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Primates	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00410000029246
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00410000029246
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00410000029246
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00410000029246
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000000436	ENSGT00910000147814	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860
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Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000000436	ENSGT00910000147814	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	137																ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961.c	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000154295.y.b.a.a.b	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991
Drill	MODERN SPECIES	1560																SFRP1 (ENSMLEG00000031900) #22	ZMAT4 (ENSMLEG00000034448) #23
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	164																SFRP1 (ENSCATG00000032533) #22	ZMAT4 (ENSCATG00000044978) #23	TCIM (ENSCATG00000015493)	IDO2 (ENSCATG00000034969)	IDO1 (ENSCATG00000033441)	ADAM2 (ENSCATG00000037580)	ADAM18 (ENSCATG00000033440)	ENSCATG00000034543	ENSCATG00000040613	ENSCATG00000031933	ADAM32 (ENSCATG00000033525)	ADAM9 (ENSCATG00000033234)	TM2D2 (ENSCATG00000044110)	HTRA4 (ENSCATG00000043700)	PLEKHA2 (ENSCATG00000043759)	TACC1 (ENSCATG00000035857)
Olive baboon	MODERN SPECIES	18	SMIM19 (ENSPANG00000018972)	SLC20A2 (ENSPANG00000015058)	VDAC3 (ENSPANG00000023234)	DKK4 (ENSPANG00000012834)	POLB (ENSPANG00000011021)	IKBKB (ENSPANG00000013874)	ENSPANG00000040523	PLAT (ENSPANG00000006697)	AP3M2 (ENSPANG00000016689)	KAT6A (ENSPANG00000021919)	ANK1 (ENSPANG00000007577)	NKX6-3 (ENSPANG00000014739)	GPAT4 (ENSPANG00000020590)	GINS4 (ENSPANG00000011023)	ENSPANG00000016690	SFRP1 (ENSPANG00000014224) #22	ENSPANG00000010363	ZMAT4 (ENSPANG00000014196) #23	TCIM (ENSPANG00000031091)	IDO2 (ENSPANG00000021632)	IDO1 (ENSPANG00000012480)	ADAM2 (ENSPANG00000009843)	ENSPANG00000039689	ADAM18 (ENSPANG00000013368)	ENSPANG00000012484	ENSPANG00000047604	ENSPANG00000042202	ENSPANG00000012877	ENSPANG00000047321	ADAM32 (ENSPANG00000009844)	ADAM9 (ENSPANG00000011024)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000000436	ENSGT00910000147814	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.b.a.b.b.a.b.a
Rhesus	MODERN SPECIES	18	SLC20A2 (ENSMMUG00000020186)	VDAC3 (ENSMMUG00000020185)	DKK4 (ENSMMUG00000020794)	ENSMMUG00000050370	POLB (ENSMMUG00000065244)	IKBKB (ENSMMUG00000008351)	PLAT (ENSMMUG00000014432)	AP3M2 (ENSMMUG00000014431)	KAT6A (ENSMMUG00000010891)	ANK1 (ENSMMUG00000014726)	ENSMMUG00000014725	NKX6-3 (ENSMMUG00000054451)	GPAT4 (ENSMMUG00000014721)	GINS4 (ENSMMUG00000009123)	GOLGA7 (ENSMMUG00000016120)	SFRP1 (ENSMMUG00000019082) #22	ZMAT4 (ENSMMUG00000000776) #23	TCIM (ENSMMUG00000045757)	IDO2 (ENSMMUG00000019306)	ENSMMUG00000000346	IDO1 (ENSMMUG00000019304)	ADAM2 (ENSMMUG00000003137)	ENSMMUG00000061001	ADAM18 (ENSMMUG00000022134)	ENSMMUG00000059961	ENSMMUG00000056251	ENSMMUG00000060473	ENSMMUG00000062108	ENSMMUG00000053391	ADAM9 (ENSMMUG00000006033)	TM2D2 (ENSMMUG00000056131)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	18	CHRNB3 (ENSMFAG00000033169)	SMIM19 (ENSMFAG00000002359)	SLC20A2 (ENSMFAG00000000865)	VDAC3 (ENSMFAG00000041877)	DKK4 (ENSMFAG00000034088)	POLB (ENSMFAG00000030793)	IKBKB (ENSMFAG00000039739)	PLAT (ENSMFAG00000041986)	AP3M2 (ENSMFAG00000045662)	KAT6A (ENSMFAG00000040843)	ANK1 (ENSMFAG00000045115)	NKX6-3 (ENSMFAG00000039180)	GPAT4 (ENSMFAG00000003498)	GINS4 (ENSMFAG00000002972)	ENSMFAG00000032651	SFRP1 (ENSMFAG00000035564) #22	ENSMFAG00000059759	ZMAT4 (ENSMFAG00000043475) #23	TCIM (ENSMFAG00000007134)	IDO2 (ENSMFAG00000041471)	ENSMFAG00000064281	IDO1 (ENSMFAG00000001509)	ADAM18 (ENSMFAG00000035678)	ENSMFAG00000054129	ENSMFAG00000035987	ENSMFAG00000057049	ADAM5 (ENSMFAG00000044676)	ENSMFAG00000058453	ADAM32 (ENSMFAG00000043270)	ADAM9 (ENSMFAG00000039520)	TM2D2 (ENSMFAG00000038805)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	539	SMIM19 (ENSMNEG00000030058)	ENSMNEG00000028888	SLC20A2 (ENSMNEG00000038811)	VDAC3 (ENSMNEG00000039811)	DKK4 (ENSMNEG00000010449)	POLB (ENSMNEG00000020348)	IKBKB (ENSMNEG00000039964)	PLAT (ENSMNEG00000024135)	AP3M2 (ENSMNEG00000041067)	KAT6A (ENSMNEG00000041057)	ANK1 (ENSMNEG00000039971)	NKX6-3 (ENSMNEG00000029491)	GPAT4 (ENSMNEG00000032523)	GINS4 (ENSMNEG00000033693)	GOLGA7 (ENSMNEG00000034042)	SFRP1 (ENSMNEG00000036962) #22	ZMAT4 (ENSMNEG00000042102) #23	ENSMNEG00000022875	TCIM (ENSMNEG00000012895)	IDO2 (ENSMNEG00000034364)	IDO1 (ENSMNEG00000042379)	ADAM2 (ENSMNEG00000039951)	ADAM18 (ENSMNEG00000035061)	ENSMNEG00000042006	ENSMNEG00000045553	ADAM32 (ENSMNEG00000044974)	ENSMNEG00000003795	ADAM9 (ENSMNEG00000024116)	TM2D2 (ENSMNEG00000040380)	HTRA4 (ENSMNEG00000005256)	PLEKHA2 (ENSMNEG00000029799)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	27	CHRNB3 (ENSCSAG00000015002)	SMIM19 (ENSCSAG00000015011)	SLC20A2 (ENSCSAG00000015019)	VDAC3 (ENSCSAG00000015024)	DKK4 (ENSCSAG00000015030)	POLB (ENSCSAG00000015034)	IKBKB (ENSCSAG00000015039)	PLAT (ENSCSAG00000015050)	AP3M2 (ENSCSAG00000015054)	KAT6A (ENSCSAG00000015058)	ANK1 (ENSCSAG00000015073)	NKX6-3 (ENSCSAG00000015081)	GPAT4 (ENSCSAG00000015087)	GINS4 (ENSCSAG00000015091)	GOLGA7 (ENSCSAG00000015096)	SFRP1 (ENSCSAG00000015099) #22	ZMAT4 (ENSCSAG00000015108) #23	TCIM (ENSCSAG00000018537)	IDO2 (ENSCSAG00000015113)	IDO1 (ENSCSAG00000015118)	ADAM2 (ENSCSAG00000015162)	ADAM18 (ENSCSAG00000015212)	ENSCSAG00000015283	ENSCSAG00000015309	ENSCSAG00000018534	ADAM32 (ENSCSAG00000015351)	ADAM9 (ENSCSAG00000015373)	TM2D2 (ENSCSAG00000015378)	HTRA4 (ENSCSAG00000015386)	PLEKHA2 (ENSCSAG00000015396)	TACC1 (ENSCSAG00000015401)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	356										ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2931														GINS4 (ENSRROG00000026206)	GOLGA7 (ENSRROG00000028796)	SFRP1 (ENSRROG00000042000) #22	ZMAT4 (ENSRROG00000040877) #23	TCIM (ENSRROG00000027707)	ENSRROG00000010865	IDO2 (ENSRROG00000036605)	IDO1 (ENSRROG00000044350)
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	778										KAT6A (ENSRBIG00000034904)	ANK1 (ENSRBIG00000042414)	NKX6-3 (ENSRBIG00000031967)	GPAT4 (ENSRBIG00000040482)	GINS4 (ENSRBIG00000027166)	GOLGA7 (ENSRBIG00000039536)	SFRP1 (ENSRBIG00000032313) #22	ZMAT4 (ENSRBIG00000031887) #23	TCIM (ENSRBIG00000027643)	ENSRBIG00000001639	IDO2 (ENSRBIG00000038872)	IDO1 (ENSRBIG00000031329)	ADAM2 (ENSRBIG00000001541)	ADAM18 (ENSRBIG00000033665)	ENSRBIG00000037243
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00410000029246
Gibbon	MODERN SPECIES	23	CHRNB3 (ENSNLEG00000012932)	SMIM19 (ENSNLEG00000027333)	SLC20A2 (ENSNLEG00000012920)	VDAC3 (ENSNLEG00000012890)	DKK4 (ENSNLEG00000012886)	POLB (ENSNLEG00000012862)	IKBKB (ENSNLEG00000012842)	PLAT (ENSNLEG00000012779)	AP3M2 (ENSNLEG00000012765)	KAT6A (ENSNLEG00000012750)	ANK1 (ENSNLEG00000012608)	NKX6-3 (ENSNLEG00000034620)	GPAT4 (ENSNLEG00000012602)	GINS4 (ENSNLEG00000012593)	GOLGA7 (ENSNLEG00000012577)	SFRP1 (ENSNLEG00000012571) #22	ZMAT4 (ENSNLEG00000012564) #23	TCIM (ENSNLEG00000028164)	IDO2 (ENSNLEG00000012542)	IDO1 (ENSNLEG00000012519)	ADAM2 (ENSNLEG00000012483)	ENSNLEG00000035094	ENSNLEG00000031652	ADAM32 (ENSNLEG00000035514)	ADAM9 (ENSNLEG00000012378)	ENSNLEG00000035701	HTRA4 (ENSNLEG00000032989)	PLEKHA2 (ENSNLEG00000031640)	TACC1 (ENSNLEG00000012333)	ENSNLEG00000012330	FGFR1 (ENSNLEG00000012322)
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00410000029246
Orangutan	MODERN SPECIES	21	CHRNB3 (ENSPPYG00000018558)	SMIM19 (ENSPPYG00000018556)	SLC20A2 (ENSPPYG00000018555)	VDAC3 (ENSPPYG00000018554)	DKK4 (ENSPPYG00000018553)	POLB (ENSPPYG00000018551)	IKBKB (ENSPPYG00000018550)	PLAT (ENSPPYG00000018549)	AP3M2 (ENSPPYG00000018548)	KAT6A (ENSPPYG00000018547)	ANK1 (ENSPPYG00000018546)	NKX6-3 (ENSPPYG00000018545)	GPAT4 (ENSPPYG00000018544)	GINS4 (ENSPPYG00000018543)	GOLGA7 (ENSPPYG00000018542)	SFRP1 (ENSPPYG00000018541) #22	ZMAT4 (ENSPPYG00000018540) #23	TCIM (ENSPPYG00000018539)	IDO2 (ENSPPYG00000018538)	IDO1 (ENSPPYG00000018537)	ADAM2 (ENSPPYG00000018536)	ADAM18 (ENSPPYG00000018535)	ENSPPYG00000018534	ENSPPYG00000018533	ADAM32 (ENSPPYG00000018532)	ADAM9 (ENSPPYG00000018531)	TM2D2 (ENSPPYG00000018530)	PLEKHA2 (ENSPPYG00000018529)	TACC1 (ENSPPYG00000018528)	ENSPPYG00000018527	FGFR1 (ENSPPYG00000018526)
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b.kb	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00410000029246	ENSGT00940000155860
Gorilla	MODERN SPECIES	21	CHRNB3 (ENSGGOG00000016274)	SMIM19 (ENSGGOG00000042840)	SLC20A2 (ENSGGOG00000014798)	VDAC3 (ENSGGOG00000001932)	DKK4 (ENSGGOG00000015784)	POLB (ENSGGOG00000009239)	IKBKB (ENSGGOG00000006769)	PLAT (ENSGGOG00000025616)	AP3M2 (ENSGGOG00000002072)	KAT6A (ENSGGOG00000004681)	ANK1 (ENSGGOG00000011729)	NKX6-3 (ENSGGOG00000016047)	GPAT4 (ENSGGOG00000016036)	GINS4 (ENSGGOG00000001536)	GOLGA7 (ENSGGOG00000001532)	SFRP1 (ENSGGOG00000037132) #22	ZMAT4 (ENSGGOG00000006633) #23	TCIM (ENSGGOG00000038998)	IDO2 (ENSGGOG00000040816)	IDO1 (ENSGGOG00000027317)	ADAM2 (ENSGGOG00000038491)	ADAM18 (ENSGGOG00000040601)	ADAM32 (ENSGGOG00000006068)	ADAM9 (ENSGGOG00000006056)	ENSGGOG00000043189	HTRA4 (ENSGGOG00000006044)	PLEKHA2 (ENSGGOG00000006037)	TACC1 (ENSGGOG00000011078)	ENSGGOG00000013992	FGFR1 (ENSGGOG00000013080)	LETM2 (ENSGGOG00000013075)
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b.kb	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860	ENSGT00950000183167.a.b.b.a.bb
