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Primates	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000163402	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Tarsier	MODERN SPECIES	2343															SEMA4G (ENSTSYG00000028089) #21	TWNK (ENSTSYG00000026887) #22
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00910000147806	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.j	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00910000147806	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.j	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00910000147806	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029.c	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Gorilla	MODERN SPECIES	1	CPN1 (ENSGGOG00000014771)	ERLIN1 (ENSGGOG00000010561)	ENSGGOG00000008996	ENSGGOG00000005525	BLOC1S2 (ENSGGOG00000025362)	PKD2L1 (ENSGGOG00000001841)	SCD (ENSGGOG00000001098)	WNT8B (ENSGGOG00000014634)	SEC31B (ENSGGOG00000014643)	NDUFB8 (ENSGGOG00000027239)	HIF1AN (ENSGGOG00000004308)	ENSGGOG00000014908	SLF2 (ENSGGOG00000002070)	SEMA4G (ENSGGOG00000025153) #21	ENSGGOG00000023716	TWNK (ENSGGOG00000015421) #22	LZTS2 (ENSGGOG00000015430)	PDZD7 (ENSGGOG00000015436)	SFXN3 (ENSGGOG00000015442)	KAZALD1 (ENSGGOG00000004516)	TLX1 (ENSGGOG00000005880)	LBX1 (ENSGGOG00000012521)	BTRC (ENSGGOG00000005023)	ENSGGOG00000038754	POLL (ENSGGOG00000005029)	DPCD (ENSGGOG00000005035)	ENSGGOG00000005039	FGF8 (ENSGGOG00000015108)	NPM3 (ENSGGOG00000027500)	OGA (ENSGGOG00000002901)	KCNIP2 (ENSGGOG00000006534)
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.j	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029.c	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554
Pan	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.j	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029.c	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554
Chimpanzee	MODERN SPECIES	1	CPN1 (ENSPTRG00000045585)	ERLIN1 (ENSPTRG00000002841)	CHUK (ENSPTRG00000033948)	CWF19L1 (ENSPTRG00000002843)	BLOC1S2 (ENSPTRG00000038697)	PKD2L1 (ENSPTRG00000002845)	SCD (ENSPTRG00000002847)	WNT8B (ENSPTRG00000002849)	SEC31B (ENSPTRG00000002850)	NDUFB8 (ENSPTRG00000002851)	HIF1AN (ENSPTRG00000002852)	PAX2 (ENSPTRG00000002853)	SLF2 (ENSPTRG00000002855)	SEMA4G (ENSPTRG00000052672) #21	MRPL43 (ENSPTRG00000002858)	TWNK (ENSPTRG00000029751) #22	LZTS2 (ENSPTRG00000042870)	PDZD7 (ENSPTRG00000002862)	SFXN3 (ENSPTRG00000002864)	KAZALD1 (ENSPTRG00000002865)	TLX1 (ENSPTRG00000002867)	LBX1 (ENSPTRG00000002868)	BTRC (ENSPTRG00000002869)	POLL (ENSPTRG00000002870)	DPCD (ENSPTRG00000002871)	FBXW4 (ENSPTRG00000048959)	FGF8 (ENSPTRG00000002874)	NPM3 (ENSPTRG00000002875)	OGA (ENSPTRG00000002876)	KCNIP2 (ENSPTRG00000002878)	ARMH3 (ENSPTRG00000002879)
Bonobo	MODERN SPECIES	1	CPN1 (ENSPPAG00000043340)	ERLIN1 (ENSPPAG00000035564)	CHUK (ENSPPAG00000037851)	CWF19L1 (ENSPPAG00000031948)	BLOC1S2 (ENSPPAG00000043419)	PKD2L1 (ENSPPAG00000027774)	SCD (ENSPPAG00000029861)	WNT8B (ENSPPAG00000039871)	SEC31B (ENSPPAG00000035674)	NDUFB8 (ENSPPAG00000025513)	HIF1AN (ENSPPAG00000035861)	ENSPPAG00000004195	SLF2 (ENSPPAG00000040627)	SEMA4G (ENSPPAG00000039460) #21	ENSPPAG00000042828	TWNK (ENSPPAG00000035055) #22	LZTS2 (ENSPPAG00000003235)	PDZD7 (ENSPPAG00000036974)	SFXN3 (ENSPPAG00000029879)	KAZALD1 (ENSPPAG00000029890)	TLX1 (ENSPPAG00000040366)	BTRC (ENSPPAG00000034237)	POLL (ENSPPAG00000036999)	DPCD (ENSPPAG00000038194)	ENSPPAG00000025691	FGF8 (ENSPPAG00000039985)	NPM3 (ENSPPAG00000040517)	OGA (ENSPPAG00000030424)	KCNIP2 (ENSPPAG00000029455)	ARMH3 (ENSPPAG00000040734)	HPS6 (ENSPPAG00000011993)
Human	MODERN SPECIES	1	CPN1 (ENSG00000120054)	ERLIN1 (ENSG00000107566)	CHUK (ENSG00000213341)	CWF19L1 (ENSG00000095485)	BLOC1S2 (ENSG00000196072)	PKD2L1 (ENSG00000107593)	SCD (ENSG00000099194)	WNT8B (ENSG00000075290)	SEC31B (ENSG00000075826)	NDUFB8 (ENSG00000166136)	HIF1AN (ENSG00000166135)	PAX2 (ENSG00000075891)	SLF2 (ENSG00000119906)	MRPL43 (ENSG00000055950)	SEMA4G (ENSG00000095539) #21	TWNK (ENSG00000107815) #22	LZTS2 (ENSG00000107816)	PDZD7 (ENSG00000186862)	SFXN3 (ENSG00000107819)	KAZALD1 (ENSG00000107821)	TLX1 (ENSG00000107807)	LBX1 (ENSG00000138136)	BTRC (ENSG00000166167)	DPCD (ENSG00000166171)	POLL (ENSG00000166169)	FBXW4 (ENSG00000107829)	FGF8 (ENSG00000107831)	NPM3 (ENSG00000107833)	OGA (ENSG00000198408)	KCNIP2 (ENSG00000120049)	ARMH3 (ENSG00000120029)
Orangutan	MODERN SPECIES	1	CPN1 (ENSPPYG00000029420)	ERLIN1 (ENSPPYG00000002560)	CHUK (ENSPPYG00000002562)	CWF19L1 (ENSPPYG00000002563)	BLOC1S2 (ENSPPYG00000033265)	PKD2L1 (ENSPPYG00000002565)	SCD (ENSPPYG00000002566)	WNT8B (ENSPPYG00000002568)	SEC31B (ENSPPYG00000002569)	NDUFB8 (ENSPPYG00000002570)	HIF1AN (ENSPPYG00000002571)	ENSPPYG00000002572	SLF2 (ENSPPYG00000002573)	SEMA4G (ENSPPYG00000002574) #21	ENSPPYG00000002575	TWNK (ENSPPYG00000002576) #22	LZTS2 (ENSPPYG00000002577)	PDZD7 (ENSPPYG00000002578)	SFXN3 (ENSPPYG00000002579)	KAZALD1 (ENSPPYG00000002580)	TLX1 (ENSPPYG00000002581)	LBX1 (ENSPPYG00000002582)	BTRC (ENSPPYG00000002583)	POLL (ENSPPYG00000002584)	DPCD (ENSPPYG00000002585)	FBXW4 (ENSPPYG00000002586)	ENSPPYG00000002587	FGF8 (ENSPPYG00000002588)	NPM3 (ENSPPYG00000002589)	OGA (ENSPPYG00000002590)	KCNIP2 (ENSPPYG00000002591)
Gibbon	MODERN SPECIES	18	CPN1 (ENSNLEG00000014719)	ERLIN1 (ENSNLEG00000014724)	CHUK (ENSNLEG00000014739)	CWF19L1 (ENSNLEG00000014744)	ENSNLEG00000033207	PKD2L1 (ENSNLEG00000014748)	SCD (ENSNLEG00000014754)	WNT8B (ENSNLEG00000014764)	SEC31B (ENSNLEG00000014765)	ENSNLEG00000029318	HIF1AN (ENSNLEG00000014784)	ENSNLEG00000014786	SLF2 (ENSNLEG00000014791)	SEMA4G (ENSNLEG00000014804) #21	ENSNLEG00000014812	TWNK (ENSNLEG00000014818) #22	LZTS2 (ENSNLEG00000014822)	PDZD7 (ENSNLEG00000014823)	SFXN3 (ENSNLEG00000014831)	KAZALD1 (ENSNLEG00000035599)	TLX1 (ENSNLEG00000029481)	LBX1 (ENSNLEG00000014840)	ENSNLEG00000028284	BTRC (ENSNLEG00000014843)	POLL (ENSNLEG00000014861)	DPCD (ENSNLEG00000014878)	ENSNLEG00000014885	FGF8 (ENSNLEG00000014890)	ENSNLEG00000029281	OGA (ENSNLEG00000014902)	ENSNLEG00000014924
