Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	664															ENSGT00530000062932	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	576															ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	70									ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00940000166736 #16	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387 #18	ENSGT00940000159447 #19	ENSGT00940000160710 #20	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000154687.B #29	ENSGT00940000163543 #30	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157920.a #33	ENSGT00950000182969.A #34	ENSGT00390000008938 #35	ENSGT00390000018089 #36	ENSGT00940000156868.g #37
Reedfish	MODERN SPECIES	17	ENSECRG00000020484	ENSECRG00000020494	ENSECRG00000020507	MYL4 (ENSECRG00000020520)	brinp1 (ENSECRG00000020530)	ENSECRG00000020542	sardh (ENSECRG00000020611) #15	ENSECRG00000020879	dbh (ENSECRG00000020934) #17	FAM163B (ENSECRG00000021015) #18	ADAMTSL2 (ENSECRG00000021032) #19	mymk (ENSECRG00000021067) #20	ENSECRG00000021086	ENSECRG00000021099	ENSECRG00000011247	slc27a4 (ENSECRG00000011301) #22	ptrh1 (ENSECRG00000011332) #23	ENSECRG00000011360 #24	ENSECRG00000011398 #25	urm1 (ENSECRG00000011426) #26	tor2a (ENSECRG00000011442) #27	sh2d3cb (ENSECRG00000011472) #28	STRBP (ENSECRG00000011531) #29	RABGAP1 (ENSECRG00000011592) #31	RC3H2 (ENSECRG00000011691) #32	zbtb26 (ENSECRG00000011741) #33	ENSECRG00000011752 ##33	si:ch211-243g18.2 (ENSECRG00000011765) #34	ndufa8 (ENSECRG00000011788) #35	morn5 (ENSECRG00000011802) #36	lhx6a (ENSECRG00000011822) #37
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00940000163543 #30	ENSGT00940000154687.B #29	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00940000166736 #16	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387 #18	ENSGT00940000159447 #19	ENSGT00940000160710 #20	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	202															ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00940000155640.a	ENSGT00950000186109	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000002955	ENSGT00530000063839
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000018089 #36	ENSGT00390000008938 #35	ENSGT00950000182969.A.a.b #34	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00940000166736 #16	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00940000155640.a	ENSGT00940000164450.a	ENSGT00950000186109	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000002955
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000156868.g #37	ENSGT00390000018089 #36	ENSGT00390000008938 #35	ENSGT00950000182969.A.a.b #34	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00390000012898	ENSGT01050000244924.a.a.a	ENSGT00940000156729	ENSGT00440000039527	ENSGT00390000006366	ENSGT00940000158994	ENSGT00950000183096.a.b	ENSGT00940000161837.c.a	ENSGT00940000158875
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	131	ENSGT01030000234607.A.a.b.b	ENSGT00940000154078.b.a	ENSGT00970000195658	ENSGT00940000169304	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00390000012898	ENSGT01050000244924.a.a.a	ENSGT00940000156729	ENSGT00440000039527	ENSGT00390000006366	ENSGT00940000158994	ENSGT00940000161837.c.a	ENSGT00940000158875	ENSGT00940000158571
Atlantic herring	MODERN SPECIES	3	RC3H2 (ENSCHAG00000020704) #32	RABGAP1 (ENSCHAG00000020736) #31	GPR21 (ENSCHAG00000020903) #30	STRBP (ENSCHAG00000020938) #29	ENSCHAG00000021236	ENSCHAG00000021263	GOLT1B (ENSCHAG00000021273)	ENSCHAG00000021287	SH2D3C (ENSCHAG00000021308) #28	urm1 (ENSCHAG00000021479) #26	CERCAM (ENSCHAG00000021508) #25	sardh (ENSCHAG00000021789) #15	dbh (ENSCHAG00000023081) #17	FAM163B (ENSCHAG00000023100) #18	swi5 (ENSCHAG00000023103) #21	slc27a4 (ENSCHAG00000023124) #22	ptgdsa (ENSCHAG00000023462)	ENSCHAG00000023480	ambp (ENSCHAG00000023520)	nrarpa (ENSCHAG00000023538)	ENSCHAG00000023541	cdc37l1 (ENSCHAG00000023549)	ugcg (ENSCHAG00000023552)	PTBP3 (ENSCHAG00000023592)	hsdl2 (ENSCHAG00000023904)	ENSCHAG00000023936	inip (ENSCHAG00000023941)	snx30 (ENSCHAG00000023944)	si:dkey-26g8.5 (ENSCHAG00000024012)	fbp1b (ENSCHAG00000024056)	PLK2 (ENSCHAG00000024068)
Denticle herring	MODERN SPECIES	13	avp (ENSDCDG00000030510)	FASTKD5 (ENSDCDG00000030523)	LZTS3 (ENSDCDG00000030526)	ENSDCDG00000030532	DDRGK1 (ENSDCDG00000030534)	RC3H2 (ENSDCDG00000030539) #32	RABGAP1 (ENSDCDG00000030572) #31	STRBP (ENSDCDG00000030666) #29	SH2D3C (ENSDCDG00000030689) #28	urm1 (ENSDCDG00000030690) #26	CERCAM (ENSDCDG00000030700) #25	sardh (ENSDCDG00000030784) #15	dbh (ENSDCDG00000030809) #17	FAM163B (ENSDCDG00000030818) #18	ENSDCDG00000013819	slc27a4 (ENSDCDG00000013853) #22	ptgdsa (ENSDCDG00000014485)	ambp (ENSDCDG00000014490)	nrarpa (ENSDCDG00000014492)	ENSDCDG00000014496	cdc37l1 (ENSDCDG00000014501)	ak3 (ENSDCDG00000014503)	ugcg (ENSDCDG00000014508)	PTBP3 (ENSDCDG00000014554)	hsdl2 (ENSDCDG00000015773)	KIAA1958 (ENSDCDG00000016246)	inip (ENSDCDG00000016249)	snx30 (ENSDCDG00000016260)	SLC46A2 (ENSDCDG00000016268)	ENSDCDG00000016277	PLPPR1 (ENSDCDG00000016284)
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Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000156868.g #37	ENSGT00390000018089 #36	ENSGT00390000008938 #35	ENSGT00950000182969.A.a.b #34	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928.d	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00390000012898	ENSGT01050000244924.a.a.a	ENSGT00940000156729	ENSGT00440000039527	ENSGT00390000006366	ENSGT00940000155881	ENSGT00940000153510.b	ENSGT00940000157329	ENSGT00940000161622
Channel catfish	MODERN SPECIES	7	lhx6 (ENSIPUG00000021490) #37	morn5 (ENSIPUG00000021487) #36	ndufa8 (ENSIPUG00000021483) #35	si:ch211-243g18.2 (ENSIPUG00000021469) #34	ENSIPUG00000021433 #32	GPR21 (ENSIPUG00000021429) #30	RABGAP1 (ENSIPUG00000021311) #31	strbp (ENSIPUG00000021251) #29	SH2D3C (ENSIPUG00000020632) #28	urm1 (ENSIPUG00000020621) #26	cercam (ENSIPUG00000020562) #25	sardh (ENSIPUG00000020519) #15	dbh (ENSIPUG00000020489) #17	fam163b (ENSIPUG00000020478) #18	swi5 (ENSIPUG00000020474) #21	slc27a4 (ENSIPUG00000020449) #22	ptgdsa (ENSIPUG00000020408)	AMBP (ENSIPUG00000020385)	nrarp (ENSIPUG00000020378)	exd3 (ENSIPUG00000020343)	cdc37l1 (ENSIPUG00000020330)	ak3 (ENSIPUG00000020312)	ugcg (ENSIPUG00000020297)	ptbp3 (ENSIPUG00000020195)	hsdl2 (ENSIPUG00000020109)	inip (ENSIPUG00000020090)	kiaa1958 (ENSIPUG00000020068)	lin54 (ENSIPUG00000020024)	cops4 (ENSIPUG00000019965)	plac8.2 (ENSIPUG00000019919)	srek1ip1 (ENSIPUG00000019898)
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Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000156868.g #37	ENSGT00390000018089 #36	ENSGT00390000008938 #35	ENSGT00950000182969.A.a.b #34	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928.d	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00390000012898	ENSGT01050000244924.a.a.a	ENSGT00940000156729	ENSGT00440000039527	ENSGT00390000006366	ENSGT00940000155881	ENSGT00940000153510.b	ENSGT00940000157329	ENSGT00940000161622
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	137	lhx6a (ENSPNAG00000017642) #37	morn5 (ENSPNAG00000017585) #36	ndufa8 (ENSPNAG00000017563) #35	si:ch211-243g18.2 (ENSPNAG00000017541) #34	ENSPNAG00000017502 #32	RABGAP1 (ENSPNAG00000017429) #31	GPR21 (ENSPNAG00000003472) #30	STRBP (ENSPNAG00000003471) #29	SH2D3C (ENSPNAG00000017213) #28	urm1 (ENSPNAG00000017145) #26	CERCAM (ENSPNAG00000017084) #25	sardh (ENSPNAG00000017076) #15	dbh (ENSPNAG00000017010) #17	FAM163B (ENSPNAG00000016959) #18	swi5 (ENSPNAG00000016943) #21	slc27a4 (ENSPNAG00000016932) #22	ptgdsa (ENSPNAG00000016858)	ambp (ENSPNAG00000016836)	nrarpa (ENSPNAG00000016775)	ENSPNAG00000016753	cdc37l1 (ENSPNAG00000003426)	ak3 (ENSPNAG00000016648)	ugcg (ENSPNAG00000016623)	PTBP3 (ENSPNAG00000016577)	hsdl2 (ENSPNAG00000016507)	ENSPNAG00000016480
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	12	ndufa8 (ENSAMXG00000032633) #35	si:ch211-243g18.2 (ENSAMXG00000006794) #34	ENSAMXG00000006778 #32	GPR21 (ENSAMXG00000037145) #30	RABGAP1 (ENSAMXG00000006727) #31	STRBP (ENSAMXG00000043016) #29	SH2D3C (ENSAMXG00000006672) #28	ENSAMXG00000039049	urm1 (ENSAMXG00000042562) #26	CERCAM (ENSAMXG00000006650) #25	sardh (ENSAMXG00000006616) #15	ENSAMXG00000025065	dbh (ENSAMXG00000006576) #17	FAM163B (ENSAMXG00000036123) #18	swi5 (ENSAMXG00000006560) #21	slc27a4 (ENSAMXG00000006543) #22	ptgdsa (ENSAMXG00000043533)	ambp (ENSAMXG00000033400)	nrarpa (ENSAMXG00000024896)	ENSAMXG00000019494	cdc37l1 (ENSAMXG00000019524)	ak3 (ENSAMXG00000039061)	ugcg (ENSAMXG00000019558)	PTBP3 (ENSAMXG00000003686)	hsdl2 (ENSAMXG00000003610)	hsdl2 (ENSAMXG00000003543)	MRPL49 (ENSAMXG00000003487)	znhit2 (ENSAMXG00000037639)	smyd4 (ENSAMXG00000003376)	SEZ6 (ENSAMXG00000006718)	PHF12 (ENSAMXG00000006728)
Electric eel	MODERN SPECIES	7	ENSEEEG00000010326	cnih2 (ENSEEEG00000010327)	wdr74 (ENSEEEG00000010328)	ehd1b (ENSEEEG00000010331)	cxadr (ENSEEEG00000010334)	ENSEEEG00000010350 #32	RABGAP1 (ENSEEEG00000010368) #31	STRBP (ENSEEEG00000010540) #29	SH2D3C (ENSEEEG00000010675) #28	urm1 (ENSEEEG00000010677) #26	CERCAM (ENSEEEG00000010682) #25	sardh (ENSEEEG00000010699) #15	dbh (ENSEEEG00000010724) #17	FAM163B (ENSEEEG00000010726) #18	swi5 (ENSEEEG00000010727) #21	slc27a4 (ENSEEEG00000010731) #22	ptgdsa (ENSEEEG00000010750)	ambp (ENSEEEG00000010751)	nrarpa (ENSEEEG00000010756)	ENSEEEG00000010758	cdc37l1 (ENSEEEG00000010768)	ak3 (ENSEEEG00000010770)	ugcg (ENSEEEG00000010771)	PTBP3 (ENSEEEG00000010789)	hsdl2 (ENSEEEG00000011182)	ENSEEEG00000011184	inip (ENSEEEG00000011186)	lin54 (ENSEEEG00000011191)	cops4 (ENSEEEG00000011200)	plac8.1 (ENSEEEG00000011203)	srek1ip1 (ENSEEEG00000011206)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00390000018089 #36	ENSGT00390000008938 #35	ENSGT00950000182969.A.a.b #34	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216.k.b #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000157216.k.a #31	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349.a #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00390000012898	ENSGT01050000244924.a.a.a	ENSGT00940000156729	ENSGT00440000039527	ENSGT00390000006366	ENSGT00940000155881	ENSGT00940000153510.b	ENSGT00940000157329.k	ENSGT00940000157329.l
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	153	ENSGT00390000018089.f #36	ENSGT00390000008938.c #35	ENSGT00950000182969.A.a.b.b.b #34	ENSGT00940000157685.l #32	ENSGT00940000157216.k.b #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000157216.k.a.b #31	ENSGT00940000154687.B.q.a.f #29	ENSGT00940000154130.a.b.e.i #28	ENSGT00390000005101.b #26	ENSGT01030000234558.D.a.b #25	ENSGT00940000157589.b #15	ENSGT00530000063085.B.e #17	ENSGT00940000159387.f.a #18	ENSGT00390000009349.a.a #21	ENSGT00940000158646.a #22	ENSGT01100000263580.mb.a.b	ENSGT00940000160109.a	ENSGT00940000161928.h	ENSGT00390000006843.d	ENSGT00390000013443.d.b	ENSGT00940000155120.d	ENSGT00390000012898.l	ENSGT01050000244924.a.a.a.l	ENSGT00940000156729.d	ENSGT00440000039527	ENSGT00390000006366.e	ENSGT00940000155881.k	ENSGT01030000234558.D.a.a #25	ENSGT00940000157589.a #15	ENSGT00530000063085.B.f #17
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	51	ENSGT00390000018089.f #36	ENSGT00390000008938.c #35	ENSGT00950000182969.A.a.b.b.b #34	ENSGT00940000157685.l #32	ENSGT00940000157216.k.b #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000157216.k.a.b #31	ENSGT00940000154687.B.q.a.f #29	ENSGT00940000154130.a.b.e.i #28	ENSGT00390000005101.b #26	ENSGT01030000234558.D.a.b #25	ENSGT00940000157589.b #15	ENSGT00530000063085.B.e #17	ENSGT00940000159387.f.a #18	ENSGT00390000009349.a.a #21	ENSGT00940000158646.a #22	ENSGT01100000263580.mb.a.b	ENSGT00940000160109.a	ENSGT00940000161928.h	ENSGT00390000006843.d	ENSGT00390000013443.d.b	ENSGT00940000155120.d	ENSGT00390000012898.l	ENSGT01050000244924.a.a.a.l	ENSGT00940000156729.d	ENSGT00440000039527	ENSGT00390000006366.e	ENSGT00940000155881.k	ENSGT00940000153510.b.j	ENSGT00940000157329.k.a	ENSGT00510000047710.b
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Goldfish	DUPLICATION
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Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00940000166736 #16	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00950000186109	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00940000166736 #16	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00950000186109	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00950000186109	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00950000186109	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000157724.a.b	ENSGT00390000006366.a	ENSGT00940000158994	ENSGT00950000183096.a.b	ENSGT00940000161837.c.a	ENSGT00940000161837.c.b	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000165673	ENSGT00390000006843	ENSGT00950000186109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375
Fugu	MODERN SPECIES	18	rasgef1bb (ENSTRUG00000005484)	snx18b (ENSTRUG00000023691)	inip (ENSTRUG00000023960)	snx30 (ENSTRUG00000006587)	SLC46A2 (ENSTRUG00000006727)	palm2akap2 (ENSTRUG00000006899)	ENSTRUG00000026503	cdc37l1 (ENSTRUG00000030669)	anxa3b (ENSTRUG00000007232)	ak3 (ENSTRUG00000010606)	rcl1 (ENSTRUG00000010493)	ENSTRUG00000010302	ENSTRUG00000010236	nrarpa (ENSTRUG00000010225)	swi5 (ENSTRUG00000029660) #21	slc27a4 (ENSTRUG00000009716) #22	ptgdsa (ENSTRUG00000009705)	ENSTRUG00000027747	ENSTRUG00000009496	FAM163B (ENSTRUG00000009489) #18	dbh (ENSTRUG00000009103) #17	sardh (ENSTRUG00000008684) #15	CERCAM (ENSTRUG00000008540) #25	urm1 (ENSTRUG00000008530) #26	SH2D3C (ENSTRUG00000008304) #28	STRBP (ENSTRUG00000003062) #29	ENSTRUG00000031096	GPR21 (ENSTRUG00000026912) #30	RABGAP1 (ENSTRUG00000003120) #31	ENSTRUG00000003364 #32	rln (ENSTRUG00000005640)
Tetraodon	MODERN SPECIES	19	snx18b (ENSTNIG00000013223)	snx30 (ENSTNIG00000013221)	ENSTNIG00000013220	snx30 (ENSTNIG00000013219)	SLC46A2 (ENSTNIG00000013218)	ENSTNIG00000013217	anxa3b (ENSTNIG00000013216)	ENSTNIG00000005294	ENSTNIG00000000983	ak3 (ENSTNIG00000013215)	rcl1 (ENSTNIG00000013214)	ENSTNIG00000013213	ENSTNIG00000013212	ENSTNIG00000001704	nrarpa (ENSTNIG00000013211)	slc27a4 (ENSTNIG00000013210) #22	ptgdsa (ENSTNIG00000013209)	ambp (ENSTNIG00000013208)	FAM163B (ENSTNIG00000018887) #18	dbh (ENSTNIG00000013207) #17	sardh (ENSTNIG00000013206) #15	CERCAM (ENSTNIG00000013205) #25	urm1 (ENSTNIG00000013204) #26	SH2D3C (ENSTNIG00000013203) #28	ENSTNIG00000004947 #29	RABGAP1 (ENSTNIG00000004941) #31	GPR21 (ENSTNIG00000004940) #30	RC3H2 (ENSTNIG00000004942) #32	jak2a (ENSTNIG00000004943)	rln1 (ENSTNIG00000000319)	plgrkt (ENSTNIG00000004944)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	109				RC3H2 (ENSLBEG00000005135) #32	GPR21 (ENSLBEG00000005043) #30	RABGAP1 (ENSLBEG00000004817) #31	STRBP (ENSLBEG00000004741) #29	SH2D3C (ENSLBEG00000004613) #28	urm1 (ENSLBEG00000004555) #26	CERCAM (ENSLBEG00000004528) #25	sardh (ENSLBEG00000004458) #15	dbh (ENSLBEG00000004397) #17	ENSLBEG00000004362	FAM163B (ENSLBEG00000004348) #18	swi5 (ENSLBEG00000004334) #21	slc27a4 (ENSLBEG00000004276) #22	ptgdsa (ENSLBEG00000004222)	ambp (ENSLBEG00000004147)	ENSLBEG00000004121	nrarpa (ENSLBEG00000004106)	ENSLBEG00000004079	cdc37l1 (ENSLBEG00000004052)	ak3 (ENSLBEG00000004015)	rcl1 (ENSLBEG00000003957)	ENSLBEG00000003903	ENSLBEG00000003761	npdc1a (ENSLBEG00000003709)	pou5f3 (ENSLBEG00000003698)	fut7 (ENSLBEG00000003688)	ENSLBEG00000003640	ENSLBEG00000003545
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000164331	ENSGT00390000006843	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00390000006843	ENSGT00940000161928	ENSGT00940000161345	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243
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Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000164331	ENSGT00390000006843	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	3	plgrkt (ENSCGOG00000011704)	rln1 (ENSCGOG00000011700)	jak2a (ENSCGOG00000009110)	ENSCGOG00000009040 ##33	RC3H2 (ENSCGOG00000008812) #32	GPR21 (ENSCGOG00000008798) #30	RABGAP1 (ENSCGOG00000006824) #31	STRBP (ENSCGOG00000006130) #29	SH2D3C (ENSCGOG00000005790) #28	urm1 (ENSCGOG00000005779) #26	CERCAM (ENSCGOG00000005166) #25	sardh (ENSCGOG00000004189) #15	dbh (ENSCGOG00000004086) #17	FAM163B (ENSCGOG00000004068) #18	swi5 (ENSCGOG00000023984) #21	slc27a4 (ENSCGOG00000023716) #22	ptgdsa (ENSCGOG00000023696)	ENSCGOG00000023694	ambp (ENSCGOG00000023684)	ENSCGOG00000023681	nrarpa (ENSCGOG00000023680)	cdc37l1 (ENSCGOG00000023678)	ak3 (ENSCGOG00000023675)	ENSCGOG00000023669	rcl1 (ENSCGOG00000023596)	anxa3b (ENSCGOG00000023492)	ENSCGOG00000023355	npdc1a (ENSCGOG00000023335)	pou5f3 (ENSCGOG00000023330)	fut7 (ENSCGOG00000023327)	clic3 (ENSCGOG00000023221)
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Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
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Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a	ENSGT00390000000459.d
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Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	3	mrrf (ENSBSLG00000013109)	ENSBSLG00000013070	plgrkt (ENSBSLG00000012783)	ENSBSLG00000012778	jak2a (ENSBSLG00000012598)	ENSBSLG00000012563 ##33	ENSBSLG00000012536 #32	RABGAP1 (ENSBSLG00000011987) #31	STRBP (ENSBSLG00000011673) #29	SH2D3C (ENSBSLG00000010756) #28	urm1 (ENSBSLG00000010577) #26	CERCAM (ENSBSLG00000010346) #25	sardh (ENSBSLG00000010104) #15	FAM163B (ENSBSLG00000010066) #18	swi5 (ENSBSLG00000010058) #21	slc27a4 (ENSBSLG00000008500) #22	ptgdsa (ENSBSLG00000026036)	dbh (ENSBSLG00000026005) #17	ambp (ENSBSLG00000025954)	nrarpa (ENSBSLG00000025782)	ENSBSLG00000025776	cdc37l1 (ENSBSLG00000025771)	ak3 (ENSBSLG00000025739)	rcl1 (ENSBSLG00000025705)	anxa3b (ENSBSLG00000025591)	ENSBSLG00000025450	npdc1a (ENSBSLG00000025150)	pou5f3 (ENSBSLG00000025149)	fut7 (ENSBSLG00000025147)	clic3 (ENSBSLG00000025144)	ENSBSLG00000024656
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	3	plgrkt (ENSMAMG00000009197)	ENSMAMG00000009187	jak2a (ENSMAMG00000009157)	ENSMAMG00000009138 ##33	ENSMAMG00000009119 #32	GPR21 (ENSMAMG00000009103) #30	ENSMAMG00000009032 #31	ENSMAMG00000008774 #29	ENSMAMG00000008733 #28	URM1 (ENSMAMG00000025662) #26	ENSMAMG00000008684 #25	sardh (ENSMAMG00000008605) #15	dbh (ENSMAMG00000008553) #17	FAM163B (ENSMAMG00000008536) #18	swi5 (ENSMAMG00000024800) #21	slc27a4 (ENSMAMG00000008495) #22	ptgdsa (ENSMAMG00000025422)	ambp (ENSMAMG00000008436)	nrarpa (ENSMAMG00000026665)	ENSMAMG00000008407	cdc37l1 (ENSMAMG00000008383)	ak3 (ENSMAMG00000008360)	RCL1 (ENSMAMG00000027190)	ENSMAMG00000008342	ENSMAMG00000008226	npdc1a (ENSMAMG00000008208)	pou5f3 (ENSMAMG00000008182)	fut7 (ENSMAMG00000008174)	clic3 (ENSMAMG00000008153)	ENSMAMG00000008127	ENSMAMG00000007938
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a	ENSGT00390000000459.d
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Turbot	MODERN SPECIES	7	ENSSMAG00000020121	plgrkt (ENSSMAG00000020103)	ENSSMAG00000020098	jak2a (ENSSMAG00000020074)	ENSSMAG00000020069 ##33	ENSSMAG00000020048 #32	ENSSMAG00000019967 #31	ENSSMAG00000019946 #29	ENSSMAG00000019931 #28	urm1 (ENSSMAG00000028849) #26	ENSSMAG00000019898 #25	sardh (ENSSMAG00000019868) #15	dbh (ENSSMAG00000019862) #17	FAM163B (ENSSMAG00000029230) #18	ENSSMAG00000034312	slc27a4 (ENSSMAG00000019834) #22	ENSSMAG00000026708	ptgdsa (ENSSMAG00000019825)	ambp (ENSSMAG00000019819)	nrarpa (ENSSMAG00000026822)	ENSSMAG00000019809	cdc37l1 (ENSSMAG00000019799)	ak3 (ENSSMAG00000019793)	RCL1 (ENSSMAG00000019751)	ENSSMAG00000019774	ENSSMAG00000019683	npdc1a (ENSSMAG00000030311)	pou5f3 (ENSSMAG00000019651)	fut7 (ENSSMAG00000028854)	clic3 (ENSSMAG00000019479)	ENSSMAG00000019446