Human	MODERN SPECIES	20	CHRNB3 (ENSG00000147432)	SMIM19 (ENSG00000176209)	SLC20A2 (ENSG00000168575)	VDAC3 (ENSG00000078668)	DKK4 (ENSG00000104371)	POLB (ENSG00000070501)	IKBKB (ENSG00000104365)	PLAT (ENSG00000104368)	AP3M2 (ENSG00000070718)	KAT6A (ENSG00000083168)	ANK1 (ENSG00000029534)	NKX6-3 (ENSG00000165066)	GPAT4 (ENSG00000158669)	GINS4 (ENSG00000147536)	GOLGA7 (ENSG00000147533)	SFRP1 (ENSG00000104332) #22	ZMAT4 (ENSG00000165061) #23	TCIM (ENSG00000176907)	IDO2 (ENSG00000188676)	IDO1 (ENSG00000131203)	ADAM2 (ENSG00000104755)	ADAM18 (ENSG00000168619)	ADAM32 (ENSG00000197140)	ADAM9 (ENSG00000168615)	TM2D2 (ENSG00000169490)	HTRA4 (ENSG00000169495)	PLEKHA2 (ENSG00000169499)	TACC1 (ENSG00000147526)	FGFR1 (ENSG00000077782)	LETM2 (ENSG00000165046)	NSD3 (ENSG00000147548)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b.kb	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000165686.C	ENSGT00940000153456.b.a.b
Chimpanzee	MODERN SPECIES	21	ENSPTRG00000039184	SLC20A2 (ENSPTRG00000020206)	VDAC3 (ENSPTRG00000020205)	DKK4 (ENSPTRG00000020204)	POLB (ENSPTRG00000020203)	IKBKB (ENSPTRG00000020202)	PLAT (ENSPTRG00000020201)	AP3M2 (ENSPTRG00000020200)	KAT6A (ENSPTRG00000020199)	ANK1 (ENSPTRG00000020198)	NKX6-3 (ENSPTRG00000020197)	GPAT4 (ENSPTRG00000020196)	GINS4 (ENSPTRG00000020195)	GOLGA7 (ENSPTRG00000020193)	ENSPTRG00000042268	SFRP1 (ENSPTRG00000020192) #22	ZMAT4 (ENSPTRG00000020191) #23	TCIM (ENSPTRG00000044702)	IDO2 (ENSPTRG00000020188)	IDO1 (ENSPTRG00000020187)	ADAM2 (ENSPTRG00000020185)	ADAM18 (ENSPTRG00000020183)	ENSPTRG00000044354	ADAM32 (ENSPTRG00000031006)	ADAM9 (ENSPTRG00000020182)	TM2D2 (ENSPTRG00000042247)	HTRA4 (ENSPTRG00000020180)	PLEKHA2 (ENSPTRG00000020179)	TACC1 (ENSPTRG00000020178)	ENSPTRG00000031009	LINC03042 (ENSPTRG00000023971)
Bonobo	MODERN SPECIES	21	SMIM19 (ENSPPAG00000035427)	SLC20A2 (ENSPPAG00000028511)	VDAC3 (ENSPPAG00000034489)	DKK4 (ENSPPAG00000033722)	POLB (ENSPPAG00000007805)	IKBKB (ENSPPAG00000034251)	PLAT (ENSPPAG00000014440)	AP3M2 (ENSPPAG00000041317)	KAT6A (ENSPPAG00000003544)	ANK1 (ENSPPAG00000030840)	NKX6-3 (ENSPPAG00000027559)	GPAT4 (ENSPPAG00000028833)	GINS4 (ENSPPAG00000015017)	GOLGA7 (ENSPPAG00000034789)	ENSPPAG00000032883	ENSPPAG00000034384 #22	ZMAT4 (ENSPPAG00000042573) #23	TCIM (ENSPPAG00000006024)	IDO2 (ENSPPAG00000038735)	IDO1 (ENSPPAG00000029122)	ADAM2 (ENSPPAG00000027835)	ADAM18 (ENSPPAG00000031334)	ENSPPAG00000039719	ADAM32 (ENSPPAG00000034037)	ADAM9 (ENSPPAG00000030625)	TM2D2 (ENSPPAG00000033239)	HTRA4 (ENSPPAG00000032700)	PLEKHA2 (ENSPPAG00000038502)	TACC1 (ENSPPAG00000024009)	ENSPPAG00000034773	ENSPPAG00000031316
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860
Capuchin	MODERN SPECIES	525											ANK1 (ENSCCAG00000030867)	NKX6-3 (ENSCCAG00000028798)	GPAT4 (ENSCCAG00000025800)	GINS4 (ENSCCAG00000032737)	GOLGA7 (ENSCCAG00000022569)	SFRP1 (ENSCCAG00000030146) #22
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	200	CHRNB3 (ENSSBOG00000019165)	SMIM19 (ENSSBOG00000020461)	SLC20A2 (ENSSBOG00000024657)	VDAC3 (ENSSBOG00000034507)	DKK4 (ENSSBOG00000023656)	POLB (ENSSBOG00000025201)	IKBKB (ENSSBOG00000022620)	PLAT (ENSSBOG00000034805)	AP3M2 (ENSSBOG00000000678)	KAT6A (ENSSBOG00000018916)	ANK1 (ENSSBOG00000020989)	NKX6-3 (ENSSBOG00000025983)	GPAT4 (ENSSBOG00000022547)	GINS4 (ENSSBOG00000028833)	ENSSBOG00000030842	SFRP1 (ENSSBOG00000019857) #22	ZMAT4 (ENSSBOG00000017391) #23	TCIM (ENSSBOG00000036356)	IDO2 (ENSSBOG00000021426)	IDO1 (ENSSBOG00000027917)	ADAM2 (ENSSBOG00000021571)	ENSSBOG00000029906	ADAM18 (ENSSBOG00000023778)	ENSSBOG00000030781	ENSSBOG00000031321	ADAM32 (ENSSBOG00000032908)
Marmoset	MODERN SPECIES	4	SMIM19 (ENSCJAG00000008061)	ENSCJAG00000083868 #23	ENSCJAG00000006505	ENSCJAG00000066704	ENSCJAG00000073426	ENSCJAG00000085434	KAT6A (ENSCJAG00000004274)	ANK1 (ENSCJAG00000004219)	NKX6-3 (ENSCJAG00000004205)	GPAT4 (ENSCJAG00000045025)	GINS4 (ENSCJAG00000011026)	ENSCJAG00000066460	GOLGA7 (ENSCJAG00000080080)	ENSCJAG00000081145	ENSCJAG00000080601	SFRP1 (ENSCJAG00000038849) #22	ENSCJAG00000073287	ENSCJAG00000076203	ENSCJAG00000058864	ENSCJAG00000076170	ZMAT4 (ENSCJAG00000072071) #23	TCIM (ENSCJAG00000043083)	IDO2 (ENSCJAG00000006481)	IDO1 (ENSCJAG00000006463)	ADAM2 (ENSCJAG00000006436)	ADAM18 (ENSCJAG00000002167)	ADAM32 (ENSCJAG00000002251)	ADAM9 (ENSCJAG00000002262)	TM2D2 (ENSCJAG00000043754)	HTRA4 (ENSCJAG00000002329)	PLEKHA2 (ENSCJAG00000002336)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	866	CHRNB3 (ENSANAG00000027416)	SMIM19 (ENSANAG00000028180)	SLC20A2 (ENSANAG00000037424)	VDAC3 (ENSANAG00000032578)	DKK4 (ENSANAG00000025941)	POLB (ENSANAG00000025608)	IKBKB (ENSANAG00000030869)	PLAT (ENSANAG00000034979)	AP3M2 (ENSANAG00000031998)	KAT6A (ENSANAG00000034349)	ANK1 (ENSANAG00000037182)	NKX6-3 (ENSANAG00000027678)	GPAT4 (ENSANAG00000028194)	GINS4 (ENSANAG00000033482)	GOLGA7 (ENSANAG00000034573)	SFRP1 (ENSANAG00000021708) #22	ZMAT4 (ENSANAG00000027926) #23	TCIM (ENSANAG00000016944)	IDO2 (ENSANAG00000036163)	IDO1 (ENSANAG00000029248)	ADAM32 (ENSANAG00000024222)	ADAM9 (ENSANAG00000033898)	TM2D2 (ENSANAG00000029293)	HTRA4 (ENSANAG00000010112)	PLEKHA2 (ENSANAG00000033902)	TACC1 (ENSANAG00000028289)	FGFR1 (ENSANAG00000021095)	LETM2 (ENSANAG00000023708)	ENSANAG00000024784	NSD3 (ENSANAG00000027966)	PLPP5 (ENSANAG00000031794)