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.g	ENSGT00910000147853	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.g	ENSGT00910000147853	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000.o.a	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.g	ENSGT00910000147853	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000.o.a	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.g	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Olive baboon	MODERN SPECIES	2	ENSPANG00000021205	BLOC1S2 (ENSPANG00000041274)	PKD2L1 (ENSPANG00000021208)	SCD (ENSPANG00000050775)	ENSPANG00000044002	ENSPANG00000047364	ENSPANG00000048712	WNT8B (ENSPANG00000021165)	SEC31B (ENSPANG00000021167)	ENSPANG00000021170	HIF1AN (ENSPANG00000021163)	PAX2 (ENSPANG00000021132)	SLF2 (ENSPANG00000021133)	SEMA4G (ENSPANG00000021137) #21	MRPL43 (ENSPANG00000021122)	TWNK (ENSPANG00000021123) #22	LZTS2 (ENSPANG00000021126)	PDZD7 (ENSPANG00000021127)	SFXN3 (ENSPANG00000021121)	KAZALD1 (ENSPANG00000021061)	TLX1 (ENSPANG00000021063)	ENSPANG00000040129	LBX1 (ENSPANG00000021064)	ENSPANG00000045293	BTRC (ENSPANG00000021065)	POLL (ENSPANG00000021067)	DPCD (ENSPANG00000021068)	FBXW4 (ENSPANG00000021059)	FGF8 (ENSPANG00000021045)	NPM3 (ENSPANG00000021046)	OGA (ENSPANG00000021048)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000.o.a	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.g	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Drill	MODERN SPECIES	660	ERLIN1 (ENSMLEG00000029926)	CHUK (ENSMLEG00000035776)	CWF19L1 (ENSMLEG00000036355)	BLOC1S2 (ENSMLEG00000044004)	PKD2L1 (ENSMLEG00000033807)	ENSMLEG00000038669	WNT8B (ENSMLEG00000032662)	SEC31B (ENSMLEG00000039004)	NDUFB8 (ENSMLEG00000030934)	HIF1AN (ENSMLEG00000042618)	PAX2 (ENSMLEG00000038896)	SLF2 (ENSMLEG00000043602)	SEMA4G (ENSMLEG00000032692) #21	MRPL43 (ENSMLEG00000031351)	PDIA2 (ENSMLEG00000027539)	TWNK (ENSMLEG00000028857) #22	LZTS2 (ENSMLEG00000043006)	PDZD7 (ENSMLEG00000044282)	ENSMLEG00000018361	SFXN3 (ENSMLEG00000041643)	KAZALD1 (ENSMLEG00000041241)	TLX1 (ENSMLEG00000036491)	LBX1 (ENSMLEG00000038173)	BTRC (ENSMLEG00000037020)	POLL (ENSMLEG00000044464)	DPCD (ENSMLEG00000036892)	FBXW4 (ENSMLEG00000039840)	FGF8 (ENSMLEG00000038840)	NPM3 (ENSMLEG00000038129)	OGA (ENSMLEG00000034257)	KCNIP2 (ENSMLEG00000040604)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	598	CPN1 (ENSCATG00000040918)	ERLIN1 (ENSCATG00000034416)	CHUK (ENSCATG00000043885)	ENSCATG00000043079	BLOC1S2 (ENSCATG00000033676)	PKD2L1 (ENSCATG00000037422)	ENSCATG00000034068	WNT8B (ENSCATG00000037399)	SEC31B (ENSCATG00000025009)	ENSCATG00000012416	HIF1AN (ENSCATG00000013935)	PAX2 (ENSCATG00000040463)	SLF2 (ENSCATG00000009305)	SEMA4G (ENSCATG00000040594) #21	MRPL43 (ENSCATG00000045001)	TWNK (ENSCATG00000031735) #22	LZTS2 (ENSCATG00000035009)	PDZD7 (ENSCATG00000041708)	ENSCATG00000013628	SFXN3 (ENSCATG00000031461)	KAZALD1 (ENSCATG00000012292)	TLX1 (ENSCATG00000027146)	LBX1 (ENSCATG00000015241)	BTRC (ENSCATG00000041687)	POLL (ENSCATG00000030579)	DPCD (ENSCATG00000015600)	FBXW4 (ENSCATG00000042023)	FGF8 (ENSCATG00000032104)	NPM3 (ENSCATG00000013755)	OGA (ENSCATG00000032677)	KCNIP2 (ENSCATG00000037631)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156000.o.a	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.g	ENSGT00910000147853	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a.a.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00390000014818.g.b.a.b	ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.d	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a.m	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000.o.a	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.g	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a.a.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00390000014818.g.b.a.b	ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.d	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a.m	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554
Rhesus	MODERN SPECIES	19	CWF19L1 (ENSMMUG00000018472)	ENSMMUG00000010827	PKD2L1 (ENSMMUG00000010818)	SCD (ENSMMUG00000058462)	ENSMMUG00000049674	WNT8B (ENSMMUG00000006621)	SEC31B (ENSMMUG00000006622)	NDUFB8 (ENSMMUG00000006636)	HIF1AN (ENSMMUG00000006637)	ENSMMUG00000030563	ENSMMUG00000040838	PAX2 (ENSMMUG00000009163)	SLF2 (ENSMMUG00000013418)	SEMA4G (ENSMMUG00000010680) #21	MRPL43 (ENSMMUG00000010679)	TWNK (ENSMMUG00000064033) #22	LZTS2 (ENSMMUG00000010674)	SFXN3 (ENSMMUG00000022620)	KAZALD1 (ENSMMUG00000017668)	TLX1 (ENSMMUG00000017667)	LBX1 (ENSMMUG00000060144)	BTRC (ENSMMUG00000006741)	POLL (ENSMMUG00000006747)	DPCD (ENSMMUG00000006751)	FBXW4 (ENSMMUG00000052198)	FGF8 (ENSMMUG00000015771)	NPM3 (ENSMMUG00000015774)	OGA (ENSMMUG00000015775)	KCNIP2 (ENSMMUG00000015776)	ARMH3 (ENSMMUG00000001539)	HPS6 (ENSMMUG00000009374)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	19	ERLIN1 (ENSMFAG00000042046)	ENSMFAG00000062447	CHUK (ENSMFAG00000000426)	ENSMFAG00000031202	PKD2L1 (ENSMFAG00000030987)	ENSMFAG00000040755	WNT8B (ENSMFAG00000035598)	SEC31B (ENSMFAG00000043520)	ENSMFAG00000040760	HIF1AN (ENSMFAG00000043376)	ENSMFAG00000004864	PAX2 (ENSMFAG00000041514)	SLF2 (ENSMFAG00000042449)	SEMA4G (ENSMFAG00000038405) #21	MRPL43 (ENSMFAG00000036954)	TWNK (ENSMFAG00000032824) #22	LZTS2 (ENSMFAG00000048904)	PDZD7 (ENSMFAG00000037794)	SFXN3 (ENSMFAG00000035501)	KAZALD1 (ENSMFAG00000063924)	TLX1 (ENSMFAG00000045878)	BTRC (ENSMFAG00000005295)	POLL (ENSMFAG00000043080)	DPCD (ENSMFAG00000036058)	FBXW4 (ENSMFAG00000044810)	FGF8 (ENSMFAG00000003751)	NPM3 (ENSMFAG00000041878)	OGA (ENSMFAG00000032188)	KCNIP2 (ENSMFAG00000046056)	ARMH3 (ENSMFAG00000044833)	ENSMFAG00000051632
