Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a ENSGT01030000234637.b.d.b ENSGT00390000003322 ENSGT00940000164126 ENSGT00390000007318 ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00940000156409 ENSGT00940000155820 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831 ENSGT00390000008631.a ENSGT00940000159731 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000005214 ENSGT00940000160100 ENSGT00590000083094.a.a ENSGT01030000234637.b.d.b ENSGT00390000003322 ENSGT00940000164126 ENSGT00390000007318 ENSGT00390000002873 ENSGT00940000157279 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00940000156409 ENSGT00940000155820 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831 ENSGT00390000008631.a ENSGT00940000159731 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00940000159882 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000162026 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00940000159882 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000162026 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 188 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000162026 ENSGT00390000013995.b.a Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 916 KBTBD8 (ENSUPAG00010023913) #22 Squirrel MODERN SPECIES 203 KBTBD8 (ENSSTOG00000020443) #22 SUCLG2 (ENSSTOG00000020195) TAFA1 (ENSSTOG00000014757) FRMD4B (ENSSTOG00000028861) LMOD3 (ENSSTOG00000026793) ARL6IP5 (ENSSTOG00000025065) UBA3 (ENSSTOG00000003215) TMF1 (ENSSTOG00000028312) EOGT (ENSSTOG00000003163) MITF (ENSSTOG00000005880) MDFIC2 (ENSSTOG00000021337) FOXP1 (ENSSTOG00000025624) EIF4E3 (ENSSTOG00000020469) PROK2 (ENSSTOG00000000976) RYBP 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FAM167A (ENSSVLG00005006418) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000161154 ENSGT00390000015136 ENSGT00940000162216 ENSGT00940000153110.A ENSGT00940000156977 ENSGT00940000160913 ENSGT00950000183042.b ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831.i ENSGT00390000008631.a ENSGT00940000159731 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00950000182994.B.a.b.x ENSGT00530000063735.b ENSGT00940000160326 ENSGT00950000182980.a.b.a.a.b ENSGT00940000155849 ENSGT01030000234553.b.b.d.c.b.a.a.a ENSGT00940000161154 ENSGT00390000015136 ENSGT00940000162216 ENSGT00940000153110.A ENSGT00940000156977 ENSGT00940000160913 ENSGT00950000183042.b ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831.i ENSGT00390000008631.a ENSGT00940000159731 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000162026 Guinea pig MODERN SPECIES 16 GDI2 (ENSCPOG00000013449) TASOR2 (ENSCPOG00000013441) ASB13 (ENSCPOG00000037175) CALML3 (ENSCPOG00000014283) NET1 (ENSCPOG00000014555) Cavporv1r602 (ENSCPOG00000035841) CHST13 (ENSCPOG00000015174) UROC1 (ENSCPOG00000002151) ZXDC (ENSCPOG00000002150) CFAP100 (ENSCPOG00000002149) KLF15 (ENSCPOG00000005315) ALDH1L1 (ENSCPOG00000006449) SLC41A3 (ENSCPOG00000007303) SLC25A26 (ENSCPOG00000002272) LRIG1 (ENSCPOG00000002275) KBTBD8 (ENSCPOG00000012739) #22 SUCLG2 (ENSCPOG00000013421) TAFA1 (ENSCPOG00000014183) TAFA4 (ENSCPOG00000013292) EOGT (ENSCPOG00000013299) TMF1 (ENSCPOG00000013302) UBA3 (ENSCPOG00000030763) ARL6IP5 (ENSCPOG00000033968) LMOD3 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ENSGT00940000162026 Kangaroo rat MODERN SPECIES 331 ENSDORG00000007693 ENSDORG00000007695 Fezf2 (ENSDORG00000000030) Cadps (ENSDORG00000006824) Synpr (ENSDORG00000001872) Sntn (ENSDORG00000001877) Cdhr18 (ENSDORG00000027325) ENSDORG00000028787 Atxn7 (ENSDORG00000007600) Psmd6 (ENSDORG00000007608) Prickle2 (ENSDORG00000005850) Adamts9 (ENSDORG00000001254) Magi1 (ENSDORG00000012586) Slc25a26 (ENSDORG00000003507) Lrig1 (ENSDORG00000003508) Kbtbd8 (ENSDORG00000000438) #22 Suclg2 (ENSDORG00000016563) Tafa1 (ENSDORG00000008222) Tafa4 (ENSDORG00000028398) Eogt (ENSDORG00000000514) Tmf1 (ENSDORG00000000515) Uba3 (ENSDORG00000000516) Arl6ip5 (ENSDORG00000029346) Lmod3 (ENSDORG00000000518) Frmd4b (ENSDORG00000002184) Mitf (ENSDORG00000003336) Mdfic2 (ENSDORG00000029192) Foxp1 (ENSDORG00000009604) Eif4e3 (ENSDORG00000006531) Prok2 (ENSDORG00000006150) Rybp (ENSDORG00000015021) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00940000156409 ENSGT00940000155820 ENSGT00550000074950 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Lrig1 (ENSNGAG00000012917) ENSNGAG00000017225 Kbtbd8 (ENSNGAG00000023811) #22 Suclg2 (ENSNGAG00000014569) Tafa1 (ENSNGAG00000017655) Tafa4 (ENSNGAG00000020616) Eogt (ENSNGAG00000015400) Tmf1 (ENSNGAG00000022497) Uba3 (ENSNGAG00000023328) Arl6ip5 (ENSNGAG00000011599) Lmod3 (ENSNGAG00000012605) Frmd4b (ENSNGAG00000014412) Mitf (ENSNGAG00000014658) Mdfic2 (ENSNGAG00000003023) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000013951 ENSGT00940000154583 ENSGT00940000155615 ENSGT00440000033958 ENSGT00940000153655.B ENSGT00940000157922 ENSGT00940000158393 ENSGT00640000091558 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000016951 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00940000156409 ENSGT00940000155820 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831 ENSGT00390000008631.a ENSGT00940000159731 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a Murinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000013951 ENSGT00940000154583 ENSGT00940000155615 ENSGT00440000033958 ENSGT00940000153655.B ENSGT00940000157922 ENSGT00940000158393 ENSGT00640000091558 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000016951 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00940000156409 ENSGT00940000155820 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831 ENSGT00390000008631.a ENSGT00940000159731 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a Mus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000013951 ENSGT00940000154583 ENSGT00940000155615 ENSGT00440000033958 ENSGT00940000153655.B ENSGT00940000157922 ENSGT00940000158393 ENSGT00640000091558 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000016951 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00940000156409 ENSGT00940000155820 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831 ENSGT00390000008631.a ENSGT00940000159731 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a Mus_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000013951 ENSGT00940000154583 ENSGT00940000155615 ENSGT00440000033958.c.a ENSGT00940000153655.B ENSGT00940000157922 ENSGT00940000158393 ENSGT00640000091558 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000016951 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00940000156409 ENSGT00940000155820 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831 ENSGT00390000008631.a.e ENSGT00940000159731 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a Mus_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000013951 ENSGT00940000154583 ENSGT00940000155615 ENSGT00440000033958.c.a ENSGT00940000153655.B ENSGT00940000157922 ENSGT00940000158393 ENSGT00640000091558 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000016951 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00940000156409 ENSGT00940000155820 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000158502 ENSGT00940000158653 #22 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000159882 ENSGT00940000156493 ENSGT00390000010697 ENSGT00550000074831 ENSGT00390000008631.a.e ENSGT00940000159731 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a Mus_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155615 ENSGT00440000033958.c.a ENSGT00940000153655.B ENSGT00940000157922 ENSGT00940000158393 ENSGT00640000091558 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000016951 ENSGT00940000153629.a.a 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