Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	158									ENSGT00950000182998.C.b	ENSGT00940000158855	ENSGT00940000158328	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00390000016901	ENSGT00940000165085	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000000631	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000162824	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000156468	ENSGT00940000157842	ENSGT00390000006665.a	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000155125
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	111					ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00940000165736	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000000631	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000165085	ENSGT00390000016901	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00940000158328	ENSGT00940000158855	ENSGT00950000182998.C.b	ENSGT00940000159388	ENSGT00940000161296	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000156388
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000000631	ENSGT00390000011082
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000000631	ENSGT00390000011082	ENSGT00390000014353	ENSGT00940000159835	ENSGT00940000155616	ENSGT00390000004064	ENSGT00940000153393.B
Theria	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00910000147297	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00910000147297	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36
Primates	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00910000147297	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00910000147297	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.b ##19	ENSGT00910000147297	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00940000157726 #34
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000164381 #10	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000164381 #10	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150.c #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Golden snub-nosed monkey	DUPLICATION
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Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000164381 #10	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	14	CAMKV (ENSCSAG00000014481)	TRAIP (ENSCSAG00000014525) #7	UBA7 (ENSCSAG00000014567) #8	INKA1 (ENSCSAG00000014577) #9	IP6K1 (ENSCSAG00000014586) #11	GMPPB (ENSCSAG00000014596) #13	AMIGO3 (ENSCSAG00000018784) #14	RNF123 (ENSCSAG00000014794) #12	MST1 (ENSCSAG00000014934) #15	APEH (ENSCSAG00000014962) #16	BSN (ENSCSAG00000014973) #17	DAG1 (ENSCSAG00000014979) #18	NICN1 (ENSCSAG00000014988) #19	AMT (ENSCSAG00000015048) #20	TCTA (ENSCSAG00000015067) #21	RHOA (ENSCSAG00000015074) #22	GPX1 (ENSCSAG00000015079) #23	USP4 (ENSCSAG00000015089) #24	C3orf62 (ENSCSAG00000015100) #25	IHO1 (ENSCSAG00000015114) #27	C3orf84 (ENSCSAG00000015128) #28	KLHDC8B (ENSCSAG00000015133) #29	LAMB2 (ENSCSAG00000015160) #30	USP19 (ENSCSAG00000015179) #31	QARS1 (ENSCSAG00000015198) #32	QRICH1 (ENSCSAG00000015224) #33	IMPDH2 (ENSCSAG00000015243) #34	NDUFAF3 (ENSCSAG00000015235) #35	DALRD3 (ENSCSAG00000015253) #37	WDR6 (ENSCSAG00000015270)	P4HTM (ENSCSAG00000015286)
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Macaca	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000164381 #10	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00940000154612.n.gb	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00940000157726 #34
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000164381 #10	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00940000154612.n.gb	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00910000146976 #36
Rhesus	MODERN SPECIES	11	TRAIP (ENSMMUG00000016476) #7	UBA7 (ENSMMUG00000020980) #8	INKA1 (ENSMMUG00000020979) #9	ENSMMUG00000031794 #10	IP6K1 (ENSMMUG00000014589) #11	GMPPB (ENSMMUG00000014584) #13	AMIGO3 (ENSMMUG00000014582) #14	RNF123 (ENSMMUG00000014564) #12	MST1 (ENSMMUG00000057113) #15	APEH (ENSMMUG00000014540) #16	BSN (ENSMMUG00000014537) #17	DAG1 (ENSMMUG00000004683) #18	NICN1 (ENSMMUG00000031780) #19	AMT (ENSMMUG00000005452) #20	TCTA (ENSMMUG00000058903) #21	RHOA (ENSMMUG00000047476) #22	GPX1 (ENSMMUG00000012963) #23	C2H3orf62 (ENSMMUG00000049541) #25	USP4 (ENSMMUG00000000822) #24	IHO1 (ENSMMUG00000053526) #27	ENSMMUG00000062159	C2H3orf84 (ENSMMUG00000046787) #28	KLHDC8B (ENSMMUG00000002833) #29	CCDC71 (ENSMMUG00000002836)	LAMB2 (ENSMMUG00000002952) #30	USP19 (ENSMMUG00000002948) #31	QARS1 (ENSMMUG00000002943) #32	QRICH1 (ENSMMUG00000005660) #33	IMPDH2 (ENSMMUG00000005656) #34	NDUFAF3 (ENSMMUG00000058322) #35	DALRD3 (ENSMMUG00000005652) #37
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	11	CAMKV (ENSMFAG00000030868)	TRAIP (ENSMFAG00000033393) #7	UBA7 (ENSMFAG00000043227) #8	INKA1 (ENSMFAG00000036646) #9	ENSMFAG00000002516 #10	IP6K1 (ENSMFAG00000040757) #11	AMIGO3 (ENSMFAG00000029250) #14	RNF123 (ENSMFAG00000028385) #12	MST1 (ENSMFAG00000003952) #15	APEH (ENSMFAG00000043600) #16	BSN (ENSMFAG00000042413) #17	DAG1 (ENSMFAG00000044374) #18	NICN1 (ENSMFAG00000044679) #19	AMT (ENSMFAG00000003688) #20	TCTA (ENSMFAG00000003146) #21	RHOA (ENSMFAG00000036093) #22	GPX1 (ENSMFAG00000035887) #23	C3orf62 (ENSMFAG00000053457) #25	USP4 (ENSMFAG00000043326) #24	IHO1 (ENSMFAG00000043646) #27	ENSMFAG00000058702	C3orf84 (ENSMFAG00000053517) #28	KLHDC8B (ENSMFAG00000044788) #29	CCDC71 (ENSMFAG00000056130)	LAMB2 (ENSMFAG00000030537) #30	USP19 (ENSMFAG00000040355) #31	QARS1 (ENSMFAG00000033478) #32	QRICH1 (ENSMFAG00000030312) #33	IMPDH (ENSMFAG00000044947) #34	ENSMFAG00000061406 #36	NDUFAF3 (ENSMFAG00000046307) #35
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	563	TRAIP (ENSMNEG00000008012) #7	UBA7 (ENSMNEG00000035088) #8	INKA1 (ENSMNEG00000042622) #9	ENSMNEG00000031670 #10	IP6K1 (ENSMNEG00000011583) #11	GMPPB (ENSMNEG00000040699) #13	AMIGO3 (ENSMNEG00000027501) #14	RNF123 (ENSMNEG00000030612) #12	MST1 (ENSMNEG00000040779) #15	APEH (ENSMNEG00000042039) #16	BSN (ENSMNEG00000044956) #17	DAG1 (ENSMNEG00000002150) #18	NICN1 (ENSMNEG00000028099) #19	AMT (ENSMNEG00000044694) #20	TCTA (ENSMNEG00000029672) #21	RHOA (ENSMNEG00000042186) #22	GPX1 (ENSMNEG00000043723) #23	USP4 (ENSMNEG00000036652) #24	C3orf62 (ENSMNEG00000041595) #25	ENSMNEG00000030741 #26	IHO1 (ENSMNEG00000041960) #27	ENSMNEG00000040259	C3orf84 (ENSMNEG00000040997) #28	KLHDC8B (ENSMNEG00000033867) #29	LAMB2 (ENSMNEG00000044894) #30	USP19 (ENSMNEG00000033317) #31	QARS1 (ENSMNEG00000035096) #32	QRICH1 (ENSMNEG00000029906) #33	ENSMNEG00000014164 #36	IMPDH2 (ENSMNEG00000036421) #34	NDUFAF3 (ENSMNEG00000033547) #35
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000164381 #10	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Olive baboon	MODERN SPECIES	11	RNF123 (ENSPANG00000000876) #12	AMIGO3 (ENSPANG00000004369) #14	GMPPB (ENSPANG00000006142) #13	IP6K1 (ENSPANG00000009897) #11	ENSPANG00000031427 #10	INKA1 (ENSPANG00000018298) #9	UBA7 (ENSPANG00000020175) #8	TRAIP (ENSPANG00000022481) #7	CAMKV (ENSPANG00000022786)	ENSPANG00000048096	MST1R (ENSPANG00000011245)	MON1A (ENSPANG00000012435)	NICN1 (ENSPANG00000019720) #19	AMT (ENSPANG00000015012) #20	TCTA (ENSPANG00000018886) #21	RHOA (ENSPANG00000031333) #22	RBM5 (ENSPANG00000018507)	SEMA3F (ENSPANG00000012481)	GNAT1 (ENSPANG00000012482)	SLC38A3 (ENSPANG00000014197)	GNAI2 (ENSPANG00000023235)	SEMA3B (ENSPANG00000015980)	LSMEM2 (ENSPANG00000020951)	IFRD2 (ENSPANG00000009082)	HYAL3 (ENSPANG00000019037)	HYAL2 (ENSPANG00000000779)	TUSC2 (ENSPANG00000006145)	RASSF1 (ENSPANG00000016900)	ZMYND10 (ENSPANG00000012439)	NPRL2 (ENSPANG00000009525)	CYB561D2 (ENSPANG00000008258)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000164381 #10	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	415	TRAIP (ENSCATG00000029131) #7	UBA7 (ENSCATG00000011919) #8	INKA1 (ENSCATG00000033705) #9	ENSCATG00000032750 #10	IP6K1 (ENSCATG00000001155) #11	GMPPB (ENSCATG00000038201) #13	AMIGO3 (ENSCATG00000012805) #14	RNF123 (ENSCATG00000033566) #12	MST1 (ENSCATG00000029698) #15	APEH (ENSCATG00000031753) #16	BSN (ENSCATG00000013946) #17	DAG1 (ENSCATG00000034325) #18	NICN1 (ENSCATG00000032696) ##19	AMT (ENSCATG00000040549) #20	TCTA (ENSCATG00000029652) #21	RHOA (ENSCATG00000018066) #22	GPX1 (ENSCATG00000012563) #23	USP4 (ENSCATG00000038050) #24	C3orf62 (ENSCATG00000038289) #25	ENSCATG00000040412 #26	IHO1 (ENSCATG00000030087) #27	C3orf84 (ENSCATG00000044627) #28	KLHDC8B (ENSCATG00000038940) #29	CCDC71 (ENSCATG00000039714)	LAMB2 (ENSCATG00000045276) #30	USP19 (ENSCATG00000041103) #31	QARS1 (ENSCATG00000037275) #32	QRICH1 (ENSCATG00000030540) #33	ENSCATG00000040928 #36	IMPDH2 (ENSCATG00000030723) #34	NDUFAF3 (ENSCATG00000039806) #35
Drill	MODERN SPECIES	806	TRAIP (ENSMLEG00000029913) #7	UBA7 (ENSMLEG00000037406) #8	INKA1 (ENSMLEG00000043314) #9	ENSMLEG00000039803 #10	IP6K1 (ENSMLEG00000034530) #11	GMPPB (ENSMLEG00000028013) #13	RNF123 (ENSMLEG00000037781) #12	AMIGO3 (ENSMLEG00000025213) #14	MST1 (ENSMLEG00000030117) #15	APEH (ENSMLEG00000035200) #16	BSN (ENSMLEG00000038838) #17	DAG1 (ENSMLEG00000034072) #18	NICN1 (ENSMLEG00000016079) #19	AMT (ENSMLEG00000034972) #20	TCTA (ENSMLEG00000038364) #21	RHOA (ENSMLEG00000038343) #22	GPX1 (ENSMLEG00000037976) #23	USP4 (ENSMLEG00000041312) #24	C3orf62 (ENSMLEG00000044233) #25	ENSMLEG00000006991 #26	IHO1 (ENSMLEG00000043657) #27	C3orf84 (ENSMLEG00000037676) #28	KLHDC8B (ENSMLEG00000040348) #29	LAMB2 (ENSMLEG00000037084) #30	USP19 (ENSMLEG00000026259) #31	QARS1 (ENSMLEG00000042334) #32	QRICH1 (ENSMLEG00000030523) #33	IMPDH2 (ENSMLEG00000038550) #34	NDUFAF3 (ENSMLEG00000038523) #35	DALRD3 (ENSMLEG00000040883) #37	WDR6 (ENSMLEG00000037052)
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Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150.b #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Orangutan	MODERN SPECIES	16	TRAIP (ENSPPYG00000013859) #7	INKA1 (ENSPPYG00000035798) #9	CDHR4 (ENSPPYG00000013862)	IP6K1 (ENSPPYG00000039264) #11	ENSPPYG00000034428	GMPPB (ENSPPYG00000013864) #13	RNF123 (ENSPPYG00000013865) #12	AMIGO3 (ENSPPYG00000013866) #14	MST1 (ENSPPYG00000013867) #15	APEH (ENSPPYG00000013868) #16	BSN (ENSPPYG00000013869) #17	DAG1 (ENSPPYG00000013870) #18	AMT (ENSPPYG00000013871) #20	NICN1 (ENSPPYG00000040178) #19	TCTA (ENSPPYG00000013872)	RHOA (ENSPPYG00000013873) #22	GPX1 (ENSPPYG00000025896) #23	USP4 (ENSPPYG00000013874) #24	C3orf62 (ENSPPYG00000040660) #25	IHO1 (ENSPPYG00000013877) #27	C3orf84 (ENSPPYG00000032258) #28	KLHDC8B (ENSPPYG00000013878) #29	CCDC71 (ENSPPYG00000013879)	USP19 (ENSPPYG00000013881) #31	QARS1 (ENSPPYG00000013882) #32	QRICH1 (ENSPPYG00000013883) #33	IMPDH2 (ENSPPYG00000013884) #34	NDUFAF3 (ENSPPYG00000013885) #35	DALRD3 (ENSPPYG00000013886) #37	WDR6 (ENSPPYG00000013887)	P4HTM (ENSPPYG00000036915)
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Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150.b.a.a #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Human	MODERN SPECIES	15	UBA7 (ENSG00000182179) #8	INKA1 (ENSG00000185614) #9	CDHR4 (ENSG00000187492)	IP6K1 (ENSG00000176095) #11	GMPPB (ENSG00000173540) #13	AMIGO3 (ENSG00000176020) #14	RNF123 (ENSG00000164068) #12	MST1 (ENSG00000173531) #15	APEH (ENSG00000164062) #16	BSN (ENSG00000164061) #17	DAG1 (ENSG00000173402) #18	NICN1 (ENSG00000145029) #19	AMT (ENSG00000145020) #20	ENSG00000283189	TCTA (ENSG00000145022) #21	RHOA (ENSG00000067560) #22	ENSG00000290318	GPX1 (ENSG00000233276) #23	USP4 (ENSG00000114316) #24	C3orf62 (ENSG00000188315) #25	IHO1 (ENSG00000173421) #27	C3orf84 (ENSG00000236980) #28	KLHDC8B (ENSG00000185909) #29	CCDC71 (ENSG00000177352)	LAMB2 (ENSG00000172037) #30	USP19 (ENSG00000172046) #31	QARS1 (ENSG00000172053) #32	QRICH1 (ENSG00000198218) #33	ENSG00000290315	IMPDH2 (ENSG00000178035) #34	NDUFAF3 (ENSG00000178057) #35
Pan	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00980000199418	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150.b.a.a #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Chimpanzee	MODERN SPECIES	16	TRAIP (ENSPTRG00000014939) #7	UBA7 (ENSPTRG00000014936) #8	INKA1 (ENSPTRG00000014935) #9	CDHR4 (ENSPTRG00000042519)	IP6K1 (ENSPTRG00000014933) #11	GMPPB (ENSPTRG00000014932) #13	AMIGO3 (ENSPTRG00000014931) #14	RNF123 (ENSPTRG00000050058) #12	MST1 (ENSPTRG00000014929) #15	APEH (ENSPTRG00000014928) #16	BSN (ENSPTRG00000014927) #17	DAG1 (ENSPTRG00000014926) #18	NICN1 (ENSPTRG00000032494) #19	AMT (ENSPTRG00000014924) #20	TCTA (ENSPTRG00000014923)	RHOA (ENSPTRG00000014922) #22	GPX1 (ENSPTRG00000014921) #23	USP4 (ENSPTRG00000014920) #24	C3H3orf62 (ENSPTRG00000038744) #25	ENSPTRG00000038743 #26	IHO1 (ENSPTRG00000014915) #27	C3H3orf84 (ENSPTRG00000050096) #28	KLHDC8B (ENSPTRG00000014914) #29	CCDC71 (ENSPTRG00000014913)	LAMB2 (ENSPTRG00000014912) #30	USP19 (ENSPTRG00000014911) #31	QARS1 (ENSPTRG00000014910) #32	QRICH1 (ENSPTRG00000023070) #33	ENSPTRG00000052442 #36	IMPDH2 (ENSPTRG00000014908) #34	NDUFAF3 (ENSPTRG00000014907) #35
Bonobo	MODERN SPECIES	16	CAMKV (ENSPPAG00000032674)	TRAIP (ENSPPAG00000036459) #7	UBA7 (ENSPPAG00000029340) #8	INKA1 (ENSPPAG00000031734) #9	CDHR4 (ENSPPAG00000031249)	IP6K1 (ENSPPAG00000016833) #11	GMPPB (ENSPPAG00000032705) #13	AMIGO3 (ENSPPAG00000008606) #14	RNF123 (ENSPPAG00000033919) #12	APEH (ENSPPAG00000041077) #16	BSN (ENSPPAG00000037774) #17	DAG1 (ENSPPAG00000035837) #18	NICN1 (ENSPPAG00000029365) #19	AMT (ENSPPAG00000038969) #20	ENSPPAG00000041505	ENSPPAG00000031493 #22	ENSPPAG00000041840 #23	USP4 (ENSPPAG00000030591) #24	C3orf62 (ENSPPAG00000034256) #25	ENSPPAG00000028818 #26	IHO1 (ENSPPAG00000041728) #27	C3orf84 (ENSPPAG00000028447) #28	KLHDC8B (ENSPPAG00000043715) #29	LAMB2 (ENSPPAG00000034500) #30	USP19 (ENSPPAG00000042808) #31	QRICH1 (ENSPPAG00000028104) #33	ENSPPAG00000040709 #36	IMPDH2 (ENSPPAG00000028755) #34	NDUFAF3 (ENSPPAG00000037616) #35	DALRD3 (ENSPPAG00000037268) #37	WDR6 (ENSPPAG00000043035)