Tongue sole	MODERN SPECIES	5	ENSCSEG00000015883	ATP8B1 (ENSCSEG00000015934)	txnl1 (ENSCSEG00000016010)	NARS1 (ENSCSEG00000016023)	fech (ENSCSEG00000016077)	ONECUT2 (ENSCSEG00000016089)	STRBP (ENSCSEG00000016110) #29	SH2D3C (ENSCSEG00000016165) #28	urm1 (ENSCSEG00000016193) #26	CERCAM (ENSCSEG00000016210) #25	sardh (ENSCSEG00000016253) #15	dbh (ENSCSEG00000016280) #17	ENSCSEG00000016291	FAM163B (ENSCSEG00000016299) #18	swi5 (ENSCSEG00000016304) #21	slc27a4 (ENSCSEG00000016318) #22	ptgdsa (ENSCSEG00000016383)	nt5c2l1 (ENSCSEG00000016429)	sppl3 (ENSCSEG00000016646)	GNAZ (ENSCSEG00000016658)	slc5a1 (ENSCSEG00000016665)	fam166b (ENSCSEG00000016686)	RNF208 (ENSCSEG00000016697)	ENSCSEG00000016703	ENSCSEG00000016747	SCARB2 (ENSCSEG00000016733)	ENSCSEG00000016750	ENSCSEG00000016760	ENSCSEG00000016777	ENSCSEG00000016788	GADD45G (ENSCSEG00000016792)
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Seriola	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a	ENSGT00390000000459.d
Greater amberjack	MODERN SPECIES	249								STRBP (ENSSDUG00000000652) #29	SH2D3C (ENSSDUG00000000601) #28	urm1 (ENSSDUG00000000566) #26	CERCAM (ENSSDUG00000000504) #25	sardh (ENSSDUG00000000396) #15	dbh (ENSSDUG00000000283) #17	FAM163B (ENSSDUG00000000259) #18	swi5 (ENSSDUG00000000253) #21	slc27a4 (ENSSDUG00000000186) #22	ptgdsa (ENSSDUG00000000176)	ambp (ENSSDUG00000000116)
Yellowtail amberjack	DUPLICATION
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2551																ENSSLDG00000004584 #22	ptgdsa (ENSSLDG00000004601)	ENSSLDG00000004620	ambp (ENSSLDG00000004640)	nrarpa (ENSSLDG00000004659)	ENSSLDG00000004671
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3034									SH2D3C (ENSSLDG00000012151) #28	urm1 (ENSSLDG00000012250) #26	CERCAM (ENSSLDG00000012309) #25	sardh (ENSSLDG00000012364) #15	dbh (ENSSLDG00000012479) #17	FAM163B (ENSSLDG00000012520) #18	swi5 (ENSSLDG00000012533) #21	slc27a4 (ENSSLDG00000012557) #22	BICD1 (ENSSLDG00000012589)	fgd4a (ENSSLDG00000012641)	ENSSLDG00000012732	nup205 (ENSSLDG00000012770)	agk (ENSSLDG00000012845)	dennd11 (ENSSLDG00000012870)	wee2 (ENSSLDG00000012923)	ENSSLDG00000012991	bcl2l13 (ENSSLDG00000012967)	atp6v1e1a (ENSSLDG00000013006)	ENSSLDG00000013037	ENSSLDG00000013085	ADA2 (ENSSLDG00000013110)	ENSSLDG00000013125	GALNT8 (ENSSLDG00000013144)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00940000166736 #16	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00940000166736 #16	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a	ENSGT00390000000459.d
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a	ENSGT00390000000459.d
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205.j.a	ENSGT00940000167205.i	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
Orange clownfish	MODERN SPECIES	7	plgrkt (ENSAPEG00000007905)	ENSAPEG00000007896	jak2a (ENSAPEG00000007819)	ENSAPEG00000007788 ##33	ENSAPEG00000007757 #32	GPR21 (ENSAPEG00000007738) #30	RABGAP1 (ENSAPEG00000007575) #31	STRBP (ENSAPEG00000007513) #29	SH2D3C (ENSAPEG00000007467) #28	urm1 (ENSAPEG00000007448) #26	CERCAM (ENSAPEG00000007386) #25	sardh (ENSAPEG00000007311) #15	dbh (ENSAPEG00000007258) #17	FAM163B (ENSAPEG00000007248) #18	swi5 (ENSAPEG00000007215) #21	slc27a4 (ENSAPEG00000007145) #22	ptgdsa (ENSAPEG00000007125)	ambp (ENSAPEG00000007084)	nrarpa (ENSAPEG00000007070)	ENSAPEG00000007019	cdc37l1 (ENSAPEG00000006980)	ak3 (ENSAPEG00000006953)	rcl1 (ENSAPEG00000006905)	anxa3b (ENSAPEG00000006863)	ENSAPEG00000006810	npdc1a (ENSAPEG00000006793)	pou5f3 (ENSAPEG00000006649)	fut7 (ENSAPEG00000006618)	fut7 (ENSAPEG00000006611)	fut7 (ENSAPEG00000006601)	fut7 (ENSAPEG00000006588)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	2875															swi5 (ENSAOCG00000013330) #21	slc27a4 (ENSAOCG00000013395) #22	ptgdsa (ENSAOCG00000013424)	ambp (ENSAOCG00000002313)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	318						GPR21 (ENSAPOG00000009072) #30	RABGAP1 (ENSAPOG00000009185) #31	STRBP (ENSAPOG00000009251) #29	SH2D3C (ENSAPOG00000009343) #28	urm1 (ENSAPOG00000009382) #26	CERCAM (ENSAPOG00000009404) #25	sardh (ENSAPOG00000009500) #15	dbh (ENSAPOG00000000271) #17	FAM163B (ENSAPOG00000009519) #18	swi5 (ENSAPOG00000009553) #21	slc27a4 (ENSAPOG00000009633) #22	ptgdsa (ENSAPOG00000009650)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	679								STRBP (ENSSPAG00000001187) #29	SH2D3C (ENSSPAG00000001115) #28	urm1 (ENSSPAG00000001097) #26	CERCAM (ENSSPAG00000001081) #25	sardh (ENSSPAG00000000974) #15	dbh (ENSSPAG00000000935) #17	FAM163B (ENSSPAG00000000911) #18	swi5 (ENSSPAG00000000905) #21	slc27a4 (ENSSPAG00000000852) #22	ptgdsa (ENSSPAG00000000805)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00940000166736 #16	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1039	plgrkt (ENSACIG00000005101)	ENSACIG00000005119	jak2a (ENSACIG00000005134)	ENSACIG00000005197 ##33	RC3H2 (ENSACIG00000005206) #32	RABGAP1 (ENSACIG00000005233) #31	GPR21 (ENSACIG00000005282) #30	STRBP (ENSACIG00000005296) #29	SH2D3C (ENSACIG00000005325) #28	urm1 (ENSACIG00000005345) #26	CERCAM (ENSACIG00000005353) #25	sardh (ENSACIG00000005385) #15	dbh (ENSACIG00000005429) #17	FAM163B (ENSACIG00000005452) #18	swi5 (ENSACIG00000005462) #21	slc27a4 (ENSACIG00000005476) #22	ptgdsa (ENSACIG00000005512)	ambp (ENSACIG00000005528)	nrarpa (ENSACIG00000005552)	ENSACIG00000005561	cdc37l1 (ENSACIG00000005653)	ak3 (ENSACIG00000005669)
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00940000166736 #16	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00940000166736 #16	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a.d	ENSGT00940000156763.b.a.c
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a.d	ENSGT00940000156763.b.a.c
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a.d	ENSGT00940000156763.b.a.c
P. nyererei	MODERN SPECIES	327	MMP17 (ENSPNYG00000011926)	rln1 (ENSPNYG00000011951)	jak2a (ENSPNYG00000011975)	ENSPNYG00000012034 ##33	RC3H2 (ENSPNYG00000012063) #32	RABGAP1 (ENSPNYG00000012166) #31	GPR21 (ENSPNYG00000012294) #30	STRBP (ENSPNYG00000012317) #29	SH2D3C (ENSPNYG00000012381) #28	ENSPNYG00000012429	urm1 (ENSPNYG00000012446) #26	CERCAM (ENSPNYG00000012488) #25	sardh (ENSPNYG00000012545) #15	dbh (ENSPNYG00000012630) #17	FAM163B (ENSPNYG00000012705) #18	slc27a4 (ENSPNYG00000012733) #22	ptgdsa (ENSPNYG00000012793)	ENSPNYG00000012799	ambp (ENSPNYG00000012815)	nrarpa (ENSPNYG00000012840)	ENSPNYG00000012849	cdc37l1 (ENSPNYG00000012873)	ak3 (ENSPNYG00000012901)	rcl1 (ENSPNYG00000012910)	anxa3b (ENSPNYG00000012963)	ENSPNYG00000012987	npdc1a (ENSPNYG00000013053)	fut7 (ENSPNYG00000013086)	pou5f3 (ENSPNYG00000013110)	clic3 (ENSPNYG00000013187)	pnpla7a (ENSPNYG00000013203)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158699.q.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a.d	ENSGT00940000156763.b.a.c
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	ENSMZEG00005016978	jak2a (ENSMZEG00005016984)	ENSMZEG00005017007	ENSMZEG00005017012	RC3H2 (ENSMZEG00005017019) #32	RABGAP1 (ENSMZEG00005017064) #31	GPR21 (ENSMZEG00005017141) #30	STRBP (ENSMZEG00005017152) #29	SH2D3C (ENSMZEG00005017175) #28	urm1 (ENSMZEG00005017191) #26	CERCAM (ENSMZEG00005017205) #25	sardh (ENSMZEG00005017212) #15	dbh (ENSMZEG00005017229) #17	FAM163B (ENSMZEG00005017238) #18	swi5 (ENSMZEG00005017240) #21	slc27a4 (ENSMZEG00005017248) #22	ptgdsa (ENSMZEG00005017257)	ENSMZEG00005017259	ambp (ENSMZEG00005017264)	nrarpa (ENSMZEG00005017267)	ENSMZEG00005017270	cdc37l1 (ENSMZEG00005017277)	ak3 (ENSMZEG00005017287)	rcl1 (ENSMZEG00005017292)	anxa3b (ENSMZEG00005017307)	ENSMZEG00005017316	npdc1a (ENSMZEG00005017326)	pou5f3 (ENSMZEG00005017334)	fut7 (ENSMZEG00005017338)	clic3 (ENSMZEG00005017347)	ENSMZEG00005017563
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	rln1 (ENSACLG00000023223)	jak2a (ENSACLG00000023172)	ENSACLG00000023156 ##33	RC3H2 (ENSACLG00000023136) #32	GPR21 (ENSACLG00000023129) #30	RABGAP1 (ENSACLG00000022769) #31	STRBP (ENSACLG00000022623) #29	ENSACLG00000022603	SH2D3C (ENSACLG00000022506) #28	urm1 (ENSACLG00000022484) #26	CERCAM (ENSACLG00000022449) #25	sardh (ENSACLG00000022216) #15	dbh (ENSACLG00000022136) #17	FAM163B (ENSACLG00000022122) #18	ENSACLG00000022118	slc27a4 (ENSACLG00000022029) #22	ptgdsa (ENSACLG00000022012)	ambp (ENSACLG00000021991)	nrarpa (ENSACLG00000021979)	ENSACLG00000021922	cdc37l1 (ENSACLG00000021866)	ak3 (ENSACLG00000021774)	rcl1 (ENSACLG00000021724)	anxa3b (ENSACLG00000021699)	ENSACLG00000021640	npdc1a (ENSACLG00000021599)	pou5f3 (ENSACLG00000021576)	fut7 (ENSACLG00000021567)	clic3 (ENSACLG00000021553)	ENSACLG00000021521	pnpla7a (ENSACLG00000021480)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	525									SH2D3C (ENSHBUG00000001446) #28	urm1 (ENSHBUG00000001440) #26	CERCAM (ENSHBUG00000001435) #25	sardh (ENSHBUG00000001427) #15	dbh (ENSHBUG00000001423) #17	FAM163B (ENSHBUG00000001419) #18	swi5 (ENSHBUG00000001418) #21	slc27a4 (ENSHBUG00000001414) #22	ptgdsa (ENSHBUG00000001412)	ENSHBUG00000001411	ambp (ENSHBUG00000001409)	nrarpa (ENSHBUG00000001408)	ENSHBUG00000001405	cdc37l1 (ENSHBUG00000001398)	ak3 (ENSHBUG00000001396)	rcl1 (ENSHBUG00000001393)	ENSHBUG00000001380	ENSHBUG00000001372	npdc1a (ENSHBUG00000001366)	pou5f3 (ENSHBUG00000001359)	clic3 (ENSHBUG00000001351)	pnpla7a (ENSHBUG00000001348)	NSMF (ENSHBUG00000001345)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	304	wnt11 (ENSNBRG00000018857)	ENSNBRG00000018876	ENSNBRG00000018891	ENSNBRG00000018902	thap12a (ENSNBRG00000018941)	ENSNBRG00000019058	stt3a (ENSNBRG00000019076)	ei24 (ENSNBRG00000019109)	ENSNBRG00000019165	B3GAT1 (ENSNBRG00000019238)	sardh (ENSNBRG00000019268) #15	ENSNBRG00000019463 #16	dbh (ENSNBRG00000019565) #17	FAM163B (ENSNBRG00000019594) #18	ENSNBRG00000019608	slc27a4 (ENSNBRG00000019627) #22	ptgdsa (ENSNBRG00000019656)	ENSNBRG00000019672	ambp (ENSNBRG00000019691)	nrarpa (ENSNBRG00000019716)	ENSNBRG00000019734	cdc37l1 (ENSNBRG00000019811)	ak3 (ENSNBRG00000019835)	rcl1 (ENSNBRG00000019854)	anxa3b (ENSNBRG00000019892)	ENSNBRG00000019919	npdc1a (ENSNBRG00000019973)	pou5f3 (ENSNBRG00000020011)	fut7 (ENSNBRG00000020062)	clic3 (ENSNBRG00000020076)	pnpla7a (ENSNBRG00000020169)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	ENSONIG00000032559	MMP17 (ENSONIG00000003963)	ENSONIG00000003962	jak2a (ENSONIG00000003957)	ENSONIG00000031422	RC3H2 (ENSONIG00000003945) #32	RABGAP1 (ENSONIG00000003929) #31	STRBP (ENSONIG00000003920) #29	SH2D3C (ENSONIG00000003912) #28	urm1 (ENSONIG00000003910) #26	CERCAM (ENSONIG00000003905) #25	sardh (ENSONIG00000003900) #15	dbh (ENSONIG00000003897) #17	FAM163B (ENSONIG00000003895) #18	swi5 (ENSONIG00000039901) #21	slc27a4 (ENSONIG00000003886) #22	ptgdsa (ENSONIG00000039127)	ENSONIG00000031160	ambp (ENSONIG00000003882)	nrarpa (ENSONIG00000020634)	ENSONIG00000003880	cdc37l1 (ENSONIG00000003878)	ak3 (ENSONIG00000034113)	rcl1 (ENSONIG00000038172)	ENSONIG00000003866	ENSONIG00000003858	npdc1a (ENSONIG00000003857)	pou5f3 (ENSONIG00000003854)	fut7 (ENSONIG00000003853)	clic3 (ENSONIG00000003840)	ENSONIG00000036237
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000156763.b.a	ENSGT00390000000459.d
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709.c	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000156763.b.a	ENSGT00390000000459.d
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	3	plgrkt (ENSOJAG00000023098)	ENSOJAG00000023092	ENSOJAG00000023089 ##33	jak2a (ENSOJAG00000022479)	RC3H2 (ENSOJAG00000022355) #32	GPR21 (ENSOJAG00000022340) #30	RABGAP1 (ENSOJAG00000022105) #31	STRBP (ENSOJAG00000022044) #29	SH2D3C (ENSOJAG00000021935) #28	urm1 (ENSOJAG00000021885) #26	CERCAM (ENSOJAG00000021765) #25	sardh (ENSOJAG00000021315) #15	dbh (ENSOJAG00000021194) #17	FAM163B (ENSOJAG00000021183) #18	swi5 (ENSOJAG00000021180) #21	slc27a4 (ENSOJAG00000020602) #22	ptgdsa (ENSOJAG00000020518)	ENSOJAG00000020512	ambp (ENSOJAG00000020501)	nrarpa (ENSOJAG00000020495)	ENSOJAG00000020484	cdc37l1 (ENSOJAG00000020480)	AK3 (ENSOJAG00000020476)	rcl1 (ENSOJAG00000020392)	anxa3b (ENSOJAG00000020232)	ENSOJAG00000020128	npdc1a (ENSOJAG00000020115)	fut7 (ENSOJAG00000020096)	pou5f3 (ENSOJAG00000020081)	ENSOJAG00000020070	ENSOJAG00000019619
Indian medaka	MODERN SPECIES	30	plgrkt (ENSOMEG00000001473)	jak2a (ENSOMEG00000023623)	rln1 (ENSOMEG00000023578)	ENSOMEG00000023570 ##33	RC3H2 (ENSOMEG00000023540) #32	RABGAP1 (ENSOMEG00000023491) #31	STRBP (ENSOMEG00000023400) #29	GPR21 (ENSOMEG00000023327) #30	SH2D3C (ENSOMEG00000023311) #28	urm1 (ENSOMEG00000023257) #26	CERCAM (ENSOMEG00000023247) #25	sardh (ENSOMEG00000023214) #15	dbh (ENSOMEG00000023184) #17	FAM163B (ENSOMEG00000023158) #18	swi5 (ENSOMEG00000023144) #21	slc27a4 (ENSOMEG00000023133) #22	ptgdsa (ENSOMEG00000023098)	ambp (ENSOMEG00000000624)	nrarpa (ENSOMEG00000023075)	ENSOMEG00000023060	cdc37l1 (ENSOMEG00000022999)	ak3 (ENSOMEG00000022991)	rcl1 (ENSOMEG00000022976)	anxa3b (ENSOMEG00000022956)	ENSOMEG00000022925	npdc1a (ENSOMEG00000022884)	pou5f3 (ENSOMEG00000022875)	fut7 (ENSOMEG00000022867)	ENSOMEG00000022860	ENSOMEG00000022843	NSMF (ENSOMEG00000022807)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000156763.b.a	ENSGT00390000000459.d	ENSGT00940000154890.b
Chinese medaka	MODERN SPECIES	199	plgrkt (ENSOSIG00000017418)	ENSOSIG00000017421	jak2a (ENSOSIG00000017472)	ENSOSIG00000018643 ##33	ENSOSIG00000018649 #32	RABGAP1 (ENSOSIG00000018721) #31	GPR21 (ENSOSIG00000019269) #30	STRBP (ENSOSIG00000019288) #29	SH2D3C (ENSOSIG00000019528) #28	CERCAM (ENSOSIG00000019777) #25	sardh (ENSOSIG00000019797) #15	dbh (ENSOSIG00000019814) #17	FAM163B (ENSOSIG00000019816) #18	swi5 (ENSOSIG00000019818) #21	ENSOSIG00000019819	slc27a4 (ENSOSIG00000019880) #22
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	3	ENSORLG00000024849	ENSORLG00000019255 ##33	ENSORLG00000010018 #32	RABGAP1 (ENSORLG00000010095) #31	GPR21 (ENSORLG00000010105) #30	STRBP (ENSORLG00000010162) #29	ENSORLG00000029576	SH2D3C (ENSORLG00000010207) #28	urm1 (ENSORLG00000024432) #26	ENSORLG00000028712	CERCAM (ENSORLG00000024859) #25	sardh (ENSORLG00000010220) #15	dbh (ENSORLG00000010252) #17	FAM163B (ENSORLG00000029662) #18	swi5 (ENSORLG00000025400) #21	slc27a4 (ENSORLG00000010311) #22	ptgdsa (ENSORLG00000010319)	ambp (ENSORLG00000024990)	ENSORLG00000010354	nrarpa (ENSORLG00000010362)	ENSORLG00000010377	cdc37l1 (ENSORLG00000030321)	ak3 (ENSORLG00000010417)	rcl1 (ENSORLG00000010443)	anxa3b (ENSORLG00000010454)	ENSORLG00000010462	npdc1a (ENSORLG00000028127)	pou5f3 (ENSORLG00000010471)	fut7 (ENSORLG00000010478)	ENSORLG00000010511	ENSORLG00000010537
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
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Guppy	MODERN SPECIES	442	jak2a (ENSPREG00000009040)	ENSPREG00000009012 ##33	RC3H2 (ENSPREG00000008979) #32	ENSPREG00000008947	GPR21 (ENSPREG00000008933) #30	RABGAP1 (ENSPREG00000008819) #31	STRBP (ENSPREG00000008696) #29	SH2D3C (ENSPREG00000008644) #28	urm1 (ENSPREG00000008611) #26	CERCAM (ENSPREG00000008544) #25	sardh (ENSPREG00000008464) #15	dbh (ENSPREG00000008394) #17	ENSPREG00000008361	FAM163B (ENSPREG00000008343) #18	swi5 (ENSPREG00000008320) #21	slc27a4 (ENSPREG00000008280) #22	ptgdsa (ENSPREG00000008250)	ENSPREG00000008241	ambp (ENSPREG00000008211)	nrarpa (ENSPREG00000008195)	ENSPREG00000008142	cdc37l1 (ENSPREG00000008071)	ak3 (ENSPREG00000008050)	rcl1 (ENSPREG00000008032)	anxa3b (ENSPREG00000008000)	ENSPREG00000007935	pou5f3 (ENSPREG00000007900)	clic3 (ENSPREG00000007874)	ENSPREG00000007691	NSMF (ENSPREG00000007579)	ENSPREG00000007542
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Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000175176	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000159174.e	ENSGT00940000165673	ENSGT00440000038604.i	ENSGT00940000165709	ENSGT00940000167205	ENSGT00940000161243	ENSGT00940000156763.b.a
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Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	16	ENSKMAG00000010772	jak2a (ENSKMAG00000010807)	ENSKMAG00000010912 ##33	ENSKMAG00000010936 #32	RABGAP1 (ENSKMAG00000011024) #31	GPR21 (ENSKMAG00000011148) #30	STRBP (ENSKMAG00000011192) #29	SH2D3C (ENSKMAG00000011360) #28	urm1 (ENSKMAG00000011433) #26	CERCAM (ENSKMAG00000011475) #25	sardh (ENSKMAG00000011529) #15	ENSKMAG00000011605	dbh (ENSKMAG00000011625) #17	FAM163B (ENSKMAG00000011648) #18	swi5 (ENSKMAG00000011669) #21	slc27a4 (ENSKMAG00000011698) #22	ptgdsa (ENSKMAG00000011744)	ENSKMAG00000011759	ambp (ENSKMAG00000011801)	nrarpa (ENSKMAG00000011866)	ENSKMAG00000011881	cdc37l1 (ENSKMAG00000011917)	ak3 (ENSKMAG00000011929)	rcl1 (ENSKMAG00000011946)	anxa3b (ENSKMAG00000011995)	ENSKMAG00000012053	npdc1a (ENSKMAG00000012101)	pou5f3 (ENSKMAG00000012120)	fut7 (ENSKMAG00000012137)	clic3 (ENSKMAG00000012149)	ENSKMAG00000012190
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	199	ENSHCOG00000003090	plgrkt (ENSHCOG00000003081)	ENSHCOG00000003073	jak2a (ENSHCOG00000003063)	RC3H2 (ENSHCOG00000003006) #32	RABGAP1 (ENSHCOG00000002980) #31	GPR21 (ENSHCOG00000000085) #30	STRBP (ENSHCOG00000002930) #29	SH2D3C (ENSHCOG00000002884) #28	urm1 (ENSHCOG00000002828) #26	CERCAM (ENSHCOG00000002809) #25	sardh (ENSHCOG00000002783) #15	dbh (ENSHCOG00000002754) #17	FAM163B (ENSHCOG00000002742) #18	swi5 (ENSHCOG00000002736) #21	slc27a4 (ENSHCOG00000002723) #22	ptgdsa (ENSHCOG00000002711)	ambp (ENSHCOG00000002676)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	3	rln1 (ENSMMDG00005012844)	jak2a (ENSMMDG00005012944)	ENSMMDG00005017684 ##33	ENSMMDG00005017686 #32	RABGAP1 (ENSMMDG00005017704) #31	GPR21 (ENSMMDG00005018217) #30	STRBP (ENSMMDG00005018220) #29	SH2D3C (ENSMMDG00005018545) #28	urm1 (ENSMMDG00005019075) #26	CERCAM (ENSMMDG00005019084) #25	sardh (ENSMMDG00005019095) #15	dbh (ENSMMDG00005019338) #17	ENSMMDG00005019342	FAM163B (ENSMMDG00005019344) #18	swi5 (ENSMMDG00005019345) #21	slc27a4 (ENSMMDG00005019410) #22	ptgdsa (ENSMMDG00005021344)	ENSMMDG00005021347	ambp (ENSMMDG00005021355)	nrarpa (ENSMMDG00005021365)	ENSMMDG00005021369	pcyox1 (ENSMMDG00005021371)	slc20a1b (ENSMMDG00005021388)	STARD7 (ENSMMDG00005021539)	drg1 (ENSMMDG00005021547)	KCNN2 (ENSMMDG00005021611)	slc2a11l (ENSMMDG00005021612)	nt5c2l1 (ENSMMDG00005021614)	sppl3 (ENSMMDG00005021746)	GNAZ (ENSMMDG00005021767)	slc5a1 (ENSMMDG00005021772)
Cod	MODERN SPECIES	17	plgrkt (ENSGMOG00000016622)	ENSGMOG00000000122	ENSGMOG00000037246	jak2a (ENSGMOG00000016634)	ENSGMOG00000016684 ##33	ENSGMOG00000016709 #32	ENSGMOG00000016738 #31	ENSGMOG00000004870 #29	ENSGMOG00000006010 #28	urm1 (ENSGMOG00000006245) #26	ENSGMOG00000006257 #25	sardh (ENSGMOG00000006278) #15	dbh (ENSGMOG00000006317) #17	FAM163B (ENSGMOG00000035957) #18	swi5 (ENSGMOG00000023602) #21	slc27a4 (ENSGMOG00000001078) #22	ptgdsa (ENSGMOG00000006519)	CDC37L1 (ENSGMOG00000004644)	ENSGMOG00000004666	RCL1 (ENSGMOG00000004677)	ENSGMOG00000004690	ENSGMOG00000004710	npdc1a (ENSGMOG00000036339)	pou5f3 (ENSGMOG00000004767)	fut7 (ENSGMOG00000004784)	clic3 (ENSGMOG00000004791)	ENSGMOG00000004813	ENSGMOG00000001288	ENSGMOG00000027599	snrpd3l (ENSGMOG00000008469)	ENSGMOG00000031274
