCGRG00001013797) Stip1 (ENSCGRG00001018895) Macrod1 (ENSCGRG00001022618) Flrt1 (ENSCGRG00001011678) Otub1 (ENSCGRG00001012395) Cox8a (ENSCGRG00001024928) ENSCGRG00001004057 Rcor2 (ENSCGRG00001008621) Mark2 (ENSCGRG00001010551) Spindoc (ENSCGRG00001001090) Zfta (ENSCGRG00001004358) Golden Hamster MODERN SPECIES 653 Bicd1 (ENSMAUG00000012563) Resf1 (ENSMAUG00000014900) Amn1 (ENSMAUG00000020982) Etfbkmt (ENSMAUG00000005207) ENSMAUG00000014686 ##22 Dennd5b (ENSMAUG00000009769) ENSMAUG00000012338 Caprin2 (ENSMAUG00000008195) Ipo8 (ENSMAUG00000011526) ENSMAUG00000009532 Tmtc1 (ENSMAUG00000012612) Ergic2 (ENSMAUG00000007255) Far2 (ENSMAUG00000017825) Ccdc91 (ENSMAUG00000013545) Pthlh (ENSMAUG00000016105) ENSMAUG00000020104 ENSMAUG00000012620 Smco2 (ENSMAUG00000011476) Arntl2 (ENSMAUG00000015279) Stk38l (ENSMAUG00000002721) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Alpin marmot MODERN SPECIES 3 PYGM (ENSMMMG00000008406) RASGRP2 (ENSMMMG00000008264) NRXN2 (ENSMMMG00000008232) SLC22A12 (ENSMMMG00000008219) SLC22A11 (ENSMMMG00000008186) RPS6KA4 (ENSMMMG00000008133) CCDC88B (ENSMMMG00000008011) PRDX5 (ENSMMMG00000007963) ENSMMMG00000007934 ESRRA (ENSMMMG00000007925) CATSPERZ (ENSMMMG00000007922) KCNK4 (ENSMMMG00000007912) GPR137 (ENSMMMG00000007790) BAD (ENSMMMG00000007784) PLCB3 (ENSMMMG00000007736) PPP1R14B (ENSMMMG00000007711) ##22 FKBP2 (ENSMMMG00000007672) VEGFB (ENSMMMG00000007651) DNAJC4 (ENSMMMG00000007635) NUDT22 (ENSMMMG00000007628) TRPT1 (ENSMMMG00000007609) FERMT3 (ENSMMMG00000007580) STIP1 (ENSMMMG00000007560) FLRT1 (ENSMMMG00000007522) MACROD1 (ENSMMMG00000007514) OTUB1 (ENSMMMG00000007484) COX8A (ENSMMMG00000007506) NAA40 (ENSMMMG00000007472) RCOR2 (ENSMMMG00000007445) MARK2 (ENSMMMG00000006813) SPINDOC (ENSMMMG00000006798) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Squirrel MODERN SPECIES 199 MAP4K2 (ENSSTOG00000010732) SF1 (ENSSTOG00000009790) PYGM (ENSSTOG00000004016) ENSSTOG00000003988 NRXN2 (ENSSTOG00000013346) SLC22A12 (ENSSTOG00000027520) RPS6KA4 (ENSSTOG00000026269) CCDC88B (ENSSTOG00000020080) PRDX5 (ENSSTOG00000002393) ESRRA (ENSSTOG00000019877) TRMT112 (ENSSTOG00000019857) KCNK4 (ENSSTOG00000008461) GPR137 (ENSSTOG00000024794) BAD (ENSSTOG00000008441) PLCB3 (ENSSTOG00000008397) PPP1R14B (ENSSTOG00000021959) ##22 FKBP2 (ENSSTOG00000028785) VEGFB (ENSSTOG00000014290) DNAJC4 (ENSSTOG00000026335) NUDT22 (ENSSTOG00000021715) FERMT3 (ENSSTOG00000014271) TRPT1 (ENSSTOG00000014285) STIP1 (ENSSTOG00000014262) MACROD1 (ENSSTOG00000034108) FLRT1 (ENSSTOG00000019831) OTUB1 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ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 14 MAP4K2 (ENSHGLG00000016920) SF1 (ENSHGLG00000009541) PYGM (ENSHGLG00000012545) RASGRP2 (ENSHGLG00000016943) NRXN2 (ENSHGLG00000019037) SLC22A11 (ENSHGLG00000019479) RPS6KA4 (ENSHGLG00000011748) CCDC88B (ENSHGLG00000012864) PRDX5 (ENSHGLG00000010351) TRMT112 (ENSHGLG00000011130) ESRRA (ENSHGLG00000011668) ENSHGLG00000044117 KCNK4 (ENSHGLG00000012923) GPR137 (ENSHGLG00000010359) BAD (ENSHGLG00000013154) PPP1R14B (ENSHGLG00000041422) ##22 FKBP2 (ENSHGLG00000037212) ENSHGLG00000013921 DNAJC4 (ENSHGLG00000010363) NUDT22 (ENSHGLG00000012442) TRPT1 (ENSHGLG00000013748) STIP1 (ENSHGLG00000016796) FLRT1 (ENSHGLG00000045678) MACROD1 (ENSHGLG00000018799) ENSHGLG00000011812 COX8A (ENSHGLG00000012316) NAA40 (ENSHGLG00000013175) RCOR2 (ENSHGLG00000014109) ENSHGLG00000011808 SPINDOC (ENSHGLG00000034024) ZFTA (ENSHGLG00000011849) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162250 ENSGT00940000157258 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Guinea pig MODERN SPECIES 42 MAP4K2 (ENSCPOG00000001461) SF1 (ENSCPOG00000012290) PYGM (ENSCPOG00000008604) RASGRP2 (ENSCPOG00000024752) NRXN2 (ENSCPOG00000000775) SLC22A12 (ENSCPOG00000020117) RPS6KA4 (ENSCPOG00000000740) CCDC88B (ENSCPOG00000026141) PRDX5 (ENSCPOG00000021239) TRMT112 (ENSCPOG00000030092) ESRRA (ENSCPOG00000015411) KCNK4 (ENSCPOG00000025100) GPR137 (ENSCPOG00000015677) ENSCPOG00000005670 PLCB3 (ENSCPOG00000021694) PPP1R14B (ENSCPOG00000002930) ##22 FKBP2 (ENSCPOG00000002928) VEGFB (ENSCPOG00000032042) DNAJC4 (ENSCPOG00000040213) NUDT22 (ENSCPOG00000032982) TRPT1 (ENSCPOG00000002923) FERMT3 (ENSCPOG00000002919) STIP1 (ENSCPOG00000002914) FLRT1 (ENSCPOG00000020108) MACROD1 (ENSCPOG00000011720) OTUB1 (ENSCPOG00000022165) COX8A (ENSCPOG00000031964) NAA40 (ENSCPOG00000001891) RCOR2 (ENSCPOG00000004737) MARK2 (ENSCPOG00000004728) SPINDOC (ENSCPOG00000004724) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000162250 ENSGT00940000171321 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 129 MEN1 (ENSCLAG00000014829) MAP4K2 (ENSCLAG00000015778) NRXN2 (ENSCLAG00000017148) PYGM (ENSCLAG00000015704) RASGRP2 (ENSCLAG00000016758) SLC22A12 (ENSCLAG00000015575) RPS6KA4 (ENSCLAG00000017283) CCDC88B (ENSCLAG00000016866) PRDX5 (ENSCLAG00000017097) TRMT112 (ENSCLAG00000016885) ESRRA (ENSCLAG00000016837) KCNK4 (ENSCLAG00000016662) GPR137 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Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 13 SF1 (ENSOARG00020011868) PYGM (ENSOARG00020011417) RASGRP2 (ENSOARG00020011246) NRXN2 (ENSOARG00020009999) SLC22A12 (ENSOARG00020009651) RPS6KA4 (ENSOARG00020009027) CCDC88B (ENSOARG00020008588) PRDX5 (ENSOARG00020008296) TRMT112 (ENSOARG00020008195) ESRRA (ENSOARG00020008111) CATSPERZ (ENSOARG00020008042) KCNK4 (ENSOARG00020007962) GPR137 (ENSOARG00020007778) BAD (ENSOARG00020007741) PLCB3 (ENSOARG00020007260) PPP1R14B (ENSOARG00020007097) ##22 ENSOARG00020006995 VEGFB (ENSOARG00020006859) DNAJC4 (ENSOARG00020006773) NUDT22 (ENSOARG00020006645) TRPT1 (ENSOARG00020006462) FERMT3 (ENSOARG00020006403) ENSOARG00020006353 ENSOARG00020024740 FLRT1 (ENSOARG00020024735) MACROD1 (ENSOARG00020024720) OTUB1 (ENSOARG00020024649) COX8A (ENSOARG00020024622) NAA40 (ENSOARG00020024575) RCOR2 (ENSOARG00020024538) MARK2 (ENSOARG00020023514) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 23 NOP9 (ENSOARG00020008363) CIDEB (ENSOARG00020008280) LTB4R2 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VEGFB (ENSCHYG00000020991) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157258 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00940000160341 ENSGT00390000009268 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Arabian camel DUPLICATION Arabian camel MODERN SPECIES 28 SFMBT2 (ENSCDRG00005013915) ITIH5 (ENSCDRG00005013853) ITIH2 (ENSCDRG00005013474) KIN (ENSCDRG00005013334) ATP5F1C (ENSCDRG00005013234) TAF3 (ENSCDRG00005013133) GATA3 (ENSCDRG00005013070) ENSCDRG00005013023 ECHDC3 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ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Chacoan peccary MODERN SPECIES 921 RASGRP2 (ENSCWAG00000015896) NRXN2 (ENSCWAG00000016249) ENSCWAG00000016777 SLC22A12 (ENSCWAG00000016807) SLC22A11 (ENSCWAG00000016953) RPS6KA4 (ENSCWAG00000017214) CCDC88B (ENSCWAG00000017293) PRDX5 (ENSCWAG00000017609) ENSCWAG00000017664 ESRRA (ENSCWAG00000017713) CATSPERZ (ENSCWAG00000017749) KCNK4 (ENSCWAG00000017785) GPR137 (ENSCWAG00000017880) BAD 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ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031.d ENSGT00410000025985 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 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(ENSPVAG00000017095) MARK2 (ENSPVAG00000017092) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031.d ENSGT00410000025985 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 2 PYGM (ENSRFEG00010006126) RASGRP2 (ENSRFEG00010006260) NRXN2 (ENSRFEG00010006436) SLC22A12 (ENSRFEG00010006774) SLC22A11 (ENSRFEG00010006994) RPS6KA4 (ENSRFEG00010007231) CCDC88B (ENSRFEG00010007302) PRDX5 (ENSRFEG00010007491) ENSRFEG00010007518 ESRRA (ENSRFEG00010007600) CATSPERZ (ENSRFEG00010007622) KCNK4 (ENSRFEG00010007639) GPR137 (ENSRFEG00010007673) BAD (ENSRFEG00010007742) PLCB3 (ENSRFEG00010007782) PPP1R14B (ENSRFEG00010008083) ##22 FKBP2 (ENSRFEG00010008165) VEGFB (ENSRFEG00010008280) DNAJC4 (ENSRFEG00010008326) NUDT22 (ENSRFEG00010008427) TRPT1 (ENSRFEG00010008580) FERMT3 (ENSRFEG00010008635) STIP1 (ENSRFEG00010008672) MACROD1 (ENSRFEG00010008886) FLRT1 (ENSRFEG00010008949) OTUB1 (ENSRFEG00010008961) COX8A (ENSRFEG00010009021) NAA40 (ENSRFEG00010009063) RCOR2 (ENSRFEG00010009161) MARK2 (ENSRFEG00010009280) SPINDOC (ENSRFEG00010009495) Microbat MODERN SPECIES 1761 ENSMLUG00000008846 TRMT112 (ENSMLUG00000008867) ESRRA (ENSMLUG00000008880) ENSMLUG00000028612 KCNK4 (ENSMLUG00000007062) GPR137 (ENSMLUG00000007042) ENSMLUG00000023184 BAD (ENSMLUG00000007029) PLCB3 (ENSMLUG00000006981) ENSMLUG00000022952 ##22 FKBP2 (ENSMLUG00000006966) VEGFB (ENSMLUG00000006955) DNAJC4 (ENSMLUG00000023122) NUDT22 (ENSMLUG00000024838) TRPT1 (ENSMLUG00000024858) FERMT3 (ENSMLUG00000030213) STIP1 (ENSMLUG00000006934) ENSMLUG00000006931 FLRT1 (ENSMLUG00000011235) Equus ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160483 ENSGT01090000260186 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031.d ENSGT00410000025985 ENSGT00600000084617 Horse MODERN SPECIES 3 SF1 (ENSECAG00000024544) PYGM (ENSECAG00000024000) RASGRP2 (ENSECAG00000022956) ENSECAG00000032259 NRXN2 (ENSECAG00000021096) SLC22A12 (ENSECAG00000019827) SLC22A11 (ENSECAG00000032146) CCDC88B (ENSECAG00000017900) PRDX5 (ENSECAG00000017747) ESRRA (ENSECAG00000015602) CATSPERZ (ENSECAG00000036140) KCNK4 (ENSECAG00000015246) GPR137 (ENSECAG00000014977) BAD (ENSECAG00000014950) PLCB3 (ENSECAG00000011700) PPP1R14B (ENSECAG00000010628) ##22 FKBP2 (ENSECAG00000010601) ENSECAG00000010539 DNAJC4 (ENSECAG00000037429) NUDT22 (ENSECAG00000009994) TRPT1 (ENSECAG00000009917) FERMT3 (ENSECAG00000008107) STIP1 (ENSECAG00000006942) FLRT1 (ENSECAG00000031616) MACROD1 (ENSECAG00000006792) OTUB1 (ENSECAG00000033949) NAA40 (ENSECAG00000000898) RCOR2 (ENSECAG00000023033) MARK2 (ENSECAG00000021754) ZFTA (ENSECAG00000029864) RTN3 (ENSECAG00000021359) Donkey MODERN SPECIES 8 ENSEASG00005029736 IFITM5 (ENSEASG00005031056) PGGHG (ENSEASG00005015278) NLRP6 (ENSEASG00005015280) ENSEASG00005024524 PSMD13 (ENSEASG00005015291) SIRT3 (ENSEASG00005015385) RIC8A (ENSEASG00005015388) ENSEASG00005031609 ODF3 (ENSEASG00005015396) ENSEASG00005025285 ENSEASG00005031748 ENSEASG00005026844 ENSEASG00005025253 ENSEASG00005019964 ENSEASG00005019971 ##22 FKBP2 (ENSEASG00005019973) ENSEASG00005019977 NUDT22 (ENSEASG00005019979) TRPT1 (ENSEASG00005019983) FERMT3 (ENSEASG00005019986) STIP1 (ENSEASG00005019992) ENSEASG00005020002 FLRT1 (ENSEASG00005020006) MACROD1 (ENSEASG00005019999) OTUB1 (ENSEASG00005020008) NAA40 (ENSEASG00005036108) RCOR2 (ENSEASG00005020018) MARK2 (ENSEASG00005020040) SPINDOC (ENSEASG00005020056) ZFTA (ENSEASG00005020064) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173.a.b ENSGT00390000018173.a.a ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.a.a ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173.a.a ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173.a.a ENSGT00390000009268.z ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b.k ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173.a.a ENSGT00390000009268.z ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Giant Panda MODERN SPECIES 7 PYGM (ENSAMEG00000017831) RASGRP2 (ENSAMEG00000017841) NRXN2 (ENSAMEG00000017852) SLC22A12 (ENSAMEG00000017883) SLC22A11 (ENSAMEG00000017927) RPS6KA4 (ENSAMEG00000017931) CCDC88B (ENSAMEG00000017942) PRDX5 (ENSAMEG00000017959) ENSAMEG00000017965 ESRRA (ENSAMEG00000017967) CATSPERZ (ENSAMEG00000017976) KCNK4 (ENSAMEG00000017983) GPR137 (ENSAMEG00000017986) BAD (ENSAMEG00000017990) PLCB3 (ENSAMEG00000017993) PPP1R14B (ENSAMEG00000018019) ##22 ENSAMEG00000018025 ENSAMEG00000028477 DNAJC4 (ENSAMEG00000018035) NUDT22 (ENSAMEG00000018038) TRPT1 (ENSAMEG00000018040) FERMT3 (ENSAMEG00000018044) STIP1 (ENSAMEG00000018068) FLRT1 (ENSAMEG00000019306) ENSAMEG00000026299 MACROD1 (ENSAMEG00000017979) OTUB1 (ENSAMEG00000018084) COX8A (ENSAMEG00000026424) NAA40 (ENSAMEG00000030824) RCOR2 (ENSAMEG00000018101) MARK2 (ENSAMEG00000018111) Ursus ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b.k ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00950000183087.A.b.b ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173.a.a ENSGT00390000009268.z ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Polar bear MODERN SPECIES 328 PYGM (ENSUMAG00000003721) RASGRP2 (ENSUMAG00000003204) NRXN2 (ENSUMAG00000003182) ENSUMAG00000003176 SLC22A11 (ENSUMAG00000002967) ENSUMAG00000002914 RPS6KA4 (ENSUMAG00000002800) ENSUMAG00000002786 ENSUMAG00000002780 ENSUMAG00000002772 ESRRA (ENSUMAG00000002751) KCNK4 (ENSUMAG00000002740) GPR137 (ENSUMAG00000002736) BAD (ENSUMAG00000002733) PLCB3 (ENSUMAG00000001701) PPP1R14B (ENSUMAG00000001474) ##22 ENSUMAG00000001463 VEGFB (ENSUMAG00000001433) DNAJC4 (ENSUMAG00000001427) NUDT22 (ENSUMAG00000001420) TRPT1 (ENSUMAG00000001410) FERMT3 (ENSUMAG00000001141) STIP1 (ENSUMAG00000000589) ENSUMAG00000000554 FLRT1 (ENSUMAG00000000548) ENSUMAG00000000546 COX8A (ENSUMAG00000000536) NAA40 (ENSUMAG00000000527) RCOR2 (ENSUMAG00000000474) MARK2 (ENSUMAG00000000439) SPINDOC (ENSUMAG00000000388) American black bear MODERN SPECIES 159 PRDX5 (ENSUAMG00000015173) ENSUAMG00000015174 ESRRA (ENSUAMG00000015178) ENSUAMG00000015180 KCNK4 (ENSUAMG00000015182) GPR137 (ENSUAMG00000015183) BAD (ENSUAMG00000015185) PLCB3 (ENSUAMG00000015187) PPP1R14B (ENSUAMG00000015193) ##22 FKBP2 (ENSUAMG00000015197) VEGFB (ENSUAMG00000015198) DNAJC4 (ENSUAMG00000015203) NUDT22 (ENSUAMG00000015205) TRPT1 (ENSUAMG00000015208) FERMT3 (ENSUAMG00000015213) ENSUAMG00000015221 MACROD1 (ENSUAMG00000015226) FLRT1 (ENSUAMG00000015231) OTUB1 (ENSUAMG00000015232) COX8A (ENSUAMG00000015233) NAA40 (ENSUAMG00000015235) RCOR2 (ENSUAMG00000015239) MARK2 (ENSUAMG00000015247) SPINDOC (ENSUAMG00000015259) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173.a.a ENSGT00390000009268.z ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.h ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 American mink MODERN SPECIES 104 PYGM (ENSNVIG00000018416) RASGRP2 (ENSNVIG00000018478) NRXN2 (ENSNVIG00000018569) SLC22A12 (ENSNVIG00000019160) SLC22A11 (ENSNVIG00000019252) RPS6KA4 (ENSNVIG00000019337) CCDC88B (ENSNVIG00000019387) PRDX5 (ENSNVIG00000019436) ENSNVIG00000019443 ESRRA (ENSNVIG00000019472) CATSPERZ (ENSNVIG00000019480) KCNK4 (ENSNVIG00000019499) GPR137 (ENSNVIG00000019545) BAD (ENSNVIG00000019573) PLCB3 (ENSNVIG00000019582) PPP1R14B (ENSNVIG00000019636) ##22 FKBP2 (ENSNVIG00000019655) VEGFB (ENSNVIG00000019672) DNAJC4 (ENSNVIG00000019687) NUDT22 (ENSNVIG00000019719) TRPT1 (ENSNVIG00000019750) FERMT3 (ENSNVIG00000019800) ENSNVIG00000019865 MACROD1 (ENSNVIG00000019904) FLRT1 (ENSNVIG00000019914) OTUB1 (ENSNVIG00000019928) COX8A (ENSNVIG00000019973) NAA40 (ENSNVIG00000019988) RCOR2 (ENSNVIG00000020036) MARK2 (ENSNVIG00000020056) SPINDOC (ENSNVIG00000020503) Ferret MODERN SPECIES 314 MAP4K2 (ENSMPUG00000012513) SF1 (ENSMPUG00000012684) PYGM (ENSMPUG00000012740) RASGRP2 (ENSMPUG00000012752) NRXN2 (ENSMPUG00000012828) SLC22A12 (ENSMPUG00000012842) SLC22A11 (ENSMPUG00000012895) RPS6KA4 (ENSMPUG00000012899) PRDX5 (ENSMPUG00000012907) TRMT112 (ENSMPUG00000012911) ESRRA (ENSMPUG00000012927) KCNK4 (ENSMPUG00000012929) GPR137 (ENSMPUG00000012949) BAD (ENSMPUG00000012954) PLCB3 (ENSMPUG00000012959) PPP1R14B (ENSMPUG00000013208) ##22 FKBP2 (ENSMPUG00000013228) VEGFB (ENSMPUG00000013232) DNAJC4 (ENSMPUG00000013266) TRPT1 (ENSMPUG00000013272) FERMT3 (ENSMPUG00000013280) STIP1 (ENSMPUG00000013297) ENSMPUG00000013306 MACROD1 (ENSMPUG00000013309) FLRT1 (ENSMPUG00000019993) OTUB1 (ENSMPUG00000013314) NAA40 (ENSMPUG00000013317) RCOR2 (ENSMPUG00000013320) MARK2 (ENSMPUG00000013326) SPINDOC (ENSMPUG00000013338) ZFTA (ENSMPUG00000013353) Canidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155978.a.a ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000163749 ENSGT00940000162485 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ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000159375 ENSGT00940000161450 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000006255.b.b.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00410000025985 Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 2 CNGA1 (ENSCAFG00020002520) ENSCAFG00020002527 ENSCAFG00020002539 CORIN (ENSCAFG00020002573) ATP10D (ENSCAFG00020002831) COMMD8 (ENSCAFG00020002897) ENSCAFG00020002902 GABRA4 (ENSCAFG00020002917) COX7B2 (ENSCAFG00020002945) GABRA2 (ENSCAFG00020002979) GABRG1 (ENSCAFG00020003060) ENSCAFG00020003081 GNPDA2 (ENSCAFG00020003082) GUF1 (ENSCAFG00020003101) YIPF7 (ENSCAFG00020003291) ENSCAFG00020003298 ##22 ENSCAFG00020003300 ENSCAFG00020003302 Dingo MODERN SPECIES 36 RASGRP2 (ENSCAFG00020014369) ENSCAFG00020014368 NRXN2 (ENSCAFG00020014363) ENSCAFG00020014355 SLC22A12 (ENSCAFG00020014353) SLC22A11 (ENSCAFG00020014250) RPS6KA4 (ENSCAFG00020014242) CCDC88B (ENSCAFG00020014176) ENSCAFG00020014168 TRMT112 (ENSCAFG00020014158) ESRRA (ENSCAFG00020014154) ENSCAFG00020014151 GPR137 (ENSCAFG00020014142) BAD (ENSCAFG00020014140) PLCB3 (ENSCAFG00020014131) ENSCAFG00020014127 ##22 FKBP2 (ENSCAFG00020014124) VEGFB (ENSCAFG00020014120) DNAJC4 (ENSCAFG00020014110) NUDT22 (ENSCAFG00020014104) TRPT1 (ENSCAFG00020014101) FERMT3 (ENSCAFG00020014088) ENSCAFG00020014064 FLRT1 (ENSCAFG00020014058) MACROD1 (ENSCAFG00020014046) OTUB1 (ENSCAFG00020014040) ENSCAFG00020014039 NAA40 (ENSCAFG00020014034) RCOR2 (ENSCAFG00020014030) MARK2 (ENSCAFG00020014004) SPINDOC (ENSCAFG00020013994) Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 4 NIPAL1 (ENSCAFG00845009684) CNGA1 (ENSCAFG00845009629) NFXL1 (ENSCAFG00845009403) CORIN (ENSCAFG00845009036) ATP10D (ENSCAFG00845008717) COMMD8 (ENSCAFG00845008641) ENSCAFG00845008573 GABRA4 (ENSCAFG00845008486) COX7B2 (ENSCAFG00845008375) GABRA2 (ENSCAFG00845015709) GABRG1 (ENSCAFG00845015632) ENSCAFG00845015556 GNPDA2 (ENSCAFG00845015497) GUF1 (ENSCAFG00845015394) YIPF7 (ENSCAFG00845015334) ENSCAFG00845015310 ##22 KCTD8 (ENSCAFG00845015280) GRXCR1 (ENSCAFG00845015179) ATP8A1 (ENSCAFG00845014721) SHISA3 (ENSCAFG00845014597) ENSCAFG00845014573 BEND4 (ENSCAFG00845014543) SLC30A9 (ENSCAFG00845014338) TMEM33 (ENSCAFG00845014117) ENSCAFG00845014079 LIMCH1 (ENSCAFG00845013654) ENSCAFG00845013420 IREB2 (ENSCAFG00845013296) HYKK (ENSCAFG00845013245) ENSCAFG00845013139 CHRNA5 (ENSCAFG00845013065) Dog MODERN SPECIES 9 SF1 (ENSCAFG00845029060) PYGM (ENSCAFG00845029235) RASGRP2 (ENSCAFG00845029413) NRXN2 (ENSCAFG00845029769) SLC22A12 (ENSCAFG00845030289) SLC22A11 (ENSCAFG00845030346) RPS6KA4 (ENSCAFG00845030464) ENSCAFG00845030543 TRMT112 (ENSCAFG00845030562) ESRRA (ENSCAFG00845030574) ENSCAFG00845030588 KCNK4 (ENSCAFG00845030598) GPR137 (ENSCAFG00845030606) BAD (ENSCAFG00845030649) PLCB3 (ENSCAFG00845030670) ENSCAFG00845030695 ##22 FKBP2 (ENSCAFG00845030714) ENSCAFG00845030726 DNAJC4 (ENSCAFG00845030731) NUDT22 (ENSCAFG00845030736) TRPT1 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(ENSVVUG00000029784) ENSVVUG00000029785 NAA40 (ENSVVUG00000029786) RCOR2 (ENSVVUG00000029787) MARK2 (ENSVVUG00000029791) SPINDOC (ENSVVUG00000029796) ZFTA (ENSVVUG00000029797) Red fox MODERN SPECIES 124 CNGA1 (ENSVVUG00000023669) ENSVVUG00000023660 ENSVVUG00000023657 CORIN (ENSVVUG00000023644) ATP10D (ENSVVUG00000023637) COMMD8 (ENSVVUG00000023634) ENSVVUG00000023173 GABRA4 (ENSVVUG00000023139) COX7B2 (ENSVVUG00000023134) GABRA2 (ENSVVUG00000023124) GABRG1 (ENSVVUG00000023123) ENSVVUG00000023104 GNPDA2 (ENSVVUG00000023103) GUF1 (ENSVVUG00000023099) YIPF7 (ENSVVUG00000023098) ENSVVUG00000023097 ##22 ENSVVUG00000023096 ENSVVUG00000023091 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183148.b.a ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000162485 ENSGT00940000163267 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173.a.b ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00400000022853 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b.g.a ENSGT00390000010740 ENSGT00940000160539 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(ENSPLOG00000011726) TRPT1 (ENSPLOG00000011484) FERMT3 (ENSPLOG00000011394) STIP1 (ENSPLOG00000011215) FLRT1 (ENSPLOG00000011165) MACROD1 (ENSPLOG00000011048) ENSPLOG00000010881 COX8A (ENSPLOG00000010835) NAA40 (ENSPLOG00000010750) RCOR2 (ENSPLOG00000010654) MARK2 (ENSPLOG00000010018) SPINDOC (ENSPLOG00000009801) leopard MODERN SPECIES 64 PYGM (ENSPPRG00000015100) RASGRP2 (ENSPPRG00000024370) NRXN2 (ENSPPRG00000023605) SLC22A12 (ENSPPRG00000000103) SLC22A11 (ENSPPRG00000000900) RPS6KA4 (ENSPPRG00000002248) CCDC88B (ENSPPRG00000003383) ENSPPRG00000003575 TRMT112 (ENSPPRG00000003855) ESRRA (ENSPPRG00000004128) CATSPERZ (ENSPPRG00000004247) KCNK4 (ENSPPRG00000006456) ENSPPRG00000007533 BAD (ENSPPRG00000007989) PLCB3 (ENSPPRG00000011007) PPP1R14B (ENSPPRG00000011369) ##22 ENSPPRG00000012134 ENSPPRG00000012406 VEGFB (ENSPPRG00000012528) DNAJC4 (ENSPPRG00000013456) NUDT22 (ENSPPRG00000014703) TRPT1 (ENSPPRG00000022870) FERMT3 (ENSPPRG00000000519) STIP1 (ENSPPRG00000002286) ENSPPRG00000002564 FLRT1 (ENSPPRG00000015154) ENSPPRG00000003587 COX8A (ENSPPRG00000004014) NAA40 (ENSPPRG00000004526) RCOR2 (ENSPPRG00000005918) MARK2 (ENSPPRG00000009691) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000163749 ENSGT00940000162485 ENSGT00940000161083 ENSGT00940000162048 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000009268 ENSGT00940000160341 ENSGT00940000171135 ENSGT00940000160310 ENSGT00940000153986.b.b ENSGT00940000165892 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000161844 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000017869 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00940000156048.a.a ENSGT00390000006255.b.b ENSGT00940000168159 ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160483 ENSGT00940000155978.b ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000163749 ENSGT00940000162485 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ENSGT00390000011639 ENSGT00940000162696.a.b ENSGT00940000155559.a.b ENSGT00390000018173 ENSGT00940000164608 ENSGT00940000153433.B.b.a ENSGT00940000160310 ENSGT00940000165892 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000164137 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00390000017869 ENSGT00510000048574 ENSGT00390000002731 ENSGT00390000013444.a.b.b ENSGT00940000154911 ENSGT00940000161450 ENSGT00940000159375 ENSGT00390000006979.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000154196.a ENSGT00940000155031 ENSGT00940000166766 ENSGT00940000166053 ENSGT00600000084617 Frog MODERN SPECIES 4 ttc9c (ENSXETG00000006013) hnrnpul2 (ENSXETG00000006015) gng3 (ENSXETG00000031380) bscl2 (ENSXETG00000042624) lrrn4cl (ENSXETG00000039604) ENSXETG00000034420 ENSXETG00000037391 prdx5 (ENSXETG00000006009) trmt112 (ENSXETG00000007218) epo (ENSXETG00000007211) ENSXETG00000044301 kcnk4 (ENSXETG00000007210) XB5994047 [provisional] (ENSXETG00000038522) ENSXETG00000007204 plcb3 (ENSXETG00000007201) ppp1r14b 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ANCESTRAL SPECIES 354 ENSGT00940000164137 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000165651 ENSGT00900000141164 ENSGT00940000164681 ENSGT00390000018613.b ENSGT00390000007071 ENSGT00940000164878 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000018173 ENSGT00940000164608 ENSGT00620000087966.b ENSGT00390000007539 ENSGT00390000011639 ENSGT01100000263497.B ENSGT00390000015553.a.a.a ENSGT00940000172086 ENSGT00390000011180 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a ENSGT00390000009379 ENSGT01060000249679 ENSGT00940000164137 ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000165651 ENSGT00900000141164 ENSGT00940000164681 ENSGT00390000018613.b ENSGT00390000007071 ENSGT00940000164878 ENSGT00940000157941 ENSGT00940000160125 ENSGT00940000154790.a.b ENSGT01030000234598.b.b ENSGT00940000159086 ENSGT00490000043395 ENSGT00730000110989 ENSGT00940000155771 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292 ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000165651.a ENSGT00900000141164.q.a ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b ENSGT00900000141164.r ENSGT00940000165651.b ENSGT00900000141164.q.b ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160125 ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00510000048151.a ENSGT00510000048151.b ENSGT00770000120838.A ENSGT00390000013762.a.e ENSGT00390000013762.a.f Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 201 ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00940000165651.b ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160125 ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00510000048151.a ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000005498 ENSGT00940000165739 ENSGT00940000165127.b ENSGT00950000182924.A.a ENSGT00390000015415 ENSGT00390000005739.a.a Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 561 ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 ENSGT00940000166331.f Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 Huchen MODERN SPECIES 8145 ENSHHUG00000001867 ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 848 ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 ENSGT00940000166331.f.a Chinook salmon MODERN SPECIES 1012 PPP1R14B (ENSOTSG00005039444) ##22 brms1 (ENSOTSG00005039446) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 26 aldh3a2a (ENSCCRG00000003265) ENSCCRG00000073227 tpst1 (ENSCCRG00000003207) ENSCCRG00000071113 tnfaip1 (ENSCCRG00000043206) timm50 (ENSCCRG00000040238) dlc (ENSCCRG00000040244) chp2 (ENSCCRG00000048949) ENSCCRG00000080524 cox7a1 (ENSCCRG00000049722) supt5h (ENSCCRG00000048960) il15l (ENSCCRG00000061013) ENSCCRG00000047164 ENSCCRG00000025550 spint2 (ENSCCRG00000037690) ENSCCRG00000037693 ##22 ENSCCRG00000037695 med13b (ENSCCRG00000037697) ENSCCRG00000043530 zgc:112083 (ENSCCRG00000043688) ENSCCRG00000043519 thap12b (ENSCCRG00000063923) dyrk1ab (ENSCCRG00000001408) alcamb (ENSCCRG00000050986) ENSCCRG00000041056 ENSCCRG00000050858 picalmb (ENSCCRG00000007787) ENSCCRG00000053709 ENSCCRG00000007609 hspa8b (ENSCCRG00000074453) lim2.3 (ENSCCRG00000038920) Common carp reference MODERN SPECIES 39 tbcela (ENSCCRG00000057010) usp2a (ENSCCRG00000004735) ENSCCRG00000070626 ENSCCRG00000004854 tpst1 (ENSCCRG00000080201) ENSCCRG00000063517 ENSCCRG00000074332 tnfaip1 (ENSCCRG00000049761) timm50 (ENSCCRG00000049760) dlc (ENSCCRG00000049759) rnaset2l (ENSCCRG00000060029) supt5h (ENSCCRG00000049733) ENSCCRG00000048952 ENSCCRG00000073144 spint2 (ENSCCRG00000019148) ENSCCRG00000019174 ##22 ENSCCRG00000038352 med13b (ENSCCRG00000038435) ENSCCRG00000051021 zgc:112083 (ENSCCRG00000051014) ENSCCRG00000051008 thap12b (ENSCCRG00000043517) dyrk1ab (ENSCCRG00000051005) alcamb (ENSCCRG00000011173) ENSCCRG00000050981 ENSCCRG00000041038 picalmb (ENSCCRG00000031209) ENSCCRG00000031164 ENSCCRG00000029538 hspa8b (ENSCCRG00000001416) lim2.3 (ENSCCRG00000037528) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000165121.b ENSGT00940000158132 ENSGT00390000018904 ENSGT00940000159026 ENSGT00390000018729.b ENSGT00960000187089 ENSGT00940000159592 ENSGT00390000005656 ENSGT00940000155980.A ENSGT00510000047418 ENSGT00390000017284.a.b.c ENSGT00940000159032.e ENSGT00550000074832 ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.rc.a ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00940000165651.b ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160125 ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000166947 ENSGT00940000166766 ENSGT00940000164342 ENSGT00400000022326.a ENSGT00390000018596.A.a.b ENSGT00950000182893.a.b.e.a ENSGT00940000159574 Denticle herring MODERN SPECIES rnf175 (ENSDCDG00000011062) tlr2 (ENSDCDG00000011041) ENSDCDG00000011024 ENSDCDG00000011009 ENSDCDG00000010981 ENSDCDG00000010963 ENSDCDG00000010952 ENSDCDG00000010828 SVEP1 (ENSDCDG00000007861) PAIP2B (ENSDCDG00000007717) hspa12b (ENSDCDG00000006882) ENSDCDG00000006702 cct7 (ENSDCDG00000005448) slc8a4b (ENSDCDG00000005433) plcb3 (ENSDCDG00000002719) PPP1R14B (ENSDCDG00000002648) ##22 brms1 (ENSDCDG00000002645) ENSDCDG00000002643 pcxb (ENSDCDG00000002624) ENSDCDG00000002614 slc3a2a (ENSDCDG00000002612) snx15 (ENSDCDG00000002610) prox3 (ENSDCDG00000002606) tmem179ba (ENSDCDG00000002604) tmem179ba (ENSDCDG00000002603) ENSDCDG00000002602 krcp (ENSDCDG00000002600) dhrs4 (ENSDCDG00000002590) tinf2 (ENSDCDG00000002585) cideb (ENSDCDG00000002583) homezb (ENSDCDG00000002580) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.b ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.b ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.b ##22 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 ENSGT00510000047760 ENSGT00390000013368 ENSGT00600000085600.b ENSGT00940000159592 ENSGT00390000005656 ENSGT00940000155980.A ENSGT00510000047418 ENSGT00390000017284.a.b.c ENSGT00940000159032 ENSGT00550000074832 ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.rc.b ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00940000165651.b ENSGT00900000141164.q.b ENSGT00940000153648.b ENSGT00980000199058 ENSGT00940000159709 ENSGT00390000015545 ENSGT00940000158971 ENSGT00940000166804 ENSGT00940000159423 ENSGT00940000159570.b ENSGT00530000063812.C ENSGT00940000164745.i.b ENSGT00890000139482.a ENSGT00550000074944 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.b ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.rc.b ##22 Common carp reference MODERN SPECIES 6 SLC2A4 (ENSCCRG00000049006) ENSCCRG00000080122 ENSCCRG00000054289 ENSCCRG00000047158 ENSCCRG00000056665 ENSCCRG00000027275 ENSCCRG00000081505 ENSCCRG00000021642 ENSCCRG00000021547 nagk (ENSCCRG00000081535) hspa12b (ENSCCRG00000021558) ENSCCRG00000021553 cct7 (ENSCCRG00000045022) slc8a4b (ENSCCRG00000045019) plcb3 (ENSCCRG00000043625) ENSCCRG00000080286 ##22 brms1 (ENSCCRG00000032708) pcxb (ENSCCRG00000005435) ENSCCRG00000070998 ENSCCRG00000033281 ENSCCRG00000080783 zgc:194930 (ENSCCRG00000074853) rell1 (ENSCCRG00000060138) rwdd (ENSCCRG00000013450) ENSCCRG00000023192 ENSCCRG00000057090 acox3 (ENSCCRG00000077056) ENSCCRG00000080751 ENSCCRG00000065060 ENSCCRG00000058589 ENSCCRG00000067770 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000165651.a ENSGT00900000141164.q.a ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000166868.b ENSGT00940000166331 ENSGT00940000165651.b ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160125 ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00510000048151.a ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000005498 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 205 ENSGT00940000160310.b ENSGT00940000160341 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000007539.b ENSGT00390000011639.p ENSGT01100000263497.B ENSGT00390000018613.b ENSGT00390000007071 ENSGT00940000168756 ENSGT00940000164878.b ENSGT00940000166053 ENSGT00940000155031.a.b ENSGT00940000164485.b ENSGT00940000167292.b ENSGT00940000164137.b ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000165651.a ENSGT00900000141164.q.a ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000156646.d ENSGT00510000048151.b ENSGT00390000013762.a.e ENSGT00390000015815.h ENSGT00940000159437.d ENSGT00530000064165.a.c ENSGT00550000075103 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160341 ENSGT00390000018173 ENSGT00390000007539.b ENSGT00390000011639.p ENSGT01100000263497.B ENSGT00390000018613.b ENSGT00390000007071 ENSGT00940000168756 ENSGT00940000164878.b ENSGT00940000166053 ENSGT00940000155031.a.b ENSGT00940000164485.b ENSGT00940000167292.b.c ENSGT00940000167292.b.d ENSGT00940000164137.b ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000165651.a ENSGT00900000141164.q.a ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.d ENSGT00940000156646.d ENSGT00510000048151.b ENSGT00390000013762.a.e ENSGT00950000183000.c.a.a.h ENSGT00390000012589 ENSGT00940000162317.c ENSGT00390000015815.h ENSGT00940000159437.d ENSGT00530000064165.a.c ENSGT00550000075103 ENSGT00940000158195 Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 23 ENSELUG00000008141 ENSELUG00000026356 ENSELUG00000000296 ENSELUG00000008496 ENSELUG00000008546 ENSELUG00000026330 ENSELUG00000001167 ENSELUG00000008085 ENSELUG00000027680 ENSELUG00000025650 ENSELUG00000028969 ENSELUG00000025334 tlr2 (ENSELUG00000008732) ENSELUG00000008765 ENSELUG00000008797 ppp1r14bb (ENSELUG00000008839) ##22 brms1 (ENSELUG00000008858) PC (ENSELUG00000008974) ENSELUG00000008888 ENSELUG00000009058 ENSELUG00000009099 snx15 (ENSELUG00000009138) prox3 (ENSELUG00000009156) tmem179ba (ENSELUG00000009184) ENSELUG00000009247 mus81 (ENSELUG00000009296) ovol1a (ENSELUG00000000343) ENSELUG00000009330 ENSELUG00000027499 ENSELUG00000030299 ENSELUG00000007305 Northern pike MODERN SPECIES 6 KCNK4 (ENSELUG00000015974) esrra (ENSELUG00000031846) prdx5 (ENSELUG00000028855) ENSELUG00000015926 bscl2 (ENSELUG00000015842) gng3 (ENSELUG00000019216) banf1 (ENSELUG00000001189) sart1 (ENSELUG00000015791) ENSELUG00000015715 ENSELUG00000015706 MARK2 (ENSELUG00000015657) zgc:77262 (ENSELUG00000031478) ENSELUG00000015539 ENSELUG00000015517 slc8a4a (ENSELUG00000015498) ppp1r14ba (ENSELUG00000015483) ##22 fkbp2 (ENSELUG00000015454) ENSELUG00000015305 pcxa (ENSELUG00000015354) ENSELUG00000015269 slc3a2b (ENSELUG00000015213) ENSELUG00000015184 ENSELUG00000015170 cfl1 (ENSELUG00000015160) tmem223 (ENSELUG00000015149) CCDC85B (ENSELUG00000015142) fibpb (ENSELUG00000000545) efemp2b (ENSELUG00000015086) ENSELUG00000015024 MRPS12 (ENSELUG00000026877) kif4 (ENSELUG00000014965) Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.sc.c ##22 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.sc.c.a ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.sc.c.a ##22 River trout MODERN SPECIES 354 ENSSTUG00000028831 brms1 (ENSSTUG00000028846) ENSSTUG00000028871 ppp1r14bb (ENSSTUG00000028879) ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.sc.c.a ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.sc.c.a ##22 Chinook salmon MODERN SPECIES 748 ppp1r14bb (ENSOTSG00005038716) ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.sc.c.b ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.sc.c.b ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182985.b.b.sc.c.b ##22 Chinook salmon MODERN SPECIES 1462 ppp1r14bb (ENSOTSG00005031149) ##22 Huchen MODERN SPECIES 6351 ENSHHUG00000024040 ppp1r14bb (ENSHHUG00000024047) ##22 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1627 ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.a.a ##22 ENSGT00940000166331.f Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 560 ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.a.a ##22 ENSGT00940000166331.f Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156171.h.p.a ENSGT00940000155951.a ENSGT00940000155951.b.`b ENSGT00950000182907.a.b.a.a ENSGT00940000155905.b.k ENSGT00940000156323.c.b ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000158122.j ENSGT00940000157467.z ENSGT00390000011679 ENSGT00510000047351.b.s ENSGT00940000155973.b.c.d.a ENSGT00940000164842 ENSGT00390000003680.a.a.b ENSGT00390000015415 ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.a.a ##22 ENSGT00940000166331.f ENSGT00940000160303.a.a.a ENSGT00940000156646.c.e ENSGT00940000154790.a.b.c ENSGT00510000048151.a.e ENSGT00390000013762.a.f.c.b ENSGT00390000001189.b.i.c ENSGT00390000002596.a ENSGT00540000073610.B ENSGT00940000154285.a.a.f ENSGT01070000253822.D.b.w ENSGT00530000063854 ENSGT00940000161036.A.e ENSGT00940000157146.a.a ENSGT00390000017890.b.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 472 ENSGT00390000015415 ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.a.a ##22 ENSGT00940000166331.f.b Coho salmon MODERN SPECIES 92 tkfc (ENSOKIG00005019030) ENSOKIG00005019099 ##22 ENSOKIG00005019115 Rainbow trout MODERN SPECIES 13 ENSOMYG00000076514 ENSOMYG00000024133 rnf175 (ENSOMYG00000016691) fgb (ENSOMYG00000073865) fga (ENSOMYG00000056976) ENSOMYG00000065635 ENSOMYG00000024056 ENSOMYG00000051393 zgc:77880 (ENSOMYG00000060039) ENSOMYG00000075790 ENSOMYG00000012002 ENSOMYG00000051074 ENSOMYG00000058779 ENSOMYG00000065277 ENSOMYG00000048693 ENSOMYG00000071042 ##22 ENSOMYG00000023713 ENSOMYG00000070401 ENSOMYG00000024019 ENSOMYG00000024003 ENSOMYG00000023971 ENSOMYG00000020500 ENSOMYG00000017475 ENSOMYG00000064038 ENSOMYG00000023777 ENSOMYG00000023865 ENSOMYG00000023875 ENSOMYG00000023881 ENSOMYG00000023891 ENSOMYG00000058958 ENSOMYG00000023922 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1681 ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.a.b ##22 ENSGT00940000166331.e.b Huchen MODERN SPECIES 4157 ENSHHUG00000037349 ENSHHUG00000037351 ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 610 ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.a.b ##22 ENSGT00940000166331.e.