Gibbon	DUPLICATION
Gibbon	MODERN SPECIES	19	TRAIP (ENSNLEG00000006911) #7	UBA7 (ENSNLEG00000006908) #8	INKA1 (ENSNLEG00000006906) #9	CDHR4 (ENSNLEG00000006902)	IP6K1 (ENSNLEG00000006900) #11	GMPPB (ENSNLEG00000006894) #13	RNF123 (ENSNLEG00000006875) #12	AMIGO3 (ENSNLEG00000018539) #14	MST1 (ENSNLEG00000006866) #15	APEH (ENSNLEG00000006859) #16	BSN (ENSNLEG00000006857) #17	DAG1 (ENSNLEG00000006853) #18	NICN1 (ENSNLEG00000006851) #19	AMT (ENSNLEG00000029101) #20	ENSNLEG00000006843	RHOA (ENSNLEG00000006839) #22	ENSNLEG00000028108 #23	USP4 (ENSNLEG00000006829) #24	C3orf62 (ENSNLEG00000006828) #25	ENSNLEG00000006827 #26	IHO1 (ENSNLEG00000006825) #27	C3orf84 (ENSNLEG00000006823) #28	KLHDC8B (ENSNLEG00000006819) #29	LAMB2 (ENSNLEG00000006812) #30	USP19 (ENSNLEG00000006789) #31	ENSNLEG00000006772 #32	QRICH1 (ENSNLEG00000006752) #33	IMPDH2 (ENSNLEG00000006743) #34	ENSNLEG00000027818 #36	NDUFAF3 (ENSNLEG00000006739) #35	ENSNLEG00000006730 #37
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Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00940000153783.b.b.c.a.a.a.k	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.b ##19	ENSGT00910000147297	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00390000001505.a.a ##19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150.f #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972.e #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00940000153783.b.b.c.b.d.a	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505.b ##19	ENSGT00910000147297	ENSGT00390000001505.a.b #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150.f.b #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972.e #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Marmoset	DUPLICATION
Marmoset	DUPLICATION
Marmoset	MODERN SPECIES	6	TRAIP (ENSCJAG00000004415) #7	UBA7 (ENSCJAG00000004368) #8	INKA1 (ENSCJAG00000004364) #9	CDHR4 (ENSCJAG00000004354)	IP6K1 (ENSCJAG00000004332) #11	GMPPB (ENSCJAG00000004306) #13	AMIGO3 (ENSCJAG00000062803) #14	MST1 (ENSCJAG00000004098) #15	RNF123 (ENSCJAG00000004025) #12	ENSCJAG00000065044	BSN (ENSCJAG00000004003) #17	DAG1 (ENSCJAG00000065054) #18	NICN1 (ENSCJAG00000003992) ##19	AMT (ENSCJAG00000003962) #20	TCTA (ENSCJAG00000070394) #21	ENSCJAG00000013657 #22	Gpx-1 (ENSCJAG00000070831) #23	USP4 (ENSCJAG00000003788) #24	C3orf62 (ENSCJAG00000003785) #25	IHO1 (ENSCJAG00000003765) #27	C3orf84 (ENSCJAG00000038262) #28	KLHDC8B (ENSCJAG00000003745) #29	CCDC71 (ENSCJAG00000003741)	LAMB2 (ENSCJAG00000003674) #30	USP19 (ENSCJAG00000003571) #31	QARS1 (ENSCJAG00000003457) #32	QRICH1 (ENSCJAG00000003440) #33	IMPDH2 (ENSCJAG00000003400) #34	NDUFAF3 (ENSCJAG00000003387) #35	DALRD3 (ENSCJAG00000003370) #37	WDR6 (ENSCJAG00000003354)
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Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	127	UBA7 (ENSSBOG00000035974) #8	INKA1 (ENSSBOG00000024118) #9	CDHR4 (ENSSBOG00000027285)	IP6K1 (ENSSBOG00000036172) #11	GMPPB (ENSSBOG00000034433) #13	RNF123 (ENSSBOG00000033273) #12	MST1 (ENSSBOG00000033724) #15	APEH (ENSSBOG00000031846) #16	BSN (ENSSBOG00000027936) #17	ENSSBOG00000028754	DAG1 (ENSSBOG00000033298) #18	ENSSBOG00000033393	NICN1 (ENSSBOG00000034672) #19	ENSSBOG00000027333 #20	TCTA (ENSSBOG00000027277) #21	RHOA (ENSSBOG00000035785) #22	GPX1 (ENSSBOG00000027004) #23	USP4 (ENSSBOG00000030849) #24	C3orf62 (ENSSBOG00000018327) #25	IHO1 (ENSSBOG00000021171) #27	C3orf84 (ENSSBOG00000030757) #28	KLHDC8B (ENSSBOG00000028793) #29	CCDC71 (ENSSBOG00000017842)	LAMB2 (ENSSBOG00000022847) #30	USP19 (ENSSBOG00000026675) #31	ENSSBOG00000025786 #32	QRICH1 (ENSSBOG00000019070) #33	IMPDH2 (ENSSBOG00000033937) #34	ENSSBOG00000016233 #36	NDUFAF3 (ENSSBOG00000020650) #35	DALRD3 (ENSSBOG00000019867) #37
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1216	INKA1 (ENSANAG00000026875) #9	CDHR4 (ENSANAG00000026198)	IP6K1 (ENSANAG00000038005) #11	GMPPB (ENSANAG00000030177) #13	RNF123 (ENSANAG00000033279) #12	MST1 (ENSANAG00000026612) #15	APEH (ENSANAG00000031110) #16	ENSANAG00000022804	BSN (ENSANAG00000037586) #17	ENSANAG00000035024	DAG1 (ENSANAG00000026927) #18	ENSANAG00000031541	ENSANAG00000030342 ##19	AMT (ENSANAG00000027123) #20	TCTA (ENSANAG00000031226) #21	ENSANAG00000035201 #22	USP4 (ENSANAG00000027506) #24	C3orf62 (ENSANAG00000033847) #25	IHO1 (ENSANAG00000036680) #27	C3orf84 (ENSANAG00000023302) #28	KLHDC8B (ENSANAG00000026478) #29	CCDC71 (ENSANAG00000005027)	LAMB2 (ENSANAG00000020048) #30	USP19 (ENSANAG00000037255) #31	ENSANAG00000031868 #32	QRICH1 (ENSANAG00000037747) #33	ENSANAG00000019030 #36	IMPDH2 (ENSANAG00000025168) #34	NDUFAF3 (ENSANAG00000022893) #35	DALRD3 (ENSANAG00000030773) #37	WDR6 (ENSANAG00000031798)
Tarsier	DUPLICATION
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Tarsier	MODERN SPECIES	4690																ENSTSYG00000027497 #22	ENSTSYG00000035465
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
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Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00980000198877	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	949													NICN1 (ENSPSMG00000026013) #19	AMT (ENSPSMG00000026012) #20	TCTA (ENSPSMG00000026011) #21	RHOA (ENSPSMG00000026009) #22	GPX1 (ENSPSMG00000026008) #23	ENSPSMG00000026006	USP4 (ENSPSMG00000026005) #24	C3orf62 (ENSPSMG00000026004) #25	ENSPSMG00000026003	C3orf84 (ENSPSMG00000026002) #28	KLHDC8B (ENSPSMG00000026001) #29	CCDC71 (ENSPSMG00000026000)	LAMB2 (ENSPSMG00000025999) #30	USP19 (ENSPSMG00000025998) #31	QARS1 (ENSPSMG00000025997) #32	QRICH1 (ENSPSMG00000025996) #33	NDUFAF3 (ENSPSMG00000025995) #35	DALRD3 (ENSPSMG00000025993) #37	WDR6 (ENSPSMG00000025992)
Coquerels sifaka	DUPLICATION
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	50	CAMKV (ENSPCOG00000022409)	TRAIP (ENSPCOG00000027327) #7	UBA7 (ENSPCOG00000026668) #8	INKA1 (ENSPCOG00000025590) #9	CDHR4 (ENSPCOG00000020495)	IP6K1 (ENSPCOG00000012769) #11	GMPPB (ENSPCOG00000026880) #13	RNF123 (ENSPCOG00000013664) #12	MST1 (ENSPCOG00000005348) #15	APEH (ENSPCOG00000028013) #16	BSN (ENSPCOG00000025030) #17	DAG1 (ENSPCOG00000023915) #18	NICN1 (ENSPCOG00000021271) #19	AMT (ENSPCOG00000016597) #20	TCTA (ENSPCOG00000018175) #21	RHOA (ENSPCOG00000014495) #22	GPX1 (ENSPCOG00000023726) #23	USP4 (ENSPCOG00000023286) #24	C3orf62 (ENSPCOG00000027475) #25	ENSPCOG00000023086	C3orf84 (ENSPCOG00000019596) #28	KLHDC8B (ENSPCOG00000005585) #29	LAMB2 (ENSPCOG00000003248) #30	USP19 (ENSPCOG00000021600) #31	QARS1 (ENSPCOG00000022610) #32	QRICH1 (ENSPCOG00000028140) #33	IMPDH2 (ENSPCOG00000027001) #34	NDUFAF3 (ENSPCOG00000014463) #35	DALRD3 (ENSPCOG00000027419) #37	WDR6 (ENSPCOG00000018888)	P4HTM (ENSPCOG00000006504)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	397						MSTN (ENSPCOG00000018963)	ENSPCOG00000024899	ENSPCOG00000027488	ENSPCOG00000023820	MFSD6 (ENSPCOG00000015506)	NEMP2 (ENSPCOG00000024548)	ENSPCOG00000022085	GLS (ENSPCOG00000028405)	STAT1 (ENSPCOG00000015237)	STAT4 (ENSPCOG00000026832)	ENSPCOG00000025067 #22	ENSPCOG00000023881	MYO1B (ENSPCOG00000024801)	NABP1 (ENSPCOG00000013496)	ENSPCOG00000014119	TMEFF2 (ENSPCOG00000016469)
Mouse lemur	DUPLICATION
Mouse lemur	MODERN SPECIES	5	TRAIP (ENSMICG00000010789) #7	UBA7 (ENSMICG00000047457) #8	INKA1 (ENSMICG00000010761) #9	CDHR4 (ENSMICG00000028215)	ENSMICG00000031354	IP6K1 (ENSMICG00000042276) #11	GMPPB (ENSMICG00000010738) #13	RNF123 (ENSMICG00000010706) #12	MST1 (ENSMICG00000041447) #15	APEH (ENSMICG00000010662) #16	BSN (ENSMICG00000010621) #17	DAG1 (ENSMICG00000010618) #18	NICN1 (ENSMICG00000001261) #19	AMT (ENSMICG00000001251) #20	TCTA (ENSMICG00000043725) #21	RHOA (ENSMICG00000032818) #22	GPX1 (ENSMICG00000034931) #23	USP4 (ENSMICG00000043936) #24	C3orf62 (ENSMICG00000044230) #25	IHO1 (ENSMICG00000029553) #27	C3orf84 (ENSMICG00000026553) #28	KLHDC8B (ENSMICG00000007972) #29	CCDC71 (ENSMICG00000034099)	LAMB2 (ENSMICG00000007913) #30	USP19 (ENSMICG00000007895) #31	QARS1 (ENSMICG00000007885) #32	QRICH1 (ENSMICG00000028751) #33	IMPDH2 (ENSMICG00000007866) #34	NDUFAF3 (ENSMICG00000007862) #35	DALRD3 (ENSMICG00000007858) #37	WDR6 (ENSMICG00000007852)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	169	ENSMICG00000034786	ENSMICG00000033128	ENSMICG00000030858	ENSMICG00000027545	SLITRK2 (ENSMICG00000003910)	ENSMICG00000014241	ENSMICG00000007978	SHROOM2 (ENSMICG00000045523)	GPR143 (ENSMICG00000010413)	ENSMICG00000010404	ANOS1 (ENSMICG00000015083)	PNPLA4 (ENSMICG00000009614)	STS (ENSMICG00000013455)	PUDP (ENSMICG00000017082)	ENSMICG00000036320	ENSMICG00000044079 #22	ENSMICG00000046354	ENSMICG00000046693	PRKX (ENSMICG00000002892)	MXRA5 (ENSMICG00000003692)	WWC3 (ENSMICG00000002471)	CLCN4 (ENSMICG00000002480)	MID1 (ENSMICG00000002488)	HCCS (ENSMICG00000014372)	ARHGAP6 (ENSMICG00000014376)	AMELX (ENSMICG00000034215)	ENSMICG00000046301	MSL3 (ENSMICG00000014399)	FRMPD4 (ENSMICG00000014417)	PRPS2 (ENSMICG00000034531)	TLR7 (ENSMICG00000030654)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Tree shrew	MODERN SPECIES	4981																RHOA (ENSTBEG00000002417) #22	GPX1 (ENSTBEG00000001653) #23	USP4 (ENSTBEG00000008478) #24	C3orf62 (ENSTBEG00000007849) #25	ENSTBEG00000007701 #26	IHO1 (ENSTBEG00000007145) #27	KLHDC8B (ENSTBEG00000006660) #29	LAMB2 (ENSTBEG00000004366) #30
Glires	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824.b	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824.b	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824.b	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Guinea pig	MODERN SPECIES	8	CAMKV (ENSCPOG00000003484)	TRAIP (ENSCPOG00000003478) #7	INKA1 (ENSCPOG00000026986) #9	UBA7 (ENSCPOG00000008926) #8	IP6K1 (ENSCPOG00000040339) #11	GMPPB (ENSCPOG00000020537) #13	AMIGO3 (ENSCPOG00000020283) #14	RNF123 (ENSCPOG00000011432) #12	MST1 (ENSCPOG00000011422) #15	APEH (ENSCPOG00000011416) #16	BSN (ENSCPOG00000040726) #17	DAG1 (ENSCPOG00000034832) #18	NICN1 (ENSCPOG00000019324) #19	AMT (ENSCPOG00000023233) #20	TCTA (ENSCPOG00000035311) #21	RHOA (ENSCPOG00000014073) #22	USP4 (ENSCPOG00000010272) #24	C3orf62 (ENSCPOG00000026439) #25	IHO1 (ENSCPOG00000013672) #27	C3orf84 (ENSCPOG00000024951) #28	KLHDC8B (ENSCPOG00000031477) #29	CCDC71 (ENSCPOG00000010009)	LAMB2 (ENSCPOG00000009993) #30	USP19 (ENSCPOG00000009975) #31	QARS1 (ENSCPOG00000009967) #32	ENSCPOG00000009958 #33	IMPDH2 (ENSCPOG00000009955) #34	NDUFAF3 (ENSCPOG00000009951) #35	DALRD3 (ENSCPOG00000022699) #37	WDR6 (ENSCPOG00000000708)	P4HTM (ENSCPOG00000008347)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824.b	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Degu	DUPLICATION
Degu	DUPLICATION
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Naked mole-rat female	DUPLICATION
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Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	1	INKA1 (ENSSVLG00005021510) #9	ENSSVLG00005021431 #10	ENSSVLG00005021379	IP6K1 (ENSSVLG00005021336) #11	GMPPB (ENSSVLG00005021153) #13	AMIGO3 (ENSSVLG00005021129) #14	RNF123 (ENSSVLG00005020644) #12	MST1 (ENSSVLG00005020451) #15	APEH (ENSSVLG00005020366) #16	BSN (ENSSVLG00005020232) #17	ENSSVLG00005020188	DAG1 (ENSSVLG00005020152) #18	NICN1 (ENSSVLG00005020072) #19	AMT (ENSSVLG00005019729) #20	TCTA (ENSSVLG00005019277) #21	RHOA (ENSSVLG00005019199) #22	GPX1 (ENSSVLG00005019095) #23	ENSSVLG00005019055	USP4 (ENSSVLG00005018952) #24	C3orf62 (ENSSVLG00005018903) #25	IHO1 (ENSSVLG00005018854) #27	C3orf84 (ENSSVLG00005018760) #28	KLHDC8B (ENSSVLG00005018723) #29	CCDC71 (ENSSVLG00005018689)	USP19 (ENSSVLG00005018580) #31	QARS1 (ENSSVLG00005017939) #32	ENSSVLG00005017903	QRICH1 (ENSSVLG00005017854) #33	IMPDH2 (ENSSVLG00005017627) #34	NDUFAF3 (ENSSVLG00005017494) #35	DALRD3 (ENSSVLG00005017322) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000007696.f #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824.b	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00390000007696.f #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824.b	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Squirrel	DUPLICATION
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Arctic ground squirrel	DUPLICATION
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Alpin marmot	DUPLICATION
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Alpin marmot	MODERN SPECIES	19	CAMKV (ENSMMMG00000003886)	ENSMMMG00000003945 #7	UBA7 (ENSMMMG00000003996) #8	INKA1 (ENSMMMG00000004578) #9	IP6K1 (ENSMMMG00000004620) #11	GMPPB (ENSMMMG00000004636) #13	RNF123 (ENSMMMG00000004667) #12	AMIGO3 (ENSMMMG00000004824) #14	MST1 (ENSMMMG00000004828) #15	APEH (ENSMMMG00000004875) #16	BSN (ENSMMMG00000004916) #17	DAG1 (ENSMMMG00000004993) #18	NICN1 (ENSMMMG00000005004) #19	AMT (ENSMMMG00000005018) #20	ENSMMMG00000005039 #21	RHOA (ENSMMMG00000005067) #22	GPX1 (ENSMMMG00000005079) #23	USP4 (ENSMMMG00000005114) #24	C3orf62 (ENSMMMG00000005162) #25	IHO1 (ENSMMMG00000005177) #27	C3orf84 (ENSMMMG00000005193) #28	KLHDC8B (ENSMMMG00000005206) #29	CCDC71 (ENSMMMG00000005226)	LAMB2 (ENSMMMG00000005235) #30	USP19 (ENSMMMG00000005310) #31	QARS1 (ENSMMMG00000005497) #32	QRICH1 (ENSMMMG00000005623) #33	IMPDH2 (ENSMMMG00000005658) #34	NDUFAF3 (ENSMMMG00000005669) #35	DALRD3 (ENSMMMG00000005693) #37	WDR6 (ENSMMMG00000005711)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Kangaroo rat	DUPLICATION
