Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000005889 #7 ENSGT00940000157274 #8 ENSGT00940000154908.q.b #9 ENSGT00940000154908.q.a.b #10 ENSGT00940000154908.q.a.a.a.a #11 ENSGT00940000154908.q.a.a.b #12 ENSGT00940000162971 ENSGT00940000160584 #14 ENSGT00390000003175.a.a #15 ENSGT00390000000628 #16 ENSGT00940000157409 #17 ENSGT00940000157412.b #18 ENSGT00530000064017.a #19 ENSGT00940000157186 #20 ENSGT00390000015375 #21 ENSGT00390000004495 #22 ENSGT00940000154078.a.a #23 ENSGT00950000183002.C #24 ENSGT00990000203892 ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #25 ENSGT00530000063555.B #26 ENSGT00940000158698 #27 ENSGT00940000161756 #28 ENSGT00940000159672 #29 ENSGT00940000158515 #30 ENSGT00390000014031 #31 ENSGT00390000005029 #32 ENSGT00940000159518 #33 ENSGT00940000158796 ENSGT00390000007726.a.a #34 ENSGT00940000157798 #35 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 13 BLOC1S2 (ENSSVLG00005011909) #7 PKD2L1 (ENSSVLG00005011378) #8 ENSSVLG00005011263 #9 ENSSVLG00005011226 #10 ENSSVLG00005011162 #11 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