Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274 #7	ENSGT00940000154908.q.b #8	ENSGT00940000154908.q.a.b #10	ENSGT00940000154908.q.a.a.a.a ##12	ENSGT00940000154908.q.a.a.b #12	ENSGT00940000162971 #13	ENSGT00940000160584 #14	ENSGT00390000003175.a.a #15	ENSGT00390000000628 #16	ENSGT00940000157409 #17	ENSGT00940000157412.b #18	ENSGT00530000064017.a #19	ENSGT00940000157186 #20	ENSGT00390000015375 #21	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a #23	ENSGT00950000183002.C #25	ENSGT00990000203892 #26	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #27	ENSGT00530000063555.B #28	ENSGT00940000158698 #29	ENSGT00940000161756 #30	ENSGT00940000159672 #31	ENSGT00940000158515 #32	ENSGT00390000014031 #33	ENSGT00390000005029 #34	ENSGT00940000159518 #35	ENSGT00940000158796 #36	ENSGT00390000007726.a.a #37	ENSGT00940000157798
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157274 #7	ENSGT00940000154908.q.b #8	ENSGT01030000234637.a.b.b.j.a #9	ENSGT00940000154908.q.a.b #10	ENSGT00940000154908.q.a.a.a.a ##12	ENSGT00940000154908.q.a.a.b #12	ENSGT00940000162971 #13	ENSGT00940000160584 #14	ENSGT00390000003175.a.a #15	ENSGT00390000000628 #16	ENSGT00940000157409 #17	ENSGT00940000157412.b #18	ENSGT00530000064017.a #19	ENSGT00940000157186 #20	ENSGT00390000015375 #21	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a #23	ENSGT00950000183002.C #25	ENSGT00990000203892 #26	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #27	ENSGT00530000063555.B #28	ENSGT00940000158698 #29	ENSGT00940000161756 #30	ENSGT00940000159672 #31	ENSGT00940000158515 #32	ENSGT00390000014031 #33	ENSGT00390000005029 #34	ENSGT00940000159518 #35	ENSGT00940000158796 #36	ENSGT00390000007726.a.a #37	ENSGT00940000157798
Alpin marmot	MODERN SPECIES	39	PKD2L1 (ENSMMMG00000022963) #7	ENSMMMG00000022972 #8	ENSMMMG00000022981 #9	ENSMMMG00000022983 #10	ENSMMMG00000022991 #11	ENSMMMG00000023014 #12	ENSMMMG00000023019 #13	WNT8B (ENSMMMG00000023029) #14	SEC31B (ENSMMMG00000023033) #15	NDUFB8 (ENSMMMG00000023049) #16	HIF1AN (ENSMMMG00000023051) #17	PAX2 (ENSMMMG00000023055) #18	SLF2 (ENSMMMG00000023066) #19	SEMA4G (ENSMMMG00000023078) #20	MRPL43 (ENSMMMG00000023087) #21	TWNK (ENSMMMG00000023092) #22	ENSMMMG00000023095 #23	ENSMMMG00000023099 #24	ENSMMMG00000023144 #25	ENSMMMG00000023146 #26	SFXN3 (ENSMMMG00000023149) #27	KAZALD1 (ENSMMMG00000023167) #28	ENSMMMG00000023172 #29	LBX1 (ENSMMMG00000023177) #30	BTRC (ENSMMMG00000023182) #31	POLL (ENSMMMG00000023200) #32	DPCD (ENSMMMG00000023210) #33	FBXW4 (ENSMMMG00000023212) #34	FGF8 (ENSMMMG00000023215) #35	NPM3 (ENSMMMG00000023217) #36	OGA (ENSMMMG00000023220) #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	76			ENSGT01030000234637.a.b.b.j.a #9	ENSGT00940000154908.q.a.b #10	ENSGT00940000154908.q.a.a.a.a ##12	ENSGT00940000154908.q.a.a.b #12	ENSGT00940000154908.q.a.a.a.b ##12	ENSGT00940000160584 #14	ENSGT00390000003175.a.a #15	ENSGT00390000000628 #16	ENSGT00940000157409.e #17	ENSGT00940000157412.b #18	ENSGT00530000064017.a #19	ENSGT00940000157186 #20	ENSGT00390000015375 #21	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a #23	ENSGT00950000183002.C #25	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #27	ENSGT00530000063555.B #28	ENSGT00940000158698 #29	ENSGT00940000161756 #30	ENSGT00940000159672 #31	ENSGT00940000158515 #32	ENSGT00390000014031 #33	ENSGT00390000005029 #34	ENSGT00940000159518 #35	ENSGT00940000158796 #36	ENSGT00390000007726.a.a #37	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554
