Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01050000244838.H.d	ENSGT00950000183104.A.a.a	ENSGT00940000161225 #7	ENSGT00940000157693 #8	ENSGT00510000048988 #9	ENSGT00390000003015 #10	ENSGT00620000088018.h #11	ENSGT00390000014984 #12	ENSGT01090000260044.A.a.b.a.a.a.a.a.a.b #13	ENSGT00940000160928	ENSGT00940000156792 #17	ENSGT00940000161958 #18	ENSGT00390000006113 #19	ENSGT00940000154169.B #20	ENSGT00390000003084 #21	ENSGT00940000158725 #22	ENSGT00940000158624 #23	ENSGT00940000153341.b.p.a.a.a #24	ENSGT00940000154721 #25	ENSGT00390000007816 #26	ENSGT00950000182834.C #27	ENSGT00390000004248 #28	ENSGT00390000014577.b #29	ENSGT00940000160362	ENSGT00940000154436.a	ENSGT00940000154436.b	ENSGT00940000157218.C	ENSGT00950000183053.A	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000157999	ENSGT00410000025651.B
Guinea pig	MODERN SPECIES	133	MPL (ENSCPOG00000006086) #7	TIE1 (ENSCPOG00000006080) #8	C1orf210 (ENSCPOG00000034493) #9	TMEM125 (ENSCPOG00000039580) #10	CFAP57 (ENSCPOG00000007489) #11	EBNA1BP2 (ENSCPOG00000005187) #12	ENSCPOG00000033534 #13	ENSCPOG00000026850 #14	ENSCPOG00000008911 #15	ENSCPOG00000035738 #16	SLC2A1 (ENSCPOG00000000635) #17	ZNF691 (ENSCPOG00000010765) #18	SVBP (ENSCPOG00000033208) #19	ENSCPOG00000027098 #20	C1orf50 (ENSCPOG00000039943) #21	P3H1 (ENSCPOG00000021271) #22	CLDN19 (ENSCPOG00000039124) #23	ENSCPOG00000010888 #24	PPIH (ENSCPOG00000008214) #25	ENSCPOG00000001391 #26	PPCS (ENSCPOG00000003240) #27	ZMYND12 (ENSCPOG00000012992) #28	RIMKLA (ENSCPOG00000005184) #29	HPDL (ENSCPOG00000019649) #30	MUTYH (ENSCPOG00000012452) #31	TOE1 (ENSCPOG00000036595) #32	ENSCPOG00000033680 #33	TESK2 (ENSCPOG00000012459) #34	MMACHC (ENSCPOG00000014136) #35	PRDX1 (ENSCPOG00000014137) #36	AKR1A1 (ENSCPOG00000012718) #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	90	ENSGT01050000244838.H.d	ENSGT00950000183104.A.a.a	ENSGT00940000161225 #7	ENSGT00940000157693 #8	ENSGT00510000048988 #9	ENSGT00390000003015 #10	ENSGT00620000088018.h #11	ENSGT00390000014984 #12	ENSGT01090000260044.A.a.b.a.a.a.a.a.a.b #13	ENSGT00940000160928	ENSGT00940000156792 #17	ENSGT00940000161958 #18	ENSGT00390000006113 #19	ENSGT00940000154169.B #20	ENSGT00390000003084 #21	ENSGT00940000158725 #22	ENSGT00940000158624 #23	ENSGT00940000153341.b.p.a.a.a #24	ENSGT00940000154721 #25	ENSGT00390000007816 #26	ENSGT00950000182834.C #27	ENSGT00390000004248 #28	ENSGT00390000014577.b #29	ENSGT00940000160362	ENSGT00940000154436.a	ENSGT00940000154436.b	ENSGT00940000157218.C	ENSGT00950000183053.A	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000157999	ENSGT00410000025651.B
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	244	ELOVL1 (ENSCLAG00000005835)	CDC20 (ENSCLAG00000005417)	MPL (ENSCLAG00000005179) #7	TIE1 (ENSCLAG00000004371) #8	C1orf210 (ENSCLAG00000003472) #9	TMEM125 (ENSCLAG00000003252) #10	CFAP57 (ENSCLAG00000002618) #11	EBNA1BP2 (ENSCLAG00000002547) #12	ENSCLAG00000017559 #13	ENSCLAG00000002144	SLC2A1 (ENSCLAG00000002106) #17	ZNF691 (ENSCLAG00000002021) #18	SVBP (ENSCLAG00000003001) #19	ENSCLAG00000002885 #20	C1orf50 (ENSCLAG00000002818) #21	P3H1 (ENSCLAG00000002493) #22	CLDN19 (ENSCLAG00000002321) #23	ENSCLAG00000002253 #24	PPIH (ENSCLAG00000002063) #25	CCDC30 (ENSCLAG00000004571) #26	ENSCLAG00000004515	PPCS (ENSCLAG00000004488) #27	ZMYND12 (ENSCLAG00000004415) #28	RIMKLA (ENSCLAG00000004183) #29	FOXJ3 (ENSCLAG00000004107)	GUCA2A (ENSCLAG00000003499)	GUCA2B (ENSCLAG00000003462)	HIVEP3 (ENSCLAG00000003048)	EDN2 (ENSCLAG00000002304)	FOXO6 (ENSCLAG00000002214)	ENSCLAG00000002113
Degu	MODERN SPECIES	286								ENSODEG00000003794	SLC2A1 (ENSODEG00000003831) #17	ENSODEG00000003864	ENSODEG00000019202 #18	SVBP (ENSODEG00000003888) #19	ENSODEG00000001409 #20	C1orf50 (ENSODEG00000001430) #21	ENSODEG00000018684	P3H1 (ENSODEG00000001470) #22	CLDN19 (ENSODEG00000001571) #23	ENSODEG00000001592 ##24	ENSODEG00000001627 #25	ENSODEG00000001693 #26	PPCS (ENSODEG00000001735) #27	ZMYND12 (ENSODEG00000001753) #28	RIMKLA (ENSODEG00000001770) #29	ENSODEG00000001782	FOXJ3 (ENSODEG00000001809)	GUCA2A (ENSODEG00000001820)	GUCA2B (ENSODEG00000001838)	ENSODEG00000018717	HIVEP3 (ENSODEG00000001881)	EDN2 (ENSODEG00000001944)	FOXO6 (ENSODEG00000001967)