Tarsier	MODERN SPECIES	3921														GINS4 (ENSTSYG00000005186)	ENSTSYG00000027287	SFRP1 (ENSTSYG00000005927) #22
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.c.a	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b.eb	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000161961	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	83	ENSGT00390000000436	ENSGT00940000156892	ENSGT00940000158062	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.c.a	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b.eb	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	167	ENSGT00390000000436	ENSGT00940000156892	ENSGT00940000158062	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.c.a	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b.eb	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	649	CHRNB3 (ENSPCOG00000019329)	CHRNA6 (ENSPCOG00000019620)	VDAC3 (ENSPCOG00000027647)	DKK4 (ENSPCOG00000021679)	POLB (ENSPCOG00000025965)	IKBKB (ENSPCOG00000022515)	PLAT (ENSPCOG00000015013)	ENSPCOG00000009338	AP3M2 (ENSPCOG00000021553)	KAT6A (ENSPCOG00000022658)	ANK1 (ENSPCOG00000016229)	NKX6-3 (ENSPCOG00000017604)	GPAT4 (ENSPCOG00000022272)	GINS4 (ENSPCOG00000026337)	GOLGA7 (ENSPCOG00000019399)	SFRP1 (ENSPCOG00000028041) #22
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	69															ENSPSMG00000005154	SFRP1 (ENSPSMG00000005180) #22	ZMAT4 (ENSPSMG00000005198) #23	TCIM (ENSPSMG00000005202)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	12	TM2D2 (ENSMICG00000003590)	ENSMICG00000047128	ADAM32 (ENSMICG00000003605)	ENSMICG00000047697	ADAM9 (ENSMICG00000003592)	ADAM18 (ENSMICG00000014558)	ADAM2 (ENSMICG00000044258)	IDO1 (ENSMICG00000000253)	IDO2 (ENSMICG00000001737)	ANK1 (ENSMICG00000006925)	ENSMICG00000043312	NKX6-3 (ENSMICG00000042313)	GPAT4 (ENSMICG00000000942)	GINS4 (ENSMICG00000017584)	ENSMICG00000000940	SFRP1 (ENSMICG00000044520) #22	ZMAT4 (ENSMICG00000047837) #23	SNTB2 (ENSMICG00000043756)	VPS4A (ENSMICG00000009652)	PDF (ENSMICG00000042281)	COG8 (ENSMICG00000009659)	NIP7 (ENSMICG00000009664)	TMED6 (ENSMICG00000001486)	TERF2 (ENSMICG00000029828)	CYB5B (ENSMICG00000036639)	NFAT5 (ENSMICG00000004942)	NQO1 (ENSMICG00000012114)	NOB1 (ENSMICG00000012123)	WWP2 (ENSMICG00000012152)	PSMD7 (ENSMICG00000027773)	ZFHX3 (ENSMICG00000003537)
Bushbaby	MODERN SPECIES	312	CHRNA6 (ENSOGAG00000002710)	SMIM19 (ENSOGAG00000007922)	SLC20A2 (ENSOGAG00000016168)	VDAC3 (ENSOGAG00000016163)	DKK4 (ENSOGAG00000016159)	POLB (ENSOGAG00000016155)	IKBKB (ENSOGAG00000005496)	PLAT (ENSOGAG00000005493)	AP3M2 (ENSOGAG00000001162)	KAT6A (ENSOGAG00000001161)	ANK1 (ENSOGAG00000034344)	NKX6-3 (ENSOGAG00000003715)	GPAT4 (ENSOGAG00000003710)	GINS4 (ENSOGAG00000003708)	GOLGA7 (ENSOGAG00000003707)	SFRP1 (ENSOGAG00000032679) #22	ENSOGAG00000031144	ZMAT4 (ENSOGAG00000012558) #23	TCIM (ENSOGAG00000009599)	IDO2 (ENSOGAG00000012941)	IDO1 (ENSOGAG00000012936)	ADAM2 (ENSOGAG00000002056)	ENSOGAG00000028618	ENSOGAG00000000694	ENSOGAG00000032695	ENSOGAG00000006535	NINL (ENSOGAG00000006517)	GINS1 (ENSOGAG00000006512)	ABHD12 (ENSOGAG00000008501)	PYGB (ENSOGAG00000032919)	ENTPD6 (ENSOGAG00000025094)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Glires	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00900000143342	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00900000143342	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860	ENSGT00950000183167.a.b.b.a
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00900000143342	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000161015.e	ENSGT00940000161015.f	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	25	ENSHGLG00000034139	VDAC3 (ENSHGLG00000018734)	DKK4 (ENSHGLG00000018668)	Polb (ENSHGLG00000033147)	IKBKB (ENSHGLG00000002996)	PLAT (ENSHGLG00000003529)	AP3M2 (ENSHGLG00000003868)	ENSHGLG00000046201	KAT6A (ENSHGLG00000003976)	ANK1 (ENSHGLG00000003086)	NKX6-3 (ENSHGLG00000009779)	AGPAT6 (ENSHGLG00000049078)	GINS4 (ENSHGLG00000038877)	GOLGA7 (ENSHGLG00000035035)	ENSHGLG00000002990	SFRP1 (ENSHGLG00000048334) #22	ENSHGLG00000003246 #23	ENSHGLG00000049581	ENSHGLG00000003519	ENSHGLG00000034332	TCIM (ENSHGLG00000047130)	ENSHGLG00000004193	ENSHGLG00000049168	IDO2 (ENSHGLG00000002830)	IDO1 (ENSHGLG00000003174)	ENSHGLG00000032725	ENSHGLG00000007788	ENSHGLG00000004079	ENSHGLG00000048335	ENSHGLG00000041202	ENSHGLG00000005367
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00900000143342	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000161015.e	ENSGT00940000161015.f	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	104	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00900000143342	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000168975	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000161015.e	ENSGT00940000161015.f	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000162466