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	550	ENSMNEG00000037598	BLOC1S2 (ENSMNEG00000034276)	PKD2L1 (ENSMNEG00000030013)	ENSMNEG00000041175	ENSMNEG00000009061	WNT8B (ENSMNEG00000026350)	SEC31B (ENSMNEG00000032578)	NDUFB8 (ENSMNEG00000021604)	HIF1AN (ENSMNEG00000036352)	ENSMNEG00000013689	ENSMNEG00000044180	PAX2 (ENSMNEG00000045259)	SLF2 (ENSMNEG00000042692)	SEMA4G (ENSMNEG00000029411) #21	MRPL43 (ENSMNEG00000038269)	TWNK (ENSMNEG00000041560) #22	LZTS2 (ENSMNEG00000022148)	ENSMNEG00000000753	PDZD7 (ENSMNEG00000036573)	SFXN3 (ENSMNEG00000041774)	KAZALD1 (ENSMNEG00000041154)	TLX1 (ENSMNEG00000039702)	LBX1 (ENSMNEG00000003768)	BTRC (ENSMNEG00000043926)	POLL (ENSMNEG00000032214)	ENSMNEG00000041174	DPCD (ENSMNEG00000039583)	FBXW4 (ENSMNEG00000007347)	FGF8 (ENSMNEG00000044546)	NPM3 (ENSMNEG00000039999)	OGA (ENSMNEG00000042719)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	28	ERLIN1 (ENSCSAG00000005667)	CHUK (ENSCSAG00000005664)	CWF19L1 (ENSCSAG00000005656)	ENSCSAG00000018449	BLOC1S2 (ENSCSAG00000005639)	PKD2L1 (ENSCSAG00000005629)	SCD (ENSCSAG00000005611)	WNT8B (ENSCSAG00000005607)	SEC31B (ENSCSAG00000005583)	NDUFB8 (ENSCSAG00000005572)	HIF1AN (ENSCSAG00000005570)	PAX2 (ENSCSAG00000005568)	SLF2 (ENSCSAG00000005566)	SEMA4G (ENSCSAG00000005560) #21	MRPL43 (ENSCSAG00000005558)	TWNK (ENSCSAG00000005548) #22	LZTS2 (ENSCSAG00000005545)	ENSCSAG00000005544	SFXN3 (ENSCSAG00000005542)	KAZALD1 (ENSCSAG00000005540)	TLX1 (ENSCSAG00000005535)	LBX1 (ENSCSAG00000005532)	BTRC (ENSCSAG00000005528)	POLL (ENSCSAG00000005523)	DPCD (ENSCSAG00000005519)	FBXW4 (ENSCSAG00000005515)	FGF8 (ENSCSAG00000005512)	NPM3 (ENSCSAG00000005509)	OGA (ENSCSAG00000005507)	KCNIP2 (ENSCSAG00000005501)	ARMH3 (ENSCSAG00000005491)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.g	ENSGT00910000147853	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.w.a	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1538													SLF2 (ENSRBIG00000027825)	SEMA4G (ENSRBIG00000025014) #21	MRPL43 (ENSRBIG00000029374)	TWNK (ENSRBIG00000042725) #22	LZTS2 (ENSRBIG00000030156)	ENSRBIG00000006061	PDZD7 (ENSRBIG00000030466)	SFXN3 (ENSRBIG00000033345)	KAZALD1 (ENSRBIG00000029657)	TLX1 (ENSRBIG00000028309)	LBX1 (ENSRBIG00000043576)	BTRC (ENSRBIG00000000373)	POLL (ENSRBIG00000034819)	ENSRBIG00000025168	DPCD (ENSRBIG00000029630)	FBXW4 (ENSRBIG00000029703)	FGF8 (ENSRBIG00000038141)	NPM3 (ENSRBIG00000039086)	OGA (ENSRBIG00000042557)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	3053	ERLIN1 (ENSRROG00000042519)	CHUK (ENSRROG00000042382)	CWF19L1 (ENSRROG00000043660)	BLOC1S2 (ENSRROG00000044178)	PKD2L1 (ENSRROG00000041606)	ENSRROG00000039965	ENSRROG00000036106	WNT8B (ENSRROG00000034714)	SEC31B (ENSRROG00000036499)	NDUFB8 (ENSRROG00000043538)	HIF1AN (ENSRROG00000035456)	PAX2 (ENSRROG00000036335)	SLF2 (ENSRROG00000032382)	SEMA4G (ENSRROG00000029089) #21	MRPL43 (ENSRROG00000036241)	TWNK (ENSRROG00000034001) #22	LZTS2 (ENSRROG00000044508)	PDZD7 (ENSRROG00000042033)	SFXN3 (ENSRROG00000042473)	KAZALD1 (ENSRROG00000028521)	TLX1 (ENSRROG00000044869)	LBX1 (ENSRROG00000044455)	BTRC (ENSRROG00000030265)	POLL (ENSRROG00000032669)	DPCD (ENSRROG00000044275)	ENSRROG00000023920	FBXW4 (ENSRROG00000038393)	FGF8 (ENSRROG00000038994)	NPM3 (ENSRROG00000029912)	OGA (ENSRROG00000045455)	KCNIP2 (ENSRROG00000029744)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.e	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.y	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796.g.b	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.e	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.y	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796.g.b	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158235	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.e	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628.y	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796.g.b	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Capuchin	MODERN SPECIES	71	ERLIN1 (ENSCCAG00000036463)	CHUK (ENSCCAG00000033466)	CWF19L1 (ENSCCAG00000031321)	ENSCCAG00000027065	PKD2L1 (ENSCCAG00000033020)	SCD (ENSCCAG00000031776)	WNT8B (ENSCCAG00000027693)	ENSCCAG00000030710	SEC31B (ENSCCAG00000025377)	ENSCCAG00000013965	HIF1AN (ENSCCAG00000028582)	PAX2 (ENSCCAG00000035623)	SLF2 (ENSCCAG00000016220)	SEMA4G (ENSCCAG00000036740) #21	MRPL43 (ENSCCAG00000027213)	TWNK (ENSCCAG00000022331) #22	LZTS2 (ENSCCAG00000028122)	ENSCCAG00000031185	PDZD7 (ENSCCAG00000027027)	SFXN3 (ENSCCAG00000027543)	KAZALD1 (ENSCCAG00000025698)	TLX1 (ENSCCAG00000022529)	ENSCCAG00000018927	LBX1 (ENSCCAG00000027225)	TYROBP (ENSCCAG00000030200)	BTRC (ENSCCAG00000028586)	POLL (ENSCCAG00000021549)	DPCD (ENSCCAG00000031078)	FBXW4 (ENSCCAG00000015377)	FGF8 (ENSCCAG00000028398)	ENSCCAG00000031043
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	47	CWF19L1 (ENSSBOG00000027396)	BLOC1S2 (ENSSBOG00000020521)	ENSSBOG00000026797	PKD2L1 (ENSSBOG00000033363)	SCD (ENSSBOG00000032833)	WNT8B (ENSSBOG00000022114)	SEC31B (ENSSBOG00000023347)	NDUFB8 (ENSSBOG00000032796)	HIF1AN (ENSSBOG00000023430)	ENSSBOG00000018963	PAX2 (ENSSBOG00000030216)	ENSSBOG00000036188	SLF2 (ENSSBOG00000034063)	SEMA4G (ENSSBOG00000026805) #21	MRPL43 (ENSSBOG00000022294)	TWNK (ENSSBOG00000020346) #22	LZTS2 (ENSSBOG00000032084)	PDZD7 (ENSSBOG00000035647)	SFXN3 (ENSSBOG00000032559)	KAZALD1 (ENSSBOG00000032715)	ENSSBOG00000030742	LBX1 (ENSSBOG00000026504)	BTRC (ENSSBOG00000034480)	POLL (ENSSBOG00000035823)	DPCD (ENSSBOG00000024659)	FBXW4 (ENSSBOG00000036214)	ENSSBOG00000026520	FGF8 (ENSSBOG00000026891)	NPM3 (ENSSBOG00000027661)	OGA (ENSSBOG00000024431)	KCNIP2 (ENSSBOG00000029268)
Marmoset	DUPLICATION
Marmoset	MODERN SPECIES	3	CWF19L1 (ENSCJAG00000017176)	BLOC1S2 (ENSCJAG00000017269)	PKD2L1 (ENSCJAG00000042503)	ENSCJAG00000045682	WNT8B (ENSCJAG00000046770)	ENSCJAG00000081845	SEC31B (ENSCJAG00000017347)	NDUFB8 (ENSCJAG00000037906)	HIF1AN (ENSCJAG00000041066)	ENSCJAG00000023350	PAX2 (ENSCJAG00000017397)	SLF2 (ENSCJAG00000017425)	SEMA4G (ENSCJAG00000070347) #21	ENSCJAG00000017480	ENSCJAG00000062174	ENSCJAG00000017487 #22	ENSCJAG00000078679 #22	LZTS2 (ENSCJAG00000041968)	PDZD7 (ENSCJAG00000017518)	SFXN3 (ENSCJAG00000017527)	KAZALD1 (ENSCJAG00000017554)	TLX1 (ENSCJAG00000017563)	ENSCJAG00000087194	LBX1 (ENSCJAG00000017569)	BTRC (ENSCJAG00000017573)	POLL (ENSCJAG00000017600)	DPCD (ENSCJAG00000017614)	FBXW4 (ENSCJAG00000017627)	FGF8 (ENSCJAG00000084172)	NPM3 (ENSCJAG00000017650)	OGA (ENSCJAG00000017657)