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Kangaroo rat	MODERN SPECIES	504					Eda2r (ENSDORG00000009069)	Pgr15l (ENSDORG00000026395)	Gpr165 (ENSDORG00000029067)	Heph (ENSDORG00000003982)	ENSDORG00000027164	Vsig4 (ENSDORG00000001232)	Msn (ENSDORG00000016668)	ENSDORG00000023763	Las1l (ENSDORG00000001130)	Zc3h12b (ENSDORG00000024832)	Zc4h2 (ENSDORG00000014468)	ENSDORG00000012364 #22	Asb12 (ENSDORG00000029329)	Amer1 (ENSDORG00000027620)	Arhgef9 (ENSDORG00000010147)	Spin4 (ENSDORG00000029504)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1657	Traip (ENSNGAG00000011282) #7	Uba7 (ENSNGAG00000012558) #8	Inka1 (ENSNGAG00000013600) #9	Cdhr4 (ENSNGAG00000014691)	Ip6k1 (ENSNGAG00000017703) #11	Gmppb (ENSNGAG00000018492) #13	Rnf123 (ENSNGAG00000000251) #12	Amigo3 (ENSNGAG00000017398) #14	Mst1 (ENSNGAG00000012975) #15	Apeh (ENSNGAG00000017302) #16	Bsn (ENSNGAG00000021371) #17	Dag1 (ENSNGAG00000002651) #18	Nicn1 (ENSNGAG00000003280) #19	Amt (ENSNGAG00000004673) #20	Tcta (ENSNGAG00000005564) #21	Rhoa (ENSNGAG00000007854) #22	Gpx1 (ENSNGAG00000015216) #23	Usp4 (ENSNGAG00000016905) #24	1700102P08Rik (ENSNGAG00000006755) #25	Iho1 (ENSNGAG00000008202) #27	BC048562 (ENSNGAG00000009611) #28	Klhdc8b (ENSNGAG00000010343) #29	Ccdc71 (ENSNGAG00000010873)	Lamb2 (ENSNGAG00000013899) #30	Usp19 (ENSNGAG00000017354) #31	Qars (ENSNGAG00000019897) #32	Qrich1 (ENSNGAG00000000436) #33	Impdh2 (ENSNGAG00000001022) #34	Ndufaf3 (ENSNGAG00000001095) #35	Dalrd3 (ENSNGAG00000002570) #37	Wdr6 (ENSNGAG00000000962)
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Mus	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007696.g #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Mus_B	DUPLICATION
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Mouse	MODERN SPECIES	18	Traip (ENSMUSG00000032586) #7	Uba7 (ENSMUSG00000032596) #8	Inka1 (ENSMUSG00000042106) #9	Cdhr4 (ENSMUSG00000032595)	Ip6k1 (ENSMUSG00000032594) #11	Gmppb (ENSMUSG00000070284) #13	Rnf123 (ENSMUSG00000041528) #12	Amigo3 (ENSMUSG00000032593) #14	Mst1 (ENSMUSG00000032591) #15	Apeh (ENSMUSG00000032590) #16	Bsn (ENSMUSG00000032589) #17	Dag1 (ENSMUSG00000039952) #18	Nicn1 (ENSMUSG00000032606) #19	Amt (ENSMUSG00000032607) #20	Tcta (ENSMUSG00000039461) #21	Rhoa (ENSMUSG00000007815) #22	Gpx1 (ENSMUSG00000063856) #23	Usp4 (ENSMUSG00000032612) #24	1700102P08Rik (ENSMUSG00000032611) #25	Iho1 (ENSMUSG00000047220) #27	BC048562 (ENSMUSG00000050641) #28	Klhdc8b (ENSMUSG00000032609) #29	Ccdc71 (ENSMUSG00000049305)	Lamb2 (ENSMUSG00000052911) #30	Usp19 (ENSMUSG00000006676) #31	Qars (ENSMUSG00000032604) #32	Qrich1 (ENSMUSG00000006673) #33	Impdh2 (ENSMUSG00000062867) #34	Ndufaf3 (ENSMUSG00000070283) #35	Dalrd3 (ENSMUSG00000019039) #37	Wdr6 (ENSMUSG00000066357)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000007696.g #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b.s #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2942	Uba7 (ENSMSIG00000023739) #8	Inka1 (ENSMSIG00000023762) #9	Cdhr4 (ENSMSIG00000023775)	Ip6k1 (ENSMSIG00000023836) #11	Gmppb (ENSMSIG00000023845) #13	Rnf123 (ENSMSIG00000023874) #12	Amigo3 (ENSMSIG00000024086) #14	Mst1 (ENSMSIG00000024095) #15	Apeh (ENSMSIG00000024125) #16	Bsn (ENSMSIG00000024136) #17	ENSMSIG00000024201	Dag1 (ENSMSIG00000024222) #18	Nicn1 (ENSMSIG00000024241) #19	Amt (ENSMSIG00000024252) #20	Tcta (ENSMSIG00000024280) #21	Rhoa (ENSMSIG00000024290) #22	Gpx1 (ENSMSIG00000024310) #23	Usp4 (ENSMSIG00000024333) #24	ENSMSIG00000024427	1700102P08Rik (ENSMSIG00000024429) #25	Iho1 (ENSMSIG00000024437) #27	BC048562 (ENSMSIG00000024449) #28	Klhdc8b (ENSMSIG00000024460) #29	Ccdc71 (ENSMSIG00000024477)	Lamb2 (ENSMSIG00000024492) #30	Usp19 (ENSMSIG00000024529) #31	Qars (ENSMSIG00000024675) #32	Qrich1 (ENSMSIG00000024752) #33	Impdh2 (ENSMSIG00000000088) #34	Ndufaf3 (ENSMSIG00000000202) #35	Dalrd3 (ENSMSIG00000000255) #37
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182945.b.b.t #22
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182945.b.b.t #22
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2634														Cobll1 (ENSMSIG00000029682)	Grb14 (ENSMSIG00000029702)	ENSMSIG00000029711 #22	ENSMSIG00000029713
Shrew mouse	MODERN SPECIES	1	Uba7 (MGP_PahariEiJ_G0015535) #8	MGP_PahariEiJ_G0015536	Inka1 (MGP_PahariEiJ_G0015537) #9	Cdhr4 (MGP_PahariEiJ_G0015538)	Ip6k1 (MGP_PahariEiJ_G0015540) #11	Gmppb (MGP_PahariEiJ_G0015541) #13	Rnf123 (MGP_PahariEiJ_G0015542) #12	Amigo3 (MGP_PahariEiJ_G0015543) #14	Mst1 (MGP_PahariEiJ_G0015544) #15	Apeh (MGP_PahariEiJ_G0015545) #16	Bsn (MGP_PahariEiJ_G0015546) #17	Dag1 (MGP_PahariEiJ_G0015547) #18	Nicn1 (MGP_PahariEiJ_G0015548) #19	Amt (MGP_PahariEiJ_G0015549) #20	MGP_PahariEiJ_G0015550 #21	Rhoa (MGP_PahariEiJ_G0015551) #22	MGP_PahariEiJ_G0015552 #23	Usp4 (MGP_PahariEiJ_G0015553) #24	1700102P08Rik (MGP_PahariEiJ_G0015554) #25	Iho1 (MGP_PahariEiJ_G0015555) #27	BC048562 (MGP_PahariEiJ_G0015556) #28	Klhdc8b (MGP_PahariEiJ_G0015557) #29	Ccdc71 (MGP_PahariEiJ_G0015558)	MGP_PahariEiJ_G0015559 #30	Usp19 (MGP_PahariEiJ_G0015560) #31	Qars (MGP_PahariEiJ_G0015561) #32	Qrich1 (MGP_PahariEiJ_G0015562) #33	Impdh2 (MGP_PahariEiJ_G0015563) #34	Ndufaf3 (MGP_PahariEiJ_G0015564) #35	Dalrd3 (MGP_PahariEiJ_G0015565) #37	Wdr6 (MGP_PahariEiJ_G0015566)
Rat	MODERN SPECIES	18	Actl11 (ENSRNOG00000032642)	Camkv (ENSRNOG00000058938)	Traip (ENSRNOG00000030101) #7	Uba7 (ENSRNOG00000029195) #8	Inka1 (ENSRNOG00000019363) #9	Cdhr4 (ENSRNOG00000061650)	Amigo3 (ENSRNOG00000064183) #14	Gmppb (ENSRNOG00000037229) #13	Rnf123 (ENSRNOG00000033378) #12	Mst1 (ENSRNOG00000019680) #15	Apeh (ENSRNOG00000029572) #16	Bsn (ENSRNOG00000030714) #17	Dag1 (ENSRNOG00000019400) #18	Nicn1 (ENSRNOG00000049083) #19	Amt (ENSRNOG00000050214) #20	Rhoa (ENSRNOG00000050519) #22	Gpx1 (ENSRNOG00000048812) #23	LOC498675 (ENSRNOG00000046155) #25	Usp4 (ENSRNOG00000054863) #24	Iho1 (ENSRNOG00000048919) #27	LOC680045 (ENSRNOG00000047468) #28	Klhdc8b (ENSRNOG00000047867) #29	Ccdc71 (ENSRNOG00000048718)	Lamb2 (ENSRNOG00000047768) #30	Usp19 (ENSRNOG00000049531) #31	Qars1 (ENSRNOG00000060912) #32	Qrich1 (ENSRNOG00000025071) #33	Impdh2 (ENSRNOG00000031965) #34	Ndufaf3 (ENSRNOG00000020068) #35	Dalrd3 (ENSRNOG00000020159) #37	Wdr6 (ENSRNOG00000020185)
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	284	Traip (ENSCGRG00001014038) #7	Uba7 (ENSCGRG00001018183) #8	Inka1 (ENSCGRG00001015099) #9	Cdhr4 (ENSCGRG00001023124)	Ip6k1 (ENSCGRG00001024230) #11	Gmppb (ENSCGRG00001023297) #13	Amigo3 (ENSCGRG00001011127) #14	Rnf123 (ENSCGRG00001003340) #12	Mst1 (ENSCGRG00001013799) #15	Apeh (ENSCGRG00001002191) #16	Bsn (ENSCGRG00001021798) #17	Dag1 (ENSCGRG00001013896) #18	Nicn1 (ENSCGRG00001012420) #19	Amt (ENSCGRG00001000903) #20	Tcta (ENSCGRG00001010040) #21	Rhoa (ENSCGRG00001019741) #22	Gpx1 (ENSCGRG00001017592) #23	Usp4 (ENSCGRG00001011482) #24	1700102P08Rik (ENSCGRG00001024671) #25	Iho1 (ENSCGRG00001013280) #27	BC048562 (ENSCGRG00001021532) #28	Klhdc8b (ENSCGRG00001015630) #29	Ccdc71 (ENSCGRG00001005293)	Lamb2 (ENSCGRG00001021919) #30	Usp19 (ENSCGRG00001020926) #31	Qars (ENSCGRG00001021363) #32	Qrich1 (ENSCGRG00001017320) #33	Impdh2 (ENSCGRG00001002016) #34	Ndufaf3 (ENSCGRG00001023494) #35	Dalrd3 (ENSCGRG00001020135) #37	Wdr6 (ENSCGRG00001020890)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Prairie vole	DUPLICATION
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Northern American deer mouse	DUPLICATION
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Pika	MODERN SPECIES	3496													ENSOPRG00000009686 #19	AMT (ENSOPRG00000009659) #20	TCTA (ENSOPRG00000009649) #21	RHOA (ENSOPRG00000009638) #22	GPX1 (ENSOPRG00000009632) #23	USP4 (ENSOPRG00000009591) #24	C3orf62 (ENSOPRG00000009584) #25	ENSOPRG00000009550 #27	ENSOPRG00000009534 #29
Rabbit	MODERN SPECIES	20	INKA1 (ENSOCUG00000006590) #9	CDHR4 (ENSOCUG00000009174)	RPL28 (ENSOCUG00000027112)	IP6K1 (ENSOCUG00000005017) #11	GMPPB (ENSOCUG00000005015) #13	AMIGO3 (ENSOCUG00000022672) #14	ENSOCUG00000004999 #12	ENSOCUG00000032568 #12	ENSOCUG00000030741	MST1 (ENSOCUG00000004997) #15	APEH (ENSOCUG00000004990) #16	ENSOCUG00000030238 ##17	DAG1 (ENSOCUG00000003439) #18	AMT (ENSOCUG00000013310) #20	TCTA (ENSOCUG00000013319) #21	RHOA (ENSOCUG00000013323) #22	ENSOCUG00000005938 #23	USP4 (ENSOCUG00000005926) #24	C3orf62 (ENSOCUG00000032815) #25	IHO1 (ENSOCUG00000005910) #27	C3orf84 (ENSOCUG00000022446) #28	KLHDC8B (ENSOCUG00000017588) #29	CCDC71 (ENSOCUG00000017593)	LAMB2 (ENSOCUG00000005101) #30	USP19 (ENSOCUG00000005092) #31	QARS1 (ENSOCUG00000005082) #32	QRICH1 (ENSOCUG00000017728) #33	IMPDH2 (ENSOCUG00000017724) #34	NDUFAF3 (ENSOCUG00000017721) #35	DALRD3 (ENSOCUG00000017715) #37	WDR6 (ENSOCUG00000017712)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00910000147297	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00910000147297	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35
Suina	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	950	TRAIP (ENSCWAG00000019468) #7	UBA7 (ENSCWAG00000019360) #8	INKA1 (ENSCWAG00000019340) #9	CDHR4 (ENSCWAG00000019261)	IP6K1 (ENSCWAG00000019240) #11	GMPPB (ENSCWAG00000019216) #13	AMIGO3 (ENSCWAG00000019208) #14	RNF123 (ENSCWAG00000019153) #12	MST1 (ENSCWAG00000019054) #15	APEH (ENSCWAG00000018898) #16	BSN (ENSCWAG00000018840) #17	DAG1 (ENSCWAG00000018804) #18	NICN1 (ENSCWAG00000018764) #19	AMT (ENSCWAG00000018363) #20	TCTA (ENSCWAG00000018314) #21	RHOA (ENSCWAG00000018291) #22	GPX1 (ENSCWAG00000018272) #23	USP4 (ENSCWAG00000018178) #24	C3orf62 (ENSCWAG00000018125) #25	IHO1 (ENSCWAG00000018076) #27	C3orf84 (ENSCWAG00000018023) #28	KLHDC8B (ENSCWAG00000018001) #29	CCDC71 (ENSCWAG00000017986)	LAMB2 (ENSCWAG00000017876) #30	USP19 (ENSCWAG00000017460) #31	QARS1 (ENSCWAG00000017330) #32	QRICH1 (ENSCWAG00000017279) #33	IMPDH2 (ENSCWAG00000017226) #34	NDUFAF3 (ENSCWAG00000017192) #35	DALRD3 (ENSCWAG00000017109) #37	WDR6 (ENSCWAG00000017019)
Pig	MODERN SPECIES	4	TRAIP (ENSSSCG00000026977) #7	UBA7 (ENSSSCG00000011393) #8	INKA1 (ENSSSCG00000049797) #9	CDHR4 (ENSSSCG00000011391)	IP6K1 (ENSSSCG00000011390) #11	GMPPB (ENSSSCG00000062528) #13	AMIGO3 (ENSSSCG00000011389) #14	RNF123 (ENSSSCG00000011387) #12	MST1 (ENSSSCG00000011386) #15	APEH (ENSSSCG00000011385) #16	BSN (ENSSSCG00000011384) #17	DAG1 (ENSSSCG00000034357) #18	NICN1 (ENSSSCG00000031594) #19	AMT (ENSSSCG00000022975) #20	TCTA (ENSSSCG00000037459) #21	RHOA (ENSSSCG00000022080) #22	GPX1 (ENSSSCG00000060656) #23	USP4 (ENSSSCG00000011382) #24	C3orf62 (ENSSSCG00000056386) #25	IHO1 (ENSSSCG00000011376) #27	C3orf84 (ENSSSCG00000058399) #28	KLHDC8B (ENSSSCG00000011379) #29	CCDC71 (ENSSSCG00000011378)	LAMB2 (ENSSSCG00000011377) #30	USP19 (ENSSSCG00000011375) #31	QARS1 (ENSSSCG00000032031) #32	IMPDH2 (ENSSSCG00000011373) #34	NDUFAF3 (ENSSSCG00000011371) #35	DALRD3 (ENSSSCG00000011370) #37	WDR6 (ENSSSCG00000011369)	P4HTM (ENSSSCG00000011368)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000006665.a	ENSGT00940000157842	ENSGT00940000156468	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Alpaca	MODERN SPECIES	2058																RHOA (ENSVPAG00000010931) #22	USP4 (ENSVPAG00000010928) #24	IHO1 (ENSVPAG00000010926) #27
Arabian camel	MODERN SPECIES	8	CAMKV (ENSCDRG00005006662)	TRAIP (ENSCDRG00005006548) #7	INKA1 (ENSCDRG00005006504) #9	UBA7 (ENSCDRG00005006225) #8	IP6K1 (ENSCDRG00005006149) #11	GMPPB (ENSCDRG00005006104) #13	AMIGO3 (ENSCDRG00005006096) #14	RNF123 (ENSCDRG00005005945) #12	MST1 (ENSCDRG00005005862) #15	APEH (ENSCDRG00005005764) #16	BSN (ENSCDRG00005005743) #17	DAG1 (ENSCDRG00005005724) #18	NICN1 (ENSCDRG00005005671) #19	AMT (ENSCDRG00005005389) #20	TCTA (ENSCDRG00005005330) #21	RHOA (ENSCDRG00005005306) #22	ENSCDRG00005005290 #23	USP4 (ENSCDRG00005005199) #24	C3orf62 (ENSCDRG00005005169) #25	IHO1 (ENSCDRG00005005122) #27	C3orf84 (ENSCDRG00005005088) #28	KLHDC8B (ENSCDRG00005005058) #29	CCDC71 (ENSCDRG00005005037)	LAMB2 (ENSCDRG00005004573) #30	QARS1 (ENSCDRG00005004349) #32	QRICH1 (ENSCDRG00005004282) #33	IMPDH2 (ENSCDRG00005004218) #34	NDUFAF3 (ENSCDRG00005004181) #35	DALRD3 (ENSCDRG00005004060) #37	WDR6 (ENSCDRG00005003990)	P4HTM (ENSCDRG00005003922)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT01030000235142.a	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT01030000235142.a	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Caprinae	DUPLICATION
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT01030000235142.a	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b.jb #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00910000146976 #36	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Goat	MODERN SPECIES	14	UBA7 (ENSCHIG00000011154) #8	INKA1 (ENSCHIG00000014035) #9	CDHR4 (ENSCHIG00000018704)	IP6K1 (ENSCHIG00000025216) #11	GMPPB (ENSCHIG00000000504) #13	RNF123 (ENSCHIG00000011253) #12	AMIGO3 (ENSCHIG00000007879) #14	MST1 (ENSCHIG00000014887) #15	APEH (ENSCHIG00000007324) #16	BSN (ENSCHIG00000015658) #17	DAG1 (ENSCHIG00000015784) #18	ENSCHIG00000009691	NICN1 (ENSCHIG00000010612) #19	AMT (ENSCHIG00000017556) #20	TCTA (ENSCHIG00000014306) #21	RHOA (ENSCHIG00000013894) #22	GPX1 (ENSCHIG00000017983) #23	USP4 (ENSCHIG00000017572) #24	C3orf62 (ENSCHIG00000009739) #25	IHO1 (ENSCHIG00000009674) #27	C3orf84 (ENSCHIG00000015744) #28	KLHDC8B (ENSCHIG00000022366) #29	CCDC71 (ENSCHIG00000012608)	LAMB2 (ENSCHIG00000015310) #30	USP19 (ENSCHIG00000019576) #31	QARS1 (ENSCHIG00000022953) #32	QRICH1 (ENSCHIG00000016705) #33	IMPDH2 (ENSCHIG00000011336) #34	ENSCHIG00000008827 #36	NDUFAF3 (ENSCHIG00000022087) #35	DALRD3 (ENSCHIG00000018628) #37