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00390000018089 #36	ENSGT00390000008938 #35	ENSGT00950000182969.A.a.b #34	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685 #32	ENSGT00940000157216 #31	ENSGT00940000163543.b #30	ENSGT00940000154687.B.q.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B #17	ENSGT00940000159387.f #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373	ENSGT00390000002955	ENSGT00530000063839.s.a	ENSGT00390000009531	ENSGT00390000011483
Salmoninae	DUPLICATION
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Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000156868.g.g.b #37	ENSGT00390000018089.d #36	ENSGT00390000008938.b #35	ENSGT00950000182969.A.a.b.e #34	ENSGT00940000157685.i.a #32	ENSGT00940000163543.b.d #30	ENSGT00940000157216.j.a #31	ENSGT00940000154687.B.q.a.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a.e #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B.d #17	ENSGT00940000159387.f.c #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646.e #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109.c	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000013443.d.c	ENSGT00940000155120.a	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000155640.b.e.a	ENSGT00940000154396.a.f	ENSGT00390000000375.k.a	ENSGT00940000161373.z	ENSGT00390000002955.c	ENSGT00530000063839.s.a	ENSGT00390000011483.a	ENSGT00390000008296.b.b.a	ENSGT00940000166601.g
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000156868.g.g.b #37	ENSGT00390000018089.d #36	ENSGT00390000008938.b #35	ENSGT00950000182969.A.a.b.e #34	ENSGT00940000157685.i.a #32	ENSGT00940000163543.b.d #30	ENSGT00940000157216.j.a #31	ENSGT00940000154687.B.q.a.a #29	ENSGT00940000154130.a.b.e.e #28	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a.e #25	ENSGT00940000157589 #15	ENSGT00530000063085.B.d #17	ENSGT00940000159387.f.c #18	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646.e #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000160109.c	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000013443.d.c	ENSGT00940000155120.a	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000155640.b.e.a	ENSGT00940000154396.a.f	ENSGT00390000000375.k.a	ENSGT00940000161373.z	ENSGT00390000002955.c	ENSGT00530000063839.s.a	ENSGT00390000011483.a	ENSGT00390000008296.b.b.a	ENSGT00940000166601.g
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Rainbow trout	MODERN SPECIES	26	morn5 (ENSOMYG00000025563) #36	ndufa8 (ENSOMYG00000025572) #35	si:ch211-243g18.2 (ENSOMYG00000025606) #34	ENSOMYG00000025659 #32	ENSOMYG00000026096 #31	ENSOMYG00000027391 #29	ENSOMYG00000029065 #28	urm1 (ENSOMYG00000029135) #26	ENSOMYG00000029176 #25	sardh (ENSOMYG00000029679) #15	ENSOMYG00000070800	ENSOMYG00000067702	ENSOMYG00000056815	ENSOMYG00000030856 #18	ENSOMYG00000030858	slc27a4 (ENSOMYG00000030841) #22	ptgdsa (ENSOMYG00000030891)	ambp (ENSOMYG00000030902)	nrarpa (ENSOMYG00000030920)	ENSOMYG00000068007	cdc37l1 (ENSOMYG00000030941)	ENSOMYG00000061853	ak3 (ENSOMYG00000030963)	rcl1 (ENSOMYG00000030970)	ENSOMYG00000062442	jak2a (ENSOMYG00000031302)	ENSOMYG00000056549	plgrkt (ENSOMYG00000032846)	ENSOMYG00000032862	RIC1 (ENSOMYG00000033226)	ERMP1 (ENSOMYG00000035370)
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Chinook salmon	MODERN SPECIES	237																slc27a4 (ENSOTSG00005040018) #22	ptgdsa (ENSOTSG00005040015)	ambp (ENSOTSG00005040013)	ENSOTSG00005039998	ENSOTSG00005039994	wwox (ENSOTSG00005039993)
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Rainbow trout	MODERN SPECIES	3	GPR21 (ENSOMYG00000072697) #30	ENSOMYG00000018766 #31	ENSOMYG00000053349	ENSOMYG00000018656 #29	ENSOMYG00000062697	ENSOMYG00000064817	ENSOMYG00000060692	ENSOMYG00000018585 #28	ENSOMYG00000066648	ENSOMYG00000018296 #25	dbh (ENSOMYG00000018264) #17	ENSOMYG00000068284 #18	ENSOMYG00000058972	ENSOMYG00000018247	ENSOMYG00000054612	slc27a4 (ENSOMYG00000018234) #22	ambp (ENSOMYG00000018191)	ENSOMYG00000018143	cdc37l1 (ENSOMYG00000018112)	ak3 (ENSOMYG00000018108)	ENSOMYG00000050530	ENSOMYG00000057482	ENSOMYG00000013875	JAK2 (ENSOMYG00000014300)	PDCD1LG2 (ENSOMYG00000013859)	ENSOMYG00000048285	RIC1 (ENSOMYG00000013787)	ERMP1 (ENSOMYG00000017179)	ENSOMYG00000017171	MLANA (ENSOMYG00000063750)	KIAA2026 (ENSOMYG00000017162)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00390000018089.c #36	ENSGT00390000008938.a #35	ENSGT00950000182969.A.a.b.f #34	ENSGT00940000157920.b ##33	ENSGT00940000157685.i.b #32	ENSGT00940000163543.b.c #30	ENSGT00940000157216.j.b #31	ENSGT00940000154687.B.q.a.b #29	ENSGT00940000154130.a.b.e.f #28	ENSGT00940000174776	ENSGT01040000241697.a	ENSGT01030000234558.D.a.f #25	ENSGT00530000063085.B.c #17	ENSGT00940000159387.f.d #18	ENSGT00990000204868.b	ENSGT00940000158646.f #22	ENSGT00940000160109.d	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d.d	ENSGT00940000155120.b	ENSGT00940000155640.b.e.b	ENSGT00940000154396.a.e	ENSGT00940000161373.y	ENSGT00390000002955.d	ENSGT00530000063839.s.b	ENSGT00390000009531.e	ENSGT00390000011483.b	ENSGT00390000008296.b.b.b	ENSGT00940000166601.h	ENSGT00940000157066.p.d	ENSGT00390000018845.e.h
Chinook salmon	MODERN SPECIES	33	paqr3b (ENSOTSG00005032923)	anxa3b (ENSOTSG00005032920)	mrrf (ENSOTSG00005032916)	rbm18 (ENSOTSG00005032913)	lhx6a (ENSOTSG00005032911) #37	morn5 (ENSOTSG00005032907) #36	ENSOTSG00005032904	si:ch211-243g18.2 (ENSOTSG00005032886) #34	ENSOTSG00005032867 ##33	ENSOTSG00005032865 #32	RABGAP1 (ENSOTSG00005032755) #31	CERCAM (ENSOTSG00005032749) #25	dbh (ENSOTSG00005032748) #17	FAM163B (ENSOTSG00005032747) #18	ENSOTSG00005032745	slc27a4 (ENSOTSG00005030646) #22	ENSOTSG00005030630	ambp (ENSOTSG00005030601)	ENSOTSG00005030592	cdc37l1 (ENSOTSG00005030589)	ak3 (ENSOTSG00005030585)	jak2a (ENSOTSG00005027989)	ENSOTSG00005027963	ENSOTSG00005027962	PDCD1LG2 (ENSOTSG00005027960)	RIC1 (ENSOTSG00005027953)	ERMP1 (ENSOTSG00005027950)	ENSOTSG00005027946	KIAA2026 (ENSOTSG00005027944)	ENSOTSG00005025175	oaz1b (ENSOTSG00005025167)
Coho salmon	MODERN SPECIES	26	lhx6a (ENSOKIG00005000066) #37	morn5 (ENSOKIG00005000040) #36	ndufa8 (ENSOKIG00005000024) #35	si:ch211-243g18.2 (ENSOKIG00005043851) #34	ENSOKIG00005043826 ##33	ENSOKIG00005043792 #32	GPR21 (ENSOKIG00005043779) #30	RABGAP1 (ENSOKIG00005042193) #31	STRBP (ENSOKIG00005041432) #29	SH2D3C (ENSOKIG00005041361) #28	ENSOKIG00005041326	ENSOKIG00005041293	CERCAM (ENSOKIG00005041060) #25	dbh (ENSOKIG00005041036) #17	FAM163B (ENSOKIG00005041033) #18	slc27a4 (ENSOKIG00005040735) #22	ambp (ENSOKIG00005040634)	ENSOKIG00005040595	ENSOKIG00005040586	cdc37l1 (ENSOKIG00005040529)	ENSOKIG00005040498	ak3 (ENSOKIG00005040486)	jak2a (ENSOKIG00005035557)	ENSOKIG00005035306	ENSOKIG00005035275	RIC1 (ENSOKIG00005035074)	ERMP1 (ENSOKIG00005034658)	ENSOKIG00005034620	KIAA2026 (ENSOKIG00005034610)	ENSOKIG00005034248	ENSOKIG00005034204
Huchen	MODERN SPECIES	3348															ENSHHUG00000020612	slc27a4 (ENSHHUG00000020500) #22	ambp (ENSHHUG00000020488)
Northern pike	MODERN SPECIES	13	ENSELUG00000006044 ##33	RC3H2 (ENSELUG00000006105) #32	RABGAP1 (ENSELUG00000000201) #31	GPR21 (ENSELUG00000006135) #30	STRBP (ENSELUG00000006540) #29	SH2D3C (ENSELUG00000006660) #28	ENSELUG00000006578	ENSELUG00000027794	ENSELUG00000005511	urm1 (ENSELUG00000006757) #26	CERCAM (ENSELUG00000006806) #25	sardh (ENSELUG00000006912) #15	dbh (ENSELUG00000006960) #17	FAM163B (ENSELUG00000028986) #18	ENSELUG00000030044	slc27a4 (ENSELUG00000007023) #22	ptgdsa (ENSELUG00000034248)	ambp (ENSELUG00000007109)	nrarpa (ENSELUG00000007137)	ENSELUG00000007181	cdc37l1 (ENSELUG00000007209)	ak3 (ENSELUG00000001121)	rcl1 (ENSELUG00000007353)	jak2a (ENSELUG00000007410)	rln1 (ENSELUG00000029279)	plgrkt (ENSELUG00000007449)	PDCD1LG2 (ENSELUG00000007468)	RIC1 (ENSELUG00000007545)	ERMP1 (ENSELUG00000007603)	MLANA (ENSELUG00000007634)	KIAA2026 (ENSELUG00000007646)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	306															ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT01100000263580	ENSGT00940000161928	ENSGT00390000006843	ENSGT00390000013443.d	ENSGT00940000155120	ENSGT00530000063404.a	ENSGT00940000155640.b	ENSGT00940000154396.a	ENSGT00390000000375	ENSGT00940000161373.bb	ENSGT00390000002955.e	ENSGT00530000063839	ENSGT00390000009531	ENSGT00390000011483	ENSGT00390000008296.b.b.e
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	21	rbm18 (ENSSFOG00015032292)	lhx6a (ENSSFOG00015001064) #37	morn5 (ENSSFOG00015001034) #36	si:ch211-243g18.2 (ENSSFOG00015001007) #34	RC3H2 (ENSSFOG00015000964) #32	RABGAP1 (ENSSFOG00015000857) #31	ENSSFOG00015000779 #29	SH2D3C (ENSSFOG00015000702) #28	urm1 (ENSSFOG00015000673) #26	CERCAM (ENSSFOG00015000611) #25	sardh (ENSSFOG00015000505) #15	dbh (ENSSFOG00015000449) #17	FAM163B (ENSSFOG00015000438) #18	ADAMTSL2 (ENSSFOG00015000229) #19	swi5 (ENSSFOG00015000214) #21	slc27a4 (ENSSFOG00015000115) #22	lcn15 (ENSSFOG00015024244)	ENSSFOG00015023097	nrarpa (ENSSFOG00015025355)	ENSSFOG00015023063	cdc37l1 (ENSSFOG00015032511)	ak3 (ENSSFOG00015023033)	rcl1 (ENSSFOG00015023020)	jak2a (ENSSFOG00015022973)	ENSSFOG00015022964	plgrkt (ENSSFOG00015025421)	ENSSFOG00015022947	RIC1 (ENSSFOG00015022905)	ERMP1 (ENSSFOG00015022882)	MLANA (ENSSFOG00015022879)	KIAA2026 (ENSSFOG00015022871)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	269			RC3H2 (ENSPKIG00000021910) #32	ENSPKIG00000021886	RABGAP1 (ENSPKIG00000021834) #31	STRBP (ENSPKIG00000021670) #29	SH2D3C (ENSPKIG00000021523) #28	urm1 (ENSPKIG00000021455) #26	CERCAM (ENSPKIG00000021433) #25	ENSPKIG00000021418	sardh (ENSPKIG00000021365) #15	dbh (ENSPKIG00000021325) #17	FAM163B (ENSPKIG00000021301) #18	ADAMTSL2 (ENSPKIG00000021270) #19	swi5 (ENSPKIG00000021253) #21	slc27a4 (ENSPKIG00000021232) #22	lcn15 (ENSPKIG00000021204)	nrarpa (ENSPKIG00000021164)	ENSPKIG00000021103	cdc37l1 (ENSPKIG00000021068)	ak3 (ENSPKIG00000021048)	rcl1 (ENSPKIG00000021022)	jak2a (ENSPKIG00000020986)	rln1 (ENSPKIG00000020961)	plgrkt (ENSPKIG00000020935)	ENSPKIG00000020916	ENSPKIG00000020903	RIC1 (ENSPKIG00000020816)	ERMP1 (ENSPKIG00000020759)	MLANA (ENSPKIG00000020736)	KIAA2026 (ENSPKIG00000020722)
Spotted gar	DUPLICATION
Spotted gar	MODERN SPECIES	660	si:ch211-243g18.2 (ENSLOCG00000002921) #34	zbtb26 (ENSLOCG00000002911) #33	ENSLOCG00000002894 #32	RABGAP1 (ENSLOCG00000002828) #31	STRBP (ENSLOCG00000002814) #29	sh2d3cb (ENSLOCG00000002795) #28	tor2a (ENSLOCG00000002778) #27	urm1 (ENSLOCG00000002768) #26	CERCAM (ENSLOCG00000002746) #25	cfap157 (ENSLOCG00000002725) #24	sardh (ENSLOCG00000002697) #15	dbh (ENSLOCG00000002677) #17	FAM163B (ENSLOCG00000002663) #18	ADAMTSL2 (ENSLOCG00000002647) #19	mymk (ENSLOCG00000002633) #20	ENSLOCG00000002619 #22	slc27a4 (ENSLOCG00000002609) #22	ENSLOCG00000002597	ENSLOCG00000002585	ENSLOCG00000002569	ENSLOCG00000002555	lrsam1 (ENSLOCG00000002536)	pole3 (ENSLOCG00000002521)	ccn1l1 (ENSLOCG00000002502)	lmo4a (ENSLOCG00000002487)	ENSLOCG00000002479	ENSLOCG00000002458	ENSLOCG00000002441	ENSLOCG00000002421	ENSLOCG00000002409	ENSLOCG00000002383
Spotted gar	MODERN SPECIES	660	zbtb26 (ENSLOCG00000002911) #33	ENSLOCG00000002894 #32	RABGAP1 (ENSLOCG00000002828) #31	STRBP (ENSLOCG00000002814) #29	sh2d3cb (ENSLOCG00000002795) #28	tor2a (ENSLOCG00000002778) #27	urm1 (ENSLOCG00000002768) #26	CERCAM (ENSLOCG00000002746) #25	cfap157 (ENSLOCG00000002725) #24	sardh (ENSLOCG00000002697) #15	dbh (ENSLOCG00000002677) #17	FAM163B (ENSLOCG00000002663) #18	ADAMTSL2 (ENSLOCG00000002647) #19	mymk (ENSLOCG00000002633) #20	ENSLOCG00000002619 #22	slc27a4 (ENSLOCG00000002609) #22	ENSLOCG00000002597	ENSLOCG00000002585	ENSLOCG00000002569	ENSLOCG00000002555	lrsam1 (ENSLOCG00000002536)	pole3 (ENSLOCG00000002521)	ccn1l1 (ENSLOCG00000002502)	lmo4a (ENSLOCG00000002487)	ENSLOCG00000002479	ENSLOCG00000002458	ENSLOCG00000002441	ENSLOCG00000002421	ENSLOCG00000002409	ENSLOCG00000002383	tor4aa (ENSLOCG00000017339) ##27
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00940000154990	ENSGT00940000154912	ENSGT00940000160578	ENSGT00940000159684	ENSGT00940000177597	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28
Coelacanth	MODERN SPECIES	338											ASS1 (ENSLACG00000017784)	FUBP3 (ENSLACG00000017619)	PRDM12 (ENSLACG00000017560)	DNM1 (ENSLACG00000017341)	golga2 (ENSLACG00000017171)	SLC27A4 (ENSLACG00000017070) #22	URM1 (ENSLACG00000016968) #26	CERCAM (ENSLACG00000016803) #25	CFAP157 (ENSLACG00000016756) #24	PTRH1 (ENSLACG00000016741) #23	ENSLACG00000016704	TOR2A (ENSLACG00000016669) #27	MIGA2 (ENSLACG00000016463)	SH3GLB2 (ENSLACG00000016270)	DOLK (ENSLACG00000016014)	PHYHD1 (ENSLACG00000015929)	LRRC8A (ENSLACG00000015799)	KYAT1 (ENSLACG00000015602)	SPOUT1 (ENSLACG00000015521)	ENDOG (ENSLACG00000015490)	TBC1D13 (ENSLACG00000015372)
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000160987	ENSGT00940000158674	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000156902	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000156902	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154382.a.a	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT01040000244417	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000154382.a.a	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT01040000244417	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000154990	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT01040000244417	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Aves	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000154990	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT01040000244417	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000154990	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT01040000244417	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154990	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT01040000244417	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156902	ENSGT00940000154990	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000012130
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Duck	MODERN SPECIES	8	SLC2A6 (ENSAPLG00000006885)	MYMK (ENSAPLG00000007109) #20	ADAMTSL2 (ENSAPLG00000007114) #19	FAM163B (ENSAPLG00000020379) #18	DBH (ENSAPLG00000007151) #17	SARDH (ENSAPLG00000007295) #15	VAV2 (ENSAPLG00000007510)	BRD3 (ENSAPLG00000008591)	WDR5B (ENSAPLG00000014714)	RXRA (ENSAPLG00000013150)	ENSAPLG00000030433	ENSAPLG00000031220	PPP1R26 (ENSAPLG00000028234)	TRUB2 (ENSAPLG00000009254)	ENSAPLG00000022910	SLC27A4 (ENSAPLG00000008614) #22	URM1 (ENSAPLG00000008603) #26	CERCAM (ENSAPLG00000023317) #25	TOR2A (ENSAPLG00000021882) #27	SH2D3C (ENSAPLG00000007801) #28	CDK9 (ENSAPLG00000021148)	DPM2 (ENSAPLG00000001324)	EEIG1 (ENSAPLG00000001915)	NAIF1 (ENSAPLG00000002142)	SLC25A25 (ENSAPLG00000002420)	ENSAPLG00000030898	ENSAPLG00000030664	ENSAPLG00000030226	ENSAPLG00000022704	MEGF9 (ENSAPLG00000031052)	CDK5RAP2 (ENSAPLG00000006791)
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Japanese quail	MODERN SPECIES	8	ZDHHC12 (ENSCJPG00005020302)	ENSCJPG00005020187	SET (ENSCJPG00005020186)	DYNC2I2 (ENSCJPG00005020185)	SPTAN1 (ENSCJPG00005020100)	GLE1 (ENSCJPG00005020099)	ODF2 (ENSCJPG00005020098)	PTGES2 (ENSCJPG00005020097)	BBLN (ENSCJPG00005020096)	CIZ1 (ENSCJPG00005020095)	DNM1 (ENSCJPG00005019953)	ENSCJPG00005019950	SWI5 (ENSCJPG00005019949) #21	TRUB2 (ENSCJPG00005019948)	COQ4 (ENSCJPG00005019947)	SLC27A4 (ENSCJPG00005019945) #22	URM1 (ENSCJPG00005019944) #26	CERCAM (ENSCJPG00005019942) #25	TOR2A (ENSCJPG00005019941) #27	SH2D3C (ENSCJPG00005019940) #28	CDK9 (ENSCJPG00005019939)	FPGS (ENSCJPG00005019938)	ENG (ENSCJPG00005019937)	AK1 (ENSCJPG00005019936)	ST6GALNAC4 (ENSCJPG00005019935)	ST6GALNAC6 (ENSCJPG00005019934)	DPM2 (ENSCJPG00005019933)	EEIG1 (ENSCJPG00005019932)	NAIF1 (ENSCJPG00005019931)	SLC25A25 (ENSCJPG00005019853)	ENSCJPG00005019852
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Kakapo	MODERN SPECIES	9	ZDHHC12 (ENSSHBG00005012414)	ENSSHBG00005012668	SET (ENSSHBG00005016110)	DYNC2I2 (ENSSHBG00005016116)	SPTAN1 (ENSSHBG00005016133)	GLE1 (ENSSHBG00005016146)	ODF2 (ENSSHBG00005016184)	PTGES2 (ENSSHBG00005016283)	BBLN (ENSSHBG00005016291)	CIZ1 (ENSSHBG00005016302)	DNM1 (ENSSHBG00005016315)	ENSSHBG00005016331	SWI5 (ENSSHBG00005016337) #21	TRUB2 (ENSSHBG00005016344)	COQ4 (ENSSHBG00005016349)	SLC27A4 (ENSSHBG00005016357) #22	URM1 (ENSSHBG00005016363) #26	CERCAM (ENSSHBG00005016380) #25	TOR2A (ENSSHBG00005016385) #27	SH2D3C (ENSSHBG00005016399) #28	CDK9 (ENSSHBG00005016419)	FPGS (ENSSHBG00005016431)	ENG (ENSSHBG00005016442)	AK1 (ENSSHBG00005016449)	ST6GALNAC6 (ENSSHBG00005016454)	ST6GALNAC4 (ENSSHBG00005016465)	DPM2 (ENSSHBG00005016469)	EEIG1 (ENSSHBG00005016473)	NAIF1 (ENSSHBG00005016475)	SLC25A25 (ENSSHBG00005016479)	ENSSHBG00005016485
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Great tit	MODERN SPECIES	7	ZDHHC12 (ENSPMJG00000009472)	ENSPMJG00000009473	SET (ENSPMJG00000009474)	DYNC2I2 (ENSPMJG00000009476)	SPTAN1 (ENSPMJG00000009478)	GLE1 (ENSPMJG00000009484)	ODF2 (ENSPMJG00000009485)	PTGES2 (ENSPMJG00000009486)	BBLN (ENSPMJG00000009487)	CIZ1 (ENSPMJG00000009507)	DNM1 (ENSPMJG00000009509)	ENSPMJG00000009515	ENSPMJG00000009523 #21	TRUB2 (ENSPMJG00000009530)	COQ4 (ENSPMJG00000009531)	SLC27A4 (ENSPMJG00000009533) #22	URM1 (ENSPMJG00000009536) #26	CERCAM (ENSPMJG00000009540) #25	PTRH1 (ENSPMJG00000009541) #23	TOR2A (ENSPMJG00000009545) #27	SH2D3C (ENSPMJG00000009546) #28	CDK9 (ENSPMJG00000009549)	FPGS (ENSPMJG00000009550)	ENG (ENSPMJG00000009551)	AK1 (ENSPMJG00000009554)	ST6GALNAC6 (ENSPMJG00000009556)	ST6GALNAC4 (ENSPMJG00000009557)	DPM2 (ENSPMJG00000009558)	EEIG1 (ENSPMJG00000009561)	NAIF1 (ENSPMJG00000009562)	SLC25A25 (ENSPMJG00000009563)
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African ostrich	MODERN SPECIES	971	ZDHHC12 (ENSSCUG00000017778)	PKN1 (ENSSCUG00000017776)	SET (ENSSCUG00000017772)	DYNC2I2 (ENSSCUG00000017765)	SPTAN1 (ENSSCUG00000017472)	GLE1 (ENSSCUG00000017248)	ODF2 (ENSSCUG00000017244)	PTGES2 (ENSSCUG00000017242)	ENSSCUG00000017240	CIZ1 (ENSSCUG00000017239)	DNM1 (ENSSCUG00000017234)	ENSSCUG00000017221	SWI5 (ENSSCUG00000017218) #21	TRUB2 (ENSSCUG00000017217)	COQ4 (ENSSCUG00000017215)	SLC27A4 (ENSSCUG00000017212) #22	ENSSCUG00000017210	ENSSCUG00000017207	TOR2A (ENSSCUG00000017206) #27	SH2D3C (ENSSCUG00000017198) #28	CDK9 (ENSSCUG00000017193)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	44	PKN1 (ENSCPRG00005002282)	SET (ENSCPRG00005002238)	DYNC2I2 (ENSCPRG00005002223)	SPTAN1 (ENSCPRG00005001460)	GLE1 (ENSCPRG00005001279)	ODF2 (ENSCPRG00005000809)	PTGES2 (ENSCPRG00005000726)	BBLN (ENSCPRG00005000719)	CIZ1 (ENSCPRG00005000678)	DNM1 (ENSCPRG00005000599)	ENSCPRG00005000485	ENSCPRG00005000436	SWI5 (ENSCPRG00005000422) #21	TRUB2 (ENSCPRG00005000402)	COQ4 (ENSCPRG00005000394)	SLC27A4 (ENSCPRG00005000384) #22	URM1 (ENSCPRG00005000380) #26	CERCAM (ENSCPRG00005000369) #25	CFAP157 (ENSCPRG00005000363) #24	PTRH1 (ENSCPRG00005000359) #23	ENSCPRG00005000351	TOR2A (ENSCPRG00005000310) #27	SH2D3C (ENSCPRG00005000297) #28	CDK9 (ENSCPRG00005000290)	FPGS (ENSCPRG00005000278)	ENG (ENSCPRG00005000267)	AK1 (ENSCPRG00005000262)	ENSCPRG00005000132	ST6GALNAC6 (ENSCPRG00005000106)	ST6GALNAC4 (ENSCPRG00005000091)	PIP5KL1 (ENSCPRG00005000086)