Marmoset	MODERN SPECIES	3	BLOC1S2 (ENSCJAG00000017269)	PKD2L1 (ENSCJAG00000042503)	ENSCJAG00000045682	WNT8B (ENSCJAG00000046770)	ENSCJAG00000081845	SEC31B (ENSCJAG00000017347)	NDUFB8 (ENSCJAG00000037906)	HIF1AN (ENSCJAG00000041066)	ENSCJAG00000023350	PAX2 (ENSCJAG00000017397)	SLF2 (ENSCJAG00000017425)	SEMA4G (ENSCJAG00000070347) #21	ENSCJAG00000017480	ENSCJAG00000062174	ENSCJAG00000017487 #22	ENSCJAG00000078679 #22	LZTS2 (ENSCJAG00000041968)	PDZD7 (ENSCJAG00000017518)	SFXN3 (ENSCJAG00000017527)	KAZALD1 (ENSCJAG00000017554)	TLX1 (ENSCJAG00000017563)	ENSCJAG00000087194	LBX1 (ENSCJAG00000017569)	BTRC (ENSCJAG00000017573)	POLL (ENSCJAG00000017600)	DPCD (ENSCJAG00000017614)	FBXW4 (ENSCJAG00000017627)	FGF8 (ENSCJAG00000084172)	NPM3 (ENSCJAG00000017650)	OGA (ENSCJAG00000017657)	KCNIP2 (ENSCJAG00000017676)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	658	ERLIN1 (ENSANAG00000022217)	CHUK (ENSANAG00000038072)	CWF19L1 (ENSANAG00000023190)	BLOC1S2 (ENSANAG00000020045)	PKD2L1 (ENSANAG00000034186)	ENSANAG00000004992	ENSANAG00000015086	WNT8B (ENSANAG00000029984)	SEC31B (ENSANAG00000034066)	ENSANAG00000019864	HIF1AN (ENSANAG00000035704)	PAX2 (ENSANAG00000008318)	SLF2 (ENSANAG00000031592)	SEMA4G (ENSANAG00000030905) #21	MRPL43 (ENSANAG00000034938)	TWNK (ENSANAG00000022264) #22	LZTS2 (ENSANAG00000012310)	PDZD7 (ENSANAG00000023929)	ENSANAG00000021408	SFXN3 (ENSANAG00000035635)	KAZALD1 (ENSANAG00000020414)	TLX1 (ENSANAG00000027104)	LBX1 (ENSANAG00000036814)	BTRC (ENSANAG00000035347)	POLL (ENSANAG00000021199)	DPCD (ENSANAG00000036663)	FBXW4 (ENSANAG00000034872)	FGF8 (ENSANAG00000031951)	ENSANAG00000027082	OGA (ENSANAG00000034639)	KCNIP2 (ENSANAG00000020362)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163402	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163402	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Mouse lemur	MODERN SPECIES	6	CYP2C23 (ENSMICG00000045388)	ERLIN1 (ENSMICG00000038590)	ENSMICG00000036445	CWF19L1 (ENSMICG00000034162)	BLOC1S2 (ENSMICG00000046700)	PKD2L1 (ENSMICG00000015366)	SCD (ENSMICG00000044298)	WNT8B (ENSMICG00000001314)	SEC31B (ENSMICG00000044332)	NDUFB8 (ENSMICG00000001341)	HIF1AN (ENSMICG00000001348)	PAX2 (ENSMICG00000001357)	SLF2 (ENSMICG00000001371)	SEMA4G (ENSMICG00000030739) #21	ENSMICG00000000014	TWNK (ENSMICG00000045106) #22	LZTS2 (ENSMICG00000000016)	PDZD7 (ENSMICG00000000017)	SFXN3 (ENSMICG00000000018)	KAZALD1 (ENSMICG00000042680)	TLX1 (ENSMICG00000000020)	LBX1 (ENSMICG00000042752)	BTRC (ENSMICG00000007365)	ENSMICG00000032738	POLL (ENSMICG00000044578)	DPCD (ENSMICG00000007381)	FBXW4 (ENSMICG00000030032)	FGF8 (ENSMICG00000011733)	NPM3 (ENSMICG00000044119)	OGA (ENSMICG00000011745)	KCNIP2 (ENSMICG00000011754)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000163402	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	870	CPN1 (ENSPCOG00000020726)	ERLIN1 (ENSPCOG00000018487)	CHUK (ENSPCOG00000027527)	CWF19L1 (ENSPCOG00000019363)	BLOC1S2 (ENSPCOG00000024329)	PKD2L1 (ENSPCOG00000001148)	SCD (ENSPCOG00000026946)	WNT8B (ENSPCOG00000027043)	SEC31B (ENSPCOG00000023825)	NDUFB8 (ENSPCOG00000014141)	HIF1AN (ENSPCOG00000018877)	PAX2 (ENSPCOG00000019488)	SLF2 (ENSPCOG00000025314)	SEMA4G (ENSPCOG00000023281) #21	MRPL43 (ENSPCOG00000027271)	TWNK (ENSPCOG00000014623) #22	LZTS2 (ENSPCOG00000023474)	PDZD7 (ENSPCOG00000026114)	SFXN3 (ENSPCOG00000025511)	KAZALD1 (ENSPCOG00000016724)	TLX1 (ENSPCOG00000000103)	LBX1 (ENSPCOG00000019643)	BTRC (ENSPCOG00000020549)	ENSPCOG00000010924	ENSPCOG00000026908	POLL (ENSPCOG00000019314)	DPCD (ENSPCOG00000017781)	FBXW4 (ENSPCOG00000021206)	FGF8 (ENSPCOG00000017981)	NPM3 (ENSPCOG00000014704)	OGA (ENSPCOG00000014940)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	375							WNT8B (ENSPSMG00000008886)	SEC31B (ENSPSMG00000008962)	NDUFB8 (ENSPSMG00000009009)	HIF1AN (ENSPSMG00000009028)	PAX2 (ENSPSMG00000009108)	ENSPSMG00000009133	SLF2 (ENSPSMG00000009144)	SEMA4G (ENSPSMG00000009158) #21	ENSPSMG00000009174	TWNK (ENSPSMG00000009185) #22	LZTS2 (ENSPSMG00000009191)	PDZD7 (ENSPSMG00000009272)	ENSPSMG00000009339	SFXN3 (ENSPSMG00000009356)	KAZALD1 (ENSPSMG00000009371)	TLX1 (ENSPSMG00000009380)	LBX1 (ENSPSMG00000009389)	BTRC (ENSPSMG00000009920)	POLL (ENSPSMG00000010806)	DPCD (ENSPSMG00000010850)	FBXW4 (ENSPSMG00000010859)
Bushbaby	MODERN SPECIES	136	CPN1 (ENSOGAG00000008493)	ERLIN1 (ENSOGAG00000026651)	CHUK (ENSOGAG00000013415)	CWF19L1 (ENSOGAG00000013425)	BLOC1S2 (ENSOGAG00000001395)	PKD2L1 (ENSOGAG00000013430)	SCD (ENSOGAG00000002486)	WNT8B (ENSOGAG00000029889)	SEC31B (ENSOGAG00000008885)	ENSOGAG00000030711	HIF1AN (ENSOGAG00000010425)	PAX2 (ENSOGAG00000015274)	SLF2 (ENSOGAG00000015280)	SEMA4G (ENSOGAG00000015286) #21	MRPL43 (ENSOGAG00000030715)	TWNK (ENSOGAG00000029204) #22	LZTS2 (ENSOGAG00000012873)	PDZD7 (ENSOGAG00000012875)	SFXN3 (ENSOGAG00000012881)	KAZALD1 (ENSOGAG00000011722)	TLX1 (ENSOGAG00000013614)	LBX1 (ENSOGAG00000008679)	BTRC (ENSOGAG00000014623)	POLL (ENSOGAG00000012042)	FBXW4 (ENSOGAG00000033125)	FGF8 (ENSOGAG00000024920)	NPM3 (ENSOGAG00000010001)	ENSOGAG00000010002	KCNIP2 (ENSOGAG00000010006)	ARMH3 (ENSOGAG00000010009)	HPS6 (ENSOGAG00000033543)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000163402	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Tree shrew	MODERN SPECIES	10376																TWNK (ENSTBEG00000013720) #22