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	10	TRAIP (ENSOARG00020018511) #7	UBA7 (ENSOARG00020018640) #8	INKA1 (ENSOARG00020018717) #9	CDHR4 (ENSOARG00020018751)	IP6K1 (ENSOARG00020019030) #11	GMPPB (ENSOARG00020019131) #13	RNF123 (ENSOARG00020019208) #12	AMIGO3 (ENSOARG00020019658) #14	MST1 (ENSOARG00020019678) #15	APEH (ENSOARG00020019834) #16	BSN (ENSOARG00020020014) #17	DAG1 (ENSOARG00020020102) #18	NICN1 (ENSOARG00020020154) #19	AMT (ENSOARG00020020285) #20	TCTA (ENSOARG00020020854) #21	RHOA (ENSOARG00020020892) #22	GPX1 (ENSOARG00020020922) #23	USP4 (ENSOARG00020020981) #24	C3orf62 (ENSOARG00020021187) #25	ENSOARG00020021222	C3orf84 (ENSOARG00020021267) #28	KLHDC8B (ENSOARG00020021328) #29	CCDC71 (ENSOARG00020021366)	ENSOARG00020021399 #30	LAMB2 (ENSOARG00020021611) #30	USP19 (ENSOARG00020021723) #31	QARS1 (ENSOARG00020022319) #32	QRICH1 (ENSOARG00020022369) #33	IMPDH2 (ENSOARG00020022397) #34	NDUFAF3 (ENSOARG00020022430) #35	DALRD3 (ENSOARG00020022500) #37
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000005739.a.a	ENSGT00800000124060.A.a	ENSGT00940000156187	ENSGT00940000153322.A	ENSGT00390000017284.a.b	ENSGT00510000047418	ENSGT00390000010888.c.a	ENSGT00390000005650	ENSGT00940000161413	ENSGT00940000161043	ENSGT00940000161863	ENSGT01030000234575.d.c	ENSGT00440000033552	ENSGT00940000159299	ENSGT00940000160058	ENSGT00950000182945.b.b.kb #22	ENSGT00390000006707.q.e.c	ENSGT00950000183114.a.a	ENSGT00950000182886.b.a	ENSGT00390000006408	ENSGT00390000008808.o	ENSGT01050000245125	ENSGT00940000156258	ENSGT00940000159934	ENSGT00940000161744	ENSGT00940000153168.B	ENSGT00940000156126	ENSGT00500000044929	ENSGT00900000143268	ENSGT00940000155823.B	ENSGT00940000158843
Goat	MODERN SPECIES	2	ENSCHIG00000016045	CYP26B1 (ENSCHIG00000017070)	DYSF (ENSCHIG00000007595)	ENSCHIG00000022714	ENSCHIG00000003741	PAIP2B (ENSCHIG00000021303)	NAGK (ENSCHIG00000025409)	TEX261 (ENSCHIG00000009683)	ATP6V1B1 (ENSCHIG00000014286)	VAX2 (ENSCHIG00000011015)	CD207 (ENSCHIG00000009900)	CLEC4F (ENSCHIG00000021250)	FIGLA (ENSCHIG00000020665)	ADD2 (ENSCHIG00000016487)	TGFA (ENSCHIG00000018063)	ENSCHIG00000013552 #22	ENSCHIG00000009384	ENSCHIG00000015553	XDH (ENSCHIG00000017276)	SRD5A2 (ENSCHIG00000025648)	MEMO1 (ENSCHIG00000006439)	ENSCHIG00000021755	ENSCHIG00000021921	SPAST (ENSCHIG00000015378)	SLC30A6 (ENSCHIG00000024551)	NLRC4 (ENSCHIG00000012340)	YIPF4 (ENSCHIG00000026569)	BIRC6 (ENSCHIG00000008751)	TTC27 (ENSCHIG00000017374)	ENSCHIG00000022577	ENSCHIG00000008282
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	19	ENSOARG00020007772	EXOC6B (ENSOARG00020007215)	CYP26B1 (ENSOARG00020007013)	DYSF (ENSOARG00020005927)	PAIP2B (ENSOARG00020005747)	NAGK (ENSOARG00020005719)	TEX261 (ENSOARG00020005704)	ANKRD53 (ENSOARG00020005675)	ATP6V1B1 (ENSOARG00020005560)	VAX2 (ENSOARG00020005545)	CD207 (ENSOARG00020005507)	ENSOARG00020005471	FIGLA (ENSOARG00020005437)	ADD2 (ENSOARG00020005142)	TGFA (ENSOARG00020005087)	ENSOARG00020005077 #22	ENSOARG00020005043	XDH (ENSOARG00020004988)	ENSOARG00020004969	ENSOARG00020004948	SRD5A2 (ENSOARG00020004906)	MEMO1 (ENSOARG00020004857)	ENSOARG00020004831	SPAST (ENSOARG00020004331)	SLC30A6 (ENSOARG00020004173)	NLRC4 (ENSOARG00020004057)	YIPF4 (ENSOARG00020004030)	BIRC6 (ENSOARG00020002705)	TTC27 (ENSOARG00020002552)	TMOD3 (ENSOARG00020002535)	LTBP1 (ENSOARG00020001760)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658.b	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Bos	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT01100000263480.a.b.b.a.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT01100000263480.a.b.b.a.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Wild yak	MODERN SPECIES	2401																RHOA (ENSBMUG00000014394) #22	GPX1 (ENSBMUG00000014390) #23	USP4 (ENSBMUG00000014366) #24	C3orf62 (ENSBMUG00000014327) #25	IHO1 (ENSBMUG00000014305) #27	C3orf84 (ENSBMUG00000014279) #28	KLHDC8B (ENSBMUG00000014264) #29	CCDC71 (ENSBMUG00000014262)	ENSBMUG00000014250 #30	LAMB2 (ENSBMUG00000014195) #30	USP19 (ENSBMUG00000014055) #31	QARS1 (ENSBMUG00000013897) #32	QRICH1 (ENSBMUG00000013833) #33	IMPDH2 (ENSBMUG00000013821) #34	NDUFAF3 (ENSBMUG00000013786) #35	DALRD3 (ENSBMUG00000013752) #37
Domestic yak	MODERN SPECIES	14	ENSBGRG00000022194 #10	ENSBGRG00000022158	IP6K1 (ENSBGRG00000022097) #11	GMPPB (ENSBGRG00000021950) #13	AMIGO3 (ENSBGRG00000021936) #14	RNF123 (ENSBGRG00000021700) #12	MST1 (ENSBGRG00000021540) #15	APEH (ENSBGRG00000020998) #16	BSN (ENSBGRG00000020893) #17	DAG1 (ENSBGRG00000020861) #18	ENSBGRG00000020826	NICN1 (ENSBGRG00000020735) #19	AMT (ENSBGRG00000020243) #20	TCTA (ENSBGRG00000020134) #21	ENSBGRG00000020118	RHOA (ENSBGRG00000020019) #22	GPX1 (ENSBGRG00000019961) #23	USP4 (ENSBGRG00000019272) #24	C3orf62 (ENSBGRG00000019210) #25	ENSBGRG00000019151	C3orf84 (ENSBGRG00000019083) #28	KLHDC8B (ENSBGRG00000019038) #29	CCDC71 (ENSBGRG00000019022)	USP19 (ENSBGRG00000017987) #31	LAMB2 (ENSBGRG00000016632) #30	QARS1 (ENSBGRG00000015757) #32	QRICH1 (ENSBGRG00000015681) #33	IMPDH2 (ENSBGRG00000015395) #34	NDUFAF3 (ENSBGRG00000015330) #35	DALRD3 (ENSBGRG00000024128) #37	WDR6 (ENSBGRG00000024062)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT01100000263480.a.b.b.a.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	14	CAMKV (ENSBIXG00005001014)	TRAIP (ENSBIXG00005011136) #7	UBA7 (ENSBIXG00005007099) #8	INKA1 (ENSBIXG00005011173) #9	CDHR4 (ENSBIXG00005001045)	IP6K1 (ENSBIXG00005011256) #11	AMIGO3 (ENSBIXG00005011300) #14	RNF123 (ENSBIXG00005011367) #12	MST1 (ENSBIXG00005011434) #15	APEH (ENSBIXG00005011475) #16	BSN (ENSBIXG00005011525) #17	DAG1 (ENSBIXG00005011549) #18	AMT (ENSBIXG00005011718) #20	TCTA (ENSBIXG00005007432) #21	ENSBIXG00005006787	RHOA (ENSBIXG00005011793) #22	GPX1 (ENSBIXG00005011815) #23	C3orf62 (ENSBIXG00005005956) #25	USP4 (ENSBIXG00005011888) #24	IHO1 (ENSBIXG00005011909) #27	C3orf84 (ENSBIXG00005001208) #28	KLHDC8B (ENSBIXG00005011961) #29	CCDC71 (ENSBIXG00005000414)	ENSBIXG00005002536 #30	LAMB2 (ENSBIXG00005016314) #30	USP19 (ENSBIXG00005017369) #31	QARS1 (ENSBIXG00005017449) #32	QRICH1 (ENSBIXG00005017495) #33	IMPDH2 (ENSBIXG00005002847) #34	NDUFAF3 (ENSBIXG00005002855) #35	DALRD3 (ENSBIXG00005017624) #37
Cow	MODERN SPECIES	14	TRAIP (ENSBTAG00000004877) #7	UBA7 (ENSBTAG00000012335) #8	INKA1 (ENSBTAG00000012322) #9	CDHR4 (ENSBTAG00000005728)	IP6K1 (ENSBTAG00000011595) #11	GMPPB (ENSBTAG00000032026) #13	RNF123 (ENSBTAG00000011588) #12	AMIGO3 (ENSBTAG00000045547) #14	MST1 (ENSBTAG00000011585) #15	APEH (ENSBTAG00000011583) #16	BSN (ENSBTAG00000011581) #17	DAG1 (ENSBTAG00000011580) #18	NICN1 (ENSBTAG00000000387) #19	AMT (ENSBTAG00000002321) #20	TCTA (ENSBTAG00000022632) #21	RHOA (ENSBTAG00000004279) #22	GPX1 (ENSBTAG00000054195) #23	USP4 (ENSBTAG00000011899) #24	C22H3orf62 (ENSBTAG00000011894) #25	IHO1 (ENSBTAG00000009371) #27	C22H3orf84 (ENSBTAG00000000982) #28	KLHDC8B (ENSBTAG00000000981) #29	CCDC71 (ENSBTAG00000013932)	ENSBTAG00000055290 #30	LAMB2 (ENSBTAG00000022635) #30	USP19 (ENSBTAG00000018921) #31	QARS1 (ENSBTAG00000018928) #32	QRICH1 (ENSBTAG00000018924) #33	IMPDH2 (ENSBTAG00000031837) #34	NDUFAF3 (ENSBTAG00000018918) #35	DALRD3 (ENSBTAG00000018913) #37
American bison	MODERN SPECIES	3218	UBA7 (ENSBBBG00000003166) #8	CDHR4 (ENSBBBG00000014084)	IP6K1 (ENSBBBG00000003137) #11	GMPPB (ENSBBBG00000014046) #13	ENSBBBG00000014023 #12	AMIGO3 (ENSBBBG00000014017) #14	ENSBBBG00000003101 #12	ENSBBBG00000014004	MST1 (ENSBBBG00000014000) #15	APEH (ENSBBBG00000013989) #16	BSN (ENSBBBG00000013959) #17	ENSBBBG00000003033	NICN1 (ENSBBBG00000003031) #19	AMT (ENSBBBG00000003011) #20	TCTA (ENSBBBG00000008744) #21	RHOA (ENSBBBG00000013828) #22	GPX1 (ENSBBBG00000013819) #23	USP4 (ENSBBBG00000013809) #24	C3orf62 (ENSBBBG00000002946) #25	IHO1 (ENSBBBG00000013760) #27	C3orf84 (ENSBBBG00000013731) #28	KLHDC8B (ENSBBBG00000002923) #29	CCDC71 (ENSBBBG00000002918)	LAMB2 (ENSBBBG00000013717) #30	USP19 (ENSBBBG00000013677) #31	QARS1 (ENSBBBG00000002795) #32	QRICH1 (ENSBBBG00000013477) #33	IMPDH2 (ENSBBBG00000002761) #34	NDUFAF3 (ENSBBBG00000013435) #35	DALRD3 (ENSBBBG00000013423) #37	WDR6 (ENSBBBG00000013397)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1221	UBA7 (ENSMMSG00000017878) #8	INKA1 (ENSMMSG00000017826) #9	CDHR4 (ENSMMSG00000017643)	IP6K1 (ENSMMSG00000017602) #11	GMPPB (ENSMMSG00000017539) #13	AMIGO3 (ENSMMSG00000017526) #14	RNF123 (ENSMMSG00000017430) #12	MST1 (ENSMMSG00000017325) #15	APEH (ENSMMSG00000017269) #16	BSN (ENSMMSG00000017196) #17	DAG1 (ENSMMSG00000017160) #18	ENSMMSG00000017122	NICN1 (ENSMMSG00000017077) #19	AMT (ENSMMSG00000015660) #20	TCTA (ENSMMSG00000015587) #21	RHOA (ENSMMSG00000015567) #22	ENSMMSG00000015545 #23	USP4 (ENSMMSG00000015420) #24	C3orf62 (ENSMMSG00000015397) #25	IHO1 (ENSMMSG00000015321) #27	C3orf84 (ENSMMSG00000015293) #28	KLHDC8B (ENSMMSG00000015273) #29	CCDC71 (ENSMMSG00000015262)	ENSMMSG00000015241 #30	LAMB2 (ENSMMSG00000015126) #30	USP19 (ENSMMSG00000014237) #31	QARS1 (ENSMMSG00000014108) #32	QRICH1 (ENSMMSG00000014082) #33	IMPDH2 (ENSMMSG00000013996) #34	NDUFAF3 (ENSMMSG00000013945) #35	DALRD3 (ENSMMSG00000013900) #37
Yarkand deer	MODERN SPECIES	16	TRAIP (ENSCHYG00000023857) #7	UBA7 (ENSCHYG00000023478) #8	INKA1 (ENSCHYG00000023419) #9	CDHR4 (ENSCHYG00000023265)	IP6K1 (ENSCHYG00000023188) #11	GMPPB (ENSCHYG00000023129) #13	AMIGO3 (ENSCHYG00000023119) #14	RNF123 (ENSCHYG00000022988) #12	MST1 (ENSCHYG00000022927) #15	APEH (ENSCHYG00000022817) #16	BSN (ENSCHYG00000022765) #17	DAG1 (ENSCHYG00000022724) #18	NICN1 (ENSCHYG00000022672) #19	AMT (ENSCHYG00000021143) #20	TCTA (ENSCHYG00000020985) #21	RHOA (ENSCHYG00000020943) #22	GPX1 (ENSCHYG00000020891) #23	USP4 (ENSCHYG00000020223) #24	C3orf62 (ENSCHYG00000020130) #25	ENSCHYG00000020109 #27	ENSCHYG00000020073	C3orf84 (ENSCHYG00000019991) #28	KLHDC8B (ENSCHYG00000019923) #29	CCDC71 (ENSCHYG00000019908)	LAMB2 (ENSCHYG00000018059) #30	USP19 (ENSCHYG00000017124) #31	QARS1 (ENSCHYG00000016793) #32	QRICH1 (ENSCHYG00000016705) #33	IMPDH2 (ENSCHYG00000016573) #34	NDUFAF3 (ENSCHYG00000016470) #35	DALRD3 (ENSCHYG00000016269) #37
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00990000203969.c.a	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Blue whale	MODERN SPECIES	2	ENSBMSG00010011457	CAMKV (ENSBMSG00010011342)	ENSBMSG00010011274 #7	UBA7 (ENSBMSG00010011261) #8	INKA1 (ENSBMSG00010011241) #9	CDHR4 (ENSBMSG00010011205)	ENSBMSG00010011075 #12	MST1 (ENSBMSG00010011031) #15	APEH (ENSBMSG00010011013) #16	BSN (ENSBMSG00010010989) #17	DAG1 (ENSBMSG00010010968) #18	ENSBMSG00010010960	NICN1 (ENSBMSG00010010937) #19	AMT (ENSBMSG00010010835) #20	TCTA (ENSBMSG00010010765) #21	RHOA (ENSBMSG00010010749) #22	ENSBMSG00010010726 #23	USP4 (ENSBMSG00010010655) #24	C3orf62 (ENSBMSG00010010582) #25	ENSBMSG00010010572 #26	IHO1 (ENSBMSG00010010547) #27	C3orf84 (ENSBMSG00010010524) #28	KLHDC8B (ENSBMSG00010010507) #29	CCDC71 (ENSBMSG00010010496)	LAMB2 (ENSBMSG00010010468) #30	USP19 (ENSBMSG00010010311) #31	QARS1 (ENSBMSG00010010201) #32	QRICH1 (ENSBMSG00010010177) #33	IMPDH2 (ENSBMSG00010010156) #34	NDUFAF3 (ENSBMSG00010010129) #35	DALRD3 (ENSBMSG00010010094) #37
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00990000203969.c.a	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00990000203969.c.a	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726.g #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Dolphin	MODERN SPECIES	1494																RHOA (ENSTTRG00000017370) #22	GPX1 (ENSTTRG00000017369) #23	USP4 (ENSTTRG00000017365) #24	ENSTTRG00000017364 #25	IHO1 (ENSTTRG00000017363) #27	KLHDC8B (ENSTTRG00000017361) #29	CCDC71 (ENSTTRG00000017360)	LAMB2 (ENSTTRG00000017357) #30	USP19 (ENSTTRG00000017355) #31	QARS1 (ENSTTRG00000017352) #32	QRICH1 (ENSTTRG00000017351) #33	IMPDH2 (ENSTTRG00000017349) #34	NDUFAF3 (ENSTTRG00000017348) #35	DALRD3 (ENSTTRG00000017347) #37	WDR6 (ENSTTRG00000017346)	P4HTM (ENSTTRG00000017345)
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00990000203969.c.a	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726.g #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Vaquita	MODERN SPECIES	2	UBA7 (ENSPSNG00000012558) #8	INKA1 (ENSPSNG00000012607) #9	CDHR4 (ENSPSNG00000012663)	IP6K1 (ENSPSNG00000012930) #11	GMPPB (ENSPSNG00000012985) #13	RNF123 (ENSPSNG00000013068) #12	AMIGO3 (ENSPSNG00000013254) #14	MST1 (ENSPSNG00000013285) #15	APEH (ENSPSNG00000013525) #16	BSN (ENSPSNG00000013663) #17	DAG1 (ENSPSNG00000013813) #18	ENSPSNG00000004157	NICN1 (ENSPSNG00000004182) #19	AMT (ENSPSNG00000004381) #20	TCTA (ENSPSNG00000004703) #21	RHOA (ENSPSNG00000004743) #22	GPX1 (ENSPSNG00000004763) #23	USP4 (ENSPSNG00000004797) #24	IHO1 (ENSPSNG00000004857) #27	C3orf84 (ENSPSNG00000004885) #28	KLHDC8B (ENSPSNG00000004916) #29	CCDC71 (ENSPSNG00000004946)	LAMB2 (ENSPSNG00000005009) #30	USP19 (ENSPSNG00000005218) #31	QARS1 (ENSPSNG00000005651) #32	QRICH1 (ENSPSNG00000005735) #33	ENSPSNG00000005779 #34	NDUFAF3 (ENSPSNG00000005911) #35	DALRD3 (ENSPSNG00000005963) #37	WDR6 (ENSPSNG00000006056)	P4HTM (ENSPSNG00000006122)
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00990000203969.c.a	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00860000135958 #26	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726.g #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Narwhal	MODERN SPECIES	310	UBA7 (ENSMMNG00015013426) #8	INKA1 (ENSMMNG00015013403) #9	CDHR4 (ENSMMNG00015013378)	IP6K1 (ENSMMNG00015013352) #11	GMPPB (ENSMMNG00015013331) #13	AMIGO3 (ENSMMNG00015013322) #14	RNF123 (ENSMMNG00015013279) #12	MST1 (ENSMMNG00015013231) #15	APEH (ENSMMNG00015013189) #16	BSN (ENSMMNG00015013162) #17	DAG1 (ENSMMNG00015013146) #18	ENSMMNG00015013133	NICN1 (ENSMMNG00015013108) #19	AMT (ENSMMNG00015013041) #20	TCTA (ENSMMNG00015012991) #21	RHOA (ENSMMNG00015012980) #22	GPX1 (ENSMMNG00015012971) #23	USP4 (ENSMMNG00015012950) #24	C3orf62 (ENSMMNG00015012883) #25	IHO1 (ENSMMNG00015012868) #27	C3orf84 (ENSMMNG00015012850) #28	KLHDC8B (ENSMMNG00015012828) #29	CCDC71 (ENSMMNG00015012816)	LAMB2 (ENSMMNG00015012783) #30	USP19 (ENSMMNG00015012611) #31	QARS1 (ENSMMNG00015012503) #32	QRICH1 (ENSMMNG00015012459) #33	IMPDH2 (ENSMMNG00015012428) #34	NDUFAF3 (ENSMMNG00015012388) #35	DALRD3 (ENSMMNG00015012304) #37	WDR6 (ENSMMNG00015012270)
