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Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160250	ENSGT00940000155061.a.b	ENSGT00940000160968	ENSGT00940000156925 #8	ENSGT00940000161801 #9	ENSGT01050000244965.a #10	ENSGT00730000111092.b #12	ENSGT00950000183137.a #13	ENSGT00390000005639.a.b #14	ENSGT00390000001546 #15	ENSGT00390000002554 #17	ENSGT00940000157798 #18	ENSGT00390000007726.a.a #19	ENSGT00940000158796 #20	ENSGT00940000159518 #21	ENSGT00390000005029 #22	ENSGT00390000014031 #23	ENSGT00940000158515 #24	ENSGT00940000159672 #25	ENSGT00940000161756 #27	ENSGT00940000158698 #28	ENSGT00530000063555.B #29	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #30	ENSGT00950000183002.C #32	ENSGT00940000154078.a.a #33	ENSGT00390000004495 #34	ENSGT00390000015375 #35	ENSGT00940000157186	ENSGT00530000064017.a #36	ENSGT00940000157412.b	ENSGT00940000157409
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Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	192	CUEDC2 (ENSCLAG00000001551)	FBXL15 (ENSCLAG00000001578)	PSD (ENSCLAG00000003741)	NFKB2 (ENSCLAG00000004104)	GBF1 (ENSCLAG00000004338) #8	PITX3 (ENSCLAG00000005073) #9	ELOVL3 (ENSCLAG00000005342) #10	NOLC1 (ENSCLAG00000001046) #12	PPRC1 (ENSCLAG00000001364) #13	LDB1 (ENSCLAG00000001555) #14	HPS6 (ENSCLAG00000001624) #15	ARMH3 (ENSCLAG00000001673) #17	KCNIP2 (ENSCLAG00000000954) #18	OGA (ENSCLAG00000001003) #19	FGF8 (ENSCLAG00000001075) #21	FBXW4 (ENSCLAG00000001132) #22	DPCD (ENSCLAG00000001147) #23	POLL (ENSCLAG00000001165) #24	BTRC (ENSCLAG00000001243) #25	LBX1 (ENSCLAG00000001298) #27	ENSCLAG00000001309 #28	ENSCLAG00000001318 #29	SFXN3 (ENSCLAG00000001996) #30	PDZD7 (ENSCLAG00000003178) #32	LZTS2 (ENSCLAG00000003292) #33	TWNK (ENSCLAG00000003486) #34	MRPL43 (ENSCLAG00000003510) #35	SEMA4G (ENSCLAG00000003839)	SLF2 (ENSCLAG00000003936) #36	PAX2 (ENSCLAG00000007272)	HIF1AN (ENSCLAG00000008195)
Degu	MODERN SPECIES	83	PITX3 (ENSODEG00000007162) #9	ELOVL3 (ENSODEG00000006606) #10	NOLC1 (ENSODEG00000006304) #12	ENSODEG00000006985 #13	ENSODEG00000009568 #13	LDB1 (ENSODEG00000009090) #14	HPS6 (ENSODEG00000007638) #15	ENSODEG00000019424	ARMH3 (ENSODEG00000007299) #17	ENSODEG00000010569	KCNIP2 (ENSODEG00000007199) #18	ENSODEG00000019634	OGA (ENSODEG00000008001) #19	NPM3 (ENSODEG00000006704) #20	FGF8 (ENSODEG00000006423) #21	FBXW4 (ENSODEG00000007897) #22	DPCD (ENSODEG00000005983) #23	POLL (ENSODEG00000007469) #24	BTRC (ENSODEG00000008464) #25	LBX1 (ENSODEG00000006684) #27	ENSODEG00000006094 #28	KAZALD1 (ENSODEG00000005804) #29	SFXN3 (ENSODEG00000007542) #30	PDZD7 (ENSODEG00000006718) #32	LZTS2 (ENSODEG00000006752) #33	TWNK (ENSODEG00000006072) #34	ENSODEG00000006668 #35	SEMA4G (ENSODEG00000005984)	SLF2 (ENSODEG00000008647) #36	PAX2 (ENSODEG00000006975)	ENSODEG00000007007
Guinea pig	MODERN SPECIES	11	FBXL15 (ENSCPOG00000021451)	PSD (ENSCPOG00000000156)	NFKB2 (ENSCPOG00000004847)	GBF1 (ENSCPOG00000004514) #8	PITX3 (ENSCPOG00000036365) #9	ELOVL3 (ENSCPOG00000014884) #10	NOLC1 (ENSCPOG00000004504) #12	PPRC1 (ENSCPOG00000032149) #13	LDB1 (ENSCPOG00000010311) #14	HPS6 (ENSCPOG00000006084) #15	ARMH3 (ENSCPOG00000031847) #17	KCNIP2 (ENSCPOG00000011918) #18	OGA (ENSCPOG00000000219) #19	NPM3 (ENSCPOG00000006301) #20	FGF8 (ENSCPOG00000021533) #21	ENSCPOG00000032448 #22	DPCD (ENSCPOG00000005499) #23	POLL (ENSCPOG00000005493) #24	BTRC (ENSCPOG00000005488) #25	LBX1 (ENSCPOG00000025830) #27	TLX1 (ENSCPOG00000003194) #28	KAZALD1 (ENSCPOG00000015270) #29	SFXN3 (ENSCPOG00000000955) #30	ENSCPOG00000000952 #32	LZTS2 (ENSCPOG00000035545) #33	TWNK (ENSCPOG00000000950) #34	MRPL43 (ENSCPOG00000040768) #35	SEMA4G (ENSCPOG00000036564)	SLF2 (ENSCPOG00000000940) #36	PAX2 (ENSCPOG00000000939)	HIF1AN (ENSCPOG00000009881)