Glires	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000163402	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000162971	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.s.a	ENSGT00940000162971	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.s.a	ENSGT00940000162971	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.s.a	ENSGT00940000162971.c.b	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000162971.d.a	ENSGT00940000162971.c.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000162971.c.b	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000154908.s.a	ENSGT00940000162971.c.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000162971.c.b	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000154908.s.a	ENSGT00940000162971.c.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000162971.c.b	ENSGT00940000162971.d.b	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000154908.t	ENSGT00940000162971.d.a	ENSGT00940000162971.c.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	215						ENSCGRG00001024403	Scd1 (ENSCGRG00001021096)	Wnt8b (ENSCGRG00001020386)	Sec31b (ENSCGRG00001008897)	Ndufb8 (ENSCGRG00001002142)	Hif1an (ENSCGRG00001019981)	Pax2 (ENSCGRG00001019089)	Slf2 (ENSCGRG00001014230)	Sema4g (ENSCGRG00001007429) #21	Mrpl43 (ENSCGRG00001003475)	Twnk (ENSCGRG00001000710) #22	Lzts2 (ENSCGRG00001023049)	Pdzd7 (ENSCGRG00001017672)	Sfxn3 (ENSCGRG00001015591)	Kazald1 (ENSCGRG00001000227)	Tlx1 (ENSCGRG00001021053)	Lbx1 (ENSCGRG00001017540)	Btrc (ENSCGRG00001015459)	Poll (ENSCGRG00001010513)	Dpcd (ENSCGRG00001005917)	Fbxw4 (ENSCGRG00001003996)	Fgf8 (ENSCGRG00001015246)	Npm3 (ENSCGRG00001013345)	Oga (ENSCGRG00001020553)	Kcnip2 (ENSCGRG00001019478)	Armh3 (ENSCGRG00001015570)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	617	Pkd2l1 (ENSMAUG00000017374)	Scd3 (ENSMAUG00000019555)	ENSMAUG00000018775	ENSMAUG00000016232	ENSMAUG00000019193	Scd1 (ENSMAUG00000018754)	ENSMAUG00000019461	Wnt8b (ENSMAUG00000017837)	Sec31b (ENSMAUG00000019690)	Ndufb8 (ENSMAUG00000020368)	Hif1an (ENSMAUG00000019619)	Pax2 (ENSMAUG00000015931)	Slf2 (ENSMAUG00000017620)	Sema4g (ENSMAUG00000016054) #21	Mrpl43 (ENSMAUG00000015594)	Twnk (ENSMAUG00000015403) #22	Lzts2 (ENSMAUG00000018041)	ENSMAUG00000015875	Sfxn3 (ENSMAUG00000017975)	Kazald1 (ENSMAUG00000017475)	Tlx1 (ENSMAUG00000015538)	Lbx1 (ENSMAUG00000015198)	Btrc (ENSMAUG00000016001)	Poll (ENSMAUG00000014674)	Dpcd (ENSMAUG00000017884)	ENSMAUG00000015787	ENSMAUG00000015569	Fgf8 (ENSMAUG00000016383)	Npm3 (ENSMAUG00000015218)	Oga (ENSMAUG00000015052)	Kcnip2 (ENSMAUG00000019652)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000162971.c.b	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000154908.s.a	ENSGT00940000162971.c.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES		Bloc1s2 (ENSPEMG00000015678)	Pkd2l1 (ENSPEMG00000003667)	Scd3 (ENSPEMG00000030007)	ENSPEMG00000030839	Scd2 (ENSPEMG00000025023)	Scd4 (ENSPEMG00000000969)	Scd1 (ENSPEMG00000024855)	Wnt8b (ENSPEMG00000015692)	Sec31b (ENSPEMG00000018861)	ENSPEMG00000016062	Hif1an (ENSPEMG00000014638)	Pax2 (ENSPEMG00000007884)	Slf2 (ENSPEMG00000018671)	Sema4g (ENSPEMG00000010019) #21	Mrpl43 (ENSPEMG00000001510)	Twnk (ENSPEMG00000013921) #22	Lzts2 (ENSPEMG00000013419)	Pdzd7 (ENSPEMG00000004000)	ENSPEMG00000030678	Sfxn3 (ENSPEMG00000012869)	Kazald1 (ENSPEMG00000018686)	Tlx1 (ENSPEMG00000016966)	Lbx1 (ENSPEMG00000026119)	Btrc (ENSPEMG00000014260)	Poll (ENSPEMG00000006876)	Dpcd (ENSPEMG00000014479)	Fbxw4 (ENSPEMG00000024901)	Fgf8 (ENSPEMG00000012905)	Npm3 (ENSPEMG00000007731)	Oga (ENSPEMG00000008883)	Kcnip2 (ENSPEMG00000015045)
Prairie vole	MODERN SPECIES	16	Bloc1s2 (ENSMOCG00000003511)	Pkd2l1 (ENSMOCG00000006800)	Scd3 (ENSMOCG00000001880)	Scd2 (ENSMOCG00000018751)	ENSMOCG00000015842	Scd1 (ENSMOCG00000018266)	Wnt8b (ENSMOCG00000017174)	Sec31b (ENSMOCG00000012074)	Ndufb8 (ENSMOCG00000003247)	Hif1an (ENSMOCG00000013701)	Pax2 (ENSMOCG00000015583)	Slf2 (ENSMOCG00000019122)	ENSMOCG00000015291	Sema4g (ENSMOCG00000004639) #21	Mrpl43 (ENSMOCG00000008602)	Twnk (ENSMOCG00000004167) #22	Lzts2 (ENSMOCG00000012162)	ENSMOCG00000014095	ENSMOCG00000019069	Sfxn3 (ENSMOCG00000022608)	Kazald1 (ENSMOCG00000015994)	Tlx1 (ENSMOCG00000017096)	Lbx1 (ENSMOCG00000018337)	Btrc (ENSMOCG00000002451)	Poll (ENSMOCG00000006566)	Dpcd (ENSMOCG00000013756)	Fbxw4 (ENSMOCG00000013178)	Fgf8 (ENSMOCG00000021407)	Npm3 (ENSMOCG00000013601)	Oga (ENSMOCG00000014392)	Kcnip2 (ENSMOCG00000022254)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000162971.c.b	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000154908.s.a	ENSGT00940000162971.c.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Mus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000162971.c.b	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000154908.s.a	ENSGT00940000162971.c.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000162971.c.b	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000154908.s.a	ENSGT00940000162971.c.a.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00940000169317	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a.p	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000162971.c.b	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000154908.s.a	ENSGT00940000162971.c.a.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00940000169317	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a.p	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000162971.c.b	ENSGT00940000154908.s.b	ENSGT00940000154908.s.a	ENSGT00940000162971.c.a.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00940000169317	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00990000203892	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a.p	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3317	ENSMSIG00000013690	Pkd2l1 (ENSMSIG00000013623)	ENSMSIG00000013604	ENSMSIG00000013578	ENSMSIG00000013562	Scd2 (ENSMSIG00000013492)	Scd1 (ENSMSIG00000013486)	Wnt8b (ENSMSIG00000013462)	Sec31b (ENSMSIG00000013336)	Ndufb8 (ENSMSIG00000013308)	Hif1an (ENSMSIG00000013295)	Pax2 (ENSMSIG00000013194)	Slf2 (ENSMSIG00000013125)	Sema4g (ENSMSIG00000013048) #21	Mrpl43 (ENSMSIG00000013030)	Twnk (ENSMSIG00000013010) #22	Lzts2 (ENSMSIG00000012984)	ENSMSIG00000012980	Pdzd7 (ENSMSIG00000012912)	Sfxn3 (ENSMSIG00000012828)	Kazald1 (ENSMSIG00000012802)	Tlx1 (ENSMSIG00000012781)	Lbx1 (ENSMSIG00000012769)	Btrc (ENSMSIG00000012680)	Poll (ENSMSIG00000012645)	ENSMSIG00000012629	ENSMSIG00000012591	Fgf8 (ENSMSIG00000012521)	Npm3 (ENSMSIG00000012497)	Oga (ENSMSIG00000012429)	ENSMSIG00000011884