Beluga whale	MODERN SPECIES	28	CAMKV (ENSDLEG00000012941)	TRAIP (ENSDLEG00000012971) #7	UBA7 (ENSDLEG00000013104) #8	FAM212A (ENSDLEG00000013168) #9	CDHR4 (ENSDLEG00000013185)	IP6K1 (ENSDLEG00000013312) #11	GMPPB (ENSDLEG00000013323) #13	AMIGO3 (ENSDLEG00000013976) #14	MST1 (ENSDLEG00000014051) #15	APEH (ENSDLEG00000014933) #16	BSN (ENSDLEG00000015162) #17	DAG1 (ENSDLEG00000015214) #18	ENSDLEG00000015224	NICN1 (ENSDLEG00000015239) #19	AMT (ENSDLEG00000015323) #20	RHOA (ENSDLEG00000015960) #22	GPX1 (ENSDLEG00000015976) #23	USP4 (ENSDLEG00000016063) #24	CUNH3orf62 (ENSDLEG00000017307) #25	ENSDLEG00000017319 #26	CCDC36 (ENSDLEG00000017335) #27	C3orf84 (ENSDLEG00000017359) #28	KLHDC8B (ENSDLEG00000017380) #29	CCDC71 (ENSDLEG00000017405)	LAMB2 (ENSDLEG00000017419) #30	USP19 (ENSDLEG00000017469) #31	QARS1 (ENSDLEG00000017603) #32	QRICH1 (ENSDLEG00000018099) #33	IMPDH2 (ENSDLEG00000018135) #34	NDUFAF3 (ENSDLEG00000018168) #35	DALRD3 (ENSDLEG00000018204) #37
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Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	8	TRAIP (ENSRFEG00010020874) #7	UBA7 (ENSRFEG00010020912) #8	INKA1 (ENSRFEG00010005318) #9	CDHR4 (ENSRFEG00010005370)	IP6K1 (ENSRFEG00010005414) #11	GMPPB (ENSRFEG00010005449) #13	RNF123 (ENSRFEG00010005504) #12	AMIGO3 (ENSRFEG00010005538) #14	MST1 (ENSRFEG00010005560) #15	APEH (ENSRFEG00010005691) #16	BSN (ENSRFEG00010005833) #17	DAG1 (ENSRFEG00010005869) #18	NICN1 (ENSRFEG00010005912) #19	AMT (ENSRFEG00010006159) #20	TCTA (ENSRFEG00010006341) #21	RHOA (ENSRFEG00010006365) #22	GPX1 (ENSRFEG00010006388) #23	USP4 (ENSRFEG00010006437) #24	C3orf62 (ENSRFEG00010006582) #25	IHO1 (ENSRFEG00010006606) #27	C3orf84 (ENSRFEG00010006639) #28	KLHDC8B (ENSRFEG00010006686) #29	CCDC71 (ENSRFEG00010006704)	ENSRFEG00010006748 #30	LAMB2 (ENSRFEG00010006962) #30	USP19 (ENSRFEG00010007084) #31	QARS1 (ENSRFEG00010007205) #32	QRICH1 (ENSRFEG00010007287) #33	IMPDH2 (ENSRFEG00010007338) #34	NDUFAF3 (ENSRFEG00010007493) #35	DALRD3 (ENSRFEG00010007609) #37
Microbat	DUPLICATION
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Canidae	DUPLICATION
Canidae	DUPLICATION
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Dingo	MODERN SPECIES	324				ENSCAFG00020022509	ENSCAFG00020022510	NIM1K (ENSCAFG00020022511)	HMGCS1 (ENSCAFG00020022512)	CCL28 (ENSCAFG00020022514)	ENSCAFG00020022515	C5orf34 (ENSCAFG00020022516)	ENSCAFG00020022518	PAIP1 (ENSCAFG00020022519)	NNT (ENSCAFG00020022539)	FGF10 (ENSCAFG00020023081)	MRPS30 (ENSCAFG00020023088)	ENSCAFG00020023093 #22	HCN1 (ENSCAFG00020023097)	EMB (ENSCAFG00020023108)	ENSCAFG00020023110	PARP8 (ENSCAFG00020023116)	ENSCAFG00020023152	ISL1 (ENSCAFG00020023153)	ENSCAFG00020023158	ITGA1 (ENSCAFG00020023171)	PELO (ENSCAFG00020023234)	ENSCAFG00020023235	ITGA2 (ENSCAFG00020023241)	MOCS2 (ENSCAFG00020023291)	FST (ENSCAFG00020023298)	ENSCAFG00020023309	ARL15 (ENSCAFG00020023332)
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Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182945.b.b.nb.b #22
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Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524.a #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b.ob #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923	ENSGT00390000013951.db.a
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Red fox	MODERN SPECIES	5	UBA7 (ENSVVUG00000028834) #8	INKA1 (ENSVVUG00000028848) #9	IP6K1 (ENSVVUG00000028850) #11	GMPPB (ENSVVUG00000028851) #13	RNF123 (ENSVVUG00000028858) #12	AMIGO3 (ENSVVUG00000028963) #14	MST1 (ENSVVUG00000028970) #15	APEH (ENSVVUG00000028983) #16	BSN (ENSVVUG00000029026) #17	DAG1 (ENSVVUG00000029028) #18	ENSVVUG00000029029	ENSVVUG00000029030	NICN1 (ENSVVUG00000029031) #19	AMT (ENSVVUG00000029036) #20	TCTA (ENSVVUG00000029052) #21	RHOA (ENSVVUG00000029053) #22	GPX1 (ENSVVUG00000029054) #23	USP4 (ENSVVUG00000029055) #24	C3orf62 (ENSVVUG00000029056) #25	CCDC36 (ENSVVUG00000029057) #27	ENSVVUG00000029059	C3orf84 (ENSVVUG00000029060) #28	KLHDC8B (ENSVVUG00000029061) #29	CCDC71 (ENSVVUG00000029062)	LAMB2 (ENSVVUG00000029063) #30	USP19 (ENSVVUG00000029068) #31	QARS1 (ENSVVUG00000029158) #32	QRICH1 (ENSVVUG00000029220) #33	NDUFAF3 (ENSVVUG00000029274) #35	WDR6 (ENSVVUG00000029289)	ENSVVUG00000029294
Caniformia_b	DUPLICATION
Caniformia_b	DUPLICATION
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182945.b.b.pb.a #22
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Giant Panda	MODERN SPECIES	577																ENSAMEG00000029495 #22
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b.pb.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b.pb.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Ferret	MODERN SPECIES	238	TRAIP (ENSMPUG00000013365) #7	UBA7 (ENSMPUG00000013373) #8	INKA1 (ENSMPUG00000013382) #9	CDHR4 (ENSMPUG00000013387)	IP6K1 (ENSMPUG00000013407) #11	GMPPB (ENSMPUG00000013431) #13	RNF123 (ENSMPUG00000013466) #12	AMIGO3 (ENSMPUG00000019647) #14	MST1 (ENSMPUG00000013611) #15	APEH (ENSMPUG00000013722) #16	BSN (ENSMPUG00000013782) #17	DAG1 (ENSMPUG00000013807) #18	NICN1 (ENSMPUG00000013809) #19	AMT (ENSMPUG00000013810) #20	TCTA (ENSMPUG00000013838) #21	RHOA (ENSMPUG00000013840) #22	GPX1 (ENSMPUG00000013843) #23	USP4 (ENSMPUG00000013846) #24	IHO1 (ENSMPUG00000013850) #27	C3orf84 (ENSMPUG00000013861) #28	KLHDC8B (ENSMPUG00000013869) #29	CCDC71 (ENSMPUG00000019649)	LAMB2 (ENSMPUG00000013872) #30	USP19 (ENSMPUG00000014117) #31	QARS1 (ENSMPUG00000014198) #32	QRICH1 (ENSMPUG00000014264) #33	NDUFAF3 (ENSMPUG00000014271) #35	DALRD3 (ENSMPUG00000014288) #37	WDR6 (ENSMPUG00000014318)	ENSMPUG00000014321	ARIH2 (ENSMPUG00000014344)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b.pb.b #22	ENSGT00940000156150.l #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Giant Panda	MODERN SPECIES	14	TRAIP (ENSAMEG00000012159) #7	INKA1 (ENSAMEG00000012287) #9	UBA7 (ENSAMEG00000012193) #8	CDHR4 (ENSAMEG00000012290)	IP6K1 (ENSAMEG00000012301) #11	GMPPB (ENSAMEG00000012315) #13	AMIGO3 (ENSAMEG00000012391) #14	RNF123 (ENSAMEG00000012331) #12	MST1 (ENSAMEG00000012393) #15	APEH (ENSAMEG00000012459) #16	BSN (ENSAMEG00000012523) #17	DAG1 (ENSAMEG00000024430) #18	NICN1 (ENSAMEG00000012544) #19	AMT (ENSAMEG00000012551) #20	ENSAMEG00000012580 #21	RHOA (ENSAMEG00000012584) #22	GPX1 (ENSAMEG00000012590) #23	USP4 (ENSAMEG00000012591) #24	C3orf62 (ENSAMEG00000012680) #25	IHO1 (ENSAMEG00000012682) #27	C3orf84 (ENSAMEG00000012687) #28	KLHDC8B (ENSAMEG00000030033) #29	CCDC71 (ENSAMEG00000020173)	LAMB2 (ENSAMEG00000012708) #30	USP19 (ENSAMEG00000012785) #31	QARS1 (ENSAMEG00000012838) #32	QRICH1 (ENSAMEG00000012907) #33	IMPDH2 (ENSAMEG00000012929) #34	NDUFAF3 (ENSAMEG00000012966) #35	DALRD3 (ENSAMEG00000012976) #37	WDR6 (ENSAMEG00000013002)
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b.pb.b #22	ENSGT00940000156150.l #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Polar bear	MODERN SPECIES	255	CAMKV (ENSUMAG00000022154)	TRAIP (ENSUMAG00000022188) #7	UBA7 (ENSUMAG00000022195) #8	INKA1 (ENSUMAG00000022202) #9	CDHR4 (ENSUMAG00000022205)	IP6K1 (ENSUMAG00000022211) #11	GMPPB (ENSUMAG00000022219) #13	RNF123 (ENSUMAG00000022315) #12	MST1 (ENSUMAG00000022561) #15	APEH (ENSUMAG00000022664) #16	ENSUMAG00000022817 #17	DAG1 (ENSUMAG00000022818) #18	NICN1 (ENSUMAG00000022819) #19	AMT (ENSUMAG00000022820) #20	TCTA (ENSUMAG00000022824) #21	RHOA (ENSUMAG00000022826) #22	GPX1 (ENSUMAG00000022827) #23	ENSUMAG00000022834 #24	USP4 (ENSUMAG00000022843) #24	C3orf62 (ENSUMAG00000022863) #25	IHO1 (ENSUMAG00000022867) #27	C3orf84 (ENSUMAG00000022882) #28	KLHDC8B (ENSUMAG00000022885) #29	CCDC71 (ENSUMAG00000022889)	LAMB2 (ENSUMAG00000022957) #30	USP19 (ENSUMAG00000023181) #31	QARS1 (ENSUMAG00000023208) #32	QRICH1 (ENSUMAG00000023411) #33	IMPDH2 (ENSUMAG00000023416) #34	NDUFAF3 (ENSUMAG00000023429) #35	ENSUMAG00000023436 #37
American black bear	MODERN SPECIES	8382																ENSUAMG00000005284 #22
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182945.b.b.qb #22
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182945.b.b.qb #22
Giant Panda	MODERN SPECIES	778																ENSAMEG00000029746 #22
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000163656	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923	ENSGT00390000014570
Armadillo	MODERN SPECIES	864	CAMKV (ENSDNOG00000036907)	TRAIP (ENSDNOG00000035213) #7	UBA7 (ENSDNOG00000005153) #8	INKA1 (ENSDNOG00000024710) #9	CDHR4 (ENSDNOG00000044013)	IP6K1 (ENSDNOG00000045127) #11	GMPPB (ENSDNOG00000012973) #13	AMIGO3 (ENSDNOG00000037102) #14	MST1 (ENSDNOG00000003406) #15	APEH (ENSDNOG00000031643) #16	BSN (ENSDNOG00000047457) #17	DAG1 (ENSDNOG00000016917) #18	NICN1 (ENSDNOG00000018341) #19	AMT (ENSDNOG00000002402) #20	TCTA (ENSDNOG00000002400) #21	RHOA (ENSDNOG00000046934) #22	USP4 (ENSDNOG00000012797) #24	C3orf62 (ENSDNOG00000019586) #25	IHO1 (ENSDNOG00000013880) #27	C3orf84 (ENSDNOG00000043752) #28	KLHDC8B (ENSDNOG00000032781) #29	ENSDNOG00000044903	ENSDNOG00000000033 #30	ENSDNOG00000031599	QARS1 (ENSDNOG00000014157) #32	QRICH1 (ENSDNOG00000014130) #33	IMPDH2 (ENSDNOG00000014105) #34	NDUFAF3 (ENSDNOG00000014096) #35	DALRD3 (ENSDNOG00000041605) #37	WDR6 (ENSDNOG00000033276)	P4HTM (ENSDNOG00000014050)
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000164381 #10	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000164381 #10	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35	ENSGT00390000014621 #37	ENSGT00420000029923
Elephant	MODERN SPECIES	49	TRAIP (ENSLAFG00000006710) #7	UBA7 (ENSLAFG00000006704) #8	INKA1 (ENSLAFG00000021603) #9	ENSLAFG00000032196 #10	IP6K1 (ENSLAFG00000013133) #11	GMPPB (ENSLAFG00000013128) #13	RNF123 (ENSLAFG00000013110) #12	AMIGO3 (ENSLAFG00000013126) #14	MST1 (ENSLAFG00000003505) #15	APEH (ENSLAFG00000003497) #16	BSN (ENSLAFG00000002847) #17	DAG1 (ENSLAFG00000011041) #18	NICN1 (ENSLAFG00000029153) #19	AMT (ENSLAFG00000009731) #20	TCTA (ENSLAFG00000009728) #21	RHOA (ENSLAFG00000009726) #22	GPX1 (ENSLAFG00000009724) #23	USP4 (ENSLAFG00000018507) #24	C3orf62 (ENSLAFG00000018504) #25	IHO1 (ENSLAFG00000018499) #27	C3orf84 (ENSLAFG00000027656) #28	KLHDC8B (ENSLAFG00000005090) #29	CCDC71 (ENSLAFG00000005096)	LAMB2 (ENSLAFG00000012871) #30	USP19 (ENSLAFG00000012851) #31	QARS1 (ENSLAFG00000012841) #32	QRICH1 (ENSLAFG00000012836) #33	IMPDH2 (ENSLAFG00000012829) #34	NDUFAF3 (ENSLAFG00000031083) #35	DALRD3 (ENSLAFG00000012826) #37	WDR6 (ENSLAFG00000012822)
Hyrax	MODERN SPECIES	9514																RHOA (ENSPCAG00000009699) #22	GPX1 (ENSPCAG00000009720) #23
Marsupialia	DUPLICATION
Marsupialia	DUPLICATION
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b.e.a #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00940000166951	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Opossum	MODERN SPECIES	5	UBA7 (ENSMODG00000012394) #8	INKA1 (ENSMODG00000012400) #9	ENSMODG00000025449	IP6K1 (ENSMODG00000012903) #11	GMPPB (ENSMODG00000012906) #13	AMIGO3 (ENSMODG00000022969) #14	ENSMODG00000012931 #12	ENSMODG00000051505	MST1 (ENSMODG00000012944) #15	APEH (ENSMODG00000012954) #16	BSN (ENSMODG00000012965) #17	DAG1 (ENSMODG00000012968) #18	NICN1 (ENSMODG00000022968) #19	AMT (ENSMODG00000012973) #20	TCTA (ENSMODG00000012978) #21	RHOA (ENSMODG00000042763) #22	GPX1 (ENSMODG00000012984) #23	USP4 (ENSMODG00000013001) #24	C3orf62 (ENSMODG00000013005) #25	ENSMODG00000043050 #27	ENSMODG00000013014 #28	KLHDC8B (ENSMODG00000013022) #29	ENSMODG00000013027	ENSMODG00000039230 #30	LAMB2 (ENSMODG00000013288) #30	USP19 (ENSMODG00000013305) #31	ENSMODG00000013310	QARS1 (ENSMODG00000013321) #32	QRICH1 (ENSMODG00000013333) #33	IMPDH2 (ENSMODG00000013354) #34	NDUFAF3 (ENSMODG00000022966) #35
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b.e.a #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00940000166951	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b.e.a #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00940000166951	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00940000161447 #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b.e.a #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000012418 #27	ENSGT00390000002177 #28	ENSGT00940000160815 #29	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #30	ENSGT00940000159085 #31	ENSGT00940000166951	ENSGT00550000074972 #32	ENSGT00940000155241 #33	ENSGT00940000157726 #34	ENSGT00390000018312 #35
Common wonbat	MODERN SPECIES	1056	TRAIP (ENSVURG00010017978) #7	UBA7 (ENSVURG00010018001) #8	INKA1 (ENSVURG00010018056) #9	ENSVURG00010018058	IP6K1 (ENSVURG00010018073) #11	GMPPB (ENSVURG00010018081) #13	RNF123 (ENSVURG00010018090) #12	AMIGO3 (ENSVURG00010018102) #14	MST1 (ENSVURG00010018107) #15	APEH (ENSVURG00010018119) #16	BSN (ENSVURG00010018149) #17	DAG1 (ENSVURG00010018158) #18	NICN1 (ENSVURG00010018161) #19	AMT (ENSVURG00010018166) #20	TCTA (ENSVURG00010018195) #21	ENSVURG00010018206 #22	GPX1 (ENSVURG00010018210) #23	USP4 (ENSVURG00010018217) #24	C3orf62 (ENSVURG00010018240) #25	ENSVURG00010018249 #27	KLHDC8B (ENSVURG00010018258) #29	ENSVURG00010018269	ENSVURG00010018280	ENSVURG00010018298 #30	ENSVURG00010018344	QARS1 (ENSVURG00010018357) #32	QRICH1 (ENSVURG00010018382) #33	IMPDH2 (ENSVURG00010018392) #34	NDUFAF3 (ENSVURG00010018404) #35	DALRD3 (ENSVURG00010018421) #37	ENSVURG00010018436