Squirrel	MODERN SPECIES	200			ENSSTOG00000022328 #9	ENSSTOG00000004270 #10	ENSSTOG00000012740 ##12	ENSSTOG00000012666 #12	ENSSTOG00000005853 ##12	WNT8B (ENSSTOG00000022425) #14	SEC31B (ENSSTOG00000009253) #15	NDUFB8 (ENSSTOG00000020727) #16	ENSSTOG00000009302 #17	PAX2 (ENSSTOG00000011575) #18	SLF2 (ENSSTOG00000008951) #19	SEMA4G (ENSSTOG00000008994) #20	MRPL43 (ENSSTOG00000009016) #21	TWNK (ENSSTOG00000009030) #22	LZTS2 (ENSSTOG00000015232) #23	PDZD7 (ENSSTOG00000009046) #25	SFXN3 (ENSSTOG00000026614) #27	KAZALD1 (ENSSTOG00000015240) #28	ENSSTOG00000023842 #29	LBX1 (ENSSTOG00000006491) #30	BTRC (ENSSTOG00000022481) #31	POLL (ENSSTOG00000011485) #32	DPCD (ENSSTOG00000011490) #33	FBXW4 (ENSSTOG00000011495) #34	FGF8 (ENSSTOG00000023351) #35	NPM3 (ENSSTOG00000022621) #36	ENSSTOG00000032901 #37	KCNIP2 (ENSSTOG00000021030)	ARMH3 (ENSSTOG00000015633)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	373				ENSUPAG00010010788 ##9	ENSUPAG00010010779 #10	ENSUPAG00010010770 #12	ENSUPAG00010010744 ##12	WNT8B (ENSUPAG00010010727) #14	SEC31B (ENSUPAG00010010697) #15	NDUFB8 (ENSUPAG00010010693) #16	ENSUPAG00010010677 #17	PAX2 (ENSUPAG00010010652) #18	SLF2 (ENSUPAG00010010631) #19	SEMA4G (ENSUPAG00010010602) #20	MRPL43 (ENSUPAG00010010598) #21	TWNK (ENSUPAG00010010588) #22	LZTS2 (ENSUPAG00010010572) #23	ENSUPAG00010010561 #25	ENSUPAG00010010444 #25	SFXN3 (ENSUPAG00010010359) #27	KAZALD1 (ENSUPAG00010010340) #28	TLX1 (ENSUPAG00010010336) #29	LBX1 (ENSUPAG00010010328) #30	ENSUPAG00010010321	BTRC (ENSUPAG00010010245) #31	POLL (ENSUPAG00010010241) #32	DPCD (ENSUPAG00010010220) #33	FBXW4 (ENSUPAG00010010202) #34	FGF8 (ENSUPAG00010010083) #35	NPM3 (ENSUPAG00010010073) #36	OGA (ENSUPAG00010010052) #37
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	13	BLOC1S2 (ENSSVLG00005011909)	PKD2L1 (ENSSVLG00005011378) #7	ENSSVLG00005011263 #8	ENSSVLG00005011226 #10	ENSSVLG00005011162 ##12	ENSSVLG00005011001 #12	ENSSVLG00005010906 ##12	WNT8B (ENSSVLG00005010847) #14	SEC31B (ENSSVLG00005010799) #15	ENSSVLG00005005940 #16	HIF1AN (ENSSVLG00005005917) #17	PAX2 (ENSSVLG00005005719) #18	SLF2 (ENSSVLG00005005553) #19	SEMA4G (ENSSVLG00005005503) #20	MRPL43 (ENSSVLG00005005460) #21	TWNK (ENSSVLG00005005412) #22	LZTS2 (ENSSVLG00005005380) #23	PDZD7 (ENSSVLG00005005347) #25	SFXN3 (ENSSVLG00005005315) #27	KAZALD1 (ENSSVLG00005005289) #28	TLX1 (ENSSVLG00005005266) #29	LBX1 (ENSSVLG00005005245) #30	BTRC (ENSSVLG00005005205) #31	POLL (ENSSVLG00005005135) #32	DPCD (ENSSVLG00005005104) #33	FBXW4 (ENSSVLG00005005056) #34	FGF8 (ENSSVLG00005005038) #35	OGA (ENSSVLG00005004824) #37	KCNIP2 (ENSSVLG00005004570)	ARMH3 (ENSSVLG00005004399)	HPS6 (ENSSVLG00005004366)