spretus	MODERN SPECIES	10	Bloc1s2 (MGP_SPRETEiJ_G0023914)	Pkd2l1 (MGP_SPRETEiJ_G0023915)	Scd3 (MGP_SPRETEiJ_G0023916)	Scd2 (MGP_SPRETEiJ_G0023917)	Scd4 (MGP_SPRETEiJ_G0023918)	Scd1 (MGP_SPRETEiJ_G0023919)	Wnt8b (MGP_SPRETEiJ_G0023920)	Sec31b (MGP_SPRETEiJ_G0023921)	MGP_SPRETEiJ_G0023922	Ndufb8 (MGP_SPRETEiJ_G0023923)	Hif1an (MGP_SPRETEiJ_G0023924)	Pax2 (MGP_SPRETEiJ_G0023925)	Slf2 (MGP_SPRETEiJ_G0023926)	Sema4g (MGP_SPRETEiJ_G0023927) #21	Mrpl43 (MGP_SPRETEiJ_G0023928)	Twnk (MGP_SPRETEiJ_G0023929) #22	Lzts2 (MGP_SPRETEiJ_G0023930)	Pdzd7 (MGP_SPRETEiJ_G0023931)	Sfxn3 (MGP_SPRETEiJ_G0023932)	Kazald1 (MGP_SPRETEiJ_G0023933)	Tlx1 (MGP_SPRETEiJ_G0023934)	Lbx1 (MGP_SPRETEiJ_G0023935)	Btrc (MGP_SPRETEiJ_G0023936)	Poll (MGP_SPRETEiJ_G0023937)	Dpcd (MGP_SPRETEiJ_G0023938)	MGP_SPRETEiJ_G0023939	Fgf8 (MGP_SPRETEiJ_G0023940)	Npm3 (MGP_SPRETEiJ_G0023941)	Oga (MGP_SPRETEiJ_G0023942)	Kcnip2 (MGP_SPRETEiJ_G0023943)	Armh3 (MGP_SPRETEiJ_G0023944)
Mouse	MODERN SPECIES	10	Bloc1s2 (ENSMUSG00000057506)	Pkd2l1 (ENSMUSG00000037578)	Scd3 (ENSMUSG00000025202)	Scd2 (ENSMUSG00000025203)	Scd4 (ENSMUSG00000050195)	Scd1 (ENSMUSG00000037071)	Wnt8b (ENSMUSG00000036961)	Sec31b (ENSMUSG00000051984)	Gm20538 (ENSMUSG00000091471)	Ndufb8 (ENSMUSG00000025204)	Hif1an (ENSMUSG00000036450)	Pax2 (ENSMUSG00000004231)	Slf2 (ENSMUSG00000036097)	Sema4g (ENSMUSG00000025207) #21	Mrpl43 (ENSMUSG00000025208)	Twnk (ENSMUSG00000025209) #22	Lzts2 (ENSMUSG00000035342)	Pdzd7 (ENSMUSG00000074818)	Sfxn3 (ENSMUSG00000025212)	Kazald1 (ENSMUSG00000025213)	Tlx1 (ENSMUSG00000025215)	Lbx1 (ENSMUSG00000025216)	Btrc (ENSMUSG00000025217)	Poll (ENSMUSG00000025218)	Dpcd (ENSMUSG00000041035)	Fbxw4 (ENSMUSG00000040913)	Fgf8 (ENSMUSG00000025219)	Npm3 (ENSMUSG00000056209)	Oga (ENSMUSG00000025220)	Kcnip2 (ENSMUSG00000025221)	Armh3 (ENSMUSG00000039901)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	10	Bloc1s2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022993)	Pkd2l1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022994)	Scd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0022995)	Scd2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022996)	Scd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0022997)	Scd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022998)	Wnt8b (MGP_CAROLIEiJ_G0022999)	Sec31b (MGP_CAROLIEiJ_G0023000)	MGP_CAROLIEiJ_G0023001	Ndufb8 (MGP_CAROLIEiJ_G0023002)	Hif1an (MGP_CAROLIEiJ_G0023003)	Pax2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023004)	Slf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023005)	Sema4g (MGP_CAROLIEiJ_G0023006) #21	Mrpl43 (MGP_CAROLIEiJ_G0023007)	Twnk (MGP_CAROLIEiJ_G0023008) #22	Lzts2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023009)	Pdzd7 (MGP_CAROLIEiJ_G0023010)	Sfxn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023011)	Kazald1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023012)	Tlx1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023013)	Lbx1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023014)	Btrc (MGP_CAROLIEiJ_G0023015)	Poll (MGP_CAROLIEiJ_G0023016)	Dpcd (MGP_CAROLIEiJ_G0023017)	Fbxw4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023018)	Fgf8 (MGP_CAROLIEiJ_G0023019)	Npm3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023020)	Oga (MGP_CAROLIEiJ_G0023021)	Kcnip2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023022)	Armh3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023023)
Shrew mouse	MODERN SPECIES		Bloc1s2 (MGP_PahariEiJ_G0014483)	Pkd2l1 (MGP_PahariEiJ_G0014484)	Scd3 (MGP_PahariEiJ_G0014485)	Scd2 (MGP_PahariEiJ_G0014486)	MGP_PahariEiJ_G0014487	Scd1 (MGP_PahariEiJ_G0014488)	Wnt8b (MGP_PahariEiJ_G0014489)	MGP_PahariEiJ_G0014490	MGP_PahariEiJ_G0014491	Ndufb8 (MGP_PahariEiJ_G0014492)	Hif1an (MGP_PahariEiJ_G0014493)	Pax2 (MGP_PahariEiJ_G0014494)	Slf2 (MGP_PahariEiJ_G0014495)	Sema4g (MGP_PahariEiJ_G0014496) #21	Mrpl43 (MGP_PahariEiJ_G0014497)	Twnk (MGP_PahariEiJ_G0014498) #22	MGP_PahariEiJ_G0014499	Pdzd7 (MGP_PahariEiJ_G0014500)	Sfxn3 (MGP_PahariEiJ_G0014501)	Kazald1 (MGP_PahariEiJ_G0014502)	Tlx1 (MGP_PahariEiJ_G0014503)	Lbx1 (MGP_PahariEiJ_G0014504)	Btrc (MGP_PahariEiJ_G0014505)	Poll (MGP_PahariEiJ_G0014506)	Dpcd (MGP_PahariEiJ_G0014507)	MGP_PahariEiJ_G0014508	Fgf8 (MGP_PahariEiJ_G0014509)	Npm3 (MGP_PahariEiJ_G0014510)	Oga (MGP_PahariEiJ_G0014511)	Kcnip2 (MGP_PahariEiJ_G0014512)	Armh3 (MGP_PahariEiJ_G0014513)
Rat	MODERN SPECIES		Bloc1s2 (ENSRNOG00000012684)	Pkd2l1 (ENSRNOG00000012591)	LOC681458 (ENSRNOG00000013279)	Scd2 (ENSRNOG00000046005)	Scd4 (ENSRNOG00000032554)	Scd (ENSRNOG00000013552)	Wnt8b (ENSRNOG00000013817)	Sec31b (ENSRNOG00000025781)	Ndufb8 (ENSRNOG00000014078)	Hif1an (ENSRNOG00000014234)	Pax2 (ENSRNOG00000014253)	Slf2 (ENSRNOG00000014482)	AC121209.1 (ENSRNOG00000036588)	Sema4g (ENSRNOG00000014650) #21	Mrpl43 (ENSRNOG00000014890)	Twnk (ENSRNOG00000014935) #22	Lzts2 (ENSRNOG00000014969)	Pdzd7 (ENSRNOG00000032946)	Sfxn3 (ENSRNOG00000015442)	Kazald1 (ENSRNOG00000016058)	Tlx1 (ENSRNOG00000016120)	Lbx1 (ENSRNOG00000025520)	Btrc (ENSRNOG00000016280)	Poll (ENSRNOG00000016748)	Dpcd (ENSRNOG00000017241)	Fbxw4 (ENSRNOG00000046211)	Fgf8 (ENSRNOG00000017524)	Npm3 (ENSRNOG00000017622)	Oga (ENSRNOG00000017822)	Kcnip2 (ENSRNOG00000018018)	Armh3 (ENSRNOG00000025523)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1300	Cwf19l1 (ENSNGAG00000021145)	Bloc1s2 (ENSNGAG00000004929)	Pkd2l1 (ENSNGAG00000011261)	Scd3 (ENSNGAG00000024197)	Scd2 (ENSNGAG00000008907)	ENSNGAG00000015109	Scd1 (ENSNGAG00000020123)	Wnt8b (ENSNGAG00000011191)	Sec31b (ENSNGAG00000003078)	Ndufb8 (ENSNGAG00000022265)	Hif1an (ENSNGAG00000022464)	Pax2 (ENSNGAG00000011967)	Slf2 (ENSNGAG00000022141)	Sema4g (ENSNGAG00000014131) #21	Mrpl43 (ENSNGAG00000023476)	Twnk (ENSNGAG00000023645) #22	Lzts2 (ENSNGAG00000023942)	ENSNGAG00000004602	Sfxn3 (ENSNGAG00000017442)	Kazald1 (ENSNGAG00000011414)	Tlx1 (ENSNGAG00000024255)	Lbx1 (ENSNGAG00000023979)	ENSNGAG00000023625	Btrc (ENSNGAG00000001803)	Poll (ENSNGAG00000021402)	Dpcd (ENSNGAG00000015959)	Fbxw4 (ENSNGAG00000022749)	Fgf8 (ENSNGAG00000018999)	ENSNGAG00000022833	Oga (ENSNGAG00000011804)	Kcnip2 (ENSNGAG00000024132)