koala	MODERN SPECIES	75	CAMKV (ENSPCIG00000032409)	TRAIP (ENSPCIG00000021541) #7	UBA7 (ENSPCIG00000021545) #8	INKA1 (ENSPCIG00000021548) #9	ENSPCIG00000021549	IP6K1 (ENSPCIG00000021552) #11	GMPPB (ENSPCIG00000021553) #13	AMIGO3 (ENSPCIG00000021572) #14	RNF123 (ENSPCIG00000021575) #12	MST1 (ENSPCIG00000021592) #15	APEH (ENSPCIG00000021665) #16	DAG1 (ENSPCIG00000021945) #18	NICN1 (ENSPCIG00000011868) #19	AMT (ENSPCIG00000011871) #20	TCTA (ENSPCIG00000033201) #21	ENSPCIG00000011878 #22	GPX1 (ENSPCIG00000011881) #23	USP4 (ENSPCIG00000011972) #24	C3orf62 (ENSPCIG00000018125) #25	ENSPCIG00000018126 #27	ENSPCIG00000018127 #28	KLHDC8B (ENSPCIG00000018128) #29	ENSPCIG00000018130 #30	LAMB2 (ENSPCIG00000018185) #30	USP19 (ENSPCIG00000018723) #31	ENSPCIG00000018725	QARS1 (ENSPCIG00000018726) #32	QRICH1 (ENSPCIG00000018727) #33	ENSPCIG00000018761 #34	NDUFAF3 (ENSPCIG00000022141) #35	DALRD3 (ENSPCIG00000022151) #37
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		UBA7 (ENSSHAG00000017846) #8	INKA1 (ENSSHAG00000027540) #9	ENSSHAG00000021000 #10	IP6K1 (ENSSHAG00000017747) #11	GMPPB (ENSSHAG00000024114) #13	RNF123 (ENSSHAG00000017590) #12	AMIGO3 (ENSSHAG00000027928) #14	MST1 (ENSSHAG00000017547) #15	APEH (ENSSHAG00000025873) #16	BSN (ENSSHAG00000020766) #17	ENSSHAG00000021948	DAG1 (ENSSHAG00000016867) #18	NICN1 (ENSSHAG00000031377) #19	AMT (ENSSHAG00000016474) #20	TCTA (ENSSHAG00000020820) #21	ENSSHAG00000016308 #22	GPX1 (ENSSHAG00000031759) #23	USP4 (ENSSHAG00000016024) #24	C3orf62 (ENSSHAG00000029899) #25	ENSSHAG00000015747 #27	ENSSHAG00000024380 #28	KLHDC8B (ENSSHAG00000027422) #29	ENSSHAG00000015577	ENSSHAG00000028406	ENSSHAG00000030662 #30	USP19 (ENSSHAG00000015212) #31	LAMB2 (ENSSHAG00000015322) #30	ENSSHAG00000031850	QRICH1 (ENSSHAG00000023020) #33	QARS1 (ENSSHAG00000015068) #32	IMPDH2 (ENSSHAG00000022188) #34
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182945.b.b.e.b #22
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000008240.m	ENSGT00940000161792	ENSGT00940000159452	ENSGT00390000016025.b.h	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000158745	ENSGT00940000158051	ENSGT00810000125473.B	ENSGT00940000154553.a.b	ENSGT00950000183193.B	ENSGT00950000182945.b.b.e.b #22	ENSGT01020000230438.B.b.b.a	ENSGT00940000153431.a	ENSGT00390000006205.b	ENSGT00940000156572	ENSGT00970000193421.B	ENSGT00950000183095.a.a	ENSGT00940000159386	ENSGT00550000074845	ENSGT00950000182865.b.a.a	ENSGT00950000183024.a.b.a	ENSGT00940000160678.a	ENSGT00940000155573	ENSGT00940000156499	ENSGT00390000008198	ENSGT00390000009196
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000008240.m	ENSGT00940000161792	ENSGT00940000159452	ENSGT00390000016025.b.h	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000158745	ENSGT00940000158051	ENSGT00810000125473.B	ENSGT00940000154553.a.b	ENSGT00950000183193.B	ENSGT00950000182945.b.b.e.b #22	ENSGT01020000230438.B.b.b.a	ENSGT00940000153431.a	ENSGT00390000006205.b	ENSGT00940000156572	ENSGT00970000193421.B	ENSGT00950000183095.a.a	ENSGT00940000159386	ENSGT00550000074845	ENSGT00950000182865.b.a.a	ENSGT00950000183024.a.b.a	ENSGT00940000160678.a	ENSGT00940000155573	ENSGT00940000156499	ENSGT00390000008198	ENSGT00390000009196
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000008240.m	ENSGT00940000161792	ENSGT00940000159452	ENSGT00390000016025.b.h	ENSGT00390000011613	ENSGT00940000160700	ENSGT00390000009277.bb	ENSGT00940000157545	ENSGT00510000047812	ENSGT00390000019406	ENSGT00940000158745	ENSGT00940000158051	ENSGT00810000125473.B	ENSGT00940000154553.a.b	ENSGT00950000183193.B	ENSGT00950000182945.b.b.e.b #22	ENSGT01020000230438.B.b.b.a	ENSGT00940000153431.a	ENSGT00390000006205.b	ENSGT00940000156572	ENSGT00970000193421.B	ENSGT00950000183095.a.a	ENSGT00940000159386	ENSGT00550000074845	ENSGT00950000182865.b.a.a	ENSGT00950000183024.a.b.a	ENSGT00940000160678.a	ENSGT00940000155573	ENSGT00940000156499	ENSGT00390000008198	ENSGT00390000009196
Common wonbat	MODERN SPECIES	1031	DUOXA1 (ENSVURG00010004249)	DUOX1 (ENSVURG00010004192)	SHF (ENSVURG00010004068)	SLC28A2 (ENSVURG00010002858)	GATM (ENSVURG00010002775)	SPATA5L1 (ENSVURG00010002757)	ENSVURG00010002749	SLC30A4 (ENSVURG00010002727)	BLOC1S6 (ENSVURG00010002717)	SQOR (ENSVURG00010002691)	ENSVURG00010002650	EGLN3 (ENSVURG00010002628)	NPAS3 (ENSVURG00010002315)	AKAP6 (ENSVURG00010002193)	ARHGAP5 (ENSVURG00010002087)	ENSVURG00010002007 #22	NUBPL (ENSVURG00010001936)	GPR33 (ENSVURG00010001847)	DTD2 (ENSVURG00010001842)	HEATR5A (ENSVURG00010001756)	HECTD1 (ENSVURG00010001700)	AP4S1 (ENSVURG00010001627)	STRN3 (ENSVURG00010001455)	COCH (ENSVURG00010001363)	SCFD1 (ENSVURG00010001249)	ENSVURG00010001211	G2E3 (ENSVURG00010001188)	PRKD1 (ENSVURG00010000998)	ENSVURG00010000899	NOVA1 (ENSVURG00010000843)	ENSVURG00010000770
koala	MODERN SPECIES	101													ENSPCIG00000018432	ARHGAP5 (ENSPCIG00000024338)	NUBPL (ENSPCIG00000024329)	ENSPCIG00000024335 #22	GPR33 (ENSPCIG00000023701)	DTD2 (ENSPCIG00000023706)	HEATR5A (ENSPCIG00000023713)	HECTD1 (ENSPCIG00000023741)	ENSPCIG00000023758	AP4S1 (ENSPCIG00000035487)	STRN3 (ENSPCIG00000023770)	COCH (ENSPCIG00000023777)	SCFD1 (ENSPCIG00000025457)	G2E3 (ENSPCIG00000025422)	PRKD1 (ENSPCIG00000024460)	ENSPCIG00000035249	ENSPCIG00000035834	ENSPCIG00000016114	NOVA1 (ENSPCIG00000024683)
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	DUOXA2 (ENSSHAG00000017461)	DUOXA1 (ENSSHAG00000017473)	DUOX1 (ENSSHAG00000017498)	SHF (ENSSHAG00000017575)	SLC28A2 (ENSSHAG00000002014)	GATM (ENSSHAG00000004129)	SPATA5L1 (ENSSHAG00000005783)	C15orf48 (ENSSHAG00000006212)	SLC30A4 (ENSSHAG00000025011)	ENSSHAG00000008981	ENSSHAG00000012920	NPAS3 (ENSSHAG00000025296)	AKAP6 (ENSSHAG00000013667)	ARHGAP5 (ENSSHAG00000001822)	NUBPL (ENSSHAG00000008500)	ENSSHAG00000028480 #22	GPR33 (ENSSHAG00000011325)	DTD2 (ENSSHAG00000024859)	HEATR5A (ENSSHAG00000011970)	HECTD1 (ENSSHAG00000013045)	AP4S1 (ENSSHAG00000013484)	STRN3 (ENSSHAG00000013827)	COCH (ENSSHAG00000014060)	ENSSHAG00000026243	SCFD1 (ENSSHAG00000014800)	G2E3 (ENSSHAG00000031633)	PRKD1 (ENSSHAG00000024235)	FOXG1 (ENSSHAG00000021849)	NOVA1 (ENSSHAG00000031756)	ENSSHAG00000005592	ENSSHAG00000030234
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182945.b.b.f #22
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182945.b.b.f #22
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182945.b.b.f #22
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182945.b.b.f #22
Common wonbat	DUPLICATION
Common wonbat	MODERN SPECIES	636	BANK1 (ENSVURG00010021100)	ENSVURG00010021095	PPP3CA (ENSVURG00010021086)	ENSVURG00010021070	DDIT4L (ENSVURG00010021061)	ENSVURG00010021060	ENSVURG00010021057	ENSVURG00010021054	ENSVURG00010021050	ENSVURG00010021045	LAMTOR3 (ENSVURG00010021042)	DAPP1 (ENSVURG00010021036)	C4orf54 (ENSVURG00010021035)	MTTP (ENSVURG00010021030)	TRMT10A (ENSVURG00010021028)	ENSVURG00010021026 #22	ENSVURG00010020999	ENSVURG00010020982
Common wonbat	MODERN SPECIES	1073	ENSVURG00010007918	FAM167A (ENSVURG00010007911)	GPCPD1 (ENSVURG00010007895)	SHLD1 (ENSVURG00010007868)	ENSVURG00010007853	ENSVURG00010007846	TRMT6 (ENSVURG00010007840)	MCM8 (ENSVURG00010007805)	CRLS1 (ENSVURG00010007768)	ENSVURG00010007755	FERMT1 (ENSVURG00010007738)	HAO1 (ENSVURG00010007710)	TMX4 (ENSVURG00010007700)	ENSVURG00010007694	PLCB1 (ENSVURG00010007654)	ENSVURG00010007631 #22	PLCB4 (ENSVURG00010007595)	LAMP5 (ENSVURG00010007578)	ENSVURG00010007546	ENSVURG00010007534	ENSVURG00010007519	ANKEF1 (ENSVURG00010007502)	SNAP25 (ENSVURG00010007480)	MKKS (ENSVURG00010007467)	JAG1 (ENSVURG00010007418)	BTBD3 (ENSVURG00010007389)	ENSVURG00010007384	ENSVURG00010007373	ENSVURG00010007368	ENSVURG00010007362	SPTLC3 (ENSVURG00010007353)
Opossum	DUPLICATION
Opossum	MODERN SPECIES	4	TMPRSS11B (ENSMODG00000020751)	TMPRSS11E (ENSMODG00000020752)	ENSMODG00000020754	UGT2A1 (ENSMODG00000020753)	ENSMODG00000027460	JADE1 (ENSMODG00000020759)	SCLT1 (ENSMODG00000020760)	C4orf33 (ENSMODG00000020761)	ENSMODG00000038142	PCDH10 (ENSMODG00000020768)	ENSMODG00000050511	ENSMODG00000000002	ENSMODG00000049320	ENSMODG00000000016	ENSMODG00000000023	ENSMODG00000024902 #22	ENSMODG00000051597	PCDH18 (ENSMODG00000000040)	ENSMODG00000000053	NOCT (ENSMODG00000000087)	ELF2 (ENSMODG00000000089)	ENSMODG00000025548	NDUFC1 (ENSMODG00000000098)	NAA15 (ENSMODG00000000107)	ENSMODG00000000115	RAB33B (ENSMODG00000044810)	SETD7 (ENSMODG00000000122)	MGST2 (ENSMODG00000025529)	ENSMODG00000051069	ENSMODG00000038155	SCOC (ENSMODG00000025528)
Opossum	MODERN SPECIES		SLC28A2 (ENSMODG00000017644)	ENSMODG00000027763	GATM (ENSMODG00000017640)	SPATA5L1 (ENSMODG00000017634)	ENSMODG00000028279	ENSMODG00000042102	SLC30A4 (ENSMODG00000017630)	BLOC1S6 (ENSMODG00000017628)	SQOR (ENSMODG00000017627)	EGLN3 (ENSMODG00000017625)	ENSMODG00000042896	NPAS3 (ENSMODG00000017620)	AKAP6 (ENSMODG00000017618)	ARHGAP5 (ENSMODG00000017613)	NUBPL (ENSMODG00000024100)	ENSMODG00000024099 #22	GPR33 (ENSMODG00000050260)	DTD2 (ENSMODG00000045920)	HEATR5A (ENSMODG00000017600)	HECTD1 (ENSMODG00000017590)	AP4S1 (ENSMODG00000017579)	ENSMODG00000048426	STRN3 (ENSMODG00000017571)	ENSMODG00000017575	COCH (ENSMODG00000017567)	SCFD1 (ENSMODG00000017563)	G2E3 (ENSMODG00000017557)	ENSMODG00000028551	PRKD1 (ENSMODG00000017552)	ENSMODG00000029330	ENSMODG00000045515
Platypus	MODERN SPECIES	84	TRAIP (ENSOANG00000015312) #7	UBA7 (ENSOANG00000012650) #8	INKA1 (ENSOANG00000037272) #9	ENSOANG00000020685 #10	IP6K1 (ENSOANG00000010236) #11	GMPPB (ENSOANG00000050893) #13	RNF123 (ENSOANG00000031636) #12	ENSOANG00000043507 #14	MST1 (ENSOANG00000007143) #15	APEH (ENSOANG00000007146) #16	BSN (ENSOANG00000047017) #17	DAG1 (ENSOANG00000013307) #18	NICN1 (ENSOANG00000040516) #19	AMT (ENSOANG00000001372) #20	TCTA (ENSOANG00000048917) #21	RHOA (ENSOANG00000013807) #22	GPX1 (ENSOANG00000036255) #23	USP4 (ENSOANG00000013806) #24	EMC3 (ENSOANG00000013805)	FANCD2 (ENSOANG00000020444)	ENSOANG00000001507	BRK1 (ENSOANG00000043269)	ENSOANG00000046901	IRAK2 (ENSOANG00000028234)	ENSOANG00000036015	TAMM41 (ENSOANG00000001504)	TNNC1 (ENSOANG00000001503)	NISCH (ENSOANG00000001501)	STAB1 (ENSOANG00000001499)	NT5DC2 (ENSOANG00000001498)	UQCC5 (ENSOANG00000036245)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00940000166138	ENSGT00940000161447.a #8	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00940000166103	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00960000192208	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00940000166103	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00940000166138	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000171658	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00960000192208	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	118																ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00960000192208	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00940000166138	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00390000011082.lb	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645.a #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00960000192208	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970.f	ENSGT00390000011082.mb	ENSGT00860000134673	ENSGT00740000115593	ENSGT00940000155525	ENSGT00900000142007	ENSGT00940000158658	ENSGT00950000183073.a.a.a	ENSGT00940000155278	ENSGT00940000154115.c.b
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00940000166138	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00960000189816	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00390000011082.lb	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645.a #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00960000192208	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970.e	ENSGT00940000165519	ENSGT00740000115593	ENSGT00940000155525	ENSGT00900000142007	ENSGT00940000158658	ENSGT00950000183073.a.a.a	ENSGT00940000155278	ENSGT00940000154115.c.b	ENSGT00940000155571.A
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2529										ENSCABG00000009770 #11	ENSCABG00000009771 #11	GMPPB (ENSCABG00000009774) #13	RNF123 (ENSCABG00000009829) #12	AMIGO3 (ENSCABG00000011104) #14	BRK1 (ENSCABG00000011106)	RHOA (ENSCABG00000011108) #22	GPX1 (ENSCABG00000011109) #23	USP4 (ENSCABG00000011110) #24	C3orf62 (ENSCABG00000011112) #25
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	21	ENSGEVG00005010889	MST1 (ENSGEVG00005010507) #15	ENSGEVG00005010434	ENSGEVG00005010416	NICN1 (ENSGEVG00005010399) #19	AMT (ENSGEVG00005010305) #20	ENSGEVG00005010265	ENSGEVG00005010033	INKA1 (ENSGEVG00005009932) #9	ENSGEVG00005009877	ENSGEVG00005009595 #11	GMPPB (ENSGEVG00005009457) #13	AMIGO3 (ENSGEVG00005009417) #14	RNF123 (ENSGEVG00005009056) #12	ENSGEVG00005008947	RHOA (ENSGEVG00005008922) #22	GPX1 (ENSGEVG00005008867) #23	USP4 (ENSGEVG00005008191) #24	ENSGEVG00005007983	EMC3 (ENSGEVG00005007912)	BRK1 (ENSGEVG00005007878)	ENSGEVG00005007859	PDLIM1 (ENSGEVG00005007726)	ENSGEVG00005007699	SORBS1 (ENSGEVG00005007537)	EIF3F (ENSGEVG00005007485)	ANXA7 (ENSGEVG00005007451)	ENSGEVG00005007433	PPP3CB (ENSGEVG00005007394)	ENSGEVG00005007366	ENSGEVG00005007331
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00390000008429 #18	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00940000166138	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00390000011082.lb	ENSGT00390000016970.e	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645.a #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970.f	ENSGT00390000011082.mb	ENSGT00860000134673	ENSGT00740000115593	ENSGT00940000155525	ENSGT00940000158658	ENSGT00950000183073.a.a.a	ENSGT00940000155278	ENSGT00940000154115.c.b	ENSGT00940000155571.B	ENSGT00950000183027.a.b