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Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000160578	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT01040000244417	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000156902	ENSGT00940000154990	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	7	ZDHHC12 (ENSGEVG00005021087)	ENSGEVG00005021080	SET (ENSGEVG00005021077)	DYNC2I2 (ENSGEVG00005021064)	SPTAN1 (ENSGEVG00005020346)	GLE1 (ENSGEVG00005019713)	ODF2 (ENSGEVG00005019681)	PTGES2 (ENSGEVG00005019626)	BBLN (ENSGEVG00005019612)	CIZ1 (ENSGEVG00005019581)	DNM1 (ENSGEVG00005019520)	ENSGEVG00005019428	SWI5 (ENSGEVG00005019405) #21	TRUB2 (ENSGEVG00005019393)	COQ4 (ENSGEVG00005019375)	SLC27A4 (ENSGEVG00005019353) #22	URM1 (ENSGEVG00005019344) #26	CERCAM (ENSGEVG00005019227) #25	CFAP157 (ENSGEVG00005019181) #24	PTRH1 (ENSGEVG00005019167) #23	ENSGEVG00005019159	TOR2A (ENSGEVG00005019140) #27	SH2D3C (ENSGEVG00005019120) #28	CDK9 (ENSGEVG00005019101)	FPGS (ENSGEVG00005019074)	ENG (ENSGEVG00005019048)	AK1 (ENSGEVG00005019033)	ENSGEVG00005018958	ST6GALNAC6 (ENSGEVG00005018913)	ST6GALNAC4 (ENSGEVG00005018898)	PIP5KL1 (ENSGEVG00005018877)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2008	ENSCABG00000002242	SET (ENSCABG00000002240)	DYNC2I2 (ENSCABG00000002237)	SPTAN1 (ENSCABG00000002222)	GLE1 (ENSCABG00000002220)	ODF2 (ENSCABG00000002212)	PTGES2 (ENSCABG00000002209)	BBLN (ENSCABG00000002208)	CIZ1 (ENSCABG00000002205)	DNM1 (ENSCABG00000002197)	ENSCABG00000002195	ENSCABG00000002194	SWI5 (ENSCABG00000002193) #21	TRUB2 (ENSCABG00000002192)	COQ4 (ENSCABG00000002191)	SLC27A4 (ENSCABG00000001941) #22	URM1 (ENSCABG00000001940) #26	CERCAM (ENSCABG00000001939) #25	CFAP157 (ENSCABG00000001937) #24	PTRH1 (ENSCABG00000001936) #23	ENSCABG00000001933	TOR2A (ENSCABG00000001930) #27	SH2D3C (ENSCABG00000001828) #28	CDK9 (ENSCABG00000001804)	FPGS (ENSCABG00000001299)	AK1 (ENSCABG00000001261)	ENSCABG00000001253	ST6GALNAC6 (ENSCABG00000001251)	ST6GALNAC4 (ENSCABG00000001246)	PIP5KL1 (ENSCABG00000001242)	DPM2 (ENSCABG00000001237)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000154912	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT01040000244417	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
painted turtle	MODERN SPECIES	716	ENSCPBG00000023369	SET (ENSCPBG00000023372)	DYNC2I2 (ENSCPBG00000023373)	SPTAN1 (ENSCPBG00000023766)	GLE1 (ENSCPBG00000024524)	ODF2 (ENSCPBG00000024574)	PTGES2 (ENSCPBG00000024615)	BBLN (ENSCPBG00000024631)	CIZ1 (ENSCPBG00000024640)	DNM1 (ENSCPBG00000024671)	ENSCPBG00000025176	ENSCPBG00000025180	ENSCPBG00000025183 #21	TRUB2 (ENSCPBG00000025186)	COQ4 (ENSCPBG00000025188)	SLC27A4 (ENSCPBG00000025193) #22	URM1 (ENSCPBG00000025196) #26	CERCAM (ENSCPBG00000025202) #25	CFAP157 (ENSCPBG00000025206) #24	PTRH1 (ENSCPBG00000025207) #23	ENSCPBG00000025209	ENSCPBG00000025212	TOR2A (ENSCPBG00000025215) #27	SH2D3C (ENSCPBG00000025216) #28	CDK9 (ENSCPBG00000025218)	FPGS (ENSCPBG00000025221)	ENG (ENSCPBG00000025225)	AK1 (ENSCPBG00000025228)	ST6GALNAC6 (ENSCPBG00000025230)	ST6GALNAC4 (ENSCPBG00000025232)	PIP5KL1 (ENSCPBG00000025234)
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	113	ZDHHC12 (ENSTMTG00000022146)	ENSTMTG00000022132	SET (ENSTMTG00000022109)	DYNC2I2 (ENSTMTG00000022095)	SPTAN1 (ENSTMTG00000022042)	GLE1 (ENSTMTG00000021986)	ODF2 (ENSTMTG00000021957)	PTGES2 (ENSTMTG00000021950)	ENSTMTG00000021946	CIZ1 (ENSTMTG00000021941)	DNM1 (ENSTMTG00000021927)	ENSTMTG00000021893	SWI5 (ENSTMTG00000021880) #21	TRUB2 (ENSTMTG00000021873)	COQ4 (ENSTMTG00000021870)	SLC27A4 (ENSTMTG00000021865) #22	URM1 (ENSTMTG00000021862) #26	CERCAM (ENSTMTG00000021841) #25	CFAP157 (ENSTMTG00000021826) #24	PTRH1 (ENSTMTG00000021821) #23	ENSTMTG00000021815	TOR2A (ENSTMTG00000021808) #27	SH2D3C (ENSTMTG00000021687) #28	CDK9 (ENSTMTG00000021656)	FPGS (ENSTMTG00000021647)	ENG (ENSTMTG00000021637)	AK1 (ENSTMTG00000021630)	ST6GALNAC6 (ENSTMTG00000021624)	ST6GALNAC4 (ENSTMTG00000021621)	PIP5KL1 (ENSTMTG00000021616)	DPM2 (ENSTMTG00000021609)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	764	ZDHHC12 (ENSPSIG00000018085)	ENSPSIG00000018074	SET (ENSPSIG00000018056)	DYNC2I2 (ENSPSIG00000018054)	SPTAN1 (ENSPSIG00000017684)	GLE1 (ENSPSIG00000017668)	ODF2 (ENSPSIG00000017580)	PTGES2 (ENSPSIG00000017553)	ENSPSIG00000000010	CIZ1 (ENSPSIG00000017082)	DNM1 (ENSPSIG00000016092)	ENSPSIG00000016085	SWI5 (ENSPSIG00000016075) #21	TRUB2 (ENSPSIG00000015701)	COQ4 (ENSPSIG00000015437)	SLC27A4 (ENSPSIG00000014465) #22	URM1 (ENSPSIG00000014442) #26	CERCAM (ENSPSIG00000014033) #25	CFAP157 (ENSPSIG00000013881) #24	PTRH1 (ENSPSIG00000013828) #23	TTC16 (ENSPSIG00000013646)	TOR2A (ENSPSIG00000013585) #27	SH2D3C (ENSPSIG00000012366) #28	CDK9 (ENSPSIG00000012225)	FPGS (ENSPSIG00000011578)	ENG (ENSPSIG00000010330)	AK1 (ENSPSIG00000009976)
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Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT01040000244417	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00960000191310	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000156662.d.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00940000166869	ENSGT00940000164950	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT01040000244417	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00960000191310	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00940000166869	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00960000191310	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00940000166869	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00960000191310	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00940000166869	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00960000191310	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	566										DNM1 (ENSNSUG00000017607)	ENSNSUG00000017606	SWI5 (ENSNSUG00000017605) #21	ENSNSUG00000017604	TRUB2 (ENSNSUG00000017603)	COQ4 (ENSNSUG00000017602)	SLC27A4 (ENSNSUG00000017600) #22	URM1 (ENSNSUG00000017599) #26
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	54	NR6A1 (ENSPTXG00000009049)	OLFML2A (ENSPTXG00000009050)	DYNC2I2 (ENSPTXG00000009052)	SPTAN1 (ENSPTXG00000009090)	GLE1 (ENSPTXG00000011368)	ODF2 (ENSPTXG00000011377)	PTGES2 (ENSPTXG00000011525)	ENSPTXG00000011526	ENSPTXG00000011527	DNM1 (ENSPTXG00000011528)	ENSPTXG00000011532	SWI5 (ENSPTXG00000011533) #21	TRUB2 (ENSPTXG00000011534)	ENSPTXG00000011535	COQ4 (ENSPTXG00000006837)	SLC27A4 (ENSPTXG00000006851) #22	URM1 (ENSPTXG00000006853) #26	ENSPTXG00000006855 ##25	PTRH1 (ENSPTXG00000006856) #23	TTC16 (ENSPTXG00000006859)	TOR2A (ENSPTXG00000006862) #27	SH2D3C (ENSPTXG00000006869) #28	CDK9 (ENSPTXG00000007754)	FPGS (ENSPTXG00000007756)	AK1 (ENSPTXG00000007850)	ST6GALNAC6 (ENSPTXG00000007851)	ST6GALNAC4 (ENSPTXG00000007852)	PIP5KL1 (ENSPTXG00000007853)	DPM2 (ENSPTXG00000007854)	EEIG1 (ENSPTXG00000007855)	NAIF1 (ENSPTXG00000007856)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	5565																SLC27A4 (ENSLLTG00000003431) #22	ENSLLTG00000003319	DNM1 (ENSLLTG00000003248)
Indian cobra	MODERN SPECIES	8	NR6A1 (ENSNNAG00000013915)	DYNC2I2 (ENSNNAG00000013945)	SPTAN1 (ENSNNAG00000014617)	GLE1 (ENSNNAG00000018191)	ODF2 (ENSNNAG00000018197)	PTGES2 (ENSNNAG00000018202)	BBLN (ENSNNAG00000018207)	ENSNNAG00000018209	DNM1 (ENSNNAG00000018402)	ENSNNAG00000018968	ENSNNAG00000018971	SWI5 (ENSNNAG00000018982) #21	COQ4 (ENSNNAG00000018986)	TRUB2 (ENSNNAG00000018991)	ENSNNAG00000018995	SLC27A4 (ENSNNAG00000018998) #22	URM1 (ENSNNAG00000019001) #26	CERCAM (ENSNNAG00000019007) #25	CFAP157 (ENSNNAG00000019014) #24	PTRH1 (ENSNNAG00000019019) #23	ENSNNAG00000019021	TOR2A (ENSNNAG00000019024) #27	SH2D3C (ENSNNAG00000019029) #28	CDK9 (ENSNNAG00000019035)	FPGS (ENSNNAG00000019042)	AK1 (ENSNNAG00000019055)	ST6GALNAC6 (ENSNNAG00000019060)	ST6GALNAC4 (ENSNNAG00000019065)	PIP5KL1 (ENSNNAG00000019071)	DPM2 (ENSNNAG00000019077)	EEIG1 (ENSNNAG00000019084)
Lizard	MODERN SPECIES	1644																ENSACAG00000010253 #22	ENSACAG00000039596 #26
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d.b	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00960000191310	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Common wall lizard	MODERN SPECIES	419	UAP1L1 (ENSPMRG00000023207)	SAPCD2 (ENSPMRG00000023214)	ENTPD2 (ENSPMRG00000023220)	ENSPMRG00000023231	ABCA2 (ENSPMRG00000023312)	FUT7 (ENSPMRG00000023431)	ODF2 (ENSPMRG00000023433)	PTGES2 (ENSPMRG00000023439)	ENSPMRG00000023444	DNM1 (ENSPMRG00000023474)	ENSPMRG00000023562	ENSPMRG00000023564	TRUB2 (ENSPMRG00000023565)	ENSPMRG00000023566	COQ4 (ENSPMRG00000023567)	SLC27A4 (ENSPMRG00000023568) #22	URM1 (ENSPMRG00000023569) #26	CERCAM (ENSPMRG00000023572) #25	CFAP157 (ENSPMRG00000023611) #24	PTRH1 (ENSPMRG00000023614) #23	ENSPMRG00000023617	ENSPMRG00000023620 #27	ENSPMRG00000023622	SH2D3C (ENSPMRG00000016453) #28	CDK9 (ENSPMRG00000016467)	FPGS (ENSPMRG00000016481)	ENG (ENSPMRG00000016516)	ENSPMRG00000016530	AK1 (ENSPMRG00000016539)	ENSPMRG00000016557	ST6GALNAC6 (ENSPMRG00000016589)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	52	ENSSMRG00000010451	ENSSMRG00000010464	ENSSMRG00000010466	ENSSMRG00000010472	ENSSMRG00000010473	ENSSMRG00000010474	ENSSMRG00000010475	ENSSMRG00000010477	ENSSMRG00000010478	ENSSMRG00000010479	ENSSMRG00000010480	ENSSMRG00000010482	SWI5 (ENSSMRG00000010483) #21	TRUB2 (ENSSMRG00000010485)	COQ4 (ENSSMRG00000010486)	SLC27A4 (ENSSMRG00000010490) #22	URM1 (ENSSMRG00000011107) #26	CERCAM (ENSSMRG00000011122) #25	CFAP157 (ENSSMRG00000011124) #24	PTRH1 (ENSSMRG00000011128) #23	TTC16 (ENSSMRG00000011129)	TOR2A (ENSSMRG00000011132) #27	SH2D3C (ENSSMRG00000011137) #28	CDK9 (ENSSMRG00000011144)	FPGS (ENSSMRG00000011150)	ENSSMRG00000011315	ENSSMRG00000011318	ENSSMRG00000011321	ENSSMRG00000011322	ENSSMRG00000011323	ENSSMRG00000011325
tuatara	MODERN SPECIES	746	ZDHHC12 (ENSSPUG00000014168)	PKN1 (ENSSPUG00000014203)	SET (ENSSPUG00000014327)	DYNC2I2 (ENSSPUG00000014383)	SPTAN1 (ENSSPUG00000014584)	GLE1 (ENSSPUG00000015268)	ODF2 (ENSSPUG00000015294)	PTGES2 (ENSSPUG00000015335)	BBLN (ENSSPUG00000015338)	CIZ1 (ENSSPUG00000015347)	DNM1 (ENSSPUG00000015376)	ENSSPUG00000015440	SWI5 (ENSSPUG00000015500) #21	TRUB2 (ENSSPUG00000015515)	COQ4 (ENSSPUG00000015526)	SLC27A4 (ENSSPUG00000015536) #22	URM1 (ENSSPUG00000015548) #26	CFAP157 (ENSSPUG00000015602) #24	PTRH1 (ENSSPUG00000000040) #23	SEC22B (ENSSPUG00000000051)	NOTCH2 (ENSSPUG00000000062)	HMGCS2 (ENSSPUG00000000080)	PHGDH (ENSSPUG00000000175)	ENSSPUG00000000396	ENSSPUG00000000416	PRKAB2 (ENSSPUG00000000426)	ENSSPUG00000000433	SIM2 (ENSSPUG00000000454)	ENSSPUG00000000498	ENSSPUG00000000519	PIGP (ENSSPUG00000000596)
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156902	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00730000111240 #24	ENSGT00390000004247 #23	ENSGT00390000004550	ENSGT00950000182888.a.b #27	ENSGT00940000154130.a.b #28	ENSGT00940000155373	ENSGT00390000016526	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098
Theria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987.c	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	164	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773.y	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25
Armadillo	MODERN SPECIES	974	AK1 (ENSDNOG00000039309)	ST6GALNAC6 (ENSDNOG00000037953)	ST6GALNAC4 (ENSDNOG00000045695)	ENSDNOG00000047322	NAIF1 (ENSDNOG00000034148)	SLC25A25 (ENSDNOG00000042927)	PTGES2 (ENSDNOG00000012002)	ENSDNOG00000039053	BBLN (ENSDNOG00000023665)	CIZ1 (ENSDNOG00000036104)	DNM1 (ENSDNOG00000012541)	ENSDNOG00000030766	ENSDNOG00000037556 #21	ENSDNOG00000045679	COQ4 (ENSDNOG00000007007)	SLC27A4 (ENSDNOG00000037021) #22	ENSDNOG00000039086 #26	CERCAM (ENSDNOG00000000342) #25
Sloth	MODERN SPECIES	5530																SLC27A4 (ENSCHOG00000003966) #22
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987.c	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987.c	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Elephant	MODERN SPECIES	472	ST6GALNAC6 (ENSLAFG00000013236)	ST6GALNAC4 (ENSLAFG00000015580)	PIP5KL1 (ENSLAFG00000000585)	DPM2 (ENSLAFG00000025601)	EEIG1 (ENSLAFG00000012074)	NAIF1 (ENSLAFG00000031104)	SLC25A25 (ENSLAFG00000005089)	PTGES2 (ENSLAFG00000005097)	LCN2 (ENSLAFG00000023195)	CIZ1 (ENSLAFG00000005106)	DNM1 (ENSLAFG00000005112)	ENSLAFG00000013576	SWI5 (ENSLAFG00000031443) #21	TRUB2 (ENSLAFG00000002174)	COQ4 (ENSLAFG00000002176)	SLC27A4 (ENSLAFG00000002177) #22	URM1 (ENSLAFG00000002178) #26	CERCAM (ENSLAFG00000022100) #25	ODF2 (ENSLAFG00000001758)	GLE1 (ENSLAFG00000018612)	SPTAN1 (ENSLAFG00000018614)	DYNC2I2 (ENSLAFG00000018622)	PKN3 (ENSLAFG00000009776)	SET (ENSLAFG00000030310)	ZDHHC12 (ENSLAFG00000028584)	ZER1 (ENSLAFG00000012950)	TBC1D13 (ENSLAFG00000021344)	ENDOG (ENSLAFG00000028267)	SPOUT1 (ENSLAFG00000014778)	KYAT1 (ENSLAFG00000022510)	LRRC8A (ENSLAFG00000018674)
Hyrax	MODERN SPECIES	5079														TRUB2 (ENSPCAG00000015068)	COQ4 (ENSPCAG00000015119)	SLC27A4 (ENSPCAG00000015172) #22	URM1 (ENSPCAG00000015239) #26	CERCAM (ENSPCAG00000015259) #25
Tenrec	MODERN SPECIES	6013																SLC27A4 (ENSETEG00000017441) #22
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	1543																ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26
Hedgehog	MODERN SPECIES	6182																SLC27A4 (ENSEEUG00000012909) #22	URM1 (ENSEEUG00000012945) #26
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Suina	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	887	ST6GALNAC4 (ENSCWAG00000018381)	PIP5KL1 (ENSCWAG00000018317)	DPM2 (ENSCWAG00000018302)	EEIG1 (ENSCWAG00000018271)	NAIF1 (ENSCWAG00000018246)	SLC25A25 (ENSCWAG00000017935)	PTGES2 (ENSCWAG00000017870)	LCN2 (ENSCWAG00000017836)	BBLN (ENSCWAG00000017811)	CIZ1 (ENSCWAG00000017779)	DNM1 (ENSCWAG00000017617)	ENSCWAG00000017348	SWI5 (ENSCWAG00000017288) #21	TRUB2 (ENSCWAG00000017252)	COQ4 (ENSCWAG00000017217)	SLC27A4 (ENSCWAG00000017166) #22	URM1 (ENSCWAG00000017111) #26	CERCAM (ENSCWAG00000017024) #25	ODF2 (ENSCWAG00000015659)	GLE1 (ENSCWAG00000015416)	SPTAN1 (ENSCWAG00000011579)	DYNC2I2 (ENSCWAG00000011266)	ENSCWAG00000011134	PKN3 (ENSCWAG00000010948)	ZDHHC12 (ENSCWAG00000010885)	ZER1 (ENSCWAG00000010856)	TBC1D13 (ENSCWAG00000010779)	ENDOG (ENSCWAG00000010746)	SPOUT1 (ENSCWAG00000010709)	KYAT1 (ENSCWAG00000010560)	LRRC8A (ENSCWAG00000010522)
Pig	MODERN SPECIES		ENSSSCG00000005623	ST6GALNAC4 (ENSSSCG00000005628)	PIP5KL1 (ENSSSCG00000005629)	DPM2 (ENSSSCG00000032481)	EEIG1 (ENSSSCG00000005631)	SLC25A25 (ENSSSCG00000005636)	PTGES2 (ENSSSCG00000022655)	LCN2 (ENSSSCG00000005638)	ENSSSCG00000022295	CIZ1 (ENSSSCG00000005640)	DNM1 (ENSSSCG00000005641)	ENSSSCG00000005643	SWI5 (ENSSSCG00000032748) #21	TRUB2 (ENSSSCG00000005645)	COQ4 (ENSSSCG00000005646)	SLC27A4 (ENSSSCG00000005648) #22	URM1 (ENSSSCG00000005649) #26	CERCAM (ENSSSCG00000005650) #25	ODF2 (ENSSSCG00000005651)	GLE1 (ENSSSCG00000005652)	SPTAN1 (ENSSSCG00000005654)	DYNC2I2 (ENSSSCG00000005655)	ENSSSCG00000005656	PKN3 (ENSSSCG00000005657)	ZDHHC12 (ENSSSCG00000063201)	ZER1 (ENSSSCG00000005659)	TBC1D13 (ENSSSCG00000005660)	ENDOG (ENSSSCG00000005661)	SPOUT1 (ENSSSCG00000005662)	KYAT1 (ENSSSCG00000005663)	LRRC8A (ENSSSCG00000005664)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.c.a.a	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.c.a.a	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773.m	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.c.a.a	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773.m	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.c.a.a	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773.m	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.c.a.a	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Narwhal	MODERN SPECIES	312	ST6GALNAC4 (ENSMMNG00015011266)	PIP5KL1 (ENSMMNG00015011295)	DPM2 (ENSMMNG00015011318)	EEIG1 (ENSMMNG00015011330)	NAIF1 (ENSMMNG00015011360)	SLC25A25 (ENSMMNG00015011401)	PTGES2 (ENSMMNG00015011488)	LCN2 (ENSMMNG00015011512)	BBLN (ENSMMNG00015011539)	CIZ1 (ENSMMNG00015011557)	DNM1 (ENSMMNG00015011636)	ENSMMNG00015011718	ENSMMNG00015011806 #21	ENSMMNG00015011820	COQ4 (ENSMMNG00015011834)	SLC27A4 (ENSMMNG00015011857) #22	URM1 (ENSMMNG00015011899) #26	CERCAM (ENSMMNG00015011954) #25	ENSMMNG00015011989	ODF2 (ENSMMNG00015012074)	GLE1 (ENSMMNG00015012220)	SPTAN1 (ENSMMNG00015012399)	DYNC2I2 (ENSMMNG00015012768)	ENSMMNG00015012809	PKN3 (ENSMMNG00015012862)	ZDHHC12 (ENSMMNG00015012907)	ZER1 (ENSMMNG00015012922)	TBC1D13 (ENSMMNG00015012949)	ENDOG (ENSMMNG00015012965)	SPOUT1 (ENSMMNG00015012974)	KYAT1 (ENSMMNG00015013000)
Beluga whale	MODERN SPECIES	19	ST6GALNAC4 (ENSDLEG00000013950)	PIP5KL1 (ENSDLEG00000013932)	DPM2 (ENSDLEG00000013905)	FAM102A (ENSDLEG00000013859)	NAIF1 (ENSDLEG00000013845)	SLC25A25 (ENSDLEG00000013826)	PTGES2 (ENSDLEG00000013811)	LCN2 (ENSDLEG00000013790)	CUNH9orf16 (ENSDLEG00000013764)	CIZ1 (ENSDLEG00000013429)	DNM1 (ENSDLEG00000013341)	ENSDLEG00000013287	ENSDLEG00000013260 #21	TRUB2 (ENSDLEG00000013238)	COQ4 (ENSDLEG00000013223)	SLC27A4 (ENSDLEG00000013192) #22	CERCAM (ENSDLEG00000013147) #25	ODF2 (ENSDLEG00000011586)	GLE1 (ENSDLEG00000011434)	SPTAN1 (ENSDLEG00000010997)	DYNC2I2 (ENSDLEG00000010796)	SET (ENSDLEG00000010550)	PKN3 (ENSDLEG00000010355)	ZDHHC12 (ENSDLEG00000010316)	ZER1 (ENSDLEG00000010294)	TBC1D13 (ENSDLEG00000010257)	ENDOG (ENSDLEG00000010240)	SPOUT1 (ENSDLEG00000010049)	KYAT1 (ENSDLEG00000009805)	LRRC8A (ENSDLEG00000009771)	PHYHD1 (ENSDLEG00000009397)
Vaquita	MODERN SPECIES	17	ST6GALNAC6 (ENSPSNG00000010123)	ST6GALNAC4 (ENSPSNG00000010065)	PIP5KL1 (ENSPSNG00000009982)	EEIG1 (ENSPSNG00000009845)	NAIF1 (ENSPSNG00000009796)	SLC25A25 (ENSPSNG00000009629)	PTGES2 (ENSPSNG00000009512)	LCN2 (ENSPSNG00000009350)	ENSPSNG00000019065	CIZ1 (ENSPSNG00000018754)	DNM1 (ENSPSNG00000018580)	ENSPSNG00000018175	SWI5 (ENSPSNG00000018049) #21	ENSPSNG00000018011	COQ4 (ENSPSNG00000017937)	SLC27A4 (ENSPSNG00000017850) #22	ENSPSNG00000017825	CERCAM (ENSPSNG00000017524) #25	ODF2 (ENSPSNG00000016983)	GLE1 (ENSPSNG00000016827)	SPTAN1 (ENSPSNG00000016557)	DYNC2I2 (ENSPSNG00000016254)	ENSPSNG00000016095	PKN3 (ENSPSNG00000016019)	ZDHHC12 (ENSPSNG00000015940)	ZER1 (ENSPSNG00000015866)	TBC1D13 (ENSPSNG00000015769)	ENDOG (ENSPSNG00000015699)	SPOUT1 (ENSPSNG00000015652)	KYAT1 (ENSPSNG00000015552)	LRRC8A (ENSPSNG00000015488)
Dolphin	MODERN SPECIES	514	ST6GALNAC4 (ENSTTRG00000016469)	PIP5KL1 (ENSTTRG00000016470)	DPM2 (ENSTTRG00000016471)	EEIG1 (ENSTTRG00000016472)	NAIF1 (ENSTTRG00000016473)	SLC25A25 (ENSTTRG00000016474)	PTGES2 (ENSTTRG00000016476)	LCN2 (ENSTTRG00000016477)	BBLN (ENSTTRG00000016479)	CIZ1 (ENSTTRG00000016480)	DNM1 (ENSTTRG00000016483)	ENSTTRG00000016484	ENSTTRG00000016485 #21	TRUB2 (ENSTTRG00000016486)	COQ4 (ENSTTRG00000016487)	SLC27A4 (ENSTTRG00000016488) #22	URM1 (ENSTTRG00000016490) #26
Sperm whale	MODERN SPECIES	263												ENSPCTG00005021995	SWI5 (ENSPCTG00005021980) #21	TRUB2 (ENSPCTG00005021977)	COQ4 (ENSPCTG00005021964)	SLC27A4 (ENSPCTG00005021955) #22
