Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	49										ENSGT00950000182951.A.a.a #17	ENSGT00940000162800	ENSGT00940000159039 #18	ENSGT00940000157513 #19	ENSGT00390000005666 #20	ENSGT00940000155830 #21	ENSGT00390000015750 #22	ENSGT00940000155698.A #23	ENSGT00390000016895 #24	ENSGT00940000161956 #25	ENSGT00390000017838 #29	ENSGT01030000234518.B.b #26	ENSGT00390000006068 #27	ENSGT00940000154307.B #28	ENSGT00940000161571 #30	ENSGT00940000161420 #31	ENSGT00940000160222 #32	ENSGT00390000015743 #33	ENSGT00940000160044 #34	ENSGT00940000153861.a #35	ENSGT00390000000324 #36	ENSGT00940000161391
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	70											ENSGT00950000182951.A.a.a #17	ENSGT00940000159039 #18	ENSGT00940000157513 #19	ENSGT00390000005666 #20	ENSGT00940000155830 #21	ENSGT00390000015750 #22	ENSGT00940000155698.A #23	ENSGT00390000016895 #24	ENSGT00940000161956 #25	ENSGT00390000017838 #29	ENSGT01030000234518.B.b #26	ENSGT00390000006068 #27	ENSGT00940000154307.B #28	ENSGT00940000161571 #30	ENSGT00940000161420 #31	ENSGT00940000160222 #32	ENSGT00390000015743 #33	ENSGT00940000160044 #34	ENSGT00940000153861.a #35	ENSGT00390000000324 #36	ENSGT00940000161391
Alpin marmot	MODERN SPECIES	77						ENSMMMG00000010556 #12	ENSMMMG00000010542 #13	ENSMMMG00000010529 #14	ENSMMMG00000010521 #15	ENSMMMG00000010508 #16	FAM20C (ENSMMMG00000010489) #17	ENSMMMG00000010482 #18	PRKAR1B (ENSMMMG00000010445) #19	DNAAF5 (ENSMMMG00000010417) #20	SUN1 (ENSMMMG00000009621) #21	GET4 (ENSMMMG00000009604) #22	ADAP1 (ENSMMMG00000009595) #23	COX19 (ENSMMMG00000009574) #24	CYP2W1 (ENSMMMG00000009569) #25	GPR146 (ENSMMMG00000009564) #26	ENSMMMG00000009549 #27	GPER1 (ENSMMMG00000009541) #28	C7orf50 (ENSMMMG00000009537) #29	ZFAND2A (ENSMMMG00000009516) #30	ENSMMMG00000009501 #31	MICALL2 (ENSMMMG00000009478) #32	INTS1 (ENSMMMG00000008745) #33	MAFK (ENSMMMG00000008730) #34	TMEM184A (ENSMMMG00000008711) #35	PSMG3 (ENSMMMG00000008708) #36	MAD1L1 (ENSMMMG00000008677) #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	141											ENSGT00950000182951.A.a.a #17	ENSGT00940000159039 #18	ENSGT00940000157513 #19	ENSGT00390000005666 #20	ENSGT00940000155830 #21	ENSGT00390000015750 #22	ENSGT00940000155698.A #23	ENSGT00390000016895 #24	ENSGT00940000161956 #25	ENSGT00390000017838 #29	ENSGT01030000234518.B.b #26	ENSGT00390000006068 #27	ENSGT00940000154307.B #28	ENSGT00940000161571 #30	ENSGT00940000161420 #31	ENSGT00940000160222 #32	ENSGT00390000015743 #33	ENSGT00940000160044 #34	ENSGT00940000153861.a #35	ENSGT00390000000324 #36	ENSGT00940000161391
Squirrel	MODERN SPECIES	354									ENSSTOG00000024440	ENSSTOG00000034676 #15	FAM20C (ENSSTOG00000019720) #17	PDGFA (ENSSTOG00000003223) #18	PRKAR1B (ENSSTOG00000003855) #19	DNAAF5 (ENSSTOG00000003874) #20	SUN1 (ENSSTOG00000003895) #21	GET4 (ENSSTOG00000003934) #22	ADAP1 (ENSSTOG00000024349) #23	COX19 (ENSSTOG00000032354) #24	CYP2W1 (ENSSTOG00000003002) #25	C7orf50 (ENSSTOG00000027588) #29	GPR146 (ENSSTOG00000030630) #26	ENSSTOG00000031759 #27	GPER1 (ENSSTOG00000034461) #28	ZFAND2A (ENSSTOG00000003030) #30	MICALL2 (ENSSTOG00000001736) #32	INTS1 (ENSSTOG00000001754) #33	MAFK (ENSSTOG00000028786) #34	TMEM184A (ENSSTOG00000019565) #35	PSMG3 (ENSSTOG00000022901) #36	ELFN1 (ENSSTOG00000022022)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	324										FAM20C (ENSUPAG00010020674) #17	PDGFA (ENSUPAG00010020683) #18	PRKAR1B (ENSUPAG00010020710) #19	DNAAF5 (ENSUPAG00010020722) #20	ENSUPAG00010020749	SUN1 (ENSUPAG00010020771) #21	GET4 (ENSUPAG00010021447) #22	ADAP1 (ENSUPAG00010021453) #23	COX19 (ENSUPAG00010021461) #24	CYP2W1 (ENSUPAG00010021467) #25	C7orf50 (ENSUPAG00010021473) #29	GPR146 (ENSUPAG00010021485) #26	ENSUPAG00010021491 #27	GPER1 (ENSUPAG00010021499) #28	ZFAND2A (ENSUPAG00010021504) #30	UNCX (ENSUPAG00010021511) #31	MICALL2 (ENSUPAG00010021515) #32	INTS1 (ENSUPAG00010021538) #33	MAFK (ENSUPAG00010022024) #34	TMEM184A (ENSUPAG00010022026) #35	PSMG3 (ENSUPAG00010000020) #36	ELFN1 (ENSUPAG00010000059)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	9	ENSSVLG00005020900	ENSSVLG00005020960	ENSSVLG00005021007	ENSSVLG00005021109	ENSSVLG00005021152	ENSSVLG00005021240	ENSSVLG00005021255	ENSSVLG00005021302	FAM20C (ENSSVLG00005021370) #17	FOXL3 (ENSSVLG00005021518)	ENSSVLG00005021568	PDGFA (ENSSVLG00005021609) #18	PRKAR1B (ENSSVLG00005021680) #19	DNAAF5 (ENSSVLG00005021703) #20	SUN1 (ENSSVLG00005021754) #21	GET4 (ENSSVLG00005021780) #22	ADAP1 (ENSSVLG00005021832) #23	COX19 (ENSSVLG00005021886) #24	CYP2W1 (ENSSVLG00005021903) #25	C7orf50 (ENSSVLG00005021970) #29	GPR146 (ENSSVLG00005021995) #26	ENSSVLG00005022016 #27	GPER1 (ENSSVLG00005022046) #28	ZFAND2A (ENSSVLG00005022062) #30	UNCX (ENSSVLG00005022092) #31	MICALL2 (ENSSVLG00005022164) #32	INTS1 (ENSSVLG00005022394) #33	MAFK (ENSSVLG00005022759) #34	TMEM184A (ENSSVLG00005022787) #35	PSMG3 (ENSSVLG00005022869) #36	ELFN1 (ENSSVLG00005022897)