painted turtle	MODERN SPECIES	695									ENSCPBG00000010531	NR2F1 (ENSCPBG00000010532)	ARRDC3 (ENSCPBG00000010539)	ENSCPBG00000010545	ENSCPBG00000010563	ENSCPBG00000010580	ENSCPBG00000010585	RHOA (ENSCPBG00000010596) #22	LYSMD3 (ENSCPBG00000010597)	ENSCPBG00000010601	MBLAC2 (ENSCPBG00000010603)	CETN3 (ENSCPBG00000010605)	MEF2C (ENSCPBG00000010619)	TMEM161B (ENSCPBG00000010638)	CCNH (ENSCPBG00000010650)	RASA1 (ENSCPBG00000010658)	ENSCPBG00000010666	COX7C (ENSCPBG00000010669)	ENSCPBG00000010674	EDIL3 (ENSCPBG00000010684)	HAPLN1 (ENSCPBG00000010699)	VCAN (ENSCPBG00000010709)	XRCC4 (ENSCPBG00000010726)
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	144												GMPPB (ENSTMTG00000018749) #13	RNF123 (ENSTMTG00000018941) #12	AMIGO3 (ENSTMTG00000020407) #14	ENSTMTG00000020411	RHOA (ENSTMTG00000020421) #22	GPX1 (ENSTMTG00000020425) #23	USP4 (ENSTMTG00000020458) #24	C3orf62 (ENSTMTG00000020702) #25	EMC3 (ENSTMTG00000020710)	FANCD2 (ENSTMTG00000020721)	ENSTMTG00000020756	ENSTMTG00000020763	ENSTMTG00000020768	ENSTMTG00000020775	HELLS (ENSTMTG00000020783)	PDLIM1 (ENSTMTG00000020848)	SORBS1 (ENSTMTG00000020908)	EIF3F (ENSTMTG00000021452)	ANXA7 (ENSTMTG00000021457)	PPP3CB (ENSTMTG00000021467)
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	52																ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000162824	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000166138	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00940000157524 #20
Aves	ANCESTRAL SPECIES	40												ENSGT00940000158328	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00940000172472	ENSGT00390000016901	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000162824	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000166138	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000001505 #19
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	35												ENSGT00940000158328	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00940000172472	ENSGT00390000016901	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000162824	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000166138	ENSGT00960000189632	ENSGT00940000157524 #20
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	42												ENSGT00940000158328	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00940000172472	ENSGT00390000016901	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000162824	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000166138	ENSGT00960000189632	ENSGT00940000157524 #20
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	80												ENSGT00940000158328	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00940000172472	ENSGT00390000016901	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000162824	ENSGT00530000063849.A #9	ENSGT00940000166138	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00390000008429 #18
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	442												RRP9 (ENSABRG00000003263)	GRM2 (ENSABRG00000003337)	ENSABRG00000003344	TEX264 (ENSABRG00000003356)	RHOA (ENSABRG00000003369) #22	GPX1 (ENSABRG00000003432) #23	USP4 (ENSABRG00000003695) #24	EMC3 (ENSABRG00000007051)	FANCD2 (ENSABRG00000007088)	BRK1 (ENSABRG00000007582)
Duck	MODERN SPECIES	4	ENSAPLG00000004256	ENSAPLG00000026057	NEK4 (ENSAPLG00000004795)	SPCS1 (ENSAPLG00000004976)	GLT8D1 (ENSAPLG00000004984)	GNL3 (ENSAPLG00000005171)	PBRM1 (ENSAPLG00000005420)	UQCC5 (ENSAPLG00000027619)	NT5DC2 (ENSAPLG00000006247)	STAB1 (ENSAPLG00000006699)	NISCH (ENSAPLG00000007897)	TNNC1 (ENSAPLG00000008432)	RPL29 (ENSAPLG00000017190)	DUSP7 (ENSAPLG00000008525)	POC1A (ENSAPLG00000007756)	RHOA (ENSAPLG00000014687) #22	GPX1 (ENSAPLG00000001202) #23	USP4 (ENSAPLG00000014796) #24	EMC3 (ENSAPLG00000001148)	ENSAPLG00000024855	ENSAPLG00000024735	ENSAPLG00000002149	AMIGO3 (ENSAPLG00000020461) #14	RNF123 (ENSAPLG00000007425) #12	ENSAPLG00000022689 #13	IP6K1 (ENSAPLG00000008308) #11	ENSAPLG00000026128 #11	DAG1 (ENSAPLG00000023906) #18	ENSAPLG00000019124 #17	ENSAPLG00000029769 #17	ENSAPLG00000004100 #7
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159388	ENSGT00940000161296	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000172472	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00390000016901	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00940000155763	ENSGT00940000165085	ENSGT00940000157976.p	ENSGT00390000006665.a	ENSGT00940000157842	ENSGT00940000156468	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00940000166103	ENSGT00940000159461 #15
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159711	ENSGT00940000161296	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000172472	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00390000016901	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00940000155763	ENSGT00940000165085	ENSGT00940000157976.p	ENSGT00390000006665.a	ENSGT00940000157842	ENSGT00940000156468	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00940000166103	ENSGT00940000159461 #15
Turkey	MODERN SPECIES	5	ENSMGAG00000002789	ENSMGAG00000002602	ENSMGAG00000002687	ENSMGAG00000002710	ENSMGAG00000016976	ENSMGAG00000002848 #7	ENSMGAG00000017545 #17	APEH (ENSMGAG00000002946) #16	ENSMGAG00000018708	ENSMGAG00000003230 #18	ENSMGAG00000007359 #20	ENSMGAG00000003155 #11	GMPPB (ENSMGAG00000002860) #13	ENSMGAG00000001722 #12	ENSMGAG00000020517 #14	RHOA (ENSMGAG00000002280) #22	ENSMGAG00000002294 #23	USP4 (ENSMGAG00000002305) #24	ENSMGAG00000002466	ENSMGAG00000002478	ENSMGAG00000007926	ENSMGAG00000003366	ENSMGAG00000018820	ALAS1 (ENSMGAG00000003188)	TWF2 (ENSMGAG00000003333)	PPM1M (ENSMGAG00000003379)	WDR82 (ENSMGAG00000003395)	GLYCTK (ENSMGAG00000003414)	DNAH1 (ENSMGAG00000003422)	ENSMGAG00000003524	BAP1 (ENSMGAG00000003535)
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Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158855	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000157756	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00390000013347.b	ENSGT01020000230364.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000000980	ENSGT00940000158328	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00940000172472	ENSGT00390000016901	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT00390000017530	ENSGT00940000155552	ENSGT00940000158818.g	ENSGT00940000158818.h	ENSGT00940000154839.C	ENSGT00530000063260	ENSGT00390000001763	ENSGT00390000016119	ENSGT00940000155766.a	ENSGT00940000158933
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000182998.C.b	ENSGT00940000158855	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000157756	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00390000013347.b	ENSGT01020000230364.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000000980	ENSGT00940000158328	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00390000016901	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000017530	ENSGT00940000155552	ENSGT00940000158818.g	ENSGT00940000158818.h	ENSGT00940000154839.C	ENSGT00530000063260	ENSGT00390000001763	ENSGT00390000016119	ENSGT00940000155766.a	ENSGT00940000158933	ENSGT00940000158894
Great tit	MODERN SPECIES	3	ENSPMJG00000012538	PARP3 (ENSPMJG00000012539)	RBM5 (ENSPMJG00000012540)	SEMA3F (ENSPMJG00000012541)	GNAT1 (ENSPMJG00000012542)	ENSPMJG00000012543	SLC38A3 (ENSPMJG00000012544)	SEMA3B (ENSPMJG00000012545)	OASL (ENSPMJG00000012546)	IFRD2 (ENSPMJG00000012547)	HYAL3 (ENSPMJG00000012548)	NAA80 (ENSPMJG00000012549)	RRP9 (ENSPMJG00000012550)	GRM2 (ENSPMJG00000012552)	TEX264 (ENSPMJG00000012554)	RHOA (ENSPMJG00000012555) #22	GPX1 (ENSPMJG00000012556) #23	USP4 (ENSPMJG00000012557) #24	EMC3 (ENSPMJG00000012558)	FANCD2 (ENSPMJG00000012559)	ENSPMJG00000012560	TKT (ENSPMJG00000012561)	ENSPMJG00000012562	ENSPMJG00000012563	CACNA1D (ENSPMJG00000012565)	CHDH (ENSPMJG00000012566)	ACTR8 (ENSPMJG00000012567)	SELENOK (ENSPMJG00000012568)	CACNA2D3 (ENSPMJG00000012570)	LRTM1 (ENSPMJG00000012571)	WNT5A (ENSPMJG00000012576)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000182998.C.b	ENSGT00940000158855	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000157756	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00390000013347.b	ENSGT01020000230364.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000000980	ENSGT00940000158328	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00390000016901	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000017530	ENSGT00940000155552	ENSGT00940000158818.g	ENSGT00940000154839.C	ENSGT00530000063260	ENSGT00390000001763	ENSGT00390000016119	ENSGT00940000155766.a	ENSGT00940000158933	ENSGT00940000158894	ENSGT00650000093320.a.b
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Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159711	ENSGT00950000182998.C.b	ENSGT00940000158855	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000157756	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00390000013347.b	ENSGT01020000230364.a.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158328	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00390000016901	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000017530	ENSGT00940000155552	ENSGT00940000158818.g	ENSGT00940000154839.C	ENSGT00530000063260	ENSGT00390000001763	ENSGT00390000016119	ENSGT00940000155766.a	ENSGT00940000158933	ENSGT00940000158894	ENSGT00650000093320.a.b
Zebra finch	MODERN SPECIES	3	ABHD14B (ENSTGUG00000006384)	PCBP4 (ENSTGUG00000006393)	ENSTGUG00000029701	PARP3 (ENSTGUG00000006405)	RBM5 (ENSTGUG00000006417)	SEMA3F (ENSTGUG00000006464)	GNAT1 (ENSTGUG00000006500)	GNAI2 (ENSTGUG00000023610)	SLC38A3 (ENSTGUG00000006517)	SEMA3B (ENSTGUG00000006529)	OASL (ENSTGUG00000006574)	HYAL3 (ENSTGUG00000027207)	RRP9 (ENSTGUG00000006584)	GRM2 (ENSTGUG00000006595)	TEX264 (ENSTGUG00000006607)	RHOA (ENSTGUG00000006623) #22	GPX1 (ENSTGUG00000006631)	USP4 (ENSTGUG00000006633) #24	EMC3 (ENSTGUG00000006702)	FANCD2 (ENSTGUG00000006733)	ENSTGUG00000022582	ENSTGUG00000027414	TKT (ENSTGUG00000006772)	DCP1A (ENSTGUG00000006820)	CACNA1D (ENSTGUG00000006839)	CHDH (ENSTGUG00000006933)	ACTR8 (ENSTGUG00000006945)	SELENOK (ENSTGUG00000006957)	LRTM1 (ENSTGUG00000007012)	CACNA2D3 (ENSTGUG00000006966)	WNT5A (ENSTGUG00000007014)
Common canary	MODERN SPECIES	15	STIMATE (ENSSCAG00000001265)	MUSTN1 (ENSSCAG00000001280)	ITIH4 (ENSSCAG00000001291)	ITIH3 (ENSSCAG00000001438)	NEK4 (ENSSCAG00000001781)	SPCS1 (ENSSCAG00000001786)	GLT8D1 (ENSSCAG00000001790)	GNL3 (ENSSCAG00000001796)	PBRM1 (ENSSCAG00000001819)	UQCC5 (ENSSCAG00000001851)	NT5DC2 (ENSSCAG00000001889)	STAB1 (ENSSCAG00000002018)	NISCH (ENSSCAG00000002069)	TNNC1 (ENSSCAG00000002187)	ENSSCAG00000002191	RHOA (ENSSCAG00000002200) #22	GPX1 (ENSSCAG00000002206) #23	USP4 (ENSSCAG00000002213) #24	EMC3 (ENSSCAG00000002222)	FANCD2 (ENSSCAG00000002229)	ENSSCAG00000002245	TKT (ENSSCAG00000002261)	DCP1A (ENSSCAG00000002277)	CACNA1D (ENSSCAG00000002294)	CHDH (ENSSCAG00000002341)	ACTR8 (ENSSCAG00000002357)	SELENOK (ENSSCAG00000002405)	CACNA2D3 (ENSSCAG00000002415)	LRTM1 (ENSSCAG00000002437)	WNT5A (ENSSCAG00000002444)	ERC2 (ENSSCAG00000002450)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	42	PCBP4 (ENSGFOG00000000372)	ENSGFOG00000000385	PARP3 (ENSGFOG00000000396)	RBM5 (ENSGFOG00000000411)	SEMA3F (ENSGFOG00000000429)	GNAT1 (ENSGFOG00000000449)	GNAI2 (ENSGFOG00000000455)	SLC38A3 (ENSGFOG00000000468)	SEMA3B (ENSGFOG00000000528)	OASL (ENSGFOG00000000777)	IFRD2 (ENSGFOG00000000814)	HYAL3 (ENSGFOG00000000848)	RRP9 (ENSGFOG00000000873)	GRM2 (ENSGFOG00000000920)	TEX264 (ENSGFOG00000001011)	RHOA (ENSGFOG00000001025) #22	GPX1 (ENSGFOG00000001029) #23	USP4 (ENSGFOG00000001038) #24	EMC3 (ENSGFOG00000001057)	FANCD2 (ENSGFOG00000001088)	ENSGFOG00000001163	TKT (ENSGFOG00000001175)	DCP1A (ENSGFOG00000001191)	CACNA1D (ENSGFOG00000001659)	CHDH (ENSGFOG00000008586)	ACTR8 (ENSGFOG00000008603)	SELENOK (ENSGFOG00000008654)	CACNA2D3 (ENSGFOG00000008739)	LRTM1 (ENSGFOG00000009424)	WNT5A (ENSGFOG00000009434)	ERC2 (ENSGFOG00000009456)
Flycatcher	MODERN SPECIES	3	PCBP4 (ENSFALG00000008831)	ENSFALG00000023354	PARP3 (ENSFALG00000008829)	RBM5 (ENSFALG00000008828)	ENSFALG00000008826	GNAT1 (ENSFALG00000008821)	ENSFALG00000008814	ENSFALG00000008803	SEMA3B (ENSFALG00000008799)	ENSFALG00000008796	HYAL3 (ENSFALG00000008789)	NAA80 (ENSFALG00000024351)	RRP9 (ENSFALG00000008778)	ENSFALG00000008768	TEX264 (ENSFALG00000008764)	RHOA (ENSFALG00000008761) #22	ENSFALG00000008759 #23	USP4 (ENSFALG00000008747) #24	ENSFALG00000008737	ENSFALG00000008718	ENSFALG00000027119	TKT (ENSFALG00000008707)	DCP1A (ENSFALG00000008704)	CACNA1D (ENSFALG00000008639)	CHDH (ENSFALG00000008585)	ACTR8 (ENSFALG00000008579)	SELENOK (ENSFALG00000008576)	CACNA2D3 (ENSFALG00000008547)	ENSFALG00000008568	ENSFALG00000023070	WNT5A (ENSFALG00000008532)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000158855	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000157756	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00390000013347.b	ENSGT01020000230364.a.a.a.a.a.a	ENSGT00390000000980	ENSGT00940000158328	ENSGT01030000234595.B.c.a	ENSGT00940000172472	ENSGT00390000016901	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT00390000017530	ENSGT00940000155552	ENSGT00940000158818.g	ENSGT00940000158818.h	ENSGT00940000154839.C	ENSGT00530000063260	ENSGT00390000001763	ENSGT00390000016119	ENSGT00940000155766.a	ENSGT00940000158933