Blue whale	MODERN SPECIES	17	ST6GALNAC4 (ENSBMSG00010004513)	PIP5KL1 (ENSBMSG00010004547)	EEIG1 (ENSBMSG00010004598)	NAIF1 (ENSBMSG00010004625)	SLC25A25 (ENSBMSG00010004676)	PTGES2 (ENSBMSG00010004846)	ENSBMSG00010004862	BBLN (ENSBMSG00010004875)	CIZ1 (ENSBMSG00010004882)	DNM1 (ENSBMSG00010014083)	ENSBMSG00010016019	ENSBMSG00010016102	SWI5 (ENSBMSG00010016121) #21	TRUB2 (ENSBMSG00010016144)	COQ4 (ENSBMSG00010016174)	SLC27A4 (ENSBMSG00010016233) #22	ENSBMSG00010016284 #26	CERCAM (ENSBMSG00010016352) #25	ODF2 (ENSBMSG00010016555)	GLE1 (ENSBMSG00010016573)	SPTAN1 (ENSBMSG00010016675)	DYNC2I2 (ENSBMSG00010016989)	ENSBMSG00010017098	PKN3 (ENSBMSG00010017783)	ZDHHC12 (ENSBMSG00010017813)	ZER1 (ENSBMSG00010017848)	TBC1D13 (ENSBMSG00010017884)	ENDOG (ENSBMSG00010017915)	SPOUT1 (ENSBMSG00010017933)	KYAT1 (ENSBMSG00010017962)	LRRC8A (ENSBMSG00010018009)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.f	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Yarkand deer	MODERN SPECIES	2	PIP5KL1 (ENSCHYG00000019437)	DPM2 (ENSCHYG00000019616)	EEIG1 (ENSCHYG00000019666)	NAIF1 (ENSCHYG00000019806)	SLC25A25 (ENSCHYG00000019866)	PTGES2 (ENSCHYG00000020542)	ENSCHYG00000020615	CIZ1 (ENSCHYG00000020788)	BBLN (ENSCHYG00000021688)	DNM1 (ENSCHYG00000021822)	ENSCHYG00000024089	SWI5 (ENSCHYG00000026349) #21	ENSCHYG00000004383	TRUB2 (ENSCHYG00000004541)	COQ4 (ENSCHYG00000004830)	SLC27A4 (ENSCHYG00000004848) #22	URM1 (ENSCHYG00000004897) #26	CERCAM (ENSCHYG00000004937) #25	ODF2 (ENSCHYG00000005210)	GLE1 (ENSCHYG00000006491)	SPTAN1 (ENSCHYG00000006836)	DYNC2I2 (ENSCHYG00000010542)	PKN3 (ENSCHYG00000010695)	ZDHHC12 (ENSCHYG00000010984)	ZER1 (ENSCHYG00000011062)	TBC1D13 (ENSCHYG00000011188)	ENDOG (ENSCHYG00000011462)	SPOUT1 (ENSCHYG00000011505)	KYAT1 (ENSCHYG00000011630)	LRRC8A (ENSCHYG00000011822)	PHYHD1 (ENSCHYG00000011859)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.f	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1178	PIP5KL1 (ENSMMSG00000021186)	DPM2 (ENSMMSG00000021226)	EEIG1 (ENSMMSG00000021259)	NAIF1 (ENSMMSG00000021305)	SLC25A25 (ENSMMSG00000021344)	PTGES2 (ENSMMSG00000021443)	LCN2 (ENSMMSG00000021462)	BBLN (ENSMMSG00000021473)	CIZ1 (ENSMMSG00000021494)	DNM1 (ENSMMSG00000021591)	ENSMMSG00000021790	SWI5 (ENSMMSG00000021995) #21	ENSMMSG00000022010	TRUB2 (ENSMMSG00000022019)	COQ4 (ENSMMSG00000022044)	SLC27A4 (ENSMMSG00000022071) #22	ENSMMSG00000022109	CERCAM (ENSMMSG00000022138) #25	ODF2 (ENSMMSG00000022206)	GLE1 (ENSMMSG00000022500)	SPTAN1 (ENSMMSG00000022626)	DYNC2I2 (ENSMMSG00000022692)	SET (ENSMMSG00000022708)	ENSMMSG00000022721	PKN3 (ENSMMSG00000022736)	ZDHHC12 (ENSMMSG00000004629)	ZER1 (ENSMMSG00000004684)	TBC1D13 (ENSMMSG00000004774)	ENDOG (ENSMMSG00000004878)	SPOUT1 (ENSMMSG00000004947)	KYAT1 (ENSMMSG00000005035)
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.f	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.f.c.a.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Bos	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.f.c.a.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.f.d	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Cow	MODERN SPECIES	2	EEIG1 (ENSBTAG00000023851)	ENSBTAG00000050072	NAIF1 (ENSBTAG00000012156)	SLC25A25 (ENSBTAG00000011912)	ENSBTAG00000049313	PTGES2 (ENSBTAG00000016218)	LCN2 (ENSBTAG00000014149)	BBLN (ENSBTAG00000014150)	CIZ1 (ENSBTAG00000012274)	DNM1 (ENSBTAG00000011307)	GOLGA2 (ENSBTAG00000011317)	ENSBTAG00000030608 #21	ENSBTAG00000055269	TRUB2 (ENSBTAG00000004663)	COQ4 (ENSBTAG00000004664)	SLC27A4 (ENSBTAG00000015436) #22	URM1 (ENSBTAG00000025612) #26	CERCAM (ENSBTAG00000038139) #25	ODF2 (ENSBTAG00000030567)	GLE1 (ENSBTAG00000030566)	SPTAN1 (ENSBTAG00000015327)	DYNC2I2 (ENSBTAG00000015343)	SET (ENSBTAG00000020959)	PKN3 (ENSBTAG00000010195)	ZDHHC12 (ENSBTAG00000030540)	ZER1 (ENSBTAG00000010208)	TBC1D13 (ENSBTAG00000012480)	ENDOG (ENSBTAG00000012484)	SPOUT1 (ENSBTAG00000012485)	KYAT1 (ENSBTAG00000036101)	ENSBTAG00000036099
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	2	ST6GALNAC4 (ENSBIXG00005006750)	PIP5KL1 (ENSBIXG00005015631)	DPM2 (ENSBIXG00005015604)	EEIG1 (ENSBIXG00005015589)	NAIF1 (ENSBIXG00005002340)	SLC25A25 (ENSBIXG00005015545)	PTGES2 (ENSBIXG00005015481)	LCN2 (ENSBIXG00005015458)	BBLN (ENSBIXG00005015446)	CIZ1 (ENSBIXG00005002265)	DNM1 (ENSBIXG00005015308)	ENSBIXG00005015206	SWI5 (ENSBIXG00005015152) #21	TRUB2 (ENSBIXG00005015125)	COQ4 (ENSBIXG00005015105)	SLC27A4 (ENSBIXG00005015088) #22	URM1 (ENSBIXG00005015065) #26	CERCAM (ENSBIXG00005002208) #25	ODF2 (ENSBIXG00005014960)	GLE1 (ENSBIXG00005014682)	SPTAN1 (ENSBIXG00005006741)	DYNC2I2 (ENSBIXG00005014302)	ENSBIXG00005014268	PKN3 (ENSBIXG00005014132)	ZDHHC12 (ENSBIXG00005014111)	ZER1 (ENSBIXG00005007117)	TBC1D13 (ENSBIXG00005001821)	ENDOG (ENSBIXG00005014033)	SPOUT1 (ENSBIXG00005014021)	ENSBIXG00005013976	ENSBIXG00005013947
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00900000143058	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.f.c.a.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00960000192839.b	ENSGT00940000158797
Wild yak	MODERN SPECIES	2257	ST6GALNAC4 (ENSBMUG00000019173)	PIP5KL1 (ENSBMUG00000019193)	DPM2 (ENSBMUG00000019212)	EEIG1 (ENSBMUG00000019254)	NAIF1 (ENSBMUG00000019278)	SLC25A25 (ENSBMUG00000019354)	PTGES2 (ENSBMUG00000019395)	LCN2 (ENSBMUG00000019409)	ENSBMUG00000019426	CIZ1 (ENSBMUG00000019488)	DNM1 (ENSBMUG00000019849)	ENSBMUG00000020249	SWI5 (ENSBMUG00000020300) #21	TRUB2 (ENSBMUG00000020324)	COQ4 (ENSBMUG00000020335)	SLC27A4 (ENSBMUG00000020352) #22	URM1 (ENSBMUG00000020356) #26	CERCAM (ENSBMUG00000020401) #25	ODF2 (ENSBMUG00000020574)	GLE1 (ENSBMUG00000020729)	SPTAN1 (ENSBMUG00000021166)	DYNC2I2 (ENSBMUG00000021287)	ENSBMUG00000021332	PKN3 (ENSBMUG00000021397)	ZDHHC12 (ENSBMUG00000021414)	ZER1 (ENSBMUG00000021439)	TBC1D13 (ENSBMUG00000021470)	ENDOG (ENSBMUG00000021487)	SPOUT1 (ENSBMUG00000021496)
Domestic yak	MODERN SPECIES	28	ST6GALNAC4 (ENSBGRG00000007710)	PIP5KL1 (ENSBGRG00000007913)	DPM2 (ENSBGRG00000008048)	EEIG1 (ENSBGRG00000008097)	NAIF1 (ENSBGRG00000008219)	SLC25A25 (ENSBGRG00000008276)	PTGES2 (ENSBGRG00000008923)	LCN2 (ENSBGRG00000008966)	BBLN (ENSBGRG00000009004)	DNM1 (ENSBGRG00000009415)	ENSBGRG00000009764	SWI5 (ENSBGRG00000010054) #21	TRUB2 (ENSBGRG00000010103)	COQ4 (ENSBGRG00000010175)	ENSBGRG00000010210	ENSBGRG00000010236 #22	ENSBGRG00000010276	CERCAM (ENSBGRG00000010359) #25	ODF2 (ENSBGRG00000010746)	GLE1 (ENSBGRG00000011941)	SPTAN1 (ENSBGRG00000012175)	DYNC2I2 (ENSBGRG00000013534)	ENSBGRG00000013648	PKN3 (ENSBGRG00000014325)	ZDHHC12 (ENSBGRG00000014417)	ZER1 (ENSBGRG00000014532)	TBC1D13 (ENSBGRG00000014747)	ENDOG (ENSBGRG00000015041)	SPOUT1 (ENSBGRG00000015119)	KYAT1 (ENSBGRG00000015519)	ENSBGRG00000015866
American bison	MODERN SPECIES	3289	ST6GALNAC4 (ENSBBBG00000008124)	PIP5KL1 (ENSBBBG00000021115)	DPM2 (ENSBBBG00000005661)	EEIG1 (ENSBBBG00000021144)	NAIF1 (ENSBBBG00000021151)	SLC25A25 (ENSBBBG00000021282)	PTGES2 (ENSBBBG00000021308)	LCN2 (ENSBBBG00000021319)	BBLN (ENSBBBG00000021329)	CIZ1 (ENSBBBG00000021514)	DNM1 (ENSBBBG00000022097)	ENSBBBG00000005857	SWI5 (ENSBBBG00000022225) #21	TRUB2 (ENSBBBG00000007202)	COQ4 (ENSBBBG00000022263)	SLC27A4 (ENSBBBG00000022292) #22	URM1 (ENSBBBG00000005877) #26	CERCAM (ENSBBBG00000022348) #25	ODF2 (ENSBBBG00000023015)	GLE1 (ENSBBBG00000023114)	SPTAN1 (ENSBBBG00000023772)	DYNC2I2 (ENSBBBG00000023833)	ENSBBBG00000023873	PKN3 (ENSBBBG00000023895)	ZDHHC12 (ENSBBBG00000023918)	ZER1 (ENSBBBG00000008636)	TBC1D13 (ENSBBBG00000008976)	ENDOG (ENSBBBG00000024001)	ENSBBBG00000024012	KYAT1 (ENSBBBG00000024044)	LRRC8A (ENSBBBG00000024057)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773.l	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.f	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	19	ST6GALNAC4 (ENSOARG00020015438)	PIP5KL1 (ENSOARG00020015289)	DPM2 (ENSOARG00020015235)	EEIG1 (ENSOARG00020015117)	NAIF1 (ENSOARG00020015076)	SLC25A25 (ENSOARG00020014113)	PTGES2 (ENSOARG00020014029)	LCN2 (ENSOARG00020013978)	BBLN (ENSOARG00020013944)	CIZ1 (ENSOARG00020013788)	DNM1 (ENSOARG00020009439)	ENSOARG00020008954	SWI5 (ENSOARG00020008915) #21	ENSOARG00020008848	COQ4 (ENSOARG00020008764)	SLC27A4 (ENSOARG00020008697) #22	URM1 (ENSOARG00020008585) #26	CERCAM (ENSOARG00020008484) #25	ODF2 (ENSOARG00020007738)	GLE1 (ENSOARG00020007574)	SPTAN1 (ENSOARG00020003920)	DYNC2I2 (ENSOARG00020003701)	ENSOARG00020003552	PKN3 (ENSOARG00020003449)	ZDHHC12 (ENSOARG00020003413)	ZER1 (ENSOARG00020003376)	TBC1D13 (ENSOARG00020003183)	ENDOG (ENSOARG00020003159)	SPOUT1 (ENSOARG00020003141)	ENSOARG00020003083	ENSOARG00020003005
Goat	MODERN SPECIES	2	ST6GALNAC4 (ENSCHIG00000012912)	PIP5KL1 (ENSCHIG00000020199)	DPM2 (ENSCHIG00000014190)	EEIG1 (ENSCHIG00000027017)	NAIF1 (ENSCHIG00000013390)	SLC25A25 (ENSCHIG00000021566)	PTGES2 (ENSCHIG00000026833)	LCN2 (ENSCHIG00000021337)	BBLN (ENSCHIG00000011939)	CIZ1 (ENSCHIG00000006845)	DNM1 (ENSCHIG00000018297)	ENSCHIG00000008218	ENSCHIG00000018627 #21	TRUB2 (ENSCHIG00000021160)	COQ4 (ENSCHIG00000011631)	SLC27A4 (ENSCHIG00000026484) #22	URM1 (ENSCHIG00000012547) #26	CERCAM (ENSCHIG00000023833) #25	ODF2 (ENSCHIG00000009088)	GLE1 (ENSCHIG00000025665)	SPTAN1 (ENSCHIG00000013404)	DYNC2I2 (ENSCHIG00000019844)	SET (ENSCHIG00000027039)	PKN3 (ENSCHIG00000018757)	ZDHHC12 (ENSCHIG00000026386)	ZER1 (ENSCHIG00000024803)	TBC1D13 (ENSCHIG00000013669)	ENDOG (ENSCHIG00000020781)	SPOUT1 (ENSCHIG00000010025)	KYAT1 (ENSCHIG00000015959)	LRRC8A (ENSCHIG00000003097)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160114	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000156902	ENSGT00940000161818	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Arabian camel	MODERN SPECIES	30	PIP5KL1 (ENSCDRG00005011974)	DPM2 (ENSCDRG00005011918)	EEIG1 (ENSCDRG00005011823)	NAIF1 (ENSCDRG00005011787)	SLC25A25 (ENSCDRG00005010833)	PTGES2 (ENSCDRG00005010746)	LCN2 (ENSCDRG00005010668)	BBLN (ENSCDRG00005010632)	CIZ1 (ENSCDRG00005010347)	DNM1 (ENSCDRG00005009936)	ENSCDRG00005008955	SWI5 (ENSCDRG00005008734) #21	ENSCDRG00005008625	TRUB2 (ENSCDRG00005008567)	COQ4 (ENSCDRG00005008522)	SLC27A4 (ENSCDRG00005008493) #22	URM1 (ENSCDRG00005008372) #26	CERCAM (ENSCDRG00005008140) #25	ODF2 (ENSCDRG00005004342)	CYCS (ENSCDRG00005004156)	GLE1 (ENSCDRG00005004027)	SPTAN1 (ENSCDRG00005002078)	DYNC2I2 (ENSCDRG00005001966)	SET (ENSCDRG00005001835)	PKN3 (ENSCDRG00005001760)	ZDHHC12 (ENSCDRG00005001723)	ZER1 (ENSCDRG00005001674)	TBC1D13 (ENSCDRG00005001632)	ENDOG (ENSCDRG00005001612)	SPOUT1 (ENSCDRG00005001575)	KYAT1 (ENSCDRG00005001537)
Alpaca	MODERN SPECIES	1742																SLC27A4 (ENSVPAG00000007920) #22
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00940000164950	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00940000164950	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Microbat	DUPLICATION
Microbat	MODERN SPECIES	1399						PTGES2 (ENSMLUG00000013576)	ENSMLUG00000016210	ENSMLUG00000029693	ENSMLUG00000016217	CIZ1 (ENSMLUG00000016220)	DNM1 (ENSMLUG00000016237)	ENSMLUG00000005290	SWI5 (ENSMLUG00000005277) #21	TRUB2 (ENSMLUG00000005256)	COQ4 (ENSMLUG00000027662)	ENSMLUG00000024488 #22	URM1 (ENSMLUG00000007275) #26	CERCAM (ENSMLUG00000007289) #25	ODF2 (ENSMLUG00000007343)	ENSMLUG00000007379	SPTAN1 (ENSMLUG00000007420)	DYNC2I2 (ENSMLUG00000007516)	SET (ENSMLUG00000014291)	PKN3 (ENSMLUG00000014295)	ZDHHC12 (ENSMLUG00000014311)	ZER1 (ENSMLUG00000004608)	TBC1D13 (ENSMLUG00000014313)	ENDOG (ENSMLUG00000014319)	SPOUT1 (ENSMLUG00000014330)	KYAT1 (ENSMLUG00000014338)	LRRC8A (ENSMLUG00000011113)
Microbat	MODERN SPECIES	631																ENSMLUG00000007254 #22
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	3	ST6GALNAC4 (ENSRFEG00010016180)	PIP5KL1 (ENSRFEG00010016211)	ENSRFEG00010016446	EEIG1 (ENSRFEG00010016498)	NAIF1 (ENSRFEG00010016568)	SLC25A25 (ENSRFEG00010016612)	PTGES2 (ENSRFEG00010016829)	LCN2 (ENSRFEG00010016852)	ENSRFEG00010016891	CIZ1 (ENSRFEG00010016921)	DNM1 (ENSRFEG00010017078)	ENSRFEG00010017344	SWI5 (ENSRFEG00010017917) #21	TRUB2 (ENSRFEG00010017959)	COQ4 (ENSRFEG00010018061)	SLC27A4 (ENSRFEG00010018105) #22	ENSRFEG00010018219 #26	CERCAM (ENSRFEG00010018305) #25	ODF2 (ENSRFEG00010018422)	GLE1 (ENSRFEG00010019081)	SPTAN1 (ENSRFEG00010019570)	DYNC2I2 (ENSRFEG00010020990)	ENSRFEG00010021026	PKN3 (ENSRFEG00010021078)	ZDHHC12 (ENSRFEG00010021123)	ZER1 (ENSRFEG00010021150)	TBC1D13 (ENSRFEG00010021197)	ENDOG (ENSRFEG00010021222)	SPOUT1 (ENSRFEG00010021243)	KYAT1 (ENSRFEG00010021274)	LRRC8A (ENSRFEG00010021299)
Megabat	MODERN SPECIES	3427											DNM1 (ENSPVAG00000001220)	ENSPVAG00000001221	ENSPVAG00000001223 #21	TRUB2 (ENSPVAG00000001224)	COQ4 (ENSPVAG00000001225)	SLC27A4 (ENSPVAG00000001226) #22	URM1 (ENSPVAG00000001227) #26	CERCAM (ENSPVAG00000001228) #25
Equus	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633.c	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Donkey	MODERN SPECIES	1	ST6GALNAC4 (ENSEASG00005020423)	PIP5KL1 (ENSEASG00005038473)	DPM2 (ENSEASG00005037543)	EEIG1 (ENSEASG00005020409)	NAIF1 (ENSEASG00005020406)	SLC25A25 (ENSEASG00005020399)	PTGES2 (ENSEASG00005020397)	ENSEASG00005020393	ENSEASG00005025180	CIZ1 (ENSEASG00005020348)	DNM1 (ENSEASG00005017247)	ENSEASG00005016851	SWI5 (ENSEASG00005035203) #21	TRUB2 (ENSEASG00005016819)	COQ4 (ENSEASG00005016814)	SLC27A4 (ENSEASG00005016248) #22	URM1 (ENSEASG00005023786) #26	CERCAM (ENSEASG00005016174) #25	ENSEASG00005016167	ODF2 (ENSEASG00005015652)	GLE1 (ENSEASG00005015580)	SPTAN1 (ENSEASG00005008947)	DYNC2I2 (ENSEASG00005008429)	SET (ENSEASG00005008414)	ZDHHC12 (ENSEASG00005030221)	PKN3 (ENSEASG00005008409)	ZER1 (ENSEASG00005007785)	TBC1D13 (ENSEASG00005007723)	ENDOG (ENSEASG00005007720)	SPOUT1 (ENSEASG00005007715)	KYAT1 (ENSEASG00005007709)
Horse	MODERN SPECIES	17	ST6GALNAC4 (ENSECAG00000017908)	ENSECAG00000033762	PIP5KL1 (ENSECAG00000023069)	DPM2 (ENSECAG00000007086)	EEIG1 (ENSECAG00000007164)	NAIF1 (ENSECAG00000014827)	SLC25A25 (ENSECAG00000015267)	PTGES2 (ENSECAG00000016744)	LCN2 (ENSECAG00000020957)	BBLN (ENSECAG00000036564)	CIZ1 (ENSECAG00000007116)	DNM1 (ENSECAG00000022878)	ENSECAG00000000485	TRUB2 (ENSECAG00000023520)	COQ4 (ENSECAG00000048391)	SLC27A4 (ENSECAG00000011716) #22	ENSECAG00000054955 #26	CERCAM (ENSECAG00000013870) #25	ODF2 (ENSECAG00000011337)	GLE1 (ENSECAG00000010980)	SPTAN1 (ENSECAG00000021297)	DYNC2I2 (ENSECAG00000024224)	SET (ENSECAG00000009117)	PKN3 (ENSECAG00000017351)	ZDHHC12 (ENSECAG00000012555)	ZER1 (ENSECAG00000015821)	TBC1D13 (ENSECAG00000007916)	ENDOG (ENSECAG00000009809)	SPOUT1 (ENSECAG00000010177)	KYAT1 (ENSECAG00000022067)	LRRC8A (ENSECAG00000013359)
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214.b	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214.b	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891.e.a	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214.b	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891.e.a	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214.b	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891.e.a	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
American black bear	MODERN SPECIES	1431									DNM1 (ENSUAMG00000019851)	ENSUAMG00000020272	ENSUAMG00000020273	SWI5 (ENSUAMG00000020274) #21	ENSUAMG00000020275	TRUB2 (ENSUAMG00000020276)	COQ4 (ENSUAMG00000020277)	SLC27A4 (ENSUAMG00000020278) #22	URM1 (ENSUAMG00000020279) #26	CERCAM (ENSUAMG00000020282) #25
Polar bear	MODERN SPECIES	214	ST6GALNAC4 (ENSUMAG00000000098)	PIP5KL1 (ENSUMAG00000022740)	DPM2 (ENSUMAG00000022739)	EEIG1 (ENSUMAG00000022736)	NAIF1 (ENSUMAG00000022734)	SLC25A25 (ENSUMAG00000022731)	PTGES2 (ENSUMAG00000022728)	LCN2 (ENSUMAG00000022726)	ENSUMAG00000022724	CIZ1 (ENSUMAG00000022712)	DNM1 (ENSUMAG00000022221)	ENSUMAG00000022056	SWI5 (ENSUMAG00000022052) #21	TRUB2 (ENSUMAG00000022051)	COQ4 (ENSUMAG00000022047)	SLC27A4 (ENSUMAG00000022037) #22	URM1 (ENSUMAG00000022029) #26	CERCAM (ENSUMAG00000021989) #25	ODF2 (ENSUMAG00000021970)	GLE1 (ENSUMAG00000021966)	SPTAN1 (ENSUMAG00000021103)	DYNC2I2 (ENSUMAG00000020934)	SETSIP (ENSUMAG00000020906)	PKN3 (ENSUMAG00000020842)	ZDHHC12 (ENSUMAG00000020825)	ZER1 (ENSUMAG00000020644)	TBC1D13 (ENSUMAG00000020633)	SPOUT1 (ENSUMAG00000020628)	KYAT1 (ENSUMAG00000020623)	LRRC8A (ENSUMAG00000020617)	PHYHD1 (ENSUMAG00000020615)
Giant Panda	MODERN SPECIES	17	ST6GALNAC4 (ENSAMEG00000015173)	PIP5KL1 (ENSAMEG00000030609)	DPM2 (ENSAMEG00000015195)	EEIG1 (ENSAMEG00000015204)	NAIF1 (ENSAMEG00000015231)	SLC25A25 (ENSAMEG00000030211)	PTGES2 (ENSAMEG00000015234)	LCN2 (ENSAMEG00000015256)	BBLN (ENSAMEG00000015254)	CIZ1 (ENSAMEG00000015276)	DNM1 (ENSAMEG00000015306)	ENSAMEG00000015345	ENSAMEG00000015272 #21	TRUB2 (ENSAMEG00000027773)	COQ4 (ENSAMEG00000015413)	SLC27A4 (ENSAMEG00000015422) #22	ENSAMEG00000015446 #26	CERCAM (ENSAMEG00000015451) #25	ODF2 (ENSAMEG00000015487)	GLE1 (ENSAMEG00000015537)	SPTAN1 (ENSAMEG00000015563)	DYNC2I2 (ENSAMEG00000015673)	ENSAMEG00000015686	PKN3 (ENSAMEG00000015712)	ENSAMEG00000015755	ZER1 (ENSAMEG00000015759)	TBC1D13 (ENSAMEG00000023701)	SPOUT1 (ENSAMEG00000015808)	KYAT1 (ENSAMEG00000015821)	LRRC8A (ENSAMEG00000015843)	PHYHD1 (ENSAMEG00000015846)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214.b	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
American mink	MODERN SPECIES	182	ST6GALNAC4 (ENSNVIG00000010732)	PIP5KL1 (ENSNVIG00000010746)	DPM2 (ENSNVIG00000010761)	EEIG1 (ENSNVIG00000010779)	NAIF1 (ENSNVIG00000010803)	SLC25A25 (ENSNVIG00000010817)	PTGES2 (ENSNVIG00000010932)	LCN2 (ENSNVIG00000010965)	BBLN (ENSNVIG00000010986)	CIZ1 (ENSNVIG00000010993)	DNM1 (ENSNVIG00000011099)	ENSNVIG00000011157	SWI5 (ENSNVIG00000011167) #21	TRUB2 (ENSNVIG00000011171)	COQ4 (ENSNVIG00000011182)	SLC27A4 (ENSNVIG00000011209) #22	URM1 (ENSNVIG00000011267) #26	CERCAM (ENSNVIG00000011292) #25	ODF2 (ENSNVIG00000011382)	GLE1 (ENSNVIG00000012432)	SPTAN1 (ENSNVIG00000012859)	DYNC2I2 (ENSNVIG00000014869)	ENSNVIG00000014949	PKN3 (ENSNVIG00000015008)	ZDHHC12 (ENSNVIG00000015192)	ZER1 (ENSNVIG00000015266)	TBC1D13 (ENSNVIG00000015384)	ENDOG (ENSNVIG00000015703)	SPOUT1 (ENSNVIG00000015760)	KYAT1 (ENSNVIG00000015951)	LRRC8A (ENSNVIG00000016088)
Ferret	MODERN SPECIES	218	AK1 (ENSMPUG00000013556)	ST6GALNAC6 (ENSMPUG00000013554)	ST6GALNAC4 (ENSMPUG00000013550)	PIP5KL1 (ENSMPUG00000013531)	DPM2 (ENSMPUG00000013522)	EEIG1 (ENSMPUG00000013517)	NAIF1 (ENSMPUG00000013510)	SLC25A25 (ENSMPUG00000013468)	PTGES2 (ENSMPUG00000013464)	LCN2 (ENSMPUG00000013458)	CIZ1 (ENSMPUG00000013449)	DNM1 (ENSMPUG00000013224)	ENSMPUG00000013211	TRUB2 (ENSMPUG00000013206)	COQ4 (ENSMPUG00000013201)	SLC27A4 (ENSMPUG00000013194) #22	URM1 (ENSMPUG00000013184) #26	CERCAM (ENSMPUG00000013176) #25	ODF2 (ENSMPUG00000013167)	GLE1 (ENSMPUG00000013164)	SPTAN1 (ENSMPUG00000013143)	DYNC2I2 (ENSMPUG00000013139)	ENSMPUG00000013069	PKN3 (ENSMPUG00000013051)	ZDHHC12 (ENSMPUG00000013061)	ZER1 (ENSMPUG00000013041)	TBC1D13 (ENSMPUG00000013034)	ENDOG (ENSMPUG00000013024)	SPOUT1 (ENSMPUG00000013017)	KYAT1 (ENSMPUG00000013007)	LRRC8A (ENSMPUG00000012999)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214.b	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.a.b	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214.b	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00390000007640.b.e.b	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Dog	MODERN SPECIES	37	DPM2 (ENSCAFG00845005179)	FAM102A (ENSCAFG00845005171)	NAIF1 (ENSCAFG00845005167)	ENSCAFG00845005158	ENSCAFG00845005153	PTGES2 (ENSCAFG00845029789)	ENSCAFG00845029780	LCN2 (ENSCAFG00845029755)	C9H9orf16 (ENSCAFG00845029737)	CIZ1 (ENSCAFG00845029626)	DNM1 (ENSCAFG00845029334)	ENSCAFG00845029221	SWI5 (ENSCAFG00845029128) #21	TRUB2 (ENSCAFG00845029098)	COQ4 (ENSCAFG00845029077)	SLC27A4 (ENSCAFG00845029005) #22	URM1 (ENSCAFG00845028967) #26	CERCAM (ENSCAFG00845028899) #25	ENSCAFG00845028880	ODF2 (ENSCAFG00845028383)	GLE1 (ENSCAFG00845028068)	SPTAN1 (ENSCAFG00845027492)	DYNC2I2 (ENSCAFG00845027324)	SET (ENSCAFG00845026963)	PKN3 (ENSCAFG00845026684)	ZDHHC12 (ENSCAFG00845026605)	ZER1 (ENSCAFG00845026245)	TBC1D13 (ENSCAFG00845026099)	ENDOG (ENSCAFG00845026038)	SPOUT1 (ENSCAFG00845025964)	KYAT1 (ENSCAFG00845025617)