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 508 ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.a.b ##22 ENSGT00940000166331.e.b Rainbow trout MODERN SPECIES 30 ENSOMYG00000013429 nagk (ENSOMYG00000013421) ENSOMYG00000013404 ENSOMYG00000013047 ENSOMYG00000012495 ENSOMYG00000066150 ENSOMYG00000060734 ENSOMYG00000012469 ENSOMYG00000054681 ENSOMYG00000012436 ENSOMYG00000012428 ENSOMYG00000074190 ENSOMYG00000012418 ENSOMYG00000053863 ENSOMYG00000012455 ENSOMYG00000059900 ##22 ENSOMYG00000076406 ENSOMYG00000070617 ENSOMYG00000051428 ENSOMYG00000061465 ENSOMYG00000075619 ENSOMYG00000074309 ENSOMYG00000069285 ENSOMYG00000063717 snx15 (ENSOMYG00000062212) prox3 (ENSOMYG00000065817) tmem179ba (ENSOMYG00000057991) ENSOMYG00000048367 ENSOMYG00000017457 ENSOMYG00000049980 mus81 (ENSOMYG00000017415) Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT01000000214440.C.r.a ENSGT00940000160310.b.c ENSGT00940000160341.h ENSGT00940000153916.A.a ENSGT00390000018173.t ENSGT00390000007539.b.c ENSGT00390000011639.p.f ENSGT01100000263497.B.m ENSGT00390000018613.b.c ENSGT00940000168756 ENSGT00940000164878.b ENSGT00940000166053.d ENSGT00940000155031.a.b.d ENSGT00940000167292.b.d ENSGT00940000164137.b.b ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.b.a ##22 ENSGT00940000157074.h ENSGT00940000165651.a.d ENSGT00900000141164.q.a.b ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.d.b ENSGT00940000156646.d.a ENSGT00390000013762.a.e.c ENSGT00950000183000.c.a.a.h.b ENSGT00390000012589 ENSGT00940000162317.c ENSGT00390000015815.h ENSGT00940000159437.d ENSGT00530000064165.a.c.d ENSGT00550000075103.n ENSGT00940000158195.h ENSGT00390000010397.a.g Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01000000214440.C.r.a ENSGT00940000160310.b.c ENSGT00940000160341.h ENSGT00940000153916.A.a ENSGT00390000018173.t ENSGT00390000007539.b.c ENSGT00390000011639.p.f ENSGT01100000263497.B.m ENSGT00390000018613.b.c ENSGT00940000168756 ENSGT00940000164878.b ENSGT00940000166053.d ENSGT00940000155031.a.b.d ENSGT00940000167292.b.d ENSGT00940000164137.b.b ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.b.a ##22 ENSGT00940000157074.h ENSGT00940000165651.a.d ENSGT00900000141164.q.a.b ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.d.b ENSGT00940000156646.d.a ENSGT00990000214255 ENSGT00390000013762.a.e.c ENSGT00950000183000.c.a.a.h.b ENSGT00390000012589 ENSGT00940000162317.c ENSGT00390000015815.h.f ENSGT00940000159437.d ENSGT00530000064165.a.c.d ENSGT00550000075103.n ENSGT00940000158195.h Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160310.b.c ENSGT00940000160341.h ENSGT00940000153916.A.a ENSGT00390000018173.t ENSGT00390000007539.b.c ENSGT00390000011639.p.f ENSGT01100000263497.B.m ENSGT00390000018613.b.c ENSGT00940000168756 ENSGT00940000164878.b ENSGT00940000166053.d ENSGT00940000155031.a.b.d ENSGT00940000164916.nb.a ENSGT00940000167292.b.d ENSGT00940000164137.b.b ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.b.a ##22 ENSGT00940000157074.h ENSGT00940000165651.a.d ENSGT00900000141164.q.a.b ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.d.b ENSGT00940000156646.d.a ENSGT00990000214255 ENSGT00390000013762.a.e.c ENSGT00950000183000.c.a.a.h.b ENSGT00390000012589 ENSGT00940000162317.c ENSGT00390000015815.h.f ENSGT00940000159437.d ENSGT00530000064165.a.c.d ENSGT00550000075103.n ENSGT00940000158195.h Rainbow trout MODERN SPECIES 364 esrra (ENSOMYG00000043994) ENSOMYG00000043987 prdx5 (ENSOMYG00000043965) ENSOMYG00000043594 bscl2 (ENSOMYG00000043496) gng3 (ENSOMYG00000032989) banf1 (ENSOMYG00000043486) sart1 (ENSOMYG00000043439) ENSOMYG00000056601 ENSOMYG00000043384 ENSOMYG00000043105 zgc:110782 (ENSOMYG00000043060) ENSOMYG00000043056 ENSOMYG00000066035 slc8a4a (ENSOMYG00000043050) ppp1r14ba (ENSOMYG00000070297) ##22 fkbp2 (ENSOMYG00000043031) ENSOMYG00000072288 ENSOMYG00000043027 pcxa (ENSOMYG00000039910) ENSOMYG00000073801 slc3a2b (ENSOMYG00000038863) ENSOMYG00000038832 ENSOMYG00000056696 ENSOMYG00000038789 tmem223 (ENSOMYG00000038779) CCDC85B (ENSOMYG00000038775) fibpb (ENSOMYG00000038742) efemp2b (ENSOMYG00000038715) ENSOMYG00000038688 mrps12 (ENSOMYG00000038677) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160310.b.c ENSGT00940000160341.h ENSGT00940000153916.A.a ENSGT00390000018173.t ENSGT00390000007539.b.c ENSGT00390000011639.p.f ENSGT01100000263497.B.m ENSGT00390000018613.b.c ENSGT00940000168756 ENSGT00940000164878.b ENSGT00940000166053.d ENSGT00940000155031.a.b.d ENSGT00940000164916.nb.a ENSGT00940000167292.b.d ENSGT00940000164137.b.b ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.b.a ##22 ENSGT00940000157074.h ENSGT00940000165651.a.d ENSGT00900000141164.q.a.b ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.d.b ENSGT00940000156646.d.a ENSGT00990000214255 ENSGT00390000013762.a.e.c ENSGT00950000183000.c.a.a.h.b ENSGT00390000012589 ENSGT00940000162317.c ENSGT00390000015815.h.f ENSGT00940000159437.d ENSGT00530000064165.a.c.d ENSGT00550000075103.n ENSGT00940000158195.h Coho salmon MODERN SPECIES 21 esrra (ENSOKIG00005040222) MPDU1 (ENSOKIG00005040252) prdx5 (ENSOKIG00005040267) ENSOKIG00005040338 bscl2 (ENSOKIG00005040849) gng3 (ENSOKIG00005040884) banf1 (ENSOKIG00005040913) sart1 (ENSOKIG00005040975) ENSOKIG00005041276 ENSOKIG00005041285 MARK2 (ENSOKIG00005041490) zgc:110782 (ENSOKIG00005044160) ENSOKIG00005044175 slc8a4a (ENSOKIG00005044186) ENSOKIG00005044203 ppp1r14ba (ENSOKIG00005044212) ##22 fkbp2 (ENSOKIG00005044217) pcxa (ENSOKIG00005044337) ENSOKIG00005045673 ENSOKIG00005045679 slc3a2b (ENSOKIG00005045697) ENSOKIG00005045704 ENSOKIG00005045715 CFL1 (ENSOKIG00005045721) tmem223 (ENSOKIG00005045732) CCDC85B (ENSOKIG00005045737) fibpb (ENSOKIG00005045740) efemp2b (ENSOKIG00005045769) ENSOKIG00005045933 mrps12 (ENSOKIG00005045939) kif4 (ENSOKIG00005045977) Chinook salmon MODERN SPECIES 26 KCNK4 (ENSOTSG00005007637) esrra (ENSOTSG00005007643) mpdu1a (ENSOTSG00005007658) prdx5 (ENSOTSG00005007661) ENSOTSG00005007678 bscl2 (ENSOTSG00005009456) gng3 (ENSOTSG00005009459) banf1 (ENSOTSG00005009460) sart1 (ENSOTSG00005009462) ENSOTSG00005009561 ENSOTSG00005009562 MARK2 (ENSOTSG00005009591) zgc:110782 (ENSOTSG00005012442) ENSOTSG00005012444 slc8a4a (ENSOTSG00005012446) ppp1r14ba (ENSOTSG00005012448) ##22 fkbp2 (ENSOTSG00005012449) pcxa (ENSOTSG00005012453) ENSOTSG00005012502 ENSOTSG00005012505 slc3a2b (ENSOTSG00005012507) ENSOTSG00005012508 ENSOTSG00005012509 cfl1 (ENSOTSG00005012511) tmem223 (ENSOTSG00005012513) CCDC85B (ENSOTSG00005012514) fibpb (ENSOTSG00005012517) efemp2b (ENSOTSG00005002987) ENSOTSG00005003246 mrps12 (ENSOTSG00005003247) kif4 (ENSOTSG00005003278) Salmo ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160341.h ENSGT00940000153916.A.a ENSGT00390000018173.t ENSGT00390000007539.b.c ENSGT00390000011639.p.f ENSGT01100000263497.B.m ENSGT00390000018613.b.c ENSGT00940000168756 ENSGT00940000164878.b ENSGT00940000166053.d ENSGT00940000155031.a.b.d ENSGT00390000007971 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.b.d ENSGT00940000164137.b.b ENSGT00950000182985.b.b.sc.d.b.a ##22 ENSGT00940000157074.h ENSGT00940000165651.a.d ENSGT00900000141164.q.a.b ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.d.b ENSGT00940000156646.d.a ENSGT00990000214255 ENSGT00390000013762.a.e.c ENSGT00950000183000.c.a.a.h.b ENSGT00940000162317.c ENSGT00390000015815.h.e ENSGT00940000159437.d ENSGT00530000064165.a.c.d ENSGT00550000075103.n ENSGT00940000158195.h ENSGT00390000010397.a.g Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 ENSSSAG00000067387 stx5 (ENSSSAG00000051611) ENSSSAG00000051554 esrra (ENSSSAG00000051537) ENSSSAG00000051529 prdx5 (ENSSSAG00000051514) nxf1 (ENSSSAG00000051042) bscl2 (ENSSSAG00000050994) sart1 (ENSSSAG00000050823) ENSSSAG00000050806 ENSSSAG00000105351 ENSSSAG00000039397 zgc:110782 (ENSSSAG00000121337) ENSSSAG00000038508 slc8a4a (ENSSSAG00000038024) ppp1r14ba (ENSSSAG00000116542) ##22 FKBP2 (ENSSSAG00000037619) ENSSSAG00000119069 pcxa (ENSSSAG00000017625) ENSSSAG00000016565 slc3a2b (ENSSSAG00000111850) ENSSSAG00000016423 ENSSSAG00000016369 COF2 (ENSSSAG00000016215) fibpb (ENSSSAG00000110899) efemp2b (ENSSSAG00000015480) ENSSSAG00000015446 kif4 (ENSSSAG00000015319) ENSSSAG00000086893 ammecr1 (ENSSSAG00000106885) ENSSSAG00000101457 River trout MODERN SPECIES 3 KCNK4 (ENSSTUG00000032784) esrra (ENSSTUG00000032764) mpdu1a (ENSSTUG00000032747) prdx5 (ENSSTUG00000032715) ENSSTUG00000032395 bscl2 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(ENSHHUG00000042471) ENSHHUG00000042586 ENSHHUG00000042592 slc3a2b (ENSHHUG00000042856) ENSHHUG00000042864 ENSHHUG00000042873 cfl1 (ENSHHUG00000042878) ENSHHUG00000042931 ENSHHUG00000042933 mrps12 (ENSHHUG00000042938) kif4 (ENSHHUG00000042940) ammecr1 (ENSHHUG00000042968) TMEM164 (ENSHHUG00000042973) fundc2 (ENSHHUG00000042976) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 151 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 Cod MODERN SPECIES 8 ENSGMOG00000028012 ENSGMOG00000029036 ENSGMOG00000023907 ENSGMOG00000028178 ENSGMOG00000019447 ENSGMOG00000019445 ENSGMOG00000019450 slc8a4b (ENSGMOG00000000139) plcb3 (ENSGMOG00000000397) ENSGMOG00000026475 ENSGMOG00000027567 ENSGMOG00000031373 ENSGMOG00000033030 ENSGMOG00000036682 ENSGMOG00000029091 ppp1r14bb (ENSGMOG00000007061) ##22 brms1 (ENSGMOG00000007053) ENSGMOG00000028635 ENSGMOG00000028538 ENSGMOG00000026367 ENSGMOG00000029013 ENSGMOG00000023366 ENSGMOG00000018292 ENSGMOG00000018268 ENSGMOG00000014249 ENSGMOG00000014228 rela (ENSGMOG00000016783) zgc:63470 (ENSGMOG00000020392) drap1 (ENSGMOG00000016768) ENSGMOG00000003592 ENSGMOG00000011867 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 9 cct7 (ENSMMDG00005020397) krcp (ENSMMDG00005020377) MARK2 (ENSMMDG00005019651) rcor2 (ENSMMDG00005019629) naa40 (ENSMMDG00005019623) b3gat3 (ENSMMDG00005019621) arl2 (ENSMMDG00005019609) PPP2R5B (ENSMMDG00005019547) ENSMMDG00005019537 gpha2 (ENSMMDG00005019534) MAJIN (ENSMMDG00005019530) zgc:101765 (ENSMMDG00005019527) badb (ENSMMDG00005019525) slc8a4b (ENSMMDG00005019514) plcb3 (ENSMMDG00005019507) ppp1r14bb (ENSMMDG00005019504) ##22 brms1 (ENSMMDG00005019500) ENSMMDG00005019497 tmem179ba (ENSMMDG00005019495) prox3 (ENSMMDG00005019492) snx15 (ENSMMDG00005019490) ENSMMDG00005019487 ENSMMDG00005019486 pcxb (ENSMMDG00005019294) ENSMMDG00005019280 ENSMMDG00005019279 DDIT4L (ENSMMDG00005019275) ENSMMDG00005019273 PPP3CA (ENSMMDG00005016762) BANK1 (ENSMMDG00005016148) NFIB (ENSMMDG00005015836) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00940000176150 ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 479 ENSHCOG00000016943 NWD2 (ENSHCOG00000016974) ENSHCOG00000016980 rell1 (ENSHCOG00000017001) per1b (ENSHCOG00000017052) pcolceb (ENSHCOG00000017077) ENSHCOG00000017085 ENSHCOG00000017091 cnpy4 (ENSHCOG00000017099) ENSHCOG00000017519 ENSHCOG00000017569 TBC1D14 (ENSHCOG00000017633) kiaa0232 (ENSHCOG00000017647) ENSHCOG00000017668 plcb3 (ENSHCOG00000017696) ppp1r14bb (ENSHCOG00000017702) ##22 ENSHCOG00000017711 tmem179ba (ENSHCOG00000017722) prox3 (ENSHCOG00000017750) snx15 (ENSHCOG00000017760) ENSHCOG00000017770 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000007971 ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000007971 ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Midas cichlid MODERN SPECIES 1021 plcb3 (ENSACIG00000024019) ppp1r14bb (ENSACIG00000024015) ##22 brms1 (ENSACIG00000024013) si:ch211-285j22.3 (ENSACIG00000024012) tmem179ba (ENSACIG00000024010) prox3 (ENSACIG00000024008) snx15 (ENSACIG00000024004) slc3a2a (ENSACIG00000024000) ENSACIG00000023997 ENSACIG00000023987 pcxb (ENSACIG00000023981) ENSACIG00000023977 ENSACIG00000023975 DDIT4L (ENSACIG00000023973) ENSACIG00000023922 ENSACIG00000023907 NFIB (ENSACIG00000023904) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Nile tilapia MODERN SPECIES 15 krcp (ENSONIG00000013562) MARK2 (ENSONIG00000013549) rcor2 (ENSONIG00000013546) naa40 (ENSONIG00000028929) b3gat3 (ENSONIG00000013540) arl2 (ENSONIG00000013539) batf2 (ENSONIG00000037996) ppp2r5b (ENSONIG00000013531) ENSONIG00000013530 gpha2 (ENSONIG00000013529) ENSONIG00000031712 zgc:101765 (ENSONIG00000034181) badb (ENSONIG00000013527) slc8a4b (ENSONIG00000013515) plcb3 (ENSONIG00000013512) ppp1r14bb (ENSONIG00000013511) ##22 brms1 (ENSONIG00000013509) tmem179ba (ENSONIG00000013506) prox3 (ENSONIG00000037877) snx15 (ENSONIG00000013503) slc3a2a (ENSONIG00000013499) ENSONIG00000040255 pcxb (ENSONIG00000013481) ENSONIG00000013495 ENSONIG00000013478 ENSONIG00000013476 DDIT4L (ENSONIG00000013475) PPP3CA (ENSONIG00000013465) BANK1 (ENSONIG00000013461) NFIB (ENSONIG00000013455) zdhhc21 (ENSONIG00000035752) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Lyretail cichlid MODERN SPECIES 381 krcp (ENSNBRG00000005619) ENSNBRG00000005662 ENSNBRG00000005670 ENSNBRG00000005677 rcor2 (ENSNBRG00000005738) naa40 (ENSNBRG00000006277) b3gat3 (ENSNBRG00000006305) arl2 (ENSNBRG00000006393) PPP2R5B (ENSNBRG00000006399) ENSNBRG00000006441 gpha2 (ENSNBRG00000006468) zgc:101765 (ENSNBRG00000006488) ENSNBRG00000006508 slc8a4b (ENSNBRG00000006527) plcb3 (ENSNBRG00000006591) ppp1r14bb (ENSNBRG00000006684) ##22 brms1 (ENSNBRG00000006704) tmem179ba (ENSNBRG00000006759) prox3 (ENSNBRG00000006786) snx15 (ENSNBRG00000006804) slc3a2a (ENSNBRG00000006815) pcxb (ENSNBRG00000006831) ENSNBRG00000006890 ENSNBRG00000006960 DDIT4L (ENSNBRG00000006989) PPP3CA (ENSNBRG00000007040) ENSNBRG00000007379 NFIB (ENSNBRG00000007455) zdhhc21 (ENSNBRG00000007509) plaa (ENSNBRG00000007538) haus6 (ENSNBRG00000007598) Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 358 cct7 (ENSHBUG00000016272) krcp (ENSHBUG00000016339) MARK2 (ENSHBUG00000016483) rcor2 (ENSHBUG00000016509) naa40 (ENSHBUG00000016533) b3gat3 (ENSHBUG00000016560) arl2 (ENSHBUG00000016592) batf2 (ENSHBUG00000016600) PPP2R5B (ENSHBUG00000016642) gpha2 (ENSHBUG00000016660) ENSHBUG00000016672 zgc:101765 (ENSHBUG00000016681) ENSHBUG00000016684 slc8a4b (ENSHBUG00000016783) plcb3 (ENSHBUG00000017029) ppp1r14bb (ENSHBUG00000017091) ##22 brms1 (ENSHBUG00000017133) si:ch211-285j22.3 (ENSHBUG00000017141) tmem179ba (ENSHBUG00000017159) prox3 (ENSHBUG00000017170) snx15 (ENSHBUG00000017182) slc3a2a (ENSHBUG00000000935) ENSHBUG00000017200 pcxb (ENSHBUG00000018780) ENSHBUG00000018874 DDIT4L (ENSHBUG00000018898) ENSHBUG00000018985 BANK1 (ENSHBUG00000019000) NFIB (ENSHBUG00000019049) zdhhc21 (ENSHBUG00000019087) plaa (ENSHBUG00000019109) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b P. nyererei MODERN SPECIES 506 ENSPNYG00000021076 gpha2 (ENSPNYG00000021084) ENSPNYG00000021103 zgc:101765 (ENSPNYG00000021115) ENSPNYG00000021132 slc8a4b (ENSPNYG00000021147) plcb3 (ENSPNYG00000021207) ppp1r14bb (ENSPNYG00000021318) ##22 brms1 (ENSPNYG00000021336) si:ch211-285j22.3 (ENSPNYG00000021350) tmem179ba (ENSPNYG00000021362) prox3 (ENSPNYG00000021381) snx15 (ENSPNYG00000021411) slc3a2a (ENSPNYG00000021444) PC (ENSPNYG00000021491) ENSPNYG00000021533 ENSPNYG00000021558 ENSPNYG00000021612 DDIT4L (ENSPNYG00000021625) PPP3CA (ENSPNYG00000021649) ENSPNYG00000021703 NFIB (ENSPNYG00000021742) zdhhc21 (ENSPNYG00000021792) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Eastern happy MODERN SPECIES 15 rcor2 (ENSACLG00000021127) naa40 (ENSACLG00000021217) b3gat3 (ENSACLG00000021239) sb:cb1058 (ENSACLG00000021268) arl2 (ENSACLG00000021338) ENSACLG00000021354 batf2 (ENSACLG00000021362) PPP2R5B (ENSACLG00000021379) ENSACLG00000021399 gpha2 (ENSACLG00000021410) ENSACLG00000021425 zgc:101765 (ENSACLG00000021435) ENSACLG00000021441 slc8a4b (ENSACLG00000021477) plcb3 (ENSACLG00000021657) ppp1r14bb (ENSACLG00000021867) ##22 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ENSMZEG00005002823 ENSMZEG00005002788 pcxb (ENSMZEG00005002715) ENSMZEG00005002689 ENSMZEG00005002614 DDIT4L (ENSMZEG00005002599) PPP3CA (ENSMZEG00005002547) ENSMZEG00005002523 NFIB (ENSMZEG00005002467) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2661 plcb3 (ENSSPAG00000013134) ppp1r14bb (ENSSPAG00000013311) ##22 brms1 (ENSSPAG00000013321) si:ch211-285j22.3 (ENSSPAG00000013332) tmem179ba (ENSSPAG00000013338) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000166766 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 ENSGT00550000074944 Spiny chromis MODERN SPECIES 29 ENSAPOG00000024212 zgc:101765 (ENSAPOG00000024194) slc8a4b (ENSAPOG00000024121) plcb3 (ENSAPOG00000024044) ppp1r14bb (ENSAPOG00000023980) ##22 brms1 (ENSAPOG00000023974) si:ch211-285j22.3 (ENSAPOG00000023940) tmem179ba (ENSAPOG00000023916) prox3 (ENSAPOG00000023882) snx15 (ENSAPOG00000023849) plaa (ENSAPOG00000023834) zdhhc21 (ENSAPOG00000023746) NFIB (ENSAPOG00000023677) BANK1 (ENSAPOG00000023557) PPP3CA (ENSAPOG00000023432) DDIT4L (ENSAPOG00000023267) ENSAPOG00000023253 pcxb (ENSAPOG00000023217) ENSAPOG00000023094 ENSAPOG00000023078 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00550000074832 ENSGT00940000166766 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 ENSGT00550000074944 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2034 plcb3 (ENSAOCG00000005175) ppp1r14bb (ENSAOCG00000005191) ##22 brms1 (ENSAOCG00000002744) si:ch211-285j22.3 (ENSAOCG00000005252) tmem179ba (ENSAOCG00000005267) ENSAOCG00000005276 snx15 (ENSAOCG00000005284) slc3a2a (ENSAOCG00000005303) Orange clownfish MODERN SPECIES 15 hspa12b (ENSAPEG00000020453) cct7 (ENSAPEG00000020488) krcp (ENSAPEG00000020513) MARK2 (ENSAPEG00000020550) rcor2 (ENSAPEG00000020634) naa40 (ENSAPEG00000020711) b3gat3 (ENSAPEG00000020734) arl2 (ENSAPEG00000020786) PPP2R5B (ENSAPEG00000020809) ENSAPEG00000020849 gpha2 (ENSAPEG00000020864) zgc:101765 (ENSAPEG00000020929) badb (ENSAPEG00000020939) slc8a4b (ENSAPEG00000020954) plcb3 (ENSAPEG00000021001) ppp1r14bb (ENSAPEG00000021114) ##22 brms1 (ENSAPEG00000021133) si:ch211-285j22.3 (ENSAPEG00000021151) tmem179ba (ENSAPEG00000021161) ENSAPEG00000021181 snx15 (ENSAPEG00000021203) ENSAPEG00000021221 slc3a2a (ENSAPEG00000021232) pcxb (ENSAPEG00000021274) ENSAPEG00000021404 ENSAPEG00000021426 DDIT4L (ENSAPEG00000021471) PPP3CA (ENSAPEG00000021489) ENSAPEG00000021533 NFIB (ENSAPEG00000021618) zdhhc21 (ENSAPEG00000021644) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160330 ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693.f ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a Oryzias ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693.f ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 ENSGT00550000074944 Indian medaka MODERN SPECIES 19 ENSOMEG00000008745 rcor2 (ENSOMEG00000008722) naa40 (ENSOMEG00000008624) b3gat3 (ENSOMEG00000000643) sb:cb1058 (ENSOMEG00000008543) arl2 (ENSOMEG00000008521) batf2 (ENSOMEG00000008462) PPP2R5B (ENSOMEG00000008434) ENSOMEG00000000205 gpha2 (ENSOMEG00000008367) ENSOMEG00000008355 zgc:101765 (ENSOMEG00000008336) ENSOMEG00000008313 slc8a4b (ENSOMEG00000008263) plcb3 (ENSOMEG00000008118) ppp1r14bb (ENSOMEG00000007960) ##22 brms1 (ENSOMEG00000007933) tmem179ba (ENSOMEG00000007901) prox3 (ENSOMEG00000007863) snx15 (ENSOMEG00000007842) SLC3A2 (ENSOMEG00000007823) pcxb (ENSOMEG00000007719) ENSOMEG00000007609 ENSOMEG00000007594 DDIT4L (ENSOMEG00000007560) PPP3CA (ENSOMEG00000007511) ENSOMEG00000007427 NFIB (ENSOMEG00000007380) zdhhc21 (ENSOMEG00000000948) plaa (ENSOMEG00000007273) ENSOMEG00000007219 Javanese ricefish MODERN SPECIES 9 hspa12b (ENSOJAG00000017455) cct7 (ENSOJAG00000017862) krcp (ENSOJAG00000017909) MARK2 (ENSOJAG00000018021) rcor2 (ENSOJAG00000018737) naa40 (ENSOJAG00000018861) b3gat3 (ENSOJAG00000018934) arl2 (ENSOJAG00000018967) batf2 (ENSOJAG00000018989) PPP2R5B (ENSOJAG00000019078) ENSOJAG00000019420 gpha2 (ENSOJAG00000019460) ENSOJAG00000019488 zgc:101765 (ENSOJAG00000019498) slc8a4b (ENSOJAG00000019561) ppp1r14bb (ENSOJAG00000020615) ##22 brms1 (ENSOJAG00000020625) tmem179ba (ENSOJAG00000020636) prox3 (ENSOJAG00000020644) snx15 (ENSOJAG00000010581) SLC3A2 (ENSOJAG00000010590) ENSOJAG00000010603 pcxb (ENSOJAG00000010733) 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(ENSNFUG00015012308) b3gat3 (ENSNFUG00015012299) ARL2 (ENSNFUG00015012281) batf2 (ENSNFUG00015012275) PPP2R5B (ENSNFUG00015012219) BX640584.1 (ENSNFUG00015012207) ENSNFUG00015012199 gpha2 (ENSNFUG00015012184) ENSNFUG00015012177 ENSNFUG00015012174 OLA.3226 (ENSNFUG00015012165) BAD (ENSNFUG00015012161) slc8a4b (ENSNFUG00015012074) ENSNFUG00015012065 PLCB3 (ENSNFUG00015011945) PPP1R14B (ENSNFUG00015011920) ##22 BRMS1 (ENSNFUG00015011907) TMEM179B (ENSNFUG00015011900) DDIT4L (ENSNFUG00015011896) ENSNFUG00015011893 ENSNFUG00015011891 PPP3CA (ENSNFUG00015011624) ENSNFUG00015011589 ENSNFUG00015011584 ENSNFUG00015011573 ENSNFUG00015011569 NFIB (ENSNFUG00015011447) ZDHHC21 (ENSNFUG00015011401) plaa (ENSNFUG00015011156) HAUS6 (ENSNFUG00015011045) ENSNFUG00015011026 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000018418 ENSGT00940000165987 ENSGT00940000165100.b ENSGT00390000000592 ENSGT00940000167107 ENSGT01030000234590.B.a.b ENSGT00550000075058 ENSGT00390000006227 ENSGT00390000002849 ENSGT00940000155384.b.b ENSGT00940000160134 ENSGT00530000063506.B ENSGT00940000174852 ENSGT00510000050415.C.i.a.a ENSGT01010000227968 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160330 ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f Tetraodon MODERN SPECIES 14 CHD3 (ENSTNIG00000012998) naa38 (ENSTNIG00000012999) dnajc3b (ENSTNIG00000013000) cldn15a (ENSTNIG00000013001) fis1 (ENSTNIG00000013002) zgc:103586 (ENSTNIG00000013003) tm4sf5 (ENSTNIG00000013004) mettl3 (ENSTNIG00000013005) ttc5 (ENSTNIG00000013006) CCNB1IP1 (ENSTNIG00000013007) ENSTNIG00000013008 slc7a7 (ENSTNIG00000013009) oxa1l (ENSTNIG00000013010) ENSTNIG00000013011 ENSTNIG00000013012 ppp1r14bb (ENSTNIG00000013013) ##22 brms1 (ENSTNIG00000013014) tmem179ba (ENSTNIG00000013015) ENSTNIG00000013016 snx15 (ENSTNIG00000013017) slc3a2a (ENSTNIG00000013018) ENSTNIG00000013019 PC (ENSTNIG00000013020) eif4ea (ENSTNIG00000013021) ENSTNIG00000013022 gar1 (ENSTNIG00000013023) pitx2 (ENSTNIG00000013024) elovl6 (ENSTNIG00000013025) egf (ENSTNIG00000013026) lrit3a (ENSTNIG00000000464) gpm6aa (ENSTNIG00000013027) Fugu MODERN SPECIES 20 naa38 (ENSTRUG00000026123) dnajc3b (ENSTRUG00000015269) cldn15a (ENSTRUG00000015308) fis1 (ENSTRUG00000028230) zgc:103586 (ENSTRUG00000015344) tm4sf5 (ENSTRUG00000015352) mettl3 (ENSTRUG00000015365) ttc5 (ENSTRUG00000015399) CCNB1IP1 (ENSTRUG00000022746) ENSTRUG00000025082 slc7a7 (ENSTRUG00000022931) oxa1l (ENSTRUG00000015484) ENSTRUG00000024949 ENSTRUG00000029750 ENSTRUG00000024574 ppp1r14bb (ENSTRUG00000015511) ##22 brms1 (ENSTRUG00000015533) prox3 (ENSTRUG00000021817) snx15 (ENSTRUG00000015560) slc3a2a (ENSTRUG00000015563) ENSTRUG00000032884 ENSTRUG00000015601 pcxb (ENSTRUG00000021779) ENSTRUG00000017522 anapc10 (ENSTRUG00000017519) abce1 (ENSTRUG00000017503) ENSTRUG00000017497 ENSTRUG00000028270 REELD1 (ENSTRUG00000022355) slc10a7 (ENSTRUG00000017490) ednrab (ENSTRUG00000017482) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 203 krcp (ENSLBEG00000016959) MARK2 (ENSLBEG00000016838) rcor2 (ENSLBEG00000016789) naa40 (ENSLBEG00000016743) b3gat3 (ENSLBEG00000016700) sb:cb1058 (ENSLBEG00000016671) arl2 (ENSLBEG00000016494) PPP2R5B (ENSLBEG00000016423) ENSLBEG00000016388 gpha2 (ENSLBEG00000016346) zgc:101765 (ENSLBEG00000016280) badb (ENSLBEG00000016200) slc8a4b (ENSLBEG00000016129) plcb3 (ENSLBEG00000015918) ENSLBEG00000015658 ppp1r14bb (ENSLBEG00000015587) ##22 brms1 (ENSLBEG00000015491) tmem179ba (ENSLBEG00000015454) prox3 (ENSLBEG00000015435) snx15 (ENSLBEG00000015411) slc3a2a (ENSLBEG00000015391) ENSLBEG00000015340 ENSLBEG00000015268 pcxb (ENSLBEG00000015103) ENSLBEG00000014952 ENSLBEG00000014847 DDIT4L (ENSLBEG00000014803) Ballan wrasse MODERN SPECIES 4358 ENSLBEG00000022388 ppp1r14bb (ENSLBEG00000022215) ##22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000157941 ENSGT01020000231217 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00550000074832 ENSGT00940000166766 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 Stickleback MODERN SPECIES 7 rcor2 (ENSGACG00000019834) naa40 (ENSGACG00000019828) b3gat3 (ENSGACG00000019824) ENSGACG00000019819 arl2 (ENSGACG00000019812) PPP2R5B (ENSGACG00000019803) ENSGACG00000019802 gpha2 (ENSGACG00000019799) zgc:101765 (ENSGACG00000019794) zgc:101765 (ENSGACG00000019790) zgc:101765 (ENSGACG00000019770) badb (ENSGACG00000019768) slc8a4b (ENSGACG00000019764) ENSGACG00000019763 plcb3 (ENSGACG00000019760) ppp1r14bb (ENSGACG00000019758) ##22 ENSGACG00000019757 brms1 (ENSGACG00000019753) tmem179ba (ENSGACG00000019751) ENSGACG00000019750 snx15 (ENSGACG00000019747) ENSGACG00000019745 ENSGACG00000019743 pcxb (ENSGACG00000019710) ENSGACG00000019708 ENSGACG00000019701 DDIT4L (ENSGACG00000019700) ENSGACG00000019699 PPP3CA (ENSGACG00000019688) ENSGACG00000019686 NFIB (ENSGACG00000019677) Lumpfish MODERN SPECIES 9 TBC1D14 (ENSCLMG00005001606) ENSCLMG00005001366 senp3b (ENSCLMG00005020868) eif4a1a (ENSCLMG00005020514) sox19b (ENSCLMG00005020513) arl2 (ENSCLMG00005020507) PPP2R5B (ENSCLMG00005020499) ENSCLMG00005020495 gpha2 (ENSCLMG00005020492) ENSCLMG00005020491 zgc:101765 (ENSCLMG00005020490) zgc:101765 (ENSCLMG00005020489) badb (ENSCLMG00005020488) slc8a4b (ENSCLMG00005020487) plcb3 (ENSCLMG00005017505) ppp1r14bb (ENSCLMG00005017483) ##22 brms1 (ENSCLMG00005017482) tmem179ba (ENSCLMG00005017481) prox3 (ENSCLMG00005017480) snx15 (ENSCLMG00005017479) slc3a2a (ENSCLMG00005017478) ENSCLMG00005017476 pcxb (ENSCLMG00005017462) ENSCLMG00005017461 ENSCLMG00005017460 DDIT4L (ENSCLMG00005017459) ENSCLMG00005017458 PPP3CA (ENSCLMG00005011573) ENSCLMG00005011521 NFIB (ENSCLMG00005011424) zdhhc21 (ENSCLMG00005011416) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000157941 ENSGT01020000231217 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Pike perch MODERN SPECIES 65 slc8a4b (ENSSLUG00000024964) plcb3 (ENSSLUG00000024765) ppp1r14bb (ENSSLUG00000024725) ##22 brms1 (ENSSLUG00000024723) tmem179ba (ENSSLUG00000024721) prox3 (ENSSLUG00000024719) snx15 (ENSSLUG00000024716) slc3a2a (ENSSLUG00000024715) ENSSLUG00000024714 ENSSLUG00000024712 pcxb (ENSSLUG00000024376) ENSSLUG00000024306 ENSSLUG00000024298 DDIT4L (ENSSLUG00000024289) ENSSLUG00000024286 PPP3CA (ENSSLUG00000023960) BANK1 (ENSSLUG00000023931) NFIB (ENSSLUG00000023914) Channel bull blenny MODERN SPECIES 9 rcor2 (ENSCGOG00000020287) naa40 (ENSCGOG00000020216) b3gat3 (ENSCGOG00000020160) arl2 (ENSCGOG00000020110) PPP2R5B (ENSCGOG00000018285) ENSCGOG00000018258 gpha2 (ENSCGOG00000018255) ENSCGOG00000018254 ENSCGOG00000018253 ENSCGOG00000018251 ENSCGOG00000018250 zgc:101765 (ENSCGOG00000018249) badb (ENSCGOG00000018248) slc8a4b (ENSCGOG00000017891) plcb3 (ENSCGOG00000016182) ppp1r14bb (ENSCGOG00000016120) ##22 brms1 (ENSCGOG00000016099) tmem179ba (ENSCGOG00000016096) prox3 (ENSCGOG00000016094) snx15 (ENSCGOG00000016091) slc3a2a (ENSCGOG00000016085) ENSCGOG00000016081 ENSCGOG00000016047 ENSCGOG00000016042 pcxb (ENSCGOG00000013813) ENSCGOG00000013754 ENSCGOG00000013750 ENSCGOG00000013737 DDIT4L (ENSCGOG00000013735) PPP3CB (ENSCGOG00000013732) PPP3CA (ENSCGOG00000013678) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125.d ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a Gilthead seabream MODERN SPECIES 1 ENSSAUG00010002064 MARK2 (ENSSAUG00010001479) rcor2 (ENSSAUG00010001439) naa40 (ENSSAUG00010001421) b3gat3 (ENSSAUG00010001406) ENSSAUG00010001399 arl2 (ENSSAUG00010001376) batf2 (ENSSAUG00010001371) PPP2R5B (ENSSAUG00010001366) ENSSAUG00010001357 gpha2 (ENSSAUG00010001350) ENSSAUG00010001336 zgc:101765 (ENSSAUG00010001317) badb (ENSSAUG00010001301) plcb3 (ENSSAUG00010027111) ppp1r14bb (ENSSAUG00010027078) ##22 brms1 (ENSSAUG00010027077) tmem179ba (ENSSAUG00010027075) prox3 (ENSSAUG00010027074) ENSSAUG00010027073 snx15 (ENSSAUG00010027071) slc3a2a (ENSSAUG00010027055) ENSSAUG00010027047 ENSSAUG00010027046 pcxb (ENSSAUG00010027042) ENSSAUG00010027027 ENSSAUG00010027020 DDIT4L (ENSSAUG00010027011) PPP3CA (ENSSAUG00010026929) ENSSAUG00010026904 NFIB (ENSSAUG00010026891) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000157941 ENSGT01020000231217 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125.d ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00990000213447 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a European seabass MODERN SPECIES 16 ENSDLAG00005008482 