Degu	MODERN SPECIES	92	ENSODEG00000006104	ENSODEG00000004860	ENSODEG00000019108	PLAT (ENSODEG00000005190)	AP3M2 (ENSODEG00000005127)	ENSODEG00000005192	KAT6A (ENSODEG00000005122)	ANK1 (ENSODEG00000006246)	ENSODEG00000005411	NKX6-3 (ENSODEG00000005528)	GPAT4 (ENSODEG00000006252)	GINS4 (ENSODEG00000006226)	ENSODEG00000007450	ENSODEG00000007500	ENSODEG00000007818	SFRP1 (ENSODEG00000005553) #22	ENSODEG00000019306	ZMAT4 (ENSODEG00000006439) #23	TCIM (ENSODEG00000019243)	ENSODEG00000006006	IDO1 (ENSODEG00000006588)	ENSODEG00000006039	RUBCNL (ENSODEG00000006136)	LRCH1 (ENSODEG00000005209)	ENSODEG00000005173	HTR2A (ENSODEG00000005410)	ENSODEG00000005886	ENSODEG00000019388	ENSODEG00000005873	ENSODEG00000006404	NUDT15 (ENSODEG00000006598)
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	243	CHRNA6 (ENSCLAG00000000775)	CHRNB3 (ENSCLAG00000001883)	SMIM19 (ENSCLAG00000002469)	SLC20A2 (ENSCLAG00000000798)	VDAC3 (ENSCLAG00000000866)	POLB (ENSCLAG00000000919)	IKBKB (ENSCLAG00000001149)	PLAT (ENSCLAG00000000644)	AP3M2 (ENSCLAG00000000733)	KAT6A (ENSCLAG00000001559)	ANK1 (ENSCLAG00000001439)	NKX6-3 (ENSCLAG00000002327)	GPAT4 (ENSCLAG00000002589)	GINS4 (ENSCLAG00000000658)	GOLGA7 (ENSCLAG00000000695)	SFRP1 (ENSCLAG00000000712) #22	ZMAT4 (ENSCLAG00000000923) #23	TCIM (ENSCLAG00000017544)	IDO2 (ENSCLAG00000003005)	IDO1 (ENSCLAG00000001109)	ADAM18 (ENSCLAG00000001412)	ENSCLAG00000001018	ENSCLAG00000001252	ENSCLAG00000001686	ENSCLAG00000003702
Guinea pig	MODERN SPECIES	80	SMIM19 (ENSCPOG00000032325)	SLC20A2 (ENSCPOG00000008610)	VDAC3 (ENSCPOG00000010512)	DKK4 (ENSCPOG00000021700)	POLB (ENSCPOG00000010567)	ENSCPOG00000039839	IKBKB (ENSCPOG00000010558)	PLAT (ENSCPOG00000026062)	AP3M2 (ENSCPOG00000002362)	KAT6A (ENSCPOG00000011695)	ANK1 (ENSCPOG00000007390)	NKX6-3 (ENSCPOG00000027500)	GPAT4 (ENSCPOG00000008006)	GINS4 (ENSCPOG00000009211)	GOLGA7 (ENSCPOG00000037269)	SFRP1 (ENSCPOG00000039437) #22	ZMAT4 (ENSCPOG00000015224) #23	TCIM (ENSCPOG00000013411)	IDO2 (ENSCPOG00000033051)	IDO1 (ENSCPOG00000014771)	ENSCPOG00000015304	ENSCPOG00000008853	ENSCPOG00000030322	ENSCPOG00000012967	ENSCPOG00000007329	CXCL17 (ENSCPOG00000039366)	LIPE (ENSCPOG00000020887)	CNFN (ENSCPOG00000034761)	MEGF8 (ENSCPOG00000012979)	TMEM145 (ENSCPOG00000012974)	PRR19 (ENSCPOG00000024016)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.b	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860	ENSGT00950000183167.a.b.b.a
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	102	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.b	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	210	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.b	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22
Squirrel	MODERN SPECIES	385	SMIM19 (ENSSTOG00000002086)	SLC20A2 (ENSSTOG00000025918)	ENSSTOG00000005888	DKK4 (ENSSTOG00000005875)	POLB (ENSSTOG00000005845)	IKBKB (ENSSTOG00000005808)	PLAT (ENSSTOG00000009680)	AP3M2 (ENSSTOG00000009669)	ENSSTOG00000029457	KAT6A (ENSSTOG00000024970)	ANK1 (ENSSTOG00000012734)	NKX6-3 (ENSSTOG00000012730)	GPAT4 (ENSSTOG00000012719)	GINS4 (ENSSTOG00000026490)	GOLGA7 (ENSSTOG00000004024)	SFRP1 (ENSSTOG00000024513) #22
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	418		SLC20A2 (ENSUPAG00010022709)	ENSUPAG00010022712	DKK4 (ENSUPAG00010022713)	ENSUPAG00010022716	IKBKB (ENSUPAG00010022720)	PLAT (ENSUPAG00010022724)	AP3M2 (ENSUPAG00010022725)	ENSUPAG00010022726	KAT6A (ENSUPAG00010022729)	ANK1 (ENSUPAG00010022735)	NKX6-3 (ENSUPAG00010022752)	GPAT4 (ENSUPAG00010022753)	GINS4 (ENSUPAG00010022754)	GOLGA7 (ENSUPAG00010022755)	SFRP1 (ENSUPAG00010022758) #22
Alpin marmot	MODERN SPECIES	116	CHRNB3 (ENSMMMG00000004635)	SMIM19 (ENSMMMG00000004626)	SLC20A2 (ENSMMMG00000004606)	ENSMMMG00000004593	DKK4 (ENSMMMG00000004584)	POLB (ENSMMMG00000004558)	IKBKB (ENSMMMG00000004520)	PLAT (ENSMMMG00000004482)	ENSMMMG00000004466	KAT6A (ENSMMMG00000004420)	ANK1 (ENSMMMG00000004306)	NKX6-3 (ENSMMMG00000004289)	GPAT4 (ENSMMMG00000004272)	GINS4 (ENSMMMG00000004261)	ENSMMMG00000004245	SFRP1 (ENSMMMG00000004226) #22	TCIM (ENSMMMG00000004221)	IDO2 (ENSMMMG00000004208)	IDO1 (ENSMMMG00000004171)	ADAM18 (ENSMMMG00000004123)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	14	SLC20A2 (ENSSVLG00005017580)	ENSSVLG00005017652	DKK4 (ENSSVLG00005017944)	POLB (ENSSVLG00005018013)	IKBKB (ENSSVLG00005018109)	PLAT (ENSSVLG00005018429)	AP3M2 (ENSSVLG00005019071)	KAT6A (ENSSVLG00005019144)	ANK1 (ENSSVLG00005019744)	NKX6-3 (ENSSVLG00005020897)	ENSSVLG00005020941	ENSSVLG00005021052	GINS4 (ENSSVLG00005021067)	GOLGA7 (ENSSVLG00005021127)	ENSSVLG00005021210	SFRP1 (ENSSVLG00005021229) #22	ZMAT4 (ENSSVLG00005021283) #23	TCIM (ENSSVLG00005021382)	IDO2 (ENSSVLG00005021403)	IDO1 (ENSSVLG00005021549)	ADAM18 (ENSSVLG00005021659)	ENSSVLG00005021965	ENSSVLG00005022023	ADAM32 (ENSSVLG00005022276)	ENSSVLG00005022608	ADAM9 (ENSSVLG00005010866)	TM2D2 (ENSSVLG00005011108)	HTRA4 (ENSSVLG00005011148)	PLEKHA2 (ENSSVLG00005011303)	TACC1 (ENSSVLG00005011491)	FGFR1 (ENSSVLG00005011874)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00900000143342	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00900000143342	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	63		ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000010017	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000010017	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000010017	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	8	ENSPEMG00000030673	Smim19 (ENSPEMG00000017562)	Slc20a2 (ENSPEMG00000012908)	Vdac3 (ENSPEMG00000015216)	Dkk4 (ENSPEMG00000000525)	Polb (ENSPEMG00000010638)	Ikbkb (ENSPEMG00000015525)	Plat (ENSPEMG00000011572)	Ap3m2 (ENSPEMG00000015995)	Kat6a (ENSPEMG00000011337)	Ank1 (ENSPEMG00000003843)	Nkx6-3 (ENSPEMG00000018691)	Gpat4 (ENSPEMG00000028560)	Gins4 (ENSPEMG00000012800)	Golga7 (ENSPEMG00000028120)	Sfrp1 (ENSPEMG00000029396) #22	Zmat4 (ENSPEMG00000024509) #23	ENSPEMG00000018163	Tcim (ENSPEMG00000003228)	Ido2 (ENSPEMG00000008645)	Ido1 (ENSPEMG00000010119)	Adam18 (ENSPEMG00000008492)	ENSPEMG00000013791	Adam5 (ENSPEMG00000009549)	Adam32 (ENSPEMG00000018779)	Adam9 (ENSPEMG00000018670)	Tm2d2 (ENSPEMG00000001527)	Htra4 (ENSPEMG00000015292)	Plekha2 (ENSPEMG00000010530)	Tacc1 (ENSPEMG00000005437)	ENSPEMG00000031133
Prairie vole	MODERN SPECIES	356	Mrps31 (ENSMOCG00000004060)	Smim19 (ENSMOCG00000007629)	Slc20a2 (ENSMOCG00000003842)	Vdac3 (ENSMOCG00000020594)	ENSMOCG00000006839	Polb (ENSMOCG00000020257)	Ikbkb (ENSMOCG00000001755)	ENSMOCG00000008549	Ap3m2 (ENSMOCG00000001108)	Kat6a (ENSMOCG00000001576)	Ank1 (ENSMOCG00000004839)	Nkx6-3 (ENSMOCG00000005779)	Gpat4 (ENSMOCG00000013451)	Gins4 (ENSMOCG00000005614)	Golga7 (ENSMOCG00000010010)	Sfrp1 (ENSMOCG00000014116) #22	Zmat4 (ENSMOCG00000015996) #23	Tcim (ENSMOCG00000007550)	Ido2 (ENSMOCG00000002008)	Ido1 (ENSMOCG00000000284)	Adam18 (ENSMOCG00000006786)	Adam3 (ENSMOCG00000017977)	Adam5 (ENSMOCG00000012220)	Adam32 (ENSMOCG00000021373)	Adam9 (ENSMOCG00000007035)	Tm2d2 (ENSMOCG00000012921)	Htra4 (ENSMOCG00000013845)	Plekha2 (ENSMOCG00000019151)	ENSMOCG00000001133	ENSMOCG00000017900	Fgfr1 (ENSMOCG00000019256)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000010017	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860	ENSGT00950000183167.a.b.b.a
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	1	Smim19 (ENSCGRG00001013840)	ENSCGRG00001008544	Slc20a2 (ENSCGRG00001007297)	ENSCGRG00001019651	Dkk4 (ENSCGRG00001018975)	Polb (ENSCGRG00001018504)	Ikbkb (ENSCGRG00001017718)	Plat (ENSCGRG00001021037)	Ap3m2 (ENSCGRG00001020086)	Kat6a (ENSCGRG00001019602)	Ank1 (ENSCGRG00001021732)	Nkx6-3 (ENSCGRG00001018532)	Gpat4 (ENSCGRG00001017830)	Gins4 (ENSCGRG00001016717)	ENSCGRG00001020215	Sfrp1 (ENSCGRG00001017613) #22	Zmat4 (ENSCGRG00001016583) #23	Tcim (ENSCGRG00001003871)	Ido2 (ENSCGRG00001014756)	Ido1 (ENSCGRG00001019736)	Adam18 (ENSCGRG00001019073)	Adam3 (ENSCGRG00001005386)	ENSCGRG00001017811	Adam5 (ENSCGRG00001015763)	Adam32 (ENSCGRG00001001096)	Adam9 (ENSCGRG00001024876)	Tm2d2 (ENSCGRG00001024782)	Htra4 (ENSCGRG00001003582)	Plekha2 (ENSCGRG00001002327)	Tacc1 (ENSCGRG00001001810)	ENSCGRG00001023264
Golden Hamster	MODERN SPECIES	624	Slc20a2 (ENSMAUG00000007412)	ENSMAUG00000010048	Dkk4 (ENSMAUG00000014089)	Polb (ENSMAUG00000002032)	Ikbkb (ENSMAUG00000015014)	Plat (ENSMAUG00000015957)	Ap3m2 (ENSMAUG00000010210)	ENSMAUG00000014493	ENSMAUG00000014837	Ank1 (ENSMAUG00000000761)	Nkx6-3 (ENSMAUG00000015260)	Gpat4 (ENSMAUG00000019450)	Gins4 (ENSMAUG00000004678)	ENSMAUG00000001580	Golga7 (ENSMAUG00000015212)	Sfrp1 (ENSMAUG00000020015) #22	ENSMAUG00000004169 #23	ENSMAUG00000017272 #23	Tcim (ENSMAUG00000006142)	Ido2 (ENSMAUG00000019264)	Ido1 (ENSMAUG00000011058)	Adam18 (ENSMAUG00000008085)	ENSMAUG00000021018	Adam5 (ENSMAUG00000015457)	Adam32 (ENSMAUG00000017370)	Adam9 (ENSMAUG00000008043)	Tm2d2 (ENSMAUG00000015269)	Htra4 (ENSMAUG00000016673)	Plekha2 (ENSMAUG00000013697)	ENSMAUG00000016926	ENSMAUG00000000685
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000010017	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Mus	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000010017	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000010017	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000010017	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000010017	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.a	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466	ENSGT00940000162784	ENSGT00940000161015	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00960000193286	ENSGT00940000155860