Dingo	MODERN SPECIES	327	PIP5KL1 (ENSCAFG00020015801)	DPM2 (ENSCAFG00020015802)	EEIG1 (ENSCAFG00020015803)	NAIF1 (ENSCAFG00020015805)	SLC25A25 (ENSCAFG00020015817)	PTGES2 (ENSCAFG00020016101)	ENSCAFG00020016102	LCN2 (ENSCAFG00020016105)	BBLN (ENSCAFG00020016109)	CIZ1 (ENSCAFG00020016118)	DNM1 (ENSCAFG00020016259)	ENSCAFG00020017105	ENSCAFG00020017306 #21	ENSCAFG00020017325	COQ4 (ENSCAFG00020017329)	SLC27A4 (ENSCAFG00020017369) #22	CERCAM (ENSCAFG00020018260) #25	ENSCAFG00020018866	ODF2 (ENSCAFG00020018928)	GLE1 (ENSCAFG00020019679)	SPTAN1 (ENSCAFG00020020094)	DYNC2I2 (ENSCAFG00020022810)	SET (ENSCAFG00020022819)	PKN3 (ENSCAFG00020022824)	ZDHHC12 (ENSCAFG00020022850)	ZER1 (ENSCAFG00020022864)	TBC1D13 (ENSCAFG00020022951)	ENDOG (ENSCAFG00020022974)	SPOUT1 (ENSCAFG00020022980)	KYAT1 (ENSCAFG00020022992)	LRRC8A (ENSCAFG00020022997)
Red fox	MODERN SPECIES	77	PIP5KL1 (ENSVVUG00000013350)	DPM2 (ENSVVUG00000013358)	FAM102A (ENSVVUG00000013364)	NAIF1 (ENSVVUG00000013368)	SLC25A25 (ENSVVUG00000013373)	PTGES2 (ENSVVUG00000013383)	ENSVVUG00000013385	LCN2 (ENSVVUG00000013386)	CUNH9orf16 (ENSVVUG00000013397)	CIZ1 (ENSVVUG00000013406)	DNM1 (ENSVVUG00000013412)	GOLGA2 (ENSVVUG00000013422)	SWI5 (ENSVVUG00000013444) #21	TRUB2 (ENSVVUG00000013451)	COQ4 (ENSVVUG00000013455)	SLC27A4 (ENSVVUG00000013463) #22	CERCAM (ENSVVUG00000013477) #25	ENSVVUG00000013489	ODF2 (ENSVVUG00000013549)	GLE1 (ENSVVUG00000015799)	ENSVVUG00000015936	SPTAN1 (ENSVVUG00000016542)	DYNC2I2 (ENSVVUG00000025620)	SET (ENSVVUG00000025637)	PKN3 (ENSVVUG00000025667)	ZDHHC12 (ENSVVUG00000025833)	ZER1 (ENSVVUG00000025838)	TBC1D13 (ENSVVUG00000025967)	ENDOG (ENSVVUG00000025998)	SPOUT1 (ENSVVUG00000025999)	KYAT1 (ENSVVUG00000026017)
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Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00910000147284	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00910000148123	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000154891.g.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00910000147284	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00910000148123	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Gibbon	MODERN SPECIES	23	ST6GALNAC4 (ENSNLEG00000026834)	PIP5KL1 (ENSNLEG00000017513)	ENSNLEG00000017516	EEIG1 (ENSNLEG00000017517)	NAIF1 (ENSNLEG00000017520)	SLC25A25 (ENSNLEG00000017522)	PTGES2 (ENSNLEG00000017529)	LCN2 (ENSNLEG00000027540)	BBLN (ENSNLEG00000017540)	CIZ1 (ENSNLEG00000017541)	DNM1 (ENSNLEG00000017543)	GOLGA2 (ENSNLEG00000017552)	ENSNLEG00000017555 #21	TRUB2 (ENSNLEG00000017556)	COQ4 (ENSNLEG00000017557)	SLC27A4 (ENSNLEG00000017562) #22	ENSNLEG00000031211 #26	CERCAM (ENSNLEG00000027773) #25	ENSNLEG00000017571	ODF2 (ENSNLEG00000017572)	GLE1 (ENSNLEG00000026659)	SPTAN1 (ENSNLEG00000017584)	DYNC2I2 (ENSNLEG00000017587)	ENSNLEG00000017595	PKN3 (ENSNLEG00000017597)	ZDHHC12 (ENSNLEG00000035415)	ZER1 (ENSNLEG00000017607)	TBC1D13 (ENSNLEG00000017611)	ENSNLEG00000017615	SPOUT1 (ENSNLEG00000017619)	ENSNLEG00000017629
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00910000147284	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00520000055649.a.j.b	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Orangutan	MODERN SPECIES	22	ENSPPYG00000019638	ENSPPYG00000030385	EEIG1 (ENSPPYG00000019639)	NAIF1 (ENSPPYG00000019640)	SLC25A25 (ENSPPYG00000019641)	PTGES2 (ENSPPYG00000019642)	ENSPPYG00000019643	ENSPPYG00000041461	CIZ1 (ENSPPYG00000019645)	DNM1 (ENSPPYG00000019646)	GOLGA2 (ENSPPYG00000019647)	ENSPPYG00000019648 #21	ENSPPYG00000034385	TRUB2 (ENSPPYG00000019650)	COQ4 (ENSPPYG00000019651)	SLC27A4 (ENSPPYG00000019652) #22	ENSPPYG00000034351 #26	CERCAM (ENSPPYG00000019653) #25	ODF2 (ENSPPYG00000019655)	GLE1 (ENSPPYG00000019656)	SPTAN1 (ENSPPYG00000019657)	DYNC2I2 (ENSPPYG00000019658)	ENSPPYG00000019659	PKN3 (ENSPPYG00000029746)	ENSPPYG00000019660	ZER1 (ENSPPYG00000019661)	TBC1D13 (ENSPPYG00000019662)	ENDOG (ENSPPYG00000031616)	ENSPPYG00000019664	ENSPPYG00000019665	LRRC8A (ENSPPYG00000019666)
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00520000055649.a.j.b	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Gorilla	MODERN SPECIES	22	PIP5KL1 (ENSGGOG00000002539)	ENSGGOG00000014688	EEIG1 (ENSGGOG00000014692)	NAIF1 (ENSGGOG00000011178)	SLC25A25 (ENSGGOG00000013681)	PTGES2 (ENSGGOG00000013692)	LCN2 (ENSGGOG00000014990)	BBLN (ENSGGOG00000025371)	CIZ1 (ENSGGOG00000014999)	ENSGGOG00000016836	ENSGGOG00000039478	GOLGA2 (ENSGGOG00000023870)	ENSGGOG00000028061 #21	TRUB2 (ENSGGOG00000014780)	COQ4 (ENSGGOG00000014789)	SLC27A4 (ENSGGOG00000014793) #22	URM1 (ENSGGOG00000014806) #26	CERCAM (ENSGGOG00000005019) #25	ODF2 (ENSGGOG00000001354)	GLE1 (ENSGGOG00000001356)	SPTAN1 (ENSGGOG00000007615)	DYNC2I2 (ENSGGOG00000007643)	ENSGGOG00000025716	PKN3 (ENSGGOG00000011365)	ZDHHC12 (ENSGGOG00000011375)	ZER1 (ENSGGOG00000012363)	TBC1D13 (ENSGGOG00000003145)	ENDOG (ENSGGOG00000014224)	SPOUT1 (ENSGGOG00000014228)	KYAT1 (ENSGGOG00000007427)	LRRC8A (ENSGGOG00000017010)
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00520000055649.a.j.b	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Human	MODERN SPECIES	21	ST6GALNAC4 (ENSG00000136840)	PIP5KL1 (ENSG00000167103)	DPM2 (ENSG00000136908)	EEIG1 (ENSG00000167106)	NAIF1 (ENSG00000171169)	SLC25A25 (ENSG00000148339)	PTGES2 (ENSG00000148334)	LCN2 (ENSG00000148346)	BBLN (ENSG00000171159)	CIZ1 (ENSG00000148337)	DNM1 (ENSG00000106976)	GOLGA2 (ENSG00000167110)	SWI5 (ENSG00000175854) #21	TRUB2 (ENSG00000167112)	COQ4 (ENSG00000167113)	SLC27A4 (ENSG00000167114) #22	URM1 (ENSG00000167118) #26	CERCAM (ENSG00000167123) #25	ODF2 (ENSG00000136811)	GLE1 (ENSG00000119392)	SPTAN1 (ENSG00000197694)	DYNC2I2 (ENSG00000119333)	SET (ENSG00000119335)	PKN3 (ENSG00000160447)	ZDHHC12 (ENSG00000160446)	ZER1 (ENSG00000160445)	TBC1D13 (ENSG00000107021)	ENDOG (ENSG00000167136)	SPOUT1 (ENSG00000198917)	ENSG00000286112	KYAT1 (ENSG00000171097)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b.a	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00520000055649.a.j.b	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Bonobo	MODERN SPECIES	22	ST6GALNAC4 (ENSPPAG00000040986)	PIP5KL1 (ENSPPAG00000032832)	ENSPPAG00000042177	EEIG1 (ENSPPAG00000041705)	NAIF1 (ENSPPAG00000029010)	SLC25A25 (ENSPPAG00000025581)	PTGES2 (ENSPPAG00000026594)	LCN2 (ENSPPAG00000026663)	BBLN (ENSPPAG00000026511)	CIZ1 (ENSPPAG00000030730)	DNM1 (ENSPPAG00000034098)	GOLGA2 (ENSPPAG00000038869)	ENSPPAG00000032486 #21	TRUB2 (ENSPPAG00000043146)	COQ4 (ENSPPAG00000035816)	SLC27A4 (ENSPPAG00000041626) #22	ENSPPAG00000030946 #26	CERCAM (ENSPPAG00000027908) #25	ENSPPAG00000033698	ODF2 (ENSPPAG00000033159)	GLE1 (ENSPPAG00000033580)	SPTAN1 (ENSPPAG00000036825)	DYNC2I2 (ENSPPAG00000028057)	ENSPPAG00000028813	PKN3 (ENSPPAG00000043402)	ZDHHC12 (ENSPPAG00000039041)	ZER1 (ENSPPAG00000033759)	TBC1D13 (ENSPPAG00000014377)	ENSPPAG00000041190	SPOUT1 (ENSPPAG00000001094)	KYAT1 (ENSPPAG00000036497)
Chimpanzee	DUPLICATION
Chimpanzee	MODERN SPECIES	670					NAIF1 (ENSPTRG00000047413)	ENSPTRG00000043901	PTGES2 (ENSPTRG00000048759)	ENSPTRG00000050396	ENSPTRG00000048462	ENSPTRG00000045021	ENSPTRG00000051673	ENSPTRG00000050745	ENSPTRG00000051871 #21	ENSPTRG00000052151	COQ4 (ENSPTRG00000042689)	ENSPTRG00000048440 #22	ENSPTRG00000043547
Chimpanzee	MODERN SPECIES	22	ST6GALNAC4 (ENSPTRG00000021404)	PIP5KL1 (ENSPTRG00000021405)	DPM2 (ENSPTRG00000021406)	EEIG1 (ENSPTRG00000029085)	ENSPTRG00000045521	SLC25A25 (ENSPTRG00000021410)	PTGES2 (ENSPTRG00000021411)	LCN2 (ENSPTRG00000021412)	BBLN (ENSPTRG00000021413)	ENSPTRG00000051341	DNM1 (ENSPTRG00000021418)	GOLGA2 (ENSPTRG00000021419)	SWI5 (ENSPTRG00000021421) #21	TRUB2 (ENSPTRG00000021423)	COQ4 (ENSPTRG00000021424)	SLC27A4 (ENSPTRG00000021425) #22	URM1 (ENSPTRG00000021427) #26	CERCAM (ENSPTRG00000021429) #25	ODF2 (ENSPTRG00000021430)	GLE1 (ENSPTRG00000021431)	SPTAN1 (ENSPTRG00000021433)	DYNC2I2 (ENSPTRG00000021435)	SET (ENSPTRG00000021436)	PKN3 (ENSPTRG00000021437)	ZDHHC12 (ENSPTRG00000021438)	ZER1 (ENSPTRG00000021439)	TBC1D13 (ENSPTRG00000021440)	ENDOG (ENSPTRG00000029057)	SPOUT1 (ENSPTRG00000023427)	KYAT1 (ENSPTRG00000021442)	LRRC8A (ENSPTRG00000021443)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00910000147284	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00910000148123	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891.g.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00910000147284	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00910000148123	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891.g.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	3	ST6GALNAC4 (ENSCSAG00000013938)	PIP5KL1 (ENSCSAG00000013955)	DPM2 (ENSCSAG00000013972)	EEIG1 (ENSCSAG00000013980)	NAIF1 (ENSCSAG00000013989)	SLC25A25 (ENSCSAG00000013992)	PTGES2 (ENSCSAG00000014017)	LCN2 (ENSCSAG00000014039)	ENSCSAG00000014048	CIZ1 (ENSCSAG00000014060)	DNM1 (ENSCSAG00000014071)	GOLGA2 (ENSCSAG00000014092)	SWI5 (ENSCSAG00000014101) #21	TRUB2 (ENSCSAG00000014117)	ENSCSAG00000014139	SLC27A4 (ENSCSAG00000014184) #22	URM1 (ENSCSAG00000014200) #26	CERCAM (ENSCSAG00000014210) #25	ODF2 (ENSCSAG00000014217)	GLE1 (ENSCSAG00000014225)	SPTAN1 (ENSCSAG00000014277)	DYNC2I2 (ENSCSAG00000014303)	PKN3 (ENSCSAG00000014351)	ZDHHC12 (ENSCSAG00000014378)	ZER1 (ENSCSAG00000014389)	TBC1D13 (ENSCSAG00000014420)	ENDOG (ENSCSAG00000014436)	KYAT1 (ENSCSAG00000014449)	LRRC8A (ENSCSAG00000014458)	PHYHD1 (ENSCSAG00000014469)	DOLK (ENSCSAG00000019710)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000001098	ENSGT00910000147284	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00990000205037.a	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00910000148123	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891.g.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349.h #21	ENSGT00990000205037.a	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00910000148123	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891.g.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	317	DPM2 (ENSMNEG00000033702)	EEIG1 (ENSMNEG00000036342)	ENSMNEG00000038978	NAIF1 (ENSMNEG00000044950)	SLC25A25 (ENSMNEG00000043707)	PTGES2 (ENSMNEG00000043945)	LCN2 (ENSMNEG00000041872)	ENSMNEG00000033466	CIZ1 (ENSMNEG00000041837)	DNM1 (ENSMNEG00000033192)	GOLGA2 (ENSMNEG00000030926)	ENSMNEG00000038127 #21	ENSMNEG00000024605	TRUB2 (ENSMNEG00000011189)	COQ4 (ENSMNEG00000034390)	SLC27A4 (ENSMNEG00000036914) #22	ENSMNEG00000045304	CERCAM (ENSMNEG00000041383) #25	ODF2 (ENSMNEG00000030817)	GLE1 (ENSMNEG00000035668)	SPTAN1 (ENSMNEG00000032010)	DYNC2I2 (ENSMNEG00000026539)	ENSMNEG00000030324	PKN3 (ENSMNEG00000036073)	ZDHHC12 (ENSMNEG00000030634)	ZER1 (ENSMNEG00000027302)	TBC1D13 (ENSMNEG00000041058)	ENDOG (ENSMNEG00000030787)	SPOUT1 (ENSMNEG00000042898)	KYAT1 (ENSMNEG00000031327)	LRRC8A (ENSMNEG00000030674)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349.h #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00910000148123	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891.g.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Rhesus	MODERN SPECIES	6	ENSMMUG00000052825	PIP5KL1 (ENSMMUG00000031631)	DPM2 (ENSMMUG00000014374)	EEIG1 (ENSMMUG00000014375)	NAIF1 (ENSMMUG00000004685)	SLC25A25 (ENSMMUG00000021833)	PTGES2 (ENSMMUG00000018258)	LCN2 (ENSMMUG00000023801)	BBLN (ENSMMUG00000032017)	CIZ1 (ENSMMUG00000013712)	DNM1 (ENSMMUG00000013717)	GOLGA2 (ENSMMUG00000022967)	ENSMMUG00000004865 #21	TRUB2 (ENSMMUG00000014146)	COQ4 (ENSMMUG00000014147)	SLC27A4 (ENSMMUG00000014148) #22	URM1 (ENSMMUG00000018612) #26	ENSMMUG00000044236	ENSMMUG00000032020 #25	ODF2 (ENSMMUG00000005987)	GLE1 (ENSMMUG00000005989)	SPTAN1 (ENSMMUG00000009327)	DYNC2I2 (ENSMMUG00000009333)	ENSMMUG00000038373	PKN3 (ENSMMUG00000010143)	ZDHHC12 (ENSMMUG00000041713)	ZER1 (ENSMMUG00000010870)	TBC1D13 (ENSMMUG00000019179)	ENSMMUG00000047511	ENSMMUG00000021848	LRRC8A (ENSMMUG00000017799)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	6	CFAP157 (ENSMFAG00000027410) #24	PTRH1 (ENSMFAG00000001700) #23	TTC16 (ENSMFAG00000042412)	SH2D3C (ENSMFAG00000000671) #28	ENSMFAG00000057443	CDK9 (ENSMFAG00000033992)	FPGS (ENSMFAG00000030927)	ENG (ENSMFAG00000034473)	AK1 (ENSMFAG00000032155)	ST6GALNAC6 (ENSMFAG00000053975)	DNM1 (ENSMFAG00000030581)	GOLGA2 (ENSMFAG00000044527)	ENSMFAG00000031210 #21	TRUB2 (ENSMFAG00000000881)	COQ4 (ENSMFAG00000039955)	SLC27A4 (ENSMFAG00000032514) #22	URM1 (ENSMFAG00000035214) #26	CERCAM (ENSMFAG00000001783) #25	ENSMFAG00000034501	ODF2 (ENSMFAG00000001606)	GLE1 (ENSMFAG00000036995)	SPTAN1 (ENSMFAG00000044099)	DYNC2I2 (ENSMFAG00000042393)	ENSMFAG00000002535	ZDHHC12 (ENSMFAG00000002386)	ZER1 (ENSMFAG00000040364)	TBC1D13 (ENSMFAG00000033076)	SPOUT1 (ENSMFAG00000016739)	ENSMFAG00000065292	KYAT1 (ENSMFAG00000001847)	ENSMFAG00000034348
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000001098	ENSGT00910000147284	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00990000205037.a	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00910000148123	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891.g.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Olive baboon	MODERN SPECIES	4	ST6GALNAC4 (ENSPANG00000024840)	PIP5KL1 (ENSPANG00000024839)	DPM2 (ENSPANG00000024838)	EEIG1 (ENSPANG00000024837)	ENSPANG00000024836	SLC25A25 (ENSPANG00000024867)	PTGES2 (ENSPANG00000024868)	LCN2 (ENSPANG00000024869)	ENSPANG00000037463	CIZ1 (ENSPANG00000024871)	DNM1 (ENSPANG00000025859)	GOLGA2 (ENSPANG00000025858)	SWI5 (ENSPANG00000025857) #21	TRUB2 (ENSPANG00000025856)	COQ4 (ENSPANG00000031182)	SLC27A4 (ENSPANG00000025877) #22	CERCAM (ENSPANG00000025881) #25	ODF2 (ENSPANG00000025879)	SPTAN1 (ENSPANG00000025894)	DYNC2I2 (ENSPANG00000025902)	ENSPANG00000025900	PKN3 (ENSPANG00000025897)	ZDHHC12 (ENSPANG00000035442)	ZER1 (ENSPANG00000025924)	TBC1D13 (ENSPANG00000025925)	ENDOG (ENSPANG00000025933)	SPOUT1 (ENSPANG00000025932)	KYAT1 (ENSPANG00000025931)	ENSPANG00000037244	LRRC8A (ENSPANG00000025930)	DOLK (ENSPANG00000003223)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00390000001098	ENSGT00910000147284	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00990000205037.a	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00910000148123	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891.g.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Drill	MODERN SPECIES	149	DPM2 (ENSMLEG00000034313)	ENSMLEG00000010567	EEIG1 (ENSMLEG00000043441)	NAIF1 (ENSMLEG00000035808)	SLC25A25 (ENSMLEG00000028079)	ENSMLEG00000040301	LCN2 (ENSMLEG00000035283)	BBLN (ENSMLEG00000036489)	CIZ1 (ENSMLEG00000035347)	DNM1 (ENSMLEG00000032695)	GOLGA2 (ENSMLEG00000033003)	SWI5 (ENSMLEG00000039820) #21	ENSMLEG00000016595	TRUB2 (ENSMLEG00000037270)	ENSMLEG00000030345	SLC27A4 (ENSMLEG00000033402) #22	URM1 (ENSMLEG00000028542) #26	CERCAM (ENSMLEG00000031817) #25	ENSMLEG00000028698	ODF2 (ENSMLEG00000030672)	GLE1 (ENSMLEG00000008252)	SPTAN1 (ENSMLEG00000042249)	DYNC2I2 (ENSMLEG00000042138)	ENSMLEG00000034568	PKN3 (ENSMLEG00000033963)	ZDHHC12 (ENSMLEG00000028249)	ZER1 (ENSMLEG00000042610)	TBC1D13 (ENSMLEG00000021631)	SPOUT1 (ENSMLEG00000028562)	KYAT1 (ENSMLEG00000043087)	LRRC8A (ENSMLEG00000031337)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	489	PIP5KL1 (ENSCATG00000029202)	DPM2 (ENSCATG00000039659)	ENSCATG00000018240	EEIG1 (ENSCATG00000039459)	NAIF1 (ENSCATG00000028502)	SLC25A25 (ENSCATG00000038464)	PTGES2 (ENSCATG00000041852)	LCN2 (ENSCATG00000035627)	BBLN (ENSCATG00000038245)	CIZ1 (ENSCATG00000034742)	DNM1 (ENSCATG00000043297)	GOLGA2 (ENSCATG00000009434)	SWI5 (ENSCATG00000037395) #21	TRUB2 (ENSCATG00000038234)	COQ4 (ENSCATG00000030060)	SLC27A4 (ENSCATG00000009907) #22	URM1 (ENSCATG00000033068) #26	CERCAM (ENSCATG00000032420) #25	ENSCATG00000036786	ODF2 (ENSCATG00000014651)	GLE1 (ENSCATG00000038445)	SPTAN1 (ENSCATG00000037805)	DYNC2I2 (ENSCATG00000036415)	ENSCATG00000020414	PKN3 (ENSCATG00000036821)	ZDHHC12 (ENSCATG00000019181)	ZER1 (ENSCATG00000037539)	TBC1D13 (ENSCATG00000044380)	ENDOG (ENSCATG00000037516)	SPOUT1 (ENSCATG00000042611)	KYAT1 (ENSCATG00000043522)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00910000147284	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT01050000246974	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891.g.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1385					NAIF1 (ENSRBIG00000036338)	SLC25A25 (ENSRBIG00000030028)	PTGES2 (ENSRBIG00000031136)	LCN2 (ENSRBIG00000039567)	BBLN (ENSRBIG00000029444)	CIZ1 (ENSRBIG00000034423)	DNM1 (ENSRBIG00000040479)	GOLGA2 (ENSRBIG00000036440)	ENSRBIG00000044787	TRUB2 (ENSRBIG00000006965)	COQ4 (ENSRBIG00000030655)	SLC27A4 (ENSRBIG00000033765) #22	URM1 (ENSRBIG00000041054) #26	CERCAM (ENSRBIG00000028951) #25	ODF2 (ENSRBIG00000026905)	GLE1 (ENSRBIG00000036689)	SPTAN1 (ENSRBIG00000044761)	DYNC2I2 (ENSRBIG00000033189)	ENSRBIG00000043093	PKN3 (ENSRBIG00000033884)	ZDHHC12 (ENSRBIG00000029977)	ZER1 (ENSRBIG00000022292)	TBC1D13 (ENSRBIG00000039606)	ENDOG (ENSRBIG00000026558)	SPOUT1 (ENSRBIG00000026633)	KYAT1 (ENSRBIG00000030782)	LRRC8A (ENSRBIG00000036375)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2461														TRUB2 (ENSRROG00000042928)	COQ4 (ENSRROG00000040672)	SLC27A4 (ENSRROG00000041174) #22
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224.o	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00390000013732.n	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a.c	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224.o	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00390000013732.n	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a.c	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	68	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224.o	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.c.b	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00390000013732.n	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a.c	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	172	PIP5KL1 (ENSSBOG00000025236)	DPM2 (ENSSBOG00000034361)	EEIG1 (ENSSBOG00000031222)	NAIF1 (ENSSBOG00000034718)	SLC25A25 (ENSSBOG00000022563)	ENSSBOG00000012374	LCN2 (ENSSBOG00000030874)	BBLN (ENSSBOG00000022463)	CIZ1 (ENSSBOG00000030332)	DNM1 (ENSSBOG00000019066)	GOLGA2 (ENSSBOG00000031355)	ENSSBOG00000033092 #21	ENSSBOG00000029825	TRUB2 (ENSSBOG00000022439)	COQ4 (ENSSBOG00000027199)	SLC27A4 (ENSSBOG00000035075) #22	URM1 (ENSSBOG00000030293) #26	CERCAM (ENSSBOG00000028939) #25	ENSSBOG00000033778	GLE1 (ENSSBOG00000020790)	SPTAN1 (ENSSBOG00000027442)	DYNC2I2 (ENSSBOG00000012533)
