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Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	GLCE (ENSSVLG00005007694) #7	NOX5 (ENSSVLG00005007597) #8	SPESP1 (ENSSVLG00005007565) #9	ENSSVLG00005007513 #10	ENSSVLG00005007452 #11	CORO2B (ENSSVLG00005007364) #12	ITGA11 (ENSSVLG00005007326) #13	FEM1B (ENSSVLG00005007302) #14	CLN6 (ENSSVLG00005007215) #15	CALML4 (ENSSVLG00005007109) #16	PIAS1 (ENSSVLG00005007019) #17	SKOR1 (ENSSVLG00005006917) #18	MAP2K5 (ENSSVLG00005006656) #19	C15orf61 (ENSSVLG00005006592) #20	IQCH (ENSSVLG00005025085) #21	AAGAB (ENSSVLG00005025018) #22	SMAD3 (ENSSVLG00005024991) #23	ENSSVLG00005024968 #24	SMAD6 (ENSSVLG00005024946) #25	LCTL (ENSSVLG00005024912) #26	ZWILCH (ENSSVLG00005024833) #27	ENSSVLG00005024744 #28	SNAPC5 (ENSSVLG00005024729) #29	MAP2K1 (ENSSVLG00005024707) #30	TIPIN (ENSSVLG00005024668) #31	DIS3L (ENSSVLG00005024622) #32	MEGF11 (ENSSVLG00005024351) #33	RAB11A (ENSSVLG00005024246) #34	DENND4A (ENSSVLG00005024160) #35	SLC24A1 (ENSSVLG00005023979) #36	INTS14 (ENSSVLG00005023820) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043 #7	ENSGT00940000162591 #8	ENSGT00390000005362 #9	ENSGT00950000182907.a.b.b.b #11	ENSGT00940000158689 #12	ENSGT00940000155465 #13	ENSGT00940000161115 #14	ENSGT00400000022240 #15	ENSGT00940000157859 #16	ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b #17	ENSGT00940000158440 #18	ENSGT00940000157505 #19	ENSGT00390000015942 #20	ENSGT00390000008908 #21	ENSGT00390000007218 #22	ENSGT00940000153499.b.b #23	ENSGT00940000158146 #25	ENSGT00940000157369 #26	ENSGT00390000013696 #27	ENSGT00390000018145 #28	ENSGT00390000010331 #29	ENSGT00940000153487.b.b #30	ENSGT00390000005764 #31	ENSGT00530000063106.B #32	ENSGT00940000155333.B #33	ENSGT00940000154914 #34	ENSGT00940000155836.B #35	ENSGT01030000234532.B.e.b #36	ENSGT00390000009486 #37	ENSGT00530000062962.b.a
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043 #7	ENSGT00940000162591 #8	ENSGT00390000005362 #9	ENSGT00950000182907.a.b.b.b #11	ENSGT00940000158689 #12	ENSGT00940000155465 #13	ENSGT00940000161115 #14	ENSGT00400000022240 #15	ENSGT00940000157859 #16	ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b #17	ENSGT00940000158440 #18	ENSGT00940000157505 #19	ENSGT00390000015942 #20	ENSGT00390000008908 #21	ENSGT00390000007218 #22	ENSGT00940000153499.b.b #23	ENSGT00940000158146 #25	ENSGT00940000157369 #26	ENSGT00390000013696 #27	ENSGT00390000018145 #28	ENSGT00390000010331 #29	ENSGT00940000153487.b.b #30	ENSGT00390000005764 #31	ENSGT00530000063106.B #32	ENSGT00940000155333.B #33	ENSGT00940000154914 #34	ENSGT00940000155836.B #35	ENSGT01030000234532.B.e.b #36	ENSGT00390000009486 #37	ENSGT00530000062962.b.a