Kakapo	MODERN SPECIES	3	RBM5 (ENSSHBG00005007167)	SEMA3F (ENSSHBG00005007251)	GNAT1 (ENSSHBG00005007310)	GNAI2 (ENSSHBG00005007330)	SLC38A3 (ENSSHBG00005007352)	SEMA3B (ENSSHBG00005007376)	OASL (ENSSHBG00005007425)	IFRD2 (ENSSHBG00005007473)	HYAL3 (ENSSHBG00005007555)	NAA80 (ENSSHBG00005007570)	RRP9 (ENSSHBG00005007593)	GRM2 (ENSSHBG00005007601)	ENSSHBG00005007612	TEX264 (ENSSHBG00005007621)	ENSSHBG00005007638	RHOA (ENSSHBG00005007707) #22	GPX1 (ENSSHBG00005007717) #23	USP4 (ENSSHBG00005007739) #24	EMC3 (ENSSHBG00005007773)	FANCD2 (ENSSHBG00005007890)	ENSSHBG00005008225	TKT (ENSSHBG00005008255)	ENSSHBG00005008292	ENSSHBG00005008308	CACNA1D (ENSSHBG00005009512)	CHDH (ENSSHBG00005020680)	ACTR8 (ENSSHBG00005020687)	SELENOK (ENSSHBG00005020691)	CACNA2D3 (ENSSHBG00005020721)	LRTM1 (ENSSHBG00005020749)	WNT5A (ENSSHBG00005020751)
Golden eagle	MODERN SPECIES	12	PARP3 (ENSACCG00020011447)	RBM5 (ENSACCG00020011484)	ENSACCG00020011519	SEMA3F (ENSACCG00020011561)	GNAT1 (ENSACCG00020011641)	GNAI2 (ENSACCG00020011666)	SLC38A3 (ENSACCG00020011708)	SEMA3B (ENSACCG00020012566)	OASL (ENSACCG00020013146)	IFRD2 (ENSACCG00020013172)	HYAL3 (ENSACCG00020013206)	RRP9 (ENSACCG00020013338)	GRM2 (ENSACCG00020013415)	ENSACCG00020013426	TEX264 (ENSACCG00020013442)	RHOA (ENSACCG00020013464) #22	GPX1 (ENSACCG00020013484) #23	USP4 (ENSACCG00020013559) #24	EMC3 (ENSACCG00020013623)	FANCD2 (ENSACCG00020013916)	BRK1 (ENSACCG00020014151)	ENSACCG00020014166	TKT (ENSACCG00020014195)	DCP1A (ENSACCG00020014215)	CACNA1D (ENSACCG00020014622)	CHDH (ENSACCG00020015093)	ACTR8 (ENSACCG00020015115)	SELENOK (ENSACCG00020015143)	CACNA2D3 (ENSACCG00020015193)	LRTM1 (ENSACCG00020015280)	WNT5A (ENSACCG00020015294)
African ostrich	MODERN SPECIES	544	IFRD2 (ENSSCUG00000006420)	OASL (ENSSCUG00000006418)	SEMA3B (ENSSCUG00000006412)	SLC38A3 (ENSSCUG00000006405)	GNAI2 (ENSSCUG00000006397)	GNAT1 (ENSSCUG00000006393)	SEMA3F (ENSSCUG00000006390)	RBM5 (ENSSCUG00000006372)	ENSSCUG00000006355	RRP9 (ENSSCUG00000006352)	ENSSCUG00000006350	GRM2 (ENSSCUG00000006348)	ENSSCUG00000006345	TEX264 (ENSSCUG00000006344)	ENSSCUG00000006343	RHOA (ENSSCUG00000006338) #22	GPX1 (ENSSCUG00000006336) #23	USP4 (ENSSCUG00000006319) #24	EMC3 (ENSSCUG00000006286)	FANCD2 (ENSSCUG00000006277)
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000166103	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00940000157756	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000157976	ENSGT00390000006665.a	ENSGT00940000157842	ENSGT00940000156468	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000159520.h.v.a.a	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13
tuatara	MODERN SPECIES	914	ENSSPUG00000001510 #17	ENSSPUG00000001543 #17	OASL (ENSSPUG00000001562)	SLC38A3 (ENSSPUG00000001774)	ENSSPUG00000001816	GNAT1 (ENSSPUG00000001819)	SEMA3F (ENSSPUG00000001845)	RBM5 (ENSSPUG00000001876)	RBM6 (ENSSPUG00000001946)	MON1A (ENSSPUG00000001959)	ENSSPUG00000001967	ENSSPUG00000001976	ENSSPUG00000001983	CAMKV (ENSSPUG00000002006)	TRAIP (ENSSPUG00000002039) #7	RHOA (ENSSPUG00000002063) #22	GPX1 (ENSSPUG00000002075) #23	EMC3 (ENSSPUG00000002087)	FANCD2 (ENSSPUG00000002096)	BRK1 (ENSSPUG00000002157)	ENSSPUG00000002166	ENSSPUG00000002172	ENSSPUG00000002195 #12	ENSSPUG00000002272 #12	GMPPB (ENSSPUG00000002305) #13	AMT (ENSSPUG00000002315) #20	TCTA (ENSSPUG00000002334) #21	ENSSPUG00000002437	INKA1 (ENSSPUG00000003155) #9	IP6K1 (ENSSPUG00000003164) #11	NICN1 (ENSSPUG00000003176) #19
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00940000157756	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000157976	ENSGT00390000006665.a	ENSGT00940000157842	ENSGT00940000171749	ENSGT00940000156468	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645.d #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00960000192208	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000159520.h.v.a.a	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00940000157756	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000157976	ENSGT00390000006665.a	ENSGT00940000157842	ENSGT00940000171749	ENSGT00940000156468	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645.d #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00960000192208	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000159520.h.v.a.a	ENSGT00420000030545.g	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21
Common wall lizard	MODERN SPECIES	10	SLC38A3 (ENSPMRG00000004671)	GNAI2 (ENSPMRG00000004663)	ENSPMRG00000004659	ENSPMRG00000004653	GNAT1 (ENSPMRG00000004645)	SEMA3F (ENSPMRG00000004623)	RBM5 (ENSPMRG00000004597)	RBM6 (ENSPMRG00000004579)	MON1A (ENSPMRG00000004566)	MST1R (ENSPMRG00000004555)	ENSPMRG00000004549	ENSPMRG00000004540	ENSPMRG00000004536	ENSPMRG00000004509	TRAIP (ENSPMRG00000004486) #7	RHOA (ENSPMRG00000004480) #22	GPX1 (ENSPMRG00000004456) #23	USP4 (ENSPMRG00000003730) #24	ENSPMRG00000003651	EMC3 (ENSPMRG00000003649)	ENSPMRG00000003646	FANCD2 (ENSPMRG00000003237)	BRK1 (ENSPMRG00000003028)	ENSPMRG00000003017	ENSPMRG00000003006	ENSPMRG00000003000	AMIGO3 (ENSPMRG00000002990) #14	ENSPMRG00000002465 #12	GMPPB (ENSPMRG00000002355) #13	NICN1 (ENSPMRG00000002331) #19	ENSPMRG00000002322
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	8	ENSSMRG00000008073	SEMA3B (ENSSMRG00000008067)	ENSSMRG00000008030	ENSSMRG00000008028	GNAI2 (ENSSMRG00000008024)	GNAT1 (ENSSMRG00000007985)	SEMA3F (ENSSMRG00000007951)	RBM5 (ENSSMRG00000007907)	ENSSMRG00000007905	RBM6 (ENSSMRG00000007888)	MON1A (ENSSMRG00000007883)	MST1R (ENSSMRG00000007871)	ENSSMRG00000007857	CAMKV (ENSSMRG00000007780)	TRAIP (ENSSMRG00000007774) #7	RHOA (ENSSMRG00000007767) #22	ENSSMRG00000007743 #23	ENSSMRG00000007741	USP4 (ENSSMRG00000007731) #24	C3orf62 (ENSSMRG00000007730) #25	EMC3 (ENSSMRG00000007727)	FANCD2 (ENSSMRG00000007715)	BRK1 (ENSSMRG00000007711)	ENSSMRG00000007710	ENSSMRG00000007706	ENSSMRG00000007621 #12	AMIGO3 (ENSSMRG00000007614) #14	ENSSMRG00000007549 #12	GMPPB (ENSSMRG00000007535) #13	NICN1 (ENSSMRG00000007528) #19	AMT (ENSSMRG00000007525) #20
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00940000157756	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000157976	ENSGT00390000006665.a	ENSGT00940000157842	ENSGT00940000171749	ENSGT00940000156468	ENSGT00390000007696 #7	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645.d #24	ENSGT00390000000252 #25	ENSGT00960000192208	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT00940000159520.h.v.a.a	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00940000157756	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000157976	ENSGT00390000006665.a	ENSGT00940000157842	ENSGT00940000171749	ENSGT00940000156468	ENSGT00390000007696.d #7	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645.d #24	ENSGT00960000192208	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT01010000229632	ENSGT00940000159520.h.v.a.a	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00940000157756	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000157976	ENSGT00390000006665.a	ENSGT00940000157842	ENSGT00940000171749	ENSGT00940000156468	ENSGT00390000007696.d #7	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645.d #24	ENSGT00960000192208	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT01010000229632	ENSGT00940000159520.h.v.a.a	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000013172 #16	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #17	ENSGT00510000046406.f.a	ENSGT00940000157756	ENSGT00940000157127	ENSGT00940000155125	ENSGT00940000160395	ENSGT00940000156703	ENSGT00940000156617	ENSGT00940000157976	ENSGT00390000006665.a	ENSGT00940000157842	ENSGT00940000171749	ENSGT00940000156468	ENSGT00390000007696.d #7	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645.d #24	ENSGT00960000192208	ENSGT00390000005780.b	ENSGT00390000016970	ENSGT00390000011082	ENSGT01010000229632	ENSGT00940000159520.h.v.a.a	ENSGT00940000171658	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	3	MST1 (ENSPTXG00000008165) #15	APEH (ENSPTXG00000008169) #16	ENSPTXG00000008176	SEMA3B (ENSPTXG00000008193)	SLC38A3 (ENSPTXG00000008202)	ENSPTXG00000008412	GNAT1 (ENSPTXG00000008416)	SEMA3F (ENSPTXG00000008417)	RBM5 (ENSPTXG00000008420)	RBM6 (ENSPTXG00000008423)	MON1A (ENSPTXG00000008425)	MST1R (ENSPTXG00000008427)	ENSPTXG00000008455	ENSPTXG00000008457	ENSPTXG00000008458 #7	RHOA (ENSPTXG00000008460) #22	GPX1 (ENSPTXG00000008461) #23	USP4 (ENSPTXG00000008467) #24	ENSPTXG00000009007	EMC3 (ENSPTXG00000009009)	FANCD2 (ENSPTXG00000012174)	BRK1 (ENSPTXG00000012175)	ENSPTXG00000012176	ENSPTXG00000012177	ENSPTXG00000012179	RNF123 (ENSPTXG00000012183) #12	AMIGO3 (ENSPTXG00000013710) #14	GMPPB (ENSPTXG00000013711) #13	NICN1 (ENSPTXG00000013712) #19	AMT (ENSPTXG00000013713) #20	TCTA (ENSPTXG00000013714) #21
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	51	ENSNSUG00000005462	ENSNSUG00000005463	SEMA3B (ENSNSUG00000005483)	SLC38A3 (ENSNSUG00000005484)	ENSNSUG00000005499	GNAT1 (ENSNSUG00000005502)	SEMA3F (ENSNSUG00000005504)	RBM5 (ENSNSUG00000005505)	ENSNSUG00000005508	ENSNSUG00000005511	MON1A (ENSNSUG00000005512)	ENSNSUG00000005513	ENSNSUG00000005514	CAMKV (ENSNSUG00000005515)	ENSNSUG00000005516 #7	RHOA (ENSNSUG00000005528) #22	GPX1 (ENSNSUG00000005529) #23	USP4 (ENSNSUG00000005531) #24	ENSNSUG00000006630	EMC3 (ENSNSUG00000006631)	ENSNSUG00000006633	BRK1 (ENSNSUG00000006634)	ENSNSUG00000006635	ENSNSUG00000006639	RNF123 (ENSNSUG00000006646) #12	AMIGO3 (ENSNSUG00000006873) #14	GMPPB (ENSNSUG00000006874) #13	NICN1 (ENSNSUG00000006876) #19	AMT (ENSNSUG00000006877) #20	TCTA (ENSNSUG00000006878) #21	ENSNSUG00000006879
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	4530																RHOA (ENSLLTG00000015432) #22	GPX1 (ENSLLTG00000015431) #23	ENSLLTG00000015429 #24
Indian cobra	MODERN SPECIES	1	ENSNNAG00000006900	SEMA3B (ENSNNAG00000006951)	ENSNNAG00000007221	SLC38A3 (ENSNNAG00000007237)	GNAI2 (ENSNNAG00000007280)	GNAT1 (ENSNNAG00000007296)	SEMA3F (ENSNNAG00000007357)	ENSNNAG00000007512	ENSNNAG00000007654	RBM6 (ENSNNAG00000007728)	MON1A (ENSNNAG00000007857)	ENSNNAG00000007888	ENSNNAG00000007956	ENSNNAG00000007973	ENSNNAG00000007997 #7	RHOA (ENSNNAG00000008022) #22	GPX1 (ENSNNAG00000008046) #23	USP4 (ENSNNAG00000008160) #24	ENSNNAG00000009510	EMC3 (ENSNNAG00000009544)	FANCD2 (ENSNNAG00000009694)	BRK1 (ENSNNAG00000011269)	ENSNNAG00000011290	ENSNNAG00000011300	RNF123 (ENSNNAG00000011486) #12	AMIGO3 (ENSNNAG00000013574) #14	GMPPB (ENSNNAG00000013587) #13	NICN1 (ENSNNAG00000013609) #19	AMT (ENSNNAG00000013716) #20	TCTA (ENSNNAG00000014549) #21	ENSNNAG00000014567
Lizard	DUPLICATION
Lizard	MODERN SPECIES	1	ENSACAG00000006125	ENSACAG00000036991	ENSACAG00000041420	ENSACAG00000006087	ENSACAG00000006080	ENSACAG00000006058	ENSACAG00000005949	ENSACAG00000005882	ccdc115 (ENSACAG00000041874)	ENSACAG00000005821	ENSACAG00000028606	ENSACAG00000005527	ENSACAG00000043207	ENSACAG00000045416	UBA1 (ENSACAG00000005270)	ENSACAG00000005247 #22	ENSACAG00000005220	ENSACAG00000005069	USP11 (ENSACAG00000004813)	ENSACAG00000004776	UXT (ENSACAG00000004754)	ELK1 (ENSACAG00000004726)	ENSACAG00000004710	ENSACAG00000040588	CFP (ENSACAG00000010932)	ENSACAG00000036893	ENSACAG00000029444	ENSACAG00000041669	SYN1 (ENSACAG00000010994)	ARAF (ENSACAG00000011249)	ENSACAG00000024977
Lizard	MODERN SPECIES	1	ENSACAG00000041615	ENSACAG00000009247	ENSACAG00000009348	ENSACAG00000038778	ENSACAG00000009146	GNAT1 (ENSACAG00000008894)	ENSACAG00000039739	SEMA3F (ENSACAG00000008723)	RBM5 (ENSACAG00000008580)	RBM6 (ENSACAG00000008480)	MON1A (ENSACAG00000008460)	MST1R (ENSACAG00000008410)	ENSACAG00000029325	CAMKV (ENSACAG00000008359)	TRAIP (ENSACAG00000008316) #7	ENSACAG00000008297 #22	ENSACAG00000008007 #24	ENSACAG00000008006 #25	EMC3 (ENSACAG00000036197)	ENSACAG00000007747	ENSACAG00000036119	ENSACAG00000038864	ENSACAG00000024664	ENSACAG00000042961	ENSACAG00000045367	AMIGO3 (ENSACAG00000007744) #14	ENSACAG00000007557 #12	ENSACAG00000007523 #13	NICN1 (ENSACAG00000007492) #19	ENSACAG00000007440 #20	TCTA (ENSACAG00000035589) #21
Anura	ANCESTRAL SPECIES	230						ENSGT00940000162824	ENSGT00940000157802 #11	ENSGT00940000158909 #13	ENSGT00950000183146.b #14	ENSGT00940000155781 #12	ENSGT00940000159461 #15	ENSGT00940000165736	ENSGT00390000001505 #19	ENSGT00940000157524 #20	ENSGT00390000004490 #21	ENSGT00950000182945.b.b #22	ENSGT00940000156150 #23	ENSGT00940000156645 #24
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	11	ENSLLEG00000030506	ENSLLEG00000030585	ENSLLEG00000030605	ENSLLEG00000030624	ENSLLEG00000030641	IP6K1 (ENSLLEG00000030656) #11	GMPPB (ENSLLEG00000030660) #13	RNF123 (ENSLLEG00000030685) #12	AMIGO3 (ENSLLEG00000030776) #14	ENSLLEG00000007957	MST1 (ENSLLEG00000007989) #15	ENSLLEG00000008070	NICN1 (ENSLLEG00000009032) #19	AMT (ENSLLEG00000009259) #20	TCTA (ENSLLEG00000009426) #21	RHOA (ENSLLEG00000009450) #22	GPX1 (ENSLLEG00000009528) #23	USP4 (ENSLLEG00000009723) #24	RBM5 (ENSLLEG00000012336)	INKA1 (ENSLLEG00000012519) #9	TRAIP (ENSLLEG00000012556) #7	ENSLLEG00000012714	MON1A (ENSLLEG00000012828)	MST1R (ENSLLEG00000012877)	CAMKV (ENSLLEG00000012967)	SEMA3F (ENSLLEG00000013071)	GNAT1 (ENSLLEG00000013251)	SLC38A3 (ENSLLEG00000013362)	ENSLLEG00000013528	ENSLLEG00000013581	GNAI2 (ENSLLEG00000013614)
Coelacanth	MODERN SPECIES	237	MYOG (ENSLACG00000014874)	PPFIA4 (ENSLACG00000014912)	ENSLACG00000015407	HIPK1 (ENSLACG00000015517)	AP4B1 (ENSLACG00000015784)	DCLRE1B (ENSLACG00000015870)	PTPN22 (ENSLACG00000016001)	RSBN1 (ENSLACG00000016161)	PHTF1 (ENSLACG00000016250)	MAGI3 (ENSLACG00000016389)	LRIG2 (ENSLACG00000016847)	SLC16A1 (ENSLACG00000016978)	ENSLACG00000017134	TAFA3 (ENSLACG00000017687)	PPM1J (ENSLACG00000017833)	ENSLACG00000017909 #22	MOV10 (ENSLACG00000017920)	CAPZA1 (ENSLACG00000017963)	ST7L (ENSLACG00000017994)	WNT2B (ENSLACG00000018074)	CTTNBP2NL (ENSLACG00000018169)	kcnd3 (ENSLACG00000018405)	kcnd3 (ENSLACG00000018457)	DDX20 (ENSLACG00000018491)	INKA2 (ENSLACG00000018507) ##9	rap1ab (ENSLACG00000018518)	ENSLACG00000018576	ATP5PB (ENSLACG00000018579)	WDR77 (ENSLACG00000018582)	GUCA1B (ENSLACG00000018596)	IRF6 (ENSLACG00000018600)