Capuchin	MODERN SPECIES	216	PIP5KL1 (ENSCCAG00000027903)	DPM2 (ENSCCAG00000021951)	FAM102A (ENSCCAG00000030993)	NAIF1 (ENSCCAG00000032986)	SLC25A25 (ENSCCAG00000024589)	PTGES2 (ENSCCAG00000036490)	LCN2 (ENSCCAG00000023292)	BBLN (ENSCCAG00000031582)	CIZ1 (ENSCCAG00000026440)	DNM1 (ENSCCAG00000029047)	GOLGA2 (ENSCCAG00000037988)	SWI5 (ENSCCAG00000019891) #21	MRI1 (ENSCCAG00000035484)	ENSCCAG00000026531	COQ4 (ENSCCAG00000023041)	SLC27A4 (ENSCCAG00000030812) #22	URM1 (ENSCCAG00000032510) #26	CERCAM (ENSCCAG00000003920) #25	ODF2 (ENSCCAG00000011357)	GLE1 (ENSCCAG00000034829)	SPTAN1 (ENSCCAG00000029377)	DYNC2I2 (ENSCCAG00000032802)
Marmoset	MODERN SPECIES		ST6GALNAC4 (ENSCJAG00000055323)	PIP5KL1 (ENSCJAG00000019915)	DPM2 (ENSCJAG00000069981)	EEIG1 (ENSCJAG00000019920)	NAIF1 (ENSCJAG00000047246)	SLC25A25 (ENSCJAG00000019924)	PTGES2 (ENSCJAG00000019932)	ENSCJAG00000019936	ENSCJAG00000057951	CIZ1 (ENSCJAG00000019948)	DNM1 (ENSCJAG00000019967)	GOLGA2 (ENSCJAG00000019995)	SWI5 (ENSCJAG00000019842) #21	TRUB2 (ENSCJAG00000020009)	COQ4 (ENSCJAG00000020013)	SLC27A4 (ENSCJAG00000020016) #22	URM1 (ENSCJAG00000020036) #26	CERCAM (ENSCJAG00000043652) #25	ODF2 (ENSCJAG00000020042)	GLE1 (ENSCJAG00000020060)	SPTAN1 (ENSCJAG00000020080)	DYNC2I2 (ENSCJAG00000020157)	ENSCJAG00000047551	PKN3 (ENSCJAG00000020165)	ZDHHC12 (ENSCJAG00000020184)	ZER1 (ENSCJAG00000020189)	TBC1D13 (ENSCJAG00000020207)	ENDOG (ENSCJAG00000020220)	SPOUT1 (ENSCJAG00000020221)	KYAT1 (ENSCJAG00000020240)	LRRC8A (ENSCJAG00000020246)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	768	ST6GALNAC6 (ENSANAG00000026734)	ST6GALNAC4 (ENSANAG00000003837)	PIP5KL1 (ENSANAG00000030544)	EEIG1 (ENSANAG00000037837)	NAIF1 (ENSANAG00000030108)	SLC25A25 (ENSANAG00000033704)	ENSANAG00000035454	CIZ1 (ENSANAG00000037943)	BBLN (ENSANAG00000037388)	DNM1 (ENSANAG00000027575)	GOLGA2 (ENSANAG00000020766)	SWI5 (ENSANAG00000032755) #21	ENSANAG00000035382	TRUB2 (ENSANAG00000036234)	ENSANAG00000022859	SLC27A4 (ENSANAG00000024035) #22	URM1 (ENSANAG00000036717) #26	CERCAM (ENSANAG00000019980) #25	ENSANAG00000034620	GLE1 (ENSANAG00000031688)	SPTAN1 (ENSANAG00000032080)	DYNC2I2 (ENSANAG00000027697)	ENSANAG00000025517	PKN3 (ENSANAG00000034145)	ZDHHC12 (ENSANAG00000035881)	ZER1 (ENSANAG00000029586)	TBC1D13 (ENSANAG00000036964)	SPOUT1 (ENSANAG00000036350)	KYAT1 (ENSANAG00000034498)	LRRC8A (ENSANAG00000035694)	PHYHD1 (ENSANAG00000036355)
Tarsier	MODERN SPECIES	4886												ENSTSYG00000030250	SWI5 (ENSTSYG00000031853) #21	TRUB2 (ENSTSYG00000034163)	COQ4 (ENSTSYG00000025423)	SLC27A4 (ENSTSYG00000002947) #22	URM1 (ENSTSYG00000028376) #26	CERCAM (ENSTSYG00000037274) #25	ODF2 (ENSTSYG00000013920)	GLE1 (ENSTSYG00000000174)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	168	ST6GALNAC4 (ENSPCOG00000023201)	PIP5KL1 (ENSPCOG00000021126)	DPM2 (ENSPCOG00000014607)	EEIG1 (ENSPCOG00000024116)	NAIF1 (ENSPCOG00000021257)	SLC25A25 (ENSPCOG00000019986)	PTGES2 (ENSPCOG00000009389)	LCN2 (ENSPCOG00000013905)	BBLN (ENSPCOG00000026958)	CIZ1 (ENSPCOG00000027303)	DNM1 (ENSPCOG00000026903)	ENSPCOG00000015095	ENSPCOG00000018443 #21	TRUB2 (ENSPCOG00000017100)	COQ4 (ENSPCOG00000019590)	SLC27A4 (ENSPCOG00000013531) #22	URM1 (ENSPCOG00000021449) #26	CERCAM (ENSPCOG00000018228) #25	ODF2 (ENSPCOG00000025698)	GLE1 (ENSPCOG00000017042)	SPTAN1 (ENSPCOG00000027155)	DYNC2I2 (ENSPCOG00000014797)	SET (ENSPCOG00000025517)	PKN3 (ENSPCOG00000027227)	ZDHHC12 (ENSPCOG00000014328)	ZER1 (ENSPCOG00000027080)	TBC1D13 (ENSPCOG00000016027)	ENDOG (ENSPCOG00000022447)	SPOUT1 (ENSPCOG00000002584)	KYAT1 (ENSPCOG00000025020)	LRRC8A (ENSPCOG00000014012)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	1052	PIP5KL1 (ENSPSMG00000008071)	DPM2 (ENSPSMG00000008051)	EEIG1 (ENSPSMG00000008044)	NAIF1 (ENSPSMG00000008022)	SLC25A25 (ENSPSMG00000007935)	PTGES2 (ENSPSMG00000007775)	LCN2 (ENSPSMG00000007755)	ENSPSMG00000007750	CIZ1 (ENSPSMG00000007658)	DNM1 (ENSPSMG00000006303)	ENSPSMG00000005857	SWI5 (ENSPSMG00000005851) #21	ENSPSMG00000005840	TRUB2 (ENSPSMG00000005835)	COQ4 (ENSPSMG00000005821)	SLC27A4 (ENSPSMG00000005787) #22	URM1 (ENSPSMG00000005739) #26	CERCAM (ENSPSMG00000005710) #25	ODF2 (ENSPSMG00000004808)	GLE1 (ENSPSMG00000004083)	SPTAN1 (ENSPSMG00000002236)	DYNC2I2 (ENSPSMG00000000885)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	1	ST6GALNAC4 (ENSMICG00000005710)	PIP5KL1 (ENSMICG00000005716)	DPM2 (ENSMICG00000027642)	EEIG1 (ENSMICG00000012755)	NAIF1 (ENSMICG00000034966)	SLC25A25 (ENSMICG00000012781)	PTGES2 (ENSMICG00000009604)	LCN2 (ENSMICG00000003402)	BBLN (ENSMICG00000046320)	CIZ1 (ENSMICG00000003411)	DNM1 (ENSMICG00000003416)	ENSMICG00000036450	SWI5 (ENSMICG00000003457) #21	TRUB2 (ENSMICG00000047032)	COQ4 (ENSMICG00000017636)	SLC27A4 (ENSMICG00000017637) #22	URM1 (ENSMICG00000042967) #26	CERCAM (ENSMICG00000043310) #25	ENSMICG00000045086	ODF2 (ENSMICG00000017639)	ENSMICG00000017640	SPTAN1 (ENSMICG00000017641)	DYNC2I2 (ENSMICG00000017642)	ENSMICG00000017643	PKN3 (ENSMICG00000017644)	ZDHHC12 (ENSMICG00000017645)	ZER1 (ENSMICG00000017646)	TBC1D13 (ENSMICG00000017647)	ENDOG (ENSMICG00000017648)	SPOUT1 (ENSMICG00000017649)	KYAT1 (ENSMICG00000014042)
Bushbaby	MODERN SPECIES	129	ST6GALNAC6 (ENSOGAG00000008127)	ST6GALNAC4 (ENSOGAG00000008130)	PIP5KL1 (ENSOGAG00000008135)	DPM2 (ENSOGAG00000008144)	EEIG1 (ENSOGAG00000027186)	NAIF1 (ENSOGAG00000031498)	SLC25A25 (ENSOGAG00000011032)	PTGES2 (ENSOGAG00000011029)	LCN2 (ENSOGAG00000033111)	BBLN (ENSOGAG00000027273)	CIZ1 (ENSOGAG00000013198)	DNM1 (ENSOGAG00000003491)	ENSOGAG00000003499	ENSOGAG00000003511	COQ4 (ENSOGAG00000003512)	SLC27A4 (ENSOGAG00000001440) #22	URM1 (ENSOGAG00000001445) #26	CERCAM (ENSOGAG00000001447) #25	ODF2 (ENSOGAG00000001450)	GLE1 (ENSOGAG00000001452)	SPTAN1 (ENSOGAG00000006481)	DYNC2I2 (ENSOGAG00000006495)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Tree shrew	MODERN SPECIES	3478														TRUB2 (ENSTBEG00000000586)	COQ4 (ENSTBEG00000000768)	SLC27A4 (ENSTBEG00000001186) #22	URM1 (ENSTBEG00000002675) #26	ENSTBEG00000003349 #25
Glires	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b
Pika	MODERN SPECIES	8515												ENSOPRG00000001908	ENSOPRG00000001954 #21	TRUB2 (ENSOPRG00000001981)	COQ4 (ENSOPRG00000002001)	SLC27A4 (ENSOPRG00000002022) #22	URM1 (ENSOPRG00000002058) #26
Rabbit	MODERN SPECIES	580	ST6GALNAC4 (ENSOCUG00000020994)	PIP5KL1 (ENSOCUG00000026071)	ENSOCUG00000026664	EEIG1 (ENSOCUG00000024612)	NAIF1 (ENSOCUG00000013385)	ENSOCUG00000026400	SLC25A25 (ENSOCUG00000007130)	LCN2 (ENSOCUG00000021002)	CIZ1 (ENSOCUG00000015985)	DNM1 (ENSOCUG00000012908)	ENSOCUG00000015982	ENSOCUG00000012923	SWI5 (ENSOCUG00000005318) #21	ENSOCUG00000026296	ENSOCUG00000016196	SLC27A4 (ENSOCUG00000008838) #22	URM1 (ENSOCUG00000008848) #26	ENSOCUG00000008855 #25	ODF2 (ENSOCUG00000012298)	GLE1 (ENSOCUG00000012314)	DYNC2I2 (ENSOCUG00000012360)	ENSOCUG00000007501	SPTAN1 (ENSOCUG00000012332)
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000154891	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007746	ENSGT00940000161613	ENSGT00390000011873	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000160428	ENSGT00390000014476	ENSGT00940000159729	ENSGT00940000160918	ENSGT00940000153601.a.a	ENSGT00390000012207	ENSGT00940000156235	ENSGT00940000163383	ENSGT01090000260597	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000154891	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007746	ENSGT00940000161613	ENSGT00390000011873	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000160428	ENSGT00390000014476	ENSGT00940000159729	ENSGT00940000160918	ENSGT00940000153601.a.a	ENSGT00390000012207	ENSGT00940000156235	ENSGT00940000163383	ENSGT01090000260597	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT00960000190071	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000007746	ENSGT00940000161613	ENSGT00390000011873	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000160428	ENSGT00390000014476	ENSGT00940000159729	ENSGT00940000160918	ENSGT00940000153601.a.a	ENSGT00390000012207	ENSGT00940000156235	ENSGT00940000163383	ENSGT01090000260597	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT00960000190071	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000007746	ENSGT00940000161613	ENSGT00390000011873	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000160428	ENSGT00390000014476	ENSGT00940000159729	ENSGT00940000160918	ENSGT00940000153601.a.a	ENSGT00390000012207	ENSGT00940000156235	ENSGT00940000163383	ENSGT01090000260597	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT00960000190071	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	17	Ak8 (ENSPEMG00000018744)	Gtf3c4 (ENSPEMG00000002789)	Ddx31 (ENSPEMG00000014798)	Barhl1 (ENSPEMG00000026128)	ENSPEMG00000025570	Cfap77 (ENSPEMG00000013789)	Ttf1 (ENSPEMG00000012727)	Setx (ENSPEMG00000000875)	Ntng2 (ENSPEMG00000011411)	Med27 (ENSPEMG00000009323)	Rapgef1 (ENSPEMG00000016265)	Gm13420 (ENSPEMG00000011970)	ENSPEMG00000018841	Trub2 (ENSPEMG00000017893)	Coq4 (ENSPEMG00000012677)	Slc27a4 (ENSPEMG00000008880) #22	Urm1 (ENSPEMG00000024350) #26	ENSPEMG00000027904	Cercam (ENSPEMG00000010584) #25	Odf2 (ENSPEMG00000017544)	ENSPEMG00000011251	Sptan1 (ENSPEMG00000016609)	Dync2i2 (ENSPEMG00000009337)	Set (ENSPEMG00000017351)	Pkn3 (ENSPEMG00000018700)	Zdhhc12 (ENSPEMG00000016258)	Zer1 (ENSPEMG00000012817)	ENSPEMG00000028798	Tbc1d13 (ENSPEMG00000012254)	Endog (ENSPEMG00000011395)	Spout1 (ENSPEMG00000009348)
Prairie vole	MODERN SPECIES	12	Ak8 (ENSMOCG00000015262)	Gtf3c4 (ENSMOCG00000011365)	Ddx31 (ENSMOCG00000020938)	Barhl1 (ENSMOCG00000013749)	Cfap77 (ENSMOCG00000010524)	Ttf1 (ENSMOCG00000022131)	Setx (ENSMOCG00000000848)	Ntng2 (ENSMOCG00000007465)	Med27 (ENSMOCG00000001125)	ENSMOCG00000001471	Rapgef1 (ENSMOCG00000003434)	Gm13420 (ENSMOCG00000016999)	ENSMOCG00000013759	Trub2 (ENSMOCG00000014291)	Coq4 (ENSMOCG00000016657)	Slc27a4 (ENSMOCG00000009385) #22	Urm1 (ENSMOCG00000007365) #26	Cercam (ENSMOCG00000019610) #25	Odf2 (ENSMOCG00000014613)	Gle1 (ENSMOCG00000014845)	Sptan1 (ENSMOCG00000012343)	Dync2i2 (ENSMOCG00000000668)	ENSMOCG00000011320	Pkn3 (ENSMOCG00000021624)	Zdhhc12 (ENSMOCG00000004344)	Zer1 (ENSMOCG00000012943)	Tbc1d13 (ENSMOCG00000022556)	Endog (ENSMOCG00000010842)	ENSMOCG00000002315	Kyat1 (ENSMOCG00000021586)	Lrrc8a (ENSMOCG00000014593)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007746	ENSGT00940000161613	ENSGT00390000011873	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000160428	ENSGT00390000014476	ENSGT00940000159729	ENSGT00940000160918	ENSGT00940000153601.a.a	ENSGT00390000012207	ENSGT00940000156235	ENSGT00940000163383	ENSGT01090000260597	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Golden Hamster	MODERN SPECIES	809										ENSMAUG00000015488	Rapgef1 (ENSMAUG00000012266)	Gm13420 (ENSMAUG00000020023)	ENSMAUG00000021606	Trub2 (ENSMAUG00000010403)	Coq4 (ENSMAUG00000020901)	Slc27a4 (ENSMAUG00000014561) #22	Urm1 (ENSMAUG00000000479) #26	Cercam (ENSMAUG00000015598) #25	Odf2 (ENSMAUG00000015398)	Gle1 (ENSMAUG00000022138)	Sptan1 (ENSMAUG00000010972)	Dync2i2 (ENSMAUG00000020469)	Pkn3 (ENSMAUG00000014746)	Zdhhc12 (ENSMAUG00000020895)	ENSMAUG00000012662	Tbc1d13 (ENSMAUG00000017508)	Endog (ENSMAUG00000015619)	Spout1 (ENSMAUG00000021158)	Kyat1 (ENSMAUG00000019437)	Lrrc8a (ENSMAUG00000012895)	Phyhd1 (ENSMAUG00000018614)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	188	Ak8 (ENSCGRG00001016050)	ENSCGRG00001008263	Gtf3c4 (ENSCGRG00001012779)	Ddx31 (ENSCGRG00001014191)	Barhl1 (ENSCGRG00001022242)	Cfap77 (ENSCGRG00001023845)	Ttf1 (ENSCGRG00001024020)	Setx (ENSCGRG00001000907)	Ntng2 (ENSCGRG00001020557)	Med27 (ENSCGRG00001021730)	Rapgef1 (ENSCGRG00001020836)	Gm13420 (ENSCGRG00001019828)	ENSCGRG00001020194	Trub2 (ENSCGRG00001024441)	Coq4 (ENSCGRG00001024557)	Slc27a4 (ENSCGRG00001023356) #22	Urm1 (ENSCGRG00001023888) #26	Cercam (ENSCGRG00001018468) #25	Odf2 (ENSCGRG00001020087)	ENSCGRG00001023522	Sptan1 (ENSCGRG00001010754)	ENSCGRG00001002900	ENSCGRG00001020955	Dync2i2 (ENSCGRG00001019053)	ENSCGRG00001001629	Pkn3 (ENSCGRG00001005515)	Zdhhc12 (ENSCGRG00001013072)	Zer1 (ENSCGRG00001011706)	Tbc1d13 (ENSCGRG00001002371)	Spout1 (ENSCGRG00001022370)	Endog (ENSCGRG00001024006)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007746	ENSGT00940000161613	ENSGT00390000011873	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000160428	ENSGT00390000014476	ENSGT00940000159729	ENSGT00940000160918	ENSGT00940000153601.a.a	ENSGT00390000012207	ENSGT00940000156235	ENSGT00940000163383	ENSGT01090000260597	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT00960000190071	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903.o	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Mus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007746	ENSGT00940000161613	ENSGT00390000011873	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000160428	ENSGT00390000014476	ENSGT00940000159729	ENSGT00940000160918	ENSGT00940000153601.a.a	ENSGT00390000012207	ENSGT00940000156235	ENSGT00940000163383	ENSGT01090000260597	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT00960000190071	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903.o	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000007746	ENSGT00940000161613	ENSGT00390000011873	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000160428	ENSGT00390000014476	ENSGT00940000159729	ENSGT00940000160918	ENSGT00940000153601.a.a	ENSGT00390000012207	ENSGT00940000156235	ENSGT00940000163383	ENSGT01090000260597	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT00960000190071	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903.o	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007746	ENSGT00940000161613	ENSGT00390000011873	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000160428	ENSGT00390000014476	ENSGT00940000159729	ENSGT00940000160918	ENSGT00940000153601.a.a	ENSGT00390000012207	ENSGT00940000156235	ENSGT00940000163383	ENSGT01090000260597	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT00960000190071	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903.o	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000007746	ENSGT00940000161613	ENSGT00390000011873	ENSGT00550000075041	ENSGT00940000160428	ENSGT00390000014476	ENSGT00940000159729	ENSGT00940000160918	ENSGT00940000153601.a.a	ENSGT00390000012207	ENSGT00940000156235	ENSGT00940000163383	ENSGT01090000260597	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT00960000190071	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903.o	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000154891	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2944						Cfap77 (ENSMSIG00000010110)	Ttf1 (ENSMSIG00000010070)	Setx (ENSMSIG00000009986)	Ntng2 (ENSMSIG00000009805)	Med27 (ENSMSIG00000009748)	Rapgef1 (ENSMSIG00000009443)	Gm13420 (ENSMSIG00000009424)	ENSMSIG00000009394	Trub2 (ENSMSIG00000009303)	Coq4 (ENSMSIG00000009264)	Slc27a4 (ENSMSIG00000009228) #22	ENSMSIG00000009200 #26	ENSMSIG00000009186	Cercam (ENSMSIG00000009108) #25	Odf2 (ENSMSIG00000008211)	ENSMSIG00000008176	Gle1 (ENSMSIG00000008134)	Sptan1 (ENSMSIG00000005300)	Dync2i2 (ENSMSIG00000005195)	ENSMSIG00000005123	Pkn3 (ENSMSIG00000005062)	Zdhhc12 (ENSMSIG00000005028)	Zer1 (ENSMSIG00000004937)	Tbc1d13 (ENSMSIG00000004898)	ENSMSIG00000004892	Endog (ENSMSIG00000004884)
spretus	MODERN SPECIES	11	Tsc1 (MGP_SPRETEiJ_G0024273)	Spaca9 (MGP_SPRETEiJ_G0024274)	Ak8 (MGP_SPRETEiJ_G0024275)	Gtf3c4 (MGP_SPRETEiJ_G0024276)	Ddx31 (MGP_SPRETEiJ_G0024277)	Barhl1 (MGP_SPRETEiJ_G0024278)	Cfap77 (MGP_SPRETEiJ_G0024279)	Ttf1 (MGP_SPRETEiJ_G0024280)	Setx (MGP_SPRETEiJ_G0024281)	Ntng2 (MGP_SPRETEiJ_G0024282)	Med27 (MGP_SPRETEiJ_G0024283)	Rapgef1 (MGP_SPRETEiJ_G0024284)	MGP_SPRETEiJ_G0024285	Trub2 (MGP_SPRETEiJ_G0024286)	Coq4 (MGP_SPRETEiJ_G0024287)	Slc27a4 (MGP_SPRETEiJ_G0024288) #22	Urm1 (MGP_SPRETEiJ_G0024289) #26	Cercam (MGP_SPRETEiJ_G0024290) #25	Odf2 (MGP_SPRETEiJ_G0024291)	Gle1 (MGP_SPRETEiJ_G0024292)	Sptan1 (MGP_SPRETEiJ_G0024293)	Dync2i2 (MGP_SPRETEiJ_G0024294)	MGP_SPRETEiJ_G0024295	Pkn3 (MGP_SPRETEiJ_G0024296)	Zdhhc12 (MGP_SPRETEiJ_G0024297)	Zer1 (MGP_SPRETEiJ_G0024298)	Tbc1d13 (MGP_SPRETEiJ_G0024299)	Endog (MGP_SPRETEiJ_G0024300)	Spout1 (MGP_SPRETEiJ_G0024301)	Kyat1 (MGP_SPRETEiJ_G0024302)	Lrrc8a (MGP_SPRETEiJ_G0024303)
Mouse	MODERN SPECIES	11	Tsc1 (ENSMUSG00000026812)	Spaca9 (ENSMUSG00000026809)	Ak8 (ENSMUSG00000026807)	Gtf3c4 (ENSMUSG00000035666)	Ddx31 (ENSMUSG00000026806)	Barhl1 (ENSMUSG00000026805)	Cfap77 (ENSMUSG00000079502)	Ttf1 (ENSMUSG00000026803)	Setx (ENSMUSG00000043535)	Ntng2 (ENSMUSG00000035513)	Med27 (ENSMUSG00000026799)	Rapgef1 (ENSMUSG00000039844)	Gm13420 (ENSMUSG00000079497)	Trub2 (ENSMUSG00000039826)	Coq4 (ENSMUSG00000026798)	Slc27a4 (ENSMUSG00000059316) #22	Urm1 (ENSMUSG00000069020) #26	Cercam (ENSMUSG00000039787) #25	Odf2 (ENSMUSG00000026790)	Gle1 (ENSMUSG00000019715)	Sptan1 (ENSMUSG00000057738)	Dync2i2 (ENSMUSG00000039715)	Set (ENSMUSG00000054766)	Pkn3 (ENSMUSG00000026785)	Zdhhc12 (ENSMUSG00000015335)	Zer1 (ENSMUSG00000039686)	Tbc1d13 (ENSMUSG00000039678)	Endog (ENSMUSG00000015337)	Spout1 (ENSMUSG00000039660)	Kyat1 (ENSMUSG00000039648)	Lrrc8a (ENSMUSG00000007476)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	11	Tsc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023356)	Spaca9 (MGP_CAROLIEiJ_G0023357)	Ak8 (MGP_CAROLIEiJ_G0023358)	Gtf3c4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023359)	Ddx31 (MGP_CAROLIEiJ_G0023360)	Barhl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023361)	Cfap77 (MGP_CAROLIEiJ_G0023362)	Ttf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023363)	Setx (MGP_CAROLIEiJ_G0023364)	Ntng2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023365)	Med27 (MGP_CAROLIEiJ_G0023366)	Rapgef1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023367)	Trub2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023368)	MGP_CAROLIEiJ_G0023369	Coq4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023370)	Slc27a4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023371) #22	Urm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023372) #26	Cercam (MGP_CAROLIEiJ_G0023373) #25	Odf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023374)	Gle1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023375)	Sptan1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023376)	Dync2i2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023377)	MGP_CAROLIEiJ_G0023378	Pkn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023379)	Zdhhc12 (MGP_CAROLIEiJ_G0023380)	Zer1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023381)	Tbc1d13 (MGP_CAROLIEiJ_G0023382)	Endog (MGP_CAROLIEiJ_G0023383)	Spout1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023384)	Kyat1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023385)	MGP_CAROLIEiJ_G0023386
Shrew mouse	MODERN SPECIES	16	Tsc1 (MGP_PahariEiJ_G0024813)	Spaca9 (MGP_PahariEiJ_G0024814)	Ak8 (MGP_PahariEiJ_G0024815)	Gtf3c4 (MGP_PahariEiJ_G0024816)	Ddx31 (MGP_PahariEiJ_G0024817)	Barhl1 (MGP_PahariEiJ_G0024818)	Cfap77 (MGP_PahariEiJ_G0024819)	MGP_PahariEiJ_G0024820	Setx (MGP_PahariEiJ_G0024821)	Ntng2 (MGP_PahariEiJ_G0024822)	Med27 (MGP_PahariEiJ_G0024823)	Rapgef1 (MGP_PahariEiJ_G0024824)	MGP_PahariEiJ_G0024825	Trub2 (MGP_PahariEiJ_G0024826)	Coq4 (MGP_PahariEiJ_G0024827)	Slc27a4 (MGP_PahariEiJ_G0024828) #22	Urm1 (MGP_PahariEiJ_G0024829) #26	Cercam (MGP_PahariEiJ_G0024830) #25	Odf2 (MGP_PahariEiJ_G0024831)	Gle1 (MGP_PahariEiJ_G0024832)	Sptan1 (MGP_PahariEiJ_G0024833)	Dync2i2 (MGP_PahariEiJ_G0024834)	MGP_PahariEiJ_G0024835	Pkn3 (MGP_PahariEiJ_G0024836)	Zdhhc12 (MGP_PahariEiJ_G0024837)	Zer1 (MGP_PahariEiJ_G0024838)	Tbc1d13 (MGP_PahariEiJ_G0024839)	Endog (MGP_PahariEiJ_G0024840)	Spout1 (MGP_PahariEiJ_G0024841)	Kyat1 (MGP_PahariEiJ_G0024842)	MGP_PahariEiJ_G0024843