spretus	MODERN SPECIES	17	Mrps31 (MGP_SPRETEiJ_G0032012)	Smim19 (MGP_SPRETEiJ_G0032013)	Slc20a2 (MGP_SPRETEiJ_G0032014)	Vdac3 (MGP_SPRETEiJ_G0032015)	Dkk4 (MGP_SPRETEiJ_G0032016)	Polb (MGP_SPRETEiJ_G0032017)	Ikbkb (MGP_SPRETEiJ_G0032018)	Plat (MGP_SPRETEiJ_G0032019)	Ap3m2 (MGP_SPRETEiJ_G0032020)	Kat6a (MGP_SPRETEiJ_G0032021)	Ank1 (MGP_SPRETEiJ_G0032022)	Nkx6-3 (MGP_SPRETEiJ_G0032023)	Gpat4 (MGP_SPRETEiJ_G0032024)	Gins4 (MGP_SPRETEiJ_G0032025)	Golga7 (MGP_SPRETEiJ_G0032026)	Sfrp1 (MGP_SPRETEiJ_G0032027) #22	Zmat4 (MGP_SPRETEiJ_G0032028) #23	MGP_SPRETEiJ_G0032029	Tcim (MGP_SPRETEiJ_G0032030)	Ido2 (MGP_SPRETEiJ_G0032031)	Ido1 (MGP_SPRETEiJ_G0032032)	Adam18 (MGP_SPRETEiJ_G0032033)	Adam3 (MGP_SPRETEiJ_G0032034)	Adam5 (MGP_SPRETEiJ_G0032035)	Adam32 (MGP_SPRETEiJ_G0032036)	Adam9 (MGP_SPRETEiJ_G0032037)	Tm2d2 (MGP_SPRETEiJ_G0032038)	Htra4 (MGP_SPRETEiJ_G0032039)	Plekha2 (MGP_SPRETEiJ_G0032040)	Tacc1 (MGP_SPRETEiJ_G0032041)	Fgfr1 (MGP_SPRETEiJ_G0032042)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3292	Slc20a2 (ENSMSIG00000022322)	Vdac3 (ENSMSIG00000022306)	Dkk4 (ENSMSIG00000022292)	Polb (ENSMSIG00000022265)	Ikbkb (ENSMSIG00000022158)	Plat (ENSMSIG00000022138)	Ap3m2 (ENSMSIG00000021987)	ENSMSIG00000021979	ENSMSIG00000021960	Kat6a (ENSMSIG00000021939)	Ank1 (ENSMSIG00000021183)	Nkx6-3 (ENSMSIG00000021160)	Gpat4 (ENSMSIG00000021135)	Gins4 (ENSMSIG00000021124)	ENSMSIG00000021106	Sfrp1 (ENSMSIG00000021081) #22	Zmat4 (ENSMSIG00000021053) #23	Tcim (ENSMSIG00000021048)	Ido2 (ENSMSIG00000021020)	Ido1 (ENSMSIG00000020979)	Adam18 (ENSMSIG00000020940)	Adam3 (ENSMSIG00000020764)	Adam5 (ENSMSIG00000020611)	Adam32 (ENSMSIG00000020547)	Adam9 (ENSMSIG00000020432)	Tm2d2 (ENSMSIG00000020418)	Htra4 (ENSMSIG00000020401)	Plekha2 (ENSMSIG00000020367)	Tacc1 (ENSMSIG00000020252)	ENSMSIG00000020242	Fgfr1 (ENSMSIG00000020120)
Mouse	MODERN SPECIES	17	Mrps31 (ENSMUSG00000031533)	Smim19 (ENSMUSG00000031534)	Slc20a2 (ENSMUSG00000037656)	Vdac3 (ENSMUSG00000008892)	Dkk4 (ENSMUSG00000031535)	Polb (ENSMUSG00000031536)	Ikbkb (ENSMUSG00000031537)	Plat (ENSMUSG00000031538)	Ap3m2 (ENSMUSG00000031539)	Kat6a (ENSMUSG00000031540)	Ank1 (ENSMUSG00000031543)	Nkx6-3 (ENSMUSG00000063672)	Gpat4 (ENSMUSG00000031545)	Gins4 (ENSMUSG00000031546)	Golga7 (ENSMUSG00000015341)	Sfrp1 (ENSMUSG00000031548) #22	Zmat4 (ENSMUSG00000037492) #23	Tcim (ENSMUSG00000056313)	Ido2 (ENSMUSG00000031549)	Ido1 (ENSMUSG00000031551)	Adam18 (ENSMUSG00000031552)	Adam3 (ENSMUSG00000031553)	Adam5 (ENSMUSG00000031554)	Adam32 (ENSMUSG00000037437)	Adam9 (ENSMUSG00000031555)	Tm2d2 (ENSMUSG00000031556)	Htra4 (ENSMUSG00000037406)	Plekha2 (ENSMUSG00000031557)	Tacc1 (ENSMUSG00000065954)	Fgfr1 (ENSMUSG00000031565)	Letm2 (ENSMUSG00000037363)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	17	MGP_CAROLIEiJ_G0030893	MGP_CAROLIEiJ_G0030894	MGP_CAROLIEiJ_G0030895	Thsd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0030896)	Slc25a15 (MGP_CAROLIEiJ_G0030897)	MGP_CAROLIEiJ_G0030898	Vdac3 (MGP_CAROLIEiJ_G0030899)	MGP_CAROLIEiJ_G0030900	MGP_CAROLIEiJ_G0030901	MGP_CAROLIEiJ_G0030902	Ap3m2 (MGP_CAROLIEiJ_G0030903)	Kat6a (MGP_CAROLIEiJ_G0030904)	MGP_CAROLIEiJ_G0030905	Gpat4 (MGP_CAROLIEiJ_G0030906)	MGP_CAROLIEiJ_G0030907	Sfrp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0030908) #22	Zmat4 (MGP_CAROLIEiJ_G0030909) #23	MGP_CAROLIEiJ_G0030910	Tcim (MGP_CAROLIEiJ_G0030911)	Ido2 (MGP_CAROLIEiJ_G0030912)	Ido1 (MGP_CAROLIEiJ_G0030913)	Adam18 (MGP_CAROLIEiJ_G0030914)	Adam3 (MGP_CAROLIEiJ_G0030915)	Adam5 (MGP_CAROLIEiJ_G0030916)	Adam32 (MGP_CAROLIEiJ_G0030917)	Adam9 (MGP_CAROLIEiJ_G0030918)	Tm2d2 (MGP_CAROLIEiJ_G0030919)	Htra4 (MGP_CAROLIEiJ_G0030920)	Plekha2 (MGP_CAROLIEiJ_G0030921)	Tacc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0030922)	Fgfr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0030923)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	10	Mrps31 (MGP_PahariEiJ_G0021364)	Smim19 (MGP_PahariEiJ_G0021365)	Slc20a2 (MGP_PahariEiJ_G0021366)	Vdac3 (MGP_PahariEiJ_G0021367)	Dkk4 (MGP_PahariEiJ_G0021368)	Polb (MGP_PahariEiJ_G0021369)	Ikbkb (MGP_PahariEiJ_G0021370)	Plat (MGP_PahariEiJ_G0021371)	Ap3m2 (MGP_PahariEiJ_G0021372)	Kat6a (MGP_PahariEiJ_G0021373)	Ank1 (MGP_PahariEiJ_G0021374)	Nkx6-3 (MGP_PahariEiJ_G0021375)	Gpat4 (MGP_PahariEiJ_G0021376)	Gins4 (MGP_PahariEiJ_G0021377)	Golga7 (MGP_PahariEiJ_G0021378)	Sfrp1 (MGP_PahariEiJ_G0021379) #22	Zmat4 (MGP_PahariEiJ_G0021380) #23	Tcim (MGP_PahariEiJ_G0021381)	Ido2 (MGP_PahariEiJ_G0021382)	Ido1 (MGP_PahariEiJ_G0021383)	Adam18 (MGP_PahariEiJ_G0021384)	MGP_PahariEiJ_G0021385	MGP_PahariEiJ_G0021386	Adam32 (MGP_PahariEiJ_G0021387)	Adam9 (MGP_PahariEiJ_G0021388)	Tm2d2 (MGP_PahariEiJ_G0021389)	Htra4 (MGP_PahariEiJ_G0021390)	Plekha2 (MGP_PahariEiJ_G0021391)	Tacc1 (MGP_PahariEiJ_G0021392)	Fgfr1 (MGP_PahariEiJ_G0021393)	Letm2 (MGP_PahariEiJ_G0021394)