Lesser Egyptian jerboa	DUPLICATION
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	70							ENSJJAG00000017635	Wnt8b (ENSJJAG00000010131)	Sec31b (ENSJJAG00000020478)	Ndufb8 (ENSJJAG00000021005)	Hif1an (ENSJJAG00000013793)	Pax2 (ENSJJAG00000000526)	Slf2 (ENSJJAG00000023625)	Sema4g (ENSJJAG00000000673) #21	Mrpl43 (ENSJJAG00000023922)	ENSJJAG00000006388 #22	Lzts2 (ENSJJAG00000015056)	ENSJJAG00000014285	Sfxn3 (ENSJJAG00000016145)	Kazald1 (ENSJJAG00000021687)	ENSJJAG00000006430	Lbx1 (ENSJJAG00000021756)	Btrc (ENSJJAG00000011813)	Poll (ENSJJAG00000024104)	Dpcd (ENSJJAG00000010119)	ENSJJAG00000016263	Fgf8 (ENSJJAG00000014440)	Npm3 (ENSJJAG00000018907)	Oga (ENSJJAG00000020565)	Kcnip2 (ENSJJAG00000019358)	Armh3 (ENSJJAG00000018861)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	75	Inpp1 (ENSJJAG00000009216)	ENSJJAG00000014804	Mfsd6 (ENSJJAG00000020391)	Nemp2 (ENSJJAG00000006107)	Nab1 (ENSJJAG00000000654)	Gls (ENSJJAG00000019300)	ENSJJAG00000013729	ENSJJAG00000012330	Stat4 (ENSJJAG00000021642)	Myo1b (ENSJJAG00000015476)	Nabp1 (ENSJJAG00000020746)	ENSJJAG00000020230	Cavin2 (ENSJJAG00000016175)	Tmeff2 (ENSJJAG00000013897)	ENSJJAG00000010385	ENSJJAG00000014758 #22
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	355	Chuk (ENSDORG00000011965)	Cwf19l1 (ENSDORG00000011967)	Bloc1s2 (ENSDORG00000028226)	Pkd2l1 (ENSDORG00000006223)	Scd4 (ENSDORG00000006872)	ENSDORG00000025859	ENSDORG00000011282	Wnt8b (ENSDORG00000000610)	Sec31b (ENSDORG00000000124)	Ndufb8 (ENSDORG00000006217)	Hif1an (ENSDORG00000026469)	Pax2 (ENSDORG00000006193)	Slf2 (ENSDORG00000004458)	Sema4g (ENSDORG00000004459) #21	Mrpl43 (ENSDORG00000023986)	Twnk (ENSDORG00000004461) #22	Lzts2 (ENSDORG00000016411)	ENSDORG00000016413	Sfxn3 (ENSDORG00000016415)	Kazald1 (ENSDORG00000016417)	ENSDORG00000025952	Lbx1 (ENSDORG00000029567)	Btrc (ENSDORG00000014204)	Poll (ENSDORG00000024173)	Dpcd (ENSDORG00000014209)	Fbxw4 (ENSDORG00000014212)	Fgf8 (ENSDORG00000029227)	Npm3 (ENSDORG00000003491)	Oga (ENSDORG00000003493)	Kcnip2 (ENSDORG00000003495)	Armh3 (ENSDORG00000003496)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000162971	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908.q.b	ENSGT01030000234637.a.b.b.j.a	ENSGT00940000154908.q.a.b	ENSGT00940000154908.q.a.a.a.a	ENSGT00940000154908.q.a.a.b	ENSGT00940000162971	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	76			ENSGT01030000234637.a.b.b.j.a	ENSGT00940000154908.q.a.b	ENSGT00940000154908.q.a.a.a.a	ENSGT00940000154908.q.a.a.b	ENSGT00940000154908.q.a.a.a.b	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409.e	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554
Squirrel	MODERN SPECIES	200			ENSSTOG00000022328	ENSSTOG00000004270	ENSSTOG00000012740	ENSSTOG00000012666	ENSSTOG00000005853	WNT8B (ENSSTOG00000022425)	SEC31B (ENSSTOG00000009253)	NDUFB8 (ENSSTOG00000020727)	ENSSTOG00000009302	PAX2 (ENSSTOG00000011575)	SLF2 (ENSSTOG00000008951)	SEMA4G (ENSSTOG00000008994) #21	MRPL43 (ENSSTOG00000009016)	TWNK (ENSSTOG00000009030) #22	LZTS2 (ENSSTOG00000015232)	PDZD7 (ENSSTOG00000009046)	SFXN3 (ENSSTOG00000026614)	KAZALD1 (ENSSTOG00000015240)	ENSSTOG00000023842	LBX1 (ENSSTOG00000006491)	BTRC (ENSSTOG00000022481)	POLL (ENSSTOG00000011485)	DPCD (ENSSTOG00000011490)	FBXW4 (ENSSTOG00000011495)	FGF8 (ENSSTOG00000023351)	NPM3 (ENSSTOG00000022621)	ENSSTOG00000032901	KCNIP2 (ENSSTOG00000021030)	ARMH3 (ENSSTOG00000015633)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	373				ENSUPAG00010010788	ENSUPAG00010010779	ENSUPAG00010010770	ENSUPAG00010010744	WNT8B (ENSUPAG00010010727)	SEC31B (ENSUPAG00010010697)	NDUFB8 (ENSUPAG00010010693)	ENSUPAG00010010677	PAX2 (ENSUPAG00010010652)	SLF2 (ENSUPAG00010010631)	SEMA4G (ENSUPAG00010010602) #21	MRPL43 (ENSUPAG00010010598)	TWNK (ENSUPAG00010010588) #22	LZTS2 (ENSUPAG00010010572)	ENSUPAG00010010561	ENSUPAG00010010444	SFXN3 (ENSUPAG00010010359)	KAZALD1 (ENSUPAG00010010340)	TLX1 (ENSUPAG00010010336)	LBX1 (ENSUPAG00010010328)	ENSUPAG00010010321	BTRC (ENSUPAG00010010245)	POLL (ENSUPAG00010010241)	DPCD (ENSUPAG00010010220)	FBXW4 (ENSUPAG00010010202)	FGF8 (ENSUPAG00010010083)	NPM3 (ENSUPAG00010010073)	OGA (ENSUPAG00010010052)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	39	PKD2L1 (ENSMMMG00000022963)	ENSMMMG00000022972	ENSMMMG00000022981	ENSMMMG00000022983	ENSMMMG00000022991	ENSMMMG00000023014	ENSMMMG00000023019	WNT8B (ENSMMMG00000023029)	SEC31B (ENSMMMG00000023033)	NDUFB8 (ENSMMMG00000023049)	HIF1AN (ENSMMMG00000023051)	PAX2 (ENSMMMG00000023055)	SLF2 (ENSMMMG00000023066)	SEMA4G (ENSMMMG00000023078) #21	MRPL43 (ENSMMMG00000023087)	TWNK (ENSMMMG00000023092) #22	ENSMMMG00000023095	ENSMMMG00000023099	ENSMMMG00000023144	ENSMMMG00000023146	SFXN3 (ENSMMMG00000023149)	KAZALD1 (ENSMMMG00000023167)	ENSMMMG00000023172	LBX1 (ENSMMMG00000023177)	BTRC (ENSMMMG00000023182)	POLL (ENSMMMG00000023200)	DPCD (ENSMMMG00000023210)	FBXW4 (ENSMMMG00000023212)	FGF8 (ENSMMMG00000023215)	NPM3 (ENSMMMG00000023217)	OGA (ENSMMMG00000023220)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	13	BLOC1S2 (ENSSVLG00005011909)	PKD2L1 (ENSSVLG00005011378)	ENSSVLG00005011263	ENSSVLG00005011226	ENSSVLG00005011162	ENSSVLG00005011001	ENSSVLG00005010906	WNT8B (ENSSVLG00005010847)	SEC31B (ENSSVLG00005010799)	ENSSVLG00005005940	HIF1AN (ENSSVLG00005005917)	PAX2 (ENSSVLG00005005719)	SLF2 (ENSSVLG00005005553)	SEMA4G (ENSSVLG00005005503) #21	MRPL43 (ENSSVLG00005005460)	TWNK (ENSSVLG00005005412) #22	LZTS2 (ENSSVLG00005005380)	PDZD7 (ENSSVLG00005005347)	SFXN3 (ENSSVLG00005005315)	KAZALD1 (ENSSVLG00005005289)	TLX1 (ENSSVLG00005005266)	LBX1 (ENSSVLG00005005245)	BTRC (ENSSVLG00005005205)	POLL (ENSSVLG00005005135)	DPCD (ENSSVLG00005005104)	FBXW4 (ENSSVLG00005005056)	FGF8 (ENSSVLG00005005038)	OGA (ENSSVLG00005004824)	KCNIP2 (ENSSVLG00005004570)	ARMH3 (ENSSVLG00005004399)	HPS6 (ENSSVLG00005004366)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	1							ENSGT00940000162971.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	3							ENSGT00940000162971.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554