Rat	MODERN SPECIES	13	Spaca9 (ENSRNOG00000012697)	Ak8 (ENSRNOG00000012761)	Gtf3c4 (ENSRNOG00000054725)	Ddx31 (ENSRNOG00000013040)	Barhl1 (ENSRNOG00000013209)	Cfap77 (ENSRNOG00000028805)	Ttf1 (ENSRNOG00000039777)	Setx (ENSRNOG00000013491)	Ntng2 (ENSRNOG00000013694)	Med27 (ENSRNOG00000013933)	Rapgef1 (ENSRNOG00000014316)	Prrt1b (ENSRNOG00000046655)	LOC102547011 (ENSRNOG00000050262)	Trub2 (ENSRNOG00000043189)	Coq4 (ENSRNOG00000026691)	Slc27a4 (ENSRNOG00000014369) #22	Cercam (ENSRNOG00000026604) #25	AC114363.1 (ENSRNOG00000057545)	Odf2 (ENSRNOG00000014584)	Gle1 (ENSRNOG00000015237)	Sptan1 (ENSRNOG00000015396)	Dync2i2 (ENSRNOG00000015636)	Set (ENSRNOG00000025892)	Zdhhc12 (ENSRNOG00000015791)	Zer1 (ENSRNOG00000025832)	Tbc1d13 (ENSRNOG00000015970)	ENSRNOG00000067313	Endog (ENSRNOG00000016033)	Spout1 (ENSRNOG00000025711)	Kyat1 (ENSRNOG00000016097)	Lrrc8a (ENSRNOG00000025296)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1249	Tsc1 (ENSNGAG00000020617)	Spaca9 (ENSNGAG00000010284)	Ak8 (ENSNGAG00000000659)	Gtf3c4 (ENSNGAG00000014984)	Ddx31 (ENSNGAG00000020928)	Barhl1 (ENSNGAG00000013497)	Cfap77 (ENSNGAG00000012081)	ENSNGAG00000017385	Ntng2 (ENSNGAG00000000374)	Med27 (ENSNGAG00000001480)	Rapgef1 (ENSNGAG00000015271)	Gm13420 (ENSNGAG00000012226)	ENSNGAG00000019768	Trub2 (ENSNGAG00000018679)	Coq4 (ENSNGAG00000000970)	Slc27a4 (ENSNGAG00000000290) #22	ENSNGAG00000015563	Urm1 (ENSNGAG00000007112) #26	Cercam (ENSNGAG00000020179) #25	Odf2 (ENSNGAG00000019109)	Gle1 (ENSNGAG00000010816)	Sptan1 (ENSNGAG00000016852)	Dync2i2 (ENSNGAG00000020218)	ENSNGAG00000017635	Pkn3 (ENSNGAG00000005915)	Zdhhc12 (ENSNGAG00000000306)	Zer1 (ENSNGAG00000010627)	Tbc1d13 (ENSNGAG00000010572)	Endog (ENSNGAG00000020601)	Spout1 (ENSNGAG00000000907)	Kyat1 (ENSNGAG00000007585)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	213	St6galnac4 (ENSJJAG00000019463)	Pip5kl1 (ENSJJAG00000018952)	Dpm2 (ENSJJAG00000018510)	Eeig1 (ENSJJAG00000015470)	Naif1 (ENSJJAG00000014845)	Slc25a25 (ENSJJAG00000019085)	Ptges2 (ENSJJAG00000016746)	ENSJJAG00000015814	Bbln (ENSJJAG00000015624)	ENSJJAG00000015415	Dnm1 (ENSJJAG00000003497)	Golga2 (ENSJJAG00000006051)	ENSJJAG00000021338 #21	Trub2 (ENSJJAG00000019181)	ENSJJAG00000018147	Slc27a4 (ENSJJAG00000015783) #22	ENSJJAG00000014799 #26	Cercam (ENSJJAG00000013007) #25	Odf2 (ENSJJAG00000020205)	ENSJJAG00000018544	Gle1 (ENSJJAG00000021252)	Sptan1 (ENSJJAG00000009750)	Dync2i2 (ENSJJAG00000016517)	ENSJJAG00000021459	Pkn3 (ENSJJAG00000019697)	Zdhhc12 (ENSJJAG00000019229)	Zer1 (ENSJJAG00000018996)	Tbc1d13 (ENSJJAG00000018509)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	374	St6galnac4 (ENSDORG00000013334)	Pip5kl1 (ENSDORG00000013335)	Dpm2 (ENSDORG00000026594)	Eeig1 (ENSDORG00000013337)	Naif1 (ENSDORG00000023751)	Slc25a25 (ENSDORG00000004321)	ENSDORG00000004322	ENSDORG00000013836	Bbln (ENSDORG00000023732)	Ciz1 (ENSDORG00000012341)	Dnm1 (ENSDORG00000016214)	Golga2 (ENSDORG00000016218)	Swi5 (ENSDORG00000016221) #21	Trub2 (ENSDORG00000016222)	Coq4 (ENSDORG00000016223)	Slc27a4 (ENSDORG00000016224) #22	Urm1 (ENSDORG00000028424) #26	Cercam (ENSDORG00000013368) #25	ENSDORG00000029642	Gle1 (ENSDORG00000012158)	ENSDORG00000023957	Dync2i2 (ENSDORG00000011867)	ENSDORG00000027815	Pkn3 (ENSDORG00000013496)	Zdhhc12 (ENSDORG00000013500)	Zer1 (ENSDORG00000013504)	Tbc1d13 (ENSDORG00000027055)	Endog (ENSDORG00000028893)	Spout1 (ENSDORG00000008670)	Kyat1 (ENSDORG00000008671)	Lrrc8a (ENSDORG00000008674)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101.f #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101.f #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000154891	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101.f #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	44	ST6GALNAC4 (ENSUPAG00010014567)	PIP5KL1 (ENSUPAG00010014573)	DPM2 (ENSUPAG00010014590)	EEIG1 (ENSUPAG00010014600)	NAIF1 (ENSUPAG00010014612)	SLC25A25 (ENSUPAG00010014616)	PTGES2 (ENSUPAG00010014679)	LCN2 (ENSUPAG00010014701)	BBLN (ENSUPAG00010014717)	CIZ1 (ENSUPAG00010014739)	DNM1 (ENSUPAG00010015447)	ENSUPAG00010016029	SWI5 (ENSUPAG00010016170) #21	TRUB2 (ENSUPAG00010016176)	COQ4 (ENSUPAG00010016217)	SLC27A4 (ENSUPAG00010016225) #22	URM1 (ENSUPAG00010016241) #26	CERCAM (ENSUPAG00010016267) #25	ODF2 (ENSUPAG00010016297)	GLE1 (ENSUPAG00010016717)	SPTAN1 (ENSUPAG00010016756)	ENSUPAG00010017643	DYNC2I2 (ENSUPAG00010017649)	ENSUPAG00010017660	PKN3 (ENSUPAG00010017678)	ZDHHC12 (ENSUPAG00010017701)	ZER1 (ENSUPAG00010017706)	TBC1D13 (ENSUPAG00010017721)	ENDOG (ENSUPAG00010017748)	SPOUT1 (ENSUPAG00010017751)	KYAT1 (ENSUPAG00010017771)
Squirrel	MODERN SPECIES	87	ST6GALNAC4 (ENSSTOG00000012578)	PIP5KL1 (ENSSTOG00000008371)	DPM2 (ENSSTOG00000003001)	EEIG1 (ENSSTOG00000003009)	NAIF1 (ENSSTOG00000007837)	SLC25A25 (ENSSTOG00000026316)	PTGES2 (ENSSTOG00000005312)	LCN2 (ENSSTOG00000025169)	ENSSTOG00000033639	BBLN (ENSSTOG00000022962)	DNM1 (ENSSTOG00000007980)	ENSSTOG00000012444	SWI5 (ENSSTOG00000023800) #21	ENSSTOG00000008024	COQ4 (ENSSTOG00000008034)	SLC27A4 (ENSSTOG00000025200) #22	URM1 (ENSSTOG00000025351) #26	CERCAM (ENSSTOG00000008102) #25	ODF2 (ENSSTOG00000008125)	GLE1 (ENSSTOG00000010493)	SPTAN1 (ENSSTOG00000010508)	DYNC2I2 (ENSSTOG00000010534)	ENSSTOG00000010546	PKN3 (ENSSTOG00000010555)	ZDHHC12 (ENSSTOG00000010570)	ZER1 (ENSSTOG00000009393)	TBC1D13 (ENSSTOG00000000112)	ENDOG (ENSSTOG00000022690)	SPOUT1 (ENSSTOG00000015657)	KYAT1 (ENSSTOG00000026320)	LRRC8A (ENSSTOG00000002088)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	47	ST6GALNAC4 (ENSMMMG00000017124)	PIP5KL1 (ENSMMMG00000017116)	DPM2 (ENSMMMG00000017104)	EEIG1 (ENSMMMG00000017094)	NAIF1 (ENSMMMG00000017092)	SLC25A25 (ENSMMMG00000017081)	ENSMMMG00000017074	LCN2 (ENSMMMG00000017068)	ENSMMMG00000017066	CIZ1 (ENSMMMG00000016798)	DNM1 (ENSMMMG00000015538)	ENSMMMG00000015453	SWI5 (ENSMMMG00000015441) #21	TRUB2 (ENSMMMG00000015419)	COQ4 (ENSMMMG00000015414)	SLC27A4 (ENSMMMG00000015405) #22	URM1 (ENSMMMG00000015393) #26	CERCAM (ENSMMMG00000015367) #25	ODF2 (ENSMMMG00000014741)	GLE1 (ENSMMMG00000014724)	ENSMMMG00000014716	SPTAN1 (ENSMMMG00000013757)	DYNC2I2 (ENSMMMG00000013692)	ENSMMMG00000013669	PKN3 (ENSMMMG00000013641)	ZDHHC12 (ENSMMMG00000013627)	ZER1 (ENSMMMG00000013601)	TBC1D13 (ENSMMMG00000013588)	ENDOG (ENSMMMG00000013572)	SPOUT1 (ENSMMMG00000013550)	KYAT1 (ENSMMMG00000013394)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	6	ST6GALNAC4 (ENSSVLG00005015398)	PIP5KL1 (ENSSVLG00005015439)	DPM2 (ENSSVLG00005015581)	EEIG1 (ENSSVLG00005015646)	NAIF1 (ENSSVLG00005015717)	SLC25A25 (ENSSVLG00005015830)	PTGES2 (ENSSVLG00005015937)	LCN2 (ENSSVLG00005015998)	ENSSVLG00005016033	CIZ1 (ENSSVLG00005016153)	DNM1 (ENSSVLG00005017313)	ENSSVLG00005017523	SWI5 (ENSSVLG00005017635) #21	TRUB2 (ENSSVLG00005017737)	COQ4 (ENSSVLG00005017850)	SLC27A4 (ENSSVLG00005017971) #22	URM1 (ENSSVLG00005018029) #26	CERCAM (ENSSVLG00005018107) #25	ODF2 (ENSSVLG00005018387)	GLE1 (ENSSVLG00005018948)	ENSSVLG00005023763	DYNC2I2 (ENSSVLG00005023796)	ENSSVLG00005023905	PKN3 (ENSSVLG00005024092)	ZDHHC12 (ENSSVLG00005024113)	ZER1 (ENSSVLG00005024151)	TBC1D13 (ENSSVLG00005024185)	ENDOG (ENSSVLG00005024228)	SPOUT1 (ENSSVLG00005024260)	KYAT1 (ENSSVLG00005024316)	LRRC8A (ENSSVLG00005024426)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a.b.a	ENSGT01050000244868.b.a.b.b.a.a	ENSGT01050000244868.b.a.b.b.b	ENSGT01050000244868.b.a.a.a.a.a.a	ENSGT00940000164950	ENSGT00440000039084	ENSGT00390000001761	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000001098	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT01050000244868.b.a.b.a	ENSGT01050000244868.b.a.b.b.a.a	ENSGT01050000244868.b.a.b.b.b	ENSGT00440000039084	ENSGT00390000001761	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	36									ENSGT00440000039084	ENSGT00390000001761	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932.d	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.h.b	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	277					ENSCLAG00000001202	ENSCLAG00000001260	ENSCLAG00000001469	ENSCLAG00000001508	CIZ1 (ENSCLAG00000001584)	BBLN (ENSCLAG00000001430)	DNM1 (ENSCLAG00000001608)	ENSCLAG00000002518	SWI5 (ENSCLAG00000001616) #21	TRUB2 (ENSCLAG00000001702)	COQ4 (ENSCLAG00000001766)	SLC27A4 (ENSCLAG00000001777) #22	URM1 (ENSCLAG00000001791) #26	CERCAM (ENSCLAG00000001818) #25	ODF2 (ENSCLAG00000001987)	GLE1 (ENSCLAG00000001047)	SPTAN1 (ENSCLAG00000001091)	DYNC2I2 (ENSCLAG00000002947)	ENSCLAG00000003024	PKN3 (ENSCLAG00000003289)	ZDHHC12 (ENSCLAG00000003973)	ZER1 (ENSCLAG00000004427)	TBC1D13 (ENSCLAG00000005683)	ENDOG (ENSCLAG00000006402)	SPOUT1 (ENSCLAG00000006487)	KYAT1 (ENSCLAG00000001172)	LRRC8A (ENSCLAG00000001240)
Degu	MODERN SPECIES	164								ENSODEG00000017243	BBLN (ENSODEG00000017312)	CIZ1 (ENSODEG00000017392)	DNM1 (ENSODEG00000017540)	ENSODEG00000017315	SWI5 (ENSODEG00000017390) #21	TRUB2 (ENSODEG00000017292)	COQ4 (ENSODEG00000017322)	SLC27A4 (ENSODEG00000018007) #22	URM1 (ENSODEG00000017296) #26	CERCAM (ENSODEG00000017562) #25	ENSODEG00000017291	ENSODEG00000017232	GLE1 (ENSODEG00000017394)	SPTAN1 (ENSODEG00000017300)	DYNC2I2 (ENSODEG00000017068)	SET (ENSODEG00000017107)	PKN3 (ENSODEG00000016958)	ZDHHC12 (ENSODEG00000016995)	ZER1 (ENSODEG00000017759)	TBC1D13 (ENSODEG00000016965)	ENDOG (ENSODEG00000017274)	KYAT1 (ENSODEG00000016683)	LRRC8A (ENSODEG00000017019)
Guinea pig	MODERN SPECIES	27	ENSCPOG00000038409	ENSCPOG00000019647	ENSCPOG00000030220	ENSCPOG00000008902	ENSCPOG00000038271	ENSCPOG00000012525	ENSCPOG00000025560	ENSCPOG00000002704	BBLN (ENSCPOG00000039651)	CIZ1 (ENSCPOG00000006863)	DNM1 (ENSCPOG00000022899)	ENSCPOG00000002298	SWI5 (ENSCPOG00000032913) #21	TRUB2 (ENSCPOG00000013535)	COQ4 (ENSCPOG00000004566)	SLC27A4 (ENSCPOG00000004570) #22	URM1 (ENSCPOG00000039069) #26	CERCAM (ENSCPOG00000007664) #25	ODF2 (ENSCPOG00000007673)	GLE1 (ENSCPOG00000004235)	SPTAN1 (ENSCPOG00000009432)	DYNC2I2 (ENSCPOG00000031445)	SET (ENSCPOG00000022617)	PKN3 (ENSCPOG00000013841)	ZDHHC12 (ENSCPOG00000022707)	ZER1 (ENSCPOG00000009341)	TBC1D13 (ENSCPOG00000015146)	ENDOG (ENSCPOG00000025286)	SPOUT1 (ENSCPOG00000004710)	KYAT1 (ENSCPOG00000021570)	LRRC8A (ENSCPOG00000004076)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	3	ENSHGLG00000014475	ENSHGLG00000013942	ENSHGLG00000013711	ENSHGLG00000044789	ENSHGLG00000013129	ENSHGLG00000036487	ENSHGLG00000039186	ENSHGLG00000012304	ENSHGLG00000012143	CIZ1 (ENSHGLG00000011900)	DNM1 (ENSHGLG00000012918)	ENSHGLG00000011778	ENSHGLG00000016708 #21	ENSHGLG00000016715	COQ4 (ENSHGLG00000016696)	SLC27A4 (ENSHGLG00000016679) #22	URM1 (ENSHGLG00000036174) #26	CERCAM (ENSHGLG00000019176) #25	ENSHGLG00000016513	GLE1 (ENSHGLG00000016370)	SPTAN1 (ENSHGLG00000011313)	DYNC2I2 (ENSHGLG00000010447)	SET (ENSHGLG00000016319)	PKN3 (ENSHGLG00000016146)	ZDHHC12 (ENSHGLG00000043046)	ZER1 (ENSHGLG00000013217)	TBC1D13 (ENSHGLG00000012272)	ENSHGLG00000012087	ENDOG (ENSHGLG00000011977)	SPOUT1 (ENSHGLG00000011378)	ENSHGLG00000010822
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.f	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.f	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.f	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157958	ENSGT00940000158633	ENSGT00390000001098	ENSGT00990000204366	ENSGT00940000156811	ENSGT00450000040324.b	ENSGT00940000157207	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000156773	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000012903	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000153877.f	ENSGT00940000161818	ENSGT00940000156902	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000158674	ENSGT00940000160987	ENSGT00390000016537	ENSGT00940000158797	ENSGT00940000154043.A
Common wonbat	MODERN SPECIES	1030	ST6GALNAC4 (ENSVURG00010016033)	ENSVURG00010016017	DPM2 (ENSVURG00010016011)	ENSVURG00010016009	EEIG1 (ENSVURG00010016003)	NAIF1 (ENSVURG00010015999)	SLC25A25 (ENSVURG00010015954)	PTGES2 (ENSVURG00010015939)	ENSVURG00010015931	ENSVURG00010015921	DNM1 (ENSVURG00010015851)	ENSVURG00010015778	ENSVURG00010015756 #21	TRUB2 (ENSVURG00010015748)	COQ4 (ENSVURG00010015627)	SLC27A4 (ENSVURG00010015595) #22	URM1 (ENSVURG00010015576) #26	CERCAM (ENSVURG00010015549) #25	ODF2 (ENSVURG00010014736)	GLE1 (ENSVURG00010014648)	SPTAN1 (ENSVURG00010013542)	DYNC2I2 (ENSVURG00010013437)	SET (ENSVURG00010013422)	PKN3 (ENSVURG00010013394)	ZDHHC12 (ENSVURG00010013384)	ZER1 (ENSVURG00010013363)	TBC1D13 (ENSVURG00010013333)	ENDOG (ENSVURG00010013322)	SPOUT1 (ENSVURG00010013316)	KYAT1 (ENSVURG00010013300)	LRRC8A (ENSVURG00010013287)
koala	MODERN SPECIES	161	ST6GALNAC6 (ENSPCIG00000005382)	ST6GALNAC4 (ENSPCIG00000026632)	ENSPCIG00000026638	DPM2 (ENSPCIG00000026647)	EEIG1 (ENSPCIG00000026652)	NAIF1 (ENSPCIG00000026658)	SLC25A25 (ENSPCIG00000026662)	PTGES2 (ENSPCIG00000026669)	BBLN (ENSPCIG00000026673)	ENSPCIG00000026674	DNM1 (ENSPCIG00000026678)	ENSPCIG00000026693	ENSPCIG00000035322 #21	TRUB2 (ENSPCIG00000026731)	COQ4 (ENSPCIG00000026733)	SLC27A4 (ENSPCIG00000026784) #22	ENSPCIG00000026786 #26	CERCAM (ENSPCIG00000026790) #25	ODF2 (ENSPCIG00000029602)	GLE1 (ENSPCIG00000029781)	SPTAN1 (ENSPCIG00000029892)	DYNC2I2 (ENSPCIG00000030096)	SET (ENSPCIG00000030104)	PKN3 (ENSPCIG00000030107)	ZER1 (ENSPCIG00000030111)	TBC1D13 (ENSPCIG00000030114)	ENDOG (ENSPCIG00000030115)	SPOUT1 (ENSPCIG00000030118)	KYAT1 (ENSPCIG00000030121)	LRRC8A (ENSPCIG00000008130)	ENSPCIG00000030128
Wallaby	MODERN SPECIES	7478																SLC27A4 (ENSMEUG00000014122) #22	URM1 (ENSMEUG00000014147) #26
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	ENSSHAG00000031076	AK1 (ENSSHAG00000028896)	ST6GALNAC6 (ENSSHAG00000028681)	ST6GALNAC4 (ENSSHAG00000018485)	ENSSHAG00000018505	DPM2 (ENSSHAG00000022334)	EEIG1 (ENSSHAG00000024179)	NAIF1 (ENSSHAG00000026154)	SLC25A25 (ENSSHAG00000027847)	ENSSHAG00000026830	DNM1 (ENSSHAG00000032239)	ENSSHAG00000018703	ENSSHAG00000028584 #21	TRUB2 (ENSSHAG00000021715)	COQ4 (ENSSHAG00000021858)	SLC27A4 (ENSSHAG00000000050) #22	CERCAM (ENSSHAG00000029760) #25	ODF2 (ENSSHAG00000018739)	GLE1 (ENSSHAG00000018769)	SPTAN1 (ENSSHAG00000018784)	DYNC2I2 (ENSSHAG00000018803)	SET (ENSSHAG00000018817)	PKN3 (ENSSHAG00000018824)	ZDHHC12 (ENSSHAG00000024938)	ZER1 (ENSSHAG00000018831)	TBC1D13 (ENSSHAG00000029784)	ENDOG (ENSSHAG00000029467)	SPOUT1 (ENSSHAG00000018857)	KYAT1 (ENSSHAG00000018862)	LRRC8A (ENSSHAG00000018882)	PHYHD1 (ENSSHAG00000028077)
Opossum	MODERN SPECIES		ENSMODG00000005618	AK1 (ENSMODG00000005639)	ST6GALNAC6 (ENSMODG00000037119)	ST6GALNAC4 (ENSMODG00000005649)	DPM2 (ENSMODG00000036505)	EEIG1 (ENSMODG00000005688)	NAIF1 (ENSMODG00000005695)	SLC25A25 (ENSMODG00000005725)	ENSMODG00000005748	ENSMODG00000005754	ENSMODG00000031735	DNM1 (ENSMODG00000005868)	ENSMODG00000005915	TRUB2 (ENSMODG00000005940)	COQ4 (ENSMODG00000005951)	SLC27A4 (ENSMODG00000005970) #22	URM1 (ENSMODG00000043638) #26	CERCAM (ENSMODG00000005999) #25	ODF2 (ENSMODG00000006078)	ENSMODG00000006130	SPTAN1 (ENSMODG00000006252)	DYNC2I2 (ENSMODG00000006276)	SET (ENSMODG00000006342)	ENSMODG00000049700	PKN3 (ENSMODG00000006395)	ZDHHC12 (ENSMODG00000006407)	ZER1 (ENSMODG00000006425)	TBC1D13 (ENSMODG00000006451)	ENDOG (ENSMODG00000006458)	SPOUT1 (ENSMODG00000006461)	KYAT1 (ENSMODG00000047627)
Platypus	MODERN SPECIES	15	ENSOANG00000043658	PKN3 (ENSOANG00000008094)	SET (ENSOANG00000046546)	DYNC2I2 (ENSOANG00000011985)	SPTAN1 (ENSOANG00000011986)	GLE1 (ENSOANG00000011987)	ODF2 (ENSOANG00000008437)	PTGES2 (ENSOANG00000048350)	BBLN (ENSOANG00000039985)	ENSOANG00000050817	DNM1 (ENSOANG00000000394)	ENSOANG00000012097	ENSOANG00000015202 #21	ENSOANG00000039795	COQ4 (ENSOANG00000041330)	SLC27A4 (ENSOANG00000037339) #22	URM1 (ENSOANG00000003949) #26	CERCAM (ENSOANG00000011889) #25	ENSOANG00000011890 #24	PTRH1 (ENSOANG00000046584) #23	TOR2A (ENSOANG00000040414) #27	SH2D3C (ENSOANG00000007349) #28	CDK9 (ENSOANG00000008397)	FPGS (ENSOANG00000008391)	ENSOANG00000047826	AK1 (ENSOANG00000038287)	ENSOANG00000015246	ST6GALNAC6 (ENSOANG00000008139)	ST6GALNAC4 (ENSOANG00000047012)	PIP5KL1 (ENSOANG00000010999)	ENSOANG00000040631
Anura	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000158674	ENSGT00530000063187.A	ENSGT00940000156902	ENSGT00940000154990.d	ENSGT00940000153877	ENSGT00940000158483	ENSGT00940000156662.d	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000009349 #21	ENSGT00940000158646 #22	ENSGT00390000005101 #26	ENSGT01030000234558.D.a #25
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	12	TBC1D13 (ENSLLEG00000028812)	ZER1 (ENSLLEG00000028562)	ZDHHC12 (ENSLLEG00000028511)	ENSLLEG00000028035	SET (ENSLLEG00000027817)	DYNC2I2 (ENSLLEG00000027505)	SPTAN1 (ENSLLEG00000023189)	GLE1 (ENSLLEG00000020128)	ODF2 (ENSLLEG00000019754)	PTGES2 (ENSLLEG00000019637)	ENSLLEG00000019593	ENSLLEG00000019284	DNM1 (ENSLLEG00000017784)	ENSLLEG00000017018	SWI5 (ENSLLEG00000016918) #21	SLC27A4 (ENSLLEG00000016704) #22	ENSLLEG00000016669	URM1 (ENSLLEG00000016442) #26	CERCAM (ENSLLEG00000016257) #25	ENSLLEG00000016194	ENSLLEG00000016081 #24	UBL4A (ENSLLEG00000016036)	INVS (ENSLLEG00000016022)	SEPHS2 (ENSLLEG00000015607)	IKBKG (ENSLLEG00000015465)	G6PD (ENSLLEG00000015353)	ENSLLEG00000015095	FAM3A (ENSLLEG00000014889)	SLC10A3 (ENSLLEG00000014858)	ENSLLEG00000014813	ENSLLEG00000014764
Frog	MODERN SPECIES	8	fam120c (ENSXETG00000023084)	wnk3 (ENSXETG00000023082)	tsr2 (ENSXETG00000033574)	fgd1 (ENSXETG00000030283)	ENSXETG00000042722	ENSXETG00000035221	fam102a (ENSXETG00000023071)	ENSXETG00000036637	slc10a3 (ENSXETG00000030360)	fam3a (ENSXETG00000023067)	XB5892679 [provisional:cerk] (ENSXETG00000030525)	g6pd (ENSXETG00000033535)	ikbkg (ENSXETG00000031817)	sephs3 (ENSXETG00000045518)	invs (ENSXETG00000023058)	slc27a4 (ENSXETG00000037018) #22	urm1 (ENSXETG00000042358) #26	cercam (ENSXETG00000009835) #25	XB997834 [provisional] (ENSXETG00000036168)	ENSXETG00000048935	ENSXETG00000035113	cacna1f (ENSXETG00000007195)	ccdc22 (ENSXETG00000007193)	foxp3 (ENSXETG00000031498)	gpr173 (ENSXETG00000047010)	sema3fl (ENSXETG00000007179)	tspyl2 (ENSXETG00000005030)	kdm5c (ENSXETG00000007178)	iqsec2 (ENSXETG00000007177)	ENSXETG00000041523	fcn2 (ENSXETG00000007176)
Elephant shark	MODERN SPECIES	1562	ENSCMIG00000000620	QSOX2 (ENSCMIG00000000627)	ENSCMIG00000000646	LHX3 (ENSCMIG00000000652)	TMEM250 (ENSCMIG00000000668)	NACC2 (ENSCMIG00000000673)	ENSCMIG00000000684	ubac1 (ENSCMIG00000000720)	camsap1b (ENSCMIG00000000788)	ENSCMIG00000000837	ENSCMIG00000000842	KCNT1 (ENSCMIG00000000907)	ST6GALNAC6 (ENSCMIG00000001153)	dnm1a (ENSCMIG00000001194)	golga2 (ENSCMIG00000001264)	slc27a4 (ENSCMIG00000001509) #22	urm1 (ENSCMIG00000001774) #26	CERCAM (ENSCMIG00000001951) #25	ENSCMIG00000002286 #24	ralgds (ENSCMIG00000002323)	glt6d1 (ENSCMIG00000002403)	ENSCMIG00000002470	zmynd19 (ENSCMIG00000002477)	dph7 (ENSCMIG00000002489)	mrpl41 (ENSCMIG00000002496)	PNPLA7 (ENSCMIG00000002824)	NSMF (ENSCMIG00000003719)	ENSCMIG00000003881	ENSCMIG00000003885	ENSCMIG00000003887	ABCA2 (ENSCMIG00000004013)