Squirrel	MODERN SPECIES	71	RPLP1 (ENSSTOG00000027893)	KIF23 (ENSSTOG00000022809)	PAQR5 (ENSSTOG00000000507)	GLCE (ENSSTOG00000019509) #7	ENSSTOG00000015929 #11	CORO2B (ENSSTOG00000015918) #12	ITGA11 (ENSSTOG00000015545) #13	FEM1B (ENSSTOG00000015544) #14	CLN6 (ENSSTOG00000015540) #15	CALML4 (ENSSTOG00000015539) #16	PIAS1 (ENSSTOG00000015532) #17	SKOR1 (ENSSTOG00000002675) #18	MAP2K5 (ENSSTOG00000010318) #19	C15orf61 (ENSSTOG00000010312) #20	IQCH (ENSSTOG00000010299) #21	AAGAB (ENSSTOG00000010291) #22	SMAD3 (ENSSTOG00000010286) #23	SMAD6 (ENSSTOG00000000696) #25	LCTL (ENSSTOG00000028073) #26	ZWILCH (ENSSTOG00000009607) #27	RPL4 (ENSSTOG00000009221) #28	SNAPC5 (ENSSTOG00000009201) #29	MAP2K1 (ENSSTOG00000009190) #30	TIPIN (ENSSTOG00000009182) #31	DIS3L (ENSSTOG00000009158) #32	MEGF11 (ENSSTOG00000015258) #33	RAB11A (ENSSTOG00000015255) #34	DENND4A (ENSSTOG00000026966) #35	SLC24A1 (ENSSTOG00000002228) #36	INTS14 (ENSSTOG00000002217) #37	HACD3 (ENSSTOG00000002211)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	397						ITGA11 (ENSUPAG00010017705) #13	FEM1B (ENSUPAG00010017736) #14	CLN6 (ENSUPAG00010017740) #15	CALML4 (ENSUPAG00010017747) #16	PIAS1 (ENSUPAG00010017772) #17	ENSUPAG00010017781	SKOR1 (ENSUPAG00010017792) #18	MAP2K5 (ENSUPAG00010017819) #19	C15orf61 (ENSUPAG00010017904) #20	IQCH (ENSUPAG00010017914) #21	AAGAB (ENSUPAG00010018001) #22	SMAD3 (ENSUPAG00010018010) #23	ENSUPAG00010018048 #24	SMAD6 (ENSUPAG00010018050) #25	LCTL (ENSUPAG00010018063) #26	ZWILCH (ENSUPAG00010018079) #27	RPL4 (ENSUPAG00010018119) #28	SNAPC5 (ENSUPAG00010018142) #29	MAP2K1 (ENSUPAG00010018149) #30
Alpin marmot	MODERN SPECIES	7	PAQR5 (ENSMMMG00000005396)	GLCE (ENSMMMG00000005432) #7	NOX5 (ENSMMMG00000005478) #8	SPESP1 (ENSMMMG00000005545) #9	ENSMMMG00000005555 #11	CORO2B (ENSMMMG00000005600) #12	ITGA11 (ENSMMMG00000005622) #13	ENSMMMG00000005671 #14	CLN6 (ENSMMMG00000005687) #15	CALML4 (ENSMMMG00000005699) #16	PIAS1 (ENSMMMG00000005733) #17	SKOR1 (ENSMMMG00000005773) #18	MAP2K5 (ENSMMMG00000005809) #19	ENSMMMG00000005844	IQCH (ENSMMMG00000005869) #21	AAGAB (ENSMMMG00000005970) #22	SMAD3 (ENSMMMG00000005977) #23	ENSMMMG00000006027 #24	SMAD6 (ENSMMMG00000006032) #25	LCTL (ENSMMMG00000006061) #26	ZWILCH (ENSMMMG00000006077) #27	ENSMMMG00000006104	RPL4 (ENSMMMG00000006109) #28	SNAPC5 (ENSMMMG00000006163) #29	MAP2K1 (ENSMMMG00000006173) #30	TIPIN (ENSMMMG00000006196) #31	DIS3L (ENSMMMG00000006220) #32	MEGF11 (ENSMMMG00000006311) #33	RAB11A (ENSMMMG00000006747) #34	ENSMMMG00000006762	DENND4A (ENSMMMG00000006769) #35