ENSDLAG00005008526 ENSDLAG00005030503 krcp (ENSDLAG00005009267) MARK2 (ENSDLAG00005009354) rcor2 (ENSDLAG00005030856) naa40 (ENSDLAG00005028020) b3gat3 (ENSDLAG00005011611) arl2 (ENSDLAG00005026470) PPP2R5B (ENSDLAG00005011693) gpha2 (ENSDLAG00005013334) MAJIN (ENSDLAG00005030779) slc8a4b (ENSDLAG00005013407) badb (ENSDLAG00005027464) plcb3 (ENSDLAG00005014729) ppp1r14bb (ENSDLAG00005019688) ##22 brms1 (ENSDLAG00005019691) ENSDLAG00005028278 tmem179ba (ENSDLAG00005027982) ENSDLAG00005019737 snx15 (ENSDLAG00005019744) ENSDLAG00005019747 ENSDLAG00005019754 ENSDLAG00005019774 ENSDLAG00005027359 ENSDLAG00005034162 ENSDLAG00005020039 DDIT4L (ENSDLAG00005033814) ENSDLAG00005020155 ENSDLAG00005020224 BANK1 (ENSDLAG00005021567) Large yellow croaker MODERN SPECIES 2 MARK2 (ENSLCRG00005021084) rcor2 (ENSLCRG00005021095) PPP2R5B (ENSLCRG00005021109) naa40 (ENSLCRG00005021850) b3gat3 (ENSLCRG00005021855) arl2 (ENSLCRG00005021859) ENSLCRG00005000059 ENSLCRG00005000063 gpha2 (ENSLCRG00005000067) ENSLCRG00005000073 zgc:101765 (ENSLCRG00005000097) badb (ENSLCRG00005000122) slc8a4b (ENSLCRG00005000412) plcb3 (ENSLCRG00005005412) ENSLCRG00005009398 ppp1r14bb (ENSLCRG00005009403) ##22 brms1 (ENSLCRG00005009407) si:ch211-285j22.3 (ENSLCRG00005009432) tmem179ba (ENSLCRG00005009433) prox3 (ENSLCRG00005009436) ENSLCRG00005009441 ENSLCRG00005009445 slc3a2a (ENSLCRG00005009447) ENSLCRG00005009448 pcxb (ENSLCRG00005009469) ENSLCRG00005010874 ENSLCRG00005010876 ENSLCRG00005010877 ENSLCRG00005010879 DDIT4L (ENSLCRG00005010880) PPP3CA (ENSLCRG00005010890) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 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zgc:101765 (ENSATEG00000027016) badb (ENSATEG00000016189) slc8a4b (ENSATEG00000016105) plcb3 (ENSATEG00000016052) ppp1r14bb (ENSATEG00000016041) ##22 brms1 (ENSATEG00000016026) tmem179ba (ENSATEG00000015993) ENSATEG00000015978 snx15 (ENSATEG00000015964) ENSATEG00000015953 ENSATEG00000015918 ENSATEG00000015899 ENSATEG00000015815 trpc5a (ENSATEG00000015769) cnpy3 (ENSATEG00000015761) dachb (ENSATEG00000015743) ENSATEG00000015711 ENSATEG00000015664 ENSATEG00000015626 ENSATEG00000029189 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00390000007971 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00770000120838.A ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155031.a.a ENSGT00940000154196.a ENSGT00390000014903 ENSGT00940000156954 ENSGT00800000125313 ENSGT00940000157941 ENSGT01030000234924 ENSGT01030000234620.a.b.b.a ENSGT00730000111179.a.b ENSGT00390000009379 ENSGT00940000168662 ENSGT00940000164916 ENSGT00940000167292.a ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000166331 ENSGT00510000048151.a ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00940000160125 ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000165651.b ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000013693 ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 Tongue sole MODERN SPECIES ENSCSEG00000018395 ENSCSEG00000018382 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ENSGT00900000141164.r.b ENSGT00940000160303.a.a ENSGT00940000156646.c ENSGT00940000160125 ENSGT00940000154790.a.b ENSGT00510000048151.a ENSGT00390000013762.a.f ENSGT00390000005498 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000007848.a.d ENSGT00940000164883 ENSGT00390000018533 ENSGT00940000164942.b ENSGT00390000011639.p ENSGT01100000263497.B ENSGT00390000018613.b ENSGT00390000007071 ENSGT00940000164878.b ENSGT00940000166053 ENSGT00940000155031.a.b ENSGT00940000164485.b ENSGT01030000234620.a.b.b.a.j ENSGT00940000167292.b ENSGT00940000164137.b ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000165651.a ENSGT00900000141164.q.a ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.a ENSGT00940000156646.d ENSGT00510000048151.b ENSGT00390000013762.a.e ENSGT00950000183000.c.a.a.f ENSGT00390000012589 ENSGT00390000015815.h ENSGT00940000159437.d ENSGT00530000064165.a.c ENSGT00550000075103 ENSGT01100000263476.D ENSGT00940000156709.d Denticle herring MODERN SPECIES 16 styxl1 (ENSDCDG00000002268) SMG8 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(ENSCHAG00000006381) nagk (ENSCHAG00000006241) ENSCHAG00000006224 hspa12b (ENSCHAG00000006026) cct7 (ENSCHAG00000005923) slc8a4b (ENSCHAG00000005644) plcb3 (ENSCHAG00000002669) ppp1r14bb (ENSCHAG00000026240) ##22 brms1 (ENSCHAG00000026236) ENSCHAG00000026228 PC (ENSCHAG00000026054) slc3a2a (ENSCHAG00000026017) snx15 (ENSCHAG00000026008) prox3 (ENSCHAG00000026003) tmem179ba (ENSCHAG00000026001) ENSCHAG00000025997 krcp (ENSCHAG00000025984) dhrs4 (ENSCHAG00000025969) tinf2 (ENSCHAG00000025958) cideb (ENSCHAG00000025952) homezb (ENSCHAG00000025946) gmpr2 (ENSCHAG00000025901) ENSCHAG00000025889 Atlantic herring MODERN SPECIES 24 NF1 (ENSCHAG00000009272) ENSCHAG00000009171 msi2a (ENSCHAG00000008415) ENSCHAG00000008384 ENSCHAG00000008359 ENSCHAG00000008345 ENSCHAG00000008336 sart1 (ENSCHAG00000008022) ENSCHAG00000007838 MARK2 (ENSCHAG00000007253) zgc:77262 (ENSCHAG00000007203) PPP2R5B (ENSCHAG00000006078) ENSCHAG00000006000 ENSCHAG00000005994 slc8a4a (ENSCHAG00000005925) ppp1r14ba (ENSCHAG00000005901) ##22 fkbp2 (ENSCHAG00000005841) ENSCHAG00000005831 pcxa (ENSCHAG00000005081) ENSCHAG00000004717 slc3a2b (ENSCHAG00000004679) ENSCHAG00000004663 TMEM151A (ENSCHAG00000004640) CFL1 (ENSCHAG00000004632) tmem223 (ENSCHAG00000004611) ENSCHAG00000004598 fibpb (ENSCHAG00000004411) efemp2b (ENSCHAG00000001592) ENSCHAG00000001438 nfrkb (ENSCHAG00000001116) ENSCHAG00000000856 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 161 ENSGT00940000159592 ENSGT00390000005656 ENSGT00940000155980.A ENSGT00510000047418 ENSGT00390000017284.a.b.c ENSGT00940000159032 ENSGT00550000074832 ENSGT00940000164137.a ENSGT00940000160539 ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000165651.a ENSGT00900000141164.q.a ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.b ENSGT00940000166331 ENSGT00940000165651.b ENSGT00900000141164.q.b ENSGT00940000153648.b ENSGT00980000199058 ENSGT00940000159709 ENSGT00390000015545 ENSGT00940000158971 ENSGT00940000166804 ENSGT00390000017455 ENSGT00390000000527 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000006734.a ENSGT00940000159147.b.a ENSGT00390000005232 ENSGT00940000158605.k ENSGT00950000182898.a.a.a.a.a.h ENSGT00940000157436.b ENSGT00940000165459.a.a.b ENSGT00390000007335 ENSGT00940000168756 ENSGT00940000164878.b ENSGT00940000166053 ENSGT00940000155031.a.b ENSGT00940000164485.b ENSGT00940000167292.b ENSGT00940000164137.b ENSGT00950000182985.b.b.sc ##22 ENSGT00940000157074 ENSGT00940000165651.a ENSGT00900000141164.q.a ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.b.b ENSGT00900000141164.r.a.a ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000156646.d ENSGT00390000018613.b ENSGT01100000263497.B ENSGT00390000011639.p ENSGT00390000007539.b ENSGT00390000018173 ENSGT00940000160341 ENSGT00940000161051.a.b ENSGT00940000160310.b Zebrafish DUPLICATION Zebrafish MODERN SPECIES 22 dok1b (ENSDARG00000099177) m1ap (ENSDARG00000099485) SEMA4F (ENSDARG00000100308) slx1b (ENSDARG00000098605) BOLA2 (ENSDARG00000111714) larp7 (ENSDARG00000017315) rpl34 (ENSDARG00000029500) trmt44 (ENSDARG00000033957) ENSDARG00000077645 etnppl (ENSDARG00000035544) ENSDARG00000111788 hspa12b (ENSDARG00000030307) cct7 (ENSDARG00000007385) slc8a4b (ENSDARG00000037145) plcb3 (ENSDARG00000068246) ppp1r14bb (ENSDARG00000030161) ##22 brms1 (ENSDARG00000051955) pcxb (ENSDARG00000051939) ENSDARG00000078078 NWD2 (ENSDARG00000077162) zgc:194930 (ENSDARG00000079584) rell1 (ENSDARG00000018312) rwdd (ENSDARG00000068256) ENSDARG00000059693 ENSDARG00000068258 acox3 (ENSDARG00000038865) HTRA3 (ENSDARG00000010925) ENSDARG00000077330 ENSDARG00000099586 tdrd7b (ENSDARG00000077523) plaa (ENSDARG00000042728) Zebrafish MODERN SPECIES 13 cfb (ENSDARG00000055278) slc29a2 (ENSDARG00000001767) actn3a (ENSDARG00000013755) rbm14a (ENSDARG00000012723) ENSDARG00000079095 dpp3 (ENSDARG00000020676) hif1al2 (ENSDARG00000044550) sart1 (ENSDARG00000005945) ENSDARG00000088601 ENSDARG00000078317 MARK2 (ENSDARG00000079905) zgc:77262 (ENSDARG00000044545) zgc:110782 (ENSDARG00000044544) ENSDARG00000087993 slc8a4a 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bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 13 ENSSFOG00015019042 esrra (ENSSFOG00015018994) prdx5 (ENSSFOG00015032960) bscl2 (ENSSFOG00015025423) gng3 (ENSSFOG00015027748) ENSSFOG00015032485 SART1 (ENSSFOG00015018792) ENSSFOG00015018782 ENSSFOG00015018777 MARK2 (ENSSFOG00015018688) RCOR2 (ENSSFOG00015018659) naa40 (ENSSFOG00015018622) zgc:77262 (ENSSFOG00015028830) PPP2R5B (ENSSFOG00015018534) slc8a4a (ENSSFOG00015018478) ppp1r14bb (ENSSFOG00015026465) ##22 fkbp2 (ENSSFOG00015032554) pcxa (ENSSFOG00015018392) ENSSFOG00015018435 ENSSFOG00015030399 slc3a2b (ENSSFOG00015018360) ENSSFOG00015018349 ENSSFOG00015030268 TMEM151A (ENSSFOG00015025550) ENSSFOG00015018328 ENSSFOG00015018318 tmem223 (ENSSFOG00015018309) ENSSFOG00015018304 efemp2b (ENSSFOG00015018161) NPAS4 (ENSSFOG00015031883) mrps12 (ENSSFOG00015018102) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015030613 krcp (ENSSFOG00015007827) MARK2 (ENSSFOG00015007918) rcor2 (ENSSFOG00015008097) ENSSFOG00015008154 b3gat3 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