Rat	MODERN SPECIES	7	Mrps31 (ENSRNOG00000011839)	Smim19 (ENSRNOG00000024930)	Slc20a2 (ENSRNOG00000019490)	Vdac3 (ENSRNOG00000019277)	Dkk4 (ENSRNOG00000019267)	Polb (ENSRNOG00000019150)	Ikbkb (ENSRNOG00000019073)	Plat (ENSRNOG00000019018)	Ap3m2 (ENSRNOG00000018650)	Kat6a (ENSRNOG00000025174)	Ank1 (ENSRNOG00000018241)	Nkx6-3 (ENSRNOG00000018147)	Gpat4 (ENSRNOG00000018077)	Gins4 (ENSRNOG00000018040)	Golga7 (ENSRNOG00000017956)	Sfrp1 (ENSRNOG00000017783) #22	Zmat4 (ENSRNOG00000042690) #23	Ido2 (ENSRNOG00000025365)	Ido1 (ENSRNOG00000031189)	Adam18 (ENSRNOG00000017683)	Adam3a (ENSRNOG00000017554)	Adam5 (ENSRNOG00000017518)	Adam32 (ENSRNOG00000025728)	Adam9 (ENSRNOG00000017231)	Tm2d2 (ENSRNOG00000016559)	Htra4 (ENSRNOG00000061160)	Plekha2 (ENSRNOG00000066109)	Tacc1 (ENSRNOG00000016423)	Rps28-ps1 (ENSRNOG00000049442)	H2az1-ps1 (ENSRNOG00000038375)	Fgfr1 (ENSRNOG00000016050)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1627						Plat (ENSNGAG00000004890)	Ap3m2 (ENSNGAG00000010292)	ENSNGAG00000018024	ENSNGAG00000015398	Ank1 (ENSNGAG00000012839)	ENSNGAG00000001292	Nkx6-3 (ENSNGAG00000018592)	Gpat4 (ENSNGAG00000019097)	Gins4 (ENSNGAG00000005157)	ENSNGAG00000013975	Sfrp1 (ENSNGAG00000014377) #22	Zmat4 (ENSNGAG00000015545) #23	Tcim (ENSNGAG00000004500)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	165	Vdac3 (ENSJJAG00000010473)	Dkk4 (ENSJJAG00000014214)	Polb (ENSJJAG00000012865)	ENSJJAG00000003998	ENSJJAG00000000210	Plat (ENSJJAG00000016962)	Ap3m2 (ENSJJAG00000016071)	ENSJJAG00000015060	ENSJJAG00000014398	Ank1 (ENSJJAG00000013390)	ENSJJAG00000012904	Nkx6-3 (ENSJJAG00000012233)	Gpat4 (ENSJJAG00000012123)	Gins4 (ENSJJAG00000015028)	ENSJJAG00000013991	Sfrp1 (ENSJJAG00000013805) #22	Zmat4 (ENSJJAG00000013484) #23	Tcim (ENSJJAG00000013073)	Ido2 (ENSJJAG00000012988)	Ido1 (ENSJJAG00000012421)	ENSJJAG00000012072	Adam3 (ENSJJAG00000020146)	Adam5 (ENSJJAG00000004291)	Adam32 (ENSJJAG00000000295)	ENSJJAG00000021924	Plekha2 (ENSJJAG00000021548)	Htra4 (ENSJJAG00000020670)	ENSJJAG00000019630	Adam9 (ENSJJAG00000014163)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	323	Slc20a2 (ENSDORG00000002428)	ENSDORG00000002427	Dkk4 (ENSDORG00000002426)	Polb (ENSDORG00000002424)	Ikbkb (ENSDORG00000012732)	Plat (ENSDORG00000011916)	Ap3m2 (ENSDORG00000011915)	ENSDORG00000013658	ENSDORG00000024601	ENSDORG00000027400	ENSDORG00000028648	Nkx6-3 (ENSDORG00000023956)	Gpat4 (ENSDORG00000014044)	Gins4 (ENSDORG00000014928)	Golga7 (ENSDORG00000027067)	Sfrp1 (ENSDORG00000029616) #22	Zmat4 (ENSDORG00000009300) #23	Tcim (ENSDORG00000006808)	Ido2 (ENSDORG00000003408)	Adam18 (ENSDORG00000006161)	ENSDORG00000025475	ENSDORG00000002119	Adam32 (ENSDORG00000001533)	Adam9 (ENSDORG00000001531)	Tm2d2 (ENSDORG00000001529)	Htra4 (ENSDORG00000001527)	Plekha2 (ENSDORG00000001523)	ENSDORG00000027298	Tacc1 (ENSDORG00000005743)	Fgfr1 (ENSDORG00000002210)	Letm2 (ENSDORG00000002201)
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	78	ENSGT00940000156892	ENSGT00390000000436	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00950000182869.e.b.b	ENSGT00940000161614	ENSGT00940000156918	ENSGT00950000182937.A.b	ENSGT00940000158930.d	ENSGT00940000157991	ENSGT00940000156962	ENSGT00940000155760	ENSGT00940000160545	ENSGT01030000234574.B.c.b.b	ENSGT00390000003246	ENSGT00390000000134.b	ENSGT00940000159875 #22	ENSGT00940000156888 #23	ENSGT00390000003458	ENSGT00940000161813	ENSGT00940000161410	ENSGT00940000162281	ENSGT00940000162466.j	ENSGT00940000156239	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000160760.b	ENSGT00940000158064	ENSGT00940000156991	ENSGT00940000155860	ENSGT00950000183167.a.b.b.a	ENSGT00940000155355	ENSGT00940000159772
Rabbit	DUPLICATION
Rabbit	MODERN SPECIES	439	ENSOCUG00000003675	SLC20A2 (ENSOCUG00000015421)	ENSOCUG00000024318	POLB (ENSOCUG00000001295)	IKBKB (ENSOCUG00000007141)	PLAT (ENSOCUG00000009967)	AP3M2 (ENSOCUG00000009960)	ENSOCUG00000000731	ENSOCUG00000038938	ANK1 (ENSOCUG00000011683)	ENSOCUG00000030778	NKX6-3 (ENSOCUG00000025759)	GPAT4 (ENSOCUG00000002071)	GINS4 (ENSOCUG00000006154)	GOLGA7 (ENSOCUG00000007546)	ENSOCUG00000033787 #22	ENSOCUG00000026917 #22	ZMAT4 (ENSOCUG00000000977) #23	TCIM (ENSOCUG00000027445)	IDO2 (ENSOCUG00000003349)	IDO1 (ENSOCUG00000003344)	ADAM18 (ENSOCUG00000027734)	ENSOCUG00000037745	ENSOCUG00000023766	ENSOCUG00000024508	ENSOCUG00000005475	ENSOCUG00000038658	ENSOCUG00000024455	ENSOCUG00000026361	ENSOCUG00000024496	ENSOCUG00000017406
Rabbit	MODERN SPECIES	439	SLC20A2 (ENSOCUG00000015421)	ENSOCUG00000024318	POLB (ENSOCUG00000001295)	IKBKB (ENSOCUG00000007141)	PLAT (ENSOCUG00000009967)	AP3M2 (ENSOCUG00000009960)	ENSOCUG00000000731	ENSOCUG00000038938	ANK1 (ENSOCUG00000011683)	ENSOCUG00000030778	NKX6-3 (ENSOCUG00000025759)	GPAT4 (ENSOCUG00000002071)	GINS4 (ENSOCUG00000006154)	GOLGA7 (ENSOCUG00000007546)	ENSOCUG00000033787 #22	ENSOCUG00000026917 #22	ZMAT4 (ENSOCUG00000000977) #23	TCIM (ENSOCUG00000027445)	IDO2 (ENSOCUG00000003349)	IDO1 (ENSOCUG00000003344)	ADAM18 (ENSOCUG00000027734)	ENSOCUG00000037745	ENSOCUG00000023766	ENSOCUG00000024508	ENSOCUG00000005475	ENSOCUG00000038658	ENSOCUG00000024455	ENSOCUG00000026361	ENSOCUG00000024496	ENSOCUG00000017406	ENSOCUG00000013399