Guinea pig	MODERN SPECIES	11	AGTPBP1 (ENSCPOG00000019771)	NAA35 (ENSCPOG00000032357)	GOLM1 (ENSCPOG00000003829)	ENSCPOG00000032645	TUT7 (ENSCPOG00000002500)	DAPK1 (ENSCPOG00000000987)	ENSCPOG00000032751	WNT8B (ENSCPOG00000027283)	SEC31B (ENSCPOG00000007432)	NDUFB8 (ENSCPOG00000024799)	HIF1AN (ENSCPOG00000009881)	PAX2 (ENSCPOG00000000939)	SLF2 (ENSCPOG00000000940)	SEMA4G (ENSCPOG00000036564) #21	MRPL43 (ENSCPOG00000040768)	TWNK (ENSCPOG00000000950) #22	LZTS2 (ENSCPOG00000035545)	ENSCPOG00000000952	SFXN3 (ENSCPOG00000000955)	KAZALD1 (ENSCPOG00000015270)	TLX1 (ENSCPOG00000003194)	LBX1 (ENSCPOG00000025830)	BTRC (ENSCPOG00000005488)	POLL (ENSCPOG00000005493)	DPCD (ENSCPOG00000005499)	ENSCPOG00000032448	FGF8 (ENSCPOG00000021533)	NPM3 (ENSCPOG00000006301)	OGA (ENSCPOG00000000219)	KCNIP2 (ENSCPOG00000011918)	ARMH3 (ENSCPOG00000031847)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	14							ENSGT00940000162971.a	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554
Degu	MODERN SPECIES	83						ENSODEG00000007841	ENSODEG00000009188	WNT8B (ENSODEG00000006011)	ENSODEG00000005730	NDUFB8 (ENSODEG00000006621)	ENSODEG00000007007	PAX2 (ENSODEG00000006975)	SLF2 (ENSODEG00000008647)	SEMA4G (ENSODEG00000005984) #21	ENSODEG00000006668	TWNK (ENSODEG00000006072) #22	LZTS2 (ENSODEG00000006752)	PDZD7 (ENSODEG00000006718)	SFXN3 (ENSODEG00000007542)	KAZALD1 (ENSODEG00000005804)	ENSODEG00000006094	LBX1 (ENSODEG00000006684)	BTRC (ENSODEG00000008464)	POLL (ENSODEG00000007469)	DPCD (ENSODEG00000005983)	FBXW4 (ENSODEG00000007897)	FGF8 (ENSODEG00000006423)	NPM3 (ENSODEG00000006704)	OGA (ENSODEG00000008001)	ENSODEG00000019634	KCNIP2 (ENSODEG00000007199)
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	192							ENSCLAG00000008947	WNT8B (ENSCLAG00000008704)	ENSCLAG00000008608	NDUFB8 (ENSCLAG00000008248)	HIF1AN (ENSCLAG00000008195)	PAX2 (ENSCLAG00000007272)	SLF2 (ENSCLAG00000003936)	SEMA4G (ENSCLAG00000003839) #21	MRPL43 (ENSCLAG00000003510)	TWNK (ENSCLAG00000003486) #22	LZTS2 (ENSCLAG00000003292)	PDZD7 (ENSCLAG00000003178)	SFXN3 (ENSCLAG00000001996)	ENSCLAG00000001318	ENSCLAG00000001309	LBX1 (ENSCLAG00000001298)	BTRC (ENSCLAG00000001243)	POLL (ENSCLAG00000001165)	DPCD (ENSCLAG00000001147)	FBXW4 (ENSCLAG00000001132)	FGF8 (ENSCLAG00000001075)	OGA (ENSCLAG00000001003)	KCNIP2 (ENSCLAG00000000954)	ARMH3 (ENSCLAG00000001673)	HPS6 (ENSCLAG00000001624)
Naked mole-rat female	DUPLICATION
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	4	HMX3 (ENSHGLG00000018386)	ACADSB (ENSHGLG00000016362)	IKZF5 (ENSHGLG00000043894)	ENSHGLG00000018111	ENSHGLG00000039463	ENSHGLG00000048517	ENSHGLG00000004047	ENSHGLG00000049539	ENSHGLG00000006335	ENSHGLG00000039278	HIF1AN (ENSHGLG00000008386)	PAX2 (ENSHGLG00000007584)	ENSHGLG00000033080	SLF2 (ENSHGLG00000011302)	ENSHGLG00000040204	ENSHGLG00000002240 #22	LZTS2 (ENSHGLG00000039393)	ENSHGLG00000035111	PDZD7 (ENSHGLG00000046047)	SFXN3 (ENSHGLG00000002107)	KAZALD1 (ENSHGLG00000002854)	TLX1 (ENSHGLG00000001823)	LBX1 (ENSHGLG00000047414)	ENSHGLG00000019498	ENSHGLG00000002588	POLL (ENSHGLG00000019504)	DPCD (ENSHGLG00000019507)	FBXW4 (ENSHGLG00000018911)	FGF8 (ENSHGLG00000013482)	NPM3 (ENSHGLG00000049984)	OGA (ENSHGLG00000019033)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	1	LNX1 (ENSHGLG00000017095)	FIP1L1 (ENSHGLG00000018937)	SCFD2 (ENSHGLG00000008861)	ENSHGLG00000035001	RASL11B (ENSHGLG00000018686)	ENSHGLG00000048480	USP46 (ENSHGLG00000018346)	ENSHGLG00000015649	SPATA18 (ENSHGLG00000040259)	ENSHGLG00000038499	ENSHGLG00000040271	ENSHGLG00000017366	ENSHGLG00000031874	ENSHGLG00000021184	CWH43 (ENSHGLG00000017904)	ENSHGLG00000033110 #22	ENSHGLG00000009214	OCIAD1 (ENSHGLG00000005766)	ENSHGLG00000007948	ENSHGLG00000045336	ENSHGLG00000039998	SLC10A4 (ENSHGLG00000013563)	ENSHGLG00000000325	SLAIN2 (ENSHGLG00000019447)	ENSHGLG00000043919	ENSHGLG00000042797	TEC (ENSHGLG00000015780)	ENSHGLG00000013808	NIPAL1 (ENSHGLG00000044376)	CNGA1 (ENSHGLG00000018977)	NFXL1 (ENSHGLG00000014142)
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000163402	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00940000156000	ENSGT00390000005889	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000003175.a.a	ENSGT00390000000628	ENSGT00940000157409	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00530000064017.a	ENSGT00940000157186 #21	ENSGT00390000015375	ENSGT00390000004495 #22	ENSGT00940000154078.a.a	ENSGT00950000183002.C	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a	ENSGT00530000063555.B	ENSGT00940000158698	ENSGT00940000161756	ENSGT00940000159672	ENSGT00940000158515	ENSGT00390000014031	ENSGT00390000005029	ENSGT00940000159518	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a	ENSGT00940000157798	ENSGT00390000002554
Rabbit	MODERN SPECIES	9	CHUK (ENSOCUG00000013114)	BLOC1S2 (ENSOCUG00000013141)	PKD2L1 (ENSOCUG00000013146)	ENSOCUG00000001375	ENSOCUG00000037667	ENSOCUG00000014801	ENSOCUG00000037427	WNT8B (ENSOCUG00000000986)	SEC31B (ENSOCUG00000000988)	NDUFB8 (ENSOCUG00000000989)	HIF1AN (ENSOCUG00000000991)	PAX2 (ENSOCUG00000012860)	SLF2 (ENSOCUG00000002728)	SEMA4G (ENSOCUG00000002737) #21	MRPL43 (ENSOCUG00000002742)	TWNK (ENSOCUG00000002746) #22	LZTS2 (ENSOCUG00000021502)	ENSOCUG00000006651	ENSOCUG00000031924	SFXN3 (ENSOCUG00000002751)	KAZALD1 (ENSOCUG00000002974)	TLX1 (ENSOCUG00000013136)	LBX1 (ENSOCUG00000013145)	BTRC (ENSOCUG00000015353)	POLL (ENSOCUG00000015364)	DPCD (ENSOCUG00000015373)	FBXW4 (ENSOCUG00000015386)	ENSOCUG00000027864	NPM3 (ENSOCUG00000016819)	OGA (ENSOCUG00000002768)	KCNIP2 (ENSOCUG00000026348)
Pika	MODERN SPECIES	604													SLF2 (ENSOPRG00000007048)	ENSOPRG00000007068 #21	MRPL43 (ENSOPRG00000007093)	TWNK (ENSOPRG00000007100) #22	LZTS2 (ENSOPRG00000007108)	ENSOPRG00000007119	KAZALD1 (ENSOPRG00000007134)	TLX1 (ENSOPRG00000007137)	LBX1 (ENSOPRG00000007142)	BTRC (ENSOPRG00000007146)	POLL (ENSOPRG00000007162)	DPCD (ENSOPRG00000007167)	